View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18950_low_8 (Length: 511)

Name: NF18950_low_8
Description: NF18950
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18950_low_8
NF18950_low_8
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (7-511)||(16743992-16744498)
chr3 (101-389)||(17912483-17912771)
chr3 (95-462)||(2049777-2050147)
chr3 (95-462)||(14842487-14842856)
chr3 (85-462)||(13838852-13839232)
chr3 (95-462)||(12030073-12030443)
chr3 (84-415)||(15858996-15859331)
chr3 (84-399)||(51158008-51158325)
chr3 (224-389)||(2449238-2449404)
chr3 (95-382)||(15936634-15936922)
chr3 (327-510)||(19231982-19232169)
chr3 (95-382)||(15938476-15938764)
chr3 (102-377)||(15614808-15615085)
chr3 (343-462)||(19260749-19260869)
chr3 (8-169)||(15468555-15468717)
chr3 (257-389)||(13975722-13975853)
chr3 (257-389)||(45860937-45861068)
chr3 (95-389)||(13954890-13955185)
chr3 (8-169)||(22275088-22275250)
chr3 (102-237)||(47984624-47984759)
chr3 (102-237)||(48003198-48003333)
chr3 (102-237)||(47993911-47994046)
chr3 (102-237)||(48012484-48012619)
chr3 (428-505)||(15857120-15857198)
chr3 (431-510)||(3992873-3992953)
chr3 (87-355)||(16821099-16821369)
chr3 (431-510)||(55513193-55513273)
chr3 (7-69)||(2449391-2449453)
chr3 (95-377)||(55316187-55316471)
chr3 (431-510)||(2844514-2844594)
chr3 (95-377)||(41270043-41270327)
chr3 (431-510)||(54037976-54038056)
chr3 (431-510)||(17955832-17955916)
chr3 (431-510)||(7854305-7854385)
chr3 (95-147)||(19231945-19231997)
chr3 (431-491)||(45581954-45582016)
chr3 (95-169)||(13975944-13976017)
chr3 (95-157)||(45860773-45860834)
chr3 (332-373)||(14080715-14080756)
chr3 (451-503)||(12031852-12031904)
chr3 (451-503)||(17205024-17205076)
chr3 (84-116)||(22144532-22144564)
chr3 (127-245)||(12264932-12265050)
chr3 (451-503)||(17191884-17191936)
chr3 (8-88)||(18969968-18970048)
chr3 (451-503)||(38810868-38810920)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (7-389)||(22907214-22907597)
chr8 (102-462)||(16193643-16194005)
chr8 (95-510)||(16404852-16405268)
chr8 (95-462)||(43373392-43373761)
chr8 (85-462)||(24928716-24929096)
chr8 (224-389)||(5238184-5238350)
chr8 (224-389)||(24661248-24661414)
chr8 (224-389)||(43685643-43685809)
chr8 (98-389)||(17345540-17345832)
chr8 (102-377)||(24548956-24549233)
chr8 (102-377)||(6774258-6774535)
chr8 (95-355)||(21844594-21844856)
chr8 (95-355)||(21851987-21852249)
chr8 (7-69)||(5238135-5238197)
chr8 (7-69)||(24661401-24661463)
chr8 (95-377)||(30120690-30120974)
chr8 (7-69)||(43685594-43685656)
chr8 (431-510)||(274766-274846)
chr8 (431-510)||(641003-641083)
chr8 (431-510)||(826809-826889)
chr8 (431-510)||(24716714-24716794)
chr8 (95-314)||(222754-222975)
chr8 (95-314)||(736377-736598)
chr8 (95-314)||(860272-860493)
chr8 (85-239)||(23837154-23837308)
chr8 (257-377)||(16674392-16674512)
chr8 (431-510)||(39115598-39115678)
chr8 (87-168)||(13662481-13662561)
chr8 (99-148)||(16674624-16674672)
chr8 (332-373)||(23226076-23226117)
chr8 (84-121)||(41246613-41246650)
chr8 (8-65)||(22321597-22321654)
chr8 (451-503)||(17285548-17285600)
chr8 (451-503)||(21198005-21198057)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (7-389)||(26680080-26680463)
chr4 (84-510)||(54118120-54118551)
chr4 (84-462)||(13246386-13246769)
chr4 (99-462)||(15675009-15675381)
chr4 (257-462)||(122020-122226)
chr4 (102-362)||(31115603-31115865)
chr4 (224-389)||(10488659-10488825)
chr4 (224-389)||(16327926-16328092)
chr4 (99-462)||(10104170-10104523)
chr4 (95-355)||(10644187-10644449)
chr4 (257-389)||(13048221-13048353)
chr4 (95-226)||(111362-111493)
chr4 (327-462)||(33240901-33241043)
chr4 (95-377)||(47357622-47357906)
chr4 (431-510)||(25119059-25119139)
chr4 (7-69)||(10488610-10488672)
chr4 (13-69)||(16328079-16328135)
chr4 (431-510)||(5682380-5682460)
chr4 (98-173)||(7849970-7850044)
chr4 (192-373)||(40885570-40885753)
chr4 (145-239)||(41166083-41166177)
chr4 (95-239)||(15044794-15044938)
chr4 (84-116)||(44055870-44055902)
chr4 (124-239)||(8374504-8374619)
chr4 (95-239)||(15109486-15109630)
chr4 (124-245)||(17145796-17145917)
chr4 (175-239)||(13809647-13809711)
chr4 (451-503)||(41165808-41165860)
chr4 (451-503)||(47534933-47534985)
chr4 (128-239)||(52265645-52265757)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (7-389)||(7292896-7293279)
chr7 (83-462)||(13036938-13037322)
chr7 (95-462)||(16211733-16212103)
chr7 (95-503)||(3059933-3060344)
chr7 (95-462)||(36052634-36053003)
chr7 (95-462)||(11580661-11581035)
chr7 (102-389)||(47481031-47481320)
chr7 (224-389)||(11516324-11516490)
chr7 (224-389)||(15441564-15441730)
chr7 (224-389)||(30262129-30262295)
chr7 (95-382)||(18253842-18254130)
chr7 (102-388)||(13320988-13321278)
chr7 (98-354)||(16478985-16479244)
chr7 (257-389)||(25292338-25292470)
chr7 (95-355)||(13572644-13572906)
chr7 (95-355)||(2437425-2437687)
chr7 (95-377)||(10989378-10989661)
chr7 (7-69)||(15441717-15441779)
chr7 (7-69)||(30262282-30262344)
chr7 (98-454)||(295900-296257)
chr7 (113-355)||(13911046-13911292)
chr7 (431-510)||(32493898-32493978)
chr7 (7-69)||(11516275-11516337)
chr7 (431-510)||(126738-126818)
chr7 (431-510)||(1936869-1936949)
chr7 (431-510)||(111121-111201)
chr7 (347-389)||(14113989-14114031)
chr7 (347-389)||(14423639-14423681)
chr7 (451-503)||(13377872-13377924)
chr7 (451-503)||(13389698-13389750)
chr7 (84-116)||(15822691-15822723)
chr7 (451-510)||(7283908-7283967)
chr7 (95-169)||(25292560-25292633)
chr7 (451-503)||(16919874-16919926)
chr7 (84-239)||(17224075-17224230)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (14-389)||(37066-37442)
scaffold0078 (431-510)||(41632-41712)
[»] chr1 (25 HSPs)
chr1 (98-511)||(41394191-41394608)
chr1 (95-462)||(20445646-20446019)
chr1 (95-450)||(20531411-20531770)
chr1 (95-462)||(20931312-20931682)
chr1 (84-462)||(20893551-20893933)
chr1 (95-462)||(20913004-20913367)
chr1 (95-462)||(37844374-37844746)
chr1 (224-389)||(51452589-51452755)
chr1 (95-339)||(22227777-22228022)
chr1 (95-339)||(22232474-22232719)
chr1 (102-355)||(2116228-2116484)
chr1 (257-355)||(45051554-45051652)
chr1 (7-69)||(51452540-51452602)
chr1 (431-510)||(21860334-21860414)
chr1 (431-504)||(44034829-44034903)
chr1 (95-355)||(18601140-18601402)
chr1 (102-182)||(45051416-45051496)
chr1 (95-377)||(5072388-5072672)
chr1 (451-510)||(41218749-41218808)
chr1 (451-503)||(27675139-27675191)
chr1 (85-116)||(49967607-49967638)
chr1 (447-503)||(20177513-20177570)
chr1 (124-205)||(20254308-20254389)
chr1 (451-503)||(13376711-13376763)
chr1 (127-206)||(22143531-22143611)
[»] chr2 (31 HSPs)
chr2 (84-510)||(19794581-19795011)
chr2 (95-510)||(43642833-43643250)
chr2 (95-462)||(36982364-36982737)
chr2 (95-510)||(20627190-20627609)
chr2 (95-462)||(462706-463075)
chr2 (95-456)||(8891209-8891574)
chr2 (99-462)||(24341309-24341681)
chr2 (224-389)||(19689401-19689567)
chr2 (224-389)||(23820168-23820334)
chr2 (224-389)||(14906440-14906606)
chr2 (102-389)||(25265390-25265679)
chr2 (224-389)||(20015108-20015274)
chr2 (98-339)||(7507894-7508138)
chr2 (257-389)||(17396653-17396784)
chr2 (95-377)||(19886661-19886945)
chr2 (369-462)||(22863171-22863267)
chr2 (431-510)||(22275045-22275125)
chr2 (431-510)||(22284278-22284358)
chr2 (432-510)||(15633538-15633617)
chr2 (7-69)||(14906593-14906655)
chr2 (7-69)||(20015059-20015121)
chr2 (7-69)||(23820119-23820181)
chr2 (24-69)||(19689554-19689599)
chr2 (447-503)||(19660217-19660273)
chr2 (95-157)||(17396887-17396948)
chr2 (451-503)||(43646237-43646289)
chr2 (124-206)||(19669279-19669362)
chr2 (145-205)||(9636761-9636821)
chr2 (127-206)||(19666525-19666605)
chr2 (161-205)||(24884718-24884762)
chr2 (84-116)||(32465813-32465845)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (95-462)||(1091-1462)
scaffold0266 (95-462)||(3508-3877)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (95-462)||(48565-48935)
scaffold0023 (99-355)||(36065-36323)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (95-463)||(36836-37209)
scaffold0077 (451-510)||(15319-15378)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (95-454)||(19173-19537)
scaffold0195 (95-389)||(21257-21553)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (84-462)||(23153403-23153786)
chr6 (102-418)||(14626089-14626407)
chr6 (95-389)||(35009439-35009735)
chr6 (98-389)||(1657748-1658040)
chr6 (98-389)||(15862443-15862734)
chr6 (102-377)||(1650105-1650382)
chr6 (98-231)||(27740808-27740941)
chr6 (95-349)||(25175531-25175787)
chr6 (95-377)||(27653983-27654267)
chr6 (431-510)||(19983144-19983224)
chr6 (431-510)||(35015009-35015089)
chr6 (394-462)||(23148266-23148335)
chr6 (84-238)||(18381821-18381975)
chr6 (95-148)||(16825986-16826038)
chr6 (306-389)||(27751605-27751688)
chr6 (431-510)||(18583640-18583720)
chr6 (451-503)||(21623511-21623563)
chr6 (109-215)||(22361926-22362032)
chr6 (192-389)||(29665937-29666137)
chr6 (84-113)||(32898745-32898774)
chr6 (84-239)||(21623123-21623278)
chr6 (451-503)||(22361619-22361671)
chr6 (175-239)||(25367374-25367438)
chr6 (127-206)||(33324690-33324770)
chr6 (127-206)||(35136182-35136262)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (95-462)||(23506932-23507302)
chr5 (84-462)||(27182471-27182854)
chr5 (103-462)||(18530988-18531355)
chr5 (99-462)||(22053753-22054125)
chr5 (224-389)||(20623066-20623232)
chr5 (224-389)||(21233528-21233694)
chr5 (227-389)||(37052844-37053007)
chr5 (224-389)||(16536294-16536460)
chr5 (98-389)||(34939248-34939540)
chr5 (224-387)||(25900408-25900571)
chr5 (95-377)||(22366481-22366765)
chr5 (95-377)||(25426596-25426880)
chr5 (95-355)||(18778014-18778276)
chr5 (95-377)||(12342-12626)
chr5 (95-377)||(19499867-19500151)
chr5 (7-69)||(20623017-20623079)
chr5 (95-377)||(21073595-21073879)
chr5 (7-69)||(21233681-21233743)
chr5 (114-355)||(4200007-4200251)
chr5 (85-169)||(17471803-17471887)
chr5 (95-355)||(27009809-27010071)
chr5 (257-377)||(29188284-29188404)
chr5 (95-355)||(43443417-43443679)
chr5 (7-69)||(25900558-25900620)
chr5 (7-69)||(37052792-37052854)
chr5 (102-175)||(29190479-29190552)
chr5 (7-69)||(16536245-16536307)
chr5 (451-505)||(11584394-11584448)
chr5 (127-239)||(23493916-23494029)
chr5 (175-239)||(7728466-7728530)
chr5 (451-503)||(21222462-21222514)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (84-462)||(41686-42066)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (95-462)||(882-1250)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (95-462)||(128095-128464)
scaffold0008 (114-355)||(31697-31942)
scaffold0008 (88-116)||(22650-22678)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (95-462)||(5990-6358)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (95-462)||(247366-247738)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (95-462)||(123087-123460)
scaffold0011 (84-116)||(255074-255106)
scaffold0011 (84-116)||(261680-261712)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (85-462)||(171863-172242)
scaffold0001 (85-462)||(177566-177945)
scaffold0001 (84-116)||(70882-70914)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (95-462)||(12083-12450)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (95-453)||(4996-5356)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (99-451)||(8820-9180)
scaffold0025 (95-421)||(148688-149018)
scaffold0025 (369-462)||(146844-146938)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (95-462)||(8846-9215)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (95-462)||(26340-26710)
scaffold0162 (102-389)||(8180-8466)
scaffold0162 (451-503)||(6877-6929)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (85-462)||(271983-272362)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (257-450)||(51121-51314)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (224-389)||(26892-27058)
scaffold0141 (224-382)||(22637-22796)
scaffold0141 (7-69)||(22588-22650)
scaffold0141 (7-69)||(26843-26905)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (224-389)||(1582-1748)
scaffold0124 (7-69)||(1735-1797)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (95-382)||(48155-48443)
scaffold0049 (451-510)||(20513-20572)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (95-382)||(107715-108003)
scaffold0026 (95-320)||(64585-64812)
scaffold0026 (332-374)||(89863-89905)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (102-389)||(13480-13769)
scaffold0132 (431-510)||(42677-42754)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (102-389)||(41622-41911)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (97-389)||(534-828)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (98-389)||(34460-34755)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (257-462)||(89378-89586)
scaffold0028 (338-462)||(107708-107835)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (102-355)||(9371-9626)
scaffold0215 (102-355)||(16269-16524)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (102-378)||(2936-3215)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (84-226)||(9338-9480)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (95-339)||(5254-5498)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (257-382)||(5660-5785)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (95-339)||(3690-3936)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (95-354)||(42965-43226)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (95-355)||(14083-14344)
scaffold0139 (95-355)||(21138-21399)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (95-355)||(3-265)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (257-355)||(13347-13445)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (95-217)||(48482-48603)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (431-510)||(80187-80267)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (95-217)||(26-147)
[»] scaffold0016 (4 HSPs)
scaffold0016 (430-510)||(166116-166197)
scaffold0016 (430-504)||(162036-162111)
scaffold0016 (451-503)||(116410-116462)
scaffold0016 (83-202)||(116687-116806)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (431-510)||(31132-31212)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (431-504)||(5735-5809)
scaffold0686 (431-504)||(5941-6015)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (430-510)||(304-385)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (127-339)||(54415-54630)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (257-377)||(1304-1424)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (103-182)||(3183-3262)
scaffold0361 (306-389)||(3370-3453)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (95-148)||(1815-1867)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (84-239)||(76984-77139)
scaffold0053 (451-503)||(76699-76751)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (451-510)||(1721-1780)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (451-510)||(19802-19861)
scaffold0122 (451-510)||(24106-24165)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (84-121)||(132505-132542)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (451-503)||(35821-35873)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (104-239)||(197390-197525)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (127-205)||(104793-104872)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (451-501)||(114-164)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (109-206)||(10642-10739)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (451-505)||(6261-6315)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (145-206)||(2471-2532)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (332-373)||(1546-1587)
scaffold0456 (332-373)||(8691-8732)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (84-113)||(7522-7551)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (332-373)||(8216-8257)
scaffold0123 (127-206)||(8007-8087)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (264-382)||(56106-56226)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (332-373)||(70307-70348)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (84-113)||(38253-38282)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (451-503)||(447-499)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (152-216)||(2548-2612)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (451-503)||(1363-1415)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 403; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 16744498 - 16743992
Alignment:
7 acatcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaattcacaaatttcaccaaaac 106  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
16744498 acatcaactatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatttcaccaaaac 16744399  T
107 accaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
16744398 accaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaacaacatcaattg 16744299  T
207 cacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatcta 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| ||    
16744298 cacaagaatcatagctcaattcaactataacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaattta 16744199  T
306 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcataca 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
16744198 accaacaatcatacacttattatcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttaacaacaatcatccataatcaaaattcataca 16744099  T
406 acatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacc-ccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctat 504  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
16744098 acatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacctcgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcactttagctcctat 16743999  T
505 gcttctc 511  Q
    | |||||    
16743998 gattctc 16743992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 101 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 17912771 - 17912483
Alignment:
101 caaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacat 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||||    
17912771 caaaacacccacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacat 17912672  T
201 caattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 299  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
17912671 cgattgaacatgaatcatagctcaattcaactacaacatatcaaattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgt 17912572  T
300 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
17912571 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatc-aagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17912483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 95 - 462
Target Start/End: Original strand, 2049777 - 2050147
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | |    
2049777 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 2049876  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     | ||||||||| |||| ||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || |||| | |||||||||     
2049877 tagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttg 2049976  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
2049977 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 2050076  T
393 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
2050077 caaaattgatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 2050147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 95 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 14842856 - 14842487
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
14842856 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatcca 14842758  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||     
14842757 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttg 14842658  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
14842657 aacatgcaatttcaccaacaatcatacaattatcttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat 14842558  T
393 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    || |||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
14842557 cacaattcatacaacatttgagaatttgcaaagtgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 14842487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 85 - 462
Target Start/End: Original strand, 13838852 - 13839232
Alignment:
85 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatcta 184  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  || ||| || |||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
13838852 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaaatcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaa 13838950  T
185 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 282  Q
    ||| || | | ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||     
13838951 ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttg 13839050  T
283 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 382  Q
    | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
13839051 ttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaat 13839150  T
383 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
13839151 tattcataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 13839232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 95 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 12030443 - 12030073
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| || | |    
12030443 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaacca 12030344  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     | ||||||||| |||||||||| |  |||| | ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||     
12030343 tagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttg 12030244  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
12030243 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 12030144  T
393 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||    
12030143 caaaagtcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataatgattaacccccttacctta 12030073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 84 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 15859331 - 15858996
Alignment:
84 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatct 183  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||     
15859331 caattcaccattttcaccaaaacaacaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 15859232  T
184 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 281  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
15859231 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 15859132  T
282 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 381  Q
     | ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
15859131 gttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaa 15859032  T
382 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa 415  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||    
15859031 ttatccattatgcaaaaattcatacaacaattgaaa 15858996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 84 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 51158325 - 51158008
Alignment:
84 caattcacaaatttcaccaaaacacc-aacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 182  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  |||||||  |||||||  |||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
51158325 caattcacaaattt-agcaaaacacttaacaacatctcaaattaacatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatc 51158227  T
183 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatt 280  Q
     |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||    
51158226 aattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt 51158127  T
281 tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaaca 380  Q
    | ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
51158126 tttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaca 51158027  T
381 atcatccataatcaaaatt 399  Q
    || |||||||| |||||||    
51158026 attatccataagcaaaatt 51158008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 224 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 2449404 - 2449238
Alignment:
224 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
2449404 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 2449305  T
323 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
2449304 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 2449238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 95 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 15936922 - 15936634
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  | || |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
15936922 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 15936824  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
15936823 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 15936724  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 382  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||    
15936723 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 15936634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 327 - 510
Target Start/End: Original strand, 19231982 - 19232169
Alignment:
327 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatt-cacaa 423  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
19231982 atcaattcatgaatataaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaa 19232081  T
424 aatgatgatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
19232082 aatgatgatgattaagataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct 19232169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 95 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 15938764 - 15938476
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  | || |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
15938764 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcagcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 15938666  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
15938665 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 15938566  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 382  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||||||    
15938565 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaat 15938476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 377
Target Start/End: Original strand, 15614808 - 15615085
Alignment:
102 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||    
15614808 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 15614907  T
202 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 299  Q
    |||||  ||||||||| | | ||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| || |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
15614908 aattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 15615007  T
300 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 377  Q
    ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||| || || |||  |||||||||| |||||    
15615008 aatttcaccaacaatcctacaattatcatcaattcatgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagca 15615085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 343 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 19260869 - 19260749
Alignment:
343 aaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggta 442  Q
    ||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
19260869 aaacatatcatcataattagagcacgaatttagcaacaattatccataaaaaaaattcatacaacatttgaaaacttacaaaatgatgatgattatgata 19260770  T
443 aagactaa-ccccttacctta 462  Q
    |||||||| ||||||||||||    
19260769 aagactaacccccttacctta 19260749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15468717 - 15468555
Alignment:
8 catcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaatt-cacaaatttcaccaaaac 106  Q
    ||||| |||| |||| ||| || ||| ||| |||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||    
15468717 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatacattccatcatgtttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaatttcaccaaaac 15468618  T
107 accaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcat 169  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||    
15468617 aacaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcat 15468555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 257 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 13975853 - 13975722
Alignment:
257 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 356  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| |||||||||||||    
13975853 gcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaa 13975755  T
357 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
13975754 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13975722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 257 - 389
Target Start/End: Original strand, 45860937 - 45861068
Alignment:
257 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 356  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| |||||||||||||    
45860937 gcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaa 45861035  T
357 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
45861036 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 45861068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 95 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 13955185 - 13954890
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  | |  ||| | || |||  |    
13955185 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattatcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 13955087  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||  ||||| |  |  ||||||||| |||  ||||||| |||||||||  |||||| ||| |||||    
13955086 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttattt 13954987  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
13954986 aaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatacaa-catatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13954890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 169
Target Start/End: Original strand, 22275088 - 22275250
Alignment:
8 catcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaatt-cacaaatttcaccaaaac 106  Q
    ||||| |||| |||| ||| || ||| ||| ||||| || ||||||||  |||||||||||| | ||||| |||   |||| ||||||||||||||||||    
22275088 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatgtttcaacaacaacatgtcataattcactaatttcacaaatttcaccaaaac 22275187  T
107 accaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcat 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| || | |||||||||    
22275188 accaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacctaagcaatgattcat 22275250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 237
Target Start/End: Original strand, 47984624 - 47984759
Alignment:
102 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 201  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||    
47984624 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatc 47984723  T
202 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 237  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
47984724 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 47984759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 237
Target Start/End: Original strand, 48003198 - 48003333
Alignment:
102 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 201  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||    
48003198 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatc 48003297  T
202 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 237  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
48003298 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 48003333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 237
Target Start/End: Original strand, 47993911 - 47994046
Alignment:
102 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 201  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||| ||| |||| || ||| ||||||    
47993911 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatc 47994010  T
202 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 237  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
47994011 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 47994046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 237
Target Start/End: Original strand, 48012484 - 48012619
Alignment:
102 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 201  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||| ||| |||| || ||| ||||||    
48012484 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatc 48012583  T
202 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 237  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
48012584 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 48012619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 428 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 15857198 - 15857120
Alignment:
428 atgatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 505  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
15857198 atgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaagtattagctctagcttcactttagctcctatg 15857120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Original strand, 3992873 - 3992953
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
3992873 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 3992953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 355
Target Start/End: Original strand, 16821099 - 16821369
Alignment:
87 ttcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctatt 186  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| |  || ||||||| |||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | |    
16821099 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaccatttat-ttatcatcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaat 16821197  T
187 agcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttct 283  Q
    | |||  | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |  |  ||||||| | |||| |||||||  ||||| |||  ||||| |    
16821198 aacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacattttt 16821297  T
284 acatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 355  Q
    |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
16821298 acatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacataacatca 16821369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Original strand, 55513193 - 55513273
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
55513193 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 55513273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 2449453 - 2449391
Alignment:
7 acatcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 69  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
2449453 acatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 2449391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 377
Target Start/End: Original strand, 55316187 - 55316471
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  | |  ||| | || |||  |    
55316187 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 55316285  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
55316286 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 55316385  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 377  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
55316386 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 55316471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Original strand, 2844514 - 2844594
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
2844514 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcaaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 2844594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 377
Target Start/End: Original strand, 41270043 - 41270327
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  | |  ||| | || |||  |    
41270043 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 41270141  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
41270142 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 41270241  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 377  Q
     |||||| |||   |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
41270242 gaacatgtaattccaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 41270327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 54038056 - 54037976
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
54038056 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 54037976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 17955916 - 17955832
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagct----ctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||||| ||||||||| ||||    
17955916 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctacctagcttcacttttgctcctatgattct 17955832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Original strand, 7854305 - 7854385
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
7854305 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 7854385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 147
Target Start/End: Original strand, 19231945 - 19231997
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
19231945 tttcaccaaaacaccaacaacaatccaaattatcatcatcaattcatgaatat 19231997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 491
Target Start/End: Original strand, 45581954 - 45582016
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacccc--ttaccttaattatctccaactactagctctagcttca 491  Q
    ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
45581954 atgattatgataaaaactaaccccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttca 45582016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13976017 - 13975944
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcat 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| | || ||||||    
13976017 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattatcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcat 13975944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 157
Target Start/End: Original strand, 45860773 - 45860834
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||    
45860773 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaa 45860834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 332 - 373
Target Start/End: Original strand, 14080715 - 14080756
Alignment:
332 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
14080715 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 14080756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 503
Target Start/End: Original strand, 12031852 - 12031904
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 503  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
12031852 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 12031904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 503
Target Start/End: Original strand, 17205024 - 17205076
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 503  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
17205024 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 17205076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 22144564 - 22144532
Alignment:
84 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
22144564 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 22144532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12265050 - 12264932
Alignment:
127 tcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 226  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||   || ||||| | || ||||||||  |||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||| |    
12265050 tcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatt 12264951  T
227 tcaactacaacatgtcaaa 245  Q
    ||||| ||||||| |||||    
12264950 tcaacaacaacatatcaaa 12264932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 451 - 503
Target Start/End: Original strand, 17191884 - 17191936
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 503  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | | |||||||||||||||||    
17191884 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaaacttcactttagctccta 17191936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 88
Target Start/End: Original strand, 18969968 - 18970048
Alignment:
8 catcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaatt 88  Q
    ||||| ||||||||| ||| || ||| ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||    
18969968 catcaacaatcaaccacaaccacaacttataatcatgctttccatcagaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 18970048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 451 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 38810920 - 38810868
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 503  Q
    |||||||||||| ||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
38810920 ccccttaccttagttatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 38810868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 7 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 22907597 - 22907214
Alignment:
7 acatcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaattcacaaatttcaccaaaac 106  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
22907597 acatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcaattcacaaatttcaccaaaac 22907498  T
107 accaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22907497 accaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 22907398  T
207 cacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatcta 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||    
22907397 cacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaattta 22907298  T
306 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
22907297 accaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 22907214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 102 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 16194005 - 16193643
Alignment:
102 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 201  Q
    |||||||||||||||  |||||||  |||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||    
16194005 aaaacaccaacaacatctcaaattaacatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc 16193906  T
202 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 299  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||  || |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
16193905 aattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 16193806  T
300 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaatt 399  Q
    ||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
16193805 aatttccccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataagcaaaatt 16193706  T
400 catacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaaccccttacctta 462  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
16193705 catacaatatttgaaaatttaccaaatgatgatgattatgataaagactaaccccttacctta 16193643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 95 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 16405268 - 16404852
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||| || |||    
16405268 tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaa 16405169  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||   ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| | | |||||     
16405168 taacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatttaac---aacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttg 16405072  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||    
16405071 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccatcat 16404972  T
393 --caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaattatctccaactactagctctagctt 489  Q
       ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
16404971 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagctt 16404873  T
490 cactttagctcctatgcttct 510  Q
    |||||| ||||||||| ||||    
16404872 cacttttgctcctatgattct 16404852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 95 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 43373761 - 43373392
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||| |||| || | |    
43373761 tttcaccaaaacaccaacaa---ttcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 43373665  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     | ||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
43373664 tagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 43373565  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||||| ||    
43373564 aacatgtaatttcaccaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagcattaattatccattat 43373465  T
393 --caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
43373464 acaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 43373392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 24929096 - 24928716
Alignment:
85 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatcta 184  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  || ||| || |||  |||||||||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||| |    
24929096 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaaatcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaa 24928998  T
185 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 282  Q
    ||| || | | ||| ||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||| |  | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||     
24928997 ttaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaacttagcgaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttg 24928898  T
283 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 382  Q
    | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
24928897 ttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagcaacaat 24928798  T
383 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccc-ttacctta 462  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
24928797 tatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgacgatgattatgataaagactaaccccattacctta 24928716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 224 - 389
Target Start/End: Original strand, 5238184 - 5238350
Alignment:
224 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
5238184 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 5238283  T
323 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
5238284 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 5238350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 224 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 24661414 - 24661248
Alignment:
224 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
24661414 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 24661315  T
323 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
24661314 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 24661248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 224 - 389
Target Start/End: Original strand, 43685643 - 43685809
Alignment:
224 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
43685643 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 43685742  T
323 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
43685743 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 43685809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 98 - 389
Target Start/End: Original strand, 17345540 - 17345832
Alignment:
98 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||    
17345540 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataa 17345639  T
198 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 295  Q
     ||||| || |||||||||||| |||||||| || | ||| | |  |||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
17345640 tatcaactgaacaagaatcataactcaattc-acaataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac 17345738  T
296 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||    
17345739 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatataaacataacatcacagttagagcacgaatttcgcaacaattatccat 17345832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 102 - 377
Target Start/End: Original strand, 24548956 - 24549233
Alignment:
102 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||    
24548956 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 24549055  T
202 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 299  Q
    |||||  ||||||||| | | ||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
24549056 aattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 24549155  T
300 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 377  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||| |||||    
24549156 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 24549233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 6774535 - 6774258
Alignment:
102 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| ||||||    
6774535 aaaacaccaacaacaaatcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc 6774436  T
202 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 299  Q
    |||||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
6774435 aattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 6774336  T
300 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 377  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||| |||||    
6774335 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 6774258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 21844856 - 21844594
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
21844856 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 21844758  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||| ||| |||| ||||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
21844757 taacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 21844658  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 355  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
21844657 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 21844594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 21852249 - 21851987
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
21852249 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 21852151  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
21852150 taacatcatttgaacaagaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 21852051  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 355  Q
    ||||||  ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
21852050 aaacatttaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 21851987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Original strand, 5238135 - 5238197
Alignment:
7 acatcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 69  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5238135 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 5238197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 24661463 - 24661401
Alignment:
7 acatcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 69  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24661463 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 24661401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 377
Target Start/End: Original strand, 30120690 - 30120974
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
30120690 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattatcatcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 30120788  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||||||| ||| |||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
30120789 taacatcaattgaacatgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 30120888  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 377  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
30120889 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 30120974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Original strand, 43685594 - 43685656
Alignment:
7 acatcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 69  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43685594 acatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 43685656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Original strand, 274766 - 274846
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
274766 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 274846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 641083 - 641003
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
641083 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 641003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 826889 - 826809
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
826889 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 826809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 24716794 - 24716714
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
24716794 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 24716714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 222975 - 222754
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
222975 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 222877  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
222876 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 222777  T
292 aaacatggaatctaaccaacaat 314  Q
     |||||| ||| | |||||||||    
222776 gaacatgtaatttcaccaacaat 222754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 736598 - 736377
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
736598 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 736500  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
736499 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 736400  T
292 aaacatggaatctaaccaacaat 314  Q
     |||||| ||| | |||||||||    
736399 gaacatgtaatttcaccaacaat 736377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 860493 - 860272
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
860493 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 860395  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
860394 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 860295  T
292 aaacatggaatctaaccaacaat 314  Q
     |||||| ||| | |||||||||    
860294 gaacatgtaatttcaccaacaat 860272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 239
Target Start/End: Original strand, 23837154 - 23837308
Alignment:
85 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatct 183  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||  || |||||| |||  ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||     
23837154 aattcaccaatttcacaaaaccaccaccaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatca 23837252  T
184 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 239  Q
     |||||| ||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| |||||||    
23837253 cttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacat 23837308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16674512 - 16674392
Alignment:
257 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 356  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  || |||||||||||| ||||||| |||||     
16674512 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcataaaaacataacatcac 16674413  T
357 agttggagcacaaatttagca 377  Q
    ||   |||||| |||||||||    
16674412 agaaagagcacgaatttagca 16674392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Original strand, 39115598 - 39115678
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaac-cccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    ||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
39115598 atgattatgatgaaaactaacacccttaccttaattattaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 39115678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13662561 - 13662481
Alignment:
87 ttcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattca 168  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
13662561 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttag-ttctcatcatcaatccataattatgtatacccaaatcatgattca 13662481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16674672 - 16674624
Alignment:
99 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatg 148  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
16674672 accaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatg 16674624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 332 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 23226117 - 23226076
Alignment:
332 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
23226117 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacaaattt 23226076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 121
Target Start/End: Original strand, 41246613 - 41246650
Alignment:
84 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattca 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
41246613 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatttca 41246650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 22321654 - 22321597
Alignment:
8 catcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaa 65  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||| |||| |||||    
22321654 catcaacaatcaaccacaatcacaacatataatcatgcattccatcacaatttaacaa 22321597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 451 - 503
Target Start/End: Original strand, 17285548 - 17285600
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 503  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||| | | |||||||||||||||||||    
17285548 ccccttaccttaattatcaccaattcctaacccaagcttcactttagctccta 17285600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 451 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 21198057 - 21198005
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 503  Q
    ||||||| |||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
21198057 ccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 21198005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 7 - 389
Target Start/End: Original strand, 26680080 - 26680463
Alignment:
7 acatcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaattcacaaatttcaccaaaac 106  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
26680080 acatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcgattcccaaatttcaccaaaac 26680179  T
107 accaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26680180 accaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 26680279  T
207 cacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatcta 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||    
26680280 cacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaattta 26680379  T
306 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
26680380 accaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 26680463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 84 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 54118551 - 54118120
Alignment:
84 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatct 183  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||     
54118551 caattcaccattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 54118452  T
184 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 281  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| || |||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||| ||    
54118451 attaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaatt 54118352  T
282 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 381  Q
     | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
54118351 gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaa 54118252  T
382 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaattatctccaactact 478  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
54118251 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactatt 54118152  T
479 agctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
54118151 agctctagcttcacttttgctcttatgattct 54118120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 84 - 462
Target Start/End: Original strand, 13246386 - 13246769
Alignment:
84 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatct 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||     
13246386 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 13246485  T
184 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 281  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
13246486 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 13246585  T
282 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 381  Q
     | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
13246586 gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcattaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgtagcacgaatttaacaacaa 13246685  T
382 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
13246686 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 13246769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 99 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 15675381 - 15675009
Alignment:
99 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||    
15675381 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataac 15675282  T
199 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 296  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
15675281 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 15675182  T
297 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatca 394  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||   |    
15675181 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaa 15675082  T
395 aaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    |||||||||| ||||||||||| |  ||||    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
15675081 aaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 15675009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 257 - 462
Target Start/End: Original strand, 122020 - 122226
Alignment:
257 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 356  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
122020 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcac 122119  T
357 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-cccct 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
122120 agttggagcacaaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaatcccct 122219  T
456 tacctta 462  Q
    |||||||    
122220 tacctta 122226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 102 - 362
Target Start/End: Original strand, 31115603 - 31115865
Alignment:
102 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||    
31115603 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatc 31115702  T
202 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 299  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  ||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |  ||||||     
31115703 aattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttaggaaaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgt 31115802  T
300 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 362  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
31115803 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 31115865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 224 - 389
Target Start/End: Original strand, 10488659 - 10488825
Alignment:
224 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
10488659 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 10488758  T
323 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
10488759 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 10488825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 224 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 16328092 - 16327926
Alignment:
224 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
16328092 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 16327993  T
323 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
16327992 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16327926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 99 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 10104523 - 10104170
Alignment:
99 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||                   ||||||    
10104523 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaac-------------------aacaac 10104443  T
199 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 296  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
10104442 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 10104343  T
297 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatca 394  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||   |    
10104342 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaacaattatccaattatgaa 10104243  T
395 aaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    |||||||||| ||||||||||| |   |||    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
10104242 aaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 10104170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Original strand, 10644187 - 10644449
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
10644187 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 10644285  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |  |  ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  ||||| |||||||||    
10644286 taacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatattt 10644385  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 355  Q
     |||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
10644386 gaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 10644449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 257 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 13048353 - 13048221
Alignment:
257 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 356  Q
    ||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||  |    
13048353 gcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaatcatgcatacaaacatatcattga 13048254  T
357 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
13048253 agttggagcatgaatttagcaacaattatccat 13048221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 95 - 226
Target Start/End: Original strand, 111362 - 111493
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | |    
111362 tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 111461  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 226  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
111462 taacatcaattgaacaagaatcataactcaat 111493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 327 - 462
Target Start/End: Original strand, 33240901 - 33241043
Alignment:
327 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaa 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| |  ||||    
33240901 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaa 33241000  T
425 ----atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
        ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
33241001 aatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 33241043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 377
Target Start/End: Original strand, 47357622 - 47357906
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
47357622 tttcaccaaaacaccaaca-cagctcaaattctcatcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 47357720  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
47357721 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 47357820  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 377  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  |||||| |||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
47357821 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 47357906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 25119139 - 25119059
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaac-cccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
25119139 atgattatgataaaaactaactcccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 25119059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Original strand, 10488610 - 10488672
Alignment:
7 acatcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 69  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
10488610 acatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 10488672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 16328135 - 16328079
Alignment:
13 tcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 69  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
16328135 tcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 16328079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 5682460 - 5682380
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaaccc-cttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| ||||    
5682460 atgattatgataaaaactaacccacttaccttaattatcaccaactattagctcatgcttcacttttgctcctatgattct 5682380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 173
Target Start/End: Original strand, 7849970 - 7850044
Alignment:
98 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaac 173  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||    
7849970 caccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcaccaattcatgattatgtatactcaagtcatgattcatcaac 7850044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40885753 - 40885570
Alignment:
192 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacata- 288  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||| |  |||| |||| | |||  ||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||     
40885753 caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataattt-cataacttgacatttatacatac 40885655  T
289 tttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 373  Q
    ||| |||||| ||| | |||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||    
40885654 tttgaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacagttggagtacgaattt 40885570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 41166177 - 41166083
Alignment:
145 tatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 239  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| || || |  | ||||||||| |||||||    
41166177 tatgaatacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttgccacaattcaacaacaacat 41166083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 239
Target Start/End: Original strand, 15044794 - 15044938
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatca 193  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |  || ||||||||||  ||||| | ||| | |||||| | |||| |||||| | ||||||||  |||||| ||    
15044794 tttcaccaaagcaacaacaacaatttat-ttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaaca 15044892  T
194 acaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 239  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
15044893 acaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 15044938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 116
Target Start/End: Original strand, 44055870 - 44055902
Alignment:
84 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
44055870 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 44055902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 239
Target Start/End: Original strand, 8374504 - 8374619
Alignment:
124 ttttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctc 223  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||| | || ||||| | || ||||||||  |||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||    
8374504 ttttcatcatcaatcgataattatgtatacccaagccataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctc 8374603  T
224 aattcaactacaacat 239  Q
    | |||||| |||||||    
8374604 atttcaacaacaacat 8374619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15109630 - 15109486
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatca 193  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |  || ||||||||||  ||||| | ||| | |||||| | |||| |||||| | |||||||   |||||| ||    
15109630 tttcaccaaagcaacaacaacaatttat-ttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattacttagcaaca 15109532  T
194 acaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 239  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
15109531 acaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 15109486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17145917 - 17145796
Alignment:
124 ttttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctc 223  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||   || ||||| | || ||||||||  |||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||    
17145917 ttttcatcatcaatccgtaattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctc 17145818  T
224 aattcaactacaacatgtcaaa 245  Q
    | |||||| ||||||| |||||    
17145817 atttcaacaacaacatatcaaa 17145796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13809711 - 13809647
Alignment:
175 acaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 239  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||  || ||||| || | ||||||||| |||||||    
13809711 acaacatcaattagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 13809647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 451 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 41165860 - 41165808
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 503  Q
    |||||||| ||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
41165860 ccccttacgttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 41165808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 451 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 47534985 - 47534933
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 503  Q
    |||||||||||||||||| |||| | || || | |||||||||||||||||||    
47534985 ccccttaccttaattatcaccaattcctcgcccaagcttcactttagctccta 47534933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 52265757 - 52265645
Alignment:
128 catcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 226  Q
    |||||||||  ||||||| ||| | |||||| | |||| ||||||||  ||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||    
52265757 catcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacatcaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaat 52265658  T
227 tcaactacaacat 239  Q
    ||||| |||||||    
52265657 tcaacaacaacat 52265645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 7 - 389
Target Start/End: Original strand, 7292896 - 7293279
Alignment:
7 acatcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaattcacaaatttcaccaaaac 106  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
7292896 acatcaacaatcaaccacaatcacaacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcaattcacaaatttcaccaaaac 7292995  T
107 accaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7292996 accaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 7293095  T
207 cacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatcta 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||    
7293096 cacaagaatcatagctcaattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaattta 7293195  T
306 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
7293196 accaacaatcatacaattattattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 7293279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 83 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 13037322 - 13036938
Alignment:
83 tcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
13037322 tcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatc 13037223  T
183 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatt 280  Q
     ||||  ||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||    
13037222 aattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt 13037123  T
281 tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaaca 380  Q
    | | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
13037122 tgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaca 13037023  T
381 atcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    || |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
13037022 attatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatggtgaagactaacccccttacctta 13036938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 95 - 462
Target Start/End: Original strand, 16211733 - 16212103
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||| |||| || | |    
16211733 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcttcattaattcatgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaacca 16211832  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||  |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
16211833 taacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 16211932  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| | || ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||     
16211933 aacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattgtccataag 16212032  T
393 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
16212033 caaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 16212103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 95 - 503
Target Start/End: Original strand, 3059933 - 3060344
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| ||   |    
3059933 tttcatcaaaacacccacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtca 3060032  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| |||||||  || |||||||| || || |||||| |||||||||    
3060033 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttaacaaaattca-ccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatattt 3060131  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataa 391  Q
     |||||| ||| | ||||||| |  |||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
3060132 gaacatgtaatttcaccaacagtattacaattatcatcaattaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataa 3060231  T
392 tcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagac-taaccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttc 490  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
3060232 gcaaaattcatataacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagacttacccccttaccttcattatctccaactattagctctagcttc 3060331  T
491 actttagctccta 503  Q
    ||||| |||||||    
3060332 acttttgctccta 3060344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 95 - 462
Target Start/End: Original strand, 36052634 - 36053003
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||| |||| || | |    
36052634 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 36052733  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||| | |||   ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
36052734 caacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaac---aacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 36052830  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||    
36052831 aacatgtaattttaccaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagtataaatttagcaacaattatccattat 36052930  T
393 --caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
36052931 acaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 36053003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 95 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 11581035 - 11580661
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | |    
11581035 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcgtcctcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca 11580936  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
11580935 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 11580836  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||    
11580835 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccattat 11580736  T
393 ---caaaattcatacaacatttgaaaattcac-aaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
        ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
11580735 gcaaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaatgatgatgattatgataaagactaatccccttacctta 11580661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 102 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 47481320 - 47481031
Alignment:
102 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| | |||||| ||||  | | | ||||||    
47481320 aaaacaccaacaacaattcaaattatcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatc 47481221  T
202 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 298  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||    
47481220 aattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatg 47481122  T
299 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
     ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
47481121 taatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 47481031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 224 - 389
Target Start/End: Original strand, 11516324 - 11516490
Alignment:
224 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
11516324 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 11516423  T
323 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
11516424 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 11516490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 224 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 15441730 - 15441564
Alignment:
224 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
15441730 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 15441631  T
323 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
15441630 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 15441564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 224 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 30262295 - 30262129
Alignment:
224 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
30262295 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 30262196  T
323 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
30262195 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 30262129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 95 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 18254130 - 18253842
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  | || |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
18254130 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 18254032  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
18254031 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 18253932  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 382  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||    
18253931 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 18253842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 388
Target Start/End: Original strand, 13320988 - 13321278
Alignment:
102 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| || | ||||||   ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||    
13320988 aaaacaccaacaacaatccaaattctcatcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatc 13321087  T
202 aattgcacaagaatcatagctcaattcaacta-caacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacata--tttaaaca 296  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| | |||| | |  ||||||| | |||  |||||| |||||||||||  ||||| ||||||  || |||||    
13321088 aattgaacatgaatcatatctcaattcaacaatcaacttagcaaaattcaccaattgagcacaa-tttcataacttgacatttatacatactttgaaaca 13321186  T
297 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca 388  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||    
13321187 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatcca 13321278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 98 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 16479244 - 16478985
Alignment:
98 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| |    
16479244 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 16479145  T
197 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa 294  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||| | ||  | ||| |  | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||    
16479144 acatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaaaataacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaa 16479045  T
295 catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatc 354  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
16479044 catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatc 16478985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 257 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 25292470 - 25292338
Alignment:
257 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 356  Q
    ||||||| |||||| ||| || ||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || | |||||||| |||||||||||||||||||    
25292470 gcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatacatacaaacatatcatcaa 25292371  T
357 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
25292370 agttggagcacaaatttagcaacaattatccat 25292338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Original strand, 13572644 - 13572906
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  | || ||| | || |||  |    
13572644 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 13572742  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
13572743 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 13572842  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 355  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
13572843 aaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 13572906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Original strand, 2437425 - 2437687
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
2437425 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 2437523  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatt 290  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||  | ||| |||||  | |  ||||||| ||| |||  |||||| |||||||||| |||||| | |||||     
2437524 taacatcatttgaacaagaatcaaatctcatattaacaacaacttaggaaaaattca-ccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatata 2437622  T
291 taaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 355  Q
    | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
2437623 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 2437687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 377
Target Start/End: Original strand, 10989378 - 10989661
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
10989378 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 10989476  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |  || |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
10989477 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat-tacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 10989575  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 377  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
10989576 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 10989661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15441779 - 15441717
Alignment:
7 acatcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 69  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15441779 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 15441717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 30262344 - 30262282
Alignment:
7 acatcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 69  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30262344 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 30262282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 98 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 296257 - 295900
Alignment:
98 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaa 197  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||| |  | ||||||||||   |||||| ||||  | ||||||    
296257 caccaaaacaccaacacaaattcaatttttcaacatcaatccatgaataagcatacccaatcagtaattcatcaac---aacatcaattaatagcaacaa 296161  T
198 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaacta-caacatgtcaaa-ttcatccatttgcaca--attttcataacttctcatttctacatatttaa 293  Q
    ||||||||| ||| |||||| | | ||||||||  | |||  |  |||| |||| ||||||| | |  ||||| |||||||||||||| |||||| || |    
296160 catcaattgaacatgaatcacaacacaattcaaacatcaatttagcaaaattca-ccatttggatataatttttataacttctcatttttacataattca 296062  T
294 acatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat- 392  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||   |||| ||| ||||||||| ||||||||| || |  | || || ||| |||||||||||||| || ||| ||     
296061 acatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataacacctcaattagaacacgaatttagcaacaattattcattatg 295962  T
393 caaaa-ttcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccc 454  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||| || ||||||||||  |||||| | ||||| ||||||    
295961 caaaatttcatacaaagtttgaaaatgca-aaaatgatgagaattatgttgaagacaaacccc 295900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 13911292 - 13911046
Alignment:
113 aacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaag 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||   || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||||||| ||| |    
13911292 aacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatg 13911193  T
213 aatcatagctcaattcaactacaacat---gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaacc 308  Q
    ||||| | ||||| ||||| ||||| |   |  ||||||| | |||  ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||    
13911192 aatcacatctcaaatcaacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcacc 13911093  T
309 aacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 355  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
13911092 aacaatcatacaattaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 13911046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 32493978 - 32493898
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
32493978 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 32493898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Original strand, 11516275 - 11516337
Alignment:
7 acatcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 69  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
11516275 acatcaacaatcaaccacaatcataacatatactcatacactccatcataattcaacaacaac 11516337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Original strand, 126738 - 126818
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||    
126738 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcatttttgctcctatgattct 126818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 1936949 - 1936869
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacc-ccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
1936949 atgattatgataaaaactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgcttctatgattct 1936869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 111201 - 111121
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
111201 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaacttttagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 111121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 14114031 - 14113989
Alignment:
347 atatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
14114031 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14113989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 14423681 - 14423639
Alignment:
347 atatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
14423681 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14423639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 503
Target Start/End: Original strand, 13377872 - 13377924
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 503  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
13377872 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 13377924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 503
Target Start/End: Original strand, 13389698 - 13389750
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 503  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
13389698 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 13389750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 15822723 - 15822691
Alignment:
84 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
15822723 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 15822691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 451 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 7283967 - 7283908
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    |||||||||||||||||| |||| || || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
7283967 ccccttaccttaattatcaccaattattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct 7283908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25292633 - 25292560
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcat 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||| | || ||||||    
25292633 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcattaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcat 25292560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 451 - 503
Target Start/End: Original strand, 16919874 - 16919926
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 503  Q
    ||||||| |||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
16919874 ccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 16919926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17224230 - 17224075
Alignment:
84 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 182  Q
    |||||||| ||||| || ||| |||||||||||| |||  || |||||| |||  ||||||| ||| |||||||| | |||| ||||||   ||||||||    
17224230 caattcaccaattttacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcattaacaacatc 17224132  T
183 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 239  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||| || || ||   ||||||||| |||||||    
17224131 acttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttacaacaattcaacaacaacat 17224075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 14 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 37442 - 37066
Alignment:
14 caatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 113  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
37442 caatcaaccacaatcacaacatataatcatacactccatcataattcaacaaaaacttatcatatttcatcaattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 37343  T
114 acaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaaga 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37342 acaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaaga 37243  T
214 atcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaaca 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
37242 atcatagctcaatccaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaaca 37143  T
313 atcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
37142 atcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Original strand, 41632 - 41712
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    |||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
41632 atgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 41712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 25)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 511
Target Start/End: Original strand, 41394191 - 41394608
Alignment:
98 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| |    
41394191 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 41394290  T
197 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa 294  Q
    ||||||||||  ||||||||| | |||||   ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||    
41394291 acatcaattgagcaagaatcaaatctcaacataacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaa 41394390  T
295 catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatca 394  Q
    |||| ||  | ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
41394391 catgtaacttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatca 41394490  T
395 aaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcact 493  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
41394491 aaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcact 41394590  T
494 ttagctcctatgcttctc 511  Q
    |||||||||||| |||||    
41394591 ttagctcctatgattctc 41394608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 95 - 462
Target Start/End: Original strand, 20445646 - 20446019
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | |    
20445646 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagcca 20445745  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  ||||||||||||  |||| |||||| | | || ||     
20445746 taacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttg 20445845  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
20445846 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattat 20445945  T
393 --caaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaac-cccttacctta 462  Q
       ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
20445946 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaactcccttacctta 20446019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 95 - 450
Target Start/End: Original strand, 20531411 - 20531770
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | |    
20531411 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagcca 20531510  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  ||||||||||||  |||| |||||| | | || ||     
20531511 taacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttg 20531610  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
20531611 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 20531710  T
393 --caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa 450  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
20531711 gcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatgataaagactaa 20531770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 95 - 462
Target Start/End: Original strand, 20931312 - 20931682
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||   || |||||||||| |||||||| |||| || | |    
20931312 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 20931411  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||  |  |||| |||| | |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |     
20931412 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatg 20931511  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
20931512 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 20931611  T
393 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
20931612 caaacttcatacaacaattgaaaatttgcaaaatgaggatgattatgataaaggctaacccccttacctta 20931682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 84 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 20893933 - 20893551
Alignment:
84 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatct 183  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
20893933 caattcacaaatttcttcaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatca 20893834  T
184 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 281  Q
    |||| ||   | ||||||||||| ||||||||||||  |||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
20893833 attaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 20893734  T
282 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 381  Q
     | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
20893733 gttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagcaacaa 20893634  T
382 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
20893633 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt-acaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 20893551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 95 - 462
Target Start/End: Original strand, 20913004 - 20913367
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||| ||| |||| || | |    
20913004 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaacca 20913103  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| ||||||||||      |||| ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |     
20913104 taacatcaattgaacaagaatca------aatt-aacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatg 20913196  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||     
20913197 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccgtaag 20913296  T
393 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
20913297 caaaattcatacaacaattgaaaatttgcaaaatgaggatgattacgataaagactaacccccttacctta 20913367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 95 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 37844746 - 37844374
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||| |||| || | |    
37844746 tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaacca 37844648  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttca-taacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||||  |||  |||||||||||| ||  || |||||| | | || ||    
37844647 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctactt 37844548  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataa 391  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||| |    
37844547 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagcaacaattatccatta 37844448  T
392 t--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
37844447 tgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 37844374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 224 - 389
Target Start/End: Original strand, 51452589 - 51452755
Alignment:
224 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
51452589 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 51452688  T
323 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
51452689 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgaagcacgaatttagcaacaattatccat 51452755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 95 - 339
Target Start/End: Original strand, 22227777 - 22228022
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | |||||| |||| |||  |    
22227777 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 22227875  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg-cacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
22227876 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttg 22227975  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 339  Q
    |||||| ||| | || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
22227976 aacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 22228022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 95 - 339
Target Start/End: Original strand, 22232474 - 22232719
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | |||||| |||| |||  |    
22232474 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 22232572  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg-cacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
22232573 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttg 22232672  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 339  Q
    |||||| ||| | || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
22232673 aacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 22232719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 355
Target Start/End: Original strand, 2116228 - 2116484
Alignment:
102 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||    
2116228 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 2116327  T
202 aattgcacaagaatc-atagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 298  Q
    |||||  |||||||| | |  |||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||    
2116328 aattgagcaagaatcaaaatatcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatg 2116427  T
299 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 355  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
2116428 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 2116484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 257 - 355
Target Start/End: Original strand, 45051554 - 45051652
Alignment:
257 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 355  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||    
45051554 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatca 45051652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Original strand, 51452540 - 51452602
Alignment:
7 acatcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 69  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
51452540 acatcatcaatcaactacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 51452602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Original strand, 21860334 - 21860414
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
21860334 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 21860414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 44034903 - 44034829
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctat 504  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
44034903 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 44034829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 18601402 - 18601140
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  | |  ||| | || |||  |    
18601402 tttcaccaaaacaccaaca-caactctaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 18601304  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
18601303 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 18601204  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 355  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
18601203 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 18601140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 182
Target Start/End: Original strand, 45051416 - 45051496
Alignment:
102 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| | ||||||    
45051416 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaataacatc 45051496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5072672 - 5072388
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  | |  ||| | || |||  |    
5072672 tttcaccaaaacaccaaca-caactctaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 5072574  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
5072573 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 5072474  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 377  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
5072473 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 5072388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 451 - 510
Target Start/End: Original strand, 41218749 - 41218808
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
41218749 ccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 41218808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 451 - 503
Target Start/End: Original strand, 27675139 - 27675191
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 503  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
27675139 ccccttaccttaattatctccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 27675191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 116
Target Start/End: Original strand, 49967607 - 49967638
Alignment:
85 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
49967607 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 49967638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 503
Target Start/End: Original strand, 20177513 - 20177570
Alignment:
447 ctaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 503  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
20177513 ctaaccccattaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 20177570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 20254308 - 20254389
Alignment:
124 ttttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaatt 205  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||   || ||||| | || ||||||| | | |||| ||||||||||||||    
20254308 ttttcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaatt 20254389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 451 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 13376763 - 13376711
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 503  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | | |||||||||||||||||    
13376763 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaaacttcactttagctccta 13376711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22143611 - 22143531
Alignment:
127 tcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 206  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||||    
22143611 tcatcatcaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagcaacaacatcaattg 22143531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 31)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 84 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 19795011 - 19794581
Alignment:
84 caattcacaaatttcaccaaaa-caccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 182  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
19795011 caattcacaa-tttcaccaaaaacaccaacaaaaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 19794913  T
183 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatt 280  Q
     |||| |   || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||    
19794912 aattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt 19794813  T
281 tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaaca 380  Q
    | | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||    
19794812 tgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacgaca 19794713  T
381 atcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaattatctccaactac 477  Q
    || |||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
19794712 attatccattatgcaaaaattcatacaacatttg-aaatttacaaaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactat 19794614  T
478 tagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
19794613 tagctctagcttcacttttgctcttatgattct 19794581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 95 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 43643250 - 43642833
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||| ||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||| || |||    
43643250 tttcatcaaaacaccaacatc---tcaaattatcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaa 43643154  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac-atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     | ||||||||| |||||||||||| ||||| | ||  ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| | | |||||     
43643153 tagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaattaataacaactaagaaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttg 43643054  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
43643053 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatttagcaacaattatccactat 43642954  T
393 --caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacc-ccttaccttaattatctccaactactagctctagctt 489  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
43642953 gcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacctccttcccttaattatctccaactattagctctagctt 43642854  T
490 cactttagctcctatgcttct 510  Q
    |||||| ||||||||| ||||    
43642853 cacttttgctcctatgattct 43642833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 95 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 36982737 - 36982364
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| || |||    
36982737 tttcactaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaa 36982638  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
36982637 taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 36982538  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| | |||| ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
36982537 aacatgtaatttcaccagcaatcttacaattatcatcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 36982438  T
393 --caaaattcatacaacatttgaaaattcac-aaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
       ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
36982437 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 36982364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 95 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 20627609 - 20627190
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||| |||||| | |||| || | |    
20627609 tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaacca 20627510  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     || |||||||| |||||||| | | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || |||||| |||||||||     
20627509 taaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttg 20627410  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
     ||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
20627409 gacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccataat 20627310  T
393 caaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttc 490  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
20627309 cataattcatacaatatttgaaaattttacaaaatgatgatgattatgataaagactaaccccgttaccttaattatctccaactattagctctagcttc 20627210  T
491 actttagctcctatgcttct 510  Q
    ||||| ||||||||| ||||    
20627209 acttttgctcctatgattct 20627190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 95 - 462
Target Start/End: Original strand, 462706 - 463075
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||  || ||||| |||| || | |    
462706 tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattcttatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagcca 462804  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
462805 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatattt 462903  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataa 391  Q
     |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
462904 gaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataa 463003  T
392 tcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
463004 gcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 463075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 95 - 456
Target Start/End: Original strand, 8891209 - 8891574
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||  | | |    
8891209 tttcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagcca 8891308  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
8891309 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 8891408  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| |  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
8891409 aacatgtaatttcgccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 8891508  T
393 --caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccctt 456  Q
       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
8891509 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccctt 8891574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 99 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 24341681 - 24341309
Alignment:
99 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaac 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||| |||| || ||| |||    
24341681 accaaaacaccaacaataattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataac 24341582  T
199 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 296  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
24341581 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 24341482  T
297 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatca 394  Q
    |  ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||||  ||   |    
24341481 tataatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcatgaatttagcaacaattatccaattatgaa 24341382  T
395 aaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    |||||||||| ||||||||||| |  ||||    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
24341381 aaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 24341309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 224 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 19689567 - 19689401
Alignment:
224 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
19689567 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 19689468  T
323 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
19689467 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 19689401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 224 - 389
Target Start/End: Original strand, 23820168 - 23820334
Alignment:
224 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
23820168 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 23820267  T
323 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
23820268 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 23820334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 224 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 14906606 - 14906440
Alignment:
224 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
14906606 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 14906507  T
323 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
14906506 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14906440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 25265679 - 25265390
Alignment:
102 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||    
25265679 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc 25265580  T
202 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 299  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  |||||||| |||||||  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||     
25265579 aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt 25265480  T
300 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
25265479 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 25265390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 224 - 389
Target Start/End: Original strand, 20015108 - 20015274
Alignment:
224 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |    
20015108 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaat 20015207  T
323 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
20015208 tattatcaattcatgcatgcaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20015274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 98 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 7508138 - 7507894
Alignment:
98 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| |    
7508138 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 7508039  T
197 acatcaatt-gcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
    |||||||||   ||| |||||||| ||||||| ||| ||||| | | |||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||     
7508038 acatcaattaaaacatgaatcatatctcaatt-aacaacaacttagccaaattca-ccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttg 7507941  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 339  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
7507940 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 7507894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 257 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 17396784 - 17396653
Alignment:
257 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 356  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| |||||||||||||    
17396784 gcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaa 17396686  T
357 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
17396685 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17396653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 95 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 19886945 - 19886661
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
19886945 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 19886847  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| |    
19886846 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatat 19886747  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 377  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
19886746 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19886661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 369 - 462
Target Start/End: Original strand, 22863171 - 22863267
Alignment:
369 aatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
22863171 aatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 22863267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Original strand, 22275045 - 22275125
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
22275045 atgattatgataaaggctaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 22275125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Original strand, 22284278 - 22284358
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
22284278 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct 22284358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 432 - 510
Target Start/End: Original strand, 15633538 - 15633617
Alignment:
432 tgattatggtaaagactaacc-ccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
15633538 tgattatgataaagactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgctcctatgattct 15633617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 14906655 - 14906593
Alignment:
7 acatcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 69  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
14906655 acatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 14906593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Original strand, 20015059 - 20015121
Alignment:
7 acatcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 69  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
20015059 acatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 20015121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Original strand, 23820119 - 23820181
Alignment:
7 acatcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 69  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
23820119 acatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 23820181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19689599 - 19689554
Alignment:
24 caatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19689599 caatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 19689554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 503
Target Start/End: Original strand, 19660217 - 19660273
Alignment:
447 ctaaccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 503  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
19660217 ctaaccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 19660273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17396948 - 17396887
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||    
17396948 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaa 17396887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 503
Target Start/End: Original strand, 43646237 - 43646289
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 503  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
43646237 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 43646289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19669362 - 19669279
Alignment:
124 ttttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 206  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||    
19669362 ttttcatcatcagttcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataacatcacttagcaacaacaacatcaattg 19669279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 205
Target Start/End: Original strand, 9636761 - 9636821
Alignment:
145 tatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaatt 205  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||| |||| |||| ||| || ||||||||||||||    
9636761 tatgaatacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt 9636821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 206
Target Start/End: Original strand, 19666525 - 19666605
Alignment:
127 tcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 206  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||||    
19666525 tcatcatcaaaacatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacgacaatatcacttagcaacaacaacatcaattg 19666605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 205
Target Start/End: Original strand, 24884718 - 24884762
Alignment:
161 atgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaatt 205  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
24884718 atgaatcatcaacaacaatatctattagcaacaacaacatcaatt 24884762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 116
Target Start/End: Original strand, 32465813 - 32465845
Alignment:
84 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
32465813 caattcataaatttcaccaaaacaccaacaaca 32465845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 180; Significance: 6e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 95 - 462
Target Start/End: Original strand, 1091 - 1462
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||| | || |||||||||| |||| ||| |||| || | |    
1091 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaacca 1190  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
1191 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 1290  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
1291 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 1390  T
393 caaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
1391 aaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 1462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 95 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 3877 - 3508
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||| |||||| |||||||| | || |||| ||||  |||||||| |||| |||| |    
3877 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaactctcctcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatcca 3779  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
3778 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 3679  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
3678 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatctataat 3579  T
393 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
3578 caaaattcatacaacttttgaaaatttacaaaatgaagatgattatgacaaagactaacccccttacctta 3508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 95 - 462
Target Start/End: Original strand, 48565 - 48935
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||  | | |    
48565 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagcca 48664  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  | | ||||| |  |||| |||| | | |  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
48665 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctagcaacaacttagcaaaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttg 48764  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
48765 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 48864  T
393 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
48865 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 48935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 355
Target Start/End: Original strand, 36065 - 36323
Alignment:
99 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaac 198  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | |  ||| | || |||  | |||    
36065 accataacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataac 36163  T
199 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 295  Q
    ||| |||| ||| |||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | ||     
36164 atctattgaacatgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaat 36263  T
296 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 355  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||  ||  |||||||||| |||||||||||| |||||    
36264 atgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatacatacaaacataacatca 36323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 95 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 37209 - 36836
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | |    
37209 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca 37110  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||| ||||||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||| | |  ||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
37109 taacgtcaattgaacaagattcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 37010  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| | |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||    
37009 aacatgtaatttcaccaacaagcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccattat 36910  T
393 --caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaa 463  Q
       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
36909 gcaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 36836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 451 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 15378 - 15319
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||| ||||    
15378 ccccttaccttaattatctccaactattagcccaagcttcacttttgctcctatgattct 15319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 95 - 454
Target Start/End: Original strand, 19173 - 19537
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || |||    
19173 tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaa 19272  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
19273 taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 19372  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
19373 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 19472  T
393 --caaaattcatacaacatttgaaaattcac-aaaatgatgatgattatggtaaagactaacccc 454  Q
       ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
19473 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaattatgatgattatgatgaagactaacccc 19537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 95 - 389
Target Start/End: Original strand, 21257 - 21553
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || |||    
21257 tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaa 21356  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
21357 taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 21456  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
21457 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 84 - 462
Target Start/End: Original strand, 23153403 - 23153786
Alignment:
84 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatct 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||     
23153403 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatccttaattcatgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatca 23153502  T
184 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 281  Q
    |||| || | | || |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
23153503 attaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 23153602  T
282 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 381  Q
     | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
23153603 gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagaaacaa 23153702  T
382 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
23153703 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 23153786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 102 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 14626407 - 14626089
Alignment:
102 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||    
14626407 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 14626308  T
202 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtca-aattcatccatttgcaca--attttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 298  Q
    |||||  ||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  || |||||| ||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
14626307 aattgagcaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcataattca-ccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatg 14626209  T
299 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaat 398  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||    
14626208 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatcacaat 14626109  T
399 tcatacaacatttgaaaatt 418  Q
    ||| ||||||||||| ||||    
14626108 tcaaacaacatttgagaatt 14626089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 95 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 35009735 - 35009439
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || |||    
35009735 tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaa 35009636  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
    |||||||||||| ||| |  ||  | |  |||||||| ||||||| |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||     
35009635 caacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattg 35009536  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
35009535 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 35009439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 98 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 1658040 - 1657748
Alignment:
98 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||    
1658040 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataa 1657941  T
198 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 295  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||| || | ||| | |  |||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
1657940 catcaactgaacaagaatcataactcaattc-acaataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac 1657842  T
296 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
1657841 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 1657748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 98 - 389
Target Start/End: Original strand, 15862443 - 15862734
Alignment:
98 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||    
15862443 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataa 15862542  T
198 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 295  Q
    ||| ||| | |||||||||||| ||||||||| | | ||| |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
15862543 cataaat-gaacaagaatcataactcaattca-caataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaac 15862640  T
296 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||    
15862641 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccat 15862734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 102 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 1650382 - 1650105
Alignment:
102 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| ||||||    
1650382 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc 1650283  T
202 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 299  Q
    |||||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||     
1650282 aattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgt 1650183  T
300 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 377  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||  |||||| ||| |||||    
1650182 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagca 1650105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 231
Target Start/End: Original strand, 27740808 - 27740941
Alignment:
98 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaa 197  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||   ||  | |||| |    
27740808 caccaaaacaccaacaccaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaaaccatgattcatccacaacaacatcagataatagcaacca 27740907  T
198 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 231  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
27740908 catcaattgaacatgaatcatatctcaattcaac 27740941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 95 - 349
Target Start/End: Original strand, 25175531 - 25175787
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
25175531 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 25175629  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
25175630 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 25175729  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 349  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
25175730 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacata 25175787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 27654267 - 27653983
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
27654267 tttcaccaaaacaccgaca-caattcaaattctcatcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 27654169  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||| | | |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
27654168 taacatcattggaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 27654069  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 377  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||||| |||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
27654068 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagca 27653983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 19983224 - 19983144
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
19983224 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 19983144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 35015089 - 35015009
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
35015089 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 35015009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 394 - 462
Target Start/End: Original strand, 23148266 - 23148335
Alignment:
394 aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
23148266 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 23148335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18381975 - 18381821
Alignment:
84 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 182  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||  || |||||| |||  ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||    
18381975 caattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatc 18381877  T
183 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 238  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| ||||||    
18381876 acttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaaca 18381821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16826038 - 16825986
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatg 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
16826038 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatg 16825986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 389
Target Start/End: Original strand, 27751605 - 27751688
Alignment:
306 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||||| ||| | ||||||    
27751605 accaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagctacatttatccat 27751688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Original strand, 18583640 - 18583720
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
18583640 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct 18583720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 503
Target Start/End: Original strand, 21623511 - 21623563
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 503  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
21623511 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 21623563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22362032 - 22361926
Alignment:
109 caacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgc 207  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||| ||| | |||||| | |||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||||     
22362032 caacaacaactcaa-ttctcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattga 22361934  T
208 acaagaat 215  Q
    ||| ||||    
22361933 acatgaat 22361926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 389
Target Start/End: Original strand, 29665937 - 29666137
Alignment:
192 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatat 289  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||||| |  |||| |||| | |||  | ||||||| ||||||||  ||||| | ||||     
29665937 caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattt-cataacttgacatttatgcatac 29666035  T
290 tt--aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcc 387  Q
    ||  ||||||| ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||  || ||| ||||| || | |||||| |||||| ||||||| ||||    
29666036 tttgaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatcc 29666135  T
388 at 389  Q
    ||    
29666136 at 29666137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 113
Target Start/End: Original strand, 32898745 - 32898774
Alignment:
84 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
32898745 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 32898774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 239
Target Start/End: Original strand, 21623123 - 21623278
Alignment:
84 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 182  Q
    |||||||| ||||| ||||||  ||||||||||| |||  ||||||||  |||  ||||||| ||| |||||||| | |||| |||| |||  |||||||    
21623123 caattcaccaattttaccaaactaccaacaacaactcat-ttttcatccacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgactcattaacatcaacatc 21623221  T
183 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 239  Q
      |||||| ||||||||||||| | ||| || || || | ||||||||| |||||||    
21623222 acttagcaacaacaacatcaatagaacatgattcttaccacaattcaacaacaacat 21623278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 451 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 22361671 - 22361619
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 503  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||  | |||||||||||||||||||    
22361671 ccccttaccttaattatcaccaattcctaggccaagcttcactttagctccta 22361619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25367438 - 25367374
Alignment:
175 acaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 239  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
25367438 acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 25367374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 206
Target Start/End: Original strand, 33324690 - 33324770
Alignment:
127 tcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 206  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
33324690 tcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattg 33324770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 35136262 - 35136182
Alignment:
127 tcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 206  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
35136262 tcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattg 35136182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 95 - 462
Target Start/End: Original strand, 23506932 - 23507302
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||| |||| || | |    
23506932 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 23507031  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
23507032 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 23507131  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||     
23507132 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattatccataag 23507231  T
393 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
23507232 caaaattcatacaacatttgaaatcttacaaaatggagatgattatgataaagactaacccccttacctta 23507302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 84 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 27182854 - 27182471
Alignment:
84 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatct 183  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| | ||||||||||||| ||||||||     
27182854 caattcaaaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatca 27182755  T
184 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 281  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
27182754 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 27182655  T
282 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 381  Q
     | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
27182654 gttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaattatcatcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagcaacaa 27182555  T
382 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
27182554 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 27182471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 103 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 18531355 - 18530988
Alignment:
103 aaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatca 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||||||    
18531355 aaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatca 18531256  T
203 attgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 299  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||     
18531255 attgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt 18531157  T
300 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcc-ataatcaaa-a 397  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| || || ||| |    
18531156 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaca 18531057  T
398 ttcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgat---gattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||||    
18531056 ttcataccacatttgaaaaattgcaaaatgatgatgacgattatgatgaagactaacccccttacctta 18530988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 99 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 22054125 - 22053753
Alignment:
99 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||    
22054125 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataac 22054026  T
199 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 296  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
22054025 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 22053926  T
297 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatca 394  Q
    || ||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||   |    
22053925 tgtaatttcaccaacaatcatacaactatcatcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaa 22053826  T
395 aaattcatacaacatttgaaaa--ttcacaaa--atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
22053825 aaattcataccacatttgaaaaatttcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 22053753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 224 - 389
Target Start/End: Original strand, 20623066 - 20623232
Alignment:
224 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
20623066 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 20623165  T
323 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
20623166 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20623232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 224 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 21233694 - 21233528
Alignment:
224 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
21233694 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 21233595  T
323 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
21233594 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21233528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 227 - 389
Target Start/End: Original strand, 37052844 - 37053007
Alignment:
227 tcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 325  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
37052844 tcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattat 37052943  T
326 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
37052944 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37053007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 224 - 389
Target Start/End: Original strand, 16536294 - 16536460
Alignment:
224 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
16536294 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 16536393  T
323 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
16536394 tattataaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16536460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 98 - 389
Target Start/End: Original strand, 34939248 - 34939540
Alignment:
98 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||    
34939248 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataa 34939347  T
198 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 295  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||| || |  || | |  |||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
34939348 catcaactgaacaagaatcataactcaattc-acaatgacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac 34939446  T
296 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||||    
34939447 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacagttatccat 34939540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 224 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 25900571 - 25900408
Alignment:
224 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 322  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| |    
25900571 aattcaacaacaacatgtcaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaat 25900473  T
323 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcc 387  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
25900472 tatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcc 25900408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 95 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22366765 - 22366481
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
22366765 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 22366667  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
22366666 taacatcatttgaacaagcatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 22366567  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 377  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
22366566 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 22366481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 95 - 377
Target Start/End: Original strand, 25426596 - 25426880
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
25426596 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 25426694  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
25426695 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 25426794  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 377  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
25426795 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 25426880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 18778276 - 18778014
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | ||  ||  |    
18778276 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattca 18778178  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
18778177 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 18778078  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 355  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
18778077 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 18778014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 95 - 377
Target Start/End: Original strand, 12342 - 12626
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
12342 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 12440  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| |    
12441 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatat 12540  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 377  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
12541 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 12626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 377
Target Start/End: Original strand, 19499867 - 19500151
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | || ||| |||||  | || ||| | || |||  |    
19499867 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattca 19499965  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
19499966 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 19500065  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 377  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
19500066 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19500151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Original strand, 20623017 - 20623079
Alignment:
7 acatcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 69  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20623017 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 20623079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21073879 - 21073595
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
21073879 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattga 21073781  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  |    ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
21073780 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 21073681  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 377  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
21073680 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 21073595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 21233743 - 21233681
Alignment:
7 acatcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 69  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21233743 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 21233681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 4200251 - 4200007
Alignment:
114 acaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaaga 213  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||||||| ||| ||    
4200251 acaattcaaattctcatcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatga 4200152  T
214 atcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaa 310  Q
    |||| | ||||| ||||| |||||||  |  ||||||| | |||| ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||    
4200151 atcacatctcaaatcaacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaa 4200052  T
311 caatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 355  Q
    ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
4200051 caatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 4200007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 17471887 - 17471803
Alignment:
85 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcat 169  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||||||||    
17471887 aattcaccaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcat 17471803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Original strand, 27009809 - 27010071
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  | || ||| | || |||  |    
27009809 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 27009907  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  | ||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
27009908 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatattt 27010007  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 355  Q
    ||||||| ||| | ||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
27010008 aaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 27010071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 257 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 29188404 - 29188284
Alignment:
257 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 356  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
29188404 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac 29188305  T
357 agttggagcacaaatttagca 377  Q
    |||  |||||| ||| |||||    
29188304 agtaagagcacgaatctagca 29188284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 43443679 - 43443417
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
43443679 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaatcctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 43443581  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtca--aattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||| ||| |||||| ||| | ||||| ||||| ||||| |   |  |||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
43443580 taacatcatttgaacaagactcacatctcaaatcaacaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 43443481  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 355  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
43443480 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 43443417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 25900620 - 25900558
Alignment:
7 acatcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 69  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
25900620 acatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 25900558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Original strand, 37052792 - 37052854
Alignment:
7 acatcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 69  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
37052792 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcataccctccatcataactcaacaacaac 37052854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 29190552 - 29190479
Alignment:
102 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaacta 175  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
29190552 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacta 29190479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Original strand, 16536245 - 16536307
Alignment:
7 acatcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 69  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
16536245 acatcatcaatcaactacaatcataacatacaatcataccctccatcataattcaacaacaac 16536307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 451 - 505
Target Start/End: Original strand, 11584394 - 11584448
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 505  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||    
11584394 ccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 11584448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 239
Target Start/End: Original strand, 23493916 - 23494029
Alignment:
127 tcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaa 225  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| | |||||| | |||| |||||| | ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || | |||    
23493916 tcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaa 23494015  T
226 ttcaactacaacat 239  Q
    |||||| |||||||    
23494016 ttcaacaacaacat 23494029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 239
Target Start/End: Original strand, 7728466 - 7728530
Alignment:
175 acaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 239  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
7728466 acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 7728530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 451 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 21222514 - 21222462
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 503  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
21222514 ccccataccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 21222462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 84 - 462
Target Start/End: Original strand, 41686 - 42066
Alignment:
84 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatct 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||| |     
41686 caattcacaa-tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctaataatcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaaca 41784  T
184 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 281  Q
    |||| || | | | ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || ||||||    
41785 attaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcattt 41884  T
282 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 381  Q
     ||||||||| | |||| ||| | |||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
41885 ttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaa 41984  T
382 tcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
41985 ttatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagaccaacccccttacctta 42066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 95 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 1250 - 882
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | |||||  |||| |||| |    
1250 tttcaccaaaacaccaa-aacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatcca 1152  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||| ||| |||||||| | | ||||||| ||| ||||| |  |||| |||||| |||  |||||||||||| ||||| | |||| |||||||||     
1151 taacatcacttgaacaagaataaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttg 1053  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
1052 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat 953  T
393 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    || |||||||||||||||||| ||||   ||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
952 cacaattcatacaacatttgagaatttgtaaagtgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 95 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 128464 - 128095
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
128464 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatcca 128365  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||| |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| |||||  ||  | |||| ||||     
128364 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacctaacaaaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttg 128266  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||     
128265 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagcaacaattatccataag 128166  T
393 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
128165 caaaattcatacaacttttgaaaatttgcaaaatgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 128095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 31942 - 31697
Alignment:
114 acaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaaga 213  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||  | || |||  | ||||||||||| ||| ||    
31942 acaattcaaattctcatcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatga 31843  T
214 atcatagctcaattcaactacaacat---gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaacca 309  Q
    |||| | ||||| ||||| ||||| |   |  ||||||| | |||  ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | || ||| ||| | ||||    
31842 atcacatctcaaatcaacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcacca 31743  T
310 acaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 355  Q
    |||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||| |||||    
31742 acaatcatacaactaacatcaattcatgcattcaaacataacatca 31697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 88 - 116
Target Start/End: Original strand, 22650 - 22678
Alignment:
88 tcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
22650 tcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 22678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 95 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 6358 - 5990
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | ||||   |||| |||| |    
6358 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatcca 6260  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||| | ||||| | |||| |||||||||     
6259 taacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttg 6161  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
6160 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat 6061  T
393 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    || |||||||||||||||||| ||||  |||| |||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
6060 cacaattcatacaacatttgagaatttgcaaagtgaaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 5990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 95 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 247738 - 247366
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| ||   |    
247738 tttcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcagttcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtca 247639  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
247638 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 247539  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| | |||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
247538 aacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 247439  T
393 --caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
247438 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 247366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 95 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 123460 - 123087
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||| |||| || | |    
123460 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 123361  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| |||||||||||| || |||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
123360 taacatcaattgaacaagaatcataacttaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 123261  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
123260 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattat 123161  T
393 --caaaattcatacaacatttgaaaattcac-aaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
       ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
123160 gcaaaaattcatacaacatttgcaaatttacaaaaattatgatgattatggtgaagactaacccccttacctta 123087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 255106 - 255074
Alignment:
84 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
255106 caattcacaaatttcacgaaaacaccaacaaca 255074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 261712 - 261680
Alignment:
84 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
261712 caattcacaaatttcacgaaaacaccaacaaca 261680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 462
Target Start/End: Original strand, 171863 - 172242
Alignment:
85 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatcta 184  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  | || | || |||  |||||||||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||| |    
171863 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttcttaa-caacaaatcatgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 171961  T
185 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 282  Q
    ||| || | | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||     
171962 ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttg 172061  T
283 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 382  Q
    | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |    
172062 ttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagt 172161  T
383 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
172162 tatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 172242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 462
Target Start/End: Original strand, 177566 - 177945
Alignment:
85 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatcta 184  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  | || | || |||  |||||||||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||| |    
177566 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttcttaa-caacaaatcatgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 177664  T
185 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 282  Q
    ||| || | | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||     
177665 ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttg 177764  T
283 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 382  Q
    | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |    
177765 ttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagt 177864  T
383 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
177865 tatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 177945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 70914 - 70882
Alignment:
84 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
70914 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 70882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 95 - 462
Target Start/End: Original strand, 12083 - 12450
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||| ||  | |||||| |||| |||  |    
12083 tttcactaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattca 12181  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| |||||||||| | |||||||  || ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
12182 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt--acaacaacttaacaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacattta 12279  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| | | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
12280 aacatgtattttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccataat 12379  T
393 caaaa-ttcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
12380 caaaatttcatacagcatttgaaagtt-acaaaattaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 95 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 5356 - 4996
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||| |||| || | |    
5356 tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagcca 5258  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
5257 taacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 5158  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| | | | |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||    
5157 aacatgtactttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcacgcatacaaacatatcgtcacagttggagtacgaatttagcaacaattatccattat 5058  T
393 -caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaaccc 453  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
5057 gaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgataatgattatgataaagactaaccc 4996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 99 - 451
Target Start/End: Original strand, 8820 - 9180
Alignment:
99 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaac 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||  | ||| |||    
8820 accaaaacaccaacaaaaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataac 8919  T
199 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 296  Q
    |||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
8920 atcaattgaacattaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 9019  T
297 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatca 394  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||  ||   |    
9020 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaa 9119  T
395 aaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaac 451  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |  ||||    ||||||||||||||| | |||||||||    
9120 aaatacataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaac 9180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 95 - 421
Target Start/End: Original strand, 148688 - 149018
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||| ||||| || |||| || | |    
148688 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaacca 148787  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
148788 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 148887  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||    
148888 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttaacaacaattatcaattat 148987  T
393 --caaaattcatacaacatttgaaaattcac 421  Q
       |||||||||||||||||||||| |||||    
148988 gcaaaaattcatacaacatttgaaatttcac 149018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 369 - 462
Target Start/End: Original strand, 146844 - 146938
Alignment:
369 aatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
146844 aatttaggaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 146938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 95 - 462
Target Start/End: Original strand, 8846 - 9215
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
8846 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 8944  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||     
8945 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattg 9044  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||  |||||||     
9045 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcgattcatgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattttccataag 9144  T
393 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
9145 caaaattcgtacaacttttgaaaatttgcaaaatgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 9215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 95 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 26710 - 26340
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||| |||| || | |    
26710 tttcatcaaaacaccaacaacact-caaattctcatcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagcca 26612  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
26611 taacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 26512  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 392  Q
    |||||| | | | ||||| |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||    
26511 aacatgtactttcaccaataatcttacaattatcatcaattcacgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatacattat 26412  T
393 -caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
26411 gaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatcatgattatgataaagactaacccccttacctta 26340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 102 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 8466 - 8180
Alignment:
102 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||    
8466 aaaacaccagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgtatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc 8367  T
202 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 299  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  ||||||||   |||||  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||| ||     
8366 aattgaacatggttctcatcataattcaac---aacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgt 8270  T
300 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
8269 aatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 451 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 6929 - 6877
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 503  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||| ||||||    
6929 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttaactccta 6877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 85 - 462
Target Start/End: Original strand, 271983 - 272362
Alignment:
85 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatcta 184  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  | |  || | |||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |    
271983 aattcactaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctctataa-caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 272081  T
185 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 282  Q
    ||| || | | |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||     
272082 ttaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttg 272181  T
283 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 382  Q
    | | ||||| |||||| ||| |  ||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||  ||||||||| | |    
272182 ttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatcaattcattcatacaaacatatcattacagttggagtacgtatttagcaatatt 272281  T
383 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
272282 tatccataatcaaaatttatacaatatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 272362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 257 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 51314 - 51121
Alignment:
257 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 356  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
51314 gcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcac 51215  T
357 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa 450  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
51214 agttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaa 51121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 224 - 389
Target Start/End: Original strand, 26892 - 27058
Alignment:
224 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
26892 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 26991  T
323 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
26992 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 27058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 224 - 382
Target Start/End: Original strand, 22637 - 22796
Alignment:
224 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
22637 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 22736  T
323 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
22737 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 22796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Original strand, 22588 - 22650
Alignment:
7 acatcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 69  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
22588 acatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 22650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Original strand, 26843 - 26905
Alignment:
7 acatcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 69  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
26843 acatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 26905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 224 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 1748 - 1582
Alignment:
224 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
1748 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 1649  T
323 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
1648 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 1582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 1797 - 1735
Alignment:
7 acatcatcaatcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 69  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
1797 acatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 1735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 95 - 382
Target Start/End: Original strand, 48155 - 48443
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | || |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
48155 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcta 48253  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
48254 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 48353  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 382  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
48354 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaat 48443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 451 - 510
Target Start/End: Original strand, 20513 - 20572
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||    
20513 ccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcatttttgctcctatgattct 20572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 95 - 382
Target Start/End: Original strand, 107715 - 108003
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
107715 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 107813  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||| | ||||| |||||| | || ||||     
107814 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttg 107913  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 382  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||    
107914 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 108003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 64812 - 64585
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  | || ||| | || |||  |    
64812 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 64714  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
64713 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 64614  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcataca 320  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||    
64613 aaacatgtaatttcaccaacaatcataca 64585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 89905 - 89863
Alignment:
332 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattta 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
89905 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 89863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 389
Target Start/End: Original strand, 13480 - 13769
Alignment:
102 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 201  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||    
13480 aaaacacctacaaaaattcaaattctcatcgtcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc 13579  T
202 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 299  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  |||||||| |||||||  |||| |||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||     
13580 aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt 13679  T
300 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
13680 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 13769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Original strand, 42677 - 42754
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
42677 atgattatgataaaaactaacccccttacctt---tatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 42754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 102 - 389
Target Start/End: Original strand, 41622 - 41911
Alignment:
102 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||    
41622 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatc 41721  T
202 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 298  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  |||||||| |||||||  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||    
41722 aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatg 41820  T
299 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| ||||||| ||||||    
41821 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatccat 41911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 828 - 534
Alignment:
97 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||| | | |    
828 tcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcaattcctgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccata 729  T
197 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa 294  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||  |||   ||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||  |||||| | | ||||| ||    
728 acatcaattaaacaagaatcataacttaatctaacagtaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaa 629  T
295 catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
628 catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 98 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 34755 - 34460
Alignment:
98 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||| |||||||| | || || ||| |    
34755 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 34656  T
197 acatcaatt-gcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 293  Q
    |||||||||   ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  | |||||||||| ||||||  |||| |||| | || |    
34655 acatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattga 34556  T
294 acatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||    
34555 acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccat 34460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 257 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 89586 - 89378
Alignment:
257 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 356  Q
    |||||||||||| ||||| | |||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
89586 gcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcac 89487  T
357 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccc 453  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||    
89486 agttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatagaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatcatgatgaagactaacccc 89387  T
454 cttacctta 462  Q
    |||||||||    
89386 cttacctta 89378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 338 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 107835 - 107708
Alignment:
338 catacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgat 435  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
107835 catacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaaaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 107736  T
436 tatggtaaagactaa-ccccttacctta 462  Q
     ||| | |||||||| ||||||||||||    
107735 catgatgaagactaacccccttacctta 107708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 102 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 9626 - 9371
Alignment:
102 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||    
9626 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 9527  T
202 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 299  Q
    | |||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
9526 atttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 9427  T
300 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 355  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
9426 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 9371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 102 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16269
Alignment:
102 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||    
16524 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 16425  T
202 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 299  Q
    | |||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
16424 atttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 16325  T
300 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 355  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
16324 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 16269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 102 - 378
Target Start/End: Original strand, 2936 - 3215
Alignment:
102 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||| ||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| ||||||    
2936 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc 3035  T
202 aattgca-caagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 298  Q
    ||||  | || |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||    
3036 aattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatg 3135  T
299 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaa 378  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||   |||||| ||||||||||    
3136 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa 3215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 226
Target Start/End: Original strand, 9338 - 9480
Alignment:
84 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatct 183  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||     
9338 caattcaccattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 9437  T
184 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 226  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
9438 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 9480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 95 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 5498 - 5254
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  |||||||| |||| |||  |    
5498 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattca 5401  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac-atgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||   |  ||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
5400 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaactcagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatattt 5302  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 339  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
5301 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 5254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 257 - 382
Target Start/End: Original strand, 5660 - 5785
Alignment:
257 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 356  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
5660 gcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaa 5759  T
357 agttggagcacaaatttagcaacaat 382  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
5760 agttggagcacgaatttagcaacaat 5785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 95 - 339
Target Start/End: Original strand, 3690 - 3936
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   || |||||||||  | |||||| |||| |||  |    
3690 tttcaccaaaacatcaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 3788  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg-cacaattttcataacttctca-tttctacatattt 291  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | ||| | |||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||    
3789 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatattt 3888  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 339  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
3889 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 3936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 95 - 354
Target Start/End: Original strand, 42965 - 43226
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
42965 tttcaccaaaacaccaaca-caatttaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 43063  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||| ||| ||| |||||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||    
43064 taacatcacttgaacacgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatattt 43163  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatc 354  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
43164 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatagaaacataacatc 43226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 14344 - 14083
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| | || |||||||||  | |||||| |  | |||  |    
14344 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattca 14246  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||| ||||| |||||||||  | ||||| | | | ||||| | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||     
14245 taacattaattgaacaagaatccaatctcaaattatcaacaacttaggaaaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttc 14146  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 355  Q
    |||||| ||| | || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
14145 aacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacagacataacatca 14083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 21399 - 21138
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||| | || |||||||||  | |||||| | || |||  |    
21399 tttcaccaaaacaccaaca-cagttcaaattttcatcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattca 21301  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 292  Q
     ||||||||||| |||||||||  | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | |||  || |||| |||||||||| |||||| |||||||||     
21300 taacatcaattgaacaagaatccaatctcaaattaacaacaacttaggaaaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttg 21201  T
293 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 355  Q
    |||||| ||| | || |||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
21200 aacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattaatggatacaaacataacatca 21138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Original strand, 3 - 265
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| |||||||||| | |||||| | || |||||| ||  | || ||| | || |||  |    
3 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 101  T
195 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 291  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||    
102 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatattt 201  T
292 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 355  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
202 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 257 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 13445 - 13347
Alignment:
257 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 355  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
13445 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 13347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 217
Target Start/End: Original strand, 48482 - 48603
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
48482 tttcatcaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatcca 48580  T
195 caacatcaattgcacaagaatca 217  Q
     |||||||| || ||||||||||    
48581 taacatcaagtgaacaagaatca 48603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Original strand, 80187 - 80267
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
80187 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 80267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 147 - 26
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 194  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | |||||| |||| |||  |    
147 tttcaccaaaacaccaa-aacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 49  T
195 caacatcaattgcacaagaatca 217  Q
     || |||| ||| ||||||||||    
48 taatatcatttgaacaagaatca 26  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 4)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 430 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 166197 - 166116
Alignment:
430 gatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    |||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
166197 gatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 166116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 430 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 162111 - 162036
Alignment:
430 gatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctat 504  Q
    |||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
162111 gatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 162036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 116462 - 116410
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 503  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
116462 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 116410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 116806 - 116687
Alignment:
83 tcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaa-tatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacat 181  Q
    ||||||||| ||||| || ||| |||||||||||| || | ||||||||| |||  |||||| |||| | |||||| | |||| |||||||| |||| ||    
116806 tcaattcaccaattttacaaaaccaccaacaacaa-tccatttttcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatat 116708  T
182 ctattagcatcaacaacatca 202  Q
    |  |||||| |||||||||||    
116707 cacttagcaacaacaacatca 116687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 31212 - 31132
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    |||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
31212 atgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 31132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 5809 - 5735
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctat 504  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
5809 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 5735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 6015 - 5941
Alignment:
431 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctat 504  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
6015 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 5941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 430 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 385 - 304
Alignment:
430 gatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
385 gatgattatgataaagaataaccccgttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 339
Target Start/End: Original strand, 54415 - 54630
Alignment:
127 tcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| | || ||||||||  |||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||| |    
54415 tcatcatcaatccataaatatgtatacccaactcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatt 54514  T
227 tcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacata--tttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 322  Q
    ||||| ||||||| || ||||||| | |||  | |||| |||||||||||  ||||| ||||||  || ||||||| ||| | ||| ||||||||||| |    
54515 tcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaa-tttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaatcatacaat 54613  T
323 tattatcaattcatgca 339  Q
    ||| |||||||||||||    
54614 tatcatcaattcatgca 54630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 257 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 1424 - 1304
Alignment:
257 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 356  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
1424 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcac 1325  T
357 agttggagcacaaatttagca 377  Q
    ||   |||||| |||||||||    
1324 agcaagagcacgaatttagca 1304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 182
Target Start/End: Original strand, 3183 - 3262
Alignment:
103 aaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 182  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
3183 aaacaccaacaacaattccaattctcttcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaatcacaacatc 3262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 389
Target Start/End: Original strand, 3370 - 3453
Alignment:
306 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 389  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| || ||||| || | |||||| ||||||||| |||| ||||||    
3370 accaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagcatcaattatccat 3453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 148
Target Start/End: Original strand, 1815 - 1867
Alignment:
95 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatg 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
1815 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatg 1867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 77139 - 76984
Alignment:
84 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 182  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||  || |||||| |||  ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||  |||| |||    
77139 caattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatc 77041  T
183 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 239  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | | ||||||||| |||||||    
77040 acttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacat 76984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 451 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 76751 - 76699
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 503  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
76751 ccccttaccttaattatcagcaattcctagcccaagcttcactttagctccta 76699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 451 - 510
Target Start/End: Original strand, 1721 - 1780
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
1721 ccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct 1780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 451 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 19861 - 19802
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
19861 ccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct 19802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 451 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 24165 - 24106
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatgcttct 510  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||    
24165 ccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcatttttgctcctatgattct 24106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 132542 - 132505
Alignment:
84 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattca 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
132542 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatttca 132505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 503
Target Start/End: Original strand, 35821 - 35873
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 503  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
35821 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 35873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 197525 - 197390
Alignment:
104 aacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatca 202  Q
    |||| ||||||||| |||| || ||||||||||  ||||| | ||| | |||||||| |||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||    
197525 aacaacaacaacaactcaa-ttctcatcatcaaagcatgatttatgaagacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatca 197427  T
203 attgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 239  Q
    |||| ||| |||||  | | ||||||||| |||||||    
197426 attgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 197390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 104872 - 104793
Alignment:
127 tcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaatt 205  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||    
104872 tcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 104793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 451 - 501
Target Start/End: Original strand, 114 - 164
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcc 501  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||    
114 ccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcc 164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 206
Target Start/End: Original strand, 10642 - 10739
Alignment:
109 caacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 206  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||| | |||| | |||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
10642 caacaacaattcat-ttttcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatgatcaacaacaacatcacttagcaaaaacaacatcaattg 10739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 451 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 6315 - 6261
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 505  Q
    |||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||||||| |||||||||    
6315 ccccttaccttaattatcacccactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 6261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 206
Target Start/End: Original strand, 2471 - 2532
Alignment:
145 tatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 206  Q
    |||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
2471 tatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg 2532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1587 - 1546
Alignment:
332 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
1587 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 1546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8732 - 8691
Alignment:
332 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
8732 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 113
Target Start/End: Original strand, 7522 - 7551
Alignment:
84 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
7522 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 7551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 373
Target Start/End: Original strand, 8216 - 8257
Alignment:
332 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
8216 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 206
Target Start/End: Original strand, 8007 - 8087
Alignment:
127 tcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 206  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||||    
8007 tcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattg 8087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 56226 - 56106
Alignment:
264 tttcataacttctcatttctacatattt--aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttg 361  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||| ||| | | | ||||||||||| |||| ||||| ||||||| || || ||| ||||| ||||     
56226 tttcataacttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagtta 56127  T
362 gagcacaaatttagcaacaat 382  Q
    |||||| |||||| |||||||    
56126 gagcacgaatttaacaacaat 56106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 70348 - 70307
Alignment:
332 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
70348 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagtacgaattt 70307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 113
Target Start/End: Original strand, 38253 - 38282
Alignment:
84 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
38253 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 38282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 451 - 503
Target Start/End: Original strand, 447 - 499
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 503  Q
    |||||||||| | ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
447 ccccttacctcagttatcaccaattcctagctcaagcttcactttagctccta 499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 216
Target Start/End: Original strand, 2548 - 2612
Alignment:
152 acccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatc 216  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
2548 acccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatc 2612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 451 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 1415 - 1363
Alignment:
451 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 503  Q
    |||||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||    
1415 ccccttacctcaattatcaccaattcctagctcaagcttcactttagttccta 1363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University