View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18913_low_3 (Length: 483)

Name: NF18913_low_3
Description: NF18913
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18913_low_3
NF18913_low_3
[»] chr3 (14 HSPs)
chr3 (17-483)||(38024843-38025309)
chr3 (23-483)||(38031295-38031755)
chr3 (134-457)||(50911863-50912186)
chr3 (17-483)||(55084488-55084958)
chr3 (139-483)||(50909787-50910132)
chr3 (17-481)||(38028736-38029203)
chr3 (17-481)||(38040051-38040518)
chr3 (17-481)||(38036763-38037231)
chr3 (17-483)||(38033743-38034217)
chr3 (289-457)||(38043881-38044049)
chr3 (262-458)||(50904785-50904981)
chr3 (290-465)||(48840698-48840872)
chr3 (295-341)||(50913480-50913526)
chr3 (219-259)||(38034963-38035003)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (23-483)||(21607264-21607725)
chr8 (17-481)||(21604724-21605194)
chr8 (371-465)||(21634603-21634697)
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (290-459)||(1756749-1756918)
chr5 (295-459)||(1754672-1754836)
chr5 (295-449)||(1754243-1754397)
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (289-464)||(17970277-17970452)
chr4 (277-459)||(27415590-27415769)
chr4 (277-461)||(27570039-27570223)
chr4 (267-482)||(27444763-27444978)
chr4 (280-452)||(27425781-27425953)
chr4 (267-465)||(27557445-27557643)
chr4 (277-459)||(27420374-27420556)
chr4 (297-459)||(27468319-27468481)
chr4 (297-459)||(27503908-27504070)
chr4 (297-459)||(27514877-27515039)
chr4 (337-459)||(27412690-27412812)
chr4 (288-482)||(27431117-27431311)
chr4 (272-458)||(27526105-27526291)
chr4 (272-481)||(27486944-27487153)
chr4 (272-481)||(27523373-27523582)
chr4 (268-452)||(27497321-27497505)
chr4 (295-450)||(27498399-27498554)
chr4 (297-459)||(27475571-27475733)
chr4 (295-465)||(27479885-27480055)
chr4 (295-457)||(27485937-27486099)
chr4 (295-459)||(27478875-27479039)
chr4 (297-459)||(27508838-27509000)
chr4 (272-458)||(27513769-27513955)
chr4 (297-459)||(27524510-27524672)
chr4 (290-483)||(27502775-27502968)
chr4 (278-459)||(27563338-27563519)
chr4 (295-458)||(27501301-27501464)
chr4 (267-482)||(27554265-27554480)
chr4 (295-465)||(27505688-27505858)
chr4 (272-465)||(27469421-27469614)
chr4 (295-459)||(27506682-27506846)
chr4 (295-451)||(27556379-27556535)
chr4 (277-449)||(27565953-27566125)
chr4 (295-465)||(27423206-27423376)
chr4 (295-481)||(27476671-27476857)
chr4 (297-447)||(27489946-27490096)
chr4 (295-451)||(27411456-27411612)
chr4 (295-451)||(27414304-27414460)
chr4 (295-451)||(27424514-27424670)
chr4 (295-451)||(27559240-27559396)
chr4 (340-459)||(27585717-27585836)
chr4 (295-451)||(27567239-27567395)
chr4 (292-431)||(27527142-27527281)
chr4 (295-450)||(27571607-27571762)
chr4 (400-470)||(27460567-27460637)
chr4 (295-450)||(27419072-27419227)
chr4 (394-465)||(27502121-27502192)
chr4 (295-465)||(27446131-27446301)
chr4 (400-458)||(27466910-27466968)
chr4 (403-464)||(27495628-27495689)
chr4 (295-451)||(27421931-27422091)
chr4 (400-483)||(27473981-27474064)
chr4 (329-483)||(27507781-27507935)
chr4 (403-459)||(27600645-27600701)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (289-464)||(3073547-3073722)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 459; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 38025309 - 38024843
Alignment:
Q  17 catctaagacaataccatgtgatctcttctcataggccccatcattttaacagctattttctaacaactggatttcaaagaaactcttgaaatctataaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38025309 catctaagacaataccatgtgatctcgtctcataggccccatcattttaacagctattttctaacaactggatttcaaagaaactcttgaaatctataaa 38025210  T
Q  117 tacattatcctccatcgcaacttcacaaatcattcaagcaaacaaatttagaaacatttttcttaaatctgagaaattcagttttttcttcaaaacattt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38025209 tacattatcctccatcgcaacttcacaaatcattcaagcaaacaaatttagaaacatttttcttaaatctgagaaattcagttttttcttcaaaacattt 38025110  T
Q  217 gaaatgggtttccgtttacctgctattagacgaacttcatttacaagtagccaagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38025109 gaaatgggtttccgtttacctgctattagacgaacttcatttacaagtagccaagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtat 38025010  T
Q  317 atgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggata 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38025009 atgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggata 38024910  T
Q  417 tgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaaattacttctcgc 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38024909 tgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagacattttcatggaaattacttctcgc 38024843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 38031755 - 38031295
Alignment:
Q  23 agacaataccatgtgatctctt--ctcataggccccatcattttaacagctattttctaacaactggatttcaaagaaactcttgaaatctataaataca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| || |||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  38031755 agacaataccatgtgatctcttgtctcatgggccccatcattttaacaatcattttctaacaaatgaatttcaaagatact--tgaaatctataaataca 38031658  T
Q  121 ttatcctccatcgcaacttcacaaatcattcaagcaaacaaatttagaaacatttttcttaaatctgagaaattcagttttttcttcaaaacatttgaaa 220  Q
     | |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38031657 ctgtccttcttcacaacttcacaaatcattcaagcaaacaaatttagaaacatttttcttaaatcagagaaattcagttttttcatcaaaacatttgaaa 38031558  T
Q  221 tgggtttccgtttacctgctattagacgaacttcatttacaagtagccaagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgt 320  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38031557 tgggtttccatttacctgctattagacgaacttcatttacaagtagccaagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgt 38031458  T
Q  321 tggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38031457 tggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgat 38031358  T
Q  421 cacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaaattacttctcgc 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38031357 cacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagacattttcatggaaattacttctcgc 38031295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 134 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 50912186 - 50911863
Alignment:
Q  134 caacttcacaaatcattcaagcaaacaaatttagaaacatttttcttaaatctgagaaattcagttttttcttcaaaacatttgaaatgggtttccgttt 233  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50912186 caacttcacaaatcactcgagcaaacaaatatagaaagattttgctgaaatctgagaaattcagttttttcttcaaaatatttgaaatgggtttccgttt 50912087  T
Q  234 acctgctattagacgaacttcatttacaagtagccaagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatg 333  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||    
T  50912086 acctgccattagacgaacttcatttacaggtagccaagcatcatcaaaagttgtgaatgtgccaaagggctatcttgcggtatatgttggagacaagatg 50911987  T
Q  334 aagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtg 433  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50911986 aaacggtttgtgatccccaagtcatacttgaaccaagcttcatttcaaaacttgttgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtg 50911887  T
Q  434 gcctcacgattccttgcacagaag 457  Q
    |||| || ||||||||||||||||    
T  50911886 gcctaacaattccttgcacagaag 50911863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 483
Target Start/End: Original strand, 55084488 - 55084958
Alignment:
Q  17 catctaagacaataccatgtgatctctt--ctcataggccccatcattttaacagctattt-tctaacaactggatttcaaagaaactcttgaaatctat 113  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| |||||||||| ||||||||  |||| || | ||| || |||||||  |||||||||||| ||||    
T  55084488 catctaagacaacaccatgtcatctcttgtctcattggccccatcaatttaacagtcatttctcaagcaaatgaatttcaat-aaactcttgaaaactat 55084586  T
Q  114 aaatacattatcctccatcgcaacttcacaaatcattcaagcaaacaaatttagaaacatttttcttaaatctgagaaattcagttttttcttcaaaaca 213  Q
    ||||||||| |||||  || ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||    
T  55084587 aaatacattgtcctctttcacaacttcacaaattactcaggcaaacaaatttagatacctttttcttaaatctgataaattcagcttgttattcaaaaca 55084686  T
Q  214 tttgaaatgggtttccgtttacctgc---tattagacgaacttcatttacaagtagccaagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttg 310  Q
    |||||||||| |||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| || | |||||    
T  55084687 tttgaaatgg-tttccgtttacctgcagctattagaaggacttcatttacgggtagccaaacatcatcaaaatctgtgaatgtgccaaaagggtgtcttg 55084785  T
Q  311 cagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatt 410  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | || |||||| |||| |||||||  || |||||||||||    
T  55084786 cagtgtatgttggagagaaaatgaagcggtttgtgatccctatgtcttacttgaaccaaccatcatttcaagacttgttgagtcgggcggaggaagaatt 55084885  T
Q  411 tggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaaattacttctcgc 483  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||    
T  55084886 tggatacgatcatccaatgggtggcctcacaattccttgcacagaagatgttttctttcatattacttctcgc 55084958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 139 - 483
Target Start/End: Original strand, 50909787 - 50910132
Alignment:
Q  139 tcacaaatcattcaagcaaacaaatttagaaacatttttcttaaatctgagaaattcagttt-tttcttcaaaacatttgaaatgggtttccgtttacct 237  Q
    |||||||||| |||||||| |||| || || || ||| ||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50909787 tcacaaatcactcaagcaatcaaacttggatacttttatcttacatctgagaaattcatcttatttcttcaaaacatttgaaatgggtttccgtttacca 50909886  T
Q  238 gc---tattagacgaacttcatttacaagtagccaagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatga 334  Q
    ||   |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||   ||||   ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  50909887 gcagctattagacgagcttcatttagcagtagccaaacatca---aaagtattgaatgtgccaaagggttatcttgcagtgtatgttggagagcaaatgc 50909983  T
Q  335 agcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtgg 434  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50909984 tgcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcatttcaaaacttgttgaatcaagtggaggaagaatttggatatgatcatccaatgggtgg 50910083  T
Q  435 cctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaaattacttctcgc 483  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  50910084 cctcacaattccttgcacagaagatgtcttcttgcaaattacttctcgc 50910132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 38029203 - 38028736
Alignment:
Q  17 catctaagacaataccatgtgatctctt--ctcataggccccatcattttaacag-ctattttctaacaactggatttcaaagaaactcttgaaatctat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| ||  ||||||||  | |||  ||| |||  |||||||||| ||||||||| || ||||    
T  38029203 catctaagacaatcccatgtgatctcttgtctcatgggccctattcttttaacaatcaattccctagcaaagggatttcaaa-aaactcttggaaactat 38029105  T
Q  114 aaatacattatcctccatcgcaact-tcacaaatcattcaagcaaacaaatttagaaacatttttcttaaatctgagaaattcagttttttcttcaaaac 212  Q
    ||||||| | |||||| || ||||  |||||||||| |||||||| |||  ||  | ||| || ||||| ||||||||||||||  || |||||||||||    
T  38029104 aaatacagtgtcctccttcacaacaatcacaaatcactcaagcaatcaatcttttatacacttatcttatatctgagaaattcatcttgttcttcaaaac 38029005  T
Q  213 atttgaaatgggtttccgtttacctgc---tattagacgaacttcatttacaagtagccaagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatctt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||| |  ||||||||| |||||   ||||   ||||||| |||||||||||||||    
T  38029004 atttgaaatgggtttccgtttacctgcagctattagacgggcttcattcagcagtagccaaacatca---aaagtattgaatgtgccaaagggctatctt 38028908  T
Q  310 gcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaat 409  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  38028907 gcagtgtacgttggagagcaaatgaagcgatttgttatccccacgtcatacttgaaccaagcttcatttcaaaacctgttgagtcaagccgaggaagaat 38028808  T
Q  410 ttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaaattacttctc 481  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||||    
T  38028807 ttggatatgaccatccaatgggcggcctcacaattccttgcacagaagacgttttcttgcatattacttctc 38028736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 38040518 - 38040051
Alignment:
Q  17 catctaagacaataccatgtgatctct--tctcataggccccatcattttaacagctattt-tctaacaactggatttcaaagaaactcttgaaatctat 113  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| || ||||||||  ||||| |||| |||  ||||||||| |||||||||| || ||||    
T  38040518 catccaagacaacaccatgtgatctctcatctcatgggccccgtccttttaacaattatttctctagcaaagggatttcaa-gaaactcttgtaaactat 38040420  T
Q  114 aaatacattatcctccatcgcaact-tcacaaatcattcaagcaaacaaatttagaaacatttttcttaaatctgagaaattcagttttttcttcaaaac 212  Q
    ||||| | | |||||| || ||||  |||||||||| |||| ||| |||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||  || ||| |||||||    
T  38040419 aaatatagtgtcctccttcacaacaatcacaaatcactcaaacaatcaaacttatatacatttatcttacatctgagaaattcatcttgttcatcaaaac 38040320  T
Q  213 atttgaaatgggtttccgtttacctgc---tattagacgaacttcatttacaagtagccaagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatctt 309  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||  ||||||| |  ||||||||| |||||   ||||   ||||||| |||||||||||||||    
T  38040319 atttgaaatgggttttcgtttatctgcagctattagacgggcttcattcagcagtagccaaacatca---aaagtattgaatgtgccaaagggctatctt 38040223  T
Q  310 gcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaat 409  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  38040222 gcagtgtacgttggagagcaaatgaagcgatttgttatccccacgtcatacttgaaccaagcttcatttcaaaacctgttgagtcaagccgaggaagaat 38040123  T
Q  410 ttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaaattacttctc 481  Q
    | |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||||    
T  38040122 tcggatatgaccatccaatgggcggcctcacaattccttgcacagaagacgttttcttgcatattacttctc 38040051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 38037231 - 38036763
Alignment:
Q  17 catctaagacaataccatgtgatctct--tctcataggccccatcattttaacagctattt-tctaacaactggatttcaaagaaactcttgaaatctat 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| || ||||||||   |||| |||| |||  |||||||||| ||||||||| || ||||    
T  38037231 catctaagacaacaccatgtgatctctcatctcatgggccccgtccttttaacaatcatttctctagcaaagggatttcaaa-aaactcttggaaactat 38037133  T
Q  114 aaatacattatcctccatcgcaact-tcacaaatcattcaagcaaacaaatttagaaacatttttcttaaatctgagaaattcagttttttcttcaaaac 212  Q
    ||||| | | |||||| || ||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||| ||||| || |||||||||||  || ||||||||||     
T  38037132 aaatataatgtcctccttcacaacaatcacaaatcactcaagcaaacaaacttatatacatttatcttacatttgagaaattcatcttgttcttcaaaaa 38037033  T
Q  213 att-tgaaatgggtttccgtttacctgc---tattagacgaacttcatttacaagtagccaagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatct 308  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||| ||||  ||||||||| ||||    ||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  38037032 aaactgaaatgggtttccgtttacctgcagctattagacgggcttcctttagcagtagccaaacatcc---aaagtattgaatgtgccaaagggctatct 38036936  T
Q  309 tgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaa 408  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  38036935 tgcagtgtacgttggagagcaaatgaaacggtttgttgtccccatgccatacttgaaccaagcttcatttcaaaatttgttgagtcaagccgaggaagaa 38036836  T
Q  409 tttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaaattacttctc 481  Q
    || |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |  ||||| || | ||||||||||    
T  38036835 ttcggatatgaccatccaatgggcggcctcacaattccttgcacagaatacgttttcttgcatattacttctc 38036763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 38034217 - 38033743
Alignment:
Q  17 catctaagacaataccatgtgatctct--tctcataggccccatcattttaacagctattt-tctaacaactggatttcaaagaaactcttgaaatctat 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||  | || |||||   |||| |||| |||  |||||||||  ||||||||| || ||||    
T  38034217 catctaagacaacaccatgtgatctctcatctcatgggccccggccttataacaatcatttctctagcaaagggatttcaac-aaactcttggaaactat 38034119  T
Q  114 aaatacattatcctccatcgcaact-tcacaaatcattcaagcaaacaaatttagaaacatttttcttaaatctgagaaattcagttttttcttcaaaac 212  Q
    ||||| |   |||||| || ||||  |||||||||| |||||||| |||| ||| | ||| || ||||| |||||||||||||   || ||||||||||     
T  38034118 aaatatagggtcctccttcacaacaatcacaaatcactcaagcaatcaaacttatatacacttatcttacatctgagaaattcgtcttgttcttcaaaaa 38034019  T
Q  213 at-ttgaaatgggtttccgtttacct---gctattagacgaacttcatttacaagtagccaagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatct 308  Q
    |  |||||||||||||||||||||||   |||||||||||  ||||||| |  ||||| ||   | ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  38034018 aaattgaaatgggtttccgtttacctgcagctattagacgggcttcattcagcagtagtca---aacatcaaaagcattgaatgtgccaaagggctatct 38033922  T
Q  309 tgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaa 408  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38033921 tgcagtgtacattggagagcaaatgaagcggtttgttatccccacgtcatacttgaaccaagcttcatttcaaaacttgttgagtcaagccgaggaagaa 38033822  T
Q  409 tttggatatgatcaccc----aatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaaattacttctcgc 483  Q
    ||||||||||| || ||    |||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  38033821 tttggatatgaccatccaattaatgggcggcatcacaattccctgcacagaagatgttttcttgcatattacttctcgc 38033743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 289 - 457
Target Start/End: Original strand, 38043881 - 38044049
Alignment:
Q  289 aatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttat 388  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||      
T  38043881 aatgtgccaaagagctatcttgcagtgtactttggagaggaaatgaagcggtttgtgatccctatgtcatacttgaatcaaacttcgtttcaagacttgc 38043980  T
Q  389 tgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaag 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  38043981 tgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcatccaatgggcggcctcacaattccttgcaccgaag 38044049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 50904981 - 50904785
Alignment:
Q  262 agtagccaagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatact 361  Q
    ||||||||||||||| |||||||    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| ||||  ||||| ||||    
T  50904981 agtagccaagcatcaacaaaagcgacaaatgtgccaaagggatatcttgcagtgtacgttggagaagaaatgaagcggtttgtgatccatatgtcctact 50904882  T
Q  362 tgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaaga 458  Q
    |||||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  50904881 tgaaccaaacttcatttcaagacttgttgagtcgagcagaggatgaattcggatatgatcatccaatgggtggcctcaccattccttgcagagaaga 50904785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 290 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 48840872 - 48840698
Alignment:
Q  290 atgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttatt 389  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || || |||||| | |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||| ||    
T  48840872 atgtgccaaagggatatcttgcattgtacgtcggagaggagatgaagcgatttgtaatccccatgccatacttgaaccaagcctcatttcaagacttgtt 48840773  T
Q  390 gagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttc 465  Q
    |||| |||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  48840772 gagt-aagtggagaaagaatttggatatgatcatccaatgggtggcctcacaattccttgcacagaagatgttttc 48840698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 341
Target Start/End: Original strand, 50913480 - 50913526
Alignment:
Q  295 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtt 341  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  50913480 ccaaaaggctatcttgcagtgtatgttggagagaaaatgaagaggtt 50913526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 219 - 259
Target Start/End: Original strand, 38034963 - 38035003
Alignment:
Q  219 aatgggtttccgtttacctgctattagacgaacttcattta 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38034963 aatgggttttcgtttacctgctattagacgatcatcattta 38035003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 21607725 - 21607264
Alignment:
Q  23 agacaataccatgtgatctctt--ctcataggccccatcattttaacagctattttctaacaactggatttcaaagaaactcttgaaatctataaataca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||| || |||||||| | |  |||||||||||||||||||    
T  21607725 agacaataccatgtgatctcttgtctcatggtccccatcattttaacaatcattttctaacaaatgaatttcaaa-agatacttgaaatctataaataca 21607627  T
Q  121 ttatcctccatcgcaacttcacaaatcattcaagcaaacaaatttagaaacatttttcttaaatctgagaaattcagttttttcttcaaaacatttgaaa 220  Q
     | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21607626 ctgtcctccttcacaacttcacaaatcattcaagcaaacaaatttagaaacatttttcttaaatcagagaaattcagttttttcttcaaaacatttgaaa 21607527  T
Q  221 tgggtttccgtttacctgctattagacgaacttcatttacaagtagccaagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21607526 tgggtttccgtttacctgctattagacgaacttcatttacaagtagccaagcatcatcaaaagttgtgaatgtaccaaagggatatcttgcggtatatgt 21607427  T
Q  321 tggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21607426 tggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccgagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgat 21607327  T
Q  421 cacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaaattacttctcgc 483  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21607326 cacccaatgggtggcctcacggttccttgcacagaagatattttcatggaaattacttctcgc 21607264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 21605194 - 21604724
Alignment:
Q  17 catctaagacaataccatgtgatctctt--ctcataggccccatcattttaacagctattttc-taacaactggatttcaaagaaactcttgaaatctat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||   |||| | || |||  |||||||||| ||||||||| || ||||    
T  21605194 catctaagacaatcccatgtgatctcttgtctcataggccctattcttttaacaatcatttccctagcaaagggatttcaaa-aaactcttggaaactat 21605096  T
Q  114 aaatacattatcctcca---tcgcaact-tcacaaatcattcaagcaaacaaatttagaaacatttttcttaaatctgagaaattcagttttttcttcaa 209  Q
    ||||||| | ||||||    || ||||  |||||||||| |||||||| | |  ||  | |||||| ||||| ||||||||||||||  || ||||||||    
T  21605095 aaatacagtgtcctcctccttcacaacaatcacaaatcactcaagcaatcgatcttttatacatttatcttatatctgagaaattcatcttgttcttcaa 21604996  T
Q  210 aacatttgaaatgggtttccgtttacctgc---tattagacgaacttcatttacaagtagccaagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||| |  ||||||||| |||||   ||||   ||||||| ||||||||||||    
T  21604995 aacatttgaaatgggtttccgtttacctgcagctattagacgggcttcattcagcagtagccaaacatca---aaagtattgaatgtgccaaagggctat 21604899  T
Q  307 cttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaag 406  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  21604898 cttgcagtgtaagtaggagagcaaatgaagcgatttgttatccccacgtcatacttgaaccaagcttcatttcaaaacatgttgagtcaagacgaggaag 21604799  T
Q  407 aatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaaattacttctc 481  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||||    
T  21604798 aattaggatatgaccatccaatgggcggcctcacaattccttgcacagaagacgttttcttgcatattacttctc 21604724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 371 - 465
Target Start/End: Original strand, 21634603 - 21634697
Alignment:
Q  371 cttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttc 465  Q
    |||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  21634603 cttcgtttcaagacttgctgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcatcgaatgggcggcttcacaattccttgcaccgaagatgttttc 21634697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 290 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 1756918 - 1756749
Alignment:
Q  290 atgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttatt 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | || |||||| |||| ||    
T  1756918 atgtaccaaagggctatcttgcagtgaatgttggagagaaacagaagcggtttgtgatcccaatatcatacttgaaccaaccatcgtttcaatacttgtt 1756819  T
Q  390 gagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 459  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1756818 gagtcaagctgaagaagaatttggatatgatcaccccatgggtggcctcaccattccttgcaccgaagat 1756749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 295 - 459
Target Start/End: Original strand, 1754672 - 1754836
Alignment:
Q  295 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 394  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||  ||| |||  ||| ||||| || ||||||||||| ||| | || ||||||  ||| |||||||    
T  1754672 ccaaagggctatgttgcagtgtatattggagagaaacagaaacggcatgtgatcccaatatcatacttgaatcaaccatcgtttcaatccttgttgagtc 1754771  T
Q  395 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 459  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1754772 aagctgcggaagagtttggatatgatcatccaatgggtggcctcaccattctttgcacagaagat 1754836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 1754397 - 1754243
Alignment:
Q  295 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 394  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| | || |||||||| ||  | |       
T  1754397 ccaaaaggatatctagctgtatatgttggagaagaaatgaagcggtttgtgatccccgtatcatacttgaaccaatcgtcatttcaaaaattgctaaaca 1754298  T
Q  395 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttg 449  Q
    || | |||||| | |||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  1754297 aatctgaggaacagtttgaatatgatcatccgatgggtggtctcactattccttg 1754243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 289 - 464
Target Start/End: Original strand, 17970277 - 17970452
Alignment:
Q  289 aatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttat 388  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||| |||||| ||||      
T  17970277 aatgtgccaaagggatatcttgcggtgtacgttggagaggaaatgaagcggtttgtgatccctacgtcatacttgaaccaaacttcatttcaatacttgc 17970376  T
Q  389 tgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatatttt 464  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  17970377 tgagtcgggcagaggaagaattcggatacgatcatccaatgggtggcctcacaattccttgcacagaagatgtttt 17970452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 277 - 459
Target Start/End: Original strand, 27415590 - 27415769
Alignment:
Q  277 tcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcct 376  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||   |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | || |    
T  27415590 tcaaaagttgtggatgtgccaaagggatatcttgcagtgtatgttggaaaacaaa---agcgatttgtgatccccatatcatacttgaaccaaccatcgt 27415686  T
Q  377 ttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 459  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27415687 ttcaagacttgttgagtcaagctgaggaagagtttggatatgatcattccatgggtggcctcaccattccttgcacagaagat 27415769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 277 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 27570223 - 27570039
Alignment:
Q  277 tcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcct 376  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| ||| |||||| | |||||||| | |||| |||| |    
T  27570223 tcaaaagctgtggatgtgccaaagggatatcttgcagtatatgttggagagaaacagacgcggtatgtgatccccgtatcatacttaagccaaccttcat 27570124  T
Q  377 ttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatat 461  Q
    ||||| ||||  |||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27570123 ttcaagacttgctgagtcaagctgaggaagagttcggatatgatcatcccatgggtggcctcaccattccttgcaccgaagatat 27570039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 267 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 27444978 - 27444763
Alignment:
Q  267 ccaagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaac 366  Q
    |||| |||| |||||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || |||||||||| |    
T  27444978 ccaaacatcttcaaaaggcgtggatgtgccaaagggatatcttgcagtatacgttggagaggaaatgaagaggtttgtgatcccaatatcatacttgagc 27444879  T
Q  367 caagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttca 466  Q
    ||| | || |||||| | ||||||| |||||| |||||| |||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||     
T  27444878 caatcatcatttcaagaattattgaatcaagccgaggaacaattcggatatgaccatccaatgggtggtctcacaattccttgcagagaagacgttttct 27444779  T
Q  467 tggaaattacttctcg 482  Q
    | || |||||||||||    
T  27444778 tagatattacttctcg 27444763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 280 - 452
Target Start/End: Original strand, 27425781 - 27425953
Alignment:
Q  280 aaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttc 379  Q
    ||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||| | || ||||    
T  27425781 aaagctgtggacgtgccaaagggatatcttgcagtatatgttggagagaaacaaaagcggtatgtgatcccaatatcatacttgaaccaaccatcatttc 27425880  T
Q  380 aaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcac 452  Q
    || ||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  27425881 aagacttattgagtcaatttgaggaagagtttggatatgatcatcccatgggtggcctcaccattccttgcac 27425953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 267 - 465
Target Start/End: Original strand, 27557445 - 27557643
Alignment:
Q  267 ccaagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaac 366  Q
    ||||||||| ||||| | |||| |||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  27557445 ccaagcatcttcaaagggtgtggatgtgccaaggggatatcttgccgtatatgttggagaggaaatgaagaggtttgtgatcccaatgtcatacttaaac 27557544  T
Q  367 caagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttc 465  Q
    ||| | || |||||| | ||  ||| |||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| |||||    
T  27557545 caaccatcatttcaagaattgctgaatcaagctgaggaacaatttgaatatgttcatccaatgggtggtctcactattccatgcagagaagatgttttc 27557643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 277 - 459
Target Start/End: Original strand, 27420374 - 27420556
Alignment:
Q  277 tcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcct 376  Q
    |||||| ||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | |||||| | |||||||||| |||| |||| |    
T  27420374 tcaaaatctgtggacgtgccaaagggatatcttgcagtatatgttggagagaaacagacgcggtatttaatccccgtatcatacttgagccaaccttcat 27420473  T
Q  377 ttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 459  Q
    |||||  |||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27420474 ttcaaggcttgctgagtcaagttgaggaagagtttggatatgatcatcccatgggtggcctcaccattccttgcacggaagat 27420556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 297 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 27468481 - 27468319
Alignment:
Q  297 aaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaa 396  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||| || ||  |||||||||  ||||  | |||||||| |||||| |||| |||||| |||| |||||||||    
T  27468481 aaagggctatgttgcggtgtatgttggagagaaactggtgcggtttgtagtccctgtatcatacttaaaccaaccttcatttcaagacttgttgagtcaa 27468382  T
Q  397 gcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 459  Q
     | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27468381 tccgaggaagaatttggatatgatcatcccatgggtggcctcaccattccttgcacggaagat 27468319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 297 - 459
Target Start/End: Original strand, 27503908 - 27504070
Alignment:
Q  297 aaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaa 396  Q
    |||||||||| || | || |||||||||||| || ||  |||||||||  | ||  | ||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||    
T  27503908 aaagggctatgtttccgtgtatgttggagagaaattggcgcggtttgtagttcctgtatcatacttgaaccaaccttcatttcaagacttgttgagtcaa 27504007  T
Q  397 gcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 459  Q
    || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27504008 gccgaggaagagtttggatatgatcatccaatgggtggcctcaccattccttgcaccgaagat 27504070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 297 - 459
Target Start/End: Original strand, 27514877 - 27515039
Alignment:
Q  297 aaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaa 396  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||| || ||  |||||||||  ||||  | ||||||||||| ||| |||| |||||| |||| |||||||||    
T  27514877 aaagggctatgttgcggtgtatgttggagagaaactggtgcggtttgtagtccctgtatcatacttgaatcaaccttcatttcaagacttgttgagtcaa 27514976  T
Q  397 gcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 459  Q
     | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27514977 tccgaggaagaatttggatatgatcatcccatgggtggcctcaccattccttgtacagaagat 27515039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 337 - 459
Target Start/End: Original strand, 27412690 - 27412812
Alignment:
Q  337 cggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcc 436  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||| | |  |||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27412690 cggtttgtgatcccaatatcatacttgaaccaaccattatttcaagacttattgagtcaagctgaagaagagtttggatatgatcatccaatgggtggcc 27412789  T
Q  437 tcacgattccttgcacagaagat 459  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  27412790 tcaccattccttgcacggaagat 27412812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 288 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 27431311 - 27431117
Alignment:
Q  288 gaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaactta 387  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||| | || |||||| | ||     
T  27431311 gaatgtgccaaagggatatattgcagtatatgttggggatgaaatgaagaggtttgtgatcccaatatcatacttgaaccaaccgtcatttcaagaattg 27431212  T
Q  388 ttgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaaattacttctcg 482  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |||||||||| ||||||  ||||| |  | |||||||||||    
T  27431211 ttgaatcaagccgaggaacaatttggatatgaccatccaaccggtggtctcacaattccttgcagagaagacgttttcttaaatattacttctcg 27431117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 272 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 27526291 - 27526105
Alignment:
Q  272 catcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagc 371  Q
    |||| ||||||| |||  |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||| |    
T  27526291 catcttcaaaaggtgtcgatgttccaaagggatatctagcagtgtatgttggagagaaaatgaagcggtttgtgattcctgtatcatacttgaaccaaac 27526192  T
Q  372 ttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaaga 458  Q
     || || ||| | || ||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27526191 ctcattccaagaattgttgagccaagctgaggaacaatttgaatatgatcatccaacgggtggtctcactattccttgcagagaaga 27526105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 272 - 481
Target Start/End: Original strand, 27486944 - 27487153
Alignment:
Q  272 catcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagc 371  Q
    |||| |||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| || || |||||| |||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||| |    
T  27486944 catcttcaaaagctgtggacgttccaaagggatatctagcagtgtacgtaggagagaaaatgaagcggtttgtgatccctttatcatacttaaaccaacc 27487043  T
Q  372 ttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaa 471  Q
     || |||||| | || ||||  ||||| || ||| |||||| ||||||||| ||||||||||| || || |||||||||| |||||| |||||| | ||     
T  27487044 atcgtttcaagaattgttgaaccaagctgaagaacaatttgaatatgatcatccaatgggtggtcttactattccttgcaaagaagacattttcttagat 27487143  T
Q  472 attacttctc 481  Q
    ||||||||||    
T  27487144 attacttctc 27487153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 272 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 27523582 - 27523373
Alignment:
Q  272 catcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagc 371  Q
    |||| |||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || || |||||| |||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||||||| |    
T  27523582 catcttcaaaagctgtggacgttccaaagggctatctagcagtgtacgtaggagagaaaatgaagcggtttgtgattcctgtatcatatttgaaccaaac 27523483  T
Q  372 ttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaa 471  Q
    ||| || ||| | || |||||  |||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| || || |||||||||| |||||| |||||| | ||     
T  27523482 ttcattccaagaattgttgagcgaagccgaggaacaatttgaatatgaccatccaatgggtggtctaactattccttgcaaagaagacattttcttagat 27523383  T
Q  472 attacttctc 481  Q
    ||||||||||    
T  27523382 attacttctc 27523373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 268 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 27497505 - 27497321
Alignment:
Q  268 caagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaacc 367  Q
    ||||||||||||||| ||||  | || |||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||   ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  27497505 caagcatcatcaaaatctgtagaagttccaaagggctatgttgcagtgtatgttggagataaacaaaagcggtttgtgatccctatctcatacttaaacc 27497406  T
Q  368 aagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcac 452  Q
    || | |  |||||| | || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||||||    
T  27497405 aaccattgtttcaatatttgttgagtcaagctgaggaagagtttggatatgatcatcccacaggtggcctcaccattccttgcac 27497321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 295 - 450
Target Start/End: Original strand, 27498399 - 27498554
Alignment:
Q  295 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 394  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||| | || || ||| |||| ||||  |    
T  27498399 ccaaagggatatctagcagtatatgttggagaggaaatgaaacgttttgtgatccctatatcatacttgaaccaaccatcgttccaagacttgttgaacc 27498498  T
Q  395 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgc 450  Q
    |||| |||||| |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27498499 aagccgaggaacaattcgaatatgatcatccaatgggtggtctcactattccttgc 27498554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 297 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 27475733 - 27475571
Alignment:
Q  297 aaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaa 396  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||| || ||  |||||||||  | ||  | ||||||||||| ||| |||| |||||| |||| |||||||||    
T  27475733 aaagggctatgttgccgtgtatgttggagagaaattggcgcggtttgtagttcctgtatcatacttgaatcaaccttcatttcaagacttgttgagtcaa 27475634  T
Q  397 gcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 459  Q
    || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  27475633 gccgaggaagagtttggatatgatcatcccatgggtggcctcaccattccttgctccgaagat 27475571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 295 - 465
Target Start/End: Original strand, 27479885 - 27480055
Alignment:
Q  295 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 394  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| ||||| || ||  | ||||||||||||||| | || || ||||| || ||||  |    
T  27479885 ccaaaaggctatctagcagtatacgtaggagagaaaatgaagcgttttgtgattcctgtatcatacttgaaccaaacatcattccaaaagttgttgaacc 27479984  T
Q  395 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttc 465  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  27479985 aagctgaggaacaatttgaatatgatcatccaatgggtggtctcaccattccttgcagagaagacattttc 27480055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 295 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 27486099 - 27485937
Alignment:
Q  295 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 394  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | |  |||||| | ||  |   ||    
T  27486099 ccaaagggctatgttgcagtgtatgttggagagaaacagaagcggtttgttgtcccaatatcatacttgaaccaaccattgtttcaagaattgctacatc 27486000  T
Q  395 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaag 457  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27485999 aagcggaagaagaatttggatatgatcatcccatgggtggcctcaccattccttgcactgaag 27485937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 295 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 27479039 - 27478875
Alignment:
Q  295 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 394  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | |  |||||| | ||  |   ||    
T  27479039 ccaaagggctatgttgcagtgtatgttggagagaaacagaagcggtttgttgtcccaatatcatacttgaaccaaccattgtttcaagaattgctacatc 27478940  T
Q  395 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 459  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  27478939 aagcggaagaagaatttggatatgatcatcccatgggtggcctcaccattccttgctccgaagat 27478875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 297 - 459
Target Start/End: Original strand, 27508838 - 27509000
Alignment:
Q  297 aaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaa 396  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||| ||| |||||  | ||  ||||||| ||||||||| |||| |||||| |||| |||| |||     
T  27508838 aaagggctatgttgcagtgtatgttggagagaaactgacgcgttttgtcgttcctgtgtcatatttgaaccaaccttcatttcaagacttgttgaatcag 27508937  T
Q  397 gcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 459  Q
    || |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  27508938 gctgaggaagagtttggatatgatcatccaacgggtggcctcaccattccatgctccgaagat 27509000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 272 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 27513955 - 27513769
Alignment:
Q  272 catcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagc 371  Q
    |||| |||||||||||  | || ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |    
T  27513955 catcttcaaaagctgttgacgtgccaaaaggatatctagcagtgtatgtaggagagaaaatgaagcggtttgtgatcccaatatcatacttgaaccaaac 27513856  T
Q  372 ttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaaga 458  Q
     || || ||| | || ||||  ||||| || ||| ||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27513855 ctcgttccaagaattgttgaaccaagctgaagaacaatatgaatatgatcatccaatgggtggtctcactattccttgcagagaaga 27513769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 297 - 459
Target Start/End: Original strand, 27524510 - 27524672
Alignment:
Q  297 aaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaa 396  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||| || ||| ||||||  |  | ||  | ||||| ||||||||| |||| |||||| |||| |||| ||||    
T  27524510 aaagggctacgttgcagtgtatgttggagagaaactgacgcggttcatagttcctgtatcatatttgaaccaaccttcatttcaagacttgttgaatcaa 27524609  T
Q  397 gcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 459  Q
    || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  27524610 gctgaggaagagtttggatatgatcatccaatgggtggcctcaccattccgtgcaccgaagat 27524672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 290 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 27502968 - 27502775
Alignment:
Q  290 atgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttatt 389  Q
    |||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||| | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||||  |    
T  27502968 atgtgccaaaaggatatcttgccgtttatgtaggagagaagatgaagcggtttgtgattccaatgtcatatttgaatcaaacttcatttcaagacttgct 27502869  T
Q  390 gagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaaattacttctcgc 483  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||   ||||||| ||||| | || || |||||||||    
T  27502868 gagccaagctgtggaagaatttggatatgaccatccaatgggtggtcttactattccttgtgaagaagattttttcgtagatatcacttctcgc 27502775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 278 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 27563519 - 27563338
Alignment:
Q  278 caaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctt 377  Q
    |||||| |||| | || |||||||||||||||||||| || ||||||||  ||   ||| |  |||| |||||| | ||||||||||||||| | |  ||    
T  27563519 caaaagttgtggacgtgccaaagggctatcttgcagtgtacgttggagataaacaaaagagaattgtgatccccgtatcatacttgaaccaaacattgtt 27563420  T
Q  378 tcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 459  Q
    |||| | ||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27563419 tcaagatttgctgagtcaagccgaagaagagtttggatatgatcatccaatgggtggcctcacaattccttgcactgaagat 27563338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 458
Target Start/End: Original strand, 27501301 - 27501464
Alignment:
Q  295 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 394  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||| | |  |||||| |||| ||||  |    
T  27501301 ccaaagggatgtctagcagtatatgttggagaggaaatgaaacggtttgtgatcccaatatcatacttaaaccaaccattgtttcaagacttgttgaacc 27501400  T
Q  395 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaaga 458  Q
    |||| |||||| |||||| ||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||    
T  27501401 aagccgaggaacaatttgaatacgatcatccaacgggtggtctcactattccttgtagagaaga 27501464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 267 - 482
Target Start/End: Original strand, 27554265 - 27554480
Alignment:
Q  267 ccaagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaac 366  Q
    ||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | || || |  || | |    
T  27554265 ccaagcatcttcaaaaggagtggatgtgccaaagggataccttgcagtatatgttggagaggaaatgaagcggtttgtgatatcaatttctttgttaagc 27554364  T
Q  367 caagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttca 466  Q
    ||| | || |||||| | ||  ||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||| | ||||| |||||||| | ||||||  |||||     
T  27554365 caaccatcgtttcaagaattgctgaatcaagctgaggaacaatttggatatgatcatccaacgggtagtctcacaattccttgtagagaagacgttttct 27554464  T
Q  467 tggaaattacttctcg 482  Q
    | || |||||||||||    
T  27554465 tagatattacttctcg 27554480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 295 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 27505858 - 27505688
Alignment:
Q  295 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 394  Q
    |||||||| ||||| ||||| || || |||||| |||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||| | || || ||| | || ||||  |    
T  27505858 ccaaaggggtatctagcagtgtacgtaggagagaaaatgaagcggtttgtgattcctgtatcatacttgaaccaaacctcattccaagaattgttgaacc 27505759  T
Q  395 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttc 465  Q
    |||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  27505758 aagctgaggaacaatttgaatatgaccatccaatgggtggtctcactattccttgcagagaagagattttc 27505688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 272 - 465
Target Start/End: Original strand, 27469421 - 27469614
Alignment:
Q  272 catcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagc 371  Q
    |||| |||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |    
T  27469421 catcttcaaaagctgtggacgttccaaagggatatctagcagtgtacgtaggagagaaaatgaagcggtttgtgatccctatatcatatttgaagcaaac 27469520  T
Q  372 ttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttc 465  Q
     || || ||| |  | ||||| ||||| || ||| |||||| |||||| || ||||||||||| || || |||||||||| |||||| ||||||    
T  27469521 atcattacaagaactgttgagccaagctgaagaacaatttgaatatgaacatccaatgggtggtctaactattccttgcagagaagaaattttc 27469614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 295 - 459
Target Start/End: Original strand, 27506682 - 27506846
Alignment:
Q  295 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 394  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||  || ||||||||| ||||| || |||||||| |||||| | |  |||||| | ||  |   ||    
T  27506682 ccaaagggctatgttgcagtatatgtcggagagaaacagacgcggtttgtgatcccaatatcatacttaaaccaaccattgtttcaagaattgctacatc 27506781  T
Q  395 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 459  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  27506782 aagcggaagaagaatttggatatgatcatcccatgggtggactcaccattccttgcactgaagat 27506846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 295 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 27556535 - 27556379
Alignment:
Q  295 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 394  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||||||| |||| |||||| | ||| |   ||    
T  27556535 ccaaaaggctatctcgcagtttatgttggagaaaaaatgaagcgatttgtgattcccatttcattattgaaccaaccttcatttcaagaattactacatc 27556436  T
Q  395 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgca 451  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  27556435 aagcagaagaagaatttggatatgatcattctatgggtggtctcacaattccatgca 27556379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 277 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 27566125 - 27565953
Alignment:
Q  277 tcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcct 376  Q
    ||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||   ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| | |  |    
T  27566125 tcaaaagttgtggacgtgccaaagggatatcttgcagtgtatgttggagagaaacaaaagcgatttgtgatccccatatcatacctgaaccaaccattgt 27566026  T
Q  377 ttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttg 449  Q
    ||||| ||||  |||  ||||  ||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27566025 ttcaagacttgctgatacaagttgaggaagagcatggatatgatcatccaatgggtggcctcaccattccttg 27565953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 465
Target Start/End: Original strand, 27423206 - 27423376
Alignment:
Q  295 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 394  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||| || ||  ||  |||  ||| |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||| | || |||||||    
T  27423206 ccaaagagatatcttgctgtatatgttggatagaaacagacacggcatgtgatccgcatatcatacttgaaccaaccttcatttcaagaattgttgagtc 27423305  T
Q  395 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttc 465  Q
    |||| |||||||| ||||| ||  |||| || ||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  27423306 aagccgaggaagagtttggttacaatcatcccatgggtggcctcaccgttccttgcacggaagatgttttc 27423376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 481
Target Start/End: Original strand, 27476671 - 27476857
Alignment:
Q  295 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 394  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||| | || || ||| |  |  |||| |    
T  27476671 ccaaagggatatctagcagtgtatgttggtgagaaaatgaagcggtttgtgattcctgtatcatacttgaaccaaacctcattccaagaactgctgagcc 27476770  T
Q  395 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaaattacttctc 481  Q
    ||   |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| || || |||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||||    
T  27476771 aaagtgaggaacaatttgaatatgatcatccaatgggtggtctaactattccttgcagagaagacattttcttggatattacctctc 27476857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 297 - 447
Target Start/End: Original strand, 27489946 - 27490096
Alignment:
Q  297 aaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaa 396  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||   || ||||||||  ||||  |||||||||| ||| || | || |||||| | || |||| ||||    
T  27489946 aaagggctatgttgtagtgtatgttggagagaaacaaaaacggtttgtagtccctgtgtcatacttaaacaaaccatcatttcaagatttgttgaatcaa 27490045  T
Q  397 gcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattcct 447  Q
    || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27490046 gccgaggaagagtttggatatgatcatccaatgggtggcctcaccattcct 27490096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 27411612 - 27411456
Alignment:
Q  295 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 394  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||   |||||  ||||| || || ||  | ||||||||||||||| | || |||||| | ||| | | ||    
T  27411612 ccaaaaggctatctcgcagtctatgttggagatagaatgagacggttcgtgattccagtatcatacttgaaccaaccatcgtttcaagaattactaaatc 27411513  T
Q  395 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgca 451  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  27411512 aagcagaagaagaatttggatatgatcatcctatgggtggtctcacaattccttgca 27411456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 27414460 - 27414304
Alignment:
Q  295 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 394  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||  |||||||| || ||  | ||||||||||||||| | || |||||| | ||| | | ||    
T  27414460 ccaaaaggctatcttgcagtctacgttggagataaaatgagacggtttgtgattcctgtatcatacttgaaccaaccctcatttcaagaattactaaatc 27414361  T
Q  395 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgca 451  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  27414360 aatcagaagaagaatttggatatgatcatccaatgggtggtcttacaattccgtgca 27414304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 27424670 - 27424514
Alignment:
Q  295 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 394  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||  | ||||||||||||||| |||| |||||| | ||  | | ||    
T  27424670 ccaaaaggctatctcgcagtctatgttggagatcaaatgaggcggtttgtgattccagtatcatacttgaaccaaccttcatttcaagaattgctaaatc 27424571  T
Q  395 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgca 451  Q
    || | || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  27424570 aatctgaagaagaatatggatatgatcatccaatgggtggtcttaccattccgtgca 27424514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 27559396 - 27559240
Alignment:
Q  295 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 394  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| | ||| | || || || ||||  ||||| ||| |||| |||||| | ||||| || |    
T  27559396 ccaaaaggctatctcgcagtttatgttggagacaaaatgaagagatttctgattcctatttcattattgaatcaatcttcatttcaatagttattaagcc 27559297  T
Q  395 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgca 451  Q
    || |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27559296 aatcagaagaagagtttggatatgatcatccaatgggtggtctcacaattccttgca 27559240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 340 - 459
Target Start/End: Original strand, 27585717 - 27585836
Alignment:
Q  340 tttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctca 439  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||| | |  |||||| | ||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  27585717 tttgtgatccccgtatcatacttgaaccaaccattgtttcaagatttgatgagtcaagccgaagaagagtttggatatgatcatccaatgggaggtctca 27585816  T
Q  440 cgattccttgcacagaagat 459  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  27585817 ccattccttgcacagaagat 27585836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 451
Target Start/End: Original strand, 27567239 - 27567395
Alignment:
Q  295 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 394  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||   |||||  ||||| || || ||  | ||||||||||||||| | || |||||| | ||| | | ||    
T  27567239 ccaaaaggctatctcgcagtctatgttggagatagaatgagacggttcgtgattccagtatcatacttgaaccaaccatcgtttcaagaattactaaatc 27567338  T
Q  395 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgca 451  Q
    || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27567339 aaacagaagaagaatttggttatgatcatccaatgggtggtctcacaattccttgca 27567395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 292 - 431
Target Start/End: Original strand, 27527142 - 27527281
Alignment:
Q  292 gtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattga 391  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||  ||| |||||||| ||||| || ||| |||| |||||| | || |||| | | ||  |||    
T  27527142 gtaccaaagggctatcttgcggtgtatgttggagataaacagaaacggtttgtgatcccaatatcacacttaaaccaaccatcgtttctagagttgctga 27527241  T
Q  392 gtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatggg 431  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  27527242 gtcaagctgaggaagagtttggatatgatcatcccatggg 27527281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 450
Target Start/End: Original strand, 27571607 - 27571762
Alignment:
Q  295 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 394  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||   ||||| |||||| || || ||  | ||||| |||| |||  | || |||||| | ||| | | ||    
T  27571607 ccaaaaggctatctcgcagtctatgttggagatagaatgaggcggttcgtgattccagtatcatatttgagccagccatcgtttcaagaattactaaatc 27571706  T
Q  395 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgc 450  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27571707 aatcagaagaagaatttggatatgatcatccaatgggtggtctcacaattccttgc 27571762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 400 - 470
Target Start/End: Original strand, 27460567 - 27460637
Alignment:
Q  400 gaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatgga 470  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  27460567 gaggaacaatttgaatatgatcatccaatgggtggtctcaccattccttgcagagaagacattttcttgga 27460637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 27419227 - 27419072
Alignment:
Q  295 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 394  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||   ||||| |||||| || || ||  | ||||| |||| |||  | || |||||| | ||| | | ||    
T  27419227 ccaaaaggctatctcgcagtctatgttggagatagaatgaggcggttcgtgattccagtatcatatttgagccagccatcgtttcaagaattactaaatc 27419128  T
Q  395 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgc 450  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  27419127 aatcagaagaagaatttggatatgatcatccaatgggtggtcttacaattccttgc 27419072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 394 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 27502192 - 27502121
Alignment:
Q  394 caagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttc 465  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| || || |||||||||| |||||| ||||||    
T  27502192 caagctgaggaacaatttgaatatgatcatccaatgggtggtctaactattccttgcagagaagacattttc 27502121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 465
Target Start/End: Original strand, 27446131 - 27446301
Alignment:
Q  295 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 394  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||| || || |  ||||  ||||| ||| |||| |||||| | |  || || |    
T  27446131 ccaaaaggctatcttgcggtttatgttggagaaaaaatgaagcgatttgtgattccaacttcattattgaatcaaccttcatttcaagagtcgttaagcc 27446230  T
Q  395 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttc 465  Q
    || |||| ||||| |||| ||||||||| | ||||| ||| ||| ||||||||||||  |||||| |||||    
T  27446231 aatcagaagaagagtttgaatatgatcatcgaatggatggtctctcgattccttgcagtgaagatgttttc 27446301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 400 - 458
Target Start/End: Original strand, 27466910 - 27466968
Alignment:
Q  400 gaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaaga 458  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27466910 gaggaacaatttgaatatgatcatccaatgggtggtctcactattccttgcagagaaga 27466968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 403 - 464
Target Start/End: Original strand, 27495628 - 27495689
Alignment:
Q  403 gaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatatttt 464  Q
    ||||| ||||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27495628 gaagagtttggatttaatcatccaatgggtggtctcaccattccttgcagagaagatatttt 27495689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 27422091 - 27421931
Alignment:
Q  295 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 394  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||   |||||| ||||| || || ||  | ||||||||||||||| | |  |||||| | ||| | | ||    
T  27422091 ccaaaaggctatctcgcagtctatgttggagatagaatgaaacggttcgtgattccagtatcatacttgaaccaaccattatttcaagaattactaaatc 27421992  T
Q  395 aagcagaggaagaatt----tggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgca 451  Q
    ||||||| ||||||||    |||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  27421991 aagcagaagaagaatttggatggatacgatcatccaacgggtggtctcacaattccttgca 27421931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 483
Target Start/End: Original strand, 27473981 - 27474064
Alignment:
Q  400 gaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaaattacttctcgc 483  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||  ||||| | || || |||||||||    
T  27473981 gaggaacaatttgaatatgatcatccaatgggtggtctcaccattccttgcggagaagacgttttcttagacatcacttctcgc 27474064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 27507935 - 27507781
Alignment:
Q  329 aaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaat 428  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||  ||||| | ||  | || || || |  ||||||||||||||||| || |||||    
T  27507935 aaatgaagcggtttgtaattccaatgtcatatttgaatcaaacttcacttcaagagttgctcagccaggctgtcgaagaatttggatatgaccatccaat 27507836  T
Q  429 gggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaaattacttctcgc 483  Q
    |||||| || || ||||||||   ||||||| ||||| | || || |||||||||    
T  27507835 gggtggtcttacaattccttgtgaagaagatcttttcttagatatcacttctcgc 27507781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 403 - 459
Target Start/End: Original strand, 27600645 - 27600701
Alignment:
Q  403 gaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 459  Q
    ||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  27600645 gaagaatttggttacaatcatccaatgggtggtctcacaattccttgcaaagaagat 27600701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 289 - 464
Target Start/End: Original strand, 3073547 - 3073722
Alignment:
Q  289 aatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttat 388  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||| |||||| ||||      
T  3073547 aatgtgccaaagggatatcttgcggtgtacgttggagaggaaatgaagcggtttgtgatccctacgtcatacttgaaccaaacttcatttcaatacttgc 3073646  T
Q  389 tgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatatttt 464  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3073647 tgagtcgggcagaggaagaattcggatacgatcatccaatgggtggcctcacaattccttgcacagaagatgtttt 3073722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University