View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18908_low_3 (Length: 713)

Name: NF18908_low_3
Description: NF18908
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18908_low_3
NF18908_low_3
[»] chr5 (6 HSPs)
chr5 (11-694)||(38605236-38605926)
chr5 (443-642)||(40181191-40181393)
chr5 (520-694)||(41885818-41885992)
chr5 (511-599)||(40180547-40180635)
chr5 (452-599)||(38604990-38605140)
chr5 (80-113)||(40180851-40180884)
[»] chr8 (10 HSPs)
chr8 (455-630)||(44459541-44459716)
chr8 (455-630)||(44467074-44467249)
chr8 (68-228)||(44459952-44460121)
chr8 (68-228)||(44467485-44467654)
chr8 (443-582)||(34502246-34502385)
chr8 (443-582)||(44460291-44460430)
chr8 (443-582)||(44467824-44467963)
chr8 (68-228)||(34502528-34502698)
chr8 (67-212)||(44459275-44459420)
chr8 (67-212)||(44466808-44466953)
[»] chr1 (2 HSPs)
chr1 (443-582)||(46359161-46359300)
chr1 (67-237)||(46358821-46358991)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (523-590)||(9161362-9161429)
chr6 (530-589)||(410918-410977)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 604; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 604; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 694
Target Start/End: Original strand, 38605236 - 38605926
Alignment:
Q  11 cacagaaaaagtatgtcattctgccttagttcaacatcaaatttagttggaacatcgcatattgctgaaacaagggattccaaaacaggggtagtgatga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38605236 cacagaaaaagtatgtcattctgccttagttcaacatcaaatttagttggaacatcgcatattgctgaaacaagagattccaaaacaggggtagtgatga 38605335  T
Q  111 gatgtgaattactcctaaaagcccacttgataaagtgaataagattatgaggagaaacctttggggtttcaactggtatagtttgacaggaggtttcaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38605336 gatgtgaattactcctaaaagcccacttgataaagtgaataagaatatgaggagaaacctttggggtttcaactggtatagtttgacaggaggtttcaat 38605435  T
Q  211 aattttgagtagaaaatgtggttgatgctgatg-------cagagtttccaagcatgtgaaactgaaacatctattaaatttgtaataataattatggag 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38605436 aattttgagtagaaaatgtggttgatgctgatggctgatgcagagtttccaagcatgtgaaactgaaacatctattaaatttgtaattataattatggag 38605535  T
Q  304 aggaggaggagtaccactaagaaatgtcattactatccggaaatcttcagatgcagtgacatcatctggacaaggaggaaggtaagtgtaagtgtaacct 403  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38605536 aggaggag---taccactaagaaatgtcatcactatccggaaatcttcagatgcagtgacatcgtctggacaaggaggaaggtaagtgtaagtgtagcct 38605632  T
Q  404 tgagaagaagagtgaagattatcatctttggagtgcag---cagcagcaagttttgacagatagaagaggcttggtggatgatatcagcactacacgttg 500  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38605633 tgagaagaagagtgacgattatcatctttggagtgcagcagcagcagcaagttttgacagatagaagaggcttggtggatgatatcagcactacacgttg 38605732  T
Q  501 tggtcaaaagagcttgaagtgtaaagtaatatgtgtcttgatttggcacacattgaaagacctcaaacatatgaaaaacttcaagtgcagacttgccttc 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38605733 tggtcaaaagagcttgaagtgtaaagtaatatgtgtcttgatttggcacacattgaaagacctcaaacatatgaaaaacttcaagtgcagacttgccttc 38605832  T
Q  601 tcgccctataattgagaagaattgtatgaggtgattgagaatgggtgggttaagaaggcctgtttgataatggccaatattcttaagcaaatcc 694  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38605833 tcgacctataattgagaagaattgtatgaggtgattgagaatgggtgggttaagaaggccggtttgataatggccaatattcttaagcaaatcc 38605926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 443 - 642
Target Start/End: Original strand, 40181191 - 40181393
Alignment:
Q  443 agcagcaagttttgacagatagaagaggcttggtggatgatatcagcactacacgttgtggtc---aaaagagcttgaagtgtaaagtaatatgtgtctt 539  Q
    |||||||| |||||| |||||||    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  40181191 agcagcaacttttgatagatagactctgcttggtggatcatatcagcactacaccttgtgctcctcaaaagagcttgcagtgtatagtaatatgtatctt 40181290  T
Q  540 gatttggcacacattgaaagacctcaaacatatgaaaaacttcaagtgcagacttgccttctcgccctataattgagaagaattgtatgaggtgattgag 639  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||| |||||||| | ||| ||||   |||| |||| ||||||| ||| |||||| | ||||||    
T  40181291 gatttggcacacattgaaatacgtcaaaattatgaaaaacatcaagtgctgcctttccttgctgccccataactgagaaggattctatgagtttattgag 40181390  T
Q  640 aat 642  Q
    |||    
T  40181391 aat 40181393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 520 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 41885992 - 41885818
Alignment:
Q  520 tgtaaagtaatatgtgtcttgatttggcacacattgaaagacctcaaacatatgaaaaacttcaagtgcagacttgccttctcgccctataattgagaag 619  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||||||| ||  ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||    
T  41885992 tgtaaagtaatatgtatcttgatttggctcacattgaaaagcctcaaatttatgaaaaacatcgtgtgcagctttcccttctcgccccataattgagaag 41885893  T
Q  620 aattgtatgaggtgattgagaatgggtgggttaagaaggcctgtttgataatggccaatattcttaagcaaatcc 694  Q
    |||| ||| || | ||| |||||  | | |||||||||||| || |||||||||||  || ||||||||||||||    
T  41885892 aattctattagtttatttagaatccgagcgttaagaaggccggtctgataatggcctgtagtcttaagcaaatcc 41885818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 511 - 599
Target Start/End: Original strand, 40180547 - 40180635
Alignment:
Q  511 agcttgaagtgtaaagtaatatgtgtcttgatttggcacacattgaaagacctcaaacatatgaaaaacttcaagtgcagacttgcctt 599  Q
    |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  40180547 agcttgcagtgtaaagatatatgtatcttgatttggcacacattgaaagacctcaaatttatgaaaaacatcaagtgcagccttccctt 40180635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 452 - 599
Target Start/End: Original strand, 38604990 - 38605140
Alignment:
Q  452 ttttgacagatagaagaggcttggtggatgatatcagcactacacgttgtggtc---aaaagagcttgaagtgtaaagtaatatgtgtcttgatttggca 548  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||| ||  |||| |||   ||||||||||  |||||||||  |||||  |||||||| ||||    
T  38604990 ttttgacagatagaagcggcttgctggagcatatcagcactgcaacttgttgtcttaaaaagagcttccagtgtaaagatatatgaatcttgattaggca 38605089  T
Q  549 cacattgaaagacctcaaacatatgaaaaacttcaagtgcagacttgcctt 599  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  38605090 cacactgaaagacctcaaatttatgaaaaacttggagtgcagtcttacctt 38605140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 113
Target Start/End: Original strand, 40180851 - 40180884
Alignment:
Q  80 acaagggattccaaaacaggggtagtgatgagat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40180851 acaagggattccagaacaggggtagtgatgagat 40180884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 10)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 455 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 44459716 - 44459541
Alignment:
Q  455 tgacagatagaagaggcttggtggatgatatcagcactacacgttgtggtcaaaagagcttgaagtgtaaagtaatatgtgtcttgatttggcacacatt 554  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| |||| || |||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  44459716 tgacagatagaagctgcttgatggatcatatgagtactacaggtcgtggtcaaaagagcttgcagagtaaagtaatatgtatcgtgatttggcacacact 44459617  T
Q  555 gaaagacctcaaacatatgaaaaacttcaagtgcagacttgccttctcgccctataattgagaagaattgtatgag 630  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44459616 gaaaggcctcaaacatatgaaaaacttcaagtgcagatttaccttctcgccccataattgagaaggattgtatgag 44459541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 455 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 44467249 - 44467074
Alignment:
Q  455 tgacagatagaagaggcttggtggatgatatcagcactacacgttgtggtcaaaagagcttgaagtgtaaagtaatatgtgtcttgatttggcacacatt 554  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| |||| || |||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  44467249 tgacagatagaagctgcttgatggatcatatgagtactacaggtcgtggtcaaaagagcttgcagagtaaagtaatatgtatcgtgatttggcacacact 44467150  T
Q  555 gaaagacctcaaacatatgaaaaacttcaagtgcagacttgccttctcgccctataattgagaagaattgtatgag 630  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44467149 gaaaggcctcaaacatatgaaaaacttcaagtgcagatttaccttctcgccccataattgagaaggattgtatgag 44467074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44460121 - 44459952
Alignment:
Q  68 catattgctgaaacaagggattccaaaacaggggtagtgatgagatgtgaatta------ctcctaa---aagcccacttgataaagtgaataagattat 158  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |      ||||| |   |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  44460121 catatttctgaaacaagggattccagaacaggggtagtgatgagatcttgataagtgttcctcctcatccaagcccactttataaagtggataagattat 44460022  T
Q  159 gaggagaaacctttggggtttcaactggtatagtttgacaggaggtttcaataattttgagtagaaaatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44460021 gaggcgaaacctttggggtttcaattaatttagtttgtgaggaggtttcaataactttgagtacaaaatg 44459952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44467654 - 44467485
Alignment:
Q  68 catattgctgaaacaagggattccaaaacaggggtagtgatgagatgtgaatta------ctcctaa---aagcccacttgataaagtgaataagattat 158  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |      ||||| |   |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  44467654 catatttctgaaacaagggattccagaacaggggtagtgatgagatcttgataagtgttcctcctcatccaagcccactttataaagtggataagattat 44467555  T
Q  159 gaggagaaacctttggggtttcaactggtatagtttgacaggaggtttcaataattttgagtagaaaatg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44467554 gaggcgaaacctttggggtttcaattaatttagtttgtgaggaggtttcaataactttgagtacaaaatg 44467485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 443 - 582
Target Start/End: Original strand, 34502246 - 34502385
Alignment:
Q  443 agcagcaagttttgacagatagaagaggcttggtggatgatatcagcactacacgttgtggtcaaaagagcttgaagtgtaaagtaatatgtgtcttgat 542  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||   ||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||   ||||| ||| |||    
T  34502246 agcagcatcttttgacagatagaagcggcttggtgggtcatatcagtgatacatcttgtgatcaaaagagctttcagtgtaaaggtgtatgtatctcgat 34502345  T
Q  543 ttggcacacattgaaagacctcaaacatatgaaaaacttc 582  Q
    | ||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  34502346 tcggcacacattgaaatgcctcaaatttatgaaaaacttc 34502385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 443 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 44460430 - 44460291
Alignment:
Q  443 agcagcaagttttgacagatagaagaggcttggtggatgatatcagcactacacgttgtggtcaaaagagcttgaagtgtaaagtaatatgtgtcttgat 542  Q
    |||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||   ||||| |||||||||||| |||||| || |||  |  |||||| |||||||    
T  44460430 agcagcatcttttgacacatagaagcggcttggtggatcatatcagtggtacactttgtggtcaaaaaagcttgcagcgtatggatatatgtatcttgat 44460331  T
Q  543 ttggcacacattgaaagacctcaaacatatgaaaaacttc 582  Q
    | ||||| ||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  44460330 tcggcacgcattgaaatgcctcaaatttatgaaaaacttc 44460291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 443 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 44467963 - 44467824
Alignment:
Q  443 agcagcaagttttgacagatagaagaggcttggtggatgatatcagcactacacgttgtggtcaaaagagcttgaagtgtaaagtaatatgtgtcttgat 542  Q
    |||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||   ||||| |||||||||||| |||||| || |||  |  |||||| |||||||    
T  44467963 agcagcatcttttgacacatagaagcggcttggtggatcatatcagtggtacactttgtggtcaaaaaagcttgcagcgtatggatatatgtatcttgat 44467864  T
Q  543 ttggcacacattgaaagacctcaaacatatgaaaaacttc 582  Q
    | ||||| ||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  44467863 tcggcacgcattgaaatgcctcaaatttatgaaaaacttc 44467824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 228
Target Start/End: Original strand, 34502528 - 34502698
Alignment:
Q  68 catattgctgaaacaagggattccaaaacaggggtagtgatgagatgtgaatta---------ctcctaaaagcccacttgataaa-gtgaataagatta 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||  || |         |||||  |||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  34502528 catattgctgaaacaagggattccagaacaagggtagtaatgagatgtttataagtgttcctcctcctccaagcccacttcataaaagtggataagatta 34502627  T
Q  158 tgaggagaaacctttggggtttcaactggtatagtttgacaggaggtttcaataattttgagtagaaaatg 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |  | |||||||| | |||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  34502628 tgaggcgaaacctttggggtttcagttaatttagtttgagaagaggcttcaataactttgagtacaaaatg 34502698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 44459420 - 44459275
Alignment:
Q  67 gcatattgctgaaacaagggattccaaaacaggggtagtgatgagatgtgaattactcctaaaagcccacttgataaagtgaataagattatgaggagaa 166  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     ||| || |  || || |||| |||||||  ||||||||||||||   |    
T  44459420 gcatattgatgaaacaagggattccagaacaggggtagtgatgaggtccttgttattcttccaaaccaactttataaagttgataagattatgaggttga 44459321  T
Q  167 acctttggggtttcaactggtatagtttgacaggaggtttcaataa 212  Q
    |||||||||| ||||||   | |||||||||| |||||||||||||    
T  44459320 acctttggggcttcaacaaatttagtttgacaagaggtttcaataa 44459275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 44466953 - 44466808
Alignment:
Q  67 gcatattgctgaaacaagggattccaaaacaggggtagtgatgagatgtgaattactcctaaaagcccacttgataaagtgaataagattatgaggagaa 166  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     ||| || |  || || |||| |||||||  ||||||||||||||   |    
T  44466953 gcatattgatgaaacaagggattccagaacaggggtagtgatgaggtccttgttattcttccaaaccaactttataaagttgataagattatgaggttga 44466854  T
Q  167 acctttggggtttcaactggtatagtttgacaggaggtttcaataa 212  Q
    |||||||||| ||||||   | |||||||||| |||||||||||||    
T  44466853 acctttggggcttcaacaaatttagtttgacaagaggtttcaataa 44466808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 443 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 46359300 - 46359161
Alignment:
Q  443 agcagcaagttttgacagatagaagaggcttggtggatgatatcagcactacacgttgtggtcaaaagagcttgaagtgtaaagtaatatgtgtcttgat 542  Q
    |||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||   ||||| |||||||||||| |||||| || |||  |  |||||| |||||||    
T  46359300 agcagcatcttttgacacatagaagcggcttggtggatcatatcagtggtacactttgtggtcaaaaaagcttgcagcgtatggatatatgtatcttgat 46359201  T
Q  543 ttggcacacattgaaagacctcaaacatatgaaaaacttc 582  Q
    | ||||| ||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  46359200 tcggcacgcattgaaatgcctcaaatttatgaaaaacttc 46359161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 46358991 - 46358821
Alignment:
Q  67 gcatattgctgaaacaagggattccaaaacaggggtagtgatgagatgtgaattactcctaaaagcccacttgataaagtgaataagattatgaggagaa 166  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     ||| || |  || || |||| |||||||  ||||||||||||||   |    
T  46358991 gcatatttctgaaacaagggattccagaacaggggtagtgatgaggtccttgttattcttccaaaccaactttataaagttgataagattatgaggttga 46358892  T
Q  167 acctttggggtttcaactggtatagtttgacaggaggtttcaataattttgagtagaaaatgtggttgatg 237  Q
    |||||||||| ||||||   | |||||||||| ||||||||||||| ||| |||  ||| ||| |||||||    
T  46358891 acctttggggcttcaacaaatttagtttgacaagaggtttcaataactttaagtgcaaagtgttgttgatg 46358821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 9161429 - 9161362
Alignment:
Q  523 aaagtaatatgtgtcttgatttggcacacattgaaagacctcaaacatatgaaaaacttcaagtgcag 590  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  9161429 aaagtaatatgtctcttgattcggaacacattgaaagacctcaaattaatgaaaaacttcaagtgcag 9161362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 530 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 410977 - 410918
Alignment:
Q  530 tatgtgtcttgatttggcacacattgaaagacctcaaacatatgaaaaacttcaagtgca 589  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  410977 tatgtatcttgatttggaacacattgaaatacctcaaatttatgaaaaacttcaagtgca 410918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University