View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18963_low_5 (Length: 635)

Name: NF18963_low_5
Description: NF18963
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18963_low_5
NF18963_low_5
[»] chr5 (70 HSPs)
chr5 (1-618)||(25428719-25429337)
chr5 (4-618)||(21336764-21337391)
chr5 (1-618)||(26736197-26736827)
chr5 (1-618)||(18781400-18782030)
chr5 (1-618)||(27520692-27521322)
chr5 (1-618)||(22136954-22137584)
chr5 (1-618)||(16358788-16359418)
chr5 (1-618)||(34568780-34569410)
chr5 (1-618)||(22350205-22350835)
chr5 (1-618)||(29473543-29474173)
chr5 (1-618)||(40711066-40711696)
chr5 (1-618)||(41773128-41773758)
chr5 (60-618)||(20802942-20803513)
chr5 (1-618)||(27665960-27666590)
chr5 (3-618)||(37288966-37289594)
chr5 (1-618)||(14997209-14997839)
chr5 (1-618)||(27612640-27613272)
chr5 (1-618)||(22330357-22330987)
chr5 (1-618)||(27682870-27683500)
chr5 (1-618)||(19772246-19772876)
chr5 (237-618)||(21882296-21882690)
chr5 (302-618)||(23473795-23474111)
chr5 (303-618)||(21342884-21343199)
chr5 (3-618)||(21561495-21562123)
chr5 (3-255)||(20465945-20466197)
chr5 (1-271)||(25850343-25850613)
chr5 (1-271)||(37541211-37541481)
chr5 (38-271)||(21984007-21984240)
chr5 (1-256)||(17267179-17267434)
chr5 (1-216)||(23473513-23473728)
chr5 (1-618)||(20778181-20778811)
chr5 (1-618)||(28892412-28893042)
chr5 (21-264)||(22233757-22234000)
chr5 (36-271)||(14884821-14885056)
chr5 (1-264)||(22464219-22464482)
chr5 (36-271)||(24796227-24796462)
chr5 (21-301)||(21409440-21409720)
chr5 (1-264)||(28921605-28921868)
chr5 (68-264)||(23078742-23078938)
chr5 (1-618)||(20823721-20824351)
chr5 (36-271)||(20344585-20344820)
chr5 (314-618)||(21983647-21983951)
chr5 (3-262)||(23564007-23564266)
chr5 (1-271)||(22504947-22505217)
chr5 (316-618)||(23563638-23563940)
chr5 (314-606)||(22464544-22464836)
chr5 (27-264)||(21676671-21676908)
chr5 (108-264)||(659-815)
chr5 (387-618)||(23078375-23078606)
chr5 (339-618)||(17266804-17267083)
chr5 (305-474)||(22233534-22233703)
chr5 (387-606)||(14884473-14884692)
chr5 (563-618)||(23460832-23460887)
chr5 (425-606)||(20311573-20311754)
chr5 (558-618)||(21631869-21631929)
chr5 (387-606)||(22505346-22505565)
chr5 (1-166)||(21935123-21935288)
chr5 (1-166)||(23507952-23508117)
chr5 (1-166)||(24583478-24583643)
chr5 (482-542)||(23525867-23525927)
chr5 (398-606)||(25850750-25850958)
chr5 (395-474)||(21676448-21676527)
chr5 (389-615)||(21409821-21410047)
chr5 (410-466)||(24618635-24618691)
chr5 (410-466)||(24714866-24714922)
chr5 (410-466)||(24747894-24747950)
chr5 (395-474)||(436-515)
chr5 (40-92)||(21625475-21625527)
chr5 (249-301)||(23473729-23473781)
chr5 (339-475)||(24796010-24796146)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (1-618)||(18033-18663)
[»] chr6 (72 HSPs)
chr6 (1-618)||(18405377-18406007)
chr6 (3-615)||(23080643-23081268)
chr6 (1-618)||(22436087-22436717)
chr6 (1-618)||(19866905-19867535)
chr6 (1-618)||(28311848-28312478)
chr6 (1-618)||(2872235-2872866)
chr6 (1-618)||(24293215-24293845)
chr6 (1-618)||(16574108-16574738)
chr6 (1-618)||(16620642-16621272)
chr6 (1-618)||(25114770-25115400)
chr6 (1-618)||(28260630-28261260)
chr6 (1-618)||(28284656-28285286)
chr6 (1-618)||(28339379-28340009)
chr6 (3-618)||(18182800-18183428)
chr6 (1-618)||(27189654-27190284)
chr6 (1-618)||(27258956-27259586)
chr6 (1-618)||(16925073-16925702)
chr6 (3-542)||(22827864-22828416)
chr6 (1-350)||(22760156-22760518)
chr6 (65-542)||(20135256-20135746)
chr6 (65-542)||(22197123-22197613)
chr6 (126-618)||(29589872-29590377)
chr6 (1-618)||(5836661-5837282)
chr6 (1-301)||(25607624-25607924)
chr6 (316-618)||(27559402-27559704)
chr6 (1-301)||(21755150-21755450)
chr6 (3-389)||(23085433-23085832)
chr6 (1-436)||(16961097-16961545)
chr6 (3-263)||(18962889-18963149)
chr6 (1-606)||(10466293-10466912)
chr6 (36-618)||(18796943-18797538)
chr6 (3-274)||(14377706-14377977)
chr6 (1-264)||(27563633-27563896)
chr6 (3-264)||(21473820-21474081)
chr6 (1-264)||(15461554-15461817)
chr6 (1-264)||(19455241-19455504)
chr6 (3-264)||(19437222-19437483)
chr6 (3-264)||(25770064-25770325)
chr6 (468-618)||(23085258-23085408)
chr6 (1-271)||(30678801-30679070)
chr6 (1-246)||(24366630-24366875)
chr6 (36-264)||(24516214-24516442)
chr6 (24-259)||(21567796-21568031)
chr6 (1-259)||(8761557-8761815)
chr6 (395-606)||(30678469-30678679)
chr6 (3-264)||(34643386-34643647)
chr6 (402-618)||(19437634-19437850)
chr6 (314-606)||(19455567-19455859)
chr6 (314-606)||(21474144-21474436)
chr6 (96-271)||(19487085-19487260)
chr6 (314-618)||(21567424-21567728)
chr6 (320-611)||(19486734-19487023)
chr6 (398-618)||(25770472-25770692)
chr6 (97-264)||(18450761-18450928)
chr6 (3-136)||(14379394-14379527)
chr6 (395-606)||(24515859-24516070)
chr6 (447-618)||(34643019-34643190)
chr6 (1-118)||(23496138-23496255)
chr6 (1-136)||(1646742-1646877)
chr6 (1-166)||(16380271-16380436)
chr6 (1-166)||(16647867-16648032)
chr6 (1-166)||(23998466-23998631)
chr6 (395-618)||(14377349-14377572)
chr6 (531-606)||(20010899-20010974)
chr6 (65-151)||(13751853-13751939)
chr6 (314-618)||(15461880-15462184)
chr6 (453-606)||(24367083-24367236)
chr6 (308-450)||(18962709-18962849)
chr6 (410-466)||(5295509-5295565)
chr6 (314-474)||(8761331-8761491)
chr6 (578-618)||(19465976-19466016)
chr6 (302-330)||(21755464-21755492)
[»] chr2 (56 HSPs)
chr2 (1-618)||(23073848-23074478)
chr2 (1-618)||(22733602-22734232)
chr2 (1-618)||(23105556-23106186)
chr2 (1-618)||(24677474-24678102)
chr2 (1-618)||(24705310-24705940)
chr2 (1-618)||(17000985-17001615)
chr2 (1-618)||(10870835-10871465)
chr2 (1-618)||(21142869-21143499)
chr2 (20-618)||(21323094-21323705)
chr2 (1-618)||(9337567-9338197)
chr2 (1-618)||(9486201-9486831)
chr2 (1-618)||(24874578-24875208)
chr2 (1-618)||(27220001-27220631)
chr2 (1-618)||(24712019-24712649)
chr2 (1-618)||(27373254-27373884)
chr2 (1-618)||(44383398-44384028)
chr2 (1-618)||(24264355-24264985)
chr2 (105-618)||(24657486-24658011)
chr2 (1-618)||(23204299-23204929)
chr2 (1-618)||(41606215-41606843)
chr2 (63-618)||(24817668-24818236)
chr2 (105-618)||(16983329-16983855)
chr2 (352-618)||(11351539-11351805)
chr2 (302-618)||(22323170-22323486)
chr2 (1-253)||(16927345-16927597)
chr2 (410-618)||(23029289-23029497)
chr2 (12-271)||(23112735-23112994)
chr2 (1-264)||(23278761-23279024)
chr2 (446-618)||(45673840-45674012)
chr2 (1-271)||(25255904-25256173)
chr2 (1-271)||(31832643-31832913)
chr2 (21-301)||(30010342-30010622)
chr2 (1-271)||(19717205-19717475)
chr2 (21-301)||(30209075-30209355)
chr2 (1-264)||(1065736-1065999)
chr2 (1-208)||(19650301-19650508)
chr2 (314-618)||(23097846-23098150)
chr2 (1-256)||(12576338-12576593)
chr2 (1-256)||(27789725-27789980)
chr2 (105-253)||(16924066-16924214)
chr2 (24-259)||(23098218-23098453)
chr2 (395-617)||(19716846-19717068)
chr2 (425-618)||(23113145-23113338)
chr2 (421-606)||(23274011-23274196)
chr2 (322-618)||(12576672-12576968)
chr2 (563-618)||(22742794-22742849)
chr2 (563-618)||(23064973-23065028)
chr2 (377-570)||(23279150-23279343)
chr2 (1-136)||(22280090-22280225)
chr2 (395-606)||(30208760-30208971)
chr2 (481-606)||(20848067-20848192)
chr2 (322-475)||(27790059-27790212)
chr2 (225-264)||(22323537-22323576)
chr2 (1-115)||(24829532-24829646)
chr2 (425-606)||(19817269-19817450)
chr2 (2-166)||(25130595-25130759)
[»] chr3 (100 HSPs)
chr3 (1-618)||(17491823-17492454)
chr3 (3-618)||(14578935-14579563)
chr3 (1-618)||(12843630-12844260)
chr3 (1-618)||(15261603-15262233)
chr3 (1-474)||(18437113-18437599)
chr3 (3-618)||(16694139-16694767)
chr3 (1-618)||(24185163-24185793)
chr3 (1-618)||(16804474-16805104)
chr3 (1-618)||(48427420-48428050)
chr3 (1-618)||(3687916-3688546)
chr3 (1-618)||(20059581-20060211)
chr3 (1-618)||(12888682-12889312)
chr3 (1-618)||(15586919-15587549)
chr3 (1-618)||(10007573-10008203)
chr3 (1-618)||(15345772-15346402)
chr3 (1-618)||(15713583-15714213)
chr3 (1-618)||(16637746-16638376)
chr3 (1-618)||(16754228-16754858)
chr3 (1-618)||(26790940-26791570)
chr3 (1-618)||(43164648-43165278)
chr3 (1-618)||(10908183-10908813)
chr3 (1-618)||(13254663-13255293)
chr3 (1-618)||(15400044-15400674)
chr3 (1-618)||(15358056-15358686)
chr3 (4-618)||(6602712-6603338)
chr3 (1-618)||(53382545-53383175)
chr3 (1-618)||(5422457-5423087)
chr3 (129-618)||(14874095-14874597)
chr3 (4-474)||(11888024-11888508)
chr3 (353-618)||(15065409-15065674)
chr3 (21-618)||(14291048-14291658)
chr3 (21-618)||(15229606-15230216)
chr3 (21-618)||(15235474-15236084)
chr3 (37-262)||(17493665-17493890)
chr3 (21-264)||(16826164-16826407)
chr3 (1-246)||(11959070-11959315)
chr3 (1-271)||(47125927-47126197)
chr3 (1-220)||(5108549-5108768)
chr3 (5-264)||(12358410-12358669)
chr3 (1-264)||(31940886-31941149)
chr3 (36-271)||(28756336-28756572)
chr3 (1-264)||(31693068-31693331)
chr3 (21-618)||(15013285-15013893)
chr3 (3-264)||(11949791-11950052)
chr3 (1-259)||(13944007-13944265)
chr3 (14-271)||(12272334-12272591)
chr3 (27-264)||(18132229-18132466)
chr3 (353-524)||(26190937-26191108)
chr3 (1-256)||(44779230-44779485)
chr3 (1-271)||(10407951-10408221)
chr3 (1-618)||(10417561-10418191)
chr3 (36-612)||(17188392-17188981)
chr3 (314-618)||(12858011-12858315)
chr3 (1-264)||(12180327-12180590)
chr3 (1-259)||(16378817-16379074)
chr3 (314-618)||(12272647-12272951)
chr3 (36-271)||(12510359-12510594)
chr3 (1-253)||(8745284-8745536)
chr3 (36-264)||(13318385-13318613)
chr3 (3-618)||(24189289-24189917)
chr3 (20-264)||(13970003-13970247)
chr3 (27-264)||(14088682-14088919)
chr3 (65-262)||(14575033-14575230)
chr3 (314-618)||(17493955-17494260)
chr3 (59-214)||(12071005-12071160)
chr3 (314-618)||(14575295-14575599)
chr3 (314-606)||(16825809-16826101)
chr3 (395-618)||(31692701-31692924)
chr3 (395-612)||(13944414-13944631)
chr3 (123-264)||(16327592-16327733)
chr3 (1-214)||(41179505-41179718)
chr3 (314-606)||(12358055-12358347)
chr3 (395-618)||(31941293-31941516)
chr3 (387-606)||(47126326-47126545)
chr3 (322-618)||(8744906-8745202)
chr3 (314-606)||(16832056-16832348)
chr3 (387-606)||(10408350-10408569)
chr3 (387-606)||(28756701-28756920)
chr3 (322-612)||(16378456-16378746)
chr3 (314-618)||(11958697-11959001)
chr3 (314-618)||(12180653-12180957)
chr3 (127-261)||(16832414-16832548)
chr3 (377-604)||(18131876-18132103)
chr3 (314-542)||(13318094-13318322)
chr3 (1-136)||(15612086-15612221)
chr3 (1-166)||(30139789-30139954)
chr3 (1-166)||(30149340-30149505)
chr3 (322-474)||(44779564-44779716)
chr3 (21-100)||(14874600-14874679)
chr3 (387-618)||(16327225-16327456)
chr3 (1-103)||(16834559-16834661)
chr3 (1-166)||(15948462-15948627)
chr3 (387-606)||(12510011-12510230)
chr3 (1-136)||(13965374-13965509)
chr3 (395-474)||(14089063-14089142)
chr3 (1-166)||(6150845-6151010)
chr3 (377-542)||(11949500-11949665)
chr3 (395-475)||(13969779-13969859)
chr3 (36-88)||(13304315-13304367)
chr3 (560-606)||(11949453-11949499)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-618)||(7606-8236)
[»] chr8 (63 HSPs)
chr8 (1-618)||(21253364-21253995)
chr8 (1-618)||(21786086-21786716)
chr8 (1-618)||(21391592-21392222)
chr8 (1-618)||(21780918-21781548)
chr8 (3-618)||(22421623-22422251)
chr8 (1-618)||(22522966-22523596)
chr8 (1-618)||(21164269-21164899)
chr8 (3-618)||(22989467-22990095)
chr8 (1-618)||(30310875-30311505)
chr8 (1-618)||(19980387-19981017)
chr8 (1-618)||(32602565-32603195)
chr8 (3-618)||(22246164-22246792)
chr8 (1-618)||(15535803-15536433)
chr8 (1-618)||(22042247-22042877)
chr8 (3-618)||(22375185-22375812)
chr8 (1-618)||(17671753-17672384)
chr8 (1-618)||(18858997-18859627)
chr8 (1-618)||(20015994-20016624)
chr8 (1-618)||(22030523-22031153)
chr8 (10-618)||(19114829-19115450)
chr8 (1-618)||(22117906-22118536)
chr8 (1-618)||(22126690-22127320)
chr8 (1-618)||(19481803-19482433)
chr8 (1-300)||(19864155-19864454)
chr8 (302-618)||(22129348-22129664)
chr8 (21-613)||(20390526-20391131)
chr8 (21-618)||(19984620-19985230)
chr8 (21-618)||(21927868-21928478)
chr8 (3-474)||(23887450-23887934)
chr8 (26-298)||(20394197-20394469)
chr8 (3-271)||(21323370-21323638)
chr8 (1-271)||(22053283-22053552)
chr8 (302-466)||(21919987-21920151)
chr8 (36-271)||(28983366-28983601)
chr8 (36-271)||(28988585-28988820)
chr8 (3-271)||(22373290-22373559)
chr8 (1-238)||(22131165-22131402)
chr8 (36-271)||(16269315-16269550)
chr8 (1-256)||(31568949-31569204)
chr8 (1-264)||(27356956-27357219)
chr8 (314-618)||(22373615-22373919)
chr8 (496-618)||(22245746-22245868)
chr8 (1-168)||(31414663-31414830)
chr8 (1-252)||(29301536-29301787)
chr8 (319-618)||(29301157-29301456)
chr8 (1-163)||(23657347-23657509)
chr8 (395-618)||(22028011-22028234)
chr8 (387-618)||(22053682-22053913)
chr8 (387-618)||(28983730-28983961)
chr8 (108-264)||(22028378-22028534)
chr8 (1-112)||(22060929-22061040)
chr8 (387-618)||(28988949-28989180)
chr8 (387-618)||(31414263-31414494)
chr8 (1-139)||(4984462-4984600)
chr8 (387-606)||(16268967-16269186)
chr8 (1-168)||(16875289-16875456)
chr8 (395-474)||(21323154-21323233)
chr8 (455-606)||(27357423-27357574)
chr8 (322-475)||(31568718-31568870)
chr8 (1-61)||(23902584-23902644)
chr8 (233-300)||(22129679-22129746)
chr8 (1-166)||(16414511-16414676)
chr8 (1-166)||(21848533-21848698)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (1-618)||(40798-41426)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (1-618)||(3817-4447)
scaffold0621 (589-618)||(1-30)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-618)||(2984-3614)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (1-618)||(54020-54650)
scaffold0080 (1-618)||(31267-31896)
scaffold0080 (1-618)||(36733-37362)
scaffold0080 (1-618)||(10529-11160)
scaffold0080 (1-618)||(13184-13815)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (36-618)||(4001-4596)
[»] scaffold0243 (3 HSPs)
scaffold0243 (1-618)||(24236-24866)
scaffold0243 (377-606)||(10075-10304)
scaffold0243 (126-264)||(10430-10568)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-618)||(103610-104240)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (1-618)||(17640-18262)
scaffold0114 (1-618)||(39441-40071)
scaffold0114 (1-202)||(22259-22460)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (57-618)||(111198-111772)
scaffold0040 (3-618)||(17263-17891)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (1-618)||(669-1303)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (3-579)||(837-1426)
scaffold0278 (575-618)||(3521-3564)
[»] chr1 (60 HSPs)
chr1 (1-558)||(21751309-21751876)
chr1 (3-618)||(16378466-16379093)
chr1 (1-618)||(17042375-17043005)
chr1 (1-618)||(19108737-19109367)
chr1 (1-474)||(22359748-22360234)
chr1 (1-618)||(16347955-16348585)
chr1 (1-618)||(33388389-33389019)
chr1 (1-618)||(51330852-51331483)
chr1 (1-618)||(21832671-21833301)
chr1 (1-474)||(21861877-21862363)
chr1 (1-443)||(20140452-20140907)
chr1 (1-618)||(41351028-41351658)
chr1 (3-513)||(22502754-22503277)
chr1 (1-357)||(429737-430106)
chr1 (1-528)||(21233181-21233721)
chr1 (1-478)||(21839319-21839809)
chr1 (230-618)||(24785217-24785618)
chr1 (21-618)||(21739396-21740006)
chr1 (20-301)||(50618088-50618369)
chr1 (3-271)||(22016465-22016733)
chr1 (21-618)||(21742912-21743522)
chr1 (1-271)||(38910546-38910816)
chr1 (1-271)||(31537717-31537987)
chr1 (1-271)||(37679449-37679719)
chr1 (1-271)||(48425273-48425543)
chr1 (1-271)||(52988141-52988411)
chr1 (458-618)||(20081736-20081896)
chr1 (6-264)||(20833627-20833885)
chr1 (21-271)||(41310946-41311196)
chr1 (78-271)||(24097335-24097528)
chr1 (1-264)||(20854487-20854750)
chr1 (36-271)||(20296816-20297051)
chr1 (396-558)||(429577-429739)
chr1 (37-262)||(19856710-19856935)
chr1 (471-618)||(21842064-21842211)
chr1 (1-264)||(21953278-21953541)
chr1 (377-618)||(19857063-19857304)
chr1 (395-618)||(22016105-22016328)
chr1 (3-213)||(20937841-20938051)
chr1 (314-618)||(24096975-24097279)
chr1 (403-606)||(20833272-20833475)
chr1 (531-618)||(22496616-22496703)
chr1 (314-606)||(20854132-20854424)
chr1 (387-606)||(12200317-12200536)
chr1 (387-606)||(31537369-31537588)
chr1 (387-606)||(38910198-38910417)
chr1 (387-606)||(48425672-48425891)
chr1 (387-606)||(52988540-52988759)
chr1 (559-618)||(21751987-21752046)
chr1 (387-606)||(37679848-37680067)
chr1 (3-136)||(19660991-19661124)
chr1 (387-606)||(20297180-20297399)
chr1 (1-166)||(20829217-20829382)
chr1 (531-606)||(18710328-18710403)
chr1 (1-136)||(20927423-20927558)
chr1 (561-606)||(20075081-20075126)
chr1 (410-466)||(23196479-23196535)
chr1 (587-618)||(21228916-21228947)
chr1 (314-357)||(41311252-41311295)
chr1 (3-61)||(21200884-21200942)
[»] chr7 (72 HSPs)
chr7 (1-615)||(14042038-14042665)
chr7 (1-615)||(14352068-14352695)
chr7 (1-618)||(11550399-11551029)
chr7 (1-618)||(14956897-14957527)
chr7 (1-618)||(44788648-44789278)
chr7 (1-617)||(10873033-10873662)
chr7 (1-618)||(11234510-11235140)
chr7 (1-618)||(9590711-9591337)
chr7 (1-618)||(17703752-17704382)
chr7 (1-611)||(12689845-12690468)
chr7 (1-618)||(18587468-18588098)
chr7 (1-618)||(8709948-8710578)
chr7 (1-618)||(14334739-14335369)
chr7 (1-618)||(18180088-18180716)
chr7 (1-618)||(13688384-13689014)
chr7 (1-618)||(15158354-15158984)
chr7 (3-606)||(15626870-15627485)
chr7 (3-383)||(15146416-15146809)
chr7 (66-489)||(14149862-14150297)
chr7 (302-618)||(8200705-8201021)
chr7 (1-301)||(11770029-11770329)
chr7 (1-453)||(16726845-16727310)
chr7 (21-618)||(14261521-14262130)
chr7 (1-618)||(15099878-15100508)
chr7 (3-271)||(48812909-48813177)
chr7 (428-618)||(15146220-15146410)
chr7 (1-618)||(18051228-18051858)
chr7 (1-243)||(13023701-13023943)
chr7 (1-271)||(49154645-49154915)
chr7 (3-271)||(16948107-16948375)
chr7 (1-271)||(11300848-11301118)
chr7 (21-271)||(16069932-16070182)
chr7 (1-271)||(26092433-26092703)
chr7 (21-264)||(26116232-26116475)
chr7 (24-271)||(12204435-12204682)
chr7 (185-618)||(19149539-19149985)
chr7 (185-618)||(20748938-20749384)
chr7 (3-271)||(21754758-21755026)
chr7 (36-271)||(13966303-13966538)
chr7 (1-259)||(14140023-14140281)
chr7 (1-246)||(12458984-12459229)
chr7 (23-259)||(14284021-14284257)
chr7 (1-264)||(13675796-13676058)
chr7 (1-264)||(15342775-15343038)
chr7 (24-259)||(11386076-11386311)
chr7 (314-618)||(13676121-13676425)
chr7 (3-208)||(12799241-12799446)
chr7 (27-264)||(19615045-19615282)
chr7 (387-606)||(12459371-12459590)
chr7 (314-618)||(11385704-11386008)
chr7 (387-606)||(49155044-49155263)
chr7 (322-618)||(14140357-14140653)
chr7 (395-606)||(12798788-12798999)
chr7 (387-618)||(16947747-16947978)
chr7 (387-606)||(26092085-26092304)
chr7 (308-618)||(14283649-14283959)
chr7 (425-618)||(12204075-12204268)
chr7 (387-618)||(13024088-13024319)
chr7 (1-109)||(15169-15277)
chr7 (453-606)||(26115877-26116030)
chr7 (398-606)||(40925104-40925312)
chr7 (189-264)||(12799143-12799218)
chr7 (1-166)||(7826243-7826408)
chr7 (437-606)||(21755205-21755374)
chr7 (1-166)||(27105536-27105701)
chr7 (1-166)||(27172624-27172789)
chr7 (314-618)||(15343101-15343405)
chr7 (395-474)||(19615426-19615505)
chr7 (225-264)||(8200615-8200654)
chr7 (395-488)||(16069702-16069795)
chr7 (455-606)||(13965955-13966106)
chr7 (308-366)||(48812801-48812859)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (3-618)||(23824-24452)
scaffold0011 (1-264)||(150954-151213)
scaffold0011 (314-618)||(151276-151580)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (120-618)||(25003-25514)
scaffold0218 (1-136)||(1738-1873)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (1-618)||(41017-41645)
scaffold0022 (1-618)||(74737-75365)
scaffold0022 (200-618)||(35006-35436)
scaffold0022 (20-301)||(56159-56440)
scaffold0022 (1-166)||(8582-8747)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (1-617)||(36411-37040)
scaffold0081 (1-617)||(20987-21616)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (1-618)||(6256-6886)
scaffold0270 (1-618)||(13386-14016)
[»] scaffold0079 (4 HSPs)
scaffold0079 (1-618)||(35881-36511)
scaffold0079 (3-471)||(28463-28944)
scaffold0079 (1-271)||(3101-3371)
scaffold0079 (314-507)||(3427-3620)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (3-446)||(8407-8863)
scaffold0120 (382-618)||(13861-14097)
[»] scaffold0001 (7 HSPs)
scaffold0001 (1-618)||(495403-496033)
scaffold0001 (6-264)||(441078-441336)
scaffold0001 (21-264)||(452871-453114)
scaffold0001 (459-618)||(441507-441666)
scaffold0001 (36-264)||(515011-515239)
scaffold0001 (387-606)||(514656-514875)
scaffold0001 (314-474)||(452648-452808)
[»] chr4 (59 HSPs)
chr4 (1-618)||(16250878-16251508)
chr4 (1-618)||(14682921-14683551)
chr4 (1-618)||(14696467-14697085)
chr4 (1-618)||(17092177-17092807)
chr4 (1-618)||(18224474-18225104)
chr4 (1-618)||(15144920-15145551)
chr4 (1-588)||(16218584-16219184)
chr4 (1-588)||(16221904-16222504)
chr4 (1-618)||(8388766-8389396)
chr4 (1-618)||(12478954-12479584)
chr4 (1-618)||(23958101-23958731)
chr4 (1-618)||(27713690-27714320)
chr4 (1-618)||(14161824-14162454)
chr4 (1-618)||(14301007-14301637)
chr4 (1-618)||(16234020-16234650)
chr4 (1-618)||(19775821-19776451)
chr4 (1-462)||(22632058-22632528)
chr4 (1-618)||(8050651-8051281)
chr4 (1-618)||(40475394-40476024)
chr4 (316-618)||(16063-16365)
chr4 (3-477)||(16352699-16353186)
chr4 (126-618)||(19634615-19635120)
chr4 (3-468)||(14848543-14849022)
chr4 (314-615)||(14188186-14188487)
chr4 (1-264)||(15356775-15357038)
chr4 (1-271)||(3262442-3262712)
chr4 (3-264)||(1646932-1647193)
chr4 (3-271)||(8708263-8708531)
chr4 (36-264)||(29451192-29451420)
chr4 (3-264)||(15258283-15258544)
chr4 (1-264)||(20892385-20892648)
chr4 (21-271)||(15072733-15072983)
chr4 (1-264)||(44659521-44659784)
chr4 (3-264)||(16150067-16150328)
chr4 (3-264)||(16154213-16154474)
chr4 (36-271)||(11204880-11205115)
chr4 (314-618)||(15073039-15073343)
chr4 (479-618)||(16350582-16350721)
chr4 (1-264)||(27902740-27903002)
chr4 (3-232)||(15001052-15001281)
chr4 (1-256)||(51604455-51604710)
chr4 (1-163)||(23443459-23443621)
chr4 (322-618)||(51604080-51604376)
chr4 (395-618)||(14993655-14993878)
chr4 (387-606)||(3262094-3262313)
chr4 (387-618)||(20892784-20893015)
chr4 (387-606)||(29450837-29451056)
chr4 (395-597)||(15258688-15258890)
chr4 (447-606)||(15354340-15354499)
chr4 (569-618)||(13513285-13513334)
chr4 (453-606)||(44659166-44659319)
chr4 (314-618)||(27903065-27903369)
chr4 (531-606)||(16150533-16150608)
chr4 (531-606)||(16154679-16154754)
chr4 (387-606)||(11204532-11204751)
chr4 (561-618)||(53750758-53750815)
chr4 (314-489)||(8708587-8708762)
chr4 (1-166)||(15290911-15291076)
chr4 (234-271)||(14994016-14994053)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (3-618)||(13770-14398)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (3-618)||(15270-15897)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (1-618)||(37111-37741)
scaffold0042 (108-618)||(25842-26365)
scaffold0042 (3-103)||(23092-23192)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (154-618)||(8486-8963)
scaffold0358 (154-524)||(17682-18065)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (3-618)||(23589-24217)
scaffold0018 (63-618)||(9642-10210)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (1-618)||(17357-17987)
scaffold0017 (302-618)||(195129-195445)
scaffold0017 (1-168)||(58400-58567)
scaffold0017 (199-618)||(23887-24319)
[»] scaffold0023 (6 HSPs)
scaffold0023 (170-618)||(151633-152094)
scaffold0023 (1-509)||(1905-2426)
scaffold0023 (230-618)||(47274-47656)
scaffold0023 (1-133)||(151495-151627)
scaffold0023 (545-618)||(30865-30938)
scaffold0023 (421-606)||(164704-164889)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (3-455)||(231-698)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (1-618)||(13415-14045)
scaffold0109 (1-618)||(40538-41168)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (1-462)||(7106-7580)
scaffold0647 (3-154)||(3286-3437)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (21-618)||(10449-11059)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (1-552)||(12571-13132)
scaffold0324 (481-618)||(1865-2002)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-618)||(216711-217341)
[»] scaffold0102 (3 HSPs)
scaffold0102 (1-618)||(50636-51266)
scaffold0102 (3-271)||(42083-42351)
scaffold0102 (314-618)||(42407-42711)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (1-618)||(21630-22260)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (1-618)||(17321-17950)
scaffold0028 (1-618)||(10859-11482)
scaffold0028 (151-601)||(53260-53723)
scaffold0028 (27-264)||(48172-48409)
scaffold0028 (1-139)||(45536-45674)
scaffold0028 (377-474)||(47949-48046)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (1-618)||(16543-17173)
scaffold0044 (1-618)||(2807-3437)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (126-618)||(12171-12676)
[»] scaffold0074 (3 HSPs)
scaffold0074 (1-618)||(5496-6126)
scaffold0074 (66-264)||(14571-14769)
scaffold0074 (395-618)||(14913-15136)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (1-466)||(20623-21102)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (1-618)||(9751-10381)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (1-618)||(11647-12277)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (1-510)||(6486-7008)
scaffold0138 (314-474)||(64-224)
[»] scaffold0010 (6 HSPs)
scaffold0010 (3-618)||(4301-4928)
scaffold0010 (386-618)||(14205-14437)
scaffold0010 (1-271)||(39984-40254)
scaffold0010 (1-264)||(45085-45348)
scaffold0010 (377-606)||(44730-44959)
scaffold0010 (387-606)||(39636-39855)
[»] scaffold0993 (2 HSPs)
scaffold0993 (3-501)||(267-778)
scaffold0993 (400-618)||(777-995)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (1-524)||(15379-15915)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (150-618)||(7790-8271)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (1-502)||(212-726)
scaffold0149 (1-261)||(5012-5272)
scaffold0149 (1-261)||(9443-9703)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (316-618)||(55761-56063)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (1-618)||(29219-29836)
[»] scaffold1615 (1 HSPs)
scaffold1615 (94-446)||(1196-1561)
[»] scaffold0312 (2 HSPs)
scaffold0312 (1-357)||(444-813)
scaffold0312 (396-558)||(811-973)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (308-618)||(14557-14867)
scaffold0342 (3-220)||(14923-15140)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (1-452)||(27952-28416)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (339-618)||(10520-10799)
scaffold0476 (39-618)||(836-1428)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-478)||(9323-9813)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (184-618)||(1323-1770)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (3-470)||(5328-5808)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (21-618)||(11363-11973)
[»] scaffold1985 (1 HSPs)
scaffold1985 (80-477)||(4-411)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (21-618)||(60142-60752)
scaffold0046 (1-264)||(79489-79752)
scaffold0046 (314-476)||(79264-79426)
scaffold0046 (578-618)||(70081-70121)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (3-474)||(114473-114957)
[»] scaffold2004 (1 HSPs)
scaffold2004 (3-219)||(516-732)
[»] scaffold0031 (5 HSPs)
scaffold0031 (70-399)||(52435-52777)
scaffold0031 (314-618)||(110319-110623)
scaffold0031 (187-271)||(110179-110263)
scaffold0031 (1-148)||(110015-110162)
scaffold0031 (1-71)||(54842-54912)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (429-618)||(11171-11360)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (69-504)||(8146-8594)
[»] scaffold1288 (2 HSPs)
scaffold1288 (1-262)||(515-776)
scaffold1288 (314-618)||(146-450)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (429-618)||(2554-2743)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (1-233)||(84919-85151)
scaffold0008 (1-109)||(85609-85717)
scaffold0008 (1-166)||(132245-132410)
[»] scaffold0529 (3 HSPs)
scaffold0529 (301-618)||(4784-5101)
scaffold0529 (33-178)||(4536-4681)
scaffold0529 (210-264)||(4680-4734)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (3-618)||(200759-201387)
scaffold0004 (3-264)||(325091-325353)
scaffold0004 (395-606)||(325497-325708)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (3-618)||(2256-2884)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (440-618)||(15257-15435)
scaffold0293 (27-381)||(14879-15246)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (1-271)||(251005-251275)
scaffold0009 (387-618)||(251404-251635)
[»] scaffold0708 (2 HSPs)
scaffold0708 (1-271)||(5796-6066)
scaffold0708 (387-611)||(5443-5667)
[»] scaffold0058 (3 HSPs)
scaffold0058 (1-271)||(21505-21775)
scaffold0058 (395-618)||(21912-22135)
scaffold0058 (3-124)||(27046-27167)
[»] scaffold0067 (7 HSPs)
scaffold0067 (1-618)||(29007-29637)
scaffold0067 (24-253)||(49849-50078)
scaffold0067 (24-253)||(58883-59112)
scaffold0067 (24-253)||(65271-65500)
scaffold0067 (314-618)||(49471-49775)
scaffold0067 (314-618)||(58505-58809)
scaffold0067 (314-618)||(64893-65197)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (21-618)||(175396-176001)
scaffold0020 (3-229)||(99255-99481)
scaffold0020 (395-618)||(98874-99097)
[»] scaffold0156 (2 HSPs)
scaffold0156 (14-264)||(36335-36585)
scaffold0156 (314-618)||(36648-36952)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (15-606)||(30629-31226)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (21-606)||(21488-22087)
[»] scaffold0304 (2 HSPs)
scaffold0304 (6-271)||(1136-1401)
scaffold0304 (314-474)||(920-1080)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (27-618)||(53456-54060)
[»] scaffold0404 (2 HSPs)
scaffold0404 (21-264)||(7147-7390)
scaffold0404 (314-612)||(7453-7751)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (1-172)||(31299-31470)
scaffold0026 (21-271)||(51215-51465)
scaffold0026 (314-489)||(51521-51696)
[»] scaffold1477 (2 HSPs)
scaffold1477 (1-271)||(611-881)
scaffold1477 (377-606)||(991-1212)
[»] scaffold0751 (2 HSPs)
scaffold0751 (21-271)||(4584-4834)
scaffold0751 (395-618)||(4971-5194)
[»] scaffold0509 (2 HSPs)
scaffold0509 (21-271)||(11233-11483)
scaffold0509 (316-618)||(11541-11843)
[»] scaffold0083 (4 HSPs)
scaffold0083 (4-246)||(6724-6966)
scaffold0083 (4-246)||(8710-8952)
scaffold0083 (314-496)||(7035-7217)
scaffold0083 (314-496)||(8459-8641)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (21-271)||(64170-64420)
scaffold0054 (314-618)||(63810-64114)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (21-618)||(49168-49776)
[»] scaffold0420 (3 HSPs)
scaffold0420 (3-264)||(1030-1291)
scaffold0420 (3-264)||(7999-8260)
scaffold0420 (395-612)||(8404-8621)
[»] scaffold0077 (3 HSPs)
scaffold0077 (461-618)||(57905-58062)
scaffold0077 (27-262)||(19294-19529)
scaffold0077 (317-470)||(19073-19226)
[»] scaffold0108 (2 HSPs)
scaffold0108 (15-271)||(49503-49758)
scaffold0108 (314-618)||(49814-50118)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (1-264)||(69755-70018)
scaffold0034 (1-264)||(2611-2874)
scaffold0034 (314-606)||(2255-2548)
scaffold0034 (377-618)||(70144-70385)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (1-271)||(33720-33990)
scaffold0106 (314-606)||(34046-34338)
[»] scaffold0865 (2 HSPs)
scaffold0865 (3-264)||(1930-2191)
scaffold0865 (316-618)||(1563-1865)
[»] scaffold0222 (4 HSPs)
scaffold0222 (3-264)||(9448-9709)
scaffold0222 (33-271)||(1138-1378)
scaffold0222 (377-606)||(20586-20815)
scaffold0222 (425-618)||(778-971)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (3-264)||(28943-29204)
scaffold0133 (316-618)||(28576-28878)
[»] scaffold1881 (2 HSPs)
scaffold1881 (414-618)||(771-975)
scaffold1881 (49-300)||(1019-1270)
[»] scaffold1530 (2 HSPs)
scaffold1530 (36-264)||(1-229)
scaffold1530 (314-606)||(292-584)
[»] scaffold0585 (2 HSPs)
scaffold0585 (21-271)||(4740-4990)
scaffold0585 (314-618)||(4380-4684)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (21-263)||(28930-29172)
scaffold0192 (425-618)||(29347-29540)
[»] scaffold0104 (4 HSPs)
scaffold0104 (33-271)||(24631-24869)
scaffold0104 (21-270)||(44070-44318)
scaffold0104 (315-618)||(43710-44013)
scaffold0104 (387-605)||(24998-25216)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (1-618)||(10077-10707)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (1-196)||(2653-2848)
[»] scaffold0348 (4 HSPs)
scaffold0348 (1-264)||(18141-18404)
scaffold0348 (1-264)||(5507-5770)
scaffold0348 (395-618)||(5140-5363)
scaffold0348 (387-618)||(17775-18006)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (24-271)||(4540-4787)
scaffold0130 (473-618)||(8070-8217)
scaffold0130 (425-618)||(4180-4373)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (21-271)||(12199-12449)
scaffold0309 (475-618)||(12597-12740)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (21-466)||(175788-176245)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-262)||(14591-14852)
scaffold0124 (1-166)||(5563-5727)
[»] scaffold0029 (4 HSPs)
scaffold0029 (1-618)||(94185-94815)
scaffold0029 (20-264)||(114963-115208)
scaffold0029 (447-618)||(115404-115575)
scaffold0029 (1-52)||(107681-107732)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (36-271)||(29352-29587)
scaffold0088 (452-606)||(29781-29935)
[»] scaffold0076 (4 HSPs)
scaffold0076 (27-259)||(31340-31572)
scaffold0076 (1-246)||(54087-54332)
scaffold0076 (395-618)||(53714-53937)
scaffold0076 (395-474)||(31112-31191)
[»] scaffold1373 (2 HSPs)
scaffold1373 (36-271)||(485-720)
scaffold1373 (387-618)||(125-356)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (21-264)||(16517-16760)
scaffold0266 (1-166)||(7617-7782)
[»] scaffold0035 (5 HSPs)
scaffold0035 (3-262)||(5136-5395)
scaffold0035 (1-286)||(41743-42028)
scaffold0035 (314-541)||(5460-5687)
scaffold0035 (531-606)||(5731-5806)
scaffold0035 (565-618)||(41399-41452)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (1-264)||(262609-262872)
scaffold0005 (314-618)||(262935-263239)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (96-202)||(126489-126595)
[»] scaffold0235 (4 HSPs)
scaffold0235 (3-264)||(9119-9380)
scaffold0235 (3-264)||(19333-19594)
scaffold0235 (395-618)||(8753-8975)
scaffold0235 (395-618)||(18967-19189)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (71-271)||(13016-13216)
scaffold0261 (71-271)||(21196-21395)
scaffold0261 (421-618)||(12639-12834)
scaffold0261 (421-606)||(20831-21014)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (465-618)||(1-154)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (69-264)||(11260-11455)
scaffold0443 (387-606)||(11591-11810)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (21-256)||(19757-19992)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (3-286)||(84157-84439)
scaffold0007 (1-133)||(268993-269125)
[»] scaffold2111 (1 HSPs)
scaffold2111 (24-264)||(245-485)
[»] scaffold0148 (2 HSPs)
scaffold0148 (1-301)||(1382-1682)
scaffold0148 (565-618)||(1959-2012)
[»] scaffold0206 (2 HSPs)
scaffold0206 (1-264)||(25498-25758)
scaffold0206 (314-618)||(25821-26125)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (3-232)||(43303-43532)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (3-264)||(3828-4089)
scaffold0117 (395-618)||(3461-3684)
[»] scaffold0405 (3 HSPs)
scaffold0405 (21-202)||(905-1086)
scaffold0405 (314-618)||(5310-5615)
scaffold0405 (198-271)||(5181-5254)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (3-264)||(21236-21497)
scaffold0090 (386-618)||(21632-21864)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (524-618)||(8329-8423)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (400-612)||(1608-1820)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (447-618)||(1174-1345)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (531-615)||(8033-8117)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (395-606)||(6828-7039)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (314-603)||(9533-9821)
scaffold0298 (1-103)||(9877-9979)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (510-618)||(7141-7249)
[»] scaffold0053 (3 HSPs)
scaffold0053 (395-618)||(65589-65812)
scaffold0053 (22-115)||(46841-46934)
scaffold0053 (1-88)||(55681-55768)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (184-271)||(23239-23326)
scaffold0234 (314-450)||(23047-23183)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (447-618)||(1145-1316)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (404-603)||(919-1118)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (308-474)||(16476-16643)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (563-618)||(424266-424321)
scaffold0003 (518-618)||(203294-203394)
[»] scaffold0118 (2 HSPs)
scaffold0118 (158-264)||(1-107)
scaffold0118 (387-606)||(243-462)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (554-618)||(1060-1124)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (566-618)||(1-53)
[»] scaffold0146 (4 HSPs)
scaffold0146 (117-268)||(5728-5879)
scaffold0146 (3-92)||(9784-9873)
scaffold0146 (3-92)||(17451-17540)
scaffold0146 (314-462)||(5521-5669)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (452-618)||(1568-1734)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (377-606)||(5512-5741)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (1-166)||(15293-15458)
scaffold0162 (1-166)||(10930-11095)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (398-606)||(41528-41736)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (531-618)||(1106-1193)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (567-618)||(14873-14924)
scaffold0403 (3-68)||(8758-8823)
[»] scaffold0335 (2 HSPs)
scaffold0335 (314-489)||(4670-4845)
scaffold0335 (554-618)||(4595-4659)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (1-92)||(38033-38124)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (387-618)||(67399-67630)
scaffold0068 (204-264)||(67766-67826)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (1-166)||(25779-25944)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (1-136)||(13411-13546)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (387-602)||(10759-10974)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (107-214)||(13-120)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (560-618)||(6548-6606)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (1-136)||(1407-1542)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (1-169)||(596-764)
scaffold0302 (1-136)||(7538-7673)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (1-61)||(477-537)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (72-166)||(23417-23511)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 454; Significance: 0; HSPs: 70)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 25428719 - 25429337
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  25428719 tgttcaactgtcgataatcaatacacaacctcatgctaccatccttcttcttcactaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaaccaa 25428818  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  25428819 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcagctcggccaactcagaagttgacatacgataaggtgtcatagacacatgcttcgttctaggaaca 25428918  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||            | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25428919 agatcaatcgaaaattcaacttctctctctggaggcacatcaggaa------------atacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatca 25429006  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  25429007 ctgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcacgttctaactgcttcagctgcttggtagacaaaaactctgcgcc 25429106  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25429107 actttcctcttcagcagaagagaaatacactgatttactaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 25429206  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25429207 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatctcaaaatcacgatcaaacatagacaagggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 25429306  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25429307 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 25429337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 21337391 - 21336764
Alignment:
Q  4 tcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactt 103  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  21337391 tcaactgtcgataatcaatgcacaatctcatgctaccatttttcttcttaaccagcaatataggcgctccccaaggtgaaacatttggtcttacaaactt 21337292  T
Q  104 tttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaaga 203  Q
     || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||     
T  21337291 cttatcaagcaaatcttctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaacaagg 21337192  T
Q  204 tcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-- 301  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||      
T  21337191 tcaattgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaagaaaaacttctggaaaatcacatacaacctgtagcttatcaatcactg 21337092  T
Q  302 -----------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccacc 390  Q
               | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||     
T  21337091 tttgattctcaacagacaaggacgccatcaaagaaaacatcaaaatttcatcacgttctaattgcttcagctgcttagtagacaagaactctgcgccact 21336992  T
Q  391 ttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacca 490  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  21336991 ttcttcttcagcagaagaaaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccattcca 21336892  T
Q  491 ctcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctg 590  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  21336891 ctcaaaggtaaacaatccaagtcaatttcaaaatcgcgaccaaacatagacaaaagacatcttaaacacacacgagaagtagtcaccaaacccttaactg 21336792  T
Q  591 gagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21336791 gagtttcgacaaccatctctccattcat 21336764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 26736827 - 26736197
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||| |||| |||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  26736827 tgttcaactgtcgataatcaatacacaatctcatactaccatctttctccttcactagcaataccggcgctccccaaggtgaaacacttagtcttacaaa 26736728  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  26736727 ctttttatcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaacttagaagctgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgttcccagaaca 26736628  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || || || ||||  ||||||||||    
T  26736627 agatcaatcgaaaattcaacttctctttctagaggcacatcgggaatttcatcaggaaaaacttctgggaaatcacacacaacctgtaacttatcaatca 26736528  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||| ||||| || |||||  |||||||||| | ||||||    
T  26736527 ctgcttgattctcaatagacaaggatgccatcaaagaaaacatcaaaattccaccacgttctaattgcttcagctgcttcatagacaaaaattttgcgcc 26736428  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  26736427 actttcctcttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcattccaaggatcacatccata 26736328  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  26736327 ccactcaaaggtaaacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacatacaagagaagtagtcaccaaacccttag 26736228  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26736227 ttggagtttcgacaaccatctctccattcat 26736197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 18781400 - 18782030
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18781400 tgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggtgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 18781499  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  18781500 tttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatggacaccggcttcgttccaggaaca 18781599  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||    
T  18781600 agatcaatagaaaactcgacttccctctctggaggaacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaagttgcataccacttgtagcttatcaatca 18781699  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  18781700 ctgcttgattctcaatagataaggaagccataaacgaaaacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcacc 18781799  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  18781800 actttcctcttcagcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccagaatcacatccata 18781899  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  18781900 ccgctcaaaggtagacaaacttaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcacggaacccttag 18781999  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18782000 ctggagtttcaacaaccatctctccattcat 18782030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 27520692 - 27521322
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27520692 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 27520791  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  27520792 cttcttctcaagcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaaca 27520891  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   | |||||||    
T  27520892 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatca 27520991  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | ||||||||| |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27520992 ctgcttgattctcaatagataaagtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcgcc 27521091  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  27521092 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 27521191  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27521192 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 27521291  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27521292 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 27521322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 22136954 - 22137584
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||  || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22136954 tgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 22137053  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||    
T  22137054 tttcttctcaagcaaatcttccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacatcggcttcgttccaggaaca 22137153  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || || |||||||| ||||||||||    
T  22137154 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacacaacttgtagcttatcaatca 22137253  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22137254 ctgcttgattctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttggtagataaaaactctgcacc 22137353  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  22137354 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 22137453  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22137454 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacataaacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 22137553  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137554 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 22137584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 16358788 - 16359418
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16358788 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 16358887  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  16358888 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 16358987  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   | |||||||    
T  16358988 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatca 16359087  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||  | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  16359088 ctgcttgattctcaatagatatagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 16359187  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  16359188 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 16359287  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16359288 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 16359387  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359388 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 16359418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 34568780 - 34569410
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34568780 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 34568879  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  34568880 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 34568979  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   | |||||||    
T  34568980 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatca 34569079  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||  | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  34569080 ctgcttgattctcaatagatatagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 34569179  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  34569180 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 34569279  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  34569280 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 34569379  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34569380 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 34569410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 22350205 - 22350835
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22350205 tgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 22350304  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |  || || ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  22350305 tttcttctcaagcaaatcttccaactgtttcttcaactcagataattcggaagcagacatacgatatggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaaca 22350404  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  ||||  |||||||||    
T  22350405 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatca 22350504  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||||| |||||| || |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  22350505 ctgcttgattctcaatagataaggtagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 22350604  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    ||  ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22350605 actctcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaaaaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 22350704  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  22350705 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcgcgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagataagtagtcaccgaacccttag 22350804  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350805 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 22350835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 29474173 - 29473543
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||  || |||||||| |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29474173 tgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 29474074  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  29474073 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 29473974  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  29473973 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 29473874  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | |||||| || |||||||| || ||||| || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  29473873 ctgcttgattctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagatatcgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 29473774  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29473773 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 29473674  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  29473673 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 29473574  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29473573 ctggagtttcgacaaccatttctccattcat 29473543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 40711066 - 40711696
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40711066 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 40711165  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  40711166 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 40711265  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  | |   | |||||||    
T  40711266 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccgggaacctgtcaatca 40711365  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | ||||||||| |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  40711366 ctgcttgattctcaatagataaagtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 40711465  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  40711466 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 40711565  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  40711566 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 40711665  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40711666 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 40711696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 41773128 - 41773758
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  41773128 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttttttactaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaa 41773227  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  41773228 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 41773327  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   | |||||||    
T  41773328 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatca 41773427  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||||| |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  41773428 ctgcttgattctcaatagataaggtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 41773527  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  41773528 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 41773627  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  | |||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  41773628 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcgcgaccaaacatagacaaagtacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 41773727  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41773728 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 41773758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 60 - 618
Target Start/End: Original strand, 20802942 - 20803513
Alignment:
Q  60 aaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgaca 159  Q
    |||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||| ||||| ||||    
T  20802942 aaaaccggtgctctccaagatgaaacacttggtctaacaaaattattctcaagcaaatcttctaattgtttcttcaactcagctagctcggaagcagaca 20803041  T
Q  160 tacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaa 259  Q
    |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20803042 tacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaacagaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaa 20803141  T
Q  260 aacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgt 346  Q
     ||||  |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||             |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | || |||    
T  20803142 tacttcaggaaaatcgcatactacttgtagcttatcaatcactgcttgattctcgatagataaagaagccatcaaagaaaacatcaagataccttcgcgt 20803241  T
Q  347 tctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacat 446  Q
    || |  ||||| || ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  20803242 tccagttgcttcagctgcttggtagataagaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatacactgacttgctaaagcaattgatatgaacat 20803341  T
Q  447 ggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacagggg 546  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  20803342 ggttgtactctaaccacttcataccaagaatcacatccataccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaagg 20803441  T
Q  547 acatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||| | ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20803442 acatttcaaacatacgagagaagtagtcaccaaacccttagctggagtttcgacaaccatctttccattcat 20803513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 27666590 - 27665960
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27666590 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 27666491  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  27666490 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 27666391  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  27666390 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 27666291  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||  | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  27666290 ctgcttgattctcaatagatatagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 27666191  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  27666190 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 27666091  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27666090 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 27665991  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665990 tcggagtttcgacaaccatctctccattcat 27665960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 3 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 37289594 - 37288966
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||  || |||||||| |||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37289594 ttcaactgtcgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggtgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaact 37289495  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||| |||||    
T  37289494 tcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccagggacaag 37289395  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| || |||||  |||   ||||||||||     
T  37289394 atcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaaatcacacaccaccggtaacctatcaatcact 37289295  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                | |||||| | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||||    
T  37289294 gcttgattctcaaaagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctacaccac 37289195  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
     |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  37289194 tttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccatacc 37289095  T
Q  490 actcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagct 589  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  37289094 gctcaaaggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacaaagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagct 37288995  T
Q  590 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37288994 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 37288966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 14997839 - 14997209
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||  || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14997839 tgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 14997740  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||| |||    
T  14997739 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccagggaca 14997640  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  14997639 agatcaatagaaaactcaacttctctctcaggaggcacatcagaaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 14997540  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||||| |||||| || |||||||| || |||   || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  14997539 ctgcttgattctcaatagataaggtagccattaacgaaaacatcaagatactgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactccgcacc 14997440  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14997439 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 14997340  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14997339 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 14997240  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997239 ccggagtttcgacaaccatctctccattcat 14997209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 27612640 - 27613272
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27612640 tgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 27612739  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  ||||| |||||||||||    
T  27612740 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcattccaggaaca 27612839  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctct--ggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaat 298  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||    
T  27612840 agatcaatagaaaactcaacttctctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaat 27612939  T
Q  299 cac-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcg 385  Q
    |||             |||||||  | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| |||||||||||     
T  27612940 caccgcttgattctcaatagatatagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgca 27613039  T
Q  386 ccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatcca 485  Q
    |||| |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  27613040 ccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatcca 27613139  T
Q  486 taccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctt 585  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27613140 taccactcaagggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaaccctt 27613239  T
Q  586 agctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27613240 agccggagtttcgacaaccatctctccattcat 27613272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 22330987 - 22330357
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| || ||||||| |||||| |||   || |||||||| ||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22330987 tgttcaaatgccgataatcaatacataactgcatactaccatctttcttgtttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 22330888  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  22330887 cttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 22330788  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   ||| |||||    
T  22330787 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatctggaatctcacccggaaaaacttcaggaaattcacacaccacaggtaacctattaatca 22330688  T
Q  301 ca-------------tagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |              ||||||||| |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  22330687 ctgcttgattctcagtagataaggtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 22330588  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22330587 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 22330488  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22330487 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 22330388  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22330387 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 22330357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 27683500 - 27682870
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||  || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27683500 tgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 27683401  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||| | |||    
T  27683400 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaaggaca 27683301  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  27683300 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 27683201  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | |||||| || |||||||| || ||| | |  ||||| |  | ||| || ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  27683200 ctgcttgattctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgttgcgttccagttccttcagctgcttagtagataaaaactccgcacc 27683101  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27683100 actttcctcttcgacggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaacagttcatacccagaatcacatccata 27683001  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27683000 ccgctcaaaggtagacacactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 27682901  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27682900 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 27682870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 19772246 - 19772876
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| | ||| || |||||||| |||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19772246 tgttcaactgccgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccagcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaa 19772345  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  19772346 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 19772445  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  19772446 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 19772545  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||  | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| |  ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  19772546 ctgcttgattctcaatagatatagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcaactgcttagtagataaaaactctgcacc 19772645  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  19772646 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaggatcacatccata 19772745  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19772746 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 19772845  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19772846 ccggagtttcgacaaccatctctccattcat 19772876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 237 - 618
Target Start/End: Original strand, 21882296 - 21882690
Alignment:
Q  237 acatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagataaggaagccatcaaag 323  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||              |||||||||||||||| |||||    
T  21882296 acatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatcattgcttgattctcaatagataaggaagccaacaaag 21882395  T
Q  324 aaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgactt 423  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |   | || ||||||||||| |||||    
T  21882396 aaaacatcaaaataccatcacgttccagttgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcaccactttcctcctagacggaggagaaatacaccgactt 21882495  T
Q  424 gctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaa 523  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  21882496 gctaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccaattcataccaagaatcacatccataccgcttaaaggtagacaaactaaatccatctcaaaa 21882595  T
Q  524 tcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21882596 tcacgaccaaacatagacaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 21882690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 302 - 618
Target Start/End: Original strand, 23473795 - 23474111
Alignment:
Q  302 atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcag 401  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||| | |||  ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||| |||||||    
T  23473795 atagacaaggacgccgtcaaagaaaacatcataattccatcacgttctaattgcttcagctgcttagtagacaagaattctgcaccactttcttcttcag 23473894  T
Q  402 cagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtag 501  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||     
T  23473895 cagaagaaaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacgtccattccactcaaaggtaa 23473994  T
Q  502 acaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgaca 601  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23473995 acaaaccaagtcaatttcaaaatctcgaccaaacatagacaaaggacatctttaatacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgaca 23474094  T
Q  602 accatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||    
T  23474095 accatctctccattcat 23474111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 303 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 21343199 - 21342884
Alignment:
Q  303 tagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagc 402  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||| |||||||||| |    
T  21343199 tagataaagaagccattaacgaaaacattaaaataccatcgcgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcaccactttcctcttcaac 21343100  T
Q  403 agaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtaga 502  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  |||| |||| |    
T  21343099 ggaatagaaataaactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccagaatcacatccataccgttcaatggtata 21343000  T
Q  503 caaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaa 602  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342999 caaactaaatccatttcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaa 21342900  T
Q  603 ccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||    
T  21342899 ccatctctccattcat 21342884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 21562123 - 21561495
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  21562123 ttcaactgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatctttcttcttaaccaacaacacctgcgctccccaaggtgaaatacttggtcttacaaact 21562024  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||||||||||| || | |||||| || |||||||| |||||   ||| |||||| ||||||| ||  |||||||    
T  21562023 tcttatcaagtaaatcctccaactgtttcttcaactcagctacctcagaggccgacatacggtaaggctccatcgacacaggcttcgtacccagaacaag 21561924  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcaca 302  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    || ||  ||| | |||||||||||    
T  21561923 atcaattgaaaattcaacttccctctctggctgcacatgaggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcattcacaaccggtaatctatcaatcaca 21561824  T
Q  303 --tagat-----------aaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
      | |||           ||| | ||||| |||||||||||||| || |||| | ||||||| ||||| |  || || |||| ||| ||||| ||   ||    
T  21561823 gcttgattctccaccgacaagtatgccattaaagaaaacattaagatctcattaggttctaattgcttcaactgtttagtagtcaagaactcagctttac 21561724  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
      || || ||||||||||| |||| ||| |  || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| |||    
T  21561723 tctcttcctcagcagaagaaaaatgcaccgttttactaaaacaattgatatgaacatggttatactccaaccagttcatcccaaagattacatccacacc 21561624  T
Q  490 actcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagct 589  Q
      |||| || | ||| || | ||||| ||||||||| | | ||||||||||||  ||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||    
T  21561623 cgtcaatggcaaacatactagatcaacttcaaaatctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacgagagaagtagttactgaacccttagct 21561524  T
Q  590 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  21561523 ggagtttcaacaaccatttctccactcat 21561495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20466197 - 20465945
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20466197 ttcaactgtcgataataaatgcataacctcatgctaccatctttcttattaactaacaatactggcgctcgccaaggtgaaacactcggttttacaaact 20466098  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || | ||||||    
T  20466097 tcttatcaagtaaatcgtctaactgtttcttcaactcagccaactcagaagccgacatacggtaaggagtcatagacacaggcttcgtacccgaaacaag 20465998  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcag 255  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20465997 atcaatcgaaaattcaacttccctttctggcggcacatcaggaatctcatcag 20465945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 25850343 - 25850613
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  25850343 tgttcaactgacggtaatctatacacaatctcatactaccatccttcttcttgaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaa 25850442  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || || || | ||  ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  25850443 tttcttatccaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacggtatggtgccatcgacaccggcttagttcctggaaca 25850542  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25850543 aggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaatacttatggaaa 25850613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 37541481 - 37541211
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  |||||||  || || ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  37541481 tgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttcttgaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaa 37541382  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || || | ||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  37541381 cttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaaca 37541282  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  37541281 agatcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcagggaatacttctggaaa 37541211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21984240 - 21984007
Alignment:
Q  38 accatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaac 137  Q
    |||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21984240 accatctttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtcttacaatcttcttatcaagtaaatcctccaattgtttcttcaac 21984141  T
Q  138 tcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggca 237  Q
    || || |||||| | | ||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  21984140 tcagctaactcatacgttgacatacggtaaggtgccatcgacactggcttcgtacccggaacaagatcaattgaaaattcaacttccctctctgacggca 21984041  T
Q  238 catcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21984040 catcaggaatctcatcaggaaaaacttctggaaa 21984007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 17267434 - 17267179
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  17267434 tgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttcttcaccaacaacataggcgctccccacggtgaaacactgggtctaacaaa 17267335  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || ||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  17267334 cttcttatcaagcaaatcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggctttgttccgggaaca 17267235  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcagg 256  Q
    || ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17267234 aggtcaattgaaaactccacctccctctctggtggcacatcgggaatctcatcagg 17267179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 23473513 - 23473728
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || || || ||||||||||| |||||||| || | ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  23473513 tgttcaattgtcgataatcaatgcataatctcatgctaccatctttcttcttaactagcaataccggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaa 23473612  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  23473613 cttcttatcaagtaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacctggaaca 23473712  T
Q  201 agatcaatcgaaaatt 216  Q
    || |||||||||||||    
T  23473713 aggtcaatcgaaaatt 23473728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 20778181 - 20778811
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||    
T  20778181 tgttcaactgacgatagtcaatgcacaacctcatacttccatctttcttctttaccaataacacgggcgctccccacggcgaaacactaggtctcacaaa 20778280  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || | ||| ||||| || |||| ||| ||||||    
T  20778281 cttcttatcaagcaagtcctccaactgtttctttaactcagccaattcagaagctgacatgcgatacggcgccatcgacactagtttcgctcccggaaca 20778380  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||    |||||| ||||| | ||||| |    
T  20778381 agatcaatcgagaactcaacttctctttctggtggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcgtgaaattcattcaccactggtagtctgtcaatta 20778480  T
Q  301 ca-----------ta--gataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    ||           ||  || || || |||||||| |||||||| | |||  |||| ||||| |||||||| |  || || ||||  | ||||| ||| ||    
T  20778481 caacttgattctctaacgacaatgatgccatcaacgaaaacataagaattccatctcgttccaactgcttcaactgtttagtagttagaaactgtgctcc 20778580  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    ||  || ||||| |||||||| || | ||| | |||| |||||||||||||    ||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||     
T  20778581 actctcttcttccgcagaagaaaagtgcaccgtcttgttaaaacaattaatacagactcggttatactctaaccaattcatcccgaaaataacatccatc 20778680  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||   ||| |||||||| || || || |  |||||||| | | ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  20778681 cccaacaacggtagacacactaagtcgacctcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacacacaagagaagtagtcactgaacccttgg 20778780  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  20778781 ctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 20778811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 28893042 - 28892412
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||    
T  28893042 tgttcaactgacgatagtcaatgcacaacctcatacttccatctttcttcttcaccaataacacgggcgctccccacggcgaaacactgggtcttacaaa 28892943  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || | ||| || ||  | |||||||| ||||||    
T  28892942 cttcttgtcaagcaagtcctccaactgtttctttaactcagccaattcagaagctgacatgcgatacggcgccatcgatactggtttcgttcccggaaca 28892843  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||    |||||| ||||| | || ||||    
T  28892842 agatcaatcgagaactcaacttccctttctggtggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcattcaccactggtagtctgtcgatca 28892743  T
Q  301 ca-----------ta--gataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    ||           ||  || || || ||||||||||||||||| | |||  |||| ||||| |||||||| |  || || ||||  | ||||||||| ||    
T  28892742 cagcttgattctctaacgacaatgatgccatcaaagaaaacataagaattccatctcgttccaactgcttcaactgtttagtagttagaaactctgctcc 28892643  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    ||  || |||||  ||||||| || | ||| | |||| |||||||||||||    ||  |||| ||||||||||| ||||| || |  || ||||||||     
T  28892642 actctcttcttccacagaagaaaagtgcaccgtcttgttaaaacaattaatacagactcggttatactctaaccaattcatcccgaagatgacatccatc 28892543  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||   ||| |||||||| || || || | ||||||||| | | ||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  28892542 cccaacaacggtagacacactaagtcgacttcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttagacacaccagagaagtagttactgaacccttgg 28892443  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  28892442 ctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 28892412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22234000 - 22233757
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| || || ||||| |||||||    
T  22234000 atacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccatggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatcaagtaaatcct 22233901  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || ||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||   |||| |||| |||||||| || || |||||||||||    
T  22233900 ccaactgtttcttcaattcagctaactcggacgccgacatacgataaggtgtcatcgacaccgacttcattccgggaacaaggtctattgaaaattcaac 22233801  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22233800 ttccctctctggtggtacatccggaatctcatcaggaaaaactt 22233757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14885056 - 14884821
Alignment:
Q  36 ctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || || |  |  ||||| || ||||||||||    
T  14885056 ctaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaacttcttatctaataggtcctccaactgtttcttca 14884957  T
Q  136 actcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggagg 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  14884956 actcagccaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaagatcaattgagaactcaacctccctctctggtgg 14884857  T
Q  236 cacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  14884856 cacatcaggaatctcatcagggaatacttctggaaa 14884821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 22464219 - 22464482
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || |||||| | ||| | |||||    
T  22464219 tgttcaactgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatccttcttcttcaccaataacacaggcgctccccacggcgaaacattgggtcttacaaa 22464318  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||  | ||||||||  |||||    
T  22464319 cttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcggctaattcagaagcggacatacgatacggtgccatcgacactggtttcgttcccagaaca 22464418  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22464419 agatcaatcgagaactcaacttctctttctggtggcacatcagggatctcatctggaaaaactt 22464482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24796462 - 24796227
Alignment:
Q  36 ctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttca 135  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || || | ||  ||||| || ||||||||||    
T  24796462 ctaccatccttcttctttactaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaacttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttca 24796363  T
Q  136 actcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggagg 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  24796362 actcagccaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaagatcaattgagaactcaacctccctctctggtgg 24796263  T
Q  236 cacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  24796262 cacatcaggaatctcatcagggaatacttctggaaa 24796227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 301
Target Start/End: Original strand, 21409440 - 21409720
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || | || | |||||||||| || ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| |    
T  21409440 atacataacctcatgctaccatctttcttcttaaccaataacaccgacactccccaaggcgatacactcggtcttacaaactttttatcaagcaaatctt 21409539  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    |||| || || |||||| | || || || |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||| || |||| ||| ||||| |||||||| ||    
T  21409540 ctaactgctttttcaacccagctaattcggaagctgacatacggtaaggtgccatagaaacaggtttcgtacccggaataagttcaatagaaaattctac 21409639  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac 301  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| || || ||||||||||  |||||||||||    
T  21409640 ttccctctctggtggcacatcaggaatttcatcaagaaaaacttctggaaattcacacaccacttgtaacttatcaatcac 21409720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28921868 - 28921605
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||    
T  28921868 tgttcaactgacgatagtcaatgcacaacctcatacttccatctttcttcttcaccaataacacgggcgctccccacggcgaaacactgggtcttacaaa 28921769  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || | ||| || ||  | |||||||| ||||||    
T  28921768 cttcttgtcaagcaagtcctccaactgtttctttaactcagccaattcagaagctgacatgcgatacggcgccatcgatactggtttcgttcccggaaca 28921669  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28921668 agatcaatcgagaactcaacttccctttctggtggcacatcaggaatctcatctggaaaaactt 28921605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 68 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 23078938 - 23078742
Alignment:
Q  68 cgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataa 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  23078938 cgcttcccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtaa 23078839  T
Q  168 ggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    |||| ||| |||||  |||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23078838 ggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaataaggtcaattgaaaattccacctccctttctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacactt 23078742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 20823721 - 20824351
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |  || |||||||| || |||||||| ||| | |||||    
T  20823721 tgttcaactgacgatagtcaatgcacaacctcatactcccatctttctttttcaccaacaacacgggtgctccccacggcgaaacactaggtctcacaaa 20823820  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || | ||| || |   | |||||||| ||||||    
T  20823821 cttcttatcaagcaagtcctccaactgtttctttaactcagccaattcagaagctgacatgcggtacggcgccattgatattggtttcgttcctggaaca 20823920  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||    |||||| ||||| | || ||||    
T  20823921 agatcaattgagaattcaacttctctttctggtggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcgggaaattcattcaccactggtagtctgtcgatca 20824020  T
Q  301 ca-----------ta--gataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    ||           ||  || || || ||||||||||||||||| | |||  |||| || || |||||||| |  || || ||||  | ||||||||| ||    
T  20824021 cagcttgattctctaacgacaaagatgccatcaaagaaaacataagaattccatctcgctccaactgcttcaactgtttagtagttagaaactctgctcc 20824120  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    ||  || |||||  ||||||| || | ||| | |||| |||||||||||||    ||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||     
T  20824121 actctcttcttccacagaagaaaagtgcaccgtcttgttaaaacaattaatacagactcggttatactctaaccaattcatcccgaaaataacatccatc 20824220  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||   ||| |||||||| || ||||| |  || ||||| | | ||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  20824221 cccaacaacggtagacacactaaatcgacctcgaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacacaccagagaagtagttactgaacccttgg 20824320  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  20824321 ctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 20824351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Original strand, 20344585 - 20344820
Alignment:
Q  36 ctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttca 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || | |||  ||||||||||||||||||| ||| | ||||| || || || | ||  ||||| || || |||||||    
T  20344585 ctaccatccttcttcttaaccaataacaccggtcctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaatttcttatctaacaggtcctccaactgcttcttca 20344684  T
Q  136 actcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggagg 235  Q
    | || || ||||||||| |||||||||| || |||| ||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  20344685 attcagctaactcagaaactgacatacggtatggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtgg 20344784  T
Q  236 cacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  20344785 cacatcaggaatctcatcaggaaatacttctggaaa 20344820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 21983951 - 21983647
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| || || || |||| ||| ||||| ||   ||| || || ||||||||||| ||||    
T  21983951 gccattaaagaaaacattaagatcccatcacgttctaattgcttcagctgtttagtagtcaagaactcagctttaccctcttcctcagcagaagaaaaat 21983852  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||| || | ||| || | |||    
T  21983851 gcaccgtcttactaaaacaattgatatgaacatggttatactccaaccagttcatcccaaagattacatccatacccgtcaacggcaaacatactagatc 21983752  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
    || ||||||||| | | |||||||| |||  ||||| || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21983751 aacttcaaaatctctaccaaacataaacaatggacaactcaaacaaacgagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcca 21983652  T
Q  614 ttcat 618  Q
     ||||    
T  21983651 ctcat 21983647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23564266 - 23564007
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    ||||||||||| ||||  || || ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| |||||||||||| || | ||||| |    
T  23564266 ttcaactgtcggtaatcgatgcataacctcatggtaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgcttcccatggtgaaacactttgtcttacaaatt 23564167  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || ||||||||  |||| || | |||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| |||| |||    
T  23564166 tcttatcaagcaagacctccaactatttcttcaactccgctaactcggacgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaataag 23564067  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaac 262  Q
     ||||| ||||||||||| || || ||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23564066 gtcaattgaaaattcaacctctctttctagtggcacatctggaatcttatcaggaaaaac 23564007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 22504947 - 22505217
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || |||| ||| ||||  || || ||||||||||||||||| |||||||| |  |  |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  22504947 tgttcaactgacggtaatcaatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacactgatgctccccaaggtgaaacactaggtcttacaaa 22505046  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || || || | ||  || || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  ||||||||||  ||||     
T  22505047 tttcttatccaacaggtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtatggtgccatcgacaccggcttcgttcctagaacg 22505146  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  22505147 aggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcacgaaatacttctggaaa 22505217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 316 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 23563940 - 23563638
Alignment:
Q  316 catcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatac 415  Q
    ||||||||||||||| | |||  ||||||| || |||||||| |  || || ||||| |  |||||||| ||||  || ||||| | |||||| |||| |    
T  23563940 catcaaagaaaacataagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttagtagatagcaactctgctccactctcttcttctgtagaagaaaaatgc 23563841  T
Q  416 actgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaa 515  Q
    || | ||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  |||| |||| |||||| || || |    
T  23563840 accgtcttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatccatacccgtcaatggtaaacaaactaagtcga 23563741  T
Q  516 tttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccatt 615  Q
     |||||| || | | ||||||||||||  | ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  23563740 cttcaaagtctctaccaaacatagacaacgtacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccttt 23563641  T
Q  616 cat 618  Q
    |||    
T  23563640 cat 23563638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 314 - 606
Target Start/End: Original strand, 22464544 - 22464836
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||  | ||||||||| ||||  |||||||| |||||||| || |    
T  22464544 gccatcaaagaaaacataagaatttcatcccgttccaactgcttcaattgtttagtagttagaaactctgctccactctcctcttccgcagaagaaaagt 22464643  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| | |||| |||||||||| ||    ||  |||||||||||||||| ||||| || | ||| |||||||| ||   ||| |||||||| || || ||    
T  22464644 gcaccgtcttgttaaaacaatttatacagactcggttgtactctaaccaattcatcccgaaaataacatccattcccaacaacggtagacatactaagtc 22464743  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
     |  |||||||| | | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22464744 gacctcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacacacaagagaagtagttactgaacccttggctggagtttcaacaaccat 22464836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21676908 - 21676671
Alignment:
Q  27 aaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaatt 126  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||| || || ||||| |||||||| |    
T  21676908 aacctcatactaccatctttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtggaacacttggtcttacaaacttcttgtcgagcaagtcctctaact 21676809  T
Q  127 gtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccct 226  Q
    ||||||||||||| || |  || || || ||||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||| || || ||||| || || || ||||| |||||    
T  21676808 gtttcttcaactcagcaagttcggatgccgacatacaataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggcaccagatcgattgagaactcaacctccct 21676709  T
Q  227 ctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
     ||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21676708 ttctggtgatacatctggaatctcatccggaaaaactt 21676671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 815 - 659
Alignment:
Q  108 tcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaa 207  Q
    |||||||| ||||| || | |||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||| |||| |||||||| ||||    
T  815 tcaagcaagtcctccaactttttcttcaactcagctaactcggacgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttccttcctggaacaaggtcaa 716  T
Q  208 tcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    | ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  715 ttgaaaattcaacctctctctccggtggcacatctggaatctcatctggaaaaactt 659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 387 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 23078606 - 23078375
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||| || || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  23078606 caccttcttcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcagttcatgtgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccat 23078507  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||   ||| || | |||||  | ||||| | |||| || | | ||||||||||||  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||||||    
T  23078506 acccgacaacggcaaacaaattagatcaactacaaagtctctaccaaacatagacaatggacatctcaagcaaactagagaagtagttactgaaccctta 23078407  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  23078406 gctggagtttcaacaaccatttctcccttcat 23078375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 339 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 17267083 - 17266804
Alignment:
Q  339 catcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaat 438  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||| |||  |||||||||  |  |||  || ||||| || ||||| ||||  || | ||| |||||||| || ||    
T  17267083 catcacgttccaactgcttcatttgcttcgtattcaaaaactcaacttcactctcttcttcggcggaagaaaaatgtaccgtcttactaaaacagttgat 17266984  T
Q  439 gtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacata 538  Q
     |||||   ||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||  |||| || | |||||| || || | ||||||||| | | ||||||||    
T  17266983 atgaactcagttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccattcccgtcaacggcaaacaaactaagtctacttcaaaatctctaccaaacata 17266884  T
Q  539 gacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    || |  ||||| || || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  17266883 gaaattggacacctcaagcaaacaagagaagtagtcactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 17266804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 305 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 22233703 - 22233534
Alignment:
Q  305 gataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcag 404  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |  || || |||| ||| ||||| ||  |||  || ||||||||||    
T  22233703 gataagtacgccatcaaggaaaacattagaattccatcacgttctaactgcttcaactgtttcgtagtcaagaactcagcttcactctcttcttcagcag 22233604  T
Q  405 aagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaag 474  Q
    |||| |||| ||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  22233603 aagaaaaatgcaccgtcttactaaagcaattaatatgaacatggttatattccaaccagttcataccaag 22233534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 387 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 14884692 - 14884473
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||  || | ||| ||||| || || || |||||  | || || |||||||| ||||||||||  || ||||||||    
T  14884692 caccttcttcttcaacagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaacccgattatattctaaccaattcataccaaagataacatccat 14884593  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| || |||||||| ||||||||  ||||||| | | |||||||||| |  ||||| |  | ||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  14884592 acccgtcaacggaagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaaccctta 14884493  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  14884492 gctggagtttcaacaaccat 14884473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 563 - 618
Target Start/End: Original strand, 23460832 - 23460887
Alignment:
Q  563 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23460832 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctcttcattcat 23460887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 425 - 606
Target Start/End: Original strand, 20311573 - 20311754
Alignment:
Q  425 ctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaat 524  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||  |||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |  | ||| || || || | | ||||||    
T  20311573 ctaaaacaattgatatgaacatagttaaactccaaccagttcatacctagtatcacatccataccactcaacgacaaacagactaagtccactgcaaaat 20311672  T
Q  525 cacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
    | | | ||||||| ||||  |||||  | || || || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20311673 ctctaccaaacatcgacaaaggacacttcaagcatactagagaagtagtcaccgaacccttagttggggtttcgacaaccat 20311754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 558 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 21631929 - 21631869
Alignment:
Q  558 acacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21631929 acactagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttccccattcat 21631869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 387 - 606
Target Start/End: Original strand, 22505346 - 22505565
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||| || || ||| ||| | || || || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  22505346 caccttcttcttcaacagaagaaaaatgcattgtcttactatagcagttgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaatcacatccat 22505445  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| |||| |||||| ||||| |   ||||||| | || ||||||||| |  ||||| |  | ||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  22505446 acccgtcaacggtaaacaaactaaatccaccacaaaatctctatgaaacatagatataggacaccccagacaaacaagagaagtagttattgaaccctta 22505545  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  22505546 gctggagtttcaacaaccat 22505565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 21935288 - 21935123
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  || || ||||| ||||||||||| ||| ||| |||    
T  21935288 tgttcaactgtcgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaa 21935189  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgata 166  Q
    ||  ||||||||||| || || || || |||||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||    
T  21935188 ctgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactccgatgcagacatccgata 21935123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 23507952 - 23508117
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  || || ||||| ||||||||||| ||| ||| |||    
T  23507952 tgttcaactgtcgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaa 23508051  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgata 166  Q
    ||  ||||||||||| || || || || |||||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||    
T  23508052 ctgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactccgatgcagacatccgata 23508117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 24583478 - 24583643
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  || || ||||| ||||||||||| ||| ||| |||    
T  24583478 tgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaa 24583577  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgata 166  Q
    || |||||||||||| || || || || |||||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||    
T  24583578 ctgtttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactccgatgcagacatccgata 24583643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 482 - 542
Target Start/End: Original strand, 23525867 - 23525927
Alignment:
Q  482 tccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagaca 542  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  23525867 tccataccgctcaaaggtagacaaactaaatccatctcaaaatcacgaccaaacatagaca 23525927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 398 - 606
Target Start/End: Original strand, 25850750 - 25850958
Alignment:
Q  398 tcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaag 497  Q
    ||||||||||| |||| ||| | ||| ||| | ||||| || |||||  | || || |||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||  |||| |    
T  25850750 tcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactatagcaattgatatgaactcgattatattctaaccaattcattccaaaaataacattcatacccgtcaacg 25850849  T
Q  498 gtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 597  Q
    | |||||||| ||||||||  ||||||| | | |||||||||| |  ||||| |  | ||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  25850850 gcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacctttagctggagtttc 25850949  T
Q  598 gacaaccat 606  Q
     ||||||||    
T  25850950 aacaaccat 25850958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 21676527 - 21676448
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaag 474  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21676527 tcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaaacaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcataccaag 21676448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 615
Target Start/End: Original strand, 21409821 - 21410047
Alignment:
Q  389 ccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatac 488  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||  ||| | ||| | |||||| ||||| |||||| ||||  | || |||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  21409821 ccttcttcttcggcagaagaaaaacgcaccgtctttcgaaaacatttaatatgaacaaggttaaattccaaccagttcatacctagtattacatccatcc 21409920  T
Q  489 cactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagc 588  Q
    || |||| || | ||| || || || | | ||||||| | | |||||||  |||  |||||  | || || || |||||| ||||||||||| |||||||    
T  21409921 cagtcaacggcaaacagactaagtccactgcaaaatctctaccaaacatcaacaaaggacacttcaagcatactagagaactagtcaccgaagccttagc 21410020  T
Q  589 tggagtttcgacaaccatctctccatt 615  Q
     || |||||||||||||| || |||||    
T  21410021 cggggtttcgacaaccatttccccatt 21410047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 410 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 24618691 - 24618635
Alignment:
Q  410 aaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttc 466  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24618691 aaatacaccgacttactaaaacaattaacatgaacatggttatactccaaccagttc 24618635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 410 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 24714922 - 24714866
Alignment:
Q  410 aaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttc 466  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24714922 aaatacaccgacttactaaaacaattaacatgaacatggttatactccaaccagttc 24714866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 410 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 24747950 - 24747894
Alignment:
Q  410 aaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttc 466  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24747950 aaatacaccgacttactaaaacaattaacatgaacatggttatactccaaccagttc 24747894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 395 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 515 - 436
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaag 474  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| | ||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  515 tcttccgcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaagcaattgatatggacatggttatactccaaccggttcataccaag 436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 92
Target Start/End: Original strand, 21625475 - 21625527
Alignment:
Q  40 catccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggt 92  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||| |||||||||||||    
T  21625475 catctttcttcttcaccaacaacactggtgctccccaagatgaaacacttggt 21625527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 249 - 301
Target Start/End: Original strand, 23473729 - 23473781
Alignment:
Q  249 tcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  23473729 tcatcaggaaaaacttctggaaaatcacatacaacctgtagcttatcgatcac 23473781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 339 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 24796146 - 24796010
Alignment:
Q  339 catcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaat 438  Q
    |||||||||| |||||||| |  || || ||||  || |||||||| ||||  || || || |||||||| |||| ||| | |||| | || ||||| ||    
T  24796146 catcacgttcaaactgcttcaactgttttgtagttaagaactctgctccactctcttcctccgcagaagaaaaatgcaccgtcttgtttaagcaattgat 24796047  T
Q  439 gtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaga 475  Q
     ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  24796046 atgaacatgggtatactccaaccagttcataccaaga 24796010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 439; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 18033 - 18663
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18033 tgttcaactgtcgataatcaataaacaatctcatgctaccatctttcttcttcactaacaaaacgggtgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 18132  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18133 ctttttctcaagcaaatcttctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctaacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaata 18232  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18233 agatcaatagaaaattcaacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttatagaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatca 18332  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18333 ctgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaattccatcacgttctaactacttcagctgcttagtagacaaaaactctgcgcc 18432  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18433 actttcctcttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccata 18532  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18533 ccactcaaaggtaaacaaaccaaatcaatttcaaaatcacaatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacgagagaagtagtcaccgaacccttag 18632  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18633 ctggagtttcgacaaccatctctccgttcat 18663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 439; Significance: 0; HSPs: 72)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 18406007 - 18405377
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  18406007 tgttcaactgtcgataatcaatacacaacctcatgctaccatccttcttcttcactaacaaaaccggcgctccccaaggtgatacacttggtctaacaaa 18405908  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18405907 ctttttctcaagtaaatcttctaattatttcttcaactcagctaactctgaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaaca 18405808  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18405807 agatcagtcgaaaatttaacttccctctctggaggcacattaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaattgcataccacttgtagtttatcaatca 18405708  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18405707 ctgcttgattctcaatagataaggaagccattaaagaaaacatcagaataccatcacgttctaactgcttcagctgcttggtagacaaaaactttgcgcc 18405608  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18405607 actttcctcttcagcagaagagaaatacactgatttactaaaacaagtaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 18405508  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18405507 ccactcaaaggcagacaaaccaaattaatttcaaaatcacaatcaaacatagacaagggacatctcaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 18405408  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18405407 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 18405377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 615
Target Start/End: Original strand, 23080643 - 23081268
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| || || |||||||| |||||||| |||| ||| |   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23080643 ttcaactgtcgataatcaatgcacaatctcatactaccatctttcttcttaaccagcaatacatgcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaact 23080742  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||    
T  23080743 ttttatcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaaattagaagctgacatacggtaaggtgtcatagacacatgcttcgttcccggaataag 23080842  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    |||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||  ||||||||||      
T  23080843 atcaatcgaaaactcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaagaaaaacttctggataatcgcataccacttgtaacttatcaatcatt 23080942  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||| | ||||||||    
T  23080943 gcttgattctcaatagacaaggacgccattaaataaaacatcaaaattccatcacgttctaattgcttcaactgcttggtagaccaaaattttgcgccac 23081042  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23081043 tttcctcttcagaagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatgattgtactctaaccagttcataccaaggattacatccatacc 23081142  T
Q  490 actcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagct 589  Q
    | ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23081143 aatcaaaggtaaacaaaccaagtcaatttcataatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcactgaacccttagct 23081242  T
Q  590 ggagtttcgacaaccatctctccatt 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23081243 ggagtttcgacaaccatctctccatt 23081268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 22436087 - 22436717
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||| ||||| |||||||  ||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  22436087 tgtttaactgacgataatcgatacataatctcatactaccatctttcttcttcactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctgacaaa 22436186  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22436187 cttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagctgacatacgataacgtgtcatagacacatgcttcgttccaggaaca 22436286  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22436287 agatcaacagaaaactcaacttctctctctggaggcacattaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatca 22436386  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  22436387 ctgcttgattttcaatagataaggtagccatcaaggaaaacatcaaaataccatcacgttccagttgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcacc 22436486  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||    
T  22436487 actttcctcttcgacgaaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccaattcataccaagaatgacgcccata 22436586  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||  | |||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22436587 ccactcaaaggcaagcaaaccatatcaatctcaaaatcacgaccaaacatagacaaagaacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 22436686  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22436687 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 22436717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 19866905 - 19867535
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19866905 tgttcaactgacgataatcgatacataatctcatactaccatctttcttcttcactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 19867004  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| |||||    
T  19867005 cttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaagaaca 19867104  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  19867105 agatcaatagaaaactcaacttctctctcttgaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacctgtagcttatcaatca 19867204  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||  || || || |||||||||||||| |||||| | ||    
T  19867205 ccgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaggaaaacatcaaaataccatcgcgttctagttgtttcagctgcttggtagacaagaactctacacc 19867304  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19867305 actttcctcttcgacggaggagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcatacccagaatcacatccata 19867404  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19867405 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatctcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 19867504  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19867505 ctggagtttcgacaaccatctcttcattcat 19867535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 28311848 - 28312478
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28311848 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 28311947  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |  || || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  28311948 cttcttctcaagcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataattctgaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 28312047  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| || |||||  ||||  |||||||||    
T  28312048 agatcaatagaaaactcgacttctctctccggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaaatcacacaccaccggtagcctatcaatca 28312147  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             | |||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  28312148 ctgcttgattctcaacagataaagaagccatcaaggaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 28312247  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  28312248 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 28312347  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  28312348 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaaaatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 28312447  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312448 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 28312478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 2872866 - 2872235
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||  || |||||||| |||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2872866 tgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggtgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 2872767  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  2872766 cttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 2872667  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| || |||||  |||   |||||||||    
T  2872666 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaaatcacacaccaccggtaacctatcaatca 2872567  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaa-ctctgcgc 386  Q
    |             | |||||| | |||||| || |||||||| || ||| | || |||||||  ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  2872566 ctgcttgattctcaaaagataacgtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttctagttgcttcagctgcttagtagataaaaaactctgcac 2872467  T
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||| |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2872466 cactttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccat 2872367  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  2872366 accgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaaccctta 2872267  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2872266 gctggagtttcgacaaccatctctccattcat 2872235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 24293845 - 24293215
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| | ||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24293845 tgttcaactatcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 24293746  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||| |||    
T  24293745 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccagggaca 24293646  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   | |||||||    
T  24293645 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatccggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatca 24293546  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||||| |||||| || |||||||| || ||| | |||||||| |  ||| | || ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  24293545 ctgcttgattctcaatagataaggtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcacgttccagttgcatcagctgcttagtagataaaaactccgcacc 24293446  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24293445 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaactaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 24293346  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24293345 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccattttgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 24293246  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24293245 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 24293215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 16574108 - 16574738
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16574108 tgttcaactgtcgataattaatacatagcctcatactaccatctttcttcttgactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaa 16574207  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||| | |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  16574208 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaaacagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 16574307  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  16574308 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 16574407  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||||||   ||||||||| |||||||| || ||| | || ||||  |  ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  16574408 ctgcttgattctcaatagataaattagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgtttcagttgcttcagctgcttagtagataaaaactccgcacc 16574507  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16574508 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataaggacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 16574607  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16574608 ccgctcaaaggtaggcaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 16574707  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16574708 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 16574738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 16621272 - 16620642
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16621272 tgttcaactgtcgataattaatacatagcctcatactaccatctttcttcttgactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaa 16621173  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||| | |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  16621172 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaaacagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 16621073  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  16621072 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 16620973  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||||||   ||||||||| |||||||| || ||| | || ||||  |  ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  16620972 ctgcttgattctcaatagataaattagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgtttcagttgcttcagctgcttagtagataaaaactccgcacc 16620873  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16620872 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataaggacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 16620773  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16620772 ccgctcaaaggtaggcaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 16620673  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16620672 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 16620642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 25114770 - 25115400
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| | ||| || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25114770 tgttcaactgtcggtaatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 25114869  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || ||||||||||| || || || ||||||||||| || |  || || ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  25114870 tttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagataattcggaagcagacatacgatatggtgccattgacaccggcttcgttccaggaaca 25114969  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  ||||  |||||||||    
T  25114970 agatcaatagaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatccggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatca 25115069  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| || || ||||||| ||| ||    
T  25115070 ctgcttgattctcaatagataaggaagccatcaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtggataaaaactttgcacc 25115169  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||| ||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  25115170 actttcctcctcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 25115269  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  25115270 ccactcaagggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 25115369  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25115370 ctggagtttcgacaatcatctctccattcat 25115400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 28261260 - 28260630
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28261260 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 28261161  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||| |  || || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  | |||||||||||||||    
T  28261160 cttcttttcaagcaagtcctccaactgttccttcaactcagataattctgaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggtttcgttccaggaaca 28261061  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| || || |||||  ||||  |||||||||    
T  28261060 agatcaatagaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaagacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatca 28260961  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
                  | |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  28260960 ttgcttgattctcaacagataaagaagccatcaaggaaaacatcaagatatcatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 28260861  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  28260860 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactttaaccagttcatacccaaaatcacatccata 28260761  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  28260760 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 28260661  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28260660 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 28260630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 28284656 - 28285286
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28284656 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 28284755  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||| |  || || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  | |||||||||||||||    
T  28284756 cttcttttcaagcaagtcctccaactgttccttcaactcagataattctgaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggtttcgttccaggaaca 28284855  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| || || |||||  ||||  |||||||||    
T  28284856 agatcaatagaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaagacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatca 28284955  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
                  | |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  28284956 ttgcttgattctcaacagataaagaagccatcaaggaaaacatcaagatatcatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 28285055  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  28285056 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactttaaccagttcatacccaaaatcacatccata 28285155  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  28285156 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 28285255  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28285256 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 28285286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 28340009 - 28339379
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28340009 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 28339910  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||| |  || || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  | |||||||||||||||    
T  28339909 cttcttttcaagcaagtcctccaactgttccttcaactcagataattctgaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggtttcgttccaggaaca 28339810  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| || || |||||  ||||  |||||||||    
T  28339809 agatcaatagaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaagacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatca 28339710  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
                  | |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  28339709 ttgcttgattctcaacagataaagaagccatcaaggaaaacatcaagatatcatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 28339610  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  28339609 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactttaaccagttcatacccaaaatcacatccata 28339510  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  28339509 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 28339410  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28339409 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 28339379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 3 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 18183428 - 18182800
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||  | ||||||||||| |||||||| || ||||| | | | |||||||| ||||||||||||||| | | |||||    
T  18183428 ttcaactatcgataatcaatacacaatgtcatgctaccatctttcttcttaactaacaataccagagctccccacggtgaaacacttggtcttataaact 18183329  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||    
T  18183328 tcttatcaagtaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcagaagccgacatatggtaaggtgtcatagacacaggcttcgaacccggaacaag 18183229  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    |||||||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||| || ||||||||||  |||| ||||||     
T  18183228 atcaatcgaaaactccacttctctttctggtggcacatcaggaatttcatcagaaaaaatttcaggaaaatcgcacaccacttgtaacttattaatcact 18183129  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||| || | ||| |||||||| |||||||| ||||    
T  18183128 gcttgattctcaatagataaagatgccattaaagaaaacatcaaaattccatcacgtcctaattgcttcagctacttagtagacaagaactctgctccac 18183029  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
     ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18183028 tttcttcttcagcagaagaaaagtacactgacttactaaaataattaatatgaacatggttgtactctaaccaattcataccaaggattacatccattcc 18182929  T
Q  490 actcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagct 589  Q
    || |||||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18182928 acacaaaggtaaacaaaacgtatcaatttcaaaatctcgaccaagcatagacaaatgacatcttaaacaaacaagagaagtagtcaccgaacccttagct 18182829  T
Q  590 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18182828 ggagtttcgactaccatctctccattcat 18182800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 27189654 - 27190284
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27189654 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 27189753  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||| |  || || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  | ||||||||||| |||    
T  27189754 cttcttttcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataattctgaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggtttcgttccagggaca 27189853  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || || || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  ||||  |||||||||    
T  27189854 agatcaatagaaaactcgacttctctttctgggggtacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatca 27189953  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             | |||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  27189954 ctgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcacc 27190053  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27190054 actttcctcttcgacagaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 27190153  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27190154 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaatatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 27190253  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27190254 ctggagtttcgacaaccatctccccattcat 27190284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 27259586 - 27258956
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27259586 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 27259487  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||| |  || || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  | ||||||||||| |||    
T  27259486 cttcttttcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataattctgaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggtttcgttccagggaca 27259387  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || || || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  ||||  |||||||||    
T  27259386 agatcaatagaaaactcgacttctctttctgggggtacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatca 27259287  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             | |||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  27259286 ctgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcacc 27259187  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27259186 actttcctcttcgacagaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 27259087  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27259086 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaatatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 27258987  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27258986 ctggagtttcgacaaccatctccccattcat 27258956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 16925702 - 16925073
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||||| ||| || ||||| ||||| |||||||| || | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  16925702 tgttcaactgacgatagtcaatacgcaatctcatgcttccatctttcttcttaactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaaaaaa 16925603  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     ||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| ||| |||||  | |||||||||||||||    
T  16925602 tttcatctcaaccagatcttctaattgtttcttcaactcggctaactcggaaacagacatacgataaggtgccatggacaccggtttcgttccaggaaca 16925503  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    || ||||| ||||| ||||| |  |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| || ||||| |    
T  16925502 ag-tcaatagaaaactcaacttgtctctctagaggcacattaggaatttcatctggaaaaacttcgggaaagtcgcataccacttgtagcttgtcaatta 16925404  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||| || |  |  ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  16925403 ccgcttgattctcaatagataaagaagccatcaaagaatacatcaaaataccatcgcgctacatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcacc 16925304  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  16925303 actttcctcttcgatggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcataccaaggatgacgtccata 16925204  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  16925203 ccactcaaaggcaaacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagaaaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgatcccttag 16925104  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16925103 ctggagtttcgacgaccatctctccattcat 16925073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 3 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 22828416 - 22827864
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  22828416 ttcaactgtcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagcaaaatcggcgttccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatt 22828317  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  || || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  22828316 tcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataattcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaag 22828217  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    |||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||     
T  22828216 atcaatagaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattccaacaccacttgtagcttatcaatcact 22828117  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                |||||||| | |||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |  ||||| |  ||||| ||||| ||||||||| | ||||    
T  22828116 gcttgattctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagatatcatcgcgttccagttgcttcacctgcttagtagataaaaactcttcaccac 22828017  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
     |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  22828016 tttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaagcaattcatacccagaatcacatccatacc 22827917  T
Q  490 actcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagaca 542  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22827916 gctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagaca 22827864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22760518 - 22760156
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||  |||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  22760518 tgttcaactgttgataatcaatacacaacctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaacgggcgctccccaaggcgaaacacttagtctaacaaa 22760419  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22760418 ctttttctcaagtaaatcttctaattatttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaaca 22760319  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22760318 agatcaatcgaaaattcaacttccctctttggaggcacatcaggaatttcatcaggaaatacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatca 22760219  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttcta 350  Q
    |             |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  22760218 ctgtttgattctcaatagataaggaagccatcaaggaaaacatcaaaataccatcatgttcta 22760156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 65 - 542
Target Start/End: Original strand, 20135256 - 20135746
Alignment:
Q  65 cggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacga 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||     
T  20135256 cggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatctagtaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactcatgagccgacatacgg 20135355  T
Q  165 taaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  20135356 taaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaacaagatcaataaaaaattcaacctcactttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaactg 20135455  T
Q  265 atggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaa 351  Q
     ||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||             ||||| || || |||||||| |||||||| |||||  ||||| |||||||    
T  20135456 ctggaaaatcacatacaacctgtaacttatcaatcactgcttgattctcaatagacaaagacgccatcaaggaaaacatcaaaattccatcatgttctaa 20135555  T
Q  352 ctgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttg 451  Q
     ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  20135556 ttgcttcagctgcttagtagacaagaactctgctccactttcttcttcagcaaaagaaaagtacactgacttactaaaacaattaatatgaacatggttg 20135655  T
Q  452 tactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagaca 542  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  20135656 tactctaactagtccataccaaggattacatccattccactcaaaggtaaacaaaccaaatcaatttcaaaatctcggccaaacatagaca 20135746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 65 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 22197613 - 22197123
Alignment:
Q  65 cggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacga 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||     
T  22197613 cggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatctagtaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactcatgagccgacatacgg 22197514  T
Q  165 taaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  22197513 taaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaacaagatcaataaaaaattcaacctcactttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaactg 22197414  T
Q  265 atggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaa 351  Q
     ||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||             ||||| || || |||||||| |||||||| |||||  ||||| |||||||    
T  22197413 ctggaaaatcacatacaacctgtaacttatcaatcactgcttgattctcaatagacaaagacgccatcaaggaaaacatcaaaattccatcatgttctaa 22197314  T
Q  352 ctgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttg 451  Q
     ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22197313 ttgcttcagctgcttagtagacaagaactctgctccactttcttcttcagcaaaagaaaagtacactgacttactaaaacaattaatatgaacatggttg 22197214  T
Q  452 tactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagaca 542  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  22197213 tactctaactagtccataccaaggattacatccattccactcaaaggtaaacaaaccaaatcaatttcaaaatctcggccaaacatagaca 22197123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 126 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 29590377 - 29589872
Alignment:
Q  126 tgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccc 225  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  29590377 tgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatagaaaactcaacttctc 29590278  T
Q  226 tctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagataagga 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   | ||||||||             |||||||  |     
T  29590277 tctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatcactgcttgattctcaatagatatagt 29590178  T
Q  313 agccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaa 412  Q
    |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||||    
T  29590177 agccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaa 29590078  T
Q  413 tacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaat 512  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29590077 tgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaaaggtagacaaactaaat 29589978  T
Q  513 caatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 612  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29589977 ccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 29589878  T
Q  613 attcat 618  Q
    ||||||    
T  29589877 attcat 29589872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 5837282 - 5836661
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| || || ||   |||||| |||||||| || | |||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  5837282 tgttcaactgacgataatcgatacataatctcataaaaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccccaaggcgaaacacttggtctaacaaa 5837183  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||         |||| |||||||||||||||| ||| ||||   |||| || ||||||||     
T  5837182 cttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcgg---------aagcagacatacgataaggtgccatcgacatcggcttagtcccaggaact 5837092  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    | |||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||||  ||||| || ||||||||||| || ||||||||||    
T  5837091 aaatcaatagaaaattcaacttctctctcaggaggcacatcgggaatttcgtctgggaacacttcaggaaagtcacataccacttgaagcttatcaatca 5836992  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             | |||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || || || ||||| || || ||||| ||    
T  5836991 ccgcttgattctcaacagataaagtagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcgcgttccagttgcttcagctgtttagtagataagaattctgcacc 5836892  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  5836891 actttcctcttcgactgaagagaaatacactgacttgctagcacaattaatatgaacatgattgtactctaaccaattcctaccaagaataacatccata 5836792  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||| || ||||  ||||| |||||||||||||    
T  5836791 ccgctcaaagggagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagaaaaaggacatttcaaacatactagagtggtagttaccgaacccttag 5836692  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5836691 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 5836661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 25607924 - 25607624
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  || |||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  25607924 tgttcaattgtcgataatcaatacacaaccttatgctaccatctttcttcttcactaacaaaacaggtgctctccaaggcgaaacacttggtctaacaaa 25607825  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  25607824 cttcttttcaagtaaatcttctaattgtttcttcaactctgccaactcagaacctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaagaaca 25607725  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25607724 agatcaatcgaaaattcaacttctctctccggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcacaccacttgtagtttatcaatca 25607625  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  25607624 c 25607624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 316 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 27559704 - 27559402
Alignment:
Q  316 catcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatac 415  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| |  ||||| ||||| || |||| ||| |||| |||||||||  | ||||||||||||    
T  27559704 catcaacgaaaacatcaaaataccatcgcgttccagttgcttcacctgcttagtagataagaactttgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatac 27559605  T
Q  416 actgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaa 515  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |    
T  27559604 actgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccagaatcacatccataccgctcaaaagtagacaaactaaatcca 27559505  T
Q  516 tttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccatt 615  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27559504 tttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccatt 27559405  T
Q  616 cat 618  Q
    |||    
T  27559404 cat 27559402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 21755150 - 21755450
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| || || || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21755150 tgttcaactgacgataatcgatacataatctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 21755249  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  21755250 cttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagtagacatacgataaggtgtcatcgacaccggcttcgttccaggaaca 21755349  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  21755350 agatcaatagaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatatgggaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgtagcttatcaatca 21755449  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  21755450 c 21755450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 23085832 - 23085433
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||||| || || ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23085832 ttcaactgtcgataaccaatgcataacctcatacttccatctttcttcttgactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaact 23085733  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  23085732 tcttatcaagcaaatattctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagccgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacctggaacaag 23085633  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| || || |||||||  ||||| |||||     
T  23085632 atcaatcgaaaattcaacttctctttctggcggcgcatcaggaatctcatcagagaaaacttcaggaaaatcacacacaacttgtaacttatctatcact 23085533  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                | ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  23085532 gcttgattctcaacagacaaggacgccatcagagaaaacatcaaaattccatcacgctctaactgtttcagctgcttagtagacaagaactctgctccac 23085433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 16961545 - 16961097
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||||| || | ||||||||| |||||||| || | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16961545 tgttcaactaacgatagtcaatacacaatctcaggctaccatctttcttcttaactagcaaaacaggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 16961446  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||  |||    
T  16961445 tttcttctcgagcagatcttctaattgtttcttcaactcggctaactcgaaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccagtcaca 16961346  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||   |||| || |||||||||||||| || ||||| |    
T  16961345 agatcaatagaaaactcaacttatctctctggtggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcgagaaagtcgcataccacttgtagcttgtcaatta 16961246  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| ||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||||| |  ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  16961245 ccgcttaattctcaatagataaagaatccatcgaagaaaacatcaatataccatcacgttccagttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcacc 16961146  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaatta 436  Q
    || |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16961145 actttcctcttcgactgaggagaaatacactgacttgctaaaactatta 16961097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18963149 - 18962889
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  18963149 ttcaactgtcgataatcaatacataacctcatgctaccatctttcttcttaaccaacaacaccggctctccccaacgtgaaacactcggtcttacaaact 18963050  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | ||| | || ||||||||    
T  18963049 tcttatcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactcagaagccgacatacggtaaggagtcatagacacatgtttcttacccggaacaag 18962950  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaact 263  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18962949 ataaatcgaaaattcaacttccctctctggcgccacatcgggaatctcatcaggaaaaact 18962889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 10466912 - 10466293
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  10466912 tgttcaactgacggtaatcaatgcacaacctcatgctaccatccttcttcttaactaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaa 10466813  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  10466812 cttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcggaagctgacatacggtaaggtgccatcgacaccggctttgttcctggaaca 10466713  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccc-tctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatc 299  Q
    || ||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||    || ||| |||   ||||||||    
T  10466712 agttcaattgaaaattcaacttcccttttctggtggcgcatcaggaatctcatcaggaaacacttctgaaaattcattcacaactagtaacctatcaatc 10466613  T
Q  300 aca-----------ta--gataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgc 386  Q
    |||           ||  |||||  | ||||||| |||| |||| |||||  |||||||||| | ||| || |  || || |||||||| |||||  |      
T  10466612 acagcttgattttctacggataaataggccatcagagaatacatcaaaattccatcacgttccagctgtttcatctgttttgtagacaagaactcaactt 10466513  T
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||| || || || |||||  |||| ||||||||||| || || |||| ||| ||||||||    
T  10466512 caccttcttcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcggttatactctaaccaatttatcccaaaaataacatccat 10466413  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| |||| |||||| |||||||   |||| || | | |||||||||| |   |||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  10466412 acccgtcaacggtaaacaaactaaatcaaccacaaagtccctaccaaacatagataacagacaccttaaacagacaagagaagtagttactgaaccctta 10466313  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  10466312 gctggagtttcaacaaccat 10466293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 36 - 618
Target Start/End: Original strand, 18796943 - 18797538
Alignment:
Q  36 ctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttca 135  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||| | || ||||| || |||||||| || || |||||||||||||    
T  18796943 ctactatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacactcggtcttacgaacttcttatcaagcaagtcttccaattgtttcttca 18797042  T
Q  136 actcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggagg 235  Q
    | || || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||    
T  18797043 attcagcaaactcagatgctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacttccctttttggtgg 18797142  T
Q  236 cacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcaca-----------ta--gataaggaagccatcaaa 322  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||   ||||||| |||  || |||||||||           ||  |||||||| ||||||||     
T  18797143 cacatcaggaatctcatctggaaacacctcaggaaaatcatttaccactggtaacttgtcaatcacagcctgattctctaacgataaggatgccatcaat 18797242  T
Q  323 gaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgact 422  Q
    ||  |||| | |||  |||||||||||| |||||| |  || || |||| |||||| ||  | ||||| || |||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  18797243 gagtacatcagaattccatcacgttctagctgcttcatctgtttcgtagtcaaaaattcaactccaccctcttcttcagcagaagaaaaatgcactgtct 18797342  T
Q  423 tgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaa 522  Q
    ||||||| || || || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||  |||  |||| ||| || || || |  |||||    
T  18797343 tgctaaagcagtttatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccatacccgtcagcggtaaacacactaagtctacctcaaa 18797442  T
Q  523 atcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||| | | |||||||||| |  ||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18797443 atccctaccaaacatagatataggaaacctcaaacaaacaagagaagtagtcactgaacccttagctagagtttcaacaaccatctctcctttcat 18797538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14377977 - 14377706
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||    
T  14377977 ttcaactaacgataataaatgcacaacctcatactaccgtccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgagacacttggtcttacaaact 14377878  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || |||||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||    
T  14377877 tcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcccggaacaag 14377778  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatc 274  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14377777 gtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcagaaatctcatcaggaaacacttctggaaaatc 14377706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27563896 - 27563633
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27563896 tgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcctgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 27563797  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  27563796 tttcttctcaagcaattcttctaactatttcttcaactcagctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcattccaggaaca 27563697  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  27563696 agatcaatagaaaactcgacttccctctctggaggcacatctggaatttcgtctggaaaaactt 27563633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Original strand, 21473820 - 21474081
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |    
T  21473820 ttcaactgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccacggtgaaacactcggtcttacaaatt 21473919  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || | ||| |||||||| || | |||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||| |||||||||    
T  21473920 tcttataaagtaaatcctccaactatttcttcaactccgctaactcggacgccgacatacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgttctaggaacaag 21474019  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21474020 atcaattgcaaattcaacctccctctctggtggcacatcagggatctcatcaggaaaaactt 21474081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 15461554 - 15461817
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||| | |||||    
T  15461554 tgttcaactgccgatagtcaatgcacaacctcatacttccatctttcttcttcaccaataacacgggcgctccccacggcgaaacacttggtctcacaaa 15461653  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    |||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || | ||| |||||  | |||||||| ||||||    
T  15461654 ctttttatcaagcaagtcctccaactgtttctttaactcagccaactcagaagctgacatgcgatacggcgccatcgacactggtttcgttcccggaaca 15461753  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15461754 agatcaatcgagaactcaacttccctttctggtggcacatcaggaatctcatctggaaaaactt 15461817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 19455241 - 19455504
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||| || ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  19455241 tgttcaactgacgatagtcaatgcataacctcatagtaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctcctcaaggtgaaacacttggtcttacaaa 19455340  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || || |||||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |  |||| ||||| ||||||    
T  19455341 attcttatcaagcaagtcctccaaatgtttcttcaattcagctaactcggaagctgacatacggtaaggtgtcatcgacgccggctttgttcctggaaca 19455440  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19455441 aggtcaattgaaaattcaacctccctctttggtggcacatctggaatctcatccggaaaaactt 19455504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Original strand, 19437222 - 19437483
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| |||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  19437222 ttcaactgacgataatcaatgcacgacctcatgctatcgtcctttttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgagacacttggttttacaaact 19437321  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || |||||||| || || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||    
T  19437322 tattatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatgcgataaggtgtcatcgacaccggcttcgttcccggaacaag 19437421  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
     |||||  |||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19437422 gtcaattaaaaattcaacctctctttctggtggcacatctggaatctcatccggaaaaactt 19437483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Original strand, 25770064 - 25770325
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |    
T  25770064 ttcaactgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccacggtgaaacactcggtcttacaaatt 25770163  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || ||||| | ||| || || || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||  |||  ||||  |||||||||||||||| ||    
T  25770164 tcttatcaagtacatcatccaactgcttcttcaactccgctaactcaaacgccgacatacgataaggtaccattaacaccggcttcgttccaggaactag 25770263  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25770264 atcaattgcaaattcaacctccctctctggtggcacatcagggatctcatcaggaaaaactt 25770325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 468 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 23085408 - 23085258
Alignment:
Q  468 taccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagaga 567  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||    
T  23085408 taccaagaattacatccattccactcaaaggcaaacaaaccaaatcaatttcaaaatctctaccaaacatagataaaggacatcttaaacacactagaga 23085309  T
Q  568 agtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23085308 agtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctccattcat 23085258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30679070 - 30678801
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||   |||||||||||||||||| ||||| ||| | | |||    
T  30679070 tgttcaactgccggtaatctatacacaaccttatgctaccatctttcttcttaactaacaacc-cggcgctccccaaggtgagacactcggtcttataaa 30678972  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || ||||||||||| || || || || ||||||||  | || |||||||| |||||||  ||| | | |||||||||| |||| || || ||||||    
T  30678971 cttcttatcaagcaaatcttccaactgctttttcaactcatctaattcagaagccgacatacagtaaagcgccatagacacatgctttgtacccggaaca 30678872  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  30678871 agatcaatcgaaaattcaacttccctctccggcggaacatcaggaatctcatcaagaaaaacttctggaaa 30678801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 24366630 - 24366875
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  24366630 tgttcaactgacggtaatctatacacaatctcatactaccatccttcttcttgaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactaggtcttacaaa 24366729  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || || | ||  ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| |||||  |||||    
T  24366730 cttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttccttgaaca 24366829  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaa 246  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24366830 aggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaa 24366875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 24516442 - 24516214
Alignment:
Q  36 ctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  24516442 ctaccatccttcttctttaccaacaacaccggcgctccccaaggttagacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttca 24516343  T
Q  136 actcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggagg 235  Q
    |||| || |  ||  |||| ||||||||||||||||  || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||    
T  24516342 actcagcaagttcgaaagccgacatacgataaggtgctatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacctctctctccggtgg 24516243  T
Q  236 cacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24516242 cacatctagaatctcatcaggaaaaactt 24516214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21568031 - 21567796
Alignment:
Q  24 cacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctcta 123  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| || |||||||| || || |    
T  21568031 cacaatctcatgctaccatccttcttctctaccaacaatacaggcgctccccacggtgagacactcggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcttcca 21567932  T
Q  124 attgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatc 223  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || | ||| |||||  |||||||||| |||||||| |||||||| || || || ||    
T  21567931 actgtttcttcaattcagccaactcagatgctgacatacgatatggcgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaatcgagaactccacctc 21567832  T
Q  224 cctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaa 259  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21567831 cctctctggtggcacatccggaatctcatcaggaaa 21567796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8761815 - 8761557
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| | |||||    
T  8761815 tgttcaactgacgatagtcaatacacaacctcatactaccattcttcttctttaccaacaataccggcgctccccaaggcgagacacttggtcttacaaa 8761716  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||| || |  || || || ||||||||||| |||| ||| |||||  |||||||||| || |||    
T  8761715 cttcttatcaagtaagtcctccaactgtttcttcaactcagcaagttcggatgccgacatacgatatggtgccatcgacaccggcttcgttcctgggaca 8761616  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaa 259  Q
    || ||||| ||||||||||| ||  |||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  8761615 aggtcaattgaaaattcaacctctttctccggtggcacatctggaatctcatcgggaaa 8761557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 395 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 30678679 - 30678469
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactca 494  Q
    |||||||||||||| |||| || |  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  30678679 tcttcagcagaagaaaaatgcattt-cttactaaaacaattaatgtgaacatggttatactccaaccaattcataccaagtattacatccattccactca 30678581  T
Q  495 aaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 594  Q
    |||| | ||| || ||||||| |||||| || ||| ||||||| ||||  | |||  | | |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  30678580 aaggaaaacagactaaatcaacttcaaagtctcgaccaaacatcgacaacgaacacttcagacacactagagaagtagtaaccaaacccttagctggagt 30678481  T
Q  595 ttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||||    
T  30678480 ttcgacaaccat 30678469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34643647 - 34643386
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| || || | |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||    
T  34643647 ttcaactgacggtagtcaatacacaacctcatactaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgagacacttggtcttacaaact 34643548  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || || || |||||||| || ||||| || ||||| || |  ||||| || |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||| || || ||    
T  34643547 tcttgtcgagtaaatcctccaactgtttttttaactcagcaagttcagatgccgacatacgataaggtgccatcgataccggcttcgttcctggtactag 34643448  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    |||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  34643447 atcaatggagaactcaacctccctctctggtggtacatatggaatctcatccggaaaaactt 34643386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 402 - 618
Target Start/End: Original strand, 19437634 - 19437850
Alignment:
Q  402 cagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtag 501  Q
    ||||||| |||| ||| | ||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||| |     
T  19437634 cagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactctaacaagttcatcccaaaaataacatccataccagtcaaaggaaa 19437733  T
Q  502 acaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgaca 601  Q
    |||||| || || | |||||| || | | |||||||| |||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  19437734 acaaactaagtcgacttcaaagtctctaacaaacataaacaacggacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaaca 19437833  T
Q  602 accatctctccattcat 618  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  19437834 accatttctcccttcat 19437850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 314 - 606
Target Start/End: Original strand, 19455567 - 19455859
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||| || |||||||| |  || || ||||| |  |||||||| ||||  || |||| || |||||| ||||    
T  19455567 gccatcaaagaaaacataagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttagtagataggaactctgctccactctcttcttaagaagaagaaaaat 19455666  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| | ||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  |||| |||| |||||| || ||    
T  19455667 gcaccgtcttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatccatacccgtcaacggtaaacaaactaagtc 19455766  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
     | |||||| || | | ||||||||||||  | ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19455767 gacttcaaagtctctaccaaacatagacaacgaacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 19455859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 314 - 606
Target Start/End: Original strand, 21474144 - 21474436
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |  |  || |||| ||| |||||  |  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  21474144 gccatcaaggaaaacattaagatctcatcacgttctagctgcttcatctatttagtagtcaacaactcaacttcaccttcttcctcagcagaagaaaaat 21474243  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
      || | ||| |||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||| |  | ||| || | |||    
T  21474244 gtaccgtcttactaaaacaattaatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaagattacatccatacccgtcaacgacaaacatacaagatc 21474343  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
    || |||||| || | | ||||||||||||  ||||| || ||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21474344 aacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacatgagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 21474436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19487260 - 19487085
Alignment:
Q  96 acaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccag 195  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||| || |    
T  19487260 acaaacttcttatcaagtaaatcctccaactgtttcttcaactcttctaactcagacgttgacatacggtaaggcgccatcgacacaggcttcgtacccg 19487161  T
Q  196 gaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19487160 gaacaagatcaattgaaaattcaacttccctcattgctggcacatcagaaatttcatcaggaaaaacttatggaaa 19487085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 21567728 - 21567424
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    |||||||||||| |||| | |||  ||||||||| ||||||||| |  ||||| || | ||| || ||  | ||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  21567728 gccatcaaagaatacatcagaattccatcacgttttaactgcttcatctgcttcgtggtcaagaattcaactccaccctcttcttccgcagaagaaaaat 21567629  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| | ||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||  |||| |||||||| || || ||    
T  21567628 gcaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaactagttcattccaaaaatgacatccatacccgtcaacggtagacacactaagtc 21567529  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
     |   ||||||| | | |||||||||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  21567528 gaccacaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatctctcct 21567429  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  21567428 ttcat 21567424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 320 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 19487023 - 19486734
Alignment:
Q  320 aaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactg 419  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| || || || |||| ||| || || ||   ||  || || ||||||||||| |||| ||  |    
T  19487023 aaagaaaacattaagatcctatcacgttctaactgcttcagctgtttagtagtcaagaaatcagctttactatcttcctcagcagaagaaaaatgcatcg 19486924  T
Q  420 acttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttc 519  Q
     ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||  || | ||| || | ||||| |||    
T  19486923 tcttactaaaacaattcatatgaacatggttatactccaaccagttcatcccaaagattacatccatacccgtca--ggcaaacatactagatcaacttc 19486826  T
Q  520 aaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctc 611  Q
    |||||| | | ||||||||||||   |||| || ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19486825 aaaatctctaccaaacatagacaacagacaactcaaacaaacaagagaagtagttactaaacccttagctggagtttcaacaaccatttctc 19486734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 398 - 618
Target Start/End: Original strand, 25770472 - 25770692
Alignment:
Q  398 tcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaag 497  Q
    ||||||||||| ||||  | || ||| |||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||| |    
T  25770472 tcagcagaagaaaaatgtattgtcttactaaaataattaatatgaacacggttatactctaaccagttcatcccaaagattacatccatacccgtcaatg 25770571  T
Q  498 gtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 597  Q
    | | ||| || |  |||| |||||| || | | ||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| |  |||||||| ||||||| |||    
T  25770572 gcaaacatacaaggtcaacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagtgattgaaccctttgctggagattc 25770671  T
Q  598 gacaaccatctctccattcat 618  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  25770672 aacaaccatttctccattcat 25770692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Original strand, 18450761 - 18450928
Alignment:
Q  97 caaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccagg 196  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||| | || ||    
T  18450761 caaacttcttatcaagcaaatcctctaagtgctttttcaactcagctaattcggaagctgacatacggtaaggtgccatagaaacaggtttcatacccgg 18450860  T
Q  197 aacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    || ||||||||| |||||||| |  ||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18450861 aataagatcaatagaaaattctaattccctcaatggcggcacatcaggaatttcatcaggaaaaactt 18450928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14379527 - 14379394
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||    
T  14379527 ttcaactaacgataataaatgcacaacctcatactaccgtccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgagacacttggtcttacaaact 14379428  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaa 136  Q
    | || |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  14379427 tcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 14379394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 395 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 24516070 - 24515859
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactca 494  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| | ||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||| ||  |||    
T  24516070 tcttccgcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaataatgtccattcccgtca 24515971  T
Q  495 aaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 594  Q
    | |||| ||| || | ||| | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| |  |||| |||| |||||||    
T  24515970 acggtaaacacactagatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttaatgaacacttaactggagt 24515871  T
Q  595 ttcgacaaccat 606  Q
    ||| ||||||||    
T  24515870 ttcaacaaccat 24515859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 34643190 - 34643019
Alignment:
Q  447 ggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacagggg 546  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||  || |||||||| ||  |||||||||  ||||| |  || | ||||||||| | | |||||||||| |  ||    
T  34643190 ggttatactctaaccaattcatcccaaatataacatccatccccgtcaaaggtaagcaaactaggtctacttcaaaatccctaccaaacatagatatagg 34643091  T
Q  547 acatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  34643090 acatctcaaacaaacaagagaagtagtcactgaacccttagccggagtttcaacgaccatttctcctttcat 34643019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 23496255 - 23496138
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||| |||||||| || | |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  23496255 tgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttctttactatcaaaactggcgctccctaaggtgaaacacttggtctaacaaa 23496156  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatc 118  Q
     || || || ||||||||    
T  23496155 tttcttttcgagcaaatc 23496138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1646877 - 1646742
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |  || || ||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  1646877 tgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatccttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacacttggtctaataaa 1646778  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaa 136  Q
    ||  ||||||||||| || || || || ||||||||    
T  1646777 ctgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 1646742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 16380436 - 16380271
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  || || ||||| ||||||||||| ||| ||| |||    
T  16380436 tgttcaactgtcgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaa 16380337  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgata 166  Q
    ||  ||||||||||| || || || || |||||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||    
T  16380336 ctgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactccgatgcagacatccgata 16380271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 16648032 - 16647867
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  || || ||||| ||||||||||| ||| ||| |||    
T  16648032 tgttcaactgccgataatccatacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaa 16647933  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgata 166  Q
    ||  ||||||||||| || || || || |||||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||    
T  16647932 ctgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgata 16647867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 23998466 - 23998631
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  || || ||||| ||||||||||| ||| ||| |||    
T  23998466 tgttcaactgccgataatccatacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaa 23998565  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgata 166  Q
    ||  ||||||||||| || || || || |||||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||    
T  23998566 ctgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactccgatgcagacatccgata 23998631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 395 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 14377572 - 14377349
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactca 494  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||| || || || |||||  |||| ||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||  |||    
T  14377572 tcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcggttatactctaactagttcattccaaaaataacatccatacccatca 14377473  T
Q  495 aaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 594  Q
    | |  | |||||| || || | ||| || || | | ||||||||||||   |||| |||| ||| |||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||    
T  14377472 acgacaaacaaactaagtcgacttcgaagtctctaccaaacatagacaacagacaccttagacaaacaagagaagtagctactaaaccctttgctggagt 14377373  T
Q  595 ttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||    
T  14377372 ttcaacaaccatttctcctttcat 14377349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 531 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 20010974 - 20010899
Alignment:
Q  531 caaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
    |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20010974 caaaaatagacaacggacaccttaaacacacaagagaagtagttactgaacccttggctggagtttcaacaaccat 20010899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 13751939 - 13751853
Alignment:
Q  65 cggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcaga 151  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||    
T  13751939 cggcgctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaacttcttatcaagtaaatcttccaactgtttcttcaactctgctaactcaga 13751853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Original strand, 15461880 - 15462184
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||||||||||||||| |  ||  |||| ||||| |||||||| |  || || ||||  | ||||||||| ||||  || |||||   |||||| ||||    
T  15461880 gccatcaaagaaaacataaggattccatctcgttccaactgcttcaactgtttagtagttagaaactctgctccactctcttcttccatagaagaaaaat 15461979  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| | |||| |||||||||||||   |||  |||| || |||||||| ||||| || |  || |||||||| ||   ||| |||||||| || || ||    
T  15461980 gcaccgtcttgttaaaacaattaatacaaactcggttatattctaaccaattcatcccgaagataacatccatccccaacaacggtagacacactaagtc 15462079  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
     |  |||||||| | | |||||||||| |  ||||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||     
T  15462080 gacctcaaaatctctaccaaacatagataacggacaccttagacacaccagagaagtagttactgaacccttggctggagtttcaacaaccatttctcct 15462179  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  15462180 ttcat 15462184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 453 - 606
Target Start/End: Original strand, 24367083 - 24367236
Alignment:
Q  453 actctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatct 552  Q
    |||||||||| ||||||||||  || |||||||||||  | || || |||||||| ||||||||  ||||||| | | |||| ||||| |  ||||| |     
T  24367083 actctaaccaattcataccaaagataacatccatacccgtgaacggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaagatagatataggacaccg 24367182  T
Q  553 taaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
     | ||| ||||||||||| || || ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  24367183 cagacaaacaagagaagtggttactgaatccttagctggagtttcaacaaccat 24367236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 18962849 - 18962709
Alignment:
Q  308 aaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaag 407  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||  ||||||||||  || ||||| |||| ||| |||||| | ||||  || |  || |||||||    
T  18962849 aaggacgccatcaaagaaaacatcaagattccatcacactctaactgctccagctgcttagtagtcaagaactctactccactctctt--tccgcagaag 18962752  T
Q  408 agaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggtt 450  Q
    | |||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  18962751 aaaaatacaccgacttattaaaacaattaatatgaacatggtt 18962709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 410 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 5295565 - 5295509
Alignment:
Q  410 aaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttc 466  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5295565 aaatacaccgacttactaaaacaattaacatgaacatggttatactccaaccagttc 5295509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 8761491 - 8761331
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||| ||||||||||| | |||  ||||||| || |||||||| |  || || ||||  || |||||||| ||||  || ||||  |||||||| || |    
T  8761491 gccattaaagaaaacataagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttagtagttaagaactctgctccactctcttctttcgcagaagaaaatt 8761392  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaag 474  Q
     ||| | ||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8761391 gcaccgtcttgctaaagcaattgatatggacatggttatactccaaccagttcataccaag 8761331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 578 - 618
Target Start/End: Original strand, 19465976 - 19466016
Alignment:
Q  578 gaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  19465976 gaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 19466016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 302 - 330
Target Start/End: Original strand, 21755464 - 21755492
Alignment:
Q  302 atagataaggaagccatcaaagaaaacat 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21755464 atagataaggaagccatcaaagaaaacat 21755492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 439; Significance: 0; HSPs: 56)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 23073848 - 23074478
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23073848 tgttcaactgtcgatagtcaatacacaacctcatgctaccatccttcttcttccctaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 23073947  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  23073948 cttcttctcaagcaaatcttctaattgtttcttcaacttggctaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggctttgttccaagaaca 23074047  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23074048 agatcaatagaaaattcaacttccctctctggagacacatcaggaatttcatcaggaaatacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatca 23074147  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  23074148 ctgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcacgttctaactgcttcagctgcttggtagataaaaactttgcgcc 23074247  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23074248 actttcctcttcagcagaagagaaatacaccgacttactataacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccaattcataccaagaattacatccata 23074347  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23074348 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatctcaaaatcaagatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 23074447  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23074448 ctggagtttcgataaccatctctccattcat 23074478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 22734232 - 22733602
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22734232 tgttcaattgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 22734133  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22734132 ctttttctcaagtaaatcttctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagttgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaaca 22734033  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22734032 agatcaatcgaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatcagaaaatacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatca 22733933  T
Q  301 ca-------------tagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |              |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22733932 ctggttgattctcagtagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcacgttcttactgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcgcc 22733833  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22733832 actttcctcttcagcagaagagaaaaacaccgacttactataacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccaggtcataccaagaattacatccata 22733733  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22733732 ccactcaaagctagacaaaccaaatcaatctgaaaatcacgatcaaacatagacaagggacatcttatacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 22733633  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22733632 ttggagtttcgacaaccatttctccattcat 22733602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 23106186 - 23105556
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  23106186 tgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcaccagcaaaacgggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacgaa 23106087  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23106086 ctttttctcgagtaaatcctctaattgtttctttaactcggcgaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaaca 23105987  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  23105986 agatcaatagaaaactcaacttttctctctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttccggaaaatcgcataccacctgtagtttatcaatca 23105887  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23105886 ccgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaatgccatcacgttccaactacttcagctgcttagtagacaaaaactctgcgcc 23105787  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  23105786 actttcctcttcatcagaagagaaatacaccgacttactataacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcatacccagaaacacatccata 23105687  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23105686 ccgatcaaaggtagacaaactaaatccatctcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 23105587  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23105586 ctggagtttcgacaaccatttctccattcat 23105556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 24677474 - 24678102
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24677474 tgttcaactgacgataatcaatacacaacctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggtgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 24677573  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||| |    
T  24677574 cttcttctcaagcaaatcttctaactgcttcttcaactcagctaactcggaagttgacatacgataaggtgcca--gacacaggcttcgttccaggaaaa 24677671  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24677672 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacgtcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagattatcaatca 24677771  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||| |  ||||| || ||||||||||| || |||| ||| ||    
T  24677772 ctgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcgtgttccagttgcttcagctgcttggtagataagaactttgcacc 24677871  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24677872 actttcctcttcgacggaggagaaatacactgacttgctataacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 24677971  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24677972 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatctcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 24678071  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24678072 ctgaagtttcgacaaccatctctccattcat 24678102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 24705940 - 24705310
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24705940 tgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 24705841  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
      | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||| |||||||    
T  24705840 tctcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttctaggaaca 24705741  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24705740 agatcaatagaaaactcgacttctctctccggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaactttaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatca 24705641  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
                  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||    
T  24705640 ttgcctgattctcaatagataaagaagccatcaacgaaaacatcaaaataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttggtagataagaactctgcacc 24705541  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||  |||    
T  24705540 actttcctcttcgacggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcataccaagaatcatattaata 24705441  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||    
T  24705440 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaagggcatctcaaacatacgagagaagtagttaccaaacccttag 24705341  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24705340 ctggagtttcgacaaccatctctgcattcat 24705310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 17000985 - 17001615
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17000985 tgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgcttcccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 17001084  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  17001085 cttcttctcaagcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 17001184  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   | |||||||    
T  17001185 agatcaatagaaaattcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatca 17001284  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | ||||||||| |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  17001285 ctgcttgattctcaatagataaagtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 17001384  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  17001385 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 17001484  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  17001485 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 17001584  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17001585 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 17001615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 10870835 - 10871465
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10870835 tgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 10870934  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  10870935 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 10871034  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||| ||||||||||    
T  10871035 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcttatcaatca 10871134  T
Q  301 ca-------------tagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |              ||||||| | |||||| || |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  10871135 ctgcttgattctcagtagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactccgcacc 10871234  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10871235 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 10871334  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||   ||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  10871335 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaacgacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 10871434  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871435 ccggagtttcgacaaccatctctccattcat 10871465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 21143499 - 21142869
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21143499 tgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 21143400  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || |||||||||||  | || || |||||||||||||| |  || || ||||| |||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||     
T  21143399 tttcttctcaagcaaggcttccaactgtttcttcaactcagataattcggaagcagacataagataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaact 21143300  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  21143299 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatctgggaaaactttaggaaaatcacacaccacttgtagcttatcaatca 21143200  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| |||||||| || |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  21143199 ctgcttgattctcaatagataaagaagccattaacgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 21143100  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21143099 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacctagaatcacatccata 21143000  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  21142999 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcatcgaacccttag 21142900  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21142899 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 21142869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 20 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 21323705 - 21323094
Alignment:
Q  20 aatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcc 119  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||| || | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||     
T  21323705 aatacacaatctcatgctaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcagatct 21323606  T
Q  120 tctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaa 219  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  21323605 tctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagctgacatccgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaatagaaaactcga 21323506  T
Q  220 catccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------ataga 306  Q
    | || |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||             |||||    
T  21323505 cttctctctctggaggcacataaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgaagcttatcaattactgcttgattctcaataga 21323406  T
Q  307 taaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaa 406  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | ||     
T  21323405 taaagaagccctcaaagaaaacatcaaaataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcgccactttcctcttcgactgag 21323306  T
Q  407 gagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaa 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21323305 gagaaatacactgacttgctaaaacagttcatatgaacatggttgtattgcaaccaattcatacccagaatcacatccacaccgctcaaaggtagacaaa 21323206  T
Q  507 ccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
    | ||||| || || ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21323205 ctaaatccatctcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 21323106  T
Q  607 ctctccattcat 618  Q
    ||||||| ||||    
T  21323105 ctctccaatcat 21323094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 9337567 - 9338197
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9337567 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 9337666  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  9337667 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 9337766  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   | |||||||    
T  9337767 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatca 9337866  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||  | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  9337867 ctgcttgattctcaatagatatagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 9337966  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  9337967 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 9338066  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9338067 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 9338166  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9338167 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 9338197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 9486201 - 9486831
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9486201 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 9486300  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  9486301 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 9486400  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   | |||||||    
T  9486401 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatca 9486500  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||  | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  9486501 ctgcttgattctcaatagatatagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 9486600  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  9486601 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 9486700  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9486701 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 9486800  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9486801 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 9486831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 24875208 - 24874578
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24875208 tgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 24875109  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |  || || |||||  ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| ||     
T  24875108 tttcttctcaagcaaatcttccaactgtttcttcaactcagataattcggaagcaaacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccagggact 24875009  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| || || ||||||||||| ||||||||||    
T  24875008 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaagaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccacttgtagcttatcaatca 24874909  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||||| |||||| || |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  24874908 ctgcttgattctcaatagataaggtagccattaacgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 24874809  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    ||  ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24874808 actctcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaatgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 24874709  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  24874708 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttgaaacatacgagagaagtagtcaccgaaaccttag 24874609  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24874608 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 24874578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 27220001 - 27220631
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27220001 tgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 27220100  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  27220101 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 27220200  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  ||    | |||||||    
T  27220201 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtgacctgtcaatca 27220300  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | ||||||||| |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  27220301 ctgcttgattctcaatagataaagtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 27220400  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  27220401 actttcctcttcgacggaagagaaacgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 27220500  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27220501 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 27220600  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27220601 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 27220631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 24712019 - 24712649
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| | ||| || |||||||| |||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24712019 tgttcaactatcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggtgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaa 24712118  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  24712119 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgaaaccggcttcgttccaggaaca 24712218  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  ||||  |||||||||    
T  24712219 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatca 24712318  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| |||||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  24712319 ctgcttgattctcaatagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 24712418  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    ||  ||||||||  | ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  24712419 actctcctcttcgacggaagagaaatgtactgatttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 24712518  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24712519 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 24712618  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24712619 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 24712649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 27373254 - 27373884
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||  || |||||||| |||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27373254 tgttcaactgtcgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggtgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 27373353  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  27373354 cttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 27373453  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  27373454 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaagaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 27373553  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||||| ||||||||| |||||||| || ||| | || ||||  |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  27373554 ctgcttgattctcaatagataaggtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgtttcagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 27373653  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27373654 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 27373753  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27373754 ccgctcaaaggtaggcaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 27373853  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373854 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 27373884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 44384028 - 44383398
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44384028 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 44383929  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  44383928 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 44383829  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  44383828 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 44383729  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||    |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||    
T  44383728 ctgcttgattctcaatagatatattagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctacacc 44383629  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  44383628 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 44383529  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  44383528 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 44383429  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383428 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 44383398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 24264355 - 24264985
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||  || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24264355 tgttcaactgtcgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaa 24264454  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  24264455 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 24264554  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| || |||||  |||   |||||||||    
T  24264555 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaaatcacacaccaccggtaacctatcaatca 24264654  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| | |||||| || ||    
T  24264655 ctgcttgattctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagatagaaactccgcacc 24264754  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24264755 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 24264854  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24264855 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacataaacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 24264954  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24264955 ccggagtttcgacaaccatctatccactcat 24264985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 105 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 24658011 - 24657486
Alignment:
Q  105 ttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagat 204  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||| |||||||||    
T  24658011 ttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcaactaactcggaagcagacatacg-taaggtgccatcgacaccggcttcgttccacgaacaagat 24657913  T
Q  205 caatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac--- 301  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||       
T  24657912 caatagaaaactcaacttccctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatcactgc 24657813  T
Q  302 ----------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccacct 391  Q
              |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||| |    
T  24657812 ctgattctcaatagataaagaagccatcaaagaatacatcaaaataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataagaactctgctccactt 24657713  T
Q  392 tcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccac 491  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  24657712 tcctcttcgacggaagagaaatacactgactgactaaaacaattgatatgaacatggttgtactctacccaattcatatcaagaatcacatccataccgc 24657613  T
Q  492 tcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctgg 591  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24657612 tcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctgg 24657513  T
Q  592 agtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24657512 agtttcgacaaccatctctccattcat 24657486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 23204299 - 23204929
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||| |||||||| || | |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  23204299 tgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttctttactatcaaaactggcgctccctaaggtgaaacacttggtctaacaaa 23204398  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||| || |||||||||    
T  23204399 tttcttttcgagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggctttgtcccaggaaca 23204498  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  23204499 agatcaatagaaaactcgacttccctttctggaggcacatcaggaatttcatttggaaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgtagattatcaatca 23204598  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
                  ||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||| |||| ||||| |  ||||| |  ||||| ||||| || ||||||||  |    
T  23204599 ttgcttgattctcaatagacaaggaagccatcaaggaatacatcaagataccatcgcgttccatttgcttcaactgcttagtagataagaactctgcatc 23204698  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  23204699 actctcctcttcagcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccagaatcacatccata 23204798  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||  |||||||   | || || |||||||||||||||||||||||||    
T  23204799 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccattacaaaatcacgaccatccatagacaaaggacatcgcgagcatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 23204898  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23204899 ctggagtatcgacaaccatctctccattcat 23204929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 41606843 - 41606215
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||  || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41606843 tgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 41606744  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||||  |||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||| |||    
T  41606743 cttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagtagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccagggaca 41606644  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  41606643 agatcaatagaaaactcaacttctctctcaggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 41606544  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||||| |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  41606543 ctgcttgattctcaatagataaggtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactccgcacc 41606444  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  41606443 actttcctcttcgacggaagagaaatgcacagacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 41606344  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  41606343 ccgctcaaagatagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagaca-aggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 41606245  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41606244 ccggagtttcgac-accatctctccattcat 41606215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 63 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 24818236 - 24817668
Alignment:
Q  63 atcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatac 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24818236 atcggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcttgtaattatttcttcaattcggccaactcagaagctgacatac 24818137  T
Q  163 gataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaac 262  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24818136 ggtaaggcgtcatagacacaggcttcgtacccggaacaagatcaatagaaaattcaacctctctttctagaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaac 24818037  T
Q  263 ttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttct 349  Q
    || | | || || || || |||||||  |||||||| ||             |  || ||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||    
T  24818036 ttctaggaagtcgcacacaacttgtaacttatcaattactgcttgattctcaactgacaaggacgccatcaaagaaaatattaaaattccatcacgctct 24817937  T
Q  350 aactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggt 449  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||  |||  || |||||  || |||| |||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  24817936 aactgtttcagttgattagtagacaagaactctgctgcactctcttcttcgacaaaagaaaaatacaccgacttattataacaattaatgtgaacatggt 24817837  T
Q  450 tgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggaca 549  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| |  |||||    
T  24817836 tacactccaaccagttcataccaagaattacatccattctactcaaaggcaaacaaaccaaatcaatctcaaaatctctaccaaacatagataaaggaca 24817737  T
Q  550 tcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24817736 tcttagacacactagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctccattcat 24817668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 105 - 618
Target Start/End: Original strand, 16983329 - 16983855
Alignment:
Q  105 ttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagat 204  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||||||    
T  16983329 ttctcaagcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagat 16983428  T
Q  205 caatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac--- 301  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   | ||||||||       
T  16983429 caatagaaaattcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatccggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatcactgc 16983528  T
Q  302 ----------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccacct 391  Q
              |||||||| | ||||||||| |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||| |    
T  16983529 ttgattctcaatagataaagtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactt 16983628  T
Q  392 tcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccac 491  Q
    ||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  16983629 tcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccac 16983728  T
Q  492 tcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctgg 591  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16983729 tcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctgg 16983828  T
Q  592 agtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16983829 agtttcgacaaccatctctccattcat 16983855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 352 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 11351805 - 11351539
Alignment:
Q  352 ctgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttg 451  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11351805 ctgcttcagctgcttggtagataagaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatatgaacatggttg 11351706  T
Q  452 tactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatc 551  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||     
T  11351705 tactctaaccaattcatacccagaatcacatccatatcgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatt 11351606  T
Q  552 ttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11351605 tcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 11351539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 302 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 22323486 - 22323170
Alignment:
Q  302 atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcag 401  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||      
T  22323486 atagataaggtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctcttcga 22323387  T
Q  402 cagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtag 501  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22323386 cggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacctaaaatcacatccataccactcaaaggtag 22323287  T
Q  502 acaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgaca 601  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22323286 acaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgaca 22323187  T
Q  602 accatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||    
T  22323186 accatctctccattcat 22323170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 16927345 - 16927597
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16927345 tgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgcttcccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 16927444  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  16927445 cttcttctcaagcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 16927544  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatc 253  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16927545 agatcaatagaaaattcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatc 16927597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 410 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 23029497 - 23029289
Alignment:
Q  410 aaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaacca 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  23029497 aaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaaggtagacaaacta 23029398  T
Q  510 aatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctc 609  Q
    |||| || || ||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  23029397 aatccatctcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggattttcgacaaccatcac 23029298  T
Q  610 tccattcat 618  Q
    |||||||||    
T  23029297 tccattcat 23029289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 271
Target Start/End: Original strand, 23112735 - 23112994
Alignment:
Q  12 cgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaa 111  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||| ||||||||| ||| | |||||||| || ||||    
T  23112735 cgataatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgcatcccaagttgaaacactcggtcttacaaacttcttatcaa 23112834  T
Q  112 gcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcga 211  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| |     
T  23112835 gtaaatcctccaattgtttcttcaactcagctaactcagacgccgacatacggtaaggcgccatcgacacaggcttcgtacccggaacaagatcaattgt 23112934  T
Q  212 aaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  23112935 aaattcaacttccctctctagaggcacatcaggaatctcatcaggaaagacttctggaaa 23112994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 23278761 - 23279024
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| || ||||||| ||||||||| | |||||    
T  23278761 tgttcaactgacgatagtcaatgcataacctcatactaccatccttcttctttaccaataataccggcgcttcctaaggtgagacacttggtcttacaaa 23278860  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||  || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  23278861 cttcttatcaagcaagtcctacaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacgataaggtgacatcgacactggcttcgttcctggaaca 23278960  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23278961 aggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaactt 23279024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 446 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 45674012 - 45673840
Alignment:
Q  446 tggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggg 545  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||       
T  45674012 tggttgtactctaaccaattcatacccagaatcacatccataccgctcaaaggtagacaaactaaattcatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaa 45673913  T
Q  546 gacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45673912 gacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 45673840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 25255904 - 25256173
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||| | |||||    
T  25255904 tgttcaactgacgataatcaatgcataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccc-acggtgaaacacttggtcttacaaa 25256002  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || || |||||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||  ||| |    
T  25256003 tttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcgggtgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccgagaata 25256102  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25256103 agatcaattgcaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaa 25256173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 31832643 - 31832913
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  |||||||  || || ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  31832643 tgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatcctttttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaa 31832742  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || || | ||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  31832743 cttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaaca 31832842  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31832843 agatcaattgaaaattcaacctccctctccggtggcacatcaggaatctcatcagggaaaacttctggaaa 31832913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 30010622 - 30010342
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || | ||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  30010622 atacataacctcatgctaccatctttcttcttaaccaataacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaattttttatcaagcaaatctt 30010523  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    |||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||| | ||||||| |||||| | | ||||||| || |||| ||||||||| |||||||| ||    
T  30010522 ctaactgttttttcaactcagctaattcggaagctgacatatggtaaggtgccatagaaataggcttcgtacccggaataagatcaatagaaaattctac 30010423  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac 301  Q
     ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||| |  |||||||||||    
T  30010422 ttccctctctggcggcacatcaagaatttcatcagggaaaacttctggaaactcgcataccacttgcaacttatcaatcac 30010342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19717475 - 19717205
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |   |||||||||| ||||| ||||||||| | |||||    
T  19717475 tgttcaactgacggtaatcaatgcacaacctcatgctaccgtccttcttctttaccaacaacacaagcgctccccacggtgagacacttggtcttacaaa 19717376  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| || || || |||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  19717375 cttcttatcaagcaagtcttccaactgtttctttaattcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccgacttcgttcctggaaca 19717276  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    || ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  19717275 aggtcaattgaaaattcgacctccctctctagtggcacatcaggaatctcattaggaaacacttctggaaa 19717205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 30209355 - 30209075
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| |    
T  30209355 atacataacctcatgcgaccatctttcttcttaaccaataacatcggcgctccccagggcgatacactcggtcttacaaactttttatcaagcaaatctt 30209256  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
     ||| || || |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||| |||| | | | ||||||| || |||| ||||||||| |||||||| ||    
T  30209255 ttaactgctttttcaactcagctaattcggaagctgacatacggtaaggtgccatataaataggcttcgtacccggaataagatcaatagaaaattctac 30209156  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac 301  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||| |  |||||||||||    
T  30209155 ttccctctctggcggcacatcaggaatttcatcagggaaaacttctggaaactcgcataccacttgcaacttatcaatcac 30209075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 1065736 - 1065999
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  |||||||  || || ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||    
T  1065736 tgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggcgaaacactgggtcttacaaa 1065835  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || || | ||  ||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  1065836 cttcttatctaacaggtcctccaactgcttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaaca 1065935  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1065936 acatcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcttcaggaaacactt 1065999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19650508 - 19650301
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || |||| |||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  19650508 tgttcaactgacggtaatcaatacataatctcatgctaccatccttcttcttaactaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaa 19650409  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   ||| ||||| ||||||    
T  19650408 cttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccgactttgttcctggaaca 19650309  T
Q  201 agatcaat 208  Q
    || |||||    
T  19650308 aggtcaat 19650301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 23098150 - 23097846
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    |||||||||||| |||| | |||  ||||||||||||||||||| |  || || |||| ||| || ||  | ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  23098150 gccatcaaagaatacatcagaattccatcacgttctaactgcttcatctgtttcgtagtcaagaattcaactccaccctcttcttcagcagaagaaaaat 23098051  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| | ||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||  |||| |||||||| || || ||    
T  23098050 gcaccgtcttgctaaaacaattgatatgaacacggttatactctacccagttcattccaaaaatgacatccatacccatcaacggtagacacactaagtc 23097951  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
     |   ||||||| | | |||||||||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  23097950 gaccacaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatctctcct 23097851  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  23097850 ttcat 23097846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 12576338 - 12576593
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| || |||||||| ||| | |||||    
T  12576338 tgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttcttcaccaacaacacaggtgctccccacggcgaaacactgggtcttacaaa 12576437  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| |||||||||| |    
T  12576438 cttcttatcaagtaaatcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggctttgttccaggaata 12576537  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcagg 256  Q
    || ||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12576538 aggtcaattgaaaactccacctccctttctggcggcacatcaggaatctcatcagg 12576593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 27789725 - 27789980
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| || |||||||| ||| | |||||    
T  27789725 tgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttcttcaccaacaacacaggtgctccccacggcgaaacactgggtcttacaaa 27789824  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  27789825 cttcttatcaagtaaatcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggctttgttccgggaaca 27789924  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcagg 256  Q
    || ||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27789925 aggtcaattgaaaactccacctccctttctggcggcacatcaggaatctcatcagg 27789980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 253
Target Start/End: Original strand, 16924066 - 16924214
Alignment:
Q  105 ttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagat 204  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| | ||| || ||  |||||||||||||||||||||    
T  16924066 ttctcaagcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggcgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagat 16924165  T
Q  205 caatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatc 253  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16924166 caatagaaaattcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatc 16924214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23098453 - 23098218
Alignment:
Q  24 cacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctcta 123  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||| | |||| ||| || |||||||  || || |    
T  23098453 cacaatctcatgctaccatccttcttctttaccaacaacataggcgctccccacggcgagacactcggtcttacaagcttcttatcaagcacgtcttcca 23098354  T
Q  124 attgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatc 223  Q
    | ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||  |||||||||  |||||||| ||||| ||||| || || ||    
T  23098353 actgtttcttcaattcagccaactccgatgctgacatacgatatggtgccatcgacaccggcttcgttcttggaacaaggtcaattgaaaactccacctc 23098254  T
Q  224 cctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaa 259  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23098253 cctctccggtggcacatcagggatctcatcaggaaa 23098218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 395 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 19717068 - 19716846
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactca 494  Q
    ||||||||||| || |||| ||| | ||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||  |||    
T  19717068 tcttcagcagatgaaaaatgcaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaataacatccatacccgtca 19716969  T
Q  495 aaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 594  Q
    | || | |||||| || || | |||||| || | | ||||||||||||  |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19716968 acggcaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacatctcaagcaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagt 19716869  T
Q  595 ttcgacaaccatctctccattca 617  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||    
T  19716868 ttcaacaaccatttctcctttca 19716846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 425 - 618
Target Start/End: Original strand, 23113145 - 23113338
Alignment:
Q  425 ctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaat 524  Q
    ||||||||||| || | |||| |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||| || | ||| || | ||||| ||||||||    
T  23113145 ctaaaacaatttatataaacacggttatactctaaccagttcatcccaaagattacatccatacccgtcaacggcaaacatactagatcaacttcaaaat 23113244  T
Q  525 cacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    | | | ||||||||||||  ||||| || ||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  23113245 ctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacgagagaagtagttactgaacccttagttggagtttcaacaaccatttctccactcat 23113338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 421 - 606
Target Start/End: Original strand, 23274011 - 23274196
Alignment:
Q  421 cttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttca 520  Q
    ||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||| ||  |||| |||| |||||| || || | ||||    
T  23274011 cttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactctaaccagtccatcccaaaaataacatccattcccgtcaacggtaaacaaactaagtcgacttca 23274110  T
Q  521 aaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
    || || | | ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23274111 aagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 23274196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 322 - 618
Target Start/End: Original strand, 12576672 - 12576968
Alignment:
Q  322 agaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgac 421  Q
    ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||  ||  | ||||  || |||||||||||||| |||| ||| | |    
T  12576672 agaaaacatcagaattccatcacgttctaactgcttcatctgctttgtagataaaatttcaactccactctcttcttcagcagaagaaaaatgcacagtc 12576771  T
Q  422 ttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaa 521  Q
    ||| |||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||  |||| |||| ||| || || || | |||||    
T  12576772 ttgttaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccatccccgtcaacggtaaacacactaagtctacttcaa 12576871  T
Q  522 aatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||| | | |||||||||| |  ||||| || || || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  12576872 aatctctaccaaacatagaaattggacacctcaagcaaaccagagaagtagtcattgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 12576968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 563 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 22742849 - 22742794
Alignment:
Q  563 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22742849 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 22742794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 563 - 618
Target Start/End: Original strand, 23064973 - 23065028
Alignment:
Q  563 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23064973 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgataaccatctctccattcat 23065028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 377 - 570
Target Start/End: Original strand, 23279150 - 23279343
Alignment:
Q  377 aactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaa 476  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| | |||||| |||| ||| | ||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||| ||| |||| ||    
T  23279150 aactctgctccactttcttcttccgtagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactctaaccagtccatcccaaaaa 23279249  T
Q  477 ttacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagt 570  Q
    | |||||||| ||  |||| |||| |||||| || || | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  23279250 taacatccattcccgtcaacggtaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagt 23279343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 22280090 - 22280225
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| || |||||||  | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  || || ||||| || |||||||||||| ||| |||    
T  22280090 tgttcaattgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagccccccacggcgaaacacttggtctaataaa 22280189  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaa 136  Q
    ||  |||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  22280190 ctgcttctgaagcaactcttctaattgtttcttcaa 22280225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 395 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 30208971 - 30208760
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactca 494  Q
    ||||| |||||||| |||  ||| | ||| |||||||||||||| ||||||| |||  | || ||  |||||||||| || || |||||||| |||||||    
T  30208971 tcttcggcagaagaaaaacgcaccgtctttctaaaacaattaatatgaacatagttaaattccaattagttcatacctagtatcacatccatcccactca 30208872  T
Q  495 aaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 594  Q
    | || | ||| || || || | | ||||||| | ||||||||| ||||  |||||  |||| ||||| ||| || |||||||||||||||| || || ||    
T  30208871 atggcaaacagactaagtccactgcaaaatctctatcaaacatcgacaaaggacactttaagcacactagaaaattagtcaccgaaccctttgccggggt 30208772  T
Q  595 ttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||||    
T  30208771 ttcgacaaccat 30208760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 606
Target Start/End: Original strand, 20848067 - 20848192
Alignment:
Q  481 atccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaa 580  Q
    |||||||||  |||| || |||||||| ||||||||  ||||||| | | |||||||||| |  ||||| |  | ||| ||||||||||| || || |||    
T  20848067 atccatacccatcaacggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaa 20848166  T
Q  581 cccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20848167 cccttagctggagtttcaacaaccat 20848192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 322 - 475
Target Start/End: Original strand, 27790059 - 27790212
Alignment:
Q  322 agaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgac 421  Q
    ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||  ||  | ||||  || |||||||||||||| |||| ||| | |    
T  27790059 agaaaacatcagaattccatcacgttctaactgcttcatctgctttgtagataaaatttcaactccactctcttcttcagcagaagaaaaatgcacagtc 27790158  T
Q  422 ttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaga 475  Q
    ||| |||| ||||| || |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27790159 ttgttaaagcaattgatatgaactcggttatactccaaccagttcataccaaga 27790212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22323576 - 22323537
Alignment:
Q  225 ctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22323576 ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaactt 22323537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 24829646 - 24829532
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  || || ||||| || |||||||| ||| ||| |||    
T  24829646 tgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccatggcgaaacactcggtctaataaa 24829547  T
Q  101 ctttttctcaagcaa 115  Q
    ||  |||||||||||    
T  24829546 ctgcttctcaagcaa 24829532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 425 - 606
Target Start/End: Original strand, 19817269 - 19817450
Alignment:
Q  425 ctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaat 524  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||  | || |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| || | ||| || || || | | ||||||    
T  19817269 ctaaaacaattaatatgaacatagttaaattccaaccagttcatacctagtatcacatccatcccactcaacggcaaacagactaagtccactgcaaaat 19817368  T
Q  525 cacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
    | | | |||| || ||||  ||| |  | || || || |||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  19817369 ctctaccaaatatcgacaaaggaaacttcaagcatactagagaagtagtcaccgaacccttagccgggtttttgacaaccat 19817450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 166
Target Start/End: Original strand, 25130595 - 25130759
Alignment:
Q  2 gttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaac 101  Q
    ||||||||| |||||||  | || |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |   | || ||||| || |||||||||||  ||| ||||    
T  25130595 gttcaactgccgataatccacactcaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactagagcaccccacggagaaacacttggcctaataaac 25130694  T
Q  102 tttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgata 166  Q
    |  ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||    
T  25130695 tgcttctcaagcaactcttctaactgcttcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgata 25130759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 436; Significance: 0; HSPs: 100)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 17491823 - 17492454
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  17491823 tgttcaaatgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaaccggcgctccccaaggcgaaaaacttggtctaacaaa 17491922  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17491923 ctttttctcaagtaaatcttctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaaca 17492022  T
Q  201 agatcaatcgaaaa-ttcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatc 299  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17492023 agatcaatcgaaaaattcaacttccctctttggaggcacatcaggaatttcatcaggaaatacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatc 17492122  T
Q  300 ac-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgc 386  Q
    ||             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  17492123 actgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcacgttctaactgcttcagctgcttagtagacaaaaactccgcgc 17492222  T
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17492223 cactttcctcttcagcagaagagaaatacacagatttactaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 17492322  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  17492323 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatctcaaaatcacgatcaaacataaacaagggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaactcttc 17492422  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17492423 gctggagtttcgacaaccatctctccattcat 17492454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 14579563 - 14578935
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    ||||||| |||||||| ||| || ||||| || || ||||| |||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  14579563 ttcaactatcgataatcaatgcataacctcatactgccatctttcttctttactaacaaaacgggcgctccccaaggcgaaacacttggtcttacaaact 14579464  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14579463 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcagtcaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaacaag 14579364  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| || ||||||||     
T  14579363 atcaatagaaaattcaacttccctttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttcagggaaatcgcataccacttgtagcttgtcaatcacc 14579264  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                ||||||||  | ||||| || || ||||||| |||  |||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  14579263 gctcgattctcaatagataaatatgccattaaggagaacattagaattccatctcgttctaactgcttcagctgcttagtagataaaaattctgcgccac 14579164  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14579163 tttcctcttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcatacctagaatcacatccatacc 14579064  T
Q  490 actcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagct 589  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || | ||||||||| || ||||||||||||    
T  14579063 actcaaaggcaaacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacatactatagaagtagttactgaacccttagct 14578964  T
Q  590 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14578963 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 14578935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 12844260 - 12843630
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12844260 tgttcaactgtcgatagtcaatgcacaacctcatactaccatctttcttcttcactaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 12844161  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |  |||    
T  12844160 cttcttatcaagcaaatcttctaattgtttcttcaactcagccaactcataagctgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacccgataca 12844061  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||| ||||||||||    
T  12844060 agatcaattgaaaattcaacttctctttctggacgcacatcaggaatttcagcaggaaaaacttctggaaaatcacatacaacctatagcttatcaatca 12843961  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| || | ||||||    
T  12843960 ccgcttgattctcaatagacaaggatgctatcaaagaaaacatcaaaattccatcacgttctaactgcttctgctgcttagtagacaagaattatgcgcc 12843861  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  12843860 actttcctcttcagcataagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcatacccaggattacatccata 12843761  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12843760 ccactcaaaggtaaacaaaccaagtcaatttcaaaatcacgatcaaacataaacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcactgaaccattag 12843661  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  12843660 ctggagtttcaacaatcatctctccattcat 12843630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 15261603 - 15262233
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||| || || |||||||| |||||||| || | ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |  ||||    
T  15261603 tgtttaactgtcgataatcaatgcacaatctcatactaccatctttcttcttaactagcaatatcggcactccccaatgtgaaacatttggtcttgcaaa 15261702  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  15261703 cttcttatcaagcaagtcttctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagccgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgttcctagaaca 15261802  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    || ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| || || || ||||  ||||||||||    
T  15261803 aggtcaatcgaaaatttaacttctctttctggaggcacattaggaatttcatcaagaaaaacttctgggaaatcacacacaacctgtaacttatcaatca 15261902  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
                  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15261903 ttgcttgattctcaatagacaaggacgccatcaaagaaaacatcaaaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcgcc 15262002  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  15262003 actttcttcttcagtagaagaaaaatacactgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcacaccaaggattacatccatt 15262102  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15262103 ccactcaaaggtaaacaaaccaaatcaatttcaaaatctcgaccaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccattag 15262202  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15262203 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 15262233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 474
Target Start/End: Original strand, 18437113 - 18437599
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18437113 tgttaaactgtcgataatcaatacacaatctcatcctaccatctttcttcttcactagcaaaaccggcgctccccaaggcgaaacacttggtctaacaaa 18437212  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  18437213 ctttttctcaagtaaatcttctaattgttttttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacataggcttcgttccaagaaca 18437312  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18437313 agatcaatagaaaattcaacttccctctctggagccacatcaggaatttcatcaggaaatacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatca 18437412  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  18437413 ccgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacattaagattccatcacgttctaactgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 18437512  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaag 474  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18437513 actttcctcttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattactatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaag 18437599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 3 - 618
Target Start/End: Original strand, 16694139 - 16694767
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||| |||||||| || | |||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  16694139 ttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttagtctaacaaatt 16694238  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||    
T  16694239 tcttttcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatctacaccggcttcgttccaggaacaag 16694338  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||     
T  16694339 atcaatagaaaactcaacttccctctctggaggcacatctggaatttcatctggaaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgtagcttatcaatcact 16694438  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  16694439 gcttaattctcaatagataacgaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcaccac 16694538  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
     |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||    
T  16694539 tttcctcttcagcggaagagaaatacattgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccataattaaatccaaacc 16694638  T
Q  490 actcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagct 589  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16694639 gctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcacagaacccttagct 16694738  T
Q  590 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16694739 ggagtctcgacaaccatctctccattcat 16694767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 24185163 - 24185793
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |  |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24185163 tgttcaactgtcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagtaaaaccggtgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 24185262  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |  || || ||||| |||||||||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||||    
T  24185263 tttcttctcaagcaaatcttccaactgtttcttcaactcagataattcggaagcagacatacgataaggtgccatcaacaccggcttcgttccaggaaca 24185362  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24185363 agatcaatagaaaactcaacttccctctctggaggcacatcatgaatttcatttggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatca 24185462  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |  ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  24185463 ctgcttgattctcaatagataaagaagccattaaagaaaacatcaaaataccatcacgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcacc 24185562  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  24185563 actttcctcttcggcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatatgaacatggttgtactccaaccaattcatacccagaatcacatccata 24185662  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |  ||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  24185663 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacaacgcaaacatacgagagaagtagtcaccaaacccttag 24185762  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24185763 ctggagtttcaacgaccatctctccattcat 24185793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 16805104 - 16804474
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16805104 tgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 16805005  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||| |||||| |||      
T  16805004 tttcttttcaagcaaatcttctaactgtttcttcaacttagccaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggctttgttccaagaatc 16804905  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  16804904 agatcaatagaaaactcaacttccctctctagaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgtagcttatcaatca 16804805  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             | |||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  16804804 ctgcttgattctcaaaagataaagaagccatcaaaggatacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 16804705  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  16804704 actttcctcttcaacggaagagaaatacactgacttggtaaaataattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccagaatcacatccata 16804605  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  || || || ||||||||||||||| |||||||||    
T  16804604 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacagaagacatcgcaagcatacgagagaagtagtcaccaaacccttag 16804505  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16804504 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 16804474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 48427420 - 48428050
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48427420 tgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 48427519  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  48427520 cttcttctcaagcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 48427619  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   | |||||||    
T  48427620 agatcaatagaaaattcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatca 48427719  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | ||||||||| |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  48427720 ctgcttgattctcaatagataaagtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 48427819  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  48427820 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaataattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 48427919  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  48427920 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 48428019  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48428020 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 48428050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 3687916 - 3688546
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3687916 tgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 3688015  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || || ||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  3688016 cttcttttcgagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 3688115  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  ||||  |||||||||    
T  3688116 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcgcacaccaccggtagcctatcaatca 3688215  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  3688216 ctgcttgattctcaatagataaagaagccatcaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 3688315  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  3688316 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactgtaaccagttcatacccaaaatcacatccata 3688415  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  3688416 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 3688515  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3688516 ccggagtttcgacaaccatctctccattcat 3688546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 20060211 - 20059581
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20060211 tgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaa 20060112  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  20060111 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 20060012  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  20060011 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 20059912  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  20059911 ctgcttgattctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 20059812  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  20059811 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 20059712  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20059711 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatactagagaagtagtcaccgaacccttag 20059612  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20059611 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 20059581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 12888682 - 12889312
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12888682 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 12888781  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  12888782 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 12888881  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  12888882 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 12888981  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  12888982 ctgcttgattctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 12889081  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  12889082 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 12889181  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12889182 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 12889281  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889282 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 12889312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 15587549 - 15586919
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15587549 tgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 15587450  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  15587449 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 15587350  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  15587349 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 15587250  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  15587249 ctgcttgattctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 15587150  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15587149 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 15587050  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15587049 ccattcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 15586950  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15586949 ccggagtttcgacaaccatctctccattcat 15586919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 10007573 - 10008203
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10007573 tgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 10007672  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || ||  ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  10007673 cttcttctcaagcaagtcttccaaccgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 10007772  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   || ||||||    
T  10007773 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctaccaatca 10007872  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  10007873 ctgcttgattctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagttgcttagtagataaaaactctgcacc 10007972  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  10007973 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 10008072  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  10008073 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcgaaatcgcgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 10008172  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10008173 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 10008203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 15346402 - 15345772
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15346402 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaa 15346303  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  15346302 cttcttctcaagcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 15346203  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  15346202 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 15346103  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | ||||||||| |||||||| || ||| | || ||||  |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  15346102 ctgcttgattctcaatagataaagtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgtttcagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 15346003  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  15346002 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatcctta 15345903  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15345902 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 15345803  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15345802 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 15345772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 15714213 - 15713583
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||  || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15714213 tgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 15714114  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  15714113 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 15714014  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||| || |||||  |||   |||||||||    
T  15714013 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatcccatctggaaaaacttcaggaaaatcacacaccaccggtaacctatcaatca 15713914  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | | |||| || |||||||| || ||||| || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  15713913 ctgcttgattctcaatagataaagtatccattaacgaaaacatcaagatatcgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 15713814  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15713813 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 15713714  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15713713 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 15713614  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15713613 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 15713583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 16637746 - 16638376
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16637746 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 16637845  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  16637846 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 16637945  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   | |||||||    
T  16637946 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatca 16638045  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||  | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  16638046 ctgcttgattctcaatagatatagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 16638145  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  16638146 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 16638245  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16638246 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 16638345  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16638346 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 16638376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 16754858 - 16754228
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16754858 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaacctgcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 16754759  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||  || || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||   | ||||||||||||||    
T  16754758 cttcttttctagcaagtcctccaactgtttcttcaactcggataattctgaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccgacgtcgttccaggaaca 16754659  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  ||||  |||||||||    
T  16754658 agatcaatagaaaactcgacttccctctctggaggcacatcaggaatctcatccggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatca 16754559  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             | |||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16754558 ctgcttgattctcaaaagataaagaagccatcaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcacc 16754459  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||| ||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16754458 actttcctcctcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 16754359  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16754358 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacagaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 16754259  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16754258 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 16754228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 26791570 - 26790940
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26791570 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttgatctaacaaa 26791471  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  26791470 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 26791371  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   | |||||||    
T  26791370 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatca 26791271  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||||| |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  26791270 ccgcttgattctcaatagataaggtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 26791171  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26791170 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 26791071  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  26791070 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 26790971  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26790970 ccggagtttcgacaaccatctctccattcat 26790940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 43164648 - 43165278
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43164648 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 43164747  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  43164748 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 43164847  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   | |||||||    
T  43164848 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatca 43164947  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||  | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  43164948 ctgcttgattctcaatagatatagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 43165047  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  43165048 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 43165147  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  43165148 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 43165247  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43165248 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 43165278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 10908183 - 10908813
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10908183 tgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactatcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 10908282  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  10908283 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 10908382  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   || ||||||    
T  10908383 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctaccaatca 10908482  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  10908483 ctgcttgattctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 10908582  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  10908583 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 10908682  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  10908683 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcgaaatgacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 10908782  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10908783 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 10908813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 13254663 - 13255293
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  13254663 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaa 13254762  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  13254763 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaacttagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 13254862  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   | |||||||    
T  13254863 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatca 13254962  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  13254963 ctgcttgattctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 13255062  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  13255063 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 13255162  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  13255163 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 13255262  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255263 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 13255293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 15400674 - 15400044
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15400674 tgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 15400575  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||  || || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  15400574 tttcttctcgagcaaatcttccaactgtttcttcaactcggataattcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcccggaaca 15400475  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || ||||||||||| ||||||||||    
T  15400474 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccacttgtagcttatcaatca 15400375  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             | |||||| | |||||| || |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  15400374 ctgcttgattctcaacagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 15400275  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    ||  | ||||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15400274 actcttctcttcgacggaagaaaaatgcactgacttactaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaattacatccata 15400175  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  15400174 ccgctcaaaggcagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaaccctaag 15400075  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15400074 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 15400044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 15358056 - 15358686
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15358056 tgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaatcggcgctccccaaggtgaaatacttggtctaacaaa 15358155  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||  || || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  15358156 tttcttctcgagcaaatcttccaactgtttcttcaactcggataattcggaagcagacatacgataaggtgccattgacaccggcttcgttcccggaaca 15358255  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    ||||||||  |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || ||||||||||| ||||||||||    
T  15358256 agatcaatacaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccacttgtagcttatcaatca 15358355  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             | |||||| | |||||| || |||||||| || ||| ||||  |||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  15358356 ctgcttgattctcaacagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccatcgtgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 15358455  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    ||  ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15358456 actctcctcttcgacggaagaaaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgcactctaactagttcatacccagaattacatccata 15358555  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15358556 ccgctcaaaggcagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 15358655  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15358656 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 15358686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 4 - 618
Target Start/End: Original strand, 6602712 - 6603338
Alignment:
Q  4 tcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactt 103  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6602712 tcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggcctaacaaactt 6602811  T
Q  104 tttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaaga 203  Q
     || |||||||| ||||| || |||||||||||||| |  || || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  6602812 cttttcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataattctgaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaaga 6602911  T
Q  204 tcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-- 301  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  | ||  ||||||||||      
T  6602912 tcaatagaaaactcgacttccctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggcagcctatcaatcactg 6603011  T
Q  302 -----------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccacc 390  Q
               | |||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  6603012 cttgattctccacagataaagaagccatcaatgaaaacatcaaaataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccact 6603111  T
Q  391 ttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacca 490  Q
    |||||||||  | ||||||||||  | |||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6603112 ttcctcttcgacggaagagaaatgtattgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactc-aaccagttcatacccagaatcacatccatacca 6603210  T
Q  491 ctcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctg 590  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603211 ctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctg 6603310  T
Q  591 gagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  6603311 gagttttgacaaccatctctccattcat 6603338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 53383175 - 53382545
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||  ||  ||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53383175 tgttcaacggccgataatcaatacacaaccgcatagtaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 53383076  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| |  || || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  | |||||||||||||||    
T  53383075 cttcttttcaagcaaatcctccaactgtttcttcaactcagataattctgaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggtttcgttccaggaaca 53382976  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||| | ||||  |||||||||    
T  53382975 agatcaatagaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccattggtagcctatcaatca 53382876  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             | |||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| ||    
T  53382875 ctgcttgattctcaacagataaagaagccatcaaggaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgtttggtagacaaaaactctgcacc 53382776  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  53382775 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactccaaccagttcatacccaaaatcacatccata 53382676  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  53382675 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 53382576  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53382575 ctggagtttcgacaatcatctctccattcat 53382545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 5423087 - 5422457
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5423087 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 5422988  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  5422987 cttcttttcaagcaagtcctccaattgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 5422888  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  5422887 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctagaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 5422788  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||  | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  5422787 ctgcttgattctcaatagatatagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 5422688  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  5422687 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 5422588  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  5422587 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaagacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 5422488  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5422487 tcggagtttcgacaaccatctctccattcat 5422457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 129 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 14874597 - 14874095
Alignment:
Q  129 ttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctct 228  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  14874597 ttcttcaactcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaatagaaaactcaacttctctct 14874498  T
Q  229 ctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagataaggaagc 315  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||             || ||||| |||||    
T  14874497 ctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatcactgcttgattctcaattgataaagaagc 14874398  T
Q  316 catcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatac 415  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||||| |  ||||| || ||||| ||| |||| |||||||| |||  |||||||||  | || |||||||||    
T  14874397 catcaaagaaaacatcaatataccatcacgttccagttgcttcagctgcttagtaaacaagaactctgcaccaatttcctcttcgactgaggagaaatac 14874298  T
Q  416 actgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaa 515  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  14874297 actgacttgctaaaataattaatatgaacatggttctactcgaaccagttcatacccagaatcacatacataccgctcaaaggtagacaaactaaatcca 14874198  T
Q  516 tttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccatt 615  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||  | || | | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14874197 tctcaaaatcacgaccaaacatagacaaagaacttttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccatt 14874098  T
Q  616 cat 618  Q
    |||    
T  14874097 cat 14874095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 11888508 - 11888024
Alignment:
Q  4 tcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactt 103  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11888508 tcaactgtcgataatcaatgcataacctcatgctaccgtctttcttcttaactaacaaaatcggcactccccaaggtgaaacacttggtcttacaaactt 11888409  T
Q  104 tttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaaga 203  Q
     || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  11888408 cttatcaagcaaatcttctaattgtttcttcaactcggacaactcagaagccgacatatggtaaggcgtcatagacacatgcttcgtaccaggaacaaga 11888309  T
Q  204 tcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-- 301  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||  |||||||| ||      
T  11888308 tcaatcgaaaattcaacctctctttctggcggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatgggaaatcacgcaccacttataacttatcaattactg 11888209  T
Q  302 -----------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccacc 390  Q
               | ||| ||||| |  |||||||||||||| || ||  |||| || |||||||| || || ||||| |||| |||||||||||| ||||     
T  11888208 cttgattctcaacagacaaggacggaatcaaagaaaacatcaagattccatcccgctctaactgtttcagctgcttagtagtcaaaaactctgctccact 11888109  T
Q  391 ttcctcttcagcagaag-agaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaag 474  Q
     || |||||| |||||| | ||||| || || ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||    
T  11888108 ctcttcttcaacagaagaaaaaatataccgatttattaaaacaattaatatgaacatggttatactccaactagttcttaccaag 11888024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 353 - 618
Target Start/End: Original strand, 15065409 - 15065674
Alignment:
Q  353 tgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgt 452  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  15065409 tgcttcagctgcttggtagataagaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatacactgactttctaaaacaattgatatgaacatggttgt 15065508  T
Q  453 actctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatct 552  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||  |||||| |    
T  15065509 actctaaccaattcataccaagaatcacatccataccgctcaaaggtagacaaactaaatccatctcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacattt 15065608  T
Q  553 taaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15065609 caaacaaacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagattcgacaaccatctctccattcat 15065674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 14291658 - 14291048
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||| ||||||||||| ||| | ||||| || || ||||| ||||| |    
T  14291658 atactcaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgcttcccacggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatcaagtaaatctt 14291559  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || |||||||| ||||| || | ||| || || |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  14291558 ccaactgtttctttaactcagctatctcggacgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccgggcacaagatcgattgaaaattcaac 14291459  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcaca--tagat----------- 307  Q
     ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    |||| | | | | |||||||||||  | |||               
T  14291458 ctccctttctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcattcaccaatggaaatctatcaatcacagcttgattctccaatgac 14291359  T
Q  308 aaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaag 407  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||| || |||| ||| ||||| ||  |||  || |||||| ||  ||    
T  14291358 aagtatgccatcaaagaaaacattaagattccatcacgttctaactgcttcaattgtttagtagtcaagaactcagcttcactctcttcttcaacaagag 14291259  T
Q  408 agaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaac 507  Q
    | |||| ||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||   ||| || | ||| ||    
T  14291258 aaaaatgcaccgtcttactaaagcaattaatatgaacatggttatactctaaccagttcatcccaaaaatcacatccatacccgacaacggcaaacatac 14291159  T
Q  508 caaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatc 607  Q
     | ||| | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  14291158 aagatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatt 14291059  T
Q  608 tctccattcat 618  Q
    ||||| |||||    
T  14291058 tctcctttcat 14291048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 618
Target Start/End: Original strand, 15229606 - 15230216
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| || || ||||| |||||||    
T  15229606 atacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccaaggtgaaactctcggtcttacaaatttcttgtcaagtaaatcct 15229705  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  15229706 ccaactgtttcttcaactcagctaactcagacgccgacatacggtaaggcgccatcgacacaggcttcgtacccggaacaagatcaattgaaaattcaac 15229805  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcaca--tagat----------- 307  Q
     || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    || ||  | | | |||||||||||  | |||               
T  15229806 ctctctctctggcggtacatcgggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcattcacaaccggcaatctatcaatcacagcttgattctccaacgac 15229905  T
Q  308 aaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaag 407  Q
    ||| | |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |  || || || | ||| ||||| ||   ||  || || ||||||||||    
T  15229906 aagtatgccatcaaggaaaacattaagatcccatcacgttctaactgtttcaactgtttagtggtcaagaactcagctttactctcttcctcagcagaag 15230005  T
Q  408 agaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaac 507  Q
    | ||||  || | ||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||  | || || | ||| ||    
T  15230006 aaaaatgtaccgtcttactaaaacaattgatatgaacacggttatactctaactagttcatcccaaagattacatccatacccgttaacggcaaacatac 15230105  T
Q  508 caaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatc 607  Q
     | ||||| ||||||||| | |  |||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  15230106 aagatcaacttcaaaatctctacaaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttaatgaacccttagctggagtttcaacaaccatt 15230205  T
Q  608 tctccattcat 618  Q
    |||||| ||||    
T  15230206 tctccactcat 15230216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 618
Target Start/End: Original strand, 15235474 - 15236084
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| || || ||||| |||||||    
T  15235474 atacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccaaggtgaaactctcggtcttacaaatttcttgtcaagtaaatcct 15235573  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  15235574 ccaactgtttcttcaactcagctaactcagacgccgacatacggtaaggcgccatcgacacaggcttcgtacccggaacaagatcaattgaaaattcaac 15235673  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcaca--tagat----------- 307  Q
     || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    || ||  | | | |||||||||||  | |||               
T  15235674 ctctctctctggcggtacatcgggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcattcacaaccggcaatctatcaatcacagcttgattctccaacgac 15235773  T
Q  308 aaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaag 407  Q
    ||| | |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |  || || || | ||| ||||| ||   ||  || || ||||||||||    
T  15235774 aagtatgccatcaaggaaaacattaagatcccatcacgttctaactgtttcaactgtttagtggtcaagaactcagctttactctcttcctcagcagaag 15235873  T
Q  408 agaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaac 507  Q
    | ||||  || | ||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||  | || || | ||| ||    
T  15235874 aaaaatgtaccgtcttactaaaacaattgatatgaacacggttatactctaactagttcatcccaaagattacatccatacccgttaacggcaaacatac 15235973  T
Q  508 caaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatc 607  Q
     | ||||| ||||||||| | |  |||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  15235974 aagatcaacttcaaaatctctacaaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttaatgaacccttagctggagtttcaacaaccatt 15236073  T
Q  608 tctccattcat 618  Q
    |||||| ||||    
T  15236074 tctccactcat 15236084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 262
Target Start/End: Original strand, 17493665 - 17493890
Alignment:
Q  37 taccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaa 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  17493665 taccatccttcttcttaaccaacaatatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 17493764  T
Q  137 ctcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggc 236  Q
     || || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||    
T  17493765 ttcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccctctcttgtggc 17493864  T
Q  237 acatcaggaatctcatcaggaaaaac 262  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17493865 acatctggaatctcatcaggaaaaac 17493890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16826407 - 16826164
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  16826407 atacacaacttcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccacggtgaaacacttggtttcacaaatttcttatcaagcaagtcct 16826308  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||    
T  16826307 ccaactgtttcttcaactcagctaactcggacgccgacatacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggttaattgaaaattcaac 16826208  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16826207 ctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaactt 16826164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11959315 - 11959070
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  11959315 tgttcaactgacggtagtcaatgcacaacctcatgctaccatccttcttcttaactaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaa 11959216  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  11959215 cttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtaaggtgccatcgacaccagctttgttcctggaaca 11959116  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaa 246  Q
    || |||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  11959115 aggtcaattaaaaattcaacctccctttctggtggcacatcaggaa 11959070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 47125927 - 47126197
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  |||||||  || || ||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  47125927 tgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttactaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaa 47126026  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    |||||| || | ||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  47126027 ctttttatctaacagttcctccaactgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaaca 47126126  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  47126127 agatcaattgaaaattcaacctccctttctggtggcacatcaggaatctcatcagggaatacttctggaaa 47126197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5108768 - 5108549
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  5108768 tgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaa 5108669  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  5108668 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagatagctcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 5108569  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  5108568 agatcaatagaaaattcaac 5108549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12358669 - 12358410
Alignment:
Q  5 caactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaacttt 104  Q
    |||||| | ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  12358669 caactgacaataatcaatgcataacctcatgctaccatccttcttcttaaccatcaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttc 12358570  T
Q  105 ttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagat 204  Q
    || |||||| | |  || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||   ||||||||| |||||||| |    
T  12358569 ttatcaagctagttgtccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacgataaggtgccatcggcaccgacttcgttcctggaacaaggt 12358470  T
Q  205 caatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12358469 caattgaaaattcaacctccctttctggtggcacatctggaatctcatccggaaaaactt 12358410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 31940886 - 31941149
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| | |||||||||  || | |||||    
T  31940886 tgttcaactgacgatagtcaatgcacagcctcatgctaccgtccttcttctttaccaacaataccggcgctccccacgatgaaacactgtgtcttacaaa 31940985  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| || || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  31940986 cttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatgcgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcccggaaca 31941085  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31941086 aggtcaattgaaaattcaacctccctttctggtggcacatctggaatctcatccggaaaaactt 31941149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Original strand, 28756336 - 28756572
Alignment:
Q  36 ctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctcccc-aaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttc 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||| || | ||  ||||| || |||||||||    
T  28756336 ctaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctcccccaaggtgaaacactgggtcttacaaactttttatctaacaggtcctccaactgtttcttc 28756435  T
Q  135 aactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggag 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  28756436 aactcagccaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaagatcaattgaaaattcaacctccctttctggtg 28756535  T
Q  235 gcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  28756536 gcacatcaggaatctcatcagggaatacttctggaaa 28756572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31693331 - 31693068
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||    
T  31693331 tgttcaactgacgatagtcaatgcacagcctcatgctaccgtccttcttctttaccaactatatcggcgctccccacggtgaaacactgggtcttacaaa 31693232  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| || || || |||||| |||| || || ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  31693231 cttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcgtcaattcagctaactcagaagctgacatgcgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcccggaaca 31693132  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    || ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  31693131 aggtcaattgaaagttcaacctccctttctggtggcacatctagaatctcatccggaaaaactt 31693068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 15013893 - 15013285
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | | |||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| || ||||||||||| |    
T  15013893 atacacaacctcatgctaccatctttcttcttaaccaacaacaccagcgctccccaaggtgacacactcggtcttacaaacttcttttcaagcaaatctt 15013794  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    |||| || || |||||||| || || || |||||||||||| | ||||||| ||| |||| | |||| || || |||| |||||||||||| ||||| ||    
T  15013793 ctaactgctttttcaactcagctaattccgaagctgacatatggtaaggtgccatcgacataggctttgtacctggaataagatcaatcgacaattctac 15013694  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagat 307  Q
     ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || || |||||||  |  |||||| ||||             |||||     
T  15013693 ctccctttctagaggtacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaattcacacaccacttccaacttatcattcactgcttgattctcaatagac 15013594  T
Q  308 aaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaag 407  Q
    | |||  ||||||| ||||||||| | ||  ||||||    ||| ||||| |  |||||||||| ||| ||||| |   ||||||| |||||||||||||    
T  15013593 agggacaccatcaacgaaaacatttagattccatcactcattaattgcttcaactgcttggtagtcaagaactcagtttcaccttcttcttcagcagaag 15013494  T
Q  408 agaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaac 507  Q
    | |||  ||| | ||| ||||||||||| || ||||||| |||  |||| ||  |||||||||| || || |||||||| |||||||| || ||| | ||    
T  15013493 aaaaacgcaccgtcttactaaaacaatttatatgaacatagttaaactccaagtagttcatacctagtatcacatccattccactcaacggcaga-atac 15013395  T
Q  508 caaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatc 607  Q
     || || | | ||||| | | | ||||||| ||||  |||||  | || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  15013394 taagtccactgcaaaa-ctctaccaaacatcgacaaaggacacttcaagcatactagagaagtagtcaccgaacccttagctggggtttcgacaaccatt 15013296  T
Q  608 tctccattcat 618  Q
    || ||||||||    
T  15013295 tccccattcat 15013285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11950052 - 11949791
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| ||||| | ||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  11950052 ttcaactgacgatagtcaatgcataacctcatactaccatccttcttctttaccaacaataccgacgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaact 11949953  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || |||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||  |||||||    
T  11949952 tcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctagaacaag 11949853  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11949852 gtcaattgaaaattcaacctccctttccgatggtacatctggaatctcatcaggaaaaactt 11949791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 13944007 - 13944265
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  13944007 tgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttcttcaccaacaacacaggtgctccccacggtgaaacactgggtctaacaaa 13944106  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  13944107 cttcttatcaagtaaatcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggctttgttccgggaaca 13944206  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaa 259  Q
    || ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  13944207 aggtcaattgaaaactccacctccctctctggcggcacatcgggaatctcatcaggaaa 13944265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 271
Target Start/End: Original strand, 12272334 - 12272591
Alignment:
Q  14 ataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagc 113  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||| || || ||||||    
T  12272334 ataatcaatgcataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaatatcggcgctccccaagttgaaacactgggtcttacaaatttcttatcaagc 12272433  T
Q  114 aaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaa 213  Q
    || ||| | || |||||||||||||| || |||||  | || |||||||| ||||||| ||| |||||   ||||||||| |||||||  || || ||||    
T  12272434 aagtcccccaactgtttcttcaactcagctaactcgaacgccgacatacggtaaggtgccatcgacaccgacttcgttcctggaacaatgtcgattgaaa 12272533  T
Q  214 attcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12272534 attcaacctccctctctggtggcacatctgaaatctcatcaggaaaaacttctggaaa 12272591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18132466 - 18132229
Alignment:
Q  27 aaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaatt 126  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||| |  || || |    
T  18132466 aacctcatactaccatccttcttctttaccaacaatacaggcgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtgttccaact 18132367  T
Q  127 gtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccct 226  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  18132366 gtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaataaggtcaattgaaaattcaacctccct 18132267  T
Q  227 ctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
     ||||| |||||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  18132266 ttctggtggcacatttggaatctcatccgaaaaaactt 18132229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 353 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 26191108 - 26190937
Alignment:
Q  353 tgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgt 452  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  26191108 tgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgt 26191009  T
Q  453 actctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaat 524  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26191008 actctaaccagttcatacctagaatcacatccataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaat 26190937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 44779230 - 44779485
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| || |||||||| ||| | |||||    
T  44779230 tgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttcttcaccaacaacacaggtgctccccacggcgaaacactgggtcttacaaa 44779329  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||||||||||    
T  44779330 cttcttatcaagtaaatcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggctttgttccaggaaca 44779429  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcagg 256  Q
    || ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44779430 aggtcaattgaaaactccacctccctctctggcggcacatcaggaatctcatcagg 44779485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 10407951 - 10408221
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  |||||||  || || ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  10407951 tgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttcttgaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaa 10408050  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || || | ||  ||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  10408051 cttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagctaattcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaaca 10408150  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  10408151 aggtctattgaaaactcaacttccctctctggtggcacatcaggaatctcatcagggaatacttctggaaa 10408221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 10418191 - 10417561
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||||| || |  || |||||||| || |||||||| ||| | |||||    
T  10418191 tgttcaactgacgatagtcaatgcacaacctcatacttccatctttctttttcaccaataacacgggtgctccccacggcgaaacactaggtctcacaaa 10418092  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || | ||| |||||  | |||||||| ||||||    
T  10418091 cttcttatcaagcaagtcctccaactgtttctttaactcagccaattcagaagctgacatgcgatacggcgccatcgacactggtttcgttcccggaaca 10417992  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||    |||||| ||||| | || ||||    
T  10417991 agatcaatcgagaactcaacttctctttctggtggcacatcaggaatctcgtctggaaaaacttcgggaaattcattcaccactggtagtctgtcgatca 10417892  T
Q  301 ca-----------ta--gataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    ||           ||  || || || ||||||||||||||||| | |||  |||| ||||| |||||||| |  || || ||||  | ||||||||| ||    
T  10417891 cagcttgattctctaacgacaatgatgccatcaaagaaaacataagaattccatctcgttccaactgcttcaactgtttagtagttagaaactctgctcc 10417792  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    ||  || |||||  ||||||| || | ||| | |||| |||||||||||||   |||   ||| ||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||     
T  10417791 actctcttcttccacagaagaaaagtgcaccgtcttgttaaaacaattaatacaaactcagttatactctaaccaattcatcccgaaaataacatccatc 10417692  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||   ||| |||||||| || || || |  || ||||| | | ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  10417691 cccaacaacggtagacacactaagtcgacctcgaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttagacacaccagagaagtagtcactgaacccttgg 10417592  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  10417591 ctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 10417561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 612
Target Start/End: Original strand, 17188392 - 17188981
Alignment:
Q  36 ctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttca 135  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  17188392 ctaccatcctttttctttactaacaacaaaggcgctccccacggtgaaacactcggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcttctaactgattcttca 17188491  T
Q  136 actcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggagg 235  Q
    | || || ||||||||||| |||||| | || |||| ||| |||||   ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||    
T  17188492 attcagctaactcagaagccgacatatggtacggtgccatcgacaccgacttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacctctctctcaggtgg 17188591  T
Q  236 cacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca-------------catagataaggaagccatcaaa 322  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||    |||||| |||   | |||||||             || ||| ||||| |||||||||    
T  17188592 cacatctggaatctcatcaggaaaaacttcaggaaattcgttcaccactggtaacctgtcaatcacaacctgattctccaaagacaaggatgccatcaaa 17188691  T
Q  323 gaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgact 422  Q
    ||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| |  || || |||| ||| || ||  | ||||| || ||||| |||||||| |||| ||| | ||    
T  17188692 gaatacatcagaattccatcacgttctagctgcttcatctgtttcgtagtcaagaattcaactccaccctcttcttccgcagaagaaaaatgcaccgtct 17188791  T
Q  423 tgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaa 522  Q
    ||||||| || || || |||||  |||| || |||||||| ||||| | || ||| ||||| || ||  |||   ||| |||||| || || | ||||||    
T  17188792 tgctaaagcagttgatatgaactcggttatattctaaccaattcattctaaaaataacatctattcccgtcagcagtaaacaaactaagtctacttcaaa 17188891  T
Q  523 atcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 612  Q
    ||| | | |||||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17188892 atctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacgagagaagtagtcactgaacccttagctggagtttcaacaaccatctctcc 17188981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 12858315 - 12858011
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || || ||||| |||| ||| ||||| |    || ||  || ||| ||||||||||||    
T  12858315 gccatcaaagaaaacattaagatctcatcacgttctaattgtttcagctgcttagtagtcaagaactcagttttacttttttcctcaacagaagagaaat 12858216  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
      || | ||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||| || | ||| || | |||    
T  12858215 gtaccgtcttactaaaacaattaatatgaacacggttatactctaaccagttcatcccaaagattacatccatacccatcaacggcaaacatacaagatc 12858116  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
    || |||||| |||| | ||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  12858115 aacttcaaagtcactaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccgtttctcca 12858016  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  12858015 ttcat 12858011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 12180327 - 12180590
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||  | ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||    
T  12180327 tgttcaactgacgataatcaatgaataacctcatggtaccatcattcttcttaaccaacaatactggcgctccccacggtgaaacactcggtcttacaaa 12180426  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || || ||||| || ||||| || | |||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||| |||  || |||||  |||||||||| ||||||    
T  12180427 tttcttatcaagtaagtcctccaactatttcttcaactcagccaactcggacgtcgacatacgataaagtgctatcgacaccggcttcgttcctggaaca 12180526  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12180527 aggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctagaatctcatcaggaaaaactt 12180590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16379074 - 16378817
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| || ||||| | ||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||||    
T  16379074 tgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcatgctactgtcctttttcttcaccaacaacacaggcactccccacggtgaaacactgggtcgaacaaa 16378975  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| || || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| |||||  |||| ||||||    
T  16378974 cttcttatcaagcaagtcttc-aactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccagctttattcctggaaca 16378876  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaa 259  Q
    || ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  16378875 aggtcaatcgaaaactccacctccctctctggtggcacatcaggactctcatcaggaaa 16378817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Original strand, 12272647 - 12272951
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |  || |  ||||  |  ||||| || ||||  || |||||||||||||| ||||    
T  12272647 gccatcaaggaaaacattaaaatttcatcacgctccaactgcttcaactgttcagtagttaggaactcagctccactctcttcttcagcagaagaaaaat 12272746  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| | ||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||| |||||| | |||    
T  12272747 gcaccgtcttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgtcaacggtaaacaaactagatc 12272846  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
     | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  12272847 gacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcct 12272946  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  12272947 ttcat 12272951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12510594 - 12510359
Alignment:
Q  36 ctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| || || || | ||  ||||| ||  |||||||||    
T  12510594 ctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaatttcttatctaacaggtcctccaaccgtttcttca 12510495  T
Q  136 actcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggagg 235  Q
    | || | ||||| ||||||||||||||| || |||| ||| |||||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||    
T  12510494 attcagtcaacttagaagctgacatacggtatggtgccatcgacactggattcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacctctctctctggtgg 12510395  T
Q  236 cacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12510394 cacatcaggaatctcatcaggaaacacttctggaaa 12510359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8745536 - 8745284
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| || ||||| | ||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| || |||||||| ||| | |||||    
T  8745536 tgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcatacttccatcctttttcttcaccaacaacacaggtgctccccacggcgaaacactgggtcttacaaa 8745437  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||||||||||    
T  8745436 cttcttatcaagtaaatcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggctttgttccaggaaca 8745337  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatc 253  Q
    || ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8745336 aggtcaattgaaaactccacctccctttctggcggcacatcaggaatctcatc 8745284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13318613 - 13318385
Alignment:
Q  36 ctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  |||| |||||| ||||||||||| ||| | ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  13318613 ctaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgttccccatggtgaaacactgggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttca 13318514  T
Q  136 actcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggagg 235  Q
    ||||||| | |||||| |  |||||||||||||||| ||  |||||  |||||||||| |||||||||||||| || || ||||  ||||| ||||| ||    
T  13318513 actcggctagctcagacgtcgacatacgataaggtgccagcgacactggcttcgttcctggaacaagatcaattgagaactcaatctccctttctggtgg 13318414  T
Q  236 cacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13318413 cacatctggaatctcatccggaaaaactt 13318385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 618
Target Start/End: Original strand, 24189289 - 24189917
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| ||||| | ||| || | ||| || ||||||||||| ||||| || ||||| |  ||||||||||| ||||||||| | ||| | |||||||    
T  24189289 ttcaactgacgatagtcaatgcatagcctcatactaccatcctttttctttactaacaacacaggcgctccccacggtgaaacattcggtcttacaaact 24189388  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || |||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||    
T  24189389 tcttatcaagcaagtcttccaactgattcttcaattcagctaactcagaagccgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaag 24189488  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca-- 300  Q
     ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||    |||||| |||   | |||||||      
T  24189489 gtcaattgaaaattcaacctctctctccggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttcaggaaattcattcaccactggtaacctgtcaatcaca 24189588  T
Q  301 -----------catagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
               || ||| ||||| |||||||||||| |||| | |||  | |||||||||| ||||||    || || |||| ||| || ||  | ||||    
T  24189589 gcctgattctccaaagacaaggatgccatcaaagaatacatcagaattccgtcacgttctagctgcttcttctgtttcgtagtcaagaattcaactccac 24189688  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
    | || ||||| |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || || |||||  |||| || |||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||    
T  24189689 cctcttcttccgcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaagcagttgatatgaactcggttatattctaaccaattcattccaaaaataacatccattcc 24189788  T
Q  490 actcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagct 589  Q
      |||  |||| | |||| || || |  |||||||| | | |||||||||| |  ||||| || ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  24189789 cgtcagcggtaaaaaaactaagtctacctcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacgagaaaagtagtcactgaacccttagct 24189888  T
Q  590 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  24189889 ggagtctcaacaaccatctctcccttcat 24189917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13970247 - 13970003
Alignment:
Q  20 aatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcc 119  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || || || || |||    
T  13970247 aatacataacctcatgctaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttgtcgagtaagtcc 13970148  T
Q  120 tctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaa 219  Q
    || || |||||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| || || ||||| || || || ||||    
T  13970147 tccaactgtttcttcaactcagcaagttcggatgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggtactagatcgatggagaactcaa 13970048  T
Q  220 catccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    | ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13970047 cctccctttctggtggtacatctggaatctcatccggaaaaactt 13970003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 264
Target Start/End: Original strand, 14088682 - 14088919
Alignment:
Q  27 aaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaatt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || || || || ||||| || |    
T  14088682 aacctcatgctaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttgtcgagtaagtcctccaact 14088781  T
Q  127 gtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccct 226  Q
    ||||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| || || ||||| || || || ||||| |||||    
T  14088782 gtttcttcaactcagcaagttcggatgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggcaccagatcgatggagaactcaacctccct 14088881  T
Q  227 ctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
     ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14088882 ttctggtggtacatctggaatctcatccggaaaaactt 14088919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 262
Target Start/End: Original strand, 14575033 - 14575230
Alignment:
Q  65 cggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacga 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||| || || || || |||||  |||||||     
T  14575033 cggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaattcggaagcatacatacgg 14575132  T
Q  165 taaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaac 262  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  14575133 taaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaagtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcatatctggaatctaatcaggaaaaac 14575230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Original strand, 17493955 - 17494260
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||  || |||||||| |  || || ||||  |  || ||||| ||||  || |||||||||||||| ||||    
T  17493955 gccatcaaagaaaacattaaaatgccatcacactccaactgcttcaactgtttcgtagttaggaattctgccccactctcttcttcagcagaagaaaaat 17494054  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| | ||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||  |||| |||| |||||| || ||    
T  17494055 ccaccgtcttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatacatacccgtcaacggtaaacaaactaagtc 17494154  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggag-tttcgacaaccatctctcc 612  Q
     | |||||| || | | ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  17494155 gacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacatcttagacaaacaagagaattagttactgaacccttagctggagttttcaacaaccatttctcc 17494254  T
Q  613 attcat 618  Q
     |||||    
T  17494255 tttcat 17494260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 59 - 214
Target Start/End: Original strand, 12071005 - 12071160
Alignment:
Q  59 caaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgac 158  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||    
T  12071005 caaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggcctaacaaacttcttctcaaacaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagac 12071104  T
Q  159 atacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaa 214  Q
    ||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12071105 atacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatagaaaa 12071160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Original strand, 14575295 - 14575599
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    |||||||| |||||||||| |||  ||||||| || |||||||| |  || || |||| ||| ||||| ||  |||  || |||||||||||||| ||||    
T  14575295 gccatcaaggaaaacattataattccatcacgctccaactgcttcaactgtttcgtagtcaagaactcagcttcactctcttcttcagcagaagaaaaat 14575394  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||  | ||| ||||| ||||||||  || |  |||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||| |||||| |  ||    
T  14575395 gcatcgtcttactaaagcaattaatacgagctcggttataatctaaccagttcattccaaaaattacatccatacccgtcaacggtaaacaaactaggtc 14575494  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
     | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  14575495 gacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcct 14575594  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  14575595 ttcat 14575599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 314 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 16826101 - 16825809
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| |  || || ||||  |  ||||| || ||||  || |||||||||||||| ||||    
T  16826101 gccatcaaagaaaacattaaaattccatcacattctaaccgcttcaactgtttagtagttaggaactcagctccactctcttcttcagcagaagaaaaat 16826002  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||  | ||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  |||| |||| |||||| | |||    
T  16826001 gcatcgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaatcacatccatacccgtcaacggtaaacaaacaagatc 16825902  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
     | |||||| || | | |||  |||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16825901 gacttcaaagtctctaccaattatagacaacggacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 16825809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 395 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 31692924 - 31692701
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactca 494  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| | ||||||||||||||| || |||||  |||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| ||  |||    
T  31692924 tcttccgcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactctaatcagttcatcccaaaaataacatccattcccgtca 31692825  T
Q  495 aaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 594  Q
    | |||| ||| || || || | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  31692824 acggtaaacacactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacacacaagagaagtagttactgaacccttagctgaagt 31692725  T
Q  595 ttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||    
T  31692724 ttcaacaaccatttctcctttcat 31692701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 395 - 612
Target Start/End: Original strand, 13944414 - 13944631
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactca 494  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | |||| |||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||  |||    
T  13944414 tcttcagcagaagaaaaatgcacagtcttgttaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccattcccgtca 13944513  T
Q  495 aaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 594  Q
    | ||||||||||| || || | ||||||||| | | |||||||||| |  ||||| || || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13944514 acggtagacaaactaagtctacttcaaaatctctaccaaacatagaaattggacacctcaagcaaactagagaagtagtcactgaacccttagctggagt 13944613  T
Q  595 ttcgacaaccatctctcc 612  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  13944614 ttcaacaaccatttctcc 13944631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16327733 - 16327592
Alignment:
Q  123 aattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacat 222  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||  |||| ||||| ||| |||| |||||  |||||||||| |    
T  16327733 aattgtttcttcaattcggctaactcagaagctgacatacggtatagtgccatcgacaccggctttgttcctggatcaaggtcaattaaaaattcaacct 16327634  T
Q  223 ccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16327633 ccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacactt 16327592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 41179505 - 41179718
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| || |||||||| ||| | |||||    
T  41179505 tgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttcttcaccaacaacacaggtgctccccacggcgaaacactgggtcttacaaa 41179604  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  41179605 cttcttatcaagtaaatcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggctttgttccgggaaca 41179704  T
Q  201 agatcaatcgaaaa 214  Q
    || ||||| |||||    
T  41179705 aggtcaattgaaaa 41179718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 314 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 12358347 - 12358055
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||| || |||||||| |  |  || ||||| |  |||||||| ||||  || ||||| | |||||| ||||    
T  12358347 gccatcaaagaaaacataagaattccatcacgctccaactgcttcaactattttgtagagaggaactctgctccactctcttcttccgtagaagaaaaat 12358248  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| |  |||||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||  |||| | || |||||| || ||    
T  12358247 gcaccgttttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcgcaaaaataacatccatacccgtcaacgctaaacaaactaagtc 12358148  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
     | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12358147 gacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 12358055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 395 - 618
Target Start/End: Original strand, 31941293 - 31941516
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactca 494  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||  |||    
T  31941293 tcttccgcagaagaaaaatgcactgtcttgctaaaacaatttatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatccattcccgtca 31941392  T
Q  495 aaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 594  Q
    | |||| ||| || || || | |||||| || |   ||||||||||||  || || |||| |||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||    
T  31941393 acggtaaacacactaagtcgacttcaaagtctctgccaaacatagacaacgggcaccttagacacacaagagaagtagttactagacccttagctggagt 31941492  T
Q  595 ttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||    
T  31941493 ttcaacaaccatttctcctttcat 31941516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 387 - 606
Target Start/End: Original strand, 47126326 - 47126545
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  || | ||| ||||| || || || |||||  | || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  47126326 caccttcttcttcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcgattatactctaaccaattcataccaaaaatcacatccat 47126425  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| || |||||||| ||||||||| ||||||| | | |||||||||| |  ||||| |  | ||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  47126426 acccgtcaacggcagacaaactaaatcaattacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaaccctta 47126525  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  47126526 gctggagtttcaacaaccat 47126545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 322 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 8745202 - 8744906
Alignment:
Q  322 agaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgac 421  Q
    ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||  ||  | ||||  || |||||||||||||| |||| ||| | |    
T  8745202 agaaaacatcagaattccatcacgttctaactgcttcatctgctttgtagataaaatttcaactccactctcttcttcagcagaagaaaaatgcacagtc 8745103  T
Q  422 ttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaa 521  Q
    ||| |||| ||||| || |||||  | || ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||  |||  || | |||||| || || | |||||    
T  8745102 ttgttaaagcaattgatatgaactcgattatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccattcccgtcagcggcaaacaaactaagtctacttcaa 8745003  T
Q  522 aatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||| | | |||||||||| |  ||||| || || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  8745002 aatctctaccaaacatagaaattggacacctcaagcaaacaagagaagtagtcactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 8744906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 314 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 16832348 - 16832056
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||||||||||| |  ||||| |||| ||| |||||  | ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  16832348 gccattaaagaatacatcaaaactccatcacgttctaactgcttcatctgcttcgtagtcaagaactcaactccaccctcttcttcagcagaagaaaaat 16832249  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
      || | ||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||| ||  |||| || | |||||| || ||    
T  16832248 gtaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaataacgtccattcccgtcaacggcaaacaaactaagtc 16832149  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
     |  |||||||| | | |||||||||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16832148 tacctcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 16832056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 387 - 606
Target Start/End: Original strand, 10408350 - 10408569
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  || | ||| ||||| || || || |||||  | || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  10408350 caccttcttcttcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaacccgattatactctaaccaattcataccaaaaatcacatccat 10408449  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| || |||||||| ||||||||  ||||||| | | |||||||||| |  ||||| |  | ||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  10408450 acccgtcaacggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcacacaaacaagagaagtggttactgaaccctta 10408549  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  10408550 gctggagtttcaacaaccat 10408569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 387 - 606
Target Start/End: Original strand, 28756701 - 28756920
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  || | ||| ||||| || || || |||||  | || || |||||||| ||||||||||  || ||||||||    
T  28756701 caccttcttcttcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcgattatattctaaccaattcataccaaagataacatccat 28756800  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| | | |||||||||| |  ||||| | || ||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  28756801 acccgtcaacggtagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgtagacaaacaagagaagtggttactgaaccctta 28756900  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  28756901 gctggagtttcaacaaccat 28756920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 322 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 16378746 - 16378456
Alignment:
Q  322 agaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgac 421  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||| |||  ||| |||||  |  |||| || |||||||||||||| ||||  || | |    
T  16378746 agaatacatcaaaattccatcacgttctaactgcttcatttgctttgtattcaagaactcaacttcaccctcttcttcagcagaagaaaaatgtaccgtc 16378647  T
Q  422 ttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaa 521  Q
    || |||||||| || || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||  |||| || | |||||| || || |  ||||    
T  16378646 ttactaaaacagttgatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccattcccgtcaacggcaaacaaactaagtctacctcaa 16378547  T
Q  522 aatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 612  Q
    |||| | | |||||||||| |  ||||| || || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16378546 aatctctaccaaacatagatattggacacctcaagcaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 16378456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 11959001 - 11958697
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||| ||| || |  || || |||||||| |||||  |  ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11959001 gccattaaagaatacatcaaaattccatcacgttctagctgtttcatctgttttgtagacaagaactcaacttcaccttcttcttcagcagaagaaaaat 11958902  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| | ||| ||||| || || || |||||  | || ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||   ||| |  | |||||| |||||    
T  11958901 gcaccgtcttactaaagcagttgatatgaactggattatactctaaccaattcataccgaaaataacatccatacccgacaacgacaaacaaactaaatc 11958802  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
    ||   |||| || | | |||||||||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  11958801 aaccacaaagtctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcct 11958702  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  11958701 ttcat 11958697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Original strand, 12180653 - 12180957
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||| || |||||||| |  |  || ||||| |  |||||||| ||||  || |||||||||||||| |||     
T  12180653 gccatcaaagaaaacataagaattccatcacgctccaactgcttcaactctttagtagataggaactctgctccactctcatcttcagcagaagaaaaaa 12180752  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| |   ||||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||  || ||| |||||||  |||| |||| | |||| || ||    
T  12180753 gcaccgttctgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaagataacaaccatacccgtcaacggtaaagaaactaagtc 12180852  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
     | |||||| || | | ||||||||||||  |||||||||  ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||     
T  12180853 gacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacatcttggacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtgtcaacaaccatttctcct 12180952  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  12180953 ttcat 12180957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 127 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16832548 - 16832414
Alignment:
Q  127 gtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccct 226  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  16832548 gtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtatggtgccatcgacaccggctttgttcccggaacaaggtcaatcgaaaactcaacctccct 16832449  T
Q  227 ctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaa 261  Q
    |||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  16832448 ctctggtggcacgtatggaatctcatccggaaaaa 16832414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 377 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 18132103 - 18131876
Alignment:
Q  377 aactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaa 476  Q
    |||||||| ||||  || ||||| |||||||| |||| ||| | ||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| | || ||    
T  18132103 aactctgctccactctcttcttccgcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcatccaaaaaa 18132004  T
Q  477 ttacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcac 576  Q
    | |||||||||||  |||| |||| ||| || || || | |||| | || | | ||||||||||||   |||| |||| ||| |||||||||||||| ||    
T  18132003 taacatccatacccgtcaacggtaaacacactaagtcgacttcatagtctctaccaaacatagacaacagacaccttagacaaacaagagaagtagttac 18131904  T
Q  577 cgaacccttagctggagtttcgacaacc 604  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18131903 tgaacccttagctggagtttcaacaacc 18131876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 314 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 13318322 - 13318094
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||| ||||| |||||||| |  || || ||||  |  |||||| | ||||  || ||||| |||||||| ||||    
T  13318322 gccatcaaagaaaacataagaattccatctcgttccaactgcttcaactgtttagtagttaggaactctcctccactctcttcttccgcagaagaaaaat 13318223  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
    |||| | |||| |||||||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||  |||| |||||||| || | |||    
T  13318222 acaccgtcttgttaaaacaatttatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccatacccatcaacggtagacatacaagatc 13318123  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagaca 542  Q
    ||  |||||||| | | ||||||||||||    
T  13318122 aacctcaaaatctctaccaaacatagaca 13318094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 15612086 - 15612221
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |  || || ||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  15612086 tgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatccttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacacttggtctaataaa 15612185  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaa 136  Q
    ||  ||||||||||| || || || || ||||||||    
T  15612186 ctgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 15612221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 30139789 - 30139954
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  || || ||||| ||||||||||| ||| ||| |||    
T  30139789 tgttcaactgtcgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaa 30139888  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgata 166  Q
    ||  ||||||||||| || || || || |||||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||    
T  30139889 ctgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactccgatgcagacatccgata 30139954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 30149340 - 30149505
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  || || ||||| ||||||||||| ||| ||| |||    
T  30149340 tgttcaactgtcgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaa 30149439  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgata 166  Q
    ||  ||||||||||| || || || || |||||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||    
T  30149440 ctgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactccgatgcagacatccgata 30149505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 322 - 474
Target Start/End: Original strand, 44779564 - 44779716
Alignment:
Q  322 agaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgac 421  Q
    ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||  ||  | |||  ||| |||||||||||||| |||| ||| | |    
T  44779564 agaaaacatcagaattccatcacgttctaactgcttcatctgctttgtagataaaatttcaactccattttcttcttcagcagaagaaaaatgcaccgtc 44779663  T
Q  422 ttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaag 474  Q
    || ||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  44779664 ttactaaaacaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcataccaag 44779716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 14874679 - 14874600
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14874679 atacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagaaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 14874600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 16327456 - 16327225
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||| || || || |||||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  16327456 caccttcttcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccgaaaataacatccat 16327357  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
     ||   ||| || |  ||||| |||||||   | ||||| | | |||||||||| |  ||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  16327356 tcccgacaacggcaagcaaactaaatcaaccacgaaatctctaccaaacatagatataggacaccccaaacaaacaagagaagtagttactgaaccctta 16327257  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  16327256 gttggagtttcaacaaccatttctcctttcat 16327225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 16834661 - 16834559
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||    
T  16834661 tgttcaactgacggtaatctatacacaacctcaggctaccatccttcttctttaccaataacacaggcgctccccatggtgaaacactgggtcgaacaaa 16834562  T
Q  101 ctt 103  Q
    |||    
T  16834561 ctt 16834559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15948627 - 15948462
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |  || || ||||| || |||||||| ||  ||| |||    
T  15948627 tgttcaactgccgataatccacacacaacctcatacttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggcgaaacactcggcctaataaa 15948528  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgata 166  Q
    || |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||    
T  15948527 ctgtttctcaagcaactcttctaactgtttcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgata 15948462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 12510230 - 12510011
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||| | || || || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  12510230 caccttcttcttcagtagaagaaaaatgcactgtcttactatagcagttgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaatcacatccat 12510131  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| |||| |||||| |||||||   ||||||| | | |||||||||| |   |||| |  ||||| || |||||||| ||  | |||  ||||    
T  12510130 acccgtcaacggtaaacaaactaaatcaaccacaaaatctctaccaaacatagatataagacaccccaaacaaaccagagaagtggttgctgaaatctta 12510031  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  12510030 gctggagtttcaacaaccat 12510011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13965509 - 13965374
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  || || ||||| ||||||||||| ||| ||| |||    
T  13965509 tgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaa 13965410  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaa 136  Q
    ||  ||||||||||| || || || || ||||||||    
T  13965409 ctgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 13965374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 474
Target Start/End: Original strand, 14089063 - 14089142
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaag 474  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14089063 tcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaaacaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcataccaag 14089142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 6151010 - 6150845
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  || || ||||| || |||||||| ||  | | |||    
T  6151010 tgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggagaaacactcggcctgataaa 6150911  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgata 166  Q
    || |||||||||||| || ||||| |||||||| || ||  ||||||| || || ||||| |||||    
T  6150910 ctgtttctcaagcaactcttctaactgtttctttaattcacccaactctgatgcagacatccgata 6150845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 11949665 - 11949500
Alignment:
Q  377 aactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaa 476  Q
    |||||||| ||||  || ||||| |||||||| |||| ||| | ||||||||||||||| || |||||  |||| ||||| |||||||||||  ||| ||    
T  11949665 aactctgctccactctcttcttccgcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactcgaaccagttcatcgcaaaaa 11949566  T
Q  477 ttacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagaca 542  Q
    | |||||||| ||  |||| |||| |||||| || || | |||||| || | | ||||||||||||    
T  11949565 taacatccattcccatcaacggtaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagaca 11949500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 13969859 - 13969779
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaga 475  Q
    ||||| || ||||| |||| ||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13969859 tcttcggcggaagaaaaatgcactgtcttgttaaagcaattgatatgaacatggttatactccaaccagttcataccaaga 13969779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 13304367 - 13304315
Alignment:
Q  36 ctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacact 88  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||    
T  13304367 ctaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccatggtgaaacact 13304315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 560 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 11949499 - 11949453
Alignment:
Q  560 acaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11949499 acaagaaaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 11949453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 435; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 7606 - 8236
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7606 tgttcaactgtcgatagtcaacacacaacctcatgctaccatctttcctcttcactaacaaaacgggcgctccccaaggtgaaacacttcgtctaacaaa 7705  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7706 ctttttctcaagtaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaaca 7805  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7806 agatcaatagaaaattcaacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgcatgccacttgtagtttatcaatca 7905  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
                  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||  | |||||||||||||||||    
T  7906 ttgtttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcacgttctaactgcttcagctgcttaattgacaaaaactctgcgcc 8005  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8006 actttcctcttcagcagaagagaaatacacagaattactaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 8105  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8106 gcactcaacggtagacaaaccaaatgaatctcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 8205  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8206 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 8236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 412; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 21253364 - 21253995
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21253364 tgttcaactgtcgatagtcaataaacaatctcatgctaccatctttcttcttcacaagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 21253463  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21253464 ctttttctcgagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcaaaagctgacatacgataaggtgtcatagacacatgcttcgttccaggaaca 21253563  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatc-tcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatc 299  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21253564 agatcaatcgaaaactcaacttccctctctggaggcacatcaggaattgtcattaggaaaaacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttaccaatc 21253663  T
Q  300 ac-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgc 386  Q
    ||             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  21253664 accgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaatgccatcacgttccaactgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcgc 21253763  T
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  21253764 cactttcctcttcagcagaagagaaatacagcgacttactataacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagctcataccaagaatcacatgcat 21253863  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21253864 accactcaaaggtagacaaaccaaatccatctcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 21253963  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21253964 gctggagtttcgacaaccatttctccattcat 21253995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 21786716 - 21786086
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21786716 tgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccttctttcttcttcactagcaaaaccggcactccccaaggtgaaacactgggtctaacaaa 21786617  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21786616 ctttttctcaagcaagtcctctaattgtttcttcaactcggccaacttataagttgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcattccaggaaca 21786517  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  21786516 agatcaatcaaaaactcaacttccctctctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgcacaccacttgtagcttatcaatca 21786417  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  21786416 ctgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcacgttctaactgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcacc 21786317  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21786316 actttcctcctcagcagaagagtaatacaccgacttactataataattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcatacccagaatcacatccata 21786217  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21786216 ccactcaaaggtagaaaaactaaatccatctcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtggtcaccgaacccttag 21786117  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21786116 ctggagtttcaacaaccatttctccattcat 21786086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 21392222 - 21391592
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21392222 tgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccttctttcttcttcactagcaaaaccggcactccccaaggtgaaacactgggtctaacaaa 21392123  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21392122 ctttttctcaagcaagtcctctaattgtttcttcaactcggccaacttataagttgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcattccaggaaca 21392023  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  21392022 agatcaatcaaaaactcaacttccctctctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgcacaccacttgtagcttatcaatca 21391923  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  21391922 ctgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaagataccatcacgttctaactgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcacc 21391823  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21391822 actttcctcctcagcagaagagtaatacaccgacttactataataattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcatacccagaatcacatccata 21391723  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21391722 ccactcaaaggtagaaaaactaaatccatctcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtggtcaccgaacccttag 21391623  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21391622 ctggagtttcaacaaccatttctccattcat 21391592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 21781548 - 21780918
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21781548 tgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccttctttcttcttcactagcaaaaccggcactccccaaggtgaaacactgggtctaacaaa 21781449  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21781448 ctttttctcaagcaagtcctctaattgtttcttcaactcggccaacttataagttgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcattccaggaaca 21781349  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  21781348 agatcaatcaaaaactcaacttccctctctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgcacaccacttgtagcttatcaatca 21781249  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  21781248 ctgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaagataccatcacgttctaactgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcacc 21781149  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21781148 actttcctcctcagcagaagagtaatacaccgacttactataataattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcatacccagaatcacatccata 21781049  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21781048 ccactcaaaggtagaaaaactaaatccatctcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtggtcaccgaacccttag 21780949  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21780948 ctggagtttcaacaaccatttctccattcat 21780918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 22422251 - 22421623
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22422251 ttcaactgtcgatagtcaatacacaatcttatgctaccatctttcttcttaaccagcaataccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaact 22422152  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22422151 tcttatcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactcagaagtcgacatacggtaaggtgtcatagacacaagcttcgttcccggaacaag 22422052  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||   | ||||| |||||||||||     
T  22422051 atcaatcgaaaattcaacttctctttctggaggcacattaggaatttcatctggaaaaacttctggaaaatcacatatagcctgtagcttatcaatcact 22421952  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||  |||||||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22421951 gcttgattctcaatagacaaggatgacatcaaagaaaacatcaaaattccatcacgttccaattgcttcagctgcttagtagacaagaactctgcgccac 22421852  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22421851 ttacctcttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtacactaactagttcatgccaagaattacatccatacc 22421752  T
Q  490 actcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagct 589  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22421751 actcaaaggtaaacaaaccaagtcaatttcaaaatcacgatcaaacatagataaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagct 22421652  T
Q  590 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22421651 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 22421623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 22522966 - 22523596
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| || || || |||||||||||||||||||| || | ||| |  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  22522966 tgttcaactgtcgataatcaatgcataatctcatgctaccatccttcttcttaactagcaatactggcgctcgccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 22523065  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22523066 cttcttatcaagcaaatcttctaattgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacatatggtaaggtgtcatagacacaggcttcgttcccggaaca 22523165  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||    
T  22523166 aggtcaatcgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcacatacaacttgtagcttaccaatca 22523265  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||| || || ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||| ||||| || |||||||||||||| |||| |||||     
T  22523266 ctacttgattctcaatagacaaagacgccatcaaagaaaacatcaaaattccatcacattctaattgcttcagctgcttggtagacaagaactttgcgct 22523365  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22523366 actttcttcttcagcagaagagaaatacaccaacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccata 22523465  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22523466 ccactcaaaggtaaacaaaccaaatcaatttcaaaatcaagaccaaacatagaaaaagaacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 22523565  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22523566 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 22523596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 21164899 - 21164269
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21164899 tgttcaactgacgataatcgatacacaacctcatactaccatctttcttcttcactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 21164800  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||||| |    
T  21164799 cttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagctgatatacgataaggtgccatcgacaccggctccgttccaggaata 21164700  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  21164699 agatcaatagaaaactcaacttctctctctagaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcacaccacttgtagcttatcaatca 21164600  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  21164599 ctgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaatatcatcgcgttccaattgcttcagctgcttagtagacaagaactctgcacc 21164500  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21164499 actttcctcttcgactgaggagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcatacccagaatcacatccata 21164400  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  21164399 ccactcaaaggtagacaaactaagtccatctcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcactgaacccttag 21164300  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21164299 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 21164269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 618
Target Start/End: Original strand, 22989467 - 22990095
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||  | ||||||||||| |||||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||     
T  22989467 ttcaaccgtcgataatcaatgcataatatcatgctaccatctttcttcttaactagcaatatcggcgcttcccaaggtgaaacacttggtcttacaaaca 22989566  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||     
T  22989567 tcttatcaagtaaatcttctaaatgtttcttcaactcggccaactcagaagtcgacatacggtaagttgtcatagacacaggcttcgtacccggaacaat 22989666  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
     ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||     
T  22989667 gtcaatcgaaaattcaacttctctttatggaggcacatcaggaatttcatcaggaaagacctctggaaaatcgcatacaacctgtagcttatcaatcact 22989766  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||| |||| |||    
T  22989767 gcttgattctcaatagacaaggacgccatcaaagaaaacatcaagattccatcacgttctaattgcttcagctgcttagtagacaagaactatgcgtcac 22989866  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22989867 tttcctcttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccatacc 22989966  T
Q  490 actcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagct 589  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22989967 actcaaaggtaaacaaaccaagtcaatttcaaaatcacgaccaaacatagacaagggacatcttaaacatacaagagaagtagtcaccgaacccttcgct 22990066  T
Q  590 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22990067 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 22990095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 30311505 - 30310875
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||| |||| |||||||| || | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30311505 tgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctatcatctttcttctttactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 30311406  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  30311405 tttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaaca 30311306  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  30311305 agatcaatagaaaactcaacttccctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcgggaaagtcgcataccacttgtagcttatcaatca 30311206  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  30311205 ctgcttgattctcaatagataatgaagccatcaacgaaaacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcacc 30311106  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  30311105 actttcctcttcagcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccagaatcacatccata 30311006  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  30311005 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 30310906  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30310905 ctggagtctcgacaaccatctctccattcat 30310875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 19980387 - 19981017
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  ||||| || || || |||||||| |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19980387 tgttcaactgacggtaatcgatacataatctcatactaccatctttcttctttactaacaaaacgggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 19980486  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  19980487 cttcttctcaagcaaatcttctaaccgtttcttcaactcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcgacacgggcttcgttccaggaaca 19980586  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||| | ||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19980587 agatcattagaaaactcaacttctctctctggagacacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatca 19980686  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  19980687 ctgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaggaaaacatcaaaataccatcccgttccagttgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcacc 19980786  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19980787 actttcctcttcgacggaggagaaatacactaacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcatacccagaatcacatccata 19980886  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19980887 ccgctcaagggtagacaaactaaatccatctcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 19980986  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19980987 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 19981017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 32602565 - 32603195
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32602565 tgttcaactgacgatagtcaatacacaacctcatgctactatctttcttctttactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 32602664  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  32602665 tttcttttcaagcaaatcatctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaaca 32602764  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  ||||| || ||||||||||| || ||||||||||    
T  32602765 agatcaatagaaaattcgacttccctttctggaggcacatcaggaatttcatttggaaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgaagattatcaatca 32602864  T
Q  301 ca-------------tagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    ||             ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || || || ||||| || |||||||| ||    
T  32602865 cagcttgattctcaatagataaagaagccatcaacgaaaacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcagctgtttagtagataagaactctgcacc 32602964  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  32602965 accttcctcttcagcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccagaatcacatccata 32603064  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  32603065 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacaaccaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 32603164  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32603165 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 32603195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 3 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 22246792 - 22246164
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| || | ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  22246792 ttcaattgtcgataatcaatacacaacctcatactaccatctttcttcttaactagcaataccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaaca 22246693  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | || |||    
T  22246692 tcttatcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaaatcagaagttgacatacggtaaggtgtcatagacacatgcttcgtacccgaaataag 22246593  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    |||||||||||||||||| || || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||     
T  22246592 atcaatcgaaaattcaacttctctttgtagaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcacatacaacctgtaatttatcaatcacc 22246493  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || | ||| ||||    
T  22246492 gcctgattctcaacagacaaggatgccatcaaagaaaacatcaaaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttagtagacaagaattatgcaccac 22246393  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
     |||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |    
T  22246392 tttcctcttcagcagaagaaaaatacatcgacttactaaaacaactaatatgaacatggttgtactctaaccaattcataccaaggattacatccatttc 22246293  T
Q  490 actcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagct 589  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22246292 actcaaaggtaaacaaaccaaattaatttcaaaatctcgaccaaacatagacaaaggacatattaagcacacaagagaagtagtcaccgaacccttagct 22246193  T
Q  590 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22246192 ggagtttcgacaaccatctatccattcat 22246164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 15535803 - 15536433
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15535803 tgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 15535902  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  15535903 tttattttcgagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagcagacatacgatatggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaaca 15536002  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || || |||||||| || |||||||||     
T  15536003 agatcaatagaaaactcgacttccctttctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaagtcgcacaccacttgaagattatcaatcg 15536102  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  15536103 ctgcttgattctcaatagataaagaagccatcaacgaaaacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcacc 15536202  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| |||| ||||    
T  15536203 actttcctcttcagcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccaattcgtacccaaaatcacattcata 15536302  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15536303 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaatatagacaaaggacaacgtaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 15536402  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15536403 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 15536433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 22042247 - 22042877
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22042247 tgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaagttgaaacacttggtctaacaaa 22042346  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  22042347 tttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaaca 22042446  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||  ||||||||||||||||| |||||   ||||||||  |||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  22042447 agatcaatagaaaactcgacttctctcttaggaggcacatcaggaatttcatctaaaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttgtcaatca 22042546  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||  || |||||||| ||    
T  22042547 ctacttgattctcaatagataaagaagccaacaacgaaaacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcagctgcttagtagttaagaactctgcacc 22042646  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  22042647 actttcctcttcagcggaagagaaatacactaacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtattctaaccaattcatacctagaatcacatccata 22042746  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22042747 ccgttcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 22042846  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22042847 ctggagtttcgacaaccatctctccaatcat 22042877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 3 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 22375812 - 22375185
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| || || |||||||| |||||||| || | ||| | |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  22375812 ttcaactatcgataatcaatacacaatctcatactaccatctttcttcttaactagcaataccggcgctccccaaggtgaaatacttggtcttacaaact 22375713  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||    
T  22375712 tcttatcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactcagaagccgacatacggcaaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaattag 22375613  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    |||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||| ||||| || || || ||||  |||||||||||     
T  22375612 atcaatcgaaaattcaacttctctttctagaggcacatcaggaatttcattaagaaaaacttctgggaaatcacacacaacctgtaacttatcaatcact 22375513  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| || || || | ||| |||||||| || ||||||||||    
T  22375512 gcttgattctcaacagacaaggacgccatcaaagaaaacatcaaaattccttcacgttctaattgattcagctacttagtagacaagaattctgcgccac 22375413  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
     |||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22375412 tttcctcgtcggcagaagaaaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccattcc 22375313  T
Q  490 actcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagct 589  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  22375312 actcaaaggtaaacaaaccaaatcaatttcaaaatctctaccaaacatagacaaaggacatcttaaacacac-ggagaagtagtcaccgaacccttagtt 22375214  T
Q  590 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22375213 ggagtttcgacgaccatctctccattcat 22375185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 17672384 - 17671753
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  17672384 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaa 17672285  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttcca-ggaac 199  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||| |||||    
T  17672284 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaaggaac 17672185  T
Q  200 aagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatc 299  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   ||||||||    
T  17672184 aagatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatc 17672085  T
Q  300 ac-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgc 386  Q
    ||             |||||||| | ||||||||| |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  17672084 actgcttgattctcaatagataaagtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcac 17671985  T
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||| |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  17671984 cactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccat 17671885  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17671884 accactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaaccctta 17671785  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17671784 gctggagtttcgacaaccatctctccattcat 17671753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 18858997 - 18859627
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||| ||||  || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18858997 tgttccactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 18859096  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||  ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||| |||||||    
T  18859097 cttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataacttggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttctaggaaca 18859196  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||  ||||  ||||  |||||||||    
T  18859197 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacaccccaccggtagcctatcaatca 18859296  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             | |||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||    
T  18859297 ctgcttgattctcaacagataaagaagccatcaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagttgacaaaaactctgcacc 18859396  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  18859397 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacttccata 18859496  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18859497 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 18859596  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859597 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 18859627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 20016624 - 20015994
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||| |||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20016624 tgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccgacgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaa 20016525  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  20016524 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 20016425  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  20016424 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaagaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 20016325  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||  | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  20016324 ccgcttgattctcaatagatatagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 20016225  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  20016224 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 20016125  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20016124 ccactcaaaggtagacaaactaaacccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 20016025  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20016024 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 20015994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 22030523 - 22031153
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22030523 tgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcatcactagaaaaacgggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 22030622  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || |||||||||||||| |||||  ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||| |||||||    
T  22030623 tttattctcaagcaaatcttctaaccgtttcttcaactcagctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcgaggaaca 22030722  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||  ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||  ||||| || |||||||||| ||| || |||||||    
T  22030723 agatcaatagaaaactcgacttctctcttaggaggcatatcaggaatttcatctggaagaacttcaggaaagtcgcataccacttatagcttgtcaatca 22030822  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
                  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||| ||| ||    
T  22030823 ttgcttgattctcaatagataaagaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcagctgcttagtagataaaaactatgcacc 22030922  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22030923 actttcctcctcagcggaagagaaacacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccagaattacatccata 22031022  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || || ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||||||||||  |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22031023 ccgcttaaatgtagacaaactaaatccatttcgaaatcatgaccaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 22031122  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22031123 ttggagtttcgacaaccatctctccattcat 22031153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 618
Target Start/End: Original strand, 19114829 - 19115450
Alignment:
Q  10 gtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctc 109  Q
    ||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19114829 gtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctc 19114928  T
Q  110 aagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatc 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||     
T  19114929 aagcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttctaggaacaagatcaata 19115028  T
Q  210 gaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------- 301  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   | ||||||||            
T  19115029 gaaaattcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatcactgcttgat 19115128  T
Q  302 -----atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctc 396  Q
         |||||||  | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  19115129 tctcaatagatacagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctc 19115228  T
Q  397 ttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaa 496  Q
    |||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  19115229 ttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaaa 19115328  T
Q  497 ggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagttt 596  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19115329 ggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcactgaacccttagctggagttt 19115428  T
Q  597 cgacaaccatctctccattcat 618  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  19115429 tgacaaccatctctccattcat 19115450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 22118536 - 22117906
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||  || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22118536 tgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 22118437  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||||||  || || ||  |||||||||||||||||    
T  22118436 cttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgcgatcgagaccggcttcgttccaggaaca 22118337  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| || |||||  |||   |||||||||    
T  22118336 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaagacttcaggaaaatcacacaccaccggtaacctatcaatca 22118237  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             | |||||| | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  22118236 ctgcttgattctcaaaagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactccgcacc 22118137  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22118136 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataaaaatgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 22118037  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || |||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22118036 ccgctcagaggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 22117937  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22117936 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 22117906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 22127320 - 22126690
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||  || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22127320 tgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 22127221  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||||| || |||||||||||||  || || ||  |||||||||||||||||    
T  22127220 cttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagaaatacgataaggtgcgatcgagaccggcttcgttccaggaaca 22127121  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| || |||||  |||   |||||||||    
T  22127120 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaagacttcaggaaaatcacacaccaccggtaacctatcaatca 22127021  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             | |||||| | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  22127020 ctgcttgattctcaaaagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 22126921  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  22126920 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 22126821  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || |||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  22126820 ccgctcagaggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtaatcaccgaacccttag 22126721  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22126720 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 22126690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 19482433 - 19481803
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19482433 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 19482334  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    |||  | || ||||| ||||| || |||||||||||||| |  || || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  | |||||||||||||||    
T  19482333 cttcctttcgagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataattctgaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggtttcgttccaggaaca 19482234  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  ||||  |||||||||    
T  19482233 agatcaatagaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatca 19482134  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             | |||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  19482133 ctgcttgattctcaacagataaagaagccatcaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 19482034  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19482033 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 19481934  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||  ||||||||||||||    
T  19481933 ccactcaaaggtaggcaaactaaatccatttcaaaatcacgactaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtaagcaccgaacccttag 19481834  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19481833 ctggagtttcgacaaccatctctccgttcat 19481803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19864454 - 19864155
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19864454 tgttcaactttcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaactcttggtctaacaaa 19864355  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19864354 ctttttctcatgcaagtcctctaattatttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgatagggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaaca 19864255  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19864254 agatcaatcgaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatca 19864155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 302 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 22129664 - 22129348
Alignment:
Q  302 atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcag 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||| |||||||||||    
T  22129664 atagataaggaagccatcaacgaaaacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaattctgcaccactttcctcttcag 22129565  T
Q  402 cagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtag 501  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22129564 cggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccagaatcacatccataccgctcaaaggtag 22129465  T
Q  502 acaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgaca 601  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22129464 acaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgaca 22129365  T
Q  602 accatctctccattcat 618  Q
    ||||||| |||||||||    
T  22129364 accatctgtccattcat 22129348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 613
Target Start/End: Original strand, 20390526 - 20391131
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||||| ||||| |    
T  20390526 atacacaacctcatgctaccatctttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaacttcttgtcaagtaaatctt 20390625  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || |||||||||||||| || ||||||||  | |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  20390626 ccaactgtttcttcaactcagctaactcagacaccgacatacggtaaggcgccatcgacaccagcatcgtacccggaacaagatcaattgaaaattcaac 20390725  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcaca--tagat----------- 307  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |     || ||| | | | |||||||||||  | |||               
T  20390726 ttccctctctggcggcacatcagggatctcatcatgaaaaacttctggaaatttattcacaactggcaatatatcaatcacagtttgattctccactgaa 20390825  T
Q  308 aaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaag 407  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| || || || |||| ||| ||||| ||   ||  || || ||||||||||    
T  20390826 aagtatgccattaaagaaaacattaagatcccatcacgttctaattgcttcagctgtttagtagtcaagaactcagctttactctcttcctcagcagaag 20390925  T
Q  408 agaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaac 507  Q
    | |||| ||  | ||| |||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||| || | ||| ||    
T  20390926 aaaaatgcatcgtcttactaaaataattgatatgaacatggttatactccaaccagttcatcccaaagattacatccatacccatcaacggcaaacatac 20391025  T
Q  508 caaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatc 607  Q
     | ||||| ||||||||| | | ||||||||||||   |||| || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  20391026 aagatcaacttcaaaatctctaccaaacatagacaacagacaactcaaacaaacgagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatt 20391125  T
Q  608 tctcca 613  Q
    ||||||    
T  20391126 tctcca 20391131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 618
Target Start/End: Original strand, 19984620 - 19985230
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| || || |||||||| ||||    
T  19984620 atacataacctcatgctaccatcattcttcttaaccagcaataccggtgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcct 19984719  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || ||||||||||| || || ||||| || || |||||||  ||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19984720 ccaactgtttcttcaattcagctaactcggacgccgacatacagtaaggtgccatcgacaccggcttcgttccgggaacaagatcaattgaaaattcaac 19984819  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcaca--tagat----------- 307  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    || ||| | | | |||||||||||  | |||               
T  19984820 ctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcattcacaactggcaatctatcaatcacaacttgattctccaacgac 19984919  T
Q  308 aaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaag 407  Q
    ||| | ||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |  || || |||| ||| ||||| ||  |||  || || |||||||| |    
T  19984920 aagtatgccattaaggaaaacattaagattccatcacgttctaactgcttcaactgtttagtagtcaagaactcagcttcactctcttcctcagcagacg 19985019  T
Q  408 agaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaac 507  Q
    | ||||  |  | ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||    |||| |  | ||| ||    
T  19985020 aaaaatgtatcgtcttactaaaacaattaatatgaacacggttatactctaaccagtttatcccaaagattacatccatattcgtcaacgacaaacatac 19985119  T
Q  508 caaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatc 607  Q
     | ||| | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  19985120 tagatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatt 19985219  T
Q  608 tctccattcat 618  Q
    |||||||||||    
T  19985220 tctccattcat 19985230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 618
Target Start/End: Original strand, 21927868 - 21928478
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||| | ||||| || || ||||| || ||||    
T  21927868 atacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggtgctccacaaggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatcaagtaagtcct 21927967  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || ||||||||||| |  || ||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||    
T  21927968 ccaactgtttcttcaatttagctaactcggacgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttctgggaacaagatcaattgaaaatttaac 21928067  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcaca--tagat----------- 307  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    || ||  | | | |||||||||||  | |||               
T  21928068 ctccctctctggtggcacatcaggaatctcattaggaaaaacttctggaaattcattcacaaccggaaatctatcaatcacagcttgattctccaatgac 21928167  T
Q  308 aaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaag 407  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  || || |||| ||| ||||| ||  |||  || || ||||||| ||    
T  21928168 aagtatgccatcaaagaaaacattaaaatcccatcacgttctaactgcttcaactgtttagtagtcaagaactcagcttcactctcttcctcagcagtag 21928267  T
Q  408 agaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaac 507  Q
      ||||  || | ||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||  |||| || | ||| ||    
T  21928268 caaaatgtaccgtcttactaaagcaattaatatgaacacggttatactctatccagttcatcccaaaaattatatccatacccgtcaacggcaaacatac 21928367  T
Q  508 caaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatc 607  Q
     | ||| | |||||| || | | ||||||||||||  | ||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  21928368 tagatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacgcacagctcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatt 21928467  T
Q  608 tctccattcat 618  Q
    || ||||||||    
T  21928468 tcgccattcat 21928478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 474
Target Start/End: Original strand, 23887450 - 23887934
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  23887450 ttcaactgtcgataatcaatgcataacctcatgctaccatctttcttcttaactaacaaaatcggcactccccaaggtgaaacactcggtcttacaaact 23887549  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgt-tccaggaacaa 201  Q
    | || ||||||||||| ||| | |||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |  ||||||| ||    
T  23887550 tcttatcaagcaaatcttcttactgtttcttcaacgcagccaactcagaagccaacatacggtaaggagtcatagacacatgcttcatacccaggaa-aa 23887648  T
Q  202 gatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca- 300  Q
    ||||||| |||| ||| || ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||| || || || || ||| | |  |||||||| |     
T  23887649 gatcaattgaaatttcgacttccctttctggcggaatatcaggaatctcatcaggaaaaacttctgggaattcacaaacaactcgcaacttatcaattac 23887748  T
Q  301 ------------catagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcca 388  Q
                || ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| || || ||||| ||||  || |||||||| |||    
T  23887749 tgcttgattctccacagacaaggacgccatcaaagaaaacatcaagattccatcacgatctaactgattcagctgcttagtagttaagaactctgctcca 23887848  T
Q  389 ccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaag 474  Q
    | ||| ||||||| |||||| ||||| |  | |||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  23887849 ctttcttcttcagtagaagaaaaatatatcggcttattaaaacaattaatatgaacatggttatactttaactagttcataccaag 23887934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20394469 - 20394197
Alignment:
Q  26 caaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaat 125  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || |||||||||||||||||     
T  20394469 caacctcatgctaccatctttcttcttaaccaacaacaccgacgctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcctctaac 20394370  T
Q  126 tgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccc 225  Q
    | ||||||  |||| || || ||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20394369 tatttcttacactcagctaattcaaaagtcgacatacgataaggtgccatagacacaagcttcgtacccagaacaagatcaatcgaaaattcaacttccc 20394270  T
Q  226 tctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaat 298  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || || || ||||| | |||||||||    
T  20394269 tctctagtggcacatcaggaatctcataaggaaaaacttctggaaactcgcacacaacttgcaatttatcaat 20394197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21323638 - 21323370
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  21323638 ttcaactgacgatagtcaatacataacctcatactaccatccttcttctttaccaacaataccggcgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaact 21323539  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || |||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||  |||||||||  ||||||||    
T  21323538 tcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcggaagctgacatacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgttcatggaacaag 21323439  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21323438 gtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaa 21323370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 22053283 - 22053552
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||| | ||||||||| | ||| |||||||    
T  22053283 tgttcaactgacgatagtcaatgcacaacctcatgctaccgtccttcttctttaccaacaacacaggcgctccc-acggtgaaacattgggtctaacaaa 22053381  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||| | ||||| || ||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||| || |||    
T  22053382 cttcttatcaagctagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagatgacatacgataaggtgccatcgacatcggcttcgttcctgggaca 22053481  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22053482 aggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacacttctggaaa 22053552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21920151 - 21919987
Alignment:
Q  302 atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcag 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21920151 atagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaataccgtcacgttctaactgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcgccactttcctcttcag 21920052  T
Q  402 cagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttc 466  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  21920051 cagaaaagaaatacaccgacttactaaaacaattaatgtgaacatggttctattccaaccagttc 21919987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Original strand, 28983366 - 28983601
Alignment:
Q  36 ctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| || || || | ||  ||||| |||||||||||||    
T  28983366 ctaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaatttcttatctaacaggtcctccaattgtttcttca 28983465  T
Q  136 actcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggagg 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||    
T  28983466 actcagccaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaagatcaattgagaattcaacctccctctctggtgg 28983565  T
Q  236 cacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  28983566 cacatcaggaatttcatcagggaaaacttctggaaa 28983601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Original strand, 28988585 - 28988820
Alignment:
Q  36 ctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| || || || | ||  ||||| |||||||||||||    
T  28988585 ctaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaatttcttatctaacaggtcctccaattgtttcttca 28988684  T
Q  136 actcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggagg 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||    
T  28988685 actcagccaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaagatcaattgagaattcaacctccctctctggtgg 28988784  T
Q  236 cacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  28988785 cacatcaggaatttcatcagggaaaacttctggaaa 28988820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 271
Target Start/End: Original strand, 22373290 - 22373559
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||| | | ||| |    
T  22373290 ttcaactgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccagcgctccccaaggtgaaacactcggtcttataaatt 22373389  T
Q  103 ttt-tctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaa 201  Q
    |   | ||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||| ||| ||||   |||||||||| |||||||    
T  22373390 tccctatcaagtaaatcctccaactgtttcatcaattcggctaactcagacgccaacatacggtaaggtgccatcgacagcggcttcgttccgggaacaa 22373489  T
Q  202 gatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22373490 gatcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcatgaatctcatcaggaaaaacatctggaaa 22373559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22131402 - 22131165
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| | ||| | ||||||||| || |||| ||| || ||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  22131402 tgttcaactgacaatagtcaatacacaatctcatgccaccgtctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacgaa 22131303  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  22131302 tttcttttcaagcaaatcttctaattgtttcttcaactcggctaactcggaagcagacatacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaaca 22131203  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcac 238  Q
    ||||  || ||||| || || ||||||| |||||||||    
T  22131202 agattcatagaaaactcgacttccctctatggaggcac 22131165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16269550 - 16269315
Alignment:
Q  36 ctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| || || || | ||  || || || ||||||||||    
T  16269550 ctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaatttcttatccaacaggtcttccaactgtttcttca 16269451  T
Q  136 actcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggagg 235  Q
    |||| || |||||||||| ||||||||| || |||| ||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||    
T  16269450 actcagctaactcagaagttgacatacggtatggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacctctctctctggtgg 16269351  T
Q  236 cacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16269350 cacatcaggaatctcatcaggaaatacttctggaaa 16269315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31569204 - 31568949
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| || |||||||| ||| | |||||    
T  31569204 tgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttcttcaccaacaacacaggtgctccccacggcgaaacactgggtcttacaaa 31569105  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || ||||| || || || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||||||||||    
T  31569104 cttcttatcaagtaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggctttgttccaggaaca 31569005  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcagg 256  Q
    || ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31569004 aggtcaattgaaaactccacctccctctctggcggcacatcaggaatctcatcagg 31568949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 27356956 - 27357219
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  27356956 tgttcaactgacggtaatctatgcacaatctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaa 27357055  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || || || | ||  ||||| || ||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| || |||   || |||||  |||||||||| ||||||    
T  27357056 tttcttatctaacaggtcctcaaactgtttcttcaatttagctaactcagaagctgacatacggtatggttctatcgacactggcttcgttcctggaaca 27357155  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27357156 aggtcaattgaaaattcaacctccctctatggtggcacataaggaatctcatcaggaaaaactt 27357219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Original strand, 22373615 - 22373919
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||||| |  |  || |||| ||| ||||| ||  |||  || || ||||||||||| ||||    
T  22373615 gccatcaaagagaacattaagattccatcacgttctaaatgcttcaactatttagtagtcaagaactcggcttcactctcttcctcagcagaagaaaaat 22373714  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
      || | ||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  || | || | ||| || | |||    
T  22373715 gtaccgtcttactaaaacaattaatatgaacacggttatactctaaccagttcatcccaaagattacatccatacctgtcgatggcaaacatacaagatc 22373814  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
    || |||||| || | ||||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22373815 aacttcaaagtctctatcaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcca 22373914  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  22373915 ttcat 22373919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 496 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 22245868 - 22245746
Alignment:
Q  496 aggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 595  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22245868 aggtaaacaaaccaaattaatttcaaaatctcgaccaaacatagacaaaggacatattaagcacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 22245769  T
Q  596 tcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  22245768 tcgacaaccatctatccattcat 22245746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 31414830 - 31414663
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || |||||||| || ||  | |||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  31414830 tgttcaactgacggtaattaatgcataatttcatgctaccatccttcttcttaactaacaacaccggcactccccaaggtgaaacacttggtcttacaaa 31414731  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataag 168  Q
    ||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  31414730 cttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacgataag 31414663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 29301787 - 29301536
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  || ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  29301787 tgttcaactgacggtaatcgatgcacaatctcatgctaccatcctttttctttactaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacacttggccttacaaa 29301688  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| | ||| |||||| |||| || || ||||||    
T  29301687 tttcttatcaagtaagtcctccaactgtttcttcaactcggctaactcagacgccgacatacggtaaggagccatcgacacaggctttgtacccggaaca 29301588  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcat 252  Q
    || || || |||||||| || || || ||||| |||||||| || |||||||    
T  29301587 aggtctattgaaaattccacttctctttctggtggcacatctggtatctcat 29301536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 319 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 29301456 - 29301157
Alignment:
Q  319 caaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacact 418  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||  || |||||  |  ||||||| || ||||||||||| |||| |||     
T  29301456 caaagaacacatcaaaatgccatcacgttctaactgcttcaactgcttagtagttaagaactcaacttcaccttcttcctcagcagaagaaaaatgcacc 29301357  T
Q  419 gacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaattt 518  Q
    | |||| |  |||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    || || | |||||| |||||||       
T  29301356 gtcttgttgtaacagttaatgtgaactcgattatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgataacggcaaacaaactaaatcaacca 29301257  T
Q  519 caaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||| || | | ||||||||||||  ||||| || | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  29301256 caaagtctctaccaaacatagacaacggacaactcagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 29301157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 23657347 - 23657509
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| || ||||||| ||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||| | | |||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  23657347 tgttcaattgacgataatcaatgcataatctcatgctaccatccttcttcttaactaacaacaccagcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaa 23657446  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacg 163  Q
     || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  23657447 tttcttatcaagcaagtcctcaaattgttttttcaattcagctaactcggaagctgacatacg 23657509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 395 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 22028234 - 22028011
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactca 494  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||  |||    
T  22028234 tcttcaacagaagaaaaatgcaccgtcttactaaaacaatttatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacattcatacccgtca 22028135  T
Q  495 aaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 594  Q
    | || | ||| || || || |  |||||||| | | ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  22028134 acggcaaacatactaagtcgacctcaaaatctctaccaaacatagacaatggacaccttaaacaaacaagagaagtagttactaaacccttagctggagt 22028035  T
Q  595 ttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||    
T  22028034 ttcaacaaccatttctcctttcat 22028011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 387 - 618
Target Start/End: Original strand, 22053682 - 22053913
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||  | ||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  22053682 caccttcttcttcagcagaagaaaaatgcatcgtcttactaaagcaattgatatgaacccggttatactctaaccaattcattccaaaaataacatccat 22053781  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| |||| |||||| |||||||   |||| || | | ||||||||||    ||||| || | ||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  22053782 acccgtcaacggtaaacaaactaaatcaaccacaaagtctctaccaaacatagatgtaggacacctcagacaaacaagagaagtagttactgaaccctta 22053881  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  22053882 gctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 22053913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 387 - 618
Target Start/End: Original strand, 28983730 - 28983961
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  || | ||| ||||| || || || |||||  | || ||||||||||| ||||||||||  || ||||||||    
T  28983730 caccttcttcttcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcgattatactctaaccaattcataccaaagataacatccat 28983829  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| || ||||||||||| |||||  ||||||| | | |||||||||| |  ||||| |  | ||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  28983830 acccgtcaacggcagacaaaccaagtcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaaccctta 28983929  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  28983930 gctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 28983961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22028534 - 22028378
Alignment:
Q  108 tcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaa 207  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  22028534 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcagacgctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcccggaacaaggtcaa 22028435  T
Q  208 tcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    | || || ||||| ||||||||| | || ||||  |||||||||||  |||||||||    
T  22028434 ttgagaactcaacctccctctctagtggtacatttggaatctcatccagaaaaactt 22028378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 22061040 - 22060929
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22061040 tgttcaactgacgataatcaatgcacaacctcatgctaccgtccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccaaggtgaaacactgggtctaacaaa 22060941  T
Q  101 ctttttctcaag 112  Q
    ||| || |||||    
T  22060940 cttcttatcaag 22060929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 387 - 618
Target Start/End: Original strand, 28988949 - 28989180
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  || | ||| ||||| || || || |||||  | || ||||||||||| ||||||||||  || ||||||||    
T  28988949 caccttcttcttcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcgattatactctaaccaattcataccaaagataacatccat 28989048  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| || ||||||||||| |||||  ||||||| | | |||||||||| |  ||||| |  | ||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  28989049 acccgtcaacggcagacaaaccaagtcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaaccctta 28989148  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  28989149 gctggagtatcaacaaccatttctcctttcat 28989180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 387 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 31414494 - 31414263
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||| ||| | ||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  31414494 caccttcttctttagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaataacatccat 31414395  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    ||   |||| |  | |||||| || ||   | |||| || | | ||||||||||||  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||||||    
T  31414394 actcgtcaacgacaaacaaactaagtcggctacaaagtctctaccaaacatagacaatggacatctcaagcaaactagagaagtagttactgaaccctta 31414295  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  31414294 gctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 31414263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 4984462 - 4984600
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  |||||||  || || ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  4984462 tgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttcttgaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaa 4984561  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactc 139  Q
    ||| || || | ||  ||||| || ||||||||||||||    
T  4984562 cttcttatccaacaggtcctccaactgtttcttcaactc 4984600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 16269186 - 16268967
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||| ||| | || || || |||||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  16269186 caccttcttcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactatagcagttgatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccgaaaataacatccat 16269087  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||   ||| || |||||||| |||||||   | ||||| | | |||||||||| |  ||||| |  | |||  ||||||||||||| || |||||||||    
T  16269086 acccgacaacggcagacaaactaaatcaaccacgaaatctctaccaaacatagatataggacaccccagacaagcaagagaagtagttactgaaccctta 16268987  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  16268986 gctggagtttcaacaaccat 16268967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16875456 - 16875289
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||| |  || || ||||| ||||||||||| ||| ||| |||    
T  16875456 tgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccagcaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaa 16875357  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataag 168  Q
    ||  ||||||||||| || || || || |||||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||||    
T  16875356 ctgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactccgatgcagacatccgataag 16875289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 21323233 - 21323154
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaag 474  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| | ||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21323233 tcttccgcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaaacaattgatatggacatggttatactccaaccagttcataccaag 21323154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 606
Target Start/End: Original strand, 27357423 - 27357574
Alignment:
Q  455 tctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatctta 554  Q
    |||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||   ||| || |||||||| |||||||   ||||||| | | |||||||||| |  ||||| |  |    
T  27357423 tctaaccaattcattccaaaaataacatccatacccgacaacggcagacaaactaaatcaaccacaaaatctctaccaaacatagatataggacacccca 27357522  T
Q  555 aacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
     ||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27357523 gacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 27357574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 322 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 31568870 - 31568718
Alignment:
Q  322 agaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgac 421  Q
    ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||| | |||||| |||   ||||||||  |  |||  || ||||| |||||||| |||| ||| | |    
T  31568870 agaaaacatcagaattccatcacgttctaactgcttcatttgcttcgtatttaaaaactcaacttcactctcttcttccgcagaaga-aaatgcaccgtc 31568772  T
Q  422 ttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaga 475  Q
    ||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31568771 ttgttaaagcaattgatatgaacatggttatactccaaccagttcataccaaga 31568718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 23902584 - 23902644
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaa 61  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23902584 tgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgctcccatccttcttcttaaccaacaa 23902644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22129746 - 22129679
Alignment:
Q  233 aggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  22129746 aggcacatcaggaatttcatctgggaaaacttccggaaagtcgcataccacttgtagattatctatca 22129679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 16414511 - 16414676
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||| || |||| ||| ||| | | |||    
T  16414511 tgttcaactgccgataatccacacacatcctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacattggagcaccccacggagaaatactcggtctgataaa 16414610  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgata 166  Q
    ||  ||||||||||| || ||||| |||| ||| || ||  ||||||| || || ||||| |||||    
T  16414611 ctgcttctcaagcaattcttctaactgttccttaaattcacccaactctgatgcagacattcgata 16414676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 21848698 - 21848533
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |   | || ||||| || |||||||||||| | | |||    
T  21848698 tgttcaactgccgataatccacacataacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactagagcaccccacggcgaaacacttggtctgataaa 21848599  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgata 166  Q
    ||  ||||||||||| || || || || |||||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||    
T  21848598 ctgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgata 21848533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 408; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 41426 - 40798
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| || ||| ||||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41426 tgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgataccatttttcttcttcactaacagaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 41327  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41326 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacatgcttcgttccaggaaca 41227  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  41226 agatcaatagaaaattcaacttctctatctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacctctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcgatca 41127  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |  || || ||||||||||||| ||||||    
T  41126 ctgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcacgttctaactacttcaaatgtttagtagacaaaaactttgcgcc 41027  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41026 actttcctcttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacatttaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattaaatccata 40927  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40926 ccactcaaaggtaaacaaaccatatcaatctcaaaatcaggatcaaacatagaaa--ggacatattaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 40829  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40828 ttggagtttcgacaaccatctctccattcat 40798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 403; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 3817 - 4447
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |  |||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  3817 tgttcaactgtcgataatcaatacacaacctcatgctaccatccttcttctttactaacaacacaggcgttcgccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 3916  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3917 ctttttctcaagcaaatcttctaattgtttcttcaactccgctaactctgaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaaca 4016  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4017 agattaatagaaaattcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcattaggaaaaacttatggaaaatcacataccacttgtagtttatcaatca 4116  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||    
T  4117 ccgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaagattccatcatgttctaactgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgtgcc 4216  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||| ||||    
T  4217 actttcctcttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccaatttttgccaagaatcacattcata 4316  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4317 ccactcaaaggtaaacaaaccaaatcgatctcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 4416  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4417 atggagtttcgacaaccatctctccattcat 4447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 589 - 618
Target Start/End: Original strand, 1 - 30
Alignment:
Q  589 tggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 tggagtttcgacaaccatctctccattcat 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 391; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 2984 - 3614
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||| | | ||||||||| || || |||||||| | |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2984 tgttcaactgccgacagtcaatacacaatctcatactaccatcttacttctttactatcaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 3083  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||  |||||    
T  3084 ctttttctcaagcaaatcctctagttgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatatgataaggtgtcatagacataggcgtcgttcccagaaca 3183  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3184 agatcaatcgaaaattcaacttctctttctagaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatca 3283  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  3284 ctacttgattctcaatagacaaggaagccatcaaagaaaacatcaaaattccataacgttctaactgcttcagctgtttagtagataaaaactctgcgcc 3383  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3384 actttcctcttccgcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 3483  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  3484 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaaatagttaccgaaaccttag 3583  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3584 ctgcagtttcgacaaccatctctccattcat 3614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 391; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 54020 - 54650
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  | ||||||||||| |||||||| || | |||||  |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  54020 tgttcaactgtcgatagtcaatacacaatgtcatgctaccatctttcttctttactagcaaaacgggcgctcccctaggtgaaacacgtggtctaacaaa 54119  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54120 ctttttctcgagcaaatcctctaattttttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaaca 54219  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  54220 agatcaatagaaaattcaacttctctctctagaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttttggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatcg 54319  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| |||||||||||||||||||  || ||  ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  54320 ctgcttgattctcaatagataacgaagccatcaaagaaaacaacaagattccatcacgttctaactgcttcaactgcttagtagacaaaaactctgcgcc 54419  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  54420 actttcctcttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcatgccaagaatcacatccata 54519  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54520 ccactcaaaggtaaacaaactaaatccatctcaaaatcacgatcaaacatagaaaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 54619  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54620 ctggagtttcgacaaccatttctccattcat 54650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 31267 - 31896
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| || |||||||  ||||| || || || |||||||| |||||||  || || |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  31267 tgttcaattgacgataatcgatacataatctcatactaccatctttcttctgtactaataaaaccggcgctccccatggtgaaacacttggtctaacaaa 31366  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  31367 cttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcacctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccagctttgttccaggaaca 31466  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  31467 agatcaatagaaaactcgacttctctctctggaggcatatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaagtcacataccacttgtagcttatcaatca 31566  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |   || | || ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  31567 ctgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcgcgttccagtcgcatcagctgcttagtagacaagaactctgcacc 31666  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |    
T  31667 actttcctcttcgacagaggagaaa-acacttacttgctaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacctagaatcacatccaaa 31765  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  31766 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatatcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagttaccgaacccttag 31865  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31866 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 31896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 36733 - 37362
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| || |||||||  ||||| || || || |||||||| |||||||  || || |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  36733 tgttcaattgacgataatcgatacataatctcatactaccatctttcttctgtactaataaaaccggcgctccccatggtgaaacacttggtctaacaaa 36832  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  36833 cttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcacctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccagctttgttccaggaaca 36932  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  36933 agatcaatagaaaactcgacttctctctctggaggcatatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaagtcacataccacttgtagcttatcaatca 37032  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |   || | || ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  37033 ctgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcgcgttccagtcgcatcagctgcttagtagacaagaactctgcacc 37132  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |    
T  37133 actttcctcttcgacagaggagaaa-acacttacttgctaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacctagaatcacatccaaa 37231  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| |  ||||||||||| || ||||||||||    
T  37232 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatatcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacataagagagaagtagtaacagaacccttag 37331  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37332 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 37362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 11160 - 10529
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgc--tccccaaggtgaaacacttggtttaaca 98  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| || | ||||||||| |||||||| || | |||||  |||||  |||||||||||||||||||  | |||||    
T  11160 tgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcaggctaccatctttcttctttactagcaaaactggcgcgctccccaaggtgaaacacttt-tctaaca 11062  T
Q  99 aactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaa 198  Q
    || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||  ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||     
T  11061 aatttcttttcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaacttggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgtcccaggag 10962  T
Q  199 caagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaat 298  Q
    |||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  10961 caagatcaatagaaaactcgacttccctctctggaggcacatcaggaatttcatccggaaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgtagcttatccat 10862  T
Q  299 cac-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcg 385  Q
    |||             |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| |  | ||| ||||| || || | |||     
T  10861 cactgcttgattctcaatagataacgaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcatctacttagtagataagaattttgca 10762  T
Q  386 ccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatcca 485  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||    
T  10761 ccactttcctcttcagcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaatttatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccataatcacatcca 10662  T
Q  486 taccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctt 585  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10661 taccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagttaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaaccctt 10562  T
Q  586 agctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10561 agctggagtttcgacaaccatctctccattcat 10529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 13815 - 13184
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgc--tccccaaggtgaaacacttggtttaaca 98  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||| |||||||| || | |||||  |||||  |||||||||||||||||||  | |||||    
T  13815 tgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttctttactagcaaaactggcgcgctccccaaggtgaaacacttt-tctaaca 13717  T
Q  99 aactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaa 198  Q
    || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||  ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||     
T  13716 aatttcttttcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaacttggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggat 13617  T
Q  199 caagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaat 298  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  13616 ctagatcaatagaaaactcgacttccctctctggaggcacatcaggaatttcatccggaaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgtagcttatccat 13517  T
Q  299 cac-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcg 385  Q
    |||             |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| |  | ||| ||||| || || | |||     
T  13516 cactgcttgattctcaatagataacgaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcatctacttagtagataagaattttgca 13417  T
Q  386 ccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatcca 485  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||    
T  13416 ccactttcctcttcagcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaatttatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccataatcacatcca 13317  T
Q  486 taccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctt 585  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13316 taccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagttaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaaccctt 13217  T
Q  586 agctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13216 agctggagtttcgacaaccatctctccattcat 13184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 618
Target Start/End: Original strand, 4001 - 4596
Alignment:
Q  36 ctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttca 135  Q
    |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4001 ctaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaactttttctcaagcaaatcttctaattgtttcttca 4100  T
Q  136 actcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggagg 235  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  4101 actcagctaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttcccggaacaagatcaatcgaaaattcaacttctctttctggagg 4200  T
Q  236 cacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagataaggaagccatcaaa 322  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||             ||||| |||||||||||||||    
T  4201 cacatcaggaatttcatcaggaaaaacttatggaaaatcgcataccacctgaagcttatcaatcaccgcttgattctcaatagacaaggaagccatcaaa 4300  T
Q  323 gaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgact 422  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4301 gaaaacatcaaaatttcatcacgttctaattgcttcagctgtttagtagataagaactctgcgcaactttcctcttcagcagaagagaaatacaccgact 4400  T
Q  423 tgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaa 522  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4401 tactaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcatgacaagaattacatccataccacacaaaggtaaacaaaccaaatcaatttcaaa 4500  T
Q  523 atcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4501 atcatgatcaaacatagacaaaggacttcttaaacacacaagggaagtagtcaccgaaccctcagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 4596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 24866 - 24236
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  24866 tgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatccttcttctttactaacaagacaggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaa 24767  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  24766 ctttttctcgagcaaatcttctatttgtttcttcaacttagctaactcggaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaaca 24667  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24666 agatcaatcgaaaattcaacttctctctctagaggcacatcaagaatttcatcaggaaaaacttatggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatca 24567  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  24566 ccgcttgattctcaatagacaaggaagccatcaaagaaatcatcaaaattccatcacgttctaactgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcacc 24467  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24466 acttttctcttcagcagaagagaaatacaccgatttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcatgccaagaatcacatccata 24367  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24366 ccactcaaaggtaaacaaaccaaatcaatcctaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatctcaaacgcacaagagaagtagtcaccgaacccttag 24267  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24266 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 24236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 377 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 10304 - 10075
Alignment:
Q  377 aactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaa 476  Q
    |||||||| ||||  || ||||| ||| |||| |||| ||| | ||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  10304 aactctgctccactctcttcttccgcaaaagaaaaatgcaccgtcttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaa 10205  T
Q  477 ttacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcac 576  Q
    | |||||||||||  |||| |||| |||||| || || | |||||| || | |  |||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  10204 taacatccatacccgtcaacggtaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctactaaacatagacaacggacatcttagacaaactagagaagtagttac 10105  T
Q  577 cgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10104 tgaacccttagctggagtttcaacaaccat 10075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 126 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 10568 - 10430
Alignment:
Q  126 tgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccc 225  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  10568 tgtttcttcaactcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccc 10469  T
Q  226 tctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  10468 tttctggtggtacatctggaatctcgtccggaaaaactt 10430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 103610 - 104240
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||| || || |||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  103610 tgttcaactatcgataatcaatgcacaatctcatactaccatctttcttcttaactagcaatatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaa 103709  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  103710 ctttttatcaagtaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaaca 103809  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||    
T  103810 aggtcaatcgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgcataccacctgtaacttatcaatca 103909  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  103910 cctcttgattctcaatagacaaggatgccatcaaagaaaacatcaaaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttggtagacaaaaactctgcgcc 104009  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||     
T  104010 actttcctcttcagcagaagagaaatacaccgacttgctaaaacaagtaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcatacccatgattacatccatg 104109  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  104110 ccactcaaaggtaaacaaaccaagtcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagttacctaacccttag 104209  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104210 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 104240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 371; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 18262 - 17640
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18262 tgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaaccggcgctctccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 18163  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  |||| |    
T  18162 ctttttctcgagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataagatgtcatagacataggcttcgttcgtggaaga 18063  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  18062 agatcaatcgaaaactcaacttccctctctggaggcacatcaggaatttcatcgggaaaaacttctggaaaatcgcacaccacttgtagtttatctatca 17963  T
Q  301 c-----------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
    |           |||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17962 ccgcttgattcaatagataaggaagccatcgaagaaaacatcaaaatgccatcacgttccaactgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcgccac 17863  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||     ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17862 tttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttactataacaattaatgtgaacatgg-----ctccaaccagttcataccaataatcacatccatacc 17768  T
Q  490 actcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagct 589  Q
    |||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17767 actcaaaggtaagcaaactaaatccatctcaaaatcacgatcaaacatagaca-aggacatcttaaacacacaagagaagtagtcagcgagcccttagct 17669  T
Q  590 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17668 ggagtttcgacaaccatttctccattcat 17640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 39441 - 40071
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| || ||||| | ||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||| |   ||||||||||  |||||||||| ||| |||||||    
T  39441 tgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcgtgctaccgtccttcttctttaccaacaacacaagcgctccccacagtgaaacactgggtctaacaaa 39540  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| || || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  39541 cttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagatgctgacatacgatatggtgccatcgacaccgacttcgttcctggaaca 39640  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    || || || || || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||  ||||| ||    |||||| |||   |||||||||    
T  39641 aggtcgatggagaactcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcctgaaaaacttcaggaaattcattcaccactggtaacctatcaatca 39740  T
Q  301 ca--taga-----taagga------agccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    ||  | ||     ||| ||       ||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||  || || |  || || |||||||| |||||  |  |    
T  39741 cagcttgattttctaacgacaaatttgccattaaagaatacatcaaaattccatcacgttctagttgtttcatctgtttcgtagacaagaactccacatc 39840  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    ||| || |||||| | ||||| |||| ||| | ||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| | | |||||||||    
T  39841 accctcttcttcatcggaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcaatttatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaactaacatccata 39940  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||  |||| |||||||| || || || |   ||||||| | | ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| |    
T  39941 cctgtcaacggtagacacactaagtcgaccacaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacagacaagagaagtagttactaaacccttgg 40040  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  40041 ctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 40071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 22259 - 22460
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  22259 tgttcaactgatgataatcaatgcacaacctcatgctaccatccttcttctttaacaacaacacaggcgctccccacggtgaaacactgggtctaacaaa 22358  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| || || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  22359 cttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagatgctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaaca 22458  T
Q  201 ag 202  Q
    ||    
T  22459 ag 22460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 57 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 111772 - 111198
Alignment:
Q  57 aacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctg 156  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  111772 aacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaactttttctcaagcaaatcttctaattgtttcttcaactcagccaactcagaagctg 111673  T
Q  157 acatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcagg 256  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  111672 acatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgttcctggaacaagatcaatcgaaaactcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcattagg 111573  T
Q  257 aaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatca 343  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||              ||||| || || |||||||| ||||||||||| ||  |||||    
T  111572 aaaaacttctggaaaatcgcataccacctgtagtttatcaatcattacttgattctcaatagacaatgatgccatcaaggaaaacattaagattccatca 111473  T
Q  344 cgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaa 443  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  111472 cgttctaactgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcgccactttccttttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaa 111373  T
Q  444 catggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacag 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  111372 catggttgtactctaaccagttcatgccaagaatcacatccataccactcaaaggtaaacaaaccaagtcaatttcaaaatcacgatcaaacataaacaa 111273  T
Q  544 gggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  111272 agggcatcttaaacacacaagagaagtagtcaacaaacccttagctggagtttcgacaaccatcactccattcat 111198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 3 - 618
Target Start/End: Original strand, 17263 - 17891
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| || || |||||||| |||||||| || ||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  17263 ttcaactgtcgataatcaataaacaatctcatactaccatctttcttcttaactaacaataccggtgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaact 17362  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || ||||| ||||| ||||  || |||||||||||   ||||| |||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||| || ||||||||    
T  17363 tcttatcaagaaaatcttctagctgcttcttcaactcaatcaactaagaagccgacatacggtaaggagtcataaacacaggcttcgtacccggaacaag 17462  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    ||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||     
T  17463 atcaatcgaaaattcaactactctttctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttctggaaaatcacatacaacctgtaacttatcaatcact 17562  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||| ||||| || | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17563 gcttgattctcaacagacaaggatgccatcaaagaaaacatcaaaattccatcgcgttctaattgcttcagctacttagtagacaaaaactctgctccac 17662  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
     ||| ||| ||| |||||| |||||||| |||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  17663 tttcttctacagtagaagaaaaatacaccgacttaacaaaacaattaatatgaacatgattgtactctaaccagttcataccaaggattacatccattcc 17762  T
Q  490 actcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagct 589  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17763 actcaaaggtaaacaaaccaaatcaatttcaaagtctcgaccaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccaaacccttagct 17862  T
Q  590 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17863 ggagtttcgacaaccatttccccattcat 17891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 1303 - 669
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccat----ccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaa 96  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||  | ||||||||||    | ||||||||||| | ||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  1303 tgtttaactgtcgatagtcaatacacaatatcatgctaccatatatctttcttcttcactagcaaaaccagcgctccccaaggcgaaacacttggtctaa 1204  T
Q  97 caaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccagg 196  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  1203 caaactttttctcaagtagatcttctaattgtttcttcaactcggccaactcataagctaacatacgataaggtgtcatagacacaggctttgttccagg 1104  T
Q  197 aacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatca 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1103 aacaagatcaatcgaaaactcaacttccctctctagaggcacattaggactttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatca 1004  T
Q  297 atcac-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctg 383  Q
    |||||             |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| |     
T  1003 atcactgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaggaaaacatcaaaatgccatcacgttctaactgcttcagctgctttgtagataaaaactttt 904  T
Q  384 cgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatc 483  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  903 cgccactttcctcttcagtagaagagaaatacaccgacttactataacaattaatgtgaacatggatgtactctaaccagttcatacccataatcacatc 804  T
Q  484 cataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccc 583  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  803 cataccacccaaaggtaaacaaaccatatcaatctcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagtgaagtagtcacagaaccc 704  T
Q  584 ttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  703 ttagctggagtttcgacaaccatttctccattcat 669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 579
Target Start/End: Original strand, 837 - 1426
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||| || ||||||| ||| |||||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  837 ttcagctgtcgatagtcaatacacaatctcatgctactatcattcttctttactaacaaaactggcgctcctcaaggtgaaacacttggtctaacaaact 936  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  937 ttttctcaagcaaatcttctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctaacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaacaag 1036  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |     
T  1037 atcaatagaaaattcaacttctctctcaagaggcacatcaggaatttcattaggaaaaacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatcgct 1136  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1137 gcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaagattccatcacgttctaactgcttcaactgcttagtagacaaaaactctacgccac 1236  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  1237 tttcctcttcagcagaagagaaatacaccaacttactaaaacaattaatatggacatggttgtactctaaccagttcatgccaagaatcacatccgtacc 1336  T
Q  490 actcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccga 579  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1337 actcaaaggtaaacaaaccaaatcaatctcaaaatcacgatcaagcatagacaaaggacatcttaaacacgcaagagaagtagtcaccga 1426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 575 - 618
Target Start/End: Original strand, 3521 - 3564
Alignment:
Q  575 accgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3521 accgaacccttagctagagtttcgacaaccatctctccattcat 3564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 60)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 558
Target Start/End: Original strand, 21751309 - 21751876
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21751309 tgttcaactgtcgataataaatacacaacctcatgctaccatccttcttctttactaacaacacaggcgctccccaaagtgaaacacttggtctaacaaa 21751408  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    |||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21751409 ctttttctcaagcaaatctttcaactgtttcttcaactc---caactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 21751505  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21751506 agatcaatagaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaagaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatca 21751605  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  21751606 ccgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacattaagattccatcacgttctaactgcttcagctgtttagtagacaaaaactctgcgcc 21751705  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  21751706 actttcctcttcagtagaagagaaatacaccgatttactaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaacgagttgatgccaagaatcacatccata 21751805  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaaca 558  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21751806 ccactcaaaggtaaacaaaccatatcaatctcaaaattacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaaca 21751876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 618
Target Start/End: Original strand, 16378466 - 16379093
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||  | || |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  16378466 ttcaactgtcggtaatcaatacacaatttcatactaccatctttctttttaactaacaatatcggcgctccccaaggagaaacacttggtctcacaaact 16378565  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  16378566 tcttatcaagcaaatcctctaactgtttcttcaacttagccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttctcggaacaag 16378665  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    |||||||| |||| |||| || |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||||||||||     
T  16378666 atcaatcggaaat-caacttctctctatagaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtaacttatcaatcact 16378764  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                |||||||| || |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  16378765 gcttgattctcaatagataaagatgccatcaaagaaaacatctaaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttagtagacaaaaactttgctccac 16378864  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
      || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  16378865 tctcttcctcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccaggattacatccattcc 16378964  T
Q  490 actcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagct 589  Q
     |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16378965 gctcaaaggtaaacaaaccaaatcaatctcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatcttaaacaaacaagagaagtagtcaccgaacccttagct 16379064  T
Q  590 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16379065 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 16379093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 17043005 - 17042375
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||| |||||||| || | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17043005 tgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 17042906  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||  ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  17042905 tttcttttcaagcaaatcctctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagcaaacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaaca 17042806  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  17042805 agatcaatagaaaattcgacttccctttctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgtagcttatctatca 17042706  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  |||  |||| |  ||||| || ||||| | ||| || |||||||| ||    
T  17042705 ctgcttgattctcaatagataaagaagccatcaacgaaaacatcaaaatactatcgtgttccatttgcttcagctgcttagcagataagaactctgcacc 17042606  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  17042605 actttcctcttcagcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccagaatcacatccata 17042506  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  17042505 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 17042406  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17042405 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 17042375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 19108737 - 19109367
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19108737 tgttcaactgtcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 19108836  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  19108837 tttcttctcaagcaaatcttccaactgtttcttcaactcagataattcagaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaaca 19108936  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||| ||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  19108937 agattaatagaaaactcgacttccctttctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtatcttatcaatca 19109036  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  19109037 ctgcttgattctcaatagataaagaagccattaaagaaaacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 19109136  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  19109137 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactctaaccaattcatacccagaatcacatccata 19109236  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19109237 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcatgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatactagagaagtagtcaccgaacccttag 19109336  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19109337 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 19109367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 22360234 - 22359748
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22360234 tgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatttttcttcttcactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 22360135  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  22360134 ctttttctcaagtaaatcttctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagaaacaggcttcgttccaggaaca 22360035  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22360034 agatcaatcgaaaattcaacttccctctctagaggcacatcaggaatttcatcaggaaatacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatca 22359935  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22359934 ctgcttgattctcaataaataaggaagccatcaaagaaaaaatcaaaataccatcacgttctaactacttcagctgcttagtagacaaaaactctgcacc 22359835  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaag 474  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22359834 acttttctcttcagcagaagagatatacactgatttactaaagcaaataatatgaacatggttatactctaaccagttcataccaag 22359748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 16348585 - 16347955
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16348585 tgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 16348486  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || || ||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  16348485 cttcttttcgagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 16348386  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  ||||  |||||||||    
T  16348385 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcgcacaccaccggtagcctatcaatca 16348286  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  16348285 ctgcttgattctcaatagataaagaagccatcaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 16348186  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  16348185 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 16348086  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16348085 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 16347986  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16347985 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 16347955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 33389019 - 33388389
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  33389019 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaa 33388920  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||||||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  33388919 ctttttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 33388820  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  33388819 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 33388720  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | ||||||||| |||||||| || ||| | || ||||  |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  33388719 ctccttgattctcaatagataaagtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgtttcagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 33388620  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  33388619 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 33388520  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  33388519 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 33388420  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33388419 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 33388389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 51331483 - 51330852
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggt-gaaacacttggtttaacaa 99  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  51331483 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggttgaaacacttggtctaacaa 51331384  T
Q  100 actttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaac 199  Q
    |||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||||||    
T  51331383 acttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaac 51331284  T
Q  200 aagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatc 299  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || || || || |||||  | |   | ||||||    
T  51331283 aagatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcagggaattcacacaccaccggcaacctgtcaatc 51331184  T
Q  300 ac-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgc 386  Q
    ||             | |||||| || |||||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  51331183 actgcttggttctcaacagataaagaggccatcaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcac 51331084  T
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||| |||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  51331083 cactttcctcttcgacggaaaagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccat 51330984  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  51330983 accactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaaccctta 51330884  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51330883 gctggagtttcgacaaccatctctccattcat 51330852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 21832671 - 21833301
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21832671 tgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaa 21832770  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||| |||    
T  21832771 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccagggaca 21832870  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  21832871 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 21832970  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||||| |||||| ||  ||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  21832971 ctgcttgattctcaatagataaggtagccattaacaaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 21833070  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21833071 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 21833170  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21833171 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccattttgaaatcacgaccaaacatagataaaggacatttcaaacagacgagagaagtagtcaccgaacccttag 21833270  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833271 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 21833301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 21862363 - 21861877
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21862363 tgttcaactgtcgataatcaatgcacaatctcatgctaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttgttctaacaaa 21862264  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  21862263 ctttttctaaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacactgacttcgttccaggaaca 21862164  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||| || ||||  ||||||||||    
T  21862163 agatcaatcaaaaattcaacttctctctctggaggcacatcgggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgtatacaacctgtaacttatcaatca 21862064  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||    
T  21862063 ctgcttgattctcaatagacaaggatgccatcaaagaaaatatcaagattccatcacgttctaattgcttcagctgcttcgtagataagaactctgcgcc 21861964  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaag 474  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21861963 acattcttcttcagcagaagagaaatacaccgacttaataaaacaattaatattaacatggttgtactccaaccagttcataccaag 21861877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 443
Target Start/End: Original strand, 20140452 - 20140907
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||  ||| || ||| | || ||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  20140452 tgttcaactgacgataagcaatgcataacttcatactaccgtctttcttctttaccaacaaaacgggcgctccccaaggcgagacacttggtctaacaaa 20140551  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  20140552 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatggacataggcttcgttccaggaaca 20140651  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  20140652 agatcgatcgaaaattcaacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttctggaaaatcgcataccgcttgtagtttatcaatta 20140751  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||  || | ||||||    
T  20140752 ctgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcacgttctaactgcttcagctgcttagtagacatgaattatgcgcc 20140851  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaa 443  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  20140852 actttcctcttcagcataagagaaatacaccgacttactaaagcaattaatgtgaa 20140907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 41351658 - 41351028
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41351658 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 41351559  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    |||  | || ||||| ||||| || |||||||||||||| |  || || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  | |||||||||||||||    
T  41351558 cttcctttcgagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataattctgaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggtttcgttccaggaaca 41351459  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  ||||  |||||||||    
T  41351458 agatcaatagaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatca 41351359  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             | |||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  41351358 ctgcttgattctcaacagataaagaagccatcaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 41351259  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  41351258 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 41351159  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||  ||||||||||||||    
T  41351158 ccactcaaaggtaggcaaactaaatccatttcaaaatcacgactaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtaagcaccgaacccttag 41351059  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41351058 ctggagtttcgacaaccatctctccgttcat 41351028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 22503277 - 22502754
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||    
T  22503277 ttcaacttacgataatcaatacacaatctcatgctaccatttttcttcttcactagcaaaaccggcgctccccagggtgaaacactgggtcttacaaact 22503178  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| |||||||    
T  22503177 tcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcagaacctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaagaacaag 22503078  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||| || |||||||||||     
T  22503077 atcaatagaaaactcaacttctctctctgaaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcagcaaaatcgcataccacttggagcttatcaatcact 22502978  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22502977 gcttgattctcaatagataaggaagccatcaaggaaaaaatcaaaataccatcgcgttctagttgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcaccac 22502878  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
     |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  22502877 tttcctcttcaacggaggagaaatacattgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcatacccagaatcacatccattcc 22502778  T
Q  490 actcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||||||||||||||||| |||||    
T  22502777 gctcaaaggtagacaaactaaatc 22502754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 430106 - 429737
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| |||||||| || | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  430106 tgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggcgaaacacttggtctaacaaa 430007  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  430006 cttcttctcaaggagatcttctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaaca 429907  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  429906 agatcaatcgaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaatttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatca 429807  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctt 357  Q
    |             |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  429806 ctgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaggaaaacatcaaaatgtcatcacgttccaactgctt 429737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 21233721 - 21233181
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21233721 tgttcaactgacgatagtcaatacacaaactcatgctaccatatttcttcttcactagcaaaactggcgttccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 21233622  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| || ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  21233621 tttcttctcaagcaattcttctaactgtttcttcaattcagctaactcggaagcagacatacgataagatgccatcgacaccggcttcgttccaggaaca 21233522  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  21233521 agatcaatagaaaactcgacttccctctctagaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgtagcttatcaatca 21233422  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             | |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||| || ||| | ||||| |  |||| ||| ||    
T  21233421 ctgcttgattctcaagagataaagaaaccatcaacgaaaacatcaaaataccatcgcgtttcatttgcttcagctgcatagtagatacgaactttgcacc 21233322  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  21233321 actttcctcttcagcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccagaatcacatccata 21233222  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacg 528  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21233221 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacg 21233181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 478
Target Start/End: Original strand, 21839319 - 21839809
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||  || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21839319 tgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 21839418  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  21839419 cttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 21839518  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || || |||||||| ||||||||||    
T  21839519 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacacaacttgtagcttatcaatca 21839618  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||||| |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  21839619 ctgcttgattctcaatagataaggtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 21839718  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaatt 478  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21839719 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatt 21839809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 230 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 24785618 - 24785217
Alignment:
Q  230 tggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagataaggaagcc 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||             |||||||| ||||||    
T  24785618 tggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatcactgcctgattctcaatagataaagaagcc 24785519  T
Q  317 atcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaataca 416  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  24785518 atcaaagaatacatcaaaataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaataca 24785419  T
Q  417 ctgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaat 516  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  24785418 ctgatttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccataattacatccataccgctcaaaggtagacaaaccagatccat 24785319  T
Q  517 ttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattc 616  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  24785318 ttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggaatttcaacgaccatctctccattc 24785219  T
Q  617 at 618  Q
    ||    
T  24785218 at 24785217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 21740006 - 21739396
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| || || |||||||| ||||    
T  21740006 atacacaacatcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacatcggcgctccccacggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcct 21739907  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || ||||||||||| ||  | ||||  ||  |||||||||| ||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  21739906 ccaactgtttcttcaattcaactaacttggacactgacatacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgttccgggaacaagatcgatagaaaattcaac 21739807  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcaca--tagat----------- 307  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||    || ||  | | |||||||||||||  | |||               
T  21739806 ctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttccggaaattcattcacaaccggcaatttatcaatcacagcttgattctccaatgac 21739707  T
Q  308 aaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaag 407  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||  ||||||| || || ||||| |  || || ||||  || ||||| ||  |||  || |||||||||||||    
T  21739706 aagtatgccatcaaagaaaacattagaattccatcacgctccaattgcttcaactgtttagtagttaagaactcagcttcactctcttcttcagcagaag 21739607  T
Q  408 agaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaac 507  Q
    | |||| | | | ||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| || | ||| ||    
T  21739606 aaaaatgcgccgtcttactaaagcaattaatatgaacacggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgtcaacggcaaacatac 21739507  T
Q  508 caaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatc 607  Q
     | ||| | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| || ||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  21739506 tagatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagaaaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatt 21739407  T
Q  608 tctccattcat 618  Q
    ||||| |||||    
T  21739406 tctcctttcat 21739396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 50618369 - 50618088
Alignment:
Q  20 aatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcc 119  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||||||| || |||||||   |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||     
T  50618369 aatacacaatctcatactaccatctttcttctttactaacaaaacgtgcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaaatct 50618270  T
Q  120 tctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaa 219  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||    
T  50618269 tctaactgtttcttcaactcagccaactcagaaactgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaataaggtcaattgaaaattcaa 50618170  T
Q  220 catccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac 301  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||  |||||||||||    
T  50618169 cttctctctctggaggcacatctggaatttcatcaggaaaaacttcgggaaaattgcataccacctgtaacttatcaatcac 50618088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22016733 - 22016465
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  22016733 ttcaactgacgataatcaatgcataacctcatgctaccatccttcttctttaccaacaacatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaatt 22016634  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || |||||||| ||||| || ||||||||||  |  || ||||| || || ||||||||||||||||  || |||||  |||||||||| ||||||||    
T  22016633 tcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcagttaagctaactcggacgccgacatacgataaggtgctatcgacaccggcttcgttcctggaacaag 22016534  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22016533 gtcaattgaaaattcaacgtccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 22016465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 21743522 - 21742912
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| || || |||||||| ||||    
T  21743522 atacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccacggtgaaacactcggtcttacaaatttattatcaagcaagtcct 21743423  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || | ||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||||| ||| |||||  |||||||||| || | |||||| || |||||||||||    
T  21743422 ccaactatttcttcaattcagctaactcggacgccgacatacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgttccgggcataagatcgattgaaaattcaac 21743323  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcaca--tagat----------- 307  Q
     |  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| || |  || ||  | | | |||||||||||  | |||               
T  21743322 ctttctctctggtggcacatctggaatctcatgaggaaaaacttctggaaattcactcacaaccggaaatctatcaatcacagcttgattctccaatgac 21743223  T
Q  308 aaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaag 407  Q
    ||  | ||||||||||||||||||| |||  ||||||| || |||||||| |  || || |||| ||| ||||  ||  |||  || |||||||||||||    
T  21743222 aactatgccatcaaagaaaacattataattccatcacgctccaactgcttcaactgtttcgtagtcaagaacttagcttcactctcttcttcagcagaag 21743123  T
Q  408 agaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaac 507  Q
    | |||| ||| | ||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||   ||| || | ||| ||    
T  21743122 aaaaatgcaccgtcttactaaagcagttaatatgaaaatggttatactctaaccagttcatcccaaaaatcacatccacacccgacaacggcaaacatac 21743023  T
Q  508 caaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatc 607  Q
     | ||| | |||||| || | | ||||||||||||   |||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  21743022 tagatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacagacaactcaaacaaacaagagacgtagttaccgaacccttagctggagtttcaacaaccatt 21742923  T
Q  608 tctccattcat 618  Q
    |||||||||||    
T  21742922 tctccattcat 21742912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 38910816 - 38910546
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  |||||||  || || ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  38910816 tgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaa 38910717  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || || | || |||||| || || |||||||||||  | |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  38910716 cttcttatctaacagatcctccaactgcttcttcaactcaactaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaaca 38910617  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38910616 agatcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaatacttatggaaa 38910546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31537987 - 31537717
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  |||||||  || || ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  31537987 tgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaa 31537888  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || || | ||  ||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  31537887 cttcttatctaacaggtcctccaactgcttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaaca 31537788  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31537787 agatcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaatacttctggaaa 31537717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 37679449 - 37679719
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  |||||||  || || |||||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  37679449 tgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttctttttgaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaa 37679548  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || || | ||  ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  37679549 cttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaaca 37679648  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  37679649 agatcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacacttctggaaa 37679719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 48425273 - 48425543
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  |||||||  || || ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  48425273 tgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaa 48425372  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || || | ||  ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  48425373 cttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaaca 48425472  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  48425473 agatcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcagggaatacttctggaaa 48425543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 52988141 - 52988411
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  |||||||  || || ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  52988141 tgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaa 52988240  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || || | ||  ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  52988241 cttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaaca 52988340  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  52988341 agatcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcagggaatacttctggaaa 52988411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 458 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 20081896 - 20081736
Alignment:
Q  458 aaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaac 557  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||    
T  20081896 aaccagttcatacccagaatcacatccataccactcaaaggtagacaaactaaatccatctcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaac 20081797  T
Q  558 acacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20081796 atacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 20081736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20833885 - 20833627
Alignment:
Q  6 aactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttt 105  Q
    ||||| ||||| | ||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  20833885 aactgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatccttcttctttactaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttct 20833786  T
Q  106 tctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatc 205  Q
    | |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |  ||||| || ||||||||||||| || ||| |||||  |||||||||| |||||||| ||    
T  20833785 tatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagcaagttcagacgccgacatacgataagatgccatcgacaccggcttcgttcccggaacaaggtc 20833686  T
Q  206 aatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  20833685 aattgaaaactcaacctccctctctggtggtacatctggaatctcatccgaaaaaactt 20833627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Original strand, 41310946 - 41311196
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| |||||| |||| ||| | ||||| || || ||||| |||||||    
T  41310946 atacacaaactcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgcttcccacggtgaatcactcggtcttacaaatttcttatcaagtaaatcct 41311045  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || ||||||||||| |  || ||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||    
T  41311046 ccaactgtttcttcaattaagctaactcggacgccgacatacgataaggtgccatggacaccggcttcgttccaggcacaagatcgattgaaaatttaac 41311145  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41311146 ctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaa 41311196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 78 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24097528 - 24097335
Alignment:
Q  78 ggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatag 177  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  24097528 ggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaacttagaagctgacatacgataaggtgccatcg 24097429  T
Q  178 acacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    ||||  |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24097428 acaccggctttgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacacttatggaaa 24097335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20854750 - 20854487
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |  || |||||||| || |||||||| ||| | |||||    
T  20854750 tgttcaactgacgatagtcaatgcacaacctcatacttccatctttcttcttcaccaataacacgggtgctccccacggcgaaacactgggtctcacaaa 20854651  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||  | |||||||| ||||||    
T  20854650 cttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcggctaattcagaagctgacatgcgatacggtgccatcgacactggtttcgttcccggaaca 20854551  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20854550 agatcaatcgagaactcaacttctctttctggtggcacatcaggaatctcatctggaaaaactt 20854487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Original strand, 20296816 - 20297051
Alignment:
Q  36 ctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| || || || | ||  || || || ||||||||||    
T  20296816 ctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaatttcttatccaacaggtcttccaactgtttcttca 20296915  T
Q  136 actcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggagg 235  Q
    |||| || ||||||||||||||||| || || |||| ||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  20296916 actcagctaactcagaagctgacatgcggtatggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccctctttggtgg 20297015  T
Q  236 cacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  20297016 cacatcaggaatctcatcaggaaatacttttggaaa 20297051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 396 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 429739 - 429577
Alignment:
Q  396 cttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaa 495  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  429739 cttcagcagaagagaaatacaccgacttactgtaacaattaatgtgcacatggttgtattccaaccaattcataccaagaatcacatccataccactcaa 429640  T
Q  496 aggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaaca 558  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||    
T  429639 atgtagacaaaccaaatccatctcaaaatcactatcaaacatagacaaatgacatcttaaaca 429577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 262
Target Start/End: Original strand, 19856710 - 19856935
Alignment:
Q  37 taccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaa 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| || || || || |||||||||||    
T  19856710 taccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgacacacttggtcttacaaactttttatcaagtaagtcttccaactgtttcttcaa 19856809  T
Q  137 ctcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggc 236  Q
     || || |  ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  19856810 ttcagcaagttcagacgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcttggaacaaggtcaattgaaaattcaacctctctctctggtggc 19856909  T
Q  237 acatcaggaatctcatcaggaaaaac 262  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19856910 acatctggaatctcatccggaaaaac 19856935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 471 - 618
Target Start/End: Original strand, 21842064 - 21842211
Alignment:
Q  471 caagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagt 570  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| | ||||| || ||||||||    
T  21842064 caagaatcacatccataccgctcaaaggcagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaatgacatttcaaacatacgagagaagt 21842163  T
Q  571 agtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21842164 agtcaccgaacccttagctggagtttcgacaacaatctctccattcat 21842211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 21953278 - 21953541
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || |||| ||| ||||  || || ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  21953278 tgttcaactgacggtaatcaatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacattgggtcttacaaa 21953377  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || || || | ||  ||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  21953378 tttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaattcagctaactccgaagctgacatacggtatggtgccatcgacaccggctttgttcctggaaca 21953477  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21953478 aggtcaattgaaaattcaacctccctatctagtggcacatcaggaatctcatcaggaaacactt 21953541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 377 - 618
Target Start/End: Original strand, 19857063 - 19857304
Alignment:
Q  377 aactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaa 476  Q
    |||||||| ||||  || |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||| ||||||| |||| ||    
T  19857063 aactctgctccactctcttcttcagcagaagaaaaatgcactgtcttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactctaacaagttcatcccaaaaa 19857162  T
Q  477 ttacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcac 576  Q
    |  ||||||||||| |||| |||| |||||| || || | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| ||||  || |||||||||||||| ||    
T  19857163 tatcatccataccagtcaacggtaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttaggcaaacaagagaagtagttac 19857262  T
Q  577 cgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  19857263 tgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 19857304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 395 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 22016328 - 22016105
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactca 494  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| | ||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||    
T  22016328 tcttctgcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgtca 22016229  T
Q  495 aaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 594  Q
    | |||| |||||| |  || | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22016228 acggtaaacaaactaggtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagt 22016129  T
Q  595 ttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||    
T  22016128 ttcaacaaccatttctcctttcat 22016105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20938051 - 20937841
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| ||||| | ||| || ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  20938051 ttcaactgacgatagtcaatgcataacctcatactaccatccttattctttaccaacaataccggcgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaact 20937952  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || |||||||||||||| || |||||||||||  | || ||||| |||||| |||| |||||||||| ||| |||||  ||||| |||| ||||||||    
T  20937951 tcttatcaagcaaatcctccaactgtttcttcaatacagctaactcggaagctaacatgcgataaggtgccatcgacaccggcttcattcctggaacaag 20937852  T
Q  203 atcaatcgaaa 213  Q
     ||||| ||||    
T  20937851 gtcaattgaaa 20937841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 24097279 - 24096975
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||| |||||| |||| | |||  |||||||||||| ||| || |  || || |||||||| |||||  |  ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24097279 gccattaaagaatacatcagaattccatcacgttctagctgtttcatctgtttcgtagacaagaactcaacttcaccttcttcttcagcagaagaaaaat 24097180  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| | ||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| | || ||| |||||||||||  |||| || | |||||| || ||    
T  24097179 gcaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcattctaaaaataacatccatacccgtcaacggcaaacaaactaagtc 24097080  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
     | | |||| || | | ||||||||||||  |||||||| || || |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  24097079 gactacaaagtctctaccaaacatagacaatggacatctcaagcaaacaagagaagtaattactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcct 24096980  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  24096979 ttcat 24096975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 403 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 20833475 - 20833272
Alignment:
Q  403 agaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtaga 502  Q
    |||||| |||| ||| | ||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||  |||| |||| |    
T  20833475 agaagaaaaatgcaccgtcttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatccattcccgtcaacggtaaa 20833376  T
Q  503 caaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaa 602  Q
    ||||| || || | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||    
T  20833375 caaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttaatgaacccttatctggagtttcaacaa 20833276  T
Q  603 ccat 606  Q
    ||||    
T  20833275 ccat 20833272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 531 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 22496703 - 22496616
Alignment:
Q  531 caaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22496703 caaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 22496616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 314 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 20854424 - 20854132
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||| ||||| |||||||| |  || || ||||  | ||||||||| ||||  |||||||| |||||||| || |    
T  20854424 gccatcaaagaaaacataagaattccatctcgttccaactgcttcaactgtttagtagttagaaactctgctccactctcctcttccgcagaagaaaagt 20854325  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| | |||| |||||||||| ||    ||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||||||| ||   ||| |||||||| || || ||    
T  20854324 gcaccgtcttgttaaaacaatttatacagactcggttatactctaaccaattcatcccgaaaataacatccattcccaacaacggtagacacactaagtc 20854225  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
     |  |||||||| | | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20854224 gacctcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacacacaagagaagtagttactgaacccttggctggagtttcaacaaccat 20854132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 387 - 606
Target Start/End: Original strand, 12200317 - 12200536
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||  || | || || || |||||  | || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  12200317 caccttcttcttcagcagaagagaaatgcaccgtcttattatagcagttgatatgaactcgattatactctaaccaattcataccaaaaatcacatccat 12200416  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| || ||||| || ||||||||  ||||||| | | |||||||||| | |||||| |  | ||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  12200417 acccgtcaacggcagacacactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatatgggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaaccctta 12200516  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  12200517 gctggagtttcaacaaccat 12200536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 387 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 31537588 - 31537369
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  || | ||| ||||| || || || |||||  | || || |||||||| ||||||||||  || ||||||||    
T  31537588 caccttcttcttcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcgattatattctaaccaattcataccaaagataacatccat 31537489  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| | | |||||||||| |  ||||| |  | ||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  31537488 acccgtcaacggtagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaaccctta 31537389  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  31537388 gctggagtttcaacaaccat 31537369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 387 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 38910417 - 38910198
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||  || | || || || |||||  | || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  38910417 caccttcttcttcagcagaagagaaatgcaccgtcttattatagcagttgatatgaactcgattatactctaaccaattcataccaaaaatcacatccat 38910318  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| || |||||||| ||||||||  ||||||| | | |||||||||| |  ||||| |  | ||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  38910317 acccgtcaacggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaaccctta 38910218  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  38910217 gctggagtttcaacaaccat 38910198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 387 - 606
Target Start/End: Original strand, 48425672 - 48425891
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  || | ||| ||||| || || || |||||  | || ||||||||||| ||||||||||  || ||||||||    
T  48425672 caccttcttcttcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcgattatactctaaccaattcataccaaagataacatccat 48425771  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| || |||||||| ||||||||  ||||||| | | |||||||||| |  ||||| |  | ||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  48425772 acccgtcaacggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaaccctta 48425871  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  48425872 gctggagtttcaacaaccat 48425891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 387 - 606
Target Start/End: Original strand, 52988540 - 52988759
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  || | ||| ||||| || || || |||||  | || ||||||||||| ||||||||||  || ||||||||    
T  52988540 caccttcttcttcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcgattatactctaaccaattcataccaaagataacatccat 52988639  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| || |||||||| ||||||||  ||||||| | | |||||||||| |  ||||| |  | ||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  52988640 acccgtcaacggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaaccctta 52988739  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  52988740 gctggagtttcaacaaccat 52988759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 559 - 618
Target Start/End: Original strand, 21751987 - 21752046
Alignment:
Q  559 cacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21751987 cacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctcttcattcat 21752046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 387 - 606
Target Start/End: Original strand, 37679848 - 37680067
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| | || || ||||| ||  | ||  |||||||||| ||||||||||  || ||||||||    
T  37679848 caccttcttcttcagcagaagagaaatgcaccgtcttactatagcagttgatgtggactcgattaaactctaaccaattcataccaaagataacatccat 37679947  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| || |||||||| ||||||||  ||||||| | | |||||||||| |  ||||| |  | ||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  37679948 acccgtcaacggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaaccctta 37680047  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  37680048 gctggagtttcaacaaccat 37680067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19661124 - 19660991
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| ||||| | ||| || ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||    
T  19661124 ttcaactgacgatagtcaatgcataacctcatagtaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgacgcacttggtcttacaaact 19661025  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaa 136  Q
    |||| |||||||| || || || |||||||||||    
T  19661024 ttttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 19660991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 387 - 606
Target Start/End: Original strand, 20297180 - 20297399
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||| ||| | || || || |||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||    
T  20297180 caccttcttcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactatagcagttgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaagatcacatccat 20297279  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| || |||||||| |||||||   ||||||| | | |||||||| | |  ||||| |  | ||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  20297280 acccgtcaacggcagacaaactaaatcaaccacaaaatctctaccaaacataaatataggacaccccagacaaacaagagaagtagttactgaaccctta 20297379  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  20297380 gctggagtttcaacaaccat 20297399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 20829382 - 20829217
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  || || ||||| ||||||||||| ||| ||| |||    
T  20829382 tgttcaactgtcgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaa 20829283  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgata 166  Q
    ||  ||||||||||| || || || || |||||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||    
T  20829282 ctgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactccgatgcagacatccgata 20829217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 531 - 606
Target Start/End: Original strand, 18710328 - 18710403
Alignment:
Q  531 caaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18710328 caaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 18710403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 20927423 - 20927558
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  || || ||||| || || |||||| || ||| |||    
T  20927423 tgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatcattcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggagatacacttcgtctaataaa 20927522  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaa 136  Q
    || |||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  20927523 ctgtttctcaagcaactcttctaactgtttcttcaa 20927558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 561 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 20075126 - 20075081
Alignment:
Q  561 caagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20075126 caagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 20075081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 410 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 23196535 - 23196479
Alignment:
Q  410 aaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttc 466  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23196535 aaatacaccgacttactaaaacaattaacatgaacatggttatactccaaccagttc 23196479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 21228947 - 21228916
Alignment:
Q  587 gctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21228947 gctggagtttcgacaaccatctctccattcat 21228916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 357
Target Start/End: Original strand, 41311252 - 41311295
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctt 357  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  41311252 gccatcaaagaaaacattataattccatcacgttctaactgctt 41311295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 21200942 - 21200884
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaa 61  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||    
T  21200942 ttcaactgccgataatccatacacaacctcatactaccatccttcttcttaactaacaa 21200884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 72)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 615
Target Start/End: Original strand, 14042038 - 14042665
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| |||||||| | ||| ||||| || || |||||||| |||||||| || | ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  14042038 tgttcaattgtcgatagtcaatgcacaatctcatactaccatctttcttctttactagcaataccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaa 14042137  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||    
T  14042138 cttcttatcaagcaaatcctctagttgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacatacggtaaggtgtcatagacacagactttgttcccggaaca 14042237  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  14042238 agatcaatcgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcacataccacctgtagcttatcaatca 14042337  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   |||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  14042338 ctgcttgattctcaatagacaaggaagccatcaaagaaaacatcaaaattctatcacgatctaattgcttcagctgcttagtagacaagaactctgcgcc 14042437  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||||||||    
T  14042438 actttcttcttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaaaaattaatgtgaacatggttgtattctaaccagttcatgctagggattacatccata 14042537  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14042538 ccactaaaaggtaaacaaaccaagtcaatttcaaaatcatgatcaaacatagacaaaggacatcttgaacacacaagagaagtagtcacaaaacccttag 14042637  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccatt 615  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  14042638 cttgagtttcgacaaccatctctccatt 14042665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 615
Target Start/End: Original strand, 14352068 - 14352695
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| |||||||| | ||| ||||| || || |||||||| |||||||| || | ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  14352068 tgttcaattgtcgatagtcaatgcacaatctcatactaccatctttcttctttactagcaataccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaa 14352167  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||    
T  14352168 cttcttatcaagcaaatcctctagttgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacatacggtaaggtgtcatagacacagactttgttcccggaaca 14352267  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  14352268 agatcaatcgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcacataccacctgtagcttatcaatca 14352367  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   |||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  14352368 ctgcttgattctcaatagacaaggaagccatcaaagaaaacatcaaaattctatcacgatctaattgcttcagctgcttagtagacaagaactctgcgcc 14352467  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||||||||    
T  14352468 actttcttcttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaaaaattaatgtgaacatggttgtattctaaccagttcatgctagggattacatccata 14352567  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14352568 ccactaaaaggtaaacaaaccaagtcaatttcaaaatcatgatcaaacatagacaaaggacatcttgaacacacaagagaagtagtcacaaaacccttag 14352667  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccatt 615  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  14352668 cttgagtttcgacaaccatctctccatt 14352695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 11551029 - 11550399
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11551029 tgttcaactgtcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 11550930  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |  || || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  11550929 tttcttctcaagcaaatcttccaactgtttcttcaactcagataattcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaaca 11550830  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11550829 agatcaatagaaaactcaacttccctctctggaggcacatcaagaatttcatctggaaaaacatcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatca 11550730  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |  ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  11550729 ctgcttgattctcaatagataaagaagccattaaagaaaacatcaaaataccatcacgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcacc 11550630  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  11550629 actttcctcttcggcggaagaggaatacactgacttgctaaaacaattaatatgaacatggttgtactccaaccaattcatacccagaatcacatccata 11550530  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  11550529 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacaacgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 11550430  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11550429 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 11550399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 14956897 - 14957527
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14956897 tgttcaactgtcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagtaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 14956996  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || |||||||||||||| || || |||||||||| ||| |  || || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  14956997 tttcttctcaagcaaatcttccaactgtttcttcagctcagataattcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaaca 14957096  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14957097 agatcaatagaaaactcaacttccctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatca 14957196  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |  ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  14957197 ctgcttgattctcaatagataaagaagccattaaagaaaacatcaaaataccatcacgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcacc 14957296  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||    
T  14957297 actttcctcttcggcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatatgaacatggttgtactccaaccaattcatacccaaaatcacatccata 14957396  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  14957397 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacaacgcaaacatacgagagaagtagtcactgaacccttag 14957496  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14957497 ctggagtttcaacgaccatctctccattcat 14957527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 44789278 - 44788648
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44789278 tgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 44789179  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  44789178 cttcttctcaagcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 44789079  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   | |||||||    
T  44789078 agatcaatagaaaattcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatca 44788979  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | ||||||||| |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  44788978 ctgcttgattctcaatagataaagtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 44788879  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  44788878 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 44788779  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  44788778 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 44788679  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44788678 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 44788648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 617
Target Start/End: Original strand, 10873033 - 10873662
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10873033 tgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 10873132  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  10873133 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcaaataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 10873232  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || || || || |||||  |||   |||||||||    
T  10873233 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcagggaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 10873332  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  10873333 ctgcttgattctcaatagataaagaagccatcaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 10873432  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  10873433 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 10873532  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  10873533 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 10873632  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattca 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873633 ctggagtttcgacaaccatctctccattca 10873662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 11235140 - 11234510
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11235140 tgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 11235041  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  11235040 cttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 11234941  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || ||||||||||| ||||||| ||    
T  11234940 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccacttgtagcttatcaacca 11234841  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             | |||||| | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  11234840 ctgcttgattctcaacagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 11234741  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11234740 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 11234641  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  11234640 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 11234541  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11234540 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 11234510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 9590711 - 9591337
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| || | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  9590711 tgttcaactgacgatagtcaatacacaacctcatgctaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaataaa 9590810  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  9590811 tttcttttcgagcaaatcttctaattgtttcttcaactcagctaacacggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaaca 9590910  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  9590911 agatcaatagaaaactcgacttccctctctggaggcacatccggaatttcatctggaaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgtagcttatcaatca 9591010  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| |||| |||||||||| |||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  9591011 ccgcttgattctcaatagataaagaagtcatcaaagaatacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcacc 9591110  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  9591111 actttcctcttcagcggaagagaaatacattgacttgctaaaacaattgatatgtacatggttgtactctaaccaattcatacctagaatcacatccata 9591210  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || |||||||||    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9591211 ccgctcaaaggt----aaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagataaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 9591306  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9591307 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 9591337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 17704382 - 17703752
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  17704382 tgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgacacacttggtctaacaaa 17704283  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  17704282 tttcttttcaagcaaatcttctaactgtctcttcaactcagctaactcggatgcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcccggaaca 17704183  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || ||  |||||||||  ||||| ||  | ||||||||||| ||||||||||    
T  17704182 agatcaatagaaaactcgacttccctctctggaggcacatcaggtatttcgtctagaaaaacttcaggaaagtcggaaaccacttgtagcttatcaatca 17704083  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || | ||| ||||| || |||||||| ||    
T  17704082 ctgcttgattctcaatagataaagaagccatcaacgaaaacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcagcttcttagtagataagaactctgcacc 17703983  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  17703982 actttcctcttcagcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtattctaaccaattcatacccagaatcacatccata 17703883  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||     
T  17703882 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttaa 17703783  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17703782 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 17703752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 611
Target Start/End: Original strand, 12689845 - 12690468
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  12689845 tgttcaactgtcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagtaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtcgaacaaa 12689944  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |  || || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||    
T  12689945 tttcttctcaagcaaatcttccaactgtttcttcaactcagataattcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgtgccaggaaca 12690044  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  12690045 agattaatagaaaactcaacttccctctctggaggcacatccggaatttcatctggataaacttcgggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatca 12690144  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |  ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  12690145 ctgcttgattctcaatagataaagacgccattaaagaaaacatcaaaataccatcacgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcacc 12690244  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  12690245 acattcttcttcggcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatatgaacatgcttgtactccaaccaattcatacccagaatcacatccata 12690344  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12690345 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacaacgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 12690444  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctc 611  Q
    |||||||||| || ||||||||||    
T  12690445 ctggagtttcaacgaccatctctc 12690468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 18588098 - 18587468
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18588098 tgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtttaacaaa 18587999  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  18587998 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 18587899  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || ||||   |||   |||||||||    
T  18587898 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccatcggtaacctatcaatca 18587799  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  18587798 ctgcttgattctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 18587699  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18587698 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 18587599  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18587598 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 18587499  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18587498 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 18587468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 8709948 - 8710578
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  8709948 tgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaa 8710047  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||   ||||||||||||||||    
T  8710048 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccgacttcgttccaggaaca 8710147  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  8710148 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 8710247  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  8710248 ctgcttgattctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 8710347  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  8710348 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 8710447  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  8710448 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 8710547  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8710548 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 8710578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 14334739 - 14335369
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| || |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14334739 tgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccgtctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaa 14334838  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  14334839 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 14334938  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  14334939 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatcgggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 14335038  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||  | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  14335039 ccgcttgattctcaatagatatagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 14335138  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  14335139 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 14335238  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14335239 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 14335338  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14335339 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 14335369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 18180088 - 18180716
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18180088 tgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 18180187  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||||  |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  18180188 cttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagtagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 18180287  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  ||||  |||||||||    
T  18180288 agatcaatagaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatca 18180387  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             | |||||| |||||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| |||||||||  |||||| ||    
T  18180388 ctgctcgattctcgacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaa--ctctgcacc 18180485  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18180486 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattgatgagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 18180585  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18180586 ccactcaagggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacaagagaagtagtcaccgaacccttag 18180685  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18180686 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 18180716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 13688384 - 13689014
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||  || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13688384 tgttcaactgtcgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 13688483  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||| |||    
T  13688484 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccagggaca 13688583  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  13688584 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggagacacatcaagaatctcatttggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 13688683  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  13688684 ctgcttgattctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactccgcacc 13688783  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13688784 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 13688883  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  13688884 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 13688983  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13688984 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 13689014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 15158984 - 15158354
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||  || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15158984 tgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 15158885  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||| |||||||| |||    
T  15158884 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggctttgttccagggaca 15158785  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  15158784 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 15158685  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  15158684 ctgcttgattctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactccgcacc 15158585  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15158584 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 15158485  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15158484 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccattttgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 15158385  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15158384 ccggagtttcgacaaccatctctccattcat 15158354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 606
Target Start/End: Original strand, 15626870 - 15627485
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    ||||||||  |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||||    
T  15626870 ttcaactgctgataattaatgcataacctcatgctaccatctttctttttaaccaacaacaccggtgctcctcaaggtgaaacactcggtcttacaaact 15626969  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  15626970 tcttatcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactcataagccgacatacggtaaggcatcatagacacaggcttcgtacccggaacaag 15627069  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||| ||  | || ||| | |  |||||||| ||     
T  15627070 atcaatcgaaaattaaacttccctctctggcggcacattagggatctcatcaggaaaaacttctagaaactcatacacaactcg-aacttatcaattact 15627168  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                | ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||| || ||||| ||||  || ||||| || ||||    
T  15627169 gcttgattctcaacagacaaggacgccatcaaagaaaacatcaagatttcatcacgctctaacagcttcagctgcttagtagttaagaactccgctccac 15627268  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
      || ||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15627269 tctcttcttccgcagaagaaaaatacaccgacttattaaaacaattaatatgaacatggttatactccaaccagttcataccaaggattacatccattcc 15627368  T
Q  490 actcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagct 589  Q
    ||||||| | | |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||| | ||  | ||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15627369 actcaaatgcaaacaaactaaatcaatttcaaagtctcgaccaaacatcggcaaagaacaccttagacacactaaagaagtagtcaccgaacccttagct 15627468  T
Q  590 ggagtttcgacaaccat 606  Q
    |||||||||| ||||||    
T  15627469 ggagtttcgaaaaccat 15627485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 15146809 - 15146416
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| ||||||| ||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15146809 ttcaactgacgataatcaatgcataacctcatactaccgtctttcttcttcactaacaaaacaggtgctccccaaggtgaaacacttggtataacaaact 15146710  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15146709 ttttctcaagcaaatcttctaactgtttctttaactcagctaactcagaagttgacatacgataaggtgtcataaacacaagcttcgttccaggaacaag 15146610  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  15146609 atcaatcgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttctggaaaatcacataccacttgtagtttatcaatcact 15146510  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctg 383  Q
                ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  15146509 gcttgattctcaatagacaaggaagccatcacggaaaaaattaaaataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctg 15146416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 66 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 14150297 - 14149862
Alignment:
Q  66 ggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  14150297 ggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctcaagcaaatcttctaattgtttcttcaactcagctaactcggaagcagacatacgat 14150198  T
Q  166 aaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactta 265  Q
    |||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||     
T  14150197 aaggtgccatcgacaccggcttcgttccaagaacaagatcaatagaaaactcgacttccctctctagaggcacatcaggaatttcatctgg-aaaacttc 14150099  T
Q  266 tggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaac 352  Q
     ||||| || |||||||||||| | |||||||| ||             |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||| || || |      
T  14150098 aggaaagtcgcataccacttgttgcttatcaattaccgcttgattctcaatagataaagaagccatcaaagaatacatcaaaataccatcgcgctccagt 14149999  T
Q  353 tgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgt 452  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  14149998 tgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctcttcagcggaagagaaatacactcacttgctaaaacaattgatatgaaaatggttgt 14149899  T
Q  453 actctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  14149898 actctaaccaattcatacccagaatcacatccatacc 14149862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 302 - 618
Target Start/End: Original strand, 8200705 - 8201021
Alignment:
Q  302 atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcag 401  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||      
T  8200705 atagataaagtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctcttcga 8200804  T
Q  402 cagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtag 501  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8200805 cggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaaaggtag 8200904  T
Q  502 acaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgaca 601  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8200905 acaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgaca 8201004  T
Q  602 accatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||    
T  8201005 accatctctccattcat 8201021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 11770329 - 11770029
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  11770329 tgttcaactgtcgataatcaatgcataacctcatgctaccatctttcttcttaactagcaatatcggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaa 11770230  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  11770229 cattttatcaagcaaatcttctaattgtttcttctgctcagccaactcagaagccgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaaca 11770130  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  11770129 aggtcaatcgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgcatacaacctgtagcttatcaatca 11770030  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  11770029 c 11770029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 16727310 - 16726845
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16727310 tgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgacacacttggtctaacaaa 16727211  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  16727210 tttcttttcaagcaaatcttctaactgtctcttcaactcagctaactcggatgcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcccggaaca 16727111  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || ||  |||||||||  ||||| ||  | ||||||||||| ||||||||||    
T  16727110 agatcaatagaaaactcgacttccctctctggaggcacatcaggtatttcgtctagaaaaacttcaggaaagtcggaaaccacttgtagcttatcaatca 16727011  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || | ||| ||||| || |||||||| ||    
T  16727010 ctgcttgattctcaatagataaagaagccatcaacgaaaacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcagcttcttagtagataagaactctgcacc 16726911  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgta 453  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16726910 actttcctcttcagcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgta 16726845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 14262130 - 14261521
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| || || |||||||| ||||    
T  14262130 atacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcct 14262031  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || ||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  14262030 ccaactgtttcttcaattcagctaactcggacgccgacatacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggcacaagatcgattgaaaattcaac 14261931  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcaca--tagat----------- 307  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |  || ||  | | | |||||||||||  | |||               
T  14261930 ctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcactcacaaccggcaatctatcaatcacagcttgattctccaatgac 14261831  T
Q  308 aaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaag 407  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |  || || |||| ||| ||||| ||  | |  || || ||||||||||    
T  14261830 aagtacgccatcaaagaaaacattagaatttcatcacgttctaactgcttcaactgttttgtagtcaagaactcagcttcgctctcttcctcagcagaag 14261731  T
Q  408 agaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaac 507  Q
    | |||| ||| | ||| ||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||   ||| || ||||| ||    
T  14261730 aaaaatgcaccgtcttactaaagcaattaatatgaatacggttatactctaaccagttcatcccaaaaatcacatccatacccgacaacggcagacatac 14261631  T
Q  508 caaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatc 607  Q
     | ||| | ||| || || | | ||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  14261630 tagatcgacttc-aattctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactaaacccttagctggagtttcaacaaccatt 14261532  T
Q  608 tctccattcat 618  Q
    |||||||||||    
T  14261531 tctccattcat 14261521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 15100508 - 15099878
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  15100508 tgttcaactgacgataatcaatgcataacctcatgctgccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaa 15100409  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  15100408 tttcttatcaagcaagtcctccaattgtttcttcaattcagctaactcggacgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaaca 15100309  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    || ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    || ||| | |  || |||||||    
T  15100308 aggtcaattgaaaattcaacctctctttctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcattcacaactggcaacttgtcaatca 15100209  T
Q  301 ca--tagat-----------aaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    ||  | |||           ||| | ||||||||||||||||| | |||  ||||||| || |||||||| |  || || ||||| |  ||||| || ||    
T  15100208 cagcttgattttccaatgacaagtatgccatcaaagaaaacatcagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttagtagataggaactcagctcc 15100109  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    ||  || |||||||||||||| |||| ||| | |||| |||| ||||| || |||||  |||| ||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||    
T  15100108 actctcttcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttgttaaagcaattgatatgaactcggttatactctaactagttcatcccaaaaatcacatccata 15100009  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||  |||| |||| |||||| |  || | |||||| || | | ||||||||||||   |||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  15100008 cccgtcaacggtaaacaaactaggtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacagacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttag 15099909  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  15099908 ctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 15099878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 48813177 - 48812909
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |  || | |||||||||||||||||||||||| | | | |||||||    
T  48813177 ttcaactgtcgataatcaatacataacctcatgctaccatctttcttcttaacaagtaacaccggcgctccccaaggtgaaacactcgatcttacaaact 48813078  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  48813077 tcttatcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactcagaagccgacatacggtaagaagtcatagacacaggcttcgtacccggaacaag 48812978  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48812977 atcaattgaaaattcaacttccctttctggcggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttctggaaa 48812909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 428 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 15146410 - 15146220
Alignment:
Q  428 aaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcac 527  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||     
T  15146410 aaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaactattacatccataccactcaaaggtaaacaaaccatatcaatctcaaaatcaa 15146311  T
Q  528 gatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15146310 gatcaaacatagataaaggacatttcgaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 15146220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 18051858 - 18051228
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| || |||||||| ||| | |||||    
T  18051858 tgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttcttcaccaacaacacaggtgctccccacggcgaaacactgggtcttacaaa 18051759  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||| ||||||||||||    
T  18051758 cttcttatcaagtaaatcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgtcatcgacaccggctttgttccaggaaca 18051659  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    || ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||    ||||||  ||| || |||||||    
T  18051658 aggtcaattgaaaactccacctccctctctggcggcacatcaggaatctcatcagggaacacctctggaaactcattcaccactgctagcttgtcaatca 18051559  T
Q  301 ca--taga-----taagg------aagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    ||  | ||     ||| |      | ||||| | ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||  ||  | ||    
T  18051558 cagcttgattttctaacgacagatatgccattagagaaaacatcagaattccatcacgttctaactgcttcatctgctttgtagataaaatttcaactcc 18051459  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    ||  || |||||||||||||| |||| ||| | |||| |||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||     
T  18051458 actctcttcttcagcagaagaaaaatgcacagtcttgttaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccatc 18051359  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||  |||| |||| ||| || ||||| | ||||||||| | | |||||||||| |  ||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  18051358 cccgtcaacggtaaacacactaaatctacttcaaaatctctaccaaacatagaaattggacacctcaagcaaaccagagaagtagtcactgaacccttag 18051259  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  18051258 ctggagtttcaacaaccatttctcccttcat 18051228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 13023701 - 13023943
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || |||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  13023701 tgttcaactgacggtaatcaatgcacaacctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggagctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaa 13023800  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||  |||||    
T  13023801 cttcttatcaagcaagtcctccaattgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgttcctagaaca 13023900  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcag 243  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  13023901 aggtcaattgaaaattcaacctccctttctggtggcacatcag 13023943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 49154645 - 49154915
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  49154645 tgttcaactgacggtaatctatacacaatctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaa 49154744  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     ||||| || | ||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  49154745 ttttttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaaca 49154844  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  49154845 agatcaattgagaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcagggaatacttctggaaa 49154915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16948375 - 16948107
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| || |||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| | | |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  16948375 ttcaactgacggtaatcaatgcacaatctcatgctaccatccttcttcttaactaacaacaccagcgctccccaaggtgaaaaacttggtcttacaaact 16948276  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || |||||||  || || || ||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||||    
T  16948275 tcttatcaagcaggtcttccaactgtttcttcaatttagctaactcagaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggctttgttcctggaacaag 16948176  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16948175 gtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcagaaatctcatcaggaaacacttctggaaa 16948107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 11301118 - 11300848
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  |||||||  || || ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  11301118 tgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaa 11301019  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |  | ||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  11301018 cttcttatataacaggtcctccaactgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaaca 11300919  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  11300918 agatcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcagggaatacttctggaaa 11300848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16070182 - 16069932
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    |||||||||||  | |||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||    
T  16070182 atacacaacctcgtactactatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaatttcttatcaagcaaatcct 16070083  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || ||||||||| |||  || ||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  16070082 ccaactgtttcttctacttagctaactcggacgccgacatacgataaggtgccatcgacatcggcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaac 16069983  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16069982 ctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaa 16069932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26092703 - 26092433
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  |||||||  || || ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  26092703 tgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaa 26092604  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || || | ||  ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  26092603 cttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaaca 26092504  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  26092503 agatcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcagggaatacttctggaaa 26092433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26116475 - 26116232
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || || | ||  ||||    
T  26116475 atacacaatctcatactaccatccttcttcttgaccaacaanaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaacttcttatctaacaggtcct 26116376  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  26116375 ccaactgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaac 26116276  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26116275 ctccctttctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacactt 26116232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12204682 - 12204435
Alignment:
Q  24 cacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctcta 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||  || | ||||| || || ||||| |||||||| |    
T  12204682 cacaacctcatgctaccatccttctttttatccaacaataccggcgctccccatggtgaaacactccgtcttacaaatttcttatcaagtaaatcctcca 12204583  T
Q  124 attgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatc 223  Q
    | ||||||||||||||  | | |||||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  12204582 actgtttcttcaactcaactagctcagacgctgacatacggtaaggcgccatcgacacaggcttcgtacccggaacaagatcaattgaaaattcaacctc 12204483  T
Q  224 cctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12204482 cctctctggcggcacatcaagaatctcatcaggaaagacttatagaaa 12204435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 185 - 618
Target Start/End: Original strand, 19149539 - 19149985
Alignment:
Q  185 cttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccact 284  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |  || |||    
T  19149539 cttcgtttcgggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcactcacaact 19149638  T
Q  285 tgtagtttatcaatcacata-------------gataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtag 371  Q
     | | | |||||||||||               |||||| | |||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |  || || ||||    
T  19149639 ggcaatctatcaatcacaacttgattctccaatgataagtacgccatcaaggaaaacattagaattccatcacgttctaactgcttcaactgtttcgtag 19149738  T
Q  372 acaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcatacc 471  Q
     ||| ||||| ||  |||  || |||||||||||||| ||||  |  | ||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  19149739 tcaagaactcagcttcactctcttcttcagcagaagaaaaatgtatcgtcttactaaagcaattaatatgaacacggttatactctaaccagttcatccc 19149838  T
Q  472 aagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagta 571  Q
    || |||||||||||||||  ||||||| | ||| || | ||  | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||    
T  19149839 aaaaattacatccatacccgtcaaaggcaaacatactagattgacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagta 19149938  T
Q  572 gtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19149939 gttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccattcat 19149985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 185 - 618
Target Start/End: Original strand, 20748938 - 20749384
Alignment:
Q  185 cttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccact 284  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |  || |||    
T  20748938 cttcgtttcgggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcactcacaact 20749037  T
Q  285 tgtagtttatcaatcacata-------------gataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtag 371  Q
     | | | |||||||||||               |||||| | |||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |  || || ||||    
T  20749038 ggcaatctatcaatcacaacttgattctccaatgataagtacgccatcaaggaaaacattagaattccatcacgttctaactgcttcaactgtttcgtag 20749137  T
Q  372 acaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcatacc 471  Q
     ||| ||||| ||  |||  || |||||||||||||| ||||  |  | ||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  20749138 tcaagaactcagcttcactctcttcttcagcagaagaaaaatgtatcgtcttactaaagcaattaatatgaacacggttatactctaaccagttcatccc 20749237  T
Q  472 aagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagta 571  Q
    || |||||||||||||||  ||||||| | ||| || | ||  | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||    
T  20749238 aaaaattacatccatacccgtcaaaggcaaacatactagattgacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagta 20749337  T
Q  572 gtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20749338 gttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccattcat 20749384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 271
Target Start/End: Original strand, 21754758 - 21755026
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| || ||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| |    
T  21754758 ttcaactgacggtaatctatgcacaatctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaatt 21754857  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || || | ||  || || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||    
T  21754858 tcttatccaacaggtcttccaactgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacggtatggtgccatcgacaccggcttcgttccgggaacaag 21754957  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
     ||||| ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21754958 gtcaattgaaaattcaatctccctctctggtagcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttctggaaa 21755026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13966538 - 13966303
Alignment:
Q  36 ctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttca 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || | ||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| || || || | ||  ||||| || ||||||||||    
T  13966538 ctaccatccttcttcttaaccaataacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaatttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttca 13966439  T
Q  136 actcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggagg 235  Q
    | || || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13966438 attcagctaactcagaagctgacatacggtatggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtgg 13966339  T
Q  236 cacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13966338 cacatcaggaatctcatcaggaaatacttttggaaa 13966303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 14140023 - 14140281
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| || ||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||    
T  14140023 tgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcatgctaccttcctttttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacactgggtcttacaaa 14140122  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  14140123 cttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaattcagatgctgacatatgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaaca 14140222  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaa 259  Q
    || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  14140223 aggtcaatcgaaaactccacctccctctctggtggcacatcaggaatctcattaggaaa 14140281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 12458984 - 12459229
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || |||| ||| ||||  || || ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  12458984 tgttcaactgacggtaatcaatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctcctcaaggtgaaacacttggtcttacaaa 12459083  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| || || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||  ||||| |||| ||||||    
T  12459084 cttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacgaaaaggtgccatcgacaccggcttcattcctggaaca 12459183  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaa 246  Q
    || ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||||||||    
T  12459184 aggtcaattgaaaattccacctccctctctagtggcacatcaggaa 12459229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14284257 - 14284021
Alignment:
Q  23 acacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctct 122  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| || ||||| ||||| |||    
T  14284257 acacaatctcatgctaccatccttcttctttaccaacaacacaagcgctccccacggtgagacactcggtcttacaaacttcttatcaagtaaatcttct 14284158  T
Q  123 aattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacat 222  Q
    || ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || |    
T  14284157 aactgtttcttcagttcagccaactcagatgctgacatacggtatggtgccatcgacaccggctttgttcctggaacaaggtcaatcgaaaactccacct 14284058  T
Q  223 ccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaa 259  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14284057 ccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaa 14284021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 13675796 - 13676058
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||| || || || |||||| | || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  13675796 tgttcaactgacgatagtcaatgcataatctcatgctatcgtctttcttcttaaccaacaacatcggtgctccccaaggtgaaacacttagtcttacaaa 13675895  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||  |||||    
T  13675896 cttcttatcaagcaagtcctccaactgtttctttaattcagctaactcagaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctagaaca 13675995  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    || |||||  |||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  13675996 aggtcaat-taaaattcaacctccctctctggtagcacatctggaatctcgtccggaaaaactt 13676058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 15342775 - 15343038
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||    
T  15342775 tgttcaactgacggtaatatatacacaacctcatgctaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacactgggtcaaacaaa 15342874  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| || || || | ||||||||| || || |||||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||   |||| ||||| ||||||    
T  15342875 cttcttatcaagcaagtcttccaactttttcttcaattcagctaactcagaggctgacatacggtacggtgccatcgacatcggctttgttcccggaaca 15342974  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  15342975 aggtcaatggaaaactcaacctccctttcttgtggcacgtctggaatctcatccggaaaaactt 15343038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11386311 - 11386076
Alignment:
Q  24 cacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctcta 123  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| || |||| ||| || || |    
T  11386311 cacaatctcatgctaccatccttcttctttaccagcaacacaggcgctccccacggcgagacactcggttttacaaacttcttatcaaacaagtcttcca 11386212  T
Q  124 attgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatc 223  Q
    | ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||    
T  11386211 actgtttcttcaattcagccaactccgatgctgacatacgatatggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaactctacctc 11386112  T
Q  224 cctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaa 259  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11386111 cctctccggtggcacatcagggatctcatcaggaaa 11386076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Original strand, 13676121 - 13676425
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||| || |||||||| | ||| || |||| ||  |||||||| ||||  || ||||| |||||||| ||||    
T  13676121 gccatcaaagaaaacataagaattccatcacgctccaactgcttcaattgtttagtagtcaggaactctgctccactctcttcttccgcagaagaaaaat 13676220  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| | ||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||  |||| |||| ||| || || ||    
T  13676221 gcaccgtcttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatccattcccgtcaacggtaaacacactaagtc 13676320  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
     | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  13676321 gacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcct 13676420  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  13676421 ttcat 13676425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12799446 - 12799241
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| || ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |    
T  12799446 ttcaactgacggtaatctatacataacctaatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaatt 12799347  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||| ||| || ||  |||||||||| ||||||||    
T  12799346 tcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcggacgccgacatacggtaaggtgccatcgataccggcttcgttcctggaacaag 12799247  T
Q  203 atcaat 208  Q
     |||||    
T  12799246 gtcaat 12799241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 264
Target Start/End: Original strand, 19615045 - 19615282
Alignment:
Q  27 aaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaatt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || || || || ||||| || |    
T  19615045 aacctcatgctaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttgtcgagtaagtcctccaact 19615144  T
Q  127 gtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccct 226  Q
    ||||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| || || ||||| || || || ||||| |||||    
T  19615145 gtttcttcaactcagcaagttcggatgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggtactagatcgatggagaactcaacctccct 19615244  T
Q  227 ctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
     ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19615245 ttctggtggtacatctggaatctcatccggaaaaactt 19615282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 387 - 606
Target Start/End: Original strand, 12459371 - 12459590
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||| || || || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  12459371 caccttcttcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcagttgatatgaacccggttatactctaaccaattcattccaaaaataacatccat 12459470  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| |||| |||||| |||||||   |||| || | | |||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  12459471 acccgtcaacggtaaacaaactaaatcaaccacaaagtctctaccaaacatagataacggacaccttaaacagacaagagaagtagttactgaaccctta 12459570  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  12459571 gctggagtttcaacaaccat 12459590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 11386008 - 11385704
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    |||||||||||| |||| | |||  ||||||||||||||||||| |  || || |||| ||| || ||  | ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  11386008 gccatcaaagaatacatcagaattccatcacgttctaactgcttcatatgtttcgtagtcaagaattcaactccaccctcttcttcagcagaagaaaaat 11385909  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| | ||||||||| || || || | |||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||  |||| || | |||||| || ||    
T  11385908 gcaccgtcttgctaaagcagttgatattaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccattcccgtcaacggcaaacaaactaagtc 11385809  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
     |  |||||||| | | |||||||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  11385808 tacctcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttcctgaacccttagctggagtttcaacaaccatctctcct 11385709  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  11385708 ttcat 11385704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 387 - 606
Target Start/End: Original strand, 49155044 - 49155263
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  || | ||| ||||| || || || |||||  | || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  49155044 caccttcttcttcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcgattatactctaaccaattcataccaaaaataacatccat 49155143  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| || || ||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||| | |||||| |  | ||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  49155144 acccgtcaacggcaggcaaaccaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatatgggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaaccctta 49155243  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  49155244 gctggagtttcaacaaccat 49155263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 322 - 618
Target Start/End: Original strand, 14140357 - 14140653
Alignment:
Q  322 agaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgac 421  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||||||||| |  ||||| |||  ||| |||||  | ||||| || |||||||||||||| ||||  || | |    
T  14140357 agaatacatcaaaattccatcacgttctaactgcttcatctgctttgtattcaagaactcaactccaccctcttcttcagcagaagaaaaatgtaccgtc 14140456  T
Q  422 ttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaa 521  Q
    || |||||||| || || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||  |||| || | ||| || || || |  ||||    
T  14140457 ttactaaaacagttgatatgaactcggttatactctaaccatttcatcccaaaaataacatccattcccgtcaacggcaaacagactaagtctacctcaa 14140556  T
Q  522 aatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||| | | |||||||||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  14140557 aatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcccttcat 14140653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 395 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 12798999 - 12798788
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactca 494  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | ||| | ||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||    
T  12798999 tcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttaccaaagcaattaatatgaacacggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgtca 12798900  T
Q  495 aaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 594  Q
    | || | ||| || | ||| | |||||| || | | ||||||||||||   |||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  12798899 acggcaaacatactagatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacagacaacttagacaaataagagaagtagttactgaacccttagcttgagt 12798800  T
Q  595 ttcgacaaccat 606  Q
    ||| ||||||||    
T  12798799 ttcaacaaccat 12798788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 387 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 16947978 - 16947747
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  16947978 caccttcttcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaataacatccat 16947879  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| || |  ||||| || || | | |||| || | | ||||||||||||  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||||||    
T  16947878 acccgtcaacggcaagcaaactaagtcgactacaaagtctctaccaaacatagacaatggacatctcaagcaaactagagaagtagttactgaaccctta 16947779  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  16947778 gctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 16947747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 387 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 26092304 - 26092085
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  || | ||| ||||| || || || |||||  | || ||||||||||| ||||||||||  || ||||||||    
T  26092304 caccttcttcttcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcgattatactctaaccaattcataccaaagataacatccat 26092205  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| || |||||||| ||||||||  ||||||| | | |||||||||| |  ||||| |  | ||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  26092204 acccgtcaacggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaaccctta 26092105  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  26092104 gctggagtttcaacaaccat 26092085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 308 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 14283959 - 14283649
Alignment:
Q  308 aaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaag 407  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | |||  |||||||||| |||||||| |  || || |||| ||| |||||  | ||||| || |||||||||||||    
T  14283959 aaggatgccatcaaagaatacatcagaattccatcacgttcaaactgcttcatatgtttcgtagtcaagaactcaactccaccctcttcttcagcagaag 14283860  T
Q  408 agaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaac 507  Q
    | |||| ||| | ||| ||||| ||  | || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||  |||| || | ||||||    
T  14283859 aaaaatgcaccgtcttactaaagcagctgatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccattcccgtcaacggcaaacaaac 14283760  T
Q  508 caaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatc 607  Q
     || || |  |||||||| | | |||||||||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||||||     
T  14283759 taagtctacctcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttggctagagtttcaacaaccatt 14283660  T
Q  608 tctccattcat 618  Q
    ||||| |||||    
T  14283659 tctcctttcat 14283649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 425 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 12204268 - 12204075
Alignment:
Q  425 ctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaat 524  Q
    ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  | ||  | | ||| || | ||||  ||||||||    
T  12204268 ctaaaacaattgatatgaacacggttatactctaaccagttcatcccaaagattacatccatacccgttaacagcaaacacacaagatcatcttcaaaat 12204169  T
Q  525 cacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    | | | ||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  12204168 ctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttattgaacccttagctagagtttcaacaaccatttctccactcat 12204075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 387 - 618
Target Start/End: Original strand, 13024088 - 13024319
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||| ||| | ||| ||||| || || || |||||  | || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  13024088 caccttcttcttaagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcgattatactctaaccaattcataccaaaaataacatccat 13024187  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| |||||||| || || || |    |||||| | | ||||||||||||  ||||| || || || || ||||||||||| || |||||||||    
T  13024188 acccgtcaacggtagacacactaagtcgaccaaaaaatccctaccaaacatagacaacggacacctcaagcaaactagagaagtagttactgaaccctta 13024287  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  13024288 gctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 13024319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 15277 - 15169
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15277 tgttcaactgacgatagtcaatacactatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 15178  T
Q  101 ctttttctc 109  Q
     || |||||    
T  15177 tttcttctc 15169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 453 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 26116030 - 26115877
Alignment:
Q  453 actctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatct 552  Q
    |||||||||| ||||||||||  || |||||||||||  |||| || |||||||| ||||||||  ||||||| | | |||||||||| |  ||||| |     
T  26116030 actctaaccaattcataccaaagataacatccatacccgtcaacggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccg 26115931  T
Q  553 taaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
     | ||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26115930 cagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 26115877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 398 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 40925312 - 40925104
Alignment:
Q  398 tcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaag 497  Q
    ||||||||||||||||  || | ||| ||||| || || || |||||  | || || |||||||| ||||||||||  || |||||||||||  |||| |    
T  40925312 tcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcgattatattctaaccaattcataccaaagataacatccatacccgtcaacg 40925213  T
Q  498 gtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 597  Q
    | |||||||| ||||||||  ||||||| | | ||||||| || | |||||| |  | ||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  40925212 gcagacaaactaaatcaatcacaaaatccctaccaaacatggatatgggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttc 40925113  T
Q  598 gacaaccat 606  Q
     ||||||||    
T  40925112 aacaaccat 40925104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12799218 - 12799143
Alignment:
Q  189 gttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  12799218 gttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatcttatcaggaaaaactt 12799143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 7826243 - 7826408
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  || || ||||| ||||||||||| ||| ||| |||    
T  7826243 tgttcaactgtcgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaa 7826342  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgata 166  Q
    ||  ||||||||||| || || || || |||||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||    
T  7826343 ctgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactccgatgcagacatccgata 7826408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 437 - 606
Target Start/End: Original strand, 21755205 - 21755374
Alignment:
Q  437 atgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaaca 536  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||   ||| || |||||||| |||||||   | ||||| | | ||||||    
T  21755205 atgtgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaatcacatccatacccgacaacggcagacaaactaaatcaaccacgaaatctctaccaaaca 21755304  T
Q  537 tagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
    |||| |  ||||| || | ||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21755305 tagatataggacacctcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 21755374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 27105701 - 27105536
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  || || ||||| ||||||||||| ||| ||| |||    
T  27105701 tgttcaactgtcgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaa 27105602  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgata 166  Q
    ||  ||||||||||| || || || || |||||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||    
T  27105601 ctgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactccgatgcagacatccgata 27105536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 27172624 - 27172789
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  || || ||||| ||||||||||| ||| ||| |||    
T  27172624 tgttcaactgtcgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaa 27172723  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgata 166  Q
    ||  ||||||||||| || || || || |||||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||    
T  27172724 ctgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactccgatgcagacatccgata 27172789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Original strand, 15343101 - 15343405
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||| |||||| |||| | |||  ||||| ||||||||||||| |  || || |||| ||| |||||  | ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  15343101 gccattaaagaatacatcagaattccatcatgttctaactgcttcatctgtttcgtagtcaagaactcaactccaccctcttcttcagcagaagaaaaat 15343200  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
      || | ||| ||||| ||||| || |||||   ||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||| ||  |||| || | |||||| || ||    
T  15343201 gtaccgtcttactaaagcaattgatatgaactctgttatactctaaccaattcattccaaaaataatgtccattcccgtcaacggcaaacaaactaagtc 15343300  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
     |  |||||||| | | |||||||||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  15343301 tacctcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactttacccttagctggagtttcaacaaccatttctcct 15343400  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  15343401 ttcat 15343405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 474
Target Start/End: Original strand, 19615426 - 19615505
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaag 474  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19615426 tcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaaacaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcataccaag 19615505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 264
Target Start/End: Original strand, 8200615 - 8200654
Alignment:
Q  225 ctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8200615 ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaactt 8200654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 395 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 16069795 - 16069702
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatac 488  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||| |||||||| |||||   ||| ||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||    
T  16069795 tcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcaattaatatgaactcagttatactctaaccaattcatcccaaaaactacatccatac 16069702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 13966106 - 13965955
Alignment:
Q  455 tctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatctta 554  Q
    |||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||   ||| || |||||||| |||||||   ||||||| | | |||||||||| |  ||||| |  |    
T  13966106 tctaactaattcattccaaaaataacatccatacccgacaacggcagacaaactaaatcaaccacaaaatctctaccaaacatagatataggacacccca 13966007  T
Q  555 aacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
     ||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13966006 gacaaacaagagaagtggttattgaacccttagctggagtttcaacaaccat 13965955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 48812859 - 48812801
Alignment:
Q  308 aaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgctt 366  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || |||||    
T  48812859 aaggacgccatcaaagaaaacatcaaaattccatcacgctctaactgcttcagctgctt 48812801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 24452 - 23824
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||  | || |||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  24452 ttcaactgtcaataatcaatgcacaatatcatactaccatctttcttctttactagcaatatcggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaact 24353  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
      || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  24352 acttatcaagaaaatcttctaattgtttcttcatctcagccaactcagaagctgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaacaag 24253  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
     ||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| | || || |||||||  ||||||||||      
T  24252 gtcaatcgaaaattcaacttctctttctagaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctgggaaaccacacacaacttgtaacttatcaatcatt 24153  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  24152 gcttgtttctcaacagacaaggacgccatcaaagaaaacatcaaaatttcatcacgttctaattgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcgccac 24053  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
     |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  24052 tttcctcttcagcagaagaaaaatataccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccattcc 23953  T
Q  490 actcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagct 589  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23952 actcaaaggtaaacaaaccaaatcaatttcaaaatctcgaccaaacatagacaaagaacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagct 23853  T
Q  590 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23852 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 23824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 150954 - 151213
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||| || ||||| ||  |||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  150954 tgttcaactgacgatagtcaatgcataacctcatagtaccatccttcttcttaaccagcaataccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaa 151053  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |  || || || |    ||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  151054 cttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagcaagttcggacgccg----acgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaaca 151149  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  151150 aggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatccggaaaaactt 151213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Original strand, 151276 - 151580
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    |||||||||| ||||||||| ||  ||||||| || |||||||| |  || || ||||| |  |||||||| ||||  || ||||| |||||||| ||||    
T  151276 gccatcaaaggaaacattaagattccatcacgctccaactgcttcaactgtttcgtagataggaactctgctccactctcttcttccgcagaagaaaaat 151375  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| | ||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  ||||  ||| |||||| || ||    
T  151376 gcaccgtcttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatccatacccgtcaactgtaaacaaactaagtc 151475  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
     | |||||  || | | ||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  151476 gacttcaatgtctctaccaaacatagacaacggacatcttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcct 151575  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  151576 ttcat 151580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 25514 - 25003
Alignment:
Q  120 tctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25514 tctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaactcaa 25415  T
Q  220 catccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------ataga 306  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||             |||||    
T  25414 cttccctctctggaggtacatcaggaatttcatcaggaaatacttctggaaaattgcataccacttgtagtttatcaattaccgcttgattctcaataga 25315  T
Q  307 taaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaa 406  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25314 taaggaagccatcaaggaaaacatcaaaatgccatcacattccaactgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcgccactttcctcttcagcagaa 25215  T
Q  407 gagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaa 506  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  25214 gagaaatacaccgacttactataacaattaatgtgaacatggttgtactctaactagttcatacccagaatcacatccataccactcaaaggtaaacaaa 25115  T
Q  507 ccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25114 ctaaatccatctcaaaatcacgatcaaacatagataaaggacatcttaaacacacaagagatgtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 25015  T
Q  607 ctctccattcat 618  Q
     |||||||||||    
T  25014 ttctccattcat 25003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1873 - 1738
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||  |||||||  | ||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||| ||| |  || || ||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  1873 tgttcaactaccgataatccacacacaacatcatgctcccatctttcttcttaaccagcaatactggagcaccccacggtgaaacacttggtctaataaa 1774  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaa 136  Q
    ||  ||||||||||| || ||||| | |||||||||    
T  1773 ctacttctcaagcaactcttctaactatttcttcaa 1738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 41017 - 41645
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  41017 tgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcgtactaccatctttcttcttaactagaaaaattggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaa 41116  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  41117 cttcttatcaagcaaatcttctaagtgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacat--ggtaaggtgtcatagacacaggcttcgttcccggaata 41214  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||  |||| |||||    
T  41215 aaatcaatcgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaacacttctggaaaatcgcataccacctgtaacttataaatca 41314  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||| || || ||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  41315 ctgcttgattctcaatagacaaagatgccatcaaagaaaacatcaagattccatcacattctaattgcttcagctgcttagtagacaagaactctgcgcc 41414  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||    
T  41415 actttcctcttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaacaaattcatatcaaggattacatccata 41514  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41515 ccactcaaaggtaaacaaactaagtcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacgagagaagtagtcaccgaacccttag 41614  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41615 ctggagttttgacaaccatctctctattcat 41645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 74737 - 75365
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  74737 tgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcgtactaccatctttcttcttaactagaaaaattggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaa 74836  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  74837 cttcttatcaagcaaatcttctaagtgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacat--ggtaaggtgtcatagacacaggcttcgttcccggaata 74934  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||  |||| |||||    
T  74935 aaatcaatcgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaacacttctggaaaatcgcataccacctgtaacttataaatca 75034  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||| || || ||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  75035 ctgcttgattctcaatagacaaagatgccatcaaagaaaacatcaagattccatcacattctaattgcttcagctgcttagtagacaagaactctgcgcc 75134  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||    
T  75135 actttcctcttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaacaaattcatatcaaggattacatccata 75234  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  75235 ccactcaaaggtaaacaaactaagtcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacgagagaagtagtcaccgaacccttag 75334  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  75335 ctggagttttgacaaccatctctctattcat 75365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 200 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 35436 - 35006
Alignment:
Q  200 aagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatc 299  Q
    ||||||||| ||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  35436 aagatcaatagaaaacttaacttctctctctagaggtacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgtataccacttgtagcttatcaatc 35337  T
Q  300 ac-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgc 386  Q
    ||             ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || |||||||||||||| |||||||| |    
T  35336 actgtgtgattctcaatagataaggacgccatcaaggaaaacatcaaaataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcac 35237  T
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||| |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| | ||||||||    
T  35236 cactttcctcttcgacggaggagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagtttatacccaga-tcacatccat 35138  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  35137 accgcttaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagacgtagtcaccgaaccctta 35038  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35037 gctggagtttcgacaaccatctctccattcat 35006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 301
Target Start/End: Original strand, 56159 - 56440
Alignment:
Q  20 aatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcc 119  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||||||| || |||||||   |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||     
T  56159 aatacacaatctcatactaccatctttcttctttactaacaaaacgtgcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaaatct 56258  T
Q  120 tctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaa 219  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||    
T  56259 tctaactgtttcttcaactcagccaactcagaaactgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaataaggtcaattgaaaattcaa 56358  T
Q  220 catccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac 301  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||  |||||||||||    
T  56359 cttctctctctggaggcacatctggaatttcatcaggaaaaacttcgggaaaattgcataccacctgtaacttatcaatcac 56440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 8747 - 8582
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |  || || ||||| || |||||||||||| ||| |||    
T  8747 tgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgctcccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggcgaaacacttggtctaataaa 8648  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgata 166  Q
    ||  ||||||||||| || || || || |||||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||    
T  8647 ctgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgata 8582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 617
Target Start/End: Original strand, 36411 - 37040
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  36411 tgttcaattgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacagttggtctaacaaa 36510  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  36511 ctttttcttaagaaaatcttctaattgtttcttcaactcagctaactcggaagctgacatacgataaggtaccatagacacaagattcattccaggaaca 36610  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  36611 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatca 36710  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||    ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  36711 ctgcttgattctcaatagataaagaagccatcaaagaaaacatcaatataccatcgcgttcctgttgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcacc 36810  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  36811 actttcctcttcgacggaggagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcatacgcagaatcacatccata 36910  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||  ||| || | ||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  36911 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatctcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggaaatttcaaacatacgagataagtagtcaccgaacccttag 37010  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattca 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37011 ctggagtttcgacaaccatctctccattca 37040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 617
Target Start/End: Original strand, 20987 - 21616
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20987 tgttcaattgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacagttggtctaacaaa 21086  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |  |||||||||||||||||    
T  21087 ctttttcttaagaaaatcttctaattgtttcttcaactcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcgacgccggcttcgttccaggaaca 21186  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21187 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatca 21286  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||    ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  21287 ctgcttgattctcaatagataaagaagccatcaaagaaaacatcaatataccatcgcgttcctgttgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcacc 21386  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  21387 actttcctcttcgacggaggagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcatacgcagaatcacatccata 21486  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||  ||| || | ||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  21487 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatctcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggaaatttcaaacatacgagataagtagtcaccgaacccttag 21586  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattca 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21587 ctggagtttcgacaaccatctctccattca 21616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 307; Significance: 1e-172; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 6256 - 6886
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||| | |||| | ||||||||| || || |||||||| |||||||| || |  || | |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  6256 tgttcaactattgatagtcaatacacaatctcatactaccatctttcttcttaactagaaataccggcgctccccaagttgaaacacttggtcttacaaa 6355  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||| || |||| |    
T  6356 cttcttatcaagcaaatcttctaaatgtttctttaactcagccagctcagaagctgacatatggtaaggtgtcataaacacaggcttcgtacccggaata 6455  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||    
T  6456 aggtcaatcgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacatctagaaaatcacataccacctgtaacttatcaatca 6555  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             | |||  ||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| |||    
T  6556 ctgcttgattctcaacagaagaggacaccatcaaagaaaacattaaaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttggtagataagaactctgtgcc 6655  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  6656 actttcctcttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccatt 6755  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6756 ccactcaaaggtaaacaaaccaagtcaatttcaaaatctcgaccaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccaaacccttag 6855  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6856 ctggagtttcgacaaccatttctccattcat 6886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 13386 - 14016
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||| | |||| | ||||||||| || || |||||||| |||||||| || |  || | |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  13386 tgttcaactattgatagtcaatacacaatctcatactaccatctttcttcttaactagaaataccggcgctccccaagttgaaacacttggtcttacaaa 13485  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||| || |||| |    
T  13486 cttcttatcaagcaaatcttctaaatgtttctttaactcagccagctcagaagctgacatatggtaaggtgtcataaacacaggcttcgtacccggaata 13585  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||    
T  13586 aggtcaatcgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacatctagaaaatcacataccacctgtaacttatcaatca 13685  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             | |||  ||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| |||    
T  13686 ctgcttgattctcaacagaagaggacaccatcaaagaaaacattaaaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttggtagataagaactctgtgcc 13785  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  13786 actttcctcttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccatt 13885  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13886 ccactcaaaggtaaacaaaccaagtcaatttcaaaatctcgaccaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccaaacccttag 13985  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13986 ctggagtttcgacaaccatttctccattcat 14016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 307; Significance: 1e-172; HSPs: 4)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 35881 - 36511
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35881 tgttcaactgacgataatcgatacataacctcatactaccatctttcttctttactaacaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 35980  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  35981 cttcttctcaagcaattcttctaattgtttcttcaactcagctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaaca 36080  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || |  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  36081 agatcaatagaaaactcgacttttctctttggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaattgcataccacttgtagcttatcaatca 36180  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| |||||||| || |||||||| | | || |||| ||||| |  ||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||    
T  36181 ctgcttgattctcaatagataaagaagccatgaaggaaaacatcacattaccatcgcgttccagttgcttcagctgcttggtaaacaagaactctgcacc 36280  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  36281 actttcctcttcgacggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccaattcataccaagaatcacatccata 36380  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  36381 ccgctcaaaggtagacaaactagatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 36480  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36481 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 36511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 471
Target Start/End: Original strand, 28463 - 28944
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    ||||||||  ||||||  ||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28463 ttcaactgatgataatcgatacataacctcatactaccatcttttttctttactaacaaaacgggcgctcctcaaggtgaaaaacttggtctaacaaact 28562  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  28563 tcttctcaagcaaatcttctaattgtttattcaactcagttaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacactggcttcgttccaggaacaag 28662  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    |||| | ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||     
T  28663 atcattagaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcggataccacttgtagcttatcaatcact 28762  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  28763 gcttgattctcaatagataaagaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaagaactctgcaccac 28862  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcatacc 471  Q
     |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28863 tttcctcttcgacggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacc 28944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 3101 - 3371
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || | ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  3101 tgttcaactgacgataatcaatgcatagcctcatggtaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaa 3200  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || || |||||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||  |||||    
T  3201 tttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcgaaagctgacatacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgttcctagaaca 3300  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3301 agctcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaa 3371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 507
Target Start/End: Original strand, 3427 - 3620
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||| || |||||||| |  || || ||||  |  ||||| || ||||  || |||||||||||||| ||||    
T  3427 gccatcaaagaaaacataagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttagtagttaggaactcagctccactctcttcttcagcagaagaaaaat 3526  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaac 507  Q
     ||| | |||||||||  |||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||| ||||||    
T  3527 gcaccgtcttgctaaagtaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgtcaacggtaaacaaac 3620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 3 - 446
Target Start/End: Original strand, 8407 - 8863
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  8407 ttcaactgtcgataatcaatacacaacctcatgctaccatccttcttcttcactaacagaaccggcgctccccaaggtgaaagacttggtctaacaaact 8506  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8507 ttttctcaagcaaatcctttaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacataggcttcgttccaggaacaag 8606  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  8607 atcaatagaaaattcaacttccctctctggtggcacatcaggaatttcatcaggaaatacttctggaaaatcgcataccacttgtaggttatcaatcact 8706  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8707 gcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacattagaataccatcacattttaactgcttcagctgcttggtagacaaaaactctgcgccac 8806  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacat 446  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  8807 tttcctcttcagcagaagagaaatacactgatttactaaaacaattaatgtgaacat 8863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 382 - 618
Target Start/End: Original strand, 13861 - 14097
Alignment:
Q  382 tgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattaca 481  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13861 tgcgccactttcctcttcaacagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattaca 13960  T
Q  482 tccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaac 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13961 tccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatctcaaagtcacgatcaaaaatagacaaagaacatcttaaacatacaagagaagtagtcaccgaac 14060  T
Q  582 ccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14061 ccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 14097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 7)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 495403 - 496033
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| || || || || |||||||| |||||||| || | ||| | |||||||||||| |||| |||||||||| | |||||    
T  495403 tgttcaactgtcgataatcaatgcataatctcatactaccatctttcttcttaactagcaataccggcgctccccacggtgcaacacttggtcttacaaa 495502  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || ||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| || || |||| |    
T  495503 cttcttatcaagcaaatcatctaaatatttcttcaactcagccaactcagaagctgacatacggtaaggtgtcatagacacagacttagtacccggaaaa 495602  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||  ||||||||||    
T  495603 agatcaatcgaaaattcaacttctctttctagaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgcatacaacctataacttatcaatca 495702  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
                  |  || ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  495703 atgcttgattctcaacggacaaggacgccatcaaagaaaacatcaaaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcgcc 495802  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||| ||||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  495803 actttcatcttcagaagaagaaaaataaaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccatt 495902  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  495903 ccactcaaaggtaaacaaaccaaatcaatttaaaaatctcgaccaaacatagacaaagaacatcttaaaaacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 496002  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  496003 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 496033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 264
Target Start/End: Original strand, 441078 - 441336
Alignment:
Q  6 aactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttt 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| || | ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  441078 aactgtcgataatcaatacacaacctcatactaccatctttcttcttaactagcaataccggcgctacccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttct 441177  T
Q  106 tctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatc 205  Q
    | ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  441178 tatcaagtaaatcttctaactatttcttcaactcagccaactcagaagccgacatacggtaatgcgtcatagacacatgcttcgtacccggaacaagatc 441277  T
Q  206 aatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    ||||||||||||||| || || ||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  441278 aatcgaaaattcaacttctctttctaggggcacatcaggaattttatcaggaaaaactt 441336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 453114 - 452871
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| | | | ||||| || || |||||||| ||||    
T  453114 atacataacctcgtgctaccatccttcttcttaaccagcaatatcggcactccccacggtgaaacactcgatcttacaaatttcttatcaagcaagtcct 453015  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| || || |||| ||||||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  453014 ctaactgtttcttcaactcagctaactcggacgccgacaaacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaattgataattcaac 452915  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  452914 ttccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaactt 452871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 459 - 618
Target Start/End: Original strand, 441507 - 441666
Alignment:
Q  459 accagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaaca 558  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||| | | |||||||||| |  |||||||||| |||    
T  441507 accaattcataccaagaattacatccattccactctaaggcaaacaaaccaaatcaatctaaaaatctctaccaaacatagataaaggacatcttagaca 441606  T
Q  559 cacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  441607 cactagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctccattcat 441666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 515239 - 515011
Alignment:
Q  36 ctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| || || || | ||  || || || ||||||||||    
T  515239 ctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaatttcttatccaacaggtcttccaactgtttcttca 515140  T
Q  136 actcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggagg 235  Q
    | || || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| ||||  || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||    
T  515139 attcagctaactcagaagctgacatacggtatggtgccatcgacaccggctttgttcctggaatgaggtcaattgaaaattcaacctctctctctggtgg 515040  T
Q  236 cacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  515039 cacatcaggaatctcatcatgaaacactt 515011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 387 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 514875 - 514656
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||| ||| | || || || |||||  |||| | ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  514875 caccttcttcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactatagcagttgatatgaactcggttattctctaaccaattcattccaaaaatcacatccat 514776  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| |||| |||||| |||||||   ||||||| | | |||||||||| |  ||||| |  | ||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  514775 acccgtcaacggtaaacaaactaaatcaaccacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccccagacaaacaagagaagtagttactgaaccctta 514676  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  514675 gctggagtttcaacaaccat 514656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 314 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 452808 - 452648
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    |||||||||||||| |||| |||  ||||||| || |||||||| |  || || ||||  |  ||||| || ||||  || |||||||||||||| || |    
T  452808 gccatcaaagaaaatattagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttagtagttaggaactcagctccactctcttcttcagcagaagaaaagt 452709  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaag 474  Q
    |||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  452708 acaccgtcttactaaaacaattaatatgaacatggttatactccaaccagttcataccaag 452648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 16251508 - 16250878
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16251508 tgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 16251409  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  16251408 tttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaattcagctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacacctgcttcgttccaggaaca 16251309  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  16251308 agatcaatagaaaactcgacttccctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgtagcttatcaatca 16251209  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| || ||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| |  ||||| || |  || ||||  || |||||||| ||    
T  16251208 ctgctagattctcaatagataaagaggccatcaacaaaaacatcaaaataccatcacgttccatttgcttcagctatttagtagttaagaactctgcacc 16251109  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  16251108 actttcctcttcagcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaatttatacccagaatcacatccata 16251009  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16251008 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 16250909  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16250908 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 16250878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 14682921 - 14683551
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14682921 tgttcaactgtcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagtaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 14683020  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || |||||||||||||| || || ||||||||| |||| |  || || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  14683021 tttcttctcaagcaaatcttccaactgtttcttcgactcagataattcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaaca 14683120  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14683121 agatcaatagaaaactcaacttccctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaactttaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatca 14683220  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |  ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  14683221 ctgcttgattctcaatagataaagaagccattaaagaaaacatcaaaataccatcacgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcacc 14683320  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  14683321 actttcctcttcggcggaagagaaatacactgacatgctaaaacaattaatatgaacatggttgtactccaaccaattcattcccagaatcacatccata 14683420  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14683421 ctgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacaacgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 14683520  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14683521 ctggagtttcaacgaccatctctccattcat 14683551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 14696467 - 14697085
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || | ||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  14696467 tgttcaactgtcgataatcaatgcataacctcatgctaccatctttcttcttaactagcaatactggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaa 14696566  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  14696567 cttcttatcaagtaaatcttctaactgtttcttcaactcaaccaactcagaagccgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaaca 14696666  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||            ||||||||||| ||| ||||| || || || ||||  || |||||||    
T  14696667 aggtcaatcgaaaattcaacttccctttctggaggcacatc------------aggaaaaacttctgggaaatcacacacaacctgtaacttctcaatca 14696754  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || | ||||||    
T  14696755 ctgcttgattctcaacagacaaggacgccatcaaagaaaacatcaaaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttagtagaaaagaattttgcgcc 14696854  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  14696855 actttcctcttcagcagaagaaaaatacactgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccatt 14696954  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14696955 ccactcaaaggtaaacaaactaaatcaatttcaaaatctcgaccaaacatagacaagggacatcttaagcacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 14697054  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14697055 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 14697085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 17092807 - 17092177
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17092807 tgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 17092708  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  17092707 cttcttctcaagcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 17092608  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   | |||||||    
T  17092607 agatcaatagaaaattcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatca 17092508  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | ||||||||| |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  17092507 ctgcttgattctcaatagataaagtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 17092408  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  17092407 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 17092308  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  17092307 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 17092208  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17092207 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 17092177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 18225104 - 18224474
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||| |||||||| || | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18225104 tgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttgactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 18225005  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || ||||  |||||||| ||||| |||||  ||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||| ||| || || | ||||||||||||||||    
T  18225004 tttcttcttgagcaaatcttctaactgttttgtcaactcagctaactcgaaagcagacatacgataaggtgccatcgataccaacttcgttccaggaaca 18224905  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  18224904 agatcaatagaaaactcaacttccctctctggaggcacattaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgtagcttatcaatca 18224805  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  18224804 ctgcttgattctcaatagataaagaagccatcaacgaaaacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcacc 18224705  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||    
T  18224704 actttcctcttcaacggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattgttatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccaaaataacatccata 18224605  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18224604 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 18224505  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18224504 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 18224474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 15145551 - 15144920
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| || || || |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15145551 tgttcaactgacgataatcgatacataatctcatactaccatctttcttcttcactaacaaaaaaggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 15145452  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  15145451 cttcttctcaagcaagtcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatagacaccggcttcattccaagaaca 15145352  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  15145351 agatcaatagaaaacttaacttctctctctagaggtacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgtataccacttgtagcttatcaatca 15145252  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  15145251 ctgtgtgattctcaatagataaggacgccatcaaggaaaacatcaaaataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcacc 15145152  T
Q  388 -accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttg-ctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatcca 485  Q
     || |||||||||  | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| | |||||||    
T  15145151 tactttcctcttcgacggaggagaaatacactgacttgactaaaacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagtttatacccaga-tcacatcca 15145053  T
Q  486 taccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctt 585  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  15145052 taccgcttaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagacgtagtcaccgaaccctt 15144953  T
Q  586 agctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144952 agctggagtttcgacaaccatctctccattcat 15144920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 588
Target Start/End: Original strand, 16218584 - 16219184
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||| |||||||| ||| || || || ||||||||||| |||||||| || | ||| | ||| ||||| |||||||||||||||||| | | |||    
T  16218584 tgttcaactatcgataatcaatgcataatctcatgctaccatctttcttcttaactagcaataccggtgctccacaaggtgaaacacttggtcttataaa 16218683  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || | ||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  16218684 cttcttatgaagtaaatcttctaactgcttcttcaactcaaccaactcataagctgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaacc 16218783  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||| || ||| | ||||||||||    
T  16218784 agatcaatcgaaaattcaacttatctttctggaggcacatcaagaatttcatcaggaaaaacttctagaaaatcacatacaacctgtggcttatcaatca 16218883  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||    
T  16218884 ctgcttgattctcaatagacaaggacgccatcaaaaaaaacatcaaaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttgatagacaagaactctgcgcc 16218983  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  16218984 actttcctcttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaccaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccatt 16219083  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  16219084 ccactcaaaggtaaacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagttattgaacccttag 16219183  T
Q  588 c 588  Q
    |    
T  16219184 c 16219184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 588
Target Start/End: Original strand, 16221904 - 16222504
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||| |||||||| ||| || || || ||||||||||| |||||||| || | ||| | ||| ||||| |||||||||||||||||| | | |||    
T  16221904 tgttcaactatcgataatcaatgcataatctcatgctaccatctttcttcttaactagcaataccggtgctccacaaggtgaaacacttggtcttataaa 16222003  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || | ||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  16222004 cttcttatgaagtaaatcttctaactgcttcttcaactcaaccaactcataagctgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaacc 16222103  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||| || ||| | ||||||||||    
T  16222104 agatcaatcgaaaattcaacttatctttctggaggcacatcaagaatttcatcaggaaaaacttctagaaaatcacatacaacctgtggcttatcaatca 16222203  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||    
T  16222204 ctgcttgattctcaatagacaaggacgccatcaaaaaaaacatcaaaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttgatagacaagaactctgcgcc 16222303  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  16222304 actttcctcttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaccaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccatt 16222403  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  16222404 ccactcaaaggtaaacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagttattgaacccttag 16222503  T
Q  588 c 588  Q
    |    
T  16222504 c 16222504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 8388766 - 8389396
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8388766 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 8388865  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  8388866 cttcttctcaagcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 8388965  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  8388966 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 8389065  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  8389066 ctgcttgattctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 8389165  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||    
T  8389166 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcattcccaaaatcacatccata 8389265  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  8389266 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagtgaagtagtcaccgaacccttag 8389365  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8389366 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 8389396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 12478954 - 12479584
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12478954 tgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 12479053  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||  ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  12479054 cttcttttcaagcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtaccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 12479153  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   | |||||||    
T  12479154 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatca 12479253  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | ||||||||| |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  12479254 ctgcttgattctcaatagataaagtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 12479353  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  12479354 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 12479453  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12479454 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 12479553  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12479554 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 12479584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 23958101 - 23958731
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23958101 tgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaa 23958200  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  23958201 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 23958300  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  23958301 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaccctatcaatca 23958400  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  23958401 ctgcttgattctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 23958500  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23958501 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 23958600  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23958601 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 23958700  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23958701 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 23958731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 27713690 - 27714320
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  27713690 tgttcaactgtcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaa 27713789  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||| |||    
T  27713790 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccagggaca 27713889  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  27713890 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 27713989  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||||| |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  27713990 ctgcttgattctcaatagataaggtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 27714089  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27714090 actttcctcttcgacggaagagaaatatactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 27714189  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||   ||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27714190 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaagacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 27714289  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27714290 ccggagtttcgacaaccatctctccattcat 27714320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 14161824 - 14162454
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  || || |||||||| |||||||| || ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  14161824 tgttcaactgtcgataatcaatacacagtctcatactaccatctttcttcttgactaacaacactggcgctccccaaggagaaacacttggtctcacaaa 14161923  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| | || |    
T  14161924 tttcttgtcaagcaaatcctccaactgtttcttcaattcagctaacttagaagcagacatacgataaggtgtcatagatataggcttcgttcccgaaata 14162023  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    ||||| || ||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||  ||||||||||    
T  14162024 agatcgattgaaaactaaacttccctttctggaggtacatcaggaatttcattgggaaaaacttctggaaaatcgcataccacctataacttatcaatca 14162123  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  14162124 ccgcttgattctcaatagacaaggatgccatcaaggaaaacatcaaaattccatcacgttctagttgcttcagttgcttggtagacaagaactctactcc 14162223  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
     | ||| |||||| |||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  14162224 gctttcttcttcaacagaggagaaggacaccgacttgctaaaacaattaataagaacatggttgtactctaaccagttcatgccaagaatcacatccatt 14162323  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14162324 ccactcaaaggtaaacaaactaaatccatttcaaaatcacgatcatacatagacaaaggacaccttaaacacacaagagaagtagttaccgaacccttag 14162423  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14162424 ctggagtttcgacaaccatttctccattcat 14162454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 14301637 - 14301007
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||  || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14301637 tgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 14301538  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  14301537 cttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 14301438  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  14301437 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 14301338  T
Q  301 ca-------------tagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |              ||||||| | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  14301337 ctgcttgattctcagtagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactccgcacc 14301238  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14301237 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 14301138  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14301137 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaatatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 14301038  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14301037 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 14301007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 16234650 - 16234020
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16234650 tgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 16234551  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  16234550 cttcttctcaagcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 16234451  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   | |||||||    
T  16234450 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatca 16234351  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||  | || ||| |  |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  16234350 ctgcttgattctcaatagatatagtaggcattagcgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 16234251  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  16234250 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 16234151  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16234150 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 16234051  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16234050 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 16234020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 19776451 - 19775821
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19776451 tgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 19776352  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  19776351 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 19776252  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  19776251 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 19776152  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||  | |||||| || |||||||| || |||   || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  19776151 ctgcttgattctcaatagatatagtagccattaacgaaaacatcaagatactgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 19776052  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  19776051 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 19775952  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  19775951 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatatgagagaagtagtcaccgaacccttag 19775852  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775851 ccggagtttcgacaaccatctctccattcat 19775821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 462
Target Start/End: Original strand, 22632058 - 22632528
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| || ||||    ||| ||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22632058 tgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgc----atctttcttcttcactaacaaaaccgacactccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 22632153  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  22632154 ctttttctcaagtaaatcttctaactgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacataggcttcattccaggaaca 22632253  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22632254 agatcaatcgaaaactcaacttccctctctggaggcacattagaaatttcatcaggaaatacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatca 22632353  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22632354 ctgcttgattctcaatagataaggaagccatcaacgaaaacatcaaaataccatcacgttctaactgcttcaactgcttagtagacaaaaactctgcgcc 22632453  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaacca 462  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  22632454 actttcctcttcagcagaagagaaatacaccgatttactaaaacaattaatatgaacatggttatactccaacca 22632528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 8051281 - 8050651
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||| |||||||| || ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  8051281 tgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcactccccaaggcgaaacacttggtctaacaaa 8051182  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  8051181 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 8051082  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  8051081 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 8050982  T
Q  301 ca-------------tagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |              ||||||| | |||||| || |||||||| || ||| | ||  |||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  8050981 ctgcttgattctcagtagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgtgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 8050882  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  8050881 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 8050782  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  ||| || | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  8050781 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggaaatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 8050682  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8050681 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 8050651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 40475394 - 40476024
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||  || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40475394 tgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatccttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 40475493  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||| |||    
T  40475494 cttcttctcaagcaaatcttccaacagtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccagggaca 40475593  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   ||||||||     
T  40475594 agatcaatagaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcc 40475693  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||||| || ||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| | ||||||||| ||    
T  40475694 ctgcttgattatcaatagataaggtagtcattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagatacaaactctgcacc 40475793  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  40475794 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctataacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 40475893  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  40475894 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 40475993  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40475994 ctggagtttcgaccaccatctctccattcat 40476024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 316 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 16365 - 16063
Alignment:
Q  316 catcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatac 415  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  16365 catcaaggaaaacatcaaaataccatcacgttctaactgcttcagctgtttagtagacaaaaactttgcgccactttcctcttcagcagaagggaaatac 16266  T
Q  416 actgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaa 515  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16265 accgacttactaaaacaattaatgtgaacatggttgtactttaaccagttcataccaaggattacatccataccactcaaaggtaaacaaaccaaatcaa 16166  T
Q  516 tttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccatt 615  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16165 tttagaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccatt 16066  T
Q  616 cat 618  Q
    |||    
T  16065 cat 16063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 16353186 - 16352699
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    ||||||||  ||||||  ||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16353186 ttcaactgatgataatcgatacataacctcatactaccatcttttttctttactaacaaaacgggcgctcctcaaggtgaaaaacttggtctaacaaact 16353087  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  16353086 tcttctcaagcaaatcttctaattgtttattcaactcagttaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacactggcttcgttccaggaacaag 16352987  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    |||| | ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||     
T  16352986 atcattagaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcggataccacttgtagcttatcaatcact 16352887  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  16352886 gcttgattctcaatagataaagaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaagaactctgcaccac 16352787  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaat 477  Q
     |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16352786 tttcctcttcgacggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccaattcataccaagaat 16352699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 126 - 618
Target Start/End: Original strand, 19634615 - 19635120
Alignment:
Q  126 tgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccc 225  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  19634615 tgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatagaaaactcaacttctc 19634714  T
Q  226 tctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagataagga 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   ||||||||||             |||||||| |     
T  19634715 tctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttgattctcaatagataaagt 19634814  T
Q  313 agccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaa 412  Q
    |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||| ||| |||| |||||||||  | |||||||||    
T  19634815 agccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactttgcaccactttcctcttcgacggaagagaaa 19634914  T
Q  413 tacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaat 512  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19634915 tgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaaggtagacaaactaaat 19635014  T
Q  513 caatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 612  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19635015 ccatttcaaaatcacgaccgaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 19635114  T
Q  613 attcat 618  Q
    ||||||    
T  19635115 attcat 19635120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 14849022 - 14848543
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  14849022 ttcaactgtcgataatcaatgcataacctcatgctaccatctttctttttaactagcaatatcggcgctccctaaggtgaaacacttggtcttacaaact 14848923  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  | |||| |||    
T  14848922 tcttctcaagtaaatcttctaattatttcttcaactcggccaactcagaagccgacatacggtaaggtgtcatagacacaggctttgtatccggaataag 14848823  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||  |||||||||||     
T  14848822 atcaatcgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcattaggaaaaacttctggaaaatcacatacaacctttaacttatcaatcact 14848723  T
Q  302 -------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcca 388  Q
                 |  || ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  | |||||||    
T  14848722 cccttgattctcaacggacaaggatgccatcaaagaaaacatcaaaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttagtagacaagagttttgcgcca 14848623  T
Q  389 ccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcat 468  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14848622 ctttcctcttcagcagaagaaaaatacaccgatttaataaaataattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcat 14848543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 314 - 615
Target Start/End: Original strand, 14188186 - 14188487
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    |||||||| | |||||| |||||  |||| |||||||  ||||| || ||||| |||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||||| ||| |      
T  14188186 gccatcaaggtaaacatcaaaattccatctcgttctagttgcttcagctgcttagtagacaagaactccactccactttcttcttcagcagaggaggagg 14188285  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
    |||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  14188286 acaccgaattgctaaaacagttgataagaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaatcacattcattccactcaaaggtaaacaaactaaatc 14188385  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14188386 catttcaaaatcacgatcaaacaaagacaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtaaccgaacctttagctggagtttcgacaaccatctctcca 14188485  T
Q  614 tt 615  Q
    ||    
T  14188486 tt 14188487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15357038 - 15356775
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  || || || || ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||    
T  15357038 tgttcaactgacgataatcgatgcataatctcatggtaccatccttcttcttaaccaacaatatcggcgctccccacggtaaaacacttggtcttacaaa 15356939  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || || |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  15356938 tttcttatcaagcaagtcttccaattgtttcttcaactcagccaactcggacgccgacatacgataaggtgccattgacaccggcttcgttcctggaaca 15356839  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15356838 aggtcaattgaaaattcaacctccctttctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaactt 15356775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3262712 - 3262442
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  |||||||  || || ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  3262712 tgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaa 3262613  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || || | ||  ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  3262612 cttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaaca 3262513  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  3262512 agatcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcagggaatacttctggaaa 3262442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1647193 - 1646932
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    ||||| || ||||| | ||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |  || |||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||    
T  1647193 ttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatctttcttctttactaacaacacaggtgctccccacggtgagacactgggtcttacaaact 1647094  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| || |||||    
T  1647093 tcttgtcaagcaaatcctccaactgtttcttcaactcagccaattcagaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcccgggacaag 1646994  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1646993 atcaatcgagaactcaacttccctttctggcggcacatcaggaatctcatctggaaaaactt 1646932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 271
Target Start/End: Original strand, 8708263 - 8708531
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| || ||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  8708263 ttcaactgacggtaatctatacacaacctcacgctaccatctttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaact 8708362  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || ||||| |||||||| || |||||||||||||| || | |||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||| | |||||||  | ||||||||    
T  8708363 tcttatcaagtaaatcctccaactgtttcttcaactctgctagctcagatgctgacatacagtaaggcgtcatcgacataggcttcgtatctggaacaag 8708462  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  8708463 atcgattgaaaattcaacttccctctttggcggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaa 8708531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 29451420 - 29451192
Alignment:
Q  36 ctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || || | ||  ||||| || ||||||||||    
T  29451420 ctaccatccttcttcttgaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaacttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttca 29451321  T
Q  136 actcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggagg 235  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||    
T  29451320 actcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgtcatcgacaccggctttgttcctggaacaagatcaattgaaaattcaacctcccgctctggtgg 29451221  T
Q  236 cacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29451220 cacatcaggaatctcatcaggaaacactt 29451192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Original strand, 15258283 - 15258544
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    ||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| | || |||||||||||||||| |||||||| | ||||| |    
T  15258283 ttcaactgtcggtaatcaatgcataacctcatgctaccgtccttcttcttaaccagcaacaccgacgctccccaaggtgaatcacttggtcttacaaatt 15258382  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || || ||||| ||||| ||  |||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||    
T  15258383 tcttatcgagcaagtcctccaacagtttcttcaattcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaag 15258482  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15258483 gtcaattgaaaattcaacctccctctccggtgggacatctggaatctcatcaggaaaaactt 15258544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 20892385 - 20892648
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || |||| ||| ||||  || || ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  20892385 tgttcaactgacggtaatcaatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaa 20892484  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || || | ||| ||||  || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  20892485 cttcttatccaacaagtccttcaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtatggtgccatcgacaccggctttgttcctggaaca 20892584  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20892585 aggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacactt 20892648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Original strand, 15072733 - 15072983
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || | || ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || || ||||| |||||||    
T  15072733 atacacaacctcatactgccatcattcttcttaaccaataataccgacgctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatcaagtaaatcct 15072832  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15072833 ccaactgtttcttcaattcagctaactcggacgctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccggggacaagatcaatcgaaaattcaac 15072932  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
     |||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15072933 ctccctccctggtggtatatcgggaatctcatcaggaaaaacttctggaaa 15072983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 44659784 - 44659521
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  |||||||  || || ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||  || | |||||    
T  44659784 tgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttcttgaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgagtcttacaaa 44659685  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || || | ||  ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | || |||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  44659684 cttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatatggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaaca 44659585  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44659584 aggtcaattgaaaattcaacttccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacactt 44659521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Original strand, 16150067 - 16150328
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||  |||||||||| ||||| |||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  16150067 ttcaactgacgataatcaatgcacaacctcatagtaccatccttattcttaaccaacaacactgacgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaaat 16150166  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || |||||||| ||||| || | ||||||||| || || |  || || || |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||    
T  16150167 tcttatcaagcaagtcctccaactatttcttcaattcagcaagttcggatgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaag 16150266  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16150267 gtcaattgaaaattcaacctccctatatggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaactt 16150328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Original strand, 16154213 - 16154474
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||  |||||||||| ||||| |||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  16154213 ttcaactgacgataatcaatgcacaacctcatagtaccatccttattcttaaccaacaacactgacgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaaat 16154312  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || |||||||| ||||| || | ||||||||| || || |  || || || |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||    
T  16154313 tcttatcaagcaagtcctccaactatttcttcaattcagcaagttcggatgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaag 16154412  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16154413 gtcaattgaaaattcaacctccctttatggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaactt 16154474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 11205115 - 11204880
Alignment:
Q  36 ctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| || || || | ||  ||||| || || ||||| |    
T  11205115 ctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaatttcttatctaacaggtcctccaactgcttcttta 11205016  T
Q  136 actcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggagg 235  Q
    | || || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  11205015 attcagctaactcagaagctgacatacggtatggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaagctcaattgaaaattcaacctccctctctggtgg 11204916  T
Q  236 cacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  11204915 cacatcagaaatctcatcaggaaatacttctggaaa 11204880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Original strand, 15073039 - 15073343
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| |  || ||  ||| ||| ||||| ||  |||  || || ||||||||||| ||||    
T  15073039 gccatcaaagaaaacattaagattccatcacattctaactgcttcaactgtttattagtcaagaactcggcttcactctcttcctcagcagaagaaaaat 15073138  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
      || | ||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||| || ||||| || | |||    
T  15073139 gtaccgtcttactaaaacaattaatatgaacacggttatactctaaccagttcatcccaaagattacatccatacccgtcaacggcagacatacaagatc 15073238  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
    || |||||| || | | ||||||||||||  ||||| || ||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15073239 aacttcaaagtctctaccaaacatagacaaaggacaactcaaactgacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcca 15073338  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  15073339 ttcat 15073343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 479 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 16350721 - 16350582
Alignment:
Q  479 acatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccg 578  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| || |||||||||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  16350721 acatccataccgctcaaaggtagacaaactagatccatttcgaaatcacgaccagacatagacaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccg 16350622  T
Q  579 aacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350621 aacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 16350582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 27902740 - 27903002
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||    |||||||| ||| | |||||    
T  27902740 tgttcaactgacgatagtcaatgcacaatctcatactaccatccttcttctttaccaacaacacaagcgctccccacaacgaaacactgggtcttacaaa 27902839  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||  | |||||||| |||| |    
T  27902840 cttcttatcaagcaagtcctc-aactgtttcttcaactcggctaattcagaagctgacatgcgatatggtgccatcgacaccggtttcgttcccggaata 27902938  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27902939 agatcaatcgagaactcaacttccctttttggtggcacatcaggaatctcatccggaaaaactt 27903002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15001281 - 15001052
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||| || ||||||||||||||| | ||||| |    
T  15001281 ttcaactgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcactcctcacggtgaaacacttggtcttacaaatt 15001182  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || |||||||| | ||| || |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||| | | |||||  ||||||||||  |||||||    
T  15001181 tcttgtcaagcaagttctccaactgtttcttcaactcagctaactcggacgccgacatacgataaggtgccttcgacaccggcttcgttcctagaacaag 15001082  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctgg 232  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15001081 gtcaattgaaaattcaacctccctctctgg 15001052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 51604710 - 51604455
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| || ||| | |||||    
T  51604710 tgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttcttcaccaacaacacaggtgctccccacggcgaaacgctgggtcttacaaa 51604611  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  51604610 cttcttatcaagtaaatcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggctttgttccgggaaca 51604511  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcagg 256  Q
    || ||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51604510 aggtcaattgaaaactccacctccctttctggcggcacatcaggaatctcatcagg 51604455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 23443459 - 23443621
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||| || || |||||||| |||||||| |  | ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||    
T  23443459 tgttcaactatcgatagtcaatacacaatctcatactaccatctttcttcttaattagcaatatcggcgctcctcaaggtgaaacatttggtcttacaaa 23443558  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacg 163  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23443559 ctttttatcaagcaaatcttctaactgtttcttcaattcagccaactcagaagctgacatacg 23443621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 322 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 51604376 - 51604080
Alignment:
Q  322 agaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgac 421  Q
    ||||||||| | |||  ||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||| ||||  ||  | ||||  || |||||||||||||| |||| ||| | |    
T  51604376 agaaaacatcagaattccatcacgttctaattgcttcatctgctttgtagataaaatttcaactccactctcttcttcagcagaagaaaaatgcacagtc 51604277  T
Q  422 ttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaa 521  Q
    ||| |||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||  |||  || | |||||| || || | |||||    
T  51604276 ttgttaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccattcccgtcagcggcaaacaaactaagtctacttcaa 51604177  T
Q  522 aatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||| | | |||||||||| |  ||||| || || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  51604176 aatctctaccaaacatagaaattggacacctcaagcaaacaagagaagtagtcactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 51604080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 395 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 14993878 - 14993655
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactca 494  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| | ||| ||||| |||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||  |||    
T  14993878 tctttagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcaattaatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaatcacatgcatacccgtca 14993779  T
Q  495 aaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 594  Q
    | |||| |||||| |  || | ||||||  | | | ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  14993778 acggtaaacaaacaaggtcgacttcaaagcctccaccaaacatagacaacggacaacttagacaaacaagagaagtagttagtgaacccttagctggagt 14993679  T
Q  595 ttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||    
T  14993678 ttcaacaaccatttctcctttcat 14993655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 387 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 3262313 - 3262094
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  || | ||| ||||| || || || |||||  | || ||||||||||| ||||||||||  || ||||||||    
T  3262313 caccttcttcttcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcgattatactctaaccaattcataccaaagataacatccat 3262214  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| || |||||||| ||||||||  ||||||| | | |||||||||| |  ||||| |  | ||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  3262213 acccgtcaacggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaaccctta 3262114  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  3262113 gctggagtttcaacaaccat 3262094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 387 - 618
Target Start/End: Original strand, 20892784 - 20893015
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||| || || || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  20892784 caccttcttcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcggttatactctaaccagttcattccaaaaataacatccat 20892883  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||   ||| || |  ||||| | |||||   ||||||| | | |||||||||| |  ||| | |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  20892884 acccgacaacggcaagcaaactagatcaaccacaaaatctctaccaaacatagatataggataccccaaacaaacaagagaagtagttactgaaccctta 20892983  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  20892984 gctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 20893015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 387 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 29451056 - 29450837
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||  || | ||| ||||| || || || |||||  | || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  29451056 caccttcttcctcagcagaagaaaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaacccgattatactctaaccaattcataccaaaaatcacatccat 29450957  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| || |||||||| ||||||||  ||||||| | | |||||||||| |  ||||| |  | ||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  29450956 acccgtcaacggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaaccctta 29450857  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  29450856 gctggagtttcaacaaccat 29450837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 395 - 597
Target Start/End: Original strand, 15258688 - 15258890
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactca 494  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | ||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| | || ||| |||||||||||  |||    
T  15258688 tcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcatccaaaaaatgacatccatacccgtca 15258787  T
Q  495 aaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 594  Q
    | |||| |||||| |  || | | |||| || | | ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  15258788 acggtaaacaaacaaggtcgactacaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaactcttagctggagt 15258887  T
Q  595 ttc 597  Q
    |||    
T  15258888 ttc 15258890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 15354499 - 15354340
Alignment:
Q  447 ggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacagggg 546  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||  |||| |||| |||||| || || | || ||| || | | ||||||||||||   |    
T  15354499 ggttatactctaatcagttcatcccaaaaataacatccatacccgtcaacggtaaacaaactaagtcgactttaaagtctctaccaaacatagacaacag 15354400  T
Q  547 acatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15354399 acatcttagacaaacaagagaagtagttactgaacccgtagctggagtttcaacaaccat 15354340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 569 - 618
Target Start/End: Original strand, 13513285 - 13513334
Alignment:
Q  569 gtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13513285 gtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 13513334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 453 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 44659319 - 44659166
Alignment:
Q  453 actctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatct 552  Q
    |||||||||| ||||||||||  || |||||||||||  |||| || |||||||| ||||||||  ||||||| | | |||||||||| |  ||||| |     
T  44659319 actctaaccaattcataccaaagataacatccatacccgtcaacggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccg 44659220  T
Q  553 taaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
     | ||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44659219 cagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 44659166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Original strand, 27903065 - 27903369
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||| ||| | |||||||| |  || || ||||  |  |||||||| ||||  |  ||||| |||||||| ||||    
T  27903065 gccatcaaagaaaacataagaatttcatctcgtcccaactgcttcaactgtttagtagttaggaactctgctccactcttttcttccgcagaagaaaaat 27903164  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| | |||| | |||||||| || | |||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||| ||  |||| |||||||| || || ||    
T  27903165 gcaccgtcttgttgaaacaatttatataaactcggttatactctaaccaattcatccctaaaataacattcattcccatcaacggtagacacactaagtc 27903264  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
     |  |||||||| | | ||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||     
T  27903265 gacctcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacaaactagagaagtagttactgaacccttggctggagtttcaacgaccatttctcct 27903364  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  27903365 ttcat 27903369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 531 - 606
Target Start/End: Original strand, 16150533 - 16150608
Alignment:
Q  531 caaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16150533 caaacatagacaacggacaccttagacacacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 16150608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 531 - 606
Target Start/End: Original strand, 16154679 - 16154754
Alignment:
Q  531 caaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16154679 caaacatagacaacggacaccttagacacacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 16154754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 11204751 - 11204532
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||| ||| | ||| ||| | || || || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  11204751 caccttcttcctcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactatagcagttgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaataacatccat 11204652  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||   ||| || |||||||| |||||||   ||||||| | | ||||||||||    ||||| |  | ||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  11204651 acccgacaacggcagacaaactaaatcaaccacaaaatctctaccaaacatagatttaggacaccccagacaaacaagagaagtggttactgaaccctta 11204552  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  11204551 gctggagtttcaacaaccat 11204532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 53750815 - 53750758
Alignment:
Q  561 caagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  53750815 caagagaagtagtcactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 53750758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 489
Target Start/End: Original strand, 8708587 - 8708762
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||| ||||| || |||| ||| |||||  |   ||  || || ||||||||||| ||||    
T  8708587 gccattaaagaaaacattaagatcccatcatgttttaactgcttcagttgtttagtagtcaagaactcaactttactctcttcctcagcagaagaaaaat 8708686  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
     ||  | ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  8708687 gcatcgtcttactaaaacaattgatatgaacatggttatacgccaaccagttcatcccaaagattacatccatacc 8708762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15291076 - 15290911
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||||  ||||||  | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||| |||||| |||| ||| ||| |||    
T  15291076 tgttcaactgcagataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacattggagcaccccacggtgaaccactcggtctaataaa 15290977  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgata 166  Q
    ||  ||||||||||| || || || || |||||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||    
T  15290976 ctgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgata 15290911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14994053 - 14994016
Alignment:
Q  234 ggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14994053 ggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaa 14994016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 3 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 14398 - 13770
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    ||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  14398 ttcaagtgtcgataatcaatgcataacctcatgctaccatctttcttcttaactagcaatatcggcgctctccacggtgaaacacttggtcttacaaact 14299  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14298 tcttatcaagtaaatcttctaactttttcttcaactcagccaactcagaagccgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtaccaggaacaag 14199  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| | ||| |||| |||||||||| |||| ||||| || || || ||||  ||||||||||      
T  14198 atcaatcgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcggaaatttcataaggaaaaactaatgggaaatcacacacaacctgtaacttatcaatcatt 14099  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                | ||| ||| | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||  |||| || ||||| |||||||| || | ||||||||    
T  14098 gcttgattctcaacagacaagaatgccatcaaagaaaacatcaaaattccatcacgttctaatagcttcagctgcttagtagacaagaattatgcgccac 13999  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13998 tttcctcttcagcagaagaaaaatacactgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccattcc 13899  T
Q  490 actcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagct 589  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13898 actcaaaggtaaacaaactaaatcaattttaaaatctcgaccaaacatagacaatggacatcttaatcacacaagagaagtagtcaccgaactcttagct 13799  T
Q  590 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13798 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 13770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 297; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 3 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 15897 - 15270
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||| |||||||| || | ||| | ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  15897 ttcaactgtcgataatcaatacacaacctcatactagcatctttcttcttaactagcaataccggcgctccccaaggtggaacacttggtctcacaaact 15798  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15797 tcttatcaagcaaatcttctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacggtaaggcgtcatagacacaggcttcgttcccggaacaag 15698  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||    |||||||| |||||||||||     
T  15697 atcaatcgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaattacacgtaacttgtagcttatcaatcact 15598  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                | ||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  15597 gcttgattctcaacagacaaggacgccat-aaaaaaaacattagaatttcatcacgctctaactgtttcagctgcttagtagacaagaactctgctccac 15499  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
      || |||||  ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15498 tctcttcttcgacagaagaaaaatacactgacttgttataacaattaatgtgaacatggttatactccaaccagttcataccaagaattacatccattcc 15399  T
Q  490 actcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagct 589  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  | | |||||||||| |  ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15398 actcaaaggcaaacaaaccaaatcaatctcaaaatatctaccaaacatagataaaggatatcttaaacacactaaagaagtagtcaccgaacccttagct 15299  T
Q  590 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15298 ggagtttcgacaaccatttctccattcat 15270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 37741 - 37111
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  37741 tgttcaactgacgataatcgatacacaacctcatacaaccatctttcttcttcacgaacaaaaccggcgctccccaaggtaaaacacttggtcgaacaaa 37642  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||| |||    
T  37641 cttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactgagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcgacatcggcttcgttccaggtaca 37542  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  37541 agatcaatagaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatca 37442  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  37441 ctgcttgattctcaatacaaaaggaaggcatcaaagaaaacatcaaaataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaagaactctgcacc 37342  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  37341 actttcctcttcgactgaggagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcatacccagaatcacatccata 37242  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| || || || |  ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  37241 ccgctcaaaggtagacaaactaagtccatcttgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatatcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 37142  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37141 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 37111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 108 - 618
Target Start/End: Original strand, 25842 - 26365
Alignment:
Q  108 tcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  25842 tcaagcaaatcttctaattgtttcttcaactcagccaactcagaagccgacatacggtaaggcgtcatagacacaggcttcgtacccggaacaagatcaa 25941  T
Q  208 tcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac------ 301  Q
    ||||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| || || |||||||  |||||| | ||          
T  25942 tcgaaaattcaacttctctttctggcggcacatcaagaatctcattaggaaaaacttctgggaaatcacacacaacttgtaacttatcatttactgcttg 26041  T
Q  302 -------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcc 394  Q
           | ||||||||| ||||||||||||| ||| || ||  ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||  ||     
T  26042 attctccacagataaggacgccatcaaagaaagcatcaagattccatcacgctctaactgctttagctgcttagtagtcaaaaactccgccccactctct 26141  T
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactca 494  Q
    |||| | ||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26142 tctttaacagaagaaaaatataccgacttattaaaacaattaatatgaacatggttatactccaaccagttcataccaaggattacatccattccactca 26241  T
Q  495 aaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 594  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26242 aaggcaaacaaaccaaatcaatttcaaagtctcgaccaaacatagataaaggacatcttagacacactagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 26341  T
Q  595 ttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  26342 ttcgacaaccatttctccattcat 26365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 103
Target Start/End: Original strand, 23092 - 23192
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  23092 ttcaactgtcgataatctatacacaacctcatactaccatctttcttcttaactaacaataccggcgctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaact 23191  T
Q  103 t 103  Q
    |    
T  23192 t 23192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 154 - 618
Target Start/End: Original strand, 8486 - 8963
Alignment:
Q  154 ctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatc 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  8486 ctgacatatgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaactcaacttccctctctagaggcacatcaggaatttcatc 8585  T
Q  254 aggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatca 340  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  8586 aggaaaaacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatcaccgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaatgcca 8685  T
Q  341 tcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgt 440  Q
    |||||||| |||| |||    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  8686 tcacgttccaactacttcgactgcttagtagacaaaaaatctgcgccactttcctcttcagcagaagagaaatacaccgacttactataacaattaatgt 8785  T
Q  441 gaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacataga 540  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  8786 gaacatggttgtattccaaccagttcataccaagaatcacatccataccactcaaaggtaaacaaactaaatccatctcaaaatcacaatcaaacataga 8885  T
Q  541 caggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8886 caaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcactgaacccttggctggagtttcgacaaccatttctccattcat 8963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 154 - 524
Target Start/End: Original strand, 17682 - 18065
Alignment:
Q  154 ctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatc 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  17682 ctgacatatgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaactcaacttccctctctagaggcacatcaggaatttcatc 17781  T
Q  254 aggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatca 340  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  17782 aggaaaaacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatcaccgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaatgcca 17881  T
Q  341 tcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgt 440  Q
    |||||||| |||| |||    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  17882 tcacgttccaactacttcgactgcttagtagacaaaaaatctgcgccactttcctcttcagcagaagagaaatacaccgacttactataacaattaatgt 17981  T
Q  441 gaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaat 524  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||    
T  17982 gaacatggttgtattccaaccagttcataccaagaatcacatccataccactcaaaggtaaacaaactaaatccatctcaaaat 18065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 3 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 24217 - 23589
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| |||||||| || | ||| | ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24217 ttcaactgtcgataatcaatacataatctcatgctaccatctttcttcttaactagcaataccggtgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaact 24118  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||    
T  24117 tcttatcaagcaaatcttctaattgtttcttcaattcagctaactcagaagccgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcaatcccggaacaag 24018  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||     
T  24017 atcaatcgaaaattcaatttctctctctggcggcacatcaggaatctcatcaggaaagacttatggaaaatcgcacacaacttgtagcttatcaattact 23918  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  23917 gttttgttctcaatagacaaggacgctatcaatgaaaacattaaaatttcatcacgctctaactggttcagctgcttagttgacaagaactctgctccac 23818  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
      || | |||  ||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23817 tctcttattcgacagaagaaaaatacaccgacttgttataacaattaatgtgaacatggttatactccaaccagttcataccaagaattacatccattcc 23718  T
Q  490 actcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagct 589  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23717 actcaaaggcaaacaaaccaaatcaatctcaaaatctctaccaaacatagataaatgacatcttaaacacacaagagaagtagtcgccgaacccttagct 23618  T
Q  590 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23617 ggagtttcgacaaccatttctccattcat 23589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 63 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 10210 - 9642
Alignment:
Q  63 atcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatac 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10210 atcggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcttgtaattatttcttcaattcggccaactcagaagctgacatac 10111  T
Q  163 gataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaac 262  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10110 ggtaaggcgtcatagacacaggcttcgtacccggaacaagatcaatagaaaattcaacctctctttctagaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaac 10011  T
Q  263 ttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttct 349  Q
    || | | || || || || |||||||  |||||||| ||             |  || ||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||    
T  10010 ttctaggaagtcgcacacaacttgtaacttatcaattactgcttgattctcaactgacaaggacgccatcaaagaaaatattaaaattccatcacgctct 9911  T
Q  350 aactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggt 449  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||  |||  || |||||  || |||| |||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  9910 aactgtttcagttgattagtagacaagaactctgctgcactctcttcttcgacaaaagaaaaatacaccgacttattataacaattaatgtgaacatggt 9811  T
Q  450 tgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggaca 549  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| |  |||||    
T  9810 tacactccaaccagttcataccaagaattacatccattctactcaaaggcaaacaaaccaaatcaatctcaaaatctctaccaaacatagataaaggaca 9711  T
Q  550 tcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9710 tcttagacacactagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctccattcat 9642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 17987 - 17357
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||||  | |||| ||||||||| || |||||||||||  |||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  17987 tgttcaactgatggtaatcaatacacaatctcatgctaccatctatcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaaaaaa 17888  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  17887 tttcttctcaggaaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagtagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaaca 17788  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17787 agatcaatagaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaagaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatca 17688  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||| || | ||| ||||| || |||||||| ||    
T  17687 ctgcctgattctcaataggtaaagaagccatcaaagaatacatcaaaataccatcgcgttccaattgcttcagcttcttagtagataagaactctgcacc 17588  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17587 actttcctcttcgacggaagagaaatatactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcataccaagaatcacatccata 17488  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
     | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  17487 tcgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagataaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 17388  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17387 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 17357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 302 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 195445 - 195129
Alignment:
Q  302 atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcag 401  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||      
T  195445 atagataatgaagccatcaaggaaaacatgaaaataccatcgcgttctaattgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcaccactttcctcttcga 195346  T
Q  402 cagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtag 501  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  195345 ctgaggagaaatacactgacttgctgaaacaattaatgtgaacatggttgtattgcaatcagttcatacccagaatcacatccacaccgctcaaaggtag 195246  T
Q  502 acaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgaca 601  Q
    | |||| ||||| || || ||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  195245 agaaactaaatccatctcgaaatcacgtccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgaca 195146  T
Q  602 accatctctccattcat 618  Q
    || ||||||||| ||||    
T  195145 actatctctccaatcat 195129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 58400 - 58567
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || | |||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  58400 tgttcaactgacgatagtcaatgcacaatctcatgctaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaatacttggtctaacaaa 58499  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataag 168  Q
     || || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||  ||||| |||||||||||||    
T  58500 tttcttttcgagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactaggaagcagacatacgataag 58567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 199 - 618
Target Start/End: Original strand, 23887 - 24319
Alignment:
Q  199 caagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaat 298  Q
    ||||| |||| |||||||  || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || | |||||| |  ||||||||    
T  23887 caagaacaatagaaaattatacttccctctctggcggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttatggaaattcacacatcacttgcaacttatcaat 23986  T
Q  299 cac-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcg 385  Q
    |||             ||| | | ||| |||||||||||||||||    ||  |||| ||   |||||| || |  ||||| |||| ||| ||||| |      
T  23987 caccgcttgattctcaatatacagggacgccatcaaagaaaacatctggattccatcgcgaattaactgtttcaactgcttagtagtcaagaactcagtt 24086  T
Q  386 ccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatcca 485  Q
     | ||||| ||||| |||||||| |||  ||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  24087 tctccttcttcttcggcagaagaaaaacgcaccgtctttctaaagcaattaatatgaacatggttaaactccaaccagttcatacctagtatcacatcca 24186  T
Q  486 taccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctt 585  Q
    | |||||||| |  | ||| || |  || | | ||||||| | | ||||||| ||||  |||||  | |  || || |||||||||||||| ||||||||    
T  24187 tcccactcaacgacaaacagactaggtccactacaaaatctctaccaaacatcgacaaaggacacttcaggcatactagagaagtagtcactgaaccctt 24286  T
Q  586 agctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  24287 agccggggtttcgacaaccatttctccattcat 24319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 6)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 170 - 618
Target Start/End: Original strand, 151633 - 152094
Alignment:
Q  170 tgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatgga 269  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  151633 tgtcatagacataagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaactcaacttccctctctgaaggcacatccggaatttcatcaggaaaaacttctgga 151732  T
Q  270 aaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgct 356  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||             |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||||    
T  151733 aaatcacataccacttggggtttatcaatcaccgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaggaaaacatcaaaatgccatcacgttccaactgct 151832  T
Q  357 ttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactc 456  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  151833 tcagctgcttagtagacaaaaactctgcgccactttcctcttcagcagaagcgaaatacaccgacttactataacaattaatgtgaacatggttgtattc 151932  T
Q  457 taaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaa 556  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  151933 caaccagttcataccaagaatcacatccataccactaaaaggtaaacaaaccaaatcaatctcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaa 152032  T
Q  557 cacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  152033 cacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctccattcat 152094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 2426 - 1905
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| || || || ||||||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  2426 tgttcaactgtcgataatcaatgcataatctcatgctaccatctttcttcttaactagcaatatcggcgctccccaaggtgaaacacttcgtcttacaaa 2327  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| | ||||| || |||||     
T  2326 cttcttatcaagtaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactcagaagccgacatatggtaaggtgtcatagacacagggttcgtacccggaacc 2227  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  2226 agatcaatcgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaactcttggaaaatcacatacgacctgtagcttatcaatca 2127  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             || || ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||| |    
T  2126 ctgcttgattctcaatcgacaaggacgccatcaaagaaaacatcaaaataccatcacgttctaattgcttcagctgtttagtagataagaactctgcgtc 2027  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    ||  || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||    
T  2026 actgtcttcttcagcagaagaaaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccaattcataccctggattacatccata 1927  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaacca 509  Q
    ||||||||||| | ||||||||    
T  1926 ccactcaaagggaaacaaacca 1905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 230 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 47656 - 47274
Alignment:
Q  230 tggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagataaggaagcc 316  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||             ||||||||| |||||    
T  47656 tggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttatggaaaatcgcatgccacttgtagtttatcaatcactgcttgattctcaatagataagcaagcc 47557  T
Q  317 atcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaataca 416  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47556 atcaaagaaaacattaagattccatcacgttctaactgcttcagctgcttagtagactaaaactctgcgccactttcctcttcagcagaagagaaataca 47457  T
Q  417 ctgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaat 516  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||                  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47456 ttgacttactaaaacaattaatgtgaacatgattgtactctaaccagttcat------------------accattcaaaggtagacaaaccaaatcaat 47375  T
Q  517 ttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattc 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47374 ttcaaaatcacgatcaaacatagacaaaagacaccttaaacacacaagagaagtagtcaccgaa-ccttagatggagtttcgacaaccatctctccattc 47276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 151495 - 151627
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  151495 tgttcaactgtcaatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcaccagcaaaaccggcgctacccaaggcgaaatacttggtctaacaaa 151594  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttctt 133  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  151595 ctttttctcaagtaaatcttctaattgtttctt 151627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 545 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 30938 - 30865
Alignment:
Q  545 ggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30938 ggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 30865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 421 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 164889 - 164704
Alignment:
Q  421 cttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttca 520  Q
    ||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||  |||| |||| ||| || ||||| |  | |    
T  164889 cttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatctattcccgtcaacggtaaacacactaaatcgacctga 164790  T
Q  521 aaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
    || || | | ||||||||||||   |||| |||| | | |||||||||||||| |  ||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  164789 aagtccctaccaaacatagacaatagacaccttagataaacaagagaagtagttattgaaccatttgctggagtttcaacaaccat 164704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 3 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 698 - 231
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  698 ttcaactgtcggtaatcaatacacaacctcatgctaccatccttcttcttcactaacaaaaccggcgctccccaaggcgaaacacttggtctaacaaact 599  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  598 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcgtccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcattccaggaacaag 499  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||     
T  498 atcaatagcaaattcaacttccctctctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaatacttctggaaaatcgcatgccacttgtagtttatcaatcact 399  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagac--aaaaactctgcgcc 387  Q
                ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||  ||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  398 gcttggttctcaatagataaggaggccatcaaagaaaacatcaaaataccattgcgttctagttgcttcagctgcttggtagacaaaaaaactctgcgcc 299  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtact 455  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  298 actttcctcttcagcagaagagaaatacaccgacttactataacaattaatgtgaacatggttgtact 231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 287; Significance: 1e-160; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 14045 - 13415
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||||  |||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14045 tgttcaactgatgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 13946  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||    
T  13945 tttcttttcaagcaaatcttctaattgtttcttcaactcagctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgtcccaggaaca 13846  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  13845 agatcaatagaaaactcgacttccctctctggaggcacataaggaatttcatttggaaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgtagcttatcaatca 13746  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||    
T  13745 ctgcttgattctcaatagataacgaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaattctgcacc 13646  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||    
T  13645 actttcctcttcagcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaatttatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccaaaatcacatccata 13546  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
     | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||| || |  |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  13545 acgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaccattgataaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 13446  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13445 ctggagtttcgacaaccatctcttcattcat 13415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 40538 - 41168
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40538 tgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 40637  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || ||||||||||| || || || | |||||||||||| |  |  || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  40638 tttcttctcaagcaagtcttccaactatttcttcaactcagatagttcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaaca 40737  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || ||||||||||| ||||||||||    
T  40738 agatcaatagaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccacttgtagcttatcaatca 40837  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             | ||| || | |||||| || |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| || ||| | ||||| ||||||||||| ||    
T  40838 ctgcttgattcttaacagacaaagtagccattaacgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcctagtagataaaaactctgcacc 40937  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  40938 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaatttataagaatgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 41037  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  41038 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 41137  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41138 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 41168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 7580 - 7106
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  7580 tgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaatacttggtctaacaaa 7481  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  7480 tttcttctcaagcagatcttctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcacagacacaggcttcgttccaggaaca 7381  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  7380 atatcaatcgaaaattcaacttccctctctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaatacttctggaaaatcgcataccacttgtagttgatcaatca 7281  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  7280 ctgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcacgttctaactgcttcagctgcttagtagacaaaaattctccgcc 7181  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaacca 462  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  7180 actttcctcttcagcagaagagaaatacaccgacttactagaacaattcatgtgaacatggttgtactccaacca 7106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Original strand, 3286 - 3437
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  |||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  3286 ttcaactgccgataatcaatacataacctcatgctaccgtctttcttcttaaccaacaacacgggcgttccccaaggtgaaacactcggtcttacaaact 3385  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagc 154  Q
    | || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3386 tcttatcaagcaaatcttctaactgtttcttcaattcagccaactcagaagc 3437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 21 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 11059 - 10449
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  11059 atacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaactttttctcgagcaaatctt 10960  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    |||| || ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||| | |||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10959 ctaactgattcttcaacacagctaactcggaagcagacatacgataagttttcatcgacatcggcttcgttccaggaacaagatcaatagaaaactcaac 10860  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagat 307  Q
     || |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |  |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||             ||||||    
T  10859 ttctctctctggaggcacatcatgaatttcatctggaaaaacatcaggaaaatcgcataccacctgtagcttatcaatcactgcctgattctcaatagat 10760  T
Q  308 aaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaag 407  Q
    || |||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| || | ||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||  |||| |    
T  10759 aaagaagccatcaaagaaaacatcaatataccatcgcgttccagttgcttcagcttcttagtagacaagaactctgcaccactttcctcttcgacagagg 10660  T
Q  408 agaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaac 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10659 agaaatacactgacttgctaaaacaactaatatgaacatgattgtactctaaccaattcatacccagaattacatccataccgctcaaaggtagacaaac 10560  T
Q  508 caaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatc 607  Q
     ||||| || |||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10559 taaatccatctcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagttaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatc 10460  T
Q  608 tctccattcat 618  Q
    |||||||||||    
T  10459 tctccattcat 10449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 13132 - 12571
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  13132 tgttcaactgcggataatcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttaactagcaaaaccggcgctccccaacgtgaaacacttggtcttacaaa 13033  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13032 ctttttaccaagcaaatcttctaattgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacgataaggtgttatagacacaggcttcgttcccggaaca 12933  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||     
T  12932 agatcaatcgaaaattcaactt--ctctctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaagtcgcatactacttgtagtttatcaatcg 12835  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             || |||||||| |||||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||  | |||||||| ||    
T  12834 ctgcttgattctcaattgataaggacgccatcaaggaaaacatcaagattccatcacgttctaactgcttcagctgcttagtaga-tagaactctgcacc 12736  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  12735 actttcctcttcagcagaagagaaatacaccaatttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagtgcatgccaagaattatatccata 12636  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatct 552  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  12635 ccactcaaaggtaagcaaaccaaatcaatttcaaaattacgatcaaacatagacaaaggacatct 12571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 481 - 618
Target Start/End: Original strand, 1865 - 2002
Alignment:
Q  481 atccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaa 580  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1865 atccataccgctcaaaggtaaacaaaccatatcaatctcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaa 1964  T
Q  581 cccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1965 cccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 2002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 217341 - 216711
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || || |||||||| |||||||| || | ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  217341 tgttcaattgtcgataatcaatacacaatctcatactaccatctttcttcttaactagcaatatcggcactccccacggtgaaacacttggtcttacaaa 217242  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||| || |||| |    
T  217241 cttcttatcaagtaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactcagaagcatacatatggtaaggtgtcataaacacaggcttcgtacccggaata 217142  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || || || || || ||||  ||||||||||    
T  217141 agatcaatcgaaaattcaacttctctttttggaggcacatcaggaatctcattaggaaaaacttataggaattcacacacaacctgtaacttatcaatca 217042  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
                  | ||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||  |||| |||||||| || || || ||||| |||||||| || | ||||||    
T  217041 ttgcttgattctcaacagacaaggacgccgtcaaagaaaacatcaaaatcccatcgcgttctaattgtttcagctgcttagtagacaagaattttgcgcc 216942  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  216941 actttccgcttcagcagaagaaaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccatt 216842  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  216841 ccactcaaaggtaaacaaaccaaatcaattttaaaatctcgaccaatcatagacaaaggacatctgaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 216742  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  216741 ctggagtttctacaaccatctctccattcat 216711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 3)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 51266 - 50636
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||  |||||||  ||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  51266 tgttcaactaacgataatcgatacataatctcatactaccgtctttcttcttcactaacaaaaccggcgctccccatggtgaaacaattggtctaacaaa 51167  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||  ||||| |||||||||||    
T  51166 cttcttctcaagcaaatcttctaattgtttcttcaactcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcaacaccggcttctttccaggaaca 51067  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    || ||||| || || |||||  | |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  51066 aggtcaatagataactcaactgctctctcctgaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacatcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatca 50967  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||| |||| |||||||  ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  50966 ctgcttgattctcaatagacaaggaagccatcaaggaaaacatcacaataccatcgcgttctagttgcttcagctgcttagtagacaagaactctgcacc 50867  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  50866 actttcctcttcgactgaggagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtattttaaccagttcatacccataatcacatccata 50767  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||    
T  50766 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatctcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatatgagagaagtagtcactgaacccttag 50667  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50666 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 50636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 271
Target Start/End: Original strand, 42083 - 42351
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |    
T  42083 ttcaactgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggcgaaacacttggtcttacaaatt 42182  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||   |||||||||  |||||||    
T  42183 tcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcggaagctgacatacggtaaggtgccatcgacaccgacttcgttcctagaacaag 42282  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  42283 gtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaacacttctggaaa 42351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Original strand, 42407 - 42711
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  || || |||||||| | |||  |  ||||||| ||||||| ||||||  |||    
T  42407 gccatcaaggaaaacattaaaattccatcacgttctaactgcttcaactgtttcgtagacaagagctcaacttcaccttcttcttcagtagaagaataat 42506  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| | ||| ||||| |||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||| |||||| || ||    
T  42507 gcaccggcttactaaagcaattaatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacctgtcaatggtaaacaaactaagtc 42606  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
     | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  42607 gacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttattgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcct 42706  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  42707 ttcat 42711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 21630 - 22260
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21630 tgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaa 21729  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  21730 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 21829  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  21830 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacattaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 21929  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| | ||||||||| |||||||| || ||| | || ||||  |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  21930 ctgcttgattctcaatagataaagtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgtttcagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 22029  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  22030 actttccttttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 22129  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22130 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 22229  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22230 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 22260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 17321 - 17950
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17321 tgttcaattgtcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagcaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 17420  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |  || || ||||| |||||| ||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  17421 tttcttctcaagcaaatcttccaactgtttcttcaactcagataattcggaagcggacatatgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaaca 17520  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||    
T  17521 agatcaatagaaaactcgacttctctctctggaggcaca-caggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccacttgtagcttatctatca 17619  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             | |||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||| | ||| |   |||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  17620 ctacttgattctcaacagataaagaagccatcaacgaaaacatcaagataccatcgcattccagtcgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 17719  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    ||  ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17720 actctcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 17819  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17820 ccgctcaaaggtagacaaaccaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacaagagaagtagtcaccgaacccttag 17919  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17920 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 17950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 10859 - 11482
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || | ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10859 tgttcaattgtcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccagcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 10958  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |  || || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  10959 tttcttctcaagcaaatcttccaactgtttcttcaactcagataattcggaagcggacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaaca 11058  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||||      || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||    
T  11059 agatcaatc------tcgacttctctctctggaggcaca-caggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccacttgtagcttatctatca 11151  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             | |||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |   |||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  11152 ctacttgattctcaacagataaagaagccatcaacgaaaacatcaagataccatcgcgttccagtcgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 11251  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    ||  ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11252 actctcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 11351  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11352 ccgctcaaaggtagacaaaccaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacaagagaagtagtcaccgaacccttag 11451  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11452 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 11482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 151 - 601
Target Start/End: Original strand, 53260 - 53723
Alignment:
Q  151 aagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctc 250  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || || || |||||| |||||||||||||||||||    
T  53260 aagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaagaacaagatcaatagaaaactcgacttctctctctagaggcacatcaggaatctc 53359  T
Q  251 atcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaata 337  Q
    ||| ||||||||||  ||||| || || |||||| |||| |||||||||||             |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||    
T  53360 atctggaaaaacttcaggaaattcacacaccactggtagcttatcaatcaccgcttgattctcaatagataaagaagccatcaacgaaaacatcaagata 53459  T
Q  338 tcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaa 437  Q
     |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||| ||| |||| |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53460 ccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactttgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaa 53559  T
Q  438 tgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacat 537  Q
    |  |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  53560 taagaacgtggttgtactccaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaaggtagacaaaccaaatccatttcaaaatcacgaccaaacat 53659  T
Q  538 agacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgaca 601  Q
    |||||  |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53660 agacaaaggacatttcaaacatacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgaca 53723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 48409 - 48172
Alignment:
Q  27 aaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaatt 126  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || || ||||| |||||||| |    
T  48409 aacctcatactaccatctttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttgtcgagcaagtcctctaact 48310  T
Q  127 gtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccct 226  Q
    |||||||||||||  | |  || || || |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| || || ||||| || || || ||||| |||||    
T  48309 gtttcttcaactcaacaagttcggatgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggcaccagatcgatggagaactcaacctccct 48210  T
Q  227 ctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
     ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  48209 ttctggtggtacatctggaatctcatccggaaaaactt 48172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 45536 - 45674
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | ||| || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  45536 tgttcacctgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaa 45635  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactc 139  Q
     || |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  45636 tttcttctcaagcaaatcttccaactgtttcttcaactc 45674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 377 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 48046 - 47949
Alignment:
Q  377 aactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaag 474  Q
    |||||||| ||||  || ||||| | |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  48046 aactctgctccactctcttcttccgtagaagaaaaatgcaccgtcttactaaaacaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcataccaag 47949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 16543 - 17173
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16543 tgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgcttccatctttcttcttcactaccaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 16642  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || ||||| |||| ||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  16643 tttcttctcgagcagatcttcaaactgtttcttcaactcagctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaaca 16742  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||| |||| |||||| |||    
T  16743 agatcaatagaaaactcgacttccctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcgggaaagtcgcataccactcgtagcttatcagtca 16842  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
                  ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||| |||| | ||| |  ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  16843 ttccttgattctcaatagataaataagccatcaaagaatacatcaaaataccatcgcattccatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcacc 16942  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  16943 actttcctcttcgacggaagagaagtacactgacttgctaaaacaattgatatgaacacggttgtactctaaccaattcatacccagaatcacatccata 17042  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||| |  || ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  17043 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgactaaacatagataaagggcatcttaaacatacgagagaagtagtcatcgaacccttag 17142  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17143 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 17173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 2807 - 3437
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||  || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2807 tgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 2906  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||| ||||||||||||    
T  2907 cttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagactggctttgttccaggaaca 3006  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||| || || |||||  |||   |||||||||    
T  3007 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatatggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatca 3106  T
Q  301 ca-------------tagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |              ||||||| | |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| |||||||  || ||    
T  3107 ctgcttgattctcagtagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaacttcgcacc 3206  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3207 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 3306  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  3307 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcatcgaacccttag 3406  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3407 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 3437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 126 - 618
Target Start/End: Original strand, 12171 - 12676
Alignment:
Q  126 tgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccc 225  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  12171 tgtttcttcaactcagctaactcggaagctgacatacgataaggttccatagacacaagtttcgttccaggaacaagatcaatagaaaactcaacttctc 12270  T
Q  226 tctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagataagga 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||             ||||||||||     
T  12271 tctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatcactgcttgattttcaatagataaggt 12370  T
Q  313 agccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaa 412  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||   | || ||||||    
T  12371 agccatcaaggaaaacatcaaaataccatcgcgttctagttgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcaccactttcctctttgacggaggagaaa 12470  T
Q  413 tacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaat 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||| ||    
T  12471 tacactgacttgctaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccaattcagaccaagaatgacgtccataccactcaaaggcaagcaaaccatat 12570  T
Q  513 caatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 612  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12571 caatctcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 12670  T
Q  613 attcat 618  Q
    ||||||    
T  12671 attcat 12676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 3)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 5496 - 6126
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||| |||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||  | | ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  5496 tgttcaactatcgataatcaatgcataacctcatgctaccatccttcttcttatctagcaataccggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaa 5595  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| || ||||||    
T  5596 cttcttctcaagtaaatcttctaattgttttttcaactcagccaactcagaaactgacatacggtaaggcgtcatagacagaggcttcgtacccggaaca 5695  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    | |||||||||||||||||| || || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| || || || || |  ||||||||||    
T  5696 atatcaatcgaaaattcaacttctctttctagcggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttttaggaaatcacacacaacctgcaacttatcaatca 5795  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             | ||| ||||| |||||||| | |||||| | |||  ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  5796 ctgcttgattctcaacagacaaggacgccatcaacgtaaacatcagaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttagtagataagaactctgctcc 5895  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||| |||||| | ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  5896 actttcttcttcaaccgaagaaaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacgttgttgcactctaaccagttcatacccaggattacatccatt 5995  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5996 ccactcaaaggtaaacaaaccaaatcaatttcaacatctcgaccaaacattgacaaaggacatcttaaacacacgagagaagtagtcaccgaacccttag 6095  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6096 ctggagtttcgacaatcatctctcctttcat 6126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 264
Target Start/End: Original strand, 14571 - 14769
Alignment:
Q  66 ggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgat 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  14571 ggcgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcctccaactgtttcttcaattcagctaactcggaagctgacatacgat 14670  T
Q  166 aaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14671 aaggtgccatcgacaccagcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccctctctagtggcacatcaggaatctcatcaggaaacactt 14769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 395 - 618
Target Start/End: Original strand, 14913 - 15136
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactca 494  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||  |||    
T  14913 tcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaataacatccatacccatca 15012  T
Q  495 aaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 594  Q
    | || | |||||| || || | ||||||||| | |  |||||||||||  ||||| |||| ||| || |||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  15013 acggcaaacaaactaagtcgacttcaaaatctctacgaaacatagacaatggacaccttagacaaactagagaagtagttgctgaacccttagctggagt 15112  T
Q  595 ttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||    
T  15113 ttcaacaaccatttctcctttcat 15136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 466
Target Start/End: Original strand, 20623 - 21102
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20623 tgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactaacaagattggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 20722  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20723 ctttttctcgagcaaatcttctaagtgtttcttcaactcggccaactcagaagctggcatacgataaggtgtcatagacgcaggcttcgttccaggaaca 20822  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  20823 agatcaatagaaaattcaacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttatggaaaatcgcataccacctgtagcttatcaatca 20922  T
Q  301 c-------------atagataaggaa-gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgc 386  Q
    |             ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||| |||| ||||| || || ||||| ||||||||||| | |||||    
T  20923 ctgcttgattctcaatagataaggaaccccatcaaagaaaacatcaaaataccgtcatgttccaactgtttcagctgcttagtagacaaaaattttgcgc 21022  T
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttc 466  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  21023 cactttcctattcagtagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatataaacatggttatactccaaccagttc 21102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 9751 - 10381
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| | ||| || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9751 tgttcaactgtcggtaatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 9850  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || ||||||||||| || || || |||||||||||||| |  || || ||||| ||||||||||| |||  ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  9851 tttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataattcggaagcagacatacgatatggttccatcgacaccggcttcgttccaggaaca 9950  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || |  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  ||||  |||||||||    
T  9951 agatcaatagaaaactcgacttatctctctagaggcacatcaggaatctcatccggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatca 10050  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||| | |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  10051 ctgcttgattctcaatagataaagaagccatcaatgaaaacatcaagataccatcgcgtcccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 10150  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10151 actttcctcttcgagggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataaaaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccata 10250  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  10251 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 10350  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10351 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 10381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 12277 - 11647
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||| |||||||| || | |||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12277 tgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttctttactagcaaaactagcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 12178  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  12177 tttcttctcgagcaaatcttctaattgtttcttcaactcatctaactcggaagcagacatacgataaggtgtcatcgacaccagcttcgttccagggaca 12078  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||| |   ||||||||||||| |||||||| |    
T  12077 agatcaatagaaaactcgacttccctctctggaggcacatccggaatttcatctggaaaaacttcaggaaagttgaataccacttgtagcttatcaatta 11978  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| |  | ||| || ||||| ||||| || |||||| | ||    
T  11977 ccgcttgattctcaatagataaagaagccatcaaagaatacatcaaaataccatcgcgttccagttacttcagctgcttagtagataagaactctacacc 11878  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||    
T  11877 actttcctcttcgacagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccataatcacatccata 11778  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  11777 ccgctcaagggtagacaaactaaattcatttcaaaatcacgactaaacatagataaaggacatctcaaacatacgagacaagtagtcaccgaacccttag 11678  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  11677 ctggagtttaaaaaaccatatctccattcat 11647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 7008 - 6486
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  7008 tgtttaactgtcgataatcaatacacaatctcatactgccatctttcttcttcactaacaaaacgggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaa 6909  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6908 cttcttatcaagaaaatcttctaattgtttcttcaactcaaccaactcagaagctgacatacagtaaggtgtcatagacacaggcttcgttcccggaaca 6809  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    || |||||||| || ||||| || || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||    
T  6808 aggtcaatcgagaactcaacttctctttctagaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgcataccacctgtaacttatcaatca 6709  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||| ||||    
T  6708 ctgcttgattctcaatagacaaggatgccattaaagaaaacatcaaaattccatcacgttctaactgcttcagctgcttagtagataagaactctacgcc 6609  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6608 actttcctcttcagcagaagagaaatacaccgacttacttaaacaattaatatgaacatggttgtactataaccagttcataccaaggattacatccata 6509  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaa 510  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  6508 ccactcaaaggtaaacaaaccaa 6486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 474
Target Start/End: Original strand, 64 - 224
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||| || |||||||| |  || || ||||| |  ||||| || ||||  || |||||||||||||| ||||    
T  64 gccatcaaagaaaacatcagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttagtagataggaactcagctccactctcttcttcagcagaagaaaaat 163  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaag 474  Q
     ||| | |||| |||| ||||| || |||||  |||| | ||| | |||||||||||||||    
T  164 gcaccgtcttgttaaagcaattgatatgaactcggttatgctccatccagttcataccaag 224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 6)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 3 - 618
Target Start/End: Original strand, 4301 - 4928
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||| |||||||| || | ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  4301 ttcaactgtcgataatcaatacacaatctcatactaccatctttcttcttaacaagcaatatcagcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaact 4400  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  4401 tcttatcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactcagaagccgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacc-ggaacaag 4499  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
     | ||||||||||||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| || || || ||||  |||| ||||||     
T  4500 gttaatcgaaaattcaacttctctttctagagacacatcaggaatttcatcaggaaaaacttcagggaaatcacacacaacctgtaacttattaatcact 4599  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                | ||| ||| | ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  4600 gcttgattctcaacagacaagaacgccatcaaagaaaacatcaaaattccatcgcgttctaattgcttcagctgcttagtagacaagaattctgctccac 4699  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
      || ||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  4700 tctcttcttcggtagaagaaaaatatactgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcatacccaggattacatccattcc 4799  T
Q  490 actcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagct 589  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||  || |||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  4800 actcaaaggtaaacaaactaagtcaatttcaaactcttgaccaaacaaagacaaaggacatgttaaacacacaagagaagtagttactaaacccttagct 4899  T
Q  590 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4900 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 4928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 386 - 618
Target Start/End: Original strand, 14205 - 14437
Alignment:
Q  386 ccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatcca 485  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  14205 ccactttcctcttcagcggaagaaaaatacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccagaatcacatcca 14304  T
Q  486 taccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctt 585  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  14305 taccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatcgcaaaaatacgagagaagtagtcaccgaaccctt 14404  T
Q  586 agctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14405 agctggagtttcgacaaccatctctccattcat 14437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 40254 - 39984
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  |||||||  || || ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  40254 tgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaa 40155  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || || | ||  ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  40154 cttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaaca 40055  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  40054 agatcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcagggaatacttctggaaa 39984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 45348 - 45085
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  45348 tgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttctttaccaacaataccggcgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaa 45249  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| || || || || ||||| || || || ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  45248 cttcttatcaagcaagtcttccaactgcttctttaattcagctaactcggaagctaacatacgataaagtgccatcgacaccggcttcgttcctggaaca 45149  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45148 aggtcaattgaaaattcaacctccctttctggtggcacatctggaatctcatccggaaaaactt 45085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 377 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 44959 - 44730
Alignment:
Q  377 aactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaa 476  Q
    |||||||| ||||  || ||||| | |||||| |||| ||| | ||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||| ||||||| |||| ||    
T  44959 aactctgctccactctcttcttccgtagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactctaactagttcatcccaaaaa 44860  T
Q  477 ttacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcac 576  Q
    | |||||||||||  |||| |||| |||||| || || | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| ||    
T  44859 taacatccatacctgtcaacggtaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttac 44760  T
Q  577 cgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
     |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  44759 tgaacccttagttggagtttcaacaaccat 44730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 387 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 39855 - 39636
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  || | ||| ||||| || || || |||||  | || ||||||||||| ||||||||||  || ||||||||    
T  39855 caccttcttcttcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcgattatactctaaccaattcataccaaagataacatccat 39756  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| || |||||||| ||||||||  ||||||| | | |||||||||| |  ||||| |  | ||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  39755 acccgtcaacggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaaccctta 39656  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  39655 gctggagtttcaacaaccat 39636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 240; Significance: 1e-132; HSPs: 2)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 3 - 501
Target Start/End: Original strand, 267 - 778
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| | ||||| ||| || || || || |||||||| |||||||| || | ||| |  || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  267 ttcaactgacaataatcaatgcataatctcatactaccatctttcttctttactagcaacacgggtgctccccaaggcgaaacacttggtctaacaaact 366  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  367 tcttctcaagaaaatcttctaattgtttcttcaactcagccaactcagaagttgacatatgataaggtttcatagacacagtcttcgttccaggaacaag 466  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |  |||||||| ||||  |||| |||||      
T  467 atcaatagaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaagaaaaacttctggaaacttgcataccacctgtaacttataaatcatt 566  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  567 gcttgattctcaatagataatgaagccatcagagaaaacatcaaaattccatcacgttctaactgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcgccac 666  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
      ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  667 tctcctctttagcagaagagaaatacactgacttactaaaacaattaatgtgaacatagttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccatacc 766  T
Q  490 actcaaaggtag 501  Q
    ||||||| ||||    
T  767 actcaaacgtag 778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 400 - 618
Target Start/End: Original strand, 777 - 995
Alignment:
Q  400 agcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggt 499  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  777 agcagaagagaaatacactgacttactaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccataccactcaaacgt 876  T
Q  500 agacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcga 599  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  877 aaacaaaccaattcaatctcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacactttaagcatacgacagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcga 976  T
Q  600 caaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||    
T  977 caaccatctctccattcat 995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 15915 - 15379
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15915 tgttcaactgtcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagcaaaattggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 15816  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |  || || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  15815 tttcttctcaagcaaatcttccaactgtttcttcaactctgataattcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaaca 15716  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||  ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  15715 agatcaacagaaaactcaacttacctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatta 15616  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |  ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||    
T  15615 ccgcttgattctcaatagataaagaagccatcaaagaatacatcaaaataccatcacgttccagttgcttcagctgcttggtagataagaactctgcacc 15516  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  15515 actttcctcttcgacgaaagagaaatacaccgacttgctaaaacagttaatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacctagaatcacatccata 15416  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaat 524  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  15415 ccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcgaaat 15379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 150 - 618
Target Start/End: Original strand, 7790 - 8271
Alignment:
Q  150 gaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatct 249  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  7790 gaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgtttcaggaacaagatcaatagagaactcaacttccctctttggaggcacatcaggaattt 7889  T
Q  250 catcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaat 336  Q
    |||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||             |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  7890 catctgggaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatcactgcttgattctcaatagataaagaagccattaaagaaaacatcaaaat 7989  T
Q  337 atcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaatta 436  Q
    | |||||||||| |  ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7990 accatcacgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcaccactatcctcttcggcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaatta 8089  T
Q  437 atgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaaca 536  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8090 atatgaacatggttgtactccaaccaattcatacccagaatcacatccataccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaaca 8189  T
Q  537 tagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||  |||||    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8190 tagacaacggacaatgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 8271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 212 - 726
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| || |||||||  ||||| || || || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  212 tgttcaagtgacgataatcgatacataatctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaaaaaa 311  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| |||  ||||  |||||||||||||||||    
T  312 cttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagctgacatacgctaaggtgccatcaacaccggcttcgttccaggaaca 411  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||| |    
T  412 agattaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaattcgcataccacttgtagcttatcaatta 511  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  512 ctgtttgattctcaatagataaggaagccatcagggaaaacatcaaaataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcacc 611  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  612 actttcctcttcgactgaggagaaattcactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcatacccagaatcacatccata 711  T
Q  488 ccactcaaaggtaga 502  Q
    || ||||||||||||    
T  712 ccgctcaaaggtaga 726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5272 - 5012
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  5272 tgttcaactgacgataatcaatgcaaaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaa 5173  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  5172 tttcttatcaagcaagtcctccaattgtttcttcaacttagccaactcggaagctgacatacgctaaggtaccatcgacaccggcttcgttcctggaaca 5073  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaa 261  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  5072 aggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaa 5012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 9703 - 9443
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  9703 tgttcaactgacgataatcaatgcaaaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaa 9604  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  9603 tttcttatcaagcaagtcctccaattgtttcttcaacttagccaactcggaagctgacatacgctaaggtaccatcgacaccggcttcgttcctggaaca 9504  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaa 261  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  9503 aggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaa 9443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 316 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 56063 - 55761
Alignment:
Q  316 catcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatac 415  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  56063 catcaaggaaaacatcaaaataccatcacgttctaactgcttcagctgtttagtagacaaaaactttgcgccactttcctcttcagcagaagggaaatac 55964  T
Q  416 actgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaa 515  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55963 accgacttactaaaacaattaatgtgaacatggttgtactttaaccagttcataccaaggattacatccataccactcaaaggtaaacaaaccaaatcaa 55864  T
Q  516 tttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccatt 615  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55863 tttagaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaatcacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccatt 55764  T
Q  616 cat 618  Q
    |||    
T  55763 cat 55761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 29836 - 29219
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| | |||||  ||| |||||||||| |||| ||||||| |||| ||    
T  29836 tgttcaactaacgatagtcaatacacgatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcactccccaaggagaaatacttggtctaacgaa 29737  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||    |||||||||||||||    
T  29736 -ttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcaactaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccgatttcgttccaggaaca 29638  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||            ||||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||  |    
T  29637 agatcaatagaaaactcaacttccctctctagaggcacatctggaa------------aaacttcaggaaagtcgcataccacttgtagcttatcaacta 29550  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || |  | ||| || ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  29549 ccgcttgattctcaatagacaaggaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcgcgctccagtttcttcagctgcttagtagataagaactctgcacc 29450  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    || |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||    
T  29449 actttcctcttcgacggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatatccagaatcacatccata 29350  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    || |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  29349 ccgctcaaatgtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagataaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 29250  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29249 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 29219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1615 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold1615
Description:

Target: scaffold1615; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 94 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 1561 - 1196
Alignment:
Q  94 taacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttcc 193  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1561 taacaaaattttactcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaacttgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttcc 1462  T
Q  194 aggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagttta 293  Q
    ||| ||||||||| | ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1461 aggtacaagatcatttgaaaactcaacttccatctctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgcataccacttgtagttta 1362  T
Q  294 tcaatcac-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaact 380  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  1361 tcaatcactgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcacgttctaactgcttcagctacttagtagacaaaaact 1262  T
Q  381 ctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacat 446  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  1261 ctgcgccactttcctctttagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaaataatatgaacat 1196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 444 - 813
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| |||||||| || | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  444 tgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggcgaaacacttggtctaacaaa 543  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  544 cttcttctcaaggagatcttctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaaca 643  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  644 agatcaatcgaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaatttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatca 743  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctt 357  Q
    |             |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  744 ctgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaggaaaacatcaaaatgtcatcacgttccaactgctt 813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 396 - 558
Target Start/End: Original strand, 811 - 973
Alignment:
Q  396 cttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaa 495  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  811 cttcagcagaagagaaatacaccgacttactgtaacaattaatgtgcacatggttgtattccaaccaattcataccaagaatcacatccataccactcaa 910  T
Q  496 aggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaaca 558  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||    
T  911 atgtagacaaaccaaatccatctcaaaatcactatcaaacatagacaaatgacatcttaaaca 973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 308 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 14867 - 14557
Alignment:
Q  308 aaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaag 407  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||    
T  14867 aaggacgccatcaaagaaaacattaaaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttagtagacaagaattatgcgccactttcctcttcagcagaag 14768  T
Q  408 agaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaac 507  Q
    | ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  14767 aaaaatacaccaacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcattccaaggattacttccattccactcaaaggtaaacaaac 14668  T
Q  508 caaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatc 607  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14667 caaatcaatttcaaaatctcgaccaaacatagacaaaggacatcttaaatacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatc 14568  T
Q  608 tctccattcat 618  Q
    |||||||||||    
T  14567 tctccattcat 14557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15140 - 14923
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  15140 ttcaaccgtcgataatcaatgcataacctcatgctaccatctttcttcttaactaacaataccggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaact 15041  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || | ||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | || |||    
T  15040 tcttattaagtaaatcttctaactatttcttcaactccgccaactcagaagctgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacccgaaataag 14941  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaac 220  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14940 atcaatcgaaaattcaac 14923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 28416 - 27952
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  28416 tgttcaactgacgataattgatacataacctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaa 28317  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||| |||||| |||||    
T  28316 cttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttagttccatgaaca 28217  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| || || || |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  28216 agatcaatagaaaactcgacttctctctctagaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatca 28117  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||    
T  28116 ctgcttgattctcaatagataaagaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcgcgtttcagttgcttcagctgcttggtagataagaactctgcacc 28017  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgt 452  Q
    || |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28016 actttcctcttctacggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatatgaacatggttgt 27952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 339 - 618
Target Start/End: Original strand, 10520 - 10799
Alignment:
Q  339 catcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaat 438  Q
    ||||| |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10520 catcaggttccaactgcttcagctgcttagtagacaaaaactctacgctactttcctcttccgcagaagagaaatacactgacttactaaaacaattaat 10619  T
Q  439 gtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacata 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10620 gtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccattccactcaaaggtaaacaaactaaatcaatttcaaaatcacgaccaaacata 10719  T
Q  539 gacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10720 gacaatggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 10799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 39 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 1428 - 836
Alignment:
Q  39 ccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaact 138  Q
    |||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| || |||||||| || || || || |||||||| |    
T  1428 ccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacactcggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcttccaactgattcttcaatt 1329  T
Q  139 cggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcac 238  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||  ||||    
T  1328 cagccaactcagatgctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacttccctttctggcagcac 1229  T
Q  239 atcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca-------------catagataaggaagccatcaaagaa 325  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |  |||||||| | ||||| | |||  || ||||| |             ||  || || || |||||||| ||     
T  1228 atcaggaatctcatctggaaacacctcaggaaaatcacttaccattggtaacttgtcaattacagcctgattctccaacgacaacgatgccatcaaggag 1129  T
Q  326 aacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgc 425  Q
     |||| | |||  |||||||||||| |||||| |  || || |||| ||| || ||  | ||||| || |||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  1128 tacatcagaattccatcacgttctagctgcttcatctgtttcgtagtcaagaattcaactccaccctcttcttcagcagaagaaaaatgcactgtcttgc 1029  T
Q  426 taaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatc 525  Q
    ||||  | || || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| || || |  ||||||||    
T  1028 taaagtagtttatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaatgacatccattcccgtcaacggtagacaaactaagtctacctcaaaatc 929  T
Q  526 acgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
     | | |||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  928 cctaccaaacatagatagaggacacctcaaacaaacaagggaagtagtcactgaacccttagctgaagtttcaacaaccatctctcctttcat 836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 478
Target Start/End: Original strand, 9323 - 9813
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||  || |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9323 tgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 9422  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  9423 cttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 9522  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || || || |||||||| ||||||||||    
T  9523 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacacaacttgtagcttatcaatca 9622  T
Q  301 c-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    |             |||||||||| |||||| || |||||||| || ||| | || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  9623 ctgcttgattctcaatagataaggtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 9722  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaatt 478  Q
    || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9723 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatt 9813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 184 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 1770 - 1323
Alignment:
Q  184 gcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccac 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||    
T  1770 gcttcgttcctggaacaagatcaatagaaaactcgacttctctctctggaggtacatcagcaatttcatctggaaaaacttcaggaaagtcacataccac 1671  T
Q  284 ttgtagtttatcaatcac-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggta 370  Q
    |||||| |||||||||||             |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||| || ||||| |||    
T  1670 ttgtagcttatcaatcaccgcctgattctcgatagataaagaagccatcaacgaaaacatcaaaataccatcgcgttgcagttgcttcagctgcttagta 1571  T
Q  371 gacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcatac 470  Q
    || | ||||||| | |||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1570 gatagaaactctacaccactttcctcttcgatggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactgtaaccaattcatac 1471  T
Q  471 caagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagt 570  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| || ||||||||    
T  1470 ccagaatcacatccataccgctcaaaggtagacaaactaaatccatctcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagt 1371  T
Q  571 agtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1370 agtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 1323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 181; Significance: 2e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 5808 - 5328
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5808 ttcaattgtcgataatcaatacataacctcatgctaccatctttcttcttaactaacaaaacgggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaact 5709  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  5708 tcttatccagcaaatcttctaattgtttcttcaactcgaccaactcagaagccgacatacggtaaggtgtcatagacacaggctttgttcctggaacaag 5609  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    ||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  | || |||||||| |||||||| ||     
T  5608 atcaatcgaaaattcgacttctctttctggcggcacatcaggaatctcatcagggaaaacttctggaaaatcaaacacaacttgtagcttatcaattact 5509  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                | ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |  ||||||| || ||||  || || |  || |||||||| |||||||| ||||    
T  5508 gcttgattctcaacagacaaggacgccatcaaataaaacattaaacttccatcacgctccaactctttcagctagttagtagacaagaactctgctccac 5409  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcatac 470  Q
      || |||||  ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5408 tatcttcttcgacagaagaaaaatacaccgacttactataacaatgaatgtgaacatggttatactccaaccagttcatac 5328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 170; Significance: 6e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 618
Target Start/End: Original strand, 11363 - 11973
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| || || ||||| |||||||    
T  11363 atacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccgacaataccggtgctccccacggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatcaagtaaatcct 11462  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || ||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  11463 cgaactgtttcttcaattcagctaactcggacgccgacatacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgttccgggaacaaggtcgattgaaaattcaac 11562  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcaca--tagat----------- 307  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |  || ||  ||| | |||||||||||  | |||               
T  11563 ctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcactcacaaccggtaatctatcaatcacagcttgattctccaatgac 11662  T
Q  308 aaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaag 407  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  || || |||| ||| ||||| ||  |||  || || ||||||||||    
T  11663 aagtatgccatcaaagaaaacattaaaatcccatcacgttctaactgcttcaactgtttagtagtcaagaactcagcttcactctcttcctcagcagaag 11762  T
Q  408 agaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaac 507  Q
    | ||||  || | ||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| || | ||||||    
T  11763 aaaaatgtaccgtcttactaaagcaattaatatgaacacggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgtcaacggcaaacaaac 11862  T
Q  508 caaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatc 607  Q
     | |||||  ||||| |  | | ||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  11863 aagatcaacctcaaagtatctaccaaacatagacaacggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatt 11962  T
Q  608 tctccattcat 618  Q
    |||||||||||    
T  11963 tctccattcat 11973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1985 (Bit Score: 169; Significance: 3e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold1985
Description:

Target: scaffold1985; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 80 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 411 - 4
Alignment:
Q  80 tgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagac 179  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  411 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaaatcttctaattgtttcttcaactcaactaactcagaagctgacatacgataaggtgccatcgac 312  T
Q  180 acaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcata 279  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||    
T  311 accggcttcgttctaggaacaagatcaatagaaaactcaa---ctctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcata 215  T
Q  280 ccacttgtagtttatcaatcac-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgctt 366  Q
    |||||||||| |||||||||||             |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| || |||||    
T  214 ccacttgtagcttatcaatcactgcttgattctcaatagataatgaagtcattaaagaaaacatcaatataccatctcgttccatttgcttcagctgctt 115  T
Q  367 ggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttc 466  Q
     ||||| |  |||||||| |||| |||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  114 agtagatatgaactctgcaccactttcctcttcgtctgatgagaaatacactgacttgctaaaacaattaatatgaacatggttgtactccaaccaattc 15  T
Q  467 ataccaagaat 477  Q
    ||||| |||||    
T  14 atacccagaat 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 618
Target Start/End: Original strand, 60142 - 60752
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || || || || |||||||    
T  60142 atacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatctagtaaatcct 60241  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || ||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  60242 ccaactgtttcttcaattcagctaactcggacgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccgggcacaagatcgattgaaaattcaac 60341  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagat 307  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||    || ||  | | | ||||||||||             | ||||    
T  60342 ctccctctctggtggcacataaggaatctcatcaggaaaaacttccggaaattcattcacaaccggcaatctatcaatcactgcttgattctcaaaagat 60441  T
Q  308 aaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaag 407  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |  || || |||| ||| ||||| ||  ||| ||| |||||||||||||    
T  60442 aagtatgccatcaaagaaaacattaaaatcccatcacgctctaaatgcttcaactgtttagtagtcaagaactcagcttcactttcttcttcagcagaag 60541  T
Q  408 agaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaac 507  Q
    | |||| ||| | ||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||   ||| || | ||| ||    
T  60542 aaaaatgcaccgtcttactaaagcaattaatatgaacacggttatactctaaccagttcatcccaaaaatcacatccatacccgacaacggcaaacatac 60641  T
Q  508 caaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatc 607  Q
     | ||| | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  60642 tagatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatt 60741  T
Q  608 tctccattcat 618  Q
    |||||||||||    
T  60742 tctccattcat 60752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 79752 - 79489
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||    
T  79752 tgttcaactgacgatagtcaatgcacaatctcattctaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacactgggtcttacaaa 79653  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  79652 cttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaattcagatgctgacatacgataatgtgccatcgacaccggcttcgttcctggaaca 79553  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    || || || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  79552 aggtcgatggagaactcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatccggaaaaactt 79489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 79426 - 79264
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||  || || |  || || ||||||||||||||  |   ||| || |||||||||||||| ||||    
T  79426 gccattaaagaatacatcaaaattccatcacgttctagttgtttcatctgtttcgtagacaaaaactccactttaccctcttcttcagcagaagaaaaat 79327  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaa 476  Q
     |||   ||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  79326 gcaccatcttactaaagcaattgatatggacatggttatactccaaccagttcataccaagaa 79264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 578 - 618
Target Start/End: Original strand, 70081 - 70121
Alignment:
Q  578 gaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  70081 gaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccattcat 70121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 114957 - 114473
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| | || || |||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  114957 ttcaactgtcgataatcaatgcataacctcatgctaccatctttcttcttaactaacaataccgacgatccccaaggtgaaacactcggtcttacaaact 114858  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | |||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  114857 tcttatcaagtaaatcttctaattgtttcttcaactcagccaactcagaagccgacatacgatatggcgccataaacacaagcttcgtacccggaacaag 114758  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| || ||||| ||| | |  |||||||| ||     
T  114757 atcaatcaaaaattcaacttccctctccggcggcacatcagggatctcattaggaaaaacttctagaaattcgcatacaactcgcaacttatcaattact 114658  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                | ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||||| || ||||| |||| ||||||||  ||  |||    
T  114657 gcttgattctcaacagacaaggacgccatcaaagaaaacatcaagattccatcacgctctaactgcttcagctgcttagtagtcaaaaacttagcttcac 114558  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaag 474  Q
      || |||||||||||||| |||| ||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  114557 tctcttcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaaacaattaatataaacatggttatactccaaccagttcataccaag 114473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2004 (Bit Score: 157; Significance: 4e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold2004
Description:

Target: scaffold2004; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 732 - 516
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  732 ttcaactgtcgataatcaatacacaacctcatgctaccatccttcttctttactaacaacacaggcgctccccatggtgaaacacttggtctaacaaact 633  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  632 ttttctcaagcaaatcttctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctaacatacgataaggtgtcatagacacagccttcgttctaggaacaag 533  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaa 219  Q
    |||||| ||||||||||    
T  532 atcaatagaaaattcaa 516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 155; Significance: 6e-82; HSPs: 5)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 52777 - 52435
Alignment:
Q  70 ctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataagg 169  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  52777 ctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaattcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagctgacatacgataagg 52678  T
Q  170 tgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatgga 269  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  |||    
T  52677 tgccatagacacaggcttcgttccaggaacaagatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcagtaatttcatctggaaaaacttcagga 52578  T
Q  270 aaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgct 356  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||             |||||||||||||||||| | |||||||| || ||| |||| ||||| | |||||    
T  52577 aaatcgcataccacttgtaccttatcaatcactgcttgattctcaatagataaggaagccatcgaggaaaacatcaacataccatcgcgttccagctgct 52478  T
Q  357 ttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttc 399  Q
    | || |||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  52477 tcagctgcttggtagacaagaactctacaccactttcctcttc 52435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Original strand, 110319 - 110623
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||| || |||||||| |  || || ||||| |  ||||| || ||||  || ||||| |||||||| ||||    
T  110319 gccatcaaagaaaacattagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttagtagataggaactcggctccactctcttcttctgcagaagaaaaat 110418  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| | ||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||| |  |     
T  110419 gcaccgtcttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgtcaaaggtaaacaaactaggtt 110518  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
     | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||  |||||||| |||||     
T  110519 gacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagccggagttttaacaaccatttctcct 110618  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  110619 ttcat 110623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 271
Target Start/End: Original strand, 110179 - 110263
Alignment:
Q  187 tcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  110179 tcgttctaggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcgggaaaaacttctggaaa 110263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 110015 - 110162
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||  ||||||| ||| || |||||  |||| |||||||||||||| || || || | |||||||||||| | ||||||||||||| | |||||    
T  110015 tgttcaacttacgataatcaatgcataacctcgtgctgccatccttcttcttaacaaataacaccggcgctccccacgatgaaacacttggtcttacaaa 110114  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactc 148  Q
     || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  110115 tttcttatcaagcaactcctccaattgtttcttcaattcggctaactc 110162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 54912 - 54842
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgct 71  Q
    |||||||||| || |||| |||||| || || || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  54912 tgttcaactgacggtaatcaatacataatctcatactaccatctttcttcttcactaacaaaatcggcgct 54842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 429 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 11360 - 11171
Alignment:
Q  429 aacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacg 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  11360 aacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcataccaagaatcacatccataccactgaaaggtagacaaaccaaatccatctcaaaatcacg 11261  T
Q  529 atcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11260 atcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctccattcat 11171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 153; Significance: 9e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 69 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 8594 - 8146
Alignment:
Q  69 gctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataag 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| || || || |||||||||||||| |  || ||  |||| |||||||||||||    
T  8594 gctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctcaaacaagtcttccaactgtttcttcaactcagataattcgaaagcagacatacgataag 8495  T
Q  169 gtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatgg 268  Q
    ||| ||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||  ||    
T  8494 gtgccatcgacaccggcttcgtcccaggaactagatcaatagaaaactcaacttctctctctggacgcacatcaggaatttcatctgggaaaacttcagg 8395  T
Q  269 aaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgc 355  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||             ||||| || |||||||| || |||||||| || ||| |||| ||||| |  | |    
T  8394 aaaatcacacaccacttgtagcttatcaatcactgcttgattctcaatagacaaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagtttc 8295  T
Q  356 tttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtact 455  Q
    || || ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||    
T  8294 ttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctcttcaacgaaagagaaatgcactgacttgctaaaacaatgaataagaacgtggttgtact 8195  T
Q  456 ctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagaca 504  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8194 ctaaccaattcatacccagaatcacatccataccactcaaaggtagaca 8146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 776 - 515
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| || || ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  776 tgttcaactgacgataataaatacataatctcatggtaccatccttcttcttaaccaacaacatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaa 677  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  676 cttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccattgacaccggcttcgttcctggaaca 577  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaac 262  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  576 aggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaac 515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 450 - 146
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    |||||||| |||||||| | |||  ||||||| || |||||||| |  || || ||||| |  ||||| || ||||  || |||||||||||||| ||||    
T  450 gccatcaaggaaaacatcagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttagtagataggaactccgctccactctcttcttcagcagaagaaaaat 351  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| |  |||||||| |||||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  |||| |||| |||||| || ||    
T  350 gcaccgttttgctaaagcaattaatatgaactcggttataccctaaccagttcatcccaaaaatcacatccatacccgtcaacggtaaacaaactaagtc 251  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
     | |||||| || | | ||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  250 gacttcaaagtctctaccaaacatagacaacgtacatcttatacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcct 151  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  150 ttcat 146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 429 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 2743 - 2554
Alignment:
Q  429 aacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacg 528  Q
    |||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  2743 aacaattaatgttaatatggttgtattccaaccagttcataccaagaatcacatccataccactcaaaggtaaacaaaccaaatctatctcaaaatcacg 2644  T
Q  529 atcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2643 atcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatgtctccattcat 2554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 85151 - 84919
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| || || |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  85151 tgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcattctaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctgacaaa 85052  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  85051 cttcttctcgagcaaatcctctaattttttcttcaactctgtcatctcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacatgcttcgttccaggaaca 84952  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctgga 233  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||| ||||    
T  84951 agatcaatcgaaaactcaacttctctctttgga 84919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 85717 - 85609
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  85717 tgttcaactatcgatagtcaatacacaatctcttactaccatctttcttcttcactaccaataccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 85618  T
Q  101 ctttttctc 109  Q
    ||| |||||    
T  85617 cttcttctc 85609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 132410 - 132245
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  | |||||||||  | || ||||| |||||||| |||||||| |  || || ||||| || |||| || |||| ||| |||    
T  132410 tgttcaactgccgataatccacacacaacctcgtacttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccatggcgaaaaacgtggtctaataaa 132311  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgata 166  Q
    || |||||||||||| || || || ||||||||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||    
T  132310 ctgtttctcaagcaactcttccaactgtttcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgata 132245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 138; Significance: 8e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 301 - 618
Target Start/End: Original strand, 4784 - 5101
Alignment:
Q  301 catagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttca 400  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||  ||||||| ||||||| ||| || ||||| |||| ||| |||| ||| ||||  || ||||||    
T  4784 catagacaaggacgccatgaaagaaaacatcaagattccatcacgctctaactacttcagctgcttagtagtcaataactttgctccactctcttcttca 4883  T
Q  401 gcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggta 500  Q
    |||||||| ||||| || |||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |    
T  4884 gcagaagaaaaatataccgacttattgaaacaattaatatgaacatggttatactccaaccagttcataccaaggattacatccattccactcaaagaca 4983  T
Q  501 gacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgac 600  Q
     |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||| ||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4984 aacaaactaaatcaatttcaaagtctcgaccaaacatcgacaaaggacaccttagacacactagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgac 5083  T
Q  601 aaccatctctccattcat 618  Q
     ||||| |||||||||||    
T  5084 gaccatatctccattcat 5101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 178
Target Start/End: Original strand, 4536 - 4681
Alignment:
Q  33 atgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttct 132  Q
    ||||||||||| |||||||| || |  || | |||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||  || ||||||||||||||||| |||||||    
T  4536 atgctaccatctttcttcttaactagtaacaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtcttacgaactccttatcaagcaaatcctctaactgtttct 4635  T
Q  133 tcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcataga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  4636 tcaactcagccaactcagaagccgacatgcggtaaggagtcataga 4681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 210 - 264
Target Start/End: Original strand, 4680 - 4734
Alignment:
Q  210 gaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4680 gaaaattcaacttcccattctggcggcacatcaggaatctcgttaggaaaaactt 4734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 201387 - 200759
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |    
T  201387 ttcaactgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatctttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaaat 201288  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || ||| | |||||| | || |||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||| || || ||||||||    
T  201287 tcttatcaggtaaatccaccaactgtttcttcaactctgataactcagacgctgacatacggtaaggcgccatcgacacaggctttgtacccggaacaag 201188  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac- 301  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| || || || | | | |   ||||||||||     
T  201187 atcgattgaaaactcaacttccctctctggcggcacatcaggaatttcatcatgaaaaacttctggaaattcacacacaattggcaacctatcaatcaca 201088  T
Q  302 ------------atagataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
                | ||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||| || || || |||| ||| |||||  |   ||    
T  201087 acctggttctctacagacaagtatgccattaaagaaaacattaagatcccatcacgttctaactacttcagctgtttagtagtcaagaactcaactttac 200988  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
      || || || |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  200987 tctcttcctccgcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaaacaattgatatgaacatggttatactccaaccagttcatcccaaagattacatccatacc 200888  T
Q  490 actcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagct 589  Q
      |||| || | ||| || | ||||| ||||||||| | | ||||||||||||   ||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||    
T  200887 cgtcaacggcaaacatactagatcaacttcaaaatctctaccaaacatagacaacagacaaatcaaacaaacgagagaagtagttactgaacccttagct 200788  T
Q  590 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  200787 ggagtttcaacaaccatttctccactcat 200759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Original strand, 325091 - 325353
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||  ||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  325091 ttcaactaacgatagtcaatgcacaacctcatgctaccgtccttcttctttaccaacaataccggcgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaact 325190  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcct-ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaa 201  Q
    |||| |||||||| || | | ||  |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| | || ||| ||| |  |||||||||| | |||||    
T  325191 ttttatcaagcaagtcttccaaaccgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatgcgatacgttgccatcgacgccggcttcgttcccgtaacaa 325290  T
Q  202 gatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    | ||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  325291 ggtcaattgaaaactaaacctccctctctggtggtacatctggaatctcatccggaaaaactt 325353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 395 - 606
Target Start/End: Original strand, 325497 - 325708
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactca 494  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| | ||| |||||| |||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||  |||    
T  325497 tcttccgcagaagaaaaatgcaccgtctttctaaaataattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatccattcccgtca 325596  T
Q  495 aaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 594  Q
    | |||| ||| || || || | |||||| || | | ||||||||||||   ||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  325597 acggtaaacacactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacagacatcttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagt 325696  T
Q  595 ttcgacaaccat 606  Q
    ||| ||||||||    
T  325697 ttcaacaaccat 325708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 618
Target Start/End: Original strand, 2256 - 2884
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |    
T  2256 ttcaactgacggtaatatatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccacggtgaaacactcggtcttacaaatt 2355  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || |||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||| |||| ||||||| ||| |||||  |||||||||| || ||| |    
T  2356 tcttatcaagcaaatcctccaactgtttcttcaattcagctaactcagacgccgacgtacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgttccgggcacatg 2455  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcaca 302  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||| |  |  || ||| | | | |||||||||||    
T  2456 atcgattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctagaatctcatcaggaaaagcttctggaaatttacccacaactggcaatctatcaatcaca 2555  T
Q  303 --tagat-----------aaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccac 389  Q
      | |||           ||  | |||||||| |||||||||| |||  ||||||| || |||| ||| |  || || |||| ||| ||||| ||  |||    
T  2556 gcttgattctccaacgacaaatacgccatcaaggaaaacattagaattccatcacgctccaactacttcaactgtttcgtagtcaagaactcagcttcac 2655  T
Q  390 cttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
      || |||||||| ||||| |||| ||| | ||| ||||| |||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  2656 tctcttcttcagcggaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcaattaatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatctatacc 2755  T
Q  490 actcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagct 589  Q
      |||| || | ||| || | ||| | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  2756 cgtcaacggcaaacatactagatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagct 2855  T
Q  590 ggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  2856 ggagtttcaacaaccatttctcctttcat 2884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 135; Significance: 5e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 440 - 618
Target Start/End: Original strand, 15257 - 15435
Alignment:
Q  440 tgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatag 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||    
T  15257 tgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccattccactcaaaggtaaacaaaccaaatcaatttcaaaatctcgaccaatcgtag 15356  T
Q  540 acaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15357 acaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagttggagtttcgacaaccatctctcctttcat 15435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 381
Target Start/End: Original strand, 14879 - 15246
Alignment:
Q  27 aaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaatt 126  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || |  || | | | |||||||  ||||||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| ||||| |    
T  14879 aacctcatgctaccatctttcttcttaactagtaataccagtgctccccgcggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatcaagtaaatcttctaact 14978  T
Q  127 gtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccct 226  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||| || ||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14979 gtttcttcaactcagccaaatcagaagccgacatacggtaaggtgtaatggacgcaggcttcatacctggaataagatcaatcgaaaattcaacttccct 15078  T
Q  227 ctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagataaggaa 313  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||             |  || |||||     
T  15079 ttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcacatacaacctgtaacttatcaatcactgcttgattctcaacggacaaggat 15178  T
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactc 381  Q
    | ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15179 gtcatcaaagaaaacataaaaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttggtagacaaaaactc 15246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 135; Significance: 5e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 251005 - 251275
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || |||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  251005 tgttcaactgacggtaatcaatgcacaacctcatactaccatccttcttctttaccaacaataccggcgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaa 251104  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||| ||||| |||| |    
T  251105 cttcttatcaagcaagtcctccaactgtttctttaattcagctaactcagaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggctttgttcctggaata 251204  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  251205 aggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacacttctggaaa 251275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 387 - 618
Target Start/End: Original strand, 251404 - 251635
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||| ||| | ||| ||||| || || || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  251404 caccttcttctttagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcagtttatttgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccat 251503  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||   ||| || | |||||| | ||| | | |||| || | | ||||||||||||  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||||||    
T  251504 acccgacaacggcaaacaaactagatcgactacaaagtctctaccaaacatagacaatggacatctcaagcaaactagagaagtagttactgaaccctta 251603  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  251604 gctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 251635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6066 - 5796
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || |||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  6066 tgttcaactgacggtaatcaatgcacaacctcatactaccatccttcttctttactagtaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaa 5967  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| |||| |    
T  5966 cttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaata 5867  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5866 aggtcaattgaaaattcaacctccctttctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacacttctggaaa 5796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 387 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 5667 - 5443
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||  | ||| || || || || || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  5667 caccttcttcttcagcagaagaaaaatgcatcgtcttactgaagcagttgatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccat 5568  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    ||    ||| || | |||||| |||||||   ||||||| | | |||||||| |||  ||||| || || || || ||||||||||| || |||||||||    
T  5567 acgcgacaacggcaaacaaactaaatcaaccacaaaatctctaccaaacataaacaatggacacctcaagcaaactagagaagtagttactgaaccctta 5468  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccatctctc 611  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  5467 gctggagtttcaacaaccatttctc 5443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 21505 - 21775
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  21505 tgttcaactgacgataatcaatgcacaacctcatgctaccgtccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacactaggtctaacaaa 21604  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||  |||| ||||| ||||||    
T  21605 cttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcagacgctgacatacgataaggtgccatcaacaccggctttgttcctggaaca 21704  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21705 aggtcaattgaaaattcaacctccctatctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacacttctggaaa 21775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 395 - 618
Target Start/End: Original strand, 21912 - 22135
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactca 494  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||  |||    
T  21912 tcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaataacatccatacccgtca 22011  T
Q  495 aaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 594  Q
      || | |||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||| |||||||  |||    
T  22012 gcggcaaacaaactaaatcgacctcaaaatctctaccaaacatagacaatggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacacttagctaaagt 22111  T
Q  595 ttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||    
T  22112 ttcaacaaccatttctcctttcat 22135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 27167 - 27046
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| || ||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || | ||||||||||||||| || ||||| ||  | |||||||    
T  27167 ttcaactgccggtaatctatacataacctcatgctaccatctttctttttaaccaataacaccggcgctccccaaggcgacacactcggccttacaaact 27068  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaa 124  Q
    | || ||||||||||| |||||    
T  27067 tcttatcaagcaaatcttctaa 27046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 7)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Original strand, 29007 - 29637
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || ||| | ||| | |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  29007 tgttcaactgccgataatcaatgcataacgtcatgttgccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaa 29106  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || || |||||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||  |||||    
T  29107 tttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcggacgccgacatacgataaggtgccatcgacactggcttcgttcctagaaca 29206  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    || ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    || ||| | |  || |||||||    
T  29207 aggtcaattgaaaattcaacctctctttctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcattcacaactggcaacttgtcaatca 29306  T
Q  301 ca--tagat-----------aaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    ||  | |||           ||| | ||||||||||||||||| | |||  ||||||| || |||||||| |  || || ||||| |  ||||| || ||    
T  29307 cagcttgattttccaatgacaagtatgccatcaaagaaaacatcagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttagtagataggaactcagctcc 29406  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    ||  || |||||||||||||| |||| ||  | |||| |||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||    
T  29407 actctcttcttcagcagaagaaaaatgcatcgtcttgttaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaatcacctccata 29506  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||  |||| |||| |||| | |  || | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  29507 cccgtcaacggtaaacaagctaggtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttag 29606  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  29607 ctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 29637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 50078 - 49849
Alignment:
Q  24 cacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctcta 123  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| || |||||||| || || |    
T  50078 cacaatctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacacaggcgctccccatggtgaaacacttggtcttacgaacttcttatcaagcaagtcttcca 49979  T
Q  124 attgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatc 223  Q
    | |||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  49978 actgtttcttcaactctgctaactcagacgccgacatacgataaggtgacatcgacaccagcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacttc 49879  T
Q  224 cctctctggaggcacatcaggaatctcatc 253  Q
    | | ||||| || |||||||||||||||||    
T  49878 cttttctggtggtacatcaggaatctcatc 49849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 59112 - 58883
Alignment:
Q  24 cacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctcta 123  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| || |||||||| || || |    
T  59112 cacaatctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacacaggcgctccccatggtgaaacacttggtcttacgaacttcttatcaagcaagtcttcca 59013  T
Q  124 attgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatc 223  Q
    | |||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  59012 actgtttcttcaactctgctaactcagacgccgacatacgataaggtgacatcgacaccagcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacttc 58913  T
Q  224 cctctctggaggcacatcaggaatctcatc 253  Q
    | | ||||| || |||||||||||||||||    
T  58912 cttttctggtggtacatcaggaatctcatc 58883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 65500 - 65271
Alignment:
Q  24 cacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctcta 123  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| || |||||||| || || |    
T  65500 cacaatctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacacaggcgctccccatggtgaaacacttggtcttacgaacttcttatcaagcaagtcttcca 65401  T
Q  124 attgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatc 223  Q
    | |||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  65400 actgtttcttcaactctgctaactcagacgccgacatacgataaggtgacatcgacaccagcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacttc 65301  T
Q  224 cctctctggaggcacatcaggaatctcatc 253  Q
    | | ||||| || |||||||||||||||||    
T  65300 cttttctggtggtacatcaggaatctcatc 65271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 49775 - 49471
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||| || ||| |  || || |||||||| |||||  |  ||||||| |||||||||||||  ||||    
T  49775 gccatcaaagaatacatcaaaattccatcacgttctagctacttcatctgtttcgtagacaagaactcaacttcaccttcttcttcagcagaagcaaaat 49676  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| | ||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||  |||| |||||||| || || ||    
T  49675 gcaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaatagcatccatacccgtcaatggtagacacactaagtc 49576  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
     |  |||||||| | | ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||     
T  49575 gacctcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttggctggagtttcaacagccatttctcct 49476  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  49475 ttcat 49471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 58809 - 58505
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||| || ||| |  || || |||||||| |||||  |  ||||||| |||||||||||||  ||||    
T  58809 gccatcaaagaatacatcaaaattccatcacgttctagctacttcatctgtttcgtagacaagaactcaacttcaccttcttcttcagcagaagcaaaat 58710  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| | ||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||  |||| |||||||| || || ||    
T  58709 gcaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaatagcatccatacccgtcaatggtagacacactaagtc 58610  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
     |  |||||||| | | ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||     
T  58609 gacctcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttggctggagtttcaacagccatttctcct 58510  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  58509 ttcat 58505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 65197 - 64893
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||| || ||| |  || || |||||||| |||||  |  ||||||| |||||||||||||  ||||    
T  65197 gccatcaaagaatacatcaaaattccatcacgttctagctacttcatctgtttcgtagacaagaactcaacttcaccttcttcttcagcagaagcaaaat 65098  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| | ||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||  |||| |||||||| || || ||    
T  65097 gcaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaatagcatccatacccgtcaatggtagacacactaagtc 64998  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
     |  |||||||| | | ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||     
T  64997 gacctcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacaaacaagagaagtagttactgaaccctttgctggagtttcaacagccatttctcct 64898  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  64897 ttcat 64893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 618
Target Start/End: Original strand, 175396 - 176001
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| || || ||||| |||||||    
T  175396 atacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctcctcaaggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatcaagtaaatcct 175495  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    |     |||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||||| ||| |||||  |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  175496 c-----gtttcttcaattcagctaactcggatgccgacatacgttaaggtgccatcgacaccggcttcgttccgggatcaagatcaattgaaaattcaac 175590  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcaca--tagat----------- 307  Q
     || |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||  | || ||| | | | |||||||||||  | |||               
T  175591 ctctctctctggtggcacatcaagaatcttatcaggaaaaacttctggaaattcatacacaactggcaatctatcaatcacagcttgattctccaatgac 175690  T
Q  308 aaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaag 407  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||| |  || || |||| ||| |||||  |  |||  || ||  |||||||||    
T  175691 aagtatgccatcaaagaaaacatcaaaattccatcacgttctaactacttcaactgtttagtagtcaagaactcaacttcactctcttccccagcagaag 175790  T
Q  408 agaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaac 507  Q
    | ||||  |  | ||| ||||||||||| || |||||| | || | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||| || | ||| ||    
T  175791 aaaaatgtatcgtcttactaaaacaattgatatgaacacgattattctctaaccagttcatcccaaagattacatccatacccgtcaacggcaaacatac 175890  T
Q  508 caaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatc 607  Q
     | ||| | ||||||||| | | ||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  175891 aagatcgacttcaaaatctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttagtgaacccttagctggagtttcaacaaccatt 175990  T
Q  608 tctccattcat 618  Q
    |||||||||||    
T  175991 tctccattcat 176001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 99481 - 99255
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |  || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |    
T  99481 ttcaactgacgataatcaatgcacaacctcatgctaccgtccttcttctttaccaacaacacaggtgctccccacggtgagacacttggtcttacaaaat 99382  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || |||||||| || || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||| ||||    
T  99381 tcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatgcgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcccggagcaag 99282  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctc 229  Q
     ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  99281 gtcaattgaaaactcaacctccctctc 99255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 395 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 99097 - 98874
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactca 494  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| | ||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  |||    
T  99097 tcttccgcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatccatacccgtca 98998  T
Q  495 aaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 594  Q
    | || | |||||| || || | |||||| || | | ||||||||||||  | ||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  98997 acggcaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacgaacaccttagacacacaagagaagtagttactgaacccttagctggagt 98898  T
Q  595 ttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||    
T  98897 ttcaacaaccatttctcccttcat 98874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 264
Target Start/End: Original strand, 36335 - 36585
Alignment:
Q  14 ataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagc 113  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||    
T  36335 ataatcaatgcataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatcaagc 36434  T
Q  114 aaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaa 213  Q
    || | ||| || ||||||||||| || || |  || || || |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||    
T  36435 aagttctccaactgtttcttcaattcagcaagttcggacgccgacatacgataaggtgccatcgacacaggcttcgttcctagaacaaggtcaattgaaa 36534  T
Q  214 attcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36535 attcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaactt 36585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Original strand, 36648 - 36952
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| |  || ||  |||| |  ||||| || ||||  || |||||||||||||| ||||    
T  36648 gccatcaaagaaaacattaaaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttcatagataggaactcagctccactctcttcttcagcagaagaaaaat 36747  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     | | | |||||||||  |||| || |||||  | || |||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||  |||| |||| |||||| || ||    
T  36748 gcgccgtcttgctaaagaaattgatatgaactcgattatactctaaacagttcatcccaaaaatatcatccatacccgtcaacggtaaacaaactaagtc 36847  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
     | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  36848 gacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttattgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcct 36947  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  36948 ttcat 36952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 31226 - 30629
Alignment:
Q  15 taattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagca 114  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||    
T  31226 taatcaatgcacaacctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttgttatcaagca 31127  T
Q  115 aatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaa 214  Q
    ||||||| || ||||||||||| || || |||||| ||| ||||||||| || |||| ||| |||||  |||| |||||  ||||||| ||||| |||||    
T  31126 aatcctccaactgtttcttcaattcagctaactcataagttgacatacggtatggtgccatcgacaccggctttgttcctagaacaaggtcaattgaaaa 31027  T
Q  215 ttcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcaca-----------t 303  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||   |||||| | |   | |||||||||           |    
T  31026 ttcaacttccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacacttctgaaaattctttcaccactggcaacctgtcaatcacagcttggttttct 30927  T
Q  304 a--gataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcag 401  Q
    |  |||||  ||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||| ||| || |  || || |||||||| |||||  |  ||||||| |||||||    
T  30926 acggataaataagccatcagagaaaacatcaaaattccatcacgttctagctgtttcatctgttttgtagacaagaactcaacttcaccttcttcttcag 30827  T
Q  402 cagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtag 501  Q
    ||||||| ||||  || | ||| ||||| || || || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| |||       |||||   ||| || |     
T  30826 cagaagaaaaatgtaccgtcttactaaagcatttgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaat-------atacccgacaacggcaa 30734  T
Q  502 acaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgaca 601  Q
    |||||| |||||||   |||| || | | ||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  30733 acaaactaaatcaaccacaaagtctctaccaaacatagacaacggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaaca 30634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 125; Significance: 5e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 22087 - 21488
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||||||||||| |    
T  22087 atacacaacctcatgctaccatctttcttcttaacgagcaacactggcgctccccaaggtgaaacactcggtattacaaacttcttatcaagcaaatctt 21988  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || |  || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||| ||  ||| |||||||||  ||||||||||    
T  21987 ccaaattctttttcaactcagctaattcagaagccgacatacggtaaggcgccattgacacaggcttcgtacc-cgaaaaagatcaataaaaaattcaac 21889  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagat 307  Q
     ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||  | || ||||| |  |||||||| ||             |||||     
T  21888 ttccctttccagcggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttctggaatttcgtacacaacttgcaacttatcaattaccgcttgattctcaatagac 21789  T
Q  308 aaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaag 407  Q
    || || |||||||||||||||||   |||  |||||||  |||||||||| || ||||| |||| ||| ||||| ||  |||  || |||||||||||||    
T  21788 aaagacgccatcaaagaaaacatcggaattccatcacgcgctaactgcttaagctgcttagtagtcaagaactcagcttcactctcttcttcagcagaag 21689  T
Q  408 agaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggtt-gtac-tctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaa 505  Q
    | ||||  || | ||| |||||||| ||||| | |||||||||  ||| || || ||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| | ||||    
T  21688 aaaaatgtaccgtcttactaaaacagttaatataaacatggttattacatccaagcagctcataccaagtattagatccattccactcaaaggcaaacaa 21589  T
Q  506 accaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaacca 605  Q
    || ||||||| |||||| || ||| ||||||| || |  |||||  | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21588 actaaatcaacttcaaagtctcgaccaaacatcgagaacggacacttcagacacactagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaacca 21489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1401 - 1136
Alignment:
Q  6 aactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttt 105  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |    
T  1401 aactgacgataataaatgcataacctcatggtaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaatttct 1302  T
Q  106 tctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatc 205  Q
    | |||||||| ||||| || ||||||||||| ||  | ||||| || || |||||||| ||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||| ||    
T  1301 tatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcaactaactcggacgccgacatacgctaaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtc 1202  T
Q  206 aatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1201 aattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaa 1136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 1080 - 920
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    |||||||||||| |||||| |||  ||||||| || | |||||| |  || || ||||| |  ||||| || ||||  || ||||| |||||||| ||||    
T  1080 gccatcaaagaagacattagaattccatcacgctccagctgcttcaactgtttagtagataggaactccgctccactctcttcttccgcagaagaaaaat 981  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaag 474  Q
     ||| | ||||| ||| ||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  980 gcaccgtcttgcaaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcataccaag 920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 618
Target Start/End: Original strand, 53456 - 54060
Alignment:
Q  27 aaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaatt 126  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| || |||||||| || || || |    
T  53456 aacctcatgctaccgtccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacactaggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcttccaact 53555  T
Q  127 gtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccct 226  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  53556 gtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatgcgataaggtgccatcgacaccggcttcattcccggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccct 53655  T
Q  227 ctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcacat-------------agataaggaa 313  Q
     ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||    |||||| |||   | ||||||||||              || || ||     
T  53656 ttctggtggtacatctggaatctcatcaggaaaaacttcaggaaattcattcaccactggtaacctgtcaatcacatcttgattttctaacgacaaagat 53755  T
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||| || || |||||||| |  || || ||||  |  || ||||| ||||  || ||||| |||||||| ||||    
T  53756 gccatcaaagaaaacataagaattccatcgcgctccaactgcttcaactgtttagtagttaggaattctgctccactatcttcttccgcagaagaaaaat 53855  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| | ||||||||||||||  || |||||  |||| ||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||  |||| |||| ||| || || ||    
T  53856 gcaccgtcttgctaaaacaatagatatgaactcggttatactctaactagttcatcccaaaaataacatccattcccgtcaacggtaaacacactaagtc 53955  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
     | || ||| || | | ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  53956 gacttaaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacacacaagagaagtagttaatgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctaca 54055  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  54056 ttcat 54060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Original strand, 7147 - 7390
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| || || |||||||| | ||    
T  7147 atacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttgatcttacaaatttcttatcaagcaagttct 7246  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  7247 ccaactgtttcttcaactcagctaactcggacgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaac 7346  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7347 ctccctctctggtggtacatcgggaatctcatcaggaaaaactt 7390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 314 - 612
Target Start/End: Original strand, 7453 - 7751
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||  ||||| |  |  || |||||||| |||||  |  |||| || |||||||||||||| ||||    
T  7453 gccatcaaagaaaacatgagaattccatcacgttctagttgcttcatctatttcgtagacaagaactcaacttcaccctcttcttcagcagaagaaaaat 7552  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||  | ||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||| |||||| | |||    
T  7553 gcatcgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgtcaacggtaaacaaacaagatc 7652  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 612  Q
     | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7653 gacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtaattaccgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 7751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 31299 - 31470
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||    
T  31299 tgttcaactgtcgataatcaatacacaacctcatgctaccatccttcttcttcactaacaaaaccggcgctccccaaggcgaaaaacttggtctaaaaaa 31398  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgt 172  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  31399 ctttttctcaagcaaatcttctaattgtttcttcaattcggccaactctgaagctgataaacgataaggtgt 31470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Original strand, 51215 - 51465
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||  |||||||||| | | | ||| | || || ||||| ||||| |    
T  51215 atacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaacaacaataccggcgctccccacagtgaaacactcgatcttacatatttcttatcaagtaaatctt 51314  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | |||||||||||||| |  || |||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||  |||| ||||  || |||||||| || |||||||||||    
T  51315 caaattgtttcttcaatttagctaactcagacgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggctttgttctgggcacaagatcgattgaaaattcaac 51414  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
     |||||||| || ||||||   |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  51415 ctccctctccggtggcacaattggaatctcgtcaggaaaaacttctggaaa 51465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 489
Target Start/End: Original strand, 51521 - 51696
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |  |  || |||| ||| |||||  |  |||  || || |||| |||||| ||||    
T  51521 gccatcaaagaaaatattaaaatcccatcacgttctaactgcttcaactatttagtagtcaagaactcaacttcactctcttcctcagtagaagaaaaat 51620  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
      || | |||  ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  51621 gtacagtcttaataaaacaattaatatgaacacggttatactctaaccagttcatcccaaagattacatccatacc 51696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 611 - 881
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||| || ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  611 tgttcaactgacgatagtcaatgcataacctcatagtaccatccttcttcttaaccaacaatatcggcgctccctaaggtgaaacacttggtcttacaaa 710  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  711 cttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcggaagctgacatacgataacgtgccatcgacaccggcttcgttcctggaaca 810  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    || ||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  811 aggtcaattgaaaattcaaccaccctttctggtggcacatctagaatctcatcaggaaacacttctggaaa 881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 377 - 606
Target Start/End: Original strand, 991 - 1212
Alignment:
Q  377 aactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaa 476  Q
    |||||||| ||||  || |||||||||||||| |||| ||| | ||||||||| ||||| || |||||  | || ||||||||| ||||||| |||| ||    
T  991 aactctgctccactctcttcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaagcaattgatatgaactcgattatactctaactagttcatcccaaaaa 1090  T
Q  477 ttacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcac 576  Q
    | |||||||||||  |||| |||| |||||| || || | |||||| || | | ||||||||||||   ||||||||| ||| |||||||||||          
T  1091 taacatccatacccgtcaacggtaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacagacatcttagacaaacaagagaagt------ 1184  T
Q  577 cgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1185 --aacccttagctggagtttcaacaaccat 1212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Original strand, 4584 - 4834
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| || || ||||| |||||||    
T  4584 atacacaacctcatgctaccatctttcttcttaaccaataataccggcgctccccacggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatcaagtaaatcct 4683  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || ||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  4684 ccaactgtttcttcaagtcagctaactcagacgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccgggcacaagatcgattgaaaattcaac 4783  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
     ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4784 ctccctctctggtggcacatctagaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 4834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 395 - 618
Target Start/End: Original strand, 4971 - 5194
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactca 494  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||| ||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||    
T  4971 tcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcaaatgatgtgaacacggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgtca 5070  T
Q  495 aaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 594  Q
    | |||| |||||| | ||| | |||||| || | | ||||||| ||||  ||||| |||| ||| ||||||||| |||| || ||| ||| |||||||||    
T  5071 acggtaaacaaacaagatcgacttcaaagtctctaccaaacattgacaacggacaacttagacaaacaagagaaatagttactgaaacctcagctggagt 5170  T
Q  595 ttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||    
T  5171 ttcaacaaccatttctcctttcat 5194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Original strand, 11233 - 11483
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| || ||||| |||||||    
T  11233 atacacaatctcatgctaccatctttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacgctcggtcttacaaacttcttatcaagtaaatcct 11332  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || |||||||||||||| || | |||||| || |||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||    
T  11333 ccaactgtttcttcaactcagctagctcagacgccgacatacggtaaggcgccatcgacacaggcttcgtacccggaataagatcaattgaaaattcaac 11432  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11433 ttccctctctggcggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacctctggaaa 11483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 316 - 618
Target Start/End: Original strand, 11541 - 11843
Alignment:
Q  316 catcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatac 415  Q
    |||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || || |||| ||| |||||  |   ||  || || |||||| |||| |||| |    
T  11541 catcaaggaaaagattaagatcccatcacgttctaactgctttagctgtttagtagtcaagaactcaactttactctcttcctcagcaaaagaaaaatgc 11640  T
Q  416 actgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaa 515  Q
    |||| ||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||   |||  | | ||| || | |||||    
T  11641 actgtcttactaaaacagttgatatgaacatggttatactccaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgacaacagcaaacatacaagatcaa 11740  T
Q  516 tttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccatt 615  Q
     ||||||||| | | ||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  11741 cttcaaaatctctaccaaacatagacaaaggacaactcaaacaaacaagagaagtagttattgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccact 11840  T
Q  616 cat 618  Q
    |||    
T  11841 cat 11843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Original strand, 6724 - 6966
Alignment:
Q  4 tcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactt 103  Q
    ||||||||||||| | ||| || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  6724 tcaactgtcgatagtcaatgcataacctcatactaccatctttcttcttaaccaaaaatatcggcactccccaaggtgaaacactcggtgttacaaactt 6823  T
Q  104 tttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaaga 203  Q
     || |  || ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  6824 cttattgagtaaatcttctaactgtttcttcaactcggtcaactcagaagccgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaacaaga 6923  T
Q  204 tcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaa 246  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||    
T  6924 tcaatcgaaaattcaacttccctttctagcggcacatcaggaa 6966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8952 - 8710
Alignment:
Q  4 tcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactt 103  Q
    ||||||||||||| | ||| || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  8952 tcaactgtcgatagtcaatgcataacctcatactaccatctttcttcttaaccaaaaatatcggggctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaactt 8853  T
Q  104 tttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaaga 203  Q
     || |  || ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  8852 cttattgagtaaatcttctaactgtttcttcaactcggtcaactcagaagccgacatacggtaaggtgttatagacacaggcttcgtacccggaacaaga 8753  T
Q  204 tcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaa 246  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||    
T  8752 tcaatcgaaaattcaacttccctttctagcggcacatcaggaa 8710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 314 - 496
Target Start/End: Original strand, 7035 - 7217
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    |||||||||||||||||   |||  |||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||| ||||| ||  |||  || ||||||| ||||||  |||    
T  7035 gccatcaaagaaaacatcggaattccatcacgcgctaactgccttagctgcttggtagtcaagaactcagcttcactctcttcttcagaagaagaataat 7134  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaa 496  Q
      || | ||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7135 gtaccgtcttactaaaacaactaatatgaacatggttatactccaaccagttaataccaagtattacatccattccactcaaa 7217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 314 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 8641 - 8459
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    |||||||||||||||||   |||   ||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||| ||||| ||  |||  || ||||||| ||||||  |||    
T  8641 gccatcaaagaaaacatcggaattctatcacgcgctaactgccttagctgcttggtagtcaagaactcagcttcactctcttcttcagtagaagaataat 8542  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaa 496  Q
      || | ||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8541 gtaccgtcttactaaaacaactaatatgaacatggttatactccaaccagttcataccaagtattacatccattccactcaaa 8459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 64420 - 64170
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || || |||||||| ||||    
T  64420 atacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccgacgctccccaaggtgaaacacttggtgttacaaatttcttatcaagcaagtcct 64321  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
      || |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  64320 tcaactgtttcttcaactcagctaactcggacgccgacatacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaac 64221  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  64220 ctccctctctggtggcacatctggaatctgatcaggaaaaacttctggaaa 64170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 64114 - 63810
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||| || |||||||| |  || || ||||  || ||||| ||  |||  || ||||||| |||||| ||||    
T  64114 gccatcaaagaaaacattagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttagtagttaagaactcagcttcactctcttcttcagtagaagaaaaat 64015  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||  | ||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||   ||| || | ||| || | |||    
T  64014 gcatcgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaatcacatccatacccaacaacggcaaacatactagatc 63915  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
     | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  63914 gacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcct 63815  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  63814 ttcat 63810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 49776 - 49168
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||   ||||||||| ||| | ||||| || || |||||||||||||    
T  49776 atacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccac--tgaaacactcggtcttacaaatttcttatcaagcaaatcct 49679  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  49678 ccaactgtttcttcaattcggctaactcggacgccgacatacggtaaggtgccatcgacaccggctttgttccgggcacaagatcaattgaaaattcaac 49579  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcaca--tagat----------- 307  Q
     |||||||  || |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| || |  || ||  | | | |||||||||||  | |||               
T  49578 ctccctcttcggtggcacatttggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcactcacaaccggcaatctatcaatcacagcttgattctccaatgac 49479  T
Q  308 aaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaag 407  Q
    ||| | |||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |  || || |||| ||| ||||| |   | |  || || ||||||||||    
T  49478 aagtacgccatcaaggaaaacattagaatttcatcactttctaactgcttcaactgtttcgtagtcaataactcagtttcgctctcttcctcagcagaag 49379  T
Q  408 agaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaac 507  Q
    | |||| ||||| ||| ||||| |||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   ||| || | | | ||    
T  49378 aaaaatgcactgtcttactaaagcaattaatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgacaacggcaaatatac 49279  T
Q  508 caaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatc 607  Q
     | ||| | |||||| || | | ||||||||||||   |||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| || |||| ||||||||     
T  49278 tagatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacagacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagcttgattttcaacaaccatt 49179  T
Q  608 tctccattcat 618  Q
    ||||| |||||    
T  49178 tctcctttcat 49168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 118; Significance: 7e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Original strand, 1030 - 1291
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||    
T  1030 ttcaactgacgataatcaatgcacaaccttatgctaccgtccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacactgggtcttacaaact 1129  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || |||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||    
T  1130 tcttatcaagcaagtcttctaactgtttcttcaattcagctaactcagatgctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaag 1229  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
     || || || || ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  1230 gtcgatggagaactcaacctccctctctggtggcacatatggaatctcatctggaaaaactt 1291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Original strand, 7999 - 8260
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||    
T  7999 ttcaactgacgataatcaatgcacaaccttatgctaccgtccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacagtgaaacactgggtctaacaaact 8098  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || |||||||| || || || ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||    
T  8099 tcttatcaagcaagtcttcaaactgtttcttcaattcaactaactcagatgctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaag 8198  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
     || || || || ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8199 gtcgatggagaactcaacctccctctctggtggcacatatggaatctcatcaggaaaaactt 8260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 395 - 612
Target Start/End: Original strand, 8404 - 8621
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactca 494  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||   |||    
T  8404 tcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccatacacgtca 8503  T
Q  495 aaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 594  Q
    | || | ||| || || || |  |||||||| | | ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8504 acggcaaacatactaagtcgacctcaaaatctctaccaaacatagacaatggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagt 8603  T
Q  595 ttcgacaaccatctctcc 612  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  8604 ttcaacaaccatttctcc 8621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 118; Significance: 7e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 461 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 58062 - 57905
Alignment:
Q  461 cagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacaca 560  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  58062 cagttcataccaaggatcacatccattccgctcaaaggtaaacaaaccaaatcaatttcaaaatctcgaccaaacatagacaaaggacatcttaaacaca 57963  T
Q  561 caagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  57962 caagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctttccattcat 57905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19529 - 19294
Alignment:
Q  27 aaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaatt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||| || |    
T  19529 aacctcatgctaccatccttcttcttaaccagcaataccggcgctccccaaggcgaaacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaact 19430  T
Q  127 gtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccct 226  Q
    |||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  19429 gtttcttcaattcagctaactcggaagctgacatacgttaatgtgccatttacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccct 19330  T
Q  227 ctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaac 262  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19329 ctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaac 19294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 19226 - 19073
Alignment:
Q  317 atcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaataca 416  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||  || |||||||| |  || || |||||||  |||||||| ||||  || |||||||||||||| |||| ||    
T  19226 atcaaagaaaacattaaaattctatcacactccaactgcttcaactgtttcgtagacaggaactctgctccactctcttcttcagcagaagaaaaatgca 19127  T
Q  417 ctgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcatac 470  Q
    | | ||||||||| ||||| || |||||  |||| |||| |||||| |||||||    
T  19126 ccgtcttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactgtaaccaattcatac 19073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 49503 - 49758
Alignment:
Q  15 taattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagca 114  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || || |||||||    
T  49503 taatcaatacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaat-ttcttatcaagca 49601  T
Q  115 aatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaa 214  Q
    | ||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||| ||| || |   |||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  49602 agtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcggacgctgacatacggtaaggtgccatcgatatcggcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaa 49701  T
Q  215 ttcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49702 ttcaacctccctttctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaa 49758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Original strand, 49814 - 50118
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |  || || ||||  |  ||||| ||  |||  || ||||| |||||||| ||||    
T  49814 gccatcaaagaaaacattagaattccatcacgttctaactacttgaactgtttagtagttaggaactcagcttcactctcttcttccgcagaagaaaaat 49913  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| | ||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||  |||| ||||  ||||| | |||    
T  49914 gcaccgtcttactaaagcaattgatatgaacttggttatactctaaccatttcatcccaaaaattacatccatacccgtcaacggtaagcaaacaagatc 50013  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
     | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||     
T  50014 gacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaacaatttctcct 50113  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  50114 ttcat 50118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 69755 - 70018
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||    
T  69755 tgttcaactgacgatagtcaatgcacaatctcatactaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggcgaaacactaggtcttacaaa 69854  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    |||||||| ||||||    
T  69855 cttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcggctaattcagaagctgacatgcgataaggtgccatcgacaccgatttcgttcccggaaca 69954  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  69955 agatcaatcgagaactcaacttccctttctggtggcacatcaggaatctcatccggaaaaactt 70018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2874 - 2611
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| || ||||| | ||| || ||||| ||||||   ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||| | |||||    
T  2874 tgttcaattgacgatagtcaatgcataacctcatgctattgtccttcttcttaaccaacaacatcgacgctccccacggtgaaacactgggtcttacaaa 2775  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  2774 cttcttatcgagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcgaaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttagttcctggaaca 2675  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    || ||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2674 aggtcaattgaaaattcaacctcccgctctggtggtacatctggaatctcatccggaaaaactt 2611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 314 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 2548 - 2255
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||| || |||| ||| |  || || ||||| |  ||||| || ||||  || ||||| ||| |||| ||||    
T  2548 gccatcaaagaaaacataagaattccatcacgctccaactacttcaactgtttagtagataggaactccgctccactctcttcttccgcaaaagaaaaat 2449  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcatac-caagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaat 512  Q
     ||| | ||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |  ||||  ||| |||||| || |    
T  2448 gcaccgtcttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcctcaaaaataacatccatagcggtcaacagtaaacaaactaagt 2349  T
Q  513 caatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
    | | |||||| || | | ||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2348 cgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacgaacatcttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 2255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 377 - 618
Target Start/End: Original strand, 70144 - 70385
Alignment:
Q  377 aactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaa 476  Q
    |||||||| ||||  || ||||| |||||||| |||| |||   |||| | |||||||| || | |||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||    
T  70144 aactctgctccactctcttcttccgcagaagacaaatgcaccatcttgttgaaacaatttatataaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaa 70243  T
Q  477 ttacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcac 576  Q
    | |||| ||| ||  |||| |||||||| || || || |  |||||||| | | ||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  70244 taacatacattcccatcaacggtagacacactaagtcgacctcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacaaactagagaagtagttac 70343  T
Q  577 cgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
     |||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  70344 tgaacccttggctagagtttcaacaacaatttctcctttcat 70385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 33720 - 33990
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||    
T  33720 tgttcaactgacgataatcaatgcataacctcaagctaccatccttcttcttaaccaacaacactggcgcttcccacggtgaaacacttggtcttacaaa 33819  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || || |||||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  | |||||||| ||||||    
T  33820 tttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggattcgttcctggaaca 33919  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  33920 aggtcaattgaaaattcaacctccctttctggtggcacatctcgaatttcatcaggaaacacttctggaaa 33990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 314 - 606
Target Start/End: Original strand, 34046 - 34338
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||| |||||||| |  || || ||||| |  ||||| || ||||  || ||||||| |||||| ||||    
T  34046 gccatcaaagaaaacatcagaattccatcacgttccaactgcttcaactgtttagtagataggaactccgctccactctcttcttcagtagaagaaaaat 34145  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| | |||||||||  |||| || |||||  | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| | || |||||| |  ||    
T  34146 gcaccgtcttgctaaagtaattgatatgaactcgattgtactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgtcaacgataaacaaactaggtc 34245  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
     | |||||| ||   | ||||||||||||  ||||| |||| ||| ||||||||| |||  || ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  34246 gacttcaaagtctttaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaaatagctactgaacccttagctggaatttcaacaaccat 34338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2191 - 1930
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||| |    
T  2191 ttcaactgacgataatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaaaaatactggcgctccccacggttaaacactcggtcttacaaatt 2092  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||| ||| ||| |||||  | |||||||||||||| ||    
T  2091 tcttatcaagtaagtcctccaactgtttcttcaactccgctaactcggacgccgacatacgataaagtgccatcgacaccggattcgttccaggaactag 1992  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1991 atcaattgcaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 1930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 316 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 1865 - 1563
Alignment:
Q  316 catcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatac 415  Q
    |||||| ||||||||||| ||  |||||||||| || ||||| |  || || |||| ||| |||||  |  ||||||| || || |||||||| ||||      
T  1865 catcaaggaaaacattaagattccatcacgttccaattgcttcatctgtttagtagtcaacaactcaacttcaccttcttcctccgcagaagaaaaatgt 1766  T
Q  416 actgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaa 515  Q
    |  | ||| |||||||||||||| |||||| |||| || |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||  |||| || | ||| || | |||||    
T  1765 atcgtcttactaaaacaattaatatgaacacggttatattctaaccaattcatcccaaagattacatccatacccgtcaacggcaaacatacaagatcaa 1666  T
Q  516 tttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccatt 615  Q
     |||||| || | | ||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  1665 cttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtaattactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccatt 1566  T
Q  616 cat 618  Q
    |||    
T  1565 cat 1563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 4)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Original strand, 9448 - 9709
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| ||||||| ||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  9448 ttcaactgacgataatcaatgcataacctcatactaccatccttcttctttaccaacaataccggcgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaact 9547  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || |||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| ||||||||    
T  9548 tcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccataaacaccggcttcgttcctggaacaag 9647  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || | ||||||||    
T  9648 gtcaattgaaaattcaacctccctttctggtggtacatctggaatctcgtcggaaaaaactt 9709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 33 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1378 - 1138
Alignment:
Q  33 atgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttct 132  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  1378 atgctaccgtccttcttctttaccaacaacataggcgctccccacggcgagacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttct 1279  T
Q  133 tcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac--atccctctct 230  Q
    |||| || || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| || || |||||   || ||||||    
T  1278 tcaattcagctaactcagacgctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcccggaacaaggtcaattgagaactcaacctctctctctct 1179  T
Q  231 ggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
     | |||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  1178 tgtggcacatctgaaatctcatcaggaaacacttctggaaa 1138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 377 - 606
Target Start/End: Original strand, 20586 - 20815
Alignment:
Q  377 aactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaa 476  Q
    |||||||| |||| ||| | ||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||| ||||||| |||| ||    
T  20586 aactctgctccactttcttgttccgcagaagaaaaatgcactgtcttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactctaactagttcatcccaaaaa 20685  T
Q  477 ttacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcac 576  Q
    | |||||||| ||  |||| |||| |||||| || || | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| ||    
T  20686 taacatccattcccgtcaacggtaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaacttagacaaacaagagaagtagttac 20785  T
Q  577 cgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20786 tgaacccttagctggagtttcaacaaccat 20815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 425 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 971 - 778
Alignment:
Q  425 ctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaat 524  Q
    ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||  |||| || | || ||| || || | |||||| |    
T  971 ctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaataacatccatacccgtcaacggaaaaccaactaagtcgacttcaaagt 872  T
Q  525 cacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    | | |  |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  871 ctctactaaacatagacaacggacattttaaacacacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 29204 - 28943
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||| |    
T  29204 ttcaactgacgataatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaaaaatactggcgctccccacggttaaacactcggtcttacaaatt 29105  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || ||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||| ||| ||| |||||  | |||||||||||||| ||    
T  29104 tcttatcaagtaagtcctccaactgtttcttcaactccgctaactcggacgccgacatacgataaagtgccatcgacaccggattcgttccaggaactag 29005  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004 atcaattgcaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 28943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 316 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 28878 - 28576
Alignment:
Q  316 catcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatac 415  Q
    |||||| ||||||||||| ||  |||||||||| || ||||| |  || || |||| ||| |||||  |  ||||||| || || |||||||| ||||      
T  28878 catcaaggaaaacattaagattccatcacgttccaattgcttcatctgtttagtagtcaacaactcaacttcaccttcttcctccgcagaagaaaaatgt 28779  T
Q  416 actgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaa 515  Q
    |  | ||| |||||||||||||| |||||| |||| || |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||  |||| || | ||| || | |||||    
T  28778 atcgtcttactaaaacaattaatatgaacacggttatattctaaccaattcatcccaaagattacatccatacccgtcaacggcaaacatacaagatcaa 28679  T
Q  516 tttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccatt 615  Q
     |||||| || | | ||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28678 cttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtaattactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccatt 28579  T
Q  616 cat 618  Q
    |||    
T  28578 cat 28576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 113; Significance: 7e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 414 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 975 - 771
Alignment:
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  975 acactgacttgctgaaacaattgatatgaacatggttgcactctaaccaattcatacccagaatcacatccataccgctcaaaggtagacaaactaaatc 876  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
     ||||||||||||||| |||||||| | |  |||||| |  | || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  875 catttcaaaatcacgaccaaacatatataaaggacatttctatcatacgagagaagtagttacctaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 776  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  775 ttcat 771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1270 - 1019
Alignment:
Q  49 tcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactc 148  Q
    ||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  1270 tcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttttcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagtcaactc 1171  T
Q  149 agaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatc 248  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||  ||||  ||||||||||||| |||| |||||| ||||| || || ||||| | ||||||||||||||||||     
T  1170 ggaagcagacatacgataaggtgccatcaacaccggcttcgttccagggacaaaatcaatagaaaactcgacttccctttttggaggcacatcaggaatt 1071  T
Q  249 tcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  1070 tcatctgggaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgtagcttatcaatca 1019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 113; Significance: 7e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 264
Target Start/End: Original strand, 1 - 229
Alignment:
Q  36 ctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||| || || || ||||||||||    
T  1 ctaccatccttcttctttaccaacaataccggcgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttca 100  T
Q  136 actcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggagg 235  Q
    |||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  101 actcagctaactcggaagctgacatgcgataaggtgtcatcgacaccggcttcgttcctggaacaagttcaattgaaaattcaacctccctttctggtgg 200  T
Q  236 cacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
     ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  201 tacatctggaatctcgtccggaaaaactt 229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 314 - 606
Target Start/End: Original strand, 292 - 584
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||| || |||||||| |  || || ||| | |  |||||||| ||||  || ||||| |||||||| ||||    
T  292 gccatcaaagaaaacataagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttcgtacataggaactctgctccactctcttcttccgcagaagaaaaat 391  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| | ||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  |||| |||| |||||| || ||    
T  392 gcaccgtcttgctaaagcaattgatatgaacccggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatccatacctgtcaacggtaaacaaactaagtc 491  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
     | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  492 gacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagatggagtttcaacaaccat 584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 4990 - 4740
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||| ||| | ||||| || || ||||| |||||||    
T  4990 atacacaatctcatactaccatccttcttcttaaccaacaatacaggggctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatcaagtaaatcct 4891  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | ||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||| |||||| ||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  4890 ccaattgtttctttaattcagctaactcggacgccgacatacgagaaggtgccatcgacactggcttcattcccggaacaagatcaattgaaaattcaac 4791  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4790 ctccctctctggtggaacatcaggaatctcatcaggaaaaacttctggaaa 4740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 4684 - 4380
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||| || ||||| |||| ||| ||||| ||   || ||| || ||||||||||||||||    
T  4684 gccatcaaagaaaacattaagatcccatcacgttctaactacttcagctgcttagtagtcaagaactcagctttactttcttcctcagcagaagagaaat 4585  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
      || | ||| |||||||| || || |||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||  |||| || | ||| || | |||    
T  4584 gtaccgtcttactaaaacagttgatatgaacacggttatattctaaccagttcatcccaaggattacatccaaacccgtcaacggcaaacatacaagatc 4485  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
    || |||||| || | | ||||||||||||  ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4484 aacttcaaagtctctaccaaacatagacaaaggacaactcaaacaaacaaaagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcca 4385  T
Q  614 ttcat 618  Q
     ||||    
T  4384 ctcat 4380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 263
Target Start/End: Original strand, 28930 - 29172
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || || || || |||||||    
T  28930 atacacaatctcatgctaccacccttcttcttaactaacaataccggcgctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatccagtaaatcct 29029  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || ||||||||||| ||||| ||||| ||  | |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  29030 ccaactgtttcttcaattcggctaactcggacaccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccgggaacaagatcaattgcaaattcaac 29129  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaact 263  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29130 ctccctctttggtggcacatcaggaatctcatcaggaaaaact 29172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 425 - 618
Target Start/End: Original strand, 29347 - 29540
Alignment:
Q  425 ctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaat 524  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||| || | ||| || | |||||  ||||| |    
T  29347 ctaaaacaattaatatgaacacggttatactctaaccagttcatcccaaagattacatccatacccgtcaacggcaaacatacaagatcaacctcaaagt 29446  T
Q  525 cacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    | | | ||||||||||||  ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  29447 ctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagtgaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccattcat 29540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 4)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 33 - 271
Target Start/End: Original strand, 24631 - 24869
Alignment:
Q  33 atgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttct 132  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  24631 atgctaccatccttcttcttgactaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttct 24730  T
Q  133 tcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctgg 232  Q
    |||| || || || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  24731 tcaattcagctaattcagaagctgacatacgataaggtgccatcgacatcggctttgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccctttctgg 24830  T
Q  233 aggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
     |  |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  24831 tgcaacatcaggaatctcatcaagaaacacttctggaaa 24869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 44318 - 44070
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||| | |||||||| || ||||| |||||||    
T  44318 atacataacctcacgctaccatccttcttcttaaccaacaatatcggcgctccccacggttaaacactcggtcttacaaacttcttatcaagtaaatcct 44219  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || || |||||||| || || ||||| || || |||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||| | || |||||||  || |||||||||||    
T  44218 ccaactggttcttcaattcagctaactcggacgccgacatacgataatgtgccatcgacaccggcttcgttacgggcacaagat-gattgaaaattcaac 44120  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaa 270  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  44119 ctccctctctggtggtacatctggaatcttatcaggaaaaaattatggaa 44070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 315 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 44013 - 43710
Alignment:
Q  315 ccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaata 414  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| | ||| || |||| ||| ||||| ||  |||  || | |||| ||||||| ||||     
T  44013 ccatcaaagaaaacattagaattccatcacgttctaactgcttcaattgtttcgtagtcaagaactcagcttcactctctttttcaacagaagaaaaatg 43914  T
Q  415 cactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatca 514  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||  |||| || | ||| || | |||     
T  43913 cactgtcttactaaagaaattaatatgaacacggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacattcatacccgtcaatggcaaacatactagatcg 43814  T
Q  515 atttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccat 614  Q
    | |||||| |  | | ||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  43813 agttcaaagtatctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactaaacccttagctggagtttcaacaaccatttttccat 43714  T
Q  615 tcat 618  Q
    ||||    
T  43713 tcat 43710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 387 - 605
Target Start/End: Original strand, 24998 - 25216
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24998 caccttctccttcagcagaagaaaaatgcacggtcttactaaagcaattaatatgaacatggttatacttcaaccagttcataccaaggattacatccat 25097  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
     ||  |||| |||| ||||||||| | ||  |||||||| | | || |||||||||  ||||| || ||||| || | ||||||||| | ||||||||||    
T  25098 tcccgtcaacggtaaacaaaccaagttaacctcaaaatctctaccatacatagacaacggacaactcaaacaaaccaaagaagtagttatcgaaccctta 25197  T
Q  587 gctggagtttcgacaacca 605  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  25198 gctcgagtttcgacaacca 25216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 10707 - 10077
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |  | ||||||||| ||| | ||||| ||| | |||||    
T  10707 tgttcaactgacggtaatctatacacaatctcatgctaccatctttcttctttaccaacaacacagtcgctccccacggtaagacactcggtcttacaaa 10608  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  10607 cttcttatcaagtaaatcttctaactgtttcttcagttcagccaactcagatgctgacatacggtatggtgccatcgacaccggctttgttcccggaaca 10508  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    || ||||||||||| || || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| ||    |||||| |||   | |||||||    
T  10507 aggtcaatcgaaaactccacctccctctctaggggcacatcaggaatctcatcaggaaacacctccggaaactcattcaccactggtaacctgtcaatca 10408  T
Q  301 ca--tagat-----------aaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    ||  | |||           ||||| |||||||| ||| |||| |||||  ||||||||||||||||||| |  || || |||| ||| |||||  | ||    
T  10407 cagcttgattttccaacgacaaggatgccatcaaggaatacatcaaaattccatcacgttctaactgcttcatctgtttcgtagtcaagaactcaactcc 10308  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||  || | ||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| | || ||| || |||||     
T  10307 accctcttcttcagcagaagaaaaatgtaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcattcaaaaaataacgtccatt 10208  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||  |||| || | |||||| || || |  |||||||| | | |||||||||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||    
T  10207 cccgtcaacggcaaacaaactaagtctacctcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactgtacccttag 10108  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  10107 ctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 10077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 2848 - 2653
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2848 tgttcaactgacgataatcaatacacaacctcatactaccatctttcttctttacttacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 2749  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccagg 196  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  2748 cttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaacttagctaactcggaagctgacatacgataacgtgccatcgacaccggcttcgttccagg 2653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 4)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18404 - 18141
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  18404 tgttcaactgacgataatcaatgcacaacctcatgctaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacactgggtctaacaaa 18305  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| || || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||||| || |||    
T  18304 cttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagatgctgacatacaataagttgccatcgacaccggcttcgttcctgggaca 18205  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    || || || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  18204 aggtcgatggagaactcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatccggaaatactt 18141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5770 - 5507
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |  || |||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  5770 tgttcaactgacgatagtcaatgcacaacctcatgctaccgtccttcttctttacaaacaacacaggtgctccccacggtgaaacactgggtctaacaaa 5671  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| || ||  | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  5670 cttcttatcaagcaagtcttccgactgtttcttcaattcagctaactcagatgctgacatacgatatggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaaca 5571  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    || || || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | | ||||||||    
T  5570 aggtcgatggagaactcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcacccgaaaaaactt 5507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 395 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 5363 - 5140
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactca 494  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||| ||| | || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||  |||    
T  5363 tcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcaactgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaataacatccatacccgtca 5264  T
Q  495 aaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 594  Q
    | |||||||| || || || |   ||||||| | | ||||||||||||  ||||| |||||| | |||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  5263 acggtagacacactaagtcgaccacaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaagagacaagagaagtagttactgaacccttggctggagt 5164  T
Q  595 ttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||    
T  5163 ttcaacaaccatttctcctttcat 5140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 387 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 18006 - 17775
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||| || || || ||||| || || ||||||||||| || || |||| ||| ||||||||    
T  18006 caccttcttcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcagttgatatgaacttgattatactctaaccaatttattccaaaaataacatccat 17907  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| |||||||| || || || |   ||||||| | | ||||||||| ||   |||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||||     
T  17906 acccgtcaacggtagacacactaagtcgaccacaaaatctctaccaaacatagtcaactgactccttaaacagacaagagaagtagttactgaacccttg 17807  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  17806 gctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 17775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 4787 - 4540
Alignment:
Q  24 cacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctcta 123  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| || || ||||| |||||||| |    
T  4787 cacaacctcatgataccatctttcttcttaaccaacaatatcggcgctccctaaggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatcaagtaaatcctcca 4688  T
Q  124 attgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatc 223  Q
    | |||||||||||||| || | || ||| || |||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4687 actgtttcttcaactcagctagcttagacgccgacatacggtaaggcgccatcgacacaggcttcgtacccagaacaagatcaattgaaaattcaacttc 4588  T
Q  224 cctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  4587 cctttctggcggcacatcaggaatctcatcatgaaaaacttctggaaa 4540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 473 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 8217 - 8070
Alignment:
Q  473 agaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacac--aagagaagt 570  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||  ||||| ||   ||||||||    
T  8217 agaatcacatccataccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaagaacatcgcaaacatacgagagagaagt 8118  T
Q  571 agtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8117 agtcaccgaacgtttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 8070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 425 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 4373 - 4180
Alignment:
Q  425 ctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaat 524  Q
    ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | || |||| ||| || |  || | |||| | |    
T  4373 ctaaaacaattgatatgaacacggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccataccctttaacggtaaacatactatttctacttcatatt 4274  T
Q  525 cacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    | | | ||||||||||||   ||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  4273 ctctaccaaacatagacaattgacatcttaaacaaacaagataagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccactcat 4180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Original strand, 12199 - 12449
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||| | | ||| || || ||||| |||||||    
T  12199 atacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccatggtgaaacacccggtcttataaatttcttatcaaggaaatcct 12298  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || ||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||||| ||| |||||  |||||||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  12299 ccaactgtttcttcaattcagctaactcggacgcagacatacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgttccgggcacaagatcgattgaaaattcaac 12398  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12399 ctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaa 12449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 475 - 618
Target Start/End: Original strand, 12597 - 12740
Alignment:
Q  475 aattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtc 574  Q
    |||||||||||||||  |||| || | |||||| | ||  |||||||| || | | ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  12597 aattacatccatacccgtcaacggcaaacaaacaagattgatttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaacttaaacaaacaagagaagtagtt 12696  T
Q  575 accgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  12697 actgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 12740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 176245 - 175788
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||    
T  176245 atacacaacctcatgctaccatttttcttcttaaccaacaacaccgacgctccc-aaggtgaaacactcgatcttacaaactttttatcaagtaaatcct 176147  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||  |  || |||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  176146 ccaactgtttcttcaactctgctaactcagacgctgacatacggtaagacgctatcgacacaggcttcgtacccggaacaagatcaatggaaaattcaac 176047  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatcac-------------atagat 307  Q
     || || ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| || || ||| |||  |||||||| ||             | |||     
T  176046 ttctctttctgatggcacatcaggaatctcatcagaaaaaacttttgggaaatcacacacaactggtaacttatcaattactgcttgattctcaacagac 175947  T
Q  308 aaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaag 407  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||||| | |||||||  || || ||||| |||| ||| ||| |||| ||||  || |||||| ||||||    
T  175946 aaggacgccatcagagaaaacatcaaaattccatcatgctctaactatttcagctgcttagtagtcaagaaccctgctccactctcttcttcaacagaag 175847  T
Q  408 agaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttc 466  Q
    | ||||| || ||||| ||||||||||||   ||||||||||| ||||  |||||||||    
T  175846 aaaaatataccgacttactaaaacaattataatgaacatggttatacttcaaccagttc 175788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 14591 - 14852
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  14591 tgttcaactgacgataatcaatgcataacctcatggtaccatccttcttcttaaccaacaatactggcgctccccacggtgaaacacttggtattacaaa 14690  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
     || || |||||||| | ||| || ||||||||||| || || |  || || || | |||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  14691 tttattatcaagcaagttctccaactgtttcttcaattcagcaagttcggacgccggcatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaaca 14790  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaac 262  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14791 aggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaac 14852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 5727 - 5563
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |  || ||  |||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  5727 tgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatccttcttcttaaccaacaacactggagc-acccacggtgaaacacttggtctaataaa 5629  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgata 166  Q
    ||  ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||    
T  5628 ctgcttctcaagcaactcctccaactgattcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgata 5563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 94815 - 94185
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||||| || |||||||| ||| | |||||    
T  94815 tgttcaactgacgatagtcaatgcacaacctcatacttccatctttcttctttaccaataacacgggcgccccccacggcgaaacactgggtcttacaaa 94716  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || | ||| |||||  | |||||||| ||||||    
T  94715 cttcttgtcaagcaagtcctccaactgtttctttaactcagccaattcagaagctgacatgcgatacggcgccatcgacactggtttcgttcccggaaca 94616  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||    |||||| ||||| | || ||||    
T  94615 agatcaatcgagaattcaacttctctttctggtggcacgtcaggaatctaatctggaaaaacttcaggaaattcattcaccactggtagtctgtcgatca 94516  T
Q  301 ca-----------ta--gataaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgcc 387  Q
    ||           ||  || || || ||||||||||||||||| | |||  |||| ||||| |||||||| |  || || ||||  | ||||||||| ||    
T  94515 cagcttgattctctaacgacaatgatgccatcaaagaaaacataagaattccatctcgttccaactgcttcaactgtttagtagttagaaactctgcccc 94416  T
Q  388 accttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccata 487  Q
    ||  || |||||  ||||||| || | ||| | |||| |||||||||||||    ||  |||| || |||||||| ||||| || | ||| ||||||||     
T  94415 actctcttcttccacagaagaaaagtgcaccgtcttgttaaaacaattaatacagactcggttatattctaaccaattcatcccgaaaataacatccatc 94316  T
Q  488 ccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttag 587  Q
    ||   ||| |||||||| || ||||| | ||||||||| | | ||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  94315 cccaacaacggtagacacactaaatcgacttcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttagacacaccagagaagtagttactgaacccttag 94216  T
Q  588 ctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  94215 ctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 94185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 264
Target Start/End: Original strand, 114963 - 115208
Alignment:
Q  20 aatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaagg-tgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatc 118  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| ||| |  ||||||||||| || ||||||||||| | | |||||||| || || || || ||    
T  114963 aatacacaacctcatactaccatccttcttctttgccagcaacacaggcgctccccacgggtgaaacacttgctcttacaaacttcttgtcgagtaagtc 115062  T
Q  119 ctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattca 218  Q
    |||||| || ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||  || || ||||| || || || |||    
T  115063 ctctaactgattcttcaactcagcaagttcggatgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcttggtactagatcgatggagaactca 115162  T
Q  219 acatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  115163 acctccctttctggtggtacatctggaatctcatccgaaaaaactt 115208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 618
Target Start/End: Original strand, 115404 - 115575
Alignment:
Q  447 ggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacagggg 546  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||  || |||||||| ||  |||  ||||  ||||| ||||| | ||||||||| | | |||||||||| |  ||    
T  115404 ggttatactctaaccaattcatcccaaatataacatccatccccgtcagtggtaagcaaactaaatctacttcaaaatccctaccaaacatagatatagg 115503  T
Q  547 acatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  115504 acatatcaaacaaacaagagaagtagtcactgaacccttagctggagtttcaacgaccatttctcctttcat 115575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 107732 - 107681
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttctt 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||||||    
T  107732 tgttcaactgtcgataattaatacataaccgcatactaccatctttcttctt 107681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Original strand, 29352 - 29587
Alignment:
Q  36 ctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||||| ||| | |||||||| || || | ||  ||||| || ||||||||||    
T  29352 ctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgccccccaaggtgaaacactgggtcttacaaacttcttatccaacaggtcctccaactgtttcttca 29451  T
Q  136 actcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggagg 235  Q
    | || || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||    
T  29452 aatcagctaactcagaagctgacatacggtatggtgccatcgacaccggcttcgttcctgtaacaagatcaattgaaaattcaatctccctctctggtgg 29551  T
Q  236 cacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  29552 cacatcaggaatctcatcaggaaacacttctggaaa 29587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 452 - 606
Target Start/End: Original strand, 29781 - 29935
Alignment:
Q  452 tactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatc 551  Q
    |||||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||||   ||| || |||||||| |||||||   ||||||| | | |||||||||| |  ||||| |    
T  29781 tactctgaccaattcattccaaaaatcacatccatacccaacaacggcagacaaactaaatcaaccacaaaatctctaccaaacatagatataggacacc 29880  T
Q  552 ttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
      | ||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29881 ccagacaaacaagagaagtggttcttgaacccttagctggagtttcaacaaccat 29935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31572 - 31340
Alignment:
Q  27 aaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaatt 126  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || |  ||||| |||||||| |    
T  31572 aacctcatactaccatctttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttgttgagcaagtcctctaact 31473  T
Q  127 gtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccct 226  Q
    ||||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||| ||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||    
T  31472 gtttcttcaactcagcaagttcggatgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacctctct 31373  T
Q  227 ctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaa 259  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31372 ctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaa 31340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 54332 - 54087
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||    
T  54332 tgttcaactgacgataatcaatgcacaacctcatactaccgtccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccaaggcaaaacacttggtcttacaaa 54233  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||  || || || |||||| |||| || || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||  || ||||||| ||||||    
T  54232 cttcttatcaagcaggtcttccaactgtttcctcaattcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcatcgttcccggaaca 54133  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaa 246  Q
    || | ||| ||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  54132 aggttaattgaaaattcaacttgcctttctggtggcacatcaggaa 54087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 395 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 53937 - 53714
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactca 494  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||  |||    
T  53937 tcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaactaattcattccaaaaataacatccatacccgtca 53838  T
Q  495 aaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 594  Q
    | || | |||||| || || | |||||| || | | ||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53837 acggcaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacatctcaagcaaacaagagaagtagtcactgaacccttagctggagt 53738  T
Q  595 ttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||    
T  53737 ttcaacaaccatttctcctttcat 53714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 31191 - 31112
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaag 474  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  31191 tcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaaacaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcataccaag 31112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 96; Significance: 9e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 720 - 485
Alignment:
Q  36 ctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| || || | ||| ||||| || ||||||||||    
T  720 ctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccagggtgaaacactgggtcttacaaacttcttatctaacaagtcctccaactgtttcttca 621  T
Q  136 actcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggagg 235  Q
    | || || |||||| |||||||| |||| || ||||  || |||||  |||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  620 attcagctaactcataagctgacgtacggtatggtgctatcgacaccggctttgttcctggaacaaggtctattgaaaattcaacctccctctctggtgg 521  T
Q  236 cacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  520 cacatcaggaatctcatcaggaaacacttctggaaa 485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 356 - 125
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||  || | ||| ||||| || || || |||||  |||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||    
T  356 caccttcttcttcagcagaagaaaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcggttatactctaaccaattcataccaaaaatcacattcat 257  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||   ||| || | |||||| ||||| |   |||| || | | |||||||||| |  ||||| |  ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||    
T  256 acccgacaacggcaaacaaactaaatccaccacaaagtccctaacaaacatagatataggacaccccaaacaaacaagagaagtagttactaaaccctta 157  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  156 gttggagtttcaacaaccatttctcctttcat 125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 96; Significance: 9e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Original strand, 16517 - 16760
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||  || || || || |||||||    
T  16517 atacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccacggtgaaacactcggtcttacaactttcttatccagtaaatcct 16616  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || ||||||||||| || || | |||||  || |||||||| ||||||| ||| |||||  |||||||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  16617 ccaactgtttcttcaattcagctagctcaggcgccgacatacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgttccgggcacaagatcgattgaaaattcaac 16716  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16717 ctccctctctggtggcacatctggaatctcatcagcaaaaactt 16760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 7782 - 7617
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||  | ||||| |||||||| |||||||| |  || || ||||| ||||||||||||||  ||| |||    
T  7782 tgttcaactgttgataatccacacacaacctcatatttccatctttcttcttaaccaacaatacgggagcaccccacggtgaaacacttggcctaataaa 7683  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgata 166  Q
    ||  ||||||||||| || || || ||||||||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||    
T  7682 ctgcttctcaagcaactcttccaactgtttcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgata 7617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 96; Significance: 9e-47; HSPs: 5)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 262
Target Start/End: Original strand, 5136 - 5395
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    ||||||||||| |||| ||| || ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  5136 ttcaactgtcggtaatcaatgcataacctcatggtaccatcattcttcttaaccaacaacaccagcgctccccaaggtgaaacactttgtcttacaaact 5235  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || |||||||| ||||| || | ||||||||| || || |  || || || |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||    
T  5236 tcttatcaagcaagtcctccaactatttcttcaattcagcaagttcggacgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaag 5335  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaac 262  Q
     ||||| ||||||||||| || |||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5336 gtcaattgaaaattcaacctcactctcaagtggcacatctggaatctcatcaggaaaaac 5395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 42028 - 41743
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| | || ||||||||||||||| ||||| | | | |||||    
T  42028 tgttcaactgccggtaatctatacacaacttcatgctaccatctttcttcttaaccaacaacaccgacgctccccaaggtgacacactcgatctcacaaa 41929  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || || | |||||| ||||| |  || |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||  | |||| |    
T  41928 cttcttatccaacaaatcgtctaactactttttcaactcagctaattccgaagctgacatacggtaaggtgccatcgacacatgcttcgtatctggaata 41829  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttg 286  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| |    ||||||||||| |||||||| ||||||| | |||| || || ||||||||    
T  41828 acatcaatcgaaaattctacatccctctctagctttacatcaggaatttcatcagggaaaacttctagaaattcacacaccacttg 41743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 541
Target Start/End: Original strand, 5460 - 5687
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||| || || |||||||| |  || || ||||| |  ||||| || ||||  || ||||| | |||||| ||||    
T  5460 gccatcaaagaaaacattaagattccatcccgctccaactgcttcaactgtttcgtagataggaactccgctccactctcttcttccgtagaagaaaaat 5559  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||||| ||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||  |||| |||| |||||| || ||    
T  5560 gcactgtcttgctaaagcaattgatatgaacccggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccatacccgtcaacggtaaacaaactaagtc 5659  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagac 541  Q
     | |||||| || | | |||||||||||    
T  5660 gacttcaaagtctctaccaaacatagac 5687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 531 - 606
Target Start/End: Original strand, 5731 - 5806
Alignment:
Q  531 caaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5731 caaacatagacaacggacatcttagacaaacaagagaagtagttactgaacccatagctggagtttcaacaaccat 5806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 565 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 41452 - 41399
Alignment:
Q  565 agaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||    
T  41452 agaagtagtcaccgaacccttagccgaagtttcgacaaccatttccccattcat 41399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 96; Significance: 9e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 262609 - 262872
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||    
T  262609 tgttcaactgacggtaatatatacacaacctcatgctaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacactgggtcaaacaaa 262708  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || |||||||| || || || | ||||||||| || || |||||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||   |||| ||||| ||||||    
T  262709 cttcttatcaagcaagtcttccaactttttcttcaattcagctaactcagaggctgacatacggtacggtgccatcgacatcggctttgttcccggaaca 262808  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  262809 aggtcaatggaaaactcaacctccctgtctggtggcacgtctggaatctcatccggaaaaactt 262872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Original strand, 262935 - 263239
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||| |||||| |||| | |||  ||||||||||||||||||| |  || || |||| ||| |||||  | ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  262935 gccattaaagaatacatcagaattccatcacgttctaactgcttcatctgtttcgtagtcaagaactcaactccaccctcttcttcagcagaagaaaaat 263034  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
      || | ||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||| ||  |||| || | |||||| || ||    
T  263035 gtaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaataacgtccattcccgtcaacggcaaacaaactaagtc 263134  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
     |  |||||||| | | |||||||||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  263135 tacctcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcct 263234  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  263235 ttcat 263239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 95; Significance: 4e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 96 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 126595 - 126489
Alignment:
Q  96 acaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccag 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  126595 acaaactttttctcgagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccgg 126496  T
Q  196 gaacaag 202  Q
    |||||||    
T  126495 gaacaag 126489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9380 - 9119
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| ||||| | ||| |||||| | || |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  9380 ttcaactgacgatagtcaatgcacaacttcatactaccatcctccttctttaccaacaaaaccggcgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaact 9281  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || |||||||| || || ||  ||||||||||||| || |  |  || || |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||     
T  9280 tcttatcaagcaagtcttccaaccgtttcttcaactcagcaagttaggacgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaac 9181  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
     ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  9180 gtcaattgaaaattcaacctctctctccggtggcacatctggaatctcgtcaggaaaaactt 9119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19594 - 19333
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| ||||| | ||| |||||| | || |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  19594 ttcaactgacgatagtcaatgcacaacttcatactaccatcctccttctttaccaacaaaaccggcgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaact 19495  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || |||||||| || || ||  ||||||||||||| || |  |  || || |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||     
T  19494 tcttatcaagcaagtcttccaaccgtttcttcaactcagcaagttaggacgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaac 19395  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
     ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19394 gtcaattgaaaattcaacctctctctccggtggcacatctggaatctcgtcaggaaaaactt 19333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 395 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 8975 - 8753
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactca 494  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||| |||| || |||| ||| || ||||| ||  |||    
T  8975 tcttcaacagaaga-aaatgcactgtcttgctaaaacaattgatatgaacccggttatactctaactagtttatcccaaaaataacgtccattcctgtca 8877  T
Q  495 aaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 594  Q
    | |||| ||| || | ||| | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8876 acggtaaacacactagatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacacacaagagaagtagttactgaacccttagctggagt 8777  T
Q  595 ttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||    
T  8776 ttcaacaaccatttctcctttcat 8753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 395 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 19189 - 18967
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactca 494  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||| |||| || |||| ||| || ||||| ||  |||    
T  19189 tcttcaacagaaga-aaatgcactgtcttgctaaaacaattgatatgaacccggttatactctaactagtttatcccaaaaataacgtccattcctgtca 19091  T
Q  495 aaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 594  Q
    | |||| ||| || | ||| | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19090 acggtaaacacactagatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacacacaagagaagtagttactgaacccttagctggagt 18991  T
Q  595 ttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||    
T  18990 ttcaacaaccatttctcctttcat 18967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 93; Significance: 6e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13216 - 13016
Alignment:
Q  71 tccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggt 170  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||| || || ||||||||  |||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||    
T  13216 tccccacggtgaaacacttggtcttacaaatttcttatcaagcaagacctccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtatggt 13117  T
Q  171 gtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaa 270  Q
    | ||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13116 gccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcattaggaaaaacttctggaa 13017  T
Q  271 a 271  Q
    |    
T  13016 a 13016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21395 - 21196
Alignment:
Q  71 tccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggt 170  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||| || || ||||||||  |||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  21395 tccccacggtgaaacacttggtcttacaaatttcttatcaagcaagacctccaactgtttcttcaattcagctaactcggaagc-gacatacggtaaggt 21297  T
Q  171 gtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaa 270  Q
    | ||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21296 gccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcattaggaaaaacttctggaa 21197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 421 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 12834 - 12639
Alignment:
Q  421 cttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttca 520  Q
    ||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    ||  || |||| |||||| |  || | ||||    
T  12834 cttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaatcacatccaagagac--aacggtaaacaaactaggtcgacttca 12737  T
Q  521 aaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    || || | | ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  12736 aagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagttggagtttcaacaaccatttctcctttcat 12639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 421 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 21014 - 20831
Alignment:
Q  421 cttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttca 520  Q
    ||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    ||  || |||| |||||| |  || | ||||    
T  21014 cttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaatcacatccaagagac--aacggtaaacaaactaggtcgacttca 20917  T
Q  521 aaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
    || || | | ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20916 aagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 20831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 465 - 618
Target Start/End: Original strand, 1 - 154
Alignment:
Q  465 tcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaag 564  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||| |  |||||||| ||||| || ||    
T  1 tcatacccagaatcacatccataccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcatgaccaaacatagataaaggacatctcaaacatacgag 100  T
Q  565 agaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  101 agaagtagtcaccaaacccttagctgaagtttcgacgaccatctctccattcat 154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 69 - 264
Target Start/End: Original strand, 11260 - 11455
Alignment:
Q  69 gctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataag 168  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || || | ||  ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |    
T  11260 gctccccaaggtgaaacactaggtcttacaaacttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacggtacg 11359  T
Q  169 gtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    ||| ||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11360 gtgccatcgacaccggcttagttcccggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccctctctagtggcacatcaggaatctcatcaggaaacactt 11455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 387 - 606
Target Start/End: Original strand, 11591 - 11810
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||  || | ||| ||||| || || || |||||  | || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  11591 caccttcttcctcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaacccgattatactctaaccaattcataccaaaaatcacatccat 11690  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| || |||||||| ||||||||  ||||||| | | |||||||||| |  ||||| |  | ||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  11691 acccgtcaacggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaaccctta 11790  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  11791 gctggagtttcaacaaccat 11810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 19757 - 19992
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| || || |||||||| || |    
T  19757 atacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccacggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatcaagcaagtctt 19856  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaac 220  Q
    | || |||||||||||||| || ||||| ||  | |||||||| || |||| ||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||  ||    
T  19857 ccaactgtttcttcaactcagctaactcggacaccgacatacggtatggtgccattgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattttac 19956  T
Q  221 atccctctctggaggcacatcaggaatctcatcagg 256  Q
     |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  19957 ctccctctctggtagcacatctggaatctcatcagg 19992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 84439 - 84157
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| | |||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||||||||  | ||||||||  | |||||||    
T  84439 ttcaactgcctataatctatacataacctcatgctaccatctttcttcttaaccaataacaccggcgctccccaaggcaacacacttggccttacaaact 84340  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || |||| |||||| ||||| || || |||||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| || |||| |||    
T  84339 tcttatcaaacaaatcttctaactgctttttcaactcagctaattcggaagctgacatacggtaaggtgtcatagaaacaggtttcgtacccggaataag 84240  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttg 286  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||| ||||  || ||||||| |||||| || || ||||||||    
T  84239 atcaatagaaaattctacttccctctctggtggcacattaggaatttcatttgg-aaaacttctggaaactcgcacaccacttg 84157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 268993 - 269125
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |  || |||||||| || |||||||| ||| | |||||    
T  268993 tgttcaactgacgatagtcaatgcacaacctcatacttccatctttcttcttcaccaataacacgggtgctccccacggcgaaacactaggtctcacaaa 269092  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttctt 133  Q
    ||| || |||||||| ||||| || ||||||||    
T  269093 cttcttatcaagcaagtcctccaactgtttctt 269125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2111 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold2111
Description:

Target: scaffold2111; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 485 - 245
Alignment:
Q  24 cacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctcta 123  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || || || ||||||||||    
T  485 cacaacctcatactaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttgtcgagtaaatcctcta 386  T
Q  124 attgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatc 223  Q
    | | |||||| ||||| || | ||| || || |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| || || ||||| || || || ||||| ||    
T  385 actatttctttaactctgcaagctcggatgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggtactagatcgatggagaactcaacctc 286  T
Q  224 cctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  285 cctttctggtggtacatctggaatctcatccggaaaaactt 245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 1382 - 1682
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |  | ||||||||||||||| ||||| ||| | |||||    
T  1382 tgttcaactgccgataatctatacaaaacctcatgctaccatctttcttcttaaccaacaacactgacgctccccaaggtgacacactcggtcttacaaa 1481  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || || |||||||| ||||| || || |||||||| |  || |  |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| || |||| |    
T  1482 cttcttatccagcaaatcttctaactgctttttcaactcagttaatttcgaagctgacatacggtaaggtgccatcgacacaggcttcgtacctggaata 1581  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaaatctcataccacttgtagtttatcaatca 300  Q
    ||||| || |||||||| || | | ||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||| || ||| || || |||||||| |  ||||||||||    
T  1582 agatctatagaaaattctactttcatctctggcggtacatcaggaatttcgtcagggaaaacttctgaaaattcacacaccacttgcaacttatcaatca 1681  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  1682 c 1682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 618
Target Start/End: Original strand, 1959 - 2012
Alignment:
Q  565 agaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  1959 agaagtagtcaccgaacccttagctggggtttcgacaaccatttccccattcat 2012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 25498 - 25758
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||||||    |||||||| |  ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||    
T  25498 tgttcaactgacgatagtcaatgcacaatctcatactaccatccttcttt---accaacaacacaggcgctccccatggcgaaacactgggtcttacaaa 25594  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaaca 200  Q
    ||| || ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||  | |||||||| ||||||    
T  25595 cttcttatcatgcaagtcctccaactgtttcttcaactcggataattcagaagctgacatgcgatacggtgccatcgacaccggtttcgttcccggaaca 25694  T
Q  201 agatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |  ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25695 agatcaatcgagaactcaacttcccttttcggtagcacatcaggaatctcatccggaaaaactt 25758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Original strand, 25821 - 26125
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||| ||||| |||||||| |  || || ||||  | ||||||||| ||||  |  ||||| | |||||| || |    
T  25821 gccatcaaagaaaacataagaattccatctcgttccaactgcttcaactgtttagtagttagaaactctgctccactatgttcttccgaagaagaaaagt 25920  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| | |||| |||||||||| ||   |||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||||||| ||  |||| |||||||| || || ||    
T  25921 gcaccgtcttgttaaaacaatttatacaaactcggttatactctaaccaattcatcccgaaaataacatccattcccatcaacggtagacacactaagtc 26020  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcca 613  Q
     |  |||||||| | | ||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||     
T  26021 gacctcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacaaactagagaagtagttactgaacccttggctggagtttcaacaaccatttctcct 26120  T
Q  614 ttcat 618  Q
    |||||    
T  26121 ttcat 26125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 232
Target Start/End: Original strand, 43303 - 43532
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |    
T  43303 ttcaactgacgatagtcaatgcataacctcatgctactgtccttcttctttaccaacaataccaacgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaaat 43402  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || |||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||    
T  43403 tcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcccggaacaag 43502  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctgg 232  Q
     ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  43503 gtcaattgaaaactcaaccttcctctctgg 43532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4089 - 3828
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| || || | ||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  4089 ttcaactgacggtagtcaatgcacaacctcatactaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaact 3990  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || || || | ||| ||||| |||||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| || || ||    
T  3989 tcttgtcgagtagatcttctaactgtttcttcaactcagcaagttcggatgccgacatacgataaggtgtcatcgacaccggcttcgttcctggtactag 3890  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    ||| || || || ||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||    
T  3889 atcgatggagaactcaacctccctctctggtggtacgtctggaatttcatctggaaaaactt 3828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 395 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 3684 - 3461
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactca 494  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | ||||||||| || || || |||||   ||| ||||||||||| ||||| ||||  || |||||||| ||  |||    
T  3684 tcttcagcagaagaaaaatgcacggtcttgctaaagcagttgatatgaactcagttatactctaaccaattcatcccaaatatcacatccatccctgtca 3585  T
Q  495 aaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 594  Q
      ||||  ||||| || || | ||||||||| | | |||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3584 gtggtaagcaaactaagtctacttcaaaatccctaccaaacatagatataggacatctcaaacaaacaagagaagtagtcactgaacccttagctggagt 3485  T
Q  595 ttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||    
T  3484 ttcaacgaccatttctcctttcat 3461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Original strand, 905 - 1086
Alignment:
Q  21 atacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcct 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| | ||| | ||||| || || ||||| |||||||    
T  905 atacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccacggtgaaacattcggtcttacaaatttcttatcaagtaaatcct 1004  T
Q  121 ctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || |||||||||||||| || ||||| ||   ||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||    
T  1005 ccaactgtttcttcaactcagctaactcggacattgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccgggaacaag 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 314 - 618
Target Start/End: Original strand, 5310 - 5615
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatca-tcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaa 412  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  || ||||||||||||||||| |  || || |||| ||| ||||| ||  | |  || |||||| ||||||| |||    
T  5310 gccatcaaggaaaacattaagatcccaatcacgttctaactgcttcaactgtttagtaggcaagaactcagcttcgctctcttcttcaacagaagaaaaa 5409  T
Q  413 tacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaat 512  Q
    |  || | ||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||   ||| || | ||| || | ||    
T  5410 tgtaccgtcttactaaagcaattaatatgaacacggttatactctaaccaattcatcccaaaaattacatccatgcccgacaacggcaaacatactagat 5509  T
Q  513 caatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 612  Q
      | |||||| || | | ||||||||||||  |||||  | ||||| | |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5510 tgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaagtcaaacaaataagagaagtagttactaaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 5609  T
Q  613 attcat 618  Q
    ||||||    
T  5610 attcat 5615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 271
Target Start/End: Original strand, 5181 - 5254
Alignment:
Q  198 acaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  5181 acaaggtcaattgaaaattcaacctccctttcaggtggcacatcaggaatctcatcaggaaaaagttctggaaa 5254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Original strand, 21236 - 21497
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaact 102  Q
    |||||||| ||||| | ||| || | ||| || ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  21236 ttcaactgacgatagtcaatgcatagcctcatactaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaact 21335  T
Q  103 ttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaag 202  Q
    | || || || |||||| | || |||||||||||||| || |  || || ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| || |||||    
T  21336 tcttgtcgagaaaatccaccaactgtttcttcaactcagcaagttcggatgctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggtacaag 21435  T
Q  203 atcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
     ||||| ||||||||||  || || ||||| || || || ||||||||||| | ||||||||    
T  21436 gtcaattgaaaattcaatctctctttctggtggtacgtctggaatctcatccgaaaaaactt 21497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 386 - 618
Target Start/End: Original strand, 21632 - 21864
Alignment:
Q  386 ccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatcca 485  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||| ||| | |||| |||| || || || |||||  |||| ||||||||||| || || |||| ||| |||||||    
T  21632 ccaccctcttcttcagcagaagaaaaatgcacggtcttgttaaagcagttgatatgaactcggttatactctaaccaattaatcccaaaaataacatcca 21731  T
Q  486 taccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctt 585  Q
    | ||  |||  |||| |||||| || || |  |||||||| | | | |||||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21732 ttcccgtcagcggtaaacaaactaagtctacctcaaaatccctaccgaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagtcactgaaccctt 21831  T
Q  586 agctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  21832 agctggagtttcaacgaccatttctcctttcat 21864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 524 - 618
Target Start/End: Original strand, 8329 - 8423
Alignment:
Q  524 tcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8329 tcacgatcaaacatagacaaaggacatctcaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttaactggagtttcgacaaccatttctccattcat 8423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 400 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 1820 - 1608
Alignment:
Q  400 agcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggt 499  Q
    ||||||||| |||| ||  | ||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||    
T  1820 agcagaagaaaaatgcatcgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgtcaacggt 1721  T
Q  500 agacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcga 599  Q
    | |||||| | ||| | |||||| || | | ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |    
T  1720 aaacaaacaagatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtaattaccgaacccttagctggagtttcaa 1621  T
Q  600 caaccatctctcc 612  Q
    ||||||| |||||    
T  1620 caaccatttctcc 1608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 447 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 1345 - 1174
Alignment:
Q  447 ggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacagggg 546  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  |||| |||| |||||| || || | |||||| || | | ||||||||||||  ||    
T  1345 ggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatccatacccgtcaacggtaaacaaactaagtccacttcaaagtctctaccaaacatagacaacgg 1246  T
Q  547 acatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  1245 acatcttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 1174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 531 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 8117 - 8033
Alignment:
Q  531 caaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccatt 615  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8117 caaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagttttcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccatt 8033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 395 - 606
Target Start/End: Original strand, 6828 - 7039
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactca 494  Q
    ||||| ||| |||| |||| ||| | ||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||  |||    
T  6828 tcttccgcaaaagaaaaatgcaccgtcttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatccattcccgtca 6927  T
Q  495 aaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 594  Q
    | |||| ||| || || || | || ||| || | | ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  6928 acggtaaacacactaagtcgactttaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacacacaagagaagtagttactgaacccttagctggagt 7027  T
Q  595 ttcgacaaccat 606  Q
    ||| ||||||||    
T  7028 ttcaacaaccat 7039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 314 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 9821 - 9533
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||||||||||||||||| |||  | ||||| || ||||||||||  |  || ||||| |  |||||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||    
T  9821 gccatcaaagaaaacattagaattccgtcacgctccaactgctttaactatttcgtagataggaactctgctccactttcttcttccgcagaagaaaaat 9722  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatc 513  Q
     ||| | ||||||||||||||| || |||||  |||| || |||||||||||||| | || ||| |||||||| ||  |||| |||| |||||| || ||    
T  9721 gcaccgtcttgctaaaacaattgatatgaactcggttatattctaaccagttcatccaaaaaataacatccat-cccgtcaacggtaaacaaactaagtc 9623  T
Q  514 aatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaac 603  Q
     | || ||  || | | ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  9622 gactttaatgtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaac 9533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 9979 - 9877
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  9979 tgttcaactgacgataatcaatgcataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaa 9880  T
Q  101 ctt 103  Q
    |||    
T  9879 ctt 9877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 510 - 618
Target Start/End: Original strand, 7141 - 7249
Alignment:
Q  510 aatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctc 609  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |  |||||  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7141 aatccatttcaaaatcacgaccaatctcagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctc 7240  T
Q  610 tccattcat 618  Q
    |||||||||    
T  7241 tccattcat 7249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 395 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 65812 - 65589
Alignment:
Q  395 tcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactca 494  Q
    |||||||||||||| ||||  || | ||| ||||| ||||| || |||||  | || ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||  |||    
T  65812 tcttcagcagaagaaaaatgtaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcgattatactctaaccaattcattccaaaaataacatccatacccgtca 65713  T
Q  495 aaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 594  Q
    | || | ||| || || |||| ||||||||| | | ||||||| || |  ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  65712 acggcaaacatactaagtcaacttcaaaatctctaccaaacatggatataggacaccttaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagt 65613  T
Q  595 ttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||    
T  65612 ttcaacaaccatttctcctttcat 65589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 46934 - 46841
Alignment:
Q  22 tacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaa 115  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||| || || ||||||||    
T  46934 tacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcactccccacggtgaaacacttggtcttacaaatttcttatcaagcaa 46841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 55768 - 55681
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacact 88  Q
    |||| ||||| || |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |  ||||||||||| |||||||||||    
T  55768 tgtttaactgacggtaatcaatgcacaacctcatgctaccatccttcttctttaccaacagcacaggcgctccccacggtgaaacact 55681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 23326 - 23239
Alignment:
Q  184 gcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatggaaa 271  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23326 gcttcgtacccggaacaagatcaattgaaaattcaacctccctctctggcggcacatcaggaatttcatcagggaaaacttatggaaa 23239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 23183 - 23047
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||| |||||| || || || |||| ||| ||||| ||   ||  || || ||||||||||| ||||    
T  23183 gccattaaagaaaacattaagatcccatcacattctagctgcttcagctgtttagtagtcaagaactcagctttactctcttcctcagcagaagaaaaat 23084  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggtt 450  Q
     ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  23083 gcactgtcttactaaaacaattgatatgaacatggtt 23047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 447 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 1316 - 1145
Alignment:
Q  447 ggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacagggg 546  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |   |||| |||| ||| || || || | |||||| || | | ||||||||||||  ||    
T  1316 ggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatccattctcgtcaacggtaaacacactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacgg 1217  T
Q  547 acatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  1216 acaccttagacacacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 1145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 404 - 603
Target Start/End: Original strand, 919 - 1118
Alignment:
Q  404 gaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagac 503  Q
    ||||| |||| ||| | ||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  |||| |||| ||    
T  919 gaagaaaaatgcaccgtcttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatccatacccgtcaacggtaaac 1018  T
Q  504 aaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaac 603  Q
    |||| || || | |||||| || | | ||||||||||||   |||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||    
T  1019 aaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacagacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttaactggagtttcaacaac 1118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 308 - 474
Target Start/End: Original strand, 16476 - 16643
Alignment:
Q  308 aaggaagccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaag 407  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| || || ||||| |||| |||||||||||| ||||  || |||| ||||||||    
T  16476 aaggacgccatcaaagaaaacatcaagattccatcacgctctaactgtttcagctgcttagtagtcaaaaactctgctccactctcttcttaagcagaag 16575  T
Q  408 -agaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaag 474  Q
     | ||||| || || ||  ||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  16576 aaaaaatataccgatttattaaaacaattaatatgaacatgattatactccaaccagttcataccaag 16643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 563 - 618
Target Start/End: Original strand, 424266 - 424321
Alignment:
Q  563 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  424266 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 424321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 518 - 618
Target Start/End: Original strand, 203294 - 203394
Alignment:
Q  518 tcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattca 617  Q
    |||||||| | | |||||||||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  203294 tcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 203393  T
Q  618 t 618  Q
    |    
T  203394 t 203394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 264
Target Start/End: Original strand, 1 - 107
Alignment:
Q  158 catacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcagga 257  Q
    |||||| || |||| ||| |||||  |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1 catacggtatggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacgaggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcagga 100  T
Q  258 aaaactt 264  Q
    || ||||    
T  101 aacactt 107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 387 - 606
Target Start/End: Original strand, 243 - 462
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||| ||| | || || || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| || |||||    
T  243 caccttcttcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactatagcagttgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaatcacctccat 342  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||  |||| |||| |||||| |||||||   ||||||| | | |||||||||| |  ||||| |  | ||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  343 acccgtcaacggtaaacaaactaaatcaaccacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccccagacaaacaagagaagtagttactgaaccctta 442  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccat 606  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  443 gctggagtttcaacgaccat 462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 554 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 1124 - 1060
Alignment:
Q  554 aaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1124 aaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctagagtttcgacaaccatctctccattcat 1060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 566 - 618
Target Start/End: Original strand, 1 - 53
Alignment:
Q  566 gaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 gaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 53  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 4)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5879 - 5728
Alignment:
Q  117 tcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaatt 216  Q
    ||||| || ||||||||||| || || |||||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||  |||||| ||| |||||||| ||||  |||||||    
T  5879 tcctccaactgtttcttcaattcagctaactcgaaagctgacatacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgctcctggaacaaggtcaagtgaaaatt 5780  T
Q  217 caacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatgg 268  Q
    |||| |||||| | |  || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  5779 caacctccctcccagatgggacatctggaatctcatcagaaaaaacttatgg 5728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 9873 - 9784
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggt 92  Q
    |||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9873 ttcaactgacgataatcaatgcataacctcatgctaccgtccttcttcttaaccagcaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggt 9784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 17540 - 17451
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggt 92  Q
    |||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17540 ttcaactgacgataatcaatgcataacctcatgctaccgtccttcttcttaaccagcaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggt 17451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 5669 - 5521
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    ||||||||||||||||| | |||  | ||||| || |||||||| |  || || ||||| |  ||||| || ||||  || |||||||||||||| ||||    
T  5669 gccatcaaagaaaacataagaattccgtcacgctccaactgcttcaactgtttagtagataggaactcagctccactctcttcttcagcagaagaaaaat 5570  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaacca 462  Q
     ||| | ||||||||| ||||| || |||||  |||| |||||||||||    
T  5569 gcaccgtcttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaacca 5521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 51; Significance: 7e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 452 - 618
Target Start/End: Original strand, 1568 - 1734
Alignment:
Q  452 tactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatc 551  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | || || | ||| || | ||| | |||||| || | | ||||||||||||| ||| | |    
T  1568 tactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgttaacggcaaacatactagatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacagtggaaaac 1667  T
Q  552 ttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    | ||||| | || ||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  1668 tcaaacaaagaaaagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaagaaccatttctccattcat 1734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 377 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 5741 - 5512
Alignment:
Q  377 aactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaa 476  Q
    |||||||| ||||  || ||||| |||||||| |||| ||| | || ||||||  || | || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  5741 aactctgctccactctcttcttccgcagaagaaaaatgcaccgtctggctaaagaaactgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaa 5642  T
Q  477 ttacatccataccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcac 576  Q
    | | |||||||||  |||| |||| ||| || || || | || ||| || | | ||||||||||||   |||| |||| ||| |||||||||||||| ||    
T  5641 taatatccatacccgtcaacggtaaacagactaagtcgactttaaagtctctaccaaacatagacaacagacaccttagacaaacaagagaagtagttac 5542  T
Q  577 cgaacccttagctggagtttcgacaaccat 606  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5541 tgaacccttagctggagtttcaacaaccat 5512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 15293 - 15458
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |  || |||| ||| ||||||| ||||||| ||| |||    
T  15293 tgttcaactgccgataatccacacacaacctcatacttccatctttcttcttaaccaacaacactggagctctccacggtgaaatacttggtctaataaa 15392  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgata 166  Q
    || |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||    
T  15393 ctgtttctcaagcaactcttctaactgtttcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgata 15458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 11095 - 10930
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||| || |||||||  | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |   | || ||||| || |||||||||||| ||| |||    
T  11095 tgttcaagtgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactagagcaccccacggcgaaacacttggtctaataaa 10996  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgata 166  Q
    ||  |||||||  || || ||||| ||||||||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||    
T  10995 ctgcttctcaaataactcttctaactgtttcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgata 10930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 398 - 606
Target Start/End: Original strand, 41528 - 41736
Alignment:
Q  398 tcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaag 497  Q
    ||||||||||||||||  || | ||| ||||| || || || |||||  | || || |||||||| ||||||||||  || |||||||||||  |||| |    
T  41528 tcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcgattatattctaaccaattcataccaaagataacatccatacccgtcaacg 41627  T
Q  498 gtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 597  Q
    | |||||||| ||||||||  ||||||| | | ||||||| || | |||||| |  | ||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  41628 gcagacaaactaaatcaatcacaaaatccctaccaaacatggatatgggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttc 41727  T
Q  598 gacaaccat 606  Q
     ||||||||    
T  41728 aacaaccat 41736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 531 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 1193 - 1106
Alignment:
Q  531 caaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  1193 caaacatagacaacggacatcttagaaaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 1106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 567 - 618
Target Start/End: Original strand, 14873 - 14924
Alignment:
Q  567 aagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14873 aagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctccattcat 14924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Original strand, 8758 - 8823
Alignment:
Q  3 ttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggc 68  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||    
T  8758 ttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaaccggc 8823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 314 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 4845 - 4670
Alignment:
Q  314 gccatcaaagaaaacattaaaatatcatcacgttctaactgctttagttgcttggtagacaaaaactctgcgccaccttcctcttcagcagaagagaaat 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| |  || || |||| ||  ||||| ||  |||  || || ||||||||||| ||||    
T  4845 gccaacaaagaaaacattaaaatcccatcacgctctacctgcttcaactgtttcgtagtcacgaactcagcttcactctcttcctcagcagaagaaaaat 4746  T
Q  414 acactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatacc 489  Q
      |  | ||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  4745 gtatcgtcttactaaaacaattaatatgaacacggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacc 4670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 554 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 4659 - 4595
Alignment:
Q  554 aaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  4659 aaacatactagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccattcat 4595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 38033 - 38124
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggt 92  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38033 tgttcaactgacgataatcaatgcataacctcatagtaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgttccccaaggtgaaacacttggt 38124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 387 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 67630 - 67399
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||| || || || |||||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| || |||||    
T  67630 caccttcttcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccgaaaataacgtccat 67531  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||   ||| || |  ||||| | |||||   ||||||| | | |||||||||| |  ||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  67530 acccgacaacggcaagcaaactagatcaaccacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccccaaacaaacaagagaagtagttactgaaccctta 67431  T
Q  587 gctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  67430 gctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 67399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 67826 - 67766
Alignment:
Q  204 tcaatcgaaaattcaacatccctctctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactt 264  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  67826 tcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatttcatcaggaaacactt 67766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 25779 - 25944
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  || || ||||| ||||||||||| ||| ||| |||    
T  25779 tgttcaactgtcgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaa 25878  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgata 166  Q
    ||  ||||||||||| || || || || |||||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||    
T  25879 ctgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactccgatgcagacatccgata 25944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13546 - 13411
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  | ||| ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||| |  || || ||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  13546 tgttcaactgccgataatccacacataacctcatgcttctatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacacttggtctaataaa 13447  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaa 136  Q
    ||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  13446 ctgcttctcaagcaactcttctaactgtttcttcaa 13411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 602
Target Start/End: Original strand, 10759 - 10974
Alignment:
Q  387 caccttcctcttcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccat 486  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||| || || || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  10759 caccttcttcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaataacatccat 10858  T
Q  487 accactcaaaggtagacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaggggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccctta 586  Q
    |||   ||| || |  ||||| |||||||   |||| || | | |||||||||| |  ||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  10859 acccgacaacggcaagcaaactaaatcaaccacaaagtccctaccaaacatagatataggacaccccaaacaaacaagagaagtagttactgaaccctta 10958  T
Q  587 gctggagtttcgacaa 602  Q
    | ||||||||| ||||    
T  10959 gttggagtttcaacaa 10974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 120 - 13
Alignment:
Q  107 ctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatca 206  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||| ||||| |||||||| |||    
T  120 ctcaagtaaatcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggctttgttccgggaacaaggtca 21  T
Q  207 atcgaaaa 214  Q
    || |||||    
T  20 attgaaaa 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 560 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 6606 - 6548
Alignment:
Q  560 acaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcat 618  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  6606 acaagagaagtagtcactgaacccttagccggagtttcaacaaccatttctcctttcat 6548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1542 - 1407
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |   | || ||||| || |||||||||||| ||| |||    
T  1542 tgttcaactgccgataatccacacacaacctcattcttccatctttcttcttaaccaacaacactagagcaccccacggcgaaacacttggtctaataaa 1443  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaa 136  Q
    ||  ||||||||||| || || || |||||||||||    
T  1442 ctgcttctcaagcaactcttccaactgtttcttcaa 1407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 596 - 764
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |  || || ||||| || |||||||||||| ||| ||     
T  596 tgttcaactgacgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggcgaaacacttggtctaataag 695  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataagg 169  Q
     |  ||||||||||| || || || ||||||||||| ||  ||||||| || || ||||| | ||||||    
T  696 ttgcttctcaagcaactcttccaactgtttcttcaattcacccaactctgatgcagacatccaataagg 764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 7538 - 7673
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |  || || ||||| || |||||||||||| ||| ||     
T  7538 tgttcaactgacgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggcgaaacacttggtctaataag 7637  T
Q  101 ctttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaa 136  Q
     |  ||||||||||| || || || |||||||||||    
T  7638 ttgcttctcaagcaactcttccaactgtttcttcaa 7673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 477 - 537
Alignment:
Q  1 tgttcaactgtcgataattaatacacaaccttatgctaccatccttcttcttcaccaacaa 61  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  477 tgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgctcccatccttcttcttaaccaacaa 537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 166
Target Start/End: Original strand, 23417 - 23511
Alignment:
Q  72 ccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgata 166  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||    
T  23417 ccccacggtgaaacacttggtctaataaactgcttctcaagcaactcctccaactgattcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgata 23511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University