View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18905_low_9 (Length: 323)

Name: NF18905_low_9
Description: NF18905
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18905_low_9
NF18905_low_9
[»] chr7 (77 HSPs)
chr7 (1-282)||(22072929-22073210)
chr7 (1-284)||(16056344-16056624)
chr7 (1-284)||(16219541-16219822)
chr7 (1-279)||(47831823-47832099)
chr7 (1-279)||(67761-68036)
chr7 (1-323)||(810915-811236)
chr7 (1-263)||(18005662-18005922)
chr7 (1-288)||(12901339-12901629)
chr7 (4-323)||(20219975-20220290)
chr7 (1-279)||(44014194-44014464)
chr7 (71-323)||(15113028-15113279)
chr7 (71-323)||(15116565-15116816)
chr7 (1-279)||(15754718-15754992)
chr7 (1-322)||(11995816-11996132)
chr7 (1-322)||(34200802-34201118)
chr7 (4-322)||(28505087-28505400)
chr7 (157-284)||(16324175-16324302)
chr7 (4-155)||(16495421-16495567)
chr7 (1-108)||(3564363-3564469)
chr7 (1-109)||(2280117-2280224)
chr7 (4-108)||(13647344-13647447)
chr7 (1-108)||(48273405-48273511)
chr7 (3-105)||(38227499-38227599)
chr7 (130-279)||(9389526-9389675)
chr7 (7-165)||(12255733-12255892)
chr7 (1-165)||(1867937-1868100)
chr7 (1-108)||(24275184-24275289)
chr7 (1-167)||(14044762-14044928)
chr7 (1-167)||(14354792-14354958)
chr7 (1-105)||(12698847-12698951)
chr7 (1-105)||(16386249-16386353)
chr7 (1-105)||(18456415-18456517)
chr7 (1-105)||(26212012-26212115)
chr7 (1-108)||(456334-456439)
chr7 (1-108)||(11393331-11393436)
chr7 (1-108)||(11972509-11972614)
chr7 (1-108)||(14949166-14949271)
chr7 (1-108)||(15376757-15376862)
chr7 (1-108)||(16232533-16232638)
chr7 (1-108)||(16410072-16410177)
chr7 (1-108)||(18640285-18640390)
chr7 (1-108)||(20385167-20385272)
chr7 (1-108)||(21189639-21189744)
chr7 (1-108)||(32125504-32125609)
chr7 (1-108)||(41522930-41523035)
chr7 (1-108)||(41525392-41525497)
chr7 (1-105)||(9509205-9509308)
chr7 (1-108)||(15144037-15144142)
chr7 (1-108)||(18430725-18430830)
chr7 (1-108)||(24702251-24702356)
chr7 (1-108)||(27216873-27216978)
chr7 (1-108)||(44116522-44116627)
chr7 (1-105)||(10589055-10589158)
chr7 (8-165)||(15008441-15008597)
chr7 (1-101)||(16213697-16213795)
chr7 (1-148)||(17061919-17062064)
chr7 (1-108)||(3386346-3386451)
chr7 (3-165)||(19486686-19486847)
chr7 (1-97)||(13869359-13869453)
chr7 (4-86)||(40443410-40443490)
chr7 (3-109)||(10063816-10063921)
chr7 (1-108)||(38898420-38898526)
chr7 (5-108)||(13831390-13831491)
chr7 (4-55)||(27847881-27847932)
chr7 (1-108)||(24704701-24704803)
chr7 (13-114)||(14036282-14036384)
chr7 (13-114)||(14346312-14346414)
chr7 (1-38)||(20110569-20110606)
chr7 (236-322)||(9751336-9751423)
chr7 (3-54)||(18154894-18154944)
chr7 (11-57)||(48991206-48991252)
chr7 (4-108)||(12756715-12756817)
chr7 (236-279)||(39267476-39267519)
chr7 (278-323)||(9177450-9177495)
chr7 (6-54)||(9177718-9177766)
chr7 (52-108)||(26356027-26356083)
chr7 (52-108)||(26358479-26358535)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-284)||(10543-10824)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (1-284)||(32552-32832)
scaffold0034 (4-86)||(51904-51985)
[»] chr5 (73 HSPs)
chr5 (1-279)||(21329326-21329602)
chr5 (4-323)||(20026725-20027043)
chr5 (1-282)||(26011861-26012140)
chr5 (1-284)||(21501978-21502261)
chr5 (1-272)||(21565558-21565827)
chr5 (4-323)||(22178004-22178323)
chr5 (1-322)||(19660624-19660940)
chr5 (1-279)||(22959364-22959637)
chr5 (1-279)||(19668914-19669189)
chr5 (4-154)||(22144068-22144217)
chr5 (1-105)||(21729066-21729169)
chr5 (1-105)||(21808391-21808494)
chr5 (1-105)||(24529236-24529339)
chr5 (1-108)||(9077968-9078074)
chr5 (1-107)||(1096483-1096588)
chr5 (1-94)||(21997547-21997639)
chr5 (1-109)||(22412200-22412306)
chr5 (1-105)||(24493585-24493687)
chr5 (1-105)||(25421548-25421651)
chr5 (5-105)||(25431414-25431513)
chr5 (4-84)||(36314596-36314675)
chr5 (1-108)||(264812-264917)
chr5 (1-108)||(10732984-10733089)
chr5 (1-108)||(20902053-20902158)
chr5 (1-108)||(20909025-20909130)
chr5 (1-108)||(39363397-39363502)
chr5 (1-105)||(8286844-8286948)
chr5 (1-105)||(13025327-13025429)
chr5 (1-105)||(13095511-13095613)
chr5 (1-105)||(22075035-22075138)
chr5 (1-105)||(23390498-23390601)
chr5 (212-323)||(25743945-25744056)
chr5 (1-108)||(29329947-29330052)
chr5 (1-108)||(42245409-42245514)
chr5 (161-279)||(21741374-21741492)
chr5 (1-108)||(36154827-36154929)
chr5 (1-97)||(39245149-39245243)
chr5 (1-108)||(2154658-2154763)
chr5 (1-108)||(11581243-11581348)
chr5 (1-108)||(29345993-29346098)
chr5 (1-97)||(10775731-10775825)
chr5 (1-97)||(18319089-18319183)
chr5 (1-108)||(29348466-29348571)
chr5 (1-108)||(29350939-29351044)
chr5 (38-142)||(29448055-29448159)
chr5 (3-165)||(40725871-40726032)
chr5 (4-108)||(37723922-37724023)
chr5 (1-97)||(31061081-31061175)
chr5 (1-97)||(38619447-38619541)
chr5 (1-108)||(32027406-32027511)
chr5 (4-56)||(21293020-21293071)
chr5 (1-97)||(23064524-23064618)
chr5 (192-267)||(27988770-27988845)
chr5 (1-72)||(20918028-20918097)
chr5 (236-322)||(24767123-24767210)
chr5 (1-55)||(26732884-26732937)
chr5 (52-109)||(20766118-20766174)
chr5 (94-155)||(21741486-21741545)
chr5 (1-97)||(24067120-24067214)
chr5 (72-155)||(10753603-10753685)
chr5 (72-155)||(21871525-21871607)
chr5 (72-155)||(21875805-21875887)
chr5 (236-322)||(22119979-22120066)
chr5 (72-155)||(22120149-22120231)
chr5 (3-38)||(26704089-26704124)
chr5 (4-55)||(26740697-26740747)
chr5 (3-38)||(26973822-26973857)
chr5 (124-155)||(36314685-36314716)
chr5 (4-54)||(15796438-15796487)
chr5 (1-85)||(18418596-18418678)
chr5 (1-38)||(20806854-20806891)
chr5 (38-105)||(18356367-18356432)
chr5 (12-72)||(21873277-21873336)
[»] chr8 (72 HSPs)
chr8 (1-282)||(21285613-21285892)
chr8 (1-282)||(6520384-6520662)
chr8 (1-263)||(38855097-38855356)
chr8 (4-323)||(17266777-17267096)
chr8 (4-323)||(20498581-20498899)
chr8 (4-323)||(37116366-37116684)
chr8 (1-323)||(983187-983511)
chr8 (1-284)||(23760665-23760949)
chr8 (4-323)||(24353039-24353360)
chr8 (4-322)||(5866063-5866376)
chr8 (68-323)||(22364745-22364998)
chr8 (1-322)||(17140932-17141248)
chr8 (1-279)||(21673720-21673995)
chr8 (1-323)||(21491011-21491328)
chr8 (1-275)||(26355533-26355803)
chr8 (1-322)||(21249400-21249716)
chr8 (1-319)||(21255238-21255551)
chr8 (1-109)||(16092340-16092447)
chr8 (1-105)||(18818411-18818514)
chr8 (1-105)||(28649046-28649149)
chr8 (1-105)||(7372794-7372897)
chr8 (1-105)||(21919002-21919105)
chr8 (4-155)||(17439458-17439609)
chr8 (1-108)||(14409488-14409593)
chr8 (1-108)||(16413360-16413465)
chr8 (1-99)||(6759274-6759371)
chr8 (1-99)||(23406395-23406492)
chr8 (3-155)||(17612062-17612213)
chr8 (1-105)||(20536224-20536327)
chr8 (1-105)||(21923930-21924033)
chr8 (1-105)||(22626752-22626854)
chr8 (1-108)||(1484415-1484520)
chr8 (1-108)||(5853336-5853441)
chr8 (3-165)||(13508027-13508188)
chr8 (1-108)||(15203275-15203380)
chr8 (1-108)||(20403240-20403345)
chr8 (1-108)||(22001766-22001871)
chr8 (5-109)||(22875085-22875187)
chr8 (3-165)||(13597559-13597720)
chr8 (1-108)||(20046239-20046344)
chr8 (1-108)||(41598201-41598306)
chr8 (1-86)||(31971273-31971356)
chr8 (1-109)||(26219730-26219835)
chr8 (1-108)||(4483294-4483398)
chr8 (1-108)||(4542417-4542522)
chr8 (4-86)||(16199666-16199746)
chr8 (4-105)||(21395984-21396082)
chr8 (4-105)||(21790477-21790575)
chr8 (1-63)||(18879275-18879336)
chr8 (1-97)||(15070571-15070665)
chr8 (1-93)||(45290754-45290844)
chr8 (4-105)||(21389454-21389552)
chr8 (4-105)||(21778780-21778878)
chr8 (4-86)||(45131019-45131098)
chr8 (1-108)||(19896278-19896386)
chr8 (1-109)||(26225291-26225396)
chr8 (1-108)||(26223932-26224037)
chr8 (4-57)||(19154936-19154989)
chr8 (4-108)||(19801426-19801527)
chr8 (1-97)||(19937061-19937155)
chr8 (68-114)||(40492844-40492890)
chr8 (13-108)||(14823798-14823891)
chr8 (1-105)||(18678104-18678207)
chr8 (72-155)||(18862430-18862512)
chr8 (72-155)||(21383896-21383978)
chr8 (72-155)||(21387316-21387398)
chr8 (72-155)||(21411189-21411271)
chr8 (72-155)||(21805681-21805763)
chr8 (72-155)||(21827799-21827881)
chr8 (1-108)||(25484319-25484417)
chr8 (71-167)||(14103165-14103260)
chr8 (1-105)||(32121748-32121851)
[»] chr6 (80 HSPs)
chr6 (4-280)||(23019425-23019699)
chr6 (1-291)||(19668387-19668676)
chr6 (1-323)||(9098310-9098619)
chr6 (1-279)||(19652211-19652485)
chr6 (1-323)||(20109154-20109476)
chr6 (2-322)||(28496260-28496575)
chr6 (2-322)||(29808671-29808986)
chr6 (1-279)||(1561319-1561593)
chr6 (4-323)||(23076749-23077067)
chr6 (4-323)||(35008167-35008485)
chr6 (44-323)||(22080523-22080800)
chr6 (1-165)||(25644336-25644500)
chr6 (155-282)||(27333111-27333238)
chr6 (155-282)||(27393851-27393978)
chr6 (4-108)||(29060559-29060662)
chr6 (1-105)||(16496260-16496363)
chr6 (1-284)||(4185648-4185926)
chr6 (1-84)||(27333241-27333323)
chr6 (1-84)||(27393981-27394063)
chr6 (1-108)||(30676754-30676859)
chr6 (1-113)||(18409821-18409932)
chr6 (1-148)||(22782240-22782385)
chr6 (1-108)||(25629354-25629460)
chr6 (1-105)||(17287798-17287901)
chr6 (1-108)||(12742330-12742435)
chr6 (1-108)||(18334636-18334741)
chr6 (1-108)||(19005059-19005164)
chr6 (1-108)||(19858963-19859068)
chr6 (1-108)||(20593789-20593895)
chr6 (1-108)||(24422560-24422665)
chr6 (1-108)||(25656642-25656747)
chr6 (1-108)||(33861807-33861912)
chr6 (1-108)||(33864291-33864396)
chr6 (1-99)||(20076716-20076812)
chr6 (4-108)||(19303540-19303642)
chr6 (1-105)||(20360962-20361065)
chr6 (1-108)||(2291224-2291329)
chr6 (1-108)||(8055042-8055147)
chr6 (1-108)||(25688515-25688620)
chr6 (1-108)||(25754822-25754927)
chr6 (1-108)||(26924684-26924789)
chr6 (1-108)||(34963386-34963491)
chr6 (1-165)||(8227453-8227616)
chr6 (12-284)||(31155223-31155491)
chr6 (40-284)||(4668038-4668277)
chr6 (40-284)||(4674885-4675124)
chr6 (4-108)||(18456735-18456837)
chr6 (4-108)||(18461895-18461997)
chr6 (1-108)||(1540955-1541060)
chr6 (1-108)||(1595562-1595667)
chr6 (1-108)||(20556936-20557041)
chr6 (1-86)||(20638304-20638388)
chr6 (1-97)||(16448582-16448676)
chr6 (4-262)||(18199261-18199519)
chr6 (1-105)||(22780229-22780332)
chr6 (6-53)||(22831524-22831571)
chr6 (8-57)||(16920679-16920728)
chr6 (4-57)||(35245605-35245658)
chr6 (4-262)||(18177517-18177775)
chr6 (4-262)||(18204096-18204354)
chr6 (1-108)||(3852061-3852166)
chr6 (4-86)||(18821866-18821946)
chr6 (1-89)||(4186383-4186470)
chr6 (4-48)||(11185524-11185568)
chr6 (1-47)||(25714433-25714478)
chr6 (129-207)||(28103799-28103877)
chr6 (68-167)||(18696570-18696667)
chr6 (37-165)||(18706356-18706483)
chr6 (6-57)||(33443068-33443118)
chr6 (234-323)||(23527891-23527980)
chr6 (179-262)||(17105925-17106007)
chr6 (72-155)||(22949384-22949466)
chr6 (72-155)||(22953340-22953422)
chr6 (72-155)||(23871828-23871910)
chr6 (72-155)||(23875784-23875866)
chr6 (72-155)||(27325388-27325470)
chr6 (184-262)||(23539165-23539243)
chr6 (235-284)||(4189203-4189252)
chr6 (1-38)||(19848063-19848100)
chr6 (4-32)||(22080799-22080827)
[»] chr4 (75 HSPs)
chr4 (1-323)||(12287994-12288315)
chr4 (1-279)||(39706118-39706393)
chr4 (4-323)||(13635-13953)
chr4 (4-323)||(53081935-53082254)
chr4 (4-323)||(46640241-46640558)
chr4 (1-322)||(12774023-12774333)
chr4 (1-283)||(43198380-43198660)
chr4 (23-284)||(16596686-16596942)
chr4 (1-275)||(8846372-8846660)
chr4 (1-279)||(15551833-15552105)
chr4 (1-165)||(52243136-52243301)
chr4 (94-279)||(15099457-15099640)
chr4 (94-279)||(15190424-15190607)
chr4 (1-108)||(16377522-16377626)
chr4 (1-105)||(7798790-7798893)
chr4 (1-105)||(12902773-12902876)
chr4 (1-105)||(52873369-52873472)
chr4 (1-109)||(54798752-54798859)
chr4 (1-105)||(7088893-7088996)
chr4 (1-109)||(14280329-14280435)
chr4 (1-108)||(18215318-18215423)
chr4 (1-108)||(44928923-44929029)
chr4 (1-105)||(7893719-7893822)
chr4 (1-105)||(23374361-23374464)
chr4 (1-108)||(12351-12456)
chr4 (1-108)||(14038664-14038770)
chr4 (1-108)||(15118396-15118501)
chr4 (1-108)||(19618216-19618321)
chr4 (1-108)||(44773131-44773236)
chr4 (1-108)||(52312523-52312628)
chr4 (1-78)||(3096309-3096385)
chr4 (5-105)||(16270238-16270336)
chr4 (1-108)||(1837553-1837658)
chr4 (1-108)||(3515020-3515125)
chr4 (1-108)||(18239463-18239568)
chr4 (1-108)||(19242712-19242817)
chr4 (1-108)||(44615301-44615406)
chr4 (1-108)||(50222383-50222488)
chr4 (1-108)||(51463912-51464017)
chr4 (4-86)||(6190481-6190563)
chr4 (1-105)||(6899907-6900009)
chr4 (1-97)||(15355380-15355474)
chr4 (1-105)||(16239972-16240074)
chr4 (1-105)||(22636451-22636554)
chr4 (1-101)||(23803316-23803414)
chr4 (1-105)||(44052845-44052948)
chr4 (2-109)||(8574867-8574971)
chr4 (1-108)||(14970751-14970856)
chr4 (4-57)||(17046506-17046559)
chr4 (1-108)||(44102227-44102332)
chr4 (3-97)||(15367708-15367800)
chr4 (3-97)||(15370036-15370128)
chr4 (3-97)||(15371220-15371312)
chr4 (3-97)||(15373501-15373593)
chr4 (3-97)||(15402721-15402813)
chr4 (4-108)||(21815629-21815731)
chr4 (4-86)||(14053323-14053403)
chr4 (1-47)||(7641286-7641331)
chr4 (1-47)||(12610963-12611008)
chr4 (66-112)||(15464926-15464972)
chr4 (3-97)||(16223550-16223642)
chr4 (177-266)||(14164739-14164827)
chr4 (4-108)||(22353852-22353955)
chr4 (236-322)||(22633999-22634086)
chr4 (177-266)||(14158034-14158122)
chr4 (72-155)||(630728-630810)
chr4 (72-155)||(3331970-3332052)
chr4 (236-279)||(13812639-13812682)
chr4 (72-155)||(13812763-13812845)
chr4 (72-155)||(14953915-14953997)
chr4 (236-322)||(24028989-24029076)
chr4 (72-155)||(25690146-25690228)
chr4 (234-315)||(16043259-16043340)
chr4 (236-323)||(13844786-13844874)
chr4 (1-97)||(20149842-20149936)
[»] chr1 (60 HSPs)
chr1 (4-323)||(21861354-21861672)
chr1 (4-276)||(22921701-22921971)
chr1 (4-323)||(21896043-21896358)
chr1 (4-320)||(16368074-16368388)
chr1 (4-323)||(50613901-50614219)
chr1 (4-323)||(50621729-50622047)
chr1 (4-323)||(50686630-50686949)
chr1 (1-275)||(33681023-33681295)
chr1 (1-279)||(22237643-22237920)
chr1 (4-300)||(41049843-41050138)
chr1 (1-284)||(52927806-52928075)
chr1 (1-322)||(21754061-21754370)
chr1 (184-323)||(12271744-12271883)
chr1 (1-322)||(20918620-20918936)
chr1 (1-279)||(20248295-20248567)
chr1 (94-279)||(35981517-35981700)
chr1 (94-279)||(49261448-49261631)
chr1 (5-155)||(14295507-14295652)
chr1 (93-279)||(20636956-20637140)
chr1 (4-165)||(35261023-35261180)
chr1 (1-108)||(50210212-50210318)
chr1 (4-148)||(45574846-45574989)
chr1 (1-105)||(34509796-34509899)
chr1 (1-164)||(16758665-16758828)
chr1 (1-105)||(27250731-27250834)
chr1 (1-108)||(13988879-13988984)
chr1 (1-108)||(21840780-21840885)
chr1 (1-108)||(21923335-21923440)
chr1 (1-108)||(23593779-23593884)
chr1 (1-107)||(31612326-31612430)
chr1 (1-105)||(21026696-21026799)
chr1 (1-88)||(20847173-20847259)
chr1 (1-108)||(21475131-21475236)
chr1 (1-108)||(29298150-29298254)
chr1 (1-108)||(433025-433128)
chr1 (4-166)||(16093825-16093987)
chr1 (3-100)||(22123119-22123215)
chr1 (1-105)||(22532285-22532388)
chr1 (1-108)||(29776701-29776806)
chr1 (1-108)||(16361930-16362035)
chr1 (38-155)||(22130863-22130975)
chr1 (11-61)||(38801433-38801483)
chr1 (1-54)||(20454606-20454658)
chr1 (1-148)||(21707180-21707325)
chr1 (1-148)||(21711722-21711867)
chr1 (1-206)||(21161732-21161932)
chr1 (1-97)||(13212917-13213011)
chr1 (1-97)||(15860064-15860158)
chr1 (1-97)||(16275419-16275513)
chr1 (1-97)||(21342109-21342203)
chr1 (1-97)||(21346974-21347068)
chr1 (1-105)||(22468698-22468801)
chr1 (6-155)||(26064959-26065107)
chr1 (61-155)||(51130639-51130729)
chr1 (1-38)||(21714558-21714595)
chr1 (1-97)||(40389167-40389261)
chr1 (72-155)||(1924914-1924996)
chr1 (72-155)||(20923928-20924010)
chr1 (71-108)||(12271639-12271676)
chr1 (239-323)||(43697623-43697708)
[»] chr3 (93 HSPs)
chr3 (1-279)||(15470940-15471215)
chr3 (1-279)||(14234503-14234781)
chr3 (1-275)||(16097344-16097616)
chr3 (4-291)||(37250984-37251270)
chr3 (1-323)||(13210113-13210432)
chr3 (1-279)||(16103796-16104071)
chr3 (4-323)||(22110136-22110454)
chr3 (1-322)||(32307693-32308003)
chr3 (145-323)||(43927291-43927469)
chr3 (1-218)||(12174152-12174364)
chr3 (4-322)||(49667870-49668178)
chr3 (94-279)||(1465240-1465423)
chr3 (4-165)||(52523669-52523831)
chr3 (95-279)||(49389459-49389642)
chr3 (3-109)||(42386428-42386533)
chr3 (1-105)||(18438550-18438653)
chr3 (1-105)||(12399225-12399328)
chr3 (1-109)||(27165263-27165370)
chr3 (1-107)||(14972870-14972975)
chr3 (4-148)||(43925977-43926121)
chr3 (1-96)||(53301562-53301656)
chr3 (179-279)||(12934141-12934241)
chr3 (1-105)||(23083363-23083466)
chr3 (1-105)||(26686903-26687006)
chr3 (1-108)||(25476384-25476490)
chr3 (1-108)||(29172627-29172732)
chr3 (1-275)||(1644517-1644778)
chr3 (4-275)||(9512939-9513195)
chr3 (4-89)||(9520914-9520998)
chr3 (4-148)||(43550482-43550625)
chr3 (1-105)||(14572605-14572707)
chr3 (1-105)||(20698437-20698540)
chr3 (1-105)||(24153211-24153313)
chr3 (1-109)||(36166611-36166716)
chr3 (1-108)||(6469178-6469283)
chr3 (1-108)||(9707651-9707756)
chr3 (1-108)||(17463191-17463296)
chr3 (1-108)||(17672639-17672744)
chr3 (3-165)||(24340665-24340826)
chr3 (1-108)||(28848655-28848760)
chr3 (1-108)||(34159339-34159444)
chr3 (1-108)||(38961935-38962040)
chr3 (1-108)||(45606951-45607056)
chr3 (1-108)||(55476504-55476609)
chr3 (3-109)||(23274705-23274810)
chr3 (1-103)||(55500955-55501055)
chr3 (1-86)||(11424781-11424864)
chr3 (1-105)||(13442290-13442393)
chr3 (1-105)||(17487872-17487975)
chr3 (1-105)||(17499354-17499457)
chr3 (1-109)||(21618462-21618567)
chr3 (1-105)||(43840948-43841051)
chr3 (1-108)||(7781391-7781496)
chr3 (5-108)||(8899111-8899212)
chr3 (1-108)||(12567573-12567678)
chr3 (1-108)||(13544038-13544143)
chr3 (1-108)||(16454325-16454430)
chr3 (3-165)||(37642207-37642368)
chr3 (1-108)||(13151834-13151940)
chr3 (1-108)||(13154299-13154405)
chr3 (4-108)||(53070697-53070799)
chr3 (1-108)||(10247767-10247872)
chr3 (1-108)||(15977528-15977633)
chr3 (1-108)||(16282855-16282960)
chr3 (1-108)||(17446699-17446803)
chr3 (234-317)||(17672869-17672952)
chr3 (1-108)||(40213720-40213825)
chr3 (1-108)||(50242835-50242940)
chr3 (1-108)||(41123903-41124005)
chr3 (234-291)||(324481-324538)
chr3 (1-50)||(28194706-28194755)
chr3 (1-97)||(12119780-12119874)
chr3 (4-113)||(12377940-12378050)
chr3 (1-105)||(14576835-14576937)
chr3 (1-97)||(15412442-15412536)
chr3 (47-165)||(2051141-2051260)
chr3 (1-97)||(8499531-8499625)
chr3 (179-275)||(9521074-9521170)
chr3 (3-165)||(22147467-22147628)
chr3 (4-108)||(606324-606428)
chr3 (1-109)||(10556998-10557105)
chr3 (1-89)||(44494822-44494908)
chr3 (1-47)||(17737249-17737294)
chr3 (1-38)||(45577950-45577987)
chr3 (226-279)||(12171935-12171988)
chr3 (236-279)||(12340000-12340043)
chr3 (72-155)||(14501207-14501290)
chr3 (236-322)||(14665853-14665940)
chr3 (236-322)||(14735366-14735453)
chr3 (72-155)||(19776007-19776089)
chr3 (72-155)||(37439421-37439503)
chr3 (6-56)||(13919350-13919399)
chr3 (1-38)||(46822281-46822318)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (1-284)||(12955-13236)
scaffold0138 (68-321)||(18024-18276)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (4-323)||(12587-12904)
[»] chr2 (66 HSPs)
chr2 (4-323)||(7517-7835)
chr2 (4-323)||(23791292-23791611)
chr2 (1-323)||(18786687-18787008)
chr2 (1-323)||(28405992-28406314)
chr2 (1-263)||(25175866-25176126)
chr2 (4-291)||(23207296-23207582)
chr2 (4-323)||(25108906-25109225)
chr2 (71-323)||(22459346-22459598)
chr2 (1-153)||(7679601-7679750)
chr2 (1-108)||(22105425-22105531)
chr2 (1-165)||(23708561-23708724)
chr2 (6-279)||(22134046-22134306)
chr2 (1-105)||(298816-298920)
chr2 (1-155)||(23071905-23072054)
chr2 (1-105)||(23060529-23060632)
chr2 (3-105)||(23076460-23076561)
chr2 (3-155)||(19671848-19671998)
chr2 (1-109)||(22337131-22337238)
chr2 (1-108)||(6726008-6726113)
chr2 (1-108)||(571410-571515)
chr2 (1-108)||(18808956-18809061)
chr2 (1-108)||(23130875-23130980)
chr2 (1-108)||(23133342-23133447)
chr2 (1-108)||(23135603-23135708)
chr2 (1-108)||(23709576-23709681)
chr2 (1-108)||(23712057-23712162)
chr2 (1-108)||(24367787-24367892)
chr2 (1-108)||(26505392-26505497)
chr2 (1-108)||(26507870-26507975)
chr2 (1-108)||(32214965-32215070)
chr2 (1-108)||(34402566-34402671)
chr2 (1-108)||(39682326-39682431)
chr2 (4-155)||(20520145-20520295)
chr2 (1-86)||(38136-38219)
chr2 (1-108)||(21155104-21155209)
chr2 (4-165)||(22413078-22413240)
chr2 (1-108)||(28577112-28577217)
chr2 (5-103)||(22731238-22731335)
chr2 (1-108)||(24898239-24898345)
chr2 (1-108)||(24900722-24900828)
chr2 (1-108)||(24903199-24903305)
chr2 (1-108)||(24905676-24905782)
chr2 (1-108)||(24908151-24908257)
chr2 (4-105)||(20309127-20309225)
chr2 (1-108)||(32039542-32039647)
chr2 (1-108)||(43137312-43137417)
chr2 (1-63)||(23285881-23285942)
chr2 (4-86)||(32451949-32452031)
chr2 (4-108)||(23103396-23103497)
chr2 (1-105)||(23660039-23660141)
chr2 (4-165)||(24697548-24697709)
chr2 (1-108)||(45029898-45030003)
chr2 (4-114)||(23004767-23004878)
chr2 (1-105)||(22738182-22738284)
chr2 (1-105)||(23654388-23654491)
chr2 (1-64)||(8946673-8946735)
chr2 (1-108)||(24529573-24529678)
chr2 (1-49)||(23040247-23040294)
chr2 (1-108)||(38967387-38967493)
chr2 (1-47)||(24643054-24643099)
chr2 (228-322)||(23071749-23071843)
chr2 (6-56)||(23287384-23287433)
chr2 (6-55)||(26392403-26392451)
chr2 (72-155)||(1283666-1283748)
chr2 (72-155)||(30344776-30344858)
chr2 (1-105)||(25616201-25616304)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (1-323)||(8482-8805)
scaffold0621 (1-279)||(6551-6826)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (1-279)||(12782-13058)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (65-282)||(8094-8310)
scaffold0556 (4-279)||(6831-7101)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (1-279)||(5952-6228)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (4-323)||(6067-6386)
scaffold0420 (4-51)||(13793-13840)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (1-284)||(1098-1379)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (1-284)||(10365-10646)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-275)||(19280-19552)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (1-275)||(100390-100662)
scaffold0023 (1-279)||(40003-40279)
scaffold0023 (1-108)||(17484-17589)
scaffold0023 (1-108)||(94424-94529)
scaffold0023 (1-58)||(119891-119948)
scaffold0023 (1-108)||(44467-44573)
scaffold0023 (192-279)||(101599-101685)
scaffold0023 (1-62)||(101515-101576)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (1-279)||(6627-6903)
scaffold0333 (1-279)||(14007-14283)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (4-290)||(136185-136471)
scaffold0021 (4-290)||(144893-145179)
scaffold0021 (4-108)||(174785-174886)
scaffold0021 (1-55)||(121782-121835)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (1-284)||(7900-8179)
scaffold0218 (32-322)||(29066-29354)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (4-323)||(53333-53651)
scaffold0075 (236-322)||(8080-8167)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (1-279)||(864-1139)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (8-323)||(38339-38654)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (1-279)||(5659-5934)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (1-279)||(2474-2750)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (1-280)||(160700-160976)
scaffold0001 (1-108)||(501097-501202)
scaffold0001 (234-315)||(85417-85498)
scaffold0001 (4-97)||(85635-85726)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (1-279)||(129921-130197)
scaffold0010 (4-112)||(60710-60818)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (1-273)||(22509-22775)
scaffold0037 (1-108)||(82085-82190)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (1-291)||(103455-103736)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (8-313)||(78345-78648)
scaffold0022 (4-323)||(128755-129072)
scaffold0022 (1-109)||(116443-116548)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-279)||(14526-14802)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (4-323)||(2588-2908)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (1-279)||(45621-45897)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (4-323)||(97024-97341)
scaffold0006 (4-323)||(106302-106619)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (35-323)||(54-342)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (43-323)||(2002-2281)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (4-291)||(19701-19987)
scaffold0080 (1-105)||(39929-40031)
scaffold0080 (72-155)||(48939-49021)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (3-261)||(62216-62469)
scaffold0028 (4-279)||(132677-132943)
scaffold0028 (1-108)||(136693-136798)
scaffold0028 (1-108)||(139162-139267)
scaffold0028 (1-108)||(144100-144205)
scaffold0028 (1-108)||(134224-134329)
scaffold0028 (1-108)||(141631-141736)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (1-322)||(15677-15993)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (1-275)||(145-416)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (4-323)||(569-885)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (1-284)||(11308-11586)
scaffold0046 (1-221)||(2013-2228)
scaffold0046 (1-105)||(28430-28533)
scaffold0046 (1-41)||(4568-4608)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (4-323)||(267679-267987)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (4-291)||(1614-1900)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (6-284)||(7882-8161)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (1-284)||(34139-34417)
scaffold0175 (35-105)||(13141-13211)
scaffold0175 (1-38)||(289-326)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (1-108)||(3185-3291)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (1-112)||(27744-27854)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (4-155)||(1025-1171)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (1-112)||(16095-16205)
scaffold0357 (4-110)||(13147-13252)
scaffold0357 (4-56)||(2680-2732)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (4-109)||(1051-1155)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (1-108)||(26064-26170)
scaffold0122 (1-109)||(44705-44812)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (176-275)||(15665-15764)
scaffold0020 (1-121)||(15763-15882)
scaffold0020 (3-38)||(178912-178947)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (1-155)||(25122-25275)
scaffold0123 (234-323)||(25353-25442)
scaffold0123 (68-165)||(620-715)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-109)||(3149-3255)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (179-322)||(28596-28740)
scaffold0211 (1-62)||(28813-28875)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-109)||(39493-39599)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (1-109)||(38700-38807)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-109)||(75213-75319)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (4-241)||(32117-32345)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (1-108)||(17214-17322)
scaffold0056 (4-108)||(79328-79430)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (1-105)||(4865-4968)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (1-89)||(23901-23988)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-105)||(51929-52032)
scaffold0011 (1-105)||(167980-168083)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (3-165)||(11482-11643)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (3-165)||(38198-38359)
scaffold0124 (72-155)||(24605-24690)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (1-108)||(16129-16235)
scaffold0120 (1-105)||(32959-33061)
scaffold0120 (1-105)||(45944-46046)
scaffold0120 (1-47)||(17389-17434)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (1-105)||(22899-23001)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (1-109)||(4524-4630)
scaffold0228 (1-109)||(12106-12212)
scaffold0228 (1-109)||(22058-22164)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-105)||(13227-13330)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (1-108)||(4707-4812)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (1-112)||(8495-8605)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-108)||(10786-10891)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (1-108)||(13405-13510)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-108)||(20760-20865)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (5-108)||(16599-16701)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (1-108)||(37834-37939)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (3-105)||(24304-24406)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (1-108)||(158494-158599)
scaffold0003 (1-108)||(339949-340052)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (2-108)||(29946-30050)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (1-105)||(1050-1153)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (1-105)||(3486-3589)
scaffold0292 (3-105)||(361-461)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (5-105)||(32962-33060)
scaffold0145 (1-105)||(38777-38879)
scaffold0145 (1-108)||(9762-9867)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-109)||(25912-26018)
scaffold0026 (1-109)||(39874-39980)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-105)||(1867-1970)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (3-165)||(17969-18130)
scaffold0247 (1-97)||(2184-2278)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (1-108)||(13960-14065)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (61-322)||(2231-2488)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (1-108)||(16797-16902)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (1-105)||(8535-8634)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (5-108)||(11305-11406)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (1-105)||(10427-10528)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (3-105)||(20928-21030)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (4-57)||(51601-51654)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (40-284)||(9133-9372)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (1-77)||(4728-4803)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (204-322)||(2088-2207)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (1-105)||(6123-6229)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (1-108)||(12293-12398)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-64)||(13513-13575)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (1-108)||(9255-9360)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (4-55)||(1308-1359)
scaffold0106 (4-57)||(7285-7338)
scaffold0106 (1-54)||(15291-15343)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (6-105)||(4545-4643)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (1-108)||(40413-40518)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (4-88)||(16301-16382)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (4-105)||(1971-2071)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (1-97)||(4227-4321)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (4-108)||(20423-20524)
scaffold0031 (60-105)||(128824-128869)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (1-108)||(4310-4415)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-56)||(32083-32137)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (1-86)||(11464-11548)
scaffold0235 (236-315)||(13811-13891)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (1-86)||(15485-15568)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (4-89)||(2694-2780)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (1-108)||(161133-161239)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (1-108)||(119-224)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (4-51)||(5183-5230)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (4-55)||(47014-47065)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (43-165)||(225465-225585)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (4-57)||(1098-1151)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (1-108)||(12077-12176)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (1-97)||(1336-1430)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (49-108)||(3529-3588)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (4-47)||(11982-12024)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (1-52)||(4888-4938)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (236-322)||(10158-10245)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (236-322)||(9620-9707)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (1-38)||(23855-23892)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (1-38)||(36466-36503)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (247-315)||(26847-26916)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (72-155)||(6-88)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (67-109)||(27911-27953)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (6-56)||(206575-206624)
[»] scaffold1419 (1 HSPs)
scaffold1419 (129-262)||(165-297)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (71-167)||(602-697)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 77)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 22072929 - 22073210
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22072929 caacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 22073028  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22073029 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatgcaattatataacattaacaacaacattagattatataattcaggcttactgaaacaacaac 22073128  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaa 282  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  22073129 atcaagacaaacaacttagttccttacctgtaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaggatcgcatttaacctaacaa 22073210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 16056344 - 16056624
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  || |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16056344 caacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgcaaa--caacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaa 16056441  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  16056442 catctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatatcattcaggcttaccgaaacaacaac 16056540  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 284  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  16056541 atcaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgctacaaagatcgcatttaacctaacaagg 16056624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16219822 - 16219541
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  16219822 caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 16219724  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16219723 catcttaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatataattcaggcttactgaaacaacaac 16219625  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 284  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16219624 agcaagataaacaacttagtttctaacctccaagatcaactaacatcaacttgtgcgacaaagatcgcatttaacctaacaagg 16219541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 47831823 - 47832099
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | | | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  47831823 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcatatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 47831921  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||||  |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47831922 catcataaacatcaaacataat-tcatataatgtatatacaattatataacattagcgacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 47832020  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    | ||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  47832021 aacaagataaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgtccgacaaagatcacatttaacctaa 47832099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 67761 - 68036
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  67761 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaa 67859  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatac-aattcaggcttactgaaacaacaa 199  Q
    ||||||||  ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||    
T  67860 catctcaat-atcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggctcactgaaacaacaa 67956  T
Q  200 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||    
T  67957 cagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaaggatcgcatttaacctaa 68036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 811236 - 810915
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||    
T  811236 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaagtcattaa 811138  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  811137 catcataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaactacaac 811039  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcacaa 299  Q
    ||||||| ||| ||||||||| || || || ||| |||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| | |||||||  || ||   || ||    
T  811038 agcaagataaataacttagtttctaacttccaaggtcaactcacatcaacttgcgcgacaaagatcgcatttaacttaaacaaggcattttgtaacataa 810939  T
Q  300 gggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    |  |||||||||||||||||||||    
T  810938 gtactcgcgaggcgagagcctcta 810915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 18005662 - 18005922
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  18005662 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtatggaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaa 18005760  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatac-aattcaggcttactgaaacaacaa 199  Q
    ||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||    
T  18005761 catctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaa 18005858  T
Q  200 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaag 263  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18005859 cagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcatatcaacttgtgcgacaaag 18005922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 12901339 - 12901629
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||| ||  || ||    
T  12901339 caacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacagca 12901438  T
Q  100 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 199  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12901439 acatcacaa-catcatacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaatcatataattcaagcttactgaaacaacaa 12901536  T
Q  200 cagcaagacaaacaacttag-ttcct---tacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgtt 288  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12901537 caacaagataaacaacttagtttcctacgtacctccaagatcaactcacatcaactcgtacgacaaatgtcacatttaacctaacaaggtgtt 12901629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 20220290 - 20219975
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||      
T  20220290 cttagaccgactcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca-- 20220194  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
     |||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| | || ||  || |||||||||||| ||||||||||    
T  20220193 -tctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactggaacaacaaca 20220096  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 301  Q
    | |||| || |||||||||| |||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  20220095 gtaagataagcaacttagtttcttacccctgtgatcacctcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttatcctaacaaggtattctgtctcacaa-g 20219997  T
Q  302 gctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    |||||| |||||||| ||||||    
T  20219996 gctcgcaaggcgagaacctcta 20219975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 44014194 - 44014464
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| ||   | |||    
T  44014194 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa---atcaa 44014289  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaa 199  Q
    ||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  44014290 catctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacagttatataccattaaaaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaa 44014387  T
Q  200 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    ||||||||  ||||||||||||  | ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||    
T  44014388 cagcaaga-taacaacttagtttttaacctct--gatcaactcacatcaattcgtgcgacaatgatcgcatttaacctaa 44014464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 71 - 323
Target Start/End: Original strand, 15113028 - 15113279
Alignment:
Q  71 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagat 170  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||| | |||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  |  ||||| |  |    
T  15113028 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaatattcacatataa-ctcaagtaatatatatacaattatatcacattataattaacatcaact 15113126  T
Q  171 tatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacat 270  Q
     ||| || |||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15113127 catataaatcagtcttactgaaacaataacagcaggataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacat 15113226  T
Q  271 ttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15113227 ttaacctaacaaggcatcctgtctcacaaggactcgcgaggcgagagcctcta 15113279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 71 - 323
Target Start/End: Original strand, 15116565 - 15116816
Alignment:
Q  71 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagat 170  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||   ||| | |||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  || ||||| |  |    
T  15116565 gatataacaatatcaattgcaagtcatcaacatctcaatattcacatataa-ctcaagtaatatatatacaattatatcacattataaataacatcaact 15116663  T
Q  171 tatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacat 270  Q
     ||| |  |||| ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15116664 catatacatcagtcttactgaaacaataacagtaggataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacat 15116763  T
Q  271 ttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15116764 ttaacctaacaaggcattctgtctcacaaggactcgcgaggcgagagcctcta 15116816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15754992 - 15754718
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| || |||||||    
T  15754992 caacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaacaa 15754894  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcaggcttactgaaacaacaa 199  Q
       |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||    |||| ||||||| || |  ||    
T  15754893 ---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcatatgcatcagtcttactggaatattaa 15754798  T
Q  200 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15754797 cagcaagataaacaacttagtttctaacctctaggatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaa 15754718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 11996132 - 11995816
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  ||||||| |||||||    
T  11996132 caacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatattgaatgtaaatcaacaa 11996034  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
       |||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| |||||||  |||  |||    
T  11996033 ---ctcaaatatcaaac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactgggacattaac 11995938  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaag 300  Q
    ||||||  |||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||| ||||  |||||   |||||     
T  11995937 agcaaggtaaacaaattagtttctaacctctaagataaactcacatcaactcgaacgacaaagatcgcatttaacctaaaaaggcattctgtaacacaaa 11995838  T
Q  301 ggctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  11995837 tgctcgcgaggcgagagcctct 11995816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 34200802 - 34201118
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  34200802 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa 34200900  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    |   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| |||||||  |||  |||    
T  34200901 c---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactgggacattaac 34200996  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaag 300  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||   ||||  | || |||||||||||| ||||  || ||   |||||     
T  34200997 agcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgaatgacagggatcgcatttaacctaaaaaggcattatgtaacacaaa 34201096  T
Q  301 ggctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  34201097 cgctcgcgaggcaagagcctct 34201118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 28505400 - 28505087
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  || ||| ||| |||       
T  28505400 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcggatataaatcagcaa--- 28505305  T
Q  104 ctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagc 203  Q
    |||||  ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||| ||||   ||| |    
T  28505304 ctcaattatcaaac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattgacaac 28505206  T
Q  204 aagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggc 303  Q
    |||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||| ||||  |||||   |||||  ||    
T  28505205 aaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgaacgacaaagatcgcattcaacctaaaaaggcattctgtaacacaaacgc 28505106  T
Q  304 tcgcgaggcgagagcctct 322  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28505105 tcgcgaggcgagagcctct 28505087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 157 - 284
Target Start/End: Original strand, 16324175 - 16324302
Alignment:
Q  157 caacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16324175 caacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagatcaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcatgc 16324274  T
Q  257 gacaaaggtcacatttaacctaacaagg 284  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16324275 gacaaggatcacatttaacctaacaagg 16324302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 16495421 - 16495567
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||       
T  16495421 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa--- 16495516  T
Q  104 ctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    |||||  |||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495517 ctcaattatcagac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 16495567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 3564469 - 3564363
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  3564469 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgtaagtcaacaa 3564371  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    ||||||||    
T  3564370 catctcaa 3564363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 2280224 - 2280117
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  2280224 caacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataataatatcaaatgcaaatcaacaa 2280126  T
Q  101 catctcaaa 109  Q
    |||||||||    
T  2280125 catctcaaa 2280117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Original strand, 13647344 - 13647447
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  13647344 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 13647442  T
Q  104 ctcaa 108  Q
    |||||    
T  13647443 ctcaa 13647447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 48273405 - 48273511
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  48273405 caacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 48273503  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    ||||||||    
T  48273504 catctcaa 48273511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 105
Target Start/End: Original strand, 38227499 - 38227599
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  38227499 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 38227596  T
Q  103 tct 105  Q
    |||    
T  38227597 tct 38227599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 130 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 9389675 - 9389526
Alignment:
Q  130 aatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||    | ||||||||| || ||||    
T  9389675 aatgtatatacaattatataacattatcatcaatattagaatatacaatccaggcttactggaatgacaacatcaaggtcgataacttagtttctaacct 9389576  T
Q  230 ctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  9389575 ccaagatcaactcacatcaactcgtgtgacaaagatcgcttttaacctaa 9389526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 12255892 - 12255733
Alignment:
Q  7 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  12255892 agacagactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatct 12255793  T
Q  106 caaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 165  Q
    |||||| ||| | || || ||| |||||  |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  12255792 caaacattcatatat-aattcaagtaatacatatacaattatatcacattataaacaacat 12255733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 1868100 - 1867937
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || | |||    
T  1868100 caacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatgaac 1868003  T
Q  99 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 165  Q
    |||||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  1868002 aacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacat 1867937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 24275184 - 24275289
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24275184 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 24275281  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  24275282 cgtctcaa 24275289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 14044762 - 14044928
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa- 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||   |||| |||  | ||||||||||||||| |||  || ||||     
T  14044762 caacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaa-cagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaat 14044859  T
Q  98 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 167  Q
    ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  14044860 caacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacatta 14044928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 14354792 - 14354958
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa- 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||   |||| |||  | ||||||||||||||| |||  || ||||     
T  14354792 caacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaa-cagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaat 14354889  T
Q  98 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 167  Q
    ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  14354890 caacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacatta 14354958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 12698847 - 12698951
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-cagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| ||    
T  12698847 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatatcaattgcaattcatca 12698945  T
Q  100 acatct 105  Q
    ||||||    
T  12698946 acatct 12698951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 16386353 - 16386249
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||  ||| |||    
T  16386353 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgtatttcatcaa 16386254  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  16386253 catct 16386249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 18456517 - 18456415
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18456517 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 18456420  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  18456419 catct 18456415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 26212012 - 26212115
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || |||||||    
T  26212012 caacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaa 26212110  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  26212111 catct 26212115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 456334 - 456439
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  456334 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 456431  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  456432 cgtctcaa 456439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 11393436 - 11393331
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11393436 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 11393339  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  11393338 cgtctcaa 11393331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 11972509 - 11972614
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11972509 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 11972606  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  11972607 cgtctcaa 11972614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 14949271 - 14949166
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14949271 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 14949174  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  14949173 cgtctcaa 14949166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 15376862 - 15376757
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15376862 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 15376765  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  15376764 cgtctcaa 15376757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 16232533 - 16232638
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16232533 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 16232630  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  16232631 cgtctcaa 16232638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 16410072 - 16410177
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16410072 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 16410169  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  16410170 cgtctcaa 16410177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 18640285 - 18640390
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18640285 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 18640382  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  18640383 cgtctcaa 18640390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 20385272 - 20385167
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20385272 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 20385175  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  20385174 cgtctcaa 20385167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 21189744 - 21189639
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21189744 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 21189647  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  21189646 cgtctcaa 21189639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 32125504 - 32125609
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32125504 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 32125601  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  32125602 cgtctcaa 32125609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 41522930 - 41523035
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41522930 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 41523027  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  41523028 cgtctcaa 41523035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 41525392 - 41525497
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41525392 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 41525489  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  41525490 cgtctcaa 41525497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 9509205 - 9509308
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||| || || ||| |||    
T  9509205 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 9509303  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  9509304 catct 9509308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 15144142 - 15144037
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| | ||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||||||    
T  15144142 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacat-ctcagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacaa 15144045  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    ||||||||    
T  15144044 catctcaa 15144037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 18430725 - 18430830
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18430725 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 18430822  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    ||||||||    
T  18430823 catctcaa 18430830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 24702251 - 24702356
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24702251 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 24702348  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  24702349 cgtctcaa 24702356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 27216873 - 27216978
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27216873 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 27216970  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  27216971 cgtctcaa 27216978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 44116522 - 44116627
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44116522 caacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 44116619  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  44116620 cgtctcaa 44116627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 10589055 - 10589158
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||||| || || |||||||    
T  10589055 caacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatcaattgcaattcaacaa 10589153  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  10589154 catct 10589158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15008597 - 15008441
Alignment:
Q  8 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||  |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||    
T  15008597 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacacct 15008500  T
Q  106 caaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 165  Q
    ||||||||| | || || ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  15008499 caaacatcatatat-aattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacat 15008441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 16213697 - 16213795
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||    
T  16213697 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatccaagtcaacaa 16213794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 17062064 - 17061919
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||    
T  17062064 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaac-tcagcagtatacaaaa-tagcatgacataataatatcaaatgcaagtcagcaa 17061967  T
Q  101 catctcaaacatcaaacata-aactcatgtaatgtatatacaattatat 148  Q
    | ||||||  ||  |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  17061966 cgtctcaattat-taacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 17061919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 3386346 - 3386451
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||    
T  3386346 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaatgcaagtcaacaa 3386443  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  3386444 cgtctcaa 3386451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 19486847 - 19486686
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  | |||||| |||||||    
T  19486847 acttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaaca 19486749  T
Q  103 tctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 165  Q
    |||||||  |||| | || || ||| || ||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  19486748 tctcaaataatcacatat-aattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 19486686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 13869359 - 13869453
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  13869359 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 13869453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 86
Target Start/End: Original strand, 40443410 - 40443490
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 86  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||| |||| ||||||||    
T  40443410 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaacaaa--cagcatgacataataatatcaa 40443490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 10063921 - 10063816
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| || || |||||||||| |||||| ||   |||| |||||||    
T  10063921 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacacaagtaaacaaca 10063823  T
Q  103 tctcaaa 109  Q
    |||||||    
T  10063822 tctcaaa 10063816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 38898526 - 38898420
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa-ca 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  38898526 caacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacgacaca-gcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatca 38898429  T
Q  100 acatctcaa 108  Q
    |||||||||    
T  38898428 acatctcaa 38898420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 108
Target Start/End: Original strand, 13831390 - 13831491
Alignment:
Q  5 ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||| || ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  13831390 ttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaaca-cggtagtatacaaaaacaacatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgtc 13831487  T
Q  105 tcaa 108  Q
    ||||    
T  13831488 tcaa 13831491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 27847932 - 27847881
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 55  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27847932 cttagaccgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagt 27847881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 24704701 - 24704803
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||   | || || |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24704701 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaa---aacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 24704795  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  24704796 cgtctcaa 24704803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Original strand, 14036282 - 14036384
Alignment:
Q  13 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa-caacatctcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  ||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||    
T  14036282 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagctcatgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaa 14036379  T
Q  110 catca 114  Q
    |||||    
T  14036380 catca 14036384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Original strand, 14346312 - 14346414
Alignment:
Q  13 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa-caacatctcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  ||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||    
T  14346312 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagctcatgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaa 14346409  T
Q  110 catca 114  Q
    |||||    
T  14346410 catca 14346414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 20110569 - 20110606
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110569 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 20110606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 9751423 - 9751336
Alignment:
Q  236 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa-caaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||  |||||   |||||| |||||||||||||||||||||    
T  9751423 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcgcatttaaactaaacaaggcattctgtaacacaagcgctcgcgaggcgagagcctct 9751336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 18154944 - 18154894
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 54  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  18154944 acttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aatagcaacataggcag 18154894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 57
Target Start/End: Original strand, 48991206 - 48991252
Alignment:
Q  11 cgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 57  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  48991206 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtat 48991252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12756817 - 12756715
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| |  || ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| |    
T  12756817 cttagaccgactcgagcagtttagttaaataac-aacagcaacaca-acaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgt 12756720  T
Q  104 ctcaa 108  Q
    |||||    
T  12756719 ctcaa 12756715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 39267519 - 39267476
Alignment:
Q  236 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39267519 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcacatttaacctaa 39267476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 9177495 - 9177450
Alignment:
Q  278 aacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9177495 aacaaggtgttctgtcttacaagagctcgcgaggcgagggcctcta 9177450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 9177766 - 9177718
Alignment:
Q  6 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 54  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||    
T  9177766 tagaccgactcatgcagcttaattcaataataaacaacaacatatgcag 9177718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 26356083 - 26356027
Alignment:
Q  52 cagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 108  Q
    |||||| ||||| |||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26356083 cagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 26356027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 26358535 - 26358479
Alignment:
Q  52 cagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 108  Q
    |||||| ||||| |||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26358535 cagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 26358479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 10543 - 10824
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  10543 caacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 10641  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10642 catctcaaacatcgaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatatgacattaacaacaacattagattatataattcaggcttactgaaacaacaac 10740  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 284  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  10741 agcaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacagagatcgcatttaacctaacaagg 10824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 32552 - 32832
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  32552 caacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaaatgcaa-tcaacaa 32649  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  32650 catctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaaaaacattagattatataattcaggcttactgaaacaataac 32748  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 284  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  32749 aacaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacccaacaagg 32832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 51985 - 51904
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || |||||  |||| || |||| ||||||||    
T  51985 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagc-acataggcagcattcaaaaatagcaagacataataatatcaa 51904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 73)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21329602 - 21329326
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||  |||||| |||    
T  21329602 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcataatataacaatatcgaattcaagtcatcaa 21329504  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329503 catcataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 21329405  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21329404 aacaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaa 21329326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026725
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaac-agttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaac 20026945  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
    ||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  20026944 atcacaa-catcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaactatatagcattatcaacaacattaaaacatataattcaggcttactgaaacaactaca 20026847  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 301  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||    
T  20026846 acaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcgactcgtgcgacaacggtcacatttaagctaacaaggcattctgtctcacaagg 20026747  T
Q  302 gctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  20026746 actcgcgaggcgagagcctcta 20026725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26012140 - 26011861
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26012140 caacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaagcaa-catgatataacaatatcaaatgtgaatcaacaa 26012042  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||     
T  26012041 catctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacatcaacaacaacatcagattatatagttcaggcttactgaaacaacaat 26011943  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaa 282  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26011942 aacaagataaacaacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgtgtgacaaagatcacatttaacctaacaa 26011861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21502261 - 21501978
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||     
T  21502261 caacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatg-taaatcagcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcat 21502163  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21502162 catcttaaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaa 21502064  T
Q  200 cagcaagacaaacaacttag-ttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 284  Q
    |||||||| ||||||||||| || || || || |||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||    
T  21502063 cagcaagataaacaacttagttttctaacttccaagatcaactaacatcaactcgtgcgacaaatatcgcatttaacccaacaagg 21501978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Original strand, 21565558 - 21565827
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  21565558 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtat-ccaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 21565656  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||  |||||||||    
T  21565657 catttcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactagaacaacaac 21565755  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacattt 272  Q
    | ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21565756 aacaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcattt 21565827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22178004
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||  ||||| |||  ||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaac-agctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 22178225  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||   || ||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  22178224 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatccaatcatataatttaggtttactgaaacaacaaca 22178126  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcacaag 300  Q
    | |||| || |||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  22178125 gtaagataagcaacttagtttcttacccccatgatcaactcacatcaactcgtgtgacaaaggtcaca-aaaccctaaacaaggtgttatgtctcacaag 22178027  T
Q  301 ggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  22178026 ggctcgcggggcgagagcctcta 22178004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 19660940 - 19660624
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  ||||| ||| ||| |||||||    
T  19660940 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcttgatataatgatatcgaatataaatcaacaa 19660842  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    |   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||| ||||  |||    
T  19660841 c---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaac 19660746  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaag 300  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  |||| ||||||| |||| ||||||   |||||     
T  19660745 agcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgaacgacaaagattgcattcaacctaaaaaggcgttctgtaacacaaa 19660646  T
Q  301 ggctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  19660645 cgctcgcgaggcgagagcctct 19660624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22959637 - 22959364
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||  |||| || |||||||    
T  22959637 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatcaacaa 22959539  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcaggcttactgaaacaacaa 199  Q
       |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||| |||| |||    |||| ||||||| ||||| ||    
T  22959538 ---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattttaaccaacatt-gattcatatgcatcagtcttactggaacaaaaa 22959444  T
Q  200 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    || ||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||    
T  22959443 caacaagataaacaacttggtttttaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcaacaagaatcgcatttaacctaa 22959364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 19668914 - 19669189
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  19668914 caacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgc-aaatcatcgtgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaa 19669012  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat-tagatt-atacaattcaggcttactgaaacaaca 198  Q
       |||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||    |||| ||||||| |||||||    
T  19669013 ---ctcaaatatcaaacat-aagtcctgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaatattcatatgcatcagtcttactggaacaaca 19669108  T
Q  199 acagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    ||| ||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| |||||    
T  19669109 acaacaagataaacgacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaagaatcacatttatcctaa 19669189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 154
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144217
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacat 22144166  T
Q  104 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatt 154  Q
    ||||||||| || | ||||  ||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  22144167 ctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcatatacaattatatcacatt 22144217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 21729169 - 21729066
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || |||||||    
T  21729169 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaa 21729071  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  21729070 catct 21729066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 21808494 - 21808391
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || |||||||    
T  21808494 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaa 21808396  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  21808395 catct 21808391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 24529236 - 24529339
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||||| ||||||||||    
T  24529236 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaatgcaagtcaacaa 24529334  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  24529335 catct 24529339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 9077968 - 9078074
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  9077968 caacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagtcaacaa 9078066  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    ||||||||    
T  9078067 catctcaa 9078074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 1096483 - 1096588
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||| || |||||||    
T  1096483 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatcaaatgcaaatcaacaa 1096581  T
Q  101 catctca 107  Q
    |||||||    
T  1096582 catctca 1096588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21997639 - 21997547
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  21997639 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 21997547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 22412200 - 22412306
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22412200 caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacgataa-caacataggcagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 22412297  T
Q  101 catctcaaa 109  Q
    |||||||||    
T  22412298 catctcaaa 22412306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 24493585 - 24493687
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24493585 caacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 24493682  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  24493683 catct 24493687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 25421548 - 25421651
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || |||||||||     
T  25421548 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacag 25421646  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  25421647 catct 25421651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 105
Target Start/End: Original strand, 25431414 - 25431513
Alignment:
Q  5 ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatc 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  25431414 ttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 25431512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 84
Target Start/End: Original strand, 36314596 - 36314675
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  36314596 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 36314675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 264917 - 264812
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  264917 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 264820  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  264819 cgtctcaa 264812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 10733089 - 10732984
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10733089 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 10732992  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  10732991 cgtctcaa 10732984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 20902158 - 20902053
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  20902158 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagtcaacaa 20902061  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  20902060 cgtctcaa 20902053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 20909025 - 20909130
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20909025 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa-agcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 20909122  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  20909123 cgtctcaa 20909130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 39363397 - 39363502
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39363397 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 39363494  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  39363495 cgtctcaa 39363502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 8286948 - 8286844
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| ||    
T  8286948 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatca 8286850  T
Q  100 acatct 105  Q
    ||||||    
T  8286849 acatct 8286844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 13025327 - 13025429
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||   |||||||||| ||||||||||    
T  13025327 caacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatcaaatgcaagtcaacaa 13025424  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  13025425 catct 13025429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 13095511 - 13095613
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||   |||||||||| ||||||||||    
T  13095511 caacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatcaaatgcaagtcaacaa 13095608  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  13095609 catct 13095613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 22075035 - 22075138
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || || |||||||    
T  22075035 caacttagaccgactcattcagcttagttaaataac-aacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaa 22075133  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  22075134 catct 22075138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 23390601 - 23390498
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || || ||| |||    
T  23390601 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 23390503  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  23390502 catct 23390498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 323
Target Start/End: Original strand, 25743945 - 25744056
Alignment:
Q  212 caacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgagg 311  Q
    ||||||||||  ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||   |||| | | |||||||||||||||    
T  25743945 caacttagtttattacccccatgatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacataaaccctaacaaggcagtctgtcactcaagggctcgcgagg 25744044  T
Q  312 cgagagcctcta 323  Q
    ||||||||||||    
T  25744045 cgagagcctcta 25744056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 29329947 - 29330052
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29329947 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 29330044  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  29330045 cgtctcaa 29330052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 42245514 - 42245409
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  42245514 caacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 42245417  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  42245416 cgtctcaa 42245409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21741492 - 21741374
Alignment:
Q  161 aacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgaca 260  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||  ||  ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21741492 aacattagaatatacaatccaggcttactggaatgacaacatcaaggtaattaacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgtgcgaca 21741393  T
Q  261 aaggtcacatttaacctaa 279  Q
    ||| || | ||||||||||    
T  21741392 aagatcgcttttaacctaa 21741374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 36154929 - 36154827
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36154929 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa----caacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 36154835  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  36154834 cgtctcaa 36154827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 39245149 - 39245243
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  39245149 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 39245243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 2154763 - 2154658
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  2154763 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaactgcaagtcaacaa 2154666  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  2154665 cgtctcaa 2154658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 11581348 - 11581243
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  11581348 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaataa 11581251  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  11581250 cgtctcaa 11581243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 29345993 - 29346098
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29345993 caacttagaccgactcatacagcttagttaaataac-aacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 29346090  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  29346091 cgtctcaa 29346098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 10775825 - 10775731
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  10775825 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gacagcgacaca-gcagtatataaaaccagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 10775731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 18319183 - 18319089
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  18319183 caacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 18319089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 29348466 - 29348571
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29348466 caacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaa-cagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 29348563  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  29348564 cgtctcaa 29348571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 29350939 - 29351044
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29350939 caacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaa-cagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 29351036  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  29351037 cgtctcaa 29351044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 142
Target Start/End: Original strand, 29448055 - 29448159
Alignment:
Q  38 aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgta 135  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | || |||||||||| |    
T  29448055 aacagcaacataggcagtatataaaac-agctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatacgt-aattcatgtaatgca 29448152  T
Q  136 tatacaa 142  Q
    |||||||    
T  29448153 tatacaa 29448159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 165
Target Start/End: Original strand, 40725871 - 40726032
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||  | |||||| |||||||    
T  40725871 acttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgc-aaagcatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaaca 40725969  T
Q  103 tctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 165  Q
    |||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  40725970 tctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 40726032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Original strand, 37723922 - 37724023
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||   |||||||| || |  |||||||||  || ||| ||||||    
T  37723922 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacatgattatatcaaattaaattcatcaacat 37724018  T
Q  104 ctcaa 108  Q
    |||||    
T  37724019 ctcaa 37724023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 31061081 - 31061175
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | | ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  31061081 caacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaaaaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 31061175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 38619447 - 38619541
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  38619447 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 38619541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 32027406 - 32027511
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||    
T  32027406 caacttagaccgactcatacaacttagttaaataac-aacaacaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatccaagtcaacaa 32027503  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  32027504 cgtctcaa 32027511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 21293071 - 21293020
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 56  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21293071 cttagaccgattcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 21293020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 23064524 - 23064618
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | | ||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||||||| |||||||    
T  23064524 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacctaataatatcaaatgcaagtcaa 23064618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27988845 - 27988770
Alignment:
Q  192 aacaacaacagcaagacaaacaacttagttcctta-cctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtca 267  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27988845 aacaacaacagatatataaacaacttagttccttaacctc-atgatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtca 27988770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 20918097 - 20918028
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatga 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| ||||||||    
T  20918097 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 20918028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24767210 - 24767123
Alignment:
Q  236 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa-caaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||    || || |||||||||||||||||||||    
T  24767210 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcacatttaacctaaacaaggcattctgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctct 24767123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732884
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 55  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26732884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 20766174 - 20766118
Alignment:
Q  52 cagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 109  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20766174 cagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 20766118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21741545 - 21741486
Alignment:
Q  94 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21741545 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacatta 21741486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 24067120 - 24067214
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  24067120 caacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 24067214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 10753603 - 10753685
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  10753603 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 10753685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21871607 - 21871525
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21871607 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaagcatcaaacat-aattcatgcaatatatatcgaattatataacatta 21871525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21875887 - 21875805
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21875887 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaagcatcaaacat-aattcatgcaatatatatcgaattatataacatta 21875805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 22120066 - 22119979
Alignment:
Q  236 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa-caaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  |||||    || || |||||||||||||||||||||    
T  22120066 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctct 22119979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22120231 - 22120149
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  22120231 atataacaattacaaatgaacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 22120149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 38
Target Start/End: Original strand, 26704089 - 26704124
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26704089 acttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 26704124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 26740747 - 26740697
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 55  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  26740747 cttagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacatagacagt 26740697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 38
Target Start/End: Original strand, 26973822 - 26973857
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26973822 acttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 26973857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 124 - 155
Target Start/End: Original strand, 36314685 - 36314716
Alignment:
Q  124 tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314685 tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 36314716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 54
Target Start/End: Original strand, 15796438 - 15796487
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 54  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  15796438 cttagaccgactcatgcagctta-atcaataataaacagcaacataggcag 15796487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 18418596 - 18418678
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaa-taacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 85  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||    
T  18418596 caacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataacaa-catcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatca 18418678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 20806891 - 20806854
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20806891 caacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaa 20806854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 105
Target Start/End: Original strand, 18356367 - 18356432
Alignment:
Q  38 aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 105  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||    
T  18356367 aacagcaacataggcagcatacaaa--cagcatgatataataatatcaatttcaattcaacaacatct 18356432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Original strand, 21873277 - 21873336
Alignment:
Q  12 gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatga 72  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| | ||||||||    
T  21873277 gactcatgcaacttagttaaataacaaa-agcagcataggcaggatacaacatcagcatga 21873336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 72)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 21285613 - 21285892
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  21285613 caacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaa 21285711  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21285712 catctcaaacatcaaacatagt-tcatgtaatgtatatacaattatatatcattaacaacaatattagattatataattcaggcttactgaaacaacaac 21285810  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaa 282  Q
    | ||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  21285811 aacaagataaagcacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgataaagatcgcatttaacctaacaa 21285892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 6520384 - 6520662
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  6520384 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 6520482  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520483 catcataaacatcaa-cataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 6520580  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaa 282  Q
    ||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||    
T  6520581 agcaagataaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcatgcaacaaagatcgcatttaacctaacaa 6520662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 38855356 - 38855097
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  38855356 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaa 38855258  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855257 catctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 38855160  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaag 263  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38855159 agcaagataaacaacttagttcctaatgtccaagatcaattcacatcaactcgtgcgacaaag 38855097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 17267096 - 17266777
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||    |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17267096 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17266997  T
Q  103 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 202  Q
    |||||||||||| | ||||  || ||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17266996 tctcaaacatcatatataat-tcttgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggctcactgaaacaacaacag 17266898  T
Q  203 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaaggg 302  Q
     |||| || |||||||||| |||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17266897 taagataagcaacttagtttcttacccccgtgatcaactcacatcaactcgtgcgataaaggtcacatttaacctaacaaggagttctgtctcacaaggg 17266798  T
Q  303 ctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  17266797 ctcgcgaggcgagagcctcta 17266777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498899
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaat-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 20498679  T
Q  104 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 202  Q
    ||||||||| || | ||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || ||| |  |||| ||||| |||||| |||||     
T  20498680 ctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatatacatcagtcttaccgaaacatcaacat 20498778  T
Q  203 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaaggg 302  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| || | |    
T  20498779 caagataaacaacttagtttcttacctccaagatcaactcacatcaactcgtgtgacaaaggtcacaataaacctaacaaggtgttctgtctctcatgag 20498878  T
Q  303 ctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20498879 ctcgcgaggcgagagcctcta 20498899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116684
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37116464  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  || |||||||||||||||||||||||    
T  37116465 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactgaaacaacaaca 37116563  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 301  Q
    | |||| || |||||||||| |||||| | | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||||    
T  37116564 gtaagataagcaacttagtttcttacccccatgatcatctcacatcaactcgtacgacaaaggtcacatttatcctaacaagcag-tctgtctcacaagg 37116662  T
Q  302 gctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  37116663 gctcgcgaggcgagagcctcta 37116684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 983511 - 983187
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  983511 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaa-caagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 983413  T
Q  99 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 198  Q
    |||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  983412 aacatcacaa-catcaaacataat-tcatgtaatgtatatacagctatataacattatcaacaacattcaatcatataattcagacttactgaaacaaca 983315  T
Q  199 acagcaa---gacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactc 295  Q
    ||| |||   || ||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||| || |||    
T  983314 acaacaacatgataaacaacttagtttcctacctccaagatcaactcatatcaactcgtgcgacaaaagtcacgttagacctaacaaagtgttatgtctc 983215  T
Q  296 acaagggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
     |  | |||||  |||||||||||||||    
T  983214 tcgtgagctcgtcaggcgagagcctcta 983187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23760949 - 23760665
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||  |||  || |||||||    
T  23760949 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgtaaatc-atcatgatataacaatattgaattcaaatcaacaa 23760851  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattataca-attcaggcttactgaaacaacaa 199  Q
    ||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||    
T  23760850 catctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatttattcaggcttactgaaacaacaa 23760753  T
Q  200 cagcaagac---aaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 284  Q
    || ||| |    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  23760752 caacaacaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaaagatcgcatttatcctaacaagg 23760665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Original strand, 24353039 - 24353360
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  24353039 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaac 24353136  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaaca---aca 198  Q
    ||||||||||||  | | ||  |||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||   |||    
T  24353137 atctcaaacatcgtatacaat-tcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 24353235  T
Q  199 acagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcaca 298  Q
    |||| |||| || |||||||||| |||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  24353236 acagtaagataagcaacttagtttcttatccccatgatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttatcctaacaaggtattctgtctcaca 24353335  T
Q  299 agggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||    
T  24353336 agggctcacgaggcgagggcctcta 24353360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 5866376 - 5866063
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||      
T  5866376 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac-- 5866280  T
Q  104 ctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagc 203  Q
     ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||| ||||  ||||||    
T  5866279 -tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagc 5866182  T
Q  204 aagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggc 303  Q
    |||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||| ||||  |||||   |||||  ||    
T  5866181 aaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgaacgacaaagatcgcattcaacctaaaaaggcattctgtaacacaaacgc 5866082  T
Q  304 tcgcgaggcgagagcctct 322  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5866081 tcgcgaggcgagagcctct 5866063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 68 - 323
Target Start/End: Original strand, 22364745 - 22364998
Alignment:
Q  68 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 167  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| || |||  |||||||| |    
T  22364745 catgatataacaatatcaaa-gaaaatcaacaacatctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcactttattaacaacatca 22364842  T
Q  168 gattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtca 267  Q
     || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22364843 aatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttattatccccctgatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtca 22364942  T
Q  268 catttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22364943 catttaacctaacaaggtgttctgtctcacaagggctcgtgaggcgagagcctcta 22364998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 17140932 - 17141248
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||    
T  17140932 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaat-ccatcatgacataataatatcgaatgtaaatcatcaa 17141030  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    |   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||| ||||  |||    
T  17141031 c---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaac 17141126  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaag 300  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || |||| ||||||| |||| ||||||   |||||     
T  17141127 agcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgaatgacaaagatcgcattcaacctaaaaaggcgttctgtaacacaaa 17141226  T
Q  301 ggctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  17141227 cgctcgcgaggcgagagcctct 17141248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 21673720 - 21673995
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  21673720 caacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaa 21673818  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaa 199  Q
    ||||||||| |||||  ||||  | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||    
T  21673819 catctcaaatatcaat-ataattt-atttaatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaagcttactgaaacaacaa 21673916  T
Q  200 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    || |||||  ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||| |||||    
T  21673917 caacaaga-taacaacttagtttttaacctctaatatcaactcacattaacttgtgcgacaaagatcgcatttatcctaa 21673995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Original strand, 21491011 - 21491328
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||| |||||||    
T  21491011 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatattgaatgtaaatcaacaa 21491109  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    |   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||| ||||  |||    
T  21491110 c---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataggcatcagtcttactggaacattaac 21491205  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaag 300  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||| || |||| ||||||| ||||  |||||   |||||     
T  21491206 agcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacattaactcgaactacaaagatcgcattcaacctaaaaaggcattctgtaacacaaa 21491305  T
Q  301 ggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
     ||||||||||| ||||||||||    
T  21491306 cgctcgcgaggcaagagcctcta 21491328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26355803 - 26355533
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| |||| || |||||||    
T  26355803 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcacgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaa 26355706  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    |||||||  |||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||  ||||| |||    
T  26355705 catctcagccatc-aacatattc-catttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactagaacaataac 26355608  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaac 275  Q
    |  |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  26355607 aaaaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaaagatcgcatttaac 26355533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 21249400 - 21249716
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaac-agcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||  | | |||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  21249400 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattc-atcatgatataataatatcgaatgtaaatcaaca 21249498  T
Q  100 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 199  Q
    ||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| |||| ||| |||  ||    
T  21249499 ac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttagtgagacattaa 21249594  T
Q  200 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaa 299  Q
    |||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||| ||||  |||||   |||||    
T  21249595 cagc-agggtaacaacttagttcctaacctctaagataaactcacatcaacttgaacgacaaagatcgcatttaacctaaaaaggcattctgtaacacaa 21249693  T
Q  300 gggctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
      |||||||||||||||||||||    
T  21249694 atgctcgcgaggcgagagcctct 21249716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 21255238 - 21255551
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaac-agcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||  | | |||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  21255238 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattc-atcatgatataataatatcgaatgtaaatcaaca 21255336  T
Q  100 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 199  Q
    ||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| |||| ||| |||  ||    
T  21255337 ac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttagtgagacattaa 21255432  T
Q  200 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaa 299  Q
    |||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||| ||||  |||||    ||||    
T  21255433 cagc-agggtaacaacttagttcctaacctctaagataaactcacatcaactcgaacgacaaagatcgcatttaacctaaaaaggcattctgtaatacaa 21255531  T
Q  300 gggctcgcgaggcgagagcc 319  Q
      ||||||||||||||||||    
T  21255532 atgctcgcgaggcgagagcc 21255551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16092447 - 16092340
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16092447 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 16092349  T
Q  101 catctcaaa 109  Q
    |||||||||    
T  16092348 catctcaaa 16092340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 18818514 - 18818411
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||     
T  18818514 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacat 18818416  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  18818415 catct 18818411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 28649149 - 28649046
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28649149 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa-agcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 28649051  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  28649050 catct 28649046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 7372794 - 7372897
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||||||     
T  7372794 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacat 7372892  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  7372893 catct 7372897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 21919105 - 21919002
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || |||||||    
T  21919105 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaa 21919007  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  21919006 catct 21919002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17439609 - 17439458
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17439609 cttagtccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 17439511  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  17439510 atctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacatta 17439458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 14409593 - 14409488
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14409593 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 14409496  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  14409495 cgtctcaa 14409488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 16413465 - 16413360
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16413465 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 16413368  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  16413367 cgtctcaa 16413360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 6759274 - 6759371
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  6759274 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 6759371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 23406395 - 23406492
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || |||||||||    
T  23406395 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 23406492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17612213 - 17612062
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  | |||||| |||||||    
T  17612213 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaaca 17612115  T
Q  103 tctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    |||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17612114 tctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacatta 17612062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 20536224 - 20536327
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| |||    
T  20536224 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 20536322  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  20536323 catct 20536327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 21924033 - 21923930
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| || | |||||||| || ||||||||||    
T  21924033 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatcaattgcaagtcaacaa 21923935  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  21923934 catct 21923930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 22626752 - 22626854
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||  || |||||||    
T  22626752 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatacaaatcaacaa 22626849  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  22626850 catct 22626854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 1484415 - 1484520
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1484415 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 1484512  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  1484513 cgtctcaa 1484520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 5853441 - 5853336
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5853441 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 5853344  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  5853343 cgtctcaa 5853336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 13508188 - 13508027
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||| || | |||| |||||||    
T  13508188 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 13508090  T
Q  103 tctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 165  Q
    ||||||| | ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  13508089 tctcaaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 13508027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 15203380 - 15203275
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15203380 caacttagagcgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaagtcaacaa 15203283  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  15203282 cgtctcaa 15203275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 20403240 - 20403345
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20403240 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 20403337  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  20403338 cgtctcaa 20403345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 22001766 - 22001871
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22001766 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 22001863  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  22001864 cgtctcaa 22001871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 109
Target Start/End: Original strand, 22875085 - 22875187
Alignment:
Q  5 ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22875085 ttagaccgactcatgcagcttagttaaatagc-agcagcaacacaggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 22875182  T
Q  105 tcaaa 109  Q
    |||||    
T  22875183 tcaaa 22875187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 13597720 - 13597559
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||| || |||||||||| |||||| || | |||| |||||||    
T  13597720 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 13597622  T
Q  103 tctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 165  Q
    || |||| | ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  13597621 tcccaaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 13597559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 20046344 - 20046239
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20046344 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 20046247  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  20046246 cgtctcaa 20046239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 41598201 - 41598306
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41598201 caacttagaccgactcatgcagcttagttgaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 41598298  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  41598299 cgtctcaa 41598306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 31971273 - 31971356
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  31971273 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaa 31971356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 26219730 - 26219835
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||||  || |||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26219730 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaa-tagtatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 26219826  T
Q  101 catctcaaa 109  Q
    |||||||||    
T  26219827 catctcaaa 26219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 4483294 - 4483398
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4483294 caacttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 4483390  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  4483391 cgtctcaa 4483398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 4542522 - 4542417
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||  || ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4542522 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acaagatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 4542425  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  4542424 cgtctcaa 4542417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16199746 - 16199666
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  || ||||| |||| ||||||||    
T  16199746 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattcaaa--caacatgacataataatatcaa 16199666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 21396082 - 21395984
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||||||  || ||| ||||||    
T  21396082 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa---cagcatgagataattatatcaaattcaattcatcaacat 21395986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 21790575 - 21790477
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||||||  || ||| ||||||    
T  21790575 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa---cagcatgagataattatatcaaattcaattcatcaacat 21790479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 18879336 - 18879275
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18879336 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 18879275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070665
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15070665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 45290844 - 45290754
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaag 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  45290844 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaag 45290754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 21389552 - 21389454
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||   |||||||| ||||  |||||||||  || ||| ||||||    
T  21389552 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa---cagcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacat 21389456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 21778878 - 21778780
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||   |||||||| ||||  |||||||||  || ||| ||||||    
T  21778878 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa---cagcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacat 21778782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 45131098 - 45131019
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||| ||||||||    
T  45131098 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaa--cagcatgacataataatatcaa 45131019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 19896278 - 19896386
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatga---tataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  | |||| ||||| ||||||||    |||| ||||||||||| |||||||    
T  19896278 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acggtatacaaaaacagcatgacataataataatatcaaatgcaagtcaa 19896375  T
Q  98 caacatctcaa 108  Q
    |||| ||||||    
T  19896376 caacgtctcaa 19896386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 26225396 - 26225291
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  || ||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||  ||||||||||    
T  26225396 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acaatatacaaaa-cagtatgacataataatatcaaatacaagtcaacaa 26225300  T
Q  101 catctcaaa 109  Q
    |||||||||    
T  26225299 catctcaaa 26225291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 26223932 - 26224037
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| | || || ||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26223932 caacttagatcgacccatgcagcttaattaaataacaa-cagcaataaag-caatatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 26224029  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    ||||||||    
T  26224030 catctcaa 26224037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 19154989 - 19154936
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 57  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19154989 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtat 19154936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801426
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-acagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgt 19801431  T
Q  104 ctcaa 108  Q
    |||||    
T  19801430 ctcaa 19801426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 19937155 - 19937061
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| || |||||||| |||||||    
T  19937155 caacttggaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataagatcaaatgcaagtcaa 19937061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 40492890 - 40492844
Alignment:
Q  68 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 114  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  40492890 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatca 40492844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Original strand, 14823798 - 14823891
Alignment:
Q  13 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 108  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14823798 actcatgcagcaaagttaaataacaa-caacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 14823891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 18678207 - 18678104
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||  | ||  | ||||| || |||| |||||||| || || |||||||    
T  18678207 caacttagactgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaattcaacaa 18678109  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  18678108 catct 18678104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18862512 - 18862430
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  18862512 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 18862430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 21383896 - 21383978
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21383896 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21383978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 21387316 - 21387398
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21387316 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21387398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 21411189 - 21411271
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21411189 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21411271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 21805681 - 21805763
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21805681 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21805763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21827881 - 21827799
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21827881 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21827799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 25484417 - 25484319
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||         ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  25484417 caacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataac-aacagc--------tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaa 25484327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 14103260 - 14103165
Alignment:
Q  71 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 167  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||| || || |||||||| | ||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  14103260 gatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatataat-tcatgtaatgcgtatacaattatatcacattaatatcaacatta 14103165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 32121748 - 32121851
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||  | ||  | ||||| || |||| |||||||| || || |||||||    
T  32121748 caacttagaatgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaattcaacaa 32121846  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  32121847 catct 32121851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 80)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 280
Target Start/End: Original strand, 23019425 - 23019699
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23019425 cttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacat 23019523  T
Q  104 ctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagc 203  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23019524 ctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacgacattagattatatagttcaggcttactgaaacaacaacagc 23019622  T
Q  204 aagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaac 280  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  23019623 aagataaacaacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgttcgacaaagatcgcatttaacctaac 23019699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Original strand, 19668387 - 19668676
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  19668387 caacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgcaaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaac 19668485  T
Q  99 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 198  Q
    |||||| ||| ||||| || |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||| |  |||| |||||||||||||||    
T  19668486 aacatcacaa-catcatacgtaat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacactacatcatatacatcagacttactgaaacaaca 19668583  T
Q  199 acagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctg 291  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668584 acagcaagataaacaacttagtttcttacctccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctg 19668676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 9098619 - 9098310
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  9098619 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcatttcaaca 9098520  T
Q  100 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 199  Q
    || || ||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||            || ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  9098519 acttcacaa-catcaaacataat-tcatgtaatgtatatataattatataacattaa------------atcatataattcaggcttactgaaacaataa 9098434  T
Q  200 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaa 299  Q
    | |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| ||     
T  9098433 ctgcaagataaacaaattagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtgacaataaacctaacaaggtgttctgtctctcat 9098334  T
Q  300 gggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    | ||||| ||||||||||||||||    
T  9098333 gagctcgtgaggcgagagcctcta 9098310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 19652211 - 19652485
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  19652211 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaa 19652308  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| ||||| |||    
T  19652309 catctcaaacatc-aacataatc-catttaaagtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataac 19652406  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  19652407 agcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttatcctaa 19652485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Original strand, 20109154 - 20109476
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  20109154 caacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacataatataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 20109252  T
Q  101 catctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatataca--attatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 197  Q
    ||||||||| | ||| | || || ||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||| |  | ||| |  |||| ||||||  ||  ||    
T  20109253 catctcaaatattcatatat-aattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattgatatacatcagtcttactagaaagac 20109351  T
Q  198 aacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcac 297  Q
    | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||| |    
T  20109352 atcagcaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacaataaacttaacaagg-gttctgtctctc 20109450  T
Q  298 aagggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    | | ||||| ||||||||||||||||    
T  20109451 atgagctcgtgaggcgagagcctcta 20109476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 28496575 - 28496260
Alignment:
Q  2 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||     
T  28496575 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa- 28496478  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
      |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||| ||||  ||||    
T  28496477 --ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcatatgcatcagtcttactggaacattaaca 28496381  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcacaag 300  Q
    |||||  ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||  |||||   ||||||    
T  28496380 gcaaggtaaacaacttagtttctaaactctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgca-ttaacctaaacaaggcattctgtaacacaag 28496282  T
Q  301 ggctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
      ||||||||||||||||||||    
T  28496281 tactcgcgaggcgagagcctct 28496260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 29808986 - 29808671
Alignment:
Q  2 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||     
T  29808986 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa- 29808889  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
      |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||| ||||  ||||    
T  29808888 --ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcatatgcatcagtcttactggaacattaaca 29808792  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcacaag 300  Q
    |||||  ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||  |||||   ||||||    
T  29808791 gcaaggtaaacaacttagtttctaaactctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgca-ttaacctaaacaaggcattctgtaacacaag 29808693  T
Q  301 ggctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
      ||||||||||||||||||||    
T  29808692 tactcgcgaggcgagagcctct 29808671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 1561319 - 1561593
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| || |||||||    
T  1561319 caacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaacaa 1561417  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcaggcttactgaaacaacaa 199  Q
       |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||    |||| ||||||| || |  ||    
T  1561418 ---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcatatgcatcagtcttactggaatattaa 1561513  T
Q  200 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1561514 cagcaagataaacaacttagtttctaacctctaggatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaa 1561593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Original strand, 23076749 - 23077067
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacc-agcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||  | |  ||||||| |||||||| ||  | |||||||||    
T  23076749 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaacaaca 23076848  T
Q  103 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 202  Q
     || |||||||| | ||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  ||||||||||||||||||||||||    
T  23076849 acttaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaacag 23076947  T
Q  203 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaaggg 302  Q
     |||| || ||| |||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||||||||    
T  23076948 taagataagcaaattagtttcttacccccatgatcaactcacatcaactcatgcaacaaaggtcacatttatcctaacaagcag-tctgtctcacaaggg 23077046  T
Q  303 ctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  23077047 ctcgcaaggcgagagcctcta 23077067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Original strand, 35008167 - 35008485
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacc-agcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||  | |  ||||||| |||||||| ||  | |||| ||||    
T  35008167 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaaaaaca 35008266  T
Q  103 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 202  Q
     || |||||||| | ||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||||||||||||||||| |||||    
T  35008267 acttaaacatcatatataat-tcatgtaatgaatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaataacag 35008365  T
Q  203 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaaggg 302  Q
     |||| || |||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  |    
T  35008366 taagataagcaacttagtttcttacccccatgatcaactcacatcaactcgtgcaacaaaggtcacatttatcctaacaagcag-tctgtctcacaacag 35008464  T
Q  303 ctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  35008465 ctcgcgaggcgagagcctcta 35008485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 44 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22080800 - 22080523
Alignment:
Q  44 aacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta-agtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaa 142  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| | ||  ||||||||||||||||||   |||||  | || |||||||||||||     
T  22080800 aacataggcagtatgcaaaac-atcatgatataacaatatcgaatgcacag--aacaacatctcaaacatcgt-cataat-taatataatgtatatacat 22080706  T
Q  143 ttatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaact 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22080705 ttatataacattaacaacatcattaggtcatatcaatttaggcttactgaaacaacaagagcaagataagcaacttagtttctaacctctaagatcaact 22080606  T
Q  242 cacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||   ||| |||||||||||||| |  |||   ||||||||||||||||||||||    
T  22080605 cacatcaactcgtgcgacaaggatcgcattattcctaaacaaggtgttctgtcagacacaagctcgcgaggcgagagcctcta 22080523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 25644336 - 25644500
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25644336 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatcaa 25644435  T
Q  101 catctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 165  Q
    |||||||||||| || | ||||  ||| ||||||  ||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  25644436 catctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcgtatacaattatatcacatcaaaaacaacat 25644500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 155 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27333238 - 27333111
Alignment:
Q  155 aacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 254  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333238 aacaacaacattggattatacaattcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaatttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 27333139  T
Q  255 gcgacaaaggtcacatttaacctaacaa 282  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27333138 gcgacaaggatcacatttaacctaacaa 27333111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 155 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27393978 - 27393851
Alignment:
Q  155 aacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 254  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27393978 aacaacaacattggattatacaattcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaatttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 27393879  T
Q  255 gcgacaaaggtcacatttaacctaacaa 282  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27393878 gcgacaaggatcacatttaacctaacaa 27393851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Original strand, 29060559 - 29060662
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  29060559 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 29060657  T
Q  104 ctcaa 108  Q
    |||||    
T  29060658 ctcaa 29060662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 16496260 - 16496363
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || |||||||    
T  16496260 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaa 16496358  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  16496359 catct 16496363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4185926 - 4185648
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||| |||| || ||| |||    
T  4185926 caacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtatgc-aactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaa 4185828  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    | ||   | |||| |||||||| ||||| ||||| |||||| || | |||||| | ||||| |||| ||||| |||||| || || |||| |||| ||||    
T  4185827 cttc-atatcatc-aacataaa-tcatgcaatgtttatacatttgtttaacatcatcaacatcattggattaaacaatt-agactcactggaacatcaac 4185732  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 284  Q
    | || |  |  ||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| |||||    
T  4185731 aacatgctaggcaacttagttcttaacatctaagatcaactcacaacaactcgtgcggcaaggatcgcatttaacctagcaagg 4185648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 27333323 - 27333241
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  27333323 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 27333241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 27394063 - 27393981
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  27394063 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 27393981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 30676859 - 30676754
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30676859 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagtcaacaa 30676762  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  30676761 cgtctcaa 30676754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 18409932 - 18409821
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18409932 caacttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 18409834  T
Q  101 catctcaaacatc 113  Q
    |||||||| ||||    
T  18409833 catctcaatcatc 18409821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 22782240 - 22782385
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22782240 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 22782337  T
Q  101 catctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 148  Q
    | ||||||  | ||| |||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  22782338 cgtctcaattattcacacat-aattcaagtaatgcatatacaattatat 22782385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 25629460 - 25629354
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| | ||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25629460 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaattacaa-caggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaa 25629362  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    ||||||||    
T  25629361 catctcaa 25629354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 17287901 - 17287798
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||| |||||||| || |||||||||     
T  17287901 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacat 17287803  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  17287802 catct 17287798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 12742330 - 12742435
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12742330 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 12742427  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  12742428 cgtctcaa 12742435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18334741 - 18334636
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18334741 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 18334644  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  18334643 cgtctcaa 18334636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 19005059 - 19005164
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19005059 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 19005156  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  19005157 cgtctcaa 19005164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 19859068 - 19858963
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19859068 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 19858971  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  19858970 cgtctcaa 19858963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 20593789 - 20593895
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20593789 caacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataa-aaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 20593887  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    ||||||||    
T  20593888 catctcaa 20593895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 24422560 - 24422665
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24422560 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 24422657  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  24422658 cgtctcaa 24422665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 25656642 - 25656747
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| || ||    
T  25656642 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagttaataa 25656739  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  25656740 cgtctcaa 25656747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 33861807 - 33861912
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33861807 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 33861904  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  33861905 cgtctcaa 33861912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 33864291 - 33864396
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33864291 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 33864388  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  33864389 cgtctcaa 33864396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 20076716 - 20076812
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||||||| || ||||||    
T  20076716 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaaca 20076812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 19303642 - 19303540
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  19303642 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacacaggaagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 19303545  T
Q  104 ctcaa 108  Q
    |||||    
T  19303544 ctcaa 19303540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 20361065 - 20360962
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| |||    
T  20361065 caacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 20360967  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  20360966 catct 20360962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 2291329 - 2291224
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2291329 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 2291232  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  2291231 cgtctcaa 2291224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 8055042 - 8055147
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8055042 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-aaagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 8055139  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  8055140 cgtctcaa 8055147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 25688515 - 25688620
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  25688515 caacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaactgcaagtcaacaa 25688612  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  25688613 cgtctcaa 25688620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 25754822 - 25754927
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  25754822 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaa 25754919  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  25754920 cgtctcaa 25754927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 26924789 - 26924684
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26924789 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 26924692  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  26924691 cgtctcaa 26924684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 34963386 - 34963491
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34963386 caacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 34963483  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  34963484 cgtctcaa 34963491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 8227616 - 8227453
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  | |||||| |||||    
T  8227616 caacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaa 8227518  T
Q  101 catctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 165  Q
    |||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  8227517 catctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 8227453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31155491 - 31155223
Alignment:
Q  12 gactcatgcagcttagttaaataacaaa-cagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaac 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||  | | | ||||||||||||||| |||| || ||| |||| ||  |  |    
T  31155491 gactcatgcaacttagttaaataacaaaacagcaac-taaacagtatgcaagtc-atcgtgatataacaatatcgaatgcaattcatcaacttcatat-c 31155395  T
Q  111 atcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaa 210  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||  ||||| | |||| || || |||| |||| ||||||||||  |     
T  31155394 atcaa-cataaa-tcatgcaatgtttatacatttatataacatcaacaacatcatcggattaaaaaatttagactcactggaacatcaacagcaagctag 31155297  T
Q  211 acaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 284  Q
     ||||||||||| | || ||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||    
T  31155296 gcaacttagttcttaacatctaaaatcatctcacaacaactcgtgcgacaaggaccgcatttaacctaacaagg 31155223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4668277 - 4668038
Alignment:
Q  40 cagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatata 139  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||| |||| || ||| |||| ||  |  |||||| |||||| ||||| ||||| ||||    
T  4668277 cagcaacataggcagtatgcaactc-atcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaacttcatat-catcaa-cataaa-tcatgcaatgtttata 4668182  T
Q  140 caattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaa 239  Q
    || || | |||||| | ||||| |||| ||||| |||||| || || |||| |||| |||||||| |  |  ||||||||||| | || |||||||||||    
T  4668181 catttgtttaacatcatcaacatcattggattaaacaatt-agactcactggaacatcaacagcatgctaggcaacttagttcttaacatctaagatcaa 4668083  T
Q  240 ctcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 284  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||    
T  4668082 ctcacaacaactcgtgcgacaaggatcgcatttaacctagcaagg 4668038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4675124 - 4674885
Alignment:
Q  40 cagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatata 139  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||| |||| || ||| |||| ||  |  |||||| |||||| ||||| ||||| ||||    
T  4675124 cagcaacataggcagtatgcaactc-atcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaacttcatat-catcaa-cataaa-tcatgcaatgtttata 4675029  T
Q  140 caattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaa 239  Q
    || || | |||||| | ||||| |||| ||||| |||||| || || |||| |||| |||||||| |  |  ||||||||||| | || |||||||||||    
T  4675028 catttgtttaacatcatcaacatcattggattaaacaatt-agactcactggaacatcaacagcatgctaggcaacttagttcttaacatctaagatcaa 4674930  T
Q  240 ctcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 284  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||    
T  4674929 ctcacaacaactcgtgcgacaaggatcgcatttaacctagcaagg 4674885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18456837
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18456832  T
Q  104 ctcaa 108  Q
    |||||    
T  18456833 ctcaa 18456837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18461997
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18461992  T
Q  104 ctcaa 108  Q
    |||||    
T  18461993 ctcaa 18461997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 1541060 - 1540955
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1541060 caacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 1540963  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  1540962 cgtctcaa 1540955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 1595562 - 1595667
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  1595562 caacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaattcaacaa 1595659  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  1595660 cgtctcaa 1595667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 20557041 - 20556936
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20557041 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaatgcaagtcaacaa 20556944  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  20556943 cgtctcaa 20556936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 20638388 - 20638304
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 86  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  20638388 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 20638304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 16448676 - 16448582
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  16448676 caacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 16448582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18199519 - 18199261
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||| || |   ||||| |  ||||||||||||||||||||||  | |||||| ||    
T  18199519 cttagaccgactcatgcagcttaatcaa-taataaacagcaacataggaagcacataaaacaactcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatca 18199421  T
Q  103 -tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
     ||| |||||||| | ||||  |||  ||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||| ||||||||||||||||||    
T  18199420 atcttaaacatcatatataat-tcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatttatatcagacttactgaaacaacaaca 18199322  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaa 262  Q
    |||  | || ||||||  || | |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18199321 gcagtataagcaacttcatttcctaccccaaggatcaactcacaacaactcgtgcgacaaa 18199261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 22780332 - 22780229
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||| |||||||| || |||||||||     
T  22780332 caacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacaaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatcaattgcaagtcaacat 22780234  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  22780233 catct 22780229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 53
Target Start/End: Original strand, 22831524 - 22831571
Alignment:
Q  6 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831524 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 22831571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 16920728 - 16920679
Alignment:
Q  8 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16920728 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtat 16920679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Original strand, 35245605 - 35245658
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  35245605 cttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtat 35245658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18177775 - 18177517
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||| ||||||||| || |   ||||| |  ||||||||||||||||||||||  | |||||| ||    
T  18177775 cttagaccgactcatgcagcttaatcaa-taataaacaacaacataggaagcacataaaacaactcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatca 18177677  T
Q  103 -tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
     ||| |||||||| | ||||  |||  ||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||| ||||||||||||||||||    
T  18177676 atcttaaacatcatatataat-tcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatttatatcagacttactgaaacaacaaca 18177578  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaa 262  Q
    |||  | || ||||||  || | |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18177577 gcagtataagcaacttcatttcctaccccaaggatcaactcacaacaactcgtgcgacaaa 18177517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 262
Target Start/End: Original strand, 18204096 - 18204354
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||| ||||||||| || |   ||||| |  ||||||||||||||||||||||  | |||||| ||    
T  18204096 cttagaccgactcatgcagcttaatcaa-taataaacaacaacataggaagcacataaaacaactcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatca 18204194  T
Q  103 -tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
     ||| |||||||| | ||||  |||  ||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||| ||||||||||||||||||    
T  18204195 atcttaaacatcatatataat-tcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatttacatcagacttactgaaacaacaaca 18204293  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaa 262  Q
    |||  | || ||||||  || | |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18204294 gcagtataagcaacttcatttcctaccccaaggatcaactcacaacaactcgtgcgacaaa 18204354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 3852166 - 3852061
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||    
T  3852166 caacttagaccgactcatgcagcttagtttaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatataaaatgcaagtcaacaa 3852069  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  3852068 cgtctcaa 3852061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821866
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgccataacaatatcaa 18821866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 4186383 - 4186470
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 89  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  4186383 caacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacaggcagcaacatagacagtatgc-aactcatcatgatataacaatatcgaatg 4186470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 48
Target Start/End: Original strand, 11185524 - 11185568
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacat 48  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11185524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacat 11185568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 25714433 - 25714478
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25714433 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28103877 - 28103799
Alignment:
Q  129 taatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaaga 207  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28103877 taatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaaga 28103799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Original strand, 18696570 - 18696667
Alignment:
Q  68 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 167  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||| |||||||| ||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||    
T  18696570 catgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctccaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatta 18696667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 165
Target Start/End: Original strand, 18706356 - 18706483
Alignment:
Q  37 aaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgt 134  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||| ||  |||||||||||||||||||| | || |||| ||||||| |||||||| | || || ||||||||||     
T  18706356 aaacagcaacataggcaatatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatcttaaacatcatatat-aattcatgtaatgc 18706452  T
Q  135 atatacaattatataacattaacaacaacat 165  Q
    ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  18706453 atatacatttatatgacattattaacaacat 18706483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 57
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443118
Alignment:
Q  6 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagtat 33443118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 23527980 - 23527891
Alignment:
Q  234 gatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||  |||| ||| || | ||| |||||||||| |||||||    
T  23527980 gatcaactcaccacaactcgtgcgacaaagatcacatgaaacctgacaaggtagtctgtctctcaggagcttgcgaggcgagggcctcta 23527891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 262
Target Start/End: Original strand, 17105925 - 17106007
Alignment:
Q  179 tcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaa 262  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| || | |||||||||  |||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17105925 tcagggttactgaa-caacaacagtaatataaacaacttcattccctaccccaaggatcaactcacaacaactcgtgcgacaaa 17106007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 22949384 - 22949466
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  22949384 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 22949466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 22953340 - 22953422
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  22953340 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 22953422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 23871828 - 23871910
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  23871828 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 23871910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 23875784 - 23875866
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  23875784 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 23875866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27325470 - 27325388
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || | ||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  27325470 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattaatgcaatatatatataattatataacatta 27325388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 262
Target Start/End: Original strand, 23539165 - 23539243
Alignment:
Q  184 cttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaa 262  Q
    ||||||||||||||||| | || | |||||||||  || | |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23539165 cttactgaaacaacaactgtaatataaacaactttatttcctaccccaaggatcaactcacaacaactcgtgcgacaaa 23539243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 284
Target Start/End: Original strand, 4189203 - 4189252
Alignment:
Q  235 atcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||    
T  4189203 atcaactcacaacaactcgtgcgacaacgatcgcatttaacctagcaagg 4189252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 19848100 - 19848063
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19848100 caacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaa 19848063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 22080827 - 22080799
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaa 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22080827 cttagaccgactcatgcagcttagttaaa 22080799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 75)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 12288315 - 12287994
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12288315 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaac 12288217  T
Q  99 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 198  Q
    |||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12288216 aacatcacaa-catcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaccaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaaca 12288119  T
Q  199 acagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcaca 298  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||| |     
T  12288118 acagcaagataaacaacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaacttatgcgacaaaagtcacattaaacctaacaaagtgttatgtctctct 12288019  T
Q  299 agggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
     | ||||||||||||||||| ||||    
T  12288018 tgagctcgcgaggcgagagcttcta 12287994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 39706393 - 39706118
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||    
T  39706393 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatgaa 39706295  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  39706294 catcataaacatcaa-cataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatcatataattcaggcttactaaaacaacaac 39706197  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  39706196 agcaagataaacaacttaattcctaatctccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaa 39706118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13635
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 13855  T
Q  104 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 202  Q
    |||||| || || | ||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || ||| |  |||| ||||||| |||| |||||     
T  13854 ctcaaatattcatatataat-tcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataaacatcagtcttactggaacatcaacat 13756  T
Q  203 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaaggg 302  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  13755 aaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggacacaataaaccttacaaggtgttctgtctcacaagga 13656  T
Q  303 ctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  13655 ctcgcgaggcgagggcctcta 13635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 53082254 - 53081935
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||| | || |||| |||    
T  53082254 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataac 53082157  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53082156 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 53082058  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctct-aagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaag 300  Q
    | |||| || |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53082057 gtaagataagcaacttagtttcttaccccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaatgtcacatttaacctaacaaggtgttctgtctcacaag 53081958  T
Q  301 ggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  53081957 ggctcgcgacgcgagagcctcta 53081935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 46640558 - 46640241
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  46640558 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataac 46640460  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
    ||||||| ||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| |||| |  |||||||| | || ||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  46640459 atctcaa-catcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacatcattaacaacatcaaatcatataattcaggtttactgaaacaataaca 46640362  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 301  Q
    | |||| || |||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  46640361 gtaagataagcaacttagtttcttacccc-atgatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtattctgtctcacaagg 46640263  T
Q  302 gctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  46640262 gctcgcaaggcgagagcctcta 46640241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 12774023 - 12774333
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||  || |||||||    
T  12774023 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatacaa-tcaacaa 12774120  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||||||||  ||| ||||||| | ||| ||||||||||||        |||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| |||||||||    
T  12774121 catctcaattatc-aacataatc-catttaatgtatatac--------aacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaac 12774210  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcacaa 299  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||   ||||   |||||    
T  12774211 agcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaggatcgcatttaacctaaacaaggcagtctgtaacacaa 12774310  T
Q  300 gggctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||    
T  12774311 gtactcgcgaggcgagagcctct 12774333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 43198660 - 43198380
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  43198660 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatca 43198561  T
Q  100 acatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 198  Q
    | |||||||| | ||| | || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |  | |||    | || ||||||| |||| ||    
T  43198560 atatctcaaatattcatatat-aattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcatatgcattagtcttactggaacatca 43198462  T
Q  199 acagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaag 283  Q
    ||| ||||| |||||||||||||  ||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  43198461 acaacaagataaacaacttagttttttacctct---agcaactcacatcaactcgtgtgacaaagatcgcatttaacctaacaag 43198380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Original strand, 16596686 - 16596942
Alignment:
Q  23 cttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||     
T  16596686 cttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcatcaac---tcaattatcaaacttaag 16596781  T
Q  123 ctcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttc 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||    |||| ||||||  ||||  |||||||||  |||||||||||||     
T  16596782 -tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaatttataagcatcagtcttacttgaacattaacagcaaggtaaacaacttagttt 16596880  T
Q  223 cttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 284  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  16596881 ctaacctctaagatcaactcacatcaactcgaacgacaaagatcacattcaacctaaaaagg 16596942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 8846372 - 8846660
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgata----------------taacaatatc 84  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |                ||||||||||    
T  8846372 caacttagaccgacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgagataacaatatcgaatgctaacaatatc 8846470  T
Q  85 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 184  Q
     |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |    
T  8846471 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtc 8846569  T
Q  185 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaac 275  Q
    |||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  8846570 ttactggaacaacaactacaagataaacaacttagtttctaatctctaagttcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaac 8846660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 15551833 - 15552105
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| || |||| |||||||    
T  15551833 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaat-ccatcatgatataataatatcgaaggtaaatcaacaa 15551931  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcaggcttactgaaacaacaa 199  Q
    |   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||| |||    |||| |||||||  |||  ||    
T  15551932 c---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacatt-gattcataagcatcagtcttactgggacattaa 15552026  T
Q  200 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    |||| ||   |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| ||||||    
T  15552027 cagc-agggtaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgaacgacaaagatcgcattttacctaa 15552105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 52243301 - 52243136
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  52243301 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-agttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaac 52243203  T
Q  99 aacatctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 165  Q
    |||||||||||||| || | |||| | || |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  52243202 aacatctcaaacattcatatataatc-caagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 52243136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 279
Target Start/End: Original strand, 15099457 - 15099640
Alignment:
Q  94 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaa 193  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  15099457 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactggaa 15099554  T
Q  194 caacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
      |||||| ||||  ||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||    
T  15099555 tgacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcatgcgacaaagatcgcttttaacctaa 15099640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 279
Target Start/End: Original strand, 15190424 - 15190607
Alignment:
Q  94 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaa 193  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  15190424 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactggaa 15190521  T
Q  194 caacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
      |||||| ||||  ||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15190522 tgacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcttttaacctaa 15190607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 16377626 - 16377522
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16377626 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 16377530  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    ||||||||    
T  16377529 catctcaa 16377522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 7798790 - 7798893
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||| |||    
T  7798790 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcatcaa 7798888  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  7798889 catct 7798893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 12902773 - 12902876
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||    
T  12902773 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaattcatcaa 12902871  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  12902872 catct 12902876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 52873472 - 52873369
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||||||     
T  52873472 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacat 52873374  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  52873373 catct 52873369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 54798859 - 54798752
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  54798859 caacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 54798761  T
Q  101 catctcaaa 109  Q
    |||||||||    
T  54798760 catctcaaa 54798752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 7088893 - 7088996
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| |||    
T  7088893 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 7088991  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  7088992 catct 7088996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 14280329 - 14280435
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14280329 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 14280426  T
Q  101 catctcaaa 109  Q
    |||||||||    
T  14280427 catctcaaa 14280435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18215423 - 18215318
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18215423 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 18215326  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  18215325 cgtctcaa 18215318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 44929029 - 44928923
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| ||    
T  44929029 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaatgcaagtcaataa 44928931  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    ||||||||    
T  44928930 catctcaa 44928923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 7893719 - 7893822
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||||||     
T  7893719 caacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacat 7893817  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  7893818 catct 7893822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 23374464 - 23374361
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||| || || |||||||    
T  23374464 caacttagaacgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaa 23374366  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  23374365 catct 23374361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12456 - 12351
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12456 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 12359  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  12358 cgtctcaa 12351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 14038664 - 14038770
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || ||||  |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14038664 caacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatgcaagtcaacaa 14038762  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    ||||||||    
T  14038763 catctcaa 14038770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 15118501 - 15118396
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15118501 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 15118404  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  15118403 cgtctcaa 15118396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 19618321 - 19618216
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19618321 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 19618224  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  19618223 cgtctcaa 19618216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 44773236 - 44773131
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44773236 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 44773139  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  44773138 cgtctcaa 44773131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 52312523 - 52312628
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  52312523 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 52312620  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  52312621 cgtctcaa 52312628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 3096309 - 3096385
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataac 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  3096309 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatgtaac 3096385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 16270336 - 16270238
Alignment:
Q  5 ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatc 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  16270336 ttagaccgactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagttaacaacatc 16270239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 1837658 - 1837553
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||    
T  1837658 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaatgcaagtcaacaa 1837561  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  1837560 cgtctcaa 1837553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 3515020 - 3515125
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3515020 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 3515117  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  3515118 cgtctcaa 3515125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18239568 - 18239463
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18239568 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 18239471  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  18239470 cgtctcaa 18239463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 19242712 - 19242817
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19242712 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 19242809  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  19242810 cgtctcaa 19242817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 44615301 - 44615406
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44615301 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 44615398  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  44615399 cgtctcaa 44615406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 50222488 - 50222383
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || ||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  50222488 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 50222391  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  50222390 cgtctcaa 50222383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 51464017 - 51463912
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  51464017 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaa 51463920  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  51463919 cgtctcaa 51463912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 86
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190563
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa 6190563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 6899907 - 6900009
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6899907 caacttagaccgactcatgcatcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatagcataataatatcaaatgcaagtcaacaa 6900004  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  6900005 catct 6900009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 15355474 - 15355380
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  15355474 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15355380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 16240074 - 16239972
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16240074 caacttagaccaactcatgcaacttaattaaataacaat-agcaaaataggcagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 16239977  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  16239976 catct 16239972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 22636451 - 22636554
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| | ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| |||    
T  22636451 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 22636549  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  22636550 catct 22636554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 23803414 - 23803316
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  23803414 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaa 23803317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 44052845 - 44052948
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| |||    
T  44052845 caacttaggccgactcatgcagctcagttaaataacaa-catcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 44052943  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  44052944 catct 44052948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 8574971 - 8574867
Alignment:
Q  2 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  8574971 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgtaattcaacaac 8574875  T
Q  102 atctcaaa 109  Q
    ||||||||    
T  8574874 atctcaaa 8574867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 14970856 - 14970751
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14970856 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaaca-gcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 14970759  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  14970758 cgtctcaa 14970751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Original strand, 17046506 - 17046559
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17046506 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtat 17046559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 44102227 - 44102332
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||    
T  44102227 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaataacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaa 44102324  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  44102325 cgtctcaa 44102332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Original strand, 15367708 - 15367800
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  15367708 acttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15367800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Original strand, 15370036 - 15370128
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  15370036 acttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15370128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Original strand, 15371220 - 15371312
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  15371220 acttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15371312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Original strand, 15373501 - 15373593
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  15373501 acttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15373593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Original strand, 15402721 - 15402813
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  15402721 acttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15402813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 21815731 - 21815629
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |  | |||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  21815731 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataac-gacagcaacaca-actgtatacaaaaacagcatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgt 21815634  T
Q  104 ctcaa 108  Q
    |||||    
T  21815633 ctcaa 21815629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 14053403 - 14053323
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 86  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||    
T  14053403 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa--cagcatgacataataatatcaa 14053323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 7641331 - 7641286
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7641331 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 7641286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 12610963 - 12611008
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12610963 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 12611008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 15464972 - 15464926
Alignment:
Q  66 agcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15464972 agcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 15464926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Original strand, 16223550 - 16223642
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||| |||||||    
T  16223550 acttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatctaatgcaagtcaa 16223642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 266
Target Start/End: Original strand, 14164739 - 14164827
Alignment:
Q  177 attcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtc 266  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||| | |||| ||| |||||||||    
T  14164739 attcaggcttactagaacaacaacagcaagataaacaacttagttcccaacccctaggatcatctcacaac-actcttgcaacaaaggtc 14164827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Original strand, 22353852 - 22353955
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||  || |  | || ||||| ||||||||||||| |  || |||||||| |    
T  22353852 cttagaccgactcatgcagcttaggtaaataac-aacagcagcataggcagattgtagcaacaacatgacataacaatatcaattacaattcaacaacgt 22353950  T
Q  104 ctcaa 108  Q
    |||||    
T  22353951 ctcaa 22353955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 22634086 - 22633999
Alignment:
Q  236 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa-caaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||  |||||   |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22634086 tcaactcataacaaatcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtgctcgcgaggcgagagcctct 22633999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 266
Target Start/End: Original strand, 14158034 - 14158122
Alignment:
Q  177 attcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtc 266  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||| ||| ||||| |||||| | |||| ||| |||||||||    
T  14158034 attcaggcttactagaacaacaacagcaagataaaaaacttagttcccaacccctaggatcatctcacaac-actcttgcaacaaaggtc 14158122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 630810 - 630728
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  630810 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aatgcatgcaatatatatccaattatataacatta 630728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 3331970 - 3332052
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  3331970 atataacaattacaaatgcatgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 3332052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13812682 - 13812639
Alignment:
Q  236 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13812682 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcacatttaacctaa 13812639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 13812845 - 13812763
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  13812845 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 13812763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14953997 - 14953915
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  14953997 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 14953915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 322
Target Start/End: Original strand, 24028989 - 24029076
Alignment:
Q  236 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa-caaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  |||||    || || |||||||||||||||||||||    
T  24028989 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctct 24029076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 25690146 - 25690228
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  25690146 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 25690228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 315
Target Start/End: Original strand, 16043259 - 16043340
Alignment:
Q  234 gatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgag 315  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| || |||  | |||||||||||  |||| ||| || | ||||||||||||||    
T  16043259 gatcaactcaccacaactcgtgcgacaaagatcgcatgaaccctaacaaggtagtctgtctctcaggagctcgcgaggcgag 16043340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Original strand, 13844786 - 13844874
Alignment:
Q  236 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa-caaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||   ||||| |||||||||||| |  |||   ||||||||||||||||||||||    
T  13844786 tcaactcacatcaactcatgcaacataggtcacgttattcctaaacaaggtgttctgtcagacacaagctcgcgaggcgagagcctcta 13844874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 20149842 - 20149936
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  | ||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  20149842 caacttagactgactcatgcaacttgataaaataacaa-cagcgacacat-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 20149936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 60)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861354
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21861574  T
Q  104 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 202  Q
    ||||||||| || | ||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || |||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21861573 ctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcatatcataatattcaggcttactgaaacaacaatag 21861475  T
Q  203 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaaggg 302  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||     
T  21861474 caagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaatgtcacatttaacctaacaaggcattctgtctcacaagga 21861375  T
Q  303 ctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    | ||||||||||| |||||||    
T  21861374 cacgcgaggcgagggcctcta 21861354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 22921971 - 22921701
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  22921971 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacat 22921873  T
Q  104 ctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatac-aattcaggcttactgaaacaacaacag 202  Q
    |||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22921872 ctcaaatatcaa-ca-aaattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacag 22921775  T
Q  203 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacc 276  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22921774 caagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacc 22921701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896043
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaac-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21896260  T
Q  104 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 202  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || |||  |||||||||||||||||||||||||     
T  21896259 ctcaaacattcatatataat-tcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataatattcaggcttactgaaacaacaaca- 21896162  T
Q  203 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaaggg 302  Q
      ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||     
T  21896161 --agataaacaacttagtttcttacatctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggcattttgtctcacaagga 21896064  T
Q  303 ctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  21896063 ctcgcgaggcgggggcctcta 21896043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16368388 - 16368074
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||| |  ||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  16368388 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacaattcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaaca 16368290  T
Q  103 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 202  Q
    |||||| ||||    ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16368289 tctcaa-catcgtttataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacag 16368192  T
Q  203 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaaggg 302  Q
     |||| |||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16368191 taagataaacaacttaatttcttacccctatgatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgtctcacaaggg 16368092  T
Q  303 ctcgcgaggcgagagcct 320  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16368091 ctcgcgaggcgagagcct 16368074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 50614219 - 50613901
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  50614219 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 50614121  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
    ||||||||||||    ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||| | || ||| |||||||||||||||||  ||||||     
T  50614120 atctcaaacatcttttataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaagtaacaacg 50614022  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 301  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50614021 gtaagacaaacaacttagtttcttaccccct-gatcaattcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgtctcacaagg 50613923  T
Q  302 gctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    ||||||| ||||||| ||||||    
T  50613922 gctcgcggggcgagaacctcta 50613901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 50622047 - 50621729
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  50622047 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 50621949  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
    ||||||||||||    ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||| | || ||| |||||||||||||||||  ||||||     
T  50621948 atctcaaacatcttttataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaagtaacaacg 50621850  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 301  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50621849 gtaagacaaacaacttagtttcttaccccct-gatcaattcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgtctcacaagg 50621751  T
Q  302 gctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    ||||||| ||||||| ||||||    
T  50621750 gctcgcggggcgagaacctcta 50621729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Original strand, 50686630 - 50686949
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||  ||  |||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  50686630 cttagaccgactcatgcagtttagttaataaacaaacggcaacataggcagttcataaaat-agttcatgatataacaatgtcaaatgcaaatcaacaac 50686728  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50686729 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcggatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 50686827  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 301  Q
    | |||| || |||||||||| |||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  50686828 gtaagataagcaacttagtttcttacccccatgatcaactcacgtcaactcgtgcgacaaaggtcacatttatcctaacaaggtattctgtctcacaggg 50686927  T
Q  302 gctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  50686928 gctcgcgaggcgagagcctcta 50686949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 33681023 - 33681295
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||  |||    
T  33681023 caacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcgtcaa 33681121  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||  |||||||||    
T  33681122 catctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactagaacaacaac 33681220  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaac 275  Q
    | ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  33681221 aacaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgtgacaaagatcgcatttaac 33681295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 22237643 - 22237920
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  22237643 caacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 22237741  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa- 199  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |  | |||    |||| ||  ||| ||||||||     
T  22237742 catctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataactttagaaacaacatcaattcatatgtatcagtctcgctggaacaacaat 22237840  T
Q  200 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  22237841 cagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgaaaaagatcgcatttaacctaa 22237920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 41050138 - 41049843
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41050138 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaat-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 41050040  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
    ||||||| ||||| | ||||  ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||| | | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41050039 atctcaa-catcatatataat-tcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacgtcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 41049942  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaag 300  Q
    | |||| ||  ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41049941 gtaagataagaaacctagttccttacccctatgatcaactcacatcaactcatgcgacaaaggtcacatataacctaacaaggtattctgtctcacaag 41049843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 52928075 - 52927806
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||                
T  52928075 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaat------------ 52927989  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| ||||||||     
T  52927988 catctcaaatatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaat 52927890  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 284  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  52927889 agcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaacaagg 52927806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 21754061 - 21754370
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  21754061 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa-tcaacaa 21754158  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||||||||  ||| ||||||| | ||| ||||||||||||        |||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| |||||  ||    
T  21754159 catctcaattatc-aacataatc-catttaatgtatatac--------aacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaatgac 21754248  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaag 300  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   ||||    |||||    
T  21754249 agcaagataaacaacttagtttctaacctctgagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaggatcacatttaacctaacaaggcagtctgtaaaacaag 21754348  T
Q  301 ggctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
      ||||||||||||||||||||    
T  21754349 tactcgcgaggcgagagcctct 21754370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 184 - 323
Target Start/End: Original strand, 12271744 - 12271883
Alignment:
Q  184 cttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaag 283  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12271744 cttactgaaacaataacagcaggataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaag 12271843  T
Q  284 gtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    |  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12271844 gcattctgtctcacaaggactcgcgaggcgagagcctcta 12271883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918936
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa 20918718  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    |   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  | |||    | || ||||||| ||||  |||    
T  20918719 c---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacatcaattcataagcatgagtcttactggaacattaac 20918814  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaag 300  Q
    | ||||  |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| || |||| ||||||| ||||  ||||    ||||      
T  20918815 aacaaggtaaacgacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaagtcgaacgacaaagatcgcattcaacctaaaaaggcattctttaacacaca 20918914  T
Q  301 ggctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  20918915 agctcgcgaggcgagagcctct 20918936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 20248295 - 20248567
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  20248295 caacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaa 20248393  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcaggcttactgaaacaacaa 199  Q
       || ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||| |||    |||| |||||||  |||||||    
T  20248394 ---cttaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatatatcattataaacaaca-tggattcatatgcatcagtcttactg-gacaacaa 20248487  T
Q  200 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    || ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||   || ||||||||||||    
T  20248488 catcaagataaataacttagtttctaacctctaagatcaatttacatcaacttgtgcgacaagaatcgcatttaacctaa 20248567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 35981700 - 35981517
Alignment:
Q  94 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaa 193  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  35981700 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatgcaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactggaa 35981603  T
Q  194 caacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
      |||||| ||||| ||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  35981602 tgacaacatcaagataaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaattcgtgcgacaaagatcgcttttaacctaa 35981517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 279
Target Start/End: Original strand, 49261448 - 49261631
Alignment:
Q  94 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaa 193  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  49261448 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataattt-atataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatatacaattccggcttactggaa 49261545  T
Q  194 caacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
      |||||| ||||  ||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  49261546 ggacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcttttaacctaa 49261631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14295652 - 14295507
Alignment:
Q  5 ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||   |    
T  14295652 ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---c 14295557  T
Q  105 tcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||  |||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295556 tcaattatcagac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 14295507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 279
Target Start/End: Original strand, 20636956 - 20637140
Alignment:
Q  93 gtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaa 192  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  20636956 gtcaacaacatcccaaata-caaacataat-tcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattaaaaaatacaattcaggcttactgga 20637053  T
Q  193 acaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    |  |||||| ||||  ||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||    
T  20637054 atgacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcatgcgacaaagatcgcttttaacctaa 20637140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35261023
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||    
T  35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaacat 35261085  T
Q  104 ctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 165  Q
    |||||||| ||| |||| || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||  ||||||||    
T  35261084 ctcaaacattcatacat-aattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacat 35261023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 50210318 - 50210212
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  50210318 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 50210220  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    ||||||||    
T  50210219 catctcaa 50210212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 45574989 - 45574846
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |    
T  45574989 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataataccaaatgcaagtcaacaacgt 45574891  T
Q  104 ctcaaacatcaaacata-aactcatgtaatgtatatacaattatat 148  Q
    |||||  ||  |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  45574890 ctcaattat-taacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 45574846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 34509796 - 34509899
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||    
T  34509796 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaatgcaagtcaacaa 34509894  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  34509895 catct 34509899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 16758665 - 16758828
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  ||  ||||    
T  16758665 caacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaac 16758763  T
Q  99 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaaca 164  Q
    |||||| |||   ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  16758764 aacatcacaacattcatatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaaca 16758828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 27250834 - 27250731
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| |||    
T  27250834 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 27250736  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  27250735 catct 27250731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 13988879 - 13988984
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13988879 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 13988976  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  13988977 cgtctcaa 13988984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 21840780 - 21840885
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21840780 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 21840877  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  21840878 cgtctcaa 21840885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 21923440 - 21923335
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21923440 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 21923343  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  21923342 cgtctcaa 21923335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 23593884 - 23593779
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23593884 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 23593787  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  23593786 cgtctcaa 23593779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 31612326 - 31612430
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31612326 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 31612423  T
Q  101 catctca 107  Q
    |||||||    
T  31612424 catctca 31612430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 21026696 - 21026799
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||  ||||||| || || |||||||    
T  21026696 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatcaattgcaattcaacaa 21026794  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  21026795 catct 21026799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 20847259 - 20847173
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||  |||||||||    
T  20847259 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtacacaaaatcagcatgacataaatatatcaaat 20847173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 21475236 - 21475131
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21475236 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 21475139  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  21475138 cgtctcaa 21475131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 29298150 - 29298254
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29298150 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaatgcaagtcaacaa 29298246  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  29298247 cgtctcaa 29298254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 433025 - 433128
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||| ||||||||| ||||| || || || |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  433025 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacg----gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 433120  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    ||||||||    
T  433121 catctcaa 433128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 16093987 - 16093825
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtc-aacaa 100  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || || |||||    
T  16093987 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaatagcaacataggcagtatagaaaa-cagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaaacaa 16093890  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatt 166  Q
    |||||||||||||| |  | || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||    
T  16093889 catctcaaacatcataggt-aattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattaaaatcaacatt 16093825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 22123215 - 22123119
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22123215 acttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacaca-acagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 22123119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 22532285 - 22532388
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| | || || |||||||    
T  22532285 caacttagaccaactcatgcaatttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatccattgcaattcaacaa 22532383  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  22532384 catct 22532388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 29776701 - 29776806
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29776701 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 29776798  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  29776799 cgtctcaa 29776806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 16361930 - 16362035
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16361930 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gacagcaacaca-acagtatataaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 16362027  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  16362028 cgtctcaa 16362035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22130975 - 22130863
Alignment:
Q  38 aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtata 137  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  |||||||||| |||    
T  22130975 aacagcaacataggcagtatccaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgcata 22130881  T
Q  138 tacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22130880 tacaattatataacatta 22130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 38801483 - 38801433
Alignment:
Q  11 cgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaa 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38801483 cgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaa 38801433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 20454658 - 20454606
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20454658 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcag 20454606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 21707180 - 21707325
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |   ||||| |||||  ||||||| | || ||||||||||| ||||||||||    
T  21707180 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaatgcaagtcaacaa 21707277  T
Q  101 catctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 148  Q
    | ||||||  | ||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  21707278 cgtctcaattattcacatataaa-tcatgtaatgcctatacaattatat 21707325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 21711722 - 21711867
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |   ||||| |||||  ||||||| | || ||||||||||| ||||||||||    
T  21711722 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaatgcaagtcaacaa 21711819  T
Q  101 catctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 148  Q
    | ||||||  | ||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  21711820 cgtctcaattattcacatataaa-tcatgtaatgcctatacaattatat 21711867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 21161732 - 21161932
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||| || ||| |||    
T  21161732 caacttggatcgactcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaaca-aaacagtatgc-aaatcatcgtgatataacaatatcgaatgcaattcatcaa 21161829  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    | ||   | |||| |||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||| |||| | ||||| |||| |||| ||||    
T  21161830 cttc-atatcatc-aacataaa-tcatacaatgtttatacacttatataacatcaacgacatcattggattaaacaaattaggctcactggaacatcaac 21161926  T
Q  201 agcaag 206  Q
    ||||||    
T  21161927 agcaag 21161932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 13213011 - 13212917
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  13213011 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacgca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 13212917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 15860158 - 15860064
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||| ||||| |||||||    
T  15860158 caacttggaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatattaaatgcaagtcaa 15860064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 16275513 - 16275419
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||||    
T  16275513 caacttagaccgactcatacaacttagttaaataac-aacaacgacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaa 16275419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 21342109 - 21342203
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  21342109 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 21342203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 21346974 - 21347068
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  21346974 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 21347068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 22468801 - 22468698
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||| | |||||||| || | |||||||| || || |||||||    
T  22468801 caacttagactgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcataatatcaattgcaattcaacaa 22468703  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  22468702 catct 22468698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 155
Target Start/End: Original strand, 26064959 - 26065107
Alignment:
Q  6 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatc 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||   ||||  |  ||||||||||||||| | |||| || |||||||||||    
T  26064959 tagaccaactcatgcagcttagttgataaacaaacagcaacataggcagtacataaaataattcatgatataacaata-ccaatgcaaatcaacaacatc 26065057  T
Q  105 tcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||| |||| | || || ||| |||||  |||||||| ||||| ||||||    
T  26065058 tcaaagatcatatat-aattcaagtaatacatatacaaatatatcacatta 26065107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Original strand, 51130639 - 51130729
Alignment:
Q  61 aaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   ||||  |||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51130639 aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac---tcaattatcagacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 51130729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 21714558 - 21714595
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21714558 caacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 21714595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 40389167 - 40389261
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  40389167 caacctagactgactcatgcaacttggttaaataacaa-cagcgacacat-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 40389261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1924996 - 1924914
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  1924996 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 1924914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20924010 - 20923928
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  20924010 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 20923928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 108
Target Start/End: Original strand, 12271639 - 12271676
Alignment:
Q  71 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  12271639 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaa 12271676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 323
Target Start/End: Original strand, 43697623 - 43697708
Alignment:
Q  239 actcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||   ||| |||||||||||||| |  |||   ||||||||||||||||||||||    
T  43697623 actcacatcaactcgtgcaacataggtcacgttattcctaaacaaggtgttctgtcagacacaagctcgcgaggcgagagcctcta 43697708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 93)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 15470940 - 15471215
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  15470940 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 15471038  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15471039 catctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaac-ttagatcatataattcaggcttactgaaacaacaac 15471136  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15471137 aacaagataaacaacttagtttctaacctccaagatcatctaacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaa 15471215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 14234503 - 14234781
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  14234503 caacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 14234601  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactga--aacaaca 198  Q
    ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  14234602 catcataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattaaacaattcaggcttactgaacaacaaca 14234700  T
Q  199 acagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  14234701 acaacaagataaataacttagtttctaacctccaagatcaactaacatcaacttgttcgacaaagatcacatttaacctaa 14234781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 16097344 - 16097616
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||| ||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  16097344 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatcatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 16097442  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| |||||||||    
T  16097443 catctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaac 16097541  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaac 275  Q
    ||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16097542 agcaagataaacaacttagtttctaatctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaac 16097616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 37251270 - 37250984
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  37251270 cttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37251172  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
    ||||||| ||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  37251171 atctcaa-catcataaataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcagacttactggaacaacaaca 37251074  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctg 291  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37251073 gtaagataaacaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacttttaacctaacaaggtgttctg 37250984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 13210432 - 13210113
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| || |||||||    
T  13210432 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaacaa 13210334  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcaggcttactgaaacaacaa 199  Q
       || ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||  ||| |||    |||| ||||||| ||    ||    
T  13210333 ---cttaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattgaattcatatgcatcagccttactggaatgttaa 13210238  T
Q  200 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcaca 298  Q
    || ||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||   ||||    
T  13210237 caacaagataaacaacttagtttctaacctctaggatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcacatttaacctaaacaaggcattctgtaacaca 13210138  T
Q  299 agggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  13210137 agtgctcgcgaggcgagagcctcta 13210113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 16103796 - 16104071
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  16103796 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaa 16103893  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |  | |||    | || ||||||| |||||||||    
T  16103894 catctcaaatatcaaacat-aattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaattcatatggattagtcttactggaacaacaac 16103992  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  16103993 agcaagataaacaacttagtttctaacctctaagattaactcacatcaactcgtgcgacaaagagcgcatttaacctaa 16104071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22110454 - 22110136
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  22110454 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacagc 22110356  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
    ||||||| ||||| | | ||  ||||||||||  |||||| |||||| ||||||  |||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110355 atctcaa-catcatatagaat-tcatgtaatgcgtatacatttatatcacattattaacaacttcaaatcatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 22110258  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 301  Q
    | |||| || |||||||||| ||||||   | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |  |     
T  22110257 gtaagataagcaacttagtttcttaccctcatgatcaactcacatcaattcgtgcgacaaaggtcacattaaacctaacaaggtgttctgtccctcttga 22110158  T
Q  302 gctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22110157 gctcgcgaggcgagagcctcta 22110136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 32307693 - 32308003
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  32307693 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaa 32307790  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||||||||  ||| ||||||| | ||| ||||||||||||        |||||||  ||||||||||  | |||    |||| ||||||  |||||  ||    
T  32307791 catctcaattatc-aacataatc-catttaatgtatatac--------aacattataaacaacattaattcataagcatcagtcttactagaacaatgac 32307880  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcacaa 299  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||  || ||   |||||    
T  32307881 agcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattatgtaacacaa 32307980  T
Q  300 gggctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||    
T  32307981 gtactcgcgaggcgagagcctct 32308003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 145 - 323
Target Start/End: Original strand, 43927291 - 43927469
Alignment:
Q  145 atataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcac 244  Q
    |||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||| | | |||||||||||    
T  43927291 atatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccatgatcaactcac 43927390  T
Q  245 atcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43927391 atcaactcgtgcgacaaaggtcacatttatcctaacaaggtattctgtctcacaagggctcgcgaggcgagagcctcta 43927469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12174364 - 12174152
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| ||   |||||    
T  12174364 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa---aacaa 12174269  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcaggcttactgaaacaacaa 199  Q
    || |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||    |||| ||||||| ||||||||    
T  12174268 caactcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatt-gattcatatgcatcagtcttactggaacaacaa 12174171  T
Q  200 cagcaagacaaacaactta 218  Q
    |||||||  ||||||||||    
T  12174170 cagcaagctaaacaactta 12174152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 49668178 - 49667870
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac-aaca 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||    
T  49668178 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaaaca 49668081  T
Q  103 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatataca--attatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    |||||   ||| ||||||| | ||| ||| |||||||||  ||||||||     |||| |||| | |   ||| ||  |||| ||||||| |||||  ||    
T  49668080 tctcatttatc-aacataatc-catttaaagtatatacagcattatata----caacatcaac-tca---tatgca--tcagtcttactggaacaatgac 49667993  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcacaa 299  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||   ||||   |||||    
T  49667992 agcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgtatttaacctaaacaaggcagtctgtaacacaa 49667893  T
Q  300 gggctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
    |  ||||||||||||||||||||    
T  49667892 gtactcgcgaggcgagagcctct 49667870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 1465423 - 1465240
Alignment:
Q  94 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaa 193  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  1465423 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatgtaatgtatatacaattgtataacattatcatcaacattagaataaacaatccaggcttactggaa 1465326  T
Q  194 caacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
      ||| || ||||  ||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  1465325 tgacagcatcaaggtaaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattacttttaacctaa 1465240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523669
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaac-agttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaac 52523733  T
Q  102 atctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 165  Q
    ||||||||||| || | ||||  ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  52523732 atctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 52523669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 95 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 49389642 - 49389459
Alignment:
Q  95 caacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaac 194  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| |||    
T  49389642 caacaacatctcaactatcaaacataat-tcatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaac 49389544  T
Q  195 aacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  49389543 aacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaacacacatcaactcgtgcgacaaggatcgcatttaacctaa 49389459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386533
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaaca 42386526  T
Q  103 tctcaaa 109  Q
    |||||||    
T  42386527 tctcaaa 42386533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 18438550 - 18438653
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18438550 caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagtcaacaa 18438648  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  18438649 catct 18438653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 12399225 - 12399328
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  12399225 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaatgcaattcaacaa 12399323  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  12399324 catct 12399328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 27165263 - 27165370
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  27165263 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgcaaaa-caacatgatataccaatatcaaatgcaagtcatcaa 27165361  T
Q  101 catctcaaa 109  Q
     ||||||||    
T  27165362 tatctcaaa 27165370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 14972870 - 14972975
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  14972870 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaa 14972968  T
Q  101 catctca 107  Q
    |||||||    
T  14972969 catctca 14972975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 148
Target Start/End: Original strand, 43925977 - 43926121
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  43925977 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 43926075  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 148  Q
    ||||||||||||| | |  || |||||||||| ||||||| ||||||    
T  43926076 atctcaaacatcatata-caattcatgtaatgcatatacatttatat 43926121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 53301656 - 53301562
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtca 96  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53301656 caacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtca 53301562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 179 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12934241 - 12934141
Alignment:
Q  179 tcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaaccta 278  Q
    |||| ||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12934241 tcagtcttactggaacaatgacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaaccta 12934142  T
Q  279 a 279  Q
    |    
T  12934141 a 12934141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 23083466 - 23083363
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  23083466 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 23083368  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  23083367 catct 23083363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 26686903 - 26687006
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||||||     
T  26686903 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacat 26687001  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  26687002 catct 26687006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 25476490 - 25476384
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25476490 caacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaacaa-cagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 25476392  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    ||||||||    
T  25476391 catctcaa 25476384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 29172732 - 29172627
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29172732 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 29172635  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  29172634 cgtctcaa 29172627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1644778 - 1644517
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||  || |||||||    
T  1644778 caacttagaccaacttatgttgcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatgcaaatc-atcattatataacaatatcgaatacaa-tcaacaa 1644682  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
     |||||||  ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||        |||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| ||||| |||    
T  1644681 tatctcaattatcaa-cataatc-catttaatgtatatacaa--------cattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataac 1644592  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaac 275  Q
    | ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  1644591 aacaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaggatcgcatttaac 1644517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 9512939 - 9513195
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| ||     ||||||    
T  9512939 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaat----caacat 9513033  T
Q  104 ctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagc 203  Q
    ||||   ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||        |||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| ||||| |||| |    
T  9513034 ctcatttatcaa-cataatc-catttaatgtatataaaa--------cattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacaac 9513123  T
Q  204 aagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaac 275  Q
    |||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||    
T  9513124 aaggtaaacaacttagtttctaacctctaagattaactcacataaacttgtgcgacaaagatcgcatttaac 9513195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 89
Target Start/End: Original strand, 9520914 - 9520998
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  9520914 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 9520998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 43550625 - 43550482
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  43550625 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataatga-cagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 43550527  T
Q  104 ctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 148  Q
    |||||  | ||| | || || ||| |||||||||||||||||||||    
T  43550526 ctcaattattcacatat-aattcaagtaatgtatatacaattatat 43550482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 14572605 - 14572707
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||    
T  14572605 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgagagtcaacaa 14572702  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  14572703 catct 14572707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 20698540 - 20698437
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||||||| || || ||| |||    
T  20698540 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatcaattgcaattcatcaa 20698442  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  20698441 catct 20698437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 24153313 - 24153211
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24153313 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gatagcaacataggtagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 24153216  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  24153215 catct 24153211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 36166611 - 36166716
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36166611 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 36166707  T
Q  101 catctcaaa 109  Q
    |||||||||    
T  36166708 catctcaaa 36166716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 6469283 - 6469178
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6469283 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 6469186  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  6469185 cgtctcaa 6469178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 9707756 - 9707651
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||    
T  9707756 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatacaagtcaacaa 9707659  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  9707658 cgtctcaa 9707651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 17463191 - 17463296
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17463191 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 17463288  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  17463289 cgtctcaa 17463296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 17672639 - 17672744
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  17672639 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaa 17672736  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  17672737 cgtctcaa 17672744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24340826 - 24340665
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || || |||||||||| |||||| || | |||| |||||||    
T  24340826 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 24340728  T
Q  103 tctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 165  Q
    ||||||| | ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  24340727 tctcaaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 24340665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 28848760 - 28848655
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28848760 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 28848663  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  28848662 cgtctcaa 28848655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 34159339 - 34159444
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34159339 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 34159436  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  34159437 cgtctcaa 34159444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 38962040 - 38961935
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38962040 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 38961943  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  38961942 cgtctcaa 38961935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 45607056 - 45606951
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45607056 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 45606959  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  45606958 cgtctcaa 45606951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 55476504 - 55476609
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  55476504 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 55476601  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  55476602 cgtctcaa 55476609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 23274705 - 23274810
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| || | |||| |||||||    
T  23274705 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 23274803  T
Q  103 tctcaaa 109  Q
    |||||||    
T  23274804 tctcaaa 23274810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 55500955 - 55501055
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  55500955 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 55501052  T
Q  101 cat 103  Q
    |||    
T  55501053 cat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 11424864 - 11424781
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 86  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11424864 caacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataacaatatcaa 11424781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 13442290 - 13442393
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || || ||| |||    
T  13442290 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 13442388  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  13442389 catct 13442393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 17487872 - 17487975
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| |||    
T  17487872 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 17487970  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  17487971 catct 17487975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 17499354 - 17499457
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| |||    
T  17499354 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 17499452  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  17499453 catct 17499457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 21618462 - 21618567
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21618462 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 21618558  T
Q  101 catctcaaa 109  Q
    |||||||||    
T  21618559 catctcaaa 21618567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 43840948 - 43841051
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||||||     
T  43840948 caacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacat 43841046  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  43841047 catct 43841051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 7781496 - 7781391
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  7781496 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaa 7781399  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  7781398 cgtctcaa 7781391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 108
Target Start/End: Original strand, 8899111 - 8899212
Alignment:
Q  5 ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  8899111 ttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 8899208  T
Q  105 tcaa 108  Q
    ||||    
T  8899209 tcaa 8899212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 12567573 - 12567678
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12567573 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 12567670  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  12567671 cgtctcaa 12567678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 13544038 - 13544143
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13544038 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 13544135  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  13544136 cgtctcaa 13544143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 16454430 - 16454325
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16454430 caacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 16454333  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  16454332 cgtctcaa 16454325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 37642368 - 37642207
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  | |||||| |||||||    
T  37642368 acttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaaca 37642270  T
Q  103 tctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 165  Q
    |||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  37642269 tctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 37642207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 13151940 - 13151834
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  13151940 caacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 13151843  T
Q  100 acatctcaa 108  Q
    || ||||||    
T  13151842 acgtctcaa 13151834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 13154405 - 13154299
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  13154405 caacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 13154308  T
Q  100 acatctcaa 108  Q
    || ||||||    
T  13154307 acgtctcaa 13154299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070697
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || || || |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 53070702  T
Q  104 ctcaa 108  Q
    |||||    
T  53070701 ctcaa 53070697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 10247872 - 10247767
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10247872 caacttagaccgactcatacagcttagttaaataac-aacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 10247775  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  10247774 cgtctcaa 10247767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 15977528 - 15977633
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15977528 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 15977625  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  15977626 cgtctcaa 15977633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 16282960 - 16282855
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||| ||||||||||    
T  16282960 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatgcaagtcaacaa 16282863  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  16282862 cgtctcaa 16282855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 17446803 - 17446699
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17446803 caacttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 17446707  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  17446706 cgtctcaa 17446699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 234 - 317
Target Start/End: Original strand, 17672869 - 17672952
Alignment:
Q  234 gatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagag 317  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17672869 gatcaactcacaacgactcgtgcgacgaaggtcacttttaacctaacaagatattctgtctcataagggctcgcgaggcgagag 17672952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 40213825 - 40213720
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| || || || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40213825 caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacatcaacaca-gcagtatacataaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 40213728  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    ||||||||    
T  40213727 catctcaa 40213720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 50242835 - 50242940
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  50242835 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaa 50242932  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  50242933 cgtctcaa 50242940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 41123903 - 41124005
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41123903 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa----caacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 41123997  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  41123998 cgtctcaa 41124005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 234 - 291
Target Start/End: Original strand, 324481 - 324538
Alignment:
Q  234 gatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctg 291  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  324481 gatcaactcacatcaacttgtacgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctg 324538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 28194706 - 28194755
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194706 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 28194755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 12119874 - 12119780
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  12119874 caacttagaccgactcatgcagctttgttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 12119780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Original strand, 12377940 - 12378050
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||  ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12377940 cttagaccgactcatacagcttagttaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaa-tagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 12378038  T
Q  102 atctcaaacatc 113  Q
    | || |||||||    
T  12378039 aacttaaacatc 12378050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 14576937 - 14576835
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || | |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  14576937 caacttagaccgactcattcaacttagttaaataac-aacagcaacatagacagtat-aaacaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 14576840  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  14576839 catct 14576835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 15412442 - 15412536
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  15412442 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15412536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 2051260 - 2051141
Alignment:
Q  47 ataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaat 143  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || | ||||  ||| |||||| |||||||||    
T  2051260 ataggcagtatgcaaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcatatacaat 2051163  T
Q  144 tatataacattaacaacaacat 165  Q
    ||||| ||||||  ||||||||    
T  2051162 tatatcacattataaacaacat 2051141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 8499531 - 8499625
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  8499531 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 8499625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 275
Target Start/End: Original strand, 9521074 - 9521170
Alignment:
Q  179 tcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaac 275  Q
    |||| ||||||| ||||| |||| ||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||    
T  9521074 tcagtcttactggaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagattaactcacataaacttgtgcgacaaagatcgcatttaac 9521170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22147628 - 22147467
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||  | |||||| |||||||    
T  22147628 acttggaccgagtcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaaca 22147530  T
Q  103 tctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 165  Q
    |||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  22147529 tctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 22147467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 606428 - 606324
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgca-aaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  || ||| |||  ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  606428 cttataccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagca--cataaatcagttcatgatataacaatatc-aatgcaattcaacaa 606332  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    ||||||||    
T  606331 catctcaa 606324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 10556998 - 10557105
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa-ca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||| || ||||| | |||||| |||| ||||||||||| ||| ||| ||    
T  10556998 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-tcagcatacaaaaacggcatgacataataatatcaaatgcaagccaatca 10557095  T
Q  100 acatctcaaa 109  Q
    ||||||||||    
T  10557096 acatctcaaa 10557105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 44494822 - 44494908
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 89  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||| | |||| |||||||||||    
T  44494822 caacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatg 44494908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 17737249 - 17737294
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17737249 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 17737294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 45577987 - 45577950
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45577987 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45577950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12171988 - 12171935
Alignment:
Q  226 acctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||||||||||    
T  12171988 acctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaagaatcgcatttaacctaa 12171935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 279
Target Start/End: Original strand, 12340000 - 12340043
Alignment:
Q  236 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12340000 tcaactctcaacaactcgtgcgacaaagatcacatttaacctaa 12340043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 14501207 - 14501290
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  14501207 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaatcataatttcatgcaacatatatccaattatataacatta 14501290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 322
Target Start/End: Original strand, 14665853 - 14665940
Alignment:
Q  236 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa-caaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  |||||    || || |||||||||||||||||||||    
T  14665853 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctct 14665940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 322
Target Start/End: Original strand, 14735366 - 14735453
Alignment:
Q  236 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa-caaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  |||||    || || |||||||||||||||||||||    
T  14735366 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctct 14735453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 19776007 - 19776089
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  19776007 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 19776089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 37439503 - 37439421
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  37439503 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 37439421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 56
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919399
Alignment:
Q  6 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 56  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||    
T  13919350 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacatagggagta 13919399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 46822281 - 46822318
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  46822281 caacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaa 46822318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 12955 - 13236
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  12955 caacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-agcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 13053  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||||  |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13054 catcataaacatcaaacataat-tcgtgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatccaattcaggcttactgaaacaacaac 13152  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 284  Q
    ||||||| ||| ||||||||| || | ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13153 agcaagataaataacttagtttctaatctccatgatcaactcacatcaactcgtgtgacaaagatcacatttaacctaacaagg 13236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 68 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18276 - 18024
Alignment:
Q  68 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 167  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  18276 catgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatca 18178  T
Q  168 gattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtca 267  Q
     |  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18177 aaacatataattcaggcttactgaaacaacaacagtgagataagcaacttagtttcttacccccatgatcatctcacatcaactcgtgcgacaaaggtca 18078  T
Q  268 catttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctc 321  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18077 catttaacctaacaaggtattctgtctcactagggctcgcgaggcgagagcctc 18024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12904
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 12685  T
Q  104 ctcaaacatcaaacata-aactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 202  Q
    |||||| | |  | ||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || |||||  | || |||||||||||||||||||    
T  12686 ctcaaata-cttatatataattca-gtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaataatacacattagacttactgaaacaacaacag 12783  T
Q  203 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaaggg 302  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |    
T  12784 caagataaacaacttagtttattacctctaagatcaactcacatccactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgtctctcatgag 12883  T
Q  303 ctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12884 ctcgcgaggcgagagcctcta 12904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 66)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 7835 - 7517
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  7835 cttagactgaatcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 7737  T
Q  104 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 202  Q
    ||||||||| || | ||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  7736 ctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgtatatacaattatatcacattaacaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacaa 7638  T
Q  203 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaaggg 302  Q
    || || ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||| ||| || | |    
T  7637 catgataaacaacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacattaaacctaaccaagtattctgtctctcatgag 7538  T
Q  303 ctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  7537 ctcgtgaggcgagagcctcta 7517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Original strand, 23791292 - 23791611
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23791292 cttagaccgactcatgtagcttagttaataagcaaacaacaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaac 23791390  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
    ||||||||||| | | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23791391 atctcaaacattatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 23791489  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 301  Q
     ||||| ||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23791490 acaagataaacaacttagtttccaacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgtctcacaagg 23791589  T
Q  302 gctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23791590 gctcgcgaggcgagagcctcta 23791611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 18787008 - 18786687
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  18787008 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgcaaa-ccagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 18786910  T
Q  99 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 198  Q
    ||| || ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  18786909 aacgtcacaa-catcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaataacattcaatcatataatttaggcttactgaaacaaca 18786812  T
Q  199 acagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcaca 298  Q
    |||||| || ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| ||| |     
T  18786811 acagcatgataaacaacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaagtcacattagacctaacaaagtgttctgtctctct 18786712  T
Q  299 agggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
     | ||||||||||||||||||||||    
T  18786711 tgagctcgcgaggcgagagcctcta 18786687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Original strand, 28405992 - 28406314
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  28405992 caacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaa 28406091  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatac-aattcaggcttactgaaacaacaa 199  Q
    ||||||||| |||||   | || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  || | ||||||||| |||||||||    
T  28406092 catctcaaatatcaac--ttaattcataaaatgtatatacaattatataccattaacaacaacaatagatcatattaaattaggcttactaaaacaacaa 28406189  T
Q  200 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa-caaggtgttctgactcaca 298  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||  || ||   ||||    
T  28406190 cagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaggatcgcatttaacctaaacaaggcattatgtaacaca 28406289  T
Q  299 agggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    ||  || ||||||||||||||||||    
T  28406290 agtacttgcgaggcgagagcctcta 28406314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 25175866 - 25176126
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  25175866 caacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaa 25175964  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatac-aattcaggcttactgaaacaacaa 199  Q
    ||||||||| ||||| |||||  |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25175965 catctcaaatatcaa-cataat-tcatataacgtatatataattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaa 25176062  T
Q  200 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaag 263  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25176063 cagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaacttacatcaattcgtgcgacaaag 25176126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 291
Target Start/End: Original strand, 23207296 - 23207582
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  23207296 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgac 23207394  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
    ||||||| ||| | | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23207395 atctcaa-cattataaataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttacttgaacaacaaca 23207492  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctg 291  Q
    | |||| || |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207493 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctg 23207582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Original strand, 25108906 - 25109225
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||||  ||  ||||||||||||||||||||   || |||||||     
T  25108906 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaat-agttcatgatataacaatatcaaagcaaaatcaacaat 25109004  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25109005 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 25109103  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 301  Q
    | |||| || |||||||||| |||| | | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  25109104 gtaagataagcaacttagtttcttatccccatgatcaacttacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttttgtctcacaagg 25109203  T
Q  302 gctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    |||| |||||| ||||||||||    
T  25109204 gctcacgaggcaagagcctcta 25109225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 71 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22459598 - 22459346
Alignment:
Q  71 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacata-aactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattaga 169  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||  | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |      
T  22459598 gatataacaacatcaaatgaaagtcatcaacatctcaaatattca-catataactcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaataacatcaac 22459500  T
Q  170 ttatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcaca 269  Q
    |  || |  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22459499 tcgtatacatcagtcttactgaaacaataacagcaagataaacaacttagtttcttacctctaaggtcaactcacatcaactcgtaggacaaaggtcaca 22459400  T
Q  270 tttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22459399 tttaacctaacaaggcattctgtctcacaaggactcgcgaggcaagagcctcta 22459346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 7679601 - 7679750
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  7679601 caacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc-aatgtaagtcatcaa 7679698  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacat 153  Q
    ||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7679699 catcataaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatataattatataacat 7679750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 22105425 - 22105531
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22105425 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 22105523  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  22105524 cttctcaa 22105531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23708724 - 23708561
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || || ||| | |    
T  23708724 caacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaattgcaaatcatcga 23708626  T
Q  101 catctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 165  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  23708625 catctcaaacattcaaatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 23708561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22134306 - 22134046
Alignment:
Q  6 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||| || |||| |||||||    
T  22134306 tagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaa-cagcaacataggcagtatgcaaatc-atcataatataacaatatcgaatgcaa-tcaataacatct 22134210  T
Q  106 caaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaa 205  Q
    ||   ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||   |||||     |||||| || |  || || ||  |||| ||||||| || ||  |||||||    
T  22134209 catttatcaa-cataatc-catttaatgtatatacaacattataa-----acaacaccaattcat-atgca--tcagtcttactggaaaaatgacagcaa 22134120  T
Q  206 gacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22134119 gataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaa 22134046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 298920 - 298816
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||| || || |||||||    
T  298920 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaa 298821  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  298820 catct 298816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23072054 - 23071905
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| ||| ||| |||    
T  23072054 caacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatcgaatataaatcagcaa 23071956  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    |   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23071955 c---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 23071905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 23060529 - 23060632
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  23060529 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 23060627  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  23060628 catct 23060632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 105
Target Start/End: Original strand, 23076460 - 23076561
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| |    
T  23076460 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaata 23076558  T
Q  103 tct 105  Q
    |||    
T  23076559 tct 23076561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 155
Target Start/End: Original strand, 19671848 - 19671998
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| || | |||| |||||||    
T  19671848 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 19671946  T
Q  103 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||   ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19671947 tctcaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacatta 19671998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 22337131 - 22337238
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||  |||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  22337131 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagacaacaa 22337229  T
Q  101 catctcaaa 109  Q
    |||||||||    
T  22337230 catctcaaa 22337238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 6726008 - 6726113
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  6726008 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaagtcaacaa 6726105  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  6726106 cgtctcaa 6726113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 571410 - 571515
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  571410 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 571507  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  571508 cgtctcaa 571515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 18808956 - 18809061
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18808956 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 18809053  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  18809054 cgtctcaa 18809061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 23130875 - 23130980
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23130875 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 23130972  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  23130973 cgtctcaa 23130980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 23133342 - 23133447
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23133342 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 23133439  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  23133440 cgtctcaa 23133447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 23135603 - 23135708
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23135603 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 23135700  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  23135701 cgtctcaa 23135708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 23709681 - 23709576
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23709681 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 23709584  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  23709583 cgtctcaa 23709576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 23712162 - 23712057
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23712162 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 23712065  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  23712064 cgtctcaa 23712057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 24367787 - 24367892
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24367787 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 24367884  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  24367885 cgtctcaa 24367892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 26505392 - 26505497
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26505392 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 26505489  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  26505490 cgtctcaa 26505497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 26507870 - 26507975
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26507870 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 26507967  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  26507968 cgtctcaa 26507975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 32215070 - 32214965
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32215070 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 32214973  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  32214972 cgtctcaa 32214965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 34402671 - 34402566
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34402671 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 34402574  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  34402573 cgtctcaa 34402566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 39682326 - 39682431
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39682326 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 39682423  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  39682424 cgtctcaa 39682431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20520295 - 20520145
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  20520295 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaac 20520198  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||||| | || || ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  20520197 atctcaaacatcatatat-aattcaagtaatgcatatacaaatatatcacatta 20520145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 38219 - 38136
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  38219 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaa 38136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 21155209 - 21155104
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  21155209 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 21155112  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  21155111 cgtctcaa 21155104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22413240 - 22413078
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataaca--atatcaaatgtaagtcaaca 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||  |||||||||| || ||||||    
T  22413240 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatatcaaatgcaaatcaaca 22413142  T
Q  100 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 165  Q
    ||||||| ||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  22413141 acatctc-aacatcataaat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 22413078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 28577112 - 28577217
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  28577112 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacgca-acagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagccaacaa 28577209  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  28577210 cgtctcaa 28577217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 22731335 - 22731238
Alignment:
Q  5 ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| ||||||    
T  22731335 ttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacat 22731238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 24898345 - 24898239
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  24898345 caacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 24898248  T
Q  100 acatctcaa 108  Q
    || ||||||    
T  24898247 acgtctcaa 24898239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 24900828 - 24900722
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  24900828 caacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 24900731  T
Q  100 acatctcaa 108  Q
    || ||||||    
T  24900730 acgtctcaa 24900722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 24903305 - 24903199
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  24903305 caacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 24903208  T
Q  100 acatctcaa 108  Q
    || ||||||    
T  24903207 acgtctcaa 24903199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 24905782 - 24905676
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  24905782 caacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 24905685  T
Q  100 acatctcaa 108  Q
    || ||||||    
T  24905684 acgtctcaa 24905676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 24908257 - 24908151
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  24908257 caacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 24908160  T
Q  100 acatctcaa 108  Q
    || ||||||    
T  24908159 acgtctcaa 24908151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Original strand, 20309127 - 20309225
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||||||  || ||| ||||||    
T  20309127 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacat 20309223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 32039647 - 32039542
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32039647 caacttagaccggctcatgcagcttagttaaataac-aacagtaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 32039550  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  32039549 cgtctcaa 32039542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 43137312 - 43137417
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | | ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  43137312 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 43137409  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  43137410 cgtctcaa 43137417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 23285881 - 23285942
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23285881 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 23285942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451949
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 86  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa 32451949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 23103497 - 23103396
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |  |||||||||  || ||| ||||||    
T  23103497 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-aaacagcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacatgattatatcaaattcaattcatcaacat 23103401  T
Q  104 ctcaa 108  Q
    |||||    
T  23103400 ctcaa 23103396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 23660039 - 23660141
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  23660039 caacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaac-aacagcaacataggcagtatacgaaa-caggatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaa 23660136  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  23660137 catct 23660141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24697709 - 24697548
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| |||| |||||||||    |||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24697709 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaacaacaacgtaggcagtacatcaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaac 24697611  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 165  Q
    ||||||||| ||| | |  || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  24697610 atctcaaacttcatata-caattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 24697548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 45030003 - 45029898
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45030003 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacacaa-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 45029906  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  45029905 cgtctcaa 45029898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 114
Target Start/End: Original strand, 23004767 - 23004878
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||   ||||  ||  || ||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23004767 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggtagtacataaaa-tagttcaggatataataatatcaaatgcaaatcaacaac 23004865  T
Q  102 atctcaaacatca 114  Q
    |||||||||||||    
T  23004866 atctcaaacatca 23004878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 22738284 - 22738182
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| |||    
T  22738284 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacattaa-ataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 22738187  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  22738186 catct 22738182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 23654491 - 23654388
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| || ||||  || ||||| |||| |||||||| || || ||| |||    
T  23654491 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 23654393  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  23654392 catct 23654388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 8946673 - 8946735
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  8946673 caacttagaccgactcatgcagcttagttagataac-aatagcaacataggcagtatacaaaac 8946735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 24529678 - 24529573
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || |||| |||||    
T  24529678 caacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aacaacaacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagttaacaa 24529581  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  24529580 cgtctcaa 24529573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 23040294 - 23040247
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacata 49  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23040294 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata 23040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 38967387 - 38967493
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa-ca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |  || ||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  38967387 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacatcgacaca-acaatatacaaaaatagcatgaaataataatatcaaatgcaagtcaatca 38967484  T
Q  100 acatctcaa 108  Q
    |||||||||    
T  38967485 acatctcaa 38967493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 24643099 - 24643054
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24643099 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 24643054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 23071843 - 23071749
Alignment:
Q  228 ctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| || |||| ||||||| ||||  || ||   |||||  |||||||||||||||||||||    
T  23071843 ctctaagatcaactcacatcaactcgaacgaaaaagatctcattcaacctaaaaaggcattttgtaacacaaacgctcgcgaggcgagagcctct 23071749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 56
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287433
Alignment:
Q  6 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 56  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagta 23287433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 55
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392451
Alignment:
Q  6 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 55  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26392451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 1283666 - 1283748
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  1283666 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 1283748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30344858 - 30344776
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  30344858 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 30344776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 25616201 - 25616304
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||  | ||  | ||||| || |||| |||||||| || || |||||||    
T  25616201 caacttagactgactcatgcaacttagttaaattac-aatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaattcaacaa 25616299  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  25616300 catct 25616304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Original strand, 8482 - 8805
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  8482 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaac-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 8580  T
Q  101 catctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaat--tatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 197  Q
    ||||||||| || || | ||||  ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||| |  | ||| |  |||| ||||||| ||||||    
T  8581 catctcaaatattcatatataat-tcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattcatatacatcagtcttactggaacaac 8679  T
Q  198 aacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcac 297  Q
    | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  8680 atcagcaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaattcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggcattctgtctcac 8779  T
Q  298 aagggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||    
T  8780 aaggactcgcgaggcgagggcctcta 8805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 6551 - 6826
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  6551 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaa 6649  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaa 199  Q
    ||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6650 catctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaa 6747  T
Q  200 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    ||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||    
T  6748 cagcaaga-taacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaaagatcgcatttatcctaa 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 12782 - 13058
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  12782 caacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 12880  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  12881 catcataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaataacaacattagatcatataattcaggcttactggaacaacaac 12979  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    ||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  12980 agcaagataaaccacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagattgcatttaacctaa 13058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Original strand, 8094 - 8310
Alignment:
Q  65 cagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaaca 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8094 cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaaca 8192  T
Q  165 ttagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagg 264  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  8193 ttagattatataattcaggcttactgaaacaacaacagcaggataaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgagacaaaga 8292  T
Q  265 tcacatttaacctaacaa 282  Q
    |||||||  |||||||||    
T  8293 tcacattatacctaacaa 8310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Original strand, 6831 - 7101
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||  |||| || |||||||       
T  6831 cttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatcaacaa--- 6926  T
Q  104 ctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagc 203  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | |||    |||| ||||||| ||||||||||||    
T  6927 ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagc 7025  T
Q  204 aagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||||||||||    
T  7026 aagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaagaatcgcatttaacctaa 7101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 6228 - 5952
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||    
T  6228 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaagtcattaa 6130  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6129 catcataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaataac 6031  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    ||||||| ||| |||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||    
T  6030 agcaagataaataacttagtttttaacctccaagatcaactaacatcaacttgcgcgacaaagatcgcatttaacctaa 5952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6067
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaac-agctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 6288  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6287 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 6189  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 301  Q
    |  ||| || |||||||||| |||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||    
T  6188 gtgagataagcaacttagtttcttacccccatgatcatctcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtattctatctcactagg 6089  T
Q  302 gctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  6088 gctcgcgaggtgagagcctcta 6067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 13840 - 13793
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagg 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  13840 cttagaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacaacaacatagg 13793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 1098 - 1379
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||  | |||| |||    
T  1098 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatacaggtcatcaa 1196  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||| |  |||| ||||||| |||||||||    
T  1197 catttcaaacatcaaacataat-tcatggaatgtatatacaactatataacattaacaacaacatcaaatcatatacatcagtcttactggaacaacaac 1295  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 284  Q
    | ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  1296 aacaagataaaaaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgtgacaaagatcgcatttaacctaacaagg 1379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10646 - 10365
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  10646 caacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 10548  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| |||||||||    
T  10547 catctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaac 10449  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 284  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  10448 aacaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcaacaaagatcgcatttaacctaacaagg 10365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 19280 - 19552
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  19280 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaa 19378  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaa 199  Q
    ||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || ||||| |||||||||||||||    
T  19379 catctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcagggttactgaaacaacaa 19476  T
Q  200 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaac 275  Q
    || ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||    
T  19477 catcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaaggatcgcatttaac 19552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 100390 - 100662
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||| |||| || |||||||    
T  100390 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataataatatcgaatgcaaatcaacaa 100488  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatac-aattcaggcttactgaaacaacaa 199  Q
    ||||||||| || || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||    
T  100489 catctcaaatattaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaatttaggcttactgaaacaacaa 100586  T
Q  200 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaac 275  Q
    || ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  100587 caacaagataaacaacttagtttctaacctctaagagcaagtcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaac 100662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 40279 - 40003
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  40279 caacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaa 40181  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatac-aattcaggcttactgaaacaacaa 199  Q
    ||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  40180 catctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacataagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaa 40083  T
Q  200 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    || ||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  40082 catcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcaacaaagatcgcatttaacctaa 40003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 17589 - 17484
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17589 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 17492  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  17491 cgtctcaa 17484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 94424 - 94529
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  94424 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 94521  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  94522 cgtctcaa 94529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 119891 - 119948
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119891 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 119948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 44467 - 44573
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | |||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  44467 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 44564  T
Q  100 acatctcaa 108  Q
    |||||||||    
T  44565 acatctcaa 44573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 279
Target Start/End: Original strand, 101599 - 101685
Alignment:
Q  192 aacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  101599 aacaacaacaacaagagaa-caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaggatcacatttaacctaa 101685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 101515 - 101576
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 62  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  101515 caacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 6627 - 6903
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| |||| |||| | ||     
T  6627 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatg-atgatataacaatatcgaatgcaagttatcat 6725  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    |||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  6726 cattataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatataattcaagcttactaaaacaacaac 6824  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    ||||||| ||||||||||| | || | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  6825 agcaagataaacaacttagattctaatctccaagttcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaa 6903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 14007 - 14283
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| |||| |||| | ||     
T  14007 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatg-atgatataacaatatcgaatgcaagttatcat 14105  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    |||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  14106 cattataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatataattcaagcttactaaaacaacaac 14204  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    ||||||| ||||||||||| | || | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  14205 agcaagataaacaacttagattctaatctccaagttcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaa 14283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 136471 - 136185
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  136471 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 136373  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||| ||  ||||  ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  136372 atcacat-catcgtacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaac 136275  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttct 290  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136274 agcaagataaacaacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaactcgtacgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttct 136185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 145179 - 144893
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  145179 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 145081  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||| ||  ||||  ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  145080 atcacat-catcgtacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaac 144983  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttct 290  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144982 agcaagataaacaacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaactcgtacgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttct 144893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Original strand, 174785 - 174886
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || |  |||||||||  || ||||||||||    
T  174785 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacatgattatatcaaattcaattcaacaacat 174881  T
Q  104 ctcaa 108  Q
    |||||    
T  174882 ctcaa 174886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 121782 - 121835
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 55  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  121782 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagt 121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8179 - 7900
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||  || |||||    
T  8179 caacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaa-ccagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaac 8081  T
Q  99 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 198  Q
    |||||| ||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8080 aacatcacaa-catcatatataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaaca 7983  T
Q  199 acagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 284  Q
       |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  7982 ---gcaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaccctaacaagg 7900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 29354 - 29066
Alignment:
Q  32 ataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaa 131  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| | | |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||  |||||||     
T  29354 ataacaaacagcaacataggtagtattcaaa-ctatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtac 29260  T
Q  132 tgtatatacaattatataacat---taacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||| ||||  |||||||||  ||||||||||||| || |||    
T  29259 tgtatatacaattatataacataattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacc 29160  T
Q  229 tctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||| ||||  |||||   |||||  |||| ||||||||||||||||    
T  29159 tctaagatcaactcacatcaactcgaacgacaaagatcgcattcaacctaaaaaggcattctgtaacacaaacgctcacgaggcgagagcctct 29066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 53651 - 53333
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  53651 cttagactgattcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 53553  T
Q  104 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 202  Q
    |||||| || || | ||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || ||| |  |||| ||||||| |||| |||||     
T  53552 ctcaaatattcatatataat-tcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataaacatcagtcttactggaacatcaacat 53454  T
Q  203 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaaggg 302  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  53453 aaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggacacaataaaccttacaaggtgttctgtctcacaagga 53354  T
Q  303 ctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  53353 ctcgcgaggcgagggcctcta 53333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 8167 - 8080
Alignment:
Q  236 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||  |||||   ||| || |||||||||||||||||||||    
T  8167 tcaacccatatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacactagtgctcgcgaggcgagagcctct 8080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 1139 - 864
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | | ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||    
T  1139 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatgcagatc-atcatgatataacaacatcgaatgcaagtcatcaa 1041  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1040 catcataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatt-tacaattcaggcttactgaaacaacaac 943  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    | ||||| ||| ||||||||| || || || |||||||||| ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||    
T  942 aacaagataaataacttagtttctaacttccaagatcaactaacatcaacttgcgcgacaaagatcgcatttaacctaa 864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 323
Target Start/End: Original strand, 38339 - 38654
Alignment:
Q  8 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  38339 gaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaac-agctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatct 38437  T
Q  106 caaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaa 205  Q
    ||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||  ||||| |||||||   |||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38438 caaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatatatatcacattaatctcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaa 38536  T
Q  206 gacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctc 305  Q
    || || |||||||||| |||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  38537 gataagcaacttagtttcttacccccgtgatcaactcacatcaactcgtgcgataaaggtctcatttaacccaacaaggtattctgtctcacaagggctc 38636  T
Q  306 gcgaggcgagagcctcta 323  Q
    ||||||||||||||||||    
T  38637 gcgaggcgagagcctcta 38654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 5659 - 5934
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  5659 caacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtatg-aaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaa 5757  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaa 199  Q
    ||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5758 catctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaa 5855  T
Q  200 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    || ||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| |||||    
T  5856 caacaagataaa-aacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaagaatcacatttagcctaa 5934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 2750 - 2474
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||| |||||||||||  |||| || |||||||    
T  2750 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtatgtaaatc-atcatgttataacaatattgaatgcaaatcaacaa 2652  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatac-aattcaggcttactgaaacaacaa 199  Q
    ||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||     
T  2651 catctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacat 2554  T
Q  200 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    |||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||    
T  2553 cagcaagataaacaacttaatttctaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgacaaagatcgcatttatcctaa 2474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 160700 - 160976
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  160700 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa-tcaacaa 160797  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||| |||||||||||    
T  160798 catgtcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatatatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaac 160896  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaac 280  Q
    | ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  160897 aacaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcacatttatcctaac 160976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 501097 - 501202
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  501097 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 501194  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  501195 cgtctcaa 501202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 234 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 85498 - 85417
Alignment:
Q  234 gatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgag 315  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||    
T  85498 gatcaactcacaacaactcgtacgacgaaggtcacttttaacctaacaaggtattctgtcttataagggctcgcgaggcgag 85417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 85726 - 85635
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  85726 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 85635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 129921 - 130197
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  129921 caacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 130019  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |  | |||    |||| ||||||| |||||||||    
T  130020 catctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattgtaaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaac 130118  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  130119 agcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttatcctaa 130197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 60818 - 60710
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  60818 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagctcatgatataccaatatc-aatgcaaatcaacaac 60721  T
Q  102 atctcaaacat 112  Q
    |||||||||||    
T  60720 atctcaaacat 60710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22775 - 22509
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  22775 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 22677  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   | ||| ||  |||| ||||||| |||| ||||    
T  22676 catctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat--caatatgca--tcagtcttactggaacagcaac 22582  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacattta 273  Q
    | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22581 atcaagacaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcattta 22509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 82085 - 82190
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  82085 caacttagaccgactcatgaagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaa 82182  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  82183 cgtctcaa 82190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 103736 - 103455
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||  ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||   ||||    
T  103736 caacttagaccgactaatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtataaaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaa---aaca 103640  T
Q  100 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 199  Q
    |||      |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  103639 aca------acatcatacataat-tcatgtaatgtatatacaactacataacattaacaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaa 103547  T
Q  200 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctg 291  Q
    ||| |||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  103546 caggaagataaagaacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaactcgtacgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctg 103455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 313
Target Start/End: Original strand, 78345 - 78648
Alignment:
Q  8 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  78345 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaac-agttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacatct 78442  T
Q  106 caaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaa 205  Q
    ||| ||||    ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  78443 caa-catcgtttataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaa 78540  T
Q  206 gacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctc 305  Q
    || || |||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  78541 gataagcaacttagttgcttacccccatgatcaactcacatcaactcatgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgtctcacaagtgctc 78640  T
Q  306 gcgaggcg 313  Q
    ||||||||    
T  78641 gcgaggcg 78648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 129072 - 128755
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  129072 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 128974  T
Q  103 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 202  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  128973 tctcaaacatcatatataat-tcatgtaatggatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactgaaacaacaacag 128875  T
Q  203 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcacaagg 301  Q
     |||| || |||||||||| |||||| | | |||||||||| | || |||||||||||||| || ||   ||||| |||||||| ||||| || ||| |     
T  128874 taagataagcaacttagtttcttacc-ccatgatcaactcataacatctcgtgcgacaaagatcgca-acaacctaaacaaggtattctgtcttacagga 128777  T
Q  302 gctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  128776 gctcgcgaggcgagagcctcta 128755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 116443 - 116548
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||    
T  116443 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaa-cagcatgacataatcatatcaaatgcaagtcaacaa 116539  T
Q  101 catctcaaa 109  Q
    |||||||||    
T  116540 catctcaaa 116548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 14802 - 14526
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||  |||||| |||| || |||||||    
T  14802 caacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagtaag-aaaatcatcatgatatagtaatatcgaatgcaaatcaacaa 14704  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatac-aattcaggcttactgaaacaacaa 199  Q
    ||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||    
T  14703 catctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatactattatataccattaacaaaaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaa 14606  T
Q  200 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    |||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| |||||    
T  14605 cagcaagatatacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaacttgtgcgaccaagatcgcatttatcctaa 14526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 2908 - 2588
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2908 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacat 2810  T
Q  104 ctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatata----caattatataacattaacaacaacattagattatac-aattcaggcttactgaaacaaca 198  Q
    |||||| ||||    | || ||||  ||||||||||    ||||||||   |||||||||||||| ||||| |||  || ||||||||||||||||||||    
T  2809 ctcaaatatcagc--ttaattcataaaatgtatatatatacaattatac--cattaacaacaacaatagatcatattaaatcaggcttactgaaacaaca 2714  T
Q  199 acagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcac 297  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| |||||||  |||||   |||    
T  2713 acagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaggatcacatttttcctaaacaaggcattctgtaacac 2614  T
Q  298 aagggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    |||  |||||||||||||||||||||    
T  2613 aagtactcgcgaggcgagagcctcta 2588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 45897 - 45621
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  45897 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgtaagtcatcaa 45799  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||||||||  ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| |||||  ||    
T  45798 catctcaattatcaaacat-aattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaattac 45700  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    ||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  45699 agcaatataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttatcctaa 45621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Original strand, 97024 - 97341
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  97024 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 97122  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||||||||||||||||||||||    
T  97123 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaaca 97221  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 301  Q
    | |||| || |||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| || |||||||||    
T  97222 gtaagaaaagcaacttagtttcttacccc-atgatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttatcctagcaagcagtt-tgtctcacaagg 97319  T
Q  302 gctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  97320 gctcgcgaggcgagagcctcta 97341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Original strand, 106302 - 106619
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  106302 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 106400  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||||||||||||||||||||||    
T  106401 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaaca 106499  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 301  Q
    | |||| || |||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| || |||||||||    
T  106500 gtaagaaaagcaacttagtttcttacccc-atgatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttatcctagcaagcagtt-tgtctcacaagg 106597  T
Q  302 gctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  106598 gctcgcgaggcgagagcctcta 106619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 323
Target Start/End: Original strand, 54 - 342
Alignment:
Q  35 acaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaat 132  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||| | ||||  |||||||||    
T  54 acaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcagatgcaaatcaataacatctcaaacatcatatataat-tcatgtaat 151  T
Q  133 gtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctcta 232  Q
    | ||||||| |||||||||||||  |||||||| | || ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||| | |    
T  152 gcatatacatttatataacattattaacaacatcaaatcatttaatttaggcttactgaaacaacaacagtaagatatgcaacttagtttcttaccccca 251  T
Q  233 agatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  252 tgatcaactcacatcaacttgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtattctgtctcacaagggctcacgaggcgagagcctcta 342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 43 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2002
Alignment:
Q  43 caacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaa 142  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||||  |||| ||||||||||||||    
T  2281 caacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcag-cataat-tcatataatgtatatacaa 2185  T
Q  143 ttatataacattaacaacaacattagattatac-aattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaact 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  2184 ttatataccattaacaacaacattggatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttattttctaacctctaagatcaact 2085  T
Q  242 cacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||  |||||   ||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  2084 cacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagaccctcta 2002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19987 - 19701
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19987 cttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaac 19889  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
    ||||||  ||||| | |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  || ||||| | || ||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  19888 atctcag-catcataaataa-ctcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaataacatcaaatcatataattcatgcttactggaacaacaaca 19791  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctg 291  Q
    | |||| || |||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19790 gtaagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcatatcaacccgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctg 19701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 39929 - 40031
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| | ||||| ||    
T  39929 caacttagaccaactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcatgtcaataa 40026  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  40027 catct 40031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 49021 - 48939
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  49021 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 48939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 261
Target Start/End: Original strand, 62216 - 62469
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| |||||| |||| |   ||||||||    
T  62216 acttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgaaaaac-atcatggtataataatatcgaatgca---caacaaca 62311  T
Q  103 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  62312 tctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattaacaacatcattagttcataacaattcaggcttactgaaacaacaaca 62409  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaa 261  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  62410 gcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcgaatcgggcgacaa 62469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Original strand, 132677 - 132943
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| |    
T  132677 cttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatacaacaatatcgaatgtaa-tcatcaacgt 132775  T
Q  104 ctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagc 203  Q
    |||||  ||||| ||||| | ||| |||||||||||      || |||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| |||||||||||     
T  132776 ctcaattatcaa-cataatc-catttaatgtatata------tacaacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 132867  T
Q  204 aagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa 279  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  132868 aagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcacatttaacctaa 132943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 136693 - 136798
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  136693 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 136790  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  136791 cgtctcaa 136798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 139162 - 139267
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  139162 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 139259  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  139260 cgtctcaa 139267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 144100 - 144205
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  144100 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 144197  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  144198 cgtctcaa 144205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 134224 - 134329
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  134224 caacatagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 134321  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  134322 cgtctcaa 134329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 141631 - 141736
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  141631 caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 141728  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  141729 cgtctcaa 141736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 15677 - 15993
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  15677 caacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa 15775  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    |   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||  | |||| ||||||| | ||  |||    
T  15776 c---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattatttcataagaatcagtcttactggatcattaac 15871  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaag 300  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||  |||||| ||||  |||||   |||||     
T  15872 agcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgaacgacaaagatcgcattccacctaaaaaggcattctgtaacacaaa 15971  T
Q  301 ggctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  15972 agctcgcgaggcgagagcctct 15993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 145 - 416
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  145 caacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaa 243  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |  | |||    |||| || |||  |||||||||    
T  244 catctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataatattataaacaacatcaattcatatgtatcagtctcactagaacaacaac 342  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaac 275  Q
    |||||||  ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  343 agcaaga-taacaactcagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtacgacaaagatcgcatttaac 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Original strand, 569 - 885
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  569 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaac-agttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaac 666  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
    ||| ||| ||||| | ||||  |||||||||| ||||||| | |||| | ||||   | || || | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  667 atcccaa-catcatatataat-tcatgtaatgcatatacattaatatcatattatttaaaagatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 764  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 301  Q
    |  ||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||       
T  765 gttagataaacaacttagtttcttacca-tatgatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtctcatttaacctaacaaggtgttctgtctaacacta 863  T
Q  302 gctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    |||||||||| ||| |||||||    
T  864 gctcgcgaggtgagggcctcta 885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 11308 - 11586
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  11308 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa 11406  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    |   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||  ||||  |||    
T  11407 c---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatactattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttacttgaacattaac 11502  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 284  Q
    | ||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||| ||||    
T  11503 accaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagattaactcacatcaactcgaacgacaaagatcgcattcaacctaaaaagg 11586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 2013 - 2228
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  2013 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa 2111  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    |   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||| ||||  |||    
T  2112 c---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagacttactggaacattaac 2207  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagtt 221  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  2208 agcaaggtaaacaacttagtt 2228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 28430 - 28533
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || || |||||||    
T  28430 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaa 28528  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  28529 catct 28533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 4568 - 4608
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaca 41  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4568 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaca 4608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Original strand, 267679 - 267987
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||     
T  267679 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaat 267777  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
    ||||||| ||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||| ||| | || |||  || ||||||||||||||||||| ||    
T  267778 atctcaa-catcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaccatcaaatcatatcatccaggcttactgaaacaacagca 267875  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagg 301  Q
    | |||  || |||||||||| ||||||  || |||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  267876 gtaagctaagcaacttagtttcttacccttatgatca----------actcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgtctcacaagg 267965  T
Q  302 gctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  267966 actcgcgaggcgagagcctcta 267987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 1900 - 1614
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||  |||||||| |||||  ||||  ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1900 cttagaccgactcatgcagcttagttattaaactaacattaacataggtagtatataaaat-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 1802  T
Q  102 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 201  Q
    ||||||| ||||| | ||||  | |||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||| | | || ||| ||||||||||||||| |||||||| |    
T  1801 atctcaa-catcatatataattt-atgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacgtcaaatcatataattcaggcttactggaacaacaata 1704  T
Q  202 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctg 291  Q
    | |||| |  |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1703 gtaagataggcaacttagtttcttaccctcaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatgtaacctaacaaggtgttctg 1614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 7882
Alignment:
Q  6 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  8161 tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaatc-agctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacat 8063  T
Q  104 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 202  Q
    || |||||| || | ||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||| | || ||| |  |||| || |||| ||||||| |||    
T  8062 cttaaacattcatatataat-tcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcatatacatcagtctcactggaacaacatcag 7964  T
Q  203 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 284  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  7963 caagataaacaacttagtttcatacctctaagatcaactcacatcaattcttgcgacaaagatcgcatttaacctagcaagg 7882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 34139 - 34417
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  34139 caacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaac-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa 34237  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 200  Q
    |   ||||  ||||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||| || |  |||    
T  34238 c---tcaattatcaaacttaag-tcaagtaatatatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaaaattaac 34333  T
Q  201 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 284  Q
    ||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  | |||||| || |||| ||||||| ||||    
T  34334 agcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactagaacaacaaagatcgcattcaacctaaaaagg 34417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 105
Target Start/End: Original strand, 13141 - 13211
Alignment:
Q  35 acaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||    
T  13141 acaaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatct 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 289 - 326
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  289 caacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaa 326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 3291 - 3185
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  3291 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgtaattcaacaa 3193  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    ||||||||    
T  3192 catctcaa 3185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 27854 - 27744
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27854 caacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaa 27756  T
Q  101 catctcaaacat 112  Q
    ||||||||||||    
T  27755 catctcaaacat 27744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1171 - 1025
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||       
T  1171 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa--- 1076  T
Q  104 ctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    |||||  |||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1075 ctcaattatcagac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16205 - 16095
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16205 caacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaa 16107  T
Q  101 catctcaaacat 112  Q
    ||||||||||||    
T  16106 catctcaaacat 16095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 110
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13252
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacat 13245  T
Q  104 ctcaaac 110  Q
    || ||||    
T  13246 ctgaaac 13252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 56
Target Start/End: Original strand, 2680 - 2732
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  2680 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaagcaacaacataggcagta 2732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 109
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1155
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||    
T  1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacat 1149  T
Q  104 ctcaaa 109  Q
    ||||||    
T  1150 ctcaaa 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 26170 - 26064
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  26170 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaattcaacaa 26072  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  26071 cgtctcaa 26064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 44812 - 44705
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44812 caacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 44714  T
Q  101 catctcaaa 109  Q
    |||||||||    
T  44713 catctcaaa 44705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15764 - 15665
Alignment:
Q  176 aattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaac 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15764 aattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaatctccaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcacatttaac 15665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 15882 - 15763
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| |||| |||||| ||     
T  15882 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatgatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcat 15784  T
Q  101 catctcaaacatcaaacataa 121  Q
    ||||  | |||||||||||||    
T  15783 catcatatacatcaaacataa 15763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 38
Target Start/End: Original strand, 178912 - 178947
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  178912 acttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 178947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 25122 - 25275
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||| ||||| |||| || |||||    
T  25122 caacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacgatatc-aatgcaaatcaac 25219  T
Q  99 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    |||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25220 aacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgtatatacaaatatatcacatta 25275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 234 - 323
Target Start/End: Original strand, 25353 - 25442
Alignment:
Q  234 gatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctcta 323  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25353 gatcaactcacaacaactcgtgcgacaaaggtcacatttatcctaacaaggtattatgtctcacaagggctcgcgagacgagaacctcta 25442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 165
Target Start/End: Original strand, 620 - 715
Alignment:
Q  68 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 165  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  620 catgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 3255 - 3149
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3255 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 3158  T
Q  101 catctcaaa 109  Q
    |||||||||    
T  3157 catctcaaa 3149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 179 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 28740 - 28596
Alignment:
Q  179 tcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct- 277  Q
    |||| ||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  28740 tcagtcttactggaacaatgacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaaccta 28641  T
Q  278 aacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
    |||||||  |||||   ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28640 aacaaggcattctgtaacacaagtactcgcgaggcgagagcctct 28596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 28875 - 28813
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-aacagcaacataggcagtatgcaaa 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28875 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaa 28813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 39493 - 39599
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39493 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 39590  T
Q  101 catctcaaa 109  Q
    |||||||||    
T  39591 catctcaaa 39599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 38807 - 38700
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  38807 caacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 38709  T
Q  101 catctcaaa 109  Q
     ||||||||    
T  38708 tatctcaaa 38700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 75319 - 75213
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  75319 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 75222  T
Q  101 catctcaaa 109  Q
    |||||||||    
T  75221 catctcaaa 75213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 32117 - 32345
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |    
T  32117 cttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgtaa-tcatcaacgt 32215  T
Q  104 ctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagc 203  Q
    |||||  ||| ||||||| | ||| |||||||||      |||| |||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| |||||||||||     
T  32216 ctcaattatc-aacataatc-catttaatgtata------tatacaacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagt 32307  T
Q  204 aagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaact 241  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32308 aagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaact 32345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 17322 - 17214
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc--aaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  17322 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 17224  T
Q  99 aacatctcaa 108  Q
    ||||||||||    
T  17223 aacatctcaa 17214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79328
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||  |||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| |    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cgacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgt 79333  T
Q  104 ctcaa 108  Q
    |||||    
T  79332 ctcaa 79328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 4865 - 4968
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  4865 caacttagaccgactcatgcagattagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaatgcaattcaacaa 4963  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  4964 catct 4968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 23988 - 23901
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 89  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  23988 caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 23901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 51929 - 52032
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||||||     
T  51929 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacat 52027  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  52028 catct 52032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 168083 - 167980
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||| || || ||| |||    
T  168083 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 167985  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  167984 catct 167980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 165
Target Start/End: Original strand, 11482 - 11643
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  | |||||| |||||||    
T  11482 acttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaaca 11580  T
Q  103 tctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 165  Q
    |||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  11581 tctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 11643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 38359 - 38198
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  | |||||| |||||||    
T  38359 acttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaaca 38261  T
Q  103 tctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 165  Q
    |||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  38260 tctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 38198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24690 - 24605
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatata--caattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  24690 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataatttcatgcaatatatatatccaattatataacatta 24605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 16129 - 16235
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||| ||| |||||     
T  16129 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacat 16227  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    ||||||||    
T  16228 catctcaa 16235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 33061 - 32959
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || |||||||    
T  33061 caacttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaa 32964  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  32963 catct 32959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 45944 - 46046
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || |||||||    
T  45944 caacttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaa 46041  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  46042 catct 46046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 17434 - 17389
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 47  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17434 caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaaca 17389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 22899 - 23001
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22899 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-ccagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 22996  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  22997 catct 23001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 4524 - 4630
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4524 caacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 4621  T
Q  101 catctcaaa 109  Q
    |||||||||    
T  4622 catctcaaa 4630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 12106 - 12212
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12106 caacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 12203  T
Q  101 catctcaaa 109  Q
    |||||||||    
T  12204 catctcaaa 12212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 22058 - 22164
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22058 caacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 22155  T
Q  101 catctcaaa 109  Q
    |||||||||    
T  22156 catctcaaa 22164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 13227 - 13330
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| |||    
T  13227 caacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 13325  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  13326 catct 13330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 4707 - 4812
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4707 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 4804  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  4805 cgtctcaa 4812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 8495 - 8605
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  8495 caacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaat-agcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 8593  T
Q  101 catctcaaacat 112  Q
    ||||| ||||||    
T  8594 catcttaaacat 8605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 10786 - 10891
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10786 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 10883  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  10884 cgtctcaa 10891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 13405 - 13510
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13405 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 13502  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  13503 cgtctcaa 13510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 20760 - 20865
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20760 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 20857  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  20858 cgtctcaa 20865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 16701 - 16599
Alignment:
Q  5 ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16701 ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatggaagtcaacagcatc 16603  T
Q  105 tcaa 108  Q
    ||||    
T  16602 tcaa 16599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 37834 - 37939
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  37834 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 37931  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  37932 cgtctcaa 37939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24304
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-cagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| ||||    
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaac 24308  T
Q  102 atct 105  Q
    ||||    
T  24307 atct 24304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 158599 - 158494
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  158599 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 158502  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  158501 cgtctcaa 158494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 340052 - 339949
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||    
T  340052 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac--acaacaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaat-caagtcaacaa 339957  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    ||||||||    
T  339956 catctcaa 339949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 108
Target Start/End: Original strand, 29946 - 30050
Alignment:
Q  2 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29946 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgtaagtcaacaac 30043  T
Q  102 atctcaa 108  Q
     ||||||    
T  30044 gtctcaa 30050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 1153 - 1050
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||| || || ||| |||    
T  1153 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 1055  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  1054 catct 1050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 3486 - 3589
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| |||    
T  3486 caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaa-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 3584  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  3585 catct 3589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 105
Target Start/End: Original strand, 361 - 461
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||  |||||||  ||| |||||||| || ||||||||||||    
T  361 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaataacataggcagtatacaaaa-tagcatgacgtaataatatcaattggaagtcaacaaca 458  T
Q  103 tct 105  Q
    |||    
T  459 tct 461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 105
Target Start/End: Original strand, 32962 - 33060
Alignment:
Q  5 ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatc 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  32962 ttagaccgactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagttaacaacatc 33059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 38777 - 38879
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| || | |||||    
T  38777 caacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaaataaacaa 38874  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  38875 catct 38879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 9762 - 9867
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  9762 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaagtgcaagtcaacaa 9859  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  9860 cgtctcaa 9867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 25912 - 26018
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||| |||| |||||    
T  25912 caacttagaccgactcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-tatcatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaa 26009  T
Q  101 catctcaaa 109  Q
    |||||||||    
T  26010 catctcaaa 26018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 39874 - 39980
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||| |||| |||||    
T  39874 caacttagaccaactcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-tatcatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaa 39971  T
Q  101 catctcaaa 109  Q
    |||||||||    
T  39972 catctcaaa 39980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 1867 - 1970
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || || ||| |||    
T  1867 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 1965  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  1966 catct 1970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 18130 - 17969
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| || || |||||||||| |||||| || | |||| |||||||    
T  18130 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 18032  T
Q  103 tctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 165  Q
    ||||||| | ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  18031 tctcaaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 17969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 2278 - 2184
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  2278 caacttagaccgactcttgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 2184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 13960 - 14065
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13960 caacttagaccgactcatgcagcttagataaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 14057  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  14058 cgtctcaa 14065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 2488 - 2231
Alignment:
Q  61 aaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaac 160  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  2488 aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaac---tcaattatcaaacttaag-tcatttaatgtatatacaattatataacattataagc 2393  T
Q  161 aacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgaca 260  Q
    |||||||  | |||    |||| ||||||| ||||  || ||||||  ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||    
T  2392 aacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaatagcaaggtaaaaaacttagtttctaacctctaagatcaactcacataaactcgaacggca 2293  T
Q  261 aaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
    ||| || |||| ||||||| ||||  |||||   ||||   |||||||||||||||||||||    
T  2292 aagatcgcattcaacctaaaaaggcattctgtaacacacacgctcgcgaggcgagagcctct 2231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 16797 - 16902
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16797 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 16894  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  16895 cgtctcaa 16902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 8634 - 8535
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||||||     
T  8634 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaat----aacagcaacataggcagtat-caaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacat 8540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 108
Target Start/End: Original strand, 11305 - 11406
Alignment:
Q  5 ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatc 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  11305 ttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 11402  T
Q  105 tcaa 108  Q
    ||||    
T  11403 tcaa 11406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 10528 - 10427
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||| |||||||| |  || |||||||    
T  10528 caacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataataatatcaatttcaattcaacaa 10432  T
Q  101 catct 105  Q
    |||||    
T  10431 catct 10427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 105
Target Start/End: Original strand, 20928 - 21030
Alignment:
Q  3 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 102  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||| |||||||| || || |||||||||    
T  20928 acttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaaca 21027  T
Q  103 tct 105  Q
    |||    
T  21028 tct 21030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Original strand, 51601 - 51654
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51601 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 51654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 284
Target Start/End: Original strand, 9133 - 9372
Alignment:
Q  40 cagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatata 139  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||| |||| || ||| |||| ||  |  |||||| |||||| ||||| ||||| ||||    
T  9133 cagcaacataggcagtatgcaactc-atcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaacttcatat-catcaa-cataaa-tcatgcaatgtttata 9228  T
Q  140 caattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaa 239  Q
    || || | |||||| | ||||| |||| ||||| |||||| || || |||| |||| |||||||| |  |  ||||||||||| | || |||||||||||    
T  9229 catttgtttaacatcatcaacatcattggattaaacaatt-agactcactggaacatcaacagcatgctaggcaacttagttcttaacatctaagatcaa 9327  T
Q  240 ctcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaacaagg 284  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||    
T  9328 ctcacaacaactcgtgcgacaaggatcgcatttaacctagcaagg 9372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 4728 - 4803
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataa 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  4728 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataa 4803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 204 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 2207 - 2088
Alignment:
Q  204 aagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcacaaggg 302  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||| |||||||  |||||   ||||||      
T  2207 aagataaacaacttagtttctaacctctaagattaactcacatccactcgtgcgacaaggatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagta 2108  T
Q  303 ctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2107 ctcgcgaggcgagagcctct 2088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 6229 - 6123
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca--aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || | |||||||| || || ||| |    
T  6229 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaattgcaattcatc 6130  T
Q  99 aacatct 105  Q
    |||||||    
T  6129 aacatct 6123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12398 - 12293
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| || ||||| |||||||| | || ||||||||||| ||||||||||    
T  12398 caacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatcaaatgcaagtcaacaa 12301  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  12300 cgtctcaa 12293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 13513 - 13575
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13513 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaac 13575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 9255 - 9360
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9255 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 9352  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  9353 cgtctcaa 9360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Original strand, 1308 - 1359
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1308 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 1359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Original strand, 7285 - 7338
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7285 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 7338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 15343 - 15291
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 54  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15343 caacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcag 15291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 105
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4643
Alignment:
Q  6 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | ||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4545 tagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatct 4643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 40413 - 40518
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40413 caacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 40510  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  40511 cgtctcaa 40518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 88
Target Start/End: Original strand, 16301 - 16382
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||||||    
T  16301 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataattatatcaaat 16382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Original strand, 1971 - 2071
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||||| || || ||||||||||    
T  1971 cttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaattgcaattcaacaacat 2069  T
Q  104 ct 105  Q
    ||    
T  2070 ct 2071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 4227 - 4321
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  4227 caacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-gacagcgacaca-gcagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 4321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20423
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-tcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 20428  T
Q  104 ctcaa 108  Q
    |||||    
T  20427 ctcaa 20423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 105
Target Start/End: Original strand, 128824 - 128869
Alignment:
Q  60 aaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 105  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  128824 aaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 128869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 4310 - 4415
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || || |||||||    
T  4310 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaaatcaacaa 4407  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  4408 cgtctcaa 4415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Original strand, 32083 - 32137
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32083 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 32137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 11548 - 11464
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 86  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  11548 caacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 315
Target Start/End: Original strand, 13811 - 13891
Alignment:
Q  236 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgag 315  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |||  ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  13811 tcaactcataacaactcgcgcgacaaagatcgcatttaacctaaaccaggaattctgtcttacaagagctcgcgaggcgag 13891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15568 - 15485
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 86  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  15568 caacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aagagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaa 15485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 89
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2780
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatg 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  2694 cttagaccgactcatgcagcttagtcaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatcaaatg 2780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 161239 - 161133
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa-ca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| | ||||||| ||||| ||  |||| |||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  161239 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatc-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaatgcaagtcaatca 161142  T
Q  100 acatctcaa 108  Q
    |||||||||    
T  161141 acatctcaa 161133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 119 - 224
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  119 caacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaa 216  T
Q  101 catctcaa 108  Q
    | ||||||    
T  217 cgtctcaa 224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 5230 - 5183
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagg 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5230 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacatagg 5183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 55
Target Start/End: Original strand, 47014 - 47065
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 55  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47014 cttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 47065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 165
Target Start/End: Original strand, 225465 - 225585
Alignment:
Q  43 caacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatataca 141  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || | ||||  ||| |||||| |||||||    
T  225465 caacatagtcagtatgcaaaac-agcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcatataca 225561  T
Q  142 attatataacattaacaacaacat 165  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||    
T  225562 attatatcacattataaacaacat 225585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 1151 - 1098
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  1151 cttagaccgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtat 1098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 12077 - 12176
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12077 caacttagaccgactcatgcagcttagtt-------aaacagcaacaca-gcagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 12168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 1430 - 1336
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  1430 caacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aacaataacacatg-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 1336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 3588 - 3529
Alignment:
Q  49 aggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 108  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3588 aggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 3529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 47
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12024
Alignment:
Q  4 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 12024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 4938 - 4888
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggc 52  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4938 caacttagaccaactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggc 4888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 322
Target Start/End: Original strand, 10158 - 10245
Alignment:
Q  236 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||  |||||   |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10158 tcaactcataacaactcgtacgacaaagatcgcatttaacctaaacaaggcattctgtaacacaagtgctcgcgaggcgagagcctct 10245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 9707 - 9620
Alignment:
Q  236 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaaggtcacatttaacctaa-caaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgagagcctct 322  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||    || || |||||||||||||||||||||    
T  9707 tcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcacatttaacctaaacaaggcattctgtaatactagtgctcgcgaggcgagagcctct 9620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 23855 - 23892
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23855 caacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 23892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 36466 - 36503
Alignment:
Q  1 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36466 caacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 36503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 247 - 315
Target Start/End: Original strand, 26847 - 26916
Alignment:
Q  247 caactcgtgcgacaaaggtcacatttaacct-aacaaggtgttctgactcacaagggctcgcgaggcgag 315  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  26847 caactcgcgcgacaaagatcacatttaacctaaacaaggcattctgacttacaggagctcgcgaggcgag 26916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 6 - 88
Alignment:
Q  72 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 155  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  6 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 88  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 109
Target Start/End: Original strand, 27911 - 27953
Alignment:
Q  67 gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 109  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27911 gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 27953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 206624 - 206575
Alignment:
Q  6 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  206624 tagatcgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagta 206575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 262
Target Start/End: Original strand, 165 - 297
Alignment:
Q  129 taatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacc 228  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||||||||||| |||||||| || || | |||||||||  || | ||||    
T  165 taatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactg-aacaacaatagtaatataaacaacttcatttcctacc 263  T
Q  229 tctaagatcaactcacatcaactcgtgcgacaaa 262  Q
     | | |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  264 ccaaggatcgactcacaacaactcgtgcgacaaa 297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 697 - 602
Alignment:
Q  71 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 167  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||| || || |||||||| | ||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  697 gatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatataat-tcatgtaatgcgtatacaattatatcacattaatatcaacatta 602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University