View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18977_high_11 (Length: 232)

Name: NF18977_high_11
Description: NF18977
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18977_high_11
NF18977_high_11
[»] chr5 (129 HSPs)
chr5 (16-216)||(34782807-34783007)
chr5 (16-214)||(20797648-20797846)
chr5 (16-216)||(34771862-34772062)
chr5 (17-216)||(43043782-43043981)
chr5 (16-216)||(10754445-10754644)
chr5 (22-214)||(42394933-42395125)
chr5 (16-216)||(24926249-24926449)
chr5 (16-216)||(36084412-36084612)
chr5 (16-216)||(36228690-36228890)
chr5 (16-214)||(8521794-8521992)
chr5 (16-213)||(1109255-1109452)
chr5 (16-216)||(20562291-20562491)
chr5 (16-216)||(24983530-24983730)
chr5 (16-213)||(1122013-1122210)
chr5 (18-216)||(20551766-20551964)
chr5 (16-214)||(31448505-31448703)
chr5 (16-214)||(31418614-31418812)
chr5 (16-214)||(43621969-43622168)
chr5 (16-216)||(17457421-17457621)
chr5 (16-216)||(19477952-19478152)
chr5 (16-216)||(30070016-30070215)
chr5 (16-214)||(23406399-23406597)
chr5 (16-216)||(17446805-17447005)
chr5 (16-216)||(19463922-19464122)
chr5 (16-214)||(23392669-23392867)
chr5 (16-214)||(34062572-34062771)
chr5 (16-183)||(21706085-21706252)
chr5 (16-183)||(21703238-21703405)
chr5 (22-214)||(34051911-34052104)
chr5 (16-218)||(5290686-5290887)
chr5 (16-218)||(9377572-9377773)
chr5 (16-218)||(14558127-14558328)
chr5 (16-218)||(14568764-14568965)
chr5 (16-218)||(23296226-23296427)
chr5 (16-218)||(23306794-23306995)
chr5 (16-218)||(24816996-24817197)
chr5 (16-218)||(24827584-24827785)
chr5 (16-218)||(27203742-27203943)
chr5 (16-218)||(27622877-27623078)
chr5 (16-218)||(39362263-39362464)
chr5 (16-217)||(31815113-31815313)
chr5 (16-220)||(23707390-23707593)
chr5 (16-218)||(6975757-6975958)
chr5 (16-218)||(9335905-9336106)
chr5 (16-218)||(9346492-9346693)
chr5 (16-218)||(15694141-15694342)
chr5 (16-218)||(16004001-16004202)
chr5 (16-218)||(22146470-22146671)
chr5 (16-218)||(22157053-22157254)
chr5 (16-218)||(24567039-24567240)
chr5 (16-218)||(24807862-24808063)
chr5 (16-218)||(39352437-39352638)
chr5 (16-218)||(42042734-42042935)
chr5 (16-218)||(42053309-42053510)
chr5 (16-217)||(31843909-31844109)
chr5 (16-220)||(30227607-30227810)
chr5 (16-220)||(30238134-30238337)
chr5 (16-218)||(5301262-5301463)
chr5 (16-218)||(6986247-6986448)
chr5 (16-218)||(7032238-7032439)
chr5 (16-218)||(14447110-14447311)
chr5 (16-218)||(14457722-14457923)
chr5 (16-210)||(15739924-15740117)
chr5 (16-210)||(15769084-15769277)
chr5 (16-218)||(22559386-22559587)
chr5 (16-218)||(40400968-40401169)
chr5 (16-216)||(21414308-21414507)
chr5 (16-218)||(6130738-6130939)
chr5 (16-218)||(14029993-14030194)
chr5 (16-218)||(14040546-14040747)
chr5 (16-218)||(15993439-15993640)
chr5 (16-218)||(23362059-23362260)
chr5 (16-218)||(27603528-27603729)
chr5 (16-210)||(33951911-33952104)
chr5 (16-210)||(35226046-35226239)
chr5 (16-218)||(36582668-36582869)
chr5 (16-218)||(36593223-36593424)
chr5 (18-214)||(37406608-37406797)
chr5 (16-218)||(39491060-39491261)
chr5 (16-218)||(39502250-39502451)
chr5 (16-218)||(40390306-40390507)
chr5 (16-218)||(40514100-40514301)
chr5 (16-218)||(22676065-22676266)
chr5 (16-218)||(22685956-22686157)
chr5 (16-210)||(27042322-27042515)
chr5 (16-218)||(27460110-27460311)
chr5 (16-218)||(27470509-27470710)
chr5 (16-210)||(35215462-35215655)
chr5 (16-218)||(23372460-23372662)
chr5 (16-216)||(106069-106269)
chr5 (16-216)||(20624716-20624915)
chr5 (16-210)||(27052946-27053140)
chr5 (16-210)||(17718875-17719068)
chr5 (16-210)||(17729527-17729720)
chr5 (16-210)||(17607020-17607211)
chr5 (16-210)||(17617634-17617825)
chr5 (16-210)||(31348494-31348685)
chr5 (16-210)||(31359108-31359299)
chr5 (16-155)||(36687707-36687846)
chr5 (16-155)||(36698273-36698412)
chr5 (16-216)||(20416854-20417052)
chr5 (16-142)||(37729362-37729488)
chr5 (16-142)||(37740678-37740804)
chr5 (16-129)||(32754055-32754167)
chr5 (127-214)||(21520012-21520099)
chr5 (24-62)||(36095755-36095793)
chr5 (24-62)||(36097212-36097250)
chr5 (17-62)||(13405122-13405167)
chr5 (16-62)||(23478374-23478421)
chr5 (27-62)||(35543231-35543266)
chr5 (17-62)||(1915423-1915469)
chr5 (24-62)||(13523202-13523240)
chr5 (24-62)||(13533929-13533967)
chr5 (24-62)||(20168169-20168207)
chr5 (17-62)||(20215201-20215247)
chr5 (25-62)||(40228673-40228710)
chr5 (16-46)||(4887027-4887057)
chr5 (16-46)||(15516974-15517004)
chr5 (17-51)||(16607518-16607552)
chr5 (16-46)||(20550900-20550930)
chr5 (16-46)||(25096928-25096958)
chr5 (18-59)||(25111966-25112008)
chr5 (16-46)||(25154898-25154928)
chr5 (18-59)||(25171057-25171099)
chr5 (16-46)||(30742985-30743015)
chr5 (16-46)||(33933272-33933302)
chr5 (16-46)||(42243685-42243715)
chr5 (19-56)||(26119922-26119959)
chr5 (18-46)||(26759156-26759184)
[»] chr4 (81 HSPs)
chr4 (16-216)||(5022958-5023158)
chr4 (16-216)||(18077742-18077942)
chr4 (16-214)||(40454187-40454385)
chr4 (16-214)||(40470426-40470624)
chr4 (17-214)||(25657359-25657557)
chr4 (16-216)||(4987496-4987696)
chr4 (16-214)||(14835942-14836140)
chr4 (16-214)||(15207252-15207450)
chr4 (16-214)||(3370938-3371135)
chr4 (16-183)||(47151949-47152116)
chr4 (16-214)||(16305329-16305527)
chr4 (16-214)||(16317553-16317751)
chr4 (16-183)||(10909631-10909798)
chr4 (16-214)||(3390678-3390875)
chr4 (20-214)||(5873596-5873790)
chr4 (16-183)||(10695862-10696029)
chr4 (16-216)||(24713653-24713853)
chr4 (16-214)||(19581463-19581662)
chr4 (16-181)||(18762972-18763137)
chr4 (16-218)||(461381-461582)
chr4 (16-218)||(4948559-4948760)
chr4 (16-218)||(14843488-14843689)
chr4 (16-218)||(24027920-24028121)
chr4 (16-218)||(30926329-30926530)
chr4 (16-218)||(30936907-30937108)
chr4 (16-218)||(52704012-52704213)
chr4 (16-181)||(18752362-18752527)
chr4 (16-216)||(10300757-10300956)
chr4 (16-216)||(31266635-31266834)
chr4 (16-218)||(450800-451001)
chr4 (16-218)||(15560914-15561115)
chr4 (16-218)||(17918276-17918477)
chr4 (16-218)||(17928924-17929125)
chr4 (16-218)||(27814780-27814981)
chr4 (16-218)||(36018560-36018761)
chr4 (16-218)||(36029113-36029314)
chr4 (16-218)||(48371355-48371556)
chr4 (16-216)||(11536068-11536267)
chr4 (16-218)||(16256093-16256294)
chr4 (16-218)||(16266686-16266887)
chr4 (16-218)||(19944162-19944363)
chr4 (16-218)||(22007235-22007436)
chr4 (18-218)||(19954797-19954996)
chr4 (16-218)||(10751003-10751204)
chr4 (16-218)||(10964772-10964973)
chr4 (16-218)||(21996637-21996838)
chr4 (16-210)||(24640472-24640665)
chr4 (16-210)||(49518359-49518552)
chr4 (16-218)||(55745087-55745288)
chr4 (16-218)||(55755698-55755899)
chr4 (16-216)||(11515258-11515456)
chr4 (16-218)||(10740429-10740630)
chr4 (16-218)||(10954198-10954399)
chr4 (16-210)||(27656825-27657018)
chr4 (16-210)||(27667398-27667591)
chr4 (16-218)||(18130075-18130275)
chr4 (16-216)||(55651547-55651745)
chr4 (16-213)||(49001820-49002015)
chr4 (93-216)||(39525998-39526119)
chr4 (17-62)||(18007071-18007116)
chr4 (16-62)||(33378414-33378461)
chr4 (24-62)||(8997268-8997306)
chr4 (24-62)||(16819364-16819402)
chr4 (24-62)||(23509348-23509386)
chr4 (17-62)||(14710790-14710835)
chr4 (17-62)||(14778454-14778499)
chr4 (17-62)||(17993805-17993850)
chr4 (17-62)||(19244002-19244047)
chr4 (17-62)||(36210119-36210165)
chr4 (185-216)||(20648470-20648501)
chr4 (16-46)||(1672392-1672422)
chr4 (16-46)||(1674867-1674897)
chr4 (16-46)||(6641687-6641717)
chr4 (16-46)||(10692854-10692884)
chr4 (16-46)||(10906620-10906650)
chr4 (16-46)||(14604985-14605015)
chr4 (16-46)||(16853506-16853536)
chr4 (16-46)||(25651182-25651212)
chr4 (16-46)||(29121373-29121403)
chr4 (16-46)||(54679933-54679963)
chr4 (24-117)||(18774613-18774705)
[»] chr8 (80 HSPs)
chr8 (16-214)||(19225149-19225347)
chr8 (16-214)||(30314563-30314761)
chr8 (16-213)||(20161097-20161294)
chr8 (16-213)||(20196173-20196370)
chr8 (16-216)||(23457168-23457369)
chr8 (16-216)||(19418567-19418767)
chr8 (16-216)||(19429144-19429344)
chr8 (16-216)||(31215231-31215430)
chr8 (16-216)||(23469324-23469525)
chr8 (16-214)||(16747216-16747414)
chr8 (16-216)||(6318382-6318581)
chr8 (16-214)||(18153950-18154149)
chr8 (16-178)||(1750309-1750471)
chr8 (16-214)||(18769004-18769202)
chr8 (16-214)||(18158470-18158669)
chr8 (16-218)||(26121126-26121327)
chr8 (89-216)||(28691189-28691316)
chr8 (16-218)||(210017-210218)
chr8 (16-218)||(252624-252825)
chr8 (16-218)||(723640-723841)
chr8 (16-218)||(848831-849032)
chr8 (16-218)||(19139496-19139697)
chr8 (16-218)||(36078152-36078353)
chr8 (16-218)||(36088738-36088939)
chr8 (16-218)||(36293135-36293336)
chr8 (16-218)||(36303738-36303939)
chr8 (16-218)||(6576383-6576584)
chr8 (16-218)||(26111448-26111649)
chr8 (16-218)||(29076946-29077147)
chr8 (16-218)||(29087197-29087398)
chr8 (16-218)||(242039-242240)
chr8 (16-218)||(3220848-3221049)
chr8 (16-218)||(6161241-6161442)
chr8 (16-218)||(18449586-18449787)
chr8 (16-218)||(32077560-32077761)
chr8 (16-218)||(32088133-32088334)
chr8 (16-218)||(6151286-6151488)
chr8 (16-218)||(9341360-9341561)
chr8 (16-218)||(9368504-9368705)
chr8 (16-218)||(9856335-9856536)
chr8 (16-218)||(15791162-15791363)
chr8 (16-206)||(19128964-19129153)
chr8 (30-218)||(43248547-43248734)
chr8 (16-214)||(40213036-40213235)
chr8 (16-218)||(3348490-3348691)
chr8 (16-218)||(3359087-3359288)
chr8 (16-218)||(15780573-15780774)
chr8 (16-210)||(13688438-13688631)
chr8 (16-106)||(30325227-30325317)
chr8 (16-216)||(3843738-3843936)
chr8 (16-216)||(20259484-20259682)
chr8 (16-216)||(21046114-21046312)
chr8 (143-214)||(30325160-30325231)
chr8 (16-133)||(44481307-44481424)
chr8 (16-133)||(44491923-44492040)
chr8 (16-216)||(23370764-23370962)
chr8 (16-115)||(7018348-7018446)
chr8 (17-62)||(23271223-23271268)
chr8 (114-218)||(16436923-16437026)
chr8 (24-62)||(22135877-22135915)
chr8 (24-62)||(22167042-22167080)
chr8 (24-62)||(22211407-22211445)
chr8 (17-62)||(8032036-8032081)
chr8 (17-62)||(19461165-19461210)
chr8 (17-62)||(19558843-19558888)
chr8 (16-62)||(28903460-28903507)
chr8 (17-62)||(40003231-40003277)
chr8 (16-51)||(26833037-26833072)
chr8 (16-46)||(1237638-1237668)
chr8 (16-46)||(9320569-9320599)
chr8 (16-46)||(15336208-15336238)
chr8 (16-46)||(15425273-15425303)
chr8 (16-46)||(15516577-15516607)
chr8 (17-62)||(17519161-17519207)
chr8 (16-46)||(17797423-17797453)
chr8 (16-46)||(19943236-19943266)
chr8 (18-59)||(21540955-21540997)
chr8 (17-62)||(29379580-29379626)
chr8 (16-46)||(45538559-45538589)
chr8 (19-51)||(17687986-17688018)
[»] chr3 (143 HSPs)
chr3 (16-216)||(6490180-6490380)
chr3 (16-216)||(6500834-6501034)
chr3 (16-216)||(12237445-12237645)
chr3 (16-216)||(12249271-12249471)
chr3 (16-218)||(7804347-7804549)
chr3 (18-216)||(24706385-24706583)
chr3 (16-216)||(9535812-9536012)
chr3 (16-214)||(23635914-23636112)
chr3 (16-216)||(9993725-9993924)
chr3 (16-216)||(17909833-17910033)
chr3 (16-216)||(9981717-9981916)
chr3 (16-216)||(19887185-19887385)
chr3 (16-218)||(7794436-7794638)
chr3 (16-213)||(29461047-29461244)
chr3 (16-214)||(16391447-16391645)
chr3 (16-213)||(29471899-29472096)
chr3 (16-216)||(48337445-48337645)
chr3 (16-216)||(933831-934031)
chr3 (16-216)||(4404476-4404676)
chr3 (16-216)||(4457119-4457319)
chr3 (16-216)||(9391033-9391233)
chr3 (16-216)||(9380487-9380687)
chr3 (16-216)||(11216552-11216752)
chr3 (20-214)||(16348467-16348662)
chr3 (16-214)||(38314903-38315101)
chr3 (16-211)||(11164033-11164228)
chr3 (16-214)||(1783903-1784101)
chr3 (16-214)||(1794315-1794513)
chr3 (16-218)||(13383093-13383294)
chr3 (16-214)||(28169285-28169483)
chr3 (16-214)||(14321514-14321713)
chr3 (16-214)||(18851524-18851723)
chr3 (16-218)||(526363-526564)
chr3 (16-218)||(4174586-4174787)
chr3 (16-218)||(5510900-5511101)
chr3 (16-218)||(6180357-6180558)
chr3 (16-218)||(6220531-6220732)
chr3 (16-218)||(13372499-13372700)
chr3 (16-218)||(13393687-13393888)
chr3 (16-218)||(16476483-16476684)
chr3 (16-218)||(19789227-19789428)
chr3 (16-218)||(23647953-23648154)
chr3 (16-218)||(41683883-41684084)
chr3 (16-218)||(41694452-41694653)
chr3 (16-217)||(5521078-5521278)
chr3 (16-216)||(27883587-27883786)
chr3 (16-179)||(12567138-12567301)
chr3 (16-179)||(13261541-13261704)
chr3 (19-218)||(16493245-16493443)
chr3 (16-218)||(503997-504198)
chr3 (16-218)||(5536851-5537052)
chr3 (16-218)||(5547435-5547636)
chr3 (16-218)||(12286808-12287009)
chr3 (16-218)||(12296630-12296831)
chr3 (16-218)||(19778590-19778791)
chr3 (16-218)||(20673025-20673226)
chr3 (16-218)||(20683610-20683811)
chr3 (16-218)||(23768099-23768300)
chr3 (16-218)||(37759875-37760076)
chr3 (16-218)||(37885783-37885984)
chr3 (16-218)||(39672712-39672913)
chr3 (17-217)||(10655094-10655293)
chr3 (16-218)||(4743942-4744143)
chr3 (16-218)||(4754527-4754728)
chr3 (16-218)||(5579463-5579664)
chr3 (16-218)||(5627847-5628048)
chr3 (16-218)||(5865523-5865724)
chr3 (16-218)||(5876122-5876323)
chr3 (16-214)||(8739961-8740158)
chr3 (16-218)||(13557779-13557980)
chr3 (16-218)||(18484250-18484451)
chr3 (16-218)||(20721318-20721519)
chr3 (16-218)||(23757503-23757704)
chr3 (16-218)||(24660105-24660306)
chr3 (16-218)||(24670685-24670886)
chr3 (16-218)||(28314061-28314262)
chr3 (16-218)||(28324677-28324878)
chr3 (16-218)||(37866650-37866851)
chr3 (16-210)||(38194930-38195123)
chr3 (16-210)||(38205466-38205659)
chr3 (17-210)||(10626779-10626971)
chr3 (16-216)||(1064342-1064541)
chr3 (16-218)||(8774863-8775064)
chr3 (16-218)||(8785448-8785649)
chr3 (16-218)||(13121867-13122068)
chr3 (16-218)||(13132110-13132311)
chr3 (16-218)||(14465796-14465997)
chr3 (16-218)||(14476428-14476629)
chr3 (16-218)||(24383348-24383549)
chr3 (16-218)||(35187582-35187783)
chr3 (16-210)||(39382896-39383089)
chr3 (16-216)||(16077133-16077332)
chr3 (20-216)||(16665959-16666154)
chr3 (16-179)||(8995825-8995987)
chr3 (16-210)||(11272220-11272413)
chr3 (16-210)||(39372259-39372452)
chr3 (16-216)||(17281264-17281464)
chr3 (20-216)||(1053917-1054112)
chr3 (20-216)||(16670994-16671189)
chr3 (16-215)||(15216173-15216371)
chr3 (16-209)||(10099272-10099465)
chr3 (16-179)||(9006377-9006539)
chr3 (16-216)||(14581342-14581541)
chr3 (17-218)||(16487098-16487298)
chr3 (16-216)||(29933396-29933589)
chr3 (16-216)||(29982550-29982743)
chr3 (16-216)||(13199074-13199273)
chr3 (16-216)||(2246571-2246769)
chr3 (18-216)||(29906018-29906209)
chr3 (18-216)||(29947183-29947374)
chr3 (18-216)||(29996337-29996528)
chr3 (17-62)||(31113971-31114016)
chr3 (24-62)||(15651055-15651093)
chr3 (24-62)||(15662690-15662728)
chr3 (24-62)||(21736322-21736360)
chr3 (24-62)||(51989128-51989166)
chr3 (18-62)||(15833414-15833459)
chr3 (17-62)||(41045752-41045797)
chr3 (17-62)||(10529355-10529401)
chr3 (17-62)||(17022036-17022082)
chr3 (16-62)||(15851017-15851065)
chr3 (16-59)||(51341019-51341063)
chr3 (24-62)||(13148282-13148321)
chr3 (15-46)||(18121743-18121774)
chr3 (15-46)||(18142873-18142904)
chr3 (16-46)||(2561196-2561226)
chr3 (16-46)||(5213585-5213615)
chr3 (16-46)||(6090740-6090770)
chr3 (16-46)||(11868277-11868307)
chr3 (16-46)||(12388993-12389023)
chr3 (16-46)||(12726351-12726381)
chr3 (16-46)||(14955435-14955465)
chr3 (16-46)||(16032533-16032563)
chr3 (16-46)||(25398376-25398406)
chr3 (24-62)||(27173044-27173082)
chr3 (16-46)||(29855417-29855447)
chr3 (16-46)||(40799882-40799912)
chr3 (16-46)||(47207714-47207744)
chr3 (16-46)||(53056848-53056878)
chr3 (17-46)||(2785073-2785102)
chr3 (19-51)||(16880026-16880058)
chr3 (18-46)||(38177764-38177792)
chr3 (18-46)||(49553610-49553638)
[»] chr6 (102 HSPs)
chr6 (17-216)||(26044368-26044567)
chr6 (16-214)||(25787855-25788053)
chr6 (16-214)||(12827847-12828045)
chr6 (16-218)||(6158361-6158563)
chr6 (16-216)||(7375600-7375800)
chr6 (16-216)||(20029746-20029946)
chr6 (18-214)||(11147093-11147289)
chr6 (16-216)||(20062497-20062697)
chr6 (16-217)||(28251407-28251607)
chr6 (16-217)||(28356554-28356754)
chr6 (18-218)||(25986238-25986437)
chr6 (16-214)||(18925606-18925804)
chr6 (20-216)||(13913207-13913403)
chr6 (20-216)||(13928346-13928542)
chr6 (16-183)||(8653814-8653981)
chr6 (16-218)||(27506098-27506299)
chr6 (16-218)||(27372988-27373189)
chr6 (16-218)||(27463338-27463539)
chr6 (16-218)||(3661537-3661738)
chr6 (16-218)||(3672201-3672402)
chr6 (16-218)||(31542738-31542939)
chr6 (96-216)||(32761774-32761894)
chr6 (16-214)||(16123380-16123579)
chr6 (16-218)||(16930605-16930806)
chr6 (16-218)||(17984550-17984751)
chr6 (16-210)||(26864943-26865136)
chr6 (16-210)||(26875567-26875760)
chr6 (16-218)||(29384906-29385107)
chr6 (16-218)||(34807000-34807201)
chr6 (16-218)||(34817632-34817833)
chr6 (16-218)||(9112335-9112536)
chr6 (16-218)||(9122972-9123173)
chr6 (16-218)||(12855176-12855377)
chr6 (16-218)||(12865702-12865903)
chr6 (16-218)||(16959776-16959977)
chr6 (16-218)||(26036188-26036389)
chr6 (16-218)||(32961769-32961970)
chr6 (16-217)||(7751077-7751277)
chr6 (16-216)||(31572568-31572767)
chr6 (16-218)||(26025614-26025815)
chr6 (16-210)||(27341849-27342042)
chr6 (16-210)||(27402589-27402782)
chr6 (16-210)||(27413248-27413441)
chr6 (16-210)||(31982474-31982667)
chr6 (16-218)||(32972388-32972589)
chr6 (16-216)||(18826081-18826280)
chr6 (16-216)||(18834477-18834676)
chr6 (16-216)||(27166286-27166485)
chr6 (16-218)||(33199483-33199683)
chr6 (102-214)||(9468-9580)
chr6 (16-208)||(12716684-12716875)
chr6 (16-208)||(12727333-12727524)
chr6 (16-216)||(4292880-4293079)
chr6 (20-216)||(9933514-9933709)
chr6 (16-132)||(29765689-29765805)
chr6 (16-209)||(22308944-22309136)
chr6 (16-216)||(5845238-5845455)
chr6 (16-141)||(17982417-17982542)
chr6 (16-216)||(25686591-25686791)
chr6 (16-217)||(27384587-27384787)
chr6 (16-217)||(27475000-27475200)
chr6 (16-210)||(27504499-27504692)
chr6 (16-216)||(17745607-17745824)
chr6 (16-155)||(4631028-4631167)
chr6 (16-215)||(25675315-25675515)
chr6 (16-215)||(25679391-25679591)
chr6 (16-215)||(25722800-25723000)
chr6 (16-155)||(32300945-32301084)
chr6 (16-155)||(32311634-32311773)
chr6 (16-216)||(17741546-17741744)
chr6 (16-216)||(25518844-25519041)
chr6 (16-215)||(25735400-25735600)
chr6 (93-214)||(16123059-16123180)
chr6 (20-132)||(17042780-17042892)
chr6 (20-132)||(17064353-17064465)
chr6 (110-214)||(17577640-17577744)
chr6 (17-62)||(11206101-11206146)
chr6 (16-62)||(7586252-7586298)
chr6 (20-62)||(17608401-17608443)
chr6 (16-62)||(20635728-20635775)
chr6 (16-62)||(22386811-22386858)
chr6 (24-62)||(12953126-12953164)
chr6 (24-62)||(18498782-18498820)
chr6 (24-62)||(18555432-18555470)
chr6 (24-62)||(19289376-19289414)
chr6 (16-62)||(21128235-21128281)
chr6 (24-62)||(31931585-31931623)
chr6 (22-62)||(11235659-11235699)
chr6 (16-51)||(19625817-19625852)
chr6 (16-46)||(9717852-9717882)
chr6 (16-46)||(14100550-14100580)
chr6 (16-46)||(15954712-15954742)
chr6 (16-46)||(16877222-16877252)
chr6 (24-62)||(17047717-17047755)
chr6 (16-46)||(21618253-21618283)
chr6 (16-46)||(29918026-29918056)
chr6 (16-46)||(32544274-32544304)
chr6 (19-56)||(18172134-18172171)
chr6 (17-46)||(21235135-21235164)
chr6 (18-46)||(13435543-13435571)
chr6 (19-51)||(19875844-19875876)
chr6 (18-46)||(22802152-22802180)
[»] chr7 (92 HSPs)
chr7 (16-214)||(15888242-15888440)
chr7 (16-216)||(589401-589601)
chr7 (16-213)||(3165923-3166120)
chr7 (16-216)||(1367818-1368018)
chr7 (16-218)||(9171174-9171376)
chr7 (16-213)||(44280685-44280882)
chr7 (16-218)||(9170373-9170575)
chr7 (16-218)||(9159918-9160120)
chr7 (16-214)||(31116424-31116622)
chr7 (16-213)||(20491195-20491392)
chr7 (16-216)||(21769854-21770054)
chr7 (16-216)||(14745580-14745780)
chr7 (16-218)||(19985721-19985924)
chr7 (16-214)||(40054666-40054865)
chr7 (16-216)||(18441385-18441584)
chr7 (16-218)||(467491-467692)
chr7 (16-218)||(2705522-2705723)
chr7 (16-218)||(6877767-6877968)
chr7 (16-218)||(20989842-20990043)
chr7 (16-218)||(24930513-24930714)
chr7 (16-218)||(48710401-48710602)
chr7 (16-216)||(18419304-18419503)
chr7 (15-218)||(9444048-9444250)
chr7 (16-218)||(454709-454910)
chr7 (16-210)||(541274-541467)
chr7 (16-210)||(1987730-1987923)
chr7 (16-210)||(1998351-1998544)
chr7 (16-218)||(2716126-2716327)
chr7 (16-218)||(4212200-4212401)
chr7 (16-218)||(4222799-4223000)
chr7 (16-218)||(5685708-5685909)
chr7 (16-218)||(6867135-6867336)
chr7 (16-218)||(8617575-8617776)
chr7 (16-218)||(9085472-9085673)
chr7 (16-218)||(9095186-9095387)
chr7 (16-218)||(9433453-9433654)
chr7 (16-210)||(11096244-11096437)
chr7 (16-218)||(21002918-21003119)
chr7 (16-214)||(30049708-30049906)
chr7 (16-218)||(37344389-37344590)
chr7 (16-218)||(40042019-40042220)
chr7 (16-218)||(40052568-40052769)
chr7 (16-218)||(8628138-8628339)
chr7 (16-218)||(11005374-11005575)
chr7 (16-218)||(17950028-17950229)
chr7 (16-218)||(17960634-17960835)
chr7 (16-218)||(22089312-22089513)
chr7 (16-218)||(22099927-22100128)
chr7 (16-218)||(26653235-26653436)
chr7 (16-218)||(26699564-26699765)
chr7 (16-214)||(38593648-38593846)
chr7 (16-216)||(6044123-6044322)
chr7 (16-218)||(167071-167272)
chr7 (16-218)||(26390006-26390207)
chr7 (16-218)||(26400648-26400849)
chr7 (16-215)||(177663-177861)
chr7 (16-210)||(8001982-8002175)
chr7 (16-210)||(8012627-8012820)
chr7 (16-210)||(42866017-42866210)
chr7 (16-210)||(42876643-42876836)
chr7 (16-218)||(24734942-24735143)
chr7 (16-218)||(24744889-24745090)
chr7 (16-216)||(8933709-8933908)
chr7 (16-216)||(48382335-48382534)
chr7 (18-216)||(26209461-26209657)
chr7 (16-216)||(3476253-3476451)
chr7 (16-216)||(13682510-13682708)
chr7 (16-216)||(29590182-29590380)
chr7 (16-216)||(12734079-12734277)
chr7 (16-216)||(15216506-15216704)
chr7 (16-92)||(26294064-26294140)
chr7 (167-213)||(9261677-9261723)
chr7 (100-218)||(26290261-26290378)
chr7 (17-62)||(8998998-8999043)
chr7 (25-60)||(11087110-11087145)
chr7 (27-62)||(24882485-24882520)
chr7 (17-62)||(13174668-13174714)
chr7 (16-46)||(4821479-4821509)
chr7 (16-46)||(14426552-14426582)
chr7 (16-46)||(19237166-19237196)
chr7 (16-46)||(21283496-21283526)
chr7 (16-46)||(22578144-22578174)
chr7 (16-46)||(24788146-24788176)
chr7 (16-46)||(27871723-27871753)
chr7 (16-46)||(28409044-28409074)
chr7 (16-46)||(30944446-30944476)
chr7 (16-46)||(44467069-44467099)
chr7 (19-56)||(13172465-13172502)
chr7 (17-46)||(19339373-19339402)
chr7 (121-218)||(22494073-22494169)
chr7 (145-218)||(23264501-23264573)
chr7 (16-44)||(13894123-13894151)
[»] chr1 (88 HSPs)
chr1 (16-214)||(4250441-4250639)
chr1 (16-216)||(39193968-39194168)
chr1 (16-213)||(154166-154363)
chr1 (16-213)||(148091-148288)
chr1 (16-216)||(7689332-7689533)
chr1 (16-213)||(5973896-5974094)
chr1 (16-216)||(20441191-20441391)
chr1 (16-183)||(18381811-18381978)
chr1 (16-211)||(39587102-39587297)
chr1 (16-214)||(47195394-47195592)
chr1 (16-218)||(2538668-2538869)
chr1 (16-218)||(4167392-4167593)
chr1 (16-218)||(4178048-4178249)
chr1 (16-218)||(5639583-5639784)
chr1 (16-218)||(5650140-5650341)
chr1 (16-218)||(12730680-12730881)
chr1 (16-218)||(12897856-12898057)
chr1 (16-218)||(23580199-23580400)
chr1 (16-218)||(35013055-35013256)
chr1 (16-214)||(17957372-17957571)
chr1 (16-218)||(19187971-19188173)
chr1 (16-218)||(3171756-3171957)
chr1 (16-218)||(3182358-3182559)
chr1 (16-218)||(12614189-12614390)
chr1 (16-218)||(12741273-12741474)
chr1 (16-218)||(21863794-21863995)
chr1 (16-218)||(21877900-21878101)
chr1 (16-218)||(7507435-7507636)
chr1 (16-218)||(7518032-7518233)
chr1 (16-218)||(12623654-12623855)
chr1 (16-210)||(21895335-21895528)
chr1 (18-218)||(33084697-33084896)
chr1 (16-179)||(12946848-12947010)
chr1 (16-210)||(5833352-5833545)
chr1 (16-210)||(5843954-5844147)
chr1 (16-218)||(10997657-10997858)
chr1 (16-210)||(35401045-35401238)
chr1 (16-210)||(35404272-35404465)
chr1 (16-210)||(35648571-35648764)
chr1 (16-218)||(36236303-36236504)
chr1 (16-218)||(36246850-36247051)
chr1 (16-218)||(51629060-51629261)
chr1 (16-218)||(51656321-51656522)
chr1 (16-216)||(11194943-11195141)
chr1 (16-214)||(9050363-9050562)
chr1 (16-218)||(19179092-19179294)
chr1 (16-210)||(35637919-35638112)
chr1 (16-210)||(38095210-38095403)
chr1 (16-210)||(38105835-38106028)
chr1 (16-210)||(47607811-47608004)
chr1 (16-210)||(47618419-47618612)
chr1 (16-216)||(14388001-14388200)
chr1 (16-216)||(18310847-18311046)
chr1 (16-116)||(20195667-20195767)
chr1 (16-216)||(41132491-41132689)
chr1 (17-216)||(675580-675777)
chr1 (100-218)||(30291949-30292066)
chr1 (16-62)||(23064957-23065003)
chr1 (17-62)||(5929712-5929757)
chr1 (17-62)||(19038016-19038061)
chr1 (16-62)||(17371050-17371097)
chr1 (24-62)||(20799080-20799118)
chr1 (24-62)||(22610002-22610040)
chr1 (24-62)||(23927074-23927112)
chr1 (24-62)||(46180907-46180945)
chr1 (17-62)||(28474236-28474281)
chr1 (17-62)||(52350712-52350757)
chr1 (18-62)||(28380005-28380049)
chr1 (16-62)||(44201019-44201066)
chr1 (16-61)||(19170360-19170406)
chr1 (17-62)||(22019345-22019391)
chr1 (17-62)||(22642904-22642950)
chr1 (17-62)||(22655486-22655532)
chr1 (17-62)||(20251783-20251828)
chr1 (24-62)||(26548282-26548321)
chr1 (16-46)||(1900353-1900383)
chr1 (16-46)||(14263493-14263523)
chr1 (24-62)||(20883910-20883948)
chr1 (16-46)||(21191907-21191937)
chr1 (16-46)||(22153865-22153895)
chr1 (16-46)||(25448608-25448638)
chr1 (16-46)||(35040174-35040204)
chr1 (16-46)||(36134198-36134228)
chr1 (16-46)||(39201034-39201064)
chr1 (24-62)||(45070681-45070719)
chr1 (17-46)||(2327482-2327511)
chr1 (17-46)||(7745132-7745161)
chr1 (16-56)||(23054374-23054414)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (16-216)||(2984-3184)
[»] chr2 (80 HSPs)
chr2 (16-216)||(18768756-18768956)
chr2 (16-216)||(21172316-21172516)
chr2 (16-213)||(2561668-2561865)
chr2 (16-216)||(28721166-28721366)
chr2 (16-216)||(28731754-28731952)
chr2 (16-214)||(24425403-24425601)
chr2 (16-214)||(24414874-24415072)
chr2 (16-216)||(27978232-27978432)
chr2 (16-216)||(28064761-28064961)
chr2 (16-183)||(26867250-26867417)
chr2 (16-183)||(28374397-28374564)
chr2 (16-218)||(7005655-7005856)
chr2 (16-214)||(38585938-38586137)
chr2 (16-218)||(9773154-9773355)
chr2 (16-218)||(9897422-9897623)
chr2 (16-218)||(9908010-9908211)
chr2 (16-218)||(10267173-10267374)
chr2 (16-218)||(10277750-10277951)
chr2 (16-218)||(21650380-21650581)
chr2 (16-218)||(24327582-24327783)
chr2 (16-218)||(36251692-36251893)
chr2 (16-218)||(43355201-43355402)
chr2 (16-218)||(4210070-4210271)
chr2 (16-218)||(9762618-9762819)
chr2 (16-218)||(11388657-11388858)
chr2 (16-218)||(17857285-17857486)
chr2 (16-218)||(22914712-22914913)
chr2 (16-218)||(22960180-22960381)
chr2 (16-218)||(29244401-29244602)
chr2 (16-218)||(29254980-29255181)
chr2 (16-218)||(34478107-34478308)
chr2 (16-218)||(34790065-34790266)
chr2 (16-218)||(34804208-34804409)
chr2 (16-218)||(43345586-43345787)
chr2 (16-218)||(4220662-4220863)
chr2 (16-218)||(24338252-24338453)
chr2 (16-210)||(27221561-27221754)
chr2 (16-218)||(30488671-30488872)
chr2 (16-218)||(40222512-40222713)
chr2 (16-218)||(40251373-40251574)
chr2 (16-216)||(36784655-36784854)
chr2 (16-183)||(26879839-26880006)
chr2 (16-218)||(43093435-43093637)
chr2 (16-218)||(1099043-1099244)
chr2 (16-218)||(11395020-11395221)
chr2 (16-218)||(11405336-11405537)
chr2 (16-210)||(18392493-18392686)
chr2 (16-210)||(35253162-35253355)
chr2 (16-210)||(35263771-35263964)
chr2 (16-210)||(35274396-35274589)
chr2 (16-218)||(39169943-39170144)
chr2 (16-217)||(32218053-32218253)
chr2 (16-218)||(43082826-43083028)
chr2 (16-218)||(4099963-4100164)
chr2 (16-216)||(967354-967552)
chr2 (16-216)||(24275205-24275402)
chr2 (16-216)||(22763834-22764034)
chr2 (18-216)||(22774540-22774738)
chr2 (18-216)||(22779918-22780116)
chr2 (16-92)||(16769122-16769198)
chr2 (18-129)||(17969146-17969256)
chr2 (100-218)||(16777117-16777234)
chr2 (17-117)||(19299959-19300058)
chr2 (16-62)||(19497994-19498040)
chr2 (17-62)||(20646610-20646655)
chr2 (113-183)||(28379736-28379806)
chr2 (17-62)||(19313020-19313065)
chr2 (17-62)||(21025530-21025575)
chr2 (19-62)||(24814633-24814677)
chr2 (24-62)||(19356507-19356545)
chr2 (16-59)||(1084017-1084061)
chr2 (16-51)||(20568138-20568173)
chr2 (16-62)||(22755469-22755516)
chr2 (16-46)||(6574191-6574221)
chr2 (16-46)||(22802463-22802493)
chr2 (16-46)||(28711765-28711795)
chr2 (16-46)||(31328033-31328063)
chr2 (16-46)||(31334754-31334784)
chr2 (19-56)||(24440789-24440826)
chr2 (18-46)||(30557388-30557416)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (16-216)||(42391-42591)
scaffold0133 (16-218)||(31318-31519)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (16-218)||(2087-2289)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (16-214)||(6758-6956)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (16-213)||(53997-54194)
scaffold0028 (17-218)||(14771-14971)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (16-214)||(7935-8133)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (16-214)||(125-323)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (16-214)||(32776-32974)
scaffold0047 (16-218)||(40322-40523)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (16-216)||(19436-19640)
scaffold0099 (16-216)||(16792-17005)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (16-214)||(6092-6289)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (16-183)||(7658-7825)
scaffold0068 (16-183)||(10505-10672)
[»] scaffold0178 (1 HSPs)
scaffold0178 (87-214)||(26995-27122)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (16-214)||(51974-52173)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (16-214)||(1533-1731)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (16-214)||(35031-35229)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (16-214)||(117284-117482)
scaffold0002 (17-62)||(475305-475351)
scaffold0002 (17-62)||(481825-481871)
scaffold0002 (24-62)||(156681-156720)
[»] scaffold0272 (1 HSPs)
scaffold0272 (20-183)||(13511-13674)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (16-214)||(36607-36805)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (16-218)||(6711-6912)
[»] scaffold0386 (1 HSPs)
scaffold0386 (16-218)||(12542-12743)
[»] scaffold0407 (2 HSPs)
scaffold0407 (16-216)||(11987-12186)
scaffold0407 (16-216)||(15818-16017)
[»] scaffold0105 (3 HSPs)
scaffold0105 (16-210)||(8148-8341)
scaffold0105 (16-210)||(36834-37027)
scaffold0105 (16-210)||(47468-47661)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (16-216)||(7416-7615)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (93-214)||(2550-2671)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (16-216)||(5481-5680)
scaffold0042 (36-216)||(12896-13075)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (18-217)||(4370-4568)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (17-216)||(10159-10357)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (18-216)||(180424-180621)
scaffold0017 (18-215)||(175512-175708)
scaffold0017 (17-62)||(40369-40414)
scaffold0017 (24-62)||(58915-58953)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (16-131)||(56737-56852)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (18-155)||(6141-6278)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (16-216)||(35723-35921)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (96-214)||(2306-2424)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (16-129)||(15915-16027)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (134-216)||(53339-53420)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (16-77)||(40688-40749)
[»] scaffold0012 (4 HSPs)
scaffold0012 (16-216)||(127832-128030)
scaffold0012 (16-216)||(140991-141189)
scaffold0012 (17-62)||(7674-7719)
scaffold0012 (16-46)||(215569-215599)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (18-216)||(2182-2378)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (97-183)||(19122-19208)
[»] scaffold0314 (1 HSPs)
scaffold0314 (160-214)||(20646-20700)
[»] scaffold0481 (1 HSPs)
scaffold0481 (16-216)||(12696-12895)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (17-117)||(833-932)
scaffold0090 (17-117)||(5213-5312)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (16-62)||(20432-20479)
[»] scaffold0774 (1 HSPs)
scaffold0774 (24-62)||(6388-6426)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (24-62)||(912-950)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (24-62)||(29669-29707)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (24-62)||(58495-58533)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (17-62)||(22050-22095)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (17-62)||(61231-61276)
scaffold0005 (16-46)||(212363-212393)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (19-62)||(6577-6621)
[»] scaffold1321 (1 HSPs)
scaffold1321 (20-62)||(990-1033)
[»] scaffold1263 (1 HSPs)
scaffold1263 (20-62)||(1183-1226)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (16-51)||(379-414)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (16-62)||(11769-11816)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (16-51)||(31851-31886)
[»] scaffold0752 (2 HSPs)
scaffold0752 (24-62)||(1399-1437)
scaffold0752 (24-62)||(2014-2052)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (17-62)||(1727-1773)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (17-62)||(17861-17907)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (17-62)||(9306-9352)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (93-215)||(15129-15250)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (17-62)||(61742-61788)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (20-53)||(143110-143143)
scaffold0007 (24-62)||(59316-59354)
[»] scaffold0655 (1 HSPs)
scaffold0655 (17-59)||(5127-5170)
[»] scaffold0604 (1 HSPs)
scaffold0604 (93-216)||(8-130)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (31-62)||(28820-28851)
[»] scaffold1359 (1 HSPs)
scaffold1359 (16-46)||(727-757)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (16-46)||(9978-10008)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (16-46)||(27501-27531)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (16-46)||(25737-25767)
scaffold0056 (16-46)||(34876-34906)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (154-216)||(69919-69981)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (16-46)||(244356-244386)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (145-218)||(19662-19734)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (18-58)||(16966-17007)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (19-51)||(948-980)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (19-51)||(10474-10506)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (18-46)||(37413-37441)
scaffold0022 (18-46)||(135473-135501)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 129)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34783007 - 34782807
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34783007 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 34782908  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34782907 ttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 34782808  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  34782807 t 34782807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20797846 - 20797648
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20797846 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 20797747  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20797746 ttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 20797648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34772062 - 34771862
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34772062 acagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 34771963  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34771962 ttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 34771863  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  34771862 t 34771862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 216
Target Start/End: Original strand, 43043782 - 43043981
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43043782 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctt 43043881  T
Q  117 tcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  43043882 tcaattcttcgttcttcttagataagattgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatacgaattaaatgtagcttctggtgatgatat 43043981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10754644 - 10754445
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10754644 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgtaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 10754545  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10754544 ttcaattcttcgttc-ttctagataaggttgaaataagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 10754446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 42395125 - 42394933
Alignment:
Q  22 tagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcact 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42395125 tagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagcgctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaat 42395026  T
Q  122 tcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42395025 tcttcgttcttcttagataagattgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 42394933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 24926249 - 24926449
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24926249 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctcctt 24926348  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24926349 ttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgata 24926448  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  24926449 t 24926449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36084612 - 36084412
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36084612 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 36084513  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36084512 ttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatattcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgata 36084413  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  36084412 t 36084412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36228890 - 36228690
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  36228890 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgttatccaaatgaccgttgatacctccct 36228791  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36228790 tacaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgata 36228691  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  36228690 t 36228690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8521992 - 8521794
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8521992 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaaatgatcagcgctatccaaatgaccgttgataccttcct 8521893  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8521892 ttcaattcttcgttcttcttagataagattgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 8521794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Original strand, 1109255 - 1109452
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  1109255 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcct 1109354  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 213  Q
    |||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1109355 ttcaattcttcgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 1109452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20562491 - 20562291
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20562491 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggaaaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 20562392  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20562391 ttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggataaaatgtagcttctggtgatgata 20562292  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  20562291 t 20562291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 24983530 - 24983730
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24983530 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaatgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 24983629  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24983630 ttcaattcttcgttcttcttaaataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgata 24983729  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  24983730 t 24983730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Original strand, 1122013 - 1122210
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  1122013 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagcgctgtccaaatgaccgttgatacattcct 1122112  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 213  Q
    |||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1122113 ttcaattcttcgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 1122210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20551964 - 20551766
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20551964 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 20551865  T
Q  118 cacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20551864 caaatcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatctttagtttgaatttacggataaaatgtagcttctggtgatgatat 20551766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31448703 - 31448505
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31448703 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaaccaaggacaaatgctcagtgctatccatatgaccgttgatacctccct 31448604  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31448603 ttcaattcttcgttcttcttagataagattgaattgataaatagctactttggatcttcagtttgaatatacggattaaatgtagcttctggtgatgat 31448505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31418812 - 31418614
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31418812 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcaatgctatccatatgaccgttgatacctccct 31418713  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31418712 ttcaattcttcgttcttcttagataatattgaattgagaaacagctactttggatctttagtttgaatatacagattaaatgtagcttctggtgatgat 31418614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 43621969 - 43622168
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaa-tgaccgttgatacctccc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43621969 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaaatgaccgttgatacctccc 43622068  T
Q  115 tttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  43622069 tttcaattcttcgttcttcttagatagtgctgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggataaaatgtagcttctggtgatgat 43622168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 17457421 - 17457621
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  17457421 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtactcagtgttctccaaatgaccgttgatacctccct 17457520  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||||||| || |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17457521 ttcaattcttcgtttttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggatcaaatgtagcttctggtgatgata 17457620  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  17457621 t 17457621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19478152 - 19477952
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19478152 acagagtagtggacgtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 19478053  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || || |||||||||||||| |||||    
T  19478052 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacaaatcaattgtagcttctggtgttgata 19477953  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  19477952 t 19477952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 30070016 - 30070215
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30070016 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgtcaacgaaggacaaatgctcagtgctatccatatgaccgttgatacctccct 30070115  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||  |||| |||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  30070116 ttcaattcttcgttcttcttagataagactgaattgagaaccagctactttggatcttcagtttgatta-atggatcaaatgtagcttctggtgaagata 30070214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23406597 - 23406399
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406597 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 23406498  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    || | |||||||||||| |||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | || || || ||||||||||||||||    
T  23406497 tttaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaatagctactttggatcttcagtttgaatttacgaatcaattgaagcttctggtgatgat 23406399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 17446805 - 17447005
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  17446805 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtactcagtgttctccaaatgaccgttgatacctccct 17446904  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||| || || ||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17446905 ttcaattcttcatttttcttatacgaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggatcaaatgtagcttctggtgatgata 17447004  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  17447005 t 17447005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19464122 - 19463922
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19464122 acagagtagtggacgtagtggttgtacacttgtactttgtcaactttgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 19464023  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || || |||||||||||||| |||||    
T  19464022 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacaaatcaattgtagcttctggtgttgata 19463923  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  19463922 t 19463922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23392867 - 23392669
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23392867 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgacctttgatacctccct 23392768  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    || | |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | || || || | ||||||||||||||    
T  23392767 tttaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacgaatcaattgaaacttctggtgatgat 23392669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34062771 - 34062572
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  34062771 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtactcagtgttctccaaatgaccgttgatacctccct 34062672  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaa-tatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| | || |||| || |||||||||||||||||||    
T  34062671 ttcaattcttcgtacttcttagacgaggttgaaatgttaaacaactactttgaatcttcagtttgaattttacggatcaattgtagcttctggtgatgat 34062572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 183
Target Start/End: Original strand, 21706085 - 21706252
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |||||||||||||||||||    
T  21706085 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgttcttcaagtgaccgttgatacctccct 21706184  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaat 183  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21706185 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttggaatgagaaacaactactttgaatcttcagtttgaat 21706252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 183
Target Start/End: Original strand, 21703238 - 21703405
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | | | ||| |||||||||||||||||||    
T  21703238 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatacttagtgttcttcaagtgaccgttgatacctccct 21703337  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaat 183  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21703338 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttggaatgagaaacagctactttgaatcttcagtttgaat 21703405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34052104 - 34051911
Alignment:
Q  22 tagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcact 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34052104 tagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaatgaaggacaagtactcagtgttctccaaatgaccgttgatacctccctttcaat 34052005  T
Q  122 tcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaa-tatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| | || |||| || |||||||||||||||||||    
T  34052004 tcttcgtacttcttagacgaggttgaaatgttaaacagctactttgaatcttcagtttgaattttacggatcaattgtagcttctggtgatgat 34051911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 5290686 - 5290887
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  5290686 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 5290785  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  5290786 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 5290884  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  5290885 ttg 5290887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 9377572 - 9377773
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  9377572 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 9377671  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9377672 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 9377770  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  9377771 ttg 9377773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 14558127 - 14558328
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  14558127 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 14558226  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14558227 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 14558325  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  14558326 ttg 14558328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 14568764 - 14568965
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  14568764 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 14568863  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14568864 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 14568962  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  14568963 ttg 14568965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23296427 - 23296226
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  23296427 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 23296328  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23296327 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 23296229  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  23296228 ttg 23296226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23306995 - 23306794
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  23306995 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 23306896  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23306895 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 23306797  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  23306796 ttg 23306794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 24816996 - 24817197
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  24816996 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 24817095  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24817096 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 24817194  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  24817195 ttg 24817197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 24827584 - 24827785
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  24827584 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 24827683  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24827684 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 24827782  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  24827783 ttg 24827785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27203943 - 27203742
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  27203943 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 27203844  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  27203843 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 27203745  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  27203744 ttg 27203742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 27622877 - 27623078
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  27622877 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 27622976  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  27622977 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 27623075  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  27623076 ttg 27623078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 39362464 - 39362263
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  39362464 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 39362365  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  39362364 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-agggatcaaacgtagcttctggtgaagata 39362266  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  39362265 ttg 39362263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 31815313 - 31815113
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  31815313 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 31815214  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || |||| |  |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  31815213 ttcaattcttcgttcttctttgataggactgaattgagaatcaactactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 31815115  T
Q  216 tt 217  Q
    ||    
T  31815114 tt 31815113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23707593 - 23707390
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  23707593 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 23707494  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23707493 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 23707395  T
Q  216 ttgat 220  Q
    |||||    
T  23707394 ttgat 23707390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6975958 - 6975757
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  6975958 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 6975859  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6975858 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 6975760  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  6975759 ttg 6975757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9336106 - 9335905
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  9336106 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 9336007  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9336006 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 9335908  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  9335907 ttg 9335905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9346693 - 9346492
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  9346693 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 9346594  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9346593 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 9346495  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  9346494 ttg 9346492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 15694141 - 15694342
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  15694141 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 15694240  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15694241 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 15694339  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  15694340 ttg 15694342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 16004001 - 16004202
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  16004001 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgcttagtgctatccatatatccgttgatacctccct 16004100  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  16004101 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 16004199  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  16004200 ttg 16004202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22146671 - 22146470
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  22146671 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 22146572  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  22146571 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 22146473  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  22146472 ttg 22146470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22157254 - 22157053
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  22157254 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 22157155  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  22157154 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 22157056  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  22157055 ttg 22157053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24567240 - 24567039
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  24567240 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 24567141  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24567140 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 24567042  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  24567041 ttg 24567039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24808063 - 24807862
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  24808063 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 24807964  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24807963 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttgagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 24807865  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  24807864 ttg 24807862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 39352638 - 39352437
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  39352638 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 39352539  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||  ||||||||||||| ||||    
T  39352538 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacatagcttctggtgaagata 39352440  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  39352439 ttg 39352437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 42042935 - 42042734
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  42042935 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagcttagtgctatccatatatccgttgatacctccct 42042836  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  42042835 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 42042737  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  42042736 ttg 42042734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 42053510 - 42053309
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  42053510 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagcttagtgctatccatatatccgttgatacctccct 42053411  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  42053410 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 42053312  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  42053311 ttg 42053309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 31844109 - 31843909
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  31844109 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 31844010  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || |||| |  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  31844009 ttcaattcttcgttcttctttgataggactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 31843911  T
Q  216 tt 217  Q
    ||    
T  31843910 tt 31843909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 220
Target Start/End: Original strand, 30227607 - 30227810
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  30227607 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagcttagtgctatccatatatccgttgatacctccct 30227706  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  30227707 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 30227805  T
Q  216 ttgat 220  Q
    |||||    
T  30227806 ttgat 30227810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 220
Target Start/End: Original strand, 30238134 - 30238337
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  30238134 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagcttagtgctatccatatatccgttgatacctccct 30238233  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  30238234 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 30238332  T
Q  216 ttgat 220  Q
    |||||    
T  30238333 ttgat 30238337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 5301262 - 5301463
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  5301262 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcagctctattaacgagaaacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 5301361  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  5301362 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 5301460  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  5301461 ttg 5301463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6986448 - 6986247
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  6986448 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 6986349  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||  ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6986348 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttaaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 6986250  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  6986249 ttg 6986247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 7032238 - 7032439
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  7032238 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 7032337  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
     ||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||| ||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  7032338 ctcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcaatttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 7032436  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  7032437 ttg 7032439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 14447110 - 14447311
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  14447110 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaaagagagacaagtgctcagtgctttccatatgtccgttgatacctccct 14447209  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14447210 ttcaattcatcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgattaca-ggatcaaatgtagcttctggtgaagata 14447308  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  14447309 ttg 14447311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 14457722 - 14457923
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  14457722 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaaagagagacaagtgctcagtgctttccatatgtccgttgatacctccct 14457821  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14457822 ttcaattcatcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgattaca-ggatcaaatgtagcttctggtgaagata 14457920  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  14457921 ttg 14457923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15740117 - 15739924
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  15740117 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 15740018  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  15740017 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 15739924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15769277 - 15769084
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  15769277 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 15769178  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  15769177 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 15769084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22559587 - 22559386
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||| ||| ||  ||||||||||||||||    
T  22559587 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctaaccatatatccgttgatacctccct 22559488  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||  ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  22559487 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttaaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 22559389  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  22559388 ttg 22559386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 40401169 - 40400968
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  40401169 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatttacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 40401070  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||  ||||||||||||| ||||    
T  40401069 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacatagcttctggtgacgata 40400971  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  40400970 ttg 40400968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 21414308 - 21414507
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  21414308 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaattacccagtgcttttcaaacgaccgttgatacctccct 21414407  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||| | |||||  ||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||  ||  || ||||||||||||||||||||    
T  21414408 ttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcttcagtttaaatttactgaacaattgtagcttctggtgatgata 21414506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6130939 - 6130738
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  6130939 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 6130840  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||| || | |||| |||  ||||||||||||| ||||    
T  6130839 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatctttagtttgatta-aaggatcaaacatagcttctggtgaagata 6130741  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  6130740 ttg 6130738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14030194 - 14029993
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  14030194 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 14030095  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  14030094 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 14029996  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  14029995 ttg 14029993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14040747 - 14040546
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  14040747 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 14040648  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  14040647 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 14040549  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  14040548 ttg 14040546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 15993439 - 15993640
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  15993439 acagattagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 15993538  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||| || ||  ||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  15993539 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgaaaatcagttactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 15993637  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  15993638 ttg 15993640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23362260 - 23362059
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||||||||  |   |||||||||||||||    
T  23362260 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatttattcgttgatacctccct 23362161  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23362160 ttcaattcttcgttcttcgttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 23362062  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  23362061 ttg 23362059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 27603528 - 27603729
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  27603528 acagagtagtggaggtagtggttgtatacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 27603627  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||  |||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| ||||||| |||||| ||||    
T  27603628 ttcaattcttcgttcttcttgaataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttatggtgaagata 27603726  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  27603727 ttg 27603729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 33951911 - 33952104
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  33951911 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccct 33952010  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  33952011 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 33952104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35226239 - 35226046
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  35226239 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccct 35226140  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  35226139 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 35226046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 36582668 - 36582869
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| || |||| |||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  36582668 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtggtcagtgctatccatatatccgttgatacatccct 36582767  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  36582768 ttcaattcttcgttcttcgttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 36582866  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  36582867 ttg 36582869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 36593223 - 36593424
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| || |||| |||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  36593223 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtggtcagtgctatccatatatccgttgatacatccct 36593322  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  36593323 ttcaattcttcgttcttcgttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 36593421  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  36593422 ttg 36593424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37406797 - 37406608
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | |       |||||||||||||||||||||    
T  37406797 agagtagtggagatagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaagtactcagtgtt-------tgaccgttgatacctcccttt 37406705  T
Q  118 cacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    || |||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||| || |||||||||||||||||||    
T  37406704 caattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacaactactttgaatcttcagtttaaatttactgatcaattgtagcttctggtgatgat 37406608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 39491060 - 39491261
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  39491060 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 39491159  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  39491160 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 39491258  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  39491259 ttg 39491261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 39502250 - 39502451
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  39502250 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 39502349  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  39502350 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 39502448  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  39502449 ttg 39502451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 40390507 - 40390306
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  40390507 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctatttacgagagacaattgcttagtgctatccatatatccgttgatacctccct 40390408  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  | || |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  40390407 ttcaattcttcgttcttcttggataagactaaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgacgata 40390309  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  40390308 ttg 40390306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 40514100 - 40514301
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  40514100 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccct 40514199  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  40514200 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 40514298  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  40514299 ttg 40514301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22676266 - 22676065
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  | |||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  22676266 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagttcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 22676167  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  22676166 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 22676068  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  22676067 ttg 22676065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22686157 - 22685956
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  | |||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  22686157 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagttcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 22686058  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  22686057 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 22685959  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  22685958 ttg 22685956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 27042322 - 27042515
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  27042322 acagagtagtggtggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 27042421  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  27042422 ttcaattcttcattcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgacta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 27042515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27460311 - 27460110
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||    
T  27460311 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctctct 27460212  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  27460211 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 27460113  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  27460112 ttg 27460110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27470710 - 27470509
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||    
T  27470710 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctctct 27470611  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  27470610 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 27470512  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  27470511 ttg 27470509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35215655 - 35215462
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  35215655 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccct 35215556  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||| ||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  35215555 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtatgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 35215462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23372662 - 23372460
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtgg-ttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccc 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||||||||  |   ||||||||||||||    
T  23372662 acagagtagtggaggtagtgggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatttattcgttgatacctccc 23372563  T
Q  115 tttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    ||||| ||||||||||||  | ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| |||    
T  23372562 tttcaattcttcgttcttcgttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagat 23372464  T
Q  215 attg 218  Q
    ||||    
T  23372463 attg 23372460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 106269 - 106069
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  106269 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaagtacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccct 106170  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagttt-gaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||| ||| | |||||  ||||||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||  ||| ||  ||| |  |||||||||||||||||||    
T  106169 ttcaattcttcattc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcatttgaatcttcagtttaaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgat 106071  T
Q  215 at 216  Q
    ||    
T  106070 at 106069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20624915 - 20624716
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | | ||| ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  20624915 acagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttatcaactctgataacgaaggacaagtacccagtgcctttcaaatgaccgttgatacctccct 20624816  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||| ||| | |||||| ||||||||| || ||||  || ||||| ||| ||||||| ||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  20624815 ttcaattcttcattc-tcttagatgaggttgaaacgaaaaactgctcctttgaatcgtcagtttaaatttactgattacttgtagcttctggtgatgata 20624717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 27052946 - 27053140
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgta-cacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccc 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||    
T  27052946 acagagtagtggtggtagtggttgtaacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccc 27053045  T
Q  115 tttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  27053046 tttcaattcttcattcttctttgataagaatgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgacta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 27053140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17719068 - 17718875
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  17719068 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccct 17718969  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| |||| |||||||||||||    
T  17718968 ttcaattcttcattcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgacta-aaggatcaaatttagcttctggtga 17718875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17729720 - 17729527
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  17729720 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccct 17729621  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| |||| |||||||||||||    
T  17729620 ttcaattcttcattcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgacta-aaggatcaaatttagcttctggtga 17729527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17607211 - 17607020
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  17607211 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccct 17607112  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||   |||||||||||| || | |||| |||| |||||||||||||    
T  17607111 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt--ctcttcagtttgatta-aaggatcaaatttagcttctggtga 17607020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17617825 - 17617634
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  17617825 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccct 17617726  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||   |||||||||||| || | |||| |||| |||||||||||||    
T  17617725 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt--ctcttcagtttgatta-aaggatcaaatttagcttctggtga 17617634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31348685 - 31348494
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  31348685 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccct 31348586  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||   |||||||||||| || | |||| |||| |||||||||||||    
T  31348585 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt--ctcttcagtttgatta-aaggatcaaatttagcttctggtga 31348494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31359299 - 31359108
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  31359299 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccct 31359200  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||   |||||||||||| || | |||| |||| |||||||||||||    
T  31359199 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaacttt--ctcttcagtttgatta-aaggatcaaatttagcttctggtga 31359108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 36687846 - 36687707
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  36687846 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccct 36687747  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaa 155  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||||||    
T  36687746 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaa 36687707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 36698412 - 36698273
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  36698412 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccct 36698313  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaa 155  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||||||    
T  36698312 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaa 36698273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20417052 - 20416854
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||   | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20417052 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccct 20416954  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| || |||||| || |||||  |  ||  || || ||||| || ||||| | ||||||||| ||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  20416953 ttcaatttttcgtt-ttcttagacgatattagaacgaaaaacagctcctttgaaacttcagtttaaatttactgatcaactgtagcttctggtgatgata 20416855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 142
Target Start/End: Original strand, 37729362 - 37729488
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  37729362 acagaatagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgcaaagtgctttccatatatccgttgatacctccct 37729461  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataag 142  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||    
T  37729462 ttcaattcttcgttcttctttgataag 37729488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 142
Target Start/End: Original strand, 37740678 - 37740804
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  37740678 acagaatagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgcaaagtgctttccatatatccgttgatacctccct 37740777  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataag 142  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||    
T  37740778 ttcaattcttcgttcttctttgataag 37740804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 129
Target Start/End: Original strand, 32754055 - 32754167
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |     ||  ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  32754055 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacgagcatccaatgcttttcaaatgaccgttgatacctccct 32754153  T
Q  116 ttcacttcttcgtt 129  Q
    |||| |||||||||    
T  32754154 ttcaattcttcgtt 32754167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21520099 - 21520012
Alignment:
Q  127 gttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||| ||| || |||| || |||||||||||||||||||    
T  21520099 gttcttcttagacaaggttgaaatgttaaacagctactttgaatctccagtttaaatttacggatcaattgtagcttctggtgatgat 21520012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 36095793 - 36095755
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36095793 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 36095755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 36097250 - 36097212
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36097250 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 36097212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 13405122 - 13405167
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13405122 cagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 13405167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 62
Target Start/End: Original strand, 23478374 - 23478421
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23478374 acagagtagtggaagtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 23478421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 35543266 - 35543231
Alignment:
Q  27 gaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35543266 gaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 35543231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 1915423 - 1915469
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1915423 cagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 1915469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Original strand, 13523202 - 13523240
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13523202 gtggagatagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 13523240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Original strand, 13533929 - 13533967
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13533929 gtggagatagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 13533967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 20168207 - 20168169
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20168207 gtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct 20168169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 20215247 - 20215201
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20215247 cagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 20215201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 62
Target Start/End: Original strand, 40228673 - 40228710
Alignment:
Q  25 tggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40228673 tggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcagctct 40228710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 4887027 - 4887057
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4887027 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 4887057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 15516974 - 15517004
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516974 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 15517004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 51
Target Start/End: Original strand, 16607518 - 16607552
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 51  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16607518 cagagtagtggagatagtggttgtacacttgtact 16607552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 20550900 - 20550930
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20550900 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 20550930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 25096958 - 25096928
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25096958 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 25096928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 25112008 - 25111966
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactttgtcaac 59  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25112008 agagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtactttgtcaac 25111966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 25154928 - 25154898
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25154928 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 25154898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 25171099 - 25171057
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactttgtcaac 59  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25171099 agagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtactttgtcaac 25171057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 30742985 - 30743015
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30742985 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 30743015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 33933272 - 33933302
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33933272 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 33933302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 42243685 - 42243715
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42243685 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 42243715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 26119959 - 26119922
Alignment:
Q  19 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtc 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  26119959 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtactatgtc 26119922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 46
Target Start/End: Original strand, 26759156 - 26759184
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26759156 agagtagtggaggtagtggttgtacactt 26759184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 81)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 5022958 - 5023158
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5022958 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 5023057  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5023058 ttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 5023157  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  5023158 t 5023158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18077942 - 18077742
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18077942 acagaggagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 18077843  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18077842 ttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgata 18077743  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  18077742 t 18077742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40454385 - 40454187
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40454385 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 40454286  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  40454285 ttaaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 40454187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40470624 - 40470426
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470624 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 40470525  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  40470524 ttaaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacagattaaatgtagcttctggtgatgat 40470426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 214
Target Start/End: Original strand, 25657359 - 25657557
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-gttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25657359 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactcttgttaacgaaggacaaatgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctctct 25657458  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  25657459 ttcaattcttcgttcttcttagataagattgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 25657557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 4987496 - 4987696
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  4987496 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctcttaacgaaggacaaatactcagtgcacttcaaatgaccgttgatacctccct 4987595  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  4987596 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttgaatcttcagtttgaatttacggatcaaatgtagcttctggtgatgata 4987695  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  4987696 t 4987696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14836140 - 14835942
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14836140 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgatcgttgatacctccct 14836041  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| || ||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || || |||||||||||||||||||    
T  14836040 ttcaattattcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacaaatcaattgtagcttctggtgatgat 14835942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15207450 - 15207252
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15207450 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtactcagtgctttccaaatgaccgttgatacctccct 15207351  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15207350 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttgaaacttcagtttatatttactgattaaatgtaacttctggtgatgat 15207252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 3370938 - 3371135
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  3370938 acagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgcacttcaaatgaccgttgatacctccct 3371037  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | | ||||| |||||||||||||||||||    
T  3371038 ttcaaatcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttaaata-acgaattaattgtagcttctggtgatgat 3371135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 47152116 - 47151949
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47152116 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtactcagggctctccaaatgaccgttgatacctccct 47152017  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaat 183  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47152016 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacaactactttgaatcttcagtttgaat 47151949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 16305329 - 16305527
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || | | |||||||||||||||||  ||||||    
T  16305329 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttatactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatacttagtgttctccaaatgaccgttgatgtctccct 16305428  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16305429 ttcaattcttcgttcttcttagacaaggttgaaatgttaaacagctactttgaatcttcagtttaaatttatggatcaattgtagcttctggtgatgat 16305527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 16317553 - 16317751
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || | | |||||||||||||||||  ||||||    
T  16317553 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttcgtcaactctgttaacgaaggacaaatacttagtgttctccaaatgaccgttgatgtctccct 16317652  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16317653 ttcaattcttcgttcttcttagacaaggttgaaatgttaaacagctactttgaatcttcagtttaaatttatggatcaattgtagcttctggtgatgat 16317751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 183
Target Start/End: Original strand, 10909631 - 10909798
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10909631 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtactcagggctctccaaatgaccgttgatacctccct 10909730  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaat 183  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  10909731 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacagctactttgaatcttcagtttgaat 10909798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 3390678 - 3390875
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  3390678 acagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgcacttcaaatgaccgttgatacctccct 3390777  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| | | ||||| | |||||||||||||||||    
T  3390778 ttcaaatcttcgttcttcttagacgaggttgaaataagaaacagctactttggatcttcagtttaaata-acgaattaattatagcttctggtgatgat 3390875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Original strand, 5873596 - 5873790
Alignment:
Q  20 agtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  5873596 agtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactatgttaatgaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttca 5873695  T
Q  120 cttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
     |||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  5873696 attcttcgttcttcttagacgaggttgaaacgagaaacaactactttgaatcttcagcttaaatttactgattaattgtagcttctggtgatgat 5873790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 183
Target Start/End: Original strand, 10695862 - 10696029
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10695862 acagggtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtactcagggctctccaaatgaccgttgatacctccct 10695961  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaat 183  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  10695962 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacagctactttgaatcttcagtttgaat 10696029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 24713653 - 24713853
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  24713653 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttaatacctccct 24713752  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||  || |||||||||| |||||||||    
T  24713753 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaacaagaaacaactactttgaatcttcagtttaaatttactgaacaattgtagcttctagtgatgata 24713852  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  24713853 t 24713853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 19581463 - 19581662
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||||||||    
T  19581463 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacaaaggacaagtactcagtgttttccaaatgatcgttgatacctccct 19581562  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaa-tatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    || | |||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| | ||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19581563 tttaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacaactactttgaatcttcagtttgaattttactgatcaaatgtaacttctggtgatgat 19581662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18763137 - 18762972
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18763137 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctattcaaatgaccgttgatacctccct 18763038  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttga 181  Q
    |||| ||||||||| |  |||||||||| ||||  ||||| |  |||||||  |||||||| ||||    
T  18763037 ttcaattcttcgttatacttagataaggctgaatggagaatcggctactttaaatcttcagattga 18762972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 461381 - 461582
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  461381 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 461480  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  461481 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 461579  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  461580 ttg 461582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 4948559 - 4948760
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  4948559 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 4948658  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  4948659 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 4948757  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  4948758 ttg 4948760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14843689 - 14843488
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  14843689 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 14843590  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  14843589 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 14843491  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  14843490 ttg 14843488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24028121 - 24027920
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  24028121 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 24028022  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  24028021 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 24027923  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  24027922 ttg 24027920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30926530 - 30926329
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  30926530 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 30926431  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  30926430 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 30926332  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  30926331 ttg 30926329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30937108 - 30936907
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  30937108 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 30937009  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  30937008 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 30936910  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  30936909 ttg 30936907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 52704012 - 52704213
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  52704012 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 52704111  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  52704112 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 52704210  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  52704211 ttg 52704213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18752527 - 18752362
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18752527 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgcttagagcaattcaaatgaccgttgatacctccct 18752428  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttga 181  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||| ||||  ||||| |  |||||||  |||||||| ||||    
T  18752427 ttcaattcttcgttctacttagataaggctgaatggagaatcggctactttaaatcttcagattga 18752362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 10300757 - 10300956
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10300757 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaaatactcaatgcttttcaaatgaccgttgatacctccct 10300856  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||| || ||||  ||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  10300857 ttcaattctttgttc-ttctagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcttcagtttaaatttactgatcaattgtagcttctggtgatgata 10300955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31266834 - 31266635
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31266834 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctcctt 31266735  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    | || |||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||| || ||||| || |||||||| ||| ||  ||| |  |||| ||| |||||||||||    
T  31266734 tacaattcttcgttc-ttttagacgaggttgaaacgaaaaacagcttctttgaatattcagtttaaatttactgatcacttgtaacttttggtgatgata 31266636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 450800 - 451001
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || || ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  450800 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagataagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 450899  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  450900 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 450998  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  450999 ttg 451001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15561115 - 15560914
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  15561115 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 15561016  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  15561015 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 15560917  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  15560916 ttg 15560914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 17918276 - 17918477
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  17918276 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactctgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 17918375  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  17918376 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 17918474  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  17918475 ttg 17918477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 17928924 - 17929125
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  17928924 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactctgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 17929023  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  17929024 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 17929122  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  17929123 ttg 17929125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27814981 - 27814780
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||    
T  27814981 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgtttatacctccct 27814882  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  27814881 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 27814783  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  27814782 ttg 27814780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 36018560 - 36018761
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  36018560 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 36018659  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  36018660 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaagatcaaatgtagcttctggtgaagata 36018758  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  36018759 ttg 36018761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 36029113 - 36029314
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  36029113 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 36029212  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  36029213 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaagatcaaatgtagcttctggtgaagata 36029311  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  36029312 ttg 36029314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 48371355 - 48371556
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  48371355 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacccccct 48371454  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  48371455 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 48371553  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  48371554 ttg 48371556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 11536068 - 11536267
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  11536068 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaagtacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccct 11536167  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||| | |||||  ||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  11536168 ttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgata 11536266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 16256093 - 16256294
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  16256093 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 16256192  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  16256193 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 16256291  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  16256292 ttg 16256294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 16266686 - 16266887
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  16266686 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 16266785  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  16266786 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 16266884  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  16266885 ttg 16266887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19944363 - 19944162
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||| ||||||    
T  19944363 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatagctccct 19944264  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || || |||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  19944263 ttcaattcttcgttcttcttggaaaagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 19944165  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  19944164 ttg 19944162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 22007235 - 22007436
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  22007235 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttagtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 22007334  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| || ||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  22007335 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgcgaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 22007433  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  22007434 ttg 22007436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19954996 - 19954797
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  19954996 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatagctcccttt 19954897  T
Q  118 cacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatatt 217  Q
    || |||||||||||| || || |||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  19954896 caattcttcgttcttcttggaaaagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagatatt 19954798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10751204 - 10751003
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  10751204 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 10751105  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  10751104 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 10751006  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  10751005 ttg 10751003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10964973 - 10964772
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  10964973 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 10964874  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  10964873 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 10964775  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  10964774 ttg 10964772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 21996637 - 21996838
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  21996637 acagagtagtagaggtagtggttgtacacttgtacttagtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 21996736  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| || ||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  21996737 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgcgaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 21996835  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  21996836 ttg 21996838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 24640472 - 24640665
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  24640472 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccct 24640571  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  24640572 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 24640665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 49518359 - 49518552
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  49518359 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 49518458  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  49518459 ttcaattcttcattcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgacta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 49518552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 55745288 - 55745087
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  55745288 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccct 55745189  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  55745188 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 55745090  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  55745089 ttg 55745087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 55755899 - 55755698
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  55755899 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccct 55755800  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  55755799 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 55755701  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  55755700 ttg 55755698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 11515258 - 11515456
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  11515258 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttttactttgttaactctgataacgaaggacaagtactcagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccct 11515357  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||| | |||||  ||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  11515358 ttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcttcagtttaaat-tactgatcacttgtagcttctggtgatgata 11515455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10740630 - 10740429
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||   |||||||||||||||    
T  10740630 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatattcgttgatacctccct 10740531  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  10740530 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 10740432  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  10740431 ttg 10740429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10954399 - 10954198
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||   |||||||||||||||    
T  10954399 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatattcgttgatacctccct 10954300  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  10954299 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 10954201  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  10954200 ttg 10954198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 27656825 - 27657018
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  27656825 acagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccct 27656924  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  27656925 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 27657018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 27667398 - 27667591
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  27667398 acagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccct 27667497  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  27667498 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 27667591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18130275 - 18130075
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| || | | |||||||||||||    
T  18130275 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatat-atccttgatacctccct 18130177  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  18130176 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 18130078  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  18130077 ttg 18130075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 55651547 - 55651745
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||   | ||| ||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  55651547 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttgatacctccct 55651645  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||||||| || |||||  || || ||| || ||||| || ||||| | ||||||||| ||| ||  ||| || |||| |||||||||||||||    
T  55651646 ttcaattcttcgtt-ttcttagacgagattaaaacgaaaaacagctcctttgaaacttcagtttaaatttactgatcaattgtaacttctggtgatgata 55651744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 49002015 - 49001820
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||   | ||  ||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  49002015 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccaatgcttttcaaatgactgttgatacctccct 49001917  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 213  Q
    |||| ||||||||| || |||||  || || ||| || ||||| || ||||| | ||||||||| ||| |   ||| || ||||||||||||||||||    
T  49001916 ttcaattcttcgtt-ttcttagacgagattaaaacgaaaaacagctcctttgaaacttcagtttaaattttctgatcaactgtagcttctggtgatga 49001820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39526119 - 39525998
Alignment:
Q  93 caaatgaccgttgatacctccctttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggatt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||  ||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||  |||     
T  39526119 caaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaa-gaaaaacagctcctttgaatcttcagtttaaatttactgatc 39526022  T
Q  193 aaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
    |  |||||||||||||||||||||    
T  39526021 acttgtagcttctggtgatgatat 39525998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 18007116 - 18007071
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18007116 cagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 18007071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 62
Target Start/End: Original strand, 33378414 - 33378461
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33378414 acagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 33378461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 8997306 - 8997268
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8997306 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 8997268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 16819402 - 16819364
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16819402 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 16819364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Original strand, 23509348 - 23509386
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23509348 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 23509386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 14710835 - 14710790
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14710835 cagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 14710790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 14778499 - 14778454
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14778499 cagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 14778454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 17993850 - 17993805
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17993850 cagagttgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 17993805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 19244002 - 19244047
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19244002 cagagttgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 19244047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 36210165 - 36210119
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36210165 cagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 36210119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20648501 - 20648470
Alignment:
Q  185 tatggattaaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20648501 tatggattaaatgtagcttctggtgatgatat 20648470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 1672392 - 1672422
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1672392 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 1672422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 1674867 - 1674897
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1674867 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 1674897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 6641687 - 6641717
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6641687 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 6641717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 10692854 - 10692884
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10692854 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 10692884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 10906620 - 10906650
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10906620 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 10906650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 14605015 - 14604985
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14605015 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14604985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 16853506 - 16853536
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16853506 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 16853536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 25651212 - 25651182
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25651212 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 25651182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 29121373 - 29121403
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29121373 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 29121403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 54679933 - 54679963
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54679933 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 54679963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 18774705 - 18774613
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 117  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||||||||  | ||| ||| | ||||||| |||||  ||||||||||    
T  18774705 gtggagatagtggttgtacaattgtattttgtcaactct-tcaatgaaggacaaacacccagtgcttttcaaatgaacgttggcacctcccttt 18774613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 80)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 19225149 - 19225347
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19225149 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagcgctatccaaatgaccgttgatacctccct 19225248  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19225249 ttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 19225347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30314761 - 30314563
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30314761 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctaagcgctatccaaatgaccgttggtacctccct 30314662  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30314661 ttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacaactactttgaatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 30314563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20161294 - 20161097
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  20161294 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcct 20161195  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 213  Q
    |||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20161194 ttcaattcttcgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacagctactttggatctttagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 20161097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Original strand, 20196173 - 20196370
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  20196173 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcct 20196272  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 213  Q
    |||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20196273 ttcaattcttcgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacagctactttggatctttagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 20196370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23457369 - 23457168
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23457369 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggaaaaatactcagtgctatccaaatgaccattgatacctccct 23457270  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaa-tatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  23457269 ttcaattcttggttcttcttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaattttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 23457170  T
Q  215 at 216  Q
    ||    
T  23457169 at 23457168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 19418567 - 19418767
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19418567 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggaaaaatactcaatgctatccaaatgaccgttgatacctccct 19418666  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19418667 ttcaattcttcgttcttcttagataatgttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggataaaatgtagcttctggtgatgata 19418766  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  19418767 t 19418767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 19429144 - 19429344
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19429144 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggaaaaatactcaatgctatccaaatgaccgttgatacctccct 19429243  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19429244 ttcaattcttcgttcttcttagataatgttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggataaaatgtagcttctggtgatgata 19429343  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  19429344 t 19429344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 31215231 - 31215430
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31215231 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaatgaaggacaaatgctcagtgctatc-aaatgacagttgatacctccct 31215329  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31215330 ttcaattcttcgttcttcttagataagattgaaaagagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttatggattaaatgtagcttctggtgatgata 31215429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23469525 - 23469324
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23469525 acagaggagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggaaaaatactcagtgctatccaaatgaccattgatacctccct 23469426  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaa-tatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  23469425 ttcaattcttggttcttcttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaattttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 23469326  T
Q  215 at 216  Q
    ||    
T  23469325 at 23469324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 16747216 - 16747414
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16747216 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 16747315  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || || |||||||||||||||||||    
T  16747316 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacaaatcaattgtagcttctggtgatgat 16747414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6318581 - 6318382
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  6318581 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgagggacaaatgctcagtgctatccatatgaccgttggtacatccct 6318482  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| || |||||||| |||||||| |||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6318481 ttcaattcttcgttcttcttagataagattgaattgagaaccagctactttgaatcttcagattgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 6318383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 18153950 - 18154149
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18153950 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtactcagtgctctccaaatgaccgttgatacctccct 18154049  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaa-tatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18154050 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacagctactttgaatcttcagtttgaattttactgatcaaatgtaacttctggtgatgat 18154149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 178
Target Start/End: Original strand, 1750309 - 1750471
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1750309 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 1750408  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtt 178  Q
    || | |||||||||||| |||||||||| |||  |||||| || |||||||  ||||||||||    
T  1750409 tttaattcttcgttcttcttagataaggctgagttgagaaccagctactttaaatcttcagtt 1750471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18769202 - 18769004
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | | |||||||||||||||||||||||    
T  18769202 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccct 18769103  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
     ||| |||||||||||| | |||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| || |||||||||||||||||||    
T  18769102 gtcaattcttcgttcttctaagacgaggttgaaatgttaaacaactactttgaatcttcagtttaaatttacggatcaattgtagcttctggtgatgat 18769004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 18158470 - 18158669
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  18158470 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactccgttaacgaaggacaagtactcagttctctccaaatgaccgttgatacctccct 18158569  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaa-tatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18158570 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacatctactttgaatcttcagtttgaattttactgatcaaatgtaacttctggtgatgat 18158669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 26121126 - 26121327
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  26121126 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 26121225  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  26121226 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcaactactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 26121324  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  26121325 ttg 26121327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 216
Target Start/End: Original strand, 28691189 - 28691316
Alignment:
Q  89 tatccaaatgaccgttgatacctccctttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  28691189 tatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacaactactttagatcttcagtttgaatttacg 28691288  T
Q  189 gattaaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28691289 gattaaatgtagcttctggtgatgatat 28691316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 210218 - 210017
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  210218 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 210119  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  210118 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 210020  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  210019 ttg 210017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 252624 - 252825
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  252624 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 252723  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  252724 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 252822  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  252823 ttg 252825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 723841 - 723640
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  723841 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 723742  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  723741 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 723643  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  723642 ttg 723640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 849032 - 848831
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  849032 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 848933  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  848932 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 848834  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  848833 ttg 848831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 19139496 - 19139697
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  19139496 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 19139595  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  19139596 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 19139694  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  19139695 ttg 19139697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 36078152 - 36078353
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  36078152 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 36078251  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  36078252 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 36078350  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  36078351 ttg 36078353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 36088738 - 36088939
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  36088738 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 36088837  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  36088838 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 36088936  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  36088937 ttg 36088939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 36293135 - 36293336
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  36293135 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 36293234  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  36293235 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 36293333  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  36293334 ttg 36293336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 36303738 - 36303939
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  36303738 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 36303837  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  36303838 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 36303936  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  36303937 ttg 36303939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6576584 - 6576383
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  6576584 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaaatgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 6576485  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||   | |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  6576484 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagagttagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 6576386  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  6576385 ttg 6576383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 26111448 - 26111649
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||    
T  26111448 acagagtagtggaggttgtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctctct 26111547  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26111548 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 26111646  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  26111647 ttg 26111649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 29076946 - 29077147
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  29076946 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 29077045  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  29077046 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 29077144  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  29077145 ttg 29077147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 29087197 - 29087398
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  29087197 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 29087296  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  29087297 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 29087395  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  29087396 ttg 29087398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 242039 - 242240
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  242039 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatctgttgatacctccct 242138  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||| ||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  242139 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctacattgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 242237  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  242238 ttg 242240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 3220848 - 3221049
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  3220848 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacttccct 3220947  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||  |||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  3220948 ttcaattcttcgttcttcttgaataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 3221046  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  3221047 ttg 3221049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 6161241 - 6161442
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||| |    
T  6161241 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccat 6161340  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  6161341 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 6161439  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  6161440 ttg 6161442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 18449586 - 18449787
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  18449586 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 18449685  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||  ||| |  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  18449686 ttcaattcttcgttcttcttgaataggactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 18449784  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  18449785 ttg 18449787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32077761 - 32077560
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  32077761 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 32077662  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  32077661 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 32077563  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  32077562 ttg 32077560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32088334 - 32088133
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  32088334 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 32088235  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  32088234 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 32088136  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  32088135 ttg 32088133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 6151286 - 6151488
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||| |    
T  6151286 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccat 6151385  T
Q  116 ttcacttcttcgttcttt-ttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| |||    
T  6151386 ttcaattcttcgttctttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagat 6151484  T
Q  215 attg 218  Q
    ||||    
T  6151485 attg 6151488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 9341360 - 9341561
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  9341360 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 9341459  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  9341460 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 9341558  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  9341559 ttg 9341561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 9368504 - 9368705
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  9368504 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 9368603  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  9368604 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 9368702  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  9368703 ttg 9368705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9856536 - 9856335
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||| ||||||    
T  9856536 acagagtagtagaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatatctccct 9856437  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  9856436 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatctttagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 9856338  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  9856337 ttg 9856335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15791363 - 15791162
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  15791363 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacatccct 15791264  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||   | |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  15791263 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagagttagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 15791165  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  15791164 ttg 15791162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 19128964 - 19129153
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  19128964 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 19129063  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctg 206  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||   ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| ||||||||||    
T  19129064 ttcaattcttcgttcttcttggataagacagaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctg 19129153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 218
Target Start/End: Original strand, 43248547 - 43248734
Alignment:
Q  30 gtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcacttcttcgtt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43248547 gtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttcaattcttcgtt 43248646  T
Q  130 ctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatattg 218  Q
    ||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  43248647 cttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagatattg 43248734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40213235 - 40213036
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt-gtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccc 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | | ||| ||| | |||| | |||||||||||||||    
T  40213235 acagagtagtggaagtagtggttgtacacttgtacttttgtcaactctgttaaagaaggacaagtacgcagtgctcttcaaacggccgttgatacctccc 40213136  T
Q  115 tttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||||  ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| |||  |  |||||| |||||||||||||||||||    
T  40213135 tttcaaatcttcgttcttgttagacgaggttgaaacgagaaacagctactttgaatctccagtttaaattcactgattaattgtagcttctggtgatgat 40213036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3348691 - 3348490
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  3348691 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 3348592  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| |||||||| |||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  3348591 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagattgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 3348493  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  3348492 ttg 3348490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3359288 - 3359087
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  3359288 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 3359189  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| |||||||| |||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  3359188 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagattgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 3359090  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  3359089 ttg 3359087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15780774 - 15780573
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| | ||||| |||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  15780774 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtactcagtgctatccatatatccgttgatacatccct 15780675  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||   | |||||||| ||||||||| ||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15780674 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagagttagctactttgaatcttcagtatgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 15780576  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  15780575 ttg 15780573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13688631 - 13688438
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  13688631 acagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccct 13688532  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  13688531 ttcagttcttcgtccttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 13688438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 30325317 - 30325227
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  30325317 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctaagcgctatccaaatgaccgttga 30325227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 3843738 - 3843936
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||   | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  3843738 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccct 3843836  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||||||| || |||||  || || ||| || ||||| || ||||| | ||||||||| ||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  3843837 ttcaattcttcgtt-ttcttagacgagattaaaacgaaaaacagctcctttgaaacttcagtttaaatttactgatcaactgtagcttctggtgatgata 3843935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20259682 - 20259484
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||   | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20259682 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttttcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccct 20259584  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||||||| || |||||  || || ||| || ||||| || ||||| | ||||||||| ||| ||   || || ||||||||||||||||||||    
T  20259583 ttcaattcttcgtt-ttcttagacgagattaaaacgaaaaacagctcctttgaaacttcagtttaaatttactaatcaactgtagcttctggtgatgata 20259485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21046312 - 21046114
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||   | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21046312 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttttcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccct 21046214  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||||||| || |||||  || || ||| || ||||| || ||||| | ||||||||| ||| ||   || || ||||||||||||||||||||    
T  21046213 ttcaattcttcgtt-ttcttagacgagattaaaacgaaaaacagctcctttgaaacttcagtttaaatttactaatcaactgtagcttctggtgatgata 21046115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 143 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30325231 - 30325160
Alignment:
Q  143 gttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30325231 gttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 30325160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 133
Target Start/End: Original strand, 44481307 - 44481424
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  44481307 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccct 44481406  T
Q  116 ttcacttcttcgttcttt 133  Q
    |||| |||||||||||||    
T  44481407 ttcaattcttcgttcttt 44481424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 133
Target Start/End: Original strand, 44491923 - 44492040
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  44491923 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccct 44492022  T
Q  116 ttcacttcttcgttcttt 133  Q
    |||| |||||||||||||    
T  44492023 ttcaattcttcgttcttt 44492040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 23370764 - 23370962
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||   | ||| ||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  23370764 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaaagaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttggtacctccct 23370862  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    || | ||||||||| || | |||| ||| | ||| || ||||| || ||||| |  |||||||| ||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  23370863 tttaattcttcgtt-ttctcagatgaggataaaacgaaaaacagctcctttgaaatttcagtttaaatttactgatcaactgtagcttctggtgatgata 23370961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 7018446 - 7018348
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||  | ||| ||| | ||||||| |||||  ||||||||    
T  7018446 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaaacacccagtgcttttcaaatgaacgttggcacctccct 7018348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 23271268 - 23271223
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23271268 cagagtagtggaagtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 23271223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16437026 - 16436923
Alignment:
Q  114 ctttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 213  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||  | |||| |||||||||||||||||| ||    
T  16437026 ctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagagacagctactttgaatcttcagtttg-attgagggatcaaatgtagcttctggtgaaga 16436928  T
Q  214 tattg 218  Q
    |||||    
T  16436927 tattg 16436923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 22135915 - 22135877
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22135915 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 22135877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 22167080 - 22167042
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22167080 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 22167042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 22211445 - 22211407
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22211445 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 22211407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 8032036 - 8032081
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8032036 cagagtcgtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct 8032081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 19461165 - 19461210
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19461165 cagagtcgtggaggtagtggttgtactcttgtactttgtcaactct 19461210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 19558843 - 19558888
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19558843 cagagtcgtggaggtagtggttgtactcttgtactttgtcaactct 19558888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 62
Target Start/End: Original strand, 28903460 - 28903507
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28903460 acagagtagtggagctagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 28903507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 40003231 - 40003277
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40003231 cagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 40003277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 51
Target Start/End: Original strand, 26833037 - 26833072
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26833037 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttatact 26833072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 1237638 - 1237668
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1237638 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 1237668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 9320569 - 9320599
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9320569 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 9320599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 15336238 - 15336208
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15336238 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 15336208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 15425303 - 15425273
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15425303 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 15425273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 15516607 - 15516577
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516607 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 15516577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 17519207 - 17519161
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17519207 cagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgttaactct 17519161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 17797423 - 17797453
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17797423 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 17797453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 19943236 - 19943266
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19943236 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 19943266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 59
Target Start/End: Original strand, 21540955 - 21540997
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactttgtcaac 59  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21540955 agagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtactttgtcaac 21540997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 29379580 - 29379626
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  29379580 cagagtcgtggaggtagtggttgtacactttctactttgtcaactct 29379626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 45538589 - 45538559
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45538589 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 45538559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 51
Target Start/End: Original strand, 17687986 - 17688018
Alignment:
Q  19 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17687986 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 17688018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 143)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6490380 - 6490180
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6490380 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 6490281  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6490280 tttaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 6490181  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  6490180 t 6490180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6501034 - 6500834
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6501034 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 6500935  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500934 ttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaaaatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 6500835  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  6500834 t 6500834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12237645 - 12237445
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12237645 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 12237546  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12237545 ttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgactatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 12237446  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  12237445 t 12237445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12249471 - 12249271
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12249471 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 12249372  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12249371 ttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgactatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 12249272  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  12249271 t 12249271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7804549 - 7804347
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7804549 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 7804450  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7804449 tttaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttatggattaaatgcagcttctggtgatgata 7804350  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  7804349 ttg 7804347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24706583 - 24706385
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24706583 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 24706484  T
Q  118 cacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24706483 caattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctacttttgatcttcagtttgaatatacggattaaatgtagcttctggtgatgatat 24706385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 9535812 - 9536012
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9535812 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 9535911  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  9535912 ttcaattcttcgttcttcttagataatgttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatttacggataaaatgtagcttctggtgatgata 9536011  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  9536012 t 9536012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 23635914 - 23636112
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23635914 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagtactatccaaatgaccgttgatacctccct 23636013  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23636014 ttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttagatcttcagtttgaatatacggattgaatgtagcttctggtgatgat 23636112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9993924 - 9993725
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9993924 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgtaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 9993825  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9993824 ttcaattcttcgttcttattagataagg-tgaaataagaaacagctactttggatcttcagtttgagtaaatggattaaatgtagcttctggtgatgata 9993726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17910033 - 17909833
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17910033 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 17909934  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17909933 ttcaattcttcgttcttcttagataaagttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacagattaaatgtagcttctggtgatgata 17909834  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  17909833 t 17909833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9981916 - 9981717
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9981916 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgtaggacagatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 9981817  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9981816 ttcaattcttcgttcttattagataagg-tgaaataagaaacagctactttggatcttcagtttgagtaaatggattaaatgtagcttctggtgatgata 9981718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19887385 - 19887185
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19887385 acagagtagtggagttagtggttgtacacttgtgctttgtcaactctgttaacgaagtacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 19887286  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19887285 ttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgata 19887186  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  19887185 t 19887185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7794638 - 7794436
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7794638 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggaaaaatacttagtgctatctaaatgaccgttgatacctccct 7794539  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7794538 tttaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttatggattaaatgcagcttctggtgatgata 7794439  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  7794438 ttg 7794436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29461244 - 29461047
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  29461244 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcct 29461145  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 213  Q
    |||| |||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29461144 ttcaattctccgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacagctactttggatctttagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 29461047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16391645 - 16391447
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16391645 acagagtagtggagatagtggttgtatacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagtgttatccaaaagaccgttgatacctccct 16391546  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16391545 ttcaattcttcgttcttcttagataagattgaattgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatacggattaaatgtagcttctggtgatgat 16391447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29472096 - 29471899
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  29472096 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcct 29471997  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 213  Q
    |||| ||||  |||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29471996 ttcaattctctgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacagctactttggatctttagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 29471899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 48337445 - 48337645
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  48337445 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaattctgttaacgaaggacaaatactcagtgctgtccaaatgaccgatgatacctccct 48337544  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  48337545 ttcaattcttcgttcttcttagataatgttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggataaaatgtagcttctggtgatgata 48337644  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  48337645 t 48337645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 933831 - 934031
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||    
T  933831 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagagcacttcaaaagaccgttgatacctccct 933930  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  933931 ttcaattcttcattcttcttagataagattgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtggtgata 934030  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  934031 t 934031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 4404476 - 4404676
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  4404476 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtactcagtgttctccaaatgaccgttgatacctccct 4404575  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||||||| || |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4404576 ttcaattcttcgtttttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggatcaaatgtagcttctagtgatgata 4404675  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  4404676 t 4404676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 4457119 - 4457319
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  4457119 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtactcagtgttctccaaatgaccgttgatacctccct 4457218  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||| || || |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  4457219 ttcaattcttcatttttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacagatcaaatgtagcttctggtgatgata 4457318  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  4457319 t 4457319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9391233 - 9391033
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||    
T  9391233 acagagtagtggaggtagtggtggtacatttgtactttctcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgcgcttcaagtgaccgttgatacctccct 9391134  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9391133 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgata 9391034  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  9391033 t 9391033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9380687 - 9380487
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  | ||| |||| ||||||||||||||    
T  9380687 acagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactatgttaacgaaggacaaatactcagtgcgcttcaagtgactgttgatacctccct 9380588  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9380587 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaatagctactttggatcttcagtttgaatttacagattaaatgtagcttctggtgatgata 9380488  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  9380487 t 9380487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11216752 - 11216552
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |   | ||||||| | |||||||||||||    
T  11216752 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcaatggacttcaaatgatcattgatacctccct 11216653  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11216652 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatttgcggatcaaatatagcttctggtgatgata 11216553  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  11216552 t 11216552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16348662 - 16348467
Alignment:
Q  20 agtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttca 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348662 agtagtggaggtagtggttgcacacttgtattttgtcaactctgttaacgaaagacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccctttca 16348563  T
Q  120 cttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaa-ctactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
     |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || || |||||||||||||||||||    
T  16348562 attcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacaagctactttggatcttcagtttgaatttacaaatcaattgtagcttctggtgatgat 16348467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 38314903 - 38315101
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | | |||||||||||||||||  ||||||    
T  38314903 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatacttagtgttctccaaatgaccgttgatgtctccct 38315002  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||| || || |||| || |||||||||||||||||||    
T  38315003 ttcaattcttcgttcttcttagacaaggttgaaatgttaaacagctactttgaatcttcagtttggatttacggatcaattgtagcttctggtgatgat 38315101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 211
Target Start/End: Original strand, 11164033 - 11164228
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  11164033 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgcacttcaaatgaccgttgatacctccct 11164132  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgat 211  Q
    |||| || ||||||||| |||||  |||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||| ||||||    
T  11164133 ttcaatttttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacagctactttgaatcttcagtttgaatttgcggatcaaatgtagcttccggtgat 11164228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1784101 - 1783903
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||   | |||||||||||||||||  ||||||    
T  1784101 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtacttagttttctccaaatgaccgttgatgtctccct 1784002  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||| ||| || |||| || |||||||||||||||||||    
T  1784001 ttcaattcttcgttcttcttagacaaggttgaaatgttaaacagctactttgaatctccagtttaaatttacggatcaattgtagcttctggtgatgat 1783903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1794513 - 1794315
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||   | ||||||||| |||||||  ||||||    
T  1794513 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtacttagttttctccaaatgatcgttgatgtctccct 1794414  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||| ||| || |||| || |||||||||||||||||||    
T  1794413 ttcaattcttcgttcttcttagacaaggttgaaatgttaaacaactactttgaatctccagtttaaatttacggatcaattgtagcttctggtgatgat 1794315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13383294 - 13383093
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  13383294 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgaaagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 13383195  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  13383194 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 13383096  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  13383095 ttg 13383093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 28169285 - 28169483
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||| | | | |||||||||||||||||||||||    
T  28169285 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgcaggacaagtactcagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccct 28169384  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||  |  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  28169385 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaacgagaaacagctactttgaatcttcagtttaaattcactgattaattgtaccttctggtgatgat 28169483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14321713 - 14321514
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaa-tgaccgttgatacctccc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||| | | | |||| ||||||||||||||||||    
T  14321713 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacaaaggacaagtactcagtgttcttcaaaatgaccgttgatacctccc 14321614  T
Q  115 tttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||  |  |||||| |||||||||||||||||||    
T  14321613 tttcaattcttcgttcttcttagatgaggttgaaacgacaaacagctactttgaatcttcagtttaaattcactgattaattgtagcttctggtgatgat 14321514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18851723 - 18851524
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  18851723 acagagtagtggaggtagtggttgtatacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacatttactcagtgttttccaaatgaccgttgatacctccct 18851624  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaata-tatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||  ||| | |||||||| |||||||| ||||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18851623 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaatagctactttgaatcttcagattgaatattactgatcaaatgtaacttctggtgatgat 18851524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 526564 - 526363
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  526564 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 526465  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  526464 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 526366  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  526365 ttg 526363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4174787 - 4174586
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  4174787 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 4174688  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  4174687 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 4174589  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  4174588 ttg 4174586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 5510900 - 5511101
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  5510900 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 5510999  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5511000 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 5511098  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  5511099 ttg 5511101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6180558 - 6180357
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  6180558 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 6180459  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  6180458 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 6180360  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  6180359 ttg 6180357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6220732 - 6220531
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  6220732 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 6220633  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  6220632 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 6220534  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  6220533 ttg 6220531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13372700 - 13372499
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  13372700 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactttattaacgaaagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 13372601  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  13372600 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 13372502  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  13372501 ttg 13372499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13393888 - 13393687
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  13393888 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 13393789  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  13393788 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggataaaacgtagcttctggtgaagata 13393690  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  13393689 ttg 13393687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 16476483 - 16476684
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  16476483 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 16476582  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  16476583 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 16476681  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  16476682 ttg 16476684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 19789227 - 19789428
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  19789227 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 19789326  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  19789327 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 19789425  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  19789426 ttg 19789428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 23647953 - 23648154
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  23647953 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 23648052  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  23648053 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 23648151  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  23648152 ttg 23648154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 41683883 - 41684084
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  41683883 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 41683982  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  41683983 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 41684081  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  41684082 ttg 41684084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 41694452 - 41694653
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  41694452 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 41694551  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  41694552 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 41694650  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  41694651 ttg 41694653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 217
Target Start/End: Original strand, 5521078 - 5521278
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  5521078 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 5521177  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5521178 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 5521276  T
Q  216 tt 217  Q
    ||    
T  5521277 tt 5521278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 27883587 - 27883786
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27883587 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccct 27883686  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
     ||| |||||||||| | |||||  ||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  27883687 gtcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcttcagtttaaatttactgatcaattgtagcttctggtgatgata 27883785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 12567301 - 12567138
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | | | |||||||||||||||||||||||    
T  12567301 acagagtagtgaaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccct 12567202  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagttt 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12567201 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaacgagaaacaactactttaaatcttcagttt 12567138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13261704 - 13261541
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | | | |||||||||||||||||||||||    
T  13261704 acagagtagtgaaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgcaggacaagtactcagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccct 13261605  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagttt 179  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13261604 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaacgagaaacaactactttaaatcttcagttt 13261541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Original strand, 16493245 - 16493443
Alignment:
Q  19 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  16493245 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctttc 16493344  T
Q  119 acttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatattg 218  Q
    | |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  16493345 aattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagatattg 16493443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 504198 - 503997
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  504198 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 504099  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  504098 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 504000  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  503999 ttg 503997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5537052 - 5536851
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  5537052 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 5536953  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5536952 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 5536854  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  5536853 ttg 5536851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5547636 - 5547435
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  5547636 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 5547537  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5547536 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 5547438  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  5547437 ttg 5547435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12287009 - 12286808
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  | |||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12287009 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagttcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 12286910  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12286909 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 12286811  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  12286810 ttg 12286808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12296831 - 12296630
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  | |||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12296831 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagttcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 12296732  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12296731 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 12296633  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  12296632 ttg 12296630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 19778590 - 19778791
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  19778590 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 19778689  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| || ||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  19778690 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgggaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 19778788  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  19778789 ttg 19778791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20673226 - 20673025
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  20673226 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 20673127  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  20673126 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 20673028  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  20673027 ttg 20673025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20683811 - 20683610
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  20683811 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 20683712  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  20683711 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 20683613  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  20683612 ttg 20683610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 23768099 - 23768300
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  23768099 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 23768198  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  23768199 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaattagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 23768297  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  23768298 ttg 23768300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 37759875 - 37760076
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  37759875 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 37759974  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  37759975 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 37760073  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  37760074 ttg 37760076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 37885783 - 37885984
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  37885783 acagagtagtggaagtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 37885882  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  37885883 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 37885981  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  37885982 ttg 37885984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 39672913 - 39672712
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||| |||    
T  39672913 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgataccttcct 39672814  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  39672813 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 39672715  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  39672714 ttg 39672712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10655293 - 10655094
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     ||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10655293 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactatgtcaactctgttaataggagacaagtgctcagtgatatccatatgaccgttgatacctccctt 10655194  T
Q  117 tcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  10655193 tcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagagacagctactttgaatcttcagtttgatta-agggatcaaatgtagcttctggtgaagatat 10655095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 4743942 - 4744143
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  4743942 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 4744041  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  4744042 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 4744140  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  4744141 ttg 4744143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 4754527 - 4754728
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  4754527 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 4754626  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  4754627 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 4754725  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  4754726 ttg 4754728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5579664 - 5579463
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  5579664 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 5579565  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  5579564 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 5579466  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  5579465 ttg 5579463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5628048 - 5627847
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  5628048 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 5627949  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  5627948 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 5627850  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  5627849 ttg 5627847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5865724 - 5865523
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  5865724 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 5865625  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  5865624 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 5865526  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  5865525 ttg 5865523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5876323 - 5876122
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  5876323 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 5876224  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  5876223 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 5876125  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  5876124 ttg 5876122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8740158 - 8739961
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | | | |||||||||||||||||||||||    
T  8740158 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaagtactcagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccct 8740059  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||| ||| || ||||  ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |  |||||||||||||||||||    
T  8740058 ttcaattcttctttc-ttctagacgaggttgaaacgaaaaacaactcctttgaatcttcagtttaaatttaatgatcacttgtagcttctggtgatgat 8739961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 13557779 - 13557980
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| | |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  13557779 acagagtagtggagatagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctccgtgctatccatatatccgttgatacctccct 13557878  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  13557879 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 13557977  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  13557978 ttg 13557980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 18484250 - 18484451
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  18484250 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccct 18484349  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18484350 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 18484448  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  18484449 ttg 18484451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 20721318 - 20721519
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  20721318 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 20721417  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  20721418 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 20721516  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  20721517 ttg 20721519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 23757503 - 23757704
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  23757503 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaaatctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 23757602  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  23757603 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaattagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 23757701  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  23757702 ttg 23757704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 24660105 - 24660306
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  24660105 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagagctatccatatatccgttgatacctccct 24660204  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  24660205 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 24660303  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  24660304 ttg 24660306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 24670685 - 24670886
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  24670685 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagagctatccatatatccgttgatacctccct 24670784  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  24670785 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 24670883  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  24670884 ttg 24670886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28314262 - 28314061
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  28314262 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccct 28314163  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28314162 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 28314064  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  28314063 ttg 28314061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28324878 - 28324677
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  28324878 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccct 28324779  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28324778 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 28324680  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  28324679 ttg 28324677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 37866650 - 37866851
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  37866650 acagagtagttgaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaacactattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 37866749  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  37866750 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 37866848  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  37866849 ttg 37866851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 38194930 - 38195123
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  38194930 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 38195029  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  38195030 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 38195123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 38205466 - 38205659
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  38205466 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 38205565  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  38205566 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 38205659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10626971 - 10626779
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     ||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10626971 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactatgtcaactctgttaataggagacaagtgctcagtgatatccatatgaccgttgatacctccctt 10626872  T
Q  117 tcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  10626871 tcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagagacagctactttgaatcttcagtttgatta-agggatcaaatgtagcttctggtga 10626779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 1064342 - 1064541
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || ||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  1064342 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaaatacctagtgctcttcaaacgaccgttgatacctccct 1064441  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||| | |||||  ||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  1064442 ttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgata 1064540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 8774863 - 8775064
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||| | || ||  ||||||||||||||||    
T  8774863 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgcttttcatatatccgttgatacctccct 8774962  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  8774963 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 8775061  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  8775062 ttg 8775064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 8785448 - 8785649
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||| | || ||  ||||||||||||||||    
T  8785448 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgcttttcatatatccgttgatacctccct 8785547  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  8785548 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 8785646  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  8785647 ttg 8785649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 13121867 - 13122068
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  13121867 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 13121966  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||  ||||||||||||| ||||    
T  13121967 ttcaattcttcgttcttcgttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacatagcttctggtgaagata 13122065  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  13122066 ttg 13122068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 13132110 - 13132311
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  13132110 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 13132209  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||  ||||||||||||| ||||    
T  13132210 ttcaattcttcgttcttcgttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacatagcttctggtgaagata 13132308  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  13132309 ttg 13132311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 14465796 - 14465997
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  14465796 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 14465895  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||  ||||||||||||| ||||    
T  14465896 ttcaattcttcgttcttcgttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacatagcttctggtgaagata 14465994  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  14465995 ttg 14465997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 14476428 - 14476629
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  14476428 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 14476527  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||  ||||||||||||| ||||    
T  14476528 ttcaattcttcgttcttcgttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacatagcttctggtgaagata 14476626  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  14476627 ttg 14476629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24383549 - 24383348
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  24383549 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 24383450  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  24383449 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 24383351  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  24383350 ttg 24383348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 35187582 - 35187783
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  35187582 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 35187681  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  35187682 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 35187780  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  35187781 ttg 35187783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 39382896 - 39383089
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  39382896 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccct 39382995  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  39382996 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 39383089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 16077133 - 16077332
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | | | |||||||||||||||||||||||    
T  16077133 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaagtactcagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccct 16077232  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||| ||| | |||||  ||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||  ||| ||  ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  16077233 ttcaattcttcattc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcttcagttaaaatttactgatcatttgtagcttctggtgatgata 16077331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16666154 - 16665959
Alignment:
Q  20 agtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16666154 agtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaagtacccagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttca 16666055  T
Q  120 cttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
     |||||||||| || ||||  ||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |  |||||||| ||||||||||||    
T  16666054 attcttcgttc-ttctagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgtagcttttggtgatgatat 16665959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 8995987 - 8995825
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  8995987 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataatgaaggacaaatactcagtgcttttaaaatgaccgttgatacctccct 8995888  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagttt 179  Q
    |||| |||||||||| | |||||  ||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  8995887 ttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagcttctttgaatcttcagttt 8995825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11272413 - 11272220
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  11272413 acagagtggtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccct 11272314  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  11272313 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 11272220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 39372259 - 39372452
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| | |||| | ||  ||||||||||||||||    
T  39372259 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgttatctatatatccgttgatacctccct 39372358  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  39372359 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 39372452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17281464 - 17281264
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  17281464 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaagtacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccct 17281365  T
Q  116 ttcacttcttc-gttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||| |||| | |||||  ||||||||| || ||||| || ||||| ||| ||||||| ||| ||  ||| |  |||||||||||||||||||    
T  17281364 ttcaattcttcagttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcgtcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgat 17281266  T
Q  215 at 216  Q
    ||    
T  17281265 at 17281264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 216
Target Start/End: Original strand, 1053917 - 1054112
Alignment:
Q  20 agtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  || ||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1053917 agtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaagtacctagtgctcttcaaatgaccgttgatatctccctttca 1054016  T
Q  120 cttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
     |||||||||| | |||||  ||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |  |||||||||||||||||||||    
T  1054017 attcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgatat 1054112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16671189 - 16670994
Alignment:
Q  20 agtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16671189 agtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaaatacccactgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttca 16671090  T
Q  120 cttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
     |||||| ||| || ||||  ||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |  |||||||| ||||||||||||    
T  16671089 attcttcattc-ttctagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgtagcttttggtgatgatat 16670994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15216371 - 15216173
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | | ||| ||| | ||||||| |||||||||||| ||    
T  15216371 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaggtacccagtgctcttcaaatgatcgttgatacctcact 15216272  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||| | |||||  ||||||||| || ||||| || ||||| ||| ||||||| ||| ||  ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  15216271 ttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcgtcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgata 15216173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 10099272 - 10099465
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  10099272 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagaggcaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 10099371  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttgga-tcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtg 209  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| | | |||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||    
T  10099372 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatttttcagtttgatta-aaagatcaaatgtagcttctggtg 10099465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9006539 - 9006377
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| |  ||||| ||||||||| ||||||    
T  9006539 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataatgaaggacaaatactcagtgcttttaaaatgcccgttgatatctccct 9006440  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagttt 179  Q
    |||| |||||||||| | |||||  || |||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  9006439 ttcaattcttcgttc-tcttagacgagattgaaacgaaaaacagcttctttgaatcttcagttt 9006377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 14581342 - 14581541
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||| | | ||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  14581342 acagggtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaacgctgaaaatgaaggacaagtacccagtgctttgtaaatgaccgttgatacctccct 14581441  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    | || |||||||||| || ||||  ||||||||| || ||| | || ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  14581442 tgcaattcttcgttc-ttctagacgaggttgaaacgaaaaaaagctcctttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgata 14581540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Original strand, 16487098 - 16487298
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctt 116  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||| || ||||  |||||  |||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||    
T  16487098 cagagtagtggaggtactggttgaacacttgtagtgtgtcaactctattgacgagagacaagagctcagtggtatccatatatccgttgatacctccctt 16487197  T
Q  117 tcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
    ||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  16487198 tcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagatat 16487296  T
Q  217 tg 218  Q
    ||    
T  16487297 tg 16487298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29933589 - 29933396
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||   ||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  29933589 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaaagaaggacaagcactccgtgctttccaaatgaccgttgatacctctct 29933491  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagttt-gaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    || | |||||||||||        |||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||  |||| |   || ||||||||||||||||||| ||    
T  29933490 tttaattcttcgttct-------caaggttgaaacgagaaacaactcctttgaaacttcagtttaaaataaactaatcaaatgtagcttctggtgattat 29933398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29982743 - 29982550
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||   ||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  29982743 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaaagaaggacaagcactccgtgctttccaaatgaccgttgatacctctct 29982645  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagttt-gaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    || | |||||||||||        |||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||  |||| |   || ||||||||||||||||||| ||    
T  29982644 tttaattcttcgttct-------caaggttgaaacgagaaacaactcctttgaaacttcagtttaaaataaactaatcaaatgtagcttctggtgattat 29982552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13199273 - 13199074
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||  | ||| ||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  13199273 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaaagaaggacaaacacccagtgcttttcaaatgaccgttggtacctccct 13199175  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagttt-gaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    || | ||| |||||| | |||||  ||||| ||| || ||||| || ||||| | |||||||||  |||||   ||| || |||||||||||||||||||    
T  13199174 tttaattcatcgttc-tcttagacgaggttaaaacgaaaaacagctcctttgaaacttcagtttaaaatattctgatcaactgtagcttctggtgatgat 13199076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 2246571 - 2246769
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||  |  || ||| | ||||||| ||||| |||||||||    
T  2246571 acagagtagtggaggtagtagttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaaacacctagtgcttttcaaatgaacgttggtacctccct 2246669  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    || | | |||||||| | |||||  ||||| ||| || |||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  2246670 tttaatccttcgttc-tcttagacgaggttaaaacgaaaaacaactcctttgaaactttagtttaaatatactgatcaactgtagcttctggtgatgata 2246768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29906209 - 29906018
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 117  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||   ||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  29906209 agagtagtataggtagtggttgtaaacttgtactttgtcaactct-tcaaagaaggacaagcactccgtgctttacaaatgaccgttgatacctctcttt 29906111  T
Q  118 cacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagttt-gaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
     | |||||||||||        |||||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||  |||| |   || ||||||||||||||||||||||||    
T  29906110 taattcttcgttct-------caaggttgaaacgagaaacagctcctttgaaacttcagtttaaaataaactaatcaaatgtagcttctggtgatgatat 29906018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29947374 - 29947183
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 117  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||   ||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  29947374 agagtagtataggtagtggttgtaaacttgtactttgtcaactct-tcaaagaaggacaagcactccgtgcttttcaaatgaccgttgatacctctcttt 29947276  T
Q  118 cacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagttt-gaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
     | |||||||||||        |||||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||  |||| |   || ||||||||||||||||||||||||    
T  29947275 taattcttcgttct-------caaggttgaaacgagaaacagctcctttgaaacttcagtttaaaataaactaatcaaatgtagcttctggtgatgatat 29947183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29996528 - 29996337
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 117  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||   ||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  29996528 agagtagtataggtagtggttgtaaacttgtactttgtcaactct-tcaaagaaggacaagcactccgtgcttttcaaatgaccgttgatacctctcttt 29996430  T
Q  118 cacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagttt-gaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
     | |||||||||||        |||||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||  |||| |   || ||||||||||||||||||||||||    
T  29996429 taattcttcgttct-------caaggttgaaacgagaaacagctcctttgaaacttcagtttaaaataaactaatcaaatgtagcttctggtgatgatat 29996337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 31114016 - 31113971
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31114016 cagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 31113971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 15651093 - 15651055
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15651093 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 15651055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 15662728 - 15662690
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15662728 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 15662690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Original strand, 21736322 - 21736360
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21736322 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 21736360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 51989166 - 51989128
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51989166 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 51989128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 62
Target Start/End: Original strand, 15833414 - 15833459
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15833414 agagtagtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 15833459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 41045752 - 41045797
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41045752 cagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 41045797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 10529355 - 10529401
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10529355 cagagtcgtggaggtagtggttgtacacttcgtactttgtcaactct 10529401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 17022036 - 17022082
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17022036 cagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 17022082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 62
Target Start/End: Original strand, 15851017 - 15851065
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtgg-ttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15851017 acagagtagtggaggtagtggtttgtacactttgtactttgtcaactct 15851065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 59
Target Start/End: Original strand, 51341019 - 51341063
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactttgtcaac 59  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  51341019 acagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtactttgtcaac 51341063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Original strand, 13148282 - 13148321
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13148282 gtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 13148321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 18121774 - 18121743
Alignment:
Q  15 cacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18121774 cacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 18121743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 18142904 - 18142873
Alignment:
Q  15 cacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18142904 cacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 18142873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 2561196 - 2561226
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2561196 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 2561226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 5213585 - 5213615
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5213585 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 5213615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 6090740 - 6090770
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6090740 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 6090770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 11868277 - 11868307
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11868277 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 11868307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 12389023 - 12388993
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12389023 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 12388993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 12726381 - 12726351
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12726381 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 12726351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 14955435 - 14955465
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14955435 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14955465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 16032533 - 16032563
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16032533 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 16032563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 25398406 - 25398376
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25398406 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 25398376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Original strand, 27173044 - 27173082
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27173044 gtggaggtcgtggttgtacatttgtactttgtcaactct 27173082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 29855417 - 29855447
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29855417 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 29855447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 40799882 - 40799912
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40799882 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 40799912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 47207714 - 47207744
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47207714 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 47207744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 53056878 - 53056848
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53056878 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 53056848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 46
Target Start/End: Original strand, 2785073 - 2785102
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2785073 cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 2785102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 51
Target Start/End: Original strand, 16880026 - 16880058
Alignment:
Q  19 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16880026 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 16880058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 38177792 - 38177764
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38177792 agagtagtggaggtagtggttgtacactt 38177764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 49553638 - 49553610
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49553638 agagtagtggaggtagtggttgtacactt 49553610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 102)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 216
Target Start/End: Original strand, 26044368 - 26044567
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26044368 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaactgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctt 26044467  T
Q  117 tcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26044468 tcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatagggattaaatgtagcttctggtgatgatat 26044567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 25787855 - 25788053
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25787855 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 25787954  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25787955 ttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatacggattaaatgtagcttctggtgatgat 25788053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 12827847 - 12828045
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12827847 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 12827946  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  12827947 ttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 12828045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 6158361 - 6158563
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6158361 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgagggacaaatgctcagtgctatccatatgaccgttgttacctccct 6158460  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6158461 ttcaattcttcgttcttcttagataagattgaattgagaaacaactactttggatcttcagtttaaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 6158560  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  6158561 ttg 6158563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7375800 - 7375600
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7375800 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 7375701  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7375700 ttcaattcttcgttcttcttagataatgttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggataaaatgtagcttctggtgatgata 7375601  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  7375600 t 7375600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20029946 - 20029746
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20029946 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 20029847  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20029846 ttcaattcttcgttcttcttagataatgttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggataaaatgtagcttctggtgatgata 20029747  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  20029746 t 20029746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11147289 - 11147093
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11147289 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 11147190  T
Q  118 cacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  11147189 caattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggattatatgtagcttctggtgttgat 11147093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20062697 - 20062497
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062697 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 20062598  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20062597 ttcaattcttcgttcttcttagataatgttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgattttacggataaaatgtagcttctggtgatgata 20062498  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  20062497 t 20062497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 28251607 - 28251407
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28251607 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgttcagagctctccaaatgaccgttgatacctccct 28251508  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    || | |||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| || |||||||  ||||||||||||| || | |||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  28251507 tttaattcttcgttcttcttagataaggctgaatggagaaccagctactttaaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgcagcttctggtgaagata 28251409  T
Q  216 tt 217  Q
    ||    
T  28251408 tt 28251407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 28356754 - 28356554
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28356754 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgttcagagctctccaaatgaccgttgatacctccct 28356655  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    || | |||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| || |||||||  ||||||||||||| || | |||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  28356654 tttaattcttcgttcttcttagataaggctgaatggagaaccagctactttaaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgcagcttctggtgaagata 28356556  T
Q  216 tt 217  Q
    ||    
T  28356555 tt 28356554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 218
Target Start/End: Original strand, 25986238 - 25986437
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  25986238 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagtgctattcatatgaccgttggtacctcccttt 25986337  T
Q  118 cacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatatt 217  Q
    || |||||||||||| |||||||||   ||| |||||| || |||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  25986338 caattcttcgttcttcttagataagaccgaattgagaaccagctactttggatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttcttgtgaagatatt 25986436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18925804 - 18925606
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || | | |||||||||||||||||  ||||||    
T  18925804 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtactaagtgttctccaaatgaccgttgatgtctccct 18925705  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||| ||| || |||| || |||||||||||||||||||    
T  18925704 ttcaattcttcgttcttcttagacaaggttgaaatgttaaacaactactttgaatctccagtttaaatttacggatcaattgtagcttctggtgatgat 18925606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 216
Target Start/End: Original strand, 13913207 - 13913403
Alignment:
Q  20 agtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  13913207 agtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttatcgaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttca 13913306  T
Q  120 cttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
     |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  13913307 attcttcgttcttcttagacgaggttgaaacgagaaacagctactttgaatctccagtttaaatttactgatcaattgtagcttctggtgatgatat 13913403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 216
Target Start/End: Original strand, 13928346 - 13928542
Alignment:
Q  20 agtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  13928346 agtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttatcgaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccctttca 13928445  T
Q  120 cttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
     |||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||  ||| || |||||||||| ||||||||||    
T  13928446 attcttcgttcttcttagacgaggttgaaacgagaaacaactactttgaatctccagtttaaatttactgatcaattgtagcttctagtgatgatat 13928542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 183
Target Start/End: Original strand, 8653814 - 8653981
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  8653814 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtattcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccct 8653913  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaat 183  Q
    |||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  8653914 ttcaattcttcgttcttcttagtcgaggttgaaatgagaaacagctactttgaatcttcagtttgaat 8653981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 27506098 - 27506299
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  27506098 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctactaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 27506197  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  27506198 ttcaattcttcgttcttcttagataagattgaattgagaatcagctactttggatcttcagtttgatta-aaggatcaaatatagcttctggtgaagata 27506296  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  27506297 ttg 27506299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 27372988 - 27373189
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  27372988 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctactaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatctgttgatacctccct 27373087  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  27373088 ttcaattcttcgttcttcttagataagattgaattgagaatcagctactttggatcttcagtttgatta-aaggatcaaatatagcttctggtgaagata 27373186  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  27373187 ttg 27373189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 27463338 - 27463539
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  27463338 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctactaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatctgttgatacctccct 27463437  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  27463438 ttcaattcttcgttcttcttagataagattgaattgagaatcagctactttggatcttcagtttgatta-aaggatcaaatatagcttctggtgaagata 27463536  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  27463537 ttg 27463539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 3661537 - 3661738
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  3661537 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 3661636  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3661637 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 3661735  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  3661736 ttg 3661738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 3672201 - 3672402
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  3672201 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 3672300  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3672301 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 3672399  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  3672400 ttg 3672402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31542939 - 31542738
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  31542939 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 31542840  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  31542839 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 31542741  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  31542740 ttg 31542738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 96 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32761894 - 32761774
Alignment:
Q  96 atgaccgttgatacctccctttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  32761894 atgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatttacggattaaa 32761795  T
Q  196 tgtagcttctggtgatgatat 216  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  32761794 tgtagcttctggtgatgatat 32761774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16123579 - 16123380
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt-gtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16123579 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttttgtcaactctgttaaagaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccc 16123480  T
Q  115 tttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||||  ||||||||||| |||||  ||||| ||| |||||||| |||||||| |||| |||||| |||  |  |||||| |||||||||||||||||||    
T  16123479 tttcaaatcttcgttcttgttagacgaggttaaaaagagaaacagctactttgaatctccagtttaaattaactgattaattgtagcttctggtgatgat 16123380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 16930605 - 16930806
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  16930605 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 16930704  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16930705 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 16930803  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  16930804 ttg 16930806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17984751 - 17984550
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  17984751 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 17984652  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  17984651 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 17984553  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  17984552 ttg 17984550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 26864943 - 26865136
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  26864943 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 26865042  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  26865043 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 26865136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 26875567 - 26875760
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  26875567 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 26875666  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  26875667 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 26875760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 29384906 - 29385107
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  29384906 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 29385005  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | | || |||||||||||||||||| ||||    
T  29385006 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aagaatcaaatgtagcttctggtgaagata 29385104  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  29385105 ttg 29385107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34807201 - 34807000
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  34807201 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 34807102  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  34807101 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 34807003  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  34807002 ttg 34807000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34817833 - 34817632
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  34817833 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 34817734  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  34817733 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 34817635  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  34817634 ttg 34817632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9112536 - 9112335
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||    
T  9112536 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatattcgttgatacctccct 9112437  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||  ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  9112436 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttaaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 9112338  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  9112337 ttg 9112335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9123173 - 9122972
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||    
T  9123173 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatattcgttgatacctccct 9123074  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||  ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  9123073 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttaaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 9122975  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  9122974 ttg 9122972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 12855176 - 12855377
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12855176 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 12855275  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  12855276 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatctttagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 12855374  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  12855375 ttg 12855377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 12865702 - 12865903
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12865702 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 12865801  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  12865802 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatctttagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 12865900  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  12865901 ttg 12865903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 16959776 - 16959977
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  16959776 acagagtagtggaggtagtggttgcacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 16959875  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16959876 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 16959974  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  16959975 ttg 16959977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 26036188 - 26036389
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  26036188 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 26036287  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || |||||| ||||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  26036288 ttcaattctttgttcttctttgataagattgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 26036386  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  26036387 ttg 26036389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32961970 - 32961769
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  32961970 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 32961871  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||  |||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  32961870 ttcaattcttcgttcttctttcataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 32961772  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  32961771 ttg 32961769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7751277 - 7751077
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  7751277 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctagtaaagagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 7751178  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  | |||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  7751177 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaaacagctactttgaatcttcagtttg-attgagggatcaaatgcagcttctggtgaagata 7751079  T
Q  216 tt 217  Q
    ||    
T  7751078 tt 7751077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 31572568 - 31572767
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  31572568 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtagtttgtcaactctgataacgaaggacaaatactcagtgcttttcaaaagaccgttgatacctccct 31572667  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||| ||| | |||||  ||||||||| || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  31572668 ttcaattcttcattc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcgttagtttaaatttactgatcaaatgtagcttctggtgatgata 31572766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 26025614 - 26025815
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  26025614 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 26025713  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  26025714 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 26025812  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  26025813 ttg 26025815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 27341849 - 27342042
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  27341849 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 27341948  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  27341949 ttcaattcttcattcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgacta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 27342042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 27402589 - 27402782
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  27402589 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 27402688  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  27402689 ttcaattcttcattcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgacta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 27402782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 27413248 - 27413441
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  27413248 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 27413347  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  27413348 ttcaattcttcattcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgacta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 27413441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31982667 - 31982474
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  31982667 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 31982568  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  31982567 ttcaattcttcattcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgacta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 31982474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32972589 - 32972388
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  32972589 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 32972490  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||  |||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| ||||||| |||||| ||||    
T  32972489 ttcaattcttcgttcttctttcataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttttggtgaagata 32972391  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  32972390 ttg 32972388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18826280 - 18826081
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | | ||| | | | |||||||||||||||||||||||    
T  18826280 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggataagtacccagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccct 18826181  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||| || ||||  ||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  18826180 ttcaattcttcgttc-ttctagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgata 18826082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18834676 - 18834477
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| | | | |||||||||||||||||||||||    
T  18834676 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaagtacccagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccct 18834577  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    || | |||||||||| || ||||  ||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  18834576 tttaattcttcgttc-ttctagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgata 18834478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27166485 - 27166286
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27166485 acagtgtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataatgaaggacaagtacacagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccct 27166386  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||| || ||||  | ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  27166385 ttcaattcttcgttc-ttctagacgatgttgaaacgaaaaacaactcctttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgata 27166287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 33199483 - 33199683
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  33199483 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccct 33199582  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| || ||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||| ||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  33199583 ttcaatttttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctac-ttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 33199680  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  33199681 ttg 33199683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9580 - 9468
Alignment:
Q  102 gttgatacctccctttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagc 201  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9580 gttgataccttcctttcaattcttcgttcttcttagatgagattgaaacgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagc 9481  T
Q  202 ttctggtgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  9480 ttctggtgatgat 9468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12716875 - 12716684
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12716875 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaaagagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 12716776  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggt 208  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||    
T  12716775 ttcaattcatcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggt 12716684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12727524 - 12727333
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12727524 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaaagagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 12727425  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggt 208  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||    
T  12727424 ttcaattcatcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggt 12727333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 4292880 - 4293079
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |   ||  ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  4292880 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgatgaagaaggacaagtatccaatgcttttcaaatgaccgttgatacctccct 4292979  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||| | |||||| ||||||||| || ||| | || ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| || || |||||||||||||||||    
T  4292980 ttcaattcttcgttc-tcttagatgaggttgaaacgaaaaatagctcctttgaatcttcagtttaaatttactgatcaattgcagcttctggtgatgata 4293078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9933709 - 9933514
Alignment:
Q  20 agtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  9933709 agtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataaagaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctttta 9933610  T
Q  120 cttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
     |||||||||| | |||||  ||||||||| || ||||| || ||||| | ||||||||| ||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  9933609 attcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaaacttcagtttaaatttactgatcaattgtagcttctggtgatgatat 9933514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 132
Target Start/End: Original strand, 29765689 - 29765805
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | | | |||||||||||||||||||||||    
T  29765689 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtacccagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccct 29765788  T
Q  116 ttcacttcttcgttctt 132  Q
    |||| ||||||||||||    
T  29765789 ttcaattcttcgttctt 29765805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 22308944 - 22309136
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | | ||| ||| | |||| |||||||||||| |||||    
T  22308944 acagagtagtggagttagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaagaacaattacccagtgcttttcaaacgaccgttgatacatccct 22309043  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtg 209  Q
    |||| |||||||||| | ||||| |||||||||| || ||||| || ||||| ||| ||||||| ||| ||  |||||  ||||||||||||||    
T  22309044 ttcaattcttcgttc-tcttagacaaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcgtcagtttaaatttactgattacttgtagcttctggtg 22309136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 5845238 - 5845455
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctca-----------------gagctatccaaatg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||                 | ||| | ||||||    
T  5845238 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgtgctcttcaaatg 5845337  T
Q  99 accgttgatacctccctttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||  ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |  |||    
T  5845338 accgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctcagacgaggttgaaacgagaaacagctactttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgt 5845437  T
Q  199 agcttctggtgatgatat 216  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5845438 agcttctggtgatgatat 5845455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 17982542 - 17982417
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  17982542 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 17982443  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataa 141  Q
    |||| |||||||||||| || |||||    
T  17982442 ttcaattcttcgttcttctttgataa 17982417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25686791 - 25686591
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagcta-tccaaatgaccgttgatacctccc 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||   | ||| |||  | ||||||||||||||||||||||    
T  25686791 acagagtagtagaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttcttcaaatgaccgttgatacctccc 25686693  T
Q  115 tttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagttt-gaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 213  Q
    ||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| || | ||| | |||||||||  |||| |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  25686692 tttcaattcttcgttc-ttttagacgaggttgaaacgagaaacagcttcattgaaacttcagtttaaaataaactgatcaaatgtagcttctggtgatga 25686594  T
Q  214 tat 216  Q
    |||    
T  25686593 tat 25686591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 217
Target Start/End: Original strand, 27384587 - 27384787
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||  ||||||||    
T  27384587 acagagtaatggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctagtaaagagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttggaacctccct 27384686  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||  || |||||||| |||||||||||| ||  | |||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  27384687 ttcaattctttgttcttcttggataagactgaattgagagccagctactttgaatcttcagtttg-attgagggatcaaatgcagcttctggtgaagata 27384785  T
Q  216 tt 217  Q
    ||    
T  27384786 tt 27384787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 217
Target Start/End: Original strand, 27475000 - 27475200
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||  ||||||||    
T  27475000 acagagtaatggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctagtaaagagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttggaacctccct 27475099  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||  || |||||||| |||||||||||| ||  | |||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  27475100 ttcaattctttgttcttcttggataagactgaattgagagccagctactttgaatcttcagtttg-attgagggatcaaatgcagcttctggtgaagata 27475198  T
Q  216 tt 217  Q
    ||    
T  27475199 tt 27475200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 27504499 - 27504692
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||  ||||||||    
T  27504499 acagagtaatggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctagtaaagagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttggaacctccct 27504598  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||  || |||||||| |||||||||||| ||  | |||| ||||| ||||||||||||    
T  27504599 ttcaattctttgttcttcttggataagactgaattgagagccagctactttgaatcttcagtttg-attgagggatcaaatgcagcttctggtga 27504692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17745824 - 17745607
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgt------------ 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||                
T  17745824 acagagtagtggaggtaatggttgtacacttctactttgtcaactctgataacgaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgtgctcttcaaatg 17745725  T
Q  104 -----tgatacctccctttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgt 198  Q
         |||||||||||||||| |||||||||||| || ||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||  |  ||  || |||    
T  17745724 accgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttggacgaggttgaaatgagaaacagctactttgaatcttcagtttaaattaactgaacaattgt 17745625  T
Q  199 agcttctggtgatgatat 216  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17745624 agcttctggtgatgatat 17745607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 155
Target Start/End: Original strand, 4631028 - 4631167
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  4631028 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccct 4631127  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaa 155  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||||||    
T  4631128 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaa 4631167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Original strand, 25675315 - 25675515
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagc-tatccaaatgaccgttgatacctccc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||   | ||| || | | ||||||||||||||||||| ||    
T  25675315 acagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgctttttcaaatgaccgttgataccttcc 25675413  T
Q  115 tttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatat--atggattaaatgtagcttctggtgatg 212  Q
    ||||| |||||||||| | |||||  ||||||| | ||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||  |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  25675414 tttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgacacgagaaacaacttctttgaaacttcagtttaaaaatgaactgatcaaatgtagcttctggtgatg 25675512  T
Q  213 ata 215  Q
    |||    
T  25675513 ata 25675515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Original strand, 25679391 - 25679591
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagc-tatccaaatgaccgttgatacctccc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||   | ||| || | | ||||||||||||||||||| ||    
T  25679391 acagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgctttttcaaatgaccgttgatacctacc 25679489  T
Q  115 tttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatat--atggattaaatgtagcttctggtgatg 212  Q
    ||||| |||||||||| | |||||  ||||||| | ||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||  |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  25679490 tttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgacacgagaaacaacttctttgaaacttcagtttaaaaatgaactgatcaaatgtagcttctggtgatg 25679588  T
Q  213 ata 215  Q
    |||    
T  25679589 ata 25679591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25723000 - 25722800
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatc-caaatgaccgttgatacctccc 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||| | | ||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  25723000 acagagtagtggaggtagtagttgtacatttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagtacccagtgctttttcaaatgaccgttgatacctccc 25722902  T
Q  115 tttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagttt--gaatatatggattaaatgtagcttctggtgatg 212  Q
    ||||| |||||||||| | |||||  ||||||| | |||||||| || ||||| | |||||||||   |||| |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  25722901 tttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgacaggagaaacagcttctttgcaacttcagtttaaaaataaactgatcaaatgtagcttctggtgatg 25722803  T
Q  213 ata 215  Q
    |||    
T  25722802 ata 25722800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 32301084 - 32300945
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  32301084 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccct 32300985  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaa 155  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||||||    
T  32300984 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaa 32300945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 32311773 - 32311634
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  32311773 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctccct 32311674  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaa 155  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||||||    
T  32311673 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaa 32311634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17741744 - 17741546
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||   | ||| ||| | |||||||  ||||||||||||||    
T  17741744 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-ttagagaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgattgttgatacctccct 17741646  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||| ||| | |||||  || || ||| || ||||| || ||||| | ||||||||| ||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  17741645 ttcaattcttcattc-tcttagacgagattaaaacgaaaaacagctcctttgaaacttcagtttaaatttactgatcaactgtagcttctggtgatgata 17741547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 25518844 - 25519041
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||   | ||| ||| | || ||||||||||||| |||| |    
T  25518844 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcagatgaccgttgata-ctcctt 25518941  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    || | |||||||||| | |||||  ||||| ||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  25518942 tttaattcttcgttc-tcttagacgaggttaaaacgagaaacagctcctttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgata 25519040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25735600 - 25735400
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagc-tatccaaatgaccgttgatacctccc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||   | ||| || | | ||||||||||||||||||||||    
T  25735600 acagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgctttttcaaatgaccgttgatacctccc 25735502  T
Q  115 tttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagttt--gaatatatggattaaatgtagcttctggtgatg 212  Q
    ||||| |||||||||| | |||||  ||||||| | |||||||| || ||||| | |||||||||   |||| |  ||| |||||||||||||| |||||    
T  25735501 tttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgacacgagaaacagcttctttgaaacttcagtttaaaaataaactgatcaaatgtagcttctgctgatg 25735403  T
Q  213 ata 215  Q
    |||    
T  25735402 ata 25735400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 93 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16123180 - 16123059
Alignment:
Q  93 caaatgaccgttgatacctccctttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggatt 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||  ||||| ||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||| ||  ||||    
T  16123180 caaatgaccgttgatacctccctttcaaatcttcgttcttgttagacgaggttaaaacgagaaacagctactttgaatctccagtttaaatttactgatt 16123081  T
Q  193 aaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  16123080 aattgtagcttctggtgatgat 16123059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 132
Target Start/End: Original strand, 17042780 - 17042892
Alignment:
Q  20 agtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||| | | ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  17042780 agtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaacgctgaaaacgaaagacaagtacccagtgctttgcaaaagaccgttgatacctcccttgca 17042879  T
Q  120 cttcttcgttctt 132  Q
     ||||||||||||    
T  17042880 attcttcgttctt 17042892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 132
Target Start/End: Original strand, 17064353 - 17064465
Alignment:
Q  20 agtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttca 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||| | | ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  17064353 agtagtggaggtagttgttgtacacttgtactttgtcaacgctgaaaatgaaagacaagtacccagtgctttgcaaaagaccgttgatacctcccttgca 17064452  T
Q  120 cttcttcgttctt 132  Q
     ||||||||||||    
T  17064453 attcttcgttctt 17064465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17577744 - 17577640
Alignment:
Q  110 ctccctttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtg 209  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||| ||| || |||| || ||||||||||||||    
T  17577744 ctccctttcaattcttcgttcttcttagacaaggttgaaatgttaaacagctactttgaatctccagtttaaatttacggatcaattgtagcttctggtg 17577645  T
Q  210 atgat 214  Q
    |||||    
T  17577644 atgat 17577640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 11206101 - 11206146
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11206101 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 11206146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 7586298 - 7586252
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7586298 acagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 7586252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 17608443 - 17608401
Alignment:
Q  20 agtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17608443 agtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 17608401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 62
Target Start/End: Original strand, 20635728 - 20635775
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20635728 acagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 20635775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 62
Target Start/End: Original strand, 22386811 - 22386858
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactttgtcaactct 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22386811 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttggtactttgtcaactct 22386858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 12953164 - 12953126
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12953164 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 12953126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Original strand, 18498782 - 18498820
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18498782 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 18498820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Original strand, 18555432 - 18555470
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18555432 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 18555470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 19289414 - 19289376
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19289414 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 19289376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 62
Target Start/End: Original strand, 21128235 - 21128281
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21128235 acagagtcgtggaagtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 21128281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Original strand, 31931585 - 31931623
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31931585 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 31931623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Original strand, 11235659 - 11235699
Alignment:
Q  22 tagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11235659 tagtggaggtagtggttgtacacttgtaatttgtcaactct 11235699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 51
Target Start/End: Original strand, 19625817 - 19625852
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19625817 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 19625852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 9717852 - 9717882
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9717852 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 9717882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 14100580 - 14100550
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14100580 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14100550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 15954712 - 15954742
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15954712 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 15954742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 16877222 - 16877252
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16877222 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 16877252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Original strand, 17047717 - 17047755
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17047717 gtggaggtcgtggttgtacatttgtactttgtcaactct 17047755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 21618253 - 21618283
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618253 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 21618283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 29918026 - 29918056
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29918026 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 29918056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 32544274 - 32544304
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32544274 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 32544304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 18172171 - 18172134
Alignment:
Q  19 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtc 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18172171 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtactatgtc 18172134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 46
Target Start/End: Original strand, 21235135 - 21235164
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21235135 cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 21235164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 46
Target Start/End: Original strand, 13435543 - 13435571
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13435543 agagtagtggaggtagtggttgtacactt 13435571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 51
Target Start/End: Original strand, 19875844 - 19875876
Alignment:
Q  19 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19875844 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 19875876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 46
Target Start/End: Original strand, 22802152 - 22802180
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802152 agagtagtggaggtagtggttgtacactt 22802180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 179; Significance: 9e-97; HSPs: 92)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15888440 - 15888242
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15888440 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 15888341  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15888340 ttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatacggattaaatgtagcttctggtgatgat 15888242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 589401 - 589601
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  589401 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 589500  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  589501 ttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgata 589600  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  589601 t 589601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Original strand, 3165923 - 3166120
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  3165923 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcct 3166022  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 213  Q
    |||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3166023 ttcaattcttcgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacaactactttggatctttagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 3166120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 1367818 - 1368018
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1367818 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 1367917  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1367918 ttcaattcttcgttcttcttagataatgttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggataaaatgtagcttctggtgatgata 1368017  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  1368018 t 1368018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 9171174 - 9171376
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9171174 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 9171273  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9171274 ttcaattcttcgttcctcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgaattttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgata 9171373  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  9171374 ttg 9171376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Original strand, 44280685 - 44280882
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  44280685 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcct 44280784  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 213  Q
    |||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44280785 ttcaattcttcgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacagctactttggatctttagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 44280882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 9170373 - 9170575
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9170373 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcantgctatccaaatgaccgttgatacctccct 9170472  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9170473 ttcaattcttcgttcctcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgaattttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgata 9170572  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  9170573 ttg 9170575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 9159918 - 9160120
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9159918 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcaatgctatccaaatgaccgttgatacctccct 9160017  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9160018 ttcaattcttcgttcctcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttgaattttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgata 9160117  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  9160118 ttg 9160120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31116622 - 31116424
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31116622 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgctaacgaaggacaaatacttagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 31116523  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  31116522 ttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatctttagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgat 31116424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Original strand, 20491195 - 20491392
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||    
T  20491195 acagagtagtggaggtagtgattgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagcgttgtccaaatgaccgttgataccttcct 20491294  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 213  Q
    |||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20491295 ttcaattcttcgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 20491392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21770054 - 21769854
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21770054 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 21769955  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||    
T  21769954 ttcaattcttcgttcttcttagataatgttgaaatgagaaacagctactttggatctccagtttgaatttacgtataaaatgtagcttctggtgatgata 21769855  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  21769854 t 21769854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14745780 - 14745580
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14745780 acagagtagtggagatagtggttgtacacttgtattttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagtgctatccatatgaccgttgatacctccct 14745681  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14745680 ttcaattcttcgttcttcttagataagattgaattgagaaacatctactttggatcttcagtttgaataaatgaattaaatgtagcatctggtgatgata 14745581  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  14745580 t 14745580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19985924 - 19985721
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19985924 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgttcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 19985825  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcag-tttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||| ||||| |||    
T  19985824 ttcatttcttcgttcctcttagataagattgaattaagaaacaactactttggatcttaagttttgaataacttgattaaatgtagcttcgggtgaagat 19985725  T
Q  215 attg 218  Q
    ||||    
T  19985724 attg 19985721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40054865 - 40054666
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt-gtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40054865 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttttgtcaactctgttaaagaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccc 40054766  T
Q  115 tttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||||  ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||| ||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  40054765 tttcaaatcttcgttcttgttagacgaggttgaaacgagaaacagctactttgaatctccagtttaaatttactgattaattgtagcttctggtgatgat 40054666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 18441385 - 18441584
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18441385 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaagtacccagtgctttccaaatgaccgttgatacctccct 18441484  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||| | |||||  ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  18441485 ttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacaactcctttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgata 18441583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 467692 - 467491
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  467692 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 467593  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  467592 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 467494  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  467493 ttg 467491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2705723 - 2705522
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  2705723 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 2705624  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  2705623 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 2705525  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  2705524 ttg 2705522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6877968 - 6877767
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  6877968 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 6877869  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  6877868 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 6877770  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  6877769 ttg 6877767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 20989842 - 20990043
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  20989842 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaaatgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 20989941  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||  || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  20989942 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagagtcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 20990040  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  20990041 ttg 20990043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24930714 - 24930513
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  24930714 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 24930615  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  24930614 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 24930516  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  24930515 ttg 24930513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 48710602 - 48710401
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  48710602 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 48710503  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  48710502 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 48710404  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  48710403 ttg 48710401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 18419304 - 18419503
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18419304 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctaataacgaaggacaagtacccagtgctttccaaatgaccgttgatacctccct 18419403  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||| | |||||  ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  18419404 ttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacaactcctttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgata 18419502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 218
Target Start/End: Original strand, 9444048 - 9444250
Alignment:
Q  15 cacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||    
T  9444048 cacagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccc 9444147  T
Q  115 tttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| |||    
T  9444148 tttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgaaaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagat 9444246  T
Q  215 attg 218  Q
    ||||    
T  9444247 attg 9444250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 454910 - 454709
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  454910 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 454811  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  454810 ttcaattctttgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 454712  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  454711 ttg 454709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 541274 - 541467
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  541274 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 541373  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| ||||||||||||||    
T  541374 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 541467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 1987730 - 1987923
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  1987730 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 1987829  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  1987830 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 1987923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 1998351 - 1998544
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  1998351 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 1998450  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  1998451 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 1998544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2716327 - 2716126
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  2716327 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttttcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 2716228  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  2716227 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 2716129  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  2716128 ttg 2716126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 4212200 - 4212401
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  4212200 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 4212299  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  4212300 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 4212398  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  4212399 ttg 4212401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 4222799 - 4223000
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  4222799 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 4222898  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  4222899 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 4222997  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  4222998 ttg 4223000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 5685708 - 5685909
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  5685708 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 5685807  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||  || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  5685808 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgttta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 5685906  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  5685907 ttg 5685909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6867336 - 6867135
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||| |||    
T  6867336 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgataccttcct 6867237  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  6867236 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 6867138  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  6867137 ttg 6867135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 8617575 - 8617776
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  8617575 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 8617674  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  8617675 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 8617773  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  8617774 ttg 8617776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 9085472 - 9085673
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  9085472 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 9085571  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9085572 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 9085670  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  9085671 ttg 9085673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 9095186 - 9095387
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  9095186 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 9095285  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9095286 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 9095384  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  9095385 ttg 9095387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 9433453 - 9433654
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  9433453 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 9433552  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  9433553 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgaaaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 9433651  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  9433652 ttg 9433654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 11096244 - 11096437
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  11096244 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 11096343  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| ||||||||||||||    
T  11096344 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 11096437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21003119 - 21002918
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  21003119 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 21003020  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||  || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  21003019 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagagtcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 21002921  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  21002920 ttg 21002918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 30049708 - 30049906
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||   | |||||||||| ||||||  ||||||    
T  30049708 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtacttagttttctccaaatgactgttgatgtctccct 30049807  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||| |||| |||||| ||| || |||| || |||||||||||||||||||    
T  30049808 ttcaattcttcgttcttcttagacaaggttgaaatgttaaacagctaatttgaatctccagtttaaatttacggatcaattgtagcttctggtgatgat 30049906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 37344389 - 37344590
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  37344389 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagaggcaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 37344488  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  37344489 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 37344587  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  37344588 ttg 37344590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 40042220 - 40042019
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  40042220 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 40042121  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  40042120 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 40042022  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  40042021 ttg 40042019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 40052769 - 40052568
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  40052769 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 40052670  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  40052669 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 40052571  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  40052570 ttg 40052568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 8628138 - 8628339
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  8628138 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 8628237  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || |||| |  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  8628238 ttcaattcttcgttcttctttgataggactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 8628336  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  8628337 ttg 8628339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 11005374 - 11005575
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  11005374 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccct 11005473  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  11005474 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 11005572  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  11005573 ttg 11005575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17950229 - 17950028
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  17950229 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 17950130  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||  ||||||||||||| ||||    
T  17950129 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacatagcttctggtgaagata 17950031  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  17950030 ttg 17950028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17960835 - 17960634
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  17960835 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 17960736  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||  ||||||||||||| ||||    
T  17960735 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacatagcttctggtgaagata 17960637  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  17960636 ttg 17960634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 22089312 - 22089513
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||    
T  22089312 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatattcgttgatacctccct 22089411  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  22089412 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 22089510  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  22089511 ttg 22089513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 22099927 - 22100128
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||    
T  22099927 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatattcgttgatacctccct 22100026  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  22100027 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 22100125  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  22100126 ttg 22100128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26653436 - 26653235
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  26653436 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 26653337  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||  |||| |||||| || |||||||| |||||| |||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26653336 ttcaattcttcgttcttcgttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttccgtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 26653238  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  26653237 ttg 26653235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26699765 - 26699564
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  26699765 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 26699666  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||  |||| |||||| || |||||||| |||||| |||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26699665 ttcaattcttcgttcttcgttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttccgtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 26699567  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  26699566 ttg 26699564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38593846 - 38593648
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  38593846 acagagtagtgaaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaaagaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccct 38593747  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||  |||| || |||||||| |||| || | | ||| ||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  38593746 ttcaaatcttcgttcttattagacgaggttgaaacaagaaccagctactttgaatctccaatataaatttactgattaattgtagcttctggtgatgat 38593648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6044322 - 6044123
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  6044322 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaagtacccagtgcctttcaaatgaccgttgatacctccct 6044223  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||| | |||||  ||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  6044222 ttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgata 6044124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 167071 - 167272
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  167071 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 167170  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||| || | |||| |||  ||||||||||||| ||||    
T  167171 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatctttagtttgatta-aaggatcaaacatagcttctggtgaagata 167269  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  167270 ttg 167272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26390207 - 26390006
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  26390207 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 26390108  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  26390107 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 26390009  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  26390008 ttg 26390006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26400849 - 26400648
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  26400849 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 26400750  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  26400749 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 26400651  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  26400650 ttg 26400648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Original strand, 177663 - 177861
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  177663 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 177762  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||| || | |||| |||  ||||||||||||| ||||    
T  177763 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatctttagtttgatta-aaggatcaaacatagcttctggtgaagata 177861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8002175 - 8001982
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  8002175 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccct 8002076  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| |||||||||| || || | |||| ||||||||||||||||||    
T  8002075 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagttggatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 8001982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8012820 - 8012627
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  8012820 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccct 8012721  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| |||||||||| || || | |||| ||||||||||||||||||    
T  8012720 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagttggatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 8012627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 42866017 - 42866210
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  42866017 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccct 42866116  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  42866117 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aagaatcaaatgtagcttctggtga 42866210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 42876643 - 42876836
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  42876643 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccct 42876742  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||    
T  42876743 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aagaatcaaatgtagcttctggtga 42876836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 24734942 - 24735143
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  24734942 acagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactctaataatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 24735041  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  24735042 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 24735140  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  24735141 ttg 24735143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 24744889 - 24745090
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  24744889 acagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactctaataatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 24744988  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  24744989 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 24745087  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  24745088 ttg 24745090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 8933709 - 8933908
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  8933709 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataaagaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccct 8933808  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    || | |||||||||| | |||||  ||||||||| || ||||| || | ||  | ||||||||| ||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  8933809 tttaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctccattaaaacttcagtttaaatttactgatcaactgtagcttctggtgatgata 8933907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 48382335 - 48382534
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   | ||| ||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  48382335 acagagtagtggaggtagcggttgtacacttgtactttgtcaactctgataaagaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacatccct 48382434  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    || | |||||||||| | |||||  ||||||||| || ||||| || ||||| | ||||||||| ||| ||  ||  || ||||||||||||||||||||    
T  48382435 tttaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaaacttcagtttaaatttactgagcaattgtagcttctggtgatgata 48382533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26209657 - 26209461
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||   | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  26209657 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctcccttt 26209559  T
Q  118 cacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
    || ||||||||| || |||||  || || ||| || ||||| || ||||| | ||||||||| ||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  26209558 caattcttcgtt-ttcttagacgagattaaaacgaaaaacagctcctttgaaacttcagtttaaatttactgatcaactgtagcttctggtgatgatat 26209461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3476451 - 3476253
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||   | ||| ||| | ||||||| ||||| |||||||||    
T  3476451 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcagagaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttggtacctccct 3476353  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    || | | |||||||| |||||||  ||  |  ||||| ||||| || ||||| | ||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  3476352 tttaatccttcgttc-ttttagacgagaatataatgaaaaacagctcctttgaaacttcagtttgaatatactgatcaactgtagcttctggtgatgata 3476254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 13682510 - 13682708
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||   | ||| | | | ||||||| ||||| |||||||||    
T  13682510 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcagagaaggacaagcacccagtgattttcaaatgaacgttggtacctccct 13682608  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    || | |||||||||| | |||||  ||||| ||| || ||||| || ||||| | ||||||||| ||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  13682609 tttaattcttcgttc-tcttagacgaggttaaaacgaaaaacagctcctttgaaacttcagtttaaatttactgatcaactgtagcttctggtgatgata 13682707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 29590182 - 29590380
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||   | ||| ||| | ||||||| ||||| |||||||||    
T  29590182 acagagtagtgaaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttggtacctccct 29590280  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    || | | |||||||| |||||||  || || ||| || |||||||| ||||| | ||||||||| ||| |   ||| || ||||||||||||||||||||    
T  29590281 tttaatccttcgttc-ttttagacgagattaaaacgaaaaacaactcctttgaaacttcagtttaaatgtcctgatcaactgtagcttctggtgatgata 29590379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12734277 - 12734079
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||   | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  12734277 acagagtaatggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcagagaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccct 12734179  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    || | ||||||||| || |||||  || || ||| || ||||| || ||||| | ||||||||| ||| ||  ||| || | |||||| |||||||||||    
T  12734178 ttaaattcttcgtt-ttcttagacgagattaaaacgaaaaacagctcctttgaaacttcagtttaaatttactgatcaactatagcttatggtgatgata 12734080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 15216506 - 15216704
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||   | ||| |||   |||||| ||||||||||||||||    
T  15216506 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttttactttgtcaactct-tcaaagaaggacaagcacccagtgcttctcaaatggccgttgatacctccct 15216604  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||||||| || ||| |  || || ||| || ||| | || ||||| | ||||||||| ||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  15216605 ttcaattcttcgtt-ttcttaaacgagattaaaacgaaaaatagctcctttgaaacttcagtttaaatttactgatcaactgtagcttctggtgatgata 15216703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 26294140 - 26294064
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatc 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||||||    
T  26294140 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatc 26294064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9261723 - 9261677
Alignment:
Q  167 ggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9261723 ggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 9261677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26290378 - 26290261
Alignment:
Q  100 ccgttgatacctccctttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgta 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||| || | |||| |||  ||    
T  26290378 ccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatctttagtttgatta-aaggatcaaacata 26290280  T
Q  200 gcttctggtgatgatattg 218  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  26290279 gcttctggtgaagatattg 26290261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 8999043 - 8998998
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8999043 cagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 8998998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 11087145 - 11087110
Alignment:
Q  25 tggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaact 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11087145 tggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaact 11087110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 24882520 - 24882485
Alignment:
Q  27 gaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24882520 gaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 24882485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 13174714 - 13174668
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13174714 cagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 13174668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 4821479 - 4821509
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4821479 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 4821509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 14426552 - 14426582
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14426552 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14426582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 19237196 - 19237166
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19237196 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 19237166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 21283526 - 21283496
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21283526 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 21283496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 22578174 - 22578144
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22578174 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 22578144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 24788146 - 24788176
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24788146 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 24788176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 27871723 - 27871753
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27871723 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 27871753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 28409044 - 28409074
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28409044 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 28409074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 30944476 - 30944446
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30944476 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 30944446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 44467069 - 44467099
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467069 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 44467099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 13172502 - 13172465
Alignment:
Q  19 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtc 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  13172502 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtactatgtc 13172465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 19339402 - 19339373
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19339402 cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 19339373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22494169 - 22494073
Alignment:
Q  121 ttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatattg 218  Q
    |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||| ||||| |||  | |||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  22494169 ttcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatctttagttt-aattaaaggatcaaacgtagcttctggtgaagatattg 22494073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23264573 - 23264501
Alignment:
Q  145 tgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatattg 218  Q
    |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  23264573 tgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagatattg 23264501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 13894151 - 13894123
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacac 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13894151 acagagtagtggaggtagtggttgtacac 13894123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 88)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4250639 - 4250441
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4250639 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagcgctatccaaatgaccgttgataccttcct 4250540  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4250539 ttcaattcttcgttcttcttagataagattgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 4250441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39194168 - 39193968
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39194168 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacagatactcagtgctatccaaataaccgttgatacctccct 39194069  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39194068 ttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgata 39193969  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  39193968 t 39193968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 154363 - 154166
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  154363 acagagtagtggaggtagtggttatacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcct 154264  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 213  Q
    |||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154263 ttcaattcttcgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 154166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 148288 - 148091
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  148288 acagagtagtggaggtagtgattgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagcgctgtccaaatgaccgttgatactttcct 148189  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 213  Q
    |||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  148188 ttcaattcttcgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 148091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7689533 - 7689332
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatg-ctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7689533 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaataactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccc 7689434  T
Q  115 tttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7689433 tttcaattcttcgttcttcttagacaaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggattaattgtagcttctggtgatgat 7689334  T
Q  215 at 216  Q
    ||    
T  7689333 at 7689332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Original strand, 5973896 - 5974094
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaa-tgaccgttgatacctccc 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||| ||    
T  5973896 acagagtagtggaggcagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagcgttgtccaaaatgaccgttgataccttcc 5973995  T
Q  115 tttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 213  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5973996 tttcaattcttcgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 5974094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20441391 - 20441191
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20441391 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggaaaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 20441292  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||  | |||||||||||||||| |||||||| ||||| | || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20441291 ttcaattcttcgttcttcttagacgatgttgaaatgagaaacagctactttgaatctttaattagaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgata 20441192  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  20441191 t 20441191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18381978 - 18381811
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18381978 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtactcagggctctccaaatgactgttgatacctccct 18381879  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaat 183  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18381878 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacagctactttgaatcttcagtttgaat 18381811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 211
Target Start/End: Original strand, 39587102 - 39587297
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || | | |||||||||||||||||  ||||||    
T  39587102 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtacttagtgttctccaaatgaccgttgatgtctccct 39587201  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgat 211  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  39587202 ttcaattcttcgttcttcttagacaaggttgaaatgttaaacagctactttgaatcttcagtttaaacttatggatcaattgtagcttctggtgat 39587297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 47195394 - 47195592
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||   | |||||||||||||||||  ||||||    
T  47195394 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtacttagttttctccaaatgaccgttgatgtctccct 47195493  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  47195494 ttcaattcttcgttcttcttagacaaggttgaaatgttaaacagctactttgaatctccagtttaaatttatggatcaattgtagcttctggtgatgat 47195592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 2538668 - 2538869
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  2538668 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 2538767  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  2538768 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 2538866  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  2538867 ttg 2538869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 4167392 - 4167593
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  4167392 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 4167491  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  4167492 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 4167590  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  4167591 ttg 4167593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 4178048 - 4178249
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  4178048 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 4178147  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  4178148 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 4178246  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  4178247 ttg 4178249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5639784 - 5639583
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  5639784 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 5639685  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  5639684 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 5639586  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  5639585 ttg 5639583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5650341 - 5650140
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  5650341 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 5650242  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  5650241 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 5650143  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  5650142 ttg 5650140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 12730680 - 12730881
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12730680 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 12730779  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  12730780 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 12730878  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  12730879 ttg 12730881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12898057 - 12897856
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12898057 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 12897958  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  12897957 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 12897859  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  12897858 ttg 12897856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23580400 - 23580199
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  23580400 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 23580301  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  23580300 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 23580202  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  23580201 ttg 23580199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 35013055 - 35013256
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  35013055 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 35013154  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  35013155 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 35013253  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  35013254 ttg 35013256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 17957372 - 17957571
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt-gtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccc 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17957372 acagagtaatggaggtagtggttgtacacttgtacttttgtaaactctgataaagaaggacaaatactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccc 17957471  T
Q  115 tttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||  |  |||||| |||||||||||||||||||    
T  17957472 tttcaaatcttcgttcttgttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttgaatctccagtttaaattcactgattaattgtagcttctggtgatgat 17957571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 19187971 - 19188173
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaa-atgaccgttgatacctccc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  19187971 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccaatatatccgttgatacctccc 19188070  T
Q  115 tttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| ||||||||| |||| |||    
T  19188071 tttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcaactactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctagtgaagat 19188169  T
Q  215 attg 218  Q
    ||||    
T  19188170 attg 19188173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 3171756 - 3171957
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  3171756 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccct 3171855  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3171856 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 3171954  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  3171955 ttg 3171957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 3182358 - 3182559
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  3182358 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccct 3182457  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3182458 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 3182556  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  3182557 ttg 3182559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12614390 - 12614189
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12614390 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 12614291  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  12614290 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 12614192  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  12614191 ttg 12614189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 12741273 - 12741474
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12741273 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 12741372  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||| ||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  12741373 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcaatttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 12741471  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  12741472 ttg 12741474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 21863794 - 21863995
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  21863794 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 21863893  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  21863894 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 21863992  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  21863993 ttg 21863995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 21877900 - 21878101
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||| | ||  ||||||||||||||||    
T  21877900 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatctatatatccgttgatacctccct 21877999  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  21878000 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 21878098  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  21878099 ttg 21878101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 7507435 - 7507636
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  7507435 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 7507534  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  7507535 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-atggatcaaaagtagcttctggtgaagata 7507633  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  7507634 ttg 7507636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 7518032 - 7518233
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  7518032 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 7518131  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  7518132 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-atggatcaaaagtagcttctggtgaagata 7518230  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  7518231 ttg 7518233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12623855 - 12623654
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12623855 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgatatccatatatccgttgatacctccct 12623756  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  12623755 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 12623657  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  12623656 ttg 12623654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 21895335 - 21895528
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  21895335 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 21895434  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| ||||||||||||||    
T  21895435 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtga 21895528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 218
Target Start/End: Original strand, 33084697 - 33084896
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  33084697 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctcccttt 33084796  T
Q  118 cacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatatt 217  Q
    || |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || |   || ||| |||||||||||||| ||||||    
T  33084797 caattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaaaatcaaacgtagcttctggtgaagatatt 33084895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Original strand, 12946848 - 12947010
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  12946848 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggataaatactcagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccct 12946947  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagttt 179  Q
    |||| ||||||||| || |||||  ||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  12946948 ttcaattcttcgtt-ttcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcttcagttt 12947010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 5833352 - 5833545
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  5833352 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccct 5833451  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  5833452 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 5833545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 5843954 - 5844147
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  5843954 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccct 5844053  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  5844054 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 5844147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10997858 - 10997657
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  10997858 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 10997759  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||| || | |||| |||  ||||||||||||| ||||    
T  10997758 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatctttagtttgatta-aaggatcaaacatagcttctggtgaagata 10997660  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  10997659 ttg 10997657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35401238 - 35401045
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  35401238 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccct 35401139  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  35401138 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 35401045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35404465 - 35404272
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  35404465 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccct 35404366  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  35404365 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 35404272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35648764 - 35648571
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  35648764 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccct 35648665  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  35648664 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 35648571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36236504 - 36236303
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  36236504 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagcttagtgctatccatatatccgttgatacctccct 36236405  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||| || || | |||||| ||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36236404 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggattaaaagtagcttctggtgaagata 36236306  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  36236305 ttg 36236303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36247051 - 36246850
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  36247051 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagcttagtgctatccatatatccgttgatacctccct 36246952  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||| || || | |||||| ||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36246951 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggattaaaagtagcttctggtgaagata 36246853  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  36246852 ttg 36246850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 51629261 - 51629060
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  51629261 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 51629162  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  51629161 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 51629063  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  51629062 ttg 51629060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 51656522 - 51656321
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  51656522 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 51656423  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  51656422 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 51656324  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  51656323 ttg 51656321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11195141 - 11194943
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11195141 acagagtagtggaggtaatggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaagacaagtacccagtgctttccaaatgaccgttgatacctccct 11195042  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||| | |||||  ||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||  ||| || || ||||||| |||||||||    
T  11195041 ttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcttcagtttaaatatactgatcaattgcagcttct-gtgatgata 11194944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9050562 - 9050363
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt-gtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| | ||||| ||| | |||||||||||| |||||||||    
T  9050562 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttttgtcaactttgttaaagaatgacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttaatacctccc 9050463  T
Q  115 tttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||||  ||||||||||| |||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||  || ||| ||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  9050462 tttcaaatcttcgttcttgttagacgaggttgaaatgagaaccagctactttgaatctccaaattaaatttactgattaattgtagcttctggtgatgat 9050363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 19179092 - 19179294
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaa-atgaccgttgatacctccc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| |||| || ||||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  19179092 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactatattaacgagagacaagtgcttagtgctatccaatatatccgttgataactccc 19179191  T
Q  115 tttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| |||    
T  19179192 tttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagat 19179290  T
Q  215 attg 218  Q
    ||||    
T  19179291 attg 19179294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35638112 - 35637919
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  | ||||||||||||||    
T  35638112 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgttatccatatatctgttgatacctccct 35638013  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| || |||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  35638012 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaattttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 35637919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 38095210 - 38095403
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||  ||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  38095210 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaggtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccct 38095309  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| |||||||||| || || | |||| ||||||||||||||||||    
T  38095310 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagttggatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 38095403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 38105835 - 38106028
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||  ||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  38105835 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaggtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccct 38105934  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| |||||||||| || || | |||| ||||||||||||||||||    
T  38105935 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagttggatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 38106028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 47608004 - 47607811
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  47608004 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaaagagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccct 47607905  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||||  |||| |||||| |  | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  47607904 ttcaattcatcgttcttctttgataagactgaattgagaatccgcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 47607811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 47618612 - 47618419
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  47618612 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaaagagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccct 47618513  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||||  |||| |||||| |  | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  47618512 ttcaattcatcgttcttctttgataagactgaattgagaatccgcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 47618419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14388200 - 14388001
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  14388200 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataaagaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccct 14388101  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    || | |||||||||| |||||||  |||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||| ||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  14388100 tttaattcttcgttc-ttttagacgaggttagaacgaaaaacagctcctttgaaacttcagtttaaatttactgatcaactgtagcttctggtgatgata 14388002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18311046 - 18310847
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   | ||| ||| | |||||||||||||||| || |||    
T  18311046 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataaagaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatatcttcct 18310947  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| | |||||||| |||||||  ||||||||| || ||||| || ||||| | |||||  || ||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  18310946 ttcaatccttcgttc-ttttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaaacttcaaattaaatttactgatcaattgtagcttctggtgatgata 18310848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 20195767 - 20195667
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  || ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20195767 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaagtacctagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccct 20195668  T
Q  116 t 116  Q
    |    
T  20195667 t 20195667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41132689 - 41132491
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||  | ||  ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  41132689 acagagtagtagaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaaagaaggacaaacacccaatgcttttcaaatgaccgttgatacctccct 41132591  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||||||| || |||||  || || ||| || ||||| ||  |||| | ||||||||| ||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  41132590 ttcaattcttcgtt-ttcttagacgagattaaaacgaaaaacagctcatttgaaacttcagtttaaatttactgatcaactgtagcttctggtgatgata 41132492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 216
Target Start/End: Original strand, 675580 - 675777
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||   |  || ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  675580 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcaccgagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccctt 675678  T
Q  117 tcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
    ||| ||||||| || | |||||  || || ||| || ||||| || ||||| | ||||||||| |||||   | | || |||||||||||||||||||||    
T  675679 tcaattcttcg-tcctcttagacgagattaaaacgaaaaacagctcctttgaaacttcagtttaaatattctgttcaactgtagcttctggtgatgatat 675777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30292066 - 30291949
Alignment:
Q  100 ccgttgatacctccctttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgta 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||| || | |||| |||  ||    
T  30292066 ccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatctttagtttgatta-aaggatcaaacata 30291968  T
Q  200 gcttctggtgatgatattg 218  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  30291967 gcttctggtgaagatattg 30291949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 62
Target Start/End: Original strand, 23064957 - 23065003
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064957 acagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 23065003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 5929712 - 5929757
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5929712 cagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 5929757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 19038016 - 19038061
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038016 cagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 19038061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 62
Target Start/End: Original strand, 17371050 - 17371097
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactttgtcaactct 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17371050 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtactttgtcaactct 17371097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Original strand, 20799080 - 20799118
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20799080 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 20799118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 22610040 - 22610002
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22610040 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 22610002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Original strand, 23927074 - 23927112
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23927074 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 23927112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 46180945 - 46180907
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46180945 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 46180907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 28474236 - 28474281
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28474236 cagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 28474281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 52350757 - 52350712
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52350757 cagagttgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 52350712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 62
Target Start/End: Original strand, 28380005 - 28380049
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28380005 agagtcgtggaggtactggttgtacacttgtactttgtcaactct 28380049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 62
Target Start/End: Original strand, 44201019 - 44201066
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44201019 acagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 44201066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 19170406 - 19170360
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactc 61  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19170406 acagagtagtggaagtagtggttgtacactttgtactttgtcaactc 19170360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 22019345 - 22019391
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22019345 cagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 22019391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 22642904 - 22642950
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22642904 cagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 22642950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 22655486 - 22655532
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22655486 cagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 22655532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 20251783 - 20251828
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20251783 cagagtcgtggaggtagtggttgtacccttgcactttgtcaactct 20251828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 26548321 - 26548282
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26548321 gtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 26548282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 1900353 - 1900383
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900353 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 1900383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 14263523 - 14263493
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14263523 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 14263493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 20883948 - 20883910
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20883948 gtggagctaatggttgtacacttgtactttgtcaactct 20883910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 21191937 - 21191907
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21191937 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 21191907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 22153865 - 22153895
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22153865 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 22153895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 25448638 - 25448608
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25448638 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 25448608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 35040174 - 35040204
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35040174 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 35040204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 36134198 - 36134228
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36134198 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 36134228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 39201064 - 39201034
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39201064 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 39201034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 45070719 - 45070681
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  45070719 gtggaggtagtggttgtacatttgtaatttgtcaactct 45070681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 2327511 - 2327482
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2327511 cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 2327482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 7745161 - 7745132
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7745161 cagagtagtggaggtagtggttgtacactt 7745132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Original strand, 23054374 - 23054414
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtc 56  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23054374 acagagtagtgaaggtagtggttgtacaattgtactatgtc 23054414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 2984 - 3184
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2984 acagagtagtggaggtattggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctaagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 3083  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3084 ttcacttcttcgttcttcttagattaggttgaaatgagaaacagctactttggaccttcagtttgaatatatggattaattgtagcttctggtgatgata 3183  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  3184 t 3184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 80)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18768956 - 18768756
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18768956 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 18768857  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18768856 ttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgata 18768757  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  18768756 t 18768756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21172516 - 21172316
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21172516 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 21172417  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21172416 ttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgata 21172317  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  21172316 t 21172316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Original strand, 2561668 - 2561865
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  2561668 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagcgctgtccaagtgaccgttgataccttcct 2561767  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 213  Q
    |||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2561768 ttcaattcttcgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 2561865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28721366 - 28721166
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28721366 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacagatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 28721267  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28721266 ttcaattcttcgttcttcttagataatgttgaaatgagaaacagctactttggatcttgagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgata 28721167  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  28721166 t 28721166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28731952 - 28731754
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28731952 acagagtagtggaggtagtggtt--acacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 28731855  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28731854 ttcaattcttcgttcttcttagatgatgttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgata 28731755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24425601 - 24425403
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24425601 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 24425502  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| || ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || || |||||||||||||||||||    
T  24425501 ttcaatttttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatttacaaatcaattgtagcttctggtgatgat 24425403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24415072 - 24414874
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24415072 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactttgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgatcgttgatacctccct 24414973  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || || |||||||||||||||||||    
T  24414972 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacaaatcaattgtagcttctggtgatgat 24414874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27978432 - 27978232
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27978432 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccct 27978333  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||  || ||  |  ||||||||||||||||||||    
T  27978332 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttgaatcttcagtttaaattaattgaacacttgtagcttctggtgatgata 27978233  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  27978232 t 27978232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28064961 - 28064761
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  28064961 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccct 28064862  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||  || ||  |  ||||||||||||||||||||    
T  28064861 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttgaatcttcagtttaaattaattgaacacttgtagcttctggtgatgata 28064762  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  28064761 t 28064761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 183
Target Start/End: Original strand, 26867250 - 26867417
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  26867250 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccct 26867349  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaat 183  Q
    |||| | |||||||||| |||||  |||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26867350 ttcaatgcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacagctactttgaatcttcagtttgaat 26867417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 28374564 - 28374397
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  28374564 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtactcagtgctctccaactgaccgttgataccttcct 28374465  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaat 183  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28374464 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacagctactttgaatcttcagtttgaat 28374397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7005856 - 7005655
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  7005856 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 7005757  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || |||||| ||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  7005756 ttcaattcttcgttcttcttggataagattgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 7005658  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  7005657 ttg 7005655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38586137 - 38585938
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt-gtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  38586137 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttttgtcaactatgttaaagaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccc 38586038  T
Q  115 tttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||||  ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||| ||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  38586037 tttcaaatcttcgttcttcttagacgaggttgaaacgagaaacagctactttgaatctacagtttaaatttactgattaattgtagcttctggtgatgat 38585938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9773355 - 9773154
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  9773355 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 9773256  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  9773255 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 9773157  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  9773156 ttg 9773154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9897623 - 9897422
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  9897623 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 9897524  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  9897523 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 9897425  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  9897424 ttg 9897422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9908211 - 9908010
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  9908211 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 9908112  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  9908111 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 9908013  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  9908012 ttg 9908010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 10267173 - 10267374
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  10267173 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 10267272  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  10267273 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 10267371  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  10267372 ttg 10267374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 10277750 - 10277951
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  10277750 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 10277849  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  10277850 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 10277948  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  10277949 ttg 10277951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21650581 - 21650380
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  21650581 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 21650482  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21650481 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 21650383  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  21650382 ttg 21650380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24327783 - 24327582
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  24327783 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 24327684  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  24327683 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 24327585  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  24327584 ttg 24327582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36251893 - 36251692
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  36251893 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 36251794  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  36251793 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 36251695  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  36251694 ttg 36251692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 43355201 - 43355402
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  43355201 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 43355300  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  43355301 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 43355399  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  43355400 ttg 43355402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 4210070 - 4210271
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  4210070 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 4210169  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  4210170 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 4210268  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  4210269 ttg 4210271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9762819 - 9762618
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  9762819 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaaagagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 9762720  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  9762719 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 9762621  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  9762620 ttg 9762618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11388858 - 11388657
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  11388858 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 11388759  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  11388758 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 11388660  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  11388659 ttg 11388657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17857486 - 17857285
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  17857486 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 17857387  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  17857386 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatctttagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 17857288  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  17857287 ttg 17857285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22914913 - 22914712
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  22914913 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 22914814  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  22914813 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 22914715  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  22914714 ttg 22914712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22960381 - 22960180
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  22960381 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 22960282  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  22960281 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 22960183  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  22960182 ttg 22960180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 29244401 - 29244602
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  29244401 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 29244500  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  29244501 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagttactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 29244599  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  29244600 ttg 29244602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 29254980 - 29255181
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  29254980 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 29255079  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  29255080 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagttactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 29255178  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  29255179 ttg 29255181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 34478107 - 34478308
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  34478107 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 34478206  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  34478207 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 34478305  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  34478306 ttg 34478308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34790266 - 34790065
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  34790266 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgcttagtgctatccatatatccgttgatacctccct 34790167  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  34790166 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 34790068  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  34790067 ttg 34790065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34804409 - 34804208
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  34804409 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgcttagtgctatccatatatccgttgatacctccct 34804310  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  34804309 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 34804211  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  34804210 ttg 34804208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 43345586 - 43345787
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  || |||||||||||||    
T  43345586 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccattgatacctccct 43345685  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  43345686 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 43345784  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  43345785 ttg 43345787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 4220662 - 4220863
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  4220662 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 4220761  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| ||| |||||||||| ||||    
T  4220762 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtaacttctggtgaagata 4220860  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  4220861 ttg 4220863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24338453 - 24338252
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||  |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  24338453 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcaatgctatccatatatccgttgatacctccct 24338354  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  24338353 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcatcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 24338255  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  24338254 ttg 24338252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 27221561 - 27221754
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  27221561 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 27221660  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  27221661 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 27221754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30488872 - 30488671
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  30488872 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 30488773  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||| ||||||| || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  30488772 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatctttagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtgaagata 30488674  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  30488673 ttg 30488671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 40222512 - 40222713
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  40222512 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 40222611  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  40222612 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatctttagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 40222710  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  40222711 ttg 40222713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 40251373 - 40251574
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  40251373 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 40251472  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  40251473 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatctttagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 40251571  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  40251572 ttg 40251574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36784854 - 36784655
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |   ||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36784854 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgatagcgaaggacaagtatccaatgctttccaaatgaccgttgatacctccct 36784755  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||| | |||||| ||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| || || |||||||||||||||||    
T  36784754 ttcaattcttcgttc-tcttagatgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcttcagtttaaatttactgatcaattgcagcttctggtgatgata 36784656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 183
Target Start/End: Original strand, 26879839 - 26880006
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  26879839 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactttgttaatgaaggataagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccct 26879938  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaat 183  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||| ||| |||| |||||||| ||||||    
T  26879939 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacagctaatttgaatcttcaggttgaat 26880006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 43093435 - 43093637
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaa-atgaccgttgatacctccc 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  43093435 acagactagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccaatatatccgttgatacctccc 43093534  T
Q  115 tttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||  |||||||||||||| |||    
T  43093535 tttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaagcgtagcttctggtgaagat 43093633  T
Q  215 attg 218  Q
    ||||    
T  43093634 attg 43093637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1099244 - 1099043
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  1099244 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 1099145  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||| || | |||| |||  ||||||||||||| ||||    
T  1099144 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatctttagtttgatta-aaggatcaaacatagcttctggtgaagata 1099046  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  1099045 ttg 1099043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11395221 - 11395020
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  11395221 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 11395122  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  11395121 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 11395023  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  11395022 ttg 11395020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11405537 - 11405336
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  11405537 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 11405438  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  11405437 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 11405339  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  11405338 ttg 11405336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18392686 - 18392493
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  18392686 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctttccatatatccgttgatacctccct 18392587  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  18392586 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 18392493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 35253162 - 35253355
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  35253162 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccct 35253261  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  35253262 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 35253355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 35263771 - 35263964
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  35263771 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccct 35263870  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  35263871 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 35263964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 35274396 - 35274589
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  35274396 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccct 35274495  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  35274496 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 35274589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 39170144 - 39169943
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  39170144 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 39170045  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  39170044 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagttgcttctggtgaagata 39169946  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  39169945 ttg 39169943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 217
Target Start/End: Original strand, 32218053 - 32218253
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  32218053 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 32218152  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||| || || ||| |||  ||||||||||||| ||||    
T  32218153 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagctactttgaatctttagtttgattaaat-gatcaaacatagcttctggtgaagata 32218251  T
Q  216 tt 217  Q
    ||    
T  32218252 tt 32218253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 43082826 - 43083028
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaa-atgaccgttgatacctccc 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || || ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  43082826 acagactagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagataagtgctcagtgctatccaatatatccgttgatacctccc 43082925  T
Q  115 tttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||  |||||||||||||| |||    
T  43082926 tttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaagcgtagcttctggtgaagat 43083024  T
Q  215 attg 218  Q
    ||||    
T  43083025 attg 43083028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 4099963 - 4100164
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  4099963 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 4100062  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||| || || |||||||| ||||| ||||||| || | |||| |||  ||||||||||||| ||||    
T  4100063 ttcaattcttcgttcttctttgataagactgaattgaaaatcagctactttgaatctttagtttgatta-aaggatcaaacatagcttctggtgaagata 4100161  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  4100162 ttg 4100164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 967552 - 967354
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||   | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  967552 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccct 967454  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||||||| || |||||  || || ||| || ||||| || ||||| | ||||||||| ||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  967453 ttcaattcttcgtt-ttcttagacgagattaaaacgaaaaacagctcctttgaaacttcagtttaaatttactgatcaactgtagcttctggtgatgata 967355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 24275205 - 24275402
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||   | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24275205 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccct 24275303  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||||||| || |||||  || || ||| || ||||| || ||||| | ||||||||| ||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  24275304 ttcaattcttcgtt-ttcttagacgagattaaaacgaaaaacagctcctttgaaacttcagtttaaat-tactgatcaactgtagcttctggtgatgata 24275401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 22763834 - 22764034
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagcta-tccaaatgaccgttgatacctccc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||   | ||| |||  | ||||||||||||||||||||||    
T  22763834 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttatcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttcttcaaatgaccgttgatacctccc 22763932  T
Q  115 tttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagttt-gaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 213  Q
    ||| | |||||||||| | |||||  ||||||||| || ||||| || ||||| | |||||||||  |||| |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  22763933 ttttaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaaacttcagtttaaaataaactgatcaaatgtagcttctggtgatga 22764031  T
Q  214 tat 216  Q
    |||    
T  22764032 tat 22764034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 22774540 - 22774738
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagc-tatccaaatgaccgttgatacctccctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||   | ||| || | | ||||||||||||||||||||||||    
T  22774540 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttcttcaaatgaccgttgatacctccctt 22774638  T
Q  117 tcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagttt-gaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    | | |||||||||| | |||||  ||||||||| || ||||| || ||||| | ||||| |||  |||| |  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22774639 ttaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaaacttcaatttaaaataaactgatcaaatgtagcttctggtgatgata 22774737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 22779918 - 22780116
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagc-tatccaaatgaccgttgatacctccctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||   | ||| || | | ||||||||||||||||||||||||    
T  22779918 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttcttcaaatgaccgttgatacctccctt 22780016  T
Q  117 tcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagttt-gaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    | | |||||||||| | |||||  ||||||||| || ||||| || ||||| | ||||| |||  |||| |  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22780017 ttaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaaacttcaatttaaaataaactgatcaaatgtagcttctggtgatgata 22780115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 92
Target Start/End: Original strand, 16769122 - 16769198
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatc 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  16769122 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatc 16769198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 17969256 - 17969146
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |   | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  17969256 agagtagtggatgtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacgagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctcccttt 17969158  T
Q  118 cacttcttcgtt 129  Q
    || |||||||||    
T  17969157 caattcttcgtt 17969146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 218
Target Start/End: Original strand, 16777117 - 16777234
Alignment:
Q  100 ccgttgatacctccctttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgta 199  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||    
T  16777117 ccgttgataccttcctttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgta 16777215  T
Q  200 gcttctggtgatgatattg 218  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  16777216 gcttctggtgaagatattg 16777234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 19300058 - 19299959
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctt 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||  | ||| ||| | ||||||| |||||| |||||||||    
T  19300058 cagagttgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaaacacccagtgcttttcaaatgaacgttgacacctccctt 19299960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 19498040 - 19497994
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19498040 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 19497994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 20646655 - 20646610
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20646655 cagagtcgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 20646610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 28379806 - 28379736
Alignment:
Q  113 cctttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaat 183  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28379806 cctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacagctactttgaatcttcagtttgaat 28379736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 19313065 - 19313020
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19313065 cagagttgtggagatagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 19313020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 21025575 - 21025530
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21025575 cagagtcgtggaggaagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 21025530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 24814677 - 24814633
Alignment:
Q  19 gagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24814677 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtactttgtcaactct 24814633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Original strand, 19356507 - 19356545
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19356507 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgccaactct 19356545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 59
Target Start/End: Original strand, 1084017 - 1084061
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaac 59  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1084017 acagagtagtggaggtagtggtcgtacactttgtactttgtcaac 1084061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 51
Target Start/End: Original strand, 20568138 - 20568173
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20568138 acagagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 20568173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 62
Target Start/End: Original strand, 22755469 - 22755516
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtaca-cttgtactttgtcaactct 62  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22755469 acagagtagtggaagtagtggtcgtacaccttgtactttgtcaactct 22755516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 6574221 - 6574191
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6574221 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 6574191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 22802463 - 22802493
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802463 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 22802493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 28711795 - 28711765
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28711795 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 28711765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 31328063 - 31328033
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31328063 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 31328033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 31334784 - 31334754
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31334784 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 31334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 24440826 - 24440789
Alignment:
Q  19 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtc 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24440826 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtactatgtc 24440789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 30557416 - 30557388
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30557416 agagtagtggaggtagtggttgtacactt 30557388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42591 - 42391
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42591 acagagtagtggaggtagtcgttgtacacttgtacgttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 42492  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42491 ttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgata 42392  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  42391 t 42391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 31318 - 31519
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  31318 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagagctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 31417  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  31418 ttcaattctttgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaaagtagcttctggtgaagata 31516  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  31517 ttg 31519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2289 - 2087
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2289 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtattttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 2190  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2189 tttaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacatctactttttatcttcagtttgaatttacggattaaatgtagcttctggtgatgata 2090  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  2089 ttg 2087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6956 - 6758
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6956 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgcttagtgctatccatatgaccgttgatacctccct 6857  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6856 ttcaattcttcgttcttcttagataagattgaattgagaaacagctagtttggatcttcagtttgaatatacggattaaatgtagcttctggtgatgat 6758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 54194 - 53997
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  54194 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgcaggacaaatgctcagcgctgtccaaatgaccgttgataccttcct 54095  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatga 213  Q
    |||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54094 ttcaattcttcgttcttcttagatgagattgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgagtatatggattaaatgtagcttctggtgatga 53997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Original strand, 14771 - 14971
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  14771 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccctt 14870  T
Q  117 tcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| |||||| |||||  || | |||| |||  ||||||||||||| |||||    
T  14871 tcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttccgtttgttta-aaggatcaaacatagcttctggtgaagatat 14969  T
Q  217 tg 218  Q
    ||    
T  14970 tg 14971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8133 - 7935
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8133 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagagctaaccaaatgaccgttgatacctccct 8034  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || || |||| ||||||||||||||    
T  8033 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacaaatcaattgtatcttctggtgatgat 7935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 125 - 323
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  125 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgataccttcct 224  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||| || || |||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||    
T  225 ttcaattcttcatttttcttagactaggttgaaatgagaaacagctactttgaatcttcagtttgaatatacgaatcaattgtagcttctggtgatgat 323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 32974 - 32776
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32974 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgatcgttgatacctccct 32875  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| || ||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || || |||||||||||||||||||    
T  32874 ttcaattattcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttcagtttgaatttacaaatcaattgtagcttctggtgatgat 32776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 40523 - 40322
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  40523 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 40424  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  40423 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 40325  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  40324 ttg 40322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 19436 - 19640
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19436 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaatgaaggacaaatactcagtgctatccaaatgaccgttgatacctccct 19535  T
Q  116 ttc-acttcttcg-ttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatctt-cagtttgaa-tatatggattaaatgtagcttctggtgat 211  Q
    ||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  19536 ttctaattcttcgtttcttcttaaataaggttgaaatgagaaacagctactttggatcttacagtttgaattttacggattaaatgtagcttctggtgat 19635  T
Q  212 gatat 216  Q
    |||||    
T  19636 gatat 19640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17005 - 16792
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtgg-ttgtac-acttgtactttgtcaactctgtt--aacgaaggacaaatgctcagagcta-tccaaatgaccg-ttga-ta 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||| ||    
T  17005 acagagtagtggaggtagtgggttgtactacttgtactttgtcaactctgttaaaacgaaggacaaatactcagtgctattccaaatgaccgtttgatta 16906  T
Q  109 cctcc-ctttcacttcttcgttctttttagat-aaggttgaaatgagaaacaa-ctactttggatcttcagtttgaa-tatatggattaaatgtag-ctt 203  Q
    |||||  ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||    
T  16905 cctcctttttcaattcttcgttcttcttagataaaggttgaaatgagaaacaagctactttggatcttcagtttgaattttacggattaaatgtagactt 16806  T
Q  204 ct-ggtgatgatat 216  Q
    || |||||||||||    
T  16805 ctgggtgatgatat 16792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6289 - 6092
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  6289 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaattctgttaacgaaggacaaatactcagtgcttttcatatgaccgttgatacctccct 6190  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   || || |||||||||||||||||||    
T  6189 ttcaattcttcgttcttcttagattatgttgaaatgagaaacagctactttggatcttcag-ttgaatttacaaatcaattgtagcttctggtgatgat 6092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 7825 - 7658
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |||||||||||||||||||    
T  7825 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatactcagtgttcttcaagtgaccgttgatacctccct 7726  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaat 183  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7725 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttggaatgagaaacaactactttgaatcttcagtttgaat 7658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 10672 - 10505
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | | | ||| |||||||||||||||||||    
T  10672 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatacttagtgttcttcaagtgaccgttgatacctccct 10573  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaat 183  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  10572 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttggaatgagaaacagctactttgaatcttcagtttgaat 10505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0178
Description:

Target: scaffold0178; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 87 - 214
Target Start/End: Original strand, 26995 - 27122
Alignment:
Q  87 gctatccaaatgaccgttgatacctccctttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatata 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26995 gctatccaaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatctttagtttgaatata 27094  T
Q  187 tggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27095 tggattaaatgtagcttctggtgatgat 27122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 52173 - 51974
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt-gtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  52173 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttttgtcaactctgttaaagaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacctccc 52074  T
Q  115 tttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||  |||||  |||||||||||||||||||    
T  52073 tttcaattcttcgttcttattagacgaggttgaaacgagaaacagctactttgaatcttcagtttaaatttactgattagttgtagcttctggtgatgat 51974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1731 - 1533
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| | ||||| | | | |||||||||||||||||||||||    
T  1731 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctaataatgaaggacaagtactcagtgttcttcaaatgaccgttgatacctccct 1632  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    || | |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| ||| ||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  1631 tttaattcttcgttcttcttagatgaggttgaaacgagaaatagctactttgaatcttcagtttaaatttactgattaattgtagcttctggtgatgat 1533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35229 - 35031
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||   | |||||||||||||||||  ||||||    
T  35229 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtacttagttttctccaaatgaccgttgatgtctccct 35130  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||| ||| || |||| || |||||||||||||||||||    
T  35129 ttcaattcttcgttcttcttagacaaggttgaaatgttaaacagctactttgaatctccagtttaaatttacggatcaattgtagcttctggtgatgat 35031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 117284 - 117482
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  117284 acagagtagcggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaagtactcagtgctcttcaaatgaccgttgatacatccct 117383  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||  || || |||||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  117384 ttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaccagctactttgaatcttcagtttaaatttactgatcaaatgtaacttctggtgatgat 117482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 475351 - 475305
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  475351 cagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 475305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 481871 - 481825
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  481871 cagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 481825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 156720 - 156681
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  156720 gtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 156681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0272
Description:

Target: scaffold0272; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 13674 - 13511
Alignment:
Q  20 agtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||    |||||||||||||||||||||||||     
T  13674 agtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgaaggacaaatactcagtgcttctgaaatgaccgttgatacctccctttcg 13575  T
Q  120 cttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaat 183  Q
     ||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13574 attcttcgttttccttagatgaggttgaaatgagaaacaactactttgaatcttcagtttgaat 13511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36805 - 36607
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||   | |||||||||||||||||  ||||||    
T  36805 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgttaactctgttaacgaaggacaagtacttagttttctccaaatgaccgttgatgtctccct 36706  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||| ||| || |||| || |||||||||||||||||||    
T  36705 ttcaattcttcgttcttcttagacaaggttgaaatgttaaacagctactttgaatctccagtttaaatttacggatcaattgtagcttctggtgatgat 36607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6912 - 6711
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  6912 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 6813  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  6812 ttcaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 6714  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  6713 ttg 6711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 12542 - 12743
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12542 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttgatacctccct 12641  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    || | |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  12642 ttaaattcttcgttcttcttggataagactgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagata 12740  T
Q  216 ttg 218  Q
    |||    
T  12741 ttg 12743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12186 - 11987
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  12186 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaagtacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccct 12087  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||| | |||||  ||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  12086 ttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgata 11988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16017 - 15818
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||| ||||| |   ||  ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16017 acagagtagtgtaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaacttttatattgaatgacaagtatccattgcttttcaaatgaccgttgatacctccct 15918  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| ||||||||||   |||||| ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| || || |||||||||||||||||    
T  15917 ttcaattcttcgttc-ccttagatgaggttgaaacgaaaatcagctcctttgaatcttcagtttaaatttactgatcaattgcagcttctggtgatgata 15819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 8148 - 8341
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||| ||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  8148 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagaggcaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccct 8247  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  8248 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 8341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37027 - 36834
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||| ||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  37027 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagaggcaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccct 36928  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  36927 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 36834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 47661 - 47468
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||| ||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  47661 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagaggcaagtgctcagtgttatccatatatccgttgatacctccct 47562  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtga 210  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||    
T  47561 ttcagttcttcgttcttctttgataagactgaattgagaatcagcaactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaatgtagcttctggtga 47468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 7416 - 7615
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  7416 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataaagaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccct 7515  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| || ||||||| | ||||| |||||||||| || | ||| || ||||| | |||||||||  || ||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  7516 ttcaatttttcgttc-tcttagacaaggttgaaacgaaagacagctcctttgaaacttcagtttagatttactgatcaattgtagcttctggtgatgata 7614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 93 - 214
Target Start/End: Original strand, 2550 - 2671
Alignment:
Q  93 caaatgaccgttgatacctccctttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggatt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||     
T  2550 caaatgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatttaaaaatc 2649  T
Q  193 aaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  2650 aattgtagcttctggtgatgat 2671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 5481 - 5680
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| ||| | |||  ||||||||||| ||||||    
T  5481 acagagtagtggaggtagtagttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaattacccagtgcttttcaaccgaccgttgatatctccct 5580  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    |||| |||||||||| | |||||  ||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| | | ||  ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  5581 ttcaattcttcgttc-tcttagacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcttcagtttaattttactgatcacttgtagcttctggtgatgata 5679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 12896 - 13075
Alignment:
Q  36 gttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctttcacttcttcgttcttttt 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| ||| | |||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||    
T  12896 gttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaattacccagtgcttttcaaccgaccgttgatatctccctttcaattcttcgttc-tctt 12994  T
Q  136 agataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
    |||  ||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| | | ||  ||| |  |||||||||||||||||||||    
T  12995 agacgaggttgaaacgaaaaacagctcctttgaatcttcagtttaattttactgatcacttgtagcttctggtgatgatat 13075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4568 - 4370
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||  ||||||||||    
T  4568 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaacgagagacaagtgctcagtgctatccatatatccgttggaacctcccttt 4469  T
Q  118 cacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatatt 217  Q
    |  ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||  || |||||||| |||||||||||| ||  | |||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  4468 cgattctttgttcttcttggataagactgaattgagattcatctactttgaatcttcagtttg-attgagggatcaaatgcagcttctggtgaagatatt 4370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10357 - 10159
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| ||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  10357 cagagtagtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaagtacccagtgcttttcaaacgaccgttgatacctccctt 10258  T
Q  117 tcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
    ||| |||||||||| | ||| |  ||||||| |  | ||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |  |||||||||||||||||||||    
T  10257 tcaattcttcgttc-tcttatacgaggttgagacaaaaaacagctcctttgaatcttcagtttaaatttactgatcacttgtagcttctggtgatgatat 10159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 180424 - 180621
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |   ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  180424 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgatgaagaaggacaagtatccaatgcttttcaaatgaccgttgatacctcccttt 180523  T
Q  118 cacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
    || |||||||||| | |||||  ||||||||| || ||| | || ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| || || ||||||||||||||||||    
T  180524 caattcttcgttc-tcttagactaggttgaaacgaaaaatagctcctttgaatcttcagtttaaatttactgatcaattgcagcttctggtgatgatat 180621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 175512 - 175708
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |   ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  175512 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgatgaagaaggacaagtatccaatgcttttcaaatgaccgttgatacctcccttt 175611  T
Q  118 cacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    || |||||||||| | |||||  ||||||||| || ||| | || ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| || || |||||||||||||||||    
T  175612 caattcttcgttc-tcttagactaggttgaaacgaaaaatagctcctttgaatcttcagtttaaatttactgatcaattgcagcttctggtgatgata 175708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 40414 - 40369
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40414 cagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 40369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 58953 - 58915
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  58953 gtggaggtagtgattgtacaattgtactttgtcaactct 58915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 56852 - 56737
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || | | | | ||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  56852 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaaatctgataacgaaggaaaatttccccgtgcttttcaaacgaccgttgatacctccct 56753  T
Q  116 ttcacttcttcgttct 131  Q
    |||| |||||||||||    
T  56752 ttcaattcttcgttct 56737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 6278 - 6141
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||  || ||| |||| ||  ||||||||||||||||||    
T  6278 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctattaatgagagacaagtgcagagtgctttccatatatccgttgatacctcccttt 6179  T
Q  118 cacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaa 155  Q
    || |||||||||||| || ||||||  |||| ||||||    
T  6178 caattcttcgttcttctttgataagactgaattgagaa 6141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 35723 - 35921
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||   | ||| ||| | ||||||| ||||| |||||||||    
T  35723 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaaagaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttggtacctccct 35821  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    || | | ||||||||| || |||  ||| |  ||||| ||||| || ||||| |  |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  35822 tttaatccttcgttctctt-agacgaggatataatgaaaaacagctcctttgaaatttcagtttgaatatactgatcaactgtagcttctggtgatgata 35920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2424 - 2306
Alignment:
Q  96 atgaccgttgatacctccctttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||| ||| ||  |||||||    
T  2424 atgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgagaaacggctactttgaaacttcagtttaaatttactgattaaa 2325  T
Q  196 tgtagcttctggtgatgat 214  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  2324 tgtaacttctagtgatgat 2306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 129
Target Start/End: Original strand, 15915 - 16027
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||   | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15915 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtaccttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacccagtgcttttcaaatgaccgttgatacctccct 16013  T
Q  116 ttcacttcttcgtt 129  Q
    |||| |||||||||    
T  16014 ttcaattcttcgtt 16027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 216
Target Start/End: Original strand, 53339 - 53420
Alignment:
Q  134 ttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53339 ttagataaggt-gaaataagaaacagctactttggatcttcagtttgagtaaatggattaaatgtagcttctggtgatgatat 53420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 77
Target Start/End: Original strand, 40688 - 40749
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaa 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40688 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgataacgaaggacaa 40749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 4)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 127832 - 128030
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || |||||||||   | ||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  127832 acagagtagtggaagtagtggttgtacacttgtacttagtcaaatct-tcaatgaaggacaagcacccagtgctttttaaatgaccgttgatacctccct 127930  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    || | || ||||||| | ||||| |||||||||| || | ||| || ||||| | |||||||||  || ||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  127931 tttaattattcgttc-tcttagacaaggttgaaacgaaagacacctcctttgaaacttcagtttagatttactgatcaattgtagcttctggtgatgata 128029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 140991 - 141189
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | || ||||||||||  | ||| ||| |  ||||||| ||||||||||||||    
T  140991 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtaaact-tttcaatgaaggacaaacacccagtgctttttaaatgactgttgatacctccct 141089  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    || | |||||||||| | ||||| ||| | |||| || | |||||| ||||| | |||||||||  || ||  ||| || ||||| |||| |||||||||    
T  141090 tttaattcttcgttc-tcttagacaagatggaaaggaaagacaactcctttgaaacttcagtttagatttactgatcaattgtagtttctagtgatgata 141188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 7719 - 7674
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7719 cagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 7674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 215599 - 215569
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  215599 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 215569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 2182 - 2378
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctcccttt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |    | ||| ||| | ||||||| ||||| |||||||||||    
T  2182 agagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaaagaaggaaaggcacccagtgcttttcaaatgaacgttggtacctcccttt 2280  T
Q  118 cacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
     | | || |||| || | |||  ||||| ||| || ||||| || ||||| | ||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  2281 taatcctacgtt-ttctcagacgaggttaaaacgaaaaacagctcctttgaaacttcagtttgaatatactgatcaactgtagcttctggtgatgatat 2378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19208 - 19122
Alignment:
Q  97 tgaccgttgatacctccctttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaat 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19208 tgaccgttgatacctccctttcaattcttcgttcttcttagacgaggttgaaatgttaaacagctactttgaatcttcagtttgaat 19122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0314 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0314
Description:

Target: scaffold0314; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20700 - 20646
Alignment:
Q  160 ctactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20700 ctactttggatcttcagtttgaatacatggattaaatgtagcttctggtgatgat 20646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0481 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0481
Description:

Target: scaffold0481; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12895 - 12696
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||   | ||| ||| | ||||||| ||||| |||||||||    
T  12895 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaaagagggacaagcacccagtgcttttcaaatgaacgttggtacctccct 12797  T
Q  116 ttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtt-tgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgat 214  Q
    || | | ||||||| || |||||  || || ||| || ||||| || ||||| | ||||||||   ||||||  ||| || |||||||||||||||||||    
T  12796 tttaatccttcgtt-ttcttagacgagattaaaacgaaaaacagctcctttgaaacttcagttcaaaatatactgatcaactgtagcttctggtgatgat 12698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 117
Target Start/End: Original strand, 833 - 932
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctt 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||   | ||| ||| | ||||||| |||||| |||||||||    
T  833 cagagttgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacacagtgcttttcaaatgaacgttgacacctccctt 931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 117
Target Start/End: Original strand, 5213 - 5312
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactctgttaacgaaggacaaatgctcagagctatccaaatgaccgttgatacctccctt 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||   | ||| ||| | ||||||| |||||| |||||||||    
T  5213 cagagttgtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct-tcaatgaaggacaagcacacagtgcttttcaaatgaacgttgacacctccctt 5311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 20479 - 20432
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20479 acagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 20432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0774 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0774
Description:

Target: scaffold0774; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 6426 - 6388
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6426 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 6388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Original strand, 912 - 950
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  912 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Original strand, 29669 - 29707
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29669 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 29707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Original strand, 58495 - 58533
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58495 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 58533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 22050 - 22095
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22050 cagagttgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 22095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 61231 - 61276
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  61231 cagagtcgtggaggtagtggttgtacaattgtactttgtcaactct 61276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 212363 - 212393
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212363 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 212393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 6621 - 6577
Alignment:
Q  19 gagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6621 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtactttgtcaactct 6577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 1033 - 990
Alignment:
Q  20 agtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactttgtcaactct 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1033 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtactttgtcaactct 990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 1226 - 1183
Alignment:
Q  20 agtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactttgtcaactct 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1226 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtactttgtcaactct 1183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 414 - 379
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  414 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 62
Target Start/End: Original strand, 11769 - 11816
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  11769 acagagtagtggaggtagtggttttacactttgtactttgtcaactct 11816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 31886 - 31851
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31886 acagagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 31851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Original strand, 1399 - 1437
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1399 gtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct 1437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Original strand, 2014 - 2052
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2014 gtggaggtagtggttgtacatttgtactttgtcaactct 2052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 1773 - 1727
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactttgtcaactct 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1773 cagagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtactttgtcaactct 1727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 17907 - 17861
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17907 cagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 17861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 9306 - 9352
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9306 cagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 9352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 93 - 215
Target Start/End: Original strand, 15129 - 15250
Alignment:
Q  93 caaatgaccgttgatacctccctttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggatt 192  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||| || | |  ||||| |||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||||  |||     
T  15129 caaatgaacgttggtacctcccttttaatccttcgttctcttaa-acgaggttaaaatgaaaaacagctcctttgaaacttcagtttaaatatactgatc 15227  T
Q  193 aaatgtagcttctggtgatgata 215  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  15228 aactgtagcttctggtgatgata 15250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 61742 - 61788
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  61742 cagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaactct 61788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 53
Target Start/End: Original strand, 143110 - 143143
Alignment:
Q  20 agtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  143110 agtagtggaggtagtggttgtacacttgtacttt 143143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 59354 - 59316
Alignment:
Q  24 gtggaggtagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  59354 gtggagataatggttgtacacttgtactttgtcaactct 59316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 59
Target Start/End: Original strand, 5127 - 5170
Alignment:
Q  17 cagagtagtggaggtagtggttgtacac-ttgtactttgtcaac 59  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5127 cagagtcgtggaggtagtggttgtacactttgtactttgtcaac 5170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0604 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0604
Description:

Target: scaffold0604; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 216
Target Start/End: Original strand, 8 - 130
Alignment:
Q  93 caaatgaccgttgatacctccctttcacttcttcgttctttttagataaggttgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggatt 192  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||| || |||  ||| |  || || ||||| || ||||| | ||||||||||||||||  |||     
T  8 caaatgaacgttggtacctcccttttaatccttcgttctctt-agacgaggatataacgaaaaacagctcctttgaaacttcagtttgaatatactgatc 106  T
Q  193 aaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  107 aactgtagcttctggtgatgatat 130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 28851 - 28820
Alignment:
Q  31 tagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28851 tagtggttgtacacttgtactttgtcaactct 28820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 757 - 727
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  757 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Original strand, 9978 - 10008
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9978 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 10008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 27531 - 27501
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27531 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 27501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 25767 - 25737
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25767 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 25737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 34906 - 34876
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34906 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 34876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 216
Target Start/End: Original strand, 69919 - 69981
Alignment:
Q  154 aaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatat 216  Q
    ||||| || ||||| | ||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  69919 aaacagctcctttgaaacttcagtttgaatatactgatcaactgtagcttctggtgatgatat 69981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 244386 - 244356
Alignment:
Q  16 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  244386 acagagtagtggaggtagtggttgtacactt 244356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19734 - 19662
Alignment:
Q  145 tgaaatgagaaacaactactttggatcttcagtttgaatatatggattaaatgtagcttctggtgatgatattg 218  Q
    |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  19734 tgaattgagaatcagctactttgaatcttcagtttgatta-aaggatcaaacgtagcttctggtgaagatattg 19662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 58
Target Start/End: Original strand, 16966 - 17007
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactttgtcaa 58  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16966 agagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtactttgtcaa 17007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 980 - 948
Alignment:
Q  19 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  980 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 10506 - 10474
Alignment:
Q  19 gagtagtggaggtagtggttgtacacttgtact 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10506 gagtagtggaggtagtggttgtacaattgtact 10474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 46
Target Start/End: Original strand, 37413 - 37441
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37413 agagtagtggaggtagtggttgtacactt 37441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 46
Target Start/End: Original strand, 135473 - 135501
Alignment:
Q  18 agagtagtggaggtagtggttgtacactt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  135473 agagtagtggaggtagtggttgtacactt 135501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University