View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18793_low_11 (Length: 535)

Name: NF18793_low_11
Description: NF18793
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18793_low_11
NF18793_low_11
[»] chr4 (3 HSPs)
chr4 (1-457)||(44474464-44474920)
chr4 (19-264)||(44474344-44474589)
chr4 (463-517)||(44475283-44475337)
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (1-505)||(38453372-38453876)
chr8 (39-342)||(39848636-39848939)
chr8 (43-331)||(38632929-38633216)
chr8 (39-264)||(38632648-38632871)
chr8 (100-258)||(34544781-34544939)
chr8 (47-264)||(34533725-34533942)
chr8 (62-264)||(34533863-34534065)
chr8 (35-259)||(38632780-38633007)
chr8 (57-264)||(39848375-39848582)
chr8 (133-259)||(38453894-38454020)
chr8 (35-264)||(34533587-34533816)
chr8 (72-257)||(34916295-34916480)
chr8 (62-269)||(39848518-39848728)
chr8 (114-259)||(34539031-34539176)
chr8 (62-264)||(34916426-34916628)
chr8 (39-125)||(34539027-34539113)
chr8 (19-264)||(38453751-38453996)
chr8 (12-169)||(34544732-34544889)
chr8 (72-257)||(34916157-34916342)
chr8 (460-513)||(38633363-38633416)
chr8 (185-273)||(34549174-34549262)
chr8 (180-264)||(38632548-38632632)
chr8 (125-249)||(36951413-36951537)
chr8 (133-257)||(39848214-39848338)
chr8 (62-147)||(34533566-34533651)
chr8 (72-169)||(34916107-34916204)
chr8 (461-513)||(39849073-39849125)
chr8 (458-496)||(36951893-36951931)
chr8 (47-128)||(34549181-34549262)
chr8 (172-257)||(34916571-34916656)
chr8 (178-253)||(34548525-34548600)
chr8 (42-127)||(38632548-38632633)
chr8 (188-264)||(39848368-39848444)
chr8 (57-111)||(36951483-36951537)
chr8 (460-513)||(34547861-34547914)
chr8 (42-142)||(39848261-39848361)
chr8 (72-112)||(34548528-34548568)
[»] chr3 (3 HSPs)
chr3 (17-410)||(7045679-7046059)
chr3 (133-198)||(7046154-7046219)
chr3 (467-502)||(7045573-7045608)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 44474464 - 44474920
Alignment:
Q  1 tggaaaacaggtaaattggatggaggagggaatttgagttgggctaatggtgatcattttaatggttgtctgtcaaatggacttagacatggatttggag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44474464 tggaaaacagggaaattggatggaagagggaatttgaattgggctaatgatgatcattttaatggttgtctgtcaaatgggcttagacatggatttggag 44474563  T
Q  101 tttatagatttgtaaatggggatgtctatatcggaaattggaaaaaagacaaaatggatggaggagggaccatgagttgggctaatggtgatgtttttga 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44474564 tttatacatttgtaaatggggatgtctatatcggaaattggaaaaatgacaaaatggatggaagagggaccatgagttggactaatggtgatgtttttga 44474663  T
Q  201 cggttgctggtcaaatggacttatacatggatctggagtttttagatttgcaaatgggggtgtcgacattggtaacttcaggggtaaacttctccatgac 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  44474664 aggttgctggtcaaatggacttatacatggatctggagtttttaaatttgcaaatggggatgtcgacattggtaacttcaggagtaaacttctttatgac 44474763  T
Q  301 aacggatcatacacatgctcaaatagaacaatctacaagggttgcatatgctcaaatgaaaaagtgatagagaaaggactgacgatatggagccttaaaa 400  Q
    |||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  44474764 aacggaacatacacatgttcaaatgaaacaatgtacaagggttgcatatgctcaaatgaaaaagtgatagagaaaggactgatgatatggagccttcaaa 44474863  T
Q  401 atcctgatggaggttgtatatgtgctaattgctcacgtggtgtgagccctgtgatca 457  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||| |||| ||||||    
T  44474864 atcctaatggaggttgtatatatcataattgctcatctggtgtgatccctttgatca 44474920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 44474344 - 44474589
Alignment:
Q  19 gatggaggagggaatttgagttgggctaatggtgatcattttaatggttgtctgtcaaatggacttagacatggatttggagtttatagatttgtaaatg 118  Q
    |||||| |||||| ||| | |||||||| ||| |||  ||||| ||||| |  ||||||||| |||  ||||||||||||||||| || || | || |||    
T  44474344 gatggaagagggattttcacttgggctattggcgatgtttttattggttcttggtcaaatggccttgtacatggatttggagtttttacatctctagatg 44474443  T
Q  119 gggatgtctatatcggaaattggaaaaaagacaaaatggatggaggagggaccatgagttgggctaatggtgatgtttttgacggttgctggtcaaatgg 218  Q
    ||||||||||    ||||||||||||| ||  ||| |||||||| ||||||   ||| ||||||||||| ||||  |||| | |||||   |||||||||    
T  44474444 gggatgtctacgctggaaattggaaaacagggaaattggatggaagagggaatttgaattgggctaatgatgatcattttaatggttgtctgtcaaatgg 44474543  T
Q  219 acttatacatggatctggagtttttagatttgcaaatgggggtgtc 264  Q
     |||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  44474544 gcttagacatggatttggagtttatacatttgtaaatggggatgtc 44474589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 463 - 517
Target Start/End: Original strand, 44475283 - 44475337
Alignment:
Q  463 agggaatatatgcaaggagttctaattgtggagaaaattagacagtattcaaaag 517  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44475283 aggggatatatgaatggagttctaattgtggagaaaattcgacagtattcaaaag 44475337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 38453876 - 38453372
Alignment:
Q  1 tggaaaacaggtaaattggatggaggagggaatttgagttgggctaatggtgatcattttaatggttgtctgtcaaatggacttagacatggatttggag 100  Q
    |||||| |||| | |||||||||| |||||| ||||| |||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  38453876 tggaaagcagggagattggatggaagagggattttgaattggactaacggtgatcaatttgatggttgtctgtcgcatggacttagacatggacttggag 38453777  T
Q  101 tttatagatttgtaaatggggatgtctatatcggaaattggaaaaaagacaaaatggatggaggagggaccatgagttgggctaatggtgatgtttttga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38453776 tttatagatttgtaaatggggatgtctacaccggaaattggaaagaagacgaaatggatggaacagggatcatgagttgggctaatggtgatgtttttga 38453677  T
Q  201 cggttgctggtcaaatggacttatacatggatctggagtttttagatttgcaaatgggggtgtcgacattggtaacttcaggggtaaacttctccatgac 300  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  || |||| |    
T  38453676 tggttgttggtcaaatggacttatacatggatctggagtttttagatttgcaaatggggatgtcgacattggtaacttcaggagtaaacaacttcatggc 38453577  T
Q  301 aacggatcatacacatgctcaaatagaacaatctacaagggttgcatatgctcaaatgaaaaagtgatagagaaaggactgacgatatggagccttaaaa 400  Q
    ||||||  ||||||||  |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| |||    
T  38453576 aacggaaaatacacattttcaaatggaacaatgtacgagggttgcatatgctcaaatggaaaagtgatagagaaaagactgatgatatgaggccttcaaa 38453477  T
Q  401 atcctgatggaggttgtatatgtgctaattgctcacgtggtgtgagccctgtgatcattgaaagggaatatatgcaaggagttctaattgtggagaaaat 500  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||| ||||  ||||||||  | |    | || |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  38453476 atcccgatggagattgtatatgtcctgattcctcatctggtgtgattctttctgttatcgaaatggaatatatgcaaagagttctgattgtggagaaaat 38453377  T
Q  501 tagac 505  Q
    |||||    
T  38453376 tagac 38453372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 39 - 342
Target Start/End: Original strand, 39848636 - 39848939
Alignment:
Q  39 ttgggctaatggtgatcattttaatggttgtctgtcaaatggacttagacatggatttggagtttatagatttgtaaatggggatgtctatatcggaaat 138  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  39848636 ttgggctaatggtgatgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttggagtttatagatttgcaaatggggatgtctacatcggaaat 39848735  T
Q  139 tggaaaaaagacaaaatggatggaggagggaccatgagttgggctaatggtgatgtttttgacggttgctggtcaaatggacttatacatggatctggag 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||| |  ||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39848736 tggaaaaaagacaaaatggatggaacagggattatgagttgggttgttggtgatgtcttcgatggttgttggtcaaatggacttatacatggatatggag 39848835  T
Q  239 tttttagatttgcaaatgggggtgtcgacattggtaacttcaggggtaaacttctccatgacaacggatcatacacatgctcaaatagaacaatctacaa 338  Q
    ||| ||||| ||| || |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||| ||||||| ||| |    
T  39848836 tttatagatatgctaacggggatgtcgatattggtaacttcaggagtaaacttctccatgacaatggaaaatacacacactcaaatggaacaatatacga 39848935  T
Q  339 gggt 342  Q
    ||||    
T  39848936 gggt 39848939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 43 - 331
Target Start/End: Original strand, 38632929 - 38633216
Alignment:
Q  43 gctaatggtgatcattttaatggttgtctgtcaaatggacttagacatggatttggagtttatagatttgtaaatggggatgtctatatcggaaattgga 142  Q
    ||||| ||||||  |||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  38632929 gctaacggtgatgtttttgatggttatttgtcaaatggacttagatatggatttggagtttataaatttgcaaatggggatgtttacgtaggaaattgga 38633028  T
Q  143 aaaaagacaaaatggatggaggagggaccatgagttgggctaatggtgatgtttttgacggttgctggtcaaatggacttatacatggatctggagtttt 242  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||||  |||| |||||||| ||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  38633029 aaa-agacaaaatggatggaatagggattatgacttgggctactggtgatgtcttcgatggttgttggtcaaatgggcttatacatggatctggagttta 38633127  T
Q  243 tagatttgcaaatgggggtgtcgacattggtaacttcaggggtaaacttctccatgacaacggatcatacacatgctcaaatagaacaa 331  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||| || ||||||    
T  38633128 tagatatgctaatggggatgtcgatattggtaacttcaggagtaaacttctccatgtcaatggaaaatacacatgctcagatggaacaa 38633216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 39 - 264
Target Start/End: Original strand, 38632648 - 38632871
Alignment:
Q  39 ttgggctaatggtgatcattttaatggttgtctgtcaaatggacttagacatggatttggagtttatagatttgtaaatggggatgtctatatcggaaat 138  Q
    ||||||| ||||||||  |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||| || ||||||    
T  38632648 ttgggctgatggtgatgcttttgatggttgtctatcaaatggatttagacatggatttggagtttatagatatgcagatgggcatgtctacatgggaaat 38632747  T
Q  139 tggaaaaaagacaaaatggatggaggagggaccatgagttgggctaatggtgatgtttttgacggttgctggtcaaatggacttatacatggatctggag 238  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  ||| |  ||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  38632748 tggaaaaaagac--aatggatggaaaaggaattatgagttgggctactggtgatgtcttcgatggttgttggtcagatggacttatacatggatttggag 38632845  T
Q  239 tttttagatttgcaaatgggggtgtc 264  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  38632846 tttatagatctgcaaatggggatgtc 38632871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 34544939 - 34544781
Alignment:
Q  100 gtttatagatttgtaaatggggatgtctatatcggaaattggaaaaaagacaaaatggatggaggagggaccatgagttgggctaatggtgatgtttttg 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||| ||||||  |||| ||||| |||||||||||||||      
T  34544939 gtttatagatttgcaaatggggatgtctacattggtaattggaaaaatgataaaatggatggaagagggattatgaattgggttaatggtgatgttttca 34544840  T
Q  200 acggttgctggtcaaatggacttatacatggatctggagtttttagatttgcaaatggg 258  Q
    | || || ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  34544839 atggatgttggtcaaatggacatagacatggatatggagtttatagattttcaaatggg 34544781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34533942 - 34533725
Alignment:
Q  47 atggtgatcattttaatggttgtctgtcaaatggacttagacatggatttggagtttatagatttgtaaatggggatgtctatatcggaaattggaaaaa 146  Q
    ||||||||  |||| ||||||||  ||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| | |  ||| ||||||||||    
T  34533942 atggtgatgtttttgatggttgttggtcaaatagacttaaagatggatatggagtttatagatatgcaaatggggatgtccacactggacattggaaaaa 34533843  T
Q  147 agacaaaatggatggaggagggaccatgagttgggctaatggtgatgtttttgacggttgctggtcaaatggacttatacatggatctggagtttttaga 246  Q
    ||    ||  ||||||  |||||  ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  34533842 agggggaaatgatggaaaagggattatgagatgggctaatggtgttgttttcgatggttgttggtcaaatggacttagacatggatatggagtttgtaga 34533743  T
Q  247 tttgcaaatgggggtgtc 264  Q
    ||| ||||||||| ||||    
T  34533742 tttacaaatggggatgtc 34533725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34534065 - 34533863
Alignment:
Q  62 atggttgtctgtcaaatggacttagacatggatttggagtttatagatttgtaaatggggatgtctatatcggaaattggaaaaaagacaaaatggatgg 161  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||  ||||||||| |||| |  ||||| |||||    
T  34534065 atggttgttggtcaaatggacttaaacatggacatggggtttatagatatgtaaatggagatgtttatagaggaaattgggaaaatgggaaaatagatgg 34533966  T
Q  162 aggagggaccatgagttgggctaatggtgatgtttttgacggttgctggtcaaatggacttatacatggatctggagtttttagatttgcaaatgggggt 261  Q
       |||||  |||| ||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  34533965 gaaagggattatgaattgggttgatggtgatgtttttgatggttgttggtcaaatagacttaaagatggatatggagtttatagatatgcaaatggggat 34533866  T
Q  262 gtc 264  Q
    |||    
T  34533865 gtc 34533863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 259
Target Start/End: Original strand, 38632780 - 38633007
Alignment:
Q  35 tgagttgggctaatggtgatcattttaatggttgtctgtcaaatggacttagacatggatttggagtttatagatttgtaaatggggatgtctatatcgg 134  Q
    |||||||||||| |||||||   ||  ||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |  ||    
T  38632780 tgagttgggctactggtgatgtcttcgatggttgttggtcagatggacttatacatggatttggagtttatagatctgcaaatggggatgtctacactgg 38632879  T
Q  135 aaattggaaaaaagacaaaatgg---atggaggagggaccatgagttgggctaatggtgatgtttttgacggttgctggtcaaatggacttatacatgga 231  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||||  || |||   ||  ||  ||||| |||||||||||||| ||||  | |||||||||||||| | |||||    
T  38632880 aaattggaaaatagacaaaatggattatgggagatggattttggattcagctaacggtgatgtttttgatggttatttgtcaaatggacttagatatgga 38632979  T
Q  232 tctggagtttttagatttgcaaatgggg 259  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||    
T  38632980 tttggagtttataaatttgcaaatgggg 38633007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 264
Target Start/End: Original strand, 39848375 - 39848582
Alignment:
Q  57 ttttaatggttgtctgtcaaatggacttagacatggatttggagtttatagatttgtaaatggggatgtctatatcggaaattggaaaaaagacaaaatg 156  Q
    |||| |||||||||  |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||| |  ||| |    
T  39848375 ttttgatggttgtcgatcaattgcgcttatacatggatttggagtttatagatatgcaaatgtgggtgtctatatcggaatttggaaaaaacatgaaagg 39848474  T
Q  157 gatggaggagggaccatgagttgggctaatggtgatgtttttgacggttgctggtcaaatggacttatacatggatctggagtttttagatttgcaaatg 256  Q
    ||||||  |||||  |||||||||| || ||| ||||| ||  | ||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||  |||||||    
T  39848475 gatggattagggattatgagttgggatactggagatgtcttctatggttgttggtcaaatggacttgcacatggatatggagtttatagatccgcaaatg 39848574  T
Q  257 ggggtgtc 264  Q
    ||| ||||    
T  39848575 gggatgtc 39848582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 133 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 38454020 - 38453894
Alignment:
Q  133 ggaaattggaaaaaagacaaaatggatggaggagggaccatgagttgggctaatggtgatgtttttgacggttgctggtcaaatggacttatacatggat 232  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  38454020 ggaaattggaaaaaagataaaagagatggaagagggactatgagttggcctgatggtgatgtttttgatggttgttggtcaaatagacttgtacatggat 38453921  T
Q  233 ctggagtttttagatttgcaaatgggg 259  Q
     |||||||| ||||| || ||||||||    
T  38453920 atggagtttatagatctgtaaatgggg 38453894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34533816 - 34533587
Alignment:
Q  35 tgagttgggctaatggtgatcattttaatggttgtctgtcaaatggacttagacatggatttggagtttatagatttgtaaatggggatgtctatatcgg 134  Q
    |||| ||||||||||||| |  |||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||| | |  ||    
T  34533816 tgagatgggctaatggtgttgttttcgatggttgttggtcaaatggacttagacatggatatggagtttgtagatttacaaatggggatgtccacagtgg 34533717  T
Q  135 aaattggaaaaaagacaaaatggatggaggagggaccatgagttgggctaatggtgatgtttttgacggttgctggtcaaatggacttatacatggatct 234  Q
    | ||||||||||||   ||| |||||||  |||||  | ||| |||||    ||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34533716 acattggaaaaaaggggaaaaggatggaaaagggattaagagatgggcaggcggtgatgttttcgatggttgttggtaaaatggacttaaacatggatct 34533617  T
Q  235 ggagtttttagatttgcaaatgggggtgtc 264  Q
    ||||||| || || ||| ||||||| ||||    
T  34533616 ggagtttatacatatgctaatggggatgtc 34533587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 34916480 - 34916295
Alignment:
Q  72 gtcaaatggacttagacatggatttggagtttatagatttgtaaatggggatgtctatatcggaaattggaaaaaagacaaaatggatggaggagggacc 171  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||   ||| |||||||  |||||      
T  34916480 gtcaaatggacataaacatggatatggagtttatagatttgcaaatggggatgtctatgctggaaattgggaaaaaggagaaaaggatggaaaagggatt 34916381  T
Q  172 atgagttgggctaatggtgatgtttttgacggttgctggtcaaatggacttatacatggatctggagtttttagatttgcaaatgg 257  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||| || ||||  |||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  34916380 atgaattggggtaatggtgctattttcgatggttattggtcaaatggactttcacatggatatggagtttatagatctgctaatgg 34916295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 269
Target Start/End: Original strand, 39848518 - 39848728
Alignment:
Q  62 atggttgtctgtcaaatggacttagacatggatttggagtttatagatttgtaaatggggatgtctatatcggaaattggaaaaaagacaaaatg---ga 158  Q
    ||||||||  |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||  || ||||||||||||| |   ||||||   ||    
T  39848518 atggttgttggtcaaatggacttgcacatggatatggagtttatagatccgcaaatggggatgtctccattggaaattggaaaacatggaaaatggatga 39848617  T
Q  159 tggaggagggaccatgagttgggctaatggtgatgtttttgacggttgctggtcaaatggacttatacatggatctggagtttttagatttgcaaatggg 258  Q
    |||  ||| ||   |   |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  39848618 tgggagagcgattttcgattgggctaatggtgatgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttggagtttatagatttgcaaatggg 39848717  T
Q  259 ggtgtcgacat 269  Q
    | |||| ||||    
T  39848718 gatgtctacat 39848728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 34539176 - 34539031
Alignment:
Q  114 aaatggggatgtctatatcggaaattggaaaaaagacaaaatggatggaggagggaccatgagttgggctaatggtgatgtttttgacggttgctggtca 213  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||   ||||  ||||||   ||||  |||| |||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||    
T  34539176 aaatggcgatgtctataatggaaattggaaaaaaaggaaaagagatggaaatgggattatgaattgggctaatggcgatgtttttaatggttgttggtca 34539077  T
Q  214 aatggacttatacatggatctggagtttttagatttgcaaatgggg 259  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  34539076 aatggacttagacatggttctggagtttatagatttgcaaatgggg 34539031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34916628 - 34916426
Alignment:
Q  62 atggttgtctgtcaaatggacttagacatggatttggagtttatagatttgtaaatggggatgtctatatcggaaattggaaaaaagacaaaatggatgg 161  Q
    ||||||||  |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||  | ||||| |  ||||||||| ||||||   ||| | ||||    
T  34916628 atggttgttggtcaaatggactttcacatggatatggagtttatagatctgcaaatggaaacgtctacactggaaattgggaaaaaggggaaaggcatgg 34916529  T
Q  162 aggagggaccatgagttgggctaatggtgatgtttttgacggttgctggtcaaatggacttatacatggatctggagtttttagatttgcaaatgggggt 261  Q
    |  |||||  ||||  |||||||| | ||||||||| || ||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  34916528 aaaagggattatgaaatgggctaacgatgatgttttcgatggttattggtcaaatggacataaacatggatatggagtttatagatttgcaaatggggat 34916429  T
Q  262 gtc 264  Q
    |||    
T  34916428 gtc 34916426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 34539113 - 34539027
Alignment:
Q  39 ttgggctaatggtgatcattttaatggttgtctgtcaaatggacttagacatggatttggagtttatagatttgtaaatggggatgt 125  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34539113 ttgggctaatggcgatgtttttaatggttgttggtcaaatggacttagacatggttctggagtttatagatttgcaaatggggatgt 34539027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 38453996 - 38453751
Alignment:
Q  19 gatggaggagggaatttgagttgggctaatggtgatcattttaatggttgtctgtcaaatggacttagacatggatttggagtttatagatttgtaaatg 118  Q
    |||||| |||||| | |||||||| || ||||||||  |||| ||||||||  ||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  38453996 gatggaagagggactatgagttggcctgatggtgatgtttttgatggttgttggtcaaatagacttgtacatggatatggagtttatagatctgtaaatg 38453897  T
Q  119 gggatgtctatatcggaaattggaaaaaagacaaaatggatggaggagggaccatgagttgggctaatggtgatgtttttgacggttgctggtcaaatgg 218  Q
    |||||||  | |  ||||||||||||  ||  | | |||||||| ||||||   ||| |||| |||| ||||||   ||||| |||||   |||  ||||    
T  38453896 gggatgttaacactggaaattggaaagcagggagattggatggaagagggattttgaattggactaacggtgatcaatttgatggttgtctgtcgcatgg 38453797  T
Q  219 acttatacatggatctggagtttttagatttgcaaatgggggtgtc 264  Q
    ||||| |||||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  38453796 acttagacatggacttggagtttatagatttgtaaatggggatgtc 38453751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 34544889 - 34544732
Alignment:
Q  12 taaattggatggaggagggaatttgagttgggctaatggtgatcattttaatggttgtctgtcaaatggacttagacatggatttggagtttatagattt 111  Q
    |||| |||||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||  ||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34544889 taaaatggatggaagagggattatgaattgggttaatggtgatgttttcaatggatgttggtcaaatggacatagacatggatatggagtttatagattt 34544790  T
Q  112 gtaaatggggatgtctatatcggaaattggaaaaaagacaaaatggatggaggaggga 169  Q
      ||||||| |||||||    |||||||  ||||| || |||||||| ||| ||||||    
T  34544789 tcaaatgggaatgtctacgcaggaaattttaaaaatgataaaatggacggaagaggga 34544732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 34916342 - 34916157
Alignment:
Q  72 gtcaaatggacttagacatggatttggagtttatagatttgtaaatggggatgtctatatcggaaattggaaaaaagacaaaatggatggaggagggacc 171  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||  |||||  | ||||| |  ||||||||| ||||||   ||| |||||||  |||||      
T  34916342 gtcaaatggactttcacatggatatggagtttatagatctgctaatggaaacgtctacactggaaattgggaaaaaggggaaagggatggaaaagggatt 34916243  T
Q  172 atgagttgggctaatggtgatgtttttgacggttgctggtcaaatggacttatacatggatctggagtttttagatttgcaaatgg 257  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||  | |||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  34916242 atgaaatgggctaacggtgatgttttcgatggttattggtcaaatggacagaaacatggctatggagtttatagatttgcaaatgg 34916157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 460 - 513
Target Start/End: Original strand, 38633363 - 38633416
Alignment:
Q  460 gaaagggaatatatgcaaggagttctaattgtggagaaaattagacagtattca 513  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38633363 gaaagggaatgtatgcaaggagttctaattgtggagaaaattagacagtattca 38633416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34549262 - 34549174
Alignment:
Q  185 atggtgatgtttttgacggttgctggtcaaatggacttatacatggatctggagtttttagatttgcaaatgggggtgtcgacattggt 273  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  34549262 atggtgatgtttttgatggttgttggtctaatggacttacacatggatatggagtttatagattttcaaatgggaatgtctacattggt 34549174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 264
Target Start/End: Original strand, 38632548 - 38632632
Alignment:
Q  180 ggctaatggtgatgtttttgacggttgctggtcaaatggacttatacatggatctggagtttttagatttgcaaatgggggtgtc 264  Q
    |||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  38632548 ggctaatggtgatgttttggatgcttgttggtcaaatggacttctacatggatttggagtttttagagctgcaaatggggatgtc 38632632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 249
Target Start/End: Original strand, 36951413 - 36951537
Alignment:
Q  125 tctatatcggaaattggaaaaaagacaaaatggatggaggagggaccatgagttgggctaatggtgatgtttttgacggttgctggtcaaatggacttat 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| | ||||  ||||  |||  ||| || ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||     
T  36951413 tctatattggaaattggaaaaaagggaaaatagatggaagggggattatgaagtggtttaacggcgatgtttttgatggttgttggttaaatggacttag 36951512  T
Q  225 acatggatctggagtttttagattt 249  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||    
T  36951513 acaaggatctggagtttatagattt 36951537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 257
Target Start/End: Original strand, 39848214 - 39848338
Alignment:
Q  133 ggaaattggaaaaaagacaaaatggatggaggagggaccatgagttgggctaatggtgatgtttttgacggttgctggtcaaatggacttatacatggat 232  Q
    |||||||||||||| || ||||  |||||| ||||||    || || ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||   || || ||||||    
T  39848214 ggaaattggaaaaatgataaaaaagatggaagagggattgagactttggctaatggtgatgtttttaatggttgttggtcaaatgactttgtatatggat 39848313  T
Q  233 ctggagtttttagatttgcaaatgg 257  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  39848314 atggagtttttagatttgcaaatgg 39848338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 34533651 - 34533566
Alignment:
Q  62 atggttgtctgtcaaatggacttagacatggatttggagtttatagatttgtaaatggggatgtctatatcggaaattggaaaaaa 147  Q
    ||||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  34533651 atggttgttggtaaaatggacttaaacatggatctggagtttatacatatgctaatggggatgtctatattggaaaatggaaaaaa 34533566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 34916204 - 34916107
Alignment:
Q  72 gtcaaatggacttagacatggatttggagtttatagatttgtaaatggggatgtctatatcggaaattggaaaaaagacaaaatggatggaggaggga 169  Q
    |||||||||||  | |||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||    
T  34916204 gtcaaatggacagaaacatggctatggagtttatagatttgcaaatggagatgtctacactggaaattggaaaaataataaaatggatggaagaggga 34916107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 461 - 513
Target Start/End: Original strand, 39849073 - 39849125
Alignment:
Q  461 aaagggaatatatgcaaggagttctaattgtggagaaaattagacagtattca 513  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  39849073 aaagggaatatatgcaaggagttttaattgtggagaaaatcagaccgtattca 39849125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 458 - 496
Target Start/End: Original strand, 36951893 - 36951931
Alignment:
Q  458 ttgaaagggaatatatgcaaggagttctaattgtggaga 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36951893 ttgaaagggaatatatgcaaggagttctaattgtggaga 36951931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 34549262 - 34549181
Alignment:
Q  47 atggtgatcattttaatggttgtctgtcaaatggacttagacatggatttggagtttatagatttgtaaatggggatgtcta 128  Q
    ||||||||  |||| ||||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  34549262 atggtgatgtttttgatggttgttggtctaatggacttacacatggatatggagtttatagattttcaaatgggaatgtcta 34549181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 34916656 - 34916571
Alignment:
Q  172 atgagttgggctaatggtgatgtttttgacggttgctggtcaaatggacttatacatggatctggagtttttagatttgcaaatgg 257  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||| || ||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  34916656 atgaattggggtaatggtgctattttcgatggttgttggtcaaatggactttcacatggatatggagtttatagatctgcaaatgg 34916571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34548600 - 34548525
Alignment:
Q  178 tgggctaatggtgatgtttttgacggttgctggtcaaatggacttatacatggatctggagtttttagatttgcaa 253  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  34548600 tgggctaatggtgatattttcgatggtggctggtcaaatggagttagacatggatttgaagtttatatatttgcaa 34548525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 127
Target Start/End: Original strand, 38632548 - 38632633
Alignment:
Q  42 ggctaatggtgatcattttaatggttgtctgtcaaatggacttagacatggatttggagtttatagatttgtaaatggggatgtct 127  Q
    |||||||||||||  |||  ||| ||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  38632548 ggctaatggtgatgttttggatgcttgttggtcaaatggacttctacatggatttggagtttttagagctgcaaatggggatgtct 38632633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 264
Target Start/End: Original strand, 39848368 - 39848444
Alignment:
Q  188 gtgatgtttttgacggttgctggtcaaatggacttatacatggatctggagtttttagatttgcaaatgggggtgtc 264  Q
    ||||||||||||| |||||  | |||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  39848368 gtgatgtttttgatggttgtcgatcaattgcgcttatacatggatttggagtttatagatatgcaaatgtgggtgtc 39848444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 111
Target Start/End: Original strand, 36951483 - 36951537
Alignment:
Q  57 ttttaatggttgtctgtcaaatggacttagacatggatttggagtttatagattt 111  Q
    |||| ||||||||  || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  36951483 ttttgatggttgttggttaaatggacttagacaaggatctggagtttatagattt 36951537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 460 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 34547914 - 34547861
Alignment:
Q  460 gaaagggaatatatgcaaggagttctaattgtggagaaaattagacagtattca 513  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  34547914 gaaagggaatataagcaaggagttgtaattacggagaaaattataaagtattca 34547861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 142
Target Start/End: Original strand, 39848261 - 39848361
Alignment:
Q  42 ggctaatggtgatcattttaatggttgtctgtcaaatggacttag-acatggatttggagtttatagatttgtaaatggggatgtctatatcggaaattg 140  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||| | | |||||| |||||||| |||||||| |||||| || ||||| |  ||||||||    
T  39848261 ggctaatggtgatgtttttaatggttgttggtcaaat-gactttgtatatggatatggagtttttagatttgcaaatggtgacgtctacactggaaattg 39848359  T
Q  141 ga 142  Q
    ||    
T  39848360 ga 39848361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 34548568 - 34548528
Alignment:
Q  72 gtcaaatggacttagacatggatttggagtttatagatttg 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  34548568 gtcaaatggagttagacatggatttgaagtttatatatttg 34548528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 3)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 7046059 - 7045679
Alignment:
Q  17 tggatggaggagggaatttgagttgggctaatggtgatcattttaatggttgtctgtcaaatggacttagacatggatttggagtttatagatttgtaaa 116  Q
    ||||||||| ||||| |||   ||||| ||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||    
T  7046059 tggatggagaagggattttatattgggttaatggtgatagttttgatggttgcctgtcaaatggactcagagatggatttggagtttataaatttagaaa 7045960  T
Q  117 tggggatgtctatatcggaaattggaaaaaagacaaaatggatggaggagggaccatgagttgggctaatggtgatgtttttgacggttgctggtcaaat 216  Q
    ||| ||||||||    |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||          |||||||||    
T  7045959 tggtgatgtctacggaggaaattggaaagaagagaaaatggatggaagagggatcatgagttgggttaatgttgatgtttt----------tggtcaaat 7045870  T
Q  217 ggacttatacatggatctggagtttttagatttgcaaatgggggtgtcgacattggtaacttcaggggtaaacttctccatgacaacggatcatacacat 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||   | |||||    
T  7045869 ggacttatacatggatatggagtttttacatttgcaaatggagatgtcaacattggtaactttaagagtcaacttctctatgacaacggaaagtgcacat 7045770  T
Q  317 gctcaaatagaacaatctacaagggttgcatatgctcaaatgaaaaagtgatagagaaaggactgacgatatggagccttaaaaatcctgatgg 410  Q
    | |||||| ||||||| ||| | ||   ||| ||     ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||    
T  7045769 ggtcaaatggaacaatgtacgaagg--ccat-tgtgttgatgaaaaagtgatagagaaaggactaatgatatggagccctcaaaatcctgatgg 7045679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7046219 - 7046154
Alignment:
Q  133 ggaaattggaaaaaagacaaaatggatggaggagggaccatgagttgggctaatggtgatgttttt 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||   |||||||||||||||||||| |||||    
T  7046219 ggaaattggaaaaaagataaaatggatggaaaagggattgtgagttgggctaatggtgattttttt 7046154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 467 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 7045608 - 7045573
Alignment:
Q  467 aatatatgcaaggagttctaattgtggagaaaatta 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7045608 aatatatgcaaggagttctaattgtggagaaaatta 7045573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University