View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18717_high_1 (Length: 974)

Name: NF18717_high_1
Description: NF18717
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18717_high_1
NF18717_high_1
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (482-944)||(4344387-4344849)
chr4 (496-944)||(4360832-4361280)
chr4 (481-955)||(4123806-4124280)
chr4 (490-939)||(4320502-4320951)
chr4 (483-947)||(4335087-4335551)
chr4 (481-881)||(4133366-4133764)
chr4 (555-946)||(7885267-7885658)
chr4 (553-913)||(6621416-6621776)
chr4 (565-947)||(6498401-6498783)
chr4 (555-947)||(6545323-6545715)
chr4 (563-947)||(6650889-6651273)
chr4 (507-931)||(6752726-6753150)
chr4 (549-943)||(6532111-6532505)
chr4 (570-931)||(6796616-6796977)
chr4 (711-947)||(6675673-6675909)
chr4 (567-947)||(6728232-6728612)
chr4 (565-947)||(6815294-6815676)
chr4 (646-946)||(6758629-6758929)
chr4 (507-933)||(6837040-6837466)
chr4 (765-947)||(6588071-6588253)
chr4 (66-113)||(47434690-47434737)
chr4 (888-946)||(4133290-4133348)
chr4 (63-105)||(31965069-31965111)
chr4 (546-663)||(6715572-6715689)
chr4 (498-611)||(6772861-6772974)
chr4 (63-104)||(49190174-49190215)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (478-942)||(5690039-5690503)
chr6 (490-950)||(5073780-5074240)
chr6 (481-942)||(5176479-5176940)
chr6 (481-942)||(5278306-5278767)
chr6 (481-953)||(5181796-5182268)
chr6 (480-955)||(5128284-5128759)
chr6 (481-949)||(5433775-5434243)
chr6 (478-942)||(5344598-5345062)
chr6 (479-951)||(5354485-5354957)
chr6 (481-950)||(5096448-5096917)
chr6 (481-947)||(5447327-5447793)
chr6 (481-953)||(5066563-5067035)
chr6 (459-953)||(5383043-5383538)
chr6 (481-955)||(5102481-5102955)
chr6 (456-953)||(5396664-5397162)
chr6 (481-953)||(5157497-5157969)
chr6 (496-953)||(5425665-5426122)
chr6 (478-953)||(5284258-5284733)
chr6 (481-955)||(5370311-5370785)
chr6 (496-953)||(5350151-5350600)
chr6 (478-832)||(5257324-5257678)
chr6 (481-815)||(5446897-5447231)
chr6 (452-672)||(5147046-5147266)
chr6 (481-779)||(5243910-5244208)
chr6 (721-931)||(5281280-5281490)
chr6 (721-931)||(5179521-5179731)
chr6 (821-942)||(5243793-5243914)
chr6 (63-112)||(2115308-2115357)
[»] chr7 (5 HSPs)
chr7 (396-944)||(36213707-36214255)
chr7 (514-944)||(18935159-18935589)
chr7 (502-944)||(34724464-34724906)
chr7 (63-105)||(21048690-21048732)
chr7 (67-101)||(38963368-38963402)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (447-953)||(8769-9276)
[»] chr5 (7 HSPs)
chr5 (478-947)||(8877346-8877815)
chr5 (849-940)||(20838740-20838831)
chr5 (718-940)||(20812254-20812476)
chr5 (852-940)||(12599054-12599142)
chr5 (849-931)||(15803019-15803101)
chr5 (813-942)||(30417892-30418021)
chr5 (63-108)||(40267010-40267055)
[»] chr3 (8 HSPs)
chr3 (400-950)||(47986744-47987275)
chr3 (400-950)||(47996031-47996562)
chr3 (400-950)||(48005318-48005849)
chr3 (400-950)||(48014603-48015134)
chr3 (708-942)||(32411083-32411314)
chr3 (831-942)||(6905806-6905917)
chr3 (635-757)||(6905991-6906113)
chr3 (67-105)||(43955324-43955362)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (565-942)||(22584094-22584471)
chr2 (63-114)||(7252243-7252294)
chr2 (627-766)||(14767123-14767262)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (563-913)||(6481-6831)
[»] scaffold0813 (1 HSPs)
scaffold0813 (563-947)||(4701-5085)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (708-940)||(3262629-3262860)
chr8 (709-941)||(3286516-3286748)
chr8 (834-942)||(3391536-3391644)
chr8 (627-940)||(31175733-31176046)
chr8 (834-942)||(3364262-3364370)
chr8 (870-942)||(3407323-3407395)
chr8 (708-939)||(3325003-3325234)
chr8 (849-939)||(3314966-3315056)
chr8 (708-940)||(3398522-3398754)
chr8 (852-942)||(3267198-3267288)
chr8 (63-105)||(37312924-37312967)
chr8 (63-105)||(37387062-37387105)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (565-947)||(8160-8542)
[»] scaffold0373 (1 HSPs)
scaffold0373 (507-933)||(9456-9882)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (831-942)||(6146-6257)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (66-123)||(7525050-7525107)
chr1 (67-123)||(17557708-17557764)
chr1 (63-126)||(40571587-40571649)
chr1 (67-105)||(347352-347390)
chr1 (63-105)||(20738718-20738760)
chr1 (63-97)||(29410162-29410196)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 482 - 944
Target Start/End: Original strand, 4344387 - 4344849
Alignment:
Q  482 gttcttgtagaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaacag 581  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||||||||| | || || ||||||||||||| |||||||||||| ||  | |||||| || |||||||||||||| ||    
T  4344387 gttcttgcagaggatggatcagctgaaaattctcaatctcagtcattctcattgtctgacacagacgcctgacttttcatacttgcctaatcttgaaaag 4344486  T
Q  582 ttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtcttt 681  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  4344487 ctagtactcaaagattgtccaaggctgtctgagatttcccaaagtattggacatctcaacaaaattcttttgataaatttgaaaaattgtattagccttt 4344586  T
Q  682 gtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaat 781  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4344587 gtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaatgattgacaagttggaagaggacttggaacaaat 4344686  T
Q  782 ggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtgga 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||  || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4344687 ggaatctttaaccactctgattgcaaataacactgctataacaaaagtacccttttcagtagtaaggtcaaaacgcattggatttatttctttgtgtgga 4344786  T
Q  882 tatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaat 944  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4344787 tatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttggtcttggatgtcaccaacaaat 4344849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 496 - 944
Target Start/End: Original strand, 4360832 - 4361280
Alignment:
Q  496 tggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaacagttagtactcaaaga 595  Q
    ||||| ||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||| || |||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  4360832 tggagcagctgaaaattctcaatcttagtcattctcaatatctgacacagacgcctgacttttcatacttgcctaatcttgaaaagctagtacttaaaga 4360931  T
Q  596 ttgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaaga 695  Q
    |||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  4360932 ttgtccaaggctgtctgagatttcccaaagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgcattagcctttgtaaccttccaaga 4361031  T
Q  696 aacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaacca 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4361032 aacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttcaatgattgacacgttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaacca 4361131  T
Q  796 ctctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctc 895  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4361132 ctctgattgcaaataacactggtataacaaaagtacccttttcaattgtaagatcaaaacgcattggatttatttctttgtgtggatatgaaggattctc 4361231  T
Q  896 acgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaat 944  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4361232 acgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgtcaccaacaaat 4361280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 481 - 955
Target Start/End: Complemental strand, 4124280 - 4123806
Alignment:
Q  481 tgttcttgtagaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaaca 580  Q
    |||||||| ||||  ||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||| || ||||||| |||||| |    
T  4124280 tgttcttgcagagaatggagcagctgaaaattctcaatcttagtcattctcattatctgacacagacccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaa 4124181  T
Q  581 gttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctt 680  Q
    | | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  4124180 gctggtactcaaagattgtccaaggctgtctgaggtatcccatacaattggacatcttaagaaagttcttttgataaatttgaaagattgtactagcctt 4124081  T
Q  681 tgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaa 780  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4124080 tctaaccttccaagaaacatttattcgttgaaatctctgaaaactctcattctatcgggatgtttaatgattgacaagttggaagaggagttggaacaaa 4123981  T
Q  781 tggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtgg 880  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4123980 tggaatctttaaccactctgattgcaaataatactgctataacaaaagtgcccttttcggtagtaaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtgg 4123881  T
Q  881 atatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataatctcccacc 955  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4123880 atatgaaggattctctcgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataatctcccacc 4123806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 490 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 4320951 - 4320502
Alignment:
Q  490 agaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaacagttagtact 589  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||| || |||||||||| ||  | |||||| || |||||||||||||| || |||| ||    
T  4320951 agaggatggagcagctgaagattctaaatcttagtcattctcatcatttgacacagacccctgacttttcatacttgcctaatcttgaaaagctagtgct 4320852  T
Q  590 caaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaacctt 689  Q
    | ||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  4320851 cgaagattgcccaaggctgtctcaggtttcccatagcattggacatctcaaaaaagttgttttgataaatttgaaagattgtattagcctttgtagcctt 4320752  T
Q  690 ccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctt 789  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4320751 ccaagaaacatctatacgttgaaaactctgaatactctcattctatcgggatgtttaatgattgacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatctt 4320652  T
Q  790 taaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaagg 889  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4320651 taaccaccctgattgcaaataatactggtataacaaaagttcccttttcattagtaaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaagg 4320552  T
Q  890 attctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaa 939  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4320551 attctcacgtgatgtgtttccttctatcatttggtcttggatgtcaccaa 4320502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 483 - 947
Target Start/End: Original strand, 4335087 - 4335551
Alignment:
Q  483 ttcttgtagaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaacagt 582  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| || |||||||||||||| |      
T  4335087 ttcttgcagaggatggagcagttgaaaattctcaatcttagtcattctcattatctaacacagacccctgatttttcatacttgcctaatcttgaaaacc 4335186  T
Q  583 tagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttg 682  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  4335187 tagtactcaaagattgtccgaggctgtctgaggtatcccatacaattggacatcttaagaaagttcttttgataaatttgaaagattgcattagcctttg 4335286  T
Q  683 taaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatg 782  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4335287 taaccttccaagaaacatctatacgttgaagtctctgaaaactctcattctatcaggatgtttaaagattgacaagttggaagaggacttggaacaaatg 4335386  T
Q  783 gaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggat 882  Q
    ||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||  || | | ||||||||||||||| | ||| ||| ||||||| |    
T  4335387 gaatctttaaccactctcatggcagataacactggtataacaaaagtgcccttttcagtagtaaagtcaaaaagcattggctatatctctttgtgtgggt 4335486  T
Q  883 atgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataat 947  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  4335487 atgaaggattctcccgtgatgtgtttccttctataatttggtcttggatggtaccaacaaataat 4335551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 481 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 4133764 - 4133366
Alignment:
Q  481 tgttcttgtagaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaaca 580  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||| || | || |||||||||||||||| |||   |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  4133764 tgttcttgcagaggctggagaatctaaaatttctcaatcttagtcattctcattgtctagtacagaccccagatttttcacacatgcctaatctagaaaa 4133665  T
Q  581 gttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctt 680  Q
      || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||||| | ||| ||||  | |||||||||||||| ||||  || |||    
T  4133664 actaatactcaaagattgtccaaggctgtctgaggtttcccataccattggtcatctccataaagttctcattataaatttgaaagactgtactagcctt 4133565  T
Q  681 tgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaa 780  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||| || ||  |||||||||||||||    
T  4133564 cgtaaccttccaagaaccatctattcgttgaaatctctgaaaactcttattctttctggctgtttaattattgacaaattgga--aggacttggaacaaa 4133467  T
Q  781 tggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtgg 880  Q
    |||| |||||||||||||||||||   || ||||||  ||||||||||||||||||||  |    |||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  4133466 tggagtctttaaccactctgattgtggataacactgcaataacaaaagtgcccttttcagtcgcaaggtcaaaaagcattgaatatatttctctttgtgg 4133367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 555 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 7885658 - 7885267
Alignment:
Q  555 ttttcaaacatgcctaatcttgaacagttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttga 654  Q
    ||||||||  |||| ||||||||| ||||| |||| || |||||||| || ||||||  ||||||   || ||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  7885658 ttttcaaaattgccaaatcttgaaaagttaatacttaaggattgtcccagtttgtcttcggtttcttctaatataggacatctcaaaaagattcttttaa 7885559  T
Q  655 taaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattga 754  Q
    ||||||||||||||||||   | ||| |  | |||||||| | ||| |||| |||  | || |||||||| |||||||| |||||||||  ||| |||||    
T  7885558 taaatttgaaagattgtacaggccttcgagaacttccaaggagcatatataagttagactcgctgaaaacactcattctgtctggatgtacaaaaattga 7885459  T
Q  755 caagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaa 854  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||  || ||||  ||||||||| ||| |||| |||||||||| |  || | || ||||||    
T  7885458 caagttagaagaggatatagaacaaatgaaatctttaaccaccttggttgcggatgacactgctatcacaagagtgccctttgcagtagtaagatcaaaa 7885359  T
Q  855 agcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataa 946  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||   |||||   |||||||||||||| |||  ||||||| |||  |||||||||||    
T  7885358 agcattgcatttatttctctatgtggttataaaggatctgcacgtagagtgtttccttctattattcagtcttggctgtctccaacaaataa 7885267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 553 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 6621776 - 6621416
Alignment:
Q  553 atttttcaaacatgcctaatcttgaacagttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattctttt 652  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||| ||||||   || || ||||| ||||||  |||| | ||| ||||  |    
T  6621776 atttttcatacatgcctaatctcgaaaagctagtgctcaaagactgtccaagtttgtctacagtctcccatagcattggatctctccataaacttctcct 6621677  T
Q  653 gataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagatt 752  Q
     |||||||||| ||| || ||  ||||| |||| |||||||||| ||||||||  || ||||||||  ||||| | ||||| || |||||||  | ||||    
T  6621676 tataaatttgacagactgcatacgtcttcgtaaacttccaagaagcatctataaattaaaatctctagaaactttaattctttcaggatgttccatgatt 6621577  T
Q  753 gacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaa 852  Q
    ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || ||  |||||||  || | |||| |||||||||||| |||||||| ||| |  | || |    
T  6621576 gacaaattggaggaggacttggaacagatggaatcattgacaaccttgattgcggataagactgctataacaaaagttcccttttcaatagtacgatcta 6621477  T
Q  853 aaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttc 913  Q
    ||| |||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6621476 aaaacattggatatatttctttatgtggatttgaaggattttcacgggatgtgtttccttc 6621416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 565 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 6498783 - 6498401
Alignment:
Q  565 tgcctaatcttgaacagttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaa 664  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| || ||||| ||||||  ||||   ||| ||||  |||| |||||||     
T  6498783 tgcctaatattgaaaagctagtactcaaagactgtccaagtttgtctacggtctcccatagcattggatctctctgtaaacttctaatgattaatttgac 6498684  T
Q  665 agattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaa 764  Q
     || || |   |||||   |||||||| |||| ||||||||  || ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||     
T  6498683 ggactgcactggtcttcaaaaccttccgagaagcatctataaattaaaatctctagaaactttgattctttctggatgttccaagattgacaaattggag 6498584  T
Q  765 gaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggat 864  Q
    |||||| ||||||| |||||||| || || ||  |||||||  || | |||| |||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||||||    
T  6498583 gaggacgtggaacagatggaatcattgacaaccttgattgcggataagactgctataacaaaagttcccttttcaatagtaagatcaaaaagcattggat 6498484  T
Q  865 ttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataat 947  Q
      |||||| |  |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||||    
T  6498483 acatttctttaggtggatttaaaggattttcacgtgatgtatttccttctctcattcggtcttggatgtcaccatcaaataat 6498401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 555 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 6545715 - 6545323
Alignment:
Q  555 ttttcaaacatgcctaatcttgaacagttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttga 654  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| ||||||   || || ||||| ||||||  |||  | ||| ||||| | |    
T  6545715 ttttcatatatgcctaatcttgaaaagatagtactcaaaggctgtccaagtttgtctacagtctcccatagcattggatctctacataaacttcttctaa 6545616  T
Q  655 taaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattga 754  Q
    ||||||||| ||| || |   ||||| | || ||||| | || ||||||||  || ||||||||  ||||| | ||||| || |||||||  |||||| |    
T  6545615 taaatttgacagactgcacaggtcttcgaaaacttccgaaaagcatctataaattaaaatctctagaaactttgattctttcgggatgttccaagattaa 6545516  T
Q  755 caagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaa 854  Q
    ||| || || |||||||||||||| |||||||| || |  ||  |||||||  || | |||| ||||||||||||||||||||| ||| | || |  |||    
T  6545515 caaattggaggaggacttggaacagatggaatcgttgaaaaccttgattgcggataagactgctataacaaaagtgcccttttcaatagttagattgaaa 6545416  T
Q  855 agcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataat 947  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||  ||||||| ||| |||| ||||||||    
T  6545415 agcattggatatatttcttttcgtggctttgaaggattttcacgtgatgtattcccttctctcattcggtcttggctgtcaccatcaaataat 6545323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 563 - 947
Target Start/End: Original strand, 6650889 - 6651273
Alignment:
Q  563 catgcctaatcttgaacagttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttg 662  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || | ||| ||||||  |||  | ||| ||||| | |||||||||    
T  6650889 catgcctaatcttgaaaagctagtactcaaagactgtccaagattaactgcggtctcccgtagcattggatctctgcataaacttcttctaataaatttg 6650988  T
Q  663 aaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttag 762  Q
    | ||| || |  ||||||   || ||||| |||| ||| ||||  || ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||| || |    
T  6650989 acagactgcacaagtcttcagaaacttcctagaagcatatataaattaaaatctctagaaactttgattctttctggatgttccaagattgacaaattgg 6651088  T
Q  763 aagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattgg 862  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  ||  |||||||  || | |||| ||||||||||||||| ||||| ||| | || | || || ||||||    
T  6651089 aggaggacttggaacagatggaatcattgaaaaccttgattgcggataagactgctataacaaaagtgccgttttcaatagtaagattaagaaacattgg 6651188  T
Q  863 atttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataat 947  Q
    || ||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||||| | || ||  ||||||||||| |||| ||| ||||    
T  6651189 atatatttctctatgtggctttgaaggattttcacgagatgtatttccttttctcgttcggtcttggatgtcaccatcaactaat 6651273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 507 - 931
Target Start/End: Original strand, 6752726 - 6753150
Alignment:
Q  507 aaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaacagttagtactcaaagattgtccaaggt 606  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||  || ||||  | || ||| | |||||| | ||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||| |    
T  6752726 aaaattcttaatcttagtcattctcaggatttgaccgaaactccagacttttcatatatgcctaatcttgaaaagcttgtactcaaagactgtccaagtt 6752825  T
Q  607 tgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatac 706  Q
    |||||   || || ||||| ||||||  |||  | ||  ||||| ||||| |||||| ||| || |  ||||||   || ||||| |||  ||| ||||     
T  6752826 tgtctacagtctcccatagcattggatctctacataatcttcttctgatagatttgacagactgcacgagtcttcagaaacttcctagatgcatatataa 6752925  T
Q  707 gttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgca 806  Q
     || ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||  | ||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |  ||  |||||||     
T  6752926 attaaaatctctagaaactttgattctttctggatgttccatgattgacaaattggaggaggacttggaacagatggaatcattgattaccttgattgcg 6753025  T
Q  807 aatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgt 906  Q
     || | |||| ||||||||||||||||||||| ||| | || |  ||||||||||||| ||||||| |  |||| | ||||||||| ||||||||||| |    
T  6753026 gataagactgctataacaaaagtgcccttttcaatagtaagattgaaaagcattggatatatttcttttcgtggctttgaaggattttcacgtgatgtat 6753125  T
Q  907 ttccttctatcatttcgtcttggat 931  Q
    | |||||| |||||  |||||||||    
T  6753126 tcccttctctcattcggtcttggat 6753150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 549 - 943
Target Start/End: Complemental strand, 6532505 - 6532111
Alignment:
Q  549 ccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaacagttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattc 648  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||  |||| | ||| |||    
T  6532505 ccaaacttttcatatatgcctaatcttgaaaagttagtactcaaagactgtccaagtttgtctgcggtctcccatagcattggatctctccaaaaacttc 6532406  T
Q  649 ttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaa 748  Q
    || |||||||||||| ||| || |   |||||   ||  |||||||||  || ||||  || ||||||||  ||||  | ||||| || |||||||  ||    
T  6532405 ttctgataaatttgacagactgcacaggtcttcaaaaaattccaagaagtatttataaattaaaatctctagaaaccttgattctttcaggatgttccaa 6532306  T
Q  749 gattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgagg 848  Q
    |||| |||| || || |||||| | ||||| |||||||| || || ||  |||||||  || | |||| |||| || |||| |||||||| ||| | ||     
T  6532305 gattaacaaattggaggaggacatagaacagatggaatcgttgacaaccttgattgcggataagactgctatagcagaagtccccttttcaatagtaaga 6532206  T
Q  849 tcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaa 943  Q
     |||||| ||||| || ||||||| | || || | ||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  6532205 ccaaaaaacattgaatatatttctatttgcggctttgaaggattttcaaatgatgtatttccttctatcattcggtcttggatgtcaccatcaaa 6532111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 570 - 931
Target Start/End: Original strand, 6796616 - 6796977
Alignment:
Q  570 aatcttgaacagttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagatt 669  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||| || ||||| ||||||  |||  | ||||||||| | |||||||||| ||| |    
T  6796616 aatcttgaaaagctagtactaaaaaattgtccaagtttgtctacggtctcccatagcattggatctctacataaaattcttctcataaatttgacagact 6796715  T
Q  670 gtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagagga 769  Q
    | ||  ||||| | || |||||||||| ||||||||| || ||||||||  ||||| | ||||| |||||||||   | |||||| || || || |||||    
T  6796716 gcataggtcttcggaaacttccaagaagcatctatacattaaaatctctagaaactttgattctttctggatgtaccatgattgaaaaattggaggagga 6796815  T
Q  770 cttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatt 869  Q
    ||||||||| |||||||| || |  ||| |||||||| || | |||  ||| ||||||||||| ||||| ||| | || |  ||||  ||||||| ||||    
T  6796816 cttggaacagatggaatcattgattactttgattgcagataagacttctatcacaaaagtgccattttcaatagtaagattgaaaaatattggatatatt 6796915  T
Q  870 tctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggat 931  Q
    ||| | ||||| | ||||||||| ||||| || || || |||||| |||||  |||||||||    
T  6796916 tctttttgtggctttgaaggattttcacgcgacgtattcccttctctcattcggtcttggat 6796977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 711 - 947
Target Start/End: Original strand, 6675673 - 6675909
Alignment:
Q  711 aaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatg 810  Q
    ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||||||  | || ||  |||||||| ||     
T  6675673 aaatctctagaaactttgattctttctggatgttccaagattgacaaattggaggaggacgtggaacagatggaatcaatgacaaccttgattgcagata 6675772  T
Q  811 acactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttcc 910  Q
    | || | ||||| |||||| |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| || ||| | ||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||    
T  6675773 aaacagctataataaaagttcccttttcaatagtaagatcaaagagcattggattcatctctttatgtggctttgaaggattttcacttgatgtatttcc 6675872  T
Q  911 ttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataat 947  Q
    |||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||||    
T  6675873 ttctctcattaagtcttggatgtcaccatcaaataat 6675909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 567 - 947
Target Start/End: Original strand, 6728232 - 6728612
Alignment:
Q  567 cctaatcttgaacagttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaag 666  Q
    |||||||||||| || | || |||||| | |||||||| ||||||  ||| || || || ||||||  |||  | ||||||||| |||||||||||| ||    
T  6728232 cctaatcttgaaaagctcgtgctcaaaaactgtccaagtttgtctacggtctcccaaagcattggatctctacaaaaaattcttctgataaatttgagag 6728331  T
Q  667 attgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaaga 766  Q
    | ||     ||||| | || ||||||||||||||||| | ||| ||||||||  ||||| | ||||| || |||||||  | ||||||||| || || ||    
T  6728332 actgcgcaggtcttcggaaacttccaagaaacatctacaagttaaaatctctagaaactttgattctttcaggatgttccatgattgacaaattggagga 6728431  T
Q  767 ggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggattt 866  Q
    |||| ||||||| |||||||| || || ||  |||||||  || | |||| ||||||||||||||| ||||| ||| | || |  ||||| ||||||| |    
T  6728432 ggacgtggaacagatggaatcattgacaaccttgattgcggataagactgctataacaaaagtgccattttcaatagtaagattgaaaagtattggatat 6728531  T
Q  867 atttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataat 947  Q
    |||||| |  |||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||| |  ||| |||||||||||  ||| ||||||||    
T  6728532 atttcttttcgtggctttgaaggattttcacgtgatgtattcccttctcttgtttggtcttggatgtcgccatcaaataat 6728612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 565 - 947
Target Start/End: Original strand, 6815294 - 6815676
Alignment:
Q  565 tgcctaatcttgaacagttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaa 664  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||   || || ||||||||||||  |||  | ||||||||| | ||||||||||     
T  6815294 tgccaaatcttgaaaagctagtactcaaaaattgtccaagtttgtctacagtctcccatagtattggatctctacataaaattcttctcataaatttgac 6815393  T
Q  665 agattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaa 764  Q
    ||| || |   ||||| | || |||||||||| || |||||  || ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||  | |||||| || || ||     
T  6815394 agactgcacaggtcttcggaaacttccaagaagcaactataaattaaaatctctagaaactttgattctttctggatgttccatgattgaaaaattggag 6815493  T
Q  765 gaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggat 864  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  ||  |||||||  || | |||| ||||| ||||||||| |||||  |  | || |  |||||||||||||    
T  6815494 gaggacttggaacagatggaatctttgattaccttgattgctgataagactgctataaaaaaagtgccattttcagtggtaagattgaaaagcattggat 6815593  T
Q  865 ttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataat 947  Q
     ||||||| |  |||| | |||||||||  |||||||||| ||| ||||| || ||   |||||||||| |||| ||||||||    
T  6815594 atatttctttaggtggctttgaaggatttacacgtgatgtattttcttctctcgttcgctcttggatgtcaccatcaaataat 6815676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 646 - 946
Target Start/End: Original strand, 6758629 - 6758929
Alignment:
Q  646 ttcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttt 745  Q
    ||||| |||||||||||| ||| || ||  ||||| | || ||||| |||| |||||| || || ||||||||  ||||| | ||||| || |||||  |    
T  6758629 ttcttctgataaatttgacagactgcataggtcttaggaaacttccgagaagcatctaaacattaaaatctctagaaactttgattctctcaggatgcat 6758728  T
Q  746 aaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactg 845  Q
     ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |  ||  |||||||  || | ||||  |||||  |||| ||| |||| ||| |     
T  6758729 caagattgacaaattggaggaggacttggaacagatggaatcattgattacattgattgcggataagactgcaataacggaagtacccatttcaatatta 6758828  T
Q  846 aggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaata 945  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||| | ||||||| | |||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  6758829 agattaaaaagcattagatttatttctctgtgtggctttgaaggatttgcacgtgatatatttccttttgtcattcggtctaggatgtcaccaacaaata 6758928  T
Q  946 a 946  Q
    |    
T  6758929 a 6758929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 507 - 933
Target Start/End: Original strand, 6837040 - 6837466
Alignment:
Q  507 aaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaacagttagtactcaaagattgtccaaggt 606  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||  || ||||  | || ||| | || ||| | ||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |    
T  6837040 aaaattcttaatcttagtcattctcaggatttgactgaaactccagacttctcatatatgccgaatcttgaaaagctagtactcaaagactgtccaagtt 6837139  T
Q  607 tgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatac 706  Q
    |||||| ||| || ||||| ||||||  |||| | ||| ||||| |||||||||| |   | || |   ||||| | || ||||| |||| |||||||||    
T  6837140 tgtctgcggtctcccatagcattggatctctccataaacttcttctgataaatttaacgaactgcacaggtcttcggaaacttccgagaagcatctatac 6837239  T
Q  707 gttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgca 806  Q
     || ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||  | ||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||||||| | |  ||  ||||||||    
T  6837240 attaaaatctctacaaactttgattctttctggatgttccatgattgacaaattggaggaggatttggtacagatggaatctcttattaccttgattgca 6837339  T
Q  807 aatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgt 906  Q
     || | |||| ||||| |||||| || ||||| ||| | ||    |||| |||||||| ||||||| |  | || | ||||||||| ||||||||||| |    
T  6837340 gataagactgctataaaaaaagttccattttcaatagtaagaatgaaaaacattggatatatttctttaagcggctttgaaggattttcacgtgatgtat 6837439  T
Q  907 ttccttctatcatttcgtcttggatgt 933  Q
    | |||||| |||||   ||||||||||    
T  6837440 tcccttctctcattcgctcttggatgt 6837466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 765 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 6588253 - 6588071
Alignment:
Q  765 gaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggat 864  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |  ||  |||||||  || | ||||  || ||||||||||| ||||| ||| | |||   |||||||||||||    
T  6588253 gaggacttggaacagatggaatcgttgattaccttgattgccgataagactgccatcacaaaagtgccattttcaatagtaaggatgaaaagcattggat 6588154  T
Q  865 ttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataat 947  Q
     ||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||  |||||||||||  ||| ||||||||    
T  6588153 atatttctttttgtggctttgaaggattttcacgtgatgtattcccttctctcattcggtcttggatgtcgccatcaaataat 6588071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 47434737 - 47434690
Alignment:
Q  66 atcttagaatttgggttaagcctaactcaaccttacaaaaacaacttg 113  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  47434737 atcttagaatttgggttgaacctaactcaaccctacaaaaccaacttg 47434690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 888 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 4133348 - 4133290
Alignment:
Q  888 ggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataa 946  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||    
T  4133348 ggatactcacgtgaagtatttccttctatcattcagacttggatgtcaccaacaaataa 4133290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 105
Target Start/End: Original strand, 31965069 - 31965111
Alignment:
Q  63 accatcttagaatttgggttaagcctaactcaaccttacaaaa 105  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  31965069 accatattagaatttgagttgagcctaactcaaccttacaaaa 31965111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 546 - 663
Target Start/End: Original strand, 6715572 - 6715689
Alignment:
Q  546 acaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaacagttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaa 645  Q
    |||||| | |||||| ||||||| ||||||||| || |  ||||| |||| |||||||| ||||||  ||| || ||||| ||||||  |||  | ||||    
T  6715572 acaccagacttttcatacatgccaaatcttgaaaagcttatactcgaagactgtccaagtttgtctacggtctcccatagcattggatctctgcataaaa 6715671  T
Q  646 ttcttttgataaatttga 663  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  6715672 ttcttctgataaatttga 6715689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 611
Target Start/End: Original strand, 6772861 - 6772974
Alignment:
Q  498 gagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaacagttagtactcaaagatt 597  Q
    ||||| || |||||| |||| ||||||||||| ||| || ||||  | || ||| | |||||| || |||| ||||||||| || ||||||||||  |||    
T  6772861 gagaatctaaaaattcttaatcttagtcattcccatgatttgaccgaaaccccagacttttcatacttgccgaatcttgaaaagctagtactcaagaatt 6772960  T
Q  598 gtccaaggttgtct 611  Q
    ||||||| ||||||    
T  6772961 gtccaagtttgtct 6772974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 104
Target Start/End: Original strand, 49190174 - 49190215
Alignment:
Q  63 accatcttagaatttgggttaagcctaactcaaccttacaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  49190174 accatcttagaatttgggttgagccaaactcaatcttacaaa 49190215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 257; Significance: 1e-142; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 478 - 942
Target Start/End: Complemental strand, 5690503 - 5690039
Alignment:
Q  478 ttatgttcttgtagaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttga 577  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||| |||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  5690503 ttatattcttgtagatgatggagaagcttaaaattctcaatcttagtcactctcattatctgacacagaccccagacttttcaatcatgcctaatcttga 5690404  T
Q  578 acagttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagt 677  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||     
T  5690403 aaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagattgtattagc 5690304  T
Q  678 ctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaac 777  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5690303 ctttctaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattaacaagttggaagaggacttggaac 5690204  T
Q  778 aaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtg 877  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  5690203 aaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttcaattgtaaggtcaaaaagcattgggtatatttctctgtg 5690104  T
Q  878 tggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaa 942  Q
     ||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5690103 cggacatgaaggattctcacgtgatatatttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaa 5690039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 490 - 950
Target Start/End: Complemental strand, 5074240 - 5073780
Alignment:
Q  490 agaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaacagttagtact 589  Q
    ||||| ||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  5074240 agaggttggagaagctgaaaatactcaatcttagtcattctcattatctgacgcaaactccagatttttcaaacttgcctaatcttgaacaactagtact 5074141  T
Q  590 caaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaacctt 689  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||   | ||||    
T  5074140 cacagattgtccaaggttgtcagaggtttctcatagtattgaacatctcaataaaattcttctgataaatttggaagattgtattggtcttcagagcctt 5074041  T
Q  690 ccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctt 789  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || || |||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||    
T  5074040 ccaagaagtatctataagttgaaatctctaaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattgacaagttggaagaggacttagaacagatgacatctt 5073941  T
Q  790 taaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaagg 889  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||  || | ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  5073940 taaccactctgatagcaaataacaccgcaataacaagagtgcccttttcagtagtaaggtcgaaaagcattggatatatttctttgtgcggctatgaagg 5073841  T
Q  890 attctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataatctc 950  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5073840 attctcacgtgatgtgttcccatcgatcatttggtcttggatgtcaccgacaaataatctc 5073780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 481 - 942
Target Start/End: Original strand, 5176479 - 5176940
Alignment:
Q  481 tgttcttgtagaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaaca 580  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  5176479 tgttcttgcagaggatggagaagctgaaaattcttaatcttagtcattctcattatctgacagagaccccagacttttcaaacatgcctaatcttgaaaa 5176578  T
Q  581 gttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctt 680  Q
    | |  |||||| |||||| |||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| |||||||||| || |||    
T  5176579 gcttatactcatagattgcccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgataaaattcttctgataaacttggaagattgtattagcctt 5176678  T
Q  681 tgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaa 780  Q
       |  ||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5176679 cagagtcttccaagaagtatctataagttgaaatctttgaaaacactcattctttctgggtgttcgatgattgacaagttggaagaggacttggaacaaa 5176778  T
Q  781 tggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtgg 880  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||  || ||| |||| ||    
T  5176779 tggaatctttaactactctgcttgcaaataacactgcaataacaagagtgcccttgtcaatagtaaggtcaaaaagcattggatacatctctttgtgcgg 5176878  T
Q  881 atatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaa 942  Q
     ||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5176879 ctatgaaggattctcacgtgatatatttccatcaatcatttggtcttggatgtcaccaacaa 5176940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 481 - 942
Target Start/End: Original strand, 5278306 - 5278767
Alignment:
Q  481 tgttcttgtagaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaaca 580  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  5278306 tgttcttgcagaggatggagaagctgaaaattcttaatcttagtcattctcattatctgacagagaccccagacttttcaaacatgcctaatcttgaaaa 5278405  T
Q  581 gttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctt 680  Q
    | |  |||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||| |||||||||| || |||    
T  5278406 gcttatactcatagattgcccaaggttgtgtgaggtttctcatagcattggatatctcgataaaattcttctgataaacttggaagattgtattagcctt 5278505  T
Q  681 tgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaa 780  Q
       |  ||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5278506 cagagtcttccaagaagtatctataagttgaaatctttgaaaacactcattctttctgggtgttcgatgattgacaagttggaagaggacttggaacaaa 5278605  T
Q  781 tggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtgg 880  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||  || ||| |||| ||    
T  5278606 tggaatctttaactactctgcttgcaaataacactgcaataacaagagtgcccttgtctatagtaaggtcaaaaagcattggatacatctctttgtgcgg 5278705  T
Q  881 atatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaa 942  Q
     ||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5278706 ctatgaaggattctcacgtgatatatttccatcaatcatttggtcttggatgtcaccaacaa 5278767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 481 - 953
Target Start/End: Complemental strand, 5182268 - 5181796
Alignment:
Q  481 tgttcttgtagaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaaca 580  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||| || |||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5182268 tgttcttgcagaggctggagaagctgaaaattctcaatcttagtcattctcattttctgtcaaagactccagacttttcaaacttgcctaaccttgaaca 5182169  T
Q  581 gttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctt 680  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| || || |||    
T  5182168 gttagtactcacagattgtccgaagttgtctgaagtttcccaaagtattggagatctcaataaaatacttttgataaatttggaagattgcattagcctt 5182069  T
Q  681 tgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaa 780  Q
       | ||||||||||| ||||||||  ||||||||  | || ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  5182068 caaagccttccaagaagcatctataatttgaaatcattaaacactctcattctttctgggtgtttaatgattgacaagttggaagaggatttggaacaaa 5181969  T
Q  781 tggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtgg 880  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||||  || | | ||| |||||||||| || ||||||  |||||||    
T  5181968 tgaaatctttaaccacattgattgcaaataacactgcaataacaagagtgccgttttcagtagtaaagtccaaaagcattgcatatatttccttgtgtgg 5181869  T
Q  881 atatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataatctccca 953  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5181868 atatgaaggattctcacatgatgtgtttccagcgatcatttggtcttggatgtcaccgacaaataatctccca 5181796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 480 - 955
Target Start/End: Complemental strand, 5128759 - 5128284
Alignment:
Q  480 atgttcttgtagaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaac 579  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | || | |||||||||||||| ||||||||| || ||| | |||||| |  | ||||||||||||     
T  5128759 atgttcttgcagatgatggagaagctgaaaattctcaatcatagtcattctcattgtctgacacacaccccagacttttcatatttacctaatcttgaaa 5128660  T
Q  580 agttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtct 679  Q
    || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||   ||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| || || ||    
T  5128659 agctagtactcaaagattgttcaatgttgtctgaggtttctactagcatcggacatctcaataaaattcttctgataaatttggaagattgcattagcct 5128560  T
Q  680 ttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaa 779  Q
     |||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5128559 atgtagcctcccaagaagcatctataagttgaaatctttgaaaactctcattctttctggttgtataatgattgacaagttggaagaggacttggaacaa 5128460  T
Q  780 atggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtg 879  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||  |||| || ||| ||||||||  || | ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  5128459 atggaatcattaacaactctgcttgcaaataacactgcaataaaaagagtacccttttcagtagtaaggtcaaaaagcattggatatatctctctgtgcg 5128360  T
Q  880 gatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataatctcccacc 955  Q
    |  |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5128359 gccatgaaggattttcaagtgatgtgtttccatctatcatctggtcttggatgtcaccaacaaatgatctcccacc 5128284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 481 - 949
Target Start/End: Original strand, 5433775 - 5434243
Alignment:
Q  481 tgttcttgtagaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaaca 580  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||  |||||||||||||| |    
T  5433775 tgttcttgcagagaatggagaagctgaaaattcttaaccttagtcattgtcattatctgacacaaacaccagacttttcaaatttgcctaatcttgaaaa 5433874  T
Q  581 gttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctt 680  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  | |||||| |||| | ||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||     
T  5433875 gttagtactcacagattgtccaagtctttctgagatttctcctagcattggccatctcaatgaaattcttctgataaatttggaagattgtattggccta 5433974  T
Q  681 tgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaa 780  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  5433975 tgtaacctcccaagaagcatatataagttgaaatctttgaaaactctcatccttactggctgtttaaagattgacaatttggaagatgacttggaacata 5434074  T
Q  781 tggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtgg 880  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||| || ||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||| ||    
T  5434075 tggaatctttaaccactctgcttgcaaataacactgcaataaaaagagtgcctctttcagtactgagatcaaaaagcattggatatatctctttgtgcgg 5434174  T
Q  881 atatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataatct 949  Q
     ||||||||||||||||  ||| | ||||| | |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5434175 ttatgaaggattctcacacgatttatttccatttatcattcagtcttggatgtcaccaacaaataatct 5434243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 478 - 942
Target Start/End: Original strand, 5344598 - 5345062
Alignment:
Q  478 ttatgttcttgtagaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttga 577  Q
    ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||| ||| || ||  | |||||  || | |||||||||||    
T  5344598 ttatgttcttacagatgatggagaagctgaaaattctcaatcttagtcattctcattacctgatacaaaccccggacttttcttacttacctaatcttga 5344697  T
Q  578 acagttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagt 677  Q
    | |||||||||||   ||||||||||| |||| |||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||| ||     
T  5344698 aaagttagtactcgtggattgtccaagtttgtgtgagatttctcatagcattggagatctcaagaaaattcttctcattaatttggaagactgtattagc 5344797  T
Q  678 ctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaac 777  Q
    || |||| ||| ||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5344798 ctatgtagcctgccaagaagcatctataagttgaattctctaaaaactctcattctttcgggttgtttaaagattgacaagttggaagaggacttagaac 5344897  T
Q  778 aaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtg 877  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||  ||||||||||| |||||||   || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5344898 aaatgaaatctttaaccattctgatcgcaaataacactgcaataacaaaagttccctttttagtagtaaggtcaaaaagcattggatatatttctctgtg 5344997  T
Q  878 tggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaa 942  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  5344998 tggctatgaaggattctcacgcgatgtatttccatctatcatctggtcttggatgtcaccaacaa 5345062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 479 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 5354957 - 5354485
Alignment:
Q  479 tatgttcttgtagaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaa 578  Q
    |||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| | || ||||||||||| |||| ||||||||| || ||  | |||||  |||||||||||||||||    
T  5354957 tatgttcttgcagagaatggagcatctgaaaattctcaatcttagtcattcacattgtctgacacatacccctgacttttcttacatgcctaatcttgaa 5354858  T
Q  579 cagttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtc 678  Q
     || | ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |  || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || || |  |    
T  5354857 aagcttgtactcaaagattgtccaatgttatctgaagtttctccaagcattggacatctcaataaaattcttctgataaatttcaaagactgcattaacc 5354758  T
Q  679 tttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaaca 778  Q
    ||| || ||| ||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  |||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  5354757 tttctagcctcccaagaagcatctacaagttgaaatctttgaaaactctcattctttctggttgtaaaaagttagacaagttggaagaggacttggaaca 5354658  T
Q  779 aatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgt 878  Q
    | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||| ||| ||||| || ||| | || || ||||||||||||| ||||||| | |||    
T  5354657 attggaatctttaaccaccctgcttgcaaatgacactgcaataacaagagtacccttctcaatagttagttccaaaagcattggatatatttctttatgt 5354558  T
Q  879 ggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataatctcc 951  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5354557 ggctatgaaggattctcacgtgatgtgtttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaaataatctcc 5354485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 481 - 950
Target Start/End: Original strand, 5096448 - 5096917
Alignment:
Q  481 tgttcttgtagaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaaca 580  Q
    |||||||| ||||| |||| || ||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||  |    
T  5096448 tgttcttgcagaggatggaaaaactgaaaattctaaatcttagtcattctcattgtctgacacacaccccagacttttcatacatgcctaatcttgagaa 5096547  T
Q  581 gttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctt 680  Q
    | | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||   |||||||| | ||| ||||| |||||||| | || |||    
T  5096548 gctggtacttaaagattgtccaatgttgtctgaggtttctcctagcattggaaatctcagtgaaattcttctaatagatttggaagattgtgttagcctt 5096647  T
Q  681 tgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaa 780  Q
     ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||| | |||||||    
T  5096648 cgtagccttccaggaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttctgggtgtataatgattgacgagttggaagaggacatagaacaaa 5096747  T
Q  781 tggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtgg 880  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||  || | |||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  5096748 tggaatcattaaccattctgcttgcaaataacactggaataaaaagagtacccttttcagtagtaaggtcaaaaagcattggatacatttctctatgtgg 5096847  T
Q  881 atatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataatctc 950  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5096848 ccatgaaggattttcacgtgatgtgtttccgtctatcatctggtcttggttgtcaccaacaaataatctc 5096917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 481 - 947
Target Start/End: Original strand, 5447327 - 5447793
Alignment:
Q  481 tgttcttgtagaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaaca 580  Q
    |||||||| ||||| |||| || ||||||| | | || |||||||||||||||  ||||||| | |  ||  | ||||||  | |||||||||||||| |    
T  5447327 tgttcttgcagaggatggaaaatctgaaaaatctcaatcttagtcattctcatcgtctgacaaacatcccggacttttcatgcttgcctaatcttgaaaa 5447426  T
Q  581 gttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctt 680  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||     
T  5447427 gctagtactcaaagattgtccaatgttgtctgaggtttctcctagcattggacatctcaataaaattcttctgataaatttggaagattgtattggccta 5447526  T
Q  681 tgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaa 780  Q
     ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  5447527 ggtaacctcccaagaagcatctataagttgaaatctttgaaaactctcattctttctggttgtttaaagattgacaagctggaagaggacttggaacaga 5447626  T
Q  781 tggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtgg 880  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||   ||||||| ||||||||||||  || | ||||| || |||||||||| ||||||| |||| ||    
T  5447627 tggaatctttaaccactctgcttgcaaataatacttcaataacaacagtgcccttttcggtagttaggtcgaagagcattggatatatttctttgtgcgg 5447726  T
Q  881 atatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataat 947  Q
    || |||||||| ||| | |||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||| |||||||    
T  5447727 atttgaaggatcctcgcatgatgtgtttccatctattattcggtcttggatgtcaccaagaaataat 5447793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 481 - 953
Target Start/End: Complemental strand, 5067035 - 5066563
Alignment:
Q  481 tgttcttgtagaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaaca 580  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||| |||||  || || ||  | |||||| | ||||||||||||||| |    
T  5067035 tgttcttgcagaggatggaaaagctgaaaattctaaatcttagccattctcattgtctgatgcacacccctgacttttcatatatgcctaatcttgaaaa 5066936  T
Q  581 gttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctt 680  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||  || ||| | ||||   |||||||| | ||| ||||| |||||||| | || |||    
T  5066935 gctagtactcaaagattgtccaatattgtccgaggtttctcctacaataggaaaactcagtgaaattcttctaatagatttggaagattgtgttagcctt 5066836  T
Q  681 tgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaa 780  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5066835 cgtaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctcttaaaactctcattctttctgggtgtataatgattgacaagttagaagaggacatagaacaaa 5066736  T
Q  781 tggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtgg 880  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || | ||||  |||| || | | ||||||||  || | |||||||||||||||||||  || ||| |||| ||    
T  5066735 tggaatctttaaccactctgcttgcacataaaactgcaataaaaagaatacccttttcagtagtaaggtcaaaaagcattggatacatctctttgtgcgg 5066636  T
Q  881 atatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataatctccca 953  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5066635 ctatgaaggattctcgcgtgatgtgtttccatctatcattttgtcttggatgtcaccaacaaataatctccca 5066563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 459 - 953
Target Start/End: Original strand, 5383043 - 5383538
Alignment:
Q  459 ctaaattttgtttataatatt-atgttcttgtagaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttt 557  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  | |||||||||||||||||||| |||   ||||| ||| | ||     
T  5383043 ctaaattctctttataatatttatgttcttgcagaggatggagatactgaaaatcctaaaccttagtcattctcattacctggtgcagaccccagacttc 5383142  T
Q  558 tcaaacatgcctaatcttgaacagttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataa 657  Q
    |||||  |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  5383143 tcaaatttgcctaatcttgaaaagctagtactcgcagattgtccgaggttgtccgaggtttctcctagcattggagatctcaagaaaattcttctgatta 5383242  T
Q  658 atttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaa 757  Q
    ||||| |||| ||| | || || |||| ||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||    
T  5383243 atttggaagactgtgttagcctatgtagcctcccaagaagcatttataagttgaaatctctgaaaactctcattctttctggttgtttaaagattaccaa 5383342  T
Q  758 gttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagc 857  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||||  ||||||| ||| ||| |||| ||  | |||||||||||     
T  5383343 gttggaagaggacatagaacaaatggaatctttaactactttgcttgcagataacactgcaataacaagagttcccctttcaattttaaggtcaaaaagt 5383442  T
Q  858 attggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataatctccca 953  Q
    |||| || ||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  5383443 attgtatatatttctttgtgcggccatgaaggattctcacgtgatgtgtttccatccatcattaagtcttggatgtcctcaacaaataatctccca 5383538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 481 - 955
Target Start/End: Complemental strand, 5102955 - 5102481
Alignment:
Q  481 tgttcttgtagaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaaca 580  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||| || || ||  | |||||| || |||||||||||||  |    
T  5102955 tgttcttgcagaggttggaaaagctgaaaattctaaatcttagtcattctcattgtctgacgcacacccctgacttttcatacttgcctaatcttgagaa 5102856  T
Q  581 gttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctt 680  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||  |||||| ||||||   |||| ||| | ||| ||||| |||||||| | || |||    
T  5102855 gctggtactcaaagattgtccaatgttgtctgaggtttgtcctaccattggagatctcactgaaatacttctaatagatttggaagattgtgttagcctt 5102756  T
Q  681 tgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaa 780  Q
     ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5102755 cgtagccttccaagaagcatctataagttgaaatctttgaaaatactcattctttctgggtgtttaatgattgacaagttggaagacgacttggaacaaa 5102656  T
Q  781 tggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtgg 880  Q
    ||||||| |||||||||||  | |||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  5102655 tggaatcattaaccactcttctagcaaacaacactgcaataacaacagtgcccttttcagtagtaaggtcaaaaagcattggatatatctctctatgtgg 5102556  T
Q  881 atatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataatctcccacc 955  Q
     ||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5102555 ctatgaaggactttcacatgatgtgtttccatctatcatctggtcttggatgtcaccaacaaataatcttccacc 5102481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 456 - 953
Target Start/End: Original strand, 5396664 - 5397162
Alignment:
Q  456 tccctaaattttgtttataatatt-atgttcttgtagaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaat 554  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |     
T  5396664 tccctaagttttctttataatatttatgttcttgcagaggctggagaagctgaaaattctcaatcttagtcattctcattatttgacacagaccccagac 5396763  T
Q  555 ttttcaaacatgcctaatcttgaacagttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttga 654  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||||| |||||| || ||||| |||| ||||||| |||| || ||||| ||| | |    
T  5396764 ttttcaaacatgcctaatcttgaacaactagtagtcactgattgtccaaagttgtcagaagtttcccataatattggagatctgaaaaaaatacttctaa 5396863  T
Q  655 taaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattga 754  Q
    |||||||| |  ||||||| |  |||   | |||||||||||  || |||| ||||||||| ||  |||||||  |||| ||||| ||||||  ||||||    
T  5396864 taaatttggagaattgtattaagcttcaaagccttccaagaagtatttataagttgaaatcactacaaactcttcttctttctgggtgtttactgattga 5396963  T
Q  755 caagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaa 854  Q
    ||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||  || |||||||| ||||||  |||| || |||||| ||||| ||  | |||| ||||    
T  5396964 caaattggaagaagatttggaacagatggaatctttaaccaccttggttgcaaataacactgcaataaaaagagtgccgttttcaattttaaggttaaaa 5397063  T
Q  855 agcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataatctccca 953  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  5397064 agcattggatttatctctttgtgcggatatgaaggattttcatgtgaagtgtttccagctatcatttcgtcttggatgtcaccaacaattaacctccca 5397162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 481 - 953
Target Start/End: Complemental strand, 5157969 - 5157497
Alignment:
Q  481 tgttcttgtagaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaaca 580  Q
    |||||||| ||| | |||| ||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||| || || ||| | |||||| ||||||||||||||||  |    
T  5157969 tgttcttgcagatgatggaaaagctaaaaattctaaatcttagtcattctcattgtctgacgcacaccccagacttttcatacatgcctaatcttgagaa 5157870  T
Q  581 gttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctt 680  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||   |||||||| | ||| ||||| |||||||| | || |||    
T  5157869 gctggtactcaaagattgtccaatgttgtctgaggtttctcctagcattggaaatctcagtgaaattcttctaatagatttggaagattgtgttagcctt 5157770  T
Q  681 tgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaa 780  Q
     | | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | | ||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||||| |    
T  5157769 cgaagccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaattttaattctttcagggtgtataatgattgacaagttggaagaggacatagaacaga 5157670  T
Q  781 tggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtgg 880  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||  |||| || ||| ||||||||  || | |||||||||||||||||||  || ||| || | ||    
T  5157669 tggaatctttaaccactctgcttgcacacgacactgcaataaaaagagtacccttttcagtagtaaggtcaaaaagcattggatacatctctttgggcgg 5157570  T
Q  881 atatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataatctccca 953  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5157569 ctatgaaggattttctcgtgatgtgtttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaaataatctccca 5157497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 496 - 953
Target Start/End: Original strand, 5425665 - 5426122
Alignment:
Q  496 tggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaacagttagtactcaaaga 595  Q
    |||| |||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||| |  || ||  | ||| ||  |||||||||||||||| || | || ||||||||    
T  5425665 tggaaaagctgaaaattctaaatcttagtcattctcattgtctgacgcgcacccctgactttacattcatgcctaatcttgaaaagctggtgctcaaaga 5425764  T
Q  596 ttgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaaga 695  Q
    |||||||| |||||||||| |||| | ||| |||||| ||||||   |||||||| | ||||||||  |||||||| |  | |||   | ||||||||||    
T  5425765 ttgtccaatgttgtctgagatttctcctagcattggaaatctcagagaaattcttctaataaatttagaagattgtgttcgccttcaaagccttccaaga 5425864  T
Q  696 aacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaacca 795  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5425865 aacatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttctgggtgtgtaatgattgacaagttggaagaggacatagaacaaatggaatctttaacca 5425964  T
Q  796 ctctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctc 895  Q
    ||||||||||| || | ||||  |||| || ||| ||||||||  |  | | |||| ||||||||||||  || ||| |||| || ||||||||||| ||    
T  5425965 ctctgattgcacataaaactgcaataaaaagagtacccttttcagtggtaatgtcacaaagcattggatacatctctttgtgcggctatgaaggattttc 5426064  T
Q  896 acgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataatctccca 953  Q
    |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5426065 acgtgatgtgtttccagcgatcatttggtcttggatgtcaccaacaaataatctccca 5426122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 478 - 953
Target Start/End: Complemental strand, 5284733 - 5284258
Alignment:
Q  478 ttatgttcttgtagaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttga 577  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||  |  ||  | ||||| |||||||||||||||||    
T  5284733 ttatgttcttgcagaggatggagaagctgaaaattctcaatcttagtcattcccattatctcacacgaagccctgacttttcgaacatgcctaatcttga 5284634  T
Q  578 acagttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagt 677  Q
    | || |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||  ||| |||||| ||     
T  5284633 aaagctagtgctcaaagattgtccaaggctatctgaggtttcacctagcattggaaatctcaataaaattgctttgataaattttgaaggttgtattagc 5284534  T
Q  678 ctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaac 777  Q
     | |||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| | ||| |||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5284533 ttatgtagcctcccacgaagcatctataagttgaaatctctaaaaactttcattctttttgggtgttcaatgattgacaagttggaagaggacttagaac 5284434  T
Q  778 aaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtg 877  Q
    | |||  |||||||||||||||||| || ||| |||| |  ||||||| ||||||||||||  || | ||||| ||||||||||||| |||| || ||||    
T  5284433 agatgacatctttaaccactctgatagctaataacaccgcaataacaagagtgcccttttcagtagtaaggtcgaaaagcattggatatattgctttgtg 5284334  T
Q  878 tggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataatctccca 953  Q
     || ||||| ||| | ||| | ||||||||||| |  || |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  5284333 cggttatgagggactttcaagcgatgtgtttccattaataattttgtcatggatgtcagcaacaaataatctccca 5284258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 481 - 955
Target Start/End: Original strand, 5370311 - 5370785
Alignment:
Q  481 tgttcttgtagaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaaca 580  Q
    |||||||| ||| | |||| ||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||| || || ||| | |||||| || ||||||| |||||| |    
T  5370311 tgttcttgcagatgatggaaaagctaaaaattctaaatcttagtcattctcattgtctgacgcacaccccagacttttcatacttgcctaagcttgaaaa 5370410  T
Q  581 gttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctt 680  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| | ||| |||||  |||||    |||||||| | ||| ||||  |||||||| | || |||    
T  5370411 gttagtactcaaagattgttcaatgctgtctgaggtttctcctagcattgggaatctcggcgaaattcttctaatagattttgaagattgtgttagcctt 5370510  T
Q  681 tgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaa 780  Q
     ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||| |||||| ||||| ||||||||  | ||||| |    
T  5370511 cgtaaccttccaagaagcatttataagttgaaatctctaaagactcttattctttcagggtgtgtaatgattgagaagttggaagaggatatagaacaga 5370610  T
Q  781 tggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtgg 880  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||| ||  || ||||||||  || |  ||||||||||||||||||  |||||  |||||||    
T  5370611 tggaatcattaaccactctgcttgcaaataacactgcaataaaaagggtacccttttcagtagtacggtcaaaaagcattggatacatttcattgtgtgg 5370710  T
Q  881 atatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataatctcccacc 955  Q
      ||| |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5370711 ccatgtaggattttcacatgatgtttttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaaattatctcccacc 5370785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 496 - 953
Target Start/End: Original strand, 5350151 - 5350600
Alignment:
Q  496 tggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaacagttagtactcaaaga 595  Q
    |||| |||||||||||| | || ||||||||||||  || |||||||||  ||||  | |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  5350151 tggaaaagctgaaaattctaaatcttagtcattcttgttgtctgacaca--cacccgacttttcatacatgcctaatcttgaaaagctagtactcaaaga 5350248  T
Q  596 ttgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaaga 695  Q
    |||||||| |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||   |||||||| | ||| ||||| | |||||| | || |||   | ||||||||||    
T  5350249 ttgtccaatgttgtccgaggtttctcctagcattggagatctcagtgaaattcttctaatagatttggaggattgtgttagccttcaaagccttccaaga 5350348  T
Q  696 aacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaacca 795  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5350349 agcatctttaagttgaaatctctcaaaactctcattctttcagggtgtataatgattgacaagttggaagaggacatagaacaaatggaatctttaacca 5350448  T
Q  796 ctctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctc 895  Q
    ||||| ||||| || | ||||  |||| || | | ||||||||  || | |||||||||||||||||||  || ||| |||| || ||||||||||| ||    
T  5350449 ctctgcttgcacataaaactgcaataaaaagaatacccttttcagtagtaaggtcaaaaagcattggatacatctctttgtgcggctatgaaggattttc 5350548  T
Q  896 acgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataatctccca 953  Q
    ||||||||||||      |||||||   |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5350549 acgtgatgtgtt------tatcattcattcttggatgtcaccaacaaataatcaccca 5350600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 478 - 832
Target Start/End: Complemental strand, 5257678 - 5257324
Alignment:
Q  478 ttatgttcttgtagaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttga 577  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||| | || ||| |||   |  ||  | ||||| |||||||||||||||||    
T  5257678 ttatgttcttgcagaggatggagaagctgaaaattctcaatcttagtcattcccgttgtctcacaagaagccctgacttttccaacatgcctaatcttga 5257579  T
Q  578 acagttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagt 677  Q
    | |||||||||||||||||||||||| | | |||  ||||||    || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||     
T  5257578 aaagttagtactcaaagattgtccaatgctatctagggtttcttcaagcattggaaatctcaagaaaattgttttgataaatttggaagattgtattagc 5257479  T
Q  678 ctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaac 777  Q
     | ||  | || ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5257478 ttatgcgaactcccaagaagcatctataagttgaaatctctaaaaactttcattctttctgggtgttcaatgattgacaagttggaagaggacttagaac 5257379  T
Q  778 aaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcc 832  Q
    | |||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||| ||||||    
T  5257378 agatgacatctttaaccactctaattgcaaataacactgcaataacaagagtgcc 5257324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 481 - 815
Target Start/End: Original strand, 5446897 - 5447231
Alignment:
Q  481 tgttcttgtagaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaaca 580  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||| | || ||||| ||||| || ||||| ||||| |  ||  | |||||||||| |||||||||| || |    
T  5446897 tgttcttgcagaggatggagaagctaaaaattctcaatcttagccattcgcactatctcacacaaagccctgacttttcaaacacgcctaatcttcaaaa 5446996  T
Q  581 gttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctt 680  Q
      |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| || || || ||     
T  5446997 actagtactcaaagattgcccactgttgtctgaggtttcacctagcatcagacatctcaataaaattcttctgataaacttggaagactgcattagccta 5447096  T
Q  681 tgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaa 780  Q
    |||| ||| |||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||  |||    
T  5447097 tgtagcctcccaaaaagcatctataagttgaaatctttgaaaactctcgttctttctggttgtttaaagattgacaaggtggaagaggacttcgagaaaa 5447196  T
Q  781 tggaatctttaaccactctgattgcaaatgacact 815  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  5447197 tggaatctttaaccactcttcttgcaaataacact 5447231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 452 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 5147266 - 5147046
Alignment:
Q  452 ttcttccctaaattttgtttataatattatgttcttgtagaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacacca 551  Q
    ||||||||||| |||| | |||||   |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | || |||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  5147266 ttcttccctaatttttctatataaatctatgttcttgcagaggatggagaagctaaaaattctcaagcttagtcactctcattatttgacacagacccca 5147167  T
Q  552 aatttttcaaacatgcctaatcttgaacagttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttt 651  Q
    || |||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  5147166 aactttttaaacttgcctaatcttgaacaactagtactctctgattgtccaatgttgtctgaagtttctcatagtattggatatctcaataaaattcttc 5147067  T
Q  652 tgataaatttgaaagattgta 672  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  5147066 tgataaatttggaagattgta 5147046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 481 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 5244208 - 5243910
Alignment:
Q  481 tgttcttgtagaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaaca 580  Q
    ||||||||| || | |||| ||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||| || || ||| | |||||| ||||| | ||||||||| |    
T  5244208 tgttcttgtggatgatggaaaagctaaaaattctaaatcttagtcattctcattgtctgacgcacaccccagacttttcatacatgtcaaatcttgaaaa 5244109  T
Q  581 gttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctt 680  Q
    | ||||||||||||||||| ||  |||||| ||| |||| | ||| |||||  ||||||   |||||||| | ||| ||||| |||||||| | || |||    
T  5244108 gctagtactcaaagattgttcagtgttgtccgagatttctcctagcattgggaatctcagtgaaattcttctaatagatttggaagattgtgttagcctt 5244009  T
Q  681 tgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaa 779  Q
     | | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || || ||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5244008 cgaagccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactttcattctctcagggtgtataatgattgagaagttggaagaggacttggaacaa 5243910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 721 - 931
Target Start/End: Original strand, 5281280 - 5281490
Alignment:
Q  721 aaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtat 820  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||  ||    
T  5281280 aaactctgattctttctgggtgttcaatgattaacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatccttaacgaccctgattgctaatgacactgcaat 5281379  T
Q  821 aacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatt 920  Q
    ||||| ||| |||||| |  ||   ||||  |||| |||||||| ||||||| | || || ||| |||||||||||||||||||  |||| | |||||||    
T  5281380 aacaagagttccctttgcagtaggaaggttgaaaaacattggatatatttctttctgcggctataaaggattctcacgtgatgtagttccatatatcatt 5281479  T
Q  921 tcgtcttggat 931  Q
      |||||||||    
T  5281480 cggtcttggat 5281490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 721 - 931
Target Start/End: Original strand, 5179521 - 5179731
Alignment:
Q  721 aaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtat 820  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||  ||    
T  5179521 aaactctgattctttctgggtgttcaaagattaacaagttggaagaggacttggaagaaatggaatccttaacgaccctgattgctaatgacactgcaat 5179620  T
Q  821 aacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatt 920  Q
    ||| | ||| |||||| |  ||   ||||  |||| |||||||| ||||||| | || || ||| |||||||||||||||||||  |||| | |||||||    
T  5179621 aactagagttccctttgcagtaggaaggttgaaaaacattggatatatttctttctgcggctataaaggattctcacgtgatgtagttccatatatcatt 5179720  T
Q  921 tcgtcttggat 931  Q
      |||||||||    
T  5179721 cggtcttggat 5179731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 821 - 942
Target Start/End: Complemental strand, 5243914 - 5243793
Alignment:
Q  821 aacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatt 920  Q
    ||||| ||||||||||||  || | |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  5243914 aacaagagtgcccttttcagtagtaaggtcaaaaagcatcggatatatttctttgtgtggctatgaaggattttcacgcgatgtatttccatctatcatc 5243815  T
Q  921 tcgtcttggatgttaccaacaa 942  Q
    | ||||||||||| ||||||||    
T  5243814 tggtcttggatgtcaccaacaa 5243793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 2115357 - 2115308
Alignment:
Q  63 accatcttagaatttgggttaagcctaactcaaccttacaaaaacaactt 112  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  2115357 accatcttagaattttggttgagcctaactcaaccctacaacaccaactt 2115308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 5)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 396 - 944
Target Start/End: Complemental strand, 36214255 - 36213707
Alignment:
Q  396 tttccactctcaaggttattgataccctctaatatctttcatttattgttttaaggttcttccctaaattttgtttataatatta-tgttcttgtagagg 494  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||  | |||| |||| |||||||| ||||| | |||||| |||| |||| ||||||| |||  |||||||| |||||    
T  36214255 tttccattctcaaggttactgatacattgtaatttcttccatttatt-ttttatgtttcttctctaagttttctttataacatttctgttcttgcagagg 36214157  T
Q  495 ctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaacagttagtactcaaag 594  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| ||    
T  36214156 ctggaaaagctgaaaattctcaatcttagtcattctcattatctgacaaagactccagatttttcaaacatgcctaaccttgaaaaactagtactcacag 36214057  T
Q  595 attgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaag 694  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||||| || |||   | |||||| |     
T  36214056 attgtccaagattgtctgaggtttcccacagtattggacatctcaataaagttcttctaataaatttggaagattgtattagccttcaaagccttcctaa 36213957  T
Q  695 aaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaacc 794  Q
    |   ||||||| ||| ||||  || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  36213956 aggtatctataagttaaaattacttaaaactctcattctttctggatgttcaaagattgacaaattggaagaggacatggaacagatggaatctttaacc 36213857  T
Q  795 actctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattct 894  Q
    ||  ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||||  || | || || |||||||| |  | ||| ||| |||| || |||||||||||||    
T  36213856 accttgattgcaaataacactgcaataacaagagtgccattttcagtagtaagatctaaaagcatcgcttatatatctttgtgcggctatgaaggattct 36213757  T
Q  895 cacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaat 944  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36213756 cacatgatgtgtttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaaat 36213707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 514 - 944
Target Start/End: Original strand, 18935159 - 18935589
Alignment:
Q  514 ttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaacagttagtactcaaagattgtccaaggttgtctga 613  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||| ||| || || || ||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||       
T  18935159 ttaatcttagtcattctcataacctgagacaaaccccgaacttttcaaacttgccgaatcttgaaaagttaatactcaaagattgcccaagtttgtcctc 18935258  T
Q  614 ggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaa 713  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||   | |||||| | |||||||||| ||||||||  ||  |     
T  18935259 ggtttctcatagtataggacttctcaagaaaattcttttaataaatttgaaagactgtacaggcctttgtgaacttccaagaagcatctataaattagag 18935358  T
Q  714 tctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgaca 813  Q
    ||  | ||| |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| |||  |||||| ||||| ||| ||||  || | |    
T  18935359 tcggtcaaagctctcattttatctggatgtacaaaaattgacaagttggaagaggacatagaacagatgacatctttgaccaccctggttgcggataaga 18935458  T
Q  814 ctggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttc 913  Q
    ||| | |||||| |||||||||| |  || | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  18935459 ctgctgtaacaagagtgccctttgcagtagtaagatcaaaaagcattggatttatttcactgtgtggatttgaaggattagcacgtaatgtgtttccttc 18935558  T
Q  914 tatcatttcgtcttggatgttaccaacaaat 944  Q
     || |||  |||||||||||  |||||||||    
T  18935559 aattattcagtcttggatgtctccaacaaat 18935589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 502 - 944
Target Start/End: Complemental strand, 34724906 - 34724464
Alignment:
Q  502 agctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaacagttagtactcaaagattgtcc 601  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||| |  ||| ||| |||||| | |||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34724906 agctgaaatttcttaatcttagtcattctcataacttgaaacaaacaccagacttttcatacttgccaaatcttgaaaagttaatactcaaagattgtcc 34724807  T
Q  602 aaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatc 701  Q
    ||  |||||    ||||| | || ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   | |||||| | |||||||||| ||||    
T  34724806 aaatttgtcctcagtttctcctaatataggaaatctcaagaaaattctattgataaatttgaaagactgtacaggcctttgtgagcttccaagaagcatc 34724707  T
Q  702 tatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctga 801  Q
    ||||  ||||| ||  | |||||||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||   ||||| |||| |||      
T  34724706 tataaattgaagtcagtaaaaactctcattgtgtctggatgtacaaaaattgacaagttggaagaggacatagaacaaatgacttctttgaccattctag 34724607  T
Q  802 ttgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtga 901  Q
    ||||  || | |||  | ||||||  || || ||| |  || | || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  ||||| |    
T  34724606 ttgcggataagacttctgtaacaagggttccatttgcagtagtaagatcaaaaagcattggatttatttcactttgtggatttgaaggatttgcacgtaa 34724507  T
Q  902 tgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaat 944  Q
    |||||| ||||| || |||  |||||||||||  |||||||||    
T  34724506 tgtgttcccttcaattattcagtcttggatgtctccaacaaat 34724464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 105
Target Start/End: Original strand, 21048690 - 21048732
Alignment:
Q  63 accatcttagaatttgggttaagcctaactcaaccttacaaaa 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21048690 accatcttagaatttgggttgagcctaactcaaccttataaaa 21048732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 101
Target Start/End: Original strand, 38963368 - 38963402
Alignment:
Q  67 tcttagaatttgggttaagcctaactcaaccttac 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38963368 tcttagaatttgggttgagcctaactcaaccttac 38963402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 200; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 447 - 953
Target Start/End: Complemental strand, 9276 - 8769
Alignment:
Q  447 taaggttcttccctaaattttgtttataatatt-atgttcttgtagaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacag 545  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||  ||     
T  9276 taagtttcttctctaaattctctttataatatttatggtcttgcagaggctggcgaagctgaaaattctcaatcttagtcattctcattatttgatgcat 9177  T
Q  546 acaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaacagttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaa 645  Q
    || ||| | |||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||  |||||| |||||    |||    
T  9176 accccagacttttcatatttgcctaatcttgaaaagctagtactcaaagattgtccaatgttgaccgaggtttctcataccattggagatctcggtgaaa 9077  T
Q  646 ttcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttt 745  Q
    | ||| | ||| ||||| |||||||| | || ||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  9076 tacttctaatagatttggaagattgtgttagccttcgtagccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttctgggtgtat 8977  T
Q  746 aaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactg 845  Q
    || |||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||   |||||| |||||||||||| ||| |     
T  8976 aatgattgacaagttggaagaggacatagaacagatggaatctttaaccactctgcttgcagataacactgcattaacaagagtgcccttttcaatagta 8877  T
Q  846 aggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaata 945  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||||    
T  8876 aggtcaaaaagtattgtatatatttctttgtgcggccatgaaggattctcacgtgatgtgtttccatctatcattaagtcttggatgtctccaacaaata 8777  T
Q  946 atctccca 953  Q
    ||||||||    
T  8776 atctccca 8769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 182; Significance: 7e-98; HSPs: 7)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 478 - 947
Target Start/End: Original strand, 8877346 - 8877815
Alignment:
Q  478 ttatgttcttgtagaggctggagaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttga 577  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | || ||||| || |||||| |||||||||| || ||| | |||| |||| |||||||||||||    
T  8877346 ttatgttcttgcagaggatggagaagctaaaaattctcaatcttagccactctcatcatctgacacaaactccagactttttaaacttgcctaatcttga 8877445  T
Q  578 acagttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagt 677  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||   ||| |||| |||| ||| |||| ||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  8877446 aaagctagtactcaaagattgtccgaggttgatagagatttcgcatactataggacttctgaataaagttcttttgataaatttggaagattgtattagc 8877545  T
Q  678 ctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaac 777  Q
    ||| | | |||||||||||  || || | |||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||| || |||||||||||| || |||||||| ||||    
T  8877546 cttcggagccttccaagaagtatatacaagttgaaatctctaaaatctctcattctttctgggtgttcaatgattgacaagttggaggaggacttagaac 8877645  T
Q  778 aaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtg 877  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||| || ||| || |||||  || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  8877646 agatgaaatctttaaccactctgcttgcaaataacactgcaataaaaagagtaccattttcattagtaaggtcaaaaagcattggatatatttctttgtg 8877745  T
Q  878 tggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataat 947  Q
     || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  8877746 cggctatgaaggattttcgcgtgatgtgtttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaaataat 8877815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 849 - 940
Target Start/End: Original strand, 20838740 - 20838831
Alignment:
Q  849 tcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaac 940  Q
    |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  20838740 tcaaaaagcattggatatatatcactatgtggatatgaaggattatcacatgatgtttttccttctctcatttggtcttggatgtcaccaac 20838831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 718 - 940
Target Start/End: Original strand, 20812254 - 20812476
Alignment:
Q  718 tgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactgg 817  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||  |    ||||||||||| || ||  |||| ||||||    | |||||    
T  20812254 tgaaaactcttattctttctggttgttcaaagattgagaagttggaagaagatataatgcaaatggaatccttgacagctctaattgcagcaaatactgg 20812353  T
Q  818 tataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatc 917  Q
    ||| | | ||||||||| ||| |||   || ||||||||||||| || ||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  20812354 tatcaaacaagtgccctattcaatagcaagatcaaaaagcattgcatatatatcactatgtggatacgaaggattatcacgtgatgtttttccttctctc 20812453  T
Q  918 atttcgtcttggatgttaccaac 940  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  20812454 atttggtcttggatgtcaccaac 20812476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 852 - 940
Target Start/End: Complemental strand, 12599142 - 12599054
Alignment:
Q  852 aaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaac 940  Q
    ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||    
T  12599142 aaaagcattggatatatatccttgtgtggatatgaaggattatcacgtgatgtttttccttctctcaattggtcttggatgtcaccaac 12599054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 849 - 931
Target Start/End: Original strand, 15803019 - 15803101
Alignment:
Q  849 tcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggat 931  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||    
T  15803019 tcaaaaagcattggatatatatctctatgtggatataaaggattatcacatgatgtttttccttctctcattaggtcttggat 15803101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 813 - 942
Target Start/End: Original strand, 30417892 - 30418021
Alignment:
Q  813 actggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttcctt 912  Q
    |||||||||  |||||  || ||||||||| | || || ||||||||||  | ||| || |||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||    
T  30417892 actggtatagaaaaagcacctttttccatagttagttcgaaaagcattgtttatatatccctgtgtggatttgaaggatttgcacgtgatgtttttcctt 30417991  T
Q  913 ctatcatttcgtcttggatgttaccaacaa 942  Q
     | ||||   ||||||||||| ||||||||    
T  30417992 gtctcatacggtcttggatgtcaccaacaa 30418021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 108
Target Start/End: Original strand, 40267010 - 40267055
Alignment:
Q  63 accatcttagaatttgggttaagcctaactcaaccttacaaaaaca 108  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  40267010 accatcttagaatttgggtttggtctaactcaaccttacaaaaaca 40267055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 159; Significance: 4e-84; HSPs: 8)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 400 - 950
Target Start/End: Complemental strand, 47987275 - 47986744
Alignment:
Q  400 cactctcaaggttattgataccctctaatatctttcatttattgttttaaggttcttccctaaattttgtttataatatt-atgttcttgtagaggctgg 498  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||| ||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  47987275 cactctcaaggttattgatacattctaaaatctttcatttattgttctaagcttcttccttaagttttgtctataaaattcatgttcttgcagaagatgg 47987176  T
Q  499 agaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaacagttagtactcaaagattg 598  Q
    | ||||| |||||| | || |||||||||||||||||||| ||||  |  |   | |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  47987175 aaaagctaaaaattctcaatcttagtcattctcattatctcacacgaagccttgacttttcaaacatgcctaatctcgaaaagctagtactcaaagattg 47987076  T
Q  599 tccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaac 698  Q
     |||| ||| |||||| |||| | ||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || || |||| ||| ||||||| |    
T  47987075 cccaatgttatctgagatttctcctagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagactgtattagcctatgtagcctcccaagaagc 47986976  T
Q  699 atctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactc 798  Q
    |  || |  || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||     
T  47986975 acatacaaattaaaatctctaaaaactctcattctttctggctgtttaaagattaacaagttggaagaggacatggaataaatgaaatctttaactactt 47986876  T
Q  799 tgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacg 898  Q
    || |||||||| ||||||  ||||||| |||||| || ||  || ||||||||                     ||||| || ||||||||||| |||||    
T  47986875 tggttgcaaataacactgcgataacaagagtgcctttatcagtagtgaggtca--------------------cctgtgcggctatgaaggattttcacg 47986796  T
Q  899 tgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataatctc 950  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47986795 tgatgtgtttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaaataatctc 47986744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 400 - 950
Target Start/End: Complemental strand, 47996562 - 47996031
Alignment:
Q  400 cactctcaaggttattgataccctctaatatctttcatttattgttttaaggttcttccctaaattttgtttataatatt-atgttcttgtagaggctgg 498  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||| ||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  47996562 cactctcaaggttattgatacattctaaaatctttcatttattgttctaagcttcttccttaagttttgtctataaaattcatgttcttgcagaagatgg 47996463  T
Q  499 agaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaacagttagtactcaaagattg 598  Q
    | ||||| |||||| | || |||||||||||||||||||| ||||  |  |   | |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  47996462 aaaagctaaaaattctcaatcttagtcattctcattatctcacacgaagccttgacttttcaaacatgcctaatctcgaaaagctagtactcaaagattg 47996363  T
Q  599 tccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaac 698  Q
     |||| ||| |||||| |||| | ||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || || |||| ||| ||||||| |    
T  47996362 cccaatgttatctgagatttctcctagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagactgtattagcctatgtagcctcccaagaagc 47996263  T
Q  699 atctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactc 798  Q
    |  || |  || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||     
T  47996262 acatacaaattaaaatctctaaaaactctcattctttctggctgtttaaagattaacaagttggaagaggacatggaataaatgaaatctttaactactt 47996163  T
Q  799 tgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacg 898  Q
    || |||||||| ||||||  ||||||| |||||| || ||  || ||||||||                     ||||| || ||||||||||| |||||    
T  47996162 tggttgcaaataacactgcgataacaagagtgcctttatcagtagtgaggtca--------------------cctgtgcggctatgaaggattttcacg 47996083  T
Q  899 tgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataatctc 950  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47996082 tgatgtgtttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaaataatctc 47996031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 400 - 950
Target Start/End: Complemental strand, 48005849 - 48005318
Alignment:
Q  400 cactctcaaggttattgataccctctaatatctttcatttattgttttaaggttcttccctaaattttgtttataatatt-atgttcttgtagaggctgg 498  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||| ||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  48005849 cactctcaaggttattgatacattctaaaatctttcatttattgttctaagcttcttccttaagttttgtctataaaattcatgttcttgcagaagatgg 48005750  T
Q  499 agaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaacagttagtactcaaagattg 598  Q
    | ||||| |||||| | || |||||||||||||||||||| ||||  |  |   | |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  48005749 aaaagctaaaaattctcaatcttagtcattctcattatctcacacgaagccttgacttttcaaacatgcctaatctcgaaaagctagtactcaaagattg 48005650  T
Q  599 tccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaac 698  Q
     |||| ||| |||||| |||| | ||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || || |||| ||| ||||||| |    
T  48005649 cccaatgttatctgagatttctcctagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagactgtattagcctatgtagcctcccaagaagc 48005550  T
Q  699 atctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactc 798  Q
    |  || |  || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||     
T  48005549 acatacaaattaaaatctctaaaaactctcattctttctggctgtttaaagattaacaagttggaagaggacatggaataaatgaaatctttaactactt 48005450  T
Q  799 tgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacg 898  Q
    || |||||||| ||||||  ||||||| |||||| || ||  || ||||||||                     ||||| || ||||||||||| |||||    
T  48005449 tggttgcaaataacactgcgataacaagagtgcctttatcagtagtgaggtca--------------------cctgtgcggctatgaaggattttcacg 48005370  T
Q  899 tgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataatctc 950  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48005369 tgatgtgtttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaaataatctc 48005318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 400 - 950
Target Start/End: Complemental strand, 48015134 - 48014603
Alignment:
Q  400 cactctcaaggttattgataccctctaatatctttcatttattgttttaaggttcttccctaaattttgtttataatatt-atgttcttgtagaggctgg 498  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||| ||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  48015134 cactctcaaggttattgatacattctaaaatctttcatttattgttctaagcttcttccttaagttttgtctataaaattcatgttcttgcagaagatgg 48015035  T
Q  499 agaagctgaaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaacagttagtactcaaagattg 598  Q
    | ||||| |||||| | || |||||||||||||||||||| ||||  |  |   | |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  48015034 aaaagctaaaaattctcaatcttagtcattctcattatctcacacgaagccttgacttttcaaacatgcctaatctcgaaaagctagtactcaaagattg 48014935  T
Q  599 tccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaac 698  Q
     |||| ||| |||||| |||| | ||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || || |||| ||| ||||||| |    
T  48014934 cccaatgttatctgagatttctcctagcattggacatctcgacaaaattcttctgataaatttggaagactgtattagcctatgtagcctcccaagaagc 48014835  T
Q  699 atctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactc 798  Q
    |  || |  || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||     
T  48014834 acatacaaattaaaatctctaaaaactctcattctttctggctgtttaaagattaacaagttggaagaggacatggaataaatgaaatctttaactactt 48014735  T
Q  799 tgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacg 898  Q
    || |||||||| ||||||  ||||||| |||||| || ||  || ||||||||                     ||||| || ||||||||||| |||||    
T  48014734 tggttgcaaataacactgcgataacaagagtgcctttatcagtagtgaggtca--------------------cctgtgcggctatgaaggattttcacg 48014655  T
Q  899 tgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataatctc 950  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48014654 tgatgtgtttccatctatcatttggtcttggatgtcaccaacaaataatctc 48014603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 708 - 942
Target Start/End: Complemental strand, 32411314 - 32411083
Alignment:
Q  708 ttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaa 807  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| || || |||||     ||   ||||||||||| || || || ||||||||||    
T  32411314 ttgaaatctttgaaaactctcatcctttctggttgttcaaagattgaaaacttggaagaaatagtg---caaatggaatcgttgacaacactgattgcaa 32411218  T
Q  808 atgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtt 907  Q
    | || || ||| ||| | | ||||||| ||| ||| | || || |||||||| | || ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || ||    
T  32411217 aagatacaggtgtaaaagaggtgccctgttcaatagtaagatcgaaaagcatcgcatatatatctctatgtggatatgaaggattatcacatgaagtatt 32411118  T
Q  908 tccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaa 942  Q
    ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  32411117 tccctctctcatttggtcttagatgtcaccaacaa 32411083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 831 - 942
Target Start/End: Complemental strand, 6905917 - 6905806
Alignment:
Q  831 cccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttgga 930  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||  | ||| || || || |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||    
T  6905917 cccttttccattgttagatcaaaaagcattgtgtatatatccctatgcggatatgaaggattatcacgtgatatttttccttctctcatttggtcttgga 6905818  T
Q  931 tgttaccaacaa 942  Q
    ||| ||||||||    
T  6905817 tgtcaccaacaa 6905806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 635 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 6906113 - 6905991
Alignment:
Q  635 tctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattcta 734  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| || ||||  |||||| | || || |||||  | ||||||  | ||| |||| ||||||||||||||||     
T  6906113 tctcaagaagcttcttctgataaatttgaaggactgtacaagtcttggcaatctaccaagggagatctatcagctgatatctgtgaaaactctcattctt 6906014  T
Q  735 tctggatgtttaaagattgacaa 757  Q
    | ||| |||| ||||||||||||    
T  6906013 tttggttgttcaaagattgacaa 6905991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Original strand, 43955324 - 43955362
Alignment:
Q  67 tcttagaatttgggttaagcctaactcaaccttacaaaa 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  43955324 tcttagaatttgggttgagcctaactcaaccttataaaa 43955362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 110; Significance: 6e-55; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 565 - 942
Target Start/End: Complemental strand, 22584471 - 22584094
Alignment:
Q  565 tgcctaatcttgaacagttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaa 664  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |  ||| ||  ||||||  |||| || | |  |||||| | | ||||| | ||||||||| |    
T  22584471 tgcctaatcttgaaaagatagtactcaaagattgtcggaacttgactatggtttcttatagcatcgtatttctcaacagagttcttctaataaatttgca 22584372  T
Q  665 agattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaa 764  Q
    ||| ||| | || ||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||  || | ||||| |||    
T  22584371 agactgtttaagcctttgtagcctcccaagaaacatctacaagttgaaatctttgaaaactctcattctttctggctgttaaaaactttataagttggaa 22584272  T
Q  765 gaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggat 864  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||  ||| | |    
T  22584271 gaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatgaaactgcaataaaaaaagtgccattttcaatatttaggtcaaaaactatttggt 22584172  T
Q  865 ttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaa 942  Q
      |||||| ||||||| ||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||| |||| ||||||||||| | ||||||    
T  22584171 acatttctttgtgtggctatgaaggactcttaagcgatgtagttccatctatgatttggtcttggatgtcatcaacaa 22584094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 7252294 - 7252243
Alignment:
Q  63 accatcttagaatttgggttaagcctaactcaaccttacaaaaacaacttgt 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7252294 accatcttagaatttgggttgagcctaactcaaccctacaaaaccaacttgt 7252243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 627 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 14767262 - 14767123
Alignment:
Q  627 attggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactc 726  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||| || ||||  ||||||   || || |||||| | ||||||   ||||||||| |||||||||    
T  14767262 attggagatctcaagaatgttcttctcataaatttgaaggactgtacaagtcttgaaaatctcccaagagagatctatcaattgaaatctttgaaaactc 14767163  T
Q  727 tcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaaga 766  Q
    |||| || || || |||| |||||||||||| || |||||    
T  14767162 tcatcctttccggctgttcaaagattgacaaattggaaga 14767123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 71; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 563 - 913
Target Start/End: Original strand, 6481 - 6831
Alignment:
Q  563 catgcctaatcttgaacagttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttg 662  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || | ||| ||||||  |||  | ||| ||||| | |||||||||    
T  6481 catgcctaatcttgaaaagctagtactcaaagactgtccaagattaactgcggtctcccgtagcattggatctctgcataaacttcttctaataaatttg 6580  T
Q  663 aaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttag 762  Q
    | ||| || |  ||||||   || ||||| |||| ||| ||||  || ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||| || |    
T  6581 acagactgcacaagtcttcagaaacttcctagaagcatatataaattaaaatctctagaaactttgattctttctggatgttccaagattgacaaattgg 6680  T
Q  763 aagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattgg 862  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  ||  |||||||  || | |||| |||||||||||| |||||||| ||| |  | || |||| ||||||    
T  6681 aggaggacttggaacagatggaatcattgaaaaccttgattgcggataagactgctataacaaaagttcccttttcaatagtacgatctaaaaacattgg 6780  T
Q  863 atttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttc 913  Q
    || ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6781 atatatttctttatgtggatttgaaggattttcacgggatgtgtttccttc 6831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0813 (Bit Score: 69; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0813
Description:

Target: scaffold0813; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 563 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 5085 - 4701
Alignment:
Q  563 catgcctaatcttgaacagttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttg 662  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || | ||| ||||||  |||  | ||| ||||| | |||||||||    
T  5085 catgcctaatcttgaaaagctagtactcaaagactgtccaagattaactgcggtctcccgtagcattggatctctgcataaacttcttctaataaatttg 4986  T
Q  663 aaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttag 762  Q
    | ||| || |  ||||||   || ||||| |||| ||| ||||  || ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||| || |    
T  4985 acagactgcacaagtcttcagaaacttcctagaagcatatataaattaaaatctctagaaactttgattctttctggatgttccaagattgacaaattgg 4886  T
Q  763 aagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattgg 862  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  ||  |||||||  || | |||| ||||||||||||||| ||||| ||| | || | || || ||||||    
T  4885 aggaggacttggaacagatggaatcattgaaaaccttgattgcggataagactgctataacaaaagtgccgttttcaatagtaagattaagaaacattgg 4786  T
Q  863 atttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataat 947  Q
    || ||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||||| | || ||  ||||||||||| |||| ||| ||||    
T  4785 atatatttctctatgtggctttgaaggattttcacgagatgtatttccttttctcgttcggtcttggatgtcaccatcaactaat 4701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 65; Significance: 5e-28; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 708 - 940
Target Start/End: Complemental strand, 3262860 - 3262629
Alignment:
Q  708 ttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaa 807  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||| || ||||| ||| | |  || |||||||| || || || ||||||||||    
T  3262860 ttgaaatctttgaaaactctcatactttctggttgctcaaagattgacaaattggaagaagacatagtgcagatggaatccttgacaacactgattgcaa 3262761  T
Q  808 atgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtt 907  Q
    | || || ||| | | | | ||||||| ||| ||| | || |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  3262760 aggatacaggtgtgaaagaggtgccctattcaatagtaagatcaaaaagcattggatatatatccctatgtggatatga-ggattttcacgtgatgtttt 3262662  T
Q  908 tccttctatcatttcgtcttggatgttaccaac 940  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3262661 tccctctatcatttggtcttggatgtcaccaac 3262629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 709 - 941
Target Start/End: Complemental strand, 3286748 - 3286516
Alignment:
Q  709 tgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaa 808  Q
    |||||||| |||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||| | |  || |||||||| || || || |||||||||||    
T  3286748 tgaaatctttgaacactctcatcctttctggttgttcaaagattgacaagttggaagaagacatagtgcagatggaatccttgacaacactgattgcaaa 3286649  T
Q  809 tgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgttt 908  Q
    | | || | | | | | ||||||||||||| ||  | || |||||||||||  ||| ||| || || ||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  3286648 taatacagctgttaaagaagtgcccttttcaattgtaagatcaaaaagcatcagatatatatccctatgtggatatgaaggattatcacatgatgttttt 3286549  T
Q  909 ccttctatcatttcgtcttggatgttaccaaca 941  Q
    |  ||| |||||  ||||||||||| |||||||    
T  3286548 caatctctcattaggtcttggatgtcaccaaca 3286516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 834 - 942
Target Start/End: Complemental strand, 3391644 - 3391536
Alignment:
Q  834 ttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgt 933  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||| |||||  |||||||||||    
T  3391644 ttttcgatagtgagatcaaaaagcattggatatatatctctatgtggatatgaaggattatcacatcatgtttttccttctctcattaggtcttggatgt 3391545  T
Q  934 taccaacaa 942  Q
     ||||||||    
T  3391544 caccaacaa 3391536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 627 - 940
Target Start/End: Original strand, 31175733 - 31176046
Alignment:
Q  627 attggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactc 726  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || || ||||  |||||| | || || |||| | |  ||||||   ||| |||  |||||| ||    
T  31175733 attggagatctcaagaatcttcttttgataaattttaaggactgtacaagtcttggcaatctcccaaaagaggtctataaagtgagatcagtgaaaagtc 31175832  T
Q  727 tcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaa 826  Q
    ||||||| ||||| |||| || ||||||||| || ||||| ||  |    ||||||||||| || || ||| | ||||||    | |||||||| | | |    
T  31175833 tcattctttctggttgttcaatgattgacaaattggaagaagatatattgcaaatggaatccttgacaactttaattgcagcaaatactggtatcaaaca 31175932  T
Q  827 agtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtct 926  Q
    |||||||| ||| |||   || ||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||| |||||| ||||    
T  31175933 agtgccctattcaatagcaagatcaaaaagcattgcatatatatctctatgtggatatgaaggattatcatgtgacgtttttccttctctcatttggtct 31176032  T
Q  927 tggatgttaccaac 940  Q
    ||||||| ||||||    
T  31176033 tggatgtcaccaac 31176046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 834 - 942
Target Start/End: Original strand, 3364262 - 3364370
Alignment:
Q  834 ttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgt 933  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||| |||||  ||||||||| |    
T  3364262 ttttcgatagtgagatcaaaaagcattggatatatatctctatgtggatatgaaggattatcacatcatgtttttccttctctcattaggtcttggatat 3364361  T
Q  934 taccaacaa 942  Q
     ||||||||    
T  3364362 caccaacaa 3364370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 870 - 942
Target Start/End: Complemental strand, 3407395 - 3407323
Alignment:
Q  870 tctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaa 942  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3407395 tctctatgtggatatcaaggattatcacgtgatgtttttccttctatcatttggtcttggatgtcaccaacaa 3407323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 708 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 3325234 - 3325003
Alignment:
Q  708 ttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaa 807  Q
    ||||||||| || ||||||| ||  ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |  || |  || |||||||| || || || |||||||| |    
T  3325234 ttgaaatctttggaaactcttatattatctggttgttcaaagattgacaagttggaagaaggtttcgggcagatggaatccttgacaacgctgattgcta 3325135  T
Q  808 atgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtt 907  Q
    | || ||   | ||| | |||| || | ||| ||||| || | |||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||| | ||||  ||||| ||    
T  3325134 aagatacatctgtaaaacaagttccttattcaatactaagattaaaaagcattggatatatatccctctgtggatatgaaggactatcacacgatgtttt 3325035  T
Q  908 tccttctatcatttcgtcttggatgttaccaa 939  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3325034 tccttctatcatttggtcttggatgtcaccaa 3325003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 849 - 939
Target Start/End: Original strand, 3314966 - 3315056
Alignment:
Q  849 tcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaa 939  Q
    ||||||| |||||||| ||| || || |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3314966 tcaaaaaacattggatatatatccctatgtgaatatgaaggtttatcacgtgatgtttttccttctatcatttggtcttggatgtcaccaa 3315056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 708 - 940
Target Start/End: Complemental strand, 3398754 - 3398522
Alignment:
Q  708 ttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaa 807  Q
    ||||||||  |||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||  |    ||||||||||| || || ||||| ||||||     
T  3398754 ttgaaatcagtgaaaactctcattatttctggttgttcaaagattgacaaattggaagaagatatattgcaaatggaatccttgacaactctaattgcag 3398655  T
Q  808 atgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtt 907  Q
       | |||||| | | | |||| || ||||| ||  | || ||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||| ||   |||||| ||    
T  3398654 caaatactggtgtcaaacaagttcctttttcgattgttagatcaaaaagcattgcatatatatctctatgtggatataaaggattatcgtctgatgtttt 3398555  T
Q  908 tccttctatcatttcgtcttggatgttaccaac 940  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  3398554 tccttctctcatttggtcatggatgtcaccaac 3398522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 852 - 942
Target Start/End: Complemental strand, 3267288 - 3267198
Alignment:
Q  852 aaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaa 942  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||   ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||||    
T  3267288 aaaagcatcggatatatatctctatgtggatatgaaggattatcagaagatgtttttcattctattattcagtcttggatgtcaccaacaa 3267198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 37312967 - 37312924
Alignment:
Q  63 accatcttagaatttgggtt-aagcctaactcaaccttacaaaa 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  37312967 accatcttagaatttgggtttaagcctaactccaccttacaaaa 37312924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 105
Target Start/End: Original strand, 37387062 - 37387105
Alignment:
Q  63 accatcttagaatttgggtt-aagcctaactcaaccttacaaaa 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  37387062 accatcttagaatttgggtttaagcctaactccaccttacaaaa 37387105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 51; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 565 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 8542 - 8160
Alignment:
Q  565 tgcctaatcttgaacagttagtactcaaagattgtccaaggttgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaa 664  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||   || || ||||||||||||  |||  | ||||||||| | ||||||||||     
T  8542 tgccaaatcttgaaaagctagtactcaaaaattgtccaagtttgtctacagtctcccatagtattggatctctacataaaattcttctcataaatttgac 8443  T
Q  665 agattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaa 764  Q
    ||| || |   ||||| | || |||||||||| || |||||  || ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||  | |||||| || || ||     
T  8442 agactgcacaggtcttcggaaacttccaagaagcaactataaattaaaatctctagaaactttgattctttctggatgttccatgattgaaaaattggag 8343  T
Q  765 gaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggat 864  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  ||  |||||||  || | |||| ||||| ||||||||| |||||  |  | || |  |||| ||||||||    
T  8342 gaggacttggaacagatggaatctttgattaccttgattgctgataagactgctataaaaaaagtgccattttcagtggtaagattgaaaaccattggat 8243  T
Q  865 ttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttggatgttaccaacaaataat 947  Q
     ||||||| |  |||| | |||||||||  |||||| ||| ||| ||||| || ||   |||||||||| |||| ||||||||    
T  8242 atatttctttaggtggctttgaaggatttacacgtgctgtattttcttctctcgttcgctcttggatgtcaccatcaaataat 8160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0373 (Bit Score: 51; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0373
Description:

Target: scaffold0373; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 507 - 933
Target Start/End: Original strand, 9456 - 9882
Alignment:
Q  507 aaaattgttaaccttagtcattctcattatctgacacagacaccaaatttttcaaacatgcctaatcttgaacagttagtactcaaagattgtccaaggt 606  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||  || ||||  | || ||| | || ||| | ||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |    
T  9456 aaaattcttaatcttagtcattctcaggatttgactgaaactccagacttctcatatatgccgaatcttgaaaagctagtactcaaagactgtccaagtt 9555  T
Q  607 tgtctgaggtttcacatagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatac 706  Q
    |||||| ||| || ||||| ||||||  |||| | ||| ||||| |||||||||| |   | || |   ||||| | || ||||| |||| |||||||||    
T  9556 tgtctgcggtctcccatagcattggatctctccataaacttcttctgataaatttaacgaactgcacaggtcttcggaaacttccgagaagcatctatac 9655  T
Q  707 gttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgca 806  Q
     || ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||  | ||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||||||| | |  ||  ||||||||    
T  9656 attaaaatctctacaaactttgattctttctggatgttccatgattgacaaattggaggaggatttggtacagatggaatctcttattaccttgattgca 9755  T
Q  807 aatgacactggtataacaaaagtgcccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgt 906  Q
     || | |||| ||||| |||||| || ||||| ||| | ||    |||| |||||||| ||||||| |  | || | ||||||||| ||||||||||| |    
T  9756 gataagactgctataaaaaaagttccattttcaatagtaagaatgaaaaacattggatatatttctttaagcggctttgaaggattttcacgtgatgtat 9855  T
Q  907 ttccttctatcatttcgtcttggatgt 933  Q
    | |||||| |||||   ||||||||||    
T  9856 tcccttctctcattcgctcttggatgt 9882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 831 - 942
Target Start/End: Complemental strand, 6257 - 6146
Alignment:
Q  831 cccttttccatactgaggtcaaaaagcattggatttatttctctgtgtggatatgaaggattctcacgtgatgtgtttccttctatcatttcgtcttgga 930  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||  | ||| || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||    
T  6257 cccttttccatatttagatcaaaaagcattgtgtatatatccctatgcggatatgaaggattatcacgtgatgtttttccttcccttatttggtcttgga 6158  T
Q  931 tgttaccaacaa 942  Q
    ||| ||||||||    
T  6157 tgtcaccaacaa 6146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 7525107 - 7525050
Alignment:
Q  66 atcttagaatttgggttaagcctaactcaaccttacaaaaacaacttgtgcggtgagg 123  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||    
T  7525107 atcttagaatttggattgagcctaactcaaccttacaaaaccagcttgtaaggtgagg 7525050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 123
Target Start/End: Original strand, 17557708 - 17557764
Alignment:
Q  67 tcttagaatttgggttaagcctaactcaaccttacaaaaacaacttgtgcggtgagg 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||    
T  17557708 tcttagaatttgggttgggcctaactcaaccttacaaaatcagcttgtaaggtgagg 17557764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 40571649 - 40571587
Alignment:
Q  63 accatcttagaatttgggttaagcctaactcaaccttacaaaaacaacttgtgcggtgaggatt 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  40571649 accatctta-aatttggattgggcctaactcaaccttacaaaaccaacttgtaaggtgaggatt 40571587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 347390 - 347352
Alignment:
Q  67 tcttagaatttgggttaagcctaactcaaccttacaaaa 105  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  347390 tcttagaatttgggttgaacctaactcaaccttacaaaa 347352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 105
Target Start/End: Original strand, 20738718 - 20738760
Alignment:
Q  63 accatcttagaatttgggttaagcctaactcaaccttacaaaa 105  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  20738718 accatcttagaatttgggatgagcctaactcaaccctacaaaa 20738760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 97
Target Start/End: Original strand, 29410162 - 29410196
Alignment:
Q  63 accatcttagaatttgggttaagcctaactcaacc 97  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29410162 accatcttagaatttgggttcagcctaactcaacc 29410196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University