View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18712_low_5 (Length: 520)

Name: NF18712_low_5
Description: NF18712
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18712_low_5
NF18712_low_5
[»] chr4 (60 HSPs)
chr4 (21-500)||(47469153-47469630)
chr4 (61-497)||(50220772-50221208)
chr4 (85-497)||(41917575-41917986)
chr4 (81-497)||(12733094-12733509)
chr4 (21-466)||(49070708-49071157)
chr4 (35-493)||(19558317-19558777)
chr4 (153-441)||(13447965-13448251)
chr4 (40-495)||(15014125-15014565)
chr4 (37-495)||(16225993-16226452)
chr4 (40-495)||(41257207-41257648)
chr4 (21-238)||(10238524-10238740)
chr4 (85-405)||(13593643-13593962)
chr4 (252-495)||(42707864-42708106)
chr4 (226-495)||(7965560-7965828)
chr4 (40-494)||(7186749-7187212)
chr4 (34-349)||(18275709-18276020)
chr4 (311-493)||(43282256-43282438)
chr4 (252-493)||(16328769-16329010)
chr4 (252-493)||(26679211-26679452)
chr4 (336-495)||(16731059-16731217)
chr4 (252-493)||(10487741-10487982)
chr4 (21-254)||(24237770-24238004)
chr4 (147-463)||(9294597-9294911)
chr4 (317-495)||(34394335-34394512)
chr4 (153-341)||(40901657-40901845)
chr4 (160-495)||(12245105-12245436)
chr4 (295-497)||(15044054-15044256)
chr4 (295-497)||(15110168-15110370)
chr4 (316-493)||(9794475-9794652)
chr4 (196-495)||(38763838-38764133)
chr4 (315-495)||(34197027-34197206)
chr4 (315-462)||(14900625-14900772)
chr4 (316-495)||(19822568-19822746)
chr4 (326-495)||(820671-820839)
chr4 (153-271)||(18240797-18240914)
chr4 (302-495)||(27960094-27960286)
chr4 (252-405)||(55377521-55377674)
chr4 (252-408)||(5683687-5683843)
chr4 (252-379)||(14995265-14995392)
chr4 (252-400)||(8373664-8373812)
chr4 (34-175)||(12134792-12134934)
chr4 (252-379)||(18250909-18251036)
chr4 (317-462)||(37958005-37958149)
chr4 (315-400)||(13810560-13810645)
chr4 (238-495)||(41166797-41167051)
chr4 (252-400)||(18167966-18168114)
chr4 (252-379)||(18247362-18247489)
chr4 (252-400)||(19019633-19019780)
chr4 (81-164)||(54364623-54364706)
chr4 (146-220)||(43282489-43282562)
chr4 (252-337)||(18294021-18294106)
chr4 (252-379)||(22355420-22355545)
chr4 (40-133)||(15043806-15043897)
chr4 (40-133)||(15110527-15110618)
chr4 (315-400)||(18495365-18495450)
chr4 (21-65)||(50223403-50223447)
chr4 (447-497)||(13443539-13443588)
chr4 (40-133)||(19999389-19999481)
chr4 (81-162)||(34197347-34197427)
chr4 (40-135)||(15288209-15288304)
[»] chr8 (60 HSPs)
chr8 (25-497)||(33171146-33171620)
chr8 (21-497)||(18042349-18042827)
chr8 (25-497)||(22498105-22498579)
chr8 (153-496)||(24553411-24553751)
chr8 (74-495)||(33611903-33612321)
chr8 (34-441)||(7469147-7469555)
chr8 (209-497)||(18262339-18262625)
chr8 (85-495)||(16001039-16001448)
chr8 (153-497)||(45468146-45468489)
chr8 (87-497)||(20708705-20709114)
chr8 (85-495)||(22886802-22887213)
chr8 (40-495)||(37654479-37654931)
chr8 (102-495)||(38636503-38636891)
chr8 (69-495)||(26010363-26010785)
chr8 (223-495)||(29296963-29297226)
chr8 (57-495)||(23148787-23149218)
chr8 (199-459)||(24267066-24267325)
chr8 (220-493)||(25609277-25609551)
chr8 (209-481)||(45561956-45562227)
chr8 (67-379)||(15932249-15932557)
chr8 (252-493)||(5237266-5237507)
chr8 (252-493)||(24662091-24662332)
chr8 (252-493)||(43684725-43684966)
chr8 (153-495)||(23226859-23227198)
chr8 (258-493)||(22908225-22908460)
chr8 (240-466)||(41507836-41508061)
chr8 (238-495)||(21199079-21199333)
chr8 (34-236)||(45560197-45560400)
chr8 (252-495)||(24718263-24718506)
chr8 (88-495)||(23836134-23836534)
chr8 (315-495)||(24107357-24107538)
chr8 (34-240)||(25294953-25295160)
chr8 (34-236)||(25756973-25757176)
chr8 (302-495)||(21191662-21191854)
chr8 (302-495)||(39447731-39447923)
chr8 (146-495)||(17284241-17284574)
chr8 (252-433)||(24929912-24930093)
chr8 (37-255)||(24238581-24238800)
chr8 (252-405)||(13663423-13663576)
chr8 (252-408)||(22007419-22007575)
chr8 (407-493)||(22322287-22322373)
chr8 (85-240)||(17500964-17501118)
chr8 (252-400)||(28836771-28836919)
chr8 (252-379)||(22146599-22146726)
chr8 (315-462)||(38532792-38532939)
chr8 (315-495)||(31195192-31195371)
chr8 (252-400)||(17150954-17151102)
chr8 (409-495)||(23153121-23153205)
chr8 (168-408)||(18618368-18618608)
chr8 (252-400)||(13721963-13722111)
chr8 (318-462)||(21696695-21696839)
chr8 (149-207)||(24906896-24906954)
chr8 (315-355)||(17730449-17730489)
chr8 (38-176)||(19332656-19332795)
chr8 (34-175)||(11543498-11543639)
chr8 (238-433)||(22736855-22737046)
chr8 (40-133)||(22908686-22908778)
chr8 (34-168)||(22312653-22312787)
chr8 (147-210)||(24107608-24107670)
chr8 (329-379)||(24969283-24969333)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (21-497)||(5769022-5769498)
chr1 (81-497)||(40437106-40437521)
chr1 (85-497)||(20193043-20193456)
chr1 (40-497)||(5471234-5471688)
chr1 (40-495)||(8538794-8539247)
chr1 (40-495)||(8604033-8604486)
chr1 (153-497)||(18165170-18165511)
chr1 (44-495)||(22144230-22144676)
chr1 (40-339)||(33396290-33396591)
chr1 (40-482)||(27673713-27674150)
chr1 (102-495)||(49998160-49998544)
chr1 (81-462)||(17607868-17608243)
chr1 (40-366)||(21194038-21194362)
chr1 (319-495)||(2421833-2422008)
chr1 (252-493)||(51451682-51451923)
chr1 (99-398)||(16655445-16655741)
chr1 (298-495)||(20176368-20176564)
chr1 (302-492)||(13377622-13377811)
chr1 (252-493)||(22365824-22366067)
chr1 (368-497)||(33396589-33396718)
chr1 (302-495)||(36357246-36357438)
chr1 (302-494)||(38034526-38034717)
chr1 (241-495)||(19602188-19602440)
chr1 (40-482)||(37234832-37235266)
chr1 (238-462)||(20955856-20956079)
chr1 (252-400)||(41218522-41218670)
chr1 (224-421)||(22836164-22836357)
chr1 (304-407)||(22353285-22353388)
chr1 (102-240)||(52400272-52400408)
chr1 (146-495)||(17022551-17022904)
chr1 (252-365)||(22249938-22250051)
chr1 (252-400)||(20253480-20253628)
chr1 (225-398)||(21224358-21224531)
chr1 (252-400)||(15862381-15862529)
chr1 (331-374)||(51628728-51628771)
chr1 (97-175)||(77102-77179)
chr1 (438-480)||(22353383-22353425)
[»] chr7 (50 HSPs)
chr7 (21-497)||(9321871-9322348)
chr7 (21-497)||(13617704-13618168)
chr7 (171-497)||(4445289-4445613)
chr7 (171-494)||(4437888-4438210)
chr7 (34-482)||(48354234-48354676)
chr7 (149-497)||(45148643-45148981)
chr7 (34-495)||(4483712-4484172)
chr7 (37-495)||(9610138-9610590)
chr7 (37-495)||(9837710-9838162)
chr7 (153-497)||(33558711-33559053)
chr7 (40-495)||(9057486-9057935)
chr7 (102-495)||(14939743-14940130)
chr7 (102-495)||(15367336-15367723)
chr7 (34-482)||(16920779-16921223)
chr7 (185-497)||(28389389-28389700)
chr7 (199-462)||(31500272-31500534)
chr7 (112-493)||(13350988-13351368)
chr7 (161-487)||(11286197-11286520)
chr7 (85-405)||(9643284-9643603)
chr7 (85-495)||(14275786-14276190)
chr7 (258-495)||(34242073-34242309)
chr7 (252-493)||(13911855-13912096)
chr7 (252-493)||(15442407-15442648)
chr7 (252-493)||(30262972-30263213)
chr7 (252-493)||(7292032-7292273)
chr7 (252-493)||(11515408-11515648)
chr7 (40-253)||(20583955-20584167)
chr7 (147-462)||(7285090-7285402)
chr7 (40-495)||(10861692-10862140)
chr7 (302-495)||(13376787-13376979)
chr7 (302-494)||(13389034-13389225)
chr7 (252-405)||(32495385-32495538)
chr7 (340-495)||(16918745-16918900)
chr7 (238-495)||(49048641-49048895)
chr7 (238-495)||(13273814-13274068)
chr7 (315-400)||(15629914-15629999)
chr7 (40-175)||(16382538-16382674)
chr7 (302-495)||(17224782-17224973)
chr7 (183-406)||(15761072-15761295)
chr7 (309-405)||(16417697-16417793)
chr7 (252-379)||(15951954-15952081)
chr7 (85-240)||(18080699-18080852)
chr7 (34-175)||(21675998-21676140)
chr7 (238-348)||(14252189-14252296)
chr7 (81-176)||(15979144-15979239)
chr7 (258-414)||(17985598-17985754)
chr7 (224-278)||(13463446-13463500)
chr7 (40-133)||(7291720-7291812)
chr7 (40-133)||(15952301-15952393)
chr7 (100-176)||(39292823-39292898)
[»] chr6 (59 HSPs)
chr6 (37-497)||(34965810-34966258)
chr6 (32-494)||(19853073-19853532)
chr6 (40-497)||(29161168-29161623)
chr6 (149-497)||(11373580-11373928)
chr6 (40-495)||(22847013-22847465)
chr6 (81-497)||(22462944-22463360)
chr6 (153-497)||(32351097-32351439)
chr6 (185-497)||(19671423-19671734)
chr6 (85-497)||(17014500-17014913)
chr6 (85-497)||(22594150-22594564)
chr6 (153-497)||(14449432-14449778)
chr6 (216-495)||(18630481-18630751)
chr6 (203-495)||(33539239-33539531)
chr6 (149-495)||(18382531-18382875)
chr6 (258-495)||(35016528-35016765)
chr6 (153-495)||(25918660-25919000)
chr6 (147-495)||(18824396-18824741)
chr6 (252-490)||(23152334-23152572)
chr6 (147-495)||(18840251-18840596)
chr6 (326-495)||(17084235-17084403)
chr6 (147-495)||(18582258-18582602)
chr6 (302-495)||(16888588-16888781)
chr6 (203-495)||(29604553-29604844)
chr6 (147-495)||(4989975-4990320)
chr6 (302-495)||(21622270-21622461)
chr6 (316-495)||(33323914-33324092)
chr6 (321-495)||(35136839-35137012)
chr6 (251-497)||(26506127-26506361)
chr6 (141-240)||(25650116-25650214)
chr6 (238-491)||(25368197-25368447)
chr6 (315-495)||(28195622-28195802)
chr6 (196-331)||(15005869-15006004)
chr6 (251-405)||(16826703-16826857)
chr6 (252-405)||(25904096-25904249)
chr6 (146-365)||(22363174-22363390)
chr6 (389-482)||(12310576-12310669)
chr6 (232-495)||(18397984-18398242)
chr6 (252-400)||(19628505-19628653)
chr6 (341-495)||(15080548-15080701)
chr6 (424-497)||(15005732-15005805)
chr6 (216-331)||(31468561-31468676)
chr6 (260-379)||(33315438-33315557)
chr6 (183-406)||(1555080-1555303)
chr6 (224-399)||(19122569-19122745)
chr6 (419-495)||(22363072-22363148)
chr6 (252-379)||(25174734-25174861)
chr6 (252-379)||(27654957-27655084)
chr6 (238-440)||(15739250-15739450)
chr6 (34-166)||(23220685-23220817)
chr6 (238-463)||(22867219-22867440)
chr6 (258-365)||(14627474-14627581)
chr6 (34-166)||(17084406-17084540)
chr6 (149-379)||(940139-940367)
chr6 (74-212)||(33323679-33323813)
chr6 (57-227)||(35137104-35137269)
chr6 (316-364)||(17790405-17790453)
chr6 (81-176)||(26505780-26505874)
chr6 (238-303)||(15736110-15736174)
chr6 (40-133)||(23976437-23976529)
[»] chr3 (70 HSPs)
chr3 (40-497)||(41660494-41660951)
chr3 (81-497)||(38376530-38376946)
chr3 (153-497)||(43428369-43428713)
chr3 (153-497)||(21167558-21167898)
chr3 (203-495)||(6229473-6229764)
chr3 (196-492)||(18969152-18969448)
chr3 (40-420)||(33369770-33370148)
chr3 (85-497)||(31413137-31413548)
chr3 (190-497)||(11637431-11637737)
chr3 (206-495)||(4146517-4146805)
chr3 (203-495)||(14816536-14816825)
chr3 (198-497)||(17319443-17319731)
chr3 (81-495)||(48420584-48420993)
chr3 (206-495)||(4163050-4163338)
chr3 (85-427)||(14180902-14181244)
chr3 (162-495)||(9591593-9591926)
chr3 (224-487)||(11401749-11402013)
chr3 (57-449)||(39654795-39655183)
chr3 (158-373)||(10912227-10912443)
chr3 (118-495)||(14522134-14522506)
chr3 (252-493)||(13837932-13838174)
chr3 (302-495)||(34559000-34559193)
chr3 (252-493)||(22274218-22274459)
chr3 (252-495)||(17203759-17204002)
chr3 (302-495)||(15875286-15875478)
chr3 (306-495)||(47785727-47785915)
chr3 (259-495)||(51159215-51159452)
chr3 (147-462)||(7852884-7853195)
chr3 (252-466)||(15469344-15469558)
chr3 (309-493)||(2450070-2450254)
chr3 (147-379)||(15516717-15516945)
chr3 (302-461)||(14060201-14060359)
chr3 (161-495)||(14079577-14079906)
chr3 (147-462)||(19945596-19945911)
chr3 (309-493)||(16745127-16745310)
chr3 (115-460)||(12489584-12489928)
chr3 (316-483)||(55441671-55441837)
chr3 (302-495)||(11329895-11330087)
chr3 (302-495)||(12952173-12952365)
chr3 (57-230)||(34558783-34558953)
chr3 (252-412)||(54039455-54039615)
chr3 (224-497)||(11516318-11516591)
chr3 (168-462)||(11987028-11987321)
chr3 (303-462)||(38811959-38812117)
chr3 (252-400)||(49231389-49231537)
chr3 (315-462)||(17138608-17138754)
chr3 (147-379)||(12020944-12021170)
chr3 (252-379)||(25057919-25058046)
chr3 (159-213)||(15549512-15549566)
chr3 (34-165)||(8603605-8603737)
chr3 (252-405)||(12808126-12808279)
chr3 (40-133)||(12951918-12952010)
chr3 (252-408)||(17957161-17957316)
chr3 (97-213)||(13327675-13327790)
chr3 (238-350)||(14294486-14294595)
chr3 (238-350)||(14300113-14300222)
chr3 (309-400)||(16820141-16820232)
chr3 (315-372)||(12562446-12562503)
chr3 (40-133)||(17957537-17957629)
chr3 (147-195)||(54652848-54652896)
chr3 (440-495)||(39655732-39655787)
chr3 (443-497)||(50312504-50312557)
chr3 (72-133)||(9591945-9592006)
chr3 (82-195)||(17203596-17203707)
chr3 (238-282)||(11062094-11062137)
chr3 (424-495)||(33369703-33369775)
chr3 (146-218)||(47983881-47983953)
chr3 (146-218)||(47993168-47993240)
chr3 (146-218)||(48002455-48002527)
chr3 (146-218)||(48011741-48011813)
[»] chr2 (46 HSPs)
chr2 (78-497)||(24276807-24277225)
chr2 (52-497)||(6093835-6094280)
chr2 (95-490)||(9635735-9636128)
chr2 (153-497)||(25133197-25133541)
chr2 (81-497)||(24561590-24562005)
chr2 (85-497)||(25594043-25594454)
chr2 (81-493)||(66470-66877)
chr2 (185-497)||(16293612-16293923)
chr2 (34-356)||(18534811-18535134)
chr2 (81-493)||(25600866-25601276)
chr2 (148-495)||(27260529-27260873)
chr2 (203-495)||(24881670-24881962)
chr2 (252-493)||(14907283-14907524)
chr2 (252-493)||(23819250-23819491)
chr2 (252-493)||(20014190-20014431)
chr2 (57-379)||(24088328-24088645)
chr2 (149-462)||(25304532-25304840)
chr2 (238-495)||(721540-721794)
chr2 (382-497)||(18536022-18536137)
chr2 (147-462)||(25211947-25212259)
chr2 (327-495)||(19665741-19665908)
chr2 (302-495)||(24295492-24295685)
chr2 (285-464)||(19670015-19670193)
chr2 (302-462)||(32738795-32738955)
chr2 (295-495)||(4197-4395)
chr2 (81-352)||(22787017-22787280)
chr2 (341-495)||(9781784-9781938)
chr2 (252-379)||(12727332-12727459)
chr2 (421-480)||(32465097-32465156)
chr2 (164-240)||(7320459-7320535)
chr2 (309-349)||(18535133-18535173)
chr2 (40-191)||(19658826-19658975)
chr2 (252-379)||(19887635-19887762)
chr2 (252-405)||(16900436-16900589)
chr2 (252-405)||(16993827-16993980)
chr2 (315-374)||(22580904-22580963)
chr2 (315-349)||(24572385-24572419)
chr2 (40-133)||(21140738-21140830)
chr2 (127-175)||(20272426-20272474)
chr2 (252-379)||(21141050-21141175)
chr2 (81-244)||(45618432-45618594)
chr2 (319-350)||(28973176-28973207)
chr2 (25-176)||(22331693-22331846)
chr2 (40-133)||(19887982-19888074)
chr2 (40-133)||(21275729-21275821)
chr2 (57-133)||(19670339-19670414)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (54-497)||(85304-85746)
scaffold0004 (40-497)||(26439-26896)
scaffold0004 (316-495)||(330652-330830)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (21-497)||(34270-34747)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (85-494)||(3646-4054)
[»] chr5 (63 HSPs)
chr5 (34-497)||(11964934-11965398)
chr5 (21-497)||(23414104-23414568)
chr5 (89-497)||(23235287-23235694)
chr5 (200-495)||(6455739-6456034)
chr5 (85-497)||(16836144-16836554)
chr5 (216-495)||(24083177-24083454)
chr5 (153-497)||(5622271-5622611)
chr5 (224-497)||(21832576-21832849)
chr5 (85-492)||(19872810-19873218)
chr5 (153-497)||(26560628-26560970)
chr5 (40-462)||(37982308-37982727)
chr5 (205-487)||(29913122-29913402)
chr5 (252-493)||(17472588-17472829)
chr5 (252-493)||(27184573-27184814)
chr5 (252-493)||(21234370-21234611)
chr5 (252-483)||(1169372-1169603)
chr5 (252-493)||(25901184-25901425)
chr5 (251-487)||(11764328-11764564)
chr5 (99-398)||(28900998-28901294)
chr5 (99-398)||(28937393-28937689)
chr5 (259-493)||(4200824-4201058)
chr5 (252-493)||(16535376-16535617)
chr5 (81-495)||(23492957-23493368)
chr5 (147-495)||(109841-110186)
chr5 (240-495)||(21223567-21223819)
chr5 (147-461)||(11582951-11583261)
chr5 (252-495)||(23505801-23506044)
chr5 (252-466)||(20615685-20615899)
chr5 (302-462)||(3673127-3673286)
chr5 (302-494)||(5451653-5451844)
chr5 (316-493)||(25004072-25004249)
chr5 (316-495)||(22881618-22881796)
chr5 (149-462)||(19861201-19861514)
chr5 (302-495)||(7727629-7727821)
chr5 (252-415)||(37052057-37052220)
chr5 (388-478)||(431631-431720)
chr5 (258-408)||(10779125-10779275)
chr5 (252-379)||(22367455-22367582)
chr5 (34-220)||(20833106-20833291)
chr5 (40-175)||(21108499-21108635)
chr5 (39-462)||(21615882-21616306)
chr5 (346-495)||(16104759-16104910)
chr5 (81-234)||(431347-431497)
chr5 (252-405)||(29191569-29191722)
chr5 (252-379)||(11525-11652)
chr5 (252-405)||(21074543-21074696)
chr5 (252-400)||(18778944-18779092)
chr5 (259-379)||(23513983-23514103)
chr5 (252-379)||(1220704-1220831)
chr5 (252-379)||(11341811-11341938)
chr5 (238-462)||(32967116-32967337)
chr5 (214-405)||(22884239-22884429)
chr5 (421-466)||(2030993-2031038)
chr5 (40-133)||(3672870-3672962)
chr5 (40-133)||(10779501-10779593)
chr5 (315-352)||(19404713-19404750)
chr5 (315-400)||(23454086-23454171)
chr5 (315-400)||(23465591-23465676)
chr5 (252-400)||(25425800-25425948)
chr5 (40-98)||(25425484-25425542)
chr5 (40-133)||(21074811-21074903)
chr5 (40-133)||(22367806-22367898)
chr5 (40-135)||(7424542-7424637)
[»] scaffold0153 (1 HSPs)
scaffold0153 (81-497)||(808-1223)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (40-494)||(130768-131222)
scaffold0022 (302-462)||(105864-106023)
scaffold0022 (302-462)||(108782-108941)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (21-497)||(44422-44895)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (21-492)||(4826-5300)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (71-495)||(84491-84912)
scaffold0025 (258-482)||(52390-52613)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (199-497)||(1794-2092)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (185-497)||(106695-107006)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (142-497)||(21022-21376)
scaffold0165 (286-497)||(29165-29374)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (199-495)||(2797-3095)
scaffold0327 (302-495)||(5161-5354)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (85-497)||(24319-24732)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (203-494)||(22878-23169)
[»] scaffold0009 (4 HSPs)
scaffold0009 (34-482)||(68384-68826)
scaffold0009 (85-472)||(97889-98274)
scaffold0009 (252-466)||(271046-271260)
scaffold0009 (251-331)||(255281-255360)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (153-497)||(36852-37186)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (40-495)||(3582-4027)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (147-495)||(7763-8108)
[»] scaffold0601 (2 HSPs)
scaffold0601 (231-497)||(1729-1991)
scaffold0601 (81-176)||(2145-2239)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (203-495)||(1648-1940)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (34-482)||(198216-198658)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (147-495)||(20680-21025)
scaffold0150 (147-495)||(27509-27854)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (203-495)||(454-746)
[»] scaffold0786 (2 HSPs)
scaffold0786 (40-495)||(567-1016)
scaffold0786 (76-495)||(5657-6071)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (40-495)||(5982-6433)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (40-495)||(23303-23759)
[»] scaffold0390 (1 HSPs)
scaffold0390 (40-495)||(4155-4604)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (146-495)||(942-1289)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (252-483)||(95539-95770)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (226-495)||(1620-1888)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (302-495)||(119120-119312)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (252-495)||(29103-29346)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (239-493)||(44953-45208)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (102-376)||(6694-6965)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (252-493)||(38072-38313)
scaffold0078 (40-133)||(38535-38627)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (252-492)||(21719-21959)
scaffold0141 (259-493)||(25981-26215)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (259-479)||(98052-98271)
scaffold0031 (34-195)||(98301-98460)
scaffold0031 (320-464)||(69842-69985)
[»] scaffold0456 (3 HSPs)
scaffold0456 (259-466)||(13266-13472)
scaffold0456 (316-393)||(11886-11963)
scaffold0456 (164-212)||(12065-12112)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (252-495)||(24-267)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (240-478)||(52143-52378)
scaffold0018 (240-478)||(56095-56330)
[»] scaffold1068 (1 HSPs)
scaffold1068 (226-495)||(2269-2536)
[»] scaffold0269 (3 HSPs)
scaffold0269 (252-493)||(12123-12363)
scaffold0269 (252-405)||(1144-1297)
scaffold0269 (252-405)||(15400-15553)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (147-493)||(105-449)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (112-405)||(13598-13888)
[»] scaffold1734 (1 HSPs)
scaffold1734 (252-493)||(412-653)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (88-495)||(3138-3542)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (147-495)||(129459-129804)
scaffold0028 (293-481)||(78803-78989)
scaffold0028 (224-363)||(38991-39130)
scaffold0028 (40-133)||(90088-90180)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (302-495)||(117449-117642)
scaffold0016 (147-220)||(117725-117796)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (302-495)||(5859-6051)
[»] scaffold1849 (1 HSPs)
scaffold1849 (316-495)||(405-584)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (251-495)||(4667-4911)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (259-493)||(14282-14516)
scaffold0032 (316-495)||(105466-105644)
scaffold0032 (40-128)||(109290-109377)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (260-495)||(7595-7829)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (238-462)||(1142-1363)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (252-493)||(2423-2664)
[»] scaffold0253 (3 HSPs)
scaffold0253 (336-495)||(6637-6796)
scaffold0253 (336-495)||(16062-16221)
scaffold0253 (338-495)||(4140-4296)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (302-495)||(59827-60021)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (148-463)||(2202-2514)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (334-480)||(30245-30390)
scaffold0010 (34-286)||(29988-30235)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (276-495)||(24486-24704)
scaffold0080 (40-220)||(24718-24897)
[»] scaffold1752 (1 HSPs)
scaffold1752 (147-355)||(564-770)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (240-462)||(18393-18612)
scaffold0120 (240-462)||(30178-30397)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (167-440)||(90552-90823)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (302-464)||(23299-23460)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (167-379)||(4831-5041)
scaffold0342 (215-405)||(1591-1780)
[»] scaffold1311 (1 HSPs)
scaffold1311 (316-466)||(892-1041)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (302-495)||(6574-6766)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (318-495)||(71166-71341)
[»] scaffold0013 (3 HSPs)
scaffold0013 (315-463)||(34602-34750)
scaffold0013 (81-176)||(8269-8364)
scaffold0013 (149-193)||(34437-34481)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (316-440)||(10749-10871)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (251-405)||(20234-20388)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (252-408)||(28091-28247)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (301-440)||(53639-53776)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (252-379)||(78625-78752)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (252-405)||(2560-2713)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (316-462)||(2338-2484)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (318-483)||(9155-9318)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (316-393)||(2460-2537)
scaffold0409 (316-393)||(10715-10792)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (258-379)||(8444-8565)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (309-405)||(6409-6505)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (258-379)||(1587-1708)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (258-379)||(17833-17954)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (34-126)||(12330-12421)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (252-408)||(155183-155339)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (252-335)||(534-617)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (413-495)||(13047-13129)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (431-497)||(10020-10086)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (81-174)||(32490-32582)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (315-355)||(2562-2602)
[»] scaffold0090 (3 HSPs)
scaffold0090 (81-244)||(35782-35943)
scaffold0090 (34-135)||(1343-1446)
scaffold0090 (34-135)||(5723-5826)
[»] scaffold1957 (1 HSPs)
scaffold1957 (233-331)||(633-731)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (34-176)||(11565-11709)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (40-114)||(1323-1399)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (315-355)||(7026-7066)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (318-350)||(158403-158435)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 60)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 47469630 - 47469153
Alignment:
Q  21 attgatatataaacattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47469630 attgatatataaacattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatg 47469531  T
Q  121 ataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaa 220  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47469530 ataaatatcatatttcacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttaatcatataaggctagtcccgaaagatttataaggtaattggctttaaagaa 47469431  T
Q  221 tcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatct 320  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47469430 tcgtt--cgacaaagttcgtatcaagtggtaaaacggccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaaact 47469333  T
Q  321 taatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacatt 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  47469332 taatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaagcattagttcaaaaattagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagttcacatt 47469233  T
Q  421 ttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtccagag 500  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47469232 ttccactttcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacatttaaccaactttacaagccttgcctaagtccagag 47469153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 50221208 - 50220772
Alignment:
Q  61 agttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatat 160  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  50221208 agttccaccactctgaatacttctcatattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatatcatattaaacacctaacaattcattcacatat 50221109  T
Q  161 cttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgacca 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||    
T  50221108 cttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattgactttaaataatcgttttcgacaaagtccgtaccaagtggaaaaacggcca 50221009  T
Q  261 acattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaac 360  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50221008 acattgataattttcaaaataaggtaacttatttaagttcgaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaac 50220909  T
Q  361 tattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaa 460  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50220908 tattaaacattagttcaaagattaggctaagttcgtatgagaaaatcccaagttctcatattccacaatcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaa 50220809  T
Q  461 gacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50220808 gacattaaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 50220772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 85 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 41917986 - 41917575
Alignment:
Q  85 cacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctag 184  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || || |||| | || ||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||||     
T  41917986 cacattccaagtaaagatgaaatacaacaccttatgatgaacatcatatccaacacctaataagtcactcacataacttcatttaatcatacaaagctat 41917887  T
Q  185 tcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaagg 284  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  41917886 tcacgaaagatttataagttaaacggctttaaagaatcattttcgacaaagtccgtatcaagtggcaaa-cggccaacgttgataattttcaaagcaaag 41917788  T
Q  285 taacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaatta 384  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  41917787 taacttattcaagtttgaaaactcacaaatcaattttaatcaatcatgtaatcatgagtttaagccacttacgaactatcaaacattagttcaaagatta 41917688  T
Q  385 gcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagcc 484  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41917687 gcctaagttcgtatgagaaaaccccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacatttaaccaactttacaagcc 41917588  T
Q  485 ttgcctaagtcca 497  Q
    |||||||||||||    
T  41917587 ttgcctaagtcca 41917575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 81 - 497
Target Start/End: Original strand, 12733094 - 12733509
Alignment:
Q  81 ttctcacattccaagtaaag-agaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataag 179  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||| || | ||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||     
T  12733094 ttctcacaatacaagtaaaggagaaaatacaacaccttatgataaacatcatgttcaacacgtaacaatt-attcacatatcttcatttgatcatataaa 12733192  T
Q  180 gctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaa 279  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12733193 gctattcacgaaagatt-acaaggtaattgactttaaagaatcgttttcgacaaagtctgtatcaagtggcaaaacggccaacattgataattatcaaaa 12733291  T
Q  280 caaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaa 379  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12733292 caaggtaacttattcaagtttggaaactcacagatcaatcttaatcaatcatgtaatcatgagcttaagccacttacgaactatcaaacattagttcaaa 12733391  T
Q  380 aattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttac 479  Q
     ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||  ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||    
T  12733392 gattagcctaagttcgtatgagaaaaccccaagtacacaaattccgtaatcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagaccatgtaccaactttac 12733491  T
Q  480 aagccttgcctaagtcca 497  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  12733492 aagtcttgcctaagtcca 12733509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 466
Target Start/End: Original strand, 49070708 - 49071157
Alignment:
Q  21 attgatatataaacattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatactt-ctcacattccaagtaaag-agaaaatgcaacacctta 118  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  49070708 attgatatacatacattaatcaacatcaactatataatatagctcaacaactccatatactttctcacaatccaagtaaaggagagaatacaacacctta 49070807  T
Q  119 tgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaa---gatttataaggtaattggcttta 215  Q
    | |||||||| |||||| || ||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||  || | ||| ||||   | | ||||||||||||| |||||    
T  49070808 tcataaatatcatattcaacacctaacaat-cactcacatatcttcatttaatcatatagagccattcatgaaattaggtgtataaggtaattgccttta 49070906  T
Q  216 aagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatc 315  Q
    | ||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||| ||| || ||||  |||||||  |||||  |||| ||    
T  49070907 aggaaccattttcgacaaagtccgtatcaagtagcaaaatggtcaacattgatatttttcaaagcaaagttacttgttcaagtttgaaaacctacaactc 49071006  T
Q  316 aatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttc 415  Q
     |||||||| |||||| ||   |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  49071007 gatcttaattaatcatataagtatgagcataggccacttacgaactatcaaacattagttcaaagattagcctaagttcgtatgagaaaatctcaagttc 49071106  T
Q  416 acattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacatt 466  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49071107 acatattccacaatcccacccgaaaatcaagttttacatgattaagacatt 49071157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 35 - 493
Target Start/End: Original strand, 19558317 - 19558777
Alignment:
Q  35 attaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatactt-ctcacattccaagtaaag-agaaaatgcaacaccttatgataaatattata 132  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||| || |||| | | | || |||||| | ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| || |||    
T  19558317 attaatcaacatcaactatatcatatggttcaacaactcgatacaatttctcacaattcaagtaaaggagaaaatacaacacattatgataaacatcata 19558416  T
Q  133 ttccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgaca 232  Q
    | | || | |  | |  ||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  19558417 tccaacacatgtagag-cattcacatgtcttcatataatcatataaggctattcacgaaagatttataaagtaattggttttaaagaatcactttcgaca 19558515  T
Q  233 aagttcgtatcaagtggc-aaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcat 331  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||  |||||  |||| || |||||||||||||||    
T  19558516 aagtccgtatcaagtggcgaaaacggccaacattaataattttcaaagctatgtaacttactcaagtttgaaaacatacaattccatcttaatcaatcat 19558615  T
Q  332 gtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcc 431  Q
     ||   |||||| || ||| |||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||  ||||||| |||    
T  19558616 ataagtatgagcatatgccgcttacgaactatcaatcattaattcaaagattagcctaagttcgtatgagaaaatccaaagtttacacattccacaatcc 19558715  T
Q  432 cacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  19558716 cacccgaaaatcaagtttgacatgattaaggcattgtaccaacttcacaagcattgcctaag 19558777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 153 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 13448251 - 13447965
Alignment:
Q  153 tcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaa 252  Q
    ||||||| |||||||||  ||| ||| |||| |||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||    
T  13448251 tcacataacttcatttaaccatttaaagctattcaccaaagatttacaagttaaacggctttaaagaatcattatcgacaaagtccgtatcaagtg-caa 13448153  T
Q  253 aacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccac 352  Q
    || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||  |||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13448152 aatggccaacattgataattttcaaagctaggtaacttaatcaagttttaaaacctacaactccatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccac 13448053  T
Q  353 ttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaa 441  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13448052 ttatgaactattaaacattagttcaaagattagcttaagttcgtatgagaaaacccaaagttcaca-tttccacattcccacccgaaaa 13447965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 40 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 15014565 - 15014125
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacg 139  Q
    ||||||||||| | || ||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||     
T  15014565 tcaacatcaactacatcatatagtttcaccactccaaatatttctcatattccaagtaaagagaaaatacaacaacttatgataaatatcatatccaaca 15014466  T
Q  140 cctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcg 239  Q
      ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||| |||||| |  || ||| |||||  |    
T  15014465 tataacaattcattcacacatcttcatttagtcatataaggctagtcaagaaaga-ccataagataattggcttaaaagaaccaattccgataaagtctg 15014367  T
Q  240 tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaa-caaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtca 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||     ||| |  ||       
T  15014366 tatcaagtggc-aaacgaccaacattgataattctcaaaagtaaagtaacttattcaagtttaaaaactcacaaaataatctt-----atcttaaag--- 15014276  T
Q  339 tgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccga 438  Q
          |||||||| ||| ||||||||  |||||||||||| | |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15014275 ------taagccacctacaaactattaggcattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaat-ccaagttcacattttccacattcccacccga 15014183  T
Q  439 aa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    || ||||||||| |||||| |||||  ||  |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15014182 aatatcaagtttaacatgactaagatgtttgaccaactttacaagtcttacctaagtc 15014125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 16226452 - 16225993
Alignment:
Q  37 taatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttc-tcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattc 135  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| | | || |||||| | | ||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  16226452 taatcaacatcaatcatatcatataatccaacaactccatacaattcctcacaatccaagtaacgagaaaatacaacacattatgataaatttcatattc 16226353  T
Q  136 cacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaag 235  Q
     || |||| ||    ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||  |||||||| |  ||||| | ||||||||||||    
T  16226352 aacacctagaagaa-attcacacatcatcatttaatcatataaagctattcacgaaagagttataatataattggcatctaagaaccattttcgacaaag 16226254  T
Q  236 ttcgtatcaagtggcaaaa-cgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgta 334  Q
    | |||||||||| |||||| || ||||| |||  | ||||||||||||||| |||||   |||||  |||||  |||||||||| | || ||||||| ||    
T  16226253 tccgtatcaagttgcaaaaacggccaaccttggcatttttcaaaacaaggtgacttaactaagtttgaaaacatacaaatcaatttcaaacaatcatata 16226154  T
Q  335 gtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccac 434  Q
      ||||| ||||  || ||| |||||||| || |||||||||||| |||  |||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  16226153 aacatgatcttagaccgcttgcgaactatcaagcattagttcaaagattttcctatgttcgtatgagaaaatcccaagttcacatattccacaatcgcac 16226054  T
Q  435 ccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16226053 ccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattgtaccaactttacaagctttgcctaagtc 16225993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 41257648 - 41257207
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacg 139  Q
    ||||||||||  | || ||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||| | ||     
T  41257648 tcaacatcaaatacatcatatagtttcaccactccaaatatttttcatattccaagcaaagggaaaatgccacaccttatgataattatcatatccaaca 41257549  T
Q  140 cctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcg 239  Q
      ||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| |||||  |    
T  41257548 tataacaattcattcacacatcttcatttagttgtataaggctagtcacgaaagatc-ataagataattgacttaaaagaatcattttcgataaagtctg 41257450  T
Q  240 tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcat 339  Q
    | |||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||  || |||||||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  41257449 tttcaagtggcaaa-cgcccaacgttgataattctcaaagtaaagtaacttattcaagtttgaaaactca-aaat-aatcttaatccatcatgtagtcat 41257353  T
Q  340 gagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaa 439  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||   |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||         |||||||||    
T  41257352 gagcttaagccacttacaaactattagaca-taggtcaaagtatagcttaagttcgtatgagaaaa-cccaagttcacattt---------ccacccgaa 41257264  T
Q  440 a-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    | ||||||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  41257263 atatcaagtttaacatgattaagatgtttgaccaactttacaagtcttacctaagtc 41257207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10238740 - 10238524
Alignment:
Q  21 attgatatataaacattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatg 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10238740 attgatatataaatattaatcaacatcaaccatatagtatagttccaccattccaaatacttatcatattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatg 10238641  T
Q  121 ataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaa 220  Q
    || ||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10238640 at-aatatcatattcaacaattaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaagttatctacaaaagatttataaggtaattggctttaaagaa 10238542  T
Q  221 tcgttttcgacaaagttc 238  Q
     | |||| ||||||||||    
T  10238541 ccatttttgacaaagttc 10238524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 85 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 13593962 - 13593643
Alignment:
Q  85 cacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctag 184  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || || |||| | ||  |||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||| || | |      
T  13593962 cacattccaagtaaagatgaaatacaacaccttatgatgaacatcatatccaacatctaacaagtcactcacataacttcatttaatcatacaaagattt 13593863  T
Q  185 tcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaagg 284  Q
    |||| ||| ||||||||| |||  | |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  13593862 tcacaaaatatttataagttaaacgacttttaagaattattttcgacaaagtccgtatcaagtggcaaa-cgaccagcattgataattttcaaagcaaag 13593764  T
Q  285 taacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaatta 384  Q
    ||||||  |||||||   ||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13593763 taacttgttcaagtttcgaaacttaccattcaatcttaatcaatcgtgtagtcatgagcttaagccacttacgaactactaaacattagttcaaagatta 13593664  T
Q  385 gcctaagtttgtatgataaaa 405  Q
    ||||||||  |||||| ||||    
T  13593663 gcctaagtacgtatgagaaaa 13593643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 252 - 495
Target Start/End: Original strand, 42707864 - 42708106
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||     ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42707864 aaacgaccaacattgataatttttccaaagttataacttattcaagttagaaaactcacaaattaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 42707963  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42707964 cttacaaactattaggcattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaa-ctcaagttcacattttccacattcccacccgaaattcaagtttga 42708062  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||||||||||| || | ||||| ||||||| |||| |||||||    
T  42708063 catgattaagacgtttatccaacattacaagtcttgtctaagtc 42708106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 226 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 7965828 - 7965560
Alignment:
Q  226 ttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatc 325  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||| || ||||| || |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  7965828 ttcgacaaagtccatatcaagtggcaaa-cggccaacattgataattcccaaaataaagtaacctattcaagtttgaaaactcacaactcaatattaatc 7965730  T
Q  326 aatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttcca 425  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   |||  ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  7965729 aatcatgtaatcatgatcttaagccacttacaaactattagacattagttcaaagtatagtttaagtttgtatgagaaaa-cccaaattcacattttcca 7965631  T
Q  426 cattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| ||  ||||||||    
T  7965630 cattcccacccgaaatatcaagtttaacatgattaagatatttgaccaactttacaagtctcacctaagtc 7965560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 7187212 - 7186749
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttct-accactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccac 138  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| | |||| | |||||| ||||||  || ||| ||| |||||||  ||||| |||||||| ||||| |||| | ||    
T  7187212 tcaacatcaactatatcatatagttttcaccatttcaaatatttctcatgttacaaataacgagaaaacacaacatcttatgatcaatatcatatccaac 7187113  T
Q  139 gcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttc 238  Q
      |||| ||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||  |||||  | ||| | | ||||| |    
T  7187112 atctaacaattcat-cacacaccttcatctagtcatataaggctagtcacgaaagatt-ataagataataggctaaaaagatccatttccaaaaaagtcc 7187015  T
Q  239 gtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtca 338  Q
     |||||||||||||| || |||||||||| |||| | |||  || ||| |||| |||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7187014 atatcaagtggcaaa-cggccaacattgacaattcttaaagtaaagtagcttattcaagtttgaaaactcacaaaataatcttaatcaatcatgtagtca 7186916  T
Q  339 tga------------gcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccac 426  Q
    |||            |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  | || | ||| || |||||| |||| ||||||| || |||||||||    
T  7186915 tgaacttagtcatgagcttaagccacttacgaactattagatattagtttaaggaataacttaaattcgtatgagaaaa-cccaagtgcatattttccac 7186817  T
Q  427 attcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagt 494  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7186816 attcccacccgaaattcaagcttgacatgattaagacatttaaccaacattacaagtcttgcctaagt 7186749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 34 - 349
Target Start/End: Original strand, 18275709 - 18276020
Alignment:
Q  34 cattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatat 133  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | ||||||  ||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  18275709 cattaatcaacttcaactatatcacatagtttcaccactccaaatatttctcatattctaagtaa-gagaacatacaacatcttatgataaatatcatat 18275807  T
Q  134 tccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaa 233  Q
     | |||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  18275808 -caacgtataacaattcattcacacctcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaaga-tcataagataattggcttaaaagaatcattttcgataa 18275905  T
Q  234 agttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgt 333  Q
    | | | ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||    | || ||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  18275906 aatccatattaagtggc-aaacgacgaacattgataattcccaagacaaggtaaccatataaaatttgaaaactctcaaaacaatcttaatcaatcatgt 18276004  T
Q  334 agtcatgagcttaagc 349  Q
    ||||||||||||||||    
T  18276005 agtcatgagcttaagc 18276020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 311 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 43282438 - 43282256
Alignment:
Q  311 aaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatccca 410  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| | |||| |||||| |||||| |||||||||    
T  43282438 aaatcaatcttaatcaatcatatagtcatgagcttaagccacttacaaactattatacatcagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaatccca 43282339  T
Q  411 agttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||    
T  43282338 agtttacacattccacaatcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattgtaccaactttacaagcattggctaag 43282256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 252 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 16329010 - 16328769
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||    
T  16329010 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcttaggcca 16328911  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16328910 cttacgaactatcgatcattagttcaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttaaacattccacattcccacccgaaaatcaattttga 16328811  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||    
T  16328810 catgattaagacattgtacgaaccttacaagcattgcctaag 16328769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 252 - 493
Target Start/End: Original strand, 26679211 - 26679452
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||| | ||   |||||| || ||||    
T  26679211 aaacggccaacattgatgattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcttataagtatgagcataggcca 26679310  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679311 cttacgaactatcgatcattagttcaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttatacattccacattcccacccgaaaatcaagtttga 26679410  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||    
T  26679411 catgattaagacattgtaccaaccttacaagcattgcctaag 26679452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 336 - 495
Target Start/End: Original strand, 16731059 - 16731217
Alignment:
Q  336 tcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacc 435  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16731059 tcatgagcttaagccacttacaaactattaaacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaa-cccaagttcacattttccacaatcccacc 16731157  T
Q  436 cgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  16731158 cgaaaatcaagtttgacatgattaagacattgtactaaccttacaagccttgtctaagtc 16731217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 493
Target Start/End: Original strand, 10487741 - 10487982
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgt-agtcatgagcttaagcc 350  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||    
T  10487741 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatatcagt-atgagcttatgcc 10487839  T
Q  351 acttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttg 450  Q
    |||||||||||||  |  |||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10487840 acttacgaactatcgattattagttcaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttaaacattccacattcccacccgaaaatcaattttg 10487939  T
Q  451 acatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||    
T  10487940 acatgattaagacattgtacgaaccttacaagcattgcctaag 10487982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 254
Target Start/End: Original strand, 24237770 - 24238004
Alignment:
Q  21 attgatatataaacattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatac-ttctcacattccaagtaaag-agaaaatgcaacacctta 118  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||  || || |||||| | || |||| | | ||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  24237770 attgatatacatacattaatcaacatcaactatatattatatctcaacaactccatacacgttcttataatccaagtaaaggagaaaatacaaaacctta 24237869  T
Q  119 tgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaag 218  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24237870 tgataaatatcatattcaacacctaaaaat-cattaacatatcttcatttaatcatataaagctattcacgaaagatttataaggtaatcggctttaaag 24237968  T
Q  219 aatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaa 254  Q
    || | ||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  24237969 aaccattttcgacaaagtacatatcaagtagcaaaa 24238004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 147 - 463
Target Start/End: Original strand, 9294597 - 9294911
Alignment:
Q  147 attcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaa-ttggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaa 245  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||  || |||| |  |||||| | ||| |||||||   ||||||||    
T  9294597 attcattcacacatcttcacttagtcatataaggatagtcacgatagatc-ataagaaaaattggttcaaaagaaacttttccgacaaaaaccgtatcaa 9294695  T
Q  246 gtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagctt 345  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||| |||| | ||||||  || |||||||  ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9294696 gtggcaaa-cggccaacattgataatttccaagacaaagcaacttagacatgttgaaag-ctctcaaa-caatcttaatcaattatgtagtcatgagctt 9294792  T
Q  346 aagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcaca-ttttccacattcccacccgaaa-atc 443  Q
    || |||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||| ||||| |||||| | || ||||||||||||||||| |||    
T  9294793 aaaccacttacaaactattagacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaa-cccaatttcacagtctttcacattcccacccgaaacatc 9294891  T
Q  444 aagtttgacatgattaagac 463  Q
    |  |||||||||||||||||    
T  9294892 acttttgacatgattaagac 9294911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 317 - 495
Target Start/End: Original strand, 34394335 - 34394512
Alignment:
Q  317 atcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttca 416  Q
    |||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||  |||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  34394335 atcttaatcaatcatgtaatcaaggacttaagccacttacaaactattagacattagttcaaagaatagtttaagttcgtataagaaaa-cccaagttca 34394433  T
Q  417 cattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  34394434 cattttccacaatcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattttactaaccttacaagccttgtctaagtc 34394512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 153 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 40901845 - 40901657
Alignment:
Q  153 tcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaa 252  Q
    ||||||| |||||||||  |||| || |||| |||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  40901845 tcacataacttcatttaaccatacaaagctattcaccaaagatttacaagttaaatggctttaaagaatcattatcgacaaagtctgtatcaagtagcaa 40901746  T
Q  253 aacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatga 341  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||  |||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  40901745 aacggccaacattgataatttttaaagctaggtaacttattcaagttttaaaacctacaattcaatcttaatccatcatgtagtcatga 40901657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 160 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 12245436 - 12245105
Alignment:
Q  160 tcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgacc 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| | |||||  ||| || ||||| ||| ||| |||   ||||||||||||||||  | ||    
T  12245436 tcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaaaggtcatatgataattaacttaaaggaatcatttccgataaaac-cgtatcaagtggcaaacag-cc 12245339  T
Q  260 aacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaa 359  Q
    ||||||||||| | ||||   ||||||||    | |||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  12245338 aacattgataactctcaagt-aaggtaacactataaagtttgaaaactcactaaacaatcttaatcaatcatgtaatcaagagcttaagccacttacaaa 12245240  T
Q  360 ctattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgatta 459  Q
    |||||| ||||||||||||| | || | |||||| |||| | ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  12245239 ctattagacattagttcaaagaataacttaagttcgtat-aaaaaaaaccaagtcaacattttccacattcccacccgaaattcacgtttaacatgatta 12245141  T
Q  460 agacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||  ||  |||||  |||||||||||  |||||||    
T  12245140 agatgtttgaccaatattacaagccttaactaagtc 12245105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 295 - 497
Target Start/End: Original strand, 15044054 - 15044256
Alignment:
Q  295 aagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagttt 394  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||     
T  15044054 aagtttaaaaactcaccaaacaatcttaatcaatcatgtaatcaagagcttaagtcacttacaaactattaaacattagttcaaagaatagcttaagttc 15044153  T
Q  395 gtatgataaaatcccaagttcaca-ttttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||| |||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||  ||  || ||| ||||||||||| ||||||    
T  15044154 gtatcataaaa-cccaagttaacattttttcacattcccacccgaaatttacgttcaacatgattaagatgtttgactaacattacaagccttacctaag 15044252  T
Q  494 tcca 497  Q
    ||||    
T  15044253 tcca 15044256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 295 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 15110370 - 15110168
Alignment:
Q  295 aagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagttt 394  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||     
T  15110370 aagtttaaaaactcaccaaacaatcttaatcaatcatgtaatcaagagcttaagtcacttacaaactattaaacattagttcaaagaatagcttaagttc 15110271  T
Q  395 gtatgataaaatcccaagttcaca-ttttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||| |||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||  ||  || ||| ||||||||||| ||||||    
T  15110270 gtatcataaaa-cccaagttaacattttttcacattcccacccgaaatttacgttcaacatgattaagatgtttgactaacattacaagccttacctaag 15110172  T
Q  494 tcca 497  Q
    ||||    
T  15110171 tcca 15110168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 316 - 493
Target Start/End: Original strand, 9794475 - 9794652
Alignment:
Q  316 aatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttc 415  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||     
T  9794475 aatcttaatcaatcatataagtatgagcataggccacttacgaactatcaatcattagttcaaagattagcctaagttcgtatgagaaactcccaagttt 9794574  T
Q  416 acattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    | |  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  || ||| |||||||| |||||||||    
T  9794575 atacattccacaatcccacccgaaaatcaagtttggcatgatttagacattgtactaaccttacaagcattgcctaag 9794652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 196 - 495
Target Start/End: Original strand, 38763838 - 38764133
Alignment:
Q  196 ttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactca 295  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||| |||| || |||||  || ||||||||||||  | |||||||||||||||  ||||| || |||||||| |||    
T  38763838 ttataaggtatttggctc-aaagaatcatttttgataaagtctgtctcaagtggcaaacag-ccaacattgataattcccaaaataaagtaacttattca 38763935  T
Q  296 agttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttg 395  Q
    ||||  || |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||  | ||||| ||||||||||| |   |||| |||||| |    
T  38763936 agtttgaagactcacaactcaatcttaatcaattatgtaatcaagagcttaagtcacttac--aatattagacattagttcagagtatagcttaagttcg 38764033  T
Q  396 tatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagt 494  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||  ||  |||||  ||||||| |||| ||||||    
T  38764034 tatgagaaaa-cccaagttcacattttcctcattcccacctgaaatatcaagtttagcatgattaagatgtttgaccaagattacaagtcttgtctaagt 38764132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 315 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 34197206 - 34197027
Alignment:
Q  315 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagtt 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   ||||  ||||  |||||| |||| ||||||||    
T  34197206 caatcttaatcaatcatgtaatcaaggacttaagccacttacaaactattagacattagttcaaaggatagctcaagtccgtatgagaaaa-cccaagtt 34197108  T
Q  415 cacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||| ||||| |||||||    
T  34197107 cacatattccacaatcccactcgaaaatcaagtttgacatgattaagacattgtactaaccttacaaaccttgtctaagtc 34197027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 315 - 462
Target Start/End: Original strand, 14900625 - 14900772
Alignment:
Q  315 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagtt 414  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||  |||||| |||| ||||||||    
T  14900625 caatcttaatcgatcttgtagtcatgaacttaagccgcttacaaactattagacattagttcaaagaatagcttaagtccgtatgagaaaa-cccaagtt 14900723  T
Q  415 cacattttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaaga 462  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||    
T  14900724 cacattttccacattcccacccaaaatatcacatttgacatgattaaga 14900772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 316 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 19822746 - 19822568
Alignment:
Q  316 aatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttc 415  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| | |||| |||||  |||||| |||| | |||||||    
T  19822746 aatcttaatcaaccatgtagtcatgagcttaagccacttacaaactattggacattagttcaaagaatagcttaagtccgtatgagaaaa-ctcaagttc 19822648  T
Q  416 acattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||| |||| |||  |||||||||||  ||  || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  19822647 acacttttcacatccccacccgaaattcaaatttagcatgattaagatgtttgactaactttacaagtcttacctaagtc 19822568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 326 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 820839 - 820671
Alignment:
Q  326 aatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttcca 425  Q
    ||||||||| ||| |  |||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||   |||| |||||| |||| | |||| ||||||| |||||||||||    
T  820839 aatcatgtaatcaaggacttaagtcacttacaaactattagaaattagttcaaaggatagcttaagttcgtataagaaaa-cccaagtccacattttcca 820741  T
Q  426 cattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  820740 caatcccacccgaaaatcaagtttaacatgattaagacatttaactaacattataggccttgcctaagtc 820671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18240914 - 18240797
Alignment:
Q  153 tcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaa 252  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| || |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||  |||||||||    
T  18240914 tcacatatcttcattcaatcatataaagctattcacaaaggatt-ataaggtaattggcttcaaagaatcattttcgacaaagtccataataagtggcaa 18240816  T
Q  253 aacgaccaacattgataat 271  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  18240815 aacggccaacattgataat 18240797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 302 - 495
Target Start/End: Original strand, 27960094 - 27960286
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||| | || ||||||||||||  ||||||  ||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||| | |||| |||| | |||||||    
T  27960094 aaaactcgccaaacaatcttaatcatccatgtaaccaaaagcttaaaccacttacaaactattgaacattagtccaaataatagcttaagatcgtatgat 27960193  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||  ||  || ||| ||||||||| | ||||||||    
T  27960194 aaaa-cccaagttaacatttttcacattcgcacccgaaattcacgtttaacatgattaagatgtttgactaacattacaagccctacctaagtc 27960286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 252 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 55377674 - 55377521
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   |||||| || ||||    
T  55377674 aaacgaccaacattgataattttcaaagttaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcataggcca 55377575  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaa 405  Q
    |||||||| ||| || |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  55377574 cttacgaattatcaatcattagctcaaagattagcctaagttcgtatgagaaaa 55377521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 5683843 - 5683687
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||    
T  5683843 aaacggccaacattgataattttcaaagttaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagccaaggacttaagcca 5683744  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcc 408  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||   |||| |||||| |||||| |||||||    
T  5683743 cttacaaactattagaaattagttcaaaggatagcttaagttcgtatgagaaaatcc 5683687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 379
Target Start/End: Original strand, 14995265 - 14995392
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||| ||  ||| |  |||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||    
T  14995265 aaacgaccaacattgataattttcaaagttaggtaacttattcaaatttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagccaaggacttaagcca 14995364  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaa 379  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  14995365 cttacaaactattagaaattagttcaaa 14995392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 400
Target Start/End: Original strand, 8373664 - 8373812
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  8373664 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaaatttgaaatcatacaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggacttaagcca 8373763  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatga 400  Q
    ||| | |||||||| | |||||||||||   |||| |||||| ||||||    
T  8373764 cttgcaaactattagaaattagttcaaaggatagcttaagttcgtatga 8373812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 12134934 - 12134792
Alignment:
Q  34 cattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatac-ttctcacattccaagt-aaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattat 131  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| || ||    
T  12134934 cattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccatatactttctcacaatccaagtaaaagagaaaatacaacactttatgataaacatcat 12134835  T
Q  132 attccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcata 175  Q
    |||| |  ||||| || |||||||||||||||||| || |||||    
T  12134834 attcaaaacctaacaa-tcattcacatatcttcatataatcata 12134792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 252 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18251036 - 18250909
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | |||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||    
T  18251036 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttatttaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagccaaggacttaagcca 18250937  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaa 379  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  18250936 cttacaaactattagaaattagttcaaa 18250909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 317 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 37958149 - 37958005
Alignment:
Q  317 atcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttca 416  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||| | || | |||| ||||||  ||||| |||| ||||| ||||    
T  37958149 atcttaatcatttatgtagtcatgagcttaagccacttacagactattaggcattagtccgaagaatagcttaagttcttatgagaaaa-cccaaattca 37958051  T
Q  417 cattttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaaga 462  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  37958050 cattttccaca-tcccacctgaaatatcacatttgacatgattaaga 37958005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 315 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13810645 - 13810560
Alignment:
Q  315 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatga 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| | |||| |||||| ||||||    
T  13810645 caatcttaatcaatcatgtaatcatgagcttaagccacttacggactattagacattattccaaagaatagcttaagttcgtatga 13810560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 41167051 - 41166797
Alignment:
Q  238 cgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtc 337  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||   ||||||||    | |||||   |||||| | || |||||||||||||||||||| |     
T  41167051 cgtatcaagtggcaaa-cgaccaacattgataactctcaagt-aaggtaacaatataaagtttggaaactcgccaaacaatcttaatcaatcatgtaatt 41166954  T
Q  338 atgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccg 437  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | || | |||||| || ||||| || ||||| || ||||||| ||||||||| || |    
T  41166953 aagagcttaagccacttacaaactattaggcattagttcaaagaataacttaagttcgtgtgatataa-cccaaattaacatttttcacattcccgcctg 41166855  T
Q  438 aaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||| | | |||  |||||||||||   ||  |||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  41166854 aaatttatgttaaacatgattaaggtgtttgaccaaccttacaagtcttacctaagtc 41166797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 400
Target Start/End: Original strand, 18167966 - 18168114
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||| | |||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  18167966 aaacggccaacattgataatttttaaagctaggcaacttatttaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggacttaagcca 18168065  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatga 400  Q
    ||| | |||||||| | |||||||||||   |||| |||||| ||||||    
T  18168066 cttgcaaactattagaaattagttcaaaggatagcttaagttcgtatga 18168114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 252 - 379
Target Start/End: Original strand, 18247362 - 18247489
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||| | ||| |||||| | |||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  18247362 aaacggccaacattgacaatttttaaagctaggcaacttatttaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggacttaagcca 18247461  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaa 379  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  18247462 cttacaaactattagaaattagttcaaa 18247489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 400
Target Start/End: Original strand, 19019633 - 19019780
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||    
T  19019633 aaacggccaacattgataattttcaag-ctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagtgaaggacttaagcca 19019731  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatga 400  Q
    ||| | |||||||| | |||||||||||   |||| |||||| ||||||    
T  19019732 cttgcaaactattagaaattagttcaaagtatagcttaagttcgtatga 19019780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 54364706 - 54364623
Alignment:
Q  81 ttctcacattccaagtaaag-agaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttc 164  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  54364706 ttctcacaatccaagtaaaggagaaaatacaacaccttatgataaatatcatattcaacacctaacaa-tcattcacatatcttc 54364623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 43282562 - 43282489
Alignment:
Q  146 aattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaa 220  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||    
T  43282562 aattcattcacacatctccatttagtcatacaaggcaagtcacgaaaga-tcataagataattggcttaaaagaa 43282489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18294106 - 18294021
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtc 337  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18294106 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatctagtc 18294021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22355545 - 22355420
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagt-tgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcc 350  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | ||| |||||| |||||| |||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  22355545 aaacggccaacattgataattttcaag-ctaggcaacttattcaagtgtgaaatcct-acaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggacttaagcc 22355448  T
Q  351 acttacgaactattaaacattagttcaaa 379  Q
    |||| | || ||||| | |||||||||||    
T  22355447 acttgc-aaatattagaaattagttcaaa 22355420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 133
Target Start/End: Original strand, 15043806 - 15043897
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatat 133  Q
    ||||||||||| | || ||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  15043806 tcaacatcaactacatcatatagtttcaccactccaaatatttctcatattccaagt-aagagaacat-aaacatcttatgataaatatcatat 15043897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15110618 - 15110527
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatat 133  Q
    ||||||||||| | || ||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  15110618 tcaacatcaactacatcatatagtttcaccactccaaatatttctcatattccaagt-aagagaacat-aaacatcttatgataaatatcatat 15110527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 315 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 18495450 - 18495365
Alignment:
Q  315 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatga 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||  ||||||||  ||| | |||| |||||| ||||||    
T  18495450 caatcttaatcaatcatgtaatcatgagcctaagctacttaaggactattggacattagtataaagaatagcttaagttcgtatga 18495365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 50223447 - 50223403
Alignment:
Q  21 attgatatataaacattaatcaacatcaaccatataatatagttc 65  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50223447 attggtatatacacattaatcaacatcaaccatattatatagttc 50223403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 447 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 13443588 - 13443539
Alignment:
Q  447 tttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  13443588 tttgacatgattaagacattgaacc-actataaaagccttgcctaagtcca 13443539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 133
Target Start/End: Original strand, 19999389 - 19999481
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatat 133  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| | |||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || |||| |||||| ||||    
T  19999389 tcaacatcaactatatgatatagtttcaccattccaaacaattctcatattccaagt-aagagaacatacaacatctcatgacaaatatcatat 19999481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 34197427 - 34197347
Alignment:
Q  81 ttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatct 162  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| | || | ||| |||||||||||| ||||    
T  34197427 ttctcatattccaagtaa-gagaacatacaacatcttatgataaatatcatatccaacacataacaattcattcacacatct 34197347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 40 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 15288304 - 15288209
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaa-agagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattc 135  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| | |||||| ||||||||||| || |||||  ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  15288304 tcaacatcaactatatcatatagtttcaccattccaaacaattctcatattccaagtaatagggaaaa-acaacatctcatgataaatatcatattc 15288209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 60)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 497
Target Start/End: Original strand, 33171146 - 33171620
Alignment:
Q  25 atatataaacattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33171146 atatataaacattaatcaacatcaaccatataatatagttccactactccaaatacttctcatattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataa 33171245  T
Q  125 atattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgt 224  Q
    |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  33171246 atatcatattcaacacctaacaattcattcacatatcttcatttagtcatgcaaggctagtcacgaaagatttataacgtaattgactttaaagaatcgt 33171345  T
Q  225 ttt-cgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagtt-gaaaaactcacaaatcaatctta 322  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33171346 ttttcgacaaaatccgtatcaagtggcaaaacggccaacattgataattctcaacacaaggtaacttattcaagtttgaaaaactcacaaatcaatctta 33171445  T
Q  323 atcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacatttt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  33171446 atcaatcatgtagtcatgagcttaagctacttacgaactattaaactttagttcaaagattagcctaagttcgtatgagaaaatctcaagttcacatatt 33171545  T
Q  423 ccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33171546 ccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattaaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 33171620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 18042827 - 18042349
Alignment:
Q  21 attgatatataaacattaat-caacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttat 119  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  18042827 attgatatatatacattaattcaacatcaactatataatatagttcaaccactccaaacacttctcgtattccaagtttagagaaaatacaacaccttat 18042728  T
Q  120 gataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaaga 219  Q
    ||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18042727 gataaatatcatattcaacacctaacaattcattcacatatcttcatttaatcatataaagctagtcacgaaagatttataaggtaattgactttaaaga 18042628  T
Q  220 atcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaag-ttgaaaaactcacaaatcaat 318  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18042627 atcgttttcgacaaagtccgtatcaagtggcaaaacggccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttattcaagtttgaaaaactcacaaatcaat 18042528  T
Q  319 cttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcaca 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  18042527 cttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttaccaactattaaacattagttcaaagactagcctaagttcgtatgagaaaatcccgagttcaca 18042428  T
Q  419 ttttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18042427 ttttccacattcccacccgaaattcaagtttgacatgattaagacatttaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 18042349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 25 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22498579 - 22498105
Alignment:
Q  25 atatataaacattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaag-agaaaatgcaacaccttatgata 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||    
T  22498579 atatatatacattaatcaacatcaactatataatatagttcaaccactccatacacttctcatattccaagtataggagaaaatacaacaccttgtgata 22498480  T
Q  124 aatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcg 223  Q
    || || |||||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22498479 aacatcatattcaacacctatcaat-cattcacatatcttcatttaatcatataaagctattcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcg 22498381  T
Q  224 ttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaa 323  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||    
T  22498380 ttttcgacaaagtccgcatcaagtggtaaaatgggcaacattgataattttcaaaacaaggtaacttattcaagtttggaaactcacaaatcaatcttaa 22498281  T
Q  324 tcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactat-taaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacatttt 422  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||  ||    
T  22498280 tcaatcatgaagtcatgagcttaagccacttttgaactatccaaacattagttcaaagattagcctaagttcgtgtgagaaaaccccaagttcacacatt 22498181  T
Q  423 ccacattcccacccg-aaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    |   | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22498180 ctgtaatcctacccgaaaaatcaagtttgacatgattaagaccttgtaccaactttacaagccttgcctaagtcca 22498105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 153 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 24553751 - 24553411
Alignment:
Q  153 tcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| || |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24553751 tcacatatcttcatttagtcatataaa-ctaatcacaaaggatt-ataaggtaattggcttcaaagaatcattttcaacaaagtccgtatcaagtggcaa 24553654  T
Q  253 aacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccac 352  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24553653 a-cgaccaacattgatagttttcaaaacaaggtaacttattcaagtttgaaaactcacaaatcaatcttaatcaattatgtagtcatgagcttaagccac 24553555  T
Q  353 ttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgac 452  Q
    | || |||||| |||| ||||||| || |||||||||||||  || || |||| ||||||||||||| |||   | || ||||| ||||||||||||||     
T  24553554 tcaccaactatcaaacgttagttcgaagattagcctaagttcatacgagaaaaccccaagttcacatattctgtaatctcacccaaaaatcaagtttgat 24553455  T
Q  453 atgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcc 496  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24553454 atgattaagacattgaaccaactttacaagccttgcctaagtcc 24553411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 74 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 33612321 - 33611903
Alignment:
Q  74 caaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtca 173  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||| |||| | ||  | || ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  33612321 caaatatttctcatattacaagtaacgagaaaacacaacatcttatgatcaatatcatatccaacatccaacaattcat-cacacatcttcatttagtca 33612223  T
Q  174 tataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattt 273  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||  || ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33612222 cataaggctagtcacgaaagatt-ataagacaattggctaaaatgaatcatttccgataaagtccgtatcaagtggcaaaacggccaacattgataattt 33612124  T
Q  274 tcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattag 373  Q
     ||||  || |||||||  |||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  33612123 ccaaagtaaagtaacttgttcaagtttgaaaactcacaaaataatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacaaactattagacattag 33612024  T
Q  374 ttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaa 473  Q
    ||||||   || | | |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  33612023 ttcaaagtataacttgagttcgtatgagaaaa-cccaagttcacattttccacattcccacccgaaattcatgtttgacatgattaagacatttaatcaa 33611925  T
Q  474 ctttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    | |||||||| |||||||||||    
T  33611924 cattacaagctttgcctaagtc 33611903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 34 - 441
Target Start/End: Original strand, 7469147 - 7469555
Alignment:
Q  34 cattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaata-cttctcacattccaagtaaaga--gaaaatgcaacaccttatgataaatatta 130  Q
    ||||||||| | ||||| |||| ||||||||| || |||||| | | ||||||| | | |||||||||   |||||| ||||||||||||||||| || |    
T  7469147 cattaatcagcttcaactatatcatatagttcaacaactccatacaacttctcataatacaagtaaaggaggaaaatacaacaccttatgataaacatca 7469246  T
Q  131 tattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcga 230  Q
    ||||| |  |||   |||| | ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7469247 tattcaagacctcgcaatt-actcacatatcttcattcaatcatataaagctattcacaaaagatt-ataaggtaaatggctttaaagaatcgttttcga 7469344  T
Q  231 caaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatca 330  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  7469345 caaagtccgtatcaagtggcgaaacggccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttattcaagtttggaaacttacaaatcaattttaatcaatca 7469444  T
Q  331 tgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattc 430  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||  |||  | ||    
T  7469445 tgtagtcatgaatttaagccacttacgaactatcaaacattagttcaaagattagcttaagttcgtatgagaaaactccaagttcacataatccgtaatc 7469544  T
Q  431 ccacccgaaaa 441  Q
    |||||||||||    
T  7469545 ccacccgaaaa 7469555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 209 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 18262625 - 18262339
Alignment:
Q  209 ggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactc 308  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||  |||||      
T  18262625 ggctttaaagaatcattatcgacaaagtccgtatcaagtggcaaaacggccaatattgataattttcaaagctaggta-cttattcaagttttaaaacct 18262527  T
Q  309 acaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcc 408  Q
    |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||| ||    
T  18262526 acaattccatcttaatcaatcgtgtagtcatgagcttaagccacttacaaactattaaacattagttcaaagattagcttaagttcgtatgagaaaaccc 18262427  T
Q  409 caagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18262426 aaagttcacatattccacattcccacccgaaaatgaagtttgacatgattaagacattaaacc-actgtacaagccttgcctaagtcca 18262339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 495
Target Start/End: Original strand, 16001039 - 16001448
Alignment:
Q  85 cacattccaagtaaag-agaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggcta 183  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| || |||||| | |||||| || | ||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
T  16001039 cacattccaagtgaaggagaaaatacaacaccctatgataaacatcatattcaatgcctaacaact-attcacatatcttcacttaatcaaataaagcta 16001137  T
Q  184 gtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaag 283  Q
     |||| |||| || |||||||||  ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16001138 atcacaaaaggttcataaggtaaccggcttaagagaatcattttcaacaaagttcgtatcaagtggcaaa-cggccaacattgataattttcaaagcaag 16001236  T
Q  284 gtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaatt 383  Q
    |||||||  |||||||   ||||  |||| |||||||||||||||||| ||   |||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  16001237 gtaacttgttcaagtttggaaacctacaattcaatcttaatcaatcatataaatatgagcataggccacttacgaactatcaagcattagttcaaagatt 16001336  T
Q  384 agcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagc 483  Q
     ||||||||| |||| | |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||| ||    
T  16001337 tgcctaagttcgtatcagaaaaccccaagttcacatattccacaatcccacccgaaaatcaagtttgatatgattaagacattaaaccatccttacatgc 16001436  T
Q  484 cttgcctaagtc 495  Q
    |||| |||||||    
T  16001437 cttgtctaagtc 16001448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 153 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 45468489 - 45468146
Alignment:
Q  153 tcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaa 252  Q
    ||||||| ||||||| |  |||| || |||| |||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  45468489 tcacataacttcattcaaccatacaaagctattcaccaaagatttacaagttaaacggctttaaagaatcattgtcgacaaagtccgtatcaagtggcaa 45468390  T
Q  253 aacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccac 352  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||  |||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45468389 aacggccaacattgataatttttaaagctaggtaacttattcaagttttaaaacctacaactccatcttaatcaatcatgtagtcatgaacttaagccac 45468290  T
Q  353 ttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccg-aaaatcaagtttga 451  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  45468289 ttacgaactattaaacattaattcaaagattagcttaagttcgtgtgagaaaacccaaagttcaca-tttccacattcccacccgaaaaatgaattttga 45468191  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  45468190 catgattaagacattaaacc-actatacaagccttgcctaagtcca 45468146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 87 - 497
Target Start/End: Original strand, 20708705 - 20709114
Alignment:
Q  87 cattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtc 186  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||| || || |||| | ||  |||| || ||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||| ||    
T  20708705 cattccgagtaaagataaaatacaataccttatgatgaacatcatatccaacatctaacaagtcactcacataactttatttagtcatacaaagctattc 20708804  T
Q  187 acgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggta 286  Q
    |||||| ||||| ||| |||  | |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  20708805 acgaaaaatttaaaagttaaacgactttaaagaatcatttccgacaaagtccgtatcaagtggcaaa-cggccaacattgataattttcaaagcaaagta 20708903  T
Q  287 acttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagc 386  Q
    ||||| |||||||    |||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |    
T  20708904 acttattcaagtttggcaacctaccattcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcatatgccacttatgaactatcaagcattagttcaaagattaac 20709003  T
Q  387 ctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagcctt 486  Q
    ||||||| |||||| |||| || |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  20709004 ctaagttcgtatgagaaaacccaaagttcacatattccacaatcccacccaaaaatcaagtttggtgtgattaagacatggtaccaactttacaagcctt 20709103  T
Q  487 gcctaagtcca 497  Q
    |||||||||||    
T  20709104 gcctaagtcca 20709114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 495
Target Start/End: Original strand, 22886802 - 22887213
Alignment:
Q  85 cacattccaagtaaag-agaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggcta 183  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| || |||||| || | ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22886802 cacattccatgtaaaggagaagatacaacaccttatgataaacatcatattcaacacttaacaat-cattcacatagcttcatttagtcatataaagcta 22886900  T
Q  184 gtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggc-aaaacgaccaacattgataattttcaaaacaa 282  Q
     |||| |||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||| || |||| | |||||||||||| |||||||| |||    
T  22886901 ttcacaaaagatttataaggtactcggctttaaagaaccatttttgacaaagtccgtatcaagtagcaaaaatggccaacattgatacttttcaaagcaa 22887000  T
Q  283 ggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaat 382  Q
     |||||||  |||||||  |||||  |||| || |||||||| |||||| ||   || |||  | |||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  22887001 agtaacttgttcaagtttgaaaacctacaactcgatcttaattaatcatataagtattagcagaggccacttacgaactatcaagcattagttcaaagat 22887100  T
Q  383 tagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaag 482  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| | ||||  |    
T  22887101 tagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagttcacatattccacaatcccacacgaaaatcaagtttggcatgattaagacatcctaccatccttacttg 22887200  T
Q  483 ccttgcctaagtc 495  Q
    ||||| |||||||    
T  22887201 ccttgtctaagtc 22887213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 40 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 37654931 - 37654479
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacg 139  Q
    ||||||||||| | || ||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  37654931 tcaacatcaactacatcatatagtttcaccactccaaatatttctcatattccaagtaaagagaaaatacaacaccttatgataaatatcatattcaaca 37654832  T
Q  140 cctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcg 239  Q
       || ||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| |||||| | ||  ||| ||| | |     
T  37654831 tagaacaatccattcacacgtcatcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatc-ataagatatttggcttaaaagaaacattcccgataaaatcca 37654733  T
Q  240 tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcat 339  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||  |||||||  |||||||||| |||     
T  37654732 tatcaagtggcaaa-cgggcaacattgataattcccaaaacaaggtaacatattcaagtttgaaaactcacaaaataatcttatacaatcatgtaatcaa 37654634  T
Q  340 gagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaa 439  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   || |  |||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37654633 gagcttaagccacttacaaactattagacattagttcaaagtataactcaagtttgtatgagaaaat-tcaagttcaca-tttccacattccctcccgaa 37654536  T
Q  440 a-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    | || |||||| ||||||||| ||  ||  |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  37654535 atattaagtttaacatgattacgatgtttgaccaactttacaagtcttacctaagtc 37654479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 102 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 38636891 - 38636503
Alignment:
Q  102 gaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataa 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||| | |||| | ||||||||||||||| | ||||||||  ||| |||| ||||||| ||||    
T  38636891 gaaaatacaacaccttatgataaatatcatattcaatacctcacaatt-actcacatatcttcattcaatcatataaaactaatcacaaaagatt-ataa 38636794  T
Q  202 ggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttga 301  Q
    |||| ||||||  |||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||| || |||||||| |||||||      
T  38636793 ggtatttggctc-aaagaatcatttt-gataaagtccgtatcaagtggcaaa-cggccaacattgataattcccaaaataaagtaacttattcaagtttg 38636697  T
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||   |||| |||||| ||||||     
T  38636696 aaaactcacaactcaatcttaatcaatcatgtaattatgagcttaagccacttacaaactattagatattagctcaaagtatagcttaagttcgtatgag 38636597  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  38636596 aaaa-cccaagttcacatttttcacatttccacccgaaatatcaagtttaacatgattaagacattcaacccactttacaagtcttgtctaagtc 38636503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 69 - 495
Target Start/End: Original strand, 26010363 - 26010785
Alignment:
Q  69 cactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcattt 168  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||| | ||   ||| |||||||||||| |||| || ||    
T  26010363 cactccaaata-ttctcatattcccagtaa-gagaacatacaacatcttatgataaa-atcatat-caacatataacaattcattcacacatctccaatt 26010458  T
Q  169 agtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgat 268  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  26010459 agtcatataaggctagtaacgaaagatc-ataagataattggcttaaaaaaatcattttcgataaaattcatatcaagtggcaaa-cggccaacattgat 26010556  T
Q  269 ---aattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactatta 365  Q
       |||| |||| ||||||||||    | |||||  ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26010557 gataattctcaagacaaggtaacaatataaagtttgaaaactctcaaaacaatcataatcaatcatgtagttatgagcttaagccacttacaaactatta 26010656  T
Q  366 aacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacat 465  Q
    |||||||||||||| | ||||  ||||| |||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  26010657 aacattagttcaaagaatagctcaagttcgtatgagaaaa-ctcaaattcacattttccacattcccacccgaaattcaagtttaacatgattaagatat 26010755  T
Q  466 tcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |  |||||||||||||| ||  ||||||||    
T  26010756 ttgaccaactttacaagtctcacctaagtc 26010785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 223 - 495
Target Start/End: Original strand, 29296963 - 29297226
Alignment:
Q  223 gttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatctta 322  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||   |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  29296963 gttttcgacaaaatccgtaccaagtggcaaaacggccaacattgataatttccaaaataaaacaacttattcaagtttaaaaactcataaatcaatctta 29297062  T
Q  323 atcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacatttt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||| |||||||| ||||||     
T  29297063 atcaatcatgtagtcatgagcttaagccatttacaaactattagacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaa-cccaagtttacattt- 29297160  T
Q  423 ccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
            |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29297161 --------ccacccgaaatatcaagtttgacatgattaagacatttaaccaacattacaagccttgcctaagtc 29297226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 57 - 495
Target Start/End: Original strand, 23148787 - 23149218
Alignment:
Q  57 atatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcac 156  Q
    ||||||||  |||| | |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||| | ||  |||| ||||||| |||    
T  23148787 atatagtttcaccatttcaaatatttctcatattccaagtaa-gagaaaatacaacatctcatgataaatatcatatacaacatctaacaattcat-cac 23148884  T
Q  157 atatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacg 256  Q
    | ||| ||||||||||| |||||  |||| |||||| ||| ||||| |||||||||  |||||||| |||  || |||||  |||||||||||||||| |    
T  23148885 acatcatcatttagtcacataag--tagttacgaaaaatt-ataagataattggctaaaaagaatcatttctgataaagtctgtatcaagtggcaaaa-g 23148980  T
Q  257 accaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttac 356  Q
     |||||||||||||||| ||||  || |||||||  |||||||  |||  ||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  23148981 cccaacattgataatttccaaagtaaagtaacttgttcaagtttgaaatttcacagagtaatcttaatcaatcatgtagtcacgagctaaagccgcttac 23149080  T
Q  357 gaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatga 456  Q
     |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||| | || |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  23149081 aaactattagacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaa-cccaagttcacattcttcatattcccacccaaaattcaagtttgacatga 23149179  T
Q  457 ttaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||||| |   ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23149180 ttaagagaactaaccaacattacaagtcttgcctaagtc 23149218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 199 - 459
Target Start/End: Original strand, 24267066 - 24267325
Alignment:
Q  199 taaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagt 298  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | || |    
T  24267066 taagataattggctttaaggaatcattttcgacaaaatccgtatcaagtggcaaaacggccaatattgataatttccaaaataaggtaacttattaaatt 24267165  T
Q  299 tgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtat 398  Q
    | |||| || ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||   |||| |||||| ||||    
T  24267166 ttaaaacct-acaatcccatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacaaattattagacattagttcaaagtatagcttaagttcgtat 24267264  T
Q  399 gataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgatta 459  Q
    || |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24267265 gagaaaacccaaagttcacatattccacattcccacccgaaattcaagtttaacatgatta 24267325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 220 - 493
Target Start/End: Original strand, 25609277 - 25609551
Alignment:
Q  220 atcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatc 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  |||| || |||    
T  25609277 atcgttttcgacaaagtccgtatcaagtggcaaaacggccaacattgataattttcaaagcaacgtaacttattcaagtttgaaaacctacaattccatc 25609376  T
Q  320 ttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtt-tgtatgataaaatcccaagttcaca 418  Q
    ||||| |||||| ||   |||||| || |  ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||    
T  25609377 ttaataaatcatataagtatgagcataggaaacttacgaactatcaatcattagttcaaagattagcctaagttcggtatgagaaaatcccaagtttaca 25609476  T
Q  419 ttttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
      || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| |||||||||    
T  25609477 gatttcacaatcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattgtaccaactccacaagcattgcctaag 25609551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 209 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 45562227 - 45561956
Alignment:
Q  209 ggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactc 308  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||| |||||||  |||||||   ||||      
T  45562227 ggctttaaagaatcattttcgacaaagtccgtatcaagtggcaaa-cgtccaacattgataattttcaatgcaaagtaacttgttcaagtttggaaacct 45562129  T
Q  309 acaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcc 408  Q
    || | |||||||||||||||||| ||   |||||| || |||||||| ||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  45562128 accattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcataggccacttatgaactatcaagtattagttcaaagattagcctaagttcgtatgagaaaaccc 45562029  T
Q  409 caagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaa 481  Q
     |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45562028 aaagtccacatattccacattcccacacgaaaattaagtttgacatgattaagacattaaaccaactttacaa 45561956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 67 - 379
Target Start/End: Original strand, 15932249 - 15932557
Alignment:
Q  67 accactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcat 166  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| | |    ||| |||||||||||| |||||| |    
T  15932249 accactccaaatatttctcatatgccaagtaa-gagaacatacaacatcttatgataaatatcatat-caatatataacaattcattcacacatcttcgt 15932346  T
Q  167 ttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattg 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| ||| ||| ||| | | |||||||||||||| || |||||||||    
T  15932347 ttagtcatataaggctagtcacgaaatatc-ataagataattggcttaaaagaatcatttccgataaaatccatatcaagtggcaaa-cggccaacattg 15932444  T
Q  267 ataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaa 366  Q
    ||||||  ||| ||||||||||    | |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15932445 ataattcccaagacaaggtaacaatataaagtttgaaaactctcaaaacaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacctacaaactattaa 15932544  T
Q  367 acattagttcaaa 379  Q
    |||||||||||||    
T  15932545 acattagttcaaa 15932557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 252 - 493
Target Start/End: Original strand, 5237266 - 5237507
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||    
T  5237266 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcttaggcca 5237365  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5237366 cttacgaactatcgatcattagttcaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttaaacattccacattcccacccgaaaatcaattttga 5237465  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||    
T  5237466 catgattaagacattgtacgaaccttacaagcattgcctaag 5237507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 252 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 24662332 - 24662091
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||    
T  24662332 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcttaggcca 24662233  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24662232 cttacgaactatcgatcattagttcaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttaaacattccacattcccacccgaaaatcaattttga 24662133  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||    
T  24662132 catgattaagacattgtacgaaccttacaagcattgcctaag 24662091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 252 - 493
Target Start/End: Original strand, 43684725 - 43684966
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||    
T  43684725 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcttaggcca 43684824  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| |||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43684825 cttacgaactatcgatcattagttcaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatctcaagtttaaacattccacattcccacccgaaaatcaattttga 43684924  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||    
T  43684925 catgattaagacattgtacgaaccttacaagcattgcctaag 43684966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 153 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 23227198 - 23226859
Alignment:
Q  153 tcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaa 252  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||  ||||  || ||| || |||| | | |||||||| ||||    
T  23227198 tcacacatcttcatttaatcacataaggctagtcacgaaaggttg-taagacaattggctaaaaagggtcatttccggcaaaatccatatcaagtagcaa 23227100  T
Q  253 aacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccac 352  Q
    | || | |||||||||||||| ||| | ||  ||||||  | |||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  23227099 a-cggctaacattgataatttccaagataaaataacttgtttaagtttgaaagctcacaagacaatcttaatcaatcatttagtcataagctcaagccac 23227001  T
Q  353 ttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgac 452  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||| | |||| |||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  23227000 ttacaaactattggacattagttcaaagaatagcttaagtccgtatgagaaaa-cccaagttcacattttccacattcccatccgaaattcaagtttaac 23226902  T
Q  453 atgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||||||||||||| ||| |   ||| ||||||||||||||||    
T  23226901 atgattaagacatttaactagtattaaaagccttgcctaagtc 23226859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 258 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 22908460 - 22908225
Alignment:
Q  258 ccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacg 357  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   |||||| || ||||| ||||    
T  22908460 ccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcataggccacctacg 22908361  T
Q  358 aactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgat 457  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22908360 aactatcaatcattagttcaaagattagcctaagttcgtatatgaaaatcccaagtttatacattccacaatcccacccgaaaatcaagtttgacatgat 22908261  T
Q  458 taagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||||||||  |||||| |||||||  |||||||||    
T  22908260 taagacattgtaccaaccttacaagaattgcctaag 22908225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 240 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 41508061 - 41507836
Alignment:
Q  240 tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttact-caagttgaaaaactcacaaatc-aatcttaatcaatcatgtagtc 337  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| | ||||||  ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  41508061 tatcaagtgacaaaa-gaccaacattgataatttccaaaataac--aacttaattcaagtttgaaagctcacaaaaataatcttaatcaatcatgtagtc 41507965  T
Q  338 atgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagtt-cacattttccacattcccaccc 436  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   |||| ||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  41507964 gtgagcttaagccacttacaaactattagacattagttcaaagtatagcttaagtctgtatgagaaaa-cccaagtttcacattttccacaatcccaccc 41507866  T
Q  437 gaaaatcaagtttgacatgattaagacatt 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41507865 gaaaatcaagtttgacatgattaagacatt 41507836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 238 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 21199333 - 21199079
Alignment:
Q  238 cgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtc 337  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||  ||||||||    | |||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  21199333 cgtatcaagtggcaaa-cggccaacattgataactctcaaagtaaggtaacaatat-aagtttgaaaactcaccaaacaatcttaatcaatcatgtaatc 21199236  T
Q  338 atgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccg 437  Q
    | ||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  21199235 aagagtttaagccacttacaaactattaggccttagttcaaagaatagcttaagttcgtatgataaaa-cccaagttaacatttttcacattcccaccct 21199137  T
Q  438 aaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||  ||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21199136 aaattcacgtttaacatgattaagatgtttgaccaacattacaagccttgcctaagtc 21199079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 45560400 - 45560197
Alignment:
Q  34 cattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaata-cttctcacattccaagtaaag-agaaaatgcaacaccttatgataaatattat 131  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| | | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||    
T  45560400 cattaatcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccatacaacttctcacaatccaagtaaaggagaaaatacaacactttatgataaacatcat 45560301  T
Q  132 attccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgac 231  Q
    |||| || ||||| ||| | ||||||||||||||| || |||||||| | ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  45560300 attcaacacctaacaat-cgttcacatatcttcatataatcatataatgatatccacaaaagatttataaggtaattggctttaaagaaccattttcgac 45560202  T
Q  232 aaagt 236  Q
    |||||    
T  45560201 aaagt 45560197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 252 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 24718506 - 24718263
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||| |||||| || |  |||||||||    
T  24718506 aaacggccaacattgataattttcaaagttaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaataatgtagccaaggacttaagcca 24718407  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    |||||  ||||||| | || ||||||||   |||| |||||| |||||| ||||||||||||| | |  ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24718406 cttacatactattataaataagttcaaaggatagcttaagttcgtatgagaaaatcccaagtttatacattccataatcccacccgaaaatcaagtttga 24718307  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||||||||||| |  || ||| |||||||||||  |||||||    
T  24718306 catgattaagacactgtactaaccttacaagccttatctaagtc 24718263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 88 - 495
Target Start/End: Original strand, 23836134 - 23836534
Alignment:
Q  88 attccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtca 187  Q
    ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||| |||| | ||   ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23836134 attccaagtaa-gagaacatataacatcttatgataaatatcatat-caacatataacaagtcattcacacatcttcatttagtcatatacggctagtca 23836231  T
Q  188 cgaaagatt-tataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggta 286  Q
    ||||||||  ||||   |||||| ||| || ||||  ||| ||| |||   ||||||||||||||||  | ||||||| || || | | |||  ||||||    
T  23836232 cgaaagatcatata---taattgacttaaaggaattatttccgataaaac-cgtatcaagtggcaaacag-ccaacatcgacaactcttaaagtaaggta 23836326  T
Q  287 acttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagc 386  Q
     |    | |||||  |||||| || || |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||| | ||||    
T  23836327 gcaatataaagtttgaaaacttaccaaacaatcttaatcaatcatgtaatcaagagcctaagccacttacaaactattggacattagttcaaagaatagc 23836426  T
Q  387 ctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagcctt 486  Q
     |||||| |||  |||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||  |||||| ||||||| |||    
T  23836427 ttaagttcgtactataaaa-ctcaagttgccattttccacattcccacccgaaattcacgtttaacatgattaagacgtttgaccaacattacaagtctt 23836525  T
Q  487 gcctaagtc 495  Q
     ||||||||    
T  23836526 acctaagtc 23836534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 24107538 - 24107357
Alignment:
Q  315 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagtt 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||| ||||| ||    
T  24107538 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacaaactattagacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaa-cccaattt 24107440  T
Q  415 cac-attttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  ||  ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  24107439 cacaatctttcacattcccacccgaaatatcatttttgacatgattaagatgtttgaccaaccatacaagtcttacctaagtc 24107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 240
Target Start/End: Original strand, 25294953 - 25295160
Alignment:
Q  34 cattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatactt-ctcacattccaagtaaag-agaaaatgcaacaccttatgataaatattat 131  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| | | || ||||||   ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||    
T  25294953 cattaatcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccatacaatttctcacaagtcaagtaaaggagaaaatacaacacattatgataaacatcat 25295052  T
Q  132 attccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgac 231  Q
    |||| || | ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25295053 attcaacacttaaaaat-cattcacatatcttcatataatcatataaagatatccacaaaatatttataaggtaattggctttaaagaaccattttcgac 25295151  T
Q  232 aaagttcgt 240  Q
    |||||||||    
T  25295152 aaagttcgt 25295160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 25756973 - 25757176
Alignment:
Q  34 cattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatactt-ctcacattccaagtaaag-agaaaatgcaacaccttatgataaatattat 131  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| | | || ||||||   ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||    
T  25756973 cattaatcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccatacaatttctcacaagtcaagtaaaggagaaaatacaacacattatgataaacatcat 25757072  T
Q  132 attccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgac 231  Q
    |||| || ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25757073 attcaacacctaaaaat-cattcacatatcttcatataatcatataaagatatccacaaaatatttataaggtaattggctttaaagaaccattttcgac 25757171  T
Q  232 aaagt 236  Q
    |||||    
T  25757172 aaagt 25757176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 302 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 21191854 - 21191662
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||||| ||  |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  21191854 aaaactcaccaaaaaatcttaaccaatcatgtaatcaagagcttaagccacttaaaaactattaggcattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgat 21191755  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
     ||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  ||  |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  21191754 -aaagcccaagttaacatttttcatattcccacccgaaattcacgtttaacatgattaagatgtttgaccaacattacaagccttacataagtc 21191662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 302 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 39447923 - 39447731
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||||| || || |||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| | |||| |||| | |||||||    
T  39447923 aaaactcaccaaacagtcttaatcaaccatgtaatcaagaacttaagccacttataaactattgaacattagtccaaagaatagcttaagatcgtatgat 39447824  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  ||  | |||| ||||||||||| ||||||||    
T  39447823 aaaa-cccaagttaacatttttcacattcccacccgaaattcacgtttaacatgattaagatgtttgatcaacgttacaagcctttcctaagtc 39447731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 495
Target Start/End: Original strand, 17284241 - 17284574
Alignment:
Q  146 aattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaa 245  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| || | ||||||||| |||| |  ||||| |||||| ||| || ||||| ||| |||||||   ||||||||    
T  17284241 aattcattcatacatcttcatttagtcaaatgaagctagtcacaaaaggtc-ataagataattgacttaaaggaatcttttccgacaaaac-cgtatcaa 17284338  T
Q  246 gtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagctt 345  Q
    |||||||| || ||||||| ||||| | |||||   |||||||    | ||||| |||||||||| || |||||||||||||            ||||||    
T  17284339 gtggcaaa-cggccaacatcgataactctcaaagttaggtaacgatataaagtttaaaaactcaccaaacaatcttaatcaa------------gagctt 17284425  T
Q  346 aagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaa 445  Q
    |||||  |||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||  ||||| |||     
T  17284426 aagccgattacaaactattagacattagttcaaagactagcttaagttcgtatgataaaa-cccaagttaacatttttcacattgccatacgaaattcac 17284524  T
Q  446 gtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| ||||||||||||  ||  |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17284525 gtttaacatgattaagatgtttgaccaacattacaagccttacctaagtc 17284574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 252 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 24930093 - 24929912
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||  |   |||||| || ||||    
T  24930093 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcataaaagtatgagcataggcca 24929994  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattccca 433  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  |||||||||||||    
T  24929993 cttacgaactatcgatcattagtccaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttatacattccacattccca 24929912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 24238581 - 24238800
Alignment:
Q  37 taatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatactt-ctcacattccaagtaaaga-gaaaatgcaacaccttatgataaatattatatt 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  || || ||| || |||||| |||| | |||||||||||| | |||| |||||| ||| ||||||  |  ||||    
T  24238581 taatcaacatcaactatataatataactcaacaacttcatatactttctcataatccaagtaaagaagtaaatacaacacgttacgataaacctcgtatt 24238680  T
Q  135 ccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaa 234  Q
    | || || || ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||| ||||||    
T  24238681 caacaccgaagaat-cattcacttatcttcatttaatcatataaatctattcacgaaagatttataaggtaatcggtattaaagaaccatttttgacaaa 24238779  T
Q  235 gttcgtatcaagtggcaaaac 255  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  24238780 gtccgtatcaagtagcaaaac 24238800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 252 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 13663576 - 13663423
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  | |||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  13663576 aaacgaccaacattgataattttcaaagttaggtaacttgtttaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggacttaagcca 13663477  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaa 405  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||   |||| |||||| |||||| ||||    
T  13663476 cttacaaactattagaaattagttcaaaggatagcttaagttcgtatgagaaaa 13663423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 22007575 - 22007419
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||| | |||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||    
T  22007575 aaacgaccaacattgataatttttaaagctaggcaacttatttaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggacttgagcca 22007476  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcc 408  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||   |||| |||||| |||||| |||||||    
T  22007475 cttacaaactattagaaattagttcaaaggatagcttaagttcgtatgagaaaatcc 22007419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 407 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 22322373 - 22322287
Alignment:
Q  407 cccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||| |||||||| |||||||||    
T  22322373 cccaacttcacattttccacaatcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagatattgtactaaccttacaagcattgcctaag 22322287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 240
Target Start/End: Original strand, 17500964 - 17501118
Alignment:
Q  85 cacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctag 184  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||| || ||||| || |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||     
T  17500964 cacattccaagtaaagatgaaatacaacaccttatgataaacatcatattcaacacctaacaa-tcattcacataatttcatttaatcatataaagctat 17501062  T
Q  185 tcacgaaagatttataaggtaattgg-ctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgt 240  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||| |||  || |||  |||||||||||||||||    
T  17501063 ccacaaaaga-ttataaggtaattggtcttacaaaaattattttcgacaaagttcgt 17501118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 400
Target Start/End: Original strand, 28836771 - 28836919
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||| |||||| |||||||  |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |  | |||||||    
T  28836771 aaacggccaacattgataattttcaaagttaggcaacttattcaagtttgaaaacctacaaatcaatcttaatcaatcacgtagtcaaggacataagcca 28836870  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatga 400  Q
    || || |||||||| | |||||||||||   |||| |||||| ||||||    
T  28836871 ctcacaaactattagaaattagttcaaaggatagcttaagttcgtatga 28836919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 252 - 379
Target Start/End: Original strand, 22146599 - 22146726
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  22146599 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaaatttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggacttaagcca 22146698  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaa 379  Q
    ||| | |||||||| | |||||||||||    
T  22146699 cttgcaaactattagaaattagttcaaa 22146726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 315 - 462
Target Start/End: Original strand, 38532792 - 38532939
Alignment:
Q  315 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagtt 414  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||  ||| | |||| |||||| |||||  |||| | ||| ||    
T  38532792 caattttaatcaatcatgtagtcatgaacttaagtcacttacggactattagacattagtctaaagaatagcttaagttcgtatg--aaaaactcaattt 38532889  T
Q  415 cac-attttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaaga 462  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  38532890 cacaatctttcacattcccacccgaaatatcacttttgacatgattaaga 38532939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 315 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 31195371 - 31195192
Alignment:
Q  315 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagtt 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||| |||| | || | |||||| |||| | |||| |||||  |    
T  31195371 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttgtatactattaaagattagtccaaagaataacttaagttcgtataagaaaa-cccaaaat 31195273  T
Q  415 cacattttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||||  ||  |||||| |||||||  || ||||||||    
T  31195272 cacattttccaca-tcccatccgaaatatcacatttgacatgcttaagatgtttgaccaaccttacaagttttacctaagtc 31195192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 17151102 - 17150954
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||| || |||| |  | || |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||    
T  17151102 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaaatttaaaatcataaaattcaatcttaatcaatcatgtagacaaggacttaagcca 17151003  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatga 400  Q
    ||||  |||||||| | |||||||||||   |||| |||||| ||||||    
T  17151002 cttaaaaactattagaaattagttcaaaggatagcttaagttcgtatga 17150954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 409 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 23153205 - 23153121
Alignment:
Q  409 caagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  23153205 caagttcacatttttcacattcccacccgaaattcaagtttgacatgattacgac--ttaactaacactacaagccttgcctaagtc 23153121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 408
Target Start/End: Original strand, 18618368 - 18618608
Alignment:
Q  168 tagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattga 267  Q
    |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||| |  || ||| ||| | | |||||||||||||| || |||||| |||    
T  18618368 tagtcatacaaaactagtcatgaaagatttataaggcgattggcttttaagaaccaattccgataaaatccatatcaagtggcaaa-cggccaacaatga 18618466  T
Q  268 taattttc-aaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaa 366  Q
    ||| |  | ||||||| |||||    | |||||  |||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| ||||||||     
T  18618467 taaatccccaaaacaaagtaacaatatgaagtttgaaaactcactgaacaatcttaatcaatcatatagtcaaggacttaagccacttacaaactattag 18618566  T
Q  367 acattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcc 408  Q
    | |||||||||||   |||| |||||| |||||  |||||||    
T  18618567 aaattagttcaaaggatagcttaagttcgtatgtgaaaatcc 18618608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13722111 - 13721963
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||| |||||| | |||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||    
T  13722111 aaacggccaacattgataattttcaaagttaggcaacttatttaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggactcaagcca 13722012  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatga 400  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||   |||| |||||| ||||||    
T  13722011 cttacaaactattagaatttagttcaaaggatagcttaagttcgtatga 13721963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 318 - 462
Target Start/End: Original strand, 21696695 - 21696839
Alignment:
Q  318 tcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcac 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||  |||   |||| |||||| |||||  |||| ||||| |||||    
T  21696695 tcttaatcaatcatgtagtcatgagctcaagccacttacggactattggacactagtataaaggatagcttaagttcgtatg--aaaaacccaatttcac 21696792  T
Q  418 -attttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaaga 462  Q
     || || |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  21696793 aatatttcacattcccacctgaaatatcacttttgacatgattaaga 21696839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 207
Target Start/End: Original strand, 24906896 - 24906954
Alignment:
Q  149 tcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaat 207  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  24906896 tcattcacatatcttcatataatcatataaggctattcacaaaagatttataaggtaat 24906954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 17730489 - 17730449
Alignment:
Q  315 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccactta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17730489 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccactta 17730449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19332795 - 19332656
Alignment:
Q  38 aatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatactt-ctcacattccaagtaaag-agaaaatgcaacaccttatgataaatattatattc 135  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||| || ||||||    
T  19332795 aatcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccatatacttcctcacaatccaagtaaagaagaaaatacttcacattatgataaacatcatattc 19332696  T
Q  136 cacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatat 176  Q
      | |||| ||| |||| ||||||||||||| || ||||||    
T  19332695 atcacctagaaa-tcatccacatatcttcatataatcatat 19332656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 175
Target Start/End: Original strand, 11543498 - 11543639
Alignment:
Q  34 cattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactcca-aatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattata 132  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| | || |||||||| | ||||| | ||||| || |||||  |||||||||| || |||    
T  11543498 cattaatcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccatactatttctcacaattcaagtgaggagaagatacaacaatttatgataaacatcata 11543597  T
Q  133 ttccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcata 175  Q
    ||| || ||||  || ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11543598 ttcaacacctagcaa-tcattcacataccttcatttaatcata 11543639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22737046 - 22736855
Alignment:
Q  238 cgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtc 337  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  | || | ||| ||  ||| ||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22737046 cgtatcaagtggcaaa-cgaccaacattgacaattctcacgagaaagcaacatatacaaattgaaag-ctctcaaa-caatcttaatcaatcatgtagtc 22736950  T
Q  338 atgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcac-attttccacattccca 433  Q
    ||||  |||||||||| |||  |||||| ||||||   |||| | |||| |||||| |||||| |||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  22736949 atgaatttaagccactcacgggctattagacattataccaaagaatagcttaagttcgtatgagaaa--cccaatttcacaatttttcacattccca 22736855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 22908778 - 22908686
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatat 133  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| | |||||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||||| ||||    
T  22908778 tcaacatcaactatatcatatagtttcaccattccaaacaattctcatattccaagt-aagagaacatacaacatcttatgacaaatatcatat 22908686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 168
Target Start/End: Original strand, 22312653 - 22312787
Alignment:
Q  34 cattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactcca-aatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattata 132  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| | || |||||||| | ||||| | ||||| || |||||  |||||||||| || |||    
T  22312653 cattaatcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccatactatttctcacaattcaagtgaggagaagatacaacaatttatgataaacatcata 22312752  T
Q  133 ttccacgcctaaaaattcattcacatatcttcattt 168  Q
    ||| || ||||  ||  |||||||||| ||||||||    
T  22312753 ttcaacacctagcaa-ccattcacataccttcattt 22312787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24107670 - 24107608
Alignment:
Q  147 attcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattgg 210  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  24107670 attcattcaaacatcttcacttagtcatataaggatagtcacgataga-ttataaggaaattgg 24107608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24969333 - 24969283
Alignment:
Q  329 catgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaa 379  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  24969333 catgtaatcaagagcttaagccacttacaaattattagacattagttcaaa 24969283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 5769498 - 5769022
Alignment:
Q  21 attgatatataaacattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5769498 attgatatataaacattaatcaacatcaacaatataatatagttccaccacttcaaatacttctcatattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatg 5769399  T
Q  121 ataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaa 220  Q
    |||||||| |||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5769398 ataaatatcatattcgacatctaacaactcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattagctttaaagaa 5769299  T
Q  221 tcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaag-ttgaaaaactcacaaatcaatc 319  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5769298 tcgttttcgacaaagtccgtatcaagtggcaaaacggccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttatttaagtttgaaaagctcacaaatcaatc 5769199  T
Q  320 ttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacat 419  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  5769198 ttaatcaatcatgtaatcatgagcttaaactacttacgaactatcaaacattagttcaaaaattagcttaagttcgtatgagaaaat-ccaagttcacat 5769100  T
Q  420 tttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
     || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5769099 atttcacattcccacctgaaaatcaagtttgacatgattaagacattaacccaactttacaagtcttgcctaggtcca 5769022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 81 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 40437521 - 40437106
Alignment:
Q  81 ttctcacattccaagtaaag-agaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataag 179  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||| || || ||| || ||||| |||| | ||||||| ||||||||| ||||||||     
T  40437521 ttctcacaatccaagtaaaggaggaaatacaataccttatgataaacatcatgttcaacacctaacaatt-actcacataacttcatttaatcatataaa 40437423  T
Q  180 gctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataatttt-caaa 278  Q
    | || |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  40437422 gttattcacaaaagatt-atagggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagtccgtatcaagtggcaaaacggtcaacattgataatttttcaaa 40437324  T
Q  279 acaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaa 378  Q
    ||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  40437323 acaaggtaacttattcaagtttggaaacccacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttataaactattaaacattagttcaa 40437224  T
Q  379 aaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaacttta 478  Q
    | ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  40437223 agatttgcctaagtttgtatgagaaaaccccaagttcacatattccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattaaaccaacctta 40437124  T
Q  479 caagccttgcctaagtcca 497  Q
     ||||||||||||||||||    
T  40437123 -aagccttgcctaagtcca 40437106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 85 - 497
Target Start/End: Original strand, 20193043 - 20193456
Alignment:
Q  85 cacattccaagtaaag-agaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggcta 183  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||| ||| |||  | ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20193043 cacattccaagtaaaggagaaaatgcaacaccttatgataaacatcatattcaacgcttaacaat-catctaaatatcttcatttaatcatataaagcta 20193141  T
Q  184 gtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaa-cgaccaacattgataattttcaaaacaa 282  Q
     |||  |||||||||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| |||    
T  20193142 atcataaaagatttataaggtaatcgactttaaagaaccaatttcgacaaagtccgtatcaagtggcaaaagcggccaacatagatatttttcaaagcaa 20193241  T
Q  283 ggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaat 382  Q
     |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||    
T  20193242 agtaacttattcaagtttgaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcttgagattaagccacttaagaactatcaaacattagttcacagat 20193341  T
Q  383 tagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaag 482  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  20193342 tagcctaagtttgtatgagaaaaccccaagttcacacattccgtaatcccacccgaaaatcaagttgaacatgattaagaccttgtaccaactttacaag 20193441  T
Q  483 ccttgcctaagtcca 497  Q
    |||||||||||||||    
T  20193442 ccttgcctaagtcca 20193456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 40 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 5471688 - 5471234
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacg 139  Q
    |||| |||||| | |||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||| | |      
T  5471688 tcaatatcaactacataatatagtttcaccactccaaatattcctcatattcaaa-taaagagataatacaacaccttatgataaacatcatatccaaaa 5471590  T
Q  140 cctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcg 239  Q
    | ||| |||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||| | ||| ||| ||||| ||    
T  5471589 cttaacaattcattcacacaccttcatttagacataataggctagtcacgaaagagttataagataattgtctt-aaagaaccatttccgataaagtccg 5471491  T
Q  240 tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaac-ttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtca 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | |||||  ||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5471490 tatcaagtggcaaa-cgaccaacattgataattcccaaaacaaggtaacattattaaagtttgaaagcttataaaccaatcttaatcaatcatgtagtca 5471392  T
Q  339 tgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccga 438  Q
     ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||  |||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  5471391 cgagtttaaaccacttacaaactattaaacattagttcaaagaatagattaagttcgtatgagaaaa-cccaatttcacattttccatattcccacccga 5471293  T
Q  439 aaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5471292 aaatcaagtttaacatgattaagacattaagccaactttacaagtcttgcctaagtcca 5471234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 40 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 8539247 - 8538794
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacg 139  Q
    ||||||||||| | || ||||||||  ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| | ||     
T  8539247 tcaacatcaactacatcatatagtttcacagctccaaatatttctcatattccaagtaaagagaaaatacaacacgttatgataaatatcatatccaaca 8539148  T
Q  140 cctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcg 239  Q
      ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| | ||  ||| ||| | |     
T  8539147 tataacaattcattcacacatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatc-ataagataattggcttaaaagaaccattcccgataaaatcca 8539049  T
Q  240 tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttc-aaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtca 338  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||  | ||||||||||||| || |||||||  ||||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||    
T  8539048 tatcaagtggcaaa-cggccaacattgataattccccaaaacaaggtaacatattcaagtttgaaaactcgcaaaataatcttaaacaatcatgtaatca 8538950  T
Q  339 tgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccga 438  Q
      ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||   |||| |||||| |||||| |||| | |||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  8538949 aaagcttaagccatttacaaactattagacattagttcaaagtatagcttaagttcgtatgagaaaa-ctcaagttcaca-tttccacatttccaccaga 8538852  T
Q  439 aa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    || ||||||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  8538851 aatatcaagtttaacatgattaagatgtttgaccaactttacaagtcttacctaagtc 8538794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 40 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 8604486 - 8604033
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacg 139  Q
    ||||||||||| | || ||||||||  ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| | ||     
T  8604486 tcaacatcaactacatcatatagtttcacagctccaaatatttctcatattccaagtaaagagaaaatacaacacgttatgataaatatcatatccaaca 8604387  T
Q  140 cctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcg 239  Q
      ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| | ||  ||| ||| | |     
T  8604386 tataacaattcattcacacatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatc-ataagataattggcttaaaagaaccattcccgataaaatcca 8604288  T
Q  240 tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttc-aaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtca 338  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||  | ||||||||||||| || |||||||  ||||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||    
T  8604287 tatcaagtggcaaa-cggccaacattgataattccccaaaacaaggtaacatattcaagtttgaaaactcgcaaaataatcttaaacaatcatgtaatca 8604189  T
Q  339 tgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccga 438  Q
      ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||   |||| |||||| |||||| |||| | |||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  8604188 aaagcttaagccatttacaaactattagacattagttcaaagtatagcttaagttcgtatgagaaaa-ctcaagttcaca-tttccacatttccaccaga 8604091  T
Q  439 aa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    || ||||||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  8604090 aatatcaagtttaacatgattaagatgtttgaccaactttacaagtcttacctaagtc 8604033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 153 - 497
Target Start/End: Original strand, 18165170 - 18165511
Alignment:
Q  153 tcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaa 252  Q
    ||||||| |||||||||  | || || |||| |||| ||||||||| ||| |||  ||||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||||||    
T  18165170 tcacataacttcatttaaccttacaaagctattcac-aaagatttacaagttaaacggctttaaagagtcattatcgacaaagtctgtatcaagtggcaa 18165268  T
Q  253 aacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccac 352  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||  |||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18165269 aacggccaacattgataattttcaaagctaggtaacttaatcaagttttaaaacctacaaattcatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccac 18165368  T
Q  353 ttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgac 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||| || |||||||  | |||||||||||||||| ||| | | |||||||    
T  18165369 ttacgaactattaaacattagttcaaagattagcttaagttcgtatgagaaaacccaaagttcatgtattccacattcccaccc-aaagtgacgtttgac 18165467  T
Q  453 atgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  18165468 atgattaagacattaaacc-actatacaagccttgcctaggtcca 18165511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 22144676 - 22144230
Alignment:
Q  44 catcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgccta 143  Q
    ||||||| | || |||||||| ||||| | |||||| |||||  ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||  | ||  |||    
T  22144676 catcaactacatcatatagttttaccatttcaaatatttctcctatttcgagtaaagagaaaatacaacatcttatgatcaatatcataaccaacatcta 22144577  T
Q  144 aaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatc 243  Q
    | ||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||   |||||||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  22144576 acaattcat-cacacatctccatttagtcacataaggctagtcacaaaaggtt-ataagataattggcaa-aaagaatcatttccgataaagttcatatc 22144480  T
Q  244 aagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagc 343  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||  |||||||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144479 aagtgacaaa-cggtcaacattgataatttccaaagtaagataacttgttcaagtttgaagactcacaaaataatcttaatcaatcatgtagtcatgagc 22144381  T
Q  344 ttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatc 443  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||   |||| |||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  22144380 ttaagccacttacaaactattaggcattagttcaaagcatagcttaagttcgtacgagaaaa-cccaagtttacattttccactttcccacccgaaattc 22144282  T
Q  444 aagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  22144281 aagtttgacatgattaagacgtttaactaacattacaagtcttgcctaagtc 22144230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 40 - 339
Target Start/End: Original strand, 33396290 - 33396591
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaat-acttctcaca-ttccaagtaaa-gagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattcc 136  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| || ||  || || | |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||     
T  33396290 tcaacatcaactatatcatatagttcaacaacatcatattatttctcacaattccaagtaaatgagaaaatacaacaccttacgataaacatcatattca 33396389  T
Q  137 acgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagt 236  Q
    || ||||  ||| ||||||||||||||||| || ||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33396390 acacctagcaat-cattcacatatcttcatataatcatataaatctattcacggaatatttataaggtaattggctttaaagaatcgtttccgacaaagt 33396488  T
Q  237 tcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagt 336  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33396489 ctgtatcaagtggcaaaacggccaacattgatgattttcaaaacaaggtaacttattcaagtttgaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagt 33396588  T
Q  337 cat 339  Q
    |||    
T  33396589 cat 33396591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 482
Target Start/End: Original strand, 27673713 - 27674150
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacg 139  Q
    ||||||||||| |  | ||||||||  | ||||||||  | |||||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | ||     
T  27673713 tcaacatcaactacctcatatagtttcatcactccaatcatttctcatattccaagtaa-gagaacatacgacatcttatgataaatatcatatccaaca 27673811  T
Q  140 cctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcg 239  Q
    | ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| | ||| ||| |||   ||    
T  27673812 cataacaattcattcacacatctccatttagtcatacaaggctagtcacgaaagatc-ataagataattggcttaaaagaaccatttccgataaaac-cg 27673909  T
Q  240 tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcat 339  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||   |||||||| || |||||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  27673910 tatcaagtggcaaa-cgaccaactttgataactctcaagt-aaggtaacgtaatcaagtttgaaaactaatacatcaatcttaatcaatcatgtagtcat 27674007  T
Q  340 gagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaa 439  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27674008 gagcttaagccacttacaaactattagacattagttcaaagaatagcttaagtccgtatgagaaaa-cccaagttcacatttttcacattcccacccgaa 27674106  T
Q  440 a-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaag 482  Q
    | ||||  |||||| |||||||||| ||  |||||| |||||||    
T  27674107 atatcacatttgacctgattaagacgtttgaccaaccttacaag 27674150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 102 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 49998544 - 49998160
Alignment:
Q  102 gaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataa 201  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |||| | |||| | ||||||||||||||  | |||||     |||  ||| ||||||| ||||    
T  49998544 gaaaatacaacaccttatgttaaatatcatattcaaggcctcacaatt-actcacatatcttcatccaatcataa----ctaaccacaaaagatt-ataa 49998451  T
Q  202 ggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttga 301  Q
    |||| ||||||  |||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||     
T  49998450 ggtatttggctc-aaagaatcatttttgataaagtccgtatcaagtggcaaa-cgaccaacattgataattttcaaaataaagtaatttattcaagatgg 49998353  T
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||   ||   |||||| ||| ||     
T  49998352 aaaactcacatctcaatcttaatcaatcatgtaatcatgagcttaagccacttacaaactattagatattagttcaaagtataatttaagttcgtacgag 49998253  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||  ||| |||||||||| |||| |||||||    
T  49998252 aaaat-ccaagttcacattttccacgttcccacccgaaattcaagtttaacatgattaagatgtttgacccactttacaagtcttgtctaagtc 49998160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 81 - 462
Target Start/End: Original strand, 17607868 - 17608243
Alignment:
Q  81 ttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataagg 180  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| |||| | ||   ||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17607868 ttctcatattccaagtaa-gagaacatacaacatctcatgataaatatcatat-caacatataacaattcactcatacatcttcatttagtcatataagg 17607965  T
Q  181 ctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaac 280  Q
    ||||||||||| |||  | ||| |||||||||| |||||| |  ||| || ||| ||| |||||||||||||  || |||||||||||||||  ||||||    
T  17607966 ctagtcacgaatgatc-acaagataattggcttaaaagaaacaattttgataaaattcatatcaagtggcaac-cggccaacattgataattcccaaaac 17608063  T
Q  281 aaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaa 380  Q
    ||||||||    | |||||  |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  17608064 aaggtaacaacataaagtttgaaaattctcaaaacaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacaaactattaaatattagttcaaag 17608163  T
Q  381 attagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaaga 462  Q
    | || |  ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17608164 aataactcaagttcgtatgagaaaa-cccaagttcatatttt-cacattcccacccgaaattcaagtttaacatgattaaga 17608243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 366
Target Start/End: Original strand, 21194038 - 21194362
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacg 139  Q
    ||||||||||| | || ||||||||  | ||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||| | ||     
T  21194038 tcaacatcaactacatcatatagtttcatcactccaaaaatttctcatatcccaagtaatgagaaaatacaacactttatgataaatatcatatccaaca 21194137  T
Q  140 cctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcg 239  Q
      ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| || ||| | ||| ||| ||||||||    
T  21194138 tatatcaattcattcacacatcttcatttagtcatataaagctagtcacgaaaga-tcataagataattggcttaaaggaaccatttccgataaagttcg 21194236  T
Q  240 tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcat 339  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||   | |||  |||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||     
T  21194237 tatcaagtggc-aaacaaccaacattgataattcccaaaacaaggtaacatatgaatgtttgaaaactcataactcaatcttaatcaataatgtaatcaa 21194335  T
Q  340 gagcttaagccacttacgaactattaa 366  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21194336 gagtttaagccacttacgaactattaa 21194362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 319 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 2422008 - 2421833
Alignment:
Q  319 cttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcaca 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  2422008 cttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagctacttacaaactattagacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaa-cccaagttcaca 2421910  T
Q  419 ttttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  2421909 ttttccacaatctcacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattgtactaaccttacaagccttgtctaagtc 2421833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 252 - 493
Target Start/End: Original strand, 51451682 - 51451923
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   ||||| ||| ||||    
T  51451682 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagtttaggcca 51451781  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51451782 cttacgaactatcgatcattagttcaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttaaacattccacattcccacccgaaaatcaattttga 51451881  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||    
T  51451882 catgattaagacattgtacgaaccttacaagcattgcctaag 51451923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 99 - 398
Target Start/End: Original strand, 16655445 - 16655741
Alignment:
Q  99 agagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagattta 198  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||  | || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |    
T  16655445 agagaacatacaacatcttatgataaatatcatagccaacacataacaattcattcacacatcttcatttagtcatacaaggctagtcacgaa-gatc-a 16655542  T
Q  199 taaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagt 298  Q
    |||| |||||||||| || ||| | ||| ||| |||||  || |||||||| |||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||    | ||||    
T  16655543 taagataattggcttaaaggaaccatttccgataaagtctgtgtcaagtgg-aaaatggccaacattgacaattctcaaaacaaggtaacaatataaagt 16655641  T
Q  299 tgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtat 398  Q
    |  ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||    
T  16655642 tcgaaaactctcaaaacaatattaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacaaacaattaaacattagttcaaagaatagcttaagttcgtat 16655741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 298 - 495
Target Start/End: Original strand, 20176368 - 20176564
Alignment:
Q  298 ttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgta 397  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| | |||| |||||| |||    
T  20176368 ttgaaagactcaccaaacaatcttaatcaatcatgtaatcaagagcttaagctacttacaaactattaggcattagttcaaagaatagcttaagttcgta 20176467  T
Q  398 tgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||  |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20176468 tgataaaa-cccaagttaacattttccacattcccacctgaaattcacgtttgacatgattaagatgtttgaccaacattacaagccttacctaagtc 20176564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 302 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13377811 - 13377622
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | |||  |||||| |||||||    
T  13377811 aaaactcaccaaacgatcttaatcaatcatgtagtcaagagcttaagccacttacaaactattaggcattagttcaaagaataggttaagttcgtatgat 13377712  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaa 492  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  ||  |||||| ||||||| ||| |||||    
T  13377711 aaaa-cccaagttaaaattttccacattcccacccgaaattcacgtttaacatgattaagatgtttgaccaaccttacaagtcttacctaa 13377622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 252 - 493
Target Start/End: Original strand, 22365824 - 22366067
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataatttt-caaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcc 350  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| | ||  |||||| |||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||| || ||   |||||| || |||    
T  22365824 aaacggccaacattgataatttttcaaagctagaaaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaattatataagtatgagcataggcc 22365923  T
Q  351 acttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccg-aaaatcaagttt 449  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||| | |  ||||||| |||||| || |||||||||||     
T  22365924 acttacgaactatcaatcattagttcaaagattagcctaagttcgtatgagaaaatctcaagtttatacattccacaatcccactcgaaaaatcaagttc 22366023  T
Q  450 gacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||    
T  22366024 gacatgattaagacattttaccaactttacacgcattgcctaag 22366067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 368 - 497
Target Start/End: Original strand, 33396589 - 33396718
Alignment:
Q  368 cattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattc 467  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  33396589 cattagttcaaagattagcctaagttcgtataagaaaaccccaagttcacacattccgtaatcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagaccttg 33396688  T
Q  468 aaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33396689 taccaactttacaagccttacctaagtcca 33396718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 302 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 36357438 - 36357246
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  36357438 aaaactcaccaaacaatcttaatcaatcatgtaattaatagcttaagccacttacaaaccattgaaaattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgat 36357339  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||  || ||||||| |||||||  || ||||||||    
T  36357338 aaaa-cccaagttaatatttttcacattcccacccgaaattcacatttaacatgattaagatgtttaaccaaccttacaagttttacctaagtc 36357246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 302 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 38034717 - 38034526
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  38034717 aaaattcaccaaacaatcttaatcaatcgtataatcaagagcttaagccacttacaaaccattgaatattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgat 38034618  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagt 494  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||  ||  |||||| ||||||| ||| |||||||    
T  38034617 aaaa-cccaagttaacatttttcacattcccacccgaaattcacatttaacatgattaagatgtttgaccaaccttacaagtcttacctaagt 38034526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 241 - 495
Target Start/End: Original strand, 19602188 - 19602440
Alignment:
Q  241 atcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatg 340  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||  ||  |||| | ||| ||  ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  19602188 atcaagtggcaaa-cggccaacattgataattcccacgacaaagcaacatagacaagttgaaag-ctctcaaa-caatcttaatcaatcatgcagtcatg 19602284  T
Q  341 agcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaa 440  Q
    ||||||||||||||    |||||||||| ||||| |||| | || | |||||| |||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19602285 agcttaagccacttgtagactattaaaccttagtccaaagaataacttaagttcgtatgagaaaacccaaaattcacattttccacattcccacccgaaa 19602384  T
Q  441 -atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
     ||||  ||||||||||||||||  ||  |||||  ||||||| ||| ||||||||    
T  19602385 tatcacatttgacatgattaagatgtttgaccaaacttacaagtcttacctaagtc 19602440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 40 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 37235266 - 37234832
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacg 139  Q
    ||||||||||| | || ||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || || ||  ||||||||||||| |||| | ||     
T  37235266 tcaacatcaactacatcatatagtttcaccactccaaatatttctcatattccaagtaa-gagaacatacagcattttatgataaatatcatat-caaca 37235169  T
Q  140 cctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatt-tataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttc 238  Q
       || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||   ||||||||||  ||||| | ||  ||  ||| | |    
T  37235168 tacaacaagtcattcacacatcttcatttagtcatataaggctagtcatgaaagatcatata---taattggctt--aagaaccattc-cggtaaaatcc 37235075  T
Q  239 gtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtca 338  Q
    ||||||||||||||| | || || ||||| ||||  ||||||||||||||    | |||||  |||   | |||   |||||||||||||||||| ||||    
T  37235074 gtatcaagtggcaaa-caactaatattgacaattcccaaaacaaggtaacaatataaagtttgaaagtcctcaagataatcttaatcaatcatgtggtca 37234976  T
Q  339 tgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccga 438  Q
    ||| | ||| |||||||| |||||||| || |||||||||| | |||| ||||||   || | |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  37234975 tgaacgtaatccacttacaaactattagactttagttcaaataatagcttaagttcacataagaaaa-cccaagttcacatttcccatattcccacccga 37234877  T
Q  439 aa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaag 482  Q
    || |||||||||  |||||||||||  ||  ||||||||||||||    
T  37234876 aatatcaagtttaccatgattaagatgtttgaccaactttacaag 37234832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 238 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 20956079 - 20955856
Alignment:
Q  238 cgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtc 337  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||  ||| |||| | ||  ||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20956079 cgtatcaagtggcaaa-cggccaacatcgataattcccaagacaaagcaatatatacaagttgaaaa-ctctcaaa-caatcttaatcaattatgtagtc 20955983  T
Q  338 atgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacatttt-ccacattcccaccc 436  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| || |||| | || | ||| || |||||| |||| || || |||||||||| ||||||||||||||    
T  20955982 atgatcttaacccacttacggactattagacattggtccaaagaataacttaaattcgtatgagaaaacccaaaattcacattttcccacattcccaccc 20955883  T
Q  437 gaaa-atcaagtttgacatgattaaga 462  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  20955882 gaaatatcacatttgacatgattaaga 20955856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 400
Target Start/End: Original strand, 41218522 - 41218670
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||   ||| || || ||||    
T  41218522 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcaaataagtatgcgcataggcca 41218621  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatga 400  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  41218622 cttacgaactatcaatcattagttcaaagattagcctaagttcgtatga 41218670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 224 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 22836357 - 22836164
Alignment:
Q  224 ttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaa 323  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||| |||||| ||| ||  || || ||||  ||| |||| ||| |||||    
T  22836357 ttttcgacaaataccgtatcaagtggcaaa-caaccaacattgataattcccaagacaaggcaacatagacaggtcgaaag-ctctcaaa-caaccttaa 22836261  T
Q  324 tcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattt 421  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||| | |||| |||||| |||||| || | ||||| |||||||||    
T  22836260 tcaatcatgtagtcatgatcttaagccacttgcaaactattagacattagtccaaagaatagcttaagttcgtatgagaata-cccaaattcacattt 22836164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 304 - 407
Target Start/End: Original strand, 22353285 - 22353388
Alignment:
Q  304 aactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataa 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||   |||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||    
T  22353285 aactcacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcatatgccacttacgaactatcaatcattagttcaaagattagccgaagttcgtatgacaa 22353384  T
Q  404 aatc 407  Q
    ||||    
T  22353385 aatc 22353388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 240
Target Start/End: Original strand, 52400272 - 52400408
Alignment:
Q  102 gaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataa 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||| | |||| | ||||||||||||| | | ||||||||  ||| |||| ||||||| ||||    
T  52400272 gaaaatacaacaccttatgataaatatcatattcaagacctcacaatt-agtcacatatcttcactcaatcatataaaactaatcacaaaagatt-ataa 52400369  T
Q  202 ggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgt 240  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  52400370 ggtatttggctttaatgaatcgtttttgacaaagttcgt 52400408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 495
Target Start/End: Original strand, 17022551 - 17022904
Alignment:
Q  146 aattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaa 245  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||| |  |||||||| | ||||  ||||  |||||| ||| || ||||| ||| |||||||   ||||||||    
T  17022551 aattcattcatacatcttcatttattcatatgaaactagtcacaacagatc-ataatataattgacttaaaggaatcatttccgacaaaac-cgtatcaa 17022648  T
Q  246 gtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaact-tactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagct 344  Q
    ||| |||| | | |||||||||||| | |||||  ||||||||  |||  |||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  17022649 gtgacaaa-caatcaacattgataactctcaaagtaaggtaacaataca-aagtttgaaaattcacaaaataatcttaatcaatcatgtaatcaagagct 17022746  T
Q  345 taagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacatt--------ttccacattcccaccc 436  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| | ||   ||||||  |||| ||||| |||||||| || ||        |||||||||||||||     
T  17022747 taagctacttacaaactattacacattagttcaaagaataatttaagttcatatgttaaaa-cccaagttaacttttttttttcttccacattcccacct 17022845  T
Q  437 gaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||   |||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17022846 gaaatctaagtttaacatgattaagatgtttgaccaactttacaagtcttacctaagtc 17022904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22250051 - 22249938
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | |||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||    
T  22250051 aaacgaccaacattgataatttttaaaactaggcaacttatttaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtaatcaaggacttaagcca 22249952  T
Q  352 cttacgaactatta 365  Q
    ||||| ||||||||    
T  22249951 cttacaaactatta 22249938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 400
Target Start/End: Original strand, 20253480 - 20253628
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  20253480 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggacttaagcca 20253579  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatga 400  Q
    ||  | |||||| | | |||||||||||   |||| |||||| ||||||    
T  20253580 ctcgcaaactatgagaaattagttcaaaggatagcttaagttcgtatga 20253628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 398
Target Start/End: Original strand, 21224358 - 21224531
Alignment:
Q  225 tttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaat 324  Q
    ||||||||||| ||||||||  |  |||||||||||| ||| | | |||||||| ||| |  ||||| |||||||  |||||  |||| |||| ||||||    
T  21224358 tttcgacaaaggtcgtatcattttacaaaacgaccaatattaacacttttcaaagcaaagcgacttattcaagtttgaaaacctacaattcaaacttaat 21224457  T
Q  325 caatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtat 398  Q
    ||||||||||  ||||||| || ||| ||||| |||||| || ||||||||||||  || ||||||||| ||||    
T  21224458 caatcatgtaagcatgagcataggcctcttacaaactatcaagcattagttcaaagttttgcctaagttcgtat 21224531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15862529 - 15862381
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||   ||| |||||| | |||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||    
T  15862529 aaacggccaacattgatccttttcaaagttaggcaacttatttaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggacttcagcca 15862430  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatga 400  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||   |||| |||||| ||||||    
T  15862429 cttacaaactattagaaattagttcaaaggatagcttaagttcgtatga 15862381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 331 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 51628771 - 51628728
Alignment:
Q  331 tgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  51628771 tgtagtcatgagcttaagccacttacggactattagacattagt 51628728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 77179 - 77102
Alignment:
Q  97 aaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcata 175  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||| || ||||| || |||||||||||||||||| || |||||    
T  77179 aaagagaaaatacaacactttatgataaacatcatattcaacacctaacaa-tcattcacatatcttcatataatcata 77102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 480
Target Start/End: Original strand, 22353383 - 22353425
Alignment:
Q  438 aaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttaca 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22353383 aaaatcaagtttgacatgattaagacattgtaccaactttaca 22353425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 9322348 - 9321871
Alignment:
Q  21 attgatatataaacattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatg 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9322348 attgatatataaactttaatcaacatcaaccatataatatagttccaccactccaaatacttctcatattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatg 9322249  T
Q  121 ataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaa 220  Q
    |||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9322248 ataaatatcatattcaacacctaacaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagttacgaaagatttataaggtaattggctttaaggaa 9322149  T
Q  221 tcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaag-ttgaaaaactcacaaatcaatc 319  Q
    || ||||||||||||| | |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  9322148 tcattttcgacaaagtccatatcaaatgacaaaacggccaacattgataattttcaaaacaaggtaactgatttaagtttgaaaagctcacaaatcaatc 9322049  T
Q  320 ttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacat 419  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9322048 ttaatcaatcatgtaatcatgagcttgagccatttacgaactattaaacattagttcaaagattagcctaagtttgtatgagaaaatcccaagttcacat 9321949  T
Q  420 tttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||   | ||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||    
T  9321948 tttccacattcccatccaaaaatcaagtttggtgtaattaagacatggtatcaactttacaagccttgcctaagtcca 9321871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 497
Target Start/End: Original strand, 13617704 - 13618168
Alignment:
Q  21 attgatatataaacattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatactt-ctcacattccaagtaaag-agaaaatgcaacacctta 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  13617704 attgatatatatacattaatcaacatcaactatataatatagctcaacaactccatacactttctcacattccaagtaaaggagaaaatacaacacctta 13617803  T
Q  119 tgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaag 218  Q
    | ||||| || ||||||  | ||||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13617804 taataaacatcatattcagcacctaacaat-cattcaaatatcttaatttaatcaaataaagttattcacgaaagatttataaggtaatcggctttaaag 13617902  T
Q  219 aatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaat 318  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||   ||| ||||||||||||    
T  13617903 aattgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgatcaacattgataa-tttcaaaacaaggtaacttattgaagtttggaaaatcacaaatcaat 13618001  T
Q  319 cttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcaca 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||| |||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||    
T  13618002 cttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaacta------------tcaaagattagcctaagttcatctgagaaaaccccaagttcaca 13618089  T
Q  419 ttttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
      |||| || | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13618090 cattccgcaattccactcgaaaataaagtttgacatgattaagacattgtaccaactttacaagccttgcctaagtcca 13618168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 171 - 497
Target Start/End: Original strand, 4445289 - 4445613
Alignment:
Q  171 tcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataa 270  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4445289 tcatataaaactagtcactaaagattt-taagataattggctttaaagaatcgttttcaacaaagtccgtatcaagtggcaaaacagccaacattgataa 4445387  T
Q  271 ttttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacat 370  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  4445388 ttttcaaaacaaggtaacttattcaagtttgaaaactcacaaaaaaatcttaatcaatcttgtagtcatgagcttaagccacttacgaactatcaaacgt 4445487  T
Q  371 tagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaac 470  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4445488 tagttcaaagattagcttaagttcgtatgagaaaa-cccaaattcacattttccacattccgacccgaaattcaagtttaacatgattaagacatccaac 4445586  T
Q  471 caactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4445587 caactttacaagccttgcctaagtcca 4445613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 171 - 494
Target Start/End: Original strand, 4437888 - 4438210
Alignment:
Q  171 tcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataa 270  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4437888 tcatataaaactagtcactaaagatt-ataagataattggctttaaagaatcgttttcaacaaagtccgtatcaagtggcaaaacggccaacattgataa 4437986  T
Q  271 ttttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacat 370  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  4437987 ttttcaaaacaaggtaacttattcaagtttgaaaactcacaaaaaaatcttaatcaatcttgtagtcatgagcttaagccacttacgaactatcaaacgt 4438086  T
Q  371 tagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaag-tttgacatgattaagacattcaa 469  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  4438087 tagttcaaagattagcctaagttcgtatgagaaaa-cccaaatttacattttccacattccgacccgaaattcaagttttaacatgattaagacatccaa 4438185  T
Q  470 ccaactttacaagccttgcctaagt 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4438186 ccaactttacaagccttgcctaagt 4438210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 34 - 482
Target Start/End: Original strand, 48354234 - 48354676
Alignment:
Q  34 cattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatat 133  Q
    ||||||||||| ||||| | || ||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||    
T  48354234 cattaatcaacttcaactacatcatatagtttcaccactccaaatatttctcatattccaagtaa-gagaacatacaacatcttatgataattatcatat 48354332  T
Q  134 tccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaa 233  Q
     | ||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  48354333 -caacatataacaattcattcacacatcttcatttagtcatataagcctagtcacgaaagatc-ataagataattggcttaaaagaatcattttcgataa 48354430  T
Q  234 agttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgt 333  Q
    | | | |||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    | |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  48354431 aatccatatcaagtggcaa--cgaccaacattgataattcccaaaacaaggtaacaatataaagtttgaaaactctcaaaacaatcttaatcaatcatgt 48354528  T
Q  334 agtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattccca 433  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48354529 agtcatgagcttaagccacttacaaactattaaacattagttcaaagaatagctcaagttcgtatgagaaaa-cccaagttcacattttccacattccca 48354627  T
Q  434 cccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaag 482  Q
    ||  ||| |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  48354628 ccaaaaattcaagtttaacatgattaagatatttgaccaactttacaag 48354676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 149 - 497
Target Start/End: Original strand, 45148643 - 45148981
Alignment:
Q  149 tcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtg 248  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  45148643 tcattcacatatcttcattcaatcatataaagctattcacgacagatttataaggtaattggctttaaagaaccattttcgacaaagtccgtatcaagtg 45148742  T
Q  249 gcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaag 348  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||          |||||||||| ||   |||||| || |    
T  45148743 gcaaaatggccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttattcaagtttgaaaactcaca----------aatcaatcatataagtatgagcatagg 45148832  T
Q  349 ccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtt 448  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| | ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  45148833 ccacttacaaactatcaaccattagttcaaagattagtctaagttcgtatgagaaaacctcaagttcacatattccacaatctcacccgaaaatcaagtt 45148932  T
Q  449 tgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45148933 tgatatgattaagacattgtaccaactttacaagccttgcctaagtcca 45148981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 34 - 495
Target Start/End: Original strand, 4483712 - 4484172
Alignment:
Q  34 cattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatactt-ctcacattccaagtaaagag-aaaatgcaacaccttatgataaatattat 131  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| | | || |||||| | ||| ||||| | ||||| |||||  |||||||||| || ||    
T  4483712 cattaatcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccatacaatttctcacaattcaaataaaggggaaaatacaacatattatgataaacatcat 4483811  T
Q  132 attccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgac 231  Q
    |||| || | |  |||   ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| | ||| |||     
T  4483812 attcaacacatgtaaaga-atttacatatcttcatttagtcatataaagctagtcacgaaagatttataagataattggctt-aaggaaccatttccgat 4483909  T
Q  232 aaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcat 331  Q
    |||||  |||||||||||||||  | |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4483910 aaagtctgtatcaagtggcaaactg-ccaacatttataattctcaaaataaggtaacttattaaagtttgaaagcttacaaatcaatcttaatcaatcat 4484008  T
Q  332 gtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcc 431  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  4484009 gtagtcatgagcttaacccacttacaaactattaaacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaat-ccaaattcacattttccacattcc 4484107  T
Q  432 cacccgaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4484108 cacccgaaatatcaagtttaacatgattaagatgtttgaccaactttacaagccttacctaagtc 4484172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 37 - 495
Target Start/End: Original strand, 9610138 - 9610590
Alignment:
Q  37 taatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattcc 136  Q
    |||||||| ||||| | || ||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| | |||||||||||| |||| |     
T  9610138 taatcaacttcaactacatcatatagtttcaccagtccaaatatttctcacattccaagtaa-gagaacatacaacatcatatgataaatatcatat-ca 9610235  T
Q  137 acgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagt 236  Q
    ||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  ||||||||| |||||||| ||| ||| ||| |    
T  9610236 acatataacaattcattcacacatcttcatttagtcatataaggctagtcaagaaagatc-ataagacaattggcttaaaagaatcatttccgataaaat 9610334  T
Q  237 tcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagt 336  Q
     | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    | |||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9610335 ccatatcaattggcaaa-cgaccaacattgataattcccaagacaaggtaacaatataaagtttgaaaactctcaaaacaatcttaatcaaccatgtagt 9610433  T
Q  337 catgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccaccc 436  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9610434 catgagcttaagccacttacaaactattaaacattagttcaaagaatagctcaagttcgtatgagaaaa-cccaagttcacatttt-cacattcccaccc 9610531  T
Q  437 gaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| ||  ||||||||    
T  9610532 gaaattcaagtttaacatgattaagatatttgaccaactttacaagtctcacctaagtc 9610590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 37 - 495
Target Start/End: Original strand, 9837710 - 9838162
Alignment:
Q  37 taatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattcc 136  Q
    |||||||| ||||| | || ||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| | |||||||||||| |||| |     
T  9837710 taatcaacttcaactacatcatatagtttcaccagtccaaatatttctcacattccaagtaa-gagaacatacaacatcatatgataaatatcatat-ca 9837807  T
Q  137 acgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagt 236  Q
    ||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  ||||||||| |||||||| ||| ||| ||| |    
T  9837808 acatataacaattcattcacacatcttcatttagtcatataaggctagtcaagaaagatc-ataagacaattggcttaaaagaatcatttccgataaaat 9837906  T
Q  237 tcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagt 336  Q
     | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    | |||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9837907 ccatatcaattggcaaa-cgaccaacattgataattcccaagacaaggtaacaatataaagtttgaaaactctcaaaacaatcttaatcaaacatgtagt 9838005  T
Q  337 catgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccaccc 436  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9838006 catgagcttaagccacttacaaactattaaacattagttcaaagaatagctcaagttcgtatgagaaaa-cccaagttcacatttt-cacattcccaccc 9838103  T
Q  437 gaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| ||  ||||||||    
T  9838104 gaaattcaagtttaacatgattaagatatttgaccaactttacaagtctcacctaagtc 9838162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 153 - 497
Target Start/End: Original strand, 33558711 - 33559053
Alignment:
Q  153 tcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaa-tcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggca 251  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  ||| |||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33558711 tcacatatcttcattcaatcatataaaactaatcacaatggatt-ataaggtaattggctttaaagaaatcgttttcgacaaagtctgtatcaagtggca 33558809  T
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    || || | |||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33558810 aa-cggctaacattgatagttt-caaaacaaagtaacttattcaagtttgaaaactcacaaatcaattttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 33558907  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||  || |  | |||||||||||||||||||||||    
T  33558908 cttacgaactatcaaacattagttcgaagattagcctgagttcgtatgagaaaaccccaagttcacaaatttcgtaatcccacccgaaaatcaagtttga 33559007  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33559008 tatgattaagatattaaaccaactttacaagttttgcctaagtcca 33559053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 40 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 9057935 - 9057486
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacg 139  Q
    ||||||||||| | || ||||||||  |||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||| |||| | ||     
T  9057935 tcaacatcaactacatcatatagtttcaccactccaattatttctcatattccaagtaa-gagaacatacaacatcttatgataagtatcatat-caaca 9057838  T
Q  140 cctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcg 239  Q
      ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| ||| ||| ||| | |     
T  9057837 tataacaattcattcacacattttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatc-ataagataattggcttaacagaatcatttccgataaaatcca 9057739  T
Q  240 tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcat 339  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||    | |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9057738 tatcaagtggcaaa-cggccaacattgataattcccaaaacaaggtaacaatataaagtttgaaaactctcaaa-caatcttaatcaatcatgtagtcat 9057641  T
Q  340 gagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaa 439  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||   ||||| |||||| ||||  ||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  9057640 gagcttaagccacttacaaactattaaacattagttcaaagaatagttcaagttcgtatgagaaaa--ccaagttaacatttcccatattcccacccgaa 9057543  T
Q  440 a-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    | ||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  9057542 atatcaagtttaacatgattaagatgtttgaccaacactacaagtcttgcctaagtc 9057486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 102 - 495
Target Start/End: Original strand, 14939743 - 14940130
Alignment:
Q  102 gaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataa 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||| | |||| | ||||||||||||||| | ||||||||  ||| |||| ||||||| ||||    
T  14939743 gaaaatacaacaccttatgataaatatcatattcaagacctcacaatt-actcacatatcttcattcaatcatataaaactaatcacaaaagatt-ataa 14939840  T
Q  202 ggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttga 301  Q
    |||| ||||||  |||| ||| |||| || ||||| |||||||||||| ||| || |||||||| ||||||  ||||| || |||||||| |||||||      
T  14939841 ggtatttggctc-aaaggatcatttt-gataaagtccgtatcaagtggtaaa-cggccaacattcataattcccaaaagaaagtaacttattcaagtttg 14939937  T
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||| ||||   |||| |||||| ||||||     
T  14939938 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtaatcatgagcttaagccatttacaaactattagatattagtccaaagtgtagcttaagttcgtatgag 14940037  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  14940038 aaaa-cccaagttcacattttccacattcccacccgaaattcaagtttaacatgattaagacattcaacccactttacaagtcttgtctaagtc 14940130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 102 - 495
Target Start/End: Original strand, 15367336 - 15367723
Alignment:
Q  102 gaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataa 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||| | |||| | ||||||||||||||| | ||||||||  ||| |||| ||||||| ||||    
T  15367336 gaaaatacaacaccttatgataaatatcatattcaagacctcacaatt-actcacatatcttcattcaatcatataaaactaatcacaaaagatt-ataa 15367433  T
Q  202 ggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttga 301  Q
    |||| ||||||  |||| ||| |||| || ||||| |||||||||||| ||| || |||||||| ||||||  ||||| || |||||||| |||||||      
T  15367434 ggtatttggctc-aaaggatcatttt-gataaagtccgtatcaagtggtaaa-cggccaacattcataattcccaaaagaaagtaacttattcaagtttg 15367530  T
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||| ||||   |||| |||||| ||||||     
T  15367531 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtaatcatgagcttaagccatttacaaactattagatattagtccaaagtgtagcttaagttcgtatgag 15367630  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  15367631 aaaa-cccaagttcacattttccacattcccacccgaaattcaagtttaacatgattaagacattcaacccactttacaagtcttgtctaagtc 15367723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 34 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 16921223 - 16920779
Alignment:
Q  34 cattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatat 133  Q
    ||||||||||| ||||| | || ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| ||||    
T  16921223 cattaatcaacttcaactacatcatatagtttcaccactctaaatacttctcatatttaaagtaa-gagaacatacaacatcttaagataaatatcatat 16921125  T
Q  134 tccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaa 233  Q
     | ||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||| ||  ||| ||    
T  16921124 -caacatagaacaattcattcacacatcttcatttagtcatataaggccagtcacgaaagatc-ataagataattggcttaaaagaatcattaccgataa 16921027  T
Q  234 agttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgt 333  Q
    | | | |||||||||||||| || |||||||||||||||  ||| ||||||||||    | |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16921026 aatccatatcaagtggcaaa-cggccaacattgataattcccaagacaaggtaacaatataaagtttgaaaactctcaaaacaatcttaatcaatcatgt 16920928  T
Q  334 agtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattccca 433  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16920927 agtcatgagcttaagccacttacaaactattaaacattagttcaaagaatagctcaagttcgtatgagaaaa-cccaagttcacattttccacattccca 16920829  T
Q  434 cccgaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaag 482  Q
    || |||| ||||||||| |||||| | | | |||  ||||||||||||||    
T  16920828 cctgaaatatcaagtttaacatgaattacatatttgaccaactttacaag 16920779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 185 - 497
Target Start/End: Original strand, 28389389 - 28389700
Alignment:
Q  185 tcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaagg 284  Q
    |||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  28389389 tcaccaaagatttacaagttaaacggctttaaagaatcattatcgataaagtccgtatcaagtggcaaaacggccaacattgataattttcaaagctagg 28389488  T
Q  285 taacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaatta 384  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  28389489 taacttattcaagttttaaaacctacaactacatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgagctattaagcattagttcaaagatta 28389588  T
Q  385 gcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaa-aatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagc 483  Q
    || |||||| || ||| |||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  28389589 gcttaagttcgtgtgagaaaacccaaagttcaca-tttccacattcccatccgaataatgaagtttgacatgattaagacattaaacc-actatacaagc 28389686  T
Q  484 cttgcctaagtcca 497  Q
    ||||||||||||||    
T  28389687 cttgcctaagtcca 28389700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 199 - 462
Target Start/End: Original strand, 31500272 - 31500534
Alignment:
Q  199 taaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagt 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  31500272 taaggtaattggccttaaagaatcattttcgacaaaattc-tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataatttccaaaataaggtaacttattcaagt 31500370  T
Q  299 tgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtat 398  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    || | |||||| ||||    
T  31500371 ttgaaaactcacaaatcaatcctaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacaagctattagacattagttcaaggtatatcttaagttcgtat 31500470  T
Q  399 gataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaaga 462  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  31500471 gagaaaacctcaagttcacattttccacattccaacccgaaattcaagtttaacatgattaaga 31500534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 112 - 493
Target Start/End: Original strand, 13350988 - 13351368
Alignment:
Q  112 caccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggc 211  Q
    ||||||||| |||| || |||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| |||| |||| || |||||||||| |||  |||    
T  13350988 caccttatggtaaacatcatattcaatacctaagaat-cattcacatatattcttttaatcatataaagctattcacaaatgatttataagttaaacggc 13351086  T
Q  212 tttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcaca 311  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||  |||    
T  13351087 tttaaagaatcatttccaacaaagtccgtatcaagtgacaaaacggtcaacattgataattttcaaagcaaggtaacttattcaagttttaaaacctaca 13351186  T
Q  312 aatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaa 411  Q
    | || ||||||||||||||| ||   |||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||| | |||    
T  13351187 attctatcttaatcaatcatatatgtatgagcataggccacttacgaactatcaatcattagttcaaagattagcctatgttcgtatgagaaaaccacaa 13351286  T
Q  412 gttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    ||| |||  ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||| |||||| || ||||||    
T  13351287 gtttacacattccagaatcccacccgaaaatcaaatttgacatgattaagaaattgtaccaacttcacaagcatttcctaag 13351368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 161 - 487
Target Start/End: Original strand, 11286197 - 11286520
Alignment:
Q  161 cttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgacca 260  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||| | | ||| |||||||||||| ||| |||||| | |||  || ||||| ||| |||||||||||  ||||||    
T  11286197 cttcacttagtcatataagaatagtcacaaca-attcataaggtaattgacttgaaagaaccatttctgataaagtccgtgtcaagtggcaac-cgacca 11286294  T
Q  261 acattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaac 360  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||    | |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11286295 acattgacaattcccaaaacaaggtaacaatataaagttcgaaaactctcaaaacaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacaaac 11286394  T
Q  361 tattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaa 460  Q
    ||||||||||||||||||| | || | |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  11286395 tattaaacattagttcaaagaataacttaagttcgtatgacaaaa-cccaagttcacattttccacaatcccactcaaaaatcaagtttgacatgtttaa 11286493  T
Q  461 gacattcaaccaactttacaagccttg 487  Q
    ||||||  |  ||| ||||||||||||    
T  11286494 gacattgtaataaccttacaagccttg 11286520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 85 - 405
Target Start/End: Original strand, 9643284 - 9643603
Alignment:
Q  85 cacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctag 184  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || || |||| | ||  |||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||| || | |      
T  9643284 cacattccaagtaaagatgaaatacaacaccttatgatgaacatcatatccaacatctaacaagtcactcacataacttcatttaatcatacaaagattt 9643383  T
Q  185 tcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaagg 284  Q
    |||| ||| ||||||||| |||  | |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  9643384 tcacaaaatatttataagttaaacgacttttaagaattattttcgacaaagtccgtatcaagtggcaaa-cgaccagcattgataattttcaaagcaaag 9643482  T
Q  285 taacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaatta 384  Q
    ||||||  |||||||   ||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9643483 taacttgttcaagtttcgaaacttaccattcaatcttaatcaatcgtgtagtcatgagcttaagccacttacgaactactaaacattagttcaaagatta 9643582  T
Q  385 gcctaagtttgtatgataaaa 405  Q
    ||||||||  |||||| ||||    
T  9643583 gcctaagtacgtatgagaaaa 9643603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 14276190 - 14275786
Alignment:
Q  85 cacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctag 184  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||| || ||||  ||| |||| ||||| ||||||||| ||| |||| |||||    
T  14276190 cacattccaagtaaagatgaaatacaacaccttatgataaacatcatattcaacacctatcaat-cattaacataacttcatttaatcaaataaagctag 14276092  T
Q  185 tcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaagg 284  Q
    |||| |||| || ||||| |||||| ||| || ||||  ||| ||| |||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||   ||||    
T  14276091 tcacaaaaggtt-ataagataattgacttaaaggaattatttccgataaaact-gtatcaagtggcaaa-cgaccaacattgataactctcaaggtaagg 14275995  T
Q  285 taacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaatta 384  Q
    ||||    | |||||  |||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||    
T  14275994 taacaatataaagtttgaaaacctacaaa-caatcttaatcaatcatgtaatcaagagcttaagccacttacaaactattagacattagttcaaagaata 14275896  T
Q  385 gcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagcc 484  Q
    |   ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| |  ||  |||||||||||||  |    
T  14275895 gatcaagttcgtatgataaaa-cccaagttaacattttccacattcccatccgaaattcacgtttaacatgattaatatgtttgaccaactttacaaatc 14275797  T
Q  485 ttgcctaagtc 495  Q
    || ||||||||    
T  14275796 ttacctaagtc 14275786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 258 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 34242309 - 34242073
Alignment:
Q  258 ccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacg 357  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||  |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  34242309 ccaacattgataatttctaaaataagacaacttattcaagtttgaaaactcataaatcaatcttaatcaatcatatagtcatgagcttaagccacttaca 34242210  T
Q  358 aactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgat 457  Q
    |||||||  ||||||||||||| | || |  || || |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34242209 aactattggacattagttcaaagaataactcaaattcgtatgagaaaa-cccaaattcacattttccacattcccacccgaaattcaag-ttgacatgat 34242112  T
Q  458 taagaca-ttcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  34242111 taagacattttaaccaacattacaagctttgcctaagtc 34242073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 252 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 13912096 - 13911855
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   |||||| || ||||    
T  13912096 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcataggcca 13911997  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| |||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911996 cttacgaactatcgatcattagttcaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatctcaagtttatacattccacattcccacccgaaaatcaagtttga 13911897  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||    
T  13911896 catgattaagacattgtaccaaccttacaagcattgcctaag 13911855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 252 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 15442648 - 15442407
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||    
T  15442648 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcttaggcca 15442549  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15442548 cttacgaactatcgatcattagttcaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttaaacattccacattcccacccgaaaatcaattttga 15442449  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||    
T  15442448 catgattaagacattgtacgaaccttacaagcattgcctaag 15442407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 252 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 30263213 - 30262972
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||    
T  30263213 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcttaggcca 30263114  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30263113 cttacgaactatcgatcattagttcaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttaaacattccacattcccacccgaaaatcaattttga 30263014  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||    
T  30263013 catgattaagacattgtacgaaccttacaagcattgcctaag 30262972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 252 - 493
Target Start/End: Original strand, 7292032 - 7292273
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   |||||| || ||||    
T  7292032 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcataggcca 7292131  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  ||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  7292132 cctacgaactatcaatcattagttcaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttatacattccacaatcccacccgaaaatcgattttga 7292231  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||    
T  7292232 catgattaagacattgtaccaaccttacaagcattgcctaag 7292273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 252 - 493
Target Start/End: Original strand, 11515408 - 11515648
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||| |||| ||  ||| |  |||| |||||||||||||||| | ||   |||||| || ||||    
T  11515408 aaacgaccaacattgataattt-caaagctaggcaacttattcaaatttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcgtataagtatgagcataggcca 11515506  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||| |||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11515507 cttacgaactatcgatcattagttcaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaagcccaagtttatacattccacattcccacccgaaaatcaagtttga 11515606  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||    
T  11515607 catgattaagacattgcaccaaccttacaagcattgcctaag 11515648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20584167 - 20583955
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacg 139  Q
    |||| |||||| | |||||||||||  | |||||||  || |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| || |||| | ||     
T  20584167 tcaatatcaactacataatatagtttcatcactccacgtatttctcatatttcaagtaa-gagaaaatacaacaccctatgataaacatcatatccaaca 20584069  T
Q  140 cctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcg 239  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||    
T  20584068 cttaacaattcattcacgtatcttcatttagtcatataaagctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaggaatcgtttttgacaaagaccg 20583969  T
Q  240 tatcaagtggcaaa 253  Q
    ||||||||| ||||    
T  20583968 tatcaagtgacaaa 20583955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 147 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 7285402 - 7285090
Alignment:
Q  147 attcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaag-aatcgttttcgacaaagttcgtatcaa 245  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||  |||| | || |||| || | |||  ||||||    |||||||    
T  7285402 attcattcacacatcttcacttagtcatataaggatagtcacgatagatc-ataagaaaatttggttcaaaggaaacatttctgacaaaaactgtatcaa 7285304  T
Q  246 gtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagctt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| | |||| |  |||||||||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7285303 gtggcaaa-cgaccaacattgataatttccaagacaaagcaactcaggcaagttgaagg-ctctcaaa-caatcttaatcaatcatgtagtcatgagctt 7285207  T
Q  346 aagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaa-atca 444  Q
    |||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  7285206 aagccactcataaactattagacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaa-ctcaatttcacgttttccacattaccacccgaaatatca 7285108  T
Q  445 agtttgacatgattaaga 462  Q
      ||||||||||||||||    
T  7285107 catttgacatgattaaga 7285090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 10862140 - 10861692
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacg 139  Q
    ||||||||||| || | |||||||| ||||| | ||| || ||||||||||| |||||| || || || ||||| || |||| |||||| |||||| |      
T  10862140 tcaacatcaactat-tcatatagttttaccatttcaagtatttctcacattctaagtaa-gataacatacaacatctcatgacaaatatcatattcaaaa 10862043  T
Q  140 cctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcg 239  Q
      |||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||| ||  || ||| | ||| ||||||    ||    
T  10862042 tataaccattcattcacacatcttcacttagtcatataaggatagtcacgatagatc-ataagataattgactcaaaggaa-catttccgacaagtaccg 10861945  T
Q  240 tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcat 339  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||  ||| |||| | ||| ||  ||||||| ||  | | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10861944 tatcaagtggcaaa-cggccaacattgataattcccaagacaaagcaacatagacaagttggaagcc-ctcaaa-caatcttaatcaatcatgtagtcat 10861848  T
Q  340 gagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaa 439  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | || |||||| |||||| |||| | |||| ||||| |||| | ||||||||||| ||||||||    
T  10861847 gagcttaagccacttacaaactattagacattagtccgaagattagcttaagttcgtataagaaaa-cccaaattcataatttccacattcgcacccgaa 10861749  T
Q  440 a-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    | ||||  ||||||| ||||||||  ||  |||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  10861748 atatcacatttgacaagattaagatgtttgaccaaccttacaagtcttacctaagtc 10861692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 302 - 495
Target Start/End: Original strand, 13376787 - 13376979
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||| | |||| |||||||    
T  13376787 aaaacttaccaaacaatcttaatcaatcatgtaatcaagagcttaagccacttacaaaccattaaacattagttcaaagaatagcttcagttcgtatgat 13376886  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||  ||  |||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  13376887 aaaa-cccaagttaacatttttcacattcccacccgaaattcacgtttaacattattaagatgtttgaccaacgttacaagtcttacctaagtc 13376979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 302 - 494
Target Start/End: Original strand, 13389034 - 13389225
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  13389034 aaaactcaccaaacaatcttaatcaatcatgtaattaagagcttaatccacttacaaactattaggcgttagttcaaagaatagcttaagttcgtatgat 13389133  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagt 494  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||  ||  |||||| ||||||| ||| |||||||    
T  13389134 aaaa-cccaagttaacatttttcacattcccacccaaaattcacgtttaacatgattaagatgtttgaccaacattacaagacttacctaagt 13389225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 252 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 32495538 - 32495385
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   |||||| ||| |||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  32495538 aaacggccaacattgataattttcaaagttaggtaaattattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggacttaagcca 32495439  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaa 405  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||   |||| |||||| |||||| ||||    
T  32495438 cttacaaactattagaaattagttcaaaggatagcttaagttcgtatgagaaaa 32495385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 340 - 495
Target Start/End: Original strand, 16918745 - 16918900
Alignment:
Q  340 gagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacatttt-ccacattcccacccga 438  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| ||| || |||||||| || || || || ||||||| ||||||||||||||||    
T  16918745 gagcttaagccacttacaaactattagacattagttcaaagaatagcttaacttcgtatgatagaa-cctaaattaacattttcccacattcccacccga 16918843  T
Q  439 aaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||   |||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16918844 aatctaagtttaacatgattaagatgtttgaccaactttacaagtcttacctaagtc 16918900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 238 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 49048895 - 49048641
Alignment:
Q  238 cgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtc 337  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||  |||  |||| ||  |||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  49048895 cgtatcaagtggcaaa-cggccaacattgataattcccaaggcaaaataacatagacaagtt-aaaagttctcaaa-caatcttaatcaatcatgtagtc 49048799  T
Q  338 atgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcac-attttccacattcccaccc 436  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| | |||| |||||| ||| |  |||| || || ||||| || |  |||||||||||||    
T  49048798 atgagcttaagccacttacggactattagacattagtctaaagaatagcttaagttcgtagg--aaaaacctaatttcacaatctatcacattcccaccc 49048701  T
Q  437 gaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||  ||  |||||  | ||||||||| ||||||||    
T  49048700 gaaatatcacttttgacatgattaagatgtttgaccaatctcacaagccttacctaagtc 49048641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 495
Target Start/End: Original strand, 13273814 - 13274068
Alignment:
Q  238 cgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtc 337  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||   ||  |||| ||  ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13273814 cgtatcaagtggcaaa-cggccaacattgataattcccaatgtaaaataacatagacaagttgaaag-ctctcaaa-caatcttaatcaatcatgtagtc 13273910  T
Q  338 atgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcac-attttccacattcccaccc 436  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||  ||| | |||| |||||| |||||  |||| ||||| ||||| || |  |||||||||||||    
T  13273911 atgaacttaagtcacttacggactattagacattagtctaaagaatagcttaagttcgtatg--aaaaacccaatttcacaatctatcacattcccaccc 13274008  T
Q  437 gaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| ||||  ||| ||||||||||||  ||  |||||  | ||||||||| ||||||||    
T  13274009 gaaatatcacttttaacatgattaagatgtttgaccaatctcacaagccttacctaagtc 13274068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 315 - 400
Target Start/End: Original strand, 15629914 - 15629999
Alignment:
Q  315 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatga 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||| ||| | |||| |||||| ||||||    
T  15629914 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttaaggactattggacattagtttaaagaatagcttaagttcgtatga 15629999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 175
Target Start/End: Original strand, 16382538 - 16382674
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatac-ttctcacattccaagtaaa-gagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattcca 137  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||| |||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |    
T  16382538 tcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccatatactttctcataatccaagtaaaggagaaaatacaacaccttataataaacatcatattcaa 16382637  T
Q  138 cgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcata 175  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||| || |||||    
T  16382638 cacctaacaa-tcattcacatatcttcatataatcata 16382674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 302 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 17224973 - 17224782
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| | | ||  |||| |||||||| ||||||||  ||||| ||| || | ||||  ||||| |||||||    
T  17224973 aaaattcacaaa-caatcttaatcaatcatgtaatgaagaatttaaaccacttacaaactattaggcattaattcgaagaatagctcaagttcgtatgat 17224875  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    | || |||||||| ||||||| || ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||| | ||||||    
T  17224874 agaa-cccaagttaacatttttcatatttccacccgaaatccaagtttaacatgattaagatgtttgaccaactttacaagtcttacgtaagtc 17224782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15761295 - 15761072
Alignment:
Q  183 agtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttc-aaaaca 281  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |  || ||| ||| | | |||||||||||||| || |||||| |||||| |  | ||||||    
T  15761295 agtcatgaaagatttataaggcaattggcttttaagaaccaattccgataaaatccatatcaagtggcaaa-cggccaacaatgataaatccccaaaaca 15761197  T
Q  282 aggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaa 381  Q
    | ||||| |  | || ||  |||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||      
T  15761196 aagtaacattatgaaatttgaaaactcaccgaacaatcttaatcaatcatatagtcaaggacttaagccacttaaaaactattagaaattagttcaaagg 15761097  T
Q  382 ttagcctaagtttgtatgataaaat 406  Q
     |||| |||||| |||||| |||||    
T  15761096 atagcttaagttcgtatgagaaaat 15761072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 405
Target Start/End: Original strand, 16417697 - 16417793
Alignment:
Q  309 acaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaa 405  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||   |||| |||||| |||||| ||||    
T  16417697 acaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggactcaagccacttacaaactattagacattagttcaaaggatagcttaagttcgtatgagaaaa 16417793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15952081 - 15951954
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | |||||  ||| |  |||| ||||| || ||||||||||||| || |  |||||||||    
T  15952081 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttatttaagtttgaaatcctacaattcaattttgatcaatcatgtagccaaggacttaagcca 15951982  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaa 379  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  15951981 cttacaaactattagaaattagttcaaa 15951954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18080852 - 18080699
Alignment:
Q  85 cacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctag 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| || || |||| | | |||||| || |||||||||||||||||  || |||||||| ||||     
T  18080852 cacattccaagtaaagagaaaatacaatacgttatgatgaacatcatatccaatgcctaacaa-tcattcacatatcttcacataatcatataaagctat 18080754  T
Q  185 tcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgt 240  Q
     ||| ||||||||   | ||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||    
T  18080753 ccacaaaagattttccaagtaattggtcttaaag-attattttcgacaaagttcgt 18080699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 21676140 - 21675998
Alignment:
Q  34 cattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactcca-aatacttctcacattccaagtaaa-gagaaaatgcaacaccttatgataaatattat 131  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |  | |||||||| | |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| || ||    
T  21676140 cattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccatacaatttctcacaattcaagtaaaggagaaaatacaacacattatgataaacatcat 21676041  T
Q  132 attccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcata 175  Q
    |||| || |||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21676040 attcaacacctataaa-gcattcacatatattcatatagtcata 21675998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 14252296 - 14252189
Alignment:
Q  238 cgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtc 337  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||| |||| | ||||||  |||||| |||  ||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14252296 cgtatcaagtggcaaa-cggccaacattgataattcccaagacaaagcaacttagacaagttcaaag-ctgtcaaa-caatcttaatcaatcatgtagtc 14252200  T
Q  338 atgagcttaag 348  Q
    ||||| |||||    
T  14252199 atgagtttaag 14252189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15979239 - 15979144
Alignment:
Q  81 ttctcacattccaagtaaag-agaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatat 176  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| ||| |||||| || |||||| || |||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||    
T  15979239 ttctcacaatccaagtaaagtagaaaatacatcacattaggataaacataatattcaacacctaaaaa-tcattcatatatcttcatataatcatat 15979144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 17985754 - 17985598
Alignment:
Q  258 ccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacg 357  Q
    |||||||||| | |||| ||| ||| ||||||||  |||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||  ||||| | ||  ||| ||       
T  17985754 ccaacattgacactttttaaagcaaagtaacttatccaagtttaaaaacctacaattcaatcttaatcaatcatataagcatgaacatagaccaattgta 17985655  T
Q  358 aactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagtt 414  Q
    || ||| || ||||||||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  17985654 aattatcaagcattagttccaagtttagcctaaatccgtatgataaaatcccaagtt 17985598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 278
Target Start/End: Original strand, 13463446 - 13463500
Alignment:
Q  224 ttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaa 278  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||    
T  13463446 ttttcgacaaagctcgtatcaagttgcaaaacgaataacattgacatttttcaaa 13463500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 133
Target Start/End: Original strand, 7291720 - 7291812
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatat 133  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| | |||||| || |||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||||| ||||    
T  7291720 tcaacatcaactatatcatatagtttcaccattccaaacaattctcatatcccaagt-aagagaacatacaacatcttatgacaaatatcatat 7291812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15952393 - 15952301
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatat 133  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| | |||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || |||| |||||| ||||    
T  15952393 tcaacatcaactatatcatatagtttcaccattccaaacaattctcatattccaagt-aagagaacatacaacatctcatgacaaatatcatat 15952301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39292898 - 39292823
Alignment:
Q  100 gagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatat 176  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||| || |||||| || |||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  39292898 gagagaatacaacacattatgataaacatcatattcaacacctagaaat-cattcacatatcttcatataatcatat 39292823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 59)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 37 - 497
Target Start/End: Original strand, 34965810 - 34966258
Alignment:
Q  37 taatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattcc 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||     
T  34965810 taatcaacatcaactatataatatagtcccaccactccaaacacttctcatattccaagtaaagagaaaataaaacaccttatgataaatatcatattca 34965909  T
Q  137 acgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagt 236  Q
    ||  |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34965910 acatctaacaattcatttacatatcttcatttaatcatataaagctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagt 34966009  T
Q  237 tcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttc-aaaacaaggtaacttactcaag-ttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgta 334  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||          
T  34966010 ccgtatcaagtggcaaaacggccaacattgataattttcaaaaaaaaggtaacttattcaagtttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaat------ 34966103  T
Q  335 gtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccac 434  Q
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  34966104 --------attaagccacttacgaactattaaacattagttcaaagattagcctaagttcgaatgagaaaatctcgagttcacattttccacattcccac 34966195  T
Q  435 ccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34966196 ccgaaaatcaagtttgacatgattaagacatttaaccaactttacaagtcttgcctaagtcca 34966258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 32 - 494
Target Start/End: Original strand, 19853073 - 19853532
Alignment:
Q  32 aacattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattat 131  Q
    ||||||| |||| |||||| | |||||||||||  | |||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  19853073 aacattattcaatatcaactacataatatagtttcatcactccaagtacttctcatatttcaagtaa-gagaaaatacaacaccctatgataaatatcat 19853171  T
Q  132 attccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgac 231  Q
    || | || | ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||    
T  19853172 atccaacacttaacaattcattcacacatcttcatttagtcttataaagcaagtcacgaaggatttataaggtaattggctttaagaaatggtttccgac 19853271  T
Q  232 aaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcat 331  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19853272 aaaatccgtatcaagtggcaaaacggccaacattgatacttttcaaaacaagg-aacttattcaagtttgaaaactaacaaatcaatcttaatcaatcat 19853370  T
Q  332 gtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcc 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19853371 gtagtcatgagcttaagccacttacaaactattaagcattagtccaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaa-cccaagttcacattttccacattcc 19853469  T
Q  432 cacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagt 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19853470 cacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattaagccaactttacaagccttgcctaagt 19853532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 40 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 29161623 - 29161168
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttct-cacattccaagtaaag-agaaaatgcaacaccttatgataaatattatattcca 137  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||| || |||||| |    
T  29161623 tcaacatcaactatatcatatagttcgacaactccatatactttttcacat-ccaagtaaaggagaaaatacttcacattatgataaacatcatattcaa 29161525  T
Q  138 cgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagtt 237  Q
    | | ||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||| | || ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  29161524 cacttaacaatt-actcacatatcttcatttagtcacataaagctatttacaaaagatt-ataaggtaattgattttaaagaatcgttttcgacaaagtc 29161427  T
Q  238 cgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtc 337  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||       
T  29161426 cgtatcaagtggcaaaacggccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttattcaagttttaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcacataagt 29161327  T
Q  338 atgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccg 437  Q
    |||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  29161326 atgagcataggccacttacgaactatcaagcattagttcaaaaattagtctcagttcgt-tgagaaaatcccaagttcacatattccacaatcccacccg 29161228  T
Q  438 aaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29161227 aaaatcaagtttgatatgattaagacattaaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 29161168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 149 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 11373928 - 11373580
Alignment:
Q  149 tcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtg 248  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||  ||||| |||     
T  11373928 tcattcacatatcttcattcaatcatataaagctattcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaaccatttttgacaaagtctgtatctagtt 11373829  T
Q  249 gcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaag 348  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11373828 gcaaaacggccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttattcaagtttggaaactcacaaatcaatcttaatatatcatgtagtcatgagcttaag 11373729  T
Q  349 ccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtt 448  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||  ||||||||||  ||||  | || |||||||||||||||||    
T  11373728 ccacttacgaactatcaaacattagttcaaagattaacctaagttcgtatgagaaaatttcaagttcacacattccgtaatctcacccgaaaatcaagtt 11373629  T
Q  449 tgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11373628 tgacatgattaagaccttgtaccaactttacaagccttgcctaagtcca 11373580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 40 - 495
Target Start/End: Original strand, 22847013 - 22847465
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacg 139  Q
    ||||||||||| | || ||||||||  ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||     
T  22847013 tcaacatcaactacatcatatagtttcaccactccaaatatttctcatattcaaagtaaagagaaaatacaacaacttatgataaatatcatatccaaca 22847112  T
Q  140 cctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcg 239  Q
      ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||| | ||  ||| ||| |       
T  22847113 tataacaattcattcaaacatcttcatttagtcatataagtttagtcacgaaagatc-ataagataattggcttaagagaaccattcccgataaaatcta 22847211  T
Q  240 tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcat 339  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||  |||||||||||||| || ||||| |  |||| |||||||  |||||||| |||||||||| |||     
T  22847212 tatcaagtggcaaa-cggccaacattaataattcccaaaacaaggtaacatattcaaggttgaaaattcacaaaataatcttaaacaatcatgtaatcaa 22847310  T
Q  340 gagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaa 439  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22847311 gagcttaagccacttacaaactattagacattagttcaaattatagcttaagttcgtatgagaaaa-cccaagttcacattttccacattcccacccaaa 22847409  T
Q  440 aatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22847410 aatcaagtttgacatgattaagacattaagccaactttacaagtcttgcctaagtc 22847465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 81 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22463360 - 22462944
Alignment:
Q  81 ttctcacattccaagtaaaga--gaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataa 178  Q
    |||||||| |||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| || |||||| |  ||| | |||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  22463360 ttctcacaatccaagtaaaggaggaaaatacaacaccttatgataaacatcatattcaagacctcacaatt-actcacatatcttcattcaatcatataa 22463262  T
Q  179 ggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaa 278  Q
     |||| |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22463261 agctattcacaaaagatttataagttaaacggatttaaagaatcattttcgacaaagtccgtatcaagtggcaaa-cgaccaacattaataattttcaaa 22463163  T
Q  279 acaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaa 378  Q
     ||| |||||||  |||||||   ||||  || | ||||| |||||||||||||||   |||| | || | |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22463162 gcaaagtaacttgttcaagtttcgaaacctaccattcaattttaatcaatcatgtaagtatgatcataggacacttatgaactatcaaacattagttcaa 22463063  T
Q  379 aaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaacttta 478  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| || |||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22463062 agattagcctaagtttgtatgagaaaacccaaagtccacttattccacattcccacccgaaaattaagtttgacatgattaagacattaaaccaacttta 22462963  T
Q  479 caagccttgcctaagtcca 497  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22462962 caagccttgcctaagtcca 22462944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 153 - 497
Target Start/End: Original strand, 32351097 - 32351439
Alignment:
Q  153 tcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaa-tcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggca 251  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  ||| |||| |  |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  32351097 tcacatatcttcattcaatcatataaaactaatcacaatggatt-ataaggtaattggcttaaaataaatcgttttcgacaaagtccgtatcaagcggca 32351195  T
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
     | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||   | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32351196 ga-cgaccaacattgatagttt-caaaacaaggtaacttattcaagtttggagactcacaagtcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttgagcca 32351293  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  32351294 cttacgaactatcaaacattagttcgaagattagcctaagttcgtatgagaaaaccccaagttcacatattccctaatcccacccgaaaatcaagtttga 32351393  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32351394 tatgattaagacattaaaccaactttacaagccttgcttaagtcca 32351439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 185 - 497
Target Start/End: Original strand, 19671423 - 19671734
Alignment:
Q  185 tcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaagg 284  Q
    |||| ||||||||| ||| |||  | |||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||    
T  19671423 tcaccaaagatttacaagttaaacgactttaaagaatcattatcaacaaagtccgtatcaagtggcaaaatggccaacattgataattttcaaagctagg 19671522  T
Q  285 taacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaatta 384  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19671523 taacttattcaagttttaaaacctacaactccatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaagatta 19671622  T
Q  385 gcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccg-aaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagc 483  Q
    || |||||| ||  || |||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  19671623 gcttaagttcgtgagaaaaaacccaaagttcaca-tttccacattcccacccgaaaaatgaagtttgacatgattaagacattaaacc-actatacaagc 19671720  T
Q  484 cttgcctaagtcca 497  Q
    ||||||||||||||    
T  19671721 cttgcctaagtcca 19671734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 85 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 17014913 - 17014500
Alignment:
Q  85 cacattccaagtaaagagaaaatgcaacac-cttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggcta 183  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| |  |||||||| || || |||| | || | ||| || ||| ||||||| |||||||||  |||| || ||||    
T  17014913 cacattccaagtaaagatgaaatacaataatcttatgatgaacatcatatccaacacttaacaagtcactcacataacttcatttaaccatacaaagcta 17014814  T
Q  184 gtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaag 283  Q
     |||| | ||||||| ||| |||  || ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  17014813 ttcaccacagatttacaagttaaacgggtttaaagaatcattatcgacaaagtctgtatcaagtggcaaaacggccaacattgataattttcaaagctag 17014714  T
Q  284 gtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaatt 383  Q
    |||||||| |||||||  ||| |  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  17014713 gtaacttattcaagttttaaaccctacaattccatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacctacgaacttttaaacattagttcaaagatt 17014614  T
Q  384 agcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccg-aaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaag 482  Q
    ||| |||||| || ||| |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  17014613 agcttaagttcgtctgagaaaacccacagttcacatattccacattcccacccgaaaaatgaagtttgatatgattaagacattaaacc-actatacaag 17014515  T
Q  483 ccttgcctaagtcca 497  Q
    |||||||||||||||    
T  17014514 ccttgcctaagtcca 17014500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22594564 - 22594150
Alignment:
Q  85 cacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctag 184  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || || |||| | || ||||| || ||| ||| |||||||||| || ||||||||  |||     
T  22594564 cacattccaagtaaagaggaaatacaacaccttatgatgaacatcatatccaacacctaacaagtcactcaaatatcttcatataatcatataaatctat 22594465  T
Q  185 tcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatc--aagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaa 282  Q
    |||  |||||||||||| | ||| |||||||||||| | |||| ||||| || ||||||  |  ||  |||||| |||||||||||| |||||||| ||     
T  22594464 tcataaaagatttataaagcaatcggctttaaagaaccatttttgacaacgtccgtatcgcatttgaaaaaacggccaacattgatacttttcaaagcac 22594365  T
Q  283 ggtaacttactcaagt-tgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaa 381  Q
     ||||||||  ||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||   |||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  22594364 agtaacttatccaagtatgaaaacct-acaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcataggccacttacgaactatcaatcattagttcaaaga 22594266  T
Q  382 ttagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaa 481  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||| ||    
T  22594265 ttagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagttcacatattccacaatcccactcgaaaatcaagtttgacatgattaagacatcgtaccaaccttaaaa 22594166  T
Q  482 gccttgcctaagtcca 497  Q
    |||||| |||||||||    
T  22594165 gccttgtctaagtcca 22594150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 153 - 497
Target Start/End: Original strand, 14449432 - 14449778
Alignment:
Q  153 tcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaa 252  Q
    ||||||| |||||||||  |||| || |||| |||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||| || ||  |||| |  ||||||||||||||    
T  14449432 tcacataacttcatttaaccatacaaagctattcaccaaagatttacaagttaaacggctttaaagaatcattatcagcaaactctgtatcaagtggcaa 14449531  T
Q  253 aacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttga--aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcc 350  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||||| |||||||    |||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14449532 aacggccaacatagatagttttcaaagctaggtaacttattcaagttttttaaaacctacaattccatcttaatcaagcatgtagtcatgagcttaagcc 14449631  T
Q  351 acttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccg-aaaatcaagttt 449  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||| || |||||||||| || |||||||||| ||| |||||  |||||    
T  14449632 acttacgaactactaaacattagttcaaaggttagcttaagttcgtatgagaaaacccaaagttcacatatttcacattcccatccgaaaaatgcagttt 14449731  T
Q  450 gacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14449732 gacatgattaagacatttaacc-actatacaagccttgcctaagtcca 14449778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 216 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 18630751 - 18630481
Alignment:
Q  216 aagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatc 315  Q
    |||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  |||||| || ||||  |||||||| |||||    
T  18630751 aagaattgttttcgacaaaatccgtaccaagtggcaaaacggccaacattgataatttccaaaataagacaacttattcgagtttgaaaactcagaaatc 18630652  T
Q  316 aatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||| || ||||||    
T  18630651 aatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacaaactattagacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaa-ccaaagttc 18630553  T
Q  416 acattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||    
T  18630552 acatttt--------ccacccgaaattcaagtttgacatgattaagacatttaatcaacattacaagccttacctaagtc 18630481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 203 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 33539531 - 33539239
Alignment:
Q  203 gtaattggctttaaagaatcgttttcgacaa-agttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttga 301  Q
    |||||||||  | |||||| ||||||||||| | | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||  |||||| |||||||      
T  33539531 gtaattggcccttaagaattgttttcgacaagaatccgtaccaagtggcaaaacggccaacattgataatttctaaaataagacaacttattcaagtttg 33539432  T
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||  ||| |     
T  33539431 aaaactcataaatcaatactaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccatttacaaactattggacattagttcaaagaatagcttaagttcatattag 33539332  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagaca-ttcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33539331 aaaa-cccaaattcacattttccacattcccactcgaaattcaag-ttgatatgattaagacattttaaccaacattacaagccttgcctaagtc 33539239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 149 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 18382875 - 18382531
Alignment:
Q  149 tcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaa-ttggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagt 247  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| | | ||| ||| || ||||| |||||||||||   ||||||||||    
T  18382875 tcattcacacatcttcatttagtcatatacggctagtcacgaaaggtc-ataagattagttgacttaaaggaatcattttcgacaaaac-cgtatcaagt 18382778  T
Q  248 ggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttg-aaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagctta 346  Q
    |||||| || ||||||||||||| | |||||  ||||||||    | |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  18382777 ggcaaa-cggccaacattgataactctcaaagtaaggtaacaatataaagttttaaaaactcaccaaacaatcttaatcaatcatgtaatcgagagctta 18382679  T
Q  347 agccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaag 446  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||||   || | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  18382678 agccacttacaaactgttagacattagttcaaagcataacttaagttcgtatgataaaa-cccaagttaacattttccacattcccacccgaaattcacg 18382580  T
Q  447 tttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||| ||||||||||||  ||  |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  18382579 tttaacatgattaagatgtttgaccaatattacaagccttacctaagtc 18382531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 258 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 35016765 - 35016528
Alignment:
Q  258 ccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacg 357  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   | |||| || ||||||||||    
T  35016765 ccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagaacgagcataggccacttacg 35016666  T
Q  358 aactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgat 457  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35016665 aactatcaatcattagttcaaagattagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttatacattccacaatcccacccgaaaatcaagtctgacatgat 35016566  T
Q  458 taagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||||||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  35016565 taagacattgtactaaccttacaagccttgtctaagtc 35016528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 153 - 495
Target Start/End: Original strand, 25918660 - 25919000
Alignment:
Q  153 tcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttc-gacaaagttcgtatcaagtggca 251  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||| || |||||   |||||||  | ||| || ||| | | | ||||||| ||    
T  25918660 tcacatatcttcatttagtcacataaggctagtcaagaaagatct-taagatagttggccagaaagaattatcttccgataaaatccatgtcaagtgaca 25918758  T
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    || ||  ||||||||||||||| |||  |||  |||  || |||||||   |||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25918759 aa-cggtcaacattgataatttccaagtcaaaataatctattcaagtttcgaaacccacaagataatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 25918857  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||| | |||| |||||  |||| | |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25918858 cttacaaactattggacattagttcaaagaatagcttaagtccgtataagaaaa-cccaagttcacacttttcgcattcccacccgaaattcaagtttga 25918956  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  25918957 catgattaagacaattaaccaacattacaagccttgtctaagtc 25919000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 147 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 18824741 - 18824396
Alignment:
Q  147 attcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaag 246  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||  |||||| |  || ||| | ||| |||||||   |||||||||    
T  18824741 attcattcacacatcttcacttagtcatataaggatagtcacaatagatt-ataagaaaattggttcaaaggaaacatttccgacaaaaaccgtatcaag 18824643  T
Q  247 tggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagctta 346  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||  || ||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18824642 tggcaaa-cgaccaacattgataatttccaagacaaagcaacttagacatgtt-aaaagctctcaaa-caatcttaatcaatcatgtagtcttgagctta 18824546  T
Q  347 agccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcac-attttccacattcccacccgaaa-atca 444  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||| ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||    
T  18824545 agccatttacaaactattagacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaa-cccaatttcacaatctttcacattcccacccaaaatatca 18824447  T
Q  445 agtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
      ||||||||||||||||  ||  ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  18824446 tttttgacatgattaagatgtttgaccaaccatacaagtcttacctaagtc 18824396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 252 - 490
Target Start/End: Original strand, 23152334 - 23152572
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| ||| | ||  |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   |||||| || ||||    
T  23152334 aaacggccatcattgattatttttaaagctagtcaacttattcaagttttaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcataggcca 23152433  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23152434 cttacgaactatcaatcattagttcaaagattagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttatacatttcacattcccacccgaaaatcaagtttga 23152533  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcct 490  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  23152534 catgattaagacattgtaccaactttacacgcattgcct 23152572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 147 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 18840596 - 18840251
Alignment:
Q  147 attcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaat-cgttttcgacaaagttcgtatcaa 245  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||  |||| | || ||||||  | |||||||||||   ||||||||    
T  18840596 attcattcacacatcttcacttagtcatataaggatagtcacgatagatt-ataagaaaattag-ttcaaagaaaacattttcgacaaaaaccgtatcaa 18840499  T
Q  246 gtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagctt 345  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||  || ||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18840498 gtggcaaa-cgaccaacattgataaattccaagacaaagcaacttagacatgtt-aaaagctctcaaa-caatcttaatcaatcatgtagtcatgagctt 18840402  T
Q  346 aagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcac-attttccacattcccacccgaaa-atc 443  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | || | ||||||  ||||| |||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  18840401 aagccatttacaaactattagacattagttcaaagaataacttaagttcttatgagaaaa-cccaatttcacaatctttcacattcccacccgaaatatc 18840303  T
Q  444 aagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |  ||||||||||||||||  ||  ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  18840302 atttttgacatgattaagatgtttgaccaaccatacaagtcttacctaagtc 18840251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 326 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 17084403 - 17084235
Alignment:
Q  326 aatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttcca 425  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||| | ||||| || ||||||||    
T  17084403 aatcatgaagtcatgagcttaagccacttacaaactattagatattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaa-ctcaagtgcatattttcca 17084305  T
Q  426 cattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  17084304 cattcccacccgaaattcaagtttgacatgattaagacaattaaccaacattacaagtcttgcctaagtc 17084235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 147 - 495
Target Start/End: Original strand, 18582258 - 18582602
Alignment:
Q  147 attcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaag 246  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||  |||||| |  |||||| | ||| |||||||   | |||||||    
T  18582258 attcattcacacatcttcacttagtcatataaggatagtcacgatagatc-ataagaaaattggttcaaaagaaacttttccgacaaaaaccatatcaag 18582356  T
Q  247 tggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagctta 346  Q
    ||||||| || |||||||||||||||  ||| |||| | ||||||  ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18582357 tggcaaa-cggccaacattgataattcccaagacaaagcaacttagacaagttgaaag-ctctcaaa-caatcttaatcaatcttgtagtcatgagctta 18582453  T
Q  347 agccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcac-attttccacattcccacccgaaa-atca 444  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||    |||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||    
T  18582454 agccacttacaaattattagacattagttcaaagaatagcttaagttcgta--ccaaaaacccaatttcacaatctttcacattcccacccgaaatatca 18582551  T
Q  445 agtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
      ||||||||||||||||| ||  ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  18582552 cttttgacatgattaagacgtttgaccaaccatacaagtcttacctaagtc 18582602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 302 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 16888781 - 16888588
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||     
T  16888781 aaaactcctaaaacaatcttaatcaatcatgtagtcaataacttaagccacttacaaactattagacattagttcaaagattagcttaagtctgtatgag 16888682  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagac-attcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||| |||||||    
T  16888681 aaaa-cccaagatcacattttccaccttcccacccgaaatccaagtttaacatgattaagacaatttaactaacattacaggccttgtctaagtc 16888588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 203 - 495
Target Start/End: Original strand, 29604553 - 29604844
Alignment:
Q  203 gtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaa-cattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttga 301  Q
    ||||||||  |||||||||  ||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||  ||||  | | ||||||| |||||||      
T  29604553 gtaattggtcttaaagaattattttcgacaatatacgtatcaagtgacaaaacggccaatctttgaaaattcccaaatga-gataacttattcaagtttg 29604651  T
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||   |||| |||||| ||||||     
T  29604652 aaaactcgcaaataaatcttaatcaatcatgtaatcatgagcttaagtcacttacaaactattagatattagttcaaagtatagcttaagttcgtatgag 29604751  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||  ||  ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  29604752 aaaa-cccaagtttacatttttcacattctcatccgaaattcaagtttaacatgattaagatgtttgaccaattttacaagtcttgtctaagtc 29604844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 147 - 495
Target Start/End: Original strand, 4989975 - 4990320
Alignment:
Q  147 attcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaag 246  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||  |||||| |  || ||| | ||| |||||||   |||||||||    
T  4989975 attcattcaaacatcttcacttagtcatataaggatagtcacgatagatt-ataagaaaattggttcaaaggaaacatttccgacaaaaaccgtatcaag 4990073  T
Q  247 tggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagctta 346  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  ||| |||| | ||||||  ||| ||||||  ||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4990074 tggcaaaagg-ccaacattgataattcccaagacaaagcaacttagacaaattgaaag-ctctcaaaa-aatcttaatcaataatgtagtcatgagctta 4990170  T
Q  347 agccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcac-attttccacattcccacccgaaa-atca 444  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||| | || | |||||| |||||| |||| ||||| ||||| || || |||||||||| |||||| ||||    
T  4990171 agccacttacaaactattagacatcagttcaaagaataacttaagttcgtatgagaaaa-cccaatttcacaatctttcacattcccatccgaaatatca 4990269  T
Q  445 agtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
      ||||||||||||||||  ||  ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  4990270 tttttgacatgattaagatgtttgaccaaccatacaagtcttacctaagtc 4990320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 302 - 495
Target Start/End: Original strand, 21622270 - 21622461
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||| | |||| |||||| | |||||    
T  21622270 aaaactcaccaaacaatcttaatcaatcatgtaatcaagagcttaagatgcttacaaaatattaaacattagttcaaagactagcttaagttcgaatgat 21622369  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  ||  |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21622370 aaaa-cccaagttaacatttt-cacattcccacccgaaattcacgtttaacatgattaagatgtttgaccaacattacaagccttacctaagtc 21622461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 316 - 495
Target Start/End: Original strand, 33323914 - 33324092
Alignment:
Q  316 aatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttc 415  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||   |||| |||||  |||||| |||| ||||| ||     
T  33323914 aatcctaatcaatcatgtaatcataagcttaagccacttacaaactattagacattggttcaaagtatagcttaagtccgtatgagaaaa-cccaaattt 33324012  T
Q  416 acattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  33324013 acatttttcacatttccacccgaaatccaagtttgacatgattaagacaatcaaccaacattacaagctttgtctaagtc 33324092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 321 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 35137012 - 35136839
Alignment:
Q  321 taatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacatt 420  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   |||| |||||  || ||| |||| ||||| || |||||    
T  35137012 taatcaatcatgtaatcataagcttaagccacttacaaactattagacattagttcaaagtatagcttaagtccgtgtgagaaaa-cccaaatttacatt 35136914  T
Q  421 ttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  35136913 tttcacatttccacccgaaatccaagtttgacatgattaagacaatcaaccaacattacaagctttgtctaagtc 35136839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 251 - 497
Target Start/End: Original strand, 26506127 - 26506361
Alignment:
Q  251 aaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcc 350  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||| | | ||||||||  ||||||  |||||  |||| |||||||||||||||||| ||   |||||| || ||     
T  26506127 aaaacggccaacattgacacttttcaaagccaagtaacttatccaagtttgaaaacctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcataggct 26506226  T
Q  351 acttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttg 450  Q
    ||||||||||||| ||||||||            ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26506227 acttacgaactatcaaacatta------------gcctaagttcgtatgagaaaatctcaagttcacatattccacaatcccacccgaaaatcaagtttg 26506314  T
Q  451 acatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26506315 acaagattaaaacattgtaccaactttacaaactttgcctaagtcca 26506361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 141 - 240
Target Start/End: Original strand, 25650116 - 25650214
Alignment:
Q  141 ctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgt 240  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25650116 ctaacaattcattcacacatcttcatttagtcatataaggctattcacaaaagattaa-aaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgt 25650214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 238 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 25368447 - 25368197
Alignment:
Q  238 cgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtc 337  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | | ||  |||||||| |  ||| || | |||||||||||||| ||||||||    
T  25368447 cgtatcaagtggcaaa-cggccaacattgataattttcaagacaaagcagcatagacaagttgatag-ctctcaga-caatcttaatcaattatgtagtc 25368351  T
Q  338 atgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcac-attttccacattcccaccc 436  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| | |||| |||||| |||||| |||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  25368350 atgagcttaagccaattacggactattagacattagtccaaagaatagcttaagttcgtatgagaaa--cccaatttcacaatttttcacattcccaccc 25368253  T
Q  437 gaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgccta 491  Q
    |||| | ||  ||||||||||||||||  ||   ||||| ||||||||||| ||||    
T  25368252 gaaataccacttttgacatgattaagatgtttggccaaccttacaagccttaccta 25368197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 315 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 28195802 - 28195622
Alignment:
Q  315 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagtt 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| | |||| | |||| |||||| |||||  |||| | ||| ||    
T  28195802 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacggaatattagacattaatccaaagaatagcttaagttcgtatg--aaaaactcaattt 28195705  T
Q  415 cac-attttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  |||||||||  | ||||||||| ||||||||    
T  28195704 cacaatctttcacattcccacccgaaatatcatttttgacatgattaagatgttcaaccaatctcacaagccttacctaagtc 28195622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 196 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15006004 - 15005869
Alignment:
Q  196 ttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactca 295  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| | |||||||||| ||     
T  15006004 ttataaggtaaacgactttaaagaatcacttacgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacggtcagcattgataattttcaaagctaggtaacttattcg 15005905  T
Q  296 agttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcat 331  Q
    | ||  |||||| |||| || |||||||||||||||    
T  15005904 aatttcaaaacttacaattccatcttaatcaatcat 15005869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 251 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 16826857 - 16826703
Alignment:
Q  251 aaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcc 350  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||  || | || ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  16826857 aaaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaagtcttataattcaatcttaatcaatcatgtagtcaagtacttaagcc 16826758  T
Q  351 acttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaa 405  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||   |||| |||||| |||||| ||||    
T  16826757 acttgcaaactattaaaaattagttcaaaggatagcttaagttcgtatgagaaaa 16826703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 252 - 405
Target Start/End: Original strand, 25904096 - 25904249
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||| |||| ||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  25904096 aaacggccaacattgataattttcaaacttaggtaacttattcaaatttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggacttaagcca 25904195  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaa 405  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||   |||| |||||| |||||| ||||    
T  25904196 cttacaaactattagaaattagttcaaaggatagcttaagttcgtatgagaaaa 25904249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 146 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22363390 - 22363174
Alignment:
Q  146 aattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaa 245  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||||  |||||  ||| || ||||| ||| |||||||   ||||||||    
T  22363390 aattcattcatacatcttcatttagtcatatgaagctagtcacaaaagatc-ataatataattaacttaaaggaatcatttccgacaaaac-cgtatcaa 22363293  T
Q  246 gtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagctt 345  Q
    |||||||| || ||||||| ||||| | |||||  ||||||||    | |||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22363292 gtggcaaa-cggccaacatcgataactctcaaagtaaggtaacaatataaagtttgaaaactcacaaaacaatattaatcaatcatgtaatcaagagctt 22363194  T
Q  346 aagccacttacgaactatta 365  Q
    ||||||| ||| ||||||||    
T  22363193 aagccacctacaaactatta 22363174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 389 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 12310669 - 12310576
Alignment:
Q  389 aagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaag 482  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  12310669 aagttcgtatgagaaaa-cccaagttcacattttccacattcccacccgaaatatcaagtttaacatgattaagatatttgaccaactttacaag 12310576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 232 - 495
Target Start/End: Original strand, 18397984 - 18398242
Alignment:
Q  232 aaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcat 331  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||  ||| ||  ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  18397984 aaagttcgtgtcaagtggcaaa-cggccaacattgacaattcccaaaacaagc-aacatagacaagttgaaag-ctctcaaa-caatcttaatcaatcat 18398079  T
Q  332 gtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcaca-ttttccacattc 430  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  | ||||||| |||||||| |||| | ||   |||||| |||||| |||  ||||| || | | ||||||||||||    
T  18398080 gtagtcatgaacttaaaccacttgtggactattagacattagtccaaagaataatttaagttcgtatgagaaa--cccaaattaatatttttccacattc 18398177  T
Q  431 ccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||||||||   |||||| ||||||||||||  ||  |||||| ||||||  ||| ||||||||    
T  18398178 ccacccgaaatctaagtttaacatgattaagatgtttgaccaacgttacaaatcttacctaagtc 18398242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 400
Target Start/End: Original strand, 19628505 - 19628653
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  19628505 aaacgaccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaaatttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggacttaagcca 19628604  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatga 400  Q
    ||| | |||||||| |  ||||||||||   |||| |||||| ||||||    
T  19628605 cttgcaaactattagaagttagttcaaaggatagcttaagttcgtatga 19628653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 341 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 15080701 - 15080548
Alignment:
Q  341 agcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaa 440  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||   ||||  ||||  || ||| |||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  15080701 agctcaagccacttacaaactgttagacattagttcaaagtatagctcaagtccgtgtgagaaaa-cccaagtttacatgtttcacattcccacccgaaa 15080603  T
Q  441 atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
      |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  15080602 tccaagtttgacatgattaagaaaaacaaccaacattataagctttgcctaagtc 15080548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 424 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 15005805 - 15005732
Alignment:
Q  424 cacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| | |||||||||||||    
T  15005805 cacaatcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattgtaccaacttcacaaccattgcctaagtcca 15005732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 31468676 - 31468561
Alignment:
Q  216 aagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatc 315  Q
    ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||  |||||||  |||||  |||| ||    
T  31468676 aagaatcattatcgacaaagtccatatcaagtggcaaaacggccaacattgataattttcaaagctaagtaacttgttcaagtttgaaaacctacaactc 31468577  T
Q  316 aatcttaatcaatcat 331  Q
     |||||||| ||||||    
T  31468576 gatcttaattaatcat 31468561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 33315557 - 33315438
Alignment:
Q  260 aacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaa 359  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||| | |||||  ||| |  |||| |||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||    
T  33315557 aacattgataatttttaaagctaggtaacttatttaagtttgaaatcctacaattcaaccttaatcaatcatgtagtcaaggacttaagccacttacaaa 33315458  T
Q  360 ctattaaacattagttcaaa 379  Q
    |||||| | |||||||||||    
T  33315457 ctattagaaattagttcaaa 33315438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 406
Target Start/End: Original strand, 1555080 - 1555303
Alignment:
Q  183 agtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttc-aaaaca 281  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |  || ||| ||| | | |||||||||||||| || |||||| |||||| |  | ||||||    
T  1555080 agtcatgaaagatttataaggcaattggcttttaagaaccaattccgataaaatccatatcaagtggcaaa-cggccaacaatgataaatccccaaaaca 1555178  T
Q  282 aggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaa 381  Q
    | ||||| |  | || ||  |||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||      
T  1555179 aagtaacattatgaaatttgaaaactcaccgaacaatcttaatcaatcatatagtcaaggacttaagccacttaaaaactattagaaattagttcaaagg 1555278  T
Q  382 ttagcctaagtttgtatgataaaat 406  Q
     |||| |||||| |||||| |||||    
T  1555279 atagcttaagttcgtatgagaaaat 1555303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 224 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 19122745 - 19122569
Alignment:
Q  224 ttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacga-ccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatctta 322  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||  | |||||||||| | ||||||||||||  |||||||  ||||||  |||||  |||||||||||| |    
T  19122745 ttttcgacaaagtccatatcaagttgcaaaaacatccaacattgacatttttcaaaacaaaataacttatccaagtttgaaaacatacaaatcaatctca 19122646  T
Q  323 atcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatg 399  Q
    | || |||| |   ||||| | || ||||||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||    
T  19122645 accattcatatgagcatgaacgtaggccacttacaaactattaagcattagatcatagattagcctaagttcgtatg 19122569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 419 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 22363148 - 22363072
Alignment:
Q  419 ttttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22363148 ttttccacattcccacccgaaattcaagtttaacatgattaagatgtttgaccaactttacaagtcttacctaagtc 22363072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 379
Target Start/End: Original strand, 25174734 - 25174861
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||| | ||  |||||| | |||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  25174734 aaacggccaacattgacaatttttaaagctagacaacttatttaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggacttaagcca 25174833  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaa 379  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  25174834 cttacaaactattagaaattagttcaaa 25174861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27655084 - 27654957
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||| | ||  |||||| | |||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  27655084 aaacggccaacattgacaatttttaaagctagacaacttatttaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggacttaagcca 27654985  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaa 379  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  27654984 cttacaaactattagaaattagttcaaa 27654957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 440
Target Start/End: Original strand, 15739250 - 15739450
Alignment:
Q  238 cgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtc 337  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||| ||| | | ||| ||   |||||||||| ||| ||||  |||| |||||||||||||||||    
T  15739250 cgtatcaagtggcaaa-cggccaacattgacaattctcacaacgaagcaacatagaaaagttgaaaa-ctctcaaacaaatcctaatcaatcatgtagtc 15739347  T
Q  338 atgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccg 437  Q
    |||| |||||| |||||  | |||||||  | ||||| |||| | || | |||||||||| || |||| |  || || ||||||| ||||||||||||||    
T  15739348 atgaacttaagtcacttgtggactattaggcgttagtccaaagaataacttaagtttgtacgagaaaacctaaaatttacatttttcacattcccacccg 15739447  T
Q  438 aaa 440  Q
    |||    
T  15739448 aaa 15739450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 166
Target Start/End: Original strand, 23220685 - 23220817
Alignment:
Q  34 cattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaa-gagaaaatgcaacaccttatgataaatattata 132  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||  |  | |||||||| | |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| || |||    
T  23220685 cattaatcaacatcaactatatcatatagttcaacaactcatataatttctcacaattcaagtaaaggagaaaatgaaacacattatgataaacatcata 23220784  T
Q  133 ttccacgcctaaaaattcattcacatatcttcat 166  Q
    ||  || |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23220785 ttaaacacctagaaa-tcattcacatatcttcat 23220817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 463
Target Start/End: Original strand, 22867219 - 22867440
Alignment:
Q  238 cgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtc 337  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||   ||| ||  ||||||||||   || |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  22867219 cgtatcaagtggcaaa-cgaccaacattgataattcccaagacaaaacaacatagacaagttgaaagt-tctcaaa-caaccttaatcaatcatatagtc 22867315  T
Q  338 atgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcac-attttccacattcccaccc 436  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||| |||||| | ||| || || | |||||| ||| |  |||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  22867316 atgagcttaagccacctccggactattagacattaatccaagaa-taacttaagttcgtacg--aaaaacccaatttcacaatctttcacattcccaccc 22867412  T
Q  437 gaaa-atcaagtttgacatgattaagac 463  Q
    |||| ||||  ||||| |||||||||||    
T  22867413 gaaatatcacttttgaaatgattaagac 22867440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 14627581 - 14627474
Alignment:
Q  258 ccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacg 357  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  |||||| |||| ||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||     
T  14627581 ccaacattgataattttcaaagctagacaacttattcaaatttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggacataagccacttaca 14627482  T
Q  358 aactatta 365  Q
    ||||||||    
T  14627481 aactatta 14627474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 17084540 - 17084406
Alignment:
Q  34 cattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactcca-aatacttctcacattccaagtaaa-gagaaaatgcaacaccttatgataaatattat 131  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||| || |||||| |  | |||||||| | |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| || ||    
T  17084540 cattaatcaacataaactatatcatatagttcaacaactccatacaatttctcacaatacaagtaaatgagaaaatacaacacattatgataaacatcat 17084441  T
Q  132 attcca-cgcctaaaaattcattcacatatcttcat 166  Q
    |||| | | ||||||||  |||||||||||||||||    
T  17084440 attcaatcacctaaaaa-gcattcacatatcttcat 17084406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 940367 - 940139
Alignment:
Q  149 tcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtg 248  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||  || |||| |||| ||||| ||||||| |||  ||||||||||  |   | | | |||||| |||||||||||    
T  940367 tcattcacataacttcatttaaccattcaaagctattcaccaaagacttataagttaaccggctttaaagcgttaatatgggcaaagtccgtatcaagtg 940268  T
Q  249 gcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaag 348  Q
    ||||  || | |||||||||||||  ||||| || ||||| |  |||||||  ||| ||| |||| |||||| ||| ||||||||| |   || ||||||    
T  940267 gcaac-cggctaacattgataattcccaaaataaagtaacatgttcaagttagaaagctctcaaa-caatctcaattaatcatgtactatcgaccttaag 940170  T
Q  349 ccacttacgaactattaaacattagttcaaa 379  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  940169 ccacttgcaaactattagacattagttcaaa 940139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 212
Target Start/End: Original strand, 33323679 - 33323813
Alignment:
Q  74 caaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtca 173  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| || | ||||| ||| |||||||||  ||| || ||||| |||| | |||||||||| ||    
T  33323679 caaatatttctcatattccaagtaa-gaggaaatacaacatctcaagataagtatcatattccacatctacaa-ttcat-cacacaccttcatttagaca 33323775  T
Q  174 tataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggct 212  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  33323776 cataaggctagtcacgaaaga-ttataagacaattggct 33323813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35137269 - 35137104
Alignment:
Q  57 atatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcac 156  Q
    ||||||||  |||| | |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||| ||| |||||| ||  ||| || ||||| |||    
T  35137269 atatagtttcaccatttcaaatatttctcatattccaagtaa-gagaaaatacaacatctcaggataagtatcatattcaacatctacaa-ttcat-cac 35137173  T
Q  157 atatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgtttt 227  Q
    | | |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| | |||||||| ||||    
T  35137172 acaccttcatttagacacataaggctagtcacgaaaga-ttataagacaattggc-taaaagaatcatttt 35137104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 17790453 - 17790405
Alignment:
Q  316 aatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactatt 364  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  17790453 aatcttaatcaatcatgtagtcaataacttaagccacttacaaactatt 17790405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Original strand, 26505780 - 26505874
Alignment:
Q  81 ttctcacattccaagtaaa-gagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatat 176  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||| |||||| || ||||||| || |||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26505780 ttctcacgatccaagtaaatgagaaaatacaacacatt-tgataaacatcatattcaacacctaacaat-cattcacatatcttcatttaatcatat 26505874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15736174 - 15736110
Alignment:
Q  238 cgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaa 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  15736174 cgtatcaagtggcaaa-cgaccaacattgataattcccaagacaaagcaacttagacaagttgaaa 15736110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 133
Target Start/End: Original strand, 23976437 - 23976529
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatat 133  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| | |||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || |||| |||||| ||||    
T  23976437 tcaacatcaactatatgatatagtttcaccattccaaacaattctcatattccaagt-aagagaacatacaacatctcatgacaaatatcatat 23976529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 70)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 40 - 497
Target Start/End: Original strand, 41660494 - 41660951
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacg 139  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||     
T  41660494 tcaacatcaactacataatataatttcaccactccaaatatttctcatatttcaagtaaagagaaaatacaacaccttatgataaatatcatatccaaca 41660593  T
Q  140 cctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaa-tcgttttcgacaaagttc 238  Q
    ||    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||||||| |    
T  41660594 ccccccaattcattctcacatattcatttagtcatataaggctagtcacgaaagagttataagataattggcttcaaagaaattgtttccgacaaagtcc 41660693  T
Q  239 gtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtca 338  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41660694 atatcaagtggcaaaacggccaacattgatacttttcaaaacaaggtaacttattcaagtttgaaaactaacaaatcgatcttaatcaatcatgtagtca 41660793  T
Q  339 tgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccga 438  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41660794 tgagcttaagccactcacgaactattaaacattagttcaaagaatagcttaagtttgtatgagaaaa-ctcaagttcacattttccacattcccatccga 41660892  T
Q  439 aaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41660893 aaatcaagtttgacatgattaagacatttaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 41660951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 81 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 38376946 - 38376530
Alignment:
Q  81 ttctcacattccaagtaaag-agaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataag 179  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| || |||  | || ||||| ||| ||||||||||||||||| || | |||| |     
T  38376946 ttctcaaaatccaagtaaaggagaaaatataacaccttatgataaacatcatacacaacacctaacaat-cattcacatatcttcatataatgatatcaa 38376848  T
Q  180 gctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaa 279  Q
     ||| |||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38376847 actattcacaaaagattcataagataatcggctttaaagaattgttttcgacaaagtccgtatcaagtggcaaaacggccaacatttataattttcaaaa 38376748  T
Q  280 caaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaa 379  Q
    |||||||||||| |||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  38376747 caaggtaacttattcaagtttggaaactcacaaatcaattttaatcaatcatgtactcatgagcttaagccacttatgaactatcaaacattaattcaaa 38376648  T
Q  380 aattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttac 479  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  38376647 aattagcctaagttcgtatgagaaaaccccaagttcacacattctgtaatcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagactttgtaccaactttac 38376548  T
Q  480 aagccttgcctaagtcca 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  38376547 aagccttgcctaagtcca 38376530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 153 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 43428713 - 43428369
Alignment:
Q  153 tcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaat-cgttttcgacaaagttcgtatcaagtggca 251  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  | | |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  43428713 tcacatatcttcattaaatcatataaaacaattcacaaaagatt-ataaagtaattggctttaaagaattcgttttcgacaaagtctgtatcaagtggca 43428615  T
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43428614 aaacggccaacattgatcattttcaaaacaaggtaacttactcaagtttgaaaactcataaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 43428515  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||   | |||||||||||||| | ||||||    
T  43428514 cttacgaactatcaaacattagttcaaagattagcctaagttcgtatgagaaaaccccaagttcacatattctgtaatcccacccgaaaattaggtttga 43428415  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43428414 catgattaagacattaaaccaactttataagccttgcctaagtcca 43428369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 153 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 21167898 - 21167558
Alignment:
Q  153 tcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaa 252  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  ||| |||| |  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21167898 tcacatatcttcattcaatcatataaaactaatcacaatggatt-ataaggcaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagtccgtatcaag-ggcaa 21167801  T
Q  253 aacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccac 352  Q
    | || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21167800 a-cggccaacattgatagttt-caaaacaaggtaacttattcaagtttgaaaactcacaaataaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccac 21167703  T
Q  353 ttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgac 452  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| || |||| |||||||| |||||| ||||  | |||||||||| ||||  | ||||||| |||||||||||||||     
T  21167702 ttaagaactatgaaacattagttcgaagattatcctaagttcgtatgagaaaactctaagttcacatattccgtaatcccacctgaaaatcaagtttgat 21167603  T
Q  453 atgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21167602 ataattaagacattaaaccaactttacaagctttgcctaagtcca 21167558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 203 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 6229764 - 6229473
Alignment:
Q  203 gtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaa 302  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||  |    
T  6229764 gtaattggccttaaagaatcattttcggcaaaatccgtatcaagtggcaaa-cgatcaacattgataattttcaaaataagataacttatttaagtttga 6229666  T
Q  303 aaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgata 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||   || | |||||| |||||| |    
T  6229665 aaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcataagcttaagccacttacaaactattagatattagttcaaagtataacttaagttcgtatgaga 6229566  T
Q  403 aaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6229565 aaa-cccaagttcacattttccacattcccacccgaaatatcaagtttgacatgattaagacatttaaccaactttacaagtcttgcctaagtc 6229473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 196 - 492
Target Start/End: Original strand, 18969152 - 18969448
Alignment:
Q  196 ttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactca 295  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||| || |||||||| |||    
T  18969152 ttataacgtatttggctttaaagaatcgtttttgacaaagttcatatcaagcggcaaaacggccaacattgatgattaccaaaataaagtaacttattca 18969251  T
Q  296 agttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttg 395  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   | || |||||| |    
T  18969252 agtttgaaaactcacaaatcaatcttaatcaatgatgtagtcatgagcttaagccacttacaaactattagacattagttcaaagtatcgcttaagttcg 18969351  T
Q  396 tatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaa 492  Q
    ||||| |||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18969352 tatgagaaaa-cctaaattcacattttccactttcccacccgaaatatcaagtttgacatgattaagacatttaaccaactttacaagccttgcctaa 18969448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 40 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 33370148 - 33369770
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacg 139  Q
    ||||||||||| | || ||||||||  |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||     
T  33370148 tcaacatcaactacatcatatagtttcaccacttcaaatatttctcatattccaagtaaagagaaaatacaacaccttatgataaatatcatatccaaca 33370049  T
Q  140 cctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcg 239  Q
      ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| |||||| | ||||||| |||||  |    
T  33370048 tataacaatccattcacacatcttcatttagtcatataaggctagtcactaaagatc-ataagataattggcttaaaagaaccattttcgataaagtctg 33369950  T
Q  240 tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaac-ttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtca 338  Q
     ||||||||||||| || ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33369949 catcaagtggcaaa-cggccaacgttgataattcccaaaacaaggtaacattactaaagtttgaaagcttaaaaatcaatcttaatcaatcatgtagtca 33369851  T
Q  339 tgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacatt 420  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | || | |||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  33369850 tgagcttaagccacttacaaactattagacattagttcaaagaataacttaagttcgtatgagaaaa-cccaagttcacatt 33369770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 85 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 31413548 - 31413137
Alignment:
Q  85 cacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctag 184  Q
    |||||||||||||||||  ||||  || ||||| |||| || ||||||| | || |  || || ||| ||||||| ||| ||||| ||||| || ||||     
T  31413548 cacattccaagtaaagatgaaatataataccttttgatgaacattatatccaacacacaacaagtcactcacataactttatttaatcatacaaagctat 31413449  T
Q  185 tcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaagg 284  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  31413448 tcacgaaagatttataagttaaacggctttaaagaatcattttcgacaaggtccgtatcaagtgtcaaa-cggccaacattgataattttcaaagcaaag 31413350  T
Q  285 taacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaatta 384  Q
    ||| ||  |||||||   ||||  |  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31413349 taatttgttcaagtttggaaacctatcattcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagtttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaagatta 31413250  T
Q  385 gcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagcc 484  Q
    ||||||||| |||| | |||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||    |||||||||||||||    
T  31413249 gcctaagttcgtataagaaaacccaaagttcacatattccacaatcccacccgaaaatcaagtttggtgtcattaagacatgattccaactttacaagcc 31413150  T
Q  485 ttgcctaagtcca 497  Q
    |||||||||||||    
T  31413149 ttgcctaagtcca 31413137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 190 - 497
Target Start/End: Original strand, 11637431 - 11637737
Alignment:
Q  190 aaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaact 289  Q
    ||||||||| ||| |||  |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  11637431 aaagatttacaagttaaacggctttaaagaatcattatcgacaaagtccgtatcaagtggcaaaatggccaacattgataattttcaaagctagataact 11637530  T
Q  290 tactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagccta 389  Q
    || |||||||  |||||  |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  11637531 tattcaagttttaaaacctacaactccatcttaatcaatcatgcagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaagattagctta 11637630  T
Q  390 agtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatc-aagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgc 488  Q
    |||| || ||| |||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  11637631 agttcgtgtgagaaaacccaaagttcata-tttccacattcccacccgaaaaacgaagtttaacatgattaagacattaaacc-actatacaagccttgc 11637728  T
Q  489 ctaagtcca 497  Q
    |||||||||    
T  11637729 ctaagtcca 11637737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 206 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 4146805 - 4146517
Alignment:
Q  206 attggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaa 305  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  ||||    
T  4146805 attggccttaaagaatcattttcggcaaaatcagtatcaagtggcaaaagg-ccaacattgataattttcaaaataagataacttattcaagtttgaaaa 4146707  T
Q  306 ctcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaa 405  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||   |||| |||||| |||||| ||||    
T  4146706 ctcacaaatcaaccttaatcaatcatgtagtcataagcttaagccacttacaaactattagatattagttcaaagtatagcttaagttcgtatgagaaaa 4146607  T
Q  406 tcccaagttcacattttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||| |||||||    
T  4146606 -cccaagttcacattttccacattcccacccgaaatatcaagtttgacatgattaagacatccaacccacattacaagtcttgtctaagtc 4146517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 203 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 14816825 - 14816536
Alignment:
Q  203 gtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaa 302  Q
    ||||||||| |||| ||||| || |||||||| | ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||| | | ||||||| |||||||  |    
T  14816825 gtaattggccttaa-gaatcattatcgacaaaatccgtatcaagtgccaaaacggtcaacattgataatttccaaaata-gataacttattcaagtttga 14816728  T
Q  303 aaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgata 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |    
T  14816727 aaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtcgtcgtgagcttaagccacttacaaactactagacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgaga 14816628  T
Q  403 aaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  14816627 aaa-cccaagttcacattttccacattcccacccgaaattcaagtttaacatgattaagacattcaacccactttacaagtcttgtctaagtc 14816536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 198 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 17319731 - 17319443
Alignment:
Q  198 ataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaag 297  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17319731 ataaggtaattgactttaaagaatcgttttcgacaaagtctgtatcaagtggcgaaacggccaacactgtta-ttttcaaaacaaggtaacttattcaag 17319633  T
Q  298 ttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgta 397  Q
    ||  ||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  17319632 tttgaaaactcacaaatcaatc----------aggtagtcatgagcttaagccacttacgaactatcaaacattagttcaaagattagcctaagttcgta 17319543  T
Q  398 tgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    ||| |||| ||||||||||||| |||   | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  17319542 tgagaaaaccccaagttcacatattctgtaatcccacccaaaaatcaagtttgatatgattaagacattaaaccaactttacaagtctagcctaagtcca 17319443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 81 - 495
Target Start/End: Original strand, 48420584 - 48420993
Alignment:
Q  81 ttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataagg 180  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| | || | ||||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||    
T  48420584 ttctcatattccaagtaa-gagaacatacaacatcttatgataaatatcatatccaacacataaaaattcgttcacacatctccatttagtcattcaagg 48420682  T
Q  181 ctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaac 280  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| | ||| ||| |||   ||||||||||||||||  | ||||| ||||||| | ||||       
T  48420683 ctagtcacgaaagatc-ataagataattggcttaaaagaaccatttccgataaaac-cgtatcaagtggcaaatgg-ccaactttgataactctcaagt- 48420778  T
Q  281 aaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaa 380  Q
    |||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||     
T  48420779 aaggtaacataatcaagtttgaaaactaataaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagtcatttacaaactattagacattagttcaaag 48420878  T
Q  381 attagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttaca 480  Q
    | |||| |||||  |||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  || ||| |||||    
T  48420879 aatagcttaagtccgtatgaaaaaaacccaagttcacatattccacaatcccacccgaaaatcacggttgacatgattaagacattgtactaaccttaca 48420978  T
Q  481 agccttgcctaagtc 495  Q
    ||||||| |||||||    
T  48420979 agccttgtctaagtc 48420993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 206 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 4163338 - 4163050
Alignment:
Q  206 attggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaa 305  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  ||||    
T  4163338 attggccttaaagaatcattttcgacaaaatccgtatcaagtggcaaa-cggccaacattgataattttcaaaataagataacttattcaagtttgaaaa 4163240  T
Q  306 ctcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaa 405  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||   |||| |||||| |||||| ||||    
T  4163239 ctcacaaatcaaccttaattaatcatgtagtcacaagcttaagccacttacaaactattagatattagttcaaagtatagcttaagttcgtatgagaaaa 4163140  T
Q  406 tcccaagttcacattttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| |||||||    
T  4163139 -cccaaattcacatttttcacattcccacccgaaatatcaagcttgacatgattaagacatccaacccactttgcaagtcttgtctaagtc 4163050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 85 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 14181244 - 14180902
Alignment:
Q  85 cacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctag 184  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || | ||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||     
T  14181244 cacattccaaataaggagaaaatacaacaccttatgataaacatcatattcaacacttaacaat-cattcacatatcttcattcaatcatataaagctat 14181146  T
Q  185 tcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggc-aaaacgaccaacattgataattttcaaaacaag 283  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||| |||| ||||||||  ||     
T  14181145 tcacaaaagatttataaggtactcggctttaaagaaccattttcgacaaagtccgtatcaagtggcaaaaatggccaacatggatatttttcaaagaaaa 14181046  T
Q  284 gtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaatt 383  Q
    ||||| |  |||||||  |||||  |||| || |||||||| |||||| ||   |||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  14181045 gtaacctgttcaagtttgaaaacgtacaactcgatcttaattaatcatataagtatgagcataggccacttacgaactatcaagcattagttcaaagatt 14180946  T
Q  384 agcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccaca 427  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  14180945 agcctaagttcgtatgagaaaatcccaagttcacatattccaca 14180902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 162 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 9591926 - 9591593
Alignment:
Q  162 ttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttc--gtatcaagtggcaaaacgacc 259  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||| ||| ||| ||| | |   ||||||||||||||||| ||    
T  9591926 ttcatttagttacataaggctagtcacgaatga-ttataagataattggctaaaaagaatcatttccgataaattccatatatcaagtggcaaaacggcc 9591828  T
Q  260 aacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaa 359  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  ||| ||| |||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9591827 aacattgataatttccaaaataa-ataatttattcaagtttgaaaactcacaagataatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacaaa 9591729  T
Q  360 ctattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaa-tcaagtttgacatgatt 458  Q
    ||||||  ||||||||||||   |||| |||||| || ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  9591728 ctattaggcattagttcaaagtatagcttaagttcgtttgagaaaa-cctaagttcacattttccacattcccatccgaaaattcaagtttgacatgatt 9591630  T
Q  459 aagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||||| | ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  9591629 aagacaattaaccaacattacaagctttgcataagtc 9591593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 224 - 487
Target Start/End: Original strand, 11401749 - 11402013
Alignment:
Q  224 ttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaa-cgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatctta 322  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| | |||||||| ||| |||||||  |||||||  |||||  |||| |||||||||    
T  11401749 ttttcgacaaagttcgtatcaagttgcaaaaacgactaacattgacatttttcaaagcaaagtaacttgttcaagtttgaaaacctacaattcaatctta 11401848  T
Q  323 atcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacatttt 422  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||| | || ||    
T  11401849 atcaatcatgtaatcatgagtttaggctacttacgaactatcaaacattagttcaaagattagcctaagttcgtatgagaaaaccccaagtttatatatt 11401948  T
Q  423 ccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttg 487  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||    
T  11401949 ccacatttccacccaaaaattaagtttgacatgattaagacattgtaccaaccttacatgccttg 11402013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 57 - 449
Target Start/End: Original strand, 39654795 - 39655183
Alignment:
Q  57 atatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcac 156  Q
    |||||||| ||||| | ||| || ||||||||||| |||||| ||| | || ||||| ||||||| |||||| |||| | ||   |||  ||||||||||    
T  39654795 atatagttttaccatttcaagtatttctcacattctaagtaa-gaggacatacaacatcttatgacaaatatcatatccaacatataaccattcattcac 39654893  T
Q  157 atatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacg 256  Q
    | ||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||  |||||  ||||| ||| |||||| | ||| ||| |||||  || |||||||||||| ||    
T  39654894 acatcttcacttagtcatataagaatagtcacgatagatc-ataagacaattgacttaaaagaaccatttccgataaagtctgtgtcaagtggcaaa-cg 39654991  T
Q  257 accaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttac 356  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||    | |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39654992 accaacattgacaattcccaaaacaaggtaacaatataaagttcgaaaactctcaaaacaatcttaatcaatcatgcagtcatgagcttaagccacttac 39655091  T
Q  357 gaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagttt 449  Q
     ||||||||||| |||||||||| | |||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  39655092 aaactattaaaccttagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaa-cccaagttcacattttccataatcccacccgaaaatcaagttt 39655183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 158 - 373
Target Start/End: Original strand, 10912227 - 10912443
Alignment:
Q  158 tatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaa-cg 256  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10912227 tatcttcatttaatcatataaagctattcataaaaggtttataaggtaatcgactttaaagaaccaatttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaaacg 10912326  T
Q  257 accaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttac 356  Q
     ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10912327 gccaacatagatatttttcaaagcaaagtaacttattcaagtttgaaaacttacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttac 10912426  T
Q  357 gaactattaaacattag 373  Q
    ||||||| |||||||||    
T  10912427 gaactatcaaacattag 10912443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 118 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 14522506 - 14522134
Alignment:
Q  118 atgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaa 217  Q
    ||||||||||| |||| | || | ||| |||||||||||| |||   ||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| || ||| ||| |||    
T  14522506 atgataaatatcatatccaacacataacaattcattcacacatcacaatttagtcatacaaggttagtcacgaaagatc-ataagatatttgacttaaaa 14522408  T
Q  218 gaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaa 317  Q
    ||||| |||  || |||   | |||||||||||||| || ||||| ||||||| | ||||   ||||||||    | |||||  ||||||||| || |||    
T  14522407 gaatcatttctgataaaac-catatcaagtggcaaa-cggccaaccttgataactctcaagt-aaggtaacaatataaagtttgaaaactcaccaaacaa 14522311  T
Q  318 tcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcac 417  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14522310 tcttaatcaatcatatagttatgagcttaagccacttacaaaccattaaacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgataaaa-cccaagttcac 14522212  T
Q  418 attttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||  |||||||||||| |||||||    
T  14522211 attttccacaatcccacccgaaaatcaagtttgacatgtttaagacattgtactaaacttacaagccttgtctaagtc 14522134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 252 - 493
Target Start/End: Original strand, 13837932 - 13838174
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataatttt-caaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcc 350  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   |||||| || |||    
T  13837932 aaacggccaacattgacaatttttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcataggcc 13838031  T
Q  351 acttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttg 450  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||     
T  13838032 acttacgaactatcaatcattagttcaaagattagcctaagttcgtatgagaaaatctcaagttcacatttttcacattcccacccgaaatccaagttta 13838131  T
Q  451 acatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||    
T  13838132 acatgattaagacattgtaccaactttacaagcattgtctaag 13838174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 302 - 495
Target Start/End: Original strand, 34559000 - 34559193
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| | ||||  ||||| ||||||     
T  34559000 aaaactctcaaaacaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacaaactattaaacattaatttaaagaatagctcaagttcgtatgag 34559099  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| ||  ||||||||    
T  34559100 aaaa-cccaagttcacattttccacattcccacccgaaatatcaagtttaacatgattaagatatttgaccaactttacaagtctcacctaagtc 34559193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 252 - 493
Target Start/End: Original strand, 22274218 - 22274459
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||  |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   |||||| || ||||    
T  22274218 aaacggccaacattgataattttcaaagctagtcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcataggcca 22274317  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22274318 cttacgaactatcgatcattagttcaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttatacattccacattcccacccgaaaatcaagtttga 22274417  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||    
T  22274418 catgattaagacattgtactaaccttacaagcattgcctaag 22274459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 495
Target Start/End: Original strand, 17203759 - 17204002
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    | ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||| || |||  |||||||||||    
T  17203759 aaacggccaacattgataattcccaaaacaaggtaacaatataaagtttaaaaactctcaaaacaatcttaatcgatcatataatcaatagcttaagcca 17203858  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcaca-ttttccacattcccacccgaaaatcaagtttg 450  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||   ||||||     
T  17203859 cttacaaactattagacattagttcaaaaaatagcttaagttcgtatgataaaa-cccaaattaacatttttccacattcccacccgaaatctaagttta 17203957  T
Q  451 acatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17203958 acatgattaagatgtttgaccaactttacaagtcttacctaagtc 17204002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 302 - 495
Target Start/End: Original strand, 15875286 - 15875478
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  15875286 aaaactcaccaaacaatcttaatcaatcatgtaatcaagagcttaagccacttacaaaccattaaacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgat 15875385  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  ||  || ||| ||||||| ||| ||||||||    
T  15875386 aaaa-cccaagttaacatttttcacattcccacccgaaattcacgtttaacatgattaagatgtttgactaacgttacaagtcttacctaagtc 15875478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 306 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 47785915 - 47785727
Alignment:
Q  306 ctcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaa 405  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   |||| |||||| |||||| ||||    
T  47785915 ctcacaaaataatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacaaactattagacattagttcaaagtatagcttaagttcgtatgagaaaa 47785816  T
Q  406 tcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
     |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||| || |||||||||||    
T  47785815 -cccaagttcacgcttttcacattctcacccgaagttcaagtttgacatgattaagacgtttaactaacattacaggctttgcctaagtc 47785727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 259 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 51159452 - 51159215
Alignment:
Q  259 caacattgataatttt-caaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacg 357  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||| || ||   |||||| || ||||||||||    
T  51159452 caacattgataatttttcaaagctaggaaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaattatataagtatgagcataggccacttacg 51159353  T
Q  358 aactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgat 457  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51159352 aactatcaatcattagttcaaagattagcataagttcgtatgagaaaatcccaagtttatacattccacaatcccacccgaaaatcaagtttgacatgat 51159253  T
Q  458 taagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||| |||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  51159252 taatacattatactaaccttacaagccttgtctaagtc 51159215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 147 - 462
Target Start/End: Original strand, 7852884 - 7853195
Alignment:
Q  147 attcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaag 246  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||  |||||  |||||| |  || ||| | ||| |||||||   |||||||||    
T  7852884 attcattcacacatcttcacttagtcatataaggatagtcgcgatagatc-ataagaaaattggttcaaaggaaacatttccgacaaaaaccgtatcaag 7852982  T
Q  247 tggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagctta 346  Q
    ||||||| || |||||||||||||||  ||| |||| | || |||   |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7852983 tggcaaa-cggccaacattgataattcccaagacaaagcaagttagaaaagttgaaag-ctctcaaa-caatcttaatcaatcatgtagtcatgagctta 7853079  T
Q  347 agccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaa-atcaa 445  Q
    || ||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  7853080 agacacttataaactattagacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaa-ctcaatttcacgttttccacattcccacccgaaatatcac 7853178  T
Q  446 gtttgacatgattaaga 462  Q
     ||||||||||||||||    
T  7853179 atttgacatgattaaga 7853195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 252 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 15469558 - 15469344
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||  |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   |||| | || ||||    
T  15469558 aaacggccaacattgataattttcaaagctagtcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgaccataggcca 15469459  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15469458 cttacgaactatcgatcattagttcaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttatacattccacattcccacccgaaaattaagtttga 15469359  T
Q  452 catgattaagacatt 466  Q
    |||||||||||||||    
T  15469358 catgattaagacatt 15469344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 309 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 2450254 - 2450070
Alignment:
Q  309 acaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcc 408  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||   |||||| || ||||||||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||    
T  2450254 acaattcaatcttaatctatcatataagtatgagcataggccacttacgaactatcgatcattagttcaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatcc 2450155  T
Q  409 caagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||    
T  2450154 caagtttatacattccacattcccacccgaaaatcaattttgacatgattaagacattgtacgaaccttacaagcattgcctaag 2450070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Original strand, 15516717 - 15516945
Alignment:
Q  147 attcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaag 246  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| |||||| | ||| | | |||   |||||||||    
T  15516717 attcattcacacatctccatttagtcatacaaggctagtcactaaagatc-ataagataattggcttaaaagaaccatttccaataaaac-cgtatcaag 15516814  T
Q  247 tggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagctta 346  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| | ||||   |||||||| || |||||||  |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15516815 tggcaaa-cgaccaactttgataactctcaagt-aaggtaacataatcaagtttgaaaactaataaatcgatcttaatcaatcatgtagtcatgagttta 15516912  T
Q  347 agccacttacgaactattaaacattagttcaaa 379  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  15516913 agccacttacaaactattagacattagatcaaa 15516945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 302 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 14060359 - 14060201
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||||    
T  14060359 aaaactcaccaaacaatcttaatcaaccatgtaatcaagaacttaagccacttacaaactattaaacattagttcaaagaatagcttaagatcgtatgat 14060260  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaag 461  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  14060259 aaaat-ccaagttaacaattttcacattcccacccgaaattcacgtttaacatgattaag 14060201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 161 - 495
Target Start/End: Original strand, 14079577 - 14079906
Alignment:
Q  161 cttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgacca 260  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||  |||||||| |||| |   || || ||||||||| ||||  |||| |    
T  14079577 cttcatttagacacataaggctagtcacgaaagatt-ataagacaattggcta-aaagaatcatttttggtgaaatttgtatcaagtagcaac-cgacta 14079673  T
Q  261 acattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaac 360  Q
    |||||||||||   ||| | ||  ||||||  |||||||  ||  |||||||   |||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||    
T  14079674 acattgataatacccaagataaaataacttgttcaagtttgaag-ctcacaagataatcctaatcaatcatgtaatcataagcttaagtcacttacaaac 14079772  T
Q  361 tattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaa 460  Q
    ||||| |||||||||||||   |||| |||||  |||||| |||| ||||| || ||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||    
T  14079773 tattagacattagttcaaagtatagcttaagtccgtatgagaaaa-cccaaatttacatttttcacattcccatctgaaatccaagtttgacatgattaa 14079871  T
Q  461 gacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  14079872 gacaatcaaccaacattacaagctttgcctgagtc 14079906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 147 - 462
Target Start/End: Original strand, 19945596 - 19945911
Alignment:
Q  147 attcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaag 246  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||  |||||| |  || ||| | ||| |||||||   |||||||||    
T  19945596 attcattcacacatcttcacttagtcatataaggatagtcacgatagatc-ataagaaaattggttcaaaggaaacatttccgacaaaaaccgtatcaag 19945694  T
Q  247 tggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagctta 346  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||   ||||||  || ||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19945695 tggcaaa-cgaccaacattgataattcccaagacaaaacaacttagacatgtt-aaaagctctcaaa-caatcttaatcaatcatgtagtcatgagctta 19945791  T
Q  347 agccacttacgaactattaaac---attagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcac-attttccacattcccacccgaaa-a 441  Q
    |||||||||| |||||||| ||   ||||||||||| | |||| ||| || |||||| |||| | ||| ||||| || || |||||||||| |||||| |    
T  19945792 agccacttacaaactattagacattattagttcaaagaatagcttaaattcgtatgagaaaa-ctcaatttcacaatctttcacattcccaaccgaaata 19945890  T
Q  442 tcaagtttgacatgattaaga 462  Q
    |||  ||||||||||||||||    
T  19945891 tcacttttgacatgattaaga 19945911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 309 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 16745310 - 16745127
Alignment:
Q  309 acaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcc 408  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  || |||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||    
T  16745310 acaattcaatcttaatcaatcatataagcacgagcataggccacttacgaactattgatcattagttcaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatcc 16745211  T
Q  409 caagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    ||| || | |  ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | |||||||    
T  16745210 caa-tttatacattcgacattcccatccgaaaattaagtttgacatgattaagacattataccaaccttacaagcatcgcctaag 16745127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 115 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 12489928 - 12489584
Alignment:
Q  115 cttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggcttt 214  Q
    |||||||||||||| |||| | || | ||| |||||||||||| ||||  | ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||  |||||||||     
T  12489928 cttatgataaatatcatatccaacacataacaattcattcacacatctctacttagtcatata-ggttagtcacgaaagatc-ataagacaattggctta 12489831  T
Q  215 aaagaatcgttttcgacaaagttcg-tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattt-tcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaa 312  Q
    |||||||| ||| ||||||   ||  ||  | |||||||| || ||||||| |||||||| |||||  |||| |||    | |||||  |||||| ||||    
T  12489830 aaagaatcatttccgacaattatccatactatgtggcaaa-cggccaacatcgataatttctcaaagtaaggcaacaatataaagtttgaaaacttacaa 12489732  T
Q  313 atcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaag 412  Q
    | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||  |||||| |||| |||||     
T  12489731 aacattcttaatctatcatgtagttatgagcttaagccacttacaaactattagacattagttcaaagaatagcttaagtccgtatgagaaaa-cccaaa 12489633  T
Q  413 ttcacattttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaa 460  Q
    || ||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  12489632 ttaacagtttccacattaccacccaaaatatcaagtttaacatgattaa 12489584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 316 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 55441837 - 55441671
Alignment:
Q  316 aatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttc 415  Q
    |||||||||||||  || | |||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||  |||||| |||| |||||||      
T  55441837 aatcttaatcaattgtgaaatcataagcttaagccacttataaactattagacattagttcaaagtttagcttaagtccgtatgagaaaa-cccaagtgt 55441739  T
Q  416 acattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagc 483  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  55441738 acatttttcacattcccacccgaaatccaaatttgacatgattaagacaatcaaccaacattacaagc 55441671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 302 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 11330087 - 11329895
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||||| || |||||| |||||| |||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||| | |||||||    
T  11330087 aaaactcaccaaacaatctcaatcaaccatgaaatcaagagcttaagccacttaaaaactattaaacattagtccaaagaatagcttaagatcgtatgat 11329988  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||  ||   | ||| ||||||||||||||||||||    
T  11329987 aaaa-cccaaattaacatttttcacattcccacccgaaattcacgtttatcatgattaagatgtttgtctaacattacaagccttgcctaagtc 11329895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 302 - 495
Target Start/End: Original strand, 12952173 - 12952365
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| | || | |||||| |||||||    
T  12952173 aaaactcaccaaataatcttaatcaatcatgtaatcaagagcttatgccacttacaaaccattaaacattagttcaaagaatatcttaagttcgtatgat 12952272  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| |||||||| |||| || ||||||||||||| ||| | |  ||| ||||||||||||  ||  |||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  12952273 aaaa-cccaagttaacatatttcacattcccacccaaaatttacatttaacatgattaagatgtttgaccaacgttacaagtcttacctaagtc 12952365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 230
Target Start/End: Original strand, 34558783 - 34558953
Alignment:
Q  57 atatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcac 156  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| | ||   ||| ||||||||| |    
T  34558783 atatagtttcaccactccaaatatttctcatattccaagtaa-gagaacatacaacatcttatgataaatatcatat-caacatataacaattcattcgc 34558880  T
Q  157 atatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcga 230  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  34558881 acatcttcatttagtcatataaggctaatcacgaaaga-tcataagataattggcttaaaagaatcattttcga 34558953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 252 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 54039615 - 54039455
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||  |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   |||||| || ||||    
T  54039615 aaacggccaacattgataattttcaaagctagacaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatttaagtatgagcataggcca 54039516  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaag 412  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  54039515 cttacgaactatcaatcattagttcaaagattagcctaagttcgtatgagaaaatcccaag 54039455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 224 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 11516591 - 11516318
Alignment:
Q  224 ttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaa-cgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagtt-gaaaaactcacaaatcaatctt 321  Q
    |||||||||||||  |||||||||  ||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||     
T  11516591 ttttcgacaaagtctgtatcaagttacaaaaacggccaacattgacatttttcaaaacaaagtaacttatccaagtttgaaaaaat-acaaatcaatctc 11516493  T
Q  322 aatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattt 421  Q
    || ||||||| |    |||| | || ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||  | |||||| |||||  | || || ||||||| ||      
T  11516492 aaccaatcatatgagaatgaacgtaggccacttacaaactattaagcattagttcaaagatttacttaagttcgtatgg-acaacccaaagttcatatac 11516394  T
Q  422 tccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    | |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11516393 tgcacaatcccaccagaaaatcaaggttgatatgattaagacattgtaccaactttacaagccttgtttaagtcca 11516318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 168 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 11987321 - 11987028
Alignment:
Q  168 tagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattga 267  Q
    |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||| |  |||||| ||| | | |||||||||||||| || |||||| |||    
T  11987321 tagtcatacaaaactaatcatgaaagatttataagacgattggcttttaagaaccaatttcgataaaatccatatcaagtggcaaa-cggccaacaatga 11987223  T
Q  268 taattttc-aaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaa 366  Q
    ||| |  | ||||||| ||||| |  | |||||  |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||    
T  11987222 taaatccccaaaacaaagtaacattataaagtttgaaaactcaccgaacaatcttaatcaatcatgtagtcaagaacttaagtcacttacaaactattaa 11987123  T
Q  367 acattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaaga 462  Q
    ||||||||||||| | || | |||| | ||| ||||||| ||||| |  |||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  11987122 acattagttcaaagaataacttaagatcgtacgataaaa-cccaactcaacattttctacattcctacccgaaattcacgtttaccatgattaaga 11987028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 303 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 38812117 - 38811959
Alignment:
Q  303 aaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgata 402  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||    
T  38812117 aaactcaccaaacaattttaatcaatcatgtaatcaagagattaagccacttacaaaccattgaacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgata 38812018  T
Q  403 aaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaaga 462  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||   ||| ||||||||||||    
T  38812017 aaa-cccaagttaacatttttcacattcccacctgaaattctcatttaacatgattaaga 38811959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 400
Target Start/End: Original strand, 49231389 - 49231537
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||| |||| ||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  49231389 aaacggccaacattgataattttcaaacttaggtaacttattcaaatttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggacttaagcca 49231488  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatga 400  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||   |||| |||||| ||||||    
T  49231489 cttacaaactattagaaattagttcaaaggatagcttaagttcgtatga 49231537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 315 - 462
Target Start/End: Original strand, 17138608 - 17138754
Alignment:
Q  315 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagtt 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||| |||| |||||| |||||  |||| | ||| ||    
T  17138608 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacggactattagatattagtctaaaaaatagcttaagttcgtatg--aaaaactcaattt 17138705  T
Q  415 cac-attttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaaga 462  Q
    ||| || |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  17138706 cacaatctatcacattcccacccgaaatatc-attttgacatgattaaga 17138754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Original strand, 12020944 - 12021170
Alignment:
Q  147 attcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatt-tataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaa 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||||     |||||||| |||||| |  || ||| ||||| | ||||||    
T  12020944 attcattcatatatcttcatttagtcatatgaagctagtcacaaaagatcatatacc---attggctt-aaagaa-ctattccgataaagtccatatcaa 12021038  T
Q  246 gtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagctt 345  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||||||||    | ||||| |||| |||  ||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  12021039 gtggcaaa-cggtcaacattgataattcccaaaacaaggtaacaatataaagtttaaaa-ctctaaaaacaatcttaatcaatcatataatcaagagctt 12021136  T
Q  346 aagccacttacgaactattaaacattagttcaaa 379  Q
    || |||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  12021137 aatccacttaaaaactattagacattagttcaaa 12021170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 252 - 379
Target Start/End: Original strand, 25057919 - 25058046
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||| |||| ||  ||| |  |||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||    
T  25057919 aaacggccaacattgataattttcaaagttaggtaacttattcaaatttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagccaaggacttaagcca 25058018  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaa 379  Q
    ||||  |||||||| | |||||||||||    
T  25058019 cttaaaaactattagaaattagttcaaa 25058046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 213
Target Start/End: Original strand, 15549512 - 15549566
Alignment:
Q  159 atcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctt 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15549512 atcttcatttagtcatataaggatagtcacgaaagatttataagataattggctt 15549566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 165
Target Start/End: Original strand, 8603605 - 8603737
Alignment:
Q  34 cattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaa-tacttctcacattccaagtaaag-agaaaatgcaacaccttatgataaatattat 131  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || ||  || | || |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  8603605 cattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaacatcatactatttctcacaatccaagtaaaggagaaaatacaacaccttatgataaacatcat 8603704  T
Q  132 attccacgcctaaaaattcattcacatatcttca 165  Q
    |||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  8603705 attcaacacctaacaa-tcattcacatatcttca 8603737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 252 - 405
Target Start/End: Original strand, 12808126 - 12808279
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| | | | |||||| | |||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||    
T  12808126 aaacggccaacattgataatttttaaagctaagcaacttatttaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagccaaggacttaagcca 12808225  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaa 405  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||   |||| |||||| |||||| ||||    
T  12808226 cttgcaaactattaaaaattagttcaaaggatagcttaagttcgtatgagaaaa 12808279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 133
Target Start/End: Original strand, 12951918 - 12952010
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatat 133  Q
    ||||||||||| | || ||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  12951918 tcaacatcaactacatcatatagtttcaccactccaaatatttctcatattccaagt-aagagaacatacaacatcttatgataaatatcatat 12952010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 17957316 - 17957161
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||   ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||||||  ||    |||||||||    
T  17957316 aaacggccaacattgata-ttttcaaagttaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtaaccaaagacttaagcca 17957218  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcc 408  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||   |||| |||||| |||||| |||||||    
T  17957217 cttacaaactattagaaattagttcaaaggatagcttaagttcgtatgagaaaatcc 17957161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13327790 - 13327675
Alignment:
Q  97 aaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcattt-agtcatataaggctagtcacgaaagat 195  Q
    ||||||||||| || ||  ||||||||||||| |||| | ||  |||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||     
T  13327790 aaagagaaaatacatcatattatgataaatatcatatccaacatctaacaattcat-cacacatcttcattttagtcacataaagctagtcacgaaaga- 13327693  T
Q  196 ttataaggtaattggctt 213  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  13327692 ttataagataattggctt 13327675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 350
Target Start/End: Original strand, 14294486 - 14294595
Alignment:
Q  238 cgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtc 337  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||  ||||||| |||  || | || ||| ||||||||||| |||||||    
T  14294486 cgtatcaagtggcaaa-cggccaacattgataattttcaagacaaaataacatagacaagttg-aaagttctc-aagcaaccttaatcaatcttgtagtc 14294582  T
Q  338 atgagcttaagcc 350  Q
    |||||||||||||    
T  14294583 atgagcttaagcc 14294595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 350
Target Start/End: Original strand, 14300113 - 14300222
Alignment:
Q  238 cgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtc 337  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||  ||||||| |||  || | || ||| ||||||||||| |||||||    
T  14300113 cgtatcaagtggcaaa-cggccaacattgataattttcaagacaaaataacatagacaagttg-aaagttctc-aagcaaccttaatcaatcttgtagtc 14300209  T
Q  338 atgagcttaagcc 350  Q
    |||||||||||||    
T  14300210 atgagcttaagcc 14300222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 400
Target Start/End: Original strand, 16820141 - 16820232
Alignment:
Q  309 acaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatga 400  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | || ||||| | |||||||||||   |||| |||||| ||||||    
T  16820141 acaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggacttaagccacttgcaaaatattagaaattagttcaaaggatagcttaagttcgtatga 16820232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 315 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 12562503 - 12562446
Alignment:
Q  315 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacatta 372  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||    
T  12562503 caatcttaatcgatcatgtggtcatgagcttaagccaccttcggactattagacatta 12562446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 17957629 - 17957537
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatat 133  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| | |||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||    
T  17957629 tcaacatcaactatatcatatagtttcaccattccaaacaattctcatattccaagt-aagagaacatacaacatctcatgataaatatcatat 17957537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 54652896 - 54652848
Alignment:
Q  147 attcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagat 195  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  54652896 attcattcacacatcttcacttagtcatataaggatagtcacgatagat 54652848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 440 - 495
Target Start/End: Original strand, 39655732 - 39655787
Alignment:
Q  440 aatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  39655732 aatcaagtttgacatgtttaagacattgtactaaccttacaagccttgtctaagtc 39655787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 497
Target Start/End: Original strand, 50312504 - 50312557
Alignment:
Q  443 caagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  50312504 caagtttgacatgattaagacataaaacc-actatacaagctttgcctaagtcca 50312557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 9592006 - 9591945
Alignment:
Q  72 tccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatat 133  Q
    |||||||| || ||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  9592006 tccaaatatttttcatattacaagtaaagagaaaatacaacatcttatgatcaatatcatat 9591945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 195
Target Start/End: Original strand, 17203596 - 17203707
Alignment:
Q  82 tctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggc 181  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| | ||   | |  ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||    
T  17203596 tctcatattccaagtaa-gagaacatacaacatcttatgataaatatcatat-caacatttcaccattcattcatacatcttcatttagtcatatgaagc 17203693  T
Q  182 tagtcacgaaagat 195  Q
    ||||||| ||||||    
T  17203694 tagtcacaaaagat 17203707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11062137 - 11062094
Alignment:
Q  238 cgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaa 282  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11062137 cgtatcaagtggcaaa-cgaccaacattgataattctcaagacaa 11062094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 424 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 33369775 - 33369703
Alignment:
Q  424 cacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||  ||||||||||||||  || ||||||||    
T  33369775 cacattcccacccgaaatattaagtttaacatgattaagatgtttgaccaactttacaagtattacctaagtc 33369703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 218
Target Start/End: Original strand, 47983881 - 47983953
Alignment:
Q  146 aattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaag 218  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| ||  |||  ||  ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  47983881 aattcattcacacatctccatttagtcatacaaaactaaccaataaagatttataaggtgattggcttaaaag 47983953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 218
Target Start/End: Original strand, 47993168 - 47993240
Alignment:
Q  146 aattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaag 218  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| ||  |||  ||  ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  47993168 aattcattcacacatctccatttagtcatacaaaactaaccaataaagatttataaggtgattggcttaaaag 47993240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 218
Target Start/End: Original strand, 48002455 - 48002527
Alignment:
Q  146 aattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaag 218  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| ||  |||  ||  ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  48002455 aattcattcacacatctccatttagtcatacaaaactaaccaataaagatttataaggtgattggcttaaaag 48002527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 218
Target Start/End: Original strand, 48011741 - 48011813
Alignment:
Q  146 aattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaag 218  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| ||  |||  ||  ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  48011741 aattcattcacacatctccatttagtcatacaaaactaaccaataaagatttataaggtgattggcttaaaag 48011813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 46)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 78 - 497
Target Start/End: Original strand, 24276807 - 24277225
Alignment:
Q  78 tacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatata 177  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24276807 tacttctcatattccaagtaa-gagaaaatacaacaccctatgataaatatcatatccaacacctaaaaattcattcacacatcttcatttagtcatata 24276905  T
Q  178 aggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaa-tcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttca 276  Q
    | ||||||||||||| | |||||   ||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  24276906 aagctagtcacgaaaaagttatagaataattggcttctaagaaattgtttccgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacggccaacattgttacttttca 24277005  T
Q  277 aaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttc 376  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24277006 aaacaaggtaacttattcaagtttgaaaactaacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaccattagttc 24277105  T
Q  377 aaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactt 476  Q
    ||  | |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24277106 aaggaatagcttaagttcgtatgagaaaa-cccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattaagccaactt 24277204  T
Q  477 tacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24277205 tacaagccttgcctaagtcca 24277225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 52 - 497
Target Start/End: Original strand, 6093835 - 6094280
Alignment:
Q  52 atataatatagttctaccactccaaatactt-ctcacattccaagtaaag-agaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaatt 149  Q
    |||| ||||||||| || |||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |  | | |||||||||| || |||||| || ||||| ||||    
T  6093835 atatcatatagttcaacaactccatatactttctcacaatccaagtaaaggagaaaatacttcgcattatgataaacatcatattcaacacctaacaatt 6093934  T
Q  150 cattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtgg 249  Q
     | ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  6093935 -actcacatatcttcatttaatcatataaagctattcacgaaagatt-ataaggtaattggctttaaagaatcattttcgacaaagttcgtatcaactgg 6094032  T
Q  250 caaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagc 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  6094033 caaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttattcaagtttggaaactcacaaatcaatcttgatcaatcatgtagtcatgaacttaagc 6094132  T
Q  350 cacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagttt 449  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||| |||||| |||||  ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  6094133 cagttacgaactatcaaacattagttcaaagattagcctaaatttgtaagagaaaaccccaagctcacacattccgtaatcccacccgaaaatcaagttt 6094232  T
Q  450 gacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6094233 gacatgattaagaccttgtaccaacttcacaagccttacctaagtcca 6094280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 95 - 490
Target Start/End: Original strand, 9635735 - 9636128
Alignment:
Q  95 gtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaaga 194  Q
    |||||||  |||| || |||||||| || || || |||| | || ||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  9635735 gtaaagatgaaatacatcaccttataatgaacatcatatccaacacctaacaagtcactcacataacttcatttaatcatacaaagctattcacgaaaga 9635834  T
Q  195 tttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactc 294  Q
    |||||||| |||  | |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  9635835 tttataagttaaacgactttaaagaatcattatcgacaaagtccgtatcaagtggcaaa-cgatcaacattgataattttcaaatcaaagtaacttattc 9635933  T
Q  295 aagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagttt 394  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  9635934 aagtttgaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactatcaaacattagttcaaagattagcctaagttc 9636033  T
Q  395 gtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcct 490  Q
    |||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9636034 gtatgagaaaa-ctcaagtccacattttccacattcccacctgaaaatcaaatttgacatgattaagacatttaaccaactttacaagccttgcct 9636128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 153 - 497
Target Start/End: Original strand, 25133197 - 25133541
Alignment:
Q  153 tcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaa 252  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||| |||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  25133197 tcacacatcttcattcaatcatataaagctattcacaatggatt-ataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagtccgtatcaagtggcat 25133295  T
Q  253 aacgaccaacattgataattttcaaaa-caaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25133296 aacaaccaacactcataattttcaaaagcaaggtaacttgctcaagtttgaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 25133395  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  25133396 cttacgaactatcaaacagtagttcaaagattagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttacattttccacatccccacccgaaattcaagtttaa 25133495  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25133496 catgatgaagacatccaaccaacgttacaagtcttgcctaagtcca 25133541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 81 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 24562005 - 24561590
Alignment:
Q  81 ttctcacattccaagtaaag-agaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataag 179  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||  |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| |     
T  24562005 ttctcacaatccaagtaaaggagaaaatacaacaccttatgataaacatcatattcaacatctaacaat-cattcacatatcttcatataatcatatcaa 24561907  T
Q  180 gctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaa 279  Q
     | |   || ||||||||   | ||| ||||   |||||| |  ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24561906 acaatctacaaaagattttctaagtatttggtcctaaagatta-ttttcgacaaagtccgtatcaagtggtaaaacggccaacattgataattttcaaaa 24561808  T
Q  280 caaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaa 379  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24561807 caaggtaacttattcaagtttggaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactatcaaacattagttcaaa 24561708  T
Q  380 aattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttac 479  Q
     ||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||    
T  24561707 gattagcctaagttcgtatgagaaaaccccaaattcacacattccgcaatcccacccgaaaatcaagtttgacatgaataagaccttgtaccaactttac 24561608  T
Q  480 aagccttgcctaagtcca 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24561607 aagccttgcctaagtcca 24561590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 85 - 497
Target Start/End: Original strand, 25594043 - 25594454
Alignment:
Q  85 cacattccaagtaaag-agaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggcta 183  Q
    |||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||| || ||||||||| | ||| ||| ||||    |||||||||||| |||||||| ||||    
T  25594043 cacattccaagtaaaggagaaaaatca-caccttatgataaa-atcatattccacacttaacaat-catttttttatcttcatttaatcatataaagcta 25594139  T
Q  184 gtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaa-cgaccaacattgataattttcaaaacaa 282  Q
     |||  |||| ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| |||    
T  25594140 ttcataaaaggtttataaggtaatcggctttaaagaaccaatttcgacaaagtccgtatcaagtggcaaaaacggccaacatagatatttttcaaagcaa 25594239  T
Q  283 ggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaat 382  Q
     ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  25594240 agtaacttactcaagtttgaaaacttacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgaacttaagtcacttacgaactatcaaacattagttcaaagat 25594339  T
Q  383 tagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaag 482  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||   ||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  25594340 tagcctaagttcgtatgagaaaaccccaagttcacgcattccgtaatcccacccgaaaatcaagtttgacaggattaagaccttgtaccaactttacaag 25594439  T
Q  483 ccttgcctaagtcca 497  Q
    |||||||||||||||    
T  25594440 ccttgcctaagtcca 25594454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 81 - 493
Target Start/End: Original strand, 66470 - 66877
Alignment:
Q  81 ttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataagg 180  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| | || | ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  66470 ttctcatattccaagtaa-gagaacatacaacatcttatgataaatatcatatacaacacataacaattcattcacacatctccatttagtcatacaagg 66568  T
Q  181 ctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaac 280  Q
    |||||||||||||||   |||| |||||||||| |||||||| ||| ||| |||  | |||||||||||||||  | | ||| ||||||| | ||||       
T  66569 ctagtcacgaaagatcg-taagataattggcttaaaagaatcatttccgataaaact-gtatcaagtggcaaacagtc-aactttgataactctcaagt- 66664  T
Q  281 aaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaa 380  Q
    |||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  66665 aaggtaacataatcaagtttgaaaactaataaatcaatcttaatcaatcatacagtcatgagtttaagccacttacaaactattagacattagttcaaag 66764  T
Q  381 attagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttaca 480  Q
    | |||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  66765 aatagcttaagttcgtatgagaaaatcccaagtttacacattccacaatcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagtcattgtaccaactttaca 66864  T
Q  481 agccttgcctaag 493  Q
    ||| |||||||||    
T  66865 agcattgcctaag 66877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 185 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 16293923 - 16293612
Alignment:
Q  185 tcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaagg 284  Q
    |||| ||||||||| ||| |||   ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||    
T  16293923 tcaccaaagatttacaagttaaacagctttaaagaatcattatcgacaaagtccgtatcaagtggcaaaacggccaacattgataattttcaaagttagg 16293824  T
Q  285 taacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaatta 384  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16293823 taacttattcaagttttaaaacctacaactccatcttattcaatcatgtagtcatgagtttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaagatta 16293724  T
Q  385 gcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccaccc-gaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagc 483  Q
    || |||||| || ||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  16293723 gcttaagttcgtgtgagaaaacccaaagttcaca-tttccacattcccacccaaaaaatgaagtttgacatgattaagacattaaacc-actatacaagc 16293626  T
Q  484 cttgcctaagtcca 497  Q
    ||||||||| ||||    
T  16293625 cttgcctaactcca 16293612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 34 - 356
Target Start/End: Original strand, 18534811 - 18535134
Alignment:
Q  34 cattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatactt-ctcacattccaagtaaag-agaaaatgcaacaccttatgataaatattat 131  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||| || |||||| | ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||  || ||    
T  18534811 cattaatcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccatataatttctcacaattcaagtaaaggagaaaatacaacacattatgataatcatcat 18534910  T
Q  132 attccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgac 231  Q
    |||| || | |  |||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18534911 attcaacacatgtaaaa-cattcacatatcttcatataatcatataaagctattcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaaccattttcgac 18535009  T
Q  232 aaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcat 331  Q
    ||||| |||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||| ||| |||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18535010 aaagtccgtatcaagtggcaaaaacggcaacattgatatttttcaaagcaaagtaatttgttcaagtttgaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcat 18535109  T
Q  332 gtagtcatgagcttaagccacttac 356  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  18535110 gtagtcatgagcttaagccagttac 18535134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 81 - 493
Target Start/End: Original strand, 25600866 - 25601276
Alignment:
Q  81 ttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataagg 180  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||| |||| |  | | ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||     
T  25600866 ttctcatattccaagtaa-gagaacatacaatatcttatgataaatatcatatccagcacataacaattcattcacacatctccatttagtcatacaaga 25600964  T
Q  181 ctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgac--aaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaa 278  Q
    |||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||| | ||||| |   ||| | |  ||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||    
T  25600965 ctagtcacgaaagatc-ataagacaattgg-tttaaagaaccattttccaataaaaatccacatcaagtggcaaa-cggccaacattgataactctcaaa 25601061  T
Q  279 acaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaa 378  Q
      || |||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25601062 gtaaagtaacttattcaagtttggaaactaacaaatcaatcttaatcaatcatatagtcatgagattaagccacttacaaactattagacattagttcaa 25601161  T
Q  379 aaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaacttta 478  Q
    | | || | |||||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||    
T  25601162 agaataacttaagttcgtatgagaaaatcccaagtttacacattccacaatcccacccgaaaatcaagtttgccatgattaagacattgtaccaacctta 25601261  T
Q  479 caagccttgcctaag 493  Q
    ||||||||| |||||    
T  25601262 caagccttgtctaag 25601276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 148 - 495
Target Start/End: Original strand, 27260529 - 27260873
Alignment:
Q  148 ttcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagt 247  Q
    |||||||| | | ||||| |||||||||||||  ||||||| | | ||| |||||||||||| ||| |||||| | ||| ||| |||||  || ||||||    
T  27260529 ttcattcatacaacttcacttagtcatataagaatagtcacaaca-attcataaggtaattgacttgaaagaaccatttccgataaagtctgtgtcaagt 27260627  T
Q  248 ggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaa 347  Q
    |||||  || |||||||||| ||||  ||||||||||||||    | |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27260628 ggcaat-cggccaacattgacaattcccaaaacaaggtaacaatataaagttcgaaaactctcaaaacaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaa 27260726  T
Q  348 gccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagt 447  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27260727 tccacttacaaactattaaacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaa-ctcaagttcacattttccacaatcccacccgaaaatcaagt 27260825  T
Q  448 ttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  27260826 ttgacatgtttaagacattgtactaaccttacaagccttgtctaagtc 27260873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 203 - 495
Target Start/End: Original strand, 24881670 - 24881962
Alignment:
Q  203 gtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcg-tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaac-aaggtaacttactcaagttg 300  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| |||||||     
T  24881670 gtaattggccttaaagaatcattttcgacaaaaatccatatcaagtggcaaa-cgaccaacattgataattttccaaagtaagataacttattcaagttt 24881768  T
Q  301 aaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatga 400  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||   |||| |||||| ||||||    
T  24881769 gaaaactcaccaataaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacaaactattagataatagttcaaagtatagcttaagttcgtatga 24881868  T
Q  401 taaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
     |||| |||||||| |  |||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||| |||||||||||    
T  24881869 gaaaa-cccaagtttaacttttccacatccccgtccgaaattcaagtttgacatgattaagacatttaaacaatattacaagcattgcctaagtc 24881962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 252 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 14907524 - 14907283
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||    
T  14907524 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcttaggcca 14907425  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14907424 cttacgaactatcgatcattagttcaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttaaacattccacattcccacccgaaaatcaattttga 14907325  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||    
T  14907324 catgattaagacattgtacgaaccttacaagcattgcctaag 14907283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 252 - 493
Target Start/End: Original strand, 23819250 - 23819491
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||    
T  23819250 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcttaggcca 23819349  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23819350 cttacgaactatcgatcattagttcaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttaaacattccacattcccacccgaaaatcaattttga 23819449  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||    
T  23819450 catgattaagacattgtacgaaccttacaagcattgcctaag 23819491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 252 - 493
Target Start/End: Original strand, 20014190 - 20014431
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgt-agtcatgagcttaagcc 350  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| || |||    
T  20014190 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatatgagt-atgagcataggcc 20014288  T
Q  351 acttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttg 450  Q
    |||||||||||||  |  |||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20014289 acttacgaactatcgataattagttcaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttatacattccacattcccacccgaaaatcaagtttg 20014388  T
Q  451 acatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||    
T  20014389 acatgattaagacattgtaccaaccttacaagcattgcctaag 20014431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 57 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24088645 - 24088328
Alignment:
Q  57 atatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcac 156  Q
    |||||||  ||||||| ||| || ||||||||||| |||||| ||| | || | ||| |||||||||||||| |||| | || | ||| ||||||||| |    
T  24088645 atatagtcttaccacttcaagtatttctcacattctaagtaa-gaggacataccacatcttatgataaatatcatatccaacacataacaattcattctc 24088547  T
Q  157 atatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacg 256  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| |||||| | ||| ||| |||   |||||||||||||||| ||    
T  24088546 acatctccatttagtcatacaaggctagtcactaaagatc-ataagataattggcttaaaagaaccatttccgataaaac-cgtatcaagtggcaaa-cg 24088450  T
Q  257 accaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttac 356  Q
     ||||| ||||||| | ||||   |||||||| || |||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24088449 gccaactttgataactctcaagt-aaggtaacataatcaagtttgaaaactaataaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgaacttaagccacttac 24088351  T
Q  357 gaactattaaacattagttcaaa 379  Q
     |||||||| |||||||||||||    
T  24088350 aaactattagacattagttcaaa 24088328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 149 - 462
Target Start/End: Original strand, 25304532 - 25304840
Alignment:
Q  149 tcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtg 248  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||||| |||| || ||||| ||  ||| |||   |||||||||||    
T  25304532 tcattcacacatcctcatttagtcatatacagctagttacgaaagatc-ataaggtaattagcttaaaggaatcattcccgataaaac-cgtatcaagtg 25304629  T
Q  249 gcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaag 348  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||   ||||||||    | |||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  25304630 gcaaa-cgaccaacattgataactctcaagt-aaggtaacaatataaagtttgaaaactcaccaaacaatcttaatcaatcatgtaatcaaaagcttaag 25304727  T
Q  349 ccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtt 448  Q
    || | ||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  25304728 cctcctacaaactattagacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgataaaa-cccaagttaacatttttcacattcccacccgaaattcacgtt 25304826  T
Q  449 tgacatgattaaga 462  Q
    | ||||||||||||    
T  25304827 taacatgattaaga 25304840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 238 - 495
Target Start/End: Original strand, 721540 - 721794
Alignment:
Q  238 cgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtc 337  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||  ||  |||| | ||| ||  ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  721540 cgtatcaagtggcaaa-cgaccaacattaatgattcccacgacaaagcaacataggcaagttgaaag-ctctcaaa-caatcttaatcaatcatgtagtc 721636  T
Q  338 atgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccg 437  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | |||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  721637 atgagcttaagccacttacaaactattagacattagtccaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaat-ccaagttcacattttccactttcccacctg 721735  T
Q  438 aaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  721736 aaatatcacatttgacatgattaagatatttgaccaaccttacaagtcttacctaagtc 721794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 382 - 497
Target Start/End: Original strand, 18536022 - 18536137
Alignment:
Q  382 ttagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaa 481  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18536022 ttagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagttcacatattccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattaaaccaactttagaa 18536121  T
Q  482 gccttgcctaagtcca 497  Q
    ||||| ||||||||||    
T  18536122 gccttacctaagtcca 18536137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 147 - 462
Target Start/End: Original strand, 25211947 - 25212259
Alignment:
Q  147 attcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaag 246  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||  |||||| |  || ||| | ||| |||||||   |||||||||    
T  25211947 attcattcacacatcttcacttagtcatataaggatagtcacgatagatt-ataagaaaattggttcaaaggaaacatttccgacaaaaaccgtatcaag 25212045  T
Q  247 tggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagctta 346  Q
     | |||| || |||||||||||||||  ||| |||| | ||||||  ||| ||||||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25212046 cgacaaa-cggccaacattgataattcccaagacaaagcaacttagacaaattgaaag-ctctcaaaa-aatcttaatcaatcatgtagtcatgagctta 25212142  T
Q  347 agccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcac-attttccacattcccacccgaaa-atca 444  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||| | |||| |||||| |||||| |||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||    
T  25212143 agccacttacaaactattagacatcagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaa-cccaatttcacaatctttcacattcccacccgaaatatca 25212241  T
Q  445 agtttgacatgattaaga 462  Q
      ||||||||||||||||    
T  25212242 cttttgacatgattaaga 25212259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 327 - 495
Target Start/End: Original strand, 19665741 - 19665908
Alignment:
Q  327 atcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccac 426  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||  |||||||  ||||||||||||| | |||| |||||| |||||| ||||| | ||||||||||||| |||    
T  19665741 atcaagtagtcataagctcaagccacttagaaactattggacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaattc-aagttcacatttttcac 19665839  T
Q  427 attcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  19665840 attctcacccgaaattcaagtttaacatgattaagacatttaactaacattacaggccttgcctaagtc 19665908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 302 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 24295685 - 24295492
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  24295685 aaaactcaccaaacaatcttaaccaatcatgtaatcaagagcttaagccgcttacaaaccattgaacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgat 24295586  T
Q  402 aaaatcccaagttca-cattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||  ||  |||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  24295585 aaaa-cccaagttaatcatttttcacattcccacccgaaattcacatttaacatgattaagatgtttgaccaaccttacaagtcttacctaagtc 24295492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 285 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 19670193 - 19670015
Alignment:
Q  285 taacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaatta 384  Q
    |||||||  ||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19670193 taacttatccaagtttgaaaattcacaaaataatcttaatcaatcatgaagtcaataacttaagccacttacaaactattagacattagttcaaagatta 19670094  T
Q  385 gcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagaca 464  Q
    || |||||  |||||| |||| |||||| | ||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  19670093 gcttaagtccgtatgagaaaa-cccaagattacattgttcacattcccacccgaaatccaagtttgacgtgattaagaca 19670015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 302 - 462
Target Start/End: Original strand, 32738795 - 32738955
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |   |||| |||||| |||| |     
T  32738795 aaaactcacaaagcaatcttaatcaatcatgtaatcatgagcttaagccatttacaaactattagacattagttcagagtatagcttaagttcgtataag 32738894  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaaga 462  Q
    |||| |||||||| || |||||| |||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  32738895 aaaa-cccaagttaacgttttccgcattcccatccgaaatatcaagttcaacatgattaaga 32738955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 4395 - 4197
Alignment:
Q  295 aagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagttt 394  Q
    ||||| |||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| ||||| | || | ||||||     
T  4395 aagtttaaaaactcaccacacaatcttaatcattcatgtaatcaagagcttaagccgcttacaaaccattgaacattag-tcaaagaataacttaagttc 4297  T
Q  395 gtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagt 494  Q
     |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||  ||  |||| | ||||||| ||| |||||||    
T  4296 atatgataaaa-cccaagttaacctttttcacattcccacccgaaattcacatttaacatgattaagatgtttgaccagccttacaagtcttacctaagt 4198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22787280 - 22787017
Alignment:
Q  81 ttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataagg 180  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  22787280 ttctcacattctaattaa-gagaacatacaacatcttatgataaatatcatattcaacatataacaattcattcacacatcttcatttagtcatataaga 22787182  T
Q  181 ctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaac 280  Q
     ||||||||| ||| | |||||  ||||| |  | ||| | | ||| ||||||    |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22787181 atagtcacgataga-tcataagacaattgac--tcaaggaacatttccgacaattaccgtatcaactggc-aaacggccaacattgataatttccaaaac 22787086  T
Q  281 aaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccac 352  Q
    || || || |   ||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22787085 aa-gtgacatggacaagttg-aaagctctcaaa-caatcttaatcaatcatgtagtcataaacttaagccac 22787017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 341 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 9781938 - 9781784
Alignment:
Q  341 agcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacatttt-ccacattcccacccgaa 439  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| | |||| ||||   ||| ||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  9781938 agcttaagccacttacaaactattagacgttagttcaaagaatagcttaagcccgtacgataaaa-cccaagttaaccttttaccacattcccacccgaa 9781840  T
Q  440 aatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |   |||| | ||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  9781839 atctaagtataacatgattaagatgttcgaccaactttacaagtcttacctaagtc 9781784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 379
Target Start/End: Original strand, 12727332 - 12727459
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||| |||||| |||| ||  ||| |  |||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||    
T  12727332 aaacggccaacattgataattttcaaagttaggcaacttattcaaatttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagccaaggacttaagcca 12727431  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaa 379  Q
     |||| |||||||| | |||||||||||    
T  12727432 tttacaaactattagaaattagttcaaa 12727459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 421 - 480
Target Start/End: Original strand, 32465097 - 32465156
Alignment:
Q  421 ttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttaca 480  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  32465097 ttccacaatcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaaaacattgaaccaaatttaca 32465156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 240
Target Start/End: Original strand, 7320459 - 7320535
Alignment:
Q  164 catttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgt 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  ||| |||| || ||||||||||    
T  7320459 catttagtcatataaggatagtcacgaaatatttataagataattggcttaaagaaattgtttccggcaaagttcgt 7320535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 349
Target Start/End: Original strand, 18535133 - 18535173
Alignment:
Q  309 acaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagc 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18535133 acaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagc 18535173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 191
Target Start/End: Original strand, 19658826 - 19658975
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacg 139  Q
    ||||||||||  | || ||||||||  |||| | |||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| |||| | ||     
T  19658826 tcaacatcaaatacatcatatagtttcaccaattcaaatatttctcatattccaagtaaa-agaaaatacaacatctcatgataaatatcatatccaaca 19658924  T
Q  140 cctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaa 191  Q
      ||| ||||||| |||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  19658925 tttaacaattcat-cacacatctttatttagacacataaggctagtcacgaa 19658975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 19887762 - 19887635
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||| | ||  |||||| | |||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  19887762 aaacggccaacattgacaatttttaaagctagacaacttatttaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggacttaagcca 19887663  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaa 379  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||    
T  19887662 cttacaaactattagaaattaattcaaa 19887635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 405
Target Start/End: Original strand, 16900436 - 16900589
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||| |||||||  ||| || |||| ||||||| |||||||||| ||| || |   ||||||||    
T  16900436 aaacggccaactttgataatttttaaaactagacaacttattcaagtttgaaatcttacaattcaatctcaatcaatcatatagccaaggaattaagcca 16900535  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaa 405  Q
    ||||  |||||||| | |||||||||||   |||| |||||| |||||| ||||    
T  16900536 cttaaaaactattagaaattagttcaaatgatagcttaagttcgtatgagaaaa 16900589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 405
Target Start/End: Original strand, 16993827 - 16993980
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||| |||||||  ||| || |||| ||||||| |||||||||| ||| || |   ||||||||    
T  16993827 aaacggccaactttgataatttttaaaactagacaacttattcaagtttgaaatcttacaattcaatctcaatcaatcatatagccaaggaattaagcca 16993926  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaa 405  Q
    ||||  |||||||| | |||||||||||   |||| |||||| |||||| ||||    
T  16993927 cttaaaaactattagaaattagttcaaatgatagcttaagttcgtatgagaaaa 16993980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22580963 - 22580904
Alignment:
Q  315 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagt 374  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  ||||||||    
T  22580963 caatcttaaccaatcatgtagtcatgagcttaagctacttaaggactattggacattagt 22580904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 24572419 - 24572385
Alignment:
Q  315 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagc 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24572419 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagc 24572385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 133
Target Start/End: Original strand, 21140738 - 21140830
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatat 133  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || |||| |||||| ||||    
T  21140738 tcaacatcaactatatcatatagtttcaccattccaaataattctcatattccaagt-aagagaacatacaacatctcatgacaaatatcatat 21140830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 175
Target Start/End: Original strand, 20272426 - 20272474
Alignment:
Q  127 attatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcata 175  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20272426 attatattcaacacctaaaaattcattcacatatcttcatataatcata 20272474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 379
Target Start/End: Original strand, 21141050 - 21141175
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||| | |||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||||||| || |   ||||||      
T  21141050 aaacggccaacattgataatttttaaagctaggcaacttatttaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagccaaggaattaagc-- 21141147  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaa 379  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  21141148 cttacaaactattagaaattagttcaaa 21141175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 244
Target Start/End: Original strand, 45618432 - 45618594
Alignment:
Q  81 ttctcacattccaagtaaa-gagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataag 179  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| || |||||| || | || |||  ||||||||||||||||| || |||||| |     
T  45618432 ttctcacaattcaagtaaaagagaaaatacaacacattatgataaaaatcatattcaacacgtagaaa-gcattcacatatcttcatataatcatatcaa 45618530  T
Q  180 gctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatca 244  Q
      ||  ||| |||||||||  | ||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  45618531 attatccacaaaagatttaccaagtaattggtcttaaag-attattttcgacaaagttcgtatca 45618594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 350
Target Start/End: Original strand, 28973176 - 28973207
Alignment:
Q  319 cttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28973176 cttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcc 28973207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Original strand, 22331693 - 22331846
Alignment:
Q  25 atatataaacattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactcca-aatacttctcacattccaagtaaa-gagaaaatgcaacaccttatgat 122  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||| || |||||| |  | |||||||| | |||||||| ||||| || |||||| |||||||    
T  22331693 atatatatgcattaatcaacataaactatatcatatagttcaacaactccatacaatttctcacaatacaagtaaaggagaagatacaacacattatgat 22331792  T
Q  123 aaatattatattcca-cgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatat 176  Q
    ||| || |||||| | | |||| |||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  22331793 aaacatcatattcaatcacctagaaa-gcattcacatatcttcatataatcatat 22331846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19888074 - 19887982
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatat 133  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| | ||||||||| |||||| ||||||| || ||||| || |||| |||||| ||||    
T  19888074 tcaacatcaactatatcatatagtttcaccattccaaacaattctcacatcccaagt-aagagaacatacaacatctcatgacaaatatcatat 19887982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21275821 - 21275729
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatat 133  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| | |||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || |||| |||||| ||||    
T  21275821 tcaacatcaactatatcatatagtttcaccattccaaacaattctcatattccaagt-aagagaacatacaacatctcatgacaaatatcatat 21275729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19670414 - 19670339
Alignment:
Q  57 atatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatat 133  Q
    ||||||||  |||| | |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  19670414 atatagtttcaccatttcaaatatttctcatattccaagtaa-gagaaaatacaacatctcatgataaatatcatat 19670339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 54 - 497
Target Start/End: Original strand, 85304 - 85746
Alignment:
Q  54 ataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcatt 153  Q
    |||||||||||  | |||||||| || |||||| |||| || ||||||||||||  ||||  | ||||||||||| |||| | || ||||| ||||||||    
T  85304 ataatatagtttcatcactccaagtatttctcatattcaaattaaagagaaaatataacaagtcatgataaatatcatatccaacacctaacaattcatt 85403  T
Q  154 cacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaa 253  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  85404 cacacatcttcatttagtcacataaggctaatcacgaaagatttataaggtaattggctt-aaggaaccatttttgataaagttcgtatcaagcggcaaa 85502  T
Q  254 acgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccact 353  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85503 acggccaacattgataattttcgaaacaaggtaacctatttaagtttgaaaactcacaaatcaattttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccact 85602  T
Q  354 tacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgaca 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85603 tacgaactattaaacattagttcaaagattagttcaagttcgtatgagaaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgaca 85702  T
Q  454 tgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  85703 tgattaagacataaaaccgactttacaagccttgcctaagtcca 85746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 40 - 497
Target Start/End: Original strand, 26439 - 26896
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataa----atattatattc 135  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  | |||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||    |||| |||| |    
T  26439 tcaacatcaactacataatatagtttcatcactccaagtactcctcatattccaagtaaa-agaaaatacaacactctatgataattaaatatcatatcc 26537  T
Q  136 cacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaag 235  Q
     || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||| ||||    
T  26538 aac-cctaacaattcattcacacatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagagttataagataattggctt-aaagaaccattttcgataaag 26635  T
Q  236 ttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtag 335  Q
    | | ||| ||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26636 tccatatgaagtggcaacacagccaacattgataactttcaaaacaaggtaacctatttaagtttgaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtag 26735  T
Q  336 tcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacc 435  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  26736 tcatgaggttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaagaatatcttaagttcgtatgagaaaa-cccaagttcacatttttcacattcgcacc 26834  T
Q  436 cgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26835 cgaaaatcaagtttgacatgattaaaacattaagccaactttacaagccttgcctaagtcca 26896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 316 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 330830 - 330652
Alignment:
Q  316 aatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttc 415  Q
    |||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||||| ||||||    
T  330830 aatcttaatccatcatgtggtccagagcttaagccacttacaaactattagatattagttcaaagattagcttaactccgtatgagaaaatcc-aagttc 330732  T
Q  416 acattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| | | ||| ||||| ||||||||| ||||    
T  330731 acatttttcacattcccacccgaaatccaagtttaacatgattaggacatttagctaacattacaggccttgccttagtc 330652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 21 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 34747 - 34270
Alignment:
Q  21 attgatatataaacattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatactt-ctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttat 119  Q
    ||||||||||  || ||||||||  | ||| ||||||||||| || || |||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  34747 attgatatatgtactttaatcaatttaaactatataatatagctcaacaactccatacactttctcacattccaagtaaggagaaaatacaacaccttat 34648  T
Q  120 gataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaaga 219  Q
    ||||||  | |||||| || ||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34647 gataaacttcatattcaacacctaacaattcattcgtatatcttcatttaatcatataaagctaatcacgaaagatttataaggtaattggctttaagga 34548  T
Q  220 atcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatc 319  Q
    | | ||||||||||||| | |||||||  ||||||     ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||    
T  34547 accattttcgacaaagtccatatcaagaagcaaaaacggaaacattgataattttcaaagcaaagtaacttgttcaagtttgaaaactcacaaatcaatc 34448  T
Q  320 ttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||| ||||||  ||||||||||    
T  34447 ttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaagattagtttaagttcgtatgagaaaatcttaagttcacat 34348  T
Q  420 tttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34347 attccacatacccacccgaaaatcaagtttgacatgatcaagacattaaaccaactttacaagtcttgcctaagtcca 34270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 85 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 4054 - 3646
Alignment:
Q  85 cacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctag 184  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| || || |||||| || ||||| || ||| ||| ||||||||||||| | |||||| | ||     
T  4054 cacattccaagtaaagaggaaataccacaccttatgatgaacatcatattcaacacctaacaagtcactcaaatatcttcatttaataatataaagttat 3955  T
Q  185 tcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaagg 284  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  3954 tcacgaaagatttataaggtagttggctttaaagaatcgttttcgacaa-gttcgtatcaagttgcaaaacggccaacattgataattttcaaaacaaga 3856  T
Q  285 taacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaatta 384  Q
    ||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3855 taacttattcaagtttggaaactcataaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttatgaactattaaacattagttcaaagatta 3756  T
Q  385 gcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagcc 484  Q
    |||  |||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  3755 gccacagttcgtatgagaaaaccccaagttcacatattccacattcccacccaaaaatcatgtttgacatgattaatacattaaaccaactttacaagtc 3656  T
Q  485 ttgcctaagt 494  Q
    || |||||||    
T  3655 ttccctaagt 3646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 63)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 34 - 497
Target Start/End: Original strand, 11964934 - 11965398
Alignment:
Q  34 cattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatactt-ctcacattccaagtaaag-agaaaatgcaacaccttatgataaatattat 131  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||| || ||| || | | || |||||| | ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||    
T  11964934 cattaatcaacatcaactatattatttagttcaacaacttcatacaatttctcacaattcaagtaaaggagaaaatacaacacattatgataaacatcat 11965033  T
Q  132 attccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgac 231  Q
    |||| || | |  |||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11965034 attcaacacatgtaaag-cattcacatatcttcatataatcatataaagctattcacgaaagatttataaggtaattgactttaaagaattgttttcgac 11965132  T
Q  232 aaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaag-ttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatca 330  Q
    ||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||  | ||||||||     
T  11965133 aaaatctgtatcaagtggcaaaacggccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttattcaagtttgaaaagctcacaagtcaaattaaatcaatct 11965232  T
Q  331 tgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattc 430  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11965233 tgtagtcatgagctcaagccacttacaaactattaaacattagttcaaagattagcttaagttcgtatgacaaaa-cccaagttcacattttccacattc 11965331  T
Q  431 ccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11965332 ccatccgaaaatcaggtttgacatgattaagacattaagccaactttacaagccttgcctaagtcca 11965398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 497
Target Start/End: Original strand, 23414104 - 23414568
Alignment:
Q  21 attgatatataaacattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatactt-ctcacattccaagtaaag-agaaaatgcaacacctta 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23414104 attgatatatatacattaatcaacatcaactatataatatagctcaacaactccatacactttctcacattccaagtaaaggagaaaatacaacacctta 23414203  T
Q  119 tgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaag 218  Q
    | ||||| || ||||||  | ||||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23414204 taataaacatcatattcagcacctaacaat-cattcaaatatcttaatttaatcaaataaagttattcacgaaagatttataaggtaatcggctttaaag 23414302  T
Q  219 aatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaat 318  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||   ||| ||||||||||||    
T  23414303 aattgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgatcaacattgataa-tttcaaaacaaggtaacttattgaagtttggaaaatcacaaatcaat 23414401  T
Q  319 cttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcaca 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||| |||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||    
T  23414402 cttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaacta------------tcaaagattagcctaagttcatctgagaaaaccccaagttcaca 23414489  T
Q  419 ttttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
      |||| || | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23414490 cattccgcaattccactcgaaaataaagtttgacatgattaagacattgtaccaactttacaagccttgcctaagtcca 23414568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 89 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 23235694 - 23235287
Alignment:
Q  89 ttccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcac 188  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||| || || |||| | ||  |||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||| ||||    
T  23235694 ttccaagtaaagatgaaatacaacaccttatgatgaacatcatatccaacatctaacaagtcattcacataactttatttaatcatacaaagctattcac 23235595  T
Q  189 gaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaac 288  Q
    |||||||||||||| | |    |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  23235594 gaaagatttataagttgaaaacctttaaggaattattttcgacaaagtccgtatcaagtggcaaa-cggccaacattgataattttcaaagcaaagtatc 23235496  T
Q  289 ttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcct 388  Q
    ||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23235495 ttgttcaagtttggaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaagattagcct 23235396  T
Q  389 aagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgc 488  Q
    ||||| |||||| |||  || |||||||||| ||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  23235395 aagttcgtatgagaaagcccaaagttcacatattctagattcccatccgaaaattaagtttgacatgattaagacatggttccaactttacaagccttgc 23235296  T
Q  489 ctaagtcca 497  Q
    |||||||||    
T  23235295 ctaagtcca 23235287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 200 - 495
Target Start/End: Original strand, 6455739 - 6456034
Alignment:
Q  200 aaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagtt 299  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6455739 aaggtaattggccttaaagaatcattttcgacaaaatccgtatcaagtggcaaaacggccaacattgataattttcaaaataaggtaacttattcaagtt 6455838  T
Q  300 gaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatg 399  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||   |||| |||||| || ||    
T  6455839 tgaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacaaactactagacattagttcaaagtatagcttaagttcgtgtg 6455938  T
Q  400 ataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||| |||| |||||||    
T  6455939 agaaaaccccaagttcacattttccacattcccacccgaaattcaagtttaacatgattaagatgtttgaccaactttacaagtcttgtctaagtc 6456034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 85 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 16836554 - 16836144
Alignment:
Q  85 cacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctag 184  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || || |||| | | |||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||     
T  16836554 cacattccaagtaaagaggaaatacaacaccttatgatgaacatcatatccaatgcctaacaat-cattaacatatctttatttaatcatacaaagctat 16836456  T
Q  185 tcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaagg 284  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  16836455 tcacaaaaggtttataagttaaatggctttaaagaatcattttcgacaaagtccatatcaaatggcaaa-cgatcaacattgataattttcaaagcaaag 16836357  T
Q  285 taacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaatta 384  Q
    ||||||  |||||||   ||||  || | |||||||||||| ||||| ||   |||||| || || ||||| ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  16836356 taacttgttcaagtttggaaacctaccattcaatcttaatcgatcatataagtatgagcatatgctacttatgaactatcaagcattagttcaaagatta 16836257  T
Q  385 gcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagcc 484  Q
    ||||||||| |||||| |||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16836256 gcctaagttcgtatgagaaaaaccaaagttcacatattccacaatcccacccgaaaattaagtttgacatgattaagacattaaaccaactttacaagcc 16836157  T
Q  485 ttgcctaagtcca 497  Q
    |||||||||||||    
T  16836156 ttgcctaagtcca 16836144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 216 - 495
Target Start/End: Original strand, 24083177 - 24083454
Alignment:
Q  216 aagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatc 315  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  24083177 aagaatcattttcgacaaaatccgtatcaagtggcaaa-cgaccaacattgataatttccaaaataagataacttattcaactttgaaaactcacaaatc 24083275  T
Q  316 aatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | |||| |||||| |||||| |||| |||||||||    
T  24083276 aatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacaaactattaaatattagttcaagta-tagcttaagttcgtatgagaaaa-cccaagttc 24083373  T
Q  416 acattttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24083374 acattttccacattcccacccgaaatatcaagtttgacatgattaagacatttaaccaactttacaagccttgcctaagtc 24083454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 153 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 5622611 - 5622271
Alignment:
Q  153 tcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaa 252  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  ||| |||| |  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5622611 tcacatatcttcattcaatcatataaaactaatcacaatggatt-ataaggcaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagtccgtatcaag-ggcaa 5622514  T
Q  253 aacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccac 352  Q
    | || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5622513 a-cggccaacattgatagttt-caaaacaaggtaacttattcaagtttgaaaactcacaaataaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccac 5622416  T
Q  353 ttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgac 452  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| || |||| |||||||| |||||| ||||  | |||||||||| ||||  | ||||||| |||||||||||||||     
T  5622415 ttaagaactatgaaacattagttcgaagattatcctaagttcgtatgagaaaactctaagttcacatattccgtaatcccacctgaaaatcaagtttgat 5622316  T
Q  453 atgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5622315 ataattaagacattaaaccaactttacaagctttgcctaagtcca 5622271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 224 - 497
Target Start/End: Original strand, 21832576 - 21832849
Alignment:
Q  224 ttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaa-cgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatctta 322  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21832576 ttttcgacaaagtccgtattaagaagcaaaaacgaa-aacattgataattttcaaagcaaagtaacttgttcaagtttgaaaactcacaaatcaatctta 21832674  T
Q  323 atcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacatttt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||| ||||||  |||||||||| ||    
T  21832675 atcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaagattagaataagttcgtatgagaaaatcaaaagttcacatatt 21832774  T
Q  423 ccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21832775 ccacatacccacccgaaaatcaagtttgacatgataaagacattaaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 21832849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 85 - 492
Target Start/End: Original strand, 19872810 - 19873218
Alignment:
Q  85 cacattccaagtaaag-agaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggcta 183  Q
    |||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| || ||||||||| | ||| ||| ||||    |||||||||||| ||||| || ||||    
T  19872810 cacattccaagtaaaggagaaaatatcacaccttatgataaacatcatattccacacttaacaat-catttctttatcttcatttaatcataaaaagcta 19872908  T
Q  184 gtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaa-cgaccaacattgataattttcaaaacaa 282  Q
     |||  |||| |||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||   ||||||||||||||| ||  ||||||  ||| |||||||| |||    
T  19872909 ttcataaaaggtttataaggtaatcagctttaaagaaccaatttcgacaaagtctatatcaagtggcaaaaacggtcaacatatatatttttcaaagcaa 19873008  T
Q  283 ggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaat 382  Q
     |||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  19873009 agtaacttattcaagtttgaaaacttacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactatcaaacattagttcaaagat 19873108  T
Q  383 tagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaag 482  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  |||   | || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||    
T  19873109 tagcctaagttcgtatgagaaaaccccaagttcacacattctgtaatcgcacccgaaaatcaagtttgacatgattaagatcttgtaccaactttacaag 19873208  T
Q  483 ccttgcctaa 492  Q
    ||||||||||    
T  19873209 ccttgcctaa 19873218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 153 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 26560970 - 26560628
Alignment:
Q  153 tcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaa-tcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggca 251  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  ||| |||| |  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26560970 tcacatatcttcattcaatcatataaaactaatcacaatggatt-ataaggtaattggcttaaaagaaatcgttttagacaaagtccgtatcaagtggca 26560872  T
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  26560871 aa-cgaccaacattgatagttt-caaaacaaggtgacttattcaagtttgaaaactcacaagtcaatcttaatcaatcatgtaatcatgagcttaagtca 26560774  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| || |  | ||||||||||||||||| |||||    
T  26560773 cttactaactatcaaacattagttcgaagattagcctaagttcgtatgagaaaaccccaagttcacatatttcgtaatcccacccgaaaatcaaatttga 26560674  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26560673 tatgattaagacattaaaccaactttacaagccttgctaaagtcca 26560628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 40 - 462
Target Start/End: Original strand, 37982308 - 37982727
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacg 139  Q
    ||||||||||| | || ||||||||  |||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| | ||     
T  37982308 tcaacatcaactacatcatatagtttcaccactccaattatttctcatattccaagtaa-gagaacatacaacatcttatgataaatatcatatcctaca 37982406  T
Q  140 cctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcg 239  Q
      ||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| | |||||||| ||||||| ||| | ||    
T  37982407 tataacaattcattcacacctcttcctttagtcatataaggctagtcacgaaaggtc-ataagataattggcataaaagaatcattttcgataaaatccg 37982505  T
Q  240 tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcat 339  Q
    | ||||||||||||  ||| || ||||| || | |||||||||||||||    | |||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37982506 tgtcaagtggcaaacggac-aatattgacaaatctcaaaacaaggtaacaatatgaagtttgaaaactcgcaaatctatcttaatcaatcatgtagtcat 37982604  T
Q  340 gagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaa 439  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   |||| |||||| |||| | |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  37982605 gagcttaagccacttacaaactattagacattagttcaaagtatagcttaagttcgtataagaaaa-ctcaagttcacatttttcacattcccatccgaa 37982703  T
Q  440 a-atcaagtttgacatgattaaga 462  Q
    | ||||||||| ||||||||||||    
T  37982704 atatcaagtttaacatgattaaga 37982727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 205 - 487
Target Start/End: Original strand, 29913122 - 29913402
Alignment:
Q  205 aattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaa 304  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||  || |||| |||||||  |||    
T  29913122 aattggccttaaagaatcatttttgacaaaatccgtatcaagtggcaaa-cggccaacattgataatttccaaaataaaataccttattcaagtttgaaa 29913220  T
Q  305 actcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaa 404  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   |||| |||||| |||||| |||    
T  29913221 attcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacaaactattagacattagttcaaagtatagcttaagttcgtatgagaaa 29913320  T
Q  405 atcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttg 487  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||| ||||    
T  29913321 a-cccaagtttacattttccacattcccacccgaaattcaagtttaacatgattaagatgtgaaaccaactttacaagtcttg 29913402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 252 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 17472829 - 17472588
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||| |  |||| ||||||||||| |||||| ||   |||||| || ||||    
T  17472829 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttaaaatcctacaattcaatcttaattaatcatataaatatgagcataggcca 17472730  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |    
T  17472729 cttacgaactatcaatcattagttcaaagattagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagttcacatttttcacattcccacccgaaatccaagtttaa 17472630  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  17472629 catgattaagacattgtaccaactttacaagcattgcctaag 17472588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 252 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 27184814 - 27184573
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   |||||| || ||||    
T  27184814 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcataggcca 27184715  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27184714 cttacgaactatcaatcattagttcaaagattagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttatacattgcacaatcccacccgaaaatcaagtttga 27184615  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||    
T  27184614 catgattaagacattgtaccaactttacacgcattgcctaag 27184573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 252 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 21234611 - 21234370
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||    
T  21234611 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcttaggcca 21234512  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21234511 cttacgaactatcgatcattagttcaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttaaacattccacattcccacccgaaaatcaattttga 21234412  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||    
T  21234411 catgattaagacattgtacgaaccttacaagcattgcctaag 21234370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 252 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 1169603 - 1169372
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| ||||||||||| |||||| ||   |||||| || ||||    
T  1169603 aaacgaccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaataaatcatataagtatgagcataggcca 1169504  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||| | |  ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1169503 cttacgaactatcaatcattagttcaaagattagcctaagttcgtatgagaaaatctcaagtttatacattccacaatcccacccgaaaattaagtttga 1169404  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagc 483  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1169403 catgattaagacattgtaccaactttacaagc 1169372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 252 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 25901425 - 25901184
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   |||||| || ||||    
T  25901425 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcataggcca 25901326  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    ||||| ||||||  | ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25901325 cttacaaactatcgatcattagttcaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttatacattccacattcccacccgaaaatcaagtttga 25901226  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||||||| ||||||  |||||| |||||||| |||||||||    
T  25901225 catgattacgacattgtaccaaccttacaagcattgcctaag 25901184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 251 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 11764564 - 11764328
Alignment:
Q  251 aaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcc 350  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||||||  ||||||  |||||  |||||||||||| || ||| || |||  ||| |||||| |||    
T  11764564 aaaacggccaacattgacatttttcaaaacaaaataacttagccaagtttgaaaacatacaaatcaatctcaaacaagcacgtaaacataagcttaggcc 11764465  T
Q  351 acttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttg 450  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  11764464 acttacgaactatcaagcattagttcaaagattagcctaagttcgtatgagaaaacccaaagttcacatattccacaatcccacccgaaaatcaagttta 11764365  T
Q  451 acatgattaagacattcaaccaactttacaagccttg 487  Q
    || |||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  11764364 acttgattaagacattgtaccaaccttacaagccttg 11764328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 99 - 398
Target Start/End: Original strand, 28900998 - 28901294
Alignment:
Q  99 agagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagattta 198  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||  | || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |    
T  28900998 agagaacatacaacatcttatgataaatatcatagccaacacataacaattcattcacacatcttcatttagtcatacaaggctagtcacgaa-gatc-a 28901095  T
Q  199 taaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagt 298  Q
    |||| |||||||||| || ||| | ||| ||| |||||  || |||||||| |||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||    | ||||    
T  28901096 taagataattggcttaaaggaaccatttccgataaagtctgtgtcaagtgg-aaaatggccaacattgacaattctcaaaacaaggtaacaatataaagt 28901194  T
Q  299 tgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtat 398  Q
    |  ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||    
T  28901195 tcgaaaactctcaaaacaatattaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacaaacaattaaacattagttcaaagaatagcttaagttcgtat 28901294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 99 - 398
Target Start/End: Original strand, 28937393 - 28937689
Alignment:
Q  99 agagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagattta 198  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||  | || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |    
T  28937393 agagaacatacaacatcttatgataaatatcatagccaacacataacaattcattcacacatcttcatttagtcatacaaggctagtcacgaa-gatc-a 28937490  T
Q  199 taaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagt 298  Q
    |||| |||||||||| || ||| | ||| ||| |||||  || |||||||| |||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||    | ||||    
T  28937491 taagataattggcttaaaggaaccatttccgataaagtctgtgtcaagtgg-aaaatggccaacattgacaattctcaaaacaaggtaacaatataaagt 28937589  T
Q  299 tgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtat 398  Q
    |  ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||    
T  28937590 tcgaaaactctcaaaacaatattaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacaaacaattaaacattagttcaaagaatagcttaagttcgtat 28937689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 259 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 4201058 - 4200824
Alignment:
Q  259 caacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacga 358  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   |||||| || |||||||||||    
T  4201058 caacattgataattttcaaagttaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcataggccacttacga 4200959  T
Q  359 actattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgatt 458  Q
    ||||| || ||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| |||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4200958 actatcaatcattagttcaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatctcaagtttattcattccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgatt 4200859  T
Q  459 aagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| |||||||||    
T  4200858 aagacattgcaccaaccttacaagcattgcctaag 4200824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 252 - 493
Target Start/End: Original strand, 16535376 - 16535617
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||  |   |||||| || ||||    
T  16535376 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcataaaagtatgagcataggcca 16535475  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16535476 cttacgaactatcgatcattagtccaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttatacattccacattcccacccgaaaatcaaatttga 16535575  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||    
T  16535576 catgattaagacattgtaccaaccttacaagcattgcctaag 16535617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 81 - 495
Target Start/End: Original strand, 23492957 - 23493368
Alignment:
Q  81 ttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataagg 180  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| | || | ||| |||||||||||| ||||  | ||||||||||| ||    
T  23492957 ttctcatattccaagtaa-gagaacatacaacatcttatgataaatatcatatccaacacataacaattcattcacacatctctacttagtcatata-gg 23493054  T
Q  181 ctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcg-tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattt-tcaaa 278  Q
    ||||||||||| |||  |||||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||   ||  || || |||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  23493055 ctagtcacgaatgatc-ataagacaattggcttaaaagaatcatttccgacaattatccataccatgtggcaaa-cgaccaacatcgataatttctcaaa 23493152  T
Q  279 acaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaa 378  Q
      |||| |||    | |||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||   |||||||| | ||||||||||    
T  23493153 gtaaggaaacaatataaagtttgaaaactcacaaaacaatcttaatcaatcaagtagtcatgagcttaagcgacttgaaaactattagatattagttcaa 23493252  T
Q  379 aaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaacttta 478  Q
    | | |||| |||||  |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||  ||  || ||| |||    
T  23493253 agaatagcttaagtccgtatgagaaaa-cccaaattaacattttccacattcccacccgaaattcaaatttaacatcattaagatgtttgactaacatta 23493351  T
Q  479 caagccttgcctaagtc 495  Q
    |||||||| ||||||||    
T  23493352 caagccttacctaagtc 23493368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 147 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 110186 - 109841
Alignment:
Q  147 attcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaag 246  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||  |||||| |  || ||| | ||| |||||||   |||||||||    
T  110186 attcattcacacatcttcacttagtcatataaggatagtcacgatagatt-ataagaaaattggttcaaatgaaacatttccgacaaaagccgtatcaag 110088  T
Q  247 tggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagctta 346  Q
    |||||||  | |||||||||||||||  ||| |||| | ||||||  ||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110087 tggcaaatgg-ccaacattgataattcccaagacaaagcaacttagacaaattgaaag-ctctcaaa-caatcttaatcaatcatgtagtcatgagctta 109991  T
Q  347 agccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcac-attttccacattcccacccgaaa-atca 444  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||| | |||| |||||| |||||| |||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||    
T  109990 agccacttacaaactattagacatcagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaa-cccaatttcacaatctttcacattcccacccgaaatatca 109892  T
Q  445 agtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
      ||||||||||||||||  ||  ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  109891 tttttgacatgattaagatgtttgaccaaccatacaagtcttacctaagtc 109841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 240 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 21223819 - 21223567
Alignment:
Q  240 tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcat 339  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| |    | ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||     
T  21223819 tatcaagtggcaag-cggccaacattgataatttccaaaacaaggtagcaatataaagtttaaaaactctcaaaacaatcttaatcaatcatataatcaa 21223721  T
Q  340 gagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaa 439  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||| ||| ||    
T  21223720 gagcttaagccacttacaaactattagacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgataaaa-cccaagttcaca-ttcccatattcccgccc-aa 21223624  T
Q  440 aatc-aagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  21223623 aatctaagtttaacatgattaagatatttgaccaactttacaagtcttacctaagtc 21223567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 147 - 461
Target Start/End: Original strand, 11582951 - 11583261
Alignment:
Q  147 attcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaag 246  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||  |||||| |  || ||| | ||| | |||||   |||||||||    
T  11582951 attcattcacacatcttcacttagtcatataaggatagtcacgatagatc-ataagaaaattggttcaaaggaaacatttccaacaaaaaccgtatcaag 11583049  T
Q  247 tggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagctta 346  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||  ||  |||| | ||||||  ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11583050 tggcaaa-cgaccaatattgataattcccacgacaaagcaacttagacaagttgaaag-ctctcaaa-caatcttaatcaatcatgtagtcatgagctta 11583146  T
Q  347 agccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaa-atcaa 445  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| | | | |||| |||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  11583147 agccacttacaaactattagacattagtttagagaatagcttaagttcgtatgagaaaa-cccaatttcacgttttccacattcccacccgaaatatcac 11583245  T
Q  446 gtttgacatgattaag 461  Q
      ||||||||||||||    
T  11583246 agttgacatgattaag 11583261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 495
Target Start/End: Original strand, 23505801 - 23506044
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| ||||||||||| |||||| ||   |||||| || ||||    
T  23505801 aaacgtccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaataaatcatataagtatgagcataggcca 23505900  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||| | |  || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23505901 cttacgaactatcaatcattagttcaaagattagcctaagttcgtatgagaaaatctcaagttaatacatttcacaatcccacccgaaaatcaagtttga 23506000  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||||||  ||| |||||||    
T  23506001 catgattaagacattgtactaaccttacaagtgttgtctaagtc 23506044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 252 - 466
Target Start/End: Original strand, 20615685 - 20615899
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   |||||| || ||||    
T  20615685 aaacggcccacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcataggcca 20615784  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| ||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20615785 cttacgaactatcgatcattagttcaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatcccatgtttaaacattccacattcccacccgaaaatcaagtttga 20615884  T
Q  452 catgattaagacatt 466  Q
    |||||||||||||||    
T  20615885 catgattaagacatt 20615899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 302 - 462
Target Start/End: Original strand, 3673127 - 3673286
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  3673127 aaaactcaccaaacaatcttaatcaatcatgtaatcaagagcttaagccacttactaaccattaaacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgat 3673226  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaaga 462  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  3673227 aaaa-cccaagttaacatttttcacattcccacccgaaattcacgtttaacatgattaaga 3673286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 302 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 5451844 - 5451653
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | | || |||||| |||||||    
T  5451844 aaaactcaccaaacaatcttaatcaatcatgtaatcaagagcttaagccacttacaaaccattaaacattagttcaaagaattgcttaagttcgtatgat 5451745  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagt 494  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||  ||  |||||| ||||||| ||| |||||||    
T  5451744 aaaa-cccaagttaacatttttcacattcccacccgaaattcgcgtttaacatgattaagatgtttgaccaacgttacaagtcttacctaagt 5451653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 316 - 493
Target Start/End: Original strand, 25004072 - 25004249
Alignment:
Q  316 aatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || |||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||  ||||| |||| |||||||||    
T  25004072 aatcttaatcaatcatgtagtcataatcttaagtcactaacaaactattggacattagttcaaagaatagcttaagttcatatgagaaaa-cccaagttc 25004170  T
Q  416 acatttt-ccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||| |||||||||    
T  25004171 acatttttccacattcccacccgaaattcaagtttgacatgattaagacattgcatcaacttcacaagcattgcctaag 25004249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 316 - 495
Target Start/End: Original strand, 22881618 - 22881796
Alignment:
Q  316 aatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttc 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   |||| |||||| |||||| |||| | |||||||    
T  22881618 aatcttaatcaatcatgtaatcaagagcttaagccac-tacaaactattaaacattagttcaaagtatagcttaagttcgtatgagaaaa-ctcaagttc 22881715  T
Q  416 acattttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22881716 acattttccacatttccacccgaaatatcaagtttaacatgattaagatgtttgaccaactttacaagtcttacctaagtc 22881796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 149 - 462
Target Start/End: Original strand, 19861201 - 19861514
Alignment:
Q  149 tcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaa-ttggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagt 247  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | | ||| ||| || |||||  || ||  |||||  || ||||||    
T  19861201 tcattcacgcatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatct-taagattagttgacttaaaggaatcaattccggtaaagtctgtgtcaagt 19861299  T
Q  248 ggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaa 347  Q
    |||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| ||||    | |||||  |||| || |||  ||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  19861300 ggcaaa-cggccaacattgacaatttccaaaacaagttaacaatataaagtttgaaaattctcaagacaatcttaatcaatcatgtggtcatgaacgtaa 19861398  T
Q  348 gccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaa-atcaag 446  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||    | | |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||    
T  19861399 gccacttacaaactattagacattagttcaaagaatagcttaagttcacgtaagaaaatcccaagttcacatttcctatattcccacccgaaatatcaag 19861498  T
Q  447 tttgacatgattaaga 462  Q
    |||  |||||||||||    
T  19861499 tttaccatgattaaga 19861514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 302 - 495
Target Start/End: Original strand, 7727629 - 7727821
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||| |||| | |||||||    
T  7727629 aaaactcaccaaacaatcttaatcaaccatgtaaccaagagcttaagccacttacaaactattaaacattaattcaaagaatagcttaagatcgtatgat 7727728  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||  ||  || ||| ||||||||||| | ||||||    
T  7727729 aaaa-cccaagttaacattttccacattcccacccgaaattcacgtttatcatgattaagatgtttgactaacgttacaagccttacataagtc 7727821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 252 - 415
Target Start/End: Original strand, 37052057 - 37052220
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||   |||||| || ||||    
T  37052057 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcccacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcataggcca 37052156  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttc 415  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  37052157 cttacgaactatcgatcattagtccaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagttc 37052220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 388 - 478
Target Start/End: Original strand, 431631 - 431720
Alignment:
Q  388 taagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaacttta 478  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  431631 taagttcgtatgagaaaa-cccaagttcacatttttcacaattccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattgaaccaacttta 431720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 10779275 - 10779125
Alignment:
Q  258 ccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacg 357  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | |||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||     
T  10779275 ccaacattgataattttcaaagctaggcaacttatttaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggacttaagccacttaca 10779176  T
Q  358 aactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcc 408  Q
    |||||||| | |||||||||||   |||| |||||| |||||| |||||||    
T  10779175 aactattagaaattagttcaaaggatagcttaagttcgtatgagaaaatcc 10779125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22367582 - 22367455
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagt-tgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcc 350  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||| |||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  22367582 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtgtgaaatcct-acaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggacttaagcc 22367484  T
Q  351 acttacgaactattaaacattagttcaaa 379  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||||    
T  22367483 acctacaaactattagacattagttcaaa 22367455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20833291 - 20833106
Alignment:
Q  34 cattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaat-acttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattata 132  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| || | |||||||| | |||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||    
T  20833291 cattattcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccatattatttctcacaatacaagtaaagagaaaatacatcatcttatgataaatatcata 20833192  T
Q  133 ttccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaa 220  Q
    | | ||   ||| |||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| || | |||||  ||||||||| ||||||    
T  20833191 tccaacatttaacaattca-tcacacatcttcatttagacacataaggctagtcacgaatga-tcataagacaattggcttaaaagaa 20833106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 175
Target Start/End: Original strand, 21108499 - 21108635
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatac-ttctcacattccaagtaaa-gagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattcca 137  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || |||||| |    
T  21108499 tcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccatatactttctcacaatccaagtaaaggagaaaatacaacaccttatggtaaacatcatattcaa 21108598  T
Q  138 cgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcata 175  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||| || |||||    
T  21108599 cacctaacaa-tcattcacatatcttcatataatcata 21108635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 462
Target Start/End: Original strand, 21615882 - 21616306
Alignment:
Q  39 atcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccac 138  Q
    |||||||||||| || | |||||||   |||| ||||  || |||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| | ||    
T  21615882 atcaacatcaactatttcatatagtctcaccattccatttatttctcatattccaagtaa-gagaacatacaacatcttatgataaatatcatat-caac 21615979  T
Q  139 gcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataag-----gtaattggctttaaagaatcgttttcgacaa 233  Q
        || || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||      || ||| ||| || ||| |  || ||  ||    
T  21615980 atacaacaagtcattcacacatcttcatttattcatataaggctagtcacgaaaga-tcataagattaattagttgacttaaatgaaccaattccggtaa 21616078  T
Q  234 agttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgt 333  Q
    ||| ||| |||||| || ||||| ||  |||||| ||||| ||||||||||||||    | |||||  ||||  | |||   | ||||||||||||||||    
T  21616079 agtccgtgtcaagttgc-aaacggccctcattgacaatttccaaaacaaggtaacaatataaagtttgaaaatcctcaagagagtcttaatcaatcatgt 21616177  T
Q  334 agtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattccca 433  Q
      |||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | || | ||||||   || | |||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21616178 gatcatgaacgtaagccacttacaaactattagacattagttcaaagaataacttaagttcacataagaaaa-cccaagttcacatttcccatattccca 21616276  T
Q  434 cccgaaa-atcaagtttgacatgattaaga 462  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  21616277 cccgaaatatcaagtttaccatgattaaga 21616306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 346 - 495
Target Start/End: Original strand, 16104759 - 16104910
Alignment:
Q  346 aagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcac-attttccacattcccacccgaaa-atc 443  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  16104759 aagccacttacaaactattagacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaaacccaatttcacaatctttcacattcccacccgaaatatc 16104858  T
Q  444 aagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |  ||||||||||||||||  ||  ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  16104859 atttttgacatgattaagatgtttgaccaaccatacaagtcttacctaagtc 16104910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 234
Target Start/End: Original strand, 431347 - 431497
Alignment:
Q  81 ttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataagg 180  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||| || ||||||||||| |||| | || | ||| |||||||||||| ||||  | |||||||||| |||    
T  431347 ttctcacattccaagtaaa-agaacatacaacatctaatgataaatatcatatccaacacataacaattcattcacacatctctacttagtcatat-agg 431444  T
Q  181 ctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaa 234  Q
    |||||||||||||| | |||||  ||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  431445 ctagtcacgaaaga-tcataagacaattgacttaaaagaatcattttcgacaaa 431497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 29191722 - 29191569
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||| | ||  |||||| | |||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  29191722 aaacggccaacattgacaatttttaaagctagacaacttatttaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaagaacataagcca 29191623  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaa 405  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||    
T  29191622 cttacaaactattagaaattagttcaaaggatagcttaagtttgtatgagaaaa 29191569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 252 - 379
Target Start/End: Original strand, 11525 - 11652
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||| | ||| |||||| | |||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  11525 aaacggccaacattgacaatttttaaagctaggcaacttatttaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggacttaagcca 11624  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaa 379  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  11625 cttacaaactattagaaattagttcaaa 11652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 252 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 21074696 - 21074543
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||| | ||| |||||| | |||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||    
T  21074696 aaacggccaacattgacaatttttaaagctaggcaacttatttaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggactcaagcca 21074597  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaa 405  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||   |||| |||||| |||||| ||||    
T  21074596 cttacaaactattagaaattagttcaaaggatagcttaagttcgtatgagaaaa 21074543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 18779092 - 18778944
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||  |||||| |||| ||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  18779092 aaacggccaacattgataattttcaaagttagtcaacttattcaaatttgaaatcatacaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggacttaagcca 18778993  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatga 400  Q
    ||| | |||||||| | |||||||||||   |||| |||||| ||||||    
T  18778992 cttgcaaactattagaaattagttcaaaggatagcttaagttcgtatga 18778944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 379
Target Start/End: Original strand, 23513983 - 23514103
Alignment:
Q  259 caacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacga 358  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| |    
T  23513983 caacattgataattttcaaagttaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggacttaagccacatacaa 23514082  T
Q  359 actattaaacattagttcaaa 379  Q
    | ||||| | |||||||||||    
T  23514083 aatattagaaattagttcaaa 23514103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1220831 - 1220704
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||| | |||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||    
T  1220831 aaacggccaacattgataatttttaaatctaggcaacttatttaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagccaaggacttaagcca 1220732  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaa 379  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||    
T  1220731 cttacaaactattagaaattatttcaaa 1220704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 379
Target Start/End: Original strand, 11341811 - 11341938
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||| |||||| |||| ||  ||| |  | || |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||    
T  11341811 aaacggccaacattgataattttcaaagttaggcaacttattcaaatttgaaatcctaaaattcaatcttaatcaatcatgtagccaaggacttaagcca 11341910  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaa 379  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  11341911 cttacaaactattagaaattagttcaaa 11341938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 32967337 - 32967116
Alignment:
Q  238 cgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtc 337  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||  |||| | ||| ||  ||||||| ||  ||| |||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  32967337 cgtatcaagtggcaaa-cgaccaacattgataactcccacgacaaagcaacatagacaagttgcaag-ctctcaaa-caattttaatcaatcatgcagtc 32967241  T
Q  338 atgagcttaagccacttacgaactattaaaca-ttagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccaccc 436  Q
    |||||||||||||||||    ||||||| ||| ||||| |||| | || | |||||| |||||| |||  | ||| ||||| |||||||||||||||||     
T  32967240 atgagcttaagccacttgtagactattagacatttagtccaaagaataacttaagttcgtatgagaaa--ctcaaattcactttttccacattcccacct 32967143  T
Q  437 gaaa-atcaagtttgacatgattaaga 462  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  32967142 gaaatatcatatttgacatgattaaga 32967116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 22884429 - 22884239
Alignment:
Q  214 taaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaa 313  Q
    ||||||| | ||| ||||||||| |  |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||   ||| |||||| |||| ||  ||| |  | ||     
T  22884429 taaagaaacatttccgacaaagtccaaatcatgtggcaaa-cggccaacattgataattttcaaagttaggcaacttattcaaatttgaaatcctaaaat 22884331  T
Q  314 tcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaa 405  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||   |||| |||||| |||||| ||||    
T  22884330 tcaatcttaatcaatcatgtaggtaaggacttaagccacttaaaaactattagaaattagttcaaaggatagcttaagttcgtatgagaaaa 22884239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 421 - 466
Target Start/End: Original strand, 2030993 - 2031038
Alignment:
Q  421 ttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacatt 466  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2030993 ttccacaatcccacccaaaaatcaagtttgacatgattaagacatt 2031038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 133
Target Start/End: Original strand, 3672870 - 3672962
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatat 133  Q
    ||||||||||| | || ||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||  || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  3672870 tcaacatcaactaaatcatatagtttcaccactccaaatatttctcatattccaggt-aagagagcatacaacatcttatgataaatatcatat 3672962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10779593 - 10779501
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatat 133  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || |||| |||||| ||||    
T  10779593 tcaacatcaactatatcatatagtttcaccattccaaataattctcatattccaagt-aagagaacatacaacatctcatgacaaatatcatat 10779501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 315 - 352
Target Start/End: Original strand, 19404713 - 19404750
Alignment:
Q  315 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccac 352  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19404713 caatcttaatcaatcatgtcgtcatgagcttaagccac 19404750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 315 - 400
Target Start/End: Original strand, 23454086 - 23454171
Alignment:
Q  315 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatga 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | ||||||  ||||||||  ||| | |||| |||||| ||||||    
T  23454086 caatcttaatcaatcatgtagtcattaaattaagccacttaaggactattggacattagtctaaagaatagcttaagttcgtatga 23454171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 315 - 400
Target Start/End: Original strand, 23465591 - 23465676
Alignment:
Q  315 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatga 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | ||||||  ||||||||  ||| | |||| |||||| ||||||    
T  23465591 caatcttaatcaatcatgtagtcattaaattaagccacttaaggactattggacattagtctaaagaatagcttaagttcgtatga 23465676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 400
Target Start/End: Original strand, 25425800 - 25425948
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||  |||||| | |||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||| |  | |||||||    
T  25425800 aaacggccaacattgataatttttaaagctagacaacttatttaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcacgtagtcaaggacataagcca 25425899  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatga 400  Q
    || || |||||||| | ||||||| |||   |||| |||||| ||||||    
T  25425900 ctcacaaactattagaaattagttaaaaggatagcttaagttcgtatga 25425948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 98
Target Start/End: Original strand, 25425484 - 25425542
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaa 98  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  25425484 tcaacatcaactatatcatatagtttcaccattccaaataattctcatattccaagtaa 25425542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21074903 - 21074811
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatat 133  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| | |||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || |||| |||||| ||||    
T  21074903 tcaacatcaactatatcatatagtttcaccattccaaacaattctcatattccaagt-aagagaacatacaacatctcatgacaaatatcatat 21074811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 22367898 - 22367806
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatat 133  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| | |||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || |||| |||||| ||||    
T  22367898 tcaacatcaactatatcatatagtttcaccattccaaacaattctcatattccaagt-aagagaacatacaacagctcatgacaaatatcatat 22367806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 40 - 135
Target Start/End: Original strand, 7424542 - 7424637
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaa-agagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattc 135  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| | |||||| ||||||||||| || |||||  ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  7424542 tcaacatcaactatatcatatagtttcaccattccaaacaattctcatattccaagtaatagggaaaa-acaacatctcatgataaatatcatattc 7424637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 81 - 497
Target Start/End: Original strand, 808 - 1223
Alignment:
Q  81 ttctcacattccaagtaaag-agaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataag 179  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| || |||||| || | |  |||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  808 ttctcacaatccaagtaaaggagaaaatacaacacattatgataaacatcatattcaacacatgtaaag-cattcacatatcctcatttagtcatataag 906  T
Q  180 gctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaa 279  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  907 gctagtcacgaaagatttgtaaggtagttggctttaaagaatcgttttcgacaaagtccgtatcaagtgg-aaaacgaccaacattgataattttcaaag 1005  T
Q  280 caaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaa 379  Q
    | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1006 ctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcttgcagtcatgagcttaggccacttacgaactatcaatcattagttcaaa 1105  T
Q  380 aattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttac 479  Q
     ||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  1106 gattagcctaaggtcgtatgagaaaatctcaagttcacatattccgtaatcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagactttaaaccaacattac 1205  T
Q  480 aagccttgcctaagtcca 497  Q
    |||||||| |||||||||    
T  1206 aagccttgtctaagtcca 1223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 40 - 494
Target Start/End: Original strand, 130768 - 131222
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacg 139  Q
    |||| |||||| | |||||||||||  | |||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||| | ||     
T  130768 tcaatatcaactacataatatagtttcatcactccaagtacttctcatatttcaagtaa-gagaaaatacaacaccccatgataaatatcatatccaaca 130866  T
Q  140 cctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcg 239  Q
      ||| ||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| | || ||||||| | ||    
T  130867 attaacaattcattcccacatcttcatttagtcatacaaagctagtcacgaaggatttataaggtaattggcttcaagaaatggcttccgacaaaatccg 130966  T
Q  240 tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcat 339  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  130967 tatcaagttgcaaaacgaccaacattgatacttttcaaaacaaggtaacttattcaagtttgaaaactaacaactcaatcttaatcaatcttgtagtcat 131066  T
Q  340 gagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaa 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  131067 gagcttaagccacttacgaactattaaacattagtccaaagaatagcttaagttcgtatgagaaa--cccaagttcacattttccacattcccacccgaa 131164  T
Q  440 aatcaag---tttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagt 494  Q
    || ||||   |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  131165 aaccaagttatttgacataattaagacattaagtcaactttacaagccttgcctaagt 131222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 302 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 106023 - 105864
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    |||||| || || ||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  106023 aaaacttaccaaacaatcttaatcaaccatgtaaacaagaacttaagccacttac-aactattaaacattagttcaaagaatagcttaagattgtatgat 105925  T
Q  402 aaaatcccaagttcaca-ttttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaaga 462  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||| |||||||||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  105924 aaaa-cccaagttaacattttttcacactcccacccgaaattcacgtttatcatgattaaga 105864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 302 - 462
Target Start/End: Original strand, 108782 - 108941
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||  ||| | |||| |||||| |||||      
T  108782 aaaactctcaaa-caatcttaatcaatcatgtagttatgagcttaagccacttatggactattggacattagtctaaagaatagcttaagttcgtatg-- 108878  T
Q  402 aaaatcccaagttcac-attttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaaga 462  Q
    |||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  108879 aaaaacccaatttcacaatcgttcacattcccacccgaaatatcacttttgacatgattaaga 108941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 44895 - 44422
Alignment:
Q  21 attgatatataaacattaatcaacatcaaccatata--atatagttctaccactccaaatactt-ctcacattccaagtaaag-agaaaatgcaacacct 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||| || || |||| | | |||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  44895 attgatatatatacattaatcaacatcaactatatataatatagctcaacaactctatacactttctcacattccaagtagaggagaaaatacaacacct 44796  T
Q  117 tatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaa 216  Q
    ||| ||||| || |||||| || ||||  ||| |||||| | ||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  44795 tataataaacatcatattcaacacctatcaat-cattcatagatcttcatttaatcatgtaaagctattcatgaaagatttataaggtaattgattttaa 44697  T
Q  217 agaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatca 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||| | ||||||||    
T  44696 agaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaatggccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttattcaagtttggaaaataacaaatca 44597  T
Q  317 atcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  44596 atcttaatcaatcatgtagtcatgagttcaagccacttatgaactattaaacattagttcaaagattagcttaagttcgtatgagaaaaccccaagttca 44497  T
Q  417 cattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    ||  |||   | ||||| ||      ||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  44496 cacattctgtaatcccaacc------caagtttgacatgattaagacattgtaccaagcttacaagccttgcctaagtcca 44422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 180; Significance: 6e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 492
Target Start/End: Original strand, 4826 - 5300
Alignment:
Q  21 attgatatataaacattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatactt-ctcacattccaagtaaag-agaaaatgcaacacctta 118  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||| || | |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4826 attgatatacatacattaatcaatatcaactatataatatagctcaacaacttcatacactttctcacaatccaagtaaaggagaaaatacaacacctta 4925  T
Q  119 tgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaag 218  Q
    ||||||| || |||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  4926 tgataaacatcatattcaacacctaacaat-cattcacatatcttcatttaatcatataaagctattcacgaaaggtttataaggtaatcagctttaaag 5024  T
Q  219 aatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgata-attttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaa 317  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||| || ||||  |||||||  |||||  |||| || |    
T  5025 aaccattttcgacaaagtccgtatcaagtagcaaaacggccaacgttgatattttttcaaagcaaagtcacttgttcaagtttgaaaacctacaactcga 5124  T
Q  318 tcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatg-ataaaatcccaagttca 416  Q
    ||||||| |||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  5125 tcttaattaatcatataagcatgagcataggccacttacgaactatcaagcattagttcaaagattaccctaagttcgtatgaaaaaaatcccaagttca 5224  T
Q  417 cattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaa 492  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||| | ||||| |||||| ||||    
T  5225 catattccacaatcccacccgaaaatcaagttttgcctgattaagacattataccatccttacatgccttgtctaa 5300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 71 - 495
Target Start/End: Original strand, 84491 - 84912
Alignment:
Q  71 ctccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttag 170  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| | ||   ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  84491 ctccaaatatttctcatatttcaagtaaagagaaaatacaataccttatgataaatatcatatccaacatataataattcattcacacatcttcatttag 84590  T
Q  171 tcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataa 270  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||| |||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  84591 tcatttaaggctagtcacaaaagatc-ataagataactggcttaaaagaaccatttccgataaagtccgtatcaagtggcaac-cggccaacattgataa 84688  T
Q  271 ttttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacat 370  Q
    || |||||  || |||||||| ||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  84689 ttctcaaagtaaagtaacttattcaaggtcgaaaactcataactcaatcttaatcaatcatgtaatcaagagcttaagccacttacaaactattagacat 84788  T
Q  371 tagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaac 470  Q
    |||||||||   |||| |||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||  ||  ||    
T  84789 tagttcaaagtatagcttaagttcgtatgagaaaa-cccaagttaacattttccacattcccaccaaaaattcaagtttaacatgattaagatgtttgac 84887  T
Q  471 caactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  84888 caactttaatagtcttacctaagtc 84912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 258 - 482
Target Start/End: Original strand, 52390 - 52613
Alignment:
Q  258 ccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacg 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    | ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  52390 ccaacattgataatttccaaaacaaggtaacaatataaagtttaaaaactctcaaaacaatcttaatcaatcatatagtcatgagcttaagccacttaca 52489  T
Q  358 aactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgat 457  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||  |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||    
T  52490 aactattaaacatgagttcaaagaatagctcaagttcatatgagaaaa-cccaagttcacattttccacattcctactcgaaatttaagtttaacatgat 52588  T
Q  458 taagacattcaaccaactttacaag 482  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||||    
T  52589 taagatatttgaccgactttacaag 52613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 199 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 2092 - 1794
Alignment:
Q  199 taaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttc-gtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaag 297  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  2092 taaggtaattggccttaaagaaacgttttcgacaaaaatctgtatcaagtggcaaaacggccaacattgataatttccacaataaggtaacttattcaag 1993  T
Q  298 ttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgta 397  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||   |||| |||||| |||    
T  1992 tttgaaaactcataaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttaaaaactattagacattagttcaaagtatagcttaagttcgta 1893  T
Q  398 tgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1892 tgagaaaa-cccaagtttacattttccacattcccatccgaaattcaagtttaacatgattaagatgtttgaccaactttacaagtcttgcctaagtcca 1794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 185 - 497
Target Start/End: Original strand, 106695 - 107006
Alignment:
Q  185 tcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaagg 284  Q
    |||| ||||||||| ||| |||  ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | | |    
T  106695 tcaccaaagatttacaagttaaacggctttaaagagtcattctcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacggtcaacattgataattttcaaagctatg 106794  T
Q  285 taacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaatta 384  Q
    ||||||| |||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  106795 taacttaatcaagttttaaaacctacaaatccatcttaatcaatcttgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaggtta 106894  T
Q  385 gcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccaccc-gaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagc 483  Q
    || |||||| |||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  106895 gcttaagttcgtatgagaaaacccaaagttcacatgttccacattcccacccaaaaaatgaagtttg-catgattaagacattaaacc-actatacaagc 106992  T
Q  484 cttgcctaagtcca 497  Q
    ||||||||||||||    
T  106993 cttgcctaagtcca 107006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 142 - 497
Target Start/End: Original strand, 21022 - 21376
Alignment:
Q  142 taaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgta 241  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||  || |||| |||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||| || ||||||||||  |||    
T  21022 taaaaagtcactcacataacttcatttaatcattcaaagctattcaccaaagatttacaagttaaacggctttaaagaatcattatcgacaaagtctgta 21121  T
Q  242 tcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatga 341  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21122 tcaagtggcaaaacggccaactttgataattttcaaagcaaggtaacttaatcaagttttaaaaccgacaactccatcttaatcaatcatgtagtcatga 21221  T
Q  342 gcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccg-aaa 440  Q
    | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  21222 gattaagccacttacaaagtattaaacattagttcaaagattagcttaagttcgtgtgagaaaacccaaagttcaca-tttccacattcccacccgaaaa 21320  T
Q  441 atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    |  ||||||||||||||| ||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21321 aggaagtttgacatgattgagaaattaaacc-actatacaagccttgcctaagtcca 21376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 286 - 497
Target Start/End: Original strand, 29165 - 29374
Alignment:
Q  286 aacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattag 385  Q
    |||||| |||||||  |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  29165 aacttattcaagttttaaaacctacaattccatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactagtaaacattagttcaaagattaa 29264  T
Q  386 cctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccg-aaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagcc 484  Q
    | |||||| || ||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||    
T  29265 cttaagttcgtgtgagaaaa-cccaagttcaca-tttccacatccccacccgaaaaatgaagtttgacatgattaagacattaaacc-actatacaaacc 29361  T
Q  485 ttgcctaagtcca 497  Q
    |||||||||||||    
T  29362 ttgcctaagtcca 29374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 199 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 3095 - 2797
Alignment:
Q  199 taaggtaattggc-tttaaagaatcgttttcgacaaagttc-gtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaa 296  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||    
T  3095 taaggtaattggcatttaaggaatcattttcaacaaaaatccgtatcaagtggcaaaacggccaacattgataatttccacattaaggtaacttattcaa 2996  T
Q  297 gttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgt 396  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||   |||| |||||| ||    
T  2995 gtttgaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacaaactattagacatttgttcaaagtatagcttaagttcgt 2896  T
Q  397 atgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    || | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2895 ataagaaaa-cccaagttcacattttccactttcccacccgaaatatcaagtttgacatgattaagatatttaaccaattttacaagccttgcctaagtc 2797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 302 - 495
Target Start/End: Original strand, 5161 - 5354
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||   |||| |||||  ||||||     
T  5161 aaaactcgcaaaataatattaatcaatcatgtagtcaataacttaagccacttacaaactattaggcattagttcaaacgatagcttaagtccgtatgag 5260  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagac-attcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||| |||||||    
T  5261 aaaa-cccaagatcacattttccacattcccacccgaaatccaagtttgacatgattaagacaatttaactaacattacaggccttgtctaagtc 5354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 85 - 497
Target Start/End: Original strand, 24319 - 24732
Alignment:
Q  85 cacattccaagtaaagagaaaatgcaacac-cttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggcta 183  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| |  |||||||| || || |||| | || | ||| || ||| ||||||| |||||||||  |||| || ||||    
T  24319 cacattccaagtaaagatgaaatacaataatcttatgatgaacatcatatccaacacttaacaagtcactcacataacttcatttaaccatacaaagcta 24418  T
Q  184 gtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaag 283  Q
     |||| | ||||||| ||| |||  || ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  24419 ttcaccacagatttacaagttaaacgggtttaaagaatcattatcgacaaagtctgtatcaagtggcaaaacggccaacattgataattttcaaagctag 24518  T
Q  284 gtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaatt 383  Q
    |||||||| |||||||  ||| |  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24519 gtaacttattcaagttttaaaccctacaattccatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacctacgaacttttaaacattagttcaaagatt 24618  T
Q  384 agcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccg-aaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaag 482  Q
    ||| |||||| || ||| |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  24619 agcttaagttcgtctgagaaaacccacagttcacatattccacattcccacccgaaaaatgaagtttgatatgattaagacattaaacc-actatacaag 24717  T
Q  483 ccttgcctaagtcca 497  Q
    |||||||||||||||    
T  24718 ccttgcctaagtcca 24732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 158; Significance: 8e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 203 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 23169 - 22878
Alignment:
Q  203 gtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataatttt-caaaacaaggtaacttactcaagtt-g 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||| || |    
T  23169 gtaattggctttaaagaatcattttcgacaaatct-gtatcaagtggcaaa-cgaccaacattgataatttttcaaagtaagataacttattcaaatttg 23072  T
Q  301 aaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatga 400  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  23071 aaaaactcaccaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacaaacaaccaatcattagttcaaagattagcctaagttcgtatga 22972  T
Q  401 taaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagt 494  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||| |||||||||||| ||||||    
T  22971 gaaaatcccaaattcacatattccacaatcccacccgaaaatcaagtttgatatgattaagacattgtactaaccttacaagccttgtctaagt 22878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 4)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 482
Target Start/End: Original strand, 68384 - 68826
Alignment:
Q  34 cattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatat 133  Q
    ||||||||||| ||||| | || || |||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  68384 cattaatcaacttcaactacatcatgtagtttcaccactccaaacatttctcatatttcaagtaa-gagaacatacaacatcttatgataaatatcatat 68482  T
Q  134 tccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaa 233  Q
     | ||   ||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||  |||||| | ||| ||| ||    
T  68483 -caacatgtaacaatccattcacacaccttcatttagtcatacaaggctagtcacgaaatatc-ataagataattggctcaaaagaaacatttccgataa 68580  T
Q  234 agttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgt 333  Q
    ||| | |||||||| |||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||    | |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  68581 agtccatatcaagtagcaaat-gaccaacattgataattcccaagacaaggtaacaatataaagtttgaaaactctcaaa-caatcttaatcaatcatgt 68678  T
Q  334 agtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattccca 433  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  68679 agtcatgagcttaagtcacttacgaactattaaacattagttcaaagaatagctcaagttcgcatgagaaaa-cccaagttcacattttccacattccca 68777  T
Q  434 cccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaag 482  Q
    ||| ||| |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  68778 cccaaaattcaagtttaacatgattaagatatttgaccaactttacaag 68826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 98274 - 97889
Alignment:
Q  85 cacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctag 184  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||  ||| | | || ||| |||| |||||||| |||||| ||| ||| |||| ||||     
T  98274 cacattccaagtaacgagaaaatacaacaccttatcatgaacatcgtatccaatgcttaacaatt-attcacatctcttcacttaatcaaataaagctaa 98176  T
Q  185 tcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaagg 284  Q
    |||| || | || |||||||||  ||||| |||||||| || || ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  98175 tcacaaatggttcataaggtaaccggcttaaaagaatcattatcaacaaagtccgtatcaagtggcaaa-caaccaacattgataattttcaaagcaagg 98077  T
Q  285 taacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaatta 384  Q
    ||||||  |||||||   ||||  |||| |||||||||||||||||| ||   |||||| |  |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  98076 taacttgttcaagtttggaaacctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcatgggccacttacgaactatcaagcattagttcaaagatta 97977  T
Q  385 gcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaacca 472  Q
    ||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  97976 gcctatgttcgtatgagaaaaccccaagttcacatattccacaatcccacccgaaaatcaagtttgatataattaagacattaaacca 97889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 252 - 466
Target Start/End: Original strand, 271046 - 271260
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   |||||| || ||||    
T  271046 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcataggcca 271145  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  271146 cttacgaactatcaatcattagttcaaagattagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttatacattccacaatcccatccgaaaatcgagtttga 271245  T
Q  452 catgattaagacatt 466  Q
    |||||||||||||||    
T  271246 catgattaagacatt 271260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 255360 - 255281
Alignment:
Q  251 aaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcat 331  Q
    |||||| ||||||||||   |||||||||||||  ||| || |||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  255360 aaaacggccaacattgactcttttcaaaacaagc-aacatattcaagtttgaaaacttacaattcaatcttaatcaatcat 255281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 153 - 497
Target Start/End: Original strand, 36852 - 37186
Alignment:
Q  153 tcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaa 252  Q
    ||||||| ||| |||||  |||| || |||| |||| ||||||||| |||  ||  |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  36852 tcacataactttatttaaccatacaaagctattcaccaaagatttacaagtgaaacggctataaagaatcgttatcgacaaagtccgtatcaagtggcaa 36951  T
Q  253 aacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccac 352  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||| |       ||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  36952 aacggtcaacattgataattttcaaagctaggtaacttatt-------aaaaaat-acaaatccatcttaatcaatcatatagtcatgagcttaaaccac 37043  T
Q  353 ttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgac 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||  ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37044 ttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcttaagttcgcacgagtaaacccaaagttcaca-tttccacattcccacccgaaaatcaagtttgac 37142  T
Q  453 atgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  37143 atgattaagacattaaacc-actatacgagccttgcctaagtcca 37186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 40 - 495
Target Start/End: Original strand, 3582 - 4027
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacg 139  Q
    ||||||||||| | || ||||||||   |||||||||||| |||||| ||||||||     ||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||     
T  3582 tcaacatcaactacatcatatagtttcgccactccaaatatttctcatattccaag-----agaaaatacaacaccttatgataaatatcatatccaaca 3676  T
Q  140 cctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcg 239  Q
      ||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| | ||| ||| ||| |||     
T  3677 tataaca-ttcattcacacatcttcatt-agtcatataaggctagtcacgaaagatc-ataagataattggcttaaaagaaccatttccgataaaattca 3773  T
Q  240 tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaac-ttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtca 338  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| | |||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  3774 tatcaagtggcaaa-cg-ccaacattgataaatcccaaaacaaggtaacattaataaagtttgaaaactcttaaaacaatcttaatcaatcatgtattca 3871  T
Q  339 tgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccga 438  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||   |||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  3872 cgagcttaagccacttacaaactattagacattagttcgaagtatagcttaagttcgtatgagaaaa-cccaagttcacatttt-gacattcccacctga 3969  T
Q  439 aa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    || ||||||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  3970 aatatcaagtttaacatgattaagatgtttgaccaactttacaagtcttgcctaagtc 4027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 147 - 495
Target Start/End: Original strand, 7763 - 8108
Alignment:
Q  147 attcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaag 246  Q
    ||||||||| | | ||||| ||| |||||||||  ||||||| | | ||| |||||||||||| ||| |||||| | ||| ||| |||||  || |||||    
T  7763 attcattcatacaacttcacttattcatataagaatagtcacaaca-attcataaggtaattgacttgaaagaaccatttccgataaagtctgtgtcaag 7861  T
Q  247 tggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagctta 346  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    | |||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7862 tggcaac-cgaccaacattgacaattcccaaaacaaggtaacaatataaagttcgaaaactctcaaaacaatcttaatcaatcatgtagtcatgagctta 7960  T
Q  347 agccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaag 446  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | | || |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7961 agccacttacaaactattaaacattagttcaaagaatggcttaagttcgtatgagaaaa-cccaagttcacattttccacaatcccacccgaaaatcaag 8059  T
Q  447 tttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  8060 tttgacatgattaagacattgtactaaccttacaagccttgtctaagtc 8108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 231 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 1991 - 1729
Alignment:
Q  231 caaagttcgtatcaagtggcaaaac-gaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatc 329  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1991 caaagttcgtatcaagtagcaaaaatggtcaacattgatatttttcaaagcaaggtaacttgtttaagtttgaaaactcacaaatcaatcttaatcaatc 1892  T
Q  330 atgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacatt 429  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||| |||     |||| |||||||||    
T  1891 atgtagtcacgagcttaagccacttacgaactatcaagcattagttcaaagattagcctatgttcgtatgcgaaaattcca-----acatattccacatt 1797  T
Q  430 cccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1796 cccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacagtaaaccaaatttacaagccttgcctaagtcca 1729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2239 - 2145
Alignment:
Q  81 ttctcacattccaagtaaag-agaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatat 176  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || || |||||| || ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||    
T  2239 ttctcacaatccaagtaaaggagaaaatacaacaccttatgat-aacatcatattcaacacctaacaa-tcattcacatatcttcatatattcatat 2145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 203 - 495
Target Start/End: Original strand, 1648 - 1940
Alignment:
Q  203 gtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaa 302  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||  |    
T  1648 gtaattggccttaaagaatcattttcgacaaaatctgtatcaagtggccaaacggccaacattgataatttccaaaataagataacttattcaagtttga 1747  T
Q  303 aaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgata 402  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||   |||| |||||| |||||| |    
T  1748 aaactcacaaatcaaacttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacaaactattagacattagttaaaagtatagcttaagttcgtatgaga 1847  T
Q  403 aaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||  ||  ||| ||||||| || |||| |||||||    
T  1848 aaa-ctcaagttcacattttccacattcccacccgaaatatcaagtttaacatgagtaagatgtttgacccactttaccagtcttgtctaagtc 1940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 34 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 198658 - 198216
Alignment:
Q  34 cattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatat 133  Q
    ||||||||||| ||||| | ||   ||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| ||||    
T  198658 cattaatcaacttcaactacatcgcatagtttcaccactccaaatatttctcatattccaagtaa-gagaacatacaacattttatgataaatatcatat 198560  T
Q  134 tccacgcctaaaaattcattcacata--tcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgac 231  Q
     | ||    || |||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||     
T  198559 -caacatacaacaattcattcacacacatcttcatctagtcatataaggctagttacgaaagatc-ataagataattgg-tttaaaaaatcatttccgat 198463  T
Q  232 aaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcat 331  Q
    |||  |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    | |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  198462 aaatcta-tatcaagtggcaaa-cgaccaacattgataattcccaagacaaggtaacaatataaagtttgaaaactctcaaa-caatcttaatcaatcat 198366  T
Q  332 gtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcc 431  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  198365 gtagtcatgagcttaaaccacttacaaactattaaatattagttcaaagaatagctcaagttcgtatgagaaaa-cccaagttcacattttccacattcc 198267  T
Q  432 cacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaag 482  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  198266 cacctgaaattcaagtttaacatgattaagatatttgaccaactttacaag 198216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 138; Significance: 7e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 147 - 495
Target Start/End: Original strand, 20680 - 21025
Alignment:
Q  147 attcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgta-tcaa 245  Q
    ||||| ||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  ||||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||  | |||     
T  20680 attcaatcacaaatctccacttagtcatata-ggctagtcacgaaagatc-ataagacaattgacttaaaagaatcatttccgacaaatatccaaatcat 20777  T
Q  246 gtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagctt 345  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20778 gtggcaaacag-ccaacattgataattctcaaaataaagtaacttattcaagtttgaaaacgcacaaattaatcttaatcaatcatgtagtcatgagctt 20876  T
Q  346 aagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaa 445  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||| ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  20877 aagccacttacaaactattagatattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaa-cccaagtgcatatttttcacattcccactcgaaattcaa 20975  T
Q  446 gtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  20976 gtttgacatgattaagacatttaaccaacattacaaatcttgcctaagtc 21025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 147 - 495
Target Start/End: Original strand, 27509 - 27854
Alignment:
Q  147 attcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgta-tcaa 245  Q
    ||||| ||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  ||||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||  | |||     
T  27509 attcaatcacaaatctccacttagtcatata-ggctagtcacgaaagatc-ataagacaattgacttaaaagaatcatttccgacaaatatccaaatcat 27606  T
Q  246 gtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagctt 345  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27607 gtggcaaacag-ccaacattgataattctcaaaataaagtaacttattcaagtttgaaaacgcacaaattaatcttaatcaatcatgtagtcatgagctt 27705  T
Q  346 aagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaa 445  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||| ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  27706 aagccacttacaaactattagatattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaa-cccaagtgcatatttttcacattcccactcgaaattcaa 27804  T
Q  446 gtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  27805 gtttgacatgattaagacatttaaccaacattacaaatcttgcctaagtc 27854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 138; Significance: 7e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 203 - 495
Target Start/End: Original strand, 454 - 746
Alignment:
Q  203 gtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaa 302  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |    
T  454 gtaattggccttaaagaatcattttcgacaaaattcttatcaagtggaaaaacggccaacattgataattttcaaaataagataacttattcaagtttga 553  T
Q  303 aaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgata 402  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||| || || |||||||   || | |||||| |||||| |    
T  554 aaactcacaaatcaatcttgatcaatcatgtagtcatgaaattaaaccacttacaaactattagacgttggttcaaagtataacttaagttcgtatgaga 653  T
Q  403 aaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  ||  ||| |||||||||| |||| |||||||    
T  654 aaa-cccaagttcacattttccacattcccacacgaaatatcaagtttaacatgattaagatgtttgacccactttacaagtcttgtctaagtc 746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 40 - 495
Target Start/End: Original strand, 567 - 1016
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacg 139  Q
    ||||||||||| | || ||||||||  |||| ||||| || |||||| |||  ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | ||     
T  567 tcaacatcaactacatcatatagtttcaccattccaa-tatttctcatattataagtaaagagaaaacaaaacacctcatgataaatatcatatccaaca 665  T
Q  140 cctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcg 239  Q
     ||| || ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |  |||||  ||||||||  ||||||| |||| ||  ||| |||     
T  666 tctataa-ttcat-cacacaccttcaattagtcatataaggctagtcacaaaaggtc-ataagacaattggctaaaaagaatagtttccggtaaaattca 762  T
Q  240 tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcat 339  Q
    |||||||| |||||  | | |||||||||||||| ||| | ||  ||| ||| |||||||  |||||||||||   | ||||||||| ||||||||||||    
T  763 tatcaagtagcaaatgg-ctaacattgataatttccaagataaaataatttattcaagtttgaaaactcacaagatattcttaatcactcatgtagtcat 861  T
Q  340 gagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaa 439  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  862 gagcttaagccacttacaaactattggacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaa-ctcaagttcacattttccacattcccacccgaa 960  T
Q  440 aatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  961 attcaagtttgacatgattaagacaattaaccaacattacaagccttgtctaagtc 1016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 76 - 495
Target Start/End: Original strand, 5657 - 6071
Alignment:
Q  76 aatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcata 175  Q
    |||| |||||| |||  ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | ||  ||| || ||||| |||| | ||||| |||||||||    
T  5657 aatatttctcatattataagtaaagagaaaacaaaacacctcatgataaatatcatatccaacatctataa-ttcat-cacacaccttcaattagtcata 5754  T
Q  176 taaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttc 275  Q
    ||||||||||||| |||| |  |||||  ||||||||  ||||||| |||| ||  ||| ||| |||||||| |||||  | | || ||||||||||| |    
T  5755 taaggctagtcacaaaaggtc-ataagacaattggctaaaaagaatagtttccggtaaaattcatatcaagtagcaaatgg-ctaatattgataatttcc 5852  T
Q  276 aaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagtt 375  Q
    || | ||  ||| ||| |||||||  |||||||||||   | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  5853 aagataaaataatttattcaagtttgaaaactcacaagatattcttaatcactcatgtagtcatgagcttaagccacttacaaactattggacattagtt 5952  T
Q  376 caaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaact 475  Q
    |||| | |||| |||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||     
T  5953 caaagaatagcttaagttcgtatgagaaaa-ctcaagttcacattttccagattcccacccgaaattcaagtttgacatgattaagacaattaaccaaca 6051  T
Q  476 ttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  6052 ttacaagccttgtctaagtc 6071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 40 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 6433 - 5982
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacg 139  Q
    ||||||| ||| || | ||||||||  |||| ||||| || |||||| ||| ||||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||| |||| | ||     
T  6433 tcaacattaactatgtcatatagtttcaccattccaattatttctcatattgcaagtaacgagaaaacacaacatcttatgatcaatatcatatccaaca 6334  T
Q  140 cctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcg 239  Q
     |||| ||||||| || | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||  || ||||| ||| ||  ||||| ||    
T  6333 tctaacaattcat-catacatcttcacttagtcacataaggctagtcacgaaagattg-taagataattggctaaaaggaatcatttccggtaaagtccg 6236  T
Q  240 tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcat 339  Q
    ||||||||| |||   | | |||||||||||||| ||| | ||  ||| ||| ||||| |  |||||||||||   |||||||||||||||||||||| |    
T  6235 tatcaagtgacaacctgtc-aacattgataatttccaagataaaataagttattcaaggttgaaaactcacaagataatcttaatcaatcatgtagtcgt 6137  T
Q  340 gagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaa 439  Q
    || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6136 gaacttaagccacttacaaactattagacattagttcaaagaatagctcaagttcgtatgagaaaa-cccaagttcacattttccacattcccacccgaa 6038  T
Q  440 aatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||    
T  6037 atccaagtttaacatgattaagacatttaactaacattacaggccttccctaagtc 5982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 23759 - 23303
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacg 139  Q
    ||||||||||| | || | ||||||  |||||| ||| || |||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| | ||     
T  23759 tcaacatcaactacatcagatagtttcaccacttcaattatttctcatattccaagtaa-gagaacatacaacatcttatgataaatatcatatccaaca 23661  T
Q  140 cctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcg 239  Q
      ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| ||   ||| ||| |||   ||    
T  23660 tataacaattcattcacatatctccatttagtcatacaaggctagtcacgaaagatc-ataagataattggcttaaaaaaactatttccgataaaac-cg 23563  T
Q  240 tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcat 339  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||  | ||||   || ||||| || |||||||  |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23562 tatcaagtggcaaa-cgaccaactttgatagctctcaagt-aacgtaacataatcaagtttgaaaagtaataaatcaatcttaatcaatcatgtagtcat 23465  T
Q  340 gagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacatt-------ttccacattccc 432  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| | || | |||||| |||||| |||| ||||||||||||||       ||||||||||||    
T  23464 gagcttaaaccacttacaaactattagacattagttcaaagaataacttaagttcgtatgagaaaa-cccaagttcacattttccacattccacattccc 23366  T
Q  433 acccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || | || || ||||||| |||| |||||||    
T  23365 acccgaaattcaagtttgacatgattaagacgtttatcccacgttacaagtcttgtctaagtc 23303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 40 - 495
Target Start/End: Original strand, 4155 - 4604
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacg 139  Q
    ||||||||||| | || ||||||||  |||| ||||| || |||||| |||  ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | ||     
T  4155 tcaacatcaactacatcatatagtttcaccattccaa-tatttctcatattataagtaaagagaaaacaaaacacctcatgataaatatcatatccaaca 4253  T
Q  140 cctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcg 239  Q
     ||| || ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |  |||||  ||||||||  ||||||| |||| ||  ||| |||     
T  4254 tctataa-ttcat-cacacaccttcaattagtcatataaggctagtcacaaaaggtc-ataagacaattggctaaaaagaatagtttccggtaaaattca 4350  T
Q  240 tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcat 339  Q
    |||||||| |||||  | | |||||||||||||| ||| | ||  ||| ||| |||||||  |||||||||||   | ||||||||| ||||||||||||    
T  4351 tatcaagtagcaaatgg-ctaacattgataatttccaagataaaataatttattcaagtttgaaaactcacaagatattcttaatcactcatgtagtcat 4449  T
Q  340 gagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaa 439  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4450 gagcttaagccacttacaaactattggacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaa-ctcaagttcacattttccacattcccacccaaa 4548  T
Q  440 aatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4549 attcaagtttgacatgattaagacaattaaccaacattacaagccttgtctaagtc 4604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 1289 - 942
Alignment:
Q  146 aattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaa 245  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||| ||| |||||||| ||| ||| |||   | ||||||    
T  1289 aattcattcacacatcttcatttagtcatataaggctactcacgaa-gaatcataagataattgacttaaaagaatcatttccgataaaacccatatcaa 1191  T
Q  246 gtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagctt 345  Q
     |||||||  ||||||||||||||||||  ||| |||||||||    | | |||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1190 atggcaaat-gaccaacattgataatttcgaaagcaaggtaacaatataatgtttgaaaactctcaaaacaatcttaatcaatcatgtagtcatgacctt 1092  T
Q  346 aagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaa-atca 444  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  1091 aagccacttacaaactattaaacattagttcaaagaatagctcaagttcgtatgagaaaa-cccaaattaacattttccacattcccacccgaaatatcc 993  T
Q  445 agtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||  |||||| |||||  ||  |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  992 agttaaacatgactaagatgtttgaccaactttacaagtcttacctaagtc 942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 116; Significance: 9e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 252 - 483
Target Start/End: Original strand, 95539 - 95770
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || | ||| |||||| |||| ||  |||||  |||| |||||||||||||||||| ||   |||||| |||||||    
T  95539 aaacggccaacattgataattttcgaagctaggcaacttattcaaatttgaaaacctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcataagcca 95638  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  95639 cttacgaactatcaatcattagttcaaagattagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttatacattccacaatcccacccgaaaatcaagtttga 95738  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagc 483  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  95739 catgattaagacattgtaccaactttacaagc 95770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 226 - 495
Target Start/End: Original strand, 1620 - 1888
Alignment:
Q  226 ttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatc 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||   |||||| ||||| ||||  ||||| ||  |||| || |||||||  |||| |||||| ||||||||||||    
T  1620 ttcgacaaagtccgtatcaagtggcaact-gaccaatattgaaaattcccaaaataaattaacatattcaagtttgaaaattcacaactcaatcttaatc 1718  T
Q  326 aatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttcca 425  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  1719 aatcatgtaatcatgatcttaagccacttacaaactattagacattagttcaaagtatagcttaagttcgtatgagaaaa-cccaagttcacattttcca 1817  T
Q  426 cattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| ||  ||||||||    
T  1818 cattcccacccgaaatatcaagtttaacatgattaagatatttgaccaactttacaagtctcacctaagtc 1888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 302 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 119312 - 119120
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||     
T  119312 aaaactctcaaaacaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacaaagtattaaacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatga- 119214  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
     ||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  119213 gaaagcccaagttcacattttgcataatcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattgtactaaccttacaagccttgtctaagtc 119120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 495
Target Start/End: Original strand, 29103 - 29346
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  | || |||||||||||||||||| ||   |||||| || | ||    
T  29103 aaacgaccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctaaaattcaatcttaatcaatcatatacgtatgagcataggtca 29202  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29203 cttacaaactatcaatcattagttcaaagattagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttatacattcaacaatcccacccgaaaatcaagtttga 29302  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  29303 catgattaagacattgtaccaactttacaagccttgtctaagtc 29346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 239 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 45208 - 44953
Alignment:
Q  239 gtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtca 338  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |    
T  45208 gtatcaagtggcgaaacgaccaacattgataattttcaaagctagacaacttattcaagtttgaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatataagta 45109  T
Q  339 tgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaag-ttcacattttccacattcccacccg 437  Q
    ||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||| |||| || ||||||| ||| ||||     
T  45108 tgagcataggccacttacgaactatcaatcattagttcaaagattagcctaagttcgtatgagaaaacccaaagtttcatatattccacaatcctaccca 45009  T
Q  438 aaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    ||||||||| |||   ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||    
T  45008 aaaatcaagattggtgtgattaagacatagtaccaactttacaagcattgcctaag 44953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 102 - 376
Target Start/End: Original strand, 6694 - 6965
Alignment:
Q  102 gaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataa 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||| | |||| | ||||||||||||||| | ||||||||  ||| | || ||||||| ||||    
T  6694 gaaaatacaacaccttatgataaatatcatattcaagacctcacaatt-actcacatatcttcattcaatcatataaaactattgacaaaagatt-ataa 6791  T
Q  202 ggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttga 301  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||| || |||||||| |||||||      
T  6792 ggtatttggctttaaagaatcatttttaacaaagttcgtatcaagtggcaaacggac-aacattgataattcccaaaataaagtaacttattcaagtttg 6890  T
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttc 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  6891 aaaactcacaactcaatcttaatcactcatgtaatcatgaacttaagccatttacaaactattagacattagttc 6965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 252 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 38313 - 38072
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   |||||| || ||||    
T  38313 aaacggccaacagtgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcataggcca 38214  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38213 cttacgaactatcgatcattagttcaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttatacattccacattcccacccgaaaatcaagtttga 38114  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||    
T  38113 catgattaagacattgtaccaaccttacaagcattgcctaag 38072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 38627 - 38535
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatat 133  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| | |||||| || |||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||||| ||||    
T  38627 tcaacatcaactatatcatatagtttcaccattccaaacaattctcatatcccaagt-aagagaacatacaacatcttatgacaaatatcatat 38535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 252 - 492
Target Start/End: Original strand, 21719 - 21959
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||    
T  21719 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcttaggcca 21818  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21819 cttacgaactatcgatcattagttcaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttaaacattccacattcccacccgaaaatcaattttga 21918  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaa 492  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||||||    
T  21919 catgattaagacattgtacgaaccttacaagcattgcctaa 21959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 259 - 493
Target Start/End: Original strand, 25981 - 26215
Alignment:
Q  259 caacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacga 358  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||    
T  25981 caacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcttaggccacttacga 26080  T
Q  359 actattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgatt 458  Q
    |||||  |  |||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26081 actatcgatgattagttcaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttaaacattccacattcccactcgaaaatcaattttgacatgatt 26180  T
Q  459 aagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    ||||||||  || ||| |||||||| |||||||||    
T  26181 aagacattgtacgaaccttacaagcattgcctaag 26215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 259 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 98271 - 98052
Alignment:
Q  259 caacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacga 358  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||    | |||||  ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |    
T  98271 caacattgataattcccaagacaaggtaacaatataaagtttgaaaactctcaaaacaatcttaatcaataatgtagtcatgaacttaagccacttacaa 98172  T
Q  359 actattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgatt 458  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  98171 actattaaacattatttcaaagaatagctcaagtttgtatgagaaaa-cccaagttcacattttccacattcccacccgaaattcaagtttaacatgatt 98073  T
Q  459 aagacattcaaccaactttac 479  Q
    |||| |||  |||||||||||    
T  98072 aagatatttgaccaactttac 98052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 98460 - 98301
Alignment:
Q  34 cattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatat 133  Q
    ||||||||||| ||||| | || ||||||||  |||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  98460 cattaatcaacttcaactacatcatatagtttcaccactccaattatttctcatattccaagtaa-gagaacatacaacatcttatgataaatatcatat 98362  T
Q  134 tccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagat 195  Q
     | ||   ||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  98361 -caacatataacaattcattcacacatctacatttaatcatataaggctagtcacaaaagat 98301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 464
Target Start/End: Original strand, 69842 - 69985
Alignment:
Q  320 ttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttc-aca 418  Q
    ||||||||| ||| | |||| || ||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||  |||||| |||   |||||||| |||    
T  69842 ttaatcaattatgaactcataagtttaagccgcttataaactattaaacgttagttcaaagtttagcttaagtccgtatgagaaat--ccaagttctaca 69939  T
Q  419 ttttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagaca 464  Q
    |||||||  |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  69940 ttttccaacttcccacccgaaatccaaatttgacatgattaagaca 69985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 259 - 466
Target Start/End: Original strand, 13266 - 13472
Alignment:
Q  259 caacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacga 358  Q
    ||||||||| ||||| |||  |||  ||||||  |||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |    
T  13266 caacattgacaatttccaaggcaacataacttgttcaagttggaaagctcataaattaatcttaatcaatcatgtagtcataatcttaagccacttacaa 13365  T
Q  359 actattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgatt 458  Q
    ||||||  ||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13366 actattggacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaa-cccaagttcacattttccacattcccacccgaaattcaagtttgacatgatt 13464  T
Q  459 aagacatt 466  Q
    ||||||||    
T  13465 aagacatt 13472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 316 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 11963 - 11886
Alignment:
Q  316 aatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtt 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | || |||||| ||||||    
T  11963 aatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacagactattagacattagtccgaagattagcttaagtt 11886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12112 - 12065
Alignment:
Q  164 catttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggct 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||    
T  12112 catttagtcatataaggctagtcacaaaaga-ttataagacaattggct 12065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 252 - 495
Target Start/End: Original strand, 24 - 267
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||| |  |||| |||||||||||||||||| ||   |||||| || ||||    
T  24 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttaaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcataggcca 123  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  ||||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  124 cttacgaactatcaatcattagttcaaagattagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttatacattccacaatccctcccgaaaatcaagtttta 223  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||||||||| | |||||||    
T  224 catgattaagacattgtactaaccttacaagcctcgtctaagtc 267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 240 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 52378 - 52143
Alignment:
Q  240 tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcat 339  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||   |||||||| || |||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52378 tatcaagtggcaaa-cggccaacattgataaatctcaagt-aaggtaacataatcaagtttgaaaactaataaatcaatcttaatcaatcatatagtcat 52281  T
Q  340 gagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaa 439  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   | |||| ||||||  ||||| |||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  52280 gagcttaagccacttacaaactattagacattagttcatggaatagcttaagttcatatgagaaaa-ctcaagttcacacttttcacattcccacccgaa 52182  T
Q  440 aatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaacttta 478  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52181 attcaagtttgacatgattaagacattgaaccaacttta 52143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 240 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 56330 - 56095
Alignment:
Q  240 tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcat 339  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||   |||||||| || |||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  56330 tatcaagtggcaaa-cggccaacattgataaatctcaagt-aaggtaacataatcaagtttgaaaactaataaatcaatcttaatcaatcatatagtcat 56233  T
Q  340 gagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaa 439  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   | |||| ||||||  ||||| |||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  56232 gagcttaagccacttacaaactattagacattagttcatggaatagcttaagttcatatgagaaaa-ctcaagttcacacttttcacattcccacccgaa 56134  T
Q  440 aatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaacttta 478  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  56133 attcaagtttgacatgattaagacattgaaccaacttta 56095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1068 (Bit Score: 106; Significance: 8e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1068
Description:

Target: scaffold1068; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 226 - 495
Target Start/End: Original strand, 2269 - 2536
Alignment:
Q  226 ttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatc 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||   ||||| || ||||| || |||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  2269 ttcgacaaagtccgtatcaagtgg-aaaacggccaacaatgataatccccaaaataaagtaacatattcaaatttgaaaactcacaactcaatcttaatc 2367  T
Q  326 aatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttcca 425  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||   |||| |||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  2368 aatcatgtaatcatgatcttaagctacttacaaactattagacattagttgaaagtatagcttaagttcgtatgagaaaa-cccaaattcacattttcca 2466  T
Q  426 cattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    || |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||  |||||| ||||||| | | ||||||||    
T  2467 cactcccacccgaaattcaagtttaacatgattaagatattttaccaacattacaagtcctacctaagtc 2536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 106; Significance: 8e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 252 - 493
Target Start/End: Original strand, 12123 - 12363
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||| | |||||||||||  || |||| |||||||||||||||||| ||   |||||| ||  |||    
T  12123 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaactcattcaagttgaaatcct-acaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcatagtcca 12221  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    ||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12222 cttacgaactatcgattattagttcaaagattagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttatacattccacattcccacccgaaaatcaagtttga 12321  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||    
T  12322 catgattaagacattgtacaaaccttacaagcattgcctaag 12363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 405
Target Start/End: Original strand, 1144 - 1297
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||    
T  1144 aaacgaccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaaccttaatcaatcatgtagtctaggacttaagcca 1243  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaa 405  Q
    || || |||||||| | |||||||||||   |||| |||||| |||||| ||||    
T  1244 ctcacaaactattagaaattagttcaaaggatagcttaagttcgtatgagaaaa 1297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 405
Target Start/End: Original strand, 15400 - 15553
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||    
T  15400 aaacgaccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaaccttaatcaatcatgtagtctaggacttaagcca 15499  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaa 405  Q
    || || |||||||| | |||||||||||   |||| |||||| |||||| ||||    
T  15500 ctcacaaactattagaaattagttcaaaggatagcttaagttcgtatgagaaaa 15553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 147 - 493
Target Start/End: Original strand, 105 - 449
Alignment:
Q  147 attcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgta-tcaa 245  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||  |||| |||  || ||||| ||| ||| |||  ||  | |||     
T  105 attcaatcacatatctccacttagtcatata-ggctagtcacgaaagatt-acaagacaattcgctaaaaggaatcatttccgataaaaatccaaatcat 202  T
Q  246 gtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgta-gtcatgagct 344  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||| || ||| |||||     
T  203 gtggcaaa-cgaccaacattgataattttcaaagataggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatataagtc-tgagca 300  T
Q  345 taagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatca 444  Q
    || |||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||| | |  ||||||| ||||||||||||||||    
T  301 taggccacttacgaactatcaatcatttgttcaaagattagcctaagttcgtttgagaaaatcccaagtttatacattccacaatcccacccgaaaatca 400  T
Q  445 agtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||    
T  401 attttgacatgattaagacattgtaccaactttacaagcatagcctaag 449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 112 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 13888 - 13598
Alignment:
Q  112 caccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggc 211  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||  |||| |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |    
T  13888 caccttatgataaatatcatatccaacatctaacaatttattcacacatcgtcatttagacatataaggctagtcacgaa-gagttataagataattgac 13790  T
Q  212 tttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaac-ttactcaagttgaaaaactcac 310  Q
    || |||||| | ||  ||| ||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | || ||  ||| || |     
T  13789 tt-aaagaaccattcccgataaa-tccatatcaagtggcaaa-cgaccaacattgataattcccaaaacaaggtaacattattaaattttgaaagcttat 13693  T
Q  311 aaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaa 405  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| |||||| ||||    
T  13692 acatcaatcttaatcaatcatgtagtcctgagcttaagccacttacaaactattaaacattagatcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaa 13598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 252 - 493
Target Start/End: Original strand, 412 - 653
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  | || |||||||||||||||||| ||   |||| | ||  |||    
T  412 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctataattcaatcttaatcaatcatataagtatgaacatagacca 511  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| | |  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  512 cttacgaactatcaatcattagttcaaagattagcctacgttcgtatgagaaaatcccaagtttatacattccacaattccacccgaaaatcaagtttga 611  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||    
T  612 catgattaagacattgtaccaactttacacgcattgcctaag 653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 88 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 3542 - 3138
Alignment:
Q  88 attccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtca 187  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| | || | ||| |||||||||||| ||||  | ||| ||||||| |||||||||    
T  3542 attccaagtaa-gagaacatacaacatcttatgataaatatcatatccaactcataacaattcattcacacatctctacttactcatata-ggctagtca 3445  T
Q  188 cgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcg-tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattt-tcaaaacaaggt 285  Q
     |||||||  |||||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||   ||  || || |||||||| || ||||||| |||||||| |||||  ||||     
T  3444 tgaaagatc-ataagacaattggcttaaaagaatcatttccgacaattatccataccatgtggcaaa-cggccaacatcgataatttctcaaagtaaggc 3347  T
Q  286 aacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattag 385  Q
    |||    | || ||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | |||    
T  3346 aacaatataaaatttgaaaactcacaaaacaatcttaatcaatcaagtagtcatgagcttaagccagttacaaactattagacattagttcaaagaatag 3247  T
Q  386 cctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagcct 485  Q
    | |||||  |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||  |  ||| ||||||||||    
T  3246 cttaagtccgtatgagaaaa-cccaaattaacattttccacattctcacccgaaattcaagtttaacatgattaagatgtttgaataacattacaagcct 3148  T
Q  486 tgcctaagtc 495  Q
    | ||||||||    
T  3147 tacctaagtc 3138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 147 - 495
Target Start/End: Original strand, 129459 - 129804
Alignment:
Q  147 attcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaag 246  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||  |||||| |  || ||| | ||| |||||||   |||||||||    
T  129459 attcattcacacatcttcacttagtcatataaggatagtcacgatagatt-ataagaaaattggttcaaaggaaacatttccgacaaaaaccgtatcaag 129557  T
Q  247 tggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagctta 346  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||  ||| |||| | ||||||  ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  129558 tggcaaa-cggccaacattgatagttcccaagacaaagcaacttagacaagttgaaag-ctctcaaa-caatcttaatcaatcatgtagtcatgcgctta 129654  T
Q  347 agccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcac-attttccacattcccacccgaaa-atca 444  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||| ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || |    
T  129655 agccacttacaaactattagacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaa-cccaatttcacaatctttcacattcccacccaaaatatta 129753  T
Q  445 agtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
      ||||||||||||||||  || |||||||  |||||| | | ||||||||    
T  129754 cttttgacatgattaagatgtttaaccaaccatacaagtcctacctaagtc 129804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 293 - 481
Target Start/End: Original strand, 78803 - 78989
Alignment:
Q  293 tcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagt 392  Q
    |||||||  ||| ||||||||  ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  78803 tcaagtttgaaagctcacaaaataatcttaatcaatcatgtgatcgagagcttaagcctcttacaaactattagacattagttcaaagattagcttaagt 78902  T
Q  393 ttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaa 481  Q
      |||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |  |||||| ||||||    
T  78903 ccgtatgagaaaa-cccaagttcacatttttcccattcccacccg-aatccaagtttgacatgattaaaacaattgaccaacattacaa 78989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 39130 - 38991
Alignment:
Q  224 ttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaa 323  Q
    |||||||||||||||||||||  |  ||||||||  || ||||| | |||||||| ||||  |||||| ||||||   ||| |  |||| ||||||||||    
T  39130 ttttcgacaaagttcgtatcattttacaaaacgataaatattgacacttttcaaagcaagaaaacttattcaagtatgaaatccaacaattcaatcttaa 39031  T
Q  324 tcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactat 363  Q
    |||||||| ||  ||||| | |||||||||||| ||||||    
T  39030 tcaatcatataagcatgaacataagccacttacaaactat 38991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 90180 - 90088
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatat 133  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| | |||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || |||| |||||| ||||    
T  90180 tcaacatcaactatatcatatagtttcaccattccaaacaattctcatattccaagt-aagagaacatacaacatctcatgacaaatatcatat 90088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 302 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 117642 - 117449
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   |||| |||||| ||||| |    
T  117642 aaaactcaccaaacaatcttaatcaatcatgtaatcaagagcttaagccacttacaaactattagacattagttcaaaggatagcttaagttcgtatgtt 117543  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  117542 aaaa-cccaagttaacattttccacattcccatccgaaatatcaagtttaacatgattaagatgtttgaccaactttacaagtcttacctaagtc 117449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 117796 - 117725
Alignment:
Q  147 attcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaa 220  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||    
T  117796 attcaatcacatatctccacttagtcatat-aggctagtcacgaaaga-tcataaggcaattggcttaaaagaa 117725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 302 - 495
Target Start/End: Original strand, 5859 - 6051
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  5859 aaaactcaccaaacaatcttaatcaatcatgtaatcaagaacataagccacttacaaactattagacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgat 5958  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  5959 aaaa-cccaagttaacattttccacattcccacccaaaattcacgtttaacatgattaagatgtttgaccaactttacaagtcttacctaagtc 6051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1849 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1849
Description:

Target: scaffold1849; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 316 - 495
Target Start/End: Original strand, 405 - 584
Alignment:
Q  316 aatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaag-tt 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    ||| |||||  |||||  |||| |||||| ||    
T  405 aatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacaaactattagacattagttcaaagtacagcttaagtccgtatgcgaaaa-cccaagttt 503  T
Q  415 cacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  504 cacattttccacaattccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattgtactaaccttacaagccttgtctaagtc 584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 251 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 4911 - 4667
Alignment:
Q  251 aaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcc 350  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||| ||| || ||||  |||||||  |||||  |||| |||||||||||||||||| ||   |||||| ||  ||    
T  4911 aaaacaaccaacattgacacttttcaaagcaaagtcacttgttcaagtttgaaaacctacaattcaatcttaatcaatcatataagtatgagcatagacc 4812  T
Q  351 acttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttg 450  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  4811 acttacgaactatcaagcattagttcaatgattagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagttcacatattccacaatcccacccgaaaatcaagtttt 4712  T
Q  451 acatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
     ||||| ||| |||||  |||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  4711 tcatgaataatacattataccatccttacatgcctttcctaagtc 4667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 259 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 14516 - 14282
Alignment:
Q  259 caacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacga 358  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||   || |  | || | |||||||||||||||| ||   |||||| || |||||||||||    
T  14516 caacattgataattttcaaagcgaggcaacttattcaagtttgtaatcctaaaatttaatcttaatcaatcatataagtatgagcataggccacttacga 14417  T
Q  359 actattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgatt 458  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| | |  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14416 actatcaatcattagttcaaagattagcctaagttcgtatgagaaactcccaagtttatacattctacaatcccacccgaaaatcaagtttgacatgatt 14317  T
Q  459 aagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    ||||||||  || ||| |||||||| |||||||||    
T  14316 aagacattgtacaaaccttacaagcattgcctaag 14282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 316 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 105644 - 105466
Alignment:
Q  316 aatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttc 415  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  | ||||||||||| | |||| || ||| |||||| |||| |||||||||    
T  105644 aatcttaatcaatcatgtagccatgagcttaaaccacttacaaactattggatattagttcaaagaatagcttacgttcgtatgagaaaa-cccaagttc 105546  T
Q  416 acattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | | ||| ||||| | ||||||||||||    
T  105545 acattttccacactcccacccgaaattcaagttttacatgattaagacatttatctaacattacaggtcttgcctaagtc 105466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 40 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 109377 - 109290
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatat 128  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| | |||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  109377 tcaacatcaactatatcatatagtttcaccattccaaacaattctcatattccaagt-aagagaacatacaacatctcatgacaaatat 109290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 260 - 495
Target Start/End: Original strand, 7595 - 7829
Alignment:
Q  260 aacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaa 359  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||    | |||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  7595 aacattgacaatttccaaaacaaggtaacaatataaagtttgaaaattcacaaaacaatcttaatcaatcatgtaatcaagagcttaagccacttacaaa 7694  T
Q  360 ctattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgatta 459  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||| |||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||   || ||| |||||||||    
T  7695 ctattagacattagttcaaagaatagcttaagttcgcatgataaaa-cccaagttaacattttccatattcccacccgaaatctaaatttaacatgatta 7793  T
Q  460 agacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||  ||  ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  7794 agatgtttgaccaacgctacaagtcttacctaagtc 7829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 238 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 1363 - 1142
Alignment:
Q  238 cgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtc 337  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||| |||| | ||||||  ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1363 cgtatcaagtggcaaa-cggccaacattgataattcccaagacaaagaaacttagacaagttgaaag-ctctcaaa-caatcttaatcaatcatgtagtc 1267  T
Q  338 atgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccg 437  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| | ||||  ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  1266 atgagcttaagccacttacaagctattagacattagttcaaagaatagctaaagttcgtatgagaaaa-cccaatttcacgttttctacattcccacccg 1168  T
Q  438 aaa-atcaagtttgacatgattaaga 462  Q
    ||| ||||   |||||||||||||||    
T  1167 aaatatcacagttgacatgattaaga 1142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 252 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 2664 - 2423
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |  |  |||||| |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||| | ||   |||||| || ||||    
T  2664 aaacggccaacattgataattttcaaagctggacaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcgtataagtatgagcataggcca 2565  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttga 451  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2564 cttacgaactatcgatcattagttcaaaggttagcctaagttcgtatgagaaaatcccaagtttttacattccacattcccacccgaaaatcaagcttga 2465  T
Q  452 catgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaag 493  Q
    |||||||||||||||  || ||  |||||||| |||||||||    
T  2464 catgattaagacattgtacgaatcttacaagcattgcctaag 2423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 336 - 495
Target Start/End: Original strand, 6637 - 6796
Alignment:
Q  336 tcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacc 435  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6637 tcatgagcttaagccacttacaaactattagacattagttcaaagtatagcttaagtttgtatgagaaaa-cccaagttcacattttccacattcccacc 6735  T
Q  436 cgaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||  ||  ||| |||||||||| |||| |||||||    
T  6736 cgaaatatcaagtttaacatgattaagatgtttgacccactttacaagtcttgtctaagtc 6796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 336 - 495
Target Start/End: Original strand, 16062 - 16221
Alignment:
Q  336 tcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacc 435  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16062 tcatgagcttaagccacttacaaactattagacattagttcaaagtatagcttaagtttgtatgagaaaa-cccaagttcacattttccacattcccacc 16160  T
Q  436 cgaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||  ||  ||| |||||||||| |||| |||||||    
T  16161 cgaaatatcaagtttaacatgattaagatgtttgacccactttacaagtcttgtctaagtc 16221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 338 - 495
Target Start/End: Original strand, 4140 - 4296
Alignment:
Q  338 atgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcaca-ttttccacattcccaccc 436  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||  ||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  4140 atgatcttaacccacttacaaactattagacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaa--cccaatttcacaatttttcacaatcccaccc 4237  T
Q  437 gaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  4238 gaaaatcaagtttgacatgtttaaaacattgtactaaccttacaagccttgtctaagtc 4296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 302 - 495
Target Start/End: Original strand, 59827 - 60021
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacatta--gttcaaaaattagcctaagtttgtatg 399  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||   |||| |||||| || |     
T  59827 aaaactcaccaaacaatcttaattaatcatgtaatcaagaacttaagccacttacaaactattagacattatagttcaaaggatagcttaagttcgtgta 59926  T
Q  400 ataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  59927 agaaaa-cccaagtccacattttccacaatcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattgtactaaccttacaagccttgtctaagtc 60021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 148 - 463
Target Start/End: Original strand, 2202 - 2514
Alignment:
Q  148 ttcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttc-gacaaagttcgtatcaag 246  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||  |||||| |  |||||| | ||||| ||||||   |||||||||    
T  2202 ttcattcacacatcttcacttagtcatataaggatagtcacgatagatt-acaagaaaattggttcaaaagaaactttttccgacaaaaaccgtatcaag 2300  T
Q  247 tggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagctta 346  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||  ||| |||| | ||||||  ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2301 tggcaaa-cggccatcattgatgattcccaagacaaagcaacttagacaagttgaaag-ctctcaaa-caatcttaatcaatcatgtagtcatgagctta 2397  T
Q  347 agccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcac-attttccacattcccacccgaaa-atca 444  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| | |    |||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||    
T  2398 agccacttacaaactattagacattagttcaaagaatagcttaagttcgca--ccaaaaacccaatttcacaatctttcacattcccacccgaaatatca 2495  T
Q  445 agtttgacatgattaagac 463  Q
      |||||||||||||||||    
T  2496 cttttgacatgattaagac 2514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 334 - 480
Target Start/End: Original strand, 30245 - 30390
Alignment:
Q  334 agtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattccca 433  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  30245 agtcatgagcttaagccacttacaaactattaaacattagttcaaagaatagctcaagttcgtatgagaaaa-cccaagttcacattttcaaaattccca 30343  T
Q  434 cccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttaca 480  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  30344 cccgaaattcaagtttaacatgattaagatatttgaccaactttaca 30390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 286
Target Start/End: Original strand, 29988 - 30235
Alignment:
Q  34 cattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatat 133  Q
    ||||||||||  ||||| | || ||||||||  |||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||    
T  29988 cattaatcaaattcaactacatcatatagtttcaccactccaattatttctcatattccaagtaa-gagaacatacaacatctcatgataaatatcatat 30086  T
Q  134 tccacgcc-taaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgaca 232  Q
      || ||  ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||| ||| |||||    
T  30087 --caagctataacaattcactcatacatcttcatttagtcatataaggttagtcacgaaaga-tcataagataattggctcaaaagaatcatttccgaca 30183  T
Q  233 aagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggta 286  Q
    || | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  30184 aa-tccatatcaagtggc-aaacgaccaacattgataattcccaaaacaaggta 30235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 276 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 24704 - 24486
Alignment:
Q  276 aaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagtt 375  Q
    ||||||||||||| || |||||||  ||||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  24704 aaaacaaggtaacatattcaagtttgaaaactcccaaaataatcttaaacaatcatgtaatcaagaacttaagccacttacaaactattagatattagtt 24605  T
Q  376 caaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaagacattcaaccaac 474  Q
    ||||   |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||    
T  24604 caaagtatagcttaagttcgtatgagaaaa-cccaagttcacatttt-catattcccacccgaaatatcaagtttaacatgattaagatgtttgaccaac 24507  T
Q  475 tttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||| |||| ||| ||||||||    
T  24506 ttttcaagtcttacctaagtc 24486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24897 - 24718
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacg 139  Q
    ||||||||||  | || ||||||||  ||||||||||||| || ||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  24897 tcaacatcaaatacatcatatagtttcaccactccaaatatttatcatatttcaagtaacgagaaaatacaacacctcatgataaatattatattcaaca 24798  T
Q  140 cctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaa 220  Q
      ||| ||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||| ||||||    
T  24797 tataacaatccattcacacatcattatttagtcatataaggctagtcacgaaaga-tcatatgataattggcttaaaagaa 24718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1752 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1752
Description:

Target: scaffold1752; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 147 - 355
Target Start/End: Original strand, 564 - 770
Alignment:
Q  147 attcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgta-tcaa 245  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||  ||||||||| || ||||| ||| |||||||  ||  | |||     
T  564 attcaatcacatatctccacttagtcatata-ggctagtaacgaaagatc-ataagacaattggcttaaatgaatcatttccgacaaatatcaaaatcat 661  T
Q  246 gtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagctt 345  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  662 gtggcaaat-gaccaacattgataattctcaaaataaagtaacttattcaagtttgaaaacgcacaaattaatcttaatcaatcatgtagtcatgagctt 760  T
Q  346 aagccactta 355  Q
    ||||||||||    
T  761 aagccactta 770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 240 - 462
Target Start/End: Original strand, 18393 - 18612
Alignment:
Q  240 tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcat 339  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||  ||  |||| | ||||||  ||||||||||  ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  18393 tatcaagtggcaaa-cggccaacattgataattcccaggacaaagcaacttagacaagttgaaag-ctctcaaa-caatcttaaccaatcatgtagtcat 18489  T
Q  340 gagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaa 439  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||| || || ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18490 gaatttaagccacttacaaactattagacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaa-cctaatttcacgttttcctcattcccacccgaa 18588  T
Q  440 a-atcaagtttgacatgattaaga 462  Q
    | ||||  ||||||||||||||||    
T  18589 atatcacatttgacatgattaaga 18612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 240 - 462
Target Start/End: Original strand, 30178 - 30397
Alignment:
Q  240 tatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcat 339  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||  |   |||| | ||||||  ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30178 tatcaagtggcaaa-cggccaacattgataattccctggacaaagcaacttagacaagttgaaag-ctctcaaa-caatcttaatcaatcatgtagtcat 30274  T
Q  340 gagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaa 439  Q
    ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||    
T  30275 gaatttaagccgcttacaaactattagacattagttcaaagaatagcttaagttcgtatgagaaaa-cccaatttcacgttttccacattcccgtccgaa 30373  T
Q  440 a-atcaagtttgacatgattaaga 462  Q
    | ||||  ||||||||||||||||    
T  30374 atatcacatttgacatgattaaga 30397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 167 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 90823 - 90552
Alignment:
Q  167 ttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcg-tatcaagtggcaaaacgaccaacatt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||   ||  || || |||||||| || |||||||     
T  90823 ttagtcatata-ggctagtcacgaaagatc-ataagacaattggcttaaaagaatcatttccgacaattatccataccatgtggcaaa-cggccaacatc 90727  T
Q  266 gataattt-tcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactatt 364  Q
    |||||||| |||||  |||| |||    | |||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  90726 gataatttctcaaagtaaggcaacaatataaagtttgaaaactcacaaaacaagcttaatcaatcaagtagtcatgagcttaagccacttacaaactatt 90627  T
Q  365 aaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaa 440  Q
    | ||||||||||||| | |||| |||||  |||||| ||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  90626 agacattagttcaaagaatagcttaagtccgtatgagaaaat-ccaagttaacacttttcacattcccacccgaaa 90552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 302 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 23460 - 23299
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||   || | |||||  ||||||     
T  23460 aaaactcgcaaaataatcttaatcaatcatgtagtcaataacttaagccacttacaaactattagacattacttcaaaggataacttaagtccgtatgag 23361  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagaca 464  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23360 aaaa-cccaagatcacatcttccacattcccacccgaaatccaagtttgacatgattaagaca 23299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 167 - 379
Target Start/End: Original strand, 4831 - 5041
Alignment:
Q  167 ttagtcatataaggctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcg-tatcaagtggcaaaacgaccaacatt 265  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |  |||||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||  ||||| |||||||| || ||||||||    
T  4831 ttagtcatata-ggctggtcacgaaaggtc-ataagacaattggcttaaaagaatcatttccgacaaaaatccatatcatgtggcaaa-cggccaacatt 4927  T
Q  266 gataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactatta 365  Q
    ||||||| |||||| || |||  ||| |||||||| |||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  4928 gataattctcaaaataaagtactttattcaagttggaaaactaaccaatcaattttaattaatcatgtagtcatgagctcaagccccttacaaactatta 5027  T
Q  366 aacattagttcaaa 379  Q
     |||||||||||||    
T  5028 gacattagttcaaa 5041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 215 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 1780 - 1591
Alignment:
Q  215 aaagaatcgttttcgacaaagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaat 314  Q
    |||||||  ||| ||||||| | | ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||  ||| |  |||| |    
T  1780 aaagaattatttccgacaaaatccatatcaagtgacaaa-cggccaacattgataattttcaaagctaggtaacttattcaagtttgaaaccctacaatt 1682  T
Q  315 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaa 405  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||   |||| |||||| |||||| ||||    
T  1681 caatcttaatcaaacatgtagtcaaggacttaagccacttacaaactattagaaattagtccaaaggatagcttaagttcgtatgagaaaa 1591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1311 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1311
Description:

Target: scaffold1311; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 316 - 466
Target Start/End: Original strand, 892 - 1041
Alignment:
Q  316 aatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttc 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||   |||||||||||   | || |||||| |||||| |||| |||||||||    
T  892 aatcttaatcaatcatgtggtcatgagcttaagccactcacaaactattaggtattagttcaaagtgtggcttaagttcgtatgagaaaa-cccaagttc 990  T
Q  416 acattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacatt 466  Q
    ||||||| |||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  991 acatttttcacattcccacccgaaatctaaatttaacatgattaagacatt 1041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 302 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 6766 - 6574
Alignment:
Q  302 aaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgat 401  Q
    ||||||||| || || |||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| | |||| |||| | |||||||    
T  6766 aaaactcaccaaacagtcttaatcaaccatgtaatcaagaacttaagccacttataaactattgaacattagtccaaagaatagcttaagatcgtatgat 6667  T
Q  402 aaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||  ||  | |||| |||||||| |||| ||||||    
T  6666 aaaa-cccaagttaacatttttcacattcccacccgaaaaaaaggtttaacatgattaagatgtttgatcaacgttacaagcattgcgtaagtc 6574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 318 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 71341 - 71166
Alignment:
Q  318 tcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgt-atgataaaatcccaagttca 416  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||  || ||| |||||  || |||| |||| |||||||| |    
T  71341 tcttaatcaatcaagtaatcataagcttaagccacttac-aactattagaaattagttcaagtat-agcttaagtccgttatgagaaaa-cccaagttta 71245  T
Q  417 cattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  71244 catttttcacattcccacccaaaatccaagtttggcatgattaagacaatcaaccaacattacaagctgtgcctaagtc 71166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 315 - 463
Target Start/End: Original strand, 34602 - 34750
Alignment:
Q  315 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagtt 414  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||   || | |||| ||||||||    
T  34602 caatcttaatcaatcatgtggtcatgaacgtaagccacttacaaactattagacattagttcaaagaatagcttaagttcacataagaaaa-cccaagtt 34700  T
Q  415 cacattttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaagac 463  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  34701 cacatttcccatattcccacccgaaatgtcaagtttaccatgattaagac 34750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8364 - 8269
Alignment:
Q  81 ttctcacattccaagtaaag-agaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatat 176  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||| ||||| || ||||||    
T  8364 ttctcacaatccaagtaaaggagaaaatacaacaccttatgataaatatcatattcaacacctaacaa-tcattcacatatattcatgtaatcatat 8269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 193
Target Start/End: Original strand, 34437 - 34481
Alignment:
Q  149 tcattcacatatcttcatttagtcatataaggctagtcacgaaag 193  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  34437 tcattcacacatcttcatttagtcatatacggctagttacgaaag 34481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 316 - 440
Target Start/End: Original strand, 10749 - 10871
Alignment:
Q  316 aatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttc 415  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||||| |||| ||  |||||    
T  10749 aatcttaat-aatcatgtggtcaagagcttaagccacttacaaactattagacattagttcaaagattagcttaagtccgtatgagaaaa-cctgagttc 10846  T
Q  416 acattttccacattcccacccgaaa 440  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  10847 acattttccacattcccaccagaaa 10871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 251 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 20388 - 20234
Alignment:
Q  251 aaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcc 350  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||   ||| |||||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||| |||||||||| || |  ||||||||    
T  20388 aaaacggccaacattgataattttcaaagttaggcaacttattcaagtttgaaatcttacaattcaatcttaataaatcatgtagccaaggacttaagcc 20289  T
Q  351 acttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaa 405  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||    
T  20288 acttaccaactattagaaattagttcaaaagatagcttaagttcgtatgagaaaa 20234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 408
Target Start/End: Original strand, 28091 - 28247
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||| ||  ||| |  |||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||    
T  28091 aaacgaccaacattgataattttcaaagttaggtaacttattcaaatttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagccaagtacttaagcca 28190  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcc 408  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||   |||| ||||||  ||||| |||||||    
T  28191 cttacaaactattagaaattagttcaaaggatagcttaagttaatatgagaaaatcc 28247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 301 - 440
Target Start/End: Original strand, 53639 - 53776
Alignment:
Q  301 aaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatga 400  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| | || | |||| |  |||||    
T  53639 aaaaactcaccaaacaatcttaatcaatcatgtagttaagaacttaagccacttacaaactatt-aactttagttcaaagaataacttaagatcatatga 53737  T
Q  401 taaaatcccaagttcacattttccacattcccacccgaaa 440  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  53738 taaaa-cccaagttcacattttctaccatcccacccgaaa 53776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 379
Target Start/End: Original strand, 78625 - 78752
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| |||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  78625 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaaacttaatcaatcatgtagtcaaggacttaagcca 78724  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaa 379  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  78725 cttacaaactattagaaattagttcaaa 78752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 2713 - 2560
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||    
T  2713 aaacggccaacattgataattttcaaagttaggcaacttactcaagtttcaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagccaaggacttaagcca 2614  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaa 405  Q
    ||||  |||||||| | |||||||||||   |||| |||||| |||||| ||||    
T  2613 cttaaaaactattataaattagttcaaaggatagcttaagttcgtatgagaaaa 2560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 316 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 2484 - 2338
Alignment:
Q  316 aatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaagttc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||| |||||   ||| ||||| |||    
T  2484 aatcttaatcaatcatgtagtcatgaacttaactcacttacggactattagacattagtataaaaaatagcttaagttcgtatg--gaaaacccaatttc 2387  T
Q  416 ac-attttccacattcccacccgaaa-atcaagtttgacatgattaaga 462  Q
    || || |  ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  2386 acaatctatcacattcccacccgaaatatcacttttgacatgattaaga 2338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 318 - 483
Target Start/End: Original strand, 9155 - 9318
Alignment:
Q  318 tcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcccaag-ttca 416  Q
    ||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  |||||| |||  |||||| || |    
T  9155 tcttaatcaattatgaactcataagcttaagccacttataaactattaaacattagttcaaagtttagcttaagtccgtatgagaaa--cccaagtttta 9252  T
Q  417 cattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagc 483  Q
    ||||||| |  |||||||||||||| |||  | |||||||||||||||  |||| ||| ||||||||    
T  9253 cattttcgaacttcccacccgaaaaacaa-atcgacatgattaagacaaccaactaacattacaagc 9318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 2537 - 2460
Alignment:
Q  316 aatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtt 393  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | || |||||| ||||||    
T  2537 aatcttaatcaatcgtgtagtcatgagcttaagccacttacagactattagacattagtccgaacattagcttaagtt 2460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 10792 - 10715
Alignment:
Q  316 aatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtt 393  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | || |||||| ||||||    
T  10792 aatcttaatcaatcgtgtagtcatgagcttaagccacttacagactattagacattagtccgaacattagcttaagtt 10715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 258 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 8565 - 8444
Alignment:
Q  258 ccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacg 357  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||| | |||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |     
T  8565 ccaacattgataatttttaaagctaggcaacttatttaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggacttaagccacttgca 8466  T
Q  358 aactattaaacattagttcaaa 379  Q
    |||||||| | |||||||||||    
T  8465 aactattagaaattagttcaaa 8444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 405
Target Start/End: Original strand, 6409 - 6505
Alignment:
Q  309 acaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaa 405  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||   |||| |||||| |||||| ||||    
T  6409 acaattcaatcttaatcaatcatgtagtcaaggactcaagccacttacaaactattagacattagttcaaaggatagcttaagttcgtatgagaaaa 6505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 379
Target Start/End: Original strand, 1587 - 1708
Alignment:
Q  258 ccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacg 357  Q
    |||||||||||||||||||||   ||| |||||| | |||||  ||| |  |||| ||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||     
T  1587 ccaacattgataattttcaaagttaggcaacttatttaagtttgaaatcctacaattcaatattaatcaatcatgtagtcaaggacttaagccacttaca 1686  T
Q  358 aactattaaacattagttcaaa 379  Q
    |||||||| |  ||||||||||    
T  1687 aactattagaagttagttcaaa 1708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 379
Target Start/End: Original strand, 17833 - 17954
Alignment:
Q  258 ccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccacttacg 357  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | |||||  ||| |  |||| | |||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||     
T  17833 ccaacattgataattttcaaagctaggcaacttatttaagtttgaaatcctacaatttaatcttaatccatcatatagtcaaggacttaagccacttaca 17932  T
Q  358 aactattaaacattagttcaaa 379  Q
    |||||||| | |||||||||||    
T  17933 aactattagaaattagttcaaa 17954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 126
Target Start/End: Original strand, 12330 - 12421
Alignment:
Q  34 cattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatacttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaat 126  Q
    ||||||||||| ||||| | || ||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  12330 cattaatcaacttcaactacatcatatagtttcaccactccaaatatttctcatattccaagt-aagagaacatacaacatcttatgataaat 12421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 155339 - 155183
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||| |||| ||  ||| |  |||| || ||||||||||||||| ||| || |   ||||||||    
T  155339 aaacggccaacattgataatttttaaagctaggcaacttattcaaatttgaaatcctacaattcgatcttaatcaatcatatagccaaggatttaagcca 155240  T
Q  352 cttacgaactattaaacattagttcaaaaattagcctaagtttgtatgataaaatcc 408  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||   |||| |||||| |||||| |||||||    
T  155239 cttacaaactattataaattagttcaaaggatagcttaagttcgtatgagaaaatcc 155183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 335
Target Start/End: Original strand, 534 - 617
Alignment:
Q  252 aaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcatgtag 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  534 aaacggccaacattgataattttcaaagctaggcaacttattcaagtttgaaatcctacaattcaatcttaatcaatcatgtag 617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 413 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 13129 - 13047
Alignment:
Q  413 ttcacattttccacattcccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtc 495  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  13129 ttcacattttctacaatcccactcgaaaatcgagttttacatgtttaagacattatactaaccttacaagccttgtctaagtc 13047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 431 - 497
Target Start/End: Original strand, 10020 - 10086
Alignment:
Q  431 ccacccgaaaatcaagtttgacatgattaagacattcaaccaactttacaagccttgcctaagtcca 497  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10020 ccacccgaaatccaagtttgacatgattaagacacttaactaacattacaggccttgcctaagtcca 10086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 174
Target Start/End: Original strand, 32490 - 32582
Alignment:
Q  81 ttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcat 174  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  32490 ttctcacattctaagtaa-gagaacatacaacatctcatgataaatatcatattcaacacataacaattcattcacacatctccatttagtcat 32582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 355
Target Start/End: Original strand, 2562 - 2602
Alignment:
Q  315 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccactta 355  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2562 caatcttattcaatcatgtagtcatgagcttaagccactta 2602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 35943 - 35782
Alignment:
Q  81 ttctcacattccaagtaaagagaaaatgcaacaccttatgataaatattatattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatataagg 180  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || |||  ||||||||| || |||||| || || |  || |||||||||||||||||| || |||||| |      
T  35943 ttctcatattccaagtaaagagaaaatacaccacactatgataaacatcatattcaacacccagcaa-tcattcacatatcttcatataatcatatcaaa 35845  T
Q  181 ctagtcacgaaagatttataaggtaattggctttaaagaatcgttttcgacaaagttcgtatca 244  Q
    |||  ||| ||||||||   | ||| |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  35844 ctatccacaaaagattttccaagtatttggttttaaag-attattttcgacaaagttcgtatca 35782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 1446 - 1343
Alignment:
Q  34 cattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactcca-aatacttctcacattccaagtaaa-gagaaaatgcaacaccttatgataaatattat 131  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || |||||| |  | |||||||| | |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| || ||    
T  1446 cattaatcaacgtcaactatatcatatagttcaacaactccatacaatttctcacaattcaagtaaaggagaaaatacaacacattatgataaacatcat 1347  T
Q  132 attc 135  Q
    ||||    
T  1346 attc 1343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 5826 - 5723
Alignment:
Q  34 cattaatcaacatcaaccatataatatagttctaccactcca-aatacttctcacattccaagtaaa-gagaaaatgcaacaccttatgataaatattat 131  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || |||||| |  | |||||||| | |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| || ||    
T  5826 cattaatcaacgtcaactatatcatatagttcaacaactccatacaatttctcacaattcaagtaaaggagaaaatacaacacattatgataaacatcat 5727  T
Q  132 attc 135  Q
    ||||    
T  5726 attc 5723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1957 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1957
Description:

Target: scaffold1957; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 731 - 633
Alignment:
Q  233 aagttcgtatcaagtggcaaaacgaccaacattgataattttcaaaacaaggtaacttactcaagttgaaaaactcacaaatcaatcttaatcaatcat 331  Q
    ||||||||||||||| |||||||  | ||||| |||| |||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||  |||| || |||||||| ||||||    
T  731 aagttcgtatcaagtagcaaaacagctaacatggatatttttcaaagcaaagtaacttgttcaagtttaaaaacctacaactcgatcttaattaatcat 633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 176
Target Start/End: Original strand, 11565 - 11709
Alignment:
Q  34 cattaatcaacat-caaccatataatatagttctaccactccaaatactt-ctcacattccaagtaaag-agaaaatgcaacaccttatgataaatatta 130  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||  || || ||| || | |||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| || |    
T  11565 cattaatcaacattcaactatataatataactcaacaacttcatacactttctcacaatccaagtaaaggagaaaataaaacaccttatgataaacatca 11664  T
Q  131 tattccacgcctaaaaattcattcacatatcttcatttagtcatat 176  Q
    ||||| || || ||||| | ||| |||||||||||| || ||||||    
T  11665 tattcaacacccaaaaa-taattgacatatcttcatataatcatat 11709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 1399 - 1323
Alignment:
Q  40 tcaacatcaaccatataatatagttctaccactccaaatac-ttctcacattccaagtaaa-gagaaaatgcaacac 114  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  1399 tcaacatcaactatatcatatagttcaacaactccatatactttctcacaatccaagtaaaggagaaaatacaacac 1323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 355
Target Start/End: Original strand, 7026 - 7066
Alignment:
Q  315 caatcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagccactta 355  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7026 caattttaatcaatcatgtagtcataagcttaagccactta 7066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 350
Target Start/End: Original strand, 158403 - 158435
Alignment:
Q  318 tcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcc 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158403 tcttaatcaatcatgtagtcatgagcttaagcc 158435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University