View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18818_low_13 (Length: 234)

Name: NF18818_low_13
Description: NF18818
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18818_low_13
NF18818_low_13
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (1-229)||(32101-32329)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (1-229)||(132661-132889)
scaffold0028 (1-228)||(62202-62433)
scaffold0028 (106-228)||(136681-136802)
scaffold0028 (106-228)||(139150-139271)
scaffold0028 (106-228)||(144088-144209)
scaffold0028 (106-228)||(134212-134333)
scaffold0028 (106-228)||(141619-141740)
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (1-229)||(12774010-12774235)
chr4 (1-229)||(8846359-8846610)
chr4 (2-217)||(13734-13957)
chr4 (8-228)||(39706179-39706405)
chr4 (4-213)||(43198438-43198657)
chr4 (1-188)||(16596692-16596883)
chr4 (1-228)||(15551821-15552051)
chr4 (3-213)||(12288094-12288312)
chr4 (2-217)||(53082035-53082258)
chr4 (160-228)||(17046491-17046559)
chr4 (128-213)||(52243212-52243298)
chr4 (133-228)||(7088881-7088975)
chr4 (133-228)||(7798778-7798872)
chr4 (106-228)||(51463908-51464029)
chr4 (133-228)||(52873390-52873484)
chr4 (106-218)||(19618212-19618323)
chr4 (124-228)||(12902761-12902864)
chr4 (106-228)||(12347-12468)
chr4 (106-228)||(15118392-15118513)
chr4 (106-228)||(18215314-18215435)
chr4 (106-228)||(23803305-23803426)
chr4 (106-228)||(44773127-44773248)
chr4 (106-228)||(52312511-52312632)
chr4 (139-228)||(3096297-3096385)
chr4 (106-220)||(16377518-16377630)
chr4 (140-228)||(44928954-44929041)
chr4 (128-228)||(54798772-54798871)
chr4 (106-228)||(1837549-1837670)
chr4 (106-228)||(18239459-18239580)
chr4 (106-228)||(19242700-19242821)
chr4 (106-228)||(44615289-44615410)
chr4 (106-228)||(50222379-50222500)
chr4 (133-215)||(6190479-6190561)
chr4 (106-227)||(14038653-14038774)
chr4 (179-228)||(22636439-22636488)
chr4 (140-213)||(23374389-23374461)
chr4 (168-217)||(46640513-46640562)
chr4 (106-228)||(3515008-3515129)
chr4 (5-56)||(14164732-14164783)
chr4 (133-228)||(44052833-44052927)
chr4 (106-228)||(44102215-44102336)
chr4 (154-228)||(6899895-6899968)
chr4 (170-228)||(7641286-7641343)
chr4 (170-228)||(12610951-12611008)
chr4 (170-228)||(14280317-14280374)
chr4 (106-218)||(15355364-15355476)
chr4 (2-68)||(46640339-46640405)
chr4 (179-216)||(22353849-22353886)
chr4 (176-228)||(14053366-14053418)
chr4 (128-228)||(16270254-16270352)
chr4 (106-217)||(21815625-21815735)
[»] chr1 (46 HSPs)
chr1 (1-225)||(21754052-21754273)
chr1 (1-229)||(33681010-33681245)
chr1 (1-229)||(22237630-22237866)
chr1 (1-229)||(22921752-22921987)
chr1 (1-229)||(52927865-52928088)
chr1 (1-229)||(20248282-20248513)
chr1 (1-213)||(20918623-20918839)
chr1 (104-228)||(14295547-14295668)
chr1 (2-217)||(21861453-21861676)
chr1 (2-217)||(21896142-21896362)
chr1 (99-216)||(45574875-45574992)
chr1 (128-217)||(35261096-35261184)
chr1 (128-229)||(21161719-21161818)
chr1 (128-228)||(50210231-50210330)
chr1 (2-76)||(16368170-16368244)
chr1 (106-218)||(21840778-21840889)
chr1 (140-228)||(34509784-34509871)
chr1 (106-228)||(13988867-13988988)
chr1 (133-213)||(16758668-16758749)
chr1 (106-228)||(21923331-21923452)
chr1 (106-228)||(23593775-23593896)
chr1 (140-228)||(20847184-20847271)
chr1 (128-228)||(31612314-31612412)
chr1 (168-228)||(38801445-38801504)
chr1 (145-228)||(21026684-21026766)
chr1 (106-228)||(21475127-21475248)
chr1 (133-228)||(27250752-27250846)
chr1 (106-228)||(29298138-29298258)
chr1 (106-228)||(29776689-29776810)
chr1 (133-225)||(16368307-16368401)
chr1 (2-76)||(50686776-50686850)
chr1 (168-217)||(50614174-50614223)
chr1 (168-217)||(50622002-50622051)
chr1 (106-213)||(22123107-22123214)
chr1 (106-228)||(21707168-21707289)
chr1 (106-228)||(21711710-21711831)
chr1 (133-228)||(22532273-22532367)
chr1 (168-218)||(20454611-20454660)
chr1 (128-217)||(41050052-41050142)
chr1 (179-228)||(13212974-13213023)
chr1 (106-218)||(16361928-16362039)
chr1 (179-228)||(21342097-21342146)
chr1 (179-228)||(21346962-21347011)
chr1 (103-179)||(22130902-22130975)
chr1 (2-46)||(12271740-12271784)
chr1 (16-76)||(41049933-41049993)
[»] chr3 (75 HSPs)
chr3 (1-225)||(32307684-32307905)
chr3 (1-229)||(9512923-9513145)
chr3 (1-229)||(9520898-9521120)
chr3 (1-229)||(49667968-49668194)
chr3 (1-229)||(16103783-16104017)
chr3 (1-229)||(16097331-16097566)
chr3 (1-225)||(1644567-1644787)
chr3 (8-229)||(12174152-12174377)
chr3 (1-229)||(15470927-15471161)
chr3 (1-120)||(49389513-49389639)
chr3 (1-228)||(13210212-13210444)
chr3 (1-74)||(12934195-12934268)
chr3 (2-216)||(37251051-37251273)
chr3 (81-228)||(14234491-14234639)
chr3 (128-217)||(52523745-52523835)
chr3 (128-228)||(12399213-12399312)
chr3 (128-228)||(18438538-18438637)
chr3 (128-228)||(27165251-27165350)
chr3 (128-228)||(53301569-53301668)
chr3 (106-228)||(15977516-15977637)
chr3 (106-216)||(43550518-43550628)
chr3 (2-76)||(43927296-43927370)
chr3 (106-218)||(50242833-50242944)
chr3 (128-228)||(14972858-14972957)
chr3 (168-228)||(28194694-28194754)
chr3 (106-217)||(53070693-53070803)
chr3 (106-228)||(7781387-7781508)
chr3 (133-228)||(11424783-11424876)
chr3 (133-228)||(13442278-13442372)
chr3 (106-228)||(17463179-17463300)
chr3 (106-228)||(17672627-17672748)
chr3 (145-228)||(20698470-20698552)
chr3 (130-213)||(23274706-23274788)
chr3 (130-213)||(24340743-24340825)
chr3 (106-228)||(28848651-28848772)
chr3 (106-228)||(29172623-29172744)
chr3 (106-228)||(34159327-34159448)
chr3 (106-228)||(45606947-45607068)
chr3 (106-228)||(55476492-55476613)
chr3 (107-228)||(6469175-6469295)
chr3 (106-227)||(16282851-16282971)
chr3 (106-218)||(12567571-12567682)
chr3 (106-218)||(13544036-13544147)
chr3 (106-218)||(38961931-38962042)
chr3 (128-213)||(42386429-42386513)
chr3 (106-228)||(15412430-15412552)
chr3 (128-228)||(25476403-25476502)
chr3 (106-212)||(8899111-8899216)
chr3 (106-228)||(9707647-9707768)
chr3 (106-228)||(16454321-16454442)
chr3 (133-228)||(17487860-17487954)
chr3 (133-228)||(17499342-17499436)
chr3 (133-228)||(23083384-23083478)
chr3 (133-228)||(26686891-26686985)
chr3 (2-76)||(22110235-22110309)
chr3 (168-225)||(14572596-14572652)
chr3 (168-217)||(22110409-22110458)
chr3 (168-217)||(43925973-43926022)
chr3 (128-228)||(8499519-8499617)
chr3 (106-228)||(13151830-13151952)
chr3 (106-228)||(13154295-13154417)
chr3 (128-228)||(24153227-24153325)
chr3 (128-228)||(55500943-55501041)
chr3 (106-228)||(10247763-10247884)
chr3 (106-228)||(17446695-17446815)
chr3 (168-225)||(606383-606441)
chr3 (170-228)||(17737237-17737294)
chr3 (179-228)||(10556986-10557035)
chr3 (168-229)||(14576890-14576950)
chr3 (179-228)||(36166599-36166648)
chr3 (132-209)||(37642287-37642363)
chr3 (106-227)||(41123892-41124009)
chr3 (179-228)||(45577950-45577999)
chr3 (106-228)||(12119764-12119886)
chr3 (128-215)||(12377938-12378026)
[»] chr6 (60 HSPs)
chr6 (1-229)||(19652198-19652431)
chr6 (1-213)||(28496357-28496573)
chr6 (1-213)||(29808768-29808984)
chr6 (1-228)||(1561307-1561539)
chr6 (2-229)||(20109140-20109378)
chr6 (1-229)||(23019408-23019644)
chr6 (130-228)||(27333238-27333335)
chr6 (130-228)||(27393978-27394075)
chr6 (2-213)||(19668390-19668609)
chr6 (110-213)||(25644339-25644443)
chr6 (128-229)||(4185839-4185939)
chr6 (128-213)||(9098530-9098616)
chr6 (106-217)||(18456731-18456841)
chr6 (106-217)||(18461891-18462001)
chr6 (128-228)||(29060544-29060643)
chr6 (128-223)||(4186376-4186470)
chr6 (133-228)||(16496248-16496342)
chr6 (106-228)||(25754810-25754931)
chr6 (106-228)||(26924680-26924801)
chr6 (106-218)||(30676750-30676861)
chr6 (106-228)||(1595550-1595671)
chr6 (106-228)||(2291220-2291341)
chr6 (106-228)||(8055030-8055151)
chr6 (106-228)||(12742318-12742439)
chr6 (133-228)||(17287819-17287913)
chr6 (106-228)||(18334632-18334753)
chr6 (106-228)||(19005047-19005168)
chr6 (106-228)||(19303536-19303657)
chr6 (106-228)||(19858959-19859080)
chr6 (106-228)||(22782228-22782349)
chr6 (106-228)||(24422548-24422669)
chr6 (106-228)||(33861795-33861916)
chr6 (106-228)||(33864279-33864400)
chr6 (150-228)||(16920669-16920747)
chr6 (2-76)||(23076895-23076969)
chr6 (2-76)||(35008313-35008387)
chr6 (169-222)||(11185515-11185568)
chr6 (168-228)||(20076704-20076763)
chr6 (168-228)||(22831507-22831567)
chr6 (128-228)||(25656630-25656728)
chr6 (168-228)||(35245590-35245650)
chr6 (133-228)||(20638306-20638400)
chr6 (106-228)||(25629350-25629472)
chr6 (128-229)||(31155415-31155515)
chr6 (106-218)||(25688513-25688624)
chr6 (106-218)||(34963384-34963495)
chr6 (128-228)||(18409845-18409944)
chr6 (133-217)||(18821868-18821950)
chr6 (16-76)||(28103796-28103856)
chr6 (106-228)||(1540951-1541072)
chr6 (106-228)||(3852057-3852178)
chr6 (133-220)||(20360983-20361069)
chr6 (170-228)||(25714421-25714478)
chr6 (128-177)||(4668229-4668277)
chr6 (128-177)||(4675076-4675124)
chr6 (108-228)||(20556934-20557053)
chr6 (128-173)||(22080756-22080800)
chr6 (179-228)||(22780295-22780344)
chr6 (168-216)||(18199475-18199522)
chr6 (24-76)||(18204242-18204294)
[»] chr2 (57 HSPs)
chr2 (1-228)||(22134100-22134323)
chr2 (1-229)||(25175853-25176088)
chr2 (81-227)||(28405981-28406128)
chr2 (79-228)||(7679589-7679738)
chr2 (31-228)||(23071865-23072066)
chr2 (140-228)||(298844-298932)
chr2 (106-228)||(22105413-22105535)
chr2 (2-76)||(22459445-22459519)
chr2 (2-217)||(23207292-23207515)
chr2 (110-217)||(7732-7839)
chr2 (106-228)||(6725996-6726117)
chr2 (130-213)||(19671849-19671931)
chr2 (133-228)||(23060517-23060611)
chr2 (3-213)||(18786787-18787005)
chr2 (133-229)||(23708642-23708738)
chr2 (168-228)||(20309112-20309172)
chr2 (2-74)||(25109054-25109126)
chr2 (106-228)||(18808944-18809065)
chr2 (133-228)||(23076446-23076540)
chr2 (106-228)||(23130863-23130984)
chr2 (106-228)||(23133330-23133451)
chr2 (106-228)||(23135591-23135712)
chr2 (106-228)||(23709572-23709693)
chr2 (106-228)||(23712053-23712174)
chr2 (106-228)||(34402562-34402683)
chr2 (106-228)||(39682314-39682435)
chr2 (154-228)||(23285869-23285942)
chr2 (108-228)||(571398-571517)
chr2 (167-228)||(23040246-23040306)
chr2 (155-228)||(23103440-23103512)
chr2 (3-76)||(23791438-23791511)
chr2 (106-218)||(24367785-24367896)
chr2 (108-227)||(43137301-43137419)
chr2 (133-228)||(38138-38231)
chr2 (133-228)||(22731257-22731351)
chr2 (106-228)||(26505380-26505501)
chr2 (106-228)||(26507858-26507979)
chr2 (106-228)||(28577100-28577221)
chr2 (170-228)||(22337119-22337176)
chr2 (168-217)||(20520250-20520299)
chr2 (106-218)||(21155100-21155211)
chr2 (106-218)||(32214961-32215072)
chr2 (161-217)||(23004763-23004819)
chr2 (106-228)||(24898235-24898357)
chr2 (106-228)||(24900718-24900840)
chr2 (106-228)||(24903195-24903317)
chr2 (106-228)||(24905672-24905794)
chr2 (106-228)||(24908147-24908269)
chr2 (106-228)||(45029894-45030015)
chr2 (154-228)||(8946661-8946734)
chr2 (133-215)||(32451951-32452033)
chr2 (179-228)||(22738247-22738296)
chr2 (179-228)||(23654454-23654503)
chr2 (179-228)||(24529641-24529690)
chr2 (1-42)||(28406174-28406215)
chr2 (179-228)||(38967375-38967424)
chr2 (170-218)||(24643054-24643101)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (1-229)||(10424-10659)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (1-229)||(45675-45910)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (1-229)||(129908-130143)
scaffold0010 (154-217)||(60759-60822)
[»] chr8 (57 HSPs)
chr8 (1-229)||(26355583-26355816)
chr8 (1-228)||(5866160-5866391)
chr8 (1-228)||(21490999-21491230)
chr8 (5-228)||(38855139-38855368)
chr8 (1-228)||(17140920-17141151)
chr8 (1-228)||(6520372-6520605)
chr8 (81-229)||(23760814-23760962)
chr8 (81-229)||(21673707-21673855)
chr8 (2-217)||(20498577-20498800)
chr8 (39-228)||(21249388-21249582)
chr8 (39-228)||(21255226-21255420)
chr8 (2-217)||(37116362-37116586)
chr8 (81-218)||(21285611-21285749)
chr8 (168-228)||(16199701-16199761)
chr8 (160-228)||(21389499-21389567)
chr8 (160-228)||(21778825-21778893)
chr8 (133-228)||(7372782-7372876)
chr8 (130-213)||(13597637-13597719)
chr8 (133-228)||(18818432-18818526)
chr8 (133-228)||(23406383-23406477)
chr8 (128-228)||(6759262-6759361)
chr8 (128-228)||(16092360-16092459)
chr8 (168-228)||(21396037-21396097)
chr8 (168-228)||(21790530-21790590)
chr8 (128-228)||(28649062-28649161)
chr8 (106-228)||(1484403-1484524)
chr8 (106-228)||(5853332-5853453)
chr8 (106-228)||(14409484-14409605)
chr8 (106-228)||(15203271-15203392)
chr8 (106-228)||(20046235-20046356)
chr8 (106-228)||(20403228-20403349)
chr8 (133-228)||(20536212-20536306)
chr8 (133-228)||(21919023-21919117)
chr8 (106-228)||(22001754-22001875)
chr8 (133-228)||(22626740-22626833)
chr8 (106-228)||(41598189-41598310)
chr8 (155-213)||(983450-983508)
chr8 (2-76)||(17266876-17266950)
chr8 (154-228)||(18879275-18879348)
chr8 (106-218)||(16413356-16413467)
chr8 (132-213)||(17612132-17612212)
chr8 (4-73)||(22364828-22364897)
chr8 (168-228)||(21923986-21924045)
chr8 (168-228)||(45131054-45131113)
chr8 (106-228)||(4542413-4542534)
chr8 (130-213)||(13508105-13508187)
chr8 (133-228)||(31971261-31971354)
chr8 (106-218)||(45290734-45290846)
chr8 (106-213)||(15070574-15070681)
chr8 (168-217)||(24353035-24353084)
chr8 (179-228)||(26219718-26219767)
chr8 (106-228)||(4483282-4483402)
chr8 (170-228)||(19896266-19896323)
chr8 (168-217)||(17267051-17267100)
chr8 (168-217)||(19154944-19154993)
chr8 (2-74)||(24353186-24353261)
chr8 (179-228)||(26225359-26225408)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (1-229)||(21565545-21565780)
chr5 (4-229)||(22959421-22959650)
chr5 (1-228)||(19668902-19669135)
chr5 (1-228)||(19660721-19660952)
chr5 (130-228)||(36314581-36314678)
chr5 (129-228)||(21329516-21329614)
chr5 (4-228)||(21502041-21502273)
chr5 (1-229)||(26011918-26012154)
chr5 (133-217)||(22144064-22144147)
chr5 (2-217)||(20026824-20027047)
chr5 (128-228)||(21997552-21997651)
chr5 (133-228)||(21729087-21729181)
chr5 (133-228)||(21808412-21808506)
chr5 (128-225)||(1096474-1096570)
chr5 (106-228)||(264808-264929)
chr5 (106-228)||(10732980-10733101)
chr5 (106-228)||(20909013-20909134)
chr5 (133-228)||(23390519-23390613)
chr5 (133-228)||(25421536-25421630)
chr5 (106-228)||(29329935-29330056)
chr5 (106-228)||(39363385-39363506)
chr5 (154-228)||(8286887-8286960)
chr5 (133-213)||(22075038-22075117)
chr5 (140-228)||(24529224-24529311)
chr5 (106-228)||(11581239-11581360)
chr5 (106-228)||(42245405-42245526)
chr5 (154-228)||(13025315-13025388)
chr5 (154-228)||(13095499-13095572)
chr5 (168-225)||(37723910-37723967)
chr5 (106-213)||(20902049-20902155)
chr5 (168-228)||(21293027-21293086)
chr5 (106-228)||(38619435-38619557)
chr5 (128-228)||(39245137-39245235)
chr5 (106-228)||(2154654-2154775)
chr5 (2-41)||(22178103-22178142)
chr5 (133-212)||(25431414-25431492)
chr5 (106-228)||(29345981-29346102)
chr5 (170-228)||(20918052-20918109)
chr5 (106-228)||(36154823-36154941)
chr5 (2-47)||(21329381-21329426)
chr5 (179-228)||(23064512-23064561)
chr5 (168-216)||(15796435-15796482)
chr5 (128-228)||(24493573-24493671)
chr5 (128-228)||(31061069-31061167)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (1-222)||(6822-7047)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (1-231)||(160685-160921)
scaffold0001 (179-228)||(85692-85741)
scaffold0001 (106-218)||(501095-501206)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (1-229)||(132-366)
[»] chr7 (60 HSPs)
chr7 (1-229)||(18005649-18005884)
chr7 (1-228)||(34200790-34201021)
chr7 (4-229)||(44014181-44014409)
chr7 (1-228)||(67749-67982)
chr7 (1-228)||(28505184-28505415)
chr7 (1-229)||(16219600-16219835)
chr7 (1-228)||(15754772-15755004)
chr7 (128-229)||(811149-811249)
chr7 (1-228)||(11995913-11996144)
chr7 (104-228)||(16495406-16495527)
chr7 (81-228)||(47831811-47831959)
chr7 (106-228)||(3564359-3564481)
chr7 (106-216)||(13647341-13647451)
chr7 (2-76)||(15116643-15116717)
chr7 (2-217)||(20220073-20220294)
chr7 (125-228)||(22072917-22073020)
chr7 (99-228)||(17061948-17062076)
chr7 (2-213)||(16056347-16056564)
chr7 (140-228)||(16386277-16386365)
chr7 (168-228)||(40443395-40443455)
chr7 (106-228)||(456322-456443)
chr7 (106-228)||(3386334-3386455)
chr7 (106-228)||(11393327-11393448)
chr7 (106-228)||(11972497-11972618)
chr7 (106-228)||(14949162-14949283)
chr7 (106-228)||(15376753-15376874)
chr7 (106-228)||(16232521-16232642)
chr7 (106-228)||(16410060-16410181)
chr7 (106-228)||(18640273-18640394)
chr7 (106-228)||(20385163-20385284)
chr7 (106-228)||(21189635-21189756)
chr7 (106-228)||(24702239-24702360)
chr7 (106-228)||(32125492-32125613)
chr7 (106-228)||(41522918-41523039)
chr7 (106-228)||(41525380-41525501)
chr7 (128-229)||(2280137-2280238)
chr7 (154-228)||(12698835-12698908)
chr7 (2-76)||(15113106-15113180)
chr7 (106-218)||(24275182-24275293)
chr7 (3-213)||(12901342-12901560)
chr7 (106-228)||(13869347-13869469)
chr7 (168-228)||(27847887-27847947)
chr7 (133-228)||(9509193-9509287)
chr7 (106-228)||(18430713-18430834)
chr7 (106-228)||(27216861-27216982)
chr7 (106-228)||(44116510-44116631)
chr7 (128-210)||(12255809-12255892)
chr7 (169-229)||(15144096-15144154)
chr7 (133-213)||(26212015-26212094)
chr7 (128-228)||(38227485-38227583)
chr7 (128-228)||(48273393-48273492)
chr7 (130-213)||(10063838-10063920)
chr7 (133-217)||(15008520-15008605)
chr7 (133-228)||(16213685-16213778)
chr7 (1-47)||(16324197-16324243)
chr7 (170-228)||(24704689-24704746)
chr7 (140-213)||(10589058-10589130)
chr7 (132-209)||(19486766-19486842)
chr7 (179-228)||(20110557-20110606)
chr7 (128-228)||(18456431-18456529)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (1-229)||(22557-22788)
scaffold0037 (106-228)||(82073-82194)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (1-113)||(28694-28804)
scaffold0211 (155-229)||(28813-28888)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-229)||(19267-19502)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (81-228)||(6539-6686)
scaffold0621 (2-213)||(8485-8706)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (1-229)||(100377-100612)
scaffold0023 (81-229)||(40144-40292)
scaffold0023 (155-229)||(101502-101576)
scaffold0023 (159-228)||(119879-119948)
scaffold0023 (106-228)||(94412-94533)
scaffold0023 (106-218)||(17480-17591)
scaffold0023 (170-228)||(44455-44512)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (1-229)||(2687-2924)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (1-228)||(11296-11527)
scaffold0046 (1-228)||(2001-2232)
scaffold0046 (133-228)||(28418-28512)
scaffold0046 (176-228)||(4556-4608)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (1-122)||(2186-2305)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (2-218)||(1096-1319)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (81-221)||(5654-5794)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (1-228)||(12770-13004)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (81-229)||(2615-2763)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (81-229)||(14667-14815)
scaffold0008 (1-48)||(14580-14627)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (1-228)||(15665-15896)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (2-217)||(53432-53655)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (121-229)||(23894-24001)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (1-228)||(34127-34358)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (2-213)||(10546-10764)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (104-228)||(1065-1186)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (128-228)||(6141-6240)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (81-229)||(32538-32687)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (81-228)||(1003-1151)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (133-217)||(1047-1130)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (4-217)||(12583-12803)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (128-228)||(6615-6714)
scaffold0333 (128-228)||(13995-14094)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (128-228)||(15795-15894)
scaffold0020 (1-47)||(15715-15761)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (3-76)||(7943-8016)
scaffold0507 (128-217)||(8077-8167)
[»] scaffold0138 (3 HSPs)
scaffold0138 (128-229)||(12942-13042)
scaffold0138 (1-47)||(13131-13177)
scaffold0138 (2-68)||(18121-18187)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (2-217)||(128853-129076)
scaffold0022 (5-76)||(78485-78556)
scaffold0022 (168-217)||(78337-78386)
scaffold0022 (179-228)||(116431-116480)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (124-228)||(3200-3303)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (1-185)||(29163-29354)
scaffold0218 (133-213)||(8095-8176)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (125-213)||(16115-16202)
scaffold0357 (128-217)||(13143-13231)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (125-213)||(27764-27851)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (1-152)||(2328-2484)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (110-225)||(26064-26179)
scaffold0122 (128-228)||(44725-44824)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (168-228)||(1293-1353)
scaffold0106 (168-228)||(7270-7330)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (128-228)||(38720-38819)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (106-228)||(13948-14069)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (106-228)||(16785-16906)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (150-228)||(5167-5245)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (150-216)||(51598-51664)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (106-218)||(10784-10895)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (128-228)||(3169-3267)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (128-228)||(4853-4952)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (168-228)||(16286-16346)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (168-216)||(174782-174830)
scaffold0021 (179-228)||(121770-121819)
scaffold0021 (3-47)||(136252-136296)
scaffold0021 (3-47)||(144960-145004)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (106-228)||(107-228)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (106-228)||(4695-4816)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (106-228)||(13393-13514)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (2-217)||(6166-6390)
scaffold0420 (168-217)||(13795-13844)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (106-228)||(20748-20869)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (133-228)||(13215-13309)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (106-228)||(37822-37943)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (133-228)||(1855-1949)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (133-228)||(51917-52011)
scaffold0011 (133-228)||(168001-168095)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (2-217)||(97020-97244)
scaffold0006 (2-217)||(106298-106522)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (106-228)||(158490-158611)
scaffold0003 (180-228)||(340016-340064)
[»] scaffold1257 (2 HSPs)
scaffold1257 (81-174)||(2188-2281)
scaffold1257 (1-48)||(2101-2148)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (145-228)||(6156-6241)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (2-76)||(19768-19842)
scaffold0080 (128-217)||(19901-19991)
scaffold0080 (128-228)||(39917-40015)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (154-228)||(17261-17334)
scaffold0056 (170-217)||(79388-79434)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (132-205)||(11491-11563)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (106-218)||(9253-9364)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (132-205)||(38278-38350)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (107-218)||(4308-4418)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (140-228)||(1956-2043)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (168-228)||(10480-10540)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (128-228)||(16618-16717)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (106-213)||(29948-30054)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (2-66)||(38491-38555)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (128-228)||(16117-16216)
scaffold0120 (133-228)||(32980-33073)
scaffold0120 (133-228)||(45932-46025)
scaffold0120 (170-228)||(17389-17446)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (168-228)||(46999-47059)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (133-228)||(8483-8577)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (133-228)||(3474-3568)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (130-213)||(18047-18129)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (2-76)||(1681-1755)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (150-228)||(1088-1166)
[»] scaffold1403 (2 HSPs)
scaffold1403 (168-217)||(565-614)
scaffold1403 (2-47)||(742-787)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (133-226)||(11466-11558)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (2-82)||(163-243)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (140-228)||(4716-4803)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (128-220)||(39489-39579)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (180-228)||(8598-8646)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (168-228)||(32071-32130)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (128-220)||(75233-75323)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (106-217)||(20419-20528)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (128-220)||(25908-25998)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (133-228)||(1071-1165)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (170-217)||(11978-12024)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (154-213)||(13516-13574)
[»] scaffold0145 (2 HSPs)
scaffold0145 (106-228)||(9750-9871)
scaffold0145 (128-228)||(32946-33044)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (106-228)||(40401-40522)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (154-213)||(24347-24405)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (106-212)||(11305-11410)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (170-228)||(22887-22944)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (3-77)||(103523-103597)
scaffold0040 (128-213)||(103647-103733)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (128-177)||(9133-9181)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (168-213)||(25125-25170)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (128-220)||(4520-4610)
scaffold0228 (128-220)||(12102-12192)
scaffold0228 (128-220)||(22054-22144)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (133-213)||(20929-21009)


Alignment Details
Target: scaffold0150 (Bit Score: 221; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32329 - 32101
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtatatatacattaaatggatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32329 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtatatatacattaaatggatta 32230  T
Q  101 tgttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  32229 tgttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcat 32130  T
Q  201 gagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32129 gagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 32101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 221; Significance: 1e-122; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 132889 - 132661
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtatatatacattaaatggatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132889 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtatatatacattaaatggatta 132790  T
Q  101 tgttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  132789 tgttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcat 132690  T
Q  201 gagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  132689 gagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 132661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 62433 - 62202
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaa 93  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |   |||||| | ||| ||||  ||||||| ||||      ||||||||| |    
T  62433 tagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgttatgaactaatgatgttgttaatgttatataattgtatatacattata 62334  T
Q  94 tggattatgttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac 193  Q
    || |||||||||||| |||||| |||| ||  | ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||| |||| |||     
T  62333 tgaattatgttgatatttgagatgttgttg--tgcattcgatattattataccatgatgttttt-catactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaa 62237  T
Q  194 gctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||    
T  62236 gctgcatgagtcggtttaagtcgaagatgatgatg 62202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 136802 - 136681
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  |||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  136802 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 136705  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  136704 cggtctaagttgattaagatgatg 136681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 139271 - 139150
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  |||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  139271 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 139174  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  139173 cggtctaagttgattaagatgatg 139150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 144209 - 144088
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  |||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  144209 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 144112  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  144111 cggtctaagttgattaagatgatg 144088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 134333 - 134212
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  |||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  134333 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 134236  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||| | |||| | |||||||    
T  134235 cggtctatgttgattaagatgatg 134212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 141740 - 141619
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  |||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||    
T  141740 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagt 141643  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  141642 cggtctaagttgattaagatgatg 141619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12774235 - 12774010
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtatatatacattaaatggatta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12774235 tagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta--tatacattaaatggatta 12774138  T
Q  101 tgttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcat 200  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  12774137 tgttgataattgagatgttgttgattgtattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 12774039  T
Q  201 gagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12774038 gagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 12774010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8846610 - 8846359
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta------tatatacattaaat 94  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||| ||    
T  8846610 tagaaactaagttgtttatcttgtagttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacat 8846511  T
Q  95 ggattatg-ttgataattgagacgttgatga----------------tta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgct 176  Q
    | |||||| |||||| |||||| ||||||||                ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  8846510 gaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttagcattcgatattgttatctcatgatga-tttgcatactgcctatgttgct 8846412  T
Q  177 gtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
    |||||||||||| ||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8846411 gtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 8846359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 217
Target Start/End: Original strand, 13734 - 13957
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatg 95  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||      |||||||||  ||    
T  13734 agaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttg 13833  T
Q  96 gattatgt-tga-taattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
     ||||| | ||| || |||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||  ||| |||    
T  13834 aattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaacta 13932  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  13933 agctgcatgagtcggtctaagatga 13957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 39706179 - 39706405
Alignment:
Q  8 taagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatggattat 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||   ||||||  | ||||||||  ||||||| ||||      ||||||||| ||| |||||    
T  39706179 taagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattat 39706278  T
Q  102 gttgataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcat 200  Q
    ||||||  ||  || ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  39706279 gttgatgtttatgatgttcatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 39706377  T
Q  201 gagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||    
T  39706378 gagtcggtctaagttgattaagatgatg 39706405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Original strand, 43198438 - 43198657
Alignment:
Q  4 aaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta------tatatacattaaatgga 97  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||      |||||||||||  || |    
T  43198438 aaactaagttgtttatcttgttgttgatgttccagtaagactaatgcatatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaa 43198537  T
Q  98 ttatgt-tg-ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatg-atgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac 193  Q
    |||| | || ||| ||||||  ||||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||| |   ||||||||||||||||||||| |||     
T  43198538 ttatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaa 43198637  T
Q  194 gctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  43198638 gctgcatgagtcggtctaag 43198657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16596883 - 16596692
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||||      ||||||||| ||    
T  16596883 tagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttcaagtaagactgatgcttataaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacat 16596784  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatgatt-acattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttattta 188  Q
    |  ||| ||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16596783 gacttaagtttgataattgag---ttgatgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttattta 16596692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15552051 - 15551821
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    |||||||||||||||| | | | |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||| ||||      ||||||||| ||    
T  15552051 tagaaactaagttgtt-accctgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaatcaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacat 15551953  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac 193  Q
    |  ||| ||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||  || ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||     
T  15551952 gacttaagtttgataattgagttgttgat--ttaccttcgatattattatatcatgatggatt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa 15551856  T
Q  194 gctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  15551855 gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 15551821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 12288094 - 12288312
Alignment:
Q  3 gaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatgg 96  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||   |||||| || ||||||||  ||||||| ||||      ||||||||| |||     
T  12288094 gaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttggtaatgttatatagttgtatatacattacatga 12288193  T
Q  97 attatgtt-gataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatga--tgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
    |||||||| |||  ||| || |||| ||| || |||| ||||||||||||||||||  ||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  12288194 attatgtttgatg-ttgtgatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactg-gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaacta 12288291  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  12288292 agctgcatgagtcggtctaag 12288312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 217
Target Start/End: Original strand, 53082035 - 53082258
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta------tatatacattaaatg 95  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |||||||  ||      ||||| ||||| |||    
T  53082035 agaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatg 53082134  T
Q  96 gattatgt-tgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatga--tgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
     ||||| | ||||  |||||| |||  |||||   || ||||||||||||||||||  || ||||   |||| ||||||||||||||||||  ||| |||    
T  53082135 aattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaacta 53082233  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  53082234 agctgcatgagtcggtctaagatga 53082258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17046559 - 17046491
Alignment:
Q  160 atactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  17046559 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 17046491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 213
Target Start/End: Original strand, 52243212 - 52243298
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatga--tgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  52243212 catttgatattgttatatcatgaactgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52243298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7088975 - 7088881
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  7088975 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 7088881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7798872 - 7798778
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  7798872 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 7798778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 51463908 - 51464029
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  51463908 ataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 51464005  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  51464006 cggtctaagttgattaagatgatg 51464029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 52873390 - 52873484
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  52873390 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 52873484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Original strand, 19618212 - 19618323
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  19618212 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 19618309  T
Q  205 cggtctaagatgat 218  Q
    ||||||||| ||||    
T  19618310 cggtctaagttgat 19618323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12902864 - 12902761
Alignment:
Q  124 attacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatga 223  Q
    |||||| | |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  12902864 attacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 12902766  T
Q  224 tgatg 228  Q
    |||||    
T  12902765 tgatg 12902761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 12347 - 12468
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  12347 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 12444  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  12445 cggtctaagttgattaagatgatg 12468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 15118392 - 15118513
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  15118392 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 15118489  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  15118490 cggtctaagttgattaagatgatg 15118513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 18215314 - 18215435
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  18215314 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 18215411  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  18215412 cggtctaagttgattaagatgatg 18215435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 23803305 - 23803426
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    |||||| |||||||| |||||  |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  23803305 ataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 23803402  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  23803403 cggtctaagttgattaagatgatg 23803426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 44773127 - 44773248
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  44773127 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 44773224  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  44773225 cggtctaagttgattaagatgatg 44773248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 52312632 - 52312511
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  52312632 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 52312535  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  52312534 cggtctaagttgattaagatgatg 52312511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3096385 - 3096297
Alignment:
Q  139 gttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  3096385 gttacatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 3096297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 220
Target Start/End: Original strand, 16377518 - 16377630
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    |||||||||| |||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  16377518 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 16377614  T
Q  205 cggtctaagatgatga 220  Q
    ||||||||| ||||||    
T  16377615 cggtctaagttgatga 16377630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 228
Target Start/End: Original strand, 44928954 - 44929041
Alignment:
Q  140 ttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  44928954 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44929041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Original strand, 54798772 - 54798871
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  54798772 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 54798870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 1837549 - 1837670
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| | |||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  1837549 ataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 1837646  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  1837647 cggtctaagttgattaagatgatg 1837670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 18239459 - 18239580
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || || ||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  18239459 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgctgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 18239556  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  18239557 cggtctaagttgattaagatgatg 18239580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19242821 - 19242700
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || ||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  19242821 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 19242724  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  19242723 cggtctaagttgattaagatgatg 19242700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44615410 - 44615289
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| ||  |||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  44615410 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 44615313  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  44615312 cggtctaagttgattaagatgatg 44615289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 50222379 - 50222500
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||| |  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  50222379 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 50222476  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  50222477 cggtctaagttgattaagatgatg 50222500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6190561 - 6190479
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagat 215  Q
    ||||||||||| ||||| |  ||||| || || | |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  6190561 gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 6190479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14038774 - 14038653
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    |||||||||| |||| ||| || |||| |||||| ||||  |||| || ||||| ||||| | | |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  14038774 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 14038676  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    | ||||||| |||||| ||||||    
T  14038675 cagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22636488 - 22636439
Alignment:
Q  179 ttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22636488 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 22636439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 213
Target Start/End: Original strand, 23374389 - 23374461
Alignment:
Q  140 ttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  23374389 ttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgttctaag 23374461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 46640513 - 46640562
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46640513 tatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 46640562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3515129 - 3515008
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| || || || ||||| ||||| ||  |||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||    
T  3515129 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagt 3515032  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  3515031 cggtctaagttgattaagatgatg 3515008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 14164783 - 14164732
Alignment:
Q  5 aactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatga 56  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||    
T  14164783 aactaagttgtttatcttgctgttgttgttctagtaagcctgaatcatatga 14164732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44052927 - 44052833
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  44052927 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatg 44052833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44102336 - 44102215
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| | | || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||  ||||  |||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  44102336 ataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactg-tgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 44102239  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  44102238 cggtctaagttgattaagatgatg 44102215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6899968 - 6899895
Alignment:
Q  154 ttttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  6899968 ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 6899895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 228
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641343
Alignment:
Q  170 tgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  7641286 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 7641343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12611008 - 12610951
Alignment:
Q  170 tgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  12611008 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12610951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14280374 - 14280317
Alignment:
Q  170 tgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  14280374 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 14280317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Original strand, 15355364 - 15355476
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgat-ga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgag 203  Q
    ||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  15355364 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 15355461  T
Q  204 tcggtctaagatgat 218  Q
    |||||||||| ||||    
T  15355462 tcggtctaagttgat 15355476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 68
Target Start/End: Original strand, 46640339 - 46640405
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtt 68  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||   |||||| |||||||||||    
T  46640339 agaaactaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaaacctgaattatatgatttgatgttgtt 46640405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22353886 - 22353849
Alignment:
Q  179 ttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatg 216  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22353886 ttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatg 22353849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 228
Target Start/End: Original strand, 14053366 - 14053418
Alignment:
Q  176 tgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  14053366 tgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatg 14053418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Original strand, 16270254 - 16270352
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  16270254 catttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgat 16270351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 217
Target Start/End: Original strand, 21815625 - 21815735
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||  ||||| |||| ||||| || ||||| |||| | || |||||||||  |||||||| ||| |||||| ||||    
T  21815625 ataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatac-agttgtgttgctgtc-gttatttaactaagctgcacgagt 21815722  T
Q  205 cggtctaagatga 217  Q
    |||||||||||||    
T  21815723 cggtctaagatga 21815735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 46)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21754273 - 21754052
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtatatatacattaaatggatta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21754273 tagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta--tatacattaaatggatta 21754176  T
Q  101 tgttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcat 200  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  21754175 tgttgataattgagatgttgttgattgcatttgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 21754077  T
Q  201 gagtcggtctaagatgatgatgatg 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  21754076 gagtcggtctaagttgatgatgatg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33681245 - 33681010
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      ||||||||| ||    
T  33681245 tagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacat 33681146  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
    | |||||||| |||| |||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  33681145 gaattatgtttgatatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaacta 33681047  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
     | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  33681046 agttgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22237866 - 22237630
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactg-ttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaa 93  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||      ||||||||| |    
T  22237866 tagaaactaagttgtttatcttgctgattgttgttccagcgagactgatacatatgaattgatgttgtttctaaagttatataattgtatatacattaca 22237767  T
Q  94 tggattatgtt-gataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatct 191  Q
    || |||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||| ||||||||||||||| ||    
T  22237766 tgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaact 22237668  T
Q  192 acgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
    | ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22237667 aagcttcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 22921752 - 22921987
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaa 93  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||||| ||||      ||||||||| |    
T  22921752 tagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattata 22921851  T
Q  94 tggattatgttgataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
    || ||| |||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||    
T  22921852 tgaattttgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacta 22921950  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921951 agctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 22921987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 52927865 - 52928088
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta------tatatacattaaat 94  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||| ||    
T  52927865 tagaaactaagttgtttatcttgctattgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacat 52927964  T
Q  95 ggattatg-ttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac 193  Q
    | |||||| |||||| |||||| |           ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||| |||     
T  52927965 gaattatgtttgatatttgagatg-----------attcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaa 52928052  T
Q  194 gctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  52928053 gctgcatgagtcggtctaagttgaagatggtgatgt 52928088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20248513 - 20248282
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||      ||||||||| ||    
T  20248513 tagaaactaagttatttatcttgatgttgttgt-ccagtaagactgatgcatatgaatccatgttgtttataatgatatataattgtatatacattacat 20248415  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac 193  Q
    |  ||||||| |||| || ||  ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||| |||| |||     
T  20248414 gacttatgtttgatatttaagttgttgat--ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaa 20248318  T
Q  194 gctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20248317 gttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 20248282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20918839 - 20918623
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    |||||||||||| ||||| |||  ||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||      ||||||||| ||    
T  20918839 tagaaactaagtcgtttaccttgttgttaatgttccagtaagactcatgcttatgaattgatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacat 20918740  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac 193  Q
    |  ||| ||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||| |||||||||||| |||     
T  20918739 gacttaagtttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaa 20918643  T
Q  194 gctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20918642 gctgcatgagtcggtctaag 20918623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Original strand, 14295547 - 14295668
Alignment:
Q  104 tgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgag 203  Q
    |||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14295547 tgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 14295643  T
Q  204 tcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||    
T  14295644 tcggtctaaaatgttgaagatgatg 14295668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 217
Target Start/End: Original strand, 21861453 - 21861676
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatg 95  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||    |||||  ||||||||||||||||||  ||||      |||||||||  ||    
T  21861453 agaaactaagttgtttatcttgctattgttgtttcagtaagcctgaatattatgatatgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttg 21861552  T
Q  96 gattatgt-tga-taattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
     ||||| | ||| |  |||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||  ||| |||    
T  21861553 aattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagcta 21861651  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  21861652 agctgcatgagtcggtctaagatga 21861676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 217
Target Start/End: Original strand, 21896142 - 21896362
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatg 95  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||||    ||||| |||||||||||||||||||  ||||      ||||||||| |||    
T  21896142 agaaactaagttgtttatctt---gttgttgtttcagtaagcctgaatattatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatg 21896238  T
Q  96 gattatgt-tga-taattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
     ||||| | ||| |  |||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||||  ||| |||    
T  21896239 aattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaacta 21896337  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
     | ||||||||||||||||||||||    
T  21896338 agttgcatgagtcggtctaagatga 21896362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 216
Target Start/End: Original strand, 45574875 - 45574992
Alignment:
Q  99 tatgttgataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctg 197  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| || |||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  45574875 tatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctg 45574973  T
Q  198 catgagtcggtctaagatg 216  Q
    |||||||||||||||||||    
T  45574974 catgagtcggtctaagatg 45574992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 217
Target Start/End: Original strand, 35261096 - 35261184
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35261096 catttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 35261184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21161818 - 21161719
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  || |||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  21161818 cattcgatattgttatatcacgatgattt-gcatactgttt-tgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgatgatgatgat 21161721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Original strand, 50210231 - 50210330
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  50210231 catttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 50210329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 76
Target Start/End: Original strand, 16368170 - 16368244
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt 76  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |||||||    
T  16368170 agaaattaagttgtttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgt 16368244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21840889 - 21840778
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  21840889 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 21840792  T
Q  205 cggtctaagatgat 218  Q
    ||||||||| ||||    
T  21840791 cggtctaagttgat 21840778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34509871 - 34509784
Alignment:
Q  140 ttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  34509871 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 34509784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13988988 - 13988867
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  13988988 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 13988891  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  13988890 cggtctaagttgattaagatgatg 13988867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16758749 - 16758668
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatga--tgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  16758749 gatattgttatatcatgaactg-gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 16758668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 21923331 - 21923452
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  21923331 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 21923428  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  21923429 cggtctaagttgattaagatgatg 21923452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 23593775 - 23593896
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  23593775 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 23593872  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  23593873 cggtctaagttgattaagatgatg 23593896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 228
Target Start/End: Original strand, 20847184 - 20847271
Alignment:
Q  140 ttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||| ||||| ||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  20847184 ttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 20847271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31612412 - 31612314
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  31612412 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 31612315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Original strand, 38801445 - 38801504
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  38801445 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatg 38801504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21026766 - 21026684
Alignment:
Q  145 tcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||| |||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  21026766 tcatgctgattttgtatactgcctatattgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgacgatgatg 21026684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 21475127 - 21475248
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  21475127 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 21475224  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
     |||||||| |||| | |||||||    
T  21475225 tggtctaagttgattaagatgatg 21475248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 27250752 - 27250846
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  27250752 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 27250846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29298258 - 29298138
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  29298258 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 29298162  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  29298161 cggtctaagttgattaagatgatg 29298138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29776810 - 29776689
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| |  ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  29776810 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 29776713  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  29776712 cggtctaagttgattaagatgatg 29776689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 225
Target Start/End: Original strand, 16368307 - 16368401
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatga-tgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatg-atgatgatg 225  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||  || || | ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16368307 gatattgttatatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaatgatgatg 16368401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 50686850 - 50686776
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt 76  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||||||   ||||||||| |||||||    
T  50686850 agaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatccgatgttgttaataatgt 50686776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 50614174 - 50614223
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50614174 tatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 50614223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 50622002 - 50622051
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50622002 tatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 50622051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Original strand, 22123107 - 22123214
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||| ||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| |  ||||| |||||  || |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  22123107 ataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagt 22123205  T
Q  205 cggtctaag 213  Q
    |||||||||    
T  22123206 cggtctaag 22123214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21707289 - 21707168
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| || | ||||| |  ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  21707289 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatacta-ttgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 21707192  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  21707191 cggtctaagttgattaagatgatg 21707168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21711831 - 21711710
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| || | ||||| |  ||||| |||||| || ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  21711831 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatacta-ttgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 21711734  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  21711733 cggtctaagttgattaagatgatg 21711710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22532367 - 22532273
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||   ||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  22532367 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 22532273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 218
Target Start/End: Original strand, 20454611 - 20454660
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgat 218  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  20454611 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20454660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 217
Target Start/End: Original strand, 41050052 - 41050142
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatg-attttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||| | |||||||||||| |||   || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41050052 catttgatattgttatatcatgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 41050142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Original strand, 13212974 - 13213023
Alignment:
Q  179 ttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  13212974 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13213023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16362039 - 16361928
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||  |||||  || |||||||||  |||||||| ||| |||||||||||    
T  16362039 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactg-ttgtgttgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagt 16361942  T
Q  205 cggtctaagatgat 218  Q
    ||||||||| ||||    
T  16361941 cggtctaagttgat 16361928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21342146 - 21342097
Alignment:
Q  179 ttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  21342146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21342097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21347011 - 21346962
Alignment:
Q  179 ttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  21347011 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21346962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 179
Target Start/End: Original strand, 22130902 - 22130975
Alignment:
Q  103 ttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtt 179  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||| | ||||||||||||    
T  22130902 ttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatg-gtttggatactgcctatgttgctgtt 22130975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 12271784 - 12271740
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg 46  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||    
T  12271784 agaaactaagttgtttatcctgctgttattgtttcagtaagactg 12271740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Original strand, 41049933 - 41049993
Alignment:
Q  16 ttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt 76  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||| |||| |||||| |||||||    
T  41049933 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgacgttgttaataatgt 41049993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32307905 - 32307684
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtatatatacattaaatggatta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  32307905 tagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttctagtaagactgatgcttatgaattaatgttgtttataatgttgtatata--cattaaatggatta 32307808  T
Q  101 tgttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcat 200  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  32307807 tgttgataattgagatgttgttgattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 32307709  T
Q  201 gagtcggtctaagatgatgatgatg 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  32307708 gagtcggtctaagttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9513145 - 9512923
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtatatatacattaaatggatta 100  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  9513145 tagaaactaagttgtttaccttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt--tttatatacattaaatggatta 9513048  T
Q  101 tgttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcat 200  Q
    ||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  9513047 tgttgataaatgaga---tgttgattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcat 9512952  T
Q  201 gagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9512951 gagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 9512923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9521120 - 9520898
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtatatatacattaaatggatta 100  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  9521120 tagaaactaagttgtttaccttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatg-tgt-tatatacattaaatggatta 9521023  T
Q  101 tgttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcat 200  Q
    ||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  9521022 tgttgataaatgaga---tgttgattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcat 9520927  T
Q  201 gagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9520926 gagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 9520898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 49667968 - 49668194
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtatatatacattaaatggatta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||    
T  49667968 tagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgagttgatgttgtatataatgctg--tatatactttaaatggatta 49668065  T
Q  101 tgttgataattgagacg-ttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgca 199  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  49668066 tgttgataaatgagatgtttgttgattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 49668164  T
Q  200 tgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49668165 tgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 49668194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16104017 - 16103783
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||      ||||||||||||    
T  16104017 tagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactaatccatatgaattgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaat 16103918  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac 193  Q
    | |||||||| |||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||     
T  16103917 gaattatgtttgatatttgagatgttgttgattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaa 16103819  T
Q  194 gctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16103818 gctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 16103783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16097566 - 16097331
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      ||||||||| ||    
T  16097566 tagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacat 16097467  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
    | |||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | | ||||||| ||||||||||||| |||    
T  16097466 gaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttaacta 16097368  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16097367 agctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 16097331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 1644567 - 1644787
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtatatatacattaaatggatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1644567 tagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttg--tatatacattaaatggatta 1644664  T
Q  101 tgttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcat 200  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||| || |||||||||| ||| ||  |||    
T  1644665 tgttgataattgagatattgttgattgtattcgatattgttatataatgatga-tttgcatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagcaacat 1644762  T
Q  201 gagtcggtctaagatgatgatgatg 225  Q
     ||| |||||||| |||||| ||||    
T  1644763 aagttggtctaagttgatgacgatg 1644787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 12174152 - 12174377
Alignment:
Q  8 taagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatggattat 101  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||      ||||||||| |||  ||||    
T  12174152 taagttgtttagcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaatcaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgacttat 12174251  T
Q  102 gtt-gataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcat 200  Q
    ||| |||| |||||  |||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  12174252 gtttgatatttgagttgttgtt--ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 12174348  T
Q  201 gagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12174349 gagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 12174377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15471161 - 15470927
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||   ||||||  | | ||||||  ||||||| ||||      ||||||||| ||    
T  15471161 tagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatctaa-gttgttgttaatgttatataattgtatatacattacat 15471063  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
    | |||||||| |||  |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||    
T  15471062 gaattatgtttgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtctgttatttaacta 15470964  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
     |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15470963 agctgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 49389513 - 49389639
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta------tatatacattaaat 94  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||    
T  49389513 tagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaat 49389612  T
Q  95 ggattatg-ttgataattgagacgttg 120  Q
    | |||||| |||||| |||||| ||||    
T  49389613 gaattatgtttgatagttgagatgttg 49389639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 13210212 - 13210444
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattga-tgttgtttataatgttgtata------tatacattaaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||    |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||      ||||||||| |    
T  13210212 tagaaactaagttgtttatcttgttgttaacattccagtaaggctgatgcatatgaattcaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattaca 13210311  T
Q  94 tggattatgtt-gataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
    ||  ||||||| |||| || ||  ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||    
T  13210312 tgacttatgtttgatatttaagttgttgat--ttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaacta 13210408  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
     |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  13210409 agctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 13210444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 12934195 - 12934268
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataat 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12934195 tagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataat 12934268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 37251051 - 37251273
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta------tatatacattaaatg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |||||||  ||      ||||| ||||| |||    
T  37251051 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagtctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatg 37251150  T
Q  96 gattatgt-tgataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatga--tgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatct 191  Q
     ||||| | ||||  |||||| |||| ||| || |||| ||||||||||||||||||  || ||||  ||||| | ||||||||||||||||  ||| ||    
T  37251151 aattatttatgat-gttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaact 37251248  T
Q  192 acgctgcatgagtcggtctaagatg 216  Q
    | ||||||||| |||||||||||||    
T  37251249 aagctgcatgactcggtctaagatg 37251273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14234639 - 14234491
Alignment:
Q  81 tatatacattaaatggattatgtt-gataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgt 178  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||  ||  || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||     
T  14234639 tatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgcctatgttgctgc 14234541  T
Q  179 ttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| || ||||||| |||| | |||||||    
T  14234540 ttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaagatgatg 14234491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 217
Target Start/End: Original strand, 52523745 - 52523835
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatga--tgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52523745 cattcgatattgttatatcatgaactg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 52523835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12399312 - 12399213
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  12399312 catttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 12399214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18438637 - 18438538
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  18438637 catttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 18438539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27165350 - 27165251
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||   ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  27165350 catttgatattggtatatcatgttg-ttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 27165252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Original strand, 53301569 - 53301668
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  53301569 catttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgat 53301667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15977637 - 15977516
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  15977637 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatacta-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 15977540  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  15977539 cggtctaagttgattaagatgatg 15977516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 216
Target Start/End: Original strand, 43550518 - 43550628
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||   ||||||| ||| |||||||||||    
T  43550518 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtca-ttatttaactaagctgcatgagt 43550616  T
Q  205 cggtctaagatg 216  Q
    ||||||||||||    
T  43550617 cggtctaagatg 43550628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 43927370 - 43927296
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt 76  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |||||||    
T  43927370 agaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgt 43927296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 50242944 - 50242833
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  50242944 ataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 50242847  T
Q  205 cggtctaagatgat 218  Q
    ||||||||| ||||    
T  50242846 cggtctaagttgat 50242833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14972957 - 14972858
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | | |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14972957 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 14972859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28194754 - 28194694
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  28194754 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 28194694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 217
Target Start/End: Original strand, 53070693 - 53070803
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| || || || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  53070693 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactg-ttatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 53070790  T
Q  205 cggtctaagatga 217  Q
    |||||||||||||    
T  53070791 cggtctaagatga 53070803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 7781387 - 7781508
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  7781387 ataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 7781484  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  7781485 cggtctaagttgattaagatgatg 7781508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 11424783 - 11424876
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  11424783 gatattgttatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 11424876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13442372 - 13442278
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13442372 gatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 13442278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17463300 - 17463179
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  17463300 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 17463203  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  17463202 cggtctaagttgattaagatgatg 17463179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17672748 - 17672627
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  17672748 ataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgct-atgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 17672651  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  17672650 cggtctaagttgattaagatgatg 17672627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Original strand, 20698470 - 20698552
Alignment:
Q  145 tcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20698470 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 20698552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 130 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23274788 - 23274706
Alignment:
Q  130 ttcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||| | |||||||||| |||||||    
T  23274788 ttcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaag 23274706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 130 - 213
Target Start/End: Original strand, 24340743 - 24340825
Alignment:
Q  130 ttcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  24340743 ttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaag 24340825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 28848651 - 28848772
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  28848651 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 28848748  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  28848749 cggtctaagttgattaagatgatg 28848772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 29172623 - 29172744
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  29172623 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 29172720  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  29172721 cggtctaagttgattaagatgatg 29172744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34159448 - 34159327
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  34159448 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 34159351  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  34159350 cggtctaagttgattaagatgatg 34159327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 45606947 - 45607068
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  45606947 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 45607044  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  45607045 cggtctaagttgattaagatgatg 45607068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 55476613 - 55476492
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  55476613 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 55476516  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  55476515 cggtctaagttgattaagatgatg 55476492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 228
Target Start/End: Original strand, 6469175 - 6469295
Alignment:
Q  107 taattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtc 205  Q
    |||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  6469175 taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 6469272  T
Q  206 ggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||| |||| | |||||||    
T  6469273 ggtctaagttgattaagatgatg 6469295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 227
Target Start/End: Original strand, 16282851 - 16282971
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  16282851 ataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 16282948  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    ||||||||| |||| | ||||||    
T  16282949 cggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12567682 - 12567571
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||| | ||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  12567682 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 12567585  T
Q  205 cggtctaagatgat 218  Q
    ||||||||| ||||    
T  12567584 cggtctaagttgat 12567571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13544147 - 13544036
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||| | ||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  13544147 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 13544050  T
Q  205 cggtctaagatgat 218  Q
    ||||||||| ||||    
T  13544049 cggtctaagttgat 13544036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Original strand, 38961931 - 38962042
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  38961931 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 38962028  T
Q  205 cggtctaagatgat 218  Q
    ||||||||| ||||    
T  38962029 cggtctaagttgat 38962042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42386513 - 42386429
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  42386513 catttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaag 42386429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15412552 - 15412430
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgat-ga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgag 203  Q
    ||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  15412552 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactg-tgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 15412455  T
Q  204 tcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| |||| | |||||||    
T  15412454 tcggtctaagttgattaagatgatg 15412430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Original strand, 25476403 - 25476502
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  25476403 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgtt-gttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 25476501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8899216 - 8899111
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  8899216 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 8899119  T
Q  205 cggtctaa 212  Q
    ||||||||    
T  8899118 cggtctaa 8899111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 9707647 - 9707768
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  9707647 ataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 9707744  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  9707745 cggtctaagttgattaagatgatg 9707768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 16454321 - 16454442
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||    
T  16454321 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 16454418  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  16454419 cggtctaagttgattaagatgatg 16454442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17487954 - 17487860
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| |||||   ||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17487954 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 17487860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17499436 - 17499342
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| |||||   ||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17499436 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 17499342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 23083384 - 23083478
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||  || ||||| ||||| | ||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23083384 gatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 23083478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26686985 - 26686891
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  26686985 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatg 26686891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 76
Target Start/End: Original strand, 22110235 - 22110309
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt 76  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    ||||| |||| |||||| |||||||    
T  22110235 agaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatgatttgaagttgttaataatgt 22110309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14572652 - 14572596
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatg 225  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14572652 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgttgatg 14572596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 22110409 - 22110458
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22110409 tatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 22110458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 43926022 - 43925973
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43926022 tatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 43925973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8499617 - 8499519
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  8499617 catttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactg-tgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 8499520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 13151830 - 13151952
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac-gctgcatgag 203  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||    
T  13151830 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgag 13151927  T
Q  204 tcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| |||| | |||||||    
T  13151928 tcggtctaagttgattaagatgatg 13151952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 13154295 - 13154417
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac-gctgcatgag 203  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||    
T  13154295 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgag 13154392  T
Q  204 tcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| |||| | |||||||    
T  13154393 tcggtctaagttgattaagatgatg 13154417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Original strand, 24153227 - 24153325
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| ||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  24153227 catttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactacctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 24153324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 55501041 - 55500943
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  55501041 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 55500944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 10247763 - 10247884
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || || ||||||| |||||||| ||| |||| ||||||    
T  10247763 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgctgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagt 10247860  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  10247861 cggtctaagttgattaagatgatg 10247884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 17446695 - 17446815
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  17446695 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 17446792  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    | ||||||| |||| | |||||||    
T  17446793 c-gtctaagttgattaagatgatg 17446815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 225
Target Start/End: Original strand, 606383 - 606441
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatg-atgatgatg 225  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  606383 tatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataagatgaatgatgatg 606441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737237
Alignment:
Q  170 tgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  17737294 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17737237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556986
Alignment:
Q  179 ttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10556986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 229
Target Start/End: Original strand, 14576890 - 14576950
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14576890 tatgttgctgtt-gttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgatgttgatgatgt 14576950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36166648 - 36166599
Alignment:
Q  179 ttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  36166648 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 36166599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 209
Target Start/End: Original strand, 37642287 - 37642363
Alignment:
Q  132 cgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtc 209  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |  |||  || ||| ||||||||||||||||    
T  37642287 cgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtc 37642363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41124009 - 41123892
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||    |||||||||| ||| |||||||||||    
T  41124009 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttg----ttgttatttaactaagctgcatgagt 41123915  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    ||||||||| |||| | ||||||    
T  41123914 cggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45577999
Alignment:
Q  179 ttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 45577999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 12119764 - 12119886
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgat-ga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgag 203  Q
    ||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||| | | ||||||||||    
T  12119764 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgtcgctgtt-gttatttaacaaagctgcatgag 12119861  T
Q  204 tcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| |||| | |||||||    
T  12119862 tcggtctaagttgattaagatgatg 12119886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12378026 - 12377938
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatg-attttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagat 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||| | |||||||||||||||   ||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  12378026 catttgatattgttatatcatgagctattttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaagat 12377938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 60)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19652431 - 19652198
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      ||||| ||||||    
T  19652431 tagaaactaagttgtttatcttgctgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatactttaaat 19652332  T
Q  95 ggattatgttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacg 194  Q
    |||||||||||||  |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||| |||| ||| |    
T  19652331 ggattatgttgatgtttgagatgttgttgattgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaag 19652233  T
Q  195 ctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19652232 ctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 19652198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 28496357 - 28496573
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta------tatatacattaaat 94  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||      ||||||||||| ||    
T  28496357 tagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacat 28496456  T
Q  95 ggattatg-ttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac 193  Q
    |  ||||| |||||| |||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| | |||||||||  |||||||||| |||     
T  28496457 gacttatgtttgatatttgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaa 28496553  T
Q  194 gctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28496554 gctgcatgagtcggtctaag 28496573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 29808768 - 29808984
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta------tatatacattaaat 94  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||      ||||||||||| ||    
T  29808768 tagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacat 29808867  T
Q  95 ggattatg-ttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac 193  Q
    |  ||||| |||||| |||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| | |||||||||  |||||||||| |||     
T  29808868 gacttatgtttgatatttgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaa 29808964  T
Q  194 gctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29808965 gctgcatgagtcggtctaag 29808984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1561539 - 1561307
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaa-ttgatgttgtttataatgttgta------tatatacattaaa 93  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||      ||||||||||| |    
T  1561539 tagaaactaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactgatgcatatgaatttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattaca 1561440  T
Q  94 tggattatg-ttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
    ||  ||||| |||||| |||||  ||||||  || ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||| | ||||||||||| |||    
T  1561439 tgacttatgtttgatatttgagttgttgat--ttgcattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactacctatattgttatttgttatttaacta 1561343  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
     |||||||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  1561342 agctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatg 1561307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20109378 - 20109140
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta--------tatatacattaaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||        |||||||||||      
T  20109378 agaaactaagttgtttatcttgctgatgtctttctagtaagactgatgtatatcaattgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattact 20109279  T
Q  94 tggattatgt-tg-ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatc 190  Q
    || ||||| | || ||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||  ||| |    
T  20109278 tgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaac 20109180  T
Q  191 tacgctgcatgagtcggtctaagatg-atgatgatgatgt 229  Q
    || |||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  20109179 taagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23019644 - 23019408
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||   |||| |  | |||| |||  ||||||| ||||      ||||||||| ||    
T  23019644 tagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaactatataatctaatgtcgttgttaatgttatataattgtatatacattacat 23019545  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
    | |||||||| |||  |||||| |||| ||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||    
T  23019544 gaattatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaacta 23019446  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatg-atgatgatgatgt 229  Q
     ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  23019445 agctgcataagtcggtctaagatgaaagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 130 - 228
Target Start/End: Original strand, 27333238 - 27333335
Alignment:
Q  130 ttcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  27333238 ttcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 27333335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 130 - 228
Target Start/End: Original strand, 27393978 - 27394075
Alignment:
Q  130 ttcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  27393978 ttcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 27394075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19668609 - 19668390
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatg 95  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |  ||||||| |||||||| ||||      ||||||||| |||    
T  19668609 agaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctgatgtatatgatgtagtgttgttgataatgttatatagttgtatatacattacatg 19668510  T
Q  96 gattatgt-tgataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatga--tgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatct 191  Q
     |||| || ||||  ||| || |||| |||||  |||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||    
T  19668509 aattacgtatgatg-ttgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttgcatactatctatgttgctgtttgttaattaact 19668412  T
Q  192 acgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  19668411 aagctgcatgagtcggtctaag 19668390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25644443 - 25644339
Alignment:
Q  110 ttgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggt 208  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25644443 ttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggt 25644344  T
Q  209 ctaag 213  Q
    |||||    
T  25644343 ctaag 25644339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 229
Target Start/End: Original strand, 4185839 - 4185939
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  4185839 cattcgatattgttatatcatgatgagtt-gcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatgatgacgat 4185937  T
Q  228 gt 229  Q
    ||    
T  4185938 gt 4185939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 213
Target Start/End: Original strand, 9098530 - 9098616
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatga-tgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  9098530 catttgatattgttatatcatgaattgttttgcatactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 9098616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18456841 - 18456731
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  18456841 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 18456744  T
Q  205 cggtctaagatga 217  Q
    |||||||||||||    
T  18456743 cggtctaagatga 18456731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18462001 - 18461891
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  18462001 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 18461904  T
Q  205 cggtctaagatga 217  Q
    |||||||||||||    
T  18461903 cggtctaagatga 18461891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29060643 - 29060544
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  29060643 catttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgat 29060545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4186470 - 4186376
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatga 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  4186470 cattcgatattgttatatcatgatgagtt-gcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatgatga 4186376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16496342 - 16496248
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16496342 gatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 16496248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25754931 - 25754810
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  25754931 ataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 25754834  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  25754833 cggtctaagttgattaagatgatg 25754810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 26924680 - 26924801
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  26924680 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 26924777  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  26924778 cggtctaagttgattaagatgatg 26924801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Original strand, 30676750 - 30676861
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  30676750 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 30676847  T
Q  205 cggtctaagatgat 218  Q
    ||||||||| ||||    
T  30676848 cggtctaagttgat 30676861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1595671 - 1595550
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  1595671 ataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 1595574  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    | ||||||| |||| | |||||||    
T  1595573 cagtctaagttgattaagatgatg 1595550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 2291220 - 2291341
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  2291220 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 2291317  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  2291318 cggtctaagttgattaagatgatg 2291341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8055151 - 8055030
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  8055151 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactt-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 8055054  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  8055053 cggtctaagttgattaagatgatg 8055030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12742439 - 12742318
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  12742439 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 12742342  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  12742341 cggtctaagttgattaagatgatg 12742318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 17287819 - 17287913
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  17287819 gatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17287913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 18334632 - 18334753
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  18334632 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 18334729  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  18334730 cggtctaagttgattaagatgatg 18334753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19005168 - 19005047
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  19005168 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 19005071  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  19005070 cggtctaagttgattaagatgatg 19005047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 19303536 - 19303657
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    |||||||||| |||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | | ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  19303536 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatacttcctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 19303633  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  19303634 cggtctaagatgatgaagatgatg 19303657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 19858959 - 19859080
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  19858959 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 19859056  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  19859057 cggtctaagttgattaagatgatg 19859080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22782349 - 22782228
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  22782349 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 22782252  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  22782251 cggtctaagttgattaagatgatg 22782228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24422669 - 24422548
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  24422669 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 24422572  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  24422571 cggtctaagttgattaagatgatg 24422548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33861916 - 33861795
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  33861916 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 33861819  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  33861818 cggtctaagttgattaagatgatg 33861795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33864400 - 33864279
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  33864400 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 33864303  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  33864302 cggtctaagttgattaagatgatg 33864279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Original strand, 16920669 - 16920747
Alignment:
Q  150 atgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||| ||| ||||| | |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  16920669 atgatgttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatg 16920747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 23076969 - 23076895
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt 76  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  | |||| ||||||||||| |||||||    
T  23076969 agaaactaatttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgt 23076895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 35008387 - 35008313
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt 76  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  | |||| ||||||||||| |||||||    
T  35008387 agaaactaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgt 35008313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11185568 - 11185515
Alignment:
Q  169 atgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatg 222  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11185568 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgatg 11185515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20076763 - 20076704
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20076763 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 20076704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22831567 - 22831507
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  22831567 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatg 22831507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25656728 - 25656630
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  25656728 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgct-atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 25656631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35245650 - 35245590
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  35245650 tatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 35245590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 20638306 - 20638400
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  20638306 gatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 20638400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 25629350 - 25629472
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    |||||||||| |||| ||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| | | |||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||    
T  25629350 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgtt-gtaatttaactaagctgcatgagt 25629448  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||||| |||||||    
T  25629449 cggtctaagttgatgaagatgatg 25629472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 229
Target Start/End: Original strand, 31155415 - 31155515
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgttt-gttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatga 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||  || ||| ||||||||||||    
T  31155415 cattcgatattgttatatcacgatgactt-gcatactgttta-gttgctgttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgatgatgatga 31155512  T
Q  227 tgt 229  Q
    |||    
T  31155513 tgt 31155515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25688624 - 25688513
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || || | |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  25688624 ataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 25688527  T
Q  205 cggtctaagatgat 218  Q
    || |||||| ||||    
T  25688526 cgatctaagttgat 25688513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34963495 - 34963384
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||    
T  34963495 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 34963398  T
Q  205 cggtctaagatgat 218  Q
    ||||||||| ||||    
T  34963397 cggtctaagttgat 34963384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Original strand, 18409845 - 18409944
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | | |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  18409845 catttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 18409943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 217
Target Start/End: Original strand, 18821868 - 18821950
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    |||||||||||  |||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18821868 gatattgttatggcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 18821950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Original strand, 28103796 - 28103856
Alignment:
Q  16 ttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt 76  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |||||||    
T  28103796 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgt 28103856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 1540951 - 1541072
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||  || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  1540951 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 1541048  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    || |||||| |||| | |||||||    
T  1541049 cgatctaagttgattaagatgatg 1541072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 3852057 - 3852178
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||  ||||| | || ||||| || ||||| |||||| || |||||||||| |||||| | ||| |||||||||||    
T  3852057 ataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatacta-ttgtgttgctgtt-gttattaaactaagctgcatgagt 3852154  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  3852155 cggtctaagttgattaagatgatg 3852178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 220
Target Start/End: Original strand, 20360983 - 20361069
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatga 220  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| || || | |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20360983 gatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatga 20361069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714421
Alignment:
Q  170 tgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  25714478 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 25714421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 177
Target Start/End: Original strand, 4668229 - 4668277
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||    
T  4668229 cattcgatattgttatatcatgatga-gttgcatactgcctatgttgctg 4668277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 177
Target Start/End: Original strand, 4675076 - 4675124
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||    
T  4675076 cattcgatattgttatatcatgatga-gttgcatactgcctatgttgctg 4675124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 228
Target Start/End: Original strand, 20556934 - 20557053
Alignment:
Q  108 aattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcg 206  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| |||||| ||||  |||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |    
T  20556934 aattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttg 20557031  T
Q  207 gtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||| |||| | |||||||    
T  20557032 gtctaagttgattaagatgatg 20557053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 173
Target Start/End: Original strand, 22080756 - 22080800
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgtt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  22080756 cattcgatattgttatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgtt 22080800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Original strand, 22780295 - 22780344
Alignment:
Q  179 ttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  22780295 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 22780344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 216
Target Start/End: Original strand, 18199475 - 18199522
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatg 216  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  18199475 tatgttgctgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatg 18199522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 18204294 - 18204242
Alignment:
Q  24 ctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt 76  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||||| |||||||    
T  18204294 ctgttgttgtttcagtaagtctgatgtaaatgatttgatgttgttaataatgt 18204242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 57)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 22134100 - 22134323
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtatatatacattaaatggatta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22134100 tagaaactaagttgtttatcttgctgtcatttttccagtaagactgatgcatatgaattggtgttgtttataatgttg--tatatacattaaatggatta 22134197  T
Q  101 tgttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcat 200  Q
    ||||||||| ||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||    
T  22134198 tgttgataaatgagatgttattgattgcattcgatattgttatattatgatga-tttgcatactgcctatgttgctg-ttgatatttaactaagctgcat 22134295  T
Q  201 gagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22134296 gagtcggtctatgatgatgatgatgatg 22134323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25176088 - 25175853
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaa 93  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||||| ||||      ||||| ||| |    
T  25176088 tagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattatatatacgttata 25175989  T
Q  94 tggattatgttgataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
    || |||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  25175988 tgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaacta 25175890  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
     ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  25175889 agctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatgt 25175853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 81 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28406128 - 28405981
Alignment:
Q  81 tatatacattaaatggattatgttgataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtt 179  Q
    ||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  28406128 tatatacattttatgaattaagttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtt 28406029  T
Q  180 tgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28406028 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7679738 - 7679589
Alignment:
Q  79 tatatatacattaaatggattatgtt-gataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgct 176  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| |||  ||  || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  7679738 tatatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgct 7679641  T
Q  177 gtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  7679640 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 228
Target Start/End: Original strand, 23071865 - 23072066
Alignment:
Q  31 tgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatggattatgtt-gataattgagacgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||      ||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||  | ||||     
T  23071865 tgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgctgat- 23071963  T
Q  124 attacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatga 223  Q
     ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||| ||    
T  23071964 -ttatattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaaga 23072061  T
Q  224 tgatg 228  Q
    |||||    
T  23072062 tgatg 23072066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 228
Target Start/End: Original strand, 298844 - 298932
Alignment:
Q  140 ttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  298844 ttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 298932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22105535 - 22105413
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    |||||||||| |||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  22105535 ataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 22105437  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  22105436 cggtctaagttgattaagatgatg 22105413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 76
Target Start/End: Original strand, 22459445 - 22459519
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt 76  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  22459445 agaaactaagttgtttatcttgctgttattgtttcagtaagactgatgtatacgagttgatgttatttataatgt 22459519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23207515 - 23207292
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta------tatatacattaaatg 95  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||| ||||||||||| |||||||  ||      ||||| ||||| |||    
T  23207515 agaaactaagttgcttatcttactgttgttgttcaagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatg 23207416  T
Q  96 gattatgttgataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatga--tgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
     ||||| |  |   |||||| || | ||| || |||| ||||||||||||||||||  || ||||  ||||| | ||||||||||||||||  ||| |||    
T  23207415 aattatttataatgttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaacta 23207317  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  23207316 agctgcatgagtcggtctaagatga 23207292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 217
Target Start/End: Original strand, 7732 - 7839
Alignment:
Q  110 ttgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggt 208  Q
    |||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| || ||    
T  7732 ttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagt 7830  T
Q  209 ctaagatga 217  Q
    |||||||||    
T  7831 ctaagatga 7839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6726117 - 6725996
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  6726117 ataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 6726020  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  6726019 cggtctaagttgattaagatgatg 6725996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 130 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19671931 - 19671849
Alignment:
Q  130 ttcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  19671931 ttcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaag 19671849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23060611 - 23060517
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23060611 gatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 23060517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 18786787 - 18787005
Alignment:
Q  3 gaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatgg 96  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| || |   |||||| |  ||||| || |||||||| ||||      ||||||||| |||     
T  18786787 gaaactaagttgtttatcatgctgttgttgtttcagtaagcctaaattatatgattgaatgttattgataatgttatatagttgtatatacattacatga 18786886  T
Q  97 attatgtt-gataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatga--tgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
    |||||||| |||  ||| ||||||| ||| || |||| || |||||||||||||||  || ||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||    
T  18786887 attatgtttgatg-ttgtgacgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactggttt-gcatactacctatgttactgattgttatttaacta 18786984  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  18786985 agctgcatgagtcggtctaag 18787005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 229
Target Start/End: Original strand, 23708642 - 23708738
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatg-atgatgatgatgt 229  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||    
T  23708642 gatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttgaaagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20309172 - 20309112
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20309172 tatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 20309112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 25109126 - 25109054
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataat 74  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |||||    
T  25109126 agaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataat 25109054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18809065 - 18808944
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  18809065 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 18808968  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  18808967 cggtctaagttgattaagatgatg 18808944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23076540 - 23076446
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  23076540 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatg 23076446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23130984 - 23130863
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  23130984 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 23130887  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  23130886 cggtctaagttgattaagatgatg 23130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23133451 - 23133330
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  23133451 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 23133354  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  23133353 cggtctaagttgattaagatgatg 23133330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23135712 - 23135591
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  23135712 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 23135615  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  23135614 cggtctaagttgattaagatgatg 23135591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 23709572 - 23709693
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  23709572 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 23709669  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  23709670 cggtctaagttgattaagatgatg 23709693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 23712053 - 23712174
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  23712053 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 23712150  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  23712151 cggtctaagttgattaagatgatg 23712174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 34402562 - 34402683
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  34402562 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 34402659  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  34402660 cggtctaagttgattaagatgatg 34402683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39682435 - 39682314
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  39682435 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 39682338  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  39682337 cggtctaagttgattaagatgatg 39682314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23285942 - 23285869
Alignment:
Q  154 ttttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23285942 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 23285869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 571517 - 571398
Alignment:
Q  108 aattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcg 206  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  571517 aattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 571420  T
Q  207 gtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||| |||| | |||||||    
T  571419 gtctaagttgattaagatgatg 571398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 228
Target Start/End: Original strand, 23040246 - 23040306
Alignment:
Q  167 ttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23040246 ttatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 23040306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Original strand, 23103440 - 23103512
Alignment:
Q  155 tttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23103440 tttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 23103512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 23791511 - 23791438
Alignment:
Q  3 gaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt 76  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |||||||    
T  23791511 gaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgt 23791438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24367896 - 24367785
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  24367896 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 24367799  T
Q  205 cggtctaagatgat 218  Q
    ||||||||| ||||    
T  24367798 cggtctaagttgat 24367785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 43137419 - 43137301
Alignment:
Q  108 aattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcg 206  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||| ||||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  43137419 aattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattactg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 43137322  T
Q  207 gtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    ||||||| |||| | ||||||    
T  43137321 gtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 38138 - 38231
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  38138 gatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 38231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 22731257 - 22731351
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| | ||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  22731257 gatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatg 22731351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26505501 - 26505380
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| |  ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  26505501 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 26505404  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  26505403 cggtctaagttgattaagatgatg 26505380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26507979 - 26507858
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| |  ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  26507979 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 26507882  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  26507881 cggtctaagttgattaagatgatg 26507858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28577221 - 28577100
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||  || |||| |||||| |||||||||| || ||||| |||||  ||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  28577221 ataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactg-ttgcgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 28577124  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  28577123 cggtctaagttgattaagatgatg 28577100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22337176 - 22337119
Alignment:
Q  170 tgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22337176 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 22337119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 20520250 - 20520299
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20520250 tatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 20520299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Original strand, 21155100 - 21155211
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || || | |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  21155100 ataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 21155197  T
Q  205 cggtctaagatgat 218  Q
    ||||||||| ||||    
T  21155198 cggtctaagttgat 21155211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Original strand, 32214961 - 32215072
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  32214961 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 32215058  T
Q  205 cggtctaagatgat 218  Q
    ||||||||| ||||    
T  32215059 cggtctaagttgat 32215072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23004819 - 23004763
Alignment:
Q  161 tactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  23004819 tactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatga 23004763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 24898235 - 24898357
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac-gctgcatgag 203  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||    
T  24898235 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgag 24898332  T
Q  204 tcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| |||| | |||||||    
T  24898333 tcggtctaagttgattaagatgatg 24898357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 24900718 - 24900840
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac-gctgcatgag 203  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||    
T  24900718 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgag 24900815  T
Q  204 tcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| |||| | |||||||    
T  24900816 tcggtctaagttgattaagatgatg 24900840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 24903195 - 24903317
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac-gctgcatgag 203  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||    
T  24903195 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgag 24903292  T
Q  204 tcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| |||| | |||||||    
T  24903293 tcggtctaagttgattaagatgatg 24903317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 24905672 - 24905794
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac-gctgcatgag 203  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||    
T  24905672 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgag 24905769  T
Q  204 tcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| |||| | |||||||    
T  24905770 tcggtctaagttgattaagatgatg 24905794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 24908147 - 24908269
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac-gctgcatgag 203  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||    
T  24908147 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgag 24908244  T
Q  204 tcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| |||| | |||||||    
T  24908245 tcggtctaagttgattaagatgatg 24908269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 45029894 - 45030015
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||| |  || ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  45029894 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattg-ttgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 45029991  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  45029992 cggtctaagttgattaagatgatg 45030015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946661
Alignment:
Q  154 ttttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 8946661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 215
Target Start/End: Original strand, 32451951 - 32452033
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagat 215  Q
    ||||||||||| ||||| |  ||||| || || | |||||||||||||| | |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  32451951 gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaagat 32452033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Original strand, 22738247 - 22738296
Alignment:
Q  179 ttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  22738247 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 22738296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Original strand, 23654454 - 23654503
Alignment:
Q  179 ttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  23654454 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 23654503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Original strand, 24529641 - 24529690
Alignment:
Q  179 ttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  24529641 ttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24529690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 28406215 - 28406174
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaag 42  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  28406215 tagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaag 28406174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967375
Alignment:
Q  179 ttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 38967375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 218
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643101
Alignment:
Q  170 tgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgat 218  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24643054 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24643101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 10424 - 10659
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      ||||||||| ||    
T  10424 tagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacat 10523  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
    | |||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  10524 gaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaacta 10622  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
     ||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  10623 agctgcataagtcggtctaagttgaagatggtgatgt 10659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 45675 - 45910
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      ||||||| | ||    
T  45675 tagaaactaagttgtttatattgctgtaattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacatcacat 45774  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| || |||||||||||||| |||    
T  45775 gaattatgtttgataattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatttttctgtttgttatttaacta 45873  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45874 agctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 45910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 130143 - 129908
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||      ||||||||| ||    
T  130143 tagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttacaatgttatataattgtatatacattacat 130044  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
    | |||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||    
T  130043 gaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaacta 129945  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  129944 agatgcatgagtcggtctaagttgatgatgaagatgt 129908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Original strand, 60759 - 60822
Alignment:
Q  154 ttttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  60759 ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatga 60822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 57)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 26355583 - 26355816
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      ||||||||||||    
T  26355583 tagaaactaagttgtttatctttttgttattgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaat 26355682  T
Q  95 ggattatgttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacg 194  Q
    ||| |||||||||   ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||| |||| ||| |    
T  26355683 ggaatatgttgatggctgagatgttgttgattgcattcgatattgttatatcgtgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaag 26355781  T
Q  195 ctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26355782 ctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 26355816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 5866160 - 5866391
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||      ||||||||| ||    
T  5866160 tagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacat 5866259  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac 193  Q
    |  ||| ||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||     
T  5866260 gacttaagtttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa 5866356  T
Q  194 gctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  5866357 gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 5866391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21491230 - 21490999
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||      ||||||||| ||    
T  21491230 tagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcctatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacat 21491131  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac 193  Q
    |  ||| ||| ||||||||||  ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||     
T  21491130 gacttaagtttgataattgagttgttgat--ttacattcaatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa 21491034  T
Q  194 gctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  21491033 gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 21490999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 38855139 - 38855368
Alignment:
Q  5 aactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatggat 98  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||      ||||||||| ||| ||    
T  38855139 aactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattatatgaat 38855238  T
Q  99 tatgttgataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctg 197  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  38855239 tatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 38855337  T
Q  198 catgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  38855338 catgagtcggtctaagttgattaagatgatg 38855368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17141151 - 17140920
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||      ||||||||| ||    
T  17141151 tagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacat 17141052  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatgatt-acattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
    |  ||| ||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  || ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  17141051 gacttaagtttgataattgag---ttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggatt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaacta 17140956  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
     |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  17140955 agctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 17140920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6520605 - 6520372
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||      ||||||||| ||    
T  6520605 tagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacat 6520506  T
Q  95 ggattatgttgataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac 193  Q
    | |||||||||||  ||  || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||     
T  6520505 gaattatgttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa 6520407  T
Q  194 gctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  6520406 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6520372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 81 - 229
Target Start/End: Original strand, 23760814 - 23760962
Alignment:
Q  81 tatatacattaaatggattatgttgataattgagacgttgatgattaca-ttcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtt 179  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| |||||  | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  23760814 tatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatgattta-catactgcctatgttgctgtt 23760912  T
Q  180 tgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23760913 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21673855 - 21673707
Alignment:
Q  81 tatatacattaaatggattatgttgataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtt 179  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||| ||||    
T  21673855 tatatacattaaataaattatattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgttgttgtt 21673757  T
Q  180 tgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  21673756 tgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttgatgatgatcatgt 21673707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20498800 - 20498577
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta------tatatacattaaatg 95  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||      |||||||||||  ||    
T  20498800 agaaactaagttgtttatcttgatgttgatgtttcggtaagactgatgtatatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttg 20498701  T
Q  96 gattatgt-tg-ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
     ||||| | || ||  |||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| | ||||||||||||||||  ||| |||    
T  20498700 aattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct-attttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaacta 20498602  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
     | ||||||||||||||||||||||    
T  20498601 agttgcatgagtcggtctaagatga 20498577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21249582 - 21249388
Alignment:
Q  39 taagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatggattatgtt-gataattgagacgttgatgattacatt 131  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||      ||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||  ||||||  |||||||    
T  21249582 taagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat--ttacatt 21249485  T
Q  132 cgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgtt-atttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  21249484 cgatattattatatcatgatgaatt-gcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 21249388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21255420 - 21255226
Alignment:
Q  39 taagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatggattatgtt-gataattgagacgttgatgattacatt 131  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||      ||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||  ||||||  |||||||    
T  21255420 taagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat--ttacatt 21255323  T
Q  132 cgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgtt-atttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  21255322 cgatattattatatcatgatgaatt-gcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 21255226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37116586 - 37116362
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt------tgtatatatacattaaatg 95  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  | |||| ||||||||||| |||||||      | | ||||| ||||| |||    
T  37116586 agaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatg 37116487  T
Q  96 gattatgt-tgataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatga--tgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatct 191  Q
     ||||| | ||||  |||||| |||| ||| || |||| ||||||||||||||||||  || ||||   |||| | ||||||||||||||||  ||| ||    
T  37116486 aattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaact 37116388  T
Q  192 acgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  37116387 aagctgcatgagtcggtctaagatga 37116362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21285749 - 21285611
Alignment:
Q  81 tatatacattaaatggattatgtt-gataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgt 178  Q
    ||||||||||| ||| | |||||| |||  |||||| |||| |||||  |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| |||    
T  21285749 tatatacattacatgaactatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgttgt 21285651  T
Q  179 ttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgat 218  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||    
T  21285650 ttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21285611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Original strand, 16199701 - 16199761
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16199701 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 16199761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 228
Target Start/End: Original strand, 21389499 - 21389567
Alignment:
Q  160 atactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21389499 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 21389567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 228
Target Start/End: Original strand, 21778825 - 21778893
Alignment:
Q  160 atactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21778825 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 21778893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7372876 - 7372782
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  7372876 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 7372782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 130 - 213
Target Start/End: Original strand, 13597637 - 13597719
Alignment:
Q  130 ttcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  13597637 ttcgatattattatatcatgatg-ttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaag 13597719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 18818432 - 18818526
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18818432 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 18818526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23406477 - 23406383
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23406477 gatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 23406383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6759361 - 6759262
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | | |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6759361 catttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 6759263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Original strand, 16092360 - 16092459
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | | |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16092360 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 16092458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Original strand, 21396037 - 21396097
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21396037 tatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 21396097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Original strand, 21790530 - 21790590
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21790530 tatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 21790590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Original strand, 28649062 - 28649161
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  28649062 catttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 28649160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1484524 - 1484403
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  1484524 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 1484427  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  1484426 cggtctaagttgattaagatgatg 1484403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 5853332 - 5853453
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  5853332 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 5853429  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  5853430 cggtctaagttgattaagatgatg 5853453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 14409484 - 14409605
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  14409484 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 14409581  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  14409582 cggtctaagttgattaagatgatg 14409605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 15203271 - 15203392
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  15203271 ataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 15203368  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    || |||||| |||| | |||||||    
T  15203369 cgctctaagttgattaagatgatg 15203392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 20046235 - 20046356
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  20046235 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 20046332  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  20046333 cggtctaagttgattaagatgatg 20046356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20403349 - 20403228
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  20403349 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 20403252  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  20403251 cggtctaagttgattaagatgatg 20403228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20536306 - 20536212
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20536306 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 20536212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 21919023 - 21919117
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  21919023 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 21919117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22001875 - 22001754
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  22001875 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 22001778  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  22001777 cggtctaagttgattaagatgatg 22001754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22626833 - 22626740
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22626833 gatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 22626740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41598310 - 41598189
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| | ||| |||||||||||    
T  41598310 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactg-tgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagt 41598213  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  41598212 cggtctaagttgattaagatgatg 41598189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 213
Target Start/End: Original strand, 983450 - 983508
Alignment:
Q  155 tttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  983450 tttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 983508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 76
Target Start/End: Original strand, 17266876 - 17266950
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt 76  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||   |||||| ||||||||||| |||||||    
T  17266876 agaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtgagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgt 17266950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 228
Target Start/End: Original strand, 18879275 - 18879348
Alignment:
Q  154 ttttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18879275 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 18879348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Original strand, 16413356 - 16413467
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  16413356 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 16413453  T
Q  205 cggtctaagatgat 218  Q
    ||||||||| ||||    
T  16413454 cggtctaagttgat 16413467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Original strand, 17612132 - 17612212
Alignment:
Q  132 cgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| || |||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  17612132 cgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaag 17612212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 22364897 - 22364828
Alignment:
Q  4 aaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataa 73  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| ||||    
T  22364897 aaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataa 22364828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Original strand, 21923986 - 21924045
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21923986 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 21924045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Original strand, 45131054 - 45131113
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  45131054 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 45131113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 4542413 - 4542534
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| || ||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  4542413 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat-cttgttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 4542510  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  4542511 cggtctaagttgattaagatgatg 4542534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 213
Target Start/End: Original strand, 13508105 - 13508187
Alignment:
Q  130 ttcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||| | | |||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  13508105 ttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaag 13508187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31971354 - 31971261
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  31971354 gatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 31971261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Original strand, 45290734 - 45290846
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgat--gattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgag 203  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || ||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  45290734 ataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 45290831  T
Q  204 tcggtctaagatgat 218  Q
    |||||||||| ||||    
T  45290832 tcggtctaagttgat 45290846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15070681 - 15070574
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgat-ga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgag 203  Q
    ||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  15070681 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactg-tgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 15070584  T
Q  204 tcggtctaag 213  Q
    ||||||||||    
T  15070583 tcggtctaag 15070574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24353084 - 24353035
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24353084 tatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 24353035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26219767 - 26219718
Alignment:
Q  179 ttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  26219767 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattatgatgatg 26219718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4483402 - 4483282
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||| | ||| |||||||||||    
T  4483402 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttattaa-ctaagctgcatgagt 4483306  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  4483305 cggtctaagttgattaagatgatg 4483282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19896323 - 19896266
Alignment:
Q  170 tgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  19896323 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19896266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 17267051 - 17267100
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    ||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17267051 tatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 17267100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 19154944 - 19154993
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  19154944 tatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatga 19154993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 24353261 - 24353186
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgt---tgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataat 74  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||   |||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |||||    
T  24353261 agaaactaagttgcttatcttactgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataat 24353186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Original strand, 26225359 - 26225408
Alignment:
Q  179 ttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  26225359 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 26225408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21565780 - 21565545
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      ||||||||| ||    
T  21565780 tagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacat 21565681  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
    | |||||||| |||| |||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||    
T  21565680 gaattatgtttgatatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaacta 21565582  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21565581 agctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 21565545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 22959421 - 22959650
Alignment:
Q  4 aaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatgga 97  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||      ||||||||| |||      
T  22959421 aaaccaagttgtttatcttgttgtttttgttccagtaagactgatgcatatgaatcaatgttggttaaaatgttatataattgtatatacattacatgac 22959520  T
Q  98 ttatgtt-gataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgct 196  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  22959521 ttatgtttgatatttgagttgttgat--ttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct 22959617  T
Q  197 gcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22959618 gcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 22959650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19669135 - 19668902
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatga--attgatgttgtttataatgttgta------tatatacattaa 92  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||     
T  19669135 tagaaactaagtcgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaatattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattac 19669036  T
Q  93 atggattatg-ttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatct 191  Q
    | |  ||||| |||||| |||||  ||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||| ||    
T  19669035 aggacttatgtttgatatttgagttgttgat--ttgcattcgatattgttatatcacgatga-tttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaact 19668939  T
Q  192 acgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
      |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19668938 gagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19668902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 19660721 - 19660952
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||      ||||||||| ||    
T  19660721 tagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacat 19660820  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac 193  Q
    |  ||| ||| ||||||||||  ||||||  ||| |||||||||  |||||||| |||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||     
T  19660821 gacttaagtttgataattgagttgttgat--ttatattcgatatcattatatcaagatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa 19660917  T
Q  194 gctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19660918 gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 19660952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 130 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36314678 - 36314581
Alignment:
Q  130 ttcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  36314678 ttcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 36314581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 228
Target Start/End: Original strand, 21329516 - 21329614
Alignment:
Q  129 attcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  21329516 attcgatattgttatattatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21329614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 228
Target Start/End: Original strand, 21502041 - 21502273
Alignment:
Q  4 aaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatgg 96  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||||| ||||      ||||||||| |||     
T  21502041 aaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatga 21502140  T
Q  97 attatgtt-gataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacg 194  Q
    |||||||| |||  || ||| | |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||||||||||||||  ||| ||| |    
T  21502141 attatgtttgatgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattta-catactgcctatgttgctgtttgtttattaactaag 21502239  T
Q  195 ctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  21502240 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21502273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 26011918 - 26012154
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||| ||||   |||| |  ||||||||||  | ||||| ||||      ||||||||| ||    
T  26011918 tagaaactaagttgtttatcttgttattgttgtttcagtaagcctgaactatataatctgatgttgttgttgatgttatataattgtatatacattacat 26012017  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatgatt-acattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
    | |||||||| |||  |||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| | ||||||||||||||||  ||| |||    
T  26012018 gaattatgtttgatgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgcttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaacta 26012116  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatg-atgatgatgatgt 229  Q
     |||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  26012117 agctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22144147 - 22144064
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22144147 gatattgttatatcatgttg-ttttgcatactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 22144064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 217
Target Start/End: Original strand, 20026824 - 20027047
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatg 95  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||| ||||   |||||  || |||||||| |||||| | ||||      ||||||||| |||    
T  20026824 agaaactaagttgtttatcttgttgtagttgtttcagtaagcctgaattatatgttttaatgttgttgataatgctatatagttgtatatacattacatg 20026923  T
Q  96 gattatgtt-gataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatga--tgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatct 191  Q
     |||||||| |||  ||| || |||| ||| || |||| |||||| |||||||||||  || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  20026924 aattatgtttgatg-ttgtgatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactg-ttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaact 20027021  T
Q  192 acgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  20027022 aagctgcatgagtcggtctaagatga 20027047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Original strand, 21997552 - 21997651
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21997552 catttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 21997650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 21729087 - 21729181
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  21729087 gatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 21729181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 21808412 - 21808506
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  21808412 gatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 21808506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1096570 - 1096474
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatg 225  Q
    |||| |||||| |||| | ||| || ||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1096570 catttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 1096474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 264808 - 264929
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  264808 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 264905  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  264906 cggtctaagttgattaagatgatg 264929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 10732980 - 10733101
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  10732980 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 10733077  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  10733078 cggtctaagttgattaagatgatg 10733101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20909134 - 20909013
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20909134 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagt 20909037  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  20909036 cggtctaagttgattaagatgatg 20909013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 23390519 - 23390613
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| |||||   |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23390519 gatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 23390613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25421630 - 25421536
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  25421630 gatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 25421536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29330056 - 29329935
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  29330056 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 29329959  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  29329958 cggtctaagttgattaagatgatg 29329935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39363506 - 39363385
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  39363506 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 39363409  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  39363408 cggtctaagttgattaagatgatg 39363385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 228
Target Start/End: Original strand, 8286887 - 8286960
Alignment:
Q  154 ttttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  8286887 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 8286960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22075117 - 22075038
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  22075117 gatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgaatgagtcggtctaag 22075038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24529311 - 24529224
Alignment:
Q  140 ttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24529311 ttatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 24529224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 11581239 - 11581360
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||  ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  11581239 ataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 11581336  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  11581337 cggtctaagttgattaagatgatg 11581360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 42245405 - 42245526
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||    
T  42245405 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 42245502  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  42245503 cggtctaagttgattaagatgatg 42245526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13025388 - 13025315
Alignment:
Q  154 ttttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13025388 ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 13025315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13095572 - 13095499
Alignment:
Q  154 ttttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13095572 ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 13095499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37723967 - 37723910
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatg 225  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  37723967 tatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Original strand, 20902049 - 20902155
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || || | |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  20902049 ataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 20902146  T
Q  205 cggtctaag 213  Q
    |||||||||    
T  20902147 cggtctaag 20902155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Original strand, 21293027 - 21293086
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  21293027 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatg 21293086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38619557 - 38619435
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttga-tga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgag 203  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | ||| | || |||||||||| ||| ||||||||||    
T  38619557 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttg-ttgttatttaactaagctgcatgag 38619460  T
Q  204 tcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| |||| | |||||||    
T  38619459 tcggtctaagttgattaagatgatg 38619435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39245235 - 39245137
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  39245235 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 39245138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 2154654 - 2154775
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || || | |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || ||||||| || |||||||| ||| |||||||||||    
T  2154654 ataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagt 2154751  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  2154752 cggtctaagttgattaagatgatg 2154775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 41
Target Start/End: Original strand, 22178103 - 22178142
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaa 41  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  22178103 agaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaa 22178142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25431492 - 25431414
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaa 212  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  25431492 gatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29346102 - 29345981
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || || ||||||| |||||||| ||| |||| ||||||    
T  29346102 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgatgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagt 29346005  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  29346004 cggtctaagttgattaagatgatg 29345981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 228
Target Start/End: Original strand, 20918052 - 20918109
Alignment:
Q  170 tgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  20918052 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20918109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 36154823 - 36154941
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  |||||    |||||||||| ||| |||||||||||    
T  36154823 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttg----ttgttatttaactaagctgcatgagt 36154917  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  36154918 cggtctaagttgattaagatgatg 36154941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 47
Target Start/End: Original strand, 21329381 - 21329426
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 47  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||    
T  21329381 agaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctga 21329426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064512
Alignment:
Q  179 ttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15796482 - 15796435
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatg 216  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  15796482 tatgttgctgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatg 15796435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24493671 - 24493573
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||||| || |||| ||| | | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  24493671 catttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 24493574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31061167 - 31061069
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  31061167 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtt-ttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 31061070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7047 - 6822
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta------tatatacattaaat 94  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||      ||||||||||| ||    
T  7047 tagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacat 6948  T
Q  95 ggattatg-ttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac 193  Q
    |  ||||| |||||| |||||  ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||      
T  6947 gacttatgtttgatatttgagttgttgat--ttgcattcaatattgttatatcatgatga-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactga 6851  T
Q  194 gctgcatgagtcggtctaagatgatgatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6850 gctgcatgagtcggtctaagatgatgatg 6822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 160921 - 160685
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||| |||| ||    
T  160921 tagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcggtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatatattacat 160822  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac 193  Q
    |  ||||||| |||| |||| | |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||| |||     
T  160821 gacttatgtttgatatttgacatgttgttgattgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaa 160723  T
Q  194 gctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgtcc 231  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  160722 gctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgtcc 160685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Original strand, 85692 - 85741
Alignment:
Q  179 ttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  85692 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatg 85741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 501206 - 501095
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||| | ||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  501206 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 501109  T
Q  205 cggtctaagatgat 218  Q
    ||||||||| ||||    
T  501108 cggtctaagttgat 501095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 366 - 132
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||      ||||||||| ||    
T  366 tagaaactgagttgtt-atcttgctgttgttgttctagtgagactgatacatatgaattgatgttgtttataatattatataattgtatatacattacat 268  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
    | |||||||| |||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||| |||| |||    
T  267 gaattatgtttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaacta 169  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
     ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  168 agctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatgt 132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 60)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18005884 - 18005649
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgca-tatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaa 93  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  | |||||  | ||||||||  ||||| | ||||      ||||||||| |    
T  18005884 tagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattata 18005785  T
Q  94 tggattatgttgataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
    || |||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18005784 tgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttc-catactgcttatgttgctgtttgttatttaacta 18005686  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18005685 agctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 18005649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34201021 - 34200790
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||      ||||||||| ||    
T  34201021 tagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacat 34200922  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac 193  Q
    |  ||| ||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||     
T  34200921 gacttaagtttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa 34200825  T
Q  194 gctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  34200824 gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 34200790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44014409 - 44014181
Alignment:
Q  4 aaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatgg 96  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||| ||||| | ||||      ||||||||| |||     
T  44014409 aaactaagttgtt-atcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtttttaatggtatataactgtatatacattatatga 44014311  T
Q  97 attatgttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgct 196  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  44014310 attatgttgatatttgagatgttgat--ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagct 44014214  T
Q  197 gcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44014213 gcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 44014181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 67982 - 67749
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaa 93  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||||| ||||      ||||||||| |    
T  67982 tagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtgagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattata 67883  T
Q  94 tggattatgttgataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
    || |||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  67882 tgaattatgttgata-ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaacta 67785  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
     |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  67784 agctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 67749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 28505184 - 28505415
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||      ||||||||| ||    
T  28505184 tagaaactaagttgtttaccttgttgtcaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacat 28505283  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac 193  Q
    |  ||| ||| ||||||||||  | ||||  ||| || ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||     
T  28505284 gacttaagtttgataattgagttgctgat--ttatatccgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa 28505380  T
Q  194 gctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28505381 gctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatg 28505415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 16219600 - 16219835
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||   |||| |  | ||||||||  ||||||| ||||      ||||||||| ||    
T  16219600 tagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacat 16219699  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
    | |||||||| |||  || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||    
T  16219700 gaattatgtttgatgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacta 16219798  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
     ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16219799 agctacatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 15754772 - 15755004
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaa-ttgatgttgtttataatgttgta------tatatacattaaa 93  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||      ||||||||||| |    
T  15754772 tagaaactaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactgatgcatatgaatttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattaca 15754871  T
Q  94 tggattatg-ttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
    ||  ||||| |||||| |||||  ||||||  || ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||| | ||||||||||| |||    
T  15754872 tgacttatgtttgatatttgagttgttgat--ttgcattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactacctatattgttatttgttatttaacta 15754968  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
     |||||||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  15754969 agctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatg 15755004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 128 - 229
Target Start/End: Original strand, 811149 - 811249
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  811149 cattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 811247  T
Q  228 gt 229  Q
    ||    
T  811248 gt 811249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 11995913 - 11996144
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||      ||||||||| ||    
T  11995913 tagaaactaatttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacat 11996012  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac 193  Q
    |  ||| ||| |||| |||||  ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||||| ||| |||     
T  11996013 gacttaagtttgatatttgagttgttgat--ttacattcaatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaa 11996109  T
Q  194 gctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  11996110 gatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 11996144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16495527 - 16495406
Alignment:
Q  104 tgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgag 203  Q
    |||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16495527 tgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 16495431  T
Q  204 tcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||    
T  16495430 tcggtctaagatgttgaagatgatg 16495406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47831959 - 47831811
Alignment:
Q  81 tatatacattaaatggattatgtt-gataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgt 178  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||  ||  || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||| |||    
T  47831959 tatatacattatatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatat-gcatactgtctatgttgttgt 47831861  T
Q  179 ttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  47831860 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 47831811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 3564359 - 3564481
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  3564359 ataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 3564457  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||||| |||||||    
T  3564458 cggtctaagttgatgaagatgatg 3564481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13647451 - 13647341
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  13647451 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 13647353  T
Q  205 cggtctaagatg 216  Q
    ||||||||||||    
T  13647352 cggtctaagatg 13647341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 15116717 - 15116643
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt 76  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  15116717 agaaactaagttgtttatcctactgttattgtttcagtaagactgatgtatatgagttgatgttatttataatgt 15116643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 217
Target Start/End: Original strand, 20220073 - 20220294
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta------tatatacattaaatg 95  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||| ||||||||||| |||||||  ||      ||||| ||||| |||    
T  20220073 agaaactaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatg 20220172  T
Q  96 gattatgt-tgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatga--tgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
     ||||| | ||||  |||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||  || ||||   |||| | ||||||| ||||||||  ||| |||    
T  20220173 aattatatatgatgtttgagatgttgat--ttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaacta 20220269  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
     |||| |||||||||||||||||||    
T  20220270 agctgtatgagtcggtctaagatga 20220294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22073020 - 22072917
Alignment:
Q  125 ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgat 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| |||| | |||    
T  22073020 ttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaagat 22072921  T
Q  225 gatg 228  Q
    ||||    
T  22072920 gatg 22072917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 228
Target Start/End: Original strand, 17061948 - 17062076
Alignment:
Q  99 tatgttgataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctg 197  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| | |||||| ||||| || | ||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  17061948 tatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgct-attttgtatactgctga-gttgctgattgttatttaactaagctg 17062045  T
Q  198 catgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  17062046 catgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17062076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16056564 - 16056347
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatg 95  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||   |||| |  | ||||||||  ||||||| ||||      ||||||||| |||    
T  16056564 agaaactaagttgtttatcttgatgttgttgtttcggtaagcctgaatgatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatg 16056465  T
Q  96 gattatgtt-gataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac 193  Q
     |||||||| |||  |||||| |||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| |   ||||||||||||||||||||| |||     
T  16056464 aattatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttg--tttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaa 16056367  T
Q  194 gctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  16056366 ggtgcatcagtcggtctaag 16056347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 228
Target Start/End: Original strand, 16386277 - 16386365
Alignment:
Q  140 ttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| | ||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16386277 ttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 16386365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40443455 - 40443395
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  40443455 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 40443395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 456443 - 456322
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  456443 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 456346  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  456345 cggtctaagttgattaagatgatg 456322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3386455 - 3386334
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| | || ||||| || ||||| |||||| || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  3386455 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatacta-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 3386358  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  3386357 cggtctaagttgattaagatgatg 3386334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 11393327 - 11393448
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  11393327 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 11393424  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  11393425 cggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11972618 - 11972497
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  11972618 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 11972521  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  11972520 cggtctaagttgattaagatgatg 11972497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 14949162 - 14949283
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  14949162 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 14949259  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  14949260 cggtctaagttgattaagatgatg 14949283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 15376753 - 15376874
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  15376753 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 15376850  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  15376851 cggtctaagttgattaagatgatg 15376874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16232642 - 16232521
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  16232642 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 16232545  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  16232544 cggtctaagttgattaagatgatg 16232521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16410181 - 16410060
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  16410181 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 16410084  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  16410083 cggtctaagttgattaagatgatg 16410060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18640394 - 18640273
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  18640394 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 18640297  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  18640296 cggtctaagttgattaagatgatg 18640273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 20385163 - 20385284
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  20385163 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 20385260  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  20385261 cggtctaagttgattaagatgatg 20385284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 21189635 - 21189756
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  21189635 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 21189732  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  21189733 cggtctaagttgattaagatgatg 21189756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24702360 - 24702239
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  24702360 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 24702263  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  24702262 cggtctaagttgattaagatgatg 24702239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32125613 - 32125492
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  32125613 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 32125516  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  32125515 cggtctaagttgattaagatgatg 32125492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41523039 - 41522918
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  41523039 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 41522942  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  41522941 cggtctaagttgattaagatgatg 41522918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41525501 - 41525380
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  41525501 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 41525404  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  41525403 cggtctaagttgattaagatgatg 41525380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 229
Target Start/End: Original strand, 2280137 - 2280238
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatg-atgatgatga 226  Q
    |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  2280137 catttgatattattatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatga 2280235  T
Q  227 tgt 229  Q
    |||    
T  2280236 tgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12698908 - 12698835
Alignment:
Q  154 ttttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12698908 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 12698835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 15113180 - 15113106
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt 76  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||    
T  15113180 agaaactaagttgtttatcctgctgttattgtttcagtaagactgatttatatgagttgatgttaattataatgt 15113106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24275293 - 24275182
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  24275293 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 24275196  T
Q  205 cggtctaagatgat 218  Q
    ||||||||| ||||    
T  24275195 cggtctaagttgat 24275182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12901560 - 12901342
Alignment:
Q  3 gaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatgg 96  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||   |||||| || ||||||||  ||||||| ||||      ||||||||| |||     
T  12901560 gaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattatatgatttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatga 12901461  T
Q  97 attatgt-tgataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatga-tgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac 193  Q
    ||||||| ||||  ||| || |||| || ||  |||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||||||| ||||||||  ||| |||     
T  12901460 attatgtatgatg-ttgtgatgttgctgttttgcatttgatattgttatatcatgaattattttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaa 12901362  T
Q  194 gctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  12901361 gctgcatgagtcggtttaag 12901342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13869469 - 13869347
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgat-ga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgag 203  Q
    ||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  13869469 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactg-tgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 13869372  T
Q  204 tcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| |||| | |||||||    
T  13869371 tcggtctaagttgattaagatgatg 13869347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Original strand, 27847887 - 27847947
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  27847887 tatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatg 27847947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9509287 - 9509193
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || | ||| ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  9509287 gatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 9509193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18430834 - 18430713
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    |||||||||| |||| ||| || |||| |||||| |||| |||||||| ||||  |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  18430834 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 18430737  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  18430736 cggtctaagttgattaagatgatg 18430713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27216982 - 27216861
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  27216982 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 27216885  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
     |||||||| |||| | |||||||    
T  27216884 tggtctaagttgattaagatgatg 27216861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44116631 - 44116510
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| | | |||||||||||    
T  44116631 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagt 44116534  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  44116533 cggtctaagttgattaagatgatg 44116510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 210
Target Start/End: Original strand, 12255809 - 12255892
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatga--tgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtct 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  12255809 catttgatattgttatatcatgaattgattt-gcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 229
Target Start/End: Original strand, 15144096 - 15144154
Alignment:
Q  169 atgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15144096 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga-gatgatgatgt 15144154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26212094 - 26212015
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  26212094 gatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaag 26212015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38227583 - 38227485
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  38227583 catttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgat 38227486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 48273492 - 48273393
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | | |||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||    
T  48273492 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgat 48273394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 213
Target Start/End: Original strand, 10063838 - 10063920
Alignment:
Q  130 ttcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||  | |||||||||| |||||| ||| ||| | |||||||||| |||||||    
T  10063838 ttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaag 10063920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 217
Target Start/End: Original strand, 15008520 - 15008605
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatga--tgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15008520 gatattgttatatcatgaactg-ttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatga 15008605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16213778 - 16213685
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  16213778 gatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16213685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 16324243 - 16324197
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 47  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  16324243 tagaaactaagttgttgatcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 16324197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24704746 - 24704689
Alignment:
Q  170 tgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  24704746 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24704689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10589130 - 10589058
Alignment:
Q  140 ttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  10589130 ttatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaag 10589058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 209
Target Start/End: Original strand, 19486766 - 19486842
Alignment:
Q  132 cgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtc 209  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |  |||  || ||| ||||||||||||||||    
T  19486766 cgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtc 19486842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110557
Alignment:
Q  179 ttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20110557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Original strand, 18456431 - 18456529
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  18456431 catttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 18456528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 22557 - 22788
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||      ||||||||| ||    
T  22557 tagaaactaagttgtttgtcttgatgttgctgttccagtaagactgatgcatat----tgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacat 22652  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
    | |||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||| |||    
T  22653 gaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaacta 22751  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
     |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  22752 agctgcatgagtcggtctaagttgaaggtgatgatgt 22788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 82194 - 82073
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||    
T  82194 ataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactg-tgttgctgtt-gttatttaactaagcttcatgagt 82097  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  82096 cggtctaagttgattaagatgatg 82073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 28694 - 28804
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtatatatacattaaatggatta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28694 tagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt--tatatatacattaaatggatta 28791  T
Q  101 tgttgataattga 113  Q
    |||||||||||||    
T  28792 tgttgataattga 28804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Original strand, 28813 - 28888
Alignment:
Q  155 tttgcatactacttatgttgctgtt-tgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
    |||||||||| | |||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28813 tttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 28888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19502 - 19267
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta------tatatacattaaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||  |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| | ||      ||||||||||| |    
T  19502 tagaaactaagttgtttatcttgatgttgttgtttcagtaaccctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattata 19403  T
Q  94 tggattatgttgataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
    || |||||||||||| |||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  19402 tgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaacta 19304  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19303 agctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 19267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6686 - 6539
Alignment:
Q  81 tatatacattaaatggattatgttgataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtt 179  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  6686 tatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtt 6588  T
Q  180 tgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6587 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 6539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8706 - 8485
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta--------tatatacattaaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||        |||||||||||      
T  8706 agaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgtatatgaattgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattact 8607  T
Q  94 tggattatgt-tg-ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatc 190  Q
    || ||||| | || ||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |    
T  8606 tgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaac 8508  T
Q  191 tacgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  8507 taagctgcatgagtcggtctaag 8485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 100612 - 100377
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| || | |  ||||||  | ||||||||  ||||||| ||||      ||||||||| |    
T  100612 tagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctaaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattata 100513  T
Q  94 tggattatgttgataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
    || |||||||| ||| |||||| |||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  100512 tgaattatgttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaacta 100414  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  100413 agctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 100377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 81 - 229
Target Start/End: Original strand, 40144 - 40292
Alignment:
Q  81 tatatacattaaatggattatgttgataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtt 179  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||    
T  40144 tatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcctactgcctatgttgctgtt 40242  T
Q  180 tgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
    | ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  40243 tattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatgt 40292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101502
Alignment:
Q  155 tttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatgt 101502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 119948 - 119879
Alignment:
Q  159 catactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  119948 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 119879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 94533 - 94412
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  94533 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 94436  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  94435 cggtctaagttgattaagatgatg 94412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Original strand, 17480 - 17591
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  ||||||| || |||||||| ||| |||||||||||    
T  17480 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagt 17577  T
Q  205 cggtctaagatgat 218  Q
    ||||||||| ||||    
T  17578 cggtctaagttgat 17591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44512 - 44455
Alignment:
Q  170 tgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  44512 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 2687 - 2924
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgca-tatga---attgatgttgtt-----tataatgttgtatatatacatta 91  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  | |||||   |||| |||||||     ||||||  | ||||||||||||     
T  2687 tagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctattgttgttgttaatggtataattgtatatatatacattt 2786  T
Q  92 aatggattatgttgataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatc 190  Q
     ||| |||| | ||||| |||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| |    
T  2787 tatgaattaagctgatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaac 2885  T
Q  191 tacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2886 taagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 2924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11527 - 11296
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||      ||||||||| ||    
T  11527 tagaaactaagttgtttaccttggtgttaatgttcaagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataatagtatatacattacat 11428  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac 193  Q
    |  ||| ||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||     
T  11427 gacttaagtttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa 11331  T
Q  194 gctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  11330 gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 11296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2232 - 2001
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||      ||||||||| ||    
T  2232 tagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagtctgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacat 2133  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac 193  Q
    |  ||| ||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||  ||||||||||||| |||     
T  2132 gacttaagtttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaa 2036  T
Q  194 gctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  2035 gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 2001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28512 - 28418
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28512 gatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 28418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4556
Alignment:
Q  176 tgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 4556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 2186 - 2305
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtatatatacattaaatggatta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2186 tagaaactaagttgtttatcttactgatcttatcccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttg--tatatacattaaatggatta 2283  T
Q  101 tgttgataattgagacgttgat 122  Q
    |||||||| | |||| ||||||    
T  2284 tgttgatattcgagatgttgat 2305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1319 - 1096
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatg 95  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| ||||      ||||||||  |||    
T  1319 agaaactaagttttttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgtatatgatttgatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattccatg 1220  T
Q  96 gattatgtt-gataattgagacgttgatgat-tacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac 193  Q
     |||||||| |||  |||| | ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||     
T  1219 aattatgtttgatgtttgaaatgttgatgacctgtattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaa 1121  T
Q  194 gctgcatgagtcggtctaagatgat 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  1120 gctgcatgagtcggtctaagttgat 1096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 81 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5794 - 5654
Alignment:
Q  81 tatatacattaaatggattatgttgataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtt 179  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  5794 tatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttt-catactgcctatgttgctgtt 5696  T
Q  180 tgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgat 221  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5695 tgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgat 5654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13004 - 12770
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||  | ||||||||  ||||||| ||||      ||||||||| ||    
T  13004 tagaaactaagtggtttatcttgctgttgttgttccagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttattaatgttatataattgtatatacattacat 12905  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
    | |||||||| |||  ||  || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||| ||||||||||||| |||    
T  12904 gaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttagcta 12806  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12805 agctgcatgagtcggtctaagttgatgattatgatg 12770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 81 - 229
Target Start/End: Original strand, 2615 - 2763
Alignment:
Q  81 tatatacattaaatggattatgttgataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtt 179  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  2615 tatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcaatattgttataacatgatgattta-catactgcctatgttgatgtt 2713  T
Q  180 tgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2714 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 2763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 81 - 229
Target Start/End: Original strand, 14667 - 14815
Alignment:
Q  81 tatatacattaaatggattatgttgataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtt 179  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||    
T  14667 tatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgatttt-cttactgcctatgttgctgtt 14765  T
Q  180 tgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 229  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14766 tgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 14815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 14580 - 14627
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgat 48  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  14580 tagaaactaagttgtatatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgat 14627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15896 - 15665
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  || ||||||||||||||| | |||||| | |||||| |||||||||| ||||      ||||||||| ||    
T  15896 tagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgatccagtaagactgattcttatgaaataatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacat 15797  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac 193  Q
    |  ||| ||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||||||||||||||||| |||     
T  15796 gacttaagtttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa 15700  T
Q  194 gctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| | |||||||    
T  15699 gctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 217
Target Start/End: Original strand, 53432 - 53655
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta------tatatacattaaatg 95  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||      |||||||||||  ||    
T  53432 agaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttg 53531  T
Q  96 gattatgt-tg-ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
     ||||| | || ||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||  ||| |||    
T  53532 aattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaacta 53630  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
     ||||||||| || |||||||||||    
T  53631 agctgcatgaatcagtctaagatga 53655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 229
Target Start/End: Original strand, 23894 - 24001
Alignment:
Q  121 atgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatga 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  23894 atgattgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaaga 23992  T
Q  221 tgatgatgt 229  Q
    |||||||||    
T  23993 tgatgatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34358 - 34127
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaat 94  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  | |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||      |||| ||||  |    
T  34358 tagaaactaagttgtttaccttgctgttaattttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatatattactt 34259  T
Q  95 ggattatgtt-gataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac 193  Q
    |  ||| ||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  || | ||||| | ||||||| ||||||||||||| |||     
T  34258 gacttaagtttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaa 34162  T
Q  194 gctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  34161 gctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 34127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10764 - 10546
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatg 95  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||   |||| |  | ||||||||  ||||||  ||||      ||||||||| |||    
T  10764 agaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgtcatataattgtatatacattacatg 10665  T
Q  96 gattatgtt-gataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctac 193  Q
     |||||||| |||  |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||   |     
T  10664 aattatgttcgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaa 10566  T
Q  194 gctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10565 gctgcatgagtcggtctaag 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Original strand, 1065 - 1186
Alignment:
Q  104 tgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgag 203  Q
    |||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1065 tgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 1161  T
Q  204 tcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||    
T  1162 tcggtctaagatgttgaagatgatg 1186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Original strand, 6141 - 6240
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  6141 cattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 6239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32687 - 32538
Alignment:
Q  81 tatatacattaaatggattatgtt-gataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtt 179  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||  |||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||    
T  32687 tatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgattgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtt 32589  T
Q  180 tgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatg-atgatgatgatgt 229  Q
    ||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  32588 tgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgatgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 1003 - 1151
Alignment:
Q  81 tatatacattaaatggattatgtt-gataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgt 178  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||  ||  || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||    
T  1003 tatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatgttgttatatcatgatgatct-gcatactacctatgttgttgt 1101  T
Q  179 ttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  1102 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 1151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 133 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1130 - 1047
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1130 gatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 1047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12803 - 12583
Alignment:
Q  4 aaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatgga 97  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||  ||| | |||||||||||||||||||  ||||      |||||||||  || |    
T  12803 aaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctaatgtgtattatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattac-tgaa 12705  T
Q  98 ttatgttga--taattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacg 194  Q
    |||| |  |  || |||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||  ||| ||| |    
T  12704 ttatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaag 12606  T
Q  195 ctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  12605 ctacatgagtcggtctaagatga 12583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6714 - 6615
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  6714 cattcgatattgttatatcatcatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 6616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14094 - 13995
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  14094 cattcgatattgttatatcatcatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 13996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Original strand, 15795 - 15894
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  15795 cattcgatattgttatatcatcatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 15893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 15715 - 15761
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 47  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  15715 tagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 15761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 76
Target Start/End: Original strand, 7943 - 8016
Alignment:
Q  3 gaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt 76  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  7943 gaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtgagactgatgtatatgatttgatgttgtttataatgt 8016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 217
Target Start/End: Original strand, 8077 - 8167
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatga--tgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    |||| |||||| |||||||||||  |||||| ||||||| | |||| |||| |||||||||||  || |||||||| ||||||||| |||||    
T  8077 catttgatattattatatcatgagctgattt-gcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtctatgatga 8167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13042 - 12942
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13042 cattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaagatgatgat 12944  T
Q  228 gt 229  Q
    ||    
T  12943 gt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 13177 - 13131
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 47  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  13177 tagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 13131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 68
Target Start/End: Original strand, 18121 - 18187
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtt 68  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||   |||||  |||||||||||    
T  18121 agaaactaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgttttgatgttgtt 18187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 217
Target Start/End: Original strand, 128853 - 129076
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt------tgtatatatacattaaatg 95  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  | |||| ||||||||||| |||||||      | | ||||| ||||| |||    
T  128853 agaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatg 128952  T
Q  96 gattatgt-tgataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatg-atgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatcta 192  Q
     ||||| | ||||  |||||| |||| ||| || |||| ||||||||||||||||| ||  ||||   |||| | ||||||||||||||||| ||| |||    
T  128953 aattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaacta 129051  T
Q  193 cgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  129052 agctgcatgagtcggtctaagatga 129076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 78556 - 78485
Alignment:
Q  5 aactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt 76  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |||||||    
T  78556 aactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgt 78485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 78386 - 78337
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  78386 tatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatga 78337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 116480 - 116431
Alignment:
Q  179 ttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  116480 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 116431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 228
Target Start/End: Original strand, 3200 - 3303
Alignment:
Q  124 attacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatga 223  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  3200 attacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 3298  T
Q  224 tgatg 228  Q
    |||||    
T  3299 tgatg 3303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 29163 - 29354
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttata---atgttgta------tatatacatta 91  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||   ||||| ||      |||||||| ||    
T  29163 tagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataattatgttatataattgtatatacagta 29262  T
Q  92 aatggattatg-ttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttat 185  Q
     |||  ||| | ||||||||||||  | ||||  |||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29263 catgacttaagtttgataattgagttgctgat--ttacattcgatattattatatcatgat-agtttgaatactacctatgttgctgtttgttat 29354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 213
Target Start/End: Original strand, 8095 - 8176
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatga--tgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||||||||||  || ||| | ||||| | ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  8095 gatattgttatatcatgaactggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 213
Target Start/End: Original strand, 16115 - 16202
Alignment:
Q  125 ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16115 ttacatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13231 - 13143
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13231 catttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 13143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 213
Target Start/End: Original strand, 27764 - 27851
Alignment:
Q  125 ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  27764 ttacatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 27851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 2328 - 2484
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta------tatatacattaaat 94  Q
    ||||||||||||| |||| ||| || ||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||      ||||||||||||||    
T  2328 tagaaactaagttttttaccttgctattaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattaaat 2427  T
Q  95 ggattatg-ttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatg 152  Q
    |  ||| | ||||||||||||  | ||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2428 gacttaagtttgataattgagttgctgat--ttacattcgatattattatatcatgatg 2484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 225
Target Start/End: Original strand, 26064 - 26179
Alignment:
Q  110 ttgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggt 208  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26064 ttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 26162  T
Q  209 ctaagatgatgatgatg 225  Q
    ||||| |||||| ||||    
T  26163 ctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Original strand, 44725 - 44824
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | | |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||||||    
T  44725 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgat 44823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1353 - 1293
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  1353 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 1293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7330 - 7270
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  7330 tatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 7270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Original strand, 38720 - 38819
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||| |||| | ||||||    
T  38720 catttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgat 38818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14069 - 13948
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  14069 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttatctaagctgcatgagt 13972  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  13971 cggtctaagttgattaagatgatg 13948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16906 - 16785
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  16906 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 16809  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  16808 cggtctaagttgattaagatgatg 16785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Original strand, 5167 - 5245
Alignment:
Q  150 atgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  5167 atgatgttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 5245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 51664 - 51598
Alignment:
Q  150 atgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatg 216  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  51664 atgatgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 51598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10895 - 10784
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  10895 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 10798  T
Q  205 cggtctaagatgat 218  Q
    ||||||||| ||||    
T  10797 cggtctaagttgat 10784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Original strand, 3169 - 3267
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  3169 catttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 3266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4952 - 4853
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  4952 catttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 4854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16346 - 16286
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16346 tatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 16286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 174830 - 174782
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  174830 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 174782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 121819 - 121770
Alignment:
Q  179 ttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  121819 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 121770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 47
Target Start/End: Original strand, 136252 - 136296
Alignment:
Q  3 gaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 47  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  136252 gaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 136296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 47
Target Start/End: Original strand, 144960 - 145004
Alignment:
Q  3 gaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 47  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  144960 gaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 145004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 228 - 107
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||    
T  228 ataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatacta-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagt 131  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  130 cggtctaagttgattaagatgatg 107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4816 - 4695
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  4816 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 4719  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  4718 cggtctaagttgattaggatgatg 4695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13514 - 13393
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  13514 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 13417  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  13416 cggtctaagttgattaagatgatg 13393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 217
Target Start/End: Original strand, 6166 - 6390
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta------tatatacattaaatg 95  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||   |||||| |||||||||||  ||||||  ||      ||||| ||||| |||    
T  6166 agaaactaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatg 6265  T
Q  96 gattatgt-tgataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatga--tgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatct 191  Q
     ||||| | ||||  |||||| |||| ||| || |||| |||||||| |||||||||  || ||||  ||||| | ||||||||||||||||  ||| ||    
T  6266 aattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaact 6364  T
Q  192 acgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    | | ||||||||||||||||||||||    
T  6365 aagttgcatgagtcggtctaagatga 6390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 13795 - 13844
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    ||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13795 tatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 13844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20869 - 20748
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  20869 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 20772  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  20771 cggtctaagttgattaagatgatg 20748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13309 - 13215
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  13309 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 13215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37943 - 37822
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  37943 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 37846  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  37845 cggtctaagttgattaagatgatg 37822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1949 - 1855
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| |||||   |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1949 gatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 1855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 52011 - 51917
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||| | | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  52011 gatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 51917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 168001 - 168095
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| |  ||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  168001 gatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 168095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 97244 - 97020
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt------tgtatatatacattaaatg 95  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||  | |||| ||||||||||| |||||||      | | ||||| ||||| |||    
T  97244 agaaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatg 97145  T
Q  96 gattatgt-tgataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatga--tgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatct 191  Q
     ||||| | ||||  |||||| |||| ||| || |||| ||||||||||||||||||  || ||||   |||| | ||||||||||||| ||  ||| ||    
T  97144 aattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaact 97046  T
Q  192 acgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||    
T  97045 aagctgcatgagtgggtctaagatga 97020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 106522 - 106298
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt------tgtatatatacattaaatg 95  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||  | |||| ||||||||||| |||||||      | | ||||| ||||| |||    
T  106522 agaaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatg 106423  T
Q  96 gattatgt-tgataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatga--tgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatct 191  Q
     ||||| | ||||  |||||| |||| ||| || |||| ||||||||||||||||||  || ||||   |||| | ||||||||||||| ||  ||| ||    
T  106422 aattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaact 106324  T
Q  192 acgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||    
T  106323 aagctgcatgagtgggtctaagatga 106298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 158490 - 158611
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  158490 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 158587  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  158588 cggtctaagttgattaagatgatg 158611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 228
Target Start/End: Original strand, 340016 - 340064
Alignment:
Q  180 tgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  340016 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatg 340064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 174
Target Start/End: Original strand, 2188 - 2281
Alignment:
Q  81 tatatacattaaatggattatgttgataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttg 174  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  2188 tatatacattatatgaattatgctgatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgcctatgttg 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 2101 - 2148
Alignment:
Q  1 tagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgat 48  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  2101 tagaaaataagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgat 2148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Original strand, 6156 - 6241
Alignment:
Q  145 tcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtt--tgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||| || ||||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  6156 tcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 6241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 76
Target Start/End: Original strand, 19768 - 19842
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt 76  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||   |||||| |||||||| || |||||||    
T  19768 agaaactaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcatgaattatatgatttgatgttattaataatgt 19842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 217
Target Start/End: Original strand, 19901 - 19991
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatga--tgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||  || ||||  ||||| | ||||||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  19901 catttgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaagatga 19991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40015 - 39917
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  40015 catttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgat 39918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 228
Target Start/End: Original strand, 17261 - 17334
Alignment:
Q  154 ttttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17261 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 17334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 217
Target Start/End: Original strand, 79388 - 79434
Alignment:
Q  170 tgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  79388 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 79434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11563 - 11491
Alignment:
Q  132 cgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtc 205  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  11563 cgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtc 11491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9364 - 9253
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| |||||||| ||||  |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  9364 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 9267  T
Q  205 cggtctaagatgat 218  Q
    ||||||||| ||||    
T  9266 cggtctaagttgat 9253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 205
Target Start/End: Original strand, 38278 - 38350
Alignment:
Q  132 cgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtc 205  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  38278 cgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtc 38350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4418 - 4308
Alignment:
Q  107 taattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtc 205  Q
    |||||||||||||| |||||  || | |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  4418 taattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 4321  T
Q  206 ggtctaagatgat 218  Q
    |||||||| ||||    
T  4320 ggtctaagttgat 4308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2043 - 1956
Alignment:
Q  140 ttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| | ||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2043 ttatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 1956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Original strand, 10480 - 10540
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  10480 tatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 10540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Original strand, 16618 - 16717
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  16618 catttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgat 16716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30054 - 29948
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  30054 ataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 29957  T
Q  205 cggtctaag 213  Q
    |||||||||    
T  29956 cggtctaag 29948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 38555 - 38491
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttg 66  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||| |||||||||    
T  38555 agaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttg 38491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16216 - 16117
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| | ||||| || || ||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16216 catttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 16118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 32980 - 33073
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | | |||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32980 gatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 33073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 46025 - 45932
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | | |||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  46025 gatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 45932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 228
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17446
Alignment:
Q  170 tgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17389 tgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 17446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47059 - 46999
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  47059 tatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 46999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8577 - 8483
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||  || ||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  8577 gatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 8483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3568 - 3474
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  3568 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 3474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 213
Target Start/End: Original strand, 18047 - 18129
Alignment:
Q  130 ttcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||| | | |||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  18047 ttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaag 18129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 76
Target Start/End: Original strand, 1681 - 1755
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt 76  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||   |||||| |||| |||||| |||||||    
T  1681 agaaactaagttgcctatcttactattgttgttccagtaagcctgaattatatgatttgacgttgttaataatgt 1755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Original strand, 1088 - 1166
Alignment:
Q  150 atgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  1088 atgatgttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 1166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 614 - 565
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  614 tatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 787 - 742
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 47  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  787 agaaactaagttgtttatctaactgttgttgtttcagtaagcctga 742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 226
Target Start/End: Original strand, 11466 - 11558
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatga 226  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  11466 gatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgttgaagatga 11558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 243 - 163
Alignment:
Q  2 agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata 82  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| || |   | |||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  243 agaaactaagttgcatatcttactgttgttgtttcagtaagcctaaattaaatgatttgatgttgttaataatgttatata 163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4716
Alignment:
Q  140 ttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  4803 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 4716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39579 - 39489
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatga 220  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  39579 catttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 39489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 228
Target Start/End: Original strand, 8598 - 8646
Alignment:
Q  180 tgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  8598 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 8646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32130 - 32071
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  32130 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 32071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 220
Target Start/End: Original strand, 75233 - 75323
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatga 220  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  75233 catttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 75323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 217
Target Start/End: Original strand, 20419 - 20528
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||  |  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  20419 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgatg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 20515  T
Q  205 cggtctaagatga 217  Q
    |||||||||||||    
T  20516 cggtctaagatga 20528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25998 - 25908
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatga 220  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| |||||| ||||| | ||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25998 catttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatga 25908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 1071 - 1165
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||| |||| ||||| |  ||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  1071 gatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 1165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11978
Alignment:
Q  170 tgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatga 217  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 11978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13574 - 13516
Alignment:
Q  154 ttttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  13574 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9871 - 9750
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || || | |||||| |||| ||||  || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  9871 ataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 9774  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  9773 cggtctaagttgattaagatgatg 9750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33044 - 32946
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 227  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  33044 catttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgat 32947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40522 - 40401
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||  || ||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||    
T  40522 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcacgagt 40425  T
Q  205 cggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  40424 cggtctaagttgattaagatgatg 40401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Original strand, 24347 - 24405
Alignment:
Q  154 ttttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24347 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11410 - 11305
Alignment:
Q  106 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagt 204  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||    
T  11410 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagt 11313  T
Q  205 cggtctaa 212  Q
    ||||||||    
T  11312 cggtctaa 11305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22944 - 22887
Alignment:
Q  170 tgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 228  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  22944 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 22887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Original strand, 103523 - 103597
Alignment:
Q  3 gaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgtt 77  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||   |||||| || ||||||||  |||||||    
T  103523 gaaactaagttctttatcttcctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgttaatgtt 103597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 213
Target Start/End: Original strand, 103647 - 103733
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatga-tgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||| |||||||||||||||||| |  ||||  ||||||| ||||||||||||| ||  ||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  103647 catttgatattgttatatcatgaattgttttttatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaag 103733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9181 - 9133
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||    
T  9181 cattcgatattgttatatcatgatga-gttgcatactgcctatgttgctg 9133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25170 - 25125
Alignment:
Q  168 tatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  25170 tatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 25125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4610 - 4520
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatga 220  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||  ||||| ||| |||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  4610 catttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatga 4520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12192 - 12102
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatga 220  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||  ||||| ||| |||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  12192 catttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatga 12102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22144 - 22054
Alignment:
Q  128 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaagatgatga 220  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||  ||||| ||| |||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  22144 catttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatga 22054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21009 - 20929
Alignment:
Q  133 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctacgctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||||||| | | |||||||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||||||||    
T  21009 gatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaag 20929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University