View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18799_high_15 (Length: 276)

Name: NF18799_high_15
Description: NF18799
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18799_high_15
NF18799_high_15
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (1-267)||(3264871-3265137)
chr4 (1-267)||(29453614-29453880)
chr4 (1-267)||(11207308-11207574)
chr4 (1-263)||(44661943-44662205)
chr4 (1-263)||(33222851-33223113)
chr4 (1-261)||(20890918-20891177)
chr4 (1-261)||(16145847-16146107)
chr4 (1-263)||(1649354-1649616)
chr4 (17-252)||(15003457-15003692)
chr4 (17-263)||(42702836-42703082)
chr4 (17-263)||(51606274-51606520)
chr4 (18-263)||(15245857-15246102)
chr4 (1-263)||(15070346-15070608)
chr4 (2-249)||(16252263-16252510)
chr4 (2-251)||(14652253-14652502)
chr4 (8-249)||(12523623-12523864)
chr4 (2-249)||(18227264-18227511)
chr4 (2-249)||(14680514-14680761)
chr4 (2-263)||(16355263-16355524)
chr4 (14-263)||(14159425-14159674)
chr4 (76-249)||(14927151-14927324)
chr4 (2-229)||(15149824-15150051)
chr4 (17-247)||(14851199-14851429)
chr4 (14-249)||(7090380-7090614)
chr4 (68-207)||(18164333-18164472)
chr4 (2-246)||(12476550-12476794)
chr4 (1-123)||(27900459-27900581)
chr4 (14-251)||(19778623-19778860)
chr4 (14-246)||(8386362-8386594)
chr4 (14-246)||(29039234-29039466)
chr4 (14-246)||(40472990-40473222)
chr4 (14-251)||(14266729-14266966)
chr4 (14-246)||(14303808-14304039)
chr4 (14-246)||(15364336-15364568)
chr4 (14-246)||(18297155-18297387)
chr4 (17-144)||(15359183-15359310)
chr4 (17-124)||(16752665-16752772)
chr4 (134-263)||(15319516-15319645)
chr4 (155-252)||(15415210-15415307)
chr4 (14-251)||(27711281-27711518)
chr4 (14-246)||(23955697-23955929)
chr4 (14-249)||(8053453-8053688)
chr4 (177-249)||(18607823-18607895)
chr4 (194-263)||(15359327-15359396)
chr4 (11-106)||(9290925-9291020)
chr4 (11-106)||(14997406-14997501)
chr4 (8-106)||(12132493-12132591)
chr4 (8-106)||(15293241-15293339)
chr4 (8-106)||(16445296-16445394)
chr4 (18-106)||(13247735-13247823)
chr4 (11-103)||(55375445-55375537)
[»] chr7 (55 HSPs)
chr7 (1-267)||(49152220-49152486)
chr7 (1-267)||(11306327-11306593)
chr7 (1-267)||(8212192-8212458)
chr7 (20-263)||(12455626-12455868)
chr7 (1-263)||(26118669-26118910)
chr7 (18-263)||(6413434-6413679)
chr7 (20-263)||(13021280-13021523)
chr7 (19-236)||(16950553-16950770)
chr7 (17-263)||(1487-1733)
chr7 (1-263)||(15102665-15102927)
chr7 (2-263)||(14129796-14130057)
chr7 (2-263)||(14433614-14433875)
chr7 (23-263)||(26288122-26288362)
chr7 (1-263)||(14264308-14264570)
chr7 (1-263)||(18054017-18054279)
chr7 (1-263)||(13665476-13665733)
chr7 (17-263)||(14286456-14286702)
chr7 (1-246)||(16072358-16072603)
chr7 (17-251)||(19147146-19147380)
chr7 (17-251)||(20746545-20746779)
chr7 (17-263)||(23199823-23200069)
chr7 (17-263)||(23505950-23506196)
chr7 (11-263)||(12206874-12207126)
chr7 (2-249)||(11553189-11553436)
chr7 (2-249)||(12687437-12687684)
chr7 (2-249)||(14954556-14954803)
chr7 (108-263)||(15340419-15340574)
chr7 (2-249)||(17403-17650)
chr7 (14-249)||(15154751-15154986)
chr7 (1-251)||(11388492-11388741)
chr7 (14-251)||(23516868-23517105)
chr7 (2-249)||(14037743-14037990)
chr7 (2-249)||(14347773-14348020)
chr7 (2-249)||(15203815-15204062)
chr7 (2-246)||(8707544-8707788)
chr7 (14-246)||(11237312-11237544)
chr7 (2-246)||(15161144-15161388)
chr7 (14-249)||(14332333-14332568)
chr7 (48-246)||(8198567-8198765)
chr7 (17-251)||(10870929-10871163)
chr7 (8-198)||(15624539-15624729)
chr7 (14-251)||(18177676-18177913)
chr7 (2-246)||(18551845-18552089)
chr7 (2-246)||(13686002-13686247)
chr7 (48-246)||(44791484-44791682)
chr7 (122-263)||(15479323-15479464)
chr7 (2-263)||(21661886-21662144)
chr7 (8-106)||(4440007-4440105)
chr7 (11-106)||(7823979-7824074)
chr7 (11-106)||(27107870-27107965)
chr7 (20-90)||(41251-41321)
chr7 (18-106)||(12193635-12193723)
chr7 (18-106)||(14936426-14936514)
chr7 (18-106)||(15364019-15364107)
chr7 (2-66)||(35964937-35965001)
[»] chr8 (57 HSPs)
chr8 (1-267)||(804193-804459)
chr8 (1-267)||(6679106-6679372)
chr8 (1-267)||(14565137-14565403)
chr8 (1-267)||(6603653-6603919)
chr8 (1-267)||(28982352-28982618)
chr8 (1-267)||(28987572-28987838)
chr8 (1-263)||(12304757-12305019)
chr8 (1-263)||(16265138-16265400)
chr8 (53-267)||(27347221-27347435)
chr8 (1-263)||(29303946-29304208)
chr8 (1-263)||(22061953-22062215)
chr8 (17-263)||(21324945-21325192)
chr8 (17-263)||(1266238-1266484)
chr8 (17-263)||(31417010-31417256)
chr8 (1-263)||(21681990-21682252)
chr8 (17-263)||(31571378-31571624)
chr8 (17-255)||(20010436-20010674)
chr8 (17-263)||(23654926-23655172)
chr8 (1-255)||(20007857-20008111)
chr8 (17-263)||(19851410-19851656)
chr8 (17-263)||(19857446-19857692)
chr8 (1-263)||(21840416-21840678)
chr8 (2-249)||(30313665-30313912)
chr8 (2-249)||(15533393-15533640)
chr8 (2-249)||(32600157-32600404)
chr8 (14-263)||(21167070-21167319)
chr8 (8-249)||(22046386-22046627)
chr8 (1-252)||(20388109-20388360)
chr8 (2-263)||(23948888-23949149)
chr8 (2-249)||(19977980-19978227)
chr8 (2-249)||(21250955-21251202)
chr8 (8-249)||(22032045-22032286)
chr8 (48-263)||(16408612-16408827)
chr8 (2-249)||(22164712-22164959)
chr8 (2-249)||(22987214-22987461)
chr8 (14-249)||(23650054-23650289)
chr8 (14-251)||(19485403-19485640)
chr8 (8-249)||(22133568-22133809)
chr8 (14-249)||(21922268-21922503)
chr8 (48-249)||(15441194-15441395)
chr8 (14-246)||(19112706-19112938)
chr8 (14-251)||(17674556-17674793)
chr8 (17-261)||(20396661-20396905)
chr8 (14-249)||(21394398-21394633)
chr8 (14-249)||(21788891-21789126)
chr8 (1-249)||(20018270-20018518)
chr8 (14-246)||(22120707-22120939)
chr8 (2-117)||(22051008-22051123)
chr8 (2-105)||(22377974-22378077)
chr8 (2-105)||(22384149-22384252)
chr8 (10-106)||(21850866-21850962)
chr8 (8-106)||(16877622-16877720)
chr8 (11-106)||(20652863-20652958)
chr8 (11-106)||(21197032-21197127)
chr8 (20-90)||(19863229-19863299)
chr8 (20-90)||(19867866-19867936)
chr8 (8-106)||(22315347-22315445)
[»] chr5 (57 HSPs)
chr5 (1-267)||(14887250-14887516)
chr5 (1-267)||(37545755-37546022)
chr5 (1-267)||(24798656-24798922)
chr5 (1-267)||(20342125-20342391)
chr5 (1-263)||(22502526-22502788)
chr5 (11-267)||(25847918-25848174)
chr5 (1-263)||(22381046-22381308)
chr5 (1-263)||(22236179-22236441)
chr5 (21-263)||(23080368-23080610)
chr5 (1-252)||(22461810-22462061)
chr5 (17-263)||(17269608-17269854)
chr5 (17-263)||(20821300-20821546)
chr5 (1-263)||(23442552-23442814)
chr5 (1-246)||(21891018-21891263)
chr5 (1-263)||(28924027-28924289)
chr5 (1-263)||(28895201-28895463)
chr5 (1-263)||(24735870-24736132)
chr5 (1-263)||(24737044-24737306)
chr5 (1-263)||(24749813-24750075)
chr5 (21-263)||(20773607-20773849)
chr5 (1-263)||(21564225-21564487)
chr5 (2-249)||(23573621-23573868)
chr5 (17-249)||(26738980-26739212)
chr5 (35-249)||(20573400-20573614)
chr5 (2-263)||(18775642-18775903)
chr5 (8-263)||(20468362-20468617)
chr5 (17-263)||(23516406-23516652)
chr5 (2-249)||(21984565-21984812)
chr5 (17-249)||(23471108-23471340)
chr5 (2-263)||(23440090-23440351)
chr5 (53-249)||(21343669-21343865)
chr5 (2-230)||(20798658-20798886)
chr5 (35-263)||(21404701-21404929)
chr5 (14-246)||(22134550-22134782)
chr5 (1-263)||(21662299-21662560)
chr5 (14-246)||(22333159-22333391)
chr5 (2-249)||(25423068-25423315)
chr5 (14-251)||(27668762-27668999)
chr5 (14-246)||(34566376-34566608)
chr5 (14-246)||(41770724-41770956)
chr5 (14-251)||(27610231-27610468)
chr5 (14-246)||(15000011-15000243)
chr5 (14-246)||(16356384-16356616)
chr5 (2-246)||(27685660-27685904)
chr5 (15-237)||(22348316-22348538)
chr5 (8-246)||(37291762-37292000)
chr5 (48-246)||(40708662-40708860)
chr5 (14-246)||(27518289-27518521)
chr5 (14-246)||(29476345-29476577)
chr5 (14-251)||(19769837-19770074)
chr5 (1-228)||(21665760-21665986)
chr5 (20-185)||(21498314-21498479)
chr5 (175-263)||(21625383-21625471)
chr5 (8-106)||(11210960-11211058)
chr5 (8-106)||(27011088-27011186)
chr5 (11-106)||(21937457-21937552)
chr5 (8-106)||(24581215-24581313)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (1-267)||(20832545-20832811)
chr2 (1-267)||(31830218-31830484)
chr2 (1-267)||(1063311-1063577)
chr2 (1-263)||(11358491-11358753)
chr2 (1-251)||(23293534-23293784)
chr2 (2-263)||(24653909-24654170)
chr2 (27-263)||(24944931-24945167)
chr2 (1-263)||(23276340-23276602)
chr2 (1-263)||(12573917-12574179)
chr2 (17-263)||(27787305-27787551)
chr2 (17-263)||(23087014-23087260)
chr2 (2-263)||(22757081-22757342)
chr2 (48-249)||(23138615-23138816)
chr2 (48-249)||(23550405-23550606)
chr2 (1-261)||(27365696-27365956)
chr2 (9-249)||(27377096-27377336)
chr2 (2-249)||(24708100-24708347)
chr2 (2-263)||(21325884-21326145)
chr2 (14-263)||(24675053-24675302)
chr2 (2-249)||(23188586-23188833)
chr2 (2-228)||(23063676-23063902)
chr2 (2-246)||(10868431-10868675)
chr2 (14-246)||(21145660-21145892)
chr2 (14-246)||(9609717-9609949)
chr2 (14-246)||(16924841-16925073)
chr2 (14-246)||(16998581-16998813)
chr2 (2-246)||(24261951-24262195)
chr2 (14-246)||(27217597-27217829)
chr2 (48-246)||(16981733-16981931)
chr2 (48-246)||(17063298-17063496)
chr2 (17-251)||(44386202-44386436)
chr2 (2-263)||(30211535-30211796)
chr2 (14-246)||(22325486-22325718)
chr2 (14-243)||(24878625-24878854)
chr2 (14-246)||(24709614-24709846)
chr2 (14-246)||(27370850-27371082)
chr2 (48-246)||(17066959-17067154)
chr2 (2-168)||(24825900-24826066)
chr2 (170-251)||(24833359-24833440)
chr2 (38-244)||(45529100-45529306)
chr2 (94-251)||(41609054-41609211)
chr2 (11-106)||(22276000-22276095)
chr2 (11-107)||(23817720-23817816)
chr2 (10-106)||(24831813-24831909)
chr2 (8-106)||(12640543-12640641)
[»] chr1 (35 HSPs)
chr1 (1-267)||(37677023-37677290)
chr1 (1-263)||(20294360-20294622)
chr1 (1-263)||(31550330-31550592)
chr1 (1-267)||(20075208-20075474)
chr1 (32-267)||(20395173-20395408)
chr1 (17-263)||(20244148-20244394)
chr1 (2-263)||(20940213-20940474)
chr1 (17-261)||(19665041-19665285)
chr1 (1-263)||(19854262-19854524)
chr1 (17-263)||(22433281-22433527)
chr1 (1-139)||(11382666-11382804)
chr1 (1-263)||(20856910-20857172)
chr1 (21-202)||(20836057-20836241)
chr1 (2-249)||(17045165-17045412)
chr1 (2-249)||(50620394-50620641)
chr1 (48-249)||(50612612-50612813)
chr1 (2-249)||(20136740-20136987)
chr1 (14-249)||(19106329-19106564)
chr1 (14-249)||(20249812-20250047)
chr1 (48-246)||(21747500-21747698)
chr1 (2-237)||(16369271-16369506)
chr1 (48-249)||(16078829-16079030)
chr1 (2-263)||(19761016-19761277)
chr1 (14-251)||(16350761-16350998)
chr1 (14-251)||(41354631-41354868)
chr1 (14-246)||(21830268-21830500)
chr1 (17-144)||(41307892-41308019)
chr1 (14-246)||(33391191-33391423)
chr1 (48-249)||(51333689-51333890)
chr1 (14-246)||(21836915-21837147)
chr1 (110-263)||(21163228-21163381)
chr1 (167-263)||(24476928-24477024)
chr1 (8-106)||(46518826-46518924)
chr1 (11-106)||(20914315-20914410)
chr1 (11-106)||(20831551-20831646)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (1-267)||(47123502-47123768)
chr3 (1-264)||(10383530-10383793)
chr3 (1-261)||(16329964-16330224)
chr3 (1-263)||(11961339-11961601)
chr3 (1-263)||(18134651-18134913)
chr3 (1-261)||(12360847-12361107)
chr3 (1-263)||(11304078-11304340)
chr3 (17-263)||(8759403-8759649)
chr3 (17-263)||(13941586-13941832)
chr3 (1-263)||(15227211-15227473)
chr3 (17-263)||(41177084-41177330)
chr3 (1-263)||(10420350-10420612)
chr3 (2-263)||(16836816-16837071)
chr3 (17-260)||(16381248-16381491)
chr3 (8-263)||(44776809-44777064)
chr3 (1-263)||(14571410-14571672)
chr3 (1-260)||(15953273-15953532)
chr3 (1-263)||(13322957-13323219)
chr3 (1-261)||(13972425-13972685)
chr3 (2-263)||(12497800-12498061)
chr3 (2-249)||(17489416-17489663)
chr3 (17-202)||(12850600-12850785)
chr3 (14-249)||(9522285-9522520)
chr3 (18-249)||(15208457-15208688)
chr3 (120-263)||(31945034-31945177)
chr3 (17-263)||(14876831-14877077)
chr3 (122-263)||(31689049-31689190)
chr3 (1-261)||(14086237-14086497)
chr3 (2-249)||(16492498-16492745)
chr3 (10-249)||(16691726-16691965)
chr3 (14-249)||(15725262-15725497)
chr3 (19-229)||(15247733-15247943)
chr3 (2-263)||(16807243-16807504)
chr3 (14-251)||(53385347-53385584)
chr3 (48-263)||(16370965-16371180)
chr3 (14-246)||(10005169-10005401)
chr3 (14-246)||(10905779-10906011)
chr3 (14-246)||(13252259-13252491)
chr3 (2-246)||(16412599-16412843)
chr3 (14-246)||(16635342-16635574)
chr3 (14-246)||(43162666-43162898)
chr3 (48-251)||(16756948-16757151)
chr3 (14-246)||(15338838-15339070)
chr3 (14-246)||(15589721-15589953)
chr3 (48-251)||(5425292-5425495)
chr3 (48-251)||(6600311-6600514)
chr3 (48-246)||(48425016-48425214)
chr3 (14-246)||(15348574-15348806)
chr3 (18-246)||(15402843-15403071)
chr3 (14-246)||(20062383-20062615)
chr3 (2-246)||(26792716-26792960)
chr3 (11-106)||(15576469-15576564)
chr3 (11-106)||(8274725-8274820)
chr3 (198-263)||(12854360-12854425)
chr3 (11-106)||(13975371-13975466)
chr3 (11-106)||(16743029-16743124)
chr3 (2-125)||(15016061-15016184)
[»] chr6 (61 HSPs)
chr6 (1-263)||(24364209-24364471)
chr6 (1-263)||(10469071-10469333)
chr6 (1-263)||(22796854-22797116)
chr6 (1-263)||(21471398-21471660)
chr6 (1-263)||(25750606-25750868)
chr6 (17-252)||(8766386-8766621)
chr6 (1-263)||(14131401-14131663)
chr6 (17-263)||(27560855-27561101)
chr6 (17-263)||(28283051-28283297)
chr6 (1-263)||(15459133-15459395)
chr6 (1-228)||(25768023-25768250)
chr6 (17-172)||(14381705-14381860)
chr6 (8-249)||(22078917-22079158)
chr6 (17-249)||(27331671-27331903)
chr6 (17-249)||(27392411-27392643)
chr6 (8-263)||(21564361-21564616)
chr6 (1-263)||(19879095-19879357)
chr6 (1-263)||(34645808-34646070)
chr6 (2-263)||(5839442-5839703)
chr6 (48-249)||(17032373-17032574)
chr6 (17-181)||(17415365-17415529)
chr6 (2-249)||(12497837-12498084)
chr6 (2-249)||(12510817-12511064)
chr6 (2-249)||(25610084-25610331)
chr6 (2-263)||(16963590-16963851)
chr6 (14-263)||(19864484-19864733)
chr6 (14-246)||(1543319-1543551)
chr6 (63-263)||(25765573-25765773)
chr6 (2-249)||(12505166-12505413)
chr6 (1-263)||(11287820-11288082)
chr6 (48-249)||(21833250-21833451)
chr6 (2-251)||(27187245-27187494)
chr6 (2-251)||(27261746-27261995)
chr6 (14-251)||(28263432-28263669)
chr6 (14-251)||(28342181-28342418)
chr6 (8-263)||(18794487-18794742)
chr6 (14-249)||(22762690-22762925)
chr6 (2-249)||(23078280-23078527)
chr6 (2-263)||(16927863-16928124)
chr6 (14-246)||(25112366-25112598)
chr6 (14-246)||(29592155-29592387)
chr6 (1-263)||(11280727-11280989)
chr6 (8-246)||(24313397-24313635)
chr6 (14-251)||(28292607-28292844)
chr6 (21-229)||(18197789-18197997)
chr6 (141-263)||(1640596-1640718)
chr6 (48-246)||(2875072-2875270)
chr6 (2-227)||(18408166-18408391)
chr6 (14-246)||(16626952-16627184)
chr6 (1-145)||(18800857-18801001)
chr6 (139-252)||(18787696-18787809)
chr6 (137-263)||(22433794-22433920)
chr6 (1-105)||(25750901-25751005)
chr6 (11-106)||(16098004-16098099)
chr6 (11-106)||(1649016-1649111)
chr6 (11-106)||(16382605-16382700)
chr6 (11-106)||(18838140-18838235)
chr6 (8-106)||(23996202-23996300)
chr6 (11-106)||(15078596-15078691)
chr6 (11-106)||(18571605-18571700)
chr6 (11-106)||(25743319-25743414)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (1-263)||(16793-17055)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (1-267)||(38967-39233)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (1-263)||(16640-16902)
scaffold0113 (17-263)||(25961-26207)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (1-263)||(26225-26487)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (1-263)||(42413-42675)
scaffold0010 (1-263)||(47479-47741)
scaffold0010 (68-125)||(2252-2309)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (20-263)||(42747-42990)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (20-263)||(248577-248820)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (1-263)||(117532-117794)
scaffold0004 (1-263)||(322668-322930)
scaffold0004 (2-263)||(203549-203810)
scaffold0004 (17-263)||(385783-386029)
scaffold0004 (10-263)||(111985-112238)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (1-263)||(195783-196044)
scaffold0011 (29-263)||(148534-148768)
scaffold0011 (56-263)||(68575-68782)
scaffold0011 (2-249)||(26614-26861)
scaffold0011 (11-106)||(122040-122135)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (2-263)||(14332-14593)
scaffold0203 (83-263)||(9039-9219)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (8-263)||(17218-17473)
scaffold0298 (8-263)||(13448-13703)
scaffold0298 (17-263)||(19947-20193)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (8-263)||(10852-11107)
scaffold0124 (8-263)||(486-741)
scaffold0124 (8-106)||(7897-7995)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (17-263)||(57912-58158)
scaffold0053 (1-263)||(49113-49375)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (17-261)||(20088-20332)
scaffold0114 (17-261)||(43471-43715)
scaffold0114 (17-261)||(44483-44727)
scaffold0114 (63-261)||(36021-36219)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (17-261)||(49303-49547)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (17-263)||(4235-4481)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (17-263)||(260272-260518)
scaffold0005 (2-251)||(164790-165039)
scaffold0005 (14-262)||(278923-279171)
scaffold0005 (14-246)||(308640-308872)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (17-263)||(21767-22013)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (1-263)||(19084-19346)
scaffold0058 (8-183)||(58493-58668)
scaffold0058 (179-263)||(59030-59114)
scaffold0058 (8-102)||(74025-74119)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (1-263)||(10163-10425)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-263)||(1249-1511)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (1-263)||(27483-27745)
scaffold0139 (1-263)||(1229-1490)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (2-260)||(47091-47349)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (1-263)||(7318-7576)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (17-263)||(12877-13123)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (17-263)||(52275-52521)
scaffold0067 (17-263)||(61309-61555)
scaffold0067 (17-228)||(67697-67908)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (17-263)||(13997-14243)
scaffold0034 (1-192)||(5033-5224)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-263)||(39703-39965)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (19-263)||(9762-10006)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (17-263)||(62-308)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (1-263)||(18617-18879)
scaffold0326 (195-263)||(3629-3697)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (1-263)||(31374-31636)
scaffold0106 (53-228)||(14038-14213)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (19-263)||(1141-1385)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (68-263)||(136083-136278)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (1-263)||(96082-96344)
scaffold0029 (1-263)||(112523-112785)
scaffold0029 (14-251)||(109904-110141)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (17-261)||(27192-27436)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (8-240)||(1611-1843)
scaffold0120 (2-249)||(6001-6248)
scaffold0120 (11-106)||(22815-22910)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (1-252)||(3866-4117)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (1-263)||(155-417)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (17-263)||(3839-4085)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (17-263)||(6010-6255)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (17-263)||(14050-14295)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (17-263)||(26106-26352)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-263)||(51943-52205)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (17-263)||(2715-2961)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (2-263)||(27931-28192)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (1-263)||(91012-91274)
scaffold0001 (48-249)||(162091-162292)
scaffold0001 (2-249)||(448037-448284)
scaffold0001 (63-129)||(175361-175427)
scaffold0001 (11-106)||(78719-78814)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (8-263)||(25158-25413)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (17-263)||(7132-7378)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (1-252)||(6158-6410)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (2-263)||(25800-26061)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (11-263)||(10829-11081)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (2-249)||(180195-180442)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (17-263)||(5098-5344)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (2-249)||(65383-65630)
scaffold0042 (56-263)||(39924-40131)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (2-263)||(5978-6239)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (2-263)||(15160-15421)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (11-263)||(5680-5932)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (2-249)||(14338-14585)
scaffold0044 (14-246)||(601-833)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (8-263)||(14841-15096)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (2-249)||(219498-219745)
scaffold0012 (17-249)||(229021-229253)
scaffold0012 (11-106)||(33085-33180)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (17-207)||(4770-4960)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (1-263)||(492-754)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (14-249)||(654-889)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (2-249)||(63-310)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (2-249)||(16965-17212)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (2-249)||(127280-127527)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (63-249)||(15471-15656)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (1-263)||(18813-19075)
scaffold0090 (1-144)||(23094-23237)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (1-263)||(28849-29111)
scaffold0064 (1-263)||(40840-41102)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (1-263)||(37166-37428)
scaffold0026 (1-150)||(27417-27566)
scaffold0026 (1-150)||(38254-38403)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (11-228)||(1-218)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (2-263)||(872-1133)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (14-246)||(7358-7590)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (44-228)||(13376-13560)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (14-246)||(43135-43367)
scaffold0028 (1-261)||(50594-50854)
scaffold0028 (14-245)||(8467-8698)
scaffold0028 (11-106)||(106663-106758)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (2-249)||(4010-4257)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (2-249)||(32833-33080)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (2-237)||(3130-3365)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (78-263)||(2023-2207)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (2-263)||(33654-33915)
scaffold0109 (2-249)||(8574-8821)
scaffold0109 (58-106)||(44583-44631)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (1-261)||(33757-34017)
scaffold0076 (11-106)||(40379-40474)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (18-249)||(357-588)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (48-249)||(5199-5400)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (2-263)||(64112-64373)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (17-159)||(10837-10979)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (2-131)||(5309-5438)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (2-229)||(9341-9568)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (14-249)||(6350-6585)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (48-263)||(16921-17136)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (2-249)||(16497-16744)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (140-263)||(3487-3610)
scaffold0222 (22-54)||(3456-3488)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (2-249)||(16546-16793)
[»] scaffold1508 (1 HSPs)
scaffold1508 (155-261)||(871-977)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (69-263)||(117053-117247)
scaffold0037 (11-122)||(23556-23667)
scaffold0037 (11-106)||(98136-98231)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (8-249)||(1117-1358)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (14-263)||(916-1164)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (2-249)||(4486-4733)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (17-251)||(390-624)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (131-240)||(45832-45941)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (2-249)||(775-1021)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (35-249)||(983-1197)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (53-207)||(49513-49667)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (8-251)||(86591-86834)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (8-162)||(21932-22086)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (2-144)||(9053-9195)
scaffold0507 (159-249)||(6955-7045)
scaffold0507 (8-105)||(420-517)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (14-246)||(6918-7152)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (2-162)||(7855-8015)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (2-249)||(13058-13305)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (174-263)||(18991-19080)
scaffold0023 (63-205)||(4567-4709)
scaffold0023 (160-249)||(36985-37074)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (8-111)||(1910-2013)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (148-263)||(9183-9298)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (1-90)||(7-96)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (141-189)||(8768-8816)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (11-106)||(1000-1095)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (1-72)||(1314-1385)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (11-106)||(10476-10571)
scaffold0447 (11-106)||(5862-5957)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (14-102)||(7522-7610)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (170-249)||(6251-6330)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (11-106)||(14778-14873)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (11-106)||(46275-46370)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (14-126)||(873-985)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (11-106)||(476-571)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (11-106)||(8216-8311)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (11-106)||(8471-8566)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (11-106)||(14827-14922)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (11-106)||(13029-13124)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (11-106)||(28356-28451)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (11-106)||(24001-24096)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (20-106)||(3280-3366)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (8-106)||(14644-14742)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (11-106)||(3965-4060)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (8-106)||(8978-9076)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 263; Significance: 1e-147; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 3264871 - 3265137
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3264871 caagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 3264970  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3264971 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 3265070  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3265071 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 3265137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 29453614 - 29453880
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  29453614 caagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttg 29453713  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29453714 actcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 29453813  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29453814 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 29453880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 11207308 - 11207574
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11207308 caagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttg 11207407  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11207408 actcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgt 11207507  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  11207508 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttcacatgtgataccgagggatgatgatgt 11207574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 44661943 - 44662205
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  44661943 caagcggagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtgttggtcgtgcgctgaagtcgagaaagttg 44662042  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44662043 actcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 44662142  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44662143 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccaagggatgatg 44662205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33223113 - 33222851
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  33223113 caagcgaagaaaggaacttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttg 33223014  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  33223013 acaccaaagttcattggtccgtatcagatttcaaagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccccatctttcgaacatgcatgatgtgt 33222914  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  33222913 ttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgattccaaaggatgatg 33222851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20891177 - 20890918
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20891177 caagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgcattgaagtcgaggaagttg 20891078  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20891077 actcctaagtttattggttcgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatag-gatgggtttccaacacatctttcgaacttgcatgatgtgt 20890979  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatga 261  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20890978 ttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgattccaagggatga 20890918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16146107 - 16145847
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16146107 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaggaggatgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttg 16146008  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16146007 actccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgt 16145908  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatga 261  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16145907 tacatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatga 16145847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 1649354 - 1649616
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  1649354 caagcggaggaaggaccttgagtttcaggagggcgatcatgtatttctaagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttg 1649453  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  1649454 acttccaagttcattggtccgtatcagatatcagagaggattggaactgtggcatatagagttgggttgccacctcatctttcgaatttgcatgatgtgt 1649553  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  1649554 ttcatgtgtcgcagctacggaagtatgtagcggatccttcacatgtaattccaagggatgatg 1649616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 252
Target Start/End: Original strand, 15003457 - 15003692
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15003457 cttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagttactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagtttattg 15003556  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
     ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  15003557 atccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaact 15003656  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattcc 252  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  15003657 tcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattcc 15003692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 42703082 - 42702836
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | || || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  42703082 cttgagtttcaagagggtgatcatgtatttataagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattg 42702983  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || ||    
T  42702982 gtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaact 42702883  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  42702882 tcggaagtatgtagcagatccttcacatgttattccgagagatgatg 42702836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 51606274 - 51606520
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | || || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  51606274 cttgagtttcaagagggtgatcatgtatttataagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattg 51606373  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || ||    
T  51606374 gtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaact 51606473  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  51606474 tcggaagtatgtagcagatccttcacatgttattccgagagatgatg 51606520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15246102 - 15245857
Alignment:
Q  18 ttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattgg 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |||||    
T  15246102 ttgagtttcaggagggagatcatgtatttctgagagttacccctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattgg 15246003  T
Q  118 tccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagctt 217  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| || || |||    
T  15246002 tccgtatcagataacagagagggttggaacagtggcatacagagtgcgtttgccaccacatctttcgaatttgcattatgtgtttcatgtgtcgcaactt 15245903  T
Q  218 cggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  15245902 cagaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 15245857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15070608 - 15070346
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||  |||||||  | |||||||    
T  15070608 caagcgaagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggtcgtgtgttgaagtttatgaagttg 15070509  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||| | |||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15070508 actacgaagtttattggtccataccagatatttgagagagttggaacagtggcatacagggtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgt 15070409  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  15070408 ttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgcagcggatccttcgcatgtgattccaagagatgatg 15070346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 16252263 - 16252510
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16252263 aagcgcaggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 16252362  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16252363 ctccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccacatctttcgaatttgcacgatgtttt 16252462  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| || || |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16252463 ccatgtgtcgcaacttcagaagtatgttccggatccatctcatgtgat 16252510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14652502 - 14652253
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  14652502 aagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttga 14652403  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    || | | ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||| |||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  14652402 cttcgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggttcaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgtgtt 14652303  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
    |||| | || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  14652302 tcatatgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgattc 14652253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12523864 - 12523623
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactccta 107  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || |    
T  12523864 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccga 12523765  T
Q  108 agtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  12523764 agtttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattaccaccgcatctttcaaatttgcacgatgttttccatgt 12523665  T
Q  208 ttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12523664 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 12523623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 18227264 - 18227511
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  18227264 aagcgcaggaagaatcttgagtttcaggaaggagagcacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttga 18227363  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||  |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||| |||| || || |||||  |||||||||| ||||||||||| ||    
T  18227364 ctctgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattaccaccgtatctttcgaatttgcacgatgtttt 18227463  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18227464 ccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgat 18227511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14680761 - 14680514
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  | || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |  |||||||    
T  14680761 aagcgcaggaaggatcttgagtttcaggaacgagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaataagttga 14680662  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    | || |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  14680661 ccccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgacgtgtt 14680562  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14680561 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 14680514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Original strand, 16355263 - 16355524
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||  | || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16355263 aagcgcaggaaagatcttgaatttcaagaaggaaaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 16355362  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  16355363 ctccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagacttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttt 16355462  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  16355463 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 16355524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14159674 - 14159425
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||| ||||| |  || |||||||| || ||||| || |||||  |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || | |||||    
T  14159674 gatcttgaatttcaaggaggagatcatgtgttcctgagagttactcccatgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaggttta 14159575  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||  |    
T  14159574 ttggtccatatcagatatcagaaagaattggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgga 14159475  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  14159474 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgattcagagtgatgatg 14159425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 249
Target Start/End: Original strand, 14927151 - 14927324
Alignment:
Q  76 acgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccacca 175  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||  |||| ||||| |||||     
T  14927151 acgtgcattgaagtcaaagaatttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtactgagtgggtttaccaccg 14927250  T
Q  176 catctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14927251 catctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 14927324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 15149824 - 15150051
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15149824 aagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 15149923  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||  |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| | ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  15149924 ctctgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtgacgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctt 15150023  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgtt 229  Q
    |||||| || || |||||||||||||||    
T  15150024 tcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 15150051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 247
Target Start/End: Original strand, 14851199 - 14851429
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||| | || ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| | ||||||||    
T  14851199 cttgagtttcaagaaggagatcatgtattttttagagtcactcatgtgaccggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttaactccgaggtttattg 14851298  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||||| |  || ||| |||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||  |    
T  14851299 gtccgtatcagatataggaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtatttcatgtgtcgcaaat 14851398  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtg 247  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14851399 tcggaagtatgttccggatccatctcatgtg 14851429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7090614 - 7090380
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||    
T  7090614 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggatgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 7090515  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    ||| || ||||||||| || || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  7090514 ttgctc-gtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgca 7090416  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  7090415 acttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgat 7090380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 207
Target Start/End: Original strand, 18164333 - 18164472
Alignment:
Q  68 ggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtt 167  Q
    ||||| ||| |||| |||||||| | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  18164333 ggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagctgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcatacagagtgggtt 18164432  T
Q  168 tgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgt 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18164433 tgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgt 18164472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12476794 - 12476550
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  12476794 aagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 12476695  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||| | || ||    
T  12476694 ccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgtttt 12476595  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12476594 ccatgtatcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 12476550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 27900581 - 27900459
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  27900581 caagcgtaggaaagaccttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggttactcctatgacgagtgtagaacgtgcattgaagtcgaagaagttg 27900482  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgta 123  Q
    ||||| ||||| |||||||||||    
T  27900481 actccaaagttcattggtccgta 27900459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 19778623 - 19778860
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  19778623 gatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 19778722  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  19778723 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 19778822  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  19778823 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 19778860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8386594 - 8386362
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||| |||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  8386594 gatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 8386495  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  8386494 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 8386395  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8386394 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 8386362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 29039234 - 29039466
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  29039234 gatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 29039333  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  29039334 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 29039433  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29039434 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 29039466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 40473222 - 40472990
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  40473222 gatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 40473123  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||| ||||||||| |  || |||||||| ||  |||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || ||    
T  40473122 ttggtctgtatcagatattggaaagagttggaacgatggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgca 40473023  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  40473022 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 40472990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 14266729 - 14266966
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||||||||| || || ||  | ||| |||| ||||| ||| |||| |||||  |||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  14266729 gatcttgagtttcaggaaggagaccacatgtttttgagagtcacccctatgactggtgtatgacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 14266828  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    ||||||| |||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || ||    
T  14266829 ttggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgca 14266928  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  14266929 acttcggaagtatgtttcggatccatctcatgtaattc 14266966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 14303808 - 14304039
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  14303808 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac-ccgaagttca 14303906  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  14303907 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 14304006  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14304007 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 14304039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15364568 - 15364336
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||| |||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  15364568 gatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 15364469  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || || ||| | || ||    
T  15364468 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatatgtcgca 15364369  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15364368 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 15364336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18297387 - 18297155
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  18297387 gatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 18297288  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  18297287 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 18297188  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18297187 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 18297155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 144
Target Start/End: Original strand, 15359183 - 15359310
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  15359183 cttgagtttcaagagggagatcatgtatttccgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaaatcgaagaagttgactccaaagttcattg 15359282  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttgg 144  Q
    ||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  15359283 gtctgtatcagatatcagagagggttgg 15359310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 16752772 - 16752665
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  16752772 cttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttaactccgaagttcattg 16752673  T
Q  117 gtccgtat 124  Q
    ||||||||    
T  16752672 gtccgtat 16752665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15319645 - 15319516
Alignment:
Q  134 gagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcgg 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||  |||| |||||||||| ||| || || |||| ||||||||| ||||    
T  15319645 gagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccagcacatctttcaaatctgcatgatgtgtttcctgtgtcacaacttcagaagtatgtagcgg 15319546  T
Q  234 atccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  15319545 atccttcgcatgttattccgagagatgatg 15319516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 155 - 252
Target Start/End: Original strand, 15415210 - 15415307
Alignment:
Q  155 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattcc 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  15415210 tatagagtgggtttgccaccacatccttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattcc 15415307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27711518 - 27711281
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  27711518 gatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 27711419  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || |||||| |||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  27711418 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 27711319  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
     ||||  ||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  27711318 acttcaaaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 27711281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23955929 - 23955697
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  23955929 gatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 23955830  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || |||||| |||| |||||  | || || ||||| || ||    
T  23955829 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcataacgttttccatgtgtcgca 23955730  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23955729 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 23955697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 8053453 - 8053688
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||| |||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  8053453 gatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 8053552  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    ||||||||||||||||    || |||||||| ||  |||| ||  | || ||||| || || |||||| |||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  8053553 ttggtccgtatcagatactggaaagagttggaacgatggcttaccgtgtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 8053652  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8053653 acttcgaaagtatgtttcggatccatctcatgtgat 8053688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 249
Target Start/End: Original strand, 18607823 - 18607895
Alignment:
Q  177 atctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18607823 atctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 18607895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 263
Target Start/End: Original strand, 15359327 - 15359396
Alignment:
Q  194 gatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  15359327 gatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatg 15359396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 9291020 - 9290925
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| | |||||| | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  9291020 aaggatattgagtttcaggttggtgatcaggtatttttgagggtgaatcctgtgaccgatgttggtcatgctttgaagtgtaggaagttgactcct 9290925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 14997501 - 14997406
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | || | |||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14997501 aaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcttgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 14997406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Original strand, 12132493 - 12132591
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    ||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | || | |||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||    
T  12132493 aggaaggacattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtgtcgaaagttgactcct 12132591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Original strand, 15293241 - 15293339
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||  || || || |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15293241 aggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaatggagtgggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 15293339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Original strand, 16445296 - 16445394
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| | ||||| | |||| |||| || || || |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16445296 aggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgtgactggagtgggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 16445394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 13247823 - 13247735
Alignment:
Q  18 ttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | || | |||  |||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  13247823 ttgagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcatgtgatcggtgttggtcttgctttgaagtgtaggaagttgactcct 13247735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Original strand, 55375445 - 55375537
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgact 103  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| | || |||||||| || ||||||||||  | ||||||||||    
T  55375445 aaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtaactggtgttggtcgagctttgaagtgtatgaagttgact 55375537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 49152486 - 49152220
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49152486 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttg 49152387  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49152386 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 49152287  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49152286 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagagatgatgatgt 49152220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 11306327 - 11306593
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11306327 caagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 11306426  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11306427 actcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 11306526  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 267  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11306527 ttcatgtctctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 11306593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 8212192 - 8212458
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8212192 caagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 8212291  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8212292 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 8212391  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 267  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8212392 ttcatgtttctcaacttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtaattccgagggacgatgatgt 8212458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12455868 - 12455626
Alignment:
Q  20 gagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  12455868 gagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggatgtgcattgaagtcgaggaagttgaatccaaagttcattggtc 12455769  T
Q  120 cgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcg 219  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  12455768 ggtatcagatttcagagagagttagaacagtggcttatagaattggtttgccaccacatctttcgaacctgcatgatgtgtttcatgtgt-gcagcttcg 12455670  T
Q  220 gaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12455669 gaagtatgtagcggatccttcacatgtgattccaagggatgatg 12455626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 26118669 - 26118910
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  26118669 caagcgaaggaaggagcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgtgctctgaagtcgagaaagttg 26118768  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26118769 actcctaagttcattggtccgtatcagatttcagatagagtt---------------------ggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 26118847  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26118848 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccaagggatgatg 26118910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6413679 - 6413434
Alignment:
Q  18 ttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  6413679 ttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcattgg 6413580  T
Q  118 tccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagctt 217  Q
    | || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  6413579 ttcgaatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagctt 6413480  T
Q  218 cggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    | ||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  6413479 cagaagtatgtagtggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 6413434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13021523 - 13021280
Alignment:
Q  20 gagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtc 119  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  13021523 gagtttcaagacggtgatcatgtttttctgagggtcactcctatgacgggcgtaaaacgtgcattgaagtcgaggaagtggactccaaagtttattggtc 13021424  T
Q  120 cgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcg 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  13021423 cgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcttatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcg 13021324  T
Q  220 gaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||    
T  13021323 gaagtatgtagcggatctttcacatgtgattccaagagatgatg 13021280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 236
Target Start/End: Original strand, 16950553 - 16950770
Alignment:
Q  19 tgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16950553 tgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggt 16950652  T
Q  119 ccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttc 218  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||    
T  16950653 ccgtatcagatttcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttggcaccacatctttcgaacttgcatgatgtgttttatgtgtcgcagcttc 16950752  T
Q  219 ggaagtatgttgcggatc 236  Q
    |||||||||| |||||||    
T  16950753 ggaagtatgtagcggatc 16950770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 1487 - 1733
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1487 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttgtgaaagttacttctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattg 1586  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||| ||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1587 gtctgtatcagatttaagaaagggttggaacactggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtctcagct 1686  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| |||| || |||| ||| ||||| ||||| ||| ||||||    
T  1687 tcggaaggatgtagcagatcattcgcatgttattccaaggaatgatg 1733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 15102665 - 15102927
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||    
T  15102665 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttg 15102764  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15102765 actccaaagttcattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgt 15102864  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  15102865 ttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 15102927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14130057 - 14129796
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| | || || |||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14130057 aagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtattttttagagttactccgatgacgagtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttga 14129958  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14129957 ctccgaagttcattggtccgtatcagattttagagaggattggaacgatggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtt 14129858  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  14129857 tcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 14129796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14433875 - 14433614
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| | || || |||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14433875 aagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtattttttagagttactccgatgacgagtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttga 14433776  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14433775 ctccgaagttcattggtccgtatcagattttagagaggattggaacgatggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtt 14433676  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  14433675 tcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 14433614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 263
Target Start/End: Original strand, 26288122 - 26288362
Alignment:
Q  23 tttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgt 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||    
T  26288122 tttcaggagggtgatcatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgcgcattgaagtcgaggaagttgactccaaaattcattggtacgt 26288221  T
Q  123 atcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaa 222  Q
    ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||    
T  26288222 atcagatttcagaaagggtttgaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcaaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcgaaa 26288321  T
Q  223 gtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     ||||| | ||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  26288322 atatgtagtggatccttcgcatgttattccaagagatgatg 26288362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 14264308 - 14264570
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||    
T  14264308 caagcgtaggaaggcgcttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttg 14264407  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  14264408 actccaaagtttattggtccatatcagatatctgaaagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcctgatgtgt 14264507  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  14264508 ttcatgtgtcgcaactttggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 14264570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 18054017 - 18054279
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  18054017 caagcggaggaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctgagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttg 18054116  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18054117 actccgaagttcattggcccgtatcagatttcagagagaataggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgt 18054216  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||| || || || |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  18054217 ttcacgtgtcacaacttcggaagtatgtagcagatccttcacatgttattccgagagatgatg 18054279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13665733 - 13665476
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| || || || |||||||||| |||||||    
T  13665733 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaagaggaagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggtcgggcattgaagtcgaagaagttg 13665634  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| |     ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13665633 actccaaagttca-----ccgtatcagatttcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgt 13665539  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  13665538 ttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatg 13665476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 14286456 - 14286702
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||  |||| ||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||    
T  14286456 cttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacaggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattg 14286555  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||| ||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||    
T  14286556 gtctgtatcagatttcatataggattggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaact 14286655  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  14286656 tcggaagtatgtagcagatccttcgcatgttattccaagagatgatg 14286702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 16072358 - 16072603
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||    
T  16072358 caagcgaaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttg 16072457  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  16072458 actccaaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatgcaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatatgt 16072557  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16072558 ttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 16072603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19147380 - 19147146
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  19147380 cttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgaagtttattg 19147281  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| || || ||    
T  19147280 gtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgagtttgccaccacatctttcgaatttgcataatgtgtttcatgtgtcgcaact 19147181  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  19147180 tcggaagtatgtagcggatccttcacatgttattc 19147146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 20746779 - 20746545
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  20746779 cttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgaagtttattg 20746680  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| || || ||    
T  20746679 gtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgagtttgccaccacatctttcgaatttgcataatgtgtttcatgtgtcgcaact 20746580  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  20746579 tcggaagtatgtagcggatccttcacatgttattc 20746545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 23199823 - 23200069
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||    
T  23199823 cttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaaattcattg 23199922  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||  | || ||  || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || ||    
T  23199923 gtccgtatcagatttcagagaggatcggaacgatgacatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaact 23200022  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  23200023 tcggaagtatgtagcagatccttcgcatgttattccgagagatgatg 23200069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 23505950 - 23506196
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||    
T  23505950 cttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaaattcattg 23506049  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||  | || ||  || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || ||    
T  23506050 gtccgtatcagatttcagagaggatcggaacgatgacatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaact 23506149  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  23506150 tcggaagtatgtagcagatccttcgcatgttattccgagagatgatg 23506196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 12206874 - 12207126
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagt 110  Q
    ||||||||| ||||||| || || || ||||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| || | ||||||||| || ||||    
T  12206874 aaggatcttaagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcaaagaagttgacgccgaagt 12206973  T
Q  111 ttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttc 210  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  12206974 ttattggttcgtaccagatatctgagagagttgcaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtc 12207073  T
Q  211 tcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  12207074 gcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatg 12207126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 11553189 - 11553436
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||    
T  11553189 aagcgcagaaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttga 11553288  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  11553289 ccccgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcacgacgtttt 11553388  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  11553389 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 11553436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12687684 - 12687437
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || ||| || | ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||    
T  12687684 aagcgcaggaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgcgagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttga 12687585  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||    
T  12687584 ccccgaagtttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccaccgcatctttcaaatttgcacgacgtttt 12687485  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12687484 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 12687437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14954803 - 14954556
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||    
T  14954803 aagcgcagaaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttga 14954704  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    | || |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||  |||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||    
T  14954703 ccccaaagtttattggtccgtataagatatcagaaagagttggaacggtggcttatcgagtgagtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgacgtttt 14954604  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14954603 ccatgtatcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 14954556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 108 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15340574 - 15340419
Alignment:
Q  108 agtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgt 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15340574 agttcattggtccgtatcagatttcagagaggattggaacggtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgt 15340475  T
Q  208 ttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  15340474 gtcacagcttcggaagtatgtagcggatctttcgcatgttattcggagagatgatg 15340419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 17403 - 17650
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  17403 aagcgcaggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttga 17502  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||  |  |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  17503 ctctgagatttattggcccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtttt 17602  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17603 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 17650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 15154751 - 15154986
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||| ||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||    
T  15154751 gatcttgaatttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 15154850  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  15154851 ttggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccactgcatctttcgaatttgcacgatgtatttcacgtgtcgca 15154950  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15154951 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 15154986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 11388492 - 11388741
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| ||||  |||||||| ||  |||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || | |||||||    
T  11388492 caagcgtaggaaggaccatgagtttcaagagga-gatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttg 11388590  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  11388591 actccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgt 11388690  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
    ||||||| || ||  | |||||||||||  |||||||||| ||||| ||||    
T  11388691 ttcatgtgtcgcaattacggaagtatgtaccggatccttcgcatgttattc 11388741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 23516868 - 23517105
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||| |||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  23516868 gatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 23516967  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    ||||||| ||||||||||  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || ||    
T  23516968 ttggtccatatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgca 23517067  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
     |||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  23517068 acttcggaagtatattccggatccatctcatgtaattc 23517105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14037990 - 14037743
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || || || ||||| || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||    
T  14037990 aagcgtaggaaagaccttgagttccaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgttgggcgtgcattgaagtcaaagaagttga 14037891  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    | || |  ||||||||| | |||||||| || || |||||| | |  ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14037890 caccaagatttattggttcatatcagatatcggaaagagtttgaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtt 14037791  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  14037790 tcatgtatcgcaacttcggaagtatgttccagatccatctcatgtgat 14037743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14348020 - 14347773
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || || || ||||| || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||    
T  14348020 aagcgtaggaaagaccttgagttccaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgttgggcgtgcattgaagtcaaagaagttga 14347921  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    | || |  ||||||||| | |||||||| || || |||||| | |  ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14347920 caccaagatttattggttcatatcagatatcggaaagagtttgaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtt 14347821  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  14347820 tcatgtatcgcaacttcggaagtatgttccagatccatctcatgtgat 14347773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15204062 - 15203815
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || || || ||||| ||| | || ||||||  | |||| |||||||| || || |||||||| |  |||||||    
T  15204062 aagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgttttttagagtcacttttgtgactggtgttggccgcgcattgaagtcaaataagttga 15203963  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| | ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||| || || |  ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15203962 ctccgaggtttattggtctgtatcagattacagaaagaattggaacggtagagtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtt 15203863  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15203862 tcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 15203815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8707788 - 8707544
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  8707788 aagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 8707689  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || ||    
T  8707688 ccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgtttt 8707589  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8707588 ccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 8707544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 11237312 - 11237544
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  11237312 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 11237411  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  11237412 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 11237511  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11237512 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 11237544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Original strand, 15161144 - 15161388
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15161144 aagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 15161243  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || ||    
T  15161244 ccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgtttt 15161343  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15161344 ccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 15161388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14332568 - 14332333
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||| |||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  14332568 gatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 14332469  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    ||||||||||||||||    || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  14332468 ttggtccgtatcagatactggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 14332369  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14332368 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgat 14332333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8198765 - 8198567
Alignment:
Q  48 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 147  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||| ||    
T  8198765 tgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaac 8198666  T
Q  148 agtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8198665 ggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 8198567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10871163 - 10870929
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||| |||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || | ||| ||||    
T  10871163 cttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaggttcattg 10871064  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||| | || || ||||| || || ||    
T  10871063 gtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaact 10870964  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
    ||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  10870963 tcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 10870929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15624729 - 15624539
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactccta 107  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  15624729 aggaaagaccttgagtttcaggaaggagaccatgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaggaaattgactccga 15624630  T
Q  108 agtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgt 198  Q
     |||||||||| | |||||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  15624629 ggtttattggttcatatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 15624539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18177913 - 18177676
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||  |||| ||||||||| | || ||||| | ||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  18177913 gatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttcttgagagtcactcctataactggtgtagaacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 18177814  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    ||||||| |||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || ||    
T  18177813 ttggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgca 18177714  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
     ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||    
T  18177713 acttcggaagtatgttccagatccatctcatgtaattc 18177676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Original strand, 18551845 - 18552089
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| |||    
T  18551845 aagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagctga 18551944  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || |||||| |||| |||||| | || ||    
T  18551945 ccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgtttt 18552044  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18552045 ccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 18552089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13686247 - 13686002
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13686247 aagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 13686148  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    | || ||||| |||||||||||||| || |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||  | ||||||||||| |||||| | || ||    
T  13686147 ccccgaagttcattggtccgtatcaaatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgtcgcatctttcgaatttgcacaacgtttt 13686048  T
Q  202 t-catgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
    | ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13686047 tccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 13686002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 246
Target Start/End: Original strand, 44791484 - 44791682
Alignment:
Q  48 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 147  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||| ||    
T  44791484 tgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaaattgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaac 44791583  T
Q  148 agtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||  |||| ||||| || || |||||| |||| |||||| | || || ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  44791584 ggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 44791682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 263
Target Start/End: Original strand, 15479323 - 15479464
Alignment:
Q  122 tatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcgga 221  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||||| || ||| | ||||    
T  15479323 tatcagatctctgagagagttggaactgtggcgtatagaattggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacatgtttcatgtgtcacagttgcgga 15479422  T
Q  222 agtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||  | |||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  15479423 agtatgtacctgatccttcgcatgttattccaagagatgatg 15479464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21662144 - 21661886
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |   | || ||||| ||| |||| ||||| ||| | || ||||||||||| ||  | || || | |||  | |    
T  21662144 aagcgtaggaaggatcttgagtttcaag---gagaccatgtgtttttgagagtcacccctcttaccggtgttggacgggcactaaaatcaaagaaactaa 21662048  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||  | || || ||||  || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  21662047 ctccgaggtttattggcccgtatcagatttcgcaaagagttggggcggttgcgtataacgtgggtttaccaccgcatctttcgaacttacatgatgtgtt 21661948  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||| || || || |  ||||||||| |  |||| |||||||||||||| || |||||||    
T  21661947 tcatgtgtcacaactacaaaagtatgtttcatatccatctcatgtgattccaagagatgatg 21661886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 4440105 - 4440007
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| || |  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4440105 aggaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaaccctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 4440007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 7824074 - 7823979
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  7824074 aaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcct 7823979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 27107870 - 27107965
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  27107870 aaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcct 27107965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 90
Target Start/End: Original strand, 41251 - 41321
Alignment:
Q  20 gagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtc 90  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41251 gagtttcaggaaggggatcatgtatttttaagagtcactccggtgacgggcgttggacgtgctttgaagtc 41321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 12193723 - 12193635
Alignment:
Q  18 ttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| | || |||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  12193723 ttgattttcaggttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcctgtaaccggtgttggacgtgctttgaaatgccggaagttgactcct 12193635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 14936514 - 14936426
Alignment:
Q  18 ttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| || | || | |||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  14936514 ttgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcttgtgactggtgttggtcgtgctttgaagtgtcggaagttgactcct 14936426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 15364107 - 15364019
Alignment:
Q  18 ttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| || | || | |||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  15364107 ttgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcttgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtcggaagttgactcct 15364019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 35964937 - 35965001
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgac 66  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||| |||| ||||||||| ||||    
T  35964937 aagcgtaggaaggatcttgagtttcaagaaggggaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgac 35965001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 57)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 804193 - 804459
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  804193 caagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 804292  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  804293 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 804392  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  804393 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 804459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6679372 - 6679106
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6679372 caagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgtgctttgaagtcgagaaagttg 6679273  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6679272 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 6679173  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6679172 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 6679106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14565403 - 14565137
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14565403 caagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 14565304  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14565303 actcctaagttcattggtccatatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatttgt 14565204  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14565203 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 14565137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6603919 - 6603653
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  6603919 caagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttg 6603820  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603819 actcctaagttcattggtccgtatcaaatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 6603720  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603719 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 6603653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28982618 - 28982352
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28982618 caagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaagttg 28982519  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28982518 actcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgacgtgt 28982419  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 267  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28982418 ttcatgtttctcagcttcggaaatatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 28982352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28987838 - 28987572
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28987838 caagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaagttg 28987739  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28987738 actcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgacgtgt 28987639  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 267  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28987638 ttcatgtttctcagcttcggaaatatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 28987572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12305019 - 12304757
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12305019 caagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttcttagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgagaaagttg 12304920  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12304919 actcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttgaaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 12304820  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12304819 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgattccaagggatgatg 12304757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 16265138 - 16265400
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16265138 caagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtctttctgagggtcactcctttgacgggtgttggatgtgctttgaagtcgaggaagttg 16265237  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16265238 actcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 16265337  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  16265338 ttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgattcaaagggatgatg 16265400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 53 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27347435 - 27347221
Alignment:
Q  53 gtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtgg 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27347435 gtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttgggacagtgg 27347336  T
Q  153 catatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattcc 252  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27347335 catataaagttggtttggcaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgattcc 27347236  T
Q  253 gagggatgatgatgt 267  Q
    |||||||||||||||    
T  27347235 gagggatgatgatgt 27347221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 29303946 - 29304208
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  29303946 caagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccaatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaagttg 29304045  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29304046 actccaaagatcataggtccgtatcagatttcagagagaattggaacagtggcttatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgt 29304145  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29304146 ttcatgtgtcgcagcttaggaagtatgtagaggatccttcacatgtgattcctagggatgatg 29304208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 22061953 - 22062215
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22061953 caagcggagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtcgaggaagttg 22062052  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22062053 actccaaagttcattggtccgtatcaaatatcagagagggttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgt 22062152  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  22062153 ttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 22062215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 21324945 - 21325192
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21324945 cttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattg 21325044  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatc-tttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagc 215  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  21325045 gtccgtatcagatatcatagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcatttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaac 21325144  T
Q  216 ttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  21325145 ttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatg 21325192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1266484 - 1266238
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  1266484 cttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattg 1266385  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  1266384 gtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaact 1266285  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  1266284 tcggaagtatgtaacggatccttcgcatgttattccaagagatgatg 1266238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 31417010 - 31417256
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31417010 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagttactcttatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattg 31417109  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||    
T  31417110 gtccgtattagatttcagaaagggttggaacagtggcatatagagttgctttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaact 31417209  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  31417210 acggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatg 31417256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 21681990 - 21682252
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||    
T  21681990 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttg 21682089  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  21682090 actccaaagttcattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgaatgatgtgt 21682189  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || || |||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  21682190 ttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgaaacggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 21682252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 31571378 - 31571624
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  31571378 cttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctgagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaaattcattg 31571477  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    | ||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || ||    
T  31571478 gcccgtatcagatttcagagagaataggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaact 31571577  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  31571578 tcggaagtatgtagcagatccttcacatgttattccgagagatgatg 31571624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 255
Target Start/End: Original strand, 20010436 - 20010674
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  20010436 cttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccgatgacgggtgtgggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattg 20010535  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  20010536 gtccgtaccagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtatttcacgtgtcgcaact 20010635  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgag 255  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20010636 tcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgag 20010674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23655172 - 23654926
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| || || |||||| | |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||    
T  23655172 cttgagtttcaagacggagatcatttgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattg 23655073  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  23655072 gtccgtatcagatatcagagagggtttgaacagtggtatatatattgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaact 23654973  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  23654972 tcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 23654926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20008111 - 20007857
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |  ||| ||    
T  20008111 caagcgtaggaaggcccttgagttccaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaacaaggtg 20008012  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20008011 actccaaagttcattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgctaccacatctttcgaatttgcatgatgtgt 20007912  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgag 255  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  20007911 ttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttataccgag 20007857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19851656 - 19851410
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  19851656 cttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccgttgacggttgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattg 19851557  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    |||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||    
T  19851556 gtccataccagatatctgagagggttggaacagtggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaact 19851457  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  19851456 tcgaaagtacgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatg 19851410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19857692 - 19857446
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  19857692 cttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccgttgacggttgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattg 19857593  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    |||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||    
T  19857592 gtccataccagatatctgagagggttggaacagtggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaact 19857493  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  19857492 tcgaaagtacgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatg 19857446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21840678 - 21840416
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||| | || ||||| ||| ||||  ||||||| | |||||||    
T  21840678 caagcgaaggaaggcacttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctaagagttactcctataacaggtgtaggaggtgcactgaagtctaagaagttg 21840579  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  21840578 actccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgagtttgccaccacatctttcaaatttgcatgatgtat 21840479  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    | || || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  21840478 tccacgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 21840416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 30313665 - 30313912
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  30313665 aagcgcaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 30313764  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  30313765 ctccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcaaatttgcacgatgtttt 30313864  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  30313865 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 30313912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15533640 - 15533393
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||  | ||| |||| ||||||||| || | |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  15533640 aagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggtgaccacatgtttttgagagtcactcctgtggctggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttga 15533541  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15533540 ctccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtt 15533441  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15533440 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtttcggatccatctcatgtgat 15533393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32600404 - 32600157
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  32600404 aagcgcaggaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttga 32600305  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    | || |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  32600304 ccccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccacgtctttcgaatttgcacgacgtgtt 32600205  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| || || ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  32600204 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatctatctcatgtgat 32600157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Original strand, 21167070 - 21167319
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  ||||    
T  21167070 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 21167169  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  21167170 ttggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagttgggttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgca 21167269  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     ||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  21167270 acttcgaaaatatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 21167319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22046627 - 22046386
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactccta 107  Q
    |||||||||||||||||| |||| || || || || ||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |    
T  22046627 aggaaggatcttgagttttaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactccagtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaaattgactccga 22046528  T
Q  108 agtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgt 207  Q
     |||||||||| |||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  22046527 ggtttattggttcgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtaggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgt 22046428  T
Q  208 ttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22046427 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 22046386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20388360 - 20388109
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||   |||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  20388360 caagcgtagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttctgagagtcactctagtgacaggtgttggtcgtgctttgaagtctaagaagttg 20388261  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    || ||   |||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  20388260 accccacggtttattggtccatattagatatctgagagagttgggacagtgacatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatgtgcatgatgtgt 20388161  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattcc 252  Q
    || |||| || ||  ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  20388160 ttaatgtgtcgcaatttcggaagtatgtagcagatccttcgcatgttattcc 20388109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23949149 - 23948888
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| || | ||||||||    
T  23949149 aagcgtaggaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgactggttttagacgtgctttgaaatcaaagaagttga 23949050  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||| ||||| ||| || |||| ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  23949049 ctccgaggtttgttggtccgtatcagatatcagaaagaattagtacggtggcgtagcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaattttcacgatgtgtt 23948950  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||| || || ||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| || || |||||||    
T  23948949 tcatgtgtcgcaactttggaagtatgtttcggatcagtctcatgtgatcccaagagatgatg 23948888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19978227 - 19977980
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  19978227 aagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 19978128  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| || || | |||||| || ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19978127 ctccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaatagttggaacggtggcgtaacgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtt 19978028  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    |||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  19978027 tcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgat 19977980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21251202 - 21250955
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  21251202 aagcgtaggaaagatcttgagtttcaataaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttga 21251103  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21251102 ctccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtt 21251003  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    |||||| || || ||||||||||||||  | ||||| || ||||||||    
T  21251002 tcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtaccagatccatcccatgtgat 21250955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22032286 - 22032045
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactccta 107  Q
    |||||||||||||||||| |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |    
T  22032286 aggaaggatcttgagttttaggatggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaaattgactccga 22032187  T
Q  108 agtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgt 207  Q
      |||||||||  ||||||||| || || |||||||  ||  |||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  22032186 gatttattggtttgtatcagatatcggaaagagttgaaacgttggcgtatcgagtaggattaccaccgcatctttcgaatttacacgatgttttccatgt 22032087  T
Q  208 ttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    ||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22032086 ttcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 22032045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 263
Target Start/End: Original strand, 16408612 - 16408827
Alignment:
Q  48 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 147  Q
    |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||    
T  16408612 tgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaac 16408711  T
Q  148 agtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtg 247  Q
     ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || |||||||||| |||  ||||||  |||||||||    
T  16408712 ggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtgtgtcccggatctatctcatgtg 16408811  T
Q  248 attccgagggatgatg 263  Q
    || | ||| |||||||    
T  16408812 atccagagtgatgatg 16408827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 22164712 - 22164959
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||   ||| ||| |||  ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||||    
T  22164712 aagcgtaggaaagatcttgagtttcaggaaggagacattgtgtttttgaaagtcactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaataagttga 22164811  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||  || |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22164812 ctccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgcatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtt 22164911  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  22164912 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtcccggatccatcacatgtgat 22164959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22987461 - 22987214
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||||||  |||| | |||||||| ||| |||||||| | ||||||||    
T  22987461 aagcgtaggaaagaccttgattttcaagaaggagatcatgtattttttagagtcactccagtgactgatgttggacatgcattgaagtcaaagaagttga 22987362  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||  |    
T  22987361 ctctgaagtttattggtccgtatcagatatcataaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgaagtaat 22987262  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22987261 acatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 22987214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23650289 - 23650054
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||||||||| || || || ||  | ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  ||||    
T  23650289 gatcttgagtttcaagaaggagaccacatgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 23650190  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |  ||    
T  23650189 ttggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacggtggcttatcgagttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcttgtgttgca 23650090  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||||||||||||   |||||| || ||||||||    
T  23650089 acttcggaagtatgtactggatccatcccatgtgat 23650054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 19485403 - 19485640
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||| ||| |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |    
T  19485403 gatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgacctcgaagttca 19485502  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    ||||||| ||||||||||  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || ||    
T  19485503 ttggtccatatcagattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgca 19485602  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  19485603 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 19485640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 22133568 - 22133809
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactccta 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||   ||| ||| |||| | ||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |    
T  22133568 aggaaagatcttgagtttcaggaaggagacattgtgtttttgagagacactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 22133667  T
Q  108 agtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgt 207  Q
      |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22133668 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtcggaataccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttccatgt 22133767  T
Q  208 ttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     || || ||||||||||||||  || |||| || ||||||||    
T  22133768 gtcgcaacttcggaagtatgtcccgaatccatcacatgtgat 22133809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 21922268 - 21922503
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |  | ||    
T  21922268 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacaagctttgaagtcgaagaagttgactccgagatata 21922367  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || ||    
T  21922368 ttggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatatttcgaatttgcacgacgtgtttcatgtgtcgca 21922467  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||||||||||||   |||||| || ||||||||    
T  21922468 acttcggaagtatgtactggatccatcccatgtgat 21922503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15441395 - 15441194
Alignment:
Q  48 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 147  Q
    |||| ||||||||| || | |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||    
T  15441395 tgagagtcactcctgtggctggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaac 15441296  T
Q  148 agtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtg 247  Q
     ||||| ||| | ||| | || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||||  |||||| |||||||||    
T  15441295 ggtggcgtatcgtgtttgattaccacctcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgtaagtatgttttggatccatctcatgtg 15441196  T
Q  248 at 249  Q
    ||    
T  15441195 at 15441194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19112938 - 19112706
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  19112938 gatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 19112839  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  19112838 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 19112739  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  19112738 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 19112706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 17674556 - 17674793
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  17674556 gatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 17674655  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  17674656 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 17674755  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  17674756 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 17674793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 261
Target Start/End: Original strand, 20396661 - 20396905
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaag-tttatt 115  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||| | || ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||    
T  20396661 cttgagtttcaggaaggagaccatgtattttttagagtcactcctgtgaccggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaaactgact-ctaagatttatt 20396759  T
Q  116 ggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagc 215  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||| |||  | |||||| ||| |||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |  || |    
T  20396760 ggtctgtatcagatatcagaaagaattgaaatagtggcgtatcgagtgggtttactaccgcatctttcgaatttgcatgatgcatttcatgtgtaacaac 20396859  T
Q  216 ttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatga 261  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  20396860 ttcggaagtgtgtttcggatccatctcatgtgattccaagagatga 20396905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 21394398 - 21394633
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |  ||||    
T  21394398 gatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgttctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 21394497  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| |  || ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || ||    
T  21394498 ttggtccgtatcagatatcggaaagagtcgtaacggtggcgtaccgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcctgtgtcgca 21394597  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  21394598 acttcagaagtatgtaccggatccatcccatgtgat 21394633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 21788891 - 21789126
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |  ||||    
T  21788891 gatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgttctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 21788990  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| |  || ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || ||    
T  21788991 ttggtccgtatcagatatcggaaagagtcgtaacggtggcgtaccgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcctgtgtcgca 21789090  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  21789091 acttcagaagtatgtaccggatccatcccatgtgat 21789126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 20018270 - 20018518
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| || || |||||||| ||| |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  20018270 caagcgtagaaaagatcttgaatttgaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttg 20018369  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||    || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || |||||| |||| |||||| | || |    
T  20018370 accccgaagttcattggtccgtatcagatactggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttt 20018469  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    | ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20018470 tccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgat 20018518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 22120707 - 22120939
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||| |    
T  22120707 gatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtgggacgtgcattgaagtcaaggaagttgacctcgaagttca 22120806  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    ||||||| |||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| |||||||| || ||| || | || || ||||| || ||    
T  22120807 ttggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcaaatttgaacaacgttttccatgtgtcgca 22120906  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22120907 actttggaagtatgttccggatccatctcatgt 22120939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 22051123 - 22051008
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||  || |||||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  22051123 aagcggaggaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttttgaaagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcaaggaagttga 22051024  T
Q  102 ctcctaagtttattgg 117  Q
    |||| ||||| |||||    
T  22051023 ctccgaagttcattgg 22051008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 105
Target Start/End: Original strand, 22377974 - 22378077
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  22377974 aagcgtaggaaagatattgagtttcaggaagcagatcatgtatttttgagggtcactccagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttga 22378073  T
Q  102 ctcc 105  Q
    ||||    
T  22378074 ctcc 22378077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 105
Target Start/End: Original strand, 22384149 - 22384252
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  22384149 aagcgtaggaaagatattgagtttcaggaagcagatcatgtatttttgagggtcactccagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttga 22384248  T
Q  102 ctcc 105  Q
    ||||    
T  22384249 ctcc 22384252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 106
Target Start/End: Original strand, 21850866 - 21850962
Alignment:
Q  10 gaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    ||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| |||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  21850866 gaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgatttgaagtgtaggaagttgactcct 21850962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Original strand, 16877622 - 16877720
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    ||||||||| ||||||||||||  || |||||||| ||  ||||||| | |||  |||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16877622 aggaaggatattgagtttcaggttggagatcatgtgttcttgagggtgaatccggtgaccggtgtcggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 16877720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 20652863 - 20652958
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| | |||||||| |  ||||||||||| ||| |||| || | || | |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20652863 aaggatatagagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagagtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 20652958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 21197032 - 21197127
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| || | |||| | || || ||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  21197032 aaggatattgagtttcaggtaggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtaactggagttggtcgtactttgaagtgtaggaagttgactcct 21197127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 19863299 - 19863229
Alignment:
Q  20 gagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtc 90  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19863299 gagtttcaggaaggcgatcatgtatttttaagagtcactccggtgacgggcgttgggcgtgctttgaagtc 19863229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 19867936 - 19867866
Alignment:
Q  20 gagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtc 90  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19867936 gagtttcaggaaggcgatcatgtatttttaagagtcactccggtgacgggcgttgggcgtgctttgaagtc 19867866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22315445 - 22315347
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| || | |||| | || ||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  22315445 aggaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtaaccggtgtaggtcgtgctttgaagtgtcggaagttgactcct 22315347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 57)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 14887250 - 14887516
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14887250 caagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttg 14887349  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14887350 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 14887449  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14887450 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagagatgatgatgt 14887516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 37545755 - 37546022
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt-tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagtt 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37545755 caagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgttttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagtt 37545854  T
Q  100 gactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37545855 gactcctaagtttattggtccgtatcagatttctgagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtg 37545954  T
Q  200 tttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37545955 tttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 37546022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 24798656 - 24798922
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24798656 caagcgaaggaaggatcttgagtttctggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttg 24798755  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24798756 actcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 24798855  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24798856 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattacgagggatgatgatgt 24798922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20342391 - 20342125
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20342391 caagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagcgtgatcatgtttttctgagagtcacccctttgacaggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttg 20342292  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20342291 actcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgt 20342192  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20342191 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttcacatgtgattccgagggatgatgatgt 20342125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22502788 - 22502526
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22502788 caagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 22502689  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22502688 actcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 22502589  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22502588 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgattccaagggatgatg 22502526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 25848174 - 25847918
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  25848174 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttttgagagtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactcctaaat 25848075  T
Q  111 ttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttc 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25848074 tcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatacagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttc 25847975  T
Q  211 tcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 267  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25847974 tcagcttcagaagtatgttgcggatccttcacatgtgattccgagggatgatgatgt 25847918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22381308 - 22381046
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22381308 caagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttg 22381209  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22381208 actccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacggtggcttatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgt 22381109  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  22381108 ttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcagatccgtcacatgtgattccaagagatgatg 22381046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 22236179 - 22236441
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22236179 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttg 22236278  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22236279 actccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtgtcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgt 22236378  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22236379 ttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagggatgatg 22236441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 23080368 - 23080610
Alignment:
Q  21 agtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtcc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23080368 agtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctatgacgggtgtaagacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtcc 23080467  T
Q  121 gtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcgg 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  23080468 gtatcagatttcagagagggttggaacagtggcttatagagttggtttaccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgttgcagcttcgg 23080567  T
Q  221 aagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23080568 aagtatgtagcggatccttcacatgtgattccaagggatgatg 23080610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22462061 - 22461810
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22462061 caagcgtaggaaggaccttgagtttcaggaaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaggaagttg 22461962  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |    
T  22461961 actccaaagttcattggtccttaccagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtat 22461862  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattcc 252  Q
    ||||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| ||||| |||||    
T  22461861 ttcatgtgtcgcaattgcggaagtatgtaccagatccttcgcatgtcattcc 22461810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 17269608 - 17269854
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17269608 cttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattg 17269707  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||  | || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  17269708 gtccgtatcagatttcagagaggatcgggacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtatttcacgtgtcacaact 17269807  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  17269808 ccggaagtatgtagcagatccttcgcatgttattccgagagatgatg 17269854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20821546 - 20821300
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20821546 cttgaatttcaggaaggtgatcatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattg 20821447  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||| |    
T  20821446 gtccttatcagatttcagaaagggttggaactgtggcgtatagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagtt 20821347  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     |||||||||||  | |||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  20821346 gcggaagtatgtacctgatccttcgcatgttattccaagagatgatg 20821300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 23442552 - 23442814
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| | || ||||    
T  23442552 caagcgtaggaaggctcttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgtgttgaagtctaagatgttg 23442651  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23442652 actccaaagttcattggtccgtatcagttatctgagagggttggaacagtggcatacaaagtggttttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgt 23442751  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||    
T  23442752 ttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgtatgttattccgagagatgatg 23442814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 21891018 - 21891263
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||| |||| ||||| ||| |||| |||||||| | |||||||    
T  21891018 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttacacctatgactggtgtaggatgtgcgttgaagtctaagaagttg 21891117  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  21891118 actccaaagtttattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatatgt 21891217  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21891218 ttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 21891263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 28924027 - 28924289
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  28924027 caagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgaccatgtttttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttg 28924126  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  28924127 actccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgt 28924226  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || ||| | |||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  28924227 ttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtacctgatccttcgcatgttattccgagagatgatg 28924289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 28895201 - 28895463
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  28895201 caagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgaccatgtttttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttg 28895300  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  28895301 actccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactctggcgtatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgt 28895400  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || ||| | |||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  28895401 ttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtacctgatccttcgcatgttattccgagagatgatg 28895463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 24735870 - 24736132
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||| || ||||| || || || | |||||||    
T  24735870 caagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacgggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttg 24735969  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  24735970 actccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgt 24736069  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || ||  | |||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  24736070 ttcatgtgtcgcaattacggaagtatgtaccggatccttcgcatgttattcctagagatgatg 24736132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 24737044 - 24737306
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||| || ||||| || || || | |||||||    
T  24737044 caagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacgggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttg 24737143  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  24737144 actccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgt 24737243  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || ||  | |||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  24737244 ttcatgtgtcgcaattacggaagtatgtaccggatccttcgcatgttattcctagagatgatg 24737306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 24749813 - 24750075
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||| || ||||| || || || | |||||||    
T  24749813 caagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacgggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttg 24749912  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  24749913 actccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgt 24750012  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || ||  | |||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  24750013 ttcatgtgtcgcaattacggaagtatgtaccggatccttcgcatgttattcctagagatgatg 24750075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20773849 - 20773607
Alignment:
Q  21 agtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtcc 120  Q
    |||||||||| || |  ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  20773849 agtttcaggaagggggccatgtttttctgagggttactcctatgacgggcgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtcc 20773750  T
Q  121 gtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcgg 220  Q
     |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||| | |||    
T  20773749 ttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcgg 20773650  T
Q  221 aagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  20773649 aagtatgtaccagatccttcgcatgttattccgagagatgatg 20773607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 21564225 - 21564487
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||| | ||||  ||||| | |||||||||||||| | ||| |||    
T  21564225 caagcgaagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttctgagagtcactcatgtgacacgtgttagtcgtgctttgaagtctaagaatttg 21564324  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    |||||   |||||||||||| |||||||| || || |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21564325 actccacggtttattggtccatatcagatatctgatagagtttggacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgt 21564424  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || || |||||||||||||  ||||||||||| ||||  ||||| || |||||||    
T  21564425 ttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgcagcggatccttcgcatgctattccaagagatgatg 21564487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23573868 - 23573621
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23573868 aagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 23573769  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  23573768 ctccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtttt 23573669  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23573668 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 23573621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 26738980 - 26739212
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| ||  | |||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| | ||||||||    
T  26738980 cttgagtttcaagaaagagatcatatatttttgagggtcactcctgtgactggtgttggatgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattg 26739079  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||| |||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  26739080 gtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaacgcatctttcgaatttgcaagatgtgtttcatgtgtcgcaact 26739179  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26739180 tcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 26739212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20573614 - 20573400
Alignment:
Q  35 gatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcag 134  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || |    
T  20573614 gatcatgtatttttgagagtcactccactgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaggaagttgacttcaaggtttattggtccgtatcagatatcgg 20573515  T
Q  135 agagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcgga 234  Q
    | ||| |||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||    
T  20573514 aaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccaga 20573415  T
Q  235 tccttctcatgtgat 249  Q
    ||| |||||||||||    
T  20573414 tccatctcatgtgat 20573400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18775903 - 18775642
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||    
T  18775903 aagcgcaggaaggatcttgagtttcaggagggagaccacgtctttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccctgaagtcaaagaagttga 18775804  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||   ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18775803 ctccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtgatgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtttt 18775704  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     ||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  18775703 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccagatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 18775642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Original strand, 20468362 - 20468617
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactccta 107  Q
    ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||  |    
T  20468362 aggaaagaccttgaatttcaggaaggagaccatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactctga 20468461  T
Q  108 agtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgt 207  Q
     |||||||||||||| |||||| | ||| ||| | |  |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  20468462 ggtttattggtccgtgtcagatattagaaagaatagaaacagtggcgtattgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgt 20468561  T
Q  208 ttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  20468562 gtcgcaacttcggaagtatgtttcggatccgtctcatgtgatcccaagagatgatg 20468617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23516652 - 23516406
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||    
T  23516652 cttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattg 23516553  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||    
T  23516552 gtccgtattagatatcagaaagagttggaacggtggcatatcgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcaagatgtctttcatgtgtcgcaact 23516453  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||| |  ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  23516452 tcggaagtatttcccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 23516406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 21984565 - 21984812
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21984565 aagcgtaggaaagatcttgagtttcaagagggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgattggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 21984664  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||||| ||| |||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21984665 ctccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagctggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcacctttcgaacttgcacgatgtgtt 21984764  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    |||||| || || |||| || ||||||  ||||||| || ||||||||    
T  21984765 tcatgtgtcgcaacttcagaggtatgtaccggatccatcccatgtgat 21984812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23471340 - 23471108
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||| |||| |||||||   |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||   | ||||||||    
T  23471340 cttgagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcaagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttggaggtttattg 23471241  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||| | ||||| ||| |||| || ||||| ||| |||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||    
T  23471240 gtccgtatcaggtatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaacgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaact 23471141  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  23471140 tcggaagtatgttccggatccatcacatgtgat 23471108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23440351 - 23440090
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23440351 aagcgcaggaaagatcttaagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaatgaagttga 23440252  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||  || || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  23440251 ctccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagagggattaccaccgcatctttcgaatttgcaagaagtatt 23440152  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  23440151 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 23440090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 53 - 249
Target Start/End: Original strand, 21343669 - 21343865
Alignment:
Q  53 gtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtgg 152  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || ||||    
T  21343669 gtcactcctgtgactggtgttggacgagcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtataagatatcagaaagagttggaacggtgg 21343768  T
Q  153 catatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    | ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  21343769 cgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 21343865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20798886 - 20798658
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20798886 aagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 20798787  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||| || | || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  20798786 ctccgagatttattggtccgtatcaaatatcagaaagagttggaccggtggcatatcgattgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttt 20798687  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttg 230  Q
     ||||| || || |||||||| |||||||    
T  20798686 ccatgtgtcgcaacttcggaaatatgttg 20798658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21404929 - 21404701
Alignment:
Q  35 gatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcag 134  Q
    |||||||| ||| | || ||||||| | |||| ||||||||||||||  | || || | |||  |||||||   |||||||||  ||||||||||||| |    
T  21404929 gatcatgtgttttttagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgcgctaaaatcaaagaaactgactccgtggtttattggctcgtatcagatttcgg 21404830  T
Q  135 agagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcgga 234  Q
    | |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||    
T  21404829 aaagagttgggacagttgcgtatagagtgggtttaccaccacatctttcgaacttacatgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatgtttcaga 21404730  T
Q  235 tccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||||    
T  21404729 tccatctcatgtgattccaagagatgatg 21404701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22134782 - 22134550
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  22134782 gatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 22134683  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  22134682 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 22134583  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22134582 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 22134550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 21662299 - 21662560
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||| || |  |||||||| ||||| || ||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  21662299 caagcgtaggaaagaccttgaatttcaagaagcagatcatgtgtttctaagagtcactcctatgataggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttg 21662398  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||| | | ||||||||||  ||||||||| || || |||||||| ||| || | |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  21662399 acttcgaggtttattggtt-gtatcagatatcggaaagagttggaacaatgacgtatagagtgggtttgccaccgcatcttttgaatttgcatgatgtat 21662497  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||| || || || |||||||| |||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  21662498 ttcaagtgtcgcaacttcggaaatatgtatcggatccatcgcatgtgattccgagggatgatg 21662560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 22333159 - 22333391
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  22333159 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 22333258  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  22333259 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 22333358  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22333359 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 22333391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25423315 - 25423068
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||  | ||||||||    
T  25423315 aagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgcgttgaagtgaaagaagttga 25423216  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||| |||   || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25423215 ctccgagatttattggcccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcaggtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtt 25423116  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    |||||| |  || |||||||| |||||  ||||||| || ||||||||    
T  25423115 tcatgtgttgcaacttcggaactatgtaccggatccatcccatgtgat 25423068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 27668762 - 27668999
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||| |||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  27668762 gatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 27668861  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    ||||||| ||||||||||  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || || || || ||    
T  27668862 ttggtccatatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccacgtgtcgca 27668961  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  27668962 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 27668999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 34566608 - 34566376
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  34566608 gatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 34566509  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  34566508 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 34566409  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  34566408 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 34566376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41770956 - 41770724
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||| |||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  41770956 gatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 41770857  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || |||||| |||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  41770856 ttggtccgtatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 41770757  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41770756 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 41770724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27610468 - 27610231
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||| |||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  27610468 gatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 27610369  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| || ||| |||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  27610368 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcaacttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 27610269  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  27610268 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 27610231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 15000011 - 15000243
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  15000011 gatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 15000110  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  15000111 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 15000210  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15000211 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 15000243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16356616 - 16356384
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  16356616 gatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 16356517  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || |||||||||||||| |||||| | ||  | ||||| || ||    
T  16356516 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttctccatgtgtcgca 16356417  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16356416 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 16356384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Original strand, 27685660 - 27685904
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  27685660 aagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 27685759  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || ||    
T  27685760 ccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgtttt 27685859  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     || || || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27685860 ccacgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 27685904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22348538 - 22348316
Alignment:
Q  15 atcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttat 114  Q
    |||||||||||| ||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| ||    
T  22348538 atcttgagtttcgggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcat 22348439  T
Q  115 tggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcag 214  Q
    ||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||     
T  22348438 tggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcctaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaa 22348339  T
Q  215 cttcggaagtatgttgcggatcc 237  Q
    ||||| ||||||||| |||||||    
T  22348338 cttcgaaagtatgttccggatcc 22348316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Original strand, 37291762 - 37292000
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactccta 107  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |  |||||||| || |    
T  37291762 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaaaaagttgaccccga 37291861  T
Q  108 agtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || || |||||    
T  37291862 agtttattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 37291961  T
Q  208 ttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  37291962 gtctcaacttcgaaagtaagttccggatccatctcatgt 37292000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 48 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 40708860 - 40708662
Alignment:
Q  48 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 147  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||| ||    
T  40708860 tgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaac 40708761  T
Q  148 agtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || || ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  40708760 ggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 40708662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27518521 - 27518289
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||| |||||||| || || |  || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  27518521 gatcttgaatttcaggaaggagacctcgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 27518422  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || |||||| |||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  27518421 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcaca 27518322  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27518321 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 27518289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 29476345 - 29476577
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||  | ||||| |    
T  29476345 gatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgacggatgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccacgaagttca 29476444  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    ||||||| |||||| | |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  29476445 ttggtccatatcaggtattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 29476544  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29476545 acttcgaaagtatgtttcggatccatctcatgt 29476577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19770074 - 19769837
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  19770074 gatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 19769975  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||| || || ||||| ||  |||| ||||| || || |||||| |||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  19769974 ttggtccgtatcagatattggaaagagtcggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 19769875  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  19769874 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 19769837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 21665760 - 21665986
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||| || |  |||||||| ||||| || ||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  21665760 caagcgtaggaaagaccttgaatttcaagaagcagatcatgtgtttctaagagtcactcctatgataggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttg 21665859  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||| | | ||||||||||  ||||||||| || || |||||||| ||| || | |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  21665860 acttcgaggtttattggtt-gtatcagatatcggaaagagttggaacaatgacgtatagagtgggtttgccaccgcatcttttgaatttgcatgatgtat 21665958  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgt 228  Q
    |||| || || || |||||||| |||||    
T  21665959 ttcaagtgtcgcaacttcggaaatatgt 21665986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 185
Target Start/End: Original strand, 21498314 - 21498479
Alignment:
Q  20 gagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtc 119  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  || |||| ||||||| | |||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||    
T  21498314 gagtttcaagagggagatcatgtagttttgagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgaattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtc 21498413  T
Q  120 cgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcga 185  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||  ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  21498414 cgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggtgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcga 21498479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21625471 - 21625383
Alignment:
Q  175 acatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||| | |||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21625471 acatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactttgaaagtatgtagtggatccttcgcatgtgattccgagagatgatg 21625383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Original strand, 11210960 - 11211058
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    ||||| ||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11210960 aggaaagatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 11211058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 27011186 - 27011088
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | || | |||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27011186 aggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcatgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 27011088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 21937457 - 21937552
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| | ||||| | |||| |||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21937457 aaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttaagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 21937552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 24581313 - 24581215
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    ||||||||| |||||||||| |  |||||||| || ||| | ||||| | |||| |||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24581313 aggaaggatattgagtttcaagttggtgatcacgtgtttgtaagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 24581215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20832811 - 20832545
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  20832811 caagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttg 20832712  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20832711 actcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 20832612  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20832611 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 20832545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 31830484 - 31830218
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31830484 caagcgaagaaaggatcttgaatttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttg 31830385  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31830384 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgt 31830285  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31830284 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 31830218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1063577 - 1063311
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  1063577 caagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttg 1063478  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1063477 actcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaattggtactgtggcatatagagttgctttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 1063378  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1063377 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 1063311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 11358491 - 11358753
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11358491 caagcggagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggtcgtgctttgaagtcgagaaagttg 11358590  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11358591 actcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagaaagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 11358690  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11358691 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccaagggatgatg 11358753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23293784 - 23293534
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  23293784 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttg 23293685  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23293684 actccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttctaacttgcatgatgtgt 23293585  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  23293584 ttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattc 23293534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24654170 - 24653909
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24654170 aagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacttgcattgaagtcgaggaagttga 24654071  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24654070 ctccaaagttcattggtccgtatcagatttcagtgaaggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtt 24653971  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||| || || |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  24653970 tcatgtgtcgcaacttcggaagtatttagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatg 24653909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 27 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24945167 - 24944931
Alignment:
Q  27 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24945167 aggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 24945068  T
Q  127 gatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtat 226  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  24945067 gatttcaaagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgggtttcatgtgtcgcagcttcggaagtat 24944968  T
Q  227 gttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  24944967 gtagcggagccttcgcatgttattccaagagatgatg 24944931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23276602 - 23276340
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| |    
T  23276602 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagatttactcctatgatgggtgtgggacgtgcattgaagtcgagtaagtcg 23276503  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23276502 actccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgt 23276403  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  23276402 ttcatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 23276340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12574179 - 12573917
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  12574179 caagcggaggaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagggttaccccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttg 12574080  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12574079 actccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagaggattgggacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgt 12573980  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||| || || ||| | ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  12573979 ttcacgtgtcacagttgcggaagtatgtagcagatccttcgcatgttattccgagagatgatg 12573917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27787551 - 27787305
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  27787551 cttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattg 27787452  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || ||    
T  27787451 gtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaact 27787352  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  27787351 tcggaagtatgtagcagatccttcacatgttattccgagagatgatg 27787305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23087260 - 23087014
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| || | ||||||||    
T  23087260 cttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcttgtgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacgccgaggtttattg 23087161  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  23087160 gtccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcgtatagagtgtgtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaact 23087061  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||    
T  23087060 tcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatcccaagagatgatg 23087014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Original strand, 22757081 - 22757342
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||  | || || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  22757081 aagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaagagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaaatcaaagaagttga 22757180  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  22757181 ctccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctt 22757280  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  22757281 tcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 22757342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 48 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23138816 - 23138615
Alignment:
Q  48 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 147  Q
    |||| ||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  23138816 tgagagtcactcttgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaac 23138717  T
Q  148 agtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtg 247  Q
     ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23138716 ggtggcatatcgagtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatggtgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtg 23138617  T
Q  248 at 249  Q
    ||    
T  23138616 at 23138615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 48 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23550606 - 23550405
Alignment:
Q  48 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 147  Q
    |||| ||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  23550606 tgagagtcactcttgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaac 23550507  T
Q  148 agtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtg 247  Q
     ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23550506 ggtggcatatcgagtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatggtgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtg 23550407  T
Q  248 at 249  Q
    ||    
T  23550406 at 23550405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 27365696 - 27365956
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || | |||||||    
T  27365696 caagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagggtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttg 27365795  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  27365796 actccaaagttcattggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgt 27365895  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatga 261  Q
    | ||||| || ||| | |||||||||||  || ||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  27365896 tccatgtgtcgcagttgcggaagtatgtaccgaatccttcgcatattattcctagggatga 27365956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 249
Target Start/End: Original strand, 27377096 - 27377336
Alignment:
Q  9 ggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |     
T  27377096 ggaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgag 27377195  T
Q  109 gtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtt 208  Q
     |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||     
T  27377196 atttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgggttggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtg 27377295  T
Q  209 tctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    || || ||||| |||||||||  |||||| |||||||||||    
T  27377296 tcgcaacttcgaaagtatgttctggatccatctcatgtgat 27377336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 24708100 - 24708347
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  24708100 aagcgcaggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 24708199  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  24708200 ctcctagattttttggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgacgtttt 24708299  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24708300 ccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgat 24708347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Original strand, 21325884 - 21326145
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  21325884 aagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttga 21325983  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||| ||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  21325984 ctccgagatttattagtccgtatcagatatcggaaagagttgggacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttt 21326083  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||| || || |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  21326084 tcatgtgtcgcaacttcagaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 21326145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24675302 - 24675053
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||    
T  24675302 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcacccctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 24675203  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  24675202 ttggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattaccaccgcatcttttgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgca 24675103  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  24675102 acttcggaagtatgttccagatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 24675053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23188833 - 23188586
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||  | ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23188833 aagcgcaggaaagatcttgagtgtcaggaaggagaccacatgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 23188734  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||  |||| ||| ||||  | || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  23188733 ctccaagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacgatggcgtatcgagtgagattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtttt 23188634  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23188633 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 23188586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23063902 - 23063676
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || |||||| | || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23063902 aagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgttttttttagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 23063803  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  ||||||||||||| |||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  23063802 ctccgagatttattggtccgtttcagatatctgaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcacctttcgaatttgcacgatgtgtt 23063703  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgt 228  Q
    |||||| || || |||| |||||||||    
T  23063702 tcatgtgtcgcaacttcagaagtatgt 23063676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10868675 - 10868431
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  10868675 aagcgtaggaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 10868576  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || ||    
T  10868575 ccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgtttt 10868476  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10868475 ccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 10868431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 21145660 - 21145892
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||    
T  21145660 gatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcaaagaagttgaccccgaagttta 21145759  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    ||| || ||||||||| |  || |||||||| ||  |||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  21145760 ttgatctgtatcagatattggaaagagttggaacgatggcttatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 21145859  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21145860 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 21145892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9609949 - 9609717
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  9609949 gatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 9609850  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  9609849 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 9609750  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9609749 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 9609717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16925073 - 16924841
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  16925073 gatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 16924974  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  16924973 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 16924874  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16924873 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 16924841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16998813 - 16998581
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  16998813 gatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 16998714  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  16998713 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 16998614  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16998613 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 16998581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24262195 - 24261951
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  24262195 aagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 24262096  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    | || ||||| ||||||| |||||| || |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || |||||||||||||| |||||| | || ||    
T  24262095 ccccgaagttcattggtctgtatcatatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgtttt 24261996  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24261995 ccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 24261951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27217829 - 27217597
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||| |||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  27217829 gatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 27217730  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  27217729 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 27217630  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27217629 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 27217597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 48 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16981931 - 16981733
Alignment:
Q  48 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 147  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||| ||    
T  16981931 tgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaac 16981832  T
Q  148 agtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || || ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16981831 ggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 16981733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 48 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17063496 - 17063298
Alignment:
Q  48 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 147  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||| ||    
T  17063496 tgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaac 17063397  T
Q  148 agtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || || ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17063396 ggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 17063298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Original strand, 44386202 - 44386436
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||| |||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || || || ||||    
T  44386202 cttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaaattcattg 44386301  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||| | || || ||||| || || ||    
T  44386302 gtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaact 44386401  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
    ||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  44386402 tcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 44386436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Original strand, 30211535 - 30211796
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||| | || ||||| | | |||| ||||||||||| ||  | || || | |||  |||    
T  30211535 aagcgtaggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtgttttttagagtcacccatgtgaccggtgttggacgggcgctaaaatcaaagaaactga 30211634  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||||||| || | ||||||    || || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  30211635 ctccgaggtttattggcccgtatcagatttcggaaaaagttggggtggttgcgtataaagtgggtttaccaccgcatctttcgaacttacatgatgtgtt 30211734  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||| || || |||||||||||||||  |||||  |||||||||||||| || |||||||    
T  30211735 tcatgtgtcacaacttcggaagtatgttttggatcaatctcatgtgattccaagagatgatg 30211796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 22325486 - 22325718
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||| |||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| || ||||| |    
T  22325486 gatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaacaagttgaccccgaagttca 22325585  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || |||||| |||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  22325586 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 22325685  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22325686 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 22325718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 24878625 - 24878854
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  24878625 gatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 24878724  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    ||||||| |||||||| |  || |||||||| || ||||| ||   ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || || ||| | || ||    
T  24878725 ttggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatctgtcgca 24878824  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctca 243  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  24878825 acttcgaaagtatgttccggatccatctca 24878854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24709846 - 24709614
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  24709846 gatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 24709747  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    ||||||||||| |||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || |||||| |||| ||| || | || || ||||| || ||    
T  24709746 ttggtccgtattagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgtacaacgttttccatgtgtcgca 24709647  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24709646 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 24709614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27371082 - 27370850
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  27371082 gatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggatgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 27370983  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| | ||| || || |||||| |||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  27370982 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtggatttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 27370883  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27370882 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 27370850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17067154 - 17066959
Alignment:
Q  48 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 147  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||| ||    
T  17067154 tgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaac 17067055  T
Q  148 agtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| |   |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || |||||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17067054 ggtggctttacgagtgggtttaccgccgcatctttcgaa-ttgcac-acgtttttcatgtgtcgca-cttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 17066959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 168
Target Start/End: Original strand, 24825900 - 24826066
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| |||| || ||| |||| ||| | || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||    
T  24825900 aagcgtaggaaagaccttgagttttaggaaggagataatgtatttttaagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttga 24825999  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggttt 168  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||| |||| |||||    
T  24826000 ctccgaggtttattggttcgtatcagatatcagaaagaattgggacggtggcgtatcgagtgggttt 24826066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 251
Target Start/End: Original strand, 24833359 - 24833440
Alignment:
Q  170 ccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24833359 ccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatgtttcggatccatctcatgtgattc 24833440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 45529306 - 45529100
Alignment:
Q  38 catgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagaga 137  Q
    ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||  | || || | |||  ||||||| | ||||||||  || ||||||||||| || |    
T  45529306 catgtgtttatgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgcgctaaaatcaaagaaactgactccgaggtttattgacccatatcagatttcggaaa 45529207  T
Q  138 gagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatcc 237  Q
    ||||||| || || || |||||||| ||||| ||||  ||||||| |||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||| ||||| | |||||    
T  45529206 gagttgggacggttgcgtatagagtgggtttaccactgcatcttttgaacttacgtgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagcatgtttcagatcc 45529107  T
Q  238 ttctcat 244  Q
     ||||||    
T  45529106 ctctcat 45529100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 251
Target Start/End: Original strand, 41609054 - 41609211
Alignment:
Q  94 gaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcac 193  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| |  || ||||||||||| ||||||    
T  41609054 gaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttacagccgcatctttcgaatttgcac 41609153  T
Q  194 gatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
     |||| || || || || || ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  41609154 aatgttttccacgtgtcgcaactttggaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 41609211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22276095 - 22276000
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| || | |||| |||| |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||    
T  22276095 aaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagggtaggaagttgactcct 22276000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 23817720 - 23817816
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactccta 107  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| || | || | |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||    
T  23817720 aaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcttgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtcggaagttgactccta 23817816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 106
Target Start/End: Original strand, 24831813 - 24831909
Alignment:
Q  10 gaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    ||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| || || || |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24831813 gaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctatgactggagtgggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 24831909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Original strand, 12640543 - 12640641
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    ||||||||| ||||||||||||  || |||||||| ||  ||||||| | |||  |||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12640543 aggaaggatattgagtttcaggttggagatcatgtgttcttgagggtgaatccggtgaccggtgtcggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 12640641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 35)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 37677290 - 37677023
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttct-gagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagtt 99  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37677290 caagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttcttgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagtt 37677191  T
Q  100 gactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37677190 gactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtg 37677091  T
Q  200 tttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 267  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37677090 tttcatgtctctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 37677023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20294622 - 20294360
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20294622 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttg 20294523  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20294522 actcctaagttcattggtccatatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 20294423  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20294422 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgtggcggatccttcgcatgtgattccaagggatgatg 20294360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 31550330 - 31550592
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  31550330 caagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttg 31550429  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31550430 actcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgt 31550529  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31550530 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccaagggatgatg 31550592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 20075208 - 20075474
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20075208 caagcggagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttg 20075307  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20075308 actcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagtgggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgt 20075407  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20075408 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgtagcagatccttcgcatgtgattccgagggatgacgatgt 20075474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 267
Target Start/End: Original strand, 20395173 - 20395408
Alignment:
Q  32 ggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagattt 131  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20395173 ggtgatcatgtttttcttagggtcactcctttgacgggtgtcggtcgtgctttgaagtcgaggaatttgactcctaagttcatcggtccgtatcagattt 20395272  T
Q  132 cagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgc 231  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  20395273 cagagagagttggaatagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatatttctcagcttcggaagtatgtagc 20395372  T
Q  232 ggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 267  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20395373 ggatccttcacatgtgattccgagggatgatgatgt 20395408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20244394 - 20244148
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  20244394 cttgagtttcaggagggtgatcatgtctttctgagggttactcctatgacgggtgtgggacatgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcg 20244295  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  20244294 gtccatatcagatttcagagagggttggaacagtggcctatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagct 20244195  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||    
T  20244194 tcggaagtatgtagcggatctttcgcatgttattccgagagatgatg 20244148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Original strand, 20940213 - 20940474
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  20940213 aagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttga 20940312  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20940313 ctccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtt 20940412  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||| ||| ||| || || ||||| || |||||||    
T  20940413 tcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcgtatctttcgcacgttattccaagagatgatg 20940474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 261
Target Start/End: Original strand, 19665041 - 19665285
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  19665041 cttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggggtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactcctaagttcattg 19665140  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||    
T  19665141 gtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtatttcatgtgtcgcaact 19665240  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatga 261  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  19665241 tcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatga 19665285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19854524 - 19854262
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| || || || |||||||||| |||||||    
T  19854524 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggtcgggcattgaagtcgaagaagttg 19854425  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  19854424 actccaaagttcattggtctgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccaaatctttcgaatttgcatgatgtgt 19854325  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  19854324 ttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatg 19854262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 22433281 - 22433527
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| || |    
T  22433281 cttgagtttcaggagggtgatcatgtgttcctgagggttactcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcg 22433380  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||||    
T  22433381 gttcgtatcagatttcagagagggttgcaactgtggcctatagagttggtttgccaccacatctttcgaatatgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagct 22433480  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  22433481 tcggaagtatgtagcggatccttcacatgttattccgagagatgatg 22433527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 11382804 - 11382666
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11382804 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaagttg 11382705  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagaga 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11382704 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagaga 11382666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 20856910 - 20857172
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20856910 caagcgtaggaaggaccttgcgtttcaggaaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaggaagttg 20857009  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |    
T  20857010 actccaaagttcattggtccttaccagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtat 20857109  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  20857110 ttcatgtgtcgcaattgcggaagtatgtaccagatccttcgcatgttattccaagagatgatg 20857172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Original strand, 20836057 - 20836241
Alignment:
Q  21 agtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaag---ttgactcctaagtttattgg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||| | || ||||||| ||||   |||||||| ||||| |||||    
T  20836057 agttttaggagggtgatcatgtttttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtacatttaagtcgaagaagaagttgactccaaagttcattgg 20836156  T
Q  118 tccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgttt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20836157 tccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgttt 20836241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 17045165 - 17045412
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  17045165 aagcgcaggaaggatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttga 17045264  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    | || |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17045265 ccccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgacgtgtt 17045364  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17045365 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 17045412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 50620394 - 50620641
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||  ||||| || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  50620394 aagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaggaagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttga 50620493  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| |||| ||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  50620494 ctccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaatggtggcatatcgagtgggtttaccaccgtatctttcgaatttgcatgatgtgtt 50620593  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  50620594 tcatgtgtcgtaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 50620641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 48 - 249
Target Start/End: Original strand, 50612612 - 50612813
Alignment:
Q  48 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 147  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |     
T  50612612 tgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaat 50612711  T
Q  148 agtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtg 247  Q
     ||||||||| |||| ||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  50612712 ggtggcatatcgagtgggtttaccaccgtatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgtaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtg 50612811  T
Q  248 at 249  Q
    ||    
T  50612812 at 50612813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20136987 - 20136740
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || || |  || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  20136987 aagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagacctcgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttga 20136888  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||| ||||||||| || || |||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20136887 ctccgagatttattggtctgtatcagatatcggaaagagttgggacagtggcgtatcgtgttggtttaccacggcatctttcgaatttgcacgatgtgtt 20136788  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    |||||| || || |||||||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  20136787 tcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtttttgatccatctcatgtgat 20136740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19106564 - 19106329
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  19106564 gatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttta 19106465  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| ||| ||||||| || | ||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || ||    
T  19106464 ttggtccatatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattactaccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgca 19106365  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19106364 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 19106329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20250047 - 20249812
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| || ||||    
T  20250047 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagcgttgaagtcaaagaagttgactccgaaattta 20249948  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    ||| ||||||| |||| ||||| |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  20249947 ttgttccgtataagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcacctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgca 20249848  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  20249847 acttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 20249812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21747698 - 21747500
Alignment:
Q  48 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 147  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| |  ||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||    
T  21747698 tgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaatccgagatttattggttcgtatcagatatcggaaagagttggaac 21747599  T
Q  148 agtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  21747598 ggtggcgtaccgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgt 21747500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16369506 - 16369271
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || || || |||||||| ||| |||| ||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  16369506 aagcgtaggaaagaccttgaattccaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgacaagtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttga 16369407  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    || | | |||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16369406 cttcgaggtttattggtctatatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgtgttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtt 16369307  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatcc 237  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| |||||||    
T  16369306 tcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 16369271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 249
Target Start/End: Original strand, 16078829 - 16079030
Alignment:
Q  48 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 147  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| |     
T  16078829 tgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaat 16078928  T
Q  148 agtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtg 247  Q
     ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || || |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16078929 ggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaactacggaagtatgttccggatccatctcatgtg 16079028  T
Q  248 at 249  Q
    ||    
T  16079029 at 16079030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Original strand, 19761016 - 19761277
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||  |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  19761016 aagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcttgtgattggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttga 19761115  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||| ||||||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| ||||    
T  19761116 ctccgagatttattggaccgtatcagatatccgaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcacctttcgaatttgcatgatatgtt 19761215  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||| || || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  19761216 tcatgtatcgcaacttcggtagtatgtttcggatccgtctcatgtgatcccaagagatgatg 19761277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 16350761 - 16350998
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  16350761 gatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 16350860  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || ||    
T  16350861 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgca 16350960  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  16350961 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 16350998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 41354631 - 41354868
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||| ||| |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |    
T  41354631 gatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgacctcgaagttca 41354730  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    ||||||| ||||||||||  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || ||    
T  41354731 ttggtccatatcagattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgca 41354830  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  41354831 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 41354868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21830500 - 21830268
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  21830500 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 21830401  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    ||||||| |||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  21830400 ttggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 21830301  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21830300 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 21830268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 41308019 - 41307892
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  41308019 cttgagtttcaagagggagaccatgtgtttctgagggttactcctatgacgggtgtatgacgtgcattgaagtctaaaaagttgactcctaagtttattg 41307920  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttgg 144  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  41307919 gtccgtatcagatatctgagagggttgg 41307892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 33391191 - 33391423
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  33391191 gatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 33391290  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || |||||| |||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  33391291 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 33391390  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33391391 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 33391423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 249
Target Start/End: Original strand, 51333689 - 51333890
Alignment:
Q  48 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 147  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |  || |||||||| ||    
T  51333689 tgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcatatattggaaagagttggaac 51333788  T
Q  148 agtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtg 247  Q
     ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || || ||||| || || ||||| |||||||||  |||||| |||||||||    
T  51333789 ggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttctggatccatctcatgtg 51333888  T
Q  248 at 249  Q
    ||    
T  51333889 at 51333890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21837147 - 21836915
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  21837147 gatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 21837048  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || |||||| |||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  21837047 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 21836948  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||  ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21836947 acttcaaaagtatgttccggatccatctcatgt 21836915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21163381 - 21163228
Alignment:
Q  110 tttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgttt 209  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||  | || ||||| |    
T  21163381 tttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatatttcgaatttgcacgacattttccatgtgt 21163282  T
Q  210 ctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    | || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  21163281 cgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 21163228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24477024 - 24476928
Alignment:
Q  167 ttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  24477024 ttgccaccacatctctcgaattttcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccctcgcatgtgattccgagagatgatg 24476928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 46518924 - 46518826
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  46518924 aggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 46518826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 20914410 - 20914315
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20914410 aaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 20914315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 20831551 - 20831646
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  20831551 aaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcct 20831646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 47123768 - 47123502
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47123768 caagcgaagaaaggatcttgaatttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttg 47123669  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47123668 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgt 47123569  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 267  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47123568 ttcatgtttctcagcttcggaggtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 47123502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 10383793 - 10383530
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  10383793 caagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgtcggtcgtgctttgaagtcgagaaagttg 10383694  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10383693 actcctaaattcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacacctttcgaacttgcacgatgtgt 10383594  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatga 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10383593 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgatcccgagggatgatga 10383530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 16329964 - 16330224
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16329964 caagcaaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacaggtgttggacgtgcattgaagtcgaggtagttg 16330063  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16330064 actccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgt 16330163  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatga 261  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16330164 ttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtggcggatccttcgcatgtgattccaagggatga 16330224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 11961339 - 11961601
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| |||    
T  11961339 caagcgaaggaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgagtgtacgacgtgcattgaagtcgaggaaattg 11961438  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11961439 actccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaatagtggcttatagagttgatttgcccccacatctttcgaacttgcatgatgtgt 11961538  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  11961539 ttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgattccaagagatgatg 11961601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 18134651 - 18134913
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18134651 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcttgtatttctgagagttactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcgaggaagttg 18134750  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18134751 actccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcttatagagttggtttgccaccacatctttcaaacttgcatgatgtgt 18134850  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  18134851 ttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatg 18134913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 12360847 - 12361107
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| || ||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12360847 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagttacttctatgacatgtgtaggacgtgcattgaaatcgaggaagttg 12360946  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12360947 actccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagaaggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgt 12361046  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatga 261  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  12361047 ttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatga 12361107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 11304078 - 11304340
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  11304078 caagcgtatgaaggctcttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctgagagttttccctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttg 11304177  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11304178 actccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaatagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgt 11304277  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||| ||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  11304278 ttcttgtgtcgcaacttcagaagtatgtagcggatccttcgcatgttattcctagtgatgatg 11304340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 8759403 - 8759649
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8759403 cttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattg 8759502  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || ||    
T  8759503 gtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaact 8759602  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  8759603 gcggaagtatgtagcagatccttcacatgttattccgagagatgatg 8759649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13941832 - 13941586
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  13941832 cttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattg 13941733  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || ||    
T  13941732 gtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaact 13941633  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  13941632 tcggaagtatgtagcagatccttcacatgttattccgagagatgatg 13941586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15227473 - 15227211
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  15227473 caagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttg 15227374  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15227373 acgccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgt 15227274  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  15227273 ttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatttcgagagatgatg 15227211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41177330 - 41177084
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  41177330 cttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattg 41177231  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || ||    
T  41177230 gtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaact 41177131  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  41177130 tcggaagtatgtagcagatccttcacatgttattccgagagatgatg 41177084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 10420350 - 10420612
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  10420350 caagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgatcatgtttttctgagggttactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttg 10420449  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  10420450 actccaaagttcattggtccttatcagatttcagaaagagtcggaactgtggcgtatagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgt 10420549  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || ||| | |||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  10420550 ttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtacctgatccttcacatgttattccgagagatgatg 10420612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Original strand, 16836816 - 16837071
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16836816 aagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttga 16836915  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |      ||||||| ||||||||    
T  16836916 ctccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagaggattggaacggtgacatatagagttggtttgccaccacacc------acttgcatgatgtgtt 16837009  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||    
T  16837010 tcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatcttattccgagagatgatg 16837071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 16381248 - 16381491
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | || || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16381248 cttgagtttcgggatggtgatcatgtatttttaagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattg 16381347  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||    
T  16381348 gtccgtatcagatttcagagaggattgggacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacagct 16381447  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatg 260  Q
    |||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  16381448 tcggaaatatgtagcagatccttcgcatgttattccgagagatg 16381491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 44777064 - 44776809
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactccta 107  Q
    |||||||  |||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  44777064 aggaaggcccttgagttccaagagggtgatcatgtatttctaagagtcactccgatgacaggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttaactccga 44776965  T
Q  108 agtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgt 207  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  44776964 agttcattggcccgtatcagatttcagagaggatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgt 44776865  T
Q  208 ttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     || ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  44776864 gtcacagttgcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 44776809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14571672 - 14571410
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||    
T  14571672 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaatttg 14571573  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  14571572 actcctaagtttattggtccttatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggcttgccaccatatctttcgaatttgcatgatgtgt 14571473  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || || |||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  14571472 ttcatgtgtcgcaacttcagaagtacgtagcggatccttcgcatgttatcccgagagatgatg 14571410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 15953273 - 15953532
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  | |||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| | |||||||    
T  15953273 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagatttactcctatgacgggtgtacgacgtgcattgaagtctaagaagttg 15953372  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15953373 actccaaagttcattggttcgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgt 15953472  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatg 260  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||    
T  15953473 ttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatcattcgcatgttattccgagagatg 15953532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 13322957 - 13323219
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||| ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||    
T  13322957 caagcgtaggaaagatcttgggtttcaggagggagaccatgtgtttctgagagttactcctatgacgggggtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttg 13323056  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||  |||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||| |    
T  13323057 actccaaagttcattggtccgtatcagatattggagaggattggaacagtggcatataggattggttttccaccacatctttcgaatttgcatggtgtat 13323156  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  13323157 tccatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccgtcgcatgttattccaagagatgatg 13323219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 13972425 - 13972685
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || | |||||||    
T  13972425 caagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttg 13972524  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  13972525 actccgaagtttattggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgt 13972624  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatga 261  Q
    ||||||| || ||| | |||||||||||  |||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  13972625 ttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtaccggatccttcgcatattattcctagggatga 13972685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12498061 - 12497800
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  12498061 aagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 12497962  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  12497961 ctccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttt 12497862  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  12497861 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 12497800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17489663 - 17489416
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  17489663 aagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 17489564  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  17489563 ctccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcacctttcgaatttgcacgatgtgtt 17489464  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    |||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  17489463 tcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgat 17489416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Original strand, 12850600 - 12850785
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  12850600 cttgagtttcaagaggaagatcatgtgtttctgagagtcactcctgtgacgggtataggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattg 12850699  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgttt 202  Q
    |||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  12850700 gtccataccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttggaatttgcatgatgtgttt 12850785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9522520 - 9522285
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||| ||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||    
T  9522520 gatcttgactttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 9522421  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  9522420 ttggtccgtatcagatatcaaaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgca 9522321  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  9522320 acttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 9522285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15208688 - 15208457
Alignment:
Q  18 ttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattgg 117  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||  | |||||||||||| | |||||||||    
T  15208688 ttgagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtaaaagaagttgactccgaggtttattgg 15208589  T
Q  118 tccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagctt 217  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||  ||| |||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || |||    
T  15208588 tccgaatcagatatcagaaagaattggaacggtggagtatcgagtgggtttacaaccgcatctttcgaattttcacgatgtgtttcatgtgtcgcaactt 15208489  T
Q  218 cggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15208488 cggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 15208457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 120 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31945177 - 31945034
Alignment:
Q  120 cgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcg 219  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  31945177 cgtatcagatatcagaaagggttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcg 31945078  T
Q  220 gaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  31945077 gaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 31945034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 14876831 - 14877077
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| || || || || || ||| |||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||    
T  14876831 cttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagttactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattg 14876930  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| ||||||| || ||||  ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||    
T  14876931 gtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattaccactgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaact 14877030  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  14877031 tcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 14877077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 122 - 263
Target Start/End: Original strand, 31689049 - 31689190
Alignment:
Q  122 tatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcgga 221  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  31689049 tatcagatatcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttgacaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgga 31689148  T
Q  222 agtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  31689149 agtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 31689190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14086497 - 14086237
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || | |||||||    
T  14086497 caagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttg 14086398  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||    
T  14086397 actccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagtcgggacagtggcttatagggtgggtttgccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgt 14086298  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatga 261  Q
    | || || || ||| | |||||||||||  |||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  14086297 tccacgtgtcgcagttgcggaagtatgtaccggatccttcgcatattattcctagggatga 14086237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 16492498 - 16492745
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||    
T  16492498 aagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttaaagtcaaagaagttga 16492597  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||| ||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  16492598 ctccgagatttattggtctgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaattttcacgatgtgtt 16492697  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    |||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  16492698 tcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgat 16492745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16691965 - 16691726
Alignment:
Q  10 gaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaag 109  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |      
T  16691965 gaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgaga 16691866  T
Q  110 tttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgttt 209  Q
    ||||||||  ||||||| || || || || ||||| || ||||||||| | || || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |    
T  16691865 tttattgggtcgtatcaaatatcggaaagggttggaacggtggcatatcgtgtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgt 16691766  T
Q  210 ctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    | || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  16691765 cacaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 16691726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 15725262 - 15725497
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||| | || ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  15725262 gatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttttagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagttta 15725361  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  15725362 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 15725461  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15725462 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgat 15725497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15247943 - 15247733
Alignment:
Q  19 tgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggt 118  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| | || |||||||    
T  15247943 tgagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtgtattggt 15247844  T
Q  119 ccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttc 218  Q
    |||||| |||| || || ||| |||| || ||||| ||| |||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  15247843 ccgtattagatatcggaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttacaaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttc 15247744  T
Q  219 ggaagtatgtt 229  Q
    |||| ||||||    
T  15247743 ggaaatatgtt 15247733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Original strand, 16807243 - 16807504
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  16807243 aagcgcagaaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttga 16807342  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||  |  ||| | |||||||||||||| ||  | | | |||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  16807343 ctctgagatttttcggtccgtatcagatatcgaaaaaatttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaacttgcacgatgtttt 16807442  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     ||||| || || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  16807443 ccatgtgtcgcaacttcggaattatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 16807504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 53385347 - 53385584
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||| |||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| |    
T  53385347 gatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaaaaagttgaccccgaagttca 53385446  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    ||||||| ||||||||||  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || ||    
T  53385447 ttggtccatatcagattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgca 53385546  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  53385547 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 53385584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16371180 - 16370965
Alignment:
Q  48 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 147  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  16371180 tgagagtcactcctgtgactggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttgggac 16371081  T
Q  148 agtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtg 247  Q
     ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |  || || ||||| || || |||||||||||||||   ||||| |||||||||    
T  16371080 ggtggcgtattgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgtcgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttctagatccatctcatgtg 16370981  T
Q  248 attccgagggatgatg 263  Q
    || | ||| |||||||    
T  16370980 atccagagtgatgatg 16370965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10005401 - 10005169
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||| |||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  10005401 gatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 10005302  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  10005301 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 10005202  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10005201 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 10005169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10906011 - 10905779
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||| ||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  10906011 gatcttgaatttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 10905912  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  10905911 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 10905812  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10905811 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 10905779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13252491 - 13252259
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||| |||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  13252491 gatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 13252392  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  13252391 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 13252292  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13252291 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 13252259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Original strand, 16412599 - 16412843
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16412599 aagcgtaggaatgaccttgagtttcatgaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 16412698  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| ||| || | || ||    
T  16412699 ccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttggacaacgtttt 16412798  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16412799 ccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 16412843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16635574 - 16635342
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  16635574 gatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 16635475  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  16635474 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 16635375  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16635374 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 16635342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 43162898 - 43162666
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  43162898 gatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 43162799  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  43162798 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 43162699  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  43162698 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 43162666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 251
Target Start/End: Original strand, 16756948 - 16757151
Alignment:
Q  48 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 147  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||  || |||||||| ||    
T  16756948 tgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcatattttggaaagagttgggac 16757047  T
Q  148 agtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtg 247  Q
     ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||     
T  16757048 ggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtc 16757147  T
Q  248 attc 251  Q
    ||||    
T  16757148 attc 16757151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15339070 - 15338838
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||||||| |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| || || ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  15339070 gatcttgagttttaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggcgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 15338971  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || ||| |||| || || || ||  |||| ||||| || |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| || ||    
T  15338970 ttggtccgtatcagatattggaaagaattggaacggtagcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgca 15338871  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15338870 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 15338838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 15589721 - 15589953
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||| |||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  15589721 gatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 15589820  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || |||||| |||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  15589821 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 15589920  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15589921 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 15589953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 48 - 251
Target Start/End: Original strand, 5425292 - 5425495
Alignment:
Q  48 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 147  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||| ||    
T  5425292 tgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaac 5425391  T
Q  148 agtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtg 247  Q
     ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || || ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||     
T  5425392 ggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgta 5425491  T
Q  248 attc 251  Q
    ||||    
T  5425492 attc 5425495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 48 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6600514 - 6600311
Alignment:
Q  48 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 147  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||  || | |||||| ||    
T  6600514 tgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgggac 6600415  T
Q  148 agtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtg 247  Q
     ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||     
T  6600414 ggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgta 6600315  T
Q  248 attc 251  Q
    ||||    
T  6600314 attc 6600311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 48 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 48425214 - 48425016
Alignment:
Q  48 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 147  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||| ||    
T  48425214 tgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaac 48425115  T
Q  148 agtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || || ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  48425114 ggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 48425016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 15348574 - 15348806
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  15348574 gatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 15348673  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || |||||| |||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  15348674 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 15348773  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15348774 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 15348806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 246
Target Start/End: Original strand, 15402843 - 15403071
Alignment:
Q  18 ttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattgg 117  Q
    ||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| || || ||||||||||||||||| | ||||||||| || | ||| |||||    
T  15402843 ttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggcgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgatgttcattgg 15402942  T
Q  118 tccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagctt 217  Q
    |||||||||||| |  || ||| |||| || ||||| ||  |||| ||||| || |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||    
T  15402943 tccgtatcagatattggaaagaattggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaactt 15403042  T
Q  218 cggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
    || ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  15403043 cgaaagtatgttccagatccatctcatgt 15403071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 20062383 - 20062615
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||| |||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| || || ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  20062383 gatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggcgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 20062482  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || |||||| |||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  20062483 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 20062582  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20062583 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 20062615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Original strand, 26792716 - 26792960
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || || ||| | || ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  26792716 aagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttaagagtcactcctatgactagtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 26792815  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||| ||  |||| ||  |||| | ||| || || ||||||||||| |||||| | || ||    
T  26792816 ccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgatggcttaccgagtggatttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgtttt 26792915  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26792916 ccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 26792960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 15576564 - 15576469
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15576564 aaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 15576469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 8274725 - 8274820
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8274725 aaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 8274820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 263
Target Start/End: Original strand, 12854360 - 12854425
Alignment:
Q  198 tgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  12854360 tgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 12854425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 13975371 - 13975466
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| || ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  13975371 aaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgttttgaagtgtaggaagttgactcct 13975466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 16743029 - 16743124
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||| ||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16743029 aaggatattgagtgtcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 16743124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 125
Target Start/End: Original strand, 15016061 - 15016184
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| | ||  | ||||||| |||  | |    
T  15016061 aagcgtaggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggatgagcactaaagtcgaagaaactaa 15016160  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatc 125  Q
    |||| | |||||||| ||||||||    
T  15016161 ctccgaggtttattgctccgtatc 15016184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 61)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24364471 - 24364209
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  24364471 caagcggagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgtgcgctgaagtcgagaaagttg 24364372  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24364371 actcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 24364272  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24364271 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccaagggatgatg 24364209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 10469071 - 10469333
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10469071 caagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgcattgaagtcgaggaagttg 10469170  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  10469171 actccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacctgcatgatgtgt 10469270  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10469271 ttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgattccaagggatgatg 10469333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 22796854 - 22797116
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  22796854 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaggaagttg 22796953  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22796954 actcctaagtttattggtctgtatcatatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgt 22797053  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || || |||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  22797054 ttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgcagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 22797116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21471660 - 21471398
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| || | |||||||    
T  21471660 caagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggggtaggacgtgcgttgaaatctaagaagttg 21471561  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21471560 actccgaagtttattgatccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgt 21471461  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  21471460 ttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgattccaagagatgatg 21471398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25750868 - 25750606
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||||| |||||||| | |||||||    
T  25750868 caagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcttgtgacgggtgtaagacgtgcgttgaagtctaagaagttg 25750769  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  25750768 actccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatatgt 25750669  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  25750668 ttcatgtgtcgcatcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 25750606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 252
Target Start/End: Original strand, 8766386 - 8766621
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||  | || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  8766386 cttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctgagggttacttctatgacaagggtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatcg 8766485  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||    
T  8766486 gtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcttacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaact 8766585  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattcc 252  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  8766586 tcgaaagtatgtagcggatccttcgcatgttattcc 8766621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 14131401 - 14131663
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||| | |||||||    
T  14131401 caagcgtaggaaggacctggagtttcaggaaggagatcatgtgtttctgagggtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcattgaagtctaagaagttg 14131500  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  14131501 acttcgaagtttattggtccgtatcagatatctgagagagttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacaacatctttcgaatttgcatgatgtgt 14131600  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    | ||||| || ||| | |||||||||||  |||||||||| | ||| ||||| || |||||||    
T  14131601 tccatgtgtcgcagttacggaagtatgtaacggatccttcgcctgttattcctagagatgatg 14131663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 27560855 - 27561101
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27560855 cttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattg 27560954  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || ||| |    
T  27560955 gtccgtatcagatttcagagaggattggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgttccacgtgtcacagtt 27561054  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  27561055 gcggaagtatgtagcagacccttcgcatgtcattccgagagatgatg 27561101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 28283051 - 28283297
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  28283051 cttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattg 28283150  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    | ||||||||||||||||||||  | || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| |    
T  28283151 gcccgtatcagatttcagagaggatcgggacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcacgatgtgtttcacgtgtcacagtt 28283250  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  28283251 gcggaagtatgtagcagatccttcgcatgttattccgagagatgatg 28283297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15459395 - 15459133
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15459395 caagcgtaggaaagatcttgagtttcaggaaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttg 15459296  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| || || |    
T  15459295 actccaaagttcattggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagtgggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtat 15459196  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || ||| | |||||||||||  | |||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  15459195 ttcatgtatcacagttgcggaagtatgtacctgatccttcgcatgttattccaagagatgatg 15459133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25768250 - 25768023
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||    
T  25768250 caagcgtaggaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcttatgacgggtgtaggacgtgcgttgaagtctaagaaattg 25768151  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  25768150 acttcaaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttccaatttgcatgatgtgt 25768051  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgt 228  Q
    |||| || || |||||||||||||||||    
T  25768050 ttcacgtgtcgcagcttcggaagtatgt 25768023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 172
Target Start/End: Original strand, 14381705 - 14381860
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14381705 cttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattg 14381804  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgcca 172  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14381805 gtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgcca 14381860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 22078917 - 22079158
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactccta 107  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22078917 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgattggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccta 22079016  T
Q  108 agtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgt 207  Q
      |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22079017 gatttattcgtccgtatcagatatcggaaagagttggtacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 22079116  T
Q  208 ttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     |  || ||||||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  22079117 gtagcaacttcggaagtatgttcctgatccatcccatgtgat 22079158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 27331671 - 27331903
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| || || ||||| || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |  |||||||    
T  27331671 cttgagtttcaagaaggggatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtaaaggaagttgactccgagatttattg 27331770  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| || || ||    
T  27331771 gtccatatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttgatgtgtcgcaact 27331870  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    |||||||||||||  |||||| || ||||||||    
T  27331871 tcggaagtatgttctggatccatcccatgtgat 27331903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 27392411 - 27392643
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| || || ||||| || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |  |||||||    
T  27392411 cttgagtttcaagaaggggatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtaaaggaagttgactccgagatttattg 27392510  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| || || ||    
T  27392511 gtccatatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttgatgtgtcgcaact 27392610  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    |||||||||||||  |||||| || ||||||||    
T  27392611 tcggaagtatgttctggatccatcccatgtgat 27392643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Original strand, 21564361 - 21564616
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactccta 107  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || || || | |||||||||||| |    
T  21564361 aggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctttgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccga 21564460  T
Q  108 agtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgt 207  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||| || |||||||||||    
T  21564461 agtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcgtatagagtgggtttgccgcctcatctttagaatttgcatgacgtgtttcatgt 21564560  T
Q  208 ttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     || ||  | |||||||||||  |||||||||| ||| | ||||| || |||||||    
T  21564561 gtcacaattacggaagtatgtaccggatccttcgcatattattcctagagatgatg 21564616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19879357 - 19879095
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| || | ||||| || ||||| ||||| || | |||||||    
T  19879357 caagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatggcaggtgtaggccgtgcattgaaatctaagaagttg 19879258  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||    
T  19879257 actccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagggtgggtttaccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgt 19879158  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    | ||||| || ||| | |||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  19879157 tccatgtgtcacagttgcggaagtatgtaccggatccttcgcatgttattccaagagatgatg 19879095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 34645808 - 34646070
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || | |||||||    
T  34645808 caagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagggtcactcctatgacaggtgtgggtcgtgcattaaaatctaagaagttg 34645907  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  34645908 actccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaactgtggcgtatagaattggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgt 34646007  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || ||| | |||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  34646008 ttcatgtgtcacagttgcggaagtacgtacctgatccttcgcatgttattccaagagatgatg 34646070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Original strand, 5839442 - 5839703
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||    ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||    
T  5839442 aagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacacgtttttgagagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcgttgaagtctaagaagttga 5839541  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||    
T  5839542 cttcgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagttggtttaccaccgcatctttcgaatttacatgatgtttt 5839641  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     ||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  5839642 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccagagtgatgatg 5839703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17032574 - 17032373
Alignment:
Q  48 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 147  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||    
T  17032574 tgagagtcactcctatgactggtgtgggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaac 17032475  T
Q  148 agtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtg 247  Q
     ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17032474 ggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtg 17032375  T
Q  248 at 249  Q
    ||    
T  17032374 at 17032373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 17415529 - 17415365
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||    
T  17415529 cttgagtttcaagagggagatcatgtgtttatgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattg 17415430  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctt 181  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17415429 gtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccgcatctt 17415365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12498084 - 12497837
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| || | ||||||||    
T  12498084 aagcgcaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttga 12497985  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  12497984 ctccgagatttattggtccgtaacagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttt 12497885  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12497884 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 12497837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 12510817 - 12511064
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| || | ||||||||    
T  12510817 aagcgcaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttga 12510916  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  12510917 ctccgagatttattggtccgtaacagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttt 12511016  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12511017 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 12511064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 25610084 - 25610331
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||  | ||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25610084 aagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacatgtttttgagagtcacacctgtgaccggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 25610183  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
     ||| |  ||||||||||||||| |||| || || |||||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  25610184 ttccgagatttattggtccgtattagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgtgttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcgcgatgtgtt 25610283  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    |||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  25610284 tcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtatcggatccatcccatgtgat 25610331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Original strand, 16963590 - 16963851
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  16963590 aagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccaagtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtaaaagaagttga 16963689  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  ||||||||||| |||||||| || || | |||||| ||  |||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16963690 ctccgagatttattggtccatatcagatatcggaaatagttggaacgatggcgtatcgtgttggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtatt 16963789  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     ||||| || || ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  16963790 acatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtaccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 16963851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19864733 - 19864484
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||||||||| || || || || || ||| | || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||    
T  19864733 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttttttagagtcactcctgtgactggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 19864634  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||||||| || ||    
T  19864633 ttggtccgtatcagatatcggaaagatttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgtatgatgtctttcatgtgtcgca 19864534  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  19864533 acttcagaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 19864484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 1543319 - 1543551
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  1543319 gatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtagggcgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 1543418  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||| ||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || ||    
T  1543419 ttggtctgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgca 1543518  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  1543519 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 1543551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 263
Target Start/End: Original strand, 25765573 - 25765773
Alignment:
Q  63 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagt 162  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| || || |||||||| || ||||  ||| ||||    
T  25765573 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtctgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggtgtatcgagt 25765672  T
Q  163 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgat 262  Q
     || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||||||    
T  25765673 gggattaccaccgcatctttcgaacttgcacgatgtgttccatgtgtcgtaactttggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 25765772  T
Q  263 g 263  Q
    |    
T  25765773 g 25765773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12505413 - 12505166
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| || | ||||||||    
T  12505413 aagcgcaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttga 12505314  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||  || || ||||| ||    
T  12505313 ctccgagatttattggtccgtaacagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgatttttcatgatgtttt 12505214  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12505213 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 12505166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 11287820 - 11288082
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||||| ||| |||||||||| || ||||| || || || | |||||||    
T  11287820 caagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcacccctatgacgggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttg 11287919  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| || ||||    
T  11287920 actccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagggtgggtttaccccctcatctttcaaatttgcatgacgtgt 11288019  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    | ||||| || ||| | ||||| |||||  ||||| |||| ||||| ||||| || |||||||    
T  11288020 tccatgtgtcacagttgcggaactatgtaccggattcttcgcatgttattccaagagatgatg 11288082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 249
Target Start/End: Original strand, 21833250 - 21833451
Alignment:
Q  48 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 147  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |     
T  21833250 tgagagtcactcctgtgactggtgttggaggtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttataggtccgtatcagatatcggaaagagttggaat 21833349  T
Q  148 agtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtg 247  Q
     ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21833350 ggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtg 21833449  T
Q  248 at 249  Q
    ||    
T  21833450 at 21833451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27187494 - 27187245
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    |||||||| || |||||||| ||| |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27187494 aagcgaagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttga 27187395  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    | || || || |||||||| ||||||||||  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || |  ||||||||||| |||||| |||| ||    
T  27187394 ccccgaaattcattggtccatatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgcagcatctttcgaatttgcacaatgtttt 27187295  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
     ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  27187294 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 27187245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 251
Target Start/End: Original strand, 27261746 - 27261995
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    |||||||| || |||||||| ||| |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27261746 aagcgaagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttga 27261845  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    | || || || |||||||| ||||||||||  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || |  ||||||||||| |||||| |||| ||    
T  27261846 ccccgaaattcattggtccatatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgcagcatctttcgaatttgcacaatgtttt 27261945  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
     ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  27261946 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 27261995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 28263432 - 28263669
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||| ||| |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  28263432 gatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 28263531  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || ||    
T  28263532 ttggtccgtatcagatattggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgca 28263631  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  28263632 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 28263669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 28342181 - 28342418
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||| ||| |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  28342181 gatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 28342280  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || ||    
T  28342281 ttggtccgtatcagatattggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgca 28342380  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  28342381 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 28342418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18794742 - 18794487
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactccta 107  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || | |||||||||||| |    
T  18794742 aggaaagaccttcagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgccttaaaatctaagaagttgactccga 18794643  T
Q  108 agtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgt 207  Q
    |||||||||| || |||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  18794642 agtttattggcccatatcagatatctaagagggttggaacagtggcatatcgagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgt 18794543  T
Q  208 ttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     || ||  | || ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  18794542 gtcacaattacgaaagtatgtaccggatccgtcgcatgttattcctagagatgatg 18794487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 22762690 - 22762925
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || |  ||||    
T  22762690 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttgtgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgaccccgagattta 22762789  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||| ||  |||| |||  ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| || ||    
T  22762790 ttggtccgaatcagatatcggaaagagttggaacgatggcgtatcaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcactttgtgtttcatgtgtcgca 22762889  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  22762890 acttcggaagtatgtatcggatccctcccatgtgat 22762925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23078527 - 23078280
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| || || |||||||| | ||||||||    
T  23078527 aagcgtaggaaagaccttgagtttcaagagggagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttgggcgcgcattgaagtcaaagaagttga 23078428  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||| || |||||||||| || || ||||||   || ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  23078427 ctccgagatttatttgttcgtatcagatatcggaaagagtttaaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcaagaagtatt 23078328  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23078327 acatgtatcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 23078280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Original strand, 16927863 - 16928124
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16927863 aagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgactagtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 16927962  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||| |  |||| || ||||| ||||||||||| | ||||||| | ||    
T  16927963 ctccgagatttattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcgtatcgtcttggattaccaccgcatctttcgaattcgcacgatatatt 16928062  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     ||||| || || ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  16928063 acatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtaccggatccatctcatgtgatacagagtgatgatg 16928124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25112598 - 25112366
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| |||| || ||||| |    
T  25112598 gatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagctgaccccgaagttca 25112499  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||| || || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || ||    
T  25112498 ttggtccgtatcagatattggaaagagtcggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgca 25112399  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     |||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25112398 acttcagaagtatgttccggatccatctcatgt 25112366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 29592155 - 29592387
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  29592155 gatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 29592254  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || |||||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  29592255 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 29592354  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29592355 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 29592387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 11280727 - 11280989
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||  |||| ||| |||| ||||| |||| ||| || || || | |||||||    
T  11280727 caagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagaatcacacctatgacaggtgtaggacatgcattaaaatctaagaagttg 11280826  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| || ||||    
T  11280827 actccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagggtgggtttaccccctcatctttcaaatttgcatgacgtgt 11280926  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    | ||||| || ||| | ||||| |||||  ||||| |||| ||||| ||||| || |||||||    
T  11280927 tccatgtgtcacagttgcggaactatgtaccggattcttcgcatgttattccaagagatgatg 11280989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Original strand, 24313397 - 24313635
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactccta 107  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || |    
T  24313397 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 24313496  T
Q  108 agtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgt 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || || |||||    
T  24313497 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 24313596  T
Q  208 ttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24313597 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 24313635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 28292607 - 28292844
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||| ||| |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| || ||||| |    
T  28292607 gatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagttaaagaagttgaccccgaagttca 28292706  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    ||||||| ||||||||||  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || ||    
T  28292707 ttggtccatatcagattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgca 28292806  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  28292807 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 28292844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 18197789 - 18197997
Alignment:
Q  21 agtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtcc 120  Q
    ||||||| |||||  ||||||| |||||||  ||||||| | ||||  |||| ||||| |  |||||||| | |||||||||||| | |||||||||||     
T  18197789 agtttcaagagggatatcatgtatttctgaaagtcactcttgtgacaagtgtaggacgcgaattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtct 18197888  T
Q  121 gtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcgg 220  Q
    |||| |||| || || ||| ||   |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  18197889 gtataagatatcggaaagaatttaaacagtggcgtatcgagtgggtttgccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtttcgcaacttcgg 18197988  T
Q  221 aagtatgtt 229  Q
    |||||||||    
T  18197989 aagtatgtt 18197997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1640718 - 1640596
Alignment:
Q  141 ttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttc 240  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||    
T  1640718 ttgggacagtggcatatagagtggatttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtacgtagcggatccttc 1640619  T
Q  241 tcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     ||||| ||||| || |||||||    
T  1640618 acatgttattccaagagatgatg 1640596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 48 - 246
Target Start/End: Original strand, 2875072 - 2875270
Alignment:
Q  48 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 147  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||| ||    
T  2875072 tgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaataagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaac 2875171  T
Q  148 agtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
    |||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || || ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  2875172 agtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 2875270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Original strand, 18408166 - 18408391
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || |  || || || ||| |||| || |||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  18408166 aagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtatttttgagagtaactcgtgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttga 18408265  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| | || || || ||||| || |||||||| |||||| |||||||    
T  18408266 ctccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgggtgggattaccaccgcacctttcgaatttgcactatgtgtt 18408365  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatg 227  Q
    |||||| || || ||||| |||||||    
T  18408366 tcatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 18408391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 16626952 - 16627184
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  16626952 gatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 16627051  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || |||||| |||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  16627052 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 16627151  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16627152 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 16627184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 18801001 - 18800857
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||  |||||||||| | |||||    
T  18801001 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggggatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaagacgtgaattgaagtcgaagcagttg 18800902  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggt 145  Q
    ||| | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  18800901 acttcaaagttcattggtccatatcagatatcagagagggttggt 18800857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18787809 - 18787696
Alignment:
Q  139 agttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatcct 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||||    
T  18787809 agttggaacagtggcatatagagtgggtttgccatcacatatttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtagcggatcct 18787710  T
Q  239 tctcatgtgattcc 252  Q
    || ||||| |||||    
T  18787709 tcgcatgttattcc 18787696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22433920 - 22433794
Alignment:
Q  137 agagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatc 236  Q
    |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||    
T  22433920 agagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatc 22433821  T
Q  237 cttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    | ||||||||||| | ||| |||||||    
T  22433820 catctcatgtgatccagagtgatgatg 22433794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 25751005 - 25750901
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| || | ||||| |    
T  25751005 caagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcctgtgacgggtgtaggacgtgcgttgaaatctaagaagtgg 25750906  T
Q  101 actcc 105  Q
    |||||    
T  25750905 actcc 25750901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 16098099 - 16098004
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| || |  ||| |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16098099 aaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaaacctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 16098004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 1649016 - 1649111
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| || ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  1649016 aaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtgggaagttgactcct 1649111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 16382605 - 16382700
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  16382605 aaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcct 16382700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 18838140 - 18838235
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| || |||| | |||| |||| |||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  18838140 aaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgtgggtgaatcctgtgaccggtgttggtcatgctttgaagtgtaggaagttgactcct 18838235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 23996300 - 23996202
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    ||||||||| |||||||||| |  |||||||| || ||| | ||||| | |||| |||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23996300 aggaaggatattgagtttcaagttggtgatcacgtgtttttaagggtgaatcctatgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 23996202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 15078596 - 15078691
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| | ||||||||||  ||||||||||| ||| ||||  | | |||  |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15078596 aaggatatcgagtttcaggttggtgatcatgtatttttgagactgaatccagtgactggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 15078691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 18571700 - 18571605
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | || | |||| | |||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  18571700 aaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcatgtgaccgatgttggtcgtgctttgaagtataggaagtagactcct 18571605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 25743319 - 25743414
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||||||| |  |||||||| || ||| ||||||  | || | |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25743319 aaggatattgagtttcaagttggtgatcaagtgtttttgagggagaatcttgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 25743414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 16793 - 17055
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  16793 caagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgtcggtcgtgctttgaagtcgagaaagttg 16892  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16893 actcctaagttcattggtccgtattagatttcagagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgt 16992  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16993 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttcacatgtgattccaagggatgatg 17055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 38967 - 39233
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  38967 caagcgaagaaaggatcttgaatttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgtcggtcgtgccttgaagtcgaggaagttg 39066  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  39067 actcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggagcagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcacgaagtgt 39166  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatgatgt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39167 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattcagagggatgatgatgt 39233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16902 - 16640
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16902 caagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgcattgaagtcgaggaagttg 16803  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16802 actcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaatagtggcatatagtgttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 16703  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16702 ttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgattccaagggatgatg 16640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 25961 - 26207
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  25961 cttgagtttcaagagggggatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggatgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattg 26060  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  || || ||    
T  26061 gtccgtatcagatatcaaaaagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcaaacttgcatgatgtgtttcatgcgtcgcaact 26160  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  26161 tcggaaatatgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatg 26207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26487 - 26225
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26487 caagtgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 26388  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26387 actcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggtgggaacagtggcttatagagctggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgt 26288  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26287 ttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtggcggatctttcgcatgtgattccaagggatgatg 26225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 42413 - 42675
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  42413 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggaagtgcattgaagtcgaggaagttg 42512  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  42513 actccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcttgatgtgt 42612  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  42613 tccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 42675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 47479 - 47741
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||    
T  47479 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggaaatgcattgaagtcgaggaagttg 47578  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  47579 actccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcttgatgtgt 47678  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  47679 tccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 47741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 2309 - 2252
Alignment:
Q  68 ggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatc 125  Q
    |||||||||||||| ||||| || | |||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  2309 ggtgttggacgtgcattgaaatcaaagaagttgactctgaggtttattggtccgtatc 2252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 42990 - 42747
Alignment:
Q  20 gagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  42990 gagtttcaggagggtgatcatgtttttcttagggtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtc 42891  T
Q  120 cgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcg 219  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  42890 cgtatcagatttcagagaaggttggaacagtggcttatagagttggtttgccaccacatcttttgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcg 42791  T
Q  220 gaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  42790 gaagtatctagcggatccttcacatgttattccaagggatgatg 42747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 248820 - 248577
Alignment:
Q  20 gagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  248820 gagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtc 248721  T
Q  120 cgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcg 219  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||    
T  248720 cgtatcagatttcagagaaagttggaaaagtggcttatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcg 248621  T
Q  220 gaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  248620 gaagtatgtagcagatccttcacatgttattccaagggatgatg 248577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 117794 - 117532
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  117794 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgagtgtgggacgtgcattgaagtcgaggaagttg 117695  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  117694 actccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgt 117595  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  117594 ttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 117532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 322930 - 322668
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  322930 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttg 322831  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  322830 actccaaagttcattggtccatatcagatatcagagagggttggaacaatggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgt 322731  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  322730 ttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagtggatccttcgcatgttattccaagagatgatg 322668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Original strand, 203549 - 203810
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||||| | |||| |||| ||| |||||||||||| | | ||||||||    
T  203549 aagcgcaggaaagaccttgaatttcaagaaggagaccatgtgtttctaagagtcactcttgtgacaggtgctggccgtgctttgaagccaaagaagttga 203648  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    | || | ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  203649 cgccgaggtttattggtccgtatcagatatctaaaagagttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 203748  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||| || || ||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  203749 tcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtattggatccatcgcatgtgattccgagggatgatg 203810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 386029 - 385783
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||  ||||||||| ||  |||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| |    
T  386029 cttgagtttcaagagggagatcatctatttctgagagtcactcctacgacgggtgtaggttgtgcgttgaagtataagaagttgactccgaagtttatag 385930  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    || | || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  385929 gttcataccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaact 385830  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  385829 tcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgattccgtgagatgatg 385783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 112238 - 111985
Alignment:
Q  10 gaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaag 109  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| | |    
T  112238 gaaggaccttgagtttcaggaaggagaccatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactcccagg 112139  T
Q  110 tttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgttt 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  112138 tttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgt 112039  T
Q  210 ctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    | || |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  112038 cgcaacttcagaagtatgtttcggatccatctcatgtgatcccaagagatgatg 111985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 195783 - 196044
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  195783 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtttt-ctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaggaagttg 195881  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  195882 actccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagaaggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgt 195981  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  195982 ttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 196044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 148768 - 148534
Alignment:
Q  29 gagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcaga 128  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  148768 gagggtgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcaga 148669  T
Q  129 tttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgt 228  Q
    | | |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  148668 tatgagagagggttggaacagtggcatacagagtaggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 148569  T
Q  229 tgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  148568 agcggatccttcgcatgttattccaagagatgatg 148534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 56 - 263
Target Start/End: Original strand, 68575 - 68782
Alignment:
Q  56 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcat 155  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  68575 actcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcat 68674  T
Q  156 atagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgag 255  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  68675 acagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgag 68774  T
Q  256 ggatgatg 263  Q
     |||||||    
T  68775 agatgatg 68782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 26614 - 26861
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| || ||| |||| || |||||| |||| ||||||||||| || |||||||  | ||||||||    
T  26614 aagcgtaggaaagaccttgagttccaggaaggagatcacgtatttttgagagttactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtgaaagaagttga 26713  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||  || ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  26714 ctccgaggtttattggcccgtatcagatatcagaaaggattgaaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttccatgatgtgtt 26813  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    | |||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26814 tgatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 26861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 122040 - 122135
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  122040 aaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 122135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Original strand, 14332 - 14593
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14332 aagcgtaggaaggcccttgagttttaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttga 14431  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14432 ctccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtt 14531  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||| || || || ||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  14532 tcaggtgtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccttcgcatgttatttcgagagatgatg 14593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 83 - 263
Target Start/End: Original strand, 9039 - 9219
Alignment:
Q  83 ttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9039 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatcttt 9138  T
Q  183 cgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  9139 cgaacttgcatgatgtgtttcaggtgtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccttcgcatgttatttcgagagatgatg 9219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Original strand, 17218 - 17473
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactccta 107  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  17218 aggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttcttagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaa 17317  T
Q  108 agtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgt 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17318 agttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcatgatgtgtttcatgt 17417  T
Q  208 ttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  17418 gtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 17473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Original strand, 13448 - 13703
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactccta 107  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  13448 aggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctaagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaa 13547  T
Q  108 agtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgt 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  13548 agttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcatgatgtgtttcatgt 13647  T
Q  208 ttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  13648 gtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 13703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20193 - 19947
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||    
T  20193 cttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcgttgaagtcgaagaagtttactccaaagttcattg 20094  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || ||    
T  20093 gtccgtatcagatatcagagaaggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatggcgtgtttcatgtgtcgcaact 19994  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||    
T  19993 tcggaagtatgtagcggatcctttgcatgttattccaagagatgatg 19947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 11107 - 10852
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactccta 107  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  11107 aggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttcttagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaa 11008  T
Q  108 agtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgt 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  11007 agttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcatgatgtgtttcatgt 10908  T
Q  208 ttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  10907 gtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 10852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Original strand, 486 - 741
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactccta 107  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  486 aggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttcttagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaa 585  T
Q  108 agtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgt 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  586 agttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatggcgtgtttcatgt 685  T
Q  208 ttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     || || |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||    
T  686 gtcgcaacttcggaagtatgtagcggatcctttgcatgttattccaagagatgatg 741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Original strand, 7897 - 7995
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| |||| || | |||| |||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7897 aggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 7995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 57912 - 58158
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  57912 cttgagtttcagaagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattg 58011  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  58012 gtctgtatcagatttcagagaggattggaacggtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagct 58111  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  58112 tcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 58158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 49113 - 49375
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| || || ||| |||| ||||| ||| |||| |||||||| | |||||||    
T  49113 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggaaatcatgtgtttctgagagtaacacctatgacaggtgtaggaagtgcgttgaagtctaagaagttg 49212  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||    
T  49213 actccaaagtttattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagcggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaattttcataatgtgt 49312  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  49313 ttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 49375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20332 - 20088
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| || |    
T  20332 cttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcttatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcg 20233  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  20232 gtccgtatcagatttcagagagtgttggaattgtggcctatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagct 20133  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatga 261  Q
    || ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  20132 tcagaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatga 20088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 43715 - 43471
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |    
T  43715 cttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgaccggggtaggacgtgcattgaattcgaggaagttgactccaaagttcatcg 43616  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  43615 gtccgtatcagatttcagagagggttggaactgtggcctatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagct 43516  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatga 261  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  43515 tcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattcagagagatga 43471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 44727 - 44483
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |    
T  44727 cttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgaccggggtaggacgtgcattgaattcgaggaagttgactccaaagttcatcg 44628  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  44627 gtccgtatcagatttcagagagggttggaactgtggcctatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagct 44528  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatga 261  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  44527 tcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattcagagagatga 44483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 63 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 36219 - 36021
Alignment:
Q  63 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagt 162  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||    
T  36219 tgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagtgttggaattgtggcctatagagt 36120  T
Q  163 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatga 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||||    
T  36119 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcaagatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtttttccgagagatga 36021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 261
Target Start/End: Original strand, 49303 - 49547
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| || |    
T  49303 cttgagtttcaagagggtgatcatgtgtttctgagggtcattcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcatcg 49402  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  49403 gtccgtatcagatttcagagagggttggaactgtggcctatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgttacatgtatcgcagct 49502  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatga 261  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  49503 tcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatga 49547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 4235 - 4481
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||| | || || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  4235 cttgagtttcaagagggggatcatgtgtttttaagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatcg 4334  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||    
T  4335 gtccgtatcagatttcaaagagggttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaact 4434  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  4435 tcggaagtatgtagcggatccttcacatgttattccgagagatgatg 4481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 260518 - 260272
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  260518 cttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttaaaatcgaggaagttgactccgaagttcattg 260419  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||  || | || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  260418 gtccgtatcagatttcagagaggattagaacggtggcatatagagtttgtttgccaccatatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagct 260319  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  260318 tcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 260272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 251
Target Start/End: Original strand, 164790 - 165039
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  164790 aagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttga 164889  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    || | | ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||| |||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  164890 cttcgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggttcaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgtgtt 164989  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
    |||| | || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  164990 tcatatgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgattc 165039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 262
Target Start/End: Original strand, 278923 - 279171
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||    
T  278923 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtgggacaagctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 279022  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  279023 taggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgca 279122  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgat 262  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  279123 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgattcagagtgatgat 279171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 308872 - 308640
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||| || || |||||||    
T  308872 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttaaccccaaagttta 308773  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || || ||||| ||  |    
T  308772 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgta 308673  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  308672 acttcgaaagtatgttctggatccatctcatgt 308640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 21767 - 22013
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  21767 cttgagtttcaagagggtaaccatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgattccgaagttcattg 21866  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||    
T  21867 gtccgtataagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaact 21966  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||    
T  21967 tcggaagtatgtagcggatccttcggatgttattccgagagatgatg 22013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19346 - 19084
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  19346 caagcggagaaaggaccttgagtttcaggatggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtcgaggaagttg 19247  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| || || |||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  19246 actccaaaattcattggttcgtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgttgtgt 19147  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || || |||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||    
T  19146 ttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgcagcggatccttcgcatgttattccgggagatgatg 19084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Original strand, 58493 - 58668
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactccta 107  Q
    |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||| |||| | ||||| | |||| |||||||||| |||  |||| || | |||  ||||||| |    
T  58493 aggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagccactcatgtgaccggtgttggacatgcactgaaatcaaagaaactgactccga 58592  T
Q  108 agtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttc 183  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  58593 ggtttattggcccgtatcagatttcagaaagaattgggacggttgcgtatagagtgggtttaccaccgcatctttc 58668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 263
Target Start/End: Original strand, 59030 - 59114
Alignment:
Q  179 ctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  59030 ctttcaaacttacatgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggatgtatgtttcggatccatctcatgtgattccaagagatgatg 59114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 74119 - 74025
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgac 102  Q
    ||||| ||| ||||||||||||  | ||||||||| |||||||| || | |||| | || ||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  74119 aggaaagatattgagtttcaggttgatgatcatgtgtttctgagagtgaatcctgtaaccggtgttggacgtgctttgaagtgttggaagttgac 74025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 10163 - 10425
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  10163 caagcgtaggaaagaccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttg 10262  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  10263 actccaaagttcattggtccatatcagagttcagaaagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgt 10362  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || ||  | |||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  10363 ttcatgtgtcgcaattgcggaagtatgtaccggatccttcgcatgttattccaagagatgatg 10425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 1249 - 1511
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||    
T  1249 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttg 1348  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  1349 actcctaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcataaaaaataggtttgccaccacatctttcgaaattgcatgatgtgt 1448  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||    
T  1449 ttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgaatgttattccgagagatgatg 1511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27745 - 27483
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| |||||||| | |||||||| |||||||    
T  27745 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacaggtgtaggacgtgcatcgaagtcgaagaagttg 27646  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  27645 actccaaagttcattggtccgtataagatatcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttttgaatttgcatgatgtgt 27546  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| |  || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  27545 ttcatgtgttgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatg 27483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 1229 - 1490
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||| |||| |||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||    
T  1229 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagaatcattcctatgacgggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttg 1328  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||||||||| ||| | ||||| |    
T  1329 actccgaagtt-attggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcataaaaagtaggtttgaaaccacatctttcgaatttgaatgatgtat 1427  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  1428 ttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 1490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 47349 - 47091
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||    
T  47349 aagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagggttactcctataacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttga 47250  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  47249 ctcctaagtttattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtt 47150  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatg 260  Q
    |||||| || || ||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  47149 tcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtaacagatccttcgcatgttattccgagagatg 47091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 7318 - 7576
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  7318 caagcgtaggaaggcccttaagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttacttctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttg 7417  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7418 actccaaagttcattggtccgtatcagatttcaga-ag-gttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatatttcgaacttgcatgatgtgt 7515  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| |  || |||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||| || |||||||    
T  7516 ttcatgtgttgcaacttcggaagtatgtagcgga--cttcgcatgttattccaagagatgatg 7576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 12877 - 13123
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||  |||||||||| | |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  12877 cttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtagaacgtgctttgaaatcaaggaagttaactccgaagttcattg 12976  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  12977 gtccgtattagatttcagagaggattggaacggtggcatacagagttggcttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagct 13076  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  13077 tcggaagtatgtagtggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 13123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 52275 - 52521
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  52275 cttgagtttcaggagggcgatcatgtatttctgagggttactcctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattg 52374  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||| ||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||    
T  52375 gtctgtatcagatatctaaaagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaaattgcatgacgtgtttcatgtgtcgcagct 52474  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  52475 tcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 52521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 61309 - 61555
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  61309 cttgagtttcaggagggcgatcatgtatttctgagggttactcctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattg 61408  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||| ||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||    
T  61409 gtctgtatcagatatctaaaagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcagct 61508  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  61509 tcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 61555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 67697 - 67908
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  67697 cttgagtttcaggagggcgatcatgtatttctgagggttactcctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattg 67796  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||| ||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||    
T  67797 gtctgtatcagatatctaaaagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcagct 67896  T
Q  217 tcggaagtatgt 228  Q
    ||||||||||||    
T  67897 tcggaagtatgt 67908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 13997 - 14243
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||| | || || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||    
T  13997 cttgagtttcaagagggggatcatgtgtttttaagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaaattgactccaaagttcattg 14096  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||    
T  14097 gtccgtatcagatatcagaaaggattggaacagtggcatatagagttgggttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaact 14196  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  14197 tcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 14243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 5033 - 5224
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5033 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaggaggatgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttg 5132  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 192  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5133 actccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 5224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39965 - 39703
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||  | ||||| | |||||||    
T  39965 caagcgtagaaaggaccttgagtttcaggagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgcgcactcaagtctaagaagttg 39866  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  39865 actccaaagttcattggtccgtatccgatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctctcgaatttgcatgatgtgt 39766  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  39765 ttcatgtgtcacaacttcggaagtatgtagcggatccttctcatgttattccgagagatgatg 39703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10006 - 9762
Alignment:
Q  19 tgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggt 118  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| || ||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  10006 tgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatggcgggtgtaggacgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggt 9907  T
Q  119 ccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttc 218  Q
    || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || || ||||    
T  9906 ccttatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatcttttgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttc 9807  T
Q  219 ggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  9806 ggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 9762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 308 - 62
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||    
T  308 cttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtatgacgtgctttgaagtctaagaagttgactccaaagttcattg 209  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || || ||    
T  208 gtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaact 109  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  108 tcggaaatatgtagcggatccttcgcatgttattccaagagatgatg 62  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 18617 - 18879
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||    
T  18617 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagttg 18716  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  18717 actcctaagtttattggtttgtatcagatatcagagagggttagaacagtggcatacagagtgggttttccaccacatcttttgaatttgcatgatgtgt 18816  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  18817 ttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattcggagagatgatg 18879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 263
Target Start/End: Original strand, 3629 - 3697
Alignment:
Q  195 atgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  3629 atgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattcggagagatgatg 3697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31636 - 31374
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||| || |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||    
T  31636 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggatatcatgtgtttctgagagttacttctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttg 31537  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  31536 actccaaagttcattggtccgtatcagatatctgataggtttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgt 31437  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||  ||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  31436 tttttgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 31374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14213 - 14038
Alignment:
Q  53 gtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtgg 152  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |  |||||||||| |||| |||| || || |||||||| || ||||    
T  14213 gtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagtagttgactccgagatttattggtctgtatgagatatcggaaagagttggaacggtgg 14114  T
Q  153 catatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgt 228  Q
    | ||| ||||  | || ||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||| || || |||| |||||||||    
T  14113 cgtatcgagtgagattaccaccgcatctttcgaatttgaactatgtgtttcatgtgtcgcaacttccgaagtatgt 14038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1141
Alignment:
Q  19 tgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggt 118  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  1385 tgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggt 1286  T
Q  119 ccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttc 218  Q
    | ||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||    
T  1285 ctgtatcagatatcttagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttc 1186  T
Q  219 ggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||    
T  1185 ggaagtatgtagcggatccttcgtatgttattccgagagatgatg 1141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 68 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 136278 - 136083
Alignment:
Q  68 ggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtt 167  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  136278 ggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtt 136179  T
Q  168 tgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| |||||||    
T  136178 ttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcggatgttatcccgagagatgatg 136083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 96082 - 96344
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  96082 caagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgaccatgtttttttgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttg 96181  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  96182 actccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgt 96281  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || ||| | |||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  96282 ttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtacctgatccttcacatgttattccgagagatgatg 96344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 112785 - 112523
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || | |||||||    
T  112785 caagcgtaggaaggatcttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttg 112686  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||    
T  112685 actccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagggtgggtttaccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgt 112586  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    | ||||| || ||| | |||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  112585 tccatgtgtcgcagttgcggaagtatgtaccggatccttcgcatgttattccaagagatgatg 112523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 109904 - 110141
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  109904 gatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 110003  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    ||||||| |||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || ||    
T  110004 ttggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgtcttccatgtgtcgca 110103  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  110104 acttcggaagtatgttccggatccctctcatgtaattc 110141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27436 - 27192
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||| || |||||| || ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  27436 cttgaatttcaagagggatatcatgtatttctgagagttactcctatgtcgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattg 27337  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  27336 gtccgtatcagatatcagagagggttggaaccgtggcatacagagtgggattgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaact 27237  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatga 261  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  27236 tcggaaatatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatga 27192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 240
Target Start/End: Original strand, 1611 - 1843
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactccta 107  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  1611 aggaaggcccttgagtttcaggtggaagatcatgtatttcggagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaa 1710  T
Q  108 agtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgt 207  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1711 agttcattagtccgtatcagatatcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttcccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgt 1810  T
Q  208 ttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttc 240  Q
     || || |||||||||||||| |||||| ||||    
T  1811 gtcgcaacttcggaagtatgtagcggattcttc 1843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6248 - 6001
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  6248 aagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcacacctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttga 6149  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6148 ctccaagatttattggcccgtatcagatatcggaaagagttgggacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtt 6049  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    || ||| || || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  6048 tcttgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 6001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22910 - 22815
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| |||| || | || | |||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22910 aaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtgaccggtgttggttgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 22815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 4117 - 3866
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| || || |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||    
T  4117 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaagatggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttg 4018  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||    
T  4017 actcctaagttcattggtctgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacatagttgttttgcctccacatctttcgaatttgcattatgtgt 3918  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattcc 252  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  3917 ttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattcc 3866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 417 - 155
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||| ||||||| || ||| |||    
T  417 caagcgtaggaaagaccttgagtttcaggagggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacgggtataggacgtgcgttgaagttgaagaacttg 318  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
T  317 actccaaagttcattggtccgtatcagatttcagaaagagttggaactgtggcatatagagttggtttgcctcctcatctttcgaatttgcatgacgtat 218  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| ||||| ||| | || |||||||    
T  217 ttcatgtgtcgcaattgcggaagtatgtaccagatccttcgcatgttatttcaagagatgatg 155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4085 - 3839
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  4085 cttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgatagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattg 3986  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  3985 gtccatatcagatatctgagagtgttggaacagtggcttacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaact 3886  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  3885 tcggaagtatgtagcggttccttcgcatgttattccaagagatgatg 3839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 6010 - 6255
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  6010 cttgagtttcaagagggagctcatgtgtttctgagggttactcctatgacgggtgtaggtcgtgcattgaagtctaagaagttgactccgaagtttattg 6109  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    |||| || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| || || ||    
T  6110 gtccataccagatatctgagagagttggaactgtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcttgatgt-tttcatgtgtcgcaact 6208  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  6209 tcggaagtatgtagaggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 6255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14295 - 14050
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  14295 cttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggtcgtgcgttgaagtcgaagaagttgactccgaagtttatcg 14196  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    || ||||  |||| || || || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  14195 gttcgtactagatatctgaaag-gttggaacagtggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaact 14097  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    || ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14096 tcagaagtatgtagcggatccttcacatgttattccgagggatgatg 14050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26352 - 26106
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  26352 cttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagtcactcctatgacgggtgtaggccgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattg 26253  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||| || || ||    
T  26252 gtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatcttttgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcgcaact 26153  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || |||| ||| |||||||    
T  26152 tcggaagtatgtagcggatccttcgcaagttattctgagagatgatg 26106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 51943 - 52205
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| | |||||||    
T  51943 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtctaagaagttg 52042  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  52043 actccaaagtttagtggtccatatcagatatctgaaagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgt 52142  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| |  || |||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| || |||||||    
T  52143 ttcatgtgttgcaacttcggaagtatgtagctgatcattcgcatgttattccaagagatgatg 52205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 2961 - 2715
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||| ||||    
T  2961 cttgagtttcaagagggatatcatgtatttatgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctgagaagttgactccaaagttcattg 2862  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  2861 gtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaact 2762  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  2761 tcggaagtatgtagaagatccttcgcatgttattccaagagatgatg 2715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 28192 - 27931
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  28192 aagcgtagaaaggatcttgaatttcaagagggtgatcatgtgtttttgagagttactccggtgactggtgttggacgtgctgtgaagtcaaagaagttga 28093  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
     |||||  |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  28092 atcctagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctt 27993  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  27992 tcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 27931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 91012 - 91274
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||  ||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||    
T  91012 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctacgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttg 91111  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||| | ||||||||| |||| ||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  91112 acttcaaagtttattagtccatattagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtaggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgt 91211  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || || || ||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  91212 ttcatgtgtcgcaactgcggaagtatgtagcaaatccttcgcatgttattccgagagatgatg 91274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 162292 - 162091
Alignment:
Q  48 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 147  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||| || | |||||| | ||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  162292 tgagagtcactcctatgactggtgttggacgagcgtcgaagtcaaagaacttgactccgagatttattggcccgtatcagatatcagaaagagttggaac 162193  T
Q  148 agtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtg 247  Q
     ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||| || ||||||    
T  162192 ggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtttcgcaacttcagaagtatgttccggatccatcccatgtg 162093  T
Q  248 at 249  Q
    ||    
T  162092 at 162091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 448284 - 448037
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || ||| | || ||||||||| | ||   ||||||||| || |||||||| | ||||||||    
T  448284 aagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagatcacgtattttttagagtcactcctgtaactattgttggacgagcattgaagtcaaagaagttga 448185  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| | |||||||||||||||||| || || || ||| |||| || |||||  ||  ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  448184 ctccgaggtttattggtccgtatcaaatatcggaaagaattggaacggtggcgcatcaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtt 448085  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    |||||| || || |||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  448084 tcatgtgtcgcaacttcggaagtattttccggatccatctcatgtgat 448037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 175427 - 175361
Alignment:
Q  63 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagat 129  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  175427 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgatcccgaagtttattggtccgtatcagat 175361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 78719 - 78814
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| |||| || | || | |||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  78719 aaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtgacaggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 78814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Original strand, 25158 - 25413
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactccta 107  Q
    ||||| |||||||| ||||| |  || || ||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |  |    
T  25158 aggaaagatcttgaatttcaagcaggagaccatgtgtttctaagagtcactcctgtgacaggtgttggtcgtgctttgaaatcgaagaagttgacgctga 25257  T
Q  108 agtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgt 207  Q
     |||||||||  |||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25258 ggtttattggctcgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgt 25357  T
Q  208 ttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     || || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  25358 gtcgcaacttcggaagtatgtatcggatccatcacatgtgattccaagggatgatg 25413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 7132 - 7378
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||    
T  7132 cttgagtgtcaagagggagatcatgtgtttctgagggttactcctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagttcattg 7231  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    |||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  7232 gtccataccagatatctgagagagttggaacagtggcttacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaact 7331  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    || ||||||||| ||||||||||| || || ||||| || |||||||    
T  7332 tcagaagtatgtagcggatccttcgcaagttattccaagagatgatg 7378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 6410 - 6158
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttc-tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagtt 99  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  6410 caagcgtaggaaagaccttgagtttcaggaaggtgaccatgtttttcctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagtt 6311  T
Q  100 gactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtg 199  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||||| || ||     
T  6310 gactccaaagttcattggtccttatcagatttcagaaagatttggaactgtggcatatagatttggtttgccatctcttctttcgaatttgcatgacgta 6211  T
Q  200 tttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattcc 252  Q
    |||||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| ||||| |||||    
T  6210 tttcatgtgtcgcaattgcggaagtatgtaccagatccttcgcatgttattcc 6158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Original strand, 25800 - 26061
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||| ||| | || ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| |||||  | |    
T  25800 aagcgtaggaaggactttgagtttcaggaaggaaaccatgtattttttagagtcactcctatgactggggttggacgtgcattgaagtcaaggaaactaa 25899  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25900 ctcggatgtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaaccgtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtt 25999  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  26000 tcatgtgtcacaacttcggaagtatgtttcggatccatctcatgtgattccaagggatgatg 26061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 10829 - 11081
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagt 110  Q
    |||||||||||||| || || || || ||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||| | || ||||| ||||| |||| ||||||||| || | ||    
T  10829 aaggatcttgagttacaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgacaggtataggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacaccgaggt 10928  T
Q  111 ttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttc 210  Q
    |||||||||| |||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||    
T  10929 ttattggtccatatcagatatctgagaaagttggaacagtggcatatagagtggatttgccaccacatctttcgaatttgcataatgtgtttcatgtgtc 11028  T
Q  211 tcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  11029 gcaacttcggaagtatgtagcggatccttcacatgttattccaagagatgatg 11081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 180442 - 180195
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||  |||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  180442 aagcgtagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgtgtttttgagagttactccggtgactggtgttggacctgctttgaagtcaaagaagttga 180343  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||| ||    
T  180342 ctccgagatttattagtccgtatcagatatcagaaagagttagaacagtggcgtatcgagttggcttaccaccgcatctttcgaattttcatgatgtctt 180243  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    ||| || || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  180242 tcaagtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 180195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 5098 - 5344
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||| ||  |||  |||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  5098 cttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagaatcactcctatgacgggtgtaggttgtgtgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattg 5197  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    || |||||||||| ||  |||| ||||| ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||    
T  5198 gttcgtatcagatatctaagagggttggaacactggcatacatagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgaatgatgtgtttcatgtgtcgcaact 5297  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||||||||| || |||| ||| ||||| |||||||| |||||||    
T  5298 tcggaagtatgtagcagatcattcgcatgttattccgagagatgatg 5344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 65630 - 65383
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  65630 aagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggcgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttga 65531  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  65530 ctccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtttt 65431  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  65430 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 65383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 263
Target Start/End: Original strand, 39924 - 40131
Alignment:
Q  56 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcat 155  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||| |  || |||||||| || ||||| |    
T  39924 actcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaatttgactccgagatttattggtccgtatcggatatgggaaagagttggaacggtggcgt 40023  T
Q  156 atagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgag 255  Q
    || ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||    
T  40024 attgagttggattaccaccgcatctttcgaacttgcatgatgtctttcatgtgtcacaacttcggaagtatgtttcggatccatctcatgtgatccagag 40123  T
Q  256 ggatgatg 263  Q
     |||||||    
T  40124 tgatgatg 40131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6239 - 5978
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || || || ||| | || ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  6239 aagcgcaggcaggatcttgagtttcaagagggagaccacgtgtttttaagagtcactcctgtgactggtgtttgacgtgctttgaagtcaaagaagttga 6140  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |  ||||| ||| ||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||    
T  6139 ctccgagatttattggtccgtatcagatattagaaagagttggaatggtggcgtatcgagttggattaccaccgcagctttcgaatttgcatgatgtctt 6040  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  6039 tcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 5978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Original strand, 15160 - 15421
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| | | |||| ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  15160 aagcgtaggaaagaccttgagtttcaggaaggagatcatgtatctttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttga 15259  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||  | ||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15260 ctctaaggttaattggtctgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtt 15359  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || || || |||||||    
T  15360 tcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtttcggatccatctcatgtcatcccaagagatgatg 15421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 5680 - 5932
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagt 110  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||  | ||||||| |||  || |||| | ||    
T  5680 aaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtatttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgagcactaaagtcgaagaaactgtctccgaggt 5779  T
Q  111 ttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttc 210  Q
    ||| |||| ||||||| |||||| | |||||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  5780 ttaatggttcgtatcatatttcataaagagttgggacagttgcgtatagagtgagtttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtc 5879  T
Q  211 tcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     || | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  5880 gcaacatcggaagtatgttccggatccatctcatgtgattccaagggatgatg 5932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14585 - 14338
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  14585 aagcgcaggaaggatcttgagtttcaggaaggataccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttga 14486  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14485 ctccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgggtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtctt 14386  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| ||  | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14385 ccatgtgtcgaaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 14338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 833 - 601
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  833 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 734  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    ||||||| ||||| || |  || |||||||| || ||||| ||   ||| ||||| || || ||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  733 ttggtccatatcaaatattggaaagagttggaacggtggcttaccaagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 634  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  633 acttcgaaagtatgtttcggatccatctcatgt 601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15096 - 14841
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactccta 107  Q
    ||||| || ||||||||||| || || |||||||| ||| |||  ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| |  ||||||||||| |    
T  15096 aggaaagaccttgagtttcatgaaggagatcatgtatttttgatagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaataagttgactccga 14997  T
Q  108 agtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgt 207  Q
     |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14996 ggtttattggtccgtatcaaatatcagaaagaattggaacggtggcgtaccgagtgggcttaccaccgcatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgt 14897  T
Q  208 ttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  14896 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagagatgatg 14841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 219498 - 219745
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |  ||||| || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  219498 aagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaagaagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcgttgaagtcaaagaagttga 219597  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||| |||  ||| || ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  219598 ctccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcaagtgggattaacaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtt 219697  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  219698 tcatgtatcgcaacttcggaagtatgttccagatccatctcatgtgat 219745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 229253 - 229021
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| ||| |||| ||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  ||| |||    
T  229253 cttgaatttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcctattactggtgtgggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttgttg 229154  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||  || | || || ||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||| || || ||    
T  229153 gtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgaatagggttaccaccgcatctttcgaatatgcacgatatgtttcatgtgtcgcaact 229054  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  229053 tcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 229021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 33085 - 33180
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| |  ||| |||| |||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||    
T  33085 aaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaaacctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaagaagttgactcct 33180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4960 - 4770
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||    
T  4960 cttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaaattgactccaaagttcattg 4861  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgt 207  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  4860 gtccgtataagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcaaatttgcatgatgtgtttcatgt 4770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 754 - 492
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| || |||||| |||| ||||| ||  |||| || || || | |||||||    
T  754 caagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagttactcctatgacaggtgtaggcagtgcattaaaatctaagaagttg 655  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  654 actccgaagtttatcggtccgtatcaaatttcagagagggttggaacagtggcttacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgt 555  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    | ||||| ||  | ||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | || |||||||    
T  554 tccatgtgtcggaacttccaaagtatgtagcggatccttcacatgttatttctagagatgatg 492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 889 - 654
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||    
T  889 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 790  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||| |  ||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  789 ttggtccgtatcagatatcggaaagggttggaatggtggcgtatcgtgttggcttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgca 690  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  689 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgat 654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 63 - 310
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| ||| | || ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  63 aagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagatcatgtattttttagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttga 162  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||  |  |||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||| ||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  163 ctctgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagtgttggaacggtggcgtatcgagtgagtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtt 262  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  263 tcatgtatcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17212 - 16965
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || ||| |||| ||||||| | |||   ||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  17212 aagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcatgtgatttgtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttga 17113  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||| |||  ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17112 ctccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtt 17013  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    |||||| || || |||||||||||||||  |||| | |||||||||||    
T  17012 tcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttctggatgcatctcatgtgat 16965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 127280 - 127527
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || || || ||||| || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  127280 aagcgtaggaaagaccttgagttccaagaaggagatcacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttga 127379  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  127380 ctccgagatttattgatccgtatcagatatcagaaagagttggaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttacatgatgtgtt 127479  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  127480 tcatgtatcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 127527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15656 - 15471
Alignment:
Q  63 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagt 162  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| || || |||||||| || ||||||||| ||||    
T  15656 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggttcgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcatatcgagt 15557  T
Q  163 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  15556 aggtttaccaccacat-tttcgaatttgcacgatgtgtttcatgggtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 15471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19075 - 18813
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||  |||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || | |||||||    
T  19075 caagcgtatgaaggaccttgagtttcaagagggagaccatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcattaaaatctaagaagttg 18976  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  18975 actccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttgggacagtggcgtatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgt 18876  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || ||  |  ||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  18875 ttcatgtgtcacaattgtggaagtatgtaccggatccttcgcatgttattcctagagatgatg 18813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 23237 - 23094
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||  |||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || | |||||||    
T  23237 caagcgtatgaaggaccttgagtttcaagagggagaccatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcattaaaatctaagaagttg 23138  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttgg 144  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  23137 actccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttgg 23094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 28849 - 29111
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| || || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| |||||  | |||||||||||||| | |||||||    
T  28849 caagcgtagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgacaggtgtctgtcgtgctttgaagtcaaagaagttg 28948  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    |||||   |||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||     
T  28949 actccacggtttattggtccatatcagatctctgagagagttgggacagtggcatatagagtgggttacccatcacatctctcgaatttgcatgatgtgc 29048  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || || |||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  29049 ttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgtagcagatccttcgcatgttattccaagagatgatg 29111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 40840 - 41102
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| || || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| |||||  | |||||||||||||| | |||||||    
T  40840 caagcgtagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgacaggtgtctgtcgtgctttgaagtcaaagaagttg 40939  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    |||||   |||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||     
T  40940 actccacggtttattggtccatatcagatctctgagagagttgggacagtggcatatagagtgggttacccatcacatctctcgaatttgcatgatgtgc 41039  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||| || || |||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  41040 ttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgtagcagatccttcgcatgttattccaagagatgatg 41102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 37428 - 37166
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||   |||||||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||| |||| ||||| || ||||| |||||||| | |||||||    
T  37428 caagcgtaggaaggccattgagtttcaagggagagatcatgtgtttcttagagtcacccctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttg 37329  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  37328 actccgaagtttattggtctatatcagatatctgaaagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccacctcatctttcaaatttgcatgatgtgt 37229  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    | ||||| || || |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  37228 tacatgtctcgcaacttcggaagtatgtagtggatccttcacatgttattctgagagatgatg 37166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 27417 - 27566
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||    
T  27417 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttg 27516  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagt 150  Q
    ||||  || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  27517 actcaaaaattaattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagt 27566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 38254 - 38403
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||    
T  38254 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttg 38353  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagt 150  Q
    ||||  || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  38354 actcaaaaattaattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagt 38403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 218 - 1
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| |  |    
T  218 aaggatcttgagtttcaagagggttatcatgtgtttttgagagtcaatccggtgactggtgttggacgtgctttgaagtaaaaaaagttgactccgagat 119  T
Q  111 ttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttc 210  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||    
T  118 ttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaatagtggcatatcgagttggtttaccaccgcatctttcaaattttcatgatgtctttcatgtgtc 19  T
Q  211 tcagcttcggaagtatgt 228  Q
     || ||||||||||||||    
T  18 gcaacttcggaagtatgt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1133 - 872
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| | || ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |  | ||| ||||    
T  1133 aagcgtaggaaagaccttgagtttcaggaaggagaccatgtattttttagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaaatgaaagaaattga 1034  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
     ||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| || | ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||    
T  1033 atccgaggtttattggtccatatcagatatcagaaagaattggaacagtggcatatcgattgggtttaccaccgcatctttcgaatatgcatgatgtgtt 934  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||| || || || ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  933 tcacgtgtcgcaactttggaagtatgtttcggatccatctcatgtgattccaagggacgatg 872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7590 - 7358
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  7590 gatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 7491  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  7490 ttggtccgtatcagatattggagagagttggaacggtggcttagcgagtgggtttaccacctcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 7391  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7390 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 7358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 228
Target Start/End: Original strand, 13376 - 13560
Alignment:
Q  44 tttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttg 143  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||| || ||||| ||||    
T  13376 tttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttaattggtaagtatcagatatctgagagggttg 13475  T
Q  144 gtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgt 228  Q
    | |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  13476 gaacagtgacatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 13560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 43367 - 43135
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  43367 gatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtagggcgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 43268  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || ||    
T  43267 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcatactgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgca 43168  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  43167 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 43135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 50594 - 50854
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || | |||||||    
T  50594 caagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttg 50693  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||    
T  50694 actccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagtcgggacagtggcttatagggtgggtttgccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgt 50793  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatga 261  Q
    | || || ||  || | |||||||||||  |||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  50794 tccacgtgtcgtagttgcggaagtatgtaccggatccttcgcatattattcctagggatga 50854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8698 - 8467
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||||||| |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  8698 gatcttgagttttaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 8599  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| |  ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||    
T  8598 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaagggtggcttaccgagtgggtttaccacctcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 8499  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatg 245  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8498 acttcggaagtatgttccggatccatctcatg 8467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 106663 - 106758
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| |||||||| | |||||| ||||  |||||||||||||||    
T  106663 aaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcctgctttaaagtgtaggaagttgactcct 106758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4257 - 4010
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| | || || |||||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||    
T  4257 aagcgtaggaaagaccttgagttttaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttga 4158  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||  |||| || ||||| |||  ||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  4157 ctccgaggtttattggtccatatcagatatcagaaaggattggaacggtggcgtatcaagtgggtttactaccgcatctttcgaatttgcatgatttgtt 4058  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4057 tcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 4010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 32833 - 33080
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||||| ||| |||||||  | ||||||||    
T  32833 aagcgtaggaaagatcttgagttttaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcttgtgactggtgttggacttgcattgaagttaaagaagttga 32932  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    || | |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  32933 cttcgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtt 33032  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33033 tcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttacggatccatctcatgtgat 33080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3365 - 3130
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| || ||| ||||||| || || |||||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||    
T  3365 aagcgtaggaaagaccttaagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttga 3266  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    || | | |||||||||| |||||||||| |  || ||| |||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  3265 cttcgaggtttattggttcgtatcagatatttgaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtt 3166  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatcc 237  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| |||||||    
T  3165 tcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 3130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 78 - 263
Target Start/End: Original strand, 2023 - 2207
Alignment:
Q  78 gtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccaca 177  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  2023 gtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatacagagtgggttttacaccaca 2122  T
Q  178 tctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  2123 tctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcgga-ccttcgcatgttattccaagagatgatg 2207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Original strand, 33654 - 33915
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||  |||  ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  33654 aagcgtaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttattgaaagtcactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttga 33753  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||| |||| || || | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  33754 ctccgagatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattactaccgcatctttcgaatttgcacgatgtttt 33853  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  33854 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccagagtgatgatg 33915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8821 - 8574
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||  |||  ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| |    
T  8821 aagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttattgaaagtcactcttgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttaa 8722  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||    
T  8721 ctccgagatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgaagtttt 8622  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| || || ||| |||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  8621 ccatgtgtcgcaactttggaagtatgttctggatccatctcatgtgat 8574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 106
Target Start/End: Original strand, 44583 - 44631
Alignment:
Q  58 tcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  44583 tcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 44631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 33757 - 34017
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttg 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || | |||||||    
T  33757 caagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttg 33856  T
Q  101 actcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgt 200  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||    
T  33857 actccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagtcgggacagtggcttatagggtgggtttgccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgt 33956  T
Q  201 ttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatga 261  Q
    | || || || ||| | |||||||||||  |||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  33957 tccacgtgtcgcagttgcggaagtatgtaccggatccttcgcatattattcctagggatga 34017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 40474 - 40379
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  40474 aaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcct 40379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Original strand, 357 - 588
Alignment:
Q  18 ttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattgg 117  Q
    |||||||||| || || || ||||| ||| |||| |||| |||| | || |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  ||||||||    
T  357 ttgagtttcaagaaggggaccatgtgtttttgagagtcaatcctgtaaccggtgttggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgagatttattgg 456  T
Q  118 tccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagctt 217  Q
    |||||||||||| ||||| ||  |||| |  ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||    
T  457 tccgtatcagatatcagaaaggattggaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactt 556  T
Q  218 cggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  557 cggaagtatgttatggatccatctcatgtgat 588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5400 - 5199
Alignment:
Q  48 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 147  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  5400 tgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaggaagtcgactccgagatttattggtctgtatcagatatcagaaagagttggaac 5301  T
Q  148 agtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtg 247  Q
     ||||| ||| |||| || || ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||  |||||| |||||||||    
T  5300 ggtggcgtatcgagtgggattaccactgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgtaattatgttctggatccatctcatgtg 5201  T
Q  248 at 249  Q
    ||    
T  5200 at 5199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Original strand, 64112 - 64373
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || || ||| |||| ||||||||| || | || |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  64112 aagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtggctggagttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 64211  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    ||   |  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||    
T  64212 ctgtgagattcattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcatgatgtctt 64311  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  64312 tcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 64373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 10979 - 10837
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || ||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  10979 cttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttcttagggttacttctatgacatgtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatcg 10880  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatag 159  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||    
T  10879 gtccgtatcagatttcagagaggattggaacagtggcctatag 10837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 5438 - 5309
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5438 aagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttga 5339  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagattt 131  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5338 ctccgaagttcattggtccgtatcagattt 5309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9568 - 9341
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || || || || || ||  |||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  9568 aagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagaccacgtattgttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaaggtga 9469  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||| || || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  9468 ctcctagatttattggtctgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcactatgtgtt 9369  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgtt 229  Q
    |||||| || || ||||| |||||||||    
T  9368 tcatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtt 9341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6585 - 6350
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||    
T  6585 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 6486  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| |  |||| |||| |||| || ||  |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||    
T  6485 ttggtccgtatcagatattggaaagagttgggatggtggtatatcgagtgggattaacaccgcatctttcgaatttgcacgatatgtttcatgtgtcgca 6386  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||||||||||||   |||||| || ||||||||    
T  6385 acttcggaagtatgtactggatccatcccatgtgat 6350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17136 - 16921
Alignment:
Q  48 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 147  Q
    |||| ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  |||||| || |||||||||| || || ||||||   ||    
T  17136 tgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatttgttcgtatcagatatcggaaagagttttaac 17037  T
Q  148 agtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtg 247  Q
     ||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  17036 ggtggcgtattgagttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatttcatgtg 16937  T
Q  248 attccgagggatgatg 263  Q
    || | ||| |||||||    
T  16936 atccagagtgatgatg 16921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 16497 - 16744
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||| ||||||||   ||||| || || |||||||| ||| | |||||||||||  |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16497 aagcgtagggaggatcttatatttcaagaaggagatcatgtattttttagggtcactccagtgattggtgttggacgtgcattgaagtcgaagaagttga 16596  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    | || |  ||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| |  ||||| |||   || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16597 caccgagatttattggtccgtataagatatcagaaagaattggaatggtggcgtatcatgtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgtacgatgtgtt 16696  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    |||||| || || |||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  16697 tcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttcgggatccatctcatgtgat 16744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 140 - 263
Target Start/End: Original strand, 3487 - 3610
Alignment:
Q  140 gttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatcctt 239  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |  |||||||||||||| ||||||||||    
T  3487 gttggaacagtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcatgatgtgtatcatgtgtcgctacttcggaagtatgtagcggatcctt 3586  T
Q  240 ctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    | ||||| |||||||| |||||||    
T  3587 cacatgttattccgagagatgatg 3610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 54
Target Start/End: Original strand, 3456 - 3488
Alignment:
Q  22 gtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggt 54  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3456 gtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggt 3488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 16546 - 16793
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||  | |||||||| | ||||||||    
T  16546 aagcgtaggaaagaccttgagtttcaagagggagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcacattgaagtcaaagaagttga 16645  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||  | ||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  16646 ctcagaggtttactggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatatgtt 16745  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| |   | |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16746 ccatgtattaaaacttcagaagtatgttccggatccatctcatgtgat 16793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1508 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1508
Description:

Target: scaffold1508; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 155 - 261
Target Start/End: Original strand, 871 - 977
Alignment:
Q  155 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  871 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcagaagtatgtagcggatccttcacatgttattccga 970  T
Q  255 gggatga 261  Q
    | |||||    
T  971 gagatga 977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 263
Target Start/End: Original strand, 117053 - 117247
Alignment:
Q  69 gtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggttt 168  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||  || ||||| ||| |||| |||||    
T  117053 gtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcaaatatcagaaagaattgtaacggtggcgtatcgagtgggttt 117152  T
Q  169 gccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     |||||  || ||||||| ||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  117153 accaccgtatatttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgtaacttcggaagtatgtttcagatctatctcatgtgattccaagggatgatg 117247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Original strand, 23556 - 23667
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagt 110  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||  | |    
T  23556 aaggatattgagtttcatgttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactccccatt 23655  T
Q  111 ttattggtccgt 122  Q
    ||||||| ||||    
T  23656 ttattggaccgt 23667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 98231 - 98136
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||||||| |  |||||||| || ||| | ||||| | |||| |||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  98231 aaggatattgagtttcaagttggtgatcacgtgtttttaagggtgaatcctatgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 98136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1358 - 1117
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactccta 107  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| | || ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| |    
T  1358 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtattttttagagtcactcctgtgactggtgttcgacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 1259  T
Q  108 agtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgt 207  Q
      ||||||| |||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||  |||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  1258 gatttattgttccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtggatttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttttatgt 1159  T
Q  208 ttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     |  || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  1158 gttgcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgat 1117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Original strand, 916 - 1164
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    ||||||||||| || || || || || |||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||    
T  916 gatcttgagttccaagaaggagaccacgttttt-tgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 1014  T
Q  114 ttggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctca 213  Q
    |||||||||||||||| | ||| | || ||| |  |||| |||| ||||||| || ||||  || |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  1015 ttggtccgtatcagatataagaaaaagatggaaaggtggaatatcgagttggattaccacagcaactttcgaaattgcatgatgtattacatgtgtcgca 1114  T
Q  214 gcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  1115 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 1164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 4486 - 4733
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||  |||  ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| |    
T  4486 aagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttattgaaagtcactcttgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttaa 4585  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||    
T  4586 ctccgagatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgaagtttt 4685  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
     ||||| || || ||| |||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  4686 ccatgtgtcgcaactttggaagtatgttctggatccatctcatgtgat 4733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 624 - 390
Alignment:
Q  17 cttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattg 116  Q
    ||||| |||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || || || ||||    
T  624 cttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaaattcattg 525  T
Q  117 gtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagct 216  Q
    ||||||||||||| |  || |||||||| |||||||| ||  |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||| | || || ||||| || || ||    
T  524 gtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaact 425  T
Q  217 tcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
    ||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  424 tcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattc 390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 131 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 45941 - 45832
Alignment:
Q  131 tcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttg 230  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |    
T  45941 tcagagagggttggaacagtggcatatagagttggttttccaccacatcattcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtag 45842  T
Q  231 cggatccttc 240  Q
    ||||||||||    
T  45841 cggatccttc 45832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 775 - 1021
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||| || || || || || ||| |||| ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  775 aagcgtaggaaagatcttaagtttcaagaaggagaccacgtgttt-tgagagtccctcgtgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 873  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| ||  | |||||||| || ||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  874 ctccgagatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacggtggcgtatcgtgtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcaggatgtgtt 973  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    ||||||    || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  974 tcatgtggagcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgat 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1197 - 983
Alignment:
Q  35 gatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcag 134  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| || |    
T  1197 gatcatgtattcttgagagtcacccctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcggatatcgg 1098  T
Q  135 agagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcgga 234  Q
    | |||||||| ||  |||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||| |||||||||  |||    
T  1097 aaagagttggaacgttggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtctttcatgtaacgcaacttcgaaagtatgttctgga 998  T
Q  235 tccttctcatgtgat 249  Q
    ||| ||| |||||||    
T  997 tccatcttatgtgat 983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 49667 - 49513
Alignment:
Q  53 gtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtgg 152  Q
    ||||||||| |||  | ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||    
T  49667 gtcactcctgtgattgttgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggcccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtgg 49568  T
Q  153 catatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgt 207  Q
    | ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49567 cgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 49513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 251
Target Start/End: Original strand, 86591 - 86834
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactccta 107  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  | ||||| ||| | || ||||||| | |||| ||||||||||||||  | || || | |||  ||||| | |    
T  86591 aggaaggatcttgagtttcaagaaggataccatgtgttttttagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgcactaaaatcaaagaaactgacttcga 86690  T
Q  108 agtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgt 207  Q
     ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | || || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||    
T  86691 ggtttattggcccgtatcaaatttcggaaagagttgggtcggttgcgtatagagtgggtttaccaccgcaactttcgaacctacatgatgtgtttcatgt 86790  T
Q  208 ttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattc 251  Q
     || || ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  86791 gtcacaacttcggaagtatgtttcagatccatctcatgtgattc 86834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22086 - 21932
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactccta 107  Q
    |||||||||||||||||||| || || || || || ||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  22086 aggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgcgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 21987  T
Q  108 agtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagt 162  Q
      |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| ||||    
T  21986 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 21932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 9195 - 9053
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  9195 aagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggggatcatgtatttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgtgcgttgaagtcaaagaagttga 9096  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttgg 144  Q
    |||| |  |||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||    
T  9095 ctccgagatttattggtctgtatcagatatcagaaagaattgg 9053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7045 - 6955
Alignment:
Q  159 gagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7045 gagtgggtttgccaccgcatgtttcgaatttgcatgatgtgtttcaagtgtcacaacttagaaagtatgttccggatccatctcatgtgat 6955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 105
Target Start/End: Original strand, 420 - 517
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcc 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||| || | |||| | ||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  420 aggaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgttcttgagagtgaatcctgtaactagtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7152 - 6918
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgt-ttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttt 112  Q
    |||||||||||||| || || || || || |||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||     
T  7152 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttc 7053  T
Q  113 attggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccaca-tctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttct 211  Q
    |||||||| |||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || || ||||||||| |||||| | || || ||||| ||     
T  7052 attggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcattctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcg 6953  T
Q  212 cagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 246  Q
    || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6952 caacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgt 6918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 8015 - 7855
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| |||||| |  |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  8015 aagcgtaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcacttcggtgaccggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttga 7916  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagt 162  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| ||||    
T  7915 ctccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 7855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 13058 - 13305
Alignment:
Q  2 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 101  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||  |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||    
T  13058 aagcgtaggaaagatcttgaatttcaagaaggagaccatgtgttattgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtctaagaaattga 13157  T
Q  102 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtt 201  Q
    || | |  |||||| || |||||||||| ||||| ||| | || |  || || ||| |||| ||||| |||||||| |||| ||| || || ||||||||    
T  13158 cttcgagatttattagttcgtatcagatatcagaaagaatgggaatggtagcgtatggagtgggtttaccaccacaacttttgaatttacatgatgtgtt 13257  T
Q  202 tcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    |||||| || || |||| ||||||| || ||||||| |||||| ||||    
T  13258 tcatgtgtcgcaacttcagaagtatttttcggatccatctcatatgat 13305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 174 - 263
Target Start/End: Original strand, 18991 - 19080
Alignment:
Q  174 cacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 263  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||    
T  18991 cacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcagatccctcgcatgttattccgagagatgatg 19080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 63 - 205
Target Start/End: Original strand, 4567 - 4709
Alignment:
Q  63 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagt 162  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| |  |||||||||||||||||| | || || ||| |||| || ||||| ||| ||||    
T  4567 tgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagtttactccgagatttattggtccgtatcaggtatcggaaagaattggaacggtggcgtatcgagt 4666  T
Q  163 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcat 205  Q
     ||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4667 gggtttaccatcgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcat 4709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 249
Target Start/End: Original strand, 36985 - 37074
Alignment:
Q  160 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    |||||| || ||||| | |||| |||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  36985 agttggattaccaccgcctcttacgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctgatgtgat 37074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 2013 - 1910
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactccta 107  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |    
T  2013 aggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaa 1914  T
Q  108 agtt 111  Q
    ||||    
T  1913 agtt 1910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9298 - 9183
Alignment:
Q  148 agtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtg 247  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| | || || |||| ||||||||| ||||||||||| |||||     
T  9298 agtggcatacagagtgggattgccaccatatctttcgaatttgcatgatgtggttcatatgtcgcaacttcagaagtatgtagcggatccttcacatgtt 9199  T
Q  248 attccgagggatgatg 263  Q
    |||||||| |||||||    
T  9198 attccgagagatgatg 9183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 96 - 7
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtc 90  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  96 caagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtc 7  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8816 - 8768
Alignment:
Q  141 ttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaactt 189  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8816 ttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaactt 8768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 1000 - 1095
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1000 aaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 1095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 1314 - 1385
Alignment:
Q  1 caagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgt 72  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1314 caagcgtaggaaagaccttgagtttcaggaaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgt 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 10571 - 10476
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  10571 aaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctttgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagtcgactcct 10476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 5957 - 5862
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||| ||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  5957 aaggatattgagtatcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctatgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagtcgactcct 5862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 7610 - 7522
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgac 102  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  7610 gatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 7522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6330 - 6251
Alignment:
Q  170 ccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 249  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  6330 ccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaactttggaagtatgtaccggatccatcccatgtgat 6251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 14873 - 14778
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| | ||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14873 aaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgtgactggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 14778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 46370 - 46275
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| | || |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  46370 aaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtaaatcctgtaaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 46275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Original strand, 873 - 985
Alignment:
Q  14 gatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttta 113  Q
    |||||||||||| |||| || || || || ||| | || ||||||||| |||| ||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  873 gatcttgagtttaaggaaggagaccacgtattttttagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcactgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 972  T
Q  114 ttggtccgtatca 126  Q
    |||||||||||||    
T  973 ttggtccgtatca 985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 476 - 571
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||||||| |  |||| |||||| ||| ||||||| | |||| |||| |||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  476 aaggatattgagtttcaagttggtgctcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggccgtgctttggagtgtaggaagttgactcct 571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 8311 - 8216
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | || | |||| |||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  8311 aaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtgctttgatgtgtaggaagttgactcct 8216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 8566 - 8471
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||||| ||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  8566 aaggatattgagtatcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctatgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagtcgactcct 8471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 14827 - 14922
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| |||| |||||||  ||||||||||| ||| ||||||| | || | ||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14827 aaggatattgaatttcaggttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcatgtgaccagtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 14922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 13124 - 13029
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||| || |  ||| |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13124 aaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgttgttgagagtgaaccctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 13029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 28356 - 28451
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| ||||||| || |  ||||||||||| ||| ||||||| | || | |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28356 aaggatattgagttacaagtaggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 28451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 24096 - 24001
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| | || || | |||  |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24096 aaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgttttttagagttaatccggtgactggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 3366 - 3280
Alignment:
Q  20 gagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||| |||| || | |||| |||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3366 gagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtgaccggtattggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 3280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 14742 - 14644
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    ||||||||  ||||||||||||  || |||||||| ||| |||| || | || | |||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  14742 aggaaggacattgagtttcaggttggggatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtgtcggaagttgactcct 14644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 3965 - 4060
Alignment:
Q  11 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||| ||| | || || | |||| |||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  3965 aaggatattgagtttcaggttgatgatcatgtgtttttaagagtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcct 4060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Original strand, 8978 - 9076
Alignment:
Q  8 aggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 106  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||||||| | ||| ||||||| | || | | || |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  8978 aggaaggacattgagtttcaggttggtgatcatctgtttttgagggtgaatcatgtcaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtcggaagttgactcct 9076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University