View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18813_low_9 (Length: 238)

Name: NF18813_low_9
Description: NF18813
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18813_low_9
NF18813_low_9
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-222)||(11299-11520)
[»] chr2 (71 HSPs)
chr2 (1-222)||(32214852-32215072)
chr2 (1-222)||(18808954-18809174)
chr2 (1-222)||(23709463-23709683)
chr2 (1-222)||(23711944-23712164)
chr2 (1-222)||(39682324-39682544)
chr2 (1-222)||(6726006-6726226)
chr2 (1-222)||(21154991-21155211)
chr2 (1-222)||(23130873-23131093)
chr2 (1-222)||(23133340-23133560)
chr2 (1-222)||(24367785-24368005)
chr2 (1-222)||(26505390-26505610)
chr2 (1-222)||(26507868-26508088)
chr2 (1-222)||(34402453-34402673)
chr2 (1-222)||(571408-571628)
chr2 (1-222)||(23135601-23135821)
chr2 (1-222)||(22105423-22105644)
chr2 (1-222)||(24898126-24898347)
chr2 (1-222)||(24900609-24900830)
chr2 (1-222)||(24903086-24903307)
chr2 (1-222)||(24905563-24905784)
chr2 (1-222)||(24908038-24908259)
chr2 (1-222)||(28577110-28577330)
chr2 (1-222)||(32039429-32039649)
chr2 (1-222)||(45029785-45030005)
chr2 (1-222)||(38967385-38967605)
chr2 (55-222)||(43137310-43137477)
chr2 (54-222)||(24529511-24529680)
chr2 (1-148)||(24642785-24642933)
chr2 (71-229)||(22337122-22337281)
chr2 (71-229)||(23060520-23060679)
chr2 (71-229)||(23076449-23076608)
chr2 (71-229)||(22731189-22731348)
chr2 (56-218)||(19671848-19672010)
chr2 (71-222)||(22738135-22738286)
chr2 (71-229)||(23285872-23286027)
chr2 (71-229)||(23654341-23654500)
chr2 (71-229)||(23660030-23660188)
chr2 (71-222)||(298769-298922)
chr2 (115-229)||(28405983-28406099)
chr2 (1-71)||(20261381-20261450)
chr2 (56-221)||(23708558-23708725)
chr2 (156-222)||(24643035-24643101)
chr2 (137-229)||(38136-38228)
chr2 (41-110)||(22173799-22173868)
chr2 (1-70)||(10684694-10684764)
chr2 (71-217)||(7688-7835)
chr2 (108-217)||(23103389-23103497)
chr2 (65-141)||(22459511-22459587)
chr2 (175-229)||(23040249-23040303)
chr2 (54-154)||(23791358-23791458)
chr2 (75-229)||(25175857-25176010)
chr2 (54-94)||(29601478-29601518)
chr2 (86-217)||(20309127-20309257)
chr2 (108-222)||(25616199-25616314)
chr2 (160-229)||(8946664-8946734)
chr2 (1-70)||(23707253-23707323)
chr2 (1-70)||(24918196-24918266)
chr2 (183-221)||(18786971-18787009)
chr2 (175-229)||(22134266-22134320)
chr2 (54-154)||(20520130-20520229)
chr2 (54-154)||(24697543-24697643)
chr2 (1-70)||(24671081-24671151)
chr2 (1-49)||(25616365-25616412)
chr2 (108-217)||(32451920-32452031)
chr2 (183-222)||(7679599-7679638)
chr2 (175-229)||(23072008-23072063)
chr2 (175-209)||(21916158-21916192)
chr2 (115-149)||(23004838-23004872)
chr2 (1-70)||(24681500-24681570)
chr2 (181-209)||(24869903-24869931)
chr2 (181-209)||(25961600-25961628)
[»] chr8 (74 HSPs)
chr8 (1-222)||(16413247-16413467)
chr8 (1-222)||(14409375-14409595)
chr8 (1-222)||(1484413-1484633)
chr8 (1-222)||(5853223-5853443)
chr8 (1-222)||(20403238-20403458)
chr8 (1-222)||(22001764-22001984)
chr8 (1-222)||(15203162-15203382)
chr8 (1-222)||(20046126-20046346)
chr8 (1-222)||(4483292-4483511)
chr8 (1-222)||(4542304-4542524)
chr8 (1-222)||(14823785-14824006)
chr8 (1-222)||(19896276-19896500)
chr8 (1-222)||(45290625-45290846)
chr8 (54-222)||(41598199-41598367)
chr8 (1-220)||(15070571-15070791)
chr8 (1-222)||(19936934-19937157)
chr8 (54-222)||(26223930-26224098)
chr8 (56-217)||(19801367-19801527)
chr8 (41-222)||(25484245-25484419)
chr8 (71-229)||(16092297-16092456)
chr8 (56-229)||(18818348-18818523)
chr8 (1-120)||(24485975-24486093)
chr8 (71-229)||(6759265-6759421)
chr8 (83-229)||(7372785-7372932)
chr8 (71-229)||(20536215-20536374)
chr8 (71-229)||(28648999-28649158)
chr8 (91-229)||(26219721-26219858)
chr8 (86-229)||(21918969-21919114)
chr8 (1-110)||(32810054-32810162)
chr8 (71-229)||(22875072-22875230)
chr8 (70-229)||(23406386-23406548)
chr8 (88-229)||(21923900-21924042)
chr8 (71-229)||(22626743-22626901)
chr8 (115-222)||(26225292-26225398)
chr8 (71-229)||(18879191-18879345)
chr8 (54-218)||(13508022-13508188)
chr8 (54-218)||(13597554-13597720)
chr8 (54-217)||(20498581-20498746)
chr8 (65-218)||(17612059-17612213)
chr8 (86-229)||(31971264-31971407)
chr8 (115-222)||(21285611-21285719)
chr8 (108-222)||(18678094-18678209)
chr8 (115-228)||(21673712-21673826)
chr8 (108-222)||(23648567-23648682)
chr8 (75-222)||(38855212-38855358)
chr8 (137-217)||(45131019-45131098)
chr8 (54-154)||(37116432-37116532)
chr8 (118-217)||(21389454-21389552)
chr8 (118-217)||(21395984-21396082)
chr8 (118-217)||(21778780-21778878)
chr8 (118-217)||(21790477-21790575)
chr8 (175-229)||(26355757-26355812)
chr8 (108-222)||(32121746-32121861)
chr8 (183-229)||(23760912-23760958)
chr8 (119-222)||(6520382-6520486)
chr8 (54-154)||(17266930-17267030)
chr8 (1-50)||(38550042-38550090)
chr8 (71-154)||(17439461-17439543)
chr8 (183-221)||(983474-983512)
chr8 (86-217)||(16199615-16199746)
chr8 (183-229)||(17140923-17140969)
chr8 (183-229)||(21491002-21491048)
chr8 (1-50)||(27472348-27472395)
chr8 (1-49)||(32121912-32121959)
chr8 (186-229)||(21249391-21249434)
chr8 (186-229)||(21255229-21255272)
chr8 (183-217)||(5866342-5866376)
chr8 (1-50)||(20982658-20982710)
chr8 (17-70)||(1326990-1327042)
chr8 (183-227)||(14398167-14398211)
chr8 (1-49)||(18677996-18678043)
chr8 (183-227)||(21383656-21383700)
chr8 (183-227)||(21387076-21387120)
chr8 (30-70)||(35026855-35026895)
[»] chr6 (66 HSPs)
chr6 (1-222)||(34963384-34963604)
chr6 (1-222)||(30676641-30676861)
chr6 (1-222)||(12742328-12742548)
chr6 (1-222)||(22782238-22782458)
chr6 (1-222)||(24422558-24422778)
chr6 (1-222)||(33861805-33862025)
chr6 (1-222)||(33864289-33864509)
chr6 (1-222)||(8055040-8055260)
chr6 (1-222)||(18334523-18334743)
chr6 (1-222)||(19005057-19005277)
chr6 (1-222)||(19858850-19859070)
chr6 (1-222)||(1540842-1541062)
chr6 (1-222)||(2291111-2291331)
chr6 (1-222)||(26924571-26924791)
chr6 (3-222)||(25656640-25656858)
chr6 (1-222)||(25688513-25688733)
chr6 (41-222)||(25754820-25755001)
chr6 (18-222)||(1595560-1595763)
chr6 (54-217)||(18456735-18456898)
chr6 (41-222)||(20556864-20557043)
chr6 (59-222)||(16448514-16448678)
chr6 (55-222)||(3852001-3852168)
chr6 (84-217)||(18461895-18462028)
chr6 (71-229)||(25629310-25629469)
chr6 (74-229)||(29060547-29060703)
chr6 (71-229)||(18409782-18409941)
chr6 (71-224)||(20360915-20361069)
chr6 (111-229)||(19303536-19303654)
chr6 (111-229)||(20593780-20593899)
chr6 (71-229)||(16496251-16496410)
chr6 (71-221)||(25644335-25644487)
chr6 (88-222)||(17287768-17287903)
chr6 (56-229)||(22780166-22780341)
chr6 (54-222)||(19847932-19848102)
chr6 (86-229)||(20638253-20638397)
chr6 (71-217)||(18821801-18821946)
chr6 (124-229)||(20076707-20076812)
chr6 (1-71)||(12942363-12942432)
chr6 (56-221)||(20109153-20109322)
chr6 (54-154)||(8227448-8227549)
chr6 (1-70)||(28289266-28289334)
chr6 (1-66)||(18913994-18914058)
chr6 (1-66)||(18937252-18937316)
chr6 (115-229)||(19652202-19652316)
chr6 (71-217)||(35245605-35245749)
chr6 (1-70)||(15875469-15875537)
chr6 (175-222)||(25714431-25714478)
chr6 (1-50)||(31630578-31630626)
chr6 (115-217)||(23019425-23019528)
chr6 (1-49)||(23992604-23992654)
chr6 (183-222)||(27333286-27333325)
chr6 (183-222)||(27394026-27394065)
chr6 (183-221)||(9098582-9098620)
chr6 (108-209)||(15041542-15041644)
chr6 (183-229)||(31155465-31155511)
chr6 (175-226)||(11185515-11185567)
chr6 (183-219)||(28496539-28496575)
chr6 (183-219)||(29808950-29808986)
chr6 (119-221)||(19668386-19668491)
chr6 (183-222)||(23992441-23992480)
chr6 (183-229)||(1561310-1561356)
chr6 (183-227)||(5616874-5616918)
chr6 (181-209)||(19790845-19790873)
chr6 (183-215)||(22831524-22831556)
chr6 (183-227)||(23414648-23414692)
chr6 (183-227)||(27556406-27556450)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (1-222)||(4705-4925)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-222)||(10784-11004)
[»] chr4 (71 HSPs)
chr4 (1-222)||(3515018-3515238)
chr4 (1-222)||(19618103-19618323)
chr4 (1-222)||(18215205-18215425)
chr4 (1-222)||(15118283-15118503)
chr4 (4-222)||(14970641-14970858)
chr4 (1-222)||(12238-12458)
chr4 (1-222)||(52312521-52312741)
chr4 (1-222)||(19242710-19242931)
chr4 (1-222)||(1837440-1837660)
chr4 (1-222)||(44615299-44615519)
chr4 (1-222)||(44773014-44773238)
chr4 (1-222)||(18239350-18239570)
chr4 (1-222)||(50222270-50222490)
chr4 (1-222)||(15355255-15355476)
chr4 (41-222)||(51463838-51464019)
chr4 (41-222)||(23803235-23803416)
chr4 (54-222)||(44102225-44102393)
chr4 (41-222)||(12610961-12611135)
chr4 (65-222)||(44928873-44929031)
chr4 (1-222)||(7641117-7641333)
chr4 (54-217)||(21815568-21815731)
chr4 (54-218)||(15367708-15367873)
chr4 (54-218)||(15402721-15402886)
chr4 (54-218)||(15371220-15371385)
chr4 (54-218)||(15373501-15373666)
chr4 (54-218)||(15370036-15370200)
chr4 (59-222)||(20149840-20150004)
chr4 (57-218)||(16223550-16223712)
chr4 (71-229)||(22636442-22636601)
chr4 (71-229)||(7088884-7089043)
chr4 (56-229)||(7798781-7798956)
chr4 (71-229)||(14038655-14038814)
chr4 (115-222)||(14280327-14280434)
chr4 (71-224)||(16377478-16377630)
chr4 (91-222)||(54798729-54798861)
chr4 (71-229)||(12902764-12902923)
chr4 (118-229)||(52873369-52873481)
chr4 (71-229)||(7893710-7893869)
chr4 (71-229)||(44052836-44052995)
chr4 (71-229)||(16270191-16270349)
chr4 (60-217)||(22353852-22354010)
chr4 (73-229)||(16239927-16240083)
chr4 (71-229)||(6899898-6900056)
chr4 (54-217)||(13788-13953)
chr4 (115-219)||(8574868-8574971)
chr4 (71-230)||(23374314-23374474)
chr4 (54-221)||(52243131-52243302)
chr4 (1-71)||(15534343-15534412)
chr4 (1-70)||(36038033-36038101)
chr4 (56-221)||(43198492-43198661)
chr4 (1-70)||(14048740-14048808)
chr4 (1-70)||(15497002-15497070)
chr4 (1-70)||(49547705-49547773)
chr4 (1-69)||(52873109-52873176)
chr4 (151-229)||(3096300-3096379)
chr4 (73-154)||(15464888-15464969)
chr4 (111-229)||(12774014-12774132)
chr4 (120-217)||(14053306-14053403)
chr4 (1-50)||(362268-362316)
chr4 (127-222)||(39706299-39706395)
chr4 (1-70)||(14746548-14746618)
chr4 (119-221)||(12288211-12288316)
chr4 (183-229)||(8846363-8846409)
chr4 (183-229)||(15551824-15551870)
chr4 (17-70)||(19857607-19857661)
chr4 (118-217)||(17046506-17046604)
chr4 (56-144)||(8846465-8846553)
chr4 (54-154)||(53082089-53082188)
chr4 (108-217)||(6190481-6190592)
chr4 (183-227)||(18236894-18236938)
chr4 (183-227)||(43256471-43256515)
[»] chr1 (51 HSPs)
chr1 (1-222)||(21840778-21840998)
chr1 (1-222)||(23593665-23593886)
chr1 (1-222)||(13988877-13989097)
chr1 (1-222)||(21923222-21923442)
chr1 (1-222)||(21475018-21475238)
chr1 (1-222)||(29776699-29776919)
chr1 (1-222)||(31612324-31612544)
chr1 (1-222)||(16361928-16362149)
chr1 (1-222)||(29298148-29298367)
chr1 (1-222)||(16275294-16275515)
chr1 (1-218)||(22122998-22123215)
chr1 (5-222)||(15859943-15860160)
chr1 (54-222)||(21346972-21347141)
chr1 (54-222)||(21342107-21342276)
chr1 (41-217)||(45574812-45574989)
chr1 (54-222)||(21707178-21707346)
chr1 (54-222)||(21711720-21711888)
chr1 (54-222)||(13212844-13213013)
chr1 (54-222)||(433023-433190)
chr1 (59-222)||(40389165-40389329)
chr1 (71-229)||(50210168-50210327)
chr1 (71-229)||(27250684-27250843)
chr1 (111-229)||(34509787-34509906)
chr1 (71-229)||(22532276-22532435)
chr1 (54-217)||(21896193-21896358)
chr1 (71-222)||(22468651-22468803)
chr1 (71-229)||(21026687-21026846)
chr1 (57-217)||(21861510-21861672)
chr1 (111-230)||(21754051-21754170)
chr1 (65-221)||(16758664-16758822)
chr1 (56-229)||(33681014-33681188)
chr1 (115-229)||(22921868-22921983)
chr1 (54-217)||(35261018-35261180)
chr1 (135-229)||(20847173-20847268)
chr1 (122-229)||(20248286-20248394)
chr1 (108-222)||(20135201-20135316)
chr1 (175-222)||(20454613-20454660)
chr1 (54-154)||(41049973-41050072)
chr1 (16-70)||(43543214-43543267)
chr1 (71-160)||(22354527-22354616)
chr1 (75-229)||(22237634-22237788)
chr1 (175-226)||(52928029-52928081)
chr1 (1-48)||(22050820-22050866)
chr1 (183-229)||(21161723-21161769)
chr1 (183-220)||(20918620-20918657)
chr1 (58-154)||(50686696-50686792)
chr1 (65-149)||(12271642-12271725)
chr1 (183-222)||(21714556-21714595)
chr1 (54-216)||(14295493-14295652)
chr1 (183-227)||(33797285-33797329)
chr1 (183-227)||(36819369-36819413)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (1-222)||(17371-17591)
scaffold0023 (1-222)||(94422-94642)
scaffold0023 (74-222)||(44465-44614)
scaffold0023 (75-229)||(100381-100534)
scaffold0023 (75-229)||(40135-40288)
scaffold0023 (175-229)||(101506-101561)
scaffold0023 (183-229)||(119882-119928)
[»] chr3 (88 HSPs)
chr3 (1-222)||(9707538-9707758)
chr3 (1-222)||(12567571-12567791)
chr3 (1-222)||(13544036-13544256)
chr3 (1-222)||(16454212-16454432)
chr3 (1-222)||(17463189-17463409)
chr3 (1-222)||(45606838-45607058)
chr3 (1-222)||(7781278-7781498)
chr3 (1-222)||(8899105-8899325)
chr3 (1-222)||(34159337-34159557)
chr3 (1-222)||(38961822-38962042)
chr3 (1-222)||(55476502-55476722)
chr3 (1-222)||(6469065-6469285)
chr3 (1-222)||(10247654-10247874)
chr3 (1-222)||(16282742-16282962)
chr3 (1-222)||(28848542-28848762)
chr3 (1-222)||(13154186-13154407)
chr3 (1-222)||(41123901-41124118)
chr3 (6-222)||(13151726-13151942)
chr3 (30-222)||(17446614-17446805)
chr3 (41-222)||(50242833-50243014)
chr3 (54-222)||(17672637-17672805)
chr3 (1-222)||(8499529-8499751)
chr3 (1-222)||(15412440-15412662)
chr3 (54-222)||(29172565-29172734)
chr3 (54-217)||(53070636-53070799)
chr3 (54-222)||(12119707-12119876)
chr3 (41-217)||(43550448-43550625)
chr3 (1-222)||(27165261-27165483)
chr3 (1-222)||(53301435-53301658)
chr3 (71-229)||(14972861-14973020)
chr3 (103-222)||(15977526-15977645)
chr3 (71-222)||(40213676-40213827)
chr3 (56-224)||(43840944-43841114)
chr3 (71-229)||(17487863-17488022)
chr3 (71-229)||(17499345-17499504)
chr3 (56-221)||(26686902-26687069)
chr3 (120-222)||(55500953-55501055)
chr3 (55-218)||(42386428-42386593)
chr3 (71-229)||(14576788-14576946)
chr3 (71-229)||(23083316-23083475)
chr3 (71-229)||(25476340-25476499)
chr3 (91-222)||(36166609-36166739)
chr3 (71-229)||(13442281-13442440)
chr3 (91-222)||(21618460-21618590)
chr3 (86-229)||(12399216-12399360)
chr3 (118-229)||(18438541-18438653)
chr3 (86-229)||(20698405-20698549)
chr3 (115-222)||(10556996-10557104)
chr3 (108-230)||(14572595-14572717)
chr3 (54-218)||(24340660-24340826)
chr3 (56-217)||(52523666-52523831)
chr3 (71-222)||(24153164-24153315)
chr3 (134-222)||(44494820-44494908)
chr3 (54-218)||(23274705-23274871)
chr3 (71-229)||(11424718-11424873)
chr3 (1-70)||(54520985-54521053)
chr3 (135-222)||(17737247-17737337)
chr3 (56-154)||(2051138-2051237)
chr3 (1-68)||(29544773-29544839)
chr3 (56-229)||(16097335-16097509)
chr3 (54-117)||(17248224-17248287)
chr3 (1-63)||(12305315-12305376)
chr3 (111-230)||(32307683-32307802)
chr3 (54-154)||(37642202-37642303)
chr3 (65-154)||(22147474-22147563)
chr3 (115-229)||(15470931-15471046)
chr3 (56-229)||(16103787-16103960)
chr3 (183-229)||(12174327-12174373)
chr3 (1-70)||(15977696-15977764)
chr3 (108-222)||(46822279-46822394)
chr3 (183-229)||(49668144-49668190)
chr3 (1-50)||(10557091-10557139)
chr3 (181-222)||(45577948-45577989)
chr3 (1-70)||(11913981-11914051)
chr3 (183-222)||(28194704-28194743)
chr3 (183-229)||(9512927-9512973)
chr3 (183-229)||(9520902-9520948)
chr3 (183-229)||(13210395-13210441)
chr3 (118-222)||(12511071-12511176)
chr3 (138-221)||(30029855-30029939)
chr3 (1-49)||(46822445-46822492)
chr3 (175-230)||(1644733-1644788)
chr3 (73-154)||(43926043-43926123)
chr3 (181-209)||(3390002-3390030)
chr3 (183-227)||(8489530-8489574)
chr3 (183-227)||(12339469-12339513)
chr3 (183-227)||(15464868-15464912)
chr3 (183-227)||(15482665-15482709)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (1-222)||(9253-9473)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-222)||(20758-20978)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (1-222)||(37832-38052)
[»] chr7 (85 HSPs)
chr7 (1-222)||(456332-456552)
chr7 (1-222)||(11393218-11393438)
chr7 (1-222)||(15376644-15376864)
chr7 (1-222)||(16232531-16232751)
chr7 (1-222)||(20385054-20385274)
chr7 (1-222)||(21189526-21189746)
chr7 (1-222)||(32125502-32125722)
chr7 (1-222)||(41522928-41523148)
chr7 (1-222)||(41525390-41525610)
chr7 (1-222)||(14949053-14949273)
chr7 (1-222)||(18640283-18640503)
chr7 (1-222)||(24702249-24702469)
chr7 (1-222)||(27216871-27217091)
chr7 (1-222)||(11972507-11972727)
chr7 (1-222)||(16213695-16213915)
chr7 (1-222)||(18430723-18430943)
chr7 (1-222)||(16410070-16410290)
chr7 (1-222)||(24704699-24704916)
chr7 (1-222)||(13869357-13869579)
chr7 (54-222)||(44116520-44116688)
chr7 (41-217)||(13647344-13647521)
chr7 (4-178)||(26355915-26356090)
chr7 (4-178)||(26358367-26358542)
chr7 (55-222)||(3386344-3386511)
chr7 (84-222)||(24275182-24275320)
chr7 (54-222)||(38898359-38898528)
chr7 (54-222)||(17061898-17062066)
chr7 (54-217)||(12756654-12756817)
chr7 (56-222)||(20110567-20110723)
chr7 (71-229)||(3564319-3564478)
chr7 (114-222)||(48273403-48273512)
chr7 (107-222)||(13831384-13831499)
chr7 (71-229)||(12698838-12698998)
chr7 (54-221)||(2280056-2280225)
chr7 (65-220)||(26212012-26212168)
chr7 (71-229)||(9509196-9509355)
chr7 (1-140)||(15081878-15082019)
chr7 (71-229)||(38227488-38227646)
chr7 (71-222)||(18456368-18456519)
chr7 (1-88)||(13841157-13841243)
chr7 (118-220)||(10589055-10589158)
chr7 (1-71)||(11303409-11303478)
chr7 (115-221)||(15144037-15144143)
chr7 (2-82)||(18627717-18627796)
chr7 (1-70)||(16108620-16108688)
chr7 (1-70)||(29796771-29796841)
chr7 (1-70)||(29800590-29800660)
chr7 (1-70)||(14269993-14270061)
chr7 (115-222)||(22072927-22073036)
chr7 (56-214)||(12255730-12255892)
chr7 (1-70)||(8468803-8468871)
chr7 (75-229)||(18005653-18005806)
chr7 (54-154)||(19486681-19486782)
chr7 (1-70)||(23664884-23664952)
chr7 (65-149)||(15113031-15113114)
chr7 (108-229)||(16386239-16386362)
chr7 (175-229)||(44014185-44014240)
chr7 (114-222)||(67759-67868)
chr7 (183-229)||(811199-811245)
chr7 (54-221)||(1867932-1868101)
chr7 (118-229)||(16219719-16219831)
chr7 (65-149)||(15116568-15116651)
chr7 (54-218)||(10063760-10063921)
chr7 (54-217)||(16495421-16495581)
chr7 (86-217)||(40443410-40443541)
chr7 (115-221)||(16056343-16056449)
chr7 (119-222)||(47831821-47831925)
chr7 (1-70)||(8940335-8940405)
chr7 (1-70)||(38898159-38898229)
chr7 (183-229)||(28505366-28505412)
chr7 (183-229)||(34200793-34200839)
chr7 (54-154)||(15008436-15008535)
chr7 (1-50)||(45847692-45847739)
chr7 (175-229)||(11996086-11996141)
chr7 (183-222)||(14932802-14932841)
chr7 (183-222)||(15356237-15356276)
chr7 (183-222)||(15360351-15360390)
chr7 (54-154)||(20220127-20220224)
chr7 (183-229)||(15754955-15755001)
chr7 (173-222)||(26356096-26356145)
chr7 (173-222)||(26358548-26358597)
chr7 (183-227)||(1859144-1859188)
chr7 (183-227)||(13635529-13635573)
chr7 (183-227)||(13918838-13918882)
chr7 (183-227)||(25927561-25927605)
[»] chr5 (64 HSPs)
chr5 (1-222)||(264699-264919)
chr5 (1-222)||(32027404-32027624)
chr5 (1-222)||(42245296-42245516)
chr5 (1-222)||(39363395-39363615)
chr5 (1-222)||(10732871-10733091)
chr5 (1-222)||(20909023-20909243)
chr5 (1-222)||(29345991-29346211)
chr5 (1-222)||(29348464-29348684)
chr5 (1-222)||(29350937-29351157)
chr5 (1-222)||(39245147-39245367)
chr5 (1-222)||(29329945-29330162)
chr5 (1-222)||(20917883-20918099)
chr5 (1-222)||(23064522-23064744)
chr5 (1-222)||(38619445-38619667)
chr5 (54-222)||(36154766-36154931)
chr5 (54-221)||(20901991-20902159)
chr5 (56-222)||(11581184-11581350)
chr5 (54-222)||(2154596-2154765)
chr5 (59-222)||(18319021-18319185)
chr5 (54-222)||(31061079-31061248)
chr5 (54-222)||(10775659-10775827)
chr5 (59-222)||(24067118-24067282)
chr5 (71-229)||(25421539-25421698)
chr5 (71-229)||(23390451-23390610)
chr5 (111-229)||(24529227-24529346)
chr5 (71-230)||(1096473-1096633)
chr5 (71-229)||(9077959-9078118)
chr5 (71-229)||(21729019-21729178)
chr5 (71-229)||(21808344-21808503)
chr5 (71-216)||(25431414-25431560)
chr5 (71-229)||(8286797-8286957)
chr5 (71-229)||(24493576-24493734)
chr5 (129-229)||(21997547-21997648)
chr5 (91-222)||(22412198-22412329)
chr5 (71-229)||(13025318-13025476)
chr5 (71-229)||(13095502-13095660)
chr5 (71-220)||(22075035-22075185)
chr5 (71-217)||(22144068-22144215)
chr5 (54-154)||(40725936-40726037)
chr5 (56-229)||(21565549-21565723)
chr5 (91-178)||(20766095-20766181)
chr5 (1-70)||(9776521-9776589)
chr5 (58-217)||(22178161-22178323)
chr5 (183-229)||(22959600-22959646)
chr5 (138-222)||(18418594-18418678)
chr5 (119-217)||(20026942-20027043)
chr5 (137-217)||(21292992-21293071)
chr5 (88-230)||(37723909-37724050)
chr5 (1-70)||(37804834-37804902)
chr5 (108-222)||(17517193-17517308)
chr5 (175-229)||(19668905-19668960)
chr5 (183-222)||(21329565-21329604)
chr5 (183-229)||(19660903-19660949)
chr5 (1-49)||(17517095-17517142)
chr5 (183-227)||(23535647-23535691)
chr5 (183-217)||(36314596-36314630)
chr5 (181-222)||(20806852-20806893)
chr5 (183-227)||(18355960-18356004)
chr5 (65-161)||(18356389-18356485)
chr5 (183-227)||(20911229-20911273)
chr5 (190-222)||(21502231-21502263)
chr5 (181-209)||(26680605-26680633)
chr5 (184-227)||(26742806-26742850)
chr5 (181-209)||(26952212-26952240)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (1-222)||(13958-14178)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (1-222)||(501095-501315)
scaffold0001 (54-222)||(85562-85731)
scaffold0001 (115-229)||(160691-160805)
scaffold0001 (183-227)||(173294-173338)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (1-222)||(136691-136911)
scaffold0028 (1-222)||(139160-139380)
scaffold0028 (1-222)||(144098-144318)
scaffold0028 (1-222)||(134222-134442)
scaffold0028 (1-222)||(141629-141849)
scaffold0028 (183-229)||(132665-132711)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (16-222)||(12195-12400)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (1-222)||(13403-13623)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (1-222)||(40411-40631)
scaffold0044 (183-227)||(12906-12950)
scaffold0044 (183-227)||(19190-19234)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (41-222)||(82083-82264)
scaffold0037 (56-221)||(22610-22776)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (54-222)||(158433-158601)
scaffold0003 (71-221)||(339905-340053)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (41-222)||(117-298)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (54-222)||(9760-9929)
scaffold0145 (71-229)||(32949-33107)
scaffold0145 (71-229)||(38768-38926)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (54-222)||(16795-16963)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (54-222)||(4308-4476)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (41-222)||(12075-12250)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (41-222)||(1250-1432)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (54-219)||(29946-30111)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (54-217)||(79267-79430)
scaffold0056 (71-229)||(17170-17331)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (54-220)||(161072-161239)
scaffold0007 (54-154)||(164573-164674)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (54-222)||(4225-4393)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (54-217)||(20363-20524)
scaffold0031 (71-222)||(128765-128916)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (54-222)||(2111-2280)
scaffold0247 (54-218)||(17964-18130)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (1-222)||(38587-38809)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (71-222)||(22897-23048)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (71-224)||(39489-39642)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (71-224)||(75170-75323)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (71-229)||(3106-3264)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (71-229)||(13218-13377)
[»] scaffold0228 (4 HSPs)
scaffold0228 (71-224)||(4520-4673)
scaffold0228 (71-224)||(12102-12255)
scaffold0228 (71-224)||(22054-22207)
scaffold0228 (183-227)||(18692-18736)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (65-229)||(51920-52085)
scaffold0011 (86-229)||(167948-168092)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (86-229)||(1018-1162)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (91-222)||(44682-44814)
scaffold0122 (71-229)||(26020-26179)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (71-229)||(16555-16714)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (71-229)||(1858-2017)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (71-229)||(3141-3300)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (72-229)||(16120-16278)
scaffold0120 (71-229)||(32913-33070)
scaffold0120 (71-229)||(45935-46092)
scaffold0120 (174-229)||(17388-17443)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (71-229)||(6076-6238)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (118-229)||(28421-28533)
scaffold0046 (183-229)||(2004-2050)
scaffold0046 (183-229)||(4559-4605)
scaffold0046 (183-229)||(11299-11345)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (56-221)||(8481-8650)
scaffold0621 (75-229)||(6542-6695)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (71-229)||(4856-5015)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (71-229)||(3477-3636)
scaffold0292 (71-218)||(361-508)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (91-222)||(116441-116571)
scaffold0022 (1-70)||(53803-53873)
scaffold0022 (54-154)||(128907-129007)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (1-110)||(6070-6178)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (56-229)||(8472-8643)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (54-221)||(27686-27855)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (71-224)||(25908-26061)
scaffold0026 (71-229)||(39865-40023)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (71-172)||(3485-3586)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (71-218)||(24257-24406)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (118-229)||(8486-8598)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (54-217)||(13147-13313)
scaffold0357 (54-221)||(16037-16206)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (76-149)||(13092-13165)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (86-217)||(1971-2103)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (54-217)||(53486-53651)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (56-172)||(13157-13274)
scaffold0175 (181-224)||(285-328)
scaffold0175 (122-229)||(34130-34238)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (54-162)||(225482-225590)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (146-229)||(4719-4803)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (54-218)||(11482-11648)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (54-218)||(38193-38359)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (71-229)||(39920-40078)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (120-229)||(11447-11557)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (1-70)||(1591-1659)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (1-70)||(3186-3254)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (71-154)||(27913-27996)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (71-229)||(10381-10537)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (54-217)||(12587-12751)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (86-215)||(4545-4675)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (75-227)||(129914-130066)
scaffold0010 (54-217)||(60652-60818)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (54-154)||(7996-8097)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (86-229)||(32074-32216)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (75-229)||(19271-19424)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (88-217)||(174785-174913)
scaffold0021 (175-229)||(121773-121827)
scaffold0021 (71-147)||(124675-124751)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (75-229)||(136-290)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (71-229)||(15420-15577)
scaffold0114 (1-64)||(27958-28020)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (56-226)||(10481-10652)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (54-119)||(12047-12112)
scaffold0503 (157-217)||(11982-12042)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (54-217)||(6220-6386)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (115-229)||(2805-2920)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (137-220)||(13513-13596)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (56-229)||(45732-45906)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (115-229)||(14696-14811)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (175-229)||(4893-4947)
scaffold0395 (71-160)||(918-1006)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (183-229)||(2713-2759)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (75-225)||(5654-5803)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (71-218)||(20928-21077)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (54-154)||(97090-97190)
scaffold0006 (54-154)||(106368-106468)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (119-229)||(12946-13057)
scaffold0138 (55-144)||(18176-18265)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (54-217)||(1011-1171)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (118-217)||(7285-7383)
scaffold0106 (1-70)||(15203-15273)
scaffold0106 (118-217)||(1308-1406)
scaffold0106 (183-222)||(15306-15345)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (4-70)||(10821-10886)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (86-172)||(6675-6761)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (54-217)||(267679-267844)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (184-229)||(28839-28884)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (127-222)||(15788-15884)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (115-217)||(1051-1154)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (175-222)||(1096-1144)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (1-70)||(645-715)
[»] scaffold0741 (1 HSPs)
scaffold0741 (1-70)||(4234-4304)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (1-70)||(1257-1327)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (175-222)||(1093-1141)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (119-225)||(12777-12884)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (175-222)||(6625-6673)
scaffold0333 (175-222)||(14005-14053)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (1-70)||(15083-15153)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (111-229)||(32105-32224)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (54-221)||(25121-25289)
scaffold0123 (54-154)||(621-720)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (115-221)||(10542-10649)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (115-221)||(32551-32657)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (115-162)||(8090-8137)
scaffold0556 (183-226)||(6822-6865)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (183-222)||(6191-6230)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (122-222)||(15675-15776)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (183-229)||(23951-23997)
scaffold0100 (1-70)||(35996-36065)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (120-217)||(16301-16397)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (183-227)||(228432-228476)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (183-222)||(23853-23892)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (183-222)||(36464-36503)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (118-217)||(51601-51699)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (183-217)||(5196-5230)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (175-209)||(9536-9570)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (54-154)||(89-189)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (71-144)||(38411-38483)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (1-70)||(6867-6937)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (183-227)||(2732-2776)


Alignment Details
Target: scaffold0029 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11520 - 11299
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11520 atgattgatgaagtgttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgattttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 11421  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11420 tcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagtt 11321  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  11320 gcatgagtcggtctaatttgat 11299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 71)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 32214852 - 32215072
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214852 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 32214950  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32214951 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagct 32215050  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  32215051 gcatgagtcggtctaagttgat 32215072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18809174 - 18808954
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18809174 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 18809076  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  18809075 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 18808976  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18808975 gcatgagtcggtctaagttgat 18808954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 23709463 - 23709683
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23709463 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 23709561  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  23709562 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 23709661  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23709662 gcatgagtcggtctaagttgat 23709683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 23711944 - 23712164
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23711944 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 23712042  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  23712043 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 23712142  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23712143 gcatgagtcggtctaagttgat 23712164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 39682544 - 39682324
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39682544 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 39682446  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  39682445 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 39682346  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  39682345 gcatgagtcggtctaagttgat 39682324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6726226 - 6726006
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6726226 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 6726128  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  6726127 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 6726028  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6726027 gcatgagtcggtctaagttgat 6726006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 21154991 - 21155211
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21154991 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 21155089  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  21155090 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 21155189  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21155190 gcatgagtcggtctaagttgat 21155211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23131093 - 23130873
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23131093 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 23130995  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  23130994 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 23130895  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23130894 gcatgagtcggtctaagttgat 23130873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23133560 - 23133340
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23133560 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 23133462  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  23133461 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 23133362  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23133361 gcatgagtcggtctaagttgat 23133340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24368005 - 24367785
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24368005 atgattgatgaagtattatatgtatatat-gatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 24367907  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  24367906 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 24367807  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24367806 gcatgagtcggtctaagttgat 24367785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26505610 - 26505390
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26505610 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 26505512  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  26505511 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagct 26505412  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26505411 gcatgagtcggtctaagttgat 26505390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26508088 - 26507868
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26508088 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 26507990  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  26507989 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagct 26507890  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26507889 gcatgagtcggtctaagttgat 26507868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 34402453 - 34402673
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34402453 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 34402551  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  34402552 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 34402651  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34402652 gcatgagtcggtctaagttgat 34402673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 571628 - 571408
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  571628 atgattaatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 571530  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  571529 ttatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 571430  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  571429 gcatgagtcggtctaagttgat 571408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23135821 - 23135601
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23135821 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgctgattatcatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaa 23135723  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  23135722 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 23135623  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23135622 gcatgagtcggtctaagttgat 23135601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22105644 - 22105423
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22105644 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattataatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 22105546  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagt 199  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||     
T  22105545 ttatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagc 22105446  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22105445 tgcatgagtcggtctaagttgat 22105423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 24898126 - 24898347
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24898126 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 24898224  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaact-aagt 199  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||     
T  24898225 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagc 24898324  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24898325 tgcatgagtcggtctaagttgat 24898347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 24900609 - 24900830
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24900609 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 24900707  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaact-aagt 199  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||     
T  24900708 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagc 24900807  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24900808 tgcatgagtcggtctaagttgat 24900830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 24903086 - 24903307
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24903086 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 24903184  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaact-aagt 199  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||     
T  24903185 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagc 24903284  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24903285 tgcatgagtcggtctaagttgat 24903307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 24905563 - 24905784
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24905563 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 24905661  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaact-aagt 199  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||     
T  24905662 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagc 24905761  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24905762 tgcatgagtcggtctaagttgat 24905784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 24908038 - 24908259
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24908038 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 24908136  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaact-aagt 199  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||     
T  24908137 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagc 24908236  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24908237 tgcatgagtcggtctaagttgat 24908259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28577330 - 28577110
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28577330 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 28577232  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |    
T  28577231 ttatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgttgcgttgctgttgttatttaactaagct 28577132  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28577131 gcatgagtcggtctaagttgat 28577110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 32039429 - 32039649
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32039429 atgatcgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 32039527  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |    
T  32039528 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttactgttgttatttaactaagct 32039627  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  32039628 gcatgagccggtctaagttgat 32039649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 45029785 - 45030005
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  45029785 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgatgattattatttcatgttgttatattgtgatataaatgtatatgcattacttgaa 45029883  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  45029884 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgttgtgttgttgttgttatttaactaagct 45029983  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  45029984 gcatgagtcggtctaagttgat 45030005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 38967605 - 38967385
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  38967605 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgtcttaagatgttgattattatttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaa 38967508  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagt 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||     
T  38967507 ttatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatattgttgtgtcgatgttgttatttaactaagc 38967408  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  38967407 tgcatgagtcggtctaagttgat 38967385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 55 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 43137477 - 43137310
Alignment:
Q  55 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137477 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 43137378  T
Q  155 tctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
      |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43137377 gttgtttttgtatattactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 43137310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Original strand, 24529511 - 24529680
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaa-taattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24529511 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtc 24529610  T
Q  153 attctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24529611 atgctgtttttgtatactgatgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgat 24529680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 24642785 - 24642933
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaa--gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24642785 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttg 24642883  T
Q  99 aatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattatta 148  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24642884 aattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22337281 - 22337122
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  22337281 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatataca 22337182  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22337181 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 22337122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23060679 - 23060520
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  | |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23060679 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23060580  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23060579 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23060520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23076608 - 23076449
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23076608 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23076509  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23076508 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatg 23076449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 22731189 - 22731348
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || | |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22731189 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22731288  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22731289 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatg 22731348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19672010 - 19671848
Alignment:
Q  56 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatt 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||     
T  19672010 ttgatgttgttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaat-attgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatg 19671912  T
Q  156 ctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 218  Q
     || ||||| |||||| || ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  19671911 atg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 19671848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 222
Target Start/End: Original strand, 22738135 - 22738286
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22738135 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22738234  T
Q  171 gctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||    ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22738235 gcctatttaatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22738286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23286027 - 23285872
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||  | || |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  23286027 tgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc----tgtttttgtatact 23285932  T
Q  171 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23285931 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23285872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 23654341 - 23654500
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| | |||  |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||    
T  23654341 tgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgct 23654440  T
Q  171 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    || | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23654441 gcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 23654500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23660188 - 23660030
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| | ||   |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  23660188 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctg-tttcgtatact 23660090  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23660089 gcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23660030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 222
Target Start/End: Original strand, 298769 - 298922
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||| |||||||||||    
T  298769 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 298868  T
Q  171 gc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    || | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  298869 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 298922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28406099 - 28405983
Alignment:
Q  115 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || ||||| ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28406099 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 28406000  T
Q  213 ctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  28405999 ctaagttgatgatgatg 28405983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 20261450 - 20261381
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 71  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20261450 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 20261381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Original strand, 23708558 - 23708725
Alignment:
Q  56 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  23708558 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcat 23708657  T
Q  155 tctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 221  Q
      || ||||| |||||| || ||||| | | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23708658 gttg-ttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga 23708725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 222
Target Start/End: Original strand, 24643035 - 24643101
Alignment:
Q  156 ctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24643035 ctgtttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24643101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 137 - 229
Target Start/End: Original strand, 38136 - 38228
Alignment:
Q  137 ttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  38136 ttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 38228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 110
Target Start/End: Original strand, 22173799 - 22173868
Alignment:
Q  41 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtga 110  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22173799 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 22173868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 10684694 - 10684764
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatat-tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10684694 atgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 10684764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 217
Target Start/End: Original strand, 7688 - 7835
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| |||||    
T  7688 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatact 7786  T
Q  171 g-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    | || ||||| || |||||  ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  7787 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Original strand, 23103389 - 23103497
Alignment:
Q  108 tgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatga 206  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  23103389 tgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatga 23103486  T
Q  207 gtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||    
T  23103487 gtcggtctaag 23103497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Original strand, 22459511 - 22459587
Alignment:
Q  65 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgat 141  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22459511 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatgactttcatttgat 22459587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 229
Target Start/End: Original strand, 23040249 - 23040303
Alignment:
Q  175 tgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23040249 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23040303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 23791458 - 23791358
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| | |||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  23791458 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatat-aatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatc 23791360  T
Q  153 at 154  Q
    ||    
T  23791359 at 23791358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25176010 - 25175857
Alignment:
Q  75 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-t 173  Q
    |||||||||||||| | |||  |||||  |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| |    
T  25176010 atataattatatatacgttatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 25175914  T
Q  174 gtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
     ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  25175913 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatg 25175857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 29601518 - 29601478
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29601518 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 29601478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20309257 - 20309127
Alignment:
Q  86 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||| | ||||| | ||    
T  20309257 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctatt 20309161  T
Q  185 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20309160 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20309127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25616314 - 25616199
Alignment:
Q  108 tgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatga 206  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | |||||  ||||  |||| | || || | |||| |||||||||||||||||||    
T  25616314 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatga 25616215  T
Q  207 gtcggtctaagttgat 222  Q
    ||| ||||||||||||    
T  25616214 gtcagtctaagttgat 25616199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946664
Alignment:
Q  160 ttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||| | ||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 8946664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 23707253 - 23707323
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaa--gatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23707253 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 23707323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 24918266 - 24918196
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaa--gatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24918266 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 24918196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 221
Target Start/End: Original strand, 18786971 - 18787009
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18786971 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 229
Target Start/End: Original strand, 22134266 - 22134320
Alignment:
Q  175 tgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22134266 tgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatg 22134320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Original strand, 20520130 - 20520229
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||    
T  20520130 atttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatc 20520227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Original strand, 24697543 - 24697643
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||  ||| ||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  24697543 attttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagt-ttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatc 24697641  T
Q  153 at 154  Q
    ||    
T  24697642 at 24697643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 24671151 - 24671081
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24671151 atgattgatgaagtattatatgtatata-tgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatat 24671081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 25616412 - 25616365
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgat 49  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  25616412 atgattgatgaagtgttatatgtatgta-tgatgttttaagatgttgat 25616365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Original strand, 32451920 - 32452031
Alignment:
Q  108 tgaataattgagatg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcat 204  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||| || |||||| || |||| | ||||| |||| | | |||||| ||| |||||    
T  32451920 tgaataattgagatgattgttggcttgcatt-gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcat 32452018  T
Q  205 gagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||    
T  32452019 gagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7679638 - 7679599
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  7679638 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 7679599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 229
Target Start/End: Original strand, 23072008 - 23072063
Alignment:
Q  175 tgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  23072008 tgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatg 23072063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 209
Target Start/End: Original strand, 21916158 - 21916192
Alignment:
Q  175 tgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtc 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21916158 tgttgtttttgttatttaactaagttgcatgagtc 21916192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 23004872 - 23004838
Alignment:
Q  115 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 149  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23004872 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattattat 23004838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 24681570 - 24681500
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaa--gatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |   ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24681570 atgattgatgaagtattagatgtatatat-gatgtttaagttgatgttgatcatcatttgatgttgttatat 24681500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24869931 - 24869903
Alignment:
Q  181 tgttgttatttaactaagttgcatgagtc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24869931 tgttgttatttaactaagttgcatgagtc 24869903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 209
Target Start/End: Original strand, 25961600 - 25961628
Alignment:
Q  181 tgttgttatttaactaagttgcatgagtc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25961600 tgttgttatttaactaagttgcatgagtc 25961628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 74)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 16413247 - 16413467
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413247 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 16413345  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16413346 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagct 16413445  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16413446 gcatgagtcggtctaagttgat 16413467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 14409375 - 14409595
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14409375 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 14409473  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  14409474 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagct 14409573  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14409574 gcatgagtcggtctaagttgat 14409595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1484633 - 1484413
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1484633 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 1484535  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  1484534 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 1484435  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  1484434 gcatgagtcggtctaagttgat 1484413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 5853223 - 5853443
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5853223 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 5853321  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  5853322 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 5853421  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5853422 gcatgagtcggtctaagttgat 5853443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20403458 - 20403238
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20403458 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 20403360  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  20403359 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 20403260  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20403259 gcatgagtcggtctaagttgat 20403238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22001984 - 22001764
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22001984 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 22001886  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  22001885 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 22001786  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22001785 gcatgagtcggtctaagttgat 22001764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 15203162 - 15203382
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15203162 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 15203260  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  15203261 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 15203360  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  15203361 gcatgagtcgctctaagttgat 15203382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 20046126 - 20046346
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20046126 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 20046224  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  20046225 ttatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 20046324  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20046325 gcatgagtcggtctaagttgat 20046346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4483511 - 4483292
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4483511 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 4483413  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  4483412 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta-ttaactaagct 4483314  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4483313 gcatgagtcggtctaagttgat 4483292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 4542304 - 4542524
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4542304 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 4542402  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  4542403 ctatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatcttgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 4542502  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4542503 gcatgagtcggtctaagttgat 4542524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14824006 - 14823785
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatat-tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttga 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14824006 atgattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttga 14823907  T
Q  100 atcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagt 199  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |     
T  14823906 attatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttatttaactttgc 14823807  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    
T  14823806 tgcatgagt-ggtctaaattgat 14823785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19896500 - 19896276
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgtttt-aagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttga 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19896500 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatatttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttga 19896402  T
Q  100 atcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatatta---ttatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaacta 196  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  19896401 attatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtataccgttgtgttgctgttgttatttaacta 19896302  T
Q  197 agttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  19896301 agctgcatgagtcggtctaagttgat 19896276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 45290625 - 45290846
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  45290625 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgacgttgttatactgtgatataattgtatctgcattaattgaa 45290723  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagt 199  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||     
T  45290724 ttatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagc 45290823  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  45290824 tgcatgagtcggtctaagttgat 45290846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41598367 - 41598199
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598367 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 41598268  T
Q  154 ttctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41598267 tgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 41598199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15070791 - 15070571
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| | ||      
T  15070791 atgattgatgaagttttatatgtatttat-gatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattcagatataattgtatatgcatcaattag 15070693  T
Q  100 atcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 198  Q
    || || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  15070692 attatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaag 15070593  T
Q  199 ttgcatgagtcggtctaagttg 220  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  15070592 ctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 19936934 - 19937157
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaa--gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  |||    
T  19936934 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataactgtatgtgcattgattg 19937032  T
Q  99 aatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaa 197  Q
    ||| || ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  19937033 aattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaa 19937132  T
Q  198 gttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    | |||||||||||||| ||||||||    
T  19937133 gctgcatgagtcggtccaagttgat 19937157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26224098 - 26223930
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224098 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 26223999  T
Q  154 ttctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    | || |||||||||| |||| | ||| ||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||    
T  26223998 tgctatttttgtatattgctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgat 26223930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 56 - 217
Target Start/End: Original strand, 19801367 - 19801527
Alignment:
Q  56 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatt 155  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  19801367 ttgatgttgttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatg 19801466  T
Q  156 ctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19801467 ctg-ttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 41 - 222
Target Start/End: Original strand, 25484245 - 25484419
Alignment:
Q  41 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttga 140  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  25484245 gatgttgattatgatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25484344  T
Q  141 tattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||       | | |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  25484345 tattattatgtcatgctgtttttgtatac-------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgat 25484419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 16092297 - 16092456
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16092297 tgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16092396  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16092397 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 16092456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Original strand, 18818348 - 18818523
Alignment:
Q  56 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18818348 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcat 18818447  T
Q  155 tctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
     |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18818448 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 18818523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 24485975 - 24486093
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24485975 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttctaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 24486073  T
Q  101 tcatatgtgaataattgaga 120  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  24486074 ttatatgtgaataattgaga 24486093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6759421 - 6759265
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| ||  ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6759421 tgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgagatgttg---acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 6759325  T
Q  171 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6759324 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 6759265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 83 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7372932 - 7372785
Alignment:
Q  83 atatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgtt 181  Q
    ||||| ||||||||||||  |||  |||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |    
T  7372932 atataagcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 7372833  T
Q  182 gttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7372832 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 7372785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20536374 - 20536215
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20536374 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20536275  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20536274 gcctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 20536215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 28648999 - 28649158
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||| ||   || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  28648999 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 28649098  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28649099 gcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 28649158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26219858 - 26219721
Alignment:
Q  91 attacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatt 190  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26219858 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatact-attttgtatactgctgtgtcgctgttgttatt 26219760  T
Q  191 taactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26219759 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattatgatg 26219721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 86 - 229
Target Start/End: Original strand, 21918969 - 21919114
Alignment:
Q  86 tatgcattacttgaatcat-atgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgt 183  Q
    |||||||||||||||  || || |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||    
T  21918969 tatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt 21919068  T
Q  184 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21919069 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 21919114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 32810162 - 32810054
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32810162 atgattgatgaagtgttacatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 32810064  T
Q  101 tcatatgtga 110  Q
    | ||||||||    
T  32810063 ttatatgtga 32810054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22875230 - 22875072
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  22875230 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 22875132  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | |||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22875131 gcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatg 22875072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23406548 - 23406386
Alignment:
Q  70 ttgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgtt--gttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtat 167  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23406548 ttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtat 23406449  T
Q  168 actgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23406448 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23406386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 229
Target Start/End: Original strand, 21923900 - 21924042
Alignment:
Q  88 tgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgt 186  Q
    |||||||||||||  |||  |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  21923900 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgt 21923999  T
Q  187 tatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21924000 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 21924042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22626901 - 22626743
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||  |||  |||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  22626901 tgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 22626803  T
Q  171 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22626802 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 22626743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 115 - 222
Target Start/End: Original strand, 26225292 - 26225398
Alignment:
Q  115 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26225292 ttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 26225390  T
Q  215 aagttgat 222  Q
    ||||||||    
T  26225391 aagttgat 26225398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 18879191 - 18879345
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||    
T  18879191 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatact 18879285  T
Q  171 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18879286 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 18879345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Original strand, 13508022 - 13508188
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  13508022 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 13508121  T
Q  153 attctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 218  Q
    ||  || || || ||| || || ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13508122 atgatg-ttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13508188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Original strand, 13597554 - 13597720
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  13597554 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 13597653  T
Q  153 attctgtttttgtatactgc-tgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 218  Q
    ||  || ||||| || |||| | ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13597654 atgatg-ttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13597720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20498746 - 20498581
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  20498746 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 20498647  T
Q  153 attctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    || ||  ||||  |||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20498646 atgct-attttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612213
Alignment:
Q  65 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttg 164  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||  || |||||    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttg 17612157  T
Q  165 tatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 218  Q
     |||||| || |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17612158 catactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 17612213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31971407 - 31971264
Alignment:
Q  86 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| | ||||| ||||    
T  31971407 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgtt 31971309  T
Q  185 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31971308 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 31971264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21285719 - 21285611
Alignment:
Q  115 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21285719 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggt 21285621  T
Q  213 ctaagttgat 222  Q
    ||||||||||    
T  21285620 ctaagttgat 21285611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 222
Target Start/End: Original strand, 18678094 - 18678209
Alignment:
Q  108 tgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatga 206  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | |||||  ||||  |||| | || || | ||||||||||||||||||||||||    
T  18678094 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 18678193  T
Q  207 gtcggtctaagttgat 222  Q
    ||| ||||||||||||    
T  18678194 gtcagtctaagttgat 18678209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21673826 - 21673712
Alignment:
Q  115 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||| ||| | |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  21673826 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggt 21673728  T
Q  213 ctaagttgatgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  21673727 ctaagttgatgatgat 21673712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23648682 - 23648567
Alignment:
Q  108 tgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatga 206  Q
    |||||| || |||||||||||  |||||  |||||||||||||||||  |||| |||||  |||| | ||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  23648682 tgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatga 23648583  T
Q  207 gtcggtctaagttgat 222  Q
    ||| ||||||||||||    
T  23648582 gtcagtctaagttgat 23648567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 222
Target Start/End: Original strand, 38855212 - 38855358
Alignment:
Q  75 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-t 173  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| |    
T  38855212 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 38855308  T
Q  174 gtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
     ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38855309 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38855358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 217
Target Start/End: Original strand, 45131019 - 45131098
Alignment:
Q  137 ttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45131019 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45131098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 37116532 - 37116432
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  37116532 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 37116434  T
Q  153 at 154  Q
    ||    
T  37116433 at 37116432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 217
Target Start/End: Original strand, 21389454 - 21389552
Alignment:
Q  118 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 215  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||   ||||||| | | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21389454 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21389550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 217
Target Start/End: Original strand, 21395984 - 21396082
Alignment:
Q  118 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 215  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21395984 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21396080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 217
Target Start/End: Original strand, 21778780 - 21778878
Alignment:
Q  118 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 215  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||   ||||||| | | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21778780 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21778876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 217
Target Start/End: Original strand, 21790477 - 21790575
Alignment:
Q  118 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 215  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21790477 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21790573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 229
Target Start/End: Original strand, 26355757 - 26355812
Alignment:
Q  175 tgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355757 tgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 26355812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32121861 - 32121746
Alignment:
Q  108 tgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatga 206  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | |||||  ||||  |||| | || || | ||||||||||||||||||||||||    
T  32121861 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 32121762  T
Q  207 gtcggtctaagttgat 222  Q
    |||  |||||||||||    
T  32121761 gtcattctaagttgat 32121746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Original strand, 23760912 - 23760958
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23760912 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatgatg 23760958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6520486 - 6520382
Alignment:
Q  119 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 216  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6520486 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 6520388  T
Q  217 gttgat 222  Q
    ||||||    
T  6520387 gttgat 6520382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Original strand, 17266930 - 17267030
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  17266930 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 17267028  T
Q  153 at 154  Q
    ||    
T  17267029 at 17267030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 38550042 - 38550090
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 50  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38550042 atgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgatt 38550090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 154
Target Start/End: Original strand, 17439461 - 17439543
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  17439461 tgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 17439543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 221
Target Start/End: Original strand, 983474 - 983512
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  983474 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 217
Target Start/End: Original strand, 16199615 - 16199746
Alignment:
Q  86 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-t 183  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||| | ||| ||| | ||||||||||||||||||  ||  |||| |||||| || ||||| || |    
T  16199615 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgaatactgtctatgttgctgtt 16199712  T
Q  184 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16199713 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16199746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17140969 - 17140923
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17140969 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 17140923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21491048 - 21491002
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21491048 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 21491002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 27472348 - 27472395
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27472348 atgattgatgaagttttatatgtatata-tgatg-tttaagatgttgatt 27472395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 32121959 - 32121912
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgat 49  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  32121959 atgattgatgaagtgttatatgtatgta-tgatgttttaagatgttgat 32121912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249391
Alignment:
Q  186 ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 21249391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255229
Alignment:
Q  186 ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 21255229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 217
Target Start/End: Original strand, 5866342 - 5866376
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5866342 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 5866376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 20982658 - 20982710
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatat---tgatgttttaagatgttgatt 50  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||    
T  20982658 atgattgatgaagtgttatatatatatatatatgatgttttaagatgttgatt 20982710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 70
Target Start/End: Original strand, 1326990 - 1327042
Alignment:
Q  17 tatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1326990 tatatgtatatac-gatgttttgagatgttgattattatttgatgttgttatat 1327042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Original strand, 14398167 - 14398211
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  14398167 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 14398211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 18677996 - 18678043
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgat 49  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18677996 atgattgatgaagtgttatatttatgtat-gatgttttaagatgttgat 18678043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21383700 - 21383656
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  21383700 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 21383656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21387120 - 21387076
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  21387120 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 21387076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 70
Target Start/End: Original strand, 35026855 - 35026895
Alignment:
Q  30 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  35026855 tgatgttttaagatgttgattatcgtttgatattgttatat 35026895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 66)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34963604 - 34963384
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963604 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 34963506  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34963505 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagtt 34963406  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34963405 gcatgagtcggtctaagttgat 34963384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 30676641 - 30676861
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676641 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 30676739  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  30676740 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagct 30676839  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  30676840 gcatgagtcggtctaagttgat 30676861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12742548 - 12742328
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12742548 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 12742450  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  12742449 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 12742350  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12742349 gcatgagtcggtctaagttgat 12742328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22782458 - 22782238
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22782458 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 22782360  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  22782359 ttatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagct 22782260  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22782259 gcatgagtcggtctaagttgat 22782238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24422778 - 24422558
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24422778 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 24422680  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  24422679 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 24422580  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24422579 gcatgagtcggtctaagttgat 24422558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33862025 - 33861805
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33862025 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 33861927  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  33861926 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 33861827  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  33861826 gcatgagtcggtctaagttgat 33861805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33864509 - 33864289
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33864509 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 33864411  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  33864410 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 33864311  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  33864310 gcatgagtcggtctaagttgat 33864289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8055260 - 8055040
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8055260 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 8055162  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  8055161 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttttgtgttgctgttgttatttaactaagct 8055062  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8055061 gcatgagtcggtctaagttgat 8055040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 18334523 - 18334743
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18334523 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 18334621  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  18334622 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 18334721  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18334722 gcatgagtcggtctaagttgat 18334743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19005277 - 19005057
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19005277 atgattgatgaaatgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 19005179  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  19005178 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 19005079  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19005078 gcatgagtcggtctaagttgat 19005057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 19858850 - 19859070
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19858850 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattgttatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 19858948  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  19858949 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 19859048  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19859049 gcatgagtcggtctaagttgat 19859070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 1540842 - 1541062
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1540842 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaa 1540940  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  1540941 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 1541040  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  1541041 gcatgagtcgatctaagttgat 1541062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 2291111 - 2291331
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2291111 atgactgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 2291209  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  2291210 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 2291309  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2291310 gcatgagtcggtctaagttgat 2291331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 26924571 - 26924791
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26924571 atgattgatgaagtgttatatgtacatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 26924669  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  26924670 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagct 26924769  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26924770 gcatgagtcggtctaagttgat 26924791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25656858 - 25656640
Alignment:
Q  3 gattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatc 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  25656858 gattgatgaagtgttatatgtatataa-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaatt 25656760  T
Q  103 atatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgc 202  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  25656759 atatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgttgctgttgttatttaactaagctgc 25656660  T
Q  203 atgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  25656659 atgagtcggtctaagttgat 25656640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25688733 - 25688513
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25688733 atgattgaggaagtgttatatgtataaat-gatgttttaagatgttgattaccatttggtgttgttatattgtgatatgattatatatgtattacttgaa 25688635  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |    
T  25688634 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagct 25688535  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  25688534 gcatgagtcgatctaagttgat 25688513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25755001 - 25754820
Alignment:
Q  41 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttga 140  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  25755001 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25754902  T
Q  141 tattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25754901 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 25754820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1595763 - 1595560
Alignment:
Q  18 atatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  1595763 atatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattg 1595665  T
Q  118 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  1595664 agacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 1595565  T
Q  218 ttgat 222  Q
    |||||    
T  1595564 ttgat 1595560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 54 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18456898 - 18456735
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 18456799  T
Q  154 ttctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    | |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18456798 tgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 222
Target Start/End: Original strand, 20556864 - 20557043
Alignment:
Q  41 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttga 140  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20556864 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa--attgagacgttgttgacttgcatttga 20556961  T
Q  141 tattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20556962 tattattatgccatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 20557043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 59 - 222
Target Start/End: Original strand, 16448514 - 16448678
Alignment:
Q  59 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcattct 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16448514 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 16448613  T
Q  158 gtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16448614 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 16448678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 222
Target Start/End: Original strand, 3852001 - 3852168
Alignment:
Q  55 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3852001 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcat 3852100  T
Q  155 tctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
     |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3852101 gctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3852168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 84 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18462028 - 18461895
Alignment:
Q  84 tatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgt 183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||    
T  18462028 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgt 18461929  T
Q  184 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18461928 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 25629310 - 25629469
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  25629310 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatact 25629409  T
Q  171 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    || ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25629410 gcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 25629469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29060703 - 29060547
Alignment:
Q  74 gatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-c 172  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||| ||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  29060703 gatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc 29060604  T
Q  173 tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  29060603 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatg 29060547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 18409782 - 18409941
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||| ||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  18409782 tgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatact 18409881  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18409882 gcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 18409941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 71 - 224
Target Start/End: Original strand, 20360915 - 20361069
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20360915 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgct 20361014  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 224  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20361015 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatga 20361069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Original strand, 19303536 - 19303654
Alignment:
Q  111 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19303536 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 19303634  T
Q  210 ggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||| |||||| ||||    
T  19303635 ggtctaagatgatgaagatg 19303654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20593899 - 20593780
Alignment:
Q  111 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| || ||||||| ||    
T  20593899 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgattc 20593800  T
Q  210 ggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  20593799 ggtctaagttgatgaagatg 20593780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16496410 - 16496251
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16496410 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 16496311  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16496310 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 16496251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25644487 - 25644335
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||  ||||||||| |||||    
T  25644487 tgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatact 25644388  T
Q  171 g-ctgtgttgttgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 221  Q
    | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25644387 gcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 88 - 222
Target Start/End: Original strand, 17287768 - 17287903
Alignment:
Q  88 tgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact-gctgtgttgttgttgt 186  Q
    |||||||||||||  |||  |||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||| ||||||    
T  17287768 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgt 17287867  T
Q  187 tatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17287868 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17287903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Original strand, 22780166 - 22780341
Alignment:
Q  56 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |   |||||||||||||  |||  |||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22780166 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaa 22780265  T
Q  155 tctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
     ||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22780266 gctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 22780341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Original strand, 19847932 - 19848102
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtg-aataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||| || |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||     
T  19847932 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtg 19848031  T
Q  153 attctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
     | |||||  ||||  ||| || || || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19848032 ttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 19848102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 229
Target Start/End: Original strand, 20638253 - 20638397
Alignment:
Q  86 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt 184  Q
    |||||||||||||||  || | |||||| |  |||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20638253 tatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt 20638352  T
Q  185 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20638353 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatg 20638397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 217
Target Start/End: Original strand, 18821801 - 18821946
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatac 169  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||   ||  ||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  18821801 tgtgatataatg-tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcgtt-gatattgttatggcatgctgtttttgtatac 18821898  T
Q  170 tgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18821899 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 124 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20076812 - 20076707
Alignment:
Q  124 tgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20076812 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20076714  T
Q  223 gatgatg 229  Q
    || ||||    
T  20076713 gaagatg 20076707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 12942432 - 12942363
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 71  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12942432 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 12942363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20109322 - 20109153
Alignment:
Q  56 ttgatgttgtt-atattgtgatataat--tatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |     
T  20109322 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatt 20109223  T
Q  153 attctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 221  Q
    ||  || ||||| |||||| || ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20109222 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20109153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Original strand, 8227448 - 8227549
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  8227448 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 8227547  T
Q  153 at 154  Q
    ||    
T  8227548 at 8227549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 28289266 - 28289334
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28289266 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttaattaccatttgatgtcgttatat 28289334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 18914058 - 18913994
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt 66  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18914058 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 18913994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 18937316 - 18937252
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt 66  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18937316 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 18937252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19652316 - 19652202
Alignment:
Q  115 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19652316 ttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggt 19652219  T
Q  213 ctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  19652218 ctaagttgatgatgatg 19652202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 35245749 - 35245605
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||   ||| |||||||||    
T  35245749 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcat---gttgttgtatact 35245654  T
Q  171 gc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    || | ||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35245653 gcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35245605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 15875537 - 15875469
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15875537 atgattaatgaaatgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 15875469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714431
Alignment:
Q  175 tgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 25714431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 31630578 - 31630626
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 50  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31630578 atgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgatt 31630626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23019528 - 23019425
Alignment:
Q  115 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| ||||||| | ||||| || |||||  ||||||||| ||||| |||||||    
T  23019528 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggt 23019430  T
Q  213 ctaag 217  Q
    |||||    
T  23019429 ctaag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 23992654 - 23992604
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatat--tgatgttttaagatgttgat 49  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23992654 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgatgttttaagatgttgat 23992604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Original strand, 27333286 - 27333325
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27333286 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 27333325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Original strand, 27394026 - 27394065
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27394026 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 27394065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 221
Target Start/End: Original strand, 9098582 - 9098620
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9098582 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 209
Target Start/End: Original strand, 15041542 - 15041644
Alignment:
Q  108 tgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatga 206  Q
    |||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||   ||| || || |  | ||||||||||||||||||||||||    
T  15041542 tgaatacttaagatgttattgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatga 15041641  T
Q  207 gtc 209  Q
    |||    
T  15041642 gtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Original strand, 31155465 - 31155511
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  31155465 ttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgatgatgatg 31155511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11185567 - 11185515
Alignment:
Q  175 tgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatg 226  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  11185567 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgatg 11185515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 219
Target Start/End: Original strand, 28496539 - 28496575
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28496539 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28496575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 219
Target Start/End: Original strand, 29808950 - 29808986
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29808950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29808986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19668491 - 19668386
Alignment:
Q  119 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatt--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtct 214  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||   ||||||| | |||||  || ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19668491 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtct 19668393  T
Q  215 aagttga 221  Q
    |||||||    
T  19668392 aagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23992480 - 23992441
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23992480 ttgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgat 23992441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561310
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatg 1561310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Original strand, 5616874 - 5616918
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  5616874 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 5616918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 209
Target Start/End: Original strand, 19790845 - 19790873
Alignment:
Q  181 tgttgttatttaactaagttgcatgagtc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19790845 tgttgttatttaactaagttgcatgagtc 19790873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22831556 - 22831524
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22831556 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22831524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23414692 - 23414648
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  23414692 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 23414648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27556450 - 27556406
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  27556450 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 27556406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4925 - 4705
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4925 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gttgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 4827  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  4826 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagct 4727  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4726 gcatgagtcggtctaagttgat 4705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11004 - 10784
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11004 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaa 10906  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  10905 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagct 10806  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10805 gcatgagtcggtctaagttgat 10784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 71)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3515238 - 3515018
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515238 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 3515140  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  3515139 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttttttaactaagct 3515040  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3515039 gcatgagtcggtctaagttgat 3515018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 19618103 - 19618323
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618103 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 19618201  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  19618202 ttataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagct 19618301  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19618302 gcatgagtcggtctaagttgat 19618323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 18215205 - 18215425
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18215205 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 18215303  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  18215304 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagct 18215403  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18215404 gcatgagtcggtctaagttgat 18215425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 15118283 - 15118503
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15118283 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 15118381  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  15118382 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 15118481  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15118482 gcatgagtcggtctaagttgat 15118503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Original strand, 14970641 - 14970858
Alignment:
Q  4 attgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatca 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  14970641 attgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgtattacttgaatta 14970739  T
Q  104 tatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgca 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14970740 tatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgctgttttgctgttgttatttaactaagctgca 14970839  T
Q  204 tgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  14970840 tgagttggtctaagttgat 14970858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 12238 - 12458
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12238 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattattggatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 12336  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  12337 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 12436  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12437 gcatgagtcggtctaagttgat 12458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 52312741 - 52312521
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52312741 atgattaatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 52312643  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  52312642 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 52312543  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  52312542 gcatgagtcggtctaagttgat 52312521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19242931 - 19242710
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttga 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242931 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttggagttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttga 19242833  T
Q  100 atcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagt 199  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||     
T  19242832 attatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagc 19242733  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19242732 tgcatgagtcggtctaagttgat 19242710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 1837440 - 1837660
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1837440 atgattgatgaagttttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaa 1837538  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  1837539 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 1837638  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  1837639 gcatgagtcggtctaagttgat 1837660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 44615519 - 44615299
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44615519 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 44615421  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  44615420 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 44615321  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  44615320 gcatgagtcggtctaagttgat 44615299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 44773014 - 44773238
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatat---tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattactt 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44773014 atgattgatgaagtgttatatgtatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattactt 44773113  T
Q  98 gaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaa 197  Q
    |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  44773114 gaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaa 44773213  T
Q  198 gttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  44773214 gctgcatgagtcggtctaagttgat 44773238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 18239350 - 18239570
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18239350 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaa 18239448  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |    
T  18239449 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttatttaactaagct 18239548  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18239549 gcatgagtcggtctaagttgat 18239570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 50222270 - 50222490
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50222270 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatattgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 50222368  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  50222369 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 50222468  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  50222469 gcatgagtcggtctaagttgat 50222490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 15355255 - 15355476
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15355255 atgattgatgaaatgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaa 15355353  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagt 199  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  15355354 ttatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagc 15355453  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15355454 tgcatgagtcggtctaagttgat 15355476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 222
Target Start/End: Original strand, 51463838 - 51464019
Alignment:
Q  41 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttga 140  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  51463838 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 51463937  T
Q  141 tattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51463938 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 51464019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 222
Target Start/End: Original strand, 23803235 - 23803416
Alignment:
Q  41 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttga 140  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  23803235 gatgttgattatgattttatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttga 23803334  T
Q  141 tattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23803335 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23803416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 44102393 - 44102225
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 153  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44102393 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtca 44102294  T
Q  154 ttctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44102293 tgctgtttttgtatactactgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44102225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12611135 - 12610961
Alignment:
Q  41 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttga 140  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12611135 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 12611036  T
Q  141 tattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||       ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12611035 tattattatgtcatgctgtttttgt-------tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12610961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 65 - 222
Target Start/End: Original strand, 44928873 - 44929031
Alignment:
Q  65 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttg 164  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  44928873 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttg 44928972  T
Q  165 tatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44928973 tatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44929031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 7641117 - 7641333
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatat-----tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattac 95  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||     |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7641117 atgattgatgaagtgttatatatatatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattac 7641216  T
Q  96 ttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaact 195  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||          ||||||| |||||||||||||||    
T  7641217 ttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt----------tgtgttgctgttgttatttaact 7641306  T
Q  196 aagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7641307 aagctgcatgagtcggtctaagttgat 7641333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 217
Target Start/End: Original strand, 21815568 - 21815731
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 153  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21815568 atttgatgttgttatattatgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtca 21815667  T
Q  154 ttctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    | |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21815668 tgctgtttttgtatacagttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15367873 - 15367708
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15367873 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15367774  T
Q  153 attctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 218  Q
    || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15367773 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15367708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15402886 - 15402721
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15402886 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15402787  T
Q  153 attctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 218  Q
    || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15402786 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15402721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15371385 - 15371220
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15371385 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtc 15371286  T
Q  153 attctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 218  Q
    || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15371285 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15371220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15373666 - 15373501
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15373666 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtc 15373567  T
Q  153 attctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 218  Q
    || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15373566 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15373501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15370200 - 15370036
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15370200 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgt-agttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15370102  T
Q  153 attctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 218  Q
    || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15370101 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15370036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20150004 - 20149840
Alignment:
Q  59 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcattct 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20150004 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 20149905  T
Q  158 gtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  20149904 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgat 20149840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 57 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16223712 - 16223550
Alignment:
Q  57 tgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  16223712 tgatgttgttatattgtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatg 16223613  T
Q  156 ctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 218  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16223612 ctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 16223550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22636601 - 22636442
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22636601 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22636502  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22636501 gtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 22636442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7089043 - 7088884
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| ||||||  | |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7089043 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7088944  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7088943 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 7088884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7798956 - 7798781
Alignment:
Q  56 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7798956 ttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcat 7798857  T
Q  155 tctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
     |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7798856 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 7798781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14038814 - 14038655
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  14038814 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatact 14038715  T
Q  171 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14038714 gcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 14038655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 115 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14280434 - 14280327
Alignment:
Q  115 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14280434 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 14280335  T
Q  215 aagttgat 222  Q
    ||||||||    
T  14280334 aagttgat 14280327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 224
Target Start/End: Original strand, 16377478 - 16377630
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  16377478 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatact 16377575  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 224  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16377576 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 16377630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 91 - 222
Target Start/End: Original strand, 54798729 - 54798861
Alignment:
Q  91 attacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttat 189  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  54798729 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttat 54798828  T
Q  190 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54798829 tcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 54798861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12902923 - 12902764
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12902923 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12902824  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12902823 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 12902764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 118 - 229
Target Start/End: Original strand, 52873369 - 52873481
Alignment:
Q  118 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 216  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52873369 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 52873468  T
Q  217 gttgatgatgatg 229  Q
    |||||||| ||||    
T  52873469 gttgatgaagatg 52873481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7893869 - 7893710
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    ||||| |||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7893869 tgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7893770  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7893769 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatg 7893710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44052995 - 44052836
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44052995 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44052896  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  44052895 gcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatg 44052836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 16270191 - 16270349
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16270191 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 16270289  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16270290 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatg 16270349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22354010 - 22353852
Alignment:
Q  60 tgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgt 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||  |||    
T  22354010 tgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgt 22353911  T
Q  160 ttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |  |  |  ||| || || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22353910 tgctacaatctgcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaag 22353852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 16239927 - 16240083
Alignment:
Q  73 tgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg- 171  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| ||  |||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  16239927 tgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgc 16240025  T
Q  172 ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    || | ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16240026 ctattttgctattgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatg 16240083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6900056 - 6899898
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| | |||||||||||  |||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  || |||||||||||    
T  6900056 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttg-ttttgtatact 6899958  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6899957 gcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 6899898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 217
Target Start/End: Original strand, 13788 - 13953
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  13788 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 13887  T
Q  153 attctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||  || ||||| |||||| || ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13888 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 219
Target Start/End: Original strand, 8574868 - 8574971
Alignment:
Q  115 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 214  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8574868 ttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 8574966  T
Q  215 aagtt 219  Q
    |||||    
T  8574967 aagtt 8574971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 230
Target Start/End: Original strand, 23374314 - 23374474
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||| |||||||||||    
T  23374314 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 23374413  T
Q  171 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgt 230  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  23374414 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatgt 23374474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 221
Target Start/End: Original strand, 52243131 - 52243302
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||    
T  52243131 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatc 52243230  T
Q  153 at--tctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 221  Q
    ||   |||  |||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52243231 atgaactg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 15534412 - 15534343
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 71  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534412 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 15534343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 36038101 - 36038033
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36038101 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 36038033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Original strand, 43198492 - 43198661
Alignment:
Q  56 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||    
T  43198492 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcat 43198591  T
Q  155 -tctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 221  Q
       |  ||||| ||| || || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43198592 gaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 14048808 - 14048740
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14048808 atgattgatgaggtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 14048740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 15497002 - 15497070
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15497002 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 15497070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 49547705 - 49547773
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49547705 atgattgatgaagtgttatatgtatctat-gatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatat 49547773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 52873109 - 52873176
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 69  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  52873109 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 52873176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096300
Alignment:
Q  151 tcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 3096300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Original strand, 15464888 - 15464969
Alignment:
Q  73 tgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  15464888 tgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 15464969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12774132 - 12774014
Alignment:
Q  111 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12774132 ataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 12774035  T
Q  209 cggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12774034 cggtctaagttgatgatgatg 12774014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Original strand, 14053306 - 14053403
Alignment:
Q  120 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14053306 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 14053403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 362316 - 362268
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 50  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  362316 atgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgatt 362268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 222
Target Start/End: Original strand, 39706299 - 39706395
Alignment:
Q  127 tgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39706299 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39706395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 14746548 - 14746618
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaa--gatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14746548 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 14746618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 221
Target Start/End: Original strand, 12288211 - 12288316
Alignment:
Q  119 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatt--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtct 214  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||   ||| ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12288211 gatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 12288309  T
Q  215 aagttga 221  Q
    |||||||    
T  12288310 aagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8846409 - 8846363
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  8846409 ttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatg 8846363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15551870 - 15551824
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15551870 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 15551824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 19857661 - 19857607
Alignment:
Q  17 tatatgtatatat-tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19857661 tatatatatatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 19857607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17046604 - 17046506
Alignment:
Q  118 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 215  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||   ||| || |||||| | | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17046604 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcat---gttgttctatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 17046508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8846553 - 8846465
Alignment:
Q  56 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatatt 144  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8846553 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 8846465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Original strand, 53082089 - 53082188
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| || ||  |||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  53082089 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 53082186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6190592 - 6190481
Alignment:
Q  108 tgaataattgagatg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcat 204  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||| |||| |||||| ||||||||| || |||||| || |||| | ||||| |||| | | |||||||||| |||||    
T  6190592 tgaataattgagatgattgttcgcttacatt-gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcat 6190494  T
Q  205 gagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||    
T  6190493 gagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18236938 - 18236894
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  18236938 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 18236894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Original strand, 43256471 - 43256515
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  43256471 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 43256515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 51)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21840998 - 21840778
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21840998 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaa 21840900  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  21840899 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagct 21840800  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21840799 gcatgagtcggtctaagttgat 21840778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 23593665 - 23593886
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttga 99  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593665 atgattaatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttga 23593763  T
Q  100 atcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagt 199  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  23593764 attatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagc 23593863  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23593864 tgcatgagtcggtctaagttgat 23593886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13989097 - 13988877
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13989097 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 13988999  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  13988998 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 13988899  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13988898 gcatgagtcggtctaagttgat 13988877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 21923222 - 21923442
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21923222 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 21923320  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  21923321 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 21923420  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21923421 gcatgagtcggtctaagttgat 21923442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 21475018 - 21475238
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21475018 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 21475116  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  21475117 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 21475216  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  21475217 gcatgagttggtctaagttgat 21475238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29776919 - 29776699
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29776919 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 29776821  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  29776820 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 29776721  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29776720 gcatgagtcggtctaagttgat 29776699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31612544 - 31612324
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31612544 atgattgatgaagtattatatgtatatat-gatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 31612446  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  31612445 ttatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagct 31612346  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  31612345 gcatgagtcggtctaagttgat 31612324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16362149 - 16361928
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttga 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16362149 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttga 16362051  T
Q  100 atcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagt 199  Q
    || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||     
T  16362050 attatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactgttgtgttgctgtcgttatttaactaagc 16361951  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16361950 tgcatgagtcggtctaagttgat 16361928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29298367 - 29298148
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29298367 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 29298269  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  29298268 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 29298170  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29298169 gcatgagtcggtctaagttgat 29298148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 16275294 - 16275515
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  16275294 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgtttcaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataatggtatatgcattaattgaa 16275392  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagt 199  Q
    |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  16275393 ttttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgtcgttgttgttatttaactaagt 16275492  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  16275493 tgtatgagtcggtctaagttgat 16275515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 22122998 - 22123215
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22122998 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 22123096  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttg-ttgttatttaactaagt 199  Q
    | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||     
T  22123097 ttaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgtgttgctgtttgctatttaactaagc 22123196  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagt 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22123197 tgcatgagtcggtctaagt 22123215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Original strand, 15859943 - 15860160
Alignment:
Q  5 ttgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcat 104  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||    
T  15859943 ttgatgaagtgttatatgtatatat-gatgtcttaagatgttgattaccatctgatgttgttatattgtgatataattgtatgtgcattgattgaattat 15860041  T
Q  105 atgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgca 203  Q
     ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  15860042 ttgtgagtaattaagacgttgattgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgca 15860141  T
Q  204 tgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  15860142 tgagtcggtccaagttgat 15860160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21347141 - 21346972
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21347141 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 21347042  T
Q  153 attctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21347041 atgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21346972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21342276 - 21342107
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21342276 atttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 21342177  T
Q  153 attctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21342176 atgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21342107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Original strand, 45574812 - 45574989
Alignment:
Q  41 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttga 140  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  45574812 gatgttgattatgatttgatgttcttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttgg 45574911  T
Q  141 tattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45574912 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21707346 - 21707178
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 153  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21707346 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtca 21707247  T
Q  154 ttctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    | || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21707246 tgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21707178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21711888 - 21711720
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 153  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21711888 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtca 21711789  T
Q  154 ttctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    | || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21711788 tgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21711720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Original strand, 13212844 - 13213013
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13212844 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 13212943  T
Q  153 attctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||  ||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13212944 atgttgtttttgtatactgttgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13213013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 433190 - 433023
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433190 atttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 433091  T
Q  153 attctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
     |  ||||||||||||||||  || |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  433090 ttgatgtttttgtatactgc-ctg-tgttgccgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 433023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 59 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 40389329 - 40389165
Alignment:
Q  59 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcattct 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40389329 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 40389230  T
Q  158 gtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  40389229 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgat 40389165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 50210168 - 50210327
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||| ||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  50210168 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50210267  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50210268 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 50210327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 27250684 - 27250843
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27250684 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27250783  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  27250784 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 27250843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34509906 - 34509787
Alignment:
Q  111 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtc 209  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34509906 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 34509807  T
Q  210 ggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  34509806 ggtctaagttgatgaagatg 34509787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22532435 - 22532276
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||   |||||| || |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22532435 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22532336  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22532335 gcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatg 22532276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 217
Target Start/End: Original strand, 21896193 - 21896358
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  21896193 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 21896292  T
Q  153 attctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    || ||| |||||||||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21896293 atgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 222
Target Start/End: Original strand, 22468651 - 22468803
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttga-atcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatac 169  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||  |    
T  22468651 tgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattat-tgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatc 22468749  T
Q  170 tgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22468750 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 22468803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21026846 - 21026687
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||| ||| |||||||||||    
T  21026846 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatact 21026747  T
Q  171 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    || | | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21026746 gcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgacgatg 21026687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 217
Target Start/End: Original strand, 21861510 - 21861672
Alignment:
Q  57 tgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatt 155  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||     
T  21861510 tgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 21861609  T
Q  156 ctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||| ||||| |||||| || ||||| || |||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21861610 ctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21754170 - 21754051
Alignment:
Q  111 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 208  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21754170 ataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 21754073  T
Q  209 cggtctaagttgatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21754072 cggtctaagttgatgatgatgt 21754051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16758822 - 16758664
Alignment:
Q  65 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatt--ctgtttt 162  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||| ||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||   ||| |||    
T  16758822 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatg-ttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactggttt 16758724  T
Q  163 tgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 221  Q
     | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16758723 -gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33681188 - 33681014
Alignment:
Q  56 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || |||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||    
T  33681188 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcat 33681090  T
Q  155 tctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
      || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33681089 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgaagatgatg 33681014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 22921868 - 22921983
Alignment:
Q  115 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22921868 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 22921966  T
Q  213 ctaagttgatgatgatg 229  Q
    ||||| |||||||||||    
T  22921967 ctaagatgatgatgatg 22921983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 217
Target Start/End: Original strand, 35261018 - 35261180
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  35261018 atttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatc 35261114  T
Q  153 attctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    || ||| ||||| |||||| || ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35261115 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 229
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847268
Alignment:
Q  135 atttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 20847268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20248394 - 20248286
Alignment:
Q  122 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 219  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20248394 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 20248296  T
Q  220 gatgatgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  20248295 gatgatgatg 20248286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20135316 - 20135201
Alignment:
Q  108 tgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatga 206  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||  |||| |||||  |||| | || || | ||||| ||||||||||||||||||    
T  20135316 tgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatga 20135217  T
Q  207 gtcggtctaagttgat 222  Q
    ||| ||||||||||||    
T  20135216 gtcagtctaagttgat 20135201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 222
Target Start/End: Original strand, 20454613 - 20454660
Alignment:
Q  175 tgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20454613 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20454660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Original strand, 41049973 - 41050072
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  41049973 atttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatg--ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 41050070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 43543267 - 43543214
Alignment:
Q  16 ttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43543267 ttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 43543214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 160
Target Start/End: Original strand, 22354527 - 22354616
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtt 160  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  22354527 tgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22237788 - 22237634
Alignment:
Q  75 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-t 173  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||| ||| |    
T  22237788 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcct 22237691  T
Q  174 gtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
     ||| | |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22237690 atgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgaagatgatg 22237634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 226
Target Start/End: Original strand, 52928029 - 52928081
Alignment:
Q  175 tgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatg 226  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  52928029 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatg 52928081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 22050820 - 22050866
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttga 48  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22050820 atgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttga 22050866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21161769 - 21161723
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21161769 ttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgatgatgatg 21161723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20918657 - 20918620
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 220  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20918657 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 50686792 - 50686696
Alignment:
Q  58 gatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    |||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||    
T  50686792 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcat 50686696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 12271725 - 12271642
Alignment:
Q  65 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 149  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||| | | ||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12271725 ttataatgtgatataattgtatatatattactttagttatacgtaaata-ttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 12271642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21714595 - 21714556
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21714595 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21714556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Original strand, 14295493 - 14295652
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 153  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| | |  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  14295493 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 14295588  T
Q  154 ttctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 216  Q
    |  || ||| | ||||| | | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14295589 tgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 14295652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33797329 - 33797285
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  33797329 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 33797285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Original strand, 36819369 - 36819413
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  36819369 ttgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagttgatgatga 36819413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 17371 - 17591
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17371 atgattgatgaagtgtcatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatactgtgatataattatatatgcattacttgaa 17469  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  17470 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctattgttatttaactaagct 17569  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17570 gcatgagtcggtctaagttgat 17591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 94642 - 94422
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  94642 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 94544  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  94543 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 94444  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  94443 gcatgagtcggtctaagttgat 94422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44465
Alignment:
Q  74 gatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctg-tttttgtatactgc 172  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt 44515  T
Q  173 tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44514 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 100534 - 100381
Alignment:
Q  75 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-t 173  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  || ||| | ||||||| |    
T  100534 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcct 100438  T
Q  174 gtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
     ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100437 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 100381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 229
Target Start/End: Original strand, 40135 - 40288
Alignment:
Q  75 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-t 173  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || ||| |  |||||| |    
T  40135 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcctactgcct 40231  T
Q  174 gtgttgttgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40232 atgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatg 40288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 101561 - 101506
Alignment:
Q  175 tgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  101561 tgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatg 101506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 119928 - 119882
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  119928 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 119882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 88)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 9707538 - 9707758
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9707538 atgattgatgaagttttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 9707636  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  9707637 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagct 9707736  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9707737 gcatgagtcggtctaagttgat 9707758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12567791 - 12567571
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567791 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 12567693  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  12567692 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagct 12567593  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12567592 gcatgagtcggtctaagttgat 12567571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13544256 - 13544036
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544256 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 13544158  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  13544157 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagct 13544058  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13544057 gcatgagtcggtctaagttgat 13544036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 16454212 - 16454432
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16454212 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 16454310  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16454311 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagtt 16454410  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16454411 gcatgagtcggtctaagttgat 16454432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17463409 - 17463189
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17463409 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 17463311  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  17463310 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 17463211  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17463210 gcatgagtcggtctaagttgat 17463189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 45606838 - 45607058
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45606838 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 45606936  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  45606937 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 45607036  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  45607037 gcatgagtcggtctaagttgat 45607058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 7781278 - 7781498
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7781278 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 7781376  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  7781377 ttatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 7781476  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7781477 gcatgagtcggtctaagttgat 7781498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8899325 - 8899105
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8899325 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 8899227  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  8899226 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 8899127  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  8899126 gcatgagtcggtctaaattgat 8899105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34159557 - 34159337
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34159557 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 34159459  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  34159458 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 34159359  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34159358 gcatgagtcggtctaagttgat 34159337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 38961822 - 38962042
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38961822 atgattgatgaagtattatatgtatatat-gatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 38961920  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  38961921 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 38962020  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  38962021 gcatgagtcggtctaagttgat 38962042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 55476722 - 55476502
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55476722 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 55476624  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  55476623 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 55476524  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  55476523 gcatgagtcggtctaagttgat 55476502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 6469065 - 6469285
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  6469065 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttcaa 6469163  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  6469164 ttatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 6469263  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6469264 gcatgagtcggtctaagttgat 6469285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 10247654 - 10247874
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10247654 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 10247752  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |    
T  10247753 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttatttaactaagct 10247852  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  10247853 gtatgagtcggtctaagttgat 10247874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 16282742 - 16282962
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16282742 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 16282840  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16282841 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 16282940  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16282941 gcatgagtcggtctaagttgat 16282962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 28848542 - 28848762
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28848542 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaa 28848640  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  28848641 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 28848740  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28848741 gcatgagtcggtctaagttgat 28848762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 13154186 - 13154407
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13154186 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 13154284  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaact-aagt 199  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||     
T  13154285 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagc 13154384  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  13154385 tgcatgagtcggtctaagttgat 13154407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41124118 - 41123901
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41124118 atgattggtgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 41124020  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| |    
T  41124019 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgt---tgttatttaactaagct 41123923  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  41123922 gcatgagtcggtctaagttgat 41123901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Original strand, 13151726 - 13151942
Alignment:
Q  6 tgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcata 105  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  13151726 tgatgaagtgtgatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattata 13151824  T
Q  106 tgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaact-aagttgcat 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  13151825 tgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcat 13151924  T
Q  205 gagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13151925 gagtcggtctaagttgat 13151942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 222
Target Start/End: Original strand, 17446614 - 17446805
Alignment:
Q  30 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttga 129  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17446614 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttga 17446713  T
Q  130 cttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17446714 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgat 17446805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 50243014 - 50242833
Alignment:
Q  41 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttga 140  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  50243014 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 50242915  T
Q  141 tattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50242914 tattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 50242833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17672805 - 17672637
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 153  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17672805 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtca 17672706  T
Q  154 ttctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17672705 tgctgtttttgtatactgctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17672637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8499751 - 8499529
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttga 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||      
T  8499751 atgattaatgaagttttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattaattag 8499653  T
Q  100 atcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 198  Q
    || || |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  8499652 attatctgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaag 8499553  T
Q  199 ttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  8499552 ctgcatgagtcggtctaagttgat 8499529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15412662 - 15412440
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||      
T  15412662 atgattgatgaagttttatatgtatatat-gaagttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattag 15412564  T
Q  100 atcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 198  Q
    || || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  15412563 attatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaag 15412464  T
Q  199 ttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  15412463 ctgcatgagtcggtctaagttgat 15412440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Original strand, 29172565 - 29172734
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172565 atttgatgttgatagtattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 29172664  T
Q  153 attctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29172665 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 29172734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 217
Target Start/End: Original strand, 53070636 - 53070799
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 153  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53070636 atttgatgttgttagattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtct 53070735  T
Q  154 ttctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |  ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53070736 tgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Original strand, 12119707 - 12119876
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  || || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12119707 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 12119806  T
Q  153 attctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12119807 atgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12119876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Original strand, 43550448 - 43550625
Alignment:
Q  41 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttga 140  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43550448 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 43550547  T
Q  141 tattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||| | ||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43550548 tattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43550625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27165483 - 27165261
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttga 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||| |    
T  27165483 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttaa 27165385  T
Q  100 atcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaa 197  Q
    || |||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||  || ||||| |||||| || | ||| || |||||||||||||||    
T  27165384 attatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttg-ttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaa 27165286  T
Q  198 gttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  27165285 gctgcatgagtcggtctaagttgat 27165261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 53301435 - 53301658
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttga 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | | |||||||    
T  53301435 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccattttatgttgtttatattgtgatataattgtatacgtaatacttga 53301533  T
Q  100 atcatatgtgaataattgagatgttgt-tgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgtt-gttatttaacta 196  Q
    || |||| |||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| ||||  |||||| | |||||| || ||||| |||| ||||||||||||    
T  53301534 attatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttatttaacta 53301632  T
Q  197 agttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  53301633 agttgtatgagtcggtctaagttgat 53301658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14973020 - 14972861
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||   || |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14973020 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14972921  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14972920 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 14972861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 103 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15977645 - 15977526
Alignment:
Q  103 atatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgc 202  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  15977645 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgc 15977546  T
Q  203 atgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15977545 atgagtcggtctaagttgat 15977526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 222
Target Start/End: Original strand, 40213676 - 40213827
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||| || ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  40213676 tgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatact 40213775  T
Q  171 gctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  40213776 gctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 40213827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 56 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43841114 - 43840944
Alignment:
Q  56 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43841114 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 43841015  T
Q  155 tctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 224  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  43841014 gctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatga 43840944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17488022 - 17487863
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17488022 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17487923  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17487922 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 17487863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17499504 - 17499345
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17499504 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17499405  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17499404 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 17499345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26687069 - 26686902
Alignment:
Q  56 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||   ||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26687069 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 26686970  T
Q  155 tctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 221  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26686969 gctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 26686902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 120 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500953
Alignment:
Q  120 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 55500956  T
Q  220 gat 222  Q
    |||    
T  55500955 gat 55500953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 42386593 - 42386428
Alignment:
Q  55 tttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 153  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42386593 tttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtca 42386494  T
Q  154 ttctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 218  Q
    | |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42386493 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 14576788 - 14576946
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||  |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  14576788 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatact 14576886  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14576887 gtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgatgttgatg 14576946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 23083316 - 23083475
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||| |||  | |  |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083316 tgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatact 23083415  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23083416 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23083475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 25476340 - 25476499
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25476340 tgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25476439  T
Q  171 -gctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
      |||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25476440 acctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatg 25476499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 91 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 36166739 - 36166609
Alignment:
Q  91 attacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatt 190  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36166739 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatt 36166641  T
Q  191 taactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36166640 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 36166609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13442440 - 13442281
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13442440 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 13442341  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13442340 gcctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 13442281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21618590 - 21618460
Alignment:
Q  91 attacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatt 190  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  21618590 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatt 21618492  T
Q  191 taactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21618491 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21618460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 86 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12399360 - 12399216
Alignment:
Q  86 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgtt 184  Q
    ||||||||||||||    ||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| ||||    
T  12399360 tatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt 12399261  T
Q  185 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12399260 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 12399216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 118 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18438653 - 18438541
Alignment:
Q  118 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18438653 agatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 18438554  T
Q  217 gttgatgatgatg 229  Q
    |||||||| ||||    
T  18438553 gttgatgaagatg 18438541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 86 - 229
Target Start/End: Original strand, 20698405 - 20698549
Alignment:
Q  86 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||  | |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  20698405 tatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 20698504  T
Q  185 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20698505 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 20698549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 115 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10557104 - 10556996
Alignment:
Q  115 ttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtc 213  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10557104 ttgagatgttgattggcttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctgatgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 10557005  T
Q  214 taagttgat 222  Q
    |||||||||    
T  10557004 taagttgat 10556996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14572717 - 14572595
Alignment:
Q  108 tgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatga 206  Q
    |||||| || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  14572717 tgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 14572619  T
Q  207 gtcggtctaagttgatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  14572618 gtcggtctaagttgatgttgatgt 14572595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Original strand, 24340660 - 24340826
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  24340660 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 24340759  T
Q  153 attctgtttttgtatactgc-tgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 218  Q
    ||  || || || ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  24340760 atgatg-ttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 24340826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 217
Target Start/End: Original strand, 52523666 - 52523831
Alignment:
Q  56 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  52523666 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 52523765  T
Q  155 --tctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
       ||| ||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52523766 gaactg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 222
Target Start/End: Original strand, 24153164 - 24153315
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||| ||  ||| ||||||| |||||  |||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  24153164 tgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 24153262  T
Q  171 -gctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
      || ||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24153263 acctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24153315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494820
Alignment:
Q  134 catttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgat 44494820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23274871 - 23274705
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  23274871 atttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 23274772  T
Q  153 attctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 218  Q
    ||  || ||||| |||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23274771 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 11424718 - 11424873
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||||||||||||||| |   ||||  |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  11424718 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgagatgttgat---ttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatact 11424813  T
Q  171 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11424814 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 11424873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 54521053 - 54520985
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54521053 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 54520985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737247
Alignment:
Q  135 atttgatattattatgtcattctgtttttgta---tactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||   || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17737247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 154
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051237
Alignment:
Q  56 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 2051237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 29544773 - 29544839
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttat 68  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29544773 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttat 29544839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16097509 - 16097335
Alignment:
Q  56 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | ||    
T  16097509 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgat 16097411  T
Q  155 tctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
      || ||| | ||| ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097410 gatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 16097335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 117
Target Start/End: Original strand, 17248224 - 17248287
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17248224 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaataattg 17248287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 12305376 - 12305315
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt 63  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12305376 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt 12305315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 111 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32307802 - 32307683
Alignment:
Q  111 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32307802 ataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 32307705  T
Q  209 cggtctaagttgatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  32307704 cggtctaagttgatgatgatgt 32307683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Original strand, 37642202 - 37642303
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  37642202 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 37642301  T
Q  153 at 154  Q
    ||    
T  37642302 at 37642303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 154
Target Start/End: Original strand, 22147474 - 22147563
Alignment:
Q  65 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||    
T  22147474 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcat 22147563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15471046 - 15470931
Alignment:
Q  115 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcggt 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15471046 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggt 15470948  T
Q  213 ctaagttgatgatgatg 229  Q
    ||||||||| |||||||    
T  15470947 ctaagttgaagatgatg 15470931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16103960 - 16103787
Alignment:
Q  56 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||  ||||| || | ||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  16103960 ttgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttga-tatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcat 16103863  T
Q  155 tctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
      || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103862 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 16103787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Original strand, 12174327 - 12174373
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174327 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 12174373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 15977764 - 15977696
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  15977764 atgattgataaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatat 15977696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 46822394 - 46822279
Alignment:
Q  108 tgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatga 206  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |  ||||  ||||  |||| | || || | ||||||||||||||||||||||||    
T  46822394 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 46822295  T
Q  207 gtcggtctaagttgat 222  Q
    ||| ||||||||||||    
T  46822294 gtcagtctaagttgat 46822279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Original strand, 49668144 - 49668190
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49668144 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatg 49668190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 10557139 - 10557091
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  10557139 atgattgatgaagttttatatgtatata-tgatgttttgagatgttgatt 10557091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 222
Target Start/End: Original strand, 45577948 - 45577989
Alignment:
Q  181 tgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45577948 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45577989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 11913981 - 11914051
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaa--gatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11913981 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 11914051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28194743 - 28194704
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28194743 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28194704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9512973 - 9512927
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9512973 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatg 9512927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9520948 - 9520902
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9520948 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatg 9520902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Original strand, 13210395 - 13210441
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13210395 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 13210441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12511176 - 12511071
Alignment:
Q  118 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 216  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |  ||||  ||||  |||| | || || | |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  12511176 agatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaa 12511077  T
Q  217 gttgat 222  Q
    ||||||    
T  12511076 gttgat 12511071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30029939 - 30029855
Alignment:
Q  138 tgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 221  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||  ||| || || || | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30029939 tgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 30029855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 46822492 - 46822445
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgat 49  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  46822492 atgattgatgaagtgttatatgtatgta-tgatgttttaagatgttgat 46822445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 230
Target Start/End: Original strand, 1644733 - 1644788
Alignment:
Q  175 tgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  1644733 tgttgttgttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatgacgatgt 1644788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 43926123 - 43926043
Alignment:
Q  73 tgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||  ||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  43926123 tgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 43926043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 209
Target Start/End: Original strand, 3390002 - 3390030
Alignment:
Q  181 tgttgttatttaactaagttgcatgagtc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390002 tgttgttatttaactaagttgcatgagtc 3390030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Original strand, 8489530 - 8489574
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  8489530 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 8489574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12339513 - 12339469
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  12339513 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 12339469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15464912 - 15464868
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  15464912 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 15464868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15482709 - 15482665
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  15482709 ttgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagttgatgatga 15482665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9473 - 9253
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9473 atgattgatgaagtgttatatgtatat-ttgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaa 9375  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  9374 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 9275  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9274 gcatgagtcggtctaagttgat 9253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20978 - 20758
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20978 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 20880  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  20879 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 20780  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20779 gcatgagtcggtctaagttgat 20758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 38052 - 37832
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38052 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 37954  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  37953 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 37854  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  37853 gcatgagtcggtctaagttgat 37832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 85)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 456552 - 456332
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  456552 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 456454  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  456453 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 456354  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  456353 gcatgagtcggtctaagttgat 456332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 11393218 - 11393438
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11393218 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 11393316  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  11393317 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 11393416  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11393417 gcatgagtcggtctaagttgat 11393438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 15376644 - 15376864
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15376644 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 15376742  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  15376743 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 15376842  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15376843 gcatgagtcggtctaagttgat 15376864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16232751 - 16232531
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16232751 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 16232653  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16232652 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 16232553  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16232552 gcatgagtcggtctaagttgat 16232531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 20385054 - 20385274
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20385054 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 20385152  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  20385153 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 20385252  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20385253 gcatgagtcggtctaagttgat 20385274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 21189526 - 21189746
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21189526 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 21189624  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  21189625 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 21189724  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21189725 gcatgagtcggtctaagttgat 21189746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32125722 - 32125502
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32125722 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 32125624  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  32125623 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 32125524  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  32125523 gcatgagtcggtctaagttgat 32125502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41523148 - 41522928
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41523148 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 41523050  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  41523049 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 41522950  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  41522949 gcatgagtcggtctaagttgat 41522928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41525610 - 41525390
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41525610 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 41525512  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  41525511 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 41525412  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  41525411 gcatgagtcggtctaagttgat 41525390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 14949053 - 14949273
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14949053 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 14949151  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  14949152 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 14949251  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14949252 gcatgagtcggtctaagttgat 14949273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18640503 - 18640283
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18640503 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattattttatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 18640405  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  18640404 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 18640305  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18640304 gcatgagtcggtctaagttgat 18640283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24702469 - 24702249
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24702469 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 24702371  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  24702370 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 24702271  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24702270 gcatgagtcggtctaagttgat 24702249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27217091 - 27216871
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27217091 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 27216993  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  27216992 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 27216893  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  27216892 gcatgagttggtctaagttgat 27216871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11972727 - 11972507
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11972727 atgattgatgaagtgttacatgtatatat-gatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 11972629  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  11972628 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 11972529  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11972528 gcatgagtcggtctaagttgat 11972507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16213915 - 16213695
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213915 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttcatatgttgattaccatttgatgttgttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaa 16213817  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16213816 ttatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagct 16213717  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16213716 gcatgagtcggtctaagttgat 16213695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18430943 - 18430723
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18430943 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 18430845  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  18430844 ttatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 18430745  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18430744 gcatgagtcggtctaagttgat 18430723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16410290 - 16410070
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16410290 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactatgatataattgtatatgtattacttgaa 16410192  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16410191 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 16410092  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16410091 gcatgagtcggtctaagttgat 16410070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24704916 - 24704699
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24704916 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 24704818  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  24704817 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc---ttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 24704721  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24704720 gcatgagtcggtctaagttgat 24704699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13869579 - 13869357
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||      
T  13869579 atgattgatgaagttttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattag 13869481  T
Q  100 atcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 198  Q
    || || | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  13869480 attatctttgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaag 13869381  T
Q  199 ttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  13869380 ctgcatgagtcggtctaagttgat 13869357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 44116688 - 44116520
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116688 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 44116589  T
Q  154 ttctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44116588 tgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44116520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13647521 - 13647344
Alignment:
Q  41 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttga 140  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13647521 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 13647422  T
Q  141 tattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13647421 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Original strand, 26355915 - 26356090
Alignment:
Q  4 attgatgaagttttatatgtatatat-tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatc 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  26355915 attgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatt 26356014  T
Q  103 atatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgtt 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  26356015 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtt 26356090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Original strand, 26358367 - 26358542
Alignment:
Q  4 attgatgaagttttatatgtatatat-tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatc 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  26358367 attgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatt 26358466  T
Q  103 atatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgtt 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  26358467 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtt 26358542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 55 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3386511 - 3386344
Alignment:
Q  55 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3386511 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcat 3386412  T
Q  155 tctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
     |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3386411 gctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3386344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 84 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275182
Alignment:
Q  84 tatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgt 183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 24275221  T
Q  184 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24275220 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24275182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Original strand, 38898359 - 38898528
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38898359 atttgacgttgttatactgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 38898458  T
Q  153 attctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  38898459 atgctgtttttatatactgctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 38898528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Original strand, 17061898 - 17062066
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17061898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtca 17061997  T
Q  154 ttctgtttttgtatactgctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    | ||  ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17061998 tgct-attttgtatactgctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17062066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 54 - 217
Target Start/End: Original strand, 12756654 - 12756817
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12756654 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtca 12756753  T
Q  154 ttctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |  |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  12756754 tgttgtttttgtatattgttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 56 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20110723 - 20110567
Alignment:
Q  56 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  20110723 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatg 20110624  T
Q  156 ctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||          | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20110623 ctgtttttgtata----------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20110567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 3564319 - 3564478
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3564319 tgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 3564418  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3564419 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 3564478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 114 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 48273512 - 48273403
Alignment:
Q  114 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  48273512 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  213 ctaagttgat 222  Q
    ||||||||||    
T  48273412 ctaagttgat 48273403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 107 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13831499 - 13831384
Alignment:
Q  107 gtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatga 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13831499 gtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 13831400  T
Q  207 gtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||| |||||    
T  13831399 gtcggtctaaattgat 13831384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12698998 - 12698838
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgt-ttttgtatac 169  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12698998 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatac 12698899  T
Q  170 tgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12698898 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 12698838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 221
Target Start/End: Original strand, 2280056 - 2280225
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  2280056 atttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatc 2280155  T
Q  153 attctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 221  Q
    || ||| ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2280156 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 2280225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 65 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26212168 - 26212012
Alignment:
Q  65 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttg 164  Q
    ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26212168 ttataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttg 26212069  T
Q  165 tatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 220  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26212068 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttg 26212012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9509355 - 9509196
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    ||||||||| |  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  9509355 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatact 9509256  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9509255 gcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 9509196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 15081878 - 15082019
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaa--gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttg 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  15081878 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattg 15081976  T
Q  99 aatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttga 140  Q
    ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  15081977 aattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttga 15082019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38227646 - 38227488
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    ||||||||||| |||| | ||||| |||||  |||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  38227646 tgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 38227548  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  38227547 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatg 38227488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 222
Target Start/End: Original strand, 18456368 - 18456519
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  18456368 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 18456466  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    | || ||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18456467 gcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18456519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 13841243 - 13841157
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatat 88  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13841243 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatat 13841157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10589158 - 10589055
Alignment:
Q  118 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 216  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  10589158 agatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaa 10589059  T
Q  217 gttg 220  Q
    ||||    
T  10589058 gttg 10589055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 11303478 - 11303409
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 71  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11303478 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 11303409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 15144037 - 15144143
Alignment:
Q  115 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||| ||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15144037 ttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgagatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 15144136  T
Q  215 aagttga 221  Q
    |||||||    
T  15144137 aagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 18627796 - 18627717
Alignment:
Q  2 tgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 82  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18627796 tgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattagtatttgatcttgttatattgtgatataatt 18627717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 16108620 - 16108688
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16108620 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccgtttgatgttgttatat 16108688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 29796841 - 29796771
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatat-tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29796841 atgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29796771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 29800660 - 29800590
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatat-tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29800660 atgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29800590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 14269993 - 14270061
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14269993 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 14270061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22073036 - 22072927
Alignment:
Q  115 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||| || || |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  22073036 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagt 22072937  T
Q  213 ctaagttgat 222  Q
    ||||||||||    
T  22072936 ctaagttgat 22072927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 214
Target Start/End: Original strand, 12255730 - 12255892
Alignment:
Q  56 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||||    
T  12255730 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcat 12255829  T
Q  155 -tctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtct 214  Q
       |   |||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  12255830 gaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 8468871 - 8468803
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8468871 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttatgatgttgattattatttgatgttgttatat 8468803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18005806 - 18005653
Alignment:
Q  75 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctg 174  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || |||   ||||||||     
T  18005806 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttcc-atactgctt 18005710  T
Q  175 -tgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
     ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005709 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 18005653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Original strand, 19486681 - 19486782
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  19486681 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 19486780  T
Q  153 at 154  Q
    ||    
T  19486781 at 19486782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 23664884 - 23664952
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23664884 atgattgatgaaaggttatatgtatatat-gatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 23664952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 15113114 - 15113031
Alignment:
Q  65 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 149  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15113114 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaata-ttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 15113031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 229
Target Start/End: Original strand, 16386239 - 16386362
Alignment:
Q  108 tgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatg 205  Q
    |||||| || |||||||| |||  | || |||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16386239 tgaatatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatg 16386338  T
Q  206 agtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||    
T  16386339 agtcggtctaagttgttgaagatg 16386362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44014240 - 44014185
Alignment:
Q  175 tgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014240 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 44014185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 67868 - 67759
Alignment:
Q  114 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcgg 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  67868 attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 67770  T
Q  212 tctaagttgat 222  Q
    |||||||||||    
T  67769 tctaagttgat 67759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Original strand, 811199 - 811245
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811199 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 811245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 221
Target Start/End: Original strand, 1867932 - 1868101
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| || ||  ||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||    
T  1867932 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttcatttgca-ttgatattgttatatc 1868029  T
Q  153 at--tctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 221  Q
    ||   ||| |||| ||||||| || |||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1868030 atgagctg-ttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 229
Target Start/End: Original strand, 16219719 - 16219831
Alignment:
Q  118 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 215  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16219719 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtcta 16219817  T
Q  216 agttgatgatgatg 229  Q
    |||||| |||||||    
T  16219818 agttgaagatgatg 16219831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 15116651 - 15116568
Alignment:
Q  65 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 149  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  15116651 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcaattgatattgttat 15116568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Original strand, 10063760 - 10063921
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||      |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||    
T  10063760 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgt-----ttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatc 10063854  T
Q  153 attctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 218  Q
    ||  || || || |||| | || ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10063855 atgatg-ttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 10063921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16495581 - 16495421
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 153  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| | |  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  16495581 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 16495486  T
Q  154 ttctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |  || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16495485 tgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16495421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40443541 - 40443410
Alignment:
Q  86 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttg-t 183  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| |||  ||||| |||||| | ||||| || |    
T  40443541 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcgtatgttgctgtt 40443444  T
Q  184 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40443443 tgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 40443410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16056449 - 16056343
Alignment:
Q  115 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||||  | ||| || || ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16056449 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttt--gcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggt 16056352  T
Q  213 ctaagttga 221  Q
    |||||||||    
T  16056351 ctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 47831925 - 47831821
Alignment:
Q  119 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 216  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||  || | | | |||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47831925 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatat-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 47831827  T
Q  217 gttgat 222  Q
    ||||||    
T  47831826 gttgat 47831821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 8940405 - 8940335
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaa--gatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8940405 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 8940335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 38898159 - 38898229
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaa--gatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38898159 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 38898229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Original strand, 28505366 - 28505412
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28505366 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatg 28505412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34200839 - 34200793
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34200839 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 34200793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Original strand, 15008436 - 15008535
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| || ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||    
T  15008436 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgaggtgttgttgatttgca-ttgatattgttatatc 15008533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 45847692 - 45847739
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgatt 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  45847692 atgattgatgaagttttatatgtatata-tgatg-tttaagatgttgatt 45847739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 229
Target Start/End: Original strand, 11996086 - 11996141
Alignment:
Q  175 tgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  11996086 tgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 11996141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Original strand, 14932802 - 14932841
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14932802 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgat 14932841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Original strand, 15356237 - 15356276
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15356237 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgat 15356276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Original strand, 15360351 - 15360390
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15360351 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgat 15360390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Original strand, 20220127 - 20220224
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| || ||  ||||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  20220127 atttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatc 20220222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15755001
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatg 15755001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Original strand, 26356096 - 26356145
Alignment:
Q  173 tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||| |||||    
T  26356096 tgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgat 26356145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Original strand, 26358548 - 26358597
Alignment:
Q  173 tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||| |||||    
T  26358548 tgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgat 26358597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Original strand, 1859144 - 1859188
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  1859144 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 1859188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Original strand, 13635529 - 13635573
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  13635529 ttgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagttgatgatga 13635573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Original strand, 13918838 - 13918882
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  13918838 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 13918882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Original strand, 25927561 - 25927605
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  25927561 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 25927605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 64)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 264699 - 264919
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  264699 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 264797  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  264798 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 264897  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  264898 gcatgagtcggtctaagttgat 264919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32027624 - 32027404
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32027624 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 32027526  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027525 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttatttaactaagtt 32027426  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  32027425 gtatgagtcggtctaagttgat 32027404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 42245296 - 42245516
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42245296 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 42245394  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42245395 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagtt 42245494  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  42245495 gcatgagtcggtctaagttgat 42245516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 39363615 - 39363395
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39363615 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 39363517  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  39363516 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 39363417  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  39363416 gcatgagtcggtctaagttgat 39363395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 10732871 - 10733091
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10732871 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatacggtgatataattgtatatgcattacttgaa 10732969  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  10732970 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 10733069  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10733070 gcatgagtcggtctaagttgat 10733091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20909243 - 20909023
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20909243 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 20909145  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |    
T  20909144 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgcttttgttatttaactaagct 20909045  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20909044 gcatgagtcggtctaagttgat 20909023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29346211 - 29345991
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29346211 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 29346113  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |    
T  29346112 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttgttatttaactaagct 29346013  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  29346012 gtatgagtcggtctaagttgat 29345991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29348684 - 29348464
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29348684 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 29348586  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||| |    
T  29348585 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttatttaactaagct 29348486  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  29348485 gtatgagtcggtctaagttgat 29348464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29351157 - 29350937
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29351157 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 29351059  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||| |    
T  29351058 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttatttaactaagct 29350959  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  29350958 gtatgagtcggtctaagttgat 29350937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 39245367 - 39245147
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  39245367 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaa 39245269  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  39245268 ttatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 39245169  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  39245168 gcatgagtcggtctaagttgat 39245147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29330162 - 29329945
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29330162 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgattatta---tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 29330067  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  29330066 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 29329967  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29329966 gcatgagtcggtctaagttgat 29329945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 20917883 - 20918099
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20917883 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgctttacttgaa 20917981  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | | |||||||||||||||| ||||||||||    ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  20917982 ttagatgtgaataattgagacgttgttgact----ttttatattattttgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 20918077  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20918078 gcatgagtcggtctaagttgat 20918099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23064744 - 23064522
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||      
T  23064744 atgattgatgaagttttatatgtatatatt-atgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattag 23064646  T
Q  100 atcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 198  Q
    || || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23064645 attatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatttaactaag 23064546  T
Q  199 ttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  23064545 ctgcatgagtcggtctaagttgat 23064522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 38619667 - 38619445
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||| | ||      
T  38619667 atgattgatgaagttttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattggaatataattgtatatgcatcaattag 38619569  T
Q  100 atcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaag 198  Q
    || || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  38619568 attatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatttaactaag 38619469  T
Q  199 ttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  38619468 ctgcatgagtcggtctaagttgat 38619445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Original strand, 36154766 - 36154931
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 153  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154766 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 36154865  T
Q  154 ttctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36154866 tgctgtttttgtatactgctg---tgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 36154931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 54 - 221
Target Start/End: Original strand, 20901991 - 20902159
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaa-taattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20901991 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtc 20902090  T
Q  153 attctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 221  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20902091 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20902159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 56 - 222
Target Start/End: Original strand, 11581184 - 11581350
Alignment:
Q  56 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  11581184 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatg 11581283  T
Q  156 ctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11581284 ttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 11581350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Original strand, 2154596 - 2154765
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaa-taattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2154596 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtc 2154695  T
Q  153 attctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2154696 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 2154765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 59 - 222
Target Start/End: Original strand, 18319021 - 18319185
Alignment:
Q  59 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcattct 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18319021 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 18319120  T
Q  158 gtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18319121 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 18319185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31061248 - 31061079
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| || ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31061248 atttgatgttgttatattgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 31061149  T
Q  153 attctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    || ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31061148 atgctgtttttgtatactactgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 31061079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Original strand, 10775659 - 10775827
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10775659 atttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 10775757  T
Q  153 attctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    || ||| |||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10775758 atgctggttttatatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 10775827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 59 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24067282 - 24067118
Alignment:
Q  59 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcattct 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  24067282 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 24067183  T
Q  158 gtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  24067182 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgat 24067118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25421698 - 25421539
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25421698 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25421599  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25421598 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 25421539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 23390451 - 23390610
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23390451 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23390550  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23390551 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23390610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24529346 - 24529227
Alignment:
Q  111 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtc 209  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24529346 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 24529247  T
Q  210 ggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  24529246 ggtctaagttgatgaagatg 24529227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1096633 - 1096473
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||   || |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||    
T  1096633 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatact 1096534  T
Q  171 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgt 230  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1096533 acctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgt 1096473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9078118 - 9077959
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| | ||   || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  9078118 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 9078019  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  9078018 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatg 9077959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 21729019 - 21729178
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21729019 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21729118  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21729119 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 21729178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 21808344 - 21808503
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21808344 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21808443  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21808444 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 21808503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 71 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25431560 - 25431414
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25431560 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25431461  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 216  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431460 gcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 8286797 - 8286957
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgttttt-gtatac 169  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  || | ||| || || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8286797 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatac 8286896  T
Q  170 tgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8286897 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 8286957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24493734 - 24493576
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |||||||  |||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  24493734 tgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 24493636  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| | |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24493635 gcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 24493576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 129 - 229
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997648
Alignment:
Q  129 acttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 21997646  T
Q  228 tg 229  Q
    ||    
T  21997647 tg 21997648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22412329 - 22412198
Alignment:
Q  91 attacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttat 189  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||| | |||||    
T  22412329 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttatcgttat 22412231  T
Q  190 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22412230 ttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 22412198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13025476 - 13025318
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| |||||  |||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||    
T  13025476 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatact 13025378  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13025377 gcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 13025318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13095660 - 13095502
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| |||||  |||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||    
T  13095660 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatact 13095562  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13095561 gcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 13095502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22075185 - 22075035
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatac- 169  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||     
T  22075185 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatact 22075086  T
Q  170 tgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 220  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22075085 tcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttg 22075035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22144215 - 22144068
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||  || ||||| |||||    
T  22144215 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatact 22144117  T
Q  171 -gctgtgttgttgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
      || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22144116 acctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 40726037 - 40725936
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  40726037 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 40725938  T
Q  153 at 154  Q
    ||    
T  40725937 at 40725936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21565723 - 21565549
Alignment:
Q  56 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  21565723 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 21565625  T
Q  155 tctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
      || ||| | ||||||| | ||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565624 gatgatttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 21565549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 178
Target Start/End: Original strand, 20766095 - 20766181
Alignment:
Q  91 attacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgtt 178  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  20766095 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgtt 20766181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 9776589 - 9776521
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9776589 atgattggtgaagggttatatgtatatat-gatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 9776521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 217
Target Start/End: Original strand, 22178161 - 22178323
Alignment:
Q  58 gatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat-- 154  Q
    |||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||      
T  22178161 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatga 22178259  T
Q  155 tctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
     ||| |||| ||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22178260 gctg-ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Original strand, 22959600 - 22959646
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959600 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 22959646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18418678 - 18418594
Alignment:
Q  138 tgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttattt-aactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18418678 tgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgat 18418594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 217
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027043
Alignment:
Q  119 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatt--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtct 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttgg-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 20027040  T
Q  215 aag 217  Q
    |||    
T  20027041 aag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 217
Target Start/End: Original strand, 21292992 - 21293071
Alignment:
Q  137 ttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21292992 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaag 21293071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 37724050 - 37723909
Alignment:
Q  88 tgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgt-tg 185  Q
    |||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||| || ||||||| |||||   ||||||||| | ||||| ||| ||    
T  37724050 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtctg 37723954  T
Q  186 ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||| |||||    
T  37723953 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatgt 37723909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 37804834 - 37804902
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  37804834 atgattaatgaagcgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttaattagaatttgatgttgttatat 37804902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 222
Target Start/End: Original strand, 17517193 - 17517308
Alignment:
Q  108 tgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatga 206  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| | |||||  ||||  |||| | || || | |||||||| |||||||||||||||    
T  17517193 tgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 17517292  T
Q  207 gtcggtctaagttgat 222  Q
    ||| ||||||||||||    
T  17517293 gtcagtctaagttgat 17517308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19668960 - 19668905
Alignment:
Q  175 tgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19668960 tgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatg 19668905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Original strand, 21329565 - 21329604
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21329565 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21329604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Original strand, 19660903 - 19660949
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19660903 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 19660949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 17517095 - 17517142
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgat 49  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  17517095 atgattgatgaagtgttatatgtatgta-tgatgttttaagatgttgat 17517142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Original strand, 23535647 - 23535691
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  23535647 ttgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagttgatgatga 23535691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36314630 - 36314596
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36314630 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 36314596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 222
Target Start/End: Original strand, 20806852 - 20806893
Alignment:
Q  181 tgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20806852 tgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgat 20806893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18356004 - 18355960
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  18356004 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 18355960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18356485 - 18356389
Alignment:
Q  65 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgttt 161  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||||| |   |||| |||||| |  |||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| ||||||    
T  18356485 ttataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgttt 18356389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Original strand, 20911229 - 20911273
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  20911229 ttgttatttaactaagttgcatgagtatgaataagttgatgatga 20911273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 222
Target Start/End: Original strand, 21502231 - 21502263
Alignment:
Q  190 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21502231 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21502263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26680633 - 26680605
Alignment:
Q  181 tgttgttatttaactaagttgcatgagtc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680633 tgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26680605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Original strand, 26742806 - 26742850
Alignment:
Q  184 tgttatttaactaagttgcatgagtc-ggtctaagttgatgatga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  26742806 tgttatttaactaagttgcatgagtctgaactaagttgatgatga 26742850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26952240 - 26952212
Alignment:
Q  181 tgttgttatttaactaagttgcatgagtc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26952240 tgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26952212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14178 - 13958
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14178 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 14080  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  14079 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttatctaagct 13980  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13979 gcatgagtcggtctaagttgat 13958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 501315 - 501095
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501315 atgattgatgatgtgttatatgtatatata-atgttttaagatgttgattactatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 501217  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  501216 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagct 501117  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  501116 gcatgagtcggtctaagttgat 501095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Original strand, 85562 - 85731
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  85562 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 85661  T
Q  153 attctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  85662 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 85731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 160805 - 160691
Alignment:
Q  115 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 212  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| | ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  160805 ttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggt 160708  T
Q  213 ctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  160707 ctaagttgatgatgatg 160691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 173338 - 173294
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  173338 ttgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagttgatgatga 173294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 136911 - 136691
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  136911 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 136813  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  136812 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 136713  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  136712 gcatgagtcggtctaagttgat 136691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 139380 - 139160
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  139380 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 139282  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  139281 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 139182  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  139181 gcatgagtcggtctaagttgat 139160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 144318 - 144098
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  144318 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 144220  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  144219 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 144120  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  144119 gcatgagtcggtctaagttgat 144098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 134442 - 134222
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  134442 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 134344  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  134343 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 134244  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  134243 gcatgagtcggtctatgttgat 134222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 141849 - 141629
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  141849 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 141751  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  141750 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 141651  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  141650 acatgagtcggtctaagttgat 141629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 132711 - 132665
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  132711 ttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatg 132665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Original strand, 12195 - 12400
Alignment:
Q  16 ttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataat 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  12195 ttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataat 12293  T
Q  116 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12294 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtcta 12393  T
Q  216 agttgat 222  Q
    |||||||    
T  12394 agttgat 12400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13623 - 13403
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13623 atgattgatgaagtgttacatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaa 13525  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  13524 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 13425  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13424 gcatgagtcggtctaagttgat 13403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 40631 - 40411
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40631 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gaagttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaa 40533  T
Q  101 tcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagtt 200  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  40532 ttttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagct 40433  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  40432 gcacgagtcggtctaagttgat 40411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12950 - 12906
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  12950 ttgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagttgatgatga 12906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19234 - 19190
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  19234 ttgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagttgatgatga 19190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 82264 - 82083
Alignment:
Q  41 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttga 140  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  82264 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 82165  T
Q  141 tattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  82164 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgat 82083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Original strand, 22610 - 22776
Alignment:
Q  56 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22610 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 22708  T
Q  155 tctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 221  Q
      || ||| | |||||| || ||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22709 gatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Original strand, 158433 - 158601
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158433 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 158532  T
Q  154 ttctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  158533 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 158601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 221
Target Start/End: Original strand, 339905 - 340053
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||| ||   || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  339905 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 340002  T
Q  171 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 221  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  340003 gcctatgttgttgt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 340053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 41 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 298 - 117
Alignment:
Q  41 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttga 140  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  298 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 199  T
Q  141 tattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  198 tattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgat 117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9929 - 9760
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaa-taattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9929 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtc 9830  T
Q  153 attctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9829 attctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 9760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33107 - 32949
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  33107 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 33009  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33008 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatg 32949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38926 - 38768
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  38926 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 38828  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| | ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  38827 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatg 38768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16963 - 16795
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 153  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 16864  T
Q  154 ttctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16863 tgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4476 - 4308
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 153  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4476 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtca 4377  T
Q  154 ttctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4376 tgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 4308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12250 - 12075
Alignment:
Q  41 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttga 140  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 12151  T
Q  141 tattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||      |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12150 tattattatgtcatgctgttttagtatactgctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 222
Target Start/End: Original strand, 1250 - 1432
Alignment:
Q  41 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttg 139  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  1250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttg 1349  T
Q  140 atattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1350 atattattatgtcatgctgtttttgtatactcatgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30111 - 29946
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  30111 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtca 30012  T
Q  154 ttctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 219  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30011 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 217
Target Start/End: Original strand, 79267 - 79430
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  79267 atttgatgttgttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtca 79366  T
Q  154 ttctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    | |||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  79367 tgctgtttttatatactgtcgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 17170 - 17331
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctg--tttttgtata 168  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  17170 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtata 17269  T
Q  169 ctg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17270 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 17331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 220
Target Start/End: Original strand, 161072 - 161239
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  161072 atttgatattgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 161171  T
Q  153 attctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 220  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  161172 attatgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 161239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Original strand, 164573 - 164674
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  164573 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 164672  T
Q  153 at 154  Q
    ||    
T  164673 at 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4393 - 4225
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4393 atttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 4295  T
Q  153 attctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    || ||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4294 atgctggttttgtatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 4225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 217
Target Start/End: Original strand, 20363 - 20524
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 153  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20363 atttgatgtt-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 20461  T
Q  154 ttctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |  || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20462 tgttg-ttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 128916 - 128765
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| | |||||||||||  |||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  |    
T  128916 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttt 128817  T
Q  171 gctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
      | ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  128816 tttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgat 128765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Original strand, 2111 - 2280
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2111 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattattatgtc 2210  T
Q  153 attctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2211 atgttgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgat 2280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Original strand, 17964 - 18130
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||    
T  17964 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 18063  T
Q  153 attctgtttttgtatactgc-tgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 218  Q
    ||  || || || ||| ||| | ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18064 atgatg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 18130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 38587 - 38809
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttga 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  38587 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttga 38685  T
Q  100 atcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaa 197  Q
    || |||| | |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||    
T  38686 attatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaa 38784  T
Q  198 gttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    | ||||||||| |||||||||||||    
T  38785 ggtgcatgagtaggtctaagttgat 38809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 71 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23048 - 22897
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23048 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22949  T
Q  171 gctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22948 ggtgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 71 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39642 - 39489
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  39642 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 39544  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 224  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39543 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 39489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 71 - 224
Target Start/End: Original strand, 75170 - 75323
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  75170 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 75268  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 224  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  75269 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 75323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 3106 - 3264
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  3106 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 3204  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3205 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 3264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13377 - 13218
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13377 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13278  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13277 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 13218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 4)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4673 - 4520
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4673 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 4574  T
Q  171 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 224  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4573 gcttgtgttgctgttgttatttaactaag-cgcatgagtcggtctaagttgatga 4520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12255 - 12102
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12255 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 12156  T
Q  171 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 224  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12155 gcttgtgttgctgttgttatttaactaag-cgcatgagtcggtctaagttgatga 12102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22207 - 22054
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22207 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 22108  T
Q  171 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 224  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22107 gcttgtgttgctgttgttatttaactaag-cgcatgagtcggtctaagttgatga 22054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Original strand, 18692 - 18736
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  18692 ttgttatttacctaagttgcatgagtctgaataagttgatgatga 18736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 52085 - 51920
Alignment:
Q  65 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttg 164  Q
    |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  52085 ttatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 51986  T
Q  165 tatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||| || || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51985 tatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 51920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 229
Target Start/End: Original strand, 167948 - 168092
Alignment:
Q  86 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgtt 184  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||    
T  167948 tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt 168047  T
Q  185 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  168048 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 168092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 229
Target Start/End: Original strand, 1018 - 1162
Alignment:
Q  86 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgtt 184  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||    
T  1018 tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt 1117  T
Q  185 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1118 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 1162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 91 - 222
Target Start/End: Original strand, 44682 - 44814
Alignment:
Q  91 attacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttgttat 189  Q
    ||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  44682 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttat 44781  T
Q  190 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44782 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 44814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 26020 - 26179
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||| ||   || ||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26020 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26119  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26120 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 16555 - 16714
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16555 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 16654  T
Q  171 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16655 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatg 16714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2017 - 1858
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2017 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1918  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1917 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 1858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 3141 - 3300
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||| ||   || ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3141 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 3240  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3241 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 3300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16278 - 16120
Alignment:
Q  72 gtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg 171  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| | ||   || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||    
T  16278 gtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactg 16179  T
Q  172 c-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16178 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 16120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 32913 - 33070
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| |||  |||  |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  32913 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 33010  T
Q  171 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    || ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33011 gcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 33070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 46092 - 45935
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| |||  |||  |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  46092 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 45995  T
Q  171 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    || ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45994 gcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 45935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Original strand, 17388 - 17443
Alignment:
Q  174 gtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17388 gtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatg 17443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 6076 - 6238
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6076 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 6175  T
Q  171 gc---tg-tgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
     |   || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6176 acctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 6238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 118 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28533 - 28421
Alignment:
Q  118 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 216  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28533 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 28434  T
Q  217 gttgatgatgatg 229  Q
    |||||||| ||||    
T  28433 gttgatgaagatg 28421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2050 - 2004
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  2050 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 2004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4559
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 4559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11345 - 11299
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  11345 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 11299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8481
Alignment:
Q  56 ttgatgttgtt-atattgtgatataat--tatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  8650 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 8551  T
Q  153 attctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 221  Q
    || ||| ||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8550 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6695 - 6542
Alignment:
Q  75 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-t 173  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| |    
T  6695 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 6599  T
Q  174 gtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
     ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6598 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 6542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5015 - 4856
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5015 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatact 4916  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4915 gcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 4856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3636 - 3477
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3636 tgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3537  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| | | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3536 gcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatg 3477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 508 - 361
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||   ||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  508 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctatttt-gtatact 410  T
Q  171 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 218  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  409 gcctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 91 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 116571 - 116441
Alignment:
Q  91 attacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatt 190  Q
    ||||||||||| ||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  116571 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatt 116473  T
Q  191 taactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  116472 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 116441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 53803 - 53873
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53803 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgtttaagtagatgttgattatcatttgatgttgttatat 53873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Original strand, 128907 - 129007
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  128907 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 129005  T
Q  153 at 154  Q
    ||    
T  129006 at 129007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 6178 - 6070
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  6178 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatttaattgcatatgcattacttgaa 6080  T
Q  101 tcatatgtga 110  Q
    | ||||||||    
T  6079 ttatatgtga 6070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Original strand, 8472 - 8643
Alignment:
Q  56 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8472 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 8571  T
Q  155 tctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
     ||||||||| |||||||     ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8572 gctgtttttg-atactgc--ctatgttgctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 8643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 221
Target Start/End: Original strand, 27686 - 27855
Alignment:
Q  54 atttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||    
T  27686 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatc 27785  T
Q  153 attctgtttttgtatact-gctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 221  Q
    || ||| ||||| |||||  || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27786 atgctg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 71 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26061 - 25908
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||    
T  26061 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatact 25963  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 224  Q
    | || ||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  25962 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatga 25908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40023 - 39865
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||    
T  40023 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatact 39925  T
Q  171 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| | |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  39924 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatg 39865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 71 - 172
Target Start/End: Original strand, 3485 - 3586
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3485 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3584  T
Q  171 gc 172  Q
    ||    
T  3585 gc 3586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 71 - 218
Target Start/End: Original strand, 24257 - 24406
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgt-ttttgtatac 169  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  24257 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatac 24356  T
Q  170 tg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 218  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24357 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 118 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8598 - 8486
Alignment:
Q  118 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact-gctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 216  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8598 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaa 8499  T
Q  217 gttgatgatgatg 229  Q
    |||||||| ||||    
T  8498 gttgatgaagatg 8486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13313 - 13147
Alignment:
Q  54 atttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaat-aattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgt 151  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||   || |||||||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  13313 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatat 13214  T
Q  152 cattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||| ||| ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13213 catgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 221
Target Start/End: Original strand, 16037 - 16206
Alignment:
Q  54 atttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||  ||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||    
T  16037 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatc 16136  T
Q  153 attctgtttttgtatact-gctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 221  Q
    ||  || ||||| |||||  || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16137 atgttg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 13165 - 13092
Alignment:
Q  76 tataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 149  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13165 tataattatatatgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1971
Alignment:
Q  86 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgtt 184  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  || |||||||||||| || ||| | ||||    
T  2103 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt 2004  T
Q  185 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2003 gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 217
Target Start/End: Original strand, 53486 - 53651
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  53486 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 53585  T
Q  153 attctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||  || ||||| |||||| || ||||| || |||||  ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  53586 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 56 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 13274 - 13157
Alignment:
Q  56 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13274 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 13175  T
Q  155 tctgtttttgtatactgc 172  Q
     |||||||||||||||||    
T  13174 gctgtttttgtatactgc 13157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 328 - 285
Alignment:
Q  181 tgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  328 tgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatga 285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34238 - 34130
Alignment:
Q  122 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 219  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||  ||   |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  34238 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-ggttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 34140  T
Q  220 gatgatgatg 229  Q
    | ||| ||||    
T  34139 gttgaagatg 34130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 225590 - 225482
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  225590 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatc 225492  T
Q  153 attctgtttt 162  Q
    |  |||||||    
T  225491 acgctgtttt 225482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 146 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4719
Alignment:
Q  146 ttatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4803 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 4719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11648 - 11482
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  11648 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 11549  T
Q  153 attctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 218  Q
    ||  || ||||| |||||| || ||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  11548 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagt 11482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Original strand, 38193 - 38359
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||    
T  38193 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 38292  T
Q  153 attctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 218  Q
    ||  || ||||| |||||| || ||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  38293 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagt 38359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40078 - 39920
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||    |||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  40078 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 39980  T
Q  171 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    || | ||||| | ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  39979 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatg 39920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 229
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11557
Alignment:
Q  120 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 218  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 11546  T
Q  219 tgatgatgatg 229  Q
    || ||| ||||    
T  11547 tgttgaagatg 11557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 1659 - 1591
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1659 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gattttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 1591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 3254 - 3186
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3254 atgattgatgaagtgttatatgtagatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 3186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 27996 - 27913
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27996 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 27913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 10381 - 10537
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || ||| || |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||   |||||||||    
T  10381 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatact 10476  T
Q  171 g-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    | || ||||| || |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  10477 gcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 10537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12751 - 12587
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| | | || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  12751 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 12653  T
Q  153 attctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    || ||| ||||| |||||| || ||||| || |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12652 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4675 - 4545
Alignment:
Q  86 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||  |||||| || |||||||||||| ||  |||||||||||| || || | ||| | ||| ||||||| | || |||||||    
T  4675 tatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgtt 4576  T
Q  185 gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4575 gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 130066 - 129914
Alignment:
Q  75 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-t 173  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| |    
T  130066 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 129969  T
Q  174 gtgttgttgt-tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  129968 atgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgatga 129914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 217
Target Start/End: Original strand, 60652 - 60818
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatat-tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||    
T  60652 atttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattggtatatc 60750  T
Q  153 at--tctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||   ||| |||||||||||| || ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  60751 atgagctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Original strand, 7996 - 8097
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  7996 atttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatc 8095  T
Q  153 at 154  Q
    ||    
T  8096 at 8097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32216 - 32074
Alignment:
Q  86 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||  || |||||| | ||||| ||||    
T  32216 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 32119  T
Q  185 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  32118 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 32074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19424 - 19271
Alignment:
Q  75 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-t 173  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| |    
T  19424 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 19328  T
Q  174 gtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
     ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19327 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 19271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 88 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 174913 - 174785
Alignment:
Q  88 tgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttg 185  Q
    |||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||| |||   |||||||||| || ||||| || |||    
T  174913 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttg 174817  T
Q  186 ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  174816 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 174785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 121827 - 121773
Alignment:
Q  175 tgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  121827 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 121773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 124751 - 124675
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattatt 147  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||    
T  124751 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 290 - 136
Alignment:
Q  75 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-t 173  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| |    
T  290 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 193  T
Q  174 gtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
     |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  192 atgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatg 136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Original strand, 15420 - 15577
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |  |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  15420 tgtgatataat-atttatgcattacttgaagaatatttttatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 15517  T
Q  171 gc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    || | ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  15518 gcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatg 15577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 28020 - 27958
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg 64  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28020 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattatttgatgttg 27958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 226
Target Start/End: Original strand, 10481 - 10652
Alignment:
Q  56 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  10481 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 10579  T
Q  155 tctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatg 226  Q
      ||  |||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10580 gatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgaagatg 10652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 12112 - 12047
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgag 119  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12112 atttgatactgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgag 12047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12042 - 11982
Alignment:
Q  157 tgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12042 tgttttggtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 217
Target Start/End: Original strand, 6220 - 6386
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttat-attgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||    
T  6220 atttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatc 6318  T
Q  153 at--tctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||   ||| |||| ||||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6319 atgagctg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 2805 - 2920
Alignment:
Q  115 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| | ||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2805 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 2903  T
Q  213 ctaagttgatgatgatg 229  Q
    ||||| |||||||||||    
T  2904 ctaagatgatgatgatg 2920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13596 - 13513
Alignment:
Q  137 ttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 220  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13596 ttgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Original strand, 45732 - 45906
Alignment:
Q  56 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 154  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||| || ||||| || | ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  45732 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttga-taattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcat 45830  T
Q  155 tctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
      || ||| | ||||||| | | ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45831 gatgattt-gcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 45906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 14696 - 14811
Alignment:
Q  115 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||  || |||| | |||||| | ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14696 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggt 14794  T
Q  213 ctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  14795 ctaagttgatgatgatg 14811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 229
Target Start/End: Original strand, 4893 - 4947
Alignment:
Q  175 tgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4893 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatg 4947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 160
Target Start/End: Original strand, 918 - 1006
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtt 160  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||   |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  918 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgca-ttgatattattatgccatgctgtt 1006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Original strand, 2713 - 2759
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2713 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 2759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5803 - 5654
Alignment:
Q  75 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-t 173  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || ||||  ||||||| |    
T  5803 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcct 5707  T
Q  174 gtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgat 225  Q
     ||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5706 atgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgat 5654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21077 - 20928
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatact 170  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||| |  | || ||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||| |    
T  21077 tgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatatt 20978  T
Q  171 g-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt 218  Q
    | || ||||| || |||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  20977 gcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagt 20928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 97190 - 97090
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  97190 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 97092  T
Q  153 at 154  Q
    ||    
T  97091 at 97090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 106468 - 106368
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  106468 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 106370  T
Q  153 at 154  Q
    ||    
T  106369 at 106368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13057 - 12946
Alignment:
Q  119 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 216  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  13057 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 12959  T
Q  217 gttgatgatgatg 229  Q
    ||||| |||||||    
T  12958 gttgaagatgatg 12946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 144
Target Start/End: Original strand, 18176 - 18265
Alignment:
Q  55 tttgatgttgttat-attgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatatt 144  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18176 tttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 18265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 217
Target Start/End: Original strand, 1011 - 1171
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 153  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| | |  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  1011 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 1106  T
Q  154 ttctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |  || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1107 tgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7383 - 7285
Alignment:
Q  118 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 215  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||   ||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7383 agatgttgatgaattgaatttgatataattatttcat---gttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 7287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 15203 - 15273
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaa--gatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15203 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 15273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1406 - 1308
Alignment:
Q  118 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 215  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||  ||||   ||| ||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1406 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 1310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Original strand, 15306 - 15345
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15306 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgat 15345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 70
Target Start/End: Original strand, 10821 - 10886
Alignment:
Q  4 attgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  10821 attgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaaaatgttgagtattatttgatgttgttatat 10886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 6761 - 6675
Alignment:
Q  86 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc 172  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||  || |||||||||||||    
T  6761 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgc 6675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 267844 - 267679
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  267844 atttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg--ttgagatattgttgatttgcatttgatattgttatatc 267747  T
Q  153 at--tctgtttttgtatactgc-tgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||   ||| |||| |||||||| | ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  267746 atgaactg-ttttatatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 229
Target Start/End: Original strand, 28839 - 28884
Alignment:
Q  184 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28839 tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 28884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 222
Target Start/End: Original strand, 15788 - 15884
Alignment:
Q  127 tgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15788 tgacttgcattcgatattgttatatcatcatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1051
Alignment:
Q  115 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 212  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||||||| |||| |||| ||||||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1154 ttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 1056  T
Q  213 ctaag 217  Q
    |||||    
T  1055 ctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1144 - 1096
Alignment:
Q  175 tgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1144 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 645
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaa--gatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  715 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 4234 - 4304
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaa--gatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4234 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 4304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 1257 - 1327
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaa--gatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1257 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 222
Target Start/End: Original strand, 1093 - 1141
Alignment:
Q  175 tgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1093 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12884 - 12777
Alignment:
Q  119 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 216  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||| ||| | |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12884 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaa 12786  T
Q  217 gttgatgat 225  Q
    |||||||||    
T  12785 gttgatgat 12777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6673 - 6625
Alignment:
Q  175 tgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6673 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14053 - 14005
Alignment:
Q  175 tgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14053 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 15153 - 15083
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgttttaa--gatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15153 atgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 15083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32224 - 32105
Alignment:
Q  111 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgctg-tgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 208  Q
    |||||||||| |||| ||| || |||| |||||| |||| ||||  || ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  32224 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagt 32126  T
Q  209 cggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  32125 cggtctaagatgatgatgatg 32105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25289 - 25121
Alignment:
Q  54 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 153  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| |||||| ||||| |||| || ||  ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||    
T  25289 atttgatgttgtaataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatatcgttatatca 25192  T
Q  154 t--tctgtttttgtatactg-ctgtgttgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 221  Q
    |   ||| |||| ||||||| || ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25191 tgagctg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 720 - 621
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| || ||  |||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  720 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10649 - 10542
Alignment:
Q  115 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||    
T  10649 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggt 10551  T
Q  213 ctaagttga 221  Q
    |||||||||    
T  10550 ctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32657 - 32551
Alignment:
Q  115 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||||| | ||||||| | ||||| |||| |||  ||||||||| |||||||||||||    
T  32657 ttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 32560  T
Q  213 ctaagttga 221  Q
    |||||||||    
T  32559 ctaagttga 32551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 8137 - 8090
Alignment:
Q  115 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttt 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  8137 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6865 - 6822
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatg 226  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  6865 ttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgatgatg 6822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Original strand, 6191 - 6230
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15776 - 15675
Alignment:
Q  122 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 219  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||  || ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15776 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagtt 15678  T
Q  220 gat 222  Q
    |||    
T  15677 gat 15675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 229
Target Start/End: Original strand, 23951 - 23997
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23951 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaagatgatg 23997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 35996 - 36065
Alignment:
Q  1 atgattgatgaa-gttttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  35996 atgattgatgaaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattattttttgatgttcttatat 36065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16397 - 16301
Alignment:
Q  120 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||| | ||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16397 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Original strand, 228432 - 228476
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  228432 ttgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagttgatgatga 228476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23892 - 23853
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23892 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36464
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 222  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 36464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 51699 - 51601
Alignment:
Q  118 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 215  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||  ||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51699 agatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 51603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 217
Target Start/End: Original strand, 5196 - 5230
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5196 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 5230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9570 - 9536
Alignment:
Q  175 tgttgttgttgttatttaactaagttgcatgagtc 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9570 tgttgttattgttatttaactaagttgcatgagtc 9536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 189 - 89
Alignment:
Q  54 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 152  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| | |||||||||||| ||||| |||| || ||  |||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| ||    
T  189 atttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgcatctgatattgttatatc 91  T
Q  153 at 154  Q
    ||    
T  90 at 89  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 38483 - 38411
Alignment:
Q  71 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatatt 144  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38483 tgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgaattgcatttgatatt 38411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 6867 - 6937
Alignment:
Q  1 atgattgatgaagttttatatgtatatattgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 70  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |   |||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  6867 atgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgtttaagttgatgttgagtatcatttaatgttgttatat 6937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Original strand, 2732 - 2776
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatga 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  2732 ttgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagttgatgatga 2776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University