View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18868_high_2 (Length: 622)

Name: NF18868_high_2
Description: NF18868
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18868_high_2
NF18868_high_2
[»] chr4 (13 HSPs)
chr4 (97-622)||(36425952-36426474)
chr4 (94-615)||(36397546-36398061)
chr4 (329-615)||(36369188-36369474)
chr4 (251-615)||(36404479-36404845)
chr4 (56-615)||(36373807-36374368)
chr4 (94-615)||(36387767-36388282)
chr4 (311-615)||(36411793-36412097)
chr4 (311-615)||(36417124-36417428)
chr4 (317-615)||(36433816-36434114)
chr4 (20-170)||(36369476-36369625)
chr4 (94-213)||(36417530-36417649)
chr4 (102-213)||(36412199-36412310)
chr4 (98-196)||(36404894-36404992)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 13)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 97 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 36426474 - 36425952
Alignment:
Q  97 acataccctttcttttttcctcccacatgcaatacatacatgaaaggaggaggacaattgcaactatagaaactaccagaaccgcagctaacctcttttt 196  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||| ||| || |||  | ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  36426474 acataccctttctctttttcttccacatgtaattcacacagaagaggaggatgacaattgcaactatagaagctacaagaattgcagctaacctcttttt 36426375  T
Q  197 accaaggattcctttgcnnnnnnngtgagtattgactttggctgataagaagcaacaagttcaaataagttcaaactgcacctaagttatatcaaattta 296  Q
     ||||||| ||||||||       ||  ||| | |  |  |  | ||||||| ||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||  | |||||||||    
T  36426374 gccaaggactcctttgctttttttgtc-gtagttagct--gacgctaagaagaaacaagtccaaagaagtttaaactacacataagtggtgtcaaattta 36426278  T
Q  297 gaacgaaaaacatggtaggggggaatatcttacctagttcaactgcattgactcgtaaaaataaatcttggccttgatcgctaactttctgaacgtccat 396  Q
    | | ||||||    | ||| ||||| ||||||||||||||||||  |  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  36426277 gcaagaaaaaaccagcaggagggaaaatcttacctagttcaactttagcgacgcgtaaaaataaatcttggccttgatcactaagtttttgaatgtccat 36426178  T
Q  397 taaatccccatgccatgccaaacaaccacttccaccattcctcacatcagcaactgcataggcagtacaagagcagtttctcaagcattctttctcacat 496  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36426177 taaatccccatgccatgccaaacatccacttccaccattcttcacgtcagcaactgcataggcagtacaagagcagtttctcaagcattctttctcacat 36426078  T
Q  497 tcatccaaattcaaaccatctatggcaactgccgtagacgtttcaggaacttttacgcttacaactttgataaacccttctccatttccacaaacagatg 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36426077 tcatccaaattcaaaccatctatggcaactgccgtagacgtttcaggaacttttacgcttacaactttgataaacccttctccatttccacaaacagatg 36425978  T
Q  597 cacctttctttcttacacagccacct 622  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36425977 cacctttctttcttacacatccacct 36425952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 94 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 36398061 - 36397546
Alignment:
Q  94 atcacataccctttcttttttcctcccacatgcaatacatacatgaaaggaggaggacaattgcaactatagaaactaccagaaccgcagctaacctctt 193  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| || ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||    
T  36398061 atcacataccctttctttttttcttccacatgtaattcacacaagagaggagaatgacgattgcaactattgaaactaccataattacagccaacctctt 36397962  T
Q  194 tttaccaaggattcctttgcnnnnnnngtgagtattgactttggctgataagaagcaacaagttcaaataagttcaaactgcacctaagttatatcaaat 293  Q
    |||| |||||| ||||||||       ||      ||   || |||||||||||| ||||||| || | ||||| ||||| ||| |||||  | ||||||    
T  36397961 tttatcaaggactcctttgctttttttgt------tgtaattagctgataagaagaaacaagtccagagaagtttaaactacacataagtggtgtcaaat 36397868  T
Q  294 ttagaacgaaaaacatggtaggggggaatatcttacctagttcaactgcattgactcgtaaaaataaatcttggccttgatcgctaactttctgaacgtc 393  Q
    ||||||  ||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||||  || ||| || ||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||    
T  36397867 ttagaagaaaaaaaacagtaggagggaatatcttaccaagttcaactttatcgacgcgcaaatataaatcttggccttgatcactaagtttttgaatgtc 36397768  T
Q  394 cattaaatccccatgccatgccaaacaaccacttccaccattcctcacatcagcaactgcataggcagtacaagagcagtttctcaagcattctttctca 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36397767 cattaaatccccatgccatgccaaacatccactaccaccattcctcacatcggctactgcataggaagtacaggagcagtttctcaagcattctttctca 36397668  T
Q  494 cattcatccaaattcaaaccatctatggcaactgccgtagacgtttcaggaacttttacgcttacaactttgataaacccttctccatttccacaaacag 593  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||  | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  36397667 cattcatccaaactcaaaccatctatggtaactgccccagatatatcaggaactttcaagcttacaactttgataaacccttcgccattcccacagacag 36397568  T
Q  594 atgcacctttctttcttacaca 615  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  36397567 atgcacctttcttccttacaca 36397546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 329 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 36369474 - 36369188
Alignment:
Q  329 cctagttcaactgcattgactcgtaaaaataaatcttggccttgatcgctaactttctgaacgtccattaaatccccatgccatgccaaacaaccacttc 428  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36369474 cctagttcaattgcattgacgcgtaaaaataaatcctggccttgatcgctaagtttctgaacgtccattaaatccccatgccatgccaaacaaccacttc 36369375  T
Q  429 caccattcctcacatcagcaactgcataggcagtacaagagcagtttctcaagcattctttctcacattcatccaaattcaaaccatctatggcaactgc 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || | ||||| ||    
T  36369374 caccattcctcacatcagcaactgcataggcagtacaagagcagtttctcaagcattctttctcacattcttccaaactcaaaccacctttagcaaccgc 36369275  T
Q  529 cgtagacgtttcaggaacttttacgcttacaactttgataaacccttctccatttccacaaacagatgcacctttctttcttacaca 615  Q
    |  ||| || || |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  36369274 cacagatgtatcgggaactttcaagctcacaactttgacaaacccttctccattcccacaaaccgatacacctttcttccttacaca 36369188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 251 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 36404845 - 36404479
Alignment:
Q  251 acaagttcaaataagttcaaactgcacctaagttatatcaaatttagaacgaaaaacatggtaggggggaatatcttacctagttcaactgcattgactc 350  Q
    |||||| |||||||||| |||||  || |||||  | |||||||||||| |||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||||||||  || ||| |    
T  36404845 acaagtccaaataagtttaaactatacataagtgctgtcaaatttagaa-gaaaaaaacagtaggaggggatatcttacctagttcaactttatcgacgc 36404747  T
Q  351 gtaaaaataaatcttggccttgatcgcta---actttctgaacgtccattaaatccccatgccatgccaaacaaccacttccaccattcctcacatcagc 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||   | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36404746 gtaaaaataaatcttggccttgatcactactaagtttttgaatgtccattaaatccccatgccatgccaaacatccactaccaccattcctcacatcagc 36404647  T
Q  448 aactgcataggcagtacaagagcagtttctcaagcattctttctcacattcatccaaattcaaaccatctatggcaactgccgtagacgtttcaggaact 547  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||  | |||| ||||    
T  36404646 aactgcataggcagtacaagagcaatttctcaagcattctttctcacattcttccaaactcaaaccatctatggcaactgctccagatatatcagcaact 36404547  T
Q  548 tttacgcttacaactttgataaacccttctccatttccacaaacagatgcacctttctttcttacaca 615  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  36404546 ttcacacttacaacttttataaacccttctccattcccacaaatagatgcacctttcttccttacaca 36404479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 56 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 36374368 - 36373807
Alignment:
Q  56 taatgaaatataaagaacaagggatgtcatccctaaat----atcacataccctttcttttttcctcccacatgcaatacatacatgaaaggaggaggac 151  Q
    |||||||||||||||||||  |||| | |||| ||||     |||||||||| |||||| ||| || |||| ||||| ||| | | || |||||||||||    
T  36374368 taatgaaatataaagaacagaggatattatccttaaaattgaatcacataccgtttcttgttttcttccacctgcaaaacacaaaggagaggaggaggac 36374269  T
Q  152 aattgcaactatagaaactaccagaaccgcagctaacctctttttaccaaggattcctttgcnnnnnnngtgagtattgactttggctgataagaagcaa 251  Q
    ||| |||||| ||||| | |||||||  ||||  | |||||||| ||| |||| ||||||||       |||  ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  36374268 aatcgcaactgtagaagcaaccagaattgcagaaatcctcttttgacctaggactcctttgcttcttttgtggttattggctttggctgataagaagaaa 36374169  T
Q  252 caagttcaaataagttcaaactgcacctaagttatatcaaatttagaacg-aaaaacatggtaggggggaatatcttacctagttcaactgcattgactc 350  Q
     |||| |||  || |||||  | |||| |||| || ||||| | |||| | ||||| |  ||  |||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  36374168 aaagtccaaggaatttcaat-tccaccaaagtgatgtcaaactaagaaaggaaaaaaaaagt--ggggaaataccttacctagttcaactgcatcgacac 36374072  T
Q  351 gtaaaaataaatcttggccttgatcgctaactttctgaacgtccattaaatccccatgccatgccaaacaaccacttccaccattcctcacatcagcaac 450  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36374071 gtacaaataaatcttggccttgatcactaagtttttgaatgtccattaaatccccataccatgccaaacagccacttccaccattactcacatcagcaac 36373972  T
Q  451 tgcataggcagtacaagagcagtttctcaagcattctttctcacattcatccaaattcaaaccatctatggcaactgccgtagacgtttcaggaactttt 550  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||| |||| || | | |||||||  |||  | |||||||||||     
T  36373971 tgcataggaagtacaagagcagtttctcaagcattcttcctcgcattcttccaaactcagaccacctttagtaactgccacagatatatcaggaactttc 36373872  T
Q  551 acgcttacaactttgataaacccttctccatttccacaaacagatgcacctttctttcttacaca 615  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  36373871 aagcttgcaactttgataaacccttctccattccgacaaatagatgcgcctttcttccttacaca 36373807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 94 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 36388282 - 36387767
Alignment:
Q  94 atcacataccctttcttttttcctcccacatgcaatacatacatgaaaggaggaggacaattgcaactatagaaactaccagaaccgcagctaacctctt 193  Q
    ||||||||||||  ||||||| || ||||||| | | || ||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||  ||||| ||||||||    
T  36388282 atcacataccctccctttttttcttccacatgtagttcacacaggagaggaggaggacaattgcaattatagaagctacaagaattgcagccaacctctt 36388183  T
Q  194 tttaccaaggattcctttgcnnnnnnngtgagtattgactttggctgataagaagcaacaagttcaaataagttcaaactgcacctaagttatatcaaat 293  Q
    |||| |||| | |||||| |       || |||| |     |||||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||| ||||| | |    |||| |    
T  36388182 tttatcaagaactccttttcgttttctgt-agtaat-----tggctgataagaagaagaaagtataaataagttcaaactacaccttaatggcgtcaact 36388089  T
Q  294 ttagaacgaaaaacatggtaggggggaatatcttacctagttcaactgcattgactcgtaaaaataaatcttggccttgatcgctaactttctgaacgtc 393  Q
    || ||| ||||||||   |||| | | |||||||||||||||||| |  || ||| |||| |||||||||||||||||||||  ||| ||| |||| |||    
T  36388088 ttggaaagaaaaacacaataggagtgtatatcttacctagttcaattttatcgacgcgtagaaataaatcttggccttgatcattaagtttttgaatgtc 36387989  T
Q  394 cattaaatccccatgccatgccaaacaaccacttccaccattcctcacatcagcaactgcataggcagtacaagagcagtttctcaagcattctttctca 493  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  36387988 tattaaatccccatgccatgccaaacatccacttccaccattcctcacatcagcaattgaataggcagtacaagaacagttttgcaagcattctttctca 36387889  T
Q  494 cattcatccaaattcaaaccatctatggcaactgccgtagacgtttcaggaacttttacgcttacaactttgataaacccttctccatttccacaaacag 593  Q
    ||||| |||||| ||||||||  | | |||||||||  ||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36387888 cattcttccaaactcaaaccacttttagcaactgccacagatgtatcaggaactttcaagcttacaactttgataaacccttctccattctcacaaacag 36387789  T
Q  594 atgcacctttctttcttacaca 615  Q
    | |  |||||||| ||||||||    
T  36387788 acgagcctttcttccttacaca 36387767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 311 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 36412097 - 36411793
Alignment:
Q  311 gtaggggggaatatcttacctagttcaactgcattgactcgtaaaaataaatcttggccttgatcgctaactttctgaacgtccattaaatccccatgcc 410  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||   | ||| || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  36412097 gtaggagggaatatcttaccaagttcaactttctcgacgcgcaaaaataaatcttggccctgattactaagtttttgaatgtccattaaattcccatgcc 36411998  T
Q  411 atgccaaacaaccacttccaccattcctcacatcagcaactgcataggcagtacaagagcagtttctcaagcattctttctcacattcatccaaattcaa 510  Q
    | | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  36411997 acgtcaaacatccactaccaccattcctcacatcagcaactgcataggcattacaagaacagtttctcaagcaatctttctcacattcttccaaagtcaa 36411898  T
Q  511 accatctatggcaactgccgtagacgtttcaggaacttttacgcttacaactttgataaacccttctccatttccacaaacagatgcacctttctttctt 610  Q
    |||||||||||||||||||  |||  | ||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  36411897 accatctatggcaactgccccagatatatcaggaactttcacccttaaaactttgttaaacccttctccattcccacaaacagatgcacctctttttctt 36411798  T
Q  611 acaca 615  Q
    |||||    
T  36411797 acaca 36411793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 311 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 36417428 - 36417124
Alignment:
Q  311 gtaggggggaatatcttacctagttcaactgcattgactcgtaaaaataaatcttggccttgatcgctaactttctgaacgtccattaaatccccatgcc 410  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||   | ||| || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  36417428 gtaggagggaatatcttaccaagttcaactttctcgacgcgcaaaaataaatcttggccctgattactaagtttttgaatgtccattaaattcccatgcc 36417329  T
Q  411 atgccaaacaaccacttccaccattcctcacatcagcaactgcataggcagtacaagagcagtttctcaagcattctttctcacattcatccaaattcaa 510  Q
    | | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  36417328 acgtcaaacatccactaccaccattcctcacatcagcaactgcataggcattacaagaacagtttctcaagcaatctttctcacattcttccaaagtcaa 36417229  T
Q  511 accatctatggcaactgccgtagacgtttcaggaacttttacgcttacaactttgataaacccttctccatttccacaaacagatgcacctttctttctt 610  Q
    |||||||||||||||||||  |||  | ||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  36417228 accatctatggcaactgccccagatatatcaggaactttcacccttaaaactttgttaaacccttctccattcccacaaacagatgcacctctttttctt 36417129  T
Q  611 acaca 615  Q
    |||||    
T  36417128 acaca 36417124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 317 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 36434114 - 36433816
Alignment:
Q  317 gggaatatcttacctagttcaactgcattgactcgtaaaaataaatcttggccttgatcgctaactttctgaacgtccattaaatccccatgccatgcca 416  Q
    |||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  36434114 gggaatttcttacctagttcaactttatcgacacgtaaaaataaatcttggccttgatcgcttactttttgaatgtccattaaatcaccatgccatgcca 36434015  T
Q  417 aacaaccacttccaccattcctcacatcagcaactgcataggcagtacaagagcagtttctcaagcattctttctcacattcatccaaattcaaaccatc 516  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |    
T  36434014 aacacccgcttccaccattgctcacattatcaactgcataggctgtacaagaacagtttctgaagcattctttttcacattcttccaaactcaaaccacc 36433915  T
Q  517 tatggcaactgccgtagacgtttcaggaacttttacgcttacaactttgataaacccttctccatttccacaaacagatgcacctttctttcttacaca 615  Q
    | |||||  |||| | || || ||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  36433914 tttggcatttgccatcgatgtatcaggaactttcaagctgacaattttgataaacccttctccattcccacaaacagatgaaccgttcttccttacaca 36433816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 36369625 - 36369476
Alignment:
Q  20 aataggacacattttgcataacagactgcnnnnnnntaatgaaatataaagaacaagggatgtcatccctaaatatcacataccctttcttttttcctcc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36369625 aataggacacattttgcataacagactgcaaaaaaataatgaattataaggaacaagggatgtcatccctaaatatcacataccctttcttttttcctcc 36369526  T
Q  120 cacatgcaatacatacatgaaaggaggaggacaattgcaactatagaaact 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36369525 cacatgcaatacatacatgaaaggaggaggacaattg-aactatagaaact 36369476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 36417649 - 36417530
Alignment:
Q  94 atcacataccctttcttttttcctcccacatgcaatacatacatgaaaggaggaggacaattgcaactatagaaactaccagaaccgcagctaacctctt 193  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| || |||  | ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||    
T  36417649 atcacataccctttctctttttcttccacatgtaattcacacagaagaggaggatgacaattgcaactatagaagctacaagaattgcagctaacctctt 36417550  T
Q  194 tttaccaaggattcctttgc 213  Q
    |||| |||||| ||||||||    
T  36417549 tttatcaaggactcctttgc 36417530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 36412310 - 36412199
Alignment:
Q  102 ccctttcttttttcctcccacatgcaatacatacatgaaaggaggaggacaattgcaactatagaaactaccagaaccgcagctaacctctttttaccaa 201  Q
    |||||||| |||| || ||||||| ||| || |||  | ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||| |||    
T  36412310 ccctttctctttttcttccacatgtaattcacacagaagaggaggatgacaattgcaactatagaagctacaagaattgcagctaacctctttttatcaa 36412211  T
Q  202 ggattcctttgc 213  Q
    ||| ||||||||    
T  36412210 ggactcctttgc 36412199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 98 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 36404992 - 36404894
Alignment:
Q  98 cataccctttcttttttcctcccacatgcaatacatacatgaaaggaggaggacaattgcaactatagaaactaccagaaccgcagctaacctcttttt 196  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||| |||  | ||| || ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||    
T  36404992 cataccctttgtttttttcttccacatgtaatttacacaggagaggaggatgacaattgcaacaatagaagctaccagaattgcagccaacctcttttt 36404894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University