View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18827_low_1 (Length: 610)

Name: NF18827_low_1
Description: NF18827
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18827_low_1
NF18827_low_1
[»] chr5 (75 HSPs)
chr5 (289-596)||(26105418-26105726)
chr5 (76-256)||(24253384-24253564)
chr5 (76-257)||(7722051-7722232)
chr5 (76-256)||(43326379-43326559)
chr5 (76-255)||(15398483-15398662)
chr5 (76-257)||(35626040-35626221)
chr5 (76-256)||(12648799-12648979)
chr5 (85-256)||(31938908-31939079)
chr5 (76-254)||(6901801-6901979)
chr5 (76-255)||(27278474-27278657)
chr5 (76-257)||(3466680-3466861)
chr5 (76-257)||(39932581-39932762)
chr5 (76-256)||(5184974-5185154)
chr5 (76-256)||(18479668-18479848)
chr5 (76-256)||(40886028-40886207)
chr5 (76-257)||(739703-739884)
chr5 (76-256)||(27938899-27939080)
chr5 (76-257)||(43262182-43262363)
chr5 (76-257)||(25831523-25831703)
chr5 (76-256)||(15683793-15683973)
chr5 (76-256)||(27501055-27501235)
chr5 (76-256)||(2484292-2484472)
chr5 (111-258)||(29789293-29789440)
chr5 (76-259)||(28424792-28424973)
chr5 (76-257)||(890908-891088)
chr5 (76-257)||(5137717-5137898)
chr5 (75-256)||(13504742-13504923)
chr5 (85-256)||(40278858-40279029)
chr5 (76-254)||(40110236-40110413)
chr5 (82-258)||(38756485-38756662)
chr5 (116-256)||(34451292-34451432)
chr5 (76-258)||(763725-763907)
chr5 (76-258)||(33617587-33617758)
chr5 (76-237)||(4149696-4149847)
chr5 (76-256)||(19295732-19295901)
chr5 (76-256)||(31293989-31294169)
chr5 (76-256)||(2585464-2585633)
chr5 (76-218)||(40632501-40632634)
chr5 (76-258)||(38015512-38015683)
chr5 (76-256)||(9374502-9374671)
chr5 (76-256)||(27503381-27503550)
chr5 (76-259)||(38637907-38638079)
chr5 (76-251)||(42658667-42658831)
chr5 (76-258)||(23195246-23195417)
chr5 (76-256)||(24167784-24167953)
chr5 (76-259)||(5497275-5497447)
chr5 (76-255)||(9424593-9424761)
chr5 (67-258)||(13957663-13957843)
chr5 (82-257)||(27390605-27390769)
chr5 (76-259)||(40686901-40687072)
chr5 (76-258)||(1402503-1402674)
chr5 (76-258)||(6973065-6973236)
chr5 (76-244)||(18327185-18327342)
chr5 (76-185)||(12558090-12558198)
chr5 (76-181)||(36472348-36472453)
chr5 (76-239)||(36365462-36365614)
chr5 (85-243)||(5120036-5120182)
chr5 (76-256)||(14971980-14972149)
chr5 (79-255)||(33623940-33624105)
chr5 (76-162)||(42247865-42247951)
chr5 (101-256)||(3656568-3656712)
chr5 (100-247)||(36948499-36948633)
chr5 (76-233)||(6206886-6207032)
chr5 (77-159)||(9171111-9171193)
chr5 (76-141)||(9527124-9527189)
chr5 (108-239)||(38492647-38492767)
chr5 (96-165)||(3940411-3940480)
chr5 (100-258)||(612755-612900)
chr5 (465-543)||(2243292-2243370)
chr5 (107-173)||(20207088-20207154)
chr5 (85-141)||(15300977-15301033)
chr5 (78-134)||(28756082-28756138)
chr5 (465-534)||(39730293-39730360)
chr5 (76-134)||(27584387-27584447)
chr5 (462-543)||(41264547-41264628)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (65-266)||(34527852-34528054)
chr6 (76-259)||(5882508-5882691)
chr6 (76-258)||(26377202-26377384)
chr6 (76-257)||(24168093-24168274)
chr6 (76-264)||(2892190-2892378)
chr6 (76-252)||(14891383-14891559)
chr6 (76-256)||(22551061-22551241)
chr6 (76-259)||(7393583-7393766)
chr6 (76-256)||(8615242-8615422)
chr6 (77-256)||(18101495-18101674)
chr6 (87-257)||(11988973-11989143)
chr6 (76-258)||(19415531-19415713)
chr6 (76-257)||(10507907-10508088)
chr6 (76-256)||(959904-960084)
chr6 (76-256)||(28947089-28947269)
chr6 (76-259)||(16703368-16703551)
chr6 (76-258)||(2593850-2594032)
chr6 (76-238)||(7345130-7345292)
chr6 (87-258)||(22341786-22341959)
chr6 (76-257)||(1970713-1970894)
chr6 (76-256)||(599894-600074)
chr6 (76-258)||(5294799-5294981)
chr6 (76-258)||(5299351-5299533)
chr6 (76-258)||(30743446-30743628)
chr6 (76-256)||(33452572-33452752)
chr6 (76-255)||(19281056-19281235)
chr6 (76-256)||(24224070-24224251)
chr6 (106-259)||(23261926-23262079)
chr6 (76-201)||(30467658-30467783)
chr6 (76-256)||(7167584-7167753)
chr6 (76-247)||(13329383-13329543)
chr6 (76-257)||(15965435-15965605)
chr6 (76-256)||(28948845-28949014)
chr6 (76-259)||(3291010-3291182)
chr6 (76-256)||(1398555-1398724)
chr6 (76-256)||(4487529-4487698)
chr6 (76-152)||(929661-929737)
chr6 (76-254)||(375729-375893)
chr6 (76-256)||(3786751-3786920)
chr6 (80-170)||(1939579-1939669)
chr6 (94-258)||(34262257-34262403)
chr6 (85-181)||(13844847-13844943)
chr6 (181-256)||(18661830-18661905)
chr6 (181-259)||(24913093-24913171)
chr6 (76-130)||(11743070-11743124)
chr6 (465-506)||(23577172-23577213)
chr6 (465-506)||(32047195-32047236)
chr6 (465-541)||(32342621-32342697)
[»] chr3 (117 HSPs)
chr3 (76-258)||(38416722-38416904)
chr3 (76-265)||(47257795-47257984)
chr3 (76-258)||(40130957-40131139)
chr3 (76-258)||(49330039-49330221)
chr3 (76-257)||(29625826-29626007)
chr3 (76-259)||(47809593-47809777)
chr3 (76-258)||(7855112-7855294)
chr3 (76-261)||(42291844-42292029)
chr3 (76-257)||(48739232-48739413)
chr3 (76-256)||(22399099-22399278)
chr3 (76-256)||(24100285-24100464)
chr3 (76-256)||(28048392-28048572)
chr3 (76-260)||(32234394-32234577)
chr3 (76-256)||(41464354-41464534)
chr3 (76-256)||(46134358-46134538)
chr3 (76-255)||(51170034-51170213)
chr3 (76-258)||(43612045-43612227)
chr3 (76-257)||(40419837-40420018)
chr3 (76-260)||(51452747-51452930)
chr3 (83-254)||(48609732-48609903)
chr3 (76-258)||(39634570-39634751)
chr3 (76-257)||(2666002-2666183)
chr3 (76-257)||(27066977-27067158)
chr3 (79-256)||(52628959-52629135)
chr3 (76-256)||(40643802-40643982)
chr3 (76-260)||(41293315-41293498)
chr3 (76-256)||(44222831-44223011)
chr3 (76-259)||(7755304-7755486)
chr3 (76-255)||(55453245-55453424)
chr3 (76-257)||(40804509-40804690)
chr3 (76-256)||(37313401-37313581)
chr3 (76-256)||(51102378-51102558)
chr3 (76-258)||(44806686-44806868)
chr3 (76-258)||(52215078-52215260)
chr3 (76-266)||(53943578-53943767)
chr3 (76-257)||(35748310-35748491)
chr3 (76-256)||(37324543-37324723)
chr3 (76-256)||(41732530-41732710)
chr3 (76-258)||(20754391-20754573)
chr3 (76-258)||(39053396-39053578)
chr3 (76-258)||(43125833-43126014)
chr3 (76-241)||(36368941-36369105)
chr3 (76-255)||(43021716-43021896)
chr3 (98-258)||(46126011-46126170)
chr3 (79-254)||(43183917-43184092)
chr3 (76-259)||(52638844-52639027)
chr3 (76-258)||(35594123-35594305)
chr3 (76-257)||(18946905-18947086)
chr3 (76-260)||(41216457-41216641)
chr3 (66-265)||(51146206-51146406)
chr3 (76-231)||(24376575-24376730)
chr3 (76-254)||(47894822-47895000)
chr3 (76-254)||(53832486-53832664)
chr3 (76-256)||(5560025-5560212)
chr3 (76-223)||(53637843-53637990)
chr3 (76-254)||(54159000-54159168)
chr3 (76-256)||(55379987-55380156)
chr3 (76-259)||(53115449-53115621)
chr3 (76-257)||(25353556-25353726)
chr3 (78-239)||(46949379-46949538)
chr3 (76-258)||(49130580-49130751)
chr3 (76-254)||(48546842-48547009)
chr3 (76-259)||(25641648-25641820)
chr3 (76-258)||(42589832-42590003)
chr3 (76-258)||(54401189-54401360)
chr3 (141-259)||(33550464-33550582)
chr3 (134-259)||(52864550-52864674)
chr3 (76-258)||(30251499-30251670)
chr3 (76-258)||(51415971-51416142)
chr3 (76-265)||(45058885-45059063)
chr3 (76-257)||(54707219-54707389)
chr3 (76-256)||(34279721-34279890)
chr3 (76-256)||(38156632-38156801)
chr3 (76-256)||(47510940-47511109)
chr3 (76-255)||(51143819-51143987)
chr3 (76-259)||(55000175-55000347)
chr3 (76-220)||(37758931-37759075)
chr3 (76-258)||(31286791-31286962)
chr3 (76-264)||(39141117-39141295)
chr3 (76-258)||(41635798-41635969)
chr3 (76-256)||(24688116-24688285)
chr3 (76-173)||(41882063-41882160)
chr3 (74-256)||(50731914-50732085)
chr3 (74-256)||(50780771-50780942)
chr3 (76-255)||(42998790-42998957)
chr3 (76-257)||(21597147-21597317)
chr3 (76-256)||(37028725-37028894)
chr3 (76-256)||(43176738-43176907)
chr3 (76-256)||(51224038-51224206)
chr3 (76-185)||(2227995-2228104)
chr3 (76-231)||(17665549-17665693)
chr3 (76-242)||(40022076-40022231)
chr3 (123-201)||(47182049-47182127)
chr3 (76-173)||(28576184-28576281)
chr3 (76-256)||(40165654-40165822)
chr3 (76-173)||(48726070-48726167)
chr3 (76-150)||(52434141-52434216)
chr3 (83-185)||(47402810-47402911)
chr3 (76-150)||(48752087-48752161)
chr3 (76-160)||(44946014-44946098)
chr3 (76-257)||(177163-177333)
chr3 (105-185)||(41609098-41609178)
chr3 (102-256)||(52756067-52756214)
chr3 (181-258)||(48534005-48534082)
chr3 (74-185)||(8847718-8847829)
chr3 (169-257)||(30429226-30429314)
chr3 (76-126)||(37741437-37741487)
chr3 (204-258)||(40688431-40688485)
chr3 (181-258)||(44945933-44946010)
chr3 (465-536)||(20519279-20519350)
chr3 (76-118)||(51942543-51942585)
chr3 (465-534)||(39341220-39341289)
chr3 (214-257)||(41882010-41882053)
chr3 (465-540)||(46303391-46303465)
chr3 (197-247)||(52434291-52434341)
chr3 (215-247)||(37760346-37760378)
chr3 (465-517)||(42091793-42091845)
[»] chr1 (118 HSPs)
chr1 (65-266)||(17994941-17995143)
chr1 (76-258)||(31308003-31308185)
chr1 (76-256)||(45538155-45538335)
chr1 (76-247)||(4068692-4068863)
chr1 (76-258)||(44661972-44662154)
chr1 (76-256)||(3611138-3611318)
chr1 (76-260)||(5981172-5981356)
chr1 (76-256)||(21139412-21139592)
chr1 (76-268)||(25678247-25678439)
chr1 (74-254)||(43251711-43251891)
chr1 (76-266)||(31040711-31040901)
chr1 (76-256)||(25058690-25058870)
chr1 (76-264)||(26277179-26277367)
chr1 (76-259)||(6327545-6327727)
chr1 (76-259)||(23984757-23984940)
chr1 (76-257)||(33884090-33884271)
chr1 (76-257)||(33959981-33960162)
chr1 (76-257)||(38790196-38790377)
chr1 (76-257)||(41999817-41999998)
chr1 (76-256)||(24245025-24245205)
chr1 (76-267)||(49253964-49254155)
chr1 (76-258)||(23932507-23932689)
chr1 (68-256)||(26085398-26085586)
chr1 (76-257)||(39646570-39646751)
chr1 (76-256)||(33112818-33112997)
chr1 (76-256)||(37620192-37620372)
chr1 (76-256)||(47671588-47671768)
chr1 (76-256)||(36566332-36566512)
chr1 (76-256)||(46784425-46784605)
chr1 (76-255)||(3285404-3285582)
chr1 (76-259)||(24885503-24885686)
chr1 (76-258)||(26524887-26525069)
chr1 (76-258)||(38331857-38332039)
chr1 (76-257)||(50774219-50774400)
chr1 (76-256)||(5980070-5980250)
chr1 (76-252)||(26794306-26794482)
chr1 (76-256)||(46967041-46967221)
chr1 (76-256)||(47383732-47383912)
chr1 (76-256)||(49398988-49399168)
chr1 (76-258)||(35692661-35692844)
chr1 (68-243)||(42863859-42864034)
chr1 (76-252)||(23220939-23221109)
chr1 (76-257)||(46616551-46616732)
chr1 (76-256)||(35273598-35273778)
chr1 (76-256)||(47317317-47317497)
chr1 (76-256)||(51057073-51057253)
chr1 (76-228)||(31844378-31844530)
chr1 (76-259)||(47187107-47187290)
chr1 (76-253)||(28888583-28888760)
chr1 (76-212)||(25518816-25518952)
chr1 (76-259)||(36003132-36003318)
chr1 (76-258)||(48373506-48373679)
chr1 (76-258)||(42313359-42313545)
chr1 (76-258)||(33073213-33073384)
chr1 (76-256)||(27983603-27983767)
chr1 (76-258)||(10928069-10928240)
chr1 (109-256)||(2450529-2450676)
chr1 (76-239)||(51403034-51403187)
chr1 (76-264)||(2954857-2955034)
chr1 (76-258)||(26685858-26686029)
chr1 (68-233)||(45475866-45476022)
chr1 (76-256)||(41467632-41467801)
chr1 (115-256)||(51045596-51045737)
chr1 (74-189)||(31980002-31980117)
chr1 (76-256)||(2657305-2657474)
chr1 (128-258)||(4808699-4808829)
chr1 (76-256)||(38716247-38716416)
chr1 (77-256)||(1388476-1388644)
chr1 (76-255)||(6626025-6626193)
chr1 (76-260)||(26472175-26472348)
chr1 (76-264)||(29770672-29770849)
chr1 (80-259)||(4953058-4953226)
chr1 (77-256)||(30289910-30290078)
chr1 (76-232)||(2556879-2557026)
chr1 (76-257)||(5961266-5961436)
chr1 (124-259)||(47772169-47772304)
chr1 (76-256)||(10920202-10920371)
chr1 (163-256)||(13312531-13312624)
chr1 (76-247)||(34752323-34752483)
chr1 (76-258)||(42234842-42235012)
chr1 (76-256)||(4243490-4243659)
chr1 (76-240)||(27924674-27924827)
chr1 (76-170)||(13313249-13313345)
chr1 (76-256)||(52323940-52324110)
chr1 (76-256)||(33187342-33187505)
chr1 (86-256)||(48683330-48683489)
chr1 (76-256)||(39475783-39475951)
chr1 (125-257)||(4156438-4156577)
chr1 (76-165)||(24649802-24649891)
chr1 (76-239)||(51155606-51155758)
chr1 (76-256)||(7561528-7561711)
chr1 (74-166)||(32448648-32448740)
chr1 (76-256)||(41895164-41895333)
chr1 (76-166)||(46428332-46428422)
chr1 (76-260)||(52367885-52368058)
chr1 (76-166)||(44544125-44544215)
chr1 (76-230)||(13281588-13281731)
chr1 (76-173)||(39637902-39637996)
chr1 (85-258)||(44293453-44293615)
chr1 (76-133)||(4156188-4156245)
chr1 (74-166)||(35991678-35991770)
chr1 (76-126)||(10919313-10919363)
chr1 (465-543)||(52432682-52432760)
chr1 (137-256)||(31286504-31286612)
chr1 (476-543)||(68129-68196)
chr1 (181-265)||(38718157-38718242)
chr1 (166-230)||(9779919-9779982)
chr1 (219-258)||(31844818-31844857)
chr1 (464-543)||(38839637-38839716)
chr1 (465-543)||(10775038-10775116)
chr1 (203-253)||(32448757-32448807)
chr1 (69-115)||(12891394-12891440)
chr1 (195-233)||(24215873-24215911)
chr1 (195-237)||(39359502-39359544)
chr1 (117-166)||(24215806-24215855)
chr1 (76-113)||(31286607-31286644)
chr1 (465-522)||(46080992-46081049)
chr1 (195-247)||(44544055-44544107)
[»] chr2 (82 HSPs)
chr2 (76-259)||(6594455-6594638)
chr2 (76-258)||(4034593-4034775)
chr2 (76-258)||(17600837-17601019)
chr2 (74-256)||(23901778-23901960)
chr2 (76-256)||(746467-746647)
chr2 (76-256)||(38997102-38997282)
chr2 (69-258)||(34518361-34518550)
chr2 (76-260)||(2324885-2325069)
chr2 (76-256)||(10244582-10244762)
chr2 (76-256)||(45370991-45371171)
chr2 (76-257)||(14660447-14660628)
chr2 (76-257)||(27651033-27651214)
chr2 (76-257)||(40635219-40635400)
chr2 (76-256)||(11184973-11185153)
chr2 (76-256)||(13815218-13815398)
chr2 (76-256)||(26710346-26710526)
chr2 (76-247)||(6430474-6430645)
chr2 (76-253)||(10424596-10424773)
chr2 (76-256)||(27400404-27400584)
chr2 (76-259)||(1091948-1092131)
chr2 (76-259)||(33427644-33427827)
chr2 (76-256)||(5726130-5726310)
chr2 (76-256)||(32327362-32327542)
chr2 (71-258)||(7892686-7892873)
chr2 (76-263)||(27024416-27024603)
chr2 (76-256)||(4609627-4609807)
chr2 (76-256)||(40735465-40735645)
chr2 (89-258)||(32856434-32856603)
chr2 (76-256)||(2914138-2914318)
chr2 (76-256)||(14697537-14697717)
chr2 (76-256)||(32948447-32948626)
chr2 (78-256)||(11159625-11159802)
chr2 (76-258)||(40037144-40037325)
chr2 (76-256)||(37620867-37621050)
chr2 (76-230)||(32608381-32608535)
chr2 (76-257)||(37255336-37255512)
chr2 (76-257)||(9444684-9444875)
chr2 (76-270)||(15925081-15925275)
chr2 (76-255)||(12842104-12842278)
chr2 (76-230)||(8432942-8433096)
chr2 (76-258)||(21734898-21735069)
chr2 (76-255)||(39103048-39103216)
chr2 (126-258)||(25294886-25295018)
chr2 (76-199)||(42899916-42900039)
chr2 (76-259)||(44481829-44482001)
chr2 (123-264)||(1229675-1229817)
chr2 (74-222)||(41172457-41172605)
chr2 (76-256)||(35158050-35158219)
chr2 (76-260)||(27331299-27331476)
chr2 (76-259)||(145283-145455)
chr2 (76-256)||(28641292-28641461)
chr2 (76-256)||(29687042-29687211)
chr2 (76-247)||(35126781-35126941)
chr2 (149-256)||(447633-447740)
chr2 (76-256)||(43898971-43899139)
chr2 (85-258)||(13543622-13543784)
chr2 (76-256)||(19428426-19428596)
chr2 (76-256)||(4258491-4258659)
chr2 (76-256)||(12333497-12333664)
chr2 (76-256)||(39301197-39301366)
chr2 (76-152)||(12814615-12814691)
chr2 (76-256)||(27764863-27765031)
chr2 (76-258)||(12730062-12730233)
chr2 (149-236)||(12827137-12827223)
chr2 (76-258)||(2688727-2688898)
chr2 (76-258)||(34249266-34249437)
chr2 (76-166)||(3266297-3266387)
chr2 (76-166)||(40544155-40544245)
chr2 (76-247)||(28566707-28566867)
chr2 (146-218)||(28014856-28014928)
chr2 (76-256)||(43356100-43356266)
chr2 (76-256)||(2000339-2000506)
chr2 (106-258)||(3711664-3711805)
chr2 (76-166)||(8056627-8056717)
chr2 (76-171)||(30545822-30545917)
chr2 (101-181)||(38985342-38985421)
chr2 (76-118)||(28019959-28020001)
chr2 (76-141)||(10176560-10176625)
chr2 (465-521)||(16576269-16576325)
chr2 (191-258)||(42900773-42900837)
chr2 (203-254)||(3266404-3266455)
chr2 (465-523)||(38576933-38576991)
[»] chr8 (72 HSPs)
chr8 (76-258)||(32984075-32984257)
chr8 (76-257)||(43328709-43328890)
chr8 (76-256)||(10646125-10646305)
chr8 (76-256)||(24079901-24080081)
chr8 (76-256)||(41862222-41862402)
chr8 (76-256)||(40435153-40435333)
chr8 (76-259)||(33730638-33730821)
chr8 (76-255)||(37301326-37301505)
chr8 (76-259)||(37956423-37956606)
chr8 (76-258)||(9303572-9303754)
chr8 (76-257)||(5946049-5946230)
chr8 (76-260)||(17718718-17718902)
chr8 (77-257)||(25185902-25186082)
chr8 (76-252)||(31830959-31831135)
chr8 (76-259)||(33981660-33981843)
chr8 (76-257)||(6365988-6366169)
chr8 (76-256)||(9734257-9734435)
chr8 (76-256)||(41653897-41654077)
chr8 (76-239)||(2714551-2714714)
chr8 (76-270)||(37419942-37420136)
chr8 (76-257)||(45236564-45236745)
chr8 (79-254)||(32114254-32114429)
chr8 (76-259)||(41231948-41232131)
chr8 (76-258)||(9013686-9013867)
chr8 (76-258)||(13356118-13356300)
chr8 (76-258)||(2275915-2276096)
chr8 (76-259)||(13760643-13760828)
chr8 (76-256)||(35628779-35628959)
chr8 (76-265)||(22878393-22878582)
chr8 (76-233)||(29048426-29048583)
chr8 (76-253)||(44088446-44088623)
chr8 (76-259)||(45066589-45066772)
chr8 (76-256)||(25248041-25248215)
chr8 (76-257)||(4447294-4447464)
chr8 (76-239)||(45258512-45258675)
chr8 (76-244)||(42701301-42701470)
chr8 (130-263)||(12032986-12033119)
chr8 (76-255)||(41639916-41640095)
chr8 (123-256)||(3904126-3904258)
chr8 (76-258)||(3211208-3211378)
chr8 (140-256)||(41981534-41981650)
chr8 (76-256)||(10378311-10378480)
chr8 (76-242)||(41843255-41843410)
chr8 (143-258)||(31336163-31336278)
chr8 (76-256)||(117329-117498)
chr8 (76-256)||(31940317-31940485)
chr8 (76-181)||(39915887-39915992)
chr8 (76-258)||(3490397-3490568)
chr8 (76-258)||(33896841-33897011)
chr8 (76-264)||(26196309-26196485)
chr8 (70-247)||(4975416-4975582)
chr8 (76-183)||(31148953-31149059)
chr8 (79-239)||(32373744-32373892)
chr8 (76-256)||(9713691-9713857)
chr8 (76-257)||(9509399-9509569)
chr8 (76-256)||(2379142-2379311)
chr8 (76-256)||(40458772-40458941)
chr8 (98-176)||(41981457-41981535)
chr8 (76-166)||(27243218-27243308)
chr8 (76-166)||(27254793-27254883)
chr8 (76-166)||(38631654-38631744)
chr8 (86-247)||(40649840-40649990)
chr8 (76-139)||(33622571-33622634)
chr8 (179-256)||(39901662-39901739)
chr8 (80-143)||(164728-164791)
chr8 (465-523)||(6630535-6630593)
chr8 (76-110)||(12032954-12032988)
chr8 (465-519)||(32166635-32166689)
chr8 (465-543)||(35574616-35574694)
chr8 (465-543)||(37010321-37010399)
chr8 (76-118)||(39901575-39901617)
chr8 (377-441)||(39280914-39280978)
[»] chr4 (128 HSPs)
chr4 (76-255)||(6019930-6020109)
chr4 (76-259)||(34276549-34276732)
chr4 (74-256)||(21366609-21366791)
chr4 (74-256)||(44984761-44984943)
chr4 (76-257)||(39077547-39077728)
chr4 (76-256)||(9798467-9798647)
chr4 (76-256)||(23437594-23437774)
chr4 (77-256)||(31972336-31972515)
chr4 (76-259)||(41702456-41702639)
chr4 (76-258)||(237479-237661)
chr4 (76-258)||(29777255-29777437)
chr4 (76-261)||(32366655-32366840)
chr4 (76-257)||(42085209-42085390)
chr4 (76-256)||(53854430-53854609)
chr4 (64-266)||(42765832-42766034)
chr4 (76-258)||(19387686-19387868)
chr4 (76-258)||(53461814-53461996)
chr4 (76-257)||(2826681-2826861)
chr4 (76-260)||(146425-146609)
chr4 (76-256)||(18462013-18462193)
chr4 (76-256)||(27373078-27373257)
chr4 (76-256)||(31532135-31532315)
chr4 (76-256)||(51363009-51363188)
chr4 (76-256)||(54574940-54575120)
chr4 (76-258)||(3692208-3692390)
chr4 (76-257)||(43471694-43471875)
chr4 (76-257)||(55056258-55056439)
chr4 (76-256)||(26091258-26091438)
chr4 (76-256)||(29478362-29478542)
chr4 (76-256)||(47344658-47344838)
chr4 (76-256)||(41949384-41949566)
chr4 (76-254)||(397404-397582)
chr4 (76-258)||(22618512-22618692)
chr4 (65-259)||(55776036-55776229)
chr4 (65-259)||(55840214-55840407)
chr4 (76-253)||(6285309-6285486)
chr4 (76-259)||(45797481-45797664)
chr4 (76-262)||(407756-407940)
chr4 (76-257)||(3170628-3170809)
chr4 (68-256)||(23609080-23609269)
chr4 (76-257)||(31914200-31914380)
chr4 (76-256)||(41560330-41560510)
chr4 (76-256)||(42033177-42033357)
chr4 (76-256)||(42222293-42222473)
chr4 (76-256)||(54607964-54608144)
chr4 (76-256)||(49881059-49881243)
chr4 (76-258)||(2243460-2243642)
chr4 (76-258)||(31070072-31070253)
chr4 (76-258)||(47662100-47662282)
chr4 (76-258)||(50234002-50234184)
chr4 (76-254)||(50457812-50457990)
chr4 (76-258)||(38591670-38591848)
chr4 (76-256)||(48313559-48313737)
chr4 (76-244)||(50534633-50534801)
chr4 (76-256)||(55519829-55520009)
chr4 (76-256)||(56022998-56023178)
chr4 (76-255)||(53834055-53834234)
chr4 (74-259)||(48657824-48658003)
chr4 (76-260)||(14017372-14017554)
chr4 (76-260)||(1932765-1932949)
chr4 (76-252)||(35446508-35446683)
chr4 (76-256)||(39587781-39587959)
chr4 (76-256)||(54086412-54086590)
chr4 (76-258)||(48654816-48655004)
chr4 (74-250)||(33897501-33897677)
chr4 (76-264)||(50536616-50536804)
chr4 (80-256)||(54424988-54425163)
chr4 (76-238)||(22468788-22468950)
chr4 (76-256)||(41632007-41632186)
chr4 (76-256)||(54805614-54805798)
chr4 (76-258)||(48259510-48259690)
chr4 (76-254)||(51951684-51951861)
chr4 (130-261)||(36532825-36532956)
chr4 (76-256)||(9997931-9998100)
chr4 (114-256)||(52728307-52728448)
chr4 (76-259)||(43890930-43891102)
chr4 (76-258)||(34835179-34835350)
chr4 (76-258)||(54715037-54715208)
chr4 (76-257)||(38547600-38547770)
chr4 (76-258)||(47811908-47812079)
chr4 (76-256)||(45633779-45633948)
chr4 (76-252)||(27398607-27398772)
chr4 (76-259)||(27580121-27580293)
chr4 (76-258)||(46720027-46720201)
chr4 (76-258)||(37239088-37239259)
chr4 (76-233)||(5117461-5117607)
chr4 (76-257)||(14335100-14335270)
chr4 (68-256)||(15060289-15060467)
chr4 (76-256)||(22620595-22620764)
chr4 (76-256)||(54216736-54216905)
chr4 (76-259)||(6371246-6371418)
chr4 (159-256)||(35595772-35595869)
chr4 (76-258)||(20351840-20352011)
chr4 (76-259)||(1662258-1662428)
chr4 (76-256)||(34552321-34552490)
chr4 (76-258)||(27873548-27873717)
chr4 (78-256)||(573807-573974)
chr4 (76-258)||(31881312-31881483)
chr4 (78-257)||(46708740-46708908)
chr4 (76-258)||(4486579-4486750)
chr4 (76-254)||(54216315-54216482)
chr4 (129-256)||(42509351-42509478)
chr4 (122-212)||(52396774-52396865)
chr4 (76-166)||(3293102-3293192)
chr4 (76-256)||(33289705-33289873)
chr4 (76-256)||(52688351-52688520)
chr4 (76-257)||(52461368-52461535)
chr4 (76-158)||(42557584-42557666)
chr4 (88-256)||(49014112-49014269)
chr4 (76-166)||(11972208-11972298)
chr4 (154-255)||(35344868-35344968)
chr4 (76-173)||(43231505-43231601)
chr4 (102-256)||(27872607-27872750)
chr4 (183-255)||(33048990-33049062)
chr4 (76-180)||(49057933-49058037)
chr4 (76-254)||(33557944-33558111)
chr4 (179-258)||(48259702-48259780)
chr4 (111-242)||(51981493-51981613)
chr4 (76-125)||(17555617-17555666)
chr4 (191-258)||(3291803-3291870)
chr4 (154-258)||(42558273-42558369)
chr4 (85-180)||(18206583-18206682)
chr4 (477-541)||(25062352-25062416)
chr4 (465-543)||(20512803-20512881)
chr4 (85-137)||(16738569-16738621)
chr4 (466-522)||(22050719-22050775)
chr4 (465-525)||(15131569-15131629)
chr4 (192-256)||(47105023-47105087)
[»] chr7 (101 HSPs)
chr7 (74-256)||(45690097-45690279)
chr7 (76-256)||(22979647-22979827)
chr7 (76-256)||(25893917-25894097)
chr7 (76-255)||(33423276-33423455)
chr7 (76-258)||(33839713-33839895)
chr7 (76-265)||(49171353-49171542)
chr7 (76-260)||(46913112-46913298)
chr7 (76-258)||(17855431-17855613)
chr7 (76-258)||(47066975-47067157)
chr7 (76-257)||(35355891-35356072)
chr7 (76-256)||(23393051-23393231)
chr7 (76-256)||(33695821-33696001)
chr7 (76-261)||(2341656-2341842)
chr7 (76-257)||(35328068-35328249)
chr7 (76-256)||(20165814-20165994)
chr7 (76-256)||(27018119-27018299)
chr7 (76-256)||(47740331-47740511)
chr7 (76-263)||(33411263-33411450)
chr7 (76-250)||(15877553-15877727)
chr7 (76-258)||(40670566-40670748)
chr7 (76-264)||(33332792-33332979)
chr7 (98-258)||(36389381-36389541)
chr7 (76-268)||(37846004-37846196)
chr7 (76-258)||(31586851-31587033)
chr7 (76-258)||(45482661-45482843)
chr7 (76-256)||(48609677-48609857)
chr7 (76-256)||(10028491-10028673)
chr7 (76-257)||(31625707-31625887)
chr7 (76-256)||(19563450-19563630)
chr7 (98-265)||(5183816-5183983)
chr7 (76-258)||(26579715-26579897)
chr7 (76-260)||(35757016-35757200)
chr7 (76-256)||(43499488-43499668)
chr7 (76-259)||(41990856-41991038)
chr7 (76-256)||(5712171-5712351)
chr7 (76-256)||(45063357-45063535)
chr7 (97-256)||(29446862-29447020)
chr7 (76-255)||(33870248-33870424)
chr7 (76-259)||(35767484-35767660)
chr7 (76-256)||(31429475-31429655)
chr7 (76-257)||(10618301-10618475)
chr7 (76-222)||(33720070-33720216)
chr7 (119-256)||(28233936-28234073)
chr7 (125-257)||(30076526-30076658)
chr7 (76-258)||(35752032-35752203)
chr7 (76-260)||(46898012-46898185)
chr7 (76-255)||(33393331-33393499)
chr7 (76-257)||(44003369-44003539)
chr7 (76-256)||(43489221-43489390)
chr7 (76-257)||(48085861-48086031)
chr7 (76-258)||(24923022-24923193)
chr7 (76-257)||(24228544-24228714)
chr7 (76-257)||(37127940-37128110)
chr7 (76-257)||(46817420-46817590)
chr7 (76-256)||(7257384-7257553)
chr7 (76-256)||(36816845-36817014)
chr7 (137-263)||(44405412-44405538)
chr7 (76-251)||(26941537-26941701)
chr7 (91-232)||(44564356-44564497)
chr7 (76-256)||(2332022-2332191)
chr7 (78-258)||(7876326-7876495)
chr7 (140-258)||(41904272-41904390)
chr7 (76-181)||(16482847-16482952)
chr7 (76-254)||(15643948-15644115)
chr7 (76-242)||(29610638-29610793)
chr7 (76-264)||(45502808-45502985)
chr7 (76-256)||(47460772-47460941)
chr7 (76-256)||(21718120-21718288)
chr7 (76-247)||(25037517-25037677)
chr7 (76-165)||(29098754-29098843)
chr7 (76-239)||(41855062-41855214)
chr7 (76-222)||(32556640-32556775)
chr7 (85-259)||(38448445-38448608)
chr7 (76-256)||(498188-498357)
chr7 (76-174)||(7720574-7720672)
chr7 (76-256)||(26371052-26371221)
chr7 (76-166)||(39323619-39323709)
chr7 (76-162)||(39453558-39453644)
chr7 (76-166)||(39866668-39866758)
chr7 (79-255)||(46103127-46103291)
chr7 (76-166)||(47906838-47906928)
chr7 (76-258)||(45237531-45237702)
chr7 (76-174)||(29863018-29863116)
chr7 (76-254)||(35484639-35484807)
chr7 (76-141)||(35557733-35557798)
chr7 (76-258)||(44659847-44660017)
chr7 (113-258)||(37443600-37443734)
chr7 (76-166)||(33455099-33455189)
chr7 (76-138)||(30077043-30077105)
chr7 (76-181)||(21649442-21649548)
chr7 (76-136)||(35823293-35823353)
chr7 (121-182)||(26456157-26456218)
chr7 (181-254)||(39453484-39453557)
chr7 (198-259)||(39866762-39866823)
chr7 (465-525)||(34891554-34891614)
chr7 (191-259)||(39323715-39323782)
chr7 (465-543)||(23944097-23944175)
chr7 (465-534)||(32138871-32138940)
chr7 (465-519)||(34891386-34891440)
chr7 (191-256)||(42272180-42272244)
chr7 (184-252)||(29098847-29098915)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (76-256)||(1871-2051)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (76-258)||(39554-39736)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (76-258)||(13760-13942)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (74-256)||(11133-11314)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (76-259)||(75241-75424)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (76-256)||(2432-2612)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (76-258)||(278008-278192)
scaffold0007 (86-257)||(176666-176837)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (76-258)||(18852-19034)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (76-228)||(32563-32715)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (76-256)||(4596-4770)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (76-257)||(3090-3262)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (76-256)||(20477-20646)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (80-256)||(14750-14915)
[»] scaffold2003 (1 HSPs)
scaffold2003 (76-256)||(104-272)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (68-256)||(7083-7262)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (76-256)||(4554-4724)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (76-256)||(3394-3564)
[»] scaffold0271 (1 HSPs)
scaffold0271 (76-222)||(17908-18043)
[»] scaffold0323 (2 HSPs)
scaffold0323 (85-180)||(19228-19327)
scaffold0323 (214-256)||(19356-19398)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 75)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 289 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 26105726 - 26105418
Alignment:
Q  289 tgacaacactcgctaacacatagagttaactaactagcatgtataacttgttttttctacgttaagccttgatgaattggtggtaattatttacctcaat 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || ||||||    
T  26105726 tgacaacactcgctaacacatagagttaactaactagtatgtataacttgttttttctacgttaagccttgatgaattgatggtaatt---tatctcaat 26105630  T
Q  389 caacgaaaaatctccattgctttatctttattcttaaaatctattaccatttttggactggt----gtcatacgtgaacaattttcatctaaagaacatc 484  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26105629 caatgaaaaatctccattgctttatctttattctttaaatttattaccatttttggactggtataggtcatacgtgaacaatttttatctaaagaacatc 26105530  T
Q  485 aaacttctccatctccttcatttcacatgtgatctccattttctttgttccataatcgagaatccaatagggataaataacccacaattcatcaagggta 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26105529 aaacttctccatctccttcatttcacatgtgatctccattttttttgttccataatcgagaatccaataggggtaaataacccacaattcatcaagggta 26105430  T
Q  585 atgtattttgat 596  Q
    || |||||||||    
T  26105429 atatattttgat 26105418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 24253384 - 24253564
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24253384 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 24253483  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24253484 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 24253564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 7722051 - 7722232
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7722051 tttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 7722150  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7722151 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 7722232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 43326559 - 43326379
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43326559 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 43326460  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  43326459 taaaaatgtgcctatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttggcacc 43326379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 76 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15398662 - 15398483
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15398662 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 15398563  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 255  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  15398562 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtactctagttgtcac 15398483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 35626040 - 35626221
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  35626040 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 35626139  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  35626140 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacct 35626221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 12648799 - 12648979
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12648799 tttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 12648898  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12648899 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 12648979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 256
Target Start/End: Original strand, 31938908 - 31939079
Alignment:
Q  85 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31938908 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31939007  T
Q  185 gcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    | |||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31939008 gtttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 31939079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 76 - 254
Target Start/End: Original strand, 6901801 - 6901979
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  6901801 tttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccact 6901900  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6901901 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 6901979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 76 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27278657 - 27278474
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatag----ttcatggatac 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||    
T  27278657 tttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagataattcatggatac 27278558  T
Q  172 cacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27278557 cacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcac 27278474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 3466861 - 3466680
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3466861 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 3466762  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  3466761 taaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttttatgggtaccctagttgtcacct 3466680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 39932581 - 39932762
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39932581 tttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 39932680  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  39932681 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccaaccattcttccatgggtactctagttgtcacct 39932762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 5184974 - 5185154
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5184974 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccact 5185073  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5185074 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 5185154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18479848 - 18479668
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18479848 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccact 18479749  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||    
T  18479748 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctagtagtcacc 18479668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 40886207 - 40886028
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40886207 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 40886108  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  40886107 t-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttttcacc 40886028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 739884 - 739703
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  739884 tttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 739785  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  739784 taaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacct 739703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 27938899 - 27939080
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27938899 tttttctagattatttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 27938998  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatggg-taccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27938999 taaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggttaccctagttgtcacc 27939080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 43262363 - 43262182
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43262363 tttttctatattacctttgaagaatggtgggtaattaacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 43262264  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43262263 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacct 43262182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 25831523 - 25831703
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  25831523 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccaat 25831621  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  25831622 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccttatttgtcacct 25831703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 15683793 - 15683973
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15683793 tttttctagattacctttgaagaatgatgtgtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 15683892  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  15683893 taaaaatgtgcttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataagtaccctagttgtcacc 15683973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27501235 - 27501055
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27501235 tttttttagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 27501136  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27501135 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgtttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2484472 - 2484292
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  2484472 tttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatactact 2484373  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  2484372 taaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 2484292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 111 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 29789440 - 29789293
Alignment:
Q  111 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggtt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29789440 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt 29789341  T
Q  211 ggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29789340 gggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 29789293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28424973 - 28424792
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28424973 tttttctagattacctttgaaggatagtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatg--caatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccact 28424876  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  28424875 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtcaccttt 28424792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 890908 - 891088
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  890908 tttttctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtcgagtcaagatagttcatggataccact 891007  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  891008 t-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacctaccattcttccatgggtatcctaattgtcacct 891088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 5137717 - 5137898
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5137717 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 5137816  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| | ||||| || | |||||||| |||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  5137817 taaaaatgtgtttatgtggctaatatgtattgatttgagtaaattatccaccattcttccattaataccctagttgtcacct 5137898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 75 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13504923 - 13504742
Alignment:
Q  75 gtttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccac 174  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13504923 gtttttctagattaccatcgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 13504824  T
Q  175 ttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| | |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13504823 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatatgtattagttgggataaattatccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 13504742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 85 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 40279029 - 40278858
Alignment:
Q  85 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 184  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40279029 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaacataattcatggataccacttaaaaatgt 40278930  T
Q  185 gcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  40278929 gcttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattacccatcattcttccatgaataccctagttgtcacc 40278858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 76 - 254
Target Start/End: Original strand, 40110236 - 40110413
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  40110236 tttttctatattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatagataccact 40110334  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 254  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  40110335 taaaaatgtgcttatgtggttaatgtatattagttagggtaaattatctaccattcttccatgagtatcctaattgtca 40110413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 38756662 - 38756485
Alignment:
Q  82 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaa 181  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38756662 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaataaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 38756563  T
Q  182 tgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctt-ccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  38756562 tgtgtttatgtggctaatgtgtattagttgagataaattacccacaattcttcccataggtaccctagttgtcacctt 38756485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 116 - 256
Target Start/End: Original strand, 34451292 - 34451432
Alignment:
Q  116 caccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  34451292 caccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggt 34451391  T
Q  216 aaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  34451392 aaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 34451432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 763725 - 763907
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  763725 tttttctagattatttttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggagttaagatagttcatggatatcact 763824  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||| ||||||||||    
T  763825 taaaaatgtacttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccatcattctttgatggatactctagttgtcacctt 763907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 33617587 - 33617758
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||             
T  33617587 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatg--------- 33617677  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
      || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  33617678 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 33617758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 76 - 237
Target Start/End: Original strand, 4149696 - 4149847
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||    
T  4149696 tttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtt----------atggataccact 4149785  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccat 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4149786 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccat 4149847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 19295732 - 19295901
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||          
T  19295732 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgtat------ 19295825  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
         ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  19295826 -----atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 19295901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31294169 - 31293989
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||   | |||| |||| ||||||||    
T  31294169 tttttctagattacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaaattattggtagggtccgggtagtccatgaataccact 31294070  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||| ||||||||||  | |||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31294069 taaaaatatgcttacgtgattgatggttattggttggagtaaattacccaccattcttacatgggtaccctagttgtcacc 31293989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 2585464 - 2585633
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||      
T  2585464 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccatc 2585563  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||  ||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  2585564 taaaaagttg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatggataccctaattgtcacc 2585633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 40632501 - 40632634
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||       
T  40632501 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc--- 40632597  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaa 218  Q
           ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40632598 ------ggtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 40632634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 38015683 - 38015512
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  38015683 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 38015593  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||    
T  38015592 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacctt 38015512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 9374671 - 9374502
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||             
T  9374671 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg--------- 9374581  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  9374580 --aatatgtgtttaggtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 9374502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 27503381 - 27503550
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  27503381 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 27503471  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  27503472 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 27503550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 38638079 - 38637907
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||      
T  38638079 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaac 38637980  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||| |||           ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38637979 taaaaaggtg-----------aatgtttattagttggggtaaattacccacaatttttccatgggtaccctagttgtcaccttt 38637907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 42658831 - 42658667
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  42658831 tttttcaaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 42658741  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattg 251  Q
      || || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  42658740 --aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctaattg 42658667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23195417 - 23195246
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  23195417 tttttctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 23195327  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
      || ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  23195326 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 23195246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24167953 - 24167784
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  24167953 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataataaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacc 24167854  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  24167853 taaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattactcaacatttttccatgggtaccctagttgtcacc 24167784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Original strand, 5497275 - 5497447
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| || ||||||||||             
T  5497275 tttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg--------- 5497365  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  5497366 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccttt 5497447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9424761 - 9424593
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  9424761 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 9424671  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 255  Q
      || || |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  9424670 --aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 9424593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 258
Target Start/End: Original strand, 13957663 - 13957843
Alignment:
Q  67 tatttatggtttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatg 166  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  13957663 tatttaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 13957762  T
Q  167 gataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
               || ||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  13957763 -----------aatatgcgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 13957843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 82 - 257
Target Start/End: Original strand, 27390605 - 27390769
Alignment:
Q  82 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaa 181  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27390605 tagattacctttgaaaaatggtggatagtttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 27390704  T
Q  182 tgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
     |||           |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27390705 ggtg-----------aatgttcattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacct 27390769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Original strand, 40686901 - 40687072
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||      
T  40686901 tttttctagattacctttgagaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccatc 40687000  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  40687001 taaaaa-gtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctaattgtcaccttt 40687072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1402674 - 1402503
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||     
T  1402674 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccacc 1402575  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
     ||||| |||           ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  1402574 caaaaaggtg-----------aatgtttattagttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttatcacctt 1402503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 6973065 - 6973236
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  6973065 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 6973155  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
      || ||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||    
T  6973156 --aatatgtgcttatgtgactaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgacacctt 6973236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18327342 - 18327185
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||     
T  18327342 tttttctagattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgcgcaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacc 18327243  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacc 244  Q
    |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18327242 taaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtacc 18327185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12558198 - 12558090
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||    
T  12558198 tttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgatgtggtcaagatagttcat-gataccact 12558100  T
Q  176 taaaaatgtg 185  Q
    ||||||||||    
T  12558099 taaaaatgtg 12558090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 36472453 - 36472348
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  36472453 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccact 36472354  T
Q  176 taaaaa 181  Q
    | ||||    
T  36472353 ttaaaa 36472348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 36365614 - 36365462
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  36365614 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 36365524  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 239  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  36365523 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattagccatcattctttcatgg 36365462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Original strand, 5120036 - 5120182
Alignment:
Q  85 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 184  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  5120036 attacctttgatgaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatat 5120134  T
Q  185 gcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtac 243  Q
    |           ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5120135 g-----------aatgtttattggttgaggtaaattatccaccattctttcatgggtac 5120182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 14971980 - 14972149
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||             
T  14971980 tttttttaaattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatg--------- 14972070  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  14972071 --aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattgattaggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 14972149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 33624105 - 33623940
Alignment:
Q  79 ttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaa 178  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||| ||||||| |             
T  33624105 ttctaaattacctttgaataatggtagataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgggt--------- 33624015  T
Q  179 aaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 255  Q
      ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  33624014 --atgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattatccaccatttttcaatggataccctaattgtcac 33623940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 76 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 42247951 - 42247865
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  42247951 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 42247865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 101 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3656712 - 3656568
Alignment:
Q  101 ggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||           || ||||||||| ||||||||||    
T  3656712 ggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttttggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggctaatg 3656624  T
Q  201 tatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  3656623 tgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 3656568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 36948633 - 36948499
Alignment:
Q  100 tggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaat 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||           ||||||||| |||||||||    
T  36948633 tggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtaggg-taagatagttcatggat-----------atgtgcttatgtggctaat 36948546  T
Q  200 gtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 247  Q
    || |||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  36948545 gtgtattgg-tagggtaaattacccaccattcttgcatgagtacccta 36948499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 6206886 - 6207032
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||| || ||||||||||             
T  6206886 tttttttaaattacttttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgagcaatttatttggggggtcaaaatagttcatg--------- 6206976  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctt 233  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6206977 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 6207032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 9171193 - 9171111
Alignment:
Q  77 ttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagata 159  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  9171193 ttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaacaaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagata 9171111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 9527189 - 9527124
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 141  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9527189 tttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaattt 9527124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 239
Target Start/End: Original strand, 38492647 - 38492767
Alignment:
Q  108 aatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattg 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||           || ||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  38492647 aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattg 38492735  T
Q  208 gttggggtaaattacccaccattcttccatgg 239  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  38492736 gttggggtaaattacccatcattctttcatgg 38492767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 3940480 - 3940411
Alignment:
Q  96 aaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||    
T  3940480 aaaatggtgggtaatttacccaccaacaaatgaaaatgagcaatttattggtgcggtcaagataattcat 3940411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 612900 - 612755
Alignment:
Q  100 tggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaat 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| || ||||             |||||| |||||||||    
T  612900 tggtgggtaatttaaccaccaacca-tgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttattgata-------------tgcttatgtggctaat 612815  T
Q  200 gtatattggttggg-gtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  612814 gtgtattggttgggagtaaattactcagtattcttccatgggtatcctagttgtcacctt 612755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 465 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 2243370 - 2243292
Alignment:
Q  465 attttcatctaaagaacatcaaacttctccatctccttcatttcacatgtgatctccattttctttgttccataatcga 543  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||    
T  2243370 attttcatctcaagaacatcaaacttcttcatatccttcattcaacatgtgatctccatcttcttcgttctagaatcga 2243292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 20207154 - 20207088
Alignment:
Q  107 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 173  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  20207154 taatttatccatcaaccaatgaaaatgaacaatttattgatgtgattaagatagttcatggatacca 20207088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15301033 - 15300977
Alignment:
Q  85 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 141  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15301033 attacctttgaagaatgattggtaatttacacatcaaccaatgaaaatgagcaattt 15300977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 134
Target Start/End: Original strand, 28756082 - 28756138
Alignment:
Q  78 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatga 134  Q
    ||||||||| |||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28756082 tttctagatcacctttaaagaaaggtggataatttacccaccaagcaatgaaaatga 28756138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 465 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 39730360 - 39730293
Alignment:
Q  465 attttcatctaaagaacatcaaacttctccatctccttcatttcacatgtgatctccattttctttgttc 534  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||  |||||| ||||| ||||||||    
T  39730360 attttcatctcaagaacatcaaactttttcatctctttcatttaaca--tgatcttcatttactttgttc 39730293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 134
Target Start/End: Original strand, 27584387 - 27584447
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtggg--taatttacccaccaaccaatgaaaatga 134  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||    
T  27584387 tttttctatatttcctttgaagaatggtgggtatagtttacccaccaaccagtgaaaatga 27584447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 543
Target Start/End: Original strand, 41264547 - 41264628
Alignment:
Q  462 acaattttcatctaaagaacatcaaacttctccatctccttcatttcacatgtgatctccattttctttgttccataatcga 543  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||| ||||||| || || ||| ||||| || ||||||| | ||||||    
T  41264547 acaattttcatatcaagaacatcaaatttcttcatctctttcatttaacttgagatttccatattttttgttctaaaatcga 41264628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 65 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 34528054 - 34527852
Alignment:
Q  65 tttatttatggtttttct-agattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttc 163  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  34528054 tttatttatggttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattc 34527955  T
Q  164 atggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttattt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34527954 atggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctttattt 34527855  T
Q  264 ata 266  Q
    |||    
T  34527854 ata 34527852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Original strand, 5882508 - 5882691
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5882508 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 5882607  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5882608 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttt 5882691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 26377384 - 26377202
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26377384 tttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 26377285  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26377284 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 26377202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 24168093 - 24168274
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24168093 tttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 24168192  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24168193 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 24168274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Original strand, 2892190 - 2892378
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2892190 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 2892289  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttattta 264  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  2892290 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttctatgggtaccctagttgtcatcttttttta 2892378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 76 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14891559 - 14891383
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14891559 tttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 14891460  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgt 252  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14891459 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 14891383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22551241 - 22551061
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  22551241 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacc 22551142  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22551141 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 22551061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7393766 - 7393583
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7393766 tttttctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 7393667  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7393666 taaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccataattgtcaccttt 7393583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 8615242 - 8615422
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8615242 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 8615341  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8615342 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacc 8615422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 77 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18101674 - 18101495
Alignment:
Q  77 ttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccactt 176  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18101674 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccactt 18101575  T
Q  177 aaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  18101574 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtatcctagttgtcacc 18101495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 87 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11989143 - 11988973
Alignment:
Q  87 tacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgc 186  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11989143 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgc 11989044  T
Q  187 ttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11989043 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 11988973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19415713 - 19415531
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19415713 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagctcatggataccact 19415614  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19415613 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 19415531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 10508088 - 10507907
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10508088 tttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgataatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 10507989  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  10507988 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccaccattcttcgatggctaccctagttgtcacct 10507907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 960084 - 959904
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  960084 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatggaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatagataccact 959985  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  959984 taaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 959904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 28947089 - 28947269
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  28947089 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccact 28947188  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28947189 taaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 28947269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Original strand, 16703368 - 16703551
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16703368 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccact 16703467  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  16703468 taaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacgcatcattcttccatgggtatcctaatttttaccttt 16703551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 2594032 - 2593850
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2594032 tttttctagattatctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 2593933  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2593932 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattatccaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 2593850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 76 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7345292 - 7345130
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7345292 tttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccact 7345193  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatg 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7345192 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatg 7345130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 87 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22341959 - 22341786
Alignment:
Q  87 tacctttgaaaaatggtgggtaatttacccacca--accaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22341959 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccaacacaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 22341860  T
Q  185 gcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22341859 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacctt 22341786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 1970713 - 1970894
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  1970713 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcact 1970812  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  1970813 taaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactttagttgtcacct 1970894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 599894 - 600074
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  599894 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 599993  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  599994 taaaaatgtgtttatgtgactaatttgtattggttgggataaattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 600074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5294981 - 5294799
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5294981 tttttctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 5294882  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  5294881 taaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 5294799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5299533 - 5299351
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5299533 tttttctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 5299434  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  5299433 taaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 5299351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 30743628 - 30743446
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||    
T  30743628 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagtttatggataccact 30743529  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  30743528 taaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacctaccattctttcatggataccctaattatcacctt 30743446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 33452752 - 33452572
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33452752 tttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaataatttgttgttggggtcaagatagttcatggataccact 33452653  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  33452652 taaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 33452572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 76 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19281235 - 19281056
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  19281235 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttgcccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcact 19281136  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 255  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||    
T  19281135 taaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtagcctagttgtcac 19281056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24224251 - 24224070
Alignment:
Q  76 tttttctagatt-acctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccac 174  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  24224251 tttttctagatttacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccac 24224152  T
Q  175 ttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||| |||| ||||||||    
T  24224151 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacctactattctttcatgagtatcctagttgtcacc 24224070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 106 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23262079 - 23261926
Alignment:
Q  106 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||| | |||    
T  23262079 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgaggttaatatgtat 23261980  T
Q  206 tggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  23261979 tggttggggtaaattatccaccgttctttcataggtaccctagttgtcaccttt 23261926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30467783 - 30467658
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30467783 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaacaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 30467684  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgt 201  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  30467683 taaacatgtgcttatgtggctaatgt 30467658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 7167584 - 7167753
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  7167584 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccacc 7167683  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  7167684 taaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 7167753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 247
Target Start/End: Original strand, 13329383 - 13329543
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||               
T  13329383 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttca----------- 13329471  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 247  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  13329472 taaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 13329543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 15965435 - 15965605
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||             
T  15965435 tttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatacttcatg--------- 15965525  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
      || ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  15965526 --aatatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacct 15965605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 28949014 - 28948845
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||             
T  28949014 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg--------- 28948924  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  28948923 --aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 28948845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Original strand, 3291010 - 3291182
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||               
T  3291010 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttca----------- 3291098  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  3291099 taaatatgtgcttatgtggctaatatgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtcaccttt 3291182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 1398555 - 1398724
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||| |||             
T  1398555 tttttctaaattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagatagttgatg--------- 1398645  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  1398646 --aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcataggtagcctagttgtcacc 1398724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 4487529 - 4487698
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| || ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  4487529 tttttttaaatttcctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 4487619  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || |||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  4487620 --aatatgtactcatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 4487698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 76 - 152
Target Start/End: Original strand, 929661 - 929737
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggt 152  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  929661 tttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggt 929737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 375893 - 375729
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||       
T  375893 tttttttagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaactaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatacc--- 375797  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 254  Q
    ||||||  ||           ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  375796 taaaaagatg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtaccttaattgtca 375729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 3786751 - 3786920
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||| || ||||||||||             
T  3786751 tttttctaaattacttttgaagaatggtggataatttacctaccaatcaatgaaaatgaagaatttatttgtggggtcaatatagttcatg--------- 3786841  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  3786842 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 3786920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1939669 - 1939579
Alignment:
Q  80 tctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggata 170  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  1939669 tctaaattatctttgaagaatggtggataatttacctataaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatggata 1939579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Original strand, 34262257 - 34262403
Alignment:
Q  94 gaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtg 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||       || ||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||  |||||| |||            
T  34262257 gaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaat-------agtaatttattggtggggtcaacatagtttatggataccatctaaaaaggtg-------- 34262341  T
Q  194 gctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
       ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34262342 ---aatgtttattggttgtgataaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacctt 34262403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 181
Target Start/End: Original strand, 13844847 - 13844943
Alignment:
Q  85 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaa 181  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||||| ||| ||| || || |||||||||  ||||||| ||||||    
T  13844847 attacctttgaaaaatggtggttaacttaaccactaacaaatgaaaatgaacaatttattgatggagtcaaaatagttcataaataccacctaaaaa 13844943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 256
Target Start/End: Original strand, 18661830 - 18661905
Alignment:
Q  181 atgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  18661830 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 18661905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 181 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24913171 - 24913093
Alignment:
Q  181 atgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| | || |||||||||||    
T  24913171 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgagtagcttagttgtcaccttt 24913093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 11743124 - 11743070
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaa 130  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  11743124 tttttctagattacccttgaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaa 11743070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 465 - 506
Target Start/End: Original strand, 23577172 - 23577213
Alignment:
Q  465 attttcatctaaagaacatcaaacttctccatctccttcatt 506  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23577172 attttcatctcaaaaacatcatacttctccatctccttcatt 23577213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 465 - 506
Target Start/End: Original strand, 32047195 - 32047236
Alignment:
Q  465 attttcatctaaagaacatcaaacttctccatctccttcatt 506  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  32047195 attttcatctcaagaacatcaaacttcttcatctcattcatt 32047236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 465 - 541
Target Start/End: Original strand, 32342621 - 32342697
Alignment:
Q  465 attttcatctaaagaacatcaaacttctccatctccttcatttcacatgtgatctccattttctttgttccataatc 541  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | |||||| ||||||  ||||| |||||| ||||| || |||||| ||||    
T  32342621 attttcatctcaaaaacatcaaactttttcatctcattcattcaacatgcgatctctatttttttcgttccagaatc 32342697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 117)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 38416904 - 38416722
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38416904 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 38416805  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38416804 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 38416722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 76 - 265
Target Start/End: Original strand, 47257795 - 47257984
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  47257795 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccact 47257894  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttatttat 265  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47257895 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctttatttat 47257984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 40131139 - 40130957
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40131139 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgtctgtggggtcaagatagttcatggataccact 40131040  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  40131039 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 40130957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 49330039 - 49330221
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49330039 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 49330138  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49330139 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 49330221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29626007 - 29625826
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29626007 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 29625908  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29625907 taaaaatatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaattatcacct 29625826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 47809777 - 47809593
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47809777 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 47809678  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggtt-ggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47809677 taaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttt 47809593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 7855294 - 7855112
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7855294 tttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaaggataccact 7855195  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7855194 taaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 7855112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 261
Target Start/End: Original strand, 42291844 - 42292029
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  42291844 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 42291943  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttat 261  Q
    | ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  42291944 tgaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacctttat 42292029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 48739413 - 48739232
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  48739413 tttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccact 48739314  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48739313 taaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 48739232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 22399099 - 22399278
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22399099 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggaaaccact 22399198  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    | |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22399199 t-aaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 22399278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 24100285 - 24100464
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24100285 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccact 24100383  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24100384 taaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 24100464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 28048572 - 28048392
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28048572 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 28048473  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28048472 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattaatttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 28048392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 32234577 - 32234394
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32234577 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 32234478  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttta 260  Q
    | ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32234477 t-aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcaccttta 32234394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 41464354 - 41464534
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  41464354 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccact 41464453  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  41464454 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccagcattcttccatgggtactctagttgtcacc 41464534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 46134358 - 46134538
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46134358 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 46134457  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  46134458 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcaccattctttcatggataccctaattgtcacc 46134538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 76 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 51170213 - 51170034
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51170213 tttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 51170114  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 255  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  51170113 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcac 51170034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 43612227 - 43612045
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  43612227 tttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcgtggtcaagatagttcatggataccact 43612128  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43612127 taaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 43612045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 40419837 - 40420018
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40419837 tttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 40419936  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  40419937 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattctttcatgggtaccctagttgtcacct 40420018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 76 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 51452930 - 51452747
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  51452930 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccact 51452831  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttta 260  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51452830 taaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccat-ggtaccctaattgtcaccttta 51452747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 83 - 254
Target Start/End: Original strand, 48609732 - 48609903
Alignment:
Q  83 agattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaat 182  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48609732 agattaccttcgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaat 48609831  T
Q  183 gtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 254  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48609832 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 48609903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 39634751 - 39634570
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  39634751 tttttctagattacttttgaagaatggtgggtattttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccact 39634653  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39634652 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacaattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 39634570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 2666002 - 2666183
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2666002 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 2666101  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  2666102 taaaactgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccactattctttcatgggtactctagttgtcacct 2666183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27067158 - 27066977
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  27067158 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcact 27067059  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27067058 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacct 27066977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 79 - 256
Target Start/End: Original strand, 52628959 - 52629135
Alignment:
Q  79 ttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaa 178  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52628959 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaa 52629058  T
Q  179 aaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  52629059 aaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 52629135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 40643802 - 40643982
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |    
T  40643802 tttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatatcatt 40643901  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40643902 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 40643982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 76 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 41293498 - 41293315
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||    
T  41293498 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataattcatgaataccact 41293399  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttta 260  Q
    | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41293398 t-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaattgtcaccttta 41293315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 44222831 - 44223011
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  44222831 tttttctaaattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatgaataccact 44222930  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44222931 taaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 44223011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7755486 - 7755304
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  7755486 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagattatggataccact 7755387  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7755386 t-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgcttggggtaaataacccatcattcttccatgggtaccctacttgtcaccttt 7755304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 76 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 55453424 - 55453245
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55453424 tttttctaggttacctttgaagaatggtgggtaatttactcatcaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccact 55453325  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 255  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  55453324 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcac 55453245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 40804690 - 40804509
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  40804690 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtaggatcaagatagttcatggataccact 40804591  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  40804590 taaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattagttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacct 40804509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 37313401 - 37313581
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  37313401 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcact 37313500  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  37313501 taaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactctaggtgtcacc 37313581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 51102558 - 51102378
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  51102558 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcact 51102459  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  51102458 taaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccgttggtaccctagttgtcacc 51102378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 44806686 - 44806868
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  44806686 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggaatcaagatagttcatggataccact 44806785  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||  |||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  44806786 taaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaagtaaattatccacaattctttcatgggtaccctagttgtcacctt 44806868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 52215078 - 52215260
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  52215078 tttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaactaatgaacatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccact 52215177  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| |||||||    
T  52215178 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttctatgggtgccttaattatcacctt 52215260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 76 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 53943767 - 53943578
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  53943767 tttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 53943668  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttatttata 266  Q
    ||||||| | |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  53943667 taaaaatatacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtactctagttgtcacctttttttata 53943578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 35748491 - 35748310
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35748491 tttttttagattagctttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 35748392  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  35748391 taaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacct 35748310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 37324543 - 37324723
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37324543 tttttctaaattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccact 37324642  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37324643 taaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 37324723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 41732530 - 41732710
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41732530 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccact 41732629  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  41732630 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccatccttccatggataccccagttgtcacc 41732710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20754573 - 20754391
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  20754573 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagagtcaagatagttcatggatatcact 20754474  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20754473 taaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattattccatgagtaccctagttgtcacctt 20754391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 39053396 - 39053578
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39053396 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccact 39053495  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| ||| ||| ||||||||||    
T  39053496 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggggtaaattacccatcatttttttatggatactctagttgtcacctt 39053578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 43125833 - 43126014
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43125833 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccact 43125932  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||| ||||||||||    
T  43125933 taaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttttataggta-cctagttgtcacctt 43126014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 76 - 241
Target Start/End: Original strand, 36368941 - 36369105
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36368941 tttttctagattacctttgaagaatggtcgataatttacccaccaactaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 36369040  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggt 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36369041 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttagggtaaattacccacca-tcttccatgggt 36369105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 76 - 255
Target Start/End: Original strand, 43021716 - 43021896
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtt-aagatagttcatggataccac 174  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  43021716 tttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggggtcaagatagttcatgaataccac 43021815  T
Q  175 ttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 255  Q
    ||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  43021816 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtcac 43021896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 98 - 258
Target Start/End: Original strand, 46126011 - 46126170
Alignment:
Q  98 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggcta 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  46126011 aatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtggcta 46126110  T
Q  198 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  46126111 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacctt 46126170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 79 - 254
Target Start/End: Original strand, 43183917 - 43184092
Alignment:
Q  79 ttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaa 178  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  43183917 ttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagttcatggataccacttaa 43184016  T
Q  179 aaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 254  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  43184017 aaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccataggtaccctagttgtca 43184092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Original strand, 52638844 - 52639027
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  52638844 tttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttaccaacgaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagataattcatggataccact 52638943  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  52638944 taaaaatgtgcttctgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattattctatgggtaccctagttgtcaccttt 52639027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 35594123 - 35594305
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  35594123 tttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcact 35594222  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  35594223 taaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgttacctt 35594305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 18946905 - 18947086
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  18946905 tttttctagattatctttgaagaatggtgcgtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccagt 18947004  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18947005 taaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgagacaaattacccaccattcttccatgggtaccctacttgtcacct 18947086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 76 - 260
Target Start/End: Original strand, 41216457 - 41216641
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41216457 tttttctagattacctttaaaggatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggttaatatagttcatggataccact 41216556  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttta 260  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  41216557 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattaattgggataaattacccactattcttccataggtactctagttgtcaccttta 41216641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 51146406 - 51146206
Alignment:
Q  66 ttatttatggttttt-ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttca 164  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  51146406 ttatttatggttttttctagattatctttgaagaatggtaggtaatttacacatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttca 51146307  T
Q  165 tggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttattta 264  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  51146306 tggataccacttaaaaatttgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgccaccattattta 51146207  T
Q  265 t 265  Q
    |    
T  51146206 t 51146206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 76 - 231
Target Start/End: Original strand, 24376575 - 24376730
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24376575 tttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacgcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 24376674  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattc 231  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24376675 taaaaatgtgcttatgtggcttatgtgtatttgttggggtaaattacccaccattc 24376730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 76 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 47895000 - 47894822
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47895000 tttttttagattacctttaaagaatggtggataatttacctaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 47894901  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 254  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47894900 taaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattagttgaggtaaatcatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 47894822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 76 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 53832664 - 53832486
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  53832664 tttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagtttatggataccaat 53832565  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 254  Q
    |||||| | ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  53832564 taaaaaggggcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgtgttccctagttgtca 53832486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 5560212 - 5560025
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatga-----aaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggata 170  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  5560212 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaattaaatgagcaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggata 5560113  T
Q  171 ccacttaaaaatgtgcttacgtggc--taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  5560112 ccacttaaaaatatgcttatgtgactataatgtctattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 5560025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Original strand, 53637843 - 53637990
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  53637843 tttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaggataattcatggataccact 53637942  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacc 223  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  53637943 taaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacc 53637990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 76 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 54159168 - 54159000
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  54159168 tttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatagataccact 54159069  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 254  Q
    |||||||||||||         |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54159068 taaaaatgtgctt---------atgtgtattggttggggt-aattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtca 54159000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 55379987 - 55380156
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  55379987 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacc 55380086  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  55380087 taaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 55380156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Original strand, 53115449 - 53115621
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  53115449 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccact 53115548  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  53115549 taaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccataggtaccctagttgtcaccttt 53115621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 25353556 - 25353726
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  25353556 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataataagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacc 25353655  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||| |||           |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25353656 taaaaaggtg-----------aatgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 25353726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 78 - 239
Target Start/End: Original strand, 46949379 - 46949538
Alignment:
Q  78 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccactta 177  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  46949379 tttctagattatctttgaaga-tggtgtgtaatttacccaccgaccaatgaaaatgaacaatttgttggcgggatcaagatagttcatggataccactta 46949477  T
Q  178 aaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 239  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  46949478 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtt-ggataaattacccaccattcttccatgg 46949538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 49130580 - 49130751
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||             
T  49130580 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatgaggtcaagatagttcatg--------- 49130670  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
      || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  49130671 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtctcctt 49130751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 48547009 - 48546842
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||    
T  48547009 tttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggg--tcaaatagttcatggataccact 48546912  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 254  Q
    |||||||||||||         |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  48546911 taaaaatgtgctt---------atgtgtattgattggggtaaattatccaccattcttccatggataccctagttgtca 48546842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Original strand, 25641648 - 25641820
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||               
T  25641648 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca----------- 25641736  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| |||||||    
T  25641737 taaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccttt 25641820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 42589832 - 42590003
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  42589832 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 42589922  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||    
T  42589923 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacctt 42590003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 54401189 - 54401360
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  54401189 tttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 54401279  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  54401280 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctaattgccacctt 54401360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 33550582 - 33550464
Alignment:
Q  141 tgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatggg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  33550582 tgttggtggggttaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgaa 33550483  T
Q  241 taccctaattgtcaccttt 259  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  33550482 taccctagttgtcaccttt 33550464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 259
Target Start/End: Original strand, 52864550 - 52864674
Alignment:
Q  134 agcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctt 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  52864550 agcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggtt-gagtaaattacccaccattctt 52864648  T
Q  234 ccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  52864649 ccatgggtaccctagttgtcaccttt 52864674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 30251670 - 30251499
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  30251670 tttttctagactacctttgaaaaatggtgggtaatttactcaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacc 30251571  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||| |||           |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30251570 taaaaaggtg-----------aatgttcattggttgggctaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacctt 30251499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 51415971 - 51416142
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||          
T  51415971 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtat------ 51416064  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
         ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  51416065 -----atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 51416142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 265
Target Start/End: Original strand, 45058885 - 45059063
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  45058885 tttttttaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 45058975  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttatttat 265  Q
      || ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||||| |||| |||||    
T  45058976 --aatatgtgcttatgttgctaatgtatattgattggggtaaattacccatcattctttcatgggcagcctagttgtcaactttttttat 45059063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 54707389 - 54707219
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  54707389 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 54707299  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  54707298 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacct 54707219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 34279890 - 34279721
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  34279890 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 34279800  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||| ||||    
T  34279799 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccacc 34279721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 38156801 - 38156632
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  38156801 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 38156711  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  38156710 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 38156632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 47511109 - 47510940
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  47511109 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 47511019  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  47511018 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 47510940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 255
Target Start/End: Original strand, 51143819 - 51143987
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||     
T  51143819 tttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaatatagtttatggataccacc 51143918  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 255  Q
    |||||| |||           ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  51143919 taaaaaggtg-----------aatgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcac 51143987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 55000347 - 55000175
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||             
T  55000347 tttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatg--------- 55000257  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  55000256 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccttt 55000175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 220
Target Start/End: Original strand, 37758931 - 37759075
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||| |||||||||    
T  37758931 tttttctagattgcttttgaagaatggtgaataatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatgaagtcaagatagttcatagataccact 37759030  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaatt 220  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37759031 taaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 37759075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 31286962 - 31286791
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  31286962 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 31286872  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
      || ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| |||| ||| |||| ||||||||||    
T  31286871 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctttcatgagtagcctagttgtcacctt 31286791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 39141295 - 39141117
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||          
T  39141295 tttttctaaattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat------ 39141202  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttattta 264  Q
       | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| || |||||||| ||||    
T  39141201 ---atatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccatcattctttcat-ggtaacctagttatcaccttttttta 39141117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 41635969 - 41635798
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  41635969 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 41635879  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  41635878 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaatctagttgtcacctt 41635798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 24688116 - 24688285
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||             
T  24688116 tttttctaaattacctttgaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg--------- 24688206  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24688207 --aatatgtgtttatgtggctaatgtctactggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtaacctagttgtcacc 24688285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 41882160 - 41882063
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  41882160 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 41882063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 50732085 - 50731914
Alignment:
Q  74 ggtttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 173  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  50732085 ggtttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggatacca 50731986  T
Q  174 cttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      |||||  |||           |||||   |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50731985 tctaaaacggtg-----------aatgttcgttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 50731914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 256
Target Start/End: Original strand, 50780771 - 50780942
Alignment:
Q  74 ggtttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 173  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  50780771 ggtttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggatacca 50780870  T
Q  174 cttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      |||||  |||           |||||   |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50780871 tctaaaacggtg-----------aatgttcgttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 50780942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 42998957 - 42998790
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  42998957 tttttctagattacctttgaaaa-tggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgatcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacc 42998859  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 255  Q
    |||||| |||           ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||    
T  42998858 taaaaaggtg-----------aatgcttattggttgggataaattacccaccatttttccatgagtaccttagttgtcac 42998790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21597317 - 21597147
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||      
T  21597317 tttttctagattacctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccaac 21597218  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||| |||           ||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || |||||||||    
T  21597217 taaaaaggtg-----------aatgtttattggtttgggtaaattatccactatttttccatgggtactttagttgtcacct 21597147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 37028725 - 37028894
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| || ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||             
T  37028725 tttttttaaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggagtcaagatagttcatg--------- 37028815  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  37028816 --aatatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 37028894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 43176907 - 43176738
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| ||||||  || ||||||||| |||||||||||     
T  43176907 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtgatgtcaagatagtttatggataccacc 43176808  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||| |||            |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  43176807 taaaaaggtg-----------gatgtttattggttgggataaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtcacc 43176738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 51224206 - 51224038
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  51224206 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaa-caataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 51224117  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||| ||| ||||    
T  51224116 --aatatgtgcttatgtgactaatatatattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggtagcctagttgccacc 51224038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 76 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 2228104 - 2227995
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| ||||    
T  2228104 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggaaatttaccgatcaaccaatgaaaataagcaatttattggtgaggtcaagatagttcatagatatcact 2228005  T
Q  176 taaaaatgtg 185  Q
    | ||||||||    
T  2228004 tcaaaatgtg 2227995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 76 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17665693 - 17665549
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  17665693 tttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 17665603  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattc 231  Q
      || || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17665602 --aatatatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattc 17665549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 242
Target Start/End: Original strand, 40022076 - 40022231
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  40022076 tttttctaaattacctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 40022166  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 242  Q
      || ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  40022167 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgggta 40022231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Original strand, 47182049 - 47182127
Alignment:
Q  123 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  47182049 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgt 47182127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 28576281 - 28576184
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 173  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28576281 tttttctagattacctttgaagtatgatgggtaatttacccatcaaccgatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 28576184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 40165654 - 40165822
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||     
T  40165654 tttttctaaattatctttgaaaaataatgg-taatttacccaccaagcaatcataatgagtaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacc 40165752  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  40165753 taaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtaccctggttgtcacc 40165822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 48726167 - 48726070
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 173  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | || |||| |||||||||||||||    
T  48726167 tttttctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaataagcaatttattggtagagtcaagacagttcatggatacca 48726070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 150
Target Start/End: Original strand, 52434141 - 52434216
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaa-tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  52434141 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaattttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggg 52434216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 47402911 - 47402810
Alignment:
Q  83 agattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaat 182  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  47402911 agattacctttaaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccatttaaaaat 47402813  T
Q  183 gtg 185  Q
    |||    
T  47402812 gtg 47402810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 150
Target Start/End: Original strand, 48752087 - 48752161
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 150  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  48752087 tttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgtgcaatttattggtggg 48752161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 44946098 - 44946014
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatag 160  Q
    ||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  44946098 tttttttaaattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatag 44946014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 177163 - 177333
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||| ||||| |||||||| | |||||| || |||||||| ||     
T  177163 tttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttagtcaccaaccaatcataacgagtaatttattggtgggatcaagatactttatggatacaacc 177262  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||| |||           ||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  || |||| |||||||||    
T  177263 taaaaaggtg-----------aatgtttattggttggagcaaattacccaccatttttccatgaatatcctagttgtcacct 177333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 185
Target Start/End: Original strand, 41609098 - 41609178
Alignment:
Q  105 ggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 185  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  41609098 ggtaatttacctaccaactaatgaaaatgagcaatttattagtggagttaaaatagttcatggatactacctaaaaatgtg 41609178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 52756214 - 52756067
Alignment:
Q  102 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggc----ta 197  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||           || ||||||||| |||||    ||    
T  52756214 gtgggttatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggctaatta 52756126  T
Q  198 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  52756125 atgtgtattggtttgggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 52756067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 48534082 - 48534005
Alignment:
Q  181 atgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||    
T  48534082 atgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacctt 48534005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8847829 - 8847718
Alignment:
Q  74 ggtttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 173  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||| |||  ||||||||  |||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| | || |||||||| | ||||||    
T  8847829 ggtttttttaaattacctttgaagaatagtgtataatttacataccaactaataaaaatgaacaatttattggtgggatcaaaatagttcacgaatacca 8847730  T
Q  174 cttaaaaatgtg 185  Q
    ||||||||||||    
T  8847729 cttaaaaatgtg 8847718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 30429314 - 30429226
Alignment:
Q  169 taccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| | ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  30429314 taccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatatgtattaattgggataaattatccaccattcttccgtaggtaccctagttgtcacct 30429226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 126
Target Start/End: Original strand, 37741437 - 37741487
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 126  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37741437 tttttttagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 37741487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 258
Target Start/End: Original strand, 40688431 - 40688485
Alignment:
Q  204 attggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  40688431 attggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacctt 40688485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 44946010 - 44945933
Alignment:
Q  181 atgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||  || ||||||| |||| ||| |||| ||||||||||    
T  44946010 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcatcattctttcatgcgtagcctagttgtcacctt 44945933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 465 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 20519350 - 20519279
Alignment:
Q  465 attttcatctaaagaacatcaaacttctccatctccttcatttcacatgtgatctccattttctttgttcca 536  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20519350 attttcatctcaagaacgtcaaatttcttcatctctttcattaaacatgtgatctccatctcctttgttcca 20519279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 51942585 - 51942543
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccac 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  51942585 tttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccac 51942543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 465 - 534
Target Start/End: Original strand, 39341220 - 39341289
Alignment:
Q  465 attttcatctaaagaacatcaaacttctccatctccttcatttcacatgtgatctccattttctttgttc 534  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  39341220 attttcatcttaagaatatcaaactttttcatctccttcattcaacatgagatctccatttacttcgttc 39341289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 41882053 - 41882010
Alignment:
Q  214 gtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41882053 gtaaattatccaccattcttccacgggtaccctagttgtcacct 41882010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 465 - 540
Target Start/End: Original strand, 46303391 - 46303465
Alignment:
Q  465 attttcatctaaagaacatcaaacttctccatctccttcatttcacatgtgatctccattttctttgttccataat 540  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  46303391 atttttatctatagagcatcaaacttcttcatcttctttattcaacatgtgatctcca-tttctttgttctataat 46303465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 247
Target Start/End: Original strand, 52434291 - 52434341
Alignment:
Q  197 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 247  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  52434291 aatgtttattggttggagtaaattacccaccatttttctataggtacccta 52434341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 247
Target Start/End: Original strand, 37760346 - 37760378
Alignment:
Q  215 taaattacccaccattcttccatgggtacccta 247  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37760346 taaattacccaccattcttccataggtacccta 37760378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 465 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 42091845 - 42091793
Alignment:
Q  465 attttcatctaaagaacatcaaacttctccatctccttcatttcacatgtgat 517  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  42091845 attttcatctcaaaaacatcaaactttttcatctctttcatttaacatgtgat 42091793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 118)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 65 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17995143 - 17994941
Alignment:
Q  65 tttatttatggttttt-ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttc 163  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  17995143 tttatttatggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattc 17995044  T
Q  164 atggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttattt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17995043 atggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttggcacctttattt 17994944  T
Q  264 ata 266  Q
    |||    
T  17994943 ata 17994941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 31308003 - 31308185
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31308003 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 31308102  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31308103 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 31308185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 45538155 - 45538335
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45538155 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 45538254  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45538255 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 45538335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 76 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4068863 - 4068692
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4068863 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 4068764  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4068763 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 4068692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 44661972 - 44662154
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  44661972 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 44662071  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44662072 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 44662154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 3611138 - 3611318
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3611138 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 3611237  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3611238 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 3611318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 76 - 260
Target Start/End: Original strand, 5981172 - 5981356
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5981172 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 5981271  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttta 260  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5981272 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttta 5981356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21139592 - 21139412
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21139592 tttttctagattacctttgaagtatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 21139493  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21139492 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 21139412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 76 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25678439 - 25678247
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25678439 tttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 25678340  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttatttatatg 268  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  25678339 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcaccattaattatatg 25678247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 74 - 254
Target Start/End: Original strand, 43251711 - 43251891
Alignment:
Q  74 ggtttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 173  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  43251711 ggtttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggatacca 43251810  T
Q  174 cttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 254  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43251811 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 43251891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 76 - 266
Target Start/End: Original strand, 31040711 - 31040901
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31040711 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 31040810  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttatttata 266  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31040811 taaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattattccatgggtaccctagttgtcacctttagttata 31040901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 25058690 - 25058870
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  25058690 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaatagttcatggataccact 25058789  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25058790 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 25058870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Original strand, 26277179 - 26277367
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26277179 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 26277278  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttattta 264  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  26277279 taaaaatttgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccattattta 26277367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6327727 - 6327545
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6327727 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 6327628  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    ||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6327627 taaaaatgtgctta-ttgactaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcaccttt 6327545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Original strand, 23984757 - 23984940
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23984757 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 23984856  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23984857 taaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttt 23984940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 33884090 - 33884271
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  33884090 tttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccatt 33884189  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33884190 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtcacct 33884271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 33960162 - 33959981
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  33960162 tttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccatt 33960063  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33960062 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtcacct 33959981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 38790377 - 38790196
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  38790377 tttttctagattacctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccact 38790278  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38790277 taaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 38790196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 41999817 - 41999998
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41999817 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccact 41999916  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  41999917 taaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacct 41999998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24245205 - 24245025
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24245205 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 24245106  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24245105 taaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 24245025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 76 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 49254155 - 49253964
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  49254155 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccact 49254056  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttatttatat 267  Q
    ||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||    
T  49254055 taaaaatgtgcttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaattatcaccttaaattatat 49253964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23932689 - 23932507
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23932689 tttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggacaccact 23932590  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23932589 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatcagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 23932507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 68 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26085586 - 26085398
Alignment:
Q  68 atttatggttttt-ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatg 166  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26085586 atttaaggtttttactagattacctt-gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 26085488  T
Q  167 gataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26085487 aataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26085398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 39646570 - 39646751
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  39646570 tttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataggtcatggataccact 39646669  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39646670 taaaaatgtgcttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 39646751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 33112997 - 33112818
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33112997 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 33112898  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  33112897 taaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcat-ggtaccctagttgtcacc 33112818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 37620372 - 37620192
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37620372 tttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 37620273  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  37620272 taaaaatgtccttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgtgtaccctagttgtcacc 37620192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 47671588 - 47671768
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47671588 tttttctagattacctttgaagaatggtggataatttaccgaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccact 47671687  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47671688 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47671768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 36566332 - 36566512
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36566332 tttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatatattcaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 36566431  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36566432 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 36566512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 46784425 - 46784605
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||    
T  46784425 tttttctagattacctttgaggaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggagaagtaaagatagttcatggataccact 46784524  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46784525 taaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctaattgtcacc 46784605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 76 - 255
Target Start/End: Original strand, 3285404 - 3285582
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3285404 tttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 3285503  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 255  Q
    | |||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3285504 t-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 3285582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Original strand, 24885503 - 24885686
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24885503 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 24885602  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    ||||||| || ||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  24885603 taaaaatatgtttatgtggataatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcaccttt 24885686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 26525069 - 26524887
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  26525069 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatagataccact 26524970  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26524969 taaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccactattcttccatggataccctagttgtcacctt 26524887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 38332039 - 38331857
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  38332039 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcact 38331940  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38331939 taaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacctt 38331857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 50774219 - 50774400
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50774219 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 50774318  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    ||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50774319 taaaaatatgcttatgtgaccaatgtgtattggttgggataaattacccacctttcttccatgggtaccctagttgtcacct 50774400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 5980070 - 5980250
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  5980070 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccact 5980169  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||    
T  5980170 taaaaattagcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctagctgtcacc 5980250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 252
Target Start/End: Original strand, 26794306 - 26794482
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26794306 tttttttaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccact 26794405  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgt 252  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26794406 taaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgt 26794482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 46967221 - 46967041
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46967221 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 46967122  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||| ||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  46967121 taaaaatgtgcttatgtggctaatatgtatttgttaggataaattacccatcattctttcatgggtaccctagttgtcacc 46967041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 47383912 - 47383732
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47383912 tttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 47383813  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  47383812 taaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattgattgggataaattacccaccattctttcattggtaccctagttgtcacc 47383732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 49399168 - 49398988
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  49399168 tttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggagttaagatagtttatggataccact 49399069  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  49399068 taaaaatgtgtttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtatcctagttgtcacc 49398988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 35692844 - 35692661
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaattta-cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccac 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  35692844 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatcccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccgc 35692745  T
Q  175 ttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  35692744 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggatactctagttgtcacctt 35692661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 68 - 243
Target Start/End: Original strand, 42863859 - 42864034
Alignment:
Q  68 atttatggtttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatgg 167  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42863859 atttttggtttttctagactacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggtggggtcaagatagttcatgg 42863958  T
Q  168 ataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtac 243  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  42863959 atactacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtac 42864034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 76 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23221109 - 23220939
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23221109 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 23221010  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgt 252  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||      || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23221009 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg------tatccaccattcttccatgggtaccctagttgt 23220939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 46616551 - 46616732
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  46616551 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcact 46616650  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  46616651 taaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtactctaggtgtcacct 46616732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 35273598 - 35273778
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35273598 tttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 35273697  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35273698 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacacaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 35273778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 47317317 - 47317497
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  47317317 tttttttatattacctttgaagaatggtgggtaatttattcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccact 47317416  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  47317417 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttctatgggtaccctagttgtcacc 47317497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 51057073 - 51057253
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  51057073 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagatcatggataccact 51057172  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51057173 taaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattagttgaggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 51057253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 76 - 228
Target Start/End: Original strand, 31844378 - 31844530
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  31844378 tttttctagattacctttgaggaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccact 31844477  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccacca 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31844478 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 31844530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Original strand, 47187107 - 47187290
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  47187107 tttttctagattacctttgaagattgatgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccact 47187206  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  47187207 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattatccaccattctttcatgggtaccgtagttgtcaccttt 47187290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 76 - 253
Target Start/End: Original strand, 28888583 - 28888760
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28888583 tttttctagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 28888682  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtc 253  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  28888683 taaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtc 28888760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 76 - 212
Target Start/End: Original strand, 25518816 - 25518952
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25518816 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 25518915  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttgg 212  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25518916 taaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 25518952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Original strand, 36003132 - 36003318
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36003132 tttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttactggtggggtcaagatagttcatggataccact 36003231  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttc---catgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||    
T  36003232 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcggataaattacccaccattcttctttcataggtaccctagttgtcaccttt 36003318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 48373506 - 48373679
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48373506 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcagtttattggtggggtcaagatagttcatggataccact 48373605  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||         |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  48373606 taaaaatgtgctt---------atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccttagttgtcacctt 48373679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 42313545 - 42313359
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgg----gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatac 171  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||  ||||    
T  42313545 tttttctagattatctttgaagaatggtggatatataatttacccaccaaccaatgaaaatgagaaatttattggtggagtcaagatagttcattaatac 42313446  T
Q  172 cacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  42313445 cacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 42313359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 33073213 - 33073384
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||             
T  33073213 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg--------- 33073303  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
      || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33073304 --aatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 33073384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27983767 - 27983603
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||| |    
T  27983767 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggg----------------ataccatt 27983684  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27983683 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27983603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 10928069 - 10928240
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||             
T  10928069 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatg--------- 10928159  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  10928160 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacctt 10928240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Original strand, 2450529 - 2450676
Alignment:
Q  109 atttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  2450529 atttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgg 2450628  T
Q  209 ttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  2450629 ttggggtaaattacctatcattcttccatgggtatcctagttgtcacc 2450676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 51403187 - 51403034
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51403187 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 51403088  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 239  Q
    | |||||||||||         || | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  51403087 t-aaaatgtgctt---------atatgtattggttgggataaattactcaccattcttccatgg 51403034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Original strand, 2954857 - 2955034
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2954857 tttttctagattacctttgacaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagttaatggataccact 2954956  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttattta 264  Q
    |||||| |||           | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2954957 taaaaaggtg-----------attgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcaccttttttta 2955034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 26685858 - 26686029
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||     
T  26685858 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccacc 26685957  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||| |||           ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26685958 taaaaaagtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacctt 26686029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 68 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 45476022 - 45475866
Alignment:
Q  68 atttatggtttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatgg 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  45476022 atttatggtttttctagattacctttgaagaatggt--------tacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttgatgg 45475931  T
Q  168 ataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctt 233  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45475930 ataccacttacaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccattctt 45475866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 41467801 - 41467632
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  41467801 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 41467711  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  41467710 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 41467632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 115 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 51045737 - 51045596
Alignment:
Q  115 ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttgggg 214  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  51045737 ccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagtttatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattaggg 51045638  T
Q  215 taaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||    
T  51045637 taaattacccaccattcttctacgggtatcctagttgtcacc 51045596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 74 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31980117 - 31980002
Alignment:
Q  74 ggtttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 173  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  31980117 ggtttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgttagggtcaagatagttcatggatacca 31980018  T
Q  174 cttaaaaatgtgctta 189  Q
    ||||||||||| ||||    
T  31980017 cttaaaaatgtcctta 31980002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 2657305 - 2657474
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  2657305 tttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 2657395  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  2657396 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 2657474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 128 - 258
Target Start/End: Original strand, 4808699 - 4808829
Alignment:
Q  128 aaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccacc 227  Q
    ||||||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4808699 aaaatgaacaatttattgatagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 4808798  T
Q  228 attcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4808799 attcttccatggataccctagttgtcacctt 4808829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 38716416 - 38716247
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||     
T  38716416 tttttctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggataccacc 38716317  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  38716316 taaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtacccttgttgtcacc 38716247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 256
Target Start/End: Original strand, 1388476 - 1388644
Alignment:
Q  77 ttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccactt 176  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  1388476 ttttctagattacatttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcatgatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccacct 1388575  T
Q  177 aaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||| |||           ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  1388576 aaaaaggtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 1388644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 6626193 - 6626025
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  6626193 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 6626103  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 255  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  6626102 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 6626025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26472348 - 26472175
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  26472348 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 26472258  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttta 260  Q
      || ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||    
T  26472257 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtcttggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttaccaccttta 26472175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Original strand, 29770672 - 29770849
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  29770672 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 29770762  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttattta 264  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||| ||| |||||| |||||    
T  29770763 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtagcctagttgccaccttaattta 29770849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 259
Target Start/End: Original strand, 4953058 - 4953226
Alignment:
Q  80 tctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaa 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||           ||    
T  4953058 tctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aa 4953146  T
Q  180 aatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
     ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  4953147 tatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtcaccttt 4953226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 30290078 - 30289910
Alignment:
Q  77 ttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccactt 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||              
T  30290078 ttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccagtgaatatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatg---------- 30289989  T
Q  177 aaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
     || ||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  30289988 -aatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattatccaccattcttccatgagtaccttagttgtcacc 30289910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2557026 - 2556879
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2557026 tttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccactaactaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaagatagttcatgaataccact 2556927  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattct 232  Q
    |||||||||| ||         |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2556926 taaaaatgtgttt---------atgtgtattggttggggtaaattacccactattct 2556879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 5961436 - 5961266
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||     
T  5961436 tttttctagattacttttgaaaaatggtggataatttacccaccaacaaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccacc 5961337  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||| |||           ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5961336 taaaaaggtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtcacct 5961266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 124 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 47772304 - 47772169
Alignment:
Q  124 aatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacc 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||| ||  |||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  47772304 aatgaaaataagcaatttgttggtagggtcaaaatagtttatatataccatttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtatattggttggagtaaattaca 47772205  T
Q  224 caccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47772204 caccattcttccatgggtaccttaattgtcaccttt 47772169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 10920202 - 10920371
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  10920202 tttttctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacc 10920301  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| || ||||||||    
T  10920302 taaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattaccgaccatttttccatggataccttagttgtcacc 10920371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 163 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13312624 - 13312531
Alignment:
Q  163 catggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  13312624 catggataccacttaaatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 13312531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34752483 - 34752323
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||             
T  34752483 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaaataaaatgagcaatttatttgtgggcttaagatagttcatg--------- 34752393  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 247  Q
      || ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  34752392 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtaaccta 34752323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 42234842 - 42235012
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  42234842 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 42234932  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
      || ||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  42234933 --aatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 42235012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4243659 - 4243490
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| |||             
T  4243659 tttttctaaattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagtttatg--------- 4243569  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||  ||| ||||||||    
T  4243568 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggatggggtaaattacccataattctttcatgggtagtctagttgtcacc 4243490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 76 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27924827 - 27924674
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||     
T  27924827 tttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccacc 27924728  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatggg 240  Q
    |||||| |||           ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  27924727 taaaaaggtg-----------aatggttattggttggggtaaattacccaccattttttcatggg 27924674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13313345 - 13313249
Alignment:
Q  76 tttttctagatta--cctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggata 170  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13313345 tttttctagattatacctttgaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggata 13313249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 52323940 - 52324110
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||| || ||| |||||||     
T  52323940 tttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagataatttatgaataccacc 52324039  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||| |||           |||||  |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  52324040 taaaaaggtg----------aaatgttcattgattggagtaaattacccaccaatcttccatgggtaccctagttgtcacc 52324110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 33187342 - 33187505
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||| || |||||||||    
T  33187342 tttttctagattatctttaaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggttggatcaagatagtttatagataccact 33187441  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||| ||                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33187442 taaaaatatg-----------------tattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 33187505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 86 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 48683489 - 48683330
Alignment:
Q  86 ttacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 185  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||  ||    
T  48683489 ttacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaagatg 48683390  T
Q  186 cttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
               ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  48683389 -----------aatgtttattggttgggataaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 48683330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 39475951 - 39475783
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||     
T  39475951 tttttctagagtacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggt-gggtcaagatagtttatggataccacc 39475853  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||||           || || ||||||||||| ||||| ||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  39475852 taaaaatgtg-----------aacgtttattggttgggataaataacccatcattttttcatgggtaccctagttgtcacc 39475783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 257
Target Start/End: Original strand, 4156438 - 4156577
Alignment:
Q  125 atgaaaatgagcaatttgttggtggggttaaga-------tagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaa 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||       ||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4156438 atgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagactcaatatagtttatggataccacttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaa 4156537  T
Q  218 attacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  4156538 attacccatcatttttccatgggtactctagttgtcacct 4156577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 76 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24649891 - 24649802
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  24649891 tttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagttatttattggtggggtcaagatagttcat 24649802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 76 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 51155758 - 51155606
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| || |||||||||||||             
T  51155758 tttttctaaattacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggagtcaagatagttcatg--------- 51155668  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 239  Q
      || ||||| ||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51155667 --aatatgtgtttatgtgactaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgg 51155606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7561711 - 7561528
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaa-gatagttcatggataccac 174  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |    | ||  |||   |    
T  7561711 tttttctaaattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaattacccataatttatagttc 7561612  T
Q  175 ttaaaaatgtgcttacgt--ggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
     | || ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7561611 atgaatatgtgcttacgtggggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacc 7561528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 166
Target Start/End: Original strand, 32448648 - 32448740
Alignment:
Q  74 ggtttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatg 166  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  32448648 ggtttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 32448740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 41895333 - 41895164
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||| ||| ||||||||||||| |||         
T  41895333 tttttctaaattacctttaaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaataacaattagcaatttatttgtgaggtcaagatagttcatgaata----- 41895239  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
          |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  41895238 ------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 41895164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 76 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 46428422 - 46428332
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatg 166  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  46428422 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccagcaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaagatagttcatg 46428332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 76 - 260
Target Start/End: Original strand, 52367885 - 52368058
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||     
T  52367885 tttttctggattacctttaaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccacc 52367984  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttta 260  Q
    |||||| |||           ||||| ||||| ||  | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  52367985 taaaaaggtg-----------aatgtttattgatttagataaattacccatcatttttccataggtaccctagttgtcaccttta 52368058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 44544215 - 44544125
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatg 166  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  44544215 tttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 44544125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13281731 - 13281588
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||| || ||||||||||             
T  13281731 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgacaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg--------- 13281641  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccatt 230  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  13281640 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcatt 13281588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 173
Target Start/End: Original strand, 39637902 - 39637996
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttc-atggatacca 173  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  39637902 tttttctagattacctatgaagaatggtgggtaatttaccc----accaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaatggatacca 39637996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 44293615 - 44293453
Alignment:
Q  85 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 184  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||           || ||||    
T  44293615 attacctttgaagaatagtaggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 44293527  T
Q  185 gcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
     |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||| || |||| ||| ||||||    
T  44293526 acttatgtggctaatatatattagttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgccacctt 44293453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 4156245 - 4156188
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 133  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4156245 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 4156188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 35991770 - 35991678
Alignment:
Q  74 ggtttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatg 166  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  35991770 ggtttttttaaattacctttgaagaattgtgggtaatttatccaccaacaattgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 35991678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 10919363 - 10919313
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10919363 tttttctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 10919313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 465 - 543
Target Start/End: Original strand, 52432682 - 52432760
Alignment:
Q  465 attttcatctaaagaacatcaaacttctccatctccttcatttcacatgtgatctccattttctttgttccataatcga 543  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  52432682 attttcatctcaagaacattaaacttcttcatctccttcatttaacaagtgatctccatctaatttgttctataatcga 52432760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31286612 - 31286504
Alignment:
Q  137 aatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttcca 236  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  31286612 aatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttcta 31286524  T
Q  237 tgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  31286523 tgggtaccctagttgtcacc 31286504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 543
Target Start/End: Original strand, 68129 - 68196
Alignment:
Q  476 aagaacatcaaacttctccatctccttcatttcacatgtgatctccattttctttgttccataatcga 543  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||| ||||||    
T  68129 aagaacatctaacttcttcatctccttcatttaacatgtgatctccatctttttcgttccaaaatcga 68196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 38718242 - 38718157
Alignment:
Q  181 atgtgcttacgtggctaatgtatattggttggg-gtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc-tttatttat 265  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  38718242 atgtgcttatgtggctaatgtatatcggttgggagtaaattacccatcattctttcat-ggtagcctagttgtcaccatttatttat 38718157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9779982 - 9779919
Alignment:
Q  166 ggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccatt 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||||||||    
T  9779982 ggataccacttaaaaatgtgtttacgtggctaatatatatttgtt-gggttaattagccaccatt 9779919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 219 - 258
Target Start/End: Original strand, 31844818 - 31844857
Alignment:
Q  219 ttacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31844818 ttacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 31844857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 464 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 38839716 - 38839637
Alignment:
Q  464 aattttcatctaaagaacatcaaacttctccatctccttcatttcacatgtgatctccattttctttgttccataatcga 543  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||  || ||||| |||||| ||||||    
T  38839716 aattttcatctcaagaacatcaaacctcttcatcttcttcattcgacatgtgatcttgatcttcttcgttccacaatcga 38839637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 465 - 543
Target Start/End: Original strand, 10775038 - 10775116
Alignment:
Q  465 attttcatctaaagaacatcaaacttctccatctccttcatttcacatgtgatctccattttctttgttccataatcga 543  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||| | |||  ||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10775038 attttcatctccagaacatcaaatttcttcgtctgtttcattcaacatgtgatcttcattttcttcgttccataatcga 10775116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 253
Target Start/End: Original strand, 32448757 - 32448807
Alignment:
Q  203 tattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||    
T  32448757 tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 32448807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 115
Target Start/End: Original strand, 12891394 - 12891440
Alignment:
Q  69 tttatggtttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacc 115  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12891394 tttaaggtttttctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacc 12891440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 233
Target Start/End: Original strand, 24215873 - 24215911
Alignment:
Q  195 ctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctt 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24215873 ctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 24215911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 237
Target Start/End: Original strand, 39359502 - 39359544
Alignment:
Q  195 ctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccat 237  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39359502 ctaatgtgtattggttggggtaaattacccacaattattccat 39359544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 166
Target Start/End: Original strand, 24215806 - 24215855
Alignment:
Q  117 accaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatg 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || || | |||||||||||||    
T  24215806 accaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatg 24215855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 31286644 - 31286607
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaattta 113  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  31286644 tttttctagattacttttaaaaaatggtgggtaattta 31286607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 465 - 522
Target Start/End: Original strand, 46080992 - 46081049
Alignment:
Q  465 attttcatctaaagaacatcaaacttctccatctccttcatttcacatgtgatctcca 522  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||| |||||||    
T  46080992 attttcatctcaagaacattaaacttcttcatctccttcactcaacatgtaatctcca 46081049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 44544107 - 44544055
Alignment:
Q  195 ctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 247  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  44544107 ctaatgtatattagttagggtaaattatccatcattctttcatgggtagccta 44544055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 82)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6594638 - 6594455
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6594638 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 6594539  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6594538 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcaccttt 6594455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 4034593 - 4034775
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4034593 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 4034692  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4034693 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 4034775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 17600837 - 17601019
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17600837 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 17600936  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17600937 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 17601019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 74 - 256
Target Start/End: Original strand, 23901778 - 23901960
Alignment:
Q  74 ggtttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 173  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23901778 ggtttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 23901877  T
Q  174 cttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23901878 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23901960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 746467 - 746647
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  746467 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 746566  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  746567 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 746647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 38997102 - 38997282
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38997102 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 38997201  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  38997202 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 38997282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 69 - 258
Target Start/End: Original strand, 34518361 - 34518550
Alignment:
Q  69 tttatggtttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatgga 168  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34518361 tttatgttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgga 34518460  T
Q  169 taccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34518461 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 34518550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 76 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 2325069 - 2324885
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2325069 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 2324970  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttta 260  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  2324969 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcaccttta 2324885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 10244762 - 10244582
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10244762 tttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 10244663  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10244662 taaaaatgtgcttatgtagctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 10244582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 45370991 - 45371171
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45370991 tttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaagatagttcatggataccact 45371090  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45371091 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 45371171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 14660447 - 14660628
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14660447 tttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 14660546  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  14660547 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacct 14660628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27651214 - 27651033
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27651214 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgcccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 27651115  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27651114 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 27651033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 40635219 - 40635400
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40635219 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 40635318  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  40635319 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacct 40635400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 11184973 - 11185153
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11184973 tttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 11185072  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11185073 taaaaatgtgcttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 11185153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13815398 - 13815218
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13815398 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 13815299  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  13815298 taaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacctttctttcatgggtaccctagttgtcacc 13815218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 26710346 - 26710526
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26710346 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcattttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 26710445  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26710446 taaaaatgtgcttatgtggctgatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 26710526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 76 - 247
Target Start/End: Original strand, 6430474 - 6430645
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6430474 tttttctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 6430573  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6430574 taaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 6430645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 253
Target Start/End: Original strand, 10424596 - 10424773
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10424596 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 10424695  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtc 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10424696 taaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 10424773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 27400404 - 27400584
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27400404 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 27400503  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27400504 taaaaatgtacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 27400584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1092131 - 1091948
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1092131 tttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 1092032  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1092031 taaaaatgtgtttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcaccttt 1091948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 33427827 - 33427644
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33427827 tttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 33427728  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  33427727 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacacaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttt 33427644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 5726130 - 5726310
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  5726130 tttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggttaccact 5726229  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||| |||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5726230 taaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 5726310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 32327362 - 32327542
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  32327362 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccagccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 32327461  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32327462 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattcttccataggtaccctagttgtcacc 32327542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 71 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 7892873 - 7892686
Alignment:
Q  71 tatggtttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggata 170  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  7892873 tatgttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaatatagttcatggata 7892774  T
Q  171 ccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  7892773 ccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatagataccctagttgtcacctt 7892686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 76 - 263
Target Start/End: Original strand, 27024416 - 27024603
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27024416 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccact 27024515  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttattt 263  Q
    ||||||| || ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27024516 taaaaatatgattatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccattattcttccatgggtaccctagttgtcaccttaattt 27024603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 4609627 - 4609807
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4609627 tttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaataagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 4609726  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4609727 taaaaatgtgcttatgtgcctaatgtgtattggttggggtaaattatccaacattcttccatgggtaccctagttgtcacc 4609807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 40735465 - 40735645
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  40735465 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccact 40735564  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40735565 taaaaatgtacttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattcttccatgagtaccctaattgtcacc 40735645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 89 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 32856603 - 32856434
Alignment:
Q  89 cctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctt 188  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32856603 cctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtgggatcaagatagttcatggataccacttacaaatgtgctt 32856504  T
Q  189 acgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  32856503 atgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 32856434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2914318 - 2914138
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  2914318 tttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccact 2914219  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  2914218 taaaaatgtgcttatgtggctgatgtgtatcggttgaggtaaattacccaccattcttccatggatatcctagttgtcacc 2914138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14697717 - 14697537
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  14697717 tttttttagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgtgatcaagatagttcatggataccact 14697618  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14697617 taaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 14697537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 32948447 - 32948626
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  32948447 tttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-agttcatggataccact 32948545  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  32948546 taaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattcttctatgggtactctagttgtcacc 32948626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 78 - 256
Target Start/End: Original strand, 11159625 - 11159802
Alignment:
Q  78 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccactta 177  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11159625 tttcttgattacctttgaaaaatggtgg-taatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatgccactta 11159723  T
Q  178 aaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  11159724 aaaatgtgtttatgtggctattgtgtattggatggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 11159802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 40037144 - 40037325
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40037144 tttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 40037243  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  40037244 taaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcatt-tttcatgggtaccctagttgtcacctt 40037325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 37621050 - 37620867
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtt---aagatagttcatggatacc 172  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  37621050 tttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtactcaagatagttcatggatacc 37620951  T
Q  173 acttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  37620950 acttaaaaatgtgcttatgtggcttatgtgtattggtttggataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 37620867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 76 - 230
Target Start/End: Original strand, 32608381 - 32608535
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  32608381 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagttcatgtataccact 32608480  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccatt 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  32608481 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccatt 32608535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 37255512 - 37255336
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  37255512 tttttctagattacctttgaagaatgg-----aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 37255418  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  37255417 taaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacct 37255336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 9444684 - 9444875
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttac-------ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatgga 168  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  9444684 tttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttaccaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggggtcaagatagttcatgga 9444783  T
Q  169 taccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccacc---attcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  9444784 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattattcttccatggataccctagttgtcacct 9444875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 76 - 270
Target Start/End: Original strand, 15925081 - 15925275
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15925081 tttttctagattacctttcaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagtaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccact 15925180  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttatttatatgct 270  Q
    ||||||| |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||| || ||| || |||||| |||||    
T  15925181 taaaaatatgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcattctttcatagataccctagttatcatctatatttaaatgct 15925275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 76 - 255
Target Start/End: Original strand, 12842104 - 12842278
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |    
T  12842104 tttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggagtcaagatagttcttggataccaat 12842203  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 255  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     ||| |||||||||||||||||    
T  12842204 taaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccat-----cataggtaccctaattgtcac 12842278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 76 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8433096 - 8432942
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8433096 tttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacctgccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccact 8432997  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccatt 230  Q
    | ||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8432996 ttaaaatatacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 8432942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21735069 - 21734898
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||             
T  21735069 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgggggggtcaagatagttcatg--------- 21734979  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
      || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21734978 --aatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 21734898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 76 - 255
Target Start/End: Original strand, 39103048 - 39103216
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||             
T  39103048 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatg--------- 39103138  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 255  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39103139 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 39103216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 258
Target Start/End: Original strand, 25294886 - 25295018
Alignment:
Q  126 tgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattaccca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25294886 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25294985  T
Q  226 ccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  25294986 tcattcttccatgagtaccctagttgtcccctt 25295018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 199
Target Start/End: Original strand, 42899916 - 42900039
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42899916 tttttctagattaccttcgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 42900015  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaat 199  Q
    |||||||| ||||| |||||||||    
T  42900016 taaaaatgcgcttatgtggctaat 42900039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Original strand, 44481829 - 44482001
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  44481829 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacc 44481928  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||| |||           || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  44481929 taaaaaggtg-----------aaagtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctggttgtcaccttt 44482001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 264
Target Start/End: Original strand, 1229675 - 1229817
Alignment:
Q  123 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattac 222  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1229675 caatgaaaatgaacaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatctggctaatatatattggttgggataaattac 1229774  T
Q  223 ccaccattcttccatggg-taccctaattgtcacctttattta 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||    
T  1229775 ccaccattcttccatgggttacccaagttgtcacctctattta 1229817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Original strand, 41172457 - 41172605
Alignment:
Q  74 ggtttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 173  Q
    ||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||  | |||||    
T  41172457 ggtttttttaaattacatttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcaaaggtacca 41172556  T
Q  174 cttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattac 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41172557 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 41172605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 35158219 - 35158050
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  35158219 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 35158129  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  35158128 --aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 35158050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 260
Target Start/End: Original strand, 27331299 - 27331476
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||| |           
T  27331299 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaa------- 27331391  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttta 260  Q
    || | ||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  27331392 tatatatgtgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcaccttta 27331476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Original strand, 145283 - 145455
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||        
T  145283 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatac---- 145378  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
           ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| ||||    
T  145379 -------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaacttt 145455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 28641461 - 28641292
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  28641461 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 28641371  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || || || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  28641370 --aatatatgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccattattctttcatgggtagcctagttgtcacc 28641292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 29687042 - 29687211
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  29687042 tttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 29687132  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  29687133 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 29687211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 247
Target Start/End: Original strand, 35126781 - 35126941
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  35126781 tttttctagattacctttgaaaaacggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacc 35126880  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 247  Q
    |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  35126881 taaaaaggtg-----------aatgtttattggttgggataaattacccaccatttttccatagatacccta 35126941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 149 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 447740 - 447633
Alignment:
Q  149 gggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaa 248  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  447740 gggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcatccatgggtaccctag 447641  T
Q  249 ttgtcacc 256  Q
    ||||||||    
T  447640 ttgtcacc 447633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 43899139 - 43898971
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||             
T  43899139 tttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg--------- 43899049  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  43899048 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 43898971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13543784 - 13543622
Alignment:
Q  85 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 184  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||           || ||||    
T  13543784 attacttttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 13543696  T
Q  185 gcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  13543695 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 13543622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19428596 - 19428426
Alignment:
Q  76 tttttctagattacc-tttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccac 174  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||            
T  19428596 tttttctaaattaccctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttacttgtggggtcaagatagttcatg-------- 19428505  T
Q  175 ttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
       || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  19428504 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 19428426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 4258491 - 4258659
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||             
T  4258491 tttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgt-gggtcaagatagttcatg--------- 4258580  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||    
T  4258581 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcgttcatgggtagcctagttgtcacc 4258659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12333664 - 12333497
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||| ||          
T  12333664 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtat------ 12333571  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
         ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  12333570 -----atgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcat-ggtagcctagttgtcacc 12333497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 39301366 - 39301197
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  39301366 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 39301276  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || |||||||||  || ||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  39301275 --aatatgtgcttatatgactaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattctttcatggatagcctagttgtcacc 39301197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 152
Target Start/End: Original strand, 12814615 - 12814691
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggt 152  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12814615 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggt 12814691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27765031 - 27764863
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||             
T  27765031 tttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg--------- 27764941  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  27764940 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaaccatca-tctttcatgggtagcctagttgccacc 27764863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 12730062 - 12730233
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||               
T  12730062 tttttctaaattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca----------- 12730150  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||| ||||||    
T  12730151 taaatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccacctt 12730233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 149 - 236
Target Start/End: Original strand, 12827137 - 12827223
Alignment:
Q  149 gggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttcca 236  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12827137 gggttaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttcca 12827223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 2688898 - 2688727
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||| || || |||| |||||||||||||             
T  2688898 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccgattaatgaaaattagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatg--------- 2688808  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
      || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  2688807 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgtcacctt 2688727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 34249266 - 34249437
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| || |||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||             
T  34249266 tttttttaaattatctttgaagaatggtgagtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatg--------- 34249356  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
      || ||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  34249357 --aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 34249437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 166
Target Start/End: Original strand, 3266297 - 3266387
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatg 166  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||    
T  3266297 tttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 3266387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 40544245 - 40544155
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatg 166  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  40544245 tttttctaaattacctttgaagaatggtggatagtttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 40544155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28566867 - 28566707
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||             
T  28566867 tttttctaaattacttttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttctggggtcaagatagttcatg--------- 28566777  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 247  Q
      || ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  28566776 --aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagccta 28566707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28014928 - 28014856
Alignment:
Q  146 gtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaa 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28014928 gtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 28014856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 43356100 - 43356266
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  43356100 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaa---acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 43356187  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||||||||| | |||||||| | ||||||||||||  |||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  43356188 --aatatgtgcttatgtggctaatttgtattggtttgagtaaattacccatgattctttcatggttagcctagttgtcacc 43356266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2000506 - 2000339
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||               
T  2000506 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttca----------- 2000418  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||| |||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  2000417 taaatatgtgcttacgtggctcatatgtatt-gttggggtaaattactcatcattctttcat-ggtagcctagttgtcacc 2000339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 258
Target Start/End: Original strand, 3711664 - 3711805
Alignment:
Q  106 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatat 205  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||           |||||||| | ||||||||| |||    
T  3711664 gtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgcggctaatgtgtat 3711752  T
Q  206 tggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||    
T  3711753 tggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacctt 3711805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 166
Target Start/End: Original strand, 8056627 - 8056717
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatg 166  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||| || |||||||||||||    
T  8056627 tttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaactatttatttgtggagtgaagatagttcatg 8056717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 171
Target Start/End: Original strand, 30545822 - 30545917
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatac 171  Q
    ||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  30545822 tttttttagattatttttgaagaatggtggataatttacctaccaaacaataaaaatgagcaacttattggtggggtcaagatagttcgtggatac 30545917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 38985421 - 38985342
Alignment:
Q  101 ggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaa 181  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |   || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38985421 ggtgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgat-atgtcaagatagttcatggataccacctaaaaa 38985342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 28020001 - 28019959
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccac 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28020001 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccac 28019959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 10176560 - 10176625
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 141  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  10176560 tttttctagattacctttaaagaatggtgggtaacttattcaccaattaatgaaaatgagcaattt 10176625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 465 - 521
Target Start/End: Original strand, 16576269 - 16576325
Alignment:
Q  465 attttcatctaaagaacatcaaacttctccatctccttcatttcacatgtgatctcc 521  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  16576269 attttcctctcaagaacatcaaacttcttcatctccttcattcaacatgtgatctcc 16576325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 258
Target Start/End: Original strand, 42900773 - 42900837
Alignment:
Q  191 gtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  42900773 gtggctaatgtat--tggttgagataaattacccaccattcttccatgtgta-cctagttgtcacctt 42900837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 254
Target Start/End: Original strand, 3266404 - 3266455
Alignment:
Q  203 tattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 254  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  3266404 tattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaacctagttgtca 3266455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 465 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 38576991 - 38576933
Alignment:
Q  465 attttcatctaaagaacatcaaacttctccatctccttcatttcacatgtgatctccat 523  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  38576991 attttcatctaaagaacattaaagttcttcatctctttcattcaacatgtgatttccat 38576933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 163; Significance: 9e-87; HSPs: 72)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 32984257 - 32984075
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32984257 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 32984158  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32984157 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 32984075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 43328709 - 43328890
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43328709 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 43328808  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43328809 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 43328890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 10646125 - 10646305
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10646125 tttttctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 10646224  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10646225 taaaaatgttcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 10646305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24080081 - 24079901
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24080081 tttttgtagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 24079982  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24079981 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 24079901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 41862222 - 41862402
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  41862222 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcact 41862321  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41862322 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctaattgtcacc 41862402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 40435333 - 40435153
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  40435333 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccact 40435234  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  40435233 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 40435153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 33730821 - 33730638
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33730821 tttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 33730722  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33730721 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcaccttt 33730638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 76 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 37301505 - 37301326
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  37301505 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggccaaaatagttcatggataccact 37301406  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 255  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  37301405 taaaaatgtgtttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcac 37301326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Original strand, 37956423 - 37956606
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37956423 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 37956522  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||    
T  37956523 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattatttcatggataccctagttgtcaccttt 37956606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9303754 - 9303572
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9303754 tttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 9303655  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9303654 taaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 9303572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 5946049 - 5946230
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5946049 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccact 5946148  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  5946149 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcataggtaccctagttgtcacct 5946230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17718902 - 17718718
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17718902 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattgatggggtcaagatagttcatggataccact 17718803  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttta 260  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17718802 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagctgtcaccttta 17718718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 77 - 257
Target Start/End: Original strand, 25185902 - 25186082
Alignment:
Q  77 ttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccactt 176  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25185902 ttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccactt 25186001  T
Q  177 aaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  25186002 aaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctaatcgtcacct 25186082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 31831135 - 31830959
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31831135 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 31831036  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgt 252  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31831035 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatttgggtaaattacctaccattcttccatgggtaccctagttgt 31830959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 33981843 - 33981660
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33981843 tttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 33981744  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  33981743 taaaaatgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcaccttt 33981660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 6365988 - 6366169
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6365988 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccact 6366087  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  6366088 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctttcatggataccctagttgtcacct 6366169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 9734257 - 9734435
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  9734257 tttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cact 9734355  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9734356 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9734435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 41653897 - 41654077
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||    
T  41653897 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaaaataattcatggataccact 41653996  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  41653997 taaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 41654077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 76 - 239
Target Start/End: Original strand, 2714551 - 2714714
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  2714551 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccact 2714650  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2714651 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgg 2714714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 76 - 270
Target Start/End: Original strand, 37419942 - 37420136
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  37419942 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactact 37420041  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttatttatatgct 270  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||| |||||    
T  37420042 taaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattgattaaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcaccattaattaaatgct 37420136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 45236745 - 45236564
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45236745 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccact 45236646  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  45236645 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttttatgggtatcctagttgtcacct 45236564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 79 - 254
Target Start/End: Original strand, 32114254 - 32114429
Alignment:
Q  79 ttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaa 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32114254 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaaaatagttcatggataccacttaa 32114353  T
Q  179 aaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 254  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  32114354 aaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 32114429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Original strand, 41231948 - 41232131
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41231948 tttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 41232047  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  41232048 taaaaatgtgcttatgtgaccaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcctccatggataccctagttgtcaccttt 41232131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 9013686 - 9013867
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9013686 tttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccact 9013785  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9013786 taaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggtt-aggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 9013867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13356300 - 13356118
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13356300 tttttttagattacatttgaagaaaggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 13356201  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13356200 taaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatgggtactctagttgtcacctt 13356118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 2275915 - 2276096
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2275915 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 2276014  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    | ||||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  2276015 t-aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccatcattcttccatgggtagactagttgtcacctt 2276096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13760828 - 13760643
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  13760828 tttttcaagattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatt 13760729  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg--gtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  13760728 taaaaatgtgcttctgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtgtaccctagttgtcaccttt 13760643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 35628779 - 35628959
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  35628779 tttttttagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaagaataccact 35628878  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  35628879 taaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttctatgagtaccctagttgtcacc 35628959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 76 - 265
Target Start/End: Original strand, 22878393 - 22878582
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22878393 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccttccaatgaaaatgatcaattttttgttggggtcaagatagttcatggataccact 22878492  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttatttat 265  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  22878493 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccacaattcttctatgggtaccctagttgtcacttttttttat 22878582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29048583 - 29048426
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29048583 tttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccact 29048484  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctt 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29048483 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 29048426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 76 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 44088623 - 44088446
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  44088623 tttttctagattacctttgaagaatgatgaataatttactcaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 44088524  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtc 253  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  44088523 taaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctaattgtc 44088446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 45066772 - 45066589
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45066772 tttttatagattacctttgaagaataatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 45066673  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45066672 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattataataaattacccatcattcttccatgggtaccctaattctcaccttt 45066589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 25248041 - 25248215
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25248041 tttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaa------aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 25248134  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    | |||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25248135 ttaaaatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatggataccctaattgtcacc 25248215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4447464 - 4447294
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||             
T  4447464 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg--------- 4447374  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
      || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4447373 --aatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 4447294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 76 - 239
Target Start/End: Original strand, 45258512 - 45258675
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  45258512 tttttttagattacttttgaagaatggtcggtaatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccatt 45258611  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 239  Q
    |||||||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45258612 taaaaatgtgtttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 45258675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 76 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 42701470 - 42701301
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  42701470 tttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatgaataccact 42701371  T
Q  176 ta---aaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacc 244  Q
    ||   |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  42701370 taaaaaaaatgtgctt--gtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccatccttccatgggtacc 42701301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 130 - 263
Target Start/End: Original strand, 12032986 - 12033119
Alignment:
Q  130 aatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccat 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12032986 aatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccat 12033085  T
Q  230 tcttccatgggtaccctaattgtcacctttattt 263  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  12033086 tcttccatgggtaccctagttgtcaccttcattt 12033119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 76 - 255
Target Start/End: Original strand, 41639916 - 41640095
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  41639916 tttttttagattacctttgaagaatgatgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatagataccgct 41640015  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 255  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  41640016 taaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatagataccctagttgtcac 41640095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 123 - 256
Target Start/End: Original strand, 3904126 - 3904258
Alignment:
Q  123 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattac 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  3904126 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctattgtgtattggttagggtaaattac 3904224  T
Q  223 ccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  3904225 ccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 3904258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 3211208 - 3211378
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||             
T  3211208 tttttctaaattacctttgaaaa-tggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatg--------- 3211297  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
      || ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3211298 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacctt 3211378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 140 - 256
Target Start/End: Original strand, 41981534 - 41981650
Alignment:
Q  140 ttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 239  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41981534 ttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 41981633  T
Q  240 gtaccctaattgtcacc 256  Q
     ||||||| ||||||||    
T  41981634 ataccctagttgtcacc 41981650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 10378311 - 10378480
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||             
T  10378311 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg--------- 10378401  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10378402 --aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 10378480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 242
Target Start/End: Original strand, 41843255 - 41843410
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||             
T  41843255 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtccagatagttcatg--------- 41843345  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 242  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41843346 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 41843410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 143 - 258
Target Start/End: Original strand, 31336163 - 31336278
Alignment:
Q  143 ttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 242  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31336163 ttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatatggctaatgtgtattggttggggcaaattacccaccattcttccatgggta 31336262  T
Q  243 ccctaattgtcacctt 258  Q
    ||||| ||||||||||    
T  31336263 ccctagttgtcacctt 31336278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 117498 - 117329
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  117498 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 117408  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  || ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  117407 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 117329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 31940317 - 31940485
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  31940317 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 31940407  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  31940408 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 31940485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 39915992 - 39915887
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39915992 tttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccact 39915893  T
Q  176 taaaaa 181  Q
    ||||||    
T  39915892 taaaaa 39915887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3490568 - 3490397
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||     
T  3490568 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggttaccacc 3490469  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||| |||           ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||    
T  3490468 taaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaactacccaccattttttcataggtaccctagttgtcacctt 3490397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 33897011 - 33896841
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||     
T  33897011 tttttctagattacctttgaaaa-tggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccacc 33896913  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    ||||||  ||           ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  33896912 taaaaagatg-----------aatgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcacctt 33896841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26196485 - 26196309
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||     
T  26196485 tttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataat-aacaatttattggtggggtcaaaatagtttatggataccacc 26196387  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttattta 264  Q
    |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  26196386 taaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgaatatcctagttgtcacctttattta 26196309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4975582 - 4975416
Alignment:
Q  70 ttatggtttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggat 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||       
T  4975582 ttatggtttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--- 4975486  T
Q  170 accacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 247  Q
            || |||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  4975485 --------aatatgtgcttatatggctaatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagccta 4975416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 76 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 31149059 - 31148953
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31149059 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttattcactaaccaatgaaaatgagctatttattgatggggttaagatagttcat-gataccact 31148961  T
Q  176 taaaaatg 183  Q
    ||||||||    
T  31148960 taaaaatg 31148953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 32373892 - 32373744
Alignment:
Q  79 ttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaa 178  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||           |    
T  32373892 ttctaaattacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatg-----------a 32373804  T
Q  179 aaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 239  Q
    | ||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32373803 atatgtgcttatgtgattaatgtgtattggttggggtaaatta-ccaccattcttccatgg 32373744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 9713691 - 9713857
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||             
T  9713691 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttac---ccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--------- 9713778  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  9713779 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 9713857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 9509569 - 9509399
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||             
T  9509569 tttttctaaattacctttaaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg--------- 9509479  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
      || ||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| || ||||||    
T  9509478 --aatatgtgtttatgtggcaaatttttattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttttcacct 9509399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 2379142 - 2379311
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| | || ||||||||||             
T  2379142 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaaaatagttcatg--------- 2379232  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  2379233 --aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgtcacc 2379311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 40458941 - 40458772
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  40458941 tttttctcaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 40458851  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||| ||  ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  40458850 --aatatgtgtttttgtggctaatatgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 40458772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 176
Target Start/End: Original strand, 41981457 - 41981535
Alignment:
Q  98 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccactt 176  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41981457 aatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 41981535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 76 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 27243308 - 27243218
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatg 166  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  27243308 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27243218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 76 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 27254883 - 27254793
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatg 166  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  27254883 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27254793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 166
Target Start/End: Original strand, 38631654 - 38631744
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatg 166  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  38631654 tttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattggtgtggtcaagatagttcatg 38631744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 40649990 - 40649840
Alignment:
Q  86 ttacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 185  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| | || ||| |||||| |||           ||||    
T  40649990 ttacctttaaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgaata-----------tgtg 40649902  T
Q  186 cttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 247  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  40649901 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccatcattctttcatgggtagccta 40649840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 33622634 - 33622571
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaat 139  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33622634 tttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaat 33622571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 256
Target Start/End: Original strand, 39901662 - 39901739
Alignment:
Q  179 aaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||| || ||||||||    
T  39901662 aaatgtgtttccgtggctaatgtttattggttgaggtaaattatccaccattcttcaatggataccttagttgtcacc 39901739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 143
Target Start/End: Original strand, 164728 - 164791
Alignment:
Q  80 tctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgt 143  Q
    |||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  164728 tctagattacctttaaggaatgatgggtaatttatccaccaaccaataaaaatgagcaatttgt 164791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 465 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 6630593 - 6630535
Alignment:
Q  465 attttcatctaaagaacatcaaacttctccatctccttcatttcacatgtgatctccat 523  Q
    |||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  6630593 attttcatcttaagatcattaaatttcttcatctccttcatttaacaagtgatctccat 6630535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 110
Target Start/End: Original strand, 12032954 - 12032988
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12032954 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaat 12032988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 465 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 32166689 - 32166635
Alignment:
Q  465 attttcatctaaagaacatcaaacttctccatctccttcatttcacatgtgatct 519  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||| ||||    
T  32166689 attttcatctcaagaacatcaaacttcttcatctcctttattcaacatgtaatct 32166635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 465 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 35574694 - 35574616
Alignment:
Q  465 attttcatctaaagaacatcaaacttctccatctccttcatttcacatgtgatctccattttctttgttccataatcga 543  Q
    |||||||||| |||||||||||| || | |||||| ||||||  |||||| |||||||| || || |||||| ||||||    
T  35574694 attttcatcttaagaacatcaaattttttcatctcattcattcaacatgtcatctccatctttttcgttccaaaatcga 35574616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 465 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 37010399 - 37010321
Alignment:
Q  465 attttcatctaaagaacatcaaacttctccatctccttcatttcacatgtgatctccattttctttgttccataatcga 543  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | ||| || ||||||| |||||||||||| || | |||  ||||||||||||    
T  37010399 attttcatctcaaaaacatcaaacttattcatttctttcatttaacatgtgatctctatctccttcattccataatcga 37010321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 118
Target Start/End: Original strand, 39901575 - 39901617
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccac 118  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  39901575 tttttctagattacctttaaagaatggtgggtaacttacccac 39901617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 377 - 441
Target Start/End: Original strand, 39280914 - 39280978
Alignment:
Q  377 atttacctcaatcaacgaaaaatctccattgctttatctttattcttaaaatctattaccatttt 441  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| || || ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  39280914 atttacccctatcaaagaaaaatccccttttcttcatctttattcttaaaatcagttaccatttt 39280978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 160; Significance: 6e-85; HSPs: 128)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 76 - 255
Target Start/End: Original strand, 6019930 - 6020109
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6019930 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccact 6020029  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 255  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6020030 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 6020109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Original strand, 34276549 - 34276732
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34276549 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 34276648  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34276649 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttt 34276732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 74 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21366791 - 21366609
Alignment:
Q  74 ggtttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 173  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21366791 ggtttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 21366692  T
Q  174 cttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21366691 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 21366609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 74 - 256
Target Start/End: Original strand, 44984761 - 44984943
Alignment:
Q  74 ggtttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 173  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44984761 ggtttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 44984860  T
Q  174 cttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44984861 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 44984943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 39077547 - 39077728
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39077547 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 39077646  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39077647 taaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaacattcttccatgggtaccctagttgtcacct 39077728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 9798467 - 9798647
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9798467 tttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 9798566  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9798567 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9798647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 23437594 - 23437774
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23437594 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 23437693  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23437694 taaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23437774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 77 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31972515 - 31972336
Alignment:
Q  77 ttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccactt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31972515 ttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccactt 31972416  T
Q  177 aaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31972415 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctaattgtcacc 31972336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 41702639 - 41702456
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41702639 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 41702540  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  41702539 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcatcttt 41702456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 237479 - 237661
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  237479 tttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacact 237578  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  237579 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacctt 237661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 29777437 - 29777255
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||    
T  29777437 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcgagatagtttacggataccact 29777338  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29777337 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 29777255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 76 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 32366840 - 32366655
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32366840 tttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 32366741  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttat 261  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  32366740 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacttttat 32366655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 42085209 - 42085390
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42085209 tttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 42085308  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  42085309 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacct 42085390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 53854609 - 53854430
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53854609 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 53854510  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  53854509 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 53854430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 42766034 - 42765832
Alignment:
Q  64 atttatttatggttttt-ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagtt 162  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42766034 atttatatatggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtt 42765935  T
Q  163 catggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttatt 262  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  42765934 cat-gataccacttaaaaatgtgctaatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacctttata 42765836  T
Q  263 tata 266  Q
    ||||    
T  42765835 tata 42765832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19387868 - 19387686
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19387868 tttttctagattacgtttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccact 19387769  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19387768 taaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 19387686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 53461996 - 53461814
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53461996 tttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 53461897  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  53461896 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacctt 53461814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2826861 - 2826681
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2826861 tttttctagattccctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 2826762  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  2826761 taaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacct 2826681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 146609 - 146425
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  146609 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 146510  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttta 260  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||    
T  146509 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttctatgcgtactctagttgtcaccttta 146425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18462193 - 18462013
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18462193 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcact 18462094  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  18462093 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatcacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 18462013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 27373078 - 27373257
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27373078 tttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 27373177  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27373178 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtactctaattgtcacc 27373257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31532315 - 31532135
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31532315 tttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 31532216  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31532215 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31532135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 51363009 - 51363188
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  51363009 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccact 51363108  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  51363109 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 51363188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 54575120 - 54574940
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54575120 tttttctagattatcttagaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttggtggtggggtcaagatagttcatggataccact 54575021  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54575020 taaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 54574940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3692390 - 3692208
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  3692390 tttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtgggattaagatagtttattgataccact 3692291  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3692290 taaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 3692208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 43471875 - 43471694
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  43471875 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtgtggtcaagatagttcatggataccact 43471776  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  43471775 taaaaatgtgattatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacct 43471694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 55056439 - 55056258
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  55056439 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaact 55056340  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  55056339 taaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtacccttgttgtcacct 55056258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26091438 - 26091258
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26091438 tttttctaaattatcttggaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 26091339  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26091338 taaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26091258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 29478362 - 29478542
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29478362 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 29478461  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  29478462 taaaaatgtgcttatatggctaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 29478542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 47344658 - 47344838
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47344658 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 47344757  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47344758 taaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47344838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 41949384 - 41949566
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41949384 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 41949483  T
Q  176 taaaaatgtgct--tacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  41949484 taaaaatgtgcttatatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtcacc 41949566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 76 - 254
Target Start/End: Original strand, 397404 - 397582
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  397404 tttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 397503  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 254  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  397504 taaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 397582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22618692 - 22618512
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22618692 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatggataccact 22618594  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22618593 taaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggtt-aggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 22618512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 65 - 259
Target Start/End: Original strand, 55776036 - 55776229
Alignment:
Q  65 tttatttatggtttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttca 164  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  55776036 tttatttaggttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttca 55776134  T
Q  165 tggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||    
T  55776135 tggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtcaccttt 55776229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 65 - 259
Target Start/End: Original strand, 55840214 - 55840407
Alignment:
Q  65 tttatttatggtttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttca 164  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  55840214 tttatttaggttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttca 55840312  T
Q  165 tggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||    
T  55840313 tggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtcaccttt 55840407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 76 - 253
Target Start/End: Original strand, 6285309 - 6285486
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6285309 tttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccact 6285408  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtc 253  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6285409 taaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 6285486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Original strand, 45797481 - 45797664
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45797481 tttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 45797580  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  45797581 taaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacctaccattcttccataggtaccctagttgtcaccttt 45797664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 76 - 262
Target Start/End: Original strand, 407756 - 407940
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  407756 tttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cact 407854  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttatt 262  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  407855 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccattatt 407940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 3170628 - 3170809
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  3170628 tttttctagattacctttgaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcact 3170727  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  3170728 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtcacct 3170809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 68 - 256
Target Start/End: Original strand, 23609080 - 23609269
Alignment:
Q  68 atttatggtttt-tctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatg 166  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  23609080 atttatggttttttctagattatctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaatcaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcacg 23609179  T
Q  167 gataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23609180 gataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctatttgtcacc 23609269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 31914200 - 31914380
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31914200 tttttttagattacctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaactgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 31914299  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31914300 taaaaatgtgcttatg-ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacct 31914380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 41560330 - 41560510
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  41560330 tttttttaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 41560429  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  41560430 taaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagctgtcacc 41560510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 42033177 - 42033357
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  42033177 tttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaattaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccact 42033276  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42033277 taaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggttgagataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 42033357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 42222293 - 42222473
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  42222293 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcattgataccact 42222392  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  42222393 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacacaccattcttttatgggtaccctagttgtcacc 42222473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 54607964 - 54608144
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  54607964 tttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccact 54608063  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  54608064 taaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatggataccctagtagtcacc 54608144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 49881243 - 49881059
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  49881243 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccact 49881144  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttgggg----taaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  49881143 taaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggcgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 49881059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 2243460 - 2243642
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  2243460 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtcgggtcaagatagttcatggataccact 2243559  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||  ||| |||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  2243560 taaaaatgtatttatgtggcttatgtgtattagttggagtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacctt 2243642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 31070253 - 31070072
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  31070253 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggagtcaagatagttcat-gataccact 31070155  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31070154 taaaaatgtgctcatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 31070072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 47662282 - 47662100
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || || |||||| ||||||||||||    
T  47662282 tttttctagattacctttgaataatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggtgtcaatatagttaatggataccact 47662183  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  47662182 taaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacctt 47662100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 50234002 - 50234184
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  50234002 tttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtgggatcaagatagttaatggataccact 50234101  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  50234102 taaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctagttgtcacctt 50234184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 76 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 50457990 - 50457812
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  50457990 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 50457891  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 254  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50457890 taaaaatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttgaggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtca 50457812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 38591670 - 38591848
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  38591670 tttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatt 38591769  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
        |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38591770 ----aatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 38591848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 48313559 - 48313737
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  48313559 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatggataccact 48313657  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    | ||||| |||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  48313658 t-aaaatatgcttatgtagctaatatatattggttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 48313737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 76 - 244
Target Start/End: Original strand, 50534633 - 50534801
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50534633 tttttttagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccact 50534732  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacc 244  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50534733 taaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacc 50534801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 55519829 - 55520009
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  55519829 tttttctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaattttttggtgggatcaagatagttcatggataccact 55519928  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  55519929 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 55520009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 56023178 - 56022998
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  56023178 tttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccact 56023079  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  56023078 taaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattttttcatgggtaccctagttgtcacc 56022998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 76 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 53834234 - 53834055
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  53834234 tttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaacaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccact 53834135  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 255  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  53834134 taaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaagtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcac 53834055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 74 - 259
Target Start/End: Original strand, 48657824 - 48658003
Alignment:
Q  74 ggtttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48657824 ggtttttttagattacctttgaagaatggtgggt------cccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 48657917  T
Q  174 cttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48657918 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttt 48658003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 76 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14017554 - 14017372
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14017554 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 14017455  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttta 260  Q
    |  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14017454 t--aagtgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctgccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttta 14017372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 76 - 260
Target Start/End: Original strand, 1932765 - 1932949
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  1932765 tttttctagattacctttgaagaatagtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatagataccact 1932864  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttta 260  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || ||||||||||||| || |||||||||    
T  1932865 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattatccatcattttttcatgggtaccctagttatcaccttta 1932949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 76 - 252
Target Start/End: Original strand, 35446508 - 35446683
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  35446508 tttttctagattaccttttaagaatggtgggtaatttacc-accgaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcact 35446606  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgt 252  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35446607 taaaaatgtgcttatttggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgt 35446683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 39587959 - 39587781
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39587959 tttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 39587860  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  39587859 taaaaatgtgcttatataactaatgtatattggttagggtaaattacccaccattcttccat-ggta-cctaattgtcacc 39587781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 54086412 - 54086590
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  54086412 tttttctagattac-tttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccgct 54086509  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54086510 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 54086590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 48654816 - 48655004
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||    
T  48654816 tttttttagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttgatagataccact 48654915  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggcta------atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    ||||||||| |||| |||||||      |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48654916 taaaaatgtacttatgtggctaatgtgtatgtgtattggttggggtaaattacctaccattcttccatggctaccctaattgtcacctt 48655004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33897677 - 33897501
Alignment:
Q  74 ggtttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33897677 ggtttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 33897578  T
Q  174 cttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaatt 250  Q
    ||||||||| || |||  |||||||||| ||||  ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  33897577 cttaaaaatatgattatatggctaatgtgtattaattggaataaattacccaccattcttctataggtaccctaatt 33897501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 50536804 - 50536616
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  50536804 tttttttagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccgatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccact 50536705  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttattta 264  Q
    ||||||| || ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  50536704 taaaaatatgtttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgttacccttattta 50536616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 80 - 256
Target Start/End: Original strand, 54424988 - 54425163
Alignment:
Q  80 tctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaa 179  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  54424988 tctagattccctatgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaa 54425087  T
Q  180 aatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  54425088 aatgtgcttatgtgactaatgtctattggttggggtaaattacccacgattcttccat-ggtacactagttgtcacc 54425163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 76 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22468950 - 22468788
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  22468950 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatagataccact 22468851  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatg 238  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22468850 taaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccatttttccatg 22468788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 41632186 - 41632007
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||    
T  41632186 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatggatatcgct 41632088  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||| ||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  41632087 taaaaatgtacttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtatcctagttgtcacc 41632007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 54805798 - 54805614
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  54805798 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtgggattaagatagttcatagataccact 54805699  T
Q  176 taaaaatgtg----cttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||||     ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  54805698 taaaaatgtgtttatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattactcatcattgttccatgggtaccctagatgtcacc 54805614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 48259690 - 48259510
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  48259690 tttttctagattacccttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaattagttggtggagtcaagatagttcatgaataccact 48259591  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    | |||||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  48259590 t-aaaatgtgcttatgtggctaatatgtattgattagggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctacttatcacctt 48259510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 76 - 254
Target Start/End: Original strand, 51951684 - 51951861
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||||||| || |    
T  51951684 tttttctagattacttttgaagaatgatgagtaatttatccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttaatggagtcaagatagttcatggatatcagt 51951783  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 254  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51951784 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt-gtgtaaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 51951861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 130 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 36532956 - 36532825
Alignment:
Q  130 aatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  36532956 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccaccat 36532857  T
Q  230 tcttccatgggtaccctaattgtcacctttat 261  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36532856 tcttccatgggtatcctagttgtcacctttat 36532825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 9998100 - 9997931
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||             
T  9998100 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagtaatttattggtgggatcaagatagttcatg--------- 9998010  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9998009 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9997931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 114 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 52728448 - 52728307
Alignment:
Q  114 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| |    
T  52728448 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgcgtattggttgag 52728349  T
Q  214 gtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  52728348 gtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 52728307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Original strand, 43890930 - 43891102
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || || ||||||||||             
T  43890930 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggagtcaatatagttcatg--------- 43891020  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  43891021 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccatagttgtcaccttt 43891102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 34835179 - 34835350
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||      
T  34835179 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccatc 34835278  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34835279 taaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacctt 34835350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 54715037 - 54715208
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||             
T  54715037 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaacatagttcatg--------- 54715127  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
      || ||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  54715128 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacctt 54715208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 38547770 - 38547600
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  38547770 tttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacc 38547671  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  38547670 taaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacct 38547600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 47811908 - 47812079
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | | || ||||||||||||| |||         
T  47811908 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattgattgagtcaagatagttcatgaata----- 47812002  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
          |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  47812003 ------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctaattgtcacctt 47812079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 45633948 - 45633779
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  45633948 tttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 45633858  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  45633857 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 45633779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 27398772 - 27398607
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27398772 tttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccact 27398673  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgt 252  Q
    |||||||||            ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||    
T  27398672 taaaaatgt-----------aaatgtttattggttggggtaaattacccaccattttttcattggtaccctagttgt 27398607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Original strand, 27580121 - 27580293
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  27580121 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacc 27580220  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    ||||||  ||           ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| | || |||||||||||    
T  27580221 taaaaagatg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccatcatttttccatgggtatcttatttgtcaccttt 27580293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 46720027 - 46720201
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||     
T  46720027 tttttctagattaactttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattgatggggtcaagatagtttatggataccacc 46720126  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||| ||| |          |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  46720127 taaaaaggtgat--------atatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgttacctt 46720201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 37239259 - 37239088
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  37239259 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 37239169  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||    
T  37239168 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacctt 37239088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5117607 - 5117461
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  5117607 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 5117517  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctt 233  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5117516 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 5117461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14335270 - 14335100
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||     
T  14335270 tttttctagattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggtcaagatagttcatagataccacc 14335171  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||| |||           ||||   |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  14335170 taaaaaggtg-----------aatgctcattgtttgaggtaaattacccaccattctttcatgggtactctagttgtcacct 14335100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15060467 - 15060289
Alignment:
Q  68 atttatggttttt-ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatg 166  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  15060467 atttatggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 15060368  T
Q  167 gataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
               || ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  15060367 -----------aatatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 15060289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 22620595 - 22620764
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  22620595 tttttctaaattatctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 22620685  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||| ||| ||||    
T  22620686 --aatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggtagcctagttgccacc 22620764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 54216905 - 54216736
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||             
T  54216905 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatg--------- 54216815  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  54216814 --aatatgtgcttatgtgattaatgtgtattggttgggataaattaccctccattcttccatggataccctagttatcacc 54216736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6371418 - 6371246
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||| || | || ||||||     
T  6371418 tttttctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttagggttaccacc 6371319  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||    
T  6371318 taaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccattttttcataggtaccctagttgtcaccttt 6371246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 159 - 256
Target Start/End: Original strand, 35595772 - 35595869
Alignment:
Q  159 agttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  35595772 agttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 35595869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20352011 - 20351840
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||             
T  20352011 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--------- 20351921  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  20351920 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagtctagttgtcacctt 20351840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1662428 - 1662258
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  1662428 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacc 1662329  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    ||||||  |             ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1662328 taaaaagat-------------atgttcattggttggggtaaattactcatcattcttccataggtaccctagttgtcaccttt 1662258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 34552321 - 34552490
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||             
T  34552321 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggtgtcaagatagttcatg--------- 34552411  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  34552412 --aatatgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 34552490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27873717 - 27873548
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||             
T  27873717 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagtaatttatttgtggggttaagatagttcatg--------- 27873627  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| |||| ||||||||||    
T  27873626 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt--ttgggtagcctagttgtcacctt 27873548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 78 - 256
Target Start/End: Original strand, 573807 - 573974
Alignment:
Q  78 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccactta 177  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  573807 tttctagattacctttaaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaccta 573906  T
Q  178 aaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  573907 aaaaagtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccactatttttccatgagtacactagttgtcacc 573974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 31881483 - 31881312
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  31881483 tttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 31881393  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
      || ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  || ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||    
T  31881392 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttgccacctt 31881312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 46708908 - 46708740
Alignment:
Q  78 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccactta 177  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||               
T  46708908 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 46708820  T
Q  178 aaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    || ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | || |||| |||||||||    
T  46708819 aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatcacccatcattctttcattgatagcctagttgtcacct 46708740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4486750 - 4486579
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||             
T  4486750 tttttctaaattatctttgaagaacggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg--------- 4486660  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||  ||| ||||||||||    
T  4486659 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatagatagtctagttgtcacctt 4486579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 254
Target Start/End: Original strand, 54216315 - 54216482
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||             
T  54216315 tttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--------- 54216405  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 254  Q
      || ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  54216406 --aatatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggggtaaattatcgatcattctttcatgggtaacctagttgtca 54216482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 256
Target Start/End: Original strand, 42509351 - 42509478
Alignment:
Q  129 aaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccacca 228  Q
    |||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||    
T  42509351 aaatgaccaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttaggataaattatccacca 42509450  T
Q  229 ttcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||    
T  42509451 ttcttccatgagtaccctagttatcacc 42509478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 122 - 212
Target Start/End: Original strand, 52396774 - 52396865
Alignment:
Q  122 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaa-gatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttgg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  52396774 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 52396865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 3293192 - 3293102
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatg 166  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  3293192 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 3293102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 33289705 - 33289873
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || || || | ||||||||||||| ||||        
T  33289705 tttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatgaatac---- 33289800  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
           ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  33289801 -------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcct-attgtcacc 33289873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 52688351 - 52688520
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||             
T  52688351 tttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcatg--------- 52688441  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  52688442 --aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 52688520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 52461368 - 52461535
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  52461368 tttttctaaattacctttgaa---tggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 52461455  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||| |||||    
T  52461456 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccacct 52461535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 76 - 158
Target Start/End: Original strand, 42557584 - 42557666
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagat 158  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  42557584 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagat 42557666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 88 - 256
Target Start/End: Original strand, 49014112 - 49014269
Alignment:
Q  88 acctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgct 187  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||           || |||| ||    
T  49014112 acctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtact 49014200  T
Q  188 tacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  49014201 tatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 49014269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 11972298 - 11972208
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatg 166  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  11972298 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 11972208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 255
Target Start/End: Original strand, 35344868 - 35344968
Alignment:
Q  154 aagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  35344868 aagatagttcatggataccacttgaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-tggtaaattatccaccattcttccataggtatcctagttgtc 35344966  T
Q  254 ac 255  Q
    ||    
T  35344967 ac 35344968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 173
Target Start/End: Original strand, 43231505 - 43231601
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 173  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  43231505 tttttctagattac-tttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 43231601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 256
Target Start/End: Original strand, 27872607 - 27872750
Alignment:
Q  102 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgt 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| |||           |||||    
T  27872607 gtggataatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgt 27872695  T
Q  202 atattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  27872696 ttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccgtagttgtcacc 27872750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 255
Target Start/End: Original strand, 33048990 - 33049062
Alignment:
Q  183 gtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 255  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33048990 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33049062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 49058037 - 49057933
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || |||||| ||||||||| ||||||| |    
T  49058037 tttttctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattgatgaggttaaaatagttcatagataccatt 49057938  T
Q  176 taaaa 180  Q
    |||||    
T  49057937 taaaa 49057933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33558111 - 33557944
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| |||||||||||||             
T  33558111 tttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaggaatttatttgtagggtcaagatagttcatg--------- 33558021  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 254  Q
      || ||||  ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||    
T  33558020 --aatatgtatttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgaatagcctaattgtca 33557944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 179 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 48259780 - 48259702
Alignment:
Q  179 aaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  48259780 aaatgtgcttatgtggctaatatgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacctt 48259702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 51981613 - 51981493
Alignment:
Q  111 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggtt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           || ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  51981613 ttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtgggattaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 51981525  T
Q  211 ggggtaaattacccaccattcttccatgggta 242  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||| ||||    
T  51981524 ggggtaaattactcatcattctttcattggta 51981493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 17555666 - 17555617
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17555666 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaa 17555617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3291870 - 3291803
Alignment:
Q  191 gtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  3291870 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctaattgtcacctt 3291803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 258
Target Start/End: Original strand, 42558273 - 42558369
Alignment:
Q  154 aagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtc 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||        |||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||    
T  42558273 aagatagttcatagataccacttaaaaatgtg--------gctaatgtgtattgattagggtaaattatccaccattcttccatgggtatcttagttgtc 42558364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 85 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18206682 - 18206583
Alignment:
Q  85 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaag----atagttcatggataccacttaaaa 180  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||   ||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||    |||||||||||||||||| |||||    
T  18206682 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatatatagttcatggataccacctaaaa 18206583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 477 - 541
Target Start/End: Original strand, 25062352 - 25062416
Alignment:
Q  477 agaacatcaaacttctccatctccttcatttcacatgtgatctccattttctttgttccataatc 541  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  25062352 agaacatcaaacttcttcatctgcttcattaaacatgtgatcttcatctcctttgttccataatc 25062416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 465 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 20512881 - 20512803
Alignment:
Q  465 attttcatctaaagaacatcaaacttctccatctccttcatttcacatgtgatctccattttctttgttccataatcga 543  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||    
T  20512881 attttcatcttataaacatcaaacttcttcatcttcttcatttaacatgtaatctccatatccttcgtttcataatcga 20512803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 137
Target Start/End: Original strand, 16738569 - 16738621
Alignment:
Q  85 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagca 137  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16738569 attacctttataaaatggtgggtaacttacccacgaactaatgaaaatgagca 16738621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 466 - 522
Target Start/End: Original strand, 22050719 - 22050775
Alignment:
Q  466 ttttcatctaaagaacatcaaacttctccatctccttcatttcacatgtgatctcca 522  Q
    |||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22050719 ttttaatctcaacaacatcaaacttcttcatttccttcatttaacatgtgatctcca 22050775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 465 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 15131629 - 15131569
Alignment:
Q  465 attttcatctaaagaacatcaaacttctccatctccttcatttcacatgtgatctccattt 525  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  15131629 atttttatctcaagaacatcaaatttcttcatctccttcattcagcatgtgatctctattt 15131569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 47105087 - 47105023
Alignment:
Q  192 tggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||  || | |||||||||| |||||    
T  47105087 tggctaatgtttaatggttgaggtaaattacccacctttcttttatagataccctaattatcacc 47105023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 101)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 74 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 45690279 - 45690097
Alignment:
Q  74 ggtttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 173  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45690279 ggtttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 45690180  T
Q  174 cttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45690179 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 45690097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22979827 - 22979647
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22979827 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 22979728  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22979727 taaaaatatgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 22979647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25894097 - 25893917
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25894097 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 25893998  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25893997 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 25893917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 76 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 33423455 - 33423276
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33423455 tttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 33423356  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 255  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33423355 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33423276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 33839895 - 33839713
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33839895 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 33839796  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  33839795 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacctt 33839713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 76 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 49171542 - 49171353
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49171542 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 49171443  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttatttat 265  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  49171442 taaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctttctttat 49171353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 76 - 260
Target Start/End: Original strand, 46913112 - 46913298
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46913112 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 46913211  T
Q  176 taaaaa--tgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttta 260  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46913212 taaaaatgtgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttta 46913298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 17855431 - 17855613
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  17855431 tttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactact 17855530  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17855531 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 17855613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 47067157 - 47066975
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47067157 tttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 47067058  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  47067057 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacctt 47066975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 35355891 - 35356072
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  35355891 tttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 35355990  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  35355991 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacct 35356072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23393231 - 23393051
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23393231 tttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 23393132  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23393131 taaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23393051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 33696001 - 33695821
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33696001 tttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 33695902  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33695901 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 33695821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 76 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2341842 - 2341656
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  2341842 tttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaact 2341743  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccat-gggtaccctaattgtcacctttat 261  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  2341742 taaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggggtaccctagttgtcacctttat 2341656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 35328249 - 35328068
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35328249 tttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 35328150  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  35328149 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacct 35328068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20165994 - 20165814
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20165994 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 20165895  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20165894 taaaaatgtacttatgtggctaatgtgtataggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 20165814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 27018119 - 27018299
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27018119 tttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccact 27018218  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  27018219 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 27018299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 47740511 - 47740331
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  47740511 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcact 47740412  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  47740411 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 47740331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 76 - 263
Target Start/End: Original strand, 33411263 - 33411450
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33411263 tttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 33411362  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttattt 263  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||    
T  33411363 taaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccataagtaccctagttgtcaccattattt 33411450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 76 - 250
Target Start/End: Original strand, 15877553 - 15877727
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15877553 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaacaaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 15877652  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaatt 250  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15877653 taaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaatt 15877727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 40670566 - 40670748
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40670566 tttttctagattacctttgaagaatggtggataatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccact 40670665  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  40670666 taaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacctt 40670748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Original strand, 33332792 - 33332979
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33332792 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccact 33332890  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttattta 264  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33332891 taaaaatatgcttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacctttattta 33332979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 98 - 258
Target Start/End: Original strand, 36389381 - 36389541
Alignment:
Q  98 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggcta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36389381 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 36389480  T
Q  198 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36389481 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 36389541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 76 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37846196 - 37846004
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  37846196 tttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataatttatggataccact 37846097  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttatttatatg 268  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  37846096 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctctttttatatg 37846004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 31586851 - 31587033
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31586851 tttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccact 31586950  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||    
T  31586951 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataagtaccctagttctcacctt 31587033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 45482661 - 45482843
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  45482661 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcact 45482760  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    ||||||| |||||| ||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  45482761 taaaaatatgcttatgtgactgatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 45482843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 48609857 - 48609677
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  48609857 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccact 48609758  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48609757 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 48609677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 10028491 - 10028673
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  10028491 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccact 10028590  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatggg--taccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  10028591 taaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtataccctagttgtcacc 10028673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 31625707 - 31625887
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31625707 tttttctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccact 31625806  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  31625807 taaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattggttggagtaaatta-ccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacct 31625887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 19563450 - 19563630
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  19563450 tttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcact 19563549  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19563550 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttaaggtaaattacccaccattcttccatgggtactctaattgtcacc 19563630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 98 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5183983 - 5183816
Alignment:
Q  98 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggcta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  5183983 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgtgcttatgtggcta 5183884  T
Q  198 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttatttat 265  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||    
T  5183883 atgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttatcaccttcatttat 5183816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 26579897 - 26579715
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  26579897 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgtataccact 26579798  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26579797 taaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacctt 26579715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 76 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 35757200 - 35757016
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  35757200 tttttctagattaactttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccact 35757102  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggtt-ggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttta 260  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35757101 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttta 35757016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 43499488 - 43499668
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43499488 tttttttagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 43499587  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||| | |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  43499588 taaaaatatacttatgtggccaatgtatattagttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttctcacc 43499668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 41991038 - 41990856
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  41991038 tttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccact 41990939  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41990938 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttggataaattactcaccattcttccatgggta-cctaattatcaccttt 41990856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 5712171 - 5712351
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  5712171 tttttctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccact 5712270  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  5712271 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtaccctagttgtcacc 5712351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 45063535 - 45063357
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  45063535 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccact 45063436  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||    
T  45063435 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtat--gttgaggtaaattatccaccattctttcattggtactctagttgtcacc 45063357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 256
Target Start/End: Original strand, 29446862 - 29447020
Alignment:
Q  97 aaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggct 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  29446862 aaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgact 29446961  T
Q  197 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29446962 aatgtgtattggttggagt-aattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 29447020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 76 - 255
Target Start/End: Original strand, 33870248 - 33870424
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  33870248 tttttctagatcacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccatt 33870347  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 255  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||||    
T  33870348 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattct---atgggtactctagttgtcac 33870424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Original strand, 35767484 - 35767660
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||       | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35767484 tttttctagattacctttgaagaatggtgggta-------ccccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 35767576  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35767577 taaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcaccttt 35767660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31429655 - 31429475
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  31429655 tttttctagattatctttgaagaatggtgggtgatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagtacatggataccact 31429556  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||  ||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31429555 taaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttgaagtaaattactcatcattctttcatgggtaccctagttgtcacc 31429475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 10618301 - 10618475
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||    
T  10618301 tttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-------atagttcatgaataccact 10618393  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  10618394 taaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacct 10618475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 76 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33720216 - 33720070
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  33720216 tttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccact 33720117  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattac 222  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  33720116 taaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattac 33720070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 119 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 28234073 - 28233936
Alignment:
Q  119 caaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaa 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  28234073 caactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaa 28233974  T
Q  219 ttacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28233973 ctacccacctttctttcatgggtaccctagttgtcacc 28233936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 125 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 30076658 - 30076526
Alignment:
Q  125 atgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattaccc 224  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  30076658 atgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggcgtaaattaccc 30076559  T
Q  225 accattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    | ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  30076558 atcattcttccatggataccctagttgtcacct 30076526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 35752203 - 35752032
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  35752203 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 35752113  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  35752112 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 35752032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 46898185 - 46898012
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||| || |||||||||| |||         
T  46898185 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaataaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaata----- 46898091  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttta 260  Q
          |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  46898090 ------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcaccttta 46898012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 255
Target Start/End: Original strand, 33393331 - 33393499
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  33393331 tttttctagattacctttaaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacc 33393430  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 255  Q
    ||||||           || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33393431 taaaaa-----------ggttaatgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33393499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 44003539 - 44003369
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||     
T  44003539 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaactaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacc 44003440  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  44003439 taaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacct 44003369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 43489221 - 43489390
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  43489221 tttttctaaattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 43489311  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||    
T  43489312 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagtctagttgtcacc 43489390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 48085861 - 48086031
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||             
T  48085861 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--------- 48085951  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  48085952 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattatcacct 48086031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24923193 - 24923022
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||             
T  24923193 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg--------- 24923103  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  24923102 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccatccttctttcatgggtagcctagttgtcacctt 24923022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 24228544 - 24228714
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  24228544 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 24228634  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
      || || |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24228635 --aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacct 24228714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 37127940 - 37128110
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||               
T  37127940 tttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca----------- 37128028  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  37128029 taaatatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacct 37128110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 46817590 - 46817420
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  46817590 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 46817500  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  46817499 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacct 46817420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 7257384 - 7257553
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||     
T  7257384 tttttctagattaccttcgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccacc 7257483  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||| |||           ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  7257484 taaaaaggtg-----------aatgattattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacc 7257553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 36817014 - 36816845
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  36817014 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 36816924  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  36816923 --aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 36816845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 137 - 263
Target Start/End: Original strand, 44405412 - 44405538
Alignment:
Q  137 aatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttcca 236  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  44405412 aatttattggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctaccattcttcca 44405511  T
Q  237 tgggtaccctaattgtcacctttattt 263  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||    
T  44405512 tgggtattctagttgtcacctttattt 44405538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26941701 - 26941537
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  26941701 tttttataaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 26941611  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattg 251  Q
      || ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||    
T  26941610 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctaattg 26941537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 91 - 232
Target Start/End: Original strand, 44564356 - 44564497
Alignment:
Q  91 tttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttac 190  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || |||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||     
T  44564356 tttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaataaaaataagcaatttattagtggtgtcaagatagttcatagataccacttaaaaatatgcttat 44564455  T
Q  191 gtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattct 232  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44564456 gtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattct 44564497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 2332022 - 2332191
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||             
T  2332022 tttttctaaattatctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatg--------- 2332112  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  2332113 --aatatgtgcttatgtggttactgtgtattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtacccaagttgtcacc 2332191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 7876495 - 7876326
Alignment:
Q  78 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccactta 177  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||               
T  7876495 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----------- 7876407  T
Q  178 aaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    || |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| ||||||||||    
T  7876406 aatatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcattggtagcctagttgtcacctt 7876326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 140 - 258
Target Start/End: Original strand, 41904272 - 41904390
Alignment:
Q  140 ttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 239  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  41904272 ttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataa 41904371  T
Q  240 gtaccctaattgtcacctt 258  Q
    ||| |||| ||||||||||    
T  41904372 gtatcctagttgtcacctt 41904390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16482952 - 16482847
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  16482952 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgataatgagcaatttattggtggggtcaagatggtttatggataccacc 16482853  T
Q  176 taaaaa 181  Q
    ||||||    
T  16482852 taaaaa 16482847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 76 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15644115 - 15643948
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||     
T  15644115 tttttctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaaaatagtttatggataccacc 15644016  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 254  Q
    |||||| |||           ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||    
T  15644015 taaaaaggtg-----------aatgtttattgattggggtaaattacccaccattttttcatgggtacactagttgtca 15643948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 76 - 242
Target Start/End: Original strand, 29610638 - 29610793
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||             
T  29610638 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg--------- 29610728  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 242  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  29610729 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggta 29610793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 45502985 - 45502808
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||           ||| |    
T  45502985 tttttctagattaactttgaagaatggtgagtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttagttgggtcaagata-----------ccatt 45502897  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctttattta 264  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||| ||| ||||    
T  45502896 taaaaatatgcttatgtagctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggataccttagttgtcactttttttta 45502808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 47460941 - 47460772
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  47460941 tttttttagattacttttaaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacc 47460842  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||  ||           ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  47460841 taaaaagatg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcacc 47460772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 21718120 - 21718288
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  21718120 tttttctaaattacctttgaataacggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 21718210  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||| || |||||||| |||| ||||||||    
T  21718211 --aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccattatt-tttcatgggtagcctagttgtcacc 21718288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 76 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25037677 - 25037517
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||             
T  25037677 tttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaattaaaatgatcaatttattggtggggtcaagatagttcatg--------- 25037587  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 247  Q
      || ||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  25037586 --aatatgtgcttatgtggctgatgtgtattgattggggtaaattactcatcattctttcatgggtagccta 25037517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 76 - 165
Target Start/End: Original strand, 29098754 - 29098843
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcat 165  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  29098754 tttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 29098843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 76 - 239
Target Start/End: Original strand, 41855062 - 41855214
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| || |||||||||||               
T  41855062 tttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaatgtgagcaatttattggtggagtcaagatagttca----------- 41855150  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 239  Q
    |||| || |||||| ||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  41855151 taaatatatgcttatgtggctaatgtgtattagtttggataaattacccatcattcttccatgg 41855214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 76 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32556775 - 32556640
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||  |||||||||||||             
T  32556775 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggacaagatagttcatg--------- 32556685  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattac 222  Q
      || ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32556684 --aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattac 32556640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 38448608 - 38448445
Alignment:
Q  85 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 184  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||| |||||||||    
T  38448608 attacctttgaaaaattgtggataatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatatcacctaaaaatgt 38448509  T
Q  185 gcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |           ||| | ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  38448508 g-----------aatatttattgattggggtaaattatccaccatttttccataagtaccctaattgtcaccttt 38448445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 498357 - 498188
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||             
T  498357 tttttataaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 498267  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || |||| ||| ||||    
T  498266 --aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatggctagcctagttgccacc 498188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 7720672 - 7720574
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccac 174  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7720672 tttttcttgattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccactaaccaataaaaataagcaatttatagattgggttaagatagttcatggataccac 7720574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 26371052 - 26371221
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||             
T  26371052 tttttttaaattatctttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg--------- 26371142  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
      || ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  26371143 --aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 26371221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 166
Target Start/End: Original strand, 39323619 - 39323709
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatg 166  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  39323619 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39323709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 39453644 - 39453558
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagtt 162  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  39453644 tttttctaaattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 39453558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 166
Target Start/End: Original strand, 39866668 - 39866758
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatg 166  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  39866668 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39866758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 255
Target Start/End: Original strand, 46103127 - 46103291
Alignment:
Q  79 ttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaa 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| || ||||||||||           |    
T  46103127 ttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaattta-ccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------a 46103214  T
Q  179 aaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 255  Q
    | ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||  ||| |||||||    
T  46103215 atatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggagtaaattactcatcattctttcatgggtagtctagttgtcac 46103291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 47906928 - 47906838
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatg 166  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||    
T  47906928 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 47906838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 45237702 - 45237531
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||| ||||||             
T  45237702 tttttctaaattacctttgaagaatgataggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagataattcatg--------- 45237612  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
      || ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||| | || ||||||||||    
T  45237611 --aatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttttatgggtagcttagttgtcacctt 45237531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 174
Target Start/End: Original strand, 29863018 - 29863116
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccac 174  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  | || ||||||||||||||||||    
T  29863018 tttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattggtggaatcaaaatagttcatggataccac 29863116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 254
Target Start/End: Original strand, 35484639 - 35484807
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaa-tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccac 174  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||            
T  35484639 tttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg-------- 35484730  T
Q  175 ttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 254  Q
       || ||||||||| ||| ||||||| ||||  ||| |||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  35484731 ---aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattatttgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctaattgtca 35484807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 35557733 - 35557798
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 141  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35557733 tttttttagaatacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 35557798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 44659847 - 44660017
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||             
T  44659847 tttttctaaattacctttgaagaatggtgg-taatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg--------- 44659936  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
      || || |||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||| |||| ||| ||||||    
T  44659937 --aatatatgcttatgtggctaatgtgtatcggttggagtaaattatccatcattcttttatgggtagcctagttgccacctt 44660017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 37443734 - 37443600
Alignment:
Q  113 acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttgg 212  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||    
T  37443734 acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttgg 37443646  T
Q  213 ggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||    
T  37443645 ggtaaattacccaccatttttttatgggtaccctagttgtcacctt 37443600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 166
Target Start/End: Original strand, 33455099 - 33455189
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatg 166  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  33455099 tttttctaaattacctatgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 33455189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 30077105 - 30077043
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaa 138  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30077105 tttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgggcaa 30077043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 21649548 - 21649442
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaa-tggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccac 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||| |||||||||||    
T  21649548 tttttttagattacctttgaaaaaatgatgggtaatttacttattaaccaatgaaaatgagcaatttattagtagatttaagatagtttatggataccac 21649449  T
Q  175 ttaaaaa 181  Q
     ||||||    
T  21649448 ctaaaaa 21649442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Original strand, 35823293 - 35823353
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagc 136  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35823293 tttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagc 35823353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 182
Target Start/End: Original strand, 26456157 - 26456218
Alignment:
Q  121 accaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaat 182  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  26456157 accaatgaaaatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaatacttcttaaaaat 26456218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 39453557 - 39453484
Alignment:
Q  181 atgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtca 254  Q
    ||||| ||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  39453557 atgtgtttatgtgactaatgtgtaatggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 39453484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 259
Target Start/End: Original strand, 39866762 - 39866823
Alignment:
Q  198 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||    
T  39866762 atgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcatgggtagtctaattgccaccttt 39866823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 465 - 525
Target Start/End: Original strand, 34891554 - 34891614
Alignment:
Q  465 attttcatctaaagaacatcaaacttctccatctccttcatttcacatgtgatctccattt 525  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34891554 attttgatctcaagaacatcaaatttcttcatctccttcattcaacatgtgatctccattt 34891614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 259
Target Start/End: Original strand, 39323715 - 39323782
Alignment:
Q  191 gtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  39323715 gtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccatcattctttcatgagtagcctagttgtcaccttt 39323782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 465 - 543
Target Start/End: Original strand, 23944097 - 23944175
Alignment:
Q  465 attttcatctaaagaacatcaaacttctccatctccttcatttcacatgtgatctccattttctttgttccataatcga 543  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||| ||||| | |||| ||||| ||||||    
T  23944097 attttcatcttaagaacatcaaacttcttcttctctttcattcaacatgtgatttccatctcctttattccagaatcga 23944175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 465 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 32138940 - 32138871
Alignment:
Q  465 attttcatctaaagaacatcaaacttctccatctccttcatttcacatgtgatctccattttctttgttc 534  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||  |||||| |||||||| ||||| ||||    
T  32138940 attttcatcttaagaacatcaaaattcttcatctccttcgttcaacatgtaatctccatcttcttcgttc 32138871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 465 - 519
Target Start/End: Original strand, 34891386 - 34891440
Alignment:
Q  465 attttcatctaaagaacatcaaacttctccatctccttcatttcacatgtgatct 519  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||    
T  34891386 attttcatattaagaacatcaaacttctttatcttcttcatttaacatgtgatct 34891440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Original strand, 42272180 - 42272244
Alignment:
Q  191 gtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||  |||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  42272180 gtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccataattcttccat-gataccctagttgtcacc 42272244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 252
Target Start/End: Original strand, 29098847 - 29098915
Alignment:
Q  184 tgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgt 252  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| || ||||| || |||| ||||    
T  29098847 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattttttcatggatagcctagttgt 29098915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 157; Significance: 4e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 1871 - 2051
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1871 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 1970  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1971 taaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 2051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 155; Significance: 6e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 39736 - 39554
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39736 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 39637  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39636 taaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 39554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 155; Significance: 6e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13942 - 13760
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13942 tttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 13843  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13842 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 13760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 74 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 11314 - 11133
Alignment:
Q  74 ggtttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 173  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11314 ggtttttctagattaccttt-aagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 11216  T
Q  174 cttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11215 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 11133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 140; Significance: 5e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 75424 - 75241
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  75424 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgcataccact 75325  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcaccttt 259  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  75324 taaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccattggtaacctagttgtcaccttt 75241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2612 - 2432
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  2612 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaaattatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccact 2513  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2512 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagttatcacc 2432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Original strand, 278008 - 278192
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggata--cca 173  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  278008 tttttttagattacctttgaagaatggtgggtaaattactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacccca 278107  T
Q  174 cttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  278108 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 278192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 257
Target Start/End: Original strand, 176666 - 176837
Alignment:
Q  86 ttacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 185  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  176666 ttacctttgaagaatggtgggtaatttaccgaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttgaaaatgta 176765  T
Q  186 cttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  176766 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtatcctagttgtcacct 176837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19034 - 18852
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  19034 tttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccact 18935  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18934 taaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggaataaattatccacaattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 18852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 76 - 228
Target Start/End: Original strand, 32563 - 32715
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  32563 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccatt 32662  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccacca 228  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32663 taaaaatgtgtttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 32715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4770 - 4596
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||      ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4770 tttttctagattaactttgaataatggtgggtaa------caccaactaataaaaatgaacaatttgttggtggggtaaagatagtttatggataccact 4677  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4676 taaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 4596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Original strand, 3090 - 3262
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  3090 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttattcac---------aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatatcact 3180  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| || |||||||||    
T  3181 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttctatggataccttagttgtcacct 3262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 95; Significance: 4e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20646 - 20477
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||     
T  20646 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggataccacc 20547  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  20546 taaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 20477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 91; Significance: 9e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 80 - 256
Target Start/End: Original strand, 14750 - 14915
Alignment:
Q  80 tctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  14750 tctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccacctaaa 14849  T
Q  180 aatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    || |||           ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14850 aaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacctaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 14915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 104 - 272
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||| |||||||     
T  104 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatgaataccacc 203  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |||||| |||           |||||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  204 taaaaaggtg-----------aatgttaattggttgaggtaaatt-cccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 68 - 256
Target Start/End: Original strand, 7083 - 7262
Alignment:
Q  68 atttatggttttt-ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcat 165  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  7083 atttatggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 7182  T
Q  166 ggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    |           || ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  7183 g-----------aatatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 7262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 76; Significance: 8e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4724 - 4554
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccac 174  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  4724 tttttctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggataccat 4625  T
Q  175 ttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||| |||           |||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  4624 ttaaaaaggtg-----------aatgttcattggttgaagtaaattatccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 4554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 76; Significance: 8e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 3394 - 3564
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccac 174  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  3394 tttttctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggataccat 3493  T
Q  175 ttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||| |||           |||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3494 ttaaaaaggtg-----------aatgttcattggttgaagtaaattatccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 3564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 222
Target Start/End: Original strand, 17908 - 18043
Alignment:
Q  76 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccact 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||| || || ||| || ||| ||||        
T  17908 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgatcaatttattgatggagtcaaaatattttatgaatac---- 18003  T
Q  176 taaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattac 222  Q
           ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18004 -------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 18043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 85 - 180
Target Start/End: Original strand, 19228 - 19327
Alignment:
Q  85 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaag----atagttcatggataccacttaaaa 180  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||   ||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||    |||||||||||||||||| |||||    
T  19228 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatatatagttcatggataccacctaaaa 19327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 256
Target Start/End: Original strand, 19356 - 19398
Alignment:
Q  214 gtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 256  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  19356 gtaaattacccaccattttttcatgggtactctaattgtcacc 19398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University