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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18803_low_1 (Length: 776)

Name: NF18803_low_1
Description: NF18803
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18803_low_1
NF18803_low_1
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (3-761)||(34864678-34865442)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 689; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 689; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 761
Target Start/End: Original strand, 34864678 - 34865442
Alignment:
Q  3 actaatagccaacattttcagttatttaatttcatatttatgttgtcttttgaaaccagtctttgacccatatgtcataacgacaactcatattccttgc 102  Q
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T  34864678 actaatagccaacattttcagttatttaatttcatatttatgttgtcttttgaaaccagtctttgacccatatgtcataacgacaactcatattccttgc 34864777  T
Q  103 tccaatctaatttacatattttcatggagagattgaacaaaatgatgtgaataaatgaaattttatacacatgagatgatgagaatattcaaggtggatc 202  Q
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T  34864778 tccaatctaatttacatattttcatggagagattgaacaaaatgatgtgaataaatgaaattttatacacatgagatgatgagaatattcaaggtggatc 34864877  T
Q  203 caaatttggctttgattaagaattcaaaggttttaatagattgaaaatctgaatgaaacatcaaggagcaatatatggatgaatctctagtctcaaatct 302  Q
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T  34864878 caaatttggctttgattaagaattcaaaggttttaatagattgaaaatctgaatgaaacatcaaggagcaatatatggatgaatctctagtctcaaatct 34864977  T
Q  303 cattatgtttgcattttgaggg-----agatccaccactcccatatttctctttactaatcttattgtcagttttcccaataggtgaagcggcagactac 397  Q
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T  34864978 cattatgtttgcattttgagggggatccgatccaccactcccatatttctctttactaatcttattgtcagttttcccaataggtgaagcggcagactac 34865077  T
Q  398 aattaattagggagggtctaaccattcgaaactaaggagatggataaataggtacttatatctattaacgatgaatggattcatggagcgaaaacgaata 497  Q
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T  34865078 aattaattagggagggtctaaccattcgaaactaaggagatggataaataggtacttatatctattaacgatgaatggattcatggagcgaaaacgaata 34865177  T
Q  498 ttagaaaagtatatgctaacggtattggatggagatataacgacaggggttgttgttgacaattgagaaaatagagggggtgtccgttatatttacacaa 597  Q
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T  34865178 ttagaaaagtatatactaacggtattggatggagatataacgacaggggttgttgttgacaattgagaaaatagagggggtgtccgttatatttacacaa 34865277  T
Q  598 acttaaggggaggtgagtgtaatttt-tccnnnnnnnnttattagtattttcatttgaaattggtgagagtcatatttttcatttcattgttaaaatatt 696  Q
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T  34865278 atttaaggggaggtgagtgtaattttcacaaaaaaaaattattattattttcatttgaaattggtgagagtcatatttttcatttcattgttaaaatatt 34865377  T
Q  697 taaacaatggcattactttattcctttcttgtgattcattttcattaatttctctatatcaatat 761  Q
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T  34865378 taaacaatggcattactttattcctttcttgtgattcattttcattaatttctctatatcaatat 34865442  T

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