View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18743_low_39 (Length: 260)

Name: NF18743_low_39
Description: NF18743
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18743_low_39
NF18743_low_39
[»] chr7 (85 HSPs)
chr7 (49-250)||(40542909-40543110)
chr7 (50-250)||(22119890-22120090)
chr7 (49-249)||(7275278-7275478)
chr7 (49-250)||(2751272-2751473)
chr7 (49-250)||(7175861-7176062)
chr7 (49-250)||(21835152-21835353)
chr7 (49-249)||(18044108-18044308)
chr7 (49-250)||(21217832-21218033)
chr7 (68-250)||(22703506-22703688)
chr7 (49-250)||(10091189-10091389)
chr7 (49-250)||(11997850-11998051)
chr7 (49-250)||(2103056-2103255)
chr7 (49-249)||(17196950-17197150)
chr7 (50-250)||(23012507-23012707)
chr7 (49-250)||(28089817-28090021)
chr7 (51-250)||(27312155-27312354)
chr7 (49-250)||(2344300-2344501)
chr7 (49-248)||(19421232-19421431)
chr7 (49-249)||(27009360-27009561)
chr7 (49-250)||(31197592-31197792)
chr7 (57-250)||(42913512-42913705)
chr7 (90-250)||(654704-654863)
chr7 (49-242)||(17212054-17212247)
chr7 (88-250)||(29861711-29861872)
chr7 (49-249)||(39145652-39145852)
chr7 (49-248)||(32849592-32849791)
chr7 (88-250)||(16374034-16374196)
chr7 (57-249)||(28950877-28951072)
chr7 (70-250)||(31273936-31274115)
chr7 (50-249)||(27704004-27704202)
chr7 (49-248)||(22638293-22638488)
chr7 (49-250)||(9717986-9718187)
chr7 (50-250)||(13332433-13332622)
chr7 (49-250)||(43785298-43785499)
chr7 (123-250)||(23092171-23092298)
chr7 (131-249)||(3851840-3851958)
chr7 (80-249)||(36772303-36772471)
chr7 (76-249)||(22643342-22643515)
chr7 (49-176)||(7799905-7800032)
chr7 (49-248)||(9683827-9684026)
chr7 (49-249)||(31712902-31713095)
chr7 (103-249)||(41907514-41907659)
chr7 (51-249)||(28646972-28647170)
chr7 (49-250)||(23330738-23330939)
chr7 (51-176)||(42814867-42814992)
chr7 (49-250)||(21574101-21574303)
chr7 (123-249)||(33137825-33137950)
chr7 (76-201)||(14199715-14199839)
chr7 (50-249)||(22696322-22696522)
chr7 (131-222)||(21373793-21373884)
chr7 (49-201)||(8435745-8435895)
chr7 (68-145)||(22299869-22299946)
chr7 (49-120)||(23854397-23854468)
chr7 (49-249)||(25333420-25333603)
chr7 (49-145)||(40332100-40332196)
chr7 (50-114)||(28003838-28003902)
chr7 (50-249)||(38864446-38864645)
chr7 (116-185)||(6491675-6491744)
chr7 (149-241)||(8943409-8943502)
chr7 (49-121)||(21370598-21370670)
chr7 (51-239)||(47541387-47541574)
chr7 (49-160)||(12211625-12211735)
chr7 (112-244)||(1766149-1766280)
chr7 (49-222)||(9769587-9769758)
chr7 (49-133)||(22264618-22264702)
chr7 (49-161)||(36173036-36173147)
chr7 (162-249)||(25102809-25102895)
chr7 (71-156)||(25956258-25956342)
chr7 (109-248)||(35476402-35476541)
chr7 (50-99)||(3951140-3951190)
chr7 (91-149)||(35173132-35173190)
chr7 (50-119)||(577681-577750)
chr7 (71-147)||(5934147-5934224)
chr7 (53-165)||(47380903-47381014)
chr7 (198-249)||(36395496-36395547)
chr7 (204-250)||(22299958-22300004)
chr7 (51-157)||(37056217-37056322)
chr7 (168-218)||(40332193-40332243)
chr7 (194-247)||(30345511-30345564)
chr7 (50-162)||(1469114-1469225)
chr7 (123-222)||(11909981-11910080)
chr7 (131-222)||(23636592-23636683)
chr7 (181-213)||(43617356-43617388)
chr7 (70-146)||(48125149-48125225)
chr7 (103-147)||(48983706-48983750)
[»] chr8 (65 HSPs)
chr8 (49-250)||(2618187-2618388)
chr8 (49-250)||(4718646-4718847)
chr8 (49-250)||(34237654-34237855)
chr8 (49-250)||(3734622-3734823)
chr8 (49-250)||(39349257-39349458)
chr8 (49-248)||(15259407-15259606)
chr8 (51-248)||(28193477-28193674)
chr8 (59-249)||(21603241-21603431)
chr8 (49-250)||(20305909-20306110)
chr8 (49-250)||(21092542-21092743)
chr8 (49-250)||(32879280-32879481)
chr8 (49-249)||(42643118-42643318)
chr8 (64-250)||(8765525-8765711)
chr8 (49-250)||(19471610-19471812)
chr8 (49-250)||(19542534-19542736)
chr8 (49-250)||(19589960-19590162)
chr8 (69-250)||(4698722-4698903)
chr8 (69-250)||(14632975-14633156)
chr8 (49-250)||(42328006-42328206)
chr8 (71-249)||(20469940-20470117)
chr8 (49-250)||(27746334-27746535)
chr8 (49-250)||(18532108-18532300)
chr8 (51-249)||(264400-264597)
chr8 (51-249)||(651324-651521)
chr8 (51-249)||(837059-837256)
chr8 (68-250)||(34610686-34610868)
chr8 (51-250)||(24018385-24018585)
chr8 (49-240)||(28088287-28088478)
chr8 (103-249)||(6953008-6953153)
chr8 (49-211)||(21667551-21667713)
chr8 (49-250)||(28964034-28964234)
chr8 (49-248)||(7557952-7558143)
chr8 (70-249)||(2166721-2166897)
chr8 (101-249)||(10292108-10292255)
chr8 (110-249)||(25248411-25248547)
chr8 (49-250)||(34694574-34694776)
chr8 (68-249)||(18128533-18128714)
chr8 (49-242)||(26168856-26169048)
chr8 (68-250)||(9047278-9047459)
chr8 (161-250)||(2639410-2639499)
chr8 (49-208)||(24999243-24999394)
chr8 (49-242)||(36848757-36848949)
chr8 (110-250)||(1219411-1219551)
chr8 (50-222)||(28908823-28908997)
chr8 (49-220)||(34639237-34639406)
chr8 (69-249)||(3403502-3403682)
chr8 (110-250)||(33746944-33747084)
chr8 (69-222)||(13749077-13749230)
chr8 (49-165)||(8042655-8042764)
chr8 (54-162)||(41070767-41070874)
chr8 (49-162)||(3794792-3794904)
chr8 (147-244)||(43817754-43817851)
chr8 (49-159)||(8387535-8387644)
chr8 (51-92)||(775938-775979)
chr8 (51-92)||(781592-781633)
chr8 (68-192)||(22200617-22200741)
chr8 (203-249)||(9713609-9713655)
chr8 (76-249)||(12312874-12313046)
chr8 (108-250)||(26261844-26261986)
chr8 (49-98)||(7373477-7373526)
chr8 (187-250)||(16990722-16990785)
chr8 (71-136)||(35690048-35690114)
chr8 (152-249)||(42332012-42332108)
chr8 (51-99)||(30911407-30911455)
chr8 (70-146)||(40136938-40137013)
[»] chr1 (84 HSPs)
chr1 (49-250)||(4621236-4621437)
chr1 (49-249)||(24674390-24674590)
chr1 (50-249)||(24122021-24122220)
chr1 (49-250)||(15059401-15059602)
chr1 (49-250)||(7766726-7766927)
chr1 (68-248)||(17935785-17935965)
chr1 (49-250)||(27454863-27455066)
chr1 (49-247)||(8077644-8077841)
chr1 (49-250)||(46607807-46608008)
chr1 (49-249)||(7197247-7197446)
chr1 (71-249)||(9500355-9500533)
chr1 (68-250)||(7578425-7578607)
chr1 (49-250)||(23734113-23734315)
chr1 (49-250)||(23741305-23741507)
chr1 (49-250)||(30677173-30677374)
chr1 (49-248)||(34778339-34778535)
chr1 (70-249)||(45859043-45859222)
chr1 (68-245)||(1378914-1379090)
chr1 (76-241)||(8779744-8779909)
chr1 (51-244)||(18646852-18647045)
chr1 (49-250)||(32729542-32729742)
chr1 (69-250)||(33905509-33905690)
chr1 (68-248)||(37351454-37351642)
chr1 (49-250)||(168198-168399)
chr1 (76-249)||(36155888-36156061)
chr1 (100-250)||(8254751-8254901)
chr1 (49-220)||(7946841-7947011)
chr1 (50-250)||(2272342-2272542)
chr1 (49-244)||(21726726-21726921)
chr1 (49-210)||(23232300-23232465)
chr1 (52-244)||(32930749-32930941)
chr1 (49-214)||(29057373-29057537)
chr1 (51-156)||(46113495-46113600)
chr1 (49-249)||(18533724-18533924)
chr1 (49-249)||(1486417-1486617)
chr1 (125-249)||(45331621-45331746)
chr1 (156-250)||(22909975-22910069)
chr1 (153-250)||(48699859-48699957)
chr1 (49-142)||(20487297-20487390)
chr1 (49-249)||(9926146-9926348)
chr1 (49-222)||(1138576-1138748)
chr1 (49-222)||(2537701-2537863)
chr1 (49-210)||(25237028-25237189)
chr1 (147-220)||(12876965-12877038)
chr1 (152-249)||(26513148-26513244)
chr1 (49-249)||(52135127-52135323)
chr1 (70-222)||(37047010-37047162)
chr1 (49-249)||(40802069-40802267)
chr1 (68-249)||(809238-809419)
chr1 (50-140)||(1378743-1378833)
chr1 (49-138)||(14258538-14258627)
chr1 (69-249)||(16539625-16539804)
chr1 (110-222)||(16899561-16899673)
chr1 (56-249)||(26820196-26820384)
chr1 (110-241)||(40145889-40146025)
chr1 (68-162)||(19034474-19034567)
chr1 (167-249)||(50202661-50202742)
chr1 (51-222)||(1095031-1095193)
chr1 (49-156)||(24216975-24217081)
chr1 (49-121)||(1818731-1818803)
chr1 (68-207)||(10059071-10059210)
chr1 (185-249)||(23041655-23041719)
chr1 (173-249)||(47091742-47091818)
chr1 (150-249)||(1818807-1818905)
chr1 (203-250)||(14603947-14603994)
chr1 (171-250)||(27159205-27159283)
chr1 (182-249)||(35138118-35138185)
chr1 (70-161)||(39964530-39964621)
chr1 (70-222)||(19480552-19480706)
chr1 (50-213)||(17447272-17447434)
chr1 (49-97)||(47091687-47091735)
chr1 (51-240)||(25496503-25496686)
chr1 (49-239)||(43769975-43770164)
chr1 (203-249)||(5315482-5315528)
chr1 (173-249)||(6776201-6776277)
chr1 (131-222)||(20999190-20999281)
chr1 (75-194)||(47360440-47360559)
chr1 (56-98)||(6776148-6776190)
chr1 (70-160)||(49101730-49101819)
chr1 (50-99)||(37349521-37349570)
chr1 (103-147)||(6122853-6122897)
chr1 (50-249)||(31162748-31162947)
chr1 (70-146)||(39012316-39012392)
chr1 (49-97)||(52592557-52592605)
[»] scaffold0576 (1 HSPs)
scaffold0576 (49-250)||(5081-5282)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (49-250)||(15360097-15360298)
chr6 (49-250)||(34147343-34147544)
chr6 (49-250)||(34159959-34160160)
chr6 (52-249)||(11448871-11449068)
chr6 (49-248)||(9238972-9239171)
chr6 (49-249)||(654146-654346)
chr6 (49-250)||(3222635-3222834)
chr6 (49-250)||(21982320-21982520)
chr6 (49-249)||(28672064-28672264)
chr6 (49-250)||(9843935-9844136)
chr6 (49-250)||(11007162-11007363)
chr6 (54-249)||(9690638-9690833)
chr6 (49-250)||(1344934-1345133)
chr6 (49-250)||(17081053-17081254)
chr6 (49-249)||(5360071-5360271)
chr6 (49-250)||(21148510-21148710)
chr6 (92-222)||(12390465-12390595)
chr6 (49-249)||(9208249-9208449)
chr6 (49-179)||(12591634-12591764)
chr6 (50-250)||(14212890-14213080)
chr6 (68-249)||(11840917-11841097)
chr6 (49-249)||(33499471-33499672)
chr6 (49-158)||(13753237-13753346)
chr6 (68-247)||(17149458-17149637)
chr6 (69-213)||(28968078-28968222)
chr6 (68-250)||(17706318-17706488)
chr6 (51-247)||(10377714-10377911)
chr6 (49-135)||(22576064-22576150)
chr6 (49-240)||(33718478-33718658)
chr6 (151-249)||(15730495-15730593)
chr6 (49-210)||(31039017-31039177)
chr6 (49-153)||(8479309-8479412)
chr6 (77-241)||(28741849-28742013)
chr6 (130-249)||(14504082-14504201)
chr6 (49-162)||(17420862-17420975)
chr6 (163-250)||(21903618-21903706)
chr6 (70-222)||(6383901-6384053)
chr6 (51-144)||(21182325-21182418)
chr6 (103-194)||(28667679-28667770)
chr6 (123-249)||(17225738-17225863)
chr6 (165-220)||(22721810-22721865)
chr6 (187-222)||(32596211-32596246)
chr6 (56-118)||(24762410-24762474)
[»] chr5 (83 HSPs)
chr5 (49-250)||(8484660-8484861)
chr5 (49-250)||(32059439-32059640)
chr5 (49-250)||(15641105-15641305)
chr5 (49-250)||(27498730-27498931)
chr5 (49-250)||(30485825-30486026)
chr5 (49-249)||(11926501-11926702)
chr5 (53-250)||(38684209-38684405)
chr5 (49-250)||(7085625-7085826)
chr5 (69-250)||(19456210-19456389)
chr5 (71-250)||(18207226-18207405)
chr5 (49-250)||(4603774-4603975)
chr5 (49-249)||(34310139-34310339)
chr5 (56-250)||(33709502-33709694)
chr5 (49-249)||(23270522-23270722)
chr5 (68-250)||(37495063-37495252)
chr5 (56-249)||(6014280-6014473)
chr5 (49-250)||(31287945-31288146)
chr5 (68-250)||(10869564-10869746)
chr5 (49-241)||(13038463-13038654)
chr5 (49-241)||(13108458-13108649)
chr5 (49-250)||(22392698-22392886)
chr5 (49-199)||(25586929-25587080)
chr5 (50-220)||(15971151-15971321)
chr5 (49-249)||(19145412-19145611)
chr5 (49-249)||(27487554-27487755)
chr5 (49-249)||(34049819-34050008)
chr5 (49-244)||(11464913-11465107)
chr5 (69-250)||(12398447-12398628)
chr5 (49-250)||(21236361-21236562)
chr5 (49-249)||(25750613-25750811)
chr5 (49-241)||(36954815-36955007)
chr5 (49-250)||(12317154-12317350)
chr5 (131-250)||(35425092-35425211)
chr5 (58-240)||(42193491-42193671)
chr5 (49-250)||(38630978-38631161)
chr5 (49-201)||(15931056-15931207)
chr5 (50-250)||(26009263-26009463)
chr5 (130-249)||(9659311-9659430)
chr5 (49-249)||(10399770-10399971)
chr5 (69-160)||(7151346-7151437)
chr5 (49-163)||(1827616-1827730)
chr5 (49-249)||(5049134-5049333)
chr5 (49-249)||(28614486-28614683)
chr5 (155-250)||(41351103-41351197)
chr5 (74-249)||(36895447-36895622)
chr5 (171-249)||(22693054-22693132)
chr5 (51-142)||(37397712-37397803)
chr5 (135-249)||(13659245-13659359)
chr5 (104-249)||(24158166-24158311)
chr5 (69-248)||(17015420-17015593)
chr5 (49-136)||(5067298-5067385)
chr5 (49-222)||(15485318-15485492)
chr5 (49-249)||(930486-930685)
chr5 (49-249)||(22253144-22253345)
chr5 (70-250)||(31206260-31206441)
chr5 (110-250)||(41568868-41569007)
chr5 (69-174)||(3639788-3639894)
chr5 (51-222)||(2499205-2499376)
chr5 (51-103)||(3715055-3715107)
chr5 (178-238)||(5067387-5067447)
chr5 (198-250)||(10631288-10631340)
chr5 (123-249)||(10813851-10813977)
chr5 (161-250)||(8821093-8821182)
chr5 (50-101)||(42006791-42006842)
chr5 (187-250)||(42006868-42006931)
chr5 (188-250)||(33737878-33737939)
chr5 (161-222)||(39459405-39459466)
chr5 (50-162)||(14302787-14302898)
chr5 (50-98)||(21042676-21042724)
chr5 (202-249)||(7151453-7151500)
chr5 (161-200)||(23290705-23290744)
chr5 (56-120)||(31669025-31669091)
chr5 (184-250)||(25548533-25548599)
chr5 (49-99)||(33025477-33025527)
chr5 (49-154)||(8780475-8780579)
chr5 (70-222)||(16247028-16247180)
chr5 (70-99)||(16616137-16616166)
chr5 (70-143)||(19373264-19373337)
chr5 (161-214)||(21042609-21042661)
chr5 (52-96)||(204177-204221)
chr5 (71-146)||(21589314-21589390)
chr5 (103-155)||(39229305-39229357)
chr5 (189-249)||(41084120-41084180)
[»] chr4 (87 HSPs)
chr4 (49-250)||(40058851-40059052)
chr4 (49-248)||(52983616-52983815)
chr4 (49-250)||(34844757-34844958)
chr4 (49-250)||(27528794-27528995)
chr4 (49-250)||(32986194-32986395)
chr4 (49-250)||(46714389-46714591)
chr4 (49-249)||(20566346-20566547)
chr4 (49-249)||(33696279-33696479)
chr4 (49-250)||(5609201-5609402)
chr4 (49-250)||(54127341-54127542)
chr4 (49-250)||(19660531-19660732)
chr4 (70-247)||(20077986-20078163)
chr4 (49-249)||(25852211-25852412)
chr4 (50-250)||(45787703-45787902)
chr4 (51-250)||(44343512-44343712)
chr4 (56-249)||(35229172-35229365)
chr4 (49-249)||(1985833-1986031)
chr4 (49-199)||(33992623-33992773)
chr4 (51-244)||(32942369-32942562)
chr4 (49-250)||(36131509-36131710)
chr4 (68-249)||(49287874-49288054)
chr4 (101-249)||(34723848-34723996)
chr4 (50-249)||(51535611-51535818)
chr4 (49-199)||(35674791-35674941)
chr4 (49-250)||(13584253-13584454)
chr4 (49-222)||(13873322-13873495)
chr4 (105-250)||(32990488-32990633)
chr4 (50-249)||(34835527-34835726)
chr4 (68-250)||(18875516-18875697)
chr4 (76-249)||(12500059-12500231)
chr4 (49-213)||(22625097-22625270)
chr4 (69-250)||(7391964-7392143)
chr4 (49-248)||(13550205-13550404)
chr4 (103-240)||(9517650-9517787)
chr4 (95-250)||(21387486-21387639)
chr4 (52-250)||(55961753-55961939)
chr4 (49-249)||(13771482-13771683)
chr4 (90-250)||(27574356-27574516)
chr4 (50-160)||(43719154-43719264)
chr4 (80-250)||(4911950-4912124)
chr4 (59-179)||(2351020-2351140)
chr4 (70-248)||(20527035-20527212)
chr4 (69-250)||(30879165-30879345)
chr4 (52-248)||(25969504-25969700)
chr4 (131-250)||(53787056-53787176)
chr4 (131-250)||(22488027-22488146)
chr4 (116-249)||(12824464-12824597)
chr4 (49-162)||(41621684-41621796)
chr4 (124-249)||(51595094-51595219)
chr4 (51-248)||(9646217-9646414)
chr4 (125-199)||(29875825-29875899)
chr4 (173-249)||(4064981-4065057)
chr4 (182-249)||(9978509-9978576)
chr4 (186-249)||(23639758-23639821)
chr4 (186-249)||(23645416-23645479)
chr4 (187-249)||(52494623-52494685)
chr4 (179-250)||(43719086-43719157)
chr4 (157-250)||(4585712-4585803)
chr4 (51-250)||(28791113-28791312)
chr4 (51-104)||(34722169-34722222)
chr4 (53-134)||(43352439-43352520)
chr4 (69-172)||(39288883-39288978)
chr4 (50-121)||(42245744-42245815)
chr4 (68-248)||(12710195-12710373)
chr4 (188-250)||(23131435-23131497)
chr4 (183-249)||(55158343-55158409)
chr4 (188-249)||(17637852-17637912)
chr4 (75-147)||(28635726-28635799)
chr4 (104-206)||(10125872-10125973)
chr4 (131-249)||(13716450-13716568)
chr4 (103-213)||(38740901-38741011)
chr4 (71-147)||(7949427-7949504)
chr4 (188-249)||(33289190-33289251)
chr4 (188-249)||(37302623-37302684)
chr4 (182-250)||(13017843-13017910)
chr4 (50-249)||(41085024-41085222)
chr4 (68-142)||(7093392-7093466)
chr4 (131-165)||(33289146-33289180)
chr4 (70-186)||(37455594-37455710)
chr4 (71-136)||(38869794-38869860)
chr4 (164-222)||(42508408-42508466)
chr4 (103-156)||(22630280-22630332)
chr4 (50-95)||(45302837-45302882)
chr4 (189-249)||(7093508-7093568)
chr4 (103-147)||(9693471-9693515)
chr4 (72-147)||(38838824-38838900)
chr4 (56-120)||(39509079-39509146)
[»] chr3 (88 HSPs)
chr3 (49-250)||(40133448-40133649)
chr3 (49-249)||(21362940-21363140)
chr3 (49-249)||(35492908-35493108)
chr3 (49-250)||(8456149-8456350)
chr3 (49-250)||(25289714-25289914)
chr3 (49-250)||(46576345-46576546)
chr3 (51-248)||(25379760-25379957)
chr3 (49-249)||(49258262-49258462)
chr3 (49-250)||(30807152-30807353)
chr3 (49-250)||(45272415-45272616)
chr3 (49-250)||(45529754-45529954)
chr3 (49-250)||(48977385-48977586)
chr3 (49-250)||(53424176-53424376)
chr3 (56-250)||(15566499-15566692)
chr3 (53-250)||(26174114-26174311)
chr3 (49-250)||(30257621-30257822)
chr3 (51-249)||(52821636-52821833)
chr3 (69-250)||(10190741-10190922)
chr3 (49-249)||(18176887-18177087)
chr3 (49-249)||(34492575-34492775)
chr3 (68-250)||(53233910-53234091)
chr3 (69-250)||(10083818-10083999)
chr3 (49-250)||(40940822-40941023)
chr3 (49-249)||(31537838-31538038)
chr3 (74-249)||(39041852-39042027)
chr3 (49-250)||(52455648-52455849)
chr3 (59-201)||(26108299-26108441)
chr3 (56-249)||(32151428-32151621)
chr3 (92-250)||(8097278-8097436)
chr3 (49-231)||(29915288-29915469)
chr3 (49-231)||(29964441-29964622)
chr3 (49-250)||(25344057-25344257)
chr3 (75-250)||(8958034-8958210)
chr3 (49-249)||(7485531-7485725)
chr3 (81-249)||(1692863-1693030)
chr3 (49-221)||(7470244-7470415)
chr3 (50-249)||(4462631-4462829)
chr3 (97-250)||(2511296-2511449)
chr3 (76-249)||(33398468-33398641)
chr3 (68-240)||(19857068-19857239)
chr3 (51-250)||(11390601-11390800)
chr3 (100-249)||(24407309-24407458)
chr3 (49-222)||(51532786-51532959)
chr3 (68-249)||(53288713-53288893)
chr3 (146-250)||(24165714-24165817)
chr3 (68-222)||(49167072-49167229)
chr3 (50-244)||(26158816-26159003)
chr3 (49-190)||(38732963-38733105)
chr3 (148-249)||(54475777-54475878)
chr3 (49-241)||(4252404-4252596)
chr3 (115-218)||(1242036-1242139)
chr3 (59-234)||(14343304-14343478)
chr3 (105-250)||(17579134-17579280)
chr3 (49-154)||(25017513-25017617)
chr3 (49-163)||(55287800-55287914)
chr3 (110-250)||(1178230-1178368)
chr3 (110-249)||(48972714-48972850)
chr3 (50-244)||(27887426-27887622)
chr3 (160-248)||(48104985-48105073)
chr3 (182-250)||(53848433-53848501)
chr3 (49-222)||(50582989-50583161)
chr3 (50-249)||(6041670-6041871)
chr3 (49-138)||(9842918-9843006)
chr3 (51-241)||(55371302-55371483)
chr3 (149-250)||(33698705-33698806)
chr3 (70-222)||(34844396-34844547)
chr3 (187-249)||(4048085-4048147)
chr3 (59-138)||(9853623-9853702)
chr3 (188-249)||(50731237-50731298)
chr3 (188-249)||(50781556-50781617)
chr3 (203-250)||(3747732-3747779)
chr3 (71-147)||(28531031-28531108)
chr3 (183-249)||(25017620-25017685)
chr3 (70-143)||(53863845-53863918)
chr3 (71-141)||(4222167-4222238)
chr3 (163-250)||(7195918-7196005)
chr3 (49-176)||(16140294-16140422)
chr3 (184-222)||(33793584-33793622)
chr3 (50-120)||(36660768-36660838)
chr3 (108-200)||(8455950-8456042)
chr3 (71-147)||(10499082-10499159)
chr3 (71-147)||(31520578-31520655)
chr3 (165-250)||(32094756-32094841)
chr3 (70-146)||(44069783-44069860)
chr3 (71-147)||(51903851-51903928)
chr3 (71-146)||(2667888-2667964)
chr3 (103-147)||(8170731-8170775)
chr3 (72-120)||(18316499-18316547)
[»] chr2 (75 HSPs)
chr2 (49-250)||(44946052-44946253)
chr2 (49-249)||(11941210-11941410)
chr2 (49-250)||(15037956-15038157)
chr2 (49-250)||(33827572-33827773)
chr2 (49-249)||(30466830-30467030)
chr2 (83-250)||(35171831-35171998)
chr2 (69-242)||(36242319-36242492)
chr2 (50-249)||(17324764-17324961)
chr2 (49-250)||(19054022-19054224)
chr2 (49-250)||(24196001-24196200)
chr2 (49-250)||(41313989-41314189)
chr2 (50-222)||(44976180-44976353)
chr2 (68-250)||(34516413-34516589)
chr2 (69-250)||(43374329-43374505)
chr2 (49-249)||(25293163-25293356)
chr2 (68-222)||(10582019-10582171)
chr2 (69-250)||(5394034-5394215)
chr2 (49-250)||(4567428-4567637)
chr2 (49-249)||(27269344-27269550)
chr2 (69-250)||(1191530-1191711)
chr2 (68-250)||(27290604-27290772)
chr2 (51-249)||(41329842-41330039)
chr2 (49-249)||(36390569-36390766)
chr2 (51-250)||(8258896-8259095)
chr2 (49-250)||(8192351-8192551)
chr2 (98-250)||(2140485-2140634)
chr2 (68-249)||(19849849-19850029)
chr2 (125-250)||(28668946-28669071)
chr2 (69-242)||(45271401-45271574)
chr2 (69-249)||(13266507-13266686)
chr2 (123-250)||(3943811-3943938)
chr2 (49-249)||(14946776-14946975)
chr2 (49-245)||(5608038-5608234)
chr2 (131-249)||(714125-714243)
chr2 (71-249)||(29361573-29361745)
chr2 (49-155)||(32845088-32845194)
chr2 (49-249)||(6714295-6714481)
chr2 (49-151)||(18976524-18976625)
chr2 (71-250)||(28194137-28194311)
chr2 (49-179)||(40997420-40997550)
chr2 (53-201)||(1845702-1845853)
chr2 (110-249)||(19174821-19174959)
chr2 (84-201)||(23787056-23787173)
chr2 (152-249)||(44610139-44610236)
chr2 (145-240)||(4769259-4769354)
chr2 (68-249)||(19605846-19606026)
chr2 (159-249)||(31778138-31778228)
chr2 (182-250)||(18692090-18692158)
chr2 (50-164)||(918782-918898)
chr2 (50-129)||(4852556-4852635)
chr2 (175-250)||(14486948-14487023)
chr2 (183-250)||(18976454-18976521)
chr2 (54-190)||(4618744-4618880)
chr2 (69-249)||(29698164-29698343)
chr2 (172-249)||(44929846-44929923)
chr2 (64-160)||(40591195-40591290)
chr2 (163-242)||(45132398-45132477)
chr2 (183-249)||(4852660-4852726)
chr2 (163-249)||(9400961-9401047)
chr2 (108-201)||(19516998-19517091)
chr2 (185-250)||(39957891-39957956)
chr2 (131-222)||(35943762-35943854)
chr2 (70-176)||(13747578-13747684)
chr2 (76-222)||(18708501-18708647)
chr2 (69-221)||(19525428-19525576)
chr2 (195-250)||(1845048-1845103)
chr2 (68-118)||(44610090-44610140)
chr2 (70-222)||(26176225-26176376)
chr2 (50-162)||(7496644-7496756)
chr2 (203-250)||(1501463-1501509)
chr2 (204-250)||(8299858-8299904)
chr2 (50-139)||(18691980-18692069)
chr2 (49-121)||(32526213-32526285)
chr2 (170-222)||(32845194-32845246)
chr2 (51-99)||(38784329-38784377)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (49-250)||(40322-40522)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (51-249)||(7309-7507)
[»] scaffold0366 (2 HSPs)
scaffold0366 (50-250)||(9299-9498)
scaffold0366 (50-250)||(12000-12199)
[»] scaffold0623 (1 HSPs)
scaffold0623 (50-249)||(1057-1255)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (71-250)||(161828-162007)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (49-250)||(52870-53071)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (49-249)||(97366-97566)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (50-250)||(10694-10892)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (49-250)||(41644-41844)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (49-249)||(66759-66951)
[»] scaffold0328 (2 HSPs)
scaffold0328 (49-240)||(14988-15178)
scaffold0328 (111-249)||(13047-13182)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (91-250)||(39131-39290)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (76-249)||(20246-20418)
[»] scaffold0717 (1 HSPs)
scaffold0717 (57-206)||(1-150)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (110-250)||(32346-32485)
[»] scaffold1175 (1 HSPs)
scaffold1175 (140-249)||(2426-2535)
[»] scaffold0199 (2 HSPs)
scaffold0199 (49-144)||(8512-8607)
scaffold0199 (187-249)||(8451-8513)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (51-249)||(29143-29340)
[»] scaffold0460 (1 HSPs)
scaffold0460 (49-142)||(8286-8379)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (49-248)||(27773-27966)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (51-119)||(12884-12952)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (49-142)||(26650-26743)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (71-136)||(11554-11620)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (128-176)||(72601-72650)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (71-146)||(19821-19897)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 85)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40543110 - 40542909
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40543110 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 40543011  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  40543010 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 40542911  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  40542910 tc 40542909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 50 - 250
Target Start/End: Original strand, 22119890 - 22120090
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22119890 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 22119989  T
Q  150 ccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22119990 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 22120089  T
Q  250 c 250  Q
    |    
T  22120090 c 22120090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 7275278 - 7275478
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7275278 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 7275377  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7275378 tccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 7275477  T
Q  249 t 249  Q
    |    
T  7275478 t 7275478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 2751272 - 2751473
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2751272 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 2751371  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2751372 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 2751471  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  2751472 tc 2751473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 7176062 - 7175861
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7176062 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 7175963  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  7175962 tccatacagagcttgctctggctttaaacaggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggatactgagttt 7175863  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  7175862 tc 7175861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 21835152 - 21835353
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21835152 ccatttagggttgacctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 21835251  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  21835252 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 21835351  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  21835352 tc 21835353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 18044108 - 18044308
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18044108 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcccaggttcgattccctcttgtgccaatttcggtgggctaag 18044207  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18044208 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccacaagtgggtggtggaattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggataccgagttt 18044307  T
Q  249 t 249  Q
    |    
T  18044308 t 18044308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21218033 - 21217832
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  21218033 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggctaag 21217934  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21217933 tccatacagagcttgctctagctttaaacgggccccccacaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagttgattcttggatcggataccgagttt 21217834  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  21217833 tc 21217832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 68 - 250
Target Start/End: Original strand, 22703506 - 22703688
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22703506 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacaaagcttgctct 22703605  T
Q  168 ggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||    
T  22703606 ggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattctttgatcggatacccagttttc 22703688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 10091189 - 10091389
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  10091189 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaag 10091288  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||    
T  10091289 tccatacagagcttgctctggctttaaatggggtccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt-gatccgataccgagttt 10091387  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  10091388 tc 10091389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 11997850 - 11998051
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  11997850 ccatttgtggttgggctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggttggctaag 11997949  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11997950 tccatacatagcttgctctggctttaaactgggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 11998049  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  11998050 tc 11998051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 2103056 - 2103255
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  2103056 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaag 2103155  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||    
T  2103156 tccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggattagtcgattcat-gatcggataccgagttt 2103253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17197150 - 17196950
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17197150 ccatttggggtcggcctagtggttggtttgcgatcttggagtttgctcctccataggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgagctaag 17197051  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17197050 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 17196951  T
Q  249 t 249  Q
    |    
T  17196950 t 17196950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 50 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23012707 - 23012507
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    ||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23012707 catttagggttggcccagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtcttaggtttgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagt 23012608  T
Q  150 ccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| | ||||||||||||||||||    
T  23012607 ccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcgtattagtcaattcattgatcggataccgagtttt 23012508  T
Q  250 c 250  Q
    |    
T  23012507 c 23012507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 28089817 - 28090021
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28089817 ccatttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagatgtctcaggttcgataccctctggtgtcaatttcggtgggctaag 28089916  T
Q  149 tccataca----gagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccga 244  Q
    ||||||||    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28089917 tccatacaaagtgagcttgctctggctttaaatgg-gcccccgcaagtgggcgatgagattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccga 28090015  T
Q  245 gttttc 250  Q
    ||||||    
T  28090016 gttttc 28090021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 51 - 250
Target Start/End: Original strand, 27312155 - 27312354
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 150  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||| ||| |||||||| || || |||||    
T  27312155 atttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtttcaggttcgattccctctagtgccaatttcgatgtgccaagtc 27312254  T
Q  151 catacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27312255 catacagagctacctctgactttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 27312354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 2344300 - 2344501
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  2344300 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaagctctcagattcgattccttctggtgccaattttggtgggctaag 2344399  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||    
T  2344400 tccatacagagctttttttggctttaaacgggacccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 2344499  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  2344500 tc 2344501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Original strand, 19421232 - 19421431
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19421232 ccatttggggttgacttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgatttcttctggtgtcaatttcgatgggctaag 19421331  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || || ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  19421332 tccatacagagcttgctctgactttaaatggggcgcccacaagtgggcggtgggattggtctcctcggattagtcgattcttgaatcagataccgagttt 19421431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 27009360 - 27009561
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27009360 ccatttggggttggcctagtggttggcttcggatcttggagtttgctcatccagaggtctcaggttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaag 27009459  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgc-aagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||| |||||| ||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  27009460 tccatacagagcttgctctgactttaaacggggcccctgcaaagtggacggtgggattggtcccctcaaattagtcgattcttggattggataccgagtt 27009559  T
Q  248 tt 249  Q
    ||    
T  27009560 tt 27009561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 31197592 - 31197792
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||  ||||    
T  31197592 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcatccagatgtctcaggtttgattcattatg-tgtcaatttcggtggattaag 31197690  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  31197691 tccatacagatcttgctcttgctttaaacggggcccccgcaagtggtcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 31197790  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  31197791 tc 31197792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 57 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 42913705 - 42913512
Alignment:
Q  57 ggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccataca 156  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | | ||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  42913705 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgatttcatatggtgccaatttcgatgggataagtccatacg 42913606  T
Q  157 gagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  42913605 gaacttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagttgattcttagatcggataccgagttttc 42913512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 90 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 654863 - 654704
Alignment:
Q  90 tttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgca 189  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  654863 tttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgg-gcccccgca 654765  T
Q  190 agtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  654764 agtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggttcttggatcggataccgagttttc 654704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 242
Target Start/End: Original strand, 17212054 - 17212247
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  17212054 ccatttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattctctctggtgccaatttcggtgggctaag 17212153  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggatacc 242  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  17212154 tccatacagagattgctctggcttaaaacgggacccctgcaagtgagtggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagatacc 17212247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 88 - 250
Target Start/End: Original strand, 29861711 - 29861872
Alignment:
Q  88 agtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccg 187  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  29861711 agtttgctcctc-agaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagaacttgctctggctttaaacggggcccccg 29861809  T
Q  188 caagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  29861810 caagtgggcggtgggattgatcccctcgaattagtcgattcttagatcggataccgagttttc 29861872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39145852 - 39145652
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||| |||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  39145852 ccatttgaggttgacctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagatgtcttcggttcgattccctgtggtgccaatttcggtgggctaag 39145753  T
Q  149 tccat-acagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||| ||||    
T  39145752 tcaataacagagcttgctctggctttaaacgg-gcccctgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttgaatcagataccaagtt 39145654  T
Q  248 tt 249  Q
    ||    
T  39145653 tt 39145652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Original strand, 32849592 - 32849791
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| || ||||||| |||||||||||    
T  32849592 ccatttggggttagcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcgggtttgattccctctagtctcaattttggtgggctaag 32849691  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||  | |||  |||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32849692 tccacactgagcttgctctggctttaaatgggactcccataagtgggcagtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggataccgagttt 32849791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 88 - 250
Target Start/End: Original strand, 16374034 - 16374196
Alignment:
Q  88 agtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccg 187  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||||    
T  16374034 agtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacagaatttgctatggctttaaacgggacccccg 16374133  T
Q  188 caagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16374134 caaatggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 16374196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 57 - 249
Target Start/End: Original strand, 28950877 - 28951072
Alignment:
Q  57 ggttggtctaatggttggcttgggatcttggagt---ttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccat 153  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  28950877 ggttggcctagtggttggcttggggtcttggagtagtttgctccttcagaggtctcaggttcgactccctctggtgccaatttcggtgggctaagttcat 28950976  T
Q  154 acagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  28950977 atagagcttgctctggctttaaacgggtccctcgcaagtcggcggtgggattggtcccctcgaactagacaattcttggatcggataccgagtttt 28951072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 70 - 250
Target Start/End: Original strand, 31273936 - 31274115
Alignment:
Q  70 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctgg 169  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31273936 gttgacttgggatcttggagtttgctcctccagagctctcaagttcgattccctctggagctaatttcggcgggctaagtccatacagagcttgctctgg 31274035  T
Q  170 ctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||||| | | |||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  31274036 ctttaaacgg-ggctccgcaagtgggcagtgagattggtcccctcgaattagtcgattcttggaccggataccgagttttc 31274115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 249
Target Start/End: Original strand, 27704004 - 27704202
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||    
T  27704004 catttggagttggtccagtggttggcttgagatcttgaagtttgctcctacagaggtctcaggttcgatttcctttggtgccaatttcggtgggctaagt 27704103  T
Q  150 ccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||  |||| ||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||    
T  27704104 ccatagagagcttgctttggctttaaatgga-cccccgcaagtgggtggtgtgattgatcccctcagattagtcgattcttgaatcagataccgagtttt 27704202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Original strand, 22638293 - 22638488
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||| | || |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||    
T  22638293 ccatttggggttggtctagtggttgacttgagatcttagagtttgctctttcaaaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaag 22638392  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    | ||    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22638393 ttca----gagcttgctctggctttaaacggggcctccgcaagtgggcggtgggattgatctcctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 22638488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9718187 - 9717986
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  9718187 ccatttgaggttggcctagtggttggcctgagatattggagtttgctcctccaaaagtctcaagttcgattccctctggtgtcaatttcgatgggctaag 9718088  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||| |||| |||| ||||||    
T  9718087 tccatagagagcttgctctggctttaaacggggccctcacaaatgagcggtggaattggtctcctcgaattagtcggttcttgaatcgaatactgagttt 9717988  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  9717987 tc 9717986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 50 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13332622 - 13332433
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  13332622 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctcctgaggtctcaggtacgattccctctggagccaatttcggtgggctaagt 13332523  T
Q  150 ccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||| |         ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  13332522 ccatacagagcttactctggctttaaac--aggccccgcaagtggcc---------ggtccactcggattagtcgattcttggatcagataccgagtttt 13332434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 43785499 - 43785298
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||  || |||  |||||| |||| |||||    
T  43785499 ccatttggggttgacctaatggttggcttgggatctttgagattgctcctccaaaggtctcaagttcgattcccacttgtgctaatttcagtggactaag 43785400  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||    
T  43785399 tccatacagagcttactctggttttaaacggggcctccgcaagtggacggtgagattggtccccttggattagtcgatttttggatcggataccgagctt 43785300  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  43785299 tc 43785298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 250
Target Start/End: Original strand, 23092171 - 23092298
Alignment:
Q  123 tctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23092171 tctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatggacggtgggattggtcccctcggattagt 23092270  T
Q  223 atattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
      |||| |||||||||||||||||||||    
T  23092271 cgattcatggatcggataccgagttttc 23092298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 131 - 249
Target Start/End: Original strand, 3851840 - 3851958
Alignment:
Q  131 caatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattctt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||    
T  3851840 caatttcggtgggctaagtccatatagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 3851939  T
Q  231 ggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3851940 ggatcggataccgagtttt 3851958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 80 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36772471 - 36772303
Alignment:
Q  80 gatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgg 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |  ||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36772471 gatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggtttgatttccccta-tgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacgg 36772373  T
Q  180 agcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
     |||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  36772372 ggcccccgggagtgggcggtggaattagtcctctcggattagtcgattctttgatcggataccgagtttt 36772303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22643515 - 22643342
Alignment:
Q  76 ttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaa 175  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | |||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22643515 ttgggatcttgaagtttactccactagaggtcttatgttcgatttcctctgatgtcaatttcggtaggctaagtccatacagagcttgctctgactttaa 22643416  T
Q  176 acggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||| |  |||||| |||| |||||| ||||||    
T  22643415 acggagccctcgcaagtggccggtgtgattagtcccctcggattaatcgattctttgatcagataccaagtttt 22643342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7800032 - 7799905
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  7800032 ccatttggggttgacctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggttaag 7799933  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaa 176  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  7799932 tccatagagagcttgctatggctttaaa 7799905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Original strand, 9683827 - 9684026
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9683827 ccatttgcggttggcctagtggttgacttgagatctgggagtttgctcctctagaggtctcaggcctaattccctctagtgccaatttcggtgggctaag 9683926  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||| | || ||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||    
T  9683927 tccataccgagcttactctggctttaaacggggtccccacaagtgggcggtaggataggtcccctcggattaatcgattcttggatcgattaccgagttt 9684026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31713095 - 31712902
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||| | ||||||| ||||        | ||||    
T  31713095 ccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctcgagaggtctcaggattgatttcctctggtgccaata-------gataag 31713003  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31713002 tccatacaacgcttactctggctttaagcgggaccctcgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 31712903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 103 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41907659 - 41907514
Alignment:
Q  103 aggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgga 202  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||     
T  41907659 aggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcagtgggctaagtccatacagaggttgctctggctttaaacgtggcccccgcaagtgggtggtggg 41907560  T
Q  203 attggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  41907559 attggtcccc-cagattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 41907514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 51 - 249
Target Start/End: Original strand, 28646972 - 28647170
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 150  Q
    |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||| |||| |||   |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  28646972 atttggggttggcctagtgattgacttgggatcttggagtgtgcttctctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc-aagtc 28647070  T
Q  151 catacagag-cttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
     ||||||||  ||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||| | | ||||||||||||| ||||||||    
T  28647071 aatacagagttttgctctggcttataacggggcccccacaagtgggcggtgggattggttccctcgaattagtctgtccttggatcggatatcgagtttt 28647170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23330939 - 23330738
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||   |||||| |||||||| ||| || |||| |||||||||||||| |||    
T  23330939 ccatttggggttagcctagtggttggcttgggattttagagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgactccctccggtgccaatttcggtgggc-aag 23330841  T
Q  149 tccatacagagctt-gctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||  || |||||||||||||||   ||||||||||||  ||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  23330840 tccatacagagctttgctctggcttaaaacgggacctccgcaagtgggcggtaagattggtcccctcaaattagtcaatccttggatcggataccgagtt 23330741  T
Q  248 ttc 250  Q
    |||    
T  23330740 ttc 23330738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 51 - 176
Target Start/End: Original strand, 42814867 - 42814992
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 150  Q
    |||||| |||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42814867 atttggagttggcttagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctcttgaagtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 42814966  T
Q  151 catacagagcttgctctggctttaaa 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||    
T  42814967 catacaaagcttgctctgactttaaa 42814992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21574303 - 21574101
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattcct-tctggtgtcaatttcggtgggctaa 147  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   |||||  ||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||| ||    
T  21574303 ccatttggggttggcctagtggttggtttgggattttggagtgtgctcctctcaaggtcacaggttcgattcccctttggtgccaacttcggtgggc-aa 21574205  T
Q  148 gtccatacagagctt-gctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagt 246  Q
    ||||||||||||||| || | |||||  ||||| |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  21574204 gtccatacagagctttgcccaggcttagaacggggcccccacaagtaggcggtgagattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagt 21574105  T
Q  247 tttc 250  Q
    ||||    
T  21574104 tttc 21574101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33137950 - 33137825
Alignment:
Q  123 tctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33137950 tctggtgtcaattttagtgggctaagtccatacagagctcgctctagctttaaatggggccct-gcaagtgggcggtgaaattggtcccctcgaattagt 33137852  T
Q  223 atattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
      |||||| ||||||||| ||||||||    
T  33137851 cgattcttagatcggatatcgagtttt 33137825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 76 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14199839 - 14199715
Alignment:
Q  76 ttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaa 175  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  14199839 ttggaatcttggagtttcctcctccagaggtctcaggttcgattccctctaatgccaattttggtgggctaagtctatatagagcttgctctgcctttaa 14199740  T
Q  176 acggagcccccgcaagtgggcggtgg 201  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||    
T  14199739 acgg-ggccccgcaagtgggtggtgg 14199715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 249
Target Start/End: Original strand, 22696322 - 22696522
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||   | |    
T  22696322 cattaggggttggcctagtggttgatttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtggg--gact 22696419  T
Q  150 ccatacagagc-ttgctctggctttaaacggagcccc--cgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagt 246  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||  |||||  ||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  22696420 ccatacagagctttgctctggcttagaacgaggcccccgcgcaagtaggcggcgggattggtcctctcggattagtcggtccttggatcggataccgagt 22696519  T
Q  247 ttt 249  Q
    |||    
T  22696520 ttt 22696522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 222
Target Start/End: Original strand, 21373793 - 21373884
Alignment:
Q  131 caatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||||||||    
T  21373793 caatttcggtgggctaagtctatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgagattggtcctcacggattagt 21373884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8435895 - 8435745
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||    
T  8435895 ccatttggggttggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctttgaagatcttaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggc-aag 8435797  T
Q  149 tccatacagagc-ttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgg 201  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||||   | |||||||||||||||| ||||    
T  8435796 tccatacaaagctttgttttggctttaa--tgggcccccgcaagtgggcagtgg 8435745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 145
Target Start/End: Original strand, 22299869 - 22299946
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggct 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22299869 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 22299946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 120
Target Start/End: Original strand, 23854397 - 23854468
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattc 120  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23854397 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattc 23854468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 25333420 - 25333603
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||   |||||||| |||| |||     
T  25333420 ccatttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgataccctctggcaccaatttcgttgggttaa- 25333518  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
                   ||||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  25333519 ---------------ctctgactttaaacaggccccccgcaagtgggcagtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcgga-accgagttt 25333602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 145
Target Start/End: Original strand, 40332100 - 40332196
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggct 145  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  40332100 ccatttggagttggtctagtggttggcttgaaatcttggagtttgctcctctaaaggtctcaggttcgatttcctctggtgtcaatttcgatgggct 40332196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 114
Target Start/End: Original strand, 28003838 - 28003902
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggtt 114  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28003838 catttggggttgatctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaagtcttaggtt 28003902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38864645 - 38864446
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    ||||||||||||  ||| |||||| |||| |||||| ||||||| |  |||||| |||| | ||| |||||||| | ||| |||||||||||| | ||||    
T  38864645 catttggggttgacctagtggttgacttgagatctttgagtttgtttttccagaagtctcacgtttgattccttttagtgccaatttcggtggaccaagt 38864546  T
Q  150 ccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
      |    |||||||||||| |||||||||||  ||| |||| ||| |||||  |||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||    
T  38864545 gtaccgcgagcttgctctgactttaaacggaatccctgcaaatggacggtgatattggtcctctcgaattagtcaattcttggatcggatatcgaatttt 38864446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 185
Target Start/End: Original strand, 6491675 - 6491744
Alignment:
Q  116 gattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccc 185  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6491675 gattccctctggtgtcaatttcgatgggctaaattcatacagagcttgctttggctttaaacggtgcccc 6491744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8943502 - 8943409
Alignment:
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagccccc-gcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggatac 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||    
T  8943502 tccatacagagcttggtctggttttaaacgggcccccccgcaagtgggcggtgtgattggtccccttgaattagtcgattcttggatcggatac 8943409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 121
Target Start/End: Original strand, 21370598 - 21370670
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattcc 121  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  21370598 ccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttactccttcagatgtctcaggttcgattcc 21370670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 239
Target Start/End: Original strand, 47541387 - 47541574
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 150  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||   |||| ||| ||| |||||  | |||||||||||||||||| | ||||     
T  47541387 atttgggattggcctaatggttggtttcagatcttggagtgtgctcctctcaaggttttaagtttgattctctttggtgtcaatttcggtggac-aagtt 47541485  T
Q  151 catacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggat 239  Q
    ||| |||   ||||| ||||||  |||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||  || ||| ||||||||    
T  47541486 catccaggctttgctttggcttagaacgggccccccgcaagtggacagtggaattggtccccttagattagtcgatccttagatcggat 47541574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12211735 - 12211625
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||   || ||| ||||| |||| | ||||||| |||||||| ||| | |||    
T  12211735 ccatttggggttggcctagtggttggcttaggatcttggagtgtgctcctctcaagatctcaggtttgatttcctctggtgccaatttcgatggac-aag 12211637  T
Q  149 tccatacagagc 160  Q
    ||||||||||||    
T  12211636 tccatacagagc 12211625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1766280 - 1766149
Alignment:
Q  112 gttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagctt-gctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcc 210  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||  ||||||  ||||| |||||  |||||||||||| | ||||||||    
T  1766280 gttcgattcccttttgtgtcaatttcggtggg-taagtccatacagaactttgccttggcttagaacggggcccca-caagtgggcggttggattggtcc 1766183  T
Q  211 cctcggattagtatattcttggatcggataccga 244  Q
    ||||||||||||   | |||| ||||||||||||    
T  1766182 cctcggattagtcggtacttgaatcggataccga 1766149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 49 - 222
Target Start/End: Original strand, 9769587 - 9769758
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||   | || |  |||| |||||  |||| |||||||||| |||||| |||    
T  9769587 ccatttggggttgggctaatggttgatttggaatcttggagtgtgctcctctcaatgtttcgggtttgattctctctgatgtcaatttcagtgggc-aag 9769685  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    | ||| ||||||||| |||| |||  ||||| |||||||||| | | |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  9769686 ttcattcagagcttgttctgtcttagaacggggcccccgcaaat-gacggtgggattggtccccttgaattagt 9769758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 22264702 - 22264618
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaa 133  Q
    |||||||||||||| | || |||||| |||| |||||||||||||||||||   |||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  22264702 ccatttggggttggccgaagggttggtttggaatcttggagtttgctcctctcaaggtctcagattcgattccctctggtgtcaa 22264618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 161
Target Start/End: Original strand, 36173036 - 36173147
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||| || ||   |||| | |||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  36173036 ccatttggggttggccttatgattgacttgggattttggagtttgttcatctcaaggtttcaggttcgattccctcttgtgccaattttggtgggc-aag 36173134  T
Q  149 tccatacagagct 161  Q
    |||||||||||||    
T  36173135 tccatacagagct 36173147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25102895 - 25102809
Alignment:
Q  162 tgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||    
T  25102895 tgctctggctttaaacagggcccccgcaagtga-cggtgggattggttccttcggattagtcgattcttggatcagataccgattttt 25102809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 25956342 - 25956258
Alignment:
Q  71 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccataca 156  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||   ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25956342 ttggcttgggaccttggagtgtgctcctctcaaggtcttaggttcaattctccctggtgtcaatgtcggt-ggctaagtccataca 25956258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 248
Target Start/End: Original strand, 35476402 - 35476541
Alignment:
Q  109 taggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagctt-gctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattgg 207  Q
    ||||||||||||  | ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||  |||| |||| ||  ||||||||||||    
T  35476402 taggttcgattctctttggtgccaattttggtggg-taagttcatacagagctttgctctggcttagaacgggacccctgcaaatgaccggtggaattgg 35476500  T
Q  208 tcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    || ||| ||||||||   |  || |||||||||||||||||    
T  35476501 tctccttggattagtcggtctttagatcggataccgagttt 35476541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 3951190 - 3951140
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggctt-gggatcttggagtttgctcctc 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3951190 catttggggttggtctagtggttggcttggggatcttggagtgtgctcctc 3951140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 35173190 - 35173132
Alignment:
Q  91 ttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  35173190 ttgctcctccaaaggtctcaggtttgatttcctctgatgtcaatttcggtgggctaagt 35173132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 119
Target Start/End: Original strand, 577681 - 577750
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgatt 119  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  577681 catttggggttggcctagtggtttgcttgggatcttagagtttgctcatttcaaggtcttaggttcgatt 577750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 147
Target Start/End: Original strand, 5934147 - 5934224
Alignment:
Q  71 ttggcttgggatcttggagtttgctcctcca-gaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaa 147  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||| | | |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5934147 ttggcttgggatctgggagtgtgctcctccttgaggtttcatgttcgattccctctggtgtcaatttaggtggactaa 5934224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 165
Target Start/End: Original strand, 47380903 - 47381014
Alignment:
Q  53 ttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtcca 152  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||   || | |||||||||||||   || ||| ||||||||||| || |||||||    
T  47380903 ttggggttggcctagtggttggcttgagattttgtagtttgctcttctcaagattttaggttcgattctcacttgtgccaatttcggtgtgc-aagtcca 47381001  T
Q  153 tacagagcttgct 165  Q
    |||| ||||||||    
T  47381002 tacatagcttgct 47381014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 249
Target Start/End: Original strand, 36395496 - 36395547
Alignment:
Q  198 gtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||    
T  36395496 gtggaattggtcctctcggattagtcgattcttggattggataccgaatttt 36395547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 250
Target Start/End: Original strand, 22299958 - 22300004
Alignment:
Q  204 ttggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22299958 ttggtcctctcggattagtcgattcttgaatcggataccgagttttc 22300004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 157
Target Start/End: Original strand, 37056217 - 37056322
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 150  Q
    ||||||||||| | || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||   |||| | || ||||||| | ||||||| |||||||| ||| | |||||    
T  37056217 atttggggttgatttagtggttggtttgtgatcttggagtgtgctcctctcaaggtttgagattcgatttcctctggtgccaatttcgatggac-aagtc 37056315  T
Q  151 catacag 157  Q
    |||||||    
T  37056316 catacag 37056322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 218
Target Start/End: Original strand, 40332193 - 40332243
Alignment:
Q  168 ggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggat 218  Q
    ||||||| |||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40332193 ggctttagacggggcctccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggat 40332243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 30345564 - 30345511
Alignment:
Q  194 ggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||    
T  30345564 ggcggtgggattggtcccctcgggttagtcggttcttagatcggataccgagtt 30345511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 162
Target Start/End: Original strand, 1469114 - 1469225
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||  ||||||||||||| || ||   |||||| |||||||||| | | |  || |||||||| ||||| ||||    
T  1469114 catttggggttggcctagtggttgacttgaaatcttggagtttgttcatctcaaggtctcaggttcgatttcctttaatgccaatttcgatgggc-aagt 1469212  T
Q  150 ccatacagagctt 162  Q
    ||||||| |||||    
T  1469213 ccatacaaagctt 1469225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11910080 - 11909981
Alignment:
Q  123 tctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc-ttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattag 221  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||  ||| ||| ||| ||||||||||  |||||  ||||||| |||||| |||||||| |||| |||||    
T  11910080 tctggtgtcaattttggtggtc-aagtccatacgaagctttgttctagctttaaacgaggcccctacaagtggacggtgggattggtcctctcgaattag 11909982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23636683 - 23636592
Alignment:
Q  131 caatttcggtgggctaagtccatacagagctt-gctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||| | ||||| | |||||| ||||| |  |||||||||||    
T  23636683 caatttcggtgggtta-gtccatatagagctttgctctggctttaaatggggccctcacaagtagacggtgggattggacttctcggattagt 23636592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43617388 - 43617356
Alignment:
Q  181 gcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccct 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43617388 gcccccgcaagtgggtggtggaattggtcccct 43617356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 48125225 - 48125149
Alignment:
Q  70 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggcta 146  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |||||| |||    | |||| ||||||||||||||||    
T  48125225 gttggcttgggaccttggagtgtgctcctccgaaggtctcaggttcaattttccccggtgccaatttcggtgggcta 48125149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 48983750 - 48983706
Alignment:
Q  103 aggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaa 147  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  48983750 aggtctcaggttcgattccctctagtgtcaatttgggtgggctaa 48983706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 65)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 2618187 - 2618388
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  2618187 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttgggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaag 2618286  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  2618287 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggattccgagttt 2618386  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  2618387 tc 2618388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 4718646 - 4718847
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4718646 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 4718745  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4718746 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 4718845  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  4718846 tc 4718847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34237855 - 34237654
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  34237855 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 34237756  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34237755 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 34237656  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  34237655 tc 34237654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3734823 - 3734622
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3734823 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 3734724  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3734723 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcagtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 3734624  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  3734623 tc 3734622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 39349257 - 39349458
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  39349257 ccatttggggttggcccagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 39349356  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  39349357 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggatcggataccaagttt 39349456  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  39349457 tc 39349458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15259606 - 15259407
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15259606 ccatttggggttggtctagtggttggtttgggatcttggattttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 15259507  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  15259506 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgtaattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggatgccgagttt 15259407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 51 - 248
Target Start/End: Original strand, 28193477 - 28193674
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 150  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28193477 atttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtc 28193576  T
Q  151 catacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28193577 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccctacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 28193674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 59 - 249
Target Start/End: Original strand, 21603241 - 21603431
Alignment:
Q  59 ttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacaga 158  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  21603241 ttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtgggctaagcccatacaga 21603340  T
Q  159 gcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21603341 gcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 21603431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 20305909 - 20306110
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20305909 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctccaaaggtctcagtttcgattccttctggtgccaatttcgatgggctaag 20306008  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  20306009 tccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgatccttggatcggataccgagttt 20306108  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  20306109 tc 20306110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 21092542 - 21092743
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21092542 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctccaaaggtctcagtttcgattccttctggtgccaatttcgatgggctaag 21092641  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  21092642 tccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgatccttggatcggataccgagttt 21092741  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  21092742 tc 21092743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 32879280 - 32879481
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32879280 ccatttggggttggtctagtggttgacttgggatcttcgagtttggtcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 32879379  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    | |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  32879380 ttcatacagagcttgctctgacattaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggattggataccgagttt 32879479  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  32879480 tc 32879481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 42643318 - 42643118
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  42643318 ccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaag 42643219  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  42643218 tccatacagagcttgctctgtcttgaaacgggggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgcattagttgattcttggatcggataccgagttt 42643119  T
Q  249 t 249  Q
    |    
T  42643118 t 42643118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 64 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8765711 - 8765525
Alignment:
Q  64 ctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttg 163  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8765711 ctaatgattggcttgagatcttggagtttgctcccccagagatctcaggttcgattccctctggtgccaatttcgatgggctaagtccatacagagcttg 8765612  T
Q  164 ctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8765611 ctctggctttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 8765525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 19471610 - 19471812
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| |||| ||||||    
T  19471610 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgagctaag 19471709  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggag-cccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  19471710 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcgaattagtcgatacttggatcggataccgagtt 19471809  T
Q  248 ttc 250  Q
    |||    
T  19471810 ttc 19471812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 19542534 - 19542736
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| |||| ||||||    
T  19542534 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgagctaag 19542633  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggag-cccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  19542634 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcgaattagtcgatacttggatcggataccgagtt 19542733  T
Q  248 ttc 250  Q
    |||    
T  19542734 ttc 19542736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19590162 - 19589960
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| |||| ||||||    
T  19590162 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgagctaag 19590063  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggag-cccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  19590062 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcgaattagtcgatacttggatcggataccgagtt 19589963  T
Q  248 ttc 250  Q
    |||    
T  19589962 ttc 19589960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4698903 - 4698722
Alignment:
Q  69 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 168  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  4698903 ggttggtttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatgaagaacttgctctg 4698804  T
Q  169 gctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  4698803 gctttaaacggagcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcatggattggataccgagttttc 4698722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Original strand, 14632975 - 14633156
Alignment:
Q  69 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14632975 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtctatacagagcttgctctg 14633074  T
Q  169 gctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||| ||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  14633075 gctttgaacggagcgtccacaagtgggcggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggataccaagttttc 14633156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 42328006 - 42328206
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  42328006 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagttt-ctcctccagaggtgtcaggtttgattccctctgttgccaatttcggtgggctaag 42328104  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  42328105 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccacaagtggacgatgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 42328204  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  42328205 tc 42328206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 71 - 249
Target Start/End: Original strand, 20469940 - 20470117
Alignment:
Q  71 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20469940 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagagccaatttagatgggctaagtccatacagagcttgctctggc 20470039  T
Q  171 tttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  20470040 tttaaacagagcccccgcaagtgggcggtgggattggt-tcctcggattagtcgatttttggatcggataccgagtttt 20470117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27746535 - 27746334
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  27746535 ccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 27746436  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagt-gggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||| ||    
T  27746435 tccatacagagcttgctctggctttaaaagg-ggccccacaagtggggcgatggaattagtcccctcggattagtcgattcttggatcgaatatcgattt 27746337  T
Q  248 ttc 250  Q
    |||    
T  27746336 ttc 27746334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 18532108 - 18532300
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  18532108 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctcagatgtcaatttcggtgggctaag 18532207  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||         ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18532208 tccatacagaacttgctctggatttaaacggggcccctgcaagtgggcggtgagatt---------ggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 18532298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 51 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 264597 - 264400
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 150  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  264597 atttggcgttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtc 264498  T
Q  151 catacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  |||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  264497 tatacatagcttgctctggctttaaacgg-gcccccacaaatgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgaatttt 264400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 51 - 249
Target Start/End: Original strand, 651324 - 651521
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 150  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  651324 atttggcgttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtc 651423  T
Q  151 catacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  |||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  651424 tatacatagcttgctctggctttaaacgg-gcccccacaaatgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgaatttt 651521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 51 - 249
Target Start/End: Original strand, 837059 - 837256
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 150  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  837059 atttggcgttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtc 837158  T
Q  151 catacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  |||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  837159 tatacatagcttgctctggctttaaacgg-gcccccacaaatgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgaatttt 837256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 68 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34610868 - 34610686
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 167  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| || |||||| |||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  34610868 tggttggcttaggattttggagtttgttcatccagatgtctgaggttcgattccctctgatgccaatttcggtggtctaagtctatacagagcttgctct 34610769  T
Q  168 ggctttaaacggagcccc-cgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  34610768 ggctttaaacg-agcccctcgcaagtgggcggtagaattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 34610686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 51 - 250
Target Start/End: Original strand, 24018385 - 24018585
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 150  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||  |||||||||| ||||||||||||    
T  24018385 atttggggttgatctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctgaggttcgatttcctctaatgtcaatttcagtgggctaagtc 24018484  T
Q  151 catacagagcttgctctggctttaaacggagc-ccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||  ||||||||||| | ||||||   |||||||| |||||| ||||||||    
T  24018485 catacagagcttgctctggctttaaacgggcctccccacaagtgggcggtgagattggtccccttgaattagtcggttcttggaccggatatcgagtttt 24018584  T
Q  250 c 250  Q
    |    
T  24018585 c 24018585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 240
Target Start/End: Original strand, 28088287 - 28088478
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  28088287 ccatctggggttggcttagtggttgacttgggatcttggagtttgttcatccagaggtctcagattcgattccctttggtgtcaatttcggtgggttaag 28088386  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggata 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  28088387 tccatacagagcttgctctgactttaaatggggcctccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcagaatagtcgattcttggatcggata 28088478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 103 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6953153 - 6953008
Alignment:
Q  103 aggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgga 202  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||     
T  6953153 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagttggcggtggg 6953054  T
Q  203 attggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  6953053 attggt-ccctcggattagtcgattcttggatcgaataccgagtttt 6953008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 211
Target Start/End: Original strand, 21667551 - 21667713
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | | |||||||||| | | |||||  |||||||||||||||||    
T  21667551 ccatttgaggttggtctagtggttggcttggaatcttggaggttgctcctccaaagatttcaggttcgatttcctttggtgctaatttcggtgggctaag 21667650  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtccc 211  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  21667651 tccatacagagcttgctctgcctttaaacggagcatccgcaagtgggcggtggaattggtccc 21667713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 28964034 - 28964234
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||   |||| | | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  28964034 ccatttggggttggtctagtggttggtttgagatcttagagtttgctcctcttaaggtttcatgttcgattccatctggtgccaatttcggtgggctaag 28964133  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| |||| ||||||    
T  28964134 tccatacggagctatgtctggctttaaacggggcccccgcaagtgggc-gtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttagatcgaatactgagttt 28964232  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  28964233 tc 28964234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7558143 - 7557952
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  7558143 ccatttggggttggcctagtagttagcttgggatcttggagtttgctcctccagaagtctcagattcgatttcctctggtgccaattttggtgggctaag 7558044  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||       ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||||||||||||||    
T  7558043 tcc-------gcttgttctggctttaaacgga-cccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgatttttgcatcggataccgagttt 7557952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 249
Target Start/End: Original strand, 2166721 - 2166897
Alignment:
Q  70 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctgg 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2166721 gttggtttgggatcttggagtttgcttctccaaaggtctcaggttcgattccctc--gtgccaatttcagtaggctaagtccatacagagcttgctctgg 2166818  T
Q  170 ctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||   || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| || ||| ||||||||||||||    
T  2166819 ctttaaata-agaccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgattttttgattggataccgagtttt 2166897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 101 - 249
Target Start/End: Original strand, 10292108 - 10292255
Alignment:
Q  101 agaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtg 200  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  10292108 agaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcagtgggctgagtccat-cagagattgctctggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtg 10292206  T
Q  201 gaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    | ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  10292207 ggattggtcccttcggattagttgattcttggatcgaataccgagtttt 10292255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 249
Target Start/End: Original strand, 25248411 - 25248547
Alignment:
Q  110 aggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtc 209  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  25248411 aggttcgattccctctggtgtcaatttcggtaggctaagtc-atacagagtttgctctggctttaaacgg-gccctcgcaagtgggcggtgggattggtc 25248508  T
Q  210 ccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  25248509 ccctcggattagtcgatt-tttgatcggataccgagtttt 25248547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34694776 - 34694574
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||     
T  34694776 ccatttggggttggtctagtggttgacttgtgatcttggagtttgctcctctcaaggtcttaggttcgattccatctggtgccaatttcggtgggc-aaa 34694678  T
Q  149 tccatacagagc-ttgctctggctttaaacgg-agcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagt 246  Q
    | |||||| ||| |||||| |||||  ||||| | ||||| | ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||| |||||    
T  34694677 ttcatacaaagctttgctccggcttagaacggaatccccctctagtggacggtgggattggtcccctcagattagtctgtccttggatcggataacgagt 34694578  T
Q  247 tttc 250  Q
    ||||    
T  34694577 tttc 34694574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 249
Target Start/End: Original strand, 18128533 - 18128714
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagctt-gctc 166  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||    ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||    
T  18128533 tggttgacttgggatcttgaagtgtgctcctttcaaggtcttagattcgattctctctggtgccaatttcggtgggcgaa-tccataaagagctttgctc 18128631  T
Q  167 tggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  18128632 tggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcctctcagattagtcggttcttggatcgaataccgagtttt 18128714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26169048 - 26168856
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||| ||| || |||||||||||||| |||    
T  26169048 ccatttagggttggcctagtggtttgcttgggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggtttgattcctcctgatgccaatttcggtgggc-aag 26168950  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccc-cgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggatacc 242  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||    
T  26168949 ttcatacagagcttgttctggctttaaa-tgagcccctcgcaagtgggggatgagattggtcccctcggagtagtcgattcttggatcgaatacc 26168856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9047459 - 9047278
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 167  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||| |||  || |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  9047459 tggttggtttgagatcttggagtttgctcctccaaaggttttaagtttgattccctctaatgccaattttggtggactaagtccatacaaagcttactct 9047360  T
Q  168 ggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||| |||| | ||||||   ||||||||||||||||||| |||||    
T  9047359 gactttaaacggaacccccgcatgtggacagtggaattggt-cccttgaattagtcggttcttggatcggataccgaattttc 9047278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 2639499 - 2639410
Alignment:
Q  161 ttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2639499 ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 2639410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 49 - 208
Target Start/End: Original strand, 24999243 - 24999394
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||||||  |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||| |||| || |||||| | |||||||||    
T  24999243 ccatttgggg--ggtctagtggttgacttgggatcatggagtttgcta------aggtcttaggttcgattccctctgatgccaattttgatgggctaag 24999334  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggt 208  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24999335 ttcatatagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt 24999394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 36848949 - 36848757
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||||||||||  || |||||| |||||| | ||||||||||||||||   |||| |||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  36848949 ccatttggggttggcatagtggttgacttgggtttttggagtttgctcctctcaaggttttagattccatttcctctggtgccaatttcggtgggctaag 36848850  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggatacc 242  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||  ||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||   || ||||||||||||||    
T  36848849 tccatacggagtttgctcgggctttaaa-tgaggcaccacaagtgggcggtgggattagtcccctcaaattagtcggtttttggatcggatacc 36848757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 250
Target Start/End: Original strand, 1219411 - 1219551
Alignment:
Q  110 aggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtc 209  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| | || ||||    
T  1219411 aggttcgattccctctgatatcaatttcagtgggctaagtccatacagaatttgttctggctttaaacggggcccccataagtgggcggtaggatcggtc 1219510  T
Q  210 ccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    || ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||    
T  1219511 ccttcggattagtcgattcttagatcgaataccgaattttc 1219551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 222
Target Start/End: Original strand, 28908823 - 28908997
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctt--aggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaa 147  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||   |||| ||  |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||| ||    
T  28908823 catttggagttggtctagtggttggtttggaattttggagtttgctcctctcaaggtgtttcaggttcaattccctctggtgtcaattacagtgggc-aa 28908921  T
Q  148 gtccatacagagc-ttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||    
T  28908922 gtccatacagagctttgttctggctttaaacggggctcccgcaagtgggcgatgtgattgatcccctcagattagt 28908997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34639406 - 34639237
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  34639406 ccatttggggttagtctagtggttggcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggctcga-tccctctggtgccaatttcggtggg-taag 34639309  T
Q  149 tccatacagagc-ttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggatta 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| | |||||||| |||| | ||||||||| ||| ||||    
T  34639308 tccatacagagctttgctctggcttagaacgg-gcctctgcaagtggacggtaggattggtcccttcgaatta 34639237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3403682 - 3403502
Alignment:
Q  69 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc-ttgctct 167  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||   |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | | ||| | |    
T  3403682 ggttggcctgagatcttggagtttgctcatctcaaggtcttatgttcgattccatctggtgccaatttcggtgggc-aagtccatacaaaactttgtttt 3403584  T
Q  168 ggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||| || |||| || ||||||||||||   |||||||||||| ||||||  |||||| || | |||||||||||||    
T  3403583 ggctttaaatggggccctcgtaagtgggcggtgaggttggtcccctcgaattagtcaattcttagaccagataccgagtttt 3403502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 250
Target Start/End: Original strand, 33746944 - 33747084
Alignment:
Q  110 aggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagctt-gctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggt 208  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| || || ||| | ||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33746944 aggttcgattccctctagtgttaatttcggtgggcaaattc-atataaagctttgttctggtttagaacggagcccccgcaagtggacggtggaattggt 33747042  T
Q  209 cccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
     | |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  33747043 tctctcggattagtcgatccttggatcggataccgagttttc 33747084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 222
Target Start/End: Original strand, 13749077 - 13749230
Alignment:
Q  69 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgatt-ccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagctt-gctc 166  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||   |||| | |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||| ||||    
T  13749077 ggttgacttgggat-ttggagtctgctcctctcaaggtttcaggttcgatttccttc-ggtgccaattttggtgggc-aagttcatacaaagctttgctc 13749173  T
Q  167 tggctttaaacggagcccc-cgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    ||||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13749174 tggcttagaacggggccccccgcaagtgggcagtggaattggtcccctcggattagt 13749230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 165
Target Start/End: Original strand, 8042655 - 8042764
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||       ||||| |||||| ||||||||| |    
T  8042655 ccatttggggttgacctagtgcttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaagtctcaggttcga-------tggtgccaattttggtgggctatg 8042747  T
Q  149 tccatacagagcttgct 165  Q
    ||||||||||| |||||    
T  8042748 tccatacagagtttgct 8042764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 162
Target Start/End: Original strand, 41070767 - 41070874
Alignment:
Q  54 tggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccat 153  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||   |||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  41070767 tggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtgtgctactctcaaggtctcaagttcgattccctttggtgtcaatttcggtgggc-aagttcat 41070865  T
Q  154 acagagctt 162  Q
    ||| |||||    
T  41070866 acatagctt 41070874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 49 - 162
Target Start/End: Original strand, 3794792 - 3794904
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||   |||||| | ||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| |||    
T  3794792 ccatttgtggttgacctaatggttggcttaggatcttgaagtttgctcctctcaaggtctcatgttcggttccctctggtgccaatttcggcgggc-aag 3794890  T
Q  149 tccatacagagctt 162  Q
    | |||||| |||||    
T  3794891 ttcatacaaagctt 3794904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 43817851 - 43817754
Alignment:
Q  147 agtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccga 244  Q
    |||||||| |||| | ||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |  ||||||||||||||| ||||    
T  43817851 agtccatatagagttcgctctagctttaaacaggacccccgcaagtgggcggtggaattggtctcctcaaattaatcgattcttggatcggatgccga 43817754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 8387644 - 8387535
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctc-cagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaa 147  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||| ||||||||| ||| ||| ||||| | |||||||| | ||||||| |||||| ||||||| ||    
T  8387644 ccatttggggttggcctagtggttgtcttgagatcttagagtttgcttctctcag-ggtctcaagttcgatttcctctggtgccaattttggtgggc-aa 8387547  T
Q  148 gtccatacagag 159  Q
    ||||||||||||    
T  8387546 gtccatacagag 8387535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 775979 - 775938
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagttt 92  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  775979 atttggggttggtccaatggttggcttgggatcttggagttt 775938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 781633 - 781592
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagttt 92  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  781633 atttggggttggtccaatggttggcttgggatcttggagttt 781592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22200741 - 22200617
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc-ttgctc 166  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||   | |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| | |||  |||| |||||||||| ||||||    
T  22200741 tggttggtttgggatcttggagtttacttctctcaaagtctcaggttcgattccctctagtgccaatttc-gagggaaaagttcatacagagctttgctc 22200643  T
Q  167 tggctttaaacggagcccccgcaagt 192  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||    
T  22200642 tggcttagaacggagcccctgcaagt 22200617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 249
Target Start/End: Original strand, 9713609 - 9713655
Alignment:
Q  203 attggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9713609 attggtccactcggattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 9713655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 249
Target Start/End: Original strand, 12312874 - 12313046
Alignment:
Q  76 ttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagctt-gctctggcttta 174  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |  ||| | |||||||| | ||||||| |||||| | ||||| ||| ||| ||| ||||| | | ||||||||    
T  12312874 ttgggatcttggagtttgctcttctcaaaatctcaagttcgatttcctctggtgccaattttgatgggc-aaggccacacaaagctttgatttggcttta 12312972  T
Q  175 aacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    || || |||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||   ||||| || |||| ||||||||||    
T  12312973 aatgg-gcccccacaagtgggcggtgggattgatcccctcgaattagtcggttcttagagcggaaaccgagtttt 12313046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 250
Target Start/End: Original strand, 26261844 - 26261986
Alignment:
Q  108 ttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattgg 207  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||  | ||| || | ||||||||| |||||| |  |||| || ||||| |||||    
T  26261844 ttaggtttgattccctctggtgtcaatttcagtggattaagtccatacgaaacttactttagctttaaacagagcccacataagtaggtggtgggattgg 26261943  T
Q  208 tcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||  ||| ||||||   |||||| |||| ||||||| |||||    
T  26261944 tccattcgaattagtcggttcttgaatcgaataccgatttttc 26261986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 7373526 - 7373477
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcct 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  7373526 ccatttggggttggtcgaatggttggtttgggatcttagagtttgttcct 7373477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 250
Target Start/End: Original strand, 16990722 - 16990785
Alignment:
Q  187 gcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||   | ||||||||||||||| |||||||    
T  16990722 gcaagtgggcggtgggactggtccccttggattagtcggtccttggatcggataccaagttttc 16990785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 35690114 - 35690048
Alignment:
Q  71 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccaga-ggtcttaggttcgattccttctggtgtcaattt 136  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||  | ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  35690114 ttggcttgggatctgggtgtttgctcctcctcaaggtctcaggttcgattctctctggtgtcaattt 35690048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 42332108 - 42332012
Alignment:
Q  152 atacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  || ||||||||||||| | | ||||||||| || ||| |||  ||| |||||||| ||||| ||||||    
T  42332108 atacagagtttgttctggctttaaacggt-cctccgcaagtgggcgttaggattggtcccttcagataagtcaattattggatcgaataccaagtttt 42332012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 30911455 - 30911407
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctc 99  Q
    |||||||||||| |||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  30911455 atttggggttggcctaatgattgatttgagatcttggagtttgctcctc 30911407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 40137013 - 40136938
Alignment:
Q  70 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggcta 146  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||| |||| || | |||| ||||||||||||||||    
T  40137013 gttggcttgggaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttgatt-ctcccggtgccaatttcggtgggcta 40136938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 84)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4621437 - 4621236
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4621437 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 4621338  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4621337 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 4621238  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  4621237 tc 4621236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 24674390 - 24674590
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24674390 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 24674489  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  24674490 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgtattagtcgattcttggatcggataccgaattt 24674589  T
Q  249 t 249  Q
    |    
T  24674590 t 24674590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 50 - 249
Target Start/End: Original strand, 24122021 - 24122220
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  24122021 catttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggggtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 24122120  T
Q  150 ccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24122121 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 24122220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15059602 - 15059401
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15059602 ccatttggggttggcctagtggttggcttggaatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaag 15059503  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15059502 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 15059403  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  15059402 tc 15059401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 7766927 - 7766726
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  7766927 ccattcggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggctaag 7766828  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  7766827 tccatacagagcttgctctgactttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggatatcgagttt 7766728  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  7766727 tc 7766726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 68 - 248
Target Start/End: Original strand, 17935785 - 17935965
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17935785 tggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagtttgctct 17935884  T
Q  168 ggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17935885 ggctttaaacggggcccccgcaagtgggcgatgggattggtccactcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 17935965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27455066 - 27454863
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||    
T  27455066 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattcactctgatgccaatttcggtgagctaag 27454967  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacgg--agcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  27454966 tccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccccccgcatgtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggatacctagt 27454867  T
Q  247 tttc 250  Q
    ||||    
T  27454866 tttc 27454863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 247
Target Start/End: Original strand, 8077644 - 8077841
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  8077644 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaag 8077743  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |  ||| |||||||||| ||||||||    
T  8077744 tccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctc-gattaatcgattattggatcggagaccgagtt 8077841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 46607807 - 46608008
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  46607807 ccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 46607906  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   | ||||||||||||| |||||||    
T  46607907 tccatacagagcttgctctgactttaaaaggcccccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcggtccttggatcggatatcgagttt 46608006  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  46608007 tc 46608008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7197446 - 7197247
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||    
T  7197446 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtggg-taag 7197348  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  7197347 tcaatacagaccttgctctggctttaaacgaggcccctgcaagtgggcggtgagattggtcccctcggattagtcgattcatggatcggataccgagttt 7197248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 71 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9500533 - 9500355
Alignment:
Q  71 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9500533 ttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 9500434  T
Q  171 tttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  9500433 tttaaacggagcccccacaagtgggcggtgagattggtctcttcggattagtcgattcttggatcggatatcgagtttt 9500355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 68 - 250
Target Start/End: Original strand, 7578425 - 7578607
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7578425 tggttggcttgggatcttggagtttgttcctccagaggtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaaagcttgctct 7578524  T
Q  168 ggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  7578525 gactttaaacggggccctcgcaagtgggtggtgggattggttccctcggattagttgatttttggatcggataccgagttttc 7578607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 23734113 - 23734315
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  23734113 ccatttggggttggtttagtagttggcttgggatcttagaatttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggctaag 23734212  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggag-cccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  23734213 tccatacagagtttgctatgcctttaaacggggccccccgcaagtgggcggtgaaattggtcccctcagattagtcgattcttgaatcggataccaagtt 23734312  T
Q  248 ttc 250  Q
    |||    
T  23734313 ttc 23734315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 23741305 - 23741507
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  23741305 ccatttggggttggtttagtagttggcttgggatcttagaatttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggctaag 23741404  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggag-cccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  23741405 tccatacagagtttgctatgcctttaaacggggccccccgcaagtgggcggtgaaattggtcccctcagattagtcgattcttgaatcggataccaagtt 23741504  T
Q  248 ttc 250  Q
    |||    
T  23741505 ttc 23741507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 30677173 - 30677374
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  30677173 ccatttggggttgacctagtggttggtttgggatctaggagtttgctcctccaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 30677272  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| |||||||    
T  30677273 tccatacagagcttgctttggctttaaatgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcggttcttggaccggatatcgagttt 30677372  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  30677373 tc 30677374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Original strand, 34778339 - 34778535
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  |||||| |||||| |       
T  34778339 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtaccaattttggtgggtt--- 34778435  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34778436 tccatacagagtttgctttggctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 34778535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45859222 - 45859043
Alignment:
Q  70 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctgg 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  45859222 gttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacatcgcttgctcttg 45859123  T
Q  170 ctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  45859122 ctttaaacagggcccccgcaagtgggtggtaggattggtcccctcggattagttgattattggatcggataccgaatttt 45859043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 68 - 245
Target Start/End: Original strand, 1378914 - 1379090
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1378914 tggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaagtctcatgttcgatttcctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagaacttgctct 1379013  T
Q  168 ggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgag 245  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  1379014 ggctttaaacgg-gcccccgcaagtggacggtgagattggtcccctcagattagtcgattcttagatcggataccgag 1379090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 76 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8779909 - 8779744
Alignment:
Q  76 ttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaa 175  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  8779909 ttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcagcttcgatttcttctagtgtcaatttcggtgggctaagtccatacacagcttactctagctttaa 8779810  T
Q  176 acggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggatac 241  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  8779809 acggggcccccacaagtaggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttagatcggatac 8779744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 51 - 244
Target Start/End: Original strand, 18646852 - 18647045
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 150  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18646852 atttggggttgacctagtggttggcttgtgatctttgagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtc 18646951  T
Q  151 catacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccga 244  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  18646952 tatacaaagtttgctctggctttaaacggagcccctgtaagtgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttgaatcggataccga 18647045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 32729542 - 32729742
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   | |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||    
T  32729542 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctctcaaagtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtgggc-aag 32729640  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||   |  ||||||||||||||||||||    
T  32729641 tccatacagagcttgctctggctttaaatggggtccccgcaagtgggcggtgggattgatccccttggattagtcggtctttggatcggataccgagttt 32729740  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  32729741 tc 32729742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33905690 - 33905509
Alignment:
Q  69 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  33905690 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtatcaatttcggtgggttaagtccatacagagtttgttctg 33905591  T
Q  169 gctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||| |||||||  |||  |  |||||| |||||||||||||||||||    
T  33905590 gctttaaacggggcctccgtaagtggacggtgggattgatcccctcaaatttatcgattctttgatcggataccgagttttc 33905509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 68 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37351642 - 37351454
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgct-- 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  37351642 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaatgtctcaggttcgattccttctgatgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 37351543  T
Q  166 -------ctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
           |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||    
T  37351542 ggaagctctggctttaaacgg-gcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 37351454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 168198 - 168399
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  168198 ccatttggagttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctctttcaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 168297  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    | ||||||||||||| |||| ||||||||||  | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||   ||||| || |||||||| |||||    
T  168298 ttcatacagagcttgttctgactttaaacgggactcccgctagtggccggtgggattggtcccctcggattagttagttcttagaccggataccaagttt 168397  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  168398 tc 168399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 76 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36156061 - 36155888
Alignment:
Q  76 ttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaa 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | | |||||    
T  36156061 ttgggatcttggagtttgctcctccagaggtgtcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggccaagtccatgcagagcttgctttagttttaa 36155962  T
Q  176 acggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    || | ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  36155961 acagggcccccgcaggtgggcggtgggattggtcccttcaaattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 36155888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8254901 - 8254751
Alignment:
Q  100 cagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggt 199  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8254901 cagaggtctcaggttcgattatctctggtgtcaatttcggtgggctaagttcatacagaacttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggt 8254802  T
Q  200 ggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    || |||| |||||| | ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  8254801 gggattgatccccttgaattagtcgattcttgaatcggataccgagttttc 8254751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 220
Target Start/End: Original strand, 7946841 - 7947011
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7946841 ccatttggggtcgacctagtggttggcttgagatcttgaagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 7946940  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggatta 220  Q
    || |||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||    
T  7946941 tctatacagagcttgctctcgctttaaatgg-ggccccgcaagtgggtggtgagattggtcccctcagatta 7947011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 50 - 250
Target Start/End: Original strand, 2272342 - 2272542
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  2272342 catttggggttggcctagtggttgacttgggatcttagagtttgctcctacagaggtctcaggtttgattccctctgatgccaatttcgctgggctaagt 2272441  T
Q  150 ccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
     |||||| || |||||||| |||||||||| |||||  |||| ||||||| | |||| |||| ||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||    
T  2272442 tcatacaaagtttgctctgactttaaacggggcccctacaagggggcggtaggattgatcccatcggattagtcgattctaagatcggatactgagtttt 2272541  T
Q  250 c 250  Q
    |    
T  2272542 c 2272542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 244
Target Start/End: Original strand, 21726726 - 21726921
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||| |||||  ||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||    
T  21726726 ccatttgaggttgacctagtggttgatttgggttcttgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcgatgggttaag 21726825  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccga 244  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  21726826 tccatatagagcttgttctagctttaaacgggtcccccacaagtgggcggtggggttgatcccctcagattaatcgattcttggatcggataccga 21726921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23232465 - 23232300
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  23232465 ccatttgggattggcctagtggttgacttgggatcttgaagtttgctcttccagaggtttcaggttcgattccctctggcgccaatttcggtgggctaag 23232366  T
Q  149 tccatacagagctt----gctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcc 210  Q
    ||||||||||||||    |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23232365 tccatacagagcttgcaagctctggctttaaatgggacccccgcaagtgggtggtgggattggtcc 23232300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 244
Target Start/End: Original strand, 32930749 - 32930941
Alignment:
Q  52 tttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtcc 151  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| | ||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  32930749 tttggggttgacctagtggttggtttggaatcttggagtttactccttcagaggtctcaagttcgatttcctctggtgcccattttggtgggctaagtcc 32930848  T
Q  152 atacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccga 244  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||| |  |||||| ||| |||||||||    
T  32930849 atgcagagcttgctctggctttaaacggggtccctgcaagtggatggtgggattgatcccctcagattaatcgattcttagattggataccga 32930941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29057537 - 29057373
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||| | ||  |||    
T  29057537 ccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctgctccaaaggtctcaggttcgattccctcttgtgccaatttcgat-ggtaaag 29057439  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctc 214  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||    
T  29057438 tctatacagagcttgctctggctttcaacgggacccccgcaaatgggcgatgtgattggtcccctc 29057373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 51 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 46113600 - 46113495
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 150  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  46113600 atttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtaccaatttcggtgggctaagtc 46113501  T
Q  151 cataca 156  Q
    ||||||    
T  46113500 cataca 46113495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18533924 - 18533724
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||   || |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| | || || |||||  ||| ||| |||||||| ||| |||||    
T  18533924 ccatttggggttgacatagtggttgacttgagatcttagagtttgctcctccagaggtatcagatttgattctctctagtgccaatttcgatggactaag 18533825  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |  |||||| ||||||||||| |||||    
T  18533824 tccatatagagcttgttctgactttaaacggggcccctgcaagtgggccgtgggattggtcccctcatattaatcgattcttagatcggataccaagttt 18533725  T
Q  249 t 249  Q
    |    
T  18533724 t 18533724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 1486417 - 1486617
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||   |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||    
T  1486417 ccatttggggttgacctagtggttggcttgggatcttggagt--gctactctcaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcgatggg-taag 1486513  T
Q  149 tccatacagagctt-gctctggctttaaacggagcccc--cgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgag 245  Q
    |||||||||||||| |||||| |||  ||||| |||||  ||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||   | ||||||||||||||||||    
T  1486514 tccatacagagctttgctctgacttagaacggggcccccccgcaagtggacggtgggatcggtcccctccgattagtcggtccttggatcggataccgag 1486613  T
Q  246 tttt 249  Q
    ||||    
T  1486614 tttt 1486617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45331746 - 45331621
Alignment:
Q  125 tggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagc-ccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagta 223  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||  ||||||| ||||| |     
T  45331746 tggtggcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctttggctttaaacggggctccccgcaagtggacggtgggattaatcccctcagattaatc 45331647  T
Q  224 tattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
T  45331646 gattcttgaatcggataccgagtttt 45331621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 250
Target Start/End: Original strand, 22909975 - 22910069
Alignment:
Q  156 agagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||    
T  22909975 agagcttgctctgactttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggatttgtcccctcggattagtcgatacttcgatcggataccgagttttc 22910069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 153 - 250
Target Start/End: Original strand, 48699859 - 48699957
Alignment:
Q  153 tacagagcttgctctgg-ctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  48699859 tacagagcttgctctgggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattgttcccttcggattagtcgattcttggatcggatatcgagttttc 48699957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 20487390 - 20487297
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgg 142  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  20487390 ccatttggggttggtttagtggttggctcgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgg 20487297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9926348 - 9926146
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctt--aggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggcta 146  Q
    |||||||| | ||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  9926348 ccatttggagctggtctagtagttgacttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctctcagattcgattccttctggtgtcaattttggtgggcaa 9926249  T
Q  147 agtccatacagagctt-gctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgag 245  Q
    | |||||||| || || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |  |||||||   | ||| ||||||||||||||    
T  9926248 a-tccatacaaagttttgctctggcttagaacggagcccccgcaactgggcggtgggattgatccctttagattagtcggtccttcgatcggataccgag 9926150  T
Q  246 tttt 249  Q
    ||||    
T  9926149 tttt 9926146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 222
Target Start/End: Original strand, 1138576 - 1138748
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||| | |||    
T  1138576 ccatttggggttgacctagtggttggcttgagatcttggagtgtgctcctctcaaggtcttaggttcgaatctctctagtgccaatttcggtggac-aag 1138674  T
Q  149 tccatacagagc-ttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    |||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1138675 tccatacagagctttgctctgacttagaacagggcccttgcaagtgggcagtggaattggt-ccctcggattagt 1138748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 222
Target Start/End: Original strand, 2537701 - 2537863
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||      ||||||||   |||||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  2537701 ccatttggggttggcctagtggttggattgggatctt------tgctcctctcaaggtctcaggtttgattccatttggtgccaatttcggtgggctatg 2537794  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    ||||     |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  2537795 tcca-----agcttgctttggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggagggattggtcccctcggattagt 2537863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25237189 - 25237028
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||| | ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||   |||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||    
T  25237189 ccatttagagttggcctaatggttagtttgggatcttggagtttgcttctctcaaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggc-aag 25237091  T
Q  149 tccatacagag-cttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcc 210  Q
    |||||||||||  |||||||| |||  || || ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  25237090 tccatacagagttttgctctgacttagaatggtgcctccgcaagtggacggtggaattggtcc 25237028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12877038 - 12876965
Alignment:
Q  147 agtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggatta 220  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12877038 agtccatacagagcttgctctagctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggatta 12876965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26513244 - 26513148
Alignment:
Q  152 atacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  26513244 atacaaagcttgctctgactttaaacgg-gcccccacaagtgggcggtgggaatggtcccctcggattagtcgattcttggatcgaataccgagtttt 26513148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 52135127 - 52135323
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||   | |||| ||||||||||   ||| ||| ||||| |||||||| ||     
T  52135127 ccatttggggttggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcatctcaatgtctcaggttcgattatctctagtgccaattccggtgggc-aaa 52135225  T
Q  149 tccatacagagc-ttgctctggc-tttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagt 246  Q
    ||||     ||| |||||||||| |||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||   |||||||||||||||| ||||    
T  52135226 tcca-----agctttgctctggcttttaaatggagccactgcaagtggacggtgggattggtcccctcatattagtcggttcttggatcggatactgagt 52135320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 222
Target Start/End: Original strand, 37047010 - 37047162
Alignment:
Q  70 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc-ttgctctg 168  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||| ||||||  |||||   ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  37047010 gttggcttgggaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttgattccccctggtacaaattttggtgggct-agtccatacagagctttgctcta 37047108  T
Q  169 gctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    |||||||| || |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  37047109 gctttaaatggggcccccacaagtggacggtgggattggacccctaggattagt 37047162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40802267 - 40802069
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||||||||||  |  ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||   |||||| | ||| |||||    ||||| |||||| | || || |||    
T  40802267 ccatttggggttggctttgtggttggcttgagatattggagtttgctcatctcaaggtctcatgtttgattctccatggtgccaattttgatgagc-aag 40802169  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||  |||||||| || | ||||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  40802168 tccatacagagcttgctctgactttaaacgg-gtccccgcaagtgggtggtgagattggtcctctagaattagtcgattcttgaatcgaataccgagttt 40802070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 249
Target Start/End: Original strand, 809238 - 809419
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagag-cttgctc 166  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||||| |||| |  || |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||    
T  809238 tggttggtttgggatcttggagtttactcctcttaaggtctcaggtttgattacccctagtgtcaatttcggtgggc-aagtccatacaaagccttgatc 809336  T
Q  167 tggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||| || || ||    |||| |||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||| |||||| |||||||    
T  809337 tggctttgaatggggcatttgcaaatgggcggtgggattggttccttcggagtagtcgattcttggattggatactgagtttt 809419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 140
Target Start/End: Original strand, 1378743 - 1378833
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggt 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  1378743 catttggggttggtctagtggttgacttggaatcttggagtttactcctccaaaggtctcatgttcgattttctctggtgtcaatttcggt 1378833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 14258627 - 14258538
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcg 138  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  14258627 ccatttgggcttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgttcctccagatgtctctggttcgattccctctggtaccaatttcg 14258538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 249
Target Start/End: Original strand, 16539625 - 16539804
Alignment:
Q  69 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagctt-gctct 167  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||    |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  16539625 ggttggtttgggatcttggagtgagctccttgcaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgggc-aagtccatacagagctttgcgct 16539723  T
Q  168 ggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||  ||||| ||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||  || |||| |||||||||||| ||||    
T  16539724 ggcttagaacggggccct-gtaagtgggtggtgggattggtcccctcaaattagtcgatacttgtatcggataccgaatttt 16539804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 222
Target Start/End: Original strand, 16899561 - 16899673
Alignment:
Q  110 aggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagctt-gctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggt 208  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||    
T  16899561 aggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggcca-gtccatacaaagctttgctctggtttagaacggggcccctgcaagtggacggtgagattggt 16899659  T
Q  209 cccctcggattagt 222  Q
    ||||||||||||||    
T  16899660 cccctcggattagt 16899673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 249
Target Start/End: Original strand, 26820196 - 26820384
Alignment:
Q  56 gggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatac 155  Q
    |||||| |||| || ||| |||| |||||| ||||||||||||      |||| || ||||||||| | || |||||||||   |||| |||||||||||    
T  26820196 gggttgatctagtgattgacttgagatcttagagtttgctccta-----gtctcagattcgattccctatgatgtcaatttttatgggttaagtccatac 26820290  T
Q  156 agagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||  |||||||||| || | ||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||    
T  26820291 agaacttgctctgcctttaaatgggacccctgcaagtggatggtggaattgatcgcttcggattagtcgattcttggattgaataccgagtttt 26820384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40146025 - 40145889
Alignment:
Q  110 aggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagccc-----ccgcaagtgggcggtggaat 204  Q
    |||||||||| | ||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||     || |||||||| ||||   |    
T  40146025 aggttcgatttcctctagtgccaatttatgtgggctaagtccatacagagcttgctctgactttaaatgggcccccacaaccacaagtgggtggtgagtt 40145926  T
Q  205 tggtcccctcggattagtatattcttggatcggatac 241  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40145925 tggtcccctcggattagtcgattcttggatcggatac 40145889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19034567 - 19034474
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagctt 162  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| | ||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19034567 tggttggtttgggatcttggagtttgttcctcaaaaggtttcaggttcgattatctctggtgccaatttcggtgggc-aagtccatacagagctt 19034474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 249
Target Start/End: Original strand, 50202661 - 50202742
Alignment:
Q  167 tggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| ||||||||    
T  50202661 tggctttaaacgggaccctcgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattaatcgattctt-gatcggatatcgagtttt 50202742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1095193 - 1095031
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 150  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||        | | |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  1095193 atttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtgttcttctc--------tcaagttcgatttcttctggtgccaatttcggtgggc-aagta 1095103  T
Q  151 catacagagctt----gctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    ||||||||||||    ||||||||||  ||||| | |||||||||||   ||||| |||||| |||||||||||||    
T  1095102 catacagagctttgcagctctggcttagaacgg-ggccccgcaagtg---ggtgggattggttccctcggattagt 1095031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 156
Target Start/End: Original strand, 24216975 - 24217081
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||| | | ||||| ||||||||||||| |||     
T  24216975 ccatttggggttgacctagtggttgacttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattacctttggtgccaatttcggtggg-taaa 24217073  T
Q  149 tccataca 156  Q
    ||||||||    
T  24217074 tccataca 24217081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 121
Target Start/End: Original strand, 1818731 - 1818803
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattcc 121  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  1818731 ccatttggggttggcctggtagttggcttaggatcttggagtttgctcttccagaggtttcaggttcgattcc 1818803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 207
Target Start/End: Original strand, 10059071 - 10059210
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagctt-gctc 166  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||   | |||| |||||  ||||  |||  ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || | |     
T  10059071 tggttgacttgagatcttggagtttgctcctctcaaagtctcaggtttaattctctctaatgtcaatttcgatgggc-aagttcatacagagttttgttt 10059169  T
Q  167 tggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattgg 207  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  10059170 tggctttaaacggagctcctgcaagtggacggtggaattgg 10059210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 249
Target Start/End: Original strand, 23041655 - 23041719
Alignment:
Q  185 ccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23041655 ccgcaagtggacagtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 23041719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 249
Target Start/End: Original strand, 47091742 - 47091818
Alignment:
Q  173 taaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||  |||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  47091742 taaacggagcccccgcaagtggggggtgggattggtccattcgatttagtaaattcttggatcggatatcgaatttt 47091818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 249
Target Start/End: Original strand, 1818807 - 1818905
Alignment:
Q  150 ccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |     ||||||| | ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  1818807 ccatacagagcttgctttggctttaaacgg-gcccccgcaagtaggtgacatgattggtcacatcggattagtcaattattggatcggataccgagtttt 1818905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 250
Target Start/End: Original strand, 14603947 - 14603994
Alignment:
Q  203 attggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  14603947 attggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 14603994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 250
Target Start/End: Original strand, 27159205 - 27159283
Alignment:
Q  171 tttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  ||  |||||||||||| |||||||||    
T  27159205 tttaaacgg-gcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcagattagtcgatctttggatcggatatcgagttttc 27159283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 249
Target Start/End: Original strand, 35138118 - 35138185
Alignment:
Q  182 cccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  35138118 cccccgcaagtgggcggtgggattgattccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagtttt 35138185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 161
Target Start/End: Original strand, 39964530 - 39964621
Alignment:
Q  70 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagct 161  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||   |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  39964530 gttggcttgcgaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctgagttcacacagagct 39964621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 222
Target Start/End: Original strand, 19480552 - 19480706
Alignment:
Q  70 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagct-tgctctg 168  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||   |||||| |  |||||||||    |||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19480552 gttgacttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcacattcgattccccgcggtgccaattttagtgggctaagtccatatagagctatgctctg 19480651  T
Q  169 gctttaaa-cggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    ||||||||  ||  |||||||| |||| |||||| |||||  ||||||| |||||    
T  19480652 gctttaaatgggtacccccgcacgtggacggtgggattggatccctcgggttagt 19480706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 213
Target Start/End: Original strand, 17447272 - 17447434
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    ||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||| |||| |||   ||||||  |||| |||||  ||||||| ||||||  |||| | || |    
T  17447272 catttggggttggcccaatggttgatttgagatcttggagtgtgcttctctgaaggtctctggtttgattctctctggtgccaattttagtggac-aatt 17447370  T
Q  150 ccatacagag-cttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccct 213  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  17447371 ccatacaaagccttgctctggatttaaatgga-cccccgcaagtgggaggtgggatttgtcccct 17447434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 49 - 97
Target Start/End: Original strand, 47091687 - 47091735
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcc 97  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47091687 ccatttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcc 47091735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25496686 - 25496503
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 150  Q
    |||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||| | |||||||||| ||| ||| | ||||||||| || ||||     
T  25496686 atttggcgttggcctagtgattggcttgggatcttggagattgctcctcttaaggtctcaagttcgattccctctagtgcctatttcggtgagc-aagtt 25496588  T
Q  151 catacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggata 240  Q
    ||||  ||||||   ||||||| ||| || | | |||||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||| | | |||||||||||||    
T  25496587 catattgagctt--actggcttaaaatgg-ggctccgcaagtggacggtgggattgatcccct--gattagtctgtacttggatcggata 25496503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 43770164 - 43769975
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||   | |||| | ||| ||||||| || |||||||||||  ||||| |||    
T  43770164 ccatttgtggttgatctagtggttggcttgaaatcttggagtttgttcatctcaaagtctgaagtttgattcctcctagtgtcaatttcaatgggc-aag 43770066  T
Q  149 tccatacagagc-ttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggat 239  Q
    |||||||||||| |  ||||| | || || || | |||| ||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  43770065 tccatacagagcataactctgaccttgaatgg-gaccccacaaatgggcggtgggattggtcccttcgaattagtcgattctaggatcggat 43769975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 249
Target Start/End: Original strand, 5315482 - 5315528
Alignment:
Q  203 attggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  5315482 attggtcccctcggataagtcgattcttggatcggataccgagtttt 5315528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 249
Target Start/End: Original strand, 6776201 - 6776277
Alignment:
Q  173 taaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||  ||| ||| |||| ||||||| ||||    
T  6776201 taaacggggcccccgcaagtaggcggtggaattgatccactcagattagtcgattattgtatcgaataccgaatttt 6776277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20999281 - 20999190
Alignment:
Q  131 caatttcggtgggctaagtccatacagagcttg-ctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||    || ||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20999281 caatttcggtgggcta-gtccatacagagctttacgctggctttaaataaggctccctcaagtggacggtggtattggacccctcggattagt 20999190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 47360559 - 47360440
Alignment:
Q  75 cttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc-ttgctctggcttt 173  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   || ||| |||||||| |||| |  ||||||||||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  47360559 cttgggaccttggagtgtgctcctctcaagatctcaggttcgaatcctcccagtgtcaatttctgcgggct-agtccatacggagctttgctctggcttt 47360461  T
Q  174 aaacggagcccccgcaagtgg 194  Q
    ||| ||  ||||||| |||||    
T  47360460 aaatggcccccccgctagtgg 47360440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 98
Target Start/End: Original strand, 6776148 - 6776190
Alignment:
Q  56 gggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcct 98  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6776148 gggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcct 6776190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 49101819 - 49101730
Alignment:
Q  70 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc 160  Q
    ||||||||  || |||||||| ||||||||   ||||||||  || ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49101819 gttggcttcagaccttggagtgtgctcctctcaaggtcttacatttgattccccctggtgccaatt-cggtgggctaagtccatacagagc 49101730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 99
Target Start/End: Original strand, 37349521 - 37349570
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctc 99  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  37349521 catttggggttggtttagtggttgacttgagatcttagagtttgctcctc 37349570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 147
Target Start/End: Original strand, 6122853 - 6122897
Alignment:
Q  103 aggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaa 147  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  6122853 aggtctcaggttcgattccctctagtgtcaatttgggtgggctaa 6122897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 249
Target Start/End: Original strand, 31162748 - 31162947
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||| | || | |||   |||| ||||| |||||||  ||||||  |||||||||||| | | ||    
T  31162748 catttggggttgacctagtggttggtttgagatcttggattgtgtttctcttaaggttttaggctcgattcactctggtaccaatttcggtggac-aggt 31162846  T
Q  150 ccatacagagctt-gctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
     ||||||| |||| ||||| |||||||| || |||| | |||||| || |||  |||||||  |||  ||||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  31162847 acatacagtgctttgctctagctttaaatggggcccacacaagtgagcagtgagattggtcatctctaattagtcgatccttgaatcggataccgagttt 31162946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Original strand, 39012316 - 39012392
Alignment:
Q  70 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggcta 146  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||   |||||||||||| ||||||    |||| ||||||||||||||||    
T  39012316 gttggcttgggaccttggagtgtgctcttctcaaggtcttaggtttgattcccctcggtgccaatttcggtgggcta 39012392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 97
Target Start/End: Original strand, 52592557 - 52592605
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcc 97  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  52592557 ccatttagagttggtctagtggttggcttgagatcttagagtttgctcc 52592605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0576 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0576
Description:

Target: scaffold0576; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5282 - 5081
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5282 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 5183  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5182 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 5083  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  5082 tc 5081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15360298 - 15360097
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15360298 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 15360199  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15360198 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 15360099  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  15360098 tc 15360097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 34147343 - 34147544
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  34147343 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcttccagaagtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 34147442  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34147443 tccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 34147542  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  34147543 tc 34147544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 34159959 - 34160160
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  34159959 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcttccagaagtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 34160058  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34160059 tccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 34160158  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  34160159 tc 34160160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 52 - 249
Target Start/End: Original strand, 11448871 - 11449068
Alignment:
Q  52 tttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtcc 151  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11448871 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 11448970  T
Q  152 atacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  11448971 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggatatcgagtttt 11449068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Original strand, 9238972 - 9239171
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  9238972 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaag 9239071  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9239072 tccatatagagcttgctttggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 9239171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 654346 - 654146
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||||| |||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  654346 ccatttgggtttggcctagtggctgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 654247  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  654246 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattattggatcggataccgagttt 654147  T
Q  249 t 249  Q
    |    
T  654146 t 654146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3222834 - 3222635
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3222834 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttgcagtttgctcctc-agaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 3222736  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3222735 tccatacagagcttgctctgtctttaaacgg-ggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 3222637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21982520 - 21982320
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||    
T  21982520 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttgaagtttgctcctccagaggtctgaggttcgattcccgatggtgccaatttcagtgggctaag 21982421  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21982420 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 21982322  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  21982321 tc 21982320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 28672064 - 28672264
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  28672064 ccatttggggttggcctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcctctagaggtcttaggttcgattccctctggtgtcaattttggtgggctaag 28672163  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  28672164 tccatacagagcttgttttggctttaaacgggcccctcgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagataccgagttt 28672263  T
Q  249 t 249  Q
    |    
T  28672264 t 28672264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 9843935 - 9844136
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  9843935 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgacttcctctggtgtcaattttggtgggttaag 9844034  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  9844035 tccatacagagcttgttctggctttaaacggggccccctcaagtgggcggtgagattggtcccttcggattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 9844134  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  9844135 tc 9844136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 11007162 - 11007363
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||    
T  11007162 ccatttggggttgatctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattcactctgctctcaatttcggtgggctaag 11007261  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  11007262 tccatacaaagcttgctctagctttaagcggggcccccgcaagtgggcggtgggattggccccctcggattagtcgattctttgatcggatacctagttt 11007361  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  11007362 tc 11007363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9690833 - 9690638
Alignment:
Q  54 tggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccat 153  Q
    ||||||||  ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9690833 tggggttgacctagtggttggtttgagattttggagtttgctcttccagaggtcttaggttcgatttcttctagtgtcaatttcggtgggctaagtccat 9690734  T
Q  154 acagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9690733 acagagcttgctctggctttaaacggggccctcacaagtggacggtgggattggtcctctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 9690638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 1344934 - 1345133
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1344934 ccatttggggttgacctagtggttgg--tgggatcttggagtttgttcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaag 1345031  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1345032 tccatacaaagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtggacggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 1345131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17081254 - 17081053
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17081254 ccatttgaggttagtctagtggttggcttaggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaagtttgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaag 17081155  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||   ||||||||||| |||||||||||    
T  17081154 tccatacagagcttgctctgactttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaataagttgtttcttggatcgaataccgagttt 17081055  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  17081054 tc 17081053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5360271 - 5360071
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||    
T  5360271 ccatttggagttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgcttctcaagaggtctcaggttcgattccctctaatgccaatttcggtgggctaag 5360172  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  5360171 tccatacagagcttgctctgactttaaacggaacccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttagatcggataccgagttt 5360072  T
Q  249 t 249  Q
    |    
T  5360071 t 5360071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21148710 - 21148510
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||    
T  21148710 ccatttggagttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctttttcagaggtctcaagttcgattccctctagtgccaatttcgatgggctaag 21148611  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  21148610 tccatacagagcttgctctgactttaaacgg-ggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 21148512  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  21148511 tc 21148510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 92 - 222
Target Start/End: Original strand, 12390465 - 12390595
Alignment:
Q  92 tgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaag 191  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  12390465 tgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaag 12390564  T
Q  192 tgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12390565 tgggcggtgggattggtcccctcggattagt 12390595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 9208249 - 9208449
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||    
T  9208249 ccatttggggttgttctagtggttggattgggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggttcgattccccctggtgccaatttcggtgggc-aag 9208347  T
Q  149 tccatacagag-cttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||  |||||||||||  ||||||||||    
T  9208348 tccatacagagccttgctttggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtctcctcagaatagtcgattcttggatcaaataccgagtt 9208447  T
Q  248 tt 249  Q
    ||    
T  9208448 tt 9208449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 179
Target Start/End: Original strand, 12591634 - 12591764
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  12591634 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctcgtgccaatttcagtgggctaag 12591733  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacgg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12591734 tccatacagagcttgctctggctttaaacgg 12591764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 50 - 250
Target Start/End: Original strand, 14212890 - 14213080
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||    
T  14212890 catttgggattgacctaatggttggctcgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggctaagt 14212989  T
Q  150 ccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||| |||          ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14212990 ccatataga----------gctttaaacgggggccccgcaagtgggtggtgggattggtccactcggattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 14213079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 249
Target Start/End: Original strand, 11840917 - 11841097
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 167  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  11840917 tggttggcttgggatattagaatttgctcctccagaggtctcaggctcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacaaagcttgcttt 11841016  T
Q  168 ggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    || ||||||||| | ||||  |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  11841017 ggttttaaacgg-ggccccataagtggacggtgggattagtcccctcgaattagtcgattattggatcggataccgagtttt 11841097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 33499471 - 33499672
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttc-gattccttctggtgtcaatttcggtgggctaa 147  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  33499471 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggttcagattccctctggtgtcaatttcggtgggct-a 33499569  T
Q  148 gtccatacagagc-ttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagt 246  Q
    ||||||||| | | ||||| |||||||||| ||  || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||  |||| ||||||||||||    
T  33499570 gtccatacaaatctttgctttggctttaaatgggccctccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcagttgatggaccggataccgagt 33499669  T
Q  247 ttt 249  Q
    |||    
T  33499670 ttt 33499672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 49 - 158
Target Start/End: Original strand, 13753237 - 13753346
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||     
T  13753237 ccatttggggttggcctagtggttggctttggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattctctctggtgccaatttcggtgggctaaa 13753336  T
Q  149 tccatacaga 158  Q
    ||||||||||    
T  13753337 tccatacaga 13753346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 68 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17149637 - 17149458
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagag-cttgctc 166  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||     
T  17149637 tggttggtttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggttggc-aagtccatacagagccttgctt 17149539  T
Q  167 tggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||   | |||| ||| |||||||||||    
T  17149538 tggctttaaatggggcccccgcaagtgaacggtgggattggtcccctcgaattagtcggtccttgaatcagataccgagtt 17149458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 69 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28968222 - 28968078
Alignment:
Q  69 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  28968222 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcagattcgattctctctagcgtcaatttcggtgggttaagtccatacagaacttactctg 28968123  T
Q  169 gctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccct 213  Q
     |||||||||| ||||  | || | |||||||| |||||||||||    
T  28968122 cctttaaacggtgcccatgtaaataggcggtgggattggtcccct 28968078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17706488 - 17706318
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||             |||||||    
T  17706488 tggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaagtctcaagttcgattccttctggtgtcaatttcggtggactaa------------tttgctct 17706401  T
Q  168 ggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||| |||||  ||||||  |||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  17706400 ggctttaaactgggccctcgcaagtggacggtgtgattggtttcctcggataagtcaattcttggatcggataccgaattttc 17706318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 51 - 247
Target Start/End: Original strand, 10377714 - 10377911
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 150  Q
    |||||||||||| | | | ||||||||| ||||||||||| ||||| |    |||||| |||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| |||||    
T  10377714 atttggggttggcccagttgttggcttgagatcttggagtgtgctcatgtcaaggtctcaggttcaattccctatggtgccaatttcggtgggc-aagtc 10377812  T
Q  151 catacagagctt-gctctggctttaaacggagcccccg-caagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    |||||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   | ||||||| ||||||||||||    
T  10377813 catacatagctttgctctgacttaaaacggggccccccacaagtgggcggtggcattggtcccctcggagtagtcggtccttggattggataccgagtt 10377911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 135
Target Start/End: Original strand, 22576064 - 22576150
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatt 135  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||    
T  22576064 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctggtgccaatt 22576150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 33718658 - 33718478
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||  |||||||  ||||| ||||  |||||    
T  33718658 ccatttagggttggtctagtggttggtttgggatcttggagtttacttctccagagatctcaggttcgattctctctggtgcaaattttggtgaactaag 33718559  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggata 240  Q
    | |||||||||           ||||||||| ||| | |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33718558 tacatacagag-----------tttaaacggggcctctgcaagtggacggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggatcggata 33718478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15730593 - 15730495
Alignment:
Q  151 catacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||    
T  15730593 catacagagcttgttctggctttaaacgtggcccccacacgtgggcggtgggattggtcacctcggattagtcgattctttgatcggatatcgagtttt 15730495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 210
Target Start/End: Original strand, 31039017 - 31039177
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||  | | | |||||||| | ||||||||||||||||| ||| || ||| | ||| |||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  31039017 ccatttggggttgacccagtagttggctttgaatcttggagtttgctccaccaaagatctcaagtttgattccctctagtatcaatttcgatgggctaag 31039116  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcc 210  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| | || ||| ||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  31039117 tccatacagagtttgctatggctatgaatgga-cccccacaagtgggcggtgtgattggtcc 31039177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 153
Target Start/End: Original strand, 8479309 - 8479412
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||   || | | |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  8479309 ccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtgtgctcctcttaagatttcaggttcgatttcctctggtgtcaatttcggtgggc-aag 8479407  T
Q  149 tccat 153  Q
    |||||    
T  8479408 tccat 8479412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28742013 - 28741849
Alignment:
Q  77 tgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagct-tgctctggctttaa 175  Q
    |||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || | |||||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  28742013 tgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattcgttctggtgttaattttggt-ggatgagtccatatagaactctgctctggcttaaa 28741915  T
Q  176 acggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggatac 241  Q
    ||||| ||||| ||| |||  ||||  |||||||| |||| ||||||   | ||||||||||||||    
T  28741914 acggaacccccacaaatggatggtgtgattggtcctctcgaattagtcggtccttggatcggatac 28741849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 130 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14504201 - 14504082
Alignment:
Q  130 tcaatttcggtgggctaagtccatacagagctt-gctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattc 228  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| | || ||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||  || |    
T  14504201 tcaatttcgatggg-taagtccatacagtgttttgctctggttttaaatggggtccccgcaagtgggcggtgggattgatcctctcgaattagtcgatcc 14504103  T
Q  229 ttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  14504102 ttgtatcggataccgagtttt 14504082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 162
Target Start/End: Original strand, 17420862 - 17420975
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgatt-ccttctggtgtcaatttcggtgggctaa 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||    ||||||| |||| |||| || ||| ||| ||||||||||||| |||    
T  17420862 ccattcggggttggtctaatggttgacttgggatcttggagtgtactcctttcaaggtctttggtttgattcccctcttgtgccaatttcggtggg-taa 17420960  T
Q  148 gtccatacagagctt 162  Q
    || |||||| |||||    
T  17420961 gttcatacatagctt 17420975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21903706 - 21903618
Alignment:
Q  163 gctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggt-cccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||||||||| || || || ||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  21903706 gctctggctttaaatggggcaccagcaagtgggcggtgggaatggtccccctcagattagtcgattcttggatcggatgcagagttttc 21903618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6384053 - 6383901
Alignment:
Q  70 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc-ttgctctg 168  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||   |||||| |||||| | ||| || |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  6384053 gttggcttgggaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttc-aatccctcgggtgccaatttcagtgggct-agtccataaagagctttgctttg 6383956  T
Q  169 gctttaaacggagcccccgcaagtgggcggt-ggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    |||||||| ||  ||||| ||||||| | || ||| |||| |||||| |||||||    
T  6383955 gctttaaatgggacccccacaagtggacagtgggatttggacccctcagattagt 6383901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 144
Target Start/End: Original strand, 21182325 - 21182418
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggc 144  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||   || ||| || ||||||||| | || || ||||||||||||||    
T  21182325 atttggggttgatctgattgttggcttgggattttggagtgtgctcctctcaagctctgagattcgattccctgtgatgccaatttcggtgggc 21182418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 194
Target Start/End: Original strand, 28667679 - 28667770
Alignment:
Q  103 aggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgct-ctggctttaaacggagcccccgcaagtgg 194  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28667679 aggtctcatgtttgattcgttctggtgtcaatctcgttgggc-aagtccatacatagcttaattctggctttaaatggagcccccgtaagtgg 28667770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 249
Target Start/End: Original strand, 17225738 - 17225863
Alignment:
Q  123 tctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc-ttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattag 221  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||| | |||||||| |||||||||| |||| || |||| ||||||    
T  17225738 tctggtgccaatttcggcgggc-aagtccatacagagctttgctctcgtttagaacgg-ggccccgcaaatgggcggtgggattgatctcctcagattag 17225835  T
Q  222 tatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |   | ||| ||||||||| ||||||||    
T  17225836 tcggtccttagatcggatatcgagtttt 17225863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 220
Target Start/End: Original strand, 22721810 - 22721865
Alignment:
Q  165 tctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggatta 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||    
T  22721810 tctggctttaaacagagcccctgcaagtgagcggtgggattggtccactcgaatta 22721865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 222
Target Start/End: Original strand, 32596211 - 32596246
Alignment:
Q  187 gcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32596211 gcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 32596246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 24762474 - 24762410
Alignment:
Q  56 gggttggtctaatggt--tggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgat 118  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || ||||||||   ||||||||||||||||    
T  24762474 gggttggtctaatggtgttggcttgggaccttggtgtgtgctcctcttaaggtcttaggttcgat 24762410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 83)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8484861 - 8484660
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  8484861 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 8484762  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8484761 ttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 8484662  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  8484661 tc 8484660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 32059640 - 32059439
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32059640 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccttctggtgccaatttcggtgggctaag 32059541  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||    
T  32059540 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 32059441  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  32059440 tc 32059439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15641305 - 15641105
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  15641305 ccatttggggttagcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaag 15641206  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  15641205 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggataccgagttt 15641107  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  15641106 tc 15641105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27498931 - 27498730
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27498931 ccatttggggttgacctagtggttggcttggaatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 27498832  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27498831 tccatacatagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 27498732  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  27498731 tc 27498730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 30485825 - 30486026
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  30485825 ccatttggggttggcccagcggttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattcactctggtgtcaatttcggtgggctaag 30485924  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  30485925 tccatacagagcttgctctggctttaaacgatgcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcaattcttggatcggataccgagttt 30486024  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  30486025 tc 30486026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11926702 - 11926501
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11926702 ccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttagattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 11926603  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggag-cccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11926602 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtt 11926503  T
Q  248 tt 249  Q
    ||    
T  11926502 tt 11926501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 53 - 250
Target Start/End: Original strand, 38684209 - 38684405
Alignment:
Q  53 ttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtcca 152  Q
    |||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38684209 ttggggttggcccagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcca 38684308  T
Q  153 tacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  38684309 tacagagcttgctctggctttaaacgg-gcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgatttttc 38684405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 7085826 - 7085625
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  7085826 ccatttggggctggcttagtggttggcttgggatcttggagttttctcctccagaggtctccggttcgattccctctagtgtcaatttcggtgggctaag 7085727  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  7085726 tccatacagagcttgctctgactttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 7085627  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  7085626 tc 7085625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19456389 - 19456210
Alignment:
Q  69 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456389 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatccct-ctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 19456291  T
Q  169 gctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19456290 gctttaaacggggcccc-gcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 19456210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 71 - 250
Target Start/End: Original strand, 18207226 - 18207405
Alignment:
Q  71 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 170  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18207226 ttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctccggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgttctggc 18207325  T
Q  171 tttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18207326 tttaaacgaggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 18207405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 4603774 - 4603975
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4603774 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaagatctcaagttcgattccttctggtgccaatttcgatgggctaag 4603873  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||    
T  4603874 tccatacagagctcgctctggctttaaacggggcccctgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 4603973  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  4603974 tc 4603975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 34310139 - 34310339
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  34310139 ccatttggggttggcctagtggtcggcttggaatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaag 34310238  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  34310239 tccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccccataagtggacggtgggattggtcccctcgaattaatcgattcttggatcggataccgagttt 34310338  T
Q  249 t 249  Q
    |    
T  34310339 t 34310339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 56 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33709694 - 33709502
Alignment:
Q  56 gggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatac 155  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33709694 gggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatac 33709595  T
Q  156 agagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||   |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  33709594 agag--agctctggctttaaacgggacccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgtgttttc 33709502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23270722 - 23270522
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||| | || | || ||||||||||||||||||    
T  23270722 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcatccaaaggtctcaagttcgatttcctccgatgccaatttcggtgggctaag 23270623  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||    
T  23270622 tccatacagagcttgctttggctttaaacggagcccccgcaaatggacggtgggattggtcccctcggattagttgattcttggattggataccaagttt 23270523  T
Q  249 t 249  Q
    |    
T  23270522 t 23270522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 68 - 250
Target Start/End: Original strand, 37495063 - 37495252
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37495063 tggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaagtccatacagagcttgctct 37495162  T
Q  168 ggctttaaacggagcc-------cccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||||||   ||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  37495163 ggctttaaacgcccccccccccgcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 37495252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 56 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6014473 - 6014280
Alignment:
Q  56 gggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatac 155  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  6014473 gggttggcctagtgattggcttgggatcttggagtttgcttctccagagatctcaggttcgattacttctggtgccaatttcggtgggttaagtccatac 6014374  T
Q  156 agagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  6014373 agagcttgctctggctttaaacggggtccacgcaagtgggcggtgagattagtcccctcgaattagtcgattcttggatcggatatcgagtttt 6014280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31288146 - 31287945
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||    
T  31288146 ccattttgggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcatgttcgattccctttggtgccaatttcggtgggttaag 31288047  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||||    
T  31288046 tccatacaaagcttgctttgactttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtctcctcgaattagtcggttcttggaccggataccgagttt 31287947  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  31287946 tc 31287945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 68 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10869746 - 10869564
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 167  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  10869746 tggttgacttgcgatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccatctggttccaatttcggtgggctaagtccacactgagcttgctct 10869647  T
Q  168 ggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  10869646 ggctttaaatggggcctccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggttcttggatcggataccaagttttc 10869564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13038654 - 13038463
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||    
T  13038654 ccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggctaag 13038555  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggatac 241  Q
    | ||||||||||  | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  13038554 ttcatacagagcaag-tatggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggatac 13038463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13108649 - 13108458
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||    
T  13108649 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggctaag 13108550  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggatac 241  Q
    | ||||||||||  | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  13108549 ttcatacagagcaag-tctgcctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggatac 13108458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 22392698 - 22392886
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||    
T  22392698 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgc---caatttcggtgggctaag 22392794  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||          ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  22392795 tc----------ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcagattagtcgatttttggatcggataccgagttt 22392884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 199
Target Start/End: Original strand, 25586929 - 25587080
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  25586929 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggctaag 25587028  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaac-ggagcccccgcaagtgggcggt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  25587029 tccatacagagcttgctctggctttaaacaggaccccccccaagtgggcggt 25587080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15971321 - 15971151
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    ||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15971321 catttagggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctgatgtcaatttcggtgggctaagt 15971222  T
Q  150 ccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggatta 220  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  15971221 ccatacatagcttgctctgactttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgagattgatcccctcggatta 15971151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19145611 - 19145412
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  19145611 ccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtatgctcctctcaaggtctccggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc-aag 19145513  T
Q  149 tccatacagagctt-gctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  19145512 tccatacagagctttgctctggctttaaatggt-cccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttggttcttggatcggataccgagtt 19145414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27487755 - 27487554
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || | ||||| |||||||||||| |||||    
T  27487755 ccatttggggttggcctagtggttgatttgggattttggagtttgctcttccagaggtctcaggtttgatcccatttggtgccaatttcggtggactaag 27487656  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaac-ggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  27487655 tccatacagagcttgctctagctttaaacgggggcccttgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggatacagagtt 27487556  T
Q  248 tt 249  Q
    ||    
T  27487555 tt 27487554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 34049819 - 34050008
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |           ||||||||||    
T  34049819 ccatttggggttgggctagtagttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttctag-----------gtgggctaag 34049907  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |||||   ||||||||||||||||    
T  34049908 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggtcggtaggattggtcccctcggattagttgattctcaaatcggataccgagttt 34050007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 11465107 - 11464913
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||| ||||||| ||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  11465107 ccatttcgggttggcctagtgattggcttgaaatcttggagtttgctcctccaaatgtctcaggttcgatttcctctggtgccaattttggtgggctaag 11465008  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccga 244  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11465007 ttcatacagagcttactctggctttaaacgg-ggccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccga 11464913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12398628 - 12398447
Alignment:
Q  69 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12398628 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctatggtgtcaatttcggtggcctaagttcatacagagcttgctctg 12398529  T
Q  169 gctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| |||||  |||| ||| |||  ||||||   ||||||||| |||||||||||||||    
T  12398528 gctttaaatggggcccccgcaaatggacggtgagattgatcctctcaaattagtcggttcttggattggataccgagttttc 12398447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21236562 - 21236361
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||| |||||||  || | ||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||    
T  21236562 ccatttagggttggcttagtagttcgcttaggatcttggagttttctccttcagaggtcttcggttcgattctctctagtgtcaatttcaatgggctaag 21236463  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  21236462 tccatacagagttttctctgactttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattagtcccctcagattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 21236363  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  21236362 tc 21236361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25750811 - 25750613
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcg--attccttctggtgtcaatttcggtgggcta 146  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  25750811 ccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttggatattccttctggtgccaatttcggtgggtta 25750712  T
Q  147 agtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagt 246  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||  ||||  |||||||| ||||  ||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25750711 agtccatatagagcttgctctggctt--aacgggacccc--caagtggggggtgagattggtcccttcagattagtcgattcttggatcggataccgagt 25750616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 241
Target Start/End: Original strand, 36954815 - 36955007
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||   |||||||| | ||||||    
T  36954815 ccatttggggttggcctagtggttgccttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggttctaatttcggcgtgctaag 36954914  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggatac 241  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||| | |||| ||| ||||||||  ||||||  |||||||||||||||||    
T  36954915 tccatacagagtttgctttggctttaaatgggccccccgcaagtggactgtgggattagtcccctcatattagtcgattcttggatcggatac 36955007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12317350 - 12317154
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  |||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12317350 ccatttggggttggcctagtggttggcttggaatcttggagtttgctcctcttgaggtctcgggtttgatttcatctggtgtcaatttcggtgggttaag 12317251  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||    |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  12317250 tc----cagagcttgctctgactttaagcgggccccccgcaagtgggtggtgggattgat-ccctcggattagtcaattcttagatcggataccgagttt 12317156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 131 - 250
Target Start/End: Original strand, 35425092 - 35425211
Alignment:
Q  131 caatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattctt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||    
T  35425092 caatttcggtgggctaagtccatacagagctcgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcctctcggattagtcgattctt 35425191  T
Q  231 ggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  35425192 ggatcggataccgaattttc 35425211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 58 - 240
Target Start/End: Original strand, 42193491 - 42193671
Alignment:
Q  58 gttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacag 157  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  42193491 gttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgcttccccagaggtctcaggttcgatttcctctgatgccaatttcggtgggctaagtctatacag 42193590  T
Q  158 agcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggata 240  Q
    || ||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  42193591 agtttgctttggctttaaatgga--ccccgcaagtgggcggtggggttggtcctctcggattagtcgattcttggatcagata 42193671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 38631161 - 38630978
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  38631161 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctggtgccaatttcgatgggctaag 38631062  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||                    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  38631061 tccatacagagc------------------aggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattaatcgattcttggatcggataccgagttt 38630980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 201
Target Start/End: Original strand, 15931056 - 15931207
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  15931056 ccatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgcttcttcacaagtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggt-ggctaag 15931154  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgg 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||    
T  15931155 tccatacagagcctgctctggctttaaacagggctctcgcaagtgggcggtgg 15931207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 50 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26009463 - 26009263
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    |||||||| || | ||| ||||||| |||||||||  |||||| |||||| | |||| |  ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||    
T  26009463 catttgggttttgcctagtggttggtttgggatctcagagtttactcctcgaaaggtttccggttcgattccctttggtgccaatttcagtgggctaagt 26009364  T
Q  150 ccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||   |||||| |||| ||| ||||||||    
T  26009363 ccatgcagagcttactctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtagtgggattagtcccctcggattagtcggttcttgaatcgaatatcgagtttt 26009264  T
Q  250 c 250  Q
    |    
T  26009263 c 26009263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9659430 - 9659311
Alignment:
Q  130 tcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattct 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||  |||||    
T  9659430 tcaatttcggtgggctaagtccatacacagcttgctctggctttaaatgggccccccgcaagtggacggtgggattggtcccttcggattagttgattct 9659331  T
Q  230 tggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  9659330 tggatgggataccgagtttt 9659311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 10399770 - 10399971
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| || || || | | ||||| |||||  ||||| | |||||||| |||||||||    
T  10399770 ccatttggtgttggtctagtggttgactttggatcttggagtttgcttcttcaaagatttcaggtttgattctctctggcgccaatttcgatgggctaag 10399869  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtc-ccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||||||  ||| ||||||    
T  10399870 tccatacggagcatgctctgactttaaacggggcccccgtaagtggacggtgggattggtcaccctcgaattagtcgattcttggatcaaatagcgagtt 10399969  T
Q  248 tt 249  Q
    ||    
T  10399970 tt 10399971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 160
Target Start/End: Original strand, 7151346 - 7151437
Alignment:
Q  69 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7151346 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctcaagaggtcttaggttcgactccctctggcgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc 7151437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 49 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 1827730 - 1827616
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||||||||||||| ||||    
T  1827730 ccatttggggttgacctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgataccaatttcggtgggttaag 1827631  T
Q  149 tccatacagagcttg 163  Q
    |||||||||||||||    
T  1827630 tccatacagagcttg 1827616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 5049134 - 5049333
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||   ||||| |||  |||| |||||| ||||||||  || | |||||| || ||| ||||| ||||||  |||||||| ||| |||||    
T  5049134 ccatttggggttgacttaatgattgatttggaatcttgaagtttgcttttctaaaggtctcagattcaattccctctggtaccaatttcgatggtctaag 5049233  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||||    
T  5049234 ttcatacagagcttgctctggctttaaacgg-gcccccgcaaatggacggtgggattggtcccatcgaattagtcgattcttggatcgaataccaagttt 5049332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28614683 - 28614486
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||| |||||||||| | |||| |||||| ||||||| | ||||    
T  28614683 ccatttggggttggtg-agtggttggcttgagatcttagagtttgttcctccaaagatctcaggttcgattacctctgatgtcaa-ttcggtgagataag 28614586  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||| |  ||||||  ||| |||||| |||| |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  28614585 tccatacaaagcttgttctgactttaaacgg-gatcccgcagatggacggtgggattgatcccctcgaattagtcgatttttggatcggataccgagttt 28614487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 155 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 41351197 - 41351103
Alignment:
Q  155 cagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  41351197 cagagcttgctctggctttaaacggggctcc-gcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 41351103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 249
Target Start/End: Original strand, 36895447 - 36895622
Alignment:
Q  74 gcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagctt-gctctggctt 172  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||| | | |||||||||| ||||||  |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  36895447 gcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtttcatgttcgattccctctggtaccaatttcggtggtc-aagtccatacaaagctttgctctggctt 36895545  T
Q  173 taaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
      |||| |||| |||||||||||||| || |||| || ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  36895546 agaacgtagccgccgcaagtgggcggggggattgttctcctcgaattagtcggttcttggatcggataccgagtttt 36895622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 171 - 249
Target Start/End: Original strand, 22693054 - 22693132
Alignment:
Q  171 tttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22693054 tttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 22693132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 51 - 142
Target Start/End: Original strand, 37397712 - 37397803
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgg 142  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  37397712 atttggggttggtctagtggttggcttgtgatcttggagtttgctcctccaaaggtctaaggtttgattccccctggtgtcaattttggtgg 37397803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13659359 - 13659245
Alignment:
Q  135 ttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggat 234  Q
    |||| |||| |||||||||| ||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |  ||||||||||    
T  13659359 ttcgatgggttaagtccatagagaacttgctttgactttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattaatcgattcttggat 13659260  T
Q  235 cggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||| ||||    
T  13659259 cggataccgaatttt 13659245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24158311 - 24158166
Alignment:
Q  104 ggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc-ttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgga 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||||  ||||| ||| | ||||||||||||||      
T  24158311 ggtctcaggttcgattccttctggtgtcaatttcgatggg-taagtccatacatagctttactctggcttagaacggggcctctgcaagtgggcggtgag 24158213  T
Q  203 attggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||| |||||||   | |||| |||||||||||| ||||    
T  24158212 attggtcccctcagattagtcggtccttgaatcggataccgaatttt 24158166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17015593 - 17015420
Alignment:
Q  69 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 168  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||     |||||| ||    
T  17015593 ggttggcttgagatcttgaagtttcctctttcagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcattgggataagtccata-----cttgctttg 17015499  T
Q  169 gctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  ||||| | | |||| ||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||    
T  17015498 gctttaaacgga-tccccgcaagtaagcggtaggaatggtaccctcggattaattaattcttgaatcggataccgagttt 17015420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 136
Target Start/End: Original strand, 5067298 - 5067385
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaattt 136  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||    
T  5067298 ccatttggagttggtctagtggttgacttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattttctctggtgtcaattt 5067385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15485492 - 15485318
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatgg-ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaa 147  Q
    |||||||||||||| |||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||  |||    ||||||||||||| |||    
T  15485492 ccatttggggttggcctagcgggttggcttgggaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccc-ctgacaccaatttcggtgggttaa 15485394  T
Q  148 gtccatacagagct-tgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    ||||||||| | || || |||||||||||| || | ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15485393 gtccatacaaaactatgttctggctttaaatggggtccccgcaagtggatggtgggattggacccctcggattagt 15485318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 930685 - 930486
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttct-ggtgtcaatttcggtgggctaa 147  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||| ||| || |||||||||||||   | |||| ||||||||||||  || |||| |||||||||||| | ||    
T  930685 ccatttggggttggcccagtggttggcttgagattttagagtttgctcctctcaaagtctcaggttcgattcccacttggtgccaatttcggtggacaaa 930586  T
Q  148 gtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
     || ||||| ||||||||| |||||  |||  ||||| ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||||    
T  930585 ttc-atacatagcttgctccggcttagaaca-agccctcgcaagtggacagtgtgattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggatatcgagtt 930488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22253345 - 22253144
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||   || ||| |||||||| |   ||| ||| |||||||| |||||||||    
T  22253345 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatctttgactttgctcctctctagatctcaggttcgactttctctagtgccaatttcgatgggctaag 22253246  T
Q  149 tccatacagagct-tgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    |||||||| |||| || ||||| |||||| |  |||||| ||| ||| | | || ||| ||||||||  ||||||    |||||||||| ||| ||||||    
T  22253245 tccatacaaagctatgttctggatttaaatgaggcccccacaactggacagcgggattcgtcccctcaaattagtcggatcttggatcgaataacgagtt 22253146  T
Q  248 tt 249  Q
    ||    
T  22253145 tt 22253144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 250
Target Start/End: Original strand, 31206260 - 31206441
Alignment:
Q  70 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagct-tgctctg 168  Q
    ||||||||||||  | ||||| |||||| |   |||||| |||||  |||||  |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||     
T  31206260 gttggcttgggacttcggagtgtgctccgctcaaggtctcaggttttattccccctggtgccaatttcattggcctaagtccatacagagctatgctctt 31206359  T
Q  169 gctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||| ||  ||||| ||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||   | |||||  ||||||||||||||||    
T  31206360 gctttaaatgggacccccacaagtggacggtgggattggactcctcggattagtcggtccttgggccggataccgagttttc 31206441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 41569007 - 41568868
Alignment:
Q  110 aggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtc 209  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| | || ||||||| |||  |||||||| |||| ||||| |||||||    
T  41569007 aggttcgatttcctcttgtgtcaatttcggtggactaagtccatacagaatttgttttgtctttaaatgga-accccgcaaatgggtggtgggattggtc 41568909  T
Q  210 ccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||  |||||||  ||| || |||| |||| |||||||||    
T  41568908 ccctaagattagttgattattcgatcagatatcgagttttc 41568868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 174
Target Start/End: Original strand, 3639788 - 3639894
Alignment:
Q  69 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagct-tgctct 167  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||   | |||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  3639788 ggttggcttgagattttggagtttgctcttctccaggtcttaggttcgattatctttggtggtaatttcggtggactaagtccatacggagctatgctct 3639887  T
Q  168 ggcttta 174  Q
    |||||||    
T  3639888 ggcttta 3639894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2499376 - 2499205
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 150  Q
    ||||||||||||  || ||| || |||||||||||||| |||||||||    | |||| |||||||||||   ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  2499376 atttggggttggcttagtggctgacttgggatcttggaatttgctcctttcaaagtctcaggttcgattctccctgttgtcaatttcgatgggc-aagtc 2499278  T
Q  151 catacagag-cttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||| ||  |||  | |||||| |||||  ||||||||||||||| ||||    
T  2499277 catatagagccttactctggctttaaatgggacccttgaaagtggacggtgagattggtcccctcggaatagt 2499205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 3715107 - 3715055
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaga 103  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3715107 atttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccaga 3715055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 238
Target Start/End: Original strand, 5067387 - 5067447
Alignment:
Q  178 ggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcgga 238  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  5067387 ggaggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctctgattagtcgattcttggatcgga 5067447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10631340 - 10631288
Alignment:
Q  198 gtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10631340 gtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 10631288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10813977 - 10813851
Alignment:
Q  123 tctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc-ttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattag 221  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | | |||| ||||| || ||||| ||| ||||||| |||||||    
T  10813977 tctggtgtcaatttttttgggctaagtccatacggagctttgctctggctttaaacag-ggccccacaagtaggtggtgggatttgtccccttggattag 10813879  T
Q  222 tatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |   |||||| | || ||||||||||||    
T  10813878 tcagttcttgaaccgaataccgagtttt 10813851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 250
Target Start/End: Original strand, 8821093 - 8821182
Alignment:
Q  161 ttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||||||||  | || ||  |||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8821093 ttgctctggctttaaattgggctccaacaagtgggtggtgggattggtcacttcgaattagtctattcttggatcagataccgagttttc 8821182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 101
Target Start/End: Original strand, 42006791 - 42006842
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctcca 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  42006791 catttggggttgggctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcatcca 42006842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 250
Target Start/End: Original strand, 42006868 - 42006931
Alignment:
Q  187 gcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||    
T  42006868 gcaagtgggcggtggaattgttccacttggattagttgattctttgatcggataccgaattttc 42006931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 250
Target Start/End: Original strand, 33737878 - 33737939
Alignment:
Q  188 caagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  33737878 caagtgggcggtgagattggtcccctcgg-ttagttgattcttgaatcggataccgagttttc 33737939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 222
Target Start/End: Original strand, 39459405 - 39459466
Alignment:
Q  161 ttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||  |||||||||||||||    
T  39459405 ttgctctggcttaaaacggagccccctcaagtggacggtgagattaatcccctcggattagt 39459466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 14302898 - 14302787
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    |||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |||| ||| |||||||| ||||| |||| | | |||||||||||| || || | ||||    
T  14302898 catttgagtttgatctagtggttgacttgggatcttagagtgtgcttctctagaggtctcaggtttgatttcatttggtgtcaattttggcggac-aagt 14302800  T
Q  150 ccatacagagctt 162  Q
    ||||| |||||||    
T  14302799 ccatatagagctt 14302787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 21042724 - 21042676
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcct 98  Q
    |||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21042724 catttggggttggtttagtgattggtttgggatcttggagtttgctcct 21042676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 249
Target Start/End: Original strand, 7151453 - 7151500
Alignment:
Q  202 aattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  7151453 aattggtcccctagaattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 7151500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 200
Target Start/End: Original strand, 23290705 - 23290744
Alignment:
Q  161 ttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtg 200  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23290705 ttgctctggcttagaacggagcccccgcaagtgggcggtg 23290744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 31669091 - 31669025
Alignment:
Q  56 gggttggtctaatggt--tggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattc 120  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  31669091 gggttggtctgatggtgttggcttgggaccttggagtctgctcctctcaaggtcttaggttcgattc 31669025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25548599 - 25548533
Alignment:
Q  184 cccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  25548599 cccgcaagtacgcggtgggattggtcatctcgaattagtcgattcttggatcgaataccgagttttc 25548533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 99
Target Start/End: Original strand, 33025477 - 33025527
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctc 99  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33025477 ccatttggggttggcctcgcggttggcttgggatcttggagtgtgctcctc 33025527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 154
Target Start/End: Original strand, 8780475 - 8780579
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||| |||||  ||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| |||| ||||    
T  8780475 ccatttgaggttgacctagtggttgacatcggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattgtctcttgtgtcaatttcgatggg-taag 8780573  T
Q  149 tccata 154  Q
    ||||||    
T  8780574 tccata 8780579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16247180 - 16247028
Alignment:
Q  70 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagctt-gctctg 168  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||    |||||| |||||| || ||  | |||| |||| | ||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||    
T  16247180 gttggcttgggaccttgcagtgtgctcctatcaaggtctcaggttcaatcccccccggtgccaatcttggtgggcta-gtccatacagaactttgctttg 16247082  T
Q  169 gctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    | |||||| ||   |||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16247081 ggtttaaatgggctccccacaagtggacggtgggattggacccctcggattagt 16247028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 99
Target Start/End: Original strand, 16616137 - 16616166
Alignment:
Q  70 gttggcttgggatcttggagtttgctcctc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616137 gttggcttgggatcttggagtttgctcctc 16616166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 143
Target Start/End: Original strand, 19373264 - 19373337
Alignment:
Q  70 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtggg 143  Q
    ||||||||| || |||||||| |||| |||   |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  19373264 gttggcttgagaccttggagtgtgctactctcaaggttttaggttcgattctatctgatgtcaatttcggtggg 19373337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21042661 - 21042609
Alignment:
Q  161 ttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctc 214  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21042661 ttgctctagctttaaatggagcccc-gcaagtggacggtgaaattggtcccctc 21042609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 204221 - 204177
Alignment:
Q  52 tttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctc 96  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  204221 tttggagttggtctagtggttgacttgtgatcttggagtttgctc 204177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 146
Target Start/End: Original strand, 21589314 - 21589390
Alignment:
Q  71 ttggcttgggatcttggagtttgctcctcca-gaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggcta 146  Q
    ||||||||||| || ||||| |||| ||||  || |||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  21589314 ttggcttgggacctgggagtctgctactcctcgatgtctcaggttcgattccctctggtgccaatttaggtgggcta 21589390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 39229357 - 39229305
Alignment:
Q  103 aggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatac 155  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||| |||||||||||    
T  39229357 aggtcttaggttcgatttcctcttgtatcagtttcggtgggttaagtccatac 39229305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 249
Target Start/End: Original strand, 41084120 - 41084180
Alignment:
Q  189 aagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  41084120 aagtgggcggtaggattgatcccttcggattagtcggttcttgaatcggataccgagtttt 41084180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 87)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40059052 - 40058851
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40059052 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaag 40058953  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  40058952 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 40058853  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  40058852 tc 40058851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Original strand, 52983616 - 52983815
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  52983616 ccatttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaag 52983715  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  52983716 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 52983815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34844958 - 34844757
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  34844958 ccatttggggttggcctagtggtttgcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaag 34844859  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34844858 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 34844759  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  34844758 tc 34844757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27528995 - 27528794
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27528995 ccatctggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 27528896  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27528895 tccatacagagcttgctctggctttatacggggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 27528796  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  27528795 tc 27528794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 32986194 - 32986395
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32986194 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 32986293  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32986294 tccatacagagcttgctctgactttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggaatagtcgattcttggatcggataccgagttt 32986393  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  32986394 tc 32986395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 46714389 - 46714591
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgatt-ccttctggtgtcaatttcggtgggctaa 147  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||    
T  46714389 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttccctttggtgccaatttcggtgggctaa 46714488  T
Q  148 gtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  46714489 gtccatacagagcttgcccttgctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcaattcttgaatcggataccgagtt 46714588  T
Q  248 ttc 250  Q
    |||    
T  46714589 ttc 46714591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 20566346 - 20566547
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctt-aggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaa 147  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  20566346 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtgatcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggcaaa 20566445  T
Q  148 gtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  20566446 gtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcgctgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggatatcgagtt 20566545  T
Q  248 tt 249  Q
    ||    
T  20566546 tt 20566547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33696479 - 33696279
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  33696479 ccatttagggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 33696380  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  33696379 tccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcctctcggattagtcaattcttggatcggatatcgagttt 33696280  T
Q  249 t 249  Q
    |    
T  33696279 t 33696279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5609402 - 5609201
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5609402 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcattcagtggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaag 5609303  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5609302 tccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 5609203  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  5609202 tc 5609201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 54127542 - 54127341
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  54127542 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcaattccctcttgtgccaatttcggtgggctaag 54127443  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||    
T  54127442 tctatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggttcttggaccggatactgagttt 54127343  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  54127342 tc 54127341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19660732 - 19660531
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||  |||||||||||| ||||    
T  19660732 ccatttggagttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattctctctgatgcaaatttcggtgggataag 19660633  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19660632 tccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 19660533  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  19660532 tc 19660531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20078163 - 20077986
Alignment:
Q  70 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctgg 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20078163 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattcccactggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctgg 20078064  T
Q  170 ctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20078063 ctttaaacggggcccccgtaagtgggcggtgggattagttccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtt 20077986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 25852211 - 25852412
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  25852211 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 25852310  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggcttt-aaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  25852311 tccatacagagcttgctctggctttaaaacgggaccctcgcaagtgggcaatgggattggtcccctcggattagtcggttcttggaccggataccgagtt 25852410  T
Q  248 tt 249  Q
    ||    
T  25852411 tt 25852412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 50 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 45787902 - 45787703
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||    
T  45787902 catttggggttggcctagtggttggcttggaatcttgga-tttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctgatgccaatttcagtgggctaagt 45787804  T
Q  150 ccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  45787803 ccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 45787704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 51 - 250
Target Start/End: Original strand, 44343512 - 44343712
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggtt-ggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || | |||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  44343512 atttggggttgggctagtggtttggcttgggatcttggagtttgctcccccaaaggactcaagttcgattccctctggtgctaattttggtgggctaagt 44343611  T
Q  150 ccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  44343612 ccatacagagcttgctctgactttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttgaatcggataccgagtttt 44343711  T
Q  250 c 250  Q
    |    
T  44343712 c 44343712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 56 - 249
Target Start/End: Original strand, 35229172 - 35229365
Alignment:
Q  56 gggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatac 155  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  35229172 gggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttct-atgccaatttcggtgggctaagtccatac 35229270  T
Q  156 agagcttgctctggctttaaac-ggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  35229271 atagcttgctctgactttaaacgggtccccccacaagtgagcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgaatttt 35229365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 1985833 - 1986031
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||    
T  1985833 ccatttgggattggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgcgaatttcgatgggctaag 1985932  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  1985933 tccatacagagtaaactctggctttaaacggagcccccacaagtgggcggtggaattggt-ctatcggattagtcgattcttggat-ggataccgagttt 1986030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 199
Target Start/End: Original strand, 33992623 - 33992773
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  33992623 ccatttagggttgacctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaag 33992722  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggt 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33992723 tccatacatagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggt 33992773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 51 - 244
Target Start/End: Original strand, 32942369 - 32942562
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 150  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  32942369 atttggggttggtctagtggttggcttgagatcttggagtttactcctccagaggtttaaggttcgattctctctgatgccaatttcggtgggctaagtc 32942468  T
Q  151 catacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccga 244  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| | |  |||||||||| ||| |||||    
T  32942469 catacagagcttactctggctttaaacggcccccccacaagtggacggtgggattggtcccctcggataaatcgattcttggattggaaaccga 32942562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 36131710 - 36131509
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||    
T  36131710 ccatttggggttggcatagtggtttgcttgggattttggagttcgttcctccagatgtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtggcctaag 36131611  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||    
T  36131610 tccatacagagcttgctatgactttaaacgggacccccgtaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattattagatcagataccgagttt 36131511  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  36131510 tc 36131509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 68 - 249
Target Start/End: Original strand, 49287874 - 49288054
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 167  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |    
T  49287874 tggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaaaatttgctat 49287973  T
Q  168 ggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||    
T  49287974 ggctttaaacgg-gctcccgcaagtgggcgctgagattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagatactgagtttt 49288054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 101 - 249
Target Start/End: Original strand, 34723848 - 34723996
Alignment:
Q  101 agaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtg 200  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  34723848 agaggcctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaaagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtg 34723947  T
Q  201 gaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  34723948 ggattggtcctctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 34723996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 249
Target Start/End: Original strand, 51535611 - 51535818
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggc----t 145  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    |    
T  51535611 catttagggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccacaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaatt 51535710  T
Q  146 aagtccatacagagctt---gctctggctttaaacggagccccc-gcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggatac 241  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||    
T  51535711 aagtccatacagagcttgcagctctggctttaaacggggcccccagcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttagatcggatac 51535810  T
Q  242 cgagtttt 249  Q
    ||| ||||    
T  51535811 cgaatttt 51535818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 35674941 - 35674791
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  35674941 ccatttggggttggccaagtggttggcttgggatcttggagtttgctcttccaaaggtcacaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaag 35674842  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggt 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35674841 tccatacagagcttgctctgcctttaaacggggcccccgcaagtgggcggt 35674791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13584454 - 13584253
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  13584454 ccatttgaggttggcctagtggttggcctgagatattggagtttgctcctccaaaagtctcaagttcgattccctctggtgtcaatttcgatgggctaag 13584355  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||| |||| |||| ||||||    
T  13584354 tccatagagagcttgctctggctttaaacggggccctcacaaatgagcggtggaattggtctcctcgaattagtcggttcttgaatcgaatactgagttt 13584255  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  13584254 tc 13584253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13873495 - 13873322
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  13873495 ccatttggggttggcctagtggtttgcttgggatcttggagtttgctccttcaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtaggctaag 13873396  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    | ||||||||| ||||||| |||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||    
T  13873395 ttcatacagagtttgctctagcttcaaacagggcccccgcaagtgggtggtggaattgatcctctgggattagt 13873322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 105 - 250
Target Start/End: Original strand, 32990488 - 32990633
Alignment:
Q  105 gtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaat 204  Q
    |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  32990488 gtctcaggttcgattccctttagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggat 32990587  T
Q  205 tggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  32990588 tggtcccctcggactagtcgattcttggatcgaatactgagttttc 32990633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 50 - 249
Target Start/End: Original strand, 34835527 - 34835726
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34835527 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctcttaaggtctcatgttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagt 34835626  T
Q  150 ccatacagagcttgctctggctttaaa-cggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||| |||||   ||||||||||||  ||  ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||| ||||||    
T  34835627 ccatacggagctatgtctggctttaaatagggccccccgcaagtgggc-gtgagattggtcccctcggattagtcgattcttagatcgaatactgagttt 34835725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 68 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18875697 - 18875516
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 167  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||| | || || || ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18875697 tggttggtttgggattttagagtttgtttcttcaaagatctcaggttcgattccctctgatgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 18875598  T
Q  168 ggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||  |||| |||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18875597 ggctttaaacgg-gcccccacaagtgggtagtgggattgatcccctcggattagtcaatttttggatcagataccgagttttc 18875516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12500231 - 12500059
Alignment:
Q  76 ttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaa 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12500231 ttgggatcttggagtttgctccttcaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcaatgggctaagtccatacatagcttgctctggctttaa 12500132  T
Q  176 acggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||  ||||||||||||||||||  ||||| | | |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  12500131 acgggacccccgcaagtgggcggtaaaattgat-ctctcggattagtcaattcttggaccggataccgagtttt 12500059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22625270 - 22625097
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  22625270 ccatttgaggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttactcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaag 22625171  T
Q  149 tccatacagagctt---------gctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccct 213  Q
    ||||||||||||||         |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22625170 tccatacagagcttgctcagccagctctgcctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccct 22625097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 7392143 - 7391964
Alignment:
Q  69 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  7392143 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggt-ggttaagtccatacagagtttgctctg 7392045  T
Q  169 gctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||| || | ||||   |||||||||||| |||| |||||||||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||    
T  7392044 gctttaaatgg-gacccccatagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcggttcttcgattggataccgagttttc 7391964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Original strand, 13550205 - 13550404
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13550205 ccatttgcggttggcctagtggttgacttgagatctgggagtttgctcctctagaggtctcaggcctaattccctctagtgccaatttcggtgggctaag 13550304  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||| | || ||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||    
T  13550305 tccataccgagcttactctggctttaaacggggtccccacaagtgggcggtaggataggtcccctcggattaatcgattcttggatcgattaccgagttt 13550404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 103 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9517787 - 9517650
Alignment:
Q  103 aggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgga 202  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||      
T  9517787 aggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcagtgggctaagtccatacagagcttgctctgactttaaacggggcccccgcaggtgggtggtgag 9517688  T
Q  203 attggtcccctcggattagtatattcttggatcggata 240  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9517687 attggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 9517650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 95 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21387639 - 21387486
Alignment:
Q  95 tcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgg 194  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  21387639 tcctccagagatctcaggttcgattccctatagtgtcaattttggtgggctaagtctatacagagcttgctctggctttaaacgggatccccgcaagtgg 21387540  T
Q  195 gcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||    
T  21387539 gcggtgg--gtggtcccctcggattagtcgattattggatcggataccaagttttc 21387486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 55961939 - 55961753
Alignment:
Q  52 tttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtcc 151  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55961939 tttgggattggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctt-----------cctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 55961851  T
Q  152 atacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| |  ||||||| |||| ||||||| |||||    
T  55961850 atacagagcttgctctgactttaaacgg-ggccccacaagtgggcggtgggattggttccttcggattaatcgattcttgaatcgaataccgaattttc 55961753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13771683 - 13771482
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||| |  ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  13771683 ccatttggggttggtctgatggttggcttgggatcttgaagtttgctcatctcaaggtctcaaattcgattccctctgatgtcaatctcggtgggctaag 13771584  T
Q  149 tccatacagagct-tgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  | ||  |||||||||||   ||||||   ||||||||||||||||||| ||    
T  13771583 tccatacgaagctatgctctggctttaaacggggctcccgcaagtggatgatgagattggtcccctataattagtcggttcttggatcggataccgaatt 13771484  T
Q  248 tt 249  Q
    ||    
T  13771483 tt 13771482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 250
Target Start/End: Original strand, 27574356 - 27574516
Alignment:
Q  90 tttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgca 189  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||   |||  |  |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27574356 tttgctcctccataggtctcaggttcgattttctcttattccaatttcggtaggctaaattcatacagagcttgctctggctttaaaaggggcccccgca 27574455  T
Q  190 agtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27574456 agtgggcggtgagtttggtcccctcggattaatcaattcttggatcggatactgagttttc 27574516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 43719264 - 43719154
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  43719264 catttggggttggtctagtggttggtttgagatcttggagtttgctcctccagaggtttcaggttcgattctctctagtgctaatttcggtgggctaagt 43719165  T
Q  150 ccatacagagc 160  Q
    |||||||||||    
T  43719164 ccatacagagc 43719154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 250
Target Start/End: Original strand, 4911950 - 4912124
Alignment:
Q  80 gatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagctt----gctctggctttaa 175  Q
    ||||||||||||||||  |  ||| || | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||||||    |||||||||||||    
T  4911950 gatcttggagtttgcttttttagaagtttcaggttcgattccctctggtgttaattttggtggcctatgtccatatagagcttgcttgctctggctttaa 4912049  T
Q  176 acggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| || ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4912050 acggagcccccgcaagtgggtggtgtgattgatccccccgaattagtcgattcttggatcagataccgagttttc 4912124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 179
Target Start/End: Original strand, 2351020 - 2351140
Alignment:
Q  59 ttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacaga 158  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||| |||||||| |    
T  2351020 ttggcctagtggttggcttggaatcttgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtcgactaaatccatacata 2351119  T
Q  159 gcttgctctggctttaaacgg 179  Q
    ||||| || ||||||||||||    
T  2351120 gcttgttccggctttaaacgg 2351140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20527212 - 20527035
Alignment:
Q  70 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctgg 169  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |    
T  20527212 gttggtttgagattttggagtttgttcctccagaggtctcaagtttgattccctctggcgccaatttcggtgggctaagtccatatagagcttgatttcg 20527113  T
Q  170 ctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
     ||||||| | | ||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||    
T  20527112 gtttaaacag-ggccccgtaagtgggcggtaggattggtctcctcggattagtcgatttttggatcaaataccgagttt 20527035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30879345 - 30879165
Alignment:
Q  69 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 168  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| || ||||||||    
T  30879345 ggttggtttgggatcttgtagtttgctccttcatgggttttaggtttgattccctctggtgccaatttcgatgggttaaatccatacaaagtttgctctg 30879246  T
Q  169 gctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||| || |  || |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||    
T  30879245 gctttaaa-gggggtcctgcaagtggacggtgggattggttccctcagattaatcgattcttggatcagataccgaattttc 30879165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25969700 - 25969504
Alignment:
Q  52 tttggggttggtctaatggttggcttggg-atcttggagtttgctcctccagaggtcttag--gttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||||||| ||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||   |||||  ||  ||| ||||||  |||||| |||||||||||| | |||    
T  25969700 tttggggttggcctactggttgatttggggatcttggagtttgctcctctcaaggtcccagaggttggattccccctggtgccaatttcggtggcc-aag 25969602  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  25969601 tccatacagaacttgctctggctttaaacgg-gcccccgtaagtgagcggtgggattggt-ccctcgaattagtcgattcttgaatcggatactgagttt 25969504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 53787176 - 53787056
Alignment:
Q  131 caatttcggtgggctaagtccatacagagct-tgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattct 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||   || |    
T  53787176 caatttcggtgggctaagtccatgcggagctatgctctggctttaaacggagcccccgcaaatgggcggtgggattagtcccctcagattagtcggtttt 53787077  T
Q  230 tggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||| |||||| ||||||    
T  53787076 tggatcgaataccgggttttc 53787056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22488146 - 22488027
Alignment:
Q  131 caatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattctt 230  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||  ||||||   | |||    
T  22488146 caatttcggtggactaagtccatatagagcttgttctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattgatcccctcaaattagtcggtcctt 22488047  T
Q  231 ggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  22488046 ggatcggataccaagttttc 22488027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 249
Target Start/End: Original strand, 12824464 - 12824597
Alignment:
Q  116 gattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcg 215  Q
    |||||| ||| |||||||||| | |||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||||| | |||    
T  12824464 gattccctcttgtgtcaattttgatgggctaagttcatatagagtttgctctagctttaaatggagctcctgcaagtggacggtgggattggtctcatcg 12824563  T
Q  216 gattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
     ||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  12824564 aattagtcgattcttggatcggatacggagtttt 12824597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 41621796 - 41621684
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||| | ||| |||| | ||||||| |||||| ||||||| ||     
T  41621796 ccatttggggttggcctaatggttggcttgagatcttggagtttgctcctctcaaggtctcatgtttgatttcctctggtgccaattttggtgggc-aaa 41621698  T
Q  149 tccatacagagctt 162  Q
    ||||||||||||||    
T  41621697 tccatacagagctt 41621684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 249
Target Start/End: Original strand, 51595094 - 51595219
Alignment:
Q  124 ctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagta 223  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| || ||| ||| ||||||||| ||||||||||   |||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| |     
T  51595094 ctggtgccaatttcgatggactaaatcaatagagaacttgctctgactttaaacgggatccccgcaagtggacggtggaattgatctcttcggattaatc 51595193  T
Q  224 tattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  51595194 gattcttggatcggataccgagtttt 51595219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9646414 - 9646217
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 150  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||    |||||| | ||| |||||  |||| || |||||||  ||||| ||||     
T  9646414 atttggggttggtctagtggttggtttgggatctttgagtgtgctcctgtcaaggtctcatgtttgattctctctgatgacaatttcaatgggc-aagtt 9646316  T
Q  151 catacagagc-ttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||| || ||||||||||||  ||| | ||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||   |  ||||||||| ||||||||||    
T  9646315 catacagtgctttgctctggcttagaaccgggccaccgcaagtgggcagtgggattgatcccctcggattagtcggtcattggatcgggtaccgagttt 9646217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 29875899 - 29875825
Alignment:
Q  125 tggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggt 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  29875899 tggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgttctgactttaaatggaacccccgcaagttggcggt 29875825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 249
Target Start/End: Original strand, 4064981 - 4065057
Alignment:
Q  173 taaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| ||||    
T  4064981 taaacggagcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgatttttggatcggatatcgaatttt 4065057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 182 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9978576 - 9978509
Alignment:
Q  182 cccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  9978576 cccccgcaagtgggcggtgggattggtcccatcggattagttgattcttagatcggataccgagtttt 9978509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 186 - 249
Target Start/End: Original strand, 23639758 - 23639821
Alignment:
Q  186 cgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23639758 cgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 23639821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 186 - 249
Target Start/End: Original strand, 23645416 - 23645479
Alignment:
Q  186 cgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23645416 cgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 23645479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 187 - 249
Target Start/End: Original strand, 52494623 - 52494685
Alignment:
Q  187 gcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  52494623 gcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 52494685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 43719157 - 43719086
Alignment:
Q  179 gagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  43719157 gagcccccgaaagtgggcggtgggattggtcatctcggattagtcgattcttggatcggataccgaattttc 43719086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4585803 - 4585712
Alignment:
Q  157 gagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| ||| ||||| |||||    
T  4585803 gagcttgctttggctttaaacgg-gcccccgcaagtgggcggtgg-attggtcctttcggattagtcgattcttagattggacaccgatttttc 4585712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 250
Target Start/End: Original strand, 28791113 - 28791312
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctc-ctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    |||||||||||||||| ||  ||  || |||| ||||||| ||||| |||   ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28791113 atttggggttggtctagtgactgatttaggatattggagtatgctctctcttaaggtcttaggttccattacctctggtgtcaatttcggtggg-taagt 28791211  T
Q  150 ccatacagagc-ttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    | ||||| | | ||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||  |||||| |  ||| ||||||   | |||| |||||||| |||||||    
T  28791212 ctatacaaaactttgctctggctttaaacgg-gtctccacaagtgggcggtgagattggttctttcgaattagtcggtccttgaatcggatatcgagttt 28791310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 104
Target Start/End: Original strand, 34722169 - 34722222
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagag 104  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34722169 atttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagag 34722222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 43352520 - 43352439
Alignment:
Q  53 ttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   ||  || |||||||||||  ||||||||||||    
T  43352520 ttggggttggtctaatggttggcttgagatcatggagtttgctcctctcaagaactcaggttcgattctctctggtgtcaat 43352439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 172
Target Start/End: Original strand, 39288883 - 39288978
Alignment:
Q  69 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 168  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||      ||  |||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39288883 ggttggtttgggatcttggagtttgctcctc------tca-aggttcaattcccactgatgtcaatttcggtgggc-aagtccatacagagcttgctctg 39288974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 121
Target Start/End: Original strand, 42245744 - 42245815
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattcc 121  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  42245744 catttggggttggcctagtggttgacttgggatcttagagtttgctcctctaaaggtctcgggttcgattcc 42245815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 248
Target Start/End: Original strand, 12710195 - 12710373
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc-ttgctc 166  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||   |||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||    
T  12710195 tggttggtttgggatcttggagtatgcttctcttaaggtctcaggttcgattccctttaatgtcaatttcggtggac-aagtccatacagtgctttgctc 12710293  T
Q  167 tggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||  |||   || |  ||||||| |||| || ||||||| |||| ||||| |   | |||||||||||||||||||||    
T  12710294 tggcttagaac--tgctctggcaagtgagcggagggattggtcacctcagattaatcggtccttggatcggataccgagttt 12710373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23131497 - 23131435
Alignment:
Q  188 caagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  23131497 caagtgggcggtaggattggtcccctcgaattagtcgattcttcgatcggataccgagttttc 23131435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 55158409 - 55158343
Alignment:
Q  183 ccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||    
T  55158409 ccccgcaaatgggtggtgggattggtcccctcggattagtcgatttttggatcggaaaccgagtttt 55158343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17637912 - 17637852
Alignment:
Q  188 caagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  17637912 caagtgggcggtgatattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggataccgagtttt 17637852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 147
Target Start/End: Original strand, 28635726 - 28635799
Alignment:
Q  75 cttgggatcttggagtttgctcctccag-aggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaa 147  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  28635726 cttgggatctgggagtgtgctcctcctggaggtcttaggttcgattctctctggtgccaatttgggtgggctaa 28635799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 206
Target Start/End: Original strand, 10125872 - 10125973
Alignment:
Q  104 ggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc-ttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgga 202  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||| ||||     
T  10125872 ggtcttaggtttgattccccctggtgccaatttcagtgggc-aaggccatacagagctttgctctagctttaaacgg-ggccctgcaagtgggcagtggg 10125969  T
Q  203 attg 206  Q
    ||||    
T  10125970 attg 10125973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13716568 - 13716450
Alignment:
Q  131 caatttcggtgggctaagtccatacagagctt-gctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattct 229  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| || ||| ||| || |||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||   ||||    
T  13716568 caatttcagtgggc-aagtccatacggaactttgctatgtctttaaacagggccctcgcaagtgggcggtgggattggtcctcttggattggtcagttct 13716470  T
Q  230 tggatcggataccgagtttt 249  Q
    || ||||||||| |||||||    
T  13716469 tgaatcggatactgagtttt 13716450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 38740901 - 38741011
Alignment:
Q  103 aggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacag-agcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgg 201  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||| |||||| |  ||||| || ||| ||||||| | ||||||||  ||||||||    
T  38740901 aggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtggac-aggtctatacagaattttgctttgacttaaaacggacctcccgcaagcaggcggtgg 38740999  T
Q  202 aattggtcccct 213  Q
     |||||||||||    
T  38741000 gattggtcccct 38741011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 7949504 - 7949427
Alignment:
Q  71 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccaga-ggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaa 147  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||  | ||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  7949504 ttggcttgggacctcggagtgtgctcctcctcaaggtctcaggttcgattctctctggtgtcaatttaggtgggctaa 7949427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 249
Target Start/End: Original strand, 33289190 - 33289251
Alignment:
Q  188 caagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  33289190 caagtggacggtgagattagtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgggtttt 33289251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 249
Target Start/End: Original strand, 37302623 - 37302684
Alignment:
Q  188 caagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  37302623 caagtgggcgatgggattggtcccttcggattagtcgattcttgaatcggataccgaatttt 37302684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 250
Target Start/End: Original strand, 13017843 - 13017910
Alignment:
Q  182 cccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||    
T  13017843 cccccgcaagtgggcagtgggattggtccactcggattagtcggtccttggatc-gataccgagttttc 13017910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 249
Target Start/End: Original strand, 41085024 - 41085222
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| | |||||    |||||| | |||||||||  |||| || | |||||| ||| | ||||    
T  41085024 catttggggttgatctagtggttgacttgagatcttggagtgtcctcctttcaaggtctaatgttcgattctctctgatgccgatttcgatggac-aagt 41085122  T
Q  150 ccatacagagc-ttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||| ||  ||||| | || ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||  ||||||| || || ||| ||||||    
T  41085123 ccatatagagctttgctctagcttt-aagtgagccactgctagtggacggtgggattggtcctctcgaattagtggattcttgtataggctactgagttt 41085221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 142
Target Start/End: Original strand, 7093392 - 7093466
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||||||||||||  |||||||  ||||| |||||    
T  7093392 tggttggcttgggatcttggagtgtgctcctttcaaggttttaggttcgattctctctggtgcaaattttggtgg 7093466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 165
Target Start/End: Original strand, 33289146 - 33289180
Alignment:
Q  131 caatttcggtgggctaagtccatacagagcttgct 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33289146 caatttcggtgggataagtccatacagagcttgct 33289180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 186
Target Start/End: Original strand, 37455594 - 37455710
Alignment:
Q  70 gttggcttgggatctt-ggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagag-cttgctct 167  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||  |||||| |||||||  |||||||| |||||| ||||  |||||||    
T  37455594 gttggcttgggacctttggagtatgctcctctcaaggtctcaggttcgattcc-cctggtgccaatttcaatgggctaa-tccatatagagatttgctct 37455691  T
Q  168 ggctttaaacggagccccc 186  Q
    ||||||||| || ||||||    
T  37455692 ggctttaaatggggccccc 37455710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 136
Target Start/End: Original strand, 38869794 - 38869860
Alignment:
Q  71 ttggcttgggatcttggagtttgctcctcc-agaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaattt 136  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  38869794 ttggcttgggatctgggagtgtgctcctcctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattt 38869860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 42508466 - 42508408
Alignment:
Q  164 ctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    ||||| ||||||| ||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  42508466 ctctgactttaaatgggccccccacaagtgggcggttgaattggtcccctcgaattagt 42508408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22630332 - 22630280
Alignment:
Q  103 aggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccataca 156  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  22630332 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggc-aagtccataca 22630280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 95
Target Start/End: Original strand, 45302837 - 45302882
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgct 95  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  45302837 catttggtgtttgtctaatggttggtttgagatcttggagtttgct 45302882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 249
Target Start/End: Original strand, 7093508 - 7093568
Alignment:
Q  189 aagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||   | ||||||||||||| ||||||||    
T  7093508 aagtgggcggtgggattggtcccttcgaattagtcggtccttggatcggatatcgagtttt 7093568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 9693515 - 9693471
Alignment:
Q  103 aggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaa 147  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  9693515 aggtctcaggttcgattccctctagtgtcaatttgggtgggctaa 9693471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 147
Target Start/End: Original strand, 38838824 - 38838900
Alignment:
Q  72 tggcttgggatcttggagtttgctcctccaga-ggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaa 147  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||  || | || |||||||||||||||||    
T  38838824 tggcttgagctcttggagtatgctcctcctcaaggtcttaggttcgattctctccgatggcaatttcggtgggctaa 38838900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 120
Target Start/End: Original strand, 39509079 - 39509146
Alignment:
Q  56 gggttggtctaatggt--tggcttgggatcttggagtttgctcctcc-agaggtcttaggttcgattc 120  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  39509079 gggttggtctcatggtaatggcttgggatctgggagtgtgctcctcctcgaggtctcaggttcgattc 39509146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 88)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40133649 - 40133448
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40133649 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggattttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaag 40133550  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  40133549 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 40133450  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  40133449 tc 40133448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 21362940 - 21363140
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  21362940 ccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtaggctaag 21363039  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  21363040 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggttccctcggattaatcgattcttggatcggataccgagttt 21363139  T
Q  249 t 249  Q
    |    
T  21363140 t 21363140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 35492908 - 35493108
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  35492908 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 35493007  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||    
T  35493008 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggattgaataccgagttt 35493107  T
Q  249 t 249  Q
    |    
T  35493108 t 35493108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8456350 - 8456149
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  8456350 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 8456251  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  8456250 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcagtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 8456151  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  8456150 tc 8456149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25289914 - 25289714
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  25289914 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaag 25289815  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25289814 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 25289716  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  25289715 tc 25289714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 46576345 - 46576546
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  46576345 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaag 46576444  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  46576445 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtcggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 46576544  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  46576545 tc 46576546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 51 - 248
Target Start/End: Original strand, 25379760 - 25379957
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 150  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  25379760 atttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttctagtgccaatttcggagggctaagtc 25379859  T
Q  151 catacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  25379860 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagcgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggatactgagttt 25379957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 49258462 - 49258262
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  49258462 ccatttggggtttgcctagtggttggcttgggatcttgcagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaag 49258363  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  49258362 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 49258263  T
Q  249 t 249  Q
    |    
T  49258262 t 49258262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30807353 - 30807152
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  30807353 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 30807254  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggag-cccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30807253 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcggtaggattggt-ccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtt 30807155  T
Q  248 ttc 250  Q
    |||    
T  30807154 ttc 30807152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 45272616 - 45272415
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  45272616 ccatttggggttggcctagtcgttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcagtttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 45272517  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  45272516 tccatacggagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgactcttggatcggataccgagttt 45272417  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  45272416 tc 45272415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 45529954 - 45529754
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||    
T  45529954 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcgatgggctaag 45529855  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  45529854 tccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggataccgagttt 45529756  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  45529755 tc 45529754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 48977385 - 48977586
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  48977385 ccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccttctggtgccaatttcggtgggttaag 48977484  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||    
T  48977485 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 48977584  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  48977585 tc 48977586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 53424376 - 53424176
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  53424376 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 53424277  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  53424276 tccatacagagtttgctatggctttaaacgg-gcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 53424178  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  53424177 tc 53424176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 56 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15566692 - 15566499
Alignment:
Q  56 gggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatac 155  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15566692 gggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatac 15566593  T
Q  156 agagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15566592 agagcttgctctggctttaaacgg-gcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 15566499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 53 - 250
Target Start/End: Original strand, 26174114 - 26174311
Alignment:
Q  53 ttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtcca 152  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26174114 ttggagttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggttaagtcca 26174213  T
Q  153 tacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26174214 tacagagcttgctctggctttaaatagggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 26174311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 30257621 - 30257822
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| ||| |||||    
T  30257621 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcgatggactaag 30257720  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  30257721 tccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtggcattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgaattt 30257820  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  30257821 tc 30257822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 51 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 52821833 - 52821636
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 150  Q
    |||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  52821833 atttggtgttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgagctaagtc 52821734  T
Q  151 catacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  52821733 catacagagcttgctctggctttaaacgg-ggccccgtaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 52821636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10190922 - 10190741
Alignment:
Q  69 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10190922 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagggctcaggtttgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 10190823  T
Q  169 gctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10190822 gctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 10190741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18177087 - 18176887
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  18177087 ccatttggggttggcctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcttccagaggtatcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggactaag 18176988  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  18176987 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccatcggattagtcgattcttggatcggatacagagttt 18176888  T
Q  249 t 249  Q
    |    
T  18176887 t 18176887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34492775 - 34492575
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  34492775 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcatgttcgattccctctgctgccaatttcgttgggctaag 34492676  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  34492675 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtccattcagattagttgattcttggatctgataccgagttt 34492576  T
Q  249 t 249  Q
    |    
T  34492575 t 34492575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 68 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 53234091 - 53233910
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53234091 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaagtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 53233992  T
Q  168 ggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  53233991 ggctctaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggataccgagttttc 53233910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10083999 - 10083818
Alignment:
Q  69 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10083999 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagggctcaggtttgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 10083900  T
Q  169 gctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10083899 gctttaaacggggcccccacaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 10083818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 40940822 - 40941023
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  40940822 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggactaag 40940921  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||| |||| |  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  40940922 tccatacagagcttgctctgactttaaacggggcccccacaagtgggtggtaggattggtcccctcgaattactcaattcttgaatcagataccgagttt 40941021  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  40941022 tc 40941023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31538038 - 31537838
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  31538038 ccatttggggttggcctagtggttggcttaggatcttggagtttgctcctccagaggtctcatgtttgattccctctggtgccaattttggtgggctaag 31537939  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  31537938 tctatacagagcttactctggctttaaacggagcccctgcaagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagtcaattcttggatcggatatcgagttt 31537839  T
Q  249 t 249  Q
    |    
T  31537838 t 31537838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 74 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39042027 - 39041852
Alignment:
Q  74 gcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggcttt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39042027 gcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatgcagagcttgctctggcttt 39041928  T
Q  174 aaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  39041927 aaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtccactcggattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 39041852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 52455849 - 52455648
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||    
T  52455849 ccatttggggttggcctagtggttggctagggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggctaag 52455750  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  52455749 tctacacagagcttgctctgactttaaacggggcccccgcaagtgactggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggattggataccgagttt 52455650  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  52455649 tc 52455648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 59 - 201
Target Start/End: Original strand, 26108299 - 26108441
Alignment:
Q  59 ttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacaga 158  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26108299 ttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaga 26108398  T
Q  159 gcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgg 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26108399 gcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggctgtgg 26108441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 56 - 249
Target Start/End: Original strand, 32151428 - 32151621
Alignment:
Q  56 gggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatac 155  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  32151428 gggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtttcaaattcgattctctctagtgccaatttcggtgggctaagctcatac 32151527  T
Q  156 agagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32151528 agagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 32151621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 92 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8097436 - 8097278
Alignment:
Q  92 tgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaag 191  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8097436 tgctcctccagaggcctcaggttcgattccctcttgtgctaatttcgatgggctaagtccatacagagcatgctctggctttaaacggggcccccgcaag 8097337  T
Q  192 tgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8097336 tgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 8097278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29915469 - 29915288
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  29915469 ccatttagggttgacctaatggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcttctggtgccattttcggtgggctaag 29915370  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttg 231  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||  |||||||    
T  29915369 tacatacagagcttgccctggctttaaacgg-gcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccatcgaattagtcgattcttg 29915288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29964622 - 29964441
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  29964622 ccatttagggttgacctaatggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcttctggtgccattttcggtgggctaag 29964523  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttg 231  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||  |||||||    
T  29964522 tacatacagagcttgccctggctttaaacgg-gcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccatcgaattagtcgattcttg 29964441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25344257 - 25344057
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||  |||| |||||    
T  25344257 ccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggtttgattccctttggtgtcaatttttgtggtctaag 25344158  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||  ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||    
T  25344157 tccatacagagtttgctctggctttaaacggggcccccgctagtgggcgatgggattggt-tcctcggattagtcgattcttagatcgaataccgagttt 25344059  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  25344058 tc 25344057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8958210 - 8958034
Alignment:
Q  75 cttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggcttt- 173  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  8958210 cttgggatcttggagtctgctccttcaaaggtcttatgttcgatttcctctggtgtcaattttggtgggctaagtccatacaaagcttgctctagcttta 8958111  T
Q  174 aaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8958110 aaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctctgattaatcgattcttggatcagataccgagttttc 8958034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7485725 - 7485531
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  7485725 ccatttggggttggcatagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggctaag 7485626  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    | |||    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7485625 ttcat----agcttgatctggctttaaacag-gcccctgcaagtggccggtgggattggt-ccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 7485532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 81 - 249
Target Start/End: Original strand, 1692863 - 1693030
Alignment:
Q  81 atcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgga 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |     
T  1692863 atcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccatttagtgtcaatttcggtggactaagtctatacagaacttgctctggctttagacag- 1692961  T
Q  181 gcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  1692962 gcccccgcaagtgggcggtgggatttgccccctcagattagtcgattcttgaatcggataccgagtttt 1693030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7470415 - 7470244
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||    
T  7470415 ccatttggggtttgcctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctaatgccaatttcggtgggctaag 7470316  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattag 221  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  7470315 ttcatacagagcttgctctggctttaaacgg-ggccctgcaagtgggcagtgggattggtcccctcagattag 7470244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 249
Target Start/End: Original strand, 4462631 - 4462829
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| || || | |||| | |||||||||| |||||   |||||||| ||||||||||    
T  4462631 catttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctacttcaaaagtctcatgttcgattccctctggcaccaatttcgatgggctaagt 4462730  T
Q  150 ccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4462731 tcatacagagcttactctagctttaaacgg-ggccccgcaagtggacggtgggattgatccactcggattagtttattcttggattggataccgagtttt 4462829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 2511449 - 2511296
Alignment:
Q  97 ctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggc 196  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||  || ||||||||||||    
T  2511449 ctccataggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctcgctctgactttaaacgggacctccgcaagtgggc 2511350  T
Q  197 ggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  2511349 ggtgggattggtctcctcgaattagtagattcttgaatcggataccaagttttc 2511296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33398641 - 33398468
Alignment:
Q  76 ttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaa 175  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | || ||| | |||||||||| ||| ||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  33398641 ttgggatcttgtagtttgctcttctaaagatctcaagttcgattccctctagtgccaattttggtgggttatgtccatacagagcttgctctagctttaa 33398542  T
Q  176 acggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  33398541 acggggcccccgcaagtgggcggtgggattggttccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgaatttt 33398468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 68 - 240
Target Start/End: Original strand, 19857068 - 19857239
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 167  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  19857068 tggttggcttgg-atcttggagtttgctcctccagatgtctcaggttcgattccctttggtgtcaatttcggtgggctaagttcagttagagcttgctct 19857166  T
Q  168 ggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggata 240  Q
      ||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||| || |||||    
T  19857167 aactttaaatggggtctccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcgcaatagtcgattcttgaattggata 19857239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 51 - 250
Target Start/End: Original strand, 11390601 - 11390800
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 150  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| || | | ||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11390601 atttggggttggcctagtggttggtttgagatcttggagttttctcctccaaagatttcaggtttgatttcctctggtgtcaattttggtgggctaagtc 11390700  T
Q  151 catacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  || |||||| ||    |||  |||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11390701 catacagagcttgctctgtctttaaatgggtcctccgcaaatgattcgtgagattattcccctcggattagtcgattcttggatcggatactgagttttc 11390800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 249
Target Start/End: Original strand, 24407309 - 24407458
Alignment:
Q  100 cagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggt 199  Q
    ||||||||| || ||||||||  |||||||  |||||||||||| |||||  |||||||  |||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  24407309 cagaggtctcagattcgattctctctggtgctaatttcggtgggttaagtatatacagaatttgctctgactttaaacggggccatcgcaagtgggcggt 24407408  T
Q  200 ggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24407409 gggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 24407458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 222
Target Start/End: Original strand, 51532786 - 51532959
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||  ||| | ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||  |||  || ||||||||||||||||||    
T  51532786 ccatttggggttgacctattagttggtttgagattttggagtttgcttctccaaaggtctcatgttcgattctctctaatgccaatttcggtgggctaag 51532885  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  51532886 tccatacagagcttgctctaactttaaatgggacccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcagattagt 51532959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 53288893 - 53288713
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 167  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  53288893 tggttggtttgggatattagagtttgctcctccaaaggtctcaggctcgattccctctggtgccaatttcggtggactaagtccatacaaagcttgcttt 53288794  T
Q  168 ggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||| | ||||||||  || |||||  ||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  53288793 ggctttaaacgg-ggccccgcaaacggacggtgagattagtcccctcgaattagtcgattattggatcggttaccaagtttt 53288713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 146 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24165817 - 24165714
Alignment:
Q  146 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgag 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24165817 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccc-gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgag 24165719  T
Q  246 ttttc 250  Q
    |||||    
T  24165718 ttttc 24165714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 68 - 222
Target Start/End: Original strand, 49167072 - 49167229
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc---ttgc 164  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||    
T  49167072 tggttggcttgagatcttggagtttgctcctccaaagatatcaggttcgattctctctggtgtcaatttcggtggactaagtccatacatagcgttttgc 49167171  T
Q  165 tctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||  ||||| |||| | ||||||    
T  49167172 tctggctttaaacgggacccccgcaagtgggtggtggggttggttcccttgaattagt 49167229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 50 - 244
Target Start/End: Original strand, 26158816 - 26159003
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    ||||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||| |||||  ||||| | ||||| ||||||||||||| |||||    
T  26158816 catttggggttggcctatgtgttggcttgagatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttcattccctttggtgccaatttcggtggg-taagt 26158914  T
Q  150 ccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccga 244  Q
    ||||||||      |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  26158915 ccatacag------ctctggcttagaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcggtccttggatcggataccga 26159003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 190
Target Start/End: Original strand, 38732963 - 38733105
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||    
T  38732963 ccatttgaggttgggctaatggttgacttggaatcttggagtttgttcctccagaggtctcaggtccgattctctctgttgtcaatttcggtgggctgag 38733062  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggag-cccccgcaa 190  Q
    | ||||||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||||||    
T  38733063 ttcatacagaggttgctctgacttttaactgagtcccccgcaa 38733105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 249
Target Start/End: Original strand, 54475777 - 54475878
Alignment:
Q  148 gtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  54475777 gtccatacagagcttgctttggctttaaacggggccaccgcaagtgggcggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcagataccgagtt 54475876  T
Q  248 tt 249  Q
    ||    
T  54475877 tt 54475878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4252596 - 4252404
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||| |||  | |||    
T  4252596 ccatttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaagtttgattccctctggtgccaatttcagtgatc-aag 4252498  T
Q  149 tccatacagagc-ttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggatac 241  Q
    |||||||| ||| || |||||| ||  |||||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  4252497 tccatacaaagctttactctggtttagaacggcccccccacaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgatccttggatcggatac 4252404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 218
Target Start/End: Original strand, 1242036 - 1242139
Alignment:
Q  115 cgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc-ttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccct 213  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1242036 cgattccctctggtgccaattttggtgggctaagtccatacagagctttgctctggctttaaacgg-ggtcccgcaagtgggcggtggaattggtcccct 1242134  T
Q  214 cggat 218  Q
     ||||    
T  1242135 tggat 1242139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14343478 - 14343304
Alignment:
Q  59 ttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacaga 158  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| | ||||  | |||||||  |||||||||||||||||||    
T  14343478 ttggtctattggttggtttgagatcttggagtttgctcctccagatgtctcagattcgatttcatctgacgccaatttcaatgggctaagtccatacaga 14343379  T
Q  159 gcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggat 234  Q
     ||||||||| ||||||||||    ||| |||||| ||||| |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||    
T  14343378 acttgctctgcctttaaacgg-tatcccacaagtgagcggtagaattgatccccttagattagtcgattcttggat 14343304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17579280 - 17579134
Alignment:
Q  105 gtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaac-ggagcccccgcaagtgggcggtggaa 203  Q
    |||| ||||| |||| | ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| || ||||||||||||||||  |    
T  17579280 gtctcaggtttgatttcctctagtgttaattttggtgggctaagtccatacagagcttgctttagctttaaacgggaccctccgcaagtgggcggtgaga 17579181  T
Q  204 ttggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||| |||||||||    
T  17579180 ttggtcccctcagattagtcgatttttggatcgaatatcgagttttc 17579134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 154
Target Start/End: Original strand, 25017513 - 25017617
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| | |   |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25017513 ccatttggggttggcccagatgttggcttgg-atcttggagtttgctcctccaaagatcttaggttcgattccatctagtgtcaatttcggtgggctaag 25017611  T
Q  149 tccata 154  Q
    ||||||    
T  25017612 tccata 25017617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 163
Target Start/End: Original strand, 55287800 - 55287914
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| |    
T  55287800 ccatttggggttggcatagtggttggcttggaatcttagagtttgctccttcagaggtttcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggctagg 55287899  T
Q  149 tccatacagagcttg 163  Q
    |||||||| ||||||    
T  55287900 tccatacaaagcttg 55287914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 250
Target Start/End: Original strand, 1178230 - 1178368
Alignment:
Q  110 aggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagctt-gctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggt 208  Q
    |||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||  || ||||||||||| ||||||    
T  1178230 aggttcgattctccctggtgccaatttcggtgggc-aagtccatacagaactttgctctggctttaaatggggcccca-cacgtgggcggtgggattggt 1178327  T
Q  209 cccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  1178328 ccc-tcggattagtcgaatcttggatcggataccgagttttc 1178368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48972850 - 48972714
Alignment:
Q  110 aggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtc 209  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |||   |||||||| |||| ||||||||    
T  48972850 aggttcgattccctctggtgccaatttcgatgggttaagttcatatagagtttgctctgactttaaacggatccc---caagtggggggtgaaattggtc 48972754  T
Q  210 ccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |  ||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  48972753 cattcgaattagtcgattcttgaatcggataccgagtttt 48972714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 244
Target Start/End: Original strand, 27887426 - 27887622
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||   | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  27887426 catttggggttgatctagtggttggcttgagatattggagtgtgcttctctcaatgtcttaggttcgattcctccttatgtcaattttggtgggctaagt 27887525  T
Q  150 ccatacagagct-tgctctggctttaaacg-gagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccga 244  Q
    ||||||  |||| |||| || ||||||| | |||| |||| ||||||| ||| | |||||||   ||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  27887526 ccatacgcagctatgctttgcctttaaatgagagctcccgtaagtgggtggtaggattggtctaatcggattagtcggttcttagatcggataccga 27887622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 160 - 248
Target Start/End: Original strand, 48104985 - 48105073
Alignment:
Q  160 cttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  48104985 cttgctctggctttaaacagggcccccacaagtgggcggtgagattggtcccttcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 48105073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 182 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 53848501 - 53848433
Alignment:
Q  182 cccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  53848501 cccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 53848433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 222
Target Start/End: Original strand, 50582989 - 50583161
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||| | |||| || |||||||| |||| ||||    
T  50582989 ccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctcttaaggtttcaggttcgatttcctctgttgccaatttcgttggg-taag 50583087  T
Q  149 tccatacagagc-ttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    |||||||| | | ||| | || ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  50583088 tccatacaaaactttgatttgactttaaatggag-ccccgtaagtgagcggtgggattggtcctctcgaattagt 50583161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6041871 - 6041670
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||   |||  | | |||||||| |  || ||| ||||||||||||  |||||    
T  6041871 catttggggttgccctaatggttgacttgaaatcttggagtttgctcctctcaaggagtcatgttcgattgcccctagtgccaatttcggtggattaagt 6041772  T
Q  150 ccatacagagct-tgctctggctttaaacggagcccccg-caagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||||||||  |||| ||||||  |||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  6041771 ccatacagagttatgctctgactttaaacgaagcccccctcaaatgggcggtgagattgttccccttagattagtcggttcttggatcagataccgagtt 6041672  T
Q  248 tt 249  Q
    ||    
T  6041671 tt 6041670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 138
Target Start/End: Original strand, 9842918 - 9843006
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcg 138  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||    
T  9842918 ccatttggggttggtctagtggttggtttgggatcttggagttttctcctccagaggtc-tcgattcgattcccactggtgtcaatttcg 9843006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 55371483 - 55371302
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 150  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||   |||||| | |||||||||| | ||||| ||||||||| || | ||||     
T  55371483 atttgaggttggcctagtggttggcttgcgattttggagtatgcttctctcaaggtctcatgttcgattccctttggtgccaatttcggcggac-aagtt 55371385  T
Q  151 catacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggatac 241  Q
    ||||        |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  55371384 cata--------gctctggcttaaaacggggccctcgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgatccttggatcggatac 55371302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 149 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33698806 - 33698705
Alignment:
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||| ||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  33698806 tccatatagagtttgctctggctttaaacggggctcccgcaaatgggtggtgggattggtcccctcaaattagtcgattctcggatcggatgccgagttt 33698707  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  33698706 tc 33698705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 222
Target Start/End: Original strand, 34844396 - 34844547
Alignment:
Q  70 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagctt-gctctg 168  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||| || |||||||||||| ||| ||    
T  34844396 gttggcttgagaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctccagagccaatttcggtggacta-gtacatacagagctttgctatg 34844494  T
Q  169 gctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34844495 gctttaaatgg-gcccccgcaagtggatggtgggattggacccctcggattagt 34844547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 187 - 249
Target Start/End: Original strand, 4048085 - 4048147
Alignment:
Q  187 gcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4048085 gcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagttgattcttggatcggataccgagtttt 4048147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 59 - 138
Target Start/End: Original strand, 9853623 - 9853702
Alignment:
Q  59 ttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcg 138  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  | |||| ||||||||    
T  9853623 ttggtctagtggttagtttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattcccaccggtgccaatttcg 9853702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 50731298 - 50731237
Alignment:
Q  188 caagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  50731298 caagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgatccttggatcggataccgagtttt 50731237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 249
Target Start/End: Original strand, 50781556 - 50781617
Alignment:
Q  188 caagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  50781556 caagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgatccttggatcggataccgagtttt 50781617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 250
Target Start/End: Original strand, 3747732 - 3747779
Alignment:
Q  203 attggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3747732 attggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 3747779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28531108 - 28531031
Alignment:
Q  71 ttggcttgggatcttggagtttgctcctcca-gaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaa 147  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  28531108 ttggcttgggatctgggagtatgctcctcctcgaggtcttaggctcaattctctctggtgtcaatttgggtgggctaa 28531031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 249
Target Start/End: Original strand, 25017620 - 25017685
Alignment:
Q  183 ccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  25017620 ccccgcaagtgggcggtgggattggttcctt-ggattagtcgattcttggatcgaataccgagtttt 25017685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 53863918 - 53863845
Alignment:
Q  70 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtggg 143  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  53863918 gttggcttgggaccttggagtgtgctcctctcaaggtcttaggttcaattctctctggtgccaatttcgttggg 53863845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 141
Target Start/End: Original strand, 4222167 - 4222238
Alignment:
Q  71 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagag-gtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtg 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  4222167 ttggcttgggatctgggagtgtgctcctcctcaaagtcttaggttcgattctctctggtgtcaatttaggtg 4222238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 250
Target Start/End: Original strand, 7195918 - 7196005
Alignment:
Q  163 gctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||| ||||||| ||  ||||| || |||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||||| |||  ||||||||||||||    
T  7195918 gctctgactttaaatgggccccccacatgtgggcagtgggattggtcccctcagattagtcgattctttgattagataccgagttttc 7196005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 176
Target Start/End: Original strand, 16140294 - 16140422
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| || || | |||||||||||||| |||||||||   | |||| | ||||||||   ||| |||||||||| ||||||| |||    
T  16140294 ccatttggggttggcctagtgattagtttgggatcttggagcttgctcctctcaaagtctcatgttcgattttctctagtgtcaattttggtgggc-aag 16140392  T
Q  149 tccatacagagc--ttgctctggctttaaa 176  Q
    |||||| | |||  | ||||||||||||||    
T  16140393 tccatataaagctatagctctggctttaaa 16140422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 222
Target Start/End: Original strand, 33793584 - 33793622
Alignment:
Q  184 cccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  33793584 cccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagt 33793622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 120
Target Start/End: Original strand, 36660768 - 36660838
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattc 120  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||    
T  36660768 catttggggttgacctagtggttggtttaggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggttcaattc 36660838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 8456042 - 8455950
Alignment:
Q  108 ttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaa-cggagcccccgcaagtgggcggtg 200  Q
    |||||||||||||  ||| ||  |||||| | ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||    
T  8456042 ttaggttcgattctctctagtaccaattttgatgggc-aagtccatacataacttgctctggctttaaatgggaccccctgcaagtgggcggtg 8455950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 10499159 - 10499082
Alignment:
Q  71 ttggcttgggatcttggagtttgctcctcca-gaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaa 147  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||  ||||||| |||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||    
T  10499159 ttggcttgggatctgggagtctgctcttccttgaggtctcaggttcgattctctccgatgtcaatttgggtgggctaa 10499082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 31520655 - 31520578
Alignment:
Q  71 ttggcttgggatcttggagtttgctcctcc-agaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaa 147  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||  ||  ||||||||||  |||||||||    
T  31520655 ttggcttgggatctgggagtgtgctcctcctcgaggtcttaggtttgattctctccagtgtcaatttgagtgggctaa 31520578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 32094841 - 32094756
Alignment:
Q  165 tctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||| ||||||| || || |||| ||| ||| ||||| |||||||| |||  ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  32094841 tctgcctttaaatggggctcccgtaagcgggtggtgggattggtcctctcatattagtcggttcttggatcggataccgagttttc 32094756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Original strand, 44069783 - 44069860
Alignment:
Q  70 gttggcttgggatcttggagtttgctcctcc-agaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggcta 146  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||   |||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
T  44069783 gttggcttgagatcttggagtgtgctcctcctcaaggtctcaggtttgattctttccggtgccaatttaggtgggcta 44069860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 51903928 - 51903851
Alignment:
Q  71 ttggcttgggatcttggagtttgctcctcc-agaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaa 147  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  | ||||| |||||||||||  || |||||||||||  |||||||||    
T  51903928 ttggcttgggatctgggagtgtgctcctcctcgtggtctcaggttcgattctctccggtgtcaatttgagtgggctaa 51903851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 146
Target Start/End: Original strand, 2667888 - 2667964
Alignment:
Q  71 ttggcttgggatcttggagtttgctcctcc-agaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggcta 146  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||  ||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||    
T  2667888 ttggcttgggatctgggagtgtgctcttcctcgaggtctcaggttcgattatctctagtgtcaatttaggtgggcta 2667964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 147
Target Start/End: Original strand, 8170731 - 8170775
Alignment:
Q  103 aggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaa 147  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  8170731 aggtctcaggttcgatttcctctggtgtcaatttgggtgggctaa 8170775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 18316547 - 18316499
Alignment:
Q  72 tggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattc 120  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  18316547 tggcttgggaccttggagtgtgctcctctcaaggtcttaggttcgattc 18316499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 75)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 44946253 - 44946052
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  44946253 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 44946154  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  44946153 tccatacagaacttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 44946054  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  44946053 tc 44946052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11941410 - 11941210
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||| |||||| |||||| ||||    
T  11941410 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctatggtgccaattttggtgggttaag 11941311  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11941310 tccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 11941211  T
Q  249 t 249  Q
    |    
T  11941210 t 11941210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 15037956 - 15038157
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  15037956 ccatttggggttggcctagtggttgactcgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 15038055  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15038056 tccatacagagcttgctttggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggataccgagttt 15038155  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  15038156 tc 15038157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33827773 - 33827572
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  33827773 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagattgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcgttgggctaag 33827674  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33827673 tccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccctgcaagtgggcggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 33827574  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  33827573 tc 33827572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30467030 - 30466830
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  30467030 ccatttggggttggcctagtggttggtttgggatattggagtttgttcctctagaggtctcaggttcgattctctctgctgccaatttcggtgggctaag 30466931  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  30466930 tccatacagagcttgctctggctttaaaccgggcccccgcaagtgggcagtgggattggtcccttcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 30466831  T
Q  249 t 249  Q
    |    
T  30466830 t 30466830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 83 - 250
Target Start/End: Original strand, 35171831 - 35171998
Alignment:
Q  83 cttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagc 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35171831 cttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggcaccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggc 35171930  T
Q  183 ccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  35171931 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggataccgagttttc 35171998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 69 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 36242492 - 36242319
Alignment:
Q  69 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 168  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  36242492 ggttggcttgggatcttgaaatttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccagccagagcttgctctg 36242393  T
Q  169 gctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggatacc 242  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  36242392 gctttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattaatcgattcttggatcggatacc 36242319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 50 - 249
Target Start/End: Original strand, 17324764 - 17324961
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  17324764 catttggggttggcctagtggttggtttggtatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 17324863  T
Q  150 ccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||  |||||| ||||||||| ||||||||    
T  17324864 ccatacagagcttgctctggctttaaatgg-gcccccacaagtgggcggtgggattagtcccctcaaattagtcgattctt-gatcggatatcgagtttt 17324961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 19054022 - 19054224
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||||||| || ||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19054022 ccatttggggtgggcctagtgattggcttgagatcttggagtctgctcctccaaaggtctcaggtttgattccttctggtgttaacttcggtgggctaag 19054121  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacgg-agcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  19054122 tccatacagagcttgctttggctttaaatggaaccccccgcaagtgggcggtgggattggtccgctcggattagtcgattcttggatcagataccgagtt 19054221  T
Q  248 ttc 250  Q
    |||    
T  19054222 ttc 19054224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 24196001 - 24196200
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  24196001 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggattttggggttcgctcctccagaggtttcaggttcgattccctctggtgcaaatttcggtgggctaag 24196100  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| || ||| |||||||||||||    
T  24196101 tccatacagaacttgctctggctttaaacg--ggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattttttgattggataccgagttt 24196198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 41313989 - 41314189
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41313989 ccatttggggttgccgtagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaag 41314088  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |  |||||| ||||||||||| |||||    
T  41314089 tctatacagagcttgctctgactttaaacgg-gatcccgcaagtggacggtgggattggtcccctcagattaatcgattcttcgatcggataccaagttt 41314187  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  41314188 tc 41314189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 50 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 44976353 - 44976180
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  44976353 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggggtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaagt 44976254  T
Q  150 ccatacagagcttgctctggctttaaacggagc-ccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  44976253 ccatacagagtttgctctggctttaaacggggctccccgcaagtgggcggtgggattgatcccttcggattagt 44976180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 68 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34516589 - 34516413
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34516589 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtttcaggttcgattc-----ggtggtaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 34516495  T
Q  168 ggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  34516494 cgctttaaacgg-gcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccaagttttc 34516413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 43374505 - 43374329
Alignment:
Q  69 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  43374505 ggttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtttatacaaagcttgctctg 43374406  T
Q  169 gctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||     |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  43374405 gcttta-----agcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccttcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 43374329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 25293163 - 25293356
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  25293163 ccatttgaggttggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctcgagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 25293262  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggag-cccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    | ||||        ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25293263 ttcata--------gctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtt 25293354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 68 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10582171 - 10582019
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10582171 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 10582072  T
Q  168 ggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  10582071 agctttaaacgg-gccctcgcaagtgggc-gtgggattggtcccctcgaattagt 10582019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Original strand, 5394034 - 5394215
Alignment:
Q  69 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 168  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5394034 ggttggcttgagatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcgatgggctaagtccatacagagtttgctctg 5394133  T
Q  169 gctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
     ||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||    
T  5394134 actttaaatggggccgccgcaagtgggcggtgggattggtccgttcggattagtcggtccttagatcggataccgaattttc 5394215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4567637 - 4567428
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||     
T  4567637 ccatttggggttggcctagtagttggcttgggatcttgaagtttgctccttcagaagtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggctaaa 4567538  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcg--------gtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggata 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||        |||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4567537 tccatacagagcttgttctggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattgtgggattggtcctctcggattagtcaattcttggatcggata 4567438  T
Q  241 ccgagttttc 250  Q
    || |||||||    
T  4567437 cccagttttc 4567428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27269550 - 27269344
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtc------aatttcggtgg 142  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||||||||      |||||||||||    
T  27269550 ccatttggggttggcatagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctctaaaggttttaggtttgattccctctggtgtcggtgtcaatttcggtgg 27269451  T
Q  143 gctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggatacc 242  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  27269450 gctaagtccatatagaacttgctctggctttaaacagccctcccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggataggatacc 27269351  T
Q  243 gagtttt 249  Q
    |||||||    
T  27269350 gagtttt 27269344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Original strand, 1191530 - 1191711
Alignment:
Q  69 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 168  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1191530 ggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgtttccctctagtaccaatttcggtgggctaagtccatacagagtttgctctg 1191629  T
Q  169 gctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||  ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| || ||||||| |||||    
T  1191630 gctttaaacggtgtccccgaaagtgaacggtggaattgttcccctcgaattagtcgattcttggaccgaataccgaattttc 1191711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 68 - 250
Target Start/End: Original strand, 27290604 - 27290772
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290604 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattcccttcggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 27290703  T
Q  168 ggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||||  |||||||||||              ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27290704 ggctttaaacgggccccccgcaagt--------------gtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 27290772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 51 - 249
Target Start/End: Original strand, 41329842 - 41330039
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 150  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||| | || ||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||    
T  41329842 atttggggttggcctagtggttagtttgggatcttagagtttgctcctccaaaggtttcagattcgattccctctggtgccaattttggcgggctaagtc 41329941  T
Q  151 catacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||||||||    
T  41329942 cata-agagcttgctctggctttaaatggggcccccacaagtgggcggtgagattggtcccctcagattagtcggttcttggaccggataccgagtttt 41330039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36390766 - 36390569
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||    
T  36390766 ccatttggggttggcctagtggttggtttgggatct--gagtttgcttctccaaaggtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtggactaag 36390669  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||  || |||| ||||||||||||||||    
T  36390668 tccatacaaagcttgctctgactttaaatgggacccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggatcagtcgatacttgaatcggataccgagttt 36390570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 51 - 250
Target Start/End: Original strand, 8258896 - 8259095
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 150  Q
    |||||||||||   |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||  | |||||| |||||| ||||||    
T  8258896 atttggggttgacataatggttagtttgagatcttggagtttgctcctccagatgtctcaggttcgattccctctgacgccaattttggtgggttaagtc 8258995  T
Q  151 catacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||| || || ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8258996 catacagatcttgttctggctttaatcggggcccccgcaagtaggcggtgggattagttccttcggattagtcgattcttggatcggatactgagttttc 8259095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8192551 - 8192351
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||    
T  8192551 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatgtcggtgggc-aag 8192453  T
Q  149 tccatacagagc-ttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||    
T  8192452 tccatatagagctttgctctggcttagaacgg-cccctcgcaagtgggcggtgggattgggcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagtt 8192354  T
Q  248 ttc 250  Q
    |||    
T  8192353 ttc 8192351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 98 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 2140634 - 2140485
Alignment:
Q  98 tccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagccccc-gcaagtgggc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||    
T  2140634 tccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgg----agtccatacagagcttgctctggctttaaatgggcccccccgcaagtgggc 2140539  T
Q  197 ggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2140538 ggtgggattggtcccctcggattagtcgattattggatcggataccgagttttc 2140485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 249
Target Start/End: Original strand, 19849849 - 19850029
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 167  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19849849 tggttggtttgagatcttggagtttgctcctccaaaggtcttaagttcgattccttttagtgtcaattttgatggactaagtctatacagagcttgctct 19849948  T
Q  168 ggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| |  ||||||||||| ||||| |||||||    
T  19849949 ggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcctctcaaattaatcgattcttggatc-gatactgagtttt 19850029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 125 - 250
Target Start/End: Original strand, 28668946 - 28669071
Alignment:
Q  125 tggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtat 224  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  28668946 tggtgccaatttcggtggactaagtccatacagagcttgctttggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg 28669045  T
Q  225 attcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  28669046 atttttggatcggataccgagttttc 28669071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 242
Target Start/End: Original strand, 45271401 - 45271574
Alignment:
Q  69 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | | |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45271401 ggttggcttgggatcttagagtttgcttctccagaggtttcatgttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagtccatacagagcttgctctg 45271500  T
Q  169 gctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggatacc 242  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||| |  |||| |||||||  ||||||  |||||| ||| |||||||    
T  45271501 gctttaaacgaagcccctgcaagtgagcggagagattgatcccctcaaattagtcgattctttgattggatacc 45271574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 249
Target Start/End: Original strand, 13266507 - 13266686
Alignment:
Q  69 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 168  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||| | |||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13266507 ggttggcttgagatcttggaatttgctcctttagaggtctcatgttcgattcactctggtgccaattccggtggactaagtccatacagagcttgctctg 13266606  T
Q  169 gctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||   ||| ||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  13266607 gctttaaacgg-ggccccgcaagtgggtaatgggattggtcccctcaaattagtcgattcttggatcggatatcgagtttt 13266686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 250
Target Start/End: Original strand, 3943811 - 3943938
Alignment:
Q  123 tctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3943811 tctggtgccaatttcggttggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggctcccgcaagtgggtggtgggattggtccccttggattagt 3943910  T
Q  223 atattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
       || |||||||||||||| |||||||    
T  3943911 cggttattggatcggataccaagttttc 3943938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 14946776 - 14946975
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14946776 ccatttggagttggcctagtggttgacttgagatcttgaagtttgctcctctcaaggttttaggttcgattttctctggtgtcaatttcagtgggctaag 14946875  T
Q  149 tccatacagagct-tgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtt 247  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||  |||| ||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||   || |||||||||| ||||||||    
T  14946876 tccatacggagctatgctctagctttaaacgga--ccccccaagtaggcagtgggattggtcccctcagattagtcagtttttggatcggagaccgagtt 14946973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5608234 - 5608038
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||| |||||||||||   |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  5608234 ccatttcgggttggtctagcagttggcttgaaatcttggaatttgctccttcagaggtctcatattcgattctctctggtgtcaattttggtgggctaag 5608135  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgag 245  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || |||| |||| || ||| |||  ||| ||| |||||||||||||    
T  5608134 tccatatagagcttgctctgactttaaacggagctcccacaaatggtcggcgggattgatcccttcagatgagtcgattattgaatcggataccgag 5608038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 131 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 714243 - 714125
Alignment:
Q  131 caatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattctt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||| |||||||  ||||||    
T  714243 caatttcggtgggctaagtccatagagagtttgctctgactttaaacggagcccccgcaaatgggcggtgggtttcgtcccctcagattagtcgattctt 714144  T
Q  231 ggatcggataccgagtttt 249  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  714143 agattggataccgagtttt 714125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 71 - 249
Target Start/End: Original strand, 29361573 - 29361745
Alignment:
Q  71 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 170  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||    ||||||||  ||||    
T  29361573 ttggattgggatcttggagtttgctcctccaaagatctcaggt-cgatttcctctgatgtcaatttcggtggactaagtcca----gagcttgccgtggc 29361667  T
Q  171 tttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| || |||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||||||    
T  29361668 tttaaacggagcccc-gcaagtgggcagtgggattgatctcctcggattaattgattcctggatcggatatcgagtttt 29361745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 155
Target Start/End: Original strand, 32845088 - 32845194
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32845088 ccatttggggttggcctagtagttagcttgggatcttggagtttgctcctccaaaagtttcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 32845187  T
Q  149 tccatac 155  Q
    |||||||    
T  32845188 tccatac 32845194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6714481 - 6714295
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |  | |||||||||||||||||    
T  6714481 ccatttgggattggcctaatggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccatctagcattaatttcggtgggctaag 6714382  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |              |||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  6714381 t--------------ctctcgctttaaacgggactcccgcaagtggacggtgagattggtcccctcaaattagtcgattcttggattggataccgagttt 6714296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 18976625 - 18976524
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| | | |||||||||||| |||||    
T  18976625 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcatgttcgattccctct-gagccaatttcggtggactaag 18976527  T
Q  149 tcc 151  Q
    |||    
T  18976526 tcc 18976524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 28194311 - 28194137
Alignment:
Q  71 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 170  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    ||    ||    
T  28194311 ttggcttgggatcttggagtgtgctcctcttaaggtcttaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggc-aagtccatacaga----gcaaaagc 28194217  T
Q  171 tttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||  ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | || |||||||   | |||||||||||||||||||||||    
T  28194216 ttagaacggggcccccgcaagtaggcggtgggattggtctcgtcagattagtcggtccttggatcggataccgagttttc 28194137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 40997550 - 40997420
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||  || ||  ||||||||||| | ||||    
T  40997550 ccatttgaggtgggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcatgttcaattccccctagtaccaatttcggtgagataag 40997451  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacgg 179  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40997450 tcaatacagagcttgctctgactttaaacgg 40997420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 53 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1845853 - 1845702
Alignment:
Q  53 ttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaa---gt 149  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | | || |||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||   ||    
T  1845853 ttggggttggtacattggttggcttgggatcttggagtttgctcctctaaaaatttcagattcgattcattctgatgtcaatttcgataggctaataagt 1845754  T
Q  150 ccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgg 201  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1845753 ccatacaaaacttgctttggctttaaacgaagcccctgcaagtgggcggtgg 1845702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 249
Target Start/End: Original strand, 19174821 - 19174959
Alignment:
Q  110 aggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc-ttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggt 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||| |||| |    
T  19174821 aggttcgattccttctggtgccaatttcggtggg-taggtccatacagagctttgctctggcttagaacggag-ccccgtaaatgggcggtgggattgat 19174918  T
Q  209 cccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||| |   | ||||||||||||||||| ||||    
T  19174919 cccctcggattaatcggtccttggatcggataccgaatttt 19174959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23787173 - 23787056
Alignment:
Q  84 ttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcc 183  Q
    ||||| |||||| || || |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||  ||    
T  23787173 ttggaatttgcttctacaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctaaatccatacagagtttgctctgactttaaatgggacc 23787074  T
Q  184 cccgcaagtgggcggtgg 201  Q
     |||||||||||||||||    
T  23787073 tccgcaagtgggcggtgg 23787056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 249
Target Start/End: Original strand, 44610139 - 44610236
Alignment:
Q  152 atacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   |||||||| || ||||||||||||    
T  44610139 atacagagcttgctctagctttaaatggggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccatcggattagtcggttcttggaccgaataccgagtttt 44610236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 240
Target Start/End: Original strand, 4769259 - 4769354
Alignment:
Q  145 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggata 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||   |||||||||||  ||||||  |||||| |||||||||    
T  4769259 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggggccccgcaagtggacggtgaggttggtcccctcaaattagtcgattcttagatcggata 4769354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19606026 - 19605846
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagag-cttgctc 166  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||| |||||||||||| |||  ||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19606026 tggttggcttgggatcttggagtgcgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctctaatgctaatttcggtgggc-aagtccatacagagtcttgctc 19605928  T
Q  167 tggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |  |||  || || |  ||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||| ||||||||    
T  19605927 tcacttagaaagg-gggcccacaagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagttgacacttggatcggatatcgagtttt 19605846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 159 - 249
Target Start/End: Original strand, 31778138 - 31778228
Alignment:
Q  159 gcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  31778138 gcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgagattggtcctctcagattagtcagttcttggatcggataccgagtttt 31778228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 182 - 250
Target Start/End: Original strand, 18692090 - 18692158
Alignment:
Q  182 cccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18692090 cccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcgtattagtcgattcttggatcggataccgagttttc 18692158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 918898 - 918782
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggt---tcgattccttctggtgtcaatttcggtgggcta 146  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||   |||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  918898 catttggggttgacctagtggttggcttgggattttgaagtttgctcct-ctgaggtctcaagttcgtcgattccctcttgtgccaatttcgttgggcta 918800  T
Q  147 agtccatacagagcttgc 164  Q
    ||||||||||||||||||    
T  918799 agtccatacagagcttgc 918782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 129
Target Start/End: Original strand, 4852556 - 4852635
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtg 129  Q
    ||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  4852556 catttggggttgacctagtggttgacttggaatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtg 4852635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 250
Target Start/End: Original strand, 14486948 - 14487023
Alignment:
Q  175 aacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||    
T  14486948 aacggggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttttc 14487023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18976521 - 18976454
Alignment:
Q  183 ccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  18976521 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgaattttc 18976454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4618880 - 4618744
Alignment:
Q  54 tggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccat 153  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||   |||| | |||||||||| |  |||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  4618880 tggggttggcctagtggttggcttggaatcttggagtatgctcctctcaaggtttcaggttcgatttcccctggtgccaatttcggcgggc-aagtccat 4618782  T
Q  154 acagagc-ttgctctggctttaaacggagcccccgcaa 190  Q
    ||| | | |||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  4618781 acaaaactttgctctggctttaaatgggtcccccgcaa 4618744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 249
Target Start/End: Original strand, 29698164 - 29698343
Alignment:
Q  69 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc-ttgctct 167  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| | |||  ||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||    
T  29698164 ggttggcttgggatcttggaatttgctcctctcaaggtctcaagttttatttcctctggtgtcaatttcggtgggc-aagttcatacagagctttactct 29698262  T
Q  168 ggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    | ||| |||| | | |||||||| |||||| ||  ||||||||||||| || |||   | ||| ||||| ||||||||||||    
T  29698263 gacttaaaacag-gaccccgcaaatgggcgatgagattggtcccctcgaataagttggtccttagatcgtataccgagtttt 29698343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44929923 - 44929846
Alignment:
Q  172 ttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  44929923 ttaaacgggacccccgcaagtggacggtgggattggtccccttgaattagtcgattcttggatcggataccgagtttt 44929846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 160
Target Start/End: Original strand, 40591195 - 40591290
Alignment:
Q  64 ctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc 160  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||   | |||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40591195 ctaatagttggcttgagatcttggagtgtgctcctctcaaagtctcaggtttgatttcttctggtggcaatttcggtgggc-aagtccatacagagc 40591290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 242
Target Start/End: Original strand, 45132398 - 45132477
Alignment:
Q  163 gctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggatacc 242  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | |||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  45132398 gctctggctttaaacggggcccccacaagtgggcagtaggattggtcctctcggattaatcgattcttggatcggatacc 45132477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 249
Target Start/End: Original strand, 4852660 - 4852726
Alignment:
Q  183 ccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| || ||||||    
T  4852660 ccccgcaagtggacggtggaattggtcccctcggattaatcgattcttggatcggatgccaagtttt 4852726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9401047 - 9400961
Alignment:
Q  163 gctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||  |||  |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  9401047 gctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcagtgggattggtttccttagattagtcgattcttggatcggatactgagtttt 9400961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 201
Target Start/End: Original strand, 19516998 - 19517091
Alignment:
Q  108 ttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgg 201  Q
    |||||||||||| | | || ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || || |||||||| ||||    
T  19516998 ttaggttcgatttcctatgctgttaattttgatgggctaagtccatacagagcttgctttggctttaaacggggtcctcgtaagtgggcagtgg 19517091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 250
Target Start/End: Original strand, 39957891 - 39957956
Alignment:
Q  185 ccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  39957891 ccgcaagtgggcgatgggattggttccctcggattagtcgattcttggattggataccgagttttc 39957956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 222
Target Start/End: Original strand, 35943762 - 35943854
Alignment:
Q  131 caatttcggtgggctaagtccatacagagct-tgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||| || | ||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  35943762 caattttggtaggctaagtccatacagtgctatgatttggctttaaattgagcccctgcaagtggacggtgggattggacccctcggattagt 35943854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13747684 - 13747578
Alignment:
Q  70 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc-ttgctctg 168  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| ||||| || |||  | |||| | ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  13747684 gttggcttgggaccttggagtatgctcctcccaaggtctcaggtttgaatccccccggtgccgatttcggtgggct-agtccatacagtgctttgctctg 13747586  T
Q  169 gctttaaa 176  Q
    ||||||||    
T  13747585 gctttaaa 13747578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 222
Target Start/End: Original strand, 18708501 - 18708647
Alignment:
Q  76 ttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc-ttgctctggcttta 174  Q
    ||||||||||||||| || |||||   |||||| |||||||| ||| |||| |  ||||||| |||||| | || |||||||||| |||||||| ||| |    
T  18708501 ttgggatcttggagtgtgttcctctcaaggtctcaggttcgactccctctgataccaatttcagtgggc-atgttcatacagagctttgctctgacttaa 18708599  T
Q  175 aacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    |||||  ||||||||| ||| |||||| |||| ||||||| |||||||    
T  18708600 aacgggacccccgcaaatggacggtgggattgatcccctcagattagt 18708647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19525576 - 19525428
Alignment:
Q  69 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 168  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||   || ||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||  |||     ||    
T  19525576 ggttggcttgggatcttgaagtgtgtttctctcaagatctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggc-aagtccatacaatgct---aatg 19525481  T
Q  169 gctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattag 221  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  19525480 gctttaaatgaggcccccgcaagtgggtggtgagattggtccccttggattag 19525428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 1845103 - 1845048
Alignment:
Q  195 gcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  1845103 gcggtggaattggtcccctcaaattagtcgattcttggctcggataccgagttttc 1845048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 118
Target Start/End: Original strand, 44610090 - 44610140
Alignment:
Q  68 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgat 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  44610090 tggttggcttgagatcttggagtttgctcttccaaaggtctcaggttcgat 44610140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26176376 - 26176225
Alignment:
Q  70 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagctt-gctctg 168  Q
    |||| ||||||| ||||| || ||||||||   |||||| || ||||||||   |||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| ||| ||| ||    
T  26176376 gttgacttgggaccttggggtgtgctcctctcaaggtctcagattcgattctccctggtgccaattttggtggccta-gtccatacagacctttgctttg 26176278  T
Q  169 gctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    | |||||| || |||||||||||||| |||||| ||||| ||| || |||||||    
T  26176277 gatttaaatgg-gcccccgcaagtggacggtgggattggacccttcagattagt 26176225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7496756 - 7496644
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    |||||| ||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    || |||||||||  ||| || || ||||||| || ||||||| ||||    
T  7496756 catttgaggttggtttggtggttggattgagatcttggagtgtgctcctattaagatcttaggttgtatttctcctagtgtcaactttggtgggcaaagt 7496657  T
Q  150 ccatacagagctt 162  Q
    |||||||||||||    
T  7496656 ccatacagagctt 7496644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 1501509 - 1501463
Alignment:
Q  203 attggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  1501509 attggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggataccgagttttc 1501463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8299904 - 8299858
Alignment:
Q  204 ttggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  8299904 ttggtcccttcggattagttgattcttgaatcggataccgagttttc 8299858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 139
Target Start/End: Original strand, 18691980 - 18692069
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcgg 139  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| ||||| ||   || ||| |||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  18691980 catttggggttggcctaatggtttgcttggaattttggagtgtgctcatctcaagatctcaggttcgattccctcctatgtcaatttcgg 18692069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 32526285 - 32526213
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattcc 121  Q
    |||||||| |||||  || ||||||  ||||||||||| ||||||||||||   |||||| ||||||||||||    
T  32526285 ccatttggagttggcttagtggttgatttgggatcttgaagtttgctcctctcaaggtctcaggttcgattcc 32526213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 222
Target Start/End: Original strand, 32845194 - 32845246
Alignment:
Q  170 ctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagt 222  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  32845194 ctttaaacagggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccttcgaattagt 32845246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 38784377 - 38784329
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctc 99  Q
    ||||||||||| |||| || |||| || |||||||||||||||||||||    
T  38784377 atttggggttgatctagtgtttgggttaggatcttggagtttgctcctc 38784329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 40322 - 40522
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40322 ccatttggggttggcctagtggttggcttaggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 40421  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  40422 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 40520  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  40521 tc 40522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 51 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7507 - 7309
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 150  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  7507 atttggggttggcctagtagttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctccggtgccaatttcggtgggctaagtc 7408  T
Q  151 catacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  7407 catacagagctttctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccaagtttt 7309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0366 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0366
Description:

Target: scaffold0366; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 50 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9498 - 9299
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  9498 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagt 9399  T
Q  150 ccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  9398 ccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattctt-gatcggataccgagtttt 9300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0366; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 50 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12199 - 12000
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  12199 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggagccaatttcggtgggctaagt 12100  T
Q  150 ccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatc-ggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  12099 ccatacagagcttgctctggctttaaatgg-ggccccacaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcaattctt-gatcgggataccgagttt 12002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0623 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0623
Description:

Target: scaffold0623; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 50 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1255 - 1057
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  1255 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagt 1156  T
Q  150 ccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  1155 ccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattctt-gatcggataccgagtttt 1057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 71 - 250
Target Start/End: Original strand, 161828 - 162007
Alignment:
Q  71 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  161828 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 161927  T
Q  171 tttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  161928 ttttaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagataccgagttttc 162007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 53071 - 52870
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||     
T  53071 ccatttgggattggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggcttcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggcaaaa 52972  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  52971 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaggtgggcggtaggattggtcctctcggattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 52872  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  52871 tc 52870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 97566 - 97366
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  97566 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttgtagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 97467  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||   || ||||| ||||||||||||||    
T  97466 tccatacagagcttgctctgactttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcctctcgtattagtcggtttttggaccggataccgagttt 97367  T
Q  249 t 249  Q
    |    
T  97366 t 97366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 50 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10892 - 10694
Alignment:
Q  50 catttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagt 149  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  10892 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggagccaatttcggtgggctaagt 10793  T
Q  150 ccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  10792 ccatacagagcttgctctggctttaaatgg-ggccccacaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcaattctt-gatcggataccgagtttt 10695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 41844 - 41644
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||| || ||||||    
T  41844 ccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctcttgttccaatttcgttgtgctaag 41745  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  41744 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccctgcaagtgggcaatgggattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggatacagagttt 41646  T
Q  249 tc 250  Q
    ||    
T  41645 tc 41644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 66759 - 66951
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  66759 ccatttgggattggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcacgttcgattccttctggtgccaattttggtgggctaag 66858  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    ||        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||    
T  66859 tc--------gcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 66950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 240
Target Start/End: Original strand, 14988 - 15178
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||||||| ||||    
T  14988 ccatttggggttggcctagtggttggcctgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctctggtgctaatttcggtgggttaag 15087  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggata 240  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15088 tccatccagagcttgctctggctttaaatgggccccccgcaagtgggcgg-gggattggtctcctcggattagtcaattcttggatcggata 15178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 111 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13182 - 13047
Alignment:
Q  111 ggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcc 210  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  13182 ggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacagagcttgcta---ctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattgatcc 13086  T
Q  211 cctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13085 cctcagattagttgattcttggatcggataccgagtttt 13047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 91 - 250
Target Start/End: Original strand, 39131 - 39290
Alignment:
Q  91 ttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaa 190  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  39131 ttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctatgtccatacagaacttgttctggctttaaacggggcccccgcaa 39230  T
Q  191 gtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39231 gtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagataccgagttttc 39290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 249
Target Start/End: Original strand, 20246 - 20418
Alignment:
Q  76 ttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaa 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20246 ttgggatcttggagtttgctccttcaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcaatgggctaagtccatacatagcttgctctggctttaa 20345  T
Q  176 acggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||  ||||||||||||||||||  ||||| | | |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  20346 acgggacccccgcaagtgggcggtaaaattgat-ctctcggattagtcaattcttggaccggataccgagtttt 20418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 150 - 1
Alignment:
Q  57 ggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccataca 156  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  150 ggttggcctagtggttggcttgtgatcttggagtttgctcgtccagaggtctcaggttcgattccctcttatgtcaatttcgatgggctaagtccataca 51  T
Q  157 gagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattg 206  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||    
T  50 gagtttgctctagctttaaacggggcccccacatgtgggcggtgggattg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 110 - 250
Target Start/End: Original strand, 32346 - 32485
Alignment:
Q  110 aggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtc 209  Q
    |||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32346 aggttcgatttcctctggagccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaatgtggcccccgcaagtgggtggtgggattggtc 32445  T
Q  210 ccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttttc 250  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  32446 ccctcggattagtcgattctt-gatcggataccgagttttc 32485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1175 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1175
Description:

Target: scaffold1175; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 140 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2535 - 2426
Alignment:
Q  140 tgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggat 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   | |||| |||||||    
T  2535 tgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtccgtccttgaatcggat 2436  T
Q  240 accgagtttt 249  Q
    ||||||||||    
T  2435 accgagtttt 2426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8607 - 8512
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggc 144  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  8607 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattatctctggtgccaatttcggtgggc 8512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8513 - 8451
Alignment:
Q  187 gcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  8513 gcaagtgggcggtgggattggtccgctcggattagtcgattcttagatcggataccgagtttt 8451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 51 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 29340 - 29143
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 150  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||| ||| || |||||   |||||||||||||||||||  ||| || || ||||||| || ||||||    
T  29340 atttgggattggcctagtggttggcttggaatcttgaagtgtgttcctctcaaggtcttaggttcgattcccgctgatgccattttcggtcgg-taagtc 29242  T
Q  151 catacagagctt-gctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagtttt 249  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||| | |||| |||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  29241 catacagagctttgctctggcttaaaatgga-cccccgcaaatggacagtgggattggtcccctcagattagtcagtccttggatcggataccgagtttt 29143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0460 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0460
Description:

Target: scaffold0460; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 8379 - 8286
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgg 142  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  8379 ccatttggggttggtttagtggttggctcgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgg 8286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Original strand, 27773 - 27966
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggctaag 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||| | ||||| ||||||  ||||||||||    
T  27773 ccatttggggttggtctagtggttggtttgggattttggagtttgctcctctcaaggtctcgggttcgattccctgtggtgccaatttgagtgggctaag 27872  T
Q  149 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattagtatattcttggatcggataccgagttt 248  Q
    |||||||  ||||       ||||||||  | | | ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  27873 tccatacgaagct-----atgctttaaatag-ggcgccgcaagtgggtggtgagatttgtcccctcggattagtcggttcttggatcagataccgagttt 27966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 12952 - 12884
Alignment:
Q  51 atttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgatt 119  Q
    ||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12952 atttgggattggcctagtggttgacttgggatcttggagttcgctcctccagagatctcaggttcgatt 12884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 26743 - 26650
Alignment:
Q  49 ccatttggggttggtctaatggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgg 142  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||| | ||| |||||  |||  || ||||||||||||    
T  26743 ccatttggggttggcctactggttggcttaggatcttggagtttgcttttcaagaggtctcatgtttgattctctcttatgccaatttcggtgg 26650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 136
Target Start/End: Original strand, 11554 - 11620
Alignment:
Q  71 ttggcttgggatcttggagtttgctcctcc-agaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaattt 136  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||    
T  11554 ttggcttgggatctgggagtgtgctcctcctcgaggtctcaggttcgattctctctggtgttaattt 11620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 72650 - 72601
Alignment:
Q  128 tgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagct-tgctctggctttaaa 176  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  72650 tgtcaattttggtgggctaagtccatacagagttatgctctggttttaaa 72601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19897 - 19821
Alignment:
Q  71 ttggcttgggatcttggagtttgctcctcc-agaggtcttaggttcgattccttctggtgtcaatttcggtgggcta 146  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||| | ||||||||| ||| | ||| ||||| |||||||||    
T  19897 ttggcttgggatctgggagtctgctcctccttgaggtctcaagttcgattctttccgatgttaatttgggtgggcta 19821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University