View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18957_low_20 (Length: 270)

Name: NF18957_low_20
Description: NF18957
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18957_low_20
NF18957_low_20
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (9-270)||(4712-4972)
scaffold0358 (75-270)||(1-196)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (9-270)||(10286-10544)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (9-270)||(909-1169)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (9-270)||(167839-168099)
scaffold0011 (9-266)||(51913-52170)
[»] chr8 (66 HSPs)
chr8 (9-270)||(31971257-31971516)
chr8 (9-270)||(16199506-16199765)
chr8 (9-270)||(45130858-45131117)
chr8 (9-270)||(21918860-21919121)
chr8 (9-270)||(20536208-20536469)
chr8 (9-230)||(21395883-21396101)
chr8 (9-230)||(21790376-21790594)
chr8 (9-225)||(21389358-21389571)
chr8 (9-212)||(21778697-21778897)
chr8 (9-266)||(18818273-18818530)
chr8 (9-266)||(22626736-22626992)
chr8 (9-270)||(18879097-18879352)
chr8 (9-266)||(21923792-21924049)
chr8 (10-266)||(28648908-28649164)
chr8 (9-240)||(7372778-7373001)
chr8 (9-239)||(23406379-23406611)
chr8 (6-265)||(6759255-6759512)
chr8 (9-265)||(16092206-16092463)
chr8 (10-266)||(23648554-23648810)
chr8 (9-265)||(22875065-22875321)
chr8 (148-266)||(25363004-25363123)
chr8 (9-86)||(21490995-21491072)
chr8 (9-81)||(17140916-17140988)
chr8 (9-129)||(38855253-38855372)
chr8 (9-86)||(5866318-5866395)
chr8 (12-161)||(14409459-14409606)
chr8 (16-175)||(16413316-16413474)
chr8 (25-129)||(21285613-21285716)
chr8 (9-128)||(6520368-6520486)
chr8 (12-161)||(1484402-1484549)
chr8 (12-161)||(5853307-5853454)
chr8 (12-161)||(20403227-20403374)
chr8 (12-161)||(22001753-22001900)
chr8 (13-86)||(26355742-26355815)
chr8 (12-161)||(41598188-41598335)
chr8 (9-87)||(17612153-17612231)
chr8 (9-81)||(23760893-23760962)
chr8 (12-161)||(4483281-4483427)
chr8 (12-161)||(4542388-4542535)
chr8 (12-161)||(15203246-15203393)
chr8 (12-125)||(20046246-20046357)
chr8 (11-131)||(18678102-18678221)
chr8 (25-129)||(21673720-21673823)
chr8 (9-59)||(21249384-21249434)
chr8 (9-59)||(21255222-21255272)
chr8 (25-86)||(983450-983511)
chr8 (12-161)||(19896265-19896415)
chr8 (12-129)||(26219717-26219831)
chr8 (11-131)||(32121734-32121853)
chr8 (12-161)||(14823774-14823920)
chr8 (28-129)||(20498581-20498681)
chr8 (25-121)||(15070571-15070665)
chr8 (28-80)||(17267044-17267096)
chr8 (28-129)||(17439507-17439609)
chr8 (28-129)||(37116366-37116468)
chr8 (6-101)||(19937081-19937174)
chr8 (16-181)||(13508034-13508199)
chr8 (12-62)||(26225359-26225409)
chr8 (16-110)||(45290761-45290853)
chr8 (28-80)||(24353039-24353091)
chr8 (16-87)||(13597660-13597731)
chr8 (28-87)||(19154930-19154989)
chr8 (10-129)||(26223917-26224034)
chr8 (28-161)||(19801397-19801527)
chr8 (12-161)||(25484290-25484430)
chr8 (30-80)||(22525579-22525628)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (9-266)||(12902757-12903014)
chr4 (9-270)||(7088877-7089138)
chr4 (9-270)||(14053162-14053422)
chr4 (16-258)||(23374231-23374473)
chr4 (9-270)||(44052829-44053090)
chr4 (9-244)||(17046487-17046719)
chr4 (11-266)||(22636437-22636691)
chr4 (9-267)||(7893703-7893958)
chr4 (12-266)||(16377387-16377639)
chr4 (9-266)||(16239834-16240090)
chr4 (9-221)||(16270145-16270356)
chr4 (14-265)||(14038653-14038904)
chr4 (9-193)||(7798774-7798958)
chr4 (9-131)||(52873367-52873488)
chr4 (138-270)||(3096772-3096904)
chr4 (9-181)||(6899891-6900062)
chr4 (9-96)||(3096293-3096379)
chr4 (148-266)||(17047936-17048055)
chr4 (9-81)||(15551817-15551889)
chr4 (12-161)||(18215289-18215436)
chr4 (9-86)||(39706332-39706409)
chr4 (12-161)||(44928894-44929042)
chr4 (12-129)||(54798756-54798872)
chr4 (12-175)||(23803265-23803427)
chr4 (6-175)||(19242693-19242861)
chr4 (12-161)||(12322-12469)
chr4 (12-129)||(14280316-14280431)
chr4 (12-161)||(15118367-15118514)
chr4 (12-161)||(52312510-52312657)
chr4 (12-175)||(3515007-3515169)
chr4 (12-175)||(51463868-51464030)
chr4 (25-224)||(52243099-52243301)
chr4 (12-181)||(1837503-1837671)
chr4 (25-128)||(12288211-12288315)
chr4 (10-175)||(19618172-19618336)
chr4 (13-86)||(12774011-12774084)
chr4 (12-161)||(18239434-18239581)
chr4 (12-161)||(44102214-44102361)
chr4 (12-161)||(44615288-44615435)
chr4 (12-125)||(44773138-44773249)
chr4 (12-161)||(50222354-50222501)
chr4 (28-181)||(13800-13953)
chr4 (98-184)||(15121749-15121834)
chr4 (13-86)||(8846360-8846433)
chr4 (16-121)||(15355380-15355483)
chr4 (9-121)||(15367690-15367800)
chr4 (9-121)||(15370018-15370128)
chr4 (9-121)||(15371202-15371312)
chr4 (9-121)||(15373483-15373593)
chr4 (9-121)||(15402703-15402813)
chr4 (28-111)||(6190481-6190564)
chr4 (12-175)||(12610950-12611105)
chr4 (25-175)||(14970707-14970856)
chr4 (11-161)||(22353835-22353984)
chr4 (25-87)||(43198598-43198660)
chr4 (12-129)||(8574871-8574985)
chr4 (9-101)||(16223532-16223622)
chr4 (12-62)||(7641294-7641344)
chr4 (206-265)||(15091093-15091152)
chr4 (28-87)||(46640499-46640558)
chr4 (28-161)||(21815600-21815731)
chr4 (28-80)||(53082202-53082254)
chr4 (62-184)||(43256106-43256227)
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (9-270)||(27250589-27250850)
chr1 (9-258)||(21026680-21026929)
chr1 (10-266)||(50210077-50210333)
chr1 (9-263)||(38801258-38801508)
chr1 (12-262)||(34509783-34510033)
chr1 (9-266)||(22532269-22532526)
chr1 (89-266)||(22354436-22354614)
chr1 (10-266)||(20135188-20135444)
chr1 (9-110)||(20847175-20847275)
chr1 (10-223)||(22468604-22468816)
chr1 (138-270)||(22356034-22356168)
chr1 (138-270)||(22357720-22357854)
chr1 (9-125)||(45574893-45575008)
chr1 (16-129)||(21754052-21754163)
chr1 (13-129)||(22921871-22921986)
chr1 (12-175)||(23593735-23593897)
chr1 (12-161)||(13988866-13989013)
chr1 (12-161)||(21923306-21923453)
chr1 (12-161)||(31612313-31612460)
chr1 (9-86)||(14295595-14295672)
chr1 (12-121)||(16275419-16275526)
chr1 (12-161)||(21475102-21475249)
chr1 (11-175)||(21840766-21840929)
chr1 (12-161)||(433012-433157)
chr1 (13-125)||(20248283-20248394)
chr1 (148-230)||(48603652-48603735)
chr1 (28-129)||(21896258-21896358)
chr1 (12-161)||(29298137-29298283)
chr1 (12-161)||(29776688-29776835)
chr1 (25-86)||(52928014-52928075)
chr1 (12-124)||(22123119-22123230)
chr1 (6-121)||(21342090-21342203)
chr1 (9-86)||(33681010-33681084)
chr1 (28-123)||(35261086-35261180)
chr1 (25-86)||(16758665-16758726)
chr1 (25-86)||(20918620-20918681)
chr1 (12-121)||(21346961-21347068)
chr1 (12-125)||(21707167-21707278)
chr1 (12-125)||(21711709-21711820)
chr1 (28-129)||(21861572-21861672)
chr1 (10-175)||(16361915-16362079)
chr1 (9-129)||(22237630-22237746)
chr1 (9-62)||(13212974-13213027)
chr1 (10-78)||(20454606-20454673)
chr1 (28-129)||(50614117-50614219)
chr1 (28-129)||(50621945-50622047)
chr1 (6-101)||(15860084-15860177)
chr1 (202-258)||(20847091-20847147)
chr1 (28-129)||(41050036-41050138)
chr1 (28-87)||(16368329-16368388)
chr1 (13-62)||(21714546-21714595)
chr1 (62-184)||(33797573-33797694)
chr1 (28-87)||(16093928-16093987)
chr1 (28-79)||(50686630-50686681)
chr1 (13-71)||(21161720-21161778)
chr1 (30-80)||(26064959-26065009)
chr1 (28-80)||(21533923-21533974)
[»] chr2 (64 HSPs)
chr2 (9-270)||(37976-38235)
chr2 (9-270)||(20309108-20309366)
chr2 (12-258)||(298686-298933)
chr2 (9-270)||(23654246-23654507)
chr2 (9-266)||(23285865-23286118)
chr2 (9-244)||(22731120-22731355)
chr2 (9-266)||(22738044-22738300)
chr2 (9-239)||(23060513-23060742)
chr2 (9-266)||(23076442-23076699)
chr2 (9-266)||(22337115-22337372)
chr2 (9-266)||(23660023-23660279)
chr2 (12-161)||(22105412-22105560)
chr2 (9-129)||(23103399-23103516)
chr2 (10-175)||(32214921-32215085)
chr2 (14-129)||(28405981-28406096)
chr2 (9-86)||(23071993-23072070)
chr2 (15-161)||(21155075-21155219)
chr2 (12-161)||(18808943-18809090)
chr2 (12-161)||(23130862-23131009)
chr2 (12-161)||(23133329-23133476)
chr2 (12-161)||(23135590-23135737)
chr2 (12-161)||(23709547-23709694)
chr2 (12-161)||(23712028-23712175)
chr2 (12-161)||(26505379-26505526)
chr2 (12-161)||(26507857-26508004)
chr2 (12-161)||(34402537-34402684)
chr2 (12-161)||(39682313-39682460)
chr2 (162-270)||(27753728-27753836)
chr2 (9-224)||(23708524-23708738)
chr2 (12-125)||(571397-571508)
chr2 (12-161)||(6725995-6726142)
chr2 (12-161)||(24367774-24367921)
chr2 (12-161)||(45029869-45030016)
chr2 (13-129)||(25175854-25175969)
chr2 (13-111)||(7679589-7679686)
chr2 (9-87)||(8946657-8946734)
chr2 (12-161)||(24898210-24898358)
chr2 (12-161)||(24900693-24900841)
chr2 (12-161)||(24903170-24903318)
chr2 (12-161)||(24905647-24905795)
chr2 (12-161)||(24908122-24908270)
chr2 (12-125)||(24529580-24529691)
chr2 (12-161)||(32039513-32039660)
chr2 (9-87)||(19671830-19671908)
chr2 (9-62)||(23040257-23040310)
chr2 (12-161)||(28577099-28577246)
chr2 (28-270)||(32451789-32452031)
chr2 (28-129)||(22413136-22413240)
chr2 (16-131)||(25616192-25616306)
chr2 (98-216)||(40622123-40622244)
chr2 (14-125)||(43137301-43137410)
chr2 (28-129)||(23207296-23207398)
chr2 (28-129)||(23791292-23791394)
chr2 (12-62)||(38967374-38967424)
chr2 (28-129)||(7735-7835)
chr2 (25-86)||(18786947-18787008)
chr2 (10-86)||(22134251-22134326)
chr2 (28-80)||(25108906-25108958)
chr2 (15-62)||(24643062-24643109)
chr2 (28-80)||(20520243-20520295)
chr2 (28-129)||(24697607-24697709)
chr2 (28-80)||(23004767-23004819)
chr2 (30-80)||(23287384-23287433)
chr2 (30-79)||(26392403-26392451)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (9-270)||(32067-32325)
[»] chr7 (75 HSPs)
chr7 (9-270)||(16386107-16386369)
chr7 (11-270)||(40443393-40443650)
chr7 (9-258)||(26211995-26212245)
chr7 (9-270)||(10589039-10589299)
chr7 (9-270)||(27847693-27847951)
chr7 (9-270)||(9509189-9509450)
chr7 (9-270)||(12698831-12699093)
chr7 (9-265)||(38227481-38227736)
chr7 (12-224)||(18456319-18456530)
chr7 (12-265)||(3564229-3564482)
chr7 (9-161)||(13647325-13647476)
chr7 (9-86)||(16495402-16495479)
chr7 (9-86)||(34200786-34200863)
chr7 (12-129)||(48273392-48273508)
chr7 (9-129)||(67745-67864)
chr7 (9-129)||(22072913-22073033)
chr7 (12-181)||(16213684-16213852)
chr7 (9-129)||(2280121-2280238)
chr7 (9-86)||(11996071-11996148)
chr7 (13-123)||(44014182-44014291)
chr7 (12-161)||(456321-456468)
chr7 (12-161)||(11972496-11972643)
chr7 (12-161)||(14949137-14949284)
chr7 (12-161)||(15376728-15376875)
chr7 (12-161)||(16232520-16232667)
chr7 (12-161)||(18640272-18640419)
chr7 (12-161)||(20385138-20385285)
chr7 (12-161)||(21189610-21189757)
chr7 (16-161)||(24275175-24275318)
chr7 (9-86)||(28505342-28505419)
chr7 (12-161)||(32125491-32125638)
chr7 (12-161)||(41522917-41523064)
chr7 (12-161)||(41525379-41525526)
chr7 (13-161)||(11393302-11393448)
chr7 (9-131)||(16219717-16219835)
chr7 (9-161)||(18430709-18430859)
chr7 (9-81)||(47831807-47831879)
chr7 (9-86)||(15754931-15755008)
chr7 (12-125)||(16410059-16410170)
chr7 (12-161)||(24702238-24702385)
chr7 (12-161)||(27216860-27217007)
chr7 (13-129)||(18005650-18005765)
chr7 (13-86)||(811175-811248)
chr7 (12-125)||(17061966-17062077)
chr7 (12-125)||(44116509-44116620)
chr7 (25-88)||(12901339-12901402)
chr7 (12-125)||(3386333-3386444)
chr7 (12-125)||(13831373-13831484)
chr7 (12-121)||(13869346-13869453)
chr7 (25-87)||(1868038-1868100)
chr7 (114-216)||(12187117-12187218)
chr7 (114-216)||(17137978-17138079)
chr7 (16-129)||(38898423-38898535)
chr7 (25-129)||(16056344-16056446)
chr7 (31-86)||(12255837-12255892)
chr7 (12-161)||(24704688-24704832)
chr7 (25-265)||(15143902-15144142)
chr7 (12-62)||(20110556-20110606)
chr7 (28-80)||(20220238-20220290)
chr7 (35-87)||(48991206-48991258)
chr7 (25-80)||(14044762-14044817)
chr7 (25-80)||(14354792-14354847)
chr7 (32-87)||(15008542-15008597)
chr7 (9-87)||(19486787-19486865)
chr7 (30-78)||(9177718-9177766)
chr7 (27-99)||(18154873-18154944)
chr7 (37-80)||(14036282-14036325)
chr7 (37-80)||(14346312-14346355)
chr7 (13-178)||(14932685-14932851)
chr7 (13-178)||(15356120-15356286)
chr7 (13-178)||(15360234-15360400)
chr7 (62-130)||(2530139-2530205)
chr7 (76-161)||(26355998-26356083)
chr7 (76-161)||(26358450-26358535)
chr7 (28-80)||(18203831-18203882)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (9-270)||(13497-13756)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (9-270)||(15325-15584)
scaffold0114 (114-180)||(7393-7459)
[»] chr3 (82 HSPs)
chr3 (9-270)||(20698296-20698556)
chr3 (9-256)||(12399209-12399456)
chr3 (9-270)||(17487856-17488117)
chr3 (9-270)||(13442274-13442535)
chr3 (9-270)||(17499338-17499599)
chr3 (9-265)||(14972854-14973110)
chr3 (9-266)||(26686887-26687144)
chr3 (9-265)||(23083226-23083482)
chr3 (9-239)||(43840932-43841162)
chr3 (9-262)||(18438534-18438787)
chr3 (25-266)||(14576697-14576937)
chr3 (9-266)||(25476249-25476506)
chr3 (25-266)||(14572605-14572845)
chr3 (12-224)||(24153115-24153326)
chr3 (12-266)||(40213585-40213838)
chr3 (9-266)||(11424627-11424880)
chr3 (27-225)||(42386428-42386627)
chr3 (148-265)||(16796685-16796803)
chr3 (12-175)||(17672626-17672788)
chr3 (25-270)||(30029856-30030100)
chr3 (9-86)||(13210371-13210448)
chr3 (12-161)||(29172598-29172745)
chr3 (12-161)||(7781362-7781509)
chr3 (12-161)||(9707622-9707769)
chr3 (12-161)||(17463178-17463325)
chr3 (12-161)||(28848626-28848773)
chr3 (12-161)||(34159326-34159473)
chr3 (12-161)||(45606922-45607069)
chr3 (12-161)||(55476491-55476638)
chr3 (12-127)||(55500942-55501055)
chr3 (12-125)||(6469185-6469296)
chr3 (12-161)||(8899094-8899241)
chr3 (13-86)||(12174303-12174376)
chr3 (11-175)||(13544024-13544187)
chr3 (13-86)||(16097332-16097405)
chr3 (12-161)||(16454296-16454443)
chr3 (16-129)||(32307684-32307795)
chr3 (12-129)||(36166598-36166712)
chr3 (12-161)||(38961906-38962053)
chr3 (28-181)||(52523676-52523831)
chr3 (16-175)||(12567564-12567722)
chr3 (9-125)||(43550529-43550644)
chr3 (12-175)||(50242822-50242984)
chr3 (148-230)||(14179570-14179653)
chr3 (12-161)||(13151805-13151953)
chr3 (12-161)||(13154270-13154418)
chr3 (9-129)||(15470927-15471043)
chr3 (14-161)||(41123892-41124034)
chr3 (12-161)||(10247738-10247885)
chr3 (12-161)||(17446670-17446816)
chr3 (13-86)||(49668120-49668193)
chr3 (13-129)||(16103784-16103898)
chr3 (9-128)||(14234487-14234605)
chr3 (14-161)||(16282826-16282971)
chr3 (12-87)||(27165250-27165325)
chr3 (12-74)||(28194693-28194755)
chr3 (13-86)||(9512924-9512997)
chr3 (13-86)||(9520899-9520972)
chr3 (12-121)||(12119780-12119887)
chr3 (12-121)||(15412429-15412536)
chr3 (12-125)||(15977515-15977626)
chr3 (28-161)||(53070668-53070799)
chr3 (25-129)||(21618462-21618563)
chr3 (11-131)||(46822267-46822386)
chr3 (12-116)||(53301566-53301669)
chr3 (13-180)||(856140-856304)
chr3 (12-121)||(8499518-8499625)
chr3 (9-181)||(24340672-24340844)
chr3 (28-129)||(37251168-37251270)
chr3 (28-129)||(43925977-43926079)
chr3 (11-130)||(12511059-12511177)
chr3 (12-62)||(10556985-10557035)
chr3 (12-62)||(17737236-17737286)
chr3 (12-110)||(44494809-44494905)
chr3 (12-62)||(45577950-45578000)
chr3 (28-80)||(22110402-22110454)
chr3 (28-131)||(12377940-12378044)
chr3 (9-87)||(23274687-23274765)
chr3 (9-87)||(37642308-37642386)
chr3 (28-129)||(606327-606428)
chr3 (16-86)||(1644718-1644787)
chr3 (9-54)||(22147601-22147646)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (9-270)||(912-1170)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (9-268)||(16282-16538)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (9-270)||(7266-7524)
scaffold0106 (9-270)||(1289-1547)
scaffold0106 (12-62)||(15306-15356)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (9-270)||(13211-13472)
[»] chr6 (64 HSPs)
chr6 (9-261)||(20360829-20361081)
chr6 (9-268)||(16920495-16920751)
chr6 (9-270)||(20638143-20638404)
chr6 (9-269)||(22831503-22831762)
chr6 (9-184)||(35245586-35245758)
chr6 (9-267)||(22780090-22780348)
chr6 (9-266)||(17287660-17287917)
chr6 (9-265)||(29060540-29060796)
chr6 (21-253)||(11185517-11185746)
chr6 (9-162)||(16496244-16496396)
chr6 (9-265)||(25629220-25629476)
chr6 (9-265)||(19303406-19303661)
chr6 (10-266)||(18409691-18409947)
chr6 (9-262)||(20593773-20594026)
chr6 (9-123)||(20076700-20076812)
chr6 (12-175)||(25754809-25754971)
chr6 (10-175)||(30676710-30676874)
chr6 (12-161)||(12742317-12742464)
chr6 (12-161)||(18334607-18334754)
chr6 (12-161)||(19005046-19005193)
chr6 (12-161)||(19858934-19859081)
chr6 (12-125)||(22782227-22782338)
chr6 (12-161)||(24422547-24422694)
chr6 (9-86)||(27333262-27333339)
chr6 (9-86)||(27394002-27394079)
chr6 (12-161)||(33861794-33861941)
chr6 (12-161)||(33864278-33864425)
chr6 (13-129)||(19652199-19652313)
chr6 (12-116)||(25656629-25656731)
chr6 (10-175)||(34963371-34963535)
chr6 (9-86)||(1561303-1561380)
chr6 (12-157)||(1595549-1595692)
chr6 (12-161)||(2291195-2291342)
chr6 (12-161)||(8055029-8055176)
chr6 (12-161)||(26924655-26924802)
chr6 (9-86)||(28496515-28496592)
chr6 (9-86)||(29808926-29809003)
chr6 (25-129)||(25644336-25644440)
chr6 (12-161)||(1540926-1541073)
chr6 (12-125)||(25688502-25688613)
chr6 (25-87)||(9098557-9098619)
chr6 (28-161)||(18456735-18456866)
chr6 (28-161)||(18461895-18462026)
chr6 (9-129)||(20109140-20109257)
chr6 (12-125)||(20556943-20557054)
chr6 (15-121)||(16448582-16448686)
chr6 (25-128)||(19668387-19668491)
chr6 (12-161)||(3852032-3852179)
chr6 (28-129)||(23019425-23019525)
chr6 (9-62)||(25714417-25714470)
chr6 (11-131)||(19847995-19848114)
chr6 (28-80)||(23076749-23076801)
chr6 (146-265)||(25603250-25603370)
chr6 (28-80)||(35008167-35008219)
chr6 (62-184)||(27415887-27416008)
chr6 (11-123)||(23992429-23992540)
chr6 (9-87)||(8227554-8227632)
chr6 (28-110)||(18821866-18821946)
chr6 (25-81)||(4185870-4185926)
chr6 (9-56)||(22080799-22080846)
chr6 (36-216)||(15041465-15041644)
chr6 (30-87)||(33443068-33443124)
chr6 (146-265)||(25611588-25611708)
chr6 (25-81)||(4186383-4186439)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (9-270)||(46995-47247)
[»] chr5 (65 HSPs)
chr5 (9-258)||(22075018-22075268)
chr5 (9-270)||(23390356-23390617)
chr5 (9-270)||(21292830-21293090)
chr5 (9-266)||(8286706-8286964)
chr5 (9-266)||(25421532-25421789)
chr5 (9-266)||(24493569-24493825)
chr5 (9-266)||(25431395-25431651)
chr5 (9-266)||(13025311-13025567)
chr5 (9-266)||(13095495-13095751)
chr5 (12-266)||(24529223-24529477)
chr5 (9-262)||(9077952-9078205)
chr5 (9-176)||(21808343-21808510)
chr5 (9-162)||(21729033-21729185)
chr5 (9-263)||(1096467-1096721)
chr5 (147-266)||(22107237-22107357)
chr5 (9-116)||(21997549-21997655)
chr5 (9-86)||(19660879-19660956)
chr5 (12-224)||(22412187-22412388)
chr5 (12-161)||(264783-264930)
chr5 (12-161)||(10732955-10733102)
chr5 (12-161)||(20909012-20909159)
chr5 (9-86)||(21329541-21329618)
chr5 (9-86)||(36314577-36314654)
chr5 (12-161)||(39363384-39363531)
chr5 (12-161)||(36154798-36154942)
chr5 (28-128)||(20026942-20027043)
chr5 (16-129)||(37723910-37724020)
chr5 (28-129)||(22144068-22144168)
chr5 (13-86)||(22959576-22959649)
chr5 (12-161)||(29329934-29330081)
chr5 (12-161)||(42245380-42245527)
chr5 (25-125)||(20902060-20902158)
chr5 (9-131)||(21502156-21502277)
chr5 (13-127)||(21565546-21565659)
chr5 (12-125)||(2154665-2154776)
chr5 (9-86)||(19668898-19668975)
chr5 (12-161)||(29345980-29346127)
chr5 (12-161)||(32027393-32027540)
chr5 (12-121)||(38619434-38619541)
chr5 (12-121)||(39245136-39245243)
chr5 (12-121)||(11581254-11581361)
chr5 (12-161)||(29348453-29348600)
chr5 (12-161)||(29350926-29351073)
chr5 (13-121)||(23064512-23064618)
chr5 (25-224)||(18418596-18418793)
chr5 (15-121)||(18319089-18319193)
chr5 (114-216)||(18769919-18770020)
chr5 (12-98)||(20918026-20918110)
chr5 (114-216)||(22032419-22032520)
chr5 (114-184)||(23572182-23572252)
chr5 (9-86)||(26012079-26012154)
chr5 (12-121)||(10775731-10775838)
chr5 (12-121)||(31061068-31061175)
chr5 (11-131)||(17517201-17517320)
chr5 (62-184)||(18356367-18356488)
chr5 (28-129)||(22178221-22178323)
chr5 (148-266)||(21986011-21986130)
chr5 (62-184)||(20910745-20910866)
chr5 (12-62)||(20806854-20806904)
chr5 (36-97)||(21873277-21873337)
chr5 (13-62)||(26704075-26704124)
chr5 (13-62)||(26973808-26973857)
chr5 (9-54)||(40725853-40725898)
chr5 (25-79)||(26732884-26732937)
chr5 (76-129)||(20766122-20766174)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (9-258)||(4849-5098)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (9-270)||(1952-2213)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (9-270)||(1851-2112)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (9-268)||(5983-6245)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (9-265)||(20910-21167)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (9-266)||(3470-3727)
scaffold0292 (9-266)||(343-599)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (12-270)||(4991-5246)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (9-270)||(51582-51840)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (9-266)||(38761-39017)
scaffold0145 (9-221)||(32942-33153)
scaffold0145 (7-125)||(9744-9860)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (27-270)||(24161-24406)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (9-266)||(3015-3271)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (9-266)||(25896-26152)
scaffold0026 (9-266)||(39858-40113)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (11-262)||(39479-39729)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (11-262)||(75083-75333)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (12-266)||(22886-23139)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (69-270)||(6669-6871)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (16-265)||(25930-26179)
scaffold0122 (12-129)||(44709-44825)
scaffold0122 (164-265)||(33360-33461)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (9-239)||(8424-8650)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (10-266)||(17079-17337)
scaffold0056 (28-161)||(79299-79430)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (12-262)||(339818-340065)
scaffold0003 (12-161)||(158465-158612)
scaffold0003 (62-184)||(71353-71474)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (9-265)||(4508-4763)
scaffold0228 (9-265)||(12090-12345)
scaffold0228 (9-265)||(22042-22297)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (9-264)||(16466-16721)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (9-266)||(39913-40169)
scaffold0080 (28-129)||(19885-19987)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (9-266)||(8479-8732)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (10-213)||(3103-3306)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (9-148)||(28414-28552)
scaffold0046 (9-86)||(11292-11369)
scaffold0046 (9-86)||(1997-2074)
scaffold0046 (9-65)||(4552-4608)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (59-266)||(13141-13349)
scaffold0175 (9-85)||(34123-34199)
scaffold0175 (9-62)||(273-326)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (104-270)||(124679-124846)
scaffold0021 (10-129)||(174767-174883)
scaffold0021 (9-79)||(121766-121835)
scaffold0021 (28-128)||(136370-136471)
scaffold0021 (28-128)||(145078-145179)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (9-265)||(32824-33077)
scaffold0120 (9-265)||(45928-46181)
scaffold0120 (9-220)||(16113-16323)
scaffold0120 (9-62)||(17397-17450)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (30-265)||(4545-4779)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (148-266)||(1052-1171)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (9-127)||(11447-11564)
scaffold0235 (203-266)||(11377-11440)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (168-266)||(3640-3738)
scaffold0165 (168-266)||(7704-7802)
scaffold0165 (25-129)||(27751-27854)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (9-86)||(1113-1190)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (9-129)||(6535-6654)
scaffold0621 (25-157)||(8482-8613)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (9-81)||(119875-119947)
scaffold0023 (13-129)||(100378-100493)
scaffold0023 (12-161)||(94411-94558)
scaffold0023 (16-175)||(17440-17598)
scaffold0023 (12-161)||(44454-44602)
scaffold0023 (13-86)||(101503-101576)
scaffold0023 (13-129)||(40176-40291)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (91-265)||(27911-28086)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (9-86)||(6611-6688)
scaffold0333 (9-86)||(13991-14068)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (9-86)||(15821-15898)
scaffold0020 (13-62)||(178898-178947)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (13-129)||(19268-19383)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (98-216)||(26911-27027)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (12-161)||(13392-13539)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (28-129)||(13147-13247)
scaffold0357 (25-129)||(16102-16205)
scaffold0357 (28-80)||(2680-2732)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (12-161)||(20747-20894)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (12-161)||(37821-37968)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (13-129)||(133-248)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (12-175)||(4694-4856)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (13-129)||(2808-2923)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (9-81)||(1083-1155)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (73-235)||(3424-3588)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (12-175)||(82072-82234)
scaffold0037 (25-129)||(22672-22775)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (12-86)||(15664-15738)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (10-175)||(11286-11450)
scaffold0029 (114-184)||(12861-12931)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (13-127)||(160688-160800)
scaffold0001 (16-175)||(501088-501246)
scaffold0001 (12-121)||(85635-85742)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (25-86)||(1098-1159)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (15-175)||(4300-4459)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (11-175)||(10772-10935)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (9-86)||(6167-6244)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (12-161)||(13947-14094)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (9-128)||(12942-13057)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (12-161)||(136680-136827)
scaffold0028 (12-161)||(139149-139296)
scaffold0028 (12-161)||(144087-144234)
scaffold0028 (12-161)||(134211-134358)
scaffold0028 (12-161)||(141618-141765)
scaffold0028 (13-96)||(132662-132745)
scaffold0028 (27-81)||(62216-62270)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (25-129)||(5659-5762)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (13-81)||(2694-2762)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (13-129)||(14699-14814)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (9-128)||(12766-12884)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (28-110)||(1051-1132)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (12-125)||(16784-16895)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (9-129)||(32538-32654)
scaffold0034 (28-270)||(51744-51985)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (12-129)||(116430-116544)
scaffold0022 (28-129)||(128971-129072)
scaffold0022 (32-129)||(78345-78442)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (12-175)||(106-268)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (25-129)||(10543-10646)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (13-101)||(32102-32190)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (25-129)||(10543-10646)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (9-86)||(23927-24001)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (10-175)||(12249-12413)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (28-129)||(12587-12687)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (11-175)||(9241-9404)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (189-266)||(17851-17928)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (25-86)||(8118-8179)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (13-86)||(45836-45909)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (12-129)||(38704-38820)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (12-125)||(40400-40511)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (169-265)||(10323-10419)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (25-129)||(129921-130024)
scaffold0010 (28-87)||(60759-60818)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (26-125)||(29946-30043)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (25-129)||(25122-25226)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (114-180)||(1979-2045)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (28-86)||(6831-6889)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (9-87)||(11464-11542)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (114-216)||(21721-21822)
scaffold0210 (114-216)||(29613-29714)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (9-87)||(38299-38377)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (15-121)||(1336-1440)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (12-121)||(4214-4321)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (62-184)||(15362-15483)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (28-161)||(20394-20524)
scaffold0031 (9-176)||(128751-128917)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (32-129)||(38339-38437)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (9-76)||(4888-4954)
scaffold0395 (69-266)||(827-1021)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (12-161)||(12064-12205)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (13-86)||(28813-28887)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (28-181)||(53498-53651)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (12-129)||(161136-161252)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (9-181)||(17976-18148)
scaffold0247 (12-121)||(2184-2291)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (30-131)||(8059-8161)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (28-129)||(6284-6386)
scaffold0420 (28-75)||(13793-13840)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (202-270)||(20596-20664)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (28-87)||(569-628)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (13-62)||(23843-23892)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (13-62)||(36454-36503)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (28-129)||(97024-97126)
scaffold0006 (28-129)||(106302-106404)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (28-129)||(267679-267781)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (28-87)||(2694-2753)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (28-62)||(11982-12016)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (25-87)||(103674-103736)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (28-129)||(1798-1900)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (65-129)||(2220-2283)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (147-216)||(69930-70000)


Alignment Details
Target: scaffold0358 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 4712 - 4972
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  4712 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataaatacatc 4810  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  4811 aattgcaattcatcaaaatcttatgtatacaaatattcttcaagtaaggcataaacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacaactt 4910  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  4911 cacagattatacttaacctcattgttaagtcttaatcctacccaaaggttcaactgtcgaca 4972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 75 - 270
Target Start/End: Original strand, 1 - 196
Alignment:
Q  75 gcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcac 174  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  1 gcagtatacaaaaacagcatgacataaatacatcaattgcaattcatcaaaatcttatgtatacaaatattcttcaagtaaggcataaacattatatcac 100  T
Q  175 atcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  101 atcataatcaacaacaacatatcttatacaacttcacagattatacttaacctcattgttaagtcttaatcctacccaaaggttcaactgtcgaca 196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10544 - 10286
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||  |||||    
T  10544 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataataatatc 10448  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10447 aatttcaattcaacaacatcttaagtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacgacatatcttatacagctt 10348  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  10347 cacagattataattaaccttattattaagtcttaattctacccaagggttcaactctcgaca 10286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 909
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||    
T  1169 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatc 1071  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||| |||||| |||||||    
T  1070 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaaccaaaacacatcttaaacagctt 971  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  970 caaagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggttcaactctcgaca 909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 168099 - 167839
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||    
T  168099 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatc 168001  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||| |||||| |||||||    
T  168000 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaaccaaaacacatcttaaacagctt 167901  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  167900 caaagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggttcaactctcgaca 167839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Original strand, 51913 - 52170
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  51913 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatc 52011  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||| |||||| |||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||  || ||||| |||||| ||||||    
T  52012 aattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatctacatcaacacatcttaaacagct 52111  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  52112 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctc 52170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 66)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 31971257 - 31971516
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  31971257 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 31971354  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  31971355 aattccaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacatctt 31971454  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  31971455 cacagattataattaacctcattgttaagtcttaatcctacccaaaggttcagctctcgaca 31971516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16199765 - 16199506
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||  || ||||||||||  |||||    
T  16199765 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattcaaa--caacatgacataataatatc 16199668  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    |||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16199667 aatttcaattcatctacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcataaacattatattacatcataatcaacaacaacatatcttatacagctt 16199568  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  16199567 cacagattataattaacctcattgttaagtcttaatcctacccaagggttcaactctcgaca 16199506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 45131117 - 45130858
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||  |||||    
T  45131117 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtaaacaaa--cagcatgacataataatatc 45131021  T
Q  109 aattgcaa-ttcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45131020 aatttcaaattcatcaacatcttaggtatacaattattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcatcaacaacaaatcttatacagct 45130921  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||    
T  45130920 tcacagattataattaacctcattattaagtcttaatcctacccaagggtccaactctcgaca 45130858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 21919121 - 21918860
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  21919121 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 21919023  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaata-ttcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  21919022 aattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcagcagcaacacatcttaaacagct 21918923  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    ||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||    
T  21918922 tcacagatcgtaattaacctcatcgttaagtcttaatcttacccaagggttcaactctcgaca 21918860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 20536208 - 20536469
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  20536208 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 20536306  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||  || ||||| |||||| ||| ||    
T  20536307 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcgacatcaacacatcttaaacaact 20536406  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||    
T  20536407 tcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactaccccaaggttcaacactcgaca 20536469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21396101 - 21395883
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||||||    
T  21396101 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa---cagcatgagataattatatc 21396005  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  21396004 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcataaacattataacacttcataatcaataacaacatatcttattcagctt 21395905  T
Q  209 cacagattataattaacctctt 230  Q
    ||||||||| ||||||| ||||    
T  21395904 cacagattacaattaacttctt 21395883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21790594 - 21790376
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||||||    
T  21790594 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa---cagcatgagataattatatc 21790498  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  21790497 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcataaacattataacacttcataatcaataacaacatatcttattcagctt 21790398  T
Q  209 cacagattataattaacctctt 230  Q
    ||||||||| ||||||| ||||    
T  21790397 cacagattacaattaacttctt 21790376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21389571 - 21389358
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||| ||||||    
T  21389571 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa---cagcatgacataattatatc 21389475  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  21389474 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcataaacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagctt 21389375  T
Q  209 cacagattataattaac 225  Q
    |||| |||| |||||||    
T  21389374 cacatattacaattaac 21389358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21778897 - 21778697
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||| ||||||    
T  21778897 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa---cagcatgacataattatatc 21778801  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  21778800 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcataaacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagctt 21778701  T
Q  209 caca 212  Q
    ||||    
T  21778700 caca 21778697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18818530 - 18818273
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  18818530 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 18818432  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    ||||| || |||||| |||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  18818431 aattgtaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagct 18818332  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||  ||||||||||    
T  18818331 tcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactaccctaaatttcaactctc 18818273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Original strand, 22626736 - 22626992
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  22626736 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 22626833  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    || | ||| ||||||||||||||  ||| ||| ||| ||||||||||||  || | |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  22626834 aaatacaaatcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtgtataacattatatcacatcattatcatcatcaacacatcttaaacagct 22626933  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||    
T  22626934 tcacagattataattaacatcctcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctc 22626992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18879352 - 18879097
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||     ||||||  |||||    
T  18879352 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaaca-----acataataatatc 18879259  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgc--ataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagc 206  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||| ||||    
T  18879258 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataa-cattatatcacatcataatcaacatcagcacatcttat-cagc 18879161  T
Q  207 ttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||    
T  18879160 ttcacagattatagttaacatcatcattaagtcttgatgctatcccaaggttcaactctcgaca 18879097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21924049 - 21923792
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| |  |||||    
T  21924049 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatc 21923951  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| | | | |||| |  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  21923950 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataaccttattttgcatcataatcaacaacaacacatcttaaacagct 21923851  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||    
T  21923850 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactacctcaaggttcaactctc 21923792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28649164 - 28648908
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatca 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||    
T  28649164 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa-agcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 28649066  T
Q  110 attgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    | ||||| ||||||||||||||  ||||||   ||  |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||    
T  28649065 aatgcaagtcaacaacatcttaattatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 28648966  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||    
T  28648965 cacatattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctc 28648908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 7372778 - 7373001
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  7372778 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7372876  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    |||||||| |||||| |||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||       |||||||||| |||||||| || ||||| |||||| |||||||    
T  7372877 aattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgc-------ttatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 7372969  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtct 240  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7372970 cacagattataattaacatcctcattaagtct 7373001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 239
Target Start/End: Original strand, 23406379 - 23406611
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  23406379 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23406477  T
Q  109 aattgcaattcaac--aacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacag 205  Q
    |||||||| |||||  | |||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| | | |||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||| |||     
T  23406478 aattgcaagtcaacatatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacatagtcaacatcaacacatcttaaacaa 23406577  T
Q  206 cttcacagattataattaacctcttcattaagtc 239  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  23406578 cttcacatattataattaacatcctcattaagtc 23406611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Original strand, 6759255 - 6759512
Alignment:
Q  6 tggacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatat 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||  ||    
T  6759255 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataat 6759353  T
Q  106 atcaattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatctt-atac 203  Q
    ||||| ||||| |   |||||||| |  ||||||   ||  ||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| | ||    
T  6759354 atcaaatgcaagt---caacatctcaattatacactcataattcaattaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaac 6759450  T
Q  204 agcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactct 265  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||    
T  6759451 agcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactct 6759512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16092463 - 16092206
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  16092463 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 16092365  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatctt-atacagc 206  Q
    || ||||| |||||||||||| |  ||||||   ||  || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| | ||| |    
T  16092364 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataatttaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacaac 16092265  T
Q  207 ttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactct 265  Q
    ||| || |||||||||||| || || |||||||| |||  | ||| |||||||||||||    
T  16092264 ttcgcatattataattaacatcatccttaagtctcaatattaccccaaggttcaactct 16092206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 266
Target Start/End: Original strand, 23648554 - 23648810
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatca 109  Q
    ||||| |||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||  ||||| | || ||||||||||  ||||||    
T  23648554 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaat-agcaacataggcagattacaacaacaacatgacataataatatca 23648652  T
Q  110 attgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
     ||||||| |||||||||||||  ||| |||  |  |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||    
T  23648653 tttgcaatacaacaacatcttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 23648752  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
     |||||||||||||||| || |||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  23648753 aacagattataattaacatcatcattaggtcttaatactaccccaaggttcaactctc 23648810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Original strand, 22875065 - 22875321
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  22875065 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagc-agcagcaacacaggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 22875162  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatctt-atacagc 206  Q
    || ||||| |||||||||||| |  ||||||   ||  |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| | |||||    
T  22875163 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagc 22875262  T
Q  207 ttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactct 265  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||  ||| ||| || ||| |||||||||||||    
T  22875263 ttcacagattataattaacatcaccattacatctcaatactaccccaaggttcaactct 22875321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 148 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25363123 - 25363004
Alignment:
Q  148 tcaagtaatgcataat-cattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgc 246  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  25363123 tcaagtaatgcataaaacattataccacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaatac 25363024  T
Q  247 tgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  25363023 tacccaaaggttcaactctc 25363004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Original strand, 21490995 - 21491072
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21490995 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 21491072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Original strand, 17140916 - 17140988
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17140916 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 17140988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 38855372 - 38855253
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  |||||    
T  38855372 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 38855274  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatct 129  Q
     | ||||| ||||||||||||    
T  38855273 gaatgcaaatcaacaacatct 38855253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 5866395 - 5866318
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5866395 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 5866318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 14409606 - 14409459
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  14409606 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14409509  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  14409508 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 14409459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16413474 - 16413316
Alignment:
Q  16 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 115  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||    
T  16413474 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 16413377  T
Q  116 attcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
    | |||||||| ||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16413376 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 16413316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 21285613 - 21285716
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||    
T  21285613 caacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaa 21285711  T
Q  125 catct 129  Q
    |||||    
T  21285712 catct 21285716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Original strand, 6520368 - 6520486
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  |||||    
T  6520368 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 6520466  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatc 128  Q
     | ||||| ||| |||||||    
T  6520467 gaatgcaagtcatcaacatc 6520486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 1484402 - 1484549
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  1484402 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 1484499  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  1484500 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 1484549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 5853454 - 5853307
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  5853454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 5853357  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  5853356 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 5853307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 20403227 - 20403374
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  20403227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20403324  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  20403325 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 20403374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 22001753 - 22001900
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  22001753 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22001850  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  22001851 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 22001900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 26355815 - 26355742
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26355815 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 26355742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 41598188 - 41598335
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | | ||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  41598188 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41598285  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  41598286 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 41598335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 17612231 - 17612153
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 87  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17612231 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaa 17612153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 23760962 - 23760893
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 81  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23760962 acatcatcatcttcaac---ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 23760893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 4483281 - 4483427
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  4483281 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 4483377  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  4483378 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 4483427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 4542535 - 4542388
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  ||  |||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  4542535 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acaagatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 4542438  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  4542437 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatagttcaagtaatgcata 4542388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 15203393 - 15203246
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  15203393 tcatcatcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15203296  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    || || |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  15203295 tgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 15203246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 20046357 - 20046246
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| || ||||||||||  |||||||     
T  20046357 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 20046260  T
Q  112 tgcaattcaacaac 125  Q
    ||||| ||||||||    
T  20046259 tgcaagtcaacaac 20046246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 18678221 - 18678102
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    |||| |||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  | || |||||||||  ||||  | ||||| |||||||| |||||||    
T  18678221 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaat-agcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaa 18678123  T
Q  111 ttgcaattcaacaacatctta 131  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18678122 ttgcaattcaacaacatctta 18678102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 21673720 - 21673823
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | ||||| |||||||    
T  21673720 caacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaa 21673818  T
Q  125 catct 129  Q
    |||||    
T  21673819 catct 21673823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 59
Target Start/End: Original strand, 21249384 - 21249434
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249384 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 21249434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 59
Target Start/End: Original strand, 21255222 - 21255272
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255222 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 21255272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 983511 - 983450
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  983511 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaa 983450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 19896265 - 19896415
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacata--aat-atatc 108  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  | |||||||||| ||||||||||||  ||| |||||    
T  19896265 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cggtatacaaaaacagcatgacataataataatatc 19896362  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    || ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  19896363 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 19896415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Original strand, 26219717 - 26219831
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | |||||||||||||| || |||||||||  |||||||     
T  26219717 tcatcatcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaat-agtatgacataataatatcaaa 26219813  T
Q  112 tgcaattcaacaacatct 129  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  26219814 tgcaagtcaacaacatct 26219831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 32121734 - 32121853
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    |||| |||||| | |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  | || |||||||||  ||||  | ||||| |||||||| |||||||    
T  32121734 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaat-agcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaa 32121832  T
Q  111 ttgcaattcaacaacatctta 131  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  32121833 ttgcaattcaacaacatctta 32121853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 14823774 - 14823920
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  14823774 tcatcatcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataacaa-caacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14823870  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  14823871 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 14823920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498681
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacat 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||| ||| ||||||    
T  20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaat-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 20498679  T
Q  128 ct 129  Q
    ||    
T  20498680 ct 20498681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 121
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070665
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | | ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15070665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 17267096 - 17267044
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17267096 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagta 17267044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 17439609 - 17439507
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaacaac 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| |||  ||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  17439609 cttagtccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 17439511  T
Q  126 atct 129  Q
    ||||    
T  17439510 atct 17439507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116468
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaacaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| | |||| |||  ||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37116464  T
Q  126 atct 129  Q
    ||||    
T  37116465 atct 37116468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 19937174 - 19937081
Alignment:
Q  6 tggacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataa 101  Q
    ||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  19937174 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataa 19937081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 13508199 - 13508034
Alignment:
Q  16 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 115  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||| || || || ||||| ||||  ||||| |  |||    
T  13508199 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacgca 13508101  T
Q  116 attcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataa 181  Q
    | | |||||||||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  13508100 agtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 13508034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 26225409 - 26225359
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225409 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 26225359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 45290853 - 45290761
Alignment:
Q  16 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  45290853 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 45290761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Original strand, 24353039 - 24353091
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  24353039 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagta 24353091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 13597731 - 13597660
Alignment:
Q  16 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 87  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||| || |||||    
T  13597731 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaa 13597660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 19154989 - 19154930
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 87  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19154989 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa 19154930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 26223917 - 26224034
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatca 109  Q
    ||||| |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| | || || |||||||||  ||||||||||||  ||||||    
T  26223917 catcaacatcttaatcaacttagatcgacccatgcagcttaattaaataacaa-cagcaataaag-caatatacaaaaatagcatgacataataatatca 26224014  T
Q  110 attgcaattcaacaacatct 129  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  26224015 aatgcaagtcaacaacatct 26224034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801397
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacat 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||  |||| |||||||| |    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-acagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgt 19801431  T
Q  128 cttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    || |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  19801430 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 19801397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 25484430 - 25484290
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||         | ||  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  25484430 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataaca---------acagctagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 25484340  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  25484339 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 25484290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 80
Target Start/End: Original strand, 22525579 - 22525628
Alignment:
Q  30 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||    
T  22525579 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacaacaacttaggcagta 22525628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Original strand, 12902757 - 12903014
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  12902757 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 12902855  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataat-cattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    ||||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  12902856 aattgtaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagct 12902955  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12902956 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatcctacccaaaggttcaactctc 12903014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 7088877 - 7089138
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  7088877 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7088975  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataat-cattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||| ||    
T  7088976 aattgcaattcatcaacatcttacatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattagcaacaacacatcttaaacaact 7089075  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  7089076 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctactcaaaggttcaactctcgaca 7089138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 14053422 - 14053162
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||  |||||    
T  14053422 acatcatcatcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa--cagcatgacataataatatc 14053325  T
Q  109 aattgcaattcaacaacat-cttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  14053324 aatttcaattcatcaacattcttatgcatacaaatattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacggct 14053225  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  14053224 tcacagattataattaacctcattgttaagtcttaatcctacccaagggttcaactctcgaca 14053162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23374473 - 23374231
Alignment:
Q  16 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23374473 catcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 23374375  T
Q  116 attcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcat-aatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacaga 214  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||| |  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||| |||    
T  23374374 attcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacagatcttaaaaagcttcagaga 23374275  T
Q  215 ttataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggtt 258  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23374274 ttatagttaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggtt 23374231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 44052829 - 44053090
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  44052829 acatcatcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataacaa-catcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 44052927  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgc--ataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagc 206  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || || || |||||| |||||    
T  44052928 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataa-cattatatcacatcataatcaacatcagcacatcttaaacagc 44053026  T
Q  207 ttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  44053027 ttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcccaaggttcaactctcgaca 44053090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 244
Target Start/End: Original strand, 17046487 - 17046719
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||   || |||||||||| ||||||    
T  17046487 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatagaa---caacatgacataattatatc 17046583  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17046584 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgtataaacattataacacatcttaatcaacaacaacatatcttattcagctt 17046683  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaat 244  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  17046684 cacagattataattaaccttattattaagtcttaat 17046719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Original strand, 22636437 - 22636691
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  22636437 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 22636535  T
Q  111 ttgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttc 209  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  || ||||| |||||| ||||||||    
T  22636536 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcgacatcaacacatctta-acagcttc 22636634  T
Q  210 acagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||| || ||| ||||||||| ||||    
T  22636635 acagattataattaacatcctcgttaagtcttaatactaccccaaggttcaattctc 22636691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 267
Target Start/End: Original strand, 7893703 - 7893958
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  7893703 acatcatcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7893801  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||| |||||| |||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||||||   |||| ||||| |||||| ||||||    
T  7893802 aattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataccattatttcacatcata---atcagcaacacatcttaaacagct 7893898  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcg 267  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||    
T  7893899 tcacagattataattaacatcatcgttaagtcttaatattaccccaaggttcaactctcg 7893958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16377639 - 16377387
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||     
T  16377639 tcattatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatcaaa 16377543  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttca 210  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||   ||  |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| |||||| ||    
T  16377542 tgcaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctcca 16377443  T
Q  211 cagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||    
T  16377442 cagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctc 16377387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16240090 - 16239834
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  16240090 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataacaat-agcaaaataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 16239993  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    || ||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||| ||| |||||||||| | | |||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  16239992 aaatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatactttaagtaatgcaaataacattatatcatatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 16239893  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| || |||||||||||    
T  16239892 tcgcagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaagttcaactctc 16239834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16270356 - 16270145
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  16270356 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 16270259  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    || ||||| | ||||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  16270258 aaatgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 16270159  T
Q  208 tcacagattataat 221  Q
    ||||||||||||||    
T  16270158 tcacagattataat 16270145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 265
Target Start/End: Original strand, 14038653 - 14038904
Alignment:
Q  14 atcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattg 113  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||| || |||| |||||  ||||||| ||    
T  14038653 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatg 14038751  T
Q  114 caattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcaca 212  Q
    ||| |||||||||||| |  ||||||   ||  ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||    
T  14038752 caagtcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatgttaaacagcttcaca 14038851  T
Q  213 gattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactct 265  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||    
T  14038852 gattataattaatatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactct 14038904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 7798774 - 7798958
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  7798774 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7798872  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaaca 193  Q
    |||||||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| | | |||| ||||||| |||||||| || |||||    
T  7798873 aattgcaagtcatcaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattgtatcacaacataatcaacatcaaca 7798958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 52873488 - 52873367
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  52873488 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 52873390  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatctta 131  Q
    |||||||| |||||| |||||||    
T  52873389 aattgcaagtcaacatcatctta 52873367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 270
Target Start/End: Original strand, 3096772 - 3096904
Alignment:
Q  138 caaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagattataattaacctcttcattaag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3096772 caaatattcttcaagtaatgcataaacattgtatctcatcataatcagcaacaacacatcttaaacagcttcacatattataattaacctcatcattaag 3096871  T
Q  238 tcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    | || || || ||||||||||||||||||||||    
T  3096872 tatttatcctacccaaaggttcaactctcgaca 3096904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 181
Target Start/End: Original strand, 6899891 - 6900062
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||  |||||  |||||    
T  6899891 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatagcataataatatc 6899988  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatg--cataatcattatatcacatcataa 181  Q
    || ||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  6899989 aaatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataa-cattatatcacatcataa 6900062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 96
Target Start/End: Original strand, 3096293 - 3096379
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatga 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3096293 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 3096379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 148 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17048055 - 17047936
Alignment:
Q  148 tcaagtaatgcataat-cattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgc 246  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  17048055 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacaggttgtaattagtctcttcattaagtcttaatac 17047956  T
Q  247 tgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  17047955 tacccaaaggttcaactctc 17047936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Original strand, 15551817 - 15551889
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15551817 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 15551889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18215436 - 18215289
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  18215436 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18215339  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  18215338 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 18215289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 39706409 - 39706332
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39706409 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 39706332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 44929042 - 44928894
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  || ||||     
T  44929042 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaa 44928944  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||| ||||||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  44928943 tgcaagtcaataacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 44928894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 54798872 - 54798756
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  54798872 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 54798774  T
Q  112 tgcaattcaacaacatct 129  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  54798773 tgcaagtcaacaacatct 54798756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 23803427 - 23803265
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | ||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  23803427 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23803330  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23803329 tgcaaatcaacaacgtctaaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 23803265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 175
Target Start/End: Original strand, 19242693 - 19242861
Alignment:
Q  6 tggacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatat 105  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |  |||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  19242693 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataat 19242790  T
Q  106 atcaattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19242791 atcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 19242861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 12469 - 12322
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  12469 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12372  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  12371 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 12322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Original strand, 14280316 - 14280431
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| || ||||||||||  |||||||     
T  14280316 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 14280413  T
Q  112 tgcaattcaacaacatct 129  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  14280414 tgcaagtcaacaacatct 14280431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 15118514 - 15118367
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  15118514 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15118417  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  15118416 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 15118367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 52312510 - 52312657
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  52312510 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 52312607  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  52312608 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 52312657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 3515007 - 3515169
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||     
T  3515007 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaa 3515104  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3515105 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 3515169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 51464030 - 51463868
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | ||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  51464030 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 51463933  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  ||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  51463932 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcaca 51463868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 52243301 - 52243099
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||  ||||||| || ||||||||    
T  52243301 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaac 52243203  T
Q  123 aacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttat-acagcttcacagattataa 220  Q
    ||||||| |   || || ||||  | ||||||||||||| |  |||||||||||| |||| || || |||   ||||||| |||||||||||||| || |    
T  52243202 aacatctcaaacattcatatataatccaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacagatcatca 52243103  T
Q  221 ttaa 224  Q
    ||||    
T  52243102 ttaa 52243099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 1837671 - 1837503
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  ||| |||     
T  1837671 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaa 1837574  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataa 181  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  1837573 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacgattatatcacattataa 1837503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12288315 - 12288211
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||  ||||| ||||  ||||||| |||||||||||    
T  12288315 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaac-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaac 12288217  T
Q  123 aacatc 128  Q
    ||||||    
T  12288216 aacatc 12288211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19618336 - 19618172
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatca 109  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||    
T  19618336 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatca 19618239  T
Q  110 attgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
    | ||||| |||||||| ||| |  ||| ||  |||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19618238 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacctataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 19618172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 12774011 - 12774084
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12774011 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 12774084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18239581 - 18239434
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  18239581 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18239484  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  18239483 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 18239434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 44102214 - 44102361
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | | ||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  44102214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaataacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44102311  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| | |||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  44102312 tgcaagtaaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 44102361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 44615288 - 44615435
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||  |||||||||||||  |||||||     
T  44615288 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 44615385  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  44615386 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 44615435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 44773249 - 44773138
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  44773249 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44773152  T
Q  112 tgcaattcaacaac 125  Q
    ||||| ||||||||    
T  44773151 tgcaagtcaacaac 44773138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 50222501 - 50222354
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  50222501 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 50222404  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  50222403 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 50222354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13800
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||||| ||||| ||| ||||||    
T  13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 13855  T
Q  128 cttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataa 181  Q
    || |  ||| || ||||  ||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||||    
T  13854 ctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataa 13800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15121834 - 15121749
Alignment:
Q  98 ataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatca 184  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  15121834 ataattatatcaatt-caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcataaacattataatacatcataatca 15121749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 8846360 - 8846433
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  8846360 catcatcatcatcaacttagaccgacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 8846433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 15355483 - 15355380
Alignment:
Q  16 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 115  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||    
T  15355483 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 15355386  T
Q  116 attcaa 121  Q
    | ||||    
T  15355385 agtcaa 15355380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Original strand, 15367690 - 15367800
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  15367690 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15367787  T
Q  109 aattgcaattcaa 121  Q
    || ||||| ||||    
T  15367788 aaatgcaagtcaa 15367800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Original strand, 15370018 - 15370128
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  15370018 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15370115  T
Q  109 aattgcaattcaa 121  Q
    || ||||| ||||    
T  15370116 aaatgcaagtcaa 15370128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Original strand, 15371202 - 15371312
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  15371202 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15371299  T
Q  109 aattgcaattcaa 121  Q
    || ||||| ||||    
T  15371300 aaatgcaagtcaa 15371312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Original strand, 15373483 - 15373593
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  15373483 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15373580  T
Q  109 aattgcaattcaa 121  Q
    || ||||| ||||    
T  15373581 aaatgcaagtcaa 15373593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Original strand, 15402703 - 15402813
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  15402703 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15402800  T
Q  109 aattgcaattcaa 121  Q
    || ||||| ||||    
T  15402801 aaatgcaagtcaa 15402813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 111
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190564
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| || |||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaat 6190564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 12610950 - 12611105
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |        |||||| |||||||||||||  |||||||     
T  12610950 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca--------acaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12611040  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12611041 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12611105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14970856 - 14970707
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaa 124  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| | || || ||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
T  14970856 caacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaaaacag-caatatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 14970759  T
Q  125 catcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
    | ||| |  ||| || ||||  |||||||||| |||| || |||||||||||    
T  14970758 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatataattatatcaca 14970707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 161
Target Start/End: Original strand, 22353835 - 22353984
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||  |  |  | || ||||||||||  |||||||    
T  22353835 atcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttaggtaaataac-aacagcagcataggcagattgtagcaacaacatgacataacaatatcaa 22353933  T
Q  111 ttgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    || |||||||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  22353934 ttacaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 22353984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 43198660 - 43198598
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  43198660 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaa 43198598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 8574985 - 8574871
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |  |||||||||||| || ||||||||||  |||||||     
T  8574985 tcatcatcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaa 8574889  T
Q  112 tgcaattcaacaacatct 129  Q
    || |||||||||||||||    
T  8574888 tgtaattcaacaacatct 8574871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Original strand, 16223532 - 16223622
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataa 101  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  16223532 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataa 16223622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 7641344 - 7641294
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641344 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 7641294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 265
Target Start/End: Original strand, 15091093 - 15091152
Alignment:
Q  206 cttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactct 265  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||    
T  15091093 cttcacagattataattaacatcttcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactct 15091152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 46640558 - 46640499
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  46640558 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaa 46640499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21815731 - 21815600
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| |  | |||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||| |||||||| |    
T  21815731 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataac-gacagcaacaca-actgtatacaaaaacagcatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgt 21815634  T
Q  128 cttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    || |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  21815633 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 21815600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 53082254 - 53082202
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||    
T  53082254 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagta 53082202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 43256227 - 43256106
Alignment:
Q  62 aacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaat-attcttcaagtaatgcat 160  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||  || ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  43256227 aacagcaacataggcagcataccaa--caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaataattctt-aagtaatgcat 43256131  T
Q  161 a-atcattatatcacatcataatca 184  Q
    | |  |||||||||||| |||||||    
T  43256130 ataatattatatcacattataatca 43256106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27250850 - 27250589
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  27250850 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 27250752  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataat-cattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  27250751 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagct 27250652  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27250651 tcacagattataattaacctcttcattaagtatcaatgctacccaaaggttcaactctcgaca 27250589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 21026680 - 21026929
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21026680 acatcatcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatc 21026778  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataat-cattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  21026779 aattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacagcaacacatcttaaacagct 21026878  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggtt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21026879 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggtt 21026929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 50210333 - 50210077
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatca 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||    
T  50210333 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 50210235  T
Q  110 attgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    | ||||| |||||||||||| | |||||||   ||  |||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||    
T  50210234 aatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 50210135  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  50210134 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactacccaaaggttcaactctc 50210077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 38801508 - 38801258
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||   ||||| ||||||| ||||||    
T  38801508 acatcatcatcttcaacatcttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaa---cagcaagacataattatatc 38801413  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    || | ||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  38801412 aaattcaattcatcaacatattatatatacaattattcttcaagtaatgcataaacattataacacatcgtaatcaacaacaacatatcttattcagctt 38801313  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaact 263  Q
    |||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  38801312 cacaaattatagttaatctcattattaagtcttaatcctacccaagggttcaact 38801258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Original strand, 34509783 - 34510033
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  34509783 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaa 34509881  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttca 210  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||   ||   ||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||| |||||||||    
T  34509882 tgcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttca 34509981  T
Q  211 cagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaac 262  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||| ||||||||||    
T  34509982 aagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaac 34510033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Original strand, 22532269 - 22532526
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  22532269 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 22532367  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
     ||||||||||||||||||||||  ||| ||   ||  ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  22532368 cattgcaattcaacaacatcttaaatattcattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 22532467  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||||| | |||| |||| || ||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||||    
T  22532468 tcacagttcataaataacatcatcattaagtctcaatactacctcaaggttcaactctc 22532526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 89 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22354614 - 22354436
Alignment:
Q  89 cagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatca 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  22354614 cagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaaca 22354515  T
Q  188 acaacatatcttatacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || || |||||||||| ||||    
T  22354514 tcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactacctaaaggttcaattctc 22354436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 266
Target Start/End: Original strand, 20135188 - 20135444
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatca 109  Q
    ||||| |||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  | || |||||||||  ||||| | || ||||||||||  ||||||    
T  20135188 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaacaat-agcagcataggcagattacaacaacatcatgacataataatatca 20135286  T
Q  110 attgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
      |||||||||||||||||||| |||| |||  |  |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| | || ||||| |||||| |||||||    
T  20135287 tgtgcaattcaacaacatcttaagtattcaataaaacttcaagtaatgcatacaacattatatcatatcataatgaacatcaacacatcttaaacagctt 20135386  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| |||||| | || ||| ||||||||||||||    
T  20135387 cacagattataattaacaacatcattaggtcttactactaccctaaggttcaactctc 20135444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 20847275 - 20847175
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20847275 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtacacaaaatcagcatgacataaatatatc 20847177  T
Q  109 aa 110  Q
    ||    
T  20847176 aa 20847175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22468816 - 22468604
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatca 109  Q
    ||||| |||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||  ||||| | ||||||||||| |  ||||||    
T  22468816 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaat-agcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcataatatca 22468718  T
Q  110 attgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||   |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| | || || || |||||| |||||||    
T  22468717 attgcaattcaacaacatcttaattattcaataatatctcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatta-catcagcacatcttaaacagctt 22468619  T
Q  209 cacagattataatta 223  Q
    |||||||||||||||    
T  22468618 cacagattataatta 22468604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 138 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22356168 - 22356034
Alignment:
Q  138 caaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatca-tcaacaacatatcttatacagcttcacagattataattaacctcttcatta 235  Q
    |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22356168 caaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatcatcaacacatcttaaatagcttcacagattataattaacatcatcatta 22356069  T
Q  236 agtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  22356068 agtcttaatgctatcccaaggttcaactctcgaca 22356034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 138 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22357854 - 22357720
Alignment:
Q  138 caaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatca-tcaacaacatatcttatacagcttcacagattataattaacctcttcatta 235  Q
    |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22357854 caaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatcatcaacacatcttaaatagcttcacagattataattaacatcatcatta 22357755  T
Q  236 agtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  22357754 agtcttaatgctatcccaaggttcaactctcgaca 22357720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 45575008 - 45574893
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |    
T  45575008 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatacc 45574910  T
Q  109 aattgcaattcaacaac 125  Q
    || ||||| ||||||||    
T  45574909 aaatgcaagtcaacaac 45574893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 129
Target Start/End: Original strand, 21754052 - 21754163
Alignment:
Q  16 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 115  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||||| ||||    
T  21754052 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgca 21754150  T
Q  116 attcaacaacatct 129  Q
    | ||||||||||||    
T  21754151 a-tcaacaacatct 21754163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 22921986 - 22921871
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaatt 112  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | |    
T  22921986 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 22921888  T
Q  113 gcaattcaacaacatct 129  Q
    |||| ||||||||||||    
T  22921887 gcaaatcaacaacatct 22921871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 23593897 - 23593735
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  23593897 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23593800  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23593799 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 23593735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 13988866 - 13989013
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  13988866 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13988963  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  13988964 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 13989013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21923453 - 21923306
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  21923453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21923356  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  21923355 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 21923306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 31612313 - 31612460
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |   ||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  31612313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 31612410  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  31612411 tgcaagtcaacaacatctcagttattcacatataattcaagtaatgcata 31612460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 14295672 - 14295595
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  14295672 acatcatcatcttcaacattttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaa 14295595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 16275526 - 16275419
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  16275526 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataac-aacaacgacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 16275429  T
Q  112 tgcaattcaa 121  Q
    ||||| ||||    
T  16275428 tgcaagtcaa 16275419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21475249 - 21475102
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  21475249 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21475152  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  21475151 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 21475102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 175
Target Start/End: Original strand, 21840766 - 21840929
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||| || ||||||||||  |||||||    
T  21840766 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 21840863  T
Q  111 ttgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
     ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  || |||||||||||| || |||||||||||    
T  21840864 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcaca 21840929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 433012 - 433157
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||  ||||| ||||||||||||||| || || |||||||  |||||||     
T  433012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat----aacggcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaa 433107  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  433108 tgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 433157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Original strand, 20248283 - 20248394
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaatt 112  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | |    
T  20248283 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 20248381  T
Q  113 gcaattcaacaac 125  Q
    |||| ||||||||    
T  20248382 gcaaatcaacaac 20248394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 230
Target Start/End: Original strand, 48603652 - 48603735
Alignment:
Q  148 tcaagtaatgcataat-cattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagattataattaacctctt 230  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48603652 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacttctt 48603735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896258
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacat 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||| ||| ||||||    
T  21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21896260  T
Q  128 ct 129  Q
    ||    
T  21896259 ct 21896258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 29298137 - 29298283
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||     
T  29298137 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaa 29298233  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  29298234 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 29298283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 29776688 - 29776835
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||  | ||||||||||  |||||||     
T  29776688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaa 29776785  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  29776786 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 29776835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 52928075 - 52928014
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  52928075 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaa 52928014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22123230 - 22123119
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||     
T  22123230 tcatcatcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacaca-acagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 22123132  T
Q  112 tgcaattcaacaa 124  Q
    ||||| |||||||    
T  22123131 tgcaagtcaacaa 22123119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 121
Target Start/End: Original strand, 21342090 - 21342203
Alignment:
Q  6 tggacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatat 105  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | ||||||||||||| || ||||||||||  ||    
T  21342090 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataat 21342187  T
Q  106 atcaattgcaattcaa 121  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  21342188 atcaaatgcaagtcaa 21342203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Original strand, 33681010 - 33681084
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  33681010 acatcatcatcttcaac---ttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 33681084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35261086
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 35261086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 86
Target Start/End: Original strand, 16758665 - 16758726
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16758665 caacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 16758726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 86
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918681
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgcaaa 20918681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 21346961 - 21347068
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | ||||||||||||| || ||||||||||  |||||||     
T  21346961 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 21347058  T
Q  112 tgcaattcaa 121  Q
    ||||| ||||    
T  21347059 tgcaagtcaa 21347068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Original strand, 21707167 - 21707278
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||||||||||  ||||||||| ||  |||||||     
T  21707167 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaa 21707264  T
Q  112 tgcaattcaacaac 125  Q
    ||||| ||||||||    
T  21707265 tgcaagtcaacaac 21707278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Original strand, 21711709 - 21711820
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||||||||||  ||||||||| ||  |||||||     
T  21711709 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaa 21711806  T
Q  112 tgcaattcaacaac 125  Q
    ||||| ||||||||    
T  21711807 tgcaagtcaacaac 21711820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861572
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||| ||| ||||||    
T  21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21861574  T
Q  128 ct 129  Q
    ||    
T  21861573 ct 21861572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Original strand, 16361915 - 16362079
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatca 109  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |  ||||||| |||| || ||||||||||  ||||||    
T  16361915 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gacagcaacaca-acagtatataaaaacaacatgacataataatatca 16362012  T
Q  110 attgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
    | ||||| |||||||| ||| |  ||| || | ||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16362013 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 16362079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 22237630 - 22237746
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| | |||||| ||||| ||||  |||||    
T  22237630 acatcatcatcttcaac---ttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 22237725  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatct 129  Q
     | ||||| ||| ||||||||    
T  22237726 gaatgcaagtcatcaacatct 22237746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 13213027 - 13212974
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13213027 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 13212974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 20454673 - 20454606
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcag 78  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  20454673 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcag 20454606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 50614219 - 50614117
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaacaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| | |||| |||  ||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  50614219 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 50614121  T
Q  126 atct 129  Q
    ||||    
T  50614120 atct 50614117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 50622047 - 50621945
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaacaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| | |||| |||  ||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  50622047 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 50621949  T
Q  126 atct 129  Q
    ||||    
T  50621948 atct 50621945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 15860177 - 15860084
Alignment:
Q  6 tggacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataa 101  Q
    ||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||||||||| || ||||||||||    
T  15860177 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataa 15860084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20847147 - 20847091
Alignment:
Q  202 acagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggtt 258  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20847147 acagcttcatagattatggttaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggtt 20847091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 41050138 - 41050036
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaacaac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  41050138 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaat-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 41050040  T
Q  126 atct 129  Q
    ||||    
T  41050039 atct 41050036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 16368388 - 16368329
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  16368388 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaa 16368329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 21714546 - 21714595
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21714546 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 21714595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 184
Target Start/End: Original strand, 33797573 - 33797694
Alignment:
Q  62 aacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaat-attcttcaagtaatgcat 160  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||  || ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  33797573 aacagcaacatatgcagcatacaaa--caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaataattctt-aagtaatgcat 33797669  T
Q  161 -aatcattatatcacatcataatca 184  Q
     || ||||||||||||| |||||||    
T  33797670 aaaacattatatcacattataatca 33797694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 16093987 - 16093928
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 87  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  16093987 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaatagcaacataggcagtatagaaaa 16093928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 79
Target Start/End: Original strand, 50686630 - 50686681
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 79  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  50686630 cttagaccgactcatgcagtttagttaataaacaaacggcaacataggcagt 50686681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 71
Target Start/End: Original strand, 21161720 - 21161778
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaaca 71  Q
    ||||||| ||| |||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  21161720 catcatcatcatcaacttggatcgactcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaaca 21161778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 80
Target Start/End: Original strand, 26064959 - 26065009
Alignment:
Q  30 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 80  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||    
T  26064959 tagaccaactcatgcagcttagttgataaacaaacagcaacataggcagta 26065009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 21533974 - 21533923
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||    
T  21533974 cttagaccgactcatgcagcttagtt-actaaacaacaacaacatacgcagta 21533923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 64)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 38235 - 37976
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  38235 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 38138  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    |||| | ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  38137 aatttcgattcatcatcatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacaacaacatgtcttatacagctt 38038  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    || ||||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  38037 cagagattataattaacctcattgttaagtcttaatcctacccaaaggttcaactctcgaca 37976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 20309108 - 20309366
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||    
T  20309108 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataattatatc 20309204  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20309205 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataaacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagctt 20309304  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  20309305 cacagattatagttaacctcattcttaagtcttaatcctacccaagggttcaactctcgaca 20309366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 298933 - 298686
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298933 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 298834  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcat-aatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttca 210  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||| |  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||    
T  298833 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattaataacaacacatcttatacagcttca 298734  T
Q  211 cagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggtt 258  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  298733 catattatagttaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggtt 298686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 23654507 - 23654246
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||  || ||||||||||  |||||    
T  23654507 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatc 23654409  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataat-cattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||    
T  23654408 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaagtattactcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattaacaacaacacatcttaaacagct 23654309  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23654308 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggttcaactctcgaca 23654246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Original strand, 23285865 - 23286118
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    ||||||  |||||    
T  23285865 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag----acataataatatc 23285959  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataat-cattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  23285960 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatgttcttcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagct 23286059  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  23286060 tcacagattataattaacatcttcattaagtcttaatactacccaaaggttcaactctc 23286118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22731355 - 22731120
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||    
T  22731355 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 22731257  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||||||| |||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  22731256 aattgcaattcatcaacatattaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 22731157  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaat 244  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22731156 tcacagattataattaacatcctcattaagtcttaat 22731120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22738300 - 22738044
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||    
T  22738300 acatcatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cattaa-ataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 22738203  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  22738202 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 22738103  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||    
T  22738102 tcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactaccccaaggttcaattctc 22738044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 239
Target Start/End: Original strand, 23060513 - 23060742
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  23060513 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23060611  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||  || ||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  23060612 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattaaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 23060711  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtc 239  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  23060712 tcaca-attataattaacatcatcattaagtc 23060742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Original strand, 23076442 - 23076699
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  23076442 acatcatcatcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 23076540  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||| ||||||| ||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||    
T  23076541 aattgcaagtcaacaatatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacagcttaaacagct 23076640  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||||||||||||||||| || |||| || ||  ||| || ||| || |||||||||||    
T  23076641 tcacagattataattaacatcatcataaaatcccaatactaccccaaagttcaactctc 23076699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Original strand, 22337115 - 22337372
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||  |||||    
T  22337115 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatc 22337213  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    || |||||  ||||||||||| |  ||||||   ||  |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||    
T  22337214 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacatatcttaaacaact 22337313  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| || | | ||||||||||||||    
T  22337314 tcacaaattataattaacatcatcattaagtcttaatactactccaaggttcaactctc 22337372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Original strand, 23660023 - 23660279
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||  |||||    
T  23660023 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaac-aacagcaacataggcagtatacgaaa-caggatgacataataatatc 23660120  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    || ||||| ||||||||||||||  ||| |||  ||   ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  23660121 aaatgcaaatcaacaacatcttaaatattcaatcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 23660220  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    | ||| |||||||||||| || ||| ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||    
T  23660221 ttacaaattataattaacatcatcaataagtctcaatactaccccaaggttcaactctc 23660279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 22105412 - 22105560
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||     
T  22105412 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22105510  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  22105511 tgcaagtcaacaacttctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 22105560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23103516 - 23103399
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||    
T  23103516 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-aaacagcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacatgattatatc 23103420  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatct 129  Q
    || | ||||||| ||||||||    
T  23103419 aaattcaattcatcaacatct 23103399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 32215085 - 32214921
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatca 109  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  32215085 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 32214988  T
Q  110 attgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
    | ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  32214987 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 32214921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 129
Target Start/End: Original strand, 28405981 - 28406096
Alignment:
Q  14 atcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattg 113  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| | ||    
T  28405981 atcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 28406080  T
Q  114 caattcaacaacatct 129  Q
    ||| ||||||||||||    
T  28406081 caaatcaacaacatct 28406096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 23072070 - 23071993
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  23072070 acatcatcatcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgcaaa 23071993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21155219 - 21155075
Alignment:
Q  15 tcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgc 114  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  21155219 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 21155122  T
Q  115 aattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    || |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  21155121 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 21155075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 18808943 - 18809090
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  18808943 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18809040  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  18809041 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 18809090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 23130862 - 23131009
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  23130862 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23130959  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  23130960 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 23131009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 23133329 - 23133476
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  23133329 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23133426  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  23133427 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 23133476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 23135590 - 23135737
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  23135590 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23135687  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  23135688 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 23135737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23709694 - 23709547
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  23709694 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23709597  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  23709596 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 23709547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23712175 - 23712028
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  23712175 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23712078  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  23712077 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 23712028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 26505379 - 26505526
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||  |||||||     
T  26505379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 26505476  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  26505477 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 26505526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 26507857 - 26508004
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||  |||||||     
T  26507857 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 26507954  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  26507955 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 26508004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 34402684 - 34402537
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  34402684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 34402587  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  34402586 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 34402537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 39682313 - 39682460
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  39682313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39682410  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  39682411 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 39682460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 270
Target Start/End: Original strand, 27753728 - 27753836
Alignment:
Q  162 atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaa 261  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||  || ||| |||||    
T  27753728 atcattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagtttcacatattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcccaagcttcaa 27753827  T
Q  262 ctctcgaca 270  Q
    |||||||||    
T  27753828 ctctcgaca 27753836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23708738 - 23708524
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||    
T  23708738 acatcatcatcttt--caacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatc 23708642  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttat-acagc 206  Q
    |||||||| ||| | |||||| |   || |||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| || || |||   ||||||| |||||    
T  23708641 aattgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcatcttataacagc 23708542  T
Q  207 ttcacagattataattaa 224  Q
    ||||||||| || |||||    
T  23708541 ttcacagatcatcattaa 23708524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Original strand, 571397 - 571508
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  571397 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 571494  T
Q  112 tgcaattcaacaac 125  Q
    ||||| ||||||||    
T  571495 tgcaagtcaacaac 571508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 6725995 - 6726142
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  6725995 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 6726092  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    || || |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  6726093 tgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 6726142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 24367774 - 24367921
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  24367774 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24367871  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  24367872 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 24367921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 45030016 - 45029869
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || ||||||||| || ||||||||||  |||||||     
T  45030016 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-acaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 45029919  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  45029918 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 45029869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Original strand, 25175854 - 25175969
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaatt 112  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | |    
T  25175854 catcatcatcatcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 25175952  T
Q  113 gcaattcaacaacatct 129  Q
    |||| ||||||||||||    
T  25175953 gcaaatcaacaacatct 25175969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Original strand, 7679589 - 7679686
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  7679589 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaat 7679686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 8946657 - 8946734
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 87  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  8946657 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa 8946734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 24898358 - 24898210
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  24898358 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24898261  T
Q  111 ttgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
     ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  24898260 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 24898210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 24900841 - 24900693
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  24900841 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24900744  T
Q  111 ttgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
     ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  24900743 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 24900693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 24903318 - 24903170
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  24903318 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24903221  T
Q  111 ttgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
     ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  24903220 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 24903170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 24905795 - 24905647
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  24905795 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24905698  T
Q  111 ttgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
     ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  24905697 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 24905647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 24908270 - 24908122
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  24908270 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24908173  T
Q  111 ttgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
     ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  24908172 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 24908122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 24529691 - 24529580
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  24529691 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aacaacaacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaag 24529594  T
Q  112 tgcaattcaacaac 125  Q
    ||||| | ||||||    
T  24529593 tgcaagttaacaac 24529580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 32039660 - 32039513
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  32039660 tcatcatcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataac-aacagtaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32039563  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  32039562 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 32039513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 19671830 - 19671908
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 87  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  19671830 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa 19671908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 23040310 - 23040257
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040310 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 23040257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 28577099 - 28577246
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |  |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||     
T  28577099 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacgca-acagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaa 28577196  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    |||||  ||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  28577197 tgcaagccaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 28577246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451789
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaa-ca 126  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| || |||||  ||||||||||||  ||||||| |||||  |||||| ||    
T  32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa-tgcaagccaacaatca 32451933  T
Q  127 tcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcat-aatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagattataattaac 225  Q
    ||| |  ||| ||  ||  ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||| ||  |||||  | || ||||||||||| ||| |||||||     
T  32451932 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtatacataatatcacatcataaatcaacattaacatcccata-acagcttcacaaattgtaattaat 32451834  T
Q  226 ctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
     || |  | ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  32451833 atcatattcaagtcttaatgctaccccaaggttcatctctcgaca 32451789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 22413240 - 22413136
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacata--aatatatcaattgcaattcaaca 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||| |||  |||||||||| ||||| ||||||    
T  22413240 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatatcaaatgcaaatcaaca 22413142  T
Q  124 acatct 129  Q
    ||||||    
T  22413141 acatct 22413136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 131
Target Start/End: Original strand, 25616192 - 25616306
Alignment:
Q  16 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 115  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||  | || |||||||||  ||||  | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25616192 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaattacaat-agcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgca 25616290  T
Q  116 attcaacaacatctta 131  Q
    ||||||||||||||||    
T  25616291 attcaacaacatctta 25616306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40622244 - 40622123
Alignment:
Q  98 ataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttatgtataca-----aatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaac 192  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||  |||    
T  40622244 ataattatatcaatt-caattcatcaacatcttatgtatacagtacaaatattcttcaagtaatgcataaacattataatacatcataatcaacacaaac 40622146  T
Q  193 atatcttatacagcttcacagatt 216  Q
    || || || |||||||||||||||    
T  40622145 atctcata-acagcttcacagatt 40622123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 125
Target Start/End: Original strand, 43137301 - 43137410
Alignment:
Q  14 atcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattg 113  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | | ||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||    
T  43137301 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 43137398  T
Q  114 caattcaacaac 125  Q
    ||| ||||||||    
T  43137399 caagtcaacaac 43137410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Original strand, 23207296 - 23207398
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaacaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||| |||  ||||| ||||  ||||||| ||||| ||||| ||    
T  23207296 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgac 23207394  T
Q  126 atct 129  Q
    ||||    
T  23207395 atct 23207398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Original strand, 23791292 - 23791394
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaacaac 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||| |||  ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  23791292 cttagaccgactcatgtagcttagttaataagcaaacaacaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaac 23791390  T
Q  126 atct 129  Q
    ||||    
T  23791391 atct 23791394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Original strand, 38967374 - 38967424
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967374 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38967424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 7835 - 7735
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacat 127  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||||| ||||| ||| ||||||    
T  7835 cttagactgaatcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 7737  T
Q  128 ct 129  Q
    ||    
T  7736 ct 7735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 18787008 - 18786947
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||    
T  18787008 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgcaaa 18786947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22134326 - 22134251
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||    
T  22134326 catcatcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatc-aacagcaacataggcagtatgcaaa 22134251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Original strand, 25108906 - 25108958
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 80  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25108906 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagta 25108958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 24643109 - 24643062
Alignment:
Q  15 tcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643109 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 24643062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 20520295 - 20520243
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||    
T  20520295 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagta 20520243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 24697709 - 24697607
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaacaac 125  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||| |  ||| |||  ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  24697709 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaacaacaacgtaggcagtacatcaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaac 24697611  T
Q  126 atct 129  Q
    ||||    
T  24697610 atct 24697607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Original strand, 23004767 - 23004819
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 80  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||    
T  23004767 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggtagta 23004819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 80
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287433
Alignment:
Q  30 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagta 23287433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392451
Alignment:
Q  30 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 79  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26392451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 32067 - 32325
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || ||||||||||  |||||    
T  32067 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtaaacaaa--caacatgacataataatatc 32163  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  32164 aatttcaattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagctt 32263  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  32264 cacagattataattaacctcattgttaagtcttaatcctacccaagggttcaactctcgaca 32325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 75)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16386369 - 16386107
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16386369 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 16386270  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcat-aatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    ||||| | |||| ||||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  16386269 aattgtatttcatcaacatcttaaatattcaaacaattctcaagtaatgcataaaacattatattacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagct 16386170  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  16386169 tcacagattatagttaacctcttcattaagtcttaatgttacccaaaggttcaactctggaca 16386107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 270
Target Start/End: Original strand, 40443393 - 40443650
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||  |||||||    
T  40443393 atcatcatcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaacaaa--cagcatgacataataatatcaa 40443490  T
Q  111 ttgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttca 210  Q
    || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  40443491 tttcaattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagcttca 40443590  T
Q  211 cagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||    
T  40443591 cagattataattaacctcattgttaagtcttaatcctacccaagggttcatctctcgaca 40443650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 26211995 - 26212245
Alignment:
Q  9 acatcatcat-cttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatat 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  26211995 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatat 26212093  T
Q  108 caattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataat-cattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |  |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  26212094 caattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacattataatcaacaacaacacatcttaaacagc 26212193  T
Q  207 ttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggtt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26212194 ttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggtt 26212245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 10589039 - 10589299
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  10589039 acatcatcatcttcgacaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatc 10589137  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||   | | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||    
T  10589138 aattgcaattcaacaacatcttcaatgttcaaatattcttcaagcaatgcataaacattatatcacatcataatcagcaacaacacatcttaaatagctt 10589237  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||    
T  10589238 cacagattataattaacctcatcattaagtcttaatcctacccaaaggtccaactctagaca 10589299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27847951 - 27847693
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||   ||| ||||||||| ||||||    
T  27847951 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtgtacaa---cagtatgacataattatatc 27847855  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27847854 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcataaacattatcacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagctt 27847755  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    ||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  27847754 cacagattatagttaatctcattattaagtcttaatcctacccaagggttcaactctcgaca 27847693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 9509189 - 9509450
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||    
T  9509189 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatc 9509287  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  9509288 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 9509387  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  9509388 tcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatgctatcccaaggttcaactctcgaca 9509450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 12698831 - 12699093
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaat-cagcatgacataaatatat 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||    
T  12698831 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatat 12698929  T
Q  108 caattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagc 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||    
T  12698930 caattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagc 12699029  T
Q  207 ttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||||||    
T  12699030 ttcacagattataattaacatcctcattaactcttaatactaccccaaggttcaactatcgaca 12699093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Original strand, 38227481 - 38227736
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  38227481 acatcatcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 38227578  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    || ||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| ||||| | | |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| | | ||    
T  38227579 aaatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaattaatgtacatatcattatatcacatcttaatcaacatcaacatatcttaaatatct 38227678  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactct 265  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  38227679 tcacatattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactct 38227736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18456530 - 18456319
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||     
T  18456530 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgat-agcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaa 18456433  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttca 210  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||    
T  18456432 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 18456333  T
Q  211 cagattataattaa 224  Q
    ||||||||||||||    
T  18456332 cagattataattaa 18456319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3564482 - 3564229
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||     
T  3564482 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 3564384  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttca 210  Q
    || || |||||||||||| |  ||||||   ||  |||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||| ||| |||||    
T  3564383 tgtaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattagatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacaacttca 3564284  T
Q  211 cagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactct 265  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||| |||||| ||||||    
T  3564283 taggttataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttaaactct 3564229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 13647325 - 13647476
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||    
T  13647325 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatc 13647423  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    || ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  13647424 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 13647476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Original strand, 16495402 - 16495479
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16495402 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 16495479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Original strand, 34200786 - 34200863
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  34200786 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 34200863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Original strand, 48273392 - 48273508
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  48273392 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 48273490  T
Q  112 tgcaattcaacaacatct 129  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  48273491 tgcaagtcaacaacatct 48273508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 67745 - 67864
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  |||||    
T  67745 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 67843  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatct 129  Q
     | ||||| ||||||||||||    
T  67844 gaatgcaaatcaacaacatct 67864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 22072913 - 22073033
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||  |||||    
T  22072913 acatcatcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 22073012  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatct 129  Q
    || || || ||||||||||||    
T  22073013 aaatgtaagtcaacaacatct 22073033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 181
Target Start/End: Original strand, 16213684 - 16213852
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||| || ||||||||||  |||||||     
T  16213684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 16213781  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataa 181  Q
    | ||| |||||||| |||||  ||| || ||||  ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  16213782 tccaagtcaacaacgtcttaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaacataa 16213852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 2280238 - 2280121
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||    
T  2280238 acatcatcatcttt--caacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataataatatc 2280142  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatct 129  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  2280141 aaatgcaaatcaacaacatct 2280121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 11996148 - 11996071
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11996148 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 11996071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 123
Target Start/End: Original strand, 44014182 - 44014291
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaatt 112  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | |    
T  44014182 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 44014280  T
Q  113 gcaattcaaca 123  Q
    |||| ||||||    
T  44014281 gcaaatcaaca 44014291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 456321 - 456468
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  456321 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 456418  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  456419 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 456468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 11972496 - 11972643
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  11972496 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 11972593  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  11972594 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 11972643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 14949284 - 14949137
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  14949284 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14949187  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  14949186 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 14949137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 15376875 - 15376728
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  15376875 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15376778  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  15376777 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 15376728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 16232520 - 16232667
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  16232520 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16232617  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  16232618 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 16232667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 18640272 - 18640419
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  18640272 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18640369  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  18640370 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 18640419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20385285 - 20385138
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  20385285 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20385188  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  20385187 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 20385138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21189757 - 21189610
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  21189757 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21189660  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  21189659 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 21189610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 161
Target Start/End: Original strand, 24275175 - 24275318
Alignment:
Q  16 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 115  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||    
T  24275175 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 24275272  T
Q  116 attcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    | |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  24275273 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 24275318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 28505419 - 28505342
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28505419 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 28505342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 32125491 - 32125638
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  32125491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32125588  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  32125589 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 32125638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 41522917 - 41523064
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  41522917 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41523014  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  41523015 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 41523064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 41525379 - 41525526
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  41525379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41525476  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  41525477 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 41525526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 11393448 - 11393302
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaatt 112  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  11393448 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 11393351  T
Q  113 gcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    |||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  11393350 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 11393302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16219835 - 16219717
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  |||||    
T  16219835 acatcatcatcttcaac---ttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 16219740  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatctta 131  Q
     | ||||| ||| ||||||||||    
T  16219739 gaatgcaagtcatcaacatctta 16219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 18430709 - 18430859
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||| |||| || ||||||||||  |||||    
T  18430709 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatc 18430806  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    || ||||| |||||||||||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  18430807 aaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 18430859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Original strand, 47831807 - 47831879
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 81  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47831807 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtat 47831879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15755008 - 15754931
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  15755008 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaa 15754931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Original strand, 16410059 - 16410170
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  16410059 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16410156  T
Q  112 tgcaattcaacaac 125  Q
    ||||| ||||||||    
T  16410157 tgcaagtcaacaac 16410170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 24702238 - 24702385
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| || ||||||||||  |||||||     
T  24702238 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 24702335  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  24702336 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 24702385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 27216860 - 27217007
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  27216860 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 27216957  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  27216958 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 27217007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Original strand, 18005650 - 18005765
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaatt 112  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||| ||||| ||||  ||||| | |    
T  18005650 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtat-ggaaatcatcatgatataacaatatcgaat 18005748  T
Q  113 gcaattcaacaacatct 129  Q
    |||| ||||||||||||    
T  18005749 gcaaatcaacaacatct 18005765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 811248 - 811175
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  811248 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaa 811175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 17062077 - 17061966
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |  |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||     
T  17062077 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaac-tcagcagtatacaaaat-agcatgacataataatatcaaa 17061980  T
Q  112 tgcaattcaacaac 125  Q
    ||||| ||| ||||    
T  17061979 tgcaagtcagcaac 17061966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Original strand, 44116509 - 44116620
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||| || ||||||||||  |||||||     
T  44116509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 44116606  T
Q  112 tgcaattcaacaac 125  Q
    ||||| ||||||||    
T  44116607 tgcaagtcaacaac 44116620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 88
Target Start/End: Original strand, 12901339 - 12901402
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaat 88  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12901339 caacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaat 12901402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Original strand, 3386333 - 3386444
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |   ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||     
T  3386333 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaa 3386430  T
Q  112 tgcaattcaacaac 125  Q
    ||||| ||||||||    
T  3386431 tgcaagtcaacaac 3386444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Original strand, 13831373 - 13831484
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||| || ||||||||||  |||| ||     
T  13831373 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaaca-cggtagtatacaaaaacaacatgacataataatataaaa 13831470  T
Q  112 tgcaattcaacaac 125  Q
    ||||| ||||||||    
T  13831471 tgcaagtcaacaac 13831484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 13869346 - 13869453
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | | ||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  13869346 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13869443  T
Q  112 tgcaattcaa 121  Q
    ||||| ||||    
T  13869444 tgcaagtcaa 13869453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 1868100 - 1868038
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1868100 caacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaa 1868038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 216
Target Start/End: Original strand, 12187117 - 12187218
Alignment:
Q  114 caattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacag 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||| |   ||||| |||||| |||||||||||    
T  12187117 caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcataaacattataatacatcatattcaactcaaacatctcttat-cagcttcacag 12187215  T
Q  214 att 216  Q
    |||    
T  12187216 att 12187218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17138079 - 17137978
Alignment:
Q  114 caattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacag 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||| ||  ||||| || ||| |||||||||||    
T  17138079 caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcataaacattataatacatcatattcaacacaaacatctcatat-cagcttcacag 17137981  T
Q  214 att 216  Q
    |||    
T  17137980 att 17137978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 38898535 - 38898423
Alignment:
Q  16 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 115  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||    
T  38898535 catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacgacaca-gcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 38898438  T
Q  116 attcaa-caacatct 129  Q
    | |||| ||||||||    
T  38898437 agtcaatcaacatct 38898423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 16056344 - 16056446
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaa 124  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||  || ||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||    
T  16056344 caacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgcaaa--caacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaa 16056441  T
Q  125 catct 129  Q
    |||||    
T  16056442 catct 16056446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 12255892 - 12255837
Alignment:
Q  31 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12255892 agacagactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaa 12255837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 24704688 - 24704832
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||   | || |||||||  |||||||     
T  24704688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaa---aacaagacataataatatcaaa 24704782  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  24704783 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 24704832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15144142 - 15143902
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||   |||||| ||| | ||||| || || |  ||||||| |||||  ||||||    
T  15144142 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacat-ctcagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacaa 15144045  T
Q  125 catcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatctt-atacagcttcacagattataatt 222  Q
    ||||| | |||||||   ||  || ||||||||| || | ||| |||||||||||||||||    ||| | ||||| | ||||||| |||||||||| |     
T  15144044 catctcaagtatacattcataatttaagtaatgcgtataacatcatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaaacagcttgacagattatatta 15143945  T
Q  223 aacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactct 265  Q
    ||| || ||||||||||||| | || |||  ||||||||||||    
T  15143944 aacatcatcattaagtcttagtactaccccgaggttcaactct 15143902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Original strand, 20110556 - 20110606
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110556 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 20110606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 20220290 - 20220238
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 80  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20220290 cttagaccgactcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagta 20220238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 48991206 - 48991258
Alignment:
Q  35 cgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 87  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48991206 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaa 48991258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 80
Target Start/End: Original strand, 14044762 - 14044817
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  14044762 caacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagta 14044817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 80
Target Start/End: Original strand, 14354792 - 14354847
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  14354792 caacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagta 14354847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 15008597 - 15008542
Alignment:
Q  32 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15008597 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaa 15008542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 19486865 - 19486787
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 87  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | || ||||||||||||||| |||||    
T  19486865 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaa 19486787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 9177766 - 9177718
Alignment:
Q  30 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcag 78  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||    
T  9177766 tagaccgactcatgcagcttaattcaataataaacaacaacatatgcag 9177718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18154944 - 18154873
Alignment:
Q  27 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||  ||||| | ||| |||||||    
T  18154944 acttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aatagcaacataggcagattacaacaacagtatgacat 18154873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 80
Target Start/End: Original strand, 14036282 - 14036325
Alignment:
Q  37 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 80  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  14036282 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagta 14036325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 80
Target Start/End: Original strand, 14346312 - 14346355
Alignment:
Q  37 actcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 80  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  14346312 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagta 14346355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14932851 - 14932685
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaatt 112  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||||||||||||| || |  | |||||| ||  ||||| |  ||||||||||||  |||||||||    
T  14932851 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataac-aatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaatt 14932753  T
Q  113 gcaa-ttcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatca 178  Q
    |||| ||||||||||  |||  ||| |||  |  |||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  14932752 gcaatttcaacaacactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatca 14932685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15356286 - 15356120
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaatt 112  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||||||||||||| || |  | |||||| ||  ||||| |  ||||||||||||  |||||||||    
T  15356286 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataac-aatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaatt 15356188  T
Q  113 gcaa-ttcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatca 178  Q
    |||| ||||||||||  |||  ||| |||  |  |||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  15356187 gcaatttcaacaacactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatca 15356120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15360400 - 15360234
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaatt 112  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||||||||||||| || |  | |||||| ||  ||||| |  ||||||||||||  |||||||||    
T  15360400 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataac-aatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaatt 15360302  T
Q  113 gcaa-ttcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatca 178  Q
    |||| ||||||||||  |||  ||| |||  |  |||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  15360301 gcaatttcaacaacactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatca 15360234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 2530205 - 2530139
Alignment:
Q  62 aacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatctt 130  Q
    |||| |||||||||||  |||||||  || ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  2530205 aacagcaacataggcaacatacaaa--caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatctt 2530139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 26356083 - 26355998
Alignment:
Q  76 cagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  26356083 cagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 26355998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 26358535 - 26358450
Alignment:
Q  76 cagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  26358535 cagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 26358450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Original strand, 18203831 - 18203882
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 80  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||    
T  18203831 cttagatcgactcatgcagcttagtt-aataaacaacaacaacatagacagta 18203882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 13497 - 13756
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||| |  |||||    
T  13497 acatcatcaacttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacatgataatatc 13594  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  13595 aatttcgattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagctt 13694  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  13695 cacagattataattaacctcattgttaagtcttaatcctaccgaaaggttcaactctcgaca 13756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15584 - 15325
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  15584 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaag-agcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 15487  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15486 aatttcaattcatcaacatcttatgtataaaaatattcttcaagtaatgcataaatattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 15387  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||| || ||||| |  |||||||||||||    
T  15386 cacagattataattaaccttattattaagtcttaatcctacccaacgagtcaactctcgaca 15325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 180
Target Start/End: Original strand, 7393 - 7459
Alignment:
Q  114 caattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcata 180  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  7393 caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcataaacattataatacatcata 7459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 82)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20698556 - 20698296
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||    
T  20698556 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatc 20698458  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||  |||||||    
T  20698457 aattgcaattcatcaacatcttatatattcaaatattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacttcaacacatcttgaacagctt 20698358  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  20698357 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaattctatccaaaggttcaactctcgaca 20698296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 256
Target Start/End: Original strand, 12399209 - 12399456
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  12399209 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 12399307  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataat-cattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||| |||||| |  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||    
T  12399308 aaatgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataagacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaatagct 12399407  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaagg 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12399408 tcacagattatagttaacctcttcattatgtcttaatgctacccaaagg 12399456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 17487856 - 17488117
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  17487856 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 17487954  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| |    
T  17487955 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagat 17488054  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  17488055 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcccaaggttcaactctcgaca 17488117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 13442274 - 13442535
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  13442274 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 13442372  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  13442373 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 13442472  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||    
T  13442473 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgtcatcccaaggttcaactctcgaca 13442535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 17499338 - 17499599
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  17499338 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 17499436  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| |    
T  17499437 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaacacatcttaaacagat 17499536  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  17499537 tcacaaattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcccaaggttcaactctcgaca 17499599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Original strand, 14972854 - 14973110
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  14972854 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 14972952  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    || ||||| |||||||||||| || ||||||   ||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  14972953 aaatgcaaatcaacaacatctcatatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 14973052  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactct 265  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||    
T  14973053 tcatagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactct 14973110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Original strand, 26686887 - 26687144
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  26686887 acatcatcatcttcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 26686985  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||| |||||| |||||||  ||| | | ||| |||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  26686986 aattgcaagtcaacatcatcttaaatattccattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagct 26687085  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||| || ||| || |||||||||||    
T  26687086 tcacagattataattaacatcctcattaagtcccaatactaccccaaagttcaactctc 26687144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23083482 - 23083226
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||    
T  23083482 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatc 23083384  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||| ||| | | |||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||  | ||||| |||||| ||||||    
T  23083383 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattttacttctagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatatcaacacatcttaaacagct 23083284  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactct 265  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  23083283 tcacagattgtaattaacatcatcactaagtcttaatactacctcaaggttcaactct 23083226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 239
Target Start/End: Original strand, 43840932 - 43841162
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  43840932 acatcattatcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 43841030  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||| |||||| |||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  43841031 aattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagct 43841130  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtc 239  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||    
T  43841131 tcacagattataattaacatcctcgttaagtc 43841162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Original strand, 18438534 - 18438787
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||    
T  18438534 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatc 18438632  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    || ||||| ||||||||||||| | ||||||   ||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||||    
T  18438633 aaatgcaagtcaacaacatcttttttatacattcatatctcaagtaatgcatataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagct 18438732  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaac 262  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| || ||| ||||||||||    
T  18438733 tcacagattatagttaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaac 18438787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14576937 - 14576697
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||| ||||||| | || |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  14576937 caacttagaccgactcattcaacttagttaaataacaa-cagcaacatagacagtataaacaa-cagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 14576840  T
Q  125 catcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagattataatta 223  Q
    |||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  14576839 catcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacaacttcacagattataatta 14576740  T
Q  224 acctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    || || ||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  14576739 acatcatcattaaatcttaatactaccccaaggttcaactctc 14576697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25476506 - 25476249
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  25476506 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaacaa-cagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 25476408  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgc--ataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagc 206  Q
    || ||||| |||||||||||| | |||||||   ||  ||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||    
T  25476407 aaatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgcataa-cattatatcacatcattatcatcatcaacacatcttaaacagc 25476309  T
Q  207 ttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||||    
T  25476308 ttcacagattgtaattaacatcctcattaagtctcaatactacctcaaggttcaactctc 25476249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Original strand, 14572605 - 14572845
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  | |||||||    
T  14572605 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacatagacagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgagagtcaacaa 14572702  T
Q  125 catcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataat-cattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagattataatta 223  Q
    |||||||  ||| ||| ||| |||||| ||||| | ||  |||||||||||||||||| || ||  |||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  14572703 catcttaaatattcaattatacttcaaataatgaaaaaaacattatatcacatcataaacaacataaacaaatcttaaacaacttcacaaattataatta 14572802  T
Q  224 acctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    || || ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  14572803 acatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctc 14572845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24153326 - 24153115
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  24153326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgat-agcaacataggtagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 24153229  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttca 210  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| ||||||| | | ||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||    
T  24153228 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgcacataacataatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 24153129  T
Q  211 cagattataattaa 224  Q
    ||||||||||||||    
T  24153128 cagattataattaa 24153115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40213838 - 40213585
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||| || || ||||||||||  |||||||     
T  40213838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-catcaacacag-cagtatacataaacatcatgacataataatatcaaa 40213741  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttca 210  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||   ||  | |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |    
T  40213740 tgcaagtcaacaacatctcaattatacattcataatccaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttta 40213641  T
Q  211 cagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||| |||||| |||||||    
T  40213640 cagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttaaactctc 40213585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11424880 - 11424627
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  11424880 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataacaatatc 11424783  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    ||| ||||   | |||||||| |  ||| ||   ||  |||||||||||| || | |||||||||||||||||| || |  ||||| |||||| ||||||    
T  11424782 aatagcaa---atcaacatctcaattatgcattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataaacaacttcaacacatcttaaacagct 11424686  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||||| ||| || ||| || |||||||||||    
T  11424685 tcacagattaaaattaacatcaacattaagtctcaatactaccccaaagttcaactctc 11424627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 225
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386627
Alignment:
Q  27 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaaca 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaaca 42386526  T
Q  127 tcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatctt-atacagcttcacagattataattaa 224  Q
    ||| |  ||| ||   ||  |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  42386527 tctcaaatattcattcataattcaagcaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaaacagcttcacagattatcattaa 42386626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 265
Target Start/End: Original strand, 16796685 - 16796803
Alignment:
Q  148 tcaagtaatgcataat-cattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgc 246  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16796685 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaaaaacaacacatcttaaacaacttcacatattataattagcctcttcattaagtcttaatgc 16796784  T
Q  247 tgcccaaaggttcaactct 265  Q
    | |||||||||||||||||    
T  16796785 tacccaaaggttcaactct 16796803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 17672626 - 17672788
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  17672626 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17672723  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  ||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  17672724 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcaca 17672788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Original strand, 30029856 - 30030100
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaa 124  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||  | || ||||| |||  ||||| | |||||||||||||  |||||| |||||||||| |||    
T  30029856 caacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaat-agcagcatagacagattacaacaacagcatgacataagaatatcatttgcaattca-caa 30029953  T
Q  125 catcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagattataatta 223  Q
    | |||||  ||| |||  |  |||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||    ||| | |||||| ||||||||||| |||||| | |    
T  30029954 cgtcttaaatattcaataaaacttcaagtaatgtacacaacattatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaacagcttcacatattatattaa 30030053  T
Q  224 acctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    || || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30030054 acatcatcattaagtcttaaagctacccaaaggttcaactctcgaca 30030100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 13210448 - 13210371
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  13210448 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaa 13210371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 29172745 - 29172598
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  29172745 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29172648  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  29172647 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 29172598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 7781509 - 7781362
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  7781509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 7781412  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  7781411 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 7781362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 9707769 - 9707622
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  9707769 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 9707672  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    | ||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  9707671 tacaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 9707622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 17463178 - 17463325
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  17463178 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17463275  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  17463276 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 17463325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 28848773 - 28848626
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  28848773 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 28848676  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  28848675 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 28848626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 34159326 - 34159473
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  34159326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 34159423  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  34159424 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 34159473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 45607069 - 45606922
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  45607069 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 45606972  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  45606971 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 45606922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 55476491 - 55476638
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  55476491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 55476588  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  55476589 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 55476638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Original strand, 55500942 - 55501055
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  55500942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 55501039  T
Q  112 tgcaattcaacaacat 127  Q
    ||||| ||||||||||    
T  55501040 tgcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 6469296 - 6469185
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  6469296 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 6469199  T
Q  112 tgcaattcaacaac 125  Q
    ||||| ||||||||    
T  6469198 tgcaagtcaacaac 6469185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 8899094 - 8899241
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  8899094 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 8899191  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  8899192 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 8899241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 12174376 - 12174303
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12174376 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 12174303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 175
Target Start/End: Original strand, 13544024 - 13544187
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||| || ||||||||||  |||||||    
T  13544024 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 13544121  T
Q  111 ttgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
     ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13544122 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 13544187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 16097332 - 16097405
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16097332 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaa 16097405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 16454443 - 16454296
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  16454443 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16454346  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  16454345 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 16454296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 129
Target Start/End: Original strand, 32307684 - 32307795
Alignment:
Q  16 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 115  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | ||||    
T  32307684 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 32307782  T
Q  116 attcaacaacatct 129  Q
    | ||||||||||||    
T  32307783 a-tcaacaacatct 32307795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Original strand, 36166598 - 36166712
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  36166598 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 36166694  T
Q  112 tgcaattcaacaacatct 129  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  36166695 tgcaagtcaacaacatct 36166712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 38962053 - 38961906
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  38962053 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 38961956  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  38961955 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 38961906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523676
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaacaac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||| ||||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaac 52523733  T
Q  126 atcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataa 181  Q
    |||| |   || || ||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  52523732 atctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 52523676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 175
Target Start/End: Original strand, 12567564 - 12567722
Alignment:
Q  16 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 115  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||    
T  12567564 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 12567661  T
Q  116 attcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
    | |||||||| ||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12567662 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12567722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 43550644 - 43550529
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||  |||||    
T  43550644 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-tgacagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatc 43550546  T
Q  109 aattgcaattcaacaac 125  Q
    || ||||| ||||||||    
T  43550545 aaatgcaagtcaacaac 43550529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 50242822 - 50242984
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | ||||||||||| || ||||||||||  |||||||     
T  50242822 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 50242919  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  50242920 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 50242984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 230
Target Start/End: Original strand, 14179570 - 14179653
Alignment:
Q  148 tcaagtaatgcataat-cattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagattataattaacctctt 230  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14179570 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacttctt 14179653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 13151953 - 13151805
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  13151953 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 13151856  T
Q  111 ttgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
     ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  13151855 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 13151805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 13154418 - 13154270
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  13154418 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 13154321  T
Q  111 ttgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
     ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  13154320 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 13154270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 15470927 - 15471043
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  |||||    
T  15470927 acatcatcatcttcaac---ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 15471022  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatct 129  Q
     | ||||| ||| ||||||||    
T  15471023 gaatgcaagtcatcaacatct 15471043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 41123892 - 41124034
Alignment:
Q  14 atcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattg 113  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||    
T  41123892 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa----caacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 41123986  T
Q  114 caattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  41123987 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 41124034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 10247885 - 10247738
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || || |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  10247885 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataac-aacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 10247788  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  10247787 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 10247738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 17446816 - 17446670
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  17446816 tcatcatcttaatcaacttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17446720  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  17446719 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatcattcaagtaatgcata 17446670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 49668193 - 49668120
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  49668193 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 49668120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Original strand, 16103784 - 16103898
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaatt 112  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | |    
T  16103784 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 16103882  T
Q  113 gcaattcaacaacatct 129  Q
    |||| ||||||||||||    
T  16103883 gcaa-tcaacaacatct 16103898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Original strand, 14234487 - 14234605
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  |||||    
T  14234487 acatcatcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 14234585  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatc 128  Q
     | ||||| ||| |||||||    
T  14234586 gaatgcaagtcatcaacatc 14234605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 16282971 - 16282826
Alignment:
Q  14 atcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattg 113  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  ||||  | ||    
T  16282971 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatg 16282874  T
Q  114 caattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  16282873 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 16282826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 27165250 - 27165325
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 87  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||    
T  27165250 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgcaaaa 27165325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 74
Target Start/End: Original strand, 28194693 - 28194755
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatag 74  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28194693 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 28194755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 9512924 - 9512997
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9512924 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 9512997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 9520899 - 9520972
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9520899 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 9520972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 12119887 - 12119780
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  12119887 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12119790  T
Q  112 tgcaattcaa 121  Q
    ||||| ||||    
T  12119789 tgcaagtcaa 12119780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 15412429 - 15412536
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | | ||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  15412429 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15412526  T
Q  112 tgcaattcaa 121  Q
    ||||| ||||    
T  15412527 tgcaagtcaa 15412536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Original strand, 15977515 - 15977626
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |   ||||||||||| || ||||||||||  |||||||     
T  15977515 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 15977612  T
Q  112 tgcaattcaacaac 125  Q
    ||||| ||||||||    
T  15977613 tgcaagtcaacaac 15977626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070668
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||| || || |||||||  ||||||| ||||| |||||||| |    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 53070702  T
Q  128 cttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    || |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  53070701 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 53070668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 21618462 - 21618563
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
T  21618462 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 21618558  T
Q  125 catct 129  Q
    |||||    
T  21618559 catct 21618563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 46822267 - 46822386
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    |||| |||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  | || |||||||||  ||||  | || || |||||||| |||||||    
T  46822267 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaat-agcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaa 46822365  T
Q  111 ttgcaattcaacaacatctta 131  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  46822366 ttgcaattcaacaacatctta 46822386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 53301669 - 53301566
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||     
T  53301669 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaa 53301571  T
Q  112 tgcaa 116  Q
    |||||    
T  53301570 tgcaa 53301566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 180
Target Start/End: Original strand, 856140 - 856304
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag-catgacataaatatatcaat 111  Q
    ||||||||| | || |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||  ||||| | ||  |||||  ||| |||| ||||    
T  856140 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataacaat-agcaacataggcagattacaacaacaatcatga--taattataccaat 856236  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcata 180  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||    
T  856237 t-caattcaacaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatacataaacattataatacatcata 856304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 8499518 - 8499625
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | | ||||||||||| || ||||||||||  |||||||     
T  8499518 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 8499615  T
Q  112 tgcaattcaa 121  Q
    ||||| ||||    
T  8499616 tgcaagtcaa 8499625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 24340844 - 24340672
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||| || || || ||||| ||||  |||||    
T  24340844 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaa-catcatgatataataatatc 24340746  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataa 181  Q
     |  |||| | |||||||||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  24340745 gaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 24340672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 37251270 - 37251168
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaacaac 125  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||| |||  ||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  37251270 cttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37251172  T
Q  126 atct 129  Q
    ||||    
T  37251171 atct 37251168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Original strand, 43925977 - 43926079
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaacaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| | |||| |||  ||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  43925977 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 43926075  T
Q  126 atct 129  Q
    ||||    
T  43926076 atct 43926079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Original strand, 12511059 - 12511177
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    |||| |||||| | |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  | || |||||||||  ||||  | || || |||||||| |||||||    
T  12511059 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaat-agcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaa 12511157  T
Q  111 ttgcaattcaacaacatctt 130  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12511158 ttgcaattcaacaacatctt 12511177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Original strand, 10556985 - 10557035
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10556985 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 10557035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Original strand, 17737236 - 17737286
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17737236 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 17737286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 110
Target Start/End: Original strand, 44494809 - 44494905
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||    
T  44494809 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcataacataataatatcaa 44494905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 45578000 - 45577950
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45578000 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45577950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 22110454 - 22110402
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  22110454 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagta 22110402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Original strand, 12377940 - 12378044
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaacaac 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  12377940 cttagaccgactcatacagcttagttaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaat-agctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 12378038  T
Q  126 atctta 131  Q
    | ||||    
T  12378039 aactta 12378044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 23274687 - 23274765
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 87  Q
    |||||| ||||||| |  |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  23274687 acatcaacatcttcgatgacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa 23274765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 37642386 - 37642308
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 87  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | || ||||||||||||||| |||||    
T  37642386 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaa 37642308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 606428 - 606327
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaacaac 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | |  |||||||  ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  606428 cttataccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcaca-taaatcagttcatgatataacaatatcaa-tgcaattcaacaac 606331  T
Q  126 atct 129  Q
    ||||    
T  606330 atct 606327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 1644787 - 1644718
Alignment:
Q  16 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  1644787 catcgtcatcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatgcaaa 1644718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 22147646 - 22147601
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagtta 54  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22147646 acatcaacatcttcaacgacttggaccgagtcatgcagcttagtta 22147601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 1170 - 912
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||| ||||||    
T  1170 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtatacaacatca---tgacataattatatc 1074  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1073 aatttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataaacattataacacatcataatcaacaacaacatattttatacagctt 974  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    ||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  973 cacagattatagttaacctcattcttaagacttaatcctacccaagggttcaactctcgaca 912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 268
Target Start/End: Original strand, 16282 - 16538
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||    
T  16282 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataattatatc 16378  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    || | ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16379 aaattcaattcatcaacatattatgtatacaaacattcttcaagtaatgcataaacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagctt 16478  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcga 268  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| || |||||  |||||||||||||    
T  16479 cacagattatagttaacctcattattaagtcttaatcctacccaagcgttcaactctcga 16538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 7266 - 7524
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||| |||| ||||||    
T  7266 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa---caacatgaaataattatatc 7362  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  7363 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcataaacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagctt 7462  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    || |||||||| |||||||| |  |||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||    
T  7463 catagattatagttaacctcattcttaagtcttaatcctacccaagggtccaactctcgaca 7524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 1289 - 1547
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||   |||||||| ||||||    
T  1289 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtacaacatca---tgacataattatatc 1385  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1386 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcataaacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagctt 1485  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    || |||||||| |||||||| |  |||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||    
T  1486 catagattatagttaacctcattcttaagtcttaatcctacccaagggtccaactctcgaca 1547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 15356 - 15306
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15356 tcatcatcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 13211 - 13472
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  13211 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 13309  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  13310 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 13409  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||    
T  13410 tcacaaattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcccaaggttcaactgtcgaca 13472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 64)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20361081 - 20360829
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||    
T  20361081 acatcatcattttcatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatc 20360983  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  20360982 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagct 20360883  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaa 261  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  20360882 tcacatattataattaacctcatcattaagtcttaatactacccaaaggttcaa 20360829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16920751 - 16920495
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||   |||||||| ||||||    
T  16920751 acatcatcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtatacaacatca---tgacataagtatatc 16920655  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    || | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  16920654 aaattccattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataaacattataccacatcataatcaacaacaacttatcttattcagctt 16920555  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcga 268  Q
    || |||||||| |||||||| |  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  16920554 catagattatagttaacctcattcttaagtcttaattctacccaagggttcaactctcga 16920495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20638404 - 20638143
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  20638404 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 20638306  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataat-cattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||||| | |||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  20638305 aattgcaatttatcaacatctttaatattcaaacattcttcaagtaatgcataaaacgttatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 20638206  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||    
T  20638205 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgttatcccaaggttcaactctcgaca 20638143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 269
Target Start/End: Original strand, 22831503 - 22831762
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||   |  ||||||||||  |||||    
T  22831503 acatcatcatcttcaacatagtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcactgttcaa---cgacatgacataatcatatc 22831599  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatctta--tgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagc 206  Q
    || | ||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22831600 aaattcaattcatcaacatcttagatgtatacaaacattcttcaagtaatgcataaacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagc 22831699  T
Q  207 ttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgac 269  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  | |||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  22831700 ttcacagattatagttaacctcattctcaagtcttaattctacccaagggttcaactctcgac 22831762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 184
Target Start/End: Original strand, 35245586 - 35245758
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||   || ||||||||||  |||||    
T  35245586 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatacaa---caacatgacataataatatc 35245682  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatca 184  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245683 aatttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatca 35245758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22780348 - 22780090
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  |||||    
T  22780348 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-caaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatc 22780250  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||| |||||| |||||||  ||| ||| ||| ||||||||||||||   | |||||||||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  22780249 aattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacgcaacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagct 22780150  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcg 267  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||||| || || ||| |||||||||||||||    
T  22780149 tcacagattatgattaacatcatcattaagtctttatactaccccaaggttcaactctcg 22780090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17287917 - 17287660
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||  |||||    
T  17287917 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatc 17287819  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||| |||||| |||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| | | |||||| ||| | |||||||| |  ||||| |||||| ||||||    
T  17287818 aattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatgtcataacataatcaacctcaacacatcttaaacagct 17287719  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  17287718 tcacaggttataattaacatcctcattaagtctcaatgctaccccaaggttcaactctc 17287660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Original strand, 29060540 - 29060796
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  29060540 acatcatcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 29060638  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    || ||||| |||||||||||| | |||||||   ||  ||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  29060639 aaatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatctcatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 29060738  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactct 265  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| || ||| |||||||| ||||    
T  29060739 tcacagattataattaatatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcagctct 29060796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Original strand, 11185517 - 11185746
Alignment:
Q  21 tcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattca 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||   || |||||||||| |||||||| | |||||||    
T  11185517 tcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatgtgcagtgtacaa---caacatgacataattatatcaaattcaattca 11185613  T
Q  121 acaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagattataa 220  Q
     || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||       
T  11185614 tcagcatcttttgtatacaaacattcttcaagtaatgcataaactttataacacttcataatcagcaacaacatatcttattcatcttcacagattacgg 11185713  T
Q  221 ttaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaa 253  Q
    ||||||||   ||||||||||||| || |||||    
T  11185714 ttaacctcactattaagtcttaatcctacccaa 11185746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Original strand, 16496244 - 16496396
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16496244 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 16496342  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataa 162  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |  |||||||||||||||    
T  16496343 aattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataa 16496396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25629476 - 25629220
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| | ||||||||| ||| |||||||||||||  |||||    
T  25629476 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattacaa-caggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatc 25629378  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    || ||||| |||||||||||| |  ||||||   ||  |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  25629377 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 25629278  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactct 265  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||    
T  25629277 tcacagattataattaacaacatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactct 25629220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19303661 - 19303406
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  19303661 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacacaggaagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 19303564  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatg--cataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagc 206  Q
    || ||||| |||||||||||| |  ||||||   ||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  |||||    
T  19303563 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgtacataa-cattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttcaacagc 19303465  T
Q  207 ttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactct 265  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||| ||| |||||||||||||    
T  19303464 ttcacagattataattaacatcatcattaattctcagtgctaccccaaggttcaactct 19303406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18409947 - 18409691
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatca 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||  ||||||    
T  18409947 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatca 18409849  T
Q  110 attgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    | ||||| |||||||||||| |   || ||   ||  ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||    
T  18409848 aatgcaagtcaacaacatctcaatcatccattcataattcaaataatacatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 18409749  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||    
T  18409748 cacatattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccctaaggttcaactctc 18409691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Original strand, 20593773 - 20594026
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||  |||||    
T  20593773 acatcatcatcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataa-aaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 20593871  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    || ||||| |||||||||||| |  |||||||  ||   ||||||||||| || | || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  20593872 aaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataaatcaagtaatgcgtataacaatatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 20593971  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaac 262  Q
    |||||||||||||||| | |  ||||||||||| ||| || ||| ||||||||||    
T  20593972 tcacagattataattatcattatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaac 20594026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Original strand, 20076700 - 20076812
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||    
T  20076700 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaaa-cagcatgacataataatatc 20076797  T
Q  109 aattgcaattcaaca 123  Q
    || ||||| ||||||    
T  20076798 aaatgcaaatcaaca 20076812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 25754809 - 25754971
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | ||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  25754809 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 25754906  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25754907 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 25754971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 30676874 - 30676710
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatca 109  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||    
T  30676874 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgatataataatatca 30676777  T
Q  110 attgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
    | ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  30676776 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 30676710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 12742317 - 12742464
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  12742317 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12742414  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  12742415 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 12742464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18334754 - 18334607
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  18334754 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18334657  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  18334656 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 18334607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 19005046 - 19005193
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  19005046 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 19005143  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  19005144 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 19005193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19859081 - 19858934
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  19859081 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 19858984  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  19858983 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 19858934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Original strand, 22782227 - 22782338
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  22782227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22782324  T
Q  112 tgcaattcaacaac 125  Q
    ||||| ||||||||    
T  22782325 tgcaagtcaacaac 22782338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 24422547 - 24422694
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  24422547 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24422644  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  24422645 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 24422694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 27333339 - 27333262
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  27333339 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 27333262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 27394079 - 27394002
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  27394079 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 27394002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 33861794 - 33861941
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  33861794 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 33861891  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  33861892 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 33861941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 33864278 - 33864425
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  33864278 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 33864375  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  33864376 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 33864425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Original strand, 19652199 - 19652313
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaatt 112  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | |    
T  19652199 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 19652297  T
Q  113 gcaattcaacaacatct 129  Q
    |||| ||||||||||||    
T  19652298 gcaa-tcaacaacatct 19652313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 116
Target Start/End: Original strand, 25656629 - 25656731
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  25656629 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 25656726  T
Q  112 tgcaa 116  Q
    |||||    
T  25656727 tgcaa 25656731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Original strand, 34963371 - 34963535
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatca 109  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  34963371 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 34963468  T
Q  110 attgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
    | ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  34963469 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 34963535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Original strand, 1561303 - 1561380
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  1561303 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaa 1561380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 157
Target Start/End: Original strand, 1595549 - 1595692
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||| || ||||||||||  |||||||     
T  1595549 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 1595646  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatg 157  Q
    |||||||||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||    
T  1595647 tgcaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatg 1595692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 2291342 - 2291195
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| || ||||||||||  |||||||     
T  2291342 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 2291245  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  2291244 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 2291195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 8055029 - 8055176
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |   ||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  8055029 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-aaagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 8055126  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  8055127 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 8055176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 26924802 - 26924655
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |   ||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  26924802 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 26924705  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  26924704 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 26924655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 28496592 - 28496515
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||    
T  28496592 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaa 28496515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 29809003 - 29808926
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||    
T  29809003 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaa 29808926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 25644336 - 25644440
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||  ||||||| || || ||| |||    
T  25644336 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatcaa 25644435  T
Q  125 catct 129  Q
    |||||    
T  25644436 catct 25644440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1541073 - 1540926
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| ||| |||||||||  |||||||     
T  1541073 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaa 1540976  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  1540975 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 1540926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Original strand, 25688502 - 25688613
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  25688502 tcattatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaac 25688599  T
Q  112 tgcaattcaacaac 125  Q
    ||||| ||||||||    
T  25688600 tgcaagtcaacaac 25688613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 9098619 - 9098557
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  9098619 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaa 9098557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 161
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18456866
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |   ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |    
T  18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18456832  T
Q  128 cttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    || |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  18456833 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 18456866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 161
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18462026
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |   ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |    
T  18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18461992  T
Q  128 cttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    || |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  18461993 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 18462026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 20109140 - 20109257
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||| | ||||  |||||    
T  20109140 acatcatcatcttt--caacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacataatataacaatatc 20109236  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatct 129  Q
    || ||||| ||| ||||||||    
T  20109237 aaatgcaagtcatcaacatct 20109257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 20557054 - 20556943
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| ||||||| |||||  |||||||     
T  20557054 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaa 20556957  T
Q  112 tgcaattcaacaac 125  Q
    ||||| ||||||||    
T  20556956 tgcaagtcaacaac 20556943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 16448686 - 16448582
Alignment:
Q  15 tcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgc 114  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||    
T  16448686 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 16448589  T
Q  115 aattcaa 121  Q
    || ||||    
T  16448588 aagtcaa 16448582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 19668387 - 19668491
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| ||||| |||  ||||| ||||  ||||||| ||||| |||||    
T  19668387 caacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgcaaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaac 19668485  T
Q  123 aacatc 128  Q
    ||||||    
T  19668486 aacatc 19668491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 3852179 - 3852032
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |   ||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||     
T  3852179 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatataaaa 3852082  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  3852081 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 3852032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Original strand, 23019425 - 23019525
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacat 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  23019425 cttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacat 23019523  T
Q  128 ct 129  Q
    ||    
T  23019524 ct 23019525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 62
Target Start/End: Original strand, 25714417 - 25714470
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25714417 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 25714470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19848114 - 19847995
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    |||| |||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || | || |||||||||  ||||  | |||||  ||||||| |||||||    
T  19848114 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcagcataggcagattacatcaacagcaacacataaaaatatcaa 19848016  T
Q  111 ttgcaattcaacaacatctta 131  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  19848015 ttgcaattcaacaatatctta 19847995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Original strand, 23076749 - 23076801
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23076749 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagta 23076801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 146 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25603370 - 25603250
Alignment:
Q  146 cttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaat 244  Q
    |||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||   || | | |||||| ||||||||||||||| || | ||| || ||||||||||||||     
T  25603370 cttcaagtaatgtatacaacatcatatcacatcataatcaatgactaaacatcttaaacagcttcacagattctattaaacatcgtcattaagtcttaaa 25603271  T
Q  245 gctgcccaaaggttcaactct 265  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  25603270 gctacccaaaggttcaactct 25603250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Original strand, 35008167 - 35008219
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35008167 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagta 35008219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27416008 - 27415887
Alignment:
Q  62 aacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaat-attcttcaagtaatgcat 160  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| | |||||||||    
T  27416008 aacagcaacataggcagcatacaaa--cagcatgacataatattatcaatttcaattcaacaacatcttgagtattcaaataattctt-aggtaatgcat 27415912  T
Q  161 -aatcattatatcacatcataatca 184  Q
     || ||||||||||||| |||||||    
T  27415911 aaaacattatatcacattataatca 27415887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 23992429 - 23992540
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    |||| |||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  | || |||||||||  ||||  | ||||| |||||||| |||||||    
T  23992429 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagctaaataacaat-agcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaa 23992527  T
Q  111 ttgcaattcaaca 123  Q
    |||||||||||||    
T  23992528 ttgcaattcaaca 23992540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 8227632 - 8227554
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 87  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  | || |||| |||||||||| |||||    
T  8227632 acatcaacatcttcaacaacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaa 8227554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821866
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| ||||||| |||||  |||||||    
T  18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgccataacaatatcaa 18821866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 4185926 - 4185870
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 81  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  4185926 caacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtat 4185870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 22080846 - 22080799
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa 56  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22080846 acatcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaa 22080799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15041644 - 15041465
Alignment:
Q  36 gactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttatgta 135  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |  | |||||||||   |||| | ||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  15041644 gactcatgcaacttagttaaataacaat-agtagcataggcagatcacaacaacagcatgacattataatatcaaatgcaattcaataacatcttaagta 15041546  T
Q  136 tacaa-atattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagatt 216  Q
    | ||| | | || |||||||||||| |  ||||| | || ||| |||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  15041545 ttcaataaaatc-tcaagtaatgcacatacattaaaccaaatcttaattatcatcaacacatcttaaacagctttacagatt 15041465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 87
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443124
Alignment:
Q  30 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 87  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||| ||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagtatataaaa 33443124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25611708 - 25611588
Alignment:
Q  146 cttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaat 244  Q
    |||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||   || | | |||||| ||||||||| ||||| |  | ||| || |||||||||| |||     
T  25611708 cttcaagtaatgtatacaacatcatatcacatcataatcaatgactaaacatcttaaacagcttcatagattctgttaaacatcgtcattaagtcctaaa 25611609  T
Q  245 gctgcccaaaggttcaactct 265  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  25611608 gctacccaaaggttcaactct 25611588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Original strand, 4186383 - 4186439
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 81  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  || |||||||| ||||||    
T  4186383 caacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacaggcagcaacatagacagtat 4186439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 46995 - 47247
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||  |||||    
T  46995 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtttacag---cagcatgacataataatatc 47091  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47092 aatttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattctccaagtaatgcataaacattatatcacatcataaacatcaacaacatatcttatacagctt 47191  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    |||||||||||      ||| |  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  47192 cacagattata------ctcattgttaagtcttaatcctacccaagggttcaactctcgaca 47247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 65)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 22075018 - 22075268
Alignment:
Q  9 acatcatcat-cttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatat 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  22075018 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcattcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatat 22075116  T
Q  108 caattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataat-cattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  22075117 caattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagc 22075216  T
Q  207 ttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggtt 258  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22075217 ttcacatattataattaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggtt 22075268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 23390617 - 23390356
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  23390617 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23390519  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||||    
T  23390518 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaatagct 23390419  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||    
T  23390418 tcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactatcccaaggttcaactctcgaca 23390356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 21293090 - 21292830
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||| |||||||||  |||||    
T  21293090 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtaaacaaa--cagtatgacataataatatc 21292994  T
Q  109 aat--tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagc 206  Q
    |||  |  |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21292993 aatattcaaattcatcaacatcttaggtatacaattattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacaac 21292894  T
Q  207 ttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||    
T  21292893 ttcacagattataattaacctcattattaagtcttaatcctacccaagggtccaactcccgaca 21292830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8286964 - 8286706
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaat-cagcatgacataaatatat 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||    
T  8286964 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatat 8286866  T
Q  108 caattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagc 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||  |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||    
T  8286865 caattgcaattcatcaacatcttaaataatcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagc 8286766  T
Q  207 ttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8286765 ttcacataatataattaacatcttcattaagtcttaatactacccaaaggttcaactctc 8286706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Original strand, 25421532 - 25421789
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  25421532 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 25421630  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||| |||||| |||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| ||||||    
T  25421631 aattgcaagtcaacagcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 25421730  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  25421731 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatgctaccccaaggttcaactctc 25421789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Original strand, 24493569 - 24493825
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  24493569 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaacaat-agcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 24493666  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    || ||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||    
T  24493667 aaatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtgatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacatatcttaaatagct 24493766  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  24493767 tcacagattataattaacatcattattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctc 24493825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Original strand, 25431395 - 25431651
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  25431395 acatcatcatcttcataaa-ttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 25431492  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||| ||||||||||||||  | | ||| ||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| ||||||    
T  25431493 aattgcaagtcaacaacatcttaaatgttcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 25431592  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||    
T  25431593 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatgctacctcaaggttcaactctc 25431651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Original strand, 13025311 - 13025567
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||    
T  13025311 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatc 13025408  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatg--cataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagc 206  Q
    || ||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||  ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||| |    
T  13025409 aaatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataa-cattatatcacatcgtaatcaacatcaacatatcttaaacaac 13025507  T
Q  207 ttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  13025508 ttcacatattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctc 13025567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Original strand, 13095495 - 13095751
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||    
T  13095495 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatc 13095592  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatg--cataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagc 206  Q
    || ||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||  ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||| |    
T  13095593 aaatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataa-cattatatcacatcgtaatcaacatcaacatatcttaaacaac 13095691  T
Q  207 ttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  13095692 ttcacatattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctc 13095751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 266
Target Start/End: Original strand, 24529223 - 24529477
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||     
T  24529223 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaa 24529321  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttca 210  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||   ||   ||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||| |||||||||    
T  24529322 tgcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttca 24529421  T
Q  211 cagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||| | ||| || ||| ||||||||||||||    
T  24529422 cagattatagttaacatcatcattaagtttcaatactaccccaaggttcaactctc 24529477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Original strand, 9077952 - 9078205
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||    
T  9077952 acatcatcatcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 9078050  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    || ||||| |||||||||||| |  ||||||   ||   ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  9078051 aagtgcaagtcaacaacatctcaattatacattcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 9078150  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaac 262  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||| ||||||||||    
T  9078151 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaac 9078205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21808510 - 21808343
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  21808510 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 21808412  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcat-aatcattatatcacat 176  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |  ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21808411 aattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacat 21808343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21729185 - 21729033
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  21729185 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 21729087  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataa 162  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |  |||||||||||||||    
T  21729086 aattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataa 21729033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 263
Target Start/End: Original strand, 1096467 - 1096721
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||| || ||| ||||||  |||||    
T  1096467 acatcaacatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatc 1096565  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    || ||||| |||||||||||| |  ||||||   ||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| ||||||    
T  1096566 aaatgcaaatcaacaacatctcacatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 1096665  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaact 263  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||    
T  1096666 tcataggttataattaacatcctcattaagtctcaatactaccccaaggtccaact 1096721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 147 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22107357 - 22107237
Alignment:
Q  147 ttcaagtaatgcataatc-attatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatg 245  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22107357 ttcaagtaatgcataatatattatatcacatcataatcaacaacaacacaccttaaacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaata 22107258  T
Q  246 ctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    || | |||||||||| |||||    
T  22107257 ctactcaaaggttcatctctc 22107237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 21997655 - 21997549
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  21997655 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 21997557  T
Q  109 aattgcaa 116  Q
    || |||||    
T  21997556 aaatgcaa 21997549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 19660956 - 19660879
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  19660956 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 19660879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 22412187 - 22412388
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  22412187 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-gataacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 22412284  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcac 211  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||   ||  ||||||||    ||||      ||| |||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||    
T  22412285 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta----ataa-----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 22412375  T
Q  212 agattataattaa 224  Q
    |||||||||||||    
T  22412376 agattataattaa 22412388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 264930 - 264783
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  264930 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 264833  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  264832 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 264783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 10733102 - 10732955
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  10733102 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 10733005  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  10733004 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 10732955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 20909012 - 20909159
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  20909012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa-agcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20909109  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  20909110 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 20909159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 21329618 - 21329541
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21329618 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 21329541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Original strand, 36314577 - 36314654
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  36314577 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaa 36314654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 39363384 - 39363531
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  39363384 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39363481  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  39363482 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 39363531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 36154942 - 36154798
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  36154942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa----caacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 36154848  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  36154847 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 36154798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026942
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaacaac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||  ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaa-cagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaac 20026945  T
Q  126 atc 128  Q
    |||    
T  20026944 atc 20026942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 129
Target Start/End: Original strand, 37723910 - 37724020
Alignment:
Q  16 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 115  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||| | |||||||| |  |    
T  37723910 catcttcaacatcttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacatgattatatcaaattaa 37724006  T
Q  116 attcaacaacatct 129  Q
    ||||| ||||||||    
T  37724007 attcatcaacatct 37724020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144168
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacat 22144166  T
Q  128 ct 129  Q
    ||    
T  22144167 ct 22144168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22959649 - 22959576
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22959649 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 22959576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 29329934 - 29330081
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| || ||||||||||  |||||||     
T  29329934 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 29330031  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  29330032 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 29330081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 42245527 - 42245380
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  42245527 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 42245430  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  42245429 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 42245380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 20902158 - 20902060
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
T  20902158 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagtcaacaa 20902061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21502277 - 21502156
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||||  |||||    
T  21502277 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtat-gtaaatcagcatgatataacaatatc 21502179  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatctta 131  Q
     | ||||| ||| || |||||||    
T  21502178 gaatgcaagtcatcatcatctta 21502156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 21565546 - 21565659
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaatt 112  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | |    
T  21565546 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtat-ccaaatcatcatgatataacaatatcgaat 21565644  T
Q  113 gcaattcaacaacat 127  Q
    |||| ||| ||||||    
T  21565645 gcaagtcatcaacat 21565659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 2154776 - 2154665
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  2154776 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaac 2154679  T
Q  112 tgcaattcaacaac 125  Q
    ||||| ||||||||    
T  2154678 tgcaagtcaacaac 2154665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Original strand, 19668898 - 19668975
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19668898 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaa 19668975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 29345980 - 29346127
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || || |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  29345980 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataac-aacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29346077  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  29346078 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 29346127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 32027393 - 32027540
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  32027393 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataac-aacaacaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32027490  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    | ||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  32027491 tccaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 32027540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 38619434 - 38619541
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  38619434 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 38619531  T
Q  112 tgcaattcaa 121  Q
    ||||| ||||    
T  38619532 tgcaagtcaa 38619541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 39245136 - 39245243
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  39245136 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39245233  T
Q  112 tgcaattcaa 121  Q
    ||||| ||||    
T  39245234 tgcaagtcaa 39245243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 11581361 - 11581254
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| || ||||||||||  |||||||     
T  11581361 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 11581264  T
Q  112 tgcaattcaa 121  Q
    ||||| ||||    
T  11581263 tgcaagtcaa 11581254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 29348453 - 29348600
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || || |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  29348453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-gaacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29348550  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  29348551 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 29348600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 29350926 - 29351073
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || || |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  29350926 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-gaacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29351023  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  29351024 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 29351073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 121
Target Start/End: Original strand, 23064512 - 23064618
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaatt 112  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||||||||| ||||||||| |||  ||||||| |    
T  23064512 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacctaataatatcaaat 23064609  T
Q  113 gcaattcaa 121  Q
    |||| ||||    
T  23064610 gcaagtcaa 23064618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 224
Target Start/End: Original strand, 18418596 - 18418793
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaa-taacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaaca 123  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||||| |||    
T  18418596 caacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataacaa-catcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatcatttgcaattc-aca 18418691  T
Q  124 acatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatctt-atacagcttcacagattataat 221  Q
    ||||||||  ||| |||  |  |||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||    ||| | ||||| | |||||||||||| |||||||    
T  18418692 acatctta-atattcaataaaacttcaagtaatgtacacaacattatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaaacagcttcacaggttataat 18418790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 18319193 - 18319089
Alignment:
Q  15 tcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgc 114  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||    
T  18319193 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 18319096  T
Q  115 aattcaa 121  Q
    || ||||    
T  18319095 aagtcaa 18319089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18770020 - 18769919
Alignment:
Q  114 caattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacag 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||| ||  ||||| || ||| |||||||||||    
T  18770020 caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcataaacattataatacatcatattcaacacaaacatctcatat-cagcttcacag 18769922  T
Q  214 att 216  Q
    |||    
T  18769921 att 18769919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 20918110 - 20918026
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgaca 98  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||    
T  20918110 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgaca 20918026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 216
Target Start/End: Original strand, 22032419 - 22032520
Alignment:
Q  114 caattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacag 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||| ||  ||||| || ||| |||||||||||    
T  22032419 caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcataaacattataatacatcatattcaacacaaacatctcgtat-cagcttcacag 22032517  T
Q  214 att 216  Q
    |||    
T  22032518 att 22032520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 184
Target Start/End: Original strand, 23572182 - 23572252
Alignment:
Q  114 caattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatca 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  23572182 caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcataaacattataatacatcataatca 23572252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 26012154 - 26012079
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  26012154 acatcatcatcttt--caacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 26012079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 10775838 - 10775731
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||| | |||||||| |||| |||||||||||||  |||||||     
T  10775838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gacagcgacaca-gcagtatataaaaccagcatgacataataatatcaaa 10775741  T
Q  112 tgcaattcaa 121  Q
    ||||| ||||    
T  10775740 tgcaagtcaa 10775731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 31061068 - 31061175
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| | | | ||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  31061068 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaaaaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 31061165  T
Q  112 tgcaattcaa 121  Q
    ||||| ||||    
T  31061166 tgcaagtcaa 31061175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17517320 - 17517201
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    |||| |||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||  | || |||||||||  ||||  | ||||| |||||||| |||||||    
T  17517320 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaat-agcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaa 17517222  T
Q  111 ttgcaattcaacaacatctta 131  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  17517221 tcgcaattcaacaacatctta 17517201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 184
Target Start/End: Original strand, 18356367 - 18356488
Alignment:
Q  62 aacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcat- 160  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||  | |||||||||||     
T  18356367 aacagcaacataggcagcatacaaa--cagcatgatataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaatatttcttaagtaatgcata 18356464  T
Q  161 aatcattatatcacatcataatca 184  Q
    || ||||||||||||| |||||||    
T  18356465 aaacattatatcacattataatca 18356488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22178221
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaacaac 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||| || |  ||||||| ||||| ||||||||    
T  22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 22178225  T
Q  126 atct 129  Q
    ||||    
T  22178224 atct 22178221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21986130 - 21986011
Alignment:
Q  148 tcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgc 246  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||| ||||| ||| || ||||| |||||| ||| ||||||| |||||| ||||| || |||| |||||| ||| |    
T  21986130 tcaagtaatgcatataacattttatcacctcatattcaacatcaacacatcttaaacaacttcacaaattatagttaacatcatcatcaagtctgaatac 21986031  T
Q  247 tgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    | ||| ||||||||||||||    
T  21986030 taccccaaggttcaactctc 21986011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20910866 - 20910745
Alignment:
Q  62 aacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaat-attcttcaagtaatgcat 160  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    || ||||| |||||| |||||||||||    
T  20910866 aacagcaacatagacagcatacaaa--cagcatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaacattcaaataattctt-aagtaatgcat 20910770  T
Q  161 -aatcattatatcacatcataatca 184  Q
     || ||||||||||||| |||||||    
T  20910769 aaaacattatatcacattataatca 20910745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 20806904 - 20806854
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20806904 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaa 20806854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 97
Target Start/End: Original strand, 21873277 - 21873337
Alignment:
Q  36 gactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgac 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21873277 gactcatgcaacttagttaaataacaaa-agcagcataggcaggatacaacatcagcatgac 21873337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 26704075 - 26704124
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26704075 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 26704124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 26973808 - 26973857
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26973808 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 26973857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 40725853 - 40725898
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagtta 54  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  40725853 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagtta 40725898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732884
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 79  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26732884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 20766174 - 20766122
Alignment:
Q  76 cagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatct 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20766174 cagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 20766122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 4849 - 5098
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  4849 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 4947  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcat-aatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    || |||||||||||||||||||| |||| |||||| |  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  4948 aaatgcaattcaacaacatcttaagtattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagct 5047  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggtt 258  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  5048 tcacagattatagctaaccccttcattaagtcttattgctagccaaaggtt 5098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 1952 - 2213
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  1952 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaa-cagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatc 2050  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataat-cattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  2051 aattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcataaaacattatatctcatcataatcaacaacaacatatcatatacagct 2150  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    | ||| ||||| | ||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  2151 ttacatattattaataaccttatcattaagtcttaatcctacccaaaggttcaactctcgaca 2213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 1851 - 2112
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  1851 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 1949  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||||    
T  1950 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaatagct 2049  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||    
T  2050 tcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactatcccaaggttcaactctcgaca 2112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 6245 - 5983
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa--acaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatata 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||    
T  6245 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataata 6146  T
Q  107 tcaattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacag 205  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||    
T  6145 tcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacag 6046  T
Q  206 cttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcga 268  Q
    |||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  6045 cttcacattttataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcccaaggttccactctcga 5983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Original strand, 20910 - 21167
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||  |||||    
T  20910 acatcaacatcttcaacgacttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatc 21009  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcat-aatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  21010 aattgcaattcaacaacatcttatatattcaaatgttctacaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcagcatcaacacatcttaaacagct 21109  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactct 265  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21110 tcacaggttataattaacatcttcattaagtcttaatactacccaaaggttcaactct 21167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Original strand, 3470 - 3727
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  3470 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaa-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 3568  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  3569 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcaaataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 3668  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| || |||||| ||||    
T  3669 tcatagattataattaacatcctcattaagtcttaatactaccccaaagttcaattctc 3727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Original strand, 343 - 599
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||    
T  343 acatcatcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caataacataggcagtatacaaaat-agcatgacgtaataatatc 440  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    ||||| || ||||||||||||||  ||| | | ||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  441 aattggaagtcaacaacatcttaaatattcgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 540  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||    
T  541 tcatatattataattaacatcctcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctc 599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 5246 - 4991
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||| ||||||||     
T  5246 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggtattatacaacatca---tgacataattatatcaaa 5150  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcac 211  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||    
T  5149 ttcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgtataaacattataacacatcttaatcaacaacaacatattttattcagtttcac 5050  T
Q  212 agattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    | ||||||||||||||  | ||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  5049 atattataattaaccttattattaaatcttaatcctacccaagggttcaactctcgaca 4991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 51582 - 51840
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||| |    
T  51582 acatcatcattttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaacatca---tgacataattataac 51678  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  51679 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaatatccttcaagaaatgcataaacattataacacttcatattcaacaacaacatatcttattcagctt 51778  T
Q  209 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    ||||||||||| ||||||||    |||||||||||| || ||||| ||| ||| ||||||||    
T  51779 cacagattatagttaacctcactcttaagtcttaatcctacccaagggtccaattctcgaca 51840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Original strand, 38761 - 39017
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  38761 acatcatcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 38858  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    || ||||| | ||||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  38859 aaatgcaaataaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 38958  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  38959 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctc 39017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Original strand, 32942 - 33153
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  32942 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 33039  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    || ||||| | ||||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  33040 aaatgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 33139  T
Q  208 tcacagattataat 221  Q
    ||||||||||||||    
T  33140 tcacagattataat 33153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Original strand, 9744 - 9860
Alignment:
Q  7 ggacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatata 106  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  9744 ggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagaatgacataataata 9841  T
Q  107 tcaattgcaattcaacaac 125  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  9842 tcaagtgcaagtcaacaac 9860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24161
Alignment:
Q  27 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaat-cagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaac 24308  T
Q  126 atcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataa-tcatcaacaacatatcttatacagcttcacagattataatta 223  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24307 atcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataattcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataatta 24208  T
Q  224 acctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    || || ||| ||||||||||| ||  || || |||||||||||||||    
T  24207 acatcctcaataagtcttaatactatcccaaagttcaactctcgaca 24161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 3271 - 3015
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  3271 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 3174  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    || ||||| |||||||||||| |  ||||||   ||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| ||||||    
T  3173 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 3074  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||    
T  3073 tcacaggttataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctc 3015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Original strand, 25896 - 26152
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  25896 acatcattatcttcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaat-atcatgacataataatatc 25993  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    || ||||| | |||||||||| |  ||| ||| ||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| ||||||    
T  25994 aaatgcaagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 26093  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  26094 tcacagattataattaacatcctcattaagtctcaatgctaccccaaggttcaactctc 26152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Original strand, 39858 - 40113
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  39858 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaat-atcatgacataataatatc 39955  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    || ||||| | |||||||||| |  ||| ||| ||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| ||||||    
T  39956 aaatgcaagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 40055  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  40056 tcacaaattataattaacatcctcattaagtctcaatgctaccc-aaggttcaactctc 40113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 262
Target Start/End: Original strand, 39479 - 39729
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  39479 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaa 39576  T
Q  111 ttgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttc 209  Q
     ||||| |||||||||||| |  ||||||   ||  ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||    
T  39577 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 39676  T
Q  210 acagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaac 262  Q
    | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| || ||| ||||||||||    
T  39677 atagattataattaacatcattattaagtctcaatactaccccaaggttcaac 39729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 75333 - 75083
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  75333 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaa 75236  T
Q  111 ttgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttc 209  Q
     ||||| |||||||||||| |  ||||||   ||  ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||    
T  75235 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 75136  T
Q  210 acagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaac 262  Q
    | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| || ||| ||||||||||    
T  75135 atagattataattaacatcattattaagtctcaatactaccccaaggttcaac 75083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 266
Target Start/End: Original strand, 22886 - 23139
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  22886 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacac-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22983  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttca 210  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| || ||||| |||||| |||||||||    
T  22984 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 23083  T
Q  211 cagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||    
T  23084 cagattataaataacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctc 23139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 69 - 270
Target Start/End: Original strand, 6669 - 6871
Alignment:
Q  69 acataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataat-catt 167  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| ||| ||||||||||||||||  | ||    
T  6669 acataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaatagcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcataaaacgtt 6768  T
Q  168 atatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcg 267  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6769 atatcacatcataatcaacaacaacatatcatatacagctttacagattataaataaccttatcattaaatcttaatcctacccaaaggttcaactctcg 6868  T
Q  268 aca 270  Q
    |||    
T  6869 aca 6871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 25930
Alignment:
Q  16 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| || |    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgta 26081  T
Q  116 attcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacaga 214  Q
    |||||||||| ||| | |||||||   ||  |||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||    
T  26080 attcaacaacgtctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcataga 25981  T
Q  215 ttataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactct 265  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||| |||||||| ||||    
T  25980 ttataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcagctct 25930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 44825 - 44709
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  44825 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44727  T
Q  112 tgcaattcaacaacatct 129  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  44726 tgcaagtcaacaacatct 44709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 33461 - 33360
Alignment:
Q  164 cattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaact 263  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| ||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||    
T  33461 cattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcataggttataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaact 33362  T
Q  264 ct 265  Q
    ||    
T  33361 ct 33360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8424
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||    
T  8650 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacag----caacataggcagtat-caaaaacagcatgacataataatatc 8556  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||| |||||| |||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  8555 aattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagct 8456  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtc 239  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8455 tcacagattataattaacatcctcattaagtc 8424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17337 - 17079
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac--aaaatcagcatgacataaatatat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||    
T  17337 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatat 17239  T
Q  108 caattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgc-ataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagc 206  Q
    ||| ||||| |||||||||||| | |||||||   ||  ||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| |||||    
T  17238 caaatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacgtcttaaacagc 17139  T
Q  207 ttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    || |||||||||||||||| || | ||||||||| ||| || ||| |||||| |||||||    
T  17138 tttacagattataattaacatcatgattaagtctcaatactaccccaaggtttaactctc 17079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79299
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  | ||||||| |||| |||||||||||||  || |||| ||||| |||||||| |    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cgacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgt 79333  T
Q  128 cttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    || |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  79332 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 79299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 340065 - 339818
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||     
T  340065 tcatcatcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca--caacaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaa 339969  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttca 210  Q
    | ||| |||||||||||| | |||||||   ||  |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||    
T  339968 t-caagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 339870  T
Q  211 cagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaac 262  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||| ||||||||||    
T  339869 cagattataattaacgtcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaac 339818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 158612 - 158465
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  158612 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 158515  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  158514 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 158465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 184
Target Start/End: Original strand, 71353 - 71474
Alignment:
Q  62 aacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaat-attcttcaagtaatgcat 160  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| | |||||||||    
T  71353 aacagcaacataggcagcatacaaa--cagcatgacataatattatcaatttcaattcaacaacatcttgagtattcaaataattctt-aggtaatgcat 71449  T
Q  161 -aatcattatatcacatcataatca 184  Q
     || ||||||||||||| |||||||    
T  71450 aaaacattatatcacattataatca 71474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Original strand, 4508 - 4763
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||||||| |||| |||||||||||||  |||||    
T  4508 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 4605  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    || ||||| |||||||||||| |  ||||||   ||  |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  4606 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 4705  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactct 265  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||    
T  4706 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactct 4763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Original strand, 12090 - 12345
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||||||| |||| |||||||||||||  |||||    
T  12090 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 12187  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    || ||||| |||||||||||| |  ||||||   ||  |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  12188 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 12287  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactct 265  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||    
T  12288 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactct 12345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Original strand, 22042 - 22297
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||||||| |||| |||||||||||||  |||||    
T  22042 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 22139  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    || ||||| |||||||||||| |  ||||||   ||  |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  22140 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 22239  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactct 265  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||    
T  22240 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactct 22297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16721 - 16466
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||  |||||    
T  16721 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 16623  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    || || || |||||| ||||| | |||||||   ||  |||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  16622 aaatggaagtcaacagcatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcaaaatcaacatcaacacatcttaaacagct 16523  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactc 264  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||    
T  16522 tcacagactataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactc 16466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Original strand, 39913 - 40169
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  39913 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 40010  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    || ||||  |||| |||||||||  |||   | ||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||| || | ||||    
T  40011 aaatgcatgtcaataacatcttaaatatttgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcataaagagct 40110  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||    
T  40111 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctc 40169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 19987 - 19885
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaacaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| |||| |||  ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  19987 cttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaac 19889  T
Q  126 atct 129  Q
    ||||    
T  19888 atct 19885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Original strand, 8479 - 8732
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||||    
T  8479 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatc 8577  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||| ||||||||||||||   || ||| | | |||||||||||||| | | |||||    |||||||||||| || ||||| ||| || ||||||    
T  8578 aattgcaagtcaacaacatcttaaacattcaagtgtacttcaagtaatgcacataacatta----acatcataatcaacatcaacacatcctaaacagct 8673  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || | | ||||||||||||||    
T  8674 tcacagattgtaattaacatcatcattaagtcttaatactactccaaggttcaactctc 8732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3306 - 3103
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatca 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||    
T  3306 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatca 3208  T
Q  110 attgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgc-ataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 208  Q
    | || ||||||||||||||| | |||||||   ||  ||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||    
T  3207 aatgtaattcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 3108  T
Q  209 cacag 213  Q
    |||||    
T  3107 cacag 3103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 148
Target Start/End: Original strand, 28414 - 28552
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  28414 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 28512  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattctt 148  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  28513 aattgcaattcaacaacatcttatatattcaaatgttctt 28552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Original strand, 11292 - 11369
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  11292 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 11369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Original strand, 1997 - 2074
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  1997 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgcaaa 2074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Original strand, 4552 - 4608
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaca 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4552 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaca 4608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 266
Target Start/End: Original strand, 13141 - 13349
Alignment:
Q  59 acaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgc 158  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  13141 acaaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgc 13240  T
Q  159 ata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggt 257  Q
    | | | |||||||||||| |||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| || ||| || ||    
T  13241 acataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagtttcacagattataattaacatcttcattaagtcccaatactaccccaaagt 13340  T
Q  258 tcaactctc 266  Q
    |||||||||    
T  13341 tcaactctc 13349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Original strand, 34123 - 34199
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34123 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa 34199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 62
Target Start/End: Original strand, 273 - 326
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  273 acatcattatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaa 326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 270
Target Start/End: Original strand, 124679 - 124846
Alignment:
Q  104 atatcaattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttata 202  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||  ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |    
T  124679 atatcaattgcaattcatcaacgttttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa 124778  T
Q  203 cagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  124779 cagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatgctatcccaaggttcaactctcgaca 124846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 174767 - 174883
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatca 109  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||| | |||||||    
T  174767 catcatcaacttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacatgattatatca 174863  T
Q  110 attgcaattcaacaacatct 129  Q
    | | ||||||||||||||||    
T  174864 aattcaattcaacaacatct 174883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 79
Target Start/End: Original strand, 121766 - 121835
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 79  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  121766 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagt 121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 136471 - 136370
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaacaac 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| | |||||||||||| |||||| |||  ||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  136471 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 136373  T
Q  126 atc 128  Q
    |||    
T  136372 atc 136370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 145179 - 145078
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaacaac 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| | |||||||||||| |||||| |||  ||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  145179 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 145081  T
Q  126 atc 128  Q
    |||    
T  145080 atc 145078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 33077 - 32824
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  33077 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 32980  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | | ||| |||| ||||||||||| | ||||||| |||||||| |||| || || |||   | | | ||||    
T  32979 aattgcaattcaacaacatcttaaatattc-attatacttcgagtaatgcatataacattataacacatcatgatcaacatcagcat-cataaaatagct 32882  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactct 265  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || ||| |||||||||||||    
T  32881 tcacagattataactaacaccttcaataagtttcaatactaccccaaggttcaactct 32824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Original strand, 45928 - 46181
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  45928 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 46025  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | | ||| |||| ||||||||||| | ||||||| |||||||| |||| || || |||   | | | ||||    
T  46026 aattgcaattcaacaacatcttaaatattc-attatacttcgagtaatgcatataacattataacacatcatgatcaacatcagcat-cataaaatagct 46123  T
Q  208 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactct 265  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || ||| |||||||||||||    
T  46124 tcacagattataactaacaccttcaataagtttcaatactaccccaaggttcaactct 46181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 16113 - 16323
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |  |||||    
T  16113 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatc 16211  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagct 207  Q
    || |||||  ||||| ||||| | |||||||   ||   |||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||| || |||||| | | | ||||||    
T  16212 aaatgcaagccaacatcatctcaagtatacattcataactcaagtaatgcatataacattatatcacgtcatgatcaacatcaacatct-taaaacagct 16310  T
Q  208 tcacagattataa 220  Q
    |||||||||||||    
T  16311 tcacagattataa 16323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 17450 - 17397
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17450 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa 17397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 265
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4779
Alignment:
Q  30 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatct 129  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||| || || |  ||||||| |  |||||||||||||||    
T  4545 tagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatct 4643  T
Q  130 tatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataat-cattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagattataattaacctc 228  Q
    ||  ||| ||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||| | | | ||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  4644 taaatattcatttatacttcaagtaatgcataatacattatatcacatcatgatcaacatcaacatct-taaaacagcctcacaaattataattaacatc 4742  T
Q  229 ttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactct 265  Q
    |||| ||||||| ||| || ||  |||||||||||||    
T  4743 ttcaataagtctcaatactacctcaaggttcaactct 4779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 148 - 266
Target Start/End: Original strand, 1052 - 1171
Alignment:
Q  148 tcaagtaatgcataat-cattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgc 246  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  1052 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacatcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaatac 1151  T
Q  247 tgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    | |||||| |||||||||||    
T  1152 tacccaaaagttcaactctc 1171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 11564 - 11447
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  11564 acatcttcatcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 11466  T
Q  109 aattgcaattcaacaacat 127  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  11465 aatttcaattcatcaacat 11447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 203 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11440 - 11377
Alignment:
Q  203 cagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  11440 cagcttcacagattataattaacctcatcattaagtcttaattctacccaaaggttcaactctc 11377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 168 - 266
Target Start/End: Original strand, 3640 - 3738
Alignment:
Q  168 atatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  3640 atatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaatactacccaaaggttcaactctc 3738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 168 - 266
Target Start/End: Original strand, 7704 - 7802
Alignment:
Q  168 atatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  7704 atatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaatactacccaaaggttcaactctc 7802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 27854 - 27751
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||| || || |||||||    
T  27854 caacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaa 27756  T
Q  125 catct 129  Q
    |||||    
T  27755 catct 27751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 1190 - 1113
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1190 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 1113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 6535 - 6654
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  |||||    
T  6535 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 6633  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatct 129  Q
     | ||||| ||||||||||||    
T  6634 gaatgcaaatcaacaacatct 6654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 157
Target Start/End: Original strand, 8482 - 8613
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||| ||| |||    
T  8482 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 8580  T
Q  125 catcttatgtatacaaatattcttcaagtaatg 157  Q
    ||||| |  ||| || ||||  |||||||||||    
T  8581 catctcaaatattcatatataattcaagtaatg 8613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Original strand, 119875 - 119947
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  119875 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 119947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Original strand, 100378 - 100493
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaatt 112  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | |    
T  100378 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataataatatcgaat 100476  T
Q  113 gcaattcaacaacatct 129  Q
    |||| ||||||||||||    
T  100477 gcaaatcaacaacatct 100493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 94411 - 94558
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  94411 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 94508  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  94509 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 94558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 17598 - 17440
Alignment:
Q  16 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 115  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||    
T  17598 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 17501  T
Q  116 attcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
    | |||||||| ||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  17500 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 17440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 44454 - 44602
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac-aaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||| |||| |||||||||||||  |||||||    
T  44454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaa 44551  T
Q  111 ttgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
     ||||| |||||||||||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  44552 atgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 44602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 101503 - 101576
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  101503 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 40291 - 40176
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaatt 112  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||| ||||| ||||  ||||| | |    
T  40291 catcatcatcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 40193  T
Q  113 gcaattcaacaacatct 129  Q
    |||| ||||||||||||    
T  40192 gcaaatcaacaacatct 40176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 91 - 265
Target Start/End: Original strand, 27911 - 28086
Alignment:
Q  91 gcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaac 189  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||   ||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |    
T  27911 gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatc 28010  T
Q  190 aacatatcttatacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactct 265  Q
    |||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||    
T  28011 aacaaatcttaaacaacttcacaggttataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactct 28086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Original strand, 6611 - 6688
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6611 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 6688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Original strand, 13991 - 14068
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13991 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 14068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15898 - 15821
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15898 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 15821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 178898 - 178947
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  178898 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 178947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Original strand, 19268 - 19383
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaatt 112  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | |    
T  19268 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 19366  T
Q  113 gcaattcaacaacatct 129  Q
    |||| ||||||||||||    
T  19367 gcaaatcaacaacatct 19383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 98 - 216
Target Start/End: Original strand, 26911 - 27027
Alignment:
Q  98 ataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatc 197  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||  ||||| ||    
T  26911 ataattatatcaatt-caattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataaacattataatacatcataatcaacacaaacatctc 27009  T
Q  198 ttatacagcttcacagatt 216  Q
     || |||||||||||||||    
T  27010 ata-acagcttcacagatt 27027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 13392 - 13539
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  13392 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13489  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  13490 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 13539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13247
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacat 13245  T
Q  128 ct 129  Q
    ||    
T  13246 ct 13247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16205 - 16102
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||  ||||||| || || |||||||    
T  16205 caacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaa 16107  T
Q  125 catct 129  Q
    |||||    
T  16106 catct 16102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Original strand, 2680 - 2732
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  2680 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaagcaacaacataggcagta 2732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 20747 - 20894
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  20747 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20844  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  20845 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 20894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 37821 - 37968
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  37821 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 37918  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  37919 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 37968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Original strand, 133 - 248
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaatt 112  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | |    
T  133 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 231  T
Q  113 gcaattcaacaacatct 129  Q
    |||| ||||||||||||    
T  232 gcaaatcaacaacatct 248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 4694 - 4856
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||| || ||||||||||  |||||||     
T  4694 tcatcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 4791  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4792 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 4856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 2923 - 2808
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaatt 112  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||||| |    
T  2923 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaat 2825  T
Q  113 gcaattcaacaacatct 129  Q
    |||| ||||||||||||    
T  2824 gcaaatcaacaacatct 2808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 1155 - 1083
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 81  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1155 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtat 1083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3588 - 3424
Alignment:
Q  73 aggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatat 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||   ||  |||||||||||| || | ||||||||    
T  3588 aggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacactcataattcaagtaatgcgtataacattatat 3489  T
Q  172 cacatcataatcatcaacaacatatctt-atacagcttcacagattataattaacctcttcatta 235  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  3488 cacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcatagattataattaacatcatcatta 3424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 82072 - 82234
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | | ||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  82072 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 82169  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  82170 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 82234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 22775 - 22672
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | ||||| ||| |||    
T  22775 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 22677  T
Q  125 catct 129  Q
    |||||    
T  22676 catct 22672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 86
Target Start/End: Original strand, 15664 - 15738
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15664 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaa 15738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Original strand, 11286 - 11450
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatca 109  Q
    ||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  11286 catcaacatcttaatcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 11383  T
Q  110 attgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
    | ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  11384 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 11450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 184
Target Start/End: Original strand, 12861 - 12931
Alignment:
Q  114 caattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatca 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  12861 caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcataaacattataatacatcataatca 12931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 160688 - 160800
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaatt 112  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||||| |    
T  160688 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaat 160786  T
Q  113 gcaattcaacaacat 127  Q
    |||| ||||||||||    
T  160787 gcaa-tcaacaacat 160800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 175
Target Start/End: Original strand, 501088 - 501246
Alignment:
Q  16 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 115  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||    
T  501088 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 501185  T
Q  116 attcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
    | |||||||| ||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  501186 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 501246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 85742 - 85635
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  85742 tcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 85645  T
Q  112 tgcaattcaa 121  Q
    ||||| ||||    
T  85644 tgcaagtcaa 85635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 86
Target Start/End: Original strand, 1098 - 1159
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1098 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 1159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 175
Target Start/End: Original strand, 4300 - 4459
Alignment:
Q  15 tcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgc 114  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||    
T  4300 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgc 4397  T
Q  115 aattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
    || |||||||| ||| |  ||  || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4398 aaatcaacaacgtctcaattaatcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 4459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 175
Target Start/End: Original strand, 10772 - 10935
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||| || ||||||||||  |||||||    
T  10772 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 10869  T
Q  111 ttgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
     ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  || |||||||||||| || |||||||||||    
T  10870 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcaca 10935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 6244 - 6167
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  6244 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgcaaa 6167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 13947 - 14094
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  13947 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14044  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  14045 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 14094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Original strand, 12942 - 13057
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||  |||||    
T  12942 acatcatcatcttcaac---ttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcagcatgatataacaatatc 13037  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatc 128  Q
     | ||||| ||| |||||||    
T  13038 gaatgcaagtcatcaacatc 13057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 136680 - 136827
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||  |||||||||||||  |||||||     
T  136680 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 136777  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  136778 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 136827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 139149 - 139296
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||  |||||||||||||  |||||||     
T  139149 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 139246  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  139247 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 139296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 144087 - 144234
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||  |||||||||||||  |||||||     
T  144087 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 144184  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  144185 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 144234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 134211 - 134358
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||  |||||||||||||  |||||||     
T  134211 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 134308  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  134309 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 134358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 141618 - 141765
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||  |||||||||||||  |||||||     
T  141618 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 141715  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  141716 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 141765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 96
Target Start/End: Original strand, 132662 - 132745
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatga 96  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |||||    
T  132662 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatga 132745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 81
Target Start/End: Original strand, 62216 - 62270
Alignment:
Q  27 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  62216 acttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat 62270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 5659 - 5762
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||  ||||| | ||||| |||||||    
T  5659 caacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtat-gaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaa 5757  T
Q  125 catct 129  Q
    |||||    
T  5758 catct 5762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 2762 - 2694
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 81  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2762 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtat 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 14814 - 14699
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaatt 112  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| |||   ||||| | |    
T  14814 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagta-agaaaatcatcatgatatagtaatatcgaat 14716  T
Q  113 gcaattcaacaacatct 129  Q
    |||| ||||||||||||    
T  14715 gcaaatcaacaacatct 14699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Original strand, 12766 - 12884
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| ||||  |||||    
T  12766 acatcatcataatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 12864  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatc 128  Q
     | ||||| ||| |||||||    
T  12865 gaatgcaagtcatcaacatc 12884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 110
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1132
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||    
T  1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaa 1132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Original strand, 16784 - 16895
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | ||||||||||| || ||||||||||  |||||||     
T  16784 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 16881  T
Q  112 tgcaattcaacaac 125  Q
    ||||| ||||||||    
T  16882 tgcaagtcaacaac 16895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 32538 - 32654
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||    
T  32538 acatcatcatcttt--caacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatc 32634  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatct 129  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  32635 aaatgcaa-tcaacaacatct 32654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 51985 - 51744
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaa-ca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||| || |||||  |||| |||||||  ||||||| |||||  |||||| ||    
T  51985 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagc-acataggcagcattcaaaaatagcaagacataataatatcaa-tgcaagccaacaatca 51888  T
Q  127 tcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaaca-acatatcttat-acagcttcacagattataattaa 224  Q
    ||| |  ||| ||  ||  ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||  |||||||   |||||| || ||||||||||| ||| |||||||    
T  51887 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtatacattatatcacatcataa--atcaacattaatatctcataacagcttcacaaattgtaattaa 51790  T
Q  225 cctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
      || |  | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  51789 tatcatattcaagtcttaatgctaccccaaggttcaactctcgaca 51744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Original strand, 116430 - 116544
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  116430 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaa-cagcatgacataatcatatcaaa 116526  T
Q  112 tgcaattcaacaacatct 129  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  116527 tgcaagtcaacaacatct 116544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 129072 - 128971
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatca-gcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaaca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||  |  ||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||    
T  129072 cttagaccgactcatgcagcttagtt-aataacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 128974  T
Q  127 tct 129  Q
    |||    
T  128973 tct 128971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 129
Target Start/End: Original strand, 78345 - 78442
Alignment:
Q  32 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatct 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||| |||| |||  ||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  78345 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacatct 78442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 106 - 268
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |   ||||||||||| || ||||||||||  |||||||     
T  106 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 203  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  204 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 10646 - 10543
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaa 124  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | ||||| ||| |||    
T  10646 caacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 10548  T
Q  125 catct 129  Q
    |||||    
T  10547 catct 10543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 101
Target Start/End: Original strand, 32102 - 32190
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataa 101  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  32102 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataa 32190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 10543 - 10646
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | ||||| ||| |||    
T  10543 caacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 10641  T
Q  125 catct 129  Q
    |||||    
T  10642 catct 10646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 24001 - 23927
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  24001 acatcatcatcttcaac---ttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 23927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 12413 - 12249
Alignment:
Q  10 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatca 109  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||||| |||||||||| ||  ||||||    
T  12413 catcaacatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatca 12316  T
Q  110 attgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
    | ||||| |||||||| ||| |  ||| || || |  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12315 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12687
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacat 127  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||| ||| ||||||    
T  12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 12685  T
Q  128 ct 129  Q
    ||    
T  12686 ct 12687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 175
Target Start/End: Original strand, 9241 - 9404
Alignment:
Q  11 atcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 110  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||| |||| || ||||||||||  |||||||    
T  9241 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaa 9338  T
Q  111 ttgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 175  Q
     ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  || |||||||||||| || |||||||||||    
T  9339 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcaca 9404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17928 - 17851
Alignment:
Q  189 caacatatcttatacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  17928 caacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactacccaaaggttcaattctc 17851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 8179 - 8118
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8179 caacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaa 8118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 45909 - 45836
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||    
T  45909 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgcaaa 45836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 38820 - 38704
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||     
T  38820 tcatcatcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaa 38722  T
Q  112 tgcaattcaacaacatct 129  Q
    ||||| ||| ||| ||||    
T  38721 tgcaagtcatcaatatct 38704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Original strand, 40400 - 40511
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| ||| |||||||||  |||||||     
T  40400 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaa 40497  T
Q  112 tgcaattcaacaac 125  Q
    ||||| ||||||||    
T  40498 tgcaagtcaacaac 40511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 265
Target Start/End: Original strand, 10323 - 10419
Alignment:
Q  169 tatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactct 265  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||| ||| || ||| |||||||||||||    
T  10323 tatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattattattaacatcattattaagtctcaatactaccccaaggttcaactct 10419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 129921 - 130024
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | ||||| ||| |||    
T  129921 caacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 130019  T
Q  125 catct 129  Q
    |||||    
T  130020 catct 130024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 60818 - 60759
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 87  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  60818 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaa 60759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 125
Target Start/End: Original strand, 29946 - 30043
Alignment:
Q  26 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| || || ||||||||    
T  29946 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgtaagtcaacaac 30043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 25122 - 25226
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||| |||  ||||| ||||  ||||||| ||||| |||||    
T  25122 caacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacgatatcaa-tgcaaatcaac 25219  T
Q  123 aacatct 129  Q
    |||||||    
T  25220 aacatct 25226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 180
Target Start/End: Original strand, 1979 - 2045
Alignment:
Q  114 caattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcata 180  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  1979 caattcatcaacatcttatgtatacaattattcttcaagtaatgcataaacattataatacatcata 2045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 86
Target Start/End: Original strand, 6831 - 6889
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6831 cttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 6889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11542
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 87  Q
    |||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  11464 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa 11542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21822 - 21721
Alignment:
Q  114 caattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacag 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||| ||  ||||| || || ||||||||||||    
T  21822 caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcataaacattataatacatcttaatcaacacaaacatctcata-acagcttcacag 21724  T
Q  214 att 216  Q
    |||    
T  21723 att 21721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29714 - 29613
Alignment:
Q  114 caattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacag 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||| ||  ||||| || || ||||||||||||    
T  29714 caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcataaacattataatacatcttaatcaacacaaacatctcata-acagcttcacag 29616  T
Q  214 att 216  Q
    |||    
T  29615 att 29613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 38377 - 38299
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 87  Q
    |||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  38377 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa 38299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 1440 - 1336
Alignment:
Q  15 tcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgc 114  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| | | ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||    
T  1440 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aacaataacacatg-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 1343  T
Q  115 aattcaa 121  Q
    || ||||    
T  1342 aagtcaa 1336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 4214 - 4321
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| | ||| | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  4214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-gacagcgacaca-gcagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaa 4311  T
Q  112 tgcaattcaa 121  Q
    ||||| ||||    
T  4312 tgcaagtcaa 4321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15483 - 15362
Alignment:
Q  62 aacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaat-attcttcaagtaatgcat 160  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  15483 aacatcaacataggcagcatacaaa--cagcatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaataattctt-aagtaatgcat 15387  T
Q  161 -aatcattatatcacatcataatca 184  Q
     || ||||||||||||| |||||||    
T  15386 aaaacattatatcacattataatca 15362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20394
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |    
T  20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-tcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 20428  T
Q  128 cttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    || |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  20427 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 20394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Original strand, 128751 - 128917
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |   |  | | |||| |||||||||||||  |||||    
T  128751 acatcatcatcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaa-agcaacaaaaaaaaaaaaaaaaa-cagcatgacataataatatc 128848  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatg--cataatcattatatcacat 176  Q
    || ||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  128849 aaatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataa-cattatatcacat 128917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 129
Target Start/End: Original strand, 38339 - 38437
Alignment:
Q  32 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatct 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||| |||  ||||| || |  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  38339 gaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatct 38437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 4954 - 4888
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggc 76  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4954 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggc 4888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1021 - 827
Alignment:
Q  69 acataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcatt 167  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |||||  |||||||| |||| ||||||| |||| |  ||| |||  ||  ||||||||||||| | | ||||    
T  1021 acataggcagtatacaa---cagcatggcataataatatcaat-gcaagtcaacaaaatctcaaatattcaatcataattcaagtaatgcacataacatt 926  T
Q  168 atatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctc 266  Q
    |||||||||| |||||  || ||||| |||||| ||||||||||| || |||| || | ||  |||||||||| ||| || ||  ||||||||||||||    
T  925 atatcacatcgtaatcgacatcaacacatcttaaacagcttcacatatcataaatagcatcaccattaagtctcaatactacctcaaggttcaactctc 827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 12064 - 12205
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||     
T  12064 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-------aaacagcaacaca-gcagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaa 12155  T
Q  112 tgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 161  Q
    ||||| |||||||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  12156 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 12205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 28887 - 28813
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-aacaacaacataggcagtatacaaa 86  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  28887 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaa 28813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 53651 - 53498
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacat 127  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||||| ||||| ||| ||||||    
T  53651 cttagactgattcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 53553  T
Q  128 cttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataa 181  Q
    || |  ||| || ||||  ||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||||    
T  53552 ctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataa 53498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 161252 - 161136
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||| | ||||||||||||| ||  |||||||||  |||||||     
T  161252 tcatcatcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatc-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaa 161155  T
Q  112 tgcaattcaa-caacatct 129  Q
    ||||| |||| ||||||||    
T  161154 tgcaagtcaatcaacatct 161136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18148 - 17976
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 108  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||| ||| || || || ||||| ||||  |||||    
T  18148 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaa-catcatgatataataatatc 18050  T
Q  109 aattgcaattcaacaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataa 181  Q
     |  |||| | |||||||||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  18049 gaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 17976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 2291 - 2184
Alignment:
Q  12 tcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 111  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||| |  |||||||||||| || ||||||||||  |||||||     
T  2291 tcatcattttaatcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 2194  T
Q  112 tgcaattcaa 121  Q
    ||||| ||||    
T  2193 tgcaagtcaa 2184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 8059
Alignment:
Q  30 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaacaacat 127  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||| | |||||||  ||||| ||||  ||||||| || |||||||||||||    
T  8161 tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgc-aaatcagctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacat 8063  T
Q  128 ctta 131  Q
    ||||    
T  8062 ctta 8059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6284
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaacaac 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||| |||  ||||| || |  ||||||| ||||| ||||||||    
T  6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 6288  T
Q  126 atct 129  Q
    ||||    
T  6287 atct 6284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 13840 - 13793
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagg 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13840 cttagaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacaacaacatagg 13793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 270
Target Start/End: Original strand, 20596 - 20664
Alignment:
Q  202 acagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctgcccaaaggttcaactctcgaca 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||    
T  20596 acagcttcacagattatagttaacatcatcattaagtcttaatgctattccaaggttcaactctcgaca 20664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 87
Target Start/End: Original strand, 569 - 628
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  569 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaa 628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 23843 - 23892
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23843 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 23892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 36454 - 36503
Alignment:
Q  13 catcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36454 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 36503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Original strand, 97024 - 97126
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaacaac 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| | |||| |||  ||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  97024 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 97122  T
Q  126 atct 129  Q
    ||||    
T  97123 atct 97126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Original strand, 106302 - 106404
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaacaac 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| | |||| |||  ||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  106302 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 106400  T
Q  126 atct 129  Q
    ||||    
T  106401 atct 106404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Original strand, 267679 - 267781
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaacaac 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| |||| |||  ||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||     
T  267679 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaat 267777  T
Q  126 atct 129  Q
    ||||    
T  267778 atct 267781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 87
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2753
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2694 cttagaccgactcatgcagcttagtcaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaa 2753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 62
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12016
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 12016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 103736 - 103674
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 87  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  103736 caacttagaccgactaatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtataaaaaa 103674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 1900 - 1798
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaaaatcag--catgacataaatatatcaattgcaattcaacaac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||  |||||||| |||||| ||||| ||  ||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  1900 cttagaccgactcatgcagcttagttattaaactaacattaacataggtagtatataaaat-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 1802  T
Q  126 atct 129  Q
    ||||    
T  1801 atct 1798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 2283 - 2220
Alignment:
Q  65 aacaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatct 129  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2283 aacaacataggcagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatct 2220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 216
Target Start/End: Original strand, 69930 - 70000
Alignment:
Q  147 ttcaagtaatgca--taatcattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagcttcacagatt 216  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| || || |||||||||||||||    
T  69930 ttcaagtaatgcaattaatcattatatcacatcatattcaacactaacatctcata-acagcttcacagatt 70000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University