View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18962_low_13 (Length: 271)

Name: NF18962_low_13
Description: NF18962
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18962_low_13
NF18962_low_13
[»] chr6 (15 HSPs)
chr6 (16-268)||(25175563-25175815)
chr6 (16-268)||(27653983-27654235)
chr6 (16-268)||(16825752-16826006)
chr6 (1-264)||(14626115-14626377)
chr6 (4-257)||(23153458-23153710)
chr6 (16-264)||(1650105-1650352)
chr6 (4-257)||(1657748-1657999)
chr6 (4-268)||(35009439-35009702)
chr6 (4-257)||(15862484-15862734)
chr6 (4-200)||(29665941-29666137)
chr6 (4-89)||(27751603-27751688)
chr6 (20-104)||(29605612-29605696)
chr6 (20-102)||(18629608-18629691)
chr6 (22-104)||(17083200-17083282)
chr6 (21-61)||(18399144-18399184)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (16-268)||(25426628-25426880)
chr5 (16-268)||(12374-12626)
chr5 (16-268)||(19499899-19500151)
chr5 (16-268)||(22366481-22366733)
chr5 (19-268)||(18777995-18778244)
chr5 (16-268)||(21073595-21073847)
chr5 (19-268)||(43443398-43443647)
chr5 (16-268)||(4199985-4200237)
chr5 (20-268)||(27009841-27010089)
chr5 (2-268)||(23506965-23507230)
chr5 (4-268)||(27182547-27182810)
chr5 (5-268)||(22053834-22054096)
chr5 (5-268)||(18531068-18531330)
chr5 (16-216)||(29188284-29188483)
chr5 (4-257)||(34939289-34939540)
chr5 (4-151)||(20623085-20623232)
chr5 (4-151)||(21233528-21233675)
chr5 (6-150)||(25900408-25900552)
chr5 (4-151)||(16536313-16536460)
chr5 (4-151)||(37052860-37053007)
chr5 (20-104)||(29918127-29918212)
chr5 (11-100)||(32950862-32950951)
chr5 (224-264)||(29190482-29190522)
chr5 (20-102)||(21310709-21310792)
chr5 (21-102)||(5450844-5450926)
chr5 (227-268)||(17471803-17471844)
chr5 (21-61)||(16595713-16595753)
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (16-268)||(19886661-19886913)
chr2 (4-268)||(17396653-17396916)
chr2 (2-263)||(462743-463003)
chr2 (4-268)||(8891242-8891505)
chr2 (4-268)||(19794704-19794967)
chr2 (4-268)||(36982441-36982704)
chr2 (1-268)||(20627310-20627576)
chr2 (5-268)||(43642958-43643220)
chr2 (5-268)||(24341390-24341652)
chr2 (4-268)||(25265390-25265653)
chr2 (54-268)||(7507894-7508107)
chr2 (4-151)||(19689401-19689548)
chr2 (4-151)||(23820187-23820334)
chr2 (4-151)||(14906440-14906587)
chr2 (4-151)||(20015127-20015274)
chr2 (21-102)||(68156-68238)
chr2 (21-102)||(22775206-22775288)
chr2 (21-102)||(22780584-22780666)
chr2 (21-100)||(43646059-43646139)
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (16-268)||(47357654-47357906)
chr4 (20-268)||(10644219-10644467)
chr4 (4-260)||(13048221-13048477)
chr4 (4-268)||(13246430-13246693)
chr4 (4-268)||(54118244-54118507)
chr4 (5-268)||(15675090-15675352)
chr4 (4-268)||(26680201-26680463)
chr4 (2-168)||(121989-122154)
chr4 (31-268)||(31115629-31115865)
chr4 (5-200)||(10104251-10104445)
chr4 (4-151)||(10488678-10488825)
chr4 (4-151)||(16327926-16328073)
chr4 (171-268)||(111395-111492)
chr4 (5-67)||(33240900-33240962)
chr4 (20-200)||(40885570-40885749)
chr4 (21-102)||(15044992-15045074)
chr4 (224-268)||(10104450-10104494)
chr4 (21-102)||(15109350-15109432)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (16-268)||(10989410-10989661)
chr7 (15-268)||(2437457-2437710)
chr7 (16-268)||(13911024-13911277)
chr7 (20-268)||(13572676-13572924)
chr7 (11-268)||(18253842-18254098)
chr7 (4-262)||(25292338-25292595)
chr7 (4-268)||(13037014-13037277)
chr7 (4-268)||(47481031-47481294)
chr7 (2-266)||(16211768-16212031)
chr7 (4-263)||(11580739-11580997)
chr7 (2-268)||(3059966-3060231)
chr7 (4-268)||(36052667-36052927)
chr7 (41-268)||(16478987-16479213)
chr7 (4-268)||(7293017-7293279)
chr7 (5-268)||(13321014-13321278)
chr7 (4-151)||(11516343-11516490)
chr7 (4-151)||(15441564-15441711)
chr7 (4-151)||(30262129-30262276)
chr7 (11-125)||(295973-296087)
chr7 (21-102)||(13377693-13377775)
chr7 (20-102)||(16914928-16915011)
chr7 (4-36)||(14113989-14114021)
chr7 (4-36)||(14423639-14423671)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (16-268)||(30120722-30120974)
chr8 (78-268)||(222753-222943)
chr8 (78-268)||(736376-736566)
chr8 (78-268)||(860271-860461)
chr8 (16-268)||(16674392-16674644)
chr8 (20-268)||(21844576-21844824)
chr8 (20-268)||(21851969-21852217)
chr8 (2-269)||(16193714-16193980)
chr8 (16-268)||(43373480-43373731)
chr8 (16-264)||(6774258-6774505)
chr8 (1-257)||(24928788-24929043)
chr8 (16-264)||(24548986-24549233)
chr8 (4-268)||(16404975-16405235)
chr8 (4-268)||(22907214-22907476)
chr8 (4-257)||(17345581-17345832)
chr8 (4-151)||(5238203-5238350)
chr8 (4-151)||(24661248-24661395)
chr8 (4-151)||(43685662-43685809)
chr8 (78-140)||(691908-691970)
chr8 (20-102)||(26011658-26011741)
[»] chr3 (32 HSPs)
chr3 (16-268)||(55316219-55316471)
chr3 (16-268)||(41270075-41270327)
chr3 (1-268)||(14842558-14842824)
chr3 (41-268)||(16821139-16821366)
chr3 (4-268)||(13975722-13975985)
chr3 (4-268)||(45860805-45861068)
chr3 (2-269)||(51158016-51158282)
chr3 (4-268)||(13954890-13955153)
chr3 (4-268)||(15859024-15859287)
chr3 (11-268)||(15936634-15936890)
chr3 (2-268)||(12030145-12030410)
chr3 (2-268)||(2049810-2050075)
chr3 (11-265)||(15938476-15938729)
chr3 (1-257)||(13838905-13839160)
chr3 (16-264)||(15614838-15615085)
chr3 (4-268)||(17912483-17912744)
chr3 (1-268)||(16744112-16744377)
chr3 (4-151)||(2449238-2449385)
chr3 (4-67)||(19231981-19232044)
chr3 (155-268)||(47984650-47984763)
chr3 (155-268)||(47993937-47994050)
chr3 (155-268)||(48003224-48003337)
chr3 (155-268)||(48012510-48012623)
chr3 (11-100)||(11986173-11986262)
chr3 (20-61)||(14080715-14080756)
chr3 (227-268)||(15468555-15468596)
chr3 (20-104)||(4145814-4145898)
chr3 (21-102)||(30207380-30207462)
chr3 (20-104)||(6228625-6228710)
chr3 (227-268)||(22275209-22275250)
chr3 (21-61)||(14059214-14059254)
chr3 (2-50)||(19260821-19260869)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (16-268)||(5072388-5072640)
chr1 (16-268)||(18601118-18601370)
chr1 (2-268)||(20931345-20931610)
chr1 (6-268)||(20913037-20913291)
chr1 (1-268)||(41394222-41394488)
chr1 (15-268)||(22227809-22228061)
chr1 (15-268)||(22232506-22232758)
chr1 (4-268)||(20893626-20893889)
chr1 (4-268)||(20445679-20445942)
chr1 (4-268)||(37844450-37844714)
chr1 (4-268)||(20531444-20531707)
chr1 (16-264)||(2116258-2116506)
chr1 (16-202)||(45051489-45051674)
chr1 (4-151)||(51452608-51452755)
chr1 (21-61)||(16646118-16646158)
chr1 (224-264)||(45051446-45051486)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (41-268)||(36093-36320)
scaffold0023 (2-268)||(48598-48863)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (41-268)||(42997-43224)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (11-244)||(5552-5785)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (41-268)||(31700-31928)
scaffold0008 (2-268)||(128167-128431)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (20-268)||(35-283)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (1-266)||(3579-3843)
scaffold0266 (2-268)||(1124-1389)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-268)||(6061-6326)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (1-268)||(953-1218)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (11-268)||(48187-48443)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (20-268)||(64527-64780)
scaffold0026 (11-268)||(107747-108003)
scaffold0026 (19-61)||(89863-89905)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (1-268)||(12115-12379)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (2-268)||(8878-9143)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (15-268)||(21115-21367)
scaffold0139 (41-268)||(14086-14312)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (4-268)||(19206-19469)
scaffold0195 (4-268)||(21290-21553)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (11-268)||(148721-148977)
scaffold0025 (5-268)||(8849-9111)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (4-268)||(123164-123427)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (4-268)||(36913-37176)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (54-268)||(5254-5466)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (4-268)||(5061-5324)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (54-268)||(3722-3936)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (11-268)||(26422-26678)
scaffold0162 (4-151)||(8180-8327)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (4-257)||(247442-247694)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (41-264)||(9374-9596)
scaffold0215 (41-264)||(16272-16494)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (1-257)||(171916-172171)
scaffold0001 (1-257)||(177619-177874)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (2-264)||(41733-41994)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (16-162)||(1304-1450)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (4-268)||(534-797)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (4-268)||(34460-34724)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-262)||(272031-272291)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (4-268)||(37066-37328)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (4-268)||(41648-41911)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (15-264)||(2966-3215)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (4-268)||(13506-13769)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (2-150)||(51180-51328)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (162-268)||(9-115)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (162-268)||(48514-48620)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (4-150)||(89454-89600)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (16-172)||(13325-13480)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (4-151)||(26911-27058)
scaffold0141 (11-151)||(22656-22796)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (4-151)||(1582-1729)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (171-268)||(9382-9479)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (4-97)||(3360-3453)
scaffold0361 (212-266)||(3210-3264)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (11-100)||(56106-56195)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (20-102)||(8174-8257)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (21-102)||(2317-2399)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (54-100)||(45198-45244)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (20-61)||(1546-1587)
scaffold0456 (20-61)||(8691-8732)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (20-61)||(70307-70348)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (21-61)||(8011-8051)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (21-61)||(3525-3565)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 15)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25175815 - 25175563
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175815 tgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25175716  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175715 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25175616  T
Q  216 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175615 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25175563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 27653983 - 27654235
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27653983 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 27654082  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27654083 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttga 27654182  T
Q  216 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27654183 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattaatgatg 27654235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 16825752 - 16826006
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgta--taattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 113  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825752 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 16825851  T
Q  114 atgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttattt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16825852 atgataagttatgaagattgtgctaaattggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatct 16825951  T
Q  214 gatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16825952 gatattatgattgatgaataattgctttgttatgcatattcatggattgatgatg 16826006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 14626115 - 14626377
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14626115 attatggataattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 14626214  T
Q  101 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 200  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||  |||||| || | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||    
T  14626215 caaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtgcaattggtgaa-ttatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgtt 14626313  T
Q  201 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 264  Q
    |||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14626314 atggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 14626377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23153710 - 23153458
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  23153710 atggataattgtttctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 23153611  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||| | | |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  23153610 ataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatg 23153512  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 257  Q
      ||||| ||||| || || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  23153511 gctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattacttgggtatacatattcatg 23153458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 264
Target Start/End: Original strand, 1650105 - 1650352
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    ||||| ||||||||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  1650105 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaat 1650204  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 215  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||    
T  1650205 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttga 1650303  T
Q  216 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 264  Q
    | || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1650304 tgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 1650352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 1657748 - 1657999
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  1657748 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 1657847  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
     |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||||     
T  1657848 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatgttatt 1657945  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 257  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1657946 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 35009439 - 35009702
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  35009439 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 35009538  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  35009539 ttatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 35009637  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35009638 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 35009702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15862734 - 15862484
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  15862734 atggataattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 15862635  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
     |||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| | | |||||||     
T  15862634 ttatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttc-atttatgttatt 15862538  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 257  Q
      || || ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15862537 gctgataattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 15862484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 29666137 - 29665941
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttca 102  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| | || || |||||| ||  |||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  29666137 atggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttca 29666038  T
Q  103 ta-tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 200  Q
     | |||||| |||||  |||||||||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  29666037 aagtatgcataaatgtcaagttatgaa-attgtactcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgtt 29665941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 27751688 - 27751603
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtga 89  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  27751688 atggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 29605696 - 29605612
Alignment:
Q  20 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 104  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| |||||||||||  || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29605696 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcata 29605612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 102
Target Start/End: Original strand, 18629608 - 18629691
Alignment:
Q  20 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 102  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||| |||||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  18629608 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 18629691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 104
Target Start/End: Original strand, 17083200 - 17083282
Alignment:
Q  22 attcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 104  Q
    |||||||||| || |||| || |||||||| |||||||||||| || || ||| ||  ||||||||||||||  |||||||||    
T  17083200 attcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcata 17083282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 18399184 - 18399144
Alignment:
Q  21 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 61  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  18399184 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 18399144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25426880 - 25426628
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426880 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25426781  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426780 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25426681  T
Q  216 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426680 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25426628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12374
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12626 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 12527  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12526 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 12427  T
Q  216 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12426 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 19500151 - 19499899
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500151 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 19500052  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500051 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19499952  T
Q  216 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19499951 tattatgattgattaataattgctttggtatgcatattcatggattgatgatg 19499899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 22366481 - 22366733
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366481 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 22366580  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366581 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 22366680  T
Q  216 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366681 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 22366733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 18777995 - 18778244
Alignment:
Q  19 taaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 118  Q
    |||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18777995 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 18778094  T
Q  119 aagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18778095 aagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatat 18778194  T
Q  219 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778195 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 18778244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 21073595 - 21073847
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073595 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 21073694  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21073695 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttga 21073794  T
Q  216 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073795 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 21073847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 43443398 - 43443647
Alignment:
Q  19 taaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 118  Q
    |||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443398 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 43443497  T
Q  119 aagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 218  Q
    |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443498 aagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 43443597  T
Q  219 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43443598 tatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 43443647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 4199985 - 4200237
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    ||||||||||||||||    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4199985 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 4200084  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 215  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4200085 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 4200184  T
Q  216 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4200185 tattatgattgatgaatgattgcttgggtttgcatattcatgggttgatgatg 4200237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27010089 - 27009841
Alignment:
Q  20 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 119  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  27010089 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 27009990  T
Q  120 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 219  Q
    ||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27009989 agttatgaatattgtactcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 27009890  T
Q  220 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27009889 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 27009841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23507230 - 23506965
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23507230 ttatggataattgttgctaaattcgtgctccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 23507131  T
Q  102 atatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtta 201  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  23507130 aaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgtta 23507032  T
Q  202 tgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||  ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23507031 tggttgttaattgatgttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 23506965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 27182547 - 27182810
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  27182547 atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaa 27182646  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||| | | |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27182647 ataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatg 27182745  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
      ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27182746 gctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatg 27182810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 268
Target Start/End: Original strand, 22053834 - 22054096
Alignment:
Q  5 tggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  22053834 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaat 22053933  T
Q  105 tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatga 204  Q
    |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||      
T  22053934 tatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattg 22054032  T
Q  205 atgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
     ||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  22054033 ctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtctacatattcatgaattgatgatg 22054096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 268
Target Start/End: Original strand, 18531068 - 18531330
Alignment:
Q  5 tggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  18531068 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaat 18531167  T
Q  105 tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatga 204  Q
    |||| |||||||  ||||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||      
T  18531168 tatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattg 18531266  T
Q  205 atgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
     ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18531267 ctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgctcgggtatacatattcatgaattgatgatg 18531330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 29188284 - 29188483
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    ||||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29188284 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 29188383  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 215  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  29188384 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 29188482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 34939540 - 34939289
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  34939540 atggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 34939441  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
     |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||  |||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||||     
T  34939440 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagtcattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatgttatt 34939343  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 257  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  34939342 gctgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 20623232 - 20623085
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  20623232 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 20623133  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 151  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  20623132 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20623085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Original strand, 21233528 - 21233675
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  21233528 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 21233627  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 151  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  21233628 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 21233675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 150
Target Start/End: Original strand, 25900408 - 25900552
Alignment:
Q  6 ggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatat 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| |||||   ||    
T  25900408 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaat 25900507  T
Q  106 atgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatt 150  Q
    |||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  25900508 atgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatt 25900552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 16536460 - 16536313
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  16536460 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16536361  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 151  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  16536360 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16536313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 37053007 - 37052860
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  37053007 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37052908  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 151  Q
    |||||   |||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  37052907 atatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 37052860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 29918212 - 29918127
Alignment:
Q  20 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 104  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||| || |||| |||||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  29918212 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 29918127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 32950951 - 32950862
Alignment:
Q  11 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| || |||||| || || || |||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  32950951 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 32950862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 264
Target Start/End: Original strand, 29190482 - 29190522
Alignment:
Q  224 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29190482 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 29190522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 102
Target Start/End: Original strand, 21310709 - 21310792
Alignment:
Q  20 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 102  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| ||||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  21310709 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 21310792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Original strand, 5450844 - 5450926
Alignment:
Q  21 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 102  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  5450844 aattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 5450926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 227 - 268
Target Start/End: Original strand, 17471803 - 17471844
Alignment:
Q  227 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17471803 atgaatcattgcttgggtacgcatattcatgaattgatgatg 17471844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 16595753 - 16595713
Alignment:
Q  21 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 61  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  16595753 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 16595713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 19886661 - 19886913
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19886661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 19886760  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886761 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19886860  T
Q  216 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886861 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19886913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 17396653 - 17396916
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  17396653 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17396751  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17396752 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 17396851  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17396852 aatgttatttgatattatgattaatggataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 17396916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 463003 - 462743
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  463003 ttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 462904  T
Q  102 atatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtta 201  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  462903 aaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgtta 462805  T
Q  202 tgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 263  Q
    ||  ||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  462804 tggctgttaattgatgtcgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattga 462743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 8891505 - 8891242
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  8891505 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaa 8891406  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||| | | |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  8891405 ataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatg 8891307  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
      | ||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8891306 gctattaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 8891242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 19794704 - 19794967
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  19794704 atggataattgtcgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 19794803  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||| | | |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  19794804 ataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatt 19794902  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
       |||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19794903 tccgttaattgatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19794967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 36982441 - 36982704
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||     
T  36982441 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaa 36982540  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | | ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||     
T  36982541 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttatt 36982639  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36982640 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36982704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 20627310 - 20627576
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||     
T  20627310 attatggataattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtc 20627409  T
Q  101 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 200  Q
    || ||||| ||||||||||| || |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||| ||    
T  20627410 caaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgatttt 20627508  T
Q  201 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||  ||||| ||| | || || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  20627509 atggttgttaattggtgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatggatattcatgaattgaggatg 20627576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 268
Target Start/End: Original strand, 43642958 - 43643220
Alignment:
Q  5 tggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 104  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  43642958 tggataattgttgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 43643057  T
Q  105 tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatga 204  Q
    || | | ||||| |||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | || ||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||      
T  43643058 taggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-ttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatgctattg 43643156  T
Q  205 atgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
     ||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43643157 ctgttaattgatgttgtagttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43643220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 268
Target Start/End: Original strand, 24341390 - 24341652
Alignment:
Q  5 tggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 104  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||      
T  24341390 tggataattgttgctaaattcatgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaat 24341489  T
Q  105 tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatga 204  Q
    |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||      
T  24341490 tatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattg 24341588  T
Q  205 atgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
     ||||| ||||| ||    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24341589 ttgttaattgatgttcctgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 24341652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 25265390 - 25265653
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  25265390 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 25265489  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  25265490 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 25265588  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
      ||||| ||||| || |  || |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25265589 gttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 25265653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 268
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508107
Alignment:
Q  54 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttct 153  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| | ||  |||||||||      
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-g 7507992  T
Q  154 cctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 252  Q
     ||||||||||||||| ||||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7507993 gctaagttgttgttaa-ttgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatat 7508091  T
Q  253 tcatggattgatgatg 268  Q
    ||||||||||||||||    
T  7508092 tcatggattgatgatg 7508107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Original strand, 19689401 - 19689548
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  19689401 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 19689500  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 151  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  19689501 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 19689548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23820334 - 23820187
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  23820334 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 23820235  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 151  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  23820234 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 23820187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Original strand, 14906440 - 14906587
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  14906440 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 14906539  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 151  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  14906540 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 14906587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 20015274 - 20015127
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||  || |||| | ||||||||| ||||||||||||       
T  20015274 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttga 20015175  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 151  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  20015174 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20015127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 68238 - 68156
Alignment:
Q  21 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 102  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  68238 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 68156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Original strand, 22775206 - 22775288
Alignment:
Q  21 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 102  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||| | ||||||||    
T  22775206 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttca 22775288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Original strand, 22780584 - 22780666
Alignment:
Q  21 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 102  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||| | ||||||||    
T  22780584 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttca 22780666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 43646139 - 43646059
Alignment:
Q  21 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 100  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  43646139 aattcgtgctctaattatgttgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattggattgttgttggtgaaatttcatgtt 43646059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 47357906 - 47357654
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357906 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 47357807  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357806 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 47357707  T
Q  216 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47357706 tattatgattgatgaataattgattgggtatgtatattcatggattgatgatg 47357654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10644467 - 10644219
Alignment:
Q  20 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 119  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  10644467 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 10644368  T
Q  120 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 219  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10644367 agttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 10644268  T
Q  220 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10644267 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10644219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Original strand, 13048221 - 13048477
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    || ||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  13048221 atggataattgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 13048320  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13048321 atatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13048420  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 260  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13048421 aatgttattagataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggat 13048477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 13246693 - 13246430
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  13246693 atggataattgttgttaaattcgtgctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 13246594  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||| | | |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13246593 ataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatg 13246495  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
      ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13246494 gctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13246430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 54118244 - 54118507
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  54118244 atggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 54118343  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||| | | || ||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||||||||     
T  54118344 ataggaacaattgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattgatgttata 54118442  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
      ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54118443 gttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 54118507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 268
Target Start/End: Original strand, 15675090 - 15675352
Alignment:
Q  5 tggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  15675090 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaat 15675189  T
Q  105 tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatga 204  Q
    |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||      
T  15675190 tatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattg 15675288  T
Q  205 atgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
     ||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15675289 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 15675352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26680463 - 26680201
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  26680463 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 26680364  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  26680363 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 26680266  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26680265 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 26680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 122154 - 121989
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 101  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  122154 ttatggataattgttgctaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 122055  T
Q  102 atatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgtta 168  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  122054 aaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtta 121989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115629
Alignment:
Q  31 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 130  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||  ||||| |||| |    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  131 ttgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 230  Q
    || |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  |||||||    
T  31115765 ttatgctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatga 31115667  T
Q  231 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31115666 atcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 31115629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 200
Target Start/End: Original strand, 10104251 - 10104445
Alignment:
Q  5 tggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 104  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  10104251 tggataattgttgctaaatccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaat 10104350  T
Q  105 tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 200  Q
    |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  10104351 tatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 10104445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 10488825 - 10488678
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  10488825 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 10488726  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 151  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  10488725 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 10488678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Original strand, 16327926 - 16328073
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  16327926 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16328025  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 151  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  16328026 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16328073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 171 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 111492 - 111395
Alignment:
Q  171 ttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  111492 ttgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 111395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 33240962 - 33240900
Alignment:
Q  5 tggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatg 67  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  33240962 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatg 33240900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 200
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885749
Alignment:
Q  20 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata-tatgcaaaaatgat 118  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||      
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtc 40885669  T
Q  119 aagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 200  Q
    |||||||||| ||| |||| ||  |||||| || | ||||||| ||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  40885670 aagttatgaa-attatgctcaattggtgaactt-tgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 40885749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 15045074 - 15044992
Alignment:
Q  21 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 102  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  15045074 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 15044992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 268
Target Start/End: Original strand, 10104450 - 10104494
Alignment:
Q  224 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10104450 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 10104494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Original strand, 15109350 - 15109432
Alignment:
Q  21 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 102  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  15109350 aattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 15109432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10989661 - 10989410
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 10989562  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 215  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989561 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttg-taatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 10989463  T
Q  216 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10989462 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10989410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2437710 - 2437457
Alignment:
Q  15 ttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 114  Q
    |||||||||||||||||    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437710 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 2437611  T
Q  115 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 214  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437610 tgataagttatgaagattgtgttcaattggtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 2437511  T
Q  215 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2437510 atattatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 2437457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 13911024 - 13911277
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    ||||||||||||||||    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911024 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 13911123  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcct-aagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 214  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13911124 gataagttatgaatattatgctcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttg 13911223  T
Q  215 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13911224 atattatgattgatgaataatttcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 13911277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 13572924 - 13572676
Alignment:
Q  20 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 119  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  13572924 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 13572825  T
Q  120 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 219  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13572824 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 13572725  T
Q  220 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13572724 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13572676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 268
Target Start/End: Original strand, 18253842 - 18254098
Alignment:
Q  11 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  18253842 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 18253941  T
Q  111 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 210  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18253942 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 18254040  T
Q  211 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18254041 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 18254098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 262
Target Start/End: Original strand, 25292338 - 25292595
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| |||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  25292338 atggataattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 25292437  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25292438 atatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgctcaattggtgaatt-ctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 25292536  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattg 262  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25292537 aatgttatttgatattatgactaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattg 25292595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 13037014 - 13037277
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| ||||||||     
T  13037014 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaa 13037113  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||| | | |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  13037114 ataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatg 13037212  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||| ||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13037213 aatattaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13037277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 47481031 - 47481294
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  47481031 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaa 47481130  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  47481131 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatc 47481229  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
      | ||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47481230 gctcttaattgatgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 47481294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16212031 - 16211768
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 101  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||||||| |||||||    
T  16212031 ttatggacaattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttc 16211932  T
Q  102 atatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtta 201  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||    
T  16211931 aaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgtta 16211833  T
Q  202 tgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 266  Q
    ||  ||||| ||||| || || ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16211832 tggttgttaattgatgttgtggttgatgattcattgcttgggtatgcatattcatgaattaatga 16211768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 263
Target Start/End: Original strand, 11580739 - 11580997
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  11580739 atggataattattgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 11580838  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||| | | |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11580839 ataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatg 11580937  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 263  Q
      ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11580938 gctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattga 11580997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3060231 - 3059966
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||    
T  3060231 ttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttc 3060132  T
Q  102 atatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtta 201  Q
    | ||||| ||||||||||| || |||| ||| |||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3060131 aaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgctcaaatggtgaattt-tgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgtta 3060033  T
Q  202 tgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||| ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3060032 tgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 3059966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 36052927 - 36052667
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||  | |||||||| || || || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  36052927 atggataattgttgctaaatttatactccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaa 36052828  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||   |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  36052827 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtg 36052732  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
      ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36052731 gttgttaattgatgttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36052667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 268
Target Start/End: Original strand, 16478987 - 16479213
Alignment:
Q  41 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  16478987 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaa 16479086  T
Q  141 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 240  Q
      ||||||||| |  |||||| || |||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||    
T  16479087 ttggtgaattt-tgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgctt 16479185  T
Q  241 gggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16479186 gggtatgcatattcatggattgatgatg 16479213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7293279 - 7293017
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  7293279 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 7293180  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||||||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  7293179 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 7293082  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7293081 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 7293017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 13321278 - 13321014
Alignment:
Q  5 tggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttcat 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  13321278 tggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaa 13321179  T
Q  104 a-tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttg-ttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtta 201  Q
    | |||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||| ||||| | ||||| | |||||| ||||||| ||||||||    
T  13321178 agtatgtataaatgtcaagttatgaa-attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtta 13321081  T
Q  202 tgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  13321080 ttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatg 13321014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 11516490 - 11516343
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  11516490 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 11516391  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 151  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  11516390 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 11516343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Original strand, 15441564 - 15441711
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  15441564 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 15441663  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 151  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  15441664 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 15441711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Original strand, 30262129 - 30262276
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  30262129 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 30262228  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 151  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  30262229 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 30262276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 125
Target Start/End: Original strand, 295973 - 296087
Alignment:
Q  11 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 110  Q
    |||||||||||||||||| || || |  | |||||||||||| ||||||||| |||| || |  ||| ||||||||||||||| |||||| |  |||| |    
T  295973 attgttgctaaattcgtgttctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgta 296072  T
Q  111 aaaatgataagttat 125  Q
    ||||||| |||||||    
T  296073 aaaatgagaagttat 296087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 13377775 - 13377693
Alignment:
Q  21 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 102  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  13377775 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 13377693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 102
Target Start/End: Original strand, 16914928 - 16915011
Alignment:
Q  20 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 102  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||| |||||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  16914928 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 16915011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 36
Target Start/End: Original strand, 14113989 - 14114021
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaact 36  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14113989 atggataattgttgctaaattcgtgctccaact 14114021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 36
Target Start/End: Original strand, 14423639 - 14423671
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaact 36  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14423639 atggataattgttgctaaattcgtgctccaact 14423671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30120974 - 30120722
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30120974 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 30120875  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 215  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30120874 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 30120775  T
Q  216 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30120774 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatcgattgatgatg 30120722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 78 - 268
Target Start/End: Original strand, 222753 - 222943
Alignment:
Q  78 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222753 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 222852  T
Q  178 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222853 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 222943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 78 - 268
Target Start/End: Original strand, 736376 - 736566
Alignment:
Q  78 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736376 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 736475  T
Q  178 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736476 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 736566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 78 - 268
Target Start/End: Original strand, 860271 - 860461
Alignment:
Q  78 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860271 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 860370  T
Q  178 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860371 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 860461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 16674392 - 16674644
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674392 tgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 16674491  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 215  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674492 gataagttatgaatattgtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 16674591  T
Q  216 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16674592 taatatgattaatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 16674644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 268
Target Start/End: Original strand, 21844576 - 21844824
Alignment:
Q  20 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 119  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  21844576 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 21844675  T
Q  120 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 219  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844676 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 21844775  T
Q  220 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21844776 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21844824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 268
Target Start/End: Original strand, 21851969 - 21852217
Alignment:
Q  20 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 119  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||    
T  21851969 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgata 21852068  T
Q  120 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 219  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21852069 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 21852168  T
Q  220 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21852169 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21852217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 269
Target Start/End: Original strand, 16193714 - 16193980
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16193714 ttatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttc 16193813  T
Q  102 atatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtta 201  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | | || |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  16193814 aaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgtta 16193912  T
Q  202 tgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 269  Q
    ||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16193913 tggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 16193980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 43373480 - 43373731
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  43373480 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 43373579  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 215  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||    
T  43373580 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattga 43373678  T
Q  216 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43373679 tgttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43373731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 264
Target Start/End: Original strand, 6774258 - 6774505
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    ||||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6774258 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6774357  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 215  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||    
T  6774358 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttga 6774456  T
Q  216 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 264  Q
    | || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6774457 tgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 6774505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 24928788 - 24929043
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24928788 attatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 24928887  T
Q  101 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 200  Q
    || ||| | | |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| |||   ||||||| ||  |||||||||| ||| |||    
T  24928888 caaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttc-gctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggtt 24928986  T
Q  201 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 257  Q
    |||  ||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24928987 atggttgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 24549233 - 24548986
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    ||||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24549233 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 24549134  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 215  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  24549133 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 24549035  T
Q  216 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 264  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24549034 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 24548986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 16404975 - 16405235
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  16404975 atggataattattgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 16405074  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||| | | ||||| |||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||   |||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||     
T  16405075 ataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaaattgacatatgattcttgttcaattgatgttatt 16405170  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16405171 gttgttaattgatgttttagttgatgaatcactgcttgggtatgcaaattcatgaattgatgatg 16405235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 22907214 - 22907476
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  22907214 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 22907313  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  22907314 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 22907411  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22907412 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 22907476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17345832 - 17345581
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  17345832 atggataattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 17345733  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
     |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |||| ||||     
T  17345732 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatattatt 17345635  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 257  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17345634 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 5238350 - 5238203
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  5238350 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 5238251  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 151  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  5238250 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 5238203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Original strand, 24661248 - 24661395
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  24661248 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 24661347  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 151  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  24661348 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 24661395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 43685809 - 43685662
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  43685809 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 43685710  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 151  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  43685709 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 43685662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 691908 - 691970
Alignment:
Q  78 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691908 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 691970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 26011741 - 26011658
Alignment:
Q  20 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 102  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  26011741 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttca 26011658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 32)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 55316471 - 55316219
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316471 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 55316372  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 215  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316371 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 55316272  T
Q  216 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55316271 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 55316219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41270327 - 41270075
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41270327 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaat 41270228  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 215  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41270227 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 41270128  T
Q  216 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41270127 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 41270075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 14842558 - 14842824
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14842558 attatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgtt 14842657  T
Q  101 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 200  Q
    || || || ||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  14842658 caaatgtgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgtt 14842756  T
Q  201 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14842757 atggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatg 14842824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 41 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16821366 - 16821139
Alignment:
Q  41 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 140  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  16821366 tgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgctaaa 16821267  T
Q  141 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 240  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16821266 ttggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 16821167  T
Q  241 gggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16821166 gggtttgcatattcatggattaatgatg 16821139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 13975722 - 13975985
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  13975722 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13975820  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13975821 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13975920  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13975921 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13975985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 45861068 - 45860805
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  45861068 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 45860970  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45860969 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 45860870  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  45860869 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 45860805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 269
Target Start/End: Original strand, 51158016 - 51158282
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51158016 ttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 51158115  T
Q  102 atatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtta 201  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  51158116 aaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgtta 51158214  T
Q  202 tgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 269  Q
    ||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  51158215 tggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 51158282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 13954890 - 13955153
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  13954890 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13954988  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13954989 ataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13955088  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13955089 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13955153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 15859024 - 15859287
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  15859024 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 15859123  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||||| | |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15859124 atatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatg 15859222  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
      ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15859223 gctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15859287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 268
Target Start/End: Original strand, 15936634 - 15936890
Alignment:
Q  11 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  15936634 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15936733  T
Q  111 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 210  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15936734 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 15936832  T
Q  211 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15936833 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 15936890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 268
Target Start/End: Original strand, 12030145 - 12030410
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12030145 ttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 12030244  T
Q  102 atatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtta 201  Q
    | ||||| |||| ||||||||| ||||  ||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||    
T  12030245 aaatatgtaaaagtgataagttgtgaaagttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgcta 12030343  T
Q  202 tgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||  ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12030344 tggttgttaattgatgttatggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 12030410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2050075 - 2049810
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2050075 ttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 2049976  T
Q  102 atatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtta 201  Q
    | ||||| ||| ||||||| || |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||    
T  2049975 aaatatgtaaacatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgcta 2049877  T
Q  202 tgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2049876 tggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 2049810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 15938476 - 15938729
Alignment:
Q  11 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 110  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |  || ||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  15938476 attgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15938575  T
Q  111 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 210  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15938576 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 15938674  T
Q  211 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatg 265  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15938675 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatg 15938729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13839160 - 13838905
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  13839160 attatgaataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgtt 13839061  T
Q  101 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 200  Q
    || ||| | | |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13839060 caaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgtt 13838962  T
Q  201 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 257  Q
    |||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13838961 atggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15615085 - 15614838
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15615085 tgctagatttgtgctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 15614986  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 215  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  15614985 gataagttgtgaatatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 15614887  T
Q  216 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 264  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15614886 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 15614838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 17912483 - 17912744
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  17912483 atggataattgttgctaaattcgtgctccaact-tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17912581  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||  | ||||||  |  || ||||| ||| | ||||| | |||||| |||||||  ||||||||     
T  17912582 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatt--tgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttatt 17912679  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17912680 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 17912744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 16744112 - 16744377
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  16744112 attatggatgattgttgttaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttt 16744211  T
Q  101 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 200  Q
     | ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||| ||| |||||||    
T  16744212 taaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttatagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgtt 16744309  T
Q  201 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
     |  ||| || |  || || |  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16744310 gttgatgctaataaatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatg 16744377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Original strand, 2449238 - 2449385
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  2449238 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 2449337  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 151  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  2449338 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 2449385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 19232044 - 19231981
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatg 67  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||    
T  19232044 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgatg 19231981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 47984763 - 47984650
Alignment:
Q  155 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 254  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47984763 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47984664  T
Q  255 atggattgatgatg 268  Q
    ||| ||||||||||    
T  47984663 atgaattgatgatg 47984650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 47994050 - 47993937
Alignment:
Q  155 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 254  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47994050 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47993951  T
Q  255 atggattgatgatg 268  Q
    ||| ||||||||||    
T  47993950 atgaattgatgatg 47993937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 48003337 - 48003224
Alignment:
Q  155 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 254  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48003337 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48003238  T
Q  255 atggattgatgatg 268  Q
    ||| ||||||||||    
T  48003237 atgaattgatgatg 48003224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 48012623 - 48012510
Alignment:
Q  155 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 254  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48012623 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48012524  T
Q  255 atggattgatgatg 268  Q
    ||| ||||||||||    
T  48012523 atgaattgatgatg 48012510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 100
Target Start/End: Original strand, 11986173 - 11986262
Alignment:
Q  11 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| || |||||| || || ||||||| || ||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  11986173 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 11986262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080715
Alignment:
Q  20 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 61  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 14080715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 268
Target Start/End: Original strand, 15468555 - 15468596
Alignment:
Q  227 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15468555 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15468596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 104
Target Start/End: Original strand, 4145814 - 4145898
Alignment:
Q  20 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 104  Q
    |||||||| |||||| |||| || |||||||| || ||||||||| || || ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  4145814 aaattcgtactccaattatggtgatatgtttgaatacatgaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattacatgttcata 4145898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 30207462 - 30207380
Alignment:
Q  21 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 102  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||| | ||||||||    
T  30207462 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttca 30207380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 104
Target Start/End: Original strand, 6228625 - 6228710
Alignment:
Q  20 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 104  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| || |||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  6228625 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcata 6228710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 227 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22275250 - 22275209
Alignment:
Q  227 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22275250 atgaatcattgcttaggtatgcatattcatgaattgatgatg 22275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 61
Target Start/End: Original strand, 14059214 - 14059254
Alignment:
Q  21 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 61  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  14059214 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 14059254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 50
Target Start/End: Original strand, 19260821 - 19260869
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgttt 50  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||    
T  19260821 ttatggataattgttgctaaattcgtgctctaattatgatgatatgttt 19260869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 5072388 - 5072640
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072388 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 5072487  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 215  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072488 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 5072587  T
Q  216 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5072588 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 5072640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 18601118 - 18601370
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    |||||||||| |||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18601118 tgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 18601217  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 215  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18601218 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 18601317  T
Q  216 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18601318 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 18601370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20931610 - 20931345
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20931610 ttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 20931511  T
Q  102 atatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtta 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  20931510 atatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgtta 20931412  T
Q  202 tgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||  ||||| ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20931411 tggttgttaattgatgttgtggttgatgaataatttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatg 20931345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20913291 - 20913037
Alignment:
Q  6 ggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatat 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20913291 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatat 20913192  T
Q  106 atgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaa 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| | | |||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||      
T  20913191 atgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttaatt-------tgattcttgttcaattgatgttatggt 20913100  T
Q  206 tgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20913099 tgttaattgatcttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 20913037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41394488 - 41394222
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  41394488 attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgtt 41394389  T
Q  101 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 200  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||  ||||| | ||||||||| |||| |||||||    
T  41394388 caaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgtt 41394290  T
Q  201 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||   ||||||||||| || |  ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394289 attgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgattgggtatgcatattcatggattgatgatg 41394222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22228061 - 22227809
Alignment:
Q  15 ttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 114  Q
    |||||||||||||||||   || || |||||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22228061 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 22227962  T
Q  115 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 214  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22227961 tgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattg 22227863  T
Q  215 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22227862 atgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22227809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22232758 - 22232506
Alignment:
Q  15 ttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 114  Q
    |||||||||||||||||   || || |||||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22232758 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 22232659  T
Q  115 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 214  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22232658 tgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattg 22232560  T
Q  215 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22232559 atgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22232506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 20893626 - 20893889
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  20893626 atggataattgttgctaaattcttgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaa 20893725  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||| | | |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  20893726 ataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatg 20893824  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    | ||||| ||||| || || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20893825 actgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcataaattgatgatg 20893889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20445942 - 20445679
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  20445942 atggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 20445843  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
     || | | |||||||||||  |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  20445842 gtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatg 20445744  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20445743 gctgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 37844450 - 37844714
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  37844450 atggataattgttgctaaattcatgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 37844549  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagtta-tgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 202  Q
     || | | |||||||||  || |||| |||||||| ||    ||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  37844550 gtaggaacaaatgataaaatagtgaaaattgtgctcaattaatgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttat 37844648  T
Q  203 gaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |  ||||| ||||| || || ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  37844649 ggttgttaattgatgttgtggttgatgagtcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 37844714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20531707 - 20531444
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  20531707 atggataattgttgctaaattcgtgctccaaatgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 20531608  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
     || | | |||||||||||  |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  20531607 gtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatg 20531509  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20531508 gctgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20531444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2116506 - 2116258
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    ||||| |||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2116506 tgctagattcgtgcttttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 2116407  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttga-gttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 214  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||    
T  2116406 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattg 2116308  T
Q  215 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 264  Q
    || || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2116307 atgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 2116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 45051674 - 45051489
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    ||||| ||||||| ||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  45051674 tgctagattcgtgttcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 45051575  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 202  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||    
T  45051574 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttat 45051489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 51452755 - 51452608
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  51452755 atggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 51452656  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 151  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  51452655 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 51452608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 16646158 - 16646118
Alignment:
Q  21 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 61  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  16646158 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 16646118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 45051486 - 45051446
Alignment:
Q  224 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 264  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45051486 ttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 45051446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 41 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 36320 - 36093
Alignment:
Q  41 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 140  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36320 tgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 36221  T
Q  141 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 240  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36220 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaataattgctt 36121  T
Q  241 gggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36120 gggtttgcatattcatggattgatgatg 36093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 48863 - 48598
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48863 ttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 48764  T
Q  102 atatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtta 201  Q
    | ||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |   ||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  48763 aaataggaaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcagttggtgaattt-tgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgtta 48665  T
Q  202 tgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||  | ||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48664 tggctattaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 48598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 41 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 43224 - 42997
Alignment:
Q  41 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 140  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43224 tgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgctaaa 43125  T
Q  141 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 240  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43124 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 43025  T
Q  241 gggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43024 gggtttgcatattcatggattgatgatg 42997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5785 - 5552
Alignment:
Q  11 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  5785 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgta 5686  T
Q  111 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 210  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5685 aaaatgataagtcatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 5586  T
Q  211 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggt 244  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5585 tttgataatatgattaatgaataattgcttgggt 5552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 268
Target Start/End: Original strand, 31700 - 31928
Alignment:
Q  41 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 140  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  31700 tgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaa 31799  T
Q  141 ggggtgaatttctcct-aagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 239  Q
      |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31800 ttggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaataattgct 31899  T
Q  240 tgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31900 tgggtttgcatattcatggattaatgatg 31928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 268
Target Start/End: Original strand, 128167 - 128431
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  128167 ttatggataattgttgctaaattcgtgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 128266  T
Q  102 atatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtta 201  Q
    | || || |||  || |||||| |||| |||||||| ||  || |||||| |  || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  128267 aaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggcgaattt-tgttaggttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaattgatgtta 128364  T
Q  202 tgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    || |||||| | ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  128365 tggatgttaatggatgttgtgattgatgaataattgattgggtatgcatattcatgaattgatgatg 128431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 283 - 35
Alignment:
Q  20 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 119  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  283 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 184  T
Q  120 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 219  Q
    ||||||| | |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183 agttatgtatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 84  T
Q  220 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  83 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatgaattgttgatg 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 3579 - 3843
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3579 attatagataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 3678  T
Q  101 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 200  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  3679 caaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgtt 3777  T
Q  201 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 266  Q
    ||| |||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3778 atggatgttaattgatgttgtgattgaggaataattgcttgggtatgcatattgatggattgatga 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 1389 - 1124
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1389 ttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 1290  T
Q  102 atatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtta 201  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  1289 aaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgtta 1191  T
Q  202 tgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||  ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1190 tggttgttaattgatattgtggttgatgaataattgcttgggtgtgcatattcatgaattgatgatg 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 6061 - 6326
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6061 attatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 6160  T
Q  101 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 200  Q
    || ||||| |||||| ||||||| | || |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  6161 caaatatgtaaaaataataagttgtaaaaattgtgctgaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgtt 6258  T
Q  201 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||| |||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6259 atggatgttaatttttgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 953 - 1218
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  953 attatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 1052  T
Q  101 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 200  Q
    || ||||| |||||| ||||||| |||| |||||||| ||  | ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| |||||||    
T  1053 caaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagattttattcttgttcaagtgatgtt 1150  T
Q  201 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1151 atggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 48443 - 48187
Alignment:
Q  11 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  48443 attgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 48344  T
Q  111 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 210  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  48343 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgtta 48245  T
Q  211 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48244 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatg 48187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 268
Target Start/End: Original strand, 64527 - 64780
Alignment:
Q  20 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaatt-----gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 114  Q
    ||||||||||||   || || |||||||||| ||||||||||||     |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  64527 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattatattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaa 64626  T
Q  115 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 214  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64627 tgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 64726  T
Q  215 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  64727 atattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 64780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 108003 - 107747
Alignment:
Q  11 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  108003 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgca 107904  T
Q  111 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 210  Q
    ||||||||||||| | || |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  107903 aaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 107805  T
Q  211 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  107804 attgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 107747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 61
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89905
Alignment:
Q  19 taaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 61  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 89905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12379 - 12115
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12379 attatggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtt 12280  T
Q  101 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 200  Q
     | || || |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||  | ||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  12279 taaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgtt 12183  T
Q  201 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12182 atgaatgttaattgatgttatgattcatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9143 - 8878
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 101  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9143 ttatggaaaattgttgctaaattcgtgctccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 9044  T
Q  102 atatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtta 201  Q
    |  |||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  9043 aattatgtaaaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgtta 8945  T
Q  202 tgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    || |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8944 tggatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatg 8878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 268
Target Start/End: Original strand, 21115 - 21367
Alignment:
Q  15 ttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 114  Q
    |||||||||||||||||    | || |||||||||||||| ||| |||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21115 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 21214  T
Q  115 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21215 tgataagttatgaagattgagctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttg 21313  T
Q  215 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  21314 atgttatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattaatgatg 21367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 268
Target Start/End: Original strand, 14086 - 14312
Alignment:
Q  41 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14086 tgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgctcaa 14185  T
Q  141 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 240  Q
      ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14186 ttggtgaattt-tcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatgaataattgctt 14284  T
Q  241 gggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  14285 gagtttgcatattcatggattgatgatg 14312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 19469 - 19206
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  19469 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 19370  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||     
T  19369 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttatt 19271  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19270 gctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21553 - 21290
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  21553 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 21454  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||     
T  21453 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttatt 21355  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21354 gctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 148977 - 148721
Alignment:
Q  11 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 110  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  148977 attgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgta 148878  T
Q  111 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 210  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  148877 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgtta 148779  T
Q  211 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
     ||||  || || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  148778 attgaagttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatg 148721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9111 - 8849
Alignment:
Q  5 tggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  9111 tggataattgttgctaaattcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaat 9012  T
Q  105 tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatga 204  Q
    |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||  ||||||| |||||||||      
T  9011 tatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattg 8913  T
Q  205 atgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
     | ||| ||||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8912 ctattaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 123164 - 123427
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  123164 atggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 123263  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||| | | |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  123264 ataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatg 123362  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
      ||||| ||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  123363 gttgttaattgatgttgtggttgatgaataatggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatg 123427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 36913 - 37176
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||   |||||||||||||||||||||||     
T  36913 atggataattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaa 37012  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||    
T  37013 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatg 37111  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
      ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37112 gctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 37176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 54 - 268
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5466
Alignment:
Q  54 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttct 153  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||  ||||||||| |    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-t 5352  T
Q  154 cctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatatt 253  Q
     || |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5353 gctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatatt 5451  T
Q  254 catggattgatgatg 268  Q
    |||||||||||||||    
T  5452 catggattgatgatg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 5061 - 5324
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||     
T  5061 atggataattgttgctaaattcgtactccaactgtgacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaa 5160  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | | ||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  5161 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatg 5259  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
      ||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5260 gctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 5324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3722
Alignment:
Q  54 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa-tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttc 152  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||   ||  |||||||||     
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaattt- 3838  T
Q  153 tcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 252  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3837 tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatat 3738  T
Q  253 tcatggattgatgatg 268  Q
    ||||||||||||||||    
T  3737 tcatggattgatgatg 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 268
Target Start/End: Original strand, 26422 - 26678
Alignment:
Q  11 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  26422 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgta 26521  T
Q  111 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 210  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  26522 aaaatgataagttgtgaaaattgttctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgtta 26620  T
Q  211 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
     ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  26621 attgatgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattgatgaattgaggatg 26678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Original strand, 8180 - 8327
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  8180 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaa 8279  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 151  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  |||||||||    
T  8280 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 8327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 257
Target Start/End: Original strand, 247442 - 247694
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| ||||||||     
T  247442 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaa 247541  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||| | | |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  247542 ataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatg 247640  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 257  Q
    | ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  247641 actgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 247694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 264
Target Start/End: Original strand, 9374 - 9596
Alignment:
Q  41 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  9374 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 9473  T
Q  141 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 240  Q
      ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  9474 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgctt 9572  T
Q  241 gggtatgcatattcatggattgat 264  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  9573 gggtatgcatattcatgaattgat 9596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 264
Target Start/End: Original strand, 16272 - 16494
Alignment:
Q  41 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  16272 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 16371  T
Q  141 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 240  Q
      ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  16372 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgctt 16470  T
Q  241 gggtatgcatattcatggattgat 264  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  16471 gggtatgcatattcatgaattgat 16494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 172171 - 171916
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 100  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  172171 attatggataactgttgctaaatacgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgtt 172072  T
Q  101 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 200  Q
    || ||| | | |||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  172071 caaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgtt 171973  T
Q  201 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 257  Q
    |||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  171972 atggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttaggtatgcatattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 177874 - 177619
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 100  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  177874 attatggataactgttgctaaatacgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgtt 177775  T
Q  101 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 200  Q
    || ||| | | |||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  177774 caaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgtt 177676  T
Q  201 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 257  Q
    |||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  177675 atggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttaggtatgcatattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 41994 - 41733
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||| ||    
T  41994 ttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctc 41895  T
Q  102 atatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtta 201  Q
    | ||||| ||||||||||| || |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  41894 aaatatgtaaaaatgataatttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgcta 41796  T
Q  202 tgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 264  Q
    ||  ||||| ||| | || |   |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41795 tggctgttaattgttgttgtagatgatgaatcattggttgggtatgcatattcatgaattgat 41733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 162
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1450
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1304 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 1403  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttg 162  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  1404 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttg 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 534 - 797
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  534 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 633  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    ||| | | ||||||| |||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | |||||||  |||||  || |||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  634 ataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattt-tgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatg 732  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
      || || ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  733 gctgctaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatg 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 34460 - 34724
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  34460 atggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 34559  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttat 202  Q
     | || ||||||   ||||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| || || || |||||||||    
T  34560 ttgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttat 34658  T
Q  203 gaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
       ||||||||||| || |  ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34659 tgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatg 34724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 272291 - 272031
Alignment:
Q  1 attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 100  Q
    ||||||||| | | ||||||||| ||| |||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  272291 attatggataaatattgctaaatacgtactccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgtt 272192  T
Q  101 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 200  Q
    || ||| | | |||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  272191 caaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgtt 272093  T
Q  201 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattg 262  Q
    ||   ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  272092 atagctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattg 272031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 37066 - 37328
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  37066 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37165  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||| |||   ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  37166 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 37263  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37264 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 37328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41911 - 41648
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  41911 atggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 41812  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  41811 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 41713  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
      |||||  |||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41712 gttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 41648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 2966
Alignment:
Q  15 ttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 114  Q
    |||||||||||||||||   || || |||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  3215 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaa 3116  T
Q  115 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttattt 213  Q
    ||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||    
T  3115 tgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttattt 3017  T
Q  214 gatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 264  Q
    ||| || |  ||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3016 gatgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgat 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 13769 - 13506
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  13769 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 13670  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 203  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  | ||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  13669 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 13571  T
Q  204 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13570 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatgaattgacgatg 13506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Original strand, 51180 - 51328
Alignment:
Q  2 ttatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  51180 ttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc 51279  T
Q  102 atatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatt 150  Q
    | ||| | |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||    
T  51280 aaataggtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 51328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 162 - 268
Target Start/End: Original strand, 9 - 115
Alignment:
Q  162 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 261  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9 gttgttaatttgatatttgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 108  T
Q  262 gatgatg 268  Q
    |||||||    
T  109 gatgatg 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 162 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 48620 - 48514
Alignment:
Q  162 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 261  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48620 gttgttaatttgagatttgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 48521  T
Q  262 gatgatg 268  Q
    |||||||    
T  48520 gatgatg 48514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 150
Target Start/End: Original strand, 89454 - 89600
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  89454 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 89553  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatt 150  Q
    ||| | | |||| ||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||    
T  89554 ataggaacaaattataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 89600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Original strand, 13325 - 13480
Alignment:
Q  16 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 115  Q
    ||||| ||||||||||  | | || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13325 tgctagattcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 13424  T
Q  116 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaattt 172  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  13425 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaattt 13480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 27058 - 26911
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  27058 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 26959  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 151  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  26958 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 26911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 22796 - 22656
Alignment:
Q  11 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||      
T  22796 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtg 22697  T
Q  111 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 151  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  22696 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 22656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Original strand, 1582 - 1729
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  1582 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 1681  T
Q  104 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 151  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  1682 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 1729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 171 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9479 - 9382
Alignment:
Q  171 ttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 268  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9479 ttgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3360
Alignment:
Q  4 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacat 97  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| | || || ||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  3453 atggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacat 3360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 3264 - 3210
Alignment:
Q  212 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 266  Q
    ||||| || |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3264 ttgatgttgtgattgatgaatcattgtttgggtaggcatattcatgaattgatga 3210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 100
Target Start/End: Original strand, 56106 - 56195
Alignment:
Q  11 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| || |||||| || || ||||||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  56106 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgtt 56195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8174
Alignment:
Q  20 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 102  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||  ||||||||||| || ||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttca 8174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Original strand, 2317 - 2399
Alignment:
Q  21 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 102  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  2317 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 2399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 45244 - 45198
Alignment:
Q  54 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 100  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45244 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtt 45198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 61
Target Start/End: Original strand, 1546 - 1587
Alignment:
Q  20 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 61  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  1546 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 61
Target Start/End: Original strand, 8691 - 8732
Alignment:
Q  20 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 61  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8691 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 61
Target Start/End: Original strand, 70307 - 70348
Alignment:
Q  20 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 61  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  70307 aaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 70348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 8051 - 8011
Alignment:
Q  21 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 61  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  8051 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 8011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 3565 - 3525
Alignment:
Q  21 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 61  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  3565 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 3525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University