View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18967_low_3 (Length: 288)

Name: NF18967_low_3
Description: NF18967
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18967_low_3
NF18967_low_3
[»] chr7 (20 HSPs)
chr7 (1-282)||(15167948-15168229)
chr7 (1-282)||(18873133-18873414)
chr7 (4-282)||(10895795-10896073)
chr7 (1-282)||(14422758-14423038)
chr7 (1-282)||(16009351-16009630)
chr7 (1-273)||(12709845-12710117)
chr7 (1-273)||(13122916-13123188)
chr7 (1-273)||(13743492-13743762)
chr7 (2-196)||(16677152-16677348)
chr7 (2-196)||(17651388-17651584)
chr7 (1-208)||(12590645-12590850)
chr7 (1-282)||(13007207-13007485)
chr7 (1-55)||(11382872-11382926)
chr7 (1-55)||(11389349-11389403)
chr7 (1-55)||(20311053-20311107)
chr7 (1-55)||(21230961-21231015)
chr7 (1-119)||(13679428-13679547)
chr7 (1-54)||(2971254-2971307)
chr7 (1-54)||(11311059-11311112)
chr7 (1-54)||(20906463-20906516)
[»] chr5 (9 HSPs)
chr5 (1-282)||(22750914-22751195)
chr5 (1-282)||(28370056-28370335)
chr5 (1-282)||(19512160-19512440)
chr5 (1-275)||(38144538-38144810)
chr5 (1-208)||(23528479-23528684)
chr5 (1-64)||(18407945-18408008)
chr5 (1-64)||(23111201-23111264)
chr5 (1-55)||(22438749-22438803)
chr5 (1-54)||(19236900-19236953)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (1-282)||(14762759-14763040)
chr3 (2-282)||(38310802-38311082)
chr3 (2-282)||(20247791-20248063)
chr3 (2-282)||(24192728-24193009)
chr3 (1-282)||(9534102-9534381)
chr3 (1-282)||(23370507-23370787)
chr3 (2-284)||(55499104-55499385)
chr3 (1-282)||(24933830-24934109)
chr3 (1-208)||(41455099-41455304)
chr3 (1-168)||(16801469-16801635)
chr3 (1-61)||(18929239-18929299)
chr3 (1-64)||(17240514-17240577)
chr3 (1-259)||(10389445-10389702)
chr3 (1-54)||(13302242-13302295)
chr3 (1-54)||(13323789-13323842)
chr3 (1-113)||(10414534-10414646)
chr3 (1-113)||(10421204-10421316)
chr3 (1-54)||(12033446-12033499)
chr3 (1-54)||(13312898-13312951)
chr3 (1-54)||(17131732-17131785)
chr3 (1-54)||(51301589-51301642)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-282)||(11852-12133)
scaffold0026 (1-282)||(111460-111739)
[»] scaffold1773 (1 HSPs)
scaffold1773 (1-276)||(958-1231)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-276)||(49959-50232)
[»] chr4 (10 HSPs)
chr4 (1-273)||(8045834-8046105)
chr4 (1-276)||(11847886-11848167)
chr4 (1-188)||(53483573-53483758)
chr4 (1-55)||(15408139-15408193)
chr4 (5-189)||(27906130-27906315)
chr4 (1-56)||(8834895-8834950)
chr4 (1-56)||(13888641-13888696)
chr4 (2-83)||(14486632-14486713)
chr4 (1-56)||(15245215-15245270)
chr4 (5-56)||(22724691-22724742)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (1-233)||(23057760-23057992)
chr6 (1-274)||(23838980-23839252)
chr6 (1-282)||(29614148-29614429)
chr6 (1-275)||(10986182-10986455)
chr6 (1-282)||(4477631-4477911)
chr6 (4-260)||(18800233-18800488)
chr6 (2-284)||(21565214-21565494)
chr6 (1-134)||(930097-930229)
chr6 (1-282)||(12168138-12168416)
chr6 (1-282)||(19287047-19287325)
chr6 (1-282)||(19785871-19786149)
chr6 (1-282)||(19878231-19878509)
chr6 (1-282)||(19884007-19884285)
chr6 (1-188)||(34639988-34640173)
chr6 (1-188)||(34646662-34646847)
chr6 (1-113)||(25469706-25469816)
chr6 (1-196)||(9187352-9187549)
chr6 (1-56)||(25397172-25397227)
chr6 (1-55)||(24512845-24512899)
chr6 (1-56)||(19471336-19471391)
chr6 (1-56)||(25348486-25348541)
chr6 (2-56)||(25598643-25598697)
chr6 (1-83)||(31252394-31252476)
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (2-282)||(8727735-8728015)
chr8 (1-282)||(44477397-44477676)
chr8 (1-282)||(44492555-44492834)
chr8 (1-273)||(23866396-23866668)
chr8 (91-274)||(27940946-27941127)
chr8 (1-208)||(17054440-17054644)
chr8 (1-109)||(18614217-18614326)
chr8 (1-64)||(23482054-23482117)
chr8 (1-56)||(39364919-39364974)
chr8 (1-54)||(29643387-29643440)
chr8 (1-55)||(14056565-14056619)
chr8 (1-55)||(25111976-25112030)
chr8 (1-54)||(24320672-24320725)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (2-282)||(14398-14678)
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (1-282)||(19661455-19661734)
chr2 (1-282)||(6483492-6483771)
chr2 (1-282)||(6486959-6487238)
chr2 (1-284)||(26583600-26583880)
chr2 (2-284)||(23089057-23089337)
chr2 (2-284)||(23878781-23879060)
chr2 (1-284)||(23101464-23101745)
chr2 (1-113)||(5706025-5706137)
chr2 (1-64)||(23265133-23265196)
chr2 (1-64)||(23280201-23280264)
chr2 (1-61)||(21908353-21908413)
chr2 (1-56)||(24661576-24661631)
chr2 (1-54)||(10577-10630)
chr2 (1-54)||(25180931-25180984)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (1-282)||(20437025-20437305)
chr1 (1-208)||(41111884-41112088)
chr1 (1-64)||(32651563-32651626)
chr1 (1-55)||(19663518-19663572)
chr1 (1-64)||(18712790-18712853)
chr1 (1-56)||(20805320-20805375)
chr1 (2-56)||(10811785-10811839)
chr1 (1-55)||(11158093-11158147)
chr1 (1-54)||(20851134-20851187)
chr1 (1-54)||(20857761-20857814)
chr1 (1-54)||(21706276-21706329)
chr1 (1-54)||(21710818-21710871)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (1-276)||(752-1027)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-282)||(111674-111936)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (1-282)||(10197-10477)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (1-282)||(1527-1807)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (1-282)||(1899-2179)
scaffold0117 (1-282)||(8576-8856)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (1-282)||(11116-11395)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (1-273)||(75-344)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (1-276)||(17948-18223)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (2-284)||(3295-3576)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (2-284)||(3624-3904)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (1-196)||(30715-30911)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (159-282)||(3435-3558)
[»] scaffold0796 (2 HSPs)
scaffold0796 (1-282)||(1734-2013)
scaffold0796 (1-190)||(5757-5943)
[»] scaffold0456 (4 HSPs)
scaffold0456 (1-82)||(904-985)
scaffold0456 (1-82)||(8049-8130)
scaffold0456 (143-239)||(806-901)
scaffold0456 (143-239)||(7951-8046)
[»] scaffold0129 (1 HSPs)
scaffold0129 (1-111)||(45276-45386)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (1-64)||(16811-16874)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (1-64)||(116887-116950)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (1-55)||(34277-34331)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (1-64)||(9-72)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (1-64)||(13623-13686)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (1-64)||(101929-101992)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (1-55)||(17643-17697)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (1-55)||(40533-40587)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (1-55)||(135473-135527)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (1-53)||(22594-22646)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (1-119)||(1321-1440)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (1-56)||(12296-12351)
[»] scaffold0609 (1 HSPs)
scaffold0609 (1-83)||(5859-5941)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (1-55)||(14998-15052)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (1-189)||(23571-23760)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (2-189)||(73149-73337)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (1-56)||(39508-39563)
[»] scaffold0815 (1 HSPs)
scaffold0815 (1-51)||(1453-1503)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (1-71)||(493030-493099)
[»] scaffold1318 (1 HSPs)
scaffold1318 (1-54)||(1914-1967)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (1-54)||(9336-9389)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (1-54)||(10239-10292)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (1-54)||(135438-135491)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 20)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15168229 - 15167948
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15168229 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 15168130  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15168129 atgatgattctgaagggaaatgggtaatgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctttgttgctgctgtgatcataaa 15168030  T
Q  201 ttgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15168029 ttgattgaaaattatgagtgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgatctgtaattgttgttgttgatg 15167948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18873414 - 18873133
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18873414 aaggtaagggtgagactttctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 18873315  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18873314 atgatgattctgaagggaaatgggtaatgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctttgttgctgctgtgatcataaa 18873215  T
Q  201 ttgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18873214 ttgattgaaaattatgagtgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgatctgtaattgttgttgttgatg 18873133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 282
Target Start/End: Original strand, 10895795 - 10896073
Alignment:
Q  4 gtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttt-ggaagataaattgagggttagggtttgat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10895795 gtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttttgaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaattgtgggttagggtttgat 10895894  T
Q  103 gatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaatt 202  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  10895895 gatgattctgaggggaa-tgggtattgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctttgttgctgctgtgatcataaatt 10895993  T
Q  203 gattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10895994 gattgaaaattatgagtgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgatctgtaattgttgttgttgatg 10896073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14423038 - 14422758
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatag-ttttggaagataaattgagggttagggttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14423038 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaattgagggttagggttt 14422939  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataa 199  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14422938 gatgatgattctg-aggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatattgttgttgtgatcataa 14422840  T
Q  200 attgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||    
T  14422839 attgattga-aattatgattgattggatgaattgatgaagatttgtatgatggtggagtgatctgtatttgttgttgttgatg 14422758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16009630 - 16009351
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16009630 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatggttttggaagataaattgtgggttaaggtttg 16009531  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaa 200  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  16009530 atgatgattctg-aggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataaa 16009432  T
Q  201 ttgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
     ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  16009431 ctgattga-aattatgattgattggatgaattgatgaagatttgtatgatggtggaatgatctgtatttgttgttgttgatg 16009351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 12709845 - 12710117
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12709845 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatttataattcctgaaa-ttgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttg 12709943  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattct-gttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataa 199  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  12709944 atgatgattatgaagagaaatgggtaatgatcatgttaattctatttgtaatataatgttcagaatataaacttaatct-tgttgttgctgtgatcgtaa 12710042  T
Q  200 attgattgagaa-ttatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttg 273  Q
    | |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  12710043 actgatttggaatttatgagtgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgatctgtgattgttg 12710117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 13122916 - 13123188
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13122916 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatttataattcctgaaa-ttgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttg 13123014  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattct-gttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataa 199  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  13123015 atgatgattatgaagagaaatgggtaatgatcatgttaattctatttgtaatataatgttcagaatataaacttaatct-tgttgttgctgtgatcgtaa 13123113  T
Q  200 attgattgagaa-ttatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttg 273  Q
    | |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  13123114 actgatttggaatttatgagtgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgatctgtgattgttg 13123188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13743762 - 13743492
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13743762 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatttataattcctgaaa-ttgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttg 13743664  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaa 200  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||  |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13743663 atgatgattatgaagagaaatgggtaatgatcatgttaattttcttgtattatgctgttcagattgaagacttaatctatgttattgctgtgatcataaa 13743564  T
Q  201 ttgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttg 273  Q
    ||| |||| |||||||   | |||||| |||||||||||   ||||| |||||||| |||  ||| |||||||    
T  13743563 ttggttga-aattatgcttggttggataaattgatgaataattgtataatggtggagtgatatgtgattgttg 13743492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16677348 - 16677152
Alignment:
Q  2 aggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatag-ttttggaagat-aaattgagggttagggttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16677348 aggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctaaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaaattaagggttagggttt 16677249  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatca 196  Q
    |||||||||| ||| | | |  | ||||| |||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||    
T  16677248 gatgatgattttgaggaggatggtgtaatgatcatgttaaatatgttgtaaagtgatgttcagaatgaattcctaatctataatgttgctgtgatca 16677152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17651584 - 17651388
Alignment:
Q  2 aggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatag-ttttggaagat-aaattgagggttagggttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  17651584 aggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctaaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaaattaagggttagggttt 17651485  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatca 196  Q
    |||||||||| ||| | | |  | ||||| |||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||    
T  17651484 gatgatgattttgaggaggatggtgtaatgatcatgttaaatatgttgtaaagtgatgttcagaatgaattcctaatctataatgttgctgtgatca 17651388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 12590645 - 12590850
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||    
T  12590645 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctg-aaattgacctaattgaatagttttggaaaataatatgaaagttagggtttg 12590743  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgat-cataa 199  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||  || |||||| || | ||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |    
T  12590744 atgatgattctgatgg--aatgagtaaagatgatgttagttttcttggaatttaatgttaagaatgaaagcttaatccatgttgttgctgtaatccatta 12590841  T
Q  200 attgattga 208  Q
    |||||||||    
T  12590842 attgattga 12590850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13007485 - 13007207
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||    
T  13007485 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctg-aaattgacctaattgaatagttttggaaaataagatgaaagttagggtttg 13007387  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgat-cataa 199  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||  || |||||| || | ||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |    
T  13007386 atgatgattctgatgg--aatgagtaaagatgatgttagtt-tcttggaatttaatgttaagaacgaaatcttaatccatgttgttgctgtaatccatga 13007290  T
Q  200 attgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatga-gctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    ||||||||| | ||  ||   |||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||  || |||||||||||| |||||    
T  13007289 attgattga-attttggatgaattgtatgaattgatgaaatattgtgtgatggtggaatgattctataattgttgttgttgatg 13007207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 11382872 - 11382926
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattg 55  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11382872 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatatataatttctgaaaattg 11382926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 11389349 - 11389403
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattg 55  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11389349 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatatataatttctgaaaattg 11389403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 20311053 - 20311107
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattg 55  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20311053 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataacgtataatttctgaaaattg 20311107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 21230961 - 21231015
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattg 55  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21230961 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcatagtatataatttctgaaaattg 21231015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 13679547 - 13679428
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagat-aaattgagggttagggttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||| ||||||  || ||| | || ||| ||| ||||  |||||||||    
T  13679547 aaggtaagggtgagactatctttcaatgatcatgatatataatttttgaaaattgatctaattaaattgttcttgatgataaaactgagaattagggttt 13679448  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaa 119  Q
    |||| ||||| |||| ||||    
T  13679447 gatgctgattttgaaaggaa 13679428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 2971307 - 2971254
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaatt 54  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  2971307 aaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatttataatttctgaaaatt 2971254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 11311112 - 11311059
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaatt 54  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||||| ||||||    
T  11311112 aaggtaagggtgagactatctctcaataataatagtgtagaatttctaaaaatt 11311059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 20906463 - 20906516
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaatt 54  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  20906463 aaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaatt 20906516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 9)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22751195 - 22750914
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22751195 aaggtaagggtgagactttctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 22751096  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22751095 atgatgattctgaagggaaatgggtaatgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctttgttgctgctgtgatcataaa 22750996  T
Q  201 ttgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22750995 ttgattgaaaattatgagtgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgatctgtaattgttgttgttgatg 22750914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 28370056 - 28370335
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28370056 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttg 28370155  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaa 200  Q
    ||||||||| || |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  28370156 atgatgattttg-aggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaacgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataaa 28370254  T
Q  201 ttgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  28370255 ttgattga-aattatgattgatgggatgaattgatgaagatttgtatgatggtggaatgatctgtatttgttgttgttgatg 28370335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19512440 - 19512160
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatag-ttttggaagataaattgagggttagggttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19512440 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaattgagggttagggttt 19512341  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataa 199  Q
    |||||||||| || |||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  19512340 gatgatgattttg-aggggaatgggtattgatcatgttaattctattgtaacgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataa 19512242  T
Q  200 attgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  19512241 attgattga-aattatgattgattggatgaattgatgaagatttgtatgatggtggaatgatctgtatttgttgttgttgatg 19512160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 38144538 - 38144810
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38144538 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcataattttggaaaataaattgagggttagggtttg 38144637  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaa 200  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  38144638 atgatgattctg-aggggaatgggtattgatcatgttaattctattgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataaa 38144736  T
Q  201 ttgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgtt 275  Q
    |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  38144737 ttgattga-aattacgattgattggatgaattgatgaagatttgtatgatggtggagtgatctgtatttgttgtt 38144810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23528684 - 23528479
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||    
T  23528684 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctg-aaattgacctaattgaatagttttggaaaataagatgaaagttagggtttg 23528586  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgat-cataa 199  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||  || |||||| || | ||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |    
T  23528585 atgatgattctgatgg--aatgagtaaggatgatgttagttttcttggaatttaatgttaagaacgaaatcttaatccatgttgttgctgtaatccatga 23528488  T
Q  200 attgattga 208  Q
    |||||||||    
T  23528487 attgattga 23528479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 18407945 - 18408008
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattg 64  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18407945 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatatataatttctgaaaattgatctaattg 18408008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 23111201 - 23111264
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattg 64  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23111201 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcatagtatataatttctgaaaattgatctaattg 23111264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 22438749 - 22438803
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattg 55  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22438749 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatgtataatttctgaaaattg 22438803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 19236953 - 19236900
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaatt 54  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  19236953 aaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaatt 19236900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 14762759 - 14763040
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14762759 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 14762858  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  14762859 atgatgattctgaagggaaatgggtaatgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctttgttgctgctgtgatcataaa 14762958  T
Q  201 ttgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  14762959 ttgattgaaaattatgagtgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggagtgatctgtaattgttgttgttgatg 14763040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 2 - 282
Target Start/End: Original strand, 38310802 - 38311082
Alignment:
Q  2 aggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38310802 aggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaatattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttga 38310901  T
Q  102 tgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  38310902 tgatgattctgaagggaaatgggtaatgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctttgttgctgctgtgatcataaat 38311001  T
Q  202 tgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  38311002 tgattgaaaattatgagtgattggatgaatggatgaatttgtgtatgaaggtggaatgatctgtaattgttgttgttgatg 38311082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 2 - 282
Target Start/End: Original strand, 20247791 - 20248063
Alignment:
Q  2 aggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20247791 aggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttga 20247890  T
Q  102 tgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20247891 tgatgattctgaagggaaatgggtaatgatcatgttaattttcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctttgttgctgctgtgatcataaat 20247990  T
Q  202 tgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    ||||||| ||||||||| |||||        |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20247991 tgattgaaaattatgagtgattg--------gatgaatttgtgtatgatggtggaatgatctgtaattgttgttgttgatg 20248063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24193009 - 24192728
Alignment:
Q  2 aggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttt-ggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24193009 aggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaattgagggttagggtttg 24192910  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtg-atcataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24192909 atgatgattctgaagggaaatgggtaatgatcatgttaattctgttgtaatgtgatgttcagaatgaaaacttaatctatgctgttgctgtgaatcataa 24192810  T
Q  200 attgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    | ||||||| || |||||  |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||    
T  24192809 actgattga-aaatatgattgattggataaattgatgaatattggtatgatggtggaatgatctgtatttcttgttgttgatg 24192728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9534381 - 9534102
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9534381 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttg 9534282  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaa 200  Q
    |||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||    
T  9534281 atgatgattctg-agtggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcataaa 9534183  T
Q  201 ttgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  9534182 ttgattga-aattatgattgattggatgaattgatgaagatttgtatgatggtggaatgatctgtatttgttgttgttgatg 9534102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 23370507 - 23370787
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatag-ttttggaagataaattgagggttagggttt 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23370507 aaggtaagggtgggactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaattgtgggttagggttt 23370606  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataa 199  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  23370607 gatgatgattctg-aggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataa 23370705  T
Q  200 attgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||    
T  23370706 attgattga-aattatgattgattggatgaattgatgaagatttgtatgatggtggagtgatctgtatttgttgttgttgatg 23370787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 284
Target Start/End: Original strand, 55499104 - 55499385
Alignment:
Q  2 aggtaagggtgagactatctctcgataatc-ataatctataatttctg-aaaattgacctaattgcatagttttggaagataaa-ttgagggttagggtt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||| | ||||||| | ||||||||||||| ||| ||   ||| | |||||| |||||||||||||||    
T  55499104 aggtaagggtgagactatctctcattaatagataatatgtaatttcgggaaaattgacctaactgcttaaccttg-aggataaaattgagggttagggtt 55499202  T
Q  99 tgatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcata 198  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||   |||||||||||||||    
T  55499203 tgatgatgattctgaggggaa-tgggtaatgatcatgttaattatgttgtaatgtgatgttcggaatgaaatcttaatctatacagttgctgtgatcata 55499301  T
Q  199 aattgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatgtc 284  Q
    |||||||||| || ||| |  |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  55499302 aattgattga-aaatataattgattggatgaattgatcaagttttgtatgatggtggaatgatctgt-attgttgttgttgatgtc 55499385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 24933830 - 24934109
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||   ||||||||||    
T  24933830 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctg-aaattgacctaattgaatagttttggaaaataatatgaaaattagggtttg 24933928  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgat-cataa 199  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||  || |||||| || | | | ||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  || ||| |    
T  24933929 atgatgattctgatgg--aatgagtaaagatgatgttagttttctcggaatttaatgttaagaatgaaagcttaatccatgttgttgctgcaatccatta 24934026  T
Q  200 attgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatga-gctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    ||||||||| | || |||   |||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||  |||||||||||| || |||||    
T  24934027 attgattga-atttttgatgtattgtatgaattgatgaatatttgtatgatggtagaatgattctgtaattgttgctgttgatg 24934109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 41455099 - 41455304
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||   |||   |||||| |||    
T  41455099 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctg-aaattgacctaattgaatagttttggaaaataggatgaaaattagggattg 41455197  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgat-cataa 199  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||  || |||||| || | ||| ||| ||||||  ||||||||| ||||||| || | |||||||| || ||| |    
T  41455198 atgatgattctgatgg--aatgagtaaagatgatgttagttttcttgaaatttaatgtcaagaatgaaatcttaatccatatggttgctgtaatccatga 41455295  T
Q  200 attgattga 208  Q
    |||||||||    
T  41455296 attgattga 41455304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 16801469 - 16801635
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagat-aaattgagggttagggttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||||| |||||||| ||    
T  16801469 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcat-atatataatttctgaaaattgacctgattgcttagcttttgaagataaaattgaaggttaggg-tt 16801566  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaa 168  Q
    |||||||||| ||| | |||  | ||||| |||||||||| | || |||||| | ||||| ||||||||    
T  16801567 gatgatgattttgaggagaatggtgtaatgatcatgttaaatatgctgtaatgtgatgtttagaatgaa 16801635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 18929299 - 18929239
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaa 61  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  18929299 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcatgatatataatttctgaaaattgatctaa 18929239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 17240514 - 17240577
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattg 64  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  17240514 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcttaatacataatttctgaaaattgatctaattg 17240577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 10389445 - 10389702
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||  |  ||||  |||   ||||||||||    
T  10389445 aaggtaagggtgggattatctttcaatgattataatgtataatttctgaaaagtaatctaattgaatagtttttaagaataatatgaaaattagggtttg 10389544  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgtta-attctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgat-cata 198  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||  || ||||||  || | | | ||| ||| ||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||  || |||     
T  10389545 atgatgattctgatgg--aatgggtaaagatgatgttagtttttctcggaatttaacgttaagaatgaaagcttaacccatgttgttgctgcaatccatt 10389642  T
Q  199 aattgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatg 259  Q
    |||||||||| | || |||   |||| |||||||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  10389643 aattgattga-atttttgatgaattgtatgaattgatgaatatttgtatgttggtagaatg 10389702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 13302242 - 13302295
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaatt 54  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13302242 aaggtaagggtgagattatctttcaataatcataatatgtaatttctgaaaatt 13302295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 13323789 - 13323842
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaatt 54  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13323789 aaggtaagggtgagattatctttcaataatcataatatgtaatttctgaaaatt 13323842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 10414534 - 10414646
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||  |  ||||  |||   ||||||||||    
T  10414534 aaggtaagggtgggattatctttcaatgattataatgtataatttctgaaaagtaatctaattgaatagtttttaagaataatatgaaaattagggtttg 10414633  T
Q  101 atgatgattctga 113  Q
    |||||||||||||    
T  10414634 atgatgattctga 10414646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 10421204 - 10421316
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||  |  ||||  |||   ||||||||||    
T  10421204 aaggtaagggtgggattatctttcaatgattataatgtataatttctgaaaagtaatctaattgaatagtttttaagaataatatgaaaattagggtttg 10421303  T
Q  101 atgatgattctga 113  Q
    |||||||||||||    
T  10421304 atgatgattctga 10421316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 12033446 - 12033499
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaatt 54  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12033446 aaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaatt 12033499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 13312898 - 13312951
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaatt 54  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  13312898 aaggtaagggtgagattatctttcaataatcataatatgtaatttttgaaaatt 13312951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 17131785 - 17131732
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaatt 54  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  17131785 aaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaatt 17131732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 51301642 - 51301589
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaatt 54  Q
    ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  51301642 aaggtaagggtgagattatcttccaataatcataatatgtaatttctgaaaatt 51301589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 11852 - 12133
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11852 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagagttagggtttg 11951  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  11952 atgatgattctgaagggaaatgggtaatgatcatgttaattctcttgtaatataatcttcagaatgaaaacttaatctttgttgttgctgtgatcataag 12051  T
Q  201 ttgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12052 ttgattgaaatttatgagtgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgatctgtaattgttgttgttgatg 12133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 111739 - 111460
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  111739 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttg 111640  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaa 200  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  111639 atgatgattctg-aggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataaa 111541  T
Q  201 ttgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  111540 ttgattga-aattatgattgattggatgaattgatgaagatttgtatgatggtggaatgatctgtatttgttgttgttgatg 111460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1773 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold1773
Description:

Target: scaffold1773; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 1231 - 958
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1231 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataattcctgaaa-ttgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttg 1133  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaa 200  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1132 atgaggattatgaagggaaatgggtaatgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatct-tgttgttgctgtgatcataaa 1034  T
Q  201 ttgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 276  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1033 ttgattgaaatttatgagtgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgatctgtaattgttgttg 958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 50232 - 49959
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50232 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataattcctgaaa-ttgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttg 50134  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaa 200  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50133 atgaggattatgaagggaaatgggtaatgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatct-tgttgttgctgtgatcataaa 50035  T
Q  201 ttgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 276  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50034 ttgattgaaatttatgagtgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgatctgtaattgttgttg 49959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 10)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 8045834 - 8046105
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8045834 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaa-ttgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttg 8045932  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaa 200  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8045933 acgagaattctgaagggaaatgggtaaagataatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatccttgttgttgctgtgatcataaa 8046032  T
Q  201 ttgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttg 273  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8046033 ttgattgaaatttatgagtgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgatctgtaattgttg 8046105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 11848167 - 11847886
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaa------ttgagggttag 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||      |||||||||||    
T  11848167 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataattcctgaaaattgacctagtggcatagttttgaaaaattaaaatcaattgagggttag 11848068  T
Q  95 ggtttgatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgat 194  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11848067 ggtttgatgacgattctgaagaggaatgggtaatgatcatgttaatccttttataatataatgttcagaatgaaaacttaatctttgttgttgctgtgat 11847968  T
Q  195 cataaattgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 276  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11847967 cataaattgattgaaaattatgagtgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatgatggaatgatctgtaattgttgttg 11847886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 53483758 - 53483573
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaat-tgagggttagggttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||| |  ||| |||   |||||||||    
T  53483758 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataattcctgaaa-ttgacctaattgaatagtttttgaaaaataatatgaaaattagggttt 53483660  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgc 188  Q
    |||||||||||||| ||  |||| ||||  || |||||| || | |   ||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53483659 gatgatgattctgatgg--aatgagtaaagatgatgttagttttctctgaatttaacgttaagaatgaaaacttaatccatgttgttgc 53483573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 15408193 - 15408139
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattg 55  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15408193 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcatagtatataatttctgaaaattg 15408139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 27906315 - 27906130
Alignment:
Q  5 taagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagat-aaattgagggttagggtttgatg 103  Q
    |||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |  |||| | |||||| | |||||| ||||||||  ||||||| |||||    
T  27906315 taagggtgggattatctttcaatgatcataatgtataatttctgaaaattaatataatagaatagttcttgaagataaaattgagaattagggtgtgatg 27906216  T
Q  104 atgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgct 189  Q
     ||||| |||| | ||| | |||| ||||||||| | | ||||||||| | |||||| | ||||   ||||||||||  |||||||    
T  27906215 ttgattttgaaagaaaaggtgtaagaatcatgtttaatgtgttgtaatttgatgttccgtatgatttcttaatctataatgttgct 27906130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 8834950 - 8834895
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattga 56  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8834950 aaggtaagggtgaggctaactctcaatgatcataatatataatttctgaaaattga 8834895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 13888696 - 13888641
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattga 56  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  13888696 aaggtaagggtgaggctaactctcaatgatcataatgtataatttctgaaaattga 13888641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 14486713 - 14486632
Alignment:
Q  2 aggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaa 83  Q
    |||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||||||||||||||| | | ||||| || ||| | |||||||||    
T  14486713 aggtaagggtgagactatccttcaatgatcataatatataatttctgaaaattaatcgaattgaattgttcttgaagataaa 14486632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 15245270 - 15245215
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattga 56  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  15245270 aaggtaagggtgaggctaactctcaatgatcgtaatatataatttctgaaaattga 15245215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 56
Target Start/End: Original strand, 22724691 - 22724742
Alignment:
Q  5 taagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattga 56  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||    
T  22724691 taagggtgagactatctctcaataataatagtatagaatttctgaaaattga 22724742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23057992 - 23057760
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23057992 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataattcctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 23057893  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  23057892 atgatgattctgaagggaaatgggtaatgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctttgttgctgctgtgatcataaa 23057793  T
Q  201 ttgattgagaattatgagcgattggatgaattg 233  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  23057792 ttgattgaaaattatgagtgattggatgaattg 23057760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23839252 - 23838980
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagt-tttggaagataaattgagggttagggttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23839252 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtgtttggaagataaattgagggttagggttt 23839153  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataa 199  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  23839152 gatgatgattct-aaggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgttcagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataa 23839054  T
Q  200 attgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgt 274  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23839053 attgattga-aattatgattgattggatgaattgatgaagatttgtatgatggtggaatgatctgtatttgttgt 23838980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 29614148 - 29614429
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaaga-taaattgagggttagggttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  29614148 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaattgacctagttgcataattttggaaaaataaattgagggttagggttt 29614247  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataa 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29614248 gatgatgattatgaagggaaatgggtaatgatcatgttaattctcttgtattg-aatgtttagaatgaaaacttaatctttgttgttgctgtgatcataa 29614346  T
Q  200 attgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
     |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||    
T  29614347 cttgattgaaatttatgaatgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaataatctgtaagtgttgttgttgatg 29614429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 10986182 - 10986455
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttt-ggaagataaattgagggttagggttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10986182 aaggtaagggtgagactatctttcaataatcataatctataatttctaaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaattgagggttagggttt 10986281  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataa 199  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  10986282 gatgatgattctgaggggaa-tgggtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgttcagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataa 10986380  T
Q  200 attgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgtt 275  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  10986381 attgattga-aattacgattgattggatgaattgatgaagatttgtatgatggtggagtgatctgtatttgttgtt 10986455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4477911 - 4477631
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatag-ttttggaagataaattgagggttagggttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4477911 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaattgtgggttagggttt 4477812  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataa 199  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  4477811 gatgatgattctg-aggggaatgggtattgatcatgctaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatattgttgttgtgatcataa 4477713  T
Q  200 attgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||    
T  4477712 attgattga-aattatgattgattggatgatttgataaagatttgtatgatggtggagtgatctgtatttgttgttgttgatg 4477631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18800488 - 18800233
Alignment:
Q  4 gtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagata-aattgagggttagggtttgat 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18800488 gtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcttagttttggaaaatagaattgagggttagggtttgat 18800389  T
Q  103 gatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaatt 202  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  18800388 gatgattctggaggg-aatgagtaatgatcatgttaattctgttgtaatgtgatgttcaaaatgaaatcttaatctatattgttgttgtgatcacaaatt 18800290  T
Q  203 gattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatga 260  Q
    |||||| || ||| |  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  18800289 gattga-aaatataattgattggatgaattgatgaagtttggtatgatggtggaatga 18800233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 284
Target Start/End: Original strand, 21565214 - 21565494
Alignment:
Q  2 aggtaagggtgagactatctctcgataatc-ataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaa-ttgagggttagggttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||   ||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  21565214 aggtaagggtgagactatctctcattaatagataatatttaatttcggaaaattgacctaattgcttaaccttg-aggataaaattgagggttagggttt 21565312  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataa 199  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| | | |||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21565313 gatgatgattct-aaggggaatgggtaatgatcatgttaattatgttgtaatgtgacgttcggaatgaaatcttaatctatactgttgctgtgatcataa 21565411  T
Q  200 attgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatgtc 284  Q
    ||||||||| || ||| |  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  21565412 attgattga-aaatataattgattggatgaattgatgaagttctgtatgatggtggaatgatctgt-attgttgttgttgatgtc 21565494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 930097 - 930229
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  930097 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctatagtttctgaaaattgacctaattgtatagttttgaaaaataaattgagggttagggtttg 930196  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcat 134  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  930197 atgatgtttctgaaggg-aatgggtaatgatcat 930229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12168416 - 12168138
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||    
T  12168416 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctg-aaattgacctaattgaatagttttggaaaataagatgaaagttagggtttg 12168318  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgat-cataa 199  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||  || |||||| || | ||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |    
T  12168317 atgatgattctgatgg--aatgagtaaagatgatgttagtt-tcttggaatttaatgttaagaacgaaatcttaatccatgttgttgctgtaatccatga 12168221  T
Q  200 attgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatga-gctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    ||||||||| | ||  ||   |||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||  || |||||||||||| |||||    
T  12168220 attgattga-attttggatgaattgtatgaattgatgaaatattgtgtgatggtggaatgattctataattgttgttgttgatg 12168138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19287325 - 19287047
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||    
T  19287325 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctg-aaattgacctaattgaatagttttggaaaataagatgaaagttagggtttg 19287227  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgat-cataa 199  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||  || |||||| || | ||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |    
T  19287226 atgatgattctgatgg--aatgagtaaagatgatgttagtt-tcttggaatttaatgttaagaacgaaatcttaatccatgttgttgctgtaatccatga 19287130  T
Q  200 attgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatga-gctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    ||||||||| | ||  ||   |||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||  || |||||||||||| |||||    
T  19287129 attgattga-attttggatgaattgtatgaattgatgaaatattgtgtgatggtggaatgattctataattgttgttgttgatg 19287047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 19785871 - 19786149
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||  |||||||||||    
T  19785871 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctg-aaattgacctagttgaatagttttggaaaataaaatgaaagttagggtttg 19785969  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgat-cataa 199  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||  || |||||| || | ||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |    
T  19785970 atgatgattctgatgg--aatgagtaaagatgatgttagtt-tcttggaatttaatgttaagaacgaaatcttaatccatgttgttgctgtaatccatga 19786066  T
Q  200 attgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatga-gctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    ||||||||| | ||  ||   |||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||  || |||||||||||| |||||    
T  19786067 attgattga-attttggatgaattgtatgaattgatgaaatattgtgtgatggtggaatgattctataattgttgttgttgatg 19786149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19878509 - 19878231
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||    
T  19878509 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctg-aaattgacctaattgaatagttttggaaaataagatgaaagttagggtttg 19878411  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgat-cataa 199  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||  || |||||| || | ||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |    
T  19878410 atgatgattctgatgg--aatgagtaaagatgatgttagtt-tcttggaatttaatgttaagaacgaaatcttaatccatgttgttgctgtaatccatga 19878314  T
Q  200 attgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatga-gctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    ||||||||| | ||  ||   |||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||  || |||||||||||| |||||    
T  19878313 attgattga-attttggatgaattgtatgaattgatgaaatattgtgtgatggtggaatgattctataattgttgttgttgatg 19878231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19884285 - 19884007
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||    
T  19884285 aaggttagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctg-aaattgacctaattgaatagttttggaaaataagatgaaagttagggtttg 19884187  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgat-cataa 199  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||  || |||||| || | ||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |    
T  19884186 atgatgattctgatgg--aatgagtaaagatgatgttagtt-tcttggaatttaatgttaagaacgaaatcttaatccatgttgttgctgtaatccatga 19884090  T
Q  200 attgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatga-gctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    ||||||||| | ||  ||   |||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||  || |||||||||||| |||||    
T  19884089 attgattga-attttggatgaattgtatgaattgatgaaatattgtgtgatggtggaatgattctataattgttgttgttgatg 19884007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 34639988 - 34640173
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||   ||||||||||    
T  34639988 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcttaatctataatttctgaaaattgacctaattgaatagttttggaaaataataagaaaattagggtttg 34640087  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgc 188  Q
    |||||| |||||| ||  |||| ||||  || |||||| || | |   ||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34640088 atgatggttctgatgg--aatgagtaaagatgatgttagttttctctgaatttaacgttaagaatgaaaacttaatccatgttgttgc 34640173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 34646662 - 34646847
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||   ||   ||||||||||    
T  34646662 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcttaatctataatttctgaaaattgacctaattgaataattttggaaaataataagaaaattagggtttg 34646761  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgc 188  Q
    |||||| |||||| ||  |||| ||||  || |||||| || | |   ||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34646762 atgatggttctgatgg--aatgagtaaagatgatgttagttttctctgaatttaacgttaagaatgaaaacttaatccatgttgttgc 34646847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 25469706 - 25469816
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||  |||   ||||||||||    
T  25469706 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataa-ttctg-aaattgacctaattgaatggttttggaaaataatatgaaaattagggtttg 25469803  T
Q  101 atgatgattctga 113  Q
    ||||| |||||||    
T  25469804 atgataattctga 25469816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 9187549 - 9187352
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctg-aaaattgacctaattgcatagttttggaagat--aaattgagggttagggt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||| ||||| || ||||||| || ||| | ||| ||  |||||| |  ||||||     
T  9187549 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcttaatacataatttctgaaaaatagatctaattgaattgttcttgaatataaaaattgggaattaggg- 9187451  T
Q  98 ttgatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatca 196  Q
    |||||| ||||| |||| ||||    |||| ||||||||| | | ||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  9187450 ttgatgctgattttgaaaggaatgatgtaagaatcatgtttaatgtgttgtaatttagtgttcagaatgatttcttaatctataatgttgttgtgatca 9187352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 25397227 - 25397172
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattga 56  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  25397227 aaggtaagggtgaggctaactctcgatgatcataatatataatttctgaaaattga 25397172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 24512845 - 24512899
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattg 55  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24512845 aaggtgagggtgagactatctctcaataatcatagtatataatttctgaaaattg 24512899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Original strand, 19471336 - 19471391
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattga 56  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19471336 aaggtaagggtgaggctacctctcgatgatcataatatataatttctggaaattga 19471391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 25348541 - 25348486
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattga 56  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||    
T  25348541 aaggtaagggtgagactatctctcaataataatagtatagaatttctgaaaattga 25348486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 25598697 - 25598643
Alignment:
Q  2 aggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattga 56  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  25598697 aggtaagggtgagactaactctcaatgatcataatatatattttctgaaaattga 25598643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 31252476 - 31252394
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaa 83  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  || || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| | |||||||||    
T  31252476 aaggtaagggtgagattatcttttaatgattataatatataatttctgaaaattaatctaattgaatagttcttgaagataaa 31252394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 282
Target Start/End: Original strand, 8727735 - 8728015
Alignment:
Q  2 aggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttt-ggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8727735 aggtaagggtgagattatccctcaataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaattgagggttagggtttg 8727834  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaa 200  Q
    | ||||||||||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  8727835 acgatgattctgaggggta-tgggtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgttcagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataaa 8727933  T
Q  201 ttgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8727934 ttgattgaaaattatgagtgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgatctgtaattgttgttgttgatg 8728015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 44477676 - 44477397
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44477676 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttg 44477577  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaa 200  Q
    ||||||||| || |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  44477576 atgatgattttg-aggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaacgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataaa 44477478  T
Q  201 ttgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  44477477 ttgattga-aattatgattgattggatgaattgatgaagatttgtatgatggtggaatgatctgtatttgttgttgttgatg 44477397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 44492834 - 44492555
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44492834 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttg 44492735  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaa 200  Q
    ||||||||| || |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  44492734 atgatgattttg-aggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaacgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataaa 44492636  T
Q  201 ttgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  44492635 ttgattga-aattatgattgattggatgaattgatgaagatttgtatgatggtggaatgatctgtatttgttgttgttgatg 44492555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23866668 - 23866396
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23866668 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatttataattcctgaaa-ttgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttg 23866570  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattct-gttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataa 199  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  23866569 atgatgattatgaagagaaatgggtaatgatcatgttaattctatttgtaatataatgttcagaatataaacttaatct-tgttgttgctctgatcgtaa 23866471  T
Q  200 attgattgagaa-ttatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttg 273  Q
    | |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  23866470 actgatttggaatttatgagtgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaataatctgtgattgttg 23866396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 91 - 274
Target Start/End: Original strand, 27940946 - 27941127
Alignment:
Q  91 ttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctg 190  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |     
T  27940946 ttagggtttgatgatgattctgaggggaa-tgggtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgttcagaatgaaaatttaatctatactgttgtta 27941044  T
Q  191 tgatcataaattgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgt 274  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| || || |||||||    
T  27941045 tgatcataaattgattga-aattatgattgattggatgaattgatgaagatttgtatgatggtggagtgatctatatttgttgt 27941127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17054644 - 17054440
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||    
T  17054644 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataattcctg-aaattgacctaattgaatagttttggaaaataagatgaaagttagggtttg 17054546  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgat-cataa 199  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||  || |||||| || | ||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |    
T  17054545 atgatgattctgatgg--aatgagtaaagatgatgttagtt-tcttggaatttaatgttaagaacgaaatcttaatccatgttgttgctgtaatccatga 17054449  T
Q  200 attgattga 208  Q
    |||||||||    
T  17054448 attgattga 17054440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 18614326 - 18614217
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagat-aaattgagggttagggttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||| || ||| | |||||| ||||||||  |||||||||    
T  18614326 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcatgatatataatttctgaaaattgatccaattgaattgttcttgaagataaaattgagaattagggttt 18614227  T
Q  100 gatgatgatt 109  Q
     ||| |||||    
T  18614226 tatgctgatt 18614217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 23482054 - 23482117
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattg 64  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23482054 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcatagtatataatttctgaaaattgatctaattg 23482117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 39364974 - 39364919
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattga 56  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||    
T  39364974 aaggtaagggtgagactatctctcaataataatagtatagaatttctgaaaattga 39364919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 29643387 - 29643440
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaatt 54  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29643387 aaggtaagggtgagattatctttcaataatcataatatgtaatttctgaaaatt 29643440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 14056565 - 14056619
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattg 55  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||| ||||||||||||    
T  14056565 aaggtaagggtgagactatctctcaataataatagtatgtaaattctgaaaattg 14056619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 25112030 - 25111976
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattg 55  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||| ||||||||||||    
T  25112030 aaggtaagggtgagactatctctcaataataatagtatgtaaattctgaaaattg 25111976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 24320672 - 24320725
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaatt 54  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  24320672 aaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaatt 24320725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 282
Target Start/End: Original strand, 14398 - 14678
Alignment:
Q  2 aggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttt-ggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14398 aggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaattgagggttagggtttg 14497  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14498 atgatgattctgaagggaaatgggtaatgatcatgttaattctgttgtaatgtgatgttccgaatgaaaacttaatctatgctgttgctgtgatcataaa 14597  T
Q  201 ttgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
     ||||||| || |||||  |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  14598 ctgattga-aaatatgattgattggataaattgatgaatattggtatgatggtggaatgatctgtatttgttgttgttgatg 14678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 19661455 - 19661734
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19661455 aaggtaagggtgagactttctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 19661554  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaa 200  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19661555 atgatgattctg-aggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatattgttgttgtgatcataaa 19661653  T
Q  201 ttgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||    
T  19661654 ttgattga-aattatgattgattggatgaattgatgaagatttgtatgatggtggagtgatctgtatttgttgttgttgatg 19661734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6483771 - 6483492
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6483771 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttg 6483672  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaa 200  Q
    ||||||||| || |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  6483671 atgatgattttg-aggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaacgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataaa 6483573  T
Q  201 ttgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  6483572 ttgattga-aattatgattgatgggatgaattgatgaagatttgtatgatggtggaatgatctgtatttgttgttgttgatg 6483492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6487238 - 6486959
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6487238 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttg 6487139  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaa 200  Q
    ||||||||| || |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  6487138 atgatgattttg-aggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaacgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataaa 6487040  T
Q  201 ttgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  6487039 ttgattga-aattatgattgatgggatgaattgatgaagatttgtatgatggtggaatgatctgtatttgttgttgttgatg 6486959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26583880 - 26583600
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  26583880 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaa-ttgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggcttg 26583782  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaa 200  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||| ||     
T  26583781 atgatgattctgaggggaaa-gggtaatgatcatgttaaatatgttgtaaagtgatgttcagaatgaattcctaatctataatgttgctgtgatcacaat 26583683  T
Q  201 ttgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatgtc 284  Q
    |||| |   |||||  |  | |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  26583682 ttgaattgtaattagaattggttggatgaattggtgaaattttgtatgatggtggaatgatctgt-attgttgttgttgatgtc 26583600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 284
Target Start/End: Original strand, 23089057 - 23089337
Alignment:
Q  2 aggtaagggtgagactatctctcgataatc-ataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaa-ttgagggttagggttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||   ||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  23089057 aggtaagggtgagactatctctcattaatagataatatttaatttcggaaaattgacctaattgcttaaccttg-aggataaaattgagggttagggttt 23089155  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataa 199  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| | | |||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23089156 gatgatgattct-aaggggaatgggtaatgatcatgttaattatgttgtaatgtgacgttcggaatgaaatcttaatctatactgttgctgtgatcataa 23089254  T
Q  200 attgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatgtc 284  Q
    ||||||||| || ||| |  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  23089255 attgattga-aaatataattgattggatgaattgatgaagttctgtatgatggtggaatgatctgt-attgttgttgttgatgtc 23089337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23879060 - 23878781
Alignment:
Q  2 aggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagat-aaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| || || |||||||||  ||||||||||||||||| ||   ||| | ||| |||||||||||||||||| |    
T  23879060 aggtaagggtgagactatctctcattaataattatatataatttcgaaaaattgacctaattgcttaaccttg-aggattaaattgagggttagggtt-g 23878963  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaa 200  Q
     |||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  23878962 ttgatgattctgaggggaatggggtaatgatcatgttaattatgttgtaatgtgatgttcagaatgaaatcttaatctatactgttgttgtgatcataaa 23878863  T
Q  201 ttgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatgtc 284  Q
    |||||||| || ||  |  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  23878862 ttgattga-aaatagaattgattggatgaattgatgaagttttgtatgatggtggaatgatctgt-attgttgttgttgatgtc 23878781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 23101464 - 23101745
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatc-ataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaa-ttgagggttagggtt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||| | ||||||| |||||||||||||||||  ||   ||| | |||||| |||||||||||||||    
T  23101464 aaggtaagggtgagactatctctcattaatagataatatgtaatttcggaaaattgacctaattgtttaaccttg-aggataaaattgagggttagggtt 23101562  T
Q  99 tgatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcata 198  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| | | |||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  23101563 tgatgatgattctgaggggaa-tgggtaatgatcatgttaattatgttgtaatgtgacgttcggaatgaaatcttaatctatactgttgttgtgatcata 23101661  T
Q  199 aattgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatgtc 284  Q
    |||||||||| || ||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||    
T  23101662 aattgattga-aaatataattgattggatgaattcatgaagttctgtatgatggtggaatgatcagt-attgttgttgttgatgtc 23101745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 5706025 - 5706137
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaat-tgagggttagggttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||| |  ||| |||   |||||||||    
T  5706025 aaggtaagggtgagactatctctcattaatcataatctataattcctgaaa-ttgacctaattgaatagtttttgaaaaataatatgaaaattagggttt 5706123  T
Q  100 gatgatgattctga 113  Q
    ||||||||||||||    
T  5706124 gatgatgattctga 5706137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 23265196 - 23265133
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattg 64  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23265196 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcatagtatataatttctgaaaattgatctaattg 23265133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 23280264 - 23280201
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattg 64  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23280264 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcatagtatataatttctgaaaattgatctaattg 23280201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 21908413 - 21908353
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaa 61  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  21908413 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcatgatatataatttctgaaaattgatctaa 21908353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 24661631 - 24661576
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattga 56  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24661631 aaggtaagggtgaggctaactctcgatgatcataatatataatttctgaaaattga 24661576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 10630 - 10577
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaatt 54  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10630 aaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaatt 10577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 25180931 - 25180984
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaatt 54  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25180931 aaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaatt 25180984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 20437025 - 20437305
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatag-ttttggaagataaattgagggttagggttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20437025 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaattgagggttagggttt 20437124  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataa 199  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  20437125 gatgatgattctg-aggggaatgggtattgatcatgttaattatgttgtaatgtaatgttcagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataa 20437223  T
Q  200 attgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  20437224 attgattga-aattatgattgattggatgaattgatgaagatttgtatgatggtggaatgatctgtatttgttgttgttgatg 20437305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 41112088 - 41111884
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||  |||||||||||    
T  41112088 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctg-aaattgacctaattgaatagttttgaaaaataagatgaaagttagggtttg 41111990  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgat-cataa 199  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||  |   ||||| || | ||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |    
T  41111989 atgatgattctgatgg--aatgagtaaagacggtgttagtt-tcttggaatttaatgttaagaacgaaatcttaatccatgttgttgctgtaatccatga 41111893  T
Q  200 attgattga 208  Q
    |||||||||    
T  41111892 attgattga 41111884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 32651626 - 32651563
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattg 64  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  32651626 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcatagtatataatttctgaaaattgatctaattg 32651563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 19663518 - 19663572
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattg 55  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  19663518 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcatagtatataatttctgaaaattg 19663572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 18712853 - 18712790
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattg 64  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18712853 aaggtatgggtgagactatctctcaataatcatagtatataatttctgaaaattgatctaattg 18712790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 20805375 - 20805320
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattga 56  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20805375 aaggtaagggtgaggctaactctcaatgatcataatatataatttctgaaaattga 20805320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 56
Target Start/End: Original strand, 10811785 - 10811839
Alignment:
Q  2 aggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattga 56  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||    
T  10811785 aggtaagggtgagactatctctcaataataatagtgtagaatttctgaaaattga 10811839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 11158147 - 11158093
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattg 55  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11158147 aaggtaagggtgagactaactctcaatgatcttaatatataatttctgaaaattg 11158093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 20851134 - 20851187
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaatt 54  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  20851134 aaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaatt 20851187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 20857761 - 20857814
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaatt 54  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  20857761 aaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaatt 20857814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 21706329 - 21706276
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaatt 54  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21706329 aaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaatt 21706276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 21710871 - 21710818
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaatt 54  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21710871 aaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaatt 21710818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 752 - 1027
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttt-ggaagataaattgagggttagggttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  752 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttttggaaaataaattgagggttagggttt 851  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataa 199  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  852 gatgaggattatgaagggaaatgggtaatgatcatgataatactcttgtaatataatgttcaggataaaaacttaatct-tgttgttgatgtgatcataa 950  T
Q  200 attgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 276  Q
    | ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  951 actgattgaaatttatgagtgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaaagatttgtgattgttgttg 1027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 111936 - 111674
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaa-ttgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111936 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggttt 111837  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  111836 gatgatgattctgaagggaaatgggtaatgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctttgttgctgctgtgatcataa 111737  T
Q  200 attgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    |||||||||                    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  111736 attgattga--------------------aattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgatctgtaattgttgttgttgatg 111674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 10197 - 10477
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatag-ttttggaagataaattgagggttagggttt 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10197 aaggtaagggtgggactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaattgtgggttagggttt 10296  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataa 199  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  10297 gatgatgattctg-aggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataa 10395  T
Q  200 attgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||    
T  10396 attgattga-aattatgattgattggatgaattgatgaagatttgtatgatggtggagtgatctgtatttgttgttgttgatg 10477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 1527 - 1807
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatag-ttttggaagataaattgagggttagggttt 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1527 aaggtaagggtgggactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaattgtgggttagggttt 1626  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataa 199  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  1627 gatgatgattctg-aggggaatgggtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataa 1725  T
Q  200 attgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||    
T  1726 attgattga-aattatgattgattggatgaattgatgaagatttgtatgatggtggagtgatctgtatttgttgttgttgatg 1807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 1899 - 2179
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaa-ttgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggttt 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1899 aaggtaagggtgagactatatctcaataatcataatctataatttctgaaaaattgacctaattgtatagttttggaaaataatttgagggttagggttt 1998  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataa 199  Q
    |||||||||| ||| ||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1999 gatgatgattttgatgg--aatgggtaatgattatgttaattctcttgtaatttaatgttcataatgaaaacttaatccttgttgttgctgtgatcataa 2096  T
Q  200 attgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
     |||||||| | | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||| |||||    
T  2097 cttgattgaaattgatgagtgattgtatgaattgatgaatttgtgtacgatggtggaataatctgtaaatgttgttgttgatg 2179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 8576 - 8856
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaa-ttgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggttt 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8576 aaggtaagggtgagactatatctcaataatcataatctataatttctgaaaaattgacctaattgtatagttttggaaaataatttgagggttagggttt 8675  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataa 199  Q
    |||||||||| ||| ||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8676 gatgatgattatgatgg--aatgggtaatgattatgttaattctcttgtaatttaatgttcaaaatgaaaacttaatccttgttgttgctgtgatcataa 8773  T
Q  200 attgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
     |||||||| | | || || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||| |||||    
T  8774 cttgattgaaattgataagtgattgtatgaattgatgaatttgtgtacgatggtggaataatctgtaaatgttgttgttgatg 8856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11395 - 11116
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagata-aattgagggttagggttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  11395 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcttagttttggaaaatagaattgagggttagggttt 11296  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataa 199  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||    
T  11295 gatgatgattctggaggg-aatgagtaatgatcatgttaattctgttgtaatgtgatgttcaaaatgaaatcttaatccatactgttgctgtgatcacaa 11197  T
Q  200 attgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    ||||||||| || ||| |  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||    
T  11196 attgattga-aaatataattgattggatgaattgatgaagttttgtatgatggtggattgatctgt-attgttgttgttgatg 11116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 344 - 75
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  344 aaggtaagggtgagactatctctcaataaccataatctataatttctgaaa-ttgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttg 246  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaa 200  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| | ||||| |||  |||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  245 atgatgattctg-aggggaatgggtaatgatcatgttaattttcttgtattatggtgttcagattgaagacttaatctatgttattgatgtgatcataaa 147  T
Q  201 ttgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttg 273  Q
    ||| |||| ||||||||  | |||||| |||||||||||   ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||    
T  146 ttggttga-aattatgattggttggataaattgatgaataattgtataatggtggagtgatctgtatttgttg 75  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 18223 - 17948
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatag-ttttggaagataaattgagggttagggttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  18223 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttttgaaaattgacctaattgcttagctttaggaaaataaattgagggttaaggttt 18124  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctg-ttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcata 198  Q
     ||||||||||| | ||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  18123 aatgatgattctaacgggaaat-ggtaatggtcatgttaattctgtttgtaatgtgatgtccagaatgaaaacttaacctatgttgttgctgtgatcatg 18025  T
Q  199 aattgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 276  Q
    |||||||||| ||||  ||  |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  18024 aattgattga-aatttggattgattggataaattgatgaatatttgtatgatggtgtgatgatctgtaattgttgttg 17948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 284
Target Start/End: Original strand, 3295 - 3576
Alignment:
Q  2 aggtaagggtgagactatctctcgataatc-ataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaa-ttgagggttagggttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||   ||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  3295 aggtaagggtgagactatctctcattaatagataatatgtaatttcggaaaattgacctaattgcttaaccttggg-gataaaattgagggttagggttt 3393  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaaatgggtaat-aatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcata 198  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |    
T  3394 gatgatgattctgaggggaa-tgggtaatgaatcatgttaattttgttgtaatgtgatgttcagaatgaaatcttaatctatactgttgctgtgatcaca 3492  T
Q  199 aattgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatgtc 284  Q
    |||||||||| || ||| |  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  3493 aattgattga-aaatataattgattggatgaattgatgaagttttgtatgatggtggaatgatctgt-attgttgttgttgatgtc 3576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 284
Target Start/End: Original strand, 3624 - 3904
Alignment:
Q  2 aggtaagggtgagactatctctcgataatc-ataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaa-ttgagggttagggttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||   ||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  3624 aggtaagggtgagactatctctcattaatagataatatgtaatttcggaaaattgacctaattgcttaaccttg-aggataaaattgagggttagggttt 3722  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataa 199  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  3723 gatgatgattctgaggggga-tgggtaatgatcatgttaattatgttgtaatgtgatgttcggaatgaaatcttaatctatactgttgttgtgatcataa 3821  T
Q  200 attgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttgatgatgtc 284  Q
    ||||||||| || ||| |  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||    
T  3822 attgattga-aaatataattgattggatgaattgatgaagttttgtatgatggtggaatgatttgt-attgttgttgttgatgtc 3904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 30911 - 30715
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagat-aaattgagggttagggttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  30911 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaaggtaaaattgaggattagggttt 30812  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatca 196  Q
    |||||||||| ||| |||||  | ||||  |||||||||| | ||||||||  | |||| |||||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||    
T  30811 gatgatgattttgaggggaatggtgtaacgatcatgttaaatatgttgtaaagtgatgtgcagaatgaattcctaatctataatgttgatgtgatca 30715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 159 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3558 - 3435
Alignment:
Q  159 tcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaat 258  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3558 tcagaatgaaaacttaatctttgttgttgctgtgatcataaattgattgaaatttatgggtgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaat 3459  T
Q  259 gagctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    || ||||||||||||||| |||||    
T  3458 gatctgtaattgttgttgttgatg 3435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0796 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0796
Description:

Target: scaffold0796; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 1734 - 2013
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||    
T  1734 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataattcctg-aaattgacctaattgaatagttttggaaaataatatgaaagttagggtttg 1832  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgat-cataa 199  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||  || |||||| || | | | ||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||  || ||| |    
T  1833 atgatgattctgatgg--aatgagtaaggatgatgttagttttctcggaatttaatgttaagaatgaaagcttaatccatgctgttgctgcaatccatta 1930  T
Q  200 attgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatga-gctgtaattgttgttgatgatg 282  Q
    | ||||||| | || |||   |||| |||||||||||||| |  | |||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  1931 actgattga-atttgtgatgaattgtatgaattgatgaatattgggatgatggtagaatgattctgtaattgttgttgttgatg 2013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0796; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 5757 - 5943
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||    
T  5757 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataattcctg-aaattgacctaattgaatagttttggaaaataatatgaaagttagggtttg 5855  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctg 190  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||  || |||||| || | | | ||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  5856 atgatgattctgatgg--aatgagtaaggatgatgttagttttctcggaatttaatgttaagaatgaaagcttaatccatgctgttgctg 5943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 4)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 985 - 904
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataa 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  985 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctatagtttctgaaaattgacctaattgcatagtcttggaagataa 904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 8130 - 8049
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataa 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8130 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctatagtttctgaaaattgacctaattgcatagtcttggaagataa 8049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 143 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 901 - 806
Alignment:
Q  143 tgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaat 239  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  901 tgttgtaatgtgatgttcagaatgaaaacttaatctgtgttgttgctgtgatcataaattgattg-gaattatgagggattggataaattgatgaat 806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 143 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8046 - 7951
Alignment:
Q  143 tgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaat 239  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  8046 tgttgtaatgtgatgttcagaatgaaaacttaatctgtgttgttgctgtgatcataaattgattg-gaattatgagggattggataaattgatgaat 7951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0129 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0129
Description:

Target: scaffold0129; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 45276 - 45386
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaat-tgagggttagggttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||| |  ||| |||   |||||||||    
T  45276 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcataatctataattcctgaaa-ttgacctaattgaatagtttttgaaaaataatatgaaaattagggttt 45374  T
Q  100 gatgatgattct 111  Q
    ||||||||||||    
T  45375 gatgatgattct 45386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 16874 - 16811
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattg 64  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  16874 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcatagtatataatttctgaaaattgatctaattg 16811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 116950 - 116887
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattg 64  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  116950 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcatagtatataatttctgaaaattgatctaattg 116887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 34277 - 34331
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattg 55  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  34277 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcatagtatataatttctgaaaattg 34331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 9 - 72
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattg 64  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  9 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcttaatacataatttctgaaaattgatctaattg 72  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 13686 - 13623
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattg 64  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  13686 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcttaatacataatttctgaaaattgatctaattg 13623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 101929 - 101992
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattg 64  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  101929 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcatagtatataattcctgaaaattgatctaattg 101992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 17697 - 17643
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattg 55  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  17697 aaggtaagggtgagactatctctcaataaccataatgtataatttctgaaaattg 17643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 40533 - 40587
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattg 55  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  40533 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcatagtatataatttctgaaaattg 40587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 135527 - 135473
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattg 55  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  135527 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcatagtatataatttctgaaaattg 135473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 22594 - 22646
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaat 53  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22594 aaggtaagggtgagactatctctcaataatcatagtatataatttctgaaaat 22646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 1440 - 1321
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagat-aaattgagggttagggttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||| ||||||  || ||| | || ||| ||| ||||  |||||||||    
T  1440 aaggtaagggtgagactatctttcaatgatcatgatatataatttttgaaaattgatctaattaaattgttcttgatgataaaactgagaattagggttt 1341  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaa 119  Q
    |||| ||||| |||| ||||    
T  1340 gatgctgattttgaaaggaa 1321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 12351 - 12296
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattga 56  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12351 aaggtaagggtgaggctaactctcaatgatcataatatataatttctgaaaattga 12296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0609
Description:

Target: scaffold0609; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 5859 - 5941
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaa 83  Q
    |||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| | |||||||||    
T  5859 aaggtaagggtgggattatctttcaatgattataatatataatttctgaaaattaatctaattgaatagttcttgaagataaa 5941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 14998 - 15052
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattg 55  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14998 aaggtaagggtgagactaactctcaatgatcttaatatataatttctgaaaattg 15052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 23571 - 23760
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaaga-taaattgagggttagggttt 99  Q
    |||||||||||| || ||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||| | ||||  | |||||| | |||||  ||||||||  ||||||| |    
T  23571 aaggtaagggtgggattatctttgaatgatcataatgtataatttctgaaaattaatctaaaagaatagttcttgaagacaaaattgagaattagggtgt 23670  T
Q  100 gatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgct 189  Q
    |||| ||||| |||| | |||   |||| ||||||||| | | ||||||||| | |||||||| ||||   ||||||||||  |||||||    
T  23671 gatgctgattttgaaagaaaagatgtaagaatcatgtttaatgtgttgtaatttgatgttcagtatgatttcttaatctataatgttgct 23760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 73337 - 73149
Alignment:
Q  2 aggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagat-aaattgagggttagggtttg 100  Q
    ||||||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| | ||||| | |||| | | |||||| ||||||||  ||||||| ||    
T  73337 aggtaagggtgggattatctttcaatgatcataatgtataatttatgaaaattaatctaataggatagctcttgaagataaaattgagaattagggtgtg 73238  T
Q  101 atgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctatgttgttgct 189  Q
    ||| ||||| |||| | ||  | |||| ||||||||| | | ||||||||| | |||||| | ||||   ||||||||||  |||||||    
T  73237 atgttgattttgaaagaaacggtgtaagaatcatgtttaatgtgttgtaatttgatgttccgtatgatttcttaatctataatgttgct 73149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Original strand, 39508 - 39563
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattga 56  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  39508 aaggtaagggtgaggctaactctcaatgatcataatatataatttcagaaaattga 39563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0815 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0815
Description:

Target: scaffold0815; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 1503 - 1453
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaa 51  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  1503 aaggtaagggtgagactaactctcaatgatcttaatgtataatttctgaaa 1453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 493030 - 493099
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtt 71  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||| | ||||||    
T  493030 aaggtaagggtgagattatctttcaataatc-taatgtataatttctgaaaattaatctaatggaatagtt 493099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1318 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1318
Description:

Target: scaffold1318; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 1914 - 1967
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaatt 54  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1914 aaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaatt 1967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 9389 - 9336
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaatt 54  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  9389 aaggtaagggtgggattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaatt 9336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 10292 - 10239
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaatt 54  Q
    ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  10292 aaggtaagggtgagattatcttccaataatcataatatgtaatttctgaaaatt 10239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 135491 - 135438
Alignment:
Q  1 aaggtaagggtgagactatctctcgataatcataatctataatttctgaaaatt 54  Q
    |||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  135491 aaggtaagcgtgagattatctttcaatagtcataatatataatttctgaaaatt 135438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University