View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18764_high_1 (Length: 2370)

Name: NF18764_high_1
Description: NF18764
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18764_high_1
NF18764_high_1
[»] chr3 (111 HSPs)
chr3 (1815-2359)||(36012252-36012806)
chr3 (409-727)||(36013423-36013741)
chr3 (2066-2359)||(33698268-33698566)
chr3 (99-285)||(36013969-36014155)
chr3 (2064-2359)||(44891612-44891912)
chr3 (2061-2359)||(46297520-46297823)
chr3 (2061-2359)||(52040680-52040983)
chr3 (2063-2359)||(26941020-26941321)
chr3 (2069-2359)||(7327246-7327543)
chr3 (2063-2359)||(32373585-32373885)
chr3 (2063-2359)||(4015575-4015875)
chr3 (2061-2359)||(22622476-22622779)
chr3 (2065-2359)||(42505837-42506136)
chr3 (2061-2359)||(53228910-53229213)
chr3 (2064-2359)||(39282767-39283067)
chr3 (2063-2360)||(2008047-2008355)
chr3 (2063-2359)||(21193721-21194023)
chr3 (2063-2356)||(33378545-33378843)
chr3 (2070-2356)||(1089811-1090102)
chr3 (2062-2340)||(25579873-25580156)
chr3 (2061-2359)||(37203182-37203486)
chr3 (2062-2359)||(29099470-29099764)
chr3 (2062-2359)||(37157822-37158125)
chr3 (2158-2359)||(45174620-45174821)
chr3 (2123-2359)||(34133050-34133285)
chr3 (2062-2359)||(3362368-3362672)
chr3 (2057-2359)||(11466939-11467232)
chr3 (2061-2359)||(14586438-14586731)
chr3 (2061-2359)||(40552017-40552320)
chr3 (739-1240)||(36002990-36003497)
chr3 (2108-2359)||(24488773-24489023)
chr3 (2063-2359)||(48355056-48355357)
chr3 (2063-2359)||(21009561-21009863)
chr3 (2078-2359)||(24707890-24708178)
chr3 (2067-2278)||(11357145-11357362)
chr3 (2111-2359)||(3655013-3655263)
chr3 (2069-2340)||(54505941-54506218)
chr3 (2064-2359)||(22445826-22446125)
chr3 (2061-2356)||(38591816-38592103)
chr3 (2126-2340)||(46994490-46994703)
chr3 (2065-2359)||(47481637-47481937)
chr3 (2063-2269)||(51212537-51212743)
chr3 (2111-2359)||(4761462-4761710)
chr3 (2062-2278)||(40936168-40936390)
chr3 (2108-2359)||(44186328-44186562)
chr3 (2142-2360)||(54828546-54828763)
chr3 (2114-2359)||(22451083-22451327)
chr3 (2108-2359)||(29163933-29164167)
chr3 (2167-2359)||(43348372-43348563)
chr3 (2063-2359)||(43975652-43975949)
chr3 (1406-1709)||(36023644-36023951)
chr3 (1839-2045)||(46163819-46164025)
chr3 (1881-2045)||(32808190-32808356)
chr3 (2061-2287)||(11356916-11357140)
chr3 (2158-2359)||(11835494-11835689)
chr3 (790-1241)||(36024086-36024543)
chr3 (2060-2316)||(20373020-20373263)
chr3 (2218-2359)||(35844441-35844581)
chr3 (281-369)||(36013828-36013916)
chr3 (1406-1587)||(36002667-36002848)
chr3 (1838-2045)||(55213965-55214172)
chr3 (1839-2045)||(45708602-45708809)
chr3 (2114-2359)||(27480175-27480440)
chr3 (2219-2359)||(53176169-53176308)
chr3 (2111-2231)||(50475053-50475180)
chr3 (1862-2045)||(3157684-3157867)
chr3 (1839-2015)||(33140276-33140453)
chr3 (971-1135)||(23473002-23473166)
chr3 (994-1134)||(35768773-35768913)
chr3 (1837-1948)||(33140536-33140647)
chr3 (1876-2045)||(2051504-2051674)
chr3 (995-1135)||(23454617-23454757)
chr3 (993-1129)||(23469089-23469225)
chr3 (1835-1978)||(46164047-46164191)
chr3 (2271-2359)||(51212955-51213042)
chr3 (1839-2017)||(12088989-12089168)
chr3 (2160-2235)||(53811597-53811672)
chr3 (1617-1714)||(36002546-36002643)
chr3 (975-1135)||(23440473-23440633)
chr3 (1839-1978)||(26121951-26122091)
chr3 (1839-1978)||(26244161-26244301)
chr3 (1965-2045)||(26245020-26245100)
chr3 (1839-1978)||(43804116-43804256)
chr3 (972-1135)||(23386834-23386997)
chr3 (309-374)||(14749833-14749898)
chr3 (2064-2134)||(34133301-34133373)
chr3 (994-1182)||(23479094-23479282)
chr3 (1965-2017)||(26122142-26122194)
chr3 (994-1236)||(23447751-23447993)
chr3 (2063-2118)||(35844608-35844663)
chr3 (993-1091)||(23401668-23401766)
chr3 (993-1135)||(23463839-23463981)
chr3 (2064-2118)||(45174835-45174889)
chr3 (993-1084)||(23405259-23405350)
chr3 (2067-2110)||(31706488-31706531)
chr3 (1862-1912)||(12015071-12015121)
chr3 (2301-2359)||(20373300-20373357)
chr3 (2068-2110)||(23165291-23165333)
chr3 (994-1092)||(23499663-23499761)
chr3 (1839-1969)||(32808390-32808523)
chr3 (1436-1498)||(35769176-35769238)
chr3 (369-407)||(36013771-36013809)
chr3 (17-51)||(36014194-36014228)
chr3 (2061-2118)||(43348575-43348633)
chr3 (2069-2110)||(53811435-53811476)
chr3 (2299-2359)||(11357366-11357425)
chr3 (1625-1704)||(23351947-23352026)
chr3 (993-1092)||(23352542-23352641)
chr3 (1406-1559)||(23454208-23454358)
chr3 (2065-2115)||(13498681-13498731)
chr3 (800-845)||(23499916-23499961)
[»] chr2 (66 HSPs)
chr2 (772-1366)||(16122088-16122679)
chr2 (736-1366)||(16336485-16337112)
chr2 (2063-2359)||(41960964-41961265)
chr2 (2068-2340)||(33709015-33709292)
chr2 (2062-2359)||(27349730-27350018)
chr2 (2065-2359)||(31570514-31570813)
chr2 (2061-2359)||(18494057-18494359)
chr2 (2062-2359)||(4167046-4167348)
chr2 (2065-2359)||(44913787-44914090)
chr2 (2064-2359)||(43648024-43648324)
chr2 (2065-2359)||(3177063-3177362)
chr2 (2130-2359)||(4478493-4478717)
chr2 (2055-2356)||(4763758-4764065)
chr2 (2061-2359)||(33660153-33660447)
chr2 (2063-2359)||(19424420-19424707)
chr2 (2061-2340)||(2325154-2325438)
chr2 (2061-2359)||(11366156-11366460)
chr2 (2062-2356)||(26357704-26358003)
chr2 (2063-2357)||(35959023-35959317)
chr2 (2129-2356)||(4263926-4264153)
chr2 (2061-2278)||(7006715-7006937)
chr2 (2063-2359)||(19289101-19289402)
chr2 (2061-2359)||(41465625-41465928)
chr2 (2082-2359)||(43770645-43770918)
chr2 (2177-2359)||(36642110-36642293)
chr2 (2069-2359)||(13711588-13711878)
chr2 (2063-2359)||(29241923-29242217)
chr2 (2066-2359)||(39167150-39167442)
chr2 (2062-2359)||(31861976-31862278)
chr2 (2148-2359)||(44286073-44286283)
chr2 (2111-2359)||(37905832-37906082)
chr2 (2062-2359)||(33550759-33551065)
chr2 (2061-2287)||(19500693-19500923)
chr2 (2108-2359)||(5881663-5881903)
chr2 (2143-2359)||(19313975-19314186)
chr2 (2188-2359)||(17071646-17071816)
chr2 (2177-2359)||(45327844-45328025)
chr2 (1406-1548)||(16121921-16122063)
chr2 (1406-1548)||(16337137-16337279)
chr2 (2206-2340)||(18258214-18258347)
chr2 (1837-2045)||(29469513-29469724)
chr2 (2108-2235)||(41051129-41051255)
chr2 (2188-2359)||(17054005-17054175)
chr2 (1840-2045)||(36937664-36937870)
chr2 (2208-2359)||(41463779-41463929)
chr2 (2063-2194)||(18257316-18257453)
chr2 (1565-1708)||(16337367-16337513)
chr2 (1836-2017)||(26407398-26407580)
chr2 (2108-2201)||(41463419-41463512)
chr2 (2064-2179)||(33902317-33902439)
chr2 (2061-2144)||(45328028-45328116)
chr2 (1958-2045)||(29166824-29166911)
chr2 (2229-2359)||(33902190-33902319)
chr2 (1847-2039)||(25961089-25961282)
chr2 (1838-1978)||(26407630-26407771)
chr2 (1617-1708)||(16121655-16121745)
chr2 (2055-2108)||(7565630-7565683)
chr2 (1839-1912)||(30786447-30786520)
chr2 (2061-2118)||(36642306-36642363)
chr2 (1565-1608)||(16121792-16121835)
chr2 (2067-2114)||(19093787-19093834)
chr2 (2062-2118)||(4263686-4263742)
chr2 (2299-2359)||(7006941-7007000)
chr2 (2067-2110)||(6178111-6178154)
chr2 (1838-1913)||(36937503-36937578)
chr2 (2061-2110)||(18514394-18514443)
[»] chr7 (75 HSPs)
chr7 (2055-2359)||(15612511-15612821)
chr7 (2063-2359)||(6546618-6546919)
chr7 (2066-2353)||(9355590-9355882)
chr7 (2061-2359)||(18797426-18797729)
chr7 (2063-2359)||(15672518-15672824)
chr7 (2065-2359)||(24211840-24212140)
chr7 (2064-2359)||(32432551-32432851)
chr7 (2056-2339)||(26587846-26588126)
chr7 (2062-2359)||(8861384-8861686)
chr7 (2062-2359)||(21991735-21992028)
chr7 (2069-2359)||(31578831-31579126)
chr7 (2061-2359)||(30055626-30055929)
chr7 (2063-2359)||(10358975-10359277)
chr7 (2063-2359)||(37109971-37110274)
chr7 (2063-2359)||(17842345-17842648)
chr7 (2063-2309)||(35353256-35353508)
chr7 (2062-2350)||(37703258-37703551)
chr7 (2095-2359)||(22687338-22687599)
chr7 (2063-2359)||(5657241-5657543)
chr7 (2066-2359)||(23111289-23111589)
chr7 (2061-2359)||(44598765-44599068)
chr7 (2075-2359)||(10481704-10481993)
chr7 (2064-2356)||(27283846-27284145)
chr7 (2062-2359)||(4583018-4583320)
chr7 (2063-2356)||(48928058-48928356)
chr7 (2063-2359)||(7334893-7335193)
chr7 (2062-2278)||(26980485-26980707)
chr7 (2063-2359)||(41764839-41765140)
chr7 (2111-2359)||(11071305-11071549)
chr7 (2114-2359)||(32820871-32821115)
chr7 (2108-2356)||(25691356-25691603)
chr7 (2061-2278)||(31520500-31520723)
chr7 (2063-2359)||(29173639-29173922)
chr7 (2126-2359)||(12165851-12166074)
chr7 (2087-2332)||(37347148-37347397)
chr7 (2151-2359)||(33688117-33688324)
chr7 (2078-2350)||(46480905-46481182)
chr7 (2108-2340)||(43925219-43925444)
chr7 (2060-2252)||(37704387-37704585)
chr7 (2167-2359)||(43686139-43686330)
chr7 (2063-2278)||(12390410-12390629)
chr7 (2186-2359)||(38258644-38258816)
chr7 (2066-2265)||(44411304-44411509)
chr7 (2091-2278)||(32592996-32593188)
chr7 (1831-2032)||(33190056-33190258)
chr7 (2063-2169)||(38258867-38258979)
chr7 (2227-2359)||(37704256-37704387)
chr7 (2113-2257)||(34361995-34362141)
chr7 (2229-2359)||(27421313-27421442)
chr7 (1839-2017)||(47247-47426)
chr7 (1835-2045)||(35315838-35316049)
chr7 (2167-2278)||(38053640-38053751)
chr7 (2205-2356)||(48928473-48928623)
chr7 (1851-1978)||(35316071-35316199)
chr7 (1835-1934)||(36642603-36642702)
chr7 (1835-2015)||(26073335-26073516)
chr7 (1835-2015)||(26097122-26097303)
chr7 (1838-1978)||(32047232-32047373)
chr7 (2268-2355)||(44413351-44413437)
chr7 (1862-1978)||(26096953-26097070)
chr7 (1961-2017)||(527541-527597)
chr7 (1840-1978)||(25658388-25658527)
chr7 (1950-2045)||(25658549-25658643)
chr7 (2059-2118)||(33688049-33688108)
chr7 (1862-1978)||(26073166-26073283)
chr7 (1838-1978)||(33189881-33190022)
chr7 (2299-2359)||(26980422-26980481)
chr7 (2063-2118)||(12166234-12166289)
chr7 (2069-2121)||(27421157-27421210)
chr7 (1837-1912)||(21297711-21297786)
chr7 (2138-2201)||(27421207-27421270)
chr7 (1838-1912)||(7511078-7511152)
chr7 (1930-2039)||(7511158-7511267)
chr7 (2299-2356)||(12390633-12390689)
chr7 (2063-2108)||(25470760-25470805)
[»] chr4 (76 HSPs)
chr4 (736-1361)||(12896007-12896638)
chr4 (2062-2350)||(47253873-47254166)
chr4 (2066-2350)||(7703642-7703931)
chr4 (2063-2359)||(55240891-55241191)
chr4 (2078-2359)||(33341522-33341808)
chr4 (2060-2359)||(17167837-17168141)
chr4 (2060-2340)||(37287869-37288157)
chr4 (2061-2359)||(23761196-23761498)
chr4 (2059-2359)||(34361273-34361579)
chr4 (2060-2359)||(17173414-17173718)
chr4 (2063-2359)||(28002772-28003073)
chr4 (2059-2359)||(37663523-37663828)
chr4 (2065-2353)||(46887946-46888238)
chr4 (2060-2359)||(25184237-25184541)
chr4 (2064-2359)||(37775791-37776082)
chr4 (2061-2359)||(17272088-17272391)
chr4 (2062-2359)||(29583985-29584287)
chr4 (2063-2359)||(6864159-6864460)
chr4 (2061-2359)||(35020815-35021122)
chr4 (2063-2359)||(19089239-19089540)
chr4 (2114-2359)||(1815425-1815669)
chr4 (2062-2359)||(32912364-32912667)
chr4 (2063-2350)||(30002427-30002710)
chr4 (2108-2359)||(34947932-34948184)
chr4 (2069-2359)||(32592217-32592503)
chr4 (2114-2359)||(55477734-55477978)
chr4 (2063-2359)||(19440434-19440735)
chr4 (2060-2359)||(27396740-27397042)
chr4 (2064-2359)||(3042743-3043043)
chr4 (2061-2359)||(36493473-36493775)
chr4 (2087-2359)||(50697365-50697643)
chr4 (2063-2359)||(879334-879635)
chr4 (2063-2359)||(5047752-5048052)
chr4 (2061-2297)||(33816300-33816542)
chr4 (2051-2359)||(42199853-42200167)
chr4 (2063-2358)||(4598117-4598407)
chr4 (2063-2329)||(32579600-32579871)
chr4 (2063-2359)||(25700842-25701144)
chr4 (2063-2359)||(49376091-49376392)
chr4 (2065-2359)||(50764854-50765143)
chr4 (2060-2257)||(39400233-39400436)
chr4 (2086-2285)||(7152013-7152218)
chr4 (2062-2235)||(4205231-4205410)
chr4 (2087-2359)||(9139369-9139628)
chr4 (2061-2211)||(23431826-23431982)
chr4 (2061-2284)||(26896285-26896515)
chr4 (2089-2220)||(35025379-35025515)
chr4 (2087-2359)||(4934022-4934289)
chr4 (2203-2359)||(54499170-54499325)
chr4 (1851-2045)||(35251547-35251742)
chr4 (2069-2332)||(46883905-46884168)
chr4 (1837-2017)||(51103554-51103735)
chr4 (2167-2356)||(38011981-38012169)
chr4 (1406-1600)||(12896674-12896868)
chr4 (1835-1948)||(39864086-39864199)
chr4 (2205-2350)||(35025530-35025674)
chr4 (2062-2176)||(38012568-38012688)
chr4 (1838-2045)||(4892547-4892753)
chr4 (1862-1972)||(4872569-4872679)
chr4 (1958-2033)||(42077141-42077216)
chr4 (1853-2017)||(43049288-43049449)
chr4 (1896-2017)||(4872734-4872856)
chr4 (1839-1912)||(51103364-51103437)
chr4 (1838-2045)||(22886416-22886627)
chr4 (1838-2045)||(22938080-22938291)
chr4 (1839-2013)||(45302323-45302498)
chr4 (2280-2340)||(39398052-39398111)
chr4 (1923-2017)||(34932246-34932341)
chr4 (2178-2235)||(56050177-56050234)
chr4 (1851-1978)||(4892397-4892525)
chr4 (1968-2015)||(40681566-40681613)
chr4 (1930-2045)||(54511477-54511590)
chr4 (2299-2359)||(33816561-33816620)
chr4 (2063-2110)||(2708227-2708274)
chr4 (1861-1912)||(35004494-35004545)
chr4 (1763-1796)||(12897061-12897094)
[»] chr5 (63 HSPs)
chr5 (2060-2359)||(35934019-35934324)
chr5 (2061-2358)||(19119984-19120286)
chr5 (2074-2359)||(15992301-15992591)
chr5 (2065-2359)||(5837679-5837978)
chr5 (2062-2359)||(38527986-38528288)
chr5 (2063-2359)||(25500676-25500977)
chr5 (2063-2359)||(22980917-22981218)
chr5 (2064-2359)||(39572943-39573235)
chr5 (2063-2359)||(31705362-31705663)
chr5 (2064-2359)||(31786397-31786697)
chr5 (2061-2359)||(27330428-27330731)
chr5 (2064-2359)||(9200357-9200648)
chr5 (2061-2359)||(22019756-22020050)
chr5 (2061-2359)||(35511230-35511528)
chr5 (2061-2359)||(40133509-40133812)
chr5 (2075-2359)||(699274-699563)
chr5 (2075-2359)||(8741647-8741937)
chr5 (2108-2359)||(30969125-30969375)
chr5 (2064-2355)||(12910483-12910779)
chr5 (2060-2359)||(22255306-22255610)
chr5 (2063-2359)||(27318238-27318538)
chr5 (2062-2359)||(36866886-36867188)
chr5 (2069-2359)||(22973838-22974133)
chr5 (2065-2359)||(32563273-32563563)
chr5 (2055-2332)||(2888187-2888469)
chr5 (2063-2359)||(33908357-33908657)
chr5 (2063-2359)||(23115980-23116273)
chr5 (2069-2359)||(7208620-7208915)
chr5 (2061-2340)||(5830035-5830319)
chr5 (2063-2359)||(42342855-42343146)
chr5 (2063-2359)||(17157781-17158082)
chr5 (2063-2359)||(15724612-15724913)
chr5 (2063-2328)||(8437120-8437390)
chr5 (2061-2278)||(24886291-24886514)
chr5 (2067-2336)||(25669733-25669997)
chr5 (2111-2359)||(35504489-35504736)
chr5 (2067-2359)||(36860547-36860845)
chr5 (2059-2359)||(13956110-13956413)
chr5 (2108-2359)||(7693354-7693595)
chr5 (2061-2359)||(28416299-28416578)
chr5 (2059-2359)||(23954548-23954840)
chr5 (2114-2327)||(35826293-35826503)
chr5 (2108-2359)||(21088570-21088817)
chr5 (2061-2278)||(1428921-1429133)
chr5 (2061-2359)||(14409089-14409378)
chr5 (2060-2254)||(25889598-25889798)
chr5 (2062-2359)||(43308409-43308703)
chr5 (2063-2281)||(8466928-8467151)
chr5 (2155-2359)||(6824329-6824530)
chr5 (2087-2359)||(14919313-14919579)
chr5 (2062-2222)||(26269069-26269235)
chr5 (2213-2359)||(26268198-26268343)
chr5 (2063-2183)||(43254154-43254280)
chr5 (1840-2045)||(36150733-36150938)
chr5 (1840-2017)||(13932749-13932927)
chr5 (1839-1978)||(36150960-36151100)
chr5 (2242-2359)||(5112249-5112364)
chr5 (2063-2106)||(11898197-11898240)
chr5 (2058-2108)||(8762855-8762905)
chr5 (2065-2110)||(21321087-21321132)
chr5 (2299-2359)||(1429137-1429196)
chr5 (2299-2359)||(8466868-8466927)
chr5 (2061-2113)||(34853843-34853895)
[»] chr8 (70 HSPs)
chr8 (2062-2359)||(16446640-16446942)
chr8 (2060-2359)||(5299709-5300013)
chr8 (2069-2359)||(44869620-44869915)
chr8 (2063-2359)||(38644101-38644402)
chr8 (2060-2359)||(11727147-11727452)
chr8 (2062-2359)||(1149397-1149699)
chr8 (2062-2359)||(37970284-37970586)
chr8 (2061-2359)||(36694730-36695033)
chr8 (2061-2359)||(43643359-43643662)
chr8 (2063-2357)||(4132452-4132750)
chr8 (2063-2359)||(1205050-1205351)
chr8 (2060-2359)||(34895090-34895389)
chr8 (2066-2359)||(465965-466253)
chr8 (2063-2359)||(7890723-7891024)
chr8 (2063-2359)||(33906335-33906634)
chr8 (2069-2356)||(1953760-1954053)
chr8 (2114-2355)||(6098336-6098581)
chr8 (2069-2355)||(39098891-39099182)
chr8 (2063-2359)||(8803582-8803884)
chr8 (2123-2359)||(9864271-9864506)
chr8 (2095-2359)||(27082636-27082905)
chr8 (2111-2359)||(16222986-16223233)
chr8 (2108-2359)||(12876232-12876483)
chr8 (2062-2359)||(30654348-30654650)
chr8 (2095-2359)||(23854229-23854498)
chr8 (2077-2359)||(35459491-35459778)
chr8 (2060-2235)||(35859180-35859361)
chr8 (2108-2340)||(40862561-40862793)
chr8 (2050-2359)||(10554957-10555269)
chr8 (2068-2336)||(18259229-18259498)
chr8 (2066-2257)||(34951826-34952023)
chr8 (2062-2226)||(33198057-33198227)
chr8 (2064-2359)||(31933653-31933953)
chr8 (2167-2356)||(13307749-13307936)
chr8 (2108-2297)||(24823211-24823392)
chr8 (2088-2247)||(12587816-12587981)
chr8 (2204-2359)||(41910902-41911055)
chr8 (2127-2287)||(1149756-1149912)
chr8 (1832-2033)||(5074425-5074627)
chr8 (2211-2359)||(43025825-43025972)
chr8 (1862-2017)||(42026966-42027122)
chr8 (2064-2180)||(41362723-41362845)
chr8 (1871-2017)||(23488776-23488922)
chr8 (1838-2017)||(16997092-16997274)
chr8 (1839-2045)||(42950341-42950548)
chr8 (2288-2359)||(7998417-7998488)
chr8 (1958-2032)||(41480626-41480700)
chr8 (1861-2013)||(38225454-38225607)
chr8 (2108-2181)||(43025974-43026047)
chr8 (1833-1980)||(23488923-23489070)
chr8 (1958-2045)||(11732713-11732800)
chr8 (2160-2235)||(34463720-34463792)
chr8 (1838-1978)||(41480735-41480876)
chr8 (2280-2359)||(1150094-1150172)
chr8 (2203-2278)||(7998481-7998556)
chr8 (2064-2134)||(9864522-9864594)
chr8 (1960-2045)||(18385845-18385930)
chr8 (1861-1948)||(7905655-7905742)
chr8 (2288-2359)||(34952028-34952098)
chr8 (2061-2118)||(13307948-13308005)
chr8 (2061-2110)||(30650897-30650946)
chr8 (2061-2118)||(41910822-41910879)
chr8 (1891-1978)||(5074303-5074391)
chr8 (2062-2096)||(7998558-7998592)
chr8 (2259-2297)||(12585300-12585338)
chr8 (2289-2359)||(41362638-41362707)
chr8 (2068-2109)||(6446181-6446222)
chr8 (2067-2108)||(34463913-34463954)
chr8 (1843-1952)||(42027199-42027308)
chr8 (1895-1971)||(42950577-42950654)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (2064-2359)||(12033-12332)
[»] chr1 (72 HSPs)
chr1 (2064-2359)||(39393503-39393804)
chr1 (2063-2359)||(27532737-27533036)
chr1 (2069-2359)||(38823334-38823629)
chr1 (2061-2359)||(47279309-47279613)
chr1 (2063-2359)||(7078818-7079119)
chr1 (2063-2358)||(2959869-2960169)
chr1 (2057-2356)||(3535055-3535350)
chr1 (2057-2359)||(32216175-32216482)
chr1 (2061-2359)||(4330401-4330704)
chr1 (2063-2359)||(8222248-8222549)
chr1 (2063-2359)||(16415766-16416067)
chr1 (2114-2359)||(27227297-27227541)
chr1 (2063-2359)||(46931531-46931831)
chr1 (2116-2359)||(3309267-3309515)
chr1 (2066-2359)||(9902812-9903110)
chr1 (2063-2359)||(34012137-34012433)
chr1 (2061-2359)||(37451405-37451708)
chr1 (2063-2355)||(10181762-10182060)
chr1 (2061-2358)||(14758162-14758455)
chr1 (2063-2359)||(19899523-19899825)
chr1 (2060-2359)||(15383053-15383358)
chr1 (2060-2359)||(10922847-10923151)
chr1 (2064-2359)||(30254543-30254843)
chr1 (2054-2359)||(15168216-15168526)
chr1 (2059-2359)||(27266952-27267255)
chr1 (2062-2359)||(32267154-32267456)
chr1 (2061-2356)||(23999470-23999771)
chr1 (2063-2359)||(47682249-47682550)
chr1 (2066-2359)||(51128979-51129275)
chr1 (2108-2359)||(238319-238569)
chr1 (2062-2350)||(1547408-1547693)
chr1 (2062-2286)||(48353735-48353964)
chr1 (2069-2356)||(27563666-27563958)
chr1 (2111-2359)||(25160752-25161000)
chr1 (2061-2278)||(11742121-11742344)
chr1 (2108-2359)||(28769772-28770023)
chr1 (2063-2359)||(15752149-15752450)
chr1 (2069-2359)||(27763071-27763367)
chr1 (2125-2359)||(30326775-30327008)
chr1 (2063-2359)||(22170831-22171132)
chr1 (2091-2359)||(28564566-28564837)
chr1 (2111-2359)||(42721159-42721403)
chr1 (2116-2359)||(18422771-18423006)
chr1 (2111-2359)||(41926283-41926523)
chr1 (2061-2286)||(1359689-1359919)
chr1 (2087-2359)||(31621327-31621609)
chr1 (2114-2355)||(40884937-40885177)
chr1 (2130-2359)||(37618729-37618948)
chr1 (2075-2231)||(21289847-21290009)
chr1 (2059-2359)||(33725362-33725656)
chr1 (2062-2235)||(31962859-31963039)
chr1 (1895-2045)||(27134014-27134165)
chr1 (2204-2359)||(48620757-48620902)
chr1 (2165-2359)||(38759653-38759846)
chr1 (1837-2024)||(33321218-33321406)
chr1 (2061-2151)||(48620916-48621012)
chr1 (1838-2045)||(4067041-4067247)
chr1 (1850-1943)||(27133830-27133923)
chr1 (1961-2017)||(34535479-34535535)
chr1 (1851-2045)||(49784533-49784726)
chr1 (1839-2045)||(23329296-23329503)
chr1 (1958-2017)||(38208376-38208435)
chr1 (2062-2115)||(38759859-38759912)
chr1 (2299-2359)||(11742348-11742407)
chr1 (1851-1903)||(38208522-38208574)
chr1 (2068-2109)||(10598223-10598264)
chr1 (1837-1945)||(7481184-7481292)
chr1 (2062-2110)||(47555092-47555140)
chr1 (2067-2110)||(5500690-5500733)
chr1 (1839-1912)||(2464205-2464278)
chr1 (1851-1948)||(34535301-34535398)
chr1 (1851-1912)||(49784819-49784880)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (2062-2359)||(4318574-4318883)
chr6 (2061-2359)||(3879696-3879999)
chr6 (2071-2359)||(8513357-8513638)
chr6 (2063-2359)||(6090941-6091243)
chr6 (2068-2359)||(33892776-33893063)
chr6 (2064-2340)||(1945977-1946260)
chr6 (2076-2359)||(29182287-29182573)
chr6 (2062-2356)||(5627518-5627818)
chr6 (2063-2356)||(7234791-7235092)
chr6 (2058-2359)||(20768208-20768512)
chr6 (2108-2359)||(6089032-6089270)
chr6 (2108-2359)||(21016928-21017172)
chr6 (2065-2229)||(7054533-7054704)
chr6 (2205-2359)||(30353265-30353418)
chr6 (2213-2359)||(15491739-15491884)
chr6 (2108-2232)||(33619080-33619207)
chr6 (1838-2045)||(10388380-10388590)
chr6 (1839-2033)||(16434804-16434998)
chr6 (1837-2017)||(67529-67710)
chr6 (2223-2359)||(7055140-7055275)
chr6 (1842-1912)||(3687627-3687697)
chr6 (1836-1948)||(67336-67448)
chr6 (1839-1978)||(10388218-10388358)
chr6 (1835-1939)||(30122812-30122916)
chr6 (1839-1978)||(30847624-30847764)
chr6 (2060-2110)||(6613654-6613704)
chr6 (2063-2115)||(21016726-21016778)
chr6 (2063-2118)||(15491886-15491941)
chr6 (2069-2110)||(4104353-4104394)
chr6 (2064-2110)||(11083823-11083869)
chr6 (2114-2156)||(33724075-33724117)
chr6 (2063-2108)||(25441826-25441871)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (2061-2359)||(8011-8314)
[»] scaffold0002 (5 HSPs)
scaffold0002 (2111-2359)||(408243-408490)
scaffold0002 (2108-2359)||(258-502)
scaffold0002 (2111-2235)||(93915-94038)
scaffold0002 (2261-2359)||(94347-94444)
scaffold0002 (2063-2115)||(690-742)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (2060-2359)||(145772-146077)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (2061-2359)||(44081-44383)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (2061-2359)||(154404-154706)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (2063-2359)||(267408-267701)
[»] scaffold0024 (2 HSPs)
scaffold0024 (1850-2005)||(70764-70920)
scaffold0024 (1875-1948)||(70624-70697)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (972-1198)||(11940-12166)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (2137-2201)||(100996-101058)
scaffold0009 (2063-2115)||(101063-101116)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (1838-1912)||(8708-8782)
scaffold0081 (1990-2043)||(8613-8666)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 389; Significance: 0; HSPs: 111)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1815 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 36012806 - 36012252
Alignment:
Q  1815 tttatattttatattgttttaaatgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaata 1914  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  36012806 tttatatttcatattatgttaaatgagtaaatcactaaattggtctctgtctttgtaccaaattatcaaattgatctctgactctattaataactcaaaa 36012707  T
Q  1915 tgatccccgtctttttcaaacgtttctcaaattgat-cctgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatt 2013  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  36012706 tggtccctgtctttttcaaacgtttctcaaattggttcctgatcttattagttgttttgtattttgagtattaatgactcaatgtcttttgaatattatt 36012607  T
Q  2014 tagtcattaatagcataatgttttttggatctaagcaagataaa-ataaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaag----- 2107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||         
T  36012606 tagtcattaatagcataatgtcttttggatctaagcaagataaatataaagggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaaa 36012507  T
Q  2108 --ttaattttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcgg 2205  Q
      |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  36012506 ttttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcagcattttggacttatcgg 36012407  T
Q  2206 tactattttatcgttggcatctttaacatggaaa-ttgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaaca 2304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36012406 tactattttatcgttggcatctttaacatggaaacaagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtgggatgttacactgaaaaca 36012307  T
Q  2305 aggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36012306 aggtaggataaaaattagattaggtgtattcttgttcatctgatgaattgatgat 36012252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 409 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 36013741 - 36013423
Alignment:
Q  409 ttatgtataactaaggaaaagaagagtgaaccaccatgacactttccttcaaaacaacaagtcctcttaaacacaactcaagtacctcttcaatgtttat 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36013741 ttatgtataactaaggaaaagaagagtgaactaccatgacactttccttcaaaacaagaagtcctcttaaacacaactcaagtacctcttcaatgtttat 36013642  T
Q  509 aattccataaagttgaagctttccttttattcaaaatatgactgaggtgttctttaagagaagtactaaaaaacaatgaaatataggatcaccaatgcaa 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36013641 aattccataaagttgaagctttccttttattcaaaatatgtctgaggtgttctttaagagaagtaataaaaaacaatgaaatataggatcaccaatgcaa 36013542  T
Q  609 gtcaatatcacaaggaaaaggaaaatcaacaaaatggtaagattcataccaacaaaaaataagatccaaaccttgagataaacacattctaagatcttaa 708  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36013541 gtcaatatcacaaggaaaaggaaaatcaacaaaaaggtaagattcataccaacaaaaaataagatccaaaccttgagataaacacattctaagatcttaa 36013442  T
Q  709 aataattttttgattgaaa 727  Q
    |||||||||||||||||||    
T  36013441 aataattttttgattgaaa 36013423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2066 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 33698566 - 33698268
Alignment:
Q  2066 agcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatc 2159  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33698566 agcttctacggtgcatttatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgactgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatc 33698467  T
Q  2160 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcattt 2259  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||      
T  33698466 aatattaattcatctagtaatgcttgcaatatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgccgatatcatgc 33698367  T
Q  2260 gatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33698366 gatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 33698268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 99 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 36014155 - 36013969
Alignment:
Q  99 cataaccaagcataagttggtttcctatttaccaaaaaacaactatacttgttgaagtattcaaacagaaatgcctagaatacgtttcaagttaagctta 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36014155 cataaccaagcataagttggtttcctatttaccaaaaaacaactatacttgttgaagtattcaaacagaaatgccttgaatacgtttcaagttaagctta 36014056  T
Q  199 aagttacaatggtagtactagtactgtttaagtattatcctaaaataaggtaatctaaccatgtgaacaatccaattgttctaatac 285  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36014055 aagttacaatggtagtaccagtactgtttaagtattatcctaaaataaggtaatctaaccatgtgaacaatccaattgttctaatac 36013969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 2064 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 44891912 - 44891612
Alignment:
Q  2064 ggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatga 2157  Q
    |||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44891912 ggagattctacaatgcagtcatcaaactgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 44891813  T
Q  2158 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcat 2257  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||    
T  44891812 tcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgtaggtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgctgatatcat 44891713  T
Q  2258 ttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatg 2357  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  44891712 gtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgattaattgatg 44891614  T
Q  2358 at 2359  Q
    ||    
T  44891613 at 44891612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Original strand, 46297520 - 46297823
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  46297520 aagggagcttctacggtgcagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaa 46297619  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||| ||||||    
T  46297620 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatat 46297719  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||| | |||||  ||| ||||||||    
T  46297720 tatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaagtttgattaagtgtagttttgttaatctaatgaattg 46297818  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  46297819 atgat 46297823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Original strand, 52040680 - 52040983
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  52040680 aagggagcttctacgctgcagtcatacaactgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaa 52040779  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||| ||||||    
T  52040780 tgatcaataatcattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatat 52040879  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
     || |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  52040880 tatgtgatagtcttaagtgttacactatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattg 52040978  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  52040979 atgat 52040983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 26941020 - 26941321
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26941020 gggagcttctacggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaacgcttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 26941119  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||| |||||| |    
T  26941120 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta 26941219  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||    
T  26941220 tatgatagttttaagtgttacactttatgaggtattacgcttataacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaat 26941318  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  26941319 gat 26941321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 2069 - 2359
Target Start/End: Original strand, 7327246 - 7327543
Alignment:
Q  2069 ttctacggtgcagtcataaaactgacttttttg--aaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatca 2160  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  7327246 ttctacggtgcagttatgaaattgacttttttttaaaaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatta 7327345  T
Q  2161 atagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttg 2260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||    
T  7327346 atagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtg 7327445  T
Q  2261 atagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  7327446 atagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacactagaaagaaggtaggataaaaa-taaattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgat 7327543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 32373885 - 32373585
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta--gattcatt---tttaaattgttgattattgattaatga 2157  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||  |||   |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32373885 gggagcttctacggtacagtcgtgaaactgaattttttgaaaaagttaattttaatcttattgatgaattcattttaaattgttgattactgattaatga 32373786  T
Q  2158 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcat 2257  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||    
T  32373785 tcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttgacatctttaatatgcaaacagagttgctgatatcat 32373686  T
Q  2258 ttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatg 2357  Q
     |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  32373685 gtgatagtcttaagtgtcacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatg 32373587  T
Q  2358 at 2359  Q
    ||    
T  32373586 at 32373585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 4015875 - 4015575
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4015875 gggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 4015776  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||  |    
T  4015775 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttaccgttggcatctttaacatgcaaa-caagttgttgatacaa 4015677  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    |  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  | ||||||||||||    
T  4015676 tgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggat-aaaattagactaattatattcttgttaatatgatgaattgat 4015578  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  4015577 gat 4015575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Original strand, 22622476 - 22622779
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattt------taatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||      ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22622476 aagggagcttttacggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaatagttgattactgattaa 22622575  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||  || ||| ||||||    
T  22622576 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacagatttgatgatat 22622675  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
     || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||    
T  22622676 tatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtatgat-aaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattg 22622774  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  22622775 atgat 22622779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 2065 - 2359
Target Start/End: Original strand, 42505837 - 42506136
Alignment:
Q  2065 gagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgat 2158  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||| || |||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42505837 gagcttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgat 42505936  T
Q  2159 caatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatt 2258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    |||| |||||| ||     
T  42505937 caatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatg 42506036  T
Q  2259 tgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatga 2358  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  42506037 tgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatga 42506135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Original strand, 53228910 - 53229213
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||| |||||||||||||      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53228910 aagggagcttctacggtgcagtcaggcaactgatttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaa 53229009  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||     
T  53229010 tgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatac 53229109  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||    
T  53229110 tatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggagttacacttaaaataaggtaggat-aaaattagattaactgtagtcttgttaatctgatgaattg 53229208  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  53229209 atgat 53229213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 2064 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 39283067 - 39282767
Alignment:
Q  2064 ggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatga 2157  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39283067 ggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 39282968  T
Q  2158 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcat 2257  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  | ||||||||||| |||| ||||||||||| | |||   | ||| |||||| ||    
T  39282967 ttaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggatttacagatactattttattgttgacatctttaacaggcaaacatatttgatgatattat 39282868  T
Q  2258 ttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatg 2357  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  39282867 gtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatggatg 39282769  T
Q  2358 at 2359  Q
    ||    
T  39282768 at 39282767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2360
Target Start/End: Complemental strand, 2008355 - 2008047
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgatta--- 2153  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| ||||||       
T  2008355 gggagcttttacggtgcaatcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattactg 2008256  T
Q  2154 ----atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgct 2249  Q
        |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  2008255 attaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgct 2008156  T
Q  2250 gatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatg 2349  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  2008155 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtg-tacacttaaaacgaggtaggat-aaaattagattaagtatattcttgttaatctgatg 2008058  T
Q  2350 aattgatgatg 2360  Q
    |||||||||||    
T  2008057 aattgatgatg 2008047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 21194023 - 21193721
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  21194023 gggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaata 21193924  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||  | |||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  21193923 atcaatagtaattcatttagtaatggttgcaacatcttgaacttacggctactattttatcgtgagaatctttaacatgcaaacagagttgctgatatca 21193824  T
Q  2257 tttgatagtc-ttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    | |||||||| ||||||||||   ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |    
T  21193823 tatgatagtctttaagtgttatcctttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattaa 21193725  T
Q  2356 tgat 2359  Q
    ||||    
T  21193724 tgat 21193721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2356
Target Start/End: Original strand, 33378545 - 33378843
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33378545 gggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttgattattgattaatg 33378644  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||| ||| || |    
T  33378645 atcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgagatta 33378744  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    |  ||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||    
T  33378745 tgcgatagtcttaagtattacacttcttggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 33378843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 2070 - 2356
Target Start/End: Complemental strand, 1090102 - 1089811
Alignment:
Q  2070 tctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaata 2163  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1090102 tctacggtgtagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaata 1090003  T
Q  2164 gtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgata 2263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| | || |||||    
T  1090002 gtaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggattta-atgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatgttatgtgata 1089904  T
Q  2264 gtcttaagtgttacattttgtgggg-tgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||| || ||||  |||||| |||||||    
T  1089903 gtcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagatttaatgtagtcctgttgatctgataaattgat 1089811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2340
Target Start/End: Complemental strand, 25580156 - 25579873
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    |||||| |||||| |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||      | |||||||||||||||||||||   |||||||    
T  25580156 agggagtttctacagtgcagtcttgaaattgacttttttaaaaaagttaatcttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattgcggattaat 25580057  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  25580056 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttagatttataggtacagttttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatc 25579957  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgtt 2340  Q
    || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  25579956 atgtaatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacactaaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtatttttgtt 25579873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 37203486 - 37203182
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  37203486 aagggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaa 37203387  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaa-ttgagttgctgata 2253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||    | ||| |||||    
T  37203386 tgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgatatattggacttacaggtactattttatcattgacatctttaacatacaaacaatatttgatgata 37203287  T
Q  2254 tcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaatt 2353  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||    
T  37203286 ttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgatacactaaaaataaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttatgaatt 37203188  T
Q  2354 gatgat 2359  Q
    ||||||    
T  37203187 gatgat 37203182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 29099764 - 29099470
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgactttttt-gaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  29099764 agggagcttctacggtgcagtcatgaaactgactttttttgaaaaagttaattttaatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaa 29099665  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  29099664 tgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 29099565  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
    ||| ||| |         |||||| |||||||||||||||||| |||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  29099564 catgtgaaa---------gttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcacgat-aaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattg 29099475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 37158125 - 37157822
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  37158125 agggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaat 37158026  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaa-ttgagttgctgatat 2254  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    | ||| ||||||    
T  37158025 gatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgacatattggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatacaaacaatatttgatgatat 37157926  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||| || |||||    
T  37157925 tatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaataaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttataaattg 37157827  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  37157826 atgat 37157822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 2158 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 45174821 - 45174620
Alignment:
Q  2158 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcat 2257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  45174821 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgttactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcat 45174722  T
Q  2258 ttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatg 2357  Q
     | |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  45174721 attatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatg 45174622  T
Q  2358 at 2359  Q
    ||    
T  45174621 at 45174620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 2123 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 34133285 - 34133050
Alignment:
Q  2123 gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttgg 2222  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  34133285 gattcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgg 34133186  T
Q  2223 catctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattag 2322  Q
    ||||||||||||| |||   | ||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  34133185 catctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattat 34133087  T
Q  2323 attaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  34133086 attaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgat 34133050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 3362672 - 3362368
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatt------ttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||      |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3362672 agggagcttctatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 3362573  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||| |||| |     
T  3362572 gatcaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatattggacttctaagtacaattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatgtt 3362473  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagatta--agtgtattcttgttcctctgatgaatt 2353  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||    |||||||||    
T  3362472 atgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgtttcacttaaaataaggtaggat-aaaattagattaatagtgtagtcttgttaacatgatgaatt 3362374  T
Q  2354 gatgat 2359  Q
    ||||||    
T  3362373 gatgat 3362368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 2057 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 11467232 - 11466939
Alignment:
Q  2057 aataaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattga 2150  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||      ||||||||||||||||||||||||        
T  11467232 aatatagggagcttctacggtgcagtcatcaaactgacttttttgaaaaagttaattttattcttaatgattgattcatttttaaattgttgatta---- 11467137  T
Q  2151 ttaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctg 2250  Q
       ||||||||||||||||||||||       |||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||  |||||| ||    
T  11467136 ---atgatcaatagtaattcatcta-------ttgcaacatcttagacttgcaggtactattttgtcgttggtatcttaaacatgcaaacagagttgttg 11467047  T
Q  2251 atatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatga 2350  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11467046 atatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 11466948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Original strand, 14586438 - 14586731
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||      |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  14586438 aagggagcttctatggtgcactcgtgaaactgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaa 14586537  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| ||||||    
T  14586538 tgatcagtagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggactta-ccgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatat 14586636  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
    |||  |         ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14586637 catacg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaagttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattg 14586726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Original strand, 40552017 - 40552320
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40552017 aagggagcttctacggtgcagtctggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaa 40552116  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||| ||||||    
T  40552117 taatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcatggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatat 40552216  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
     || ||| | || |||||||||||  ||||||| |||||| || | |||||| || ||| ||||||| |||||||||| | |||||  ||||||||||||    
T  40552217 tatgtgacaatcctaagtgttacacgttgtgggatgttacgcttataacaagctaagat-aaaattaaattaagtgtagtgttgttaatctgatgaattg 40552315  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  40552316 atgat 40552320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 739 - 1240
Target Start/End: Complemental strand, 36003497 - 36002990
Alignment:
Q  739 tgatgcatcttatgtagaaaccccagctctcagaaaaagacttgcgcgtacaaaatgtttcattgtgttggatgatgtagaaaccttagagcaagcagaa 838  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | |||| |||||||||  ||  |||| |||| | |||||||||||||||   ||||||||||||||  |||    
T  36003497 tgatgcaccttatgtagaaaccccaatttttagaagaagacttgcatgtgaaaaaagtttgactgtgttggatgatgtgacaaccttagagcaagtggaa 36003398  T
Q  839 aatcttaacatag---------gtttgggaccaggtagtatagtcattgtcacaacaagagataagcagatatgtagtcaatttgatggatgcaaagtat 929  Q
    | |||||||||||         |||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||   | |||    
T  36003397 attcttaacatagataatatttgtttgggaccgggtagtagaatcattgtcacaactagagataagcagatatgtaaccaatttaatgaatgtgcaatat 36003298  T
Q  930 acgaggtcaaggaattaagtgaaaatgaatctcttcaactactattcagttggaatgcatttcgagaaaaacatccaaaagttggatacgaagagctctc 1029  Q
    | |||||| ||| ||| |  ||| ||||||||||| |  ||   ||| ||| | | || ||  |||||||| |||||||| |||| ||    |  || ||    
T  36003297 atgaggtcgagggattgaacgaagatgaatctcttgaggta---ttctgtttggaggctttcagagaaaaatatccaaaaattgggtataggggtctatc 36003201  T
Q  1030 aaaaagtgcaattggctattgcagtggcaatcctctcgctttaaaagttttaggtgcaaatcttcgtataaaaagcaaagaagcatgggaaagtgaattg 1129  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36003200 aaaaagagcaattggctattgcggaggcaatcccctggctttaaaagttttaggtgcaaatttccgtacaaaaagcaaagaagcatgggaaagtgaattg 36003101  T
Q  1130 gaaaagataaaagagattccctatgcgggaattcatgatgtgttaaaattgagcttcaatgacttagatcatattcagcgggagatatttctagacattg 1229  Q
    |||||| | ||| |||||||  ||| | |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| || ||| | |||||||||| |||||||||    
T  36003100 gaaaagctcaaaaagattcctaatgggagaattcatgatgtgctaaaattgagtttcgatgacttagatcgtactcaacaggagatatttttagacattg 36003001  T
Q  1230 catgcttcttc 1240  Q
    |||||||||||    
T  36003000 catgcttcttc 36002990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 2108 - 2359
Target Start/End: Original strand, 24488773 - 24489023
Alignment:
Q  2108 ttaattttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggta 2207  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |    
T  24488773 ttaatattaatgtttgattcatttttaaattattgattattgattcatgattaatagtaatgcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttactgaca 24488872  T
Q  2208 ctattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaagg 2307  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  24488873 ctattttattgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttacaccttgtgaggtgttacacttaaaacaatg 24488972  T
Q  2308 taggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24488973 taagat-aaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgat 24489023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 48355357 - 48355056
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||| |||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  48355357 gggagcttctatggtgcagttaggaaattgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgcttactgattaatg 48355258  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || || |||||||||||| |||  |||||| |||||| |    
T  48355257 atcaataataattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacagatactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta 48355158  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  48355157 tgtgatagtcttaagtgttacactttgtggtatgttacatttataacaaggtaggat-aaaattagactaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgat 48355059  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  48355058 gat 48355056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 21009561 - 21009863
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21009561 gggagtttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 21009660  T
Q  2157 atcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   |||| ||||||     
T  21009661 atcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatattgttgatgatatt 21009760  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  || | |||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||   ||||||||||||    
T  21009761 atgtgatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaagttatgat-aaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattga 21009859  T
Q  2356 tgat 2359  Q
    ||||    
T  21009860 tgat 21009863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 2078 - 2359
Target Start/End: Original strand, 24707890 - 24708178
Alignment:
Q  2078 gcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaa------ttttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattca 2171  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||      |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  24707890 gcagtcagaaaattgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattta 24707989  T
Q  2172 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaag 2271  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   | ||| |||||| || |||| || |||||    
T  24707990 tctaataatgcttgcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgattgttttaag 24708089  T
Q  2272 tgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagat--taagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  24708090 tgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggat-aaaattagatcaaaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 24708178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 2067 - 2278
Target Start/End: Original strand, 11357145 - 11357362
Alignment:
Q  2067 gcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatca 2160  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11357145 gcttctacgatgcagtcagacaactgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatca 11357244  T
Q  2161 atagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttg 2260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||| |||||| || ||    
T  11357245 atagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtg 11357344  T
Q  2261 atagtcttaagtgttaca 2278  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11357345 atagtcttaagtgttaca 11357362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 2111 - 2359
Target Start/End: Original strand, 3655013 - 3655263
Alignment:
Q  2111 attttaatgttagattc-atttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcat--ctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggta 2207  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  3655013 attttaatgtttgattttatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtg 3655112  T
Q  2208 ctattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaagg 2307  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||    
T  3655113 ttattttatcgatggaatctttaacatgcaaacagagctgatgatatcatgtgatagttttaagtgttacattttgtggtgtgttacgcttctaacaagg 3655212  T
Q  2308 taggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3655213 taggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 3655263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 128; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 2069 - 2340
Target Start/End: Complemental strand, 54506218 - 54505941
Alignment:
Q  2069 ttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaat 2162  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54506218 ttctacggtgcagtcaggaaattgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaat 54506119  T
Q  2163 agta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttga 2261  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| | |||||| || |||    
T  54506118 agtatattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttataaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagtagatgatattatgtga 54506019  T
Q  2262 tagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgtt 2340  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||  || | ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  54506018 tagtcttaagtgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaaggtatgat-aaaattatattaagtgtagtcttgtt 54505941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 2064 - 2359
Target Start/End: Original strand, 22445826 - 22446125
Alignment:
Q  2064 ggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatt------ttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatga 2157  Q
    ||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||      |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22445826 ggagcttctatagtgcagtcaggaaactgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatatttaaattgttgattactgattaatga 22445925  T
Q  2158 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcat 2257  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||   ||||| |||||| ||    
T  22445926 tcaatagtaattcatccagtaatacttgcaacattttggacttaaaggtactattttatcgttggtatctttaatatgcaaaaatagttgatgatattat 22446025  T
Q  2258 ttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatg 2357  Q
     |||||||||| ||||||| |  |||| | |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||    
T  22446026 atgatagtcttgagtgttatacattgt-gagtgttacacttaaaacaatgtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttatttatatgatgaattgatg 22446123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2356
Target Start/End: Complemental strand, 38592103 - 38591816
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatca 2160  Q
    ||||||||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38592103 aagggagcttcaacggtgcagttaagaaattgacttttttgaaaaagttaatttt-------gattcatttttaaattgttgattactgattaatgatca 38592011  T
Q  2161 atagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttg 2260  Q
    |||||||||  | || ||||||||||||||||||||| |||    |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||| || ||| |||||| || ||    
T  38592010 atagtaatttgtttaataatgcttgcaacatcttggatttacaaatacttttttatcgttgtcatctttgacatgcaaatagatttgatgatattatgtg 38591911  T
Q  2261 atagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  38591910 atagtcttaagtgtcacgttttgtggggtattacacttgaaacaagataggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgat 38591816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 2126 - 2340
Target Start/End: Original strand, 46994490 - 46994703
Alignment:
Q  2126 tcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcat 2225  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| || || ||    
T  46994490 tcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaat 46994589  T
Q  2226 ctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagatt 2325  Q
    ||||| |||| |||   | ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  46994590 ctttagcatgcaaacataattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggcgttacacttataacaaggtaggat-aaaattagatt 46994688  T
Q  2326 aagtgtattcttgtt 2340  Q
    ||||||| |||||||    
T  46994689 aagtgtagtcttgtt 46994703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 2065 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 47481937 - 47481637
Alignment:
Q  2065 gagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgat 2158  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47481937 gagcttctacggtacagtcaggaaattgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgat 47481838  T
Q  2159 caatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcat 2257  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||| |||||  |||||| ||    
T  47481837 caatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaagtactattttatcgttgaaatctttaatatgcaaatagagtttatgatattat 47481738  T
Q  2258 ttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatg 2357  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  || | || ||||||  || ||||||| |||||||||| |||||||    |||||||||||||    
T  47481737 gtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaataaggtataat-aaaattatattaagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatg 47481639  T
Q  2358 at 2359  Q
    ||    
T  47481638 at 47481637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2269
Target Start/End: Original strand, 51212537 - 51212743
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaat 2162  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  51212537 gggagcttctatggtgcagtcagaaaactgacatttttgaaaaagttaattttgatcttaatttcatttttaaattgttgatttttaattaatgatcaat 51212636  T
Q  2163 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgat 2262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||||||||||| |||  |||||| |||||| || ||||    
T  51212637 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgat 51212736  T
Q  2263 agtctta 2269  Q
    || ||||    
T  51212737 agcctta 51212743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 122; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 2111 - 2359
Target Start/End: Original strand, 4761462 - 4761710
Alignment:
Q  2111 attttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtacta 2210  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4761462 attttaatgtttgattcattttcaaattgttgatttctgattaatgattaatagtaattcatctggtaatgtttgcaacattttggacttataggtacta 4761561  T
Q  2211 ttttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgt-ggggtgttacactgaaaacaaggta 2309  Q
    |||||| || || |||||||||||| ||||  ||||| |||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||| | |||||||||    
T  4761562 ttttattgtcggaatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgggggtgttatacttataacaaggta 4761661  T
Q  2310 ggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||    
T  4761662 ggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgat 4761710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 120; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2278
Target Start/End: Complemental strand, 40936390 - 40936168
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||      |||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  40936390 agggagcttctacggtgcggacatcaaattgacttttttgaaaaagttaatttcaatcttaatgattgatttatttttaaattgttgattaccgattaat 40936291  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||    
T  40936290 gatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctaatatc 40936191  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttaca 2278  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  40936190 atgtgatagtcttaagtgttaca 40936168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 2108 - 2359
Target Start/End: Original strand, 44186328 - 44186562
Alignment:
Q  2108 ttaattttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggta 2207  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  44186328 ttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagacttagaggta 44186427  T
Q  2208 ctattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaagg 2307  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| ||||||                ||||||||||||||| | |||||||||    
T  44186428 ctattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatag----------------ttgtggggtgttacatttaaaacaagg 44186511  T
Q  2308 taggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||    
T  44186512 taggat-aaaattagattaagtgtatttttgttaatttgatgaattgatgat 44186562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 115; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 2142 - 2360
Target Start/End: Original strand, 54828546 - 54828763
Alignment:
Q  2142 gattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaatt 2241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| || ||||||||  |||      
T  54828546 gattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatagttggaatttttaacatacaaaca 54828645  T
Q  2242 gagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttc 2341  Q
     ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  54828646 tagttgatgatattatttgatagttttaagtgttacactttgtgggatgttacacttataataaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttc 54828744  T
Q  2342 ctctgatgaattgatgatg 2360  Q
     | ||||||||||||||||    
T  54828745 atatgatgaattgatgatg 54828763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 114; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 2114 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 22451327 - 22451083
Alignment:
Q  2114 ttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattt 2213  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  22451327 ttaatgttcgattcatttttaaatttttgattgctgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattt 22451228  T
Q  2214 tatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggat 2313  Q
    ||| |||| ||||||||||||| |||   ||||| |||||| ||  |||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  22451227 tattgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacgatagtgttaaatgttacacttactggggtgttacacttaaaacaaggtaaggt 22451128  T
Q  2314 aaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
     |||||||||||||||| | |||||||  | |||||||||||||||    
T  22451127 -aaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgat 22451083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 2108 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 29164167 - 29163933
Alignment:
Q  2108 ttaattttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggta 2207  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   |||    
T  29164167 ttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttagacttacaagta 29164075  T
Q  2208 ctattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaagg 2307  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||         ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  29164074 ctattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagg 29163984  T
Q  2308 taggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  29163983 taggat-aaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgat 29163933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 113; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 2167 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 43348563 - 43348372
Alignment:
Q  2167 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtc 2266  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  43348563 attcatttagtaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtc 43348464  T
Q  2267 ttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||||| ||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43348463 ttaagtgtcacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 43348372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 111; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 43975652 - 43975949
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||      |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43975652 gggagtttctacggtgcagtcagaaaactgactcttttgaaaaaattaatcttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatg 43975751  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatgga---aattgagttgctgata 2253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||   ||||| |||||    
T  43975752 atcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacaacatagttgatgata 43975851  T
Q  2254 tcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaatt 2353  Q
    | ||  |||       ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| | | |||||  |||||||||||    
T  43975852 ttatgcgat-------agtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaagataagat-aaaattagattaagtgcaattttgttaatctgatgaatt 43975943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 104; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 1406 - 1709
Target Start/End: Complemental strand, 36023951 - 36023644
Alignment:
Q  1406 catgatttgttggtagaaatgggacgagagattgttaagcaagaatgtcctaaaaaccctggaagcagaagtagattgtgggatcccaaggaaatttatc 1505  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||| |     
T  36023951 catgatttgttagtagaaatgggacgagagattgttaagcaacaatctcctaaaaaccctggaagtagaagtcgattgtgggatcccatggaagtttgtg 36023852  T
Q  1506 aagtatttaaatacaacaaggtaagtagaagactt-aattacttctatatgaaaatgcaagtatatatttgattatgaaatataagcaagataaatatgt 1604  Q
    |   ||| ||||| || ||||||||  || |  || |||| ||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36023851 atacattgaaatataaaaaggtaaggggatggtttcaatttcttctatataaaagtgcatgtgtatatttgattatgaaatataagcaagataaatatgt 36023752  T
Q  1605 atg----atttcacatattattcttctaaattttgtttgtcagggaaccaaagttgttgaagttatacaattcgatatttctgaaattggtgatctatac 1700  Q
    |||    | ||  |  |||||| ||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||   |||||| ||||| |||||| | |||||||||    
T  36023751 atgacaaactttgctaattattattctaaa-tttgttttttagggaaccgaagttgttgaagtcatcatattcgacatttcagaaattagagatctatac 36023653  T
Q  1701 ttgagctct 1709  Q
    |||| ||||    
T  36023652 ttgacctct 36023644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 103; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1839 - 2045
Target Start/End: Original strand, 46163819 - 46164025
Alignment:
Q  1839 gagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtt 1938  Q
    ||||||| ||| || |||||| |||||||| |||||||||| ||| ||| |||   |||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| |||    
T  46163819 gagtaaaccatcaagttggtccctgtctttgtaccaaattctcaatttggtccgcgactctattaataactcaaaatggtccctgtctttgtcaaatgtt 46163918  T
Q  1939 tctcaaattgatcctgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatgttttt 2038  Q
    ||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||    
T  46163919 tctcagattgatcctgactctattaattgttttgtattttgagtgttaatggctcaatgtcttttggatattatttagtagttaatggcataatgtcttt 46164018  T
Q  2039 tggatct 2045  Q
    |||||||    
T  46164019 tggatct 46164025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1881 - 2045
Target Start/End: Original strand, 32808190 - 32808356
Alignment:
Q  1881 caaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtttctcaaattgatc-ctgatc-ctattagttgttttgtatttt 1978  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||    
T  32808190 caaattggtccctgactctattaataactcaaaatgatctctgtctttgtcaaatgtttctcaaattggtctctgacctctattagttgttttgtatttt 32808289  T
Q  1979 gagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatgttttttggatct 2045  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  32808290 gagtgttaatagttcaatgtcttttggatattatttagtggttaatagcataatgtcttttggatct 32808356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 89; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2287
Target Start/End: Original strand, 11356916 - 11357140
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  11356916 aagggagcatctacggtgcagtcagacaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttggattcatttttaaattgttgattactaattaa 11357015  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    |||| ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||| ||||||||  ||   |||||| ||||||    
T  11357016 tgatgaatagtaatt--------aatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcattggcatatttaacatacaaccagagttgatgatat 11357107  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggg 2287  Q
     || |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11357108 tatatgatagtcttgagtgttacactttgtggg 11357140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 2158 - 2359
Target Start/End: Original strand, 11835494 - 11835689
Alignment:
Q  2158 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcat 2257  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||||  ||||      ||| |||| |||||| |||||||||    
T  11835494 tcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttaacatc------atgcaaatagagttgatgatatcat 11835587  T
Q  2258 ttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatg 2357  Q
     |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||| ||||||||    
T  11835588 gtgatagtcttaattgttacactttgtaggttgttacacttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgtatttttgttaatatgataaattgatg 11835687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 87; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 790 - 1241
Target Start/End: Complemental strand, 36024543 - 36024086
Alignment:
Q  790 aaaatgtttcattgtgttggatgatgtagaaaccttagagcaagcagaaaatcttaacataggt---------ttgggaccaggtagtatagtcattgtc 880  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |         || ||||||||||||| ||||||||||    
T  36024543 aaaaagtttaattgtattggatgatgtggcaaccttagagcaagcagaaaatcttaacatagttaataattgcttaggaccaggtagtagagtcattgtc 36024444  T
Q  881 acaacaagagataagcagatatgtagtcaatttgatggatgcaaagtatacgaggtcaaggaattaagtgaaaatgaatctcttcaactactattcagtt 980  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||   | |||| |||||||||  ||| |   || ||||||||||  |  ||   ||| |||    
T  36024443 acaactagagataagcaggtatgtagccaatttaataaatgtgcaatatatgaggtcaagagattgaacaaagatgaatctctcgaggta---ttctgtt 36024347  T
Q  981 ggaatgcatttcgagaaaaacatccaaaagttggatacgaagagctctcaaaaagtgcaattggctattgcagtggcaatcctctcgctttaaaagtttt 1080  Q
     | | || ||  |||||||| |||| ||| |||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || | ||||||||||||    
T  36024346 tggaggctttcagagaaaaatatcctaaaattgggtatggagatctatcaaaaagagcaattggctattgcggaggcaatcccctaggtttaaaagtttt 36024247  T
Q  1081 aggtgcaaatcttcgtataaaaagcaaagaagcatgggaaagtgaattggaaaagataaaagagattccctatgcgggaattcatgatgtgttaaaattg 1180  Q
    |||| ||||| ||||||  |||||||||||||  |||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||| ||    | ||||||||||||||||||||     
T  36024246 aggtacaaattttcgtaccaaaagcaaagaagtgtgggaaagtgaactggaaaagctcaaaaagatacccaatcgaaggattcatgatgtgttaaaatta 36024147  T
Q  1181 agcttcaatgacttagatcatattcagcgggagatatttctagacattgcatgcttcttct 1241  Q
    || ||  |||  ||||||  || ||||| ||| |||||| ||||||| | |||||||||||    
T  36024146 agttttgatggtttagattgtactcagcaggatatatttttagacatagtatgcttcttct 36024086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 86; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 2060 - 2316
Target Start/End: Original strand, 20373020 - 20373263
Alignment:
Q  2060 aaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgatta 2153  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20373020 aaagagagcttctatggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatta 20373119  T
Q  2154 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgata 2253  Q
    ||||||||||||||||||||                   ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  20373120 atgatcaatagtaattcatc-------------------ttggacttatatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgata 20373200  T
Q  2254 tcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaa 2316  Q
    | || ||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||| || | ||||||||||||||||    
T  20373201 ttatgtgatagttttaagtgttacactttatgggatattacgcttataacaaggtaggataaa 20373263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 86; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 2218 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 35844581 - 35844441
Alignment:
Q  2218 gttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaa 2317  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35844581 gttgacatctttaacatggaaacaaagttactgatatcatgtgata-tcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaactaggtaggataaaa 35844483  T
Q  2318 attagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  35844482 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 35844441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 281 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 36013916 - 36013828
Alignment:
Q  281 aatacagaatacagagatcctgaacagaacaaataaagaaaccgagagcatctgagaagaggaaaacattgcaaatgtatctctttttt 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36013916 aatacagaatacagagatcctgaacaggacaaataaagaaaccgagagcatctgagaagaggaaaacattgcaaatttatctctttttt 36013828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1406 - 1587
Target Start/End: Complemental strand, 36002848 - 36002667
Alignment:
Q  1406 catgatttgttggtagaaatgggacgagagattgttaagcaagaatgtcctaaaaaccctggaagcagaagtagattgtgggatcccaaggaaatttatc 1505  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||| || |||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||| | |||     
T  36002848 catgatttgttagtagaaatgggaagagagattgttaggaaagaatctcttaaagaccccggaagtagaagtcgattgtgggatcctaaggaagtgtatg 36002749  T
Q  1506 aagtatttaaatacaacaaggtaagtagaagacttaattacttctatatgaaaatgcaagtatatatttgattatgaaatat 1587  Q
    |  |||| ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  36002748 atttattgaaatataacaaggtaagtcgaaaactcaattacttctattaaaaaatgcatgcatatatttgattatgaaatat 36002667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 77; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 1838 - 2045
Target Start/End: Original strand, 55213965 - 55214172
Alignment:
Q  1838 tgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgt 1937  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||| |  || | |||||||||||||||| ||| ||   |||||| ||||||||    
T  55213965 tgagtaaa-catcaaattagtctctgtctttgtaccaaattttcaaattggtatctgaatctattaataactcaaaatggtcaaggtctttgtcaaacgt 55214063  T
Q  1938 ttctcaaattgatc-ctgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatgttt 2036  Q
    ||||||||||| || | ||  |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |    
T  55214064 ttctcaaattggtctccgactctattagtggttttgcattttgagtgttaatgattcaatgtcttttggatattatttagtggttaataacataatgtct 55214163  T
Q  2037 tttggatct 2045  Q
    |||| ||||    
T  55214164 tttgaatct 55214172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1839 - 2045
Target Start/End: Complemental strand, 45708809 - 45708602
Alignment:
Q  1839 gagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtt 1938  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| |   |||||| || || ||| | |||||||||||| |||  | | |||||| |||||||||    
T  45708809 gagtaaatcattaaattggtccatgtctttgtactaaaattttaaattggtcactgactatgttaataactcaaaatggcctctgtctttgtcaaacgtt 45708710  T
Q  1939 tctcaaattgatc-ctgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatgtttt 2037  Q
     ||||||||| || ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| ||||    
T  45708709 cctcaaattggtctctgactcgattagttgttttgtattttgactgttaatgactcaatgtcttttagatattatttagtcgttaatgacataatttttt 45708610  T
Q  2038 ttggatct 2045  Q
    ||||||||    
T  45708609 ttggatct 45708602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 2114 - 2359
Target Start/End: Original strand, 27480175 - 27480440
Alignment:
Q  2114 ttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttg----caacatcttggacttatcggtact 2209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     ||||| |||||||||   |||||    
T  27480175 ttaatgttcgattcatttttaaattgttgatcgctgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgtttgtaattaacattttggacttacatgtact 27480274  T
Q  2210 attttatcgttggcatctttaacatggaa----attgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattt-----tgt--------ggggtgtt 2292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||    ||  ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||     |||         |||||||    
T  27480275 attttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacacttctgggtgttacacttctgggtgtt 27480374  T
Q  2293 acactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||  | |||||||||||||||    
T  27480375 acacttaaaacaatgtaggat-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgat 27480440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 2219 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 53176308 - 53176169
Alignment:
Q  2219 ttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaa 2318  Q
    ||||||||||  | ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | | ||||  |||| |||| ||||    
T  53176308 ttggcatcttgtatatgtaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttatatttaaaatgaggttggat-aaaa 53176210  T
Q  2319 ttagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  53176209 ttagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgat 53176169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 2111 - 2231
Target Start/End: Complemental strand, 50475180 - 50475053
Alignment:
Q  2111 attttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgat-------caatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatc 2203  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||       ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  50475180 attttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaca 50475081  T
Q  2204 ggtactattttatcgttggcatctttaa 2231  Q
     ||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  50475080 agtattattttatccttgacatctttaa 50475053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1862 - 2045
Target Start/End: Original strand, 3157684 - 3157867
Alignment:
Q  1862 tgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtttctcaaattgatcctgatcctat 1961  Q
    ||||||| |||||||||| ||  ||  ||| ||||||||||||||| | || ||| | |   ||||| ||||| |||||||| || | ||||||  ||||    
T  3157684 tgtctttgtaccaaattctcagtttcgtccataactctattaataatttaaaatggttcttttctttgtcaaatgtttctcagatcggtcctgactctat 3157783  T
Q  1962 tagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatgttttttggatct 2045  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||    
T  3157784 taattgttttttattttgagtgttaatggttcaatgttttttggatattatttagtgattaatgacataatgtcttttggatct 3157867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 1839 - 2015
Target Start/End: Original strand, 33140276 - 33140453
Alignment:
Q  1839 gagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtt 1938  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||| || |||||||  |||||  |  || |||||||||||||||||| |||||    |||||| |||||| ||    
T  33140276 gagtaaatcattaatttggtccatgtctttgtatcaaattcttaaattagtttctgactctattaataactcaaaatgatttttgtctttgtcaaacatt 33140375  T
Q  1939 tctcaaattgatcctgatcct-attagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattattta 2015  Q
    | |||||||| || | | | | ||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  33140376 tttcaaattggtcatcaactttattagttattttgtattttgagtgttaatgtcttaatgtcttttggatattattta 33140453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 971 - 1135
Target Start/End: Complemental strand, 23473166 - 23473002
Alignment:
Q  971 ctattcagttggaatgcatttcgagaaaaacatccaaaagttggatacgaagagctctcaaaaagtgcaattggctattgcagtggcaatcctctcgctt 1070  Q
    |||||||||| |||||| ||  ||| |||||| || ||| ||||||| ||||| || ||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||    
T  23473166 ctattcagtttgaatgccttcggaggaaaacagcctaaaattggatatgaagatctatcagaaagtgtaattgcctattgcaaaggcaatcctctggctt 23473067  T
Q  1071 taaaagttttaggtgcaaatcttcgtataaaaagcaaagaagcatgggaaagtgaattggaaaag 1135  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||   || | ||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  23473066 taaaagttttaggggtaaatctccgctcaagaggcaaagaggcatgggaaaatgaattgaaaaag 23473002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 994 - 1134
Target Start/End: Original strand, 35768773 - 35768913
Alignment:
Q  994 agaaaaacatccaaaagttggatacgaagagctctcaaaaagtgcaattggctattgcagtggcaatcctctcgctttaaaagttttaggtgcaaatctt 1093  Q
    |||||| ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||  |||| ||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| ||||||  ||||    
T  35768773 agaaaagcatcctaaaagtggatatgaagagctctcagaaagtgttattgcctattgcaaaggcaatcctttggctttaaaagttttgggtgcacgtctt 35768872  T
Q  1094 cgtataaaaagcaaagaagcatgggaaagtgaattggaaaa 1134  Q
    |||  || ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  35768873 cgttcaagaagtaaagaagcatggaaaaatgaattggaaaa 35768913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 1837 - 1948
Target Start/End: Complemental strand, 33140647 - 33140536
Alignment:
Q  1837 atgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacg 1936  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||||     
T  33140647 atgagtaaatcactaaattggtccttgtctttgtaccaaatgctcaaattgatctctgactctattaataactcaaaatggtcactgtctttgtcaaaca 33140548  T
Q  1937 tttctcaaattg 1948  Q
    ||||||| ||||    
T  33140547 tttctcagattg 33140536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1876 - 2045
Target Start/End: Original strand, 2051504 - 2051674
Alignment:
Q  1876 attcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtttctcaaattgatcct-gatcctattagttgttttgta 1974  Q
    |||| ||||||| || || ||||| |||||||||||| ||| |||   ||||| |||||||||||||| |||| || | | | |||||||||||||||||    
T  2051504 attctcaaattggtctctgactctgttaataactcaaaatggtccttatctttgtcaaacgtttctcatattggtcattgtttctattagttgttttgta 2051603  T
Q  1975 ttttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatgttttttggatct 2045  Q
    ||||||| ||||||   |||||| ||||| |||| ||||||||  || ||| |||||||| ||||||||||    
T  2051604 ttttgagggttaatggttcaatgccttttagataatatttagtggttgataacataatgtcttttggatct 2051674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 995 - 1135
Target Start/End: Complemental strand, 23454757 - 23454617
Alignment:
Q  995 gaaaaacatccaaaagttggatacgaagagctctcaaaaagtgcaattggctattgcagtggcaatcctctcgctttaaaagttttaggtgcaaatcttc 1094  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||| | |||| ||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||      
T  23454757 gaaaaacatcctaaaattggatatgaagatctatcagagagtgtaattgcctattgcaaaggcaatcctctggctttaaaagttttaggtgctaatctga 23454658  T
Q  1095 gtataaaaagcaaagaagcatgggaaagtgaattggaaaag 1135  Q
    ||  || | ||||||| | |||||||| ||||||| |||||    
T  23454657 gttcaagaggcaaagatgaatgggaaaatgaattgaaaaag 23454617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 993 - 1129
Target Start/End: Complemental strand, 23469225 - 23469089
Alignment:
Q  993 gagaaaaacatccaaaagttggatacgaagagctctcaaaaagtgcaattggctattgcagtggcaatcctctcgctttaaaagttttaggtgcaaatct 1092  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||| | |||| ||||| ||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||     
T  23469225 gagaaaaacatcctaaaattggatatgaagatctatcagagagtgtaattgcctattgcaaaggcaatcctctggctataaaagttttaggtgcaaatcc 23469126  T
Q  1093 tcgtataaaaagcaaagaagcatgggaaagtgaattg 1129  Q
      ||  || |||||| ||||||||||| | |||||||    
T  23469125 gagttcaagaagcaaggaagcatgggacaatgaattg 23469089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1835 - 1978
Target Start/End: Complemental strand, 46164191 - 46164047
Alignment:
Q  1835 aaatgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaa 1934  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| | |||||||| || ||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||| || | |||||| |||||    
T  46164191 aaatgagtaaaccaccaaattggaccctgtctttgtatcaaattctcaaattagtccctgactctattaataactcaaaatggtctctgtctttgtcaaa 46164092  T
Q  1935 cgtttctcaaattgat-cctgatcctattagttgttttgtatttt 1978  Q
    ||||||||| |||| | |||||  ||||||||||| ||| |||||    
T  46164091 cgtttctcatattggtccctgactctattagttgtattgcatttt 46164047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 2271 - 2359
Target Start/End: Original strand, 51212955 - 51213042
Alignment:
Q  2271 gtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||    
T  51212955 gtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggat-aaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgat 51213042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1839 - 2017
Target Start/End: Original strand, 12088989 - 12089168
Alignment:
Q  1839 gagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtt 1938  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||   |||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||| | |  || ||| |||||  ||    
T  12088989 gagtaaatcattaaattggtctatgtttttgtaccaaatttttaaattggtccctgactttattaataattcaaaatggttcatgtatttatcaaaattt 12089088  T
Q  1939 tctcaaattgatcct-gatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagt 2017  Q
    | | | |||  |||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||    
T  12089089 ttttagattagtccccgactctattagttgttttgtattttgagtgttaatggttaaatgtcttttggatattatttagt 12089168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2160 - 2235
Target Start/End: Original strand, 53811597 - 53811672
Alignment:
Q  2160 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatg 2235  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  53811597 aatagtaattcatctaggaatgcctgcaacatcttggacttacgagtattattttatcgttggtatctttaacatg 53811672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1617 - 1714
Target Start/End: Complemental strand, 36002643 - 36002546
Alignment:
Q  1617 attattcttctaaattttgtttgtcagggaaccaaagttgttgaagttatacaattcgatatttctgaaattggtgatctatacttgagctctacttc 1714  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  36002643 attattattttaaattttgtttttcagggaactgaagttgttgaagttatatttttcgatatttgtgactttggggatctatacttgagctctgcttc 36002546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 975 - 1135
Target Start/End: Complemental strand, 23440633 - 23440473
Alignment:
Q  975 tcagttggaatgcatttcgagaaaaacatccaaaagttggatacgaagagctctcaaaaagtgcaattggctattgcagtggcaatcctctcgctttaaa 1074  Q
    |||||| |||||| ||  ||||||||||  | ||| ||||||  ||||| || ||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  23440633 tcagtttgaatgccttcggagaaaaacagtctaaaattggatgtgaagatctatcagaaagtgtaattgcctattgcaaaggcaatcctctggctttaaa 23440534  T
Q  1075 agttttaggtgcaaatcttcgtataaaaagcaaagaagcatgggaaagtgaattggaaaag 1135  Q
    ||||||||| | |||||| ||   || | ||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  23440533 agttttaggggaaaatctccgctcaagaggcaaagaggcatgggaaaatgaattgaaaaag 23440473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1839 - 1978
Target Start/End: Original strand, 26121951 - 26122091
Alignment:
Q  1839 gagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtt 1938  Q
    |||||||| || | ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| ||| ||| |  | |||||| ||||| |||    
T  26121951 gagtaaattatcacattggtcactgtctttataccaaattctcaaattggtccatgactctattaataacacaaaatggtatctgtctttgtcaaatgtt 26122050  T
Q  1939 tctcaaattgatcc-tgatcctattagttgttttgtatttt 1978  Q
    ||| | |||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  26122051 tcttagattggtccatgactctattagttgttttgtatttt 26122091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1839 - 1978
Target Start/End: Original strand, 26244161 - 26244301
Alignment:
Q  1839 gagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtt 1938  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||| || ||||||   |||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| || | |||||| || || |||    
T  26244161 gagtaaattattaaattggttactgtctttgtaacaaatttttaaattgatccatgactctattaataacacaaaatggtctctgtctttgtccaatgtt 26244260  T
Q  1939 tctcaaattgatcc-tgatcctattagttgttttgtatttt 1978  Q
    ||||| |||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  26244261 tctcagattggtccttgactctattagttgttttgtatttt 26244301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1965 - 2045
Target Start/End: Complemental strand, 26245100 - 26245020
Alignment:
Q  1965 ttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatgttttttggatct 2045  Q
    |||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||    
T  26245100 ttgtttcgtattttgaatggtaatgactcaatgtcttttgaatattatttagtggttaatgacataatgttttttggatct 26245020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1839 - 1978
Target Start/End: Complemental strand, 43804256 - 43804116
Alignment:
Q  1839 gagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtt 1938  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||   |||||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||| ||   |||||| ||||| |||    
T  43804256 gagtaaatcatcaaattggtctttgtctttgcaccaaatttttaaattggtccttaactttattaataattcaaaatggtcattgtctttgtcaaatgtt 43804157  T
Q  1939 tctcaaattgatc-ctgatcctattagttgttttgtatttt 1978  Q
    ||||| |||| || ||||  |||||||||||||||||||||    
T  43804156 tctcagattggtctctgaatctattagttgttttgtatttt 43804116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 972 - 1135
Target Start/End: Complemental strand, 23386997 - 23386834
Alignment:
Q  972 tattcagttggaatgcatttcgagaaaaacatccaaaagttggatacgaagagctctcaaaaagtgcaattggctattgcagtggcaatcctctcgcttt 1071  Q
    ||||||||| |||||| ||  |||||||||| || ||| ||||||| |||||  | ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| | |||||    
T  23386997 tattcagtttgaatgccttcggagaaaaacagcctaaaattggatatgaagatatatcagaaagtgtaattgcctattgcagaggcaaccctttggcttt 23386898  T
Q  1072 aaaagttttaggtgcaaatcttcgtataaaaagcaaagaagcatgggaaagtgaattggaaaag 1135  Q
    |||||||||||||  |||||| |||  || | ||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  23386897 aaaagttttaggtaaaaatctccgttcaagaggcaaaaaagtatgggaagatgaattgaaaaag 23386834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 309 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14749898 - 14749833
Alignment:
Q  309 acaaataaagaaaccgagagcatctgagaagaggaaaacattgcaaatgtatctcttttttaacat 374  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  14749898 acaagtaaagaaaccaagagcatccgagaagaggaaaacattgcagatgtctttcttttttaacat 14749833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 2064 - 2134
Target Start/End: Complemental strand, 34133373 - 34133301
Alignment:
Q  2064 ggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta--gattcattttta 2134  Q
    |||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  34133373 ggagcttctaaggtgcagttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattcattttta 34133301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 994 - 1182
Target Start/End: Complemental strand, 23479282 - 23479094
Alignment:
Q  994 agaaaaacatccaaaagttggatacgaagagctctcaaaaagtgcaattggctattgcagtggcaatcctctcgctttaaaagttttaggtgcaaatctt 1093  Q
    ||||||||| || ||| ||||||| ||||| || ||| |||||| ||||| ||||||||  || || ||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  23479282 agaaaaacaacctaaaattggatatgaagatctatcagaaagtgtaattgcctattgcaaaggtaaccctctggcattaaaagttttaggtgcaaatctc 23479183  T
Q  1094 cgtataaaaagcaaagaagcatgggaaagtgaattggaaaagataaaagagattccctatgcgggaattcatgatgtgttaaaattgag 1182  Q
     ||  ||   || ||||||| ||||||| ||||||| ||||| |  || |||||||| ||     ||||||| ||||||||||||||||    
T  23479182 agttcaaggggccaagaagcgtgggaaaatgaattgaaaaagctccaaaagattcccaatcgaaaaattcataatgtgttaaaattgag 23479094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1965 - 2017
Target Start/End: Complemental strand, 26122194 - 26122142
Alignment:
Q  1965 ttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagt 2017  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26122194 ttgtttggtattttgagtggtaatgactcaatgtcttttggatattatttagt 26122142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 994 - 1236
Target Start/End: Complemental strand, 23447993 - 23447751
Alignment:
Q  994 agaaaaacatccaaaagttggatacgaagagctctcaaaaagtgcaattggctattgcagtggcaatcctctcgctttaaaagttttaggtgcaaatctt 1093  Q
    |||||||||||| |||  |||||| ||||| || ||| | |||| ||||| ||||||||  || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  23447993 agaaaaacatcctaaaactggatatgaagatctatcagatagtgtaattgcctattgcaaaggtaaccctctggctttaaaagttttaggtgcaaatctc 23447894  T
Q  1094 cgtataaaaagcaaagaagcatgggaaagtgaattggaaaagataaaagagattccctatgcggga-attcatgatgtgttaaaattgagcttcaatgac 1192  Q
     ||  ||   ||  |||||||||||||| |||| || ||||| |  || |||||||| || ||  | ||| ||||||||||||||||||| |   ||||     
T  23447893 agttcaaggggccgagaagcatgggaaaatgaactgaaaaagctccaaaagattcccaat-cgaaagatttatgatgtgttaaaattgagttatgatgat 23447795  T
Q  1193 ttagatcatattcagcgggagatatttctagacattgcatgctt 1236  Q
    |||||||||  ||||  ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  23447794 ttagatcattgtcagaaggccatatttctagacatcgcatgctt 23447751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2118
Target Start/End: Complemental strand, 35844663 - 35844608
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaat 2118  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35844663 gggagcttttacggtgcagttatgaaattgacttttttgaaaaagttaattttaat 35844608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 993 - 1091
Target Start/End: Complemental strand, 23401766 - 23401668
Alignment:
Q  993 gagaaaaacatccaaaagttggatacgaagagctctcaaaaagtgcaattggctattgcagtggcaatcctctcgctttaaaagttttaggtgcaaatc 1091  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| ||||| || ||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  23401766 gagaaaaacatcctaaaactggatatgaagatctatcagaaagtgtaattgcctattgcaaaggcaatcatctggctataaaagttttaggtgaaaatc 23401668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 993 - 1135
Target Start/End: Complemental strand, 23463981 - 23463839
Alignment:
Q  993 gagaaaaacatccaaaagttggatacgaagagctctcaaaaagtgcaattggctattgcagtggcaatcctctcgctttaaaagttttaggtgcaaatct 1092  Q
    |||||||||| || ||| ||||||| ||||| || ||  |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||||    
T  23463981 gagaaaaacagcctaaaattggatatgaagatctatcggaaagtgtaattgcctattgcagaggcaaccctttggctttaaaagttttaggtaaaaatct 23463882  T
Q  1093 tcgtataaaaagcaaagaagcatgggaaagtgaattggaaaag 1135  Q
     |||  || | ||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  23463881 ccgttcaagaggcaaaaaagtatgggaagatgaattgaaaaag 23463839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 2064 - 2118
Target Start/End: Complemental strand, 45174889 - 45174835
Alignment:
Q  2064 ggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaat 2118  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45174889 ggagcttcttcggtgtagtcatcaaactggcttttttgaaaaagttaattttaat 45174835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 993 - 1084
Target Start/End: Complemental strand, 23405350 - 23405259
Alignment:
Q  993 gagaaaaacatccaaaagttggatacgaagagctctcaaaaagtgcaattggctattgcagtggcaatcctctcgctttaaaagttttaggt 1084  Q
    |||||||||| || ||| ||||||| ||||| || ||  |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  23405350 gagaaaaacagcctaaaattggatatgaagatctatctgaaagtgtaattgcctattgcagaggcaaccctttggctttaaaagttttaggt 23405259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 2067 - 2110
Target Start/End: Original strand, 31706488 - 31706531
Alignment:
Q  2067 gcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagtta 2110  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31706488 gcttcaacggtgcagtcaaaaaactgacttttttgaaaaagtta 31706531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 1862 - 1912
Target Start/End: Complemental strand, 12015121 - 12015071
Alignment:
Q  1862 tgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaa 1912  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12015121 tgtctttgtaccaaattctcaatttgatccccaactctattaataactcaa 12015071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 2301 - 2359
Target Start/End: Original strand, 20373300 - 20373357
Alignment:
Q  2301 aacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||    
T  20373300 aacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgat 20373357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 2068 - 2110
Target Start/End: Original strand, 23165291 - 23165333
Alignment:
Q  2068 cttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagtta 2110  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23165291 cttctacggtgcagtcatgaaattgacttttttgaaaaagtta 23165333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 994 - 1092
Target Start/End: Complemental strand, 23499761 - 23499663
Alignment:
Q  994 agaaaaacatccaaaagttggatacgaagagctctcaaaaagtgcaattggctattgcagtggcaatcctctcgctttaaaagttttaggtgcaaatct 1092  Q
    |||||||||||| |||  |||||| |||||  | ||| | |||| ||||| ||||||||  || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23499761 agaaaaacatcctaaaactggatatgaagatgtatcagatagtgtaattgcctattgcaaaggtaaccctctggctttaaaagttttaggtgcaaatct 23499663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 1839 - 1969
Target Start/End: Complemental strand, 32808523 - 32808390
Alignment:
Q  1839 gagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctatta--ataactcaatatgatccccgtctttttcaaacg 1936  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| ||| |  ||||||||  ||||||||| ||| || |  ||||| |||||||    
T  32808523 gagtaaatcaccaaattggtctctgtctttgtaccaaaatttcaaattggtccttggctctattatgataactcaaaatggtctctatctttgtcaaacg 32808424  T
Q  1937 tttctcaaattgat-cctgatcctattagttgtt 1969  Q
    ||||||| |||| | |||||  ||||||||||||    
T  32808423 tttctcagattggtccctgactctattagttgtt 32808390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 1436 - 1498
Target Start/End: Original strand, 35769176 - 35769238
Alignment:
Q  1436 attgttaagcaagaatgtcctaaaaaccctggaagcagaagtagattgtgggatcccaaggaa 1498  Q
    |||||| | ||||||| ||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35769176 attgttcatcaagaatctcccaaagatcctggaagcagaagtcgattgtgggatcccaaggaa 35769238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 369 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 36013809 - 36013771
Alignment:
Q  369 taacataagatgttcacatgaccttaaaaatcattgaac 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36013809 taacataagatgttcacatgaccttaaaaatcaatgaac 36013771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 36014228 - 36014194
Alignment:
Q  17 atacaccaacaccagtgacctttataattattctt 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36014228 atacaccaacaccagtgacctttataattattctt 36014194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2118
Target Start/End: Complemental strand, 43348633 - 43348575
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgactttttt-gaaaaagttaattttaat 2118  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  43348633 aagggagtttctacggttcagtcataaaattgattttttttgaaaaagttaattttaat 43348575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 2069 - 2110
Target Start/End: Original strand, 53811435 - 53811476
Alignment:
Q  2069 ttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagtta 2110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  53811435 ttctacggtgcagtcagaaaactgactttcttgaaaaagtta 53811476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2299 - 2359
Target Start/End: Original strand, 11357366 - 11357425
Alignment:
Q  2299 aaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  11357366 aaaataaggtaggataaaa-ttagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 11357425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 1625 - 1704
Target Start/End: Complemental strand, 23352026 - 23351947
Alignment:
Q  1625 tctaaattttgtttgtcagggaaccaaagttgttgaagttatacaattcgatatttctgaaattggtgatctatacttga 1704  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||  |||||||| | | ||| |||| |||||||||||||    
T  23352026 tctaatttttgtttgtcagggaactgaagttgtggaaggtataatattcgatagtacagaagttggggatctatacttga 23351947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 993 - 1092
Target Start/End: Complemental strand, 23352641 - 23352542
Alignment:
Q  993 gagaaaaacatccaaaagttggatacgaagagctctcaaaaagtgcaattggctattgcagtggcaatcctctcgctttaaaagttttaggtgcaaatct 1092  Q
    ||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| || ||| || ||| ||||| |||||||   |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  23352641 gagaaaagcatcctaatattggatatgaagatctatcagaacgtgtaattgcctattgccaaggcaatccgctggctttaaaagttttaggtgctaatct 23352542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 1406 - 1559
Target Start/End: Complemental strand, 23454358 - 23454208
Alignment:
Q  1406 catgatttgttggtagaaatgggacgagagattgttaagcaagaatgtcctaaaaaccctggaagcagaagtagattgtgggatcccaaggaaatttatc 1505  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||||   ||||| |||||||| || |  | ||||| | |     
T  23454358 catgatttgttacaagaaatgggacgagagattgttaatcaagaat---ctaagaaccctggaaaacgaagtcgattgtggaatgctgaagaaatatctg 23454262  T
Q  1506 aagtatttaaatacaacaaggtaagtagaagacttaattacttctatatgaaaa 1559  Q
    | ||||| ||| | |||||||||||||||  |   ||||||||| |||||||||    
T  23454261 atgtattgaaaaaaaacaaggtaagtagacaatgcaattacttccatatgaaaa 23454208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2065 - 2115
Target Start/End: Complemental strand, 13498731 - 13498681
Alignment:
Q  2065 gagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt 2115  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  13498731 gagcttctacagtgtagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaatttt 13498681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 800 - 845
Target Start/End: Complemental strand, 23499961 - 23499916
Alignment:
Q  800 attgtgttggatgatgtagaaaccttagagcaagcagaaaatctta 845  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  23499961 attgtgttggatggtgtagaaaccttagagcaaatagaagatctta 23499916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 301; Significance: 1e-168; HSPs: 66)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 772 - 1366
Target Start/End: Complemental strand, 16122679 - 16122088
Alignment:
Q  772 aaaaagacttgcgcgtacaaaatgtttcattgtgttggatgatgtagaaaccttagagcaagcagaaaatcttaacataggtttgggaccaggtagtata 871  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||| |    
T  16122679 aaaaagacttgaacgtgcaaaatgtttgattgtgttggacgatgttgcaaccttagagcaagcagaaaatctaaagattggtctgggaccaggtagtaga 16122580  T
Q  872 gtcattgtcacaacaagagataagcagatatgtagtcaatttgatggatgcaaagtatacgaggtcaaggaattaagtgaaaatgaatctcttcaactac 971  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||  ||||||||| ||||     |||   ||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||     
T  16122579 gtcattgtcacaacaagagatagccaaatatgtcatcaatttgaaggatttgtggtacgtgaggtcaagaaattgaatgaagatgaatctcttcaacta- 16122481  T
Q  972 tattcagttggaatgcatttcgagaaaaacatccaaaagttggatacgaagagctctcaaaaagtgcaattggctattgcagtggcaatcctctcgcttt 1071  Q
      |||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  16122480 --ttcagttgtaatgcatttcaagaaaaacatgctaaagaaggatacgaagagctctcaaaaagtgcaattggatattgcagaggcaatcctctagcttt 16122383  T
Q  1072 aaaagttttaggtgcaaatcttcgtataaaaagcaaagaagcatgggaaagtgaattggaaaagataaaagagattccctatgcgggaattcatgatgtg 1171  Q
     |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16122382 gaaagttttaggtgcgaatctttgtgcaaaaagcaaagaagcatgggaaagtgaattggaaaagataaaagagattccttatgcaggaattcatgatgtg 16122283  T
Q  1172 ttaaaattgagcttcaatgacttagatcatattcagcgggagatatttctagacattgcatgcttcttctgcccaaaaataaatgaatttgcttgttata 1271  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| || ||| || || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16122282 ttaaaattgagtttctatgacttagatcgtactcaacgtgacatatttctagacattgcctgcttcttctacccaacaataaatgaatttgattgttata 16122183  T
Q  1272 gtcagggagaatacatgatagatctatttaatgcttgcgaattttatccggcaactgggatagaagtccttctgcataaagcactcataactttt 1366  Q
      ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||   |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  16122182 cacagcgagaatacataatagatctatttaatgcttgtaaattttatccagcaacttcaatagaagtccttcttcataaatcactcatgactttt 16122088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 736 - 1366
Target Start/End: Original strand, 16336485 - 16337112
Alignment:
Q  736 tcttgatgcatcttatgtagaaaccccagctctcagaaaaagacttgcgcgtacaaaatgtttcattgtgttggatgatgtagaaaccttagagcaagca 835  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||||| || ||| |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  16336485 tcttgatgcgccttattttgaaaccccaactttcaaaaaaagacttgaacgtgcaaaatgtttgattgtgttggacgatgttgcaaccttagagcaagca 16336584  T
Q  836 gaaaatcttaacataggtttgggaccaggtagtatagtcattgtcacaacaagagataagcagatatgtagtcaatttgatggatgcaaagtatacgagg 935  Q
    |||||||| || || ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||  ||||||||| ||||     ||||| ||||    
T  16336585 gaaaatctaaagatcggtctgggactaggtagtagagtcattgtcacaacaagagataggaaaatatgtcatcaatttgaaggatttgtggtatatgagg 16336684  T
Q  936 tcaaggaattaagtgaaaatgaatctcttcaactactattcagttggaatgcatttcgagaaaaacatccaaaagttggatacgaagagctctcaaaaag 1035  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||| |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16336685 tcaaggaattgaatgaagatgaatctcttcaacta---ttctgttgtaatgcatttcaagaaaaacatgctaaagaaggatacgaagagctctcaaaaag 16336781  T
Q  1036 tgcaattggctattgcagtggcaatcctctcgctttaaaagttttaggtgcaaatcttcgtataaaaagcaaagaagcatgggaaagtgaattggaaaag 1135  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16336782 tgcaattggatattgcagaggcaatcctctagctttgaaagttttaggtgcgaattttcgtgcaaaaagcaaagaagcatgtgaaagtgaattggaaaag 16336881  T
Q  1136 ataaaagagattccctatgcgggaattcatgatgtgttaaaattgagcttcaatgacttagatcatattcagcgggagatatttctagacattgcatgct 1235  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||| || || ||||||||||||||||| ||||    
T  16336882 ataaaagagattccttatgcaggaattcatgatgtgttaaaactgagtttctatgacttagatcgtactcaacgtgacatatttctagacattgcctgct 16336981  T
Q  1236 tcttctgcccaaaaataaatgaatttgcttgttatagtcagggagaatacatgatagatctatttaatgcttgcgaattttatccggcaactgggataga 1335  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||  ||||||| | | | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||    
T  16336982 tcttctacccaaaaataaatcacttttattgttatggacggcgagaatacataatagatctatttaatgcttgcaaattttatccggcaacttcaataga 16337081  T
Q  1336 agtccttctgcataaagcactcataactttt 1366  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  16337082 agtccttcttcataaatcactcatgactttt 16337112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 41961265 - 41960964
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41961265 gggagcttctacggtgcagtcaggaaactgaattttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 41961166  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||| |||||| |    
T  41961165 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatatta 41961066  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  41961065 tgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 41960967  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  41960966 gat 41960964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 2068 - 2340
Target Start/End: Original strand, 33709015 - 33709292
Alignment:
Q  2068 cttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaa------ttttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaa 2161  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||      |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33709015 cttctacggtgcagtcatgatactgaattttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaa 33709114  T
Q  2162 tagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttga 2261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  ||    
T  33709115 tagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaagtactattttatcattgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcga 33709214  T
Q  2262 tagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgtt 2340  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  33709215 tagtcttaagtgtgacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagcgtattcttgtt 33709292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2359
Target Start/End: Original strand, 27349730 - 27350018
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaa-tgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatca 2160  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27349730 agggagcttctacagtgcagtcatgaaactgacttttctgaaaaagttaattttaaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatca 27349829  T
Q  2161 atagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttg 2260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||| || |||  ||||| |||||||||| ||    
T  27349830 atagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttggaatctttaacttgcaaacagagttcctgatatcatgtg 27349929  T
Q  2261 atagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
             ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27349930 ---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 27350018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 2065 - 2359
Target Start/End: Original strand, 31570514 - 31570813
Alignment:
Q  2065 gagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgat 2158  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||      |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  31570514 gagcttctacactgcagtcatgaaactgactttttttaaaaagttaattttcattttaatgattgattcatttttaaatatttgattactgattaatgat 31570613  T
Q  2159 caatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatt 2258  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||     
T  31570614 caatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacagagttgttgatatcatg 31570713  T
Q  2259 tgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatga 2358  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  31570714 tgacagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattcatga 31570812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Original strand, 18494057 - 18494359
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18494057 aagggagcttatacggtgtagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaa 18494156  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| | ||||||    
T  18494157 tgatcaatagcaattcatctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtcgttgatat 18494256  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
    ||| |||||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  18494257 catgtgatagtcttaagtgtgactctttgtgaggt-ttacacttaatacaaggtaggat-aaaattagatcaagtgtattctagtgaatctgatgaattg 18494354  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  18494355 atgat 18494359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 4167348 - 4167046
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgttag------attcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  4167348 agggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcat 4167249  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||| ||||||||||||  |||   ||||| ||||||     
T  4167248 gattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatatt 4167149  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||     
T  4167148 atgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgt 4167050  T
Q  2356 tgat 2359  Q
    ||||    
T  4167049 tgat 4167046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 2065 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 44914090 - 44913787
Alignment:
Q  2065 gagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgat 2158  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  44914090 gagcttctacggtgcagtcagcaaactggtttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgat 44913991  T
Q  2159 caatagtaattcat---ctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
     |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||     
T  44913990 taatagtaattcattttctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatatt 44913891  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgt-ggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  44913890 atgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggggtgttacacttaaaacaatgtatgat-aaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattg 44913792  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  44913791 atgat 44913787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 2064 - 2359
Target Start/End: Original strand, 43648024 - 43648324
Alignment:
Q  2064 ggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattt------taatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatga 2157  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43648024 ggagcttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 43648123  T
Q  2158 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcat 2257  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||   || ||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||| |||||| ||    
T  43648124 tcaatagtaattcatctagtaatgtttgcgacatcttggacttacaagtgctattttatcgttgaaatctttaacatggaaacaaagttgatgatattat 43648223  T
Q  2258 ttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatg 2357  Q
     |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||    
T  43648224 gtgatagtcttaagtgttatactttgtgtggtgttacacttataacaaggtatgat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatg 43648322  T
Q  2358 at 2359  Q
    ||    
T  43648323 at 43648324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 2065 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 3177362 - 3177063
Alignment:
Q  2065 gagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagtta------attttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgat 2158  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| | ||| |||||    
T  3177362 gagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttattttcaaattgttgattacttattcatgat 3177263  T
Q  2159 caatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatt 2258  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||   ||||| |||||| ||     
T  3177262 aaatagtaattcatctagtaatgcttgtaatatcttggacttacatgtactattttatagttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatg 3177163  T
Q  2259 tgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatga 2358  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  3177162 tgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagat-aaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatga 3177064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 2130 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 4478717 - 4478493
Alignment:
Q  2130 ttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatcttt 2229  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  4478717 ttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgatactattttatcattggcatcttt 4478618  T
Q  2230 aacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagt 2329  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4478617 aacatggaaacagagttggtgatatcatgtgatagacttaagtgttacacttt-----gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagt 4478523  T
Q  2330 gtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4478522 gtattcttgttaatctgatgaattgatgat 4478493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 2055 - 2356
Target Start/End: Complemental strand, 4764065 - 4763758
Alignment:
Q  2055 aaaataaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaa-gttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattat 2147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||  ||||| |||||||||      |||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  4764065 aaaataaagggagcttctacggtgcagtaaggaaactgactttttaaaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattac 4763966  T
Q  2148 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttg 2247  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  || |||    
T  4763965 tgattaatgatcaatagtaattcaactagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaaaagaattg 4763866  T
Q  2248 ctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctga 2347  Q
     |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||  |||||    
T  4763865 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgctacacttgaaacaaggtagaat-aaaattagattaagtgtagttttgttaatctga 4763767  T
Q  2348 tgaattgat 2356  Q
    |||||||||    
T  4763766 tgaattgat 4763758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Original strand, 33660153 - 33660447
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaa------ttttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||      |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33660153 aagggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttctgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaa 33660252  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||    
T  33660253 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctcagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatat 33660352  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
    ||| ||          |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  33660353 catgtg---------ggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcctgttaatctaatgaattg 33660442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 19424420 - 19424707
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19424420 gggagcttctacggtgcagtcatcaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 19424519  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||              |||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  19424520 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcaggtactat--------------ctttaacatgcaaacagagttgctgatatca 19424605  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  19424606 tgtgatagtcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagat-aaaattagattaagcgtattcttgttaatctgatgaattgat 19424704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2340
Target Start/End: Original strand, 2325154 - 2325438
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||      |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  2325154 aagggagcttctacggtgcagtcagaaaattgattttttttaaaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaa 2325253  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||   | ||| ||||||    
T  2325254 taatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatat 2325353  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgtt 2340  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  2325354 tatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgtt 2325438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Original strand, 11366156 - 11366460
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11366156 aagggagcatctacggtgcagtcagaaaattgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaa 11366255  T
Q  2155 tgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgata 2253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  11366256 tgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgata 11366355  T
Q  2254 tcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaatt 2353  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||   | | |||||| || ||| ||||||| ||||| |||| |||||||   ||||||||||    
T  11366356 ttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgtttagaacaagatatgat-aaaattatattaaatgtagtcttgttaacctgatgaatt 11366454  T
Q  2354 gatgat 2359  Q
    ||||||    
T  11366455 gatgat 11366460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2356
Target Start/End: Complemental strand, 26358003 - 26357704
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    |||||||||||||  |||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26358003 agggagcttctacattgcagttagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 26357904  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||   | ||| | ||||     
T  26357903 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaaatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacacatttgataatatt 26357804  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||  | |||||||||||    
T  26357803 atgtgatagttttaagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtgatcttgttaatatgatgaattga 26357705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2357
Target Start/End: Complemental strand, 35959317 - 35959023
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35959317 gggagcttctacggtgcactcaaaaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 35959218  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||   ||||| |||||| |    
T  35959217 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacat----gtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 35959122  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||  |||||| |||||||| | |||||||  | ||||||||||||    
T  35959121 tgtgatagtcttaactgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggat--aaattatattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgat 35959024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 2129 - 2356
Target Start/End: Original strand, 4263926 - 4264153
Alignment:
Q  2129 tttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctt 2228  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  4263926 tttttaaattgttgattactgatcaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttatatgtactattttattgttggcatctt 4264025  T
Q  2229 taacatggaaattgagttgctgatatcat-ttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaa 2327  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4264026 taacatgcaaacagagttgctgatatcatgttgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaaacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaa 4264124  T
Q  2328 gtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    |||||||||| ||  | ||||||||||||    
T  4264125 gtgtattcttcttaatatgatgaattgat 4264153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2278
Target Start/End: Original strand, 7006715 - 7006937
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaat------gttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7006715 aagggagct-ctacggtgcaatcatgaaaatgacttttttgaaaaagttaattttaatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaa 7006813  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  7006814 tgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 7006913  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttaca 2278  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||    
T  7006914 catgtgatattcttaagtgttaca 7006937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 19289101 - 19289402
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||  |||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  19289101 gggagcttctatggtgcagttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttaatttctgattaatg 19289200  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||| || || |||||||||||| | |  |||||| |||||| |    
T  19289201 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtattattttattgtcggaatctttaacatgcacacagagttgatgatatta 19289300  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | | ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||||||| |||||    
T  19289301 tgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacatttataacaatgtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatgagttgat 19289399  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  19289400 gat 19289402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 41465928 - 41465625
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  41465928 aagggagtttatatggtgcagttagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcaattttaaattgttgattgctgattaa 41465829  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   | ||| ||||||    
T  41465828 tgatcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacataattgatgatat 41465729  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
     ||  ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||  | ||||||   ||| ||||||||    
T  41465728 tatgcgatagtcttaagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtagaat-aaaattagattaagttcagtcttgtgaatctaatgaattg 41465630  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  41465629 atgat 41465625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 2082 - 2359
Target Start/End: Original strand, 43770645 - 43770918
Alignment:
Q  2082 tcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatcta 2175  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  43770645 tcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctaattaatgatcaatagaaattcatcta 43770744  T
Q  2176 gtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgtt 2275  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||         ||||||    
T  43770745 gtaatgcttgcaacatcttgaacttaaagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtg---------agtgtt 43770835  T
Q  2276 acattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43770836 acactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcaggat-aaaattaaattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgat 43770918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 2177 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 36642293 - 36642110
Alignment:
Q  2177 taatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgtta 2276  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  36642293 taatgcttgcaacatcttgaacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctggtatcatgtgatagtcttaagtgtta 36642194  T
Q  2277 cattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggata-aaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  36642193 cactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgat 36642110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 2069 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 13711878 - 13711588
Alignment:
Q  2069 ttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaat 2162  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||| | |      ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  13711878 ttctacggtgcagttataaaattgtcttttttgaaaaaattaattttaatttaaatgattgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaat 13711779  T
Q  2163 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgat 2262  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| | ||    
T  13711778 agtaattcatctagtattgtttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgctggcatctttaacatgcatacagagttgctgatatcatgtcat 13711679  T
Q  2263 agtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||||| | ||| | ||| |||||||||||||| |||||| | |      ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13711678 agtcttaactattatactttatggggtgttacacttaaaacatgat------aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 13711588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 29241923 - 29242217
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatt------ttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||| |||||||||||      |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29241923 gggagcttctatggtgcagtcaggaaactgaactttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatg 29242022  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
     ||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||   |||||| |||||| |    
T  29242023 ttcaatagtaattcatctagtaattc-------atcttggacttacaggtactattgtatcgttgacatctttaacatacaaccagagttgatgatatta 29242115  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||    
T  29242116 tgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgat 29242214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 2066 - 2359
Target Start/End: Original strand, 39167150 - 39167442
Alignment:
Q  2066 agcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgttag------attcatttttaaattgttgattattgattaatgatc 2159  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||     
T  39167150 agcttctactgtgcaatcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgttttattcatttttaaattgttgattactgattcataatt 39167249  T
Q  2160 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcattt 2259  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||  |||||| |||||| || |    
T  39167250 aatagtaattcatctagtaatgctagcaacaatttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgatgatattatgt 39167349  T
Q  2260 gatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||      ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  39167350 gatagt------tgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtataat-aaaattagaataagtgtattcttgttactctaatgaattgatgat 39167442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 31862278 - 31861976
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    |||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| || |||      ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  31862278 agggagcttctatggtgcagtcgggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactgattaat 31862179  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||   |||||||||||| || || ||| |||||||| |||  || ||| ||||||     
T  31862178 gatcaatagtaattcatctagtaatgtctacaatatcttggacttacaagtactattttattgtcggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatatt 31862079  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    || ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| ||| | | |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  31862078 atgtgataattttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaatgtatg-ttaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattga 31861980  T
Q  2356 tgat 2359  Q
    ||||    
T  31861979 tgat 31861976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 2148 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 44286283 - 44286073
Alignment:
Q  2148 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttg 2247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||   |||||    
T  44286283 tgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttagcatatttaacatgcaaacaaagttg 44286184  T
Q  2248 ctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctga 2347  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  44286183 ttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaat-aaaattagattaagtgtattattgttaatctga 44286085  T
Q  2348 tgaattgatgat 2359  Q
    |||||| |||||    
T  44286084 tgaatttatgat 44286073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 2111 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 37906082 - 37905832
Alignment:
Q  2111 attttaatgttagatt-catttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtact 2209  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   ||  |    
T  37906082 attttaatgtttgatttcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaattcttgcaacatcttggacttacatgtgtt 37905983  T
Q  2210 attttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgt--ggggtgttacactgaaaacaagg 2307  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||  |||||  |||||| ||  |||||| |||||||||||| |||||  |||||||||| || | |||||||    
T  37905982 attttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttaatgatattatgcgatagttttaagtgttacactttgtggggggtgttacgcttataacaagg 37905883  T
Q  2308 taggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37905882 taggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 37905832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2359
Target Start/End: Original strand, 33550759 - 33551065
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaa-gttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||  ||||| |||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  33550759 agggagcttctacagtgctgtcagaaaactgaatttttaaaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactggttaa 33550858  T
Q  2155 tga----tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctg 2250  Q
    | |    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||   ||||| ||    
T  33550859 taaataatcaatagttattcatctagtaatgcttgcaacatattggactttcaagtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatg 33550958  T
Q  2251 atatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatga 2350  Q
    |||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  33550959 atattatacg-tagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaacgtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 33551056  T
Q  2351 attgatgat 2359  Q
    |||||||||    
T  33551057 attgatgat 33551065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2287
Target Start/End: Original strand, 19500693 - 19500923
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattt-----taatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||| | | |||     |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19500693 aagggatcttctatggtgcagtcaaaaaatt-acttttttgaaaaaataattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 19500791  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||| | ||||     
T  19500792 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaaattacatgtactattttatcgttaacatctttaacatgtaaatagagttgataatatt 19500891  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggg 2287  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500892 atgtgatagtcttaagtgttacattttgtggg 19500923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 2108 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 5881903 - 5881663
Alignment:
Q  2108 ttaattttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggta 2207  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||    
T  5881903 ttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgaataatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgta 5881804  T
Q  2208 ctattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaagg 2307  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| |||   | ||| ||||||||| ||         ||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  5881803 ctattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaaattgttgatatcatgtg---------agtgttacactttgtgaggtattacacttaaaacaagg 5881713  T
Q  2308 taggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    || |||  |||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  5881712 tatgat--aaattagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgat 5881663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 2143 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 19314186 - 19313975
Alignment:
Q  2143 attattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcg---gtactattttatcgttggcatctttaacatggaaa 2239  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     |||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  19314186 attactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttataacatgtactattttatcgctgacatctttaacatgcaaa 19314087  T
Q  2240 ttgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgt 2339  Q
       ||||||||||||||| |||||||       |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  19314086 catagttgctgatatcatgtgatagt-------gttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagggt-aaaattcgattaagtgtattcttgt 19313995  T
Q  2340 tcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |  |||||||||||||||||    
T  19313994 taatctgatgaattgatgat 19313975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 2188 - 2359
Target Start/End: Original strand, 17071646 - 17071816
Alignment:
Q  2188 acatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggg 2287  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   | ||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17071646 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 17071745  T
Q  2288 gtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  17071746 gtgttacgcttaaaataaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 17071816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 2177 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 45328025 - 45327844
Alignment:
Q  2177 taatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgtta 2276  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||  |||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  45328025 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgcgatagtcttatgtgtta 45327926  T
Q  2277 cattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    || ||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    
T  45327925 cactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 45327844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1406 - 1548
Target Start/End: Complemental strand, 16122063 - 16121921
Alignment:
Q  1406 catgatttgttggtagaaatgggacgagagattgttaagcaagaatgtcctaaaaaccctggaagcagaagtagattgtgggatcccaaggaaatttatc 1505  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||  |||||| |||||||||||||| ||  |||||||     
T  16122063 catgatttggtcgtagaaatgggacgagagattgttaagcaagaagctccgaaagaccccggaaaaagaagtcgattgtgggatcccgagttaatttatg 16121964  T
Q  1506 aagtatttaaatacaacaaggtaagtagaagacttaattactt 1548  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16121963 aagtatttaaatacaacaaggtaagtggaagacttaattactt 16121921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1406 - 1548
Target Start/End: Original strand, 16337137 - 16337279
Alignment:
Q  1406 catgatttgttggtagaaatgggacgagagattgttaagcaagaatgtcctaaaaaccctggaagcagaagtagattgtgggatcccaaggaaatttatc 1505  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||  |||||| |||||||||||||| ||  |||||||     
T  16337137 catgatttggtcgtagaaatgggacgagagattgttaagcaagaagctccgaaagaccccggaaaaagaagtcgattgtgggatcccgagttaatttatg 16337236  T
Q  1506 aagtatttaaatacaacaaggtaagtagaagacttaattactt 1548  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16337237 aagtatttaaatacaacaaggtaagtggaagacttaattactt 16337279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 2206 - 2340
Target Start/End: Original strand, 18258214 - 18258347
Alignment:
Q  2206 tactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaa 2305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||    
T  18258214 tactattttatcgttgggatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacacttaaaaaaa 18258313  T
Q  2306 ggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgtt 2340  Q
     ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18258314 tgtaggat-aaaattagattaagtttattcttgtt 18258347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 1837 - 2045
Target Start/End: Original strand, 29469513 - 29469724
Alignment:
Q  1837 atgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacg 1936  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| |    
T  29469513 atgagtaaatctcgaaattggtctctgcctttgtaccaaattctcaaattggtcattgactctattaataactcaaaatggtcgctgtctttgtcaaatg 29469612  T
Q  1937 tttctcaaattgatcc---tgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatg 2033  Q
    ||||||| |||  |||   |||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||    
T  29469613 tttctcagattagtccccctgactctattaattgttttgtattttgagtgttaatgactcaatgtcttttggatattatttagtggttaatgacataatg 29469712  T
Q  2034 ttttttggatct 2045  Q
    | |||| |||||    
T  29469713 tcttttcgatct 29469724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 2108 - 2235
Target Start/End: Original strand, 41051129 - 41051255
Alignment:
Q  2108 ttaattttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggta 2207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  ||||    
T  41051129 ttaattttaatgtttgattcatttttgaattgttgattattgattaatgatcaataacaattcatctagcaatgcttacaacatcttgaacttacaggta 41051228  T
Q  2208 ctattttatcgttggcatctttaacatg 2235  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41051229 ctattttatccttggcat-tttaacatg 41051255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 2188 - 2359
Target Start/End: Original strand, 17054005 - 17054175
Alignment:
Q  2188 acatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggg 2287  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||   | ||| |||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17054005 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaacctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtnttaagtgttacactttgtggg 17054104  T
Q  2288 gtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||    
T  17054105 gtgttacgcttaaaataaggtaggat-aaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgat 17054175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1840 - 2045
Target Start/End: Complemental strand, 36937870 - 36937664
Alignment:
Q  1840 agtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgttt 1939  Q
    |||||| ||| ||||||||   ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| | ||||||||||||||| || ||| || | |||||| | ||| ||||    
T  36937870 agtaaaccatcaaattggttcttgtctttgtaccaaattctcaatttggtccttgactctattaataactgaaaatggtctctgtctttgtgaaatgttt 36937771  T
Q  1940 ctcaaattgatcc-tgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatgttttt 2038  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||  |||||  |||||||  |||    
T  36937770 ctcaaattgatccctgactctattagttgttttgtattttgagtgttaatgactcagtatcttttagatattatttagtggttaatgacataatgccttt 36937671  T
Q  2039 tggatct 2045  Q
    |||||||    
T  36937670 tggatct 36937664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 2208 - 2359
Target Start/End: Original strand, 41463779 - 41463929
Alignment:
Q  2208 ctattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaagg 2307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |    
T  41463779 ctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaaatgttacattttgtgaggtgttacaattaaaacaaag 41463878  T
Q  2308 taggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    || ||| ||||||| |||||  |||||||||||  | |||||||||||||||    
T  41463879 tatgat-aaaattatattaaaagtattcttgttaatatgatgaattgatgat 41463929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2194
Target Start/End: Original strand, 18257316 - 18257453
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgttag------attcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||       ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  18257316 gggagtttatacggtgcagttatcaaactgacttttgtgaaaaagttaattttaatattaataatttattcattttaaaattgtcgattactgattaatg 18257415  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 2194  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257416 ataaataataattcatctagtaatgcttgcaacatctt 18257453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1708
Target Start/End: Original strand, 16337367 - 16337513
Alignment:
Q  1565 gtatatatttgattatgaaatataagcaagataaatatgtatga----tttcacatattattcttctaaattttgtttgtcagggaaccaaagttgttga 1660  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||  |  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||  | | ||||||    
T  16337367 gtatataattgattatgaaatataagcaagataaatatgtatgacaacctttgctaattattattcaaaattttgttt-tcagggaactgatgctgttga 16337465  T
Q  1661 agttatacaattcgatatttctgaaattggtgatctatacttgagctc 1708  Q
    |||||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16337466 agttatactatttgatacttctaaaattggtgatgtatacttgagctc 16337513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1836 - 2017
Target Start/End: Original strand, 26407398 - 26407580
Alignment:
Q  1836 aatgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaac 1935  Q
    ||||||||| |||  || ||||||  ||||||| |||||||||  ||||||| |  |  |||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||    
T  26407398 aatgagtaagtcacgaatttggtccatgtctttgtaccaaattttcaaattggtttcagactctattaataactcaaaatggtccctgtctttgtcaaac 26407497  T
Q  1936 gtttctcaaattgatcctgatc-ctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagt 2017  Q
     ||||||| |||| |||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  26407498 ttttctcagattggtccatgtctctattagttgatttgtattttgagtgttaatggttcaatatcttttgaatattatttagt 26407580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 2108 - 2201
Target Start/End: Original strand, 41463419 - 41463512
Alignment:
Q  2108 ttaattttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta 2201  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||    
T  41463419 ttaatcttaatgattgattcatttttaaattattaattattgattaatgatcaatagtaatttatctattaatgtttacaacatcttagactta 41463512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 2064 - 2179
Target Start/End: Complemental strand, 33902439 - 33902317
Alignment:
Q  2064 ggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaa-gttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||      |||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||     
T  33902439 ggagcttctacggtgcaatcagaaaactaactttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattacagattaata 33902340  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaa 2179  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  33902339 atcaataataattcatctagtaa 33902317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2144
Target Start/End: Complemental strand, 45328116 - 45328028
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatt------ttaatgttagattcatttttaaattgttgat 2144  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||      |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45328116 aagggagcttctacggtgcagtcagaaa-ctgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgat 45328028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1958 - 2045
Target Start/End: Original strand, 29166824 - 29166911
Alignment:
Q  1958 ctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatgttttttggatct 2045  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||| | ||||||  ||||||||||    
T  29166824 ctattagttgttttgtatttcgagtgttaatgacttaatgtcttttgaatattatttagtggttaatggtataatgccttttggatct 29166911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 2229 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 33902319 - 33902190
Alignment:
Q  2229 taacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaag 2328  Q
    |||||||||||  |||||  |||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||     
T  33902319 taacatggaaacagagttaatgatattatgtgatactattaagtgttacactttgtggggtgctacccttaaaacaaggtaggat-aaaattcgattaaa 33902221  T
Q  2329 tgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    | || |||||||  ||||||||| |||||||    
T  33902220 tatagtcttgttaatctgatgaactgatgat 33902190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1847 - 2039
Target Start/End: Original strand, 25961089 - 25961282
Alignment:
Q  1847 cattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtttctcaaat 1946  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||  ||| ||  ||||| |||| | ||||||||||||||| || ||| |||| || ||| |||||||||||||| ||    
T  25961089 cattaaattggtccctgactttgtattaaaatcttaaatttatccatgactctattaataacttaaaatggtccctgtttttatcaaacgtttctcatat 25961188  T
Q  1947 tgatcct-gatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatgtttttt 2039  Q
    |  || | ||  |||||| |||||||||| | | |||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||  |||||  |||||||||||||    
T  25961189 tagtctttgactctattaattgttttgtactgtaagtgttaatggctcaatgttttttagatattatttagtggttaatgacataatgtttttt 25961282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1838 - 1978
Target Start/End: Complemental strand, 26407771 - 26407630
Alignment:
Q  1838 tgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgt 1937  Q
    |||||||||||| || || ||| |||||||| |||||||||  || |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| |||| |||||| |||| | |    
T  26407771 tgagtaaatcatcaatttagtccctgtctttgtaccaaattttcatattggtccctgactctattaataattcaaaatggtccctgtctttgtcaatcat 26407672  T
Q  1938 ttctcaaattgatcc-tgatcctattagttgttttgtatttt 1978  Q
    || |||  ||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  26407671 ttttcatgttgatccttgactctattagttgttttgtatttt 26407630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1617 - 1708
Target Start/End: Complemental strand, 16121745 - 16121655
Alignment:
Q  1617 attattcttctaaattttgtttgtcagggaaccaaagttgttgaagttatacaattcgatatttctgaaattggtgatctatacttgagctc 1708  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||  | | |||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16121745 attattattcaaaattttgttt-tcagggaactgatgctgttgaagttatactatttgatacttctaaaattggtgatgtatacttgagctc 16121655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 2055 - 2108
Target Start/End: Complemental strand, 7565683 - 7565630
Alignment:
Q  2055 aaaataaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagt 2108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  7565683 aaaattaagggagcttctacggtgcagtcaaaaaaatgacttttttaaaaaagt 7565630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1839 - 1912
Target Start/End: Complemental strand, 30786520 - 30786447
Alignment:
Q  1839 gagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaa 1912  Q
    ||||||| ||| |||||| ||| ||||||| ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30786520 gagtaaaccatcaaattgatctttgtctttgtaccaaactttcaaattgatccctgactctattaataactcaa 30786447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2118
Target Start/End: Complemental strand, 36642363 - 36642306
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaat 2118  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36642363 aagggagcttctatggtgcattcatgaaattgacttttttgaaaaagctaattttaat 36642306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1608
Target Start/End: Complemental strand, 16121835 - 16121792
Alignment:
Q  1565 gtatatatttgattatgaaatataagcaagataaatatgtatga 1608  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16121835 gtatataattgatgatgaaatataagcaagataaatatgtatga 16121792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 2067 - 2114
Target Start/End: Complemental strand, 19093834 - 19093787
Alignment:
Q  2067 gcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattt 2114  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19093834 gcttctacggtgcagtcaaaaaattgacttttttaaaaaagttaattt 19093787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2118
Target Start/End: Original strand, 4263686 - 4263742
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaat 2118  Q
    |||||| ||||||| | ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4263686 agggagtttctacgatacagtcatgaaactgattttttttaaaaagttaattttaat 4263742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2299 - 2359
Target Start/End: Original strand, 7006941 - 7007000
Alignment:
Q  2299 aaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||    
T  7006941 aaaacaaggtatgataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatcttataaattgatgat 7007000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 2067 - 2110
Target Start/End: Complemental strand, 6178154 - 6178111
Alignment:
Q  2067 gcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagtta 2110  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  6178154 gcttctacggtgcagtcaaaaaactgacttttttagaaaagtta 6178111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 1838 - 1913
Target Start/End: Original strand, 36937503 - 36937578
Alignment:
Q  1838 tgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaat 1913  Q
    |||||||| ||  ||||| ||| || ||||| |||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  36937503 tgagtaaaccaccaaattagtccctatctttgtaccaaattctcaaattggtctctgactctattaataactcaat 36937578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2110
Target Start/End: Original strand, 18514394 - 18514443
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagtta 2110  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  18514394 aagggggcttctacggtggagtcaggaaactgaattttttgaaaaagtta 18514443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 197; Significance: 1e-106; HSPs: 75)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2055 - 2359
Target Start/End: Original strand, 15612511 - 15612821
Alignment:
Q  2055 aaaataaa-gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattat 2147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||      ||||||||||||||||||||||||     
T  15612511 aaaataaatgggagcttctacggtgcagtcatgaaactgactttttttaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattac 15612610  T
Q  2148 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttg 2247  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  15612611 tgattaatgatcaacaataattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttg 15612710  T
Q  2248 ctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctga 2347  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  15612711 ctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattaaattaagtgtattcttgttaatctga 15612809  T
Q  2348 tgaattgatgat 2359  Q
    ||||||||||||    
T  15612810 tgaattgatgat 15612821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 6546919 - 6546618
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6546919 gggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 6546820  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||    
T  6546819 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcctcatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatca 6546720  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | ||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6546719 tgtgataatattaagtgttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgat 6546621  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  6546620 gat 6546618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 2066 - 2353
Target Start/End: Original strand, 9355590 - 9355882
Alignment:
Q  2066 agcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattt------taatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatc 2159  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9355590 agcttctatggtgcaggcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatc 9355689  T
Q  2160 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcattt 2259  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||| || |    
T  9355690 aatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgt 9355789  T
Q  2260 gatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaatt 2353  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  9355790 gatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-gaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 9355882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 18797729 - 18797426
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    |||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18797729 aagggagcttttatgatgcagtcagaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaa 18797630  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||||||||||| |||  |||||| ||||||    
T  18797629 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatat 18797530  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||    
T  18797529 tatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttataacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttg 18797431  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  18797430 atgat 18797426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 15672518 - 15672824
Alignment:
Q  2063 gggagcttctac--ggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaa------tgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  15672518 gggagcttctacagggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaaattaattttaaccttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgatgca 15672617  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactatt---ttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctga 2251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||    
T  15672618 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattattttatcgttggcatctttaacattcaaatagagttgatga 15672717  T
Q  2252 tatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaa 2351  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15672718 tattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaa 15672816  T
Q  2352 ttgatgat 2359  Q
    ||||||||    
T  15672817 ttgatgat 15672824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2065 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 24212140 - 24211840
Alignment:
Q  2065 gagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgat 2158  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24212140 gagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgat 24212041  T
Q  2159 caatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcat 2257  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| |||||| ||    
T  24212040 caatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattat 24211941  T
Q  2258 ttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatg 2357  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  24211940 gtgatagtcttaggtgttacactttgtaggatgttacacttagaacaaggtatgat-aaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatg 24211842  T
Q  2358 at 2359  Q
    ||    
T  24211841 at 24211840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2064 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 32432851 - 32432551
Alignment:
Q  2064 ggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatga 2157  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32432851 ggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttacttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattcatga 32432752  T
Q  2158 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcat 2257  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  | |||| |||||| ||    
T  32432751 ttaataataattcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagtgttgatgatattat 32432652  T
Q  2258 ttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatg 2357  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  32432651 gtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggat-aaaattatattaactgtattcttgttagtctgatgaattgatg 32432553  T
Q  2358 at 2359  Q
    ||    
T  32432552 at 32432551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 2056 - 2339
Target Start/End: Original strand, 26587846 - 26588126
Alignment:
Q  2056 aaataaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattg 2149  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  26587846 aaataaagggagcttctacggcgcaatcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactg 26587945  T
Q  2150 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgct 2249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||        |||||| |    
T  26587946 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcctgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaaca--------gagttgtt 26588037  T
Q  2250 gatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgt 2339  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26588038 gatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgt 26588126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 8861686 - 8861384
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgttag------attcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8861686 agggagcttcaacggtgcagtgatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttagtgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 8861587  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  8861586 gatcaatagtatttcatctagtaatgcatgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaagagagttgctgatatc 8861487  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    || |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||||| ||||||    
T  8861486 atgtgatggtcttgagtgttacactttgcggggtgttacacttaaaataaggtaggat-aaaattagattaaatgtattgttgttaatctgattaattga 8861388  T
Q  2356 tgat 2359  Q
    ||||    
T  8861387 tgat 8861384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 21992028 - 21991735
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| ||||        
T  21992028 agggagcttctacggtgtaatcatgaaactgacttttttgaaaaggttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgat---- 21991933  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   |||||||||||||    
T  21991932 gatcaatagtaattcatct-----tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatc 21991838  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21991837 atgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattga 21991739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 2069 - 2359
Target Start/End: Original strand, 31578831 - 31579126
Alignment:
Q  2069 ttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaat 2162  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31578831 ttctatggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttattgtttgattcatttttaaattattgattattgattaatgatcaat 31578930  T
Q  2163 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgat 2262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| |||||| || ||||    
T  31578931 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgat 31579030  T
Q  2263 agtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  31579031 agtcttaagtgttacactttatagggtgttatacttataacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 31579126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 30055929 - 30055626
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||| || |||      |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30055929 aagggagcttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaa 30055830  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    |||| ||||||    
T  30055829 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatat 30055730  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || | | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||     
T  30055729 tatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttatagcaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatta 30055631  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  30055630 atgat 30055626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 10358975 - 10359277
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10358975 gggagcttctacggtgcagttaagaaactaacttttttgaaaaagttaattttgatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 10359074  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||  |||||| || | | |    
T  10359075 atcaatagtaaatcatttagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactaatttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgttgtta 10359174  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattaga-ttaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  10359175 tgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgat-aaaattagatttaagtgtagtcttgttgatctgatgaattga 10359273  T
Q  2356 tgat 2359  Q
    ||||    
T  10359274 tgat 10359277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 37110274 - 37109971
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37110274 gggagcttctacggtgcagtcaagaaattgatttttttggaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 37110175  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||||| |||||| |    
T  37110174 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta 37110075  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaagg--taggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||  |||||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  37110074 tgtggtagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtataggat-aaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattg 37109976  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  37109975 atgat 37109971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 17842345 - 17842648
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaa------ttttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||      |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17842345 gggagcttctacggtgcagtcaagaaattgacttttttggaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 17842444  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||||| |||||| |    
T  17842445 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta 17842544  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaagg--taggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||| |||||| || | |||||||  |||||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  17842545 tgtggtagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacgcttataacaaggtataggat-aaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattg 17842643  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  17842644 atgat 17842648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2309
Target Start/End: Complemental strand, 35353508 - 35353256
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35353508 gggagcttctaaggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatg 35353409  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||||| |    
T  35353408 atcaatagtgattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatatagttgatgatatta 35353309  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggta 2309  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  35353308 tgagatagtcttaagtgttacattttctggggtgttacacttaaaacaaggta 35353256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2350
Target Start/End: Original strand, 37703258 - 37703551
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||      ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37703258 agggagcttctatggtgcagtcagtaaattgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaat 37703357  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||| ||||||     
T  37703358 gatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt 37703457  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatga 2350  Q
    || ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| ||| || ||| |||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||    
T  37703458 atgtgatagtcttaagtggtacactttgtgggatgttacacttaaaataagatatgat-aaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatga 37703551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 2095 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 22687599 - 22687338
Alignment:
Q  2095 ttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 2188  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22687599 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtatgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctattaatgcttgcaa 22687500  T
Q  2189 catcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtgggg 2288  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||        |||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22687499 catcttggacttacatgtactattttatcgttggcatccttaaca--------gagttgttgatatcatgagatagtcttgagtgttacactttgtgggg 22687408  T
Q  2289 tgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  22687407 tgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattattgttaatctgatgaattgatgat 22687338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 5657241 - 5657543
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgttagat-------tcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||       ||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  5657241 gggagcttctacaatgcagttatgaaactgacatttttgaaaaagttaattttaatctttaatgatttattcatttttaaatttttgattactcattaat 5657340  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||    
T  5657341 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgctgatatc 5657440  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    ||  ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||  | |||||||||||    
T  5657441 atgcgatagtcttaagtattacactttgtgggctgttacacttaaaacaaagtaggat-aaaattaaattaagtgtatttttgttaatatgatgaattga 5657539  T
Q  2356 tgat 2359  Q
    ||||    
T  5657540 tgat 5657543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 2066 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 23111589 - 23111289
Alignment:
Q  2066 agcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatc 2159  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||      |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  23111589 agcttctacggtacagtcagaaaactgacttttttaaaaaagttaactttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatttatgatc 23111490  T
Q  2160 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcattt 2259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||   |||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||||| |||||| || |    
T  23111489 aatagtaattcttctagtaatgctttcaacatctttgatttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgt 23111390  T
Q  2260 gatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggata-aaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatga 2358  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  23111389 gatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaagtatgatataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatga 23111290  T
Q  2359 t 2359  Q
    |    
T  23111289 t 23111289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 44599068 - 44598765
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta--gattcatt---tttaaattgttgattatt---gatt 2152  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||  |||| |||   ||||||||||||||||||   ||||    
T  44599068 aagggagtttctacggtgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaaattaattttaatcttaacgattgattcattttaaattgttgattattattgatt 44598969  T
Q  2153 aatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgat 2252  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||| ||||    
T  44598968 aatgatcaatagt--ttcatctagtaatgcttgtaacatcttagacttacatgtattattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgttgat 44598871  T
Q  2253 atcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaat 2352  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  44598870 atcatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaat-aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaat 44598772  T
Q  2353 tgatgat 2359  Q
    | |||||    
T  44598771 ttatgat 44598765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 2075 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 10481993 - 10481704
Alignment:
Q  2075 ggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgttag------attcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaat 2168  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||       ||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  10481993 ggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttaatttatttttaaattgttaattactgattaacgatcaatagtaat 10481894  T
Q  2169 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtctt 2268  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||  |||||| |||||| || ||||||||||    
T  10481893 tcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacggatactattttattgttggaatctttgacatgcaaagagagttgatgatattatgtgatagtctt 10481794  T
Q  2269 aagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  10481793 aagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagat-aaaattagattaagcgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 10481704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 2064 - 2356
Target Start/End: Complemental strand, 27284145 - 27283846
Alignment:
Q  2064 ggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaag-------ttaattttaatgttagattc-atttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||  |||||       || ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27284145 ggagcttctacggtgcagtcaggaaattgactttttttgaaaagattaattttgattttaatgtttgattttatttttaaattattgattactgattaat 27284046  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   ||||| | ||||     
T  27284045 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgataatatt 27283946  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||  |||||| ||||||    
T  27283945 atgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggat-aaaattagattaagtatagtcttgttaatctgataaattga 27283847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 4583320 - 4583018
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgttag------attcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  4583320 agggagcttctacggtgcagccagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgatgactgattcat 4583221  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    || ||||| ||||||| ||||||||||||  |||   ||||| ||||||     
T  4583220 gattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattatttgatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatatt 4583121  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||     
T  4583120 atgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggat-aaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgt 4583022  T
Q  2356 tgat 2359  Q
    ||||    
T  4583021 tgat 4583018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2356
Target Start/End: Original strand, 48928058 - 48928356
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| ||||||||      |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48928058 gggagcttctacggtgcagttagaaaattgacttttttaaaaaaattaattttgatctaaatgttcgatttatttttaaattgttgattgttgattaatg 48928157  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||   ||||| |||||| |    
T  48928158 atcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatatta 48928257  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    |  ||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||    
T  48928258 tgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaacaatgtaggat-aaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgat 48928356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 7335193 - 7334893
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||      |||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  7335193 gggagcttctatggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattattgatttctgattaatg 7335094  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| || || |||||||||||  ||| | ||||| |||||| |    
T  7335093 attaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttattgtcggaatctttaacattcaaact-agttgatgatatta 7334995  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |||||    
T  7334994 tctgataatcttaagtgttacactctgtggggtgttacacttataacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaagctgatgagttgat 7334896  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  7334895 gat 7334893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2278
Target Start/End: Complemental strand, 26980707 - 26980485
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||      ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26980707 agggagcttctaaggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattaccgattaat 26980608  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26980607 gatcaacaataattcatctagtaatacttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgctgatatc 26980508  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttaca 2278  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  26980507 atgtgatagtcttaagtgttaca 26980485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 41764839 - 41765140
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||| |||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||| |||||||||      |||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41764839 gggagtttctacggtggagtcgggaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatg 41764938  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||| |    
T  41764939 atcaataataattcatccagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 41765038  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||    
T  41765039 tgtgatagtcttaagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggta-gagtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 41765137  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  41765138 gat 41765140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 2111 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 11071549 - 11071305
Alignment:
Q  2111 attttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtacta 2210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||    
T  11071549 attttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaggtatta 11071450  T
Q  2211 ttttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtag 2310  Q
    |||||||||||   |||||||||||  ||   ||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  11071449 ttttatcgttg---tctttaacatgcgaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtag 11071353  T
Q  2311 gataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||||||||||||||||    
T  11071352 gat-aaaattagattaagcgtagtgttgttaatctgatgaattgatgat 11071305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 134; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 2114 - 2359
Target Start/End: Original strand, 32820871 - 32821115
Alignment:
Q  2114 ttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattt 2213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||    
T  32820871 ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatgaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattt 32820970  T
Q  2214 tatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggat 2313  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||  |||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  32820971 tatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggat 32821070  T
Q  2314 aaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
     |||| || ||||| |||| |||||||  ||| |||||||||||||    
T  32821071 -aaaactaaattaactgtagtcttgttaatctaatgaattgatgat 32821115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 2108 - 2356
Target Start/End: Original strand, 25691356 - 25691603
Alignment:
Q  2108 ttaattttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggta 2207  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||   ||     
T  25691356 ttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacattttgaacttacatgtg 25691455  T
Q  2208 ctattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaagg 2307  Q
     ||||||||||||  |||||||||| || |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25691456 ttattttatcgttaacatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaataagg 25691555  T
Q  2308 taggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||  | ||||||||||||    
T  25691556 taggat-aaaattagattaaatgtatttttgttaatatgatgaattgat 25691603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2278
Target Start/End: Original strand, 31520500 - 31520723
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatt------ttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||      |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  31520500 aagggagcttctatggtgcagttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaa 31520599  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  31520600 tgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatat 31520699  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttaca 2278  Q
     || ||||||||||||||||||||    
T  31520700 tatgtgatagtcttaagtgttaca 31520723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 29173922 - 29173639
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  29173922 gggagcttctacgatgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatg 29173823  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||| |||||| |    
T  29173822 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatatta 29173724  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | ||||||||||||                 |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  29173723 tgtgatagtcttaa-----------------gtgtaacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttagtttgatgaattgat 29173642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 2126 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 12166074 - 12165851
Alignment:
Q  2126 tcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcat 2225  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  12166074 tcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgtcat 12165975  T
Q  2226 ctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagatt 2325  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| || ||         ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  12165974 ctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaat-aaaattagatt 12165885  T
Q  2326 aagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12165884 aagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 12165851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 2087 - 2332
Target Start/End: Complemental strand, 37347397 - 37347148
Alignment:
Q  2087 aaactgacttttttgaaaaagttaatt------ttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 2180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||      |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37347397 aaactgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaat 37347298  T
Q  2181 gcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacatt 2280  Q
    |||||||| ||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  37347297 gcttgcaatatcttggacttacagatactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacact 37347198  T
Q  2281 ttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgta 2332  Q
    |||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37347197 ttgtggagt-ttacacttaaaacaatgtatgat-aaaattagattaagtgta 37347148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 2151 - 2359
Target Start/End: Original strand, 33688117 - 33688324
Alignment:
Q  2151 ttaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctg 2250  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||||| || |||  |||||||||    
T  33688117 ttaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctg 33688216  T
Q  2251 atatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatga 2350  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  33688217 atatcatatgatagtcttgaatgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaagtatgat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 33688315  T
Q  2351 attgatgat 2359  Q
    |||||||||    
T  33688316 attgatgat 33688324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 2078 - 2350
Target Start/End: Original strand, 46480905 - 46481182
Alignment:
Q  2078 gcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatt------ttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattca 2171  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46480905 gcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgttttatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattca 46481004  T
Q  2172 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaag 2271  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||  |||||| || |||||||||||||    
T  46481005 tctagtaatgtttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttaatgatattatgtgatagtcttaag 46481104  T
Q  2272 tgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatga 2350  Q
    ||||||| ||| || | ||||||||| ||||||| |||| || ||||||| || |||| || |||||||  ||||||||    
T  46481105 tgttacactttatgagatgttacacttaaaacaatgtagaat-aaaattacatcaagtatagtcttgttaatctgatga 46481182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 2108 - 2340
Target Start/End: Complemental strand, 43925444 - 43925219
Alignment:
Q  2108 ttaattttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggta 2207  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||    
T  43925444 ttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggac------gta 43925351  T
Q  2208 ctattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaagg 2307  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| || |||| || |||||| ||| |  ||||| |||||| |||| |||||||||    
T  43925350 ttattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgattgtattaagtattaaacgttgtgaggtgttgcacttaaaacaagg 43925251  T
Q  2308 taggataaaaattagattaagtgtattcttgtt 2340  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  43925250 tatgat-aaaattagattaagtgtattattgtt 43925219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 2060 - 2252
Target Start/End: Complemental strand, 37704585 - 37704387
Alignment:
Q  2060 aaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaat------tttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgatta 2153  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||  ||||      ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  37704585 aaagggagcttttatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaaactaatcttgattttaatgtttgattcatttgtaaattgttgattactaatta 37704486  T
Q  2154 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgat 2252  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  37704485 atgatcaatagtaattcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgat 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 2167 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 43686330 - 43686139
Alignment:
Q  2167 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtc 2266  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||| ||||||||||||  |||   ||||| |||||| || |||||||     
T  43686330 attcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtt 43686231  T
Q  2267 ttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  43686230 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgat 43686139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2278
Target Start/End: Original strand, 12390410 - 12390629
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||      ||||||   ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  12390410 gggagcttctacggtgaagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttatttcatttttaaattgtcaattactgattaatg 12390509  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| |    
T  12390510 ataaatagtaattcatctagtaatggttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatgcaagctgagttgatgatatta 12390609  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttaca 2278  Q
    | ||  ||||||||||||||||    
T  12390610 tgtg--agtcttaagtgttaca 12390629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 2186 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 38258816 - 38258644
Alignment:
Q  2186 caacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtg 2285  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   ||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  38258816 caacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 38258717  T
Q  2286 gggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    
T  38258716 gggtgttacgcttataacaaggtaggat-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 38258644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 2066 - 2265
Target Start/End: Original strand, 44411304 - 44411509
Alignment:
Q  2066 agcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatt------ttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatc 2159  Q
    ||||| || ||||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||||      ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  44411304 agcttatatggtgcagtcaggaaactaacttttttggaaaggttaattatgatcttaatgtttcattcatttttaaattgttgattactgattaatggtc 44411403  T
Q  2160 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcattt 2259  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||| || |    
T  44411404 aatattaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagataatattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgt 44411503  T
Q  2260 gatagt 2265  Q
    ||||||    
T  44411504 gatagt 44411509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 2091 - 2278
Target Start/End: Original strand, 32592996 - 32593188
Alignment:
Q  2091 tgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 2184  Q
    |||||||||||||||||||||||||      ||||||  ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||    
T  32592996 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttt-aaattgttgattgctgattaatgatccatagtaatttatctagtaatattt 32593094  T
Q  2185 gcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttaca 2278  Q
    | |||||||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||   ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  32593095 gtaacatcttggacttacatgtactattttaacgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttaca 32593188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1831 - 2032
Target Start/End: Complemental strand, 33190258 - 33190056
Alignment:
Q  1831 ttttaaatgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtcttttt 1930  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||| | ||||||| || ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||| || | |||||| |    
T  33190258 ttttaaatgagtaaactatcgaattggtttatgtctttatatcaaattttcaatttgatccctgactctattaataattcaaaatggtctctgtctttgt 33190159  T
Q  1931 caaacgtttctcaaattgatc-ctgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcat 2029  Q
     ||| |||||||| |||| || ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  33190158 taaatgtttctcagattggtctctgactctattagttgttttgtattttaagtgttaatgtctcaatgtcttttggatattatttagtggttaatggcat 33190059  T
Q  2030 aat 2032  Q
    |||    
T  33190058 aat 33190056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2169
Target Start/End: Complemental strand, 38258979 - 38258867
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38258979 gggagcttctacggtgcagtcagaaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 38258880  T
Q  2157 atcaatagtaatt 2169  Q
    |||||||||||||    
T  38258879 atcaatagtaatt 38258867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 2227 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 37704387 - 37704256
Alignment:
Q  2227 tttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagatta 2326  Q
    ||||||||| |||  |||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  37704387 tttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattaaatta 37704289  T
Q  2327 agtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||| |||||||  |||||| ||||||||||    
T  37704288 agtgtagtcttgttaatctgataaattgatgat 37704256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 2113 - 2257
Target Start/End: Original strand, 34361995 - 34362141
Alignment:
Q  2113 tttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactatt 2212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  | |||||||    
T  34361995 tttaatgtttgattcatttttaaattgttaatgactgattaatgatcaaaagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactatt 34362094  T
Q  2213 ttatcgttggcatctttaacatggaa--attgagttgctgatatcat 2257  Q
    |||||||||  || ||||||||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  34362095 ttatcgttgatatttttaacatgcaaacagagagttgctgatatcat 34362141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 2229 - 2359
Target Start/End: Original strand, 27421313 - 27421442
Alignment:
Q  2229 taacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaag 2328  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  27421313 taacatgcaaacagagttgctgatatcatacgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtaggat-aaaattagattaag 27421411  T
Q  2329 tgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| |||||    
T  27421412 tgtattcttgttaatctgataaatttatgat 27421442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1839 - 2017
Target Start/End: Complemental strand, 47426 - 47247
Alignment:
Q  1839 gagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtt 1938  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||   |||||| ||  |  ||||||||||||||||| |||||| | |||||| || ||| ||    
T  47426 gagtaaattattaaattggtctctatctttgtaccaaattattaaattggtctttgtctctattaataactcaaaatgatctctgtctttgtcgaacatt 47327  T
Q  1939 tctcaaattgatcc-tgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagt 2017  Q
    | ||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  47326 tttcagattggtccctgattctattagttgttttgtattttgagtgttaacggctcaatatcttttgaatattatttagt 47247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 1835 - 2045
Target Start/End: Original strand, 35315838 - 35316049
Alignment:
Q  1835 aaatgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaa 1934  Q
    ||||||||||| ||  |||||  |||||| |||| |||||||||  ||| | | ||||| |||||||||||||||||| ||  ||   |||||| |||||    
T  35315838 aaatgagtaaaccaccaaattaatctctgcctttgtaccaaattgtcaattcggtccctgactctattaataactcaaaatagtctatgtctttgtcaaa 35315937  T
Q  1935 cgtttctcaaattgatcc-tgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatg 2033  Q
     |||||||| |||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||    
T  35315938 tgtttctcagattgctccctgactctattagttgttttgtattttgagtgttattgacccaatgtcttttggatattttttagtggttaatgacataatg 35316037  T
Q  2034 ttttttggatct 2045  Q
      ||||||||||    
T  35316038 ccttttggatct 35316049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 2167 - 2278
Target Start/End: Complemental strand, 38053751 - 38053640
Alignment:
Q  2167 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtc 2266  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||| |||||| || ||||||||    
T  38053751 attcatcaaataatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgttggaatctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 38053652  T
Q  2267 ttaagtgttaca 2278  Q
    ||||||||||||    
T  38053651 ttaagtgttaca 38053640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 2205 - 2356
Target Start/End: Original strand, 48928473 - 48928623
Alignment:
Q  2205 gtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaaca 2304  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||| |||||| ||  ||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| |||| |    
T  48928473 gtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaata 48928572  T
Q  2305 aggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||    
T  48928573 atgtaggat-aaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgat 48928623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 1851 - 1978
Target Start/End: Complemental strand, 35316199 - 35316071
Alignment:
Q  1851 aaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtttctcaaattgat 1950  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| |    
T  35316199 aaattagtctctgtctttgtaccaaattcttaaattggtccctgactctattaataactcaaaatggtccctgtctttctcaaacgtttctcagattggt 35316100  T
Q  1951 -cctgatcctattagttgttttgtatttt 1978  Q
     ||| |  ||||||||||||||| |||||    
T  35316099 ccctaactctattagttgttttgcatttt 35316071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1835 - 1934
Target Start/End: Original strand, 36642603 - 36642702
Alignment:
Q  1835 aaatgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaa 1934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||    
T  36642603 aaatgagtaaatcattaaattggtctctatctttgtaccaaattttcaaattggtccctgactctattaataactcaacatcatctctgtctttgtcaaa 36642702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 1835 - 2015
Target Start/End: Complemental strand, 26073516 - 26073335
Alignment:
Q  1835 aaatgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaa 1934  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| || | |||||| |||||    
T  26073516 aaatgagtaaaccatcaaattggtcactgtctttgtaccaaattttcaatttggtccctgactctattaataattcaaaatggtctctgtctttgtcaaa 26073417  T
Q  1935 cgtttctcaaattgatc-ctgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattattta 2015  Q
     |||||| | |||| || |||    ||||| ||||||||||||||||||||||   | |||| || ||||||||||||||||    
T  26073416 tgtttcttagattggtctctgcctttattaattgttttgtattttgagtgttatcgattcaacgtgttttggatattattta 26073335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 1835 - 2015
Target Start/End: Complemental strand, 26097303 - 26097122
Alignment:
Q  1835 aaatgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaa 1934  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| || | |||||| |||||    
T  26097303 aaatgagtaaaccatcaaattggtcactgtctttgtaccaaattttcaatttggtccctgactctattaataattcaaaatggtctctgtctttgtcaaa 26097204  T
Q  1935 cgtttctcaaattgatc-ctgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattattta 2015  Q
     |||||| | |||| || |||    ||||| ||||||||||||||||||||||   | |||| || ||||||||||||||||    
T  26097203 tgtttcttagattggtctctgcctttattaattgttttgtattttgagtgttatcgattcaacgtgttttggatattattta 26097122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1838 - 1978
Target Start/End: Original strand, 32047232 - 32047373
Alignment:
Q  1838 tgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgt 1937  Q
    |||||||||||  ||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||| ||| || | |||||| |||||| |    
T  32047232 tgagtaaatcaccaaattggtccctatctttgtaccaaattctcaaattggtctctgactctattaataactcaaaatggtctctgtctttgtcaaactt 32047331  T
Q  1938 ttctcaaattgatcctgatc-ctattagttgttttgtatttt 1978  Q
    |||||| |||  |||  | | |||||||||||||||||||||    
T  32047332 ttctcatattattccccaactctattagttgttttgtatttt 32047373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2268 - 2355
Target Start/End: Original strand, 44413351 - 44413437
Alignment:
Q  2268 taagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||    
T  44413351 taagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgat-aaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatgaattga 44413437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1862 - 1978
Target Start/End: Original strand, 26096953 - 26097070
Alignment:
Q  1862 tgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtttctcaaattgat-cctgatccta 1960  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| || |  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||   |||    
T  26096953 tgtctttgtaccaaattttcaaattgacctctaactctattaataactcaaaatggtcactttctttgtcaaacgtttctcaaattggtccctgcctcta 26097052  T
Q  1961 ttagttgttttgtatttt 1978  Q
    |||||||||||| |||||    
T  26097053 ttagttgttttgcatttt 26097070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1961 - 2017
Target Start/End: Original strand, 527541 - 527597
Alignment:
Q  1961 ttagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagt 2017  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  527541 ttagttgttttgtattttgagtgttaatgactcaatgttttttagatattatttagt 527597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 1840 - 1978
Target Start/End: Original strand, 25658388 - 25658527
Alignment:
Q  1840 agtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgttt 1939  Q
    ||||||||| |||||| ||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||   || ||| ||||||||||    
T  25658388 agtaaatcagtaaattagtccctatctttgtaccaaattctcaaattggtccctgactctgttaataactcaaaatggtcattgtttttgtcaaacgttt 25658487  T
Q  1940 ctcaaattgatcct-gatcctattagttgttttgtatttt 1978  Q
     ||| |||| |||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  25658488 atcagattgctcctcgactttattagttgttttgtatttt 25658527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 1950 - 2045
Target Start/End: Complemental strand, 25658643 - 25658549
Alignment:
Q  1950 tcctgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatgttttttggatct 2045  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||   |||| ||||||||| ||||||||||    
T  25658643 tcctgattttattagttgttttatattttgagtgttaatgattcaacgtctttt-gatattatttagtggataattgcataatgtgttttggatct 25658549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 2059 - 2118
Target Start/End: Original strand, 33688049 - 33688108
Alignment:
Q  2059 taaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaat 2118  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33688049 taaagggagcttctacagtgcagtcgtgaaactgacttttttaaaaaagttaattttaat 33688108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 1862 - 1978
Target Start/End: Original strand, 26073166 - 26073283
Alignment:
Q  1862 tgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtttctcaaattgat-cctgatccta 1960  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| || |  ||||| |||||||||||||| |||| | ||||   |||    
T  26073166 tgtctttgtaccaaattttcaaattgacctctaactctattaataactcaaaatggtcactttctttgtcaaacgtttctcagattggtccctgcctcta 26073265  T
Q  1961 ttagttgttttgtatttt 1978  Q
    |||||||||||| |||||    
T  26073266 ttagttgttttgcatttt 26073283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 1838 - 1978
Target Start/End: Original strand, 33189881 - 33190022
Alignment:
Q  1838 tgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgt 1937  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||| ||| |    |||||| ||||| ||    
T  33189881 tgagtaaaccatcaaactggtctctgtctttgtaccaacttctcaaattggtctttgactctattaataactcaaaatggtatttgtctttatcaaaagt 33189980  T
Q  1938 ttctcaaattgat-cctgatcctattagttgttttgtatttt 1978  Q
    |||||| |||| | |||||  ||||||||||||||| |||||    
T  33189981 ttctcagattggtccctgactctattagttgttttgcatttt 33190022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 2299 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 26980481 - 26980422
Alignment:
Q  2299 aaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  26980481 aaaacaaggtagaataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgat 26980422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2118
Target Start/End: Complemental strand, 12166289 - 12166234
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaat 2118  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  12166289 gggagcttctacactgcagtcatgaaactgacttttctaaaaaagttaattttaat 12166234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 2069 - 2121
Target Start/End: Original strand, 27421157 - 27421210
Alignment:
Q  2069 ttctacggtgcagtcataaaactgac-ttttttgaaaaagttaattttaatgtt 2121  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27421157 ttctacggtacagtcatgaaactgactttttttgaaaaaattaattttaatgtt 27421210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 1837 - 1912
Target Start/End: Original strand, 21297711 - 21297786
Alignment:
Q  1837 atgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaa 1912  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||  || ||  || || ||||||||||||||||||    
T  21297711 atgagtaaaccatcaaattggtccctgtctttgtaccaaattcttaatttagtctctgactctattaataactcaa 21297786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 2138 - 2201
Target Start/End: Original strand, 27421207 - 27421270
Alignment:
Q  2138 tgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta 2201  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  27421207 tgttgatcattaattaatgatcaatattatttcatcttgtaacatttgcaacatcttggactta 27421270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1838 - 1912
Target Start/End: Original strand, 7511078 - 7511152
Alignment:
Q  1838 tgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaa 1912  Q
    |||||||| ||| ||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||  | ||||| ||||||||||||    
T  7511078 tgagtaaaccatcaaattggtccctatctttgtaccaaattctcaaattggtcaatgactctgttaataactcaa 7511152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1930 - 2039
Target Start/End: Original strand, 7511158 - 7511267
Alignment:
Q  1930 tcaaacgtttctcaaattgatcctgatc-ctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagca 2028  Q
    |||||||||||||| |||| |||  | | |||||| |||||||||||||| |||||||||   |||||||| |||| ||||||||||||  |||||  ||    
T  7511158 tcaaacgtttctcagattggtccctaactctattaattgttttgtattttaagtgttaatagttcaatgtc-tttgaatattatttagtagttaatgaca 7511256  T
Q  2029 taatgtttttt 2039  Q
    ||||| |||||    
T  7511257 taatgcttttt 7511267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 2299 - 2356
Target Start/End: Original strand, 12390633 - 12390689
Alignment:
Q  2299 aaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  12390633 aaaagaaggtagaataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 12390689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2108
Target Start/End: Complemental strand, 25470805 - 25470760
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagt 2108  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  25470805 gggagcttctatggtgcagtcaaaaaaatgacttttttaaaaaagt 25470760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 197; Significance: 1e-106; HSPs: 76)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 736 - 1361
Target Start/End: Original strand, 12896007 - 12896638
Alignment:
Q  736 tcttgatgcatcttatgtagaaaccccagctctcagaaaaagacttgcgcgtacaaaatgtttcattgtgttggatgatgtagaaaccttagagcaagca 835  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    ||| || |||||||||  ||  |||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12896007 tcttgatgcaccttatgtagaaaccccaatgttcataagaagacttgcatgtgaaaaaagtttcattgtattggatgatgtggcaaccttagagcaagca 12896106  T
Q  836 gaaaatcttaacataggt---------ttgggaccaggtagtatagtcattgtcacaacaagagataagcagatatgtagtcaatttgatggatgcaaag 926  Q
    ||| ||||||||||||||         || || || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||   |     
T  12896107 gaatatcttaacataggtaaaaattgtttaggccctggtagtagagtcatcgtcacaactagagataagcaaatatgcagtcaatttgatgaatgtgcaa 12896206  T
Q  927 tatacgaggtcaaggaattaagtgaaaatgaatctcttcaactactattcagttggaatgcatttcgagaaaaacatccaaaagttggatacgaagagct 1026  Q
    |||||||||||||||  || |    |  ||| |||||||| |||   ||| || ||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||| || || ||    
T  12896207 tatacgaggtcaagggtttgaacataggtgactctcttcagcta---ttctgtaggaatgcctttggagaaaaacatcctaaagatggatatgaggatct 12896303  T
Q  1027 ctcaaaaagtgcaattggctattgcagtggcaatcctctcgctttaaaagttttaggtgcaaatcttcgtataaaaagcaaagaagcatgggaaagtgaa 1126  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  12896304 atcaaagagtgcaattggctattgtagaggcaatcccctggctttgaaagttttaggtgcaaattttcgtacaaaaagcaaagaagcatgggcaagtgaa 12896403  T
Q  1127 ttggaaaagataaaagagattccctatgcgggaattcatgatgtgttaaaattgagcttcaatgacttagatcatattcagcgggagatatttctagaca 1226  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||   || ||||||||||| |    
T  12896404 ttggaaaagataaaaaagattccttatgggagaattcatgatgtgttaaaattgagtttcgatgacttagatcgtactcaggaagacatatttctagata 12896503  T
Q  1227 ttgcatgcttcttctgcccaaaaataaatgaatttgcttgttatagtcagggagaatacatgatagatctatttaatgcttgcgaattttatccggcaac 1326  Q
    |||||||||||| || | ||||| ||| ||| |||| || || |||| |  |||| ||| | | || |||||| ||||||||| | |||| | ||  ||     
T  12896504 ttgcatgcttctcctactcaaaattaactgattttgattattttagtgatcgagattacctaacagttctattgaatgcttgcaatttttttgcgctaag 12896603  T
Q  1327 tgggatagaagtccttctgcataaagcactcataa 1361  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12896604 tgggatagaagtccttctacataaagcactcataa 12896638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2350
Target Start/End: Complemental strand, 47254166 - 47253873
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47254166 agggagcttctacggtggagtcatcaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaat 47254067  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  47254066 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatc 47253967  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatga 2350  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  47253966 atgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatga 47253873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2066 - 2350
Target Start/End: Complemental strand, 7703931 - 7703642
Alignment:
Q  2066 agcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatc 2159  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  7703931 agcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgata 7703832  T
Q  2160 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcattt 2259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||| |    
T  7703831 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgt 7703732  T
Q  2260 gatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatga 2350  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7703731 gatagtcttaagtgtgacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtagaat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 7703642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 55240891 - 55241191
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55240891 gggaacttctacggtgcagttatgaaactgacttttttgaaaaatttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 55240990  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||    
T  55240991 attaatagtaatttatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgacatca 55241090  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||    
T  55241091 tgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtatgat-aaaattagattaagtgtattcttctt-atctgataaattgat 55241188  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  55241189 gat 55241191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 2078 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 33341808 - 33341522
Alignment:
Q  2078 gcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattca 2171  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33341808 gcagtcatgatactgacttttttaaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattca 33341709  T
Q  2172 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaag 2271  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33341708 tctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaag 33341609  T
Q  2272 tgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33341608 tgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattatattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgat 33341522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2060 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 17168141 - 17167837
Alignment:
Q  2060 aaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagtta------attttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgatta 2153  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||      ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  17168141 aaagggagtttctacggtgcagtaaagaaactgacttttttgaaaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactaatta 17168042  T
Q  2154 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgata 2253  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  17168041 atgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgata 17167942  T
Q  2254 tcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaatt 2353  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  17167941 ttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggat-aaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaatt 17167843  T
Q  2354 gatgat 2359  Q
     |||||    
T  17167842 aatgat 17167837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2060 - 2340
Target Start/End: Complemental strand, 37288157 - 37287869
Alignment:
Q  2060 aaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaa-------tgttagattcatttttaaattgttgattattgatt 2152  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  37288157 aaagggagcttccacggtgcagtcatgaaagtgacttttttgaaaaagttaattttaaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgatt 37288058  T
Q  2153 aatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgat 2252  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||| |||   ||||||||||    
T  37288057 aatgctcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatcttcaacatgcaaacaaagttgctgat 37287958  T
Q  2253 atcatttgatagtcttaagtgttacattttgt-ggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgtt 2340  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37287957 atcatgtgctagtcttaagtgttacattttgtgggggcgttacacttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgtt 37287869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 23761498 - 23761196
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    |||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  23761498 aagggagcttattcggtgtagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaa 23761399  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||  |||||||||||||    
T  23761398 tgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtacaattttatcgttggtatctttaacgtgcaaacagagttgctgatat 23761299  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
    |||  ||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23761298 catgcgatagtcttaaatgtgacactttatgaggtgttacacttaaaacaaggta-gat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattg 23761201  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  23761200 atgat 23761196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 2059 - 2359
Target Start/End: Original strand, 34361273 - 34361579
Alignment:
Q  2059 taaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgatt 2152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34361273 taaagggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatt 34361372  T
Q  2153 aatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctga 2251  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||    
T  34361373 aatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatga 34361472  T
Q  2252 tatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaa 2351  Q
    ||| || ||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| | |||||   | ||||||    
T  34361473 tattatgtgatagctttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgat-aaaattatattaagtgtaattttgttaaccggatgaa 34361571  T
Q  2352 ttgatgat 2359  Q
    ||||||||    
T  34361572 ttgatgat 34361579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 2060 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 17173718 - 17173414
Alignment:
Q  2060 aaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagtta------attttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgatta 2153  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||      ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||     
T  17173718 aaagggagtttctacggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattacttattc 17173619  T
Q  2154 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgata 2253  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  17173618 atgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgata 17173519  T
Q  2254 tcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaatt 2353  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  17173518 ttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggat-aaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaatt 17173420  T
Q  2354 gatgat 2359  Q
     |||||    
T  17173419 aatgat 17173414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 28002772 - 28003073
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||      |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28002772 gggagcttctacactgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatg 28002871  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||| |||||| |    
T  28002872 atcaatagtaattcatctagtaatgttagcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 28002971  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||  || |||||||||||    
T  28002972 tgtgatagttttaagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatccgatgaattgat 28003070  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  28003071 gat 28003073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 2059 - 2359
Target Start/End: Original strand, 37663523 - 37663828
Alignment:
Q  2059 taaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgatt 2152  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| | |||||||||||| || |||      |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37663523 taaagggagcttctacggtacagtcaggaaattgacttttttaataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgatt 37663622  T
Q  2153 aatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgat 2252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    |||| ||||    
T  37663623 aatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgat 37663722  T
Q  2253 atcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaat 2352  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  37663723 attatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaat 37663821  T
Q  2353 tgatgat 2359  Q
    |||||||    
T  37663822 tgatgat 37663828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 2065 - 2353
Target Start/End: Original strand, 46887946 - 46888238
Alignment:
Q  2065 gagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgat 2158  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46887946 gagcttctacggtgcaatcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgat 46888045  T
Q  2159 caatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatt 2258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||| |||||| ||     
T  46888046 caatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatg 46888145  T
Q  2259 tgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaatt 2353  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||    
T  46888146 tgatagtc-taagtgttacgttttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaatt 46888238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 2060 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 25184541 - 25184237
Alignment:
Q  2060 aaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgatta 2153  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25184541 aaagggagcttctatggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactgatta 25184442  T
Q  2154 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgata 2253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| || || || ||||||||| |||  |||||| | |||    
T  25184441 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataata 25184342  T
Q  2254 tcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaatt 2353  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||| ||    
T  25184341 ttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggat-aaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagtt 25184243  T
Q  2354 gatgat 2359  Q
    ||||||    
T  25184242 gatgat 25184237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 2064 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 37776082 - 37775791
Alignment:
Q  2064 ggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattt------taatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatga 2157  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37776082 ggagcttctacggtgcagtcatgaaattgacttttttaaaaaagttaatttcaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 37775983  T
Q  2158 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcat 2257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||    
T  37775982 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcat 37775883  T
Q  2258 ttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatg 2357  Q
     ||         ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  37775882 gtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatg 37775793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 17272391 - 17272088
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||      ||||||||||||||| ||| ||||  ||||||    
T  17272391 aagggagcttctacggtgcagtcatgaaattgacttatttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattaccgattaa 17272292  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||  |||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  17272291 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttgaaatctttaatatgcaaatagagttgctgatat 17272192  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
    |||  ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||    
T  17272191 catgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaat-aaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattg 17272093  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  17272092 atgat 17272088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2359
Target Start/End: Original strand, 29583985 - 29584287
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||      ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  29583985 agggagcttctacggtgcagtcatgaaattgacttgtttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaat 29584084  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  29584085 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatc 29584184  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    ||  ||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  29584185 atgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgtaacacttaaaacaaggtagaat-aaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattga 29584283  T
Q  2356 tgat 2359  Q
    ||||    
T  29584284 tgat 29584287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 6864460 - 6864159
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6864460 gggagcttctacggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 6864361  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    || |||||||||||||  |||||||||||| |||   ||||| |||||| |    
T  6864360 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatatta 6864261  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||    
T  6864260 tgtgatagtcttaagtattacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtatgat-aaaattaaattaaatgtagtcttgttaatctgataaattgat 6864162  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  6864161 gat 6864159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Original strand, 35020815 - 35021122
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||      |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  35020815 aagggagcttctacggtgtagtcagaaaactgactcttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaa 35020914  T
Q  2155 tgatcaata----gtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctg 2250  Q
    |||||||||    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||| ||    
T  35020915 tgatcaatatatagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatg 35021014  T
Q  2251 atatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatga 2350  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||| ||||    
T  35021015 atattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatga 35021113  T
Q  2351 attgatgat 2359  Q
    |||||||||    
T  35021114 attgatgat 35021122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 19089239 - 19089540
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||| || |||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19089239 gggagcttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 19089338  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||    |||| |||||| |    
T  19089339 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatatta 19089438  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |  | | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  19089439 tgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcatatagcaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 19089537  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  19089538 gat 19089540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 2114 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 1815669 - 1815425
Alignment:
Q  2114 ttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattt 2213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  1815669 ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaattgtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggatttacaggtactattt 1815570  T
Q  2214 tatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggat 2313  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1815569 tatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacccttaaaacaaggtaggat 1815470  T
Q  2314 aaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
     ||||||||| ||| |||| |||||||  | |||||||||||||||    
T  1815469 -aaaattagagtaaatgtagtcttgttaatatgatgaattgatgat 1815425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2359
Target Start/End: Original strand, 32912364 - 32912667
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32912364 agggagcttttacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaaattcattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 32912463  T
Q  2156 gatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||| ||||||    
T  32912464 gatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatacaaatagagttgatgatat 32912563  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||   ||||| |||||    
T  32912564 tatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgat-aaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattg 32912662  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  32912663 atgat 32912667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2350
Target Start/End: Original strand, 30002427 - 30002710
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||      ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  30002427 gggagcttctacggtgcagttatgaaattgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtttattactgattaatg 30002526  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  30002527 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatca 30002626  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatga 2350  Q
    | ||         ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30002627 tgtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 30002710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 2108 - 2359
Target Start/End: Original strand, 34947932 - 34948184
Alignment:
Q  2108 ttaattttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggta 2207  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  34947932 ttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaacgatcaatagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgta 34948031  T
Q  2208 ctattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagt--gttacattttgtggggtgttacactgaaaacaa 2305  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||  ||||||    
T  34948032 ttattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtacgttacactttgtggggtgttgcactttaaacaa 34948131  T
Q  2306 ggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  34948132 gataggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgat 34948184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 2069 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 32592503 - 32592217
Alignment:
Q  2069 ttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaat 2162  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32592503 ttctacggtgcagtcataaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaacgatcaat 32592404  T
Q  2163 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgat 2262  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||   ||||||||| ||||| ||      
T  32592403 agtaattcatttagtaatgctttcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgtagacatctttaacatgcaaacaaagttgctgaaatcatatg-- 32592306  T
Q  2263 agtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
           ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32592305 -------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 32592217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 2114 - 2359
Target Start/End: Original strand, 55477734 - 55477978
Alignment:
Q  2114 ttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattt 2213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  55477734 ttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattt 55477833  T
Q  2214 tatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggat 2313  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||  |||||| |||||| || |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  55477834 tatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttcagtgttacacgttgtggggtgttacacttataacaagttaggat 55477933  T
Q  2314 aaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
     |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  55477934 -aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 55477978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 19440434 - 19440735
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||      |||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19440434 gggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattaatttttaaattattgattactgattaatg 19440533  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||  |||||| |||||| |    
T  19440534 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta 19440633  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | | |||  |||||| ||||||  |||||||||||||| || | |||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  19440634 tgttataaacttaagggttacacgttgtggggtgttacgcttataacaagctaagat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 19440732  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  19440733 gat 19440735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 2060 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 27397042 - 27396740
Alignment:
Q  2060 aaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgatta 2153  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||      ||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  27397042 aaagagagcttttacggtgcaatcatgaaactgattttttaaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattac--atta 27396945  T
Q  2154 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgata 2253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  27396944 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttataggtaccactttatcgttgacatctttaacatgcaaacagcgttgctgata 27396845  T
Q  2254 tcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaatt 2353  Q
    ||||  ||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27396844 tcatgcgatggtcttaagtgtgacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtagaat-aaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 27396746  T
Q  2354 gatgat 2359  Q
    ||||||    
T  27396745 gatgat 27396740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 2064 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 3043043 - 3042743
Alignment:
Q  2064 ggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatga 2157  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  3043043 ggagcttctacggtgcagtcaagaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataa 3042944  T
Q  2158 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcat 2257  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||| | |||   ||||| |||||| ||    
T  3042943 tcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatgttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacaagcaaacaaagttgatgatattat 3042844  T
Q  2258 ttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatg 2357  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | || |||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||  | |||||||||||||    
T  3042843 gtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataataaggtatgat-aaaattatattaagtgtaatcttgttaatatgatgaattgatg 3042745  T
Q  2358 at 2359  Q
    ||    
T  3042744 at 3042743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Original strand, 36493473 - 36493775
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatt------ttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||      |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  36493473 aagggagcttctatggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaa 36493572  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||    
T  36493573 tgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaatatcttagacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatat 36493672  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
     || || ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||    
T  36493673 tatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggagt-ttacacttaaaacaatgtatgat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattg 36493770  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  36493771 atgat 36493775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 2087 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 50697643 - 50697365
Alignment:
Q  2087 aaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 2180  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50697643 aaactgacttttttgaaaaaattaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 50697544  T
Q  2181 gcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaaca-tggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacat 2279  Q
    |||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||  |||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||     
T  50697543 gcttacaacatcttggaattacaggtactattttatcgttggaatctttaacattgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcac 50697444  T
Q  2280 tttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||| |||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  50697443 tttgtgtggtgttacgcttataacaaggtaggat-aaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 50697365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 879334 - 879635
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  879334 gggagcttctatggtgtagtcagaaaactgactttttaaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattacttattaatg 879433  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||| |||   ||||| |||||| |    
T  879434 atcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatatta 879533  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  879534 tgtgatagtcttaaatgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggat-aaaattagattatgtgtagtcttgttaatctgatgagttgat 879632  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  879633 gat 879635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 5047752 - 5048052
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattt------taatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||      ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  5047752 gggagcttttacggtgcagtcaggaaacagacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgttcgattcatttttaaattgtttattgttgattactg 5047851  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    ||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||| |||   ||||  ||||||||    
T  5047852 atcaataataatttatctagtaaaacttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagtttatgatatca 5047951  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||  ||| ||||||||||    
T  5047952 tgtgatagtcttaagtgttacattttg-cgggtattacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaaatgcagtcttgttaatctcatgaattgat 5048049  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  5048050 gat 5048052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2297
Target Start/End: Original strand, 33816300 - 33816542
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  33816300 aagggagcttctacgatgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaa 33816399  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||| ||||||    
T  33816400 tgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgaactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 33816499  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacact 2297  Q
     ||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  33816500 tatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattacact 33816542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 2051 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 42200167 - 42199853
Alignment:
Q  2051 agataaaataaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttta-----atgttagattcatttttaaattgttgatt 2145  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||||||||| |     ||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  42200167 agataaattatagggagcttctacggtgcaatcaggaaattgacctttttgaaaaagttaatttgattttgatgtttgattaatttttaaattattgatt 42200068  T
Q  2146 attgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatc-ggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattga 2243  Q
    | |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  42200067 actgattaatgaacagtagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaggtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaataga 42199968  T
Q  2244 gttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcct 2343  Q
    |||  |||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  || | ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |    
T  42199967 gtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgat-aaaattatattaagtgtagtcttgttaat 42199869  T
Q  2344 ctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||||||||||||    
T  42199868 ctgatgaattgatgat 42199853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2358
Target Start/End: Complemental strand, 4598407 - 4598117
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4598407 gggagcttctacggtgcagtcatgaaactgactttttgtaaaatgttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatg 4598308  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  4598307 atcaatagtaattaatctaataatgcttgcaacatcttggatttaaatgtattattttatcgttggcatctttaacatgaaaacagagttgctgatatca 4598208  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | ||         ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  4598207 tgtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaa-gcaggat-aaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgat 4598119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2329
Target Start/End: Complemental strand, 32579871 - 32579600
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||      |||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  32579871 gggagtttctacggtgcagttagaaaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattgctgattaatg 32579772  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||   ||||| |||||| |    
T  32579771 atcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacatagttgatgatatta 32579672  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagt 2329  Q
    |  |||||||||||| |||||| ||| || ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32579671 taagatagtcttaagagttacactttctgaggtcttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagt 32579600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 25700842 - 25701144
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||      |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25700842 gggagtttctacggtgcagttaggaaattgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtacattattgattaatg 25700941  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |||  | |||||||||||||||| | ||||||||||| |||   ||||| |||| | |    
T  25700942 atcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaaaatcttagatttacggatactattttatcgttgacttctttaacatgcaaacaaagttgatgatgtta 25701041  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtgggg-tgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||    
T  25701042 tgtgataatcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagatttagtgtagtcctgttaatctgatgaattga 25701140  T
Q  2356 tgat 2359  Q
    ||||    
T  25701141 tgat 25701144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 49376392 - 49376091
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  49376392 gggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattcttgattactgattaatg 49376293  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||   ||||| |||||| |    
T  49376292 atcaatagtaattcatttagtaatgctttcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacaaagttgatgatatta 49376193  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | ||||| ||||||||||||||  |||||||||||   ||| ||| ||||| || || |||||||||| ||| ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  49376192 tgtgataatcttaagtgttacacattgtggggtgtataacttaaatcaaggcagaat-aaaattagatcaagcgtaatcttgttaatctgatgaattgat 49376094  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  49376093 gat 49376091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 2065 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 50765143 - 50764854
Alignment:
Q  2065 gagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgat 2158  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50765143 gagcttctacggtgcaatcatgaaacaaacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgat 50765044  T
Q  2159 caatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatt 2258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| || |||   |||||||||||||||     
T  50765043 caatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacttgcaaacatagttgctgatatcatg 50764944  T
Q  2259 tgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatga 2358  Q
    ||||| | || |||||| || |||||||||||||||||          ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  50764943 tgataatattgagtgtttcactttgtggggtgttacac----------gtaggat-aaaattagattaaatgtattcttgttaatctaatgaattgatga 50764855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 121; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 2060 - 2257
Target Start/End: Complemental strand, 39400436 - 39400233
Alignment:
Q  2060 aaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgatta 2153  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  39400436 aaaggaagtttctacggtccagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgatta 39400337  T
Q  2154 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgata 2253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  39400336 atgatcaatagtcattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttaaaggtaccattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgata 39400237  T
Q  2254 tcat 2257  Q
    ||||    
T  39400236 tcat 39400233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 2086 - 2285
Target Start/End: Original strand, 7152013 - 7152218
Alignment:
Q  2086 aaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 2179  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7152013 aaaactgacttttttgaaaaagttatttttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataa 7152112  T
Q  2180 tgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacat 2279  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||  |||||| |||| | || ||||||| |||||||||| |     
T  7152113 tgcttgcaaaatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtattaagtgttatac 7152212  T
Q  2280 tttgtg 2285  Q
    ||||||    
T  7152213 tttgtg 7152218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2235
Target Start/End: Complemental strand, 4205410 - 4205231
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagtta------attttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||| ||    
T  4205410 agggagcttctacggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattacttattcat 4205311  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatg 2235  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205310 gataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatg 4205231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 2087 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 9139628 - 9139369
Alignment:
Q  2087 aaactgacttttttgaaaaagttaatt------ttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 2180  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||      |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9139628 aaactgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaatta--gattattgattaatgatcaatagtaattcgtctagtaat 9139531  T
Q  2181 gcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacatt 2280  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||     ||           |||||||||||||| |    
T  9139530 gcttgcaacatcttggacttacatgtactacgttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtt-----ta-----------tcttaagtgttacact 9139447  T
Q  2281 ttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||    
T  9139446 ttgtagggtgttacagttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgat 9139369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2211
Target Start/End: Complemental strand, 23431982 - 23431826
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||      ||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  23431982 aagggagcttctacagtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattgttgattactaattaa 23431883  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactat 2211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23431882 tgatcaatagtaattcatctactaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactat 23431826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2284
Target Start/End: Complemental strand, 26896515 - 26896285
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26896515 aagggaacttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattactgattaa 26896416  T
Q  2155 tgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt-ggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgat 2252  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||   |||||||||||||||||  || ||||||||| |||| || ||| | ||    
T  26896415 tgatcaatagtatattcatctagtaatgtttgcaacattttcggacttacaagtactattttatcgttgaaat-tttaacatgcaaatagacttgatcat 26896317  T
Q  2253 atcatttgatagtcttaagtgttacattttgt 2284  Q
    || ||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  26896316 attatgcgatagtcttaagtgttacactttgt 26896285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 2089 - 2220
Target Start/End: Original strand, 35025379 - 35025515
Alignment:
Q  2089 actgacttttttgaaaaagttaatttt-----aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgct 2183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||     |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35025379 actgacttttatgaaaaagttaattttgatttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgct 35025478  T
Q  2184 tgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgtt 2220  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  35025479 tgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgtt 35025515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 2087 - 2359
Target Start/End: Original strand, 4934022 - 4934289
Alignment:
Q  2087 aaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaa-ttgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 2179  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||      ||||||  ||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  4934022 aaactgacttttttgaacaagttaattttgatcttaatgtttaatttatttttaaaatttttgattactgattaatgattaatagaaattcatctattaa 4934121  T
Q  2180 tgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacat 2279  Q
    ||| ||||||||            |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||     
T  4934122 tgcgtgcaacata-----------ggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacac 4934210  T
Q  2280 tttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||| ||||||  ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||    
T  4934211 tttgtgaggtgttggacttaaaacaaggtagaat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaaatgatgat 4934289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 2203 - 2359
Target Start/End: Original strand, 54499170 - 54499325
Alignment:
Q  2203 cggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaa 2302  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  54499170 cggtaccattttatcgttggcat-tttaacatggaaacagagttactaatatcatgtgatagtcttaaaagttacactttgtagggtgttacacttaaaa 54499268  T
Q  2303 caaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  54499269 caaggtatgataaaaattagattaagtatattcttgttaatatgatgaattgatgat 54499325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 1851 - 2045
Target Start/End: Complemental strand, 35251742 - 35251547
Alignment:
Q  1851 aaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtttctcaaattgat 1950  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |  ||| ||   |||||| ||||| |||||||| |||| |    
T  35251742 aaattggtccctgtctttgtaccaaattctcaatttggtccctaactctattaataacttataatggtctttgtctttctcaaatgtttctcagattggt 35251643  T
Q  1951 c-ctgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatgttttttggatct 2045  Q
    | ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||  | |||||| ||||||||||    
T  35251642 ctctgactctattagttgttttttattttgagtgttaataactcaatgtcttttggatattatttagtggttaatgacgtaatgtcttttggatct 35251547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 2069 - 2332
Target Start/End: Original strand, 46883905 - 46884168
Alignment:
Q  2069 ttctacggtgcagtcataaaactgactttttt-gaaaaagttaattt------taatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaa 2161  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| |||||||      ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46883905 ttctacggtgcagtcaaaaaattgattttttttgaaaaaattaatttttattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaa 46884004  T
Q  2162 tagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttga 2261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    |||||||||||| |||| || ||||||||| |||   | ||  |||||| || |||    
T  46884005 tagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc--ggactta--catactattttatctttggaatttttaacatgcaaacaaaatttatgatattatgtga 46884100  T
Q  2262 tagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgta 2332  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||  || | |||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  46884101 tagt-ttaagtgttacattttgtgagatgtta-gcttataacaagatatgat-aaaattagattaagtgta 46884168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 1837 - 2017
Target Start/End: Complemental strand, 51103735 - 51103554
Alignment:
Q  1837 atgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacg 1936  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| || ||||| |||||||||  ||||||| || || |||||||||||||||||| ||  || | |||||| ||||||     
T  51103735 atgagtaaaccatcaaattggtccctatctttgtaccaaattttcaaattggtcactgactctattaataactcaaaatagtctctgtctttatcaaaca 51103636  T
Q  1937 tttctcaaattgatcc-tgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagt 2017  Q
    |||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  51103635 tttctcaaattggttcatgattctattagttgttttgtattttgagtgttaatggttcaatgtcttttggatattatttagt 51103554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 2167 - 2356
Target Start/End: Complemental strand, 38012169 - 38011981
Alignment:
Q  2167 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtc 2266  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||| || |||   ||||| |||||| || ||||||||    
T  38012169 attcatctagtaatatttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatttttaacgtgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 38012070  T
Q  2267 ttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    ||||| |||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  38012069 ttaagcgttacactttctgggatgttacacttaaaacaaggtataat-aaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 38011981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1406 - 1600
Target Start/End: Original strand, 12896674 - 12896868
Alignment:
Q  1406 catgatttgttggtagaaatgggacgagagattgttaagcaagaatgtcctaaaaaccctggaagcagaagtagattgtgggatcccaaggaaatttatc 1505  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| | |||     
T  12896674 catgatttgttagtagaaatgggacgagagattgttaagcaagaatctcccaagaaccccggaagaagaagtcgattgtgggatcccgaggaagtgtatg 12896773  T
Q  1506 aagtatttaaatacaacaaggtaagtagaagacttaattacttctatatgaaaatgcaagtatatatttgattatgaaatataagcaagataaat 1600  Q
    | ||| | ||| | |||| ||| ||| ||||| | |||||||  ||||||||||| || ||| || ||||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  12896774 atgtactgaaaaataacatggtgagtggaagattcaattactattatatgaaaatacatgtacatgtttgactataaaatgtaaccaagataaat 12896868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1835 - 1948
Target Start/End: Original strand, 39864086 - 39864199
Alignment:
Q  1835 aaatgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaa 1934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  39864086 aaatgagtaaatcattaaattggtctctgtctttgtaccaaatttttaaattggtccccgactctattaataactcaaaatgatccctgtctttgtcaaa 39864185  T
Q  1935 cgtttctcaaattg 1948  Q
    | ||||||| ||||    
T  39864186 cttttctcatattg 39864199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 2205 - 2350
Target Start/End: Original strand, 35025530 - 35025674
Alignment:
Q  2205 gtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaaca 2304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||    
T  35025530 gtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgtgacacttaaaaca 35025629  T
Q  2305 aggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatga 2350  Q
    || |||||| ||||||| ||||| || | |||||||  ||||||||    
T  35025630 agataggat-aaaattatattaaatgcagtcttgttaatctgatga 35025674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2176
Target Start/End: Complemental strand, 38012688 - 38012568
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    ||||||||| ||| |||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||      |||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  38012688 agggagcttttacagtgcagtcaggaaactaatttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgctgattaat 38012589  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctag 2176  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  38012588 gatcaatagtaattcatctag 38012568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 1838 - 2045
Target Start/End: Complemental strand, 4892753 - 4892547
Alignment:
Q  1838 tgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgt 1937  Q
    |||||||| ||| ||||| || ||| ||||| |||||||||| ||| ||| ||||  |||||||| | || |||| ||| ||   |||||| | ||| ||    
T  4892753 tgagtaaaccatcaaatttgtttctatctttgtaccaaattctcaatttggtcccagactctatttacaattcaaaatggtctttgtctttgtgaaatgt 4892654  T
Q  1938 ttctcaaattgatcct-gatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatgttt 2036  Q
    |||||| |||| |||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||    
T  4892653 ttctcagattggtccacgactctattagttgttttgtattttgagtgttaatggttcactgtcttttggatattatttagtgtttaatggc--aatgttt 4892556  T
Q  2037 tttggatct 2045  Q
    |||||||||    
T  4892555 tttggatct 4892547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 1862 - 1972
Target Start/End: Original strand, 4872569 - 4872679
Alignment:
Q  1862 tgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtttctcaaattgat-cctgatccta 1960  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| |||||  |||    
T  4872569 tgtctttgtaccaaattcttaaattgatctctaactctattaataactcaaaatgatctctgtctttgtcaaacgtttct-agattgatccctgactcta 4872667  T
Q  1961 ttagttgttttg 1972  Q
    ||||||||||||    
T  4872668 ttagttgttttg 4872679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 1958 - 2033
Target Start/End: Original strand, 42077141 - 42077216
Alignment:
Q  1958 ctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatg 2033  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  42077141 ctattagttgttttgtattttgagtgataatggctcaatgttttttgaatattatttagtgattaatagcataatg 42077216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 1853 - 2017
Target Start/End: Complemental strand, 43049449 - 43049288
Alignment:
Q  1853 attggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtttctcaaattgatc- 1951  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||  ||||||||| || | ||||||||||| |||| ||| |    || ||| |||||||||||||| |||||||     
T  43049449 attggtttctgt-tttgtaccaaattcttaaattgatctctgagtctattaataattcaaaatggtt---gtttttgtcaaacgtttctcagattgatct 43049354  T
Q  1952 ctgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagt 2017  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  43049353 ctgactctattagttgttttgtatttttaatgttaatagttcaatgtcttttggatattatttagt 43049288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1896 - 2017
Target Start/End: Complemental strand, 4872856 - 4872734
Alignment:
Q  1896 ctctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtttctcaaattgatc-ctgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactca 1994  Q
    |||||||||||||| || |||||| | |||||| | ||  |||||||| |||| || ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  4872856 ctctattaataacttaaaatgatctctgtctttatgaagtgtttctcatattggtctctgactctattagttgttttgtattttgggtgttaatggctca 4872757  T
Q  1995 atgtcttttggatattatttagt 2017  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  4872756 atgtcttttgtatattatttagt 4872734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1839 - 1912
Target Start/End: Original strand, 51103364 - 51103437
Alignment:
Q  1839 gagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaa 1912  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  51103364 gagtaaatcactaaattggtctctgtctttgtaccaaattctcaaattggtccctgactctattaataattcaa 51103437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1838 - 2045
Target Start/End: Original strand, 22886416 - 22886627
Alignment:
Q  1838 tgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataa---ctcaatatgatccccgtctttttcaaa 1934  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||| ||| ||||||||||  |||||| | ||| ||| |||||||||   ||||| ||  | |  |||||| |||||    
T  22886416 tgagtaaatcatcaaattggttcatgtatttgtaccaaattcttaaattggttcctgactttattaataataactcaaaatagtacttgtctttgtcaaa 22886515  T
Q  1935 cgtttctcaaattgatc-ctgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatg 2033  Q
     |||||||| |||  || || || ||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||  |||||   ||||||    
T  22886516 tgtttctcagattagtctctaattctattagttgttttgtatttttagtgttcatggctcaatgtcttttgaatattatttagtggttaatgatataatg 22886615  T
Q  2034 ttttttggatct 2045  Q
    | ||||||||||    
T  22886616 tgttttggatct 22886627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1838 - 2045
Target Start/End: Original strand, 22938080 - 22938291
Alignment:
Q  1838 tgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataa---ctcaatatgatccccgtctttttcaaa 1934  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||| ||| ||||||||||  |||||| | ||| ||| |||||||||   ||||| ||  | |  |||||| |||||    
T  22938080 tgagtaaatcatcaaattggttcatgtatttgtaccaaattcttaaattggttcctgactttattaataataactcaaaatagtacttgtctttgtcaaa 22938179  T
Q  1935 cgtttctcaaattgatc-ctgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatg 2033  Q
     |||||||| |||  || || || ||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||  |||||   ||||||    
T  22938180 tgtttctcagattagtctctaattctattagttgttttgtatttttagtgttcatggctcaatgtcttttgaatattatttagtggttaatgatataatg 22938279  T
Q  2034 ttttttggatct 2045  Q
    | ||||||||||    
T  22938280 tgttttggatct 22938291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 1839 - 2013
Target Start/End: Original strand, 45302323 - 45302498
Alignment:
Q  1839 gagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtt 1938  Q
    ||||||| ||| |||||| || || ||||| || |||||||  || ||||||||| |||||| |||||| |||| ||  || | |||||| | ||| |||    
T  45302323 gagtaaaccatcaaattgatccctctctttatatcaaattcttaatttgatccctgactctactaataattcaaaatattcactgtctttgtgaaatgtt 45302422  T
Q  1939 tctcaaattgatc-ctgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatt 2013  Q
    |||||||||| || || |  |||||||||||||||||||||||| ||||||    || ||||||||||||||||||    
T  45302423 tctcaaattggtctctaactctattagttgttttgtattttgagcgttaatagtccagtgtcttttggatattatt 45302498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 2280 - 2340
Target Start/End: Complemental strand, 39398111 - 39398052
Alignment:
Q  2280 tttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgtt 2340  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39398111 tttgtggggtgttacacttaaaataaggcaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgtt 39398052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1923 - 2017
Target Start/End: Complemental strand, 34932341 - 34932246
Alignment:
Q  1923 gtctttttcaaacgtttctcaaattgatcc-tgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagt 2017  Q
    |||||| |||||| | |||||||||| ||| |||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  34932341 gtctttgtcaaacttgtctcaaattggtccatgactctattagttactttatattttgagtgttaatggctcaatgtcttttgaatattatttagt 34932246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 2178 - 2235
Target Start/End: Complemental strand, 56050234 - 56050177
Alignment:
Q  2178 aatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatg 2235  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  56050234 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaagtctttaacatg 56050177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 1851 - 1978
Target Start/End: Original strand, 4892397 - 4892525
Alignment:
Q  1851 aaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtttctcaaattgat 1950  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  || |  |||||||||||||||||| ||| |  | |||||| |||||| ||||| | |||| |    
T  4892397 aaattggtctctgtctttgtaccaaattcttaaattagtctccgactctattaataactcaaaatggttactgtctttgtcaaacatttcttagattggt 4892496  T
Q  1951 -cctgatcctattagttgttttgtatttt 1978  Q
     |||||  ||||||||||||||| |||||    
T  4892497 ccctgactctattagttgttttgcatttt 4892525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1968 - 2015
Target Start/End: Original strand, 40681566 - 40681613
Alignment:
Q  1968 ttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattattta 2015  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  40681566 ttttgtattttgagtgttaatagctcaatgtcttatggatattattta 40681613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 1930 - 2045
Target Start/End: Complemental strand, 54511590 - 54511477
Alignment:
Q  1930 tcaaacgtttctcaaattgatcc-tgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagca 2028  Q
    |||||||||| | |||||| ||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| ||| |   |||| |||||||||||||||||||||| |||||   |    
T  54511590 tcaaacgttttttaaattggtccctgactctattagctgttttgtattttgagtattagt---tcaacgtcttttggatattatttagtcgttaatgata 54511494  T
Q  2029 taatgttttttggatct 2045  Q
    |||| | ||||||||||    
T  54511493 taatatcttttggatct 54511477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2299 - 2359
Target Start/End: Original strand, 33816561 - 33816620
Alignment:
Q  2299 aaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||  |||||| ||||||||||    
T  33816561 aaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgataaattgatgat 33816620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2110
Target Start/End: Complemental strand, 2708274 - 2708227
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagtta 2110  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  2708274 gggagcttctacggtgaagtcagaaaattgacttttttaaaaaagtta 2708227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 1861 - 1912
Target Start/End: Original strand, 35004494 - 35004545
Alignment:
Q  1861 ctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaa 1912  Q
    |||||||| |||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  35004494 ctgtctttgtaccaaattctcatattggtccctgactctattaataactcaa 35004545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 1763 - 1796
Target Start/End: Original strand, 12897061 - 12897094
Alignment:
Q  1763 gaaaatgctacaatgtgcacctccttgatggtct 1796  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12897061 gaaaatgctacaatgtgcacctccttgaaggtct 12897094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 195; Significance: 1e-105; HSPs: 63)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2060 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 35934324 - 35934019
Alignment:
Q  2060 aaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgatta 2153  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||      || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35934324 aaagggagtttctacggtgcagttatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgaatcatttttaaattgttgattactgatta 35934225  T
Q  2154 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgata 2253  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  35934224 atgatcaataataattcaactagtaatgcttgcaacatcttggacttaccggtactattttattgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgata 35934125  T
Q  2254 tcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaatt 2353  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  35934124 tcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaactagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 35934025  T
Q  2354 gatgat 2359  Q
    ||||||    
T  35934024 gatgat 35934019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2358
Target Start/End: Complemental strand, 19120286 - 19119984
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19120286 aagggagcttctaaggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgatcactgattaa 19120187  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  19120186 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagactttgaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctgatat 19120087  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  19120086 catgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttatacttaaaacaaggtaggat-aaaattagagtaagtttattcttgttaatctgatgaattg 19119988  T
Q  2355 atga 2358  Q
    ||||    
T  19119987 atga 19119984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 2074 - 2359
Target Start/End: Original strand, 15992301 - 15992591
Alignment:
Q  2074 cggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaa 2167  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||      ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  15992301 cggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaa 15992400  T
Q  2168 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtct 2267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  15992401 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttcctgatatcatgcgatagtct 15992500  T
Q  2268 taagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15992501 taagtgtgacactttgtggggtgttgcactcaaatcaaggtagaat-aaaattagatcaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 15992591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 2065 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 5837978 - 5837679
Alignment:
Q  2065 gagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgat 2158  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5837978 gagcttctctggtgcagtcatcaaactgacttttttgaaaaggttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgat 5837879  T
Q  2159 caatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatt 2258  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||     
T  5837878 caacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttgcaggtactattttgtcgttgtcatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatg 5837779  T
Q  2259 tgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatga 2358  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  5837778 tgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaatgtaggat-taaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatga 5837680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2359
Target Start/End: Original strand, 38527986 - 38528288
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattt------taatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38527986 agggagcttctacggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 38528085  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||| ||||||     
T  38528086 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgatatctttaacatgtaaatagatttgatgatatt 38528185  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||    
T  38528186 atgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaagat-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattga 38528284  T
Q  2356 tgat 2359  Q
    ||||    
T  38528285 tgat 38528288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 25500676 - 25500977
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgttag------attcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  25500676 gggagcttctacggtgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttagtatttgattcatttttaaattgttaattactgattaatg 25500775  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||    
T  25500776 atcaacagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatctaaagaaagttgctgatatca 25500875  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  25500876 tgtgatgatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattaaattaagtttattcttgttaatctgatgaattgat 25500974  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  25500975 gat 25500977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 22981218 - 22980917
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22981218 gggagcttctatggtgcagtcaggaaactgactttttaaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 22981119  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||  |||||| |    
T  22981118 atcaataataattcatctagtaatgattgcaacatcttggacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtttatgatatta 22981019  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  22981018 tgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 22980920  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  22980919 gat 22980917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 2064 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 39573235 - 39572943
Alignment:
Q  2064 ggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatga 2157  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39573235 ggagcttctacggtgcagttatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 39573136  T
Q  2158 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcat 2257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||        |||||| |||||||||    
T  39573135 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggcatctttaaca--------gagttgttgatatcat 39573044  T
Q  2258 ttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatg 2357  Q
     |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  39573043 gtgatagtctcgagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatg 39572945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 31705362 - 31705663
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattt------taatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31705362 gggagattctacggtgcagtcaagaaattgacttttttgaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 31705461  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||  |||||| |||||| |    
T  31705462 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtactattttatctttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta 31705561  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  31705562 tgtgatggtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 31705660  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  31705661 gat 31705663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 2064 - 2359
Target Start/End: Original strand, 31786397 - 31786697
Alignment:
Q  2064 ggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatga 2157  Q
    |||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31786397 ggagattctatggtgcaatcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 31786496  T
Q  2158 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcat 2257  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |||||| ||    
T  31786497 acaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaatcagagttgatgatattat 31786596  T
Q  2258 ttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatg 2357  Q
     ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||    
T  31786597 gtgatagttttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaagataggat-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 31786695  T
Q  2358 at 2359  Q
    ||    
T  31786696 at 31786697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 27330731 - 27330428
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||      ||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  27330731 aagggagcttctacggtgcagtcatgaaattgacttgtttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaa 27330632  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27330631 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatat 27330532  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
    |||  ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||    
T  27330531 catgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaat-aaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattg 27330433  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  27330432 atgat 27330428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 2064 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 9200648 - 9200357
Alignment:
Q  2064 ggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatga 2157  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9200648 ggagcttctacggtgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaaattaattttaattttaaattttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 9200549  T
Q  2158 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcat 2257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  9200548 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttatagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcat 9200449  T
Q  2258 ttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatg 2357  Q
     ||         ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  9200448 gtg---------agtgttacactttgtggaatgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatg 9200359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 22020050 - 22019756
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22020050 aagggaacttctacggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaa 22019951  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22019950 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttagacttacaagtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgctgatat 22019851  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
    ||| ||         ||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  22019850 catgtg---------agtgttatactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaagtg 22019761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Original strand, 35511230 - 35511528
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattt------taatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35511230 aagggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaa 35511329  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||||    
T  35511330 tgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatat 35511429  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
     || |||||||     |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  35511430 tatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattg 35511523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 40133812 - 40133509
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgttag------attcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  40133812 aagggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattca 40133713  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||| ||||||||||||  |||   ||||| ||||||    
T  40133712 tgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatat 40133613  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
     || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  40133612 tatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattg 40133514  T
Q  2355 atgat 2359  Q
     ||||    
T  40133513 ttgat 40133509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 2075 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 699563 - 699274
Alignment:
Q  2075 ggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaat 2168  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||      |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  699563 ggtgcagtcaggaaactgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaataatcaatagtaat 699464  T
Q  2169 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtctt 2268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||| || ||||||||||    
T  699463 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctt 699364  T
Q  2269 aagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  699363 aagtattacactttgtggagtgttacacttaaaataaggtatgat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 699274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 2075 - 2359
Target Start/End: Original strand, 8741647 - 8741937
Alignment:
Q  2075 ggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaat 2168  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  8741647 ggtgcagtcatgaaacagacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatt 8741746  T
Q  2169 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgat-atcatttgatagtct 2267  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||| || ||||| |||||||||    
T  8741747 tcatctagtgatgcttgcaacattttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctcataatcatgtgatagtct 8741846  T
Q  2268 taagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  8741847 taagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatga-caaaattagattaattgtattcttgttaatttgatgaattgatgat 8741937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 2108 - 2359
Target Start/End: Original strand, 30969125 - 30969375
Alignment:
Q  2108 ttaattttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggta 2207  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| | ||    
T  30969125 ttaattttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactgattaatgattaatagtaactcatctagtaatacttgcagcatcttgaacttatagata 30969224  T
Q  2208 ctattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaagg 2307  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  30969225 ctattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaag 30969324  T
Q  2308 taggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  30969325 taggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 30969375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 2064 - 2355
Target Start/End: Complemental strand, 12910779 - 12910483
Alignment:
Q  2064 ggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatt------ttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatga 2157  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||      |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  12910779 ggagcttctatggtgcagtcaggaaactgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgt 12910680  T
Q  2158 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcat 2257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||   |||||| |||||| ||    
T  12910679 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattgtattgttggcatctttaacatacaaccagagttgatgatattat 12910580  T
Q  2258 ttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||    
T  12910579 gtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcatgttaatctgatgaattga 12910483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 2060 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 22255610 - 22255306
Alignment:
Q  2060 aaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgatta 2153  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22255610 aaagggagcttctacggtacagtcaggaaactgactttttttaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatta 22255511  T
Q  2154 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgata 2253  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||   ||||| |||||    
T  22255510 atgatcaatagtaattcatctagtaaggcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatatttaacatgcaaacatagttgatgata 22255411  T
Q  2254 tcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaatt 2353  Q
    | || | ||||| |||||||||||| |||||| |||||||| || | |||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  22255410 ttatgtaatagttttaagtgttacactttgtgtggtgttacgcttataacaaaataggct-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 22255312  T
Q  2354 gatgat 2359  Q
    ||||||    
T  22255311 gatgat 22255306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 27318238 - 27318538
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaa-ttgttgattattgattaat 2155  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27318238 gggagtttctatggtgcagtcagaaaactgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaaattgttgatttttgattaat 27318337  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||||| ||||||     
T  27318338 gatcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaacatcttaaacttat--gtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatt 27318435  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||    
T  27318436 atgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattga 27318534  T
Q  2356 tgat 2359  Q
    ||||    
T  27318535 tgat 27318538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 36867188 - 36866886
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgttag------attcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  36867188 agggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcat 36867089  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    || ||||||||||||| ||||||||||||  |||   ||||| ||||||     
T  36867088 gattaatagtaattcatccagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatatt 36866989  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||     
T  36866988 atgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgt 36866890  T
Q  2356 tgat 2359  Q
    ||||    
T  36866889 tgat 36866886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 2069 - 2359
Target Start/End: Original strand, 22973838 - 22974133
Alignment:
Q  2069 ttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaat 2162  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22973838 ttctatggtgcagtcagaaaactgattttttttaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaat 22973937  T
Q  2163 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgat 2262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| || |  |||||||||||| |||  |||||| | |||| || | ||    
T  22973938 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgaaatctttaacatgcaaacagagttgataatattatgtaat 22974037  T
Q  2263 agtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||    
T  22974038 agtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacgcttataacaagataggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgat 22974133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 2065 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 32563563 - 32563273
Alignment:
Q  2065 gagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgat 2158  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||      ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  32563563 gagcttctacggtgcagttatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttaattgctgattaatgat 32563464  T
Q  2159 caatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatt 2258  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||     
T  32563463 caataataatttatctagtaattcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctataacatgcaaacagagttgctgatatcatg 32563364  T
Q  2259 tgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatga 2358  Q
    ||         ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  32563363 tg---------agtgttacactttgtgggctgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatga 32563274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 2055 - 2332
Target Start/End: Original strand, 2888187 - 2888469
Alignment:
Q  2055 aaaataaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaa------ttttaatgttagattcatttttaaattgttgattatt 2148  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||      |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  2888187 aaaatacagggggcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattact 2888286  T
Q  2149 gattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgc 2248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   | |||     
T  2888287 gattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatatttga 2888386  T
Q  2249 tgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgta 2332  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||  ||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  2888387 tgatattatctgatagtcttaagtgttacactttatggaatgttaaacttgaaacaaggtaaaat-aaaattagattaagtgta 2888469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 33908657 - 33908357
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  33908657 gggagcatctacggtgcagttagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatg 33908558  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  |||   |||||  ||||| |    
T  33908557 atcaatagtaatt-atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgacgatatta 33908459  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||  |||||  |||||||    
T  33908458 tgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgttacatttaaaacaaggtatgat-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgaataattgat 33908360  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  33908359 gat 33908357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 23115980 - 23116273
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||| |||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23115980 gggagtttctacggtgaagtcaggaaaatgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 23116079  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    ||||||||| |        ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || ||| |||||| |    
T  23116080 atcaatagtca--------gtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 23116171  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||    
T  23116172 tgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtaatattgttaatctgatgaattgat 23116270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 2069 - 2359
Target Start/End: Original strand, 7208620 - 7208915
Alignment:
Q  2069 ttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattt------taatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaat 2162  Q
    ||||||| |||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7208620 ttctacgttgcagttaagaaactgactttttttaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaat 7208719  T
Q  2163 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgat 2262  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||   |||| || ||||    
T  7208720 aataattcatctagtaatacttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgaaaatattatgtgat 7208819  T
Q  2263 agtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||  | | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  7208820 agtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgtttataacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 7208915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2340
Target Start/End: Complemental strand, 5830319 - 5830035
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagatt-catttttaaattgttgattattgatta 2153  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||| |||||||||      |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5830319 aaggaagcttctacggtgcagtcagaaaattgacattttggaaaa-gttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgatta 5830221  T
Q  2154 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgata 2253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  5830220 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgata 5830121  T
Q  2254 tcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgtt 2340  Q
    | || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  5830120 ttatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagat-aaaatgagattaagtgtagtcttgtt 5830035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 42343146 - 42342855
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42343146 gggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 42343047  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || |||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||| ||||||||    
T  42343046 atcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtcctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatca 42342947  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | ||         ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42342946 tgtg---------agtgttacactttgtggtgtattacacttaaaacaa-gtaagat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgat 42342858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 17157781 - 17158082
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaa------ttttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| ||      |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17157781 gggagcttctacggtacagtcaagaaattgacttttttgaaaaagtcaagtttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 17157880  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||  |||||| | |||| |    
T  17157881 atcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgttgaaatctttatcatgcaaacagagttgataatatta 17157980  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||| | ||||| | |||||||| |||||||  ||||||||||| ||    
T  17157981 tgtgatggtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataataaggtaagat-acaattatactaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaat 17158079  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  17158080 gat 17158082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 15724913 - 15724612
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaa------tgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    |||||||| || |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15724913 gggagcttttaaggtgaagtcatgaaactaatttttttgaaaaagttaattttaactttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 15724814  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||   |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||   ||||| ||||||||    
T  15724813 attaatagtaattcatctagtaatgcttacaatattttggacttacaagtactattttatagttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatca 15724714  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | |||||||||||| || |||| |||| || |||||| ||| |||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  15724713 tatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaat-aaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgat 15724615  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  15724614 gat 15724612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2328
Target Start/End: Complemental strand, 8437390 - 8437120
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgttag------attcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||       ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8437390 gggagcatctacgatgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttaattcatttttaaattgttgattactgattaatg 8437291  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||| | |||| |    
T  8437290 atcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacattcaaacagagttgatcatatta 8437191  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaag 2328  Q
    | ||||| ||||||||||||||  |||||||||||   ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8437190 tgtgataatcttaagtgttacacattgtggggtgtataacttaaaacaaggcaggat-aaaattagattaag 8437120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2278
Target Start/End: Complemental strand, 24886514 - 24886291
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24886514 aagggagcttttatggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaa 24886415  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||  |||||| ||||||    
T  24886414 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatat 24886315  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttaca 2278  Q
     || ||||||||||||||||||||    
T  24886314 tatgtgatagtcttaagtgttaca 24886291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 2067 - 2336
Target Start/End: Complemental strand, 25669997 - 25669733
Alignment:
Q  2067 gcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatca 2160  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25669997 gcttctacggtgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatca 25669898  T
Q  2161 atagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttg 2260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| ||    
T  25669897 atagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtg 25669798  T
Q  2261 atagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattct 2336  Q
             |||||||||  |||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25669797 ---------agtgttaca-cttgtggagtgttacacttaaaacaaagtaggat-aaaattagattaagtgtattct 25669733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 2111 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 35504736 - 35504489
Alignment:
Q  2111 attttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtacta 2210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||    
T  35504736 attttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacatgtacta 35504637  T
Q  2211 ttttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtag 2310  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||  || ||| | |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | || | |||||    
T  35504636 ttttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagatttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataatatggtag 35504537  T
Q  2311 gataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||  | |||||||||||||||    
T  35504536 gat-aaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgat 35504489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 2067 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 36860845 - 36860547
Alignment:
Q  2067 gcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatca 2160  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |    
T  36860845 gcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgcttgattcatttttaaattgttgattactaattcatgatta 36860746  T
Q  2161 atagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttg 2260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||| ||||||||||||  |||   ||||| |||||| || ||    
T  36860745 atagtaattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtg 36860646  T
Q  2261 atagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacac-tgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||| ||||    
T  36860645 atagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaaaaaaggtaggat-aaaattagattaaatgtactcttgttagtatgatgaattgttgat 36860547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 2059 - 2359
Target Start/End: Original strand, 13956110 - 13956413
Alignment:
Q  2059 taaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta--gattcattt--ttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||| || |||  | || |     ||||||||||||||| |||||||    
T  13956110 taaagagagcttctacggtgcagtcagaaagctgatttttttgaaaatgttaattttgattttaatgtttgaaaaagttaaattgttgattactgattaa 13956209  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   | ||| ||||||    
T  13956210 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactaacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatat 13956309  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
     || |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||| ||  || |||||||||||||||| | | |||||  ||||||||||||    
T  13956310 tatatgatagtcttaagtgttacgctttgtagggtgttacacttgaaacaagataaaat-aaaattagattaagtgaagttttgttaatctgatgaattg 13956408  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  13956409 atgat 13956413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 2108 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 7693595 - 7693354
Alignment:
Q  2108 ttaattttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggta 2207  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||    
T  7693595 ttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagta 7693496  T
Q  2208 ctattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaagg 2307  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||| ||         ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  7693495 ttattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctaatatcatgtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagg 7693405  T
Q  2308 taggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||| ||||  ||| |||||||||||||    
T  7693404 taagat-aaaattagattaagcgtattcatgttaatctaatgaattgatgat 7693354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Original strand, 28416299 - 28416578
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||      ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28416299 aagggagcttctacggtgcagtcatgaagctgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattgttgattaa 28416398  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||               |||||||||||||    
T  28416399 tgatcaatagtaattcatcaagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgttggcatc---------------gagttgctgatat 28416483  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
    ||| ||         ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  28416484 catgtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcagaat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattg 28416573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 122; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 2059 - 2359
Target Start/End: Original strand, 23954548 - 23954840
Alignment:
Q  2059 taaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatt------ttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgatt 2152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||  |||||||||||||||||||||||          
T  23954548 taaagggagcttctatggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgatta------ 23954641  T
Q  2153 aatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgat 2252  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||| |     ||||||| |||||    || ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||| ||||    
T  23954642 -atgatcaatagtaattcatcaagtaatgtt-----catcttgcacttacaaatattattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgat 23954734  T
Q  2253 atcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaat 2352  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||    
T  23954735 attatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaat 23954833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 119; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 2114 - 2327
Target Start/End: Original strand, 35826293 - 35826503
Alignment:
Q  2114 ttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattt 2213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  35826293 ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattt 35826392  T
Q  2214 tatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggat 2313  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||  |||||| ||||||  | ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||||||| |||| ||    
T  35826393 tatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatat--tatgataatcttaagggttacactttgtggagtgttacgcttaaaacaatgtagaat 35826490  T
Q  2314 aaaaattagattaa 2327  Q
     |||||||||||||    
T  35826491 -aaaattagattaa 35826503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 2108 - 2359
Target Start/End: Original strand, 21088570 - 21088817
Alignment:
Q  2108 ttaattttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggta 2207  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||   |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  | |     
T  21088570 ttaatcttaatgtttgattcatttttaaattg---attatttattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttggatttacagatg 21088666  T
Q  2208 ctattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaagg 2307  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  21088667 ttattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaagg 21088766  T
Q  2308 taggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||  | |||||||||| ||||    
T  21088767 taggat-aaagttagattaaatgtattcttgttagtatgatgaattgttgat 21088817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 108; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2278
Target Start/End: Original strand, 1428921 - 1429133
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgttagattcatttttaaattgttgattatt---gattaatga 2157  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||   ||||||  |||||||||| ||||   |||||||||    
T  1428921 aagggagcttctatggtgcactcatgaaactgacttttttggaaaagttaatt---atgata---tcattt--aaattgttgaatattactgattaatga 1429012  T
Q  2158 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcat 2257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  |||||| ||    
T  1429013 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaataaagtttatgatattat 1429112  T
Q  2258 ttgatagtcttaagtgttaca 2278  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  1429113 gtgatagtcttaagtgttaca 1429133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Original strand, 14409089 - 14409378
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaa------ttttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||      |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  14409089 aagggagcttctacggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaatttaattttaattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgaataa 14409188  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||| ||||||    
T  14409189 tgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 14409288  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
     ||  |||||||||||| ||               |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||    
T  14409289 tatgcgatagtcttaagagt--------------agttacacttaaaacaaggtagaat-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattg 14409373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 2060 - 2254
Target Start/End: Complemental strand, 25889798 - 25889598
Alignment:
Q  2060 aaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgatta 2153  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||      ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25889798 aaagggagcttctacgatgcagtcaggaaactgacttttctggaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgatta 25889699  T
Q  2154 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgata 2253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  25889698 atgatcaatagtaattcatctagtaatgctttcaacatcttggatttacaggtactattttattgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgata 25889599  T
Q  2254 t 2254  Q
    |    
T  25889598 t 25889598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 104; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2359
Target Start/End: Original strand, 43308409 - 43308703
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgttag------attcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    |||||||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||      |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  43308409 agggagcttcaatggtgcagttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttagtatttgattcgtttttaaattgttgatttctgattaat 43308508  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || || |||||||||||| ||   |||||| ||||       
T  43308509 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagaagagttgatgat--- 43308605  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
         |||||||||||||||||| |||   |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||   ||||||| ||||    
T  43308606 -----atagtcttaagtgttacacttttcagggtgttacacttataacaaggtaagat-aaaattagattaagtatagttttgttaagctgatgagttga 43308699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2281
Target Start/End: Complemental strand, 8467151 - 8466928
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttta------atgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||      ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  8467151 gggagtttctatggtgcaatcattaaactgattttttttaaaaagttaattttatttttaatgtttgattcatttttaaactgttgattactaattaatg 8467052  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    || ||||||||||||  || |||||| ||| |||  |||||| ||||||||    
T  8467051 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaataatattttatcgtt-acacctttaatatgtaaacagagttggtgatatca 8466953  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattt 2281  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  8466952 tatgatagtcttaagtgttacattt 8466928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 2155 - 2359
Target Start/End: Original strand, 6824329 - 6824530
Alignment:
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||| | ||||||| ||| ||||||||||||| |||  |||||||| ||||    
T  6824329 tgatcaatagtatctcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtattgttttatc-ttgacatctttaacatgcaaacagagttgct-atat 6824426  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  6824427 cttgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtatgat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaattg 6824525  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  6824526 atgat 6824530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 2087 - 2359
Target Start/End: Original strand, 14919313 - 14919579
Alignment:
Q  2087 aaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 2180  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||      |||||| |||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||          
T  14919313 aaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattttagatttctgattaatgatcaat-gtaattcatct------ 14919405  T
Q  2181 gcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacatt 2280  Q
    | |||||| |||||||||||||    || ||||||| ||||| |||||||||||| |||  |||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  14919406 gattgcaatatcttggacttat----acaattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaat 14919501  T
Q  2281 ttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||| ||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  | |||||| ||||||||    
T  14919502 ttgtgaggtgttacacttataataaggtaggat-aaaattagattaagtgtagttttgttaatatgatgagttgatgat 14919579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2222
Target Start/End: Complemental strand, 26269235 - 26269069
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||      | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26269235 agggagtttctacggtgcagtcatgaaactgacttttatgaaaaagttaattttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattactgattaat 26269136  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttgg 2222  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||  |||||  |||||||||||||| ||||    
T  26269135 gatcagtagtaatttatctagtattgcttacaacatcttaaacttacaggtactattttatccttgg 26269069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 2213 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 26268343 - 26268198
Alignment:
Q  2213 ttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtagga 2312  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  26268343 ttatccttgacatctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgcggtgttacacttaaaacaaggtatga 26268244  T
Q  2313 taaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    | |||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26268243 t-aaaatttgattaattgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 26268198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2183
Target Start/End: Complemental strand, 43254280 - 43254154
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43254280 gggagcttctatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 43254181  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgct 2183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  43254180 atcaatagtaattcatctagtaatgct 43254154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 1840 - 2045
Target Start/End: Original strand, 36150733 - 36150938
Alignment:
Q  1840 agtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttt-tcaaacgtt 1938  Q
    |||||||||  ||||||||| || ||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| | |  ||||||| ||||| |||    
T  36150733 agtaaatcaccaaattggtccctatctatgtactaaattctcaaattggtccctaactctatgaataactcaaaatggttcatgtcttttgtcaaatgtt 36150832  T
Q  1939 tctcaaattgatc-ctgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatgtttt 2037  Q
    ||||| |||  || |||   |||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||    
T  36150833 tctcagatttgtcactggctctattagt-gttttgtattt-gagtgttattgactcaatgtcttttggatattatttagtggttaatggcataatgcttt 36150930  T
Q  2038 ttggatct 2045  Q
    ||||||||    
T  36150931 ttggatct 36150938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1840 - 2017
Target Start/End: Complemental strand, 13932927 - 13932749
Alignment:
Q  1840 agtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgttt 1939  Q
    |||||| ||| ||||||||| || | ||| ||| |||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||| ||| ||   |||||| ||||||||||    
T  13932927 agtaaaccatcaaattggtccctatttttgtactaaattctcaaattgattctcgactctattaataactcaaaatggtcaatgtctttgtcaaacgttt 13932828  T
Q  1940 ctcaaattgatcc-tgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagt 2017  Q
    |||| ||||||||  ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  ||| ||||||||    
T  13932827 ctcagattgatccacgactctattagttattttgtattttgagtgttaatggctcaatatctttttaatactatttagt 13932749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1839 - 1978
Target Start/End: Complemental strand, 36151100 - 36150960
Alignment:
Q  1839 gagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtt 1938  Q
    ||||||||||  | |||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| || | |||||| |||||||||    
T  36151100 gagtaaatcaccatattggtccttgtatttgtaccaaattctcaaattggttcctaactctatgaataactcaaaatggtctctgtctttgtcaaacgtt 36151001  T
Q  1939 tctcaaattgat-cctgatcctattagttgttttgtatttt 1978  Q
    |||||||||||| || ||  || ||||||||||||||||||    
T  36151000 tctcaaattgatccccgactctcttagttgttttgtatttt 36150960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 2242 - 2359
Target Start/End: Original strand, 5112249 - 5112364
Alignment:
Q  2242 gagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttc 2341  Q
    |||||| |||||| || ||| |||||||||||||  | |||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||     
T  5112249 gagttgatgatattatgtgaaagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacatggtatgataaaa-ttagattaagtatagtcttgtta 5112346  T
Q  2342 ctctgatgaattgatgat 2359  Q
     | | |||||||||||||    
T  5112347 atttaatgaattgatgat 5112364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2106
Target Start/End: Complemental strand, 11898240 - 11898197
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaa 2106  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11898240 gggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaa 11898197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 2058 - 2108
Target Start/End: Original strand, 8762855 - 8762905
Alignment:
Q  2058 ataaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagt 2108  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  8762855 ataaagggagcttctatggtgcagtcaaaaaaatgacttttttaaaaaagt 8762905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 2065 - 2110
Target Start/End: Complemental strand, 21321132 - 21321087
Alignment:
Q  2065 gagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagtta 2110  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21321132 gagcttctatggtgcagccagaaaactgacttttttgaaaaagtta 21321087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2299 - 2359
Target Start/End: Original strand, 1429137 - 1429196
Alignment:
Q  2299 aaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||||||||    
T  1429137 aaaacaaggtaggat-aaaattagattaaatgtagtcttgttaatttgatgaattgatgat 1429196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2299 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 8466927 - 8466868
Alignment:
Q  2299 aaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  8466927 aaaacaaggtagaataaaa-ttaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgat 8466868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2113
Target Start/End: Original strand, 34853843 - 34853895
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatt 2113  Q
    ||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||    
T  34853843 aagggagcttctatggtgcagtcgggaaactgacttttttggaaaagttaatt 34853895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 189; Significance: 1e-101; HSPs: 70)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2359
Target Start/End: Original strand, 16446640 - 16446942
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattt------taatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16446640 agggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgttagattcatttttaaattgttgattactgattaat 16446739  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  || ||| ||||||     
T  16446740 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatt 16446839  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  16446840 atgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggat-aaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattga 16446938  T
Q  2356 tgat 2359  Q
    ||||    
T  16446939 tgat 16446942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2060 - 2359
Target Start/End: Original strand, 5299709 - 5300013
Alignment:
Q  2060 aaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgttag------attcatttttaaattgttgattattgatta 2153  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5299709 aaagggagcttctatggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgatta 5299808  T
Q  2154 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgata 2253  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||| |||   | |||||||||    
T  5299809 atgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacaaaattgctgata 5299908  T
Q  2254 tcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaatt 2353  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5299909 tcatttgataatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 5300007  T
Q  2354 gatgat 2359  Q
    ||||||    
T  5300008 gatgat 5300013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2069 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 44869915 - 44869620
Alignment:
Q  2069 ttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaat 2162  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  44869915 ttctacgatgcagttatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttggttactgattaatgatcaat 44869816  T
Q  2163 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgat 2262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  44869815 agtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttatcggtactattttatcgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatttgat 44869716  T
Q  2263 agtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||    
T  44869715 agtcttaagtgttacactttgtgggg-acaacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattattgttaatctgataaattgatgat 44869620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 38644402 - 38644101
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  38644402 gggagcttttacggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaatttttgattactgattaatg 38644303  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||||| || |||  |||||||||||||||    
T  38644302 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctgatatca 38644203  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  38644202 tatgatagtcttgagtgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgat 38644104  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  38644103 gat 38644101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 2060 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 11727452 - 11727147
Alignment:
Q  2060 aaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgac-ttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgatt 2152  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11727452 aaagggagcttctacggtgcagtcatgaaattgacattttttaaaaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactgatt 11727353  T
Q  2153 aatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgat 2252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||| ||||    
T  11727352 aatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacattcaaacaaagttgttgat 11727253  T
Q  2253 atcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaat 2352  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||    
T  11727252 atcatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggat-aaaattagattaaatgtattcttgttaatttgatgaat 11727154  T
Q  2353 tgatgat 2359  Q
    |||||||    
T  11727153 tgatgat 11727147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2359
Target Start/End: Original strand, 1149397 - 1149699
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattt------taatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||      ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1149397 agggagcttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaat 1149496  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   ||||| | ||||     
T  1149497 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgataatatt 1149596  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||    
T  1149597 atgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttga 1149695  T
Q  2356 tgat 2359  Q
    ||||    
T  1149696 tgat 1149699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2359
Target Start/End: Original strand, 37970284 - 37970586
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37970284 agggagcttctatggtgcagtcaggaaagtgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaat 37970383  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||| |||  |||||| ||||||     
T  37970384 gatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtaaggatctttaacatgcaaacagagttgatgatatt 37970483  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||  |||||||||    
T  37970484 atgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatgaattga 37970582  T
Q  2356 tgat 2359  Q
    ||||    
T  37970583 tgat 37970586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Original strand, 36694730 - 36695033
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagtta------attttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||||||||      ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| | ||| |    
T  36694730 aagggagcttctacgatgcagtgaagaaactgatttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttatttttaaattattgattacttattca 36694829  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||    
T  36694830 tgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttggatttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatat 36694929  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  36694930 tatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggat-aaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattg 36695028  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  36695029 atgat 36695033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Original strand, 43643359 - 43643662
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  43643359 aagggagcttctatggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaa 43643458  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| || || || ||||||||| |||  |||||| | ||||    
T  43643459 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatat 43643558  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||| |||    
T  43643559 tatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggat-aaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttg 43643657  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  43643658 atgat 43643662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2357
Target Start/End: Original strand, 4132452 - 4132750
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgttag------attcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||       |||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  4132452 gggagcttctatggtgcagtcagcaaactgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtgtaattcatttttaaattgttgattacaaattaatg 4132551  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||| |    
T  4132552 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 4132651  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  4132652 tgtgatagtcttatgtgttacactttgtggggtgttacact-taaacaaggtagaat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgat 4132749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 1205351 - 1205050
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaat------gttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||      ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  1205351 gggagcttctacggtgtagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttgatcttgttgtttgattcatttttaaattgctgattagtgattaatg 1205252  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||| |||  |||||| |||||| |    
T  1205251 atcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta 1205152  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||  | ||||||| ||||    
T  1205151 tgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaagat-aaaattagattaagtgtaatcttgttaatatgatgaactgat 1205053  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  1205052 gat 1205050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 2060 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 34895389 - 34895090
Alignment:
Q  2060 aaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgatta 2153  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34895389 aaagggagcttctacggtgcagttaggaaattgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatta 34895290  T
Q  2154 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgata 2253  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || ||| |||||    
T  34895289 atgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttttcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgata 34895190  T
Q  2254 tcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaatt 2353  Q
    | || |||||||     |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  34895189 ttatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 34895096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 2066 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 466253 - 465965
Alignment:
Q  2066 agcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatc 2159  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  466253 agcttctacggtgcagtcatgaaactgatttttttgaataagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatc 466154  T
Q  2160 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcattt 2259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| || |    
T  466153 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtattattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat-atgt 466055  T
Q  2260 gatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |         ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  466054 g---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 465965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 7890723 - 7891024
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7890723 gggagcttctacggtgcggtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 7890822  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||| ||   |||||| |||||| |    
T  7890823 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaccagagttgatgatatta 7890922  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| || | ||||| ||| ||| |||| |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  7890923 tgtgataatcttaagtgttacacgttgtggggtgttacgcttataacaaagtaagat-aaaactagattgagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 7891021  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  7891022 gat 7891024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 33906634 - 33906335
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||      ||||||||||||||||  |||||  |||||||||    
T  33906634 gggagcttctacagtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttactattcgattcatttttaaatt--tgattgctgattaatg 33906537  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||| |||||| |    
T  33906536 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 33906437  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||| |||  |||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||    
T  33906436 tgcgatagtcttaagtgttacactttttggaatgttacccttaaaacaaggtatgat-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 33906338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 2069 - 2356
Target Start/End: Original strand, 1953760 - 1954053
Alignment:
Q  2069 ttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaat 2162  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||      |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1953760 ttctacggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgattattgattaatgatcaat 1953859  T
Q  2163 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgat 2262  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||||||||| |||  |||||| |||| | || ||||    
T  1953860 agtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggatttacaggtactattttatcgttgacaactttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgat 1953959  T
Q  2263 agtcttaagtgttacattttgtgggg-tgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| || | ||  ||||||||||||||    
T  1953960 agtcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtatgat-aaaattagatttagtgtagtcatattaatctgatgaattgat 1954053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 2114 - 2355
Target Start/End: Original strand, 6098336 - 6098581
Alignment:
Q  2114 ttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattt 2213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||     
T  6098336 ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattg 6098435  T
Q  2214 tat-----cgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggt 2308  Q
    |||     ||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  6098436 tattgtatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagat 6098535  T
Q  2309 aggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||    
T  6098536 aggat-aaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattga 6098581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 2069 - 2355
Target Start/End: Original strand, 39098891 - 39099182
Alignment:
Q  2069 ttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaa------ttttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaat 2162  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||      |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  39098891 ttctacggtgcaatcatgaaactgatttttttaaaaaaattaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattattgattattaattaatgatcaat 39098990  T
Q  2163 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgat 2262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||  |||    
T  39098991 agtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacatatactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgat 39099090  T
Q  2263 agtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    |||||||||||| | | |||||||| ||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  39099091 agtcttaagtgtgatactttgtgggatgttacacttaaaacagggtaagat-aaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatgaattga 39099182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 8803582 - 8803884
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||| || |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||      |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8803582 gggagtttttacggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttcattactgattaatg 8803681  T
Q  2157 atcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||     
T  8803682 atcaatagtatattcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatatt 8803781  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||   ||||| ||||||    
T  8803782 atgtgatagtattaagtgttacactttttagggtgttacgcttagaacaaggtatgat-aaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattga 8803880  T
Q  2356 tgat 2359  Q
    ||||    
T  8803881 tgat 8803884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 2123 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 9864506 - 9864271
Alignment:
Q  2123 gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttgg 2222  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  9864506 gattcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagttattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgttgg 9864407  T
Q  2223 catctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattag 2322  Q
    ||||||||||||| |||   | ||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  9864406 catctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattat 9864308  T
Q  2323 attaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  9864307 attaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgat 9864271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 2095 - 2359
Target Start/End: Original strand, 27082636 - 27082905
Alignment:
Q  2095 ttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 2188  Q
    |||||||||||||||||||||      ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  27082636 ttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgataagtagtaattcatctagtaatgcttgcaa 27082735  T
Q  2189 catcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtgggg 2288  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||  |||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27082736 catcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgcgggg 27082835  T
Q  2289 tgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||| ||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||    
T  27082836 tgttagacttaaaacatggtaagat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgat 27082905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 2111 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 16223233 - 16222986
Alignment:
Q  2111 attttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtacta 2210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||    
T  16223233 attttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtacta 16223134  T
Q  2211 ttttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtag 2310  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||| |||   ||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||| ||    
T  16223133 ttttatcattggaatctttaaaatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatactcttaagtgttacactttttggggtgttacgtttaaaacaaggaag 16223034  T
Q  2311 gataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||    
T  16223033 gat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgat 16222986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 2108 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 12876483 - 12876232
Alignment:
Q  2108 ttaattttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggta 2207  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||   |||    
T  12876483 ttaattttaatgtttgatttattttcaaactgttgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtaatgcctgtaacatcttggacttacatgta 12876384  T
Q  2208 ctattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtc-ttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaag 2306  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||| |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||    
T  12876383 ctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataag 12876284  T
Q  2307 gtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||    
T  12876283 gtaggat-aaaattagattaagtgtatccttcttaatctgatgaattgatgat 12876232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2359
Target Start/End: Original strand, 30654348 - 30654650
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||      |||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  30654348 agggagtttctacggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttt-aaattgttaattactgattaat 30654446  T
Q  2156 gatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||  ||||||    
T  30654447 gatcaataatatattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatttttaacatgcaaatagagtttatgatat 30654546  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||| ||| | | ||||||| |||||||||| |||||||   |||||||| ||    
T  30654547 tatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaatgtatggt-aaaattaaattaagtgtagtcttgttaacctgatgaagtg 30654645  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  30654646 atgat 30654650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 2095 - 2359
Target Start/End: Original strand, 23854229 - 23854498
Alignment:
Q  2095 ttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 2188  Q
    |||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23854229 ttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 23854328  T
Q  2189 catcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtgggg 2288  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| || || |||||||||||| ||   |||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| ||| || ||    
T  23854329 catcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagcagagttgatgatattatgtgattgtcttaagtgttacactttatgcgg 23854428  T
Q  2289 tgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||||| | ||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| | |||||  ||| |||| ||||||||    
T  23854429 tgttacacttataactaggtaagat-aaaattagattaattgtagtattgttaatctaatgagttgatgat 23854498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 2077 - 2359
Target Start/End: Original strand, 35459491 - 35459778
Alignment:
Q  2077 tgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattc 2170  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35459491 tgcagttagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattc 35459590  T
Q  2171 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaa 2270  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||  | ||||||||||| || |  |||||||||||  |||  || ||| |||||| || | ||||||||||    
T  35459591 atctagtaatgtttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcgaaatctttaacatacaaacagaattgatgatattatgtaatagtcttaa 35459690  T
Q  2271 gtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||| | | |||||| ||||||| | | ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||    
T  35459691 gtgttataatctgtgggatgttacatttataacaaagtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgat 35459778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 2060 - 2235
Target Start/End: Complemental strand, 35859361 - 35859180
Alignment:
Q  2060 aaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgatta 2153  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35859361 aaagggagtttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatta 35859262  T
Q  2154 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatg 2235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35859261 atgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaacatctcgaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatg 35859180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 2108 - 2340
Target Start/End: Complemental strand, 40862793 - 40862561
Alignment:
Q  2108 ttaattttaatgttagattcattttt-aaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggt 2206  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  40862793 ttaatcttaatgtttgattcattttttaaattgtcgattactgatttatgacaaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgt 40862694  T
Q  2207 actattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaag 2306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||   ||||| | |||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||     
T  40862693 actattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttagaacaaa 40862594  T
Q  2307 gtaggataaaaattagattaagtgtattcttgtt 2340  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  40862593 gtaggat-aaaattagattaagtgtatttttgtt 40862561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 2050 - 2359
Target Start/End: Original strand, 10554957 - 10555269
Alignment:
Q  2050 aagataaaataaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaag-ttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttg 2142  Q
    |||| |||| || ||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||      |||||| |||||||||||||||||||     
T  10554957 aagaaaaaaaaatgggagcttctatggtgcggtcagaaaattgacttttttgaaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttt 10555056  T
Q  2143 attattgattaatgatcaatagt--aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaat 2240  Q
    |||| |   ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| || || |||||||||||| |||     
T  10555057 attact---taatgatcaatagtgtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaac 10555153  T
Q  2241 tgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgtt 2340  Q
      ||||| |||||| || ||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| | || | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  10555154 aaagttgatgatattatgtgatagtc--aagtgttacgttttgtgaggtgttgcgcttataacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgtt 10555250  T
Q  2341 cctctgatgaattgatgat 2359  Q
      |||||||||||||||||    
T  10555251 aatctgatgaattgatgat 10555269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 2068 - 2336
Target Start/End: Complemental strand, 18259498 - 18259229
Alignment:
Q  2068 cttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaa 2161  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  18259498 cttctatggtgcagtcatgaaattgacttttttgaaaaggttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattactcattactgatcaa 18259399  T
Q  2162 tagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttga 2261  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| | |||    
T  18259398 caataattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaattaaattgctgatatcttgtga 18259299  T
Q  2262 tagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattct 2336  Q
        |||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  18259298 ----cttaggtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtatgat-aaaattaaattaaatgtattct 18259229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 2066 - 2257
Target Start/End: Original strand, 34951826 - 34952023
Alignment:
Q  2066 agcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatc 2159  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34951826 agcttctacggtgcaatcatgaaactgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatc 34951925  T
Q  2160 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcat 2257  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  34951926 aatagtaattcatgtagtaagacttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcat 34952023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2226
Target Start/End: Complemental strand, 33198227 - 33198057
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33198227 agggagcttctacggtgcaatcatgaaattgacttttttgaaaaagttaatcttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaat 33198128  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatc 2226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  33198127 gatcaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttggcatc 33198057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 2064 - 2359
Target Start/End: Original strand, 31933653 - 31933953
Alignment:
Q  2064 ggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatga 2157  Q
    |||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||      ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  31933653 ggagcttctatggtgcagttgggaaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatga 31933752  T
Q  2158 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcat 2257  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||   |||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||  || ||| |||||| ||    
T  31933753 tcaataataattcatctagtaatgtctgcaatatcttagacttacaagtactattttattgttggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattat 31933852  T
Q  2258 ttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatg 2357  Q
     ||||| | |||||||||||| |||||| ||| |||  || | ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  31933853 gtgataattttaagtgttacactttgtgcggtattatgcttataacaaggtatgat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatg 31933951  T
Q  2358 at 2359  Q
    ||    
T  31933952 at 31933953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 2167 - 2356
Target Start/End: Complemental strand, 13307936 - 13307749
Alignment:
Q  2167 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtc 2266  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||  |||||| ||||||||| ||||||||    
T  13307936 attcatcttgtaatgcttgcaacatcttgaacttacgggtactattttatcgttgacat-tttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtc 13307838  T
Q  2267 ttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  13307837 ttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaataaagtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgctaatctgatgaattgat 13307749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 2108 - 2297
Target Start/End: Original strand, 24823211 - 24823392
Alignment:
Q  2108 ttaattttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggta 2207  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  24823211 ttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgta 24823310  T
Q  2208 ctattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacact 2297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||||||| ||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  24823311 ctattttatcgttggcatctttaaca--------gagttgttgatatcatgtgataatcttgagtattatactttgtggggtgttacact 24823392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 2088 - 2247
Target Start/End: Complemental strand, 12587981 - 12587816
Alignment:
Q  2088 aactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 2181  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||      |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12587981 aactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 12587882  T
Q  2182 cttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttg 2247  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  12587881 cttgcaaaatctttgacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttg 12587816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 2204 - 2359
Target Start/End: Original strand, 41910902 - 41911055
Alignment:
Q  2204 ggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaac 2303  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  41910902 ggtaatattttatcgttg-catctttaacatgcaaacagagttggtgatatcatgtgatagtattaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaac 41911000  T
Q  2304 aaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  41911001 aaggtaggat-aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 41911055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 2127 - 2287
Target Start/End: Original strand, 1149756 - 1149912
Alignment:
Q  2127 catttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatc 2226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| |||    
T  1149756 catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggaatc 1149855  T
Q  2227 tttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggg 2287  Q
    ||||||||| |||   ||||| |||||| || |    ||||||||||||||| ||||||||    
T  1149856 tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgt----gtcttaagtgttacactttgtggg 1149912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 1832 - 2033
Target Start/End: Complemental strand, 5074627 - 5074425
Alignment:
Q  1832 tttaaatgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttc 1931  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||| ||  | ||||| |||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||    
T  5074627 tttatatgagtaaaccatcaaattgatccatatctttgtaccaaattctcaaattggtccctgtctctattaataactcaaaatggtccctgtctttgtc 5074528  T
Q  1932 aaacgtttctcaaattgat-cctgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcata 2030  Q
    ||| |||| ||| |||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||    
T  5074527 aaatgtttttcagattggttcctgactctattagttgttttgtattttgagtgttaatgactcaatgtcttttggatattatttggtggttaatggcata 5074428  T
Q  2031 atg 2033  Q
    |||    
T  5074427 atg 5074425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 2211 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 43025972 - 43025825
Alignment:
Q  2211 ttttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtag 2310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  43025972 ttttatcgttgacatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacattttgtggggtgttacagttaaaataaggtag 43025873  T
Q  2311 gataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  43025872 gat-aaaattagattaaatgtattcttcttagtctgatgaattgatgat 43025825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 1862 - 2017
Target Start/End: Original strand, 42026966 - 42027122
Alignment:
Q  1862 tgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtttctcaaattgatcc-tgatccta 1960  Q
    ||||||| |||||||||   |||||| ||||  ||| |||||||||||||| ||| |   ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||  |||    
T  42026966 tgtctttttaccaaatttttaaattggtccccgactttattaataactcaaaatgtttttcgtctttgtcaaacctttctcaaattgatccgtgactcta 42027065  T
Q  1961 ttagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagt 2017  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42027066 ttaattgttttgtattttgagttttaatgactcaatgtcttttggatattatttagt 42027122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 2064 - 2180
Target Start/End: Complemental strand, 41362845 - 41362723
Alignment:
Q  2064 ggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatga 2157  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||      ||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  41362845 ggagcttctatggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactggttaatga 41362746  T
Q  2158 tcaatagtaattcatctagtaat 2180  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  41362745 tcaatagtaattcatctagtaat 41362723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 1871 - 2017
Target Start/End: Complemental strand, 23488922 - 23488776
Alignment:
Q  1871 accaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtttctcaaattgatcct-gatcctattagttgtt 1969  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| |||| ||| || | |||||| |||||  ||||||| |||| |||| ||  |||||||| |||    
T  23488922 accaaattctcaaattggtccctgactctatgaataattcaaaatggtctctgtctttgtcaaatatttctcagattggtccttgactctattagt-gtt 23488824  T
Q  1970 ttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagt 2017  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23488823 ttgtattttgagtgttaatgactcaatgtcttttggatattatttagt 23488776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1838 - 2017
Target Start/End: Original strand, 16997092 - 16997274
Alignment:
Q  1838 tgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgt 1937  Q
    |||||||| ||| ||||||||| || ||||| |||||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||   |||||| ||||| ||    
T  16997092 tgagtaaaccatcaaattggtccctatctttgtaccaaattatcaatttggttcctaactctattaataactcaaaatggtctttgtctttgtcaaatgt 16997191  T
Q  1938 ttctcaaattgatcc---tgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagt 2017  Q
    ||||||  ||| |||   |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| ||||||||||||    
T  16997192 ttctcatgttggtccacatgactctattagttgttttgtattttgagttttaatggttcaatgtcttttgaatattatttagt 16997274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1839 - 2045
Target Start/End: Original strand, 42950341 - 42950548
Alignment:
Q  1839 gagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtt 1938  Q
    ||||||| ||| ||||||||   ||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||   | | || ||||| |||    
T  42950341 gagtaaaccatcaaattggttcttgtctttgtatcaaattttcaatttgatccctaactttattaataactcaaaatgatctatgccgttgtcaaatgtt 42950440  T
Q  1939 tctcaaattgatcctgatc-ctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatgtttt 2037  Q
    ||||| |||| |||  | | || ||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||||||| ||    
T  42950441 tctcagattggtccctaactctgttaattgttttgtattttgagtgttaatggttcaatgtcttttgaatattatttagtggctaataacataatgtctt 42950540  T
Q  2038 ttggatct 2045  Q
    ||||||||    
T  42950541 ttggatct 42950548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 2288 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 7998488 - 7998417
Alignment:
Q  2288 gtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  7998488 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgtattgatgat 7998417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1958 - 2032
Target Start/End: Original strand, 41480626 - 41480700
Alignment:
Q  1958 ctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataat 2032  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||    
T  41480626 ctattagttgttttgtattttgagtgttaatgactcaatgtcttttgaatattatttagtggttaatggcataat 41480700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 1861 - 2013
Target Start/End: Original strand, 38225454 - 38225607
Alignment:
Q  1861 ctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtttctcaaattgatc-ctgatcct 1959  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||   || ||| |||||  ||| ||| |||| || ||||  ||    
T  38225454 ctgtctttgtaccaaattctcaatttggtcccttactctattaataactcaaaatggtcttggtatttgtcaaatatttttcagattggtctctgactct 38225553  T
Q  1960 attagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatt 2013  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  38225554 attagttgttttgcattttaagtgttaatggctcaatgtcttttggatattatt 38225607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 2108 - 2181
Target Start/End: Complemental strand, 43026047 - 43025974
Alignment:
Q  2108 ttaattttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 2181  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  43026047 ttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatcactgattcatgatcaatagtaatttatctaataatg 43025974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1833 - 1980
Target Start/End: Complemental strand, 23489070 - 23488923
Alignment:
Q  1833 ttaaatgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttca 1932  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||| ||   |||||| |||    
T  23489070 ttaaatgagtaaatcaccaaattgatccttgtctttgtaccaaattctcaaattggtccatgactctatgaataactcaaaatggtcattgtctttgtca 23488971  T
Q  1933 aacgtttctcaaattgatcc-tgatcctattagttgttttgtattttga 1980  Q
    || ||||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||||||||||||    
T  23488970 aatgtttctcaaattggtccttgactctattag-tgttttgtattttga 23488923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1958 - 2045
Target Start/End: Original strand, 11732713 - 11732800
Alignment:
Q  1958 ctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatgttttttggatct 2045  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  11732713 ctatttgttgttttgtattttgagtgttaatgactcaatatcatttgaatattatttagtggttaatggcataatgcattttggatct 11732800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 2160 - 2235
Target Start/End: Complemental strand, 34463792 - 34463720
Alignment:
Q  2160 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatg 2235  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34463792 aatagtaattcatttagtaatgcttgcaacat---ggacttataggtattattttatcgttgacatctttaacatg 34463720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1838 - 1978
Target Start/End: Complemental strand, 41480876 - 41480735
Alignment:
Q  1838 tgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgt 1937  Q
    |||||||||||| || || ||| || ||||| |||||||||| || |||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| |  | |||||| |||||| |    
T  41480876 tgagtaaatcatcaatttagtccctatctttgtaccaaattctcatattgttccctgactttattaataactcaaaatggttactgtctttgtcaaacat 41480777  T
Q  1938 ttctcaaattgatcc-tgatcctattagttgttttgtatttt 1978  Q
    || ||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  41480776 ttttcatattgatccttgactctattagttgttttgtatttt 41480735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 2280 - 2359
Target Start/End: Original strand, 1150094 - 1150172
Alignment:
Q  2280 tttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||    
T  1150094 tttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgat 1150172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 2203 - 2278
Target Start/End: Complemental strand, 7998556 - 7998481
Alignment:
Q  2203 cggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttaca 2278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  7998556 cggtactattttatcgttggcatctttaatatagaaacagagttgttgatattatgtgatagtattaagtgttaca 7998481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 2064 - 2134
Target Start/End: Complemental strand, 9864594 - 9864522
Alignment:
Q  2064 ggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta--gattcattttta 2134  Q
    |||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  9864594 ggagcttctaaggtgcagttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattcattttta 9864522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 1960 - 2045
Target Start/End: Original strand, 18385845 - 18385930
Alignment:
Q  1960 attagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatgttttttggatct 2045  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||  |||||||| ||||| ||||    
T  18385845 attaattgttttgtattttaagtgttaatgactcaatatcttttgaatattatttagtggttaatgacataatgtcttttgaatct 18385930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1861 - 1948
Target Start/End: Original strand, 7905655 - 7905742
Alignment:
Q  1861 ctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtttctcaaattg 1948  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||    
T  7905655 ctgtctttgtaccaaattttcaaattagtccctgactctattaataactcaaaatgatctctgtctttatcaaacgtttttcagattg 7905742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 2288 - 2359
Target Start/End: Original strand, 34952028 - 34952098
Alignment:
Q  2288 gtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||    
T  34952028 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttattaatttgatgaattgatgat 34952098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2118
Target Start/End: Complemental strand, 13308005 - 13307948
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaat 2118  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13308005 aagggagcttctatggtgcaatcatgaaattgactattttgaaaaagttaattttaat 13307948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2110
Target Start/End: Original strand, 30650897 - 30650946
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagtta 2110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  30650897 aagggagcttctacggtgcagtcaagaaattgacttttttgaaaaagtta 30650946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2118
Target Start/End: Original strand, 41910822 - 41910879
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaat 2118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  41910822 aagggagcttctatggtgcagtcattaatttgacttttttaaaaaagttaattttaat 41910879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 1891 - 1978
Target Start/End: Original strand, 5074303 - 5074391
Alignment:
Q  1891 cctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtttctcaaattgat-cctgatcctattagttgttttgtatttt 1978  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| || |||  |||||| |||||||||||||    
T  5074303 cctaactctatgaataactcaaaataatctctgtctttgtcaaatgtttctcaaattgatccccgattttattagctgttttgtatttt 5074391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2096
Target Start/End: Complemental strand, 7998592 - 7998558
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgactt 2096  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7998592 agggagcttctacggtgcagtcatgaaactgactt 7998558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2259 - 2297
Target Start/End: Complemental strand, 12585338 - 12585300
Alignment:
Q  2259 tgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacact 2297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12585338 tgatagtattaagtgttagattttgtggggtgttacact 12585300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2289 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 41362707 - 41362638
Alignment:
Q  2289 tgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || |||| || |||||||  |||||||||||||||||    
T  41362707 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaa-ttatatcaagtttagtcttgttaatctgatgaattgatgat 41362638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 2068 - 2109
Target Start/End: Original strand, 6446181 - 6446222
Alignment:
Q  2068 cttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagtt 2109  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  6446181 cttctacggtgcagtcaagaaactgacttttttaaaaaagtt 6446222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 2067 - 2108
Target Start/End: Complemental strand, 34463954 - 34463913
Alignment:
Q  2067 gcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagt 2108  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  34463954 gcttctacggtgcagtcataaaattaacttttttaaaaaagt 34463913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 1843 - 1952
Target Start/End: Complemental strand, 42027308 - 42027199
Alignment:
Q  1843 aaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtttctc 1942  Q
    |||||| |||||| |||  ||||||| ||| ||||||  |||||| || || ||||||||||||||| || ||| | |  |||||| |||||  ||||||    
T  42027308 aaatcactaaattagtcattgtctttatacaaaattcttaaattggtctctgactctattaataacttaaaatggttcttgtctttgtcaaatctttctc 42027209  T
Q  1943 aaattgatcc 1952  Q
    ||||||||||    
T  42027208 aaattgatcc 42027199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 1895 - 1971
Target Start/End: Complemental strand, 42950654 - 42950577
Alignment:
Q  1895 actctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtttctcaaattgatc-ctgatcctattagttgtttt 1971  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||   |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  42950654 actctattaataactcaaaatggtcattgtctttgtcaaacatttctcatattgatctctgactctattagttgtttt 42950577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 183; Significance: 4e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 2064 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 12332 - 12033
Alignment:
Q  2064 ggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatga 2157  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||      |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12332 ggagcttctacggtgcagtcatgaaacttacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatt-atttttaaattgttgattactgattaatga 12234  T
Q  2158 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcat 2257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  12233 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcat 12134  T
Q  2258 ttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatg 2357  Q
      ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12133 gcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaagataggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatg 12035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 183; Significance: 4e-98; HSPs: 72)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 2064 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 39393804 - 39393503
Alignment:
Q  2064 ggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgttag------attcatttttaaattgttgattattgattaatga 2157  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39393804 ggagcttctacgcggcagtcatgaaattgacttttttaaaaaagttaattttaattttaatgttttattcatttttaaattgttgattactgattaatga 39393705  T
Q  2158 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcat 2257  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  39393704 tcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggatttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctaatatcat 39393605  T
Q  2258 ttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatg 2357  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  39393604 atgatagtcttaagtgttacactttgtaggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagatgaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatg 39393505  T
Q  2358 at 2359  Q
    ||    
T  39393504 at 39393503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 27532737 - 27533036
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||      ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27532737 gggagcttctacggtgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaa-ttgttgattactgattaatg 27532835  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||    
T  27532836 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttgcaaacagaattgctgatatca 27532935  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27532936 tgtgatagtcttgagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa--ttgattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgat 27533033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 2069 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 38823629 - 38823334
Alignment:
Q  2069 ttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaat 2162  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||      | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38823629 ttctacggtgcagtcatgaaactgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatatttgtttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaat 38823530  T
Q  2163 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgat 2262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| ||||    
T  38823529 agtaattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacaggtattattttatcgttggcatctctaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgat 38823430  T
Q  2263 agtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  38823429 agtcttaagtgttacactttgttgggtgttacacttaaaataaagtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 38823334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 47279613 - 47279309
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgactttttt-gaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgatta 2153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  47279613 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgattttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaatta 47279514  T
Q  2154 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgata 2253  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||   ||||| |||||    
T  47279513 atgatcaatagtaattcatctaataatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgata 47279414  T
Q  2254 tcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaatt 2353  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  47279413 tcatgtgatagtcttaagtgttacactttatgggatgttacaattaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 47279315  T
Q  2354 gatgat 2359  Q
    ||||||    
T  47279314 gatgat 47279309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 7078818 - 7079119
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||| || |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7078818 gggagtttttacggtacagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatg 7078917  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||    
T  7078918 atcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatca 7079017  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  7079018 tgtgatagtcttaagtcttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgat 7079116  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  7079117 gat 7079119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2358
Target Start/End: Complemental strand, 2960169 - 2959869
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2960169 gggatcttctacggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 2960070  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||   | ||| |||||| |    
T  2960069 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatttgatgatatta 2959970  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  2959969 tgtgatagtcttaagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgat 2959871  T
Q  2357 ga 2358  Q
    ||    
T  2959870 ga 2959869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2057 - 2356
Target Start/End: Complemental strand, 3535350 - 3535055
Alignment:
Q  2057 aataaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattga 2150  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||      ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3535350 aataaagggagcttctacggtgtagtcatgaaactgattttttttaaaaagttagttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttga 3535251  T
Q  2151 ttaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctg 2250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  3535250 ttaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctg 3535151  T
Q  2251 atatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatga 2350  Q
    |||||||          ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  3535150 atatcat---------gtaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggcaggat-aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatga 3535061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 2057 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 32216482 - 32216175
Alignment:
Q  2057 aataaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattga 2150  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  32216482 aatatagggagcttctacggtgcagtcagaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactga 32216383  T
Q  2151 ttaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctg 2250  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||  ||    
T  32216382 ttaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtttatg 32216283  T
Q  2251 atatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatga 2350  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| || | |||||  ||| ||||    
T  32216282 atattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaatttgattaagtttagttttgttaatctaatga 32216184  T
Q  2351 attgatgat 2359  Q
    |||||||||    
T  32216183 attgatgat 32216175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 4330704 - 4330401
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||| ||||||||      |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4330704 aaggaagcttctacggtgcagtcagacaactgatttttttggaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttatattgttgattactgattaa 4330605  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||  |||||| ||||||    
T  4330604 tgatcaattgtaattcatctagtaatgcttgcaacatattggacttacaagtactattttatctttgacatctttaacatgcaaaaagagttgatgatat 4330505  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||  |||||| |||||    
T  4330504 tatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgataaattg 4330406  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  4330405 atgat 4330401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 8222549 - 8222248
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagatt-catttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8222549 gggagcttctacggtacagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaat 8222450  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||| ||||||     
T  8222449 gatcaata-taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatt 8222351  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  | |||||||||||    
T  8222350 atgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggat-aaaatgagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattga 8222252  T
Q  2356 tgat 2359  Q
    ||||    
T  8222251 tgat 8222248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 16416067 - 16415766
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||  |||| ||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16416067 gggagcttctacggcgcagtcaaataactaacttttttagaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 16415968  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |    
T  16415967 atcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta 16415868  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  16415867 tgtgatagtcttaagtattacaatatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgat 16415769  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  16415768 gat 16415766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 2114 - 2359
Target Start/End: Original strand, 27227297 - 27227541
Alignment:
Q  2114 ttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattt 2213  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  27227297 ttaatgtttaattcatttttaaatggttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattt 27227396  T
Q  2214 tatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggat 2313  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||   ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27227397 tatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatcatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat 27227496  T
Q  2314 aaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
     |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  27227497 -aaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgat 27227541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 46931831 - 46931531
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46931831 gggagcttctacggtgcagtaaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 46931732  T
Q  2157 atcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| ||||||     
T  46931731 atcaataatatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatatt 46931632  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||   ||||||||||||    
T  46931631 atgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgctg--aacaaggtatgat-aaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattga 46931535  T
Q  2356 tgat 2359  Q
    ||||    
T  46931534 tgat 46931531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 2116 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 3309515 - 3309267
Alignment:
Q  2116 aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactatttta 2215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  3309515 aatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacgggtactatttta 3309416  T
Q  2216 tcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttaca-----ttttgtggggtgttacactgaaaacaaggtag 2310  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     | | ||| ||||||||| | ||||||| ||||    
T  3309415 tcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacacttagtgtagtgaggtgttacatttaaaacaaagtag 3309316  T
Q  2311 gataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3309315 gttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 3309267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 2066 - 2359
Target Start/End: Original strand, 9902812 - 9903110
Alignment:
Q  2066 agcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatc 2159  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| || |||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9902812 agcttctacggtgcagtcaagaatttgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatc 9902911  T
Q  2160 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcattt 2259  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   | ||| |||||| || |    
T  9902912 aatagtaattcatctagtagtgcttgcagcatcttggacttactggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgt 9903011  T
Q  2260 gatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||    
T  9903012 gatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaatgtaagat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgat 9903110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 34012137 - 34012433
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattt------taatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34012137 gggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 34012236  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||| |||||| |    
T  34012237 atcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 34012336  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | |||||||     |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  34012337 tgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggat-aaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgat 34012430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 37451708 - 37451405
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37451708 aagggagattctacggtgcagtgaagaaattgacttttttgaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaa 37451609  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||| ||||||    
T  37451608 tgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatat 37451509  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
     || |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| | ||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||  | |||| |||||    
T  37451508 tatgtgatagtcttaagtgttacactttttgaggtgttacacttataacaaggtcagat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgataaattg 37451410  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  37451409 atgat 37451405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2355
Target Start/End: Original strand, 10181762 - 10182060
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatt------ttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||      |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10181762 gggagcttctatggtgcagtcaggaaactaacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatg 10181861  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta-tcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| ||| |||| ||||||||||||  ||   |||||| ||||||     
T  10181862 ttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaggtactattgtattgttgtcatctttaacatacaaccagagttgatgatatt 10181961  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  10181962 atgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattga 10182060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2358
Target Start/End: Complemental strand, 14758455 - 14758162
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||      |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14758455 aagggagcttctacggtgcagtcacgaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaa 14758356  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| ||||||    
T  14758355 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 14758256  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
     ||  |||||||||||         ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||  ||| ||||||||    
T  14758255 tatgcgatagtcttaa---------tttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctaatgaattg 14758166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 19899523 - 19899825
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    |||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19899523 gggagcttctacagtgcagttaggaaactgacttttttggaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 19899622  T
Q  2157 atcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||     
T  19899623 atcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttggtgatatt 19899722  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||| ||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||   ||||||||||||    
T  19899723 atgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaatgtatgat-aaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattga 19899821  T
Q  2356 tgat 2359  Q
    ||||    
T  19899822 tgat 19899825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 2060 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 15383358 - 15383053
Alignment:
Q  2060 aaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagatt-catttttaaattgttgattattgatt 2152  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||      |||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  15383358 aaagggagcttctacggttcagtcaggaaattgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattgctgatt 15383259  T
Q  2153 aatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgat 2252  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |   ||||| ||||    
T  15383258 aataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcatacatagttgatgat 15383159  T
Q  2253 atcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaat 2352  Q
    || || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  15383158 attatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaat 15383060  T
Q  2353 tgatgat 2359  Q
    |||||||    
T  15383059 tgatgat 15383053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 2060 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 10923151 - 10922847
Alignment:
Q  2060 aaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgatta 2153  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10923151 aaagggagcttctatggtgcagtcagaaaactgactcttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatta 10923052  T
Q  2154 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgata 2253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||  | |||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  10923051 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacagagttgatgata 10922952  T
Q  2254 tcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaatt 2353  Q
    | || ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| || | ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| ||    
T  10922951 ttatgtgacagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacccttataacaaggtatgat-aaaataagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagtt 10922853  T
Q  2354 gatgat 2359  Q
    ||||||    
T  10922852 gatgat 10922847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 2064 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 30254843 - 30254543
Alignment:
Q  2064 ggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatga 2157  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30254843 ggagtttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaataa 30254744  T
Q  2158 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcat 2257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||| || ||| ||    
T  30254743 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgttattat 30254644  T
Q  2258 ttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatg 2357  Q
     ||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||  || | ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||    
T  30254643 gtgacagtcttaagtgttacactttatagggtgttatgcttataacaaggtaggat-aaaattagattaagtctagtcttgttaatctgatgaattgatg 30254545  T
Q  2358 at 2359  Q
    ||    
T  30254544 at 30254543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 2054 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 15168526 - 15168216
Alignment:
Q  2054 taaaataaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattat 2147  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||      
T  15168526 taaattaaagagagcttctacggtgcagttaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgc 15168427  T
Q  2148 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttg 2247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   |||||    
T  15168426 tgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttgtacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttg 15168327  T
Q  2248 ctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctga 2347  Q
     |||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||  |||||    
T  15168326 atgatattatgcgatagccttaagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaactgcagtcttgttaatctga 15168228  T
Q  2348 tgaattgatgat 2359  Q
    ||||||||||||    
T  15168227 tgaattgatgat 15168216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 2059 - 2359
Target Start/End: Original strand, 27266952 - 27267255
Alignment:
Q  2059 taaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgatt 2152  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||||| |||||||||      ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27266952 taaaggaagcttctatggtgcattcaggaaactgactttttggaaaa-gttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattattgattattgatt 27267050  T
Q  2153 aatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgat 2252  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||| ||||    
T  27267051 aattatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgat 27267150  T
Q  2253 atcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaat 2352  Q
    || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  27267151 attatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggtgttacactcaaaacaaggtagatt--aaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaat 27267248  T
Q  2353 tgatgat 2359  Q
    |||||||    
T  27267249 tgatgat 27267255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 32267456 - 32267154
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32267456 agggagcttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 32267357  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||   ||||| ||||||     
T  32267356 gttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacctacaggtactattttatagttggaatatttaacatgcaaacaaagttgatgatatt 32267257  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    || |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||    
T  32267256 atgtgatagtcttgagtgttacactttgtggagtgttacgcttataacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgggttga 32267158  T
Q  2356 tgat 2359  Q
    ||||    
T  32267157 tgat 32267154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2356
Target Start/End: Complemental strand, 23999771 - 23999470
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23999771 aagggagcttctatggtgcagtcaggaaattgacctttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaa 23999672  T
Q  2155 tgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgata 2253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  23999671 tgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgata 23999572  T
Q  2254 tcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaatt 2353  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  || | ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  23999571 ttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgat-aaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaatt 23999473  T
Q  2354 gat 2356  Q
    |||    
T  23999472 gat 23999470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 47682249 - 47682550
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgttag------attcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||       |||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  47682249 gggagcttctatggtgcagtcagtaaactgacttttttgaacaagttaattttaatcttaatgtttaattcttttttaaattgttaattactgattaatg 47682348  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||| |||||| |    
T  47682349 atcaatagtaattcatttagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 47682448  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| || || |||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  47682449 tatgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcagaat-aaaattagtttaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgat 47682547  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  47682548 gat 47682550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 2066 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 51129275 - 51128979
Alignment:
Q  2066 agcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattt----taatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaa 2161  Q
    |||||||||| || ||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||    ||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51129275 agcttctacgatgtagttaagaaattgacttttttgaaaaagttaatttattttaatacttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaa 51129176  T
Q  2162 tagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttga 2261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||||| |||||| || |||    
T  51129175 tagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtga 51129076  T
Q  2262 tagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||  | |||||||||||||||    
T  51129075 tagttttaattgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtatgat-aaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgat 51128979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 2108 - 2359
Target Start/End: Original strand, 238319 - 238569
Alignment:
Q  2108 ttaattttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggta 2207  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  238319 ttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagata 238418  T
Q  2208 ctattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaagg 2307  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  238419 ttattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagg 238518  T
Q  2308 taggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||    
T  238519 tagaat-aaaattagattaagtgtattcttgttagtctgattaattgttgat 238569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2350
Target Start/End: Complemental strand, 1547693 - 1547408
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    |||||| ||||||||| || | || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1547693 agggagtttctacggtacaattatgaaactgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 1547594  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||        |||||| |||||||    
T  1547593 gatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggtatctttaaca--------gagttgttgatatc 1547502  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatga 2350  Q
    || ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  1547501 atgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggat-aaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatga 1547408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2286
Target Start/End: Complemental strand, 48353964 - 48353735
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48353964 agggagcttctacggtgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 48353865  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  48353864 gatcaataataattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatc 48353765  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtgg 2286  Q
    || |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  48353764 atgtgatagtctt-agtgttacactttgtgg 48353735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 2069 - 2356
Target Start/End: Original strand, 27563666 - 27563958
Alignment:
Q  2069 ttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatt------ttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaat 2162  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||      |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27563666 ttctatggtgcagtcaggaaactgatttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattactgattaatgatcaat 27563765  T
Q  2163 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgat 2262  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| ||| || || ||||    
T  27563766 attaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacatatactattttatcgtttgcatctttaacatgcaaacagagttgatgaaattatatgat 27563865  T
Q  2263 agtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  27563866 agtcttaagtgttcctctttgtggggtattatacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 27563958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 2111 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 25161000 - 25160752
Alignment:
Q  2111 attttaatgttagatt-catttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtact 2209  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  25161000 attttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtact 25160901  T
Q  2210 attttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggta 2309  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||   ||||| |||||| || ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25160900 attttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacacttataacaaggta 25160801  T
Q  2310 ggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||    
T  25160800 ggat-aaaatgagattaagtgtagtcttattaatctaatgaattgatgat 25160752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2278
Target Start/End: Original strand, 11742121 - 11742344
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11742121 aagggagtttctatggcgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaa 11742220  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  11742221 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaagagagttgctgatat 11742320  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttaca 2278  Q
    ||| |||||||||||| |||||||    
T  11742321 catgtgatagtcttaattgttaca 11742344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 2108 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 28770023 - 28769772
Alignment:
Q  2108 ttaattttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggta 2207  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  28770023 ttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgtttgcaacatcttggacttacaggta 28769924  T
Q  2208 ctattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgt-ggggtgttacactgaaaacaag 2306  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||  ||| || |||||| || ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||  | | ||||||    
T  28769923 ctattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagaggtgatgatattatgtgatagtcttaagcgttacactttgtgggggtgttacgtttataacaag 28769824  T
Q  2307 gtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||    
T  28769823 gtatgat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgat 28769772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 15752450 - 15752149
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||  ||||| ||||||||      ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15752450 gggagcttctacggtgcagtcagaaaattgattttttaaaaaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatg 15752351  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||   ||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||  |||||  |||||| |    
T  15752350 atcaatagtaattcatctagtaaaaattgcaacttcttggacttacatgtattattttgtcgttggaatttttaacatgcaaacagagttaatgatatta 15752251  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  15752250 tgtgatactcttaagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 15752152  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  15752151 gat 15752149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 2069 - 2359
Target Start/End: Original strand, 27763071 - 27763367
Alignment:
Q  2069 ttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaat 2162  Q
    ||||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27763071 ttctacggtacagtcaggaaattgacatttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaat 27763170  T
Q  2163 agta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttga 2261  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| | |||| || |||    
T  27763171 agtatatttatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgattatattatgtga 27763270  T
Q  2262 tagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| || | ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||    
T  27763271 tagtcttaagtattacactttgtagggtgttacgcttagaactaggtatgat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgat 27763367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 2125 - 2359
Target Start/End: Original strand, 30326775 - 30327008
Alignment:
Q  2125 ttcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggca 2224  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| |    
T  30326775 ttcatttttaaattgttgattactgattgatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtattattttatcgttggaa 30326874  T
Q  2225 tctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagat 2324  Q
    ||||||||||| |||   ||||| |||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||| ||||    
T  30326875 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggat-aaaatgagat 30326973  T
Q  2325 taagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||||| | |||||  |||||||||||||||||    
T  30326974 taagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgat 30327008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 22171132 - 22170831
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||      |||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22171132 gggagcttctacggtgcaattagaaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactaattaatg 22171033  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||   | | ||||||||||||| ||||||||||||| |||  || ||| |||||| |    
T  22171032 atcaatagtaatttatctaataatgtttgcaacatcttagacttacaagaattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 22170933  T
Q  2257 tttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgat 2356  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| | || ||  ||| ||||||||||    
T  22170932 tgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttgaaacaaggtaggat-gaaattagattaagtgtagtgttattaatctaatgaattgat 22170834  T
Q  2357 gat 2359  Q
    |||    
T  22170833 gat 22170831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 2091 - 2359
Target Start/End: Original strand, 28564566 - 28564837
Alignment:
Q  2091 tgacttttttgaaaaagttaattt------taatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 2184  Q
    ||||||||||||||||||||||||      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28564566 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttt 28564665  T
Q  2185 gcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgt 2284  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||||||||||||  |||||||||||| |||  |||||| |||||| || ||||||  |||||||||||| |||      
T  28564666 gcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag--ttaagtgttacactttac 28564763  T
Q  2285 ggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||||||  || | ||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||    
T  28564764 ggggtgttatgcttataacaaggcatgat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgat 28564837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 119; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 2111 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 42721403 - 42721159
Alignment:
Q  2111 attttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtacta 2210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||   ||| ||    
T  42721403 attttaatgtttgattcatttttaaattattgattactcattaatgatcaatagtaattaatctagtaataattgcaacatcttggacttacatgtaata 42721304  T
Q  2211 ttttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtag 2310  Q
    |||||||||||   ||||||||||| |||   ||||| |||||| |  ||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  42721303 ttttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattacgtgataatcttaagtgttatactttgtggggtattacacttaaaacaaggtag 42721207  T
Q  2311 gataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  42721206 gat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 42721159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 118; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 2116 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 18423006 - 18422771
Alignment:
Q  2116 aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactatttta 2215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |||||    
T  18423006 aatgtttgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttggacttacatgtgctttttta 18422914  T
Q  2216 tcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataa 2315  Q
    ||||||| |||||||||||| |||  ||| || |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  | ||||||||||||| |    
T  18422913 tcgttggaatctttaacatgcaaacggaggtgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcatataacaaggtaggat-a 18422815  T
Q  2316 aaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  18422814 aaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgat 18422771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 118; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 2111 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 41926523 - 41926283
Alignment:
Q  2111 attttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtacta 2210  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||    
T  41926523 attttaatgtttgattcaattttaaatcattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttg-aatatcttggacttacaagtacta 41926425  T
Q  2211 ttttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtag 2310  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||| |      ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  41926424 ttttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatttaa------taagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaagtag 41926331  T
Q  2311 gataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  41926330 gat-aaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgat 41926283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2286
Target Start/End: Original strand, 1359689 - 1359919
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattt-----taatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||   |||||     ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1359689 aagggatcttctacggtgcagtcagaaaactgacttgttaaaaaaaaaaaatttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 1359788  T
Q  2156 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   ||||| ||||||     
T  1359789 gatcgatagtaattcatccagtaatgcttgcaacattttgaacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt 1359888  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtgg 2286  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1359889 atatgataatcttaagtgttacactttgtgg 1359919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 2087 - 2359
Target Start/End: Original strand, 31621327 - 31621609
Alignment:
Q  2087 aaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttt-taaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 2179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  31621327 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcattttttaaattgttgattgatgattaatgatcaatagtagttcatctactaa 31621426  T
Q  2180 tgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatct-----ttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgt 2274  Q
    |||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||||||     |||||||| |||   ||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  31621427 tgcttgcaacatattgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgttgatattatgcgatagtcttaagtgt 31621526  T
Q  2275 tacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
     |||  || |||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    
T  31621527 caca-cttctggggtattgcacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 31621609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 2114 - 2355
Target Start/End: Complemental strand, 40885177 - 40884937
Alignment:
Q  2114 ttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattt 2213  Q
    ||||| || ||||||||||| |||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||    
T  40885177 ttaatattcgattcatttttgaattattgattgctaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattt 40885078  T
Q  2214 tatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggat 2313  Q
    |||| | ||||||||||||||| |||   ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  40885077 tatcatcggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacacttttcggaatgttacacttaaaacaagataggat 40884978  T
Q  2314 aaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
     |||| ||||||||||| | |||||||  |||||||||||||    
T  40884977 -aaaactagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattga 40884937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 2130 - 2359
Target Start/End: Original strand, 37618729 - 37618948
Alignment:
Q  2130 ttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatcttt 2229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||    
T  37618729 ttttaaattgttgattattgattaatggtcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatcttt 37618828  T
Q  2230 aacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagt 2329  Q
    |||||| |||  |||||| |||||| || ||         ||||||||| ||| |||| |||||  || | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37618829 aacatgcaaacagagttgatgatattatatg---------agtgttacactttatgggatgttatgcttataacaaggtaggat-aaaattagattaagt 37618918  T
Q  2330 gtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||| | |||||  |||||||||||||||||    
T  37618919 gtagtattgttaatctgatgaattgatgat 37618948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 2075 - 2231
Target Start/End: Complemental strand, 21290009 - 21289847
Alignment:
Q  2075 ggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaat 2168  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  |||| ||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21290009 ggtgcagttaaaaaactgacttttttagaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataat 21289910  T
Q  2169 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaa 2231  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  21289909 tcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttataagtgttattttatcgttggcatctttaa 21289847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 2059 - 2359
Target Start/End: Original strand, 33725362 - 33725656
Alignment:
Q  2059 taaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcattttta-aattgttgattattgat 2151  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||      |||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||    
T  33725362 taaagggagcttatacgttgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagtttattttgatcttaatgttcgattcatttttttaattgttgattgctgat 33725461  T
Q  2152 taatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctga 2251  Q
    |||||||||||||||||            | ||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||| |||    
T  33725462 taatgatcaatagtaat------------gtttgcaacattttggtcttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatga 33725549  T
Q  2252 tatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaa 2351  Q
    ||| ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||  | |||||||    
T  33725550 tattatgcgatagtcttaaatgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagggt-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaa 33725648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2235
Target Start/End: Complemental strand, 31963039 - 31962859
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaa-ttgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |||| ||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  31963039 agggagcttctacggtgcagttatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaaattgttgattaccgattaa 31962940  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatg 2235  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||    || |||||||||||||   |||||||||||    
T  31962939 tgatcaatagtagttcatctaataatgcttgcaacatcttaaacttacatatattattttatcgttgatttctttaacatg 31962859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1895 - 2045
Target Start/End: Complemental strand, 27134165 - 27134014
Alignment:
Q  1895 actctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtttctcaaattgatc-ctgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactc 1993  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |  |||||| ||||| |||||||| |||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27134165 actctattaataactcaaaatggttcatgtctttgtcaaatgtttctcagattggtctctgactctattagttgttttgtattttgagtgttaatgactc 27134066  T
Q  1994 aatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatgttttttggatct 2045  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27134065 aatgtattttggatattatttagtggttaatggcataatgtcttttggatct 27134014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 2204 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 48620902 - 48620757
Alignment:
Q  2204 ggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaac 2303  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||         |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  48620902 ggtactatttattcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaac 48620812  T
Q  2304 aaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  48620811 aaagtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 48620757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 2165 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 38759846 - 38759653
Alignment:
Q  2165 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatag 2264  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    || |||||||| |||| || |||||||||| |||   ||||| |||||| || ||||||    
T  38759846 taattaatctagtaatgcttgcaacatcttggagttacatatattattttatagttgacacctttaacatgcaaacatagttggtgatattatctgatag 38759747  T
Q  2265 tcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||||| ||||| |||| | || ||  | |||||||||||||||    
T  38759746 tctcaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataagatatgat-aaaattaaattaaatgtagttttattaatatgatgaattgatgat 38759653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1837 - 2024
Target Start/End: Complemental strand, 33321406 - 33321218
Alignment:
Q  1837 atgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacg 1936  Q
    ||||||||||||| || |||  |||||| ||| |||||||||   |||||| |  || |||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||     
T  33321406 atgagtaaatcatcaatttgacctctgtttttgtaccaaatttttaaattggtttctgactctattaataactcaaaatagtccacgtctttgtcaaact 33321307  T
Q  1937 tttctcaaattgatcctgatc-ctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaat 2024  Q
    ||| |||||||| || |  || |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  33321306 tttttcaaattggtcattgtctctattatttgttttgtattttgagtgataatgactcattgtcttttggatattatttaatcgttaat 33321218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2151
Target Start/End: Complemental strand, 48621012 - 48620916
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattt------taatgttagattcatttttaaattgttgattattgat 2151  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||      ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  48621012 aagggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgattaatgat 48620916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1838 - 2045
Target Start/End: Complemental strand, 4067247 - 4067041
Alignment:
Q  1838 tgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgt 1937  Q
    |||||||||||| |||||| || |  ||||| |||||||||   |||||| ||  | |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| ||    
T  4067247 tgagtaaatcatcaaattgatcccc-tctttgtaccaaatttttaaattggtcattgactctattaataactcaaaatggtcac-gtctttgtcaaatgt 4067150  T
Q  1938 ttctcaaattgatcc-tgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatgttt 2036  Q
    |||||| |||| ||| |||  || ||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||  | |||  |||||||| |    
T  4067149 ttctcagattggtccatgactctgttaattgttttttattttgagtgttaatggctcaatgtcttttggatattatttcgtagtaaatgacataatgtct 4067050  T
Q  2037 tttggatct 2045  Q
    |||||||||    
T  4067049 tttggatct 4067041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1850 - 1943
Target Start/End: Original strand, 27133830 - 27133923
Alignment:
Q  1850 taaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtttctca 1943  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||   |||||| ||||||||||||||    
T  27133830 taaattggtccctgtctttgtaccaaattcttaaattgatccctgactttattaataactcaaaatggtctatgtctttgtcaaacgtttctca 27133923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1961 - 2017
Target Start/End: Complemental strand, 34535535 - 34535479
Alignment:
Q  1961 ttagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagt 2017  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  34535535 ttagttgttttgtattttgagtgttaatggctcaatgtcttttgaatattatttagt 34535479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1851 - 2045
Target Start/End: Original strand, 49784533 - 49784726
Alignment:
Q  1851 aaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtttctcaaattgat 1950  Q
    ||||| ||| |||||||| ||| |||||  ||| ||  ||||| |||||||||||||||||| ||| |    |||||| ||||  |||||||| |||| |    
T  49784533 aaattagtccctgtctttgtactaaattttcaatttagtccctgactctattaataactcaaaatggtat--gtctttgtcaagtgtttctcagattggt 49784630  T
Q  1951 cc-tgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatgttttttggatct 2045  Q
    || |||  | |||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| ||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  49784631 ccctgactcaattagttgttttgtattttgagtgttgatggttcaatgtgttttgaatattatgtagtggttaatggcataatgtcttttgaatct 49784726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1839 - 2045
Target Start/End: Original strand, 23329296 - 23329503
Alignment:
Q  1839 gagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtt 1938  Q
    ||||||| ||| ||||||||   | ||||| || ||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||| ||| | ||| || | || ||| |||||||||    
T  23329296 gagtaaaccatcaaattggttcttatctttgtatcaaattctcaatttggttcctgactctattaatacctcgaaatggtctctgtgtttgtcaaacgtt 23329395  T
Q  1939 tctcaaattgatc-ctgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatgtttt 2037  Q
     |||| |||| || || |   |||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| | ||||||||||||  |||||  |||||||  ||    
T  23329396 actcagattggtctctaactttattagttgttttgtatttttagtgttaatagttcaatgtctttagaatattatttagtggttaatgacataatgcctt 23329495  T
Q  2038 ttggatct 2045  Q
    ||||||||    
T  23329496 ttggatct 23329503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1958 - 2017
Target Start/End: Original strand, 38208376 - 38208435
Alignment:
Q  1958 ctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagt 2017  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38208376 ctattaattattttgtattttgagtgtaaatgactcaatgtctcttggatattatttagt 38208435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2115
Target Start/End: Complemental strand, 38759912 - 38759859
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt 2115  Q
    |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38759912 agggagcttctatggtgcagtcaattaactgacttttttgaaaaagttaatttt 38759859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 2299 - 2359
Target Start/End: Original strand, 11742348 - 11742407
Alignment:
Q  2299 aaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  11742348 aaaacaaggtaagataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgat 11742407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 1851 - 1903
Target Start/End: Complemental strand, 38208574 - 38208522
Alignment:
Q  1851 aaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctatta 1903  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  38208574 aaattggtctctgtctttgtaccaaattctcaaattggtccctgactctatta 38208522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 2068 - 2109
Target Start/End: Complemental strand, 10598264 - 10598223
Alignment:
Q  2068 cttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagtt 2109  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10598264 cttctacggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaagtt 10598223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1837 - 1945
Target Start/End: Complemental strand, 7481292 - 7481184
Alignment:
Q  1837 atgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacg 1936  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| || ||||||| |||| || ||    ||||||||||||||| || ||| || |  ||||| |||||||    
T  7481292 atgagtaaaccatcaaattggtctctgtatttgtaacaaattctcaaactggtcttcgactctattaataacttaaaatggtctctatctttgtcaaacg 7481193  T
Q  1937 tttctcaaa 1945  Q
    |||||||||    
T  7481192 tttctcaaa 7481184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2110
Target Start/End: Complemental strand, 47555140 - 47555092
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagtta 2110  Q
    |||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  47555140 agggggcttctacggtgcagttaggaaactgacttttttgaaaaagtta 47555092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 2067 - 2110
Target Start/End: Complemental strand, 5500733 - 5500690
Alignment:
Q  2067 gcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagtta 2110  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  5500733 gcttctacggtgcagttaaaaaactaacttttttgaaaaagtta 5500690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 1839 - 1912
Target Start/End: Complemental strand, 2464278 - 2464205
Alignment:
Q  1839 gagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaa 1912  Q
    ||||||||||  ||||| || | ||| ||| |||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  2464278 gagtaaatcaccaaattagtttttgtatttgtaccaaattctcaaattggtccatgactctattaataactcaa 2464205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 1851 - 1948
Target Start/End: Original strand, 34535301 - 34535398
Alignment:
Q  1851 aaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtttctcaaattg 1948  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||  ||||||  ||| | ||||||||||||||| || ||| || | |  ||| |||||||||||||||||||    
T  34535301 aaattggtccctgtttttgtaccaaattttcaaattagtccttgactctattaataacttaaaatggtcactgaatttgtcaaacgtttctcaaattg 34535398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 1851 - 1912
Target Start/End: Complemental strand, 49784880 - 49784819
Alignment:
Q  1851 aaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaa 1912  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| ||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  49784880 aaattggtccatgtctttgtaccaagttctcatattggtccctgactctattaataactcaa 49784819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 181; Significance: 7e-97; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2359
Target Start/End: Original strand, 4318574 - 4318883
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaa------------ttttaatgttagattcatttttaaattgttgattattg 2149  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||            |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  4318574 agggagcttctacggtgcagttatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattaatg 4318673  T
Q  2150 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgct 2249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  4318674 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactttcccgtactatttcatcgttgacatctttaacatgaaaacagagttgct 4318773  T
Q  2250 gatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatg 2349  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  4318774 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctaatg 4318873  T
Q  2350 aattgatgat 2359  Q
    ||||||||||    
T  4318874 aattgatgat 4318883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Original strand, 3879696 - 3879999
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  3879696 aagggaccttctacggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattca 3879795  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||| ||||||    
T  3879796 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatat 3879895  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  3879896 tatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtaggat-aaaattagaataagtatattcttgttagtctgatgaattg 3879994  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  3879995 atgat 3879999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 2071 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 8513638 - 8513357
Alignment:
Q  2071 ctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatag 2164  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||      ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||    
T  8513638 ctacggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatag 8513546  T
Q  2165 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatag 2264  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  8513545 taattcatctagtaatgcttgcaagattttggacttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatag 8513446  T
Q  2265 tcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  8513445 tcttaagtgttacactttgtagggtgtt------aaaacaaggtaggataaaaattagatcaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgat 8513357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Original strand, 6090941 - 6091243
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6090941 gggagcttctacggtgcagtcagaaaacttacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 6091040  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||  |||||| |||||| |    
T  6091041 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtttgaatctttaatatgcaaacagagttgatgatatta 6091140  T
Q  2257 tttgatagtc-ttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||  ||| |||||||||    
T  6091141 tgtgatagtctttaagtgttacactttgttgggtgttacgcttaaaacaaggtatgat-aaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattga 6091239  T
Q  2356 tgat 2359  Q
    ||||    
T  6091240 tgat 6091243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 2068 - 2359
Target Start/End: Original strand, 33892776 - 33893063
Alignment:
Q  2068 cttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaa------tgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaa 2161  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33892776 cttctacggtgcaattatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaaccttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaa 33892875  T
Q  2162 tagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttga 2261  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||     
T  33892876 tagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaactgagttgctgatatcatgtg- 33892974  T
Q  2262 tagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
            ||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33892975 --------agtgttacactttgtggggtgttatacataaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 33893063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 2064 - 2340
Target Start/End: Complemental strand, 1946260 - 1945977
Alignment:
Q  2064 ggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaa-gttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1946260 ggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 1946161  T
Q  2157 atcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatc 2255  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||     
T  1946160 atcaatagtatattcatctaataatgcttgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatatt 1946061  T
Q  2256 atttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgtt 2340  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  1946060 atgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgat-aaaattatattaagtgtagtcttgtt 1945977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 2076 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 29182573 - 29182287
Alignment:
Q  2076 gtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaatt 2169  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||    
T  29182573 gtgcaggcatgaaactaacttttttgaaaaagttaattttagtcttaatgattgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatca---gtaatt 29182477  T
Q  2170 catctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtctta 2269  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29182476 catctagtaatacttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacctgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtctta 29182377  T
Q  2270 agtgttacattttgt-ggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  29182376 agtgttacactttatgggggtgttacacttaaaatatggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgat 29182287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 2062 - 2356
Target Start/End: Complemental strand, 5627818 - 5627518
Alignment:
Q  2062 agggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaat 2155  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5627818 agggagcttctacggtgcagtcaggaaactgatttttttaaaaaaattaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 5627719  T
Q  2156 gatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  5627718 gatcaatagtatattcacctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatat 5627619  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
     || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  || | ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||    
T  5627618 tatgtgatagtcttaagtattacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgat-aaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattg 5627520  T
Q  2355 at 2356  Q
    ||    
T  5627519 at 5627518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2356
Target Start/End: Original strand, 7234791 - 7235092
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattg---atta 2153  Q
    |||||||| ||||||| |||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||      |||||| |||| |||||||||||||||||| |||   ||||    
T  7234791 gggagcttttacggtgtagtcaggaaaatgatttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgttgttgatta 7234890  T
Q  2154 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgata 2253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||| |||||    
T  7234891 atgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgata 7234990  T
Q  2254 tcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaatt 2353  Q
    | ||  |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||    
T  7234991 ttatgcgatagtcttaagcgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaatt 7235089  T
Q  2354 gat 2356  Q
    |||    
T  7235090 gat 7235092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 2058 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 20768512 - 20768208
Alignment:
Q  2058 ataaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgat 2151  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||      ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20768512 ataatgggagcttctacggtgcagtcaggaaattgatttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttttaaattgttgattactgat 20768413  T
Q  2152 taatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctga 2251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   | ||| |||    
T  20768412 taatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacataattgatga 20768313  T
Q  2252 tatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaa 2351  Q
    ||| ||  |||  |||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||  |||||||||    
T  20768312 tattatgcgatgatcttaagtgttacactttatgggatgttacacttaaaacaaagtaggat-aaaattagattaa--gtaatcttgttaatctgatgaa 20768216  T
Q  2352 ttgatgat 2359  Q
    || |||||    
T  20768215 ttaatgat 20768208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 2108 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 6089270 - 6089032
Alignment:
Q  2108 ttaattttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggta 2207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  6089270 ttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacattttggacttactggta 6089178  T
Q  2208 ctattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaagg 2307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||| | |||||      |||||||||    
T  6089177 ctattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttataccttgtagagtgtt------aaaacaagg 6089084  T
Q  2308 taggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6089083 taggataaaaattagatcaaggatattcttgttaatctgatgaattgatgat 6089032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 2108 - 2359
Target Start/End: Original strand, 21016928 - 21017172
Alignment:
Q  2108 ttaattttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggta 2207  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |||    
T  21016928 ttaatcttaatatttgattcatttataaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagac------gta 21017021  T
Q  2208 ctattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaagg 2307  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||  |||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  21017022 ctattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataacg 21017121  T
Q  2308 taggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21017122 taggat-aaaattagattaagtttattcttgttagtctgatgaattgatgat 21017172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 2065 - 2229
Target Start/End: Original strand, 7054533 - 7054704
Alignment:
Q  2065 gagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattt------taatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgat 2158  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7054533 gagcttttacggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatctttaaattgttgattaatgattaatgat 7054632  T
Q  2159 caatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatcttt 2229  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||    
T  7054633 caatagtatattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacagttactattttatcgttggaatcttt 7054704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 2205 - 2359
Target Start/End: Original strand, 30353265 - 30353418
Alignment:
Q  2205 gtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaaca 2304  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  30353265 gtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaaca 30353364  T
Q  2305 aggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  30353365 aggcatgat-aaaattagattaagtgtattcttgtttatatgatgaattgatgat 30353418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 2213 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 15491884 - 15491739
Alignment:
Q  2213 ttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtagga 2312  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||  || ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  15491884 ttatcgttagcatctttaacatccaaacagaattgctgatatcatgtgatatttttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtagga 15491785  T
Q  2313 taaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  15491784 t-aaaattagattaagtgcattcttgttaatctgatgaattgatgat 15491739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 2108 - 2232
Target Start/End: Complemental strand, 33619207 - 33619080
Alignment:
Q  2108 ttaattttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgat---taatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcg 2204  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       
T  33619207 ttaatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgatcattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatattggacttacat 33619108  T
Q  2205 gtactattttatcgttggcatctttaac 2232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33619107 gtactattttatcgttggcatctttaac 33619080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 1838 - 2045
Target Start/End: Complemental strand, 10388590 - 10388380
Alignment:
Q  1838 tgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgt 1937  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||||| |||| |||||||  |||||| ||| | ||    
T  10388590 tgagtaaactattaaattggtctccgtctttgtaccatattctcaaattggtttctaactctattaataaatcaaaatgatccatgtctttgtcagatgt 10388491  T
Q  1938 ttctcaaattgatcctgatcc---tattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatgt 2034  Q
    |||| | || ||||| |  |    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||    
T  10388490 ttcttatatcgatcccggactctatattagttgttttgtattttgagtattaatgactcaatgtcttttggatattattttgtggttaatggcataatgt 10388391  T
Q  2035 tttttggatct 2045  Q
     ||||||||||    
T  10388390 cttttggatct 10388380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 1839 - 2033
Target Start/End: Original strand, 16434804 - 16434998
Alignment:
Q  1839 gagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtt 1938  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||| || ||| |  | |||||| |||||  ||    
T  16434804 gagtaaaccatcaaattagtctctctctttgtaccaaattctcaaattggtca-tgactctattaataactaaaaatggtatctgtctttgtcaaaaatt 16434902  T
Q  1939 tctcaaattgatcct-gatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatg 2033  Q
    ||||| |||| |||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  16434903 tctcagattggtccttgactttattagttgttttgtattttgagtgttaatagctcaatgtattttggatattatttagtggttaatagtataatg 16434998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 1837 - 2017
Target Start/End: Complemental strand, 67710 - 67529
Alignment:
Q  1837 atgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacg 1936  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||  ||||||| || || | | |||||||||||||| ||  || |||||||| ||| |||    
T  67710 atgactaaatcatcaaattggtcccagtctttgtaccaaattttcaaattggtctctgattttattaataactcaaaatagtctccgtctttgtcatacg 67611  T
Q  1937 tttctcaaattgatcc-tgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttggatattatttagt 2017  Q
    ||| ||| |||| ||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  67610 tttttcagattggtccctgactctattagttgttttgtattttcagtgttaattgatcaatgccttttggatattatttagt 67529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 2223 - 2359
Target Start/End: Original strand, 7055140 - 7055275
Alignment:
Q  2223 catctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattag 2322  Q
    ||||||||||||  |||| |||||| |||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||| ||| |||||||     
T  7055140 catctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagcgtgttacacttagaacaaggtatgat-aaaattat 7055238  T
Q  2323 attaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  7055239 attaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgat 7055275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1842 - 1912
Target Start/End: Original strand, 3687627 - 3687697
Alignment:
Q  1842 taaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaa 1912  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  3687627 taaatcattaaattggtctctgtctttgtatcaaattctcaaattgatccatgactctgttaataactcaa 3687697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1836 - 1948
Target Start/End: Original strand, 67336 - 67448
Alignment:
Q  1836 aatgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaac 1935  Q
    |||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||| |||| || ||| ||||||    
T  67336 aatgagtaaatcaccaaattggtccatgtctttgtaccaaattctcaaattggtccctgactatattaataacttaaaatggtccctgtttttatcaaac 67435  T
Q  1936 gtttctcaaattg 1948  Q
     ||||||| ||||    
T  67436 atttctcagattg 67448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1839 - 1978
Target Start/End: Original strand, 10388218 - 10388358
Alignment:
Q  1839 gagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtt 1938  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||   ||| || || || |||||||||||||||||| ||| || | |||||| | ||| |||    
T  10388218 gagtaaattattaaattgatctttgtctttataccaaatttttaaactggtctctgactctattaataactcaaaatggtctctgtctttgttaaatgtt 10388317  T
Q  1939 tctcaaattgatc-ctgatcctattagttgttttgtatttt 1978  Q
    ||||| |||| || ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  10388318 tctcatattggtctctgactctattaggtgttttgtatttt 10388358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1835 - 1939
Target Start/End: Complemental strand, 30122916 - 30122812
Alignment:
Q  1835 aaatgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaa 1934  Q
    ||||||| |||  |||||||||||  |||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| || | |||||| |||||    
T  30122916 aaatgaggaaactattaaattggttcctgtctttgtatcaaattctcaaattggtccctaactttattaataactcaaaatggtctctgtctttgtcaaa 30122817  T
Q  1935 cgttt 1939  Q
     ||||    
T  30122816 tgttt 30122812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1839 - 1978
Target Start/End: Original strand, 30847624 - 30847764
Alignment:
Q  1839 gagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtt 1938  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||   ||||| ||  | | ||||||||||| | || ||| ||||  ||||| |||||||||    
T  30847624 gagtaaaccattaaattggtctatgtctttataccaaattcttgaattggtctatgattctattaataatttaaaatggtccctatctttgtcaaacgtt 30847723  T
Q  1939 tctcaaattgatc-ctgatcctattagttgttttgtatttt 1978  Q
    ||||| |||| || || |  |||||||||||||||||||||    
T  30847724 tctcagattggtctctaactctattagttgttttgtatttt 30847764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 2060 - 2110
Target Start/End: Original strand, 6613654 - 6613704
Alignment:
Q  2060 aaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagtta 2110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6613654 aaagggagcttgtacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagtta 6613704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2115
Target Start/End: Original strand, 21016726 - 21016778
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt 2115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  21016726 gggagcttctacggtgcagtcagaaaattgtcttttttgaaaaagttattttt 21016778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2118
Target Start/End: Complemental strand, 15491941 - 15491886
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaat 2118  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  15491941 gggagcttctacgttgcagtcatgaaactaacttttttaaaaaagttaatattaat 15491886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 2069 - 2110
Target Start/End: Complemental strand, 4104394 - 4104353
Alignment:
Q  2069 ttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagtta 2110  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4104394 ttctactgtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagtta 4104353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2064 - 2110
Target Start/End: Original strand, 11083823 - 11083869
Alignment:
Q  2064 ggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagtta 2110  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  11083823 ggagcttctacggtgaagtcaaaaaatttacttttttgaaaaagtta 11083869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2114 - 2156
Target Start/End: Original strand, 33724075 - 33724117
Alignment:
Q  2114 ttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  33724075 ttaatgtttgattcatttttaaattgttgcttaatgattaatg 33724117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2108
Target Start/End: Complemental strand, 25441871 - 25441826
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagt 2108  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  25441871 gggagcttctatggtgcagtcaaaaaaatgacttttttaaaaaagt 25441826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 158; Significance: 4e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 8314 - 8011
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||| || |||      |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8314 aagggagcttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaa 8215  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    |||| ||||||    
T  8214 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatat 8115  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | | |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  8114 tatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaagttaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattg 8016  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  8015 atgat 8011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 153; Significance: 3e-80; HSPs: 5)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 2111 - 2359
Target Start/End: Original strand, 408243 - 408490
Alignment:
Q  2111 attttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtacta 2210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  408243 attttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtacta 408342  T
Q  2211 ttttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtag 2310  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||  |||||| ||||||  | ||||||||||||||||| || |||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  408343 ttttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttccactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtag 408442  T
Q  2311 gataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  408443 gat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 408490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 2108 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 502 - 258
Alignment:
Q  2108 ttaattttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggta 2207  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||    
T  502 ttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggac------gta 409  T
Q  2208 ctattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaagg 2307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||     
T  408 ctattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacacttaaaataaga 309  T
Q  2308 taggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  308 taggat-aaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgatgat 258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 2111 - 2235
Target Start/End: Original strand, 93915 - 94038
Alignment:
Q  2111 attttaatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtacta 2210  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  93915 attttaatgtttgattcatttt-aaattgttgattagtgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtacta 94013  T
Q  2211 ttttatcgttggcatctttaacatg 2235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  94014 ttttatcgttgacatctttaacatg 94038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 2261 - 2359
Target Start/End: Original strand, 94347 - 94444
Alignment:
Q  2261 atagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattgatgat 2359  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||| || ||||||| |||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||    
T  94347 atagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaagctagaat-aaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctcatgaattgatgat 94444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2115
Target Start/End: Complemental strand, 742 - 690
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt 2115  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  742 gggagcttctacggtgcagtcaagaaattgatttttttgaaaaagttaatttt 690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 140; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 2060 - 2359
Target Start/End: Original strand, 145772 - 146077
Alignment:
Q  2060 aaagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgatta 2153  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||      ||||||  ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  145772 aaagggagcttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttaattcatttttaaattttttattactgatta 145871  T
Q  2154 atgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgat 2252  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  145872 atgatcaattgtatattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacagacactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgat 145971  T
Q  2253 atcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaat 2352  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  || | ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||    
T  145972 attatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgat-aaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaat 146070  T
Q  2353 tgatgat 2359  Q
    |||||||    
T  146071 tgatgat 146077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 126; Significance: 4e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 44383 - 44081
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaatttt------aatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||      ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44383 aagggagcttctacgatgcagtcaacaaactgacttttttgaaaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaa 44284  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||| |||   ||||| ||||||    
T  44283 tgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatat 44184  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
     || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || | |||||| || ||| ||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||    
T  44183 tatgtgatag-cttaagtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgat-aaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattg 44086  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  44085 atgat 44081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 126; Significance: 4e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 2061 - 2359
Target Start/End: Original strand, 154404 - 154706
Alignment:
Q  2061 aagggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattt------taatgttagattcatttttaaattgttgattattgattaa 2154  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||      |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  154404 aagggagcttctacgatgcagtcaacaaactgacttttttgaaaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaa 154503  T
Q  2155 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatat 2254  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||| |||   ||||| ||||||    
T  154504 tgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatat 154603  T
Q  2255 catttgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattg 2354  Q
     || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || | |||||| || ||| ||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||    
T  154604 tatgtgatag-cttaagtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgat-aaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattg 154701  T
Q  2355 atgat 2359  Q
    |||||    
T  154702 atgat 154706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 105; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2359
Target Start/End: Complemental strand, 267701 - 267408
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatgtta------gattcatttttaaattgttgattattgattaatg 2156  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || |||      |||||||||||||||||||||||| |||||  |     
T  267701 gggagattctatggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattggt- 267603  T
Q  2157 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaattgagttgctgatatca 2256  Q
            |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||| |    
T  267602 --------taattcatctagtaattcttgcagcatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatatta 267511  T
Q  2257 tttgatagtc-ttaagtgttacattttgtggggtgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttcctctgatgaattga 2355  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||||    
T  267510 tgtgatagtctttaagtgttacactttgtgggatgttacatttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtagtcttgctaatctaatgaattga 267412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 77; Significance: 8e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 1850 - 2005
Target Start/End: Complemental strand, 70920 - 70764
Alignment:
Q  1850 taaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtttctcaaattga 1949  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||| |||  |||||| |||||||||||||| ||||     
T  70920 taaattggtccctgtctttgtactaaattctcaaattggtctctgactctattaatagctcaaaatggtccatgtctttgtcaaacgtttctcagattgg 70821  T
Q  1950 tc-ctgatcctattagttgttttgtattttgagtgttaatcactcaatgtcttttgg 2005  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  70820 tctctgactctattagttgttttgtattttgagtgttaatgactcaatgtcttttgg 70764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 1875 - 1948
Target Start/End: Original strand, 70624 - 70697
Alignment:
Q  1875 aattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaatatgatccccgtctttttcaaacgtttctcaaattg 1948  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||    
T  70624 aattctcaaattggtccctcactttattaataacttaaaatgatttctgtctttgtcaaacgtttctcagattg 70697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 63; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 972 - 1198
Target Start/End: Complemental strand, 12166 - 11940
Alignment:
Q  972 tattcagttggaatgcatttcgagaaaaacatccaaaagttggatacgaagagctctcaaaaagtgcaattggctattgcagtggcaatcctctcgcttt 1071  Q
    ||||||||| |||||| ||  |||||||||| || ||| ||||||| ||||| || ||| |||||| ||||  ||||||||  ||||||||||| |||||    
T  12166 tattcagtttgaatgccttcggagaaaaacagcctaaaattggatatgaagatctatcagaaagtgtaatttcctattgcaaaggcaatcctctagcttt 12067  T
Q  1072 aaaagttttaggtgcaaatcttcgtataaaaagcaaagaagcatgggaaagtgaattggaaaagataaaagagattccctatgcgggaattcatgatgtg 1171  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||  || | ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||  ||| || |||| |  |||||    
T  12066 aaaagttataggggcaaatctccgttcaagaggcaaagaggcatgggaaaatgaattgaaaaagctcaaaaagattccaaatggggaaatttacaatgtg 11967  T
Q  1172 ttaaaattgagcttcaatgacttagat 1198  Q
    ||||||||||| |   |||||||||||    
T  11966 ttaaaattgagttatgatgacttagat 11940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 2137 - 2201
Target Start/End: Complemental strand, 101058 - 100996
Alignment:
Q  2137 ttgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta 2201  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  101058 ttgttgattactgattaatgatc--tagtaatgcatttagtaatgcttgcaacatcttggactta 100996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 2063 - 2115
Target Start/End: Complemental strand, 101116 - 101063
Alignment:
Q  2063 gggagcttctacggtgcagtcataaaact-gacttttttgaaaaagttaatttt 2115  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  101116 gggagtttctacggtgcagtaagaaaacttgacttttttaaaaaagttaatttt 101063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 1838 - 1912
Target Start/End: Complemental strand, 8782 - 8708
Alignment:
Q  1838 tgagtaaatcattaaattggtctctgtctttctaccaaattcgcaaattgatccctaactctattaataactcaa 1912  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||  || ||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  8782 tgagtaaaccattaaattggtctctatctttatattaagttctcaatttggaccctaactctattaataactcaa 8708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 1990 - 2043
Target Start/End: Complemental strand, 8666 - 8613
Alignment:
Q  1990 actcaatgtcttttggatattatttagtcattaatagcataatgttttttggat 2043  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| | ||||||||    
T  8666 actcaatgtcttttggatattatttagtggttaatgacataatatcttttggat 8613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University