View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18715_low_7 (Length: 333)

Name: NF18715_low_7
Description: NF18715
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18715_low_7
NF18715_low_7
[»] chr4 (104 HSPs)
chr4 (1-314)||(44615292-44615605)
chr4 (1-314)||(15118198-15118510)
chr4 (1-314)||(50222185-50222497)
chr4 (1-314)||(18239265-18239577)
chr4 (1-314)||(44772929-44773245)
chr4 (1-314)||(3515011-3515324)
chr4 (1-327)||(14970552-14970878)
chr4 (1-314)||(19242703-19243017)
chr4 (33-314)||(12185-12465)
chr4 (33-314)||(52312514-52312794)
chr4 (33-314)||(18215152-18215432)
chr4 (1-314)||(1837365-1837667)
chr4 (33-318)||(15355202-15355487)
chr4 (33-327)||(19618050-19618343)
chr4 (1-314)||(7641032-7641340)
chr4 (126-314)||(51463838-51464026)
chr4 (126-314)||(23803235-23803423)
chr4 (139-314)||(44102218-44102393)
chr4 (126-314)||(12610954-12611135)
chr4 (139-320)||(15367691-15367873)
chr4 (139-320)||(15402704-15402886)
chr4 (150-314)||(44928873-44929038)
chr4 (139-302)||(21815568-21815731)
chr4 (139-320)||(15371203-15371385)
chr4 (139-320)||(15373484-15373666)
chr4 (139-320)||(15370019-15370200)
chr4 (142-320)||(16223533-16223712)
chr4 (144-314)||(20149833-20150004)
chr4 (1-154)||(15534345-15534498)
chr4 (1-154)||(36038034-36038187)
chr4 (1-154)||(14048741-14048894)
chr4 (1-154)||(49547619-49547772)
chr4 (200-314)||(54798753-54798868)
chr4 (200-314)||(14280320-14280434)
chr4 (33-155)||(52873056-52873177)
chr4 (33-154)||(15496949-15497069)
chr4 (1-108)||(362390-362497)
chr4 (1-108)||(19617912-19618019)
chr4 (156-314)||(14038655-14038814)
chr4 (156-313)||(16377478-16377634)
chr4 (1-108)||(52872918-52873025)
chr4 (156-320)||(7088878-7089043)
chr4 (156-320)||(7798775-7798940)
chr4 (156-319)||(22636437-22636601)
chr4 (1-108)||(18215014-18215121)
chr4 (156-320)||(7893704-7893869)
chr4 (156-320)||(12902758-12902923)
chr4 (1-101)||(29267570-29267670)
chr4 (209-320)||(52873375-52873487)
chr4 (5-108)||(15355068-15355171)
chr4 (1-108)||(15496019-15496126)
chr4 (200-314)||(8574868-8574981)
chr4 (145-302)||(22353852-22354010)
chr4 (1-108)||(14746357-14746464)
chr4 (156-320)||(16270191-16270355)
chr4 (33-154)||(14746495-14746617)
chr4 (134-302)||(13783-13953)
chr4 (156-320)||(44052830-44052995)
chr4 (156-320)||(6899892-6900056)
chr4 (141-306)||(43198492-43198661)
chr4 (139-306)||(52243131-52243302)
chr4 (67-135)||(362268-362336)
chr4 (1-68)||(12100-12167)
chr4 (158-320)||(16239927-16240089)
chr4 (1-111)||(52312769-52312879)
chr4 (156-316)||(23374314-23374475)
chr4 (1-108)||(19857798-19857895)
chr4 (33-115)||(19857685-19857767)
chr4 (236-320)||(3096294-3096379)
chr4 (139-302)||(46640393-46640558)
chr4 (158-247)||(15464888-15464977)
chr4 (139-302)||(53082089-53082254)
chr4 (268-320)||(39706356-39706408)
chr4 (103-154)||(19857608-19857659)
chr4 (160-306)||(12288169-12288316)
chr4 (150-320)||(15551818-15551985)
chr4 (196-307)||(12774021-12774132)
chr4 (141-229)||(8846465-8846553)
chr4 (222-320)||(14053323-14053421)
chr4 (260-320)||(17046488-17046549)
chr4 (1-44)||(30147189-30147232)
chr4 (222-302)||(6190481-6190563)
chr4 (260-307)||(8846370-8846418)
chr4 (33-67)||(9923591-9923625)
chr4 (33-67)||(25513032-25513066)
chr4 (34-67)||(10272793-10272826)
chr4 (34-67)||(12622677-12622710)
chr4 (34-67)||(13164411-13164444)
chr4 (34-67)||(13164523-13164556)
chr4 (34-67)||(14508055-14508088)
chr4 (34-67)||(15041855-15041888)
chr4 (34-67)||(15112536-15112569)
chr4 (139-191)||(16043142-16043195)
chr4 (34-111)||(19617998-19618075)
chr4 (34-67)||(25512939-25512972)
chr4 (34-67)||(26445174-26445207)
chr4 (34-67)||(26922468-26922501)
chr4 (34-67)||(40229671-40229704)
chr4 (34-67)||(46740441-46740474)
chr4 (34-67)||(46740567-46740600)
chr4 (34-67)||(55582553-55582586)
chr4 (139-190)||(15791905-15791957)
chr4 (260-300)||(17333298-17333338)
chr4 (35-67)||(35660202-35660234)
[»] chr7 (122 HSPs)
chr7 (1-314)||(14948968-14949280)
chr7 (1-314)||(15376559-15376871)
chr7 (1-314)||(20384969-20385281)
chr7 (1-314)||(21189441-21189753)
chr7 (1-314)||(32125495-32125807)
chr7 (1-314)||(456325-456638)
chr7 (1-314)||(16232524-16232837)
chr7 (1-314)||(41522921-41523234)
chr7 (1-314)||(41525383-41525696)
chr7 (1-314)||(11393132-11393445)
chr7 (1-314)||(16410063-16410375)
chr7 (1-314)||(27216864-27217177)
chr7 (1-314)||(18640276-18640588)
chr7 (1-320)||(18430710-18431028)
chr7 (1-314)||(24702242-24702545)
chr7 (3-314)||(16213688-16213999)
chr7 (33-314)||(11972500-11972780)
chr7 (1-314)||(24704692-24704992)
chr7 (1-314)||(13869350-13869665)
chr7 (1-314)||(26355827-26356152)
chr7 (1-314)||(26358279-26358604)
chr7 (139-314)||(44116513-44116688)
chr7 (140-314)||(3386337-3386511)
chr7 (126-302)||(13647344-13647521)
chr7 (169-327)||(24275162-24275320)
chr7 (139-314)||(17061898-17062073)
chr7 (1-167)||(18627717-18627882)
chr7 (33-225)||(15081825-15082019)
chr7 (139-314)||(38898359-38898535)
chr7 (139-302)||(12756654-12756817)
chr7 (141-314)||(20110560-20110723)
chr7 (1-154)||(11303411-11303564)
chr7 (1-154)||(16108534-16108687)
chr7 (33-154)||(14269940-14270060)
chr7 (59-173)||(13841157-13841270)
chr7 (199-314)||(48273396-48273512)
chr7 (1-108)||(8940489-8940596)
chr7 (192-314)||(13831377-13831499)
chr7 (1-154)||(29796772-29796927)
chr7 (1-154)||(29800591-29800746)
chr7 (156-314)||(3564319-3564478)
chr7 (5-108)||(14269806-14269909)
chr7 (5-154)||(23664802-23664951)
chr7 (1-108)||(15081687-15081794)
chr7 (156-314)||(18456368-18456526)
chr7 (156-320)||(12698832-12698998)
chr7 (5-106)||(45847504-45847605)
chr7 (33-154)||(38898106-38898228)
chr7 (67-154)||(8468804-8468891)
chr7 (1-108)||(8468945-8469052)
chr7 (156-320)||(9509190-9509355)
chr7 (156-320)||(38227482-38227646)
chr7 (33-154)||(8940336-8940458)
chr7 (139-306)||(2280056-2280225)
chr7 (33-135)||(45847638-45847739)
chr7 (1-98)||(13841274-13841371)
chr7 (150-305)||(26212012-26212168)
chr7 (28-108)||(38897995-38898075)
chr7 (200-306)||(15144037-15144143)
chr7 (207-305)||(10589055-10589154)
chr7 (1-111)||(11972755-11972865)
chr7 (160-320)||(67746-67904)
chr7 (139-320)||(19486681-19486864)
chr7 (160-307)||(18005660-18005806)
chr7 (200-320)||(22072914-22073036)
chr7 (160-306)||(16056343-16056488)
chr7 (139-320)||(16495403-16495581)
chr7 (150-320)||(34200787-34200954)
chr7 (160-320)||(47831808-47831968)
chr7 (139-306)||(1867932-1868101)
chr7 (141-299)||(12255730-12255892)
chr7 (150-234)||(15113031-15113114)
chr7 (160-306)||(16219677-16219823)
chr7 (222-320)||(16386268-16386368)
chr7 (139-240)||(20220127-20220225)
chr7 (139-320)||(10063760-10063938)
chr7 (156-319)||(40443393-40443555)
chr7 (160-307)||(811091-811238)
chr7 (260-320)||(28505357-28505418)
chr7 (150-234)||(15116568-15116651)
chr7 (268-307)||(44014192-44014231)
chr7 (260-314)||(18154901-18154955)
chr7 (268-320)||(15754955-15755007)
chr7 (34-113)||(13745569-13745648)
chr7 (216-314)||(14932749-14932848)
chr7 (33-108)||(15119918-15119993)
chr7 (216-314)||(15356184-15356283)
chr7 (216-314)||(15360298-15360397)
chr7 (139-240)||(15008436-15008536)
chr7 (263-327)||(15211450-15211515)
chr7 (268-320)||(11996095-11996147)
chr7 (34-98)||(38294567-38294631)
chr7 (275-306)||(14044761-14044792)
chr7 (275-306)||(14354791-14354822)
chr7 (296-327)||(16213622-16213653)
chr7 (263-321)||(2832504-2832562)
chr7 (34-84)||(9743795-9743845)
chr7 (33-67)||(20619575-20619609)
chr7 (34-67)||(8473054-8473087)
chr7 (34-67)||(8514393-8514426)
chr7 (34-67)||(8851889-8851922)
chr7 (139-191)||(9033283-9033336)
chr7 (34-67)||(13745506-13745539)
chr7 (34-67)||(14153622-14153655)
chr7 (34-67)||(15119972-15120005)
chr7 (34-67)||(15576619-15576652)
chr7 (139-191)||(20619511-20619564)
chr7 (34-67)||(25941538-25941571)
chr7 (271-320)||(27847901-27847950)
chr7 (34-67)||(33556906-33556939)
chr7 (34-67)||(33556968-33557001)
chr7 (34-67)||(36301549-36301582)
chr7 (34-67)||(37538498-37538531)
chr7 (34-67)||(37538652-37538685)
chr7 (34-67)||(43747766-43747799)
chr7 (34-67)||(48213658-48213691)
chr7 (35-67)||(4691559-4691591)
chr7 (32-64)||(14153671-14153703)
chr7 (35-67)||(15576494-15576526)
chr7 (34-66)||(15576556-15576588)
chr7 (35-67)||(20253005-20253037)
chr7 (35-67)||(43747829-43747861)
[»] chr6 (93 HSPs)
chr6 (1-314)||(18334438-18334750)
chr6 (1-314)||(24422551-24422863)
chr6 (1-314)||(33861798-33862110)
chr6 (1-314)||(33864282-33864594)
chr6 (1-314)||(2291026-2291338)
chr6 (1-314)||(12742321-12742634)
chr6 (1-327)||(30676555-30676881)
chr6 (1-327)||(34963364-34963690)
chr6 (1-314)||(1540757-1541069)
chr6 (1-314)||(19858765-19859077)
chr6 (1-314)||(8055033-8055346)
chr6 (1-314)||(26924486-26924798)
chr6 (1-314)||(22782231-22782543)
chr6 (33-314)||(19005050-19005330)
chr6 (1-313)||(25688507-25688819)
chr6 (50-314)||(25656633-25656897)
chr6 (104-314)||(1595553-1595763)
chr6 (126-314)||(25754813-25755001)
chr6 (126-314)||(20556864-20557050)
chr6 (139-302)||(18456735-18456898)
chr6 (1-327)||(19847813-19848122)
chr6 (140-314)||(3852001-3852175)
chr6 (144-314)||(16448514-16448685)
chr6 (166-302)||(18461895-18462031)
chr6 (1-154)||(12942365-12942518)
chr6 (1-122)||(17377693-17377814)
chr6 (1-134)||(23992604-23992739)
chr6 (33-151)||(18913994-18914111)
chr6 (1-154)||(28289182-28289333)
chr6 (33-135)||(31630524-31630626)
chr6 (156-320)||(25629310-25629475)
chr6 (1-109)||(1598266-1598373)
chr6 (156-323)||(18409782-18409950)
chr6 (159-320)||(29060541-29060703)
chr6 (1-108)||(18914142-18914249)
chr6 (33-154)||(15875470-15875590)
chr6 (196-320)||(20593774-20593899)
chr6 (173-320)||(17287768-17287916)
chr6 (156-320)||(20360915-20361080)
chr6 (156-306)||(25644335-25644487)
chr6 (156-302)||(18821801-18821946)
chr6 (156-320)||(16496245-16496410)
chr6 (196-320)||(19303536-19303660)
chr6 (5-108)||(31630390-31630493)
chr6 (209-320)||(20076701-20076812)
chr6 (82-151)||(18937252-18937321)
chr6 (173-320)||(22780199-22780347)
chr6 (1-108)||(19005361-19005468)
chr6 (1-84)||(25535641-25535724)
chr6 (216-320)||(20638298-20638403)
chr6 (141-306)||(20109153-20109322)
chr6 (139-320)||(8227448-8227631)
chr6 (1-108)||(15875621-15875718)
chr6 (160-302)||(23019425-23019567)
chr6 (260-320)||(25714418-25714478)
chr6 (260-320)||(27333277-27333338)
chr6 (260-320)||(27394017-27394078)
chr6 (209-327)||(23992421-23992540)
chr6 (160-306)||(9098473-9098620)
chr6 (150-304)||(28496424-28496575)
chr6 (150-304)||(29808835-29808986)
chr6 (207-306)||(19668386-19668488)
chr6 (274-320)||(22080799-22080845)
chr6 (139-191)||(23076862-23076915)
chr6 (268-320)||(1561304-1561356)
chr6 (268-307)||(19652209-19652248)
chr6 (268-302)||(11185524-11185558)
chr6 (34-108)||(35056707-35056781)
chr6 (222-320)||(35245587-35245684)
chr6 (139-191)||(18696617-18696670)
chr6 (139-191)||(18706435-18706488)
chr6 (260-300)||(22831524-22831565)
chr6 (139-191)||(35008280-35008333)
chr6 (268-320)||(16920698-16920750)
chr6 (260-300)||(33443068-33443108)
chr6 (193-294)||(15041542-15041644)
chr6 (33-67)||(18928118-18928152)
chr6 (223-327)||(25603406-25603512)
chr6 (223-327)||(25611744-25611850)
chr6 (34-92)||(32259078-32259136)
chr6 (34-67)||(10445380-10445413)
chr6 (34-67)||(13284938-13284971)
chr6 (34-111)||(15875565-15875642)
chr6 (139-191)||(18177609-18177662)
chr6 (139-191)||(18199353-18199406)
chr6 (139-191)||(18204209-18204262)
chr6 (34-67)||(20411319-20411352)
chr6 (34-67)||(20411382-20411415)
chr6 (139-191)||(28103836-28103889)
chr6 (34-67)||(29044492-29044525)
chr6 (34-67)||(35056632-35056665)
chr6 (34-67)||(35056695-35056728)
chr6 (260-307)||(4185880-4185928)
[»] chr3 (121 HSPs)
chr3 (1-314)||(34159330-34159642)
chr3 (1-314)||(55476495-55476807)
chr3 (1-314)||(16454127-16454439)
chr3 (1-314)||(17463182-17463494)
chr3 (1-314)||(6468980-6469292)
chr3 (1-314)||(45606752-45607065)
chr3 (1-314)||(13154101-13154414)
chr3 (1-314)||(7781192-7781505)
chr3 (2-327)||(13544016-13544340)
chr3 (1-314)||(10247569-10247881)
chr3 (1-314)||(13151636-13151949)
chr3 (1-327)||(12567551-12567876)
chr3 (1-314)||(28848467-28848769)
chr3 (33-314)||(9707484-9707765)
chr3 (33-314)||(8899098-8899378)
chr3 (33-314)||(16282689-16282969)
chr3 (33-310)||(38961769-38962045)
chr3 (33-314)||(41123894-41124171)
chr3 (11-314)||(8499522-8499827)
chr3 (1-314)||(15412433-15412748)
chr3 (1-314)||(27165254-27165569)
chr3 (115-314)||(17446614-17446812)
chr3 (1-314)||(53301349-53301665)
chr3 (139-314)||(29172565-29172741)
chr3 (126-310)||(50242830-50243014)
chr3 (139-314)||(17672630-17672805)
chr3 (139-302)||(53070636-53070799)
chr3 (1-154)||(15977697-15977849)
chr3 (139-314)||(12119707-12119883)
chr3 (126-302)||(43550448-43550625)
chr3 (1-327)||(46822259-46822578)
chr3 (187-314)||(15977519-15977646)
chr3 (1-154)||(54520986-54521139)
chr3 (1-148)||(12305315-12305462)
chr3 (207-314)||(55500946-55501053)
chr3 (1-135)||(10557091-10557225)
chr3 (156-320)||(14972855-14973020)
chr3 (156-314)||(40213676-40213834)
chr3 (200-314)||(36166602-36166715)
chr3 (156-320)||(17487857-17488022)
chr3 (156-320)||(17499339-17499504)
chr3 (200-308)||(21618459-21618566)
chr3 (1-153)||(29544687-29544839)
chr3 (1-108)||(12119499-12119606)
chr3 (156-320)||(25476340-25476505)
chr3 (140-303)||(42386428-42386593)
chr3 (156-313)||(43840940-43841098)
chr3 (215-314)||(10556989-10557088)
chr3 (207-320)||(18438535-18438649)
chr3 (156-320)||(13442275-13442440)
chr3 (156-320)||(20698391-20698555)
chr3 (156-320)||(23083316-23083481)
chr3 (156-320)||(26686888-26687053)
chr3 (193-320)||(12399210-12399338)
chr3 (1-97)||(13436520-13436616)
chr3 (156-307)||(14576788-14576939)
chr3 (139-320)||(24340660-24340843)
chr3 (219-314)||(44494813-44494908)
chr3 (33-154)||(11913928-11914050)
chr3 (156-314)||(24153164-24153322)
chr3 (193-307)||(14572603-14572717)
chr3 (220-314)||(17737240-17737337)
chr3 (1-84)||(24513910-24513993)
chr3 (1-111)||(38961684-38961794)
chr3 (1-98)||(25237063-25237160)
chr3 (156-320)||(11424718-11424879)
chr3 (141-302)||(52523666-52523831)
chr3 (33-113)||(17444694-17444773)
chr3 (1-68)||(16282603-16282670)
chr3 (139-303)||(23274705-23274871)
chr3 (5-111)||(17444613-17444719)
chr3 (5-111)||(41124146-41124252)
chr3 (139-320)||(37642202-37642385)
chr3 (1-98)||(25229476-25229573)
chr3 (141-240)||(2051138-2051238)
chr3 (160-306)||(15470939-15471085)
chr3 (33-100)||(25237009-25237075)
chr3 (141-307)||(16097342-16097509)
chr3 (139-202)||(17248224-17248287)
chr3 (193-327)||(30029834-30029968)
chr3 (160-320)||(14234488-14234648)
chr3 (139-302)||(37251105-37251270)
chr3 (141-307)||(16103794-16103960)
chr3 (150-247)||(22147474-22147571)
chr3 (265-314)||(45577947-45577996)
chr3 (260-314)||(28194697-28194752)
chr3 (196-317)||(32307681-32307802)
chr3 (150-320)||(13210280-13210447)
chr3 (150-307)||(12174212-12174366)
chr3 (207-327)||(12511051-12511172)
chr3 (158-302)||(43925977-43926123)
chr3 (1-42)||(20630037-20630078)
chr3 (139-302)||(22110289-22110454)
chr3 (109-146)||(15977663-15977700)
chr3 (260-307)||(49668135-49668183)
chr3 (34-108)||(25201323-25201397)
chr3 (260-321)||(14665397-14665458)
chr3 (260-307)||(9512934-9512982)
chr3 (260-307)||(9520909-9520957)
chr3 (260-300)||(13919350-13919390)
chr3 (1-32)||(10379613-10379644)
chr3 (260-314)||(856143-856197)
chr3 (263-317)||(3389999-3390053)
chr3 (263-321)||(14668553-14668611)
chr3 (34-92)||(15025934-15025992)
chr3 (139-188)||(15207070-15207120)
chr3 (139-188)||(15246152-15246202)
chr3 (139-188)||(15265273-15265323)
chr3 (34-76)||(18700200-18700242)
chr3 (260-314)||(23077537-23077591)
chr3 (260-317)||(1644733-1644790)
chr3 (34-67)||(3528206-3528239)
chr3 (33-98)||(17044330-17044395)
chr3 (34-67)||(17207568-17207601)
chr3 (139-191)||(23318653-23318706)
chr3 (34-67)||(25201248-25201281)
chr3 (139-191)||(28194822-28194875)
chr3 (34-67)||(50351882-50351915)
chr3 (34-66)||(17207632-17207664)
chr3 (35-67)||(50351664-50351696)
chr3 (35-67)||(54330969-54331001)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (1-314)||(136684-136996)
scaffold0028 (1-314)||(139153-139465)
scaffold0028 (1-314)||(144091-144403)
scaffold0028 (1-314)||(134215-134527)
scaffold0028 (1-314)||(141622-141934)
scaffold0028 (196-307)||(132672-132784)
scaffold0028 (160-303)||(62216-62355)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (1-314)||(94415-94727)
scaffold0023 (1-316)||(17285-17600)
scaffold0023 (159-314)||(44458-44614)
scaffold0023 (160-307)||(100388-100534)
scaffold0023 (160-307)||(40135-40281)
scaffold0023 (260-320)||(119876-119937)
scaffold0023 (268-307)||(101513-101552)
[»] chr8 (119 HSPs)
chr8 (1-314)||(1484406-1484718)
chr8 (1-314)||(5853138-5853450)
chr8 (1-314)||(14409290-14409602)
chr8 (1-314)||(22001757-22002069)
chr8 (1-314)||(4542219-4542531)
chr8 (1-314)||(4483285-4483597)
chr8 (1-316)||(16413161-16413476)
chr8 (1-314)||(20046041-20046353)
chr8 (33-314)||(20403231-20403511)
chr8 (1-314)||(14823778-14824091)
chr8 (33-314)||(15203109-15203389)
chr8 (33-318)||(45290572-45290857)
chr8 (33-314)||(19896269-19896553)
chr8 (1-305)||(15070571-15070877)
chr8 (34-314)||(19936882-19937164)
chr8 (1-205)||(24485889-24486093)
chr8 (139-314)||(41598192-41598367)
chr8 (33-195)||(32810054-32810215)
chr8 (139-323)||(26223914-26224098)
chr8 (126-314)||(25484245-25484426)
chr8 (141-302)||(19801367-19801527)
chr8 (1-327)||(32121726-32122045)
chr8 (1-327)||(18677910-18678229)
chr8 (1-135)||(27472262-27472395)
chr8 (156-320)||(16092297-16092462)
chr8 (156-320)||(6759259-6759421)
chr8 (156-323)||(28648999-28649167)
chr8 (33-135)||(38549988-38550090)
chr8 (156-320)||(18818364-18818529)
chr8 (169-320)||(7372779-7372931)
chr8 (200-314)||(26225292-26225405)
chr8 (156-320)||(20536209-20536374)
chr8 (1-108)||(1326777-1326884)
chr8 (156-320)||(21918955-21919120)
chr8 (200-314)||(26219721-26219834)
chr8 (2-108)||(38549851-38549957)
chr8 (1-106)||(16401770-16401875)
chr8 (156-320)||(22875066-22875230)
chr8 (1-97)||(16198115-16198211)
chr8 (173-320)||(21923900-21924048)
chr8 (209-320)||(23406380-23406492)
chr8 (139-318)||(13597554-13597735)
chr8 (33-135)||(20982604-20982710)
chr8 (156-320)||(22626737-22626901)
chr8 (33-154)||(1326915-1327041)
chr8 (1-97)||(25657998-25658094)
chr8 (139-318)||(13508022-13508203)
chr8 (1-88)||(24048841-24048927)
chr8 (33-144)||(16401908-16402020)
chr8 (1-115)||(19896524-19896638)
chr8 (156-320)||(18879191-18879351)
chr8 (150-320)||(17612059-17612230)
chr8 (33-108)||(13425336-13425411)
chr8 (1-68)||(15203024-15203091)
chr8 (33-108)||(20982498-20982573)
chr8 (160-320)||(38855212-38855371)
chr8 (1-111)||(20403486-20403596)
chr8 (139-302)||(20498581-20498746)
chr8 (156-320)||(31971258-31971421)
chr8 (193-327)||(23648547-23648682)
chr8 (160-312)||(21285606-21285758)
chr8 (139-302)||(37116366-37116532)
chr8 (160-320)||(6520369-6520528)
chr8 (44-108)||(13425241-13425305)
chr8 (1-108)||(19936753-19936850)
chr8 (222-320)||(45131019-45131116)
chr8 (1-111)||(45290487-45290597)
chr8 (150-320)||(5866227-5866394)
chr8 (150-320)||(17140917-17141084)
chr8 (139-240)||(17266930-17267031)
chr8 (150-320)||(21490996-21491163)
chr8 (222-320)||(16199666-16199764)
chr8 (156-240)||(17439461-17439544)
chr8 (160-306)||(23760805-23760950)
chr8 (150-320)||(21249385-21249553)
chr8 (150-320)||(21255223-21255391)
chr8 (260-306)||(983465-983512)
chr8 (37-108)||(21513636-21513707)
chr8 (34-108)||(18815609-18815683)
chr8 (207-320)||(21389458-21389570)
chr8 (207-320)||(21395988-21396100)
chr8 (160-307)||(21673718-21673864)
chr8 (207-320)||(21778784-21778896)
chr8 (207-320)||(21790481-21790593)
chr8 (139-302)||(24353039-24353204)
chr8 (268-307)||(26355766-26355805)
chr8 (139-240)||(22364745-22364845)
chr8 (34-108)||(36733302-36733376)
chr8 (34-108)||(38988730-38988804)
chr8 (34-108)||(39019827-39019901)
chr8 (109-154)||(35026849-35026894)
chr8 (41-108)||(5083001-5083068)
chr8 (156-191)||(14103180-14103215)
chr8 (109-154)||(2418860-2418905)
chr8 (34-67)||(6573743-6573776)
chr8 (34-67)||(17438110-17438143)
chr8 (139-191)||(17438154-17438207)
chr8 (34-67)||(17979142-17979175)
chr8 (34-67)||(18819393-18819426)
chr8 (34-111)||(19936829-19936906)
chr8 (34-67)||(20517910-20517943)
chr8 (34-67)||(22207536-22207569)
chr8 (34-67)||(22258951-22258984)
chr8 (34-67)||(22355991-22356024)
chr8 (34-67)||(22473856-22473889)
chr8 (34-67)||(22473919-22473952)
chr8 (139-191)||(23667939-23667992)
chr8 (34-67)||(23669841-23669874)
chr8 (34-67)||(23669967-23670000)
chr8 (34-67)||(23670030-23670063)
chr8 (34-67)||(36405773-36405806)
chr8 (139-191)||(37515835-37515888)
chr8 (34-67)||(38988655-38988688)
chr8 (34-67)||(38988834-38988867)
chr8 (34-67)||(39019752-39019785)
chr8 (34-67)||(39019931-39019964)
chr8 (35-67)||(4381456-4381488)
chr8 (35-67)||(18817125-18817157)
chr8 (34-98)||(38549936-38550000)
[»] chr5 (88 HSPs)
chr5 (1-314)||(42245211-42245523)
chr5 (1-314)||(264614-264926)
chr5 (1-314)||(20909016-20909328)
chr5 (1-314)||(10732786-10733098)
chr5 (1-314)||(39245140-39245452)
chr5 (1-314)||(39363388-39363701)
chr5 (1-314)||(29345984-29346296)
chr5 (1-314)||(29348457-29348769)
chr5 (1-314)||(29350930-29351242)
chr5 (33-314)||(32027397-32027677)
chr5 (33-314)||(29329938-29330215)
chr5 (1-314)||(38619438-38619753)
chr5 (33-314)||(20917830-20918106)
chr5 (1-314)||(23064515-23064830)
chr5 (1-314)||(2154477-2154772)
chr5 (33-314)||(20901904-20902168)
chr5 (141-314)||(11581184-11581357)
chr5 (139-314)||(36154766-36154938)
chr5 (144-314)||(18319021-18319192)
chr5 (139-314)||(10775659-10775834)
chr5 (144-314)||(24067111-24067282)
chr5 (1-327)||(17517009-17517328)
chr5 (139-314)||(31061072-31061248)
chr5 (1-154)||(9776522-9776675)
chr5 (5-154)||(37804752-37804901)
chr5 (1-108)||(20901766-20901873)
chr5 (156-320)||(1096468-1096633)
chr5 (156-320)||(23390451-23390616)
chr5 (156-320)||(9077953-9078118)
chr5 (156-320)||(25421533-25421698)
chr5 (214-320)||(21997547-21997654)
chr5 (196-314)||(24529227-24529346)
chr5 (156-320)||(21729019-21729184)
chr5 (156-320)||(21808344-21808509)
chr5 (156-320)||(24493570-24493734)
chr5 (156-320)||(8286797-8286963)
chr5 (156-301)||(25431414-25431560)
chr5 (200-314)||(22412191-22412305)
chr5 (156-320)||(13025312-13025476)
chr5 (156-320)||(13095496-13095660)
chr5 (1-111)||(32027652-32027762)
chr5 (156-302)||(22144068-22144215)
chr5 (156-305)||(22075035-22075185)
chr5 (1-98)||(20917692-20917789)
chr5 (141-307)||(21565556-21565723)
chr5 (1-68)||(29330233-29330299)
chr5 (139-320)||(40725854-40726037)
chr5 (200-263)||(20766119-20766181)
chr5 (160-320)||(21329457-21329617)
chr5 (160-320)||(21502116-21502276)
chr5 (160-302)||(20026900-20027043)
chr5 (143-302)||(22178161-22178323)
chr5 (173-318)||(37723906-37724050)
chr5 (222-320)||(21292992-21293089)
chr5 (160-306)||(26011995-26012141)
chr5 (259-314)||(20806845-20806900)
chr5 (160-307)||(22959495-22959639)
chr5 (260-320)||(19660894-19660955)
chr5 (223-311)||(18418590-18418678)
chr5 (37-108)||(18743965-18744036)
chr5 (33-111)||(20917777-20917855)
chr5 (260-320)||(36314578-36314639)
chr5 (141-320)||(19668899-19669076)
chr5 (263-314)||(26704078-26704129)
chr5 (263-314)||(26973811-26973862)
chr5 (34-108)||(1628169-1628243)
chr5 (260-302)||(26740705-26740747)
chr5 (34-75)||(24067282-24067323)
chr5 (260-305)||(26732892-26732937)
chr5 (139-184)||(36314685-36314730)
chr5 (36-108)||(21399896-21399968)
chr5 (33-67)||(8833821-8833855)
chr5 (33-67)||(21503316-21503350)
chr5 (33-67)||(26761796-26761830)
chr5 (34-67)||(8833885-8833918)
chr5 (34-67)||(14026596-14026629)
chr5 (34-67)||(14026659-14026692)
chr5 (34-67)||(16062684-16062717)
chr5 (34-67)||(16062845-16062878)
chr5 (34-67)||(18743840-18743873)
chr5 (34-67)||(20198318-20198351)
chr5 (34-67)||(21399733-21399766)
chr5 (34-67)||(21399796-21399829)
chr5 (34-67)||(26749356-26749389)
chr5 (34-67)||(26749419-26749452)
chr5 (34-67)||(30611369-30611402)
chr5 (35-67)||(1628044-1628076)
chr5 (126-154)||(6765915-6765943)
[»] chr2 (103 HSPs)
chr2 (1-314)||(18808947-18809259)
chr2 (1-314)||(23711859-23712171)
chr2 (1-314)||(39682317-39682630)
chr2 (1-314)||(23130866-23131179)
chr2 (1-314)||(23133333-23133646)
chr2 (1-314)||(23709378-23709690)
chr2 (1-314)||(26505383-26505695)
chr2 (1-314)||(26507861-26508173)
chr2 (1-314)||(28577103-28577415)
chr2 (1-314)||(34402367-34402680)
chr2 (1-314)||(24898041-24898354)
chr2 (1-314)||(24905478-24905791)
chr2 (1-314)||(24907953-24908266)
chr2 (1-314)||(571401-571714)
chr2 (1-314)||(24900524-24900837)
chr2 (1-314)||(24903001-24903314)
chr2 (1-314)||(32039344-32039656)
chr2 (1-314)||(23135594-23135896)
chr2 (33-314)||(6725999-6726279)
chr2 (1-327)||(32214776-32215092)
chr2 (37-314)||(21154942-21155218)
chr2 (33-310)||(24367782-24368058)
chr2 (33-314)||(22105416-22105697)
chr2 (33-314)||(38967378-38967658)
chr2 (86-314)||(45029784-45030012)
chr2 (8-314)||(24529399-24529687)
chr2 (33-233)||(24642732-24642933)
chr2 (140-314)||(43137303-43137477)
chr2 (1-327)||(25616179-25616498)
chr2 (1-154)||(20261383-20261536)
chr2 (1-108)||(23707062-23707169)
chr2 (1-108)||(24918350-24918457)
chr2 (156-320)||(22337116-22337281)
chr2 (1-154)||(10684608-10684763)
chr2 (1-108)||(24642594-24642701)
chr2 (1-108)||(24671235-24671342)
chr2 (1-108)||(24681654-24681761)
chr2 (156-320)||(23060514-23060679)
chr2 (156-320)||(23076443-23076608)
chr2 (141-320)||(19671831-19672010)
chr2 (1-108)||(38967689-38967796)
chr2 (33-154)||(23707200-23707322)
chr2 (156-320)||(22731189-22731354)
chr2 (33-154)||(24918197-24918319)
chr2 (1-92)||(45027750-45027840)
chr2 (156-320)||(22738135-22738299)
chr2 (1-111)||(24368033-24368143)
chr2 (240-314)||(24643034-24643108)
chr2 (36-154)||(24671082-24671201)
chr2 (156-314)||(298769-298929)
chr2 (156-320)||(23285866-23286027)
chr2 (33-154)||(24681501-24681623)
chr2 (1-111)||(22105672-22105782)
chr2 (156-320)||(23660024-23660188)
chr2 (141-306)||(23708558-23708725)
chr2 (222-320)||(38136-38234)
chr2 (1-68)||(21154853-21154920)
chr2 (1-111)||(6726254-6726364)
chr2 (1-111)||(41523918-41524028)
chr2 (156-320)||(23654341-23654506)
chr2 (126-195)||(22173799-22173868)
chr2 (156-302)||(7688-7835)
chr2 (193-320)||(23103389-23103515)
chr2 (260-320)||(23040249-23040309)
chr2 (139-240)||(23791357-23791458)
chr2 (160-307)||(28405990-28406137)
chr2 (139-302)||(23207296-23207461)
chr2 (260-320)||(8946658-8946718)
chr2 (150-226)||(22459511-22459587)
chr2 (260-314)||(7679592-7679647)
chr2 (139-240)||(24697543-24697644)
chr2 (207-320)||(20309109-20309221)
chr2 (139-302)||(20520130-20520295)
chr2 (260-323)||(22134266-22134329)
chr2 (139-228)||(22413073-22413161)
chr2 (268-306)||(18786971-18787009)
chr2 (34-108)||(21368365-21368439)
chr2 (160-307)||(25175864-25176010)
chr2 (167-302)||(32451894-32452031)
chr2 (270-320)||(23072019-23072069)
chr2 (34-108)||(23799457-23799531)
chr2 (139-191)||(25109019-25109072)
chr2 (39-115)||(22686145-22686221)
chr2 (260-300)||(23287384-23287424)
chr2 (260-300)||(26392403-26392443)
chr2 (139-179)||(29601478-29601518)
chr2 (33-76)||(41524003-41524045)
chr2 (34-67)||(1384411-1384444)
chr2 (139-191)||(19201912-19201965)
chr2 (34-67)||(20915476-20915509)
chr2 (139-191)||(21237883-21237936)
chr2 (34-67)||(21316436-21316469)
chr2 (34-67)||(21336329-21336362)
chr2 (34-67)||(21368353-21368386)
chr2 (34-67)||(22686077-22686110)
chr2 (34-67)||(22690052-22690085)
chr2 (34-67)||(22694648-22694681)
chr2 (34-67)||(25587416-25587449)
chr2 (34-67)||(28345851-28345884)
chr2 (34-67)||(36736894-36736927)
chr2 (35-67)||(1384349-1384381)
chr2 (126-154)||(18358739-18358767)
chr2 (166-234)||(23004838-23004905)
[»] chr1 (81 HSPs)
chr1 (1-314)||(13988870-13989182)
chr1 (1-314)||(21923137-21923449)
chr1 (8-314)||(21474939-21475245)
chr1 (1-314)||(23593579-23593893)
chr1 (1-327)||(16361908-16362235)
chr1 (1-319)||(21840766-21841083)
chr1 (33-314)||(29776692-29776972)
chr1 (33-314)||(29298141-29298420)
chr1 (33-314)||(31612317-31612597)
chr1 (33-314)||(22122945-22123226)
chr1 (3-314)||(15859856-15860167)
chr1 (33-314)||(16275240-16275522)
chr1 (139-314)||(21707171-21707346)
chr1 (139-314)||(21711713-21711888)
chr1 (139-320)||(13212844-13213026)
chr1 (126-302)||(45574812-45574989)
chr1 (139-314)||(21346965-21347141)
chr1 (139-314)||(21342100-21342276)
chr1 (144-314)||(40389158-40389329)
chr1 (139-314)||(433016-433190)
chr1 (156-323)||(50210168-50210336)
chr1 (196-314)||(34509787-34509906)
chr1 (156-320)||(27250684-27250849)
chr1 (33-133)||(22050767-22050866)
chr1 (1-108)||(16275102-16275209)
chr1 (133-302)||(21896187-21896358)
chr1 (156-320)||(22532270-22532435)
chr1 (1-111)||(22122860-22122970)
chr1 (1-98)||(27161432-27161529)
chr1 (156-327)||(22468651-22468823)
chr1 (1-111)||(22050682-22050792)
chr1 (1-111)||(29776947-29777057)
chr1 (133-302)||(21861501-21861672)
chr1 (1-111)||(31612572-31612682)
chr1 (34-122)||(27161518-27161605)
chr1 (260-327)||(20454613-20454680)
chr1 (1-98)||(29298461-29298558)
chr1 (139-302)||(35261018-35261180)
chr1 (193-327)||(20135181-20135316)
chr1 (156-305)||(21026696-21026846)
chr1 (220-320)||(20847173-20847274)
chr1 (141-306)||(33681022-33681188)
chr1 (150-306)||(16758664-16758822)
chr1 (102-154)||(43543215-43543267)
chr1 (139-301)||(14295493-14295652)
chr1 (160-306)||(22237642-22237788)
chr1 (1-52)||(13227129-13227180)
chr1 (196-317)||(21754049-21754170)
chr1 (1-52)||(29535317-29535368)
chr1 (141-305)||(20918620-20918782)
chr1 (139-302)||(50614053-50614219)
chr1 (139-302)||(50621881-50622047)
chr1 (139-302)||(41049973-41050138)
chr1 (160-307)||(22921830-22921976)
chr1 (143-240)||(50686695-50686792)
chr1 (263-314)||(21714549-21714600)
chr1 (268-306)||(52928038-52928076)
chr1 (33-98)||(29298408-29298473)
chr1 (139-190)||(16368224-16368276)
chr1 (131-240)||(22130840-22130946)
chr1 (139-240)||(51130646-51130743)
chr1 (156-245)||(22354527-22354616)
chr1 (150-234)||(12271642-12271725)
chr1 (268-307)||(20248293-20248332)
chr1 (37-75)||(1642854-1642892)
chr1 (246-307)||(21161730-21161792)
chr1 (263-321)||(24783155-24783213)
chr1 (34-67)||(7321576-7321609)
chr1 (34-67)||(7321639-7321672)
chr1 (34-67)||(12710178-12710211)
chr1 (34-67)||(18120835-18120868)
chr1 (139-191)||(22124415-22124468)
chr1 (34-67)||(22824136-22824169)
chr1 (34-67)||(24720419-24720452)
chr1 (260-320)||(38801447-38801507)
chr1 (34-67)||(44891754-44891787)
chr1 (34-67)||(50544145-50544178)
chr1 (141-189)||(52927922-52927971)
chr1 (35-67)||(6833571-6833603)
chr1 (276-319)||(21533948-21533989)
chr1 (35-67)||(50544208-50544240)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-314)||(20751-21064)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (1-314)||(13951-14264)
scaffold0230 (1-109)||(23376-23484)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (1-314)||(37825-38138)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (1-314)||(13396-13709)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (1-314)||(40404-40716)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-327)||(11279-11606)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (1-319)||(9241-9558)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (1-314)||(4698-5011)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-319)||(10772-11089)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (51-327)||(501075-501351)
scaffold0001 (139-314)||(85562-85738)
scaffold0001 (141-307)||(160698-160864)
scaffold0001 (1-36)||(501347-501382)
[»] scaffold0494 (3 HSPs)
scaffold0494 (101-327)||(12194-12420)
scaffold0494 (1-108)||(369-476)
scaffold0494 (33-108)||(507-582)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (21-314)||(38521-38816)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (35-304)||(29946-30196)
scaffold0149 (1-108)||(30229-30336)
[»] scaffold0145 (4 HSPs)
scaffold0145 (33-314)||(9753-10016)
scaffold0145 (156-320)||(32943-33107)
scaffold0145 (156-320)||(38762-38926)
scaffold0145 (35-97)||(10005-10067)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (138-314)||(158432-158608)
scaffold0003 (156-306)||(339905-340053)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (1-195)||(6070-6263)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (126-314)||(110-298)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (126-314)||(82076-82264)
scaffold0037 (141-306)||(22610-22776)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (139-314)||(16788-16963)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (126-314)||(12068-12250)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (126-314)||(1250-1439)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (139-302)||(79267-79430)
scaffold0056 (156-323)||(17170-17340)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (139-314)||(4301-4476)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (139-310)||(2111-2283)
scaffold0247 (139-320)||(17964-18147)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (139-302)||(20363-20524)
scaffold0031 (156-320)||(128752-128916)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (139-314)||(4218-4393)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (139-314)||(161072-161248)
scaffold0007 (139-239)||(164573-164674)
[»] scaffold0741 (1 HSPs)
scaffold0741 (1-154)||(4148-4303)
[»] scaffold0306 (2 HSPs)
scaffold0306 (1-154)||(15084-15239)
scaffold0306 (1-67)||(11185-11251)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (156-314)||(22890-23048)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (1-154)||(3187-3340)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (1-154)||(6781-6936)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (1-154)||(53717-53872)
scaffold0022 (200-314)||(116434-116547)
scaffold0022 (139-302)||(128907-129072)
scaffold0022 (139-190)||(78453-78505)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (1-154)||(1592-1745)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (33-149)||(27958-28073)
scaffold0114 (1-111)||(28048-28158)
scaffold0114 (222-320)||(15485-15583)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (200-314)||(44706-44821)
scaffold0122 (156-314)||(26020-26179)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (156-320)||(3106-3270)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (156-320)||(16555-16720)
[»] scaffold1792 (1 HSPs)
scaffold1792 (1-109)||(416-524)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (156-307)||(4522-4673)
scaffold0228 (156-307)||(12104-12255)
scaffold0228 (156-307)||(22056-22207)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (33-154)||(10765-10885)
scaffold0513 (21-108)||(10647-10734)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (156-320)||(13212-13377)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (156-320)||(1852-2017)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (156-320)||(51914-52079)
scaffold0011 (156-320)||(167934-168098)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (156-323)||(3141-3309)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (156-312)||(39486-39642)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (156-312)||(75170-75326)
[»] scaffold0106 (5 HSPs)
scaffold0106 (33-154)||(15150-15272)
scaffold0106 (260-314)||(15298-15352)
scaffold0106 (9-108)||(15030-15119)
scaffold0106 (260-320)||(1290-1351)
scaffold0106 (268-320)||(7267-7319)
[»] scaffold0747 (2 HSPs)
scaffold0747 (1-108)||(799-906)
scaffold0747 (33-154)||(646-768)
[»] scaffold0043 (2 HSPs)
scaffold0043 (10-108)||(10001-10099)
scaffold0043 (33-67)||(9936-9970)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (156-320)||(1004-1168)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (156-320)||(4850-5015)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (156-320)||(3471-3636)
scaffold0292 (156-320)||(344-508)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (156-320)||(32913-33076)
scaffold0120 (156-320)||(45929-46092)
scaffold0120 (157-320)||(16114-16278)
scaffold0120 (259-320)||(17388-17449)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (141-306)||(8481-8650)
scaffold0621 (160-320)||(6536-6695)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (45-154)||(35955-36064)
scaffold0100 (260-306)||(23942-23989)
[»] scaffold0046 (6 HSPs)
scaffold0046 (207-320)||(28415-28529)
scaffold0046 (150-320)||(11293-11460)
scaffold0046 (150-320)||(1998-2165)
scaffold0046 (268-320)||(4553-4605)
scaffold0046 (136-191)||(26013-26069)
scaffold0046 (144-191)||(16861-16909)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (156-313)||(25904-26061)
scaffold0026 (156-320)||(39859-40023)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (156-320)||(6076-6244)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (156-320)||(8488-8649)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (1-100)||(13472-13571)
scaffold0040 (5-58)||(42999-43052)
[»] scaffold0639 (3 HSPs)
scaffold0639 (207-320)||(8480-8594)
scaffold0639 (34-67)||(7319-7352)
scaffold0639 (34-67)||(7382-7415)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (139-306)||(27686-27855)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (156-303)||(24257-24406)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (139-320)||(11465-11648)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (156-256)||(3485-3585)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (139-320)||(38193-38376)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (134-302)||(53481-53651)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (135-302)||(12587-12755)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (1-91)||(57708-57798)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (33-154)||(1204-1326)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (139-302)||(13147-13313)
scaffold0357 (139-306)||(16037-16206)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (171-320)||(1953-2103)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (161-234)||(13092-13165)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (156-320)||(39914-40078)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (139-247)||(225482-225590)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (141-306)||(10481-10647)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (231-320)||(4713-4803)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (160-307)||(129919-130066)
scaffold0010 (139-302)||(60652-60818)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (242-302)||(11982-12042)
scaffold0503 (139-212)||(12039-12112)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (150-314)||(15668-15829)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (139-318)||(6220-6400)
scaffold0420 (275-318)||(13813-13854)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (156-320)||(32068-32230)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (160-307)||(19278-19424)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (222-314)||(11464-11557)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (139-320)||(1011-1189)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (141-307)||(45732-45899)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (173-302)||(174785-174913)
scaffold0021 (260-320)||(121767-121827)
scaffold0021 (156-232)||(124675-124751)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (222-305)||(13513-13596)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (156-256)||(13158-13258)
scaffold0175 (265-313)||(281-329)
scaffold0175 (268-320)||(34124-34176)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (139-306)||(25121-25289)
scaffold0123 (139-240)||(620-720)
scaffold0123 (35-98)||(16263-16326)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (1-55)||(6714-6768)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (160-307)||(5657-5803)
scaffold0278 (1-61)||(7996-8056)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (160-320)||(6083-6243)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (139-240)||(97089-97190)
scaffold0006 (139-240)||(106367-106468)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (160-307)||(143-290)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (171-320)||(10395-10543)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (156-241)||(27911-27996)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (268-320)||(1102-1154)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (268-320)||(6612-6664)
scaffold0333 (268-320)||(13992-14044)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (160-306)||(32551-32696)
scaffold0034 (156-302)||(51839-51985)
[»] scaffold0020 (4 HSPs)
scaffold0020 (268-320)||(15845-15897)
scaffold0020 (263-314)||(178901-178952)
scaffold0020 (139-191)||(142712-142765)
scaffold0020 (34-67)||(142776-142809)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (160-247)||(8090-8176)
scaffold0556 (150-307)||(6826-6980)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (207-320)||(20911-21026)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (1-52)||(68227-68278)
scaffold0064 (268-320)||(46996-47048)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (139-240)||(7996-8098)
scaffold0507 (34-67)||(2564-2597)
scaffold0507 (139-191)||(2608-2661)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (140-229)||(18176-18265)
scaffold0138 (160-306)||(12954-13100)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (160-307)||(14658-14804)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (268-312)||(1091-1135)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (260-320)||(4893-4953)
scaffold0395 (156-245)||(918-1006)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (156-298)||(38339-38483)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (139-306)||(8011-8180)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (139-302)||(267679-267844)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (200-307)||(2805-2913)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (207-320)||(16283-16395)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (220-302)||(1051-1134)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (160-306)||(10542-10688)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (139-240)||(1735-1835)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (268-307)||(2713-2752)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (263-314)||(23846-23897)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (139-240)||(88-189)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (144-307)||(12780-12944)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (268-314)||(36457-36503)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (171-300)||(4545-4675)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (196-307)||(32112-32224)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (34-113)||(15282-15361)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (260-302)||(51601-51644)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (268-302)||(5196-5230)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (269-307)||(28839-28877)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (171-256)||(6676-6761)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (156-191)||(10603-10638)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (156-191)||(617-652)
[»] scaffold0205 (2 HSPs)
scaffold0205 (216-314)||(29561-29660)
scaffold0205 (34-67)||(29847-29880)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (33-67)||(1099-1133)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (136-189)||(57948-58002)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (263-320)||(193039-193097)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (139-191)||(547-600)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (139-191)||(1069-1122)
[»] scaffold1419 (1 HSPs)
scaffold1419 (139-179)||(165-206)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (160-240)||(2179-2257)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (275-320)||(1124-1169)
[»] scaffold0462 (2 HSPs)
scaffold0462 (34-67)||(688-721)
scaffold0462 (34-67)||(6194-6227)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (34-67)||(10000-10033)
[»] scaffold0170 (2 HSPs)
scaffold0170 (139-191)||(3087-3140)
scaffold0170 (34-67)||(3151-3184)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (34-67)||(24654-24687)
scaffold0162 (34-67)||(24717-24750)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (139-191)||(7560-7613)
scaffold0111 (139-191)||(14679-14732)
[»] scaffold0108 (2 HSPs)
scaffold0108 (34-67)||(7508-7541)
scaffold0108 (35-67)||(7445-7477)
[»] scaffold0086 (2 HSPs)
scaffold0086 (34-67)||(36287-36320)
scaffold0086 (34-66)||(36350-36382)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (34-67)||(62024-62057)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (34-67)||(46667-46700)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (34-67)||(29395-29428)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (139-191)||(30462-30515)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (35-67)||(18521-18553)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (260-300)||(206584-206624)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (126-154)||(85632-85660)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 104)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44615605 - 44615292
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44615605 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 44615506  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44615505 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 44615406  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615405 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 44615306  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  44615305 agttgattaagatg 44615292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 15118198 - 15118510
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15118198 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 15118296  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15118297 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 15118396  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118397 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 15118496  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  15118497 agttgattaagatg 15118510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 50222185 - 50222497
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50222185 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 50222283  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50222284 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatattgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 50222383  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222384 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 50222483  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  50222484 agttgattaagatg 50222497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 18239265 - 18239577
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18239265 ttacttcacgtaggtcacagtgaatttttgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 18239363  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18239364 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 18239463  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239464 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18239563  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  18239564 agttgattaagatg 18239577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 44772929 - 44773245
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44772929 ttactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 44773027  T
Q  101 gttatatgtatatat----gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaa 196  Q
    |||||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44773028 gttatatgtatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaa 44773127  T
Q  197 taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773128 taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 44773227  T
Q  297 tctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||    
T  44773228 tctaagttgattaagatg 44773245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3515324 - 3515011
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  3515324 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgtatgtatatttttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 3515225  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3515224 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataat 3515125  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3515124 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtcta 3515025  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  3515024 agttgattaagatg 3515011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 14970552 - 14970878
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  14970552 ttactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcataattgatgaagt 14970651  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14970652 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataat 14970751  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14970752 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtcta 14970851  T
Q  301 agttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14970852 agttgattaaaatgttgatgatgatgt 14970878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19243017 - 19242703
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19243017 ttactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 19242918  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19242917 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttggagttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataa 19242818  T
Q  200 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242817 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 19242718  T
Q  300 aagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||    
T  19242717 aagttgattaagatg 19242703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Original strand, 12185 - 12465
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12185 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 12283  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 232  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12284 attattattggatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 12383  T
Q  233 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12384 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 52312794 - 52312514
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312794 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 52312696  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 232  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312695 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 52312596  T
Q  233 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312595 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 52312514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Original strand, 18215152 - 18215432
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215152 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 18215250  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 232  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215251 attatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 18215350  T
Q  233 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215351 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18215432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 1837365 - 1837667
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1837365 ttactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg-----------ttgtgaaaacgatattgtccatgattgatgaagt 1837453  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1837454 tttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 1837553  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837554 tgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 1837653  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  1837654 agttgattaagatg 1837667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 33 - 318
Target Start/End: Original strand, 15355202 - 15355487
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355202 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 15355300  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattat 231  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15355301 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattat 15355400  T
Q  232 tatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355401 tatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 15355487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 33 - 327
Target Start/End: Original strand, 19618050 - 19618343
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618050 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 19618148  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 232  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618149 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 19618248  T
Q  233 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19618249 atgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgataatgt 19618343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 7641032 - 7641340
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  7641032 ttactgcctgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatatttttcatgattgatgaagt 7641130  T
Q  101 gttatatgtatatat------gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtg 194  Q
    ||||||| |||||||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  7641131 gttatatatatatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgta 7641230  T
Q  195 aataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641231 aataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttt----------ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 7641320  T
Q  295 ggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7641321 ggtctaagttgattaagatg 7641340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 126 - 314
Target Start/End: Original strand, 51463838 - 51464026
Alignment:
Q  126 gatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51463838 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 51463937  T
Q  226 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463938 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 51464026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 126 - 314
Target Start/End: Original strand, 23803235 - 23803423
Alignment:
Q  126 gatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 225  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23803235 gatgttgattatgattttatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttga 23803334  T
Q  226 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803335 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23803423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44102393 - 44102218
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 238  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44102393 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtca 44102294  T
Q  239 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102293 tgctgtttttgtatactactgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44102218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 126 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12611135 - 12610954
Alignment:
Q  126 gatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12611135 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 12611036  T
Q  226 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611035 tattattatgtcatgctgtttt-------tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12610954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 139 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15367873 - 15367691
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15367873 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15367774  T
Q  238 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  15367773 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15367691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 139 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15402886 - 15402704
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15402886 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15402787  T
Q  238 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  15402786 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15402704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Original strand, 44928873 - 44929038
Alignment:
Q  150 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 249  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44928873 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttg 44928972  T
Q  250 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928973 tatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44929038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Original strand, 21815568 - 21815731
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 238  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21815568 atttgatgttgttatattatgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtca 21815667  T
Q  239 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21815668 tgctgtttttgtatacagttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 139 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15371385 - 15371203
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15371385 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtc 15371286  T
Q  238 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  15371285 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15371203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 139 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15373666 - 15373484
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15373666 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtc 15373567  T
Q  238 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  15373566 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15373484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 139 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15370200 - 15370019
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15370200 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgt-agttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15370102  T
Q  238 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  15370101 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15370019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 142 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16223712 - 16223533
Alignment:
Q  142 tgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatg 240  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16223712 tgatgttgttatattgtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatg 16223613  T
Q  241 ctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  16223612 ctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 16223533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 144 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20150004 - 20149833
Alignment:
Q  144 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 242  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20150004 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 20149905  T
Q  243 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20149904 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 20149833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 15534498 - 15534345
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15534498 ttactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 15534399  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15534398 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 15534345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 36038187 - 36038034
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  36038187 ttactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaagatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 36038088  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36038087 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 36038034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 14048894 - 14048741
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  14048894 ttactacacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgataaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaggt 14048795  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14048794 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 14048741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 49547619 - 49547772
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  49547619 ttactgcacgtaggtcatagtgaagaattatttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 49547718  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49547719 gttatatgtatctatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttata 49547772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 200 - 314
Target Start/End: Original strand, 54798753 - 54798868
Alignment:
Q  200 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54798753 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtc 54798852  T
Q  299 taagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||    
T  54798853 taagttgattaagatg 54798868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 200 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14280434 - 14280320
Alignment:
Q  200 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280434 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 14280335  T
Q  300 aagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||    
T  14280334 aagttgattaagatg 14280320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 155
Target Start/End: Original strand, 52873056 - 52873177
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873056 tatgattgatgaattaatatacgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 52873154  T
Q  133 attattatttgatgttgttatac 155  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  52873155 attattatttgatgttgttatac 52873177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 33 - 154
Target Start/End: Original strand, 15496949 - 15497069
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15496949 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 15497047  T
Q  133 attattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15497048 attattatttgatgttgttata 15497069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 362497 - 362390
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  362497 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 362398  T
Q  101 gttatatg 108  Q
    ||||||||    
T  362397 gttatatg 362390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 19617912 - 19618019
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19617912 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 19618011  T
Q  101 gttatatg 108  Q
    ||||||||    
T  19618012 gttatatg 19618019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14038814 - 14038655
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| |||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14038814 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatact 14038715  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  14038714 gcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 14038655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 313
Target Start/End: Original strand, 16377478 - 16377634
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16377478 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatact 16377575  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 313  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16377576 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 16377634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 52872918 - 52873025
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  52872918 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgatgt 52873017  T
Q  101 gttatatg 108  Q
    ||||||||    
T  52873018 gttatatg 52873025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 7089043 - 7088878
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  | |||||||||| ||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7089043 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7088944  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7088943 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7088878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 7798940 - 7798775
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    ||||||| |||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798940 tgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7798841  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7798840 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7798775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 22636601 - 22636437
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22636601 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22636502  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 319  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22636501 gtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 18215014 - 18215121
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18215014 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttattaatacgatattgttcatgattgatgaagt 18215113  T
Q  101 gttatatg 108  Q
    ||||||||    
T  18215114 gttatatg 18215121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 7893869 - 7893704
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893869 tgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7893770  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7893769 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7893704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 12902923 - 12902758
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  | |||||||||| ||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902923 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12902824  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  12902823 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 12902758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 29267670 - 29267570
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29267670 ttactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 29267571  T
Q  101 g 101  Q
    |    
T  29267570 g 29267570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 209 - 320
Target Start/End: Original strand, 52873375 - 52873487
Alignment:
Q  209 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873375 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 52873474  T
Q  308 taagatgttgatg 320  Q
     |||||| |||||    
T  52873475 gaagatgatgatg 52873487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 108
Target Start/End: Original strand, 15355068 - 15355171
Alignment:
Q  5 tgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgtta 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15355068 tgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgtta 15355167  T
Q  105 tatg 108  Q
    ||||    
T  15355168 tatg 15355171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 15496019 - 15496126
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15496019 ttactgcacgtaagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttctgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 15496118  T
Q  101 gttatatg 108  Q
    ||||||||    
T  15496119 gttatatg 15496126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 200 - 314
Target Start/End: Original strand, 8574868 - 8574981
Alignment:
Q  200 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574868 ttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 8574966  T
Q  300 aagttgattaagatg 314  Q
    ||||| |||||||||    
T  8574967 aagttaattaagatg 8574981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 145 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22354010 - 22353852
Alignment:
Q  145 tgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt 244  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||| |||    
T  22354010 tgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgt 22353911  T
Q  245 ttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |  |  |  |||  | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22353910 tgctacaatctgcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaag 22353852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 14746357 - 14746464
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||    
T  14746357 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatatatgtatatgtttgtgaatactattatgttcatgattgatgaagt 14746456  T
Q  101 gttatatg 108  Q
    ||||||||    
T  14746457 gttatatg 14746464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Original strand, 16270191 - 16270355
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16270191 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 16270289  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  16270290 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatg 16270355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 154
Target Start/End: Original strand, 14746495 - 14746617
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  14746495 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 14746593  T
Q  131 tgattattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  14746594 tgattatcatttgatgttgttata 14746617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 302
Target Start/End: Original strand, 13783 - 13953
Alignment:
Q  134 ttattatttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 232  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  13783 ttatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgtt 13882  T
Q  233 atgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    || ||||| || ||||| ||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13883 atatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 44052995 - 44052830
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||  ||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44052995 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44052896  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  44052895 gcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatg 44052830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 6900056 - 6899892
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| | |||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||    
T  6900056 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-gtatact 6899958  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6899957 gcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 6899892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 141 - 306
Target Start/End: Original strand, 43198492 - 43198661
Alignment:
Q  141 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 239  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||| ||||    
T  43198492 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcat 43198591  T
Q  240 g-ctgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |  |  ||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198592 gaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 306
Target Start/End: Original strand, 52243131 - 52243302
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||    
T  52243131 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatc 52243230  T
Q  238 atg--ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |||  |||  |||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243231 atgaactg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 362336 - 362268
Alignment:
Q  67 ttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362336 ttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 362268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 12100 - 12167
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12100 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 12167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 158 - 320
Target Start/End: Original strand, 16239927 - 16240089
Alignment:
Q  158 tgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg- 256  Q
    |||||||||  ||| |||||||| | || ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  16239927 tgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgc 16240025  T
Q  257 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
     | | ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  16240026 ctattttgctattgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 16240089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 52312879 - 52312769
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  |||||||||||| |    
T  52312879 ttactgcacgcaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaatt 52312780  T
Q  101 gttatatgtat 111  Q
      |||||||||    
T  52312779 agtatatgtat 52312769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 316
Target Start/End: Original strand, 23374314 - 23374475
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  23374314 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 23374413  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgtt 316  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  23374414 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatgtt 23374475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 19857895 - 19857798
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19857895 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagta----------tatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 19857806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 19857767 - 19857685
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19857767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattttatatatatat 19857685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 236 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096294
Alignment:
Q  236 tcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 3096294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Original strand, 46640393 - 46640558
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    |||||| ||| |||| || ||||||||||| |||| ||    
T  46640393 atttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga--tgttgagatgttattgattttcatttgatattgttatatc 46640490  T
Q  238 atg--ctgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||  ||| |||| |||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640491 atgaactg-ttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 247
Target Start/End: Original strand, 15464888 - 15464977
Alignment:
Q  158 tgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  15464888 tgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctatttt 15464977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Original strand, 53082089 - 53082254
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  53082089 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 53082186  T
Q  238 atg--ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||  ||| |||| | ||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082187 atgaactg-ttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Original strand, 39706356 - 39706408
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39706356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 39706408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19857659 - 19857608
Alignment:
Q  103 tatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857659 tatatatatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 19857608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Original strand, 12288169 - 12288316
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgt 257  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||    ||| || |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||| ||| | ||||||     
T  12288169 atatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatg--ttgtgatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgc 12288265  T
Q  258 -tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
     | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288266 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15551985 - 15551818
Alignment:
Q  150 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 249  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || | || ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  15551985 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttaccttcgatattattatatcatgatggatt-g 15551891  T
Q  250 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
     ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  15551890 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 15551818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 196 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12774132 - 12774021
Alignment:
Q  196 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 293  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12774132 ataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 12774035  T
Q  294 cggtctaagttgat 307  Q
    ||||||||||||||    
T  12774034 cggtctaagttgat 12774021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8846553 - 8846465
Alignment:
Q  141 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 229  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  8846553 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 8846465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 320
Target Start/End: Original strand, 14053323 - 14053421
Alignment:
Q  222 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | || || || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||||| ||||    
T  14053323 ttgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgat 14053420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17046549 - 17046488
Alignment:
Q  260 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  17046549 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 17046488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 30147232 - 30147189
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatga 44  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30147232 ttactacacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatga 30147189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 6190563 - 6190481
Alignment:
Q  222 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| || |||  | |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190563 ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 8846418 - 8846370
Alignment:
Q  260 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8846418 tgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgat 8846370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 9923625 - 9923591
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9923625 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 9923591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 25513066 - 25513032
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25513066 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 25513032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 10272826 - 10272793
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10272826 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 10272793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 12622710 - 12622677
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12622710 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 12622677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 13164444 - 13164411
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13164444 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 13164411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 13164556 - 13164523
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13164556 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 13164523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 14508088 - 14508055
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14508088 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 14508055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 15041855 - 15041888
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15041855 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 15041888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 15112569 - 15112536
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15112569 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 15112536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16043195 - 16043142
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  16043195 atttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatat 16043142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 111
Target Start/End: Original strand, 19617998 - 19618075
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtat 111  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  |||||||||||| || |||||||||    
T  19617998 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattggtatatgtat 19618075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 25512972 - 25512939
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25512972 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 25512939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 26445207 - 26445174
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26445207 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 26445174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 26922468 - 26922501
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26922468 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 26922501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 40229704 - 40229671
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40229704 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 40229671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 46740474 - 46740441
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46740474 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 46740441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 46740600 - 46740567
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46740600 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 46740567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 55582586 - 55582553
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55582586 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 55582553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 15791957 - 15791905
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattata 190  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  15791957 atttgatgttgttaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattata 15791905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17333338 - 17333298
Alignment:
Q  260 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  17333338 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtcta 17333298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 35660234 - 35660202
Alignment:
Q  35 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35660234 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 35660202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 122)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 14948968 - 14949280
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14948968 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 14949066  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14949067 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 14949166  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949167 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 14949266  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  14949267 agttgattaagatg 14949280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 15376559 - 15376871
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15376559 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 15376657  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15376658 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 15376757  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376758 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 15376857  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  15376858 agttgattaagatg 15376871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 20384969 - 20385281
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20384969 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 20385067  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20385068 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 20385167  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385168 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20385267  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  20385268 agttgattaagatg 20385281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 21189441 - 21189753
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21189441 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtata-gtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 21189539  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21189540 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 21189639  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189640 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21189739  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  21189740 agttgattaagatg 21189753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 32125807 - 32125495
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32125807 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 32125709  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32125708 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 32125609  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125608 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 32125509  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  32125508 agttgattaagatg 32125495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 456638 - 456325
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  456638 ttactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 456539  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  456538 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 456439  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456438 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 456339  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  456338 agttgattaagatg 456325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16232837 - 16232524
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16232837 ttactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 16232738  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16232737 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 16232638  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232637 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 16232538  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  16232537 agttgattaagatg 16232524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41523234 - 41522921
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41523234 ttactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 41523135  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41523134 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 41523035  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523034 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 41522935  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  41522934 agttgattaagatg 41522921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41525696 - 41525383
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41525696 ttactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 41525597  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41525596 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 41525497  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525496 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 41525397  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  41525396 agttgattaagatg 41525383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 11393132 - 11393445
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11393132 ttactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 11393231  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11393232 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 11393331  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393332 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 11393431  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  11393432 agttgattaagatg 11393445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16410375 - 16410063
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16410375 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatcaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 16410277  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16410276 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactatgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataat 16410177  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410176 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 16410077  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  16410076 agttgattaagatg 16410063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27217177 - 27216864
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27217177 ttactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 27217078  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27217077 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 27216978  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27216977 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtcta 27216878  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  27216877 agttgattaagatg 27216864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18640588 - 18640276
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18640588 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattactatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattttccatgattgatgaagt 18640490  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18640489 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattattttatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 18640390  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640389 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18640290  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  18640289 agttgattaagatg 18640276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18431028 - 18430710
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18431028 ttactgcacgtagaacatagtgaataattgaatctgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 18430930  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18430929 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 18430830  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430829 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18430730  T
Q  301 agttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  18430729 agttgattaagatgatgatg 18430710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24702545 - 24702242
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||          ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24702545 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtatatg----------tttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 24702456  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24702455 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 24702356  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702355 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 24702256  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  24702255 agttgattaagatg 24702242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 3 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16213999 - 16213688
Alignment:
Q  3 actgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16213999 actgcacgtaggtcacagtgaataattgaataagattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgt 16213900  T
Q  103 tatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattg 202  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  16213899 tatatgtatatatgatgttttcatatgttgattaccatttgatgttgttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatta 16213800  T
Q  203 agacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213799 agacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16213700  T
Q  303 ttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||    
T  16213699 ttgattaagatg 16213688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11972780 - 11972500
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11972780 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgcccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatattg 11972682  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 232  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972681 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 11972582  T
Q  233 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972581 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 11972500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24704992 - 24704692
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||          ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24704992 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtatatg----------tttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 24704903  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24704902 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 24704803  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704802 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc---ttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 24704706  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  24704705 agttgattaagatg 24704692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13869665 - 13869350
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13869665 ttactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 13869566  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |  |  ||||| | |||||||    
T  13869565 tttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattagattatctttgaataa 13869466  T
Q  200 ttgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869465 ttgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 13869366  T
Q  299 taagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||    
T  13869365 taagttgattaagatg 13869350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 26355827 - 26356152
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26355827 ttactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatgtt-gtaaatacgatattgtccataattgatgaagt 26355925  T
Q  101 gttatatgtata--tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaata 198  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26355926 gttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaata 26356025  T
Q  199 attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac-----------tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgc 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           |||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  26356026 attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtttatgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgc 26356125  T
Q  288 atgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  26356126 atgagtcagtctaaattgattaagatg 26356152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 26358279 - 26358604
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26358279 ttactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatgtt-gtaaatacgatattgtccataattgatgaagt 26358377  T
Q  101 gttatatgtata--tatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaata 198  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26358378 gttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaata 26358477  T
Q  199 attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac-----------tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgc 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           |||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  26358478 attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtttatgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgc 26358577  T
Q  288 atgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  26358578 atgagtcagtctaaattgattaagatg 26358604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44116688 - 44116513
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116688 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 44116589  T
Q  239 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116588 tgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44116513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 140 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3386511 - 3386337
Alignment:
Q  140 tttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 239  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3386511 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcat 3386412  T
Q  240 gctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386411 gctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3386337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 126 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13647521 - 13647344
Alignment:
Q  126 gatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647521 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 13647422  T
Q  226 tattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647421 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 169 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275162
Alignment:
Q  169 tatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 24275221  T
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24275220 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgttgattatgt 24275162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Original strand, 17061898 - 17062073
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17061898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtca 17061997  T
Q  239 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||  |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17061998 tgct-attttgtatactgctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17062073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18627882 - 18627717
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  18627882 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattttccgtgattgatgaagt 18627784  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataatt 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18627783 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattagtatttgatcttgttatattgtgatataatt 18627717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 33 - 225
Target Start/End: Original strand, 15081825 - 15082019
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaa--gatgt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  15081825 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 15081923  T
Q  131 tgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttga 225  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15081924 tgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttga 15082019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Original strand, 38898359 - 38898535
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38898359 atttgacgttgttatactgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 38898458  T
Q  238 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38898459 atgctgtttttatatactgctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Original strand, 12756654 - 12756817
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12756654 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtca 12756753  T
Q  239 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12756754 tgttgtttttgtatattgttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 141 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20110723 - 20110560
Alignment:
Q  141 ttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 240  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110723 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatg 20110624  T
Q  241 ctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110623 ctgtttttgtata----------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20110560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 11303564 - 11303411
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11303564 ttactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 11303465  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  11303464 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 11303411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 16108534 - 16108687
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16108534 ttactacacgtacgtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacaatattgtcaatgattgatgaagt 16108633  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  16108634 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccgtttgatgttgttata 16108687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 154
Target Start/End: Original strand, 14269940 - 14270060
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269940 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 14270038  T
Q  133 attattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14270039 attattatttgatgttgttata 14270060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 13841270 - 13841157
Alignment:
Q  59 gtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgt 158  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13841270 gtatatgttt-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgt 13841172  T
Q  159 gatataattgtatat 173  Q
    |||||||||||||||    
T  13841171 gatataattgtatat 13841157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 48273512 - 48273396
Alignment:
Q  199 attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 297  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48273512 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  298 ctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||    
T  48273412 ctaagttgattaagatg 48273396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 8940596 - 8940489
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8940596 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 8940497  T
Q  101 gttatatg 108  Q
    ||||||||    
T  8940496 gttatatg 8940489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 192 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13831499 - 13831377
Alignment:
Q  192 gtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13831499 gtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 13831400  T
Q  292 gtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  13831399 gtcggtctaaattgattaagatg 13831377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 29796927 - 29796772
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  29796927 ttactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagg 29796828  T
Q  101 gttatatgtat--atatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  29796827 gttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttata 29796772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 29800746 - 29800591
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  29800746 ttactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagg 29800647  T
Q  101 gttatatgtat--atatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  29800646 gttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttata 29800591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 314
Target Start/End: Original strand, 3564319 - 3564478
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||   || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3564319 tgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 3564418  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3564419 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 3564478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 108
Target Start/End: Original strand, 14269806 - 14269909
Alignment:
Q  5 tgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgtta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14269806 tgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgtta 14269905  T
Q  105 tatg 108  Q
    ||||    
T  14269906 tatg 14269909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Original strand, 23664802 - 23664951
Alignment:
Q  5 tgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgtta 104  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||    
T  23664802 tgcatgtaggtcacagtgaagaattgttgatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaaaggtta 23664901  T
Q  105 tatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  23664902 tatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttata 23664951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 15081687 - 15081794
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15081687 ttactgcacgtaggtctaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 15081786  T
Q  101 gttatatg 108  Q
    ||||||||    
T  15081787 gttatatg 15081794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 156 - 314
Target Start/End: Original strand, 18456368 - 18456526
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18456368 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 18456466  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |  | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456467 gcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18456526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 12698998 - 12698832
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatac 254  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12698998 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatac 12698899  T
Q  255 tgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12698898 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 12698832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 106
Target Start/End: Original strand, 45847504 - 45847605
Alignment:
Q  5 tgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgtta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  45847504 tgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtctgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgtta 45847603  T
Q  105 ta 106  Q
    ||    
T  45847604 ta 45847605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 154
Target Start/End: Original strand, 38898106 - 38898228
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  38898106 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 38898204  T
Q  131 tgattattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  38898205 tgattatcatttgatgttgttata 38898228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 8468891 - 8468804
Alignment:
Q  67 ttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8468891 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttatgatgttgattattatttgatgttgttata 8468804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 8469052 - 8468945
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  8469052 ttactgcatgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttttgaatacgatattgttcatgattgatgaaat 8468953  T
Q  101 gttatatg 108  Q
    ||||||||    
T  8468952 gttatatg 8468945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 9509355 - 9509190
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    ||||||||| |  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9509355 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatact 9509256  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  9509255 gcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 9509190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 38227646 - 38227482
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| | |||||  |||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38227646 tgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 38227548  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  38227547 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatg 38227482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 8940458 - 8940336
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  8940458 tatgattgatgaattagtatatttatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 8940360  T
Q  131 tgattattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  8940359 tgattatcatttgatgttgttata 8940336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 139 - 306
Target Start/End: Original strand, 2280056 - 2280225
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  2280056 atttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatc 2280155  T
Q  238 atgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |||||| ||||| ||||||  | ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2280156 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 2280225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 135
Target Start/End: Original strand, 45847638 - 45847739
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45847638 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatatgatg-tttaagatgttg 45847736  T
Q  133 att 135  Q
    |||    
T  45847737 att 45847739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 13841371 - 13841274
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  ||||||||||||    
T  13841371 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 13841274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 150 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26212168 - 26212012
Alignment:
Q  150 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 249  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||| |||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26212168 ttataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttg 26212069  T
Q  250 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26212068 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttg 26212012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 108
Target Start/End: Original strand, 38897995 - 38898075
Alignment:
Q  28 ttgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38897995 ttgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 38898075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 200 - 306
Target Start/End: Original strand, 15144037 - 15144143
Alignment:
Q  200 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144037 ttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgagatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 15144136  T
Q  300 aagttga 306  Q
    |||||||    
T  15144137 aagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 207 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 10589154 - 10589055
Alignment:
Q  207 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10589154 gttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 10589055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 11972865 - 11972755
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||  || ||||  |||||||||||| |    
T  11972865 ttactgtacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgcatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaatt 11972766  T
Q  101 gttatatgtat 111  Q
      |||||||||    
T  11972765 agtatatgtat 11972755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 67904 - 67746
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||   ||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  67904 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat--attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 67809  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  67808 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 67746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 320
Target Start/End: Original strand, 19486681 - 19486864
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  19486681 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 19486780  T
Q  238 atgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||| || ||||| ||||||  | |||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||    
T  19486781 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatg 19486864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18005806 - 18005660
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-tt 258  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   |||||| ||    
T  18005806 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttcc-atactgctt 18005710  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005709 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18005660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 200 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22073036 - 22072914
Alignment:
Q  200 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 297  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  22073036 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagt 22072937  T
Q  298 ctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  22072936 ctaagttgattaagatgatgatg 22072914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16056488 - 16056343
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||  | ||| ||| |    
T  16056488 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttt--gcataatgtct 16056392  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16056391 atgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16495581 - 16495403
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 238  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  16495581 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 16495486  T
Q  239 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    || || ||| | ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  16495485 tgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 16495403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 150 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 34200954 - 34200787
Alignment:
Q  150 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 249  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  34200954 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 34200860  T
Q  250 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
     ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  34200859 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 34200787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 47831968 - 47831808
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| |  ||  || |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || | | | ||||||| |    
T  47831968 atataattgtatatacattatatgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatat-gcatactgtct 47831871  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
     ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47831870 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 47831808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 306
Target Start/End: Original strand, 1867932 - 1868101
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||| | ||||| |||||||| |||| ||    
T  1867932 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttcatttgca-ttgatattgttatatc 1868029  T
Q  238 at--gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    ||  |||| |||| |||||||  | ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868030 atgagctg-ttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 12255730 - 12255892
Alignment:
Q  141 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 239  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  |||||| ||||| || || ||||||||||| |||| ||||    
T  12255730 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcat 12255829  T
Q  240 g-ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
    |  |   |||| ||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255830 gaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15113114 - 15113031
Alignment:
Q  150 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15113114 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 15113031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Original strand, 16219677 - 16219823
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  || ||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  16219677 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 16219774  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16219775 atgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 16219823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 320
Target Start/End: Original strand, 16386268 - 16386368
Alignment:
Q  222 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 319  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  16386268 ttgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 16386367  T
Q  320 g 320  Q
    |    
T  16386368 g 16386368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 240
Target Start/End: Original strand, 20220127 - 20220225
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  20220127 atttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatc 20220222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 320
Target Start/End: Original strand, 10063760 - 10063938
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||| ||    
T  10063760 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatg--tt---tgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatc 10063854  T
Q  238 atgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||| || || || |||| |  | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||| ||||||||    
T  10063855 atgatg-ttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgttgatg 10063938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 40443555 - 40443393
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  40443555 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtttact 40443459  T
Q  256 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 319  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  40443458 gcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 307
Target Start/End: Original strand, 811091 - 811238
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  ||  || |||  ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  811091 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 811188  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
     ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811189 atgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 811238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 320
Target Start/End: Original strand, 28505357 - 28505418
Alignment:
Q  260 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  28505357 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatg 28505418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15116651 - 15116568
Alignment:
Q  150 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  15116651 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcaattgatattgttat 15116568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 44014231 - 44014192
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014231 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44014192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 314
Target Start/End: Original strand, 18154901 - 18154955
Alignment:
Q  260 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18154901 tgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 18154955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15755007
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 15755007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 113
Target Start/End: Original strand, 13745569 - 13745648
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  || |||| ||||||| ||||| | ||||||| ||||    
T  13745569 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattaatgaattattatatgaatat 13745648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 314
Target Start/End: Original strand, 14932749 - 14932848
Alignment:
Q  216 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  ||   | || | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14932749 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 14932848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 108
Target Start/End: Original strand, 15119918 - 15119993
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 108  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  || |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  15119918 tatgatttatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 15119993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 314
Target Start/End: Original strand, 15356184 - 15356283
Alignment:
Q  216 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  ||   | || | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15356184 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15356283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 314
Target Start/End: Original strand, 15360298 - 15360397
Alignment:
Q  216 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  ||   | || | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15360298 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15360397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 240
Target Start/End: Original strand, 15008436 - 15008536
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||  |||||||| ||||| |||||||| |||| ||    
T  15008436 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgaggtgttgttgatttgca-ttgatattgttatatc 15008533  T
Q  238 atg 240  Q
    |||    
T  15008534 atg 15008536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15211515 - 15211450
Alignment:
Q  263 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15211515 tgctgttgttaattaactaagttgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatgttgatgt 15211450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Original strand, 11996095 - 11996147
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  11996095 ttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 11996147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 38294631 - 38294567
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaa 98  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||  || |||| |||||||||||||    
T  38294631 atgattgatgaattattctatgaatgtatatgttggcgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 38294567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14044792 - 14044761
Alignment:
Q  275 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044792 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14354822 - 14354791
Alignment:
Q  275 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354822 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 296 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16213653 - 16213622
Alignment:
Q  296 gtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213653 gtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 16213622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 321
Target Start/End: Original strand, 2832504 - 2832562
Alignment:
Q  263 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatga 321  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||    
T  2832504 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatga 2832562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 84
Target Start/End: Original strand, 9743795 - 9743845
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgt 84  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  |||||||    
T  9743795 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatattgt 9743845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 20619609 - 20619575
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20619609 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 20619575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 8473087 - 8473054
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8473087 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 8473054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 8514393 - 8514426
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8514393 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 8514426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 8851889 - 8851922
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8851889 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 8851922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Original strand, 9033283 - 9033336
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  9033283 atttgatgttgttaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatat 9033336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 13745506 - 13745539
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13745506 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 13745539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 14153622 - 14153655
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14153622 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 14153655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 15119972 - 15120005
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15119972 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 15120005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 15576619 - 15576652
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15576619 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 15576652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20619564 - 20619511
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20619564 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 20619511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 25941571 - 25941538
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25941571 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 25941538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 320
Target Start/End: Original strand, 27847901 - 27847950
Alignment:
Q  271 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| |||||    
T  27847901 ttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatg 27847950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 33556906 - 33556939
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33556906 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 33556939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 33556968 - 33557001
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33556968 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 33557001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 36301549 - 36301582
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36301549 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 36301582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 37538531 - 37538498
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37538531 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 37538498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 37538685 - 37538652
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37538685 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 37538652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 43747799 - 43747766
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43747799 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 43747766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 48213658 - 48213691
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48213658 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 48213691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 4691559 - 4691591
Alignment:
Q  35 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4691559 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 4691591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 64
Target Start/End: Original strand, 14153671 - 14153703
Alignment:
Q  32 atatgattgatgaattagtatatgaatgtatat 64  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14153671 atatgattgatgaattattatatgaatgtatat 14153703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 15576494 - 15576526
Alignment:
Q  35 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15576494 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 15576526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 66
Target Start/End: Original strand, 15576556 - 15576588
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgt 66  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15576556 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgt 15576588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 20253005 - 20253037
Alignment:
Q  35 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20253005 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 20253037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 43747861 - 43747829
Alignment:
Q  35 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43747861 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 43747829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 93)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 18334438 - 18334750
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18334438 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 18334536  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18334537 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 18334636  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334637 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18334736  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  18334737 agttgattaagatg 18334750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24422863 - 24422551
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24422863 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24422765  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24422764 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 24422665  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422664 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 24422565  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  24422564 agttgattaagatg 24422551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33862110 - 33861798
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33862110 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 33862012  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33862011 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 33861912  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861911 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 33861812  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  33861811 agttgattaagatg 33861798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33864594 - 33864282
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33864594 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 33864496  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33864495 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 33864396  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864395 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 33864296  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  33864295 agttgattaagatg 33864282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 2291026 - 2291338
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2291026 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgactgatgaagt 2291124  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2291125 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 2291224  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291225 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 2291324  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  2291325 agttgattaagatg 2291338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12742634 - 12742321
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  12742634 ttactgcaagtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgaccttgtccatgattgatgaagt 12742535  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12742534 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 12742435  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742434 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12742335  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  12742334 agttgattaagatg 12742321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 30676555 - 30676881
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30676555 ttacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 30676654  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30676655 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataat 30676754  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676755 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 30676854  T
Q  301 agttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  30676855 agttgattaagatgttgatgatgatgt 30676881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 34963690 - 34963364
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  34963690 ttactgcacatagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 34963591  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34963590 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataat 34963491  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34963490 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 34963391  T
Q  301 agttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  34963390 agttgattaagatgttgatgatgatgt 34963364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 1540757 - 1541069
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1540757 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 1540855  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1540856 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 1540955  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1540956 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatcta 1541055  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  1541056 agttgattaagatg 1541069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 19858765 - 19859077
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19858765 ttactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgct-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 19858863  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19858864 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattgttatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 19858963  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858964 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 19859063  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  19859064 agttgattaagatg 19859077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 8055346 - 8055033
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8055346 ttactgaatgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 8055247  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8055246 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 8055147  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055146 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 8055047  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  8055046 agttgattaagatg 8055033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 26924486 - 26924798
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26924486 ttactgcacgtacgtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 26924584  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26924585 gttatatgtacatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 26924684  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924685 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 26924784  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  26924785 agttgattaagatg 26924798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22782543 - 22782231
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22782543 ttactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 22782445  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22782444 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataat 22782345  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782344 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22782245  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  22782244 agttgattaagatg 22782231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19005330 - 19005050
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005330 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 19005232  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 232  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005231 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 19005132  T
Q  233 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005131 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19005050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25688819 - 25688507
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25688819 ttactgcacgtaggtgacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatttttgtgaatacgatattgtccatgattgaggaagt 25688720  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25688719 gttatatgtataaatgatgttttaagatgttgattaccatttggtgttgttatattgtgatatgattatatatgtattacttgaattatatgtgaataat 25688620  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25688619 tgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatcta 25688520  T
Q  301 agttgattaagat 313  Q
    |||||||||||||    
T  25688519 agttgattaagat 25688507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 50 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 25656897 - 25656633
Alignment:
Q  50 tatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttg 149  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||     
T  25656897 tatatgtatgtatatatttgtgactacgatattgtccaagattgatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgttt 25656798  T
Q  150 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 249  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656797 ttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 25656698  T
Q  250 tatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656697 tatactgctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 25656633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 104 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1595763 - 1595553
Alignment:
Q  104 atatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1595763 atatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattga 1595664  T
Q  204 gacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1595663 gacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 1595564  T
Q  304 tgattaagatg 314  Q
    |||||||||||    
T  1595563 tgattaagatg 1595553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 126 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 25755001 - 25754813
Alignment:
Q  126 gatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25755001 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25754902  T
Q  226 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754901 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 25754813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 126 - 314
Target Start/End: Original strand, 20556864 - 20557050
Alignment:
Q  126 gatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20556864 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa--attgagacgttgttgacttgcatttga 20556961  T
Q  226 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20556962 tattattatgccatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatg 20557050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18456898 - 18456735
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 18456799  T
Q  239 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456798 tgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 19847813 - 19848122
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19847813 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 19847912  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtg-aataa 199  Q
    |||||||||||||||||||                   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||     
T  19847913 gttatatgtatatatgatg-------------------atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaatat 19847993  T
Q  200 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    || |||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||  |||||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19847994 ttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtc 19848093  T
Q  299 taagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19848094 taagttgattaagatgttgataatgatgt 19848122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 140 - 314
Target Start/End: Original strand, 3852001 - 3852175
Alignment:
Q  140 tttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 239  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3852001 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcat 3852100  T
Q  240 gctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3852101 gctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3852175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 144 - 314
Target Start/End: Original strand, 16448514 - 16448685
Alignment:
Q  144 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 242  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448514 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 16448613  T
Q  243 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16448614 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 16448685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 166 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18462031 - 18461895
Alignment:
Q  166 ttgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgc 265  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18462031 ttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgc 18461932  T
Q  266 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461931 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 12942518 - 12942365
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12942518 ttactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 12942419  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12942418 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 12942365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 17377693 - 17377814
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17377693 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaaatagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 17377792  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17377793 gttatatgtatatatgatgttt 17377814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23992739 - 23992604
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23992739 ttactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 23992641  T
Q  101 gttatatgtatat---atgatgttttaagatgttgat 134  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  23992640 gttatatgtatatatgatgatgttttaagatgttgat 23992604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 18914111 - 18913994
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914111 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtta-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 18914013  T
Q  133 attattatttgatgttgtt 151  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18914012 attattatttgatgttgtt 18913994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 28289182 - 28289333
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||   | |||||||||||||||||||||||    
T  28289182 ttactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgag--cgatattgtccatgattgatgaagt 28289279  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  28289280 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgtcgttata 28289333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 33 - 135
Target Start/End: Original strand, 31630524 - 31630626
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630524 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 31630623  T
Q  133 att 135  Q
    |||    
T  31630624 att 31630626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Original strand, 25629310 - 25629475
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25629310 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatact 25629409  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25629410 gcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 25629475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 1598373 - 1598266
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1598373 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 1598275  T
Q  101 gttatatgt 109  Q
    |||||||||    
T  1598274 gttatatgt 1598266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 156 - 323
Target Start/End: Original strand, 18409782 - 18409950
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||||| ||||  ||||||||   || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18409782 tgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatact 18409881  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatg 323  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18409882 gcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 18409950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 29060703 - 29060541
Alignment:
Q  159 gatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-t 257  Q
    ||||||||  ||| |||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  29060703 gatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc 29060604  T
Q  258 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  29060603 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatg 29060541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18914249 - 18914142
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18914249 ttactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtaaatacgatattgttcatgattgatgaagt 18914150  T
Q  101 gttatatg 108  Q
    ||||||||    
T  18914149 gttatatg 18914142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 15875590 - 15875470
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15875590 tatgattgatgaattattatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtaaatgattaatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 15875492  T
Q  133 attattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15875491 attattatttgatgttgttata 15875470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 196 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20593899 - 20593774
Alignment:
Q  196 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 294  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  20593899 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgattc 20593800  T
Q  295 ggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||    
T  20593799 ggtctaagttgatgaagatgatgatg 20593774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 173 - 320
Target Start/End: Original strand, 17287768 - 17287916
Alignment:
Q  173 tgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgt 271  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||    
T  17287768 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgt 17287867  T
Q  272 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17287868 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 17287916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Original strand, 20360915 - 20361080
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20360915 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgct 20361014  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||    
T  20361015 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatg 20361080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25644487 - 25644335
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  25644487 tgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatact 25644388  T
Q  256 g-ttgtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644387 gcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 156 - 302
Target Start/End: Original strand, 18821801 - 18821946
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 254  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||| | ||  ||||||||||||| | |||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18821801 tgtgatataat-gtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcgtt-gatattgttatggcatgctgtttttgtatac 18821898  T
Q  255 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821899 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16496410 - 16496245
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16496410 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 16496311  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  16496310 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 16496245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 196 - 320
Target Start/End: Original strand, 19303536 - 19303660
Alignment:
Q  196 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 294  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303536 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 19303634  T
Q  295 ggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||    
T  19303635 ggtctaagatgatgaagatgatgatg 19303660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 108
Target Start/End: Original strand, 31630390 - 31630493
Alignment:
Q  5 tgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgtta 104  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31630390 tgcacgtatgtcacaatgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgataaagtgtta 31630489  T
Q  105 tatg 108  Q
    ||||    
T  31630490 tatg 31630493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 209 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20076812 - 20076701
Alignment:
Q  209 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076812 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20076714  T
Q  308 taagatgttgatg 320  Q
     |||||| |||||    
T  20076713 gaagatgatgatg 20076701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 18937321 - 18937252
Alignment:
Q  82 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18937321 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 18937252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 173 - 320
Target Start/End: Original strand, 22780199 - 22780347
Alignment:
Q  173 tgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgt 271  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||  ||||||    
T  22780199 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgt 22780298  T
Q  272 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  22780299 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 22780347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 19005468 - 19005361
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| |    
T  19005468 ttactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattactataggtatgtatatgtttgtgaatgcgatattgttcataattgatgaaat 19005369  T
Q  101 gttatatg 108  Q
    ||||||||    
T  19005368 gttatatg 19005361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 25535724 - 25535641
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgt 84  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  25535724 ttactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 25535641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 216 - 320
Target Start/End: Original strand, 20638298 - 20638403
Alignment:
Q  216 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20638298 ttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatg 20638397  T
Q  315 ttgatg 320  Q
     |||||    
T  20638398 atgatg 20638403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20109322 - 20109153
Alignment:
Q  141 ttgatgttgtt-atactgtgatataat--tgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |     
T  20109322 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatt 20109223  T
Q  238 atgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    ||| || ||||| ||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109222 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20109153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 320
Target Start/End: Original strand, 8227448 - 8227631
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  8227448 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 8227547  T
Q  238 atgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||| || ||||| ||||||  |  ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  8227548 atgatg-ttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatg 8227631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 15875718 - 15875621
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15875718 ttactgcacgtaggtcacagtaaataattgaatatgattgatgaattagta----------tatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 15875629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 160 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 23019567 - 23019425
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-tt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| ||    
T  23019567 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgctt 23019470  T
Q  259 gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
     |||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23019469 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714418
Alignment:
Q  260 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 25714418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 320
Target Start/End: Original strand, 27333277 - 27333338
Alignment:
Q  260 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27333277 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 27333338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 320
Target Start/End: Original strand, 27394017 - 27394078
Alignment:
Q  260 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27394017 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 27394078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23992540 - 23992421
Alignment:
Q  209 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23992540 tgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgat 23992441  T
Q  308 taagatgttgatgatgatgt 327  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  23992440 taagatgttgataatgatgt 23992421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Original strand, 9098473 - 9098620
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgt- 257  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||    ||| || ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||   | ||||| ||||||      
T  9098473 atataattatatatacattacatgaattatgtttgatg--ttgtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgcatactgcc 9098570  T
Q  258 tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098571 tttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 304
Target Start/End: Original strand, 28496424 - 28496575
Alignment:
Q  150 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 249  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| || |||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  28496424 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttga-tatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 28496518  T
Q  250 tatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
     ||||||  | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496519 catactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28496575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 304
Target Start/End: Original strand, 29808835 - 29808986
Alignment:
Q  150 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 249  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| || |||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  29808835 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttga-tatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 29808929  T
Q  250 tatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
     ||||||  | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29808930 catactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29808986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19668488 - 19668386
Alignment:
Q  207 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| | ||||| | | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668488 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 19668390  T
Q  303 ttga 306  Q
    ||||    
T  19668389 ttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 320
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080845
Alignment:
Q  274 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatg 22080845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23076915 - 23076862
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23076915 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatat 23076862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561304
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 1561304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 19652248 - 19652209
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19652248 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19652209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 11185558 - 11185524
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185558 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 35056781 - 35056707
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||  || |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  35056781 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgattatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 35056707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 35245684 - 35245587
Alignment:
Q  222 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 319  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  35245684 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 35245588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18696670 - 18696617
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18696670 atttaatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 18696617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18706488 - 18706435
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18706488 atttgatgttgttaataatgtcatataaatgtatatgcattacatgaattatat 18706435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22831565 - 22831524
Alignment:
Q  260 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831565 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22831524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35008333 - 35008280
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  35008333 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatattcattacatgaattatat 35008280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Original strand, 16920698 - 16920750
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||| |||||    
T  16920698 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatg 16920750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 33443108 - 33443068
Alignment:
Q  260 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33443108 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 294
Target Start/End: Original strand, 15041542 - 15041644
Alignment:
Q  193 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 291  Q
    |||||| || ||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||  | || | || |||||||||||||||| |||||||    
T  15041542 tgaatacttaagatgttattgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatga 15041641  T
Q  292 gtc 294  Q
    |||    
T  15041642 gtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 18928152 - 18928118
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18928152 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 18928118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 327
Target Start/End: Original strand, 25603406 - 25603512
Alignment:
Q  223 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgttgatg 320  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||  |||  | || ||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||    
T  25603406 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatg 25603505  T
Q  321 atgatgt 327  Q
     ||||||    
T  25603506 ttgatgt 25603512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 327
Target Start/End: Original strand, 25611744 - 25611850
Alignment:
Q  223 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgttgatg 320  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||  |||  | || ||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||    
T  25611744 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatg 25611843  T
Q  321 atgatgt 327  Q
     ||||||    
T  25611844 ttgatgt 25611850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 32259136 - 32259078
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgatt 92  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  || |||| |||||||    
T  32259136 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgatt 32259078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 10445413 - 10445380
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10445413 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 10445380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 13284971 - 13284938
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13284971 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 13284938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 15875642 - 15875565
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtat 111  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  15875642 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattattatatgtat 15875565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Original strand, 18177609 - 18177662
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  18177609 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatat 18177662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Original strand, 18199353 - 18199406
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  18199353 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatat 18199406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18204262 - 18204209
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  18204262 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatat 18204209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 20411319 - 20411352
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20411319 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 20411352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 20411382 - 20411415
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20411382 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 20411415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Original strand, 28103836 - 28103889
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  28103836 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattatgtgaattatat 28103889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 29044525 - 29044492
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29044525 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 29044492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 35056665 - 35056632
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35056665 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 35056632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 35056728 - 35056695
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35056728 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 35056695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 307
Target Start/End: Original strand, 4185880 - 4185928
Alignment:
Q  260 tgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4185880 tgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgat 4185928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 121)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 34159642 - 34159330
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34159642 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 34159544  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34159543 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 34159444  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159443 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 34159344  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  34159343 agttgattaagatg 34159330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 55476807 - 55476495
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55476807 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 55476709  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55476708 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 55476609  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476608 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 55476509  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  55476508 agttgattaagatg 55476495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 16454127 - 16454439
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16454127 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 16454225  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16454226 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 16454325  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16454326 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 16454425  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  16454426 agttgattaagatg 16454439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17463494 - 17463182
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17463494 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 17463396  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17463395 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 17463296  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463295 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 17463196  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  17463195 agttgattaagatg 17463182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 6468980 - 6469292
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6468980 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 6469078  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  6469079 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaat 6469178  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469179 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 6469278  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  6469279 agttgattaagatg 6469292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 45606752 - 45607065
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45606752 ttactgaatgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 45606851  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45606852 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 45606951  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606952 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 45607051  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  45607052 agttgattaagatg 45607065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 13154101 - 13154414
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13154101 ttactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 13154199  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13154200 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 13154299  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtct 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13154300 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtct 13154399  T
Q  300 aagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||    
T  13154400 aagttgattaagatg 13154414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 7781192 - 7781505
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7781192 ttactgaacataggtcacagtgaataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 7781291  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7781292 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 7781391  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781392 tgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 7781491  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  7781492 agttgattaagatg 7781505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 2 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13544340 - 13544016
Alignment:
Q  2 tactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtg 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13544340 tactgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtg 13544242  T
Q  102 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13544241 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatt 13544142  T
Q  202 gagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544141 gagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 13544042  T
Q  302 gttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  13544041 gttgattaagatgttgataatgatgt 13544016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 10247569 - 10247881
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10247569 ttactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 10247667  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10247668 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 10247767  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10247768 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtcta 10247867  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  10247868 agttgattaagatg 10247881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 13151636 - 13151949
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  13151636 ttactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaaggtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgcctgatgaagt 13151734  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13151735 gtgatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 13151834  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtct 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13151835 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtct 13151934  T
Q  300 aagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||    
T  13151935 aagttgattaagatg 13151949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12567876 - 12567551
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12567876 ttacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 12567778  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12567777 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataat 12567678  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567677 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12567578  T
Q  301 agttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||    
T  12567577 agttgattaagatgttgtttatgatgt 12567551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 28848467 - 28848769
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28848467 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg-----------ttgtgaatacgatattttccatgattgatgaagt 28848555  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28848556 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 28848655  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848656 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 28848755  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  28848756 agttgattaagatg 28848769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Original strand, 9707484 - 9707765
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707484 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 9707583  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 232  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9707584 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattatt 9707683  T
Q  233 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707684 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 9707765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 8899378 - 8899098
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899378 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 8899280  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 232  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899279 attatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 8899180  T
Q  233 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8899179 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatg 8899098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Original strand, 16282689 - 16282969
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282689 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 16282787  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 232  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16282788 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattatt 16282887  T
Q  233 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282888 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16282969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 38961769 - 38962045
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961769 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgttg 38961867  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 232  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961868 gttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 38961967  T
Q  233 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961968 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 38962045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41124171 - 41123894
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124171 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattggtgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 41124073  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 232  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124072 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 41123973  T
Q  233 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41123972 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 41123894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 8499827 - 8499522
Alignment:
Q  11 taggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgta 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  8499827 taggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaagttttatatgta 8499728  T
Q  111 tatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgtt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||| ||    
T  8499727 tatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacatt 8499628  T
Q  210 g-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 308  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499627 gattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 8499528  T
Q  309 aagatg 314  Q
    ||||||    
T  8499527 aagatg 8499522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15412748 - 15412433
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15412748 ttactgaacgtaggtcacagtgtataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 15412649  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataa 199  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |  |  ||||| |||||||||    
T  15412648 tttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataa 15412549  T
Q  200 ttgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412548 ttgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 15412449  T
Q  299 taagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||    
T  15412448 taagttgattaagatg 15412433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27165569 - 27165254
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27165569 ttactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 27165470  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||| ||||||     
T  27165469 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatat 27165370  T
Q  200 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 297  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| ||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165369 ttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttg-ttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 27165271  T
Q  298 ctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||    
T  27165270 ctaagttgattaagatg 27165254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 115 - 314
Target Start/End: Original strand, 17446614 - 17446812
Alignment:
Q  115 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17446614 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttga 17446713  T
Q  215 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17446714 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatg 17446812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 53301349 - 53301665
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  53301349 ttactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtacatgattgatgaagt 53301448  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| | | ||| |||||||||| ||||||     
T  53301449 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccattttatgttgtttatattgtgatataattgtatacgtaatacttgaattatatatgaatat 53301548  T
Q  200 ttgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 296  Q
    ||||||  |||  |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  53301549 ttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcgg 53301647  T
Q  297 tctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||    
T  53301648 tctaagttgattaagatg 53301665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Original strand, 29172565 - 29172741
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172565 atttgatgttgatagtattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 29172664  T
Q  238 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172665 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29172741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 126 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 50243014 - 50242830
Alignment:
Q  126 gatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50243014 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 50242915  T
Q  226 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 310  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242914 tattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 50242830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17672805 - 17672630
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 238  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17672805 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtca 17672706  T
Q  239 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672705 tgctgtttttgtatactgctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17672630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Original strand, 53070636 - 53070799
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 238  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53070636 atttgatgttgttagattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtct 53070735  T
Q  239 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070736 tgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 15977849 - 15977697
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15977849 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgataaagt 15977751  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15977750 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttata 15977697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Original strand, 12119707 - 12119883
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12119707 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 12119806  T
Q  238 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119807 atgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12119883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 126 - 302
Target Start/End: Original strand, 43550448 - 43550625
Alignment:
Q  126 gatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550448 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 43550547  T
Q  226 tattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550548 tattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43550625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 46822578 - 46822259
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46822578 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 46822479  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   | | | ||| ||||  ||       | ||| |||||||| |||  |||   |||||| |    
T  46822478 gttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgatgattgaat-aagatgtgatacattg-------tttatgtgcattacttgagatattattgaatatt 46822387  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
    | ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  46822386 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtct 46822287  T
Q  300 aagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  46822286 aagttgattaagatgttgataatgatgt 46822259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 187 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15977646 - 15977519
Alignment:
Q  187 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977646 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctg 15977547  T
Q  287 catgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977546 catgagtcggtctaagttgattaagatg 15977519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 54521139 - 54520986
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  54521139 ttactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 54521040  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  54521039 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 54520986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 12305462 - 12305315
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12305462 ttactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 12305363  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12305362 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt 12305315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 207 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 55501053 - 55500946
Alignment:
Q  207 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501053 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 55500954  T
Q  307 ttaagatg 314  Q
    ||||||||    
T  55500953 ttaagatg 55500946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 10557225 - 10557091
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10557225 ttactgcacataggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaattcgatattgtccatgattgatgaagt 10557126  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 135  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10557125 tttatatgtatatatgatgttttgagatgttgatt 10557091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 14973020 - 14972855
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||   || |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14973020 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14972921  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  14972920 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 14972855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 314
Target Start/End: Original strand, 40213676 - 40213834
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| || |||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40213676 tgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatact 40213775  T
Q  256 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213776 gctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatg 40213834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 200 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 36166715 - 36166602
Alignment:
Q  200 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166715 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 36166617  T
Q  300 aagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||    
T  36166616 aagttgattaagatg 36166602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17488022 - 17487857
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488022 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17487923  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17487922 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17487857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17499504 - 17499339
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499504 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17499405  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17499404 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17499339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 200 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21618566 - 21618459
Alignment:
Q  200 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618566 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 21618468  T
Q  300 aagttgatt 308  Q
    |||||||||    
T  21618467 aagttgatt 21618459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 29544687 - 29544839
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||    
T  29544687 ttactgcacgtaggtcacaatgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatctatatatttgttaaaatgatattgtcaatgattgatgaagt 29544786  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29544787 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttat 29544839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 12119499 - 12119606
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12119499 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 12119598  T
Q  101 gttatatg 108  Q
     |||||||    
T  12119599 attatatg 12119606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Original strand, 25476340 - 25476505
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||  ||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476340 tgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25476439  T
Q  256 -gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
       ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25476440 acctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 25476505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 140 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 42386593 - 42386428
Alignment:
Q  140 tttgatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 238  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||| | ||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42386593 tttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtca 42386494  T
Q  239 tgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42386493 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 156 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 43841098 - 43840940
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43841098 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 43840999  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 313  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43840998 gtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagat 43840940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 215 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 10557088 - 10556989
Alignment:
Q  215 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557088 cttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctgatgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10556989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 207 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18438649 - 18438535
Alignment:
Q  207 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18438649 gttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 18438550  T
Q  306 attaagatgttgatg 320  Q
    || |||||| |||||    
T  18438549 atgaagatgatgatg 18438535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13442440 - 13442275
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13442440 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 13442341  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13442340 gcctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 13442275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Original strand, 20698391 - 20698555
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||  |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20698391 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatact 20698489  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20698490 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 20698555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Original strand, 23083316 - 23083481
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||  ||| || |  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23083316 tgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatact 23083415  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23083416 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23083481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26687053 - 26686888
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||   ||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26687053 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26686954  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  26686953 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatgatg 26686888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 193 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 12399338 - 12399210
Alignment:
Q  193 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 291  Q
    |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399338 tgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 12399239  T
Q  292 gtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||    
T  12399238 gtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 12399210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 13436616 - 13436520
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatga 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13436616 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 13436520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 307
Target Start/End: Original strand, 14576788 - 14576939
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14576788 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatact 14576886  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14576887 gtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgat 14576939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 139 - 320
Target Start/End: Original strand, 24340660 - 24340843
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  24340660 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 24340759  T
Q  238 atgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||| || || || ||||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  24340760 atgatg-ttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 24340843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 219 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494813
Alignment:
Q  219 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatg 44494813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 154
Target Start/End: Original strand, 11913928 - 11914050
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  11913928 tatgattgatgaattagtatatgtatgtacatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 11914026  T
Q  131 tgattattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  11914027 tgattatcatttgatgttgttata 11914050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 156 - 314
Target Start/End: Original strand, 24153164 - 24153322
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||| ||  ||| |||||||  |||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24153164 tgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 24153262  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
       | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153263 acctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24153322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 14572717 - 14572603
Alignment:
Q  193 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 291  Q
    |||||| || ||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572717 tgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 14572619  T
Q  292 gtcggtctaagttgat 307  Q
    ||||||||||||||||    
T  14572618 gtcggtctaagttgat 14572603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737240
Alignment:
Q  220 atttgatattattatgtcatgctgtttttgta---tactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17737240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 24513993 - 24513910
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgt 84  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24513993 ttactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgt 24513910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 38961684 - 38961794
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  |||||||||||| |    
T  38961684 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaatt 38961783  T
Q  101 gttatatgtat 111  Q
      |||||||||    
T  38961784 agtatatgtat 38961794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 25237160 - 25237063
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  ||||||||||||    
T  25237160 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 25237063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Original strand, 11424718 - 11424879
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   || ||||||||||   |||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11424718 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgaga---tgttgatttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatact 11424813  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  11424814 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 11424879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 302
Target Start/End: Original strand, 52523666 - 52523831
Alignment:
Q  141 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 239  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  52523666 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 52523765  T
Q  240 g--ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |  ||| ||||| ||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523766 gaactg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 113
Target Start/End: Original strand, 17444694 - 17444773
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444694 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 17444773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 16282603 - 16282670
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 68  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282603 ttactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 16282670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23274871 - 23274705
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  23274871 atttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 23274772  T
Q  238 atgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||| || ||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23274771 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 111
Target Start/End: Original strand, 17444613 - 17444719
Alignment:
Q  5 tgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgtta 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  |||||||||||| |  ||    
T  17444613 tgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagta 17444712  T
Q  105 tatgtat 111  Q
    |||||||    
T  17444713 tatgtat 17444719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 41124252 - 41124146
Alignment:
Q  5 tgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgtta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  |||||||||||| |  ||    
T  41124252 tgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaactagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagta 41124153  T
Q  105 tatgtat 111  Q
    |||||||    
T  41124152 tatgtat 41124146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 320
Target Start/End: Original strand, 37642202 - 37642385
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  37642202 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 37642301  T
Q  238 atgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||| || ||||| ||||||  | |||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||    
T  37642302 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatg 37642385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 25229573 - 25229476
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaa 98  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  ||||||||||||    
T  25229573 ttactacacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 25229476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 240
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051238
Alignment:
Q  141 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 239  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 2051237  T
Q  240 g 240  Q
    |    
T  2051238 g 2051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15471085 - 15470939
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  15471085 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 15470988  T
Q  259 gtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470987 atgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15470939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 25237075 - 25237009
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25237075 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 25237009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 141 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16097509 - 16097342
Alignment:
Q  141 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 239  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| | ||    
T  16097509 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgat 16097411  T
Q  240 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    | || ||| | ||| ||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097410 gatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16097342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 202
Target Start/End: Original strand, 17248224 - 17248287
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17248224 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaataattg 17248287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 193 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 30029968 - 30029834
Alignment:
Q  193 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 291  Q
    |||||| || ||||||||| || |||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||  |||| | || |||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  30029968 tgaatatttaagacgttgt-gaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 30029870  T
Q  292 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  30029869 gtcagtctaagttgaatgagatgttgatgatgatgt 30029834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 14234648 - 14234488
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  ||  || |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  14234648 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 14234551  T
Q  259 gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  14234550 atgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaagatgatgatg 14234488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Original strand, 37251105 - 37251270
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  37251105 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatga--tgttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 37251202  T
Q  238 atg--ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||  ||| |||| |||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37251203 atgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16103960 - 16103794
Alignment:
Q  141 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 239  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  16103960 ttgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttga-tatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcat 16103863  T
Q  240 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103862 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16103794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 247
Target Start/End: Original strand, 22147474 - 22147571
Alignment:
Q  150 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  22147474 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt 22147571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 314
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45577996
Alignment:
Q  265 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45577996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28194752 - 28194697
Alignment:
Q  260 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194752 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 28194697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 196 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 32307802 - 32307681
Alignment:
Q  196 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 293  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32307802 ataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 32307705  T
Q  294 cggtctaagttgattaagatgttg 317  Q
    |||||||||||||| | |||||||    
T  32307704 cggtctaagttgatgatgatgttg 32307681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 320
Target Start/End: Original strand, 13210280 - 13210447
Alignment:
Q  150 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 249  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| || || ||   ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  13210280 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttga-tatttaag---ttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-g 13210374  T
Q  250 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
     ||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  13210375 catactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 13210447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 150 - 307
Target Start/End: Original strand, 12174212 - 12174366
Alignment:
Q  150 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 249  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| || |||||  ||||||   ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  12174212 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttga-tatttgagttgttgtt---ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 12174306  T
Q  250 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174307 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12174366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12511172 - 12511051
Alignment:
Q  207 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  12511172 gttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttg 12511073  T
Q  306 attaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  12511072 attaagatgttgataatgatgt 12511051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 43926123 - 43925977
Alignment:
Q  158 tgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--gctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||| |||| | ||||    
T  43926123 tgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctg-ttttatgtact 43926026  T
Q  256 g-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926025 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 20630037 - 20630078
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgat 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630037 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgat 20630078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Original strand, 22110289 - 22110454
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||    |||||| | |||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  22110289 atttgaagttgttaataatgtgatataaatgtatacgcattacatgaattctatatga--tgttgagatgctgttgatttgcatttgatattgttatatc 22110386  T
Q  238 atg--ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||  ||| |||| | |||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110387 atgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15977700 - 15977663
Alignment:
Q  109 tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977700 tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatg 15977663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 307
Target Start/End: Original strand, 49668135 - 49668183
Alignment:
Q  260 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49668135 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 49668183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 25201397 - 25201323
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  25201397 atgattgatgaattattatatgaatgtatatattgatgaatatgatattgttcatgattaatgaattattatatg 25201323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14665458 - 14665397
Alignment:
Q  260 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatga 321  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||    
T  14665458 tgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatga 14665397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 9512982 - 9512934
Alignment:
Q  260 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9512982 tgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 9512934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 9520957 - 9520909
Alignment:
Q  260 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9520957 tgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 9520909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13919390 - 13919350
Alignment:
Q  260 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13919390 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 10379644 - 10379613
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10379644 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 10379613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 856197 - 856143
Alignment:
Q  260 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  856197 tgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 856143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 317
Target Start/End: Original strand, 3389999 - 3390053
Alignment:
Q  263 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  3389999 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 3390053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14668611 - 14668553
Alignment:
Q  263 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatga 321  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||    
T  14668611 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatga 14668553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 92
Target Start/End: Original strand, 15025934 - 15025992
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgatt 92  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||  ||||||| |||||||    
T  15025934 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgatgatgaatatgatattgttcatgatt 15025992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15207120 - 15207070
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttat-actgtgatataattgtatatgcattacatgaatta 188  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15207120 atttgatgttgttattaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaatta 15207070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15246202 - 15246152
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttat-actgtgatataattgtatatgcattacatgaatta 188  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15246202 atttgatgttgttattaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaatta 15246152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15265323 - 15265273
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttat-actgtgatataattgtatatgcattacatgaatta 188  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15265323 atttgatgttgttattaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaatta 15265273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 76
Target Start/End: Original strand, 18700200 - 18700242
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatac 76  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  18700200 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatac 18700242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 314
Target Start/End: Original strand, 23077537 - 23077591
Alignment:
Q  260 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  23077537 tgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatg 23077591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 317
Target Start/End: Original strand, 1644733 - 1644790
Alignment:
Q  260 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  1644733 tgttgttgttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatgacgatgttg 1644790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 3528206 - 3528239
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3528206 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 3528239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 17044395 - 17044330
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaa 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  || |||| |||||||||||||    
T  17044395 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatattgacgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 17044330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 17207601 - 17207568
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17207601 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 17207568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Original strand, 23318653 - 23318706
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23318653 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatat 23318706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 25201281 - 25201248
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25201281 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 25201248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28194875 - 28194822
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  28194875 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 28194822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 50351882 - 50351915
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50351882 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 50351915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 17207664 - 17207632
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgt 66  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17207664 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgt 17207632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 50351664 - 50351696
Alignment:
Q  35 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50351664 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 50351696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 54330969 - 54331001
Alignment:
Q  35 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54330969 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 54331001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 136996 - 136684
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  136996 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 136898  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  136897 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 136798  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136797 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 136698  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  136697 agttgattaagatg 136684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 139465 - 139153
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  139465 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 139367  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  139366 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 139267  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139266 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 139167  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  139166 agttgattaagatg 139153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 144403 - 144091
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  144403 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 144305  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  144304 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 144205  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144204 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 144105  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  144104 agttgattaagatg 144091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 134527 - 134215
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  134527 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 134429  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  134428 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 134329  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134328 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 134229  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||    
T  134228 tgttgattaagatg 134215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 141934 - 141622
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  141934 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 141836  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  141835 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 141736  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  141735 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtcta 141636  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  141635 agttgattaagatg 141622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 132784 - 132672
Alignment:
Q  196 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 293  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| || | ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  132784 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagt 132686  T
Q  294 cggtctaagttgat 307  Q
    ||||||||| ||||    
T  132685 cggtctaagatgat 132672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 62355 - 62216
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||   |||||| |||||||||||  |||| |||||||  ||||||  |    
T  62355 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttg---tgcattcgatattattataccatgatgtttttc-atactgcct 62262  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  62261 atgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 94727 - 94415
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  94727 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 94629  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  94628 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 94529  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94528 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 94429  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  94428 agttgattaagatg 94415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 17285 - 17600
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17285 ttactgcacgtaggtcacagtgaatagttgaatatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 17384  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17385 gtcatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatactgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataat 17484  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17485 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 17584  T
Q  301 agttgattaagatgtt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  17585 agttgattaagatgtt 17600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 159 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44458
Alignment:
Q  159 gatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgt 257  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt 44515  T
Q  258 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44514 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 160 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 100534 - 100388
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  || |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  100534 atataattgtatatacattatatgaattat--gttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcct 100438  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100437 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 100388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 307
Target Start/End: Original strand, 40135 - 40281
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |  |||||  |    
T  40135 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcctactgcct 40231  T
Q  259 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
     ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40232 atgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 40281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 119937 - 119876
Alignment:
Q  260 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  119937 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 119876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 268 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 101552 - 101513
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  101552 ttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgat 101513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 119)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1484718 - 1484406
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1484718 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 1484620  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1484619 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 1484520  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484519 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 1484420  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  1484419 agttgattaagatg 1484406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 5853138 - 5853450
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5853138 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 5853236  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5853237 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 5853336  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853337 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 5853436  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  5853437 agttgattaagatg 5853450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 14409290 - 14409602
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14409290 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 14409388  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14409389 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 14409488  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409489 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 14409588  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  14409589 agttgattaagatg 14409602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22002069 - 22001757
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22002069 ttactgcacgtaggtaacattgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 22001971  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22001970 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 22001871  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001870 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22001771  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  22001770 agttgattaagatg 22001757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 4542219 - 4542531
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4542219 ttactgcacgtaggtcgcagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 4542317  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  4542318 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataat 4542417  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542418 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatcttgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 4542517  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  4542518 agttgattaagatg 4542531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4483597 - 4483285
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4483597 ttactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 4483498  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4483497 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 4483398  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4483397 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtcta 4483299  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  4483298 agttgattaagatg 4483285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 16413161 - 16413476
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16413161 ttacttcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 16413260  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16413261 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataat 16413360  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413361 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 16413460  T
Q  301 agttgattaagatgtt 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  16413461 agttgattaagatgtt 16413476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 20046041 - 20046353
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20046041 ttactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattttccatgattgatgaagt 20046139  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20046140 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataat 20046239  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046240 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20046339  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  20046340 agttgattaagatg 20046353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20403511 - 20403231
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403511 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 20403413  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 232  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403412 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 20403313  T
Q  233 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403312 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20403231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14824091 - 14823778
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14824091 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatgtt-gtaaatacgatattatccatgattgatgaagt 14823993  T
Q  101 gttatatgtatatat--gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaata 198  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14823992 gttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaata 14823893  T
Q  199 attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  14823892 attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtc 14823794  T
Q  299 taagttgattaagatg 314  Q
    ||| ||||||||||||    
T  14823793 taaattgattaagatg 14823778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Original strand, 15203109 - 15203389
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203109 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaataagatattatccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 15203207  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 232  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15203208 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattatt 15203307  T
Q  233 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15203308 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatg 15203389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 33 - 318
Target Start/End: Original strand, 45290572 - 45290857
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290572 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 45290670  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattat 231  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  45290671 attattatttgacgttgttatactgtgatataattgtatctgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattat 45290770  T
Q  232 tatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290771 tatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 45290857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19896553 - 19896269
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttt-aagatgtt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19896553 tatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatatttttaagatgtt 19896455  T
Q  132 gattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatta- 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19896454 gattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattat 19896355  T
Q  231 --ttatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896354 tattatgtcatgctgtttttgtataccgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19896269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15070877 - 15070571
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15070877 ttactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 15070778  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataa 199  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||| |  |  ||||| |||||||||    
T  15070777 tttatatgtatttatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattcagatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataa 15070678  T
Q  200 ttgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070677 ttgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 15070578  T
Q  299 taagttg 305  Q
    |||||||    
T  15070577 taagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 34 - 314
Target Start/End: Original strand, 19936882 - 19937164
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaa--gatgtt 131  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  19936882 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 19936980  T
Q  132 gattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatatta 230  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||   |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  19936981 gattatcatttgatgttgttatattgtgatataactgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttgatctta 19937080  T
Q  231 ttatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19937081 ttatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 19937164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 24485889 - 24486093
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24485889 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 24485988  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24485989 gttatatgtatatatgatgttctaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 24486088  T
Q  201 tgaga 205  Q
    |||||    
T  24486089 tgaga 24486093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41598367 - 41598192
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598367 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 41598268  T
Q  239 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598267 tgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 41598192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 33 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 32810215 - 32810054
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32810215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgttg 32810117  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32810116 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 32810054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 139 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 26224098 - 26223914
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224098 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 26223999  T
Q  239 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatg 323  Q
    |||| |||||||||| || | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26223998 tgctatttttgtatattgctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatgatg 26223914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 126 - 314
Target Start/End: Original strand, 25484245 - 25484426
Alignment:
Q  126 gatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 225  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25484245 gatgttgattatgatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25484344  T
Q  226 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  25484345 tattattatgtcatgctgtttttgtatac-------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatg 25484426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 141 - 302
Target Start/End: Original strand, 19801367 - 19801527
Alignment:
Q  141 ttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 240  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19801367 ttgatgttgttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatg 19801466  T
Q  241 ctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801467 ctg-ttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 32122045 - 32121726
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32122045 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgcatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 32121946  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   | | | ||| ||||  ||       | ||| |||||||| |||  |||   |||||| |    
T  32121945 gttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgatgattgaat-aagatgtgatacattg-------tttatgtgcattacttgagatattattgaatatt 32121854  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
    | ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  32121853 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattct 32121754  T
Q  300 aagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  32121753 aagttgattaagatgttgataatgatgt 32121726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 18677910 - 18678229
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18677910 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatgtatatgtatatgtttgtgaatacgatattatccatgattgatgaagt 18678009  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||   | | | ||| ||||  ||       | ||| |||||||| |||  |||   |||||| |    
T  18678010 gttatatttatgtatgatgttttaagatgttgatgattgaat-aagatgtgatacattg-------tttatgtgcattacttgagatattattgaatatt 18678101  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
    | ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18678102 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtct 18678201  T
Q  300 aagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18678202 aagttgattaagatgttgataatgatgt 18678229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 27472262 - 27472395
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27472262 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 27472361  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 135  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27472362 tttatatgtatatatgatg-tttaagatgttgatt 27472395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Original strand, 16092297 - 16092462
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| | ||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092297 tgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16092396  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16092397 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 16092462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 6759421 - 6759259
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||| ||||||  ||||||||  ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6759421 tgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgaga---tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 6759325  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6759324 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 6759259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 156 - 323
Target Start/End: Original strand, 28648999 - 28649167
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||||  |||||| ||||||||   || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28648999 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 28649098  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatg 323  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  28649099 gcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 28649167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 135
Target Start/End: Original strand, 38549988 - 38550090
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549988 tatgattgatgaattagtatacgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 38550087  T
Q  133 att 135  Q
    |||    
T  38550088 att 38550090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Original strand, 18818364 - 18818529
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818364 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18818463  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18818464 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18818529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 169 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 7372931 - 7372779
Alignment:
Q  169 tatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctg 267  Q
    |||| ||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  7372931 tataagcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg 7372832  T
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7372831 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7372779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 200 - 314
Target Start/End: Original strand, 26225292 - 26225405
Alignment:
Q  200 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225292 ttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 26225390  T
Q  300 aagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||    
T  26225391 aagttgattaagatg 26225405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20536374 - 20536209
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536374 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20536275  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20536274 gcctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 20536209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 1326777 - 1326884
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  1326777 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtacatgtttgtaaatacgatattgtttatgattgatgaagt 1326876  T
Q  101 gttatatg 108  Q
    ||||||||    
T  1326877 gttatatg 1326884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Original strand, 21918955 - 21919120
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattat-atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 254  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||  || || |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21918955 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 21919053  T
Q  255 tgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  21919054 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21919120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 200 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26219834 - 26219721
Alignment:
Q  200 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219834 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 26219736  T
Q  300 aagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||| ||||    
T  26219735 aagttgattatgatg 26219721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 108
Target Start/End: Original strand, 38549851 - 38549957
Alignment:
Q  2 tactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtg 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |     
T  38549851 tactgcacgtatgtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaattt 38549950  T
Q  102 ttatatg 108  Q
    |||||||    
T  38549951 ttatatg 38549957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 16401770 - 16401875
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16401770 ttacagcaggtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 16401869  T
Q  101 gttata 106  Q
    ||||||    
T  16401870 gttata 16401875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22875230 - 22875066
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22875230 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 22875132  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  22875131 gcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatg 22875066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 16198211 - 16198115
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatga 97  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16198211 ttactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 16198115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 173 - 320
Target Start/End: Original strand, 21923900 - 21924048
Alignment:
Q  173 tgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgt 271  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  21923900 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgt 21923999  T
Q  272 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21924000 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 21924048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 209 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23406492 - 23406380
Alignment:
Q  209 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406492 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23406393  T
Q  308 taagatgttgatg 320  Q
     |||||| |||||    
T  23406392 gaagatgatgatg 23406380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 139 - 318
Target Start/End: Original strand, 13597554 - 13597735
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  13597554 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 13597653  T
Q  238 atgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 318  Q
    ||| || ||||| || ||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||    
T  13597654 atgatg-ttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttga 13597735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 135
Target Start/End: Original strand, 20982604 - 20982710
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgt----tatatgtatatatgatgttttaagat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20982604 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatatatatgatgttttaagat 20982703  T
Q  129 gttgatt 135  Q
    |||||||    
T  20982704 gttgatt 20982710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22626901 - 22626737
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22626901 tgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 22626803  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22626802 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 22626737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 154
Target Start/End: Original strand, 1326915 - 1327041
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgt------tatatgtatatatgatgttttaag 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||      |||||||||||| |||||||| ||    
T  1326915 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatgtatatacgatgttttgag 1327013  T
Q  127 atgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1327014 atgttgattattatttgatgttgttata 1327041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 25657998 - 25658094
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatga 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  25657998 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatttgatattgttcatgattgatga 25658094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 139 - 318
Target Start/End: Original strand, 13508022 - 13508203
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  13508022 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 13508121  T
Q  238 atgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 318  Q
    ||| || || || ||| ||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||    
T  13508122 atgatg-ttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttga 13508203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 24048927 - 24048841
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccat 88  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  24048927 ttactgca-gtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtncat 24048841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 144
Target Start/End: Original strand, 16401908 - 16402020
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  16401908 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 16402006  T
Q  131 tgattattatttga 144  Q
    ||||||| ||||||    
T  16402007 tgattatcatttga 16402020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 19896638 - 19896524
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  |||||||||||| |    
T  19896638 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatgtgattgatgaattaggatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaatt 19896539  T
Q  101 gttatatgtatatat 115  Q
      |||||||||||||    
T  19896538 agtatatgtatatat 19896524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Original strand, 18879191 - 18879351
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||  ||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||    
T  18879191 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatact 18879285  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18879286 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18879351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 150 - 320
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612230
Alignment:
Q  150 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 249  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| |||||| |    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-g 17612157  T
Q  250 tatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
     ||||||  | ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  17612158 catactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 17612230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 108
Target Start/End: Original strand, 13425336 - 13425411
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13425336 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 13425411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 15203024 - 15203091
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15203024 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgaatgtatatgttt 15203091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 108
Target Start/End: Original strand, 20982498 - 20982573
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20982498 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 20982573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 320
Target Start/End: Original strand, 38855212 - 38855371
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  38855212 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 38855308  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38855309 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 38855371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 20403596 - 20403486
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  |||||||||||| |    
T  20403596 ttactgcgcgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaatt 20403497  T
Q  101 gttatatgtat 111  Q
      |||||||||    
T  20403496 agtatatgtat 20403486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20498746 - 20498581
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  20498746 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 20498647  T
Q  238 atgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||  ||||  ||||||  | |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20498646 atgct-attttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 31971421 - 31971258
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  31971421 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 31971324  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  31971323 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 31971258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 193 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23648682 - 23648547
Alignment:
Q  193 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 291  Q
    |||||| || ||| |||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |||  | ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  23648682 tgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatga 23648583  T
Q  292 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23648582 gtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 23648547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21285758 - 21285606
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||  |    
T  21285758 atataattgtatatacattacatgaactatgtttga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcct 21285661  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 312  Q
     ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21285660 atgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 21285606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 37116532 - 37116366
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  37116532 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 37116434  T
Q  238 atg--ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||  ||| |||| | |||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116433 atgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 6520528 - 6520369
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||  ||  ||  || |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  6520528 atataattgtatatacattacatgaattat--gttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 6520432  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6520431 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 6520369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 108
Target Start/End: Original strand, 13425241 - 13425305
Alignment:
Q  44 aattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 108  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13425241 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 13425305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 19936753 - 19936850
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||          |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  19936753 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgtttatgattgatgaatta----------gtatatgtttgtgaatattatattgttcatgattgatgaagt 19936842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 222 - 320
Target Start/End: Original strand, 45131019 - 45131116
Alignment:
Q  222 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  45131019 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 45131116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 45290487 - 45290597
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  |||||||||||| |    
T  45290487 ttactgcacgtagatcatagtgaataattgaatatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaatt 45290586  T
Q  101 gttatatgtat 111  Q
      |||||||||    
T  45290587 agtatatgtat 45290597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 320
Target Start/End: Original strand, 5866227 - 5866394
Alignment:
Q  150 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 249  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  5866227 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 5866321  T
Q  250 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  5866322 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 5866394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17141084 - 17140917
Alignment:
Q  150 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 249  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||| ||| || |||| ||||||||||||||||| ||  || |    
T  17141084 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggatt-g 17140990  T
Q  250 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
     ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  17140989 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 17140917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 240
Target Start/End: Original strand, 17266930 - 17267031
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  17266930 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 17267028  T
Q  238 atg 240  Q
    |||    
T  17267029 atg 17267031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21491163 - 21490996
Alignment:
Q  150 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 249  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || ||||  |||||||||| ||||| || ||| |    
T  21491163 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggttt-g 21491069  T
Q  250 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
     ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  21491068 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21490996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 320
Target Start/End: Original strand, 16199666 - 16199764
Alignment:
Q  222 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  16199666 ttgatattattatgtcatgttgttt--gaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 16199763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 240
Target Start/End: Original strand, 17439461 - 17439544
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 240  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  17439461 tgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 17439544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Original strand, 23760805 - 23760950
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||| |||  ||||| |||| ||||| || |||   ||||||  |    
T  23760805 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatgatttac-atactgcct 23760901  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760902 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23760950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21249553 - 21249385
Alignment:
Q  150 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 249  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  21249553 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaatt-g 21249459  T
Q  250 tatactg-ttgtgttgctgttgtt--atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
     |||||| || ||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  21249458 catactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21249385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21255391 - 21255223
Alignment:
Q  150 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 249  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  21255391 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaatt-g 21255297  T
Q  250 tatactg-ttgtgttgctgttgtt--atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
     |||||| || ||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  21255296 catactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21255223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 306
Target Start/End: Original strand, 983465 - 983512
Alignment:
Q  260 tgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983465 tgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 21513707 - 21513636
Alignment:
Q  37 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  || |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21513707 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 21513636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Original strand, 18815609 - 18815683
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 108  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||  || |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18815609 atgattgatgaattattatgtgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 18815683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 320
Target Start/End: Original strand, 21389458 - 21389570
Alignment:
Q  207 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21389458 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21389554  T
Q  305 gattaagatgttgatg 320  Q
    | | |||||| |||||    
T  21389555 gttgaagatgatgatg 21389570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 320
Target Start/End: Original strand, 21395988 - 21396100
Alignment:
Q  207 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21395988 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21396084  T
Q  305 gattaagatgttgatg 320  Q
    | | |||||| |||||    
T  21396085 gttgaagatgatgatg 21396100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21673864 - 21673718
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||  |    
T  21673864 atataattgtatatacattaaataaattatat-tga-tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcct 21673768  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
     ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21673767 atgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttgat 21673718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 320
Target Start/End: Original strand, 21778784 - 21778896
Alignment:
Q  207 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21778784 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21778880  T
Q  305 gattaagatgttgatg 320  Q
    | | |||||| |||||    
T  21778881 gttgaagatgatgatg 21778896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 320
Target Start/End: Original strand, 21790481 - 21790593
Alignment:
Q  207 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21790481 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21790577  T
Q  305 gattaagatgttgatg 320  Q
    | | |||||| |||||    
T  21790578 gttgaagatgatgatg 21790593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24353204 - 24353039
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  | ||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||    
T  24353204 atttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatacg-atgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatc 24353107  T
Q  238 atg--ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||  ||| |||| | |||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353106 atgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 307
Target Start/End: Original strand, 26355766 - 26355805
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355766 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26355805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22364845 - 22364745
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| || | ||||||||| |||| ||    
T  22364845 atttgatgttgttaataaagtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgattttc-tttgatattgttatatc 22364748  T
Q  238 atg 240  Q
    |||    
T  22364747 atg 22364745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Original strand, 36733302 - 36733376
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 108  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||  || || | ||||||||||||||| |||||||    
T  36733302 atgattgatgatttattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtttttcatgattgatgaagtattatatg 36733376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 38988804 - 38988730
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||  ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  38988804 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatg 38988730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 39019901 - 39019827
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||  ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  39019901 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatg 39019827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 154
Target Start/End: Original strand, 35026849 - 35026894
Alignment:
Q  109 tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  35026849 tatatatgatgttttaagatgttgattatcgtttgatattgttata 35026894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 108
Target Start/End: Original strand, 5083001 - 5083068
Alignment:
Q  41 atgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  || |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  5083001 atgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 5083068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 156 - 191
Target Start/End: Original strand, 14103180 - 14103215
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14103180 tgtgatataattgtatacgcattacatgaattatat 14103215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 154
Target Start/End: Original strand, 2418860 - 2418905
Alignment:
Q  109 tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  2418860 tatatatgatgtttcaagatgttgattatcgtttgatattgttata 2418905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 6573743 - 6573776
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6573743 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 6573776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 17438110 - 17438143
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17438110 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 17438143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Original strand, 17438154 - 17438207
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  17438154 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 17438207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 17979142 - 17979175
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17979142 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 17979175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 18819393 - 18819426
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18819393 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 18819426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 111
Target Start/End: Original strand, 19936829 - 19936906
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtat 111  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||  || |||| ||||||||||||| |  |||||||||    
T  19936829 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgttcatgattgatgaattagtatatgtat 19936906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 20517910 - 20517943
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20517910 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 20517943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 22207569 - 22207536
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22207569 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 22207536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 22258951 - 22258984
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22258951 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 22258984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 22356024 - 22355991
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22356024 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 22355991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 22473889 - 22473856
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22473889 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 22473856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 22473952 - 22473919
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22473952 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 22473919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23667992 - 23667939
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  23667992 atttgaggttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatatgaattatat 23667939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 23669874 - 23669841
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23669874 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 23669841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 23670000 - 23669967
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23670000 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 23669967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 23670063 - 23670030
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23670063 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 23670030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 36405773 - 36405806
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36405773 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 36405806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 37515888 - 37515835
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  37515888 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatat 37515835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 38988688 - 38988655
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38988688 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 38988655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 38988867 - 38988834
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38988867 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 38988834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 39019785 - 39019752
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39019785 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 39019752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 39019964 - 39019931
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39019964 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 39019931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 4381456 - 4381488
Alignment:
Q  35 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4381456 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 4381488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 18817125 - 18817157
Alignment:
Q  35 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18817125 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 18817157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 98
Target Start/End: Original strand, 38549936 - 38550000
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaa 98  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  ||||||||||||    
T  38549936 atgattgatgaatttttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 38550000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 88)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 42245211 - 42245523
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42245211 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 42245309  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42245310 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 42245409  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42245410 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 42245509  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  42245510 agttgattaagatg 42245523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 264614 - 264926
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  264614 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 264712  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  264713 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 264812  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264813 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 264912  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  264913 agttgattaagatg 264926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20909328 - 20909016
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20909328 ttactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 20909230  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20909229 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 20909130  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909129 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20909030  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  20909029 agttgattaagatg 20909016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 10732786 - 10733098
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10732786 ttactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgattttgtccatgattgatgaagt 10732884  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10732885 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatacggtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 10732984  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732985 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 10733084  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  10733085 agttgattaagatg 10733098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 39245452 - 39245140
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39245452 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 39245354  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39245353 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 39245254  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245253 tgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 39245154  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  39245153 agttgattaagatg 39245140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 39363701 - 39363388
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  39363701 ttactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 39363602  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39363601 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 39363502  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363501 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 39363402  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  39363401 agttgattaagatg 39363388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29346296 - 29345984
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29346296 ttactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 29346198  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29346197 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 29346098  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29346097 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtcta 29345998  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  29345997 agttgattaagatg 29345984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29348769 - 29348457
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29348769 ttactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 29348671  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29348670 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 29348571  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29348570 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtcta 29348471  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  29348470 agttgattaagatg 29348457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29351242 - 29350930
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29351242 ttactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 29351144  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29351143 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 29351044  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29351043 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtcta 29350944  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  29350943 agttgattaagatg 29350930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 32027677 - 32027397
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027677 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 32027579  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 232  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32027578 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattatt 32027479  T
Q  233 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  32027478 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 32027397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29330215 - 29329938
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  29330215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatg--- 29330120  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 232  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330119 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 29330020  T
Q  233 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330019 atgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29329938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 38619753 - 38619438
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38619753 ttactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 38619654  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| |  |  ||||| |||||||||    
T  38619653 tttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattggaatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataa 38619554  T
Q  200 ttgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619553 ttgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 38619454  T
Q  299 taagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||    
T  38619453 taagttgattaagatg 38619438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Original strand, 20917830 - 20918106
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917830 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatcttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 20917928  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 232  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||    
T  20917929 attattatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgctttacttgaattagatgtgaataattgagacgttgttgact----ttttatattatt 20918024  T
Q  233 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918025 ttgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20918106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23064830 - 23064515
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23064830 ttactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 23064731  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataa 199  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |  |  ||||| |||||||||    
T  23064730 tttatatgtatatattatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataa 23064631  T
Q  200 ttgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064630 ttgagacgttgattgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23064531  T
Q  299 taagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||    
T  23064530 taagttgattaagatg 23064515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 2154477 - 2154772
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2154477 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatactgtccatgattgatgaagt 2154576  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaa-taa 199  Q
    |||||||||||||||||||                   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  2154577 gttatatgtatatatgatg-------------------atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataa 2154657  T
Q  200 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154658 ttgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 2154757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Original strand, 20901904 - 20902168
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  20901904 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg------------- 20901990  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattat 231  Q
          |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20901991 ------atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattat 20902084  T
Q  232 tatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-attaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20902085 tatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaagatg 20902168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 141 - 314
Target Start/End: Original strand, 11581184 - 11581357
Alignment:
Q  141 ttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 240  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581184 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatg 11581283  T
Q  241 ctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581284 ttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 11581357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Original strand, 36154766 - 36154938
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 238  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154766 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 36154865  T
Q  239 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154866 tgctgtttttgtatactgctgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 36154938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 144 - 314
Target Start/End: Original strand, 18319021 - 18319192
Alignment:
Q  144 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 242  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18319021 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 18319120  T
Q  243 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18319121 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 18319192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Original strand, 10775659 - 10775834
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10775659 atttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 10775757  T
Q  238 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775758 atgctggttttatatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10775834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 144 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24067282 - 24067111
Alignment:
Q  144 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 242  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24067282 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 24067183  T
Q  243 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24067182 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatg 24067111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 17517009 - 17517328
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17517009 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 17517108  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   | | | ||| ||||  ||       | ||| |||||||| |||  |||   |||||| |    
T  17517109 gttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgatgattgaat-aagatgtgatacattg-------tttatgtgcattacttgagatattattgaatatt 17517200  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
    | ||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | || |||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  17517201 taagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtct 17517300  T
Q  300 aagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17517301 aagttgattaagatgttgataatgatgt 17517328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 31061248 - 31061072
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31061248 atttgatgttgttatattgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 31061149  T
Q  238 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31061148 atgctgtttttgtatactactgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 31061072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 9776675 - 9776522
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||     
T  9776675 ttactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattggtgaagg 9776576  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  9776575 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttata 9776522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Original strand, 37804752 - 37804901
Alignment:
Q  5 tgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgtta 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||    
T  37804752 tgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattaatgaagcgtta 37804851  T
Q  105 tatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  37804852 tatgtatatatgatgttttaagatgttaattagaatttgatgttgttata 37804901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 20901766 - 20901873
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20901766 ttactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 20901865  T
Q  101 gttatatg 108  Q
    ||||||||    
T  20901866 gttatatg 20901873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 1096633 - 1096468
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||   || |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  1096633 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatact 1096534  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1096533 acctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatg 1096468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Original strand, 23390451 - 23390616
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23390451 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23390550  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23390551 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23390616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 9078118 - 9077953
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9078118 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 9078019  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  9078018 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 9077953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 25421698 - 25421533
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25421698 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25421599  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25421598 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 25421533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 214 - 320
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997654
Alignment:
Q  214 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 21997646  T
Q  313 tgttgatg 320  Q
    || |||||    
T  21997647 tgatgatg 21997654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 196 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24529346 - 24529227
Alignment:
Q  196 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 294  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529346 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 24529247  T
Q  295 ggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  24529246 ggtctaagttgatgaagatg 24529227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Original strand, 21729019 - 21729184
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21729019 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21729118  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  21729119 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21729184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Original strand, 21808344 - 21808509
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21808344 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21808443  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  21808444 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21808509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 24493734 - 24493570
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| ||||| || |||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24493734 tgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 24493636  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24493635 gcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 24493570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Original strand, 8286797 - 8286963
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt-gtatac 254  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  || | ||| || || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8286797 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatac 8286896  T
Q  255 tgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8286897 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 8286963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 25431560 - 25431414
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||| | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25431560 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25431461  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431460 gcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 200 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22412305 - 22412191
Alignment:
Q  200 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22412305 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtc 22412207  T
Q  299 taagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||    
T  22412206 taagttgattaagatg 22412191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13025476 - 13025312
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| | |||||  |||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  13025476 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatact 13025378  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13025377 gcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 13025312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13095660 - 13095496
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| | |||||  |||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  13095660 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatact 13095562  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13095561 gcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 13095496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 32027762 - 32027652
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  |||||||||||| |    
T  32027762 ttactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaatt 32027663  T
Q  101 gttatatgtat 111  Q
      |||||||||    
T  32027662 agtatatgtat 32027652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 156 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22144215 - 22144068
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||    
T  22144215 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatact 22144117  T
Q  256 -gttgtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
       | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144116 acctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22075185 - 22075035
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22075185 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatact 22075086  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22075085 tcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttg 22075035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 20917692 - 20917789
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaa 98  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  ||||||||||||    
T  20917692 ttactgcacgtaagtcacggtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 20917789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21565723 - 21565556
Alignment:
Q  141 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 239  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| || |||| | |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  21565723 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 21565625  T
Q  240 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    | || ||| | ||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565624 gatgatttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21565556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 29330299 - 29330233
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 68  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330299 ttactgcacgtaggtaacagtgaa-aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 29330233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 40726037 - 40725854
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  40726037 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 40725938  T
Q  238 atgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||| ||  |||| ||||||  |  ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||    
T  40725937 atgatg-ctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatg 40725854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 263
Target Start/End: Original strand, 20766119 - 20766181
Alignment:
Q  200 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtt 263  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20766119 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgtt 20766181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 320
Target Start/End: Original strand, 21329457 - 21329617
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  ||  || |||| ||||||| ||| |||||| |||| | ||| || ||| | ||||||  |    
T  21329457 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgattt-gcatactgcct 21329554  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21329555 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 21329617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 320
Target Start/End: Original strand, 21502116 - 21502276
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  || ||| | || ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||||||  |    
T  21502116 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcct 21502213  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
     |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21502214 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 21502276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 302
Target Start/End: Original strand, 20026900 - 20027043
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgt 257  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||    ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||     
T  20026900 atatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatg--ttgtgatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttgg-atactgc 20026996  T
Q  258 -tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
     | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026997 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 302
Target Start/End: Original strand, 22178161 - 22178323
Alignment:
Q  143 gatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat-- 239  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||      
T  22178161 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatga 22178259  T
Q  240 gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||| |||| |||||||  | ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22178260 gctg-ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 37724050 - 37723906
Alignment:
Q  173 tgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgt-tg 270  Q
    |||||||| ||||||||   ||||| ||||||| |||| ||| ||  ||||||||| || |||||||||||||   ||||||||  | ||||||||| ||    
T  37724050 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtctg 37723954  T
Q  271 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  37723953 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatgttga 37723906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 320
Target Start/End: Original strand, 21292992 - 21293089
Alignment:
Q  222 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| |||||    
T  21292992 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21293089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Original strand, 26011995 - 26012141
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  |||||| |||||||| |  ||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  26011995 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgcttt-gcatactgcct 26012092  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
     |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012093 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 26012141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 314
Target Start/End: Original strand, 20806845 - 20806900
Alignment:
Q  259 gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20806845 gtgtcgctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatg 20806900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 307
Target Start/End: Original strand, 22959495 - 22959639
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| || |||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  22959495 atataattgtatatacattacatgacttatgtttga-tatttgag---ttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 22959589  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959590 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22959639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 320
Target Start/End: Original strand, 19660894 - 19660955
Alignment:
Q  260 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  19660894 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 19660955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18418678 - 18418590
Alignment:
Q  223 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttattt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18418678 tgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgattaag 18418590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18744036 - 18743965
Alignment:
Q  37 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  || |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18744036 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 18743965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 111
Target Start/End: Original strand, 20917777 - 20917855
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  |||||||||||| |  |||||||||    
T  20917777 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtattatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 20917855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 36314639 - 36314578
Alignment:
Q  260 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  36314639 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 36314578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 19669076 - 19668899
Alignment:
Q  141 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 239  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||| || |||| | ||| || |||||   ||||||| ||||||| |||||| |||| |||     
T  19669076 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacaggacttatgtttga-tatttgag---ttgttgatttgcattcgatattgttatatcac 19668981  T
Q  240 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  19668980 gatgattt-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatg 19668899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26704129 - 26704078
Alignment:
Q  263 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26704129 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 26704078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26973862 - 26973811
Alignment:
Q  263 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26973862 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 26973811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Original strand, 1628169 - 1628243
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 108  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||  || ||||  |||||||||||||| |||||||    
T  1628169 atgattgatgaactattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttaatgattgatgaagtattatatg 1628243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 302
Target Start/End: Original strand, 26740705 - 26740747
Alignment:
Q  260 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740705 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 24067323 - 24067282
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaata 75  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  24067323 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtttatgaata 24067282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 305
Target Start/End: Original strand, 26732892 - 26732937
Alignment:
Q  260 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732892 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 36314730 - 36314685
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatga 184  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  36314730 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatga 36314685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 108
Target Start/End: Original strand, 21399896 - 21399968
Alignment:
Q  36 gattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  || |||| |||| |||||||| | |||||||    
T  21399896 gattgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgttgttcatggttgatgaattattatatg 21399968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 67
Target Start/End: Original strand, 8833821 - 8833855
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8833821 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 8833855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 21503350 - 21503316
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21503350 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 21503316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 26761830 - 26761796
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26761830 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 26761796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 8833885 - 8833918
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8833885 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 8833918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 14026596 - 14026629
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14026596 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 14026629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 14026659 - 14026692
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14026659 atgattgatgaattaatatatgaatgtatatgtt 14026692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 16062717 - 16062684
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16062717 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 16062684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 16062878 - 16062845
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16062878 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 16062845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 18743873 - 18743840
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18743873 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 18743840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 20198318 - 20198351
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20198318 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 20198351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 21399733 - 21399766
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21399733 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 21399766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 21399796 - 21399829
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21399796 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 21399829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 26749389 - 26749356
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26749389 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 26749356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 26749452 - 26749419
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26749452 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 26749419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 30611402 - 30611369
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30611402 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 30611369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 1628044 - 1628076
Alignment:
Q  35 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1628044 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 1628076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 6765943 - 6765915
Alignment:
Q  126 gatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765943 gatgttgattattatttgatgttgttata 6765915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 103)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18809259 - 18808947
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18809259 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 18809161  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18809160 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 18809061  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809060 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18808961  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  18808960 agttgattaagatg 18808947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 23711859 - 23712171
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23711859 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 23711957  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23711958 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 23712057  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712058 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23712157  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  23712158 agttgattaagatg 23712171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 39682630 - 39682317
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39682630 ttactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 39682531  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39682530 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 39682431  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682430 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 39682331  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  39682330 agttgattaagatg 39682317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23131179 - 23130866
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23131179 ttactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 23131080  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23131079 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 23130980  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130979 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23130880  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  23130879 agttgattaagatg 23130866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23133646 - 23133333
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23133646 ttactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 23133547  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23133546 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 23133447  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133446 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23133347  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  23133346 agttgattaagatg 23133333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 23709378 - 23709690
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23709378 ttactgcacgtaggtcacaatgaagaattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 23709476  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23709477 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 23709576  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709577 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23709676  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  23709677 agttgattaagatg 23709690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26505695 - 26505383
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26505695 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattttccatgattgatgaagt 26505597  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26505596 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 26505497  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505496 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 26505397  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  26505396 agttgattaagatg 26505383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26508173 - 26507861
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26508173 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattttccatgattgatgaagt 26508075  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26508074 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 26507975  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507974 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 26507875  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  26507874 agttgattaagatg 26507861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28577415 - 28577103
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577415 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 28577317  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28577316 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 28577217  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577216 tgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgttgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 28577117  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  28577116 agttgattaagatg 28577103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 34402367 - 34402680
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  34402367 ttactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 34402466  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34402467 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 34402566  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402567 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 34402666  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  34402667 agttgattaagatg 34402680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 24898041 - 24898354
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24898041 ttactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24898139  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24898140 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 24898239  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtct 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24898240 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtct 24898339  T
Q  300 aagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||    
T  24898340 aagttgattaagatg 24898354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 24905478 - 24905791
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24905478 ttactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24905576  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24905577 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 24905676  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtct 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24905677 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtct 24905776  T
Q  300 aagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||    
T  24905777 aagttgattaagatg 24905791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 24907953 - 24908266
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24907953 ttactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24908051  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24908052 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 24908151  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtct 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24908152 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtct 24908251  T
Q  300 aagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||    
T  24908252 aagttgattaagatg 24908266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 571714 - 571401
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  571714 ttactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaagt 571615  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  571614 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaat 571515  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571514 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 571415  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  571414 agttgattaagatg 571401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 24900524 - 24900837
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24900524 ttactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24900622  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24900623 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 24900722  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtct 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24900723 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtct 24900822  T
Q  300 aagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||    
T  24900823 aagttgattaagatg 24900837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 24903001 - 24903314
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24903001 ttactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24903099  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24903100 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 24903199  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtct 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24903200 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtct 24903299  T
Q  300 aagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||    
T  24903300 aagttgattaagatg 24903314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 32039344 - 32039656
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  32039344 ttactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatctgatattgtccatgatcgatgaagt 32039442  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32039443 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 32039542  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32039543 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtcta 32039642  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  32039643 agttgattaagatg 32039656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23135896 - 23135594
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23135896 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg-----------ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 23135808  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23135807 gttatatgtatatatgatgttttaagatgctgattatcatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 23135708  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135707 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23135608  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  23135607 agttgattaagatg 23135594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6726279 - 6725999
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726279 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 6726181  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 232  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6726180 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattatt 6726081  T
Q  233 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726080 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 6725999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 32214776 - 32215092
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32214776 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat----------atgtttgtgtatacgatattgttcatgattgatgaagt 32214865  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32214866 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataat 32214965  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214966 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 32215065  T
Q  301 agttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  32215066 agttgattaagatgttgatgatgatgt 32215092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Original strand, 21154942 - 21155218
Alignment:
Q  37 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21154942 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 21155040  T
Q  137 ttatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgt 236  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21155041 ttatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgt 21155140  T
Q  237 catgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155141 catgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21155218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24368058 - 24367782
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368058 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattttccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgttg 24367960  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 232  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367959 gttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 24367860  T
Q  233 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367859 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 24367782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22105697 - 22105416
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105697 tatgattgatgaattagtatatgtatgtaaatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 22105599  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 232  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22105598 attataatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattatt 22105499  T
Q  233 atgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105498 atgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 22105416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 38967658 - 38967378
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38967658 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgttg 38967560  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattat 231  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  38967559 attattatttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattat 38967461  T
Q  232 tatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967460 tatttcatgctatttttgtatattgttgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 38967378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 86 - 314
Target Start/End: Original strand, 45029784 - 45030012
Alignment:
Q  86 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  45029784 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgatgattattatttcatgttgttatattgtgatataaatgtatatgcattacttgaa 45029883  T
Q  186 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45029884 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgttgtgttgttgttgttatttaactaagct 45029983  T
Q  286 gcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45029984 gcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45030012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 8 - 314
Target Start/End: Original strand, 24529399 - 24529687
Alignment:
Q  8 acgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529399 acgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatat 24529498  T
Q  108 gtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaa-taattgagac 206  Q
    || |||||||||                   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||    
T  24529499 gtgtatatgatg-------------------atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagac 24529579  T
Q  207 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24529580 gttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgatgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttga 24529679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 33 - 233
Target Start/End: Original strand, 24642732 - 24642933
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaa--gatgt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  24642732 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 24642830  T
Q  131 tgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatta 230  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642831 tgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatta 24642930  T
Q  231 tta 233  Q
    |||    
T  24642931 tta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 140 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 43137477 - 43137303
Alignment:
Q  140 tttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 239  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137477 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 43137378  T
Q  240 gctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137377 gttgtttttgtatattactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 43137303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 25616498 - 25616179
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25616498 ttacttcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 25616399  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   | | | ||| ||||  ||||       ||| |||||||| |||  |||   |||||| |    
T  25616398 gttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgatgattgaat-aagatgtgatacattgat-------tatgtgcattacttgagatattattgaatatt 25616307  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
    | ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | || |||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25616306 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatgagtcagtct 25616207  T
Q  300 aagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||    
T  25616206 aagttgattaagatgttaataatgatgt 25616179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20261536 - 20261383
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20261536 ttactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 20261437  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20261436 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 20261383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 23707062 - 23707169
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23707062 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 23707161  T
Q  101 gttatatg 108  Q
    ||||||||    
T  23707162 gttatatg 23707169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 24918457 - 24918350
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24918457 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 24918358  T
Q  101 gttatatg 108  Q
    ||||||||    
T  24918357 gttatatg 24918350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22337281 - 22337116
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   || ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22337281 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatataca 22337182  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22337181 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 22337116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 10684608 - 10684763
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  10684608 ttactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagg 10684707  T
Q  101 gttatatg--tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  10684708 gttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttata 10684763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 24642594 - 24642701
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24642594 ttactgcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 24642693  T
Q  101 gttatatg 108  Q
    ||||||||    
T  24642694 gttatatg 24642701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 24671342 - 24671235
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24671342 ttactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 24671243  T
Q  101 gttatatg 108  Q
    ||||||||    
T  24671242 gttatatg 24671235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 24681761 - 24681654
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24681761 ttactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 24681662  T
Q  101 gttatatg 108  Q
    ||||||||    
T  24681661 gttatatg 24681654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23060679 - 23060514
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23060679 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23060580  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23060579 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23060514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23076608 - 23076443
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076608 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23076509  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  23076508 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatg 23076443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 141 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 19672010 - 19671831
Alignment:
Q  141 ttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 240  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| || ||||||||||| |||||    
T  19672010 ttgatgttgttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaat-attgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatg 19671912  T
Q  241 ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
     || ||||| ||||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  19671911 atg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 19671831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 38967796 - 38967689
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  38967796 ttactgcacgcagctcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgttgaagt 38967697  T
Q  101 gttatatg 108  Q
    ||||||||    
T  38967696 gttatatg 38967689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 154
Target Start/End: Original strand, 23707200 - 23707322
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  23707200 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 23707298  T
Q  131 tgattattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  23707299 tgattatcatttgatgttgttata 23707322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Original strand, 22731189 - 22731354
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22731189 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22731288  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  22731289 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatg 22731354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 24918319 - 24918197
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  24918319 tatgattgatgaattagtatatgtatgcatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 24918221  T
Q  131 tgattattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  24918220 tgattatcatttgatgttgttata 24918197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 45027750 - 45027840
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgatt 92  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  45027750 ttactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 45027840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Original strand, 22738135 - 22738299
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22738135 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22738234  T
Q  256 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |     ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22738235 gcctatttaatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatg 22738299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 24368143 - 24368033
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  |||||||||||| |    
T  24368143 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatcatgttgtttatgattgatgaatt 24368044  T
Q  101 gttatatgtat 111  Q
      |||||||||    
T  24368043 agtatatgtat 24368033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 240 - 314
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643108
Alignment:
Q  240 gctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24643108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 24671201 - 24671082
Alignment:
Q  36 gattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttga 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   ||||||||    
T  24671201 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgtttaagttgatgttga 24671103  T
Q  134 ttattatttgatgttgttata 154  Q
    |||| ||||||| ||||||||    
T  24671102 ttatcatttgatattgttata 24671082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 314
Target Start/End: Original strand, 298769 - 298929
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  298769 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 298868  T
Q  256 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298869 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 298929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23286027 - 23285866
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  | |||||||||| ||||  | || |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  23286027 tgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc----tgtttttgtatact 23285932  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23285931 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23285866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 24681623 - 24681501
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |   |||||    
T  24681623 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattagatgtatatatgatgtttaagttgatgt 24681525  T
Q  131 tgattattatttgatgttgttata 154  Q
    |||| || ||||||||||||||||    
T  24681524 tgatcatcatttgatgttgttata 24681501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 22105782 - 22105672
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  |||||||||||| |    
T  22105782 ttactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaatt 22105683  T
Q  101 gttatatgtat 111  Q
      |||||||||    
T  22105682 agtatatgtat 22105672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23660188 - 23660024
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||   |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  23660188 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttc-gtatact 23660090  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23660089 gcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23660024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 306
Target Start/End: Original strand, 23708558 - 23708725
Alignment:
Q  141 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 239  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| || | ||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  23708558 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcat 23708657  T
Q  240 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    | |||||| | ||||||  | ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23708658 gttgtttt-gcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga 23708725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 222 - 320
Target Start/End: Original strand, 38136 - 38234
Alignment:
Q  222 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  38136 ttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 38234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 21154853 - 21154920
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 68  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21154853 ttactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 21154920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 6726364 - 6726254
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  |||||||||||| |    
T  6726364 ttactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaatt 6726265  T
Q  101 gttatatgtat 111  Q
      |||||||||    
T  6726264 agtatatgtat 6726254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 41523918 - 41524028
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||  || ||||  |||||||||||| |    
T  41523918 ttactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaatt 41524017  T
Q  101 gttatatgtat 111  Q
      |||||||||    
T  41524018 agtatatgtat 41524028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Original strand, 23654341 - 23654506
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  | |||||||||| ||| | |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  23654341 tgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgct 23654440  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  23654441 gcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 23654506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 195
Target Start/End: Original strand, 22173799 - 22173868
Alignment:
Q  126 gatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtga 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22173799 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 22173868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 302
Target Start/End: Original strand, 7688 - 7835
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||    
T  7688 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatact 7786  T
Q  256 g-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7787 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 193 - 320
Target Start/End: Original strand, 23103389 - 23103515
Alignment:
Q  193 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 291  Q
    ||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23103389 tgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatga 23103486  T
Q  292 gtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||| || | |||||| |||||    
T  23103487 gtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 23103515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 320
Target Start/End: Original strand, 23040249 - 23040309
Alignment:
Q  260 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23040249 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23040309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23791458 - 23791357
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  23791458 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatat-aatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatc 23791360  T
Q  238 atg 240  Q
    |||    
T  23791359 atg 23791357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 28406137 - 28405990
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||   ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  |    
T  28406137 atataattgtatatacattttatgaattaa--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcct 28406040  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28406039 atgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 28405990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 23207461 - 23207296
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||  |||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  23207461 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttat-aat-gttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatc 23207364  T
Q  238 atg--ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||  ||| |||| |||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207363 atgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 8946718 - 8946658
Alignment:
Q  260 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8946718 tgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 8946658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 22459511 - 22459587
Alignment:
Q  150 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgat 226  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  22459511 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatgactttcatttgat 22459587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 7679647 - 7679592
Alignment:
Q  260 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7679647 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 7679592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 240
Target Start/End: Original strand, 24697543 - 24697644
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  24697543 attttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaa-gtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatc 24697641  T
Q  238 atg 240  Q
    |||    
T  24697642 atg 24697644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20309221 - 20309109
Alignment:
Q  207 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20309221 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 20309125  T
Q  305 gattaagatgttgatg 320  Q
    | | |||||| |||||    
T  20309124 gttgaagatgatgatg 20309109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Original strand, 20520130 - 20520295
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||    
T  20520130 atttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatc 20520227  T
Q  238 atg--ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||  ||| |||| | |||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520228 atgaactg-ttttatgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 323
Target Start/End: Original strand, 22134266 - 22134329
Alignment:
Q  260 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatg 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||| ||||||||    
T  22134266 tgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatgatg 22134329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 228
Target Start/End: Original strand, 22413073 - 22413161
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatat 228  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||    |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22413073 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatga--tgttgagatgttgttgatttgcatttgatat 22413161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 306
Target Start/End: Original strand, 18786971 - 18787009
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786971 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 21368439 - 21368365
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  || |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21368439 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 21368365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 25176010 - 25175864
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||| ||||| | ||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  25176010 atataattatatatacgttatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 25175914  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25175913 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgat 25175864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 302
Target Start/End: Original strand, 32451894 - 32452031
Alignment:
Q  167 tgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttg 264  Q
    |||||| ||||||| |||| | ||  ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| || |||  | |||||    
T  32451894 tgtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcatt-gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttg 32451992  T
Q  265 ctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32451993 ctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 320
Target Start/End: Original strand, 23072019 - 23072069
Alignment:
Q  270 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  23072019 gttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatg 23072069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 23799531 - 23799457
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  || || | ||||||||||||| | |||||||    
T  23799531 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgttgaatatgatgttattcatgattgatgaattattatatg 23799457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25109072 - 25109019
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25109072 atttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 25109019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 22686221 - 22686145
Alignment:
Q  39 tgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  || || | ||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  22686221 tgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtttttcatgattgatgaattattatatgaatatat 22686145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23287424 - 23287384
Alignment:
Q  260 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23287424 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26392443 - 26392403
Alignment:
Q  260 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26392443 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29601518 - 29601478
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcatta 179  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  29601518 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 29601478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 76
Target Start/End: Original strand, 41524003 - 41524045
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatac 76  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  41524003 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatac 41524045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 1384411 - 1384444
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1384411 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 1384444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Original strand, 19201912 - 19201965
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19201912 atttgaagttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatatgaattatat 19201965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 20915509 - 20915476
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20915509 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 20915476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21237936 - 21237883
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  21237936 atttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatat 21237883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 21316436 - 21316469
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21316436 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 21316469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 21336329 - 21336362
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21336329 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 21336362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 21368386 - 21368353
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21368386 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 21368353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 22686110 - 22686077
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22686110 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 22686077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 22690085 - 22690052
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22690085 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 22690052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 22694681 - 22694648
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22694681 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 22694648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 25587416 - 25587449
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25587416 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 25587449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 28345851 - 28345884
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28345851 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 28345884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 36736894 - 36736927
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36736894 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 36736927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 1384349 - 1384381
Alignment:
Q  35 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1384349 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 1384381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 154
Target Start/End: Original strand, 18358739 - 18358767
Alignment:
Q  126 gatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18358739 gatgttgattattatttgatgttgttata 18358767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23004905 - 23004838
Alignment:
Q  166 ttgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 234  Q
    ||||||||||||||  || ||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23004905 ttgtatatgcattatgtggattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattattat 23004838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 81)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13989182 - 13988870
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13989182 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 13989084  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13989083 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 13988984  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988983 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 13988884  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  13988883 agttgattaagatg 13988870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 21923137 - 21923449
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21923137 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 21923235  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21923236 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 21923335  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923336 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21923435  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  21923436 agttgattaagatg 21923449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 8 - 314
Target Start/End: Original strand, 21474939 - 21475245
Alignment:
Q  8 acgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474939 acgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatat 21475038  T
Q  108 gtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21475039 gtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacg 21475138  T
Q  208 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21475139 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 21475238  T
Q  308 taagatg 314  Q
    |||||||    
T  21475239 taagatg 21475245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 23593579 - 23593893
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23593579 ttactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaagt 23593678  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23593679 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataa 23593778  T
Q  200 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593779 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 23593878  T
Q  300 aagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||    
T  23593879 aagttgattaagatg 23593893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16362235 - 16361908
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16362235 ttactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgttaatacgatattgtccatgattgatgaagt 16362136  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16362135 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataa 16362036  T
Q  200 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16362035 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactgttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 16361936  T
Q  300 aagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361935 aagttgattaagatgttgatgatgatgt 16361908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 21841083 - 21840766
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21841083 ttacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 21840985  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21840984 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataat 21840885  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840884 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21840785  T
Q  301 agttgattaagatgttgat 319  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21840784 agttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29776972 - 29776692
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776972 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 29776874  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 232  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776873 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 29776774  T
Q  233 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776773 atgtcatgttatttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29776692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29298420 - 29298141
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298420 tatgattgatgaattagtatatatatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 29298322  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 232  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298321 attattatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 29298222  T
Q  233 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298221 at-tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29298141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 31612597 - 31612317
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31612597 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatattg 31612499  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 232  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31612498 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattatt 31612399  T
Q  233 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612398 atgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 31612317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Original strand, 22122945 - 22123226
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22122945 tatgattgatgaattggtatatgtatgtttatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatattg 22123043  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 232  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22123044 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattatt 22123143  T
Q  233 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22123144 atgtcatgctatttttgtatactgttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatg 22123226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 314
Target Start/End: Original strand, 15859856 - 15860167
Alignment:
Q  3 actgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15859856 actgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatctt-gcgaatacgatattgtccatggttgatgaagtgt 15859954  T
Q  103 tatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattg 202  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||| |||||     
T  15859955 tatatgtatatatgatgtcttaagatgttgattaccatctgatgttgttatattgtgatataattgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaatta 15860054  T
Q  203 agacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15860055 agacgttgattgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaa 15860154  T
Q  302 gttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||    
T  15860155 gttgattaagatg 15860167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Original strand, 16275240 - 16275522
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16275240 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttcaagatattg 16275339  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattat 231  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16275340 attattatttgatgttgttatattgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattat 16275439  T
Q  232 tatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16275440 tatgtcatgctgtttttgtatactgctatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 16275522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21707346 - 21707171
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 238  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21707346 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtca 21707247  T
Q  239 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707246 tgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21707171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21711888 - 21711713
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 238  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21711888 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtca 21711789  T
Q  239 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711788 tgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21711713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 139 - 320
Target Start/End: Original strand, 13212844 - 13213026
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13212844 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 13212943  T
Q  238 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13212944 atgttgtttttgtatactgttgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 13213026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 126 - 302
Target Start/End: Original strand, 45574812 - 45574989
Alignment:
Q  126 gatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 225  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45574812 gatgttgattatgatttgatgttcttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttgg 45574911  T
Q  226 tattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45574912 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21347141 - 21346965
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21347141 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 21347042  T
Q  238 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347041 atgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21346965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21342276 - 21342100
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21342276 atttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 21342177  T
Q  238 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342176 atgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21342100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 144 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 40389329 - 40389158
Alignment:
Q  144 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 242  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40389329 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 40389230  T
Q  243 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40389229 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatg 40389158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 433190 - 433016
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433190 atttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 433091  T
Q  238 atgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
     || |||||||||||||||  ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433090 ttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 433016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 323
Target Start/End: Original strand, 50210168 - 50210336
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  || | ||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50210168 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50210267  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatg 323  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  50210268 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 50210336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 196 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 34509906 - 34509787
Alignment:
Q  196 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 294  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509906 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 34509807  T
Q  295 ggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  34509806 ggtctaagttgatgaagatg 34509787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Original strand, 27250684 - 27250849
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  | |||||||||| ||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250684 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27250783  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  27250784 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 27250849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 133
Target Start/End: Original strand, 22050767 - 22050866
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 22050865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 16275102 - 16275209
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  16275102 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatacgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaattcgatattgttcatgattgatgaagt 16275201  T
Q  101 gttatatg 108  Q
    ||||||||    
T  16275202 gttatatg 16275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 133 - 302
Target Start/End: Original strand, 21896187 - 21896358
Alignment:
Q  133 attattatttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattat 231  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  21896187 attatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgt 21896286  T
Q  232 tatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21896287 tatatcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22532435 - 22532270
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||   |||||| || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532435 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22532336  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  22532335 gcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 22532270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 22122860 - 22122970
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  |||||||||||| |    
T  22122860 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaatt 22122959  T
Q  101 gttatatgtat 111  Q
    | |||||||||    
T  22122960 ggtatatgtat 22122970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 27161432 - 27161529
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  27161432 ttactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttatgaataaaatattgttaatgattgatgaa 27161529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 156 - 327
Target Start/End: Original strand, 22468651 - 22468823
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||  |||   ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||    
T  22468651 tgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatct 22468750  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22468751 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgaagatgt 22468823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 22050682 - 22050792
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  |||||||||||| |    
T  22050682 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaatt 22050781  T
Q  101 gttatatgtat 111  Q
      |||||||||    
T  22050782 agtatatgtat 22050792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 29777057 - 29776947
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  |||||||||||| |    
T  29777057 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaatt 29776958  T
Q  101 gttatatgtat 111  Q
      |||||||||    
T  29776957 agtatatgtat 29776947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 133 - 302
Target Start/End: Original strand, 21861501 - 21861672
Alignment:
Q  133 attattatttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattat 231  Q
    ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  21861501 attatgatatgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgt 21861600  T
Q  232 tatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21861601 tatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 31612682 - 31612572
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||  |||||||  |||||||||||| |    
T  31612682 ttactgcacgtaggtcaaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatcagtatgatattgtttatgattgatgaatt 31612583  T
Q  101 gttatatgtat 111  Q
      |||||||||    
T  31612582 agtatatgtat 31612572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 122
Target Start/End: Original strand, 27161518 - 27161605
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 122  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161518 atgattgatgaattagtatatatatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 27161605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 260 - 327
Target Start/End: Original strand, 20454613 - 20454680
Alignment:
Q  260 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20454613 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgataatgt 20454680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 29298558 - 29298461
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaa 98  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  ||||||||||||    
T  29298558 ttactgcacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 29298461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Original strand, 35261018 - 35261180
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  35261018 atttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatc 35261114  T
Q  238 atgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||| | ||||||  | |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261115 atgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 193 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20135316 - 20135181
Alignment:
Q  193 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 291  Q
    |||||| || ||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |||  | || |||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  20135316 tgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatga 20135217  T
Q  292 gtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20135216 gtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 20135181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21026846 - 21026696
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||| |||||||||||    
T  21026846 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatact 21026747  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
    |  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026746 gcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21026696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 220 - 320
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847274
Alignment:
Q  220 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 318  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 20847272  T
Q  319 tg 320  Q
    ||    
T  20847273 tg 20847274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 33681188 - 33681022
Alignment:
Q  141 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 239  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| |||||| ||||  |||||||||| |||||| |||| ||||    
T  33681188 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcat 33681090  T
Q  240 gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    | ||  |||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33681089 gatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 33681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 150 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16758822 - 16758664
Alignment:
Q  150 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttt 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| || |||||||  ||| |||||||||| |||| |||||  |||  ||    
T  16758822 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaat-gttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactg-gtt 16758725  T
Q  248 tgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    || ||||||  | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16758724 tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 43543267 - 43543215
Alignment:
Q  102 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43543267 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 43543215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 301
Target Start/End: Original strand, 14295493 - 14295652
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 238  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  14295493 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatca 14295588  T
Q  239 tgctgtttttgtatact-gttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 301  Q
    || ||  |||| |||||   | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295589 tgatg-gtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 14295652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22237788 - 22237642
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-tt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||| ||  |    
T  22237788 atataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcataatgcct 22237691  T
Q  259 gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
     ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22237690 atgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttga 22237642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 13227180 - 13227129
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 52  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13227180 ttactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 13227129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 196 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21754170 - 21754049
Alignment:
Q  196 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 293  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21754170 ataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 21754073  T
Q  294 cggtctaagttgattaagatgttg 317  Q
    |||||||||||||| | |||||||    
T  21754072 cggtctaagttgatgatgatgttg 21754049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 29535368 - 29535317
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 52  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29535368 ttactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 29535317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 141 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20918782 - 20918620
Alignment:
Q  141 ttgatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 239  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  20918782 ttgatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcat 20918687  T
Q  240 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918686 gatggttt-gcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Original strand, 50614053 - 50614219
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttat-actgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  50614053 atttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaag-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 50614151  T
Q  238 atg--ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||  ||| |||| | |||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614152 atgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Original strand, 50621881 - 50622047
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttat-actgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  50621881 atttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaag-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 50621979  T
Q  238 atg--ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||  ||| |||| | |||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621980 atgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Original strand, 41049973 - 41050138
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  41049973 atttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatga--tgttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 41050070  T
Q  238 atgctgt-ttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||   | |||| |||||||  | |||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  41050071 atgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 307
Target Start/End: Original strand, 22921830 - 22921976
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  22921830 atataattgtatatacattatatgaatttt--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 22921926  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
     ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22921927 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 22921976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 50686792 - 50686695
Alignment:
Q  143 gatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 240  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||    
T  50686792 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatg 50686695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21714600 - 21714549
Alignment:
Q  263 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21714600 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatg 21714549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 306
Target Start/End: Original strand, 52928038 - 52928076
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928038 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 29298473 - 29298408
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  ||||||||||||    
T  29298473 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 29298408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 190
Target Start/End: Original strand, 16368224 - 16368276
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattata 190  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16368224 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattata 16368276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 240
Target Start/End: Original strand, 22130840 - 22130946
Alignment:
Q  131 tgattattatttgatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 229  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||    
T  22130840 tgattatgatttgatgttgcttataatgttatataattgtatatgcattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatatt 22130935  T
Q  230 attatgtcatg 240  Q
    ||||| |||||    
T  22130936 attatatcatg 22130946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 51130743 - 51130646
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 238  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  51130743 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatca 51130648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 245
Target Start/End: Original strand, 22354527 - 22354616
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 245  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22354527 tgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12271725 - 12271642
Alignment:
Q  150 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||| | | ||||| || |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12271725 ttataatgtgatataattgtatatatattactttagttatacgtaaata-ttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 12271642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 268 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20248332 - 20248293
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20248332 ttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 20248293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 1642892 - 1642854
Alignment:
Q  37 attgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaata 75  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1642892 attgatgaattattatatgaatgtatatgtttatgaata 1642854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21161792 - 21161730
Alignment:
Q  246 tttgtatactgttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  21161792 tttgcatactgttttgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgat 21161730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 321
Target Start/End: Original strand, 24783155 - 24783213
Alignment:
Q  263 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatga 321  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||||    
T  24783155 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatga 24783213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 7321576 - 7321609
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7321576 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 7321609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 7321639 - 7321672
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7321639 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 7321672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 12710211 - 12710178
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12710211 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 12710178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 18120868 - 18120835
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18120868 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 18120835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22124468 - 22124415
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  22124468 atttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatat 22124415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 22824136 - 22824169
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22824136 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 22824169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 24720419 - 24720452
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24720419 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 24720452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 320
Target Start/End: Original strand, 38801447 - 38801507
Alignment:
Q  260 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  38801447 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatg 38801507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 44891787 - 44891754
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44891787 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 44891754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 50544178 - 50544145
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50544178 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 50544145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 189
Target Start/End: Original strand, 52927922 - 52927971
Alignment:
Q  141 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattat 189  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52927922 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattat 52927971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 6833603 - 6833571
Alignment:
Q  35 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6833603 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 6833571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 319
Target Start/End: Original strand, 21533948 - 21533989
Alignment:
Q  276 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  21533948 taactaagctgcatgagtcggtctaagatg--taagatgttgat 21533989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 50544240 - 50544208
Alignment:
Q  35 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50544240 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 50544208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21064 - 20751
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21064 ttactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 20965  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20964 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 20865  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20864 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20765  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  20764 agttgattaagatg 20751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14264 - 13951
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14264 ttactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 14165  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14164 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 14065  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14064 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtcta 13965  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  13964 agttgattaagatg 13951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 23376 - 23484
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23376 ttactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 23475  T
Q  101 gttatatgt 109  Q
    |||||||||    
T  23476 gttatatgt 23484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 38138 - 37825
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38138 ttactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 38039  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38038 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 37939  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37938 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 37839  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  37838 agttgattaagatg 37825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13709 - 13396
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13709 ttactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 13610  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13609 gttacatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 13510  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13509 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 13410  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  13409 agttgattaagatg 13396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 40716 - 40404
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40716 ttactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 40618  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  40617 gttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataat 40518  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40517 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtcta 40418  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||    
T  40417 agttgattaagatg 40404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11606 - 11279
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11606 ttactgcacgtaggtcacagttaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 11507  T
Q  101 gttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataa 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11506 gttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgattttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataa 11407  T
Q  200 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11406 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 11307  T
Q  300 aagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||    
T  11306 aatttgattaagatgttgatgataatgt 11279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 9558 - 9241
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9558 ttactgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 9460  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  9459 gttatatgtatatttgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataat 9360  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9359 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 9260  T
Q  301 agttgattaagatgttgat 319  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9259 agttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 5011 - 4698
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5011 ttacagcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 4912  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4911 gttatatgtatatatgttgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataat 4812  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4811 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 4712  T
Q  301 agttgattaagatg 314  Q
    ||||||||| ||||    
T  4711 agttgattaggatg 4698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 11089 - 10772
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11089 ttacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 10991  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10990 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataat 10891  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10890 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 10791  T
Q  301 agttgattaagatgttgat 319  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10790 agttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 51 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 501351 - 501075
Alignment:
Q  51 atatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgt 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  501351 atatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgatgtgttatatgtatatataatgttttaagatgttgattactatttgatgttgt 501252  T
Q  151 tatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgt 250  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  501251 tatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgt 501152  T
Q  251 atactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  501151 atattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgttgattatgt 501075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Original strand, 85562 - 85738
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  85562 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 85661  T
Q  238 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  85662 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatg 85738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 141 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 160864 - 160698
Alignment:
Q  141 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 239  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| |||| | ||| || |||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  160864 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatatattacatgacttatgtttga-tatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcat 160767  T
Q  240 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  160766 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 160698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 501382 - 501347
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatg 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501382 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatg 501347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 3)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 101 - 327
Target Start/End: Original strand, 12194 - 12420
Alignment:
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12194 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataat 12293  T
Q  201 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12294 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtcta 12393  T
Q  301 agttgattaagatgttgatgatgatgt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12394 agttgattaagatgttgatgatgatgt 12420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 369 - 476
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  369 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgataaagt 468  T
Q  101 gttatatg 108  Q
    ||||||||    
T  469 gttatatg 476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 108
Target Start/End: Original strand, 507 - 582
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  507 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 314
Target Start/End: Original strand, 38521 - 38816
Alignment:
Q  21 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgt 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38521 tgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgt 38620  T
Q  121 tttaagatgttgattattatttgatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgc 219  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| | |||| ||||||  ||| ||||||||    
T  38621 tttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgc 38720  T
Q  220 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38721 atttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatg 38816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 35 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 30196 - 29946
Alignment:
Q  35 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
T  30196 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg--------------- 30112  T
Q  135 tattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 234  Q
        |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  30111 ----atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattat 30016  T
Q  235 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30015 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 30336 - 30229
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30336 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 30237  T
Q  101 gttatatg 108  Q
    ||||||||    
T  30236 gttatatg 30229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 4)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 10016 - 9753
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |                 
T  10016 tatgattgatgagttagtatatgtatgtataagtttgtgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatgacg------------- 9930  T
Q  133 attattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattat 231  Q
          |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9929 ------atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattat 9836  T
Q  232 tatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9835 tatgtcattctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 9753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 33107 - 32943
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33107 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 33009  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  33008 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatg 32943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 38926 - 38762
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38926 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 38828  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  38827 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatg 38762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 10067 - 10005
Alignment:
Q  35 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatga 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||  |||||||||||    
T  10067 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtacgatgttgtttatgattgatga 10005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 158432 - 158608
Alignment:
Q  138 tatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158432 tatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 158531  T
Q  238 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158532 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 158608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 306
Target Start/End: Original strand, 339905 - 340053
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||||  |||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  339905 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 340002  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |  | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  340003 gcctatgttgttgt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 340053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6263 - 6070
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6263 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 6165  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtga 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6164 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatttaattgcatatgcattacttgaattatatgtga 6070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 126 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 298 - 110
Alignment:
Q  126 gatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  298 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 199  T
Q  226 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  198 tattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatg 110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 126 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 82264 - 82076
Alignment:
Q  126 gatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  82264 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 82165  T
Q  226 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  82164 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatg 82076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 306
Target Start/End: Original strand, 22610 - 22776
Alignment:
Q  141 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 239  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22610 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 22708  T
Q  240 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    | || ||| | ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22709 gatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16963 - 16788
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 238  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 16864  T
Q  239 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16863 tgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 126 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12250 - 12068
Alignment:
Q  126 gatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 12151  T
Q  226 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12150 tattattatgtcatgctgttttagtatactgctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 126 - 314
Target Start/End: Original strand, 1250 - 1439
Alignment:
Q  126 gatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttg 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttg 1349  T
Q  225 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1350 atattattatgtcatgctgtttttgtatactcatgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Original strand, 79267 - 79430
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  79267 atttgatgttgttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtca 79366  T
Q  239 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79367 tgctgtttttatatactgtcgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 323
Target Start/End: Original strand, 17170 - 17340
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt--gtata 253  Q
    |||||||||||  || | ||||||| ||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  17170 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtata 17269  T
Q  254 ctgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatg 323  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17270 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 17340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4476 - 4301
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 238  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4476 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtca 4377  T
Q  239 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4376 tgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 139 - 310
Target Start/End: Original strand, 2111 - 2283
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2111 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattattatgtc 2210  T
Q  238 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 310  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2211 atgttgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaa 2283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 139 - 320
Target Start/End: Original strand, 17964 - 18147
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  17964 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 18063  T
Q  238 atgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||| || || || ||| ||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  18064 atgatg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 18147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Original strand, 20363 - 20524
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 238  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20363 atttgatgtt-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 20461  T
Q  239 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20462 tgttg-ttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 128916 - 128752
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| | |||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |    
T  128916 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttt 128817  T
Q  256 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
     || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  128816 tttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatg 128752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4393 - 4218
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4393 atttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 4295  T
Q  238 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4294 atgctggttttgtatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Original strand, 161072 - 161248
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  161072 atttgatattgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 161171  T
Q  238 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  161172 attatgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatg 161248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Original strand, 164573 - 164674
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  164573 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 164672  T
Q  238 at 239  Q
    ||    
T  164673 at 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 4148 - 4303
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4148 ttactgcacgtgggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatattgtccatgattgatgaagt 4247  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    |||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4248 gttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttata 4303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 15239 - 15084
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15239 ttactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatttatatgtttgtgaatactatattgtccatgattgatgaagt 15140  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    |||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15139 gttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttata 15084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 11185 - 11251
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11185 ttactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 11251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 156 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23048 - 22890
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23048 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22949  T
Q  256 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22948 ggtgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 22890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 3340 - 3187
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3340 ttactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 3241  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3240 gttatatgtagatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 3187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 6781 - 6936
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6781 ttactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgtccatgattgatgaagt 6880  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    |||||||||||||||||||||| |   |||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  6881 gttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgagtatcatttaatgttgttata 6936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 53717 - 53872
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  53717 ttactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatattgttcatgattgatgaagt 53816  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53817 gttatatgtatatatgatgtttaagtagatgttgattatcatttgatgttgttata 53872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 200 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 116547 - 116434
Alignment:
Q  200 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116547 ttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 116449  T
Q  300 aagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||||||    
T  116448 aagttgattaagatg 116434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Original strand, 128907 - 129072
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  128907 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 129005  T
Q  238 atg-ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||  |  |||| | |||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  129006 atgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 78505 - 78453
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattata 190  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  78505 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattata 78453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 1745 - 1592
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1745 ttactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatttatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 1646  T
Q  101 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1645 gttatatgtatatatgattttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 1592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 28073 - 27958
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28073 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 27975  T
Q  133 attattatttgatgttg 149  Q
    |||||||||||||||||    
T  27974 attattatttgatgttg 27958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 28158 - 28048
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  |||||||||||| |    
T  28158 ttacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaatt 28059  T
Q  101 gttatatgtat 111  Q
      |||||||||    
T  28058 agtatatgtat 28048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 222 - 320
Target Start/End: Original strand, 15485 - 15583
Alignment:
Q  222 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  15485 ttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 15583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 314
Target Start/End: Original strand, 44706 - 44821
Alignment:
Q  200 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44706 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 44805  T
Q  299 taagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||    
T  44806 taagttgattaagatg 44821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 314
Target Start/End: Original strand, 26020 - 26179
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  || | ||||||| ||||||||   || ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26020 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26119  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26120 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Original strand, 3106 - 3270
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  3106 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 3204  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3205 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 3270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Original strand, 16555 - 16720
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   || ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16555 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 16654  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  16655 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatg 16720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 524 - 416
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  524 ttactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtaagtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 425  T
Q  101 gttatatgt 109  Q
    |||||||||    
T  424 gttatatgt 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 156 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4673 - 4522
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4673 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 4574  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4573 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgat 4522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 156 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12255 - 12104
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12255 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 12156  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12155 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgat 12104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 156 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 22207 - 22056
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22207 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 22108  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22107 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgat 22056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 33 - 154
Target Start/End: Original strand, 10765 - 10885
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10765 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatactgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaaatgttg 10863  T
Q  133 attattatttgatgttgttata 154  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  10864 agtattatttgatgttgttata 10885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Original strand, 10647 - 10734
Alignment:
Q  21 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10647 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 10734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13377 - 13212
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13377 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13278  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  13277 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 13212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 2017 - 1852
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2017 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1918  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1917 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 1852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 52079 - 51914
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52079 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatatt 51980  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  51979 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 51914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Original strand, 167934 - 168098
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  167934 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatact 168032  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  168033 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 168098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 323
Target Start/End: Original strand, 3141 - 3309
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  || | ||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3141 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 3240  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatg 323  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  3241 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 3309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 156 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 39642 - 39486
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39642 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 39544  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 312  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39543 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 39486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 156 - 312
Target Start/End: Original strand, 75170 - 75326
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  75170 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 75268  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 312  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  75269 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 75326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 5)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 154
Target Start/End: Original strand, 15150 - 15272
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  15150 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 15248  T
Q  131 tgattattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  15249 tgattatcatttgatgttgttata 15272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 314
Target Start/End: Original strand, 15298 - 15352
Alignment:
Q  260 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15298 tgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatg 15352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Original strand, 15030 - 15119
Alignment:
Q  9 cgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||          |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15030 cgtaggtcatagtgaataattgaatatgattaatgaatta----------gtatatgtttgtgaatactatattgttcataattgatgaagtgttatatg 15119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 1351 - 1290
Alignment:
Q  260 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  1351 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 1290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 7319 - 7267
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  7319 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 7267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 906 - 799
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  906 ttactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatttgtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 807  T
Q  101 gttatatg 108  Q
     |||||||    
T  806 tttatatg 799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 768 - 646
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 130  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  768 tatgattgattaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 670  T
Q  131 tgattattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  669 tgattatcatttgatgttgttata 646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 10099 - 10001
Alignment:
Q  10 gtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10099 gtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtgtgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 10001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 9970 - 9936
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9970 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 9936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Original strand, 1004 - 1168
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1004 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatact 1102  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  1103 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 1168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 5015 - 4850
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||    ||| |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5015 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatact 4916  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  4915 gcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 4850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 3636 - 3471
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3636 tgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3537  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3536 gcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 3471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 508 - 344
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||   ||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  508 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctatttt-gtatact 410  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  409 gcctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatg 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Original strand, 32913 - 33076
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||  ||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32913 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 33010  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33011 gcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 33076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 46092 - 45929
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||  ||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46092 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 45995  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  45994 gcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 45929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 157 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16278 - 16114
Alignment:
Q  157 gtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 256  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||   || ||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  16278 gtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactg 16179  T
Q  257 t-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
      | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16178 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 16114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 320
Target Start/End: Original strand, 17388 - 17449
Alignment:
Q  259 gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17388 gtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 141 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8481
Alignment:
Q  141 ttgatgttgtt-atactgtgatataat--tgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  8650 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 8551  T
Q  238 atgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |||||||||| | ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8550 atgctgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 6695 - 6536
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  6695 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 6599  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  6598 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatg 6536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 154
Target Start/End: Original strand, 35955 - 36064
Alignment:
Q  45 attagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaa-gtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttg 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35955 attagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatgattgatgaaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattttttg 36053  T
Q  144 atgttgttata 154  Q
    ||||| |||||    
T  36054 atgttcttata 36064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 306
Target Start/End: Original strand, 23942 - 23989
Alignment:
Q  260 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23942 tgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 23989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 6)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 207 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 28529 - 28415
Alignment:
Q  207 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28529 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 28430  T
Q  306 attaagatgttgatg 320  Q
    || |||||| |||||    
T  28429 atgaagatgatgatg 28415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 11460 - 11293
Alignment:
Q  150 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 249  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  11460 ttataatgttatataatagtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 11366  T
Q  250 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
     ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  11365 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 11293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 2165 - 1998
Alignment:
Q  150 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 249  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  2165 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 2071  T
Q  250 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
     ||||||  | ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  2070 catactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 1998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4553
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 4553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 191
Target Start/End: Original strand, 26013 - 26069
Alignment:
Q  136 attatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26013 attatttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatat 26069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 191
Target Start/End: Original strand, 16861 - 16909
Alignment:
Q  144 atgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16861 atgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatat 16909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26061 - 25904
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  || ||||||||| |||| ||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  26061 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatact 25963  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 313  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  25962 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagat 25904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 40023 - 39859
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  || ||||||||| |||| ||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  40023 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatact 39925  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  39924 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 39859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Original strand, 6076 - 6244
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6076 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 6175  T
Q  256 g----ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
         |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6176 acctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Original strand, 8488 - 8649
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8488 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atact 8586  T
Q  256 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8587 gcctatgttgc---tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 8649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 13472 - 13571
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13472 ttactgaacgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 13571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 43052 - 42999
Alignment:
Q  5 tgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 58  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43052 tgcacgtaggtcacagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgaat 42999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 207 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 8594 - 8480
Alignment:
Q  207 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8594 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttg 8495  T
Q  306 attaagatgttgatg 320  Q
    || |||||| |||||    
T  8494 atgaagatgatgatg 8480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 7319 - 7352
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7319 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 7352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 7382 - 7415
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7382 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 7415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 306
Target Start/End: Original strand, 27686 - 27855
Alignment:
Q  139 atttgatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||    
T  27686 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatc 27785  T
Q  238 atgctgtttttgtatact-gttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |||||| ||||| |||||   | ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27786 atgctg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 303
Target Start/End: Original strand, 24257 - 24406
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatac 254  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24257 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatac 24356  T
Q  255 tgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 303  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24357 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 11648 - 11465
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  11648 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 11549  T
Q  238 atgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||| || ||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | | ||||||||||||    
T  11548 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatg 11465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 256
Target Start/End: Original strand, 3485 - 3585
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3485 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3584  T
Q  256 g 256  Q
    |    
T  3585 g 3585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 320
Target Start/End: Original strand, 38193 - 38376
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  38193 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 38292  T
Q  238 atgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||| || ||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | | ||||||||||||    
T  38293 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatg 38376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 302
Target Start/End: Original strand, 53481 - 53651
Alignment:
Q  134 ttattatttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 232  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  53481 ttatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgtt 53580  T
Q  233 atgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    || ||||| || ||||| ||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  53581 atatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 135 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12755 - 12587
Alignment:
Q  135 tattatttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 233  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | | || |||||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  12755 tattatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattac-tgaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgtta 12657  T
Q  234 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    | |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12656 tatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 57798 - 57708
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgat 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  57798 ttactgcacgtaggtcacagtgaatacttgaatatgagtgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgat 57708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 154
Target Start/End: Original strand, 1204 - 1326
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 130  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| || ||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  1204 tatgattaataaattagtatatgaatataaatgtt-gagaataagatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 1302  T
Q  131 tgattattatttgatgttgttata 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  1303 tgattatcatttgatgttgttata 1326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13313 - 13147
Alignment:
Q  139 atttgatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaat-aattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgt 236  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   || ||| |||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  13313 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatat 13214  T
Q  237 catgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||||||| ||||| ||||||  | ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13213 catgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 306
Target Start/End: Original strand, 16037 - 16206
Alignment:
Q  139 atttgatgttg-ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||    
T  16037 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatc 16136  T
Q  238 atgctgtttttgtatact-gttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    ||| || ||||| |||||   | ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16137 atgttg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 171 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1953
Alignment:
Q  171 tatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 269  Q
    |||||||||| ||||| || | |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||  | ||| ||||||    
T  2103 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt 2004  T
Q  270 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  2003 gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 1953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13165 - 13092
Alignment:
Q  161 tataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 234  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13165 tataattatatatgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 40078 - 39914
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||    |||| || ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  40078 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 39980  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  39979 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 39914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 225590 - 225482
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  225590 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatc 225492  T
Q  238 atgctgtttt 247  Q
    | ||||||||    
T  225491 acgctgtttt 225482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 141 - 306
Target Start/End: Original strand, 10481 - 10647
Alignment:
Q  141 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 239  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  10481 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 10579  T
Q  240 gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    | ||  |||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10580 gatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 231 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4713
Alignment:
Q  231 ttatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  4803 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 4713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 160 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 130066 - 129919
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  130066 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 129969  T
Q  259 gtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  129968 atgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgat 129919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Original strand, 60652 - 60818
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||| ||    
T  60652 atttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattggtatatc 60750  T
Q  238 at--gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||  |||| ||||||||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  60751 atgagctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 242 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12042 - 11982
Alignment:
Q  242 tgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12042 tgttttggtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12112 - 12039
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 212  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12112 atttgatactgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgaggcgttgtt 12039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15829 - 15668
Alignment:
Q  150 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 249  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  15829 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttg 15735  T
Q  250 tatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15734 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatg 15668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 318
Target Start/End: Original strand, 6220 - 6400
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttat-actgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||    
T  6220 atttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatc 6318  T
Q  238 at--gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 318  Q
    ||  |||| |||| |||||||  | |||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  6319 atgagctg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaagatga--aagatgttga 6400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 318
Target Start/End: Original strand, 13813 - 13854
Alignment:
Q  275 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  13813 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga--aagatgttga 13854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 32230 - 32068
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  || ||||    
T  32230 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gtttact 32134  T
Q  256 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  32133 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 32068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 19424 - 19278
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  19424 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 19328  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19327 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 222 - 314
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11557
Alignment:
Q  222 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  11464 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgttgaagatg 11557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 320
Target Start/End: Original strand, 1011 - 1189
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 238  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  1011 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 1106  T
Q  239 tgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    || || ||| | ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  1107 tgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 1189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 141 - 307
Target Start/End: Original strand, 45732 - 45899
Alignment:
Q  141 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 239  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  45732 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttga-taattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcat 45830  T
Q  240 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    | || ||| | ||||||  | | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45831 gatgattt-gcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 173 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 174913 - 174785
Alignment:
Q  173 tgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-g 270  Q
    |||||||| ||||||||   ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |    
T  174913 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttg 174817  T
Q  271 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174816 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 174785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 121827 - 121767
Alignment:
Q  260 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  121827 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 121767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 124751 - 124675
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 232  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||  |||| |||||| || | |||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  124751 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 222 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13596 - 13513
Alignment:
Q  222 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 305  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13596 ttgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13258 - 13158
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 255  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13258 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13159  T
Q  256 g 256  Q
    |    
T  13158 g 13158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 281
Alignment:
Q  265 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagat 281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 34176 - 34124
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  34176 ttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 34124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25289 - 25121
Alignment:
Q  139 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 238  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| ||||| |||||||  |||| |||    
T  25289 atttgatgttgtaataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatatcgttatatca 25192  T
Q  239 t--gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |  |||| |||| |||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25191 tgagctg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 720 - 620
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  720 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 623  T
Q  238 atg 240  Q
    |||    
T  622 atg 620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 16326 - 16263
Alignment:
Q  35 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaa 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  || |||| |||||||||||||    
T  16326 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 16263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 6768 - 6714
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg 55  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6768 ttactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg 6714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 5803 - 5657
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||  ||||||  |    
T  5803 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcct 5707  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5706 atgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 5657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 8056 - 7996
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgta 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8056 ttactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgta 7996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 320
Target Start/End: Original strand, 6083 - 6243
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  ||  || |||  ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  6083 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 6180  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
     |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6181 atgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 6243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 97190 - 97089
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  97190 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 97092  T
Q  238 atg 240  Q
    |||    
T  97091 atg 97089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 106468 - 106367
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  106468 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 106370  T
Q  238 atg 240  Q
    |||    
T  106369 atg 106367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 290 - 143
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-tt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||||||  |    
T  290 atataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcct 193  T
Q  259 gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  192 atgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgat 143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 320
Target Start/End: Original strand, 10395 - 10543
Alignment:
Q  171 tatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 269  Q
    |||||||||| ||||  |||| || ||| || ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  10395 tatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 10491  T
Q  270 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
     |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  10492 tgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 10543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27996 - 27911
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 241  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27996 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1154
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1102 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 1154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 6664 - 6612
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6664 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 6612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 14044 - 13992
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14044 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 13992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32696 - 32551
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||  |    
T  32696 atatagttgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcct 32600  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
     |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32599 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 32551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 302
Target Start/End: Original strand, 51839 - 51985
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 254  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||| | ||  ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||| || |    
T  51839 tgtgatataat-gtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcatt-gatattattatgtcttgctatttttgaatgc 51936  T
Q  255 tg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    ||  | || ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51937 tgcctatg-tgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 4)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Original strand, 15845 - 15897
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15845 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 15897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 178952 - 178901
Alignment:
Q  263 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  178952 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 178901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 142765 - 142712
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  142765 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 142712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 142809 - 142776
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  142809 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 142776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8176 - 8090
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8176 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6980 - 6826
Alignment:
Q  150 ttatactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 249  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| || |||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| ||||| || ||| |    
T  6980 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttga-tatttgag---ttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-g 6886  T
Q  250 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6885 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgat 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 207 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21026 - 20911
Alignment:
Q  207 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||  | |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||     
T  21026 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtc 20927  T
Q  305 gattaagatgttgatg 320  Q
    | | ||||||||||||    
T  20926 gttgaagatgttgatg 20911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 68278 - 68227
Alignment:
Q  1 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 52  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68278 ttactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 68227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 47048 - 46996
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  47048 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 46996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 240
Target Start/End: Original strand, 7996 - 8098
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||  || ||| |||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  7996 atttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatc 8095  T
Q  238 atg 240  Q
    |||    
T  8096 atg 8098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 2564 - 2597
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2564 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 2597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Original strand, 2608 - 2661
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  2608 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 2661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 229
Target Start/End: Original strand, 18176 - 18265
Alignment:
Q  140 tttgatgttgttat-actgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 229  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18176 tttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 18265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13100 - 12954
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||| |  ||  || |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||  |    
T  13100 atataattgtatatacattacacgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcct 13003  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
     ||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  13002 atgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 12954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 307
Target Start/End: Original strand, 14658 - 14804
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| || |||| | |||||  |    
T  14658 atataatagtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcct 14754  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14755 atgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 268 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 1135 - 1091
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1135 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 1091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 320
Target Start/End: Original strand, 4893 - 4953
Alignment:
Q  260 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  4893 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 4953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 245
Target Start/End: Original strand, 918 - 1006
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 245  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  918 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgca-ttgatattattatgccatgctgtt 1006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 38483 - 38339
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--gctgtttttgtata 253  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||  |||| |||| ||||    
T  38483 tgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctg-ttttatata 38386  T
Q  254 ctg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298  Q
    |||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38385 ctgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 306
Target Start/End: Original strand, 8011 - 8180
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||| |||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    ||| || |||||||| ||| |||||||||| |||| ||    
T  8011 atttaatgttgttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatg--ttgtgatgttgttgatttgtatttgatattgttatatc 8108  T
Q  238 atg--ctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
    |||  ||| ||| ||||||||  | |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8109 atgaactggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 267844 - 267679
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  267844 atttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga--tgttgagatattgttgatttgcatttgatattgttatatc 267747  T
Q  238 atg--ctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||  ||| |||| |||||||  | ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  267746 atgaactg-ttttatatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 200 - 307
Target Start/End: Original strand, 2805 - 2913
Alignment:
Q  200 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 297  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2805 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 2903  T
Q  298 ctaagttgat 307  Q
    ||||| ||||    
T  2904 ctaagatgat 2913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16395 - 16283
Alignment:
Q  207 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 304  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16395 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 16299  T
Q  305 gattaagatgttgatg 320  Q
    | | |||||| |||||    
T  16298 gttgaagatgatgatg 16283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1134 - 1051
Alignment:
Q  220 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1134 atttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10688 - 10542
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |  |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  10688 atataattgtatatacattacatgaattatgttcga-tgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 10591  T
Q  259 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 306  Q
     ||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10590 atgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 240
Target Start/End: Original strand, 1735 - 1835
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  1735 atttgacgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacataaattatatatga--tgttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 1832  T
Q  238 atg 240  Q
    |||    
T  1833 atg 1835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 307
Target Start/End: Original strand, 2713 - 2752
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2713 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 2752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23897 - 23846
Alignment:
Q  263 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23897 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatg 23846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 189 - 88
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 237  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||||| ||||||| |||| ||    
T  189 atttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgcatctgatattgttatatc 91  T
Q  238 atg 240  Q
    |||    
T  90 atg 88  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12944 - 12780
Alignment:
Q  144 atgttgttat-actgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 242  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  ||  || |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |    
T  12944 atgttgttattaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 12846  T
Q  243 gtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    | ||| | ||| ||  | ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12845 gattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36457
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatg 36457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4675 - 4545
Alignment:
Q  171 tatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 269  Q
    |||||||||| |||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||  |||||||||||| || || ||||| | ||| ||||||  | || || ||||    
T  4675 tatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgtt 4576  T
Q  270 gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4575 gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 32224 - 32112
Alignment:
Q  196 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 293  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32224 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagt 32126  T
Q  294 cggtctaagttgat 307  Q
    ||||||||| ||||    
T  32125 cggtctaagatgat 32112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 15361 - 15282
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 113  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  15361 atgattgatgaattattatttgaatgtatatgtcgatgaatatgatattgttcatgattgatgaattattatatgaatat 15282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 51644 - 51601
Alignment:
Q  260 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 302
Target Start/End: Original strand, 5196 - 5230
Alignment:
Q  268 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5196 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 5230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 307
Target Start/End: Original strand, 28839 - 28877
Alignment:
Q  269 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 307  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28839 tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6761 - 6676
Alignment:
Q  171 tatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 256  Q
    |||||||||| ||||| || | |||||| || ||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  6761 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactg 6676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 156 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10638 - 10603
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10638 tgtgatataattgtatacgcattacatgaattatat 10603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 156 - 191
Target Start/End: Original strand, 617 - 652
Alignment:
Q  156 tgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  617 tgtgatataattgtatacgcattacatgaattatat 652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29660 - 29561
Alignment:
Q  216 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 314  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  ||   | || | || ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29660 ttgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatg 29561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 29880 - 29847
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29880 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 29847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 1133 - 1099
Alignment:
Q  33 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1133 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 1099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 58002 - 57948
Alignment:
Q  136 attatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattat 189  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  58002 attatttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattat 57948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 320
Target Start/End: Original strand, 193039 - 193097
Alignment:
Q  263 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgttgatg 320  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||    
T  193039 tgctgttgttaattaactaagttgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatg 193097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 600 - 547
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  600 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1122 - 1069
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  1122 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 1069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 206 - 165
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcatta 179  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  206 atttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcatta 165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 240
Target Start/End: Original strand, 2179 - 2257
Alignment:
Q  160 atataattgtatatgcattacatgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 240  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  |   ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  2179 atataattgtatatacattatatgaattat--gctgatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 2257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 320
Target Start/End: Original strand, 1124 - 1169
Alignment:
Q  275 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  1124 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 721 - 688
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  721 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 6227 - 6194
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6227 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 6194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 10033 - 10000
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10033 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 10000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3140 - 3087
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  3140 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 3087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 3184 - 3151
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3184 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 3151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 24654 - 24687
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24654 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 24687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 24717 - 24750
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24717 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 24750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7613 - 7560
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  7613 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 7560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14732 - 14679
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  14732 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 14679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 7508 - 7541
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7508 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 7541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 7445 - 7477
Alignment:
Q  35 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7445 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 7477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 36287 - 36320
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36287 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 36320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 66
Target Start/End: Original strand, 36350 - 36382
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgt 66  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36350 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgt 36382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 62057 - 62024
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  62057 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 62024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 46667 - 46700
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46667 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 46700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 29428 - 29395
Alignment:
Q  34 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29428 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 29395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30515 - 30462
Alignment:
Q  139 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 191  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  30515 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 30462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 18553 - 18521
Alignment:
Q  35 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 67  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18553 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 18521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 300
Target Start/End: Original strand, 206584 - 206624
Alignment:
Q  260 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 300  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  206584 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 85660 - 85632
Alignment:
Q  126 gatgttgattattatttgatgttgttata 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  85660 gatgttgattattatttgatgttgttata 85632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University