View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18757_low_73 (Length: 232)

Name: NF18757_low_73
Description: NF18757
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18757_low_73
NF18757_low_73
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (2-226)||(22009102-22009326)
chr8 (1-226)||(21967897-21968122)
chr8 (1-226)||(21980737-21980962)
chr8 (1-226)||(21985720-21985945)
chr8 (2-226)||(44494129-44494345)
chr8 (1-191)||(22000688-22000873)
chr8 (1-175)||(11774296-11774470)
chr8 (2-226)||(34950043-34950259)
chr8 (1-175)||(8414881-8415055)
chr8 (6-226)||(11251997-11252204)
chr8 (1-162)||(21328579-21328740)
chr8 (1-162)||(42560786-42560947)
chr8 (96-176)||(21386158-21386238)
chr8 (96-175)||(23427826-23427905)
chr8 (96-175)||(23913265-23913344)
chr8 (96-175)||(44385833-44385912)
chr8 (96-175)||(14399092-14399171)
chr8 (155-226)||(42561025-42561096)
chr8 (96-175)||(27942684-27942764)
chr8 (96-175)||(21409900-21409980)
chr8 (96-175)||(21804392-21804472)
chr8 (96-175)||(21974183-21974262)
chr8 (96-175)||(43250202-43250281)
chr8 (101-175)||(18864109-18864183)
chr8 (101-173)||(30941569-30941641)
chr8 (116-175)||(363268-363327)
chr8 (96-175)||(21978293-21978372)
chr8 (187-226)||(22003050-22003089)
chr8 (101-175)||(21829465-21829539)
chr8 (101-175)||(22110601-22110675)
chr8 (1-30)||(21967862-21967891)
chr8 (1-30)||(21980702-21980731)
chr8 (1-30)||(21985685-21985714)
chr8 (1-30)||(22000653-22000682)
chr8 (1-30)||(22009066-22009095)
chr8 (139-175)||(8729652-8729688)
chr8 (1-29)||(16197694-16197722)
chr8 (1-29)||(16197728-16197756)
chr8 (1-29)||(21328745-21328773)
chr8 (1-29)||(21328779-21328807)
chr8 (1-29)||(21328813-21328841)
chr8 (1-29)||(21980534-21980562)
chr8 (1-29)||(21985517-21985545)
chr8 (1-29)||(22000552-22000580)
chr8 (1-29)||(22005531-22005559)
[»] chr7 (58 HSPs)
chr7 (6-225)||(16185474-16185693)
chr7 (2-226)||(11394784-11395000)
chr7 (1-175)||(41283645-41283819)
chr7 (1-162)||(15213061-15213222)
chr7 (96-175)||(13891630-13891709)
chr7 (96-175)||(20486742-20486821)
chr7 (96-175)||(7520215-7520294)
chr7 (96-175)||(10607320-10607399)
chr7 (96-175)||(11660282-11660361)
chr7 (96-175)||(25928371-25928450)
chr7 (96-175)||(39268313-39268392)
chr7 (96-162)||(13892026-13892092)
chr7 (102-175)||(14420787-14420860)
chr7 (102-175)||(16005004-16005077)
chr7 (102-175)||(18606338-18606411)
chr7 (102-175)||(18871297-18871370)
chr7 (103-175)||(146500-146572)
chr7 (96-175)||(838132-838212)
chr7 (96-175)||(1203312-1203392)
chr7 (96-175)||(9752507-9752586)
chr7 (96-175)||(18424235-18424314)
chr7 (102-175)||(10897902-10897975)
chr7 (96-175)||(16109974-16110054)
chr7 (96-175)||(26291156-26291236)
chr7 (96-175)||(39721195-39721275)
chr7 (96-175)||(1860021-1860100)
chr7 (96-175)||(2833481-2833560)
chr7 (96-175)||(13919412-13919491)
chr7 (96-175)||(16582421-16582500)
chr7 (96-175)||(834044-834124)
chr7 (96-175)||(1199224-1199304)
chr7 (1-106)||(13892117-13892221)
chr7 (96-153)||(18301373-18301430)
chr7 (96-175)||(15083225-15083305)
chr7 (96-175)||(31725-31804)
chr7 (96-175)||(12706122-12706201)
chr7 (96-175)||(12713540-12713619)
chr7 (96-175)||(12722198-12722277)
chr7 (155-226)||(15212912-15212983)
chr7 (96-175)||(16908509-16908588)
chr7 (96-175)||(18281958-18282037)
chr7 (101-175)||(45171505-45171579)
chr7 (30-106)||(13891734-13891810)
chr7 (96-175)||(12717287-12717366)
chr7 (100-175)||(18277994-18278069)
chr7 (111-175)||(2531347-2531410)
chr7 (101-175)||(72376-72450)
chr7 (101-175)||(76485-76559)
chr7 (1-30)||(15213397-15213426)
chr7 (139-175)||(15166250-15166286)
chr7 (1-29)||(15213328-15213356)
chr7 (1-29)||(16251547-16251575)
chr7 (1-29)||(16251744-16251772)
chr7 (1-29)||(16251810-16251838)
chr7 (104-176)||(23666460-23666531)
chr7 (1-29)||(29003776-29003804)
chr7 (1-29)||(34957122-34957150)
chr7 (1-29)||(34957159-34957187)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (2-226)||(19075846-19076062)
chr5 (2-226)||(31253116-31253332)
chr5 (1-175)||(33473836-33474010)
chr5 (1-162)||(36459561-36459722)
chr5 (101-212)||(43243764-43243867)
chr5 (96-175)||(15238117-15238196)
chr5 (96-175)||(22120591-22120670)
chr5 (102-175)||(28372087-28372160)
chr5 (102-175)||(37600014-37600087)
chr5 (102-175)||(19510462-19510535)
chr5 (102-175)||(22339012-22339085)
chr5 (102-175)||(38146424-38146497)
chr5 (96-172)||(10751820-10751896)
chr5 (96-175)||(20912252-20912331)
chr5 (102-176)||(22749160-22749234)
chr5 (102-175)||(22335482-22335555)
chr5 (102-175)||(23113408-23113481)
chr5 (102-175)||(41878657-41878730)
chr5 (96-175)||(18354797-18354876)
chr5 (96-175)||(24768562-24768641)
chr5 (155-226)||(36459412-36459483)
chr5 (2-60)||(43243711-43243769)
chr5 (96-175)||(19474172-19474251)
chr5 (96-175)||(20294514-20294593)
chr5 (101-175)||(11219555-11219629)
chr5 (96-175)||(22108449-22108527)
chr5 (101-175)||(11224141-11224215)
chr5 (101-175)||(11226157-11226231)
chr5 (101-175)||(11227963-11228037)
chr5 (101-175)||(11229953-11230027)
chr5 (101-176)||(9774940-9775014)
chr5 (47-106)||(41878567-41878626)
chr5 (1-29)||(36459796-36459824)
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (2-226)||(45220868-45221084)
chr3 (2-226)||(5841123-5841339)
chr3 (6-226)||(2249126-2249338)
chr3 (1-175)||(41134-41308)
chr3 (1-175)||(16325946-16326120)
chr3 (1-162)||(16840108-16840269)
chr3 (21-162)||(11912440-11912581)
chr3 (52-175)||(10834896-10835020)
chr3 (101-212)||(14648275-14648378)
chr3 (96-176)||(4590160-4590240)
chr3 (96-176)||(8491732-8491812)
chr3 (96-175)||(12853363-12853442)
chr3 (96-175)||(14670026-14670105)
chr3 (96-175)||(16795503-16795582)
chr3 (1-106)||(8928737-8928842)
chr3 (96-175)||(13435818-13435897)
chr3 (98-176)||(17318511-17318589)
chr3 (102-175)||(3801970-3802043)
chr3 (1-106)||(13435922-13436027)
chr3 (102-175)||(14764801-14764874)
chr3 (102-175)||(18899453-18899526)
chr3 (102-175)||(20249855-20249928)
chr3 (102-175)||(54519597-54519670)
chr3 (103-175)||(12304174-12304246)
chr3 (100-174)||(8928871-8928945)
chr3 (96-176)||(23173296-23173377)
chr3 (103-175)||(9532258-9532330)
chr3 (96-176)||(14068062-14068142)
chr3 (96-175)||(14681550-14681627)
chr3 (96-175)||(18933355-18933435)
chr3 (96-175)||(30064384-30064464)
chr3 (96-175)||(5219847-5219926)
chr3 (155-226)||(11912291-11912362)
chr3 (96-175)||(14664425-14664504)
chr3 (96-175)||(14667589-14667668)
chr3 (96-175)||(15463878-15463957)
chr3 (155-226)||(51608665-51608736)
chr3 (2-60)||(14648222-14648280)
chr3 (96-173)||(16751901-16751978)
chr3 (102-175)||(23372549-23372622)
chr3 (102-175)||(29545944-29546017)
chr3 (102-175)||(51299533-51299606)
chr3 (96-172)||(11853709-11853785)
chr3 (100-175)||(11301669-11301744)
chr3 (96-175)||(19774198-19774277)
chr3 (149-207)||(16840341-16840399)
chr3 (105-175)||(38312866-38312936)
chr3 (96-175)||(7108238-7108317)
chr3 (96-175)||(7112173-7112252)
chr3 (96-175)||(11068613-11068692)
chr3 (96-175)||(14497947-14498026)
chr3 (96-175)||(15616177-15616256)
chr3 (96-175)||(22320129-22320208)
chr3 (96-175)||(22335184-22335263)
chr3 (96-175)||(55021376-55021455)
chr3 (96-175)||(11167093-11167172)
chr3 (96-175)||(28948461-28948540)
chr3 (172-222)||(16840452-16840502)
chr3 (101-175)||(4108793-4108868)
chr3 (101-175)||(4112642-4112717)
chr3 (96-147)||(37440680-37440731)
chr3 (47-106)||(54519701-54519760)
chr3 (96-175)||(12337257-12337333)
chr3 (1-29)||(16840007-16840035)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (2-226)||(11944951-11945167)
chr1 (2-226)||(43630898-43631114)
chr1 (6-225)||(11809859-11810078)
chr1 (4-129)||(636478-636596)
chr1 (101-226)||(20032180-20032297)
chr1 (52-175)||(29533887-29534011)
chr1 (96-176)||(21406252-21406332)
chr1 (96-175)||(22132098-22132177)
chr1 (96-175)||(41801278-41801357)
chr1 (102-175)||(16370925-16370998)
chr1 (96-175)||(41389664-41389743)
chr1 (96-175)||(20230138-20230218)
chr1 (96-175)||(33796033-33796112)
chr1 (2-60)||(20032127-20032185)
chr1 (102-175)||(32649067-32649140)
chr1 (96-160)||(39245170-39245234)
chr1 (96-160)||(39248725-39248789)
chr1 (96-175)||(1009262-1009341)
chr1 (96-175)||(1926795-1926874)
chr1 (96-175)||(16376815-16376894)
chr1 (96-175)||(20925809-20925888)
chr1 (96-160)||(52634283-52634347)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (2-226)||(37839097-37839313)
chr4 (2-226)||(42597826-42598042)
chr4 (1-175)||(28384851-28385025)
chr4 (96-176)||(631747-631827)
chr4 (96-176)||(10711824-10711904)
chr4 (96-176)||(10925594-10925674)
chr4 (96-175)||(22634926-22635005)
chr4 (96-175)||(24048384-24048463)
chr4 (96-176)||(27532751-27532831)
chr4 (96-175)||(12422943-12423022)
chr4 (96-175)||(13818320-13818399)
chr4 (96-175)||(17052445-17052524)
chr4 (96-161)||(13813832-13813897)
chr4 (102-175)||(15533219-15533292)
chr4 (96-175)||(30145783-30145863)
chr4 (103-175)||(36036952-36037024)
chr4 (96-175)||(15223546-15223625)
chr4 (102-175)||(18211604-18211677)
chr4 (96-175)||(20158447-20158526)
chr4 (96-175)||(20163898-20163977)
chr4 (96-175)||(23996966-23997044)
chr4 (102-156)||(49549088-49549142)
chr4 (96-172)||(20161123-20161199)
chr4 (96-175)||(4562773-4562852)
chr4 (96-175)||(5758455-5758534)
chr4 (96-175)||(9555069-9555148)
chr4 (96-175)||(12486271-12486350)
chr4 (96-175)||(14758991-14759070)
chr4 (96-175)||(14955759-14955838)
chr4 (96-175)||(17807054-17807133)
chr4 (96-175)||(33740836-33740915)
chr4 (47-106)||(49548998-49549057)
chr4 (96-162)||(25688455-25688521)
chr4 (85-176)||(38106945-38107037)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (2-226)||(28707816-28708032)
chr6 (1-175)||(23955369-23955543)
chr6 (6-224)||(9622823-9623032)
chr6 (1-162)||(34297677-34297838)
chr6 (1-162)||(25737905-25738066)
chr6 (101-212)||(14594666-14594769)
chr6 (96-176)||(18918580-18918660)
chr6 (105-212)||(7429398-7429497)
chr6 (102-175)||(27222832-27222905)
chr6 (103-175)||(12941221-12941293)
chr6 (96-175)||(2076286-2076365)
chr6 (96-162)||(23537994-23538060)
chr6 (96-176)||(18953483-18953563)
chr6 (96-175)||(23400677-23400757)
chr6 (155-226)||(1254019-1254090)
chr6 (96-175)||(31479462-31479541)
chr6 (103-173)||(28290901-28290971)
chr6 (102-175)||(4475795-4475868)
chr6 (111-162)||(1254172-1254223)
chr6 (2-57)||(7429499-7429554)
chr6 (155-226)||(34297916-34297987)
chr6 (3-60)||(14594614-14594671)
chr6 (96-160)||(16622850-16622914)
chr6 (111-175)||(22075405-22075469)
chr6 (96-175)||(8242412-8242491)
chr6 (96-175)||(11565401-11565480)
chr6 (96-175)||(11716940-11717019)
chr6 (96-175)||(12620333-12620412)
chr6 (96-175)||(27555540-27555618)
chr6 (101-175)||(19869187-19869261)
chr6 (101-175)||(23393641-23393715)
chr6 (101-175)||(23413549-23413623)
chr6 (111-175)||(27416542-27416606)
chr6 (96-175)||(22861755-22861834)
chr6 (96-175)||(23988303-23988382)
chr6 (149-207)||(25737775-25737833)
chr6 (101-162)||(22947680-22947741)
chr6 (101-162)||(22951636-22951697)
chr6 (101-162)||(23870124-23870185)
chr6 (101-162)||(23874080-23874141)
chr6 (47-106)||(4475900-4475959)
chr6 (112-175)||(14470881-14470944)
chr6 (101-175)||(16758715-16758789)
chr6 (1-30)||(25738168-25738197)
chr6 (1-29)||(34297329-34297357)
chr6 (1-29)||(34297400-34297428)
chr6 (1-29)||(34297505-34297533)
chr6 (1-29)||(34297574-34297602)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (2-175)||(37379036-37379209)
chr2 (102-175)||(9240674-9240747)
chr2 (99-175)||(21074510-21074586)
chr2 (96-175)||(9783994-9784073)
chr2 (102-175)||(19663563-19663636)
chr2 (102-175)||(20260257-20260330)
chr2 (102-175)||(6481784-6481857)
chr2 (102-175)||(6485251-6485324)
chr2 (96-175)||(24630047-24630126)
chr2 (96-175)||(24645151-24645230)
chr2 (96-175)||(24647927-24648006)
chr2 (96-175)||(27380993-27381072)
chr2 (96-175)||(27384963-27385042)
chr2 (96-175)||(27600371-27600450)
chr2 (96-175)||(30346657-30346736)
chr2 (101-175)||(41532447-41532521)
chr2 (122-175)||(10686272-10686325)
chr2 (96-175)||(10103296-10103375)
chr2 (96-175)||(12902606-12902685)
chr2 (1-37)||(22702873-22702909)
chr2 (111-175)||(24647094-24647158)
chr2 (96-175)||(31343917-31343996)
chr2 (1-30)||(18359200-18359229)
chr2 (1-30)||(22702916-22702945)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (4-226)||(173133-173338)
scaffold0016 (1-29)||(172865-172893)
[»] scaffold0815 (1 HSPs)
scaffold0815 (4-192)||(1-181)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (2-146)||(3171-3315)
[»] scaffold0001 (7 HSPs)
scaffold0001 (1-116)||(175425-175540)
scaffold0001 (1-91)||(163504-163594)
scaffold0001 (149-226)||(163705-163782)
scaffold0001 (1-106)||(153682-153787)
scaffold0001 (117-162)||(163588-163633)
scaffold0001 (1-29)||(153284-153312)
scaffold0001 (1-29)||(153350-153378)
[»] scaffold0599 (2 HSPs)
scaffold0599 (21-162)||(4134-4275)
scaffold0599 (155-226)||(3985-4056)
[»] scaffold0098 (2 HSPs)
scaffold0098 (101-226)||(34011-34128)
scaffold0098 (2-60)||(34123-34181)
[»] scaffold2015 (2 HSPs)
scaffold2015 (101-212)||(444-547)
scaffold2015 (2-60)||(391-449)
[»] scaffold0380 (1 HSPs)
scaffold0380 (96-176)||(3973-4053)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (96-176)||(23937-24017)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (96-176)||(62839-62919)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (96-176)||(74331-74411)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (96-175)||(6960-7039)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (96-175)||(37202-37281)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (98-175)||(25569-25646)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (96-176)||(37197-37277)
[»] scaffold0080 (6 HSPs)
scaffold0080 (96-175)||(28472-28551)
scaffold0080 (96-175)||(33937-34016)
scaffold0080 (1-102)||(28580-28681)
scaffold0080 (1-102)||(34045-34146)
scaffold0080 (1-30)||(28751-28780)
scaffold0080 (1-30)||(34216-34245)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (102-175)||(200-273)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (102-175)||(10827-10900)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (102-175)||(109601-109674)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (102-175)||(224148-224221)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (96-175)||(8739-8818)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (102-175)||(5242-5315)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (1-62)||(208655-208716)
scaffold0015 (1-30)||(208722-208751)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (102-175)||(3522-3595)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (102-175)||(18823-18896)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (96-153)||(21339-21396)
[»] scaffold1852 (1 HSPs)
scaffold1852 (100-175)||(824-899)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (96-175)||(8577-8656)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (96-175)||(14844-14923)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (96-175)||(11059-11138)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (101-175)||(10767-10841)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (96-175)||(6320-6399)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (96-175)||(11051-11130)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (96-175)||(34127-34206)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (96-175)||(60325-60404)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (101-175)||(15579-15653)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (111-175)||(70755-70819)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (96-175)||(68555-68634)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (96-175)||(11777-11856)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (96-175)||(5826-5902)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (112-175)||(5546-5609)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (1-30)||(48145-48174)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Original strand, 22009102 - 22009326
Alignment:
Q  2 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattaca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22009102 tataagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattaca 22009201  T
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22009202 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaagaagaatt 22009301  T
Q  202 attattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  22009302 attattaagtgtatatgatgatgtc 22009326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 21967897 - 21968122
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21967897 ttataagaggtggtgtaatcttacattgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 21967996  T
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21967997 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgagcactaaggggatgttaagaagaat 21968096  T
Q  201 tattattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21968097 tattattgagtgtatatgatgatgtc 21968122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 21980737 - 21980962
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21980737 ttataagaggtggtgtactcttacattgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgattttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 21980836  T
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21980837 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgagcactaaggggatgttaagaagaat 21980936  T
Q  201 tattattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21980937 tattattgagtgtatatgatgatgtc 21980962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 21985720 - 21985945
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21985720 ttataagaggtggtgtactcttacattgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatattttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 21985819  T
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21985820 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgagcactaaggggatgttaagaagaat 21985919  T
Q  201 tattattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21985920 tattattgagtgtatatgatgatgtc 21985945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Original strand, 44494129 - 44494345
Alignment:
Q  2 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattaca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44494129 tataagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgtgaggttgttatgatattaca 44494228  T
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaatt 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||        |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  44494229 tgatgttacctatgaattgttaaatgtacttgatgatggttatgt--------taagttgtcttctattcatgagcactaaggggatgttaagaataatt 44494320  T
Q  202 attattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  44494321 attattgagtgtatatgatgatgtc 44494345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 22000688 - 22000873
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||    
T  22000688 ttataagaggtggtgtactcttacattgtttatgttgatgagtatgactaggttatgatgatcttttatagg-----atgtgaggttgttatgatattac 22000782  T
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgtt 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22000783 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgagcactaaggggatgtt 22000873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11774470 - 11774296
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  11774470 ttataagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttttatgatgttgaatgtggggttgttatgatattac 11774371  T
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  11774370 atgaggttacccatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 11774296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34950259 - 34950043
Alignment:
Q  2 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattaca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34950259 tataagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttatatagtgttgaatgtgaggttgttctgatattaca 34950160  T
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || | |||  ||      || | || | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  34950159 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagttttttttta--tt------ttttttttttttcatgagcactaatgggatgttaagaagaatt 34950068  T
Q  202 attattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  34950067 attattgagtgtatatgatgatgtc 34950043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 8414881 - 8415055
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  8414881 ttataagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttttatgatgttaaatgtggggttgttatgatattac 8414980  T
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  8414981 atgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgattagggttattttaagttgataagttgtcttttattcatga 8415055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 226
Target Start/End: Original strand, 11251997 - 11252204
Alignment:
Q  6 agaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattacatgat 105  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||     |||||    
T  11251997 agaggtggtgtactcttacgtggtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgtgaggtggttatgat-----atgat 11252091  T
Q  106 gttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttcta-ttcatgagcactaaggggatgttaaggagaattatt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||        |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11252092 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatga-ggttatgt--------taagttgtcttctatttcatgagcactaaggggatgttaagaagaattatt 11252182  T
Q  205 attgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11252183 attgagtgtatatgatgatgtc 11252204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21328740 - 21328579
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21328740 ttataagaggtggtgtactcttacgttttttatgttgatgattatgacgatgttatgatgattgtttatagtgttgaatgtgaggttgttatgatgttac 21328641  T
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgt 162  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21328640 atgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 21328579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 42560786 - 42560947
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||| |||| |||| |||| ||||    
T  42560786 ttataagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttgatgattatgacgatgctatgatgattgtttatagtgttgaatgagaggctgttttgatgttac 42560885  T
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgt 162  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||    
T  42560886 atgatgttatctatgagttgttaaatgtacgtgatggtggttatgttaagttgacaagttgt 42560947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21386238 - 21386158
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgag 176  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21386238 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgag 21386158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 23427905 - 23427826
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23427905 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttaatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 23427826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 23913344 - 23913265
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23913344 attacatgatgttatctataagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 23913265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 44385833 - 44385912
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  44385833 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaacttgataagttgtcttttattcatga 44385912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 14399092 - 14399171
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14399092 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 14399171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 226
Target Start/End: Original strand, 42561025 - 42561096
Alignment:
Q  155 taagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaattattattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  42561025 taagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaattattattgggtggatttgatgatgtc 42561096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 27942684 - 27942764
Alignment:
Q  96 attacatgatgttac-ctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||    
T  27942684 attacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgataagttaataagttgtcttttattcatga 27942764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 21409980 - 21409900
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgtt-aagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||    
T  21409980 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattaatga 21409900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 21804472 - 21804392
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgtt-aagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||    
T  21804472 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattaatga 21804392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 21974183 - 21974262
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  21974183 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 21974262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 43250281 - 43250202
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  43250281 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 43250202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Original strand, 18864109 - 18864183
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  18864109 atgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatga 18864183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 173
Target Start/End: Original strand, 30941569 - 30941641
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcat 173  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  30941569 atgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcat 30941641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 363327 - 363268
Alignment:
Q  116 agttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  363327 agttgttaaatgtacttgttgatggttatgttaagatgataagttgtcttttattcatga 363268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 21978293 - 21978372
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||  |||||||||||| || |||| ||||    
T  21978293 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttatattgataagttgtcttttattaatga 21978372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 226
Target Start/End: Original strand, 22003050 - 22003089
Alignment:
Q  187 atgttaaggagaattattattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22003050 atgttaagaagaattattattgagtgtatatgatgatgtc 22003089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Original strand, 21829465 - 21829539
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  21829465 atgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 21829539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22110675 - 22110601
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  22110675 atgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatttttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 22110601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Original strand, 21967862 - 21967891
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtt 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21967862 ttataagaggtggtgtactcttactttgtt 21967891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Original strand, 21980702 - 21980731
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtt 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21980702 ttataagaggtggtgtactcttactttgtt 21980731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Original strand, 21985685 - 21985714
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtt 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21985685 ttataagaggtggtgtactcttactttgtt 21985714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Original strand, 22000653 - 22000682
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtt 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22000653 ttataagaggtggtgtactcttactttgtt 22000682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Original strand, 22009066 - 22009095
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtt 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22009066 ttataagaggtggtgtactcttactttgtt 22009095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 175
Target Start/End: Original strand, 8729652 - 8729688
Alignment:
Q  139 ggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  8729652 ggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 8729688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 16197722 - 16197694
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16197722 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 16197694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 16197756 - 16197728
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16197756 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 16197728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 21328773 - 21328745
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21328773 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 21328745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 21328807 - 21328779
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21328807 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 21328779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 21328841 - 21328813
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21328841 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 21328813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 21980534 - 21980562
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21980534 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 21980562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 21985517 - 21985545
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21985517 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 21985545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 22000552 - 22000580
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22000552 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 22000580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 22005531 - 22005559
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22005531 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 22005559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 58)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16185693 - 16185474
Alignment:
Q  6 agaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattacatgat 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16185693 agaggtggtgtactcttacgttggttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgtgaggttgttatgatattacatgat 16185594  T
Q  106 gttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaattatta 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16185593 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggtcatgttaagttgataagtcgtcttctattcatgagcactaaggggatgttaagaagaattaata 16185494  T
Q  206 ttgagtgtatatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16185493 ttgagtgtatatgatgatgt 16185474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Original strand, 11394784 - 11395000
Alignment:
Q  2 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattaca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11394784 tataagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattaca 11394883  T
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaatt 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11394884 tgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttga--------cttctattcatgagcactaagagaatgttaaggagaatt 11394975  T
Q  202 attattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||    
T  11394976 attattgaatgtatctgatgatgtc 11395000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 41283819 - 41283645
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  41283819 ttataagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttttatgatgttgaatgtggggttgttatgatattac 41283720  T
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  41283719 atgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 41283645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15213222 - 15213061
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||| |||| |||| ||||    
T  15213222 ttataagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttgatgattatcacgatgttatgatgattgtttatagtgttgaatgagaggctgttttgatgttac 15213123  T
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgt 162  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15213122 atgatgttatccatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 15213061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 13891709 - 13891630
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  13891709 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 13891630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 20486821 - 20486742
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20486821 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 20486742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 7520215 - 7520294
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  7520215 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 7520294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 10607320 - 10607399
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  10607320 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttagtcatga 10607399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11660361 - 11660282
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  11660361 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttggtaagttgtcttttattcatga 11660282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 25928371 - 25928450
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  25928371 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtactttatgatggttatgttaagttgataagttgttttttattcatga 25928450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 39268313 - 39268392
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  39268313 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgccttttattcatga 39268392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13892092 - 13892026
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgt 162  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  13892092 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 13892026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14420860 - 14420787
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14420860 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 14420787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16005077 - 16005004
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16005077 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 16005004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18606411 - 18606338
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18606411 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 18606338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18871370 - 18871297
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18871370 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 18871297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 146572 - 146500
Alignment:
Q  103 gatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  146572 gatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctactcatga 146500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 838132 - 838212
Alignment:
Q  96 attacatgatgttac-ctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  838132 attacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 838212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 1203312 - 1203392
Alignment:
Q  96 attacatgatgttac-ctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1203312 attacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 1203392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 9752507 - 9752586
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  9752507 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttggtgatggttatgttaagttgataagttgccttttattcatga 9752586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18424314 - 18424235
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18424314 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 18424235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Original strand, 10897902 - 10897975
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  10897902 tgatgttatctatgagtcgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 10897975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 16109974 - 16110054
Alignment:
Q  96 attacatgatgttac-ctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  16109974 attacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttatcttttattcatga 16110054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 26291236 - 26291156
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgtt-aagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  26291236 attacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatga 26291156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 39721275 - 39721195
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgtt-aagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  39721275 attacatgatgatatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatga 39721195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 1860021 - 1860100
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1860021 attacaggatgttatatatgagttgttaaatgtacttgatgacgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 1860100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 2833481 - 2833560
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  2833481 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 2833560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 13919412 - 13919491
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  13919412 attacaggatgttatatatgagttgttaaatgtacttgatgacgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 13919491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16582500 - 16582421
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||    
T  16582500 attacatgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgataagttgataagttgtctttttttcatga 16582421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 834044 - 834124
Alignment:
Q  96 attacatgatgttac-ctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  834044 attacatgatgttaagctatgagttgttaattctacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 834124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 1199224 - 1199304
Alignment:
Q  96 attacatgatgttac-ctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1199224 attacatgatgttaagctatgagttgttaattctacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 1199304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 13892221 - 13892117
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| | | |||||||| ||||||||||   ||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  13892221 ttataagaggtggtgtactctcacattgtt-atattgtttattatgacgatgttatgatgactgtttatggagttgaatatgaggttgttatgatgttac 13892123  T
Q  101 atgatg 106  Q
    ||||||    
T  13892122 atgatg 13892117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18301430 - 18301373
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttg 153  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18301430 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttg 18301373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15083305 - 15083225
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgtt-aagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| || |||||||||    
T  15083305 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaaattgataagttgtcttttattcatga 15083225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 31804 - 31725
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  31804 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 31725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 12706122 - 12706201
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  12706122 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 12706201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 12713619 - 12713540
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  12713619 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 12713540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 12722277 - 12722198
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  12722277 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 12722198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15212983 - 15212912
Alignment:
Q  155 taagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaattattattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    ||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  15212983 taagttgtcctcaattcatgagtactaaggggatgttaagaagaattattattgggtggatttgatgatgtc 15212912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 16908509 - 16908588
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  16908509 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 16908588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18282037 - 18281958
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  18282037 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattgatga 18281958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Original strand, 45171505 - 45171579
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  45171505 atgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatga 45171579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 13891810 - 13891734
Alignment:
Q  30 ttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattacatgatg 106  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||   ||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13891810 ttatgttgttgattatgacgatgttatgatgactgtttatggagttgaatatgaggttgttatgatgttacatgatg 13891734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 12717366 - 12717287
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  12717366 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgctgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 12717287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18278069 - 18277994
Alignment:
Q  100 catgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  18278069 catgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattgatga 18277994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Original strand, 2531347 - 2531410
Alignment:
Q  111 ctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||  ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  2531347 ctatgagttgttaggtgtacttgatgatg-ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 2531410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Original strand, 72376 - 72450
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||| || |||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  72376 atgatgatatctatgaattgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 72450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Original strand, 76485 - 76559
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||| || |||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  76485 atgatgatatctatgaattgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 76559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Complemental strand, 15213426 - 15213397
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtt 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15213426 ttataagaggtggtgtactcttactttgtt 15213397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15166286 - 15166250
Alignment:
Q  139 ggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  15166286 ggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 15166250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 15213356 - 15213328
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15213356 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 15213328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 16251547 - 16251575
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16251547 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 16251575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 16251744 - 16251772
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16251744 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 16251772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 16251810 - 16251838
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16251810 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 16251838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 176
Target Start/End: Original strand, 23666460 - 23666531
Alignment:
Q  104 atgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgag 176  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||  ||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  23666460 atgttatctatgagttgttaaatgtacttgatga-tgttacgtatagttgctaagttgtcctctattcatgag 23666531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 29003804 - 29003776
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29003804 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 29003776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 34957150 - 34957122
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34957150 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 34957122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 34957187 - 34957159
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34957187 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 34957159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 164; Significance: 8e-88; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19076062 - 19075846
Alignment:
Q  2 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattaca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19076062 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattaca 19075963  T
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaatt 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19075962 tgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaa--------gttgtcttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaatt 19075871  T
Q  202 attattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  19075870 attattgaatgtatatgatgatgtc 19075846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Original strand, 31253116 - 31253332
Alignment:
Q  2 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattaca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31253116 tataagaggtggtgtactcttaccttgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattaca 31253215  T
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaatt 201  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||        |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31253216 tgaggttacctacaagttgttaaatgtacttgatgagggttatgt--------taagttgtcttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaatt 31253307  T
Q  202 attattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  31253308 atcattgagtgtatatgatgatgtc 31253332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 33473836 - 33474010
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  33473836 ttataagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttttatgatgttgaatgtggggttgttatgatattac 33473935  T
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  33473936 atgaggttacccatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 33474010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 36459722 - 36459561
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||| |||| |||| ||||    
T  36459722 ttataagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttgatgattatgacgatgttatgatgattgtttatagtgttgaatgagaggctgttttgatgttac 36459623  T
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgt 162  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||    
T  36459622 atgatgttatctatgagttgttaaatgtacttaatgatgattatgttaagttgataagttgt 36459561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 212
Target Start/End: Original strand, 43243764 - 43243867
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||        |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  43243764 atgatgttacctatgagttgttaaatgtactcgaggagggttatgt--------taagttgtcttctattcatgagcattaaggggatgttaagaagaat 43243855  T
Q  201 tattattgagtg 212  Q
    ||||||| ||||    
T  43243856 tattattaagtg 43243867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 15238117 - 15238196
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  15238117 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 15238196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 22120591 - 22120670
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22120591 attatatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 22120670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Original strand, 28372087 - 28372160
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  28372087 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 28372160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Original strand, 37600014 - 37600087
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  37600014 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 37600087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19510535 - 19510462
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  19510535 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatga 19510462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22339085 - 22339012
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  22339085 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttacgttgataagttgtcttttattcatga 22339012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Original strand, 38146424 - 38146497
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  38146424 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 38146497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 10751896 - 10751820
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattca 172  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  10751896 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattca 10751820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 20912252 - 20912331
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20912252 attacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtgtatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 20912331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22749234 - 22749160
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgag 176  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  22749234 tgatgttatctatgagtggttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcctatattcatgag 22749160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22335555 - 22335482
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  22335555 tgatgttatctatgagttgttaaatgtatttgatgatggttatgttacgttgataagttgtcttttattcatga 22335482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Original strand, 23113408 - 23113481
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23113408 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattgtgttaagttgataagttgtcttttattcatga 23113481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Original strand, 41878657 - 41878730
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  41878657 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatagttatgttaagttgataagttgtcttttatttatga 41878730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18354876 - 18354797
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  18354876 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataaattgtcttttattcatga 18354797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 24768562 - 24768641
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24768562 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacctgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 24768641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36459483 - 36459412
Alignment:
Q  155 taagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaattattattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  36459483 taagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaaaaattattattgggtggatttgatgatgtc 36459412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 43243711 - 43243769
Alignment:
Q  2 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatg 60  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  43243711 tataagaggtggtttactcttacgttgtttatgttgatgagtatgatgaggttatgatg 43243769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 19474172 - 19474251
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  19474172 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 19474251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 20294593 - 20294514
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  20294593 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 20294514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11219629 - 11219555
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  11219629 atgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatga 11219555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 22108449 - 22108527
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||  | |||||||||||| || |||||||||    
T  22108449 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatga-tgttacgtataattgataagttgtcttttattcatga 22108527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11224215 - 11224141
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||| || |||||||||    
T  11224215 atgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatga 11224141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11226231 - 11226157
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||| || |||||||||    
T  11226231 atgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatga 11226157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11228037 - 11227963
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||| || |||||||||    
T  11228037 atgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatga 11227963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11230027 - 11229953
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||| || |||||||||    
T  11230027 atgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatga 11229953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9775014 - 9774940
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgag 176  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||  ||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  9775014 atgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatga-tgttacgtatagttgctaagttgtcctctattcatgag 9774940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 106
Target Start/End: Original strand, 41878567 - 41878626
Alignment:
Q  47 acgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattacatgatg 106  Q
    |||||||||||||||   ||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  41878567 acgaagttatgatgactgtttatggtgttgaatatgaggttgttatgatgttacatgatg 41878626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 36459824 - 36459796
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36459824 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 36459796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 164; Significance: 8e-88; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Original strand, 45220868 - 45221084
Alignment:
Q  2 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattaca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45220868 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattaca 45220967  T
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaatt 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||        |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45220968 tgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgt--------taagttgtcttctattcatgagcactacggggatgttaaggagaatt 45221059  T
Q  202 attattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  45221060 attattgagtgtatatgatgatgtc 45221084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5841339 - 5841123
Alignment:
Q  2 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattaca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5841339 tataagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattaca 5841240  T
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaatt 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  5841239 tgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttga--------cttctattcatgagcactaagagaatgttaaggagaatt 5841148  T
Q  202 attattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||    
T  5841147 attattgaatgtatctgatgatgtc 5841123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 226
Target Start/End: Original strand, 2249126 - 2249338
Alignment:
Q  6 agaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattacatgat 105  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2249126 agaggtggtgtactcttacgtggtctatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgtgaggttgttatgatattacatgat 2249225  T
Q  106 gttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaattatta 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||        |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  2249226 gttacctatgagttattaaatgtacttgatgagggttatgt--------taagttgtcttctattcatgagcactaaggggatgttaagaagaagaatta 2249317  T
Q  206 ttgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2249318 ttgagtgtatatgatgatgtc 2249338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 41308 - 41134
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  41308 ttataagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttttatgatgttgaatgtggggttgttatgatattac 41209  T
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  41208 atgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 41134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 16325946 - 16326120
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16325946 ttataagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatgatgttgaatatgaggttgttatgatattac 16326045  T
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  16326046 atgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgtcaagttgataagttgtcttttattcatga 16326120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 16840108 - 16840269
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16840108 ttataagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttgatgattatgatgatgttatgatgattgtttatagtgttgaatgtgaggttgttatgatgttac 16840207  T
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgt 162  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  16840208 atgattttatctatgagttgttaaatgtatttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 16840269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 11912581 - 11912440
Alignment:
Q  21 ttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattacatgatgttacctatgagttg 120  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  ||||||| |||||||| |||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  11912581 ttacgttgtttatgttgatgattatgatgatgttatgatgattgtttatagtgttgaatgagaggcttttttgatgttacatgatgttatctatgagttg 11912482  T
Q  121 ttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgt 162  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  11912481 ttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 11912440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 175
Target Start/End: Original strand, 10834896 - 10835020
Alignment:
Q  52 gttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgat-attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaag 150  Q
    ||||||||||   ||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  10834896 gttatgatgactgtttatggtgttgaatatgaggttgttatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaag 10834995  T
Q  151 ttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||| || |||||||||    
T  10834996 ttgataagttgtcttttattcatga 10835020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 212
Target Start/End: Original strand, 14648275 - 14648378
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||        | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14648275 atgatgttacctatgagttgttaaatgtactcgaggagggttatgttaagttg--------tcttctattcatgagcattaaggggatgttaagaagaat 14648366  T
Q  201 tattattgagtg 212  Q
    ||||||||||||    
T  14648367 tattattgagtg 14648378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Original strand, 4590160 - 4590240
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgag 176  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4590160 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgag 4590240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Original strand, 8491732 - 8491812
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgag 176  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8491732 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgag 8491812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 12853363 - 12853442
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12853363 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 12853442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14670105 - 14670026
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14670105 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 14670026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16795582 - 16795503
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16795582 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 16795503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 8928737 - 8928842
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 100  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||  |||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  8928737 ttatgagaggtggtgtactctcacgttgtttatgttgttgattatgacgatgttatgatgactttttatggagttgaatatgaggttgttatgatgttac 8928836  T
Q  101 atgatg 106  Q
    ||||||    
T  8928837 atgatg 8928842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 13435897 - 13435818
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  13435897 attacatgatgttatatatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 13435818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 176
Target Start/End: Original strand, 17318511 - 17318589
Alignment:
Q  98 tacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgag 176  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17318511 tacatgaagttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgag 17318589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 3802043 - 3801970
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3802043 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 3801970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 13436027 - 13435922
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||   ||||| | ||||||| ||||||||||||||| || |    
T  13436027 ttataagaggtggtgtactctcacgttgtttatgttgttgattatgacgatgttatgatgactgtttatggtgttgaatatgaggttgttatgatgtttc 13435928  T
Q  101 atgatg 106  Q
    ||||||    
T  13435927 atgatg 13435922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Original strand, 14764801 - 14764874
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14764801 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 14764874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18899526 - 18899453
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18899526 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 18899453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Original strand, 20249855 - 20249928
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20249855 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 20249928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 54519670 - 54519597
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  54519670 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 54519597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 12304246 - 12304174
Alignment:
Q  103 gatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12304246 gatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtattttattcatga 12304174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Original strand, 8928871 - 8928945
Alignment:
Q  100 catgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatg 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  8928871 catgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatggtggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatg 8928945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23173377 - 23173296
Alignment:
Q  96 attacatgatgttac-ctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgag 176  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23173377 attacatgatgttaagctatgagttgttaaatatacttgatgatagttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgag 23173296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 9532330 - 9532258
Alignment:
Q  103 gatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  9532330 gatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttgagttgataagttgtcttttattcatga 9532258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Original strand, 14068062 - 14068142
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgag 176  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  14068062 attacatgatgttatctaggagttgctaaatgtatttgatgatggttatgttaagtcgataagttgtcttctattcatgag 14068142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14681627 - 14681550
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14681627 attacatgatgttatct--gagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 14681550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 18933355 - 18933435
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgtt-aagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  18933355 attacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtattttattcatga 18933435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 30064464 - 30064384
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgtt-aagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  30064464 attacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatga 30064384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 5219926 - 5219847
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  5219926 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 5219847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11912362 - 11912291
Alignment:
Q  155 taagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaattattattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  11912362 taagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaattattattgggtggatttgatgatgtc 11912291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14664504 - 14664425
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14664504 attacataatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 14664425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14667668 - 14667589
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14667668 attacatgatgagatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 14667589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15463957 - 15463878
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  15463957 attacaggatgttatatatgagttgttaaatgtacttgatgacgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 15463878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 226
Target Start/End: Original strand, 51608665 - 51608736
Alignment:
Q  155 taagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaattattattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  51608665 taagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaattattattgggtggatttgatgatgtc 51608736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 14648222 - 14648280
Alignment:
Q  2 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatg 60  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14648222 tataagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttgatgagtatgatgaggttatgatg 14648280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 173
Target Start/End: Original strand, 16751901 - 16751978
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcat 173  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  16751901 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttatcttttattcat 16751978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Original strand, 23372549 - 23372622
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23372549 tgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 23372622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Original strand, 29545944 - 29546017
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  29545944 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttgtgttaagttgataagttgtcttttagtcatga 29546017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 51299606 - 51299533
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  51299606 tgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 51299533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 11853785 - 11853709
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattca 172  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11853785 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattca 11853709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 175
Target Start/End: Original strand, 11301669 - 11301744
Alignment:
Q  100 catgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  11301669 catgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 11301744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19774277 - 19774198
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  19774277 attacatgatattgtctgtgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 19774198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 207
Target Start/End: Original strand, 16840341 - 16840399
Alignment:
Q  149 agttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaattattatt 207  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16840341 agttgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaattattatt 16840399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 175
Target Start/End: Original strand, 38312866 - 38312936
Alignment:
Q  105 tgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  38312866 tgttatctatgagtggttaaatgtacttgatgatggttatgttaagtttataagttgtcttttattcatga 38312936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 7108317 - 7108238
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  7108317 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 7108238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 7112252 - 7112173
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  7112252 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 7112173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11068692 - 11068613
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  11068692 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 11068613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14498026 - 14497947
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  14498026 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 14497947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15616256 - 15616177
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  15616256 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgaagatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 15616177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22320208 - 22320129
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  22320208 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 22320129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22335263 - 22335184
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  22335263 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 22335184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 55021455 - 55021376
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  55021455 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 55021376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 11167093 - 11167172
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  11167093 attacatgatgatatctatgagttgttaagtttacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 11167172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 28948540 - 28948461
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  28948540 attacatgatgatatctataagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 28948461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 222
Target Start/End: Original strand, 16840452 - 16840502
Alignment:
Q  172 atgagcactaaggggatgttaaggagaattattattgagtgtatatgatga 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  16840452 atgagtactaaggggatgttaagaagaattattattgagtggatttgatga 16840502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Original strand, 4108793 - 4108868
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaa-tgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  4108793 atgatgatatctatgagttgttaaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 4108868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Original strand, 4112642 - 4112717
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaa-tgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  4112642 atgatgatatctatgagttgttaaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 4112717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 147
Target Start/End: Original strand, 37440680 - 37440731
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgtt 147  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  37440680 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgtt 37440731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 54519760 - 54519701
Alignment:
Q  47 acgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattacatgatg 106  Q
    |||||||||||||||   ||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  54519760 acgaagttatgatgactgtttatggtgttgaatatgaggttgttatgatgttacatgatg 54519701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 12337333 - 12337257
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||| |||||| || |||||||||    
T  12337333 attacatgatgata--tatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgat-agttgtcttttattcatga 12337257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 16840007 - 16840035
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16840007 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 16840035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 164; Significance: 8e-88; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11945167 - 11944951
Alignment:
Q  2 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattaca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11945167 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattaca 11945068  T
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaatt 201  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11945067 tgaggttacctacgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaa--------gttgtcttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaatt 11944976  T
Q  202 attattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11944975 attattgagtgtatatgatgatgtc 11944951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Original strand, 43630898 - 43631114
Alignment:
Q  2 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattaca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43630898 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattaca 43630997  T
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaatt 201  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||        |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43630998 tgaggttacctacgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgt--------taagttgtcttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaatt 43631089  T
Q  202 attattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  43631090 attattgagtgtatatgatgatgtc 43631114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 11809859 - 11810078
Alignment:
Q  6 agaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattacatgat 105  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11809859 agaggtggtatactcttacgttggttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcatctatagtgttgaatgtgaggttgttatgatattacatgat 11809958  T
Q  106 gttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaattatta 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  11809959 gttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggtcatgttaagttgataagtcgtcttctattcacgagcattaaggggatgttaagaagaattaata 11810058  T
Q  206 ttgagtgtatatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11810059 ttgagtgtatatgatgatgt 11810078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Original strand, 636478 - 636596
Alignment:
Q  4 taagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattacatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  636478 taagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatctt-------gttgaatgcgatgttgttatgatattacatg 636570  T
Q  104 atgttacctatgagttgttaaatgta 129  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  636571 aggttacctatgagttgttaaatgta 636596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 226
Target Start/End: Original strand, 20032180 - 20032297
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||        | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20032180 atgatgttacctatgagttgttaaatgtactcgaggagggttatgttaagttg--------tcttctattcatgagcattaaggggatgttaagaagaat 20032271  T
Q  201 tattattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||    
T  20032272 tattattgagtgcatatggtgatgtc 20032297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 29534011 - 29533887
Alignment:
Q  52 gttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattacatgatgttac-ctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaag 150  Q
    ||||||||||   ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  29534011 gttatgatgactgtttatggtgttgaatatgaggttgttatgatattacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtgtttgatgatggttatgttaag 29533912  T
Q  151 ttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||| || |||||||||    
T  29533911 ttgataagttgtcttttattcatga 29533887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21406332 - 21406252
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgag 176  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21406332 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgag 21406252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 22132098 - 22132177
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22132098 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 22132177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 41801278 - 41801357
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  41801278 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 41801357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16370998 - 16370925
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16370998 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 16370925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 41389664 - 41389743
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  41389664 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgttttttattcatga 41389743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 20230138 - 20230218
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgtt-aagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  20230138 attacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatga 20230218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 33796112 - 33796033
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  33796112 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 33796033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 20032127 - 20032185
Alignment:
Q  2 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatg 60  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20032127 tataagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttgatgagtatgatgaggttatgatg 20032185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 32649140 - 32649067
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  32649140 tgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 32649067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 160
Target Start/End: Original strand, 39245170 - 39245234
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagtt 160  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  39245170 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagtt 39245234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 160
Target Start/End: Original strand, 39248725 - 39248789
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagtt 160  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  39248725 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagtt 39248789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 1009341 - 1009262
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  1009341 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 1009262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 1926795 - 1926874
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  1926795 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 1926874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 16376815 - 16376894
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  16376815 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 16376894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 20925809 - 20925888
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  20925809 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 20925888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 52634347 - 52634283
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagtt 160  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||    
T  52634347 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagtt 52634283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Original strand, 37839097 - 37839313
Alignment:
Q  2 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattaca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37839097 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattaca 37839196  T
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaatt 201  Q
     || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||        |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37839197 cgaggttacctacaagttgttaaatgtacttgatgagggttatgt--------taagttgtcttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaatt 37839288  T
Q  202 attattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  37839289 attattgagtgtatatgatgatgtc 37839313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Original strand, 42597826 - 42598042
Alignment:
Q  2 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattaca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42597826 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttatataatgttgaatgagaggttgttatgatattaca 42597925  T
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaatt 201  Q
     || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||        |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42597926 agaggttacctaaaagttgttaaatgtacttgatgagggttatgt--------taagttgtcttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaatt 42598017  T
Q  202 attattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  42598018 attattgagtgtatatgatgatgtc 42598042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 28385025 - 28384851
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  28385025 ttataagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttgatgagtatgacgatgttatgatgatcttttatgatgttgaatgtggggttgttatgatattac 28384926  T
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  28384925 atgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 28384851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Original strand, 631747 - 631827
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgag 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  631747 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtattctattcatgag 631827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10711904 - 10711824
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgag 176  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10711904 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgag 10711824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10925674 - 10925594
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgag 176  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10925674 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgag 10925594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 22634926 - 22635005
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22634926 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 22635005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 24048384 - 24048463
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24048384 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 24048463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27532831 - 27532751
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgag 176  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27532831 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgccttctattcatgag 27532751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 12423022 - 12422943
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12423022 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 12422943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 13818320 - 13818399
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  13818320 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgcattttattcatga 13818399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 17052445 - 17052524
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17052445 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 17052524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 161
Target Start/End: Original strand, 13813832 - 13813897
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttg 161  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13813832 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttg 13813897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15533292 - 15533219
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  15533292 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 15533219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 30145863 - 30145783
Alignment:
Q  96 attacatgatgttac-ctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  30145863 attacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 30145783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 36037024 - 36036952
Alignment:
Q  103 gatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  36037024 gatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 36036952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15223625 - 15223546
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  15223625 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 15223546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18211677 - 18211604
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  18211677 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttgagttgataagttgtcttttattcatga 18211604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 20158447 - 20158526
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20158447 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgcttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 20158526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 20163898 - 20163977
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20163898 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 20163977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 23996966 - 23997044
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| | || |||||||||    
T  23996966 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatg-taagttgataagttctcttttattcatga 23997044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 156
Target Start/End: Original strand, 49549088 - 49549142
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgata 156  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  49549088 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgata 49549142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Original strand, 20161123 - 20161199
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattca 172  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | | |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  20161123 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgataatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattca 20161199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 4562773 - 4562852
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  4562773 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 4562852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 5758455 - 5758534
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  5758455 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 5758534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 9555148 - 9555069
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  9555148 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 9555069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 12486350 - 12486271
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  12486350 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 12486271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 14758991 - 14759070
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  14758991 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 14759070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 14955759 - 14955838
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  14955759 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 14955838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 17807133 - 17807054
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  17807133 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 17807054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 33740915 - 33740836
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  33740915 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 33740836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 106
Target Start/End: Original strand, 49548998 - 49549057
Alignment:
Q  47 acgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattacatgatg 106  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  49548998 acgaagttatgatgattgtttatagtgttgaatatgaggttgttatgatgttacatgatg 49549057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25688521 - 25688455
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgt 162  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||    
T  25688521 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgt 25688455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38107037 - 38106945
Alignment:
Q  85 gttgttatgat-attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgag 176  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||| || | ||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||    
T  38107037 gttgttatgatgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatatgattgatgatgtttatgttaagttgataaattgtctttcattcatgag 38106945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28708032 - 28707816
Alignment:
Q  2 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattaca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28708032 tataagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattaca 28707933  T
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaatt 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  28707932 tgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttga--------cttctattcatgagcactaagagaatgttaaggagaatt 28707841  T
Q  202 attattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||    
T  28707840 attattgaatgtatctgatgatgtc 28707816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 23955543 - 23955369
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23955543 ttataagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttttatgatgttgaatgtggggttgttatgatattac 23955444  T
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23955443 atgaggttacccatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 23955369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Original strand, 9622823 - 9623032
Alignment:
Q  6 agaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattacatgat 105  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9622823 agaggtggtgtactcttacgtggtttatgttgatgagtatgacgagcttatgatgattctctataatgttgaatgtgaggttgttatgatattacatgat 9622922  T
Q  106 gttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaattatta 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9622923 gttacctatgagttgtt-aatgtacttgatgagggttatgt--------aaagttgtcttctattcatgagcactaaggggatgttaagaagaattatta 9623013  T
Q  206 ttgagtgtatatgatgatg 224  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9623014 ttgagtgtatatgatgatg 9623032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 34297677 - 34297838
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||  ||| |||| |||| ||||    
T  34297677 ttataagaggtggcgtactcttacgttgtttatgttgatgattatgacgatgttatgatgattgtttatagtgttgaatgaaaggctgttttgatgttac 34297776  T
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgt 162  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  34297777 atgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgctgatggttatgttaagttgataagttgt 34297838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25738066 - 25737905
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 100  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  25738066 ttataagagatgatgtactcttacgttggttatgttgatgattatgacgaggttatgatgattgtttatagtgttgagtgtgaggtttttatgatgttac 25737967  T
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgt 162  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||    
T  25737966 atgatgttatctatgagttggtaaatgtacttgatgatgattatgctaagttgataagttgt 25737905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 212
Target Start/End: Original strand, 14594666 - 14594769
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||        | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14594666 atgatgttacctatgagttgttaaatgtactcgaggagggttatgttaagttg--------tcttctattcatgagcattaaggggatgttaagaagaat 14594757  T
Q  201 tattattgagtg 212  Q
    ||||||||||||    
T  14594758 tattattgagtg 14594769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Original strand, 18918580 - 18918660
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgag 176  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18918580 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgag 18918660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7429497 - 7429398
Alignment:
Q  105 tgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaattatt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||        | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  7429497 tgttacctatgagttgttaaatgtactcgaggggggttatgttaagttg--------tcttctattcatgagcattaaggggatgttaagaagaattatt 7429406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 27222905 - 27222832
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27222905 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 27222832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 12941293 - 12941221
Alignment:
Q  103 gatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12941293 gatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 12941221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 2076365 - 2076286
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  2076365 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtatttgatgatgattatgttaagttgataagttgttttttattcatga 2076286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 23538060 - 23537994
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgt 162  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  23538060 attacatgatgttgtctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 23537994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Original strand, 18953483 - 18953563
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgag 176  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  18953483 attacatgatgtcatctaggagttgttaaatgtacttgatgatgattatgttaagtcgataagttgtcttctattcatgag 18953563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 23400757 - 23400677
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgtt-aagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||    
T  23400757 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcctttattcatga 23400677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1254090 - 1254019
Alignment:
Q  155 taagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaattattattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  1254090 taagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaattattattgggtggatttgatgatgtc 1254019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 31479462 - 31479541
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  31479462 attacatgatattatctatgagttgttaaatgtatttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 31479541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 173
Target Start/End: Original strand, 28290901 - 28290971
Alignment:
Q  103 gatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcat 173  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  28290901 gatgttatctataagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcat 28290971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 4475868 - 4475795
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  4475868 tgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 4475795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 1254223 - 1254172
Alignment:
Q  111 ctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgt 162  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  1254223 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 1254172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 7429554 - 7429499
Alignment:
Q  2 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatg 57  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  7429554 tataagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttgatgagtatgatgaggttatg 7429499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 226
Target Start/End: Original strand, 34297916 - 34297987
Alignment:
Q  155 taagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaattattattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  34297916 taagttgtcttctattcatgagtactaaggcgatgttaagaagaattattattgggtggatttgatgatgtc 34297987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 60
Target Start/End: Original strand, 14594614 - 14594671
Alignment:
Q  3 ataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatg 60  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  14594614 ataagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttgatgagtatgatgagggtatgatg 14594671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16622914 - 16622850
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagtt 160  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  16622914 attacatgatattatctatgaattgttaaatgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagtt 16622850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Original strand, 22075405 - 22075469
Alignment:
Q  111 ctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22075405 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 22075469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 8242491 - 8242412
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  8242491 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 8242412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11565480 - 11565401
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  11565480 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 11565401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 11716940 - 11717019
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  11716940 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 11717019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 12620333 - 12620412
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  12620333 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 12620412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 27555618 - 27555540
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  27555618 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-agttgtcttttattcatga 27555540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19869261 - 19869187
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  19869261 atgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatga 19869187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 23393715 - 23393641
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  23393715 atgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatga 23393641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 23413623 - 23413549
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  23413623 atgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatga 23413549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Original strand, 27416542 - 27416606
Alignment:
Q  111 ctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  27416542 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataggttgtcttttattcatga 27416606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22861834 - 22861755
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  22861834 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttggtgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 22861755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 23988382 - 23988303
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | |||| |||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  23988382 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatattaaattgataagttgtcttttattaatga 23988303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 149 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25737833 - 25737775
Alignment:
Q  149 agttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaattattatt 207  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  25737833 agttgttaagttgtcttctattcatgagggctaaggggatgttatgaagaattattatt 25737775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22947741 - 22947680
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgt 162  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||    
T  22947741 atgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgt 22947680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22951697 - 22951636
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgt 162  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||    
T  22951697 atgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgt 22951636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 23870185 - 23870124
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgt 162  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||    
T  23870185 atgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgt 23870124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 23874141 - 23874080
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgt 162  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||    
T  23874141 atgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgt 23874080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 4475959 - 4475900
Alignment:
Q  47 acgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattacatgatg 106  Q
    |||| |||||||||| | ||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4475959 acgatgttatgatgaccgtttatggtgttgaatatgaggttgttatgatgttacatgatg 4475900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14470944 - 14470881
Alignment:
Q  112 tatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||||  ||||||||| || | |||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  14470944 tatgagttgttaggtgtacttgatgatgtttatgttaggttgataagttgtcttttattcatga 14470881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16758789 - 16758715
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||| || ||||||||| |||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  16758789 atgatgatatctatgagttattaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 16758715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Complemental strand, 25738197 - 25738168
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtt 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25738197 ttataagaggtggtgtactcttactttgtt 25738168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 34297329 - 34297357
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297329 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 34297357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 34297400 - 34297428
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297400 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 34297428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 34297505 - 34297533
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297505 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 34297533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 34297574 - 34297602
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297574 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 34297602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 37379209 - 37379036
Alignment:
Q  2 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattaca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37379209 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttttatgatgttgaatgtggggttgttatgatattaca 37379110  T
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  37379109 tgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 37379036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 9240747 - 9240674
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9240747 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 9240674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 175
Target Start/End: Original strand, 21074510 - 21074586
Alignment:
Q  99 acatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  21074510 acatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 21074586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 9784073 - 9783994
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  9784073 attacatgatgttatctatgagttgtttaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 9783994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Original strand, 19663563 - 19663636
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  19663563 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 19663636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 20260330 - 20260257
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20260330 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 20260257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 6481857 - 6481784
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  6481857 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatga 6481784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 6485324 - 6485251
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  6485324 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatga 6485251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 24630047 - 24630126
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  24630047 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 24630126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24645230 - 24645151
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  24645230 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 24645151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24648006 - 24647927
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  24648006 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 24647927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 27380993 - 27381072
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  27380993 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 27381072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 27384963 - 27385042
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  27384963 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 27385042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 27600450 - 27600371
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  27600450 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 27600371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 30346657 - 30346736
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  30346657 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 30346736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Original strand, 41532447 - 41532521
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  41532447 atgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatga 41532521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 175
Target Start/End: Original strand, 10686272 - 10686325
Alignment:
Q  122 taaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  10686272 taaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 10686325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 10103296 - 10103375
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  10103296 attacatgttgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 10103375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 12902606 - 12902685
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  12902606 attacataatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 12902685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 22702909 - 22702873
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttg 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22702909 ttataagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttg 22702873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24647158 - 24647094
Alignment:
Q  111 ctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  24647158 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 24647094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 31343996 - 31343917
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||  ||||||||| || |  ||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  31343996 attacatgaagatatctatgagttgttaggtgtacttgatgatgtatatgttaagttgataagctgtcttttattcatga 31343917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Original strand, 18359200 - 18359229
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtt 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18359200 ttataagaggtggtgtactcttactttgtt 18359229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Complemental strand, 22702945 - 22702916
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtt 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22702945 ttataagaggtggtgtactcttactttgtt 22702916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 226
Target Start/End: Original strand, 173133 - 173338
Alignment:
Q  4 taagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattacatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  173133 taagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttttatagtgttgaatgtgaggttgttatgatattatatg 173232  T
Q  104 atgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaattat 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||                 || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  173233 atgttacctattagttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaa-----------------tactcatgagcactaaggggatgttaagaagaattat 173315  T
Q  204 tattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  173316 tattgagtgtatatgatgatgtc 173338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 172865 - 172893
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  172865 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 172893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0815 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0815
Description:

Target: scaffold0815; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 181 - 1
Alignment:
Q  4 taagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattacatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  181 taagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattacatg 82  T
Q  104 atgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgtta 192  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||        |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  81 aggttacctttgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgt--------taagctgtcttctattcatgagcactaaggagatgtta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 146
Target Start/End: Original strand, 3171 - 3315
Alignment:
Q  2 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattaca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3171 tataagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttctatagtgttgaatgcgaggttgttatgatattaca 3270  T
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgt 146  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3271 tgaggttacctatgagttgttaaatgtacttgatgagggttatgt 3315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 7)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 175540 - 175425
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  175540 ttataagaggtggtgtactcttacattgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgatcttttatgatgttgaatgtggggttgttatgatattac 175441  T
Q  101 atgatgttacctatga 116  Q
    |||| |||||||||||    
T  175440 atgaggttacctatga 175425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 163504 - 163594
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgtta 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  163504 ttataagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttgatgattatgacgatgttgtgacgattgtttatagtgttgaatgtgaggttgtta 163594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 149 - 226
Target Start/End: Original strand, 163705 - 163782
Alignment:
Q  149 agttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaattattattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  163705 agttgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaattattattgagtggatttgatgatgtc 163782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 153682 - 153787
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 100  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| | | |||||||| ||||||||||   ||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  153682 ttatgagaggtggtgtactctcacgttgtttatgttgtttattatgacgatgttatgatgactgtttatggtgttgaatatgaggttgttatgatgttac 153781  T
Q  101 atgatg 106  Q
    ||||||    
T  153782 atgatg 153787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 162
Target Start/End: Original strand, 163588 - 163633
Alignment:
Q  117 gttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgt 162  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  163588 gttgttaaatgtacttgatgagggttatgttaagttgataacttgt 163633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 153284 - 153312
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  153284 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 153312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 153350 - 153378
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  153350 ttataagaggtggtgtactcttactttgt 153378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 4275 - 4134
Alignment:
Q  21 ttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattacatgatgttacctatgagttg 120  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  ||||||| |||||||| |||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  4275 ttacgttgtttatgttgatgattatgatgatgttatgatgattgtttatagtgttgaatgagaggcttttttgatgttacatgatgttatctatgagttg 4176  T
Q  121 ttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgt 162  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  4175 ttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 4134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4056 - 3985
Alignment:
Q  155 taagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaattattattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  4056 taagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaattattattgggtggatttgatgatgtc 3985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34128 - 34011
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||        | | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  34128 atgatgttacctatgagttgttaaatgtactcgaggagtgttatgttaggttg--------tctgctattcatgagcattaaggggatgttaagaagaat 34037  T
Q  201 tattattgagtgtatatgatgatgtc 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  34036 tattattgagtgtatatgatgatgtc 34011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 34181 - 34123
Alignment:
Q  2 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatg 60  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34181 tataagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatg 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2015 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold2015
Description:

Target: scaffold2015; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 212
Target Start/End: Original strand, 444 - 547
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||        | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  444 atgatgttacctatgagttgttaaatgtactcgaggagggttatgttaagttg--------tcttctattcatgagcattaaggggatgttaagaagaat 535  T
Q  201 tattattgagtg 212  Q
    ||||||||||||    
T  536 tattattgagtg 547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2015; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 391 - 449
Alignment:
Q  2 tataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatg 60  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  391 tataagaggtggtgtactcttacgttgtttatgttgatgagtatgatgagggtatgatg 449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0380 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0380
Description:

Target: scaffold0380; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4053 - 3973
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgag 176  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4053 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgag 3973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Original strand, 23937 - 24017
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgag 176  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23937 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgag 24017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Original strand, 62839 - 62919
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgag 176  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  62839 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgag 62919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Original strand, 74331 - 74411
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgag 176  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  74331 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgag 74411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 6960 - 7039
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  6960 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 7039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 37202 - 37281
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  37202 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 37281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 98 - 175
Target Start/End: Original strand, 25569 - 25646
Alignment:
Q  98 tacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  25569 tacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 25646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Original strand, 37197 - 37277
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatgag 176  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  37197 attacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagtcgataagttgtcttctattcatgag 37277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 6)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 28551 - 28472
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  28551 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatcgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 28472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 34016 - 33937
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  34016 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatcgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 33937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 28681 - 28580
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 100  Q
    |||| ||||||| |||||||| || |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||   |||||   ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28681 ttatgagaggtgatgtactctcacgttgtttatgttattgattatgacgatgttatgatgactgtttatgatgttgaatatgaggttgttatgatgttac 28582  T
Q  101 at 102  Q
    ||    
T  28581 at 28580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 34146 - 34045
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgatcttttatagggttgaatgtgaggttgttatgatattac 100  Q
    |||| ||||||| |||||||| || |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||   |||||   ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  34146 ttatgagaggtgatgtactctcacgttgtttatgttattgattatgacgatgttatgatgactgtttatgatgttgaatatgaggttgttatgatgttac 34047  T
Q  101 at 102  Q
    ||    
T  34046 at 34045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Complemental strand, 28780 - 28751
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtt 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28780 ttataagaggtggtgtactcttactttgtt 28751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Complemental strand, 34245 - 34216
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtt 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34245 ttataagaggtggtgtactcttactttgtt 34216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 273 - 200
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  273 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Original strand, 10827 - 10900
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  10827 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 10900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 109674 - 109601
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  109674 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 109601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Original strand, 224148 - 224221
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  224148 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 224221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 8739 - 8818
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  8739 attacatgatgttatctacgagttgttaaatgtacatgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 8818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 5315 - 5242
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  5315 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtctattattcatga 5242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 208716 - 208655
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtttatgttgatgagtatgacgaagttatgatgat 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  208716 ttataagaggtggtgtaatcttacattgtttatgttgatgagtatgacgaggttatgatgat 208655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Complemental strand, 208751 - 208722
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtt 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  208751 ttataagaggtggtgtactcttactttgtt 208722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Original strand, 3522 - 3595
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3522 tgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 3595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18896 - 18823
Alignment:
Q  102 tgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  18896 tgatgttatctataagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcatttattcatga 18823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 153
Target Start/End: Original strand, 21339 - 21396
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttg 153  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21339 attacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatggttatgttaagttg 21396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 175
Target Start/End: Original strand, 824 - 899
Alignment:
Q  100 catgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  824 catgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 8656 - 8577
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  8656 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttaataagttgtcttttattcatga 8577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14923 - 14844
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14923 attacatgaagatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 14844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 11059 - 11138
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  11059 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacctgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 11138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 10841 - 10767
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  10841 atgatgatatctaagagttgttaagtgtacttgatgatggttatgttaagttgataagttgtattttattcatga 10767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 6320 - 6399
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  6320 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 6399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11130 - 11051
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  11130 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 11051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 34127 - 34206
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  34127 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 34206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 60325 - 60404
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  60325 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 60404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Original strand, 15579 - 15653
Alignment:
Q  101 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  15579 atgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatga 15653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 70819 - 70755
Alignment:
Q  111 ctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  70819 ctatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataggttgtcttttattcatga 70755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 68555 - 68634
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |  | ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  68555 attacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatggtgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatga 68634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11856 - 11777
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  11856 attacatgatgaaatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgcttatgttaagttgatatgttgtcttttatacatga 11777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 5902 - 5826
Alignment:
Q  96 attacatgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  5902 attacatgatgata--tatgagttgttaagtgtacttgatgatgtttatgttaagttgat-agttgtcttttattcatga 5826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 175
Target Start/End: Original strand, 5546 - 5609
Alignment:
Q  112 tatgagttgttaaatgtacttgacgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 175  Q
    |||||||| |||  ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  5546 tatgagttcttaggtgtacttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 5609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Complemental strand, 48174 - 48145
Alignment:
Q  1 ttataagaggtggtgtactcttactttgtt 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48174 ttataagaggtggtgtactcttactttgtt 48145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University